##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN5_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN5_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN5_R_activity_profile --assembly-region-out CAN5_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN5_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 5:46:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN5_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN5_R
chr1	69511	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=472;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=1253.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,448:0.996:449:1,191:0,250:1,0,314,134
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=496.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,123:0.992:123:0,61:0,58:0,0,24,99
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=16,29;MFRL=85,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:0,3:1,7:4,0,0,10
chr1	866515	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:4,0:7,0:0|1:866515_T_C:866515:1,10,4,0
chr1	866518	.	C	CCCGGGGGG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=158,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:4,2:7,2:0|1:866515_T_C:866515:1,11,4,0
chr1	866519	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,11;MFRL=158,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:4,0:7,0:0|1:866515_T_C:866515:1,11,4,0
chr1	866523	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,0:0|1:866515_T_C:866515:1,11,2,0
chr1	866527	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:8,1:0|1:866515_T_C:866515:1,11,2,0
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,12,3
chr1	878778	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:0,0:3,2:0|1:878778_C_T:878778:1,4,1,1
chr1	878796	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:3,2:0|1:878778_C_T:878778:0,5,1,1
chr1	878797	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0|1:878778_C_T:878778:0,5,1,1
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,7,12
chr1	883804	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:883804_C_G:883804:0,0,1,0
chr1	883809	.	TC	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:883804_C_G:883804:0,0,1,0
chr1	883814	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:883804_C_G:883804:0,0,1,0
chr1	884076	.	C	CTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:884076_C_CTAT:884076:0,0,0,1
chr1	884077	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:884076_C_CTAT:884076:0,0,0,1
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr1	894388	.	TTTCGGACTCGGA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCGGACTCGGA;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:12,0:10,12,1,1
chr1	898008	.	T	TGGTGGTGCATGCCTGTAATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=222,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	898323	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	900505	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:8,7:8,8:9,7,8,7
chr1	906682	.	G	GCCCC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=97,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:0|1:906682_G_GCCCC:906682:0,9,2,0
chr1	906683	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=97,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,0:0|1:906682_G_GCCCC:906682:0,9,2,0
chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=97,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,1:9,1:0|1:906682_G_GCCCC:906682:2,11,2,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:0|1:906682_G_GCCCC:906682:3,11,2,0
chr1	906698	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:0|1:906682_G_GCCCC:906682:3,11,2,0
chr1	911595	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,8,7
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chr1	914852	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr1	914876	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,2:0,0,3,7
chr1	935061	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:10,1:0|1:935061_C_T:935061:7,14,1,1
chr1	935067	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:11,0:9,2:0|1:935061_C_T:935061:7,13,1,1
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,9,1
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,7,3
chr1	949303	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,37;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,0:3,3:7,0,1,2
chr1	949925	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	970549	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=G;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.688:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,10,7
chr1	977570	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr1	981834	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=78,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,0:16,2:0|1:981834_G_A:981834:8,11,1,1
chr1	981838	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=78,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:2,0:16,2:0|1:981834_G_A:981834:8,11,1,1
chr1	982659	.	GGATGCCAGGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=219,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GATGCCAGGCA;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr1	982844	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr1	985079	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	986443	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr1	988932	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:988932_G_C:988932:0,0,2,5
chr1	988950	.	TGCCAGGCTGCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:988932_G_C:988932:0,2,0,1
chr1	988965	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:988932_G_C:988932:0,2,0,1
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	1026272	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=107,5;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,0:8,6:11,8,6,0
chr1	1026801	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,2,1
chr1	1118212	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr1	1132178	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:1132178_GCC_G:1132178:0,0,0,1
chr1	1132183	.	A	AGATGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1132178_GCC_G:1132178:0,0,0,1
chr1	1133254	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:1133254_G_A:1133254:1,3,0,2
chr1	1133273	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:1133254_G_A:1133254:0,3,0,1
chr1	1163804	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	1192787	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1198729	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=111,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:5,10,1,1
chr1	1201558	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:1201558_C_T:1201558:12,12,1,1
chr1	1201582	.	T	TTA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:1201558_C_T:1201558:10,11,1,1
chr1	1201584	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:1201558_C_T:1201558:11,10,1,1
chr1	1201586	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:10,2:0|1:1201558_C_T:1201558:11,10,1,1
chr1	1222690	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=76,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	1231736	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:1231736_G_T:1231736:0,1,0,1
chr1	1231739	.	C	CAGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1231736_G_T:1231736:0,1,0,1
chr1	1231743	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1231736_G_T:1231736:0,0,0,1
chr1	1231747	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1231736_G_T:1231736:0,0,0,1
chr1	1233870	.	ACCTGAGGACCCCACCCCCG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTGAGGACCCCACCCCCG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr1	1234008	.	C	CTGCT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=73,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:0|1:1234008_C_CTGCT:1234008:3,3,1,1
chr1	1234009	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=73,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:1234008_C_CTGCT:1234008:3,3,1,1
chr1	1234012	.	G	GCCCACAC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=73,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:1234008_C_CTGCT:1234008:3,3,1,1
chr1	1234016	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=73,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:1234008_C_CTGCT:1234008:3,3,1,1
chr1	1234033	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=85,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr1	1235634	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	1239471	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:5,11,1,1
chr1	1244169	.	GGGCA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:12,0:2,21,0,2
chr1	1246758	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:4,6,1,2
chr1	1249187	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,15,13
chr1	1250859	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.226:13:4,0:5,0:0,10,3,0
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr1	1254315	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=145,171;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.433:28:7,0:8,12:0|1:1254315_T_A:1254315:3,13,0,12
chr1	1254317	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,171;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.434:28:6,0:9,12:0|1:1254315_T_A:1254315:3,13,0,12
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	1269015	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=161,53;MMQ=57,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:1269015_G_C:1269015:5,1,1,1
chr1	1269017	.	CTGG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:4,0:0|1:1269015_G_C:1269015:7,2,1,1
chr1	1269022	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:6,0:0|1:1269015_G_C:1269015:7,2,1,1
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr1	1292131	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.448:15:4,2:4,4:0,8,2,5
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	1293802	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,0:2,1:0,3,5,0
chr1	1293809	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,2:0|1:1293809_A_C:1293809:1,5,3,0
chr1	1293813	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,19;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,0:5,1:0|1:1293809_A_C:1293809:3,6,3,0
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	1328276	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1328276_C_G:1328276:0,2,0,1
chr1	1328278	.	CTT	C,GTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30,27;MFRL=0,122,129;MMQ=60,60,60;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.68,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.375,0.376:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr1	1328281	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,22;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1|0:1328276_C_G:1328276:0,2,0,1
chr1	1333809	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr1	1334663	.	AGCC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	1354789	.	C	CTGAGCCCTCTGCTCTGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=81,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:5,4,1,1
chr1	1356193	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr1	1374621	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=188,175;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	1374649	.	G	GTCAAACGTCTGCTTCAGCCACTTTGGTGCCGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=155,172;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	1412613	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:15,2:29,2:22,23,1,3
chr1	1414123	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=230,212;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:1414123_G_C:1414123:0,1,0,1
chr1	1414125	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=230,212;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1414123_G_C:1414123:0,1,0,1
chr1	1417649	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=97,158;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:3,5,1,2
chr1	1421241	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=115,156;MMQ=52,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:4,4,3,4
chr1	1426050	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,202;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:2,2,2,2
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=106,144;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	1475234	.	G	GTGAATCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1475234_G_GTGAATCAT:1475234:0,2,0,1
chr1	1475238	.	CG	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,28;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:1475234_G_GTGAATCAT:1475234:0,2,0,1
chr1	1475242	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1475234_G_GTGAATCAT:1475234:0,2,0,1
chr1	1509825	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,6:5,2:7,6,4,4
chr1	1560100	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	1560847	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1560847_T_A:1560847:0,0,1,0
chr1	1560851	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1560847_T_A:1560847:0,0,1,0
chr1	1560856	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1560847_T_A:1560847:0,0,1,0
chr1	1560859	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1560847_T_A:1560847:0,0,1,0
chr1	1560865	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=100,272;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1560847_T_A:1560847:1,0,1,0
chr1	1563789	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	1564194	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	1564952	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1570085	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=251,175;MMQ=27,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:1570085_CA_C:1570085:0,1,0,1
chr1	1570087	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=251,175;MMQ=27,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:1570085_CA_C:1570085:0,1,0,1
chr1	1570094	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1570085_CA_C:1570085:0,0,0,1
chr1	1570096	.	CT	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1570085_CA_C:1570085:0,0,0,1
chr1	1572332	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.181:29:13,1:11,3:15,9,3,2
chr1	1572939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=398,186;MMQ=45,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,2,6
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	1599673	.	A	AAAGGGAACACTGTTGGTGGGAGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=206,173;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=94,150;MMQ=45,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,6:10,2:5,9,7,1
chr1	1599981	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=92,147;MMQ=51,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:0,8:2,10:1,1,0,18
chr1	1601015	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr1	1601052	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:1,18:0,11:0,1,19,10
chr1	1635272	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,176;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,3:11,2:13,5,2,3
chr1	1635723	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,96;MMQ=40,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=82.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,37:0.491:75:20,0:18,35:15,23,0,37
chr1	1636313	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,74;MMQ=52,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:1636313_C_T:1636313:6,3,1,1
chr1	1636331	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=148,74;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:0|1:1636313_C_T:1636313:6,6,1,1
chr1	1647686	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=89,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=91,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:8,1:4,7:0|1:1647722_G_T:1647722:11,3,8,1
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=91,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:9,2:5,7:0|1:1647722_G_T:1647722:11,3,8,1
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=91,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:9,3:5,8:0|1:1647722_G_T:1647722:11,3,9,2
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=25,21;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.575:40:11,6:4,14:0|1:1647745_G_A:1647745:10,7,15,8
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.581:43:13,7:5,15:0|1:1647745_G_A:1647745:11,7,15,10
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,40:0.654:61:12,14:8,26:10,11,24,16
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,47:0.601:78:19,24:12,23:13,18,26,21
chr1	1647871	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=7;MBQ=23,32;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,49:0.619:79:15,23:14,25:17,13,21,28
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=74;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=101,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=141.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.624:62:13,18:10,14:14,9,16,23
chr1	1647928	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=23,30;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,18:0.346:53:23,9:11,9:10,25,8,10
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,17:0.545:31:7,12:5,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:2,12,6,11
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,17:0.545:31:9,12:5,5:0|1:1647968_C_CAT:1647968:2,12,6,11
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=24,23;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:5,6:3,3:0|1:1647983_T_A:1647983:1,11,2,7
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:0|1:1647983_T_A:1647983:1,11,1,5
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.512:37:8,11:8,7:0|1:1650938_CGG_C:1650938:3,15,6,13
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:9,10:9,7:0|1:1650938_CGG_C:1650938:3,15,6,14
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:5,6:6,5:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,11,3,11
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:4,5:5,3:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,9,3,7
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr1	1653097	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=97,82;MMQ=52,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:9,3:9,8,1,2
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,2,2
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,2,2
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,2,2
chr1	1656963	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,32815;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:10,0:11,2:0|1:1656963_T_TG:1656963:6,16,0,2
chr1	1656965	.	T	TGTATAGGCTTTTCTTAG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,32815;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:11,2:0|1:1656963_T_TG:1656963:6,16,0,2
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=167,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	1663851	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,2:5,1:0|1:1663851_G_C:1663851:5,1,4,1
chr1	1663861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:1,2:7,3:0|1:1663851_G_C:1663851:6,2,4,1
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	1666303	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=110,115;MMQ=31,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:3,5,0,3
chr1	1666338	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=91,119;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:5,14:6,1:0|1:1669734_G_T:1669734:7,6,9,6
chr1	1669748	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=113,91;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,12:0.433:28:15,6:1,6:1|0:1669734_G_T:1669734:7,9,6,6
chr1	1670415	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=127,146;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:3,5:14,0:9,8,3,2
chr1	1670554	.	T	TCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=138,31535;MMQ=30,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.103:26:10,2:14,0:4,20,0,2
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=135,175;MMQ=57,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,0:5,6:2,9,0,6
chr1	1684347	.	CCCT	C,CCCTCCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28,32;MFRL=156,74,162;MMQ=60,60,60;MPOS=6,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=CCT;STR;TLOD=7.01,6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.308,0.226:10:1,1,0:4,2,2:4,1,2,3
chr1	1685921	.	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.644:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:0|1:1686943_T_C:1686943:1,4,2,5
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:2,2:0|1:1686943_T_C:1686943:1,4,0,4
chr1	1688168	.	CCACGCTCACGCTGA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=233,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:1,1:0|1:1688168_CCACGCTCACGCTGA_C:1688168:0,3,0,1
chr1	1688184	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=227,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1688168_CCACGCTCACGCTGA_C:1688168:0,2,0,1
chr1	1688186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=227,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1688168_CCACGCTCACGCTGA_C:1688168:0,2,0,1
chr1	1688192	.	AC	CA,GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35,30;MFRL=0,113,219;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,0:3,5:4,1,4,1
chr1	1688575	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,14;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,0:4,0:1,12,3,0
chr1	1688581	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:7,0:4,0:0|1:1688581_A_C:1688581:0,11,3,0
chr1	1688584	.	T	TGGGG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=112,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=G;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:8,0:4,0:0|1:1688581_A_C:1688581:0,12,3,0
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.533:41:10,8:9,13:10,9,11,11
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,19,4
chr1	1696879	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:1,9:9,7:3,7,3,13
chr1	1737864	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=180,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,0:4,4:9,1,3,1
chr1	1749371	.	T	TAAGAGCCCACTGAATCACGCAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=224,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	1847856	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,4:2,4:5,5,5,3
chr1	1848043	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=143,294;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:1848043_T_G:1848043:2,6,1,1
chr1	1848048	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=143,294;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:1848043_T_G:1848043:1,6,1,1
chr1	1848050	.	A	ACCATC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=143,294;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:5,0:2,1:0|1:1848043_T_G:1848043:1,6,1,1
chr1	1848109	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr1	1849529	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:1,4,4,4
chr1	1855182	.	GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=31,0;MFRL=160,29;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:4,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:10,5,0,2
chr1	1855221	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=24,21;MFRL=163,29;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:6,5,0,2
chr1	1855224	.	AGC	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=24,19;MFRL=162,29;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:1,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:6,6,0,2
chr1	1855228	.	CCACCTGGAGCTTGTCGG	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=115,29;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:2,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:9,9,0,2
chr1	1855249	.	AGTAGAGG	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=24,22;MFRL=112,29;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:3,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:9,10,0,2
chr1	1855257	.	CTTTCGTGGT	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=110,29;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.131:22:13,2:6,0:0|1:1855182_GCCGGGCTGAGCTTGCAGAGCCAGAGCCGCACCTTTTC_G:1855182:10,10,0,2
chr1	1855280	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=112,58;MMQ=60,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:10,6:7,0:10,7,4,2
chr1	1855450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=232,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	1858309	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:2,1,3,2
chr1	1896493	.	TT	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=194,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:1,0:2,2,1,1
chr1	1918488	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=118,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:3,3,5,0
chr1	1956300	.	CTGCATCCCCAGGAAGGGACCCAGGCTCAGTGGAATTAAATTAAGTCCTGGCCTGTCTGACCGGTGGCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.151:22:1,2:2,0:13,4,1,4
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr1	1960926	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1960953	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:1960953_G_A:1960953:3,0,1,0
chr1	1960956	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:1960953_G_A:1960953:3,0,1,0
chr1	1987890	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	1987993	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=86,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,9:0,8:0,1,9,8
chr1	1988044	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=95,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:0,4:6,4:1,5,3,5
chr1	1991123	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr1	2005740	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	2082227	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,5:8,0:9,5,5,0
chr1	2105478	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:3,8,0,2
chr1	2116430	.	C	CCTGGCCGCCCTCGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:0|1:2116430_C_CCTGGCCGCCCTCGG:2116430:5,5,1,1
chr1	2116431	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:0|1:2116430_C_CCTGGCCGCCCTCGG:2116430:5,5,1,1
chr1	2116434	.	G	GTGCCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,2:3,0:0|1:2116430_C_CCTGGCCGCCCTCGG:2116430:5,5,1,1
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.509:22:6,4:3,7:8,3,9,2
chr1	2118724	.	CT	C,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,30,21;MFRL=119,177,112;MMQ=60,60,60;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.52,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,4:0.179,0.198:20:5,1,1:3,3,3:3,9,1,7
chr1	2121037	.	TGCGGGGGAGCCGAGAGGCGGGGCTGCTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGGGGGAGCCGAGAGGCGGGGCTGCTG;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.443:8:1,2:1,1:5,0,3,0
chr1	2160974	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=185,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:2160974_CA_C:2160974:0,5,1,1
chr1	2160976	.	CAAGTTCG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=199,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,2:1,0:0|1:2160974_CA_C:2160974:1,5,1,1
chr1	2234632	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=229,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,2,1
chr1	2234903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	2235580	.	CTGTGGGGGTGGCACTGGCTGAGGGGGGCTGGTCGCCGGGGGTGCGTTGGTGGCCCCATGTTTCGCAGGTTCCTCCGGGAGCGGCGCGTCTCCCTGG	C	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.375:21:4,1:1,2:10,7,0,4
chr1	2235656	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:2,2,3,0
chr1	2235662	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0|1:2235662_G_A:2235662:3,0,2,2
chr1	2235672	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.809:8:0,3:1,4:0|1:2235662_G_A:2235662:1,0,3,4
chr1	2252759	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr1	2288852	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:1,4,5,5
chr1	2317254	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,3:8,0:16,6,0,3
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:6,7:1,11:3,5,3,15
chr1	2340200	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:6,4,6,3
chr1	2340212	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,6:4,5:7,6,7,5
chr1	2409892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:2,1,5,1
chr1	2411451	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	2418935	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:1,2,4,0
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	2420913	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr1	2426248	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr1	2428388	.	CT	TC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:11,2:6,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:6,12,1,1
chr1	2428392	.	CGTG	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:5,12,1,1
chr1	2428398	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:4,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:5,9,1,1
chr1	2428400	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:5,8,1,1
chr1	2428405	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,2:4,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:5,8,1,1
chr1	2428407	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:8,2:4,0:0|1:2428388_CT_TC:2428388:5,8,1,1
chr1	2428874	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	2436511	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2436511_A_G:2436511:0,0,0,1
chr1	2436519	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2436511_A_G:2436511:0,0,0,1
chr1	2440346	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr1	2441358	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,8:9,2:5,7,0,10
chr1	2441392	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:2,8,0,8
chr1	2443212	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	2444226	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	2445406	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,3:6,3:8,5,6,0
chr1	2446960	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:6,0,3,3
chr1	2447107	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.202:26:10,1:11,3:7,14,2,3
chr1	2449924	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=276,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr1	2450544	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,2:2,0:4,1,2,0
chr1	2452357	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:1,5,3,5
chr1	2489214	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:22,0:23,4:22,23,1,3
chr1	2494330	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:8,5:2,10:2,8,6,9
chr1	2494785	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	2519235	.	AGTGGGGGCGGGAACCCTTGGGTAGCGTGGG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.324:15:8,0:3,1:5,6,2,2
chr1	2522392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	2522955	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr1	2528133	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr1	2537810	.	G	GATTACAGGCGT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=150,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:3,0:0|1:2537810_G_GATTACAGGCGT:2537810:3,5,1,1
chr1	2537814	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=150,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:2,0:0|1:2537810_G_GATTACAGGCGT:2537810:2,5,1,1
chr1	2537817	.	GT	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=150,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:2537810_G_GATTACAGGCGT:2537810:2,5,1,1
chr1	2537821	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=132,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,2:1,0:0|1:2537810_G_GATTACAGGCGT:2537810:1,5,1,1
chr1	2542872	.	G	GTGTGGTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2542872_G_GTGTGGTCTTT:2542872:1,2,0,1
chr1	2542881	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2542872_G_GTGTGGTCTTT:2542872:0,2,0,1
chr1	2938265	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:4,4,3,6
chr1	2939244	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=119,131;MMQ=60,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:13,0:6,6:11,9,0,6
chr1	3102659	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=173,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:7,6,1,1
chr1	3334587	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=59,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:3334587_G_A:3334587:2,2,0,4
chr1	3334603	.	C	CCCAGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,2:3,0:1|0:3334587_G_A:3334587:1,4,1,1
chr1	3342077	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3342077_A_C:3342077:0,0,1,0
chr1	3342081	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,14;MFRL=104,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:3342077_A_C:3342077:1,0,1,0
chr1	3342083	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,14;MFRL=104,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:3342077_A_C:3342077:1,0,1,0
chr1	3342109	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=9,24;MFRL=104,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.707:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr1	3342403	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3342530	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=299,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr1	3347550	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:7,12,0,4
chr1	3379727	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:4,2:7,9,1,1
chr1	3382792	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=98,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:9,12,0,2
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	3385599	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,2908;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:0,6,2,0
chr1	3388213	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:3,3:8,0:8,4,3,0
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	3395213	.	A	ATTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:3395213_A_ATTC:3395213:0,3,0,1
chr1	3395214	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:3395213_A_ATTC:3395213:0,3,0,1
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3413305	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,0:10,4:7,7,2,2
chr1	3414944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=179,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.451:5:0,0:1,2:3,0,1,1
chr1	3416449	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	3417131	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	3417960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	3418565	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	3424355	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=168,37;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.139:20:6,0:8,2:0|1:3424355_G_C:3424355:12,6,1,1
chr1	3424363	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:3424355_G_C:3424355:11,6,1,1
chr1	3424364	.	T	TCCACC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:3424355_G_C:3424355:11,6,1,1
chr1	3431271	.	A	ATGGTGGTGGGCTCCGTCTGAGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=94,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	3431871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	3477414	.	GGGCT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	3496479	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,16:0,0,19,17
chr1	3518944	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=198,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,1:3,3:0,7,0,4
chr1	3542106	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,2:1,2:0,3,2,7
chr1	3544235	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=199,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.845:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	3548136	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	3548150	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3548150_A_C:3548150:0,2,0,1
chr1	3548159	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3548150_A_C:3548150:0,2,0,1
chr1	3548160	.	GAGCAC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3548150_A_C:3548150:0,2,0,1
chr1	3555428	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=243,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,0:0,5:0,1,2,3
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr1	3638834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr1	3640085	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3640134	.	TCTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGC;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,5,0
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,6,2
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	3649568	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.756:2:0,2:0,0:0|1:3649568_C_T:3649568:0,0,0,2
chr1	3649574	.	C	CCTGCTGTCTTGGTTCTAGGAAACTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:3649568_C_T:3649568:0,0,0,2
chr1	3662316	.	C	CCCAGCTAATTTTTGCATTTTTATTTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=205,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr1	3662473	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=74,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:12,8:4,0:10,6,8,0
chr1	3672018	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,81;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:4,7,1,3
chr1	3683117	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=87,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:3683117_G_A:3683117:7,6,1,1
chr1	3683122	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,2:10,0:0|1:3683117_G_A:3683117:8,7,1,1
chr1	3683237	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3683237_C_CA:3683237:0,1,0,1
chr1	3683239	.	C	CAACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3683237_C_CA:3683237:0,1,0,1
chr1	3683241	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3683237_C_CA:3683237:0,1,0,1
chr1	3683868	.	CCAGCTGCAGGAGCAGGTGGAACTGGACCAGAACCACCTGCAGAGGTGGAAG	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=109,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.069:42:13,1:12,0:0|1:3683868_CCAGCTGCAGGAGCAGGTGGAACTGGACCAGAACCACCTGCAGAGGTGGAAG_C:3683868:20,20,1,1
chr1	3683942	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:3683868_CCAGCTGCAGGAGCAGGTGGAACTGGACCAGAACCACCTGCAGAGGTGGAAG_C:3683868:9,15,1,1
chr1	3684107	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	3697993	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr1	3699135	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:3,0,6,1
chr1	3701557	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	3703337	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	3732103	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3746585	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0|1:3746585_T_G:3746585:0,0,1,9
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:3746585_T_G:3746585:0,0,1,8
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,8,7
chr1	3751728	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	3755656	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:11,0:11,3:7,15,3,0
chr1	3755675	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,9,16
chr1	3761493	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=73,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:8,3:5,4,2,1
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	3761772	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	3764216	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	3765266	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,3:8,0:4,10,0,3
chr1	3765355	.	AACACATTTTTATATTTTCT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3765355_AACACATTTTTATATTTTCT_A:3765355:0,1,0,1
chr1	3765377	.	ACAACTTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3765355_AACACATTTTTATATTTTCT_A:3765355:0,1,0,1
chr1	3765386	.	GCAGAGGGTTTCT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3765355_AACACATTTTTATATTTTCT_A:3765355:0,1,0,1
chr1	3768834	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:1,0:1,1:1,2,3,0
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr1	3782412	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:0|1:3782412_A_C:3782412:11,11,1,2
chr1	3782414	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,2:10,0:0|1:3782412_A_C:3782412:11,11,1,2
chr1	3782608	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	3782648	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=157,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	3784454	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,1:0|1:3784454_T_C:3784454:0,0,5,2
chr1	3784464	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:3784454_T_C:3784454:0,0,5,2
chr1	3788978	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=63,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:2,4:2,0:4,3,3,3
chr1	3789180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr1	3800403	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3800403_A_T:3800403:0,1,0,1
chr1	3800405	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3800403_A_T:3800403:0,1,0,1
chr1	3807593	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	4832365	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=125,268;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:12,7,3,0
chr1	4832530	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,0:2,2:6,6,2,0
chr1	4834606	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0,3,1,1
chr1	5923487	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:2,10,0,2
chr1	5925371	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=287,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	5927031	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:5,2,4,2
chr1	5927067	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=120,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:11,7,0,3
chr1	5927738	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5927738_G_A:5927738:0,0,1,0
chr1	5927742	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5927738_G_A:5927738:0,0,1,0
chr1	5928092	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,2:0,1:3,3,2,1
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr1	5935222	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=238,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr1	5937413	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:1,7,1,4
chr1	5951013	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:8,2:6,6:7,7,5,3
chr1	5965880	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:6,2:1,1:1,6,2,1
chr1	5969315	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:4,7,1,2
chr1	5987696	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,3:5,8:4,3,7,4
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	6101771	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=287,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	6133850	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:11,0:8,5:0|1:6133850_G_C:6133850:10,10,0,5
chr1	6133855	.	C	CACTCTCCACGCCGCTTCTG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,38;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:11,0:8,5:0|1:6133850_G_C:6133850:9,11,0,5
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,7,15
chr1	6145380	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,4:2,8:0,5,2,10
chr1	6145407	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr1	6150637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr1	6157282	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	6169790	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=148,122;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,0:2,6:5,0,6,0
chr1	6169906	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:6169906_A_C:6169906:12,11,1,1
chr1	6169909	.	GGT	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:9,2:0|1:6169906_A_C:6169906:12,11,1,1
chr1	6172190	.	A	AGGT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:5,2:9,0:8,12,1,1
chr1	6185180	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.424:10:2,2:3,0:0|1:6185180_C_CT:6185180:3,4,2,1
chr1	6185181	.	C	CGGTATTTCTGTTTAACATTGTACAGGAGGTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.424:10:0,3:3,0:0|1:6185180_C_CT:6185180:3,4,2,1
chr1	6186645	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=75,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,0,2
chr1	6195514	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	6203853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=18,27;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:0,0:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,3,0
chr1	6203857	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,28;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,0:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,4,0
chr1	6203859	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.506:4:1,0:0,0:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6203862	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=18,11;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6203868	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:6203853_A_C:6203853:2,2,2,0
chr1	6203872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:1,0:0|1:6203853_A_C:6203853:2,2,2,0
chr1	6206759	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=103,175;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.545:44:8,24:12,0:11,9,24,0
chr1	6207011	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	6209271	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	6257856	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	6266787	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6266787_G_C:6266787:0,1,0,1
chr1	6266788	.	T	TCCCACCTGAGACCTGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6266787_G_C:6266787:0,1,0,1
chr1	6272137	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,2:2,0:0,3,1,2
chr1	6273330	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=180,103;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,0:4,3:0,10,1,3
chr1	6273332	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=180,72;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:6,0:4,2:0,10,1,2
chr1	6278414	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,4:5,11:4,5,8,7
chr1	6292087	.	AGCC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,1:12,1:0|1:6292087_AGCC_A:6292087:14,14,0,2
chr1	6292091	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,1:14,1:0|1:6292087_AGCC_A:6292087:14,14,0,2
chr1	6304426	.	ATGGAGAAAAAGCGCCGGGCACGCATCAATGTGTCACTGGAGCAGCTCAAGTCGCTGC	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:8,2:10,0:25,10,1,1
chr1	6304447	.	CGCAT	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.363:28:8,10:10,0:0|1:6304447_CGCAT_C:6304447:10,8,10,0
chr1	6304448	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.193:18:6,2:9,1:9,6,1,2
chr1	6304454	.	ATGTGTCACTGGAGCAGCTCAAGTCGCTGCTGGAGAAACACTACTCGCACCAG	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.328:31:8,9:8,0:0|1:6304447_CGCAT_C:6304447:11,10,10,0
chr1	6355065	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,6:3,4:2,4,5,5
chr1	6387572	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	6393668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=128,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr1	6399711	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=120,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:6399711_A_G:6399711:0,1,0,4
chr1	6399724	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=140,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:6399711_A_G:6399711:0,2,0,3
chr1	6409811	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr1	6418850	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:4,0:12,13:9,7,12,1
chr1	6453501	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=87,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:6453501_G_GC:6453501:2,2,0,1
chr1	6453504	.	G	GGAGGCCGCGTTCGATTCGCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=87,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:6453501_G_GC:6453501:2,2,0,1
chr1	6453507	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=87,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:6453501_G_GC:6453501:2,2,0,1
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6500919	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	6505833	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:6505833_AC_A:6505833:0,4,0,1
chr1	6505837	.	AGC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=164,146;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6505833_AC_A:6505833:0,2,0,1
chr1	6517388	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,42;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.238:31:17,7:7,0:14,10,6,1
chr1	6524813	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6524813_G_T:6524813:0,0,0,1
chr1	6524815	.	T	TGAGTAATAACAGAATGTAGGGATGTGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6524813_G_T:6524813:0,0,0,1
chr1	6525165	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,0:11,4:6,10,0,4
chr1	6530306	.	T	TCACAGCCCTGTCCACCCTGGCCCTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=172,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:5,2:1,0:5,1,1,1
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	6535029	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:6,0,1,1
chr1	6536012	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:6536012_T_C:6536012:9,7,1,1
chr1	6536017	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=127,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:6536012_T_C:6536012:10,7,1,1
chr1	6536024	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=127,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:6536012_T_C:6536012:10,7,1,1
chr1	6579653	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,7:0,0,7,12
chr1	6593532	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=64,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:3,3,2,5
chr1	6593546	.	C	CTGGTTTACAG	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:4,0:0|1:6593546_C_CTGGTTTACAG:6593546:2,6,2,2
chr1	6593548	.	A	AGGGGAG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,0:0|1:6593546_C_CTGGTTTACAG:6593546:2,5,2,2
chr1	6593567	.	TGGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,1:3,0:0|1:6593567_TGGTG_T:6593567:0,3,0,1
chr1	6593572	.	AGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,21;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6593567_TGGTG_T:6593567:0,2,0,1
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr1	6609563	.	CAT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:3,0:5,1,3,0
chr1	6609792	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:4,3:2,8,0,5
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr1	6610366	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=209,155;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	6614230	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,2:1,4:5,3,5,1
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	6631352	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	6634735	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,3:11,0:8,10,3,0
chr1	6635009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=113,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:2,0:5,2:0|1:6635009_G_A:6635009:2,5,0,2
chr1	6635014	.	T	TTTCCTCTGCTATCTCTCAATATTTTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=103,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:6635009_G_A:6635009:2,4,0,2
chr1	6637056	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,10:2,3:2,1,6,7
chr1	6637171	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:0,6:2,7:0,2,1,12
chr1	6646057	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=118,98;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:12,8:15,0:16,11,8,0
chr1	6648596	.	TTG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6648596_TTG_T:6648596:0,0,0,1
chr1	6648603	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6648596_TTG_T:6648596:0,0,0,1
chr1	6659445	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,6:4,6:4,5,2,10
chr1	6662449	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=156,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:6662449_G_C:6662449:7,8,1,1
chr1	6662456	.	A	AGTTACCAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=156,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:10,2:0|1:6662449_G_C:6662449:7,8,1,1
chr1	6674266	.	C	CCAACCCAAAGCCTCCTTTGCGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:6674266_C_CCAACCCAAAGCCTCCTTTGCGT:6674266:0,0,0,1
chr1	6674272	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6674266_C_CCAACCCAAAGCCTCCTTTGCGT:6674266:0,0,0,1
chr1	6679848	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,29:0.637:45:7,13:9,15:7,9,17,12
chr1	6679859	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:20,1:23,1:24,19,0,2
chr1	6680446	.	GA	TC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:6680446_GA_TC:6680446:1,3,1,1
chr1	6680449	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,1:0|1:6680446_GA_TC:6680446:1,3,1,1
chr1	6680452	.	T	TGTCATTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6680446_GA_TC:6680446:1,2,0,1
chr1	6681375	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,7:0,0,0,12
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr1	6694803	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,5:6,2:6,8,5,2
chr1	6694927	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	6695785	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:13,10,1,1
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,10,12
chr1	6696280	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:13,0:7,5:8,13,0,5
chr1	6705230	.	A	AAAGGATCCCTCAAGTAAGTCCTGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr1	6705793	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=113,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:10,4:3,2:1,13,2,4
chr1	7737799	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	7796447	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=100,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:19,0:10,5:12,17,2,3
chr1	7796641	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=85,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr1	7797692	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=161,304;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,1,0,1
chr1	7797694	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=161,304;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,1,0,1
chr1	7797698	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,25;MFRL=161,304;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,1,0,1
chr1	7797703	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=23,23;MFRL=161,304;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,1,0,1
chr1	7797706	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,22;MFRL=233,304;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,2,0,1
chr1	7797707	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=233,304;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,2,0,1
chr1	7797712	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,22;MFRL=233,304;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,2,0,1
chr1	7797718	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=305,304;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7797692_C_CT:7797692:0,1,0,1
chr1	7798454	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=107,155;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:16,0:18,6:0|1:7798454_C_T:7798454:22,12,0,6
chr1	7798461	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=107,155;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:16,0:16,5:0|1:7798454_C_T:7798454:20,14,0,6
chr1	7811203	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:14,4,1,1
chr1	7811453	.	GTGGGTGGAGAAGAGCTCAT	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:3,0:7,2:0|1:7811453_GTGGGTGGAGAAGAGCTCAT_G:7811453:7,12,1,1
chr1	7811478	.	TAAAGC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:11,2:0|1:7811453_GTGGGTGGAGAAGAGCTCAT_G:7811453:2,15,1,1
chr1	7811489	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=-1073741808;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:5,0:9,2:0|1:7811453_GTGGGTGGAGAAGAGCTCAT_G:7811453:1,14,1,2
chr1	7826645	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:5,0:8,3:0|1:7826645_G_A:7826645:3,11,1,2
chr1	7826653	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=176,96;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:3,1:0|1:7826645_G_A:7826645:2,11,0,2
chr1	7845695	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr1	7858485	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:1,2:4,5:3,2,6,1
chr1	7861304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,1:2,6:2,5,1,6
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	7863293	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,17:0,0,18,9
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	7879571	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=215,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7879571_T_C:7879571:0,2,0,1
chr1	7879579	.	G	GACATCACTTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7879571_T_C:7879571:0,0,0,1
chr1	7880178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=94,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:10,3:13,10,0,3
chr1	7880208	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:13,13,0,3
chr1	7880469	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,2,1
chr1	7889804	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	7890264	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	7897133	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:5,9:3,6:4,4,9,6
chr1	7904125	.	T	TTTTTGAGACAGAGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=177,88;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:7904125_T_TTTTTGAGACAGAGTC:7904125:0,1,0,1
chr1	7904128	.	G	GCTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=177,88;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7904125_T_TTTTTGAGACAGAGTC:7904125:0,1,0,1
chr1	7904130	.	T	TCGCCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=177,88;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7904125_T_TTTTTGAGACAGAGTC:7904125:0,1,0,1
chr1	7906859	.	T	TAAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,1:0,3,0,2
chr1	7907855	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:7907855_G_A:7907855:16,7,1,1
chr1	7907857	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:14,0:0|1:7907855_G_A:7907855:16,7,1,1
chr1	7907971	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=108,98;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.371:26:11,0:6,9:5,12,0,9
chr1	7913004	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,11:7,5:9,3,9,7
chr1	7995215	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,1:5,2:3,8,2,1
chr1	7995250	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	8029584	.	T	TGGGCAGCAGACAGAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr1	8378273	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:8378273_G_C:8378273:3,4,1,1
chr1	8378275	.	C	CTCTCCACGGGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:8378273_G_C:8378273:3,4,1,1
chr1	8384268	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	8390246	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:4,1,5,2
chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,2:0,2:0,1,2,3
chr1	8395441	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	8395594	.	CCACCATCTGCAACATGCCCAAGGCGCTACG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:0,3:3,2,1,2
chr1	8420469	.	G	GGATGAGTACTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=83,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:8420469_G_GGATGAGTACTC:8420469:1,1,1,1
chr1	8420474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=83,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:8420469_G_GGATGAGTACTC:8420469:1,1,0,1
chr1	8420478	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=83,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:8420469_G_GGATGAGTACTC:8420469:1,1,0,1
chr1	8420481	.	GCC	AGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=83,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:8420469_G_GGATGAGTACTC:8420469:1,1,0,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	8423004	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	8425798	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:2,1,2,0
chr1	8425900	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:6,9:4,4:7,5,11,2
chr1	8425918	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:14,4:6,0:12,8,2,2
chr1	8525933	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,0:8,3:10,3,2,1
chr1	8568830	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	8601207	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.295:14:2,4:8,0:7,3,2,2
chr1	8930661	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,16;MFRL=274,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:8930661_G_T:8930661:0,2,0,1
chr1	8930662	.	GAA	G,GCCAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,29,33;MFRL=311,126,237;MMQ=60,60,60;MPOS=5,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr1	8930663	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=311,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8930663_AAG_A:8930663:0,1,0,1
chr1	8930668	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,23;MFRL=274,126;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:8930661_G_T:8930661:0,2,0,1
chr1	8930672	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=311,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8930663_AAG_A:8930663:0,1,0,1
chr1	8930675	.	G	GCCCCTGA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=311,237;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8930663_AAG_A:8930663:0,1,0,1
chr1	8934790	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	9009444	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,2:3,5:0|1:9009444_A_C:9009444:5,5,3,4
chr1	9009451	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,77;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,3:2,6:0|1:9009444_A_C:9009444:4,6,4,5
chr1	9009470	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=88,77;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,4:3,6:0|1:9009444_A_C:9009444:4,7,4,6
chr1	9009547	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=104,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:2,2,2,5
chr1	9034598	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,6:3,3:3,0,8,1
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr1	9034838	.	CGCA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9034838_CGCA_C:9034838:0,3,0,1
chr1	9034842	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9034838_CGCA_C:9034838:0,3,0,1
chr1	9034849	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9034838_CGCA_C:9034838:0,3,0,1
chr1	9034851	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9034838_CGCA_C:9034838:0,3,0,1
chr1	9063602	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=80,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:8,2,3,4
chr1	9063646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=195,176;MMQ=41,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	9063656	.	C	CTGCTGCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=230,176;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	9067417	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:6,7,2,1
chr1	9074794	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:6,6:0,1:4,2,3,4
chr1	9079218	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr1	9098447	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=159,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	9107737	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,0:16,2:12,14,1,1
chr1	9117748	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=241,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr1	9165669	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,4:2,5:6,4,3,6
chr1	9305071	.	CTCCATAATCCTGCTGGGAGCAACTGGGGACCTGGCTAAGAAGTACTTATGGCAGGGACTGTTCCAGCTGTACCTGGATGAAGCGGGGAGGGGTCACAGTTTTAGCT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=110,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.064:52:14,4:2,1:24,22,2,4
chr1	9305445	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.663:19:4,7:2,4:4,2,6,7
chr1	9307075	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,1:11,2:14,13,2,1
chr1	9323674	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,84;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:20,6:7,0:17,10,5,1
chr1	9324479	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=102,48837527;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,0:9,3:8,6,1,2
chr1	9416703	.	TGG	CCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	9627521	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	9633387	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:4,1:2,1:5,4,2,0
chr1	9642329	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:3,3:5,5:5,3,6,4
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,4,1
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:1,8,0,6
chr1	9661061	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	9670607	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,2,2
chr1	9670752	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=91,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.230:23:7,1:8,1:7,11,5,0
chr1	9670881	.	C	CAGGCATGCCCCACCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	9714247	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:9,6:5,4:12,4,6,5
chr1	9714538	.	G	GGA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,7,0,2
chr1	9714539	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,7,0,2
chr1	9714541	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,7,0,2
chr1	9714543	.	A	ACCCC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:4,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,6,0,3
chr1	9714544	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:4,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,6,0,3
chr1	9770690	.	C	CAG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=124,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AG;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,0:3,6:0,3,1,5
chr1	9776223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	9781140	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:9781140_A_C:9781140:0,0,2,0
chr1	9781144	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,11;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:9781140_A_C:9781140:0,0,2,0
chr1	9781146	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:9781140_A_C:9781140:0,0,2,0
chr1	9781412	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	9782556	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:3,2,5,2
chr1	9790639	.	CCCT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=98,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCT;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,2:8,0:10,12,1,1
chr1	9795593	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:10,1:11,2:0|1:9795593_G_A:9795593:8,13,1,2
chr1	9795596	.	G	GCTAGTTAGTGGCTCTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:0|1:9795593_G_A:9795593:8,14,1,1
chr1	9797507	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:12,0:3,4:11,4,2,2
chr1	9801277	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:15,0:8,5:11,12,2,3
chr1	9801295	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:13,0:9,5:0|1:9801295_T_C:9801295:12,11,2,3
chr1	9801299	.	A	ATTATCCAATCACCTCCCACCAGC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:11,0:9,5:0|1:9801295_T_C:9801295:12,11,2,3
chr1	9816620	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr1	9992764	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=173,187;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:9992764_G_T:9992764:1,0,1,0
chr1	9992768	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=173,187;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:9992764_G_T:9992764:1,0,1,0
chr1	9992770	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=173,187;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:9992764_G_T:9992764:1,0,1,0
chr1	9992773	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=189,187;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:9992764_G_T:9992764:2,0,1,0
chr1	10041298	.	ATT	A,AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,23,20;MFRL=122,107,56;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.28,8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,5:0.127,0.212:26:9,3,2:4,0,2:7,11,3,5
chr1	10057228	.	G	GGGGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:10057228_G_GGGGCCCC:10057228:0,0,2,0
chr1	10057233	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:10057228_G_GGGGCCCC:10057228:0,0,2,0
chr1	10057239	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=248,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:10057228_G_GGGGCCCC:10057228:1,0,2,0
chr1	10057246	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,1:0|1:10057228_G_GGGGCCCC:10057228:2,0,2,0
chr1	10093627	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	10155441	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10155441_C_T:10155441:2,0,1,0
chr1	10155451	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:10155441_C_T:10155441:2,0,1,0
chr1	10161257	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:4,5:11,0:8,7,5,0
chr1	10177658	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.126:30:10,2:12,1:11,16,0,3
chr1	10190884	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:1,1,0,4
chr1	10190905	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	10221220	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:10,0:10,7:12,8,7,0
chr1	10322054	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,6,2
chr1	10327407	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=207,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,2:6,1:4,2,1,2
chr1	10328338	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,11:3,7:2,6,5,13
chr1	10336365	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:6,3,1,1
chr1	10339209	.	CAT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=70,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:1,4:5,5:3,4,3,6
chr1	10342352	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,3:4,7:6,1,8,2
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	10355834	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,3:3,2:3,2,1,5
chr1	10356562	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,6:0,1:2,0,7,0
chr1	10356680	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:0|1:10356680_C_CA:10356680:9,13,1,1
chr1	10356682	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:11,2:0|1:10356680_C_CA:10356680:9,13,1,1
chr1	10357206	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:4,2:4,2:8,2,4,0
chr1	10357406	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=236,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:0,4,1,6
chr1	10363487	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:1,4,4,2
chr1	10384176	.	C	CTTGAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr1	10386238	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,1:17,3:20,15,1,3
chr1	10394536	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,5:1,1:4,2,5,1
chr1	10402009	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	10403292	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:13,4:15,0:15,13,2,2
chr1	10408837	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:2,4:6,1:5,11,0,7
chr1	10420918	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=128,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,4,1
chr1	10420937	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:3,5:5,1:8,2,5,1
chr1	10425117	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr1	10428452	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	10431158	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,2:3,2:5,4,4,0
chr1	10435104	.	G	GACATAAGGCCGACGGACGACAACAAAAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:10,2:5,0:8,9,1,1
chr1	10435170	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,4:1,3:0,5,0,7
chr1	10435453	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:0|1:10435453_G_A:10435453:10,8,1,1
chr1	10435459	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=102,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:7,2:0|1:10435453_G_A:10435453:10,10,1,1
chr1	10435461	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:10435453_G_A:10435453:7,10,1,1
chr1	10459779	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,5:4,7:5,8,4,8
chr1	10460635	.	GCCAGCTGTGCTCTCAGCTGCTACCACGA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,3:3,0:2,6,1,2
chr1	10464150	.	TAGCATAATGAAACATGGA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=133,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCATAATGAAACATGGA;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:5,3:1,0:16,1,1,2
chr1	10479055	.	GT	G,GTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30,24;MFRL=126,161,89;MMQ=60,60,41;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.04,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,2:0.411,0.203:12:4,4,1:0,0,0:1,4,1,6
chr1	10479635	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:7,4:7,3:10,4,3,4
chr1	10479678	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=96,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,5:5,5:5,8,8,2
chr1	10502307	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,6:8,4:7,4,7,3
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:3,11:6,3:7,2,7,7
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,3,12
chr1	10699155	.	CTCGTCGTCGTCCTCG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCGTCGTCGTCCTCG;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:3,1:6,6,1,1
chr1	10706167	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:5,6:7,5:5,7,8,4
chr1	10716839	.	TCCCAGCCCCAGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CCCAGC;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	11008036	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,1:3,2,4,2
chr1	11024211	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:11024211_C_T:11024211:3,2,1,1
chr1	11024218	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=68,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:11024211_C_T:11024211:2,2,2,1
chr1	11077119	.	A	AGTGGTTCTCCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	11077145	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11077145_G_GA:11077145:0,1,0,1
chr1	11077147	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11077145_G_GA:11077145:0,1,0,1
chr1	11077150	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11077145_G_GA:11077145:0,1,0,1
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=213,142;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	11091031	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=76,199;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:11091031_G_A:11091031:0,4,0,1
chr1	11091036	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=76,199;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:11091031_G_A:11091031:0,4,0,1
chr1	11091040	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11091031_G_A:11091031:0,3,0,1
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.618:11:0,1:4,6:0|1:11105106_C_T:11105106:2,2,2,5
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:0,1:2,5:0|1:11105106_C_T:11105106:1,2,1,5
chr1	11105152	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=171,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr1	11106666	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:3,2,1,3
chr1	11119402	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:2,0:19,3:7,14,0,3
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=62,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:4,6:3,5:5,3,9,2
chr1	11128654	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=103,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:11,3:0,6:6,5,6,3
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=285,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr1	11131099	.	C	CCCTTCCTCTCCCCTCTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11131099_C_CCCTTCCTCTCCCCTCTTCCT:11131099:0,1,0,1
chr1	11131105	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11131099_C_CCCTTCCTCTCCCCTCTTCCT:11131099:0,1,0,1
chr1	11133956	.	A	AAAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=95,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,3:2,10:2,3,1,12
chr1	11133984	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.398:51:11,6:18,13:10,21,6,14
chr1	11134099	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=129,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:7,8:7,0:3,11,0,9
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	11134470	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=216,197;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr1	11137075	.	T	TCTCG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11137075_T_TCTCG:11137075:0,3,0,1
chr1	11137077	.	TTA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:11137075_T_TCTCG:11137075:0,3,0,1
chr1	11137080	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11137075_T_TCTCG:11137075:0,2,0,1
chr1	11137084	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11137075_T_TCTCG:11137075:0,2,0,1
chr1	11137086	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11137075_T_TCTCG:11137075:0,2,0,1
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:3,6,3,6
chr1	11141187	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:12,2:8,6:9,11,5,3
chr1	11142715	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:8,2:5,0:12,2,1,1
chr1	11156012	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=171,29;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:0,3,2,0
chr1	11174536	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr1	11181366	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:5,2:6,8,1,1
chr1	11181449	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=207,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:11181449_G_C:11181449:1,3,0,1
chr1	11181450	.	T	TTTCTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=207,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:11181449_G_C:11181449:1,3,0,1
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	11187913	.	G	GGCAGTCCATCTGCCTCGGCCTCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	11199800	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=144,128;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11199800_G_C:11199800:0,2,0,1
chr1	11199807	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=162,128;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11199800_G_C:11199800:0,1,0,1
chr1	11199810	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,128;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11199800_G_C:11199800:0,1,0,1
chr1	11210220	.	C	CAGAGAA	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=90,28;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:11210220_C_CAGAGAA:11210220:3,4,1,1
chr1	11210221	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=90,28;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:11210220_C_CAGAGAA:11210220:3,4,1,1
chr1	11210248	.	GTCCA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=96,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:11210248_GTCCA_G:11210248:2,2,0,1
chr1	11210256	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11210248_GTCCA_G:11210248:1,1,0,1
chr1	11210258	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11210248_GTCCA_G:11210248:1,1,0,1
chr1	11210277	.	T	TCATGAGGAAGGGCACAAGTTC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	11227551	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:11227551_G_T:11227551:0,4,0,1
chr1	11227555	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11227551_G_T:11227551:0,3,0,1
chr1	11227559	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11227551_G_T:11227551:0,3,0,1
chr1	11253603	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=264,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	11291176	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr1	11292669	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=177,156;MMQ=55,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	11293577	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	11298015	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,94;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:8,0:15,9:11,12,0,9
chr1	11301714	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=166,77;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,4:2,7:2,1,7,4
chr1	11308209	.	CACTGTGGATTCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11308209_CACTGTGGATTCT_C:11308209:0,4,0,1
chr1	11308225	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11308209_CACTGTGGATTCT_C:11308209:0,1,0,1
chr1	11308232	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11308209_CACTGTGGATTCT_C:11308209:0,1,0,1
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=249,236;MMQ=30,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:11317320_C_T:11317320:0,1,0,2
chr1	11317321	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=236,249;MMQ=50,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1|0:11317320_C_T:11317320:0,2,0,1
chr1	11561452	.	C	CATCTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	11574366	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	11574596	.	T	TTGCCGTCCCCATGTAAGAAGTGCCTTTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr1	11575331	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=225,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:3,2,2,1
chr1	11577574	.	TGG	CTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=178,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	11584164	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	11584208	.	TCAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	11586677	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:13,2:1,3:8,6,2,3
chr1	11590919	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=194,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:3,2,2,2
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=98,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,5:0,2:1,0,4,4
chr1	11594400	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=97,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,5:1,0:3,1,4,1
chr1	11594461	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=91,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,6:4,5,8,4
chr1	11594681	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=234,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.353:24:9,2:4,6:7,9,5,3
chr1	11709051	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.809:3:0,0:0,1:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,0,2,1
chr1	11709052	.	C	CCCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.809:3:0,0:0,2:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,0,2,1
chr1	11731927	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.532:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr1	11733604	.	A	ATGATGATTAATTTTATGTGTCAATTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=234,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	11733787	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:4,5:12,0:10,6,4,1
chr1	11735151	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:0|1:11735151_C_T:11735151:10,7,1,1
chr1	11735154	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:11735151_C_T:11735151:9,8,1,1
chr1	11735269	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=198,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr1	11735298	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=198,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	11737051	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:4,3:2,3:1,5,2,4
chr1	11740329	.	AGGCGTGAGCCAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:1,5:3,0:5,0,5,0
chr1	11766370	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=110,79;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,4:10,0:13,8,4,0
chr1	11771984	.	ACT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:11771984_ACT_A:11771984:5,4,1,1
chr1	11771989	.	AA	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:11771984_ACT_A:11771984:5,4,1,1
chr1	11779762	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,4:0,0,9,9
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	11810201	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=128,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:3,2:0|1:11810201_T_C:11810201:6,9,1,1
chr1	11810207	.	T	TGAGGCCTTCGTTG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:11810201_T_C:11810201:6,8,1,1
chr1	11832100	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,22,9
chr1	11832347	.	AG	GA	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=139,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,0:7,3:12,7,1,2
chr1	11832354	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=121,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:5,2:0|1:11832354_A_G:11832354:12,7,0,2
chr1	11832357	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=141,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:11832354_A_G:11832354:9,7,0,2
chr1	11832408	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr1	11836441	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	11838848	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr1	11839199	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:11839199_C_T:11839199:0,4,0,2
chr1	11839207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0|1:11839199_C_T:11839199:0,5,0,2
chr1	11839998	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,12,4
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	11845113	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	11845169	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	11849447	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,16,9
chr1	11850953	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=90,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:23,0:11,1:0|1:11850953_G_A:11850953:20,16,1,1
chr1	11850976	.	A	ACCATCAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:5,2:0|1:11850953_G_A:11850953:11,12,1,1
chr1	11860465	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	11879468	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	11879685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr1	11879699	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr1	11883731	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=231,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr1	11883917	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,86;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,0:11,5:8,12,1,4
chr1	11884619	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr1	11886137	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:0|1:11886137_C_CA:11886137:2,1,1,0
chr1	11886140	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:3,0:0|1:11886137_C_CA:11886137:2,1,1,0
chr1	11886190	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:10,0:14,7,0,4
chr1	11886383	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	11887097	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	11887125	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	11887303	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr1	11887373	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	11889213	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=355,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:0,1,6,4
chr1	11895966	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	11897271	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=192,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:2,0:2,2,1,1
chr1	11897286	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr1	11897592	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	11900142	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=231,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,1:2,1,4,1
chr1	11905981	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:4,4,3,0
chr1	11905995	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:4,4,3,2
chr1	11907648	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,1:6,6:6,4,5,2
chr1	11917618	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:0|1:11917618_A_AT:11917618:5,2,5,0
chr1	11917620	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,7:0.563:12:3,1:2,6:1|0:11917618_A_AT:11917618:5,0,5,2
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:3,2,5,1
chr1	11982580	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:8,5,7,3
chr1	11983206	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=122,185;MMQ=60,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.236:24:3,4:13,1:6,13,3,2
chr1	12004479	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=241,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=AC;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr1	12004493	.	C	CAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr1	12009956	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:4,7,2,10
chr1	12016957	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:2,4:4,3:4,3,2,5
chr1	12024625	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,35;MFRL=65,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12024625_A_C:12024625:0,1,1,0
chr1	12024628	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=65,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:12024625_A_C:12024625:0,1,1,0
chr1	12024631	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=65,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr1	12024635	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=65,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:12024625_A_C:12024625:0,1,1,0
chr1	12024639	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=65,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:12024625_A_C:12024625:0,1,1,0
chr1	12025557	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,58;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,0:8,3:13,7,0,3
chr1	12027204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:2,3,0,3
chr1	12030951	.	GT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12030951_GT_TC:12030951:0,1,0,1
chr1	12030957	.	T	TTGATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12030951_GT_TC:12030951:0,1,0,1
chr1	12033113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:12033113_A_G:12033113:1,5,0,2
chr1	12033120	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:12033113_A_G:12033113:0,5,0,2
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	12059156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:2,2:8,1:3,8,3,1
chr1	12062062	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:13,3:12,0:15,11,1,2
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:1,4,2,4
chr1	12067044	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr1	12144609	.	GTGAGTGGGGGCGTTGGGGGTGGGGAGAAGGGGGGAAATTTGTCCTCAATTGATGACCCTCTTGGGGGATTGA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.304:11:2,2:3,2:2,4,1,4
chr1	12164391	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:7,2:3,2:7,3,3,1
chr1	12164675	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	12169794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	12175729	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr1	12175818	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	12198203	.	GA	G,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=218,194,159;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=6.53,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.364,0.273:8:1,1,1:2,2,1:3,0,5,0
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.415:45:13,12:13,7:14,12,10,9
chr1	12267097	.	G	GGGCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:12267097_G_GGGCATA:12267097:0,4,0,1
chr1	12267099	.	C	CTGCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:12267097_G_GGGCATA:12267097:0,4,0,1
chr1	12294475	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:3,2:3,7,0,2
chr1	12321247	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=85,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.340:13:3,2:4,2:2,7,2,2
chr1	12322057	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:12,3:16,0:13,15,3,0
chr1	12328081	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=176,178;MMQ=46,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12328081_T_C:12328081:0,4,0,1
chr1	12328085	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=176,178;MMQ=46,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12328081_T_C:12328081:0,4,0,1
chr1	12328087	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=176,178;MMQ=46,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12328081_T_C:12328081:0,4,0,1
chr1	12331093	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:9,0:0|1:12331093_C_T:12331093:8,12,1,1
chr1	12331096	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:12331093_C_T:12331093:8,12,1,1
chr1	12368705	.	GT	G,GTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30,31;MFRL=0,144,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.03,3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,3:0.290,0.192:18:5,3,1:3,1,1:3,6,2,7
chr1	12368798	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=77,141;MMQ=48,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	12374425	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chr1	12374434	.	T	TTCCAACGAAATCCTGAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:2,7,0,2
chr1	12378275	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=128,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:11,6:10,3:10,11,4,5
chr1	12398439	.	TG	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:12398439_TG_GT:12398439:0,2,0,1
chr1	12398444	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=215,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12398439_TG_GT:12398439:0,1,0,1
chr1	12398445	.	G	GATTTGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=12,31;MFRL=215,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:12398439_TG_GT:12398439:0,1,0,1
chr1	12398448	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=215,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12398439_TG_GT:12398439:0,1,0,1
chr1	12398451	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=215,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12398439_TG_GT:12398439:0,1,0,1
chr1	12401999	.	C	CACATCGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	12405577	.	TTCAGGAAGTCAGATGGTTAAGCGACTG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.280:13:6,1:1,2:2,8,1,2
chr1	12415911	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	12416497	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=103,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:6,2:0|1:12416497_C_T:12416497:11,9,1,1
chr1	12416507	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=118,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:16,0:7,2:0|1:12416497_C_T:12416497:14,9,1,1
chr1	12416508	.	T	TTCTGCTTTTTCA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=118,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:16,0:7,2:0|1:12416497_C_T:12416497:14,9,1,1
chr1	12418700	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr1	12418718	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=206,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:12418718_AGG_A:12418718:0,2,0,1
chr1	12418721	.	A	ATAGTTATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=206,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:12418718_AGG_A:12418718:0,2,0,1
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=261,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	12628492	.	TGGGGCAGGATCCAGGGGCTGGGTCGCTGGTGGCCATGTGAGAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=152,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.228:12:4,0:3,2:1,9,1,1
chr1	12704820	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12704820_C_T:12704820:0,1,0,1
chr1	12704822	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12704820_C_T:12704820:0,1,0,1
chr1	12726169	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,4:7,2:1,7,1,5
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=119,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr1	12776344	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=101,58;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:7,10:4,3:5,6,5,8
chr1	12779432	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=227,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12779432_G_C:12779432:1,0,1,0
chr1	12779437	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=227,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:12779432_G_C:12779432:1,0,1,0
chr1	12781034	.	G	GAGGCCGAAGAGAACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=52,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr1	12785093	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=653,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr1	12820952	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=217,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	12820961	.	G	GCCAAACGCCTGTAATCCCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=207,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	12820971	.	A	ACCTAGTTGTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12820971_A_ACCTAGTTGTTTCT:12820971:0,0,0,1
chr1	12820973	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12820971_A_ACCTAGTTGTTTCT:12820971:0,0,0,1
chr1	12835868	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.814:10:1,0:0,8:1,1,2,6
chr1	12835937	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=61,87;MMQ=60,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,6:7,0:8,7,6,0
chr1	12837634	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,14,11
chr1	12837840	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	12853403	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	12853975	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	12854021	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	12854041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:12854041_T_C:12854041:0,0,1,1
chr1	12854052	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=73,122;MMQ=47,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,1:0,0:0|1:12854041_T_C:12854041:1,0,1,1
chr1	12854090	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,25;MFRL=88,201;MMQ=49,36;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:9,2:1,1:0|1:12854090_T_A:12854090:7,3,2,2
chr1	12854097	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,28;MFRL=88,201;MMQ=49,36;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:9,2:1,1:0|1:12854090_T_A:12854090:7,3,2,2
chr1	12854105	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=20,33;MFRL=88,201;MMQ=49,36;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:11,2:1,2:0|1:12854090_T_A:12854090:8,4,2,2
chr1	12854530	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,48;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	12854544	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,49;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	12854716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	12854930	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=86,160;MMQ=33,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	12854947	.	T	TATGTGCATGTGCATATGTGCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=130,153;MMQ=26,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=169,126;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12907199_T_A:12907199:2,0,1,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=204,121;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0|1:12907199_T_A:12907199:2,1,5,0
chr1	12907282	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=105,88;MMQ=52,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:11,4:6,3:0|1:12907282_G_C:12907282:9,8,3,4
chr1	12907284	.	TG	CC	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=114,88;MMQ=52,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:10,4:5,3:0|1:12907282_G_C:12907282:9,9,3,4
chr1	12907304	.	C	CTGT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=101,53;MMQ=40,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:11,3:8,0:0|1:12907304_C_CTGT:12907304:7,13,1,2
chr1	12907306	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=105,53;MMQ=40,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,3:8,0:0|1:12907304_C_CTGT:12907304:6,13,1,2
chr1	12907308	.	C	CTCTGTCTCTCTCTCT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=113,53;MMQ=40,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:0|1:12907304_C_CTGT:12907304:6,12,1,2
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=123,96;MMQ=54,25;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,2:5,10,0,3
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,79;MMQ=49,51;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.545:42:9,12:10,11:12,7,17,6
chr1	12919220	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=167,163;MMQ=55,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	12921313	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=205,69;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:4,2:18,0:15,7,1,1
chr1	12921332	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=126,130;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,6:3,11:3,2,10,7
chr1	12921642	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=144,123;MMQ=23,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=143,113;MMQ=37,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	12943277	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	13052789	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=55168,79;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,14:0.177:82:29,6:37,8:31,37,7,7
chr1	13052806	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=148,163803;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,27:0.341:80:35,0:18,26:34,19,0,27
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=186,165;MMQ=40,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:5,3,2,1
chr1	13183012	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=105,182;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:15,1:16,2:0|1:13183012_G_C:13183012:17,16,1,2
chr1	13183014	.	TG	CC	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=105,182;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:16,1:16,2:0|1:13183012_G_C:13183012:18,17,1,2
chr1	13183109	.	TC	CA	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=23,34;MFRL=120,228;MMQ=56,38;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,1:14,1:14,16,0,2
chr1	13183115	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=31,24;MFRL=126,182;MMQ=52,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,2:13,1:12,17,0,3
chr1	13183130	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=30,24;MFRL=117,228;MMQ=52,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:14,1:15,1:0|1:13183130_G_A:13183130:8,23,0,2
chr1	13183138	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=27,24;MFRL=117,228;MMQ=52,38;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,1:14,1:0|1:13183130_G_A:13183130:8,21,0,2
chr1	13183187	.	AT	GA	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=23,26;MFRL=117,206;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:7,1:14,1:0|1:13183187_AT_GA:13183187:8,15,3,0
chr1	13183195	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=23,32;MFRL=115,206;MMQ=46,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:6,1:11,2:0|1:13183187_AT_GA:13183187:10,10,3,0
chr1	13183199	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=28,31;MFRL=128,193;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:7,1:13,3:0|1:13183187_AT_GA:13183187:9,11,4,0
chr1	13183213	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=25,28;MFRL=124,179;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,1:7,4:7,7,5,0
chr1	13183225	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=27,31;MFRL=155,153;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,1:5,5:0|1:13183225_T_C:13183225:4,6,7,0
chr1	13183228	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=32,24;MFRL=155,153;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,1:5,6:0|1:13183225_T_C:13183225:4,6,7,0
chr1	13183237	.	CT	TC	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=34,24;MFRL=166,153;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:7,1:4,6:0|1:13183225_T_C:13183225:6,5,7,0
chr1	13183243	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=27,30;MFRL=164,159;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,1:4,6:0|1:13183225_T_C:13183225:6,4,8,0
chr1	13183248	.	TC	AA	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=27,28;MFRL=164,159;MMQ=40,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,1:4,7:0|1:13183225_T_C:13183225:6,4,8,0
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=110,151;MMQ=60,45;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,8:0.143:61:5,4:47,4:0|1:13183511_T_C:13183511:12,41,0,8
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=107,163;MMQ=52,41;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:3,4:10,5:0|1:13183511_T_C:13183511:8,7,0,9
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=83,163;MMQ=52,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:3,4:13,5:0|1:13183511_T_C:13183511:9,8,0,9
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=141,184;MMQ=52,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:3,4:12,3:0|1:13183567_C_T:13183567:6,11,0,7
chr1	13183573	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=132,200;MMQ=52,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:4,2:12,2:0|1:13183567_C_T:13183567:5,11,0,5
chr1	13184008	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=139,124;MMQ=57,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr1	13669138	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=118,72;MMQ=27,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:1,5,5,2
chr1	13669201	.	A	AGATCTTCGCCCTACTTCGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=107,85;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:13669201_A_AGATCTTCGCCCTACTTCGG:13669201:0,2,0,1
chr1	13669204	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,22;MFRL=107,85;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13669201_A_AGATCTTCGCCCTACTTCGG:13669201:0,2,0,1
chr1	13669209	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=125,88;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13669209_C_T:13669209:0,1,0,1
chr1	13669216	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=125,88;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13669209_C_T:13669209:0,1,0,1
chr1	13669217	.	A	AAGATTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=125,88;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13669209_C_T:13669209:0,1,0,1
chr1	13695816	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,24;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	13695954	.	A	ATGCCTGTAATCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	13718514	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=188,156;MMQ=22,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr1	13719061	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	13802325	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr1	13802437	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=95,91;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,2:7,2:6,7,1,3
chr1	13802641	.	T	TTCAAATTTTGGACATGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	13839382	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	13839931	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0|1:13839931_G_T:13839931:1,3,1,1
chr1	13839933	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:13839931_G_T:13839931:1,3,1,1
chr1	13910681	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=204,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	13940117	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,6:3,0:4,1,6,0
chr1	13940864	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,11:0,0,11,16
chr1	13942521	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:5,2:2,0:0|1:13942521_C_T:13942521:3,5,0,2
chr1	13942522	.	ACTCAG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,21;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:2,2:2,0:0|1:13942521_C_T:13942521:3,5,0,2
chr1	14042246	.	ATTGTGT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:14042246_ATTGTGT_A:14042246:0,4,0,1
chr1	14042253	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:14042246_ATTGTGT_A:14042246:0,4,0,1
chr1	14042254	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:14042246_ATTGTGT_A:14042246:0,4,0,1
chr1	14057542	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:12,8:2,5:8,6,8,5
chr1	14105504	.	GGCGGCGACATGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:6,6,1,1
chr1	14108307	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,5:17,0:16,11,5,0
chr1	14143090	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=31,20;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.172:25:11,0:10,4:0|1:14143090_C_T:14143090:11,10,2,2
chr1	14143100	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=24,33;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:14143090_C_T:14143090:11,10,0,2
chr1	14143103	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:14143090_C_T:14143090:10,11,0,2
chr1	14143107	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=24,29;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:14143090_C_T:14143090:10,12,0,2
chr1	14143109	.	TCAA	T	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=20,27;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:6,2:0|1:14143090_C_T:14143090:10,13,0,2
chr1	14143114	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=20,27;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:12,0:2,2:7,8,0,2
chr1	14143116	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=20,25;MFRL=73,77;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,0:1,1:0|1:14143090_C_T:14143090:7,7,0,2
chr1	14143122	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=24,27;MFRL=86,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0|1:14143122_G_T:14143122:3,5,0,2
chr1	14143124	.	CT	TG	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=20,27;MFRL=88,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:1,0:0|1:14143122_G_T:14143122:3,6,0,2
chr1	14143128	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=26,26;MFRL=94,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:0,0:0|1:14143122_G_T:14143122:3,5,0,2
chr1	14143131	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=20,27;MFRL=88,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:0,0:0|1:14143122_G_T:14143122:2,5,0,2
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,17,8
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,14,10
chr1	14925741	.	G	GCCTGGCCAACATGGTGAAACCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	15390178	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0|1:15390178_C_T:15390178:1,3,0,3
chr1	15390211	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:0|1:15390178_C_T:15390178:0,3,0,3
chr1	15427982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	15438825	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=6612356,189;MMQ=43,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=22,14;RU=TG;STR;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.719:8:0,5:0,1:2,0,5,1
chr1	15439083	.	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,11:0,4:0,0,3,15
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	15541537	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	15541793	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.190:26:9,0:12,3:10,11,1,4
chr1	15563266	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=133,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:9,11,0,2
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.626:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr1	15628028	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=199,14421542;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:15628028_G_A:15628028:0,4,0,2
chr1	15628034	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=209,14421542;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:15628028_G_A:15628028:0,5,0,2
chr1	15628036	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=209,14421542;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:15628028_G_A:15628028:0,5,0,2
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,2:2,5:2,5,3,4
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:3,3:1,2:1,4,1,5
chr1	15654759	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.247:19:10,0:2,0:5,9,5,0
chr1	15666039	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:10,0:0|1:15666039_G_A:15666039:7,12,1,1
chr1	15666048	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:15666039_G_A:15666039:6,9,1,1
chr1	15687059	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,5:5,3:5,3,6,2
chr1	15687244	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	15693906	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr1	15695912	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.105:64:34,6:24,0:24,34,1,5
chr1	15702297	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	15707137	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr1	15708540	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=95,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.543:31:11,8:3,8:10,4,8,9
chr1	15709551	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:12,0:12,10,2,0
chr1	15709555	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=103,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:10,2:11,1:13,9,2,1
chr1	15723843	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:11,8:8,9:7,12,7,10
chr1	15724003	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	15736794	.	C	CCG	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=102,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.148:32:11,3:16,1:0|1:15736794_C_CCG:15736794:6,22,4,0
chr1	15736803	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.180:26:8,2:11,1:0|1:15736794_C_CCG:15736794:3,19,4,0
chr1	15736807	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,1:12,0:0|1:15736794_C_CCG:15736794:1,19,4,0
chr1	15753591	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:13,3,1,1
chr1	15754402	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:10,10,2,0
chr1	15769085	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=122,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:15769085_C_A:15769085:1,5,1,1
chr1	15769086	.	C	CAAAATTGAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:15769085_C_A:15769085:1,5,1,1
chr1	15769876	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	15772017	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=242,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	15772050	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=225,271;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=269,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr1	15772089	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:2,2:5,4,1,1
chr1	15772110	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:15772110_C_T:15772110:11,9,1,1
chr1	15772112	.	G	GAATTTCAGTTTTGTCATCGTTTA	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:15772110_C_T:15772110:11,9,1,1
chr1	15773144	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:11,3:5,1:4,12,1,3
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	15783553	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=119,171;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:2,1:7,1:7,2,1,1
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=161,124;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	15789273	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=130,438;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:7,2:7,12,3,0
chr1	15789297	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,5:2,6:2,4,6,5
chr1	15789446	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:15789446_C_G:15789446:0,0,1,2
chr1	15789450	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:15789446_C_G:15789446:0,0,1,2
chr1	15803004	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,6:5,2:5,3,8,0
chr1	15807680	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=130,9857;MMQ=46,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr1	15807710	.	C	CTTCTAATATAGATTCAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=167,9857;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:15807710_C_CTTCTAATATAGATTCAT:15807710:2,8,0,2
chr1	15807714	.	TG	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=167,9857;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:15807710_C_CTTCTAATATAGATTCAT:15807710:2,8,0,2
chr1	15808145	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=129,134;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:5,4:17,0:14,8,4,0
chr1	15808289	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	15808767	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,71;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,0:4,7:5,2,3,4
chr1	15808872	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:0,8:4,6:1,3,10,4
chr1	15808939	.	G	GAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,65;MMQ=59,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr1	15809706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=54,156;MMQ=56,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr1	15832383	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr1	15833362	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:1,1:2,0,2,0
chr1	15834297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr1	15834491	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=80,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:1,2,1,3
chr1	15844704	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=95,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:11,14,0,2
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	15850553	.	C	CGGGGGCG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGGCG;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	15873386	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.619:35:1,14:10,6:5,8,15,7
chr1	15874961	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,5:1,5,2,8
chr1	15890342	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:2,1:4,0,3,0
chr1	15893802	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=122,287;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:0|1:15893802_A_T:15893802:0,8,0,3
chr1	15893804	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=122,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:0|1:15893802_A_T:15893802:0,8,0,3
chr1	15893806	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=122,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:0|1:15893802_A_T:15893802:0,8,0,3
chr1	15893808	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=122,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,2:5,0:0|1:15893802_A_T:15893802:0,8,0,3
chr1	15900234	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,0:14,2:0|1:15900234_A_G:15900234:7,17,1,1
chr1	15900240	.	A	AGCCCTTCCTGC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:15900234_A_G:15900234:7,16,1,1
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=76,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,4:4,1:1,4,1,4
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=230,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr1	15976153	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,145;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:5,4:0,5:5,0,9,1
chr1	16045216	.	GG	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16045216_GG_TT:16045216:0,0,0,1
chr1	16045219	.	A	ACACTTTAGAAAGTTCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16045216_GG_TT:16045216:0,0,0,1
chr1	16045224	.	GT	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16045216_GG_TT:16045216:0,0,0,1
chr1	16051957	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=150,47;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:7,11,1,1
chr1	16051972	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:12,2:0|1:16051972_CT_C:16051972:7,11,1,1
chr1	16051975	.	T	TCCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=153,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:0|1:16051972_CT_C:16051972:6,10,1,1
chr1	16051977	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=153,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,0:11,2:0|1:16051972_CT_C:16051972:6,10,1,1
chr1	16056933	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=229,67;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:2,0,1,1
chr1	16056942	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=67,229;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr1	16058298	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=212,147;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	16058579	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,0:7,4:1,11,0,4
chr1	16059185	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:3,0:7,2:0|1:16059185_C_CA:16059185:4,6,1,1
chr1	16059193	.	AC	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=135,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:3,0:5,1:0|1:16059185_C_CA:16059185:4,5,1,1
chr1	16069185	.	C	CCTACTTCCTTCCCCCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=93,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr1	16074184	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,429;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	16096934	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:5,1,5,6
chr1	16101514	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,154;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr1	16174458	.	AGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	16246018	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,31:0.668:46:9,10:5,18:4,11,14,17
chr1	16262597	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.312:23:7,6:9,0:12,4,7,0
chr1	16264264	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:2,0:5,3,1,2
chr1	16264390	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,149;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:7,6,1,1
chr1	16269516	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr1	16270348	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:10,2:10,1:0|1:16270348_CG_C:16270348:12,9,2,1
chr1	16270351	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:9,2:11,0:0|1:16270348_CG_C:16270348:12,9,2,1
chr1	16332349	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=94,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:2,1,1,0
chr1	16342036	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.132:21:9,0:7,0:0|1:16342036_C_G:16342036:17,2,0,2
chr1	16342038	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=93,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.151:22:8,2:8,0:0|1:16342036_C_G:16342036:17,2,0,3
chr1	16342049	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.164:26:10,0:8,1:0|1:16342036_C_G:16342036:18,4,0,4
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	16346009	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	16346035	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=66,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:16346035_C_T:16346035:0,4,0,1
chr1	16346040	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=66,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:16346035_C_T:16346035:0,4,0,1
chr1	16346041	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=66,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:16346035_C_T:16346035:0,4,0,1
chr1	16352937	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=213,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.899:17:1,6:0,10:0,1,4,12
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,5,15
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr1	16374769	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:9,1,1,1
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,10,1
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,10,1
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,6:0,0,8,11
chr1	16376421	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=91,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:3,10,1,1
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	16377362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,89;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,2,0
chr1	16378627	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=546,21182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	16382056	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=206,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16382056_T_G:16382056:1,0,0,1
chr1	16382060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=192,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:16382056_T_G:16382056:2,0,0,1
chr1	16382070	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=186,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,0:0,0:0|1:16382056_T_G:16382056:2,0,0,1
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.935:12:0,5:0,6:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,9,3
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,4:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,9,3
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,9,3
chr1	16382857	.	G	GAATGGAATGGAGTGGAGTAAAATGGTTTGGAAT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:4,2:6,0:7,3,1,1
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,0,0,4
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,0,0,4
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=391,144;MMQ=40,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,2:0,12:1,0,6,8
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=206,184;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:3,0,1,2
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0,0,16,3
chr1	16383682	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=131,136;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.374:27:10,4:7,5:10,7,7,3
chr1	16384868	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,167;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0|1:16385248_C_T:16385248:0,0,0,5
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:16385248_C_T:16385248:0,0,0,5
chr1	16385958	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:2,0:2,2,2,0
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr1	16386305	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:0,0,1,0
chr1	16386315	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,206;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16386305_G_GC:16386305:0,0,1,0
chr1	16388548	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,88;MMQ=33,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:16388548_G_A:16388548:6,1,1,1
chr1	16388555	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=119,88;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:16388548_G_A:16388548:8,1,1,1
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr1	16388709	.	G	C,T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31,28;MFRL=0,236,130;MMQ=60,27,27;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.47,9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.559:6:0,1,1:0,1,3:0,0,3,3
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=236,162;MMQ=27,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,0,6
chr1	16389105	.	TGGGTGG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=172,112;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGTGG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	16389106	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=104,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:16389106_G_T:16389106:3,0,0,1
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16389106_G_T:16389106:2,1,0,1
chr1	16390213	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=186,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr1	16451767	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,4:7,4:9,5,6,3
chr1	16458814	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=50,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:2,3:7,6:7,2,4,5
chr1	16461028	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:11,0:11,4:15,7,2,2
chr1	16462283	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=154,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.379:8:3,0:0,1:3,2,0,3
chr1	16528218	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr1	16528843	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	16542366	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=94,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:4,3,3,1
chr1	16542876	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr1	16542937	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:2,10:4,6:6,0,15,1
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	16555566	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	16555882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	16559541	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	16560345	.	GC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=907,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	16583030	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr1	16583256	.	TAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,0:12,2:9,9,0,2
chr1	16621183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	16621234	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:5,2:7,3:8,4,5,1
chr1	16693725	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.350:20:2,2:11,3:13,0,5,2
chr1	16725330	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=247,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:0,8:4,8:2,2,5,11
chr1	16725818	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr1	16726036	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,2,3
chr1	16727305	.	G	GCTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=60,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,2:2,3,3,4
chr1	16730206	.	AACC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=85,86;MMQ=60,46;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:11,1:17,0:10,21,2,0
chr1	16730413	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:3,3,2,4
chr1	16731549	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.135:42:15,5:22,0:17,20,4,1
chr1	16731646	.	TG	CC,CG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34,24;MFRL=0,155,138546746;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.78,4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.512,0.381:5:0,2,1:0,1,1:0,0,1,4
chr1	16731661	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=53722231,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr1	16736326	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=171,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,2:5,7:5,6,5,4
chr1	16736546	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:3,6,1,4
chr1	16748486	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:8,2:1,0:5,4,0,2
chr1	16751920	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:16751920_A_G:16751920:4,0,1,0
chr1	16751922	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:16751920_A_G:16751920:4,0,1,0
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=124,136;MMQ=48,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,32:0.611:52:12,12:7,20:14,6,26,6
chr1	16890428	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=137,124;MMQ=49,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.202:52:20,4:22,6:33,9,6,4
chr1	16890484	.	G	C	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.059:88:42,2:40,3:50,33,2,3
chr1	16890639	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=120,106;MMQ=45,23;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,10:0.145:73:28,6:32,4:45,18,9,1
chr1	16890644	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=109,121;MMQ=44,45;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,53:0.641:82:19,23:10,27:25,4,33,20
chr1	16890663	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=109,196;MMQ=45,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,2:0.032:93:44,0:46,2:0|1:16890663_C_T:16890663:56,35,2,0
chr1	16890671	.	TG	CA	.	.	DP=96;ECNT=8;MBQ=23,29;MFRL=109,109;MMQ=60,45;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=295.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,74:0.789:93:10,31:8,43:15,4,39,35
chr1	16890672	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=106,161;MMQ=60,56;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,11:0.363:29:11,2:6,9:0|1:16890663_C_T:16890663:14,4,5,6
chr1	16890712	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=109,124;MMQ=47,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,17:0.256:68:26,8:23,9:19,32,5,12
chr1	16890742	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=152,123;MMQ=47,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.343:41:15,9:12,4:9,18,5,9
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=75,155;MMQ=53,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.744:29:3,12:4,10:2,5,9,13
chr1	16893841	.	C	T	.	.	DP=126;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=129,145;MMQ=40,39;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,6:0.056:122:58,2:57,4:36,80,1,5
chr1	16893854	.	A	C	.	.	DP=137;ECNT=3;MBQ=21,24;MFRL=118,123;MMQ=40,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,23:0.171:137:54,12:59,11:35,79,5,18
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=111,154;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,50:0.659:76:11,22:14,28:2,24,5,45
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=104,125;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,7:0.096:80:48,1:24,6:43,30,4,3
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=158,155;MMQ=22,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:7,2:0,2:0,7,0,4
chr1	16909178	.	A	ACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=347,264;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16909178_A_ACAG:16909178:0,1,0,1
chr1	16909181	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=347,264;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16909178_A_ACAG:16909178:0,1,0,1
chr1	16913677	.	TGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,21;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.792:2:0,2:0,0:0|1:16913677_TGTG_T:16913677:0,0,1,1
chr1	16913682	.	CTATTTGAACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:16913677_TGTG_T:16913677:0,0,1,1
chr1	16913700	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:16913677_TGTG_T:16913677:0,0,1,1
chr1	16913773	.	G	GATAGAGATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=232,217;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	16914139	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=162,108;MMQ=23,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,1:3,3:2,1,4,1
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=108,118;MMQ=51,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:5,2,3,1
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=108,118;MMQ=52,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:6,3,2,2
chr1	16914196	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=68,71;MMQ=25,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,9:0.120:80:26,8:45,1:56,15,5,4
chr1	16914393	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=211,171;MMQ=30,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=120,129;MMQ=20,22;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:9,2:1,12,0,8
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr1	17256810	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,76;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:6,12,1,1
chr1	17266352	.	C	CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=270,186;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17266352_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG:17266352:1,1,1,0
chr1	17266353	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=270,186;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17266352_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG:17266352:1,1,1,0
chr1	17275429	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=110,186;MMQ=39,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,3:3,0:2,1,0,3
chr1	17277458	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=99,115;MMQ=46,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.178:29:8,0:16,4:13,11,3,2
chr1	17281148	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=185,134;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:8,0,3,0
chr1	17287187	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287190	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287192	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287199	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287202	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287203	.	GTC	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,1,1,1
chr1	17287209	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:17287187_G_A:17287187:0,0,1,1
chr1	17287409	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17287409_G_A:17287409:0,0,0,1
chr1	17287414	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17287409_G_A:17287409:0,0,0,1
chr1	17292347	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=84,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:6,6:5,9:4,7,6,9
chr1	17292870	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,7:0,3:0,1,7,3
chr1	17296359	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:12,0:0|1:17296359_T_C:17296359:11,11,1,1
chr1	17296366	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,2:16,0:0|1:17296359_T_C:17296359:12,13,1,1
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,1,16
chr1	17298192	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17298192_C_T:17298192:0,0,1,0
chr1	17298196	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,0;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17298192_C_T:17298192:0,0,1,0
chr1	17299014	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=159,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	17301780	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:6,2,5,3
chr1	17301900	.	AGACAGAACCTGGCACGGGAGCCCG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=99,223;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GACAGAACCTGGCACGGGAGCCCG;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.462:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	17303333	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:6,0:5,6:5,7,6,0
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	17312927	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=261,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr1	17313244	.	CCCCAGGGCTCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=199,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	17313454	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,7:2,3:3,1,3,8
chr1	17313709	.	GTGGTGATGACCAGGTCGATGGCCAGGAACTGCAGGTCACCCAGGT	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:4,2:5,0:8,15,1,1
chr1	17313774	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:17313774_G_A:17313774:4,9,1,1
chr1	17313782	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:17313774_G_A:17313774:4,9,1,1
chr1	17316478	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=139,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.573:36:8,18:7,0:10,5,0,21
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	17331676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	17332285	.	AAA	TGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=103,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:4,4,2,2
chr1	17349074	.	CAGAGCTGAGGGTCACCAGCCCCACGTACCTTAGGACAGGTCCTTGTGCAGTTCATGATGGTGTGGCAGCGGTAT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=94,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.123:41:8,4:7,0:26,11,2,2
chr1	17354149	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=181,7890563;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	17359655	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:7,0:5,2:3,11,0,2
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	17371221	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,7:9,0:10,6,5,2
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	17396801	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:17396801_C_CT:17396801:0,2,0,1
chr1	17396802	.	AGGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr1	17396803	.	G	GATATTTGCCCCAGAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17396801_C_CT:17396801:0,1,0,1
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,1,3
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,1,3
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr1	17402116	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	17402255	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr1	17402374	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=230,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr1	17402418	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,2:2,6:3,5,2,6
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	17411010	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=142.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.972:32:0,10:0,21:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,18,14
chr1	17418894	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=149.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,11:0,23:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,20,14
chr1	17419066	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	17422302	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	17429524	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:15,0:12,4:15,13,0,4
chr1	17431618	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	17531764	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:19,0:10,2:20,11,1,1
chr1	17531909	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	17551034	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	17555199	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:7,0:0|1:17555199_G_A:17555199:10,7,1,1
chr1	17555202	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:17555199_G_A:17555199:10,7,1,1
chr1	17555573	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17555573_C_T:17555573:0,0,0,1
chr1	17555574	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17555573_C_T:17555573:0,0,0,1
chr1	17555578	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17555573_C_T:17555573:0,0,0,1
chr1	17555580	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17555573_C_T:17555573:0,0,0,1
chr1	17557039	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	17557133	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr1	17563967	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,7:0,6:0,1,7,6
chr1	17567090	.	TCTTCCTAGTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:4,4:5,6,2,2
chr1	17570466	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,9,7
chr1	17570767	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr1	17588677	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:6,6,0,2
chr1	17592121	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:13,5,1,2
chr1	17592324	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17592324_T_C:17592324:0,1,0,1
chr1	17592330	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17592324_T_C:17592324:0,1,0,1
chr1	17593144	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	17597314	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	17597721	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr1	17601083	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,16,4
chr1	17607068	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr1	17660499	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:3,5:1,4:3,1,5,5
chr1	17660697	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,4:2,2:6,1,5,1
chr1	17660802	.	A	AT,ATT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,24,20;MFRL=167,99,106;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=15.73,4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,8:0.554,0.329:22:1,12,4:1,0,4:1,1,10,10
chr1	17662541	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	17662751	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,18:0,6:0,0,11,13
chr1	17662804	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	17666095	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	17666139	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:2,1,2,1
chr1	17666326	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:2,2,5,2
chr1	17668609	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,1:2,3,0,6
chr1	17668976	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	17674537	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=59,77;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,1:3,9:4,1,5,5
chr1	17674601	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=245,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	17689954	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,2,1
chr1	17698725	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,3:9,5:8,9,6,2
chr1	17699509	.	G	GGTGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=155,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:2,1,4,0
chr1	17699539	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,1:2,9:3,3,7,3
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	17708597	.	CTTGTGCCAGCTCCAGCTTTGCCTGCTCTCGACGTGCCAGGCAAG	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.125:23:9,1:8,1:0|1:17708597_CTTGTGCCAGCTCCAGCTTTGCCTGCTCTCGACGTGCCAGGCAAG_C:17708597:10,11,1,1
chr1	17708627	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=89,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,7:0.572:12:2,4:3,3:1|0:17708597_CTTGTGCCAGCTCCAGCTTTGCCTGCTCTCGACGTGCCAGGCAAG_C:17708597:1,4,4,3
chr1	17715081	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	17715135	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	17715475	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=76.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,10,16
chr1	17718750	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	17718756	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17721388	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	17722058	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:17722058_GC_G:17722058:3,10,1,1
chr1	17722060	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:10,2:0|1:17722058_GC_G:17722058:3,10,1,1
chr1	17722230	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17725358	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr1	17727876	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.126:26:9,0:14,2:13,10,0,3
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr1	17738570	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=77.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,9:0,0,17,10
chr1	17743046	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,6:6,0:6,6,6,0
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,10,1
chr1	17929980	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr1	17930144	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:4,0:1,2:1,5,0,3
chr1	17939629	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=82,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,2:6,1:8,9,2,1
chr1	17945969	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr1	17952584	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:9,3:1,0:4,6,1,2
chr1	17982631	.	T	TCAGTACTCCTAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=60,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:0,0:0|1:17982631_T_TCAGTACTCCTAGG:17982631:0,2,0,1
chr1	17982634	.	G	GAGTTCCAGAGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=60,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17982631_T_TCAGTACTCCTAGG:17982631:0,2,0,1
chr1	17991052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr1	17991088	.	C	CTTTCTTTTTTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:17991088_C_CTTTCTTTTTTG:17991088:1,6,1,1
chr1	17991089	.	A	ACAG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:0|1:17991088_C_CTTTCTTTTTTG:17991088:1,6,1,1
chr1	18021574	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	18021699	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=84,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,1:8,0:0|1:18021699_G_A:18021699:8,5,0,2
chr1	18021708	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:0|1:18021699_G_A:18021699:9,4,0,2
chr1	18021867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr1	18023509	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	18688644	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:3,4,1,2
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr1	18703523	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=237,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr1	18703538	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=69,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.733:12:1,5:1,4:1,2,3,6
chr1	18807536	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:2,1:8,1:7,3,0,2
chr1	18808526	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr1	18812316	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr1	18812478	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34,33;MFRL=203,156,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=6.48,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.375,0.352:9:1,4,1:1,0,2:1,1,3,4
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=263,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	19062310	.	ACA	TTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=160,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:5,0:0|1:19062310_ACA_TTG:19062310:7,5,1,1
chr1	19062315	.	A	ATG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=172,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:3,0:0|1:19062310_ACA_TTG:19062310:6,5,1,1
chr1	19181554	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:1,10,0,2
chr1	19184199	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=234,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19184199_C_T:19184199:0,1,0,1
chr1	19184203	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=234,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19184199_C_T:19184199:0,1,0,1
chr1	19186129	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr1	19199473	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	19202970	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,17;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:19202970_G_T:19202970:0,1,0,1
chr1	19202973	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19202970_G_T:19202970:0,1,0,1
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	19204173	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	19205892	.	G	GAGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=86,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:0|1:19205892_G_GAGA:19205892:8,9,1,1
chr1	19205894	.	T	TTTA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:7,2:0|1:19205892_G_GAGA:19205892:8,10,1,1
chr1	19205899	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=86,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:0|1:19205892_G_GAGA:19205892:7,10,1,1
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	19208387	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:19208387_C_T:19208387:4,5,1,1
chr1	19208393	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:19208387_C_T:19208387:4,5,1,1
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	19210018	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=74,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:3,2:6,4:6,4,5,1
chr1	19228878	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19228878_CG_C:19228878:1,0,1,0
chr1	19228886	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19228878_CG_C:19228878:1,0,1,0
chr1	19238064	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=230,158;MMQ=56,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19238064_G_A:19238064:0,2,0,1
chr1	19238067	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=230,158;MMQ=56,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19238064_G_A:19238064:0,2,0,1
chr1	19238072	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=230,158;MMQ=56,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19238064_G_A:19238064:0,2,0,1
chr1	19244875	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,0:7,5:9,4,0,5
chr1	19403221	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,5:4,10:5,3,8,7
chr1	19404638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=163,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:3,1:9,11:4,8,4,11
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr1	19410951	.	GCAGGGTGGGTCTGCGAGATGCCGCCCCTGGGACA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.140:20:4,2:3,0:15,3,1,1
chr1	19411188	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=127,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,10:0.202:52:25,0:16,9:0|1:19411188_T_A:19411188:15,27,0,10
chr1	19411193	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,38;MFRL=124,101;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.218:48:23,0:13,9:0|1:19411188_T_A:19411188:12,26,0,10
chr1	19411195	.	A	ACGATCCAAATGTTTGGTCACCT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=126,101;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,10:0.223:47:18,0:12,0:0|1:19411188_T_A:19411188:12,25,0,10
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr1	19421391	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=48,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:19421391_C_T:19421391:2,2,1,0
chr1	19421393	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=48,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:19421391_C_T:19421391:2,2,1,0
chr1	19421415	.	G	GAAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:19421415_G_GAAA:19421415:6,2,1,1
chr1	19421416	.	G	GGAGCAAGGAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:19421415_G_GAAA:19421415:6,2,1,1
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr1	19433449	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.620:18:4,8:2,3:3,4,4,7
chr1	19437185	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	19442135	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=97,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:3,6,0,2
chr1	19446587	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=228,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr1	19446664	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:9,7,2,1
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	19455650	.	C	CTGCCCTTCCCATCTTCTGGTAACCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	19464773	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	19465765	.	AAC	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:19465765_AAC_A:19465765:4,17,0,2
chr1	19465778	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:19465765_AAC_A:19465765:1,15,0,2
chr1	19470662	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	19476307	.	GAA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.143:18:5,0:0,0:5,11,0,2
chr1	19486804	.	GAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,16;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,0:0,1:0,5,0,4
chr1	19486839	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=60,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr1	19487667	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=112,706;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:19487667_C_CAA:19487667:1,3,1,0
chr1	19487668	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=112,706;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:19487667_C_CAA:19487667:1,3,1,0
chr1	19487689	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr1	19488839	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:7,0,6,0
chr1	19490700	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:13,5,3,0
chr1	19490883	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,46;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:18,4:17,0:21,14,3,1
chr1	19491857	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.675:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	19497158	.	AATAGTAAACGCCAGTAGGCACCAAGGGAGAGAAGCC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:1,1,0,6
chr1	19500729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr1	19510611	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=114,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:18,5:4,0:14,8,2,3
chr1	19525376	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=111,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,1:20,2:27,11,2,1
chr1	19549309	.	TTGGTGTTCCAGTAC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:10,2:9,20,1,1
chr1	19554023	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19554023_G_C:19554023:0,2,0,1
chr1	19554027	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,14;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:19554023_G_C:19554023:0,2,0,1
chr1	19557348	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=64,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,3:6,4:4,3,5,3
chr1	19561814	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=129,122;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0|1:19561814_C_CT:19561814:0,6,0,2
chr1	19561816	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=117,122;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,1:5,1:0|1:19561814_C_CT:19561814:0,7,0,2
chr1	19567572	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,116;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:14,0:10,4:12,12,0,4
chr1	19571555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr1	19571586	.	C	CTTCACCAGCTCTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	19578192	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,10,1
chr1	19581254	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=92,66;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:9,0:8,8:0|1:19581254_C_T:19581254:10,7,1,7
chr1	19581260	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,22;MFRL=111,66;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:8,0:8,7:0|1:19581254_C_T:19581254:11,7,1,7
chr1	19581268	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=146,66;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.359:23:7,0:8,1:0|1:19581254_C_T:19581254:9,6,1,7
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr1	19583506	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,2:0,2,1,1
chr1	19583734	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	19585352	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr1	19596156	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0,0,7,8
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=94,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:7,4,4,6
chr1	19610629	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=146,70;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:19610629_G_T:19610629:6,14,1,1
chr1	19610632	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=158,70;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:19610629_G_T:19610629:6,12,1,1
chr1	19610637	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,70;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:19610629_G_T:19610629:5,12,1,1
chr1	19610643	.	A	AGAGGAGGCGAGATGCCAGTGG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=162,70;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:19610629_G_T:19610629:5,12,1,1
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	19611693	.	G	GGAAGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,1:2,0:0|1:19611693_G_GGAAGT:19611693:0,4,0,1
chr1	19611695	.	C	CTACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19611693_G_GGAAGT:19611693:0,4,0,1
chr1	19611697	.	TTAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19611693_G_GGAAGT:19611693:0,4,0,1
chr1	19611702	.	A	AGTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19611693_G_GGAAGT:19611693:0,4,0,1
chr1	19611708	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:19611693_G_GGAAGT:19611693:0,3,0,1
chr1	19612477	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=119,178;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,1,3
chr1	19612492	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	19612742	.	A	AGGC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:12,13,1,1
chr1	19635130	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:6,2:2,3:3,5,0,5
chr1	19638309	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:5,2,2,5
chr1	19651102	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	19651300	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	19651330	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	19652132	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	19652642	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	19653023	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.253:38:8,0:16,9:20,9,8,1
chr1	19654023	.	ATCCCTCCC	A,ATCCCTCCCTCCCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27,20;MFRL=0,155,59;MMQ=60,60,60;MPOS=21,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,8;RU=TCCC;STR;TLOD=3.54,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.337,0.454:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr1	19655233	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	19683161	.	TGCCAGA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCAGA;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:13,0:13,2:16,17,1,1
chr1	19683915	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.207:40:17,0:15,7:17,15,0,8
chr1	19705232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19705232_C_T:19705232:0,0,1,0
chr1	19705241	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19705232_C_T:19705232:0,0,1,0
chr1	19746332	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,5:0,4:1,0,7,3
chr1	20005337	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:5,1,1,2
chr1	20005835	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,0:15,2:7,13,1,1
chr1	20005853	.	A	ATTGGCCAGCCC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,0:9,2:3,12,1,1
chr1	20009638	.	GGCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCA;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:6,5,1,1
chr1	20020993	.	AC	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,11:3,6:0,5,5,12
chr1	20027287	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=106,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,1:8,1:13,5,0,2
chr1	20066485	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0|1:20066485_G_A:20066485:1,5,2,5
chr1	20066490	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:4,3:2,3:0|1:20066485_G_A:20066485:1,5,2,5
chr1	20067186	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	20073146	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:14,6:7,3:12,9,1,8
chr1	20073188	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=190,172;MMQ=40,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:1,0:0,10,0,2
chr1	20073668	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=91,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:15,3:15,0:17,17,1,2
chr1	20097038	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:11,5,1,1
chr1	20107018	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,1:4,5:2,3,5,1
chr1	20141528	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,5:2,4:5,4,5,4
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:4,2,6,1
chr1	20224144	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=102,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:13,2:0|1:20224144_C_T:20224144:6,18,1,1
chr1	20224150	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=102,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:12,2:0|1:20224144_C_T:20224144:7,19,1,1
chr1	20224152	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=102,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:15,2:0|1:20224144_C_T:20224144:7,19,1,1
chr1	20224154	.	A	AGTTTTCCT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=102,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:12,2:0|1:20224144_C_T:20224144:7,18,1,1
chr1	20234258	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,4:5,3:4,4,2,5
chr1	20246987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr1	20249253	.	A	AGAGAGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GAGAGG;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	20250113	.	GGGCC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:12,2:3,0:0|1:20250113_GGGCC_G:20250113:2,14,0,2
chr1	20250118	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=106,107;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:3,0:0|1:20250113_GGGCC_G:20250113:1,14,0,2
chr1	20304874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:20304874_G_A:20304874:8,2,1,1
chr1	20304879	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:20304874_G_A:20304874:8,2,1,1
chr1	20304962	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,2:3,3:4,6,3,2
chr1	20305065	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	20440723	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.288:43:10,12:21,0:13,18,10,2
chr1	20446071	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.185:19:11,0:4,1:0|1:20446071_A_C:20446071:1,15,3,0
chr1	20446075	.	AG	CC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:11,0:4,2:0|1:20446071_A_C:20446071:1,15,3,0
chr1	20446079	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.201:18:10,0:4,0:0|1:20446071_A_C:20446071:1,14,3,0
chr1	20446081	.	G	GGCCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,0:0|1:20446071_A_C:20446071:1,13,2,0
chr1	20466799	.	G	GTAGCACAAGTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20466799_G_GTAGCACAAGTAA:20466799:0,1,0,1
chr1	20466802	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20466799_G_GTAGCACAAGTAA:20466799:0,1,0,1
chr1	20466807	.	T	TCCCAAGTAGCTGGGACTAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20470009	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:20470009_C_T:20470009:9,6,1,1
chr1	20470014	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:20470009_C_T:20470009:10,9,1,1
chr1	20470017	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:0|1:20470009_C_T:20470009:10,9,1,1
chr1	20501442	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,0:2,4:3,1,3,1
chr1	20501600	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:20501600_C_T:20501600:12,7,1,1
chr1	20501608	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:20501600_C_T:20501600:13,6,1,1
chr1	20519276	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,3:7,0:10,11,2,1
chr1	20637043	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=272,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,2:1,8:0,1,7,3
chr1	20664061	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr1	20671961	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	20672101	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,8,10
chr1	20676597	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr1	20678551	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=96,79;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:3,4:2,4:4,1,5,3
chr1	20678636	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:7,0:13,8:13,7,0,8
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr1	20680784	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=160,291;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:20680784_G_GT:20680784:0,2,0,1
chr1	20680786	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,23;MFRL=160,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20680784_G_GT:20680784:0,2,0,1
chr1	20680789	.	G	GCCCCAGGGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=160,291;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:20680784_G_GT:20680784:0,2,0,1
chr1	20829808	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:1,5:4,4:0,7,0,9
chr1	20879676	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:4,1:11,1:7,8,1,1
chr1	20880990	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:3,3,4,0
chr1	20881394	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=90,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:2,0:12,2:5,9,0,2
chr1	20915589	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=223,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.712:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	20944889	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr1	20944909	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=97,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:4,2:1,0:3,2,3,0
chr1	20944922	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=97,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,3:1,2:5,4,3,2
chr1	20964269	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:4,1:4,3,2,1
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,20,11
chr1	20964457	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,9:7,0:3,8,8,1
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,11,12
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	20978832	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	20979241	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:4,4,1,1
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	20980085	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=94,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:2,4:5,3:5,3,3,4
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:8,7:9,6:8,9,8,5
chr1	20981221	.	C	CCCTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:20981221_C_CCCTTA:20981221:0,4,0,1
chr1	20981225	.	G	GACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:20981221_C_CCCTTA:20981221:0,4,0,1
chr1	20982151	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:5,0,5,5
chr1	20982631	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,15:0,28:0|1:20982631_G_A:20982631:0,0,15,30
chr1	20982653	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,19:0.530:36:11,0:5,19:0|1:20982631_G_A:20982631:8,9,0,19
chr1	20987667	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:14,2:0|1:20987667_AC_A:20987667:8,15,1,1
chr1	20987671	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:8,0:16,2:0|1:20987667_AC_A:20987667:9,15,1,1
chr1	20991147	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:22,5:4,0:23,3,5,0
chr1	21009459	.	C	CTGTCAGCAAACAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	21014486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=243,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	21014523	.	TG	AT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=182,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr1	21014533	.	G	C,GTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20,33;MFRL=166,198,197;MMQ=60,40,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.295:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr1	21014537	.	GT	TT,G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31,33;MFRL=182,198,166;MMQ=60,40,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.297:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	21044219	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	21083715	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,0:9,5:7,9,0,5
chr1	21099846	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	21102502	.	C	CAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=167,140;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:2,0:2,3,0,2
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	21183819	.	TTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:2,1:7,0,2,0
chr1	21188871	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr1	21205811	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=92,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,0:10,6:13,5,6,0
chr1	21212771	.	TCAGGTGTACATC	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:12,0:28,3:0|1:21212771_TCAGGTGTACATC_T:21212771:17,29,0,3
chr1	21212786	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=85,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:11,0:24,3:0|1:21212771_TCAGGTGTACATC_T:21212771:10,26,0,3
chr1	21276608	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=81,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:14,0:0|1:21276608_G_A:21276608:7,13,1,1
chr1	21276611	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=90,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:13,0:0|1:21276608_G_A:21276608:7,13,1,1
chr1	21307743	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	21329213	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:14,3:25,1:23,16,3,1
chr1	21329287	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:11,0:20,2:0|1:21329287_A_AT:21329287:12,19,0,2
chr1	21329288	.	G	GGCCC	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,0:20,1:0|1:21329287_A_AT:21329287:12,20,0,2
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr1	21494634	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=219,125;MMQ=40,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,23:1,9:0,1,11,21
chr1	21494648	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=136,90;MMQ=42,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:16,2:7,1:6,18,0,3
chr1	21494649	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=140,90;MMQ=41,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,2:8,0:0|1:21494649_C_CT:21494649:6,19,0,2
chr1	21494652	.	TTTG	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=140,90;MMQ=41,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:7,0:0|1:21494649_C_CT:21494649:5,18,0,2
chr1	21494671	.	CA	AG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=147,169;MMQ=40,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr1	21560253	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,5,11
chr1	21582348	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,15,6
chr1	21584128	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:2,5,0,5
chr1	21585086	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	21585090	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21585090_AG_CC:21585090:0,0,1,0
chr1	21585095	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21585090_AG_CC:21585090:0,0,1,0
chr1	21585102	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	21585267	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=106,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,3:11,0:11,9,1,2
chr1	21797124	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,2:4,0:4,7,2,0
chr1	21797283	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:2,7,0,2
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr1	21799460	.	TCTA	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=98,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:8,0:0|1:21799460_TCTA_T:21799460:12,10,0,2
chr1	21799467	.	G	GTAT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=93,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:21799460_TCTA_T:21799460:9,8,0,2
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr1	21800074	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:22,0:9,3:10,22,2,1
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	21804620	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=121,169;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:3,4,4,2
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,6,7
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	21805965	.	AC	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=201,118;MMQ=48,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:21805965_AC_CA:21805965:0,4,0,1
chr1	21805968	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=201,118;MMQ=48,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:21805965_AC_CA:21805965:0,4,0,1
chr1	21805970	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=163,118;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:21805965_AC_CA:21805965:0,3,0,1
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	21806447	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=79,87;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr1	21806619	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=112,178;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,1:1,1:0|1:21806619_T_C:21806619:5,4,0,2
chr1	21806621	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=112,178;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,1:1,0:0|1:21806619_T_C:21806619:5,4,0,2
chr1	21807521	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=143,162;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	21809924	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,384;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21887081	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr1	21890464	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	21894816	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr1	21896887	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,2,1
chr1	21896893	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:3,2:3,0:0|1:21896893_A_AT:21896893:1,7,1,1
chr1	21896895	.	G	GCTTGAGCCAAGGAGTTTGAGAC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:3,1:3,0:0|1:21896893_A_AT:21896893:1,5,1,1
chr1	21900112	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.687:11:1,0:2,5:2,1,6,2
chr1	21900146	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.680:20:2,5:1,8:0|1:21900146_C_G:21900146:3,3,10,4
chr1	21900151	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.715:19:4,5:1,8:0|1:21900146_C_G:21900146:2,3,10,4
chr1	21900171	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:7,7:2,6:5,4,6,7
chr1	21902950	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	21929456	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	21932530	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	21934667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:5,4:4,3:5,5,2,5
chr1	21940555	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,97;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:4,6:7,2:6,7,3,5
chr1	21943781	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:8,3,2,0
chr1	21944058	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:21944058_G_GCC:21944058:0,2,0,1
chr1	21944059	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:21944058_G_GCC:21944058:0,2,0,1
chr1	21944062	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:21944058_G_GCC:21944058:0,2,0,1
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	21978048	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=101,89;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.090:63:20,0:38,5:31,27,0,5
chr1	22013561	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	22013771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	22016678	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.678:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	22027910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=119,176;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:22027910_G_A:22027910:4,0,1,0
chr1	22027912	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=119,176;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:22027910_G_A:22027910:4,0,1,0
chr1	22030204	.	T	TCTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=258,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	22032907	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:6,0,3,0
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr1	22074828	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,259;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	22079069	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=87,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,0:3,2:6,8,2,0
chr1	22082967	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=76,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.496:13:0,2:1,2:2,5,5,1
chr1	22083110	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:16,0:21,2:0|1:22083110_C_A:22083110:20,21,1,1
chr1	22083116	.	T	TCCCTGTCA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:18,0:20,2:0|1:22083110_C_A:22083110:23,21,1,1
chr1	22148752	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=203,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	22150257	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,1,4
chr1	22150792	.	G	GGATCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,1:6,2:0|1:22150792_G_GGATCA:22150792:8,4,0,3
chr1	22150794	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,1:6,2:0|1:22150792_G_GGATCA:22150792:8,4,0,3
chr1	22159178	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:22159178_G_C:22159178:0,3,1,0
chr1	22159180	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,14;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:22159178_G_C:22159178:0,3,1,0
chr1	22159184	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:22159178_G_C:22159178:0,3,1,0
chr1	22159186	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:22159178_G_C:22159178:0,3,1,0
chr1	22159189	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:22159178_G_C:22159178:0,2,1,0
chr1	22159199	.	CGGAACCTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=111,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	22173118	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:7,1:3,9,1,2
chr1	22174162	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=88,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:5,1:4,4,3,2
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	22183739	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.659:18:3,6:2,6:3,3,7,5
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	22186421	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,2,0
chr1	22191646	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22191646_C_T:22191646:2,1,1,0
chr1	22191654	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22191646_C_T:22191646:2,1,1,0
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	22199641	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	22202109	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,3:0,0,8,2
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	22211210	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=151,298;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr1	22214482	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=107,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:9,5,1,1
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	22216574	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,8,15
chr1	22217108	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,5,8
chr1	22222426	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:5,2:5,0:0|1:22222426_TC_T:22222426:4,7,1,1
chr1	22222442	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,2:8,0:0|1:22222426_TC_T:22222426:4,9,1,1
chr1	22307340	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,239;MMQ=60,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	22307358	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	22307376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=163,169;MMQ=49,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,3:0,1:5,0,2,2
chr1	22307538	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,55;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,9,8
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,9,8
chr1	22310262	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,4:0,0,10,3
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,17:0,4:0,0,14,7
chr1	22310725	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,10:0,0,11,12
chr1	22313017	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=81,138;MMQ=53,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,8:5,5:8,5,5,8
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	22315780	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=183,154;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22315780_G_C:22315780:0,3,0,1
chr1	22315783	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=175,231;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	22315784	.	AG	GC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=179,154;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:22315780_G_C:22315780:0,2,0,1
chr1	22315787	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=183,154;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:22315780_G_C:22315780:0,3,0,1
chr1	22315798	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,30;MFRL=175,154;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22315798_A_C:22315798:0,1,0,1
chr1	22315800	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=175,154;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22315798_A_C:22315798:0,1,0,1
chr1	22315803	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=175,154;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22315798_A_C:22315798:0,1,0,1
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,4,2
chr1	22332008	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=110,135;MMQ=58,39;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:19,3:20,2:19,21,0,5
chr1	22333538	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=104,147;MMQ=52,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:6,3:2,2:4,4,1,5
chr1	22333595	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr1	22338923	.	TG	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=191,175;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:22338923_TG_AT:22338923:0,3,0,1
chr1	22338927	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=191,175;MMQ=27,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:22338923_TG_AT:22338923:0,3,0,1
chr1	22338929	.	C	CTATCTCTTCAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=191,175;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:22338923_TG_AT:22338923:0,3,0,1
chr1	22338930	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=191,162;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:22338923_TG_AT:22338923:0,3,0,1
chr1	22338934	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=209,162;MMQ=34,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:22338923_TG_AT:22338923:0,2,0,1
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	22416405	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,103065947;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr1	22447005	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:8,4:9,0:8,10,4,0
chr1	22447645	.	C	CTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	22827931	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:2,3:5,2:8,0,4,1
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr1	22835305	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=271,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22835305_T_C:22835305:0,1,0,1
chr1	22835310	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=271,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22835305_T_C:22835305:0,1,0,1
chr1	22835312	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=271,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22835305_T_C:22835305:0,1,0,1
chr1	22835313	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=271,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:22835305_T_C:22835305:0,1,0,1
chr1	22837586	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.807:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr1	22846452	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22848972	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=99,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,2:0,3:2,1,0,5
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	22852715	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,9:5,4:6,2,9,4
chr1	22915758	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	22965527	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=178,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:9,3:9,6,1,2
chr1	22970432	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	23101688	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:9,7:9,4:10,8,5,6
chr1	23107832	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr1	23107978	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=73,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:14,0:13,15,0,4
chr1	23111080	.	A	AGAAGTGTGTGCCACCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=158,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.625:9:3,4:0,0:0,3,1,5
chr1	23222159	.	T	TTCCCTCTGAGGCTCTGCGGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=67,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:2,2,4,2
chr1	23291884	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=218,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:23291884_T_A:23291884:1,1,0,1
chr1	23291887	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=218,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:23291884_T_A:23291884:1,1,0,1
chr1	23356864	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,13,2
chr1	23398649	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,2:14,0:0|1:23398649_G_A:23398649:12,15,1,1
chr1	23398651	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=93,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:11,2:16,0:0|1:23398649_G_A:23398649:14,17,1,1
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	23409869	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:23409869_T_C:23409869:0,4,0,1
chr1	23409872	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:23409869_T_C:23409869:0,4,0,1
chr1	23409898	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23409898_CT_C:23409898:0,1,0,1
chr1	23409907	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23409898_CT_C:23409898:0,1,0,1
chr1	23409910	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23409898_CT_C:23409898:0,1,0,1
chr1	23415334	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:8,0:8,3:12,4,1,2
chr1	23417849	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:7,17:7,0:9,5,17,0
chr1	23519763	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=97,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:15,0:22,7:18,19,0,7
chr1	23696152	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr1	23697617	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,0:3,5:4,3,3,2
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,6,12
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0,2,3,3
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr1	23735296	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23735296_C_G:23735296:0,1,0,1
chr1	23735298	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23735296_C_G:23735296:0,1,0,1
chr1	23735300	.	G	GCAGATGTTCACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23735296_C_G:23735296:0,1,0,1
chr1	23745455	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:23745455_A_C:23745455:0,1,1,0
chr1	23745457	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23745455_A_C:23745455:0,1,1,0
chr1	23745493	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,18;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:23745493_C_G:23745493:0,2,1,0
chr1	23745498	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:23745493_C_G:23745493:0,3,1,0
chr1	23745506	.	TCT	GGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:23745493_C_G:23745493:0,3,1,0
chr1	23745510	.	T	TGGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,14;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:23745493_C_G:23745493:0,3,1,0
chr1	23751140	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=87,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,4:2,1:1,3,1,5
chr1	23756496	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:23756496_C_A:23756496:0,2,0,1
chr1	23756498	.	C	CCTTTCTTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,1:1,0:0|1:23756496_C_A:23756496:0,2,0,1
chr1	23757587	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr1	23758499	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	23762256	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	23763449	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:3,3,1,5
chr1	23768310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr1	23769167	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=176,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr1	23810399	.	C	CTGTGAGTGGCCTCTTGGCTACATCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	23836364	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:4,4:10,6:4,10,6,4
chr1	23847464	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=105,85;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:4,2,2,4
chr1	23885599	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:3,3,3,2
chr1	23967093	.	CTGACTAAAAAATA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23967093_CTGACTAAAAAATA_C:23967093:0,0,0,1
chr1	23967109	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23967093_CTGACTAAAAAATA_C:23967093:0,0,0,1
chr1	24082286	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=159,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:5,5:3,3:4,6,0,8
chr1	24082525	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:24082525_G_A:24082525:5,14,1,1
chr1	24082532	.	CTG	ACA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:24082525_G_A:24082525:5,13,1,1
chr1	24082538	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:24082525_G_A:24082525:5,12,1,1
chr1	24082540	.	G	GCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:24082525_G_A:24082525:5,12,1,1
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24122986	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=152,176;MMQ=57,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr1	24123580	.	AGCCAGAGGCATGGGCACCTGTGGGGTTGAAATAGCGCAGCAGCACTGCGTTCCAAGTCTGTGGGATGTGGGTCAGGTGGTGAG	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.149:41:9,2:9,2:0|1:24123580_AGCCAGAGGCATGGGCACCTGTGGGGTTGAAATAGCGCAGCAGCACTGCGTTCCAAGTCTGTGGGATGTGGGTCAGGTGGTGAG_A:24123580:16,18,2,5
chr1	24123676	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=119,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,5:1,0:0|1:24123580_AGCCAGAGGCATGGGCACCTGTGGGGTTGAAATAGCGCAGCAGCACTGCGTTCCAAGTCTGTGGGATGTGGGTCAGGTGGTGAG_A:24123580:0,6,1,4
chr1	24123681	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=119,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,5:1,0:0|1:24123580_AGCCAGAGGCATGGGCACCTGTGGGGTTGAAATAGCGCAGCAGCACTGCGTTCCAAGTCTGTGGGATGTGGGTCAGGTGGTGAG_A:24123580:0,6,1,4
chr1	24124815	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.468:8:1,1:2,3:0|1:24124815_T_TG:24124815:0,4,0,4
chr1	24124816	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.468:8:2,1:2,3:0|1:24124815_T_TG:24124815:0,4,0,4
chr1	24129115	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	24129126	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	24151996	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:0,8,0,6
chr1	24201919	.	TT	CC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,2:7,4:5,4,3,3
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=200,139;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=150.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,46:0.941:48:0,22:2,24:0,2,23,23
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,45;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,11,16
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,7:0,8:0,0,1,15
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,26:0,13:0,0,14,26
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,6:0,0,14,7
chr1	24294450	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,0:0,0,1,8
chr1	24298084	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:17,0:22,4:21,18,2,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	24298585	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:24298585_CA_C:24298585:0,0,0,1
chr1	24298590	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24298585_CA_C:24298585:0,0,0,1
chr1	24298592	.	T	TCCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24298585_CA_C:24298585:0,0,0,1
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	24384083	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:0|1:24384083_G_A:24384083:4,13,1,1
chr1	24384084	.	GGT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:0|1:24384083_G_A:24384083:4,13,1,1
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	24389812	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=180,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24389812_G_T:24389812:1,0,0,1
chr1	24389814	.	G	GCGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=180,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24389812_G_T:24389812:1,0,0,1
chr1	24389816	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=180,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24389812_G_T:24389812:1,0,0,1
chr1	24389818	.	G	GTGACTGGGCTTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=180,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24389812_G_T:24389812:1,0,0,1
chr1	24392797	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=259,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:24392797_G_A:24392797:0,1,0,1
chr1	24392798	.	GGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=267,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:24392797_G_A:24392797:0,2,0,1
chr1	24393656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	24397815	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24397815_T_A:24397815:0,1,0,1
chr1	24397817	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24397815_T_A:24397815:0,1,0,1
chr1	24397824	.	C	CACGCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:24397815_T_A:24397815:0,2,0,1
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,13,2
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,10:0,0,15,14
chr1	24408015	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	24408414	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,9,3
chr1	24408751	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24408751_G_C:24408751:0,2,0,1
chr1	24408752	.	C	CGGGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:24408751_G_C:24408751:0,2,0,1
chr1	24408765	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	24409191	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=195,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,14:0,4:0,1,5,13
chr1	24417426	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,261;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.357:33:6,0:14,9:10,11,0,12
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr1	24421804	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,11,3
chr1	24421950	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,2:0,13:0,0,6,9
chr1	24432640	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24432640_C_A:24432640:0,1,0,1
chr1	24432643	.	T	TGCCTATAGAAAAATGTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24432640_C_A:24432640:0,1,0,1
chr1	24433749	.	C	CCCTCTTTGCTGGGCTGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:4,5,1,7
chr1	24447214	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=39,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:24447214_G_A:24447214:3,1,2,0
chr1	24447237	.	C	CAGCATTAGGTGTGTGGCCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=98,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.269:9:3,2:4,0:1|0:24447214_G_A:24447214:7,0,1,1
chr1	24447468	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,7:7,6:4,11,4,9
chr1	24465113	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,14:0,34:0,0,31,18
chr1	24485941	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=111,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.560:32:5,12:9,6:6,8,12,6
chr1	24507162	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,3,1,0
chr1	24507165	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,4,1,0
chr1	24507172	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,4,1,0
chr1	24507176	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24507162_T_C:24507162:0,4,1,0
chr1	24507433	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24507433_A_G:24507433:0,1,0,2
chr1	24507437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24507433_A_G:24507433:0,1,0,2
chr1	24663676	.	G	GTGTTTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=106,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:24663676_G_GTGTTTAT:24663676:2,2,0,1
chr1	24663677	.	C	CCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=106,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:24663676_G_GTGTTTAT:24663676:2,2,0,1
chr1	24666075	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr1	24666279	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,17;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:4,0:0|1:24666279_T_A:24666279:4,15,1,1
chr1	24666285	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:5,0:0|1:24666279_T_A:24666279:2,15,1,1
chr1	24666288	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:0|1:24666279_T_A:24666279:2,13,1,1
chr1	24668581	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:6,7,1,1
chr1	24671287	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=98,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,3:4,2:6,2,4,1
chr1	24671482	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:4,0:12,2:0|1:24671482_C_T:24671482:3,14,5,0
chr1	24671485	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:3,3:10,2:0|1:24671482_C_T:24671482:3,14,5,0
chr1	24768469	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	24768778	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	24775967	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:9,7:2,6:3,8,6,7
chr1	24779873	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr1	24782749	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:10,4:10,0:7,13,2,2
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,6:2,5:4,1,10,1
chr1	24784214	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,3:2,3:7,1,5,2
chr1	24792617	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	24840768	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr1	24857657	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.293:20:5,2:8,4:11,3,5,1
chr1	24859617	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,4:5,2:4,7,5,2
chr1	24861704	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:10,10:9,3:13,6,9,4
chr1	24927561	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=178,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr1	24977932	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,0:18,3:19,16,3,0
chr1	24978892	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=17489038,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:2,6:0,2:2,0,8,0
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chr1	24996665	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,80;MMQ=60,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:17,0:12,3:15,14,3,0
chr1	25140628	.	C	CACACACACACACACACACACACACACA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:21,3:19,0:20,20,0,3
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr1	25553874	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.281:18:5,0:8,4:0|1:25553874_G_A:25553874:7,6,3,2
chr1	25553877	.	T	TAC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=70,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,6:0.211:30:4,1:20,2:1|0:25553874_G_A:25553874:15,9,3,3
chr1	25573205	.	TCCGCGAGTATGA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:6,2:11,0:10,12,1,1
chr1	25611035	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,14,6
chr1	25667060	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=90,218;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,5:0.074:79:49,0:24,5:37,37,0,5
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	25679379	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:11,13:6,6:12,5,8,12
chr1	25717139	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=154,173;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr1	25729136	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=104,45;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:16,0:10,2:0|1:25729136_T_A:25729136:14,12,1,1
chr1	25729143	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=107,45;MMQ=52,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:17,0:11,2:0|1:25729136_T_A:25729136:15,13,1,1
chr1	25729149	.	T	TCTTGCCACCATCATTCTATTACCACGATTAC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=109,45;MMQ=52,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,0:11,2:0|1:25729136_T_A:25729136:13,13,1,1
chr1	25780668	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=73,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	25780889	.	A	ATG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=128,171;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.453:22:7,5:4,4:0|1:25780889_A_ATG:25780889:8,4,3,7
chr1	25780893	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=130,171;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.437:23:8,5:4,4:0|1:25780889_A_ATG:25780889:8,5,3,7
chr1	25780965	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25785060	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=105,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,3:11,0:11,16,3,0
chr1	25785412	.	C	CCAGAAACACTGTATCCTCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25785412_C_CCAGAAACACTGTATCCTCTA:25785412:0,3,0,1
chr1	25785416	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:25785412_C_CCAGAAACACTGTATCCTCTA:25785412:0,3,0,1
chr1	25815585	.	TACAGGCCTGAGTC	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,23;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:3,0,1,0
chr1	25815592	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=210,164;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.393:3:1,1:1,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:2,0,1,0
chr1	25815597	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=210,164;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,1:1,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:2,0,1,0
chr1	25815601	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=198,164;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:3,0,1,0
chr1	25815602	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=198,164;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:3,0,1,0
chr1	25815606	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=198,164;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:3,0,1,0
chr1	25815608	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=198,164;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:25815585_TACAGGCCTGAGTC_T:25815585:3,0,1,0
chr1	25815818	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=174,48974;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	25889528	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:15,4:19,0:17,17,2,2
chr1	25889672	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:6,5:3,4:2,8,1,8
chr1	25890050	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=243,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	25891806	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.628:19:3,0:3,12:0,7,12,0
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	25893546	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	26085113	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=131,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:5,0:3,10,2,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	26098330	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	26110065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	26110298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=240,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	26136282	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=146,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:2,7:5,7:3,4,7,7
chr1	26138136	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	26138421	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:26138421_TG_T:26138421:0,12,0,2
chr1	26138427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:26138421_TG_T:26138421:0,12,0,2
chr1	26138451	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	26139137	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=92.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,18:0,0,12,19
chr1	26150224	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=74,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,8:5,2:4,6,6,5
chr1	26152758	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0,0,9,6
chr1	26158337	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	26162198	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,4:13,0:15,11,3,1
chr1	26162222	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:12,0:15,8,3,1
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,5:2,1:5,0,3,3
chr1	26310500	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:11,4:14,9,0,4
chr1	26310527	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,0:13,4:16,10,0,4
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	26314901	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=185,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26314901_G_A:26314901:0,1,0,1
chr1	26314905	.	T	TGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=185,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26314901_G_A:26314901:0,1,0,1
chr1	26349967	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	26360400	.	C	CTGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:26360400_C_CTGT:26360400:0,3,0,1
chr1	26360402	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26360400_C_CTGT:26360400:0,3,0,1
chr1	26360404	.	C	CATCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26360400_C_CTGT:26360400:0,3,0,1
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	26369297	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	26370892	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:26370892_T_A:26370892:5,12,2,0
chr1	26370902	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:5,0:0|1:26370892_T_A:26370892:4,12,2,0
chr1	26371756	.	G	GTTATTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	26378267	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=197,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:0,0:0,5,2,0
chr1	26384219	.	G	GCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=261,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0|1:26384219_G_GCAT:26384219:0,1,0,1
chr1	26384221	.	G	GTGCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=261,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26384219_G_GCAT:26384219:0,1,0,1
chr1	26384224	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=261,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26384219_G_GCAT:26384219:0,1,0,1
chr1	26384226	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=261,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:26384219_G_GCAT:26384219:0,1,0,1
chr1	26441176	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=134,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	26487942	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:2,2,2,3
chr1	26488611	.	CGGACTGGCCCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGACTGGCCCCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr1	26507341	.	GTGGAGCTGTTGCA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:8,0:11,12,1,1
chr1	26510341	.	CCCGA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=91,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:26510341_CCCGA_C:26510341:0,10,0,2
chr1	26510348	.	TGC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=88,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:26510341_CCCGA_C:26510341:0,9,0,2
chr1	26510362	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26510341_CCCGA_C:26510341:0,3,0,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr1	26517160	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:26517160_C_T:26517160:4,0,1,1
chr1	26517169	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:26517160_C_T:26517160:5,0,1,1
chr1	26517425	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26517425_C_CT:26517425:0,1,0,1
chr1	26517426	.	G	GATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26517425_C_CT:26517425:0,1,0,1
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:1,6:0,6:0,1,10,2
chr1	26526554	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=161,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,10:1,13:0,1,12,11
chr1	26526630	.	T	TACTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=275,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:26526630_T_TACTCA:26526630:0,1,0,1
chr1	26526633	.	T	TAACAGAGTGGAACCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=275,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26526630_T_TACTCA:26526630:0,1,0,1
chr1	26527255	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:0,0,6,0
chr1	26527260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:0,0,6,0
chr1	26527304	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0|1:26527304_T_C:26527304:0,0,8,3
chr1	26527310	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:26527304_T_C:26527304:0,0,8,4
chr1	26527809	.	AG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr1	26527951	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr1	26528922	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,13:0,1:0,0,10,4
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	26586309	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=112,35;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:26586309_G_T:26586309:3,10,1,1
chr1	26586315	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=110,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:26586309_G_T:26586309:3,9,1,1
chr1	26586317	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:26586309_G_T:26586309:3,9,1,1
chr1	26586318	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:26586309_G_T:26586309:3,9,1,1
chr1	26586361	.	A	ACAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=162,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	26597673	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	26601570	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:0,7:5,6:1,4,2,11
chr1	26603636	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=98,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,14:0.159:92:41,0:37,14:34,44,0,14
chr1	26603883	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:1,2,0,2
chr1	26607726	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,1:1,2:0,4,0,3
chr1	26608769	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,6:1,6:0,1,11,2
chr1	26608896	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,29;MFRL=81,197;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.649:6:0,3:1,1:1,1,2,2
chr1	26609093	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:3,3,2,3
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	26610823	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:11,6,0,4
chr1	26612297	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:4,3:12,4:9,7,2,5
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	26627478	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:6,9:8,6:0|1:26627478_T_C:26627478:6,8,5,10
chr1	26627481	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=118,157;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,3:0.116:28:12,2:13,0:1|0:26627478_T_C:26627478:8,17,3,0
chr1	26644399	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr1	26646602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=92,124;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,1,0
chr1	26648381	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,4,1
chr1	26648826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	26655208	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr1	26655462	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,8,3
chr1	26663362	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,5,1
chr1	26673076	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,1:7,7:6,4,2,6
chr1	26673108	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:6,3,3,4
chr1	26673220	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	26688623	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=121,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,1:15,1:9,14,0,2
chr1	26689648	.	G	GATATTTAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=212,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr1	26689650	.	G	GGC,GCATTTTGTCTTGAGGTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34,30;MFRL=246,157,62;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.222,0.333:6:1,0,1:2,1,0:0,3,1,2
chr1	26691284	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:6,7,1,2
chr1	26698884	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,2:2,5:2,6,1,6
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,1:6,4:0,7,0,5
chr1	26752067	.	A	AGGACAGCAAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=243,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,6,15
chr1	26786627	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:1,10:4,7:3,2,7,10
chr1	26795314	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26795314_A_C:26795314:3,0,0,1
chr1	26795316	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26795314_A_C:26795314:3,0,0,1
chr1	26872554	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:2,4:4,3:2,5,0,7
chr1	26878245	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr1	26878323	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	26879792	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	26879920	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,10,8
chr1	26880989	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=146,156;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.195:19:3,2:9,1:8,8,0,3
chr1	26881565	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr1	26881806	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=230,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	26898142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:2,7,1,2
chr1	26898428	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:2,3,0,3
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr1	27058095	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.163:44:15,3:22,3:6,31,3,4
chr1	27089786	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:27089786_G_T:27089786:3,5,1,1
chr1	27089788	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:27089786_G_T:27089786:3,5,1,1
chr1	27100032	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=66,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr1	27100203	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.155:21:7,2:10,0:5,13,1,2
chr1	27101611	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,30;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:27101611_G_A:27101611:3,8,1,1
chr1	27101617	.	C	CAGCGTCTCGACT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=175,30;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:27101611_G_A:27101611:3,9,1,1
chr1	27102010	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	27176874	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=130,87;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.190:33:10,0:16,5:16,11,0,6
chr1	27190821	.	GGT	G,GTGTGT	.	.	DP=135;ECNT=2;MBQ=33,31,30;MFRL=133,132,131;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.26,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,5,5:0.146,0.027:38:11,0,2:14,5,2:10,18,6,4
chr1	27190896	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=94,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.095:60:16,5:39,0:11,44,0,5
chr1	27210721	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,5:5,7:5,4,7,5
chr1	27212547	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,1:14,2:14,15,0,3
chr1	27217730	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=227,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27217730_G_A:27217730:0,1,0,1
chr1	27217731	.	G	GAGTGTTTCAACTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=227,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27217730_G_A:27217730:0,1,0,1
chr1	27226512	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:8,0:9,2:0|1:27226512_C_T:27226512:10,7,1,1
chr1	27226531	.	G	GTCTCCTTGTCTGTTACT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:27226512_C_T:27226512:10,10,1,1
chr1	27250534	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:0|1:27250534_C_T:27250534:10,7,1,1
chr1	27250538	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:11,2:0|1:27250534_C_T:27250534:11,7,1,1
chr1	27332751	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,4:10,0:14,9,2,2
chr1	27338934	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:6,7,1,1
chr1	27429134	.	CCCTG	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:3,0:9,1:0|1:27429134_CCCTG_C:27429134:10,4,1,1
chr1	27429147	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:0|1:27429134_CCCTG_C:27429134:9,4,1,1
chr1	27432424	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=94,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.318:32:12,0:10,9:14,8,0,10
chr1	27440777	.	C	CTACACAGAAGCTGAGAAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.086:32:17,2:13,0:13,17,1,1
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27614262	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,113;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:10,11,3,0
chr1	27659061	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=131,1000;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr1	27660817	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:27660817_T_TA:27660817:1,1,0,1
chr1	27660818	.	G	GAAGGGAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:27660817_T_TA:27660817:1,1,0,1
chr1	27674208	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:6,0:3,0:11,2,0,2
chr1	27674213	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,2:3,3:0|1:27674213_T_G:27674213:12,1,0,5
chr1	27674217	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,2:3,2:0|1:27674213_T_G:27674213:12,1,0,5
chr1	27674521	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:9,8,1,1
chr1	27675553	.	A	AGATTCTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:6,0:12,5,1,1
chr1	27676008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:27676008_T_C:27676008:0,3,0,1
chr1	27676010	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:27676008_T_C:27676008:0,3,0,1
chr1	27679692	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr1	27680292	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,13,14
chr1	27683536	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:10,18,0,3
chr1	27684396	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	27684639	.	A	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,14:0.226:64:16,14:32,0:40,10,14,0
chr1	27685108	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.414:20:9,6:3,2:2,10,3,5
chr1	27685112	.	GAGGGTGAACA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=166,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:5,0:4,18,1,1
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,1,14
chr1	27687763	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:5,8,2,1
chr1	27689234	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:12,0:8,5:11,10,0,6
chr1	27690857	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,4:9,0:11,8,4,0
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	27699722	.	CC	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:6,0:15,2:9,14,1,1
chr1	27700534	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr1	27706621	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:6,16:4,8:6,4,10,14
chr1	27708909	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=94,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.465:8:2,0:2,1:3,1,0,4
chr1	27709725	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27709725_T_TAA:27709725:1,2,0,1
chr1	27709727	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27709725_T_TAA:27709725:1,2,0,1
chr1	27721557	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:9,0:14,7:8,15,0,7
chr1	27734625	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=159,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr1	27875824	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,5,9
chr1	27876482	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=166,87;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:4,2:4,8:2,7,2,8
chr1	27876608	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=197,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr1	27877301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	27939417	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,3:5,0:5,10,2,1
chr1	27941507	.	CCCCGCCCCTCAGCCCCTCCCACCTGGA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.456:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,7:0,0,5,13
chr1	28086114	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=90,111;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:16,3:25,0:19,22,3,0
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:28086955_C_A:28086955:2,0,2,1
chr1	28086962	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:28086955_C_A:28086955:4,0,1,1
chr1	28116143	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:16,0:21,2:0|1:28116143_G_A:28116143:22,17,1,1
chr1	28116149	.	A	ACTATGAT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:17,0:21,2:0|1:28116143_G_A:28116143:21,17,1,1
chr1	28128319	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.127:29:13,1:13,2:0|1:28128319_G_T:28128319:13,13,1,2
chr1	28128327	.	GTA	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:13,1:12,1:0|1:28128319_G_T:28128319:12,13,0,2
chr1	28144531	.	A	AGTTCAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=7219076,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	28173673	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=127,94;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:28173673_T_C:28173673:5,15,1,1
chr1	28173675	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,94;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:9,2:0|1:28173673_T_C:28173673:5,16,1,1
chr1	28206503	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:6,2:13,2:10,10,3,1
chr1	28209188	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,2:3,0:0|1:28209188_G_T:28209188:4,9,1,1
chr1	28209197	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:0|1:28209188_G_T:28209188:5,8,1,1
chr1	28209362	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0|1:28209362_T_C:28209362:0,0,8,10
chr1	28209366	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0|1:28209362_T_C:28209362:0,0,7,10
chr1	28233572	.	GAA	G,GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,17,18;MFRL=149,191,225;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.89,9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,5:0.172,0.283:19:1,0,0:4,1,1:3,8,1,7
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:28261593_T_C:28261593:0,0,3,0
chr1	28261600	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:28261593_T_C:28261593:0,0,4,1
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,8:0,0,11,6
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=117.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,11:0,16:0|1:28268833_C_CG:28268833:0,0,16,12
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.968:28:0,11:0,16:0|1:28268833_C_CG:28268833:0,0,16,12
chr1	28281133	.	A	ATCCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28281133_A_ATCCTC:28281133:0,0,0,1
chr1	28281135	.	A	ACTCCCCCGCCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28281133_A_ATCCTC:28281133:0,0,0,1
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,5,20
chr1	28303963	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=217,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:0|1:28303963_G_C:28303963:0,2,0,1
chr1	28303964	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=217,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:0|1:28303963_G_C:28303963:0,2,0,1
chr1	28303970	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=217,143;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:28303963_G_C:28303963:0,2,0,1
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,9,10
chr1	28555579	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	28559574	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	28562676	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	28661460	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:17,2:11,2:0|1:28661460_A_G:28661460:15,14,2,2
chr1	28661466	.	C	CCAACTGTAGCCA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:19,2:11,2:0|1:28661460_A_G:28661460:15,17,2,2
chr1	28858792	.	T	TCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=85,9;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.132:28:16,4:5,0:11,10,0,7
chr1	28879693	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=100,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.073:65:30,2:31,2:29,32,2,2
chr1	28921084	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=114,159;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.075:41:7,3:30,0:27,11,2,1
chr1	28921086	.	CA	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=101,182;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.183:46:9,2:19,7:22,15,6,3
chr1	29037240	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,11,1
chr1	29064036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:12,0,8,0
chr1	29189597	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr1	29320013	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,188;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:17,2:18,0:16,19,1,1
chr1	29338456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:3,0:12,3:4,11,3,0
chr1	29342090	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,135;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	29435923	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=100,100;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:17,12,0,4
chr1	29439016	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	29447611	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:9,0:16,7:13,12,1,6
chr1	29475341	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.351:39:5,7:18,6:19,6,3,11
chr1	29475366	.	GCGGCTCCTGCTC	G	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=122,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.072:63:16,2:38,2:26,33,2,2
chr1	29475394	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.439:50:5,7:22,14:8,20,13,9
chr1	29475648	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,5,22
chr1	29522384	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=193,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr1	29533366	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=95,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:10,4,1,1
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	29542637	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr1	29581937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=80,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:5,8,1,4
chr1	29581953	.	C	CCTTCCTTCCTTCCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=98,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,0:4,2:4,8,0,2
chr1	29585361	.	T	TGAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=281,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	29602101	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=108,115;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:8,4,5,0
chr1	29602139	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:9,0:0|1:29602139_G_C:29602139:12,11,1,1
chr1	29602141	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:0|1:29602139_G_C:29602139:12,11,1,1
chr1	29602143	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:29602139_G_C:29602139:12,11,1,1
chr1	29602145	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:0|1:29602139_G_C:29602139:12,11,1,1
chr1	29602320	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr1	29630427	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:5,5,1,2
chr1	29630455	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:2,5,0,6
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,2,3
chr1	29637313	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,164;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,4:8,0:13,9,4,0
chr1	29639059	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:8,10,1,1
chr1	29642700	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=84,171;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,15:0.251:62:37,0:8,15:25,22,0,15
chr1	29649937	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=64,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:6,2:0|1:29649937_G_A:29649937:6,5,1,1
chr1	29649945	.	T	TTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=64,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:4,1:0|1:29649937_G_A:29649937:5,6,1,1
chr1	29649946	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=64,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:6,1:0|1:29649937_G_A:29649937:5,5,1,1
chr1	29652140	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,0;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:5,10,1,1
chr1	31187034	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:31187034_G_C:31187034:2,1,1,0
chr1	31187037	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:31187034_G_C:31187034:2,1,1,0
chr1	31188089	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.565:19:4,2:4,7:4,4,4,7
chr1	31194267	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=138,50;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,2:11,1:9,9,2,1
chr1	31194611	.	C	CAGGTCACGTGATCCCAGTAGGTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:31194611_C_CAGGTCACGTGATCCCAGTAGGTA:31194611:0,3,1,1
chr1	31194618	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=162,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31194611_C_CAGGTCACGTGATCCCAGTAGGTA:31194611:0,2,0,1
chr1	31196255	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:3,1,6,0
chr1	31206806	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,6:2,3:1,2,5,4
chr1	31208042	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=93,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:9,3,1,3
chr1	31208074	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=105,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:31208074_C_T:31208074:8,8,1,1
chr1	31208078	.	CTGTAGCACCGCCACACGCACTTGAACA	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:6,2:0|1:31208074_C_T:31208074:12,14,1,1
chr1	31230475	.	ACGCACACACACCCGGGGCC	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:15,0:10,2:20,14,1,1
chr1	31347399	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,73;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.547:18:3,4:4,4:1,7,5,5
chr1	31347491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=222,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	31349302	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,151;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,3:5,0:5,2,3,0
chr1	31349839	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,0:12,2:0|1:31349839_C_T:31349839:7,6,1,1
chr1	31349847	.	CTGG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:0|1:31349839_C_T:31349839:7,8,1,1
chr1	31349852	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:7,2:0|1:31349839_C_T:31349839:6,8,1,1
chr1	31349854	.	CTGGCT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:0|1:31349839_C_T:31349839:4,7,1,1
chr1	31406263	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:3,9,0,2
chr1	31409726	.	CCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:2,2:1,3,1,6
chr1	31415040	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=186,74;MMQ=54,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	31467970	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:22,0:32,1:0|1:31467970_C_A:31467970:26,33,1,1
chr1	31467975	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:22,0:29,2:0|1:31467970_C_A:31467970:25,31,1,1
chr1	31467977	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:20,0:29,2:0|1:31467970_C_A:31467970:25,27,1,1
chr1	31468003	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.066:42:12,2:28,0:15,25,1,1
chr1	31501755	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:1,3,0,6
chr1	31732892	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:5,5,7,1
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:3,5,2,6
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr1	31754367	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=90,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,2:4,6:4,4,2,6
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=204,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,2:0,2,4,2
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	31764935	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=235,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31764935_CA_C:31764935:0,2,0,1
chr1	31764937	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=235,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31764935_CA_C:31764935:0,2,0,1
chr1	31819407	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	31837028	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.081:58:34,0:20,4:28,26,2,2
chr1	31837089	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=79,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,3:4,6:3,10,1,8
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	31882582	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,3:5,1:5,1,4,2
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,13,11
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=112,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:2,2:8,1:9,1,2,1
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=85,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.340:33:4,7:18,4:19,3,6,5
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,4,12
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:2,5,0,2
chr1	31902418	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=87,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,2:1,4:2,2,3,3
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,5:2,6:1,1,6,5
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr1	31907086	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=218,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31907086_T_TCA:31907086:0,1,0,1
chr1	31907087	.	G	GCCTCCCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=218,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31907086_T_TCA:31907086:0,1,0,1
chr1	32051062	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:9,0:7,4:5,11,0,5
chr1	32087232	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32087232_T_A:32087232:0,0,0,1
chr1	32087233	.	G	GGGCCAGCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32087232_T_A:32087232:0,0,0,1
chr1	32089076	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=125,80;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.344:25:4,5:12,0:11,5,9,0
chr1	32098996	.	C	CCCCTGGGAGAAGGGATTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=87,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:4,5:4,2:5,3,6,1
chr1	32126298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=73,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	32126568	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=176,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	32126685	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=148,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:5,15:11,0:10,6,16,0
chr1	32126738	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:10,0:9,2:8,11,0,3
chr1	32127953	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,12:0,24:0,0,18,18
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	32133737	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr1	32134378	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=78,108;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:20,7:17,0:22,15,7,0
chr1	32136168	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=13,23;MFRL=198,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=134.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.981:55:0,23:0,24:0,1,35,19
chr1	32140752	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:3,3:6,0:3,6,4,0
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	32145131	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:10,4:15,0:13,12,5,0
chr1	32145157	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:5,7:11,0:8,8,5,2
chr1	32145527	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,1,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=93,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:2,3:1,1:3,1,3,1
chr1	32148832	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:4,0:14,5:8,10,1,4
chr1	32154761	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=71,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:5,2:1,7:3,3,8,2
chr1	32155313	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:7,6,1,2
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,4:6,2:2,5,4,2
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=97,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:3,5:6,2:3,6,6,2
chr1	32156722	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr1	32158304	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=167,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:1,3,1,3
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr1	32161808	.	G	GGA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:32161808_G_GGA:32161808:0,5,1,1
chr1	32161811	.	ACC	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:32161808_G_GGA:32161808:0,5,1,1
chr1	32161814	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:32161808_G_GGA:32161808:0,5,1,1
chr1	32161818	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,2:1,0:0|1:32161808_G_GGA:32161808:0,5,1,1
chr1	32193858	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,207;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.299:15:5,0:4,4:4,7,0,4
chr1	32196647	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,1,2
chr1	32197036	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32197036_GGA_G:32197036:0,2,0,1
chr1	32197040	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32197036_GGA_G:32197036:0,2,0,1
chr1	32197046	.	GG	AC,GCCCG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,26,30;MFRL=195,155,86;MMQ=60,60,60;MPOS=15,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr1	32197047	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=195,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32197036_GGA_G:32197036:0,1,0,1
chr1	32197049	.	G	T,GGGAC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,27,30;MFRL=195,155,86;MMQ=60,60,60;MPOS=12,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr1	32197054	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32197054_CTG_C:32197054:0,2,0,1
chr1	32197057	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32197054_CTG_C:32197054:0,1,0,1
chr1	32197061	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32197054_CTG_C:32197054:0,1,0,1
chr1	32202295	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=78,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:7,2:13,2:11,9,2,2
chr1	32203163	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=111,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:8,7:6,4:7,7,7,4
chr1	32203718	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	32207581	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=187,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,1,2
chr1	32221913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:7,5,3,1
chr1	32222276	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:11,0:17,4:15,13,4,0
chr1	32224806	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,199;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:4,0,4,0
chr1	32258805	.	AAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=95,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,2:8,1,5,1
chr1	32258946	.	AT	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=147,58;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:25,0:14,3:17,24,0,3
chr1	32259047	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.594:45:11,0:7,26:2,16,0,27
chr1	32263845	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:5,1:5,6,0,2
chr1	32265647	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:11,4:15,0:10,16,3,1
chr1	32265717	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=95,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:9,1:9,9,1,1
chr1	32265738	.	A	AGAGCAGTGGCGCGATCTC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=97,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:8,12,1,1
chr1	32265760	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:32265760_A_C:32265760:3,7,1,1
chr1	32265766	.	T	TAGTCTC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:32265760_A_C:32265760:2,7,1,1
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,8:0,0,14,6
chr1	32381417	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,107;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:18,8:7,0:23,2,8,0
chr1	32381592	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.398:12:1,2:5,3:1,6,1,4
chr1	32479609	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr1	32502430	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	32508208	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:32508208_C_T:32508208:2,5,1,1
chr1	32508229	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.289:8:2,0:4,2:0|1:32508208_C_T:32508208:1,5,1,1
chr1	32508234	.	A	ATTGAAAACAAAATGAAACT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.284:8:2,0:4,1:0|1:32508208_C_T:32508208:1,5,1,1
chr1	32508325	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=281,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	32538779	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	32541440	.	GGT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GT;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:1,1:1,1:0,4,0,3
chr1	32560559	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:10,0:3,3:6,7,1,2
chr1	32620112	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=116,170;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,0:3,15:6,0,15,0
chr1	32623140	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32623140_C_T:32623140:0,1,0,1
chr1	32623141	.	TGC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32623140_C_T:32623140:0,1,0,1
chr1	32623146	.	T	TCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32623140_C_T:32623140:0,1,0,1
chr1	32631637	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:1,2:4,2:5,1,4,1
chr1	32631733	.	TG	GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,0:20,2:13,27,0,2
chr1	32646186	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,6:0,4:1,3,2,9
chr1	32658089	.	C	CAATTTTAGAGGGTTGTCTGTCAATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=199,148;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.358:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	32660473	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,4:7,3:10,3,6,1
chr1	32669382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=185,169;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	32672784	.	GA	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:3,3,6,2
chr1	32673369	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=143,314;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,4:6,0:7,7,0,4
chr1	32674927	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,2:6,8:4,8,3,7
chr1	32678506	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,145;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr1	32681205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:3,5,3,0
chr1	32681463	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:32681463_G_A:32681463:6,5,1,1
chr1	32681471	.	A	AAGATGGCAGAGCTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:32681463_G_A:32681463:5,4,1,1
chr1	32682962	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,4:7,4:2,6,2,6
chr1	32687777	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,122;MMQ=54,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:10,2:7,18:17,0,24,0
chr1	32694062	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.211:25:8,4:12,0:14,6,5,0
chr1	32696628	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:4,2,3,6
chr1	32696845	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr1	32696862	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=119,237;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	32712984	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:13,5,0,3
chr1	32768248	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,0:13,4:11,12,2,2
chr1	32768268	.	T	TCATCCTCAGTGGATG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:15,2:10,13,0,2
chr1	32792505	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:10,4,3,0
chr1	32800143	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=121,58;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:10,3,2,0
chr1	32800706	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=78,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:2,6,0,4
chr1	32828216	.	GAGC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:9,0,5,0
chr1	32828486	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:0|1:32828486_G_C:32828486:0,14,1,1
chr1	32828492	.	G	GGAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:32828486_G_C:32828486:0,14,1,1
chr1	32828494	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:6,0:0|1:32828486_G_C:32828486:0,14,1,1
chr1	32842319	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr1	32844421	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=98,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.134:42:15,3:22,2:19,18,3,2
chr1	32846911	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=106,175;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:7,0:7,4:4,10,0,5
chr1	32852450	.	GTAAACTCCGTCAGGTCCCGCTTCA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.173:16:9,2:4,0:6,8,1,1
chr1	32936931	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,4:11,0:9,7,4,0
chr1	33065846	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=136,278;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:8,6,2,0
chr1	33099421	.	TAAAGAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	33099643	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=100,56;MMQ=53,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:10,2:0|1:33099643_T_C:33099643:7,14,1,1
chr1	33099649	.	CAGAGT	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=100,56;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:33099643_T_C:33099643:8,11,1,1
chr1	33099657	.	C	CTG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=90,56;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:8,2:0|1:33099643_T_C:33099643:8,8,1,1
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,6,16
chr1	33117663	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=152,93;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,3:10,0:1,16,2,1
chr1	33117695	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,0:6,2:0,8,1,1
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=88.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,12,13
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,5,14
chr1	33146113	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=87,142;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.310:23:6,4:8,3:7,9,4,3
chr1	33160617	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=61,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:6,6,0,3
chr1	33160878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr1	33161212	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr1	33231380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:8,5,2,3
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	33233541	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:33233541_G_C:33233541:15,9,1,1
chr1	33233546	.	C	CACCTCCTCCAGTCCTCCA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,0:9,2:0|1:33233541_G_C:33233541:15,9,1,1
chr1	33234153	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=311,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	33236255	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr1	33237885	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.410:20:1,2:8,0:0|1:33237885_A_C:33237885:0,12,8,0
chr1	33237889	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.430:19:3,3:7,2:0|1:33237885_A_C:33237885:0,11,8,0
chr1	33237892	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:3,2:6,1:0|1:33237885_A_C:33237885:0,11,8,0
chr1	33237897	.	CAGTTA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:3,3:5,2:0|1:33237885_A_C:33237885:1,12,7,0
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:1,6,1,5
chr1	33263511	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=178,90;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:5,2:0|1:33263511_G_T:33263511:0,5,1,1
chr1	33263513	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=178,90;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0|1:33263511_G_T:33263511:0,5,1,1
chr1	33263527	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=186,90;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:33263511_G_T:33263511:0,3,0,1
chr1	33263533	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=228,90;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:33263511_G_T:33263511:0,3,0,1
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,16,3
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr1	33359274	.	T	TGCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:33359274_T_TGCCAA:33359274:1,0,1,0
chr1	33359278	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=12,14;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,0:0|1:33359274_T_TGCCAA:33359274:1,0,1,0
chr1	33359282	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=116,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:0|1:33359274_T_TGCCAA:33359274:2,0,1,0
chr1	33363987	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,150;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr1	33402334	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.331:15:4,2:3,2:7,3,4,1
chr1	33402377	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:18,4:14,0:21,13,0,4
chr1	33476353	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.125:37:11,2:22,2:22,11,2,2
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=131,102;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:15,4:20,3:0|1:33476385_C_G:33476385:24,14,3,4
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=127,102;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,7:0.167:46:16,3:22,3:0|1:33476385_C_G:33476385:24,15,3,4
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=127,102;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:15,4:20,3:0|1:33476385_C_G:33476385:21,15,3,4
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=126,102;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:16,4:15,3:0|1:33476385_C_G:33476385:18,13,3,4
chr1	33478900	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=86,116;MMQ=60,26;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:21,1:14,2:14,21,1,2
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=120,104;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:18,4:21,2:13,27,2,4
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=128,104;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.134:50:18,4:24,2:18,26,2,4
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=116,91;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,10:0.166:64:25,7:26,3:21,33,2,8
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=117,87;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,8:0.169:51:24,5:18,3:19,24,1,7
chr1	33479002	.	A	ATG	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=23,23;MFRL=119,91;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,7:0.181:42:21,4:14,3:0|1:33479002_A_ATG:33479002:11,24,1,6
chr1	33479004	.	C	CATCTTTCA	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=119,91;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,7:0.181:42:19,3:13,3:0|1:33479002_A_ATG:33479002:11,24,1,6
chr1	33480248	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:14,0:12,4:8,19,0,4
chr1	33549791	.	TAGTCCA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,12,19
chr1	33567376	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:6,4,3,0
chr1	33611400	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr1	33746083	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:2,0:9,2:0|1:33746083_C_T:33746083:4,8,1,1
chr1	33746091	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,0:5,2:0|1:33746083_C_T:33746083:2,7,1,1
chr1	33746098	.	GC	AA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:4,2:0|1:33746083_C_T:33746083:1,7,1,1
chr1	33746102	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,1:0|1:33746083_C_T:33746083:1,7,1,1
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr1	33777626	.	AG	CA,CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34,34;MFRL=154,43,128;MMQ=60,60,60;MPOS=20,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.90,15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,6:0.157,0.369:16:5,0,6:3,2,0:6,2,6,2
chr1	33777785	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=53,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=280,822;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	33794416	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	33795572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:3,1,7,1
chr1	33795590	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:3,1,8,1
chr1	33797918	.	T	TGGTG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:17,1:12,2:0|1:33797918_T_TGGTG:33797918:14,20,0,3
chr1	33797922	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:19,0:11,1:0|1:33797918_T_TGGTG:33797918:14,20,0,2
chr1	33820033	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:10,3:5,3:9,6,3,3
chr1	33833119	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33833119_A_G:33833119:0,1,0,1
chr1	33833122	.	G	GCTTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33833119_A_G:33833119:0,1,0,1
chr1	33833126	.	A	AGGAGTTCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33833119_A_G:33833119:0,1,0,1
chr1	33833128	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.481:2:0,0:1,1:0|1:33833119_A_G:33833119:0,1,0,1
chr1	33954352	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=147,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr1	33956743	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:4,3,3,2
chr1	33957152	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr1	33958839	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=84,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:8,9,3,0
chr1	33959758	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.294:18:7,2:6,3:10,3,4,1
chr1	33960062	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:5,2:1,5:3,3,3,4
chr1	33961081	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,0:9,2:0|1:33961081_C_T:33961081:3,9,1,1
chr1	33961091	.	AACAAC	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:33961081_C_T:33961081:2,5,1,1
chr1	33961099	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:33961081_C_T:33961081:1,5,1,1
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	33992865	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,1:12,0:0|1:33992865_G_A:33992865:10,7,1,1
chr1	33992875	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:12,0:0|1:33992865_G_A:33992865:9,8,1,1
chr1	33999331	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,204;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:4,3,0,5
chr1	33999584	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:33999584_C_A:33999584:1,1,0,1
chr1	33999587	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:33999584_C_A:33999584:1,1,0,1
chr1	33999599	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	34008297	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	34016046	.	G	GTGGAGGCCGTGGGGAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34016046_G_GTGGAGGCCGTGGGGAGC:34016046:0,1,0,1
chr1	34016049	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34016046_G_GTGGAGGCCGTGGGGAGC:34016046:0,1,0,1
chr1	34016050	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34016046_G_GTGGAGGCCGTGGGGAGC:34016046:0,1,0,1
chr1	34033301	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=123,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:8,0:8,3:10,6,1,2
chr1	34033441	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34033441_G_A:34033441:0,0,0,1
chr1	34033448	.	A	AGTGGGCTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34033441_G_A:34033441:0,0,0,1
chr1	34042810	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	34042834	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	34043169	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	34049494	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34049494_T_TA:34049494:0,1,0,1
chr1	34049496	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34049494_T_TA:34049494:0,1,0,1
chr1	34049498	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:34049494_T_TA:34049494:0,2,0,1
chr1	34049503	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:34049494_T_TA:34049494:0,2,0,1
chr1	34052305	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	34052729	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=70,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.091:40:15,2:22,0:23,14,1,2
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:4,0,2,1
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr1	34071525	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:5,5:0,9:3,2,11,4
chr1	34071530	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=82,48;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:11,5,2,0
chr1	34076550	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	34076683	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,2:9,1:9,4,2,1
chr1	34083106	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,2:9,0:9,6,1,1
chr1	34100991	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=236,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:34100991_C_T:34100991:0,2,0,1
chr1	34101002	.	C	CTTGTGATTCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=236,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:34100991_C_T:34100991:0,2,0,1
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	34204747	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:5,2:0|1:34204747_A_T:34204747:4,4,1,1
chr1	34204749	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:6,1:0|1:34204747_A_T:34204747:4,4,1,1
chr1	34238283	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=91,67;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr1	34238346	.	TCG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	34285342	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,6,5
chr1	34285381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr1	34285995	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	34286115	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=85,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.154:23:13,2:5,1:12,8,1,2
chr1	34286189	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	34330067	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr1	34330342	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=102,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,1:4,0:0|1:34330342_AG_A:34330342:5,4,1,1
chr1	34330347	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:34330342_AG_A:34330342:5,4,1,1
chr1	34662919	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,0,3
chr1	34663411	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	34667863	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr1	35251545	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:6,12:5,2:6,5,11,3
chr1	35259807	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr1	35259961	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:1,5:9,6:3,7,7,4
chr1	35260642	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=126,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:0|1:35260642_A_C:35260642:2,6,0,2
chr1	35260645	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=126,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:35260642_A_C:35260642:2,6,0,2
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.617:16:4,4:1,6:3,3,3,7
chr1	35350573	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,1:3,7:1,3,2,6
chr1	35452612	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	35453837	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,27:0.560:48:13,15:8,12:9,12,12,15
chr1	35561604	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,0:4,6:1,7,0,6
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=221,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	35577722	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:30,0:16,3:34,12,3,0
chr1	35579063	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:4,6,0,2
chr1	35580883	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35580883_T_TC:35580883:0,0,0,1
chr1	35580886	.	A	ATGCAGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35580883_T_TC:35580883:0,0,0,1
chr1	35650010	.	TAAACAAAA	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=90,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAACAAAA;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:11,2:14,0:29,11,1,1
chr1	35656462	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:14,0:22,4:20,16,0,4
chr1	35835939	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=92,97;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=29,27;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.255:9:1,2:4,0:5,2,2,0
chr1	35847103	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,3,3
chr1	35859139	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:4,1:8,0,4,0
chr1	35859273	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.106:54:15,0:34,5:30,19,1,4
chr1	35870653	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=115,115;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.195:34:18,0:10,6:9,19,0,6
chr1	35879555	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.146:27:15,1:9,2:18,6,3,0
chr1	35881261	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:35881261_A_AT:35881261:1,2,1,1
chr1	35881263	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:35881261_A_AT:35881261:1,2,1,1
chr1	35921895	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:5,3,5,0
chr1	35926075	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,3,1
chr1	35972707	.	TC	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=143,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.291:36:7,0:19,10:12,14,1,9
chr1	36023827	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,3:13,0:16,15,1,2
chr1	36040598	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.327:47:14,15:18,0:20,12,15,0
chr1	36040676	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:6,9:9,0:1,15,0,9
chr1	36070783	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=107,87;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:4,0:8,4,3,0
chr1	36202597	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,2:12,0:15,11,0,2
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	36212638	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	36216835	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	36282417	.	A	AAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=167,33;MMQ=49,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:0,3:1,7:2,0,6,4
chr1	36298019	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.598:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr1	36316381	.	C	CAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,32;RU=A;STR;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,1:0,9:0,0,12,0
chr1	36316401	.	C	CCAAAAAAAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=122,74;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.235:10:2,0:3,0:4,4,1,1
chr1	36316418	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.915:33:0,7:1,13:0,2,6,25
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chr1	36372556	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=162,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:7,3:9,1:10,6,2,2
chr1	36379976	.	T	TAGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:36379976_T_TAGAC:36379976:0,1,0,1
chr1	36379978	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36379976_T_TAGAC:36379976:0,1,0,1
chr1	36439108	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,2:4,1:4,7,2,1
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chr1	36553836	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=80,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr1	36554442	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	36556779	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,2:3,5:4,1,4,3
chr1	36563077	.	TTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr1	36564357	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=225,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36564357_G_A:36564357:1,0,1,0
chr1	36564369	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:36564357_G_A:36564357:2,0,1,0
chr1	36564372	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:36564357_G_A:36564357:2,0,1,0
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=63,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.939:16:0,4:1,11:0,1,15,0
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,12:0,0,13,4
chr1	36565646	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,6:6,6:8,6,6,6
chr1	36602856	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,2:11,1:12,8,3,0
chr1	36602888	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:36602888_G_A:36602888:11,10,0,2
chr1	36602893	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:36602888_G_A:36602888:9,10,0,2
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr1	36605351	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:12,3:9,0:11,10,2,1
chr1	36642027	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36642027_G_T:36642027:0,0,0,1
chr1	36642029	.	G	GCGCTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36642027_G_T:36642027:0,0,0,1
chr1	36642413	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0|1:36642413_G_A:36642413:2,9,0,2
chr1	36642420	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,6:0.583:10:0,2:4,4:1|0:36642413_G_A:36642413:0,4,0,6
chr1	36752433	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.948:36:1,15:0,18:0,1,11,24
chr1	36754735	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,188;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.147:39:16,5:17,0:15,19,5,0
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	36767332	.	GG	AA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:2,12,0,2
chr1	36773774	.	G	T	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=79,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,8:0.123:67:31,0:27,7:37,22,0,8
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,14,11
chr1	36773877	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:36773877_T_TA:36773877:2,2,0,2
chr1	36773899	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:36773877_T_TA:36773877:5,3,0,2
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=92,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,6:5,5:4,3,5,6
chr1	36785312	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=92,164915472;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:5,4:15,0:8,12,2,2
chr1	36785398	.	GGCTCCTGACAAAGTCCCCTCCCCAGAGAAGACCCTCACTCTAGGGGACAAGGCCTCTATCCCAGGGAACTCCACCTCGGGGAAGATCCCA	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=82,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.161:43:16,4:8,2:13,24,3,3
chr1	36788356	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36807438	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=171,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:6,5,2,0
chr1	36807481	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,2:1,2:3,5,3,1
chr1	36824321	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:1,5:8,6:5,4,7,4
chr1	36884530	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.426:29:8,4:4,4:7,10,8,4
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	36893829	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=295,209;MMQ=41,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:36893829_TC_AA:36893829:1,0,1,0
chr1	36893832	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=295,209;MMQ=41,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:36893829_TC_AA:36893829:1,0,1,0
chr1	36909590	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=105,127;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:19,0:18,4:21,17,0,4
chr1	36921453	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,0:16,3:17,20,1,2
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,12,12
chr1	36927733	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,9:0,12:0|1:36927733_G_A:36927733:0,0,13,10
chr1	36927740	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:0|1:36927733_G_A:36927733:12,10,1,1
chr1	36937059	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr1	36937065	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr1	37324683	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=96,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:6,4,2,2
chr1	37324935	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	37325564	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:5,9,3,0
chr1	37335398	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,1:0|1:37335398_A_T:37335398:4,7,1,1
chr1	37335405	.	G	GATCATAGCTCACCA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:37335398_A_T:37335398:3,6,1,1
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,1
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,1
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=76,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:10,7:12,5:10,12,6,6
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,10:6,6:4,8,6,10
chr1	37962371	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:21,0:26,3:16,32,0,3
chr1	37978999	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:5,10:2,2:5,2,7,5
chr1	38006335	.	T	TGAGAAAGTGAAAACTGCCCCTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	38006339	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38006339_G_A:38006339:0,1,0,1
chr1	38006341	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38006339_G_A:38006339:0,1,0,1
chr1	38018150	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr1	38018165	.	AAC	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=109,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:5,1:6,1:13,3,2,0
chr1	38023148	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,5:3,1:4,1,6,0
chr1	38023345	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=104,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:5,4:1,7,2,2
chr1	38025103	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,2:4,5:4,5,1,6
chr1	38030786	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=141,304;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	38033217	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,0:1,3:5,1,3,0
chr1	38041159	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,153;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.181:29:8,4:16,0:21,3,5,0
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=161,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,2,0
chr1	38052867	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,138;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.217:17:5,0:9,2:13,1,2,1
chr1	38052895	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.158:38:9,1:22,4:16,16,3,3
chr1	38056437	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:4,3:3,6,1,2
chr1	38082381	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:1,8,2,4
chr1	38095531	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=86,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:5,2:6,0:8,3,2,1
chr1	38155265	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,9:3,2:3,3,8,3
chr1	38158258	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr1	38161617	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,3:15,0:24,13,2,1
chr1	38161694	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.639:23:1,7:7,7:1,7,5,10
chr1	38164724	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	38167361	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	38172566	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr1	38184206	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,2:8,0:0|1:38184206_C_CA:38184206:5,10,0,2
chr1	38184209	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:38184206_C_CA:38184206:5,10,0,2
chr1	38184212	.	C	CTCAGCATGTCCCCTCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:38184206_C_CA:38184206:5,10,0,2
chr1	38184316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:1,0:3,2:2,2,2,1
chr1	38185337	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=215,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:0,2,1,1
chr1	38185361	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38185814	.	GC	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=250,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:0,2,0,4
chr1	38186189	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,4:1,5:2,4,2,7
chr1	38186597	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	38188841	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:6,2:2,8,1,2
chr1	38220109	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	38227368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr1	38227391	.	T	TCTCTTCCTCTCCTTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:5,2,1,1
chr1	38272660	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,3:5,3:4,8,2,4
chr1	38280944	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,3:3,0:8,5,1,2
chr1	38280968	.	G	GCTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.217:16:8,3:5,0:0|1:38280968_G_GCTT:38280968:10,3,2,1
chr1	38280972	.	G	GACCCTTGGACCCACGCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.205:17:8,1:6,0:0|1:38280968_G_GCTT:38280968:10,4,2,1
chr1	38298036	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr1	38304469	.	C	CTTTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=22,26;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	38304515	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=198,160;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38304515_C_T:38304515:0,3,0,1
chr1	38304518	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=198,160;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38304515_C_T:38304515:0,3,0,1
chr1	38323087	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:11,10:18,0:19,10,10,0
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,22,7
chr1	38328154	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	38329999	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,2:3,3:2,3,2,3
chr1	38339868	.	CCT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38339868_CCT_C:38339868:0,0,0,1
chr1	38339872	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38339868_CCT_C:38339868:0,0,0,1
chr1	38339874	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:38339868_CCT_C:38339868:0,0,0,1
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	38348403	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:38348403_G_A:38348403:1,1,1,0
chr1	38348414	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=86,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:38348403_G_A:38348403:1,1,1,0
chr1	38352545	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.148:45:10,6:29,0:28,11,6,0
chr1	38357168	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=135,194;MMQ=60,43;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38357168_TG_CA:38357168:0,3,0,1
chr1	38357171	.	ACAT	GCAT,A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,33,25;MFRL=148,194,135;MMQ=60,43,60;MPOS=31,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,0,0:0,1,1:0,2,0,2
chr1	38357176	.	G	GTCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:38357168_TG_CA:38357168:0,3,0,1
chr1	38357188	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,26;MFRL=148,194;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:38357168_TG_CA:38357168:0,2,0,1
chr1	38357198	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=148,194;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:38357168_TG_CA:38357168:0,2,0,1
chr1	38411350	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr1	38411445	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,5:9,3:8,6,5,3
chr1	38425724	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,2:7,4:7,1,4,2
chr1	38425895	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:1,7,4,4
chr1	38442547	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:18,6:3,5:13,8,5,6
chr1	38444333	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=235,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr1	38455389	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=204,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,2,1
chr1	38463374	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:3,0:9,2:8,5,0,3
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=126.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,24:0,0,27,14
chr1	38483296	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27,20,26;MFRL=92,130,112,68;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,22,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.95,5.40,8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,4,6,4:0.188,0.245,0.194:23:5,3,2,1:3,1,3,2:5,4,8,6
chr1	38485104	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=98,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.297:12:5,2:3,1:1,8,0,3
chr1	38488506	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=215,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:0,1:1,2:0,2,1,3
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,1,2
chr1	39311525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=93,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:2,1,5,0
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,5:6,6:7,5,7,4
chr1	39340303	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:11,5:15,0:13,13,5,0
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,7:4,6:10,0,9,4
chr1	39457293	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39466626	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:4,6:4,6:5,4,5,8
chr1	39466786	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,8:5,3,8,7
chr1	39500093	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,137;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.185:41:12,7:22,0:15,19,7,0
chr1	39550210	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	39749884	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:10,7:2,2:2,10,6,3
chr1	39757799	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=188,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,1,2
chr1	39763242	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,3,1
chr1	39763352	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=113,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:14,6:14,0:10,18,6,0
chr1	39766041	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=80,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr1	39788406	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr1	39798025	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,2:9,1:6,9,1,2
chr1	39800562	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr1	39800580	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,0:8,4:7,10,0,4
chr1	39802351	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=339,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39802351_C_CT:39802351:0,1,0,1
chr1	39802355	.	C	CAGCATTGCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=339,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39802351_C_CT:39802351:0,1,0,1
chr1	39802377	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39802377_G_T:39802377:0,0,0,1
chr1	39802379	.	TAAA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39802377_G_T:39802377:0,0,0,1
chr1	39802383	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39802377_G_T:39802377:0,0,0,1
chr1	39803057	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=150,1965;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:3,3:2,0:0,5,4,0
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr1	39815143	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:6,2,3,3
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,6:6,5:2,6,4,7
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.488:18:1,4:8,5:6,3,5,4
chr1	39823353	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:10,8,2,0
chr1	39823475	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:7,8:10,3:10,7,4,7
chr1	39824718	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr1	39826391	.	A	ATTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	39853561	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=185,185;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:8,3,3,0
chr1	39876821	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:11,2:5,0:12,4,2,0
chr1	39877932	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=143,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:14,7:13,0:14,13,7,0
chr1	39879544	.	CCCACCCCTGCAGCTATGGTGG	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=79,41;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:8,1:9,2:0|1:39879544_CCCACCCCTGCAGCTATGGTGG_C:39879544:11,8,1,2
chr1	39879580	.	TT	CC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.224:16:6,0:5,2:0|1:39879544_CCCACCCCTGCAGCTATGGTGG_C:39879544:7,6,1,2
chr1	39879585	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:4,0:5,2:0|1:39879544_CCCACCCCTGCAGCTATGGTGG_C:39879544:5,6,1,1
chr1	39881006	.	AT	A,ATT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=23,23,25;MFRL=99,96,99;MMQ=60,60,60;MPOS=13,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.36,5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,3,6:0.091,0.150:39:13,2,2:10,1,3:15,15,4,5
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:11,3:1,3:0,12,0,6
chr1	39881468	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=96,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:5,4:7,4:6,6,4,4
chr1	39882152	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	39882165	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,19;MFRL=222,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr1	39882177	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=229,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	39882178	.	AC	A,GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27,28;MFRL=0,222,229;MMQ=60,60,60;MPOS=4,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:5,7,2,5
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,5:1,4:5,1,7,2
chr1	39893601	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=161,143;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,11:4,0:8,1,11,0
chr1	39893965	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,126;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:17,0:29,5:23,23,0,5
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=102,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,6:4,3:9,2,8,1
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:5,3,4,1
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=138,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:4,5:6,6,3,7
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,2,19
chr1	39929240	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=89,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,7:6,4:7,5,7,4
chr1	39934499	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr1	39935183	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:9,4:12,0:16,6,4,0
chr1	40027951	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,4:10,0:2,12,4,0
chr1	40028180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	40031097	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	40031122	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40031122_C_T:40031122:0,1,0,1
chr1	40031134	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40031122_C_T:40031122:0,0,0,1
chr1	40031144	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40031122_C_T:40031122:0,0,0,1
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=61,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,3:2,6:1,3,3,6
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:1,3:6,1:6,2,4,0
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	40096053	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=89,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:3,2,1,3
chr1	40096090	.	G	GTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	40097136	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,6:8,5:8,5,8,3
chr1	40097307	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	40097312	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	40098328	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr1	40105171	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=99,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,0:0,1,2,0
chr1	40149695	.	C	CTAACAATTTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:3,0:0|1:40149695_C_CTAACAATTTCT:40149695:0,5,1,1
chr1	40149696	.	G	GACCAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,1:3,0:0|1:40149695_C_CTAACAATTTCT:40149695:0,5,1,1
chr1	40207169	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=276,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:0,2,2,3
chr1	40208933	.	A	ATTCGACAAGTGCGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:4,3,1,1
chr1	40209019	.	TTAG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=65,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40209019_TTAG_T:40209019:1,2,0,1
chr1	40209025	.	G	GGAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=65,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40209019_TTAG_T:40209019:1,2,0,1
chr1	40209030	.	TTTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:40209019_TTAG_T:40209019:1,3,0,1
chr1	40209035	.	T	TACAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=205,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:40209019_TTAG_T:40209019:0,3,0,1
chr1	40209039	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=217,65;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40209019_TTAG_T:40209019:0,2,0,1
chr1	40209408	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	40226045	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=242,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	40229319	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,188;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	40229454	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=149,125;MMQ=52,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,2:4,5:7,6,2,5
chr1	40230531	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=164,89;MMQ=27,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:2,9,1,3
chr1	40235448	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,110;MMQ=57,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:7,10,0,4
chr1	40235921	.	ACAGTCATGCTGGGACTGATGAAGTTGCTGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=232,193;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr1	40319587	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:2,0,5,0
chr1	40323177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr1	40363054	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr1	40363660	.	T	TTTAATGGACTCACAGTTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:3,7,0,2
chr1	40367142	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40367142_G_A:40367142:0,0,0,1
chr1	40367146	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40367142_G_A:40367142:0,0,0,1
chr1	40430957	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,0:13,4:7,17,2,2
chr1	40431214	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=106,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:17,1:17,1:15,19,1,1
chr1	40432932	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	40433492	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,88;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,5:11,0:9,13,4,1
chr1	40533266	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,3,18
chr1	40533287	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,0,17
chr1	40533315	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,4,10
chr1	40533320	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,6,11
chr1	40533326	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,50;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,6,10
chr1	40533347	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,11:0,11:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,14,14
chr1	40533358	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.475:31:8,8:8,4:8,8,8,7
chr1	40535610	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:15,1:3,2:0|1:40535610_T_C:40535610:1,18,0,3
chr1	40535616	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:17,0:2,2:0|1:40535610_T_C:40535610:1,19,0,3
chr1	40535619	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=155,144;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:16,0:2,1:0|1:40535610_T_C:40535610:1,18,0,2
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,14:0,20:0,0,23,14
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	40556942	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.549:16:0,4:7,4:6,1,5,4
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	40559512	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=178,128;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,1:10,2:13,0,3,0
chr1	40559555	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=17,24,17,29;MFRL=98,92,152,101;MMQ=60,56,60,60;MPOS=14,14,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,19,20,22;RU=A;STR;TLOD=6.31,4.48,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,8,5,18:0.183,0.137,0.543:36:1,3,0,1:0,1,0,6:1,4,10,21
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=231,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	40701378	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:1,1,7,0
chr1	40704931	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,157;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:18,0:20,3:12,26,0,3
chr1	40735817	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,7:5,5:3,6,1,11
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr1	40775759	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,1,2
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:0,1:2,16:1,1,1,16
chr1	40777884	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=246,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:2,2:2,2,2,1
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chr1	40839907	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=105,75;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.162:65:32,0:21,8:32,22,1,10
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chr1	40840274	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=114,166;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,0:1,2:8,1,2,0
chr1	40840353	.	A	G	.	.	DP=108;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=321.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,100:0.990:100:0,42:0,58:0,0,38,62
chr1	40872356	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:7,1,6,0
chr1	40872623	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=86,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	40875383	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,0:8,3:11,3,2,1
chr1	40879808	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	40879917	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:8,3:12,0:10,10,1,2
chr1	40879952	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:6,4:3,0:1,8,2,2
chr1	40881799	.	ACC	GGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,1,0
chr1	40928067	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	40961208	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=100,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:0|1:40961208_A_G:40961208:8,8,1,1
chr1	40961213	.	T	TACA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:40961208_A_G:40961208:8,8,1,1
chr1	40981452	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,2:7,0:6,5,2,0
chr1	40981947	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=100,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:18,0:20,4:16,23,3,1
chr1	41220067	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:6,2:9,0:0|1:41220067_G_A:41220067:11,6,0,2
chr1	41220071	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,1:10,0:0|1:41220067_G_A:41220067:10,7,0,2
chr1	41224008	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=469,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	41224043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=258,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	41232194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	41232327	.	T	TTTGGGAGGC	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,2:17,0:0|1:41232327_T_TTTGGGAGGC:41232327:11,21,1,1
chr1	41232329	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:10,2:17,0:0|1:41232327_T_TTTGGGAGGC:41232327:11,19,1,1
chr1	41232331	.	GTT	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=112,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:11,2:16,0:0|1:41232327_T_TTTGGGAGGC:41232327:12,19,1,1
chr1	41232337	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=88,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.057:51:29,1:19,0:29,20,1,1
chr1	41232338	.	A	AC	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=83,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.057:50:29,1:19,0:0|1:41232327_T_TTTGGGAGGC:41232327:29,19,1,1
chr1	41282919	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:5,3:5,5:0|1:41282919_C_T:41282919:5,5,4,5
chr1	41282921	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:0|1:41282919_C_T:41282919:5,5,4,5
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,0:1,3:0|1:41284509_C_G:41284509:1,0,5,0
chr1	41284520	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:0|1:41284509_C_G:41284509:1,0,5,0
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0|1:41284509_C_G:41284509:1,0,5,0
chr1	41285171	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:4,7:6,2:7,4,4,5
chr1	41285585	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0|1:41285585_G_A:41285585:3,5,1,1
chr1	41285591	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=173,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:0|1:41285585_G_A:41285585:2,5,1,3
chr1	41289973	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=270,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,1,0,1
chr1	41289981	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=270,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,1,0,1
chr1	41289990	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=257,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,2,0,1
chr1	41289991	.	T	TTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=257,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,2,0,1
chr1	41289993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=136,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	41289996	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=257,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,2,0,1
chr1	41289998	.	CC	GT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=257,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41289973_C_T:41289973:0,2,0,1
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:4,1,1,4
chr1	41449006	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,54;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,3:13,0:16,16,2,1
chr1	41456823	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=92,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.423:11:2,0:3,0:0,6,5,0
chr1	41461645	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=77,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,4:13,0:8,18,3,1
chr1	41483367	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=92,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,0:6,2:5,5,0,2
chr1	41494009	.	G	GCCACAGCAAGACCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41494009_G_GCCACAGCAAGACCA:41494009:0,0,0,1
chr1	41494011	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41494009_G_GCCACAGCAAGACCA:41494009:0,0,0,1
chr1	41503162	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:8,6:14,0:8,14,6,0
chr1	41512128	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,104;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.371:57:15,21:21,0:26,10,21,0
chr1	41512204	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.119:56:27,2:22,4:27,23,3,3
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,14,12
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,12,11
chr1	41541215	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=17762,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41541215_G_GAT:41541215:1,1,0,1
chr1	41541217	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=17762,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41541215_G_GAT:41541215:1,1,0,1
chr1	41579151	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:11,3:6,8:6,11,4,7
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	41651918	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=83,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:41651918_T_C:41651918:0,2,0,1
chr1	41651925	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=83,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:41651918_T_C:41651918:0,2,0,1
chr1	41828034	.	G	GAGTGGGCAGAGAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	41945227	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	41949680	.	CAGAGCT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=81,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:2,0:8,2:7,8,2,0
chr1	41949685	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=96,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.156:18:6,0:7,2:0|1:41949685_C_A:41949685:8,8,1,1
chr1	41949689	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=89,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:41949685_C_A:41949685:10,8,1,1
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr1	41976729	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:14,7,2,0
chr1	41979156	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	41984015	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=84,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:9,0:9,7,3,0
chr1	41984049	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=77,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:7,8:11,7:9,9,7,8
chr1	42045499	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,0:10,4:10,12,0,4
chr1	42046613	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:7,7:5,3:1,11,3,7
chr1	42048811	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:4,0:7,2:0|1:42048811_G_C:42048811:8,3,1,1
chr1	42048815	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:3,0:5,1:0|1:42048811_G_C:42048811:9,2,1,1
chr1	42050462	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,670;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:4,0:5,5,0,2
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,9,5
chr1	42645525	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr1	42647509	.	CACCTGCCATCGTTGTTCCTGGAGTGCTCACACACACACACACACACACACACACACTCACTCTCTCTCTCTCTCTT	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=108,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.086:54:0,5:1,1:29,19,5,1
chr1	42647568	.	ACT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.139:33:12,3:10,0:19,10,3,1
chr1	42657196	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:10,5:11,7:7,16,6,6
chr1	42693597	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,13,10
chr1	42744370	.	ATATCAAGGAAAGAACC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,17;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.610:3:1,1:0,0:0|1:42744370_ATATCAAGGAAAGAACC_A:42744370:0,1,1,1
chr1	42744390	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:42744370_ATATCAAGGAAAGAACC_A:42744370:0,1,1,1
chr1	42744392	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:42744370_ATATCAAGGAAAGAACC_A:42744370:0,1,1,1
chr1	42776776	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:22,4:26,0:19,29,0,4
chr1	42846786	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	42865091	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:4,7,3,0
chr1	42870338	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	42898843	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0|1:42898843_A_G:42898843:0,0,14,4
chr1	42898864	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.235:19:6,2:9,2:0|1:42898843_A_G:42898843:10,5,2,2
chr1	42901082	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr1	42914363	.	T	TGCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:42914363_T_TGCA:42914363:0,4,0,1
chr1	42914366	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:42914363_T_TGCA:42914363:0,4,0,1
chr1	42914368	.	G	GTATTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:42914363_T_TGCA:42914363:0,4,0,1
chr1	42914394	.	C	CCT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42914394_C_CCT:42914394:0,0,0,1
chr1	42914395	.	A	ACCATTAGGTATCATCTCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42914394_C_CCT:42914394:0,0,0,1
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	42922235	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:6,5:3,0:7,3,5,0
chr1	42922249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:9,6:4,0:9,5,5,1
chr1	42925669	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:42925669_T_A:42925669:0,3,0,1
chr1	42925673	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:42925669_T_A:42925669:0,3,0,1
chr1	42925676	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:42925669_T_A:42925669:0,3,0,1
chr1	42925688	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	43002199	.	AAG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=105,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:7,2:14,8,2,0
chr1	43002347	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	43002358	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:1,2:0,2:0,1,0,5
chr1	43004960	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.249:38:16,0:13,9:9,20,0,9
chr1	43005072	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=172,178;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0|1:43005072_A_T:43005072:0,3,0,2
chr1	43005076	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=172,178;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:43005072_A_T:43005072:0,3,0,2
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	43032239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	43055078	.	CTCAGCAACAATCCAGAAT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:5,0:16,1:13,12,0,2
chr1	43055243	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	43076555	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	43110276	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43119119	.	GTAAAGTCAAGACAAA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:7,0:3,12,1,1
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,20,6
chr1	43132372	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=191,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43132372_T_G:43132372:0,2,0,1
chr1	43132376	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43132372_T_G:43132372:0,2,0,1
chr1	43148153	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,55;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	43201534	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:3,1,5,2
chr1	43212869	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=115,123;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:5,2:5,4:3,7,3,3
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr1	43213797	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	43216080	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=173,176;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,3,0,1
chr1	43216083	.	CT	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=173,176;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,3,0,1
chr1	43216086	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=173,176;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,3,0,1
chr1	43216089	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=173,176;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,3,0,1
chr1	43216091	.	TCCCA	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=173,176;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,3,0,1
chr1	43216097	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=168,176;MMQ=53,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43216080_T_C:43216080:0,2,0,1
chr1	43220924	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.242:14:2,3:9,0:5,6,1,2
chr1	43220943	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:3,2:1,6,1,1
chr1	43224584	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:12,0:4,5:9,7,0,5
chr1	43225001	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:5,9,3,0
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,8,7
chr1	43233353	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,1:8,1:1,11,0,2
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	43255545	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:5,7,1,1
chr1	43260033	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,1:2,1:5,0,3,0
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:6,3,3,1
chr1	43300766	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:6,0:13,2:0|1:43300766_T_C:43300766:10,12,0,2
chr1	43300771	.	G	GACAATACTAGATTCTGGGGATGCAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:6,0:15,2:0|1:43300766_T_C:43300766:10,12,0,2
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	43317793	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:9,6:22,3:28,3,4,5
chr1	43409038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=152,269;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr1	43610910	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,1:4,6:7,3,2,5
chr1	43611005	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:0,1:10,4:4,6,2,3
chr1	43613786	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr1	43630143	.	T	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,3:13,0:10,9,0,3
chr1	43630221	.	G	GCCTCGAGCCACTTCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	43632536	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,6:5,9:2,4,9,6
chr1	43632815	.	TT	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,1:1,2:4,4,3,1
chr1	43634645	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=95,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:16,0:18,3:12,23,0,3
chr1	43637685	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=159,352;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:10,0:11,4:12,10,4,0
chr1	43637932	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:4,2:9,9:5,9,6,5
chr1	43638410	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,0:2,6:1,3,5,1
chr1	43638457	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=83,86;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,2:4,6:7,6,2,6
chr1	43650741	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,7,12
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,7,21
chr1	43664119	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	43664319	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,6:0,1:1,4,3,4
chr1	43665255	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chr1	43688743	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	43688756	.	T	TAGA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=161,192;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.368:3:2,1:0,0:0|1:43688756_T_TAGA:43688756:0,2,0,1
chr1	43688759	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=161,192;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43688756_T_TAGA:43688756:0,2,0,1
chr1	43688760	.	C	CAAGAATTGCTTGAATCTAGGTGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=161,192;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43688756_T_TAGA:43688756:0,2,0,1
chr1	43689850	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,1:3,6,0,2
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=123,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:2,0:1,2:3,2,1,1
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=95,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.622:29:4,13:6,5:6,5,9,9
chr1	43771090	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=93,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	43773078	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=144,53;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,0:2,2:3,1,1,1
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:1,6,1,2
chr1	43777330	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:8,2,0,2
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	43783765	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.360:11:4,1:2,0:5,2,0,4
chr1	43784931	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=74,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,1:13,2:10,12,1,2
chr1	43784956	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:8,6:5,9:3,10,7,8
chr1	43805091	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:14,2:0|1:43805091_G_C:43805091:13,11,1,1
chr1	43805093	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:15,2:0|1:43805091_G_C:43805091:13,11,1,1
chr1	43805098	.	C	CGGTTTTTGCCAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:43805091_G_C:43805091:12,11,1,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr1	43812127	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,0:7,3:0|1:43812127_G_A:43812127:7,5,0,3
chr1	43812129	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:4,0:7,3:0|1:43812127_G_A:43812127:7,5,0,3
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	43825352	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.294:25:8,7:10,0:14,4,7,0
chr1	43825644	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:10,8:4,4:8,6,7,5
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,4,0
chr1	43828715	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,104;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.192:43:17,7:18,0:22,13,8,0
chr1	43829844	.	TGAGAGGACTAGAGGGGAAGAGGGGGTAGAGAAA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=131,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.093:31:13,0:7,2:7,22,0,2
chr1	43831200	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:2,2:9,0:9,2,2,0
chr1	43851692	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.173:40:15,0:18,5:13,20,0,7
chr1	43852696	.	T	TTTCTTTTTA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:0|1:43852696_T_TTTCTTTTTA:43852696:3,11,0,2
chr1	43852698	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:43852696_T_TTTCTTTTTA:43852696:3,11,0,2
chr1	43852700	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:0|1:43852696_T_TTTCTTTTTA:43852696:3,11,0,2
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,1,3
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,2:1,1:2,1,1,2
chr1	43855781	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:5,0,5,2
chr1	43890812	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=114,102;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:12,10,0,2
chr1	43895628	.	G	GACAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43898795	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=87,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,4:7,0:6,12,4,0
chr1	43903433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=83,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:4,2:1,3:3,3,3,2
chr1	43903628	.	G	GCTTTTAAGATGGTGACTTGTTGCTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	43908831	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.230:33:15,7:9,0:19,7,6,1
chr1	44035472	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:1,2,0,4
chr1	44070691	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,2:2,2:0,2,1,3
chr1	44071221	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:5,10:10,5:8,7,8,7
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	44072137	.	TG	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44072137_TG_GC:44072137:0,1,0,1
chr1	44072142	.	C	CTCCCAAGTAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44072137_TG_GC:44072137:0,1,0,1
chr1	44072420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=84,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.449:45:14,15:10,5:14,11,11,9
chr1	44078602	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	44079248	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,298;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:11,8:12,0:16,7,9,0
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,3:3,4:4,2,2,5
chr1	44083507	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.348:32:7,2:14,8:14,7,8,3
chr1	44083519	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.314:29:7,1:13,7:12,8,5,4
chr1	44084739	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=87,128;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:5,2,4,2
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=228,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr1	44086821	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=100,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,1:8,2:9,11,2,1
chr1	44086831	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=84,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:5,8:4,8:4,5,8,8
chr1	44087678	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,0:9,2:7,5,1,1
chr1	44128715	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=76,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:8,3:3,8,2,1
chr1	44137257	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=92,125;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,2:5,5:3,2,6,1
chr1	44149255	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=168,159;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:44149255_C_G:44149255:8,1,2,0
chr1	44149257	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=168,159;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:44149255_C_G:44149255:8,1,2,0
chr1	44154669	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:10,3:11,11,3,0
chr1	44156797	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44156797_GG_TA:44156797:0,1,0,1
chr1	44156801	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44156797_GG_TA:44156797:0,1,0,1
chr1	44156803	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44156797_GG_TA:44156797:0,1,0,1
chr1	44163692	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:2,3,1,2
chr1	44169300	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,37;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:44169300_C_T:44169300:5,6,1,1
chr1	44169310	.	G	GTGTTGAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=108,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:6,2:0|1:44169300_C_T:44169300:4,7,1,1
chr1	44169674	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.275:49:19,13:16,0:25,11,13,0
chr1	44303786	.	CA	C,CAAAAAA,CAAAAAAAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34,32,34;MFRL=125,167,185,200;MMQ=60,40,40,40;MPOS=30,9,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,21,25;RU=A;STR;TLOD=3.35,3.31,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,1,1,1:0.237,0.229,0.228:5:1,1,1,1:1,0,0,0:2,0,3,0
chr1	44365457	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr1	44386615	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:0,2:5,9:3,2,9,3
chr1	44395985	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=133,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=90,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:7,5:4,14:3,8,6,13
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=78,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:4,4:0,0:0|1:44432500_C_G:44432500:2,2,3,1
chr1	44432503	.	C	CATCTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:5,2:0,0:1|0:44432500_C_G:44432500:3,2,1,1
chr1	44432674	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:12,9,2,1
chr1	44437761	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:44437761_G_A:44437761:11,7,0,2
chr1	44437770	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:44437761_G_A:44437761:9,7,0,2
chr1	44442930	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:1,3:3,3:1,5,1,5
chr1	44447006	.	TAGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	44447531	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:8,0:20,8:14,15,8,0
chr1	44450737	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr1	44451115	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,8,0
chr1	44595345	.	C	CAATGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr1	44679537	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=83,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,2:18,0:20,8,1,1
chr1	44685686	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=229,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44685686_C_T:44685686:1,1,1,0
chr1	44685703	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=229,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:44685686_C_T:44685686:1,1,1,0
chr1	44804710	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:10,3:13,9,1,2
chr1	44878456	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	45080061	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=232,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	45097879	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=99,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.086:56:29,4:23,0:29,23,4,0
chr1	45101295	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=108,54630611;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:11,1:4,1:5,10,1,1
chr1	45125989	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=97,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	45155630	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,186;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	45169711	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.199:26:11,1:7,5:11,9,2,4
chr1	45212979	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,141;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.352:11:5,2:1,2:6,1,4,0
chr1	45213074	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:18,5:14,0:12,20,0,5
chr1	45218966	.	G	GCCGAGATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45218966_G_GCCGAGATT:45218966:2,5,1,1
chr1	45218971	.	AGA	CAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=132,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:45218966_G_GCCGAGATT:45218966:2,6,1,1
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=165,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	45224941	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:10,7,2,1
chr1	45226370	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:8,4:7,15,0,4
chr1	45228427	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	45266652	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.202:23:6,1:9,1:16,2,0,5
chr1	45267258	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr1	45267698	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,1,4
chr1	45272150	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	45277733	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=88,53;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,12:0.196:64:32,12:20,0:31,21,12,0
chr1	45292725	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,283;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:5,9,0,2
chr1	45293709	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=284,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,1,3
chr1	45294173	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.204:12:4,0:5,2:0|1:45294173_C_T:45294173:7,3,1,1
chr1	45294175	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.205:12:4,0:6,1:0|1:45294173_C_T:45294173:7,3,1,1
chr1	45297450	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,2:10,1:12,12,0,3
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,7:4,6:4,2,9,4
chr1	45446727	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,128;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,4:8,0:9,8,4,0
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	45472798	.	TTGTGTGTGTG	T,TTG,TTGTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26,26,25;MFRL=0,166,168,170;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,29,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,11,12;RU=TG;STR;TLOD=6.13,13.00,8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,5,3:0.209,0.407,0.323:11:0,2,3,1:0,1,2,1:0,0,6,5
chr1	45473941	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,40;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:21,0:16,6:16,22,3,3
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr1	45475379	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,0:7,3:3,9,0,3
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr1	45478560	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=127,177;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.386:28:4,4:9,2:0|1:45478560_A_C:45478560:4,13,11,0
chr1	45478566	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=122,177;MMQ=60,54;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.386:28:5,3:10,1:0|1:45478560_A_C:45478560:5,12,11,0
chr1	45479272	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=102,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,2:14,1:20,12,1,2
chr1	45480631	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=113,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.157:49:23,7:18,0:17,25,6,1
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr1	45481173	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=70,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,1:3,7:3,5,2,6
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,10:0,9:0,1,11,8
chr1	45501750	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=150,294;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:9,5,3,0
chr1	45501769	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=145,294;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:4,5,3,0
chr1	45501926	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:16,10:13,0:19,10,9,1
chr1	45502022	.	CT	GG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.200:26:1,1:9,0:6,15,5,0
chr1	45502026	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=17,24,19;MFRL=150,120,108;MMQ=60,60,42;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.09,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.331,0.390:10:0,1,0:0,2,1:2,1,0,7
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	45509093	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:45509093_T_C:45509093:0,5,1,1
chr1	45509094	.	A	AGAAGAAAAATCTGCCATTCAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:45509093_T_C:45509093:0,5,1,1
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	45553865	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:3,8,0,3
chr1	45794983	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=95,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:11,12,1,2
chr1	45796269	.	GC	CC,TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31,20;MFRL=0,120,65;MMQ=60,60,60;MPOS=15,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=72.13,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,2:0.848,0.115:23:0,11,0:0,10,2:0,0,8,15
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr1	45805559	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.183:39:13,0:10,1:0|1:45805559_A_C:45805559:11,21,7,0
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.977:40:0,19:0,20:0|1:45805559_A_C:45805559:0,0,16,24
chr1	45807959	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=200,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:45807959_A_T:45807959:3,0,1,1
chr1	45807963	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=200,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:45807959_A_T:45807959:3,0,1,1
chr1	45807967	.	C	CCCTGCTTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=200,44;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:45807959_A_T:45807959:3,0,1,1
chr1	45811252	.	G	GTTCCTGGTTTTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=178,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.476:2:0,1:1,0:0|1:45811252_G_GTTCCTGGTTTTCT:45811252:0,1,0,1
chr1	45811256	.	C	CTCCAGTAGACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=178,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45811252_G_GTTCCTGGTTTTCT:45811252:0,1,0,1
chr1	45962409	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	45965307	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,0:4,5:5,5,2,3
chr1	45965340	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	45981228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=198,178;MMQ=47,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr1	45981258	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	45981401	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:11,0:17,5:11,18,1,4
chr1	45981512	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	46034396	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,7:5,0:4,5,0,7
chr1	46065998	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,23:0,12:0,0,22,15
chr1	46073403	.	C	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,81;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.098:69:38,6:24,0:32,31,6,0
chr1	46079003	.	ATTGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:0|1:46079003_ATTGC_A:46079003:0,3,0,1
chr1	46079009	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:0|1:46079003_ATTGC_A:46079003:0,3,0,1
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:2,1:6,5:3,5,5,2
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:6,5,5,4
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=71,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.778:11:0,6:2,3:1,1,3,6
chr1	46083351	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	46083821	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=87,59;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:14,1:11,3:15,10,2,2
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr1	46086913	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:3,1,4,1
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr1	46089459	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=92,80;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:14,0:10,7:0|1:46089459_C_T:46089459:16,8,1,6
chr1	46089461	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=92,80;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:14,0:9,7:0|1:46089459_C_T:46089459:16,8,1,6
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=113,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:4,7:10,11:6,8,10,8
chr1	46158976	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,59;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,1:13,2:13,17,2,1
chr1	46160260	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	46182778	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,277;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,0:5,7:0,6,0,7
chr1	46195211	.	TAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr1	46269791	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:5,10,1,1
chr1	46290311	.	GTA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	46295110	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:9,0:0|1:46295110_G_A:46295110:14,7,1,1
chr1	46295115	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:46295110_G_A:46295110:12,7,1,1
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:4,0:1,2:3,2,4,0
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	46472153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	46473902	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=99,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:4,1,7,2
chr1	46496683	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:8,5,0,2
chr1	46496709	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,7:1,5:3,2,7,5
chr1	46497356	.	T	TGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	46500613	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:4,2,4,5
chr1	46521517	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,7:2,1:3,4,4,4
chr1	46521559	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=86,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:5,7,5,1
chr1	46654349	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:46654349_G_A:46654349:12,2,2,0
chr1	46654359	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:10,0:0|1:46654349_G_A:46654349:12,8,2,0
chr1	46654362	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:0|1:46654349_G_A:46654349:11,8,2,0
chr1	46655100	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:6,3,8,3
chr1	46655495	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=58,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.704:18:0,5:4,5:4,1,8,5
chr1	46658317	.	ACAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=179,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:46658317_ACAGAG_A:46658317:0,4,0,2
chr1	46658327	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:46658317_ACAGAG_A:46658317:0,3,0,2
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=102,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:46658328_A_G:46658328:0,3,0,2
chr1	46658343	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:46658328_A_G:46658328:0,1,0,3
chr1	46658600	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:0|1:46658600_C_T:46658600:9,10,1,1
chr1	46658606	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:13,2:0|1:46658600_C_T:46658600:7,8,1,1
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,3,3
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:1,1,3,2
chr1	46659636	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,5:4,2:2,4,2,5
chr1	46660461	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=293,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:46660461_T_C:46660461:2,1,0,1
chr1	46660469	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=293,291;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:46660461_T_C:46660461:2,1,0,1
chr1	46661776	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=139,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.451:13:6,2:1,2:2,5,1,5
chr1	46661816	.	T	TGGGTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=169,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0|1:46661816_T_TGGGTG:46661816:0,2,1,1
chr1	46661817	.	A	ACCCAGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=169,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0|1:46661816_T_TGGGTG:46661816:0,2,1,1
chr1	46662609	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:3,2,6,2
chr1	46669299	.	G	GGGGGGTTTGGTACAAAACAGATAAAATTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	46714312	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,3:6,0:1,12,1,2
chr1	46715587	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,155;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:46715587_CT_GG:46715587:4,0,1,0
chr1	46715591	.	AT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=174,155;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:46715587_CT_GG:46715587:3,0,1,0
chr1	46715594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=174,155;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:46715587_CT_GG:46715587:3,0,1,0
chr1	46724274	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:9,3,2,0
chr1	46726316	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:46726316_T_C:46726316:4,9,1,1
chr1	46726321	.	G	GGTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:5,2:0|1:46726316_T_C:46726316:4,8,1,1
chr1	46726322	.	C	CAGGCTTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:46726316_T_C:46726316:4,8,1,1
chr1	46738945	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46738945_G_T:46738945:0,0,1,0
chr1	46738949	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46738945_G_T:46738945:0,0,1,0
chr1	46740349	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=100,79;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:15,2:8,5:8,15,7,0
chr1	46782192	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=127,70;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:8,4,2,2
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr1	46810405	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	46818442	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:46818442_G_A:46818442:0,0,3,1
chr1	46818452	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:46818442_G_A:46818442:0,0,4,1
chr1	46818479	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	46818508	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=235,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,5:0,5:1,0,7,3
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,11,4
chr1	46877791	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:9,7,1,1
chr1	46878747	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:4,3,2,0
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,7:0,0,5,7
chr1	47014821	.	A	AAAAAG,AAAAAAG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,24,27;MFRL=43,91,130;MMQ=60,58,55;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.60,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,19,7:0.676,0.253:28:2,6,0:0,13,7:0,2,17,9
chr1	47024469	.	G	GTTGTAGGTGTGATCGTTTTTGGAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,106;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	47030732	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=117,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:17,4,2,1
chr1	47042283	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,1:6,5:3,4,2,4
chr1	47059934	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	47155395	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0|1:47155395_A_T:47155395:1,5,1,1
chr1	47155396	.	C	CCCAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:47155395_A_T:47155395:1,5,1,1
chr1	47264900	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=104,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:4,4:8,2:6,6,1,5
chr1	47276728	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr1	47276870	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:3,9,1,1
chr1	47278145	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=143,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,2:3,0:4,1,1,1
chr1	47279558	.	CCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCT;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr1	47279986	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=106,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:5,7,1,1
chr1	47395973	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=104,74;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:2,7:9,6:4,8,6,7
chr1	47398496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,166;MMQ=27,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:1,2,1,5
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=78,79;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:6,4:3,5:7,3,4,5
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47402487	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTGTG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,31,27;MFRL=117,151,0;MMQ=60,60,60;MPOS=23,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,7,12;RU=TG;STR;TLOD=5.50,25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,7:0.119,0.446:16:5,0,6:0,2,1:1,6,5,4
chr1	47402517	.	CA	GT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.331:16:7,4:3,0:0|1:47402517_CA_GT:47402517:5,6,0,5
chr1	47402520	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.292:15:7,2:3,0:0|1:47402517_CA_GT:47402517:5,6,0,4
chr1	47402522	.	GC	TG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=111,136;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:3,0:0|1:47402517_CA_GT:47402517:5,6,0,2
chr1	47403140	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=134,220;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47403140_TC_T:47403140:0,1,0,1
chr1	47403143	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=134,220;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47403140_TC_T:47403140:0,1,0,1
chr1	47495605	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,6:4,0:9,2,4,2
chr1	47497037	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=72,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,3:1,5:2,1,8,1
chr1	47501876	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47501876_A_G:47501876:0,4,0,1
chr1	47501881	.	G	GTTGCCACAAACCTTCAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:47501876_A_G:47501876:0,4,0,1
chr1	47515596	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=234,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	47571902	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=116,104;MMQ=52,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:8,1:15,4:0|1:47571902_C_T:47571902:14,11,2,3
chr1	47571905	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=116,104;MMQ=52,39;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:9,1:14,4:0|1:47571902_C_T:47571902:14,11,2,3
chr1	47571996	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=138,169;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:1,8,0,3
chr1	47581122	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	47582246	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:9,8:4,5:9,5,11,2
chr1	47582292	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=108,126;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:10,11:6,11:9,7,15,7
chr1	47583415	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,145;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:5,3,6,0
chr1	47609668	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=461,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	47610742	.	C	CTTGAAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47610742_C_CTTGAAAT:47610742:0,0,0,1
chr1	47610743	.	C	CTTGTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47610742_C_CTTGAAAT:47610742:0,0,0,1
chr1	47611598	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=92,141;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:2,5,0,3
chr1	47649730	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,0:6,11:3,7,0,11
chr1	47650627	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr1	47653170	.	T	TAAAACCAGGGCTTCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr1	47689842	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47717663	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=173,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:47717663_C_CAT:47717663:0,1,0,1
chr1	47717667	.	C	CCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47717663_C_CAT:47717663:0,1,0,1
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	47753170	.	AA	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=165,256;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,4:1,0:4,1,4,0
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	47834323	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,1:8,3:3,11,0,4
chr1	47840647	.	TTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,1,0
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	47842431	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr1	47883762	.	G	GCTGGGCGGCTTGGCTGGCTTGGCTGGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:1,4:0,6:0,2,3,8
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	48695081	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=95,96;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:2,5,3,4
chr1	48701455	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:9,2:0|1:48701455_C_T:48701455:14,12,1,1
chr1	48701468	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:15,0:11,2:0|1:48701455_C_T:48701455:16,12,1,1
chr1	48701567	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,1:1,8:0,4,1,8
chr1	48703571	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:3,3,0,2
chr1	48713306	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:48713306_AA_CC:48713306:0,0,0,1
chr1	48713313	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48713306_AA_CC:48713306:0,0,0,1
chr1	48764553	.	C	CTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=97,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:5,1:6,1:0|1:48764553_C_CTA:48764553:4,7,0,2
chr1	48764555	.	G	GAACAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=97,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:0|1:48764553_C_CTA:48764553:4,7,0,2
chr1	48918848	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=231,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr1	48918888	.	A	ATCCTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:48918888_A_ATCCTC:48918888:0,4,0,1
chr1	48918889	.	A	ACCTGTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:48918888_A_ATCCTC:48918888:0,4,0,1
chr1	48918892	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:48918888_A_ATCCTC:48918888:0,4,0,1
chr1	49201884	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,160;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,7:7,0:9,4,7,0
chr1	49225055	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:1,3,1,5
chr1	49511359	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,44;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,0:7,2:7,8,0,2
chr1	50572082	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:2,3,0,2
chr1	50575643	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:19,2:17,0:0|1:50575643_G_A:50575643:30,11,2,1
chr1	50575665	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=70,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:13,3:16,0:0|1:50575643_G_A:50575643:20,9,2,1
chr1	50575675	.	CTG	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=86,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:9,1:1,1:6,4,1,1
chr1	50661357	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=20,22;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:50661357_C_T:50661357:14,9,2,0
chr1	50661362	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=20,26;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,0:8,2:0|1:50661357_C_T:50661357:16,12,2,0
chr1	50661364	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=21,25;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:18,0:7,2:0|1:50661357_C_T:50661357:16,11,2,0
chr1	50661366	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:18,0:7,2:0|1:50661357_C_T:50661357:14,12,2,0
chr1	50661369	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:18,0:7,2:0|1:50661357_C_T:50661357:13,12,2,0
chr1	50661371	.	AG	TT	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=24,22;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:18,0:6,2:0|1:50661357_C_T:50661357:13,12,2,0
chr1	50661374	.	C	CTTCCT	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=96,23;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:18,0:6,2:0|1:50661357_C_T:50661357:13,11,2,0
chr1	50661375	.	CAGCCAGG	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,18;MFRL=91,23;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:18,0:6,1:0|1:50661357_C_T:50661357:14,11,2,0
chr1	50661411	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr1	50666515	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,1:0,0,5,4
chr1	50666773	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:9,2,2,0
chr1	50941270	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,2:9,1:14,8,0,3
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,13:0,0,7,15
chr1	51049361	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=103,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:15,0:14,3:23,6,2,1
chr1	51049363	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=103,36;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:24,6,1,1
chr1	51049405	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=149,76;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:51049405_G_A:51049405:4,13,1,1
chr1	51049418	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=150,76;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:51049405_G_A:51049405:2,15,1,1
chr1	51049421	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=150,76;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:51049405_G_A:51049405:1,15,1,1
chr1	51061859	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:2,3:16,2:7,11,2,3
chr1	51767352	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:1,1,4,1
chr1	51768132	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:16,3,2,1
chr1	51770808	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=112,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:9,2:0|1:51770808_A_C:51770808:9,8,1,1
chr1	51770812	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=112,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:51770808_A_C:51770808:10,7,1,1
chr1	51777939	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:51777939_A_AG:51777939:0,2,0,1
chr1	51777944	.	C	CCATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:51777939_A_AG:51777939:0,2,0,1
chr1	51777945	.	TAGAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:51777939_A_AG:51777939:0,2,0,1
chr1	51869298	.	A	ACTAGTACTTGGAGACATTCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	51905949	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=119,138;MMQ=55,57;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=TG;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	51910575	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:51910575_C_T:51910575:13,8,1,1
chr1	51910591	.	AA	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:51910575_C_T:51910575:12,8,1,1
chr1	51929445	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:3,5,1,2
chr1	51984950	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=87,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:10,9,1,1
chr1	52135277	.	G	GTGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=125,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	52215978	.	T	TGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=133,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52215978_T_TGAA:52215978:0,1,0,1
chr1	52215980	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=133,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52215978_T_TGAA:52215978:0,1,0,1
chr1	52254930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,1:9,2:13,8,1,2
chr1	52256665	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:7,5,1,2
chr1	52257177	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.952:19:0,9:1,8:0,1,10,8
chr1	52287089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:8,1,3,0
chr1	52287205	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:22,0:17,3:26,13,0,3
chr1	52290984	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,9:4,9:4,4,6,12
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,6,26
chr1	52293630	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,24;MFRL=199,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52293630_G_A:52293630:0,3,0,1
chr1	52293633	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:52293630_G_A:52293630:0,4,0,1
chr1	52293634	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52293630_G_A:52293630:0,4,0,1
chr1	52293635	.	T	TTGA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52293630_G_A:52293630:0,4,0,1
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,24;MFRL=95,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	52302138	.	A	ACAGGGAGGGAG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=86,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.127:35:15,2:15,2:0|1:52302138_A_ACAGGGAGGGAG:52302138:13,18,2,2
chr1	52302141	.	A	AGAC	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=86,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:13,2:0|1:52302138_A_ACAGGGAGGGAG:52302138:13,20,1,1
chr1	52302143	.	A	AAC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=92,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:12,0:9,1:0|1:52302138_A_ACAGGGAGGGAG:52302138:11,20,1,1
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,5:5,2:5,7,3,4
chr1	52343918	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,1:9,2:16,2,3,0
chr1	52385760	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=102,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,0:9,3:10,14,0,3
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	52490321	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	52517346	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr1	52520592	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:18,3,2,0
chr1	52520643	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:20,3:40,0:32,29,3,0
chr1	52729427	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52729427_C_T:52729427:0,0,1,0
chr1	52729432	.	CC	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52729427_C_T:52729427:0,0,1,0
chr1	52811760	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,1:10,2:10,9,1,2
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr1	52820246	.	AACCCCTTTGGCTTGCCCAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=92,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:4,1:9,6,1,1
chr1	52821898	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=205,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:8,2:4,0:9,4,2,0
chr1	52822826	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=109,34;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	52822842	.	C	CTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:52822842_C_CTTT:52822842:0,2,0,1
chr1	52822845	.	C	CAGTCTCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:52822842_C_CTTT:52822842:0,2,0,1
chr1	52822849	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52822842_C_CTTT:52822842:0,1,0,1
chr1	52824400	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:10,11,1,1
chr1	52824423	.	TGA	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:52824423_TGA_T:52824423:8,9,1,1
chr1	52824426	.	T	TCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:52824423_TGA_T:52824423:8,8,1,1
chr1	52824427	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:52824423_TGA_T:52824423:8,8,1,1
chr1	52826646	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,114;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:13,0:9,7:8,14,0,7
chr1	52827212	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TCC;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,4:5,1:6,8,4,1
chr1	52838796	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:5,2:16,1:16,6,1,2
chr1	52839098	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=220,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	52847514	.	A	ATAAATCAGTCAGCACATCTTTGCTGAGTACCTGCTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=315,92;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	52859536	.	C	CCGCCTCCTGGGTTCAAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	52912286	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,137;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:14,0:11,17,4,0
chr1	52933987	.	C	CACAGCGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52933987_C_CACAGCGG:52933987:0,2,0,1
chr1	52933994	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52933987_C_CACAGCGG:52933987:0,2,0,1
chr1	53072454	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr1	53074121	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=178,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr1	53245472	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	53267488	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,11;MFRL=116,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.355:21:2,0:6,0:7,6,8,0
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.614:11:1,3:3,4:1,3,2,5
chr1	53323260	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:7,2,1,1
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=448,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,0,5
chr1	53333330	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:4,3:4,3:5,4,4,2
chr1	53358699	.	TCAGTTGTCATTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=207,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53358699_TCAGTTGTCATTG_T:53358699:0,1,0,1
chr1	53358720	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=207,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53358699_TCAGTTGTCATTG_T:53358699:0,1,0,1
chr1	53364908	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:2,5,0,5
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr1	53372131	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,1:0|1:53372131_C_A:53372131:10,2,2,0
chr1	53372141	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:3,2:0|1:53372131_C_A:53372131:10,3,2,0
chr1	53372162	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.270:19:8,0:5,0:6,8,5,0
chr1	53407406	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:1,3:2,5:3,1,7,2
chr1	53407632	.	G	GCTGCTCAGTGGTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	53443800	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=152,33;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:53443800_C_CTG:53443800:3,0,1,1
chr1	53443801	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=152,33;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:53443800_C_CTG:53443800:3,0,1,1
chr1	53443805	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=152,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:53443800_C_CTG:53443800:3,0,1,1
chr1	53453640	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=221,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	53453683	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,6:4,2:4,1,6,2
chr1	53480745	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:8,5:7,8:6,9,6,7
chr1	53493540	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	53493625	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:3,3,3,0
chr1	53493822	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	53513704	.	A	AACTGTTTGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53527793	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:53527793_C_CG:53527793:4,0,2,0
chr1	53527798	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:53527793_C_CG:53527793:4,0,2,0
chr1	53535443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:2,1:1,6:3,2,4,3
chr1	53535758	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:4,9,1,1
chr1	53535859	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53540208	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=73,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.508:11:4,2:1,0:4,1,0,6
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	53543312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:2,1,3,1
chr1	53543541	.	TCCAGC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCAGC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	53553657	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr1	53554533	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr1	53559310	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53568980	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	53608133	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr1	53662823	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	53676086	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=96,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:5,0:7,3,2,0
chr1	53676448	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr1	53676731	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:8,4:9,8,4,0
chr1	53681699	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=94,101;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:4,2:8,8:5,7,4,6
chr1	53683921	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,7:8,7:3,8,5,9
chr1	53684525	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,5:0,0,14,4
chr1	53699129	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr1	53716629	.	C	CCAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:0|1:53716629_C_CCAAA:53716629:0,1,0,2
chr1	53716631	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:53716629_C_CCAAA:53716629:0,1,0,2
chr1	53716633	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:53716629_C_CCAAA:53716629:0,1,0,2
chr1	53723190	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:0,2,1,7
chr1	53755151	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	53972205	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=117,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,0:2,0,3,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=96,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,2:2,8:2,4,5,5
chr1	53986485	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr1	53990569	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=14,28;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.505:10:0,3:2,2:2,3,1,4
chr1	53995365	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	54252952	.	G	GCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	54254876	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,0:16,4:10,19,0,4
chr1	54254957	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,0:2,7:1,4,0,7
chr1	54262403	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=102,88;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:19,0:16,4:18,17,0,4
chr1	54269524	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,175;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,2:18,0:22,6,2,0
chr1	54284760	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.262:22:5,2:11,4:6,10,2,4
chr1	54293928	.	G	GTCCCACAGCCTCTTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=159,280;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr1	54344282	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	54344453	.	C	CAAAGTCCTTAAAAGGATTTAAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	54344467	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54344467_G_C:54344467:0,1,0,1
chr1	54344469	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54344467_G_C:54344467:0,1,0,1
chr1	54370264	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=106,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,5:6,3:11,1,7,1
chr1	54370306	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:14,9:8,9:15,7,12,6
chr1	54375706	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=97,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,2:0,5:2,2,2,5
chr1	54389471	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	54389517	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	54394153	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:1,2,2,4
chr1	54395673	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:3,6:0,1:4,1,5,2
chr1	54405627	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=94,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:5,5,4,5
chr1	54474784	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr1	54476147	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	54476155	.	G	GCTGAGGCACAGGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	54477726	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	54483694	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=111,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.300:20:2,2:11,2:6,8,3,3
chr1	54502395	.	G	GA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.110:40:15,3:21,1:5,31,1,3
chr1	54561916	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=79,59;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.763:23:3,6:2,12:1,4,16,2
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr1	54649961	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:8,2:9,2:8,9,2,2
chr1	54686374	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr1	54692816	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,44;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:14,0:8,3:13,10,0,3
chr1	54692854	.	A	AG,AGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32,31;MFRL=64,55,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=G;STR;TLOD=3.20,7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.298,0.403:7:0,2,2:2,0,1:2,0,5,0
chr1	54694154	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,1:8,0:0|1:54694154_G_GA:54694154:3,9,1,1
chr1	54694158	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:0|1:54694154_G_GA:54694154:4,9,1,1
chr1	54694214	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,8:4,3:2,6,4,7
chr1	54703951	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:11,0:23,3:16,18,0,3
chr1	54704462	.	C	CCAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,6,4
chr1	54706626	.	GG	AA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:7,0:10,12,1,1
chr1	54706733	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	54722810	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=103,73;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:23,3:9,0:0|1:54722810_A_T:54722810:18,16,2,1
chr1	54722813	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=109,73;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:23,3:8,0:0|1:54722810_A_T:54722810:16,16,2,1
chr1	54722849	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=143,88;MMQ=60,43;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:17,4:6,0:12,11,2,2
chr1	54747276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,288;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	55013860	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,26;MFRL=80,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:1,1,2,0
chr1	55014099	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr1	55014102	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=164,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:0,6,0,4
chr1	55058301	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=75.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:6,0:8,19:0|1:55058301_T_G:55058301:7,11,0,20
chr1	55058303	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=75.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:6,0:12,15:0|1:55058301_T_G:55058301:7,11,0,20
chr1	55069986	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:1,2:0,1:1,1,1,2
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	55073699	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	55074922	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	55075706	.	GGTCAT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	55080612	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=GT;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.829:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	55081919	.	TAC	GTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=240,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	55085499	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	55088849	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=263,214;MMQ=51,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,6,4
chr1	55119289	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,12,10
chr1	55119534	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=119,36;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:7,6,2,4
chr1	55119546	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,7,6
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	55136356	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr1	55138892	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=122,42;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.298:11:5,3:1,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,7,2,1
chr1	55138895	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=144,42;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,3:1,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,6,2,1
chr1	55138897	.	A	AAT	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=144,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:1,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,6,2,1
chr1	55138900	.	G	GAAAA	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=122,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,3:2,0:0|1:55138892_G_A:55138892:2,6,2,1
chr1	55138906	.	G	GTC	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,7,2,1
chr1	55138907	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,7,2,1
chr1	55138910	.	G	GGGTACAA	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,1:3,0:0|1:55138892_G_A:55138892:1,7,2,1
chr1	55139741	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr1	55152183	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:55152183_G_GGC:55152183:0,1,0,1
chr1	55152186	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55152183_G_GGC:55152183:0,1,0,1
chr1	55161220	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,246;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:6,4:13,0:1,19,0,4
chr1	55165760	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:10,11:9,0:14,5,12,0
chr1	55167954	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr1	55199260	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=86,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr1	55199439	.	TTTTTTTTGCG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	55223386	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55223386_G_GC:55223386:0,0,0,1
chr1	55223388	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55223386_G_GC:55223386:0,0,0,1
chr1	55223393	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=101,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:55223386_G_GC:55223386:1,0,0,1
chr1	55223397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=101,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:55223386_G_GC:55223386:1,0,0,1
chr1	55224936	.	GCTCT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	55250522	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:14,0:15,12,0,3
chr1	55250533	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,3:13,0:15,13,0,3
chr1	55251689	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,4,13
chr1	55271774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	55277599	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0,0,9,7
chr1	55319902	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,10,10
chr1	55337329	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=91,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,0:4,2:6,6,0,2
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:55446664_G_C:55446664:3,1,2,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:55446664_G_C:55446664:3,1,2,0
chr1	55446697	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr1	55446863	.	G	GCAACCCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=206,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	55451859	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:2,6,1,1
chr1	55457710	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=50,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:7,2:4,4:4,8,2,4
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	55474262	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,6:5,1:4,5,5,2
chr1	55474325	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	55517861	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr1	55517883	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=168,88;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:3,2:6,0,2,1
chr1	55518166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=202,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,1,2
chr1	55518287	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:9,2:3,0:9,5,0,2
chr1	55518528	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=420,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	55522980	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr1	55523033	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,6,13
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,18,8
chr1	55524160	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:17,0:21,8:24,14,0,9
chr1	55524197	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,10:0,0,26,6
chr1	55524237	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,17:0,12:0,0,20,11
chr1	55524339	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGTGT	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,29,24;MFRL=91,149,185;MMQ=30,59,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=26,18,20;RU=GT;STR;TLOD=13.94,10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,4:0.441,0.448:9:0,1,3:0,3,1:0,1,1,7
chr1	55524387	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=15,25;MFRL=91,190;MMQ=30,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.881:15:0,4:0,8:0,1,2,12
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	55544353	.	ATTCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=221,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	55549514	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,3:15,0:15,14,0,3
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr1	55555313	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=71,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,1:18,2:19,9,0,3
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,2
chr1	55557864	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,3
chr1	55558661	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr1	55563396	.	GA	G,GAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=18,30,18;MFRL=136,205,159;MMQ=60,60,60;MPOS=29,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.28,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.222,0.230:14:3,1,0:0,1,0:3,5,0,6
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	55567409	.	G	GTAACATGACTTTTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.240:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr1	55591133	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=115,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,1:11,2:9,8,2,1
chr1	55604692	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.308:13:3,2:6,2:2,7,1,3
chr1	55604747	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	55609728	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:1,1:5,2,2,0
chr1	55612669	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,0:19,3:11,25,1,2
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55614153	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:55614153_A_G:55614153:8,9,1,1
chr1	55614156	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:0|1:55614153_A_G:55614153:8,9,1,1
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55632377	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55632377_T_C:55632377:0,4,0,1
chr1	55632384	.	T	TAATTCAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55632377_T_C:55632377:0,4,0,1
chr1	55638075	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,7:0,15:0,1,14,8
chr1	55642006	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.155:26:2,0:10,1:12,10,4,0
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr1	57002771	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.179:65:29,0:25,11:23,31,0,11
chr1	57111169	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:1,6,1,4
chr1	57158169	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=87,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,1:3,2:3,10,1,2
chr1	57185584	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=150,220;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	57216921	.	CTAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57216921_CTAA_C:57216921:0,1,0,1
chr1	57216926	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:57216921_CTAA_C:57216921:0,1,0,1
chr1	57219631	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr1	57224460	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	57254772	.	TG	CA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=107,48;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:22,0:17,4:18,21,0,4
chr1	57340727	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,5:2,1:1,5,2,4
chr1	57395298	.	G	GTTCCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=214,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:57395298_G_GTTCCAA:57395298:0,1,0,1
chr1	57395300	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=214,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57395298_G_GTTCCAA:57395298:0,1,0,1
chr1	57415358	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:4,0:4,8,1,2
chr1	57476289	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=193,116;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	57480832	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=22,17;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:1,1:0|1:57480832_C_T:57480832:4,10,1,1
chr1	57480841	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:2,2:0|1:57480832_C_T:57480832:4,11,1,1
chr1	57480843	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:13,0:2,0:0|1:57480832_C_T:57480832:4,11,1,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr1	59042181	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:9,5:4,10:6,7,9,6
chr1	59042388	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr1	59042882	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	59127193	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,15:0,11:0,0,17,9
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr1	59160735	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr1	59160982	.	ATACT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	59249347	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,23,18
chr1	60019849	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.161:41:16,6:19,0:12,23,5,1
chr1	60104012	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,2:8,1:7,8,2,1
chr1	60125861	.	CTTCTTCTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=94,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:7,0:9,9,1,1
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	60280749	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	60312736	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:10,5:7,0:11,7,4,1
chr1	60324236	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	60324244	.	TCAACAAAAA	T,CCAACAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24,31;MFRL=217,115,0;MMQ=60,60,60;MPOS=10,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.297:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr1	60324256	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:60324256_A_T:60324256:0,4,0,1
chr1	60324260	.	AC	CT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.283:5:3,1:0,0:0|1:60324256_A_T:60324256:0,4,0,1
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:4,3:6,4:9,2,3,4
chr1	60466855	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:3,0:9,0:0,12,1,2
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=207,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,2:2,9:0,2,1,10
chr1	60491122	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=67,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:6,5,1,1
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr1	61548344	.	TTCTC	T,TTC	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=24,25,27;MFRL=113,92,112;MMQ=60,60,60;MPOS=13,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TC;STR;TLOD=9.67,21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,6,11:0.115,0.229:50:13,4,7:15,2,4:28,5,14,3
chr1	61548466	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=111,42;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,4:0.052:88:38,4:46,0:19,65,1,3
chr1	61743160	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr1	61869813	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.292:35:9,5:15,4:20,5,5,5
chr1	61872220	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,39;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0|1:61872220_C_A:61872220:0,5,1,1
chr1	61872223	.	C	CTCCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=114,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0|1:61872220_C_A:61872220:0,5,1,1
chr1	61872226	.	C	CGTTGGCTGACGAAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=114,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:0|1:61872220_C_A:61872220:0,5,1,1
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	61921059	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=88,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:10,0:24,4:18,17,2,2
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	62175127	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=62,278;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:3,0:10,4:4,9,0,4
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	62232173	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	62240893	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:20,0:13,2:22,11,1,1
chr1	62261168	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.627:19:3,9:3,3:5,2,5,7
chr1	62274312	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=238,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	62274321	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	62288784	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:1,10,0,2
chr1	62329885	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=131,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.757:15:3,6:0,6:0,3,7,5
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,4,2
chr1	62350123	.	GTTTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	62365217	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	62365428	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=205,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	62366995	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=122,149;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:14,6:9,0:13,10,6,0
chr1	62374197	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:0|1:62374197_G_A:62374197:0,7,0,2
chr1	62374219	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:62374197_G_A:62374197:0,4,0,1
chr1	62380158	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,4:4,6:5,0,9,1
chr1	62380195	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.486:29:7,6:8,8:6,9,8,6
chr1	62380223	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:7,8:17,7:11,14,6,9
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,13,4
chr1	62393438	.	C	CATCTCTCAAAAGTCCCTGCAAAGATATCTCTAGGAAGTG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=140,71;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:9,7,0,2
chr1	62393497	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=83,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:3,0:0|1:62393497_C_T:62393497:6,8,1,1
chr1	62393501	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=83,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:3,0:0|1:62393497_C_T:62393497:6,9,1,1
chr1	62393510	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=91,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:62393497_C_T:62393497:5,9,1,1
chr1	62417951	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=94,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:1,14:0,5:1,0,17,2
chr1	62483599	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr1	62545085	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.727:12:0,4:2,4:0,3,0,9
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr1	62672364	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=125,120;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:9,0:16,4:13,12,0,4
chr1	62672590	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,0:17,4:19,14,0,4
chr1	62672609	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=81,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:10,2:24,1:17,18,1,2
chr1	62673134	.	T	TAATGATAGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:13,0:10,16,1,1
chr1	62675619	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,32:0,13:0,0,33,12
chr1	62675644	.	ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=123,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.122:36:13,0:5,4:22,10,2,2
chr1	62676061	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=103,120;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:14,0:16,3:12,18,0,4
chr1	62676801	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:10,8:4,0:10,4,8,0
chr1	62704134	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	62728784	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=69,123;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:5,2:11,2:9,8,2,2
chr1	62728838	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=74,157;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:4,10:10,0:0|1:62728838_T_C:62728838:5,9,6,4
chr1	62728861	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=100,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.545:20:2,11:6,0:0|1:62728838_T_C:62728838:3,6,5,6
chr1	62728918	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:0,4,2,3
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,0,4
chr1	62733939	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=92,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:5,3:11,6:12,4,6,3
chr1	62734217	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,1,0
chr1	62738904	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=124,90;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.432:21:8,5:3,3:7,5,1,8
chr1	62739198	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,9,11
chr1	62940947	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:11,2:13,2:17,7,2,2
chr1	62943448	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=97,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,1:12,1:7,9,0,2
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	62958449	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=153,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:14,0:19,2:0|1:62958449_T_C:62958449:16,19,1,1
chr1	62958455	.	CTT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:17,2:0|1:62958449_T_C:62958449:15,19,1,1
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	62961956	.	TGCCTATTTAACAA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=109,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:7,0:10,7,1,1
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	63010790	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=246,255;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:63010790_A_G:63010790:0,2,0,1
chr1	63010799	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=246,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:63010790_A_G:63010790:0,2,0,1
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr1	63044645	.	CAA	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=18,19;MFRL=98,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:3,2:4,0:6,14,1,3
chr1	63044718	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63044718_A_AG:63044718:0,0,0,1
chr1	63044721	.	A	ACTGTGGAACTTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63044718_A_AG:63044718:0,0,0,1
chr1	63044724	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63044718_A_AG:63044718:0,0,0,1
chr1	63050535	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:16,5:8,0:10,14,6,0
chr1	63052344	.	CTA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	63052360	.	A	ACACAGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:0|1:63052360_A_ACACAGC:63052360:0,4,0,2
chr1	63052363	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0|1:63052360_A_ACACAGC:63052360:0,5,0,2
chr1	63066781	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.098:59:26,3:28,2:27,27,5,0
chr1	63067618	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	63084511	.	TG	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:6,11,0,3
chr1	63085483	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	63119889	.	TAAAACTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:63119889_TAAAACTTA_T:63119889:0,4,0,1
chr1	63119899	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:63119889_TAAAACTTA_T:63119889:0,4,0,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=132,102,112;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.88,8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,7,7:0.199,0.222:34:6,2,4:8,5,2:12,8,11,3
chr1	63307303	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	63789780	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	63790197	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	63871915	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr1	63920515	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:5,0,7,0
chr1	63974190	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=110,110;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.115:59:26,0:27,6:20,33,0,6
chr1	63988904	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	64089187	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:14,2:14,9,0,2
chr1	64097413	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:14,6,1,1
chr1	64097432	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,6:4,7:5,4,7,6
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,10,8
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	64117537	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr1	64125368	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,11:0,9:1,0,7,14
chr1	64125414	.	TG	CC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr1	64515379	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr1	64603231	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=169,322;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr1	64608329	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,7,2
chr1	64644383	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:64644383_C_T:64644383:10,10,1,1
chr1	64644385	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:64644383_C_T:64644383:10,10,1,1
chr1	64680654	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,21;MFRL=95,114;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,6:4,5:5,6,5,7
chr1	64680667	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=110,54;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:4,11,1,1
chr1	64680682	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=147,161;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,6:0,2:1,6,0,8
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr1	65099701	.	G	GTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:1,2:2,1:3,0,2,2
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,0,15
chr1	65113568	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr1	65129494	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:9,6,1,1
chr1	65131675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=155,118;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:65131675_A_G:65131675:2,1,2,0
chr1	65131683	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=155,118;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:65131675_A_G:65131675:2,1,2,0
chr1	65141676	.	TTAATAATAATAA	T,TTAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28,31;MFRL=0,154,198;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,12;RU=TAA;STR;TLOD=16.97,6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.639,0.287:7:0,3,0:0,2,2:0,0,0,7
chr1	65255018	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	65255072	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:6,5,2,0
chr1	65301028	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:4,1,1,1
chr1	65310489	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:8,1:11,8:6,15,5,4
chr1	65310500	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,1:14,2:12,17,0,3
chr1	65311116	.	GC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	65311262	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=60,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:8,1:3,6:6,5,3,4
chr1	65313414	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=175,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.440:7:2,1:1,2:0|1:65313414_G_A:65313414:0,4,1,2
chr1	65313422	.	A	AGCTACTGTGTTCTTCTGACCTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=195,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,1:1,0:0|1:65313414_G_A:65313414:0,4,0,2
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,4:11,0:4,13,1,3
chr1	65323544	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=132,363;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:65323544_T_A:65323544:0,2,0,1
chr1	65323551	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=146,363;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:65323544_T_A:65323544:0,1,0,1
chr1	65323552	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=146,363;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:65323544_T_A:65323544:0,1,0,1
chr1	65325970	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:2,3,1,5
chr1	65330682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,7:2,3:0,6,1,9
chr1	65830297	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.827:10:0,5:0,4:0|1:65830297_G_T:65830297:1,0,6,3
chr1	65830299	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.671:8:1,2:1,3:0|1:65830297_G_T:65830297:2,0,3,3
chr1	65831674	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr1	65849914	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:11,2:8,1:10,9,2,1
chr1	65858088	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:6,3,4,5
chr1	65867391	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	65874411	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:20,3:11,0:18,13,3,0
chr1	65895703	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:17,0:8,17,0,2
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:4,2,5,0
chr1	66064574	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=175,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	66085574	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,6:8,3:10,3,7,2
chr1	66088701	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr1	66088716	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr1	66088736	.	A	AACAAAAAAAAGCTAATTTTGATGAGGCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=156,206;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66088736_A_AACAAAAAAAAGCTAATTTTGATGAGGCCCAG:66088736:0,2,0,1
chr1	66088739	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=156,206;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66088736_A_AACAAAAAAAAGCTAATTTTGATGAGGCCCAG:66088736:0,2,0,1
chr1	66088741	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=156,206;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66088736_A_AACAAAAAAAAGCTAATTTTGATGAGGCCCAG:66088736:0,2,0,1
chr1	66088744	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=156,206;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66088736_A_AACAAAAAAAAGCTAATTTTGATGAGGCCCAG:66088736:0,2,0,1
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chr1	66713394	.	TC	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:66713392_G_C:66713392:0,4,0,1
chr1	66829000	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:1,2:13,1:2,13,1,2
chr1	66829225	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:15,4:11,4:12,15,0,8
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:1,5,2,6
chr1	66834681	.	T	TCACCAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=186,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	66834701	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=232,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:66834701_G_C:66834701:0,2,0,1
chr1	66834707	.	G	GTATGGCTCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=232,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:66834701_G_C:66834701:0,2,0,1
chr1	67099850	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,35;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:8,0:9,2:0|1:67099850_C_T:67099850:10,9,1,1
chr1	67099858	.	T	TCTGTTTCTTCTTAGC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=136,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:8,2:0|1:67099850_C_T:67099850:10,10,1,1
chr1	67099884	.	TTGGTCCCCTCCCTGGGTTCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:6,10,1,1
chr1	67105346	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=109,109;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:3,4:12,0:16,0,4,0
chr1	67126251	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:0|1:67126251_T_A:67126251:9,14,1,2
chr1	67126257	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:0|1:67126251_T_A:67126251:7,12,1,2
chr1	67145468	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=87,153;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr1	67195184	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:67195184_C_G:67195184:0,0,1,6
chr1	67195192	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:67195184_C_G:67195184:0,0,1,5
chr1	67242005	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=83,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:20,3:11,0:14,19,2,1
chr1	67292473	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:67292473_A_AT:67292473:0,0,2,2
chr1	67292478	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:67292473_A_AT:67292473:0,0,2,2
chr1	67292618	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:15,10:13,0:16,12,9,1
chr1	67293623	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.545:33:10,0:4,18:2,13,0,18
chr1	67303303	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:9,2,5,1
chr1	67306054	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	67306412	.	A	AACGACTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.249:6:1,0:4,1:0,5,0,1
chr1	67306433	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=269,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	67359195	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=162,295;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr1	67390642	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=218,74;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.568:21:4,6:5,6:6,3,9,3
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr1	67438535	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	67442210	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=140,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	67442275	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=97,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:5,3:8,4:8,6,6,2
chr1	67447450	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=76,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,6:4,8:4,3,9,5
chr1	67450295	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,125;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,3:10,0:12,15,3,0
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:0,4:3,4:2,1,5,3
chr1	67560956	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,6:5,5:5,3,6,5
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:2,5,0,6
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=95,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	67591611	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=199,0;MMQ=60,58;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:1,0:0,2,1,0
chr1	67633812	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=198,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:3,5,5,4
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr1	67685469	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:67685469_CTG_C:67685469:0,4,0,1
chr1	67685474	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:67685469_CTG_C:67685469:0,4,0,1
chr1	67685496	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67685496_T_C:67685496:0,2,0,1
chr1	67685498	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67685496_T_C:67685496:0,2,0,1
chr1	67685501	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67685496_T_C:67685496:0,2,0,1
chr1	67794012	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:11,0:17,3:14,14,2,1
chr1	67816825	.	T	TAAAATTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	67861587	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=67,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:67861587_C_T:67861587:5,11,1,1
chr1	67861593	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=74,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:67861587_C_T:67861587:7,12,1,1
chr1	67878789	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.408:18:5,4:5,3:9,2,6,1
chr1	67878995	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.190:35:22,0:5,6:7,22,0,6
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.407:30:3,7:15,5:0|1:67890526_A_G:67890526:13,5,9,3
chr1	67890528	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:10,0:17,2:1|0:67890526_A_G:67890526:21,7,1,1
chr1	67890530	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.097:29:10,0:17,2:1|0:67890526_A_G:67890526:20,7,1,1
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr1	68173264	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=86,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,3:4,7:5,4,5,5
chr1	68512516	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=140,216;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:12,0:8,13:10,10,0,13
chr1	68620762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr1	68649370	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=178,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:68649370_G_T:68649370:0,2,0,1
chr1	68649374	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=178,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:68649370_G_T:68649370:0,2,0,1
chr1	68649379	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=178,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:68649370_G_T:68649370:0,2,0,1
chr1	68649388	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	68905358	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=91,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.505:13:0,3:5,3:2,4,0,7
chr1	68905367	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=108,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.599:9:0,3:2,3:1,2,0,6
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0|1:68943436_G_A:68943436:0,0,6,3
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,0:0,11:0|1:68943436_G_A:68943436:0,0,6,5
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,2:2,9:0,3,3,8
chr1	68944633	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,5,2
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	68947754	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,1:8,1:17,6,1,1
chr1	68948126	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=147,143;MMQ=27,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:4,5,4,0
chr1	68960011	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	68960476	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=80,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:2,6,1,3
chr1	70034419	.	CCGGGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGGGG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	70225832	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,6:2,1:2,1,6,1
chr1	70226061	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:3,6,2,0
chr1	70303952	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=99,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:8,6:14,0:12,10,5,1
chr1	70446182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=109,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:2,4,2,2
chr1	70486660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:3,3,3,0
chr1	70541752	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr1	70587553	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=132,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:70587553_C_T:70587553:7,8,1,1
chr1	70587556	.	G	GAGGCTTGAAAACATTC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:70587553_C_T:70587553:7,8,1,1
chr1	70618017	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	70698078	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:0|1:70698078_T_A:70698078:1,6,1,1
chr1	70698082	.	T	TGGCAGTGTTAACA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=166,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:70698078_T_A:70698078:1,6,1,1
chr1	70758145	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=107,159;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.153:28:4,0:18,3:8,16,0,4
chr1	70877113	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=124,121;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=107.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,41:0.793:51:6,19:4,22:7,3,6,35
chr1	70877153	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:14,7:16,0:18,12,7,0
chr1	70904523	.	T	TTGTG,TTGTGTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28,27;MFRL=0,103,135;MMQ=60,35,60;MPOS=9,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=TG;STR;TLOD=4.15,11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.303,0.624:7:0,1,4:0,1,0:0,0,1,6
chr1	71327936	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	71331430	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,1:1,4:3,4,2,3
chr1	71331498	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr1	71439879	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:0,0,1,0
chr1	71439882	.	ATT	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:0,0,1,0
chr1	71439885	.	CTCAGAGATGGTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:2,0,1,0
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chr1	71439912	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:3,0,1,0
chr1	71439913	.	AACTCC	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:3,0,1,0
chr1	71439922	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:1,1:2,0:0|1:71439879_T_TCCC:71439879:3,0,1,0
chr1	71532580	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,0:10,4:10,13,2,2
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chr1	71537943	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=77,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.146:31:20,2:7,2:3,24,2,2
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	72058552	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,14,14
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,69666;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	74610233	.	T	TAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,22;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.319:7:2,1:1,1:0,5,1,1
chr1	74610294	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=165,150;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:5,0:6,8:0,11,0,8
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	74664149	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=212,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0,2,1,1
chr1	74671519	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=80,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:3,3,2,5
chr1	74701055	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=167,149;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	74716521	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:74716521_T_C:74716521:0,1,0,1
chr1	74716527	.	T	TCTTTTCTTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74716521_T_C:74716521:0,1,0,1
chr1	74801902	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	74808689	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,7:3,0:2,4,0,7
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr1	74901658	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	74901739	.	CTTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.460:9:0,4:1,0:0,5,4,0
chr1	74905344	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	74937749	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr1	74941210	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=117,90;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:3,2,3,4
chr1	74941261	.	G	GGCCACACAGGC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:9,2:6,0:5,10,1,1
chr1	74941293	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:8,4:1,3:5,4,3,4
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	75037845	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,4:6,7:5,4,5,6
chr1	75038611	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:9,2:10,2:9,11,2,3
chr1	75038885	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=134,239;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:6,0:9,14:8,9,0,14
chr1	75042626	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,1:4,1:2,8,0,2
chr1	75072264	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=154,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	75086665	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:0,4,1,2
chr1	75172928	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=41,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:1,5,0,3
chr1	75188707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	75189042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr1	75190452	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,3:3,9:3,3,8,4
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=94,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:7,3,3,2
chr1	75229741	.	AATG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATG;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:4,2:0,4,1,1
chr1	75602384	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr1	75602843	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	75606677	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:6,0:0|1:75606677_A_G:75606677:10,6,2,0
chr1	75606678	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:7,0:0|1:75606677_A_G:75606677:10,6,2,0
chr1	75614380	.	CT	C,CTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30,32;MFRL=147,120,108;MMQ=60,60,60;MPOS=20,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=21.14,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,14,5:0.588,0.205:23:3,5,4:0,8,1:3,1,13,6
chr1	75679569	.	C	CT,CTT,CTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31,28,34;MFRL=195,126,106,68;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,4,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.71,5.25,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,3,2:0.321,0.292,0.213:11:1,2,0,0:1,2,3,1:2,0,7,2
chr1	75681511	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=123,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:2,8:6,4:6,2,6,6
chr1	75685498	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=128,55;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:75685498_C_T:75685498:6,9,1,1
chr1	75685507	.	A	AGGTACAG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=99,55;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:8,2:0|1:75685498_C_T:75685498:8,12,1,1
chr1	75685511	.	G	GAGTGGAGC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=101,55;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:75685498_C_T:75685498:9,12,1,1
chr1	75685513	.	A	AATGT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=97,55;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:9,1:0|1:75685498_C_T:75685498:11,12,1,1
chr1	75688187	.	A	AGCAAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	75699646	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:9,0,1,2
chr1	75699771	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:3,5,3,5
chr1	75699831	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0,5,1,6
chr1	75704370	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=1769,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:75704370_TAA_T:75704370:0,1,0,1
chr1	75704373	.	TGATGTCC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=1019,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:75704370_TAA_T:75704370:0,2,0,1
chr1	75704383	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=1019,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:75704370_TAA_T:75704370:0,2,0,1
chr1	75704391	.	AAG	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=1019,128;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:75704370_TAA_T:75704370:0,2,0,1
chr1	75707652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:6,2,3,2
chr1	75708579	.	G	GAACTACCTATAAAGCTAGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=100,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:6,2,1,1
chr1	76007074	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	76200522	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.301:28:17,5:2,3:11,9,8,0
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=107.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,17:0,0,18,20
chr1	76255613	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr1	76257074	.	AT	A,ATT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,26,26;MFRL=118,183,173;MMQ=60,60,60;MPOS=14,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.86,3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,3:0.277,0.199:17:4,4,1:4,1,2:2,7,4,4
chr1	76262629	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=88,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:14,2:3,0:12,6,2,0
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	76314010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,2:4,0:1,3,0,2
chr1	76344011	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,5:0,16:0,0,7,14
chr1	76345640	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,5:0,0,5,5
chr1	76349322	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=84,117;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:7,3,5,0
chr1	76349534	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr1	76363505	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	76363755	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=98,4663;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:6,10,1,1
chr1	76378357	.	ATAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr1	76378641	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	76387991	.	A	AAGAGAGTTGTGGAGCCTATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.268:13:6,0:2,1:5,6,0,2
chr1	76397975	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=144,103;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:76397975_A_T:76397975:1,3,0,1
chr1	76397980	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=144,103;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:76397975_A_T:76397975:1,3,0,1
chr1	76878156	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	77509825	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr1	77510332	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=60,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:1,2,1,0
chr1	77515857	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,5:3,0:4,0,5,0
chr1	77558121	.	CC	TT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,0:18,2:19,17,1,1
chr1	77588033	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=136,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:7,0:15,4:11,11,0,4
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr1	77752726	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:11,0:13,5:14,11,0,5
chr1	77759380	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=93,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,3:2,0:2,0,4,0
chr1	77763480	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:5,0:9,5:5,9,5,0
chr1	77763542	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,1:0,10:0,0,5,6
chr1	77883482	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77883482_T_A:77883482:0,0,0,1
chr1	77883485	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77883482_T_A:77883482:0,0,0,1
chr1	77951907	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:0,1:0|1:77951907_G_C:77951907:2,0,1,0
chr1	77951930	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:2,0:4,1:0|1:77951907_G_C:77951907:4,2,1,1
chr1	77952119	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	77952156	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=290,188;MMQ=51,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:77952156_A_G:77952156:0,1,0,2
chr1	77952165	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=238,205;MMQ=38,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77952156_A_G:77952156:0,2,0,1
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=83.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,10:0,0,11,10
chr1	78024415	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=86,61;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:2,8,0,2
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=83.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr1	78034156	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,17;MFRL=154,250;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=21,15;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:0,0:0,2,0,1
chr1	78045189	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=139,120;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:5,3:10,0:9,7,4,0
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	78098241	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=79,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,0,2
chr1	78177446	.	CC	TT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:17,2:14,15,1,1
chr1	78184433	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=170,167;MMQ=46,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	78184440	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=205,151;MMQ=50,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	78191383	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:5,2:4,7,4,3
chr1	78196346	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:10,6,1,1
chr1	78196358	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:78196358_G_C:78196358:7,7,1,1
chr1	78196360	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:78196358_G_C:78196358:7,7,1,1
chr1	78196362	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:78196358_G_C:78196358:7,7,1,1
chr1	78196365	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:78196358_G_C:78196358:7,7,1,1
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	78399114	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=95,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.083:75:50,0:18,5:23,46,0,6
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr1	78408574	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:12,8,1,1
chr1	78422167	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr1	78432506	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=172,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr1	78471060	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	78546588	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78546588_TT_CC:78546588:0,4,0,1
chr1	78546591	.	A	AAAACAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78546588_TT_CC:78546588:0,4,0,1
chr1	78585174	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,4:7,0:1,17,1,3
chr1	78591601	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.161:24:11,2:9,0:9,11,4,0
chr1	78591663	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	79095473	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,0:13,3:13,9,1,2
chr1	79101176	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr1	79107449	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=142,47;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,4:5,0:8,5,4,0
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.689:30:8,10:1,11:3,6,11,10
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr1	79357360	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,82;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:3,3,3,2
chr1	79383300	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.371:14:8,3:1,2:8,1,3,2
chr1	79383374	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=117,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,2:19,0:0|1:79383374_C_G:79383374:14,18,0,2
chr1	79383377	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,2:18,0:0|1:79383374_C_G:79383374:14,19,0,2
chr1	79383378	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,2:18,0:0|1:79383374_C_G:79383374:14,19,0,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:5,2,5,3
chr1	79387242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr1	79403751	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr1	79411888	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=250,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	82302600	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	82409414	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:9,5,3,0
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	82417552	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	82431828	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,0:21,3:19,21,0,3
chr1	82431853	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:15,0:25,3:15,25,0,3
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,0,2,6
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,0,2,7
chr1	82452565	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:9,1:4,6:12,1,7,0
chr1	82456567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:8,8,2,1
chr1	84372134	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:6,2:3,1:2,7,2,1
chr1	84399521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=88,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:84399521_C_T:84399521:1,1,0,1
chr1	84399531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:84399521_C_T:84399521:1,2,0,1
chr1	84403777	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	84414475	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:84414475_T_C:84414475:0,1,0,1
chr1	84414476	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:84414475_T_C:84414475:0,1,0,1
chr1	84414481	.	A	AAAGAATGAAACCAGATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:84414475_T_C:84414475:0,2,0,1
chr1	84415767	.	T	TTAAGCAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	84639137	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=216,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr1	84640834	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	84764249	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=238,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr1	84765295	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=105,44;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,5:0.065:89:48,5:35,0:24,60,5,0
chr1	84765356	.	ATATT	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=122,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TATT;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:9,2:4,0:5,10,0,2
chr1	84765358	.	ATT	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=22,23;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.349:14:5,4:3,0:3,6,0,5
chr1	84765364	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,2:7,1:4,16,1,2
chr1	84765407	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr1	84791374	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:7,9:5,8:6,6,10,8
chr1	84815468	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,6:1,5:2,4,3,8
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr1	84956161	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.232:22:6,0:11,5:4,13,2,3
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	85031795	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	85113203	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	85113229	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr1	85122225	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85128262	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	85128290	.	G	GGGCAAGGACT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.241:6:1,1:4,0:0|1:85128290_G_GGGCAAGGACT:85128290:0,5,0,1
chr1	85128292	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.245:6:1,1:4,0:0|1:85128290_G_GGGCAAGGACT:85128290:0,5,0,1
chr1	85128305	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	85136768	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=127,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=85.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,5:0,13:0,0,5,16
chr1	85392324	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,10,9
chr1	85397136	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=109,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:19,1:18,2:19,18,0,3
chr1	85418307	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	85424474	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	85487839	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=103,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:4,0:17,6:10,11,0,6
chr1	85488030	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=845,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,6:1,9:0,1,7,8
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	85537652	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,2:24,0:0|1:85537652_T_TA:85537652:18,20,0,2
chr1	85537655	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,2:23,0:0|1:85537652_T_TA:85537652:18,20,0,2
chr1	85537661	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:14,2:22,0:17,21,0,2
chr1	85538655	.	A	G,AG	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=14,20,27;MFRL=159,116,129;MMQ=40,50,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.91,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,11:0.332,0.623:20:0,2,1:1,2,9:3,0,8,9
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chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=297,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr1	85575838	.	TAAA	T,TAAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=154,166,359;MMQ=60,60,50;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,15;RU=A;STR;TLOD=3.82,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.156,0.209:12:2,1,1:4,1,1:3,5,1,3
chr1	85583557	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=71,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.450:20:3,7:8,1:5,6,2,7
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.935:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr1	85592126	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,6:0,19:0,0,15,10
chr1	85595759	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=106,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:10,3:10,0:12,8,1,2
chr1	85595766	.	ATGG	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=114,40;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:11,0:0|1:85595766_ATGG_A:85595766:10,10,1,1
chr1	85595770	.	AACT	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=112,40;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:85595766_ATGG_A:85595766:9,10,1,1
chr1	85595777	.	AATGGC	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=108,40;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:10,0:0|1:85595766_ATGG_A:85595766:7,13,1,1
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,11,4
chr1	85648905	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	85725353	.	GCCGGAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGGAAA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,7,4
chr1	85787118	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0|1:85787114_A_T:85787114:4,2,3,2
chr1	85787323	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	85787334	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr1	85790567	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,0:11,3:4,13,0,3
chr1	85790633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	85817295	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,2:5,6:3,6,0,8
chr1	86047311	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:1,8,1,4
chr1	86119882	.	C	CCATCACCCACTCCCTGTAAGAACTCTGAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=166,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	86119890	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86119890_A_T:86119890:0,0,0,1
chr1	86119898	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:86119890_A_T:86119890:0,1,0,1
chr1	86123663	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=139,139;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86123663_T_C:86123663:0,1,0,1
chr1	86123667	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=139,139;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86123663_T_C:86123663:0,1,0,1
chr1	86123669	.	A	AAACAAACAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=139,139;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86123663_T_C:86123663:0,1,0,1
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	86173298	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr1	86200656	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:86200656_A_C:86200656:6,8,1,1
chr1	86200659	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=140,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:86200656_A_C:86200656:6,7,1,1
chr1	86200663	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:86200656_A_C:86200656:5,8,1,1
chr1	86200664	.	G	GAC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:86200656_A_C:86200656:5,8,1,1
chr1	86200669	.	GC	CT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:2,2:0|1:86200656_A_C:86200656:4,6,1,1
chr1	86200748	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	86210495	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,0:3,10:2,3,0,11
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	86249286	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr1	86249735	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,3:4,3:3,1,4,2
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	86306992	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=102,130;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:3,0:19,2:4,18,0,2
chr1	86342808	.	C	CTGGAGAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=89,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:4,3:16,0:10,10,1,2
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:1,8,1,2
chr1	86362196	.	T	TCCA,TTTCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26,29;MFRL=0,171,171;MMQ=60,60,60;MPOS=4,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr1	86362199	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	86435850	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:6,4:3,8:6,3,11,2
chr1	86435957	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:6,2:4,14,0,3
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr1	86482922	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=48,276;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:2,3:3,1:1,4,2,2
chr1	86487981	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr1	86487992	.	A	AACAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=71.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,10:0,0,6,11
chr1	86488232	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=72,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:3,15:8,7:6,5,12,10
chr1	86554813	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=73,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.361:24:4,4:9,3:0|1:86554813_G_GA:86554813:10,5,7,2
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=106,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.564:30:3,8:10,9:0|1:86554813_G_GA:86554813:8,5,14,3
chr1	86554954	.	AA	CC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=103,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:8,0:21,3:0|1:86554954_AA_CC:86554954:5,24,0,3
chr1	86554960	.	A	ATG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=103,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:7,0:19,3:0|1:86554954_AA_CC:86554954:5,22,0,3
chr1	86554963	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=103,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:7,0:18,3:0|1:86554954_AA_CC:86554954:5,20,0,3
chr1	86578329	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=120,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:86578329_T_C:86578329:7,8,1,1
chr1	86578334	.	G	GTCCATATCCTTCAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=120,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:86578329_T_C:86578329:5,8,1,1
chr1	86590509	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	86590915	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr1	86621992	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:2,1:3,7:4,1,3,5
chr1	86814445	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:5,6:10,7:8,7,11,2
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=93,251;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:6,2,0,3
chr1	86824594	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,2:10,0:0|1:86824594_G_GA:86824594:1,20,1,1
chr1	86824598	.	C	CTGAAGCAG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:86824594_G_GA:86824594:1,21,1,1
chr1	86834454	.	CATT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATT;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=145,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	86891005	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:12,6:1,5:9,4,8,3
chr1	86891205	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:4,0:0|1:86891205_C_A:86891205:1,8,0,2
chr1	86891206	.	ACC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0|1:86891205_C_A:86891205:1,8,0,2
chr1	86896706	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	86897970	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:86897970_T_A:86897970:1,0,2,0
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:86897970_T_A:86897970:1,0,2,0
chr1	86900491	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr1	86900525	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr1	86909703	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,2:1,4:1,1,1,5
chr1	86909713	.	T	TGCATTTAATCTTTTTCTTTTTTGAGATGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=104,140;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	86921014	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:12,2:15,11,2,0
chr1	86934903	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86934903_GA_CC:86934903:0,0,0,1
chr1	86934910	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86934903_GA_CC:86934903:0,0,0,1
chr1	86934911	.	C	CAACATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86934903_GA_CC:86934903:0,0,0,1
chr1	86939130	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,16,12
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr1	86952324	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,12,13
chr1	86954912	.	A	AGGCAG	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=27,27;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:86954912_A_AGGCAG:86954912:0,4,0,1
chr1	86954915	.	G	GTGC	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=34,31;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:86954912_A_AGGCAG:86954912:0,4,0,1
chr1	86954916	.	A	ACCAGAC	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=27,23;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:86954912_A_AGGCAG:86954912:0,4,0,1
chr1	86954925	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,2,0,1
chr1	86954927	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,34;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,2,0,1
chr1	86954931	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=34,34;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,2,0,1
chr1	86954936	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,1,0,1
chr1	86954939	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,0,0,1
chr1	86954940	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,0,0,1
chr1	86954947	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,0,0,1
chr1	86954950	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86954925_G_A:86954925:0,0,0,1
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	86959258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:2,4:5,4:4,3,5,3
chr1	86959361	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=250,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	86961157	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:3,3,6,1
chr1	86965801	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:4,3,4,2
chr1	87040467	.	C	CTGCCTTCCTTCCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:5,11:5,10:5,6,11,10
chr1	87099909	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:5,2:10,4:12,3,4,2
chr1	87102521	.	GGAGTATTTGAT	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:22,2:17,0:23,20,1,1
chr1	87189937	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:11,0:18,0,4,0
chr1	87200729	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,131;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,1,2
chr1	87208953	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,5:3,9:1,4,3,11
chr1	87333872	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=244,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	87368917	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:4,0,6,3
chr1	87369176	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr1	87379637	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:6,1,3,0
chr1	87379833	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.264:34:12,0:13,7:9,16,0,9
chr1	87380631	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	87380851	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=95,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,6:7,2:7,11,4,4
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,2:2,6:3,2,7,1
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,6:3,2:7,2,4,4
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,1,4
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:7,1,6,3
chr1	87805343	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	87810583	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr1	89225976	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,21:0,0,17,16
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,11,6
chr1	89279394	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,3:8,0:6,14,2,1
chr1	89352872	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	89357054	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=215,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	89408797	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:1,8,3,7
chr1	89415000	.	C	CGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	89420954	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,217;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,0:7,3:1,8,0,3
chr1	89427152	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:18,0:8,5:8,19,0,5
chr1	89449508	.	AT	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=100,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,20:0.354:55:19,8:14,11:19,16,10,10
chr1	89453915	.	TGTAA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAA;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:19,0:23,2:29,16,2,0
chr1	89475230	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,158;MMQ=49,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	89478854	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=90,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:6,7:11,4:13,5,5,6
chr1	89479063	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:2,5,1,7
chr1	89519075	.	GTCTGGAGATCCTGTA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:11,0:12,2:12,23,1,1
chr1	89520329	.	GAAAAAC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,147;MMQ=56,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,7:1,2:3,1,8,1
chr1	89520574	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr1	89520636	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=181,162;MMQ=40,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,6:2,0:0|1:89520636_G_A:89520636:1,2,3,3
chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=181,148;MMQ=40,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:0|1:89520636_G_A:89520636:1,2,3,2
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:2,1,3,2
chr1	89522646	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=100,134;MMQ=50,44;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,3:3,1,3,3
chr1	89524657	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=106,80;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,4:5,9,7,4
chr1	89525966	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=74,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.447:43:8,10:14,9:14,10,8,11
chr1	89525976	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=126,69;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:11,5:19,0:15,15,4,1
chr1	89574026	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	89582804	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,92;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:8,9:11,0:12,7,7,2
chr1	89583544	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	89614879	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	89614950	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.408:10:1,0:4,3:6,0,2,2
chr1	89615941	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=186,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr1	89618472	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.721:12:1,2:0,3:1,3,4,4
chr1	89630371	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:1,4:7,0:7,1,4,0
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	89652071	.	TC	CT	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=81,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.136:27:12,2:10,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:14,10,0,3
chr1	89652075	.	CC	TT	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=73,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,5:0.259:21:9,0:7,5:1|0:89652071_TC_CT:89652071:8,8,1,4
chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=76,115;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:6,2:10,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:8,11,0,3
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=76,115;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:6,2:13,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:8,12,1,2
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=86,115;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:5,2:12,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:6,13,1,2
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=86,154;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:5,2:13,0:0|1:89652071_TC_CT:89652071:6,13,2,1
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=86,127;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,1:13,1:0|1:89652097_C_T:89652097:5,14,2,0
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=94,127;MMQ=60,47;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,1:11,1:0|1:89652097_C_T:89652097:6,14,2,0
chr1	89652846	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	89654407	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,0:11,5:9,10,0,6
chr1	89658678	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=123,128;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:5,11,0,3
chr1	89659134	.	CTTCATTCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=TTCA;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr1	89661137	.	T	TTCCATCACGACCAATCTCTCTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.313:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr1	89834221	.	AGTG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GTG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:6,1:10,7,1,1
chr1	89844040	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:10,1:13,9,2,0
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr1	89847496	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=87,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,3:12,0:9,12,2,1
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr1	89849340	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:0|1:89849340_G_T:89849340:9,12,1,1
chr1	89849345	.	G	GCCA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:89849340_G_T:89849340:9,13,1,1
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:1,8:0,11:1,0,6,13
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	89849657	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=100,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:18,3:16,1:24,11,3,1
chr1	89851100	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.706:1:0,0:0,0:0|1:89851100_GT_G:89851100:0,0,0,1
chr1	89851118	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=261,203;MMQ=49,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89851100_GT_G:89851100:0,1,0,1
chr1	89851123	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=261,203;MMQ=49,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89851100_GT_G:89851100:0,1,0,1
chr1	90048132	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	90178743	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=41,125;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,12:1,9:0,1,9,13
chr1	90398642	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=110,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:7,7,2,0
chr1	90401405	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:4,1,2,1
chr1	90482803	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	90483014	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=104,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:24,0:16,5:23,18,1,4
chr1	91178266	.	TGC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:91178266_TGC_T:91178266:0,6,0,2
chr1	91178272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:91178266_TGC_T:91178266:0,6,0,2
chr1	91383688	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:91383688_A_C:91383688:8,11,1,1
chr1	91383694	.	T	TTCTTTTGTTTCTTTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:91383688_A_C:91383688:7,9,1,1
chr1	91447985	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	91726888	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,2:12,1:8,11,2,1
chr1	91726936	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:0|1:91726936_G_C:91726936:1,8,1,1
chr1	91726946	.	CT	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:7,2:0|1:91726936_G_C:91726936:1,9,1,1
chr1	91727781	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,7:6,2:4,4,6,3
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr1	91739414	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	91781506	.	C	CAT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:7,2:0|1:91781506_C_CAT:91781506:9,13,1,1
chr1	91781508	.	T	TTTG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:7,2:0|1:91781506_C_CAT:91781506:10,13,1,1
chr1	91781510	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:5,2:0|1:91781506_C_CAT:91781506:10,13,1,1
chr1	91781644	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,6:6,6:5,2,9,3
chr1	91782031	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,0,2
chr1	91788846	.	C	CCCTGGATATTCAGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	91816488	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=11,27;MFRL=124,847;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=61.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	91850641	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:2,0:9,2:10,2,2,0
chr1	91862051	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=89.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,2,25
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	92163786	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=327,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	92174260	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,13,6
chr1	92181882	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:7,9,3,0
chr1	92184814	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	92185461	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=80,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:10,6,1,1
chr1	92185477	.	G	A,C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20,20;MFRL=89,74,62;MMQ=60,60,60;MPOS=24,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.21,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,4,2:0.207,0.120:21:8,2,0:7,2,2:9,6,3,3
chr1	92185478	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=80,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:11,9,1,1
chr1	92187512	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:6,3,2,0
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:92200593_A_G:92200593:0,2,0,2
chr1	92200597	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1|0:92200593_A_G:92200593:0,2,0,2
chr1	92430342	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=116,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:15,13,2,0
chr1	92447227	.	GAGC	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.238:27:9,1:11,5:7,14,2,4
chr1	92456623	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,256;MMQ=60,53;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	92467741	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=199,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,1:1,5:0,1,0,7
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,5:1,2:1,2,1,6
chr1	92647590	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=126,112;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,0:7,5:10,6,0,5
chr1	92710491	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=67294601,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	92712574	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=280,96;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr1	92713348	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	92729286	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:1,2:8,0:6,3,1,1
chr1	92729291	.	T	TTTAGCAGGGATCTTACCTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:6,3,1,1
chr1	92732104	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=194,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:6,3,1,1
chr1	92754667	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=103,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:0,7:8,1:5,3,5,3
chr1	92763091	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.315:23:5,2:9,5:3,13,0,7
chr1	92763105	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,1:0|1:92763105_A_C:92763105:2,20,1,1
chr1	92763108	.	CAAA	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,0:13,1:0|1:92763105_A_C:92763105:2,20,1,1
chr1	92763436	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:22,5:23,0:25,20,5,0
chr1	92765880	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=200,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0,2,0,2
chr1	92789080	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=92,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,4:12,0:7,12,4,0
chr1	92852504	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=208,124;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	93073188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr1	93073228	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr1	93159821	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:5,3:17,1:11,16,3,2
chr1	93160002	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	93163633	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	93167796	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=103,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:2,8,0,2
chr1	93167854	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	93168990	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr1	93170137	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,8:10,0:10,8,1,7
chr1	93306048	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:5,2,1,2
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,7,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,8,0
chr1	93426874	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,8,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,3,16
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=197,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,7:1,5:1,0,8,4
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,14,10
chr1	93581088	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=103,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:7,0:13,4:12,8,0,4
chr1	93583818	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:1,3:0,1:11,0,4,0
chr1	93583830	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:6,9:3,0:9,0,10,0
chr1	93584870	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:2,2:4,4:5,3,5,1
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	93646295	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.202:26:11,4:10,0:15,6,5,0
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	93672723	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.966:23:0,7:0,16:0,0,11,12
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=202,199;MMQ=40,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:0,1,0,7
chr1	93687528	.	CTTT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:14,1:6,1:10,14,1,2
chr1	93691855	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,30,20,33;MFRL=123,135,99,106;MMQ=60,60,60,60;MPOS=6,17,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.45,3.17,7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,7,7,5:0.217,0.197,0.200:30:7,2,6,2:2,4,0,1:8,3,12,7
chr1	93697961	.	GAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	93698077	.	A	AAACAGTTCCTG	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:17,2:24,0:26,18,1,1
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:1,3,3,5
chr1	93712532	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,254;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,2:9,1:1,13,0,3
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=73.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,11:0,0,11,13
chr1	94009615	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:11,21:9,0:17,3,21,0
chr1	94018103	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr1	94033491	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=164,138;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr1	94033509	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=190,147;MMQ=58,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	94041612	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,2:4,0:7,8,1,1
chr1	94041625	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:10,8:1,4:5,6,7,5
chr1	94041787	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	94079543	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=94.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.974:33:0,11:0,22:0,0,16,17
chr1	94312509	.	AAG	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=25,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,2:19,0:0|1:94312509_AAG_A:94312509:6,19,1,1
chr1	94312513	.	A	AC	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=23,20;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:16,0:0|1:94312509_AAG_A:94312509:5,20,1,1
chr1	94312515	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=29,20;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:18,0:0|1:94312509_AAG_A:94312509:5,20,1,1
chr1	94312521	.	A	ACACCACAT	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=24,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:0|1:94312509_AAG_A:94312509:3,19,1,1
chr1	94312522	.	G	GCAAC	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,1:14,0:0|1:94312509_AAG_A:94312509:3,19,1,1
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,4:0,9:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,14
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=65.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,10:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,15
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,9:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,13
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,3:0,8:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,12
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=13;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,7
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	.	.	DP=7;ECNT=13;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,7
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=13;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,7
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	94343023	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr1	94476388	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,5:5,5:3,2,5,5
chr1	94476555	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr1	94476991	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=74,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	94485239	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=101,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:12,10,3,1
chr1	94486796	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:11,3:5,0:7,9,4,0
chr1	94487018	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,243;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:4,14:3,0:3,4,0,15
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=69,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:12,4:8,5:6,14,2,7
chr1	94487354	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,1:6,4:8,7,2,3
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	94496602	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:3,4,5,6
chr1	94506868	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,0:9,3:9,8,1,2
chr1	94508503	.	G	GTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:0,1:4,0:0,4,1,0
chr1	94508522	.	AA	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	94512564	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=113,251;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,16:0.279:58:33,0:7,15:7,35,0,16
chr1	94526157	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,90;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,3:9,0:9,6,2,1
chr1	94544135	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,4:0,4:0,0,4,8
chr1	94544276	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr1	94544326	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	94544805	.	TCACA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=CA;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:4,0:12,6,3,0
chr1	94549083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	94568491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	94639378	.	CACAAAATAACACAACAACA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=207,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:4,0,1,0
chr1	94639852	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=70,46;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:94639852_T_A:94639852:5,10,1,1
chr1	94639860	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=70,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:94639852_T_A:94639852:5,12,1,1
chr1	94639863	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=70,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:94639852_T_A:94639852:5,12,1,1
chr1	94639864	.	TCCCC	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=70,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,1:0|1:94639852_T_A:94639852:5,14,1,1
chr1	94639871	.	T	TCAAA	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=85,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:8,2:0|1:94639852_T_A:94639852:4,10,1,1
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,4:0,0,0,8
chr1	94668046	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	94670784	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:94941376_G_A:94941376:0,0,0,7
chr1	94941393	.	A	ACACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,0:0|1:94941376_G_A:94941376:0,2,0,1
chr1	94944125	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.074:51:31,0:17,3:20,28,1,2
chr1	94944134	.	TG	CA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=114,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:32,0:12,2:16,31,1,1
chr1	94948864	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:9,1:6,17,0,2
chr1	94964139	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=95,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.443:12:2,3:3,1:5,2,4,1
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,262;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	95293005	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,2:0,3:1,0,3,2
chr1	95294089	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:5,6,2,1
chr1	95303331	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=115,136;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,4:10,0:13,7,4,0
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr1	95322949	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=115,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:10,6:6,5:6,10,7,4
chr1	95358096	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:95358096_A_G:95358096:0,0,1,5
chr1	95358113	.	C	CATCCTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:95358096_A_G:95358096:0,4,0,1
chr1	95358114	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:95358096_A_G:95358096:0,4,0,1
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	95367649	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr1	95367894	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	95614215	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:2,0:2,2,5,2
chr1	97189216	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:97189216_AG_A:97189216:0,3,0,2
chr1	97189219	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:97189216_AG_A:97189216:0,3,0,2
chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	97278804	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr1	97544771	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	97547831	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	98039541	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr1	98060525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	99127392	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr1	99150696	.	C	CCCCCTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:99150696_C_CCCCCTA:99150696:0,1,0,1
chr1	99150699	.	T	TCTAAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:99150696_C_CCCCCTA:99150696:0,2,0,1
chr1	99150703	.	A	AAAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99150696_C_CCCCCTA:99150696:0,2,0,1
chr1	99150704	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99150696_C_CCCCCTA:99150696:0,2,0,1
chr1	99150708	.	G	GAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,7;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99150696_C_CCCCCTA:99150696:0,2,0,1
chr1	99156634	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:4,7:1,0:3,2,4,4
chr1	99164246	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,252;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.387:6:2,2:1,0:4,0,2,0
chr1	99225759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:99225759_C_T:99225759:0,2,0,1
chr1	99225762	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99225759_C_T:99225759:0,2,0,1
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	99418925	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:5,0:0,2:0|1:99418925_G_C:99418925:0,5,1,1
chr1	99418950	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:99418925_G_C:99418925:0,0,0,1
chr1	99418952	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:99418925_G_C:99418925:0,0,0,1
chr1	99418955	.	TT	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	99470269	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr1	99753705	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:0,2,2,8
chr1	99764689	.	C	CACAACAGGCCACACCATGCCACAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=98.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,21,10
chr1	100154899	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=59,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:4,7:1,6:3,2,8,5
chr1	100155141	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=77,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.219:25:15,0:5,5:13,7,1,4
chr1	100155298	.	AAAT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=86,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:14,0:8,15,0,2
chr1	100185282	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,1,2
chr1	100203571	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=162,163;MMQ=43,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr1	100203597	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=105,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,0:11,4:6,9,3,2
chr1	100206569	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	100207779	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:100207779_G_A:100207779:11,12,1,1
chr1	100207785	.	AA	TT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:11,2:0|1:100207779_G_A:100207779:11,13,1,1
chr1	100207791	.	TG	CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:10,2:0|1:100207779_G_A:100207779:9,13,1,1
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	100335883	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	100335989	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:13,3:7,0:13,7,1,2
chr1	100342227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=296209,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,2,4
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,8:4,3:5,2,7,4
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	100366446	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.735:5:0,0:0,4:0,1,0,4
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=127,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0|1:100376448_G_A:100376448:1,8,0,4
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=127,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:100376448_G_A:100376448:1,5,0,4
chr1	100379143	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.146:20:7,0:8,3:0|1:100379143_A_G:100379143:7,10,1,2
chr1	100379148	.	T	TAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=133,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.140:21:6,0:9,3:0|1:100379143_A_G:100379143:8,10,1,2
chr1	100379149	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.147:20:6,0:10,3:0|1:100379143_A_G:100379143:7,10,1,2
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	100525442	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,2:15,0:16,11,1,1
chr1	100533596	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=122,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:12,10,0,2
chr1	100542702	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=85,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,3:3,1:5,1,4,0
chr1	100572367	.	G	GGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,1:10,0,3,0
chr1	100572613	.	GTAT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.503:12:1,3:5,3:2,4,0,6
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,9,19
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	100620657	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:9,5:9,0:10,9,5,0
chr1	100620780	.	CAATT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=35929,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATT;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,4:2,0:0,2,1,3
chr1	100620846	.	G	GTATCTGATGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	100624014	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=137,227;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100624014_G_A:100624014:0,1,0,1
chr1	100624024	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=137,227;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100624014_G_A:100624014:0,1,0,1
chr1	100671867	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:1,0:3,2:1,5,0,3
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	100731819	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0|1:100731819_C_CA:100731819:0,0,5,0
chr1	100731820	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.868:5:0,2:0,1:0|1:100731819_C_CA:100731819:0,0,5,0
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.855:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,10:1,8:1,0,14,4
chr1	100961732	.	TC	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=234,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	101006577	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=177,106;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:1,5:2,7:1,3,7,5
chr1	101203664	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=110,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,2:2,6:2,0,5,4
chr1	101203698	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,0:7,5:3,5,2,3
chr1	101342497	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	101362253	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:101362253_G_C:101362253:2,14,1,1
chr1	101362259	.	G	GTCGC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:101362253_G_C:101362253:2,13,1,1
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	101387477	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=171,134;MMQ=50,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr1	101456287	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=324,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	101467112	.	ACAAT	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:11,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:3,13,2,0
chr1	101467119	.	A	AGCTG	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:3,10,2,0
chr1	101467120	.	AAC	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:3,10,2,0
chr1	101467125	.	TCTCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:8,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:1,12,2,0
chr1	101467132	.	A	AAGG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=141,53;MMQ=60,60;MPOS=-11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:1,11,2,0
chr1	101467134	.	ACTTATAT	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=26,0;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:6,0:0|1:101467112_ACAAT_A:101467112:1,12,2,0
chr1	101487373	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,16;MFRL=216,87;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=AC;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr1	101704496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	101704532	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	101704598	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.282:22:3,5:13,0:10,6,6,0
chr1	101705773	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:12,6,1,2
chr1	101706301	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:16,4:2,0:12,6,4,0
chr1	101707147	.	AGTGAAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=265,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:101707147_AGTGAAGG_A:101707147:0,1,0,1
chr1	101707157	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=265,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:101707147_AGTGAAGG_A:101707147:0,1,0,1
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,1:0,8:0,1,1,8
chr1	102296144	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	102302360	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	103354115	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:1,7:8,10:7,2,9,9
chr1	103354135	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:9,3:6,9:0|1:103354135_G_C:103354135:9,6,9,3
chr1	103354138	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:8,3:5,9:0|1:103354135_G_C:103354135:9,6,9,3
chr1	103354939	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TG;STR;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	103356072	.	CA	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=93,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.472:19:6,6:3,3:4,6,3,6
chr1	103356107	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr1	103379870	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=84,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,3:4,1:4,9,2,2
chr1	103380379	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.636:25:5,5:3,5:1,9,4,11
chr1	103380393	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=87,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:10,1:5,8:2,13,3,6
chr1	103381129	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:6,3,6,1
chr1	103388995	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,1:12,5:1,18,0,6
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	103404537	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,4:4,0:8,1,4,0
chr1	103405793	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	103427381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	103444497	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=90,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:10,3:9,10:8,11,8,5
chr1	103444679	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,3:3,4,1,4
chr1	103449598	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	103453379	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	103467596	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,2,3
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	103468767	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:7,12:14,5:13,8,13,4
chr1	103468855	.	TAA	T,TA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,28,28;MFRL=139,124,116;MMQ=60,60,60;MPOS=28,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=5.34,11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,6:0.180,0.318:19:5,0,2:4,3,4:2,8,0,9
chr1	103470034	.	CCA	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:15,0:0|1:103470034_CCA_C:103470034:15,11,0,2
chr1	103470039	.	T	TCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=126,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,2:14,0:0|1:103470034_CCA_C:103470034:15,11,0,2
chr1	103470044	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,1:12,0:0|1:103470034_CCA_C:103470034:11,10,0,2
chr1	103471456	.	CCAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAT;STR;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.930:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	103471734	.	AAAAT	A,AAAATAAATAAAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28,26;MFRL=109,118,146;MMQ=60,60,54;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,9;RU=AAAT;STR;TLOD=5.75,26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,7:0.141,0.425:16:4,1,5:2,1,2:2,5,3,6
chr1	103481226	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:8,4:11,1:12,7,5,0
chr1	103481360	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	103481391	.	AATTTGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTTGC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:2,3:0,1:1,1,0,6
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr1	103496805	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr1	103544191	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=78,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,5:5,2:9,3,4,3
chr1	103544254	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=114,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:6,2:0|1:103544254_C_T:103544254:11,9,1,1
chr1	103544259	.	G	GTGTAGCTTTTGCTGTTTGTATTGGATAT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,1:0|1:103544254_C_T:103544254:11,10,1,1
chr1	103544434	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=110,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.287:15:4,3:7,1:6,5,1,3
chr1	103544464	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:14,0:3,12:0,18,0,12
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	104116312	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=73,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:7,4:3,5:8,3,8,1
chr1	107601015	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,636;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:25,4:8,0:11,23,0,4
chr1	107963847	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0|1:107963847_TG_T:107963847:0,6,1,1
chr1	107963850	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0|1:107963847_TG_T:107963847:0,6,1,1
chr1	107979396	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr1	108023196	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=73,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0|1:108023196_G_C:108023196:0,3,4,0
chr1	108023198	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,22;MFRL=73,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:2,1:0|1:108023196_G_C:108023196:0,3,4,0
chr1	108023202	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=73,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:2,1:0|1:108023202_A_C:108023202:0,5,4,0
chr1	108023206	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=105,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:1,1:5,3:0|1:108023202_A_C:108023202:1,6,4,0
chr1	108023211	.	TA	CC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=89,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,1:5,2:0|1:108023202_A_C:108023202:1,7,4,0
chr1	108023215	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=73,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:2,0:6,0:0|1:108023202_A_C:108023202:2,7,3,0
chr1	108139037	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=252,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108139037_T_C:108139037:0,1,0,1
chr1	108139038	.	A	AGCTCATTCTGAAAGAAAGTGGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=252,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108139037_T_C:108139037:0,1,0,1
chr1	108160260	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=79,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.534:23:4,5:1,3:4,7,1,11
chr1	108247346	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr1	108299775	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=TG;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.702:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:6,5:3,12:6,3,12,5
chr1	108771721	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=116,169;MMQ=60,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:13,7:12,1:14,11,3,5
chr1	109167372	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:7,2:0|1:109167372_T_G:109167372:8,6,1,1
chr1	109167380	.	TG	GA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:109167372_T_G:109167372:6,6,1,1
chr1	109167384	.	G	GAGGGAAGGTCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:109167372_T_G:109167372:6,6,1,1
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr1	109177797	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:109177797_C_T:109177797:4,16,1,1
chr1	109177799	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:109177797_C_T:109177797:4,16,1,1
chr1	109177802	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,10:0.458:22:6,6:6,4:1|0:109177797_C_T:109177797:4,8,1,9
chr1	109177808	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:109177797_C_T:109177797:4,14,1,1
chr1	109177809	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:109177797_C_T:109177797:4,14,1,1
chr1	109187229	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	109200186	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:9,14,1,1
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	109261321	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr1	109265029	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr1	109273456	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:1,5,2,4
chr1	109289353	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.459:28:6,7:9,4:12,3,8,5
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:1,2:5,5:0,6,0,8
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:2,8,1,1
chr1	109302589	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:12,2:12,1:16,8,2,1
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr1	109350205	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=127,115;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:0|1:109350205_T_A:109350205:7,4,0,4
chr1	109350209	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=128,115;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:6,0:6,4:0|1:109350205_T_A:109350205:7,5,0,4
chr1	109363140	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=97,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr1	109363232	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.341:19:3,3:7,3:8,5,2,4
chr1	109366370	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=74,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:3,4:7,5:4,6,7,2
chr1	109377157	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109391472	.	ATGGTTTCTCATGTGTGAATT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:5,0:7,9,1,1
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,6:0,0,7,7
chr1	109394552	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=78,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:17,2:8,0:0|1:109394552_G_T:109394552:13,12,1,1
chr1	109394556	.	CCTGA	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=88,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:16,2:7,0:0|1:109394552_G_T:109394552:12,12,1,1
chr1	109474028	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=101,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:13,4:2,0:10,5,4,0
chr1	109479989	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:109479989_C_T:109479989:5,9,1,1
chr1	109479997	.	T	TGTTTGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=154,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:109479989_C_T:109479989:5,10,1,1
chr1	109482182	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,183;MMQ=40,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr1	109482358	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=92,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.163:41:11,6:24,0:20,15,6,0
chr1	109482485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=161,1083190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	109525421	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,0:7,3:3,6,0,3
chr1	109526090	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=113,114;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:3,3:2,12,0,3
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	109545078	.	A	AAAACTTAACTATTGACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=209,241;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	109554404	.	GAC	AGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr1	109554416	.	A	AGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:109554416_A_AGC:109554416:0,2,0,2
chr1	109554418	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:109554416_A_AGC:109554416:0,2,0,2
chr1	109554419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:109554416_A_AGC:109554416:0,2,0,2
chr1	109554421	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:109554416_A_AGC:109554416:0,2,0,2
chr1	109618558	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,43183376;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,0:15,2:14,10,1,1
chr1	109618578	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=133,67;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:8,0:17,6:12,13,1,5
chr1	109650611	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:26,0:14,4:20,20,0,4
chr1	109655409	.	T	TGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=160,32;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,0:0|1:109655409_T_TGG:109655409:0,6,1,1
chr1	109655410	.	T	TGTTGGCTAGTTGAGTCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=160,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:109655409_T_TGG:109655409:0,6,1,1
chr1	109714636	.	G	GGT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:12,0:12,12,1,1
chr1	109731805	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:3,9,1,2
chr1	109734157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.900:17:0,3:1,13:1,0,6,10
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	109740310	.	AGT	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.191:13:5,1:5,1:1,10,0,2
chr1	109740333	.	G	GTATACA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=114,127;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:5,1:6,1:0|1:109740333_G_GTATACA:109740333:1,10,0,2
chr1	109740335	.	G	GCA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=114,127;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:0|1:109740333_G_GTATACA:109740333:1,10,0,2
chr1	109740339	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0|1:109740339_G_T:109740339:0,4,0,2
chr1	109740341	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,1:2,1:0|1:109740339_G_T:109740339:0,4,0,2
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr1	109743622	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	109773705	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=18,26;MFRL=100,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,1:0,1:0|1:109773705_ATT_A:109773705:0,2,0,2
chr1	109773709	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=100,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:2,0:0,1:0|1:109773705_ATT_A:109773705:0,2,0,2
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	109792735	.	A	ACGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,20;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CGC;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.756:5:0,0:0,2:1,0,2,2
chr1	109804544	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:7,6,0,2
chr1	109805327	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=243,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	109806442	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,366;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,1:1,3:2,0,5,0
chr1	109813092	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,0:9,3:10,11,0,3
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:3,4:3,0:1,6,1,3
chr1	109813296	.	C	CGTTGGCCTCCCAAAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=239,177;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	109813510	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	109813719	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr1	109815002	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,1,1
chr1	109815067	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109815067_G_A:109815067:0,4,0,1
chr1	109815069	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109815067_G_A:109815067:0,4,0,1
chr1	109815071	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:109815067_G_A:109815067:0,4,0,1
chr1	109815967	.	GGCACCCCCA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:6,0:7,2:0|1:109815967_GGCACCCCCA_G:109815967:3,11,0,2
chr1	109815979	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:109815967_GGCACCCCCA_G:109815967:1,11,0,2
chr1	109815983	.	GAGCTCCCCT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:109815967_GGCACCCCCA_G:109815967:2,11,0,2
chr1	109816003	.	CT	AG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:2,10,0,2
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0|1:109816176_A_C:109816176:0,0,5,6
chr1	109816178	.	G	GCCCCCCCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,14;RU=C;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:5,2:2,1:0|1:109816176_A_C:109816176:1,6,3,0
chr1	109816185	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:5,2:2,0:0|1:109816176_A_C:109816176:1,6,3,0
chr1	109823766	.	TGCTCTCCCACTGGGCCCG	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:13,0:15,3:20,20,1,2
chr1	109837928	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,43;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:109837928_C_T:109837928:2,9,1,1
chr1	109837937	.	G	GAGAATTGTTTAAATCCA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,2:0|1:109837928_C_T:109837928:2,9,1,1
chr1	109837943	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=80,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:4,2:0|1:109837928_C_T:109837928:1,8,1,1
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,11:0,0,8,6
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,13:0,21:0,0,14,21
chr1	109839433	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0,0,14,10
chr1	109839954	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	109840751	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:109840751_G_A:109840751:2,2,0,1
chr1	109840758	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:109840751_G_A:109840751:2,2,0,1
chr1	109840947	.	C	CCCGGGTGTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	109840950	.	C	CCACTCCAGGTGCACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	109860638	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0,6,2,0
chr1	109869812	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0|1:109869812_CA_C:109869812:1,5,1,1
chr1	109869816	.	TAG	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0|1:109869812_CA_C:109869812:1,5,1,1
chr1	109869820	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:109869812_CA_C:109869812:1,5,1,1
chr1	109869825	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:109869812_CA_C:109869812:0,5,1,1
chr1	109883383	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,5:10,4:7,6,4,5
chr1	109883504	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:5,5,1,1
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	109897103	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,7:0,1:0,0,4,5
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	110009654	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr1	110021972	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	110022195	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:6,3:2,13,1,2
chr1	110031078	.	GACCTGCA	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=126,30;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.162:17:5,0:9,2:0|1:110031078_GACCTGCA_G:110031078:8,7,1,1
chr1	110031089	.	TAACCCCCTTCCCACTGCA	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=130,30;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:8,2:0|1:110031078_GACCTGCA_G:110031078:6,9,1,1
chr1	110031109	.	GGTGAGGGAGGACAGCACAGGGCTTGCC	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=139,30;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.191:14:3,0:6,2:0|1:110031078_GACCTGCA_G:110031078:4,8,1,1
chr1	110031188	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=192,990;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr1	110051516	.	GGTCACGGTGGGGGTGCATAGT	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:14,2:15,0:13,26,1,1
chr1	110129582	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	110141577	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,3:12,0:11,10,4,0
chr1	110153100	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,5:10,0:6,14,0,5
chr1	110163604	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:16,3:22,0:24,14,0,3
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:11,4:2,2:6,8,5,1
chr1	110169105	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110169105_C_A:110169105:1,0,0,1
chr1	110169106	.	C	CTACTCTAAAAGTCATTAAATCATAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110169105_C_A:110169105:1,0,0,1
chr1	110169108	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110169105_C_A:110169105:1,0,0,1
chr1	110169467	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,24;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:0|1:110169467_G_A:110169467:7,14,1,1
chr1	110169470	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,24;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:0|1:110169467_G_A:110169467:7,14,1,1
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:8,1:1,3:1,9,3,1
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:3,1,2,1
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:8,0,3,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=106,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:8,1,3,1
chr1	110172845	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=127,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:1,0:6,1:6,1,2,1
chr1	110173021	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:16,0:4,1:0|1:110173021_T_G:110173021:3,17,1,1
chr1	110173023	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,19;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,0:4,1:0|1:110173021_T_G:110173021:3,17,1,1
chr1	110200360	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:9,17:13,4:12,10,13,8
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,20:0,14:0,0,19,15
chr1	110201699	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,13:0,0,10,13
chr1	110201760	.	GA	CC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=133,189;MMQ=34,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,3:8,0:0|1:110201760_GA_CC:110201760:5,11,0,3
chr1	110201762	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=133,189;MMQ=34,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:0|1:110201760_GA_CC:110201760:5,11,0,3
chr1	110201763	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=133,189;MMQ=34,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,3:8,0:0|1:110201760_GA_CC:110201760:5,11,0,3
chr1	110201809	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,4,12
chr1	110201812	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,4,12
chr1	110210671	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,15:0,0,16,8
chr1	110210810	.	C	CGAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,0:2,2:0|1:110210810_C_CGAG:110210810:3,0,1,1
chr1	110210814	.	G	GATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:110210810_C_CGAG:110210810:3,1,1,1
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,220;MMQ=27,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr1	110211835	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=271,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	110233138	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,21;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	110251178	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,10:0.275:38:13,0:14,10:0|1:110251178_C_T:110251178:10,18,0,10
chr1	110251183	.	CC	TT	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:13,0:23,2:9,27,1,1
chr1	110251185	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,10:0.275:38:13,0:15,10:0|1:110251178_C_T:110251178:10,18,0,10
chr1	110251206	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:0|1:110251206_T_C:110251206:6,11,1,1
chr1	110251208	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:110251206_T_C:110251206:6,11,1,1
chr1	110255174	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=183,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	110279821	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,2:4,5:4,6,3,4
chr1	110280646	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,0:6,4:6,1,2,2
chr1	110280665	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,0:6,4:10,1,2,2
chr1	110281941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:4,0,3,0
chr1	110282495	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:4,8,0,2
chr1	110282510	.	C	CATCCATCCAGCCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:3,10,0,2
chr1	110282972	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:2,4:0,1:1,1,0,6
chr1	110294478	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:110294478_CCT_C:110294478:2,2,0,1
chr1	110294483	.	AGCT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:110294478_CCT_C:110294478:2,2,0,1
chr1	110294490	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:110294478_CCT_C:110294478:2,2,0,1
chr1	110294785	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,0:11,6:7,11,0,6
chr1	110295890	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,1,3
chr1	110300173	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:110300173_C_T:110300173:7,5,1,1
chr1	110300184	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=108,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:110300173_C_T:110300173:6,6,1,1
chr1	110300191	.	G	GCTCCGAAGAGATTATGACCTTTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:110300173_C_T:110300173:5,7,1,1
chr1	110300441	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:4,1:7,4,1,4
chr1	110300504	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr1	110464649	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:6,6,2,2
chr1	110464685	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=162,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:110464685_TG_AA:110464685:0,2,0,1
chr1	110464689	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=208,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:110464685_TG_AA:110464685:0,3,0,1
chr1	110466390	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=92,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:12,0:5,0:9,14,2,0
chr1	110466675	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.250:43:19,8:10,0:16,16,8,3
chr1	110466709	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=66,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.873:21:0,12:2,7:1,1,7,12
chr1	110467745	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr1	110554039	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:0,7,0,4
chr1	110554074	.	G	GCCTGATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	110563381	.	A	AGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=110,27;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,2:6,0:0|1:110563381_A_AGC:110563381:4,6,1,1
chr1	110563383	.	C	CTGTA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,27;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:2,2:7,0:0|1:110563381_A_AGC:110563381:4,6,1,1
chr1	110581780	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=107,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:17,4:4,1:13,8,4,1
chr1	110589400	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=92,91;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:20,0:11,3:15,16,1,2
chr1	110589409	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=92,91;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,0:8,2:12,15,1,1
chr1	110589423	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:0|1:110589423_C_G:110589423:3,10,1,1
chr1	110589426	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:110589423_C_G:110589423:3,10,1,1
chr1	110589439	.	CGAGG	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=137,69;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:110589423_C_G:110589423:1,9,1,1
chr1	110589479	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=198,129;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	110592048	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.418:5:2,2:0,0:2,1,2,0
chr1	110604213	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	110612925	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	110655171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,0:8,3:9,6,2,1
chr1	110655622	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:110655622_G_GT:110655622:2,1,1,1
chr1	110655623	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:110655622_G_GT:110655622:2,1,1,1
chr1	110655624	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:110655622_G_GT:110655622:2,1,1,1
chr1	110656387	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:23,0:8,2:0|1:110656387_C_T:110656387:10,22,1,1
chr1	110656391	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:24,0:7,2:0|1:110656387_C_T:110656387:10,21,1,1
chr1	110709755	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:0|1:110709755_G_A:110709755:3,5,1,1
chr1	110709764	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,0:7,1:0|1:110709755_G_A:110709755:3,6,1,1
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=238,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr1	110741086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,2,5
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=231,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	110766428	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:8,9,2,1
chr1	110766688	.	CT	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110766688_CT_GC:110766688:0,0,0,1
chr1	110766691	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110766688_CT_GC:110766688:0,0,0,1
chr1	110766697	.	G	GAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110766688_CT_GC:110766688:0,0,0,1
chr1	110768707	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:10,4,0,2
chr1	110884294	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:9,2:9,4,1,1
chr1	110884307	.	C	CTATCTCG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:8,2:5,6,1,1
chr1	110921953	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:5,7,1,1
chr1	110924353	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=100,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,30:0.500:60:9,14:21,16:10,20,10,20
chr1	111059812	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=119,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.514:6:2,0:0,3:0|1:111059812_CG_C:111059812:2,1,3,0
chr1	111059814	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=119,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:111059812_CG_C:111059812:2,1,3,0
chr1	111060669	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=184,86;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,8:3,0:4,0,6,2
chr1	111061043	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:111061043_C_T:111061043:4,3,2,0
chr1	111061050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:111061043_C_T:111061043:4,3,2,0
chr1	111061062	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=51786263,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:1,1,6,2
chr1	111434170	.	CTGGTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr1	111434987	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=123,2692;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:13,8,4,0
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,8:4,2:3,1,10,0
chr1	111441829	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=98,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:1,5,1,3
chr1	111441858	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr1	111660868	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.179:18:6,0:9,3:0|1:111660868_C_T:111660868:6,9,2,1
chr1	111660871	.	C	CATTGCTCCTCTCTAGGTTTGTTTTTCT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,0:9,2:0|1:111660868_C_T:111660868:5,9,2,1
chr1	111703851	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.158:42:20,6:16,0:16,20,6,0
chr1	111725607	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=112,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:10,0:14,6:5,21,0,6
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,9,22
chr1	111731024	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,0:6,4:3,8,0,5
chr1	111731215	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	111737183	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	111737398	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	111739771	.	G	GCAGGACAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,9:0,0,13,7
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr1	111773568	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr1	111773600	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr1	111773830	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,16,10
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	111778566	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=247,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:111778566_T_TA:111778566:1,1,0,1
chr1	111778568	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=247,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111778566_T_TA:111778566:1,1,0,1
chr1	111778570	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=247,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111778566_T_TA:111778566:1,1,0,1
chr1	111778572	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=250,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111778572_GC_G:111778572:0,2,1,0
chr1	111778575	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=250,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111778572_GC_G:111778572:0,2,1,0
chr1	111778578	.	AC	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,34;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:111778566_T_TA:111778566:2,1,0,1
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,318;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr1	111783942	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,4:6,2:7,6,4,2
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,1:0,4:0,0,1,6
chr1	111784783	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:5,3:1,1:5,1,2,3
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:6,5:0,3:5,1,2,6
chr1	111833535	.	G	GGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,3:3,0:3,7,2,1
chr1	111833644	.	CTTATTATATCAAGTTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111853201	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,2:1,5:1,1,2,5
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=985,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	111857107	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	111857120	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=127,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr1	111857154	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=98,187;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,3:6,2:9,5,4,1
chr1	111857276	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:1,7,1,4
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	111862074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:4,5,2,4
chr1	111862890	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,1:5,3:6,6,2,2
chr1	111892793	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:7,2:8,6,1,1
chr1	111893788	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0|1:111893788_GT_G:111893788:0,0,1,0
chr1	111893810	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=74,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:111893788_GT_G:111893788:0,2,1,0
chr1	111893815	.	CT	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:111893788_GT_G:111893788:1,2,1,0
chr1	111969294	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,1:1,5:1,3,1,5
chr1	111969307	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,1,4
chr1	111969719	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:5,1,2,2
chr1	111985212	.	T	TACACACACACACAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=5,12;RU=AC;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:5,0,1,1
chr1	111985229	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr1	111990265	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr1	111992078	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=177,177;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,12:4,0:8,0,12,0
chr1	111992095	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=177,165;MMQ=39,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:17,1:2,3:19,0,4,0
chr1	111998679	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	112020144	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=139,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112020144_G_T:112020144:0,1,0,1
chr1	112020151	.	G	GAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:112020144_G_T:112020144:1,1,0,1
chr1	112020220	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112020220_C_CA:112020220:0,1,1,0
chr1	112020221	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112020220_C_CA:112020220:0,1,1,0
chr1	112020233	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=54,108;MMQ=41,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:112020220_C_CA:112020220:0,2,1,0
chr1	112020238	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,54;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	112026198	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	112028334	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:1,0:3,0:3,7,3,0
chr1	112028340	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.276:15:3,0:8,0:4,7,4,0
chr1	112029193	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,14:0,0,13,13
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	112031643	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=133,133;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,20:0.349:58:29,0:7,19:23,15,20,0
chr1	112032126	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=219,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:112032126_T_C:112032126:1,0,2,0
chr1	112032131	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=219,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0|1:112032126_T_C:112032126:1,0,2,0
chr1	112032205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=122,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,2,1
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=153,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,3:1,4,2,3
chr1	112032376	.	G	GTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr1	112237915	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr1	112299435	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=164,120;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:3,0:9,6:0,12,0,6
chr1	112302996	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,0,3
chr1	112309506	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112309506_G_GC:112309506:0,1,0,1
chr1	112309509	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112309506_G_GC:112309506:0,1,0,1
chr1	112309511	.	G	GTTTGATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112309506_G_GC:112309506:0,1,0,1
chr1	112958898	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr1	112991698	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=111,94;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,1:6,5:7,8,2,4
chr1	113057446	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	113057752	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=154,115;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.568:13:1,0:4,7:0|1:113057752_C_T:113057752:1,5,0,7
chr1	113057759	.	T	TTGTAGTTTAGTCCAGTCTCACTGTGAACAAA	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,38;MFRL=212,115;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:1,0:4,7:0|1:113057752_C_T:113057752:0,5,0,7
chr1	113057761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=215,115;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,0:3,2:0,4,0,8
chr1	113057776	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=279,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113057776_G_GTGTGTGT:113057776:0,2,0,1
chr1	113057780	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=340,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113057776_G_GTGTGTGT:113057776:0,1,0,1
chr1	113057782	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=340,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113057776_G_GTGTGTGT:113057776:0,1,0,1
chr1	113068577	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=87,1160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:4,2,2,0
chr1	113068768	.	C	CCAACAGACACAGGGATCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=45730547,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.380:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	113125187	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=218,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	113140583	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:7,5:5,5:9,3,9,1
chr1	113143547	.	A	AAGAGGGAGAATCGGGCTCGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=196,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	113159371	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.188:22:3,1:12,3:15,3,3,1
chr1	113162449	.	G	GTTCT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:11,0:0|1:113162449_G_GTTCT:113162449:11,7,1,1
chr1	113162453	.	CAGAA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,2:15,0:0|1:113162449_G_GTTCT:113162449:11,10,1,1
chr1	113197333	.	T	TCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:113197333_T_TCA:113197333:7,12,0,2
chr1	113197337	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,2:0|1:113197333_T_TCA:113197333:7,12,0,2
chr1	113212236	.	A	AGGAAAATCAGATTTTTTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=118,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.071:39:17,2:20,0:22,15,0,2
chr1	113231461	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	113231636	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.162:32:10,3:17,1:11,16,3,2
chr1	113231988	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:113231988_A_C:113231988:0,0,1,0
chr1	113231990	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:113231988_A_C:113231988:0,0,1,0
chr1	113237361	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=95,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:9,0:21,7:0|1:113237361_C_A:113237361:14,17,0,7
chr1	113237363	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=95,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:9,0:21,7:0|1:113237361_C_A:113237361:14,17,0,7
chr1	113238017	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:0|1:113238017_C_T:113238017:8,4,1,1
chr1	113238031	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:0|1:113238017_C_T:113238017:6,4,1,1
chr1	113238034	.	T	TGGAGTTGG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0|1:113238017_C_T:113238017:5,5,1,1
chr1	113238035	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0|1:113238017_C_T:113238017:5,5,1,1
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:1,6,0,5
chr1	113240863	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=90,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:14,6:6,0:0|1:113240863_G_A:113240863:18,2,6,0
chr1	113240873	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,13:0.500:26:7,13:5,0:1|0:113240863_G_A:113240863:12,1,13,0
chr1	113241052	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.461:15:2,3:6,4:1,7,2,5
chr1	113241522	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	113246219	.	GGGGGCGGGGTCTCAGGGT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.258:17:6,2:3,2:0|1:113246219_GGGGGCGGGGTCTCAGGGT_G:113246219:13,0,0,4
chr1	113246245	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,11;MFRL=107,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.318:16:6,0:5,2:0|1:113246219_GGGGGCGGGGTCTCAGGGT_G:113246219:11,0,0,5
chr1	113252797	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:113252797_G_GT:113252797:7,17,1,1
chr1	113252799	.	C	CTGTTCTTATTCCTGAAACTGGGGGTGAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:113252797_G_GT:113252797:7,17,1,1
chr1	113252814	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,3:8,0:7,6,1,2
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	113255686	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=TG;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr1	113269273	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,0:6,6:8,5,0,6
chr1	113471629	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	113616055	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,74;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.351:43:12,14:16,0:17,11,14,1
chr1	113635861	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.554:40:12,10:4,12:9,9,12,10
chr1	113636167	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=98,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:15,2:30,1:22,23,3,0
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,9:0,0,16,12
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr1	113662044	.	TAGAGAGCCTGATACCGTCAGCCAAC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:12,3:8,0:15,11,2,1
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	114189292	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=196,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	114196364	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	114214516	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=101,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:8,0:3,2:0|1:114214516_T_A:114214516:1,10,1,1
chr1	114214521	.	T	TTTTCTTGTTCTGTTCTTTTTTTTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=114,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,1:0|1:114214516_T_A:114214516:0,12,1,1
chr1	114226705	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=264,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,7:0,9:0,1,10,6
chr1	114241002	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,0:8,9:4,10,0,9
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	114280717	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=96.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr1	114372332	.	TAA	T,TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27,25;MFRL=244,185,124;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.16,13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,7:0.215,0.633:10:0,1,2:1,1,4:0,1,0,9
chr1	114372427	.	T	TGATTTGGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=248,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,9:1,1:1,0,2,8
chr1	114380493	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:10,3:2,0:7,5,2,1
chr1	114381105	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=184,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:114381105_G_A:114381105:5,3,1,1
chr1	114381107	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=184,36;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:114381105_G_A:114381105:5,3,1,1
chr1	114381109	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=179,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:0|1:114381105_G_A:114381105:6,3,1,1
chr1	114381111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,15;MFRL=174,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,0:0|1:114381105_G_A:114381105:6,2,1,1
chr1	114381113	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=162,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:114381105_G_A:114381105:6,2,1,1
chr1	114381116	.	A	AATTT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=162,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:114381105_G_A:114381105:6,2,1,1
chr1	114381194	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=80,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:9,6:17,0:15,11,6,0
chr1	114381239	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:19,4:23,0:11,31,4,0
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=99,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,4:1,6:0,1,5,5
chr1	114401274	.	TT	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=157,104;MMQ=53,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:114401274_TT_GC:114401274:0,2,0,1
chr1	114401286	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=83,104;MMQ=39,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114401274_TT_GC:114401274:1,2,0,1
chr1	114401287	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=83,104;MMQ=39,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114401274_TT_GC:114401274:1,2,0,1
chr1	114401296	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=83,104;MMQ=39,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114401274_TT_GC:114401274:1,2,0,1
chr1	114401704	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	114401904	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr1	114441361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,1:9,1:7,2,0,2
chr1	114454391	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=84,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.249:38:12,0:17,9:14,15,0,9
chr1	114499812	.	T	TCAAAGTTAAATTGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:16,2:3,0:10,10,0,2
chr1	114511181	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=91,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.157:36:15,0:15,5:0|1:114511181_C_T:114511181:18,13,1,4
chr1	114511190	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=95,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.157:36:16,0:14,4:0|1:114511181_C_T:114511181:18,13,1,4
chr1	114522582	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=102,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	114636512	.	A	ACTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr1	114940632	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,32,32;MFRL=174,141,174;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.45,11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.271,0.551:8:0,2,2:0,0,1:0,1,0,7
chr1	114948281	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr1	115110683	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,5,1
chr1	115110782	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=91,59;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:16,2:0|1:115110782_G_A:115110782:11,17,1,1
chr1	115110784	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=91,59;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:0|1:115110782_G_A:115110782:11,17,1,1
chr1	115110795	.	G	GAGCTTTTTGGTTTAAAT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=96,59;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:14,2:10,18,1,1
chr1	115119199	.	ACA	GTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=264,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,3,1
chr1	115130494	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=67,134;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,0:9,8:9,8,0,8
chr1	115137208	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,0:0,5,0,2
chr1	115141937	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=116,125;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:16,0:10,4:0|1:115141937_C_T:115141937:13,13,0,4
chr1	115141944	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=116,125;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:16,0:10,4:0|1:115141937_C_T:115141937:13,13,0,4
chr1	115141960	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=116,125;MMQ=60,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:13,0:10,4:11,12,0,4
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	115147741	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:115147741_G_A:115147741:0,1,0,1
chr1	115147742	.	G	GCAAATAAAATATTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:115147741_G_A:115147741:0,1,0,1
chr1	115165577	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr1	115166350	.	ATTGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	115215870	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,1:7,2:6,6,1,2
chr1	115216651	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:115216651_G_T:115216651:9,10,1,1
chr1	115216663	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:0|1:115216651_G_T:115216651:10,9,1,1
chr1	115218492	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=114,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:9,1,1,2
chr1	115221038	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:4,5,2,0
chr1	115223144	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:115223144_A_G:115223144:0,2,0,1
chr1	115223145	.	C	CTAATCAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:115223144_A_G:115223144:0,2,0,1
chr1	115223148	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:115223144_A_G:115223144:0,2,0,1
chr1	115223152	.	A	AACCGGCTAATTTTGTATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	115229292	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr1	115231369	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:5,3:14,0:5,14,0,3
chr1	115238016	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,1:1,1:1,1,2,2
chr1	115256486	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=109,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:18,1:6,2:9,15,1,2
chr1	115258805	.	G	GCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:3,14,0,2
chr1	115277201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:0,11,1,1
chr1	115280193	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,2:8,2:2,12,0,5
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	115399940	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,3:6,2:6,10,1,4
chr1	115400006	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:6,0:11,6,0,3
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr1	115488821	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr1	115537563	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,3:10,0:11,16,2,1
chr1	115576023	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr1	115576175	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr1	115596074	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=114,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,3:10,0:10,13,0,3
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,3,13
chr1	115604681	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr1	115604798	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.658:39:8,10:5,16:5,8,11,15
chr1	115829454	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:115829454_A_T:115829454:0,3,0,1
chr1	115829460	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:115829454_A_T:115829454:0,3,0,1
chr1	116206423	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=72,78;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:3,4,2,4
chr1	116206951	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	116224925	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	116224940	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr1	116245655	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr1	116247790	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:13,4:7,1:13,7,2,3
chr1	116260532	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,12,12
chr1	116260544	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=89,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:10,3:3,5:7,7,3,5
chr1	116260604	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	116268178	.	GAAA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=69,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.426:8:3,1:2,0:5,0,1,2
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,8,3
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	116287634	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	116311198	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	116383364	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.468:7:2,1:2,0:3,1,1,2
chr1	116384773	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=94,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,5:2,9:6,1,9,5
chr1	116386244	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr1	116534631	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:16,7:9,0:18,7,7,0
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	116609356	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:1,3,2,4
chr1	116609381	.	A	ACGTGAGTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=226,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	116609590	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.411:7:4,1:0,0:4,0,1,2
chr1	116927462	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:20,3:15,0:14,21,1,2
chr1	116935705	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=272,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:116935705_AG_CA:116935705:0,1,0,1
chr1	116935709	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=272,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:116935705_AG_CA:116935705:0,1,0,1
chr1	116935711	.	A	ATGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=272,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:116935705_AG_CA:116935705:0,1,0,1
chr1	116940519	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:3,12,3,0
chr1	116944275	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:13,0:18,9:9,22,0,9
chr1	116947097	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:116947097_G_T:116947097:5,7,1,1
chr1	116947104	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:6,1:0|1:116947097_G_T:116947097:5,7,1,1
chr1	116952917	.	T	TGTCATCTCGTTCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	117113642	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=215,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=162,136;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.384:34:9,7:12,5:8,13,7,6
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=169,141;MMQ=60,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,3:9,2:11,10,3,2
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=168,129;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.433:14:5,2:2,3:5,3,4,2
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=183,120;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:4,3:4,6,2,2
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,218;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:6,3:0,1:1,5,0,4
chr1	117146504	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,141;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.346:20:8,3:5,1:4,9,5,2
chr1	117146592	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=202,159;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:2,6,0,3
chr1	117146629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=200,164;MMQ=34,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=113,186;MMQ=60,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.239:19:7,2:6,2:0|1:117150928_C_T:117150928:6,9,1,3
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=109,162;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.212:17:7,1:6,2:0|1:117150928_C_T:117150928:6,8,1,2
chr1	117150966	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=173,171;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=102,112;MMQ=59,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.351:43:13,6:15,8:11,17,6,9
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=111,112;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:12,5:13,9:11,14,8,6
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=120,111;MMQ=56,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.398:23:10,3:4,6:7,7,1,8
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=118,119;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,0:3,4:6,5,0,4
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,154;MMQ=42,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,2:14,3:14,17,1,4
chr1	117158857	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,24;MFRL=132,146;MMQ=25,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,1:5,0:0|1:117158857_C_T:117158857:8,7,2,0
chr1	117158862	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=132,131;MMQ=25,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:9,2:6,1:0|1:117158857_C_T:117158857:8,7,3,0
chr1	117158898	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=167,130;MMQ=24,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,2:6,2:5,7,4,0
chr1	117158909	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=122,130;MMQ=24,24;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,2:6,2:7,5,4,0
chr1	117158934	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=142,128;MMQ=33,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:14,2:8,3:13,9,2,3
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=122,130;MMQ=34,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:12,3:10,3:11,11,2,4
chr1	117159024	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=123,127;MMQ=25,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	117214486	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.088:40:19,3:18,0:0|1:117214486_T_A:117214486:9,28,2,1
chr1	117214491	.	C	CCCCTTAAAACATGTAACTCTATGCCATTT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.090:39:18,3:16,0:0|1:117214486_T_A:117214486:7,29,2,1
chr1	117452833	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	117487270	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,1:2,2:4,5,2,1
chr1	117527207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr1	117559726	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr1	117602960	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.966:28:0,18:0,8:0,0,16,12
chr1	117603188	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr1	117605130	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,25,23;MFRL=105,146,100;MMQ=60,60,60;MPOS=30,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.86,4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,5:0.175,0.231:23:5,1,1:6,1,1:4,10,2,7
chr1	117618067	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,14,11
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	117619309	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,103;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.117:31:9,0:17,3:15,13,0,3
chr1	117620472	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:6,1,3,0
chr1	117622286	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,6,14
chr1	117624494	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=120,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:9,11,0,3
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr1	117634021	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:2,4,0,2
chr1	117655093	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,1:5,7:1,4,3,5
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr1	117663811	.	T	TCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=98,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,4:3,1:6,6,4,1
chr1	117696037	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.709:11:1,3:1,5:0,3,1,7
chr1	117699423	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=105,60;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:20,2:8,0:8,21,1,1
chr1	117699439	.	C	CTGCTGCCGAAGTCCCACTACACAGCTGTAGGCTGCTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,60;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:8,0:7,12,1,1
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,1:3,2:4,0,3,1
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	118067831	.	AA	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:118067831_AA_GT:118067831:0,4,1,1
chr1	118067835	.	A	AGCCTTGACCCCAGGACTCCCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:118067831_AA_GT:118067831:0,4,1,1
chr1	118166750	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:2,2,2,5
chr1	118167727	.	GT	G,GTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29,33;MFRL=158,252,179;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.17,7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.222,0.298:14:3,1,0:4,2,4:2,5,2,5
chr1	118168126	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:118168126_G_T:118168126:12,9,1,1
chr1	118168131	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:118168126_G_T:118168126:14,9,1,1
chr1	118168137	.	T	TGGAGTCTGGGGC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=86,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:9,2:0|1:118168126_G_T:118168126:13,10,1,1
chr1	118168141	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=20,19;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:10,0:11,1:0|1:118168126_G_T:118168126:12,10,1,1
chr1	118169326	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:0|1:118169326_TG_T:118169326:7,7,1,1
chr1	118169330	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:11,0:2,2:0|1:118169326_TG_T:118169326:7,6,1,1
chr1	118490940	.	TATGAAGTCTTTTCTAAATTGTGCAGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:0,2:5,2,1,1
chr1	118492443	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:9,11,0,2
chr1	118494784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118494784_T_C:118494784:0,2,0,1
chr1	118494788	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:118494784_T_C:118494784:0,2,0,1
chr1	118495240	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:10,1,1,1
chr1	118497269	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr1	118498036	.	T	TCTCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:118498036_T_TCTCCA:118498036:0,3,0,1
chr1	118498037	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:118498036_T_TCTCCA:118498036:0,3,0,1
chr1	118498067	.	A	AGAGAACTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:118498067_A_AGAGAACTT:118498067:0,0,0,1
chr1	118498069	.	A	AGTAGAAACCAACCAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118498067_A_AGAGAACTT:118498067:0,0,0,1
chr1	118501676	.	A	AAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=171,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:0|1:118501676_A_AAAGG:118501676:0,3,0,1
chr1	118501678	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=218,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:118501676_A_AAAGG:118501676:0,4,0,1
chr1	118526592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	118534216	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118534216_G_A:118534216:0,1,0,1
chr1	118534220	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118534216_G_A:118534216:0,1,0,1
chr1	118534225	.	C	CCTGTGATCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118534216_G_A:118534216:0,1,0,1
chr1	118548283	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:118548283_C_CT:118548283:0,3,0,1
chr1	118548293	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:118548283_C_CT:118548283:0,3,0,1
chr1	118558719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:4,7,2,1
chr1	118584480	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,3:14,0:15,15,3,0
chr1	118616394	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	118617274	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,5,7
chr1	118623681	.	TACACAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AC;STR;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.794:7:0,2:0,4:1,0,5,1
chr1	118628550	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:9,7,2,0
chr1	118636030	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118636030_A_C:118636030:0,2,0,1
chr1	118636034	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118636030_A_C:118636030:0,2,0,1
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=161,286;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr1	119925464	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,2,1
chr1	119929523	.	A	AGCAGTAACGAGAGCAGTGGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	119964978	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,25593;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:15,0:10,14,0,2
chr1	120166453	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr1	120254545	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	120269423	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,11:4,0:5,2,11,0
chr1	120269567	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:5,5,3,4
chr1	120277283	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:120277283_C_T:120277283:9,7,1,1
chr1	120277285	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:120277283_C_T:120277283:9,7,1,1
chr1	120278072	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	120286457	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	120293362	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=138,136;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:3,8:19,0:19,3,8,0
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=136,138;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.632:31:9,2:2,15:11,0,17,3
chr1	120336876	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:5,4:2,1:1,7,0,5
chr1	120337384	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120337403	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,6:2,5:0,5,4,7
chr1	120385154	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.119:32:12,2:14,1:11,18,2,1
chr1	120438600	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,0,2
chr1	120459221	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:13,2:0|1:120459221_TA_T:120459221:14,18,1,1
chr1	120459223	.	TGGTC	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:19,0:13,2:0|1:120459221_TA_T:120459221:14,18,1,1
chr1	120478285	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	120491594	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,7:4,3:6,5,6,4
chr1	120491643	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,5:13,0:20,8,4,1
chr1	120502132	.	G	GTAGAGCCTAGACAAGAGTTAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=68,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,124;MMQ=21,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,7:0,6:1,0,12,1
chr1	143768201	.	T	TCCCTCCCTCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.380:43:18,6:7,10:22,5,10,6
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,18:0.330:55:29,9:7,8:25,12,8,10
chr1	144618009	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,152;MMQ=49,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:5,2,2,0
chr1	144825446	.	G	GAGGATTGT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,59;MMQ=40,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:144825446_G_GAGGATTGT:144825446:2,3,1,1
chr1	144825448	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,59;MMQ=40,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:144825446_G_GAGGATTGT:144825446:2,3,1,1
chr1	144825529	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=139,77;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	144828446	.	TCTAACCAGTTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=161,114;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:5,0:14,5,1,1
chr1	144828764	.	GA	TT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,78;MMQ=47,44;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:11,2:7,4:7,11,3,3
chr1	144828784	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=133,78;MMQ=47,44;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,2:7,4:2,12,3,3
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,162;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:3,2,4,0
chr1	144854047	.	CCC	TGG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=176,166;MMQ=53,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=184,174;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=132,155;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,3:3,5:8,1,5,3
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=153,122;MMQ=43,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:0|1:144854087_A_G:144854087:8,4,8,0
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:9,4:8,5:0|1:144854087_A_G:144854087:11,6,9,0
chr1	144854245	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=144,149;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,3:8,3:2,17,0,6
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=101,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:2,3:2,5:1,3,0,8
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=24,34;MFRL=144,183;MMQ=40,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:4,4:6,2:0|1:144854491_T_G:144854491:10,1,5,1
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=147,123;MMQ=43,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:5,5:6,4:0|1:144854491_T_G:144854491:10,2,8,1
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=107,180;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,1:10,3:0|1:144854528_A_G:144854528:13,10,2,2
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=23,34;MFRL=99,171;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:13,1:14,4:0|1:144854528_A_G:144854528:14,13,2,3
chr1	144854565	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=115,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.173:42:19,3:15,3:17,18,1,6
chr1	144854581	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=129,139;MMQ=60,33;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:24,2:12,2:16,22,2,2
chr1	144854594	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=105,172;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.170:45:19,4:17,3:9,29,3,4
chr1	144854597	.	TC	CC,CT	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=27,32,29;MFRL=159,172,101;MMQ=60,40,60;MPOS=13,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.43,78.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,7,22:0.167,0.492:44:4,4,14:9,3,8:2,13,10,19
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=170,137;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr1	144855935	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:0,7,1,3
chr1	144856753	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,581730;MMQ=34,23;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,138;MMQ=33,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,9:6,6:4,7,7,8
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.654:12:3,4:0,3:3,1,6,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,103;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,4:2,1:3,7,0,5
chr1	144863360	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=140,140;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,2:9,2:8,4,2,2
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=167,166;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:11,6:2,2:5,8,3,6
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=101,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:3,2,0,4
chr1	144868229	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=248,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:144868229_G_A:144868229:0,3,0,1
chr1	144868232	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:144868229_G_A:144868229:0,3,0,1
chr1	144868234	.	G	GAAACAGATTTTGGCTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:144868229_G_A:144868229:0,3,0,1
chr1	144868239	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	144871738	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=184,147;MMQ=60,53;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.574:24:5,4:5,7:0|1:144871738_C_A:144871738:7,3,10,4
chr1	144871755	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:8,3:4,7:0|1:144871738_C_A:144871738:8,5,8,3
chr1	144871782	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=125,151;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.377:38:12,5:11,9:14,10,10,4
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,26:0.586:44:12,10:6,15:7,11,8,18
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=125,124;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:3,1:2,8:4,1,8,2
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=113,112;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.556:32:6,6:8,11:11,3,12,6
chr1	144873887	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=118,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.530:45:11,12:9,11:13,8,14,10
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=108,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.451:38:12,10:8,7:12,9,8,9
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=121,164;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:2,7,1,7
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=108,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0|1:144874070_C_T:144874070:0,6,0,3
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=118,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0|1:144874070_C_T:144874070:0,5,0,2
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:8,3,7,2
chr1	144874950	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:1,7,1,2
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=198,219;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr1	144879054	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=91,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:15,6:13,4:12,16,3,7
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,5:5,5:7,0,10,0
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:0,5,1,7
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:4,1,5,2
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=51302449,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,9:0,3:1,1,5,8
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=195,207;MMQ=49,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,3:6,4:7,2,7,0
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:0|1:144916486_T_G:144916486:6,0,5,1
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:0|1:144916486_T_G:144916486:6,0,5,1
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=122,127;MMQ=31,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.533:45:8,13:13,11:14,7,14,10
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=120,117;MMQ=44,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,24:0.463:52:11,14:17,10:20,8,12,12
chr1	144919008	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,2:7,6:2,13,0,8
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,2:9,5:1,9,1,6
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,1:3,3:6,2,0,4
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.588:29:4,6:7,11:7,5,5,12
chr1	144923887	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:7,1:7,4:0,14,0,5
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,28:0.521:54:9,10:15,17:17,9,17,11
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=116,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.525:57:11,14:16,16:16,11,16,14
chr1	144931392	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:16,7:9,17:7,18,13,11
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=146.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,18:0,23:0,0,9,33
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.381:29:6,6:12,4:0,18,1,10
chr1	145016035	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:12,1:16,2:3,25,0,3
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:6,5:13,7:0|1:145021024_G_C:145021024:18,1,12,0
chr1	145021034	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:7,6:12,11:0|1:145021024_G_C:145021024:19,2,15,2
chr1	145021051	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,9:0.161:60:15,4:32,5:0|1:145021051_A_G:145021051:34,17,9,0
chr1	145021055	.	A	T	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,9:0.151:64:20,4:35,5:0|1:145021051_A_G:145021051:36,19,9,0
chr1	145021089	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,12:0.133:95:37,3:41,9:43,40,6,6
chr1	145021265	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,6:10,3:0,12,1,8
chr1	145039633	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.109:61:34,3:21,3:25,30,4,2
chr1	145039744	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,3:13,0,6,2
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=117,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.565:51:10,12:12,16:14,8,20,9
chr1	145075903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=227,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:15,3:5,6:19,2,9,0
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,2:1,4:1,4,0,6
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.350:32:13,6:8,5:20,1,9,2
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=126.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,36:0.862:41:2,23:3,13:5,0,33,3
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.097:59:32,3:19,2:47,7,5,0
chr1	145109549	.	G	T	.	.	DP=116;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,13:0.123:111:58,6:39,7:49,49,7,6
chr1	145109583	.	C	A	.	.	DP=117;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,55:0.501:110:30,27:24,28:21,34,27,28
chr1	145109661	.	G	A	.	.	DP=138;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=92,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,22:0.172:131:54,11:55,11:44,65,9,13
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=183,133;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,2:7,1:0|1:145112284_CCG_C:145112284:12,3,2,1
chr1	145112287	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:4,4:9,2,6,1
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=183,138;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,2:8,1:0|1:145112284_CCG_C:145112284:12,3,3,1
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:10,3:8,5:13,6,7,1
chr1	145112485	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,18:0.212:83:24,5:41,10:29,36,7,11
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=179,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:6,2:9,1,5,0
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=117,110;MMQ=52,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,29:0.333:88:25,6:34,23:20,39,10,19
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,144;MMQ=27,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:6,3:11,3:0,17,1,5
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=127,101;MMQ=27,49;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,24:0.330:73:30,13:18,11:29,20,12,12
chr1	145281408	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=124,125;MMQ=45,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,31:0.326:96:40,20:25,10:39,26,15,16
chr1	145281543	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=140,154;MMQ=30,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,17:0.239:73:32,3:24,14:30,26,10,7
chr1	145281613	.	C	A	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=119,150;MMQ=52,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,18:0.171:109:54,9:33,9:45,46,9,9
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=115,153;MMQ=57,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.302:37:12,5:14,5:15,11,4,7
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,175;MMQ=57,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:14,2:16,3:4,27,0,5
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:20,2:19,2:32,9,4,0
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=156,128;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.233:45:18,5:17,5:27,8,9,1
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=125,113;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,34:0.443:77:17,9:26,25:27,16,23,11
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=8;MBQ=23,28;MFRL=118,134;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,7:0.089:87:27,2:52,5:49,31,5,2
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=114;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=107,148;MMQ=54,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,22:0.200:112:37,9:49,12:50,40,14,8
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=126;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=119,97;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,23:0.200:117:41,12:52,11:55,39,9,14
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=121;ECNT=8;MBQ=23,34;MFRL=113,148;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,9:0.082:120:49,6:60,3:0|1:145290401_T_G:145290401:60,51,4,5
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=118,148;MMQ=52,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,9:0.085:116:47,6:55,3:0|1:145290401_T_G:145290401:59,48,4,5
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=99;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=137,156;MMQ=52,38;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,10:0.118:90:35,4:44,6:35,45,4,6
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=138,190;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.067:71:28,2:39,2:18,49,2,2
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=142,233;MMQ=60,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.062:61:25,2:33,1:12,46,1,2
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.237:61:19,8:28,6:8,39,3,11
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,12:0.241:52:14,6:23,6:2,38,1,11
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,754653;MMQ=29,29;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:4,3,0,5
chr1	145311706	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=194,156;MMQ=25,21;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	145415399	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=517,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:145415399_G_T:145415399:2,0,0,1
chr1	145415401	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=517,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:145415399_G_T:145415399:2,0,0,1
chr1	145415405	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=517,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:145415399_G_T:145415399:2,0,0,1
chr1	145440427	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,163;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:9,5:15,0:15,9,5,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,26,32;MFRL=130,122,159;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=11.10,11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,8,6:0.251,0.228:30:5,4,2:4,2,4:4,12,3,11
chr1	145457039	.	CTCT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:14,2:13,1:16,12,1,2
chr1	145457669	.	G	GCACTCCCCCTCACCCTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr1	145457864	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,2:3,1:7,3,3,0
chr1	145460106	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,0:14,3:20,19,0,3
chr1	145492420	.	A	AGGGGCTAGCAGGAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	145498833	.	T	TTAGCGGAGAATAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=142,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr1	145508524	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,58;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.089:63:31,5:25,0:31,27,3,2
chr1	145518036	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=126,118;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:6,4:28,0:24,10,4,0
chr1	145524976	.	GGGGCAGGAT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:7,1,1,1
chr1	145525150	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:11,2:19,3:17,13,0,5
chr1	145527516	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	145530302	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,4:11,0:5,21,2,2
chr1	145530935	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=85,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:8,3:17,0:18,7,2,1
chr1	145532658	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:0,2:7,0:5,3,1,1
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	145537089	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=118,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,0:7,2:0|1:145537089_C_T:145537089:17,1,1,1
chr1	145537106	.	ACTTTCCCCCTATTCTATTC	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,2:0.079:36:12,1:12,1:1|0:145537089_C_T:145537089:23,11,2,0
chr1	145537578	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:9,4:4,2:5,8,2,4
chr1	145538139	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,2,2
chr1	145538664	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:0,5:1,0:1,0,4,1
chr1	145539271	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	145539892	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	145556706	.	ACTGGGCCACGCTGCTTGCTTGCCCCTGGTACAGCAGCAGTCGGGGGCGGTG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.095:31:8,2:10,0:9,20,1,1
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr1	145561228	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=125,76;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,9:0.178:52:22,8:20,0:24,19,1,8
chr1	145567084	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=81,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.582:29:7,9:5,8:9,3,9,8
chr1	145576115	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.458:26:4,6:8,5:7,7,8,4
chr1	145577985	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr1	145580666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:1,9,1,2
chr1	145581644	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:0,2:0,3,0,6
chr1	145581662	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:1,2:0,7,0,4
chr1	145584331	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr1	145584526	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=103,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.365:39:11,14:14,0:14,11,14,0
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	145585518	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:0,2,2,0
chr1	145586658	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:14,2:14,10,1,1
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=266,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.371:20:5,4:5,3:1,12,4,3
chr1	145586839	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:3,5:3,4,3,5
chr1	145587618	.	T	TACTCGTGATCTCCCAGGAATCACAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=134,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,0,1
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=100,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:145587631_G_C:145587631:0,1,3,0
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=100,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0|1:145587631_G_C:145587631:0,1,3,0
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=100,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:145587631_G_C:145587631:0,1,3,0
chr1	145587644	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,31;MFRL=185,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:1,1,2,0
chr1	145587838	.	AA	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:145587838_AA_GC:145587838:0,11,1,1
chr1	145587842	.	T	TTGCAGGTA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:3,0:0|1:145587838_AA_GC:145587838:0,10,1,1
chr1	145587858	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:1,0:1,3:0,3,0,4
chr1	145588384	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:11,10,0,2
chr1	145588435	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:0|1:145588435_C_T:145588435:8,9,1,1
chr1	145588440	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:145588435_C_T:145588435:8,8,1,1
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:6,4:2,6,2,3
chr1	145589069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:7,8,0,2
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:1,1,3,1
chr1	145601732	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=116,116;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:12,3:16,0:20,8,3,0
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr1	145682193	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=202,199;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:145682193_T_C:145682193:0,1,0,1
chr1	145682201	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=202,199;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:145682193_T_C:145682193:0,1,0,1
chr1	145682205	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145682193_T_C:145682193:0,0,0,1
chr1	145696694	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr1	145748265	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	145748490	.	TGTGATGAATGGAGGTGTGCAAACTTGGACCCAGCCCCGGCTCTGCTATCTC	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=152,191419;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.055:71:8,0:3,3:26,42,0,3
chr1	145788902	.	AAATGGC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=134,77;MMQ=50,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,2:9,0:4,20,1,1
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=188,201;MMQ=52,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	146656292	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	146685086	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=175,41187539;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,1,0
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	146714255	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	146728149	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:6,6:11,6:11,6,10,3
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=75.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,18,9
chr1	146739068	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:4,3:1,2:4,1,3,2
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	146740489	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:12,17,3,0
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=246,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	146751737	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,6:10,0:8,9,6,0
chr1	146756212	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:8,0:6,2:0|1:146756212_C_A:146756212:1,13,1,1
chr1	146756218	.	T	TCCCTG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:3,2:0|1:146756212_C_A:146756212:1,13,1,1
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,2:0,0,10,2
chr1	147083744	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=86,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:7,2:3,3:6,5,0,5
chr1	147086504	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	147090730	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,0:10,5:11,9,0,5
chr1	147091981	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=109,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.275:20:7,5:7,0:8,7,4,1
chr1	147092112	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:2,4:5,7:6,2,6,5
chr1	147096091	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,48;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.174:16:5,0:8,2:0|1:147096091_C_T:147096091:6,8,1,1
chr1	147096101	.	G	GGTCATTCCCATTGGGCTGAGGGTTGGCATC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,48;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.171:17:5,0:8,2:0|1:147096091_C_T:147096091:8,7,1,1
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	147120300	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:147120300_T_C:147120300:0,2,0,1
chr1	147120304	.	C	CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:147120300_T_C:147120300:0,2,0,1
chr1	147124310	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.513:27:5,6:8,7:6,7,8,6
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=85,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,5:5,6:5,3,5,6
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=504,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	147230978	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:13,9,2,1
chr1	147380854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=185,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:147380854_T_C:147380854:4,3,1,1
chr1	147380861	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=185,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:147380854_T_C:147380854:4,3,1,1
chr1	147380864	.	A	AACCTCGGTCAAGGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=185,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:147380854_T_C:147380854:4,3,1,1
chr1	147381444	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	148009510	.	G	A	.	.	DP=165;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,44:0.297:148:44,20:56,22:47,57,15,29
chr1	148252048	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=95,113;MMQ=25,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.378:24:6,4:9,4:0|1:148252048_T_A:148252048:9,6,5,4
chr1	148252049	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=139,86;MMQ=27,22;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,8:0.332:25:8,3:9,5:1|0:148252048_T_A:148252048:9,8,5,3
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=118,112;MMQ=48,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:5,0:13,5:5,13,3,2
chr1	148342090	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=145,196;MMQ=43,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	148756432	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=217,107;MMQ=22,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:0|1:148756432_C_A:148756432:3,2,2,1
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=106,217;MMQ=23,22;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.545:9:0,3:4,2:1|0:148756432_C_A:148756432:2,2,3,2
chr1	149755694	.	C	CCACTCTTTCCTCCTAGGCTATGGTGAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,385167;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:12,3:3,0:6,9,0,3
chr1	149881538	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr1	149882448	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,2:11,1:7,6,2,1
chr1	149897883	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:15,4:7,0:18,4,4,0
chr1	149900985	.	CAA	C,CA,AAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29,30,20;MFRL=128,132,171,117;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,20,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.27,5.64,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,4,5,4:0.149,0.256,0.199:20:3,0,1,1:4,2,4,1:7,0,8,5
chr1	149903964	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:149903964_A_T:149903964:2,5,0,2
chr1	149903967	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:149903964_A_T:149903964:2,5,0,2
chr1	149903972	.	GGGT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,2:0|1:149903964_A_T:149903964:3,6,0,2
chr1	149915851	.	G	GTAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:3,11,0,2
chr1	149936344	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,18;MFRL=140,174;MMQ=41,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0,4,0,1
chr1	149936352	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=149,146;MMQ=41,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:149936352_T_C:149936352:0,4,0,1
chr1	149936354	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=22,30;MFRL=149,146;MMQ=41,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:149936352_T_C:149936352:0,4,0,1
chr1	149936358	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=149,146;MMQ=41,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:149936352_T_C:149936352:0,4,0,1
chr1	149936363	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=146,133;MMQ=42,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149936363_GC_AT:149936363:0,3,0,1
chr1	149936364	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=83,146;MMQ=44,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:149936352_T_C:149936352:0,2,0,1
chr1	149936368	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,24;MFRL=133,146;MMQ=42,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:149936352_T_C:149936352:0,3,0,1
chr1	149936372	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=156,133;MMQ=43,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:149936363_GC_AT:149936363:0,2,0,1
chr1	150054710	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	150122476	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150122476_G_A:150122476:1,1,0,1
chr1	150122484	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150122476_G_A:150122476:1,1,0,1
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,5,5
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	150199039	.	CTCCTCT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=88,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCT;STR;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.412:37:3,6:17,9:6,16,3,12
chr1	150202884	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,4:11,0:14,7,3,1
chr1	150204119	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:6,2:7,2:7,7,2,2
chr1	150236107	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=82,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:4,7,0,5
chr1	150248990	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,2:13,1:15,12,2,1
chr1	150249101	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	150255587	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr1	150258952	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=87,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.212:40:18,0:14,8:17,15,0,8
chr1	150259400	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	150297334	.	CTTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.262:26:5,3:7,4:11,7,6,2
chr1	150315775	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=110,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:8,7:12,0:13,7,7,0
chr1	150319023	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150319023_C_CT:150319023:1,0,0,1
chr1	150319024	.	A	AATGAATATGGAGGATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150319023_C_CT:150319023:1,0,0,1
chr1	150319026	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:150319023_C_CT:150319023:1,0,0,1
chr1	150337414	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,12:0.173:73:34,0:27,12:25,36,1,11
chr1	150430120	.	GCAGGTA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150430120_GCAGGTA_G:150430120:0,0,0,1
chr1	150430129	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150430120_GCAGGTA_G:150430120:0,0,0,1
chr1	150482173	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr1	150525187	.	C	CACA,CTGCACTGAAGCAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35,33;MFRL=0,143,252;MMQ=60,60,60;MPOS=17,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr1	150525189	.	TCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=252,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:150525189_TCCC_T:150525189:0,1,0,1
chr1	150525193	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150525189_TCCC_T:150525189:0,0,0,1
chr1	150525198	.	AACTCCC	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150525189_TCCC_T:150525189:0,0,0,1
chr1	150525480	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:8,2:0|1:150525480_TG_T:150525480:16,7,1,1
chr1	150525488	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:0|1:150525480_TG_T:150525480:18,7,1,1
chr1	150528090	.	G	GACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr1	150530043	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:4,6,4,4
chr1	150530173	.	A	ACTCAGGGTCTCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=213,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:150530173_A_ACTCAGGGTCTCG:150530173:0,2,0,1
chr1	150530178	.	G	GTTGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=213,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:150530173_A_ACTCAGGGTCTCG:150530173:0,2,0,1
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr1	150531447	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,5:5,6:4,3,6,5
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr1	150595195	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr1	150595289	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=91,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,36:0.480:75:21,16:18,20:30,9,27,9
chr1	150595354	.	GA	G	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.248:26:8,0:3,1:13,7,1,5
chr1	150598103	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=131,173;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:20,4:13,0:21,12,4,0
chr1	150598121	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=134,52;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,3:11,0:20,10,2,1
chr1	150598132	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=134,173;MMQ=55,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.124:34:19,3:10,0:19,11,4,0
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	150676546	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,0:9,5:13,2,5,0
chr1	150676674	.	TAA	T,TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25,23;MFRL=95,144,141;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.98,14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,9:0.247,0.486:20:3,3,2:2,2,7:1,4,10,5
chr1	150779149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=85,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:10,6:5,0:8,7,6,0
chr1	150779341	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=148,121;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150779341_T_A:150779341:0,2,0,1
chr1	150779343	.	GGCT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=148,121;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150779341_T_A:150779341:0,2,0,1
chr1	150779349	.	A	AAGGTCCGC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=124,169;MMQ=58,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	150779352	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=148,121;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:150779341_T_A:150779341:0,2,0,1
chr1	150779356	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=126,121;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150779341_T_A:150779341:0,1,0,1
chr1	150779357	.	GAGAAAGGTAGAC	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=63,121;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:150779341_T_A:150779341:1,1,0,1
chr1	150779379	.	G	GCACCCACAAACATACGTATACAT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=63,121;MMQ=60,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr1	150799189	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:12,2:2,0:0,14,0,2
chr1	150804401	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=49,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,1:0,0:1,1,1,2
chr1	150849071	.	ACC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.894:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	150849103	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:3,2:0,4,0,3
chr1	150900311	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:17,2:13,0:0|1:150900311_C_T:150900311:20,10,1,1
chr1	150900317	.	T	TGGTTCAC	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,2:13,0:0|1:150900311_C_T:150900311:21,11,1,1
chr1	150912552	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	150914947	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:1,0:3,2:7,0,2,0
chr1	150919401	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=109,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:150919401_C_T:150919401:11,7,1,1
chr1	150919407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:0|1:150919401_C_T:150919401:11,8,1,1
chr1	150936369	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,4:3,0:8,0,4,0
chr1	150936496	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:19,0:15,2:16,19,0,2
chr1	150936499	.	A	ATTT	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:17,0:16,2:16,19,0,2
chr1	150936501	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,0:15,2:15,19,0,2
chr1	150936509	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,1:14,2:15,16,0,3
chr1	150936510	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,1:14,2:15,15,0,4
chr1	150936513	.	G	GAA	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,1:14,2:15,16,0,3
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr1	150958877	.	T	TCACAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:7,5,1,1
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:5,3,1,3
chr1	150960733	.	CTCCATCCT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:19,2:19,0:19,23,1,1
chr1	150967819	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.350:37:13,0:11,11:10,14,0,13
chr1	150970836	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,253;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	150972497	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr1	150972538	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr1	150973829	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:150973829_C_T:150973829:8,14,1,1
chr1	150973841	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:150973829_C_T:150973829:3,15,1,1
chr1	150973844	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:150973829_C_T:150973829:3,14,1,1
chr1	150973847	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,1:0|1:150973829_C_T:150973829:3,11,1,1
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,4:6,2:5,2,3,3
chr1	150998221	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=239,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998226	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998228	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998233	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=239,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998240	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,29;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998245	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1|0:150998221_AT_A:150998221:0,2,0,1
chr1	150998249	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150998221_AT_A:150998221:0,0,0,1
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	151006539	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:12,6:5,5:11,6,8,3
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=109,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,1:4,5:3,3,2,4
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,10,14
chr1	151060676	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,3:7,0:10,5,3,0
chr1	151070252	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	151076068	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,3:11,0:8,9,2,1
chr1	151090090	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,159;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	151090653	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:10,5:18,0:19,10,4,1
chr1	151090791	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=81.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,32:0.731:43:6,0:5,28:0,11,0,32
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=50,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,1:11,3:14,1,4,0
chr1	151106923	.	TATGAAGAAGGGACAGGGTGAAGATGGGGGGAAAGAGAAGCTTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.186:15:4,0:7,2:3,10,1,1
chr1	151109124	.	G	GACACCTAAGAAGGACGTGAAGTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=255,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=214,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	151111071	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,1:0|1:151111071_A_C:151111071:0,4,2,0
chr1	151111074	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:151111071_A_C:151111071:0,4,2,0
chr1	151111079	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,0:0|1:151111071_A_C:151111071:1,5,2,0
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=278,130;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr1	151115017	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=89,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:10,8:4,7:12,2,6,9
chr1	151115182	.	G	GAACCCAGAGAATGGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=108,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=155,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	151139073	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.489:14:1,4:5,1:1,6,0,7
chr1	151140898	.	T	TTCTTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.349:7:2,2:3,0:0|1:151140898_T_TTCTTG:151140898:2,3,1,1
chr1	151140903	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.282:9:3,2:1,0:0|1:151140898_T_TTCTTG:151140898:2,5,1,1
chr1	151140905	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=208,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,0:0|1:151140898_T_TTCTTG:151140898:1,4,1,1
chr1	151142685	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr1	151149218	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:11,4:17,0:8,20,2,2
chr1	151149488	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=81,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.161:41:16,0:19,6:0|1:151149488_C_T:151149488:20,15,2,4
chr1	151149493	.	G	GCTTCTTTGGGCCCTCAGTGATTCTCTAGGGC	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=88,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,6:0.120:56:16,0:33,5:0|1:151149488_C_T:151149488:36,14,2,4
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,2,13
chr1	151188590	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=150,192;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:151188590_C_A:151188590:0,9,0,2
chr1	151188599	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=150,192;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:0|1:151188590_C_A:151188590:0,9,0,2
chr1	151205248	.	AGCAGGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=244,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151205248_AGCAGGGT_A:151205248:0,1,0,1
chr1	151205259	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=244,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:151205248_AGCAGGGT_A:151205248:0,1,0,1
chr1	151209063	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,19,6
chr1	151209117	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=129,118;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.182:47:12,0:27,8:18,21,8,0
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr1	151211747	.	T	TAAAAGTAGAGCGTAACAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.269:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	151212399	.	C	CCTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.894:17:1,9:0,7:1,0,12,4
chr1	151238086	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=18324426,148;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151238086_G_GT:151238086:0,2,0,1
chr1	151238088	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=18324426,148;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151238086_G_GT:151238086:0,2,0,1
chr1	151238089	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=18324426,148;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151238086_G_GT:151238086:0,2,0,1
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr1	151254214	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,0:5,6:0,6,0,6
chr1	151254234	.	G	GTTTTGCCTTTTCCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=239,144;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	151258754	.	TGGGATCTGCCGATATGG	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:10,2:17,0:14,20,1,1
chr1	151258973	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,82;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:6,0:8,2:8,6,1,2
chr1	151260575	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.221:36:12,0:16,6:14,14,1,7
chr1	151260599	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:9,0:12,9:7,14,1,8
chr1	151261098	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=95,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:17,0:13,3:14,16,0,3
chr1	151266464	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.126:23:6,2:10,0:0|1:151266464_CT_C:151266464:15,6,2,0
chr1	151266467	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:11,0:0|1:151266464_CT_C:151266464:13,6,2,0
chr1	151288391	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	151317578	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.533:43:11,14:9,9:10,10,12,11
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	151341557	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:5,12,1,1
chr1	151341567	.	G	GGT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:151341567_G_GGT:151341567:5,12,1,1
chr1	151341569	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:151341567_G_GGT:151341567:4,12,1,1
chr1	151341570	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:151341567_G_GGT:151341567:4,12,1,1
chr1	151341572	.	A	AGCAGTTTCTCTT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:8,0:0|1:151341567_G_GGT:151341567:4,12,1,1
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	151341728	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	151342051	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=156,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:3,2:0|1:151342051_AG_A:151342051:3,4,1,1
chr1	151342059	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=159,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,0:0|1:151342051_AG_A:151342051:4,4,1,1
chr1	151342145	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,2,0
chr1	151345240	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=73,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,11:0,0,17,10
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	151377949	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=79,42;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,0:4,2:13,4,2,0
chr1	151378722	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.347:27:12,7:5,2:8,10,5,4
chr1	151378841	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=89,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,7:6,4:1,8,3,8
chr1	151380502	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=142,165;MMQ=44,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:0,2:5,2:4,1,4,0
chr1	151380507	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=152,151;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.363:12:3,0:5,1:0|1:151380507_AG_A:151380507:6,2,4,0
chr1	151380510	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=27,24;MFRL=152,151;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,0:6,3:0|1:151380507_AG_A:151380507:10,2,4,0
chr1	151380514	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=26,17;MFRL=151,151;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:4,0:5,2:0|1:151380507_AG_A:151380507:11,2,4,0
chr1	151380517	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=148,151;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,0:6,3:0|1:151380507_AG_A:151380507:12,3,4,0
chr1	151380520	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=148,151;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:5,0:7,2:0|1:151380507_AG_A:151380507:13,4,4,0
chr1	151380523	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=147,159;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:5,0:8,2:0|1:151380507_AG_A:151380507:14,5,3,0
chr1	151380725	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=89,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:3,2:4,9,1,2
chr1	151381173	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=99,143;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,4:13,0:12,14,4,0
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr1	151384052	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:2,2:3,4:5,0,6,0
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	151384733	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=291,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,6:0,5:0,1,11,1
chr1	151491030	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,2:9,0:15,9,3,0
chr1	151491689	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=127,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:7,0:15,2:0|1:151491689_A_C:151491689:9,16,1,1
chr1	151491695	.	C	CCTGTG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:15,2:0|1:151491689_A_C:151491689:9,15,1,1
chr1	151492795	.	TAGCTTTGTTTCCCA	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:8,0:0|1:151492795_TAGCTTTGTTTCCCA_T:151492795:6,13,0,2
chr1	151492814	.	CCCTGA	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:5,0:0|1:151492795_TAGCTTTGTTTCCCA_T:151492795:5,9,0,2
chr1	151492823	.	TACC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=215,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:0|1:151492795_TAGCTTTGTTTCCCA_T:151492795:5,8,0,3
chr1	151492828	.	TTTCCTGATCTCTGCTACC	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:8,3:3,0:0|1:151492795_TAGCTTTGTTTCCCA_T:151492795:7,12,0,3
chr1	151493110	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:6,0:9,10,1,1
chr1	151496030	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:6,9,1,1
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	151505088	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=127,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=21,23;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	151506627	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.180:40:16,0:16,6:13,20,0,7
chr1	151508061	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.381:16:1,2:9,3:6,4,3,3
chr1	151509342	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,1:8,3:4,12,2,2
chr1	151512802	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:0,5:4,4:3,1,8,2
chr1	151535020	.	A	ATC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=99,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:5,1:4,2:8,2,2,1
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=99,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:3,5:10,8:10,3,11,2
chr1	151542251	.	G	GTTTGTCA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:19,1:20,2:18,21,1,2
chr1	151546854	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:22,3:28,0:25,25,2,1
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:6,4:1,8:2,5,0,12
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=278,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	151611600	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:151611600_G_T:151611600:1,5,1,1
chr1	151611606	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:151611600_G_T:151611600:1,5,1,1
chr1	151611607	.	C	CACAGATA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:151611600_G_T:151611600:1,5,1,1
chr1	151665100	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr1	151666826	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=78,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.386:14:6,3:2,2:4,5,5,0
chr1	151677684	.	T	TCACAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:1,2:5,0:0|1:151677684_T_TCACAGA:151677684:0,6,0,2
chr1	151677687	.	C	CAGGCGAAATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:1,2:4,0:0|1:151677684_T_TCACAGA:151677684:0,6,0,2
chr1	151678361	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:4,8,1,1
chr1	151679066	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=146,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:1,2:6,0:7,1,2,0
chr1	151679279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=153,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	151679291	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=250,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:151679291_A_G:151679291:0,2,0,1
chr1	151679304	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151679291_A_G:151679291:0,0,0,1
chr1	151679309	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151679291_A_G:151679291:0,0,0,1
chr1	151681567	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:0,1,5,4
chr1	151686983	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	151735711	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.563:5:0,0:2,2:0|1:151735711_G_C:151735711:0,2,3,0
chr1	151735714	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=109,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:0,0:3,1:0|1:151735711_G_C:151735711:1,2,3,0
chr1	151735731	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:4,3:3,4,2,1
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,15,6
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=GA;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.887:7:0,2:0,5:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:0,0,5,2
chr1	151742565	.	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.902:7:0,1:0,5:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:0,0,5,2
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,4,9
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	151748029	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=86,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.216:16:2,1:11,2:3,10,2,1
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	151748976	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,93;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.203:31:15,5:9,0:13,12,6,0
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,4,7
chr1	151752576	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=125,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:13,0:10,6:11,12,0,7
chr1	151754015	.	CG	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=101,66;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.164:34:18,0:10,5:17,12,1,4
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr1	151774041	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=271,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	151774785	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:151774785_A_T:151774785:6,3,1,1
chr1	151774790	.	GGCCTGAGAAGACCCCAGGCC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:5,2:0|1:151774785_A_T:151774785:7,6,1,1
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.765:2:0,1:0,0:0|1:151789609_C_T:151789609:0,0,2,0
chr1	151789611	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0|1:151789609_C_T:151789609:0,0,2,0
chr1	151789647	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	151789785	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr1	151811226	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151823695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:4,5,0,2
chr1	151849695	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=213,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151849695_T_C:151849695:0,1,0,1
chr1	151849697	.	T	TTTCTCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=213,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151849695_T_C:151849695:0,1,0,1
chr1	151849699	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=213,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151849695_T_C:151849695:0,1,0,1
chr1	152005327	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,9:0,0,2,11
chr1	152009530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	152059083	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=75,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:3,2:0|1:152059083_T_A:152059083:5,7,1,1
chr1	152059089	.	C	CTGCCTCCTGACTTCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=66,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:4,2:0|1:152059083_T_A:152059083:4,7,1,1
chr1	152060086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:152060086_G_A:152060086:0,0,0,1
chr1	152060087	.	A	AATTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:152060086_G_A:152060086:0,0,0,1
chr1	152081706	.	TCTCTTCTCTTCTCTTTCCTCTCTCAGCAACTGCTTTTCCTCTTGGGACTTCCTGTCGCGCCTTTTGGCTTCCTTTTGCTCTTCTCGCTCCAGCTGTTCTTCCTCTGGGAAATGCCTGTCGCGCTGCTGCCAGCGC	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,9:0.051:90:15,4:16,1:41,40,1,8
chr1	152084129	.	G	GGTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=140,83;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:9,0:5,2:9,6,1,1
chr1	152128432	.	CTGACCATAGTGGGAACTCTGACCTTGTCTGTTTGGTTGACTGTAGTGGGAACCCTGGCCTTGTCTGTTTGTCTGATCATAATGATAACACTGGCCTTTTCTGTCCATT	C	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=95,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,31:0.049:125:9,14:9,13:37,57,14,17
chr1	152185750	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=1587,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:6,2,4,6
chr1	152186753	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=139,132;MMQ=25,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:0|1:152186753_T_C:152186753:8,13,1,1
chr1	152186766	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,137;MMQ=25,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,3:0.160:23:9,1:10,2:1|0:152186753_T_C:152186753:6,14,2,1
chr1	152187935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=161,166;MMQ=24,23;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:1,2:0|1:152187935_C_T:152187935:1,4,3,0
chr1	152187945	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=162,166;MMQ=24,23;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:152187935_C_T:152187935:1,5,3,0
chr1	152188413	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,96;MMQ=25,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.246:47:17,9:14,2:20,16,4,7
chr1	152190835	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=94,140;MMQ=50,24;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,0:1,4:4,4,3,1
chr1	152190929	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=199,149;MMQ=37,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:152190929_T_A:152190929:2,0,1,1
chr1	152190945	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=157,179;MMQ=24,44;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1|0:152190929_T_A:152190929:0,1,4,0
chr1	152191709	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=97,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:6,6:2,4:5,3,6,4
chr1	152192114	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=108,150;MMQ=60,56;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,2:10,4:11,7,5,1
chr1	152192163	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=92,132;MMQ=50,35;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:10,12,3,0
chr1	152192219	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=126,134;MMQ=50,35;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:5,6,0,5
chr1	152192825	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:2,3:9,3:5,6,6,1
chr1	152193851	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,7:6,2:6,2,7,2
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:3,2:0,1:1,2,0,4
chr1	152195579	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,12:2,3:6,1,11,4
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	152275881	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,0:6,3:5,13,1,2
chr1	152276459	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=185,121;MMQ=40,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr1	152276772	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,119;MMQ=27,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,14:0.297:48:30,4:4,9:7,27,6,8
chr1	152277055	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=113,148;MMQ=50,49;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,3:3,2:8,4,2,3
chr1	152277168	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=163,175;MMQ=40,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,4,2
chr1	152277197	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=141,150;MMQ=58,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:11,2,0,3
chr1	152278792	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=93,487;MMQ=55,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,4:0.082:58:30,3:24,1:0|1:152278792_C_T:152278792:27,27,4,0
chr1	152278814	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=108,90;MMQ=52,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:51,6:0.118:57:31,5:19,1:1|0:152278792_C_T:152278792:29,22,2,4
chr1	152278984	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=129,71;MMQ=27,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:152278984_C_A:152278984:10,8,1,1
chr1	152278988	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=129,71;MMQ=27,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:152278984_C_A:152278984:12,8,1,1
chr1	152279019	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=90,133;MMQ=27,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:26,3:16,0:19,23,2,1
chr1	152279920	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:8,4,2,0
chr1	152281304	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,207;MMQ=50,54;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,3:13,1:9,13,1,3
chr1	152281479	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=111,106;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.679:41:2,16:10,12:7,6,8,20
chr1	152281523	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=130,174;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:6,1:7,6:0|1:152281523_A_C:152281523:6,8,0,7
chr1	152281534	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=130,162;MMQ=60,43;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,1:6,4:0|1:152281523_A_C:152281523:5,7,0,6
chr1	152281690	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=87,144;MMQ=57,44;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.454:22:4,4:8,5:4,8,4,6
chr1	152282311	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:7,3:4,2:5,6,3,3
chr1	152282917	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=77,132;MMQ=60,53;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:9,5:2,2:8,3,5,2
chr1	152282928	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=109,1700;MMQ=60,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:20,2:3,2:0|1:152282928_C_T:152282928:15,8,0,4
chr1	152282931	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=109,1700;MMQ=60,20;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:19,2:2,2:0|1:152282928_C_T:152282928:14,8,0,4
chr1	152283660	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=100,1095;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,0:13,4:10,13,4,0
chr1	152283975	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=133,132;MMQ=27,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,5:5,4:3,5,4,5
chr1	152284006	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=127,55;MMQ=35,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:0|1:152284006_T_C:152284006:6,6,1,1
chr1	152284011	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=128,55;MMQ=40,21;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,0:6,2:0|1:152284006_T_C:152284006:6,7,1,1
chr1	152284014	.	A	ATCCTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=134,55;MMQ=45,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:152284006_T_C:152284006:5,7,1,1
chr1	152284095	.	ATGGCCTGACACTGACTGTGTGTCTGACTCCTCTGAATGTCCCTCACTATCAC	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=86,155;MMQ=57,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.110:28:10,0:2,3:0|1:152284095_ATGGCCTGACACTGACTGTGTGTCTGACTCCTCTGAATGTCCCTCACTATCAC_A:152284095:9,15,1,3
chr1	152284121	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=161,79;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.184:14:8,2:4,0:1|0:152284095_ATGGCCTGACACTGACTGTGTGTCTGACTCCTCTGAATGTCCCTCACTATCAC_A:152284095:3,9,0,2
chr1	152284123	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=161,79;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.184:14:8,2:4,0:1|0:152284095_ATGGCCTGACACTGACTGTGTGTCTGACTCCTCTGAATGTCCCTCACTATCAC_A:152284095:3,9,0,2
chr1	152284125	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=161,79;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.184:14:8,1:4,0:1|0:152284095_ATGGCCTGACACTGACTGTGTGTCTGACTCCTCTGAATGTCCCTCACTATCAC_A:152284095:3,9,0,2
chr1	152284644	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=99,3122;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,4:9,0:6,14,0,4
chr1	152284854	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,143;MMQ=60,51;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:2,5,2,3
chr1	152284997	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:6,10,2,0
chr1	152285099	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:2,4,7,6
chr1	152286367	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=100,145;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:5,8,1,2
chr1	152323686	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=94,4009370;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:10,0:13,9,0,3
chr1	152323812	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:5,0:0|1:152323812_C_T:152323812:4,8,1,1
chr1	152323834	.	C	CTG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:152323812_C_T:152323812:6,8,1,1
chr1	152323837	.	C	CATGTAT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.202:18:8,2:7,0:0|1:152323812_C_T:152323812:6,9,2,1
chr1	152323838	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.202:18:8,2:7,0:0|1:152323812_C_T:152323812:6,9,2,1
chr1	152325368	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:152325368_G_A:152325368:5,10,1,1
chr1	152325374	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:152325368_G_A:152325368:5,11,1,1
chr1	152326887	.	AGACTGACCTGAGCCCGATCCATATTGGCCAAAGCCAGAG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=86,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:5,1:6,1:12,12,1,1
chr1	152328073	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=88,76;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:21,2:6,0:0|1:152328073_G_A:152328073:13,15,1,1
chr1	152328080	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,76;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:21,2:6,0:0|1:152328073_G_A:152328073:14,15,1,1
chr1	152329435	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:3,2,1,2
chr1	152331153	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	152382062	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:5,0:0,4:4,1,3,2
chr1	152382120	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:6,3,2,2
chr1	152382453	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.088:64:23,2:36,3:36,23,4,1
chr1	152383447	.	A	AACTTGTGTATTAAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152383447_A_AACTTGTGTATTAAGT:152383447:0,1,0,1
chr1	152383449	.	C	CAAGGAAAACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152383447_A_AACTTGTGTATTAAGT:152383447:0,1,0,1
chr1	152384498	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr1	152384759	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=99,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	152484418	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,3:8,1:12,6,4,0
chr1	152538358	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=132,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:7,3,5,0
chr1	152538802	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	152552346	.	GGGGACACTTGGGTGA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:12,3:6,1:10,13,4,0
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=164,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:3,1:3,5,0,4
chr1	152659421	.	CC	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:3,0:14,2:7,11,1,1
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=78,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.414:7:1,2:3,0:2,2,3,0
chr1	152691943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=83,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr1	152692472	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,7:4,7:1,4,3,11
chr1	152692781	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:2,6,4,6
chr1	152692948	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=80,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:8,4:6,7:0|1:152692948_T_A:152692948:7,8,5,6
chr1	152692952	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=80,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:9,4:6,6:0|1:152692948_T_A:152692948:7,8,5,5
chr1	152733740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:4,7,2,1
chr1	152734493	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:4,12,0,3
chr1	152760339	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=107,10786;MMQ=27,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,0:7,5:7,7,5,0
chr1	152770828	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=129,76;MMQ=52,51;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:8,3,2,1
chr1	152771078	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,112;MMQ=51,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:7,12,1,1
chr1	152777868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=180,165;MMQ=60,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:3,0:4,1,1,1
chr1	152778062	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:0|1:152778062_A_T:152778062:0,7,0,3
chr1	152778066	.	TGATGAAC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,3:4,0:0|1:152778062_A_T:152778062:0,7,0,3
chr1	152778075	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,0:0|1:152778062_A_T:152778062:0,5,0,3
chr1	152882338	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=84,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:10,1:0|1:152882338_C_T:152882338:8,11,1,1
chr1	152882354	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=69,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:152882338_C_T:152882338:7,9,1,1
chr1	152883164	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=82,64;MMQ=60,53;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.203:16:5,2:7,0:0|1:152883164_T_G:152883164:8,5,2,1
chr1	152883173	.	G	GGGGAGAACAGGCCGTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=67,64;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.179:18:6,3:9,0:0|1:152883164_T_G:152883164:10,5,2,1
chr1	152883861	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=148,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:12,0:0|1:152883861_C_G:152883861:15,12,1,1
chr1	152883864	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,2:12,0:0|1:152883861_C_G:152883861:15,13,1,1
chr1	152883867	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,2:10,0:0|1:152883861_C_G:152883861:15,13,1,1
chr1	152884433	.	T	TTAAATCTTGGCTCCACCACTGGCTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	152944594	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=169,67;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,3:6,7:5,3,6,4
chr1	152975829	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=96,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:3,3:5,3:3,7,4,2
chr1	152975941	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:9,5,4,4
chr1	152976371	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:152976371_T_TG:152976371:0,4,0,1
chr1	152976372	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:152976371_T_TG:152976371:0,4,0,1
chr1	152976375	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:152976371_T_TG:152976371:0,4,0,1
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=107,37;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:5,2:7,2:0|1:153004778_C_T:153004778:8,4,4,0
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:8,4:8,3:0|1:153004778_C_T:153004778:10,6,7,0
chr1	153004848	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.345:30:11,4:8,5:0|1:153004848_T_C:153004848:11,9,9,1
chr1	153004853	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,12:0.373:33:7,4:7,8:0|1:153004848_T_C:153004848:11,10,10,2
chr1	153004983	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=70,151;MMQ=52,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.346:18:6,5:4,0:8,4,2,4
chr1	153005156	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=62,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:5,5:4,8,5,5
chr1	153012766	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=199,109;MMQ=40,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:153012766_G_A:153012766:1,2,0,1
chr1	153012785	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=199,109;MMQ=40,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:153012766_G_A:153012766:0,3,0,1
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,5:1,0:5,0,4,1
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,283;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr1	153190542	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	153233642	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153233642_G_C:153233642:0,1,0,1
chr1	153233645	.	G	GATCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:153233642_G_C:153233642:0,1,0,1
chr1	153233648	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153233642_G_C:153233642:0,0,0,1
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	153270704	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,0:0,6:0,0,0,7
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	153279730	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=106,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:4,4,0,2
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,7,11
chr1	153314153	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	153318759	.	C	CCCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr1	153320372	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,9:0,20:0,0,15,15
chr1	153362788	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,1:2,5:5,0,4,2
chr1	153390542	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,109;MMQ=43,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.383:18:8,1:3,4:8,3,4,3
chr1	153391786	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,3:5,6:2,11,2,7
chr1	153410798	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,6:4,3:2,6,2,7
chr1	153410822	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:1,6,0,7
chr1	153430249	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,4:5,5:6,2,9,0
chr1	153430514	.	GGAGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=97,88;MMQ=59,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:153430514_GGAGGA_G:153430514:2,2,0,1
chr1	153430520	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=97,88;MMQ=59,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:153430514_GGAGGA_G:153430514:2,2,0,1
chr1	153430525	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,16;MFRL=97,88;MMQ=59,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:153430514_GGAGGA_G:153430514:2,2,0,1
chr1	153430527	.	ATACAG	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=133,61;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:153430527_ATACAG_A:153430527:1,3,1,1
chr1	153430528	.	TA	AG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=21,22;MFRL=133,88;MMQ=59,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.258:6:3,1:1,0:0|1:153430514_GGAGGA_G:153430514:2,3,0,1
chr1	153430531	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=20,23;MFRL=133,88;MMQ=59,54;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.258:6:3,1:2,0:0|1:153430514_GGAGGA_G:153430514:2,3,0,1
chr1	153430535	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=133,61;MMQ=58,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:153430527_ATACAG_A:153430527:1,3,1,1
chr1	153431406	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,7,10
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:10,6:7,6:6,11,6,6
chr1	153512724	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:0,2,1,7
chr1	153513836	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=93,227;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:6,0:7,4,4,0
chr1	153516162	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:3,1:6,1,2,0
chr1	153534055	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.119:30:12,2:15,1:0|1:153534055_CA_C:153534055:9,18,1,2
chr1	153534059	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.120:30:12,1:15,1:0|1:153534055_CA_C:153534055:9,18,1,2
chr1	153535848	.	CA	C,CAA	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,30,19;MFRL=107,124,132;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.84,9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,9,8:0.195,0.203:40:9,1,2:9,5,1:16,7,7,10
chr1	153535868	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.046:91:30,3:43,0:30,57,3,1
chr1	153587308	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,2,0
chr1	153588261	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=104,167;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:14,4:10,0:12,12,4,0
chr1	153588283	.	GG	TT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.091:30:16,0:11,2:12,16,1,1
chr1	153598888	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:13,7:15,0:15,13,7,0
chr1	153600710	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:2,3,2,3
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:5,6:7,5:8,4,10,1
chr1	153614712	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,6:7,10:6,6,3,13
chr1	153617510	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.402:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr1	153632139	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=317,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	153633595	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:7,0,1,1
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:2,2:2,4:3,1,6,0
chr1	153636432	.	T	TTAC,TTACTACTAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,21,24;MFRL=125,207,166;MMQ=60,60,50;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,16;RU=TAC;STR;TLOD=3.03,6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.295,0.448:4:0,0,1:1,1,1:1,0,3,0
chr1	153637022	.	G	GAACTA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr1	153637037	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,27;MFRL=226,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,2,0,1
chr1	153637042	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=226,254;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,2,0,1
chr1	153637044	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=226,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,2,0,1
chr1	153637046	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=220,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,1,0,1
chr1	153637047	.	G	GCTATTGTTA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=220,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,1,0,1
chr1	153637050	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,24;MFRL=220,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,1,0,1
chr1	153637052	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=220,254;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153637037_AAG_A:153637037:0,1,0,1
chr1	153638308	.	C	CATTCCCATGTAACCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	153640827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr1	153642249	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:0|1:153642249_GA_G:153642249:14,8,1,1
chr1	153642251	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:0|1:153642249_GA_G:153642249:14,8,1,1
chr1	153642255	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:17,9,1,1
chr1	153653671	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,0:14,2:10,9,1,1
chr1	153656405	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	153658187	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,5:1,0:1,3,6,0
chr1	153658767	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr1	153660109	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:4,0:0|1:153660109_G_A:153660109:6,6,1,1
chr1	153660114	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:153660109_G_A:153660109:6,7,1,1
chr1	153662340	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:5,6:5,3:0|1:153662340_G_A:153662340:4,6,6,4
chr1	153662343	.	T	TAAGAGAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:0|1:153662340_G_A:153662340:9,9,1,1
chr1	153662347	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:153662340_G_A:153662340:9,9,1,1
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,2:2,3:3,2,2,3
chr1	153701314	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:17,3:4,0:0,21,0,3
chr1	153719760	.	G	GA	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:20,2:18,0:0|1:153719760_G_GA:153719760:24,15,1,1
chr1	153719763	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:21,2:20,0:0|1:153719760_G_GA:153719760:28,15,1,1
chr1	153719765	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=119,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:21,2:18,0:0|1:153719760_G_GA:153719760:29,15,1,1
chr1	153719767	.	G	GGTGTCAATTTTGAATCTT	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:23,2:20,0:0|1:153719760_G_GA:153719760:29,15,1,1
chr1	153740051	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	153742390	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=214,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:153742390_A_T:153742390:0,1,0,1
chr1	153742392	.	TATCAGGAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=214,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153742390_A_T:153742390:0,1,0,1
chr1	153744934	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=161,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:11,1:22,1:18,16,1,1
chr1	153746473	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.153:25:7,0:14,3:12,10,2,1
chr1	153746478	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.158:24:6,0:14,3:0|1:153746478_T_TG:153746478:11,10,2,1
chr1	153746486	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:9,2:0|1:153746478_T_TG:153746478:6,8,2,1
chr1	153790017	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:5,8,1,1
chr1	153790030	.	G	GCAGCAAGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:153790030_G_GCAGCAAGA:153790030:3,8,1,1
chr1	153790035	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:153790030_G_GCAGCAAGA:153790030:4,8,1,1
chr1	153790501	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,7:6,6:4,4,8,5
chr1	153904885	.	CA	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:11,2:9,15,0,2
chr1	153906397	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,8:3,4:0,7,2,10
chr1	153907278	.	CCTGCTGCTG	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=155,585648;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=CTG;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,2:5,0:6,4,1,1
chr1	153907279	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:153907279_C_T:153907279:10,6,1,1
chr1	153907302	.	G	GCCGTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:153907279_C_T:153907279:5,4,1,1
chr1	153907306	.	T	TCCTA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,1:0|1:153907279_C_T:153907279:5,3,1,1
chr1	153920564	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:8,1,3,0
chr1	153924534	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:10,7,2,0
chr1	153925983	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,124;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:7,6,3,0
chr1	153927270	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	153949331	.	C	CCACATGGAATGAGGGCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:9,5,1,1
chr1	153949389	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:0|1:153949389_G_A:153949389:10,4,1,1
chr1	153949395	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:8,0:0|1:153949389_G_A:153949389:8,8,1,1
chr1	153954674	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=69,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:6,3:7,8:6,7,5,6
chr1	153954778	.	AACAC	A,AACACAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=14,26,28;MFRL=84,122,169;MMQ=60,60,44;MPOS=5,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=AC;STR;TLOD=6.63,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.353,0.365:6:0,0,0:0,3,1:0,1,5,0
chr1	153955141	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=114,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:8,0:20,2:18,11,2,0
chr1	153963995	.	A	AAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:3,9:11,6:8,6,12,4
chr1	153967487	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,1:2,1:3,0,2,1
chr1	153995870	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	153998137	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:5,12,0,2
chr1	154018452	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	154018454	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=188,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	154018455	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=194,193;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	154027381	.	ATTTT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.519:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	154029450	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,6:6,6:4,6,5,7
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	154115980	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,0:10,3:13,14,1,2
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.285:45:18,4:9,7:13,19,8,5
chr1	154144970	.	G	GAGATCTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154144970_G_GAGATCTGC:154144970:0,1,0,1
chr1	154144972	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154144970_G_GAGATCTGC:154144970:0,1,0,1
chr1	154145775	.	C	CACTCCATTCAGCTCCACTCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	154171981	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.127:41:19,0:17,4:21,15,5,0
chr1	154185184	.	TGGAGTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	154186505	.	A	AGGTGTTTTTCTTCTATGAGATAAT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=208,121;MMQ=50,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.274:5:2,1:2,0:0|1:154186505_A_AGGTGTTTTTCTTCTATGAGATAAT:154186505:0,4,0,1
chr1	154186514	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=192,177;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:154186505_A_AGGTGTTTTTCTTCTATGAGATAAT:154186505:0,4,0,1
chr1	154186519	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=192,177;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:154186505_A_AGGTGTTTTTCTTCTATGAGATAAT:154186505:0,4,0,1
chr1	154186523	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=186,177;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:154186505_A_AGGTGTTTTTCTTCTATGAGATAAT:154186505:0,3,0,1
chr1	154186918	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,4:4,0:8,3,2,2
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr1	154207659	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,8:0.170:51:20,8:18,0:33,10,8,0
chr1	154207674	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.083:57:28,3:21,1:36,17,3,1
chr1	154209050	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:14,2:14,0:0|1:154209050_G_C:154209050:14,16,1,1
chr1	154209056	.	C	CAGTCAGCATTA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:16,0:0|1:154209050_G_C:154209050:14,19,1,1
chr1	154209502	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,77;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:8,7:12,0:13,7,7,0
chr1	154218639	.	TTCAG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr1	154227292	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:3,3:0,0:3,0,2,1
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:1,5,0,9
chr1	154239144	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=236,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	154245142	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,6:5,5:5,3,7,4
chr1	154245372	.	A	AGATGTTACTGATGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154245372_A_AGATGTTACTGATGTG:154245372:0,1,0,1
chr1	154245374	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154245372_A_AGATGTTACTGATGTG:154245372:0,1,0,1
chr1	154248060	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:13,7:14,0:22,5,7,0
chr1	154248077	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,2:15,0:0|1:154248077_G_A:154248077:29,5,1,1
chr1	154248086	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.072:40:17,2:17,0:0|1:154248077_G_A:154248077:29,9,1,1
chr1	154248142	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.180:48:19,0:21,8:14,26,0,8
chr1	154300390	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:4,0:2,9,1,2
chr1	154303228	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,3:5,3:5,1,5,1
chr1	154304071	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:11,0:9,11,3,0
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,12,3
chr1	154313232	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,3,4
chr1	154317347	.	TGA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr1	154317418	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=100,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,4:0,4:1,0,9,0
chr1	154317674	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.159:16:7,2:7,0:0|1:154317674_G_T:154317674:5,9,1,1
chr1	154317677	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.161:16:6,1:7,0:0|1:154317674_G_T:154317674:5,9,1,1
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	154401796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,1:4,7:2,4,5,4
chr1	154401972	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr1	154407150	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,65;MMQ=60,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:14,0:18,5:12,22,5,0
chr1	154407419	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:5,0,4,0
chr1	154407713	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr1	154407724	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=196,0;MMQ=60,20;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr1	154420517	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.382:13:3,3:5,1:7,1,3,2
chr1	154420768	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr1	154426970	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=84,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:12,4:5,6:9,9,1,9
chr1	154437596	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=94,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.103:65:30,6:29,0:28,31,6,0
chr1	154437628	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=98,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.125:54:26,6:22,0:24,24,6,0
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	154461755	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,59;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:9,2:8,0:0|1:154461755_C_T:154461755:6,11,1,1
chr1	154461778	.	T	TATTTTCAATTTGGTGGAGTCTGCCAGGGCAGAGAC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,59;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:154461755_C_T:154461755:11,9,1,1
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,1,2
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,2:1,3:6,2,3,2
chr1	154492935	.	T	TTCAGGCACTGGCAGAGGACAAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	154515193	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,3:6,9:5,5,8,4
chr1	154517025	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:0|1:154517025_G_A:154517025:2,12,1,1
chr1	154517029	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0|1:154517025_G_A:154517025:2,12,1,1
chr1	154517217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr1	154519800	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	154523583	.	A	AAAGTGCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154524747	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr1	154524808	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,2,2
chr1	154524973	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=111,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:5,4:9,6:9,6,5,5
chr1	154525031	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:3,2,0,8
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	154528352	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:13,5,2,0
chr1	154528363	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:15,6,2,1
chr1	154543939	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:6,0:8,2:4,13,1,1
chr1	154544437	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	154544497	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=229,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=49,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,6:4,7:6,2,8,5
chr1	154570940	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,113;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,0:17,3:12,15,0,3
chr1	154575040	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr1	154680585	.	AGCT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCT;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:1,0:0|1:154680585_AGCT_A:154680585:4,1,1,1
chr1	154680599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1|0:154680585_AGCT_A:154680585:7,3,1,1
chr1	154680613	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.200:13:7,2:3,0:1|0:154680585_AGCT_A:154680585:8,3,1,1
chr1	154832290	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	154841415	.	TCTCTCTCTCTCACA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:2,3:5,0,8,0
chr1	154901569	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:10,0:9,2:12,8,0,2
chr1	154920335	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:154920335_T_A:154920335:0,0,0,1
chr1	154920337	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:154920335_T_A:154920335:2,1,0,1
chr1	154920342	.	C	CTTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:154920335_T_A:154920335:2,1,0,1
chr1	154965418	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:12,0:9,8:10,11,0,9
chr1	154965594	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=158,21909533;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	154987959	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:154987959_G_A:154987959:9,12,1,1
chr1	154987966	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:154987959_G_A:154987959:11,11,1,1
chr1	154988957	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:2,2:4,8:3,4,4,6
chr1	154991111	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=96,63;MMQ=60,20;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,8:0.124:69:37,7:22,1:28,33,0,8
chr1	154995503	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	154996272	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,2:11,1:17,9,2,1
chr1	155001929	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:2,5,1,5
chr1	155001947	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:1,4:0,7,0,5
chr1	155003963	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,11;MFRL=89,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:155003963_A_C:155003963:1,1,1,0
chr1	155003981	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=18,11;MFRL=89,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:155003963_A_C:155003963:1,1,1,0
chr1	155003987	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=89,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:155003963_A_C:155003963:1,1,1,0
chr1	155003988	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0|1:155003988_C_CA:155003988:0,0,1,0
chr1	155003992	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155003988_C_CA:155003988:0,0,1,0
chr1	155003995	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155003988_C_CA:155003988:0,0,1,0
chr1	155004000	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:155003988_C_CA:155003988:1,0,1,0
chr1	155004005	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155003988_C_CA:155003988:2,0,1,0
chr1	155006091	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:7,5:9,9:11,5,4,10
chr1	155014030	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:7,0:9,19:4,12,0,19
chr1	155019885	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.384:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	155028522	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr1	155033317	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=76,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:2,1,0,3
chr1	155033334	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=162,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:0,3,2,1
chr1	155034680	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=217,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:0,0:1,2,1,0
chr1	155034687	.	C	CCCCCCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,1:1,1:5,2,2,0
chr1	155039313	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:9,0:12,2:0|1:155039313_C_CA:155039313:13,12,1,1
chr1	155039323	.	GG	TT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:155039313_C_CA:155039313:14,12,1,1
chr1	155058816	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,2,2
chr1	155058820	.	T	TGCTGCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCTGCC;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,2,2
chr1	155059035	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:1,2:1,3,2,4
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	155108894	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=116,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:11,0:0|1:155108894_G_A:155108894:12,13,1,1
chr1	155108899	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=116,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:8,0:0|1:155108894_G_A:155108894:12,11,1,1
chr1	155108945	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=119,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:155108945_C_T:155108945:3,7,1,1
chr1	155108948	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=119,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:155108945_C_T:155108945:3,7,1,1
chr1	155108957	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=154,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:155108945_C_T:155108945:3,8,1,1
chr1	155109218	.	CA	C,CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=136,169,157;MMQ=60,60,60;MPOS=28,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.08,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.208,0.208:15:4,0,0:5,3,3:9,0,6,0
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=101,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:9,10:6,5:11,4,11,4
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=88,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.396:51:18,10:13,10:22,9,13,7
chr1	155148609	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=101,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:9,0:13,3:9,14,0,3
chr1	155149670	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:5,0:0|1:155149670_G_A:155149670:10,8,1,1
chr1	155149679	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:0|1:155149670_G_A:155149670:15,6,1,1
chr1	155151037	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:6,3:12,0:7,13,3,0
chr1	155159774	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=129,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:155159774_C_T:155159774:16,9,1,1
chr1	155159776	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=129,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:155159774_C_T:155159774:16,9,1,1
chr1	155161794	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=112,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,2:3,4:4,2,5,2
chr1	155162067	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:8,2:8,4:7,9,1,5
chr1	155167583	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:155167583_C_T:155167583:14,6,2,0
chr1	155167589	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,3:0.191:19:7,3:9,0:1|0:155167583_C_T:155167583:10,6,3,0
chr1	155167786	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=115,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:1,2:6,4:5,4,1,5
chr1	155171262	.	GGGGCTGTGGGCT	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,2:16,0:24,14,1,1
chr1	155173418	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:0|1:155173418_AG_A:155173418:1,8,0,2
chr1	155173422	.	ACAGG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:155173418_AG_A:155173418:1,8,0,2
chr1	155174564	.	G	GTATCTAATTTGATAGCACACAGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,1,1
chr1	155175089	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=92,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,3:5,6:6,9,1,8
chr1	155176262	.	AG	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=209,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,90;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,5:4,9:5,5,5,9
chr1	155182435	.	G	T	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,136;MMQ=57,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=106.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,53:0.629:84:18,53:12,0:19,12,53,0
chr1	155182470	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=141,126;MMQ=53,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:13,11:7,9:10,10,13,7
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr1	155186722	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=114,90;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.245:39:12,0:17,9:12,18,0,9
chr1	155186729	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,7:6,8:4,7,6,9
chr1	155194531	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,125;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.543:8:0,0:4,4:4,0,4,0
chr1	155205662	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=189,112;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:155205662_C_T:155205662:0,4,0,1
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	155205672	.	A	ACCATTCTTAACAAGTGCTGGCTGTGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=181,112;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:155205662_C_T:155205662:0,3,0,1
chr1	155205680	.	G	GATTTTATAGAATGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155206311	.	C	CATCCCCACAGACAAACCCAGAAATAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=205,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.361:6:2,1:1,0:0|1:155206311_C_CATCCCCACAGACAAACCCAGAAATAA:155206311:0,5,0,1
chr1	155206313	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.386:4:1,1:1,0:0|1:155206311_C_CATCCCCACAGACAAACCCAGAAATAA:155206311:0,3,0,1
chr1	155206341	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	155207030	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=153,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,1:6,12:5,4,9,4
chr1	155218168	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:4,2:0,3:3,1,4,2
chr1	155218365	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr1	155223417	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=109,73;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:10,3:20,2:16,14,1,4
chr1	155224091	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=222,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	155224301	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,1,2
chr1	155230024	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=155,203;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:155230024_T_C:155230024:3,0,1,0
chr1	155230028	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=155,203;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:155230024_T_C:155230024:3,0,1,0
chr1	155230040	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=179,203;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:155230040_CA_TG:155230040:3,0,1,0
chr1	155230044	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=179,203;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:155230040_CA_TG:155230040:3,0,1,0
chr1	155230131	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,4:3,1:2,5,5,0
chr1	155231545	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,1:5,3:2,6,0,4
chr1	155247707	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr1	155252496	.	GC	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=98,52;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.180:37:22,0:7,6:14,17,0,6
chr1	155255837	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155260350	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,1,1
chr1	155261577	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:12,10,1,1
chr1	155263043	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=105,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.161:26:7,2:14,0:0|1:155263043_A_C:155263043:11,11,3,1
chr1	155263046	.	T	TGAGATTTTCCTCC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=105,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.163:26:7,3:14,1:0|1:155263043_A_C:155263043:12,10,3,1
chr1	155263048	.	A	ACTACCCAAAAG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=105,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.163:26:8,1:13,0:0|1:155263043_A_C:155263043:12,10,3,1
chr1	155265177	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,1,3
chr1	155288822	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	155289545	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:1,4:9,6:6,4,6,4
chr1	155290447	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr1	155291027	.	CCCCCACCCCTTTCCTGCATTCACCAGACAAACTCTGCGTATTG	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:7,0:12,2:15,27,1,1
chr1	155291756	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:3,0:2,3:2,3,0,3
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	155317582	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=91,180;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:11,0:11,7:0|1:155317582_T_C:155317582:12,10,0,7
chr1	155317587	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=91,180;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:9,0:9,7:0|1:155317582_T_C:155317582:8,10,0,7
chr1	155324369	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,2:12,0:13,10,1,1
chr1	155429725	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr1	155448755	.	CCG	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.343:11:3,2:4,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:1,6,1,3
chr1	155448758	.	AATTTCACTTAGGCGACTTATTAGTTCCTCCAGCTCTG	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:3,2:4,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:4,6,0,3
chr1	155448798	.	ATAAAGTC	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,21;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=-39;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:4,2:1,0:0|1:155448755_CCG_C:155448755:7,2,0,3
chr1	155448808	.	GATCCTGTCT	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:3,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:10,0,0,2
chr1	155448822	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:10,0,0,2
chr1	155448824	.	AAGCTGGGGATATTTCTTT	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=28,22;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,1:5,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:13,2,0,2
chr1	155448847	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:13,2,0,2
chr1	155448849	.	TTTCGTTTCTG	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=24,24;MFRL=112,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:8,1:0|1:155448755_CCG_C:155448755:13,4,0,2
chr1	155449123	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:2,1:10,2:0|1:155449123_G_A:155449123:6,6,0,3
chr1	155449126	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:155449123_G_A:155449123:6,7,0,2
chr1	155451935	.	AG	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:9,13,1,1
chr1	155581311	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=119,112;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:2,4,3,6
chr1	155582145	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,115;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:11,4:7,2:14,4,0,7
chr1	155583172	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:7,1:0,1:6,2,2,0
chr1	155630752	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	155638525	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:5,6,1,2
chr1	155686739	.	CAA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:2,2:6,1:8,12,3,0
chr1	155687004	.	A	ACAAACCTTATTTATGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=196,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,0:2,1:0|1:155687004_A_ACAAACCTTATTTATGC:155687004:0,2,0,1
chr1	155687007	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=196,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155687004_A_ACAAACCTTATTTATGC:155687004:0,2,0,1
chr1	155687009	.	A	ACAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=196,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155687004_A_ACAAACCTTATTTATGC:155687004:0,2,0,1
chr1	155695904	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=160,119;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.581:5:0,2:0,1:0,2,0,3
chr1	155701055	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:5,1:7,7,1,2
chr1	155720556	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.289:18:6,1:7,4:3,10,0,5
chr1	155720596	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=167,149;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155720596_TG_CC:155720596:0,3,0,1
chr1	155720600	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=167,149;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:155720596_TG_CC:155720596:0,3,0,1
chr1	155724315	.	G	GTT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=211,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,25;RU=T;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.683:11:0,5:2,3:0,3,6,2
chr1	155724328	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=103,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:14,3,0,2
chr1	155734982	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:6,9,3,0
chr1	155735012	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.477:15:2,5:5,2:6,2,3,4
chr1	155746340	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=66,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:1,4:3,3:0,4,0,9
chr1	155747369	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:7,0:15,3:18,10,2,1
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr1	155755239	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=106.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr1	155785629	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:17,2:18,3:17,18,3,2
chr1	155786003	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:9,0:19,4:14,14,0,4
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	155823120	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:2,4,6,3
chr1	155829511	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,4:9,5:13,2,6,3
chr1	155829628	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,166;MMQ=60,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,0:8,5:9,12,0,5
chr1	155837865	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr1	155837920	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:11,2:30,0:29,12,0,2
chr1	155850889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	155870416	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	155880159	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr1	155880391	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,2,5
chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr1	155884155	.	GA	G,GAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34,32;MFRL=127,186,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.76,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,3:0.302,0.194:17:4,1,1:3,4,2:1,8,1,7
chr1	155891230	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:15,6:9,0:13,11,6,0
chr1	155895533	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,0:5,2:0|1:155895533_C_T:155895533:8,12,1,1
chr1	155895553	.	GA	TT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:155895533_C_T:155895533:8,16,1,1
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.446:16:1,3:8,4:7,2,6,1
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:7,6:10,12:5,12,7,11
chr1	155904177	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,13,7
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	155920672	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:7,2:6,2:4,9,2,2
chr1	155927752	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,13
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,2,7
chr1	155935244	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:6,7:6,7:5,7,1,13
chr1	155935299	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:155935299_C_CA:155935299:0,12,0,2
chr1	155935300	.	T	TCTCCACCAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:155935299_C_CA:155935299:0,12,0,2
chr1	156108600	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr1	156131050	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,0:2,4:4,5,1,3
chr1	156145318	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=98,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,22:0.397:56:11,22:23,0:12,22,21,1
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156180122	.	T	TCTGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:156180122_T_TCTGC:156180122:9,11,0,2
chr1	156180124	.	A	AAGGCCCGGCGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:156180122_T_TCTGC:156180122:9,11,0,2
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:1,3:5,4:6,0,8,0
chr1	156202076	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:8,2,0,2
chr1	156202292	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,253;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	156209394	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:8,4:13,0:7,16,3,1
chr1	156213695	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=96,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:6,3:9,5:8,7,5,3
chr1	156214166	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=179,192;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0|1:156214166_A_G:156214166:0,3,0,6
chr1	156214171	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=179,192;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0|1:156214166_A_G:156214166:0,3,0,6
chr1	156214601	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.297:28:3,1:16,7:3,17,4,4
chr1	156214625	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:5,6,1,1
chr1	156214641	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,1:5,6:4,4,2,5
chr1	156230272	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=73,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:4,5:10,3:8,6,4,4
chr1	156235800	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:3,2,0,7
chr1	156236549	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr1	156237496	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:11,2:4,0:10,7,1,2
chr1	156247907	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr1	156247924	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=151,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:156247924_A_C:156247924:0,3,0,1
chr1	156247928	.	CC	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:156247924_A_C:156247924:0,4,0,1
chr1	156247932	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,21;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:156247924_A_C:156247924:0,4,0,1
chr1	156247934	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:156247924_A_C:156247924:0,4,0,1
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	156262899	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:156262899_A_G:156262899:9,13,1,1
chr1	156262907	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:156262899_A_G:156262899:7,11,1,1
chr1	156262908	.	A	AAGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:6,2:0|1:156262899_A_G:156262899:7,9,1,1
chr1	156264383	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0,12,0,2
chr1	156278978	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,0:8,3:8,3,2,1
chr1	156280296	.	GATAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATAA;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr1	156287360	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	156347131	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:7,7:4,8:6,5,7,9
chr1	156347683	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156347683_A_C:156347683:0,0,2,0
chr1	156347687	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156347683_A_C:156347683:0,0,2,0
chr1	156347690	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:156347683_A_C:156347683:0,0,2,0
chr1	156347693	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:156347683_A_C:156347683:1,0,1,0
chr1	156347696	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=20,13;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156347683_A_C:156347683:1,0,1,0
chr1	156347699	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,14;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156347683_A_C:156347683:1,0,1,0
chr1	156347702	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,17;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156347683_A_C:156347683:1,0,1,0
chr1	156347704	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,14;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156347683_A_C:156347683:1,0,1,0
chr1	156347964	.	G	GAGACTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:6,0,1,1
chr1	156351399	.	A	ATTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156351399_A_ATTTT:156351399:1,0,0,1
chr1	156351401	.	A	ACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156351399_A_ATTTT:156351399:1,0,0,1
chr1	156354293	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=92,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:4,2,5,1
chr1	156354347	.	TC	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=84,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:10,3:4,6:8,8,6,3
chr1	156354367	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=115,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.529:27:6,6:4,8:5,8,7,7
chr1	156374432	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=66,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:11,8,0,2
chr1	156374476	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156374476_G_A:156374476:0,3,0,1
chr1	156374479	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156374476_G_A:156374476:0,3,0,1
chr1	156374484	.	ATGATCTCGGCT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	156377072	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	156390262	.	GGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:3,2:0,5,0,2
chr1	156396550	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:15,0:26,2:0|1:156396550_C_T:156396550:29,12,1,1
chr1	156396568	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:18,0:25,2:0|1:156396550_C_T:156396550:25,19,1,1
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,2:5,2:3,4,3,1
chr1	156496179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=138,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:0|1:156496179_C_T:156496179:3,0,1,0
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:156496179_C_T:156496179:0,0,4,0
chr1	156498673	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	156500014	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:4,12,2,0
chr1	156500128	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	156502991	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,5:1,6:1,0,8,3
chr1	156503807	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr1	156503947	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,2,1
chr1	156504579	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=207,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.822:26:3,19:1,2:0,4,0,22
chr1	156504964	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:156504964_C_T:156504964:7,6,1,1
chr1	156504968	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:156504964_C_T:156504964:7,6,1,1
chr1	156505061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:2,0:7,5:3,6,3,2
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	156510483	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=108,96;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:156510483_A_G:156510483:4,3,2,0
chr1	156510488	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=122,96;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:0|1:156510483_A_G:156510483:4,4,2,0
chr1	156510716	.	GA	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,2:7,0:8,11,1,1
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:156520173_T_A:156520173:0,0,0,4
chr1	156520176	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:156520173_T_A:156520173:0,4,0,1
chr1	156520184	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=157,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156520173_T_A:156520173:0,3,0,1
chr1	156520190	.	CT	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=181,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:156520173_T_A:156520173:0,4,0,1
chr1	156521539	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=98,21;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,0:11,4:16,8,1,3
chr1	156524221	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr1	156524274	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:156524274_C_G:156524274:0,3,0,2
chr1	156524280	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:156524274_C_G:156524274:0,3,0,2
chr1	156526558	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,19;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:156526558_G_C:156526558:0,5,1,1
chr1	156526559	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:156526558_G_C:156526558:0,5,1,1
chr1	156526564	.	CC	AC,GA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,24,17;MFRL=0,120,64;MMQ=60,60,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.25,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.667,0.222:6:0,2,0:0,3,0:0,0,0,6
chr1	156526570	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=76,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:156526570_G_C:156526570:0,4,0,1
chr1	156526573	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:156526570_G_C:156526570:0,3,0,1
chr1	156526577	.	GT	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=82,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:156526570_G_C:156526570:0,2,0,1
chr1	156532977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,10,1
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,10,1
chr1	156536251	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,18:0,19:0,0,22,15
chr1	156536330	.	T	TGATTGCCTTGAAACTGGGAGCCTCTAGGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr1	156551248	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=113,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,2:2,4:3,3,2,5
chr1	156551848	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:3,4,2,2
chr1	156553102	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=266,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,6:0,11:1,0,7,10
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,10,10
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr1	156563370	.	G	GCTGGGCCTTGGCTTGCACATTCGGTGTTGTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.160:26:13,0:10,2:10,13,2,1
chr1	156563375	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.985:57:0,20:0,35:0,0,18,39
chr1	156565472	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:4,21,1,1
chr1	156565834	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr1	156566286	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:3,6,0,3
chr1	156595033	.	TGGCTGGCTGAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:3,2:4,2,2,0
chr1	156617761	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,2:6,0:0|1:156617761_T_A:156617761:6,4,1,1
chr1	156617782	.	A	ATTTC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,2:10,0:0|1:156617761_T_A:156617761:8,9,1,1
chr1	156617968	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr1	156618642	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=108,108;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:1,10,0,2
chr1	156622443	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.391:26:12,10:4,0:10,6,10,0
chr1	156626185	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=51,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:0|1:156626185_A_T:156626185:6,4,1,1
chr1	156626192	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=51,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:3,2:0|1:156626185_A_T:156626185:4,3,1,1
chr1	156626193	.	G	GTGGTGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=51,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:156626185_A_T:156626185:4,1,1,1
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	156627621	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,169;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:3,6:0,5,0,6
chr1	156628104	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:1,2,0,1
chr1	156628161	.	T	TGGTAAAACCCCATCTCTACTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=190,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	156639312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=101,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:156639312_C_T:156639312:8,13,1,1
chr1	156639320	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:14,2:0|1:156639312_C_T:156639312:7,16,1,1
chr1	156639753	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=98,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:2,6:9,11:4,7,7,10
chr1	156640156	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=83,97;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,4:2,1:0,2,2,3
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=56,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,2,3
chr1	156642604	.	GACTGGCCTGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:5,2:4,4,1,1
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr1	156696603	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=247,171;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	156704328	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=136,60;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.476:9:2,1:1,1:0,5,1,3
chr1	156706559	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	156708244	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:4,2,1,1
chr1	156713380	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.405:22:8,1:5,6:3,10,0,9
chr1	156714228	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	156737695	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,1:14,2:10,14,2,1
chr1	156760887	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,7:6,6:6,5,7,6
chr1	156761618	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:4,1:3,5:4,3,3,3
chr1	156764529	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:16,0:26,4:19,23,2,2
chr1	156779533	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=100,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:0,7:5,8:2,3,9,6
chr1	156784186	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=110,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=224,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,4:3,2:0|1:156785762_AG_A:156785762:3,3,6,1
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=224,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:3,2:3,3,6,1
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0|1:156785762_AG_A:156785762:4,3,6,1
chr1	156786523	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=95,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0|1:156786523_C_T:156786523:5,5,1,1
chr1	156786532	.	G	GGCAGGGCATC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=95,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,1:0|1:156786523_C_T:156786523:5,4,1,1
chr1	156810885	.	ATC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=187,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:156810885_ATC_A:156810885:3,8,1,1
chr1	156810890	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:156810885_ATC_A:156810885:3,7,1,1
chr1	156813166	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:156813166_T_C:156813166:6,2,1,1
chr1	156813173	.	C	CCAAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.190:13:8,0:3,2:0|1:156813166_T_C:156813166:7,4,1,1
chr1	156816379	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:4,4,1,2
chr1	156819275	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	156838384	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.326:13:2,0:5,3:7,2,0,4
chr1	156843594	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,1:8,2:9,7,2,1
chr1	156845890	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:10,0:4,5:8,7,2,3
chr1	156846109	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.400:10:4,0:2,0:0|1:156846109_A_C:156846109:4,2,0,4
chr1	156846116	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=145,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.485:8:3,0:1,0:0|1:156846109_A_C:156846109:4,0,0,4
chr1	156874828	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=83,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,2,0
chr1	156874881	.	G	GTGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,7,0
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,7,1
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,6,1
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	156877457	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,9,12
chr1	156882886	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=199,281;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156882886_G_T:156882886:1,0,0,1
chr1	156882890	.	T	TAGGTAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=199,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156882886_G_T:156882886:1,0,0,1
chr1	156882891	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=199,281;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	156882996	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,95;MMQ=60,33;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,3:10,0:11,5,2,1
chr1	156884365	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1,4,2,1
chr1	156894784	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:4,4,1,1
chr1	156902545	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=244,159;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156902545_CAG_C:156902545:1,0,1,0
chr1	156902552	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156902545_CAG_C:156902545:0,0,1,0
chr1	156902558	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,159;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156902545_CAG_C:156902545:0,0,1,0
chr1	156902619	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,4:4,0:5,7,2,2
chr1	156911181	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.198:23:7,4:12,0:0|1:156911181_G_GT:156911181:8,11,2,2
chr1	156911183	.	T	TAGAACTGGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=96,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:6,4:12,0:0|1:156911181_G_GT:156911181:8,11,2,2
chr1	156913887	.	GTGGAGGTC	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:7,0:0|1:156913887_GTGGAGGTC_G:156913887:11,6,1,1
chr1	156913905	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:156913887_GTGGAGGTC_G:156913887:11,6,1,1
chr1	156914234	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:9,4:17,0:9,17,2,2
chr1	156914240	.	CCATT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CATT;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:5,1:0,9,0,3
chr1	156916816	.	G	GTTTGGGCACAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156924728	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=121,108;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:3,15,0,2
chr1	156926110	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=185,145;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr1	156926114	.	C	G,T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,31,20;MFRL=243,145,0;MMQ=60,40,43;MPOS=17,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.256,0.222:5:0,0,1:3,1,0:3,0,2,0
chr1	156926118	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=158,0;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:5,0,1,0
chr1	156928914	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=75,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,2:12,1:11,9,3,0
chr1	156930373	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	156949153	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=198,219;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.526:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr1	156949179	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=198,219;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156949179_A_G:156949179:0,1,0,1
chr1	156949196	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=198,219;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156949179_A_G:156949179:0,1,0,1
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=259,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	157069153	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,18166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.225:11:4,0:5,2:0|1:157069153_A_C:157069153:3,6,0,2
chr1	157069158	.	G	GTGTCCAGCTACCTCTCTGAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,18166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:157069153_A_C:157069153:3,6,0,2
chr1	157095862	.	T	TTCAGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=98,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157095862_T_TTCAGTG:157095862:0,1,0,1
chr1	157095864	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=98,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157095862_T_TTCAGTG:157095862:0,1,0,1
chr1	157095865	.	C	CAGCCAGAGATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=98,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157095862_T_TTCAGTG:157095862:0,1,0,1
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,3,12
chr1	157489516	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:7,8:2,4:5,4,3,9
chr1	157489690	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr1	157490710	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=91,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,1:5,6:3,5,2,5
chr1	157557829	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:157557829_T_C:157557829:11,6,1,1
chr1	157557835	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:7,2:0|1:157557829_T_C:157557829:11,7,1,1
chr1	157557842	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,2:7,2:0|1:157557842_T_C:157557842:9,4,2,2
chr1	157557844	.	TG	CT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,2:6,2:0|1:157557842_T_C:157557842:9,4,2,2
chr1	157557847	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:0|1:157557842_T_C:157557842:9,3,2,2
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=248,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=125,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=86,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,5:4,5:2,7,1,9
chr1	157567751	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:14,4:7,8:8,13,5,7
chr1	157567763	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:15,2:0|1:157567763_G_T:157567763:15,22,1,1
chr1	157567772	.	A	ATTAATAAATAATTT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,0:17,2:0|1:157567763_G_T:157567763:14,16,1,1
chr1	157668390	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,1:5,3:8,7,2,2
chr1	157668427	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:6,2:1,4:2,5,2,4
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,13,3
chr1	157736824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,4,0,1
chr1	157736827	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,4,0,1
chr1	157736829	.	T	TCG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,3,0,1
chr1	157736832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,3,0,1
chr1	157736836	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,3,0,1
chr1	157736838	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,3,0,1
chr1	157736842	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:157736824_C_T:157736824:0,3,0,1
chr1	157738374	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,3,2
chr1	157740098	.	TCTATATTTAGCCCATGAGCAGCTTTCCCCTACCCAGTACCCACCCTGCCTTGCTGCCGTGGTCTCTCACCCAGCCCATCCCACAGAAGTCAGGGTTTTACCTTGGACTTTTATCTTTA	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.111:33:3,2:1,0:20,7,3,3
chr1	157740114	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=153,196;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,1:5,3:0|1:157740186_GTC_G:157740186:4,4,3,1
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:0|1:157740186_GTC_G:157740186:4,4,3,1
chr1	157768000	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=114,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,5:8,10:6,9,6,9
chr1	157769983	.	C	CATTTGACCCCTGTGTTGCTGATGAGTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.384:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr1	157773880	.	G	GCTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:6,11,1,1
chr1	157801852	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,3,0
chr1	157803387	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:157803387_A_C:157803387:0,0,1,0
chr1	157803390	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:157803387_A_C:157803387:0,0,1,0
chr1	157803395	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:157803387_A_C:157803387:0,0,1,0
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:3,7:2,4:4,2,8,3
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	158056460	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:158056460_G_A:158056460:8,8,1,1
chr1	158056462	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:158056460_G_A:158056460:8,8,1,1
chr1	158057986	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:1,2,2,3
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.496:32:7,10:9,5:11,5,10,6
chr1	158058123	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:19,0:16,3:21,14,3,0
chr1	158152892	.	TCC	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=104,60;MMQ=58,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:13,3:6,0:12,8,2,1
chr1	158152986	.	TGGTCCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=132,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0|1:158152986_TGGTCCTC_T:158152986:0,1,0,1
chr1	158152995	.	GGCATAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=188,79;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:0,0:0|1:158152986_TGGTCCTC_T:158152986:0,1,0,1
chr1	158153009	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=133,79;MMQ=57,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:158152986_TGGTCCTC_T:158152986:0,2,0,1
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	158225118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:0,6,1,5
chr1	158226092	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158226092_T_C:158226092:0,3,0,1
chr1	158226094	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158226092_T_C:158226092:0,3,0,1
chr1	158226101	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:158226092_T_C:158226092:0,3,0,1
chr1	158226568	.	C	CCTA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:19,0:9,2:9,19,1,1
chr1	158226667	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,209;MMQ=50,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:3,3,1,3
chr1	158226933	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=73,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:158226933_T_C:158226933:0,2,0,1
chr1	158226938	.	T	TGACTGGATATACCTGGACTTAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=145,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:158226933_T_C:158226933:0,1,0,1
chr1	158260004	.	A	AGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=128,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	158262724	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:158262724_G_A:158262724:0,2,0,1
chr1	158262726	.	AAATTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:158262724_G_A:158262724:0,2,0,1
chr1	158299257	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,180;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,2:14,0:13,7,1,1
chr1	158299827	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,0:0|1:158299827_A_G:158299827:9,7,1,1
chr1	158299834	.	AT	CC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:158299827_A_G:158299827:10,8,1,1
chr1	158299838	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:158299827_A_G:158299827:10,7,1,1
chr1	158299840	.	C	CTTTATT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,1:0|1:158299827_A_G:158299827:10,7,1,1
chr1	158300595	.	GG	AA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:9,0:13,13,1,1
chr1	158300596	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.170:27:15,2:7,2:0|1:158300596_G_C:158300596:12,11,2,2
chr1	158300603	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.165:28:16,0:7,2:0|1:158300596_G_C:158300596:13,11,2,2
chr1	158300604	.	CGG	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=125,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:13,0:7,2:0|1:158300596_G_C:158300596:13,13,1,2
chr1	158324540	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	158325966	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=238,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:158325966_G_GT:158325966:0,1,0,1
chr1	158325968	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=238,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:158325966_G_GT:158325966:0,1,0,1
chr1	158326447	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,0:1,1:0,2,2,2
chr1	158368541	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=52,153;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,4:4,0:4,4,0,5
chr1	158368846	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:6,2,5,3
chr1	158389630	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,166;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:4,0,4,1
chr1	158390252	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=97,194;MMQ=60,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:6,4,0,4
chr1	158390501	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=64,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.573:38:10,7:6,14:10,6,16,6
chr1	158435278	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=88,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,7:3,7:4,6,4,10
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	158516948	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=77,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:6,0:11,4:9,9,0,4
chr1	158532389	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=68,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr1	158532405	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,0,2
chr1	158532614	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:3,2:7,3:5,5,2,3
chr1	158533224	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:7,6:12,6:14,5,5,7
chr1	158549492	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=70,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:2,5:2,3,4,4
chr1	158549511	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=89,79;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:3,3:1,4,4,5
chr1	158549521	.	C	CAGCAGGAA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:3,2:0|1:158549521_C_CAGCAGGAA:158549521:9,7,1,1
chr1	158549525	.	A	AAACT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:158549521_C_CAGCAGGAA:158549521:9,7,1,1
chr1	158587446	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=184,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:158587446_A_C:158587446:0,3,0,1
chr1	158587454	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=184,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:158587446_A_C:158587446:0,3,0,1
chr1	158587457	.	C	CGTGCCTGAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=184,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:158587446_A_C:158587446:0,3,0,1
chr1	158587459	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=193,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:158587446_A_C:158587446:0,2,0,1
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,16,9
chr1	158596070	.	A	ACAGTCTTGATTTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=77,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:1,4,1,1
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr1	158609275	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=202,180;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,4:2,0:2,0,4,0
chr1	158624367	.	ACTTTTTGATGGAAAGATTAGAAGGAAAAGTCAC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:6,0:5,4:12,9,0,4
chr1	158624528	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=82,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr1	158637868	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=201,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:158637868_A_G:158637868:1,2,1,1
chr1	158637870	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=201,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:158637868_A_G:158637868:1,2,1,1
chr1	158639601	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr1	158650522	.	G	GGGCAGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:158650522_G_GGGCAGC:158650522:1,3,1,1
chr1	158650523	.	T	TGGGATTAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:158650522_G_GGGCAGC:158650522:1,3,1,1
chr1	158650526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:158650522_G_GGGCAGC:158650522:1,3,0,1
chr1	158655091	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=88,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.326:22:12,0:3,6:8,7,0,7
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	158656347	.	C	CAGAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=88,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AG;STR;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:0,2:1,4:1,1,1,5
chr1	158687902	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,158;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:7,0:16,3:3,20,0,3
chr1	158724537	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	158724914	.	AA	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=143,60;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0|1:158724914_AA_CT:158724914:1,4,1,1
chr1	158724918	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=148,60;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:158724914_AA_CT:158724914:1,6,1,1
chr1	158724922	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=148,60;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:158724914_AA_CT:158724914:1,6,1,1
chr1	158735691	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=234,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,9:1,5:1,0,8,6
chr1	158735740	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chr1	158736147	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=103,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:5,4,0,2
chr1	158813819	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,13:0,0,15,10
chr1	158815277	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=235,144;MMQ=54,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:158815277_G_A:158815277:4,0,1,0
chr1	158815285	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=235,144;MMQ=54,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:158815277_G_A:158815277:4,0,1,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,15,5
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:158913525_A_G:158913525:0,0,11,2
chr1	158913532	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:0|1:158913525_A_G:158913525:7,3,4,1
chr1	158985673	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.443:34:10,6:8,8:10,9,9,6
chr1	158986477	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,33:0.557:59:13,14:13,18:13,13,13,20
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:4,0,7,1
chr1	158988463	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=105,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:3,6,2,4
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	159015311	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=155,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,0:6,3:1,10,1,2
chr1	159032486	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:7,1:6,2:5,9,1,2
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	159163756	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,132;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:7,10,3,0
chr1	159166612	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,10,11
chr1	159175354	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.412:24:4,4:10,4:7,7,6,4
chr1	159176248	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:159176248_C_T:159176248:5,7,1,1
chr1	159176253	.	C	CCGCGAGGAACAGTCTA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:159176248_C_T:159176248:5,7,1,1
chr1	159272530	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	159276068	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:159276068_A_G:159276068:0,3,0,1
chr1	159276071	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:159276068_A_G:159276068:0,3,0,1
chr1	159276074	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:159276068_A_G:159276068:0,3,0,1
chr1	159276077	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:159276068_A_G:159276068:0,3,0,1
chr1	159276081	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=210,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	159284503	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	159410173	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=103,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:0|1:159410173_A_C:159410173:10,11,1,1
chr1	159410177	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:159410173_A_C:159410173:10,12,1,1
chr1	159505029	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,80;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,0:8,3:9,12,3,0
chr1	159505662	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=102,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:16,0:4,5:9,11,0,5
chr1	159558258	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:5,1,5,2
chr1	159558599	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	159772137	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=151,251;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:3,1,1,0
chr1	159778981	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,97;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:10,7,0,3
chr1	159778983	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=113,152;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:4,3:10,2:7,8,3,2
chr1	159784174	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	159785370	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=103,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:6,4,3,7
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr1	159799910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:1,1,3,4
chr1	159810558	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=79,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.194:23:11,0:8,4:12,7,4,0
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,1,5
chr1	159825916	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	159828746	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	159832356	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:10,8,1,1
chr1	159842684	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=242,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:159842684_C_A:159842684:2,0,2,0
chr1	159842691	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1|0:159842684_C_A:159842684:2,0,2,0
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	159857531	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=193,256;MMQ=59,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr1	159857533	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	159857555	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	159857823	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:0,11,1,1
chr1	159857882	.	A	AGGCTGAGTGAGGTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	159860259	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=106,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,5:12,3:13,8,7,1
chr1	159863028	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=112,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:7,11:11,7:5,13,9,9
chr1	159869783	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:5,6,4,0
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=124.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,13:0,18:0|1:159897126_C_T:159897126:0,0,18,15
chr1	159897132	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,24:0.659:36:3,13:9,11:0|1:159897126_C_T:159897126:5,7,14,10
chr1	159897327	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=114,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.371:22:12,4:1,3:6,8,2,6
chr1	159897388	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=252,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,6:0,2:1,4,4,4
chr1	159897681	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27,25,28;MFRL=0,150,112,171;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,21,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.20,8.83,10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,7,7:0.168,0.398,0.393:17:0,2,2,3:0,1,4,4:0,0,4,13
chr1	159897754	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr1	159902518	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:159902518_G_C:159902518:1,2,0,1
chr1	159902520	.	G	GATCACCTGACAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:159902518_G_C:159902518:1,1,0,1
chr1	159906156	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	159912665	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	160062674	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=17,33;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:160062674_A_G:160062674:3,0,1,0
chr1	160062676	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:160062674_A_G:160062674:3,0,1,0
chr1	160062680	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:160062674_A_G:160062674:3,0,1,0
chr1	160062682	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:160062674_A_G:160062674:3,0,1,0
chr1	160062686	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:160062674_A_G:160062674:3,0,1,0
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	160091047	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=23,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:8,0:0|1:160091047_T_C:160091047:11,12,1,1
chr1	160091053	.	G	GTGAGTTACTTTGGGGAGGA	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:0|1:160091047_T_C:160091047:10,12,1,1
chr1	160091055	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:0|1:160091047_T_C:160091047:10,12,1,1
chr1	160091136	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=123,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr1	160091146	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:160091146_A_T:160091146:0,3,0,2
chr1	160091148	.	G	GGTTCGTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:160091146_A_T:160091146:0,2,0,2
chr1	160091152	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:160091146_A_T:160091146:0,2,0,2
chr1	160091154	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:160091146_A_T:160091146:0,2,0,2
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	160097443	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:160097443_A_G:160097443:9,4,1,1
chr1	160097458	.	TT	CA	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=135,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:160097443_A_G:160097443:12,3,1,1
chr1	160097462	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,17;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,1:0|1:160097443_A_G:160097443:12,2,1,1
chr1	160097469	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:160097443_A_G:160097443:13,5,1,1
chr1	160097470	.	A	ATTTTTGTGTT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,17;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,1:0|1:160097443_A_G:160097443:13,5,1,1
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=210,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr1	160099241	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160099241_AG_CT:160099241:0,1,0,1
chr1	160099244	.	G	GCAGCATTCTCTTTCTTGATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160099241_AG_CT:160099241:0,1,0,1
chr1	160100144	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:3,0:5,0:0|1:160100144_T_G:160100144:7,1,0,3
chr1	160100154	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,0:4,1:0|1:160100144_T_G:160100144:7,0,0,3
chr1	160105367	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,171;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:5,3,2,3
chr1	160106649	.	TCCTCCGACACTCTCATCTGTCTCTGCCCACCCTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.116:25:4,2:8,0:12,11,1,1
chr1	160109408	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=229,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,1:1,0,2,1
chr1	160109636	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,4:0,1:2,1,4,1
chr1	160109656	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,4:0,0:1,1,3,1
chr1	160109788	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,2:3,3:4,4,1,4
chr1	160121899	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.470:17:4,5:5,3:4,5,6,2
chr1	160124875	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,6,6
chr1	160125822	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:11,1:11,1:11,12,2,0
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	160136225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr1	160136350	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=66,161;MMQ=60,51;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:5,3,1,1
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,6:2,4:1,2,5,5
chr1	160141636	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:0,3,4,5
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:8,6:3,8:4,8,8,7
chr1	160151624	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.559:14:5,4:1,3:1,5,3,5
chr1	160162704	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=182,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:160162704_A_G:160162704:3,1,0,1
chr1	160162709	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:160162704_A_G:160162704:2,1,0,1
chr1	160162713	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:160162704_A_G:160162704:2,1,0,1
chr1	160165173	.	ATTGG	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,1,1,1
chr1	160165178	.	G	GCT	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=34,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,0,1,1
chr1	160165181	.	C	CCCT	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,1,1,1
chr1	160165183	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,24;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,1,1,1
chr1	160165186	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=33,26;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,1,1,1
chr1	160165187	.	TGGG	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=24,25;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:4,1,1,1
chr1	160165192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-1073741834;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:3,1,1,1
chr1	160165194	.	T	TGA	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=23,25;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:3,1,1,1
chr1	160165198	.	TCCCGGGCA	T	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,2:0|1:160165173_ATTGG_A:160165173:5,1,1,1
chr1	160171158	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=91,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:9,4:13,0:10,13,1,3
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,10,5
chr1	160178376	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:3,6:6,1:8,1,5,2
chr1	160188747	.	A	ACCATCCAC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:0|1:160188747_A_ACCATCCAC:160188747:10,9,2,2
chr1	160188748	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,0:9,4:0|1:160188747_A_ACCATCCAC:160188747:10,11,2,2
chr1	160188752	.	A	AGGAGGGC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:11,0:10,4:0|1:160188747_A_ACCATCCAC:160188747:10,12,2,2
chr1	160251792	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr1	160260233	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=69,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,0,2
chr1	160263124	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr1	160267555	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=207,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,4:3,1:0,5,0,5
chr1	160268834	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.344:14:3,3:0,2:3,6,3,2
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,8,3
chr1	160276963	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=95,15;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,1:13,3:17,11,4,0
chr1	160279054	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=307,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:160279054_C_CT:160279054:0,1,0,1
chr1	160279055	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=307,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:160279054_C_CT:160279054:0,1,0,1
chr1	160303416	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=110,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.836:16:0,3:2,10:1,1,5,9
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,9:0,0:0,0,4,5
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,6:4,2:4,3,2,6
chr1	160313395	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr1	160318835	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:10,10:3,4:10,4,6,9
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr1	160321585	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,0:10,3:7,15,1,2
chr1	160321656	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	160341680	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=189,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.483:10:3,1:0,1:3,2,1,4
chr1	160342651	.	T	TTCCTTCGTTCTCTGCTGGCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=223,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	160385612	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:4,0,4,1
chr1	160389195	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:8,2:6,0:0|1:160389195_T_TA:160389195:5,9,1,1
chr1	160389196	.	C	CTTTTAGGTCATTAATCCAGTTTTAGT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:7,2:6,0:0|1:160389195_T_TA:160389195:5,9,1,1
chr1	160394155	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=199,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:0,2,1,4
chr1	160456569	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:4,7:2,2:5,2,6,3
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=111,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	160492963	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:13,0:9,4:14,8,2,2
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,4,4
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,4,4
chr1	160522391	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr1	160582182	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:160582182_C_T:160582182:4,0,2,0
chr1	160582187	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:160582182_C_T:160582182:5,0,2,0
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	160720074	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=90,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,4:6,8:8,7,7,5
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.960:46:1,19:0,26:0,1,12,33
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	160784620	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.533:2:0,0:0,1:0,1,1,0
chr1	160786704	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	160789191	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=185,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:160789191_G_A:160789191:0,5,0,2
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,5:0,1:0|1:160789191_G_A:160789191:0,0,0,7
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:6,13:11,12:9,8,11,14
chr1	160806111	.	G	GTGGAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:3,2:3,3,1,1
chr1	160808937	.	T	TTCTCTTTTCTGTCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=279,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=104,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,18:0.559:32:0,8:13,10:0|1:160849060_G_A:160849060:5,9,7,11
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=99,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,22:0.535:41:2,9:16,12:0|1:160849060_G_A:160849060:5,14,7,15
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:1,6:5,1:2,4,5,2
chr1	160851070	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:21,2:5,0:0|1:160851070_G_A:160851070:18,8,1,1
chr1	160851076	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:0|1:160851070_G_A:160851070:10,6,1,1
chr1	160851087	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=139,332;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:12,2:3,1:7,8,3,0
chr1	160851868	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=150,98;MMQ=51,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:17,3:3,1:11,9,1,3
chr1	160851894	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=163,118;MMQ=49,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:10,5:1,6:5,6,4,7
chr1	160852022	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,0,3
chr1	160852046	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr1	160853347	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=93,42;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:3,0:6,2:0|1:160853347_C_CA:160853347:4,5,1,1
chr1	160853351	.	TTTGACACAAAACCTACC	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=93,42;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:4,2:0|1:160853347_C_CA:160853347:4,5,1,1
chr1	160853373	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=86,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:160853347_C_CA:160853347:3,3,1,1
chr1	160853374	.	CTATCACTA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=93,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,2:0|1:160853347_C_CA:160853347:3,4,1,1
chr1	160853384	.	TCCCAC	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,18;MFRL=131,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:160853347_C_CA:160853347:2,2,1,1
chr1	160914839	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=212,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:160914839_C_T:160914839:2,0,1,0
chr1	160914848	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=212,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:160914839_C_T:160914839:2,0,1,0
chr1	160917902	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=91,125;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,9:4,4:6,5,10,3
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,18:0,8:0,0,16,10
chr1	160920966	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=160,128;MMQ=48,56;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:2,7:8,7:2,8,7,7
chr1	160968609	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,5:2,7:2,2,8,4
chr1	160968813	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=101,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:0|1:160968813_C_G:160968813:6,12,0,3
chr1	160968820	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=100,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:0|1:160968813_C_G:160968813:6,11,0,3
chr1	160969110	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,1:4,5:6,1,3,3
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr1	160969930	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=73,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,4:6,9:6,9,5,8
chr1	160970968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,2,3
chr1	160971015	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,1,4
chr1	160990875	.	TC	CA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.595:30:5,6:6,12:0|1:160990875_TC_CA:160990875:5,7,5,13
chr1	160990878	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,17:0.621:27:3,5:6,12:0|1:160990875_TC_CA:160990875:4,6,4,13
chr1	160990906	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:3,3:3,6:0,6,2,7
chr1	161010762	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	161011355	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=219,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	161011736	.	GGA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=220,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GA;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr1	161012590	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.373:49:18,10:12,8:18,13,12,6
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,16,20
chr1	161019040	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,11,14
chr1	161022047	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=81,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:9,5,1,1
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,4,5
chr1	161022639	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	161023078	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,0:6,4:11,5,4,0
chr1	161029405	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=96,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:18,3:10,0:15,13,3,0
chr1	161043571	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=119,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:12,3:10,13,0,3
chr1	161044046	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.119:39:22,4:13,0:25,10,2,2
chr1	161047364	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=109,125;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:10,0:8,5:10,8,5,0
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,6,3
chr1	161089006	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.153:41:19,0:16,5:18,17,0,6
chr1	161089202	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:6,10,3,0
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=277,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr1	161093100	.	A	ATCAAAGACATGTGTAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:5,6:5,8:9,1,10,5
chr1	161133848	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,140;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:8,6:16,0:11,13,0,6
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,3:8,2:11,3,4,1
chr1	161137316	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=140,22934536;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:5,2:0|1:161137316_C_T:161137316:7,8,1,1
chr1	161137339	.	C	A,CTT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,23,34;MFRL=37,239,168;MMQ=51,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.305,0.222:4:2,1,0:0,0,1:1,1,0,2
chr1	161137341	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=117,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:161137316_C_T:161137316:1,3,0,1
chr1	161137344	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=159,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:161137316_C_T:161137316:1,2,0,1
chr1	161137349	.	TT	AC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,22;MFRL=159,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:161137316_C_T:161137316:1,2,0,1
chr1	161137351	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:161137316_C_T:161137316:1,2,0,1
chr1	161137355	.	TT	GG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=161,239;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:161137316_C_T:161137316:1,3,0,1
chr1	161138254	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=108,33;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:10,2:29,0:0|1:161138254_TG_T:161138254:22,17,1,1
chr1	161138257	.	AGTG	A	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=112,33;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:10,2:28,0:0|1:161138254_TG_T:161138254:23,19,1,1
chr1	161138262	.	TTGCAGGCAACAGCC	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=108,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:10,2:25,0:0|1:161138254_TG_T:161138254:24,24,1,1
chr1	161138280	.	A	AG	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=108,33;MMQ=60,60;MPOS=-16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.058:49:13,2:30,0:0|1:161138254_TG_T:161138254:23,24,1,1
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:7,0,6,0
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,7,8
chr1	161166001	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:19,0:17,2:0|1:161166001_A_C:161166001:17,20,1,1
chr1	161166008	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:20,0:15,2:0|1:161166001_A_C:161166001:17,19,1,1
chr1	161166009	.	CAA	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=118,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:20,0:14,2:0|1:161166001_A_C:161166001:19,20,1,1
chr1	161166012	.	TGGCACAG	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,0:15,2:0|1:161166001_A_C:161166001:17,23,1,1
chr1	161166024	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=103,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:28,0:15,2:0|1:161166001_A_C:161166001:15,30,1,1
chr1	161166554	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=201,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.132:20:10,0:7,2:0|1:161166554_G_A:161166554:9,9,1,1
chr1	161166559	.	C	CTGA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=192,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:11,0:8,2:0|1:161166554_G_A:161166554:10,10,1,1
chr1	161166564	.	G	GTTGAATGT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=192,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:9,0:7,2:0|1:161166554_G_A:161166554:7,9,1,1
chr1	161166628	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=117,1214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:3,0:6,4:2,7,4,0
chr1	161166723	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	161179386	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=188,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr1	161179466	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=190,244;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:1,1,4,0
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=78,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,3:3,6:3,8,6,3
chr1	161184059	.	C	CTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=73,142;MMQ=53,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TG;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.649:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr1	161184097	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	161185058	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:6,1,4,1
chr1	161188664	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=120,117;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:13,7,3,0
chr1	161192845	.	CCACACACACACACA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=CA;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.525:8:1,1:0,3:3,1,0,4
chr1	161196672	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.085:55:26,0:24,4:35,16,3,1
chr1	161196782	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:16,0:30,5:16,31,0,5
chr1	161197244	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:0,4,1,3
chr1	161197545	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:4,11,1,1
chr1	161199523	.	CATTTTCCCACTCCAGTG	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=126,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:11,0:16,2:0|1:161199523_CATTTTCCCACTCCAGTG_C:161199523:22,15,0,2
chr1	161199544	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:161199523_CATTTTCCCACTCCAGTG_C:161199523:17,11,0,2
chr1	161199677	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,4:7,0:5,11,4,0
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=86,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:5,3,3,4
chr1	161201350	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=166,165;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,4:3,0:0|1:161201350_G_T:161201350:0,5,0,5
chr1	161201352	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=166,165;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0|1:161201350_G_T:161201350:0,5,0,5
chr1	161205828	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=186,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:161205828_TG_T:161205828:1,2,0,1
chr1	161205833	.	TG	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=186,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161205828_TG_T:161205828:1,2,0,1
chr1	161228800	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,0:0,2:2,0,1,2
chr1	161275633	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.621:11:0,0:3,0:0,4,7,0
chr1	161275637	.	CCCCGATCCCCCGCCCGGCCCGCTAACCGCTATTTCTTATCCTTGCGAGACT	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.107:43:1,0:4,3:15,24,4,0
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,13,4
chr1	161332091	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27,30;MFRL=139,150,154;MMQ=60,60,60;MPOS=1,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.28,6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,5:0.152,0.266:24:9,1,1:5,2,4:15,1,8,0
chr1	161475750	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:8,2:3,5:7,4,2,5
chr1	161476204	.	CA	TG	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,152;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.553:45:12,14:7,10:8,12,12,13
chr1	161479599	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:2,4:8,8:6,4,8,4
chr1	161483656	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,115;MMQ=52,36;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:12,5:10,9:14,9,7,7
chr1	161487775	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=106,142;MMQ=52,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.093:51:24,0:23,4:24,23,2,2
chr1	161512731	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,176;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:7,2,5,1
chr1	161514759	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=186,202;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr1	161518214	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=125,142;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr1	161518676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	161518757	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=90,98;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:9,14:8,6:9,8,11,9
chr1	161519386	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=172,92;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:4,4:6,0:0|1:161519386_C_T:161519386:9,1,3,1
chr1	161519396	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=163,92;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:0|1:161519386_C_T:161519386:7,1,3,1
chr1	161519476	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=130,107;MMQ=52,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:9,2:14,3:13,10,3,2
chr1	161561236	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,172;MMQ=27,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:1,4,0,5
chr1	161565381	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=112,143;MMQ=56,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:9,2:21,2:17,15,3,1
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=77.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,19:0,8:0,0,21,6
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,11:0,0,14,8
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	161596072	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=104,170;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:22,2:24,1:17,30,3,0
chr1	161599693	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=98,117;MMQ=33,33;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:7,7,2,2
chr1	161599704	.	A	AAAGTGAATGGTGTGATTTATT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=95,40856;MMQ=36,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:0|1:161599704_A_AAAGTGAATGGTGTGATTTATT:161599704:11,7,0,2
chr1	161599707	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=95,40856;MMQ=36,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:0|1:161599704_A_AAAGTGAATGGTGTGATTTATT:161599704:11,7,0,2
chr1	161599708	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=95,40856;MMQ=36,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:161599704_A_AAAGTGAATGGTGTGATTTATT:161599704:11,7,0,2
chr1	161600287	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=164,167;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:0,14,0,3
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	161600792	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=155,205;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr1	161600832	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=115,131;MMQ=40,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:8,1,5,1
chr1	161600995	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=83,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.563:44:8,16:11,7:9,10,12,13
chr1	161680258	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=83,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,1:5,5:4,9,3,3
chr1	161681780	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,5:7,3:8,7,5,3
chr1	161682851	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,1:6,6:5,3,7,0
chr1	161692610	.	T	TGGTCTTTGATGATAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161693079	.	AACTCAGGTCGTTTCTTTGGGCACCTCACCTTGATTCTCTTTGCATGCTGCCCCCTCTCACCCCACTCCCCACCCCAGCT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,35;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.205:14:1,2:0,0:6,5,2,1
chr1	161695639	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:8,5:10,10:7,11,7,8
chr1	161697000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	161721398	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=122,307;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:24,6:11,0:33,4,6,0
chr1	161721402	.	G	GT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:27,1:10,2:31,6,4,0
chr1	161722779	.	C	CAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=105,131;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=A;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:4,4:4,1:8,1,5,0
chr1	161748056	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,4:1,5:5,0,5,4
chr1	161753802	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=121,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:5,6,6,4
chr1	161753841	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=161,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,2:7,7:3,10,3,6
chr1	161753917	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=210,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	161761114	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161761114_G_GCA:161761114:0,0,0,1
chr1	161761116	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161761114_G_GCA:161761114:0,0,0,1
chr1	161761119	.	TATG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161761114_G_GCA:161761114:0,0,0,1
chr1	161761186	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,6:9,0:12,3,6,0
chr1	161761276	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,5:3,2:4,6,3,4
chr1	161761312	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:7,3:2,5:2,7,3,5
chr1	161771942	.	A	AC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=117,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.251:34:12,6:14,0:11,15,8,0
chr1	161789625	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:9,4:9,8:6,12,6,6
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	161953960	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,3:8,0:4,9,2,1
chr1	161967681	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:7,6:6,5:0|1:161967681_A_G:161967681:6,7,3,8
chr1	161967683	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,3:0.153:24:10,0:8,3:1|0:161967681_A_G:161967681:8,13,1,2
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,8:0,18:0,0,19,7
chr1	162326846	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=120,82;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:162326846_C_T:162326846:4,4,0,2
chr1	162326849	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=120,82;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:3,2:0|1:162326846_C_T:162326846:4,4,0,2
chr1	162335186	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:11,9,2,0
chr1	162335424	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	162343774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr1	162346433	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	162348637	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:9,0,3,1
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,11,5
chr1	162367103	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=60,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.371:14:3,4:6,1:7,2,2,3
chr1	162367235	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	162368634	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	162470961	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.584:8:2,2:1,0:0,3,1,4
chr1	162557367	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=87,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:8,0:20,2:0|1:162557367_C_T:162557367:12,20,1,1
chr1	162557380	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=79,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,0:19,2:0|1:162557367_C_T:162557367:12,18,1,1
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,562;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	162740327	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,1:0,14:0,0,5,11
chr1	162742000	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,0:8,5:7,12,1,4
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	162760551	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:162760551_C_T:162760551:0,0,6,0
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0|1:162760551_C_T:162760551:0,0,7,1
chr1	162762505	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,155;MMQ=34,42;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,0:18,2:12,10,2,0
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,10,12
chr1	162782282	.	TAGTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=198,286;MMQ=27,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:162782282_TAGTGA_T:162782282:0,3,0,1
chr1	162782288	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=271,165;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:162782288_G_GA:162782288:0,3,0,1
chr1	162782289	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=198,286;MMQ=27,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:162782282_TAGTGA_T:162782282:0,3,0,1
chr1	162782290	.	C	CAAAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=198,286;MMQ=27,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:162782282_TAGTGA_T:162782282:0,3,0,1
chr1	162782291	.	C	CACA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=271,165;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:162782288_G_GA:162782288:0,3,0,1
chr1	162782292	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=198,286;MMQ=27,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:162782282_TAGTGA_T:162782282:0,3,0,1
chr1	162782304	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,23;MFRL=198,271;MMQ=27,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr1	162825209	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=477,279;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:162825209_C_T:162825209:0,1,0,1
chr1	162825213	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=477,279;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:162825209_C_T:162825209:0,1,0,1
chr1	162825223	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162825209_C_T:162825209:0,0,0,1
chr1	162825225	.	A	ATTTATTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162825209_C_T:162825209:0,0,0,1
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	163117351	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	163122528	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	163297381	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=97,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,19:0.399:48:18,9:11,10:0|1:163297381_G_A:163297381:12,17,12,7
chr1	163297382	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=97,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,3:0.080:48:27,0:18,2:1|0:163297381_G_A:163297381:22,23,2,1
chr1	163297391	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:43,3:0.083:46:26,0:16,3:1|0:163297381_G_A:163297381:20,23,2,1
chr1	163297394	.	T	TGCAGCTGTTGTAAAAGGG	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:41,3:0.087:44:24,0:14,3:1|0:163297381_G_A:163297381:18,23,2,1
chr1	163298768	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:9,2:2,1:3,9,0,4
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	164529281	.	G	T	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,25:0.248:102:38,0:37,24:20,57,1,24
chr1	164761725	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,9:0.180:52:26,9:17,0:28,15,6,3
chr1	164769050	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr1	164769110	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,2:8,1:5,6,2,1
chr1	164776922	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=137,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.258:19:4,0:10,2:0|1:164776922_G_T:164776922:4,10,2,3
chr1	164776930	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=138,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.246:20:5,0:10,3:0|1:164776922_G_T:164776922:3,12,2,3
chr1	164776932	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=138,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,0:9,1:0|1:164776922_G_T:164776922:3,12,2,1
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr1	165173168	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:165173168_T_C:165173168:12,6,1,1
chr1	165173174	.	TC	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:165173168_T_C:165173168:12,6,1,1
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	165370400	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	165370475	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,1:0,0,4,5
chr1	165376148	.	TTG	CAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:165376148_TTG_CAA:165376148:4,2,1,1
chr1	165376153	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:165376148_TTG_CAA:165376148:4,2,1,1
chr1	165376156	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:165376148_TTG_CAA:165376148:4,2,1,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr1	165378729	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=82,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.588:5:1,2:0,0:1,1,2,1
chr1	165378992	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=389,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr1	165389285	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	165513456	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	165513463	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr1	165533022	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:11,5,2,0
chr1	165533099	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,9,0,2
chr1	165533104	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,9,0,2
chr1	165533105	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,9,0,2
chr1	165533112	.	T	TAACCC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,8,0,2
chr1	165533117	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,9,0,2
chr1	165533119	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:165533099_T_C:165533099:0,9,0,2
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	165621098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=193,101;MMQ=46,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	165621129	.	C	CAAAAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,0:0,2:0,0,2,6
chr1	165623411	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr1	165623451	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,5:4,5:6,3,8,2
chr1	165623529	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=118,74;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.197:33:12,0:15,5:14,13,1,5
chr1	165630698	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr1	165636752	.	T	TGCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:165636752_T_TGCTC:165636752:0,2,0,1
chr1	165636753	.	A	AGGAGGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:165636752_T_TGCTC:165636752:0,2,0,1
chr1	165636758	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:165636752_T_TGCTC:165636752:0,1,0,1
chr1	165636759	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:165636752_T_TGCTC:165636752:0,1,0,1
chr1	165648886	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:165648886_G_A:165648886:0,3,0,3
chr1	165648894	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:165648886_G_A:165648886:0,2,0,3
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,4,8
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	165712366	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,2:4,0:14,3,2,0
chr1	165712555	.	GAA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=179,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:0,0:2,4,2,1
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr1	165721354	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=69,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:3,0:26,3:15,14,3,0
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr1	165859640	.	G	GTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	166819536	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=98,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:13,0:15,2:0|1:166819536_A_T:166819536:9,20,1,1
chr1	166819541	.	C	CTTTCTCCAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=98,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:16,2:0|1:166819536_A_T:166819536:9,21,1,1
chr1	166958937	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=121,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:2,2,4,2
chr1	166961857	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	166974420	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:4,4:13,7:6,11,3,8
chr1	167024245	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,0:1,2:4,5,1,1
chr1	167024945	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.412:8:5,1:0,2:2,3,1,2
chr1	167032913	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=96,185;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.463:34:8,0:9,13:8,10,0,16
chr1	167038453	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:167038453_CA_C:167038453:0,1,0,2
chr1	167038460	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:167038453_CA_C:167038453:0,1,0,2
chr1	167038462	.	GTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:167038453_CA_C:167038453:0,1,0,2
chr1	167038468	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:167038453_CA_C:167038453:0,1,0,2
chr1	167059462	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=61,74;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,6:6,4:5,7,8,2
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,60396466;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	167095220	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:10,1:9,1:11,10,1,1
chr1	167095944	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:13,4:10,4:10,13,3,5
chr1	167341144	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=88,1020;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:15,0:21,3:20,16,0,3
chr1	167353258	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,25,24;MFRL=108,200,197;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.83,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.281,0.280:8:1,1,2:3,1,0:1,3,0,4
chr1	167358825	.	CCAGCAACCCCAACACGCACAATAG	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.066:78:27,3:18,2:43,30,2,3
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,4,0
chr1	167381640	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=83,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.472:46:14,8:10,10:14,10,11,11
chr1	167382399	.	AGT	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:4,1:0,2:2,3,0,3
chr1	167385178	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	167385324	.	TAA	T,TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=137,104,125;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=4.12,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,5:0.203,0.300:17:3,0,0:4,2,4:2,7,1,7
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr1	167654701	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=74,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,12:0.288:43:17,0:10,12:0|1:167654701_T_G:167654701:9,22,0,12
chr1	167654708	.	GTT	CAC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=74,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,12:0.265:47:20,0:10,1:0|1:167654701_T_G:167654701:13,22,0,12
chr1	167741501	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.585:34:6,9:7,10:7,7,14,6
chr1	167792461	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=181,222;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	167815284	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:12,10,0,2
chr1	167823781	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	167847584	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:4,4:8,2:11,2,5,1
chr1	167871297	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.263:11:2,1:2,1:1,7,0,3
chr1	167889125	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr1	167889145	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.365:22:2,0:8,8:11,3,7,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=95,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.534:53:7,8:15,20:11,14,14,14
chr1	167893778	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.219:40:9,3:19,4:12,20,3,5
chr1	167944149	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:167944149_G_C:167944149:7,11,1,1
chr1	167944152	.	T	TTA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=127,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:4,0:0|1:167944149_G_C:167944149:8,11,1,1
chr1	167985002	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,144;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,6:8,0:9,7,6,0
chr1	168020245	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=246,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:168020245_A_T:168020245:0,3,0,1
chr1	168020248	.	T	TCGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=246,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:168020245_A_T:168020245:0,3,0,1
chr1	168020249	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=246,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:168020245_A_T:168020245:0,3,0,1
chr1	168056724	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	168059977	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:168059977_A_C:168059977:0,0,0,1
chr1	168059979	.	A	ATGGCCTTTCTTCAAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:168059977_A_C:168059977:0,0,0,1
chr1	168066416	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:3,2:13,0:12,4,2,0
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chr1	168074167	.	A	ATCACACACTGGAGCCCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=315,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168074166_A_C:168074166:0,1,0,1
chr1	168154184	.	A	AAAGTGTGGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	168160836	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,188;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:1,6,0,2
chr1	168161538	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=154,153;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168161538_C_G:168161538:0,1,0,1
chr1	168161541	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=154,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168161538_C_G:168161538:0,1,0,1
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.873:12:1,4:0,7:1,0,11,0
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,9:0,0,13,9
chr1	168211861	.	G	GCCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168211861_G_GCCTT:168211861:0,1,0,1
chr1	168211863	.	C	CCTCTTTCTAGCTTCGATGGTTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168211861_G_GCCTT:168211861:0,1,0,1
chr1	168260725	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:1,2,0,7
chr1	168262289	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	168262299	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr1	168274521	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=174,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168274521_T_C:168274521:0,1,0,1
chr1	168274524	.	CTAAAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168274521_T_C:168274521:0,1,0,1
chr1	168278149	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=115,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:0,7,0,4
chr1	168282261	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:2,2,2,5
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	168511349	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	168513243	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr1	168545880	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,83;MMQ=53,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:12,0:10,10,1,1
chr1	168549254	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,129;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:5,1,5,0
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=111,164;MMQ=52,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,4:5,5:6,9,2,7
chr1	168549475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:2,7,0,2
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=197,111;MMQ=51,29;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,10,7
chr1	168665811	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=83,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:4,2,3,4
chr1	168670170	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,156;MMQ=58,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	168683360	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	168683683	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168683683_TA_T:168683683:0,1,0,1
chr1	168683685	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168683683_TA_T:168683683:0,1,0,1
chr1	169076212	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.734:8:0,5:1,1:0,2,1,5
chr1	169080837	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=81,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:10,15:6,3:8,8,17,1
chr1	169094162	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.168:22:8,3:9,0:8,11,0,3
chr1	169199855	.	TTTTACATTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=194,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr1	169200111	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr1	169256501	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,4:6,7:7,2,8,3
chr1	169272299	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:2,0,5,1
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=96,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.418:20:10,6:2,2:8,4,4,4
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	169366697	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=192,449;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	169388343	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:3,0:15,2:0|1:169388343_C_T:169388343:6,12,1,1
chr1	169388363	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:2,0:9,1:0|1:169388343_C_T:169388343:2,11,1,1
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	169437928	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:10,0:0|1:169437928_A_G:169437928:14,11,1,1
chr1	169437930	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:11,0:0|1:169437928_A_G:169437928:14,11,1,1
chr1	169447008	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:2,0:4,3,0,3
chr1	169483629	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:0|1:169483629_C_T:169483629:11,10,1,1
chr1	169483648	.	T	TGGCCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:4,2:0|1:169483629_C_T:169483629:7,9,1,1
chr1	169492559	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:16,0:13,5:6,24,1,4
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,9:0,0,16,10
chr1	169499951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	169500348	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,303;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,7:1,4:0,1,11,1
chr1	169510233	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=93,70;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.492:65:21,21:12,11:18,15,15,17
chr1	169510617	.	ATGGCTGAGGTCTGGAGAAATGGGCATCTGACCGAGGGCTGGGGAAAGGTTTCTCTGAATGAGTTCTGGAGAGAGAGTCGTG	A	.	.	DP=153;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=92,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,49:0.064:150:25,22:21,23:40,61,25,24
chr1	169510691	.	G	A	.	.	DP=94;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.062:43:18,2:22,0:0|1:169510691_G_A:169510691:10,31,1,1
chr1	169510706	.	GG	AA	.	.	DP=92;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=91,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,2:0.039:92:41,2:37,0:0|1:169510691_G_A:169510691:39,51,1,1
chr1	169511230	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,0:5,6:4,4,0,6
chr1	169511555	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,69;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,3:4,3:4,2,5,2
chr1	169512027	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,5:1,5:2,3,5,5
chr1	169512093	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,3,4
chr1	169515874	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr1	169525808	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	169560727	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28,25,26;MFRL=173,161,140,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,18,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.72,11.36,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,5,2:0.202,0.340,0.164:15:2,1,4,0:1,2,1,2:0,5,1,9
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	169580717	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:0,2:6,5:4,2,6,1
chr1	169580892	.	C	CTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,2:5,5:4,9,4,3
chr1	169586407	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.243:39:15,9:15,0:8,22,9,0
chr1	169588546	.	G	GAAAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=102,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:7,1:11,11:12,6,8,5
chr1	169599316	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=96,116;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,15:0.333:46:15,0:16,15:0|1:169599316_C_A:169599316:14,17,0,15
chr1	169599320	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=96,116;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,15:0.333:46:14,0:15,15:0|1:169599316_C_A:169599316:14,17,0,15
chr1	169599325	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=105,116;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,15:0.327:47:14,0:14,14:0|1:169599316_C_A:169599316:14,18,0,15
chr1	169599331	.	G	GGAGGGAGTGTGGACAGAGGAGAA	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=31,38;MFRL=110,116;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,15:0.347:44:13,0:15,15:0|1:169599316_C_A:169599316:13,16,0,15
chr1	169672595	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:0,0:2,0:1,2,0,4
chr1	169677687	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:13,5:21,0:13,23,5,0
chr1	169679491	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:12,1,4,0
chr1	169679627	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.097:44:19,0:21,3:25,15,0,4
chr1	169694795	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=156,138;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,5:6,0:7,1,5,0
chr1	169698820	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,0:1,2:0,7,0,2
chr1	169701897	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:16,0:11,5:12,19,1,4
chr1	169763055	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169763055_A_G:169763055:0,0,1,0
chr1	169763063	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169763055_A_G:169763055:0,0,1,0
chr1	169763128	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:169763128_C_T:169763128:0,0,0,1
chr1	169763130	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:169763128_C_T:169763128:0,0,0,1
chr1	169797046	.	G	GATTCTGGCTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	169797065	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169797065_G_T:169797065:0,0,0,1
chr1	169797073	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169797065_G_T:169797065:0,0,0,1
chr1	169799524	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr1	169821152	.	C	CTGGAGCACACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	169821165	.	C	CTAACTGCTCTATGAAAAGAAAGGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=198,255;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	169822061	.	CAATGGA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATGGA;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:8,2:7,10,1,1
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	169941547	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr1	169947146	.	C	CA,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30,33;MFRL=254,164,121;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=6.85,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.525,0.220:5:1,1,1:0,2,0:1,0,4,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	169951997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,4,8
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr1	169985796	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	170001160	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=113,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:0,3,1,1
chr1	170003539	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=129,41;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:10,0:18,2:0|1:170003539_T_C:170003539:11,18,1,1
chr1	170003542	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=134,41;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:10,0:19,2:0|1:170003539_T_C:170003539:11,19,1,1
chr1	170003549	.	GC	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=129,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:8,0:19,2:0|1:170003539_T_C:170003539:10,19,1,1
chr1	170003552	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=129,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:8,0:19,2:0|1:170003539_T_C:170003539:10,19,1,1
chr1	170003555	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=133,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:6,0:18,2:0|1:170003539_T_C:170003539:11,19,1,1
chr1	170003557	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=133,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:6,0:21,2:0|1:170003539_T_C:170003539:10,18,1,1
chr1	170008440	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	170043463	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,3:2,0:6,1,2,1
chr1	170115156	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	170501456	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,4,12
chr1	170699462	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:10,2:0|1:170699462_AC_A:170699462:5,15,1,1
chr1	170699464	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:170699462_AC_A:170699462:5,15,1,1
chr1	170927571	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=88,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:8,3:4,1:6,6,3,1
chr1	170927615	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:10,5:9,7:6,13,5,10
chr1	170928516	.	A	AAAAT,AAAATAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,0,244;MMQ=60,39,26;MPOS=9,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,6,7;RU=AAAT;STR;TLOD=3.52,7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.334,0.505:3:0,0,1:0,1,1:0,0,3,0
chr1	170931197	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	170955862	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=173,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,0:5,4:3,7,1,3
chr1	170961439	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:12,0:12,5:15,9,0,5
chr1	170961452	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=85,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:13,0:11,5:14,10,0,5
chr1	170993610	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=78,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.223:37:15,7:13,0:15,14,8,0
chr1	171031433	.	C	CACGGTGGCTCACGTCTATAATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	171121463	.	C	CCTCTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=196,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	171121483	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171121483_T_C:171121483:0,0,0,1
chr1	171121486	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171121483_T_C:171121483:0,0,0,1
chr1	171121489	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171121483_T_C:171121483:0,0,0,1
chr1	171121496	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171121483_T_C:171121483:0,0,0,1
chr1	171174531	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:4,5,2,3
chr1	171227216	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,9:0,0,12,6
chr1	171227316	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:12,0:11,4:13,11,2,2
chr1	171247766	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:171247766_CC_TT:171247766:4,0,1,0
chr1	171247776	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=217,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.374:6:1,0:3,2:1|0:171247766_CC_TT:171247766:4,0,2,0
chr1	171302094	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	171303925	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,7,8
chr1	171310778	.	AC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=108,118;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,0:13,4:9,12,0,4
chr1	171311003	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	171486948	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=82,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:4,4:9,1:6,7,4,2
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=93,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:4,1,1,2
chr1	171514848	.	T	TTTTA,TTTTATTTA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=21,28,28;MFRL=169,139,169;MMQ=60,60,45;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TTTA;STR;TLOD=8.86,10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.412,0.388:8:1,2,3:0,1,0:0,2,0,6
chr1	171514875	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:11,2:3,0:0,14,0,2
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=76,88;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.514:41:8,13:11,7:8,12,12,9
chr1	171526782	.	C	CCAA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.082:33:9,2:22,0:0|1:171526782_C_CCAA:171526782:18,13,1,1
chr1	171526787	.	CTTG	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.071:39:10,2:22,0:0|1:171526782_C_CCAA:171526782:22,15,1,1
chr1	171526793	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=95,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.075:37:11,1:22,0:0|1:171526782_C_CCAA:171526782:20,15,1,1
chr1	171527313	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=18,18;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.240:17:4,1:2,0:1,12,0,4
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:0,11,1,4
chr1	171527353	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=118,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:171527353_TA_T:171527353:0,3,0,1
chr1	171527357	.	TACTC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=118,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:171527353_TA_T:171527353:0,3,0,1
chr1	171530304	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=157,151;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:171530304_G_A:171530304:0,2,0,1
chr1	171530307	.	TGT	CAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=201,151;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:171530304_G_A:171530304:0,1,0,1
chr1	171530317	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171530304_G_A:171530304:0,0,0,1
chr1	171535274	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=246,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	171546833	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=79,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr1	171548617	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:171548868_T_C:171548868:1,0,1,0
chr1	171548874	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:171548868_T_C:171548868:2,0,1,0
chr1	171549045	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:0|1:171549045_G_A:171549045:4,8,1,1
chr1	171549066	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=100,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:12,1:2,0:0|1:171549045_G_A:171549045:6,8,1,1
chr1	171549189	.	C	CTGCTATTCCTCACTTTTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171549189_C_CTGCTATTCCTCACTTTTAA:171549189:0,0,0,1
chr1	171549193	.	AA	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171549189_C_CTGCTATTCCTCACTTTTAA:171549189:0,0,0,1
chr1	171560650	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:7,0,3,0
chr1	171560976	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.087:43:23,2:17,1:13,27,1,2
chr1	171561022	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	171605723	.	C	CTGCCTCAGCCTCCCGAGCAAGTGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=99,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr1	171673749	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	171707537	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,0:16,2:0|1:171707537_C_T:171707537:17,14,1,1
chr1	171707549	.	A	AGGCTGCAGGAGAGTCT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:14,2:0|1:171707537_C_T:171707537:16,17,1,1
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:5,3,2,2
chr1	171753692	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171753692_G_GA:171753692:0,0,0,1
chr1	171753693	.	G	GGACCCGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171753692_G_GA:171753692:0,0,0,1
chr1	171753697	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171753692_G_GA:171753692:0,0,0,1
chr1	171753699	.	G	GAACACTGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171753692_G_GA:171753692:0,0,0,1
chr1	171755071	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.668:34:5,9:6,14:4,7,10,13
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:4,9:10,10:4,10,10,9
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.553:27:5,3:6,11:7,5,5,10
chr1	171765923	.	C	CACTGTCAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=134,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	171891036	.	T	TGGAATTGTGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	171956803	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,2,1
chr1	172007376	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr1	172017787	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:172017787_C_T:172017787:9,10,1,1
chr1	172017809	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:12,0:5,2:0|1:172017787_C_T:172017787:9,8,1,1
chr1	172277845	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=214,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr1	172292355	.	C	CTCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,3:2,0,5,0
chr1	172356437	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,12,13
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,186;MMQ=35,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:0,2,0,10
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,51;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	172414332	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=99,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:4,11,1,2
chr1	172417746	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:172417746_C_T:172417746:0,11,0,2
chr1	172417748	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:172417746_C_T:172417746:0,11,0,2
chr1	172425529	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.480:5:0,0:2,2:3,0,1,1
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	172431404	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=95,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:5,2:0|1:172431404_T_C:172431404:7,12,1,1
chr1	172431411	.	A	AGAAGAATTCTCAGAAACTTCTTGAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=104,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:13,0:4,2:0|1:172431404_T_C:172431404:6,12,1,1
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=77.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.968:26:0,13:0,11:0,0,16,10
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	172525135	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:6,6,0,2
chr1	172548301	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,5:0,0,13,9
chr1	172558524	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,12,11
chr1	172577864	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,31,29;MFRL=102,130,135;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.79,16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,10:0.123,0.479:22:5,1,4:3,1,3:7,3,9,3
chr1	172633637	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	173174405	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:7,6,0,2
chr1	173450488	.	C	CACTGGGCATG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.202:17:8,1:5,2:0|1:173450488_C_CACTGGGCATG:173450488:6,8,2,1
chr1	173450490	.	C	CCTGCTGCAGTTGCCCCCTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.207:17:7,0:6,1:0|1:173450488_C_CACTGGGCATG:173450488:6,8,2,1
chr1	173455439	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:173455439_T_C:173455439:6,11,0,2
chr1	173455441	.	C	CTGCCTGTTAACTCAAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:173455439_T_C:173455439:6,11,0,2
chr1	173490407	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.681:9:3,2:0,4:2,1,3,3
chr1	173490547	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:3,3:4,0:3,7,0,3
chr1	173493823	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	173495828	.	TTGGTTTCCAAAATTTCACA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:10,0:11,14,1,1
chr1	173505008	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,4,3
chr1	173616003	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:0|1:173616003_C_T:173616003:11,7,1,1
chr1	173616015	.	T	TTCCTCACTCACTTCCTCA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,0:8,1:0|1:173616003_C_T:173616003:10,8,1,1
chr1	173721157	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,22;MFRL=198,147;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173721157_A_AT:173721157:0,1,0,1
chr1	173721158	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=198,147;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173721157_A_AT:173721157:0,1,0,1
chr1	173721159	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=198,147;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173721157_A_AT:173721157:0,1,0,1
chr1	173726110	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:8,4,2,1
chr1	173754326	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=89,72934353;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:7,1:10,11,1,1
chr1	173810132	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:4,7,1,1
chr1	173819570	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,0:12,3:11,11,2,1
chr1	173839521	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=103,191;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.211:50:24,0:14,10:17,23,0,10
chr1	173941674	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=100,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,1:15,0:0|1:173941674_G_A:173941674:15,14,1,1
chr1	173941683	.	GAT	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=89,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:14,0:0|1:173941674_G_A:173941674:13,13,1,1
chr1	173941699	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:173941699_C_T:173941699:11,7,1,1
chr1	173941707	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:173941699_C_T:173941699:9,7,1,1
chr1	173953653	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:11,0:0|1:173953653_C_T:173953653:10,7,1,1
chr1	173953658	.	T	TCTGAGAATGATTCTG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:9,0:0|1:173953653_C_T:173953653:10,7,1,1
chr1	174188231	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=101,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.415:8:4,1:1,1:4,1,3,0
chr1	174188285	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=92,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,12:5,4:3,6,8,8
chr1	174221809	.	T	TCTTTTCTTTTTAAATGTACCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=106,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	174245018	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.210:31:8,0:17,6:12,13,2,4
chr1	174274062	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr1	174274349	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	174274355	.	T	TTTGCCAAAACAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=204,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,3:1,0:0,2,3,0
chr1	174418108	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,0:3,3:6,5,2,1
chr1	174652772	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,2:6,2:1,8,2,2
chr1	174668838	.	G	GGGCGTGTAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	174948104	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174948104_C_T:174948104:0,1,0,1
chr1	174948113	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174948104_C_T:174948104:0,1,0,1
chr1	174948119	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174948104_C_T:174948104:0,1,0,1
chr1	174948126	.	AG	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174948104_C_T:174948104:0,1,0,1
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:8,2:5,5:9,4,4,3
chr1	175049596	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=90,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,1:1,1,3,4
chr1	175049650	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=258,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:175049650_T_TC:175049650:0,1,0,1
chr1	175049651	.	T	TCATGGCTTTAACTGCCACCATGACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=258,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:175049650_T_TC:175049650:0,1,0,1
chr1	175053101	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,0,7
chr1	175054548	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:2,5,4,2
chr1	175063031	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	175063072	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr1	175067569	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.203:23:9,0:7,3:0|1:175067569_C_T:175067569:11,8,1,3
chr1	175067590	.	G	GGGAGAGGGCTTCAAGGTA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:18,2:0|1:175067569_C_T:175067569:11,12,1,1
chr1	175086059	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.214:17:6,0:8,3:13,1,3,0
chr1	175086245	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=103,938;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,0:11,4:13,15,4,0
chr1	175087677	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:4,3,3,1
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	175105053	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=76,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:12,4:32,0:37,7,3,1
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:4,3:1,3:0,6,0,7
chr1	175129946	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,7:3,4:1,8,4,7
chr1	175292672	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr1	175323446	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	175355076	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:175355076_C_T:175355076:1,0,1,0
chr1	175355080	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:175355076_C_T:175355076:1,0,1,0
chr1	175355391	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	175365663	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:2,3:6,5:4,4,5,4
chr1	175366029	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:175366029_C_T:175366029:0,1,0,1
chr1	175366039	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175366029_C_T:175366029:0,0,0,1
chr1	175366043	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175366029_C_T:175366029:0,0,0,1
chr1	175375635	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:5,4,5,0
chr1	175375894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=130,277;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:5,2:0|1:175375894_C_T:175375894:2,3,0,2
chr1	175375902	.	A	AGTTGTCGTTGTTGTTGTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=130,277;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:2,2:0|1:175375894_C_T:175375894:2,3,0,2
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	176525959	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:176525959_C_T:176525959:7,5,1,1
chr1	176525971	.	T	TTGTGTAAAAAGAAGGAAAAGTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:176525959_C_T:176525959:7,5,1,1
chr1	176526460	.	A	AGGCAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	176664866	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:4,4,3,0
chr1	176671944	.	G	GATGTGGGTGTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,135;MMQ=50,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	176681165	.	ATGTGTG	A,ATG	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=22,23,23;MFRL=145,141,176;MMQ=60,60,60;MPOS=24,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=TG;STR;TLOD=6.09,12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.237,0.527:10:1,2,3:1,1,1:0,2,0,8
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	176740058	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	176760387	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=453,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr1	176762806	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=37,98;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:3,4,0,2
chr1	176833330	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176833330_T_A:176833330:1,0,1,0
chr1	176833331	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176833330_T_A:176833330:1,0,1,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr1	176913215	.	AT	A,ATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,23,26;MFRL=129,146,159;MMQ=60,60,50;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.74,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.403,0.382:7:1,3,1:0,0,2:0,1,1,5
chr1	176915022	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:3,3:3,0,2,1
chr1	176915294	.	A	ACCTATATTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=177,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	176926763	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr1	176927407	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=107,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	176992676	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr1	176993789	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.250:42:13,10:19,0:17,15,10,0
chr1	177000185	.	CAGAAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	177001736	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:12,2:6,2:12,6,3,1
chr1	177002011	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=266,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:177002011_T_A:177002011:1,0,1,1
chr1	177002013	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=266,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:177002011_T_A:177002011:1,0,1,1
chr1	177199320	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:177199320_G_A:177199320:1,1,0,1
chr1	177199323	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:177199320_G_A:177199320:1,1,0,1
chr1	177242773	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=199,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:177242773_TAA_T:177242773:1,2,0,1
chr1	177242800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=195,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:177242773_TAA_T:177242773:0,4,0,1
chr1	177247734	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,10:7,0:7,9,10,0
chr1	177247854	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,13,13
chr1	177899829	.	C	CTTGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=216,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr1	177901817	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,3:6,0:7,3,2,1
chr1	177906657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	177916890	.	A	AAGGGACAGGGAGGGGAGGTGAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr1	177923425	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:177923425_C_T:177923425:2,10,1,1
chr1	177923431	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0|1:177923425_C_T:177923425:2,9,1,1
chr1	177923440	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:0,6:1,9:0|1:177923425_C_T:177923425:0,1,5,10
chr1	177930096	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,6:0,3:1,0,2,7
chr1	177930697	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	177936782	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=95,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,4:10,0:8,7,4,0
chr1	178359379	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:12,0:2,10:1,13,0,11
chr1	178408795	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=217,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	178420929	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	178425767	.	C	CATCTGGAGCTGGTCTTACCTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=88,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178425767_C_CATCTGGAGCTGGTCTTACCTGAT:178425767:1,0,0,1
chr1	178425770	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=88,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178425767_C_CATCTGGAGCTGGTCTTACCTGAT:178425767:1,0,0,1
chr1	178427081	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:6,3,1,1
chr1	178433368	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0|1:178433368_C_T:178433368:5,1,2,2
chr1	178433370	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0|1:178433368_C_T:178433368:5,1,2,2
chr1	178434963	.	AAAAGAAAGAAAGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,1:2,4:6,0,5,0
chr1	178442190	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=79,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:17,2:7,8:16,8,6,4
chr1	178483231	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr1	178514978	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:5,7,0,2
chr1	178846849	.	T	TGTAATCTTTTGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	179019445	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:3,0:7,2:3,7,1,1
chr1	179036027	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:0|1:179036027_AT_A:179036027:0,7,1,1
chr1	179036033	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,1:0|1:179036027_AT_A:179036027:0,7,1,1
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:7,4:11,3:16,3,5,2
chr1	179041202	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:13,4:14,0:17,14,4,0
chr1	179052006	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr1	179052038	.	TGGTCTCCTCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,2:7,0:0|1:179052038_TGGTCTCCTCTC_T:179052038:8,5,1,1
chr1	179052059	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:9,0:0|1:179052038_TGGTCTCCTCTC_T:179052038:8,7,1,1
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.466:56:15,16:15,10:13,17,16,10
chr1	179067011	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=109,67;MMQ=56,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0|1:179067011_G_GAA:179067011:0,2,1,1
chr1	179067012	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=109,67;MMQ=56,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,1:2,0:0|1:179067011_G_GAA:179067011:0,2,1,1
chr1	179067016	.	G	GCACCCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=125,67;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179067011_G_GAA:179067011:0,1,0,1
chr1	179067017	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=125,67;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179067011_G_GAA:179067011:0,1,0,1
chr1	179067018	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,23;MFRL=125,67;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179067011_G_GAA:179067011:0,1,0,1
chr1	179067071	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	179076783	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,1614;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:179076783_A_ACC:179076783:2,0,1,0
chr1	179076785	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,1614;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:179076783_A_ACC:179076783:2,0,1,0
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr1	179089239	.	GA	G,GAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27,33;MFRL=137,89,171;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.76,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.355,0.270:8:1,1,1:2,2,1:3,0,4,1
chr1	179089475	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	179089491	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	179091100	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,6:1,1:0,6,2,5
chr1	179316770	.	T	TAACAAGGCCCCCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,1:8,0:0|1:179316770_T_TAACAAGGCCCCCA:179316770:7,12,0,2
chr1	179316771	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:0|1:179316770_T_TAACAAGGCCCCCA:179316770:7,12,0,2
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=91,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,6:5,3:5,7,2,7
chr1	179320368	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:9,2:0|1:179320368_G_A:179320368:14,0,2,0
chr1	179320376	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:0|1:179320368_G_A:179320368:15,0,2,0
chr1	179338037	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=120,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.110:61:43,6:12,0:12,43,0,6
chr1	179348683	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,0:4,2:0|1:179348683_C_T:179348683:1,8,2,1
chr1	179348688	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:179348683_C_T:179348683:0,8,1,1
chr1	179348703	.	TG	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=160,63;MMQ=55,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:179348683_C_T:179348683:0,6,1,1
chr1	179354304	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	179364379	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:9,2:0,3:0,9,2,3
chr1	179399649	.	A	AATATGACTCTAAGTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:0,0:2,5,1,1
chr1	179399748	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:3,7,0,3
chr1	179401379	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.397:10:2,3:4,1:5,1,3,1
chr1	179401564	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:1,3:5,0:0,6,0,3
chr1	179437801	.	T	TCTAATGGCCCCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0|1:179462149_A_G:179462149:0,0,0,5
chr1	179462155	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,2,0,1
chr1	179462157	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,34;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,2,0,1
chr1	179462160	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,2,0,1
chr1	179462163	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,3,0,1
chr1	179462168	.	A	AGGTCATGGTG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,3,0,1
chr1	179462170	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:179462149_A_G:179462149:0,3,0,1
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=72,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:3,8:6,3:6,3,1,10
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,8:2,4:0,6,0,13
chr1	179520254	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:4,2,3,0
chr1	179520506	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=217,89;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,14:0.318:45:12,6:19,8:5,26,6,8
chr1	179561683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr1	179604864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=69,131;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:4,4,4,4
chr1	179605058	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=92,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	179623457	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:15,3:10,0:11,15,3,1
chr1	179660090	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	179834335	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:14,0:24,2:18,22,0,2
chr1	179851537	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr1	179852074	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,22:0,0,16,20
chr1	179983478	.	AGAGCTCTACCGG	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:16,2:20,0:0|1:179983478_AGAGCTCTACCGG_A:179983478:19,27,0,2
chr1	179983492	.	AG	A	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=115,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:20,2:23,0:0|1:179983478_AGAGCTCTACCGG_A:179983478:18,26,0,2
chr1	179983495	.	AGAAGGAAGCCTTTACT	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:21,2:23,0:0|1:179983478_AGAGCTCTACCGG_A:179983478:21,32,0,2
chr1	179983515	.	GT	CA	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:18,2:14,0:0|1:179983478_AGAGCTCTACCGG_A:179983478:17,18,0,2
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr1	179989997	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:17,11:8,0:15,10,11,0
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,1229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	179993793	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	180003191	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=100,97;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:12,3:9,19,0,3
chr1	180006034	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:4,6,1,1
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	180053349	.	CTA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:19,4:24,0:20,25,2,2
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr1	180144555	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=68,55;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:10,2:0|1:180144555_C_T:180144555:4,7,1,1
chr1	180144563	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=90,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:8,2:0|1:180144555_C_T:180144555:3,8,1,1
chr1	180144568	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:7,2:0|1:180144555_C_T:180144555:3,7,1,1
chr1	180144570	.	TA	CT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:180144555_C_T:180144555:3,7,1,1
chr1	180144575	.	GGG	CCT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:180144555_C_T:180144555:2,7,1,1
chr1	180151271	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:180155376_C_G:180155376:0,0,0,1
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:180155376_C_G:180155376:0,0,0,1
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	180217322	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	180240650	.	TGGACATGAGGGTCGTACAGGTGAGATGCCAGCACTCCTGTGCCCTCCGGGGATCCCAGGCCCG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.225:12:4,2:4,0:2,8,1,1
chr1	180243524	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:3,5,1,2
chr1	180257583	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:18,0:10,2:0|1:180257583_T_C:180257583:19,9,1,1
chr1	180257586	.	C	CTGCAGCCTCCTCCCA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,0:9,2:0|1:180257583_T_C:180257583:19,10,1,1
chr1	180257588	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=94,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:9,1:0|1:180257583_T_C:180257583:16,10,1,1
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr1	180601282	.	TGCCGCC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GCC;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:5,2:12,4,1,1
chr1	180757056	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	180772617	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:5,0:9,4:6,8,0,5
chr1	180885430	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,6:0,14:0,0,14,6
chr1	180885898	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:8,8,1,2
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	180897792	.	ATGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGC;STR;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	180905694	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:2,2,1,2
chr1	181018180	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,135;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:3,2,6,4
chr1	181018491	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:10,0:1,1:0|1:181018491_A_C:181018491:0,12,4,0
chr1	181018496	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:1,1:0|1:181018491_A_C:181018491:0,12,2,0
chr1	181022895	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr1	181024404	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:9,4:13,9:14,8,4,9
chr1	181058231	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=170,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	181058540	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	181480664	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:23,0:12,4:14,21,2,2
chr1	181480666	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,29;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:20,0:13,2:0|1:181480666_C_A:181480666:15,22,1,1
chr1	181480668	.	GT	TA	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=108,29;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:21,0:12,2:0|1:181480666_C_A:181480666:13,22,1,1
chr1	181480714	.	GGC	AAA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=156,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr1	181688868	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:5,1:3,4:5,3,3,3
chr1	181695307	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:14,3:4,0:7,11,1,2
chr1	181701423	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	181705660	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=60320912,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,4:3,1:1,3,1,5
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=130,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,3:8,1,7,0
chr1	181727273	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:1,5,4,5
chr1	181728019	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=90,66;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,0:13,3:7,15,0,3
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=71,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.635:8:1,3:1,2:1,2,5,0
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr1	181732746	.	AG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181732746_AG_TT:181732746:0,1,0,1
chr1	181732753	.	TCACC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181732746_AG_TT:181732746:0,1,0,1
chr1	181750469	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	181752769	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=80,33;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.626:17:2,6:5,2:4,3,7,3
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=103.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,19:0,5:0,0,4,20
chr1	181754824	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:16,13:8,0:14,10,13,0
chr1	182026407	.	CCTCAGCCTCT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=205,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:182026407_CCTCAGCCTCT_C:182026407:2,2,1,1
chr1	182026422	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=205,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:182026407_CCTCAGCCTCT_C:182026407:2,2,1,1
chr1	182026426	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=227,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:182026407_CCTCAGCCTCT_C:182026407:3,2,1,1
chr1	182026598	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr1	182026612	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:3,1,5,0
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=82,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,9:8,4:3,12,3,10
chr1	182369233	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=102,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,3:7,4:10,4,3,4
chr1	182369295	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,8:5,0:7,4,8,0
chr1	182429295	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=80,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr1	182443462	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,1:7,7:5,3,5,3
chr1	182458262	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,4:9,0:6,10,4,0
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	182491111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr1	182491126	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:8,1,3,0
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,8:1,3:1,1,4,7
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	182517642	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:1,6,0,5
chr1	182517926	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,0:14,2:0|1:182517926_C_T:182517926:8,9,1,1
chr1	182517935	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,0:17,2:0|1:182517926_C_T:182517926:10,11,1,1
chr1	182522552	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:5,2,2,2
chr1	182523886	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:182523886_A_AG:182523886:0,4,1,1
chr1	182523887	.	A	AACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:182523886_A_AG:182523886:0,4,1,1
chr1	182523890	.	GGAGATGGTAT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:182523886_A_AG:182523886:0,4,1,1
chr1	182551458	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=118,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:182551458_T_TA:182551458:0,3,0,1
chr1	182551460	.	G	GCAAAACTGCCATAGACTACCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=118,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:182551458_T_TA:182551458:0,3,0,1
chr1	182551482	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:182551482_ATG_A:182551482:0,0,0,1
chr1	182551485	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:182551482_ATG_A:182551482:0,0,0,1
chr1	182551488	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:182551482_ATG_A:182551482:0,0,0,1
chr1	182571003	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:2,1,8,0
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	182784022	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:2,6,1,4
chr1	182786036	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	182787840	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=52,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr1	182787850	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:182787850_G_GA:182787850:2,2,1,1
chr1	182787853	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:182787850_G_GA:182787850:2,2,1,1
chr1	182835774	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=188,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:182835774_A_G:182835774:0,1,0,1
chr1	182835780	.	G	GCAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=188,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:182835774_A_G:182835774:0,1,0,1
chr1	182850411	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,4:13,0:15,13,3,1
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	182909650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=101,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,3:9,0:5,7,1,2
chr1	182993358	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	183077615	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:183077615_C_T:183077615:0,2,0,5
chr1	183077618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:183077615_C_T:183077615:0,2,0,5
chr1	183079853	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=70,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	183079877	.	TTGAAAGGAAAGCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	183084607	.	AC	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr1	183090765	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,195;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr1	183094682	.	A	ATTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:15,0:6,2:8,13,0,2
chr1	183095185	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24,23;MFRL=181,158,973574;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=8.54,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.502,0.302:7:1,2,0:0,2,1:1,0,5,1
chr1	183095234	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=180,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:5,4:7,5:11,2,5,4
chr1	183095477	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,1,5
chr1	183096634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=209,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr1	183097946	.	C	CATTGTCTGGCTTTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	183099701	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.777:16:2,4:1,8:2,1,3,10
chr1	183101444	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=174,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	183101471	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:4,1,2,1
chr1	183101686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:6,1:0,3:1,5,1,4
chr1	183102719	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:0,4,2,4
chr1	183103969	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.441:16:4,0:4,6:2,7,2,5
chr1	183104003	.	GGTCTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	183104079	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=324,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr1	183104200	.	AGCTGATGCTGCCAAGGCCCTC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:8,2:10,0:19,9,1,1
chr1	183104340	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	183106739	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	183177218	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,6:8,8:8,7,3,11
chr1	183184625	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,77;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:14,9,1,2
chr1	183192395	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:3,5,4,3
chr1	183206517	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,179;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:46,3:41,0:57,30,3,0
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,7:0,0,2,5
chr1	183253213	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=85,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,1:1,3:0,2,0,5
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,3:3,8:1,3,6,5
chr1	183481943	.	C	CTTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,23;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:2,2:1,1:2,1,3,2
chr1	183486859	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr1	183496658	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,2:4,10:5,1,8,4
chr1	183498190	.	G	GATGTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=156,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	183498197	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	183510294	.	TGCGCGCACACGC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:183510294_TGCGCGCACACGC_T:183510294:0,2,1,1
chr1	183510303	.	ACGCGCG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=CG;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:183510294_TGCGCGCACACGC_T:183510294:0,1,0,1
chr1	183510311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:183510294_TGCGCGCACACGC_T:183510294:1,2,0,1
chr1	183510323	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,21;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1|0:183510294_TGCGCGCACACGC_T:183510294:1,3,0,1
chr1	183510326	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1|0:183510294_TGCGCGCACACGC_T:183510294:1,3,0,1
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,0:4,8:0,4,0,8
chr1	183518526	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	183532666	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,5:2,5:4,4,6,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.612:39:8,13:6,10:4,11,9,15
chr1	183536473	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=108,156;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:12,0:7,3:8,11,0,3
chr1	183536484	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=103,156;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:7,11,0,3
chr1	183556129	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,125;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:4,0:5,2:1,8,0,3
chr1	183592594	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=89,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,1:5,6:6,7,4,3
chr1	183596703	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=103,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,24:0.390:62:21,10:17,14:16,22,11,13
chr1	183599638	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:10,4,3,3
chr1	183602138	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	183602308	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.425:38:6,4:16,12:7,15,6,10
chr1	183604596	.	GG	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=155,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	183616884	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:3,2,6,4
chr1	183617094	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.459:31:9,11:7,4:5,11,8,7
chr1	183617105	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.504:29:8,10:6,4:7,7,9,6
chr1	183617311	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:3,8,1,4
chr1	183617413	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=72,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,4:1,3:2,5,5,2
chr1	183617693	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,4:7,12:4,6,10,6
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	183711521	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	183775638	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=77,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.650:15:1,6:4,4:2,3,2,8
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr1	183867085	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.795:8:1,3:0,2:1,0,1,6
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	183873898	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	183876287	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr1	183876308	.	GGA	TCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183876308_GGA_TCC:183876308:0,4,0,1
chr1	183876312	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183876308_GGA_TCC:183876308:0,4,0,1
chr1	183876315	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183876308_GGA_TCC:183876308:0,4,0,1
chr1	183876320	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,21;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183876308_GGA_TCC:183876308:0,4,0,1
chr1	183876322	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,21;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183876308_GGA_TCC:183876308:0,4,0,1
chr1	183885726	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=99,69;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:17,0:22,5:16,23,2,3
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	183908192	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:5,12,1,2
chr1	183908236	.	A	AAGGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	183933290	.	CTA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	183944444	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	184021067	.	ACCCAGGCAGAACACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=183,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	184023529	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:10,6:1,11:6,5,11,6
chr1	184023927	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=160,199;MMQ=53,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,2:10,0:10,11,1,1
chr1	184446692	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,63;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:8,9,4,0
chr1	184446798	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:184446798_TGA_T:184446798:0,2,0,1
chr1	184446801	.	T	TTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184446798_TGA_T:184446798:0,2,0,1
chr1	184446803	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184446798_TGA_T:184446798:0,2,0,1
chr1	184675954	.	AAA	GTC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=105,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:184675954_AAA_GTC:184675954:2,6,0,2
chr1	184675962	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=105,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:184675954_AAA_GTC:184675954:2,6,0,2
chr1	184675965	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=86,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:184675954_AAA_GTC:184675954:1,6,0,2
chr1	184675968	.	T	TAACC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=96,239;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:184675954_AAA_GTC:184675954:1,5,0,2
chr1	184681065	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=203,157;MMQ=58,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,1:0,3,0,2
chr1	184688237	.	CGT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=106,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.222:12:3,0:4,2:10,0,1,1
chr1	184718767	.	A	AATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:0|1:184718767_A_AATT:184718767:3,9,0,2
chr1	184718769	.	GT	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:3,0:6,2:0|1:184718767_A_AATT:184718767:3,10,0,2
chr1	184765231	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=299,282;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	184868251	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,6:0,1:3,0,6,1
chr1	185060950	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	185109174	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=119,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.126:45:17,5:23,0:23,17,5,0
chr1	185120927	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.262:20:6,1:5,3:11,4,4,1
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=186,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=223.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,51:0.929:54:1,26:2,15:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:2,1,28,23
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,46:0.921:49:1,27:1,16:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:2,1,29,17
chr1	185137464	.	T	TAA,TTAA	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,25,24;MFRL=325,125,112;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=87.48,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,37,3:0.851,0.089:42:1,24,1:1,12,2:2,0,26,14
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,1,5
chr1	185144095	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:185144095_C_T:185144095:9,10,1,1
chr1	185144102	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:13,2:0|1:185144095_C_T:185144095:9,10,1,1
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	185259731	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	185267114	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr1	185269100	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:11,2:4,2:11,5,4,0
chr1	185833565	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr1	185834847	.	GTTTC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:1,0:5,3,3,0
chr1	185891558	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:8,10,2,0
chr1	185933013	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,72;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,0:8,3:8,12,1,2
chr1	185951596	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:185951596_A_ATG:185951596:0,3,0,1
chr1	185951597	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:185951596_A_ATG:185951596:0,3,0,1
chr1	185984618	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0|1:185984618_C_CTG:185984618:0,2,1,1
chr1	185984620	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0|1:185984618_C_CTG:185984618:0,2,1,1
chr1	185984626	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:185984618_C_CTG:185984618:0,2,0,1
chr1	186022032	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	186026474	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,5,9
chr1	186034629	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186034629_T_TTC:186034629:0,1,0,1
chr1	186034634	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186034629_T_TTC:186034629:0,1,0,1
chr1	186039006	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	186055371	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr1	186057181	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr1	186081918	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr1	186082179	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=248,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	186083158	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.431:35:8,0:12,15:0|1:186083158_A_G:186083158:9,11,0,15
chr1	186083164	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,15:0.363:42:12,0:12,1:0|1:186083158_A_G:186083158:14,13,0,15
chr1	186086578	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr1	186089375	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=213,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:186089375_C_A:186089375:0,5,0,2
chr1	186089376	.	A	ATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=213,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:186089375_C_A:186089375:0,5,0,2
chr1	186097254	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=91,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,3:12,0:6,11,3,0
chr1	186097324	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	186099163	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=96,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,4:10,0:14,8,3,1
chr1	186113852	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	186114443	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	186135230	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:186135230_T_A:186135230:4,0,1,0
chr1	186135231	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,31;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,1:0,3:1|0:186135230_T_A:186135230:1,0,4,0
chr1	186135236	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:186135230_T_A:186135230:0,0,5,0
chr1	186135249	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:186135230_T_A:186135230:3,0,1,0
chr1	186141301	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr1	186151493	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	186270902	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,34;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	186270907	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,34;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270911	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=27,27;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270913	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=23,26;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270918	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270920	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,30;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270921	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270924	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,22;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186270927	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186270907_T_C:186270907:0,1,0,1
chr1	186277088	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,7:0,15:0,0,10,13
chr1	186278300	.	T	TCTCCTTATAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:186278300_T_TCTCCTTATAC:186278300:0,1,0,1
chr1	186278302	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:186278300_T_TCTCCTTATAC:186278300:0,1,0,1
chr1	186278304	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:186278300_T_TCTCCTTATAC:186278300:0,1,0,1
chr1	186283133	.	T	TCCCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=C;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,0:4,2:7,7,1,1
chr1	186296675	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=93,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,0:13,4:11,11,4,0
chr1	186307244	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:0|1:186307244_A_T:186307244:9,11,1,1
chr1	186307251	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:186307244_A_T:186307244:8,10,1,1
chr1	186310139	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=68,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,6:7,4:7,4,6,4
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr1	186321217	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=103,112;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,0:9,4:8,11,0,4
chr1	186330695	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24,23;MFRL=177,166,191;MMQ=60,60,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.47,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.240,0.449:10:3,1,1:0,1,4:3,0,6,1
chr1	186337155	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:186337155_G_GA:186337155:0,2,0,1
chr1	186337156	.	C	CTATCTCAAGAACTTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:186337155_G_GA:186337155:0,2,0,1
chr1	186337166	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186337166_AAG_A:186337166:0,0,0,1
chr1	186337169	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186337166_AAG_A:186337166:0,0,0,1
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr1	186358722	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:186358722_T_C:186358722:6,10,1,1
chr1	186358728	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:186358722_T_C:186358722:7,11,1,1
chr1	186358731	.	GA	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=79,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:186358722_T_C:186358722:6,11,1,1
chr1	186370678	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	186643875	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=81,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:186643875_T_TG:186643875:7,5,1,1
chr1	186643885	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:186643875_T_TG:186643875:5,6,1,1
chr1	186647323	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:3,2:8,0,2,1
chr1	186863385	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,0,4
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	186925168	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	186925194	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	186934811	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0,7,0,3
chr1	186946912	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,19:0,0,13,19
chr1	190130107	.	TACATATAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	190195319	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:6,0:15,2:0|1:190195319_T_A:190195319:13,10,1,1
chr1	190195323	.	G	GAAAATAATAACAATA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:13,2:0|1:190195319_T_A:190195319:13,10,1,1
chr1	190250701	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:6,5:2,0:6,2,7,0
chr1	190423830	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=97,128;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:10,0:13,8,3,0
chr1	190423855	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=105,128;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,3:16,0:17,10,3,0
chr1	192312192	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:17,2:0|1:192312192_C_T:192312192:24,9,1,1
chr1	192312212	.	A	AAGAGAAACTCG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:14,2:0|1:192312192_C_T:192312192:11,14,1,1
chr1	192335325	.	GTC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:192335325_GTC_G:192335325:0,0,0,1
chr1	192335331	.	T	TCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:192335325_GTC_G:192335325:0,0,0,1
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	192547525	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=156,849;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,0:3,5:0|1:192547525_A_T:192547525:1,7,5,0
chr1	192547533	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=143,849;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,0:3,5:0|1:192547525_A_T:192547525:1,6,5,0
chr1	192547563	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,16;MFRL=175,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:192547563_A_AT:192547563:0,3,0,1
chr1	192547565	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=175,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:192547563_A_AT:192547563:0,3,0,1
chr1	192547569	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=175,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:192547563_A_AT:192547563:0,3,0,1
chr1	192548508	.	C	CTTGTGATAGCAGAGAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=231,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	192779227	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	192780088	.	GCT	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=156.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,20:0,25:0,0,20,26
chr1	192780337	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr1	193051893	.	ATTTT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=15,19;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:2,1:0,0:0,9,0,2
chr1	193051909	.	T	TAATC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=179,221;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:0,8,0,2
chr1	193051938	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,1:2,1:0,7,0,2
chr1	193053996	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	193104840	.	G	GATGTGATTGCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	193111228	.	TGA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=113,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:6,2:1,1:1,9,0,3
chr1	193172858	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,29:0.715:40:6,29:5,0:9,2,29,0
chr1	196251522	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	196254970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	196303038	.	G	GGCATATCCCCAAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:10,4,1,1
chr1	196311377	.	C	CCCACG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr1	196398619	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	196438244	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	196448266	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,5:3,0:6,3,4,1
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,4,15
chr1	196658497	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr1	196696155	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	196711271	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196711271_G_A:196711271:0,1,0,1
chr1	196711274	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196711271_G_A:196711271:0,1,0,1
chr1	196711275	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196711271_G_A:196711271:0,1,0,1
chr1	196711277	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196711271_G_A:196711271:0,1,0,1
chr1	196763762	.	TC	GG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,2:4,2:0|1:196763762_TC_GG:196763762:5,12,2,2
chr1	196763765	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,2:4,2:0|1:196763762_TC_GG:196763762:5,12,2,2
chr1	196763771	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:11,2:3,2:0|1:196763762_TC_GG:196763762:3,11,2,2
chr1	196763773	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:10,2:3,2:0|1:196763762_TC_GG:196763762:3,11,2,2
chr1	196794892	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=178,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:1,4,0,2
chr1	196879313	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=6969448,143;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:196879313_C_A:196879313:1,0,1,0
chr1	196879317	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=10,14;MFRL=6969448,143;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:196879313_C_A:196879313:1,0,1,0
chr1	196879330	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=6969448,143;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:196879313_C_A:196879313:1,0,1,0
chr1	196879336	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=6969448,143;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:196879313_C_A:196879313:1,0,1,0
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	197053555	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=99,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.262:9:3,0:2,0:0|1:197053555_G_C:197053555:3,4,0,2
chr1	197053561	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=99,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:3,1:2,1:0|1:197053555_G_C:197053555:2,3,0,2
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,8,6
chr1	197056096	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	197063352	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr1	197070088	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:11,0:7,6:9,9,0,6
chr1	197070901	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	197071199	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,5199029;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:16,8,0,2
chr1	197072420	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr1	197072554	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:4,16,0,4
chr1	197091808	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	197094050	.	G	GTGTGTCTGTGT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,2:15,0:0|1:197094050_G_GTGTGTCTGTGT:197094050:8,15,1,1
chr1	197094053	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,1:15,0:0|1:197094050_G_GTGTGTCTGTGT:197094050:8,16,1,1
chr1	197097891	.	AAAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	197098513	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,2:8,0:0,9,0,2
chr1	197101303	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,15,6
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=208,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.803:23:4,11:0,8:3,1,17,2
chr1	197141253	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.167:27:14,4:9,0:20,3,2,2
chr1	197147471	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	197297598	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,29;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:9,0:14,2:12,11,1,1
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	197397109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	197407886	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	197411365	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.145:20:4,2:13,1:7,10,2,1
chr1	197479805	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=214,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:4,0,6,2
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	197876320	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:19,5:16,0:17,20,3,2
chr1	197881753	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=86,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:7,12,0,3
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	197898072	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,186;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:6,0:17,0,2,0
chr1	197898258	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,81;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:13,0:12,5:9,16,1,4
chr1	197901215	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=250,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	198225658	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	198225711	.	C	CCTATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:198225711_C_CCTATCT:198225711:0,1,0,1
chr1	198225714	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:198225711_C_CCTATCT:198225711:0,1,0,1
chr1	198233297	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=142,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:17,0:20,4:20,17,1,3
chr1	198233396	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:4,12,0,2
chr1	198675923	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:6,5:9,12:6,9,9,8
chr1	198711170	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.342:14:4,1:2,3:3,6,1,4
chr1	198717218	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.289:17:1,2:9,2:8,5,3,1
chr1	198828027	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.156:23:14,3:4,0:0|1:198828027_G_GC:198828027:8,12,1,2
chr1	198828028	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=111,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.156:23:14,3:5,0:0|1:198828027_G_GC:198828027:8,12,1,2
chr1	200017278	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=142,0;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:200017278_C_G:200017278:1,3,1,0
chr1	200017280	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,19;MFRL=142,0;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:1,0:0|1:200017278_C_G:200017278:1,3,1,0
chr1	200017284	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=130,76;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0,2,2,0
chr1	200080464	.	CA	C,AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20,20;MFRL=202,73,135;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.05,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.291,0.231:11:2,2,1:2,1,1:1,4,2,4
chr1	200143072	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:5,9:4,8:9,0,17,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	200311868	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=275,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,15:1,11:1,0,11,16
chr1	200311910	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr1	200312546	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34,28;MFRL=188,121,91;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.23,8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.271,0.528:7:0,0,2:1,2,1:0,1,2,4
chr1	200312600	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:200312600_CGG_C:200312600:0,2,0,1
chr1	200312603	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:200312600_CGG_C:200312600:0,2,0,1
chr1	200378731	.	TGCC	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.096:28:8,0:16,2:7,19,1,1
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0|1:200523514_A_G:200523514:0,0,7,0
chr1	200523518	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0|1:200523514_A_G:200523514:0,0,7,0
chr1	200530098	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:200530098_C_T:200530098:0,0,0,1
chr1	200530106	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200530098_C_T:200530098:0,0,0,1
chr1	200534248	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,7:0,21:0,0,10,18
chr1	200534278	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:5,3:17,0:7,15,3,0
chr1	200534359	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:6,5,1,1
chr1	200534377	.	A	AGGAGCTAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:200534377_A_AGGAGCTAG:200534377:3,6,1,1
chr1	200534381	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:6,0:0|1:200534377_A_AGGAGCTAG:200534377:3,6,1,1
chr1	200549422	.	TTTTCC	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:12,0:17,2:0|1:200549422_TTTTCC_T:200549422:22,13,1,1
chr1	200549434	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:18,2:0|1:200549422_TTTTCC_T:200549422:23,9,1,1
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	200558286	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	200561464	.	T	TGATATAATTTTTTCTCTTAGTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	200567334	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,1,11
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	200709127	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,141;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.363:34:11,0:10,12:4,18,0,12
chr1	200730320	.	A	ACGAAGATATTTCCTTTTCTGCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	200784875	.	T	TTGTATGGGTCATTATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	200801374	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=137,106;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:16,4:10,0:12,14,4,0
chr1	200801405	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=123,106;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,4:12,0:11,14,4,0
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	200818281	.	G	GTTAAACTCTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:6,4,0,2
chr1	200819180	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=126,96;MMQ=60,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:11,0:17,4:0|1:200819180_G_T:200819180:8,21,0,4
chr1	200819186	.	C	CAGATATAAAGGAA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,38;MFRL=126,96;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:9,0:18,4:0|1:200819180_G_T:200819180:6,22,0,4
chr1	200819188	.	TC	AG	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=126,96;MMQ=60,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:10,0:17,1:0|1:200819180_G_T:200819180:6,22,0,4
chr1	200822605	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,1:20,2:11,26,2,1
chr1	200826395	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,1:7,2:9,3,3,0
chr1	200842611	.	C	CGGGCGTGGTGGCACACGACTGTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	200860612	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,7,0
chr1	200869318	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:200869318_C_T:200869318:10,12,1,1
chr1	200869328	.	GA	CC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:200869318_C_T:200869318:10,9,1,1
chr1	200869331	.	TGG	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:9,2:0|1:200869318_C_T:200869318:12,10,1,1
chr1	200869334	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:200869318_C_T:200869318:12,10,1,1
chr1	200869339	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:200869318_C_T:200869318:12,9,1,1
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	200877881	.	CCTCCAGAGT	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:15,0:13,2:18,17,1,1
chr1	200880978	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	200944057	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	200959337	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:9,2:0|1:200959337_C_T:200959337:3,11,1,1
chr1	200959347	.	C	CCACGATACACCACCGAACTCACGAATT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:0|1:200959337_C_T:200959337:5,10,1,1
chr1	200973542	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=97,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.468:34:8,0:10,15:9,9,0,16
chr1	201009556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=250,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	201013457	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:8,5,2,1
chr1	201013471	.	C	CTTTCCTTCCTTCCTCCTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:5,0:10,2:11,7,1,1
chr1	201013669	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,170;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	201013684	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=154,184;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.411:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	201016296	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:5,9:3,5:3,5,6,8
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr1	201022376	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,3:2,0:2,4,2,1
chr1	201028272	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	201028410	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,0:5,3:9,4,2,1
chr1	201031011	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=150,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr1	201031029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=189,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	201031517	.	C	CACACATTTTGTTGAAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=77,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.381:3:1,0:1,1:2,0,0,1
chr1	201042618	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=93,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	201044635	.	C	CACAGTGCAGCCACCGGATGGTGCG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=100,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,3:5,1:3,4,3,1
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	201052507	.	T	TGACTATTTAAAATGTTTCTGCAGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201060865	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=74,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,4:3,2:7,3,2,4
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,983;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	201162411	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.339:21:7,3:6,3:7,7,4,3
chr1	201163191	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr1	201165154	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=39,22;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:14,0:1,4:1,14,0,4
chr1	201166281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=214237,274;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:8,0,2,1
chr1	201168451	.	G	GTGCCTCTTCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:1,2:8,0:3,6,1,1
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,7,5
chr1	201171007	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr1	201171035	.	T	TGTCGGGGTTCCTTGCTGTCAGGGCTCCTGATGGTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=236,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr1	201173104	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr1	201174324	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=111,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:13,0:6,4:8,11,2,2
chr1	201175617	.	G	GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:3,5,0,2
chr1	201182117	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:3,4,1,6
chr1	201182609	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:10,2:9,5:8,11,3,4
chr1	201182650	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=91,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:201182650_G_A:201182650:7,10,1,1
chr1	201182662	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=91,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:201182650_G_A:201182650:7,8,1,1
chr1	201182678	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=100,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:201182650_G_A:201182650:4,7,1,1
chr1	201182740	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=31,0;MFRL=150,889;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,2,0,1
chr1	201182744	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=31,11;MFRL=150,889;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,2,0,1
chr1	201182746	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=150,889;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,2,0,1
chr1	201182750	.	GTA	G,GGGCTCCCGGCTCTA	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=30,31,31;MFRL=199,889,101;MMQ=60,60,60;MPOS=8,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr1	201182754	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=30,31;MFRL=199,889;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182759	.	TCTCTGCTGAGCTGGCTCCCATGGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=27,28;MFRL=199,889;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182786	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=24,24;MFRL=199,889;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182789	.	GACAGT	G	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=30,31;MFRL=199,889;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182798	.	GAGCTCCCTGGCCACT	G	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=21,31;MFRL=591,889;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,2,0,1
chr1	201182817	.	ATGCTT	A	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=26,24;MFRL=982,889;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182825	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=982,889;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201182829	.	GTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=982,889;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201182740_GA_G:201182740:0,1,0,1
chr1	201184097	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	201186659	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	201187828	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	201190732	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:2,4,4,2
chr1	201192052	.	G	GTTGCTGTTGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201195119	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0|1:201195119_C_T:201195119:0,0,3,4
chr1	201195122	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:201195119_C_T:201195119:3,4,1,1
chr1	201195126	.	ACCGCTT	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:201195119_C_T:201195119:3,6,1,1
chr1	201195134	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:201195119_C_T:201195119:3,6,1,1
chr1	201196183	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.241:33:9,6:16,0:11,14,8,0
chr1	201285759	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,12,12
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,2:0,7:1,0,8,1
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr1	201293512	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	201294194	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,0:4,7:0|1:201294194_C_T:201294194:1,7,0,7
chr1	201294198	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.464:16:4,0:4,7:0|1:201294194_C_T:201294194:1,8,0,7
chr1	201330562	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201330562_G_A:201330562:0,2,0,1
chr1	201330569	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201330562_G_A:201330562:0,0,0,1
chr1	201331554	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,10,15
chr1	201331584	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:3,0:10,6:4,9,0,7
chr1	201331664	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	201336984	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:1,7,1,3
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=70.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr1	201350924	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:7,5:11,0:10,8,2,3
chr1	201352317	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,1:13,2:21,10,3,0
chr1	201353827	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	201354857	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=108,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:15,4:9,0:12,14,1,3
chr1	201383611	.	G	GCCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=99,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=C;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr1	201687451	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	201749716	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	201751446	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=113,140;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:16,0:11,8:12,15,0,8
chr1	201752707	.	G	GCCGATATTTTTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:201752707_G_GCCGATATTTTTTTTTT:201752707:3,2,0,2
chr1	201752709	.	C	CAAAAGTACGCATACAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:201752707_G_GCCGATATTTTTTTTTT:201752707:3,2,0,2
chr1	201752712	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:201752707_G_GCCGATATTTTTTTTTT:201752707:3,2,0,2
chr1	201754410	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=134,282;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:0,1:3,0,1,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	201773566	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	201778354	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.448:36:15,0:5,16:14,6,0,16
chr1	201781678	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:7,4,1,1
chr1	201786347	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:0|1:201786347_TG_T:201786347:4,9,0,2
chr1	201786351	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:4,0:0|1:201786347_TG_T:201786347:5,8,0,2
chr1	201786354	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:201786347_TG_T:201786347:5,7,0,2
chr1	201786357	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:201786347_TG_T:201786347:5,7,0,2
chr1	201786359	.	C	CTCTTGACAGAAAGAAA	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:4,0:0|1:201786347_TG_T:201786347:5,7,0,2
chr1	201786413	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,3,1
chr1	201798400	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:8,4:7,3:12,3,6,1
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,6:5,6:8,1,9,3
chr1	201822085	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=90,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:8,10:7,0:12,3,10,0
chr1	201825158	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=220,157;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,353;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,2,0
chr1	201828204	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=160,63;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:201828204_T_C:201828204:0,5,1,1
chr1	201828209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,63;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:201828204_T_C:201828204:0,5,1,1
chr1	201828216	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=148,63;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:201828204_T_C:201828204:0,3,1,1
chr1	201837821	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=109,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:13,4:15,14,4,0
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=20,28,20;MFRL=54,107,80;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.03,14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,12:0.176,0.591:22:1,1,5:4,4,7:2,3,9,8
chr1	201838853	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,19846206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:2,3,0,4
chr1	201839998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:201839998_G_A:201839998:0,3,0,1
chr1	201840000	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:201839998_G_A:201839998:0,3,0,1
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,21:0,0,28,10
chr1	201843979	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,2:6,0:8,12,1,1
chr1	201844126	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=305,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:201844126_C_G:201844126:0,1,1,3
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,0:0|1:201844126_C_G:201844126:0,0,1,4
chr1	201845313	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:6,6,0,3
chr1	201858765	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,0:6,6:5,4,0,6
chr1	201860626	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,5:1,7:5,2,4,8
chr1	201867323	.	AGT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=184,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:0,0:0|1:201867323_AGT_A:201867323:5,0,2,0
chr1	201867328	.	G	GGAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,239;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0|1:201867323_AGT_A:201867323:5,0,2,0
chr1	201868569	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:9,0:7,3:0|1:201868569_T_G:201868569:8,9,1,2
chr1	201868573	.	T	TTTTGTTTGTAGTCAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:10,0:6,3:0|1:201868569_T_G:201868569:8,10,1,2
chr1	201869257	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=93,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:3,6:3,8:3,3,9,5
chr1	201869716	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,3:8,7:5,9,3,8
chr1	201915342	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,1:10,2:9,7,2,1
chr1	201926355	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,79;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,3:9,0:11,0,3,0
chr1	201926448	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=78,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.406:45:12,12:14,6:11,16,10,8
chr1	201952488	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=194,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:3,2,3,2
chr1	201972436	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.266:16:3,3:8,0:4,8,4,0
chr1	201972623	.	TGC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:201972623_TGC_T:201972623:2,2,1,1
chr1	201972627	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:201972623_TGC_T:201972623:2,2,1,1
chr1	201972629	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,0:0|1:201972623_TGC_T:201972623:2,2,1,1
chr1	201972632	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=274,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:201972623_TGC_T:201972623:1,2,0,1
chr1	201981218	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,12:5,3:5,3,7,8
chr1	201981625	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=300,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:201981625_A_AG:201981625:1,1,0,1
chr1	201981628	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=300,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:201981625_A_AG:201981625:1,1,0,1
chr1	201983106	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:26,9:19,0:21,24,9,0
chr1	201983242	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:0,7,0,8
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=150,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	202092580	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.963:22:0,10:0,12:0,0,8,14
chr1	202097524	.	A	ACTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CTG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:2,2:2,0:4,0,0,2
chr1	202104330	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,5:6,4:8,5,5,4
chr1	202107422	.	AACACACACACAC	A,AACAC,AACACAC,AACACACACACACACACAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28,21,27,28;MFRL=133,157,207,131,150;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,12,8,23;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,10,12,13,19;RU=AC;STR;TLOD=6.45,5.12,4.27,5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,2,2,2,2:0.178,0.177,0.196,0.270:9:0,1,1,1,0:0,1,0,1,1:1,0,8,0
chr1	202107545	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.135:46:16,5:24,0:9,31,0,6
chr1	202121643	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr1	202121771	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:9,5:1,1:3,7,2,4
chr1	202122840	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.475:24:8,8:5,3:10,3,7,4
chr1	202126923	.	TC	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=99,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:15,0:20,2:17,18,2,0
chr1	202163731	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=107,72;MMQ=52,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:7,2:7,0:0|1:202163731_G_A:202163731:5,9,1,1
chr1	202163740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=101,72;MMQ=52,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:202163731_G_A:202163731:5,8,1,1
chr1	202163742	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=97,72;MMQ=52,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:0|1:202163731_G_A:202163731:5,9,1,1
chr1	202163753	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=91,72;MMQ=52,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:7,0:0|1:202163731_G_A:202163731:2,10,1,1
chr1	202166306	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,143;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202166306_C_CA:202166306:1,0,0,1
chr1	202166307	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=192,143;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202166306_C_CA:202166306:1,0,0,1
chr1	202166317	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=180,143;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:202166306_C_CA:202166306:1,3,0,1
chr1	202194535	.	A	ACT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:202194535_A_ACT:202194535:8,11,1,1
chr1	202194540	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:202194535_A_ACT:202194535:8,11,1,1
chr1	202197161	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=524,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr1	202266607	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr1	202270392	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=-1073741817;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:0,6,0,2
chr1	202272581	.	T	TCTCTTTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202272581_T_TCTCTTTCTC:202272581:0,0,0,1
chr1	202272583	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202272581_T_TCTCTTTCTC:202272581:0,0,0,1
chr1	202274936	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	202276494	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,1,2
chr1	202279464	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,4:7,2:7,6,2,4
chr1	202287016	.	TTGGTCCTGAAGACC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=152,220;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr1	202287156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,4:8,4:1,10,4,4
chr1	202287754	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:4,6,3,0
chr1	202287813	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:2,4,4,2
chr1	202288293	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.516:25:5,5:7,6:7,5,10,3
chr1	202288383	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.415:5:0,2:3,0:0|1:202288383_C_CT:202288383:1,2,1,1
chr1	202288384	.	C	CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:0,2:3,0:0|1:202288383_C_CT:202288383:1,2,1,1
chr1	202302035	.	CAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=192,235;MMQ=30,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=33,29;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:0|1:202302035_CAAAA_C:202302035:1,0,1,0
chr1	202302069	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=85,235;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:202302035_CAAAA_C:202302035:1,2,1,0
chr1	202386016	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=119,48;MMQ=59,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:9,5:11,0:8,12,5,0
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,6,13
chr1	202399950	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=118,65;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:202399950_A_T:202399950:8,7,1,1
chr1	202399955	.	T	TTTTATCCTTCAGAATCTA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,65;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:202399950_A_T:202399950:6,8,1,1
chr1	202407242	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,121;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	202418143	.	CAACAGCAGAGAA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,105;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,2:7,0:8,7,1,1
chr1	202443000	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=86,110;MMQ=31,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:3,9:6,8:5,4,7,10
chr1	202464471	.	G	GC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,115;MMQ=50,20;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,3:16,0:15,15,3,0
chr1	202527877	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=139,174;MMQ=50,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	202533516	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	202568484	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,6:6,6:4,5,6,6
chr1	202571588	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=129,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:202571588_A_AT:202571588:3,4,1,1
chr1	202571590	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:202571588_A_AT:202571588:3,4,1,1
chr1	202573567	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=179,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,3,0
chr1	202700064	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:4,2:14,0:10,8,3,0
chr1	202703053	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	202705280	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	202709723	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,12;MFRL=233,173;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.741:5:0,1:0,0:1,0,4,0
chr1	202710863	.	ACACAGGT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=145,293;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:202710863_ACACAGGT_A:202710863:0,1,0,2
chr1	202710874	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:202710863_ACACAGGT_A:202710863:0,0,0,2
chr1	202715244	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:3,5:2,3:4,1,8,0
chr1	202715284	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=102,224;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,3:4,3:7,2,6,1
chr1	202718028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	202724669	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=25628374,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202724669_T_A:202724669:0,2,0,1
chr1	202724678	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=25628374,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:202724669_T_A:202724669:0,2,0,1
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	202861566	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	202862350	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=93,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:17,2:4,1:10,11,1,2
chr1	202862479	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,59;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:0|1:202862479_C_T:202862479:12,9,1,1
chr1	202862496	.	G	GCTGGCAGGTGTC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,59;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:0|1:202862479_C_T:202862479:8,10,1,1
chr1	202864755	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=82,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:16,2:11,0:0|1:202864755_T_C:202864755:15,12,1,1
chr1	202864761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=82,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,2:9,0:0|1:202864755_T_C:202864755:16,10,1,1
chr1	202880237	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:19,5:8,0:13,14,5,0
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,16:0,0,19,8
chr1	202894384	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,0:6,4:3,13,0,4
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	202931839	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=181,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	202931958	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	202931998	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,0:2,4:4,0,2,2
chr1	202933657	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:7,1,2,0
chr1	202934988	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.171:42:14,6:21,0:18,17,7,0
chr1	202978032	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr1	202987770	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr1	202987796	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr1	202989994	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,142;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:8,3:4,5,3,0
chr1	203018190	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=666,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	203018741	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=15,12;MFRL=179,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:203018741_A_C:203018741:2,1,1,0
chr1	203018745	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,14;MFRL=179,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:203018741_A_C:203018741:2,1,1,0
chr1	203018749	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=19,14;MFRL=179,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:203018741_A_C:203018741:2,1,1,0
chr1	203018750	.	CTCT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=179,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:203018741_A_C:203018741:2,1,1,0
chr1	203018765	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=143,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=C;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1,2,1,0
chr1	203018773	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=20,21;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:0,0:1,3,2,0
chr1	203018777	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:0,1:1,3,2,0
chr1	203025209	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=53,2115;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:4,11:7,5:5,6,3,13
chr1	203029620	.	T	TACCTCCAACCAGGAGACCACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=228,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203029620_T_TACCTCCAACCAGGAGACCACAG:203029620:0,1,0,1
chr1	203029622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=228,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203029620_T_TACCTCCAACCAGGAGACCACAG:203029620:0,1,0,1
chr1	203030202	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:0|1:203030202_G_A:203030202:6,5,1,1
chr1	203030207	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:203030202_G_A:203030202:6,5,1,1
chr1	203030211	.	C	CTG	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=122,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:203030202_G_A:203030202:5,5,1,1
chr1	203030214	.	CCA	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:0|1:203030202_G_A:203030202:5,4,1,1
chr1	203030261	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	203030685	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=72,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:10,2:5,4:12,4,3,3
chr1	203032922	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	203036757	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=194,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:2,1,4,1
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	203141162	.	G	GGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,2:7,1:0|1:203141162_G_GGA:203141162:14,6,2,1
chr1	203141165	.	GCC	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,2:8,0:0|1:203141162_G_GGA:203141162:16,6,2,1
chr1	203141168	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=123,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:203141162_G_GGA:203141162:16,6,1,1
chr1	203143725	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:4,7,4,6
chr1	203144859	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,63;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:21,0:2,3:9,14,0,3
chr1	203186825	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,0:7,3:7,4,2,1
chr1	203186950	.	C	CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.520:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr1	203188496	.	G	GGCCTATAGAGCTTAAGCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:203188496_G_GGCCTATAGAGCTTAAGCCA:203188496:3,6,1,1
chr1	203188501	.	T	TCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=129,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:203188496_G_GGCCTATAGAGCTTAAGCCA:203188496:3,6,1,1
chr1	203188692	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=189,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,3,1
chr1	203188921	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,4:4,0:5,10,4,0
chr1	203191262	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	203276159	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:2,1:1,0:7,0,3,0
chr1	203276500	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=107,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,0:9,2:0|1:203276500_C_T:203276500:8,8,1,1
chr1	203276516	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:203276500_C_T:203276500:7,9,1,1
chr1	203276519	.	G	GAAGTGGCCTCCCCAGGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:203276500_C_T:203276500:7,8,1,1
chr1	203317407	.	T	TAGGGCACAGGGCCCCACTGAGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:203317407_T_TAGGGCACAGGGCCCCACTGAGGG:203317407:0,1,0,1
chr1	203317411	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:203317407_T_TAGGGCACAGGGCCCCACTGAGGG:203317407:0,1,0,1
chr1	203453028	.	GG	AA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,2:16,0:8,14,1,1
chr1	203455754	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:4,1:2,2:6,1,3,0
chr1	203469020	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:203469020_A_T:203469020:0,0,0,1
chr1	203469022	.	C	CTGGGATCAAGCGATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:203469020_A_T:203469020:0,0,0,1
chr1	203667536	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=211,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	203670128	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=209,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	203690382	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,2:8,2:10,11,2,2
chr1	203690589	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	203786152	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	203797335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr1	203797384	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,4:5,5:6,5,7,2
chr1	203799343	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=104,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:3,3:6,5:4,6,2,6
chr1	203799349	.	G	GTCACA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,54;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:203799349_G_GTCACA:203799349:4,12,1,1
chr1	203799350	.	G	GTAAAGTAAGCTAGGGAAGAGAAAATA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,54;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:203799349_G_GTCACA:203799349:4,12,1,1
chr1	203800735	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:11,2,2,1
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr1	203807028	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,2:3,3:8,0,5,0
chr1	203807233	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr1	203807273	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	203809380	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.412:34:12,5:8,8:9,11,7,7
chr1	203817549	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:9,7:4,7:6,7,7,7
chr1	203817608	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:0,4,1,6
chr1	203817620	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,1,5
chr1	203819203	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	203831261	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.573:33:8,10:5,8:11,3,10,9
chr1	203832964	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr1	204082063	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:10,7,2,0
chr1	204083752	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,0:5,0:8,4,0,4
chr1	204085763	.	AAGC	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=85,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGC;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:15,1:13,2:13,16,1,2
chr1	204091165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:1,5,0,3
chr1	204091889	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=196,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	204094987	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:3,0,5,1
chr1	204101425	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=93,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:12,2:11,0:0|1:204101425_G_A:204101425:6,17,0,3
chr1	204101429	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=93,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,3:10,0:0|1:204101425_G_A:204101425:5,15,0,3
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,4,2
chr1	204110475	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.131:25:10,2:12,0:13,9,0,3
chr1	204116628	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=89,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:5,5,3,6
chr1	204121057	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	204125957	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:204125957_A_AT:204125957:0,1,0,1
chr1	204125960	.	A	ATGCAGCCATGCCCCTTTCCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,23;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:204125957_A_AT:204125957:0,1,0,1
chr1	204129671	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:3,4:3,4:6,0,3,5
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,2,1
chr1	204162079	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=102,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:204162079_A_G:204162079:0,2,0,1
chr1	204162081	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=102,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:204162079_A_G:204162079:0,2,0,1
chr1	204162084	.	AT	CC,CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,33,34;MFRL=111,92,168;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,1,1:0,1,0,2
chr1	204162091	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:204162079_A_G:204162079:0,1,0,1
chr1	204162092	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:204162079_A_G:204162079:0,1,0,1
chr1	204167672	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,2,2
chr1	204170993	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=229,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	204192754	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:204192754_G_A:204192754:1,0,0,1
chr1	204192756	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:204192754_G_A:204192754:1,0,0,1
chr1	204199614	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,5:7,3:11,4,7,1
chr1	204210997	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:0,7,1,4
chr1	204214780	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,0:11,3:8,6,2,1
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.724:13:2,7:1,3:1,2,3,7
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	204219821	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	204227030	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:2,0:8,2:0|1:204227030_A_C:204227030:6,9,1,1
chr1	204227034	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,0:13,2:0|1:204227030_A_C:204227030:6,10,1,1
chr1	204228436	.	C	CATGGTCCAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=163,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr1	204228800	.	AGGCTGTTGTGGGGT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:11,0:14,2:17,15,1,1
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.431:12:2,3:3,2:0|1:204234222_T_C:204234222:0,7,0,5
chr1	204234225	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,3:5,3:0|1:204234222_T_C:204234222:0,7,0,7
chr1	204237416	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,4:3,5:2,6,2,8
chr1	204380566	.	T	TCCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=240,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204380566_T_TCCTG:204380566:0,1,0,1
chr1	204380569	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=240,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204380566_T_TCCTG:204380566:0,1,0,1
chr1	204394836	.	AGGGGTC	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=119,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,1:18,2:16,23,1,2
chr1	204401400	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=96,57;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:18,0:16,4:16,18,0,4
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,11:0,0,8,5
chr1	204410728	.	GGCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=200,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	204413235	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,0:16,3:16,10,3,0
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.975:30:0,12:0,17:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,13,17
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=128.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,13,17
chr1	204415130	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=81.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,29:0.423:69:22,0:18,28:15,25,0,29
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr1	204423848	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:10,6,2,1
chr1	204425031	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:5,4,1,1
chr1	204426052	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=48,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.830:11:1,3:0,6:0|1:204426052_A_C:204426052:1,1,8,1
chr1	204426066	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,6:0.386:16:3,1:5,5:1|0:204426052_A_C:204426052:7,3,1,5
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr1	204434289	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:2,0:3,2:0|1:204434289_G_GC:204434289:0,5,3,0
chr1	204434296	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:2,0:3,0:0|1:204434289_G_GC:204434289:0,5,3,0
chr1	204434302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:2,1:3,0:0|1:204434289_G_GC:204434289:0,5,3,0
chr1	204438780	.	G	GCAAC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,4:9,0:0|1:204438780_G_GCAAC:204438780:10,10,2,2
chr1	204438782	.	T	TCCGCCTCC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,4:10,0:0|1:204438780_G_GCAAC:204438780:10,10,2,2
chr1	204438785	.	G	GGTTCAAGTGA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:10,4:10,0:0|1:204438780_G_GCAAC:204438780:10,10,2,2
chr1	204495595	.	G	T,GT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,27,14;MFRL=146,128,122;MMQ=60,45,49;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.19,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,13,5:0.333,0.381:22:2,10,2:1,2,0:1,3,4,14
chr1	204501988	.	C	CAATTTTTA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=108,58;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:204501988_C_CAATTTTTA:204501988:11,12,1,1
chr1	204501993	.	T	TTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,58;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.105:28:14,0:9,2:0|1:204501988_C_CAATTTTTA:204501988:11,15,1,1
chr1	204507083	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.465:39:16,10:4,8:9,12,9,9
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	204513888	.	G	GTTTTGTTTTGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	204513898	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,30;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:204513898_C_CTA:204513898:0,1,0,1
chr1	204513901	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:204513898_C_CTA:204513898:0,1,0,1
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr1	204587014	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=87,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:13,0:6,2:9,10,1,1
chr1	204587033	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=105,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:204587033_C_A:204587033:10,7,1,1
chr1	204587035	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:204587033_C_A:204587033:10,6,1,1
chr1	204587038	.	T	TATTGGAATCAGGTACA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:5,2:0|1:204587033_C_A:204587033:9,6,1,1
chr1	204587828	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:204587828_T_G:204587828:4,7,1,1
chr1	204587830	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:0|1:204587828_T_G:204587828:4,7,1,1
chr1	204587832	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0|1:204587828_T_G:204587828:4,6,1,1
chr1	204589066	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,2:1,4:2,1,5,2
chr1	204589297	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=92,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:5,4,1,1
chr1	204589482	.	TC	AG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:204589482_TC_AG:204589482:1,2,0,1
chr1	204589487	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:204589482_TC_AG:204589482:1,2,0,1
chr1	204589493	.	CTGGATT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:204589482_TC_AG:204589482:1,2,0,1
chr1	204589522	.	C	CCCGCAGGA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=178,178;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	204589523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=178,178;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:204589523_A_T:204589523:0,1,0,1
chr1	204589525	.	C	CCAAAA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=178,178;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:204589523_A_T:204589523:0,1,0,1
chr1	204589526	.	TGAGTA	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=178,178;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:204589523_A_T:204589523:0,1,0,1
chr1	204589545	.	G	GGCAGAGC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204589523_A_T:204589523:0,0,0,1
chr1	204589864	.	GTA	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,218;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=73.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.517:37:12,13:6,6:9,9,0,19
chr1	204591237	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,13:0,0,13,12
chr1	204923879	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=131,186;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:10,2,5,0
chr1	204926980	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=250,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,2,1
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,5:0,0,12,5
chr1	204943947	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=87,99;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,13:7,3:3,7,8,8
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:1,10:4,2:1,4,6,7
chr1	204943992	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr1	204944019	.	A	AACTAGAGACAATAAAAC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=91,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr1	204951209	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	204954993	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	204955319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=76,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	204966428	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=93,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,18:0.422:43:9,7:16,9:0|1:204966428_C_G:204966428:14,11,12,6
chr1	204966446	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,3:18,0:0|1:204966428_C_G:204966428:18,17,3,0
chr1	204978643	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:8,2,9,3
chr1	204978676	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=85,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:6,6,5,4
chr1	204978847	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=299,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:204978847_GGT_G:204978847:0,1,0,1
chr1	204978851	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=299,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:204978847_GGT_G:204978847:0,1,0,1
chr1	205022207	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=244,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	205028229	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:4,5:3,3:5,3,5,3
chr1	205041138	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr1	205069250	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:4,2,5,2
chr1	205073231	.	A	AGTGGCTCCTTCCTTCAGTCTATACAGAATCTCTCCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=235,123;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.659:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	205211131	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:205211131_G_C:205211131:12,7,1,1
chr1	205211133	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:205211131_G_C:205211131:12,7,1,1
chr1	205211141	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=179,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:205211131_G_C:205211131:9,7,1,1
chr1	205225477	.	TCTGCTGGCCACTCACAGAATTTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:2,0:3,2:7,5,1,1
chr1	205273142	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=232,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:2,7:3,3:2,3,1,9
chr1	205275421	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,10,14
chr1	205290475	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr1	205290486	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr1	205290794	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	205312280	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	205312767	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr1	205353377	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:7,1,8,2
chr1	205493410	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=95,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:11,5:22,0:17,16,5,0
chr1	205495172	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=93,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:2,2:5,2:3,4,3,1
chr1	205495392	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,2,4
chr1	205495613	.	C	CACATGATGAGAGTCTGCCCACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	205495976	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr1	205496887	.	CCTTCCACCCCACATTTCT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:7,2:3,11,1,1
chr1	205497066	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:2,4,5,1
chr1	205498432	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:0,2:4,3,3,0
chr1	205499495	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,1:2,4,1,1
chr1	205499701	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	205538446	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=180,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:205538446_C_T:205538446:0,3,1,1
chr1	205538457	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=180,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:205538446_C_T:205538446:0,3,1,1
chr1	205561496	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr1	205568357	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.164:34:13,0:16,5:7,22,0,5
chr1	205568390	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:2,5,0,8
chr1	205589402	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:31,3:10,0:20,22,0,3
chr1	205589959	.	A	ACGTTGAACTCAGGCTTCGTTTTGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=200,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.462:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	205631033	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,0:8,4:11,6,1,3
chr1	205687348	.	CTTTTTTCTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTCTTT;STR;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,1:4,3:7,1,4,0
chr1	205689807	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	205739518	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:205739518_C_T:205739518:9,7,1,1
chr1	205739526	.	T	TTTTAAGAGAAGTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=122,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:205739518_C_T:205739518:10,7,1,1
chr1	205743885	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,19;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:0,0:0,1:0|1:205743885_A_C:205743885:1,0,2,0
chr1	205743892	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,16;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:0,0:0,0:0|1:205743885_A_C:205743885:1,0,2,0
chr1	205744138	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:2,4,0,2
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:1,5,1,4
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr1	205766231	.	G	A,GAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,23,28;MFRL=186,263,172;MMQ=60,60,60;MPOS=31,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.256:5:1,1,0:2,0,1:0,3,0,2
chr1	205814497	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,4:1,7:3,2,7,4
chr1	205884274	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:2,5,2,0
chr1	205886376	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=100,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,2:2,0:5,3,2,0
chr1	205890679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	205893608	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,73;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:4,11,1,1
chr1	205896395	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,8:4,6:2,4,11,3
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=74,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr1	205896647	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,6:7,2:7,2,4,4
chr1	205901736	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=76,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=226,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,3:2,7:2,1,5,5
chr1	206141609	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,298;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206141609_A_T:206141609:0,0,0,1
chr1	206141611	.	C	CTGGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,298;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206141609_A_T:206141609:0,0,0,1
chr1	206141613	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,298;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206141609_A_T:206141609:0,0,0,1
chr1	206230837	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=105,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:0|1:206230837_A_C:206230837:7,6,1,1
chr1	206230854	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:206230837_A_C:206230837:9,7,1,1
chr1	206239508	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr1	206241749	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:206241749_A_C:206241749:0,6,0,2
chr1	206241752	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:206241749_A_C:206241749:0,6,0,2
chr1	206318477	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,0:9,6:6,9,0,6
chr1	206320159	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:9,2,5,0
chr1	206320416	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:206320416_A_T:206320416:0,1,0,1
chr1	206320417	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:206320416_A_T:206320416:0,1,0,1
chr1	206329019	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:4,8,0,2
chr1	206516261	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,208;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,159;MMQ=45,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:1,7,0,4
chr1	206575069	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=124,138;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:17,0:16,3:3,31,0,3
chr1	206610212	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:5,0,1,0
chr1	206619455	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=98,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:12,0:13,5:13,13,0,5
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=33,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:1,1:5,3:3,3,2,2
chr1	206626656	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:4,8,1,2
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=225,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	206632168	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=181,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,0:10,5:12,7,0,5
chr1	206647673	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,201;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:8,5:9,0:8,9,5,0
chr1	206647787	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=81,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.903:28:2,18:0,8:1,1,13,13
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,7:1,0:0,1,0,8
chr1	206649952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,2:2,3:9,0,5,0
chr1	206651467	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.573:10:2,1:2,3:3,1,4,2
chr1	206651770	.	T	TTGGACCTGGAAGCGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=296,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	206652524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	206664882	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=214,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr1	206665896	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,10,13
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr1	206760374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=79,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr1	206760416	.	G	GGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=109,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.544:14:1,3:5,4:4,2,5,3
chr1	206772974	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:17,4:5,0:6,17,4,0
chr1	206773607	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=104,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:8,2:0|1:206773607_C_T:206773607:13,9,1,1
chr1	206773612	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=96,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:7,2:0|1:206773607_C_T:206773607:13,10,1,1
chr1	206773659	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr1	206902316	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=158,136;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,4:1,0:5,1,4,0
chr1	206902328	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,136;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,4:0,0:4,1,4,0
chr1	206902471	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=107,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,5:2,4:2,9,4,5
chr1	206902927	.	T	TCCAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=104,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,6:4,0:5,5,2,4
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,1:4,4:6,4,3,2
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.243:34:19,2:6,5:22,4,8,0
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr1	207040012	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207040012_T_C:207040012:2,1,0,1
chr1	207040014	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207040012_T_C:207040012:2,1,0,1
chr1	207040032	.	G	GCCTCCTCGGCCTCGGCGTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	207071250	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=153,124;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr1	207071293	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=13,22;MFRL=181,194;MMQ=30,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:207071293_T_A:207071293:0,1,0,1
chr1	207071296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=16,22;MFRL=181,194;MMQ=30,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:207071293_T_A:207071293:0,1,0,1
chr1	207071318	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	207071334	.	CTA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207071334_CTA_C:207071334:0,0,0,1
chr1	207071340	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,21;MFRL=0,181;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207071334_CTA_C:207071334:0,0,0,1
chr1	207071343	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207071334_CTA_C:207071334:0,0,0,1
chr1	207083629	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:7,2:0|1:207083629_A_T:207083629:8,6,2,1
chr1	207083632	.	A	AAGCGATTCTCCT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.207:17:5,0:8,3:0|1:207083629_A_T:207083629:8,6,2,1
chr1	207105097	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:1,3:11,0:5,8,2,1
chr1	207108981	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:4,5,1,2
chr1	207109167	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,18:1,8:1,0,14,12
chr1	207110363	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	207113755	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,6:0,0,15,4
chr1	207132100	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:207132100_C_G:207132100:5,10,1,1
chr1	207132105	.	GCAAGTTTTCAAGAACT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:6,2:0|1:207132100_C_G:207132100:6,11,1,1
chr1	207133119	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=111,97;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.179:31:15,0:10,5:15,11,1,4
chr1	207133152	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=114,97;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,0:8,4:4,18,0,4
chr1	207134559	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,0:3,2:0,7,1,2
chr1	207134570	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=106,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	207135920	.	A	ATTGTCCCTATTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:207135920_A_ATTGTCCCTATTT:207135920:0,7,1,1
chr1	207135922	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,0:0|1:207135920_A_ATTGTCCCTATTT:207135920:0,7,1,1
chr1	207135945	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=110,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:207135945_ACT_A:207135945:1,2,0,1
chr1	207135949	.	T	TATGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=63,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:207135945_ACT_A:207135945:1,1,0,1
chr1	207139046	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:5,2,6,5
chr1	207139362	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	207143550	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:0,3,1,3
chr1	207143573	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr1	207195224	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:207195224_GC_G:207195224:3,0,1,0
chr1	207195226	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:207195224_GC_G:207195224:3,0,1,0
chr1	207198430	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:207198430_G_C:207198430:1,1,0,1
chr1	207198435	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:207198430_G_C:207198430:1,0,0,1
chr1	207198437	.	G	GCTTACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:207198430_G_C:207198430:1,0,0,1
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:9,3:6,9:8,7,8,5
chr1	207240818	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:4,1:9,1,2,0
chr1	207241440	.	A	AGTGTGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=GT;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.352:11:5,2:2,0:7,0,3,1
chr1	207252206	.	G	GAGGGAAGGGAGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=210,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:4,1,1,0
chr1	207262980	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,15:0,16:0,0,6,25
chr1	207263829	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=71.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,12,12
chr1	207265264	.	TATC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=241,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	207288897	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr1	207297226	.	TAGG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:10,1,1,1
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:3,3,2,7
chr1	207304900	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:5,1,0,5
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:3,5:0,3:1,2,2,6
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:4,0,6,0
chr1	207643530	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207643530_C_CCA:207643530:0,1,0,1
chr1	207643532	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207643530_C_CCA:207643530:0,1,0,1
chr1	207643534	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207643530_C_CCA:207643530:0,1,0,1
chr1	207643541	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207643530_C_CCA:207643530:0,0,0,1
chr1	207646322	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,5:8,3:5,6,5,3
chr1	207646898	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=102,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:4,5:5,5:4,5,7,3
chr1	207646923	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=73,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,7:3,6:3,4,9,4
chr1	207649680	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=118,106;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:9,7:9,0:0|1:207649680_G_A:207649680:9,9,7,0
chr1	207649684	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=118,106;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:9,7:8,0:0|1:207649680_G_A:207649680:9,9,7,0
chr1	207652650	.	A	ATTTCACTGGAAACGGG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=174,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr1	207652656	.	T	TATTACAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=200,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:207652656_T_TATTACAA:207652656:0,4,0,1
chr1	207652659	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=200,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:207652656_T_TATTACAA:207652656:0,4,0,1
chr1	207652662	.	A	AAAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=201,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:207652656_T_TATTACAA:207652656:0,4,0,1
chr1	207652664	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=201,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:207652656_T_TATTACAA:207652656:0,4,0,1
chr1	207697297	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,135;MMQ=33,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr1	207700314	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=215,167;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:207700314_G_A:207700314:0,4,0,1
chr1	207700316	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=215,167;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:207700314_G_A:207700314:0,4,0,1
chr1	207700348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:3,3:1,8,0,3
chr1	207739127	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr1	207751107	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,0;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,2:17,1:16,11,0,3
chr1	207753846	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=87,150;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.217:30:7,0:7,4:11,12,7,0
chr1	207755438	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	207760982	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,179;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr1	207784968	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,7:0,8:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,12,7
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,12,8
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,12,8
chr1	207941191	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr1	207943822	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=186,225;MMQ=44,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:0,2,0,6
chr1	207959122	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=466,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:207959122_CTTT_C:207959122:1,1,0,2
chr1	207959136	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=466,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:207959122_CTTT_C:207959122:1,1,0,2
chr1	207975937	.	A	AACCGGAGACAAGGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=192,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.308:4:1,1:2,0:0|1:207975937_A_AACCGGAGACAAGGC:207975937:0,3,0,1
chr1	207975938	.	T	TTTCACTTTAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=192,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,1:2,0:0|1:207975937_A_AACCGGAGACAAGGC:207975937:0,3,0,1
chr1	208041392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=126,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr1	208061196	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=144,339;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.184:23:6,0:13,3:7,12,0,4
chr1	208062260	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=192,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr1	208062265	.	G	GGTGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=219,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=94,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:4,5:9,6:7,6,7,4
chr1	208062973	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.180:18:6,1:9,1:9,6,1,2
chr1	208063067	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.461:20:5,5:4,4:6,5,5,4
chr1	208063100	.	G	GA,GAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,17,17;MFRL=120,145,130;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=11.46,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,4:0.566,0.312:12:1,2,0:0,1,1:1,0,4,7
chr1	208063270	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=174,88;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	208206906	.	T	TGTGTGATGAGGCACTGCCTTTCTCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr1	208208011	.	C	CACAATTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=382,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:208208011_C_CACAATTCTGA:208208011:0,1,0,1
chr1	208208013	.	A	AAGGTTGGGAGATTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=382,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:208208011_C_CACAATTCTGA:208208011:0,1,0,1
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	208212115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:5,3:1,0:0|1:208212115_T_C:208212115:5,1,4,0
chr1	208212122	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:5,4:1,1:0|1:208212115_T_C:208212115:5,1,5,0
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr1	208213241	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	208213500	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:208213500_G_A:208213500:0,3,0,1
chr1	208213501	.	C	CACTTAGGACTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:208213500_G_A:208213500:0,3,0,1
chr1	208216304	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	208218186	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:208218186_C_T:208218186:0,3,0,1
chr1	208218187	.	A	AAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:208218186_C_T:208218186:0,3,0,1
chr1	208218188	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:208218186_C_T:208218186:0,3,0,1
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr1	208219545	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	208233998	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:4,5:5,8:6,3,8,5
chr1	208234039	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:13,9,1,1
chr1	208252777	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,5:2,0:1,6,2,3
chr1	208270244	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	208315800	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	208390561	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,4:8,0:4,7,4,0
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AGC;STR;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.566:16:3,2:2,4:0,7,1,8
chr1	209768386	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=51,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,2:9,0:7,5,2,0
chr1	209786078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr1	209788514	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,9:0,0,3,13
chr1	209796267	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=71,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:4,1,6,0
chr1	209800230	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,5:4,7:6,1,9,3
chr1	209800341	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:8,5:9,8:3,14,3,10
chr1	209801519	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,3:9,7:3,11,4,6
chr1	209803111	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:15,0:10,4:21,4,2,2
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,3:8,5:9,4,7,1
chr1	209811866	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=82,133;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:13,5:11,0:14,11,4,1
chr1	209811886	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,8:3,3:6,6,5,6
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	209823510	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:5,6:8,10:11,2,11,5
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,24:0.611:39:4,11:9,12:0|1:209849399_AG_A:209849399:7,8,14,10
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=94,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,25:0.650:38:5,8:8,14:0|1:209849399_AG_A:209849399:6,7,14,11
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=47.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.626:36:6,17:6,6:7,6,17,6
chr1	209879245	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:13,0:9,3:14,8,3,0
chr1	209936060	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,3:7,3:4,4,4,2
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:0,13:9,4:3,6,7,11
chr1	209950736	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:18,0:14,19,2,1
chr1	209950760	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:5,4:2,9:3,4,5,8
chr1	209951602	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,5:0,5,0,8
chr1	209963803	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=102,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,2,3
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=97,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,1:0,5:2,1,2,4
chr1	210015930	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=115,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.149:24:11,3:9,0:7,14,2,1
chr1	210024782	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:7,3:13,0:8,12,1,2
chr1	210111733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	210329132	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:7,5,2,0
chr1	210332905	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,4,0,1
chr1	210332906	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,4,0,1
chr1	210332909	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,4,0,1
chr1	210332912	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,4,0,1
chr1	210332915	.	G	GATCATGTAT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,3,0,1
chr1	210332919	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=189,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:210332905_C_CA:210332905:0,2,0,1
chr1	210332938	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=205,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	210406940	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=178,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,1,1
chr1	210407031	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:3,5,5,1
chr1	210407329	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.354:10:2,0:5,2:1,6,0,3
chr1	210407339	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,1:1,6,0,3
chr1	210411281	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,10;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.535:19:3,2:2,0:2,6,11,0
chr1	210411512	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.229:20:8,3:5,0:0,15,4,1
chr1	210414871	.	G	GT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=97,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.522:33:5,9:7,4:13,3,13,4
chr1	210414879	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=94,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.184:39:9,2:9,0:19,12,4,4
chr1	210536078	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=75,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr1	210686614	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=192,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	210761462	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	210847740	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	210856989	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:5,3:4,6:5,5,4,5
chr1	210857457	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr1	210977444	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:8,5,3,0
chr1	211093288	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=76,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:211093288_A_C:211093288:10,14,1,1
chr1	211093292	.	A	AAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=76,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:211093288_A_C:211093288:9,13,1,1
chr1	211280738	.	AGGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=76,31;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:1,0:3,2,2,0
chr1	211433141	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211433141_T_C:211433141:0,0,0,1
chr1	211433143	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211433141_T_C:211433141:0,0,0,1
chr1	211447435	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	211452529	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=76,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,2:0,6:1,1,5,4
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.590:37:4,8:11,14:2,13,8,14
chr1	211452728	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,3:4,7:0,5,1,9
chr1	211843840	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,7:5,1:2,6,0,8
chr1	211846772	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,205;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:6,0:14,4:15,5,4,0
chr1	212141899	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:5,2:16,0:0|1:212141899_T_C:212141899:8,20,1,1
chr1	212141908	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:14,0:0|1:212141899_T_C:212141899:11,20,1,1
chr1	212142042	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,0:10,3:10,22,0,3
chr1	212142054	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=20,32,31;MFRL=122,82,182;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.01,18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,9:0.156,0.550:16:2,1,0:1,1,7:1,4,1,10
chr1	212142069	.	G	GTTCTTAA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:10,0:0|1:212142069_G_GTTCTTAA:212142069:1,16,1,1
chr1	212142072	.	AT	GA	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:3,1:10,0:0|1:212142069_G_GTTCTTAA:212142069:1,17,1,1
chr1	212142075	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,17;MFRL=182,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,1:10,0:0|1:212142069_G_GTTCTTAA:212142069:1,12,1,1
chr1	212148730	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:5,3:0|1:212148730_G_A:212148730:2,10,0,3
chr1	212148735	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=104,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,0:5,3:0|1:212148730_G_A:212148730:2,8,0,3
chr1	212154611	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	212180671	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:14,2:7,2:13,8,2,2
chr1	212180875	.	A	AAATGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:212180875_A_AAATGC:212180875:0,2,0,1
chr1	212180879	.	T	TCCCTACAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:212180875_A_AAATGC:212180875:0,2,0,1
chr1	212180882	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:212180875_A_AAATGC:212180875:0,2,0,1
chr1	212193383	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:3,0,5,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,4:0,0,10,3
chr1	212220822	.	T	TTAGAAATTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:212220822_T_TTAGAAATTC:212220822:0,4,0,1
chr1	212220824	.	T	TTACCTGTTGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:212220822_T_TTAGAAATTC:212220822:0,4,0,1
chr1	212220847	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	212245344	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	212274413	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,3,5
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	212538768	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=117,155;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:5,0:1,0:0|1:212538768_A_T:212538768:5,2,0,2
chr1	212538771	.	C	CTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=127,159;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=19,33;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:1,0:0|1:212538768_A_T:212538768:5,3,0,2
chr1	212553431	.	C	CATCAGAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.382:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	212587979	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.616:6:0,0:2,1:0|1:212587979_A_C:212587979:0,2,4,0
chr1	212587981	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.616:6:0,1:2,0:0|1:212587979_A_C:212587979:0,2,4,0
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:3,1,5,0
chr1	212788567	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:4,8,1,2
chr1	212791621	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:1,3,1,6
chr1	212792557	.	CTC	GAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=226,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,0:2,4,1,1
chr1	212798408	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,4:10,0:19,6,4,0
chr1	212798601	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:3,5,0,4
chr1	212798977	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:5,3,0,5
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=68,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr1	212900487	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=81,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,3:8,3:6,7,4,4
chr1	212911836	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,5:4,4:3,5,3,6
chr1	212964844	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=78,134;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,11:0.245:47:16,11:19,0:0|1:212964844_G_A:212964844:21,15,11,0
chr1	212964849	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=78,134;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,11:0.244:47:16,11:19,0:0|1:212964844_G_A:212964844:21,15,11,0
chr1	212969842	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:3,6:4,0:6,1,7,4
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr1	213003563	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,3:13,1:19,10,3,1
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	213139767	.	TAAATTCTCAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=140,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:213139767_TAAATTCTCAGA_T:213139767:0,2,0,1
chr1	213139780	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=140,222;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:213139767_TAAATTCTCAGA_T:213139767:0,2,0,1
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:7,1:3,7:3,7,6,2
chr1	213178340	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=203,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	213180441	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=101,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.536:8:0,1:2,1:1,3,2,2
chr1	213224719	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:4,3:2,4:5,3,5,3
chr1	213244436	.	A	ATGC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGC;STR;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:8,10:3,5:4,7,5,10
chr1	213244494	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,0:1,2:0|1:213244494_G_A:213244494:1,6,0,2
chr1	213244496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,1:0|1:213244494_G_A:213244494:1,6,0,2
chr1	213244499	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,1:0|1:213244494_G_A:213244494:1,5,0,2
chr1	213303158	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr1	213405414	.	GGCAACTGAGGAT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACTGAGGAT;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:1,0:4,3:7,2,1,2
chr1	213415671	.	T	TTCTTCTTCACAATTTCACAGATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	213416099	.	T	TTTGTTTTGTCTTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	213436078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:9,4,1,2
chr1	214170479	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=95,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,2:8,1:9,8,2,1
chr1	214171021	.	GGTCTTCCCACCTCTCCAGATCCCCCAGGCCAGATTTGCAGTCAATGGGGAAAACCACAATTTCCACACCGCCAACCAGCGCCTGCAGTGCTTTGGCGAC	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.091:55:9,0:9,4:28,23,2,2
chr1	214171491	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,3:10,0:7,8,1,2
chr1	214171505	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,0:7,5:7,7,0,5
chr1	214171642	.	AAAAAGGTTTCCC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=89,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr1	214178459	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=99,132;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.363:23:7,8:7,0:11,4,8,0
chr1	214209260	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=110,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	214454748	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=118,57;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.135:21:9,0:9,2:0|1:214454748_C_T:214454748:11,8,1,1
chr1	214454762	.	C	CCCTAGTCCTCCAGACAGCTATAAATGAAGCTTACA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,57;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:214454748_C_T:214454748:9,7,1,1
chr1	214478439	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr1	214488190	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:11,0:21,6:10,22,0,6
chr1	214500907	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr1	214504462	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:2,7,0,2
chr1	214507627	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,0:7,3:7,12,0,3
chr1	214510115	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,0:2,7:2,3,2,5
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:4,6,3,1
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:2,3:3,1,4,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.484:27:6,6:8,7:7,7,5,8
chr1	214571440	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,7,2
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr1	214788427	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:0,7,1,5
chr1	214794006	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=110,60;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.256:36:12,0:14,8:13,14,1,8
chr1	214804041	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	214811174	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,3:5,5,7,3
chr1	214813487	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:4,5,7,1
chr1	214813695	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:4,7:9,8:6,7,7,8
chr1	214813782	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=113,129;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,2:7,6:5,6,5,3
chr1	214815228	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,5:9,0:9,3,6,0
chr1	214816224	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:4,2:5,3,4,1
chr1	214816278	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:5,9,0,4
chr1	214816297	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,7:4,2:2,4,3,6
chr1	214818945	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,5:7,3:5,5,4,4
chr1	214819633	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:3,18,1,1
chr1	214820494	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:3,2,5,5
chr1	214820524	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:3,3,6,5
chr1	214821959	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=209,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,4:3,1,6,1
chr1	214826196	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	215408490	.	C	CTTAAGATGGTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	215747340	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,2:10,0:8,6,0,2
chr1	215749420	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=173,83;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:215749420_T_TC:215749420:1,15,1,1
chr1	215749422	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=173,83;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:4,2:0|1:215749420_T_TC:215749420:1,15,1,1
chr1	215749425	.	TT	AC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,18;MFRL=175,83;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:4,1:0|1:215749420_T_TC:215749420:1,14,1,1
chr1	215749428	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=175,83;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:0|1:215749420_T_TC:215749420:1,14,1,1
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.683:23:2,8:5,8:2,5,6,10
chr1	215754338	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:9,2:4,2:5,9,0,4
chr1	215754391	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=173,150;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0|1:215754391_T_C:215754391:0,3,0,1
chr1	215754397	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=212,150;MMQ=50,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:215754391_T_C:215754391:0,2,0,1
chr1	215754425	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=212,150;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	215754427	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=251,162;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:215754427_G_A:215754427:0,1,0,2
chr1	215754430	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,22;MFRL=251,162;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:215754427_G_A:215754427:0,1,0,2
chr1	215754432	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=201,173;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	215785301	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:4,11,0,2
chr1	215799139	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:19,6:3,0:7,15,6,0
chr1	215799192	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:9,3:4,0:3,10,0,3
chr1	215808007	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:5,4,6,7
chr1	215814039	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=102,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:16,0:16,3:14,18,0,3
chr1	215824195	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr1	215848789	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,1060;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:6,0:9,5,2,2
chr1	215849043	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:215849043_C_A:215849043:0,3,0,1
chr1	215849045	.	T	TCTGATAGGTTATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:215849043_C_A:215849043:0,3,0,1
chr1	215853748	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.417:8:2,1:2,2:1,4,0,3
chr1	215853781	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:215853781_A_AC:215853781:0,4,0,1
chr1	215853783	.	A	ATTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:215853781_A_AC:215853781:0,4,0,1
chr1	215901299	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	215914751	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,8:7,2:6,4,6,4
chr1	215916421	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	215931922	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr1	215933227	.	A	AAGTGCTTGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=107,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:2,5,0,3
chr1	216011375	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:16,2:11,0:0|1:216011375_G_A:216011375:20,7,1,1
chr1	216011380	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,2:12,0:0|1:216011375_G_A:216011375:20,7,1,1
chr1	216019438	.	T	TAACCAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	216073613	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216073613_AGC_A:216073613:0,1,0,1
chr1	216073616	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216073613_AGC_A:216073613:0,1,0,1
chr1	216073617	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216073613_AGC_A:216073613:0,1,0,1
chr1	216172380	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0|1:216172380_A_G:216172380:0,0,8,10
chr1	216172403	.	G	GTTCAAACCCTTTGGGCTCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:0|1:216172380_A_G:216172380:3,6,1,1
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=115,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	216363583	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:7,3:2,3:4,5,4,2
chr1	216370130	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	216371666	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:216371666_C_A:216371666:11,6,1,1
chr1	216371675	.	C	CTTCTTCCCTCCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:8,0:0|1:216371666_C_A:216371666:10,7,1,1
chr1	216373476	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr1	216390694	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr1	216390905	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=159,48;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:216390905_C_T:216390905:3,6,1,1
chr1	216390910	.	AAAC	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=159,48;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:216390905_C_T:216390905:3,6,1,1
chr1	216390915	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:216390905_C_T:216390905:3,5,1,1
chr1	216390917	.	CAAAGAG	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=164,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:216390905_C_T:216390905:3,4,1,1
chr1	216390924	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=169,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:216390905_C_T:216390905:2,3,1,1
chr1	216390928	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=169,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:216390905_C_T:216390905:1,4,1,1
chr1	216390930	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=169,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:216390905_C_T:216390905:1,4,1,1
chr1	216424527	.	A	AAACAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:216424527_A_AAACAT:216424527:0,0,0,1
chr1	216424529	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:216424527_A_AAACAT:216424527:0,0,0,1
chr1	216462705	.	C	CATAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:216462705_C_CATAAA:216462705:5,12,1,1
chr1	216462709	.	AA	TC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=154,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:0|1:216462705_C_CATAAA:216462705:6,13,1,1
chr1	216497601	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:19,4:6,0:11,14,3,1
chr1	216741382	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,0:5,5:4,4,0,5
chr1	216824505	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	216896530	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:216896530_C_G:216896530:0,0,1,0
chr1	216896535	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:216896530_C_G:216896530:0,0,1,0
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	217665204	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	217783709	.	AT	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:217783709_AT_TC:217783709:3,2,1,1
chr1	217783714	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:217783709_AT_TC:217783709:3,2,1,1
chr1	217783715	.	TGAAGGCGA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:217783709_AT_TC:217783709:3,2,1,1
chr1	217784431	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=75,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:4,3:0,6,0,3
chr1	217793610	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:4,5,4,2
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr1	217915324	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,1:3,7:5,3,7,1
chr1	217975289	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	218036237	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=265,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	218475791	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.138:24:10,3:11,0:13,8,2,1
chr1	218578685	.	T	TTTGTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TTG;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr1	218610662	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20,29;MFRL=0,108,55;MMQ=60,60,60;MPOS=6,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.80,7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.389,0.521:8:0,1,2:0,1,2:0,0,6,2
chr1	218683417	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:2,2:3,1,2,2
chr1	218683528	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=242,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:1,3:0,10:0|1:218683528_A_G:218683528:1,0,7,7
chr1	218683536	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=242,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,2:0,6:0|1:218683528_A_G:218683528:1,0,5,4
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,14,4
chr1	219383905	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,10:0,16:0,0,15,12
chr1	220101230	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.234:14:7,0:3,2:3,8,0,3
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	220154246	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	220154659	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.774:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,12,9
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	220174584	.	TG	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:11,2:6,0:0|1:220174584_TG_CA:220174584:7,10,0,2
chr1	220174588	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=143,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:220174584_TG_CA:220174584:7,11,0,2
chr1	220174591	.	A	ATCTTTCTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=143,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:7,0:0|1:220174584_TG_CA:220174584:7,11,0,2
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	220184357	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,0:4,3:3,6,1,2
chr1	220191746	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,5:2,0:5,3,2,3
chr1	220191942	.	A	ATGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:220191942_A_ATGG:220191942:0,2,0,1
chr1	220191946	.	AC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:220191942_A_ATGG:220191942:0,2,0,1
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	220198377	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220198377_G_A:220198377:1,0,1,0
chr1	220198379	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220198377_G_A:220198377:1,0,1,0
chr1	220198383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:220198377_G_A:220198377:2,0,1,0
chr1	220205693	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr1	220205943	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,15:0,0,10,18
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	220231180	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=124.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,24:0,15:0,0,28,11
chr1	220236134	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=98,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,5:10,2:7,7,5,2
chr1	220269426	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31,31;MFRL=122,159,89;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.40,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,3:0.240,0.192:17:4,0,1:6,3,2:10,0,6,1
chr1	220269639	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=164,144;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,0:1,4:0,6,0,4
chr1	220276806	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:19,6:11,0:14,16,6,0
chr1	220284112	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,2:3,1:6,1,3,0
chr1	220326673	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,2:11,0:14,9,1,1
chr1	220379361	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,1:4,2:4,16,1,2
chr1	220387312	.	C	CTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:11,1:9,2:0|1:220387312_C_CTT:220387312:3,17,1,2
chr1	220387318	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:0|1:220387312_C_CTT:220387312:3,15,0,2
chr1	220771688	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:21,3:11,1:12,20,3,1
chr1	220771740	.	T	TTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TA;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:3,2:3,1:1,5,0,3
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	220789355	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=98,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,2:5,3:2,5,3,2
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr1	220808666	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,29,33;MFRL=94,157,67;MMQ=60,60,60;MPOS=10,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=T;STR;TLOD=9.11,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.317,0.455:11:0,2,3:1,1,0:1,1,6,3
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr1	220808950	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=220,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,10:2,1:1,5,3,8
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:0,8,2,2
chr1	220835249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,0,2
chr1	220953265	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	220965086	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220965086_G_C:220965086:0,1,0,1
chr1	220965091	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220965086_G_C:220965086:0,1,0,1
chr1	220986546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	221054761	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	221875661	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	221879517	.	AA	CC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=96,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:18,0:8,2:12,14,1,1
chr1	221912361	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:6,3:9,9:6,9,7,5
chr1	221912808	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:7,4,3,9
chr1	222712206	.	T	TTTCTGACTGGTATGAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.465:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr1	222715507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=141,256;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,0:5,2:3,5,0,2
chr1	222721288	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=143,77;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:2,4:4,7:5,1,6,5
chr1	222736498	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:6,2,4,1
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	222750744	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:4,3,3,1
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	222753050	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr1	222791646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	222794455	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,4,0
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr1	222802276	.	A	AATG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=95,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:222802276_A_AATG:222802276:7,9,0,2
chr1	222802278	.	T	TAAAGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=95,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:222802276_A_AATG:222802276:7,9,0,2
chr1	222802376	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,4,4
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=93,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:2,4,1,2
chr1	222805706	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:1,0:1,2,0,3
chr1	222806606	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.479:19:5,3:5,5:3,7,2,7
chr1	222817862	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=111,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:15,0:23,3:0|1:222817862_G_T:222817862:18,22,0,3
chr1	222817868	.	C	CTTAAGCGCCTTGGCCTCCAAAAGTG	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,38;MFRL=111,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.086:44:17,0:24,3:0|1:222817862_G_T:222817862:18,23,0,3
chr1	222823738	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.427:16:6,3:2,3:0|1:222823738_GT_G:222823738:3,6,3,4
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,6:0.318:20:7,6:7,0:1|0:222823738_GT_G:222823738:6,8,2,4
chr1	222825658	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:21,0:22,3:24,19,0,3
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:8,3:3,7:1,10,2,9
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,3:4,6:1,8,5,4
chr1	222833307	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:2,0:10,2:0|1:222833307_C_T:222833307:6,6,1,1
chr1	222833327	.	A	AGTC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:0|1:222833307_C_T:222833307:2,7,1,1
chr1	222833330	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,1:0|1:222833307_C_T:222833307:1,7,1,1
chr1	222892328	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:18,6:19,0:17,20,6,0
chr1	222919895	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,4:5,7:7,4,5,6
chr1	222922461	.	T	TGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=0,491;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:222922461_T_TGA:222922461:0,3,1,0
chr1	222922462	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=0,491;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:222922461_T_TGA:222922461:0,3,1,0
chr1	222923351	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,9:9,0:9,6,4,5
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,16,8
chr1	223156485	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:223156485_A_G:223156485:7,13,1,1
chr1	223156496	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:223156485_A_G:223156485:6,14,1,1
chr1	223156498	.	G	GGTACTGGGTCATCA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:223156485_A_G:223156485:6,14,1,1
chr1	223175769	.	ACTGCTGCCTC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=76,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:8,2:4,17,1,1
chr1	223178972	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=80,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:14,0:20,4:22,12,0,4
chr1	223286227	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=141,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:6,4,3,0
chr1	223533605	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:5,2:17,0:0|1:223533605_G_A:223533605:22,2,1,1
chr1	223533607	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:5,2:15,0:0|1:223533605_G_A:223533605:22,2,1,1
chr1	223536545	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:223536545_G_GT:223536545:2,0,1,1
chr1	223536546	.	G	GTGGGTTCAAATGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:223536545_G_GT:223536545:2,0,1,1
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,12,11
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	223717345	.	T	TCAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:223717345_T_TCAAA:223717345:2,0,0,1
chr1	223717347	.	T	TGCCTGCCTGCCTCCCGATGCTTGTCTCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:223717345_T_TCAAA:223717345:2,0,0,1
chr1	223717351	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:223717345_T_TCAAA:223717345:2,0,0,1
chr1	223717379	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	223718278	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr1	223718287	.	C	T,CCACAGTCCCCAGAG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,27,33;MFRL=152,175,152;MMQ=60,60,60;MPOS=7,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,0,0:3,1,1:0,4,0,2
chr1	223718293	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	223718651	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.955:19:0,4:0,15:0|1:223718651_G_A:223718651:0,0,5,14
chr1	223718670	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,2:0,10:0|1:223718651_G_A:223718651:0,0,2,12
chr1	223722780	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0|1:223722780_G_A:223722780:0,0,3,6
chr1	223722781	.	G	GTTGTC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:223722780_G_A:223722780:2,5,1,1
chr1	223722789	.	G	GCATGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:223722780_G_A:223722780:1,3,0,1
chr1	223722791	.	A	ATAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:223722780_G_A:223722780:1,3,0,1
chr1	223807044	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,0:11,4:3,13,1,3
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	223815851	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,7,4
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,9,6
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	223900612	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=184,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,4:2,8:0,5,5,7
chr1	223936864	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	223938565	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr1	223949349	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,1:1,6:2,5,2,5
chr1	223949786	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	223951985	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,1:3,3:0,3,1,3
chr1	223958272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,1:3,5:1,6,3,3
chr1	223958304	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=224,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:223958304_TA_T:223958304:0,2,0,1
chr1	223958308	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=224,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:223958304_TA_T:223958304:0,2,0,1
chr1	223959452	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr1	223959651	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:2,0:8,4:3,7,0,4
chr1	223959796	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	223959959	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	223959994	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	223962512	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:7,0:0|1:223962512_A_AT:223962512:5,11,1,1
chr1	223962513	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:223962512_A_AT:223962512:5,11,1,1
chr1	223980207	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,1,1
chr1	223986158	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,7:6,3:3,5,6,4
chr1	223990456	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:8,3:19,0:17,10,3,0
chr1	223990466	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,1:15,2:10,11,3,0
chr1	224001904	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,0:5,3:7,0,1,2
chr1	224008913	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.666:28:2,6:7,12:7,2,11,8
chr1	224301749	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,9:0,0,1,14
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,10,7
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	224345486	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:224345486_T_C:224345486:0,2,0,1
chr1	224345490	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:224345486_T_C:224345486:0,2,0,1
chr1	224345498	.	G	GGGACACCATGTTGCTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:224345486_T_C:224345486:0,2,0,1
chr1	224363766	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=196,183;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:224363766_C_T:224363766:0,4,0,1
chr1	224363768	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=203,193;MMQ=47,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	224363770	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=190,202;MMQ=53,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:224363770_T_C:224363770:0,3,0,1
chr1	224363774	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,22;MFRL=202,183;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:224363766_C_T:224363766:0,3,0,1
chr1	224363776	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=190,202;MMQ=53,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:224363770_T_C:224363770:0,3,0,1
chr1	224363778	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=203,202;MMQ=47,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:224363770_T_C:224363770:0,2,0,1
chr1	224363782	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=203,202;MMQ=47,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:224363770_T_C:224363770:0,2,0,1
chr1	224378110	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:0|1:224378110_C_A:224378110:0,10,0,2
chr1	224378112	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,1:4,0:0|1:224378110_C_A:224378110:0,10,0,2
chr1	224380234	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	224444663	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=133,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:14,0:16,8,4,0
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,7:0,0,1,15
chr1	224463003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=81,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:1,3,4,1
chr1	224468986	.	C	CGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,16,5
chr1	224499605	.	ATCCTAAAAAAATGACTACCC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:0,0:3,2:0|1:224499605_ATCCTAAAAAAATGACTACCC_A:224499605:2,3,1,1
chr1	224499631	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:224499605_ATCCTAAAAAAATGACTACCC_A:224499605:0,2,1,1
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=117.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,22:0,8:0,0,16,15
chr1	224505715	.	A	AGTTATACAAACGATTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=185,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	224514275	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr1	224544529	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,2:0,0,3,1
chr1	224566891	.	T	TAGAGATCGTTCAGGGTGTTGTAACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:224566891_T_TAGAGATCGTTCAGGGTGTTGTAACTG:224566891:0,1,0,1
chr1	224566893	.	CC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:224566891_T_TAGAGATCGTTCAGGGTGTTGTAACTG:224566891:0,1,0,1
chr1	224605972	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:8,0:7,2:8,7,1,1
chr1	224804945	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:8,2:12,1:9,11,1,2
chr1	224868596	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,0,3
chr1	224872397	.	GCTT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=203,185;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:224872397_GCTT_G:224872397:1,2,1,0
chr1	224872401	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=212,185;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:224872397_GCTT_G:224872397:2,2,1,0
chr1	224872443	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:2,2,5,1
chr1	224872456	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=81,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:6,4,2,0
chr1	224872473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=71,96;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,3,2
chr1	225231496	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,3:8,0:9,9,1,2
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	225267308	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	225268343	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:225268343_A_G:225268343:0,0,3,7
chr1	225268346	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:225268343_A_G:225268343:0,0,3,7
chr1	225332213	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:4,5,2,0
chr1	225340665	.	AGGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:225340665_AGGG_A:225340665:0,0,0,1
chr1	225340672	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:225340665_AGGG_A:225340665:0,0,0,1
chr1	225341484	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:225341484_G_A:225341484:11,7,1,1
chr1	225341488	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:0|1:225341484_G_A:225341484:11,5,1,1
chr1	225428314	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,5:3,0:6,3,5,0
chr1	225428402	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.247:26:7,3:12,3:10,10,2,4
chr1	225460850	.	ATTG	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=25,26;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	225460868	.	C	CAGG	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:225460868_C_CAGG:225460868:0,3,0,1
chr1	225460869	.	TTAC	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:225460868_C_CAGG:225460868:0,3,0,1
chr1	225460882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:225460868_C_CAGG:225460868:0,3,0,1
chr1	225460893	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=176,161;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:225460893_G_A:225460893:0,1,0,1
chr1	225460900	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=176,161;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:225460893_G_A:225460893:0,1,0,1
chr1	225460903	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=23,32;MFRL=176,161;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:225460893_G_A:225460893:0,1,0,1
chr1	225460905	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,28;MFRL=176,161;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:225460893_G_A:225460893:0,1,0,1
chr1	225460907	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=29,22;MFRL=176,161;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:225460893_G_A:225460893:0,1,0,1
chr1	225477491	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	225477546	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,17,3
chr1	225477793	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr1	225492545	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,2:3,1:3,1,4,0
chr1	225492845	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr1	225506262	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=94,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:8,2,4,1
chr1	225512402	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:2,2,4,2
chr1	225546172	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=185,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.814:9:0,5:1,1:0,1,5,3
chr1	225552624	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,5:2,9:0,3,3,11
chr1	225552650	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:0,4,0,7
chr1	225555481	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,172;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,7:3,0:8,2,8,0
chr1	225555602	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=112,173;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:3,4:6,4:5,4,3,5
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,10,10
chr1	225565015	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr1	225565073	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,9:0,17:0,0,15,11
chr1	225576055	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:0|1:225576055_A_G:225576055:8,0,3,0
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:225576055_A_G:225576055:0,0,11,0
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	225600351	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,27,24;MFRL=111,125,65;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=5.28,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,5,5:0.193,0.200:27:6,1,3:8,4,1:6,11,4,6
chr1	225603101	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:1,1:11,1:0|1:225603101_C_CAT:225603101:0,12,0,2
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,2:0,14:0|1:225603101_C_CAT:225603101:0,0,0,17
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	225686025	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.403:28:9,7:7,4:13,4,9,2
chr1	225700613	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:13,0:17,7:21,9,0,8
chr1	225702396	.	CAGGGAGGGGTGGGGCAGGAGGTGGTGGAGGAGGAGGGGGTACTTGATTAGGGAGAGGAGGGGGAGGAGGGGGCGGTGGAGGCCCGGTGGATGGGAGTGGAGGAGGTGGAGGGGGCCCTGGGGGAGG	C	.	.	DP=80;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=107,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.039:75:19,2:2,0:64,8,1,2
chr1	225702411	.	CAGGAGGTGGTGGAGGAGGAGGGGGTACTTGATTAGGGAGAGGAGGGGGAGGAGGGGGCGGTGGAGGCCCGGTGGATGGGAGTGGAGGAGGTGGAGGGGGCCCTGGGGGAGGAGGGAGGGCTACTGAAGCCTGTGCAGGCCCTGGTGGGAGTGGTGG	C	.	.	DP=101;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,8:0.033:99:12,7:3,1:70,21,5,3
chr1	225702507	.	G	GTGCAA	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=34,21;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.107:32:20,3:8,0:29,0,1,2
chr1	225702610	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.595:25:7,9:3,6:1,9,4,11
chr1	225965803	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr1	225965810	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	226016381	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	226016397	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=111,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:2,1,5,2
chr1	226026637	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:3,4,0,2
chr1	226027067	.	G	GGT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=89,177;MMQ=54,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=GT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.406:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr1	226027771	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:226027771_G_T:226027771:0,3,0,1
chr1	226027774	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226027771_G_T:226027771:0,3,0,1
chr1	226027777	.	AC	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226027771_G_T:226027771:0,3,0,1
chr1	226027781	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226027771_G_T:226027771:0,3,0,1
chr1	226032156	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0|1:226032156_GC_G:226032156:3,4,2,3
chr1	226032158	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0|1:226032156_GC_G:226032156:3,4,2,3
chr1	226032160	.	GTGGC	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,1:4,4:0|1:226032156_GC_G:226032156:3,4,2,3
chr1	226034963	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:5,13,1,1
chr1	226036309	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr1	226048604	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:7,8,0,3
chr1	226054688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr1	226054714	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	226054937	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:226054937_G_A:226054937:0,4,0,1
chr1	226054944	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:226054937_G_A:226054937:0,4,0,1
chr1	226058940	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:226058940_A_C:226058940:0,3,0,1
chr1	226058942	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:226058940_A_C:226058940:0,3,0,1
chr1	226058944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:226058940_A_C:226058940:0,3,0,1
chr1	226108894	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,6:1,4:4,4,8,2
chr1	226109000	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,0:13,3:13,15,0,3
chr1	226111718	.	G	GCCGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCGCCTC;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=77.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,7,19
chr1	226180026	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=234,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,0:2,3:2,0,3,1
chr1	226180538	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,6,1
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=78.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,17:0,0,7,22
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=135.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,26:0,25:0,0,41,10
chr1	226334514	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=97,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:12,1:8,2:10,10,3,0
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	226334605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	226347075	.	A	ACAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:0|1:226347075_A_ACAT:226347075:4,12,1,1
chr1	226347078	.	T	TGCTAAGTGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:226347075_A_ACAT:226347075:4,12,1,1
chr1	226349361	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,14:0.249:59:14,0:30,14:0|1:226349361_T_C:226349361:15,30,0,14
chr1	226349368	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,14:0.233:63:15,0:32,13:0|1:226349361_T_C:226349361:14,35,0,14
chr1	226349373	.	C	CTCCCTCCTGGGTTGGTGTTAGT	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=28,38;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,14:0.248:59:15,0:29,14:0|1:226349361_T_C:226349361:11,34,0,14
chr1	226453435	.	C	CCCAGGCTGGAGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,167;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	226465653	.	A	AAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:226465653_A_AAT:226465653:0,7,0,2
chr1	226465655	.	ATAC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:226465653_A_AAT:226465653:0,7,0,2
chr1	226485327	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr1	226549885	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	226550924	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=282,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr1	226567237	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,2:8,0:13,8,1,1
chr1	226567812	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,5:9,3:5,11,2,6
chr1	226567921	.	C	CCAGTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	226576270	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:3,1,5,0
chr1	226578047	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:6,1,5,2
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:1,7:6,4:3,4,8,3
chr1	226589958	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:6,1:2,4:6,3,3,3
chr1	226590180	.	C	CTGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	226595647	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:7,3:0,4:3,4,4,3
chr1	227071364	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=72,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:1,4:5,6:5,1,9,2
chr1	227071377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=81,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:1,5:6,5:5,2,8,3
chr1	227073410	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=217,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr1	227077770	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:9,12,0,2
chr1	227078875	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=132,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	227078955	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,6:2,4:2,4,5,5
chr1	227081622	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:0,2:8,4:6,2,5,1
chr1	227081850	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr1	227081857	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0|1:227081857_C_T:227081857:0,6,1,1
chr1	227081860	.	GG	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=184,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,1:3,0:0|1:227081857_C_T:227081857:0,6,1,1
chr1	227153474	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:227153474_G_C:227153474:0,1,0,1
chr1	227153475	.	C	CTCCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:227153474_G_C:227153474:0,1,0,1
chr1	227165097	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	227170768	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:4,3:1,4:2,3,1,6
chr1	227171739	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	227223270	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,0:10,2:13,12,0,2
chr1	227227740	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	227239691	.	GAAAATAAGTCGGGA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:8,0:9,11,1,1
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr1	227261751	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,10,5
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr1	227335329	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:227335329_T_C:227335329:0,0,0,5
chr1	227335335	.	A	ACGGATGCTCTCCTTTCAAACAAGCCCAAATACCAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=170,224;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:227335329_T_C:227335329:0,3,0,1
chr1	227348349	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:2,6,1,5
chr1	227381674	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=210,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,4:0,10:0,1,4,10
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,6:3,2:8,1,4,4
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=246,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:1,3,0,4
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=110,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:9,9:3,4:5,7,9,4
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,2,1
chr1	227954677	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=45,167;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:3,2:6,1:5,5,3,0
chr1	227963657	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=64,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	228003764	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,79;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.409:25:9,0:5,10:12,3,10,0
chr1	228033626	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,0,3
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=84,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:4,5,0,3
chr1	228113073	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=183,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:0,1:3,2:1,2,3,2
chr1	228290246	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:228290246_A_C:228290246:5,1,1,1
chr1	228290247	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:228290246_A_C:228290246:5,1,1,1
chr1	228290248	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:1,0:0|1:228290246_A_C:228290246:5,1,1,1
chr1	228295556	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:5,5,2,1
chr1	228346750	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=124,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:9,8:9,0:12,6,8,0
chr1	228351768	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:3,2:2,1:3,2,3,1
chr1	228399482	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:3,0,6,0
chr1	228401070	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=79,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228401070_T_TG:228401070:0,1,1,0
chr1	228401078	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=79,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:228401070_T_TG:228401070:0,1,1,0
chr1	228401081	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=79,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:228401070_T_TG:228401070:0,1,1,0
chr1	228401086	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=79,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228401070_T_TG:228401070:0,1,1,0
chr1	228402508	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,4:2,2:1,3,6,3
chr1	228402836	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr1	228402864	.	A	AAGGCAGGCGGGGCGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr1	228403623	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228403623_G_A:228403623:0,0,0,1
chr1	228403627	.	C	CCAAGTCCCCCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228403623_G_A:228403623:0,0,0,1
chr1	228404668	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,4:0,3:4,0,7,0
chr1	228412227	.	TG	CA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:13,9:2,11:8,7,9,11
chr1	228431095	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:10,17:5,4:7,8,8,13
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:0,2,0,3
chr1	228431990	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,2:8,1:7,3,2,1
chr1	228433217	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.602:23:2,6:7,8:5,4,7,7
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=110,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,6:2,2:4,1,4,4
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=125,108;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=87.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,29:0.770:37:5,19:3,9:5,3,22,7
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,1,3
chr1	228462332	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,0:7,6:12,5,4,2
chr1	228464100	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:2,1,7,1
chr1	228465522	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:12,3:15,0:16,12,2,1
chr1	228465632	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,1:0,7,0,2
chr1	228476288	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	228494357	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228494357_C_T:228494357:0,1,0,1
chr1	228494382	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228494357_C_T:228494357:0,1,0,1
chr1	228496014	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:4,4,3,2
chr1	228496949	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:0|1:228496949_G_GA:228496949:2,8,1,1
chr1	228496951	.	C	CACATGGATAAAGAATATTCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:0|1:228496949_G_GA:228496949:2,8,1,1
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr1	228505103	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:4,0,0,1
chr1	228505204	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=110,195;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:2,1:4,4,1,2
chr1	228505668	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=178,69;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:3,1,4,4
chr1	228505699	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=126,77;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.414:15:6,2:3,4:7,2,3,3
chr1	228505739	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=102,124;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,4:5,6:8,5,4,7
chr1	228505742	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=109,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:12,10,1,2
chr1	228522560	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,0:10,2:0|1:228522560_A_G:228522560:6,13,1,1
chr1	228522567	.	AGAAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:9,2:0|1:228522560_A_G:228522560:6,13,1,1
chr1	228523447	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	228525008	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:4,4:7,1:7,4,4,2
chr1	228525669	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:7,2:9,1:6,10,2,1
chr1	228526742	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=233,226;MMQ=50,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=CA;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:1,1:0|1:228526742_C_CCA:228526742:0,2,0,2
chr1	228526777	.	C	CACAGCCTTGGCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=284,180;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1|0:228526742_C_CCA:228526742:0,3,0,1
chr1	228528918	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:10,4:10,0:14,7,2,2
chr1	228538476	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,3:6,1:12,2,3,1
chr1	228547857	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:6,8,3,0
chr1	228548117	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr1	228556788	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,2:0,4:2,2,2,4
chr1	228557980	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,2:6,4:5,6,3,3
chr1	228558929	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=269,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228558929_CA_TC:228558929:0,1,0,1
chr1	228558934	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=269,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228558929_CA_TC:228558929:0,1,0,1
chr1	228560700	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	228560780	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=48,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:2,0:0,1:0|1:228560780_A_G:228560780:1,1,0,1
chr1	228560788	.	CCCCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=232,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCCCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:228560780_A_G:228560780:0,1,0,1
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=108,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,0,4
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.953:23:0,8:0,14:0,1,7,15
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	228646356	.	CGT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.562:15:4,5:1,3:6,1,7,1
chr1	228646545	.	T	TC	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=26,20;MFRL=107,86;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,4:0.089:54:33,0:16,4:0|1:228646545_T_TC:228646545:30,20,2,2
chr1	228646549	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=11;MBQ=26,20;MFRL=118,86;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,4:0.085:57:31,0:15,4:0|1:228646545_T_TC:228646545:30,23,2,2
chr1	228646565	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=27,20;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.179:31:15,2:11,3:0|1:228646565_T_C:228646565:13,13,2,3
chr1	228646569	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=152,82;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.159:29:14,1:11,2:0|1:228646565_T_C:228646565:13,12,1,3
chr1	228646573	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=172,82;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,1:10,2:0|1:228646565_T_C:228646565:10,12,0,3
chr1	228646577	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=177,82;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:12,1:10,1:0|1:228646565_T_C:228646565:10,13,0,3
chr1	228646595	.	GC	AA	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=179,235;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:5,4:0|1:228646595_GC_AA:228646595:0,13,0,4
chr1	228646602	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=178,235;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:5,4:0|1:228646595_GC_AA:228646595:0,12,0,4
chr1	228646603	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=27,33;MFRL=178,235;MMQ=60,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:5,4:0|1:228646595_GC_AA:228646595:0,12,0,4
chr1	228646605	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=26,33;MFRL=178,235;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,0:5,4:0|1:228646595_GC_AA:228646595:0,12,0,4
chr1	228646613	.	CG	AA	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,27;MFRL=179,235;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,0:6,4:0|1:228646595_GC_AA:228646595:0,13,0,4
chr1	228647205	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,1:14,0:0|1:228647205_G_A:228647205:16,6,1,1
chr1	228647213	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,2:15,0:0|1:228647205_G_A:228647205:16,6,1,1
chr1	228647675	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:29,0:34,2:35,35,3,0
chr1	228647697	.	AT	A,ATT	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=23,23,24;MFRL=127,106,125;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=16.93,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,15,3:0.566,0.140:25:4,11,1:2,4,2:1,6,5,13
chr1	228647783	.	T	TCCACCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=197,205;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:228647783_T_TCCACCC:228647783:0,3,0,1
chr1	228647787	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=197,205;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:228647783_T_TCCACCC:228647783:0,3,0,1
chr1	228680946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:228680946_C_T:228680946:1,6,1,1
chr1	228680954	.	GG	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=188,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.246:10:4,0:4,2:1|0:228680946_C_T:228680946:1,7,1,1
chr1	228681588	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,9:0.186:52:17,9:23,0:18,25,9,0
chr1	228699477	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,6:6,5:9,4,6,5
chr1	228700072	.	G	GGAGA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:4,10,0,2
chr1	228879163	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=115,104;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,0:10,6:10,9,0,6
chr1	229385591	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,83;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,0:12,2:18,11,1,1
chr1	229387337	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,109;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:229387337_TG_CA:229387337:0,9,0,2
chr1	229387340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=155,109;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:3,0:0|1:229387337_TG_CA:229387337:0,9,0,2
chr1	229407233	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,14:0,0,18,9
chr1	229440907	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:17,4:20,0:19,18,4,0
chr1	229567660	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:0|1:229567660_C_CG:229567660:4,3,4,2
chr1	229567663	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:0|1:229567660_C_CG:229567660:4,3,4,2
chr1	229567683	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:0,2:0|1:229567660_C_CG:229567660:3,4,4,1
chr1	229567707	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:229567660_C_CG:229567660:5,3,2,0
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	229568632	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=75,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:2,2:3,1,1,2
chr1	229568637	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=87,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:3,3,1,1
chr1	229568934	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,0:0,5:0,2,0,5
chr1	229584826	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:8,3,2,0
chr1	229588228	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=78,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:3,3,3,0
chr1	229619962	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr1	229622190	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.349:38:14,13:11,0:15,10,13,0
chr1	229625620	.	CAATA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AATA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	229631362	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=161,268;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:229631362_A_C:229631362:1,3,0,1
chr1	229631365	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=161,268;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:229631362_A_C:229631362:1,3,0,1
chr1	229631651	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:4,5,2,1
chr1	229654126	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=90,47;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:229654126_G_GA:229654126:13,11,1,1
chr1	229654134	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=108,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:229654126_G_GA:229654126:13,11,1,1
chr1	229654137	.	T	TTG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=108,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:229654126_G_GA:229654126:13,11,1,1
chr1	229654138	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=108,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:13,2:0|1:229654126_G_GA:229654126:13,11,1,1
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.964:21:0,11:0,7:0,0,5,16
chr1	229678121	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=113,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:5,10,0,2
chr1	229745771	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	229771140	.	C	CAGAAAGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=68,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,1:7,0:0|1:229771140_C_CAGAAAGG:229771140:6,6,1,1
chr1	229771141	.	C	CTA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=68,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:7,0:0|1:229771140_C_CAGAAAGG:229771140:6,6,1,1
chr1	229771144	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=68,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,2:7,0:0|1:229771140_C_CAGAAAGG:229771140:6,6,1,1
chr1	229771638	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,3:6,3:7,6,5,1
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:6,0,2,1
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:3,2:4,10:1,6,2,10
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,4,2
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.446:7:4,2:0,1:0|1:229783236_T_C:229783236:3,1,2,1
chr1	229790048	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,94;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:4,12:7,4:5,6,9,8
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=56,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:1,3,0,4
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:4,5,1,4
chr1	230379199	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:5,0:2,3:0|1:230379199_T_A:230379199:2,5,2,1
chr1	230379204	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,0:1,3:0|1:230379199_T_A:230379199:2,5,2,1
chr1	230379205	.	G	GGTTGCAGTGAGCCAAGA	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:1,3:0|1:230379199_T_A:230379199:2,5,2,1
chr1	230379230	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:230379230_A_G:230379230:0,2,0,1
chr1	230379234	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:230379230_A_G:230379230:0,2,0,1
chr1	230379236	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,22;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:230379230_A_G:230379230:0,2,0,1
chr1	230379238	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:230379230_A_G:230379230:0,2,0,1
chr1	230379240	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:230379230_A_G:230379230:0,2,0,1
chr1	230384937	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=89,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:5,6:5,7:7,3,7,7
chr1	230386174	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=63,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:4,4:4,5:3,5,5,4
chr1	230386359	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr1	230398853	.	G	GCCACCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	230415244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=60,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	230472835	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=83,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:9,3,3,0
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr1	230798808	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr1	230798864	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.554:15:5,5:1,2:6,1,6,2
chr1	230805215	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:5,2,0,3
chr1	230819295	.	ATTC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:4,2:4,5,3,1
chr1	230819479	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:1,2,4,1
chr1	230841687	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr1	230845794	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:3,4:4,2:4,3,2,5
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=99,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,3:5,5:0,5,2,6
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=99,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.558:11:0,3:3,3:0,5,0,6
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:0,9,1,3
chr1	230898494	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=85,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,3:1,3,2,3
chr1	230903234	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,1:3,3:4,0,5,0
chr1	230903350	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,1:4,4:7,1,1,4
chr1	230904911	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=88,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,7:5,6:6,7,7,6
chr1	230910420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:230910420_C_T:230910420:13,7,2,0
chr1	230910422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,0:11,2:0|1:230910420_C_T:230910420:13,7,2,0
chr1	230915983	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,2:8,7,0,3
chr1	230928351	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	230937397	.	ACCTTCAGAACTTCTCTTGGTGTGGAACCATTACGCCCAGGGTTCACTCCCCTCTCATCGTCCGGCCTTCTC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.119:28:10,4:7,1:5,18,3,2
chr1	231044702	.	TTTTTCCTGCTACTTC	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:10,2:14,0:23,10,1,1
chr1	231047143	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=89,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,11,15
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	231048544	.	A	ATTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:231048544_A_ATTAT:231048544:0,1,0,1
chr1	231048545	.	G	GATTTTACATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:231048544_A_ATTAT:231048544:0,1,0,1
chr1	231048548	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:231048544_A_ATTAT:231048544:0,1,0,1
chr1	231057287	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,8:4,4:1,5,5,7
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,3:2,5,0,5
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:7,1,3,1
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	231075318	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:231075318_TA_AT:231075318:0,0,0,1
chr1	231075321	.	A	ATCAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:231075318_TA_AT:231075318:0,0,0,1
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr1	231094050	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.519:6:1,1:1,0:1,2,0,3
chr1	231299470	.	AGCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=123,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,1,0
chr1	231361110	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	231362495	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=106,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.193:34:11,0:16,6:0|1:231362495_T_A:231362495:15,13,1,5
chr1	231362502	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=106,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.198:33:12,0:15,1:0|1:231362495_T_A:231362495:15,12,1,5
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,4:2,3:1,4,5,2
chr1	231386612	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	231401379	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,327;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:231401379_GGA_G:231401379:3,0,0,1
chr1	231401384	.	A	ACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=174,327;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:231401379_GGA_G:231401379:3,0,0,1
chr1	231401387	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=166,327;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:231401379_GGA_G:231401379:4,0,0,1
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr1	231406502	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,118;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,6:10,0:12,8,6,0
chr1	231480507	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,11:0,11:0,1,7,15
chr1	231486989	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	231487017	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr1	231502244	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	231557050	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,157;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:8,6:3,0:8,4,6,0
chr1	231697030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,4:5,3:0,5,0,7
chr1	231903074	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,89;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:0,0:3,1:2,1,0,1
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	232002392	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=59,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,6:0,2,2,9
chr1	232098999	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=80,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr1	232099423	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:3,5,1,2
chr1	232534957	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:1,3,2,4
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,3,12
chr1	232538245	.	A	AATCCTAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=208,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0|1:232538245_A_AATCCTAAG:232538245:2,4,1,1
chr1	232538248	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=210,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:0|1:232538245_A_AATCCTAAG:232538245:2,5,1,1
chr1	232564116	.	TTA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=82,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.191:14:3,0:7,0:0|1:232564116_TTA_T:232564116:6,6,2,0
chr1	232564125	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,0:0|1:232564116_TTA_T:232564116:8,9,2,0
chr1	232564162	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.494:45:11,14:10,8:4,19,7,15
chr1	232568263	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:232568263_C_A:232568263:0,3,0,1
chr1	232568266	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:232568263_C_A:232568263:0,3,0,1
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	232576998	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:3,2,4,1
chr1	232581247	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr1	232601208	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,1,2
chr1	232607050	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	232607094	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=204,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr1	232626820	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=99,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,6:7,0:1,15,0,6
chr1	232629214	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:6,1,8,0
chr1	232629475	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	232944569	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr1	233113827	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	233114092	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	233119951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	233120192	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=103,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:9,10:2,6:3,8,7,9
chr1	233122127	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:2,2,1,1
chr1	233134086	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:2,6,5,4
chr1	233134281	.	C	CAGCTAGGCTAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=229,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233134281_C_CAGCTAGGCTAGGAG:233134281:0,1,0,1
chr1	233134285	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:233134281_C_CAGCTAGGCTAGGAG:233134281:0,2,0,1
chr1	233135092	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=127,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:17,5:23,0:33,8,5,0
chr1	233135198	.	CTTT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=148,167;MMQ=55,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:1,0:3,7,0,2
chr1	233150605	.	G	GCAAGGTCACGCTCAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.931:14:0,4:1,6:1,1,2,10
chr1	233295992	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.403:12:4,2:2,2:4,3,3,2
chr1	233344224	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=95,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.278:14:4,0:2,0:7,3,4,0
chr1	233354031	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=215,167;MMQ=40,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	233362930	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr1	233394006	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=98,74;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:12,12,0,3
chr1	233398849	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=124,75;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,1:9,2:7,8,1,2
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,15,7
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,10,16
chr1	233489723	.	GT	CC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:0|1:233489723_GT_CC:233489723:3,14,1,1
chr1	233489726	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:233489723_GT_CC:233489723:3,12,1,1
chr1	233489727	.	T	TGCG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:233489723_GT_CC:233489723:3,12,1,1
chr1	233489731	.	G	GTCT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:233489723_GT_CC:233489723:3,12,1,1
chr1	233490536	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:233490536_A_G:233490536:0,0,3,0
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:233490536_A_G:233490536:0,0,5,1
chr1	233490764	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr1	233490776	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	233497903	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:9,6,0,2
chr1	233507814	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,4:6,0:12,7,3,1
chr1	233515102	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,3:5,8:5,4,4,7
chr1	233515285	.	AGTGGTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:11,2:7,10,1,1
chr1	233518029	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,4:1,0:7,0,4,0
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	233766997	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:0|1:233766997_C_T:233766997:5,4,1,1
chr1	233767004	.	C	CTGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:233766997_C_T:233766997:5,8,1,1
chr1	233767007	.	GTTT	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,1:0|1:233766997_C_T:233766997:5,8,1,1
chr1	233785786	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,1:6,5:6,6,3,3
chr1	233802644	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:7,12,2,0
chr1	233807160	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:17,0:5,3:11,12,0,3
chr1	234041297	.	GTCAGCCCCCGGAGACTGTCCGACA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,0:4,2:5,6,1,1
chr1	234444761	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:3,1:0,1:3,0,1,1
chr1	234444823	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=85,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.170:31:11,3:14,1:18,8,0,5
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	234458668	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=251,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr1	234509191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:14,2,3,0
chr1	234519385	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr1	234527575	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr1	234528243	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:5,3:18,0:11,13,0,3
chr1	234528373	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	234541622	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	234561590	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=82,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr1	234601456	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=166,81;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.450:10:3,1:3,1:4,2,2,2
chr1	234601529	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	234603205	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=63,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,2:4,4:5,1,5,1
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	235315889	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:6,0,3,0
chr1	235316088	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.246:23:7,1:11,4:2,16,1,4
chr1	235318511	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=320,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235318511_G_C:235318511:0,1,0,1
chr1	235318513	.	C	CGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=320,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235318511_G_C:235318511:0,1,0,1
chr1	235384838	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	235424117	.	C	CTTCCTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	235506802	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,207;MMQ=48,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr1	235507466	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=97,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.256:15:5,1:2,1:3,9,2,1
chr1	235507733	.	T	TAACACA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:235507733_T_TAACACA:235507733:4,7,1,1
chr1	235507734	.	G	GAAAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:235507733_T_TAACACA:235507733:4,7,1,1
chr1	235507736	.	T	TGAATGCCA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:7,0:0|1:235507733_T_TAACACA:235507733:4,7,1,1
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr1	235634283	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=99,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr1	235643312	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,2:6,0:0|1:235643312_A_C:235643312:10,3,2,0
chr1	235643334	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,2:6,0:0|1:235643312_A_C:235643312:8,5,2,0
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,8,2
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,4:6,1:1,6,2,3
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,0:0,3,1,2
chr1	235715617	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=220,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	235747005	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr1	235747154	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,4:2,4:2,4,4,4
chr1	235826382	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,26,28;MFRL=154,0,131;MMQ=60,60,60;MPOS=32,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.78,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.299,0.231:10:2,2,0:1,1,2:0,5,1,4
chr1	235826476	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235826476_T_C:235826476:0,0,0,1
chr1	235826477	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235826476_T_C:235826476:0,0,0,1
chr1	235826478	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235826476_T_C:235826476:0,0,0,1
chr1	235840429	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:13,2:0|1:235840429_C_T:235840429:12,13,1,1
chr1	235840435	.	GA	AG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:0|1:235840429_C_T:235840429:13,14,1,1
chr1	235914569	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.174:32:14,5:13,0:12,15,4,1
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	235969712	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,0:13,3:7,15,2,1
chr1	235971725	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,0:12,2:0|1:235971725_G_C:235971725:5,15,3,0
chr1	235971731	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:10,0:15,0:0|1:235971725_G_C:235971725:7,19,3,0
chr1	235971734	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:11,0:15,0:0|1:235971725_G_C:235971725:6,20,3,0
chr1	235971737	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:11,0:15,2:0|1:235971725_G_C:235971725:6,20,3,0
chr1	235971741	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=23,19;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,1:0|1:235971725_G_C:235971725:6,21,2,0
chr1	235972637	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,0:12,3:12,10,1,2
chr1	235993742	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.317:8:1,1:3,1:0,6,0,2
chr1	236141248	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=82,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:16,4:7,0:13,10,4,0
chr1	236142253	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,3:3,5:5,4,6,2
chr1	236143132	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,0:3,2:7,5,1,1
chr1	236145145	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=245,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr1	236154365	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,2,1
chr1	236154429	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:0,0:2,1:0|1:236154429_C_A:236154429:2,0,0,1
chr1	236154431	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:236154429_C_A:236154429:2,0,0,1
chr1	236154439	.	ATGCACGCATG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:236154429_C_A:236154429:2,0,0,1
chr1	236154455	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:236154429_C_A:236154429:2,0,0,1
chr1	236175270	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=134,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr1	236175327	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.718:12:1,7:2,1:0|1:236175327_C_A:236175327:1,2,5,4
chr1	236175339	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.718:12:1,8:2,1:0|1:236175327_C_A:236175327:1,2,5,4
chr1	236175347	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=119,267;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:4,0:3,7,3,0
chr1	236175378	.	A	AGAGCAACATGGGGGGTGGAAACTAACATAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,23;MFRL=157,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	236175393	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	236180580	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:1,6,0,5
chr1	236180622	.	A	ACTGGGCCGGGTGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:236180622_A_ACTGGGCCGGGTGC:236180622:0,0,0,1
chr1	236180623	.	A	AGTGGATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:236180622_A_ACTGGGCCGGGTGC:236180622:0,0,0,1
chr1	236187365	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:8,2,3,2
chr1	236205121	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	236208688	.	AT	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	236209024	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	236209081	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	236368391	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.603:18:1,7:6,4:7,0,7,4
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.487:39:11,8:9,11:10,10,10,9
chr1	236381917	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.460:30:9,7:7,7:8,8,5,9
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=228,171;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:2,2:18,3:0|1:236381987_A_G:236381987:1,19,0,5
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=38,26;MFRL=228,171;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:2,2:18,3:0|1:236381987_A_G:236381987:1,19,0,5
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,7:0,3,3,8
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:8,0,4,0
chr1	236385336	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:7,18,0,2
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,4:3,8:0,8,1,11
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:0,8,0,8
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:236393654_A_G:236393654:0,0,0,5
chr1	236393677	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=226,163;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:236393654_A_G:236393654:0,4,0,1
chr1	236393681	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=226,163;MMQ=52,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:236393654_A_G:236393654:0,4,0,1
chr1	236413147	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:0|1:236413147_T_C:236413147:7,1,4,0
chr1	236413164	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=126,143;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.250:14:3,3:7,0:1|0:236413147_T_C:236413147:7,4,3,0
chr1	236413282	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=133,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,2:6,1:5,8,0,3
chr1	236415444	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=108,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.830:7:1,1:0,5:0,1,5,1
chr1	236572475	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,14,0
chr1	236572510	.	T	G	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,16:0.210:79:17,16:46,0:54,9,16,0
chr1	236572622	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=113,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:5,19,0,4
chr1	236590659	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,5:0,0,11,1
chr1	236590675	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:4,2:8,1,1,2
chr1	236590816	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr1	236631562	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:9,9,2,0
chr1	236631633	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,4:5,3:4,9,4,3
chr1	236689474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:0,4,1,3
chr1	236700857	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=81,67;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,1:5,6:7,4,4,3
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,3,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=58,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:1,3:4,2,5,2
chr1	236702171	.	T	TATCACATGGACCTCCATGAGC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=75,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,0:11,9,1,1
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=89,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.498:16:2,7:6,1:0|1:236702447_T_G:236702447:1,7,1,7
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,6:5,1:0|1:236702447_T_G:236702447:1,7,0,7
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr1	236703767	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,4:3,1:3,0,6,0
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.554:11:2,1:3,4:3,2,3,3
chr1	236704888	.	A	AACAGGT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:7,3:6,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:11,3,11,2
chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.454:31:8,8:6,5:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:13,4,11,3
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.405:35:7,9:9,5:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:16,5,11,3
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,4:5,3:1,6,3,4
chr1	236706396	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:236706396_T_A:236706396:0,2,0,1
chr1	236706402	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:236706396_T_A:236706396:0,2,0,1
chr1	236706780	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	236707007	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,1:1,5:0,5,0,6
chr1	236707036	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:236707036_A_T:236707036:0,3,0,2
chr1	236707045	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=302,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:236707036_A_T:236707036:0,2,0,2
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:5,3:10,3:6,9,5,2
chr1	236708316	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,3:5,10:5,1,10,3
chr1	236711323	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.607:31:3,5:9,14:9,3,16,3
chr1	236714292	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=9,17;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:0,0:0,2:0,5,2,3
chr1	236714312	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=47,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.255:10:3,0:3,2:0|1:236714312_C_A:236714312:2,6,0,2
chr1	236714317	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=47,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:236714312_C_A:236714312:0,6,0,2
chr1	236714319	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=47,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:236714312_C_A:236714312:0,6,0,2
chr1	236714324	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=47,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:236714312_C_A:236714312:0,6,0,2
chr1	236716833	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	236717102	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=83,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,2,3
chr1	236721610	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,6:8,2:6,7,3,5
chr1	236721660	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr1	236721731	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,14,9
chr1	236721770	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=142,220;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:10,6:5,0:11,5,6,0
chr1	236722195	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	236722526	.	C	CAGAGAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:0,4:10,9:0,10,1,12
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:1,7,3,6
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:2,0,3,2
chr1	236740135	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=82,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,0:3,7:6,3,4,3
chr1	236745977	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:7,4,1,1
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,10:1,6:2,2,10,6
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	236749807	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	236751217	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=93,110;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,4:6,0:15,4,4,0
chr1	236754202	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.156:29:11,4:13,0:0|1:236754202_G_A:236754202:12,13,2,2
chr1	236754203	.	C	CCCAGTATAG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.156:29:11,3:14,0:0|1:236754202_G_A:236754202:12,13,2,2
chr1	236755427	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=81,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.584:17:3,4:4,6:3,4,2,8
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,4:6,7:0|1:236755814_G_A:236755814:5,5,6,5
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=91,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:6,4:5,12:0|1:236755814_G_A:236755814:7,4,7,10
chr1	236755937	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.503:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr1	236757507	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr1	236760347	.	AGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=178,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	236762988	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,0:4,13:1,5,0,13
chr1	236766447	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:2,1,6,1
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,2:1,0,6,1
chr1	236882303	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,8,7
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	236894647	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	236898889	.	GGT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,1:13,1:13,7,0,2
chr1	236898908	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,0:15,3:13,18,2,1
chr1	236899020	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:9,13,1,1
chr1	236899042	.	G	A,T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,24,20;MFRL=119,162,59;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.52,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,2:0.333,0.167:15:5,3,0:3,2,2:6,2,1,6
chr1	236899047	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:236899047_G_T:236899047:6,6,1,1
chr1	236899048	.	T	TACA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:2,2:0|1:236899047_G_T:236899047:6,6,1,1
chr1	236902560	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,2:7,4:6,5,4,3
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=77,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.493:20:3,6:7,4:3,7,4,6
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr1	236921007	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=183,180;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr1	236978982	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,3:12,1:7,15,1,3
chr1	236978992	.	T	TTCTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.524:17:4,5:4,3:1,7,3,6
chr1	237023028	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	237025713	.	GCCT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=165,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237025713_GCCT_G:237025713:0,1,0,1
chr1	237025719	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=165,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:237025713_GCCT_G:237025713:0,1,0,1
chr1	237025721	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=165,86;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237025713_GCCT_G:237025713:0,1,0,1
chr1	237037998	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.455:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:1,4,1,3
chr1	237057608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	237057757	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:0|1:237057757_T_TA:237057757:5,9,1,1
chr1	237057758	.	T	TCCAAAACAGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:0|1:237057757_T_TA:237057757:5,9,1,1
chr1	237057882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,2:2,2:1,4,0,4
chr1	237058828	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=123,77;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:4,6:9,5:4,9,6,5
chr1	237060383	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,0:10,3:12,13,2,1
chr1	237060433	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=114,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:5,4:3,2:2,6,3,5
chr1	237060945	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.591:7:1,2:2,1:1,2,2,2
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,1:4,6:5,1,5,2
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,4,1
chr1	237551536	.	AT	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=185,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0|1:237551536_AT_TA:237551536:0,3,1,1
chr1	237551541	.	T	TGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=185,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:237551536_AT_TA:237551536:0,3,0,1
chr1	237586384	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,1:7,8:4,4,5,4
chr1	237586622	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,0:6,5:0,9,0,5
chr1	237619875	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr1	237632367	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,2:3,0:4,3,0,2
chr1	237656205	.	GAAAGC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=92,273;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:3,1:3,1:6,8,2,0
chr1	237664225	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,133755;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr1	237675126	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:237675126_C_CA:237675126:1,1,0,1
chr1	237675128	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,20;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:237675126_C_CA:237675126:1,1,0,1
chr1	237675163	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	237753074	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.775:9:2,6:0,1:1,1,6,1
chr1	237753364	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	237753859	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:237753859_G_GA:237753859:1,1,1,1
chr1	237753860	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:237753859_G_GA:237753859:1,1,1,1
chr1	237754340	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	237755188	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr1	237755203	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	237757027	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	237765470	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	237789154	.	A	ACCACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=147,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	237796837	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=112,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,3,3
chr1	237796850	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=179,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:3,4,2,7
chr1	237797082	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	237797103	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=134,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237813126	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	237814898	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	237817784	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	237829734	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=181,72174136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	237850663	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=0,52;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.534:8:0,0:0,0:0|1:237850663_C_CT:237850663:2,2,3,1
chr1	237850666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=18,21;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.614:10:1,3:0,2:0|1:237850663_C_CT:237850663:2,2,3,3
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	237862436	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	237863718	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	237868554	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=153,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:0|1:237868554_G_A:237868554:13,12,1,1
chr1	237868557	.	CTT	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:0|1:237868554_G_A:237868554:14,12,1,1
chr1	237868563	.	CTGTAGCA	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:7,2:0|1:237868554_G_A:237868554:14,11,1,1
chr1	237868573	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=143,56;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:237868554_G_A:237868554:11,6,1,1
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	237890437	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,4,8
chr1	237905570	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:0,1:1,2,1,1
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	237924381	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=98,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:2,10,0,2
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr1	237948122	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,0:8,3:8,6,2,1
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=87,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,5:0,8:0,1,3,10
chr1	237955682	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=132,99;MMQ=45,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,1,0,1
chr1	237955685	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=132,99;MMQ=45,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,1,0,1
chr1	237955686	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=132,99;MMQ=45,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,1,0,1
chr1	237955691	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=132,99;MMQ=45,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237955682_C_T:237955682:0,1,0,1
chr1	237955702	.	T	TTGAGGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,45;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,4,2
chr1	237957309	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	237972240	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:14,0:10,4:10,15,0,4
chr1	237972271	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=94,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:13,0:11,3:10,14,0,4
chr1	238048884	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,84;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,0:10,5:9,9,1,4
chr1	238050116	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:8,4,0,2
chr1	238050248	.	C	CTTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:238050248_C_CTTCCCT:238050248:0,0,0,1
chr1	238050249	.	A	ACCTGACCACAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:238050248_C_CTTCCCT:238050248:0,0,0,1
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	240072721	.	G	A,GAAA,GAAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24,19,24;MFRL=0,132,177,224;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,18,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=10.88,7.33,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,9,5,2:0.291,0.454,0.196:16:0,6,1,0:0,3,0,1:0,0,2,14
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,3,2
chr1	240075424	.	ATC	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=92,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.267:31:15,6:7,1:12,11,2,6
chr1	240075494	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:6,0:7,2:6,7,3,0
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,4:0,2:1,2,0,6
chr1	240371844	.	ACTCCTCCCACAAGTTGGGAGTAGCACTTTACCAACCCCACAGGTGTGTGGATTTCTTC	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.097:32:6,0:10,2:18,10,3,1
chr1	240374444	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,63;MMQ=55,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,4:9,0:6,9,2,2
chr1	240421383	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,0,3
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=346,282;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,9:1,10:0,1,5,14
chr1	240497265	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,17:0,11:0,0,15,13
chr1	240497598	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	240656797	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:3,2,1,3
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:6,5:2,1:5,3,4,2
chr1	240977964	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=98,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.830:9:0,3:0,5:1,0,1,7
chr1	241663902	.	T	TGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=GA;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:1,2:0,2:0,2,0,5
chr1	241718798	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:241718798_A_G:241718798:0,0,1,0
chr1	241718808	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:241718798_A_G:241718798:0,0,1,0
chr1	241755411	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:0|1:241755411_G_T:241755411:6,16,1,1
chr1	241755422	.	C	CCAATTCTGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:11,0:0|1:241755411_G_T:241755411:6,14,1,1
chr1	241757998	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:4,0:10,5:0|1:241757998_G_C:241757998:5,9,5,0
chr1	241758001	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:4,0:10,5:0|1:241757998_G_C:241757998:5,9,5,0
chr1	241767920	.	G	GTTGGATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	241767930	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	241823930	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,5:3,8:1,6,6,7
chr1	241838057	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:4,4:10,4:0|1:241838057_C_T:241838057:7,7,4,4
chr1	241838065	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,4:7,3:0|1:241838057_C_T:241838057:6,6,4,3
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	241875251	.	T	TAGTGGCTGGTAATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	241907743	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=93,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:15,0:12,7:13,14,0,7
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr1	241958401	.	C	CTTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:241958401_C_CTTGT:241958401:0,0,4,0
chr1	241958409	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:241958401_C_CTTGT:241958401:0,0,5,0
chr1	242020804	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:3,4,0,4
chr1	242030437	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:7,2:0,0:0,7,0,2
chr1	242035382	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:4,12:6,10:6,4,8,14
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	242052685	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	242263875	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.560:12:4,5:1,0:4,1,7,0
chr1	242287837	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,170;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:3,5,1,4
chr1	242288045	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=352,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	242383394	.	TGTTCATGTACGTCACCTCGGCTCCTAGGA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.136:21:12,0:6,2:8,11,1,1
chr1	242451572	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	243299421	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,153;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:5,8,1,2
chr1	243305846	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=186,59;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:243305846_A_T:243305846:0,6,0,2
chr1	243305848	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=186,59;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:243305846_A_T:243305846:0,6,0,2
chr1	243305850	.	A	AAC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=186,59;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:243305846_A_T:243305846:0,6,0,2
chr1	243305852	.	G	GTCTATCTATT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=186,59;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:243305846_A_T:243305846:0,6,0,2
chr1	243335940	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=100,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.714:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chr1	243354791	.	CG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,21;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	243362331	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,219;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	243384952	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,228;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:13,0,2,0
chr1	243388643	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	243419429	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:12,7:2,4:10,5,5,6
chr1	243467922	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr1	243471192	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	243480230	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.189:31:9,4:15,2:10,15,2,4
chr1	243652459	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,3:8,2:4,9,3,2
chr1	243736210	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,140;MMQ=41,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:8,0,2,0
chr1	243777066	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,4:4,7:0,9,0,11
chr1	243809238	.	C	CTCTCTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:8,8,0,2
chr1	244220229	.	CT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,26,33;MFRL=144,107,74;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.42,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,4:0.180,0.194:22:7,3,1:7,1,3:9,5,3,5
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr1	244595765	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=132,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,0:6,4:12,0,4,0
chr1	244595962	.	CTTTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=143,140;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:0,0:1,1:1,3,0,3
chr1	244600913	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:9,1,4,1
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	244662215	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,8:9,0:11,0,8,0
chr1	244724250	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=89,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:9,0:11,2:10,10,1,1
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr1	244803205	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34,31;MFRL=173,147,188;MMQ=60,60,60;MPOS=18,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.55,15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,7:0.269,0.587:11:0,2,2:1,1,5:1,0,10,0
chr1	244849842	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr1	244849877	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chr1	245005379	.	TATTTCTCTATGTACTAAAAAAAGC	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.090:32:14,2:7,0:7,23,0,2
chr1	245009964	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:4,1:14,2:4,14,0,3
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=103,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:5,7,3,2
chr1	245021344	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=94,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:17,4:24,0:19,22,0,4
chr1	245025697	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=A;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.552:11:3,3:2,2:5,0,5,1
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=196,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	245133623	.	T	TCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=235,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTCC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr1	245246667	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:8,4,2,0
chr1	245249945	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	245318688	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:3,1,4,2
chr1	245530134	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:10,5,2,1
chr1	245530190	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,2125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:8,5:13,0:10,11,3,2
chr1	245772651	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:6,4:10,3:10,6,4,3
chr1	245772692	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:12,9:6,2:11,7,8,3
chr1	245774993	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr1	245848842	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:10,4,1,1
chr1	245850010	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=159,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,1:0|1:245850010_A_C:245850010:2,5,1,1
chr1	245850033	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=161,33;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:245850010_A_C:245850010:3,2,1,1
chr1	245850512	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=237,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:245850512_C_T:245850512:1,4,1,1
chr1	245850536	.	C	CAGATGTTCTCTGCCTTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=203,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:245850512_C_T:245850512:1,6,1,1
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,6,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,6,0
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,6,0
chr1	246078968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,0:2,4:0|1:246490438_T_C:246490438:1,2,4,0
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:246490438_T_C:246490438:1,2,4,0
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0|1:246490438_T_C:246490438:3,2,4,0
chr1	246498866	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	246670296	.	CCCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:6,0:11,8:14,3,5,3
chr1	246711789	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	246720066	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,153;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,0:6,6:2,8,0,6
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	246754778	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	246797974	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=232,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	246805435	.	GTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=127,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr1	246823700	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=234,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:246823700_G_GGT:246823700:1,2,0,1
chr1	246823702	.	G	GGGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=234,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:246823700_G_GGT:246823700:1,2,0,1
chr1	246823704	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=234,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	246890158	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:3,0,6,0
chr1	246903654	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr1	246922236	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=191,61;MMQ=40,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:246922236_A_G:246922236:5,0,1,1
chr1	246922240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=191,61;MMQ=40,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:246922236_A_G:246922236:5,0,1,1
chr1	246929442	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:8,5,2,0
chr1	246929483	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,3:0,5:0,1,3,5
chr1	246939610	.	A	ATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATT;STR;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr1	246940179	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr1	246940182	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr1	246940442	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,21;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	246942107	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=96,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,1:4,5:11,2,4,2
chr1	247004392	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	247006151	.	G	GTAATCCCACACCTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=163,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	247006160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	247006179	.	T	TATGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247006179_T_TATGC:247006179:1,0,0,1
chr1	247006181	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247006179_T_TATGC:247006179:1,0,0,1
chr1	247007042	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:7,1:6,10:14,1,9,2
chr1	247007043	.	AA	TT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.577:26:1,6:10,6:9,2,14,1
chr1	247024451	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,41;MMQ=27,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,1:6,2:6,11,1,2
chr1	247024691	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	247025207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	247027204	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	247031203	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,130;MMQ=30,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	247054409	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:8,3:11,0:4,15,1,2
chr1	247069044	.	A	ACCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=167,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:247069044_A_ACCT:247069044:0,6,0,2
chr1	247069047	.	A	ATCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=167,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:247069044_A_ACCT:247069044:0,6,0,2
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,16:0,7:0,0,19,5
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:0,7,0,5
chr1	247162658	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,11,5
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr1	247201695	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=218,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247201695_C_T:247201695:0,1,0,1
chr1	247201697	.	T	TACTGGATCCTGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=218,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247201695_C_T:247201695:0,1,0,1
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=204,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:6,0,5,3
chr1	247320225	.	AGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTTCTTTCATGGTAATGAAGGCAATTGGAGTAACGGAAGGCTTTCCCACAGTGCTTACATTCATAG	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.108:44:8,6:3,4:14,16,7,7
chr1	247321252	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=158,174;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.237:11:2,2:3,0:1,8,0,2
chr1	247321270	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=165,61;MMQ=54,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:5,1:1,13,0,2
chr1	247321318	.	AA	GC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=175,148;MMQ=58,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	247321326	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=154,130;MMQ=53,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr1	247323020	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=79,73;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:17,0:6,3:14,9,1,2
chr1	247464244	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,4:3,4:3,5,3,5
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	247582461	.	TATA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,2
chr1	247582466	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,2
chr1	247587477	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,12:0,5:0,0,8,9
chr1	247587982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr1	247588053	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:1,1,2,5
chr1	247597329	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:247597329_C_T:247597329:0,0,5,0
chr1	247597365	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:247597329_C_T:247597329:0,0,7,2
chr1	247597656	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr1	247608167	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:2,9,1,5
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:3,5:1,3:2,2,4,4
chr1	247695427	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:2,4,1,3
chr1	247726822	.	CTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:4,3:4,2,6,0
chr1	247729206	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=16,20,24,27;MFRL=110,83,120,20952710;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.32,3.60,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,5,4,2:0.313,0.261,0.163:15:0,3,2,1:1,0,0,0:1,3,6,5
chr1	247752367	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:3,6:4,5:3,4,5,7
chr1	247835908	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr1	247836207	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr1	247875552	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr1	247875571	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,3:0,0:1,4,3,0
chr1	247875583	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=84,124;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:6,1,2,1
chr1	247875608	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=87,112;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:3,5,4,2
chr1	247875975	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	247876015	.	G	GACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	247886493	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=110,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,9:5,0:8,4,5,4
chr1	247886615	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=91,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:2,2:5,4,4,3
chr1	247902902	.	G	GTTTTAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:247902902_G_GTTTTAAAT:247902902:0,1,0,1
chr1	247902906	.	T	TTGACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247902902_G_GTTTTAAAT:247902902:0,1,0,1
chr1	247921100	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0,0,11,6
chr1	247921717	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=313,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:0,3:1,0,5,1
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	248004614	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr1	248004687	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248023966	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,3:6,9:4,4,7,5
chr1	248039451	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=70,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:2,1,7,3
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,434;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr1	248059779	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr1	248084511	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,249;MMQ=28,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,2,1
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	248098065	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:248098065_A_C:248098065:0,2,0,1
chr1	248098072	.	C	CAAAGTCCATACAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:248098065_A_C:248098065:0,2,0,1
chr1	248224595	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,90;MMQ=60,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.283:29:12,4:9,3:12,9,2,6
chr1	248262644	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chr1	248264018	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr1	248366370	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=69,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:2,4:12,3:6,8,7,1
chr1	248366657	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=83,134;MMQ=52,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:9,9:13,0:8,14,9,0
chr1	248436611	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,36;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248436611_G_A:248436611:0,0,2,0
chr1	248436616	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,36;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248436611_G_A:248436611:0,0,2,0
chr1	248436638	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=133,131;MMQ=40,40;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,4,2
chr1	248457979	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,57;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr1	248487638	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,126;MMQ=35,50;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,6:0,6:0,1,8,4
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr1	248512749	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr1	248512767	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	248524799	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,197867;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.377:13:5,4:1,1:8,0,5,0
chr1	248525057	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:16,0:12,3:18,10,3,0
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,98;MMQ=42,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=88.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.965:28:0,12:1,15:1,0,13,14
chr1	248525974	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=363,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:248525974_AT_A:248525974:0,2,0,1
chr1	248525976	.	ATGAG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=363,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:248525974_AT_A:248525974:0,2,0,1
chr1	248526001	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=503,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:248526001_T_TC:248526001:0,1,0,1
chr1	248526007	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=503,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:248526001_T_TC:248526001:0,1,0,1
chr1	248550976	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr1	248550988	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,0:9,2:0|1:248550988_T_A:248550988:13,6,1,1
chr1	248550996	.	TGT	CAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:248550988_T_A:248550988:12,5,1,1
chr1	248551117	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=100,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:7,3:21,0:9,19,2,1
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	248569852	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:248569852_T_C:248569852:8,9,1,1
chr1	248569862	.	G	GCCT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:248569852_T_C:248569852:8,10,1,1
chr1	248569863	.	G	GGCCAGCTTTTCCATTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:248569852_T_C:248569852:8,10,1,1
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	248738133	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,128;MMQ=35,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	248756520	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:5,6,2,2
chr1	248756532	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,0:7,4:5,6,2,2
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	248789504	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,15,10
chr1	248790478	.	G	GAACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:248790478_G_GAACT:248790478:0,1,0,1
chr1	248790479	.	G	GCCTAACTCGCCCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:248790478_G_GAACT:248790478:0,1,0,1
chr1	248790482	.	G	GCATGAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:248790478_G_GAACT:248790478:0,1,0,1
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,5,13
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	248813168	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=120,91;MMQ=52,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	248814052	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,171;MMQ=39,34;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:6,1,1,1
chr1	248845097	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr1	248845388	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=77,84;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.445:43:10,19:14,0:13,11,19,0
chr1	248845411	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,33:0,12:0,0,35,10
chr1	248845458	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr1	248845471	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,13,6
chr1	248845499	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,3:0,15:0,0,9,9
chr1	249106306	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,17;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,0:1,1:2,6,0,4
chr1	249110906	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr1	249141454	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	249141729	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=193,273;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr1	249211156	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0|1:249211156_A_AAT:249211156:5,3,1,1
chr1	249211160	.	C	CTGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:6,2:1,0:0|1:249211156_A_AAT:249211156:5,3,1,1
chr1	249214047	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,35;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:13,1:7,1:9,11,1,1
chr2	45574	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=115,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,0:10,6:7,11,0,6
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.330:21:10,0:4,5:5,9,2,5
chr2	230030	.	AGG	A	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:9,0:18,4:0|1:230030_AGG_A:230030:12,17,2,2
chr2	230033	.	T	TGCC	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:10,0:18,4:0|1:230030_AGG_A:230030:12,17,2,2
chr2	230034	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:10,0:19,3:0|1:230030_AGG_A:230030:12,17,2,2
chr2	230038	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=122,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,0:16,2:0|1:230030_AGG_A:230030:12,16,0,2
chr2	230040	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:17,2:0|1:230030_AGG_A:230030:11,15,0,2
chr2	230043	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:17,2:0|1:230030_AGG_A:230030:11,16,0,2
chr2	230049	.	GA	AT	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=31,23;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:18,2:0|1:230030_AGG_A:230030:11,15,0,2
chr2	230052	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=24,34;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:18,2:0|1:230030_AGG_A:230030:11,15,0,2
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,1,1
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	242800	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,4:1,7:4,4,3,8
chr2	242879	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=67,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,5:1,0:1,2,1,4
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.470:25:9,3:4,9:2,11,5,7
chr2	243579	.	A	AATAGCAG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=139,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:17,0:7,21,0,3
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,5:4,1:7,1,6,0
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	269352	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,6:6,0:6,9,3,3
chr2	271998	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.718:8:1,3:1,2:1,1,3,3
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,4:7,1:5,6,5,0
chr2	276965	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:6,2:9,4:10,6,5,1
chr2	283231	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	669622	.	T	TCTCTCTCTCTC	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.077:60:22,3:31,1:40,16,1,3
chr2	677213	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	905393	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:1,2:2,3:0,3,3,3
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:4,1:6,4:0,10,1,5
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,2:0,0:0|1:1079130_G_A:1079130:5,0,2,0
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,2:0,0:0|1:1079130_G_A:1079130:5,0,2,0
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:10,10:5,3:8,7,6,7
chr2	1094065	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=101,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,1:3,4:5,5,1,4
chr2	1099176	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=201,154;MMQ=42,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	1099183	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=171,231;MMQ=43,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:1099183_C_T:1099183:0,1,0,1
chr2	1099185	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=171,231;MMQ=43,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:1099183_C_T:1099183:0,1,0,1
chr2	1099187	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=171,231;MMQ=43,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:1099183_C_T:1099183:0,1,0,1
chr2	1099200	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1099183_C_T:1099183:0,0,0,1
chr2	1099203	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1099183_C_T:1099183:0,0,0,1
chr2	1133188	.	G	GCA,GCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=117,164,119;MMQ=60,60,60;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=CA;STR;TLOD=5.41,9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.302,0.402:7:0,2,0:2,0,3:2,0,4,1
chr2	1168781	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=49,165;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:2,1:2,5,1,1
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	1241680	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,1:8,7,0,2
chr2	1243608	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=168,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:0|1:1243608_A_C:1243608:1,7,3,3
chr2	1243645	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.623:14:3,5:2,3:0|1:1243608_A_C:1243608:1,4,2,7
chr2	1251087	.	A	AAAGGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:1,2,2,1
chr2	1251088	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:1,2,2,1
chr2	1271426	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	1418192	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=86,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:5,4,3,7
chr2	1426787	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr2	1437163	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:1,3,3,5
chr2	1442551	.	ATTTT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,2:1,1:4,1,3,0
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr2	1481155	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	1481231	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	1488668	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,5:3,1:0,9,1,5
chr2	1491497	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr2	1491826	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=75,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:1491826_C_CA:1491826:1,4,1,1
chr2	1491827	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=75,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:1491826_C_CA:1491826:1,4,1,1
chr2	1491829	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=75,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:1491826_C_CA:1491826:1,4,1,1
chr2	1491833	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=75,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:1491826_C_CA:1491826:1,4,1,1
chr2	1491837	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=75,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,1:0|1:1491826_C_CA:1491826:1,4,1,1
chr2	1499728	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:3,1,3,1
chr2	1507436	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	1544617	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,2:7,4:8,8,3,3
chr2	1546327	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=183,86;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:1,6:2,11:0,3,6,12
chr2	1546361	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:4,6,0,3
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642545	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,7,0
chr2	1643114	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:15,0:10,5:9,16,2,3
chr2	1652521	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,2:5,0:12,4,0,2
chr2	1652822	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,5,14
chr2	1683889	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	1683923	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.723:23:6,12:0,5:3,3,10,7
chr2	1813044	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	1926363	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=128,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:6,8,2,0
chr2	1926437	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,16,8
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:5,5:17,3:7,17,1,7
chr2	1946968	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:8,8:13,14:7,14,13,9
chr2	1982877	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,0:5,2:3,4,1,1
chr2	1983395	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=162,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:5,4,3,1
chr2	1983619	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=180,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	3212247	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr2	3212493	.	CGTGAGGCTCGTGGCGGGTCCTTCTGTGAGTGAGGCCCGTGGCGAGTCCTTCTTCCTTGA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,107;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.104:28:9,0:5,2:11,15,0,2
chr2	3212817	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3212817_C_CAAA:3212817:0,0,0,1
chr2	3212818	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3212817_C_CAAA:3212817:0,0,0,1
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr2	3261285	.	A	ATGGAAACTCCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	3322796	.	A	AAAACGGATGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=85,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3322796_A_AAAACGGATGAGTT:3322796:0,2,0,1
chr2	3322797	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=124,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1|0:3322796_A_AAAACGGATGAGTT:3322796:0,1,0,2
chr2	3322798	.	A	ATGTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=85,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3322796_A_AAAACGGATGAGTT:3322796:0,2,0,1
chr2	3341965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	3342009	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,10,5
chr2	3358295	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=172,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:8,7:1,5:8,2,9,3
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr2	3392075	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=543,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:1,13:0,9:1,0,10,12
chr2	3392513	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	3393565	.	C	CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,9,12
chr2	3447410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	3447585	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:8,10,1,2
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr2	3469506	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,6:6,1:5,5,1,6
chr2	3470115	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,14,6
chr2	3470124	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,6:0,0,13,5
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=99.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,14,17
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:3481637_T_C:3481637:0,0,0,9
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:3481637_T_C:3481637:0,0,0,5
chr2	3482722	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=59,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,7:2,1:1,2,2,6
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:4,0,7,0
chr2	3488502	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,15:0,32:0,0,18,29
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	3604391	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:29,1:9,2:24,15,3,0
chr2	3605528	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=209,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0|1:3605528_T_G:3605528:0,4,1,6
chr2	3605538	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,3:3,2:0|1:3605528_T_G:3605528:0,5,1,6
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,1:4,8:0,10,1,8
chr2	3627648	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.604:16:2,4:4,4:5,1,9,1
chr2	3651177	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:11,1:13,3,1,1
chr2	3652616	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:13,9:15,6:10,18,12,3
chr2	3660856	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:0,9:4,5:4,0,8,6
chr2	3685046	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	3685074	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	3687847	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,22;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr2	3687850	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,63;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:4,3:7,7,1,2
chr2	3718692	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=96,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:0,3:4,2:3,3,3,2
chr2	3721632	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:4,0,3,3
chr2	3721729	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,8,4
chr2	3726163	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=126,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,2:4,1:6,7,0,3
chr2	3749084	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=115,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:6,2:4,7,1,4
chr2	3749151	.	GGAA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=79,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:5,6,1,2
chr2	3749267	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=105,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:1,5,1,2
chr2	3749909	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=89,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:12,5:10,0:15,7,5,0
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr2	3789556	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=138,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:13,5:11,0:13,11,4,1
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,2:5,2:8,6,0,4
chr2	3815250	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	3815477	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,5:5,9:5,8,8,6
chr2	3815532	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=114,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.543:6:0,0:2,1:0,3,0,3
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr2	5833484	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	5834346	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=70,248;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	5834662	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=135,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,4:0.086:56:28,0:23,4:0|1:5834662_C_T:5834662:33,19,4,0
chr2	5834672	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=130,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,4:0.087:55:26,0:23,3:0|1:5834662_C_T:5834662:32,19,4,0
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:0,0:5,4:2,4,2,3
chr2	5835596	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=141,58801225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:12,11,2,0
chr2	5835697	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.751:7:1,1:0,3:1,1,1,4
chr2	5837271	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:2,2,0,2
chr2	5838161	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:1,2:3,2,2,2
chr2	7001233	.	ACG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,5:0,0,12,0
chr2	7001249	.	ACACACACACC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=160,161;MMQ=51,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr2	7003613	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=91,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:14,3,2,0
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:3,0:5,2:1,7,1,2
chr2	7036129	.	G	GGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:7036129_G_GGAT:7036129:0,3,0,1
chr2	7036132	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:7036129_G_GGAT:7036129:0,3,0,1
chr2	7154826	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.437:24:8,4:6,6:6,8,7,3
chr2	7164483	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,3:7,2:7,5,4,1
chr2	7170157	.	TATC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr2	7179843	.	CTGCAAG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=90,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCAAG;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:6,2:6,7,1,1
chr2	7208324	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=79,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,1:9,4:10,9,2,3
chr2	8822373	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=98,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:16,2:23,1:22,17,3,0
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,28;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.774:19:2,2:0,10:4,0,8,7
chr2	8823101	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=155,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:16,4:13,0:5,24,0,4
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	8877042	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,7:2,6:2,1,6,7
chr2	8887175	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0|1:8887175_C_T:8887175:6,0,2,0
chr2	8887180	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.781:7:1,1:0,5:0|1:8887175_C_T:8887175:1,0,6,0
chr2	8887426	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	8890400	.	C	CTGTTGAATCTAAGAGTCTGTTCTAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:7,6,1,1
chr2	8910717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=219,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	8910736	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	8943291	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	8958900	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:4,18,0,2
chr2	8958911	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:4,12,0,2
chr2	8998775	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.398:6:1,1:2,1:3,1,2,0
chr2	8998871	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:7,2:8,4:7,8,5,1
chr2	9002899	.	GAGTTTACAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=225,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	9083250	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,7:1,0:4,2,5,2
chr2	9083423	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,3:5,0:5,12,0,3
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:13,1,2,1
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr2	9475337	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,8:3,7:1,3,3,12
chr2	9484561	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,6;RU=A;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,17,15
chr2	9514917	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,7,13
chr2	9528609	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:5,0:8,2:4,11,1,1
chr2	9533625	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.217:18:5,2:6,0:0|1:9533625_A_C:9533625:3,11,4,0
chr2	9533627	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.194:20:5,1:6,0:0|1:9533625_A_C:9533625:3,13,4,0
chr2	9533680	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.861:15:2,7:0,6:0,2,5,8
chr2	9543563	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	9552379	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:9552379_C_T:9552379:0,0,8,0
chr2	9552383	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.659:10:1,4:2,2:0|1:9552379_C_T:9552379:2,1,6,1
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,5:0,13:0,0,12,6
chr2	9554280	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,8:0,19:0,0,19,8
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr2	9558905	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=247,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.620:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	9572793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,2:6,1:6,8,2,1
chr2	9572888	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	9576553	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	9580540	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	9599767	.	CTTTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,75;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=28,23;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.740:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	9599848	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	9611586	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,0:13,7:6,15,0,7
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,12:1,15:1,0,19,9
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	9631340	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,11:0,0,5,13
chr2	9642478	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	9650177	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:16,0:10,5:10,16,5,0
chr2	9650350	.	C	CATAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	9658381	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:5,2:4,2,0,2
chr2	9727657	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:1,3:8,3:6,3,1,5
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,6:0,7:0,0,11,4
chr2	9985341	.	TC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=83,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.737:28:6,9:1,12:3,4,10,11
chr2	9986102	.	ACT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:0,2:3,9:3,1,8,4
chr2	10008929	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	10044951	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:9,1,3,0
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,12:1,6:0,1,6,12
chr2	10059097	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,16,8
chr2	10059735	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,5:6,0:11,3,4,1
chr2	10073989	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.131:40:17,4:18,0:19,16,5,0
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,11,1
chr2	10103973	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,8:6,0:9,2,6,2
chr2	10104559	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:10104559_C_T:10104559:0,4,0,1
chr2	10104562	.	C	CTTTGCTCAGCATTGTTTTTTACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:10104559_C_T:10104559:0,4,0,1
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,8,5
chr2	10132118	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=92,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.411:11:3,2:2,2:6,1,4,0
chr2	10135956	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,21;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.739:10:2,2:0,2:2,0,8,0
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,9,1
chr2	10223943	.	AA	CC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:15,2:18,14,1,1
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,10,6
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:10226306_G_GC:10226306:0,1,0,3
chr2	10226307	.	C	CCTACCTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:10226306_G_GC:10226306:0,3,0,1
chr2	10226308	.	G	GGTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:10226306_G_GC:10226306:0,3,0,1
chr2	10226309	.	A	ACCTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:10226306_G_GC:10226306:0,3,0,1
chr2	10226311	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:10226306_G_GC:10226306:0,3,0,1
chr2	10262920	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=83,191;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,2:11,2:6,11,1,3
chr2	10264057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	10282147	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=106,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:8,4:17,1:11,14,2,3
chr2	10559992	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,153;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:15,7:11,0:16,10,7,0
chr2	10563236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,3:0,11:0,0,12,2
chr2	10566792	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr2	10566804	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,13,4
chr2	10584258	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,0:17,3:10,15,1,2
chr2	10595534	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,20,8
chr2	10717700	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:0|1:10717700_A_C:10717700:8,2,2,0
chr2	10717714	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.938:14:0,9:0,3:0|1:10717700_A_C:10717700:0,0,12,2
chr2	10729897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	10741141	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	10743153	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,11,7
chr2	10743191	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,13,10
chr2	10747246	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:10747246_C_G:10747246:0,0,2,0
chr2	10747271	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0|1:10747246_C_G:10747246:0,0,9,0
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,7:0,0,2,19
chr2	10799472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:0|1:10799472_G_A:10799472:0,2,0,1
chr2	10799475	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:10799472_G_A:10799472:0,2,0,1
chr2	10799477	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=160,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10799472_G_A:10799472:0,1,0,1
chr2	10799481	.	A	AAATAAAAAGAAACCACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10799472_G_A:10799472:0,0,0,1
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,11:0,20:0,0,20,11
chr2	10813693	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:27,0:17,3:21,23,0,3
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	10815833	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,1:5,3:12,1,4,0
chr2	10894212	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:7,0:6,10,1,2
chr2	10911891	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	10912153	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	10915090	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	10915195	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:0|1:10915195_T_TC:10915195:8,15,1,2
chr2	10915196	.	A	AGCCGTGTTGG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:9,3:13,0:0|1:10915195_T_TC:10915195:8,15,1,2
chr2	10922434	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:12,8,1,1
chr2	10959292	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	10959384	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:2,7:9,12:6,5,10,9
chr2	10959407	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.592:27:3,5:7,11:6,5,9,7
chr2	10959461	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=93,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:7,7:6,5:6,8,3,9
chr2	10959475	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=93,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,7:6,5:5,6,3,9
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	10994788	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:10994788_A_G:10994788:1,1,1,1
chr2	10994790	.	T	TTGACAGGTATTGGGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:10994788_A_G:10994788:1,1,1,1
chr2	10994795	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=211,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10994795_C_CCT:10994795:1,0,0,1
chr2	10994797	.	T	TCTCTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=211,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,1:0|1:10994795_C_CCT:10994795:1,2,0,1
chr2	10994799	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=211,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:10994795_C_CCT:10994795:1,2,0,1
chr2	10994910	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=184,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,5:4,0:3,4,4,1
chr2	11053827	.	CGAGCTG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGCTG;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,0:12,2:14,5,1,1
chr2	11054133	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=62,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,2:0|1:11054133_C_T:11054133:10,10,1,1
chr2	11054140	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=62,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:7,2:0|1:11054133_C_T:11054133:10,11,1,1
chr2	11273813	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,9:0,0,8,18
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,5:2,2:1,6,2,5
chr2	11304271	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=87,169;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:21,3:28,0:30,19,3,0
chr2	11311986	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:5,0,1,0
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	11332238	.	CTT	C,CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32,30;MFRL=146,153,104;MMQ=60,60,60;MPOS=9,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.14,7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,2,5:0.120,0.247:21:5,1,1:6,1,4:13,1,7,0
chr2	11333967	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:2,8,1,2
chr2	11334037	.	TATTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	11348364	.	C	CTAACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	11348609	.	CAAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	11356190	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr2	11356447	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=190,310;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	11356449	.	A	G,C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34,35;MFRL=180,243,310;MMQ=60,45,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr2	11356455	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=190,243;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,14,4
chr2	11376149	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11376149_A_G:11376149:0,2,0,1
chr2	11376151	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11376149_A_G:11376149:0,2,0,1
chr2	11389874	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,124;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.364:53:20,0:14,19:18,16,0,19
chr2	11427913	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,98;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,0:16,3:6,24,0,3
chr2	11716433	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.204:18:4,2:11,1:10,5,3,0
chr2	11725241	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:7,2:2,7:5,4,8,3
chr2	11727507	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,10:3,4:6,3,5,9
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr2	11741193	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=219,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:1,3:0,4:1,0,1,7
chr2	11770147	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:5,3:3,9,0,3
chr2	11772080	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:5,8,2,1
chr2	11774324	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,3:5,3:8,3,5,1
chr2	11775598	.	G	GAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr2	11810003	.	CCAGCAG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=CAG;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:0,0:5,2:3,2,1,1
chr2	11810095	.	GC	AC,AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23,22;MFRL=0,145,159;MMQ=60,60,60;MPOS=8,30;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.32,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.569,0.286:4:0,1,1:0,1,0:0,0,2,2
chr2	11810103	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,1,0
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.662:19:3,6:3,7:5,1,6,7
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:3,3,3,4
chr2	11908076	.	T	TCCCTAATGTCATTGCAGCGACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr2	11913714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=107,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:0|1:11913714_C_T:11913714:3,0,1,0
chr2	11913727	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=72,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.503:6:1,0:2,3:0|1:11913714_C_T:11913714:3,0,3,0
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,3:3,5:3,0,7,1
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	11944749	.	G	GGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11944749_G_GGCT:11944749:0,2,0,1
chr2	11944752	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:11944749_G_GGCT:11944749:0,2,0,1
chr2	12858398	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,0:5,2:7,3,2,0
chr2	12863770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	12880765	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=164,20985078;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr2	14776969	.	ATTTTTCTTTCTTTTTCTTTT	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.069:42:22,2:11,0:11,29,0,2
chr2	14778337	.	C	CAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=21,24;RU=A;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.635:6:0,2:1,1:0,2,3,1
chr2	14779227	.	TAC	T,TACAC	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,23,21;MFRL=150,137,102;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=AC;STR;TLOD=14.06,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,9,2:0.321,0.096:27:3,4,0:2,5,1:16,0,8,3
chr2	14779240	.	A	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.110:71:27,7:36,0:40,24,7,0
chr2	15319070	.	TA	T,TAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,23,20;MFRL=53,94,93;MMQ=60,60,60;MPOS=8,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.89,5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,6:0.238,0.409:15:2,2,2:2,3,4:3,1,5,6
chr2	15372692	.	A	AGATGTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:15372692_A_AGATGTT:15372692:0,0,0,1
chr2	15372696	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15372692_A_AGATGTT:15372692:0,0,0,1
chr2	15372698	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15372692_A_AGATGTT:15372692:0,0,0,1
chr2	15372700	.	TT	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15372692_A_AGATGTT:15372692:0,0,0,1
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr2	15415706	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,0:15,3:11,15,1,2
chr2	15417045	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=116,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:15417045_A_G:15417045:13,11,1,1
chr2	15417053	.	AG	TC	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=110,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:13,2:0|1:15417045_A_G:15417045:14,12,1,1
chr2	15417056	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:15417045_A_G:15417045:14,12,1,1
chr2	15417058	.	CA	AT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=110,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:15417045_A_G:15417045:14,12,1,1
chr2	15427159	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,2:8,9:10,2,11,0
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=20,31;MFRL=48,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=84.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:2,6:0,3:1,1,15,5
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,15,8
chr2	15533832	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=22,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:20,2:16,0:0|1:15533832_A_C:15533832:12,27,1,1
chr2	15533853	.	TGTG	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=26,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,2:14,0:0|1:15533832_A_C:15533832:15,17,1,1
chr2	15533858	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=26,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,2:13,0:0|1:15533832_A_C:15533832:14,16,1,1
chr2	15533861	.	A	ACTT	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=24,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:12,0:0|1:15533832_A_C:15533832:13,15,1,1
chr2	15533873	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=24,30;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,0:8,3:12,11,0,3
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,11,12
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0|1:15533895_A_G:15533895:0,0,5,11
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:15533895_A_G:15533895:0,0,5,10
chr2	15534483	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,0:2,5:1,8,0,5
chr2	15555840	.	AA	GC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:18,0:11,2:20,10,1,1
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	15616013	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,10:0,0,8,12
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,4,13
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	15674686	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,8,8
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,13,12
chr2	15753307	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.461:20:10,5:1,4:10,1,8,1
chr2	15767297	.	T	TTTCTCCTGACCCACCAGGACTCTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=122,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:2,10,1,1
chr2	15840505	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:13,4,4,0
chr2	15840522	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,0:6,5:11,4,5,0
chr2	15841288	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,1,1
chr2	16734295	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=74,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,7:6,7:4,6,8,6
chr2	16742328	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:16742328_GA_G:16742328:7,11,1,1
chr2	16742333	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:16742328_GA_G:16742328:7,10,1,1
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:3,3:1,3:0,4,0,7
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,7:2,10:3,4,2,15
chr2	17830586	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=250,157;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,6:2,0:4,0,6,0
chr2	17830599	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=346,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	17836450	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,3:3,4:3,5,6,2
chr2	17883218	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,5:7,2:2,9,1,6
chr2	17884495	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:2,3:7,4:4,5,3,4
chr2	17888457	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr2	17890091	.	G	GTATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17890091_G_GTATA:17890091:0,0,0,1
chr2	17890112	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=252,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17890091_G_GTATA:17890091:0,1,0,1
chr2	17897618	.	TG	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=483,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0|1:17897618_TG_GC:17897618:1,1,0,1
chr2	17897622	.	C	CAAAGCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=483,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0|1:17897618_TG_GC:17897618:1,1,0,1
chr2	17898326	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,10,3
chr2	17899584	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	17902381	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=7272622,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:2,5:0,6:1,1,7,4
chr2	17927275	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,1:0,2:0|1:17927275_C_T:17927275:0,0,0,5
chr2	17927284	.	A	ATAAAAGCGGTGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=253,7607241;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,1:1,1:0|1:17927275_C_T:17927275:0,2,0,2
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=93,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr2	17946184	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=78,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:14,7,0,2
chr2	17948034	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=242,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	17949939	.	TTAA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=83.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:1,11:9,11:8,3,15,7
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=275,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr2	17954421	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:7,15:3,5:4,6,6,14
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=224,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:1,3,0,3
chr2	17955455	.	GGAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,311;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:17955455_GGAAA_G:17955455:2,0,1,0
chr2	17955462	.	A	AGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=172,311;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17955455_GGAAA_G:17955455:2,0,1,0
chr2	17998025	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,9:0,0,11,13
chr2	18736681	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=104,68;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:11,1:6,0:0|1:18736681_A_G:18736681:8,11,5,1
chr2	18736691	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=131,68;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.218:30:15,6:9,0:0|1:18736681_A_G:18736681:11,13,5,1
chr2	20101698	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr2	20133282	.	C	CGAGAATGTGCTGAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:3,4,1,1
chr2	20133301	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	20174308	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=102.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,40:0.477:84:16,11:28,29:14,30,38,2
chr2	20197059	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,133;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:1,6,0,3
chr2	20233135	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	20402103	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.265:8:1,1:3,0:2,4,1,1
chr2	20403794	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0,0,7,13
chr2	20403827	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,1,4
chr2	20405050	.	A	C,T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24,23;MFRL=0,146,141;MMQ=60,60,60;MPOS=7,34;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.20,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.496,0.333:3:0,1,0:0,0,1:0,0,3,0
chr2	20490591	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,3:6,0:0|1:20490591_T_A:20490591:1,10,0,3
chr2	20490594	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,3:7,0:0|1:20490591_T_A:20490591:1,10,0,3
chr2	20490596	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,3:7,0:0|1:20490591_T_A:20490591:1,10,0,3
chr2	20490598	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,3:6,0:0|1:20490591_T_A:20490591:1,9,0,3
chr2	20508421	.	A	AAATGCAAATAAAGTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=197,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr2	20508432	.	ATGGTC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:20508432_ATGGTC_A:20508432:0,3,0,1
chr2	20508439	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:20508432_ATGGTC_A:20508432:0,3,0,1
chr2	20648933	.	A	AT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,41:0.811:51:1,20:7,14:7,3,23,18
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr2	20798006	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	20818840	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:6,8:3,10:5,4,5,13
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:5,1,5,1
chr2	20823724	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,8:0,0,12,8
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,0,2
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	20840906	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	20870424	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20870424_C_T:20870424:0,1,0,1
chr2	20870446	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20870424_C_T:20870424:0,0,0,1
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,13,13
chr2	20884550	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20939706	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,6:0|1:20939706_T_C:20939706:0,0,8,5
chr2	20939708	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:20939706_T_C:20939706:0,0,8,5
chr2	21225117	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,6,3
chr2	21225844	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:6,4,0,4
chr2	21227383	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,4:1,6:1,1,4,6
chr2	21230149	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,125;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,3:8,0:8,13,3,0
chr2	21231524	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=107,0;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:14,1:5,2:12,7,1,2
chr2	21236480	.	C	CCTTCCATCTTGATTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=258,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	21237238	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=201,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:2,4:1,1:3,0,3,2
chr2	21237544	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	21239603	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=172,166;MMQ=40,52;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr2	21247730	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,2:11,1:12,11,1,2
chr2	21249907	.	T	TAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=163,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	21250914	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr2	21250961	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=219,40868;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr2	21250991	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=122,316;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21250991_C_CT:21250991:0,1,0,1
chr2	21250993	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=122,316;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21250991_C_CT:21250991:0,1,0,1
chr2	21250996	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=122,316;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:21250991_C_CT:21250991:0,1,0,1
chr2	21257876	.	T	TCAAAAAGACATGCGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21257876_T_TCAAAAAGACATGCGTGC:21257876:0,1,0,1
chr2	21257879	.	T	TATACTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21257876_T_TCAAAAAGACATGCGTGC:21257876:0,1,0,1
chr2	21265317	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=109,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:14,7,0,2
chr2	21360827	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:6,3,0,2
chr2	23608644	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	23784996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=165,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	23862187	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,2,4
chr2	23907211	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.480:6:1,2:0,1:2,1,3,0
chr2	23919375	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:1,3,4,5
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=71,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr2	23980695	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=102,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,0:13,4:13,9,4,0
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	24046533	.	TAATCAATACTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	24103432	.	CA	C,CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31,31;MFRL=208,0,128;MMQ=60,60,56;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.53,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.394,0.297:7:1,2,0:1,1,2:2,0,3,2
chr2	24103658	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,1:3,7:4,0,8,0
chr2	24110657	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,1:8,6:10,1,6,1
chr2	24110911	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr2	24245938	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=203,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,6:1,0:1,3,10,0
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	24291096	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,230;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr2	24291368	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:24291368_A_T:24291368:1,8,0,2
chr2	24291373	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:24291368_A_T:24291368:1,9,0,2
chr2	24302246	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	24344060	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:5,9,1,1
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr2	24390517	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0,0,9,6
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	24398487	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,7,21
chr2	24406343	.	C	CAATGAAGGGGGCAGTAGTGGGAAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:4,1:7,1:5,7,0,2
chr2	24432620	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,3,1
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr2	24435422	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr2	24484463	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,1:10,0:11,6,1,1
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr2	24521686	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.326:16:5,1:5,4:2,9,0,5
chr2	24521766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr2	24550867	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34,33;MFRL=152,147,214;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=10.43,8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.464,0.385:11:0,4,3:2,1,1:1,1,8,1
chr2	24896389	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr2	24929861	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:11,6,0,2
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	24962249	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:7,0,2,0
chr2	24974918	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=101,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:13,4:20,0:15,18,1,3
chr2	24974945	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,7,15
chr2	24981025	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:6,9,1,1
chr2	25013518	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	25013523	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	25022442	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=152,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.755:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	25045593	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:25045593_A_T:25045593:0,1,0,1
chr2	25045595	.	AC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:25045593_A_T:25045593:0,1,0,1
chr2	25045600	.	A	ATAGAAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25045593_A_T:25045593:0,0,0,1
chr2	25046090	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr2	25047408	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,2:0,9:0,0,8,5
chr2	25048847	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	25057879	.	T	TTGCAGTGAGCTGAGATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=193,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr2	25062838	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.266:18:4,0:6,0:5,8,5,0
chr2	25064079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	25095596	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=103,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.142:47:17,0:23,6:12,29,1,5
chr2	25174284	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:9,1:6,12,1,1
chr2	25181356	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,99;MMQ=60,43;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.346:20:5,5:8,0:9,4,7,0
chr2	25181493	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	25181502	.	C	CAAGCTATGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	25181518	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=235,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25181518_G_A:25181518:0,1,0,1
chr2	25181519	.	T	TTGCACAGGGGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=235,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:25181518_G_A:25181518:0,1,0,1
chr2	25190136	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=86,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:14,0:15,10:15,14,0,10
chr2	25314186	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=63,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.903:28:2,13:0,13:1,1,13,13
chr2	25344464	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr2	25352910	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:15,0:15,15,4,0
chr2	25356417	.	A	AAAATACAGCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	25457088	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=93,115;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.271:35:12,8:13,0:17,9,9,0
chr2	25457136	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=77,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:14,0:23,2:19,20,1,1
chr2	25457143	.	G	GACTCACGGCCCTTTATC	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=77,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:14,0:25,2:19,21,1,1
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.772:33:3,9:4,17:5,2,14,12
chr2	25459984	.	G	GGGCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25459984_G_GGGCAC:25459984:0,0,0,1
chr2	25459987	.	C	CAGCGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:25459984_G_GGGCAC:25459984:0,0,0,1
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:1,0,6,3
chr2	25469239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=197,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr2	25469574	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=58,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:2,5:4,10:4,2,9,6
chr2	25551692	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	25602310	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	25606874	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25606874_C_CTT:25606874:0,1,0,1
chr2	25606876	.	G	GGCTGTCAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,31;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:25606874_C_CTT:25606874:0,1,0,1
chr2	25610053	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,5:2,0:3,0,5,0
chr2	25610274	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=101,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:9,3:6,9,0,3
chr2	25610287	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,5:0,6:0,0,4,9
chr2	25655772	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,1:3,2:6,4,1,2
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,14:0,0,15,25
chr2	25754412	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:8,3:11,0:10,9,1,2
chr2	25875401	.	T	TAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=92,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:2,3:2,1:3,1,3,4
chr2	25875478	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=100,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:20,4:24,0:12,32,0,4
chr2	25965550	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,2:5,0:6,7,1,1
chr2	25965950	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=78,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:0|1:25965950_A_T:25965950:6,10,3,0
chr2	25965955	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=78,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.228:20:8,3:8,1:0|1:25965950_A_T:25965950:6,10,4,0
chr2	25967084	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,158;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:8,7,2,0
chr2	25973309	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr2	25990640	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,3:1,4,2,5
chr2	25994412	.	A	AG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:10,3:6,1:9,8,2,4
chr2	26068509	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr2	26101152	.	G	GTCTCTCTCACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:1,8,0,2
chr2	26152746	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=184,86;MMQ=57,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:3,1,2,1
chr2	26152770	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=100,86;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:5,0:0|1:26152770_A_C:26152770:7,5,1,1
chr2	26152775	.	TC	GT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=100,86;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,1:7,0:0|1:26152770_A_C:26152770:7,5,1,1
chr2	26177198	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:2,1,2,11
chr2	26179354	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	26203852	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:4,7,1,1
chr2	26204739	.	C	CAGGATAGATTCTAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:26204739_C_CAGGATAGATTCTAA:26204739:1,4,1,1
chr2	26204741	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:26204739_C_CAGGATAGATTCTAA:26204739:1,4,1,1
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,3:7,2:7,8,1,4
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:7,2,7,2
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr2	26415088	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	26415320	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:5,7,1,1
chr2	26424248	.	G	GACAAAGTGAAGAAGAAAGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=129,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:26424248_G_GACAAAGTGAAGAAGAAAGC:26424248:0,3,1,1
chr2	26424251	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:26424248_G_GACAAAGTGAAGAAGAAAGC:26424248:0,3,1,1
chr2	26424265	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:26424265_C_CA:26424265:0,1,0,1
chr2	26424269	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26424265_C_CA:26424265:0,1,0,1
chr2	26432671	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=93,59;MMQ=39,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:7,2:0|1:26432671_C_G:26432671:9,11,1,1
chr2	26432686	.	TGCAC	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=93,59;MMQ=39,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,0:5,2:0|1:26432671_C_G:26432671:9,11,1,1
chr2	26432693	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:26432671_C_G:26432671:8,3,1,1
chr2	26432698	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:26432671_C_G:26432671:8,4,1,1
chr2	26452982	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26452982_TG_CA:26452982:0,0,1,0
chr2	26452986	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26452982_TG_CA:26452982:0,0,1,0
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.449:18:3,5:7,3:0|1:26454996_A_G:26454996:6,4,6,2
chr2	26455002	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,10:0.500:20:5,3:5,7:1|0:26454996_A_G:26454996:7,3,6,4
chr2	26457267	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr2	26459765	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:26459765_A_T:26459765:7,5,1,1
chr2	26459788	.	A	AGCGGTAGCAACCCTCTTGGCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:11,0:0|1:26459765_A_T:26459765:8,8,1,1
chr2	26461733	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:3,16:7,5:7,3,17,4
chr2	26462093	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:2,6,4,9
chr2	26467347	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,0:1,7:3,0,6,1
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=118.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,8:0,20:0,0,19,10
chr2	26500101	.	CTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr2	26501389	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=76,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:4,5:0,4:4,0,9,0
chr2	26501953	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:4,7:5,12:8,1,14,5
chr2	26502768	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,4,1
chr2	26507043	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,6:12,0:9,11,6,0
chr2	26507724	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=77,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:4,10:4,3:4,4,8,5
chr2	26508187	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	26508219	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=114,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,3:5,3,2,1
chr2	26508387	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:9,11,1,1
chr2	26508403	.	G	GAAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:10,10,1,1
chr2	26512733	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,6:1,7:1,0,8,5
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:0,8,1,2
chr2	26532735	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:9,4:3,2:6,6,1,5
chr2	26534112	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.836:16:1,6:1,8:0,2,4,10
chr2	26536523	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=192,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr2	26536694	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,125;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,0:7,3:7,4,1,2
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,21:0,0,14,22
chr2	26587076	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,11,11
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr2	26609469	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr2	26654736	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=68,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:26654736_C_T:26654736:2,7,1,1
chr2	26654741	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=78,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:26654736_C_T:26654736:2,6,1,1
chr2	26654748	.	TT	CA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=78,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:26654736_C_T:26654736:2,6,1,1
chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=149,146;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.446:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	26663327	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.220:48:16,10:22,0:24,14,10,0
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=86,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,7:6,5:7,7,6,6
chr2	26676322	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,10:0,0,11,11
chr2	26682831	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:3,1,1,0
chr2	26684497	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	26686300	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.553:29:8,16:4,0:13,0,16,0
chr2	26686787	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,3,1
chr2	26688524	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,4:1,4:6,0,7,1
chr2	26688719	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=98,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,6:2,5:5,1,5,6
chr2	26689687	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=139,48;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.192:29:10,0:12,4:0|1:26689687_T_A:26689687:12,12,2,3
chr2	26689692	.	G	GAGGCTTGCTTTC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=134,48;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:13,0:14,4:0|1:26689687_T_A:26689687:14,14,2,3
chr2	26689696	.	C	CTGGCTAGATGACAT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=127,24;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:0|1:26689687_T_A:26689687:15,15,1,1
chr2	26690176	.	GCGCCCCCCTCTTCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr2	26693515	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:7,0:10,4:9,8,2,2
chr2	26696054	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:6,2,2,2
chr2	26702082	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr2	26703808	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=105,266;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:13,0:7,16,4,0
chr2	26703973	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	26705515	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:5,1:5,1:4,8,0,2
chr2	26717779	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:9,5,2,0
chr2	26724725	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=86.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.756:35:4,17:4,8:2,6,20,7
chr2	26726649	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,3:10,0:12,13,1,2
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:6,1,1,1
chr2	26801795	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr2	26804122	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	26804218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	26804247	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=72,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,5:2,5:2,1,3,7
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=85,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0|1:26818006_T_C:26818006:3,3,3,0
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=85,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:0|1:26818006_T_C:26818006:3,3,5,0
chr2	26916041	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26916041_G_A:26916041:1,1,0,1
chr2	26916046	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:26916041_G_A:26916041:1,1,0,1
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr2	26997031	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	27001054	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr2	27016116	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,2:13,1:14,11,0,3
chr2	27147981	.	T	TGCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27147981_T_TGCG:27147981:0,1,0,1
chr2	27147985	.	G	GAGCGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27147981_T_TGCG:27147981:0,1,0,1
chr2	27157396	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	27163044	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:3,2,1,2
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=85,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:12,3:5,3:10,7,4,2
chr2	27248534	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:9,4,1,1
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,2,13
chr2	27258742	.	TGGACCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=165,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:4,2:8,0,1,1
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=96,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	27262768	.	G	GCAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=186,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr2	27281506	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	27291661	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	27292597	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:33,0:16,5:8,43,0,5
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,6,17
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr2	27303755	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,13,5
chr2	27305508	.	GAGC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,36;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:27305508_GAGC_G:27305508:4,7,1,1
chr2	27305512	.	TGGGCCGGCGACTGGCAGA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=145,36;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:27305508_GAGC_G:27305508:6,7,1,1
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr2	27307956	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:5,6,0,2
chr2	27308192	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.238:43:14,9:19,0:17,16,0,10
chr2	27310177	.	TC	AG	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:21,2:24,0:18,28,1,1
chr2	27317827	.	C	CCTCCACTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=55,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27317827_C_CCTCCACTT:27317827:0,2,0,1
chr2	27317829	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=55,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:27317827_C_CCTCCACTT:27317827:0,2,0,1
chr2	27317836	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27317836_A_C:27317836:0,2,0,1
chr2	27317841	.	T	TTCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27317836_A_C:27317836:0,2,0,1
chr2	27325141	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:4,2:4,1:7,1,4,0
chr2	27327395	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=88,103;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:13,2:6,0:9,10,2,0
chr2	27351279	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=308,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,9:0,0:1,0,8,1
chr2	27353270	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,0:14,4:15,9,0,4
chr2	27353339	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.623:25:7,4:2,9:4,5,5,11
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=33,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.777:11:2,4:0,5:0,2,8,1
chr2	27355695	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.303:31:5,0:12,0:5,16,10,0
chr2	27359887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	27360168	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:13,0:0|1:27360168_G_A:27360168:10,14,1,1
chr2	27360177	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:13,0:0|1:27360168_G_A:27360168:10,16,1,1
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chr2	27361074	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,2:15,0:11,18,0,2
chr2	27361339	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:12,4:5,0:11,6,4,0
chr2	27361472	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=121,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:11,7,1,1
chr2	27372272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:0,1:2,2:0,5,0,3
chr2	27424169	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=112,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:1,0:11,2:0|1:27424169_C_T:27424169:5,7,1,1
chr2	27424179	.	CC	TT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:1,0:9,2:0|1:27424169_C_T:27424169:4,7,1,1
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	27428295	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.969:26:0,17:0,8:0,0,13,13
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr2	27429842	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:7,16,0,2
chr2	27435250	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,27:0,23:0,0,22,29
chr2	27439739	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=100,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:24,0:24,4:25,25,3,1
chr2	27445058	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=119,138;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:10,5:6,0:7,10,5,0
chr2	27445315	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,2:3,1:3,3,2,1
chr2	27446658	.	T	TTCCACTTCCCTGGCAGGTGAGAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.311:6:1,0:2,1:0,5,0,1
chr2	27448904	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr2	27449501	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=65,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:0|1:27449501_C_T:27449501:18,9,2,0
chr2	27449507	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=65,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:27449501_C_T:27449501:18,8,2,0
chr2	27449540	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr2	27454787	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr2	27456699	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	27457428	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:12,6,1,1
chr2	27462405	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	27463272	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,3:7,0:3,11,0,3
chr2	27479339	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=117,59;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.174:38:15,6:16,0:0|1:27479339_C_T:27479339:18,14,2,4
chr2	27479356	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=111,59;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:11,2:14,0:0|1:27479339_C_T:27479339:12,15,2,4
chr2	27479358	.	A	AGGGAGCTCAAGATCATAAATTACTCAT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:0|1:27479339_C_T:27479339:12,15,2,1
chr2	27481888	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	27505758	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=78,137;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:6,3:6,4:5,7,3,4
chr2	27505782	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:1,3,3,4
chr2	27521669	.	AT	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:27521669_AT_TC:27521669:0,3,1,1
chr2	27521672	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:27521669_AT_TC:27521669:0,3,1,1
chr2	27528692	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.348:24:6,4:9,4:8,8,3,5
chr2	27528981	.	A	AATTCAAGACTGTTTTTTCTACCTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr2	27532870	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.595:30:7,6:5,12:3,9,7,11
chr2	27535149	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=93,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,3:12,0:6,12,1,2
chr2	27535164	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=86,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,0:8,4:5,10,0,4
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=112.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,12:0,21:0,0,13,22
chr2	27535603	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=101,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:4,3:2,7,1,2
chr2	27535693	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27535693_T_A:27535693:0,1,0,1
chr2	27535695	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27535693_T_A:27535693:0,1,0,1
chr2	27535696	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=156,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27535693_T_A:27535693:0,1,0,1
chr2	27535861	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:11,5,2,1
chr2	27535880	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=140,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,2:0|1:27535880_G_A:27535880:11,6,1,1
chr2	27535886	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:27535880_G_A:27535880:10,8,1,1
chr2	27535888	.	GGTC	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:27535880_G_A:27535880:9,9,1,1
chr2	27535896	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:27535880_G_A:27535880:8,8,1,1
chr2	27535901	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,1:0|1:27535880_G_A:27535880:7,8,1,1
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chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,169;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
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chr2	27606568	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	27656822	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.636:25:7,10:2,6:7,2,11,5
chr2	27659832	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.259:20:5,0:7,5:12,3,4,1
chr2	27663215	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,8:2,3:5,1,9,2
chr2	27663416	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=1135,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:1,1,3,2
chr2	27664047	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=108,115;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:26,4:21,0:27,21,0,4
chr2	27665361	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.463:35:7,9:11,7:8,11,4,12
chr2	27666463	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr2	27666476	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=187,174;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	27670307	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,3:2,3:1,1,6,0
chr2	27681598	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:6,2,3,0
chr2	27684734	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=75,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0|1:27684734_A_G:27684734:1,4,1,3
chr2	27684755	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1|0:27684734_A_G:27684734:1,3,0,1
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chr2	27688601	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr2	27693873	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:12,11,1,1
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chr2	27700572	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27700567_A_AAAAGCCCTCCGTGAGC:27700567:0,0,0,1
chr2	27706640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:27706640_T_C:27706640:0,0,3,2
chr2	27706643	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=118,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:27706640_T_C:27706640:3,1,0,1
chr2	27715207	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	27715416	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:3,8:4,6:3,4,6,8
chr2	27721971	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr2	27722416	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	27728777	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr2	27729480	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=174,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,3:1,7:3,4,5,5
chr2	27730886	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=96,43;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:13,7:11,0:13,11,8,0
chr2	27730940	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:1,4:4,11:3,2,11,4
chr2	27801298	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:9,3:14,10,0,3
chr2	27804071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:27804071_C_T:27804071:5,7,1,1
chr2	27804076	.	G	GCAGCACAATTC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:27804071_C_T:27804071:5,6,1,1
chr2	27804078	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:27804071_C_T:27804071:5,6,1,1
chr2	27804197	.	TC	AG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.174:26:10,2:11,2:0|1:27804197_TC_AG:27804197:13,9,2,2
chr2	27804203	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=93,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:9,2:0|1:27804197_TC_AG:27804197:12,10,1,1
chr2	27804209	.	CT	TC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=87,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:27804197_TC_AG:27804197:13,10,1,1
chr2	27804398	.	CCATCGCAGTCCCTCAGAGAGAAGCCATCGCAGTTCCTCTGAGAGAAGA	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=101,75;MMQ=60,47;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:5,0:8,0:17,13,1,1
chr2	27804432	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=101,119;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.220:25:7,1:9,4:0|1:27804432_T_C:27804432:12,8,3,2
chr2	27804446	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,11;MFRL=99,172;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,0:14,0:0|1:27804432_T_C:27804432:14,9,2,0
chr2	27804985	.	C	CTG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=130,116;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:10,2:0|1:27804985_C_CTG:27804985:10,10,0,2
chr2	27804990	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=130,116;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,1:0|1:27804985_C_CTG:27804985:10,10,0,2
chr2	27806022	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.261:44:14,0:19,11:0|1:27806022_G_C:27806022:19,14,0,11
chr2	27806028	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=138,235;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.261:44:12,0:18,11:0|1:27806022_G_C:27806022:18,15,0,11
chr2	27806032	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=24,36;MFRL=138,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.267:43:11,0:18,11:0|1:27806022_G_C:27806022:17,15,0,11
chr2	27822982	.	T	TGTGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:13,0:3,3:0|1:27822982_T_TGTGTG:27822982:3,13,0,3
chr2	27822986	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.192:19:12,0:3,3:0|1:27822982_T_TGTGTG:27822982:3,13,0,3
chr2	27824259	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:18,1:19,1:28,10,2,0
chr2	27830990	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:9,4,3,1
chr2	27850192	.	C	CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,98;MMQ=57,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:13,1:17,1:16,15,0,2
chr2	27851348	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,162;MMQ=52,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:6,7:5,3:7,4,8,3
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.404:10:3,2:3,2:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:1,5,1,3
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.404:10:3,1:3,1:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:1,5,1,3
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:3,0,5,1
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:22,3:8,6:18,13,3,6
chr2	27858081	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:20,0:15,3:27,10,3,0
chr2	27861245	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,2,1
chr2	27861707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,9,2
chr2	27870728	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,7:5,1:7,7,0,8
chr2	27876666	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:3,2:1,2:2,2,0,5
chr2	27890067	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,6:3,0:6,0,6,0
chr2	27910827	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,106;MMQ=58,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:17,2:24,0:0|1:27910827_G_A:27910827:22,21,1,1
chr2	27910832	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,106;MMQ=59,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:19,2:21,0:0|1:27910827_G_A:27910827:24,20,1,1
chr2	27930475	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=112,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.078:73:52,3:16,2:41,27,3,2
chr2	27997336	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=102,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:18,4:30,0:24,24,4,0
chr2	28084539	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28084539_G_GAT:28084539:0,0,0,1
chr2	28084542	.	G	GCCATACTTCTAAACCATCAGATCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28084539_G_GAT:28084539:0,0,0,1
chr2	28352297	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=181,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,4,1,1
chr2	28352303	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=197,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,3,1,1
chr2	28352305	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=91,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,1,1,1
chr2	28352307	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=91,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,1,1,1
chr2	28352311	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=91,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,1,1,1
chr2	28352312	.	C	CAGCGCCGG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=238,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:28352297_T_C:28352297:0,1,1,1
chr2	28352318	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,25;MFRL=238,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28352297_T_C:28352297:0,1,0,1
chr2	28521140	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:5,2,2,0
chr2	28550382	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,0:4,9:0,9,0,9
chr2	28635229	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,7,6
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,5
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,4
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,8:0,0,8,15
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr2	28766254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=159,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	28773062	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,150;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,1:0,1:0,8,0,2
chr2	28800894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr2	28804835	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.601:21:3,5:2,8:6,2,11,2
chr2	28805410	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr2	28808539	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:9,0,5,0
chr2	28812285	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr2	28812982	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:1,6:5,5:2,4,4,7
chr2	28814033	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=63,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.614:39:6,7:8,17:6,9,11,13
chr2	28816814	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32,32,34;MFRL=134,154,171,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,8,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.12,4.87,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,4:0.127,0.206,0.258:17:5,1,3,2:2,1,1,1:7,0,9,1
chr2	28816948	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=92,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.271:45:21,7:11,4:14,19,5,7
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,2:5,9:1,5,2,9
chr2	28824940	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=72,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:1,4,0,2
chr2	28826984	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:3,3:7,0:0|1:28826984_C_T:28826984:0,11,2,1
chr2	28826985	.	T	TTGGACCAATATGGTAAAATA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:3,3:7,0:0|1:28826984_C_T:28826984:0,11,2,1
chr2	28829283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,2,0
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.502:20:4,5:6,5:3,7,3,7
chr2	28843653	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=189,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:28843653_A_C:28843653:0,3,2,0
chr2	28843658	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:28843653_A_C:28843653:0,3,1,0
chr2	28843665	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:28843653_A_C:28843653:0,3,1,0
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,2:5,0,6,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.588:10:0,1:3,5:0,4,0,6
chr2	28853377	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr2	28854816	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=202,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr2	28863738	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,1:2,7:2,1,7,1
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:7,3:1,6:1,7,1,8
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:0,8,0,4
chr2	28999886	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:3,0:13,4:3,13,0,4
chr2	29041877	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,1:8,4:10,7,4,1
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	29075170	.	T	TGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	29075208	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,14;MFRL=197,145;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,1,1,0
chr2	29075212	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,14;MFRL=197,145;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,1,1,0
chr2	29075214	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=22,14;MFRL=197,145;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,1,1,0
chr2	29075216	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,22;MFRL=197,145;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,1,1,0
chr2	29075221	.	GC	CA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=197,145;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,1,1,0
chr2	29075227	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=185,145;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:29075208_G_T:29075208:2,2,1,0
chr2	29087814	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,31;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr2	29117721	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,3:22,0:17,20,2,1
chr2	29129513	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=181,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=85,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.404:35:10,7:11,7:9,12,9,5
chr2	29149504	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,693;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr2	29152384	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,5:1,5:4,0,8,2
chr2	29222070	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:5,7:0,3:4,1,7,3
chr2	29222345	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,0:2,5,1,1
chr2	29222388	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	29225642	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=170,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:7,4:1,9,0,4
chr2	29226343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,1:6,2:9,3,2,1
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:1,1,4,1
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:14,11:7,12:10,11,12,11
chr2	29240576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:29240576_C_T:29240576:2,0,1,0
chr2	29240581	.	GTC	ACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:29240576_C_T:29240576:2,0,1,0
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,2:0,0:1|0:29240576_C_T:29240576:0,0,2,0
chr2	29245933	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=96,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:4,1:4,4:4,4,5,2
chr2	29247304	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=243,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr2	29247330	.	G	GATAAAGAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=254,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,3:0,1,0,7
chr2	29258528	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:3,12,1,1
chr2	29259320	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=239,255;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,0,2
chr2	29268289	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,1:1,1:0|1:29268289_AG_CC:29268289:0,4,5,0
chr2	29268295	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,0:2,2:0|1:29268289_AG_CC:29268289:0,5,4,0
chr2	29268300	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:29268289_AG_CC:29268289:0,6,3,0
chr2	29274704	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=83,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.292:39:19,5:9,6:14,14,6,5
chr2	29274705	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=99,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:20,4:14,1:17,17,3,2
chr2	29274720	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=87,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.363:34:17,5:4,7:11,11,6,6
chr2	29287708	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=195,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,0:1,3:3,1,2,1
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:2,3:3,1:1,4,3,1
chr2	29293446	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,4:11,3:11,4,4,3
chr2	29294629	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=209,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.684:14:3,5:1,4:3,1,7,3
chr2	29295016	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:2,5:1,4:3,1,4,6
chr2	29295992	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:8,6,2,0
chr2	29296653	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:24,4:22,0:25,21,0,4
chr2	29356728	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:0,4,0,5
chr2	29366646	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,3:6,4:7,8,3,4
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr2	29375775	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=57,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,11:0,0,4,10
chr2	29390299	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:4,8:4,8:7,1,11,6
chr2	29404754	.	T	TACAAAACTTCCAGTCCTGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=125,31838680;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,1,0
chr2	29416572	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr2	29416794	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:10,0:7,6:8,9,2,4
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:1,1,4,2
chr2	29444043	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=100,164;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.160:58:20,0:28,8:19,30,1,8
chr2	29446128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr2	29456384	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,1,0
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=93,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:0,1,3,6
chr2	29541104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	29543663	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,18:0,0,11,14
chr2	29551161	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:2,2:2,2:2,2,4,0
chr2	29754721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	29755018	.	G	GAGTTCTCACCAGATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	29755035	.	A	AACTTGAGAAGATTCCTAGCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,5:4,4:6,5,3,6
chr2	30682630	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=195,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr2	30756196	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:5,11:0,3:1,4,3,12
chr2	30756265	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,16,0
chr2	30953728	.	TCCTCCCTCGGAA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30953728_TCCTCCCTCGGAA_T:30953728:0,3,0,1
chr2	30953745	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:30953728_TCCTCCCTCGGAA_T:30953728:0,2,0,1
chr2	30953773	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30953773_T_TA:30953773:0,0,0,1
chr2	30953776	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30953773_T_TA:30953773:0,0,0,1
chr2	30955528	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	30961400	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=124,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	30986045	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=123,47;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:6,6,0,2
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=100,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,6:1,4:2,1,3,7
chr2	30998859	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:9,1:3,2:8,4,1,2
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,6:2,3:3,5,3,6
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=97,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:2,8,1,3
chr2	31155135	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31155135_A_AT:31155135:0,1,0,1
chr2	31155136	.	C	CTTTATGGCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31155135_A_AT:31155135:0,1,0,1
chr2	31155143	.	G	GAACCAGATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	31165181	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr2	31181405	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=162,980043;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0,13,0,2
chr2	31337706	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,1:12,0:5,15,1,1
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=91.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,7,25
chr2	31410792	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:31410792_T_G:31410792:0,2,0,1
chr2	31410796	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31410792_T_G:31410792:0,2,0,1
chr2	31411286	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:31411286_C_T:31411286:1,5,1,1
chr2	31411291	.	C	CCCCATT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:31411286_C_T:31411286:1,6,1,1
chr2	31411326	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:31411326_CA_C:31411326:0,1,0,1
chr2	31411330	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31411326_CA_C:31411326:0,1,0,1
chr2	31411336	.	G	GTTAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31411326_CA_C:31411326:0,1,0,1
chr2	31411339	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31411326_CA_C:31411326:0,1,0,1
chr2	31412342	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:31412342_G_A:31412342:0,4,1,1
chr2	31412344	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:31412342_G_A:31412342:0,4,1,1
chr2	31412346	.	T	TCCCACCTCAGCCTCCCAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=198,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:31412342_G_A:31412342:0,3,1,1
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,1,2
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=206,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	31467393	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=185,300;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31467393_C_T:31467393:0,2,0,1
chr2	31467403	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=185,300;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:31467393_C_T:31467393:0,2,0,1
chr2	31467406	.	T	TGCAGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=198,300;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31467393_C_T:31467393:0,1,0,1
chr2	31488965	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr2	31572482	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	31588288	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,14:0,0,15,12
chr2	31589654	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=105,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr2	31589685	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:5,6,1,1
chr2	31589762	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=77,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,3:4,4:3,2,3,4
chr2	31590759	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	31596666	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=59,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:1,1,4,2
chr2	31626094	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	31628746	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=81,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.346:49:10,4:22,11:14,18,8,9
chr2	31751174	.	C	CATATATATATATAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.872:5:0,0:0,1:0|1:31751174_C_CATATATATATATAT:31751174:0,0,2,3
chr2	31751175	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,4:0,3:0|1:31751174_C_CATATATATATATAT:31751174:2,0,5,3
chr2	31751178	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0|1:31751174_C_CATATATATATATAT:31751174:2,0,5,3
chr2	31805619	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	31805880	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.939:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr2	32117213	.	A	AAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.309:14:5,3:5,1:0|1:32117213_A_AAC:32117213:1,9,0,4
chr2	32117217	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=18,24;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.310:14:1,3:3,1:0|1:32117213_A_AAC:32117213:1,9,0,4
chr2	32118297	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:2,0:3,0:2,5,2,0
chr2	32188138	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:3,0,8,0
chr2	32248479	.	C	CCATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,2:8,4:14,2,4,3
chr2	32288981	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr2	32288985	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=21,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:1,1:0|1:32288985_C_CA:32288985:2,1,3,0
chr2	32288986	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=21,16;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:1,0:0|1:32288985_C_CA:32288985:2,1,3,0
chr2	32288994	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.290:11:2,0:4,0:0|1:32288985_C_CA:32288985:4,4,3,0
chr2	32288999	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=22,12;MFRL=136,163;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,0:0|1:32288985_C_CA:32288985:6,5,2,0
chr2	32289003	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=130,163;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:6,1:0|1:32288985_C_CA:32288985:8,5,2,0
chr2	32289006	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=130,163;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,1:7,0:0|1:32288985_C_CA:32288985:8,5,2,0
chr2	32312700	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:4,5,0,4
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	32369932	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,2:5,0:0|1:32369932_A_G:32369932:7,0,2,0
chr2	32369934	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:32369932_A_G:32369932:7,0,2,0
chr2	32369943	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:7,2,4,0
chr2	32372414	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=122,154;MMQ=47,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=25,24;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,1:1,1,0,2
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=146,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	32475856	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=91,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:18,3:12,0:13,17,3,0
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:8,6:4,10:0|1:32481793_AT_A:32481793:5,7,9,7
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:8,6:4,10:0|1:32481793_AT_A:32481793:5,7,9,7
chr2	32605305	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=87,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:12,2:6,0:3,16,1,1
chr2	32620722	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,3:3,1:1,7,0,4
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,12:0.226:52:19,5:18,7:36,4,8,4
chr2	32690253	.	AT	A	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,9:0.204:77:35,3:25,5:37,31,1,8
chr2	32690274	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.143:31:9,2:15,0:0|1:32690274_C_G:32690274:4,22,5,0
chr2	32690277	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.157:29:6,0:14,0:0|1:32690274_C_G:32690274:4,20,5,0
chr2	32698305	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.313:42:15,0:13,12:7,22,0,13
chr2	32706356	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:15,8:15,0:20,10,8,0
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,9:0,0,4,24
chr2	32706616	.	C	CCTGAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,142;MMQ=45,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,3,15
chr2	32713706	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,11:0,21:0,0,15,17
chr2	32713727	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=86,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:13,3:19,0:13,19,3,0
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,9,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,8,2
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,2:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,9,3
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.942:14:0,10:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,11,3
chr2	32757201	.	CGTGTGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,9;RU=GT;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:6,3:4,0:19,18,2,1
chr2	32757349	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=111,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.372:44:12,12:14,4:7,21,4,12
chr2	32774499	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:11,6:17,0:17,12,6,0
chr2	32800534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	32822957	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:0,1:8,6:4,4,3,4
chr2	32822997	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=174,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:1,0:3,4:0|1:32822997_T_TG:32822997:0,5,2,2
chr2	32822998	.	T	TGTGTGTGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=174,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:1,0:4,4:0|1:32822997_T_TG:32822997:0,5,2,2
chr2	32832760	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,27;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:32832760_A_AAT:32832760:0,3,0,1
chr2	32832762	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,26;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:32832760_A_AAT:32832760:0,3,0,1
chr2	32832779	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32832781	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32832783	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32832787	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32832789	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32832793	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32832779_T_A:32832779:0,1,0,1
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,4:1,4:0,1,0,9
chr2	32961691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,19,4
chr2	33002921	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,2:8,1:14,4,2,1
chr2	33003009	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=99,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:17,3:21,0:0|1:33003009_G_A:33003009:16,22,2,1
chr2	33003014	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:19,3:20,0:0|1:33003009_G_A:33003009:16,23,2,1
chr2	33007817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr2	33007833	.	CCTTGTTTTACCTTTCTCGCCCATGTATATGAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr2	33036324	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:1,8,1,2
chr2	33045867	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=85,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:3,2:5,1:7,1,2,1
chr2	33335847	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,2:0,12:0,0,5,10
chr2	33413622	.	TTTTCCTCCCAATCTGTTGTAGTGAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	33500848	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,3:8,3:9,7,2,4
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr2	33540248	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr2	33572555	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,5:1,4,2,5
chr2	33586464	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	33614187	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:4,1:5,2,2,0
chr2	33614437	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33614437_A_AGG:33614437:0,1,0,1
chr2	33614439	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33614437_A_AGG:33614437:0,1,0,1
chr2	33614441	.	T	TGGAGACACAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33614437_A_AGG:33614437:0,1,0,1
chr2	33614443	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33614437_A_AGG:33614437:0,1,0,1
chr2	33614446	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33614437_A_AGG:33614437:0,1,0,1
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,18,8
chr2	33787879	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:33787879_C_T:33787879:0,4,0,2
chr2	33787903	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:33787879_C_T:33787879:0,5,0,2
chr2	33787907	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:33787879_C_T:33787879:0,4,0,2
chr2	33787908	.	ACC	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:33787879_C_T:33787879:0,4,0,2
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr2	36605612	.	C	CCTTACTGATTTATGCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=98,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	36605624	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=107,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:36605624_C_A:36605624:0,3,0,1
chr2	36605625	.	CTGGGCCATA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:36605624_C_A:36605624:0,4,0,1
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=82,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,3:14,0:3,14,0,3
chr2	36739560	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=151,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,0:3,8:0,8,0,8
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:5,5,3,0
chr2	36756288	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:8,3:8,4:12,5,4,3
chr2	36779251	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:19,0:11,2:0|1:36779251_C_T:36779251:11,20,1,1
chr2	36779255	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:17,0:9,2:0|1:36779251_C_T:36779251:10,18,1,1
chr2	36780431	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:3,7:0,0:0,3,0,8
chr2	36782769	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,3:6,6:4,2,7,2
chr2	36808669	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:6,6:13,13:11,8,13,6
chr2	36943394	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=84,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36943394_G_A:36943394:2,0,1,0
chr2	36943403	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=84,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36943394_G_A:36943394:2,0,1,0
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr2	36943454	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,1:4,3:4,4,2,3
chr2	36986260	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,113;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.218:24:4,0:14,4:8,11,0,5
chr2	37002279	.	G	GGGACGAGCCACGGAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=110,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=121,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:4,0:12,2:5,12,2,0
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	37077029	.	A	AAGAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr2	37078095	.	A	AT,ATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27,30;MFRL=127,156,145;MMQ=60,60,60;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=10.55,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.575,0.273:8:0,2,2:1,3,0:1,0,7,0
chr2	37085066	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:18,0:17,3:20,15,0,3
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	37104946	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=159,175;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.262:6:1,1:4,0:0|1:37104946_T_TG:37104946:5,0,1,0
chr2	37104958	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,175;MMQ=43,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:0|1:37104946_T_TG:37104946:5,0,1,0
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,4:4,8:6,1,11,1
chr2	37111242	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,2:4,0:2,10,1,1
chr2	37152389	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,76;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.261:21:9,3:6,3:1,14,2,4
chr2	37195615	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=184,202;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr2	37195637	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=154,145;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,1:17,1:19,2,2,0
chr2	37195642	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=156,81;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,0:18,2:21,1,1,1
chr2	37195647	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=157,83;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:5,1:19,0:0|1:37195647_C_T:37195647:23,1,1,1
chr2	37195649	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=157,83;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:4,2:19,0:0|1:37195647_C_T:37195647:22,1,1,1
chr2	37195652	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=157,83;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:4,2:19,0:0|1:37195647_C_T:37195647:22,1,1,1
chr2	37195660	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:8,2:19,1:25,3,2,1
chr2	37195665	.	CTG	TCA	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=155,83;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:11,2:18,0:0|1:37195647_C_T:37195647:26,6,1,1
chr2	37255015	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,3:4,0:8,1,3,0
chr2	37255902	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:14,0:26,2:0|1:37255902_G_A:37255902:17,24,1,1
chr2	37255910	.	GTGTC	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:17,0:28,2:0|1:37255902_G_A:37255902:20,26,1,1
chr2	37255915	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:15,0:28,3:20,23,0,3
chr2	37255916	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:15,0:27,2:0|1:37255902_G_A:37255902:19,25,1,1
chr2	37259992	.	TATATATACATACATAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	37280571	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,4:2,1:7,1,3,2
chr2	37280685	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,135;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:27,0:26,4:28,25,0,4
chr2	37286101	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=112,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:13,0:21,3:14,20,3,0
chr2	37286123	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:12,0:20,3:15,17,3,0
chr2	37287866	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:4,10,0,2
chr2	37289162	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,3:4,0:7,5,1,2
chr2	37296076	.	G	GAACCGCACTAACCTGGCGTTCCTCCAGAACC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	37316717	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=87,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:1,1:6,3:7,8,4,0
chr2	37362768	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,14;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,2,0
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,11,3
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:8,8:8,14:9,7,9,13
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:13,1:3,9:2,14,3,7
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,2:4,6:7,1,6,2
chr2	37410716	.	T	TGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:0,9,0,4
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=110,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,9:1,7:1,0,12,4
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr2	37428712	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,8:2,5:4,1,13,0
chr2	37428918	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=120,93;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.056:52:35,0:14,0:26,24,0,2
chr2	37428935	.	G	GACGGAGGCT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=130,93;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:31,0:13,2:0|1:37428935_G_GACGGAGGCT:37428935:24,22,0,2
chr2	37428938	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=123,93;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:31,0:12,2:0|1:37428935_G_GACGGAGGCT:37428935:24,20,0,2
chr2	37429836	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=155,197;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.736:12:0,3:0,4:0|1:37429836_G_A:37429836:2,0,10,0
chr2	37429839	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=155,197;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.720:12:0,1:2,6:0|1:37429836_G_A:37429836:2,0,10,0
chr2	37429843	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=21,21;MFRL=155,197;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.721:12:0,1:2,4:0|1:37429836_G_A:37429836:2,0,10,0
chr2	37438054	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=109,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0|1:37438054_C_A:37438054:1,1,2,0
chr2	37438062	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=91,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:37438054_C_A:37438054:2,1,2,0
chr2	37438993	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.787:26:4,11:1,10:3,2,14,7
chr2	37444268	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=104,222;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:37444268_T_C:37444268:0,4,0,1
chr2	37444270	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=99,222;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37444268_T_C:37444268:0,3,0,1
chr2	37444279	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=99,222;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37444268_T_C:37444268:0,3,0,1
chr2	37444288	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=99,222;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37444268_T_C:37444268:0,3,0,1
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=180,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.594:7:2,3:1,1:0|1:37447465_A_G:37447465:3,0,4,0
chr2	37447472	.	ATAT	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.289:9:4,1:3,0:7,0,2,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.894:6:0,3:0,2:0|1:37447465_A_G:37447465:0,0,6,0
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.904:6:0,3:0,3:0|1:37447465_A_G:37447465:0,0,6,0
chr2	37454713	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,1:6,2:10,2,2,1
chr2	37468623	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	37480249	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,292;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	37481280	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:6,2:10,0:15,2,2,0
chr2	37487620	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=200,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:0,3,0,6
chr2	37503027	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:9,0:4,5:2,11,0,5
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	37599619	.	ATG	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.328:17:9,2:3,3:2,10,1,4
chr2	37873458	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.173:32:17,3:10,2:14,13,2,3
chr2	37873696	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=113,147;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:16,0:13,3:0|1:37873696_G_T:37873696:18,13,3,0
chr2	37873699	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=113,147;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:17,0:13,3:0|1:37873696_G_T:37873696:18,13,3,0
chr2	38177683	.	AGAAGG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=84,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAAGG;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:12,2:10,13,1,1
chr2	38178362	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=99,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,5:3,1:3,3,5,1
chr2	38178817	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=77,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:14,2:0|1:38178817_G_GA:38178817:12,9,1,1
chr2	38178822	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=77,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:38178817_G_GA:38178817:12,9,1,1
chr2	38179134	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr2	38179373	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr2	38201353	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:10,16,1,1
chr2	38201362	.	G	GAACTTGCTTTGTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:9,0:7,14,1,1
chr2	38202502	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	38244818	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.640:12:3,2:1,5:0|1:38244818_A_C:38244818:0,4,0,8
chr2	38244824	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:0|1:38244818_A_C:38244818:1,6,0,6
chr2	38298448	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:7,11,1,1
chr2	38298465	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:38298465_T_A:38298465:6,13,1,1
chr2	38298468	.	A	AGAATGCTTGTGATT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:8,0:0|1:38298465_T_A:38298465:5,13,1,1
chr2	38523966	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	38526324	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,23,0
chr2	38526547	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,5:0,13:0,0,1,17
chr2	38537626	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,4,11
chr2	38542371	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:5,0:13,3:18,0,3,0
chr2	38542573	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	38545598	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:4,1:29,1:27,8,1,1
chr2	38545615	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.124:43:9,2:16,1:23,15,2,3
chr2	38604391	.	CC	TT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:21,0:24,2:15,31,1,1
chr2	38791446	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:2,6,0,8
chr2	38800334	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr2	38809162	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,5:5,11:2,5,8,8
chr2	38830016	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.757:35:4,18:4,9:3,5,12,15
chr2	38916906	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,3:0,10:0,0,10,3
chr2	38973848	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,66;MMQ=60,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:19,4:23,0:27,15,1,3
chr2	38975332	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:0,1:1,5,0,4
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=212,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:0,8,0,4
chr2	39025555	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=80,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:4,7,3,7
chr2	39033743	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,0:9,3:12,9,1,2
chr2	39041102	.	TG	CA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,1:5,18,1,1
chr2	39041140	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=172,183;MMQ=51,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:2,1:0|1:39041140_C_T:39041140:0,7,0,2
chr2	39041143	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=172,183;MMQ=51,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:39041140_C_T:39041140:0,7,0,2
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr2	39042663	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=127,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:39042663_C_T:39042663:11,6,1,1
chr2	39042665	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:39042663_C_T:39042663:12,6,1,1
chr2	39042668	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:39042663_C_T:39042663:12,6,1,1
chr2	39043360	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.241:22:8,0:4,3:8,9,1,4
chr2	39046271	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=105,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:19,5,0,2
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr2	39083645	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=15222494,176;MMQ=50,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:0,0:1,0:1,1,0,1
chr2	39088438	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,2:14,0:6,14,1,1
chr2	39089566	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	39095551	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,0:10,3:7,12,1,2
chr2	39108773	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,1:5,3:4,7,1,3
chr2	39156293	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=137,264;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:39156293_T_C:39156293:1,3,0,1
chr2	39156299	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=142,264;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:39156293_T_C:39156293:1,4,0,1
chr2	39156310	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=144,194;MMQ=43,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	39163001	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=92,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:21,0:14,4:14,21,0,4
chr2	39163037	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:11,0:11,9:7,15,0,9
chr2	39178157	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:12,2:15,2:14,13,1,3
chr2	39186927	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:9,10,2,0
chr2	39187519	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,17,15
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	39240584	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=101,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.296:19:3,2:10,3:7,7,5,0
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	39262296	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,2:8,1:14,3,3,0
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr2	39282001	.	A	ATTTTATTTATC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39282001_A_ATTTTATTTATC:39282001:1,1,0,1
chr2	39282005	.	AG	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39282001_A_ATTTTATTTATC:39282001:1,1,0,1
chr2	39282008	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39282001_A_ATTTTATTTATC:39282001:1,1,0,1
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chr2	39282030	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,30;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39282027_A_G:39282027:0,0,1,0
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	39485822	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39485822_T_A:39485822:0,3,0,1
chr2	39485824	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39485822_T_A:39485822:0,3,0,1
chr2	39485837	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	39505516	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.234:20:8,1:6,3:8,8,2,2
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,20,4
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,13,11
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,11:0,0,14,6
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	39914402	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,10:3,0:8,1,10,0
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.475:34:8,5:9,11:10,8,11,5
chr2	39996254	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:2,4:6,6:4,5,4,6
chr2	40342600	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:8,3:9,3:9,9,0,6
chr2	40392142	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=122,75;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:4,12,0,3
chr2	40397496	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=135,74;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:4,0:9,4:0|1:40397496_A_G:40397496:6,8,1,3
chr2	40397500	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=135,74;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:4,0:11,4:0|1:40397496_A_G:40397496:6,10,1,3
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chr2	40405725	.	ACTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40405719_AGCT_A:40405719:0,0,0,1
chr2	40655563	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CA;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.783:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	40656665	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,2:7,2:11,5,2,2
chr2	42483653	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:17,0:15,4:18,14,4,0
chr2	42491929	.	AA	GG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=218,154;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:3,5,0,6
chr2	42491951	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=169,154;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,8:1,2:1,1,3,8
chr2	42507911	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=224,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	42513315	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:19,3,2,0
chr2	42552711	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	42578274	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=180,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	42578306	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:6,0:8,3,4,0
chr2	42578526	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:42578526_T_A:42578526:2,15,1,1
chr2	42578532	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:42578526_T_A:42578526:0,13,1,1
chr2	42578534	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:42578526_T_A:42578526:0,13,1,1
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	42871418	.	ACAAATATATCTTGAAACT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:2,2:4,0:0,9,1,1
chr2	42922802	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42922802_G_A:42922802:0,0,1,0
chr2	42922806	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42922802_G_A:42922802:1,0,1,0
chr2	42922807	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,14;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42922802_G_A:42922802:1,0,1,0
chr2	42922810	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:42922802_G_A:42922802:2,0,1,0
chr2	42922888	.	ATT	A,AT	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=27,26,26;MFRL=111,141,142;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.11,21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,12:0.153,0.405:32:2,3,2:11,2,10:10,5,15,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,10:4,2:7,2,12,0
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.393:21:5,6:7,2:7,6,7,1
chr2	42979431	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:2,6,1,2
chr2	42989994	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr2	42990010	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:3,4:2,1:4,1,5,1
chr2	42990336	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr2	42997614	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,4:4,2,2,4
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	43451365	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=79,266;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43451365_A_C:43451365:0,1,1,0
chr2	43451367	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=79,266;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43451365_A_C:43451365:0,1,1,0
chr2	43625078	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr2	43655265	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:21,8,1,2
chr2	43732958	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	43768233	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=125,218;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:4,0:10,0,3,0
chr2	43799070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	43801862	.	C	CTCCTGCCTCAGCCTCCCGGTAG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=104,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:6,4:9,0:8,7,2,2
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	43809164	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43809164_A_AG:43809164:0,1,0,1
chr2	43809167	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43809164_A_AG:43809164:0,1,0,1
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,11,6
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,4,3
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	43933594	.	T	TACTTGAAAATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	43937500	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr2	43939525	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	43947944	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,18:0,0,18,8
chr2	44016951	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	44047218	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,157;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.164:34:17,0:12,5:15,14,0,5
chr2	44065632	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,1,1
chr2	44078853	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,6:5,1:4,6,4,3
chr2	44079004	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	44079943	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:3,9,0,3
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	44101537	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.532:13:5,3:1,4:0|1:44101537_A_AT:44101537:6,0,6,1
chr2	44101538	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0|1:44101537_A_AT:44101537:0,0,12,1
chr2	44101649	.	G	GC,GCC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=120,42,110;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,8;RU=C;STR;TLOD=3.29,16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,7:0.165,0.446:15:5,1,2:0,1,3:2,4,2,7
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,1:0,2:2,0,3,0
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	44117433	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.257:41:15,10:16,0:20,11,9,1
chr2	44117511	.	A	T	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,16:0.231:69:33,0:20,14:33,20,0,16
chr2	44117618	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=180,116;MMQ=47,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,2:3,0:0,14,0,2
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	44145181	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,1:10,2:15,10,3,0
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,4,4
chr2	44152234	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:44152234_C_T:44152234:10,13,1,1
chr2	44152239	.	C	CCTTGCAAGTATCCAGCAACTAGT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:14,2:0|1:44152234_C_T:44152234:10,13,1,1
chr2	44161854	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.307:13:3,1:6,3:7,2,3,1
chr2	44161918	.	T	TC	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.162:28:7,0:17,4:0|1:44161918_T_TC:44161918:9,15,2,2
chr2	44161919	.	T	TCTCTCTCTCTC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.162:28:7,0:17,4:0|1:44161918_T_TC:44161918:9,15,2,2
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr2	44173422	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=268,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,5:1,8:0,1,1,12
chr2	44175366	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:2,3,2,5
chr2	44187829	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=129,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	44201191	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,5:3,0:3,0,5,0
chr2	44201259	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr2	44209426	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:15,1:11,2:0|1:44209426_G_T:44209426:12,14,1,2
chr2	44209431	.	CAGT	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.146:25:13,1:8,1:0|1:44209426_G_T:44209426:13,9,1,2
chr2	44209477	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:5,6:13,1:9,9,4,3
chr2	44436529	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:44436529_T_C:44436529:0,3,0,1
chr2	44436531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:44436529_T_C:44436529:0,3,0,1
chr2	44445604	.	GT	G,GTT	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,32,32;MFRL=125,112,91;MMQ=60,60,60;MPOS=17,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.31,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,7,4:0.225,0.158:30:12,6,1:5,1,2:15,4,11,0
chr2	44445663	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=79,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,6:0.089:74:38,6:26,0:25,43,3,3
chr2	44445670	.	T	TCTTTCTAGCAAA	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,7:0.102:75:38,7:27,0:0|1:44445670_T_TCTTTCTAGCAAA:44445670:24,44,3,4
chr2	44445672	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,7:0.102:75:39,4:28,0:0|1:44445670_T_TCTTTCTAGCAAA:44445670:24,44,3,4
chr2	44471313	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:1,1:6,1,2,0
chr2	44502788	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,7,18
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	44565447	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	44566504	.	TAG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:8,1:2,2:0,11,0,3
chr2	44566551	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr2	44569739	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=9,18;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:0,0:0,3,0,2
chr2	44570804	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	44570871	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=124,771;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:11,0:12,4:17,7,4,0
chr2	44617324	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	44931520	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=87,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:3,5,2,5
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr2	44970769	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:16,1:19,3:18,18,1,3
chr2	44993542	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:4,6:0,5:3,1,7,4
chr2	44999291	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=131,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,0:0,6:0,1,1,5
chr2	45715370	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,5:2,0:5,6,5,0
chr2	45715488	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=68,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:2,3,0,2
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	45774050	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	45806963	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	45829115	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.433:37:7,0:14,15:8,13,1,15
chr2	45829151	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,15:0.301:51:11,0:24,15:13,23,0,15
chr2	45832469	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr2	45879220	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:5,2:0,8,1,1
chr2	45879610	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	46583278	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:2,1:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,5,3,0
chr2	46583279	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:2,1:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,5,3,0
chr2	46583281	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,1:1,5,3,0
chr2	46584015	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	46588284	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:46588284_G_GTT:46588284:0,3,0,1
chr2	46588286	.	G	GGAGGCTGTGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:46588284_G_GTT:46588284:0,3,0,1
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:2,2,2,3
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,2,6
chr2	46739563	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=90,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:4,2:0|1:46739563_A_T:46739563:5,7,1,1
chr2	46739574	.	C	CAGCCCATAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=94,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:6,2:0|1:46739563_A_T:46739563:11,7,1,1
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,132;MMQ=27,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.865:20:2,9:0,9:0,2,5,13
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:6,1,6,1
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	46839477	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.508:34:8,9:6,8:6,11,9,8
chr2	46845849	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr2	46850848	.	T	TGACGGCAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,33;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:46850848_T_TGACGGCAC:46850848:5,0,1,1
chr2	46850849	.	T	TTGGCAGCCTCTAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,33;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:46850848_T_TGACGGCAC:46850848:5,0,1,1
chr2	46851183	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=223,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,1,3
chr2	46985899	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,133;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.245:31:9,7:15,0:8,16,7,0
chr2	46989623	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=146,129;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:7,5,3,0
chr2	47044392	.	AGAGGCAAATCCAGAAATCAGCCCTCCAGCTTCCTCTACCAAGAAGACTGGCGGTTACAACCCTGGCTCTGTGGGGCTTCTCTTGCCCTCTCTTCTGACTGCCCTACTTGGCTCCAGGT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=104,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.069:43:9,2:2,0:21,19,1,2
chr2	47081092	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,5,2
chr2	47081196	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=49,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.799:13:2,4:0,6:1,1,3,8
chr2	47083030	.	ATG	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:2,5:3,4:0|1:47083030_ATG_A:47083030:7,0,11,0
chr2	47083041	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,17:0.720:23:1,7:5,5:0|1:47083030_ATG_A:47083030:6,0,16,1
chr2	47083044	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,17:0.720:23:1,11:5,6:0|1:47083030_ATG_A:47083030:6,0,16,1
chr2	47085398	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=220,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr2	47168904	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,3:4,0:1,8,1,2
chr2	47238488	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:9,10,1,1
chr2	47238506	.	A	ATTTTCAACTCCACCACAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:3,11,1,1
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	47314346	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=172,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:47314346_CT_C:47314346:0,3,0,1
chr2	47314351	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=166,261;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47314346_CT_C:47314346:0,2,0,1
chr2	47314355	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=166,261;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:47314346_CT_C:47314346:0,2,0,1
chr2	47357349	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,3:17,0:17,9,2,1
chr2	47357382	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=110,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:10,3:23,1:17,16,2,2
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:0,3,2,11
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,8:4,7:1,5,5,10
chr2	47387989	.	CAAAAAA	C,CAAAAAAAAAAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=17,31,30;MFRL=129,185,81;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,18,29;RU=A;STR;TLOD=9.91,9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,6:0.198,0.396:16:2,2,3:0,2,1:1,5,5,5
chr2	47388765	.	CA	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:5,0,6,0
chr2	47703783	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=266,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47703783_C_T:47703783:0,3,0,1
chr2	47703786	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=266,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:47703783_C_T:47703783:0,3,0,1
chr2	47703792	.	A	ATACT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47703783_C_T:47703783:0,2,0,1
chr2	47703795	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47703783_C_T:47703783:0,2,0,1
chr2	47703798	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47703783_C_T:47703783:0,2,0,1
chr2	48010648	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=103,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.330:15:3,0:4,0:4,6,0,5
chr2	48018281	.	ATGTGTGTGTGTTTGTGTG	A	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=85,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.050:58:37,1:17,1:27,29,0,2
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.653:15:5,6:0,4:2,3,1,9
chr2	48023196	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.071:53:29,3:20,0:22,28,1,2
chr2	48023211	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.087:42:22,3:17,0:0|1:48023211_C_T:48023211:15,24,2,1
chr2	48023216	.	A	AATAAAAATAATAAAAACACCAGGCTG	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.093:40:21,3:16,0:0|1:48023211_C_T:48023211:13,24,2,1
chr2	48023217	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=91,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,2:15,0:14,24,1,1
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.369:22:10,4:4,3:3,11,0,8
chr2	48032740	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.274:33:17,6:4,3:20,4,9,0
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,4:0,10:0,0,2,12
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,13,12
chr2	48033890	.	CTTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27,29,30;MFRL=324,135,109,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,5,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.27,6.23,4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,5,3:0.242,0.372,0.263:12:1,2,3,2:0,0,2,1:1,0,11,0
chr2	48033943	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=82,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.161:30:5,4:14,0:16,10,2,2
chr2	48035541	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:4,5,0,2
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=107,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.593:17:3,3:4,6:4,3,7,3
chr2	48046012	.	TAA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:3,0:5,3:2,9,0,3
chr2	48573966	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	48681602	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	48685165	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=104,49;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:13,0:18,4:14,17,0,4
chr2	48685417	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	48685463	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:48685463_G_T:48685463:0,8,0,2
chr2	48685466	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:48685463_G_T:48685463:0,9,0,2
chr2	48685467	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:48685463_G_T:48685463:0,9,0,2
chr2	48688258	.	ATT	A,AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,22,27;MFRL=145,106,113;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.53,11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,8:0.165,0.342:24:6,1,6:4,3,1:11,1,10,2
chr2	48698577	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48698577_A_G:48698577:0,3,0,1
chr2	48698579	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48698577_A_G:48698577:0,3,0,1
chr2	48722942	.	A	AGGAATATGGACATTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=144,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr2	48725563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	48738388	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	48738685	.	AGGAAGAGGACATAAGATTTAAAGTGTTTGTAAGGGCCAGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:48738685_AGGAAGAGGACATAAGATTTAAAGTGTTTGTAAGGGCCAGGG_A:48738685:0,3,0,1
chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,1:0,1:1|0:48738685_AGGAAGAGGACATAAGATTTAAAGTGTTTGTAAGGGCCAGGG_A:48738685:0,0,0,2
chr2	48808882	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:4,1,3,3
chr2	48808898	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:2,3:5,1:5,2,4,1
chr2	48809756	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr2	48822381	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=77,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.740:24:1,3:4,14:2,4,9,9
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,2:2,7:5,2,9,1
chr2	48848295	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	48848515	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:0,3,2,5
chr2	48869459	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,0:5,4:11,0,4,0
chr2	48873512	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28,29;MFRL=148,126,166;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.37,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.271,0.418:7:0,1,1:2,1,1:2,0,5,0
chr2	48898798	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,12,16
chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr2	48915059	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr2	48915871	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,4:3,7:5,4,9,2
chr2	48921375	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:6,5,3,4
chr2	48925746	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	48925986	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr2	48956431	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr2	49244815	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=172,246;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	49381585	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:3,2,1,2
chr2	50201383	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr2	50280338	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	50574185	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50574185_G_A:50574185:0,0,0,1
chr2	50574187	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50574185_G_A:50574185:0,0,0,1
chr2	50692560	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.349:21:8,3:5,4:11,3,6,1
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,2:2,6:5,1,7,1
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr2	50758657	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	51153145	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=97,128;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.489:41:11,0:10,19:7,14,0,20
chr2	53831866	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=235,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	53832072	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=95,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,2,6
chr2	53897799	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=109,34;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:17,0:16,1:22,13,1,1
chr2	53920931	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	53921018	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:11,3,2,0
chr2	53943919	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=78,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	53955850	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr2	53994929	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,2:2,2:2,0,5,0
chr2	54001442	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,9:2,9:1,4,7,11
chr2	54001505	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:11,0:1,3:6,6,0,3
chr2	54023013	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=129,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:4,3,4,0
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,5:0,13:0,0,10,8
chr2	54024957	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:7,0:7,4:8,6,2,2
chr2	54035374	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	54040168	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0|1:54040168_C_T:54040168:11,14,1,1
chr2	54040170	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:0|1:54040168_C_T:54040168:11,14,1,1
chr2	54080245	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr2	54086865	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54086865_C_T:54086865:0,0,1,0
chr2	54086869	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:54086865_C_T:54086865:0,0,1,0
chr2	54114967	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,14,2
chr2	54115839	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=145,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:5,0,0,2
chr2	54115904	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,15,11
chr2	54116003	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr2	54119870	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr2	54122625	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	54122889	.	TC	AT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=110,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:54122889_TC_AT:54122889:4,19,0,2
chr2	54122894	.	T	TAC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=112,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:54122889_TC_AT:54122889:2,21,0,2
chr2	54122895	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=112,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:54122889_TC_AT:54122889:2,21,0,2
chr2	54122956	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	54126936	.	C	CAGAGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=134,153;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGAGCA;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,2:6,0:7,0,2,0
chr2	54126963	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,153;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr2	54133867	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:1,9,2,0
chr2	54135429	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr2	54146387	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.479:15:2,0:1,1:2,6,1,6
chr2	54147487	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=94,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,0:17,3:16,11,1,2
chr2	54148003	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:0|1:54148003_C_T:54148003:10,2,1,1
chr2	54148014	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:54148003_C_T:54148003:8,3,1,1
chr2	54148016	.	AA	TT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:6,2:0|1:54148003_C_T:54148003:9,3,1,1
chr2	54152927	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	54155240	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	54158957	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr2	54161885	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	54163854	.	G	GAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.217:23:7,1:10,0:16,2,5,0
chr2	54163989	.	A	AAACTT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:17,3:18,0:0|1:54163989_A_AAACTT:54163989:12,23,0,3
chr2	54163993	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,3:18,0:0|1:54163989_A_AAACTT:54163989:12,23,0,3
chr2	54164031	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:1,5:4,3:0,5,2,6
chr2	54176185	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,0,2
chr2	54365877	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=113,280;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:27,0:23,4:26,24,0,4
chr2	54365899	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=127,280;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:19,0:13,4:20,12,0,4
chr2	54365976	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:1,2:0,7,0,2
chr2	54482703	.	GGGGCCC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCCC;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,2:1,0:3,2,0,2
chr2	54482929	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr2	54482964	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:4,6:3,5:7,1,7,4
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:1,6:0,14:0,1,4,16
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,7:0,0,11,11
chr2	54494448	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:4,8,7,2
chr2	54608883	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0|1:54839276_A_G:54839276:0,0,17,12
chr2	54839284	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=111,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:38,5:0.133:43:15,5:21,0:1|0:54839276_A_G:54839276:23,15,5,0
chr2	54845117	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=111,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	54849634	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.243:27:9,0:11,6:6,15,0,6
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr2	54855454	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=189,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,2:2,5:0,3,0,7
chr2	54857020	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=48,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,1:4,1:3,3,2,0
chr2	54858131	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,0:10,4:10,10,0,4
chr2	54858154	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,4:3,5:5,5,6,3
chr2	54876369	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:2,12,0,2
chr2	54876792	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,108;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:9,0:22,3:21,10,0,3
chr2	54882381	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,1:10,3:2,12,0,4
chr2	54884944	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:4,3:8,2,2,1
chr2	54894649	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:6,7:3,5:8,1,10,3
chr2	54952381	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.482:10:4,0:1,3:0,5,0,5
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=240,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	55086884	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:55086884_G_A:55086884:0,3,1,0
chr2	55086888	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55086884_G_A:55086884:0,3,1,0
chr2	55086893	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55086884_G_A:55086884:0,3,1,0
chr2	55091029	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.201:21:8,1:9,2:7,10,2,2
chr2	55094115	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr2	55119757	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,4:3,12:5,5,5,11
chr2	55138272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:0,2,0,6
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=150,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr2	55155957	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	55176112	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=144,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.499:28:5,7:9,7:6,8,8,6
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr2	55187297	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	55194103	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:14,2,1,1
chr2	55197094	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:2,8:7,0:8,2,8,0
chr2	55200800	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=161,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:7,3:4,7,2,2
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,11,8
chr2	55214815	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=94,157;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.096:71:28,0:37,6:28,37,0,6
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0|1:55214912_C_G:55214912:0,0,0,4
chr2	55214923	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:55214912_C_G:55214912:0,3,0,1
chr2	55404925	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,2:1,2:0,3,0,4
chr2	55407754	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	55408869	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,0:10,2:2,11,0,2
chr2	55408907	.	T	TAGCAAGGACTACAGCCGTGCGCCACCATGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	55408958	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=292,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55408958_T_A:55408958:0,1,0,1
chr2	55408960	.	TGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=292,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55408958_T_A:55408958:0,1,0,1
chr2	55408969	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=292,129;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55408958_T_A:55408958:0,1,0,1
chr2	55436488	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.707:11:0,3:3,5:2,1,7,1
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,7,24
chr2	55463726	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr2	55463755	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:13,8,2,0
chr2	55464474	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=118,75;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.271:35:15,0:11,9:11,15,1,8
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr2	55473371	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	55473417	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,4:12,0:14,4,4,0
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	55479748	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.156:43:23,0:13,6:20,17,0,6
chr2	55491077	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=268,274;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55491077_A_C:55491077:0,1,0,1
chr2	55491079	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=268,274;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55491077_A_C:55491077:0,1,0,1
chr2	55491085	.	G	GTGACTGATATAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=268,274;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55491077_A_C:55491077:0,1,0,1
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	55522961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=182,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0|1:55522961_G_A:55522961:1,2,1,1
chr2	55522963	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=182,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:55522961_G_A:55522961:1,2,1,1
chr2	55523308	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,0:0|1:55523308_C_CAAA:55523308:0,0,2,2
chr2	55523309	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:55523308_C_CAAA:55523308:0,0,2,2
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	55528431	.	A	AATTAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:5,2:1,6,2,2
chr2	55536491	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr2	55559651	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=90,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:1,1,1,0
chr2	55561620	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:15,0:3,2:8,10,1,1
chr2	55566531	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=209,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:4,0,3,0
chr2	55571720	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	55582635	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=280,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	55582668	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55582668_C_T:55582668:2,1,1,0
chr2	55582677	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:55582668_C_T:55582668:3,1,1,0
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:11,0,2,0
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,19:0,0,22,20
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=79.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr2	55765882	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25,25,24;MFRL=119,98,160,69;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,8,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.20,5.70,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,2,4,4:0.132,0.221,0.188:20:5,0,0,1:0,1,2,1:5,5,3,7
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,15,8
chr2	55771203	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,88;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:10,11,0,4
chr2	55792259	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55792259_T_C:55792259:0,1,0,1
chr2	55792261	.	A	ATTACTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55792259_T_C:55792259:0,1,0,1
chr2	55800992	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	55805563	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=254,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55805563_G_C:55805563:0,1,0,1
chr2	55805567	.	G	GCATGACTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=254,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55805563_G_C:55805563:0,1,0,1
chr2	55805572	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=254,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55805563_G_C:55805563:0,1,0,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr2	55863360	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=75,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.723:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr2	55863535	.	A	AGCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:55863535_A_AGCC:55863535:3,6,1,1
chr2	55863537	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:55863535_A_AGCC:55863535:3,6,1,1
chr2	55873301	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,15,8
chr2	55894243	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,3:5,9:0|1:55894243_G_A:55894243:1,5,4,8
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,5:0,13:0|1:55894243_G_A:55894243:0,0,5,15
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr2	55900283	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	56145121	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:0|1:56145121_C_T:56145121:8,11,2,1
chr2	56145151	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:5,0:10,1:0|1:56145121_C_T:56145121:4,12,1,1
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:11,4,2,1
chr2	56149496	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,1:8,2:12,8,1,2
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	56603127	.	G	GTGTTAGTGAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=86,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0|1:56603127_G_GTGTTAGTGAA:56603127:2,4,1,1
chr2	56603128	.	C	CATTGTGTTTACTCCGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.285:8:3,2:3,0:0|1:56603127_G_GTGTTAGTGAA:56603127:2,4,1,1
chr2	58276170	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:0,7,0,5
chr2	58373601	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:6,8,0,2
chr2	58387000	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	58388696	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,13,14
chr2	58390538	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=93,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.553:34:9,10:5,6:0|1:58390538_T_C:58390538:11,4,16,3
chr2	58390547	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=92,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,25:0.603:41:8,15:7,9:0|1:58390538_T_C:58390538:11,5,16,9
chr2	58390679	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.246:22:7,5:10,0:5,12,2,3
chr2	58390690	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.125:21:12,0:7,2:6,13,0,2
chr2	58390710	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.169:15:10,0:3,2:2,11,0,2
chr2	58431168	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	58431410	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr2	58453930	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=91,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,35:0.707:49:4,17:10,18:7,7,12,23
chr2	58453956	.	A	ATTCACTTGGGCCTAC	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:12,1:21,2:12,21,0,3
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=228,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	59504636	.	C	CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.789:6:0,4:0,1:0,1,5,0
chr2	59504776	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,4:0,13:0,0,3,15
chr2	60679788	.	GGT	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,2:6,0:0|1:60679788_GGT_G:60679788:9,13,1,1
chr2	60679805	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,2:5,0:0|1:60679788_GGT_G:60679788:8,14,1,1
chr2	60688394	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=170,7134395;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:2,3,2,0
chr2	60688625	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:2,2:5,2,0,2
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=137.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,14:0,31:0,0,33,12
chr2	60983669	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=111,97;MMQ=60,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:18,2:8,0:0|1:60983669_G_A:60983669:21,5,0,2
chr2	60983671	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=111,97;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,2:8,0:0|1:60983669_G_A:60983669:21,5,0,2
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=81,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:3,2,3,2
chr2	61009110	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:7,11,1,2
chr2	61009814	.	AA	TT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=89,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.280:27:9,3:7,1:0|1:61009814_AA_TT:61009814:5,14,8,0
chr2	61009819	.	AGG	TTT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=89,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.136:37:15,2:10,0:0|1:61009814_AA_TT:61009814:10,22,5,0
chr2	61009823	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=89,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.087:35:11,0:15,0:0|1:61009814_AA_TT:61009814:10,22,3,0
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,51:0.649:79:16,21:9,30:10,18,11,40
chr2	61009938	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.138:38:11,4:12,1:3,30,1,4
chr2	61014036	.	A	AC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:11,8:9,0:15,5,10,0
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:1,3,0,5
chr2	61022215	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=170,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,0:0,2:0,6,1,1
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,8:0,0,17,6
chr2	61143976	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	61145498	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,1:2,1:5,3,0,2
chr2	61233648	.	AGCATGCACTTCACATACAGTTTTAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:0,0:5,2:9,3,1,1
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,11:0,0,13,11
chr2	61236187	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61236187_G_A:61236187:0,1,0,1
chr2	61236188	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61236187_G_A:61236187:0,1,0,1
chr2	61236192	.	T	TCCAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61236187_G_A:61236187:0,1,0,1
chr2	61236193	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61236187_G_A:61236187:0,1,0,1
chr2	61236198	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61236187_G_A:61236187:0,1,0,1
chr2	61300556	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:5,0:2,3:8,1,3,0
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,6,3
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	61308569	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31,25,31;MFRL=103,165,146,190;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,15,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.74,7.90,5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,6,4:0.144,0.270,0.214:21:7,3,4,2:1,0,1,0:7,1,10,3
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chr2	61333731	.	TATA	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=97,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:10,2:20,0:0|1:61333731_TATA_T:61333731:16,15,1,1
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chr2	61385047	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,202;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,0:17,3:12,14,3,0
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chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr2	61413037	.	TATTA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.523:23:9,8:2,4:4,7,5,7
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,11,3
chr2	61420140	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.496:28:8,7:6,6:3,11,5,9
chr2	61456194	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=179,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:0,0:0|1:61456194_A_C:61456194:0,3,0,1
chr2	61456196	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=179,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:61456194_A_C:61456194:0,3,0,1
chr2	61456197	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=179,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:61456194_A_C:61456194:0,3,0,1
chr2	61456230	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	61456611	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.788:20:0,4:2,9:2,3,2,13
chr2	61456624	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.217:39:8,3:22,4:5,26,1,7
chr2	61468761	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:5,5:1,6:3,3,1,10
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chr2	61484556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	61510405	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:10,0:15,7:9,16,0,7
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chr2	61538615	.	G	GAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=176,129;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,8;RU=A;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.453:9:3,1:2,2:1|0:61538602_G_GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA:61538602:5,0,4,0
chr2	61542060	.	CC	TT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:21,0:25,2:23,24,1,1
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chr2	61552411	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.391:10:2,2:5,1:6,1,3,0
chr2	61552412	.	AAAAAAAAAAAAAAACTGCAGAAATCAGAAGCAAAAGTAAATTTAGTTCTTCCAATAGTCAAAACAGATTTTT	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,11:0.055:66:3,1:2,4:30,25,8,3
chr2	61552484	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,30:0,20:0,0,25,25
chr2	61566824	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:0,0:1,1:1,5,1,5
chr2	61576101	.	C	CATTCGATGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr2	61577665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,1,1
chr2	61607510	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:4,3:4,0:1,7,1,2
chr2	61622374	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.247:21:7,3:7,1:4,12,1,4
chr2	61709735	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	61710033	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:12,0,2,0
chr2	61715975	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	61726050	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.193:27:5,1:16,4:9,13,2,3
chr2	61729258	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,9,12
chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,9,13
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,12,2
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,12:0,0,10,7
chr2	61760823	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,160;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,3:3,0:0|1:61760823_A_T:61760823:6,1,3,0
chr2	61760828	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=144,160;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:0|1:61760823_A_T:61760823:9,2,3,0
chr2	62063093	.	TAA	T,TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,25,23;MFRL=122,125,102;MMQ=60,60,60;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=14.71,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,11,7:0.430,0.301:24:1,7,3:3,4,4:2,4,12,6
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.583:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr2	62067127	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:5,7,2,0
chr2	62069528	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:1,6,1,3
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	62104242	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr2	62104660	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.512:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,13,4
chr2	62110551	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=89,158,191;MMQ=60,60,50;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.03,5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.261,0.322:9:0,0,0:1,2,2:1,3,4,1
chr2	62112221	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:62112221_G_GA:62112221:0,0,2,4
chr2	62112222	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:62112221_G_GA:62112221:0,0,2,4
chr2	62133046	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	62450732	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.126:40:16,4:17,1:22,13,3,2
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr2	63175544	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:6,0:12,4:6,12,2,2
chr2	63182611	.	G	GT,GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27,31;MFRL=0,129,205;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=18.01,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,2:0.695,0.230:10:0,6,1:0,2,1:0,0,7,3
chr2	63220885	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	63540324	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	63605430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr2	63631889	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	63667099	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,0:1,9:0,5,0,9
chr2	63719887	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	63719993	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,14:0.288:50:24,0:12,14:23,13,0,14
chr2	63822733	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:0|1:63822733_C_CA:63822733:0,3,1,1
chr2	63822734	.	T	TGGACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:63822733_C_CA:63822733:0,3,1,1
chr2	63832011	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:1,7,0,2
chr2	64069277	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=98,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr2	64111152	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=114,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,0:7,4:9,11,2,2
chr2	64112768	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:7,0:11,5,3,1
chr2	64126765	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr2	64139681	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,152;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=73.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.572:47:11,27:9,0:14,6,27,0
chr2	64139831	.	TA	T,TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=14,25,27;MFRL=130,153,111;MMQ=60,60,60;MPOS=28,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=13.37,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,2:0.442,0.184:13:1,2,1:0,2,1:0,5,0,8
chr2	64140301	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,19,4
chr2	64195997	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=89,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.564:11:4,2:1,2:3,2,4,2
chr2	64202180	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,1:5,2:5,10,2,2
chr2	64210979	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.412:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr2	64323351	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:16,0:12,4:12,16,1,3
chr2	64331815	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=125,118,132;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.71,10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,8:0.226,0.457:18:5,3,4:1,1,3:5,1,11,1
chr2	64682364	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=210,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr2	64780630	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=327,193;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64780630_C_T:64780630:0,1,0,1
chr2	64780632	.	G	GCTATTTTCATCTTTCTTAAATTGATAAGGTCACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=327,193;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64780630_C_T:64780630:0,1,0,1
chr2	64794945	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr2	64796847	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr2	64796932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	64812726	.	A	ACTTGCTTCTAGAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=202,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	65216743	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:12,4,4,0
chr2	65216886	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	65231245	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	65245147	.	CAT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,4:6,7:13,1,9,2
chr2	65315880	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	65315903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	65325255	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=214,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65325255_G_GTA:65325255:0,1,0,1
chr2	65325257	.	C	CTTTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=214,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65325255_G_GTA:65325255:0,1,0,1
chr2	65356930	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:4,0:0|1:65356930_G_C:65356930:7,4,2,0
chr2	65356933	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:3,0:0|1:65356930_G_C:65356930:7,4,2,0
chr2	65473930	.	AAAATTTTC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr2	65540997	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=210,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr2	65659048	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.236:15:2,0:1,1:0|1:65659048_A_C:65659048:9,3,3,0
chr2	65659050	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.223:16:4,0:3,0:0|1:65659048_A_C:65659048:9,4,3,0
chr2	65659058	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:3,0:0|1:65659048_A_C:65659048:9,5,2,0
chr2	65659066	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:3,0:0|1:65659048_A_C:65659048:11,5,2,0
chr2	66662907	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=86,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,12:0.260:43:13,1:16,0:0|1:66662907_A_G:66662907:7,24,12,0
chr2	66662912	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=84,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.186:41:14,1:16,0:0|1:66662907_A_G:66662907:8,26,7,0
chr2	66662916	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=105,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,7:0.152:51:16,2:19,0:0|1:66662916_A_T:66662916:10,34,7,0
chr2	66662920	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,7:0.139:56:21,5:21,1:0|1:66662916_A_T:66662916:11,38,7,0
chr2	66662924	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=101,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,5:0.106:55:24,0:23,0:0|1:66662907_A_G:66662907:12,38,5,0
chr2	66664933	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:12,1:12,12,1,1
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	66667186	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	66688941	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=112,67;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:15,6:12,0:18,9,5,1
chr2	66795889	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:17,2:12,0:0|1:66795889_G_A:66795889:10,20,1,1
chr2	66795893	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=81,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,2:11,0:0|1:66795889_G_A:66795889:10,20,1,1
chr2	66798524	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=102,293;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:9,0:12,6:9,12,0,6
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,4:0,0,8,11
chr2	68269960	.	CGGGGGGGG	CGG,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27,33;MFRL=151,90,125;MMQ=60,60,60;MPOS=2,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,13,11;RU=G;STR;TLOD=10.35,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.542,0.251:6:0,0,1:0,3,0:1,0,5,0
chr2	68269974	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.604:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr2	68270258	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	68273280	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:0,10,0,3
chr2	68358329	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=123,0;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,4:9,0:13,2,1,3
chr2	68358339	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=105,0;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:14,0:14,10,0,2
chr2	68358341	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.505:27:5,7:8,7:6,7,8,6
chr2	68368959	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:0|1:68368959_T_A:68368959:3,18,1,1
chr2	68368967	.	A	ACCCAAAGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:0|1:68368959_T_A:68368959:2,17,1,1
chr2	68374715	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:4,7,1,2
chr2	68389276	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:5,1:1,2:5,1,2,1
chr2	68389518	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:7,19,1,1
chr2	68389557	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:0,1:2,4,1,1
chr2	68402012	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	68415563	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=54,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:2,1:6,2:8,1,3,0
chr2	68444143	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,23,23;MFRL=111,124,135;MMQ=60,59,60;MPOS=8,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=4.28,6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,4:0.103,0.190:23:7,1,1:8,1,3:15,2,5,1
chr2	68444171	.	C	G,CGCAG	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=29,30,30;MFRL=104,193,115;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.33,12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,3,6:0.127,0.235:50:12,1,2:23,2,4:22,19,9,0
chr2	68511506	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=280,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr2	68511663	.	G	GTAACTTTTGCACTCAAAGCAAAATGTATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:8,10:9,0:7,11,3,7
chr2	68620463	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:1,2:9,1:0,10,0,3
chr2	68622914	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=98,95;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.365:39:13,7:12,7:10,15,6,8
chr2	68772281	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	68882806	.	CAGAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=247,264;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:6,2,1,2
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:2,6,1,6
chr2	69046164	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	69049398	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr2	69177269	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:3,10:0,5:2,1,14,1
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:0|1:69201894_C_T:69201894:1,8,0,5
chr2	69201916	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:69201894_C_T:69201894:0,4,0,1
chr2	69201918	.	A	AGAGTTCCCAGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:69201894_C_T:69201894:0,4,0,1
chr2	69240635	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,140;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,10:3,0:5,0,10,0
chr2	69298854	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:11,5:9,1:12,8,4,2
chr2	69300087	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:0|1:69300087_G_C:69300087:8,2,4,1
chr2	69300088	.	GGAC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:0|1:69300087_G_C:69300087:8,2,4,1
chr2	69300093	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:0|1:69300087_G_C:69300087:8,2,3,1
chr2	69304523	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.250:38:14,9:14,0:23,6,9,0
chr2	69304719	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	69317925	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chr2	69318129	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:69318129_T_G:69318129:1,2,0,1
chr2	69318142	.	A	AACCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69318129_T_G:69318129:1,0,0,1
chr2	69330118	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=192,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,3:4,1:1,7,1,3
chr2	69351617	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	69397522	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:69397522_T_A:69397522:1,3,0,1
chr2	69397523	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:69397522_T_A:69397522:1,3,0,1
chr2	69397526	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:69397522_T_A:69397522:1,3,0,1
chr2	69399647	.	AA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69399647_AA_TC:69399647:0,0,0,1
chr2	69399651	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69399647_AA_TC:69399647:0,0,0,1
chr2	69399655	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69399647_AA_TC:69399647:0,0,0,1
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr2	69409696	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:18,3:15,0:11,22,0,3
chr2	69475343	.	G	GT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.192:35:13,4:13,3:13,15,3,4
chr2	69565563	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.216:26:17,2:4,3:13,8,3,2
chr2	69573029	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:12,1:5,4:7,11,4,1
chr2	69586293	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	69642513	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,262;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:5,4:0,0:1,5,1,4
chr2	69703140	.	AA	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	69704045	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:15,0:14,6:12,18,0,6
chr2	69708091	.	TTTCTTTCGTAACAGAGCATTAAGAAGAGGAAAGGGTAAGGGAAAGGGAGTCAGAAGTTTCTTTAGGAAATTCTGTGAAGCTTTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.211:31:7,7:5,4:2,17,0,12
chr2	69736568	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,0:17,2:0|1:69736568_G_T:69736568:17,14,1,1
chr2	69736572	.	T	TTTCTGTCTCTCTCTGTCTGCCTCTCTCTTTCTCTATC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=125,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.080:36:14,0:18,2:0|1:69736568_G_T:69736568:18,16,1,1
chr2	69741753	.	CTGT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.558:21:7,6:2,6:6,3,10,2
chr2	70033437	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,3:3,0:4,0,2,2
chr2	70043262	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,7:0.156:49:24,7:18,0:0|1:70043262_G_A:70043262:21,21,7,0
chr2	70043265	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=135,59;MMQ=60,43;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:43,4:0.099:47:29,0:13,4:1|0:70043262_G_A:70043262:26,17,0,4
chr2	70076933	.	C	CTGA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,1:3,1:0|1:70076933_C_CTGA:70076933:1,14,0,2
chr2	70076935	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:5,0:0|1:70076933_C_CTGA:70076933:1,14,0,2
chr2	70122125	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.297:22:9,6:4,0:16,0,6,0
chr2	70130459	.	T	TTTATTGTTTTTCTTCAGGGTAAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr2	70131320	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	70142564	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:16,2:5,0:7,17,0,2
chr2	70188936	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:8,1:0|1:70188936_A_C:70188936:10,11,1,1
chr2	70188942	.	C	CAGTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:9,0:12,2:0|1:70188936_A_C:70188936:12,13,1,1
chr2	70189331	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=16,20,20;MFRL=137,94,113;MMQ=60,60,60;MPOS=26,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=AC;STR;TLOD=11.88,14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,7:0.445,0.347:22:1,3,3:0,6,1:1,3,6,12
chr2	70189370	.	A	ACACAC	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:12,4:16,0:7,22,0,4
chr2	70377680	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=140,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:70377680_A_C:70377680:5,8,1,1
chr2	70377686	.	G	GTCTTAGTGTTTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:0|1:70377680_A_C:70377680:5,7,1,1
chr2	70392622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,0:7,5:6,4,2,3
chr2	70456452	.	TAA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.140:27:6,0:11,3:4,19,3,1
chr2	70463168	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.241:11:4,1:3,1:9,0,2,0
chr2	70463393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=176,248;MMQ=48,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	70475513	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,162847366;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:4,1,1,1
chr2	70475542	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=193,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr2	70486768	.	GA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70486772	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70486776	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70486779	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70486786	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70486788	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=236,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70486768_GA_TG:70486768:0,1,0,1
chr2	70503936	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,4:13,0:17,11,3,1
chr2	70524437	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=128,170;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:20,0:9,2:0|1:70524437_A_G:70524437:21,9,2,0
chr2	70524444	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=131,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:11,2:0|1:70524437_A_G:70524437:21,11,2,0
chr2	70524451	.	CA	TG	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=131,160;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:20,1:12,2:0|1:70524437_A_G:70524437:20,12,3,0
chr2	70524477	.	GG	CA	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=145,160;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,1:9,2:11,12,3,0
chr2	70524508	.	A	ACAGC	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=149,143;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:11,3:6,0:0|1:70524508_A_ACAGC:70524508:6,12,3,0
chr2	70524511	.	ACTGT	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=145,143;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,3:7,0:0|1:70524508_A_ACAGC:70524508:6,13,3,0
chr2	70524576	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:15,5:10,2:12,13,1,6
chr2	70680302	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:10,3,6,1
chr2	70741999	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=87,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.684:39:5,14:7,13:5,7,13,14
chr2	70900543	.	C	CATTACCCTTCCCAGCCTCTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=85,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:70901785_A_G:70901785:2,3,1,4
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=85,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:70901785_A_G:70901785:2,3,1,4
chr2	70905099	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	70906115	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:10,5:8,2:7,11,1,6
chr2	70915134	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:9,1:5,5:12,2,4,2
chr2	71004368	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,11:0,0,15,0
chr2	71004413	.	C	CA,CAA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=17,17,26;MFRL=0,98,118;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,18;RU=A;STR;TLOD=8.85,14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,10,14:0.347,0.462:31:1,2,0:1,1,4:1,6,5,19
chr2	71004586	.	T	TCAACACCGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,2:7,3:0,16,1,4
chr2	71043178	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:0|1:71043178_C_T:71043178:16,8,1,1
chr2	71043185	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:11,2:0|1:71043178_C_T:71043178:11,9,1,1
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=113.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,10:0,23:0,0,17,16
chr2	71159835	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	71159854	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=69,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,0:2,3,2,0
chr2	71160222	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:5,4,3,2
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	71163051	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=45,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:3,6,5,0
chr2	71163086	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr2	71163111	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:5,1:7,2:9,4,2,2
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr2	71185391	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:5,4,7,1
chr2	71185581	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	71206205	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71206205_T_TGC:71206205:1,0,1,0
chr2	71206210	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:71206205_T_TGC:71206205:1,0,1,0
chr2	71206214	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:71206205_T_TGC:71206205:1,0,1,0
chr2	71209290	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71209290_C_CTT:71209290:0,3,0,1
chr2	71209291	.	C	CTGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71209290_C_CTT:71209290:0,3,0,1
chr2	71211397	.	CCCTAGGGCAGGGACTGTGTCTCCCATGTCAAGTTGGAGTCTCA	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=95,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.172:16:5,2:8,0:4,10,1,1
chr2	71211417	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=77,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:4,1:0,4:2,2,1,4
chr2	71212401	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,11;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:4,0:5,1:0|1:71212401_A_C:71212401:1,9,3,0
chr2	71212404	.	CTG	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:4,1:6,2:0|1:71212401_A_C:71212401:2,9,3,0
chr2	71212405	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,3:1,6:1,3,3,6
chr2	71215746	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=113,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,1:9,2:17,8,3,0
chr2	71215941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,4,1
chr2	71216246	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr2	71220793	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,4:5,3:4,5,5,2
chr2	71295898	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=63.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,0:10,21:0,19,0,21
chr2	71299057	.	A	AGAGGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=230,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	71303709	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:10,4,2,0
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=165,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:0|1:71360723_A_G:71360723:0,7,0,7
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,158;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:5,4:3,2:0|1:71360723_A_G:71360723:1,7,0,6
chr2	71376469	.	GC	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:19,0:20,8:23,18,0,8
chr2	71429687	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.472:21:3,4:8,5:4,7,4,6
chr2	71577330	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:71577330_T_TAA:71577330:0,1,0,1
chr2	71577333	.	T	TGGTAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71577330_T_TAA:71577330:0,1,0,1
chr2	71582785	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:10,2:18,9:20,8,11,0
chr2	71607539	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr2	71620484	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,2:9,1:15,4,1,2
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	71627539	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,11:0,3:0,0,14,0
chr2	71633474	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=210,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71633474_G_C:71633474:0,1,0,1
chr2	71633476	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=210,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71633474_G_C:71633474:0,1,0,1
chr2	71633477	.	C	CCTTGGCCCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=210,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71633474_G_C:71633474:0,1,0,1
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,9,11
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr2	71645890	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,17522880;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	71650846	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:20,0:23,2:0|1:71650846_C_T:71650846:18,26,1,1
chr2	71650849	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:20,0:21,2:0|1:71650846_C_T:71650846:18,25,1,1
chr2	71650855	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:20,0:22,1:0|1:71650846_C_T:71650846:15,29,1,1
chr2	71654076	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,72;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:7,6,4,1
chr2	71693943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	71707909	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=123,75;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:5,1,3,0
chr2	71709081	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=75,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:12,6:4,0:8,8,6,0
chr2	71738987	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:6,3:0,0:2,4,2,1
chr2	71742736	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=77,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:8,4:12,3:11,9,6,1
chr2	71744232	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:71744232_TG_T:71744232:1,3,1,1
chr2	71744235	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:71744232_TG_T:71744232:1,3,1,1
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr2	71747428	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.416:3:2,1:0,0:0|1:71747428_G_A:71747428:0,2,0,1
chr2	71747432	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.533:2:1,1:0,0:0|1:71747428_G_A:71747428:0,1,0,1
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=73,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,6,1
chr2	71753487	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.374:15:5,2:4,0:0,9,1,5
chr2	71755380	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr2	71762176	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,2:8,1:11,11,1,2
chr2	71762232	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=72,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:5,6:2,7:3,4,10,3
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:5,2:2,6:3,4,2,7
chr2	71776366	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	71776626	.	G	GAAGACAGGAATAGCAGGGGACAGGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr2	71778888	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:71778888_G_T:71778888:0,4,1,0
chr2	71778890	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:71778888_G_T:71778888:0,4,1,0
chr2	71778893	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:71778893_G_GA:71778893:1,3,0,1
chr2	71778897	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:71778893_G_GA:71778893:1,3,0,1
chr2	71780215	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,15,9
chr2	71795490	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,1:1,0:1,3,0,1
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	71797501	.	G	GTTCTAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0|1:71797501_G_GTTCTAA:71797501:1,3,1,1
chr2	71797502	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:71797501_G_GTTCTAA:71797501:1,3,1,1
chr2	71797760	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,6:9,0:8,10,4,2
chr2	71825677	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,4:5,0:9,4,4,1
chr2	71825707	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=90,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:4,6:0,6:2,2,7,5
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr2	71883347	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,3:14,0:10,14,1,2
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,4:0,10:0,0,11,3
chr2	71892492	.	C	CTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:71892492_C_CTCT:71892492:0,2,0,1
chr2	71892493	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:71892492_C_CTCT:71892492:0,2,0,1
chr2	71896785	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:19,7:14,1:26,7,8,0
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr2	71901512	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71901512_G_A:71901512:0,1,0,1
chr2	71901518	.	G	GTTGCAGCTCTTATAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71901512_G_A:71901512:0,1,0,1
chr2	71901520	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,0:1,1:0|1:71901512_G_A:71901512:0,1,0,1
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	72359312	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,4,3
chr2	72371274	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:18,5:7,0:12,13,5,0
chr2	72374983	.	A	ATTGTGGTCAGATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:72374983_A_ATTGTGGTCAGATG:72374983:0,1,1,1
chr2	72374988	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:72374983_A_ATTGTGGTCAGATG:72374983:0,1,1,1
chr2	72607011	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0,6,1,1
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr2	72725742	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=131,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:72725742_T_TCA:72725742:1,1,0,1
chr2	72725746	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=131,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:72725742_T_TCA:72725742:1,1,0,1
chr2	72725748	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=131,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:72725742_T_TCA:72725742:1,1,0,1
chr2	72725752	.	C	CTTAAAACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,33;MFRL=131,247;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:72725742_T_TCA:72725742:1,1,0,1
chr2	72725757	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=161,247;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:72725742_T_TCA:72725742:1,2,0,1
chr2	72741728	.	TAAATAA	T,TATAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,25,25;MFRL=118,137,111;MMQ=40,42,40;MPOS=30,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,6:0.143,0.463:13:4,1,3:1,1,3:5,0,8,0
chr2	72741732	.	TAA	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=155,107;MMQ=48,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.321:15:6,3:4,2:10,0,5,0
chr2	72741734	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=161,150;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.763:19:3,6:2,8:5,0,13,1
chr2	72742083	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32,32;MFRL=100,172,154;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=AC;STR;TLOD=5.02,14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.272,0.555:8:1,1,3:0,1,2:1,0,7,0
chr2	72802777	.	C	CAA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:10,0:12,2:0|1:72802777_C_CAA:72802777:13,12,1,1
chr2	72802786	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,1:0|1:72802777_C_CAA:72802777:12,11,1,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr2	72958236	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.220:21:6,1:10,2:6,11,2,2
chr2	72968531	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,2:9,1:10,13,2,1
chr2	73118740	.	A	AATAAGTCCTGGGTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:73118740_A_AATAAGTCCTGGGTCC:73118740:0,1,0,1
chr2	73118744	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73118740_A_AATAAGTCCTGGGTCC:73118740:0,1,0,1
chr2	73144142	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.118:48:17,0:26,5:0|1:73144142_C_T:73144142:25,18,0,5
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chr2	73188315	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,2,0
chr2	73195490	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:73195490_T_G:73195490:0,1,1,0
chr2	73195492	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=193,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:0,0:0|1:73195490_T_G:73195490:1,1,1,0
chr2	73200594	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=109,55;MMQ=60,20;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,0:6,4:10,8,0,4
chr2	73215562	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr2	73226259	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	73285752	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:4,0,1,6
chr2	73285832	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,183;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73285832_G_C:73285832:0,2,0,1
chr2	73285834	.	C	CCCAACATAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=148,183;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73285832_G_C:73285832:0,2,0,1
chr2	73302625	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:9,2,5,0
chr2	73302891	.	G	GGCCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=93,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCCT;STR;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:1,3,0,9
chr2	73315143	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr2	73315173	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:73315173_C_T:73315173:11,5,1,1
chr2	73315178	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:73315173_C_T:73315173:12,5,1,1
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	73437956	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=112,190;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:12,0:0|1:73437956_G_T:73437956:8,9,2,0
chr2	73437960	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=112,190;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:13,0:0|1:73437956_G_T:73437956:8,10,2,0
chr2	73445945	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=147,12205552;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:73445945_C_T:73445945:3,1,0,1
chr2	73445953	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=74,12205552;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73445945_C_T:73445945:2,1,0,1
chr2	73450061	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,150;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,8:2,0:6,0,8,0
chr2	73452155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	73452167	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr2	73466984	.	T	TGGGTCTTG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,3:4,2:0|1:73466984_T_TGGGTCTTG:73466984:0,10,3,2
chr2	73466989	.	C	CAGATCCTTCAGGAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,60;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0|1:73466984_T_TGGGTCTTG:73466984:0,10,0,2
chr2	73466991	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=146,60;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0|1:73466984_T_TGGGTCTTG:73466984:0,10,0,2
chr2	73471193	.	GTT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:3,1:5,1:3,7,0,2
chr2	73471850	.	C	CCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:5,12,0,2
chr2	73474997	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:12,4,1,1
chr2	73477645	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=171,105;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	73477653	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,105;MMQ=60,53;MPOS=-4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	73490503	.	G	GCCCTGGGCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=175,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:73490503_G_GCCCTGGGCGC:73490503:0,1,1,1
chr2	73490506	.	G	GCTGCAGAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=175,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:73490503_G_GCCCTGGGCGC:73490503:0,1,1,1
chr2	73491683	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,5:0,0,2,7
chr2	73493494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=305,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	73518802	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=99,108;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:6,0:10,6:6,10,0,6
chr2	73518813	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=93,108;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:4,0:11,6:5,10,0,6
chr2	73650122	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,24;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:1,2,0,5
chr2	73650180	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:73650180_GG_AA:73650180:0,2,0,1
chr2	73650186	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:73650180_GG_AA:73650180:0,2,0,1
chr2	73650188	.	TTTGAGG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:73650180_GG_AA:73650180:0,2,0,1
chr2	73650200	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:73650180_GG_AA:73650180:0,2,0,1
chr2	73650202	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:73650180_GG_AA:73650180:0,2,0,1
chr2	73651668	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,0:13,3:13,11,1,2
chr2	73675227	.	T	TCTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:1,7:4,4:3,2,8,5
chr2	73777497	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,0:5,10:7,4,10,0
chr2	73828310	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,7:3,2:3,0,9,0
chr2	73836618	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chr2	73927689	.	G	GAGAGGAAGAAGCACATGGGGGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=195,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:6,0,1,1
chr2	73927931	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:6,2:9,6:7,9,2,6
chr2	73928366	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,8:4,4:3,5,3,9
chr2	73957124	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:7,14:3,10:2,8,10,14
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	73996567	.	C	CAACTTAGCTTCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=244,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	74040687	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.426:17:7,7:2,0:8,2,7,0
chr2	74058087	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.124:37:11,4:22,0:19,14,2,2
chr2	74058206	.	CT	TA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,205;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:9,0:13,12:13,11,0,12
chr2	74087290	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:3,3:4,10:3,4,4,10
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,6:0,17:0,0,16,8
chr2	74128660	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	74129389	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	74143990	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	74273383	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:4,3:9,3,4,1
chr2	74274204	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=85,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.151:51:31,0:12,7:20,24,0,7
chr2	74275459	.	CCTGGACACACCCACCAAGAGTCTG	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,0:11,2:22,11,1,1
chr2	74326314	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	74327453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=71,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr2	74394177	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:13,2:8,0:0|1:74394177_G_A:74394177:8,13,1,1
chr2	74394179	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:74394177_G_A:74394177:8,13,1,1
chr2	74394199	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=121,123;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,0:5,4:4,9,0,4
chr2	74433094	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=192,154;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr2	74439055	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr2	74459863	.	C	CAAACTAGGCTGGGCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=255,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	74482892	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,5:3,3:5,4,5,3
chr2	74513113	.	A	AGTTGGTTTATAGTGTCAGTGGGCTAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	74531832	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=86,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:1,3:7,3:3,5,2,5
chr2	74594811	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr2	74596700	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74601343	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr2	74601370	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,0:0,0:0,1,2,0
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,13;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:74601371_G_GCCCCCCCC:74601371:0,2,1,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74601371_G_GCCCCCCCC:74601371:0,2,1,0
chr2	74601499	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=88,99;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:18,0:19,4:20,17,0,4
chr2	74601505	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.124:37:16,4:17,0:15,18,2,2
chr2	74642499	.	CAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:74642499_CAGG_C:74642499:3,4,2,0
chr2	74642504	.	GCCTCCTCCA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=159,72;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:74642499_CAGG_C:74642499:4,5,2,0
chr2	74643444	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=988,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	74649921	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.818:14:1,5:1,5:1,2,5,6
chr2	74650049	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:27,4:11,1:14,25,0,5
chr2	74653534	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,0:6,9:9,2,0,9
chr2	74655660	.	C	CCTCTTAGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr2	74656968	.	T	TTC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=112,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:12,2:0|1:74656968_T_TTC:74656968:10,11,0,2
chr2	74656969	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=112,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:0|1:74656968_T_TTC:74656968:10,11,0,2
chr2	74666762	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=99,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.349:38:7,6:17,7:10,15,7,6
chr2	74668949	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=122,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,2:5,0:0|1:74668949_C_T:74668949:4,8,2,0
chr2	74668972	.	AGT	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:6,2:5,0:0|1:74668949_C_T:74668949:2,10,2,0
chr2	74668977	.	G	GAC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:74668949_C_T:74668949:2,11,2,0
chr2	74668980	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=155,82;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:74668949_C_T:74668949:2,10,2,0
chr2	74690033	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.608:14:3,5:2,4:3,2,3,6
chr2	74710254	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:12,3:29,0:19,23,3,0
chr2	74710361	.	G	GTGGTCTGGCAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:74710361_G_GTGGTCTGGCAC:74710361:7,12,0,2
chr2	74710364	.	G	GACTCACAATATGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:74710361_G_GTGGTCTGGCAC:74710361:7,12,0,2
chr2	74717123	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74717123_G_C:74717123:0,0,1,0
chr2	74717126	.	TC	AA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74717123_G_C:74717123:0,0,1,0
chr2	74717131	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74717123_G_C:74717123:0,0,1,0
chr2	74717136	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74717123_G_C:74717123:2,0,1,0
chr2	74717141	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=21,31;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74717123_G_C:74717123:2,0,1,0
chr2	74717146	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=93,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0|1:74717123_G_C:74717123:3,0,1,0
chr2	74720002	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	74720215	.	ACCGAAG	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=83,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:14,0:16,2:17,18,1,1
chr2	74720229	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.136:33:9,0:14,2:11,17,4,1
chr2	74730062	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,1,4
chr2	74733834	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,8:5,9:7,5,13,5
chr2	74741965	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=137,30;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,1:7,0:0|1:74741965_T_A:74741965:12,8,0,2
chr2	74741967	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=137,30;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:74741965_T_A:74741965:12,8,0,2
chr2	74745686	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=97,14;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:7,0:20,4:9,18,4,0
chr2	74746852	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=105,155;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,6:2,6,0,6
chr2	74747107	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.204:22:7,2:11,2:9,9,2,2
chr2	74782045	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:0,8,0,4
chr2	74785899	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=111,91;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:7,4:13,0:10,10,4,0
chr2	74842290	.	CG	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.131:20:8,0:10,2:0|1:74842290_CG_C:74842290:5,13,1,1
chr2	74842295	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:74842290_CG_C:74842290:5,14,1,1
chr2	74842299	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:74842290_CG_C:74842290:5,14,1,1
chr2	74883613	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=84.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,28:0.829:33:2,28:3,0:5,0,28,0
chr2	74883631	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=83.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,28:0.783:35:3,26:4,0:5,2,28,0
chr2	74884786	.	GTTGA	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:0|1:74884786_GTTGA_G:74884786:10,13,0,2
chr2	74884793	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,1:13,0:0|1:74884786_GTTGA_G:74884786:10,13,0,2
chr2	74884798	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:10,2:0|1:74884798_G_C:74884798:8,14,1,1
chr2	74884805	.	C	CTGGGTTGGTT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:74884798_G_C:74884798:7,15,1,1
chr2	74900588	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,5:2,7:4,1,7,6
chr2	74901602	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:3,1,5,3
chr2	74902872	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.721:30:2,12:6,10:3,5,8,14
chr2	74907416	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=229,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74907416_G_C:74907416:1,2,0,1
chr2	74907418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=229,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74907416_G_C:74907416:1,2,0,1
chr2	75061873	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr2	75104329	.	GCTGGTGAGGCTTATC	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=109,192;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:24,3:13,0:20,23,0,3
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr2	75107528	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,71;MMQ=60,28;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,2:8,0:9,14,2,0
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:2,4,5,3
chr2	75185852	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:7,4:9,0:14,3,4,0
chr2	75186558	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=98,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:11,0:23,5:15,19,0,5
chr2	75276783	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,255;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,1,0
chr2	75347618	.	GGAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAA;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:9,0,2,0
chr2	75347775	.	G	GCTGCTATAGTCTAGCTCAAGGGTTGGCAAT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,185;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.142:17:10,0:5,2:10,5,0,2
chr2	75720372	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.633:20:7,7:0,5:7,0,11,2
chr2	75720568	.	CGCTGTCGCT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCTGTCGCT;STR;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.550:20:6,6:3,5:4,5,4,7
chr2	75874390	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:2,6,1,3
chr2	75879728	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=137,172;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,0:15,3:17,13,0,3
chr2	75882385	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,1:11,2:13,13,1,2
chr2	75938062	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	77745747	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,2,0
chr2	79253979	.	TG	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=163,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:2,0:3,7,1,1
chr2	79254316	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,46;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:79254316_C_T:79254316:3,6,1,1
chr2	79254322	.	G	GAGGTTATCGTC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,46;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:79254316_C_T:79254316:3,6,1,1
chr2	79254355	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=0,140;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79254355_CA_TC:79254355:1,0,0,1
chr2	79254360	.	C	CTCCTTGGTCTTCTCCTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79254355_CA_TC:79254355:0,0,0,1
chr2	79255426	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr2	79313975	.	TAGTAGC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,65;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:7,2:8,9,1,1
chr2	79314004	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=99,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:12,0:6,4:11,7,2,2
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=67,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	79314633	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=95,13512346;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:16,2:4,0:13,8,1,1
chr2	79347982	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:5,0:10,3:7,8,1,2
chr2	79348089	.	C	CCAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:1,1:0,0:0|1:79348089_C_CCAAG:79348089:0,1,0,1
chr2	79348090	.	T	TCAGCATTCTCGTTCTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:79348089_C_CCAAG:79348089:0,1,0,1
chr2	79348092	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79348089_C_CCAAG:79348089:0,1,0,1
chr2	79385673	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79385673_G_GAA:79385673:0,1,0,1
chr2	79385675	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79385673_G_GAA:79385673:0,1,0,1
chr2	79385678	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:79385673_G_GAA:79385673:0,1,0,1
chr2	79385933	.	G	GTTT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:79385933_G_GTTT:79385933:1,2,0,1
chr2	79385934	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,0:1,2,0,1
chr2	79385935	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:79385933_G_GTTT:79385933:1,2,0,1
chr2	79385936	.	G	GTTGTTCCCCA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:79385933_G_GTTT:79385933:1,2,0,1
chr2	79385939	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:79385933_G_GTTT:79385933:1,2,0,1
chr2	79385944	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=23938,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:79385933_G_GTTT:79385933:1,1,0,1
chr2	79385950	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=47769,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr2	79878664	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:5,1:2,2:6,1,4,0
chr2	79914570	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	80101515	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0,3,0,2
chr2	80531042	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=114,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:8,0:0|1:80531042_A_T:80531042:7,7,0,2
chr2	80531044	.	G	GTCTTGTGTCTGCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=114,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:0|1:80531042_A_T:80531042:7,7,0,2
chr2	80540600	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr2	80540829	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80540829_G_A:80540829:0,3,0,1
chr2	80540831	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80540829_G_A:80540829:0,3,0,1
chr2	80540863	.	A	ACAGAAACACAAGAAGGATGCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	80555593	.	G	GTCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80555593_G_GTCTT:80555593:0,1,0,1
chr2	80555595	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80555593_G_GTCTT:80555593:0,1,0,1
chr2	80620235	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=223,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	80809027	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr2	81421230	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,14,14
chr2	81421257	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:11,3:9,15,0,3
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr2	84676886	.	TAAAA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=81,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.818:11:1,1:2,6:3,0,0,8
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	84784780	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=28,37;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr2	84806553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	84816015	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.210:26:7,4:14,1:13,8,1,4
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:1,5,0,2
chr2	84848719	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:84848719_C_T:84848719:3,10,1,1
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chr2	84852011	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:5,2,5,2
chr2	84852228	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,1,2
chr2	84896587	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,0:6,2:0|1:84896587_G_A:84896587:8,11,1,1
chr2	84896594	.	AGC	GAT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:84896587_G_A:84896587:8,14,1,1
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr2	84897501	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:7,4:19,4:9,17,4,4
chr2	84897517	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,11,13
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chr2	84932720	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,6:2,3:5,2,5,4
chr2	84950006	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	84955090	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	85011776	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	85012014	.	C	CTGTGACCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr2	85014460	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr2	85023554	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,5:5,8,2,5
chr2	85039563	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,5:6,8:5,3,7,6
chr2	85046402	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:2,3:4,4:3,3,5,2
chr2	85051122	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:6,3,4,1
chr2	85059227	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:5,7,4,3
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	85262919	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85262919_T_G:85262919:0,1,0,1
chr2	85262920	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85262919_T_G:85262919:0,1,0,1
chr2	85361101	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr2	85550124	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,6:0.091:76:52,1:16,5:24,46,2,4
chr2	85550126	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.051:77:49,1:20,2:25,49,1,2
chr2	85550131	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=128,186;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.089:60:39,1:15,4:12,43,1,4
chr2	85550139	.	TG	CA	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=137,123;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.074:50:35,0:11,3:5,42,0,3
chr2	85550162	.	AT	GC	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=23,28;MFRL=150,135;MMQ=40,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:18,4:2,0:0,20,0,4
chr2	85550193	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=179,187;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr2	85550203	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=179,187;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr2	85550218	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=172,196;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr2	85554080	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:17,7:13,5:18,14,6,6
chr2	85554271	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,5:0.084:69:21,3:36,2:0|1:85554271_T_C:85554271:39,25,3,2
chr2	85554274	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,5:0.084:69:19,2:33,2:0|1:85554271_T_C:85554271:39,25,3,2
chr2	85554278	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=145,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,5:0.080:73:17,3:35,2:0|1:85554271_T_C:85554271:41,27,3,2
chr2	85554281	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,5:0.079:74:27,3:31,2:0|1:85554271_T_C:85554271:42,27,3,2
chr2	85554287	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=142,49;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:25,1:36,1:0|1:85554271_T_C:85554271:40,24,1,2
chr2	85554438	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,5:0.074:79:35,2:28,3:0|1:85554438_T_C:85554438:37,37,2,3
chr2	85554440	.	TGCCA	T	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,5:0.074:79:39,2:32,3:0|1:85554438_T_C:85554438:37,37,2,3
chr2	85554446	.	T	TTGGA	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,5:0.078:75:37,2:28,3:0|1:85554438_T_C:85554438:34,36,2,3
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=85,154;MMQ=34,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.691:14:3,6:1,3:1,3,1,9
chr2	85571327	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,106;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:6,0:17,3:9,14,0,3
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,12,6
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr2	85573299	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr2	85576451	.	GTC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	85617266	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=96,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:15,4:11,0:14,12,2,2
chr2	85622059	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,25:0,11:0,0,18,18
chr2	85625166	.	CAGAGCCCGT	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.115:41:13,2:18,2:0|1:85625166_CAGAGCCCGT_C:85625166:21,16,2,2
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chr2	85625846	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:8,4:13,0:8,13,2,2
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,12,6
chr2	85662139	.	CCCCCACCCCA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=CCCCA;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,0:6,2:0,13,0,2
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,10:0,4:1,0,6,8
chr2	85766545	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.358:38:14,7:10,3:5,19,2,12
chr2	85768937	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:14,0:18,4:20,12,0,4
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr2	85769711	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.365:61:27,10:12,12:19,20,15,7
chr2	85769975	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=155,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,1,2
chr2	85770726	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=136,144;MMQ=37,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:9,1,5,0
chr2	85777270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:1,8,0,3
chr2	85778881	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,0;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,3:13,0:16,6,0,3
chr2	85779781	.	T	TCCAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:85779781_T_TCCAGG:85779781:1,1,0,1
chr2	85779784	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:85779781_T_TCCAGG:85779781:1,1,0,1
chr2	85779785	.	G	GGTGATCCTCCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,1:0,0:0|1:85779781_T_TCCAGG:85779781:1,1,0,1
chr2	85781318	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,18:0,36:0,0,36,18
chr2	85781418	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=102,64901429;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.086:32:9,1:21,1:10,20,1,1
chr2	85788401	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=84,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.482:31:7,6:9,8:4,12,6,9
chr2	85829010	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,8:0.135:64:23,8:32,0:32,24,8,0
chr2	85836167	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,3:13,0:0|1:85836167_A_C:85836167:12,15,1,2
chr2	85836171	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:11,3:11,0:0|1:85836167_A_C:85836167:11,15,1,2
chr2	85836746	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,0:5,1:2,4,1,1
chr2	85848747	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29,30,34;MFRL=0,151,90,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,19,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.31,5.46,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,3,3:0.231,0.357,0.342:8:0,1,0,0:0,1,2,2:0,0,0,8
chr2	85866594	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=230,201;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85866594_CA_TG:85866594:0,1,0,1
chr2	85866599	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=341,201;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:85866594_CA_TG:85866594:0,2,0,1
chr2	85866607	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=341,201;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:85866594_CA_TG:85866594:0,2,0,1
chr2	85889093	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,4:6,0:14,2,4,0
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chr2	85892988	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr2	85894373	.	C	CGAAGCTCAATTCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	85895338	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr2	85923339	.	A	AGGGTCTCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	85924729	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,12,16
chr2	85924899	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	85925730	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:9,8,1,1
chr2	85925749	.	C	CAGGATCATACAGCTGGTAAGA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,1,1
chr2	85925756	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0,0,5,6
chr2	86079998	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,88;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,3:16,0:9,18,3,0
chr2	86258610	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:5,1:4,3:6,3,2,2
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=72,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:0,3:4,6:1,3,3,7
chr2	86259443	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=57,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:4,10:5,7:5,4,6,13
chr2	86270395	.	C	CAAAAGTTATGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:86270395_C_CAAAAGTTATGAG:86270395:0,1,0,1
chr2	86270399	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86270395_C_CAAAAGTTATGAG:86270395:0,1,0,1
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	86304934	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0,0,3,7
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr2	86315741	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr2	86325954	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=215,29597761;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0,2,0,2
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,10,6
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr2	86334414	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,0:5,3:13,0,1,2
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr2	86346117	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=125,112;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:17,0:11,3:8,20,0,3
chr2	86353100	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=156,162;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	86353107	.	CT	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,173;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	86354982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,0:3,2:5,1,3,0
chr2	86357730	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=118,158;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,2:8,0:9,4,2,0
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	86360225	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr2	86378459	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:14,8:11,0:12,13,8,0
chr2	86385668	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.633:17:1,5:3,6:0|1:86385668_T_C:86385668:5,1,10,1
chr2	86385682	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,15:0.545:27:4,8:7,7:0|1:86385668_T_C:86385668:8,4,14,1
chr2	86385728	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.379:32:12,6:7,5:13,7,6,6
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.928:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	86398291	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,4:2,0,9,2
chr2	86400703	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,178;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.651:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	86400824	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=80,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:8,7:6,5:3,12,7,5
chr2	86408385	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=68,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:5,3,4,3
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.438:46:11,11:10,9:0|1:86422416_T_C:86422416:14,12,9,11
chr2	86422421	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.438:46:14,11:9,9:0|1:86422416_T_C:86422416:13,13,9,11
chr2	86434387	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.114:40:12,4:24,0:13,23,3,1
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:1,5:9,2:8,2,6,1
chr2	86479258	.	T	TGATCCTCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=193,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86479258_T_TGATCCTCG:86479258:0,2,0,1
chr2	86479261	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=193,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:86479258_T_TGATCCTCG:86479258:0,2,0,1
chr2	86479287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	86481835	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,134;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,4:4,1:6,2,3,2
chr2	86491242	.	C	CACTATGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:8,3:9,8:13,5,4,7
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=107,18;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:3,5:9,0:5,7,2,3
chr2	86564658	.	C	CAACATGGTGAAACCCCGTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr2	86683817	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,5:3,0:7,3,5,0
chr2	86683901	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=101,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,33:0.726:45:7,23:5,10:9,3,20,13
chr2	86697391	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=112,77;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.180:46:10,7:28,0:14,24,7,1
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr2	86707515	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=200,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:86707515_T_TC:86707515:1,3,1,1
chr2	86707516	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=200,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:86707515_T_TC:86707515:1,3,1,1
chr2	86709623	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=117,144;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,0:13,3:12,13,0,3
chr2	86712820	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:3,6:1,8:4,0,12,2
chr2	86716676	.	ACG	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.108:34:15,0:14,2:0|1:86716676_ACG_A:86716676:13,18,0,3
chr2	86716680	.	ACTC	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.105:35:15,0:12,3:0|1:86716676_ACG_A:86716676:14,18,0,3
chr2	86716685	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:13,0:10,3:0|1:86716685_C_A:86716685:13,18,0,3
chr2	86716688	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,0:13,3:0|1:86716685_C_A:86716685:10,18,0,3
chr2	86716691	.	AGCGATTTATTG	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.097:38:14,0:11,3:0|1:86716685_C_A:86716685:14,21,0,3
chr2	86716705	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:15,0:14,3:0|1:86716685_C_A:86716685:12,17,0,3
chr2	86717927	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,6,0
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chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:7,3,6,0
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	88422677	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:4,13,0,2
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0|1:88474370_A_G:88474370:0,0,6,11
chr2	88474373	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:6,5:7,0:0|1:88474370_A_G:88474370:3,10,3,2
chr2	88474942	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.300:34:12,0:12,9:8,16,0,10
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chr2	88485079	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=89.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,23:0.522:44:11,23:10,0:0|1:88485077_G_A:88485077:17,4,23,0
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr2	88751751	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	88825204	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,30:0.739:40:5,14:5,16:6,4,18,12
chr2	88828733	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,22:0.370:59:16,18:20,1:17,20,22,0
chr2	88874915	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88874915_T_A:88874915:0,1,0,1
chr2	88874919	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88874915_T_A:88874915:0,1,0,1
chr2	88874922	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:88874915_T_A:88874915:0,1,0,1
chr2	88882942	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=193,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,2:7,3:6,3,3,2
chr2	88888226	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:9,7,1,1
chr2	88890162	.	CAGTAGTTATATAGTTCCAACCCATAAAATACCATTTAAAATCACAAATTTATAAAAGCACAGAGAACAAGCTGAGAGCCCCAAGT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:2,1:11,4,1,1
chr2	89160990	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,103;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:15,4,3,0
chr2	89196834	.	CAG	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=80,42;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,0:15,2:0|1:89196834_CAG_C:89196834:11,16,1,1
chr2	89196846	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=89,42;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:16,2:0|1:89196834_CAG_C:89196834:10,16,1,1
chr2	89292337	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=89,107583;MMQ=60,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:7,15,3,0
chr2	89309411	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=128.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,48:0.831:57:4,45:5,0:5,4,48,0
chr2	89309693	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=113,117;MMQ=52,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,2:9,1:12,5,0,3
chr2	89326955	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,133;MMQ=40,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,0,2
chr2	89327275	.	A	AGGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=193,60;MMQ=27,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr2	89339696	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=145,144;MMQ=27,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr2	89339720	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=144,96;MMQ=27,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr2	89340106	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=169,222;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89340106_T_TG:89340106:0,1,0,1
chr2	89340108	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,30;MFRL=169,222;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89340106_T_TG:89340106:0,1,0,1
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chr2	89521289	.	GGA	CCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89521284_G_GTC:89521284:0,0,0,1
chr2	89568174	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,58;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:0|1:89568174_T_C:89568174:8,8,1,1
chr2	89568179	.	T	TAGTGTCCTGGCTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=102,58;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:89568174_T_C:89568174:8,8,1,1
chr2	89975758	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=210,198;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr2	90060768	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=167,175;MMQ=27,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90060768_A_G:90060768:2,0,1,0
chr2	90060781	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,175;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:90060768_A_G:90060768:2,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,1:9,4:10,7,1,4
chr2	90139397	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,289804;MMQ=55,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:10,0:1,6:3,8,6,0
chr2	90139433	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=108,289804;MMQ=58,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,0:3,6:6,5,6,0
chr2	90154203	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,132;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:1,2,1,4
chr2	90193417	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=113,158;MMQ=27,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0|1:90193417_A_G:90193417:1,0,5,2
chr2	90193429	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=113,158;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0|1:90193417_A_G:90193417:1,0,5,2
chr2	90193503	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=117,126;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,1,6
chr2	90211808	.	TC	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=80,130;MMQ=60,28;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,1:5,3,3,1
chr2	90211909	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=137,413459;MMQ=50,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:7,15,0,2
chr2	90229198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:8,3:6,3,1,2
chr2	90229260	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,5:2,6:3,4,4,7
chr2	90229301	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=143,928205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:8,8,0,4
chr2	90259965	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=123,91;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,5:4,6:4,5,6,5
chr2	95537245	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	95539286	.	AT	GG	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=118,57;MMQ=60,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:0|1:95539286_AT_GG:95539286:6,7,1,1
chr2	95539291	.	GG	TC	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=118,57;MMQ=60,29;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:3,1:0|1:95539286_AT_GG:95539286:7,8,1,1
chr2	95539297	.	G	GCCTGGATAACAA	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=64,57;MMQ=60,29;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:95539286_AT_GG:95539286:7,8,1,1
chr2	95539307	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=82,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:8,2:2,4:6,4,3,3
chr2	95539334	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:8,2:7,4:0|1:95539334_C_T:95539334:9,6,3,3
chr2	95539342	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=99,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:7,2:0|1:95539334_C_T:95539334:6,6,1,2
chr2	95540540	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=135,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:95540540_C_T:95540540:6,3,1,1
chr2	95540543	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=135,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,1:0|1:95540540_C_T:95540540:6,3,1,1
chr2	95540572	.	TG	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
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chr2	95541428	.	G	GCATCACTTCCT	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=129,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:0|1:95541425_C_CTAGTA:95541425:8,13,1,1
chr2	95541432	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,1:11,0:0|1:95541425_C_CTAGTA:95541425:6,15,1,1
chr2	95541442	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=137,140;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,1:11,1:0|1:95541442_C_T:95541442:6,10,0,2
chr2	95541447	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=145,140;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:0|1:95541442_C_T:95541442:5,10,0,2
chr2	95541465	.	TGCC	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=169,140;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,1:8,1:0|1:95541465_TGCC_T:95541465:3,10,0,2
chr2	95541471	.	G	GGCA	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=169,140;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:7,1:0|1:95541465_TGCC_T:95541465:3,10,0,2
chr2	95541473	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=28,27;MFRL=145,140;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,1:7,1:0|1:95541465_TGCC_T:95541465:3,8,0,2
chr2	95542340	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=153,130;MMQ=60,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,1,0
chr2	95542363	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=132,75;MMQ=60,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.498:16:4,8:4,0:6,2,4,4
chr2	95542376	.	GC	TT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=99,75;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:7,10:7,0:8,6,5,5
chr2	95542416	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=110,75;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,12:6,1:8,8,7,6
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=110,75;MMQ=60,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,9:6,1:8,8,7,6
chr2	95766553	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:1,2:1,2:2,1,4,0
chr2	95815306	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,6:2,6:3,1,4,8
chr2	95815453	.	GGGCTTTTCTCCAGTATGAGTTCTTTGATGTTTAATAAGGGATGAAATATGACCAAAGGCTCTTCCACAGTCACTGCATTCATAC	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.062:48:13,0:9,2:17,29,1,1
chr2	95818477	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:4,11,0,2
chr2	95841876	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr2	95846073	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,0:0,7:0,4,0,7
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=76.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,10,9
chr2	95942136	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=177,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,0:1,2:1,4,2,0
chr2	95944632	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.754:12:0,4:1,5:3,0,6,3
chr2	95944902	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr2	95950680	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=122,30793;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.113:29:9,2:17,0:12,14,0,3
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.936:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr2	95963242	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	95976043	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,0:1,8:3,0,9,0
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr2	96040698	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=209,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:96040698_C_T:96040698:4,4,1,1
chr2	96040700	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=209,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:96040698_C_T:96040698:4,4,1,1
chr2	96040701	.	G	GACTGCTTCTCA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=209,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:96040698_C_T:96040698:4,4,1,1
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	96698185	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	96780716	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,6:0,0,8,6
chr2	96781411	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.659:7:1,1:1,2:1,1,0,5
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	96932049	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr2	96933112	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,6:1,7:5,1,6,7
chr2	96943462	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:1,4,4,0
chr2	96949066	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=91,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:96949066_A_T:96949066:6,13,1,1
chr2	96949073	.	TC	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:5,2:0|1:96949066_A_T:96949066:4,14,1,1
chr2	96949078	.	G	GTGGCTTTTGCTGAT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:96949066_A_T:96949066:4,10,1,1
chr2	96949384	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:9,0:11,5,1,1
chr2	96952283	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr2	97019150	.	T	TGGCCCTAAATG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,2:3,0:0|1:97019150_T_TGGCCCTAAATG:97019150:3,11,1,1
chr2	97019152	.	G	GTTATGAAAAATCTTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,2:3,0:0|1:97019150_T_TGGCCCTAAATG:97019150:3,11,1,1
chr2	97020178	.	TTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTCTAATTAAAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	97034779	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=109,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.143:27:11,0:11,2:11,12,1,3
chr2	97215077	.	GGGAGCGGGAGGA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:7,2:22,0:16,21,1,1
chr2	97267966	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=94,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:9,8,3,0
chr2	97278133	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:13,5:6,0:4,15,6,0
chr2	97326075	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:9,9,1,1
chr2	97334925	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	97350229	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=86,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,3:1,0:2,5,0,3
chr2	97355498	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:3,10,1,1
chr2	97364398	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:2,4,2,0
chr2	97364933	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,0:0,4:0,2,0,5
chr2	97366303	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	97368175	.	A	ACCCATGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr2	97377557	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,4:8,0:0|1:97377557_G_C:97377557:11,9,4,0
chr2	97377562	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.184:25:11,4:9,0:0|1:97377557_G_C:97377557:12,9,4,0
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chr2	97494013	.	GC	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:97494007_CT_C:97494007:0,3,0,1
chr2	97494936	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0|1:97494936_G_C:97494936:0,1,0,3
chr2	97494939	.	TTG	ACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:97494936_G_C:97494936:0,1,0,3
chr2	97494945	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:97494936_G_C:97494936:0,1,0,3
chr2	97494947	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:97494936_G_C:97494936:0,1,0,3
chr2	97494949	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:97494936_G_C:97494936:0,1,0,2
chr2	97526963	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:6,4:0,0:3,4,2,2
chr2	97529958	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=119,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:4,2,1,1
chr2	97532214	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,3:13,0:4,14,1,2
chr2	97568453	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=57,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:19,2:12,3:20,11,1,4
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr2	97613616	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=70,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,48:0.945:50:2,18:0,29:1,1,29,19
chr2	97613647	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=96,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.136:28:8,1:8,2:9,16,0,3
chr2	97617140	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0,0,17,13
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,18:0,24:0,0,10,32
chr2	97749417	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=192,98;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr2	97751832	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,103;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:5,2,5,2
chr2	97752054	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=65780268,253;MMQ=53,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	97757285	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,72;MMQ=27,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:6,3:5,0:6,5,1,2
chr2	97757347	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=126,138;MMQ=27,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:7,4,3,1
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=19,29;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:0,2:0,4:0,1,1,5
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,22,0
chr2	98128183	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=151,153;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:13,4:9,2:21,1,6,0
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=133.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,27,3
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=20,26;MFRL=121,163;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:11,2:10,3:14,7,4,1
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,12
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,12
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=23,29;MFRL=172,166;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:0,8,0,6
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=168,192;MMQ=27,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,8:1,3:0,3,0,11
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=149,158;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:1,3:0|1:98128515_C_T:98128515:3,0,4,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=149,158;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:98128515_C_T:98128515:3,0,4,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=149,156;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=141,172;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:1,6:0,3,0,8
chr2	98129924	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,202;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr2	98139994	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98139994_C_A:98139994:0,0,0,1
chr2	98139996	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98139994_C_A:98139994:0,0,0,1
chr2	98139997	.	A	ATCAACAACTACACCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98139994_C_A:98139994:0,0,0,1
chr2	98148910	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=136,114;MMQ=25,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.596:3:1,0:0,2:0|1:98148910_C_T:98148910:1,0,1,1
chr2	98148913	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=136,114;MMQ=25,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.596:3:1,0:0,0:0|1:98148910_C_T:98148910:1,0,1,1
chr2	98148923	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=136,114;MMQ=25,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98148923_C_A:98148923:1,0,0,1
chr2	98148925	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=136,114;MMQ=25,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98148923_C_A:98148923:1,0,0,1
chr2	98148960	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=185,114;MMQ=26,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	98162104	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	98164084	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=120,183;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,1:3,3:5,2,5,0
chr2	98169519	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=261,315336;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	98169544	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,315336;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	98169742	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,157;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,4:8,6:6,5,7,3
chr2	98169901	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=228,176;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	98171409	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=31,23;MFRL=175,186;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	98171424	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=169,163;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,1:2,3:0|1:98171424_T_A:98171424:6,0,4,0
chr2	98171434	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=23,33;MFRL=166,138;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:98171424_T_A:98171424:6,1,2,0
chr2	98171437	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=23,32;MFRL=166,138;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:98171424_T_A:98171424:6,1,2,0
chr2	98171443	.	C	CCG	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=166,138;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0|1:98171424_T_A:98171424:6,1,2,0
chr2	98171459	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=26,34;MFRL=166,93;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:6,1,6,0
chr2	98171480	.	T	TAA	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=24,26;MFRL=109,84;MMQ=50,27;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=81.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,20:0.656:30:7,13:3,5:0|1:98171480_T_TAA:98171480:8,2,17,3
chr2	98171482	.	TCTG	T	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=23,26;MFRL=109,84;MMQ=50,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,20:0.656:30:7,15:3,5:0|1:98171480_T_TAA:98171480:8,2,17,3
chr2	98171488	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=30,26;MFRL=111,84;MMQ=50,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=80.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,20:0.618:32:7,14:3,5:0|1:98171480_T_TAA:98171480:9,3,17,3
chr2	98171493	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=111,84;MMQ=50,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=80.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,20:0.618:32:7,15:3,5:0|1:98171480_T_TAA:98171480:9,3,17,3
chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,180;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,135;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,6:2,3:3,1,4,5
chr2	98196849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=219,159;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:0|1:98196849_G_A:98196849:3,0,4,2
chr2	98196859	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=219,168;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0|1:98196849_G_A:98196849:3,0,6,2
chr2	98206188	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=62,111;MMQ=53,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:3,6:0,6:2,1,5,7
chr2	98264467	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:18,4:21,0:25,15,4,0
chr2	98273290	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr2	98274527	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr2	98277090	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,2:9,4:3,9,2,4
chr2	98277184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr2	98341708	.	A	AGATGAGAAC	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.092:39:15,3:21,0:19,17,0,3
chr2	98341728	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.533:30:8,5:6,11:7,7,6,10
chr2	98351707	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=149,111;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:1,2:11,0:8,5,2,0
chr2	98373842	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:5,3:5,3:3,8,1,5
chr2	98376989	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	98388785	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.094:47:24,0:18,4:25,18,2,2
chr2	98392302	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=141,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,34:0.660:51:10,19:7,15:10,7,13,21
chr2	98411421	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:98411421_G_C:98411421:7,11,1,1
chr2	98411431	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:98411421_G_C:98411421:7,11,1,1
chr2	98411433	.	AGTTAG	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=146,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:5,2:0|1:98411421_G_C:98411421:8,12,1,1
chr2	98411440	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=138,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:4,2:0|1:98411421_G_C:98411421:6,11,1,1
chr2	98414015	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=106,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:2,6,1,2
chr2	98418812	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:1,1:3,0,5,0
chr2	98418876	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.475:24:4,7:9,4:7,6,6,5
chr2	98426068	.	TTACTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr2	98427633	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=84,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:12,5:4,4:10,6,5,4
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,14,11
chr2	98451036	.	TAA	T,TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,25,23;MFRL=157,162,137;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=12.98,13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,9,9:0.371,0.370:24:4,7,3:2,2,6:6,0,15,3
chr2	98460742	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=113,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.766:19:3,8:1,7:1,3,3,12
chr2	98475979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	98544058	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,6:2,3:0,2,0,9
chr2	98795792	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:7,4:9,5:5,11,3,6
chr2	98795812	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:4,9,0,2
chr2	98804519	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:8,0:9,4:9,8,2,2
chr2	98804667	.	CCCTTTTATTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:2,1:0,0:0|1:98804667_CCCTTTTATTT_C:98804667:0,2,0,1
chr2	98804679	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98804667_CCCTTTTATTT_C:98804667:0,0,0,1
chr2	98804683	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98804667_CCCTTTTATTT_C:98804667:0,0,0,1
chr2	98887116	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,20,33;MFRL=126,100,104;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.35,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,13,6:0.293,0.158:37:9,8,2:4,4,3:8,10,11,8
chr2	98916610	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=100,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:98916610_C_T:98916610:7,10,1,1
chr2	98916621	.	C	CAATA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:98916610_C_T:98916610:6,10,1,1
chr2	98916622	.	C	CTATGTTG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,0:7,2:0|1:98916610_C_T:98916610:6,10,1,1
chr2	98928494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	98928509	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=197,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	98948224	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,53;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,1,3
chr2	98949790	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,0:4,4:3,3,0,4
chr2	98994136	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:8,0:0|1:98994136_A_T:98994136:6,7,1,1
chr2	98994158	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:98994136_A_T:98994136:7,8,1,1
chr2	98994641	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=91,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:5,8:9,7:5,9,10,5
chr2	99155501	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=119,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:1,8,0,5
chr2	99160506	.	GCGCA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=51,138;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:2,0:0|1:99160506_GCGCA_G:99160506:0,6,0,2
chr2	99160508	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.888:6:0,4:0,2:1|0:99160506_GCGCA_G:99160506:0,0,0,6
chr2	99160512	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=51,138;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:2,0:0|1:99160506_GCGCA_G:99160506:0,6,0,2
chr2	99165422	.	GA	AT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:18,5:9,0:16,12,4,1
chr2	99165455	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.146:36:16,4:14,0:14,17,4,1
chr2	99181315	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,6:2,2:1,2,0,8
chr2	99226367	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.203:37:11,7:19,0:17,13,7,0
chr2	99234586	.	AT	A,ATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25,27;MFRL=157,138,114;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.12,5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.213,0.349:11:0,0,3:4,2,1:4,1,6,0
chr2	99237792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	99272802	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=88,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.678:29:4,14:5,6:6,3,11,9
chr2	99294851	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:11,7,1,1
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	99614595	.	CA	C,CAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30,30;MFRL=113,117,202;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.38,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.275,0.274:8:3,1,1:1,1,1:4,0,4,0
chr2	99637016	.	CACAAAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99637016_CACAAAAT_C:99637016:0,0,0,1
chr2	99637025	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99637016_CACAAAAT_C:99637016:0,0,0,1
chr2	99637029	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99637016_CACAAAAT_C:99637016:0,0,0,1
chr2	99637032	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99637016_CACAAAAT_C:99637016:0,0,0,1
chr2	99688436	.	T	TATCCCAGTGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	99695097	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr2	99721804	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.713:16:2,6:1,5:3,1,11,1
chr2	99722026	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=95,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:6,9,0,3
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,2:9,4:0,13,0,6
chr2	99778569	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,83;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,3:15,0:14,11,2,1
chr2	99779642	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=97,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.206:23:7,2:8,1:2,17,0,4
chr2	99779652	.	AAAC	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=94,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.134:25:10,0:11,3:2,20,0,3
chr2	99785905	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.264:31:11,0:12,7:14,9,0,8
chr2	99787084	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=103,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:8,2:10,0:0|1:99787084_A_G:99787084:12,8,1,1
chr2	99787089	.	T	TAACAGGCC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:8,2:13,0:0|1:99787084_A_G:99787084:12,9,1,1
chr2	99802596	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,4:12,0:13,3,4,0
chr2	99802806	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=164,98;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,0:2,2:0,13,0,2
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=185,175;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:8,4:1,0:0,9,0,4
chr2	99859863	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.610:13:1,4:3,4:3,2,3,5
chr2	99860058	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=240,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99860058_AT_GC:99860058:0,1,0,1
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chr2	100015124	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr2	100017906	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
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chr2	100021184	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
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chr2	100041443	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr2	100055859	.	A	AAGTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100055857_AC_TT:100055857:0,1,0,1
chr2	100058714	.	CA	C,CAAAAAAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,173,125;MMQ=60,40,40;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,23,31;RU=A;STR;TLOD=3.32,17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.251,0.675:9:0,0,0:0,2,4:0,0,6,3
chr2	100068069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
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chr2	100081461	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.146:30:12,2:13,2:7,19,0,4
chr2	100081532	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	100081561	.	A	AAAGTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=192,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:0,1,2,1
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,9:0,5:1,0,10,4
chr2	100182177	.	C	CCACCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100182177_C_CCACCCA:100182177:0,1,0,1
chr2	100182180	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100182177_C_CCACCCA:100182177:0,1,0,1
chr2	100182182	.	C	CTATCCACG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:100182177_C_CCACCCA:100182177:0,1,0,1
chr2	100209720	.	C	CCG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,13:5,0:7,6,13,0
chr2	100210613	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=118,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,1:10,1:10,18,2,0
chr2	100210713	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=107,131;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.183:34:14,5:14,0:17,11,0,6
chr2	100218080	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	100266007	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=101,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:6,1:11,4,1,1
chr2	100360586	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=107,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,4:10,0:14,9,0,4
chr2	100454038	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.244:6:2,0:3,1:0|1:100454038_A_C:100454038:1,4,0,1
chr2	100454044	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.244:6:2,0:3,1:0|1:100454038_A_C:100454038:1,4,0,1
chr2	100454045	.	A	AAAAAAGGTATT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.244:6:1,0:3,1:0|1:100454038_A_C:100454038:1,4,0,1
chr2	100454047	.	A	AATAAATGTTT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.244:6:1,0:3,1:0|1:100454038_A_C:100454038:1,4,0,1
chr2	100454072	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	100623992	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:100623992_C_A:100623992:0,1,0,1
chr2	100623996	.	T	TGAACTCCTTGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100623992_C_A:100623992:0,0,0,1
chr2	100912088	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=275,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100912088_T_TTA:100912088:0,1,0,1
chr2	100912089	.	G	GATGGGTAGGCGTTTGACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=275,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100912088_T_TTA:100912088:0,1,0,1
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	100916445	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=180,43;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	100917075	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=103,130;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr2	100917091	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=65,130;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,2:2,0:8,4,2,0
chr2	100917109	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=106,73;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:9,8:1,4:7,3,9,3
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:6,5:7,8:2,11,9,4
chr2	101033496	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:0|1:101033496_C_T:101033496:9,10,1,1
chr2	101033502	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:101033496_C_T:101033496:9,10,1,1
chr2	101033506	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=67,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:0|1:101033496_C_T:101033496:8,13,1,1
chr2	101033507	.	GCTGAA	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=86,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:12,0:0|1:101033496_C_T:101033496:8,14,1,1
chr2	101033515	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=67,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:0|1:101033496_C_T:101033496:7,12,1,1
chr2	101087035	.	A	AAGCTAAGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,1,1
chr2	101095733	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	101096834	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=93,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr2	101096860	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=93,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,5:3,3:2,1,7,1
chr2	101096903	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=150,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,7:3,2:3,1,3,7
chr2	101188373	.	C	CCTGTGTATGAGTGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,5:1,0:0,2,1,4
chr2	101521173	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20,30,27;MFRL=99,95,132,108;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,21,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.99,4.76,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,6,4,4:0.217,0.203,0.226:21:4,4,3,0:3,2,1,3:6,1,10,4
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=357,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,8:0,8:0,1,5,11
chr2	101564628	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,16,1
chr2	101592002	.	C	CTACCTTAGAATATCTGTGGAATCAGAATACT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.125:33:14,3:13,0:17,13,2,1
chr2	101604707	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,0:5,6:5,8,0,6
chr2	101612051	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr2	101612101	.	GCCACAGGAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:101612101_GCCACAGGAGA_G:101612101:1,0,0,1
chr2	101612114	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101612101_GCCACAGGAGA_G:101612101:1,0,0,1
chr2	101612118	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101612101_GCCACAGGAGA_G:101612101:1,0,0,1
chr2	101612120	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101612101_GCCACAGGAGA_G:101612101:1,0,0,1
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=119.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,14:0,20:0,0,6,31
chr2	101619291	.	C	CACCTCACCCTCATCCCAACCCGT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:13,2:13,0:2,26,0,2
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=424,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,8:0,7:0,1,2,13
chr2	101622696	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	101627343	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=79,138;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.679:12:2,2:2,4:3,1,5,3
chr2	101627852	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr2	101638888	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,10,14
chr2	101640141	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.137:48:13,6:29,0:21,21,3,3
chr2	101644789	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:7,7,1,1
chr2	101645856	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,85;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	101646144	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,7,12
chr2	101648854	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:6,8,2,1
chr2	101654931	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:8,1:9,4,1,1
chr2	101675808	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,25737281;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	101883046	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	101885656	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:10,3:11,0:14,7,0,3
chr2	101885694	.	TTG	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:14,1:13,1:14,13,1,1
chr2	101911385	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:4,2:3,3:4,3,5,0
chr2	101925026	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=254,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,14,7
chr2	101971754	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,5:6,0:9,6,5,0
chr2	102000210	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.918:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	102013928	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	102018878	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr2	102029548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	102031273	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=82,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,1:1,1:5,3,0,2
chr2	102031489	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	102033925	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=160,175;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:102033925_T_C:102033925:7,0,2,0
chr2	102033948	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=120,175;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:0|1:102033925_T_C:102033925:7,5,2,0
chr2	102083183	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:9,0,2,2
chr2	102083393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr2	102314437	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,6:1,4:3,0,10,0
chr2	102460740	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=98,48;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.070:54:33,3:16,0:0|1:102460740_G_A:102460740:24,27,3,0
chr2	102460773	.	GG	AA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=83,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:42,2:0.065:44:21,2:20,0:1|0:102460740_G_A:102460740:15,27,0,2
chr2	102480243	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=103,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:11,0:16,20:17,10,20,0
chr2	102503486	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=83,0;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:1,0:0|1:102503486_CAAA_C:102503486:1,2,1,0
chr2	102503508	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=83,0;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:2,0:0|1:102503486_CAAA_C:102503486:1,2,1,0
chr2	102632318	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=122,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.125:34:9,3:20,0:20,10,4,0
chr2	102632582	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	102785093	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=98,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:31,0:19,4:35,15,4,0
chr2	102785158	.	GT	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=144,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.433:32:8,7:10,7:6,12,4,10
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr2	102835454	.	GAT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,3:19,0:24,19,3,0
chr2	102851526	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.121:30:19,1:7,2:11,16,2,1
chr2	102851837	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=234,304;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr2	102955468	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,2:7,1:7,10,1,2
chr2	102957291	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=114,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:19,3:7,1:12,14,1,3
chr2	102958804	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:102958804_C_T:102958804:0,3,0,1
chr2	102958805	.	A	AGGGTTTTTATGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:102958804_C_T:102958804:0,3,0,1
chr2	102979028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	102984279	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr2	102988319	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:12,3:13,8:16,9,7,4
chr2	103011033	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:7,3:16,0:12,12,3,0
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:1,11,0,6
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:103040177_A_T:103040177:1,0,3,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:103040177_A_T:103040177:1,0,3,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=155.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,19:0,16:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,33,4
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=155.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,20:0,17:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,33,4
chr2	103040825	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:15,2:8,0:13,10,0,2
chr2	103040945	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=114,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr2	103057717	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,1:5,5:7,4,5,1
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	103095304	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:7,2:0|1:103095304_A_C:103095304:6,12,1,1
chr2	103095308	.	C	CTCTGGAGAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:103095304_A_C:103095304:7,12,1,1
chr2	103120039	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:14,2:22,0:0|1:103120039_G_GA:103120039:18,21,1,1
chr2	103120040	.	G	GAAGTGTCTGTTCAT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:17,2:22,0:0|1:103120039_G_GA:103120039:18,21,1,1
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,7:0,5:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,1,11
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,1,10
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=117.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,16:0,24:0,0,22,18
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,15:0,0,6,17
chr2	103149100	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,0,16
chr2	103274069	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=117,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:13,7:15,0:16,12,7,0
chr2	103300031	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	103324575	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	103343275	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,17;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,2:0,3:1,0,3,7
chr2	103378581	.	CTTT	C,CTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,31,31;MFRL=117,150,99;MMQ=60,60,60;MPOS=29,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,17;RU=T;STR;TLOD=3.12,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.232,0.470:4:0,0,0:0,1,2:0,1,3,0
chr2	103414271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=105,178;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:9,3:1,0:9,1,3,0
chr2	105472227	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	105472643	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=78,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:1,1,1,1
chr2	105473141	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=140,34;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:7,2:0|1:105473141_C_T:105473141:10,6,1,1
chr2	105473146	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=144,34;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:105473141_C_T:105473141:11,7,1,1
chr2	105473150	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,34;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:105473141_C_T:105473141:11,7,1,1
chr2	105473152	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=144,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:105473141_C_T:105473141:11,7,1,1
chr2	105473362	.	CG	AC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:0|1:105473362_CG_AC:105473362:9,8,1,1
chr2	105473365	.	C	CGAGAGGCGGAGCTGACAGTGA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:8,0:0|1:105473362_CG_AC:105473362:9,8,1,1
chr2	105665874	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	105713539	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=179,111;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr2	105713765	.	TC	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,2:14,0:7,19,0,3
chr2	105713766	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=114,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:7,16,0,3
chr2	105859249	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,3:8,2:4,8,2,3
chr2	105885961	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,3,8
chr2	105889502	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,0,2
chr2	105954140	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:10,8:4,5:7,7,9,4
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr2	105977842	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=106,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:14,1:17,11,0,2
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=90,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:5,5:7,6:7,5,6,5
chr2	105994564	.	C	CATCAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,5:3,5:0,6,6,6
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,4:8,1:3,7,1,4
chr2	106015201	.	CCCCACAGCTCAACTCCTTTCTCCCGGCTTCTCCCCGCACGGTTCGGGTCCCCTCTCCCAGTGGTCTTCCCGGA	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.074:40:2,0:4,2:25,12,2,1
chr2	106690542	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:0,2,3,5
chr2	106710553	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,3:19,0:16,24,2,1
chr2	106715342	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	106717493	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,2:4,9:7,2,4,7
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	106742177	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr2	106761607	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,1:5,2:7,3,1,2
chr2	106779993	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=99.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,9:0,0,15,8
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	107032279	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,173;MMQ=57,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:10,5:4,0:9,5,5,0
chr2	107073469	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=92,155;MMQ=39,23;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,1:8,10,2,1
chr2	107073647	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,203;MMQ=24,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=188,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	108475928	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,97;MMQ=49,22;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:9,3:11,2:10,11,3,2
chr2	108618540	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=231,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr2	108863752	.	ATGG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:9,2:12,0:14,7,0,2
chr2	108875192	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:10,0:0|1:108875192_G_GA:108875192:18,9,1,1
chr2	108875196	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:12,0:0|1:108875192_G_GA:108875192:16,11,1,1
chr2	108875198	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:11,0:0|1:108875192_G_GA:108875192:16,11,1,1
chr2	108875356	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=173,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:108875356_GTC_G:108875356:0,3,0,1
chr2	108875363	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=173,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:108875356_GTC_G:108875356:0,3,0,1
chr2	108881290	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,2:4,8:5,3,7,4
chr2	108881411	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:19,2:0|1:108881411_C_T:108881411:13,14,1,1
chr2	108881413	.	T	TACA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:7,0:19,2:0|1:108881411_C_T:108881411:13,14,1,1
chr2	108881415	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:19,2:0|1:108881411_C_T:108881411:13,14,1,1
chr2	108998803	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=111,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:7,9:13,0:19,1,9,0
chr2	108999483	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	109065858	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=223,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr2	109066234	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=174,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,1:0,1,0,4
chr2	109066241	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=236,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:109066241_T_TC:109066241:0,4,0,1
chr2	109066242	.	T	TCCCATGTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=236,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:109066241_T_TC:109066241:0,4,0,1
chr2	109069008	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr2	109085373	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.682:23:4,7:3,9:4,3,14,2
chr2	109085621	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,285;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,3:0,9,0,4
chr2	109087863	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=121,139;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:15,5:18,0:19,15,5,0
chr2	109089404	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,8:5,4:2,4,4,8
chr2	109092121	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=83,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.811:29:5,12:0,12:2,3,10,14
chr2	109098994	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=198,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,0:0,3:0,3,0,3
chr2	109099477	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	109099572	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,14,8
chr2	109103108	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=62,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,3:3,6:2,1,1,8
chr2	109103136	.	C	CAGGCTTTTCACAAACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	109123950	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=138,120;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,11:3,2:6,4,11,2
chr2	109123988	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,31,20,29;MFRL=120,117,98,113;MMQ=60,60,60,54;MPOS=18,19,8;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=18.30,11.59,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,11,11,4:0.295,0.309,0.140:34:3,6,5,1:4,5,4,3:5,3,15,11
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	109292979	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,136;MMQ=38,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr2	109294588	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=234,145;MMQ=52,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,0,6
chr2	109347720	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=193,222;MMQ=45,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	109365363	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,166;MMQ=41,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.117:38:20,0:14,4:20,14,3,1
chr2	109375034	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	109384297	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=323,233;MMQ=22,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:109384297_A_G:109384297:1,1,1,0
chr2	109384299	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=323,233;MMQ=22,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:109384297_A_G:109384297:1,1,1,0
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	109399185	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:12,1:18,3:9,21,1,3
chr2	109404474	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=100,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.148:32:16,3:9,1:23,5,3,1
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	109421324	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.178:37:16,6:13,0:15,15,3,4
chr2	109490104	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	109490146	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=266,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,8:1,7:1,0,12,7
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,52156963;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	109527373	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,15:0,16:0,0,13,18
chr2	109964329	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:12,3:14,2:11,15,0,5
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,286;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,2:2,0:0,4,0,3
chr2	110049113	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,11196766;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr2	110053248	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	110065896	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=78,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:11,3:16,1:15,12,0,4
chr2	110259305	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	110325590	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	110372942	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr2	110373110	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:11,12:9,0:8,12,0,12
chr2	110375333	.	TG	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:2,15,1,1
chr2	110375592	.	CAAAAA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=111,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.412:25:1,5:0,3:0,15,7,3
chr2	110552147	.	T	TCGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	110552150	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	110881454	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=87,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.170:37:25,5:6,0:15,16,5,1
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:5,2:7,1,6,2
chr2	110902204	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0|1:110905664_G_A:110905664:0,9,0,2
chr2	110905671	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:3,0:0|1:110905664_G_A:110905664:0,7,0,2
chr2	110919321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr2	110922064	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	110922703	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:10,7:21,4:10,21,5,6
chr2	110937303	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:110937303_A_C:110937303:0,2,0,1
chr2	110937308	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:110937303_A_C:110937303:0,2,0,1
chr2	110937310	.	C	CTTCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:110937303_A_C:110937303:0,2,0,1
chr2	111397237	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	111399154	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr2	111406724	.	TCA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CA;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr2	111416260	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:7,0:6,13,3,0
chr2	111435507	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.311:26:7,1:7,1:4,13,9,0
chr2	111435521	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.227:33:11,0:10,0:0|1:111435521_C_G:111435521:12,14,7,0
chr2	111435525	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:11,1:12,1:0|1:111435521_C_G:111435521:12,15,6,0
chr2	111435530	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.138:34:13,0:14,1:0|1:111435530_A_C:111435530:13,17,4,0
chr2	111435533	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:13,1:14,0:0|1:111435530_A_C:111435530:13,18,4,0
chr2	111435535	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=23,16;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:12,0:15,0:0|1:111435530_A_C:111435530:13,18,4,0
chr2	111542365	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,0:15,3:13,8,0,3
chr2	111721300	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=116,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,1:19,2:9,29,1,2
chr2	111744636	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,3:1,0:5,0,2,1
chr2	111753449	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,14,6
chr2	111806808	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,3:9,0:7,8,1,2
chr2	111851179	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=134,94;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:2,17,1,1
chr2	111851198	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=147,128;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr2	111851212	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,4:3,1:0,5,0,6
chr2	111881263	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,2:10,3:18,1,5,0
chr2	111886180	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,1:2,0:4,1,1,1
chr2	112526866	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=108,116;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,5:2,1:3,4,1,5
chr2	112536264	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	112541903	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=150,114;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,8:10,2:12,6,6,4
chr2	112578794	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=195,137;MMQ=27,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	112582766	.	CTT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,118;MMQ=37,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:6,13:4,9:4,7,10,12
chr2	112583476	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:4,2:4,4:3,5,3,5
chr2	112583493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=141,138;MMQ=53,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:3,4,0,6
chr2	112590989	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	112604685	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=126,152;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,5:7,7:5,5,9,3
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,3,18
chr2	112615933	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,85;MMQ=60,49;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,11:0.149:78:28,5:39,6:28,39,7,4
chr2	112621199	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	112621498	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=91,150;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.627:13:0,2:1,2:1,4,1,7
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,7:3,6:6,3,7,6
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATTTATTTATTTATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=191,121;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=TATT;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.512:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:9,7:7,4:6,10,7,5
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.593:20:6,6:2,6:3,5,6,6
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr2	112725684	.	A	ATGTG,ATGTGTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24,22;MFRL=70,190,81;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=TG;STR;TLOD=7.64,13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.225,0.409:16:5,0,4:2,3,0:4,3,5,4
chr2	112725870	.	TC	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:5,2:2,10,1,1
chr2	112725881	.	T	TGAGACAAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=217,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:112725881_T_TGAGACAAA:112725881:1,8,1,1
chr2	112725882	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=217,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:112725881_T_TGAGACAAA:112725881:1,8,1,1
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=112,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,5,1
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,5:4,6:6,4,9,3
chr2	112755129	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112755129_T_C:112755129:0,0,0,1
chr2	112755134	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112755129_T_C:112755129:0,0,0,1
chr2	112755137	.	G	GTTACTTTAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112755129_T_C:112755129:0,0,0,1
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr2	112779238	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=225,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:112779238_G_GAT:112779238:0,1,0,1
chr2	112779240	.	A	AGATGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=225,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112779238_G_GAT:112779238:0,1,0,1
chr2	112779242	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=225,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112779238_G_GAT:112779238:0,1,0,1
chr2	112779245	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=225,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112779238_G_GAT:112779238:0,1,0,1
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,18:0,0,4,23
chr2	112817696	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=190,205;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0,14,0,2
chr2	112817720	.	CAG	TGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,243;MMQ=60,32;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:2,0:0|1:112817720_CAG_TGA:112817720:0,7,0,2
chr2	112817726	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=165,243;MMQ=60,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:112817720_CAG_TGA:112817720:0,7,0,2
chr2	112821804	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=70,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:0|1:112821804_T_A:112821804:10,13,1,1
chr2	112821808	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=80,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:112821804_T_A:112821804:9,13,1,1
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,33:0.642:51:6,10:11,23:13,5,19,14
chr2	112843565	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=148,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,3:2,1:1,1,2,2
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:0,3:4,5:3,1,6,3
chr2	112854584	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.406:43:15,9:7,6:21,5,12,5
chr2	112854621	.	A	T	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,8:0.130:67:37,0:18,8:28,31,2,6
chr2	112854787	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:4,9,0,2
chr2	112856161	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=111,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.190:24:18,0:2,4:0|1:112856161_C_A:112856161:15,5,2,2
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.965:27:0,20:0,7:0|1:112856161_C_A:112856161:0,0,18,9
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=73,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,4:2,4:4,0,8,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	112873551	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	112940492	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:7,0:3,8:2,8,8,0
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:0,1,0,5
chr2	112988534	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:7,1:10,2:4,13,1,2
chr2	112990804	.	T	TATAAAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:4,1:6,1:9,1,1,1
chr2	113033652	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.101:52:26,0:13,0:29,17,0,6
chr2	113074775	.	CTT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=111,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.250:24:7,3:6,3:13,5,4,2
chr2	113079362	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:18,6:20,0:20,19,5,1
chr2	113088520	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.421:19:3,4:6,4:0|1:113088520_TAA_T:113088520:9,2,7,1
chr2	113088524	.	TTTATTA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.353:23:5,4:6,4:0|1:113088520_TAA_T:113088520:12,3,7,1
chr2	113147692	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=104,77;MMQ=52,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:113147692_T_A:113147692:8,10,0,2
chr2	113147693	.	ATCATT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=104,77;MMQ=52,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:113147692_T_A:113147692:8,10,0,2
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,6:1,5:0,3,2,9
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:0,2,1,6
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=86,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.723:7:0,3:2,2:1,1,4,1
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:7,2:2,4:5,4,3,3
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=354,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:3,0,8,1
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=90,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,8:0,5:1,1,5,8
chr2	113331484	.	AGT	CTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=230,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=155,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:3,3:3,6:4,2,9,1
chr2	113346509	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:1,8,1,1
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=154,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:2,5:1,3,1,6
chr2	113414576	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,1:6,9,1,1
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,0:0,0,1,4
chr2	113480556	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=332,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr2	113480938	.	G	GCACACA,GCACACACACA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33,29;MFRL=0,154,155;MMQ=60,60,50;MPOS=3,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,20,22;RU=CA;STR;TLOD=8.31,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.570,0.360:6:0,2,1:0,2,1:0,0,6,0
chr2	113483909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:113483909_G_A:113483909:3,7,1,1
chr2	113483915	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:113483909_G_A:113483909:3,7,1,1
chr2	113484316	.	G	GAAGACAGAC	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=76,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,2:0.053:55:24,0:28,2:17,36,1,1
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,23:0,28:0,0,16,36
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.950:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr2	113498566	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:3,5:6,4:5,5,3,6
chr2	113500240	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,68;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:10,0:15,6,3,1
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:5,5:0,5:5,0,10,0
chr2	113513877	.	GG	AA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:8,2:16,0:19,7,1,1
chr2	113514159	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,17:0.418:41:11,7:10,9:0|1:113514159_T_A:113514159:13,11,9,8
chr2	113514180	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,14:0.334:43:19,6:10,7:0|1:113514159_T_A:113514159:14,15,7,7
chr2	113514763	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=96,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,2:6,1:4,8,0,3
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,3:0,0,4,14
chr2	113537339	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=110,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	113540177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr2	113541373	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=118,36;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:16,2:22,2:20,19,2,2
chr2	113588793	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	113590390	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=113,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.564:37:9,10:7,11:6,10,6,15
chr2	113590467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	113590480	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=140,175;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,0:0,1:0|1:113590480_T_TA:113590480:0,2,0,1
chr2	113590481	.	T	TGAAGATATTCCCGTTTCCAACGAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=140,175;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,0:0,1:0|1:113590480_T_TA:113590480:0,2,0,1
chr2	113590486	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=140,175;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:113590480_T_TA:113590480:0,2,0,1
chr2	113671378	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.226:42:12,3:21,6:13,20,5,4
chr2	113671410	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=83,81;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.336:31:7,4:11,6:8,13,7,3
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=99,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr2	113675427	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:113675427_C_T:113675427:0,2,0,1
chr2	113675430	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:113675427_C_T:113675427:0,2,0,1
chr2	113675434	.	C	CTGTGTAGAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:113675427_C_T:113675427:0,2,0,1
chr2	113764095	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=189,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr2	113765361	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,14046462;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:8,3,1,1
chr2	113785727	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	113788783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=129,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr2	113816940	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:3,1:0|1:113816940_C_G:113816940:5,3,3,0
chr2	113816942	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0|1:113816940_C_G:113816940:5,3,3,0
chr2	113819614	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	113820007	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=104,129;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:7,5,3,0
chr2	113875509	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:11,3:4,3:8,7,5,1
chr2	113887207	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:10,7:8,8:11,8,10,5
chr2	113887262	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,3:13,4:8,13,1,6
chr2	113887273	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,2:9,4:4,13,0,6
chr2	113887294	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,0:5,4:3,8,0,4
chr2	113887335	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:1,3:0,2,0,7
chr2	113887338	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr2	113888579	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr2	113942609	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,2:9,0:5,8,0,2
chr2	113942903	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,3:2,2:4,0,6,0
chr2	113943470	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:1,9:4,10:2,3,11,8
chr2	113950776	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:9,8,3,0
chr2	113951223	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=87,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:10,2:17,0:14,13,0,2
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,5,14
chr2	113977811	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=105,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:5,0:7,7:4,9,0,7
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	113994365	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:113994365_GCC_G:113994365:0,4,0,1
chr2	113994370	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:113994365_GCC_G:113994365:0,3,0,1
chr2	113999534	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,4:5,5:6,1,6,3
chr2	113999736	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	113999743	.	A	AATAATAGACATGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr2	113999751	.	CCCTCACAGCCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,23;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:113999751_CCCTCACAGCCCT_C:113999751:0,2,0,1
chr2	113999767	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113999751_CCCTCACAGCCCT_C:113999751:0,1,0,1
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	114256759	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=281,113;MMQ=49,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,9:0,5:1,0,12,2
chr2	114256793	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=125,82;MMQ=47,27;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.235:27:11,6:8,0:10,11,3,3
chr2	114256978	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=136,162;MMQ=34,31;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:1,1:2,3,1,1
chr2	114258394	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,60;MMQ=60,24;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr2	114340450	.	AGAG	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=137,147;MMQ=22,22;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,1:11,2:21,6,3,0
chr2	114340454	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=140,131;MMQ=22,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:14,2:10,5:18,6,7,0
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=131,137;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,21:0.273:78:28,11:29,10:50,7,17,4
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=142;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=120,103;MMQ=22,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:122,13:0.099:135:55,8:66,5:85,37,8,5
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=122,140;MMQ=40,23;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,55:0.609:90:17,27:18,28:16,19,22,33
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=121,141;MMQ=47,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,32:0.392:82:25,18:23,14:25,25,11,21
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=119,161;MMQ=53,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,20:0.350:58:19,8:18,12:16,22,2,18
chr2	114386172	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,155;MMQ=21,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	114395237	.	AAGAGGATAATGGGGCAAGGAAAATGGGGGCAGTGTAGTGCAGAAGTCTGACCCTCAAGAGC	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=101,50;MMQ=40,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.208:14:4,0:3,2:5,6,1,2
chr2	114395263	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=103,59;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:2,2:0|1:114395263_G_T:114395263:4,4,1,1
chr2	114395265	.	GGC	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=103,59;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0|1:114395263_G_T:114395263:4,4,1,1
chr2	114395268	.	A	ATC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=103,59;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:0|1:114395263_G_T:114395263:4,4,1,1
chr2	114399145	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=102,250;MMQ=57,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr2	114476879	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,0:1,6:1,2,0,6
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:1,8,0,5
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	114493524	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:1,4,1,3
chr2	114501242	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,3:8,2,2,1
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:2,4:8,1:5,6,4,3
chr2	114647828	.	GGCA	G	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:16,0:15,3:15,19,1,2
chr2	114647917	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=107,46;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:114647917_G_C:114647917:10,5,1,1
chr2	114647923	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=51,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:114647917_G_C:114647917:10,2,1,1
chr2	114647926	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=43,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:114647917_G_C:114647917:10,1,1,1
chr2	114647931	.	A	ACCAG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=43,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:114647917_G_C:114647917:10,1,1,1
chr2	114691822	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.293:19:7,2:3,0:9,4,5,1
chr2	114691826	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=107,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,3:7,0:15,6,3,0
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,5:2,4:4,1,2,7
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.618:10:1,5:1,1:3,1,6,0
chr2	116593695	.	GATAT	G,GAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,34,32;MFRL=133,130,131;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=AT;STR;TLOD=9.65,23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,9:0.282,0.604:14:1,4,6:0,0,2:1,0,11,2
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr2	118572471	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:6,3:0,4:2,4,1,6
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr2	118579852	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=186,216;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	118583191	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,32;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:2,8,1,1
chr2	118688730	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=74,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,2:8,0:10,12,0,2
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr2	118698948	.	TG	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118698948_TG_AT:118698948:0,0,0,1
chr2	118698951	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118698948_TG_AT:118698948:0,0,0,1
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr2	118704503	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:0,5,2,7
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	118709363	.	G	GCAGATCACAGAGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118709363_G_GCAGATCACAGAGTTC:118709363:0,1,0,1
chr2	118709366	.	G	GACTGGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118709363_G_GCAGATCACAGAGTTC:118709363:0,1,0,1
chr2	118732737	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=132,52;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr2	118753097	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:6,5:4,4:4,6,3,6
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,5,0
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	119604362	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=76,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,6:5,7:6,5,7,6
chr2	119738896	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=50,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,1:10,3:5,9,2,2
chr2	119740076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:119740076_G_A:119740076:0,3,0,1
chr2	119740078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:119740076_G_A:119740076:0,3,0,1
chr2	119748135	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=90,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.271:18:2,2:5,3:0,13,0,5
chr2	119748153	.	T	TATTATAC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:8,2:8,0:0|1:119748153_T_TATTATAC:119748153:5,12,0,2
chr2	119748157	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:0|1:119748153_T_TATTATAC:119748153:7,12,0,2
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr2	119750963	.	T	TCTCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	119752006	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=91,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.733:27:3,3:3,17:2,5,5,15
chr2	119752137	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,8:0,0:0,0,6,2
chr2	119915414	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,1:2,1:1,3,1,1
chr2	119915442	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=149,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:119915442_C_T:119915442:0,3,1,0
chr2	119915445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=149,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:119915442_C_T:119915442:0,3,1,0
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	120005840	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:3,3:4,0,5,1
chr2	120125053	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=88.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0|1:120125053_C_G:120125053:0,0,18,3
chr2	120125058	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,10:0|1:120125053_C_G:120125053:0,0,18,3
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr2	120125384	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr2	120125689	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	120125910	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	120128482	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	120129841	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=61,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,8:5,3:5,2,8,3
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=115.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,16:0,9:0,0,9,17
chr2	120194852	.	C	CTCT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=83,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:17,2:20,9,2,0
chr2	120194866	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=88,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,1:15,2:19,8,2,1
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=299,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,7:0,7:1,0,8,6
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,4,9
chr2	120210989	.	A	AAAATGGGAATGAGAGCAGCACCCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	120221666	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr2	120230941	.	GTCCTCTCCCAGGGCC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=194,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCTCCCAGGGCC;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr2	120231049	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=92,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:12,9,3,0
chr2	120231133	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:6,10,1,1
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,4:4,2:7,4,3,3
chr2	120362473	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:8,7:8,10:5,11,0,17
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr2	120369268	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=97,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.141:44:15,5:23,0:19,19,5,1
chr2	120369300	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,17,21
chr2	120383138	.	CATT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:6,2,5,3
chr2	120385157	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=244,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	120387637	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	120388220	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:10,1:6,2:0|1:120388220_A_AG:120388220:7,9,1,2
chr2	120388222	.	A	AGCTGACAATACCAAGG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:10,1:6,2:0|1:120388220_A_AG:120388220:7,9,1,2
chr2	120404463	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=94,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:7,2:1,0:6,2,0,3
chr2	120404629	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=175,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:0,0:3,3:0,4,1,3
chr2	120413871	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr2	120413984	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,51;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,4:8,3:5,6,4,3
chr2	120414083	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	120438696	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,6,8
chr2	120567392	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.441:5:1,2:1,0:2,1,2,0
chr2	120635009	.	GATTAATTAGAACTACTTTT	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,2:15,0:18,14,1,1
chr2	120635074	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.676:32:8,10:2,11:8,2,10,12
chr2	120635205	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	120640221	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=140,102;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,4:5,14,0,4
chr2	120643280	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	120658266	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,7:8,8:8,4,9,6
chr2	120689934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr2	120703842	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=210,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	120720365	.	G	GACTTGGCATCTTTGATGCTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr2	120734723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr2	120734737	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,5:0,3:0,0,1,9
chr2	120776579	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	120830627	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:1,0,15,0
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,7:0,0,5,18
chr2	120831654	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.287:14:5,2:4,2:7,3,3,1
chr2	120857949	.	T	TTCTATTCCTCTAAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr2	120918487	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=97,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:4,0:10,2:6,8,1,1
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr2	121103992	.	G	GATGTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:121103992_G_GATGTGTGT:121103992:4,3,1,1
chr2	121103994	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,0:0|1:121103992_G_GATGTGTGT:121103992:4,3,1,1
chr2	121103995	.	G	GTTGATATAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:3,0:0|1:121103992_G_GATGTGTGT:121103992:4,3,1,1
chr2	121554936	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.433:37:9,15:12,0:15,6,15,1
chr2	121708893	.	CTGGGGAGTCCCCCTTCAACGCCCCCCACCCGTACGTGAACCCCCACATGGAGCACTACCTCCGTTCTGTGCACAGCAGCCCCACGCTCTCCATGATCTCTGCAGCCAGGGGCCTCAGCCCCGCTGATGGTGAGTAGGGTGTGGGGA	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.081:59:7,7:4,2:19,30,9,1
chr2	121709091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	121713041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	121729473	.	GCCCTGC	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=108,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:11,2:13,0:0|1:121729473_GCCCTGC_G:121729473:25,6,1,1
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0|1:121729473_GCCCTGC_G:121729473:0,0,22,9
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,10,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,9,0
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	121744237	.	G	GATGGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	121982011	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	121989489	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,6:2,7:2,3,6,7
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	122122941	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122122941_T_C:122122941:0,1,0,1
chr2	122122948	.	CCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122122941_T_C:122122941:0,1,0,1
chr2	122125104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:2,0,3,0
chr2	122139841	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:13,3:27,0:15,26,1,2
chr2	122155795	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:122155795_C_T:122155795:2,0,1,0
chr2	122155797	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:122155795_C_T:122155795:2,0,1,0
chr2	122161850	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr2	122162119	.	T	TGTGACCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=165,151;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.483:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	122166600	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=83,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.091:52:23,0:21,1:0|1:122166600_C_T:122166600:27,21,1,3
chr2	122166607	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=88,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.097:49:22,0:21,4:0|1:122166600_C_T:122166600:26,19,1,3
chr2	122168606	.	C	CGATTCCATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr2	122168612	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:122168612_C_T:122168612:0,2,0,1
chr2	122168622	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=159,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:122168612_C_T:122168612:0,1,0,1
chr2	122168626	.	CA	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122168612_C_T:122168612:0,0,0,1
chr2	122184855	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=175,150;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	122184962	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=100,230;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,10:0.132:81:27,10:44,0:45,26,10,0
chr2	122205778	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:3,0,3,2
chr2	122208613	.	TGATGCAAGTGAAACCAGGTGGG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.308:8:3,0:1,2:0|1:122208613_TGATGCAAGTGAAACCAGGTGGG_T:122208613:0,6,1,1
chr2	122208639	.	AATAACTTCCAAATGGCAACATGG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:122208613_TGATGCAAGTGAAACCAGGTGGG_T:122208613:1,4,1,1
chr2	122260837	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:12,0:21,4:15,18,0,4
chr2	122260899	.	TCC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0,19,0,2
chr2	122273187	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=96,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr2	122283313	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=324,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,0:0,3:2,0,4,0
chr2	122286442	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr2	122514346	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=278,207;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:122514346_A_G:122514346:0,3,0,1
chr2	122514351	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=325,207;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:122514346_A_G:122514346:1,3,0,1
chr2	122514355	.	CA	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=325,207;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:122514346_A_G:122514346:1,3,0,1
chr2	122514358	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=325,207;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:122514346_A_G:122514346:1,3,0,1
chr2	125232422	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:125232422_A_T:125232422:7,8,1,1
chr2	125232428	.	CTA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:125232422_A_T:125232422:6,8,1,1
chr2	125232433	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0|1:125232422_A_T:125232422:6,8,1,1
chr2	125281883	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:10,0:11,5,1,2
chr2	125521276	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,0:10,3:11,9,1,2
chr2	125521286	.	T	TG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,0:10,2:16,9,0,2
chr2	125547598	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:6,1:5,1:5,6,1,1
chr2	125623096	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,0:0,1:0|1:125623096_TG_AT:125623096:0,0,0,1
chr2	125623101	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125623096_TG_AT:125623096:0,0,0,1
chr2	125623104	.	CT	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125623096_TG_AT:125623096:0,0,0,1
chr2	125623109	.	G	GCCTCACTTTAAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125623096_TG_AT:125623096:0,0,0,1
chr2	125627220	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:5,7,1,2
chr2	125627240	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:5,9,1,2
chr2	125669225	.	T	TCCTTCCCACATGCCTTCTCCCCTTTAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.646:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr2	125672796	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:5,1:14,2:15,4,3,0
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=230,174;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr2	127453479	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:3,2:1,1:3,1,4,1
chr2	127453808	.	A	ACCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=164,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.254:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:1,5:6,2:2,6,2,5
chr2	127811565	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:15,4:22,0:15,23,2,2
chr2	127819669	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr2	127821411	.	G	GCAGCACGCAGGCTGGGCACCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=235,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGCACGCAGGCTGGGCACCA;STR;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:1,1:1,1:2,0,5,0
chr2	127821453	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:5,2,5,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:5,4,9,0
chr2	127825841	.	G	GTAGTATGAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,0:1,2:0|1:127825841_G_GTAGTATGAA:127825841:0,3,1,1
chr2	127825844	.	G	GAGAATAGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:127825841_G_GTAGTATGAA:127825841:0,3,1,1
chr2	127826632	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:4,4:1,2:0,6,1,5
chr2	127834380	.	G	GCGGAGACCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=251,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:127834380_G_GCGGAGACCAC:127834380:0,1,0,1
chr2	127834382	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=251,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:127834380_G_GCGGAGACCAC:127834380:0,1,0,1
chr2	127834385	.	C	CTTGTTGAATAACTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=251,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:127834380_G_GCGGAGACCAC:127834380:0,1,0,1
chr2	127956899	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=129,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.100:31:13,2:13,0:15,12,1,3
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr2	128029065	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.521:8:4,3:0,1:2,2,1,3
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=54,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,1:0,3:4,1,3,1
chr2	128066336	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:4,3:10,0:5,10,2,1
chr2	128079629	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=76,122;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.188:39:17,6:14,1:15,17,6,1
chr2	128087651	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	128100847	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128100847_TT_CA:128100847:0,3,0,1
chr2	128100853	.	TA	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:128100847_TT_CA:128100847:0,3,0,1
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128253571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:5,3,6,5
chr2	128317452	.	C	CTCTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	128345976	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:6,8,1,1
chr2	128350551	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,0:2,2:1,9,0,2
chr2	128351111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,42;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,2:6,0:7,3,1,2
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	128370276	.	C	CAAGTTGACCTATGTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	128377974	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,0:5,2:7,5,0,3
chr2	128383017	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:128383017_C_T:128383017:5,11,1,1
chr2	128383036	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:128383017_C_T:128383017:2,9,1,1
chr2	128383039	.	A	ATTTATTGAATAGGGAGTCCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:128383017_C_T:128383017:2,8,1,1
chr2	128384844	.	G	GAATTAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128384844_G_GAATTAC:128384844:3,6,1,1
chr2	128384845	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128384844_G_GAATTAC:128384844:3,6,1,1
chr2	128384890	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=172,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:1,5,2,1
chr2	128388489	.	CCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACCTCCCAGCCCCACCTCACCTCATTGCACCCCCTGCT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.199:17:4,0:4,2:2,12,1,2
chr2	128388943	.	C	CAGTTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=94,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:5,0:25,2:6,26,1,1
chr2	128389343	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:2,8,0,2
chr2	128392596	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	128393289	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=74,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:5,4,2,3
chr2	128394875	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.302:18:4,1:9,4:0|1:128394875_C_CA:128394875:6,7,2,3
chr2	128394877	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:3,2:8,4:0|1:128394875_C_CA:128394875:4,7,3,3
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr2	128409905	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:6,4,4,4
chr2	128409950	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:128409950_C_T:128409950:7,13,1,1
chr2	128409972	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:128409950_C_T:128409950:7,12,1,1
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	128415142	.	GGCAGGAGACAGGAGGAGTGAGTCAGAGCTGGTCAGGGGT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.088:33:18,2:6,0:8,23,1,1
chr2	128460251	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.254:37:15,7:13,2:13,15,0,9
chr2	128462512	.	AC	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,1:1,0:1,3,0,1
chr2	128462515	.	A	ATACTTAGTGGATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=234,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr2	128462866	.	C	CAACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:128462866_C_CAACA:128462866:0,4,0,1
chr2	128462867	.	T	TAGCAAGACCTCATCTCTACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:128462866_C_CAACA:128462866:0,4,0,1
chr2	128481981	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=92,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:14,0:23,7:21,17,6,1
chr2	128526579	.	T	TTAAATAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TAAA;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr2	128608153	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:19,3:15,0:16,18,0,3
chr2	128608186	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=146,113;MMQ=60,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:24,0:24,4:26,22,4,0
chr2	128608271	.	GA	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=18,33;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.359:33:6,4:4,8:4,17,3,9
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.507:26:4,6:7,7:2,11,4,9
chr2	128610719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr2	128699722	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=85,59;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,0:5,7:5,6,0,7
chr2	128708062	.	AT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128708062_AT_TA:128708062:0,2,0,1
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,2:0,0:1|0:128708062_AT_TA:128708062:0,0,0,2
chr2	128744414	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=153,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,4:9,0:10,11,1,3
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=67,14;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,0:3,6:0|1:128744580_A_G:128744580:1,3,2,4
chr2	128744587	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=14,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.300:8:0,0:6,2:1|0:128744580_A_G:128744580:2,4,1,1
chr2	128744591	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=14,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.300:8:0,0:6,2:1|0:128744580_A_G:128744580:2,4,1,1
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,72;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr2	128757995	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:8,6:13,6:11,10,4,8
chr2	128772310	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,9:1,1:1,0,10,0
chr2	128772462	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=105,1147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:128772462_G_A:128772462:6,11,0,2
chr2	128772467	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=96,1147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:6,0:0|1:128772462_G_A:128772462:7,11,0,2
chr2	128849114	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,8:0,0,12,9
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr2	128890935	.	C	CCACATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=210,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	128892504	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:128892504_G_A:128892504:4,12,1,1
chr2	128892506	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:0|1:128892504_G_A:128892504:4,12,1,1
chr2	128910390	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:11,9,2,0
chr2	128918139	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.229:36:17,0:11,7:13,15,0,8
chr2	128932483	.	A	ACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	128934317	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,5:4,0:8,0,4,1
chr2	128938587	.	T	TCTCTCTCTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:12,10,2,2
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.232:32:9,5:14,2:14,11,4,3
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=117,127;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=86.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,24:0.417:58:21,14:10,10:19,15,10,14
chr2	130739712	.	CT	C	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.132:45:22,5:13,1:22,17,3,3
chr2	130739717	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=153,189;MMQ=60,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,11:0.209:55:23,11:21,0:18,26,11,0
chr2	130831868	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=82,248;MMQ=22,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:130831868_C_T:130831868:1,2,0,1
chr2	130831875	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=93,248;MMQ=23,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:130831868_C_T:130831868:1,3,0,1
chr2	130833159	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,118;MMQ=25,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:1,2:9,2:1,9,0,4
chr2	130898862	.	GGCCTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,85;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCTT;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr2	130929980	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,17:0.322:54:23,0:13,17:18,19,0,17
chr2	130934305	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:130934305_G_A:130934305:0,5,0,2
chr2	130934307	.	CTGG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,0:0|1:130934305_G_A:130934305:0,5,0,2
chr2	130948327	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,168;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:4,2:1,4,0,2
chr2	130949411	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=44,120;MMQ=45,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,6:1,3:2,2,6,3
chr2	130951548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,46;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr2	130951566	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr2	131096792	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,2:8,1:5,12,1,2
chr2	131098479	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:12,2:0|1:131098479_A_C:131098479:11,13,1,1
chr2	131098485	.	C	CCAGTTCTGGGTTTGTAT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:0|1:131098479_A_C:131098479:9,15,1,1
chr2	131221102	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=177,190;MMQ=24,25;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr2	131221170	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,25;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	131221287	.	G	GCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=157,123;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131221287_G_GCTC:131221287:0,1,0,1
chr2	131221292	.	G	GTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=157,123;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131221287_G_GCTC:131221287:0,1,0,1
chr2	131221294	.	TGCCG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=162,123;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:131221287_G_GCTC:131221287:0,2,0,1
chr2	131232617	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	131487513	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=116,143;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:3,4,2,0
chr2	131487673	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr2	131523456	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=108,123;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:10,6:12,0:13,9,6,0
chr2	131672460	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	131673462	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,0:6,3:0|1:131673462_C_T:131673462:1,7,2,1
chr2	131673465	.	GG	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:0|1:131673462_C_T:131673462:2,6,1,1
chr2	131673586	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,3:9,0:6,8,3,0
chr2	131674523	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:6,5,0,2
chr2	131798817	.	GATCTA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=125,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,0:0|1:131798817_GATCTA_G:131798817:6,4,1,1
chr2	131798825	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:131798817_GATCTA_G:131798817:6,4,1,1
chr2	131798830	.	TA	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=98,44;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:131798817_GATCTA_G:131798817:7,4,1,1
chr2	131802216	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	131803016	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=113,131;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:11,7:13,0:14,10,7,0
chr2	131829517	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr2	131840296	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,0:5,12:2,8,0,12
chr2	131883579	.	T	TTTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	131890524	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:17,0:12,5:16,13,0,5
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,97;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=58.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:0,14:1,11:1,0,18,9
chr2	132120638	.	T	TTTATGAATACTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=249,143;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	132121686	.	T	TTCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC;STR;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,1:0,0,1,4
chr2	132237130	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,122;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	132237994	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,74;MMQ=50,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,0:8,3:10,5,1,2
chr2	132243695	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=80,115;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.731:20:4,9:1,6:2,3,6,9
chr2	132243757	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=86,180;MMQ=27,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,2:14,1:16,10,1,2
chr2	132243765	.	AGGCACAAAGCAGACAATAGCCACCACGCATCTCTTGTGGTACAAACTGCCATAATTCTAGTCCCCACTGACTGGTCAAGG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=80,40;MMQ=27,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.221:15:6,2:6,0:2,11,1,1
chr2	132243817	.	T	TTCTCTCCCGCTTTCCCTCCCAGACAGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=274,80;MMQ=46,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	132286114	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=150,88;MMQ=40,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,2:9,14,1,1
chr2	132286131	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=149,88;MMQ=40,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:4,10,1,2
chr2	132905660	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=152,155;MMQ=44,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,1:9,0:0|1:132905660_G_A:132905660:14,8,2,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=152,155;MMQ=44,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,1:10,1:0|1:132905660_G_A:132905660:14,8,2,0
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=152,133;MMQ=25,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,2:8,2:0|1:132905660_G_A:132905660:11,7,4,0
chr2	132905693	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=121,130;MMQ=26,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:11,2:12,3:0|1:132905660_G_A:132905660:14,12,5,0
chr2	132905703	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=118,128;MMQ=40,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:12,2:15,3:0|1:132905660_G_A:132905660:14,13,6,0
chr2	132905706	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=23,32;MFRL=118,125;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:10,2:14,3:0|1:132905660_G_A:132905660:12,13,5,0
chr2	132905741	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=118,125;MMQ=40,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,2:8,3:9,12,3,2
chr2	132911348	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	132912217	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=127,122;MMQ=41,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,5:0,9:1,0,12,2
chr2	132915046	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=124,178;MMQ=58,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:132915046_A_T:132915046:1,11,0,2
chr2	132915048	.	A	ATTGTCTTTTTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=124,178;MMQ=58,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:132915046_A_T:132915046:1,11,0,2
chr2	133014510	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133014510_T_C:133014510:0,0,1,0
chr2	133014513	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133014510_T_C:133014510:0,0,1,0
chr2	133014721	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	133175524	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=205,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chr2	133403204	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,2:2,2:4,0,5,0
chr2	133426183	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	133489491	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=89,73;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.387:39:18,14:6,0:11,13,14,1
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr2	133539566	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=105,98;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:3,8:4,9:4,3,9,8
chr2	133539745	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:9,3,2,0
chr2	133540139	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:1,0:2,3,0,3
chr2	133540506	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,132;MMQ=60,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.193:41:21,0:12,6:21,12,0,8
chr2	133618220	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=115,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr2	135012298	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=131,162;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,0:7,4:0,12,0,4
chr2	135102453	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,2,0
chr2	135199516	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=102,17927163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr2	135214259	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=91,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:1,3:4,4:3,3,5,2
chr2	135677471	.	A	AGTTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:7,11:3,12:4,6,10,14
chr2	135694324	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=177,168;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr2	135694354	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,2:2,2:3,0,4,1
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0,0,9,3
chr2	135694398	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:0,12:6,6:4,2,9,9
chr2	135700151	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:3,6:4,3:7,0,4,6
chr2	135703650	.	GTT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,1:4,1:6,7,1,1
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	135710242	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=109,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:14,11,2,0
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,14:0,0,9,12
chr2	135745722	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=90,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:4,6,3,4
chr2	135756486	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=114,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:13,7,0,2
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,5:2,3:6,0,7,1
chr2	135810083	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:10,0:11,10,2,1
chr2	135848595	.	GAGAA	G	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,2:0.044:66:34,0:26,2:0|1:135848595_GAGAA_G:135848595:39,25,1,1
chr2	135848601	.	TC	T	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:34,0:28,2:0|1:135848595_GAGAA_G:135848595:40,26,1,1
chr2	135848607	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=89,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,2:0.040:73:35,0:31,1:0|1:135848595_GAGAA_G:135848595:44,27,1,1
chr2	135848608	.	A	AACTG	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=88,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,2:0.041:72:36,0:31,1:0|1:135848595_GAGAA_G:135848595:43,27,1,1
chr2	135887514	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.318:19:10,5:3,1:12,1,6,0
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chr2	135926297	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,16:0.404:40:9,0:13,16:0|1:135926297_C_T:135926297:8,16,1,15
chr2	135926305	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.396:41:10,0:11,1:0|1:135926297_C_T:135926297:11,14,1,15
chr2	135985361	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=99,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:12,6,3,0
chr2	136028919	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:9,0:19,5:15,14,0,5
chr2	136107509	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:136107509_C_T:136107509:0,0,1,0
chr2	136107511	.	CCC	TTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:136107509_C_T:136107509:0,0,1,0
chr2	136148394	.	GAA	G,GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,16,17;MFRL=0,109,149;MMQ=60,60,60;MPOS=32,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=3.15,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.447,0.361:6:1,1,0:0,0,0:1,0,1,4
chr2	136396300	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:3,6,0,5
chr2	136399316	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=172,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,2:7,0:0|1:136399316_C_T:136399316:5,8,1,1
chr2	136399330	.	C	CCCCCCTCCACCATCCTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=164,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0|1:136399316_C_T:136399316:6,8,1,1
chr2	136402967	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:17,10:6,0:14,9,10,0
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=96,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,6:10,1:11,3,7,0
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=122,136;MMQ=60,50;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.433:35:9,4:11,11:11,9,14,1
chr2	136409464	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,18;MFRL=83,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,1:13,0:0|1:136409464_A_C:136409464:1,20,2,0
chr2	136409467	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=87,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,1:12,0:0|1:136409464_A_C:136409464:2,20,2,0
chr2	136409470	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=87,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,1:13,0:0|1:136409464_A_C:136409464:2,20,2,0
chr2	136409473	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=87,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,0:12,0:0|1:136409464_A_C:136409464:2,20,2,0
chr2	136409616	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:23,0:18,2:0|1:136409616_T_A:136409616:16,26,1,1
chr2	136409620	.	C	CTA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:21,0:16,2:0|1:136409616_T_A:136409616:14,26,1,1
chr2	136409627	.	T	TACGATTTTAATTTCTG	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,0:13,2:0|1:136409616_T_A:136409616:10,23,1,1
chr2	136433135	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=193,14694298;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.341:36:9,7:15,5:8,16,4,8
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr2	136519454	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,51;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:15,5:18,0:16,18,5,0
chr2	136527443	.	G	GTGAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGAT;STR;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,2:0,2,0,6
chr2	136527483	.	C	CAAAATCTCTCAGCATTTGCTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	136533841	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:13,0:5,2:0|1:136533841_C_T:136533841:9,9,1,1
chr2	136533847	.	C	CTGCGTTGCTCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:4,2:0|1:136533841_C_T:136533841:11,9,1,1
chr2	136545844	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	136547345	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,0:10,4:9,14,2,2
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr2	136552188	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=81,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:3,4,4,0
chr2	136552288	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,2:19,0:0|1:136552288_A_T:136552288:13,20,1,1
chr2	136552295	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,2:19,0:0|1:136552288_A_T:136552288:13,20,1,1
chr2	136552371	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:0,7,1,5
chr2	136558157	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=87,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:7,1:14,6:15,6,4,3
chr2	136561557	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=82,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,3:7,3:3,5,3,3
chr2	136567348	.	G	GACACTGCTCCTTTAAGATGTCAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:5,8,0,2
chr2	136575199	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=95,170;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,4:2,1:3,6,4,1
chr2	136575228	.	C	CTCTGTCTGTAGCTACTATGCTGAACCTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,1,1
chr2	136594108	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:10,5:17,0:15,12,5,0
chr2	136605704	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:13,1:4,2:9,9,1,2
chr2	136614255	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,4,2
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=150,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:6,1,4,1
chr2	136690414	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=19,25,28;MFRL=131,69,209;MMQ=60,52,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.49,10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.219,0.248:11:2,1,0:1,1,3:2,4,1,4
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=129,209;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:6,0:4,3:4,7,0,3
chr2	136736954	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:12,1:10,2:3,19,0,3
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,3:5,2:10,1,4,1
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:7,4:2,3:2,7,0,7
chr2	136873549	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.691:39:3,13:9,14:7,5,17,10
chr2	137814477	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,6:3,4:5,3,5,5
chr2	137814489	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:9,5:1,2:5,5,3,4
chr2	137852550	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,6:8,2:2,7,4,4
chr2	137852698	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=80,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,12:4,4:1,7,10,6
chr2	137917922	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:22,2:7,4:3,27,1,5
chr2	137928320	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=120,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,2:2,1:0,2,4,0
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	138000226	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	138030234	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=107,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,1:9,4:7,13,0,5
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr2	138208631	.	G	T,A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27,22;MFRL=129,133,88;MMQ=60,60,60;MPOS=24,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.30,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.375,0.375:5:0,2,2:1,0,0:0,1,0,4
chr2	138208634	.	A	ATTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:138208634_A_ATTC:138208634:0,3,0,2
chr2	138208638	.	T	TGCTTCAGCCTCTCGAGTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:138208634_A_ATTC:138208634:0,3,0,2
chr2	138375896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:138375896_G_A:138375896:3,0,3,0
chr2	138375898	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:138375896_G_A:138375896:3,0,3,0
chr2	138413292	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=91,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr2	138434130	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.645:20:3,5:3,8:3,4,5,8
chr2	138434220	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=68,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,5:1,4:0,2,2,7
chr2	138724796	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138724796_C_T:138724796:0,2,0,1
chr2	138724799	.	AG	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138724796_C_T:138724796:0,2,0,1
chr2	138724806	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	138727686	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=115,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:13,0:10,5:11,12,5,0
chr2	138727872	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=195,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.641:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	138762873	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr2	139308397	.	T	TTCTCTC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=TC;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.570:10:0,1:3,2:3,1,5,1
chr2	139316934	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:11,6:9,4:5,15,3,7
chr2	139318315	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,6,1
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=89,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.364:18:6,2:5,4:6,6,6,0
chr2	139322475	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=113,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:5,0:10,1:0|1:139322475_A_AT:139322475:10,5,1,1
chr2	139322476	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=113,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:0|1:139322475_A_AT:139322475:10,5,1,1
chr2	139322504	.	ATGCAGG	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:7,2:8,8,1,1
chr2	139326627	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=78,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:11,2:20,1:21,11,1,2
chr2	139429286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=246,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	140992340	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=71,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,3:2,7:1,1,8,2
chr2	141079716	.	G	GTTTGGCCTCCAAAAGAATAATTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=82,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	141108531	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,5:0,1,6,4
chr2	141110440	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	141110677	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=68,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:1,6:2,1:2,2,2,5
chr2	141115707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr2	141130548	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr2	141130695	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,7:6,7:2,8,6,8
chr2	141130702	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=138,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,2:11,0:0|1:141130702_T_C:141130702:7,12,1,1
chr2	141130709	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=134,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,1:11,0:0|1:141130702_T_C:141130702:7,11,1,1
chr2	141135863	.	T	TA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.517:47:9,9:12,16:7,15,13,12
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	141294285	.	GAA	G,GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,32,21;MFRL=119,172,137;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.08,14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,7:0.219,0.437:17:0,2,3:1,2,1:1,5,1,10
chr2	141298467	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:1,5:4,8:1,4,3,10
chr2	141298749	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	141359287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,10:0,4:0,0,10,4
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	141474456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr2	141598681	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	141607972	.	CTTGAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=132,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	141660795	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141660795_A_C:141660795:0,1,0,1
chr2	141660797	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141660795_A_C:141660795:0,1,0,1
chr2	141660798	.	A	AAGTATTTTAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141660795_A_C:141660795:0,1,0,1
chr2	141707868	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr2	141707994	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,1:6,5:3,7,0,6
chr2	141708021	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr2	141709406	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=158,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,5,5
chr2	141747249	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:0,1,2,7
chr2	141747293	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr2	141986866	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,8:2,7:1,3,6,9
chr2	142238190	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=72,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	142567879	.	GC	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=86,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:37,0:18,2:0|1:142567879_GC_G:142567879:18,39,0,2
chr2	142567882	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=86,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:34,0:17,2:0|1:142567879_GC_G:142567879:18,39,0,2
chr2	142888107	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	142888376	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr2	143676141	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,28,28,24;MFRL=150,95,126,100;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,21,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.95,8.88,13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,7,5,12:0.196,0.204,0.414:29:2,4,5,5:3,2,0,5:5,0,20,4
chr2	143676187	.	C	A	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,9:0.117:67:27,5:22,0:27,31,6,3
chr2	143713700	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	143746494	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,4:2,1:1,8,2,3
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,2:3,7:5,4,8,1
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,18:0,8:0,0,13,13
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr2	144194447	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=77,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:4,4,4,1
chr2	144194473	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=90,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:7,2:0|1:144194473_T_A:144194473:12,7,1,1
chr2	144194479	.	C	CTTCTGTTGATTTGATGAAAT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=89,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:7,2:0|1:144194473_T_A:144194473:13,8,1,1
chr2	144194481	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=89,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,1:0|1:144194473_T_A:144194473:13,8,1,1
chr2	144460926	.	ATGTACC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=224,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTACC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,1,0
chr2	144765021	.	GGCCATGGACAGAACCGCACCGCCATTTCCTTTAAGGCCGA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=112,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:7,2:6,12,2,0
chr2	144936399	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=59,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr2	145146457	.	G	GAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,0:1,0:1,3,0,2
chr2	145156486	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=138,297;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:16,7:6,0:8,14,7,0
chr2	145187390	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=94,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:21,0:12,5:17,16,0,5
chr2	145255431	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=212,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.785:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	145274844	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.207:46:15,0:17,9:0|1:145274844_C_T:145274844:18,19,2,7
chr2	145274858	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,9:0.217:44:15,0:17,3:0|1:145274844_C_T:145274844:16,19,2,7
chr2	145274860	.	GA	TC	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:17,0:15,3:0|1:145274844_C_T:145274844:17,19,2,1
chr2	148700945	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.724:12:1,4:2,5:2,1,7,2
chr2	148701099	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,31,26;MFRL=165,164,113;MMQ=60,60,60;MPOS=23,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.38,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,6:0.231,0.490:13:0,2,2:1,1,2:0,4,2,7
chr2	148712819	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.710:19:2,8:3,6:5,0,11,3
chr2	148730482	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=168,219;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,0:3,4:0,7,0,4
chr2	148730957	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=69.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:11,20:11,7:18,4,27,0
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	149240657	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr2	149243260	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	149243429	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,3:14,0:17,14,1,2
chr2	149248121	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:2,8,0,3
chr2	149267632	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,4:11,0:13,7,2,2
chr2	149402538	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=109,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:5,1:4,0:6,5,3,0
chr2	149449185	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr2	149501270	.	GA	CC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:25,3:15,0:19,22,4,0
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,4:1,18:1,0,15,7
chr2	149526832	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:2,9,0,2
chr2	149539377	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=85,218;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,11:0.240:48:17,0:20,11:13,24,0,11
chr2	149542268	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=114,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:11,4:4,0:11,6,2,2
chr2	149542570	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.259:13:5,2:5,1:3,7,1,2
chr2	149639294	.	C	G	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=226.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,81:0.923:87:1,54:5,27:4,2,51,30
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=1107;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=76,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1053,11:9.375e-03:1064:525,0:509,11:604,449,4,7
chr2	149639419	.	A	ATCACCACGATCAAAAGGGACAAGCATCAAGCACGCAG	.	.	DP=549;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:543,5:0.012:548:182,2:245,3:188,355,2,3
chr2	149806371	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,1:14,2:10,16,1,2
chr2	149818721	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=181,174;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:13,2:2,0:0,15,0,2
chr2	149840170	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.119:22:9,0:11,2:11,9,1,1
chr2	149847714	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	149853854	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=87,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.170:21:5,1:13,0:0|1:149853854_G_T:149853854:8,10,0,3
chr2	149853863	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=93,80;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:6,3:11,0:0|1:149853854_G_T:149853854:7,11,0,3
chr2	149861803	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	149864393	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr2	150069645	.	C	CGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,7:2,3:4,1,3,8
chr2	150320627	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.409:18:5,4:4,3:8,3,7,0
chr2	150320811	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:0|1:150320811_A_C:150320811:1,11,0,2
chr2	150320813	.	ATT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:1,2:0|1:150320811_A_C:150320811:1,11,0,2
chr2	150325224	.	CG	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:4,0:7,4,1,1
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=95,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,2:2,11:1,4,4,9
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=347,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	151328266	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:11,0:14,4:13,16,1,3
chr2	151328284	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=18,16;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.655:15:0,3:1,1:1,4,2,8
chr2	151331522	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,0:1,9:0,1,3,6
chr2	151890223	.	ATAATT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAATT;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr2	151900390	.	TAAAAAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.869:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:3,8:6,3:4,6,9,2
chr2	152118010	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:16,3:11,15,1,2
chr2	152118271	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.589:15:4,4:2,4:0|1:152118271_G_A:152118271:1,5,4,5
chr2	152118275	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:2,5:0|1:152118271_G_A:152118271:0,5,4,5
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:0,3,1,3
chr2	152128331	.	C	CAGACGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=228,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152128331_C_CAGACGA:152128331:0,1,0,1
chr2	152128332	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=228,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152128331_C_CAGACGA:152128331:0,1,0,1
chr2	152128336	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=228,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:152128331_C_CAGACGA:152128331:0,1,0,1
chr2	152138383	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,329;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:9,1,2,0
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=214,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:6,2:7,8:3,10,4,6
chr2	152236045	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=22,28;MFRL=100,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,0:2,3:2,2,0,4
chr2	152236096	.	T	TAGAAGCCTAGAGCTAAAGAAGCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=233,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	152236100	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=238,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:152236100_GA_G:152236100:0,1,0,1
chr2	152236104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=238,228;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:152236100_GA_G:152236100:0,1,0,1
chr2	152236112	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=238,228;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:152236100_GA_G:152236100:0,1,0,1
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.623:32:7,11:4,9:4,8,7,13
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr2	152267721	.	AT	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.689:41:5,15:6,12:8,5,21,7
chr2	152267897	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=30,30,30,30;MFRL=117,128,124,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,18,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.54,25.64,6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,5,13,6:0.143,0.407,0.172:33:8,3,13,5:1,2,0,1:3,6,4,20
chr2	152267932	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=153,153;MMQ=60,28;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.235:41:25,0:4,9:4,28,0,9
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:3,5:0,8:0,3,1,12
chr2	152293947	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,230;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr2	152300262	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr2	152302863	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr2	152311570	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.742:29:3,6:4,15:5,2,10,12
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	152316589	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=95,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,11:0.205:56:24,0:21,11:20,25,1,10
chr2	152316624	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=155,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.127:36:13,0:19,4:4,28,1,3
chr2	152318848	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,6:2,5:3,6,4,7
chr2	152320364	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:13,3:14,1:18,9,3,1
chr2	152330458	.	C	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=80,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,5:0.069:83:28,5:50,0:48,30,5,0
chr2	152331515	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=113,73;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:6,4:17,0:14,9,3,1
chr2	152342529	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=263,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152342529_T_C:152342529:0,1,0,1
chr2	152342531	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=263,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152342529_T_C:152342529:0,1,0,1
chr2	152342534	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=263,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:152342529_T_C:152342529:0,1,0,1
chr2	152342535	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=263,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:152342529_T_C:152342529:0,1,0,1
chr2	152342537	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:152342529_T_C:152342529:0,0,0,1
chr2	152346612	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=134,268;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:18,0:15,5:7,26,0,5
chr2	152346979	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=95,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:4,4:1,5:4,1,4,5
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:1,3,4,3
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,5:1,3:0,1,1,8
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.464:11:5,2:1,3:5,1,4,1
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,8:2,7:3,3,8,7
chr2	152381229	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=180,183;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,4:4,1:3,6,3,2
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr2	152387592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:2,2,1,6
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,9:1,1:4,1,9,1
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.688:17:4,4:1,8:1,4,4,8
chr2	152393785	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:0|1:152393785_G_GT:152393785:2,5,1,1
chr2	152393787	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=89,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0|1:152393785_G_GT:152393785:2,5,1,1
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:1,3,1,2
chr2	152397999	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr2	152404757	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr2	152406145	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,0:13,3:23,8,1,2
chr2	152409358	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	152417314	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=237,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	152421937	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:1,2:1,2:3,0,5,0
chr2	152424933	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.382:9:1,1:0,0:1,5,1,2
chr2	152436061	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=176,175;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	152438180	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=131,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,2:0,4:2,2,0,6
chr2	152466446	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,258;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,0:7,2:8,7,0,2
chr2	152466461	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=126,258;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:7,11,0,2
chr2	152472509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:0|1:152472509_C_T:152472509:8,6,1,1
chr2	152472518	.	C	CTGCTTGTTTGGCAAATAAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:4,2:0|1:152472509_C_T:152472509:11,7,1,1
chr2	152472520	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=112,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:13,0:4,2:0|1:152472509_C_T:152472509:10,7,1,1
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	152481976	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=181,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:0|1:152481976_CA_TG:152481976:9,0,2,0
chr2	152481977	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,9:0.768:11:2,6:0,3:1|0:152481976_CA_TG:152481976:2,0,9,0
chr2	152484280	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,104;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:18,3:16,0:19,16,1,2
chr2	152499355	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:6,12:4,9:4,6,12,9
chr2	152500449	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,194;MMQ=55,50;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:4,4,3,1
chr2	152507331	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:1,2:5,0:0|1:152507331_G_GT:152507331:4,2,1,1
chr2	152507334	.	A	AATTGAAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,2:8,0:0|1:152507331_G_GT:152507331:7,3,1,1
chr2	152507336	.	C	CTGTAACCTATG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:8,0:0|1:152507331_G_GT:152507331:7,3,1,1
chr2	152511778	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=93,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	152518679	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,1:10,1:8,13,1,1
chr2	152520027	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,7:3,0,8,2
chr2	152520446	.	AGCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=246,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:152520446_AGCT_A:152520446:0,1,0,1
chr2	152520453	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=246,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152520446_AGCT_A:152520446:0,1,0,1
chr2	152521983	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,8:6,6:4,4,4,10
chr2	152522556	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	152533994	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr2	152534545	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:5,1,1,8
chr2	152536498	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr2	152537301	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:11,6,0,2
chr2	152541367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:8,0:8,11,0,2
chr2	152551152	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	152552062	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:5,0,2,1
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,2:7,2:5,7,3,2
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	152586193	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr2	152589615	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=97,176;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:12,3:3,1:11,4,1,3
chr2	152670892	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,3:3,1:1,9,1,3
chr2	152684704	.	AC	A,ACC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27,17;MFRL=120,148,170;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=C;STR;TLOD=3.32,13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,7:0.149,0.427:16:4,0,2:3,2,1:3,4,4,5
chr2	152739695	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	152988610	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=81,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.674:22:2,9:5,5:4,3,9,6
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	153001359	.	GAT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=65.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,8:4,9:1,6,7,10
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	153415229	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:3,2:6,2,4,0
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.264:17:5,3:7,1:0|1:153415234_T_TG:153415234:11,2,3,1
chr2	153415244	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,3:5,1:0|1:153415234_T_TG:153415234:10,2,3,1
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,2:4,2:4,10,2,2
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	153463984	.	TACACAC	T,TAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28,23;MFRL=128,192,193;MMQ=60,60,60;MPOS=30,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=AC;STR;TLOD=11.04,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,4:0.475,0.380:10:1,1,0:0,3,2:0,1,0,9
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.875:12:1,4:0,6:0,1,1,10
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=60.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.925:24:0,9:1,13:1,0,9,14
chr2	153482128	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr2	153486111	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	153514610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr2	153519560	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:8,8,2,0
chr2	153520503	.	TCAAAAGCTAGCTCTAAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:4,6,1,1
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,5:0,0,5,10
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	153525679	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,1:9,1:7,14,2,0
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,15:0,25:0,0,15,26
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	153576287	.	AAC	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,3:3,0:9,0,3,0
chr2	153576294	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=201,212;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:4,0:8,0,4,0
chr2	153576297	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=190,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,0:3,0:10,0,4,0
chr2	153576301	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:6,0:12,0,3,0
chr2	153576304	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=30,15;MFRL=198,229;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:4,0:11,0,3,0
chr2	153576306	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=190,229;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:5,0:10,0,3,0
chr2	153576315	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=27,18;MFRL=177,202;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:8,0:14,0,2,0
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,10,1
chr2	155098787	.	TAT	AGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	155295072	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=217,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	157186093	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:1,4,3,0
chr2	157352734	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.219:19:7,3:6,1:7,8,1,3
chr2	157368895	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	157370018	.	GT	G,GTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26,33;MFRL=126,99,142;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.50,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.302,0.252:17:3,1,1:3,5,3:2,5,5,5
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=79.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,19:0,5:0,0,9,15
chr2	157425502	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=262,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.680:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	157427837	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,2,6
chr2	157427850	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,0:1,6:0,1,1,5
chr2	157436124	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,1,1
chr2	157439451	.	G	GATT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,2:7,0:0|1:157439451_G_GATT:157439451:1,13,0,3
chr2	157439452	.	C	CACAGTTTTGA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:0|1:157439451_G_GATT:157439451:1,13,0,3
chr2	157439456	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,2:8,1:0|1:157439451_G_GATT:157439451:1,13,0,3
chr2	158114862	.	A	ATGAAAGGCAGAGCTTGGGAGCCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=102,62486688;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,1:6,0:7,5,0,2
chr2	158115082	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=103,123;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.240:31:8,7:16,0:13,11,7,0
chr2	158140717	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=161,161;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	158156075	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:17,0:18,15,3,0
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	158275111	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.813:11:1,3:1,6:0,2,0,9
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG,TAGAGAG	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=23,21,22,26;MFRL=133,145,101,118;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,9,1;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=AG;STR;TLOD=3.86,39.79,7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,18,5:0.065,0.553,0.162:34:2,0,4,1:2,3,9,2:4,4,18,8
chr2	158291124	.	AGAGAGG	A	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:16,3:47,0:39,39,1,2
chr2	158291324	.	ATCTC	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=TC;STR;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.952:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,11,10
chr2	158399415	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158399415_G_T:158399415:0,2,0,1
chr2	158399421	.	T	TGGGTAATTTACAAAGGAAGAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158399415_G_T:158399415:0,2,0,1
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr2	158401137	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,3,20
chr2	158485075	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:1,3,3,3
chr2	158626980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	158655883	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.785:6:0,4:0,1:0,1,4,1
chr2	158958551	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,8:3,7:2,2,12,3
chr2	158958605	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,9:2,8:2,2,7,10
chr2	158958679	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:1,4,0,3
chr2	158962542	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	158971828	.	A	ATTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:158971828_A_ATTGTTT:158971828:0,0,0,1
chr2	158971829	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:158971828_A_ATTGTTT:158971828:0,0,0,1
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	159477735	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:14,4,0,3
chr2	159477892	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:23,0:21,5:26,18,0,5
chr2	159481675	.	T	TTGAAGGAGAAGAG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:12,9,0,2
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,11:2,3:4,1,13,2
chr2	159651896	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:13,10,2,0
chr2	159663599	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,109;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.690:24:4,6:3,9:3,4,10,7
chr2	159663701	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr2	159672158	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	160005845	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=107,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:1,4,0,3
chr2	160035195	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.232:32:12,5:13,2:10,15,3,4
chr2	160035653	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=103,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,0:14,2:0|1:160035653_C_T:160035653:11,11,1,1
chr2	160035657	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:160035653_C_T:160035653:10,10,1,1
chr2	160042430	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:11,10:3,6:5,9,7,9
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,3:5,6:6,2,8,1
chr2	160075886	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:7,3:11,3:5,13,2,4
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:160082354_C_T:160082354:0,0,3,9
chr2	160082364	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=179,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:0|1:160082354_C_T:160082354:2,6,1,1
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	160084473	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,4:2,3:3,2,3,4
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr2	160114437	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.363:42:14,7:13,8:16,11,11,4
chr2	160114501	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:0|1:160114501_A_G:160114501:11,18,1,1
chr2	160114507	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:10,0:14,2:0|1:160114501_A_G:160114501:7,23,1,1
chr2	160114509	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:12,2:0|1:160114501_A_G:160114501:7,22,1,1
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:9,2:11,9:12,8,5,6
chr2	160128160	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,6:9,0:9,3,6,0
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	160136337	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,19,18
chr2	160136360	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:20,2:12,1:12,20,2,1
chr2	160139595	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:3,6,2,2
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,8,14
chr2	160181417	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:17,6:18,0:16,19,6,0
chr2	160181552	.	TATTA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,2
chr2	160181561	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,2
chr2	160182074	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	160193370	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:2,2:0,2:2,0,5,0
chr2	160203934	.	A	C,T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31,23;MFRL=0,155,187;MMQ=60,60,60;MPOS=16,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.32,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.556,0.333:6:0,2,0:0,2,2:0,0,6,0
chr2	160205720	.	A	AAAATTAAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:12,0:2,2:0|1:160205720_A_AAAATTAAC:160205720:6,8,0,2
chr2	160205724	.	T	TATATATATATA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:2,2:0|1:160205720_A_AAAATTAAC:160205720:6,8,0,2
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,0:1,6:0,4,0,6
chr2	160261387	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:2,2,3,3
chr2	160303389	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.165:19:6,1:9,2:0|1:160303389_A_T:160303389:5,11,2,1
chr2	160303396	.	C	CTTGGAAGGT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,0:10,2:0|1:160303389_A_T:160303389:6,13,1,1
chr2	160303397	.	C	CTTTATTTCTCCTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,0:8,2:0|1:160303389_A_T:160303389:6,13,1,1
chr2	160605268	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,3:11,2:12,6,3,2
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,0,6
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr2	160636492	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.410:30:10,6:6,6:14,4,8,4
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr2	160639970	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,3:7,0:4,5,0,3
chr2	160666954	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr2	160673469	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:16,0:7,4:11,12,0,4
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr2	160676444	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr2	160676445	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=74,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:1,1,3,5
chr2	160698698	.	CTA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	160708645	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=107,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr2	160708923	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,146;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:3,2:0,9,0,3
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=14,30;MFRL=146,160;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.606:8:0,2:1,1:0,3,0,5
chr2	160710922	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=88,103;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:15,7:8,12:12,11,11,8
chr2	160711045	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.598:30:10,12:1,6:7,5,10,8
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	160735008	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,5:5,3:2,7,2,7
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	160742862	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr2	160755407	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:15,0:19,4:18,17,0,4
chr2	160761082	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr2	160798333	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,255;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:8,5,0,2
chr2	160811685	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,3:15,0:18,13,3,0
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	160843623	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:4,2,2,0
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	160873294	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	160876827	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	160885442	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=92,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:10,9:12,3:9,13,6,6
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	160898783	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=94,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	160901517	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr2	160958349	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:11,3:14,3:3,22,0,6
chr2	161025755	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:10,0:13,3,1,2
chr2	161052940	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:3,12,1,1
chr2	161056612	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,3:8,0:4,10,2,1
chr2	161135000	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:2,3:3,4:3,2,7,0
chr2	161169828	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,1,1
chr2	161174693	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.367:39:14,9:10,5:16,9,11,3
chr2	161223688	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,5:1,4:3,1,9,0
chr2	162059324	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=100,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,0:14,4:18,10,4,0
chr2	162059496	.	T	TAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:162059496_T_TAG:162059496:0,0,0,1
chr2	162059500	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162059496_T_TAG:162059496:0,0,0,1
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:7,10:2,11:5,4,14,7
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,6:2,8:4,3,10,4
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	162273212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:3,7,0,4
chr2	162273296	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:7,2,1,1
chr2	162275642	.	G	GAATAACTAACAGGCCAAATACTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=102,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,5,9
chr2	162751427	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,123;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	162814895	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=180,0;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:162814895_T_G:162814895:2,0,1,0
chr2	162814897	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=180,0;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:162814895_T_G:162814895:2,0,1,0
chr2	162814901	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=180,0;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:162814895_T_G:162814895:2,0,1,0
chr2	162814903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=170,0;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:162814895_T_G:162814895:3,0,1,0
chr2	162814907	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=170,0;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:162814895_T_G:162814895:3,0,1,0
chr2	162833486	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	162849944	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr2	162865103	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:4,0:7,4:3,8,2,2
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	162877041	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr2	162890175	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0,0,0,8
chr2	162890196	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr2	163027628	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=216,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:163027628_G_GC:163027628:0,1,0,1
chr2	163027630	.	C	CCGCATGCTGCCTTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=216,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:163027628_G_GC:163027628:0,1,0,1
chr2	163174464	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:15,0:7,4:12,10,2,2
chr2	163200740	.	TCCGCTCGTC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCTCGTC;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:10,0:10,19,1,2
chr2	163292171	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	163693156	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=100,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,1:11,3:9,11,2,2
chr2	163693342	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:163693342_G_GAT:163693342:0,4,0,1
chr2	163693343	.	C	CTTAAAGGGAGCAAAGGTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:163693342_G_GAT:163693342:0,4,0,1
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=94,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:163694878_C_G:163694878:3,1,2,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=94,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:163694878_C_G:163694878:3,1,2,0
chr2	164466217	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:164466217_G_C:164466217:13,5,1,1
chr2	164466221	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:8,2:0|1:164466217_G_C:164466217:14,5,1,1
chr2	164466227	.	G	GACACTACCCCACTTCCTTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:164466217_G_C:164466217:11,4,1,1
chr2	164467484	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=304,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0|1:164467484_G_A:164467484:0,1,1,1
chr2	164467487	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=304,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:164467484_G_A:164467484:0,1,1,1
chr2	164467488	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=231,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:164467484_G_A:164467484:0,2,1,1
chr2	164467491	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,18;MFRL=231,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:164467484_G_A:164467484:0,2,1,1
chr2	164467494	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=12,18;MFRL=158,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0|1:164467484_G_A:164467484:0,1,1,1
chr2	164467498	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,21;MFRL=203,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:164467484_G_A:164467484:1,1,1,1
chr2	164467871	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,256;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.424:29:6,7:9,5:9,8,0,12
chr2	165349459	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=295,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr2	165365042	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:13,2:5,0:0|1:165365042_G_A:165365042:7,11,1,1
chr2	165365048	.	C	CCATCTCAACCTCCAAAGCACTGGGATTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:0|1:165365042_G_A:165365042:7,10,1,1
chr2	165383686	.	AATATATATATATATAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,14;RU=AT;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,1:12,4:13,5,4,1
chr2	165584407	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:8,0,2,1
chr2	165636171	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=104,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:15,9,0,2
chr2	165636332	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	165636343	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,11;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:165636343_A_G:165636343:0,2,0,1
chr2	165636347	.	A	AACATATACATACTTAAGTTTCTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:165636343_A_G:165636343:1,2,0,1
chr2	165694012	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.192:31:9,3:16,2:13,12,2,4
chr2	165771792	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.323:14:7,1:3,2:3,7,0,4
chr2	165809138	.	ATG	A,ATGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,108,70;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=TG;STR;TLOD=19.71,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,3:0.632,0.304:12:0,5,2:0,3,0:0,0,11,1
chr2	165988022	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=291,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	165994524	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=90,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:8,8,3,0
chr2	165996107	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,4:4,4:2,2,3,5
chr2	165997308	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=98,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:10,0:12,3:13,9,1,2
chr2	166003187	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:7,1,2,0
chr2	166003344	.	ATTTG	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=105,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,0:14,2:16,14,1,1
chr2	166003479	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=84,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,6:4,5:5,6,4,7
chr2	166003573	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=235,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,3,2
chr2	166012379	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=94,51;MMQ=60,29;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:15,0:13,4:11,17,0,4
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,22,6
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	166179650	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:1,0,10,2
chr2	166187932	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,105;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:14,0:12,6:12,14,0,6
chr2	166201337	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,76;MMQ=51,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.099:47:20,4:23,0:23,20,1,3
chr2	166210617	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=73,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	166211113	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	166234076	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr2	166237696	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=141,169;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.220:34:13,0:14,7:6,21,7,0
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr2	166731233	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:16,4:12,0:20,8,4,0
chr2	166758460	.	GGA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,2:10,3:1,17,1,4
chr2	166786351	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	166788336	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,7:0,16:0,0,14,13
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr2	166806117	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=121,269;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:13,0:18,7:15,17,0,7
chr2	166847953	.	T	TTTGTTTTTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:6,2:2,0:0|1:166847953_T_TTTGTTTTTG:166847953:6,2,1,1
chr2	166847956	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:3,0:0|1:166847953_T_TTTGTTTTTG:166847953:7,3,1,1
chr2	166848765	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,301805;MMQ=54,29;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,3:11,1:10,7,4,0
chr2	166850970	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,0:4,4:1,3,0,4
chr2	166859325	.	TTCCCCTAGTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	166868765	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:3,14,1,2
chr2	166872111	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:9,2:15,3,1,1
chr2	166872134	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:166872134_T_TC:166872134:15,4,1,1
chr2	166872136	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:166872134_T_TC:166872134:16,4,1,1
chr2	166893081	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:166893081_G_A:166893081:0,0,0,2
chr2	166893089	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:166893081_G_A:166893081:0,0,0,2
chr2	166894230	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr2	166895913	.	CTTT	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.866:13:1,6:0,5:1,1,10,1
chr2	166895932	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.594:45:9,25:8,1:14,4,27,0
chr2	166896143	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,3,26
chr2	166900606	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	166903228	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr2	166903445	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,51;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr2	166904346	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	166904378	.	A	AAATAAAATAATTAAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	166905375	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,13,15
chr2	166905480	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,9,12
chr2	166909544	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr2	166911273	.	GT	AC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:166911273_GT_AC:166911273:5,6,1,1
chr2	166911277	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,1:0|1:166911273_GT_AC:166911273:3,8,1,1
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	167055221	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.087:39:23,0:11,3:22,14,2,1
chr2	167056174	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:8,2:19,0:0|1:167056174_C_T:167056174:8,19,1,1
chr2	167056181	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=91,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:4,2:19,0:0|1:167056174_C_T:167056174:10,13,1,1
chr2	167056185	.	A	AC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=96,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:4,2:20,0:0|1:167056174_C_T:167056174:11,13,1,1
chr2	167056428	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr2	167082978	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	167085560	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=260,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:167085560_GA_TT:167085560:0,1,0,1
chr2	167085562	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=260,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:167085560_GA_TT:167085560:0,1,0,1
chr2	167085565	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=260,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:167085560_GA_TT:167085560:0,1,0,1
chr2	167089976	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,3,2
chr2	167090042	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=89,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:0,1:3,10:1,2,6,5
chr2	167143210	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=227,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=88,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:6,7:2,5:6,2,10,2
chr2	167163043	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.529:30:6,11:8,4:7,7,9,7
chr2	167163199	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=226,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,3,2
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	167167917	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	167261996	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	167262169	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.463:24:5,8:7,3:6,7,8,3
chr2	167263204	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr2	167263252	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=225,96;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr2	167279922	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=82,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:1,5:4,7:2,3,6,7
chr2	167279949	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=111,1777;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,1:9,1:4,8,1,1
chr2	167284315	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:1,0:7,2:4,5,1,1
chr2	167300262	.	GAC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	167313337	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=242,110;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:167328750_C_T:167328750:0,0,5,0
chr2	167328754	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0|1:167328750_C_T:167328750:0,0,5,0
chr2	167328963	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=107,52;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:11,0:13,5:6,18,0,5
chr2	167334234	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr2	167760451	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	167992573	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=206,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	168041107	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:15,0:8,16,1,1
chr2	168041109	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,0:12,3:8,13,0,3
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.829:27:0,16:4,7:2,2,9,14
chr2	168100389	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:5,6:8,0:0|1:168100389_A_G:168100389:6,8,0,7
chr2	168100392	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,7:9,0:0|1:168100389_A_G:168100389:6,8,0,7
chr2	168101381	.	G	GCCCCACCTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=103,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:14,1:4,1:8,11,0,2
chr2	168115954	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=264,159;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168115954_A_G:168115954:0,1,0,1
chr2	168115960	.	T	TATTTCTGTCTCTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=264,159;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168115954_A_G:168115954:0,1,0,1
chr2	168931636	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,5:3,7:1,5,7,5
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.263:32:5,3:19,5:10,14,4,4
chr2	168996775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=98,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,6:2,2:2,1,5,3
chr2	168997097	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=113,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:4,0,4,0
chr2	169020179	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=164,96;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:0,4:3,0:3,1,2,2
chr2	169103936	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=212,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr2	169487660	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	169487668	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	169571414	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	169668052	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:4,2:0|1:169668052_T_G:169668052:6,6,0,2
chr2	169668059	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:169668052_T_G:169668052:6,8,0,2
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGTTTG	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,28,28;MFRL=0,25922358,137;MMQ=60,40,45;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=6.06,20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.283,0.658:8:0,2,4:0,0,1:0,0,1,7
chr2	169690729	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.823:17:1,11:3,2:1,3,5,8
chr2	169707552	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	169711931	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:15,0:23,4:20,18,4,0
chr2	169717446	.	GCCTGGGTCCTACTGGCAGGGCACATTGCTACATTTAAATTTTAGTTTCAGAGCCACTTTGA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.151:21:9,2:5,0:5,12,3,1
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr2	169728069	.	GAAA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=18,16;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.905:18:0,2:0,3:0,1,2,15
chr2	169732612	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:34,1:23,2:25,33,1,2
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	169783729	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:169783729_C_CT:169783729:8,10,1,1
chr2	169783732	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:169783729_C_CT:169783729:8,10,1,1
chr2	169788825	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,203;MMQ=40,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:11,0,2,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,8,11
chr2	169814655	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr2	169820618	.	AT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=145,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr2	169826461	.	TCCCA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169826461_TCCCA_T:169826461:0,0,1,0
chr2	169826467	.	CCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169826461_TCCCA_T:169826461:0,0,1,0
chr2	169828325	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:8,6,2,1
chr2	169828605	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169828605_G_T:169828605:0,1,0,1
chr2	169828608	.	T	TCCTCAGTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169828605_G_T:169828605:0,1,0,1
chr2	169830155	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr2	169836321	.	G	GGGCCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169836321_G_GGGCCC:169836321:0,0,1,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169836321_G_GGGCCC:169836321:0,0,1,0
chr2	169847436	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=133,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:11,1:7,9,1,1
chr2	169851982	.	CAAA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:12,15,1,1
chr2	169938432	.	G	GTTCCA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:25,2:9,0:0|1:169938432_G_GTTCCA:169938432:19,15,1,1
chr2	169938433	.	G	GC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:25,2:9,0:0|1:169938432_G_GTTCCA:169938432:19,15,1,1
chr2	169938438	.	GG	TA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:22,1:6,0:0|1:169938432_G_GTTCCA:169938432:15,15,1,1
chr2	169997149	.	G	GCAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169997149_G_GCAAC:169997149:0,0,0,1
chr2	169997150	.	G	GAAAATAGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169997149_G_GCAAC:169997149:0,0,0,1
chr2	170038785	.	G	GGAGTTTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:6,7,0,2
chr2	170038922	.	T	TAACCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	170060802	.	A	AAAGGACAATATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=138,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	170063004	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:7,3,3,0
chr2	170063489	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=123,77;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:11,0:4,3:8,7,2,1
chr2	170099551	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=118,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:170099551_A_AAAT:170099551:1,5,1,1
chr2	170099552	.	C	CCAAGACAAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=118,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:170099551_A_AAAT:170099551:1,5,1,1
chr2	170099555	.	T	TCCG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=118,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:170099551_A_AAAT:170099551:1,5,1,1
chr2	170115726	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:6,3:2,8,0,3
chr2	170127380	.	TAC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=113,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.162:26:9,1:11,3:10,12,1,3
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	170134228	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.262:16:6,3:6,0:6,6,4,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr2	170145684	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr2	170150634	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,10:0.150:70:23,10:36,0:30,30,10,0
chr2	170151227	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.847:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	170175334	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.409:15:7,4:2,2:7,2,3,3
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr2	170356015	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.160:39:16,5:17,0:18,15,5,1
chr2	170360765	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,2:8,3:8,6,4,1
chr2	170371545	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=138,127;MMQ=53,45;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:1,1:0,0:0,4,1,4
chr2	170374983	.	G	GTCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=243,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:170374983_G_GTCTT:170374983:0,2,0,1
chr2	170374984	.	G	GCTCTGTTGCCCAGGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=243,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170374983_G_GTCTT:170374983:0,2,0,1
chr2	170413709	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=98,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:3,0:6,3:5,4,3,0
chr2	170413897	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	170462632	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=105,48;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.177:41:12,0:22,6:18,16,0,7
chr2	170465345	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,194;MMQ=58,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,1:4,3:0,12,0,4
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,16,11
chr2	170492682	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=100,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:29,3:18,0:20,27,1,2
chr2	170492754	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=138,270;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:11,0:7,16:0|1:170492754_T_C:170492754:6,12,0,16
chr2	170492757	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=138,270;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:11,0:7,16:0|1:170492754_T_C:170492754:6,12,0,16
chr2	170493103	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,24:0,0,28,19
chr2	170502343	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,6,1
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,12:0,0,17,4
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,3,23
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr2	170550727	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=83,45;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,2:9,5:10,6,5,2
chr2	170597835	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=213,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr2	170606293	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,7:2,2:0,3,0,9
chr2	170629766	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170632960	.	C	CA,CAA,CAAAAA	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=30,30,29,30;MFRL=134,147,118,29;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,20,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=8,9,10,13;RU=A;STR;TLOD=47.48,7.87,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,24,6,4:0.651,0.174,0.126:35:0,9,1,1:1,12,4,1:1,0,13,21
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=161.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,12:0,27:0,0,15,25
chr2	170633001	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.741:29:2,5:5,14:1,6,10,12
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,2,6
chr2	170667742	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,56;MMQ=56,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:9,3:12,7,0,3
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr2	170668811	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=256,166;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170668811_G_T:170668811:2,0,1,0
chr2	170668813	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=166,256;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	170668814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=256,166;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170668811_G_T:170668811:2,0,1,0
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	170684285	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170684285_G_A:170684285:0,0,0,1
chr2	170684295	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170684285_G_A:170684285:0,0,0,1
chr2	170751840	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:170751840_G_A:170751840:4,11,1,1
chr2	170751841	.	CTTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:170751840_G_A:170751840:4,11,1,1
chr2	170751847	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:170751840_G_A:170751840:3,10,1,1
chr2	170751850	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,1:0|1:170751840_G_A:170751840:3,11,1,1
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170782220	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:11,4:21,0:11,21,2,2
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.850:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	170783208	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=92,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:22,3:13,0:17,18,1,2
chr2	170783442	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:13,0:0|1:170783442_A_T:170783442:15,10,1,1
chr2	170783446	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:170783442_A_T:170783442:15,10,1,1
chr2	170783449	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=142,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:0|1:170783442_A_T:170783442:14,8,1,1
chr2	170804033	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=80,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	170850922	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=108,131;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,0:13,4:11,17,4,0
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	170897424	.	C	CTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=146,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:1,2:5,0:0|1:170897424_C_CTCT:170897424:5,1,1,1
chr2	170897430	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,0:0|1:170897424_C_CTCT:170897424:7,1,1,1
chr2	170917983	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.906:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr2	171055942	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr2	171056569	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	171070850	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,19,7
chr2	171070912	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=317,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.946:34:0,12:1,21:1,0,12,21
chr2	171071369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	171240264	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=100,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:8,14,3,0
chr2	171243601	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:7,2,6,0
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=241,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr2	171259308	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=73,303;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:4,1,2,0
chr2	171260787	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=104,214;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,1:13,2:9,7,2,1
chr2	171260820	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,4:9,2:5,6,4,2
chr2	171264179	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.678:20:2,6:4,6:4,2,11,3
chr2	171300575	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=82,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr2	171300648	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=85,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,3:2,10:2,2,3,10
chr2	171356274	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,15:0,0,13,15
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	171358474	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	171503323	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,125;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	171570768	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:7,11,1,1
chr2	171570779	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=120,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:7,2:0|1:171570779_C_T:171570779:7,6,1,1
chr2	171570781	.	G	GAGACGAGGTT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0|1:171570779_C_T:171570779:6,5,1,1
chr2	171572906	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr2	171572940	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	171693455	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr2	171702480	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:2,14:2,6:1,3,12,8
chr2	171715459	.	GA	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=195,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr2	171786239	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,17:0,0,19,20
chr2	171793242	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:171793242_G_GT:171793242:0,3,0,1
chr2	171793243	.	G	GAGCCATGCAGGGGATGATCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:171793242_G_GT:171793242:0,3,0,1
chr2	171793287	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	171806232	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=115,137;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,18:0.320:57:22,0:17,18:21,18,0,18
chr2	171807835	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:12,8,1,1
chr2	171813158	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=102,268;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:171813158_CA_TG:171813158:0,2,0,1
chr2	171813170	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=102,268;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:171813158_CA_TG:171813158:0,2,0,1
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,3,10
chr2	171819326	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:4,2:7,2,1,1
chr2	171862578	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,1:5,3:8,1,3,1
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	171906469	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,6:0,15:0,1,6,15
chr2	171911574	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.113:50:20,0:25,5:28,17,5,0
chr2	171911713	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,19,34;MFRL=94,167,88;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=A;STR;TLOD=5.91,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,6:0.314,0.490:12:1,1,1:1,0,3:1,1,1,9
chr2	172016756	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	172194020	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,14:0.234:62:17,0:31,14:20,28,0,14
chr2	172305092	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	172305129	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:4,0,0,2
chr2	172305177	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.659:14:3,5:2,1:5,0,7,2
chr2	172305263	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.118:40:16,4:19,0:0|1:172305263_C_T:172305263:19,17,2,2
chr2	172305265	.	T	TGAACCCCTGAGGAGGGA	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:17,4:18,0:0|1:172305263_C_T:172305263:19,17,2,2
chr2	172305328	.	G	GCCATGTTTAAGTGCTT	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:15,1:19,2:0|1:172305328_G_GCCATGTTTAAGTGCTT:172305328:9,25,0,3
chr2	172305332	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:11,1:18,2:0|1:172305328_G_GCCATGTTTAAGTGCTT:172305328:8,24,0,3
chr2	172333295	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr2	172336541	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=97,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:5,1,4,5
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=220,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,0,2
chr2	172378893	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=220,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,0,2
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:0,5:1,9:1,0,10,4
chr2	172379781	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:6,11:7,8:7,6,9,10
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:5,5,5,4
chr2	172398386	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=184,154;MMQ=52,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:172398386_T_C:172398386:0,2,0,1
chr2	172398403	.	C	CTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=200,154;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:172398386_T_C:172398386:0,4,0,1
chr2	172411273	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.718:37:4,10:6,17:5,5,13,14
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=64.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.753:26:5,7:1,12:5,1,17,3
chr2	172563922	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:0,8,1,4
chr2	172571985	.	G	GTTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=218,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172571985_G_GTTCCCC:172571985:0,1,0,1
chr2	172571986	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=218,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172571985_G_GTTCCCC:172571985:0,1,0,1
chr2	172582108	.	GT	G,GTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,23,28;MFRL=137,86,118;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=9.46,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,8,7:0.270,0.223:29:6,1,4:3,3,2:9,5,6,9
chr2	172582111	.	T	TG	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.185:32:11,5:15,1:12,14,5,1
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr2	172584380	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,105;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.736:32:3,13:4,11:2,6,13,11
chr2	172642057	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr2	172666802	.	GA	TC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:15,2:12,0:10,18,1,1
chr2	172683495	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=139,270;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr2	172712505	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr2	172750746	.	CGAGCGAGT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:13,0:7,2:6,14,1,1
chr2	172750779	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=114,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GC;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr2	172822038	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.213:16:8,3:5,0:5,8,1,2
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=360,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,4:1,1:2,0,2,3
chr2	172943883	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.334:10:3,1:4,1:0|1:172943883_G_GT:172943883:7,0,2,1
chr2	172943894	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:1,0:0|1:172943883_G_GT:172943883:9,0,1,1
chr2	172950761	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=157,118;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:0|1:172950761_G_A:172950761:3,13,0,3
chr2	172950769	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=135,118;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,0:7,3:0|1:172950761_G_A:172950761:3,8,0,3
chr2	172967302	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,12:0,0,5,19
chr2	173332115	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=239,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	173333815	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,6:0,3:2,0,9,0
chr2	173334161	.	T	TATGATTTAGTACC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,0:0,4,0,2
chr2	173337519	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=205,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:4,8:6,11:5,5,6,13
chr2	173339808	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:14,9:8,2:10,12,3,8
chr2	173344474	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=64,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:2,7:0,16:1,1,11,12
chr2	173344476	.	C	CTTTTCATATGCTGATGGGA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=72,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:14,0:11,12,1,1
chr2	173352536	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:9,0:10,4:4,15,2,2
chr2	173356032	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.593:30:2,7:10,10:7,5,9,9
chr2	173362697	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,31:0.618:50:12,16:6,15:15,4,18,13
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.342:18:3,2:7,4:2,10,1,5
chr2	173427053	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:4,4:8,6:4,8,2,8
chr2	173428874	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr2	173435374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr2	173435559	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:15,1:8,3:15,11,3,1
chr2	173435578	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:4,1:6,6,1,3
chr2	173451045	.	GAC	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,2:14,1:12,14,0,3
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr2	173662298	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=82,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,0:8,4:13,10,2,2
chr2	173679199	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=244,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:173679199_A_AC:173679199:0,1,0,1
chr2	173679202	.	G	GAATCCTACACCCCCAACCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=244,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:173679199_A_AC:173679199:0,1,0,1
chr2	173679203	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=244,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:173679199_A_AC:173679199:0,1,0,1
chr2	173679206	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=244,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:173679199_A_AC:173679199:0,1,0,1
chr2	173825951	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:1,4,3,5
chr2	173848200	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr2	173848401	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	173861256	.	TTGAGGCAACTTTAAA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:15,0:17,2:21,17,1,1
chr2	173865976	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,9:0,15:0,0,18,7
chr2	173866110	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=101,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:1,7:5,3:1,5,0,11
chr2	173881198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:173881198_T_C:173881198:0,7,1,1
chr2	173881199	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:173881198_T_C:173881198:0,7,1,1
chr2	173881206	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:173881198_T_C:173881198:0,7,1,1
chr2	173881208	.	AA	GC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:173881198_T_C:173881198:0,7,1,1
chr2	173883523	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,2:6,1:7,11,2,1
chr2	173885389	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:6,1:9,8,2,0
chr2	174068513	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr2	174085975	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=102,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:20,0:23,3:33,11,3,0
chr2	174086285	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:7,0:15,7:7,15,1,6
chr2	174094500	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:9,10:7,3:5,11,6,7
chr2	174104153	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:13,4:15,0:14,16,2,2
chr2	174123399	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	174123624	.	C	CAATGGCGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:174123624_C_CAATGGCGTGA:174123624:0,1,0,1
chr2	174123626	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:174123624_C_CAATGGCGTGA:174123624:0,1,0,1
chr2	174131511	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.651:13:1,3:4,5:0,5,0,8
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,11:0,2:0,0,6,7
chr2	174230302	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:6,2:1,0:1,6,0,2
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr2	174777699	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,0,1
chr2	174819713	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:14,5:6,6:13,7,4,7
chr2	174829314	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=72,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,0,1
chr2	174943876	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	175093978	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:9,4:12,8:16,5,8,4
chr2	175199803	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=130,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:15,4:11,2:16,10,5,1
chr2	175199839	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.115:49:20,5:24,0:24,20,4,1
chr2	175199869	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.176:43:22,2:14,5:18,18,5,2
chr2	175202174	.	GGGCGGCGGCAGCGGC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCGGCGGCAGCGGC;STR;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.784:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr2	175213873	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:2,8,0,2
chr2	175246403	.	GAAAA	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.050:58:18,2:24,0:23,33,1,1
chr2	175263218	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=218,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	175289259	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:14,3:9,10:11,12,6,7
chr2	175306804	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:10,3:14,5:15,9,5,3
chr2	175309769	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:8,2,3,1
chr2	175318396	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	175318590	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,4:4,3,2,5
chr2	175324505	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=193,233;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:3,0,2,0
chr2	175326162	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:8,13:15,0:12,11,13,0
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	175426750	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr2	175431707	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr2	175432855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=229,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	175436234	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	175436940	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	175439536	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,4,0
chr2	175439681	.	TAA	TA,TAAAA,T,TAAA	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=28,22,25,27,26;MFRL=146,109,110,66,146;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=28,16,28,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,15,11,14;RU=A;STR;TLOD=5.88,18.94,3.14,11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,5,12,2,7:0.143,0.375,0.075,0.251:31:1,3,8,1,2:3,1,3,1,3:0,5,2,24
chr2	175439697	.	TACAGGTTAC	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:12,3:17,0:0|1:175439697_TACAGGTTAC_T:175439697:2,30,0,3
chr2	175439709	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:10,3:15,0:0|1:175439697_TACAGGTTAC_T:175439697:1,26,0,3
chr2	175445980	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:13,6:3,0:15,1,6,0
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	175614716	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:9,2:11,7:13,7,5,4
chr2	175614846	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:8,0:17,3:0|1:175614846_A_T:175614846:11,14,0,3
chr2	175614848	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:8,0:17,3:0|1:175614846_A_T:175614846:11,14,0,3
chr2	175614908	.	CAAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,33,33;MFRL=115,53576893,62;MMQ=60,60,60;MPOS=8,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.251:9:0,1,0:2,1,2:2,3,0,4
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=199.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,31:0,39:0,0,16,54
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.731:17:2,4:1,6:3,1,4,9
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,4,0
chr2	175711611	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,2:9,0:13,2,3,0
chr2	175711942	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr2	175712416	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=67,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.158:33:14,0:14,4:12,16,5,0
chr2	175939461	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=82,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:11,10,0,3
chr2	176042921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr2	176795003	.	AACACACACACACACACACACACAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,9;RU=AC;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.792:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	176804220	.	T	TAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=182,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr2	176844508	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=235,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,5,2
chr2	176844644	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:1,5:6,12:2,5,8,11
chr2	176958197	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr2	176958437	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,2,0
chr2	176959113	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=180,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=CA;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	176964747	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr2	176994623	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=188,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,5:1,0:1,0,4,1
chr2	177033779	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr2	177054411	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:2,2,3,5
chr2	177465595	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=202,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	178080266	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=121,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.081:71:33,4:33,1:32,34,0,5
chr2	178080828	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	178098087	.	CA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.197:44:17,4:19,4:9,27,0,8
chr2	178129390	.	TGGC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,5:0,1:0,2,0,8
chr2	178257613	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	178310433	.	T	TCGATAAATAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,2
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,2
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=216,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	178482698	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,92;MMQ=60,51;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,1:6,2:3,12,2,1
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=70.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:4,12:4,8:6,2,14,7
chr2	178528555	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr2	178528641	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:5,5,1,2
chr2	178528657	.	C	CTATGTATCCATCCATCCTTCCAACTGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,15:0,0,17,8
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,8:2,5:2,2,10,3
chr2	178633945	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=78,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:4,3,5,0
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	178988164	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,6:3,0:8,0,0,6
chr2	178988607	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:6,0:19,2:0|1:178988607_G_C:178988607:10,16,0,2
chr2	178988610	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:5,0:19,2:0|1:178988607_G_C:178988607:10,16,0,2
chr2	179197332	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=165,165;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:16,3,2,0
chr2	179197857	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:179197857_C_T:179197857:0,4,0,1
chr2	179197863	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:179197857_C_T:179197857:0,4,0,1
chr2	179296821	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:6,2,8,2
chr2	179300971	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,13:0.359:37:11,9:12,3:0|1:179300971_G_A:179300971:11,13,7,6
chr2	179300979	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=94,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.343:33:8,8:13,3:0|1:179300971_G_A:179300971:11,11,6,5
chr2	179306397	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.072:66:36,4:25,0:29,33,3,1
chr2	179314990	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=111,92;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,5:0.066:85:44,4:35,0:51,29,3,2
chr2	179315031	.	T	C	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=108,1453;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,6:0.075:83:36,3:41,2:36,41,2,4
chr2	179315734	.	GGC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=99,707;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,4:6,2:0|1:179315734_GGC_G:179315734:7,5,2,5
chr2	179315757	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=99,710;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:5,9:6,4:0|1:179315734_GGC_G:179315734:5,7,4,9
chr2	179315781	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=132,720;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:2,6:4,5:2,4,2,10
chr2	179330480	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,147;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr2	179334406	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:12,2:11,2:0|1:179334406_G_A:179334406:10,13,2,2
chr2	179334412	.	GT	AA	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:12,2:12,2:0|1:179334406_G_A:179334406:11,14,2,2
chr2	179334416	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,2:12,2:0|1:179334406_G_A:179334406:12,14,2,2
chr2	179334420	.	GT	CA	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:12,2:11,2:0|1:179334406_G_A:179334406:12,12,2,2
chr2	179334424	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,2:12,2:0|1:179334406_G_A:179334406:12,12,2,2
chr2	179342038	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	179343148	.	T	TTCCTC	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.149:38:17,5:16,0:0|1:179343148_T_TTCCTC:179343148:20,13,3,2
chr2	179343151	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,2:15,0:0|1:179343148_T_TTCCTC:179343148:20,14,0,2
chr2	179343153	.	C	CTTCTTTCT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,2:14,0:0|1:179343148_T_TTCCTC:179343148:20,13,0,2
chr2	179345666	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=84,84;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:20,0:14,7:22,14,0,7
chr2	179353824	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=199,99;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,8:2,0:0,3,0,8
chr2	179360350	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,55;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.096:34:14,2:16,0:18,13,1,2
chr2	179360370	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,55;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:15,2:14,0:0|1:179360370_C_A:179360370:18,15,1,1
chr2	179360372	.	T	TTAA	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=132,55;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:15,2:16,0:0|1:179360370_C_A:179360370:17,15,1,1
chr2	179360374	.	C	CTGTACCAGA	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,55;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:14,0:0|1:179360370_C_A:179360370:17,15,1,1
chr2	179363909	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:4,3:5,4:4,6,5,2
chr2	179395560	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=89,68;MMQ=60,30;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.123:62:24,0:31,7:27,28,6,1
chr2	179398331	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:13,8,0,2
chr2	179399156	.	C	CTCAGCTTTGCTTTCTCCCGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	179406226	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=95,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,1:6,1:8,12,2,0
chr2	179409252	.	GAGATGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=186,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179409252_GAGATGCA_G:179409252:0,1,0,1
chr2	179409266	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=186,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179409252_GAGATGCA_G:179409252:0,1,0,1
chr2	179411158	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:7,9,3,0
chr2	179411291	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,0:5,3:0|1:179411291_A_C:179411291:13,2,0,3
chr2	179411294	.	ATTTT	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,0:5,3:0|1:179411291_A_C:179411291:15,2,0,3
chr2	179411304	.	GG	AA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,0:7,3:0|1:179411291_A_C:179411291:17,3,0,3
chr2	179411307	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:12,0:7,2:0|1:179411291_A_C:179411291:17,3,0,3
chr2	179419149	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr2	179424858	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=98,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:16,3:4,0:5,15,3,0
chr2	179429736	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=187,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:9,1,2,1
chr2	179432175	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:5,5:5,0:6,4,5,0
chr2	179437954	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:6,9,0,2
chr2	179439210	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr2	179441006	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=137,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:179441006_C_T:179441006:5,9,1,1
chr2	179441012	.	C	CTCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=145,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:179441006_C_T:179441006:4,9,1,1
chr2	179441015	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=158,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:7,2:0|1:179441006_C_T:179441006:4,9,1,1
chr2	179442947	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,5:3,0:1,2,0,5
chr2	179444768	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	179448593	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:179448593_A_T:179448593:11,9,1,1
chr2	179448598	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:0|1:179448593_A_T:179448593:11,8,1,1
chr2	179448601	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:0|1:179448593_A_T:179448593:11,8,1,1
chr2	179450041	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=86,96;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:16,0:10,6:0|1:179450041_G_C:179450041:7,19,0,6
chr2	179450047	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=86,96;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:13,0:8,6:0|1:179450041_G_C:179450041:6,17,0,6
chr2	179454063	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:9,6:16,0:11,14,6,0
chr2	179456456	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,0:15,3:10,22,0,3
chr2	179460214	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.284:9:1,2:6,0:6,1,2,0
chr2	179460624	.	G	GATAGACAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179462712	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=108,87;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:0|1:179462712_C_T:179462712:4,7,0,3
chr2	179462720	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=108,87;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:4,3:0|1:179462712_C_T:179462712:5,6,0,3
chr2	179464151	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr2	179466444	.	C	CAAATCTGCTGGTAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=208,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.190:13:2,2:9,0:4,7,1,1
chr2	179468863	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=131,70;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:17,3:5,0:13,9,2,1
chr2	179474163	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=91,114;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,0:10,3:11,11,0,3
chr2	179477296	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=190,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:179477296_T_A:179477296:1,7,1,1
chr2	179477301	.	G	GAACTTTCAAACACTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=183,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,1:0|1:179477296_T_A:179477296:1,6,1,1
chr2	179483576	.	TGCA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:3,2:2,8,1,1
chr2	179499153	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.171:19:6,0:10,2:10,6,0,3
chr2	179499293	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,3:11,0:13,11,2,1
chr2	179507130	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=269,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:179507130_T_TA:179507130:0,1,0,1
chr2	179507133	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=269,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:179507130_T_TA:179507130:0,1,0,1
chr2	179507136	.	T	TTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=269,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179507130_T_TA:179507130:0,1,0,1
chr2	179511767	.	GTATATA	G,GTATA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20,32;MFRL=95,60,178;MMQ=60,60,60;MPOS=4,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,10;RU=TA;STR;TLOD=6.56,10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,5:0.172,0.291:18:5,2,1:3,1,3:7,3,5,3
chr2	179534967	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=104,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.091:30:13,1:14,1:18,10,2,0
chr2	179537446	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,242;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,0:3,5:1,5,0,5
chr2	179543286	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:2,9,1,2
chr2	179548695	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=67,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.577:13:0,4:4,2:3,3,6,1
chr2	179548791	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:9,1:19,2:12,16,0,3
chr2	179549366	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,0;MFRL=111,57;MMQ=60,54;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.190:40:10,0:21,0:0|1:179549366_G_GA:179549366:17,16,7,0
chr2	179549374	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=95,57;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,7:0.181:42:10,7:25,0:0|1:179549366_G_GA:179549366:18,17,7,0
chr2	179559613	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=77,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,0:9,5:8,9,0,5
chr2	179563601	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:179563601_A_T:179563601:10,5,1,1
chr2	179563614	.	G	GCTGGTC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:179563601_A_T:179563601:9,5,1,1
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	179569392	.	T	TTATTCTCCTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179569392_T_TTATTCTCCTAGCC:179569392:0,1,0,1
chr2	179569395	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179569392_T_TTATTCTCCTAGCC:179569392:0,1,0,1
chr2	179569397	.	C	CTCTGATCAAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179569392_T_TTATTCTCCTAGCC:179569392:0,1,0,1
chr2	179574494	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:1,3,1,0
chr2	179576956	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:179576956_C_T:179576956:7,13,1,1
chr2	179576961	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:179576956_C_T:179576956:7,14,1,1
chr2	179576966	.	TAA	GCC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=134,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:179576956_C_T:179576956:7,13,1,1
chr2	179577811	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:14,10,1,2
chr2	179578108	.	TACAAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ACAAA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,2:6,0:6,10,1,1
chr2	179578759	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=157,73218708;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.143:18:6,2:10,0:9,7,2,0
chr2	179580314	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:10,0:10,6:12,8,0,6
chr2	179582813	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=182,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	179583850	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=108,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:7,0:13,4,5,0
chr2	179584478	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,0:3,2:4,3,2,0
chr2	179597450	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:12,6:7,0:8,12,6,0
chr2	179604502	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=113,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:7,9,3,0
chr2	179605059	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,53;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.174:16:3,0:9,2:0|1:179605059_C_T:179605059:7,7,1,1
chr2	179605065	.	C	CCCTTTCTTTTTTCCTTCCTTTCTTCCTTCTACT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,53;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:10,2:0|1:179605059_C_T:179605059:6,7,1,1
chr2	179614952	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr2	179615000	.	C	CAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=132,73236782;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:11,7,0,2
chr2	179623758	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,8,10
chr2	179623939	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	179629156	.	T	TAACTGCTCTTCCCCAAAGCTATTCTCTTAGCCTAGAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=297,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	179629461	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,13,9
chr2	179632710	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr2	179634376	.	GTA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	179634824	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,2:7,2:8,7,1,3
chr2	179635882	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	179639789	.	CC	TT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,0:9,2:12,15,1,1
chr2	179642425	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	179643886	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	179643934	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	179644855	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,17,11
chr2	179647711	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:14,0:7,10:11,10,0,10
chr2	179648523	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:0|1:179648523_AC_A:179648523:8,11,1,1
chr2	179648528	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:179648523_AC_A:179648523:7,11,1,1
chr2	179650954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	179654800	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:0|1:179654800_C_A:179654800:9,13,1,1
chr2	179654805	.	A	AATCTAATTTCTGTTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:179654800_C_A:179654800:9,13,1,1
chr2	179658199	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,72;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,0:13,3:9,10,0,3
chr2	179702114	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:3,6,3,0
chr2	179710555	.	A	AAGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179710555_A_AAGGT:179710555:0,1,0,1
chr2	179710556	.	C	CCTCTAAAGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179710555_A_AAGGT:179710555:0,1,0,1
chr2	179714675	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	179732980	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	179732997	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	179736944	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=92,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.352:51:10,8:23,8:16,17,18,0
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	179839833	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr2	179988395	.	TA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25,24;MFRL=162,179,152;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.86,20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,13:0.159,0.733:16:1,1,5:0,1,6:1,0,14,1
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	180047908	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr2	180311207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=273,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	180348245	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	180409496	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=216,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,4:4,1:5,1,5,1
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	180810264	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,24,14
chr2	180815528	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr2	180835792	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.959:21:0,6:0,15:0|1:180835792_T_A:180835792:0,0,6,15
chr2	180835798	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:5,0:11,3:0|1:180835792_T_A:180835792:5,11,1,2
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,7,1
chr2	180838006	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.621:32:6,5:5,14:5,7,9,11
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	181851996	.	TT	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:7,2,3,2
chr2	182344846	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=100,144;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.514:36:12,6:4,12:11,7,14,4
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,1:5,2:2,4,0,3
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	182360182	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:0,7:3,3:1,2,3,7
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,6:4,2:7,5,6,2
chr2	182374534	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=73,73;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,3:0,4:0,2,2,5
chr2	182374553	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=172,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:182374553_A_T:182374553:1,6,0,2
chr2	182374567	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=175,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:182374553_A_T:182374553:0,5,0,2
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=104,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	182399497	.	A	AT,ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28,27;MFRL=166,149,109;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.23,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,5:0.363,0.395:12:1,2,3:2,2,1:3,0,8,1
chr2	182399638	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,8:0,0,5,13
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=137,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,7:0,0,11,1
chr2	182403851	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,9,8
chr2	182412633	.	G	GACACACACAC,GACACACACACACAC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=148,191,148;MMQ=60,60,57;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,9,11;RU=AC;STR;TLOD=9.31,11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.307,0.350:13:3,1,0:3,2,4:1,5,0,7
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=241,58681482;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:182413602_A_T:182413602:0,1,0,2
chr2	182413610	.	C	CCATTTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=58681540,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:182413602_A_T:182413602:0,2,0,1
chr2	182430233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:0,3,1,2
chr2	182468803	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=100,185;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:4,3:4,1:2,7,2,2
chr2	182766661	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=73,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.162:26:8,2:13,1:10,12,0,4
chr2	182778704	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:3,5:0,1:0,3,1,6
chr2	182785263	.	ATATGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:182785263_ATATGC_A:182785263:1,0,1,0
chr2	182785273	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,25;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:182785263_ATATGC_A:182785263:1,0,1,0
chr2	182785276	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:182785263_ATATGC_A:182785263:1,0,1,0
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,14:0,19:0,0,10,23
chr2	182981846	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,0:1,6:4,0,6,0
chr2	183033020	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.661:10:1,4:0,0:1,2,2,5
chr2	183033060	.	A	AGATATTTTCTGTGGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=82,85;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	183053658	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr2	183066377	.	C	CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,29,17;MFRL=202,139,133;MMQ=60,60,60;MPOS=24,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.35,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,7:0.264,0.376:17:3,3,1:2,0,1:5,1,4,7
chr2	183066391	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=131,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.148:28:6,2:14,2:9,15,4,0
chr2	183066394	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=104,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.125:33:6,2:15,2:12,17,4,0
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,15,8
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr2	183595701	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,4,9
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=223,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr2	183699584	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=98,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:5,2,3,2
chr2	183817579	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,55;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:13,0:6,3:0|1:183817579_C_T:183817579:7,12,2,1
chr2	183817581	.	C	CGTTTCTCCTTAGGTATTTGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,55;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:0|1:183817579_C_T:183817579:8,13,1,1
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	183943884	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:12,0:9,6:9,12,1,5
chr2	183960143	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.277:13:6,3:4,0:9,1,3,0
chr2	183993278	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=216,181;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	183998237	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr2	183998366	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.632:11:1,4:1,1:2,2,4,3
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,3:0,1,2,12
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,2,7
chr2	186673763	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:21,5:13,0:23,11,2,3
chr2	186673797	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:12,12:8,0:13,7,11,1
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,1:0,12:0,0,10,3
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:3,0:3,2:6,0,3,0
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.874:6:0,2:0,4:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,0,1,5
chr2	187369020	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,4,0,1
chr2	187369022	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,4,0,1
chr2	187369024	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,4,0,1
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr2	187490371	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.369:41:19,8:5,5:7,19,5,10
chr2	187490405	.	TGAGA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GA;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,5:4,1:0,7,0,6
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,3,1
chr2	187519338	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.540:24:6,5:4,7:8,3,7,6
chr2	187519365	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.118:45:21,5:18,0:24,16,3,2
chr2	187531818	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:9,0,2,0
chr2	187532417	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,17,8
chr2	187540732	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	187559029	.	A	ACAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=CAG;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,3:0,1:0,0,4,2
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	187605214	.	G	GCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,252;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:2,14,0,2
chr2	187605219	.	T	TCTGGGAAAGTTTTTA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:2,11,0,3
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	187627337	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=72,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,2,1
chr2	187697841	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:14,1:13,11,2,0
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	187698751	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=208,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:2,3,0,2
chr2	187698784	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=207,618;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:1,6,0,2
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr2	188224025	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=139,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:0|1:188224025_T_A:188224025:2,10,0,2
chr2	188224027	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,1:6,1:0|1:188224025_T_A:188224025:2,11,0,2
chr2	188224029	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,1:7,1:0|1:188224025_T_A:188224025:2,9,0,2
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	189448931	.	TATTTAGCATTACA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,3:1,1:10,2,3,1
chr2	189851828	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,2:6,1:5,8,1,2
chr2	189854746	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=193,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,5:0,8:1,0,9,5
chr2	189856233	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:17,0:8,3:14,12,0,3
chr2	189857993	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=271,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	189858675	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,0;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr2	189858809	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:6,14,1,2
chr2	189859073	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:6,4:1,9,1,7
chr2	189859434	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.158:21:7,1:8,2:12,6,3,0
chr2	189859442	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,0:13,3:20,8,1,2
chr2	189860792	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,3:7,4:8,0,7,0
chr2	189860975	.	AGTGT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=GT;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr2	189860997	.	T	TGTGTGTTGTGTTTCTGAACTTAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=222,139;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr2	189862048	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:4,4:8,1:8,4,3,3
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	189862352	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:4,0,3,6
chr2	189862890	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=92,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	189864023	.	GCCCCTGGTGAACGTGGACCTCCTGGATTGGCAGGGGCCCCAGGACTTAGAGGTGGAGCTGGTC	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.113:35:13,0:3,3:17,15,0,3
chr2	189864582	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=75,109;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:15,6:8,9:13,12,7,8
chr2	189864605	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=66,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:20,0:12,8:14,19,8,0
chr2	189864725	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	189866342	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:1,4:4,3:1,4,2,5
chr2	189866901	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:3,14:5,0:8,0,14,0
chr2	189867144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:1,2,1,6
chr2	189868381	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:1,5:1,2:0,2,6,2
chr2	189868410	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,8:3,3:2,3,8,3
chr2	189870019	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	189870246	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,0:0,6,0,3
chr2	189871573	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr2	189871623	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,6:5,3:0|1:189871623_G_A:189871623:6,6,8,1
chr2	189871627	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.479:23:7,8:4,3:0|1:189871623_G_A:189871623:6,6,9,2
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,0:5,3:8,1,3,0
chr2	189898842	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:189898842_G_C:189898842:7,2,1,1
chr2	189898847	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:189898842_G_C:189898842:7,2,1,1
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	189906352	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,53;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:11,11,3,0
chr2	189910039	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,2:8,0:4,11,0,2
chr2	189910066	.	ATG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=129,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.487:9:2,2:3,2:1,4,0,4
chr2	189917016	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:8,0:7,2:2,13,0,2
chr2	189917030	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.180:14:7,0:5,2:0|1:189917030_C_T:189917030:2,10,0,2
chr2	189917031	.	AGG	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.171:15:7,0:5,2:0|1:189917030_C_T:189917030:2,11,0,2
chr2	189917036	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.171:15:8,0:5,2:0|1:189917030_C_T:189917030:2,11,0,2
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25,25;MFRL=0,152,128;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=11.90,18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,10:0.362,0.591:16:0,3,5:0,3,5:0,0,4,12
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,7,22
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189928816	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=90,49;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:4,11,0,4
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=85182,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	189943274	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=143,78;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:18,0:23,4:0|1:189943274_C_T:189943274:14,28,1,4
chr2	189943276	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=143,78;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:8,1:18,4:0|1:189943274_C_T:189943274:14,28,1,4
chr2	189957190	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=24,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:189957190_A_C:189957190:1,7,1,1
chr2	189957195	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=196,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:189957190_A_C:189957190:1,6,1,1
chr2	189957198	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:189957190_A_C:189957190:1,5,1,1
chr2	189957211	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=30,30;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:189957211_G_T:189957211:1,3,0,1
chr2	189957212	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,35;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:189957211_G_T:189957211:1,3,0,1
chr2	189957216	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:189957211_G_T:189957211:1,3,0,1
chr2	189957218	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:189957211_G_T:189957211:1,3,0,1
chr2	189957224	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=25,25;MFRL=211,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:189957224_A_T:189957224:1,1,0,2
chr2	189957227	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=36,26;MFRL=211,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:189957224_A_T:189957224:1,1,0,2
chr2	189957231	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=31,29;MFRL=225,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:189957224_A_T:189957224:1,0,0,2
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	190319966	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,150;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	190444623	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:12,4:20,0:0|1:190444623_G_GTGTGTGTGT:190444623:13,19,2,2
chr2	190444625	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:11,2:19,0:0|1:190444623_G_GTGTGTGTGT:190444623:13,19,2,2
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,4:12,4:9,11,3,5
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,2,1
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	190541843	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:190541843_T_A:190541843:0,0,0,1
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chr2	190559794	.	C	CCATTATTTAAAAGTTA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:190559787_TA_AT:190559787:5,7,1,1
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr2	190593168	.	ATTTTT	A,TTTTTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,24,20;MFRL=110,67,95;MMQ=60,60,40;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.84,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,5,2:0.202,0.103:26:12,5,0:5,0,2:14,5,3,4
chr2	190593173	.	T	TCC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,95;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:190593173_T_TCC:190593173:16,5,1,1
chr2	190593174	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=93,95;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:5,2:0|1:190593173_T_TCC:190593173:16,7,1,1
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	190602645	.	G	GTGCCCTTTAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=254,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:2,8:6,11:4,4,11,9
chr2	190611189	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:16,2:14,14,1,1
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:2,2:4,2:0,6,0,5
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	190670539	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,3:3,5:3,2,6,2
chr2	190682989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	191065042	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:4,7,1,1
chr2	191065236	.	TTTTG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,7:4,3:1,3,6,4
chr2	191066769	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,18:0,0,9,19
chr2	191067477	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:12,0:13,5:7,18,0,5
chr2	191067766	.	T	TTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:4,1,6,4
chr2	191109533	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	191116355	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr2	191155233	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=17,27;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:0,1:1,1:0|1:191155233_TA_T:191155233:1,1,0,2
chr2	191155257	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:191155233_TA_T:191155233:1,2,0,1
chr2	191155258	.	A	AAATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=216,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:191155233_TA_T:191155233:1,1,0,1
chr2	191155262	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=216,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:191155233_TA_T:191155233:1,1,0,1
chr2	191159232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr2	191161622	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:14,4:7,4:12,9,5,3
chr2	191161761	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,0:4,6:0,9,0,6
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,14,17
chr2	191224752	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,6:4,6:6,1,11,1
chr2	191227235	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=92,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:2,3,2,0
chr2	191227260	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=240,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,0,3
chr2	191227492	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,6:1,8:0,4,0,14
chr2	191231503	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,5:4,8:4,1,6,7
chr2	191231520	.	CC	TT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,0:15,2:10,12,1,1
chr2	191235702	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:13,0:22,2:19,16,2,2
chr2	191301915	.	C	CCACACAACTCCTACTCAAATAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.162:15:5,2:8,0:7,6,0,2
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,2:0,0,7,5
chr2	191353562	.	C	CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:8,2:12,1:4,17,1,2
chr2	191354572	.	CAGTGCCAGATGAGGAAGAAGGTAATTATTTCCATTCTTTCTTAATATTCCTAACAGTTCAGGCCATGGGAAGTCAACAAATGCCCCGAGAAGCCTAGA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.143:22:7,3:8,0:2,16,2,2
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	191364708	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=86,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:4,7:8,3:8,4,7,5
chr2	191383348	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,6:3,2:4,0,7,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:1,6:6,4:1,6,3,7
chr2	191523862	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:0,1:5,2,2,0
chr2	191552107	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.358:6:2,0:2,2:0|1:191552107_A_C:191552107:3,1,1,1
chr2	191552114	.	C	CATCCCATTCCTTGGTATTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:191552107_A_C:191552107:1,1,0,1
chr2	191745838	.	CT	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,2:0|1:191745838_CT_AC:191745838:3,2,1,1
chr2	191745844	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:191745838_CT_AC:191745838:3,2,1,1
chr2	191760004	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:7,2:5,6:2,10,0,8
chr2	191777802	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:191777802_C_T:191777802:3,0,2,0
chr2	191777809	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0|1:191777802_C_T:191777802:3,0,2,0
chr2	191789370	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:7,3:10,12,2,1
chr2	191789380	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=113,76;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:7,2:10,13,1,1
chr2	191789428	.	G	GTGAAGATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=180,113;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.276:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	191839976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr2	191841759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:2,4:5,5:2,6,2,7
chr2	191841781	.	A	AAACAAAAAAAGCTTCTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:1,12,1,1
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	191851886	.	A	AGATTTATTTTTTATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=199,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	191851897	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	191854423	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,7:4,11:0,8,6,12
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:6,11:10,9:9,7,10,10
chr2	191897687	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=106,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:15,1:20,2:20,16,3,0
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	191923543	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:0,5:5,4:0,5,0,9
chr2	191941054	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.207:18:2,1:10,2:3,12,1,2
chr2	191996518	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:6,4,3,2
chr2	192011485	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,0:4,3:0,8,0,3
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr2	192225477	.	G	GTGGTGTTGT	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.431:51:17,17:12,5:18,11,11,11
chr2	192225519	.	CTGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:192225519_CTGGG_C:192225519:0,2,0,1
chr2	192225525	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:192225519_CTGGG_C:192225519:0,2,0,1
chr2	192225527	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:192225519_CTGGG_C:192225519:0,2,0,1
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=63.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr2	192251908	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:192251908_C_T:192251908:11,3,1,1
chr2	192251920	.	C	CTTTT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:192251908_C_T:192251908:14,5,1,1
chr2	192251924	.	C	CTAACCCT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:192251908_C_T:192251908:13,5,1,1
chr2	192251926	.	T	TCCG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=128,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,0:12,1:0|1:192251908_C_T:192251908:14,5,1,1
chr2	192255274	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=283,202;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,0:1,1:0|1:192255274_C_T:192255274:0,2,0,1
chr2	192255283	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=283,202;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:192255274_C_T:192255274:0,2,0,1
chr2	192255291	.	C	CAAATGTTAGCCAGGCCCAGGGTTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=359,202;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:192255274_C_T:192255274:0,1,0,1
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:1,0,5,0
chr2	192548841	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,24,27;MFRL=129,0,185;MMQ=60,46,60;MPOS=15,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.256,0.256:5:2,0,1:0,1,0:3,0,2,0
chr2	192548865	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=129,93;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:3,0:0|1:192548865_C_A:192548865:6,1,2,0
chr2	192548870	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=109,93;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,0:0|1:192548865_C_A:192548865:6,1,2,0
chr2	192550370	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:19,0:23,3:28,14,1,2
chr2	192701453	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,2,4
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	193049170	.	C	CTGTA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.216:16:7,3:6,0:4,9,1,2
chr2	193056737	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,3:7,4:1,9,1,7
chr2	196571531	.	T	TCCTCATTTTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	196571561	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	196578307	.	T	TGC	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=129,119;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,12:0.240:52:20,0:18,12:0|1:196578307_T_TGC:196578307:18,22,0,12
chr2	196578308	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=129,119;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,12:0.240:52:21,0:19,12:0|1:196578307_T_TGC:196578307:18,22,0,12
chr2	196578313	.	CT	C,CTT	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,30,27;MFRL=162,112,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.91,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,7,4:0.273,0.158:24:5,3,3:8,4,0:4,9,4,7
chr2	196602614	.	G	GAAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:8,1,3,0
chr2	196619299	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,178;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	196673588	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:2,8,1,1
chr2	196688882	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr2	196726360	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=205,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr2	196740524	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=72,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,1:2,7:1,1,4,4
chr2	196749512	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,8:4,1:2,6,5,4
chr2	196749544	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	196765280	.	G	GTAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=3450152,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	196771780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	196836945	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr2	196849453	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:3,7,1,4
chr2	196852616	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:4,1,2,1
chr2	196852942	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:14,0:7,3:11,10,1,2
chr2	196866420	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,4:5,2:4,9,5,1
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,5:2,2,7,3
chr2	197002187	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,2:11,0:10,5,1,1
chr2	197005972	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:16,7,1,1
chr2	197005988	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,2:11,2:11,6,1,3
chr2	197008449	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:0,2:5,6:1,5,0,8
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:0,9:5,8:3,2,14,4
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.529:21:8,6:2,5:0,10,1,10
chr2	197093005	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=127,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.423:36:6,5:14,10:4,17,5,10
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.607:21:3,7:5,5:5,3,11,2
chr2	197118671	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:0|1:197118671_G_A:197118671:14,13,1,1
chr2	197118673	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,2:15,0:0|1:197118671_G_A:197118671:14,13,1,1
chr2	197118729	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,16:0,5:0,0,8,13
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:4,1:4,3:0|1:197171175_C_T:197171175:4,4,5,0
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:6,0:4,5:0|1:197171175_C_T:197171175:5,5,4,1
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,1:3,5:0,9,0,6
chr2	197172856	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=135,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	197184321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,67;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:1,3,1,2
chr2	197184409	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr2	197531518	.	CA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.126:39:15,3:11,1:10,24,3,2
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	197576769	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0|1:197576769_A_C:197576769:0,0,3,0
chr2	197576785	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=16,17;MFRL=170,204;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:197576769_A_C:197576769:3,0,1,0
chr2	197576789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,16;MFRL=170,204;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:197576769_A_C:197576769:3,0,1,0
chr2	197576792	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,14;MFRL=167,204;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:197576769_A_C:197576769:2,0,1,0
chr2	197643881	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:197643881_T_TTG:197643881:0,4,0,1
chr2	197643883	.	TCC	TC,T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30,26;MFRL=153,192,183;MMQ=60,60,60;MPOS=20,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,2,1;RU=C;STR;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:2,1,0:0,3,0,2
chr2	197643888	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:197643881_T_TTG:197643881:0,4,0,1
chr2	197645397	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=98,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,8:4,3:0,4,1,10
chr2	197654593	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=115,153;MMQ=41,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr2	197655980	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr2	197657765	.	TCC	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=101,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.078:62:18,0:40,4:22,36,0,4
chr2	197664437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,3:1,7,1,4
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	197711776	.	ACAGTAGGCCACTC	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:10,0:13,4:15,12,2,2
chr2	197762941	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,138;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.443:21:3,1:9,6:12,0,7,2
chr2	197767400	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=110,42;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,0:13,2:0|1:197767400_G_A:197767400:14,20,1,1
chr2	197767405	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=107,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:15,0:14,2:0|1:197767400_G_A:197767400:13,20,1,1
chr2	197767409	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=112,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:0|1:197767400_G_A:197767400:12,17,1,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr2	197791353	.	ACCG	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.151:17:5,0:9,2:1,14,0,2
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,2:11,4:3,16,0,6
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr2	197872627	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=101,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:5,10,0,3
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=64.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,14,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,14,9
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=97,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr2	197990527	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:2,0,8,1
chr2	197990834	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,3:2,2:0,5,0,5
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=144,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,2:8,3:2,10,0,5
chr2	198257043	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:11,4:13,0:18,6,4,0
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.618:6:1,0:2,3:0|1:198257652_T_TA:198257652:3,0,3,0
chr2	198257665	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.383:9:3,0:3,0:0|1:198257652_T_TA:198257652:6,0,3,0
chr2	198257768	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=86,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:7,0:28,5:21,16,0,5
chr2	198257795	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,8:0,27:0,0,21,14
chr2	198263146	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:4,4,4,0
chr2	198264903	.	AAAT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=48.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,7:11,6:6,14,2,11
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr2	198266221	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:14,0:12,5:11,16,0,5
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=102.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,8:0,18:0,0,12,17
chr2	198269724	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:10,6:14,0:21,3,6,0
chr2	198283305	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,11,13
chr2	198285214	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=125,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,10:0.187:57:22,0:25,10:22,25,0,10
chr2	198338419	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=86,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	198359315	.	CAGATAACTCAAACTTTTGATCATA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.507:32:3,7:7,9:9,7,9,7
chr2	198359953	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.302:22:10,2:5,3:15,1,6,0
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr2	198365788	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,27:0.417:65:22,19:16,8:19,19,14,13
chr2	198404963	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=171,205;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,0:11,4:9,18,0,4
chr2	198509058	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,1,4
chr2	198631268	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.204:62:36,12:12,0:17,33,12,0
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,2:3,3:1,2,3,2
chr2	198950817	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,2:11,1:7,11,2,1
chr2	198953816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:7,4:4,1:2,9,0,6
chr2	200137042	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:18,5:13,0:17,14,5,0
chr2	200173599	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:13,5,1,2
chr2	200173640	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:14,2:0|1:200173640_C_T:200173640:17,10,1,1
chr2	200173657	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:11,2:0|1:200173640_C_T:200173640:13,14,1,1
chr2	200173658	.	C	CCAGGCAGGTGGGTTAG	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:11,2:0|1:200173640_C_T:200173640:13,14,1,1
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,10:0,0,3,18
chr2	200188634	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=109,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:21,2:8,4:16,14,1,5
chr2	200246318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,13:0.246:54:18,8:21,4:25,16,9,4
chr2	201171173	.	AGT	A	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=103,113;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:19,2:19,0:0|1:201171173_AGT_A:201171173:22,20,0,2
chr2	201171180	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=20,24;MFRL=103,113;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:15,2:13,0:0|1:201171173_AGT_A:201171173:22,19,0,2
chr2	201171181	.	G	GGGA	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=103,113;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGA;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,2:17,0:21,19,0,2
chr2	201171188	.	GAGCT	G	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=103,113;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:19,2:20,0:0|1:201171188_GAGCT_G:201171188:23,23,0,2
chr2	201171191	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=95,118;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.317:42:13,7:16,6:16,13,5,8
chr2	201171198	.	GGGCGTGT	G	.	.	DP=49;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=100,84;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.064:47:21,2:19,1:0|1:201171188_GAGCT_G:201171188:21,23,0,3
chr2	201171207	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.315:39:15,6:12,6:13,14,3,9
chr2	201194279	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	201253956	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,98;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,5:7,2:4,7,4,3
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	201277011	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,9:1,7:1,0,2,14
chr2	201280996	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=187,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	201281022	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:7,1:15,3,2,0
chr2	201284126	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:15,4:16,1:13,18,4,1
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,4:4,9:1,7,3,11
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr2	201436525	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=80,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:13,5:18,0:18,13,5,0
chr2	201438415	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.552:29:6,0:6,16:4,9,0,16
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,5:2,8:3,2,11,2
chr2	201448283	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	201460104	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=92,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,4:4,4:2,6,1,7
chr2	201460125	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:201460125_T_C:201460125:0,9,1,1
chr2	201460129	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,1:0|1:201460125_T_C:201460125:0,9,1,1
chr2	201460132	.	ATTTT	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=118,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:201460125_T_C:201460125:0,8,1,1
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	201466954	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,2:3,1,8,0
chr2	201468732	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:6,4:1,10:2,6,6,9
chr2	201470233	.	ATTTT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:4,3:2,2:5,1,5,0
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=83,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:3,1,6,1
chr2	201474179	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,6:1,5:2,3,5,6
chr2	201485603	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201485603_T_C:201485603:0,1,0,1
chr2	201485605	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201485603_T_C:201485603:0,1,0,1
chr2	201485830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:8,0,4,1
chr2	201488758	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,6:4,5:1,6,3,8
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr2	201521472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr2	201521731	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr2	201527791	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201527791_G_GA:201527791:0,0,0,1
chr2	201527793	.	G	GGCCGTGGTGCTGCCCCAGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201527791_G_GA:201527791:0,0,0,1
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:2,11:8,9:6,4,10,11
chr2	201683504	.	G	GA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,183;MMQ=55,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,2:17,1:15,15,3,0
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr2	201686122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	201719258	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.653:15:1,3:2,6:3,2,9,1
chr2	201719916	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr2	201736112	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=98,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,7:6,4:7,5,5,6
chr2	201736287	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=149,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	201752450	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:201752450_C_CA:201752450:0,1,0,1
chr2	201752451	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201752450_C_CA:201752450:0,1,0,1
chr2	201760188	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=237,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	201768238	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=86,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.582:34:7,7:6,12:4,10,11,9
chr2	201778717	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,11;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:2,2:3,0:5,3,1,4
chr2	201785657	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,5,1
chr2	201785921	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201785921_TG_CA:201785921:0,2,0,1
chr2	201785925	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201785921_TG_CA:201785921:0,2,0,1
chr2	201822764	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,4:11,0:13,6,4,0
chr2	201881677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	201881854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,0:7,4:6,9,1,3
chr2	201881954	.	T	TATCTCCCCCAAATAACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=82,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201881954_T_TATCTCCCCCAAATAACAG:201881954:0,2,0,1
chr2	201881957	.	T	TAAGTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=82,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201881954_T_TATCTCCCCCAAATAACAG:201881954:0,2,0,1
chr2	201994540	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:2,9:7,5:6,3,10,4
chr2	201994902	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:201994902_G_A:201994902:2,2,0,1
chr2	201994908	.	G	GGTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:201994902_G_A:201994902:2,2,0,1
chr2	202025131	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr2	202070711	.	T	TTTCTTTCTTTC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=126,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:0|1:202070711_T_TTTCTTTCTTTC:202070711:2,12,0,2
chr2	202070715	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=126,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:202070711_T_TTTCTTTCTTTC:202070711:2,12,0,2
chr2	202070718	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=126,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:5,0:0|1:202070711_T_TTTCTTTCTTTC:202070711:2,12,0,2
chr2	202070735	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,7:0,0:0,0,2,5
chr2	202074207	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,2:8,3:6,6,2,3
chr2	202139579	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=140,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:18,0:10,5:21,7,5,0
chr2	202139600	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.135:39:19,2:14,2:25,9,5,0
chr2	202139739	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=86,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:1,2:5,1:1,6,0,4
chr2	202151140	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=231,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	202151395	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=182,129;MMQ=40,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:12,2:0,0:0|1:202151395_G_A:202151395:0,13,0,2
chr2	202151415	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=192,139;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:12,3:0,0:0|1:202151395_G_A:202151395:0,12,0,3
chr2	202154389	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:202154389_A_G:202154389:1,0,0,2
chr2	202154392	.	C	CCTGGCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,117;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:202154389_A_G:202154389:2,0,0,2
chr2	202154397	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	202172177	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,196;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:4,0,6,0
chr2	202173812	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	202195311	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr2	202213061	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=98,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:3,2,0,2
chr2	202213147	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	202215409	.	C	CAAAACAAAACAAAACAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAACAAAACAAAACAA;STR;TLOD=70.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.666:28:2,3:7,4:7,2,5,14
chr2	202215607	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,5:4,1:4,1,5,1
chr2	202245666	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=84,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:23,3:18,1:26,16,0,4
chr2	202245944	.	TAA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.856:11:0,4:1,6:0|1:202245944_TAA_T:202245944:1,0,3,7
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.813:14:0,5:2,6:0|1:202245944_TAA_T:202245944:1,1,3,9
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=99,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,5:2,1:1,2,3,4
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.661:18:3,10:1,2:3,3,2,10
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	202264316	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr2	202337730	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,126;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,6:7,4:5,9,1,9
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.687:13:1,4:3,5:2,2,8,1
chr2	202342802	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=116,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:13,4:13,3:13,13,4,3
chr2	202344179	.	GTT	G,GT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,128,117;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=3.13,67.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,34:0.119,0.857:39:0,2,15:0,3,19:0,0,27,12
chr2	202352649	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=105,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,0:6,6:2,11,2,4
chr2	202410352	.	C	CAAAAAAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,0;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=24,31;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.699:9:1,0:0,0:1,1,0,7
chr2	202430428	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,29,30;MFRL=118,175,123;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,18,19;RU=T;STR;TLOD=5.52,13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,8:0.247,0.372:23:5,4,7:2,1,1:7,2,14,0
chr2	202430431	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.612:24:5,11:3,4:7,2,15,0
chr2	202430432	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.244:23:12,4:4,2:14,3,6,0
chr2	202430679	.	T	TTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=250,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr2	202436645	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:9,6:9,8:11,7,9,5
chr2	202436753	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,5:1,8:1,5,2,11
chr2	202436782	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,3:1,4:0,5,0,7
chr2	202439101	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202439101_G_C:202439101:0,1,0,1
chr2	202439106	.	A	ATTCATCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202439101_G_C:202439101:0,1,0,1
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	202490812	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.726:42:3,16:8,14:8,3,20,11
chr2	202492883	.	TAA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=97,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=68.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.707:25:4,12:3,6:1,6,9,9
chr2	202494015	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:16,0:13,14,1,2
chr2	202494630	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	202498041	.	TCCTCCGAGGTTTTTGAATAACTG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:6,2:13,5,1,1
chr2	202499457	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr2	202499683	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=284,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,14:0.278:52:4,9:31,5:9,29,5,9
chr2	202501448	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr2	202504757	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:2,3,4,5
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=79,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.589:32:6,7:7,12:7,6,11,8
chr2	202505740	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	202505771	.	AC	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=170,111;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:202505771_AC_CT:202505771:0,2,0,1
chr2	202505776	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=208,111;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:202505771_AC_CT:202505771:0,3,0,1
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,0:0,2:0,1,3,0
chr2	202510016	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=101,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.171:27:7,0:14,4:0|1:202510016_A_C:202510016:12,11,0,4
chr2	202510022	.	C	CTTATTCAGGGCAATGTTTGATGGCAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,38;MFRL=109,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.176:26:9,0:11,4:0|1:202510016_A_C:202510016:13,9,0,4
chr2	202512640	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	202512644	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0|1:202512644_T_TA:202512644:0,2,0,1
chr2	202512646	.	A	AGCTGACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0|1:202512644_T_TA:202512644:0,2,0,1
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.913:17:0,11:1,4:1,0,10,6
chr2	202545816	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:5,3:2,11,0,3
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	202557796	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:202557796_T_A:202557796:1,2,1,1
chr2	202557797	.	A	AACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:202557796_T_A:202557796:1,2,1,1
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	202569251	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:6,2:26,1:17,15,2,1
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,5,5
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,3,8
chr2	202574755	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=86,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,0:7,2:10,8,1,1
chr2	202574773	.	A	ATACAGCATTACCAGCACCCC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:6,7,1,1
chr2	202574810	.	G	GAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,8;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202574810_G_GAAAAA:202574810:0,2,0,1
chr2	202574816	.	A	AATGAGTATGAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202574810_G_GAAAAA:202574810:0,2,0,1
chr2	202575821	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr2	202580531	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=81,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:33,0:17,4:23,27,1,3
chr2	202588182	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=120,116;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:6,2:0|1:202588182_G_A:202588182:2,10,0,2
chr2	202588187	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=120,116;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:202588182_G_A:202588182:2,10,0,2
chr2	202592490	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:9,8:7,0:7,10,8,0
chr2	202606639	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	202611254	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,1:9,2:9,4,2,1
chr2	202622544	.	A	ACAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202622544_A_ACAT:202622544:0,0,0,1
chr2	202622547	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202622544_A_ACAT:202622544:0,0,0,1
chr2	202622549	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202622544_A_ACAT:202622544:0,0,0,1
chr2	202625615	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr2	202899587	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:11,0:12,12,1,1
chr2	202899604	.	C	CTGGAGGACATACT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:13,0:11,13,1,1
chr2	202902348	.	CATA	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,20:0.350:58:16,6:20,14:16,22,12,8
chr2	202902385	.	TA	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,10:0.168:61:21,4:25,6:28,23,5,5
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:4,5:1,9:3,3,10,4
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr2	202962310	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,19,24;MFRL=87,84,185;MMQ=60,60,60;MPOS=28,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=T;STR;TLOD=6.72,8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.291,0.447:9:1,1,2:0,0,2:1,1,2,5
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	202964380	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.706:21:2,7:3,8:4,2,5,10
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,0:2,6:5,0,5,1
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr2	202974261	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	202979399	.	C	CTAAAATAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr2	202979615	.	T	TTGAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGAA;STR;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,4:1,6:2,0,8,5
chr2	203003066	.	G	GGT,GGTGT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,23,31;MFRL=68,96,98;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=GT;STR;TLOD=3.42,28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,11:0.173,0.478:23:5,1,7:3,3,2:5,3,9,6
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:8,5,1,2
chr2	203051768	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:203051768_G_A:203051768:10,10,1,1
chr2	203051773	.	G	GAAAGAAAGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=87,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:203051768_G_A:203051768:10,10,1,1
chr2	203052947	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=176,94;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,24:0.757:31:0,19:7,5:2,5,9,15
chr2	203054997	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.180:55:18,8:26,0:15,30,10,0
chr2	203058233	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:2,3,2,4
chr2	203058861	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=49,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr2	203059018	.	AGAGGAGTTTCGGAGGAAACTGCGAGAACTACAGAGAAAAAAGCAGCAG	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.057:51:11,2:9,0:21,28,1,1
chr2	203079025	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.243:18:6,2:5,0:10,4,2,2
chr2	203130595	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:8,1,1,1
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.881:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr2	203139945	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=133,97;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:24,0:16,3:12,28,0,3
chr2	203142654	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.214:19:8,1:7,3:14,1,3,1
chr2	203152355	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=95,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:9,7:7,9:9,7,8,8
chr2	203155015	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,6,1
chr2	203168091	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=109,147;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:26,0:25,3:30,21,0,3
chr2	203168173	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,35:0.655:53:13,19:5,16:11,7,13,22
chr2	203378398	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=105,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:4,0,3,0
chr2	203378616	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr2	203384776	.	C	CT,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,189,142;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.22,11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.562:6:0,1,3:0,1,1:0,0,5,1
chr2	203624153	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=168,174;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:203624153_T_C:203624153:0,3,0,1
chr2	203624155	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,174;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:203624153_T_C:203624153:0,3,0,1
chr2	203661779	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	203676382	.	CAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33,31;MFRL=154,151,139;MMQ=43,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,22;RU=A;STR;TLOD=5.02,6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.109,0.657:11:0,1,1:2,1,1:2,0,4,5
chr2	203676415	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=117,156;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,6:0.088:63:23,0:29,0:13,44,6,0
chr2	203682062	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=80,280;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr2	203682187	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:203682187_C_T:203682187:3,5,0,2
chr2	203682192	.	T	TGAGACTTCTGAGGTTAAAGTGGTATGGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:203682187_C_T:203682187:3,5,0,2
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr2	203693823	.	CA	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	203748824	.	AC	GC,GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,28,28;MFRL=209,171,156;MMQ=60,30,40;MPOS=27,33;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,1,1:3,0,0:4,0,2,0
chr2	203748829	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=177,171;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr2	203817257	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,10,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=151.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,32:0,14:0,0,26,20
chr2	203942441	.	CTTAT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAT;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:9,0:13,2,2,0
chr2	203964456	.	CT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24,26;MFRL=60,114,138;MMQ=60,57,55;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.86,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,2:0.277,0.166:14:6,1,1:1,1,0:3,5,2,4
chr2	203991488	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,1:3,7:4,5,3,5
chr2	203996635	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	204062132	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=88,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.270:20:10,0:5,5:0|1:204062132_T_A:204062132:7,8,2,3
chr2	204062138	.	A	ATTTTGCCTTGTTCAAATGCAAGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=95,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,0:3,5:0|1:204062132_T_A:204062132:6,8,2,3
chr2	204062157	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=122,133;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr2	204103923	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:9,5:3,0:0,13,0,5
chr2	204111394	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,5,0
chr2	204111398	.	GTTAA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,6,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,12:0,0,11,7
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr2	204131460	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=129,173;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr2	204131490	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=162,203;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	204137562	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=191,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.206:13:4,0:2,2:2,9,0,2
chr2	204137574	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=125,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:1,0:2,2:2,4,0,3
chr2	204144938	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204144938_G_GT:204144938:0,1,0,1
chr2	204144943	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204144938_G_GT:204144938:0,1,0,1
chr2	204144946	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204144938_G_GT:204144938:0,1,0,1
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr2	204255821	.	C	CCTAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=88,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:204255821_C_CCTAA:204255821:5,9,1,1
chr2	204255823	.	C	CGTAAATCTCAATCACAGTA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=88,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:204255821_C_CCTAA:204255821:5,9,1,1
chr2	204255888	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.221:16:5,3:8,0:1|0:204255821_C_CCTAA:204255821:3,10,1,2
chr2	204305620	.	G	GAATAAAGAGGAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	204306114	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=84,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:10,2:15,2:14,11,2,2
chr2	204354912	.	C	CTGGACG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204820587	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:6,7:2,10:5,3,7,10
chr2	204821494	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,5:6,2:4,11,0,7
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.430:14:2,6:3,0:0|1:204824178_AGT_A:204824178:5,3,6,0
chr2	204824200	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=105,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.380:22:5,6:8,2:0|1:204824178_AGT_A:204824178:9,5,6,2
chr2	205551001	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:0|1:205551001_A_C:205551001:8,13,1,1
chr2	205551006	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:7,2:0|1:205551001_A_C:205551001:8,12,1,1
chr2	205551008	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:205551001_A_C:205551001:8,10,1,1
chr2	205551011	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:205551001_A_C:205551001:8,10,1,1
chr2	205969220	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr2	205978113	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr2	205978118	.	GTGT	G,GGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30,31;MFRL=0,102,117;MMQ=60,60,60;MPOS=8,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.52,20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,9:0.385,0.570:16:0,4,5:0,2,4:0,0,16,0
chr2	205978347	.	T	TGATTTGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GATTTGA;STR;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr2	205990353	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.916:21:0,11:0,9:0,1,14,6
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr2	206041202	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=102,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,2:12,0:0|1:206041202_T_G:206041202:20,15,2,0
chr2	206041210	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=105,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:21,2:12,0:0|1:206041202_T_G:206041202:20,14,2,0
chr2	206041366	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,18;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.636:6:0,2:0,0:0,2,0,4
chr2	206166395	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=99,96;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.204:52:18,10:23,0:21,21,10,0
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr2	206364822	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,11,9
chr2	206480393	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,14:0.245:59:18,9:27,5:27,18,6,8
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,3:0,0,10,6
chr2	206562498	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:4,0:5,11:2,8,0,11
chr2	206592525	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	206592557	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr2	206592573	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=24011157,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr2	206592695	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr2	206608331	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206610677	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=126,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	206617660	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:0|1:206617660_T_A:206617660:3,15,1,1
chr2	206617668	.	C	CCCGTTGGCCTCAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=138,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.146:20:7,0:8,2:0|1:206617660_T_A:206617660:2,15,2,1
chr2	206874421	.	T	A	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,21:0.238:92:26,0:37,21:0|1:206874421_T_A:206874421:26,45,0,21
chr2	206874426	.	T	TCAGTGTCAAAGTGAGTGCCTGACATATATG	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=26,38;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,21:0.250:87:27,0:37,20:0|1:206874421_T_A:206874421:24,42,0,21
chr2	206884537	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,1:10,1:12,11,0,2
chr2	206884573	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=175,64;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:13,0:8,21,1,1
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.940:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr2	206911187	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=140,140;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:4,2:5,0:7,4,2,0
chr2	206911191	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=147,120;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.752:15:3,5:0,6:2,1,8,4
chr2	206921451	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr2	207006825	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr2	207008670	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.301:6:4,1:0,1:0|1:207008670_C_CT:207008670:4,0,2,0
chr2	207008675	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=178,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.392:7:4,2:0,1:0|1:207008670_C_CT:207008670:4,0,3,0
chr2	207012664	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=89,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.370:44:13,7:13,9:10,18,6,10
chr2	207026246	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,113;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:5,0:1,2:1,5,1,1
chr2	207027356	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:6,1:4,2:5,5,2,2
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:6,2,2,2
chr2	207041053	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,2:6,5:10,7,5,2
chr2	207169731	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,11:5,2:5,6,1,12
chr2	207170376	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:9,10,1,1
chr2	207170390	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:207170390_G_C:207170390:6,11,1,1
chr2	207170392	.	GA	AT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:207170390_G_C:207170390:6,11,1,1
chr2	207170396	.	G	GTAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:207170390_G_C:207170390:6,11,1,1
chr2	207174316	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr2	207175391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=182,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr2	207413129	.	T	TTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	207425971	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=143,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:11,0:12,7:0|1:207425971_C_T:207425971:6,19,0,7
chr2	207425977	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:11,0:9,7:0|1:207425971_C_T:207425971:5,17,0,7
chr2	207425981	.	T	TTGCTACACCCTAGCAACAGC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,38;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:9,0:8,6:0|1:207425971_C_T:207425971:3,15,0,7
chr2	207432117	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=219,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	207452978	.	A	ATTTATTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207452978_A_ATTTATTT:207452978:0,0,0,1
chr2	207452981	.	T	TACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207452978_A_ATTTATTT:207452978:0,0,0,1
chr2	207516721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=265,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr2	207527608	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,2:2,4:7,1,5,1
chr2	207527742	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=103,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:4,7,1,1
chr2	207527840	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:11,3,4,5
chr2	207527897	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=107,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:9,6:14,0:10,14,6,0
chr2	207559630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:207559630_C_T:207559630:3,4,1,1
chr2	207559638	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=67,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:207559630_C_T:207559630:3,3,1,1
chr2	207559639	.	T	TGGAGCCCTAAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=67,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:207559630_C_T:207559630:3,3,1,1
chr2	207569715	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr2	207570705	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	207634906	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:13,3:15,13,2,1
chr2	207638988	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,4,3
chr2	207652940	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=90,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	207652951	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	207653484	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,13;MFRL=128,229;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:3,0:0,0:3,1,2,0
chr2	207814453	.	T	TGGCG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:4,0:1,2:0|1:207814453_T_TGGCG:207814453:2,3,1,1
chr2	207814459	.	G	GTGTAATCCCAGCTACTCGGA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:207814453_T_TGGCG:207814453:2,3,1,1
chr2	207814470	.	T	TCGTTCTGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207814470_T_TCGTTCTGG:207814470:2,1,0,1
chr2	207814473	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207814470_T_TCGTTCTGG:207814470:2,1,0,1
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr2	207953168	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:11,5,0,2
chr2	207953406	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	208461669	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.127:46:11,1:29,4:19,22,0,5
chr2	208489101	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=235,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,3:4,2:0,6,2,3
chr2	208489115	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=80,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,0,6
chr2	208598662	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:12,0:5,4:11,6,2,2
chr2	208632983	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:2,1,0,1
chr2	208693129	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:8,6,0,2
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr2	208693307	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	208811097	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=74,140;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:3,1,6,1
chr2	208842069	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=116,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:208842069_A_G:208842069:9,14,1,1
chr2	208842076	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:208842069_A_G:208842069:9,10,1,1
chr2	208842394	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,1:5,5:2,3,0,6
chr2	208865712	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,2:2,1:4,0,3,0
chr2	208866412	.	G	GACTTTAGAACACACTGTTAACAGAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0,0,11,14
chr2	208989037	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,143;MMQ=52,33;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,1:8,2:6,5,2,1
chr2	209010891	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,4:4,3:6,6,4,3
chr2	209027871	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	209028257	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=81,187;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:13,0:11,16:12,12,16,0
chr2	209028271	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=101,187;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:14,0:12,16:10,16,16,0
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,17,6
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	209036778	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,13:0,18:0,0,12,20
chr2	209045839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	209049840	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr2	209104005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr2	209104603	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,7:6,7:7,4,7,7
chr2	209113458	.	A	ACATTTGACGCCAACATTATGCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,14:0,5:0,0,8,12
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,17,2
chr2	209178975	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,5:2,6:4,0,9,2
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	209200005	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,2:5,0:11,4,1,1
chr2	209200708	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=183,210;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.347:32:14,0:7,10:8,13,0,11
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr2	209204194	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=117,52;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:15,11,0,3
chr2	209204714	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,23,4
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	209212707	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,17:0,33:0,0,19,31
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	209307284	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=235,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:209307284_CA_TT:209307284:0,1,0,1
chr2	209307287	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=235,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209307284_CA_TT:209307284:0,1,0,1
chr2	209309474	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:11,0:0|1:209309474_G_A:209309474:14,5,1,1
chr2	209309481	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:0|1:209309474_G_A:209309474:16,6,1,1
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,8,19
chr2	209345944	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27,19;MFRL=159,189,146;MMQ=50,40,60;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.42,9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,5:0.211,0.554:9:1,0,1:0,1,1:0,2,0,7
chr2	209353656	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	210517831	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=88,232;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr2	210543378	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,0:15,3:12,11,0,3
chr2	210559072	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:210559072_T_C:210559072:9,12,1,1
chr2	210559082	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:210559072_T_C:210559072:9,7,1,1
chr2	210574821	.	C	CAG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:9,3:15,0:0|1:210574821_C_CAG:210574821:11,14,1,2
chr2	210574823	.	AGT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=111,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.119:31:10,2:12,0:0|1:210574821_C_CAG:210574821:14,14,1,2
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr2	210636802	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:11,14:8,0:6,13,12,2
chr2	210699825	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210699825_TTC_T:210699825:0,0,0,1
chr2	210699828	.	A	ATTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210699825_TTC_T:210699825:0,0,0,1
chr2	210699830	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210699825_TTC_T:210699825:0,0,0,1
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr2	210783343	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,39;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,0:6,3:9,10,0,3
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	210798580	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,2:13,0:0|1:210798580_G_A:210798580:11,17,1,1
chr2	210798587	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,2:13,0:0|1:210798580_G_A:210798580:12,15,1,1
chr2	210805958	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.251:26:14,5:5,0:14,6,6,0
chr2	210808255	.	G	GTTTCAGCT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,2:6,0:1,14,1,1
chr2	210819045	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,34;MFRL=188,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:0,2:0,3,0,2
chr2	210823828	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:4,0:11,2:0|1:210823828_T_C:210823828:6,9,1,1
chr2	210823832	.	C	CTGTACCTGATAAAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:3,0:10,2:0|1:210823828_T_C:210823828:6,9,1,1
chr2	210849524	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:4,5:5,0:12,0,5,0
chr2	210849721	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:5,0:1,13,0,2
chr2	210880893	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=102,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.566:28:4,9:8,7:8,4,7,9
chr2	210880950	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,3:13,0:4,18,0,3
chr2	210882135	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,19;MFRL=56,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:210882135_A_C:210882135:0,4,2,0
chr2	210882141	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,2:0|1:210882135_A_C:210882135:1,4,2,0
chr2	210882147	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:210882135_A_C:210882135:1,4,2,0
chr2	210882150	.	AA	CC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=114,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:210882135_A_C:210882135:1,5,2,0
chr2	210882171	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:3,3,2,3
chr2	210889759	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.728:16:3,8:1,4:3,1,9,3
chr2	210962806	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=90,41429662;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:11,10,2,0
chr2	211018247	.	CATCCAAATCGTCATCAGAGCTGCTATCAGTTGCATCGGA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:6,0:9,11,1,1
chr2	211060050	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,6:1,6:1,2,5,7
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	211090029	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	211167560	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,171;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,9:0,7,0,9
chr2	211168181	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.455:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:1,5,1,4
chr2	211179728	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:11,0:5,16,0,3
chr2	211306107	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=137,151;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,4:8,0:13,8,4,0
chr2	211306135	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=110,151;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,4:14,0:17,10,4,0
chr2	211319824	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	211320047	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=229,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:211320047_A_G:211320047:0,3,0,1
chr2	211320051	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=229,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:211320047_A_G:211320047:0,3,0,1
chr2	211341156	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	211342502	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,11,9
chr2	211444550	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0|1:211444550_G_GCC:211444550:1,0,0,1
chr2	211444555	.	T	TCCTAGCTCCCTGGGAAGCTGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=123,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:211444550_G_GCC:211444550:4,0,0,1
chr2	211452908	.	C	CTCTTCCCTCACCAAAACCCGAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr2	211471649	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,0:9,14:8,9,0,14
chr2	211481114	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=166,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr2	211502574	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:211502574_G_A:211502574:10,15,1,1
chr2	211502576	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:211502574_G_A:211502574:10,15,1,1
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	211515058	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=282,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.644:20:4,7:2,6:6,1,10,3
chr2	211521227	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.748:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr2	211527827	.	GTT	G,GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35,34;MFRL=83,138,159;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.14,12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,6:0.188,0.512:12:2,2,4:1,0,2:4,0,7,1
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	212251864	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chr2	212252809	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	212285103	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	212295665	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=98,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:10,4:15,0:14,11,3,1
chr2	212488828	.	GTC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=219,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:2,1:0,4,0,2
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	212543691	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=25,34;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	212543810	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=89,99;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,7:0.135:57:30,0:20,7:0|1:212543810_C_T:212543810:21,29,0,7
chr2	212543814	.	CT	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=92,99;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,7:0.135:57:29,0:19,7:0|1:212543810_C_T:212543810:21,29,0,7
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,0:5,3:1,9,0,3
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.541:7:1,1:2,1:2,1,0,4
chr2	212587239	.	G	GCCACCC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:10,2:12,0:0|1:212587239_G_GCCACCC:212587239:7,15,1,1
chr2	212587242	.	A	ATCCCTGCTGGGCAGGAGAGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:0|1:212587239_G_GCCACCC:212587239:7,15,1,1
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr2	212615435	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:6,9,0,2
chr2	212615539	.	G	GGGCTATGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	213403091	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	213872024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,202;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr2	213872836	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=13,20;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.516:13:1,0:1,5:2,4,1,6
chr2	213872853	.	TACA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACA;STR;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,1:0,8:0,0,3,9
chr2	213872868	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,7:0,0,2,9
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.914:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr2	214012508	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr2	214174767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	214182100	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	214727150	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	214727367	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:2,2,1,5
chr2	215013803	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=162,150;MMQ=40,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:215013803_A_G:215013803:1,0,1,0
chr2	215013822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=153,150;MMQ=50,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:215013803_A_G:215013803:2,0,1,0
chr2	215013826	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=147,162;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:215013826_C_A:215013826:4,0,1,0
chr2	215013828	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,19;MFRL=147,162;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:215013826_C_A:215013826:4,0,1,0
chr2	215301343	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:9,1,4,0
chr2	215301533	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:215301533_A_C:215301533:0,4,0,1
chr2	215301542	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:215301533_A_C:215301533:0,2,0,1
chr2	215593689	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,72;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:4,6:16,0:10,11,5,1
chr2	215609874	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,0:14,3:11,11,1,2
chr2	215632256	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,8,14
chr2	215657178	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:2,0:3,0:2,7,0,5
chr2	215657182	.	TAA	T,TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=17,24,28;MFRL=80,156,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.92,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.283,0.269:11:1,1,1:1,1,2:0,4,0,7
chr2	215797332	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:2,2,5,1
chr2	215797527	.	AATTC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr2	215798724	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	215812297	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=58,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,7:1,2:0,2,2,8
chr2	215818860	.	C	CATATATATAAAGAATGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=258,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	215818896	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=258,300;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,78219432;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:5,2,0,2
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	215840414	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=252,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr2	215840829	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	215847177	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	215848676	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,35;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:215848676_A_C:215848676:0,1,0,1
chr2	215848678	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:215848676_A_C:215848676:0,1,0,1
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,11:0,3:0,0,7,7
chr2	215854458	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:215854458_A_C:215854458:0,1,0,1
chr2	215854460	.	T	TACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:215854458_A_C:215854458:0,1,0,1
chr2	215855780	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=102,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:2,5:1,4:1,3,2,7
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,11,9
chr2	215862580	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=166,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:6,2:10,0:0|1:215862580_C_A:215862580:0,16,0,2
chr2	215862582	.	A	AACAGACTATCACGAAATCAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=166,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:215862580_C_A:215862580:0,16,0,2
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	215865777	.	T	TATGCACAATGTGTGTGTCCTCTCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=187,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr2	215865824	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865824_G_C:215865824:0,0,0,1
chr2	215865828	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865824_G_C:215865824:0,0,0,1
chr2	215865830	.	C	CTGGCACATGGTAGGCATTTAAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865824_G_C:215865824:0,0,0,1
chr2	215866316	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:215866316_A_T:215866316:21,3,1,1
chr2	215866322	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:215866316_A_T:215866316:18,6,1,1
chr2	215866325	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:215866316_A_T:215866316:18,6,1,1
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	215876680	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=98,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:7,5,0,3
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	215884424	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=52,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr2	215890324	.	G	GT,GTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31,33;MFRL=186,160,157;MMQ=60,60,56;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=18.68,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,2:0.604,0.198:12:1,5,2:1,3,0:2,0,10,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,158;MMQ=55,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.893:13:1,8:1,1:2,0,10,1
chr2	215891661	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=88,88;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:15,0:4,3:5,14,0,3
chr2	215910786	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr2	215929028	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,15,0
chr2	216182769	.	AC	TC,TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,24;MFRL=0,121,181;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.06,4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,3:0.590,0.317:8:0,3,2:0,2,1:0,0,8,0
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	216209696	.	TTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr2	216213733	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	216213803	.	C	CACTCCCAATTCTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:5,5,1,1
chr2	216226373	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:0,0:12,5:3,9,0,5
chr2	216234981	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:5,2,3,3
chr2	216237024	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,0:10,2:13,13,2,0
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=66,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,8:1,4:2,0,10,2
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	216249587	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,13,9
chr2	216251707	.	GAGAAAAAAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:2,0:0,5,1,1
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr2	216262052	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	216262621	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr2	216263926	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	216263938	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr2	216269031	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:216269031_G_T:216269031:0,0,5,0
chr2	216269033	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:216269031_G_T:216269031:0,0,5,0
chr2	216272819	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,12:0,0,9,9
chr2	216272900	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0|1:216272900_T_G:216272900:0,0,6,13
chr2	216272907	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.856:19:1,4:1,10:0|1:216272900_T_G:216272900:1,1,5,12
chr2	216274684	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=91,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.109:62:18,6:36,0:37,19,6,0
chr2	216274853	.	AAC	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,16:0.741:21:1,4:3,12:0|1:216274853_AAC_A:216274853:2,3,7,9
chr2	216274874	.	ACG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=114,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,4:0.188:24:5,0:12,4:1|0:216274853_AAC_A:216274853:8,12,1,3
chr2	216283958	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	216289860	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=107,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,0:8,4:11,7,2,2
chr2	216299550	.	GC	AA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=382,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,8:0,1,4,10
chr2	216299571	.	T	TTAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=382,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAC;STR;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr2	216299629	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	216861273	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	216913986	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:216913986_C_T:216913986:13,9,1,1
chr2	216913989	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:216913986_C_T:216913986:14,9,1,1
chr2	216916238	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=101,278;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,4:13,0:10,14,0,4
chr2	216982370	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr2	217005903	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=82,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.552:25:3,6:8,7:6,5,9,5
chr2	217024780	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr2	217057367	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,19:0.344:56:20,19:16,0:21,16,19,0
chr2	217057475	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=100,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.131:48:23,0:19,5:14,28,0,6
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,4,13
chr2	217070057	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=230,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr2	217123958	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	217234685	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:3,2,0,2
chr2	217293555	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.222:7:2,1:3,0:0,6,0,1
chr2	217293561	.	A	ACTTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:2,1:3,0:0|1:217293561_A_ACTTCC:217293561:0,5,0,1
chr2	217293563	.	A	ATCCATTGTGATATTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:217293561_A_ACTTCC:217293561:0,5,0,1
chr2	217297474	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:18,4:15,1:20,13,5,0
chr2	217303320	.	A	AGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	217364051	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,103;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:17,0:20,4:20,18,0,4
chr2	217364677	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,114;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.269:39:12,10:16,0:16,13,10,0
chr2	217526776	.	G	GTATACTCGAACAGTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	217526811	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:217526811_CT_AC:217526811:0,1,0,1
chr2	217526820	.	C	CAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:217526811_CT_AC:217526811:0,1,0,1
chr2	217526821	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:217526811_CT_AC:217526811:0,1,0,1
chr2	217528635	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=82,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:19,8:5,5:18,6,8,5
chr2	217541582	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,13:0,13:0,0,13,13
chr2	217559489	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:217559489_G_GC:217559489:4,0,1,1
chr2	217559492	.	A	AGATCGCGCCATTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:217559489_G_GC:217559489:4,0,1,1
chr2	217724381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,1:5,2:6,3,1,2
chr2	217724706	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=105,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,2:11,1:10,13,0,3
chr2	218669084	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=221,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr2	218677086	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:13,10,0,3
chr2	218678015	.	TCATGGGTCATGTCTCCTGGGACAAAGAGAAAGAAATAAGGCTCAGTCCCTGCC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=179,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:4,2:7,0:6,12,1,1
chr2	218678077	.	CCTCCCA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=83,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:1,5,0,3
chr2	218682474	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr2	218683368	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,2:8,1:10,9,2,1
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,10,3
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,10,3
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:9,5:6,6:7,8,6,5
chr2	218694691	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=233,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr2	218694962	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=236,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	218712918	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,3,2
chr2	218745685	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr2	218750487	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:10,10,2,0
chr2	218758123	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=CA;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.542:7:1,1:2,0:2,1,1,3
chr2	218758345	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr2	218759862	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:218759862_C_T:218759862:0,3,0,1
chr2	218759864	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:218759862_C_T:218759862:0,3,0,1
chr2	218759867	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:218759862_C_T:218759862:0,3,0,1
chr2	218938244	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:1,1:5,2:2,4,0,3
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,6:0,4:1,1,9,1
chr2	219000310	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=274,170;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,6:1,10:1,0,11,5
chr2	219000958	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.057:53:31,0:19,2:21,29,2,1
chr2	219000963	.	GG	AT	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=105,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.077:52:27,0:16,3:0|1:219000963_GG_AT:219000963:19,29,2,2
chr2	219000966	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=27,21;MFRL=100,105;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,43:0.933:46:0,21:2,15:2,1,15,28
chr2	219000967	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=105,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.064:47:24,0:16,1:0|1:219000963_GG_AT:219000963:16,28,2,1
chr2	219000992	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=21,27;MFRL=140,137;MMQ=48,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:2,0:0,1:0,5,0,2
chr2	219103340	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=82,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.180:29:10,2:13,0:6,17,6,0
chr2	219130961	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219130961_A_C:219130961:0,0,0,1
chr2	219130964	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219130961_A_C:219130961:0,0,0,1
chr2	219130966	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:219130961_A_C:219130961:0,0,0,1
chr2	219134199	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:18,0:21,7:0|1:219134199_G_T:219134199:19,21,0,7
chr2	219134205	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=133,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:15,0:20,7:0|1:219134199_G_T:219134199:17,21,0,7
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	219142491	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,3,4
chr2	219142594	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr2	219143189	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=117,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:4,3,3,0
chr2	219143327	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=283,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,13:1,11:0,1,13,13
chr2	219144149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,2,11
chr2	219144815	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr2	219146607	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,18,4
chr2	219146868	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,10,13
chr2	219146882	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,11:0,0,9,12
chr2	219204808	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:6,1:2,2:5,3,1,3
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr2	219209796	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	219221982	.	G	GTCTCTCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,294;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,20;RU=TC;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.373:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	219229509	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=132,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,2:6,0:3,8,0,2
chr2	219249013	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:3,6,3,3
chr2	219251320	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr2	219252208	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,5:5,7:10,4,10,2
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr2	219259732	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:3,5:6,7:4,5,5,7
chr2	219259813	.	ATGTG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:1,4,0,4
chr2	219266204	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	219267781	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,16:0,0,12,12
chr2	219267870	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=103,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:11,3:11,10,0,3
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,17,12
chr2	219290609	.	A	AAGAAAGTTGTTGAAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	219294258	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr2	219296545	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:4,3,5,1
chr2	219303437	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=92,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,2:8,0:11,7,2,0
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:5,1,2,1
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=236,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	219320233	.	GAAAAA	G,GAA,GAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30,33,33;MFRL=0,193,184,196;MMQ=60,60,60,49;MPOS=31,17,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.25,6.38,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,3,1:0.316,0.428,0.167:6:0,0,2,1:0,2,1,0:0,0,6,0
chr2	219350358	.	CAAAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:1,2:2,0:3,6,2,1
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,1,3
chr2	219362396	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,2:8,0:0|1:219362396_A_G:219362396:7,5,2,0
chr2	219362404	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:219362396_A_G:219362396:9,7,2,0
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,3:9,3:11,4,3,3
chr2	219433717	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,24:0.328:74:20,16:30,8:22,28,14,10
chr2	219480569	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:7,9,0,2
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,5:2,0:2,3,1,4
chr2	219499419	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	219500534	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,0:10,5:5,13,0,5
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=100,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.378:21:7,2:6,4:6,7,4,4
chr2	219508372	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:4,6:2,6:0,6,4,9
chr2	219508988	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=109,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,12:11,3:10,11,10,5
chr2	219509482	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,140;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:12,8:5,0:7,10,8,0
chr2	219509618	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,1:8,4:8,10,2,3
chr2	219527005	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=64,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,4:1,7:0,2,2,9
chr2	219532903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=91,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.626:6:1,2:1,1:0|1:219532903_C_T:219532903:0,2,2,2
chr2	219532905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=91,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,3:0,1:0|1:219532903_C_T:219532903:0,2,2,2
chr2	219533116	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:4,0:0,1:0|1:219533116_GC_G:219533116:2,2,1,0
chr2	219533118	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:3,0:0,1:0|1:219533116_GC_G:219533116:2,2,1,0
chr2	219541056	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr2	219544673	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:10,7,0,2
chr2	219545309	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:0,3:3,7:2,1,10,0
chr2	219549873	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=126,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,2:8,0:13,9,0,2
chr2	219556977	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.252:26:9,6:11,0:7,13,6,0
chr2	219559263	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=103,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:12,0:24,4:22,14,3,1
chr2	219609776	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:4,0,8,1
chr2	219609995	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr2	219610322	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,7:3,8:6,0,15,0
chr2	219610883	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:17,0:12,3:12,18,0,3
chr2	219612282	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:5,7:4,10:7,2,9,8
chr2	219613718	.	C	CCCCGTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.160:16:4,2:10,0:1,13,1,1
chr2	219618237	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,39289083;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr2	219618497	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=216,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	219619130	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=109,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:6,0:14,4:0|1:219619130_G_C:219619130:4,16,1,3
chr2	219619137	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:4,0:9,1:0|1:219619130_G_C:219619130:3,13,1,3
chr2	219679789	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:6,0:3,8,0,4
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	219692025	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=95,184;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,0:14,2:17,14,0,2
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,10:0,0,11,7
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,8:0,0,11,11
chr2	219692806	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:0|1:219692806_G_A:219692806:6,9,1,1
chr2	219692808	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:4,0:0|1:219692806_G_A:219692806:6,9,1,1
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,13,10
chr2	219736640	.	GGAGGGGGGCGTTAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr2	219738121	.	ACG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=68,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:219738121_ACG_A:219738121:1,1,0,1
chr2	219738125	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=81,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:219738121_ACG_A:219738121:2,1,0,1
chr2	219738127	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=81,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:219738121_ACG_A:219738121:2,1,0,1
chr2	219738132	.	G	GGCAGAACCTGCTCCAGCCGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=81,109;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:219738121_ACG_A:219738121:2,1,0,1
chr2	219826019	.	CCT	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.107:28:8,2:17,1:11,14,1,2
chr2	219826034	.	C	CT	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.154:32:9,1:16,3:0|1:219826034_C_CT:219826034:12,15,1,4
chr2	219826035	.	C	CT	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.154:32:10,1:15,3:0|1:219826034_C_CT:219826034:12,15,1,4
chr2	219849868	.	T	TGAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,27;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:219849868_T_TGAGAAA:219849868:0,1,0,1
chr2	219849871	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219849868_T_TGAGAAA:219849868:0,1,0,1
chr2	219855668	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:11,0:20,6:16,15,0,6
chr2	219855783	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=93,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:219855783_C_T:219855783:0,2,0,1
chr2	219855784	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=93,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:219855783_C_T:219855783:0,2,0,1
chr2	219867762	.	C	CTGGTTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.239:10:5,2:3,0:0|1:219867762_C_CTGGTTG:219867762:6,2,1,1
chr2	219867763	.	A	AGAACTAGTGTTCTAGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:5,2:3,0:0|1:219867762_C_CTGGTTG:219867762:6,2,1,1
chr2	219878026	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=97,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,2:11,0:9,10,2,0
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chr2	219888220	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	219888240	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	219892233	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=80,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.718:30:2,5:6,16:3,5,12,10
chr2	219895602	.	TGTGGCCCCAGCTGAACAGCCCCTCGAAGAAGGCAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.358:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr2	219920412	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:1,0,4,7
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	219922505	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219924944	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:6,8,1,1
chr2	219941063	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,14:0,7:0,0,13,8
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr2	220023011	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,0:7,3:7,13,0,3
chr2	220028900	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	220034324	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:10,10:8,4:11,7,11,3
chr2	220034865	.	G	GAGTAAAGGACATGAGATAGGTGAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	220037508	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=87,96;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:22,5:22,0:23,21,0,5
chr2	220037557	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=159,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:3,2,5,5
chr2	220037733	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:8,7,0,3
chr2	220037756	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr2	220040216	.	CA	C,CAAAAA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,30,0;MFRL=134,98,175;MMQ=60,60,60;MPOS=11,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,18;RU=A;STR;TLOD=4.65,4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,3:0.247,0.261:14:2,1,0:3,4,0:6,0,8,0
chr2	220040330	.	A	G	.	.	DP=125;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=410.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,124:0.985:125:0,54:1,68:0,1,30,94
chr2	220040347	.	G	A	.	.	DP=94;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,6:0.074:91:35,6:50,0:24,61,0,6
chr2	220040374	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.117:57:27,6:24,0:11,40,0,6
chr2	220041091	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	220045519	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:13,0:19,3:0|1:220045519_T_C:220045519:10,22,0,3
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chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,13,5
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chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
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chr2	220072743	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:13,3:13,16,0,3
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,12:0,0,14,16
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr2	220073465	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220073465_A_C:220073465:0,2,0,1
chr2	220073466	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220073465_A_C:220073465:0,2,0,1
chr2	220073467	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:220073465_A_C:220073465:0,2,0,1
chr2	220073478	.	A	ACTCCTGACCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=265,197;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr2	220074978	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,0:13,4:15,14,0,4
chr2	220075577	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,0,2
chr2	220077079	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,2:13,0:11,8,3,0
chr2	220077253	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,15,5
chr2	220081620	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=239,1086;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220081620_T_C:220081620:0,1,1,0
chr2	220081623	.	GGGAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=239,1086;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220081620_T_C:220081620:0,1,1,0
chr2	220081629	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,1086;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220081620_T_C:220081620:0,0,1,0
chr2	220083279	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=211,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:1,14:0,25:0,1,16,25
chr2	220083314	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=161,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:22,5:19,0:17,24,5,0
chr2	220083338	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:14,6:12,0:15,12,5,1
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,1,11
chr2	220086050	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.296:20:4,4:10,0:10,4,0,6
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	220089590	.	T	TC,TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,16,14;MFRL=0,202,225;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.72,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,3:0.634,0.291:10:0,1,0:0,1,1:0,0,1,9
chr2	220090275	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:9,3:16,0:0|1:220090275_C_A:220090275:11,15,1,2
chr2	220090277	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=125,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:9,2:17,0:0|1:220090275_C_A:220090275:11,15,1,2
chr2	220090294	.	C	CACCCCTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:6,11,0,2
chr2	220092602	.	T	TAGTGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=126,93475548;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:11,0:11,2:13,9,0,2
chr2	220099629	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=103,736;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.212:48:25,0:12,9:18,20,5,5
chr2	220104849	.	A	AATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=131,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr2	220118672	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.716:8:1,0:1,3:2,0,2,4
chr2	220144576	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:6,0:16,3:13,9,1,2
chr2	220156249	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:16,0:15,10:16,15,0,10
chr2	220172594	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,2:12,1:9,15,2,1
chr2	220173742	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:12,1:12,8:2,22,0,9
chr2	220194508	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,15;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:3,1,0,1
chr2	220197821	.	C	CTA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:7,1:9,0:16,0,2,0
chr2	220197929	.	CTT	C,CT,CTTTTTTT	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=31,25,30,30;MFRL=75,69,127,91;MMQ=60,60,60,60;MPOS=29,29,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,18,19,25;RU=T;STR;TLOD=5.44,6.68,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,6,7,14:0.131,0.187,0.369:38:6,4,2,3:2,2,3,5:8,3,17,10
chr2	220239106	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,1,1
chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,11,9
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,16:0,0,12,12
chr2	220246121	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.278:41:16,11:13,0:10,20,0,11
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,12,13
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,3,8
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=216,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr2	220251590	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:0|1:220251590_C_G:220251590:0,5,2,0
chr2	220251592	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,0:0|1:220251590_C_G:220251590:0,7,2,0
chr2	220252063	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.087:43:15,0:25,3:17,23,2,1
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr2	220283826	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220284717	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=110,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,2:10,2:11,8,2,2
chr2	220285309	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=119,88;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,6:2,7:4,3,6,7
chr2	220285635	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=138,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:6,6,2,1
chr2	220285666	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:3,3,0,3
chr2	220286142	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,8:6,4:5,5,6,6
chr2	220308717	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:21,0:12,3:17,16,1,2
chr2	220313730	.	AT	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:1,0:1,0:1,1,2,0
chr2	220315934	.	TGTG	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=125,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTG;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:3,10,2,0
chr2	220315970	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,10:0,0,5,8
chr2	220316010	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,0;MFRL=87,144;MMQ=60,54;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.217:15:8,0:4,0:0|1:220316010_C_T:220316010:4,8,0,3
chr2	220316020	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=88,144;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.232:14:7,0:2,2:0|1:220316010_C_T:220316010:4,7,0,3
chr2	220316039	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	220326613	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:5,2:0|1:220326613_C_T:220326613:10,11,1,1
chr2	220326617	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:9,2:0|1:220326613_C_T:220326613:12,13,1,1
chr2	220330642	.	TGTGCGCGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220330657	.	GTGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220330724	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr2	220342434	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=83,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:18,3:7,0:13,12,3,0
chr2	220342899	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	220344450	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=174,113;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,0:4,0,3,0
chr2	220348910	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,93603837;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:1,6,0,2
chr2	220353104	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=265,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr2	220353440	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:4,3:2,3:4,2,3,3
chr2	220353602	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.360:17:5,0:6,5:4,7,0,6
chr2	220354108	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=92,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,3:4,7:5,5,5,5
chr2	220354470	.	ACCAGCCCCTGAGCCC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAGCCCCTGAGCCC;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:2,1:5,1:4,8,1,1
chr2	220356449	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=195,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr2	220356993	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:4,10,0,2
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	220361520	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr2	220364848	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=86,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:22,2:19,0:20,21,2,0
chr2	220370455	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	220371181	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	220371222	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,2,0,1
chr2	220371224	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,2,0,1
chr2	220371227	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,2,0,1
chr2	220371232	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,2,0,1
chr2	220371234	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,2,0,1
chr2	220371242	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220371222_GT_G:220371222:0,0,0,1
chr2	220371442	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=130,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:8,4:6,11,2,2
chr2	220379183	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:3,0:7,8,1,1
chr2	220396808	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,228;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,7:10,0:7,15,7,0
chr2	220401751	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:2,2,4,0
chr2	220402090	.	A	ATGCTCTTGGTCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,16;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,0:1,0:1,1,0,1
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	220412256	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr2	220412717	.	CC	TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=91,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr2	220412845	.	G	GTGTGCGGGTGTATGTGGTGTGCACCTGCATGTGTGTGCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=241,156;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	220416570	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	220416591	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,20:0,0,15,13
chr2	220416942	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,3:10,8:8,9,4,7
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=175,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,3:5,6:1,6,3,7
chr2	220418474	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187276917;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:220418474_G_GTC:220418474:0,0,0,1
chr2	220418477	.	GA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,187276917;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220418474_G_GTC:220418474:0,0,0,1
chr2	220420956	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,18,12
chr2	220421479	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=81,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:4,2:8,5:1,12,2,5
chr2	220422452	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=200,9046626;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr2	220422974	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:4,2:0|1:220422974_G_T:220422974:5,9,1,1
chr2	220422979	.	G	GTACCACAGAGAGTAGAGTTCT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:220422974_G_T:220422974:5,10,1,1
chr2	220427395	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=194,80;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:2,0,3,5
chr2	220427428	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	220428134	.	C	CTGCGCA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:14,7,0,2
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,3,5
chr2	220431458	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr2	220433113	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220437081	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:6,4:5,7:6,5,4,7
chr2	220439872	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:6,5,3,0
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.577:19:4,3:2,7:4,4,8,3
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr2	220471492	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,166;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,2:7,0:3,6,2,0
chr2	220472859	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:7,2:0|1:220472859_T_C:220472859:9,6,1,1
chr2	220472865	.	CCT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=115,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:220472859_T_C:220472859:8,7,1,1
chr2	220472871	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:220472859_T_C:220472859:8,6,1,1
chr2	220473489	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:220473489_C_T:220473489:2,9,1,1
chr2	220473506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:0|1:220473489_C_T:220473489:1,10,1,1
chr2	220473522	.	G	GCGGTGGCTCATGCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:220473489_C_T:220473489:0,8,1,1
chr2	220476286	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:2,0:1,0:3,1,0,4
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr2	220479136	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=193,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:220479136_C_CT:220479136:3,1,0,1
chr2	220479137	.	C	CCTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=193,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,1:3,0:0|1:220479136_C_CT:220479136:3,1,0,1
chr2	220479141	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=192,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:220479136_C_CT:220479136:4,1,0,1
chr2	220479312	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	220480842	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=106,79;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.348:24:10,0:5,8:9,7,8,0
chr2	220493340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,271;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1,12,0,2
chr2	220494118	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr2	220498739	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,50;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:1,9,0,2
chr2	220500261	.	CATCCCAGGGCCCTAAGGCTGTGACCCCAGCCCCGTCCTGACTCCTGGAGTCCTTTGCATCCCTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,93679426;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.239:11:3,0:2,2:2,7,0,2
chr2	220500423	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:220500423_A_G:220500423:0,0,7,3
chr2	220500426	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0|1:220500423_A_G:220500423:0,0,8,3
chr2	220501545	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=94,167;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:17,2:6,0:0|1:220501545_C_A:220501545:9,14,2,0
chr2	220501548	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=109,167;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:17,2:8,0:0|1:220501545_C_A:220501545:9,16,2,0
chr2	220502367	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:2,5:3,8:1,4,8,6
chr2	220505421	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,2,0
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	222321338	.	TTGGTTGTAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:1,0:8,3,2,0
chr2	222321471	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:6,4,0,2
chr2	222347019	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	223066919	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	223096709	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	223096805	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=102,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:8,9,1,1
chr2	223159119	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	223161624	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	223161997	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	223169081	.	G	GGGC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,2:6,0:0|1:223169081_G_GGGC:223169081:12,10,0,2
chr2	223169083	.	G	GAATATTTGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,2:6,0:0|1:223169081_G_GGGC:223169081:12,10,0,2
chr2	223423362	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0,0,12,17
chr2	223489249	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:2,4:0,6,0,4
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:223493435_G_A:223493435:0,0,6,0
chr2	223493440	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:223493435_G_A:223493435:0,0,6,0
chr2	223498056	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,2:5,0:3,3,0,2
chr2	223499077	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	223559199	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=97,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,4:14,0:10,13,4,0
chr2	223773609	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:8,3:15,1:15,9,3,1
chr2	223773761	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:8,2:0|1:223773761_G_A:223773761:12,9,0,2
chr2	223773768	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:0|1:223773761_G_A:223773761:13,10,0,2
chr2	223773770	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:13,2:0|1:223773761_G_A:223773761:13,11,0,2
chr2	223773772	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:11,2:0|1:223773761_G_A:223773761:13,11,0,2
chr2	223773774	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:223773761_G_A:223773761:12,10,0,2
chr2	223781018	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.904:17:1,10:0,6:1,0,13,3
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	223806189	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.455:5:1,2:1,0:2,1,2,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,8,5
chr2	223806414	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:223806414_C_CAA:223806414:0,4,0,1
chr2	223806420	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:223806414_C_CAA:223806414:0,4,0,1
chr2	223917629	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:3,6:9,7:5,7,11,3
chr2	223917638	.	CGGCAAT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:3,6:8,8:5,7,11,3
chr2	223917983	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:3,5:0,3:2,1,2,6
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,184;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	223919675	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=202,179;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:223919675_C_CA:223919675:0,4,0,1
chr2	223919679	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=184,179;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:223919675_C_CA:223919675:0,3,0,1
chr2	223920146	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:9,6:15,4:11,13,6,4
chr2	224463164	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=113,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.422:31:7,5:9,7:11,7,6,7
chr2	224463878	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.198:43:20,0:13,7:0|1:224463878_G_T:224463878:15,20,0,8
chr2	224463882	.	G	GGCCTCAGCATCACGAAGGACAGTGGGTGGGT	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,38;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.200:41:19,0:13,8:0|1:224463878_G_T:224463878:13,20,0,8
chr2	224463969	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,172;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:19,10:9,0:20,8,10,0
chr2	224640803	.	C	CAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=47,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:6,5:4,9:6,4,9,6
chr2	224749288	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr2	224749457	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:224749457_A_T:224749457:10,11,1,1
chr2	224749463	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:224749457_A_T:224749457:10,10,1,1
chr2	224749464	.	A	AAGGCTTCCCCTGGAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:224749457_A_T:224749457:10,9,1,1
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,19:0,15:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,9,25
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=116.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,10:0,15:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,6,22
chr2	224842407	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	224856592	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=93,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:11,1:11,14,0,2
chr2	224862821	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:6,0,3,4
chr2	224862842	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:3,4:3,0,4,5
chr2	224863090	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	225265769	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=108,96062278;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:225265769_G_T:225265769:9,2,2,0
chr2	225265777	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=99,96062278;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:10,2:5,0:0|1:225265769_G_T:225265769:9,7,2,0
chr2	225343000	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:12,8,1,1
chr2	225365056	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:7,2,3,1
chr2	225367669	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,3,2
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:5,0,2,1
chr2	225376034	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:3,2:9,6:9,3,4,4
chr2	225400185	.	CCTTCAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTCAA;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:3,7,1,1
chr2	225431637	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:7,0:17,2:12,12,1,1
chr2	225634931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,0:4,2:4,3,2,0
chr2	225659714	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,4:8,11,0,4
chr2	225665074	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	225666758	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:7,11,0,2
chr2	225668813	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:10,0:16,8,0,3
chr2	225668895	.	GTGGA	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:21,3:10,0:0|1:225668895_GTGGA_G:225668895:9,23,0,3
chr2	225668901	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:15,3:10,0:0|1:225668895_GTGGA_G:225668895:9,16,0,3
chr2	225672608	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:6,2,1,1
chr2	225679143	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:225679143_T_TA:225679143:0,1,0,1
chr2	225679145	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:225679143_T_TA:225679143:0,1,0,1
chr2	225679151	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225679143_T_TA:225679143:0,0,0,1
chr2	225679155	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225679143_T_TA:225679143:0,0,0,1
chr2	225719781	.	G	GAC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=92,133;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,1:0,0:0,1,0,5
chr2	225729811	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=106,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr2	225751254	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:225751254_AT_A:225751254:2,2,1,1
chr2	225751264	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:225751254_AT_A:225751254:2,2,1,1
chr2	225848562	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:11,2:23,0:0|1:225848562_C_A:225848562:18,17,1,1
chr2	225848566	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,2:21,0:0|1:225848562_C_A:225848562:16,16,1,1
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=89,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:10,2:15,3:13,12,1,4
chr2	226491770	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr2	226491802	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=103,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.296:28:12,0:8,6:0|1:226491802_C_T:226491802:8,12,2,6
chr2	226491810	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:10,0:5,6:0|1:226491802_C_T:226491802:6,10,0,6
chr2	226491815	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,38;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:9,0:5,6:0|1:226491802_C_T:226491802:5,9,0,6
chr2	226491816	.	C	CTTCAGCAGCACACGAGGG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:9,0:5,1:0|1:226491802_C_T:226491802:5,9,0,6
chr2	227661043	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,1,2
chr2	227663087	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:0|1:227663087_C_T:227663087:13,9,1,1
chr2	227663094	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,1:9,0:0|1:227663087_C_T:227663087:14,9,1,1
chr2	227729672	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=137,206;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,0:6,5:4,6,0,5
chr2	227771389	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:4,11:1,6:5,0,13,5
chr2	227773466	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,5:2,10:5,1,12,3
chr2	227872182	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,3:3,6:1,3,4,6
chr2	227872995	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=239,168;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,1:0,3:2,0,1,4
chr2	227873028	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr2	227874957	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr2	227886925	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:2,1,1,6
chr2	227892619	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=185,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,6:2,5:2,1,7,4
chr2	227892644	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,0:7,7:12,6,1,6
chr2	227895125	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,3,2
chr2	227896652	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,6:4,9:4,4,6,9
chr2	227896976	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,2:0,5,2,4
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	227915601	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	227919271	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr2	227919500	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=153,108;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:227919500_A_G:227919500:4,13,0,2
chr2	227919504	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=154,108;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:8,2:0|1:227919500_A_G:227919500:4,10,0,2
chr2	227922104	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:227922104_T_C:227922104:0,0,2,1
chr2	227922109	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:227922104_T_C:227922104:0,0,2,1
chr2	227924322	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=101,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,0:11,3:12,13,0,3
chr2	227924817	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr2	227925017	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:227925017_A_AG:227925017:0,2,0,1
chr2	227925018	.	A	AAGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:227925017_A_AG:227925017:0,2,0,1
chr2	227925021	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:227925017_A_AG:227925017:0,2,0,1
chr2	227927189	.	GTT	G,GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32,31;MFRL=184,134,136;MMQ=60,60,60;MPOS=32,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.16,13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.210,0.561:11:1,1,3:0,1,3:1,1,8,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	227966298	.	T	TA,TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,24,20;MFRL=67,117,95;MMQ=60,60,60;MPOS=21,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=23.05,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,13,4:0.718,0.227:19:2,4,1:0,8,2:1,1,4,13
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.932:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,8:0,0,11,8
chr2	227968855	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227968855_AA_CC:227968855:0,1,0,1
chr2	227968859	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227968855_AA_CC:227968855:0,1,0,1
chr2	227968861	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227968855_AA_CC:227968855:0,1,0,1
chr2	227968863	.	G	GGCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:227968855_AA_CC:227968855:0,1,0,1
chr2	227968866	.	T	TTACTCTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227968855_AA_CC:227968855:0,0,0,1
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.817:14:0,4:2,8:1,1,3,9
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=174,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,2:2,6:3,0,5,4
chr2	228109627	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=88,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,0:7,2:6,4,3,0
chr2	228109784	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr2	228118403	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr2	228124550	.	C	CCAAGAGAGCTGTCAAATGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr2	228128540	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=262,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:0,6:1,19:1,0,14,11
chr2	228137655	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:0|1:228137655_GT_G:228137655:9,11,1,1
chr2	228137658	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:0|1:228137655_GT_G:228137655:9,11,1,1
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	228154891	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	228155585	.	GGA	TTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=86,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr2	228159144	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=132,194;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,3:7,0:13,3,3,0
chr2	228159660	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:0,0:0|1:228159660_GT_G:228159660:2,1,2,0
chr2	228159677	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=100,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,1:0|1:228159660_GT_G:228159660:3,3,2,0
chr2	228162639	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:6,0:4,6:1,9,0,7
chr2	228168784	.	CCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.125:37:2,3:9,5:10,15,6,6
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:1,0,9,1
chr2	228172564	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=123,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:15,0:26,5:0|1:228172564_C_T:228172564:13,30,0,5
chr2	228172574	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=113,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:12,0:26,5:0|1:228172564_C_T:228172564:13,27,0,5
chr2	228172592	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.197:38:10,0:21,7:9,22,1,6
chr2	228172640	.	TGTCCCA	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCCCA;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,2:10,0:9,18,1,1
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	228212012	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=64,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:6,10,0,4
chr2	228220288	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=70,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	228230727	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:7,1:2,4:9,0,5,0
chr2	228230733	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,6:7,0:17,0,6,0
chr2	228230945	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,4:8,4:3,9,2,6
chr2	228337356	.	AGCGGGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=299,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	228356307	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=114,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.108:71:33,0:30,7:39,25,7,0
chr2	228356364	.	GTTT	G,GT,GTT,GTTTT	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=33,33,31,31,28;MFRL=147,100,129,88,159;MMQ=60,60,60,60,44;MPOS=23,18,20,5;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.68,3.65,23.79,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:12,3,5,16,3:0.069,0.096,0.397,0.097:39:6,1,2,7,2:6,2,3,8,0:5,7,7,20
chr2	228384814	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:228384814_C_T:228384814:4,16,1,1
chr2	228384823	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:228384814_C_T:228384814:2,21,1,1
chr2	228384826	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=128,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:228384814_C_T:228384814:2,19,1,1
chr2	228384827	.	T	TCC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=128,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,1:0|1:228384814_C_T:228384814:2,19,1,1
chr2	228395855	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:12,1:22,2:16,18,1,2
chr2	228397036	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	228416712	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,17:0,0,18,17
chr2	228476253	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,71;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,2:7,2:11,5,2,2
chr2	228477814	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr2	228565888	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=100,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr2	228565906	.	CACCCG	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:1,2:4,0:0|1:228565906_CACCCG_C:228565906:1,5,1,1
chr2	228565909	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=50,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.363:3:1,0:1,1:0|1:228565909_C_G:228565909:1,1,0,1
chr2	228565910	.	C	CTCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=50,240;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.363:3:1,0:1,1:0|1:228565909_C_G:228565909:1,1,0,1
chr2	228565916	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:228565906_CACCCG_C:228565906:0,2,1,1
chr2	228565918	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:228565906_CACCCG_C:228565906:0,2,1,1
chr2	228565920	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:228565906_CACCCG_C:228565906:0,2,1,1
chr2	228736308	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,8:6,6:7,1,13,1
chr2	228736313	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:9,2:8,6:14,3,6,2
chr2	228736341	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:4,13:8,11:6,6,13,11
chr2	228736527	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr2	228741250	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:7,2:4,3:5,7,1,4
chr2	228758456	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,5,1
chr2	228758538	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:11,5,2,0
chr2	228758554	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:8,2,7,3
chr2	228762954	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:16,0:22,4:18,20,3,1
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	228783635	.	GT	TC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=153,87;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:0|1:228783635_GT_TC:228783635:1,10,1,1
chr2	228783641	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=155,87;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:228783635_GT_TC:228783635:1,9,1,1
chr2	228783643	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,87;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:228783635_GT_TC:228783635:1,9,1,1
chr2	228883626	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=106,85405050;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,0:0,2:3,5,1,1
chr2	228973660	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=396,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.771:6:1,2:0,3:1,0,2,3
chr2	228996637	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	228996650	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	228996672	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.537:13:5,3:1,4:6,0,5,2
chr2	228996756	.	CTGCTGCGGTTCCAAAACGTCATACATCCGTGATGACTCCAAGT	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:5,1:6,2:2,14,1,2
chr2	228996766	.	TCCAAAACGTCATACATCCGTGATGACTCCAAGTTGCTGTTTGTGAC	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:1,2:6,0:0,14,1,1
chr2	229890660	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:6,1:7,5,0,2
chr2	230096587	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,1:4,4:4,0,5,0
chr2	230096837	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0|1:230096837_C_T:230096837:1,4,0,3
chr2	230096865	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,180;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:230096837_C_T:230096837:0,4,0,1
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=105.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,19,15
chr2	230135789	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,1:0|1:230135789_C_T:230135789:3,14,1,1
chr2	230135794	.	G	GCACGCTGTCTCTGTTTGGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=148,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,1:0|1:230135789_C_T:230135789:2,12,1,1
chr2	230223451	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=67,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr2	230231889	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	230312225	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=137,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:12,2:14,1:0|1:230312225_C_T:230312225:10,17,2,1
chr2	230312226	.	A	ATAAGG	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=137,36;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:11,2:15,0:0|1:230312225_C_T:230312225:13,18,1,1
chr2	230312227	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=136,36;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,2:15,0:0|1:230312225_C_T:230312225:13,19,1,1
chr2	230312229	.	T	TG	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=126,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,2:16,0:0|1:230312225_C_T:230312225:12,18,1,1
chr2	230312232	.	T	TTTTG	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=137,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,2:17,0:0|1:230312225_C_T:230312225:13,16,1,1
chr2	230312233	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=136,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,2:17,0:0|1:230312225_C_T:230312225:13,15,1,1
chr2	230453214	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,0:0,1:0,0,0,4
chr2	230632268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,4,1
chr2	230633985	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:19,0:21,5:18,23,0,5
chr2	230650669	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:230650669_C_A:230650669:0,1,0,1
chr2	230650671	.	C	CTACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:230650669_C_A:230650669:0,1,0,1
chr2	230656987	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.231:19:6,0:8,4:0,15,0,4
chr2	230663576	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,2:9,1:11,2,2,1
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr2	230668982	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	230694010	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:230694010_G_A:230694010:2,10,1,1
chr2	230694017	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:230694010_G_A:230694010:2,10,1,1
chr2	230705516	.	TAA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=105,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.131:26:8,0:11,2:14,9,2,1
chr2	231036541	.	G	GTTGGAGCCCATATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	231042276	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=101,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,2:8,1:14,9,3,0
chr2	231043050	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	231072709	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,5:0,15:0,0,10,10
chr2	231076289	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr2	231077154	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:5,3:4,10:1,9,4,9
chr2	231077643	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,8;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:11,0:9,1:16,4,0,3
chr2	231110737	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,1:4,1:1,5,0,2
chr2	231112634	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.197:37:19,6:11,0:23,7,7,0
chr2	231112838	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=141,169;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:2,12,0,3
chr2	231115603	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	231115730	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=99,464;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,4:13,0:14,8,2,2
chr2	231118041	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,2:13,1:6,12,0,3
chr2	231149097	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=105,119;MMQ=60,59;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.237:36:20,7:7,1:17,11,4,4
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,21:0,7:0,0,17,12
chr2	231149134	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=112,102852992;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:19,2:5,0:11,14,1,1
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.269:23:5,3:12,2:4,13,2,4
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=95,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	231192072	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,0:9,3:7,18,0,3
chr2	231222499	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,7:6,3:7,5,4,6
chr2	231222592	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:2,5,2,0
chr2	231248261	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,29:0.613:47:11,10:7,19:0|1:231248261_C_T:231248261:11,7,10,19
chr2	231248264	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=92,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.100:48:17,4:26,0:0|1:231248261_C_T:231248261:20,24,2,2
chr2	231248271	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=92,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:18,4:24,0:0|1:231248261_C_T:231248261:18,25,2,2
chr2	231253183	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:5,1,2,1
chr2	231253216	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:7,8:7,1:11,4,7,2
chr2	231254731	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=120,150;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:16,4:19,0:12,23,0,4
chr2	231261620	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,188;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	231307584	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,0:5,4:8,2,3,1
chr2	231307860	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=89194301,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	231309139	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=222,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	231314436	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=118,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:12,0:17,4:11,20,0,4
chr2	231326188	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,2,1
chr2	231326201	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=208,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	231327248	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=89,45962329;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,1:8,1:6,9,2,0
chr2	231327291	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	231328696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr2	231328720	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0|1:231328720_C_T:231328720:0,0,17,0
chr2	231328728	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0|1:231328720_C_T:231328720:0,0,17,1
chr2	231331799	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr2	231333763	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr2	231333834	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,2,9
chr2	231333852	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr2	231333890	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	231334421	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr2	231334504	.	AAAAG	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=40,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.921:28:0,11:2,15:0,2,20,6
chr2	231334679	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,8,8
chr2	231337960	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr2	231359098	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:2,2:3,6:4,2,5,3
chr2	231359225	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:1,5:1,14:0,2,6,13
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.628:21:3,3:4,10:1,6,3,11
chr2	231363315	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr2	231368897	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,3,2
chr2	231375974	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	231405572	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.250:16:7,2:4,1:7,5,3,1
chr2	231406529	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	231406680	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,10,7
chr2	231407519	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr2	231674867	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr2	231678693	.	C	CTTTTTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=34,44;RU=T;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,1:1,0,4,1
chr2	231729823	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:231729823_CG_C:231729823:7,6,1,1
chr2	231729825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:5,1:0|1:231729823_CG_C:231729823:7,6,1,1
chr2	231729839	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,2:5,0:5,3,0,2
chr2	231738168	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,3:0,8:1,0,5,6
chr2	231738263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0|1:231738263_C_T:231738263:3,5,3,7
chr2	231738269	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:2,4:6,4:0|1:231738263_C_T:231738263:3,5,3,6
chr2	231738275	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=90,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:5,10,1,1
chr2	231738318	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,0,5
chr2	231740276	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	231740498	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:231740498_C_T:231740498:3,6,1,1
chr2	231740515	.	TT	AG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:231740498_C_T:231740498:2,4,1,1
chr2	231740522	.	G	GTGCAGCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=199,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:231740498_C_T:231740498:2,2,0,1
chr2	231740524	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=199,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:231740498_C_T:231740498:2,2,0,1
chr2	231740525	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=199,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:231740498_C_T:231740498:2,2,0,1
chr2	231741474	.	CA	C,TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32,25;MFRL=212,155,109;MMQ=50,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.03,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,1:0,0,0:2,0,2,0
chr2	231741475	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=202,174;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.440:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	231741601	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:11,3:1,0:4,8,1,2
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	231861032	.	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=100,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.153:44:14,2:14,3:24,14,4,2
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=160,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,1:2,2:2,4,2,1
chr2	231906103	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:12,0:11,14,0,3
chr2	231911751	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,3:13,0:8,14,2,1
chr2	231940295	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=104,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.308:31:10,7:9,3:12,9,5,5
chr2	231940386	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr2	231943497	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=105,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTTTT;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.163:17:10,0:3,2:9,6,1,1
chr2	231973947	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,0:7,5:9,8,1,4
chr2	232025985	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:0,0:6,0,2,0
chr2	232081288	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,101;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:8,3,3,0
chr2	232087474	.	AT	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,11,17
chr2	232100082	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=103,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:9,0:15,4:13,11,2,2
chr2	232121172	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:1,1:7,0,1,1
chr2	232127159	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.288:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	232156084	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:6,2:3,3:5,5,4,1
chr2	232156210	.	A	ATGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	232160995	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:6,4:11,0:5,12,2,2
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr2	232196564	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,10:5,6:8,3,6,10
chr2	232196597	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,7:1,4:5,1,6,5
chr2	232262419	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	232321956	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,4:1,12:3,0,9,7
chr2	232324780	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	232326801	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	232389890	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:8,3,3,0
chr2	232393572	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,0:11,6:8,12,0,6
chr2	232572381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr2	232573292	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=180,76;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:232573292_T_C:232573292:1,0,1,1
chr2	232573301	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=180,76;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:232573292_T_C:232573292:1,0,1,1
chr2	232574807	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,5:3,4:1,2,1,9
chr2	232656859	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,217;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:4,11,0,2
chr2	232660966	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,2:3,0:6,7,2,0
chr2	232790053	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	232952143	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr2	232952286	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=100,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,9:6,6:4,5,4,11
chr2	232952455	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=104,51;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:6,0:10,3:0|1:232952455_C_G:232952455:6,11,0,3
chr2	232952458	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=100,51;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:5,0:9,3:0|1:232952455_C_G:232952455:5,11,0,3
chr2	233028149	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,2:4,0:0|1:233028149_C_T:233028149:12,4,1,1
chr2	233028156	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:7,0:0|1:233028149_C_T:233028149:15,4,1,1
chr2	233028409	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=186,242;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:233028409_C_CG:233028409:0,2,0,1
chr2	233028412	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=186,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:233028409_C_CG:233028409:0,2,0,1
chr2	233028420	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=186,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:233028409_C_CG:233028409:0,2,0,1
chr2	233199147	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,3:11,0:7,12,1,2
chr2	233199152	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=119,599;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,3:12,0:8,11,0,3
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr2	233245082	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:1,0:1,1:2,2,0,4
chr2	233245958	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,165;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:3,0,5,1
chr2	233271697	.	TAC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:5,5:5,0:0|1:233271697_TAC_T:233271697:7,7,1,4
chr2	233271721	.	A	AACAGATAGAGAG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=98,51;MMQ=57,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:7,2:9,0:0|1:233271697_TAC_T:233271697:14,13,1,1
chr2	233272528	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:1,3:2,11:3,0,6,8
chr2	233273022	.	CC	TT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=77,73;MMQ=32,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:23,0:10,2:7,27,1,1
chr2	233321302	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:7,0:8,7,1,2
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=226,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:0,1:0,1,1,3
chr2	233323493	.	A	ATGAACAGTCAGTTTTGAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.365:6:3,0:1,2:3,1,1,1
chr2	233344991	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:1,5,1,5
chr2	233345213	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:233345213_G_C:233345213:0,4,0,1
chr2	233345215	.	AG	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:233345213_G_C:233345213:0,4,0,1
chr2	233345223	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:233345213_G_C:233345213:0,4,0,1
chr2	233345249	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=200,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	233345893	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:233345893_GCT_G:233345893:1,3,0,1
chr2	233345896	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:233345893_GCT_G:233345893:1,3,0,1
chr2	233346455	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=129,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,5,3
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	233349903	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,1:5,1:4,4,0,2
chr2	233350000	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr2	233391435	.	C	CATAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:3,0:0|1:233391435_C_CATAGAGA:233391435:2,1,0,1
chr2	233391440	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:233391435_C_CATAGAGA:233391435:2,1,0,1
chr2	233391444	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:233391435_C_CATAGAGA:233391435:2,2,0,1
chr2	233391446	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233391435_C_CATAGAGA:233391435:0,2,0,1
chr2	233393777	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=211,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:233393777_C_CAA:233393777:0,4,0,1
chr2	233393780	.	AC	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=146,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:1,0:2,0:1|0:233393777_C_CAA:233393777:0,3,0,1
chr2	233393781	.	C	CATAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=207,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:233393777_C_CAA:233393777:0,3,0,1
chr2	233406324	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233406324_T_TA:233406324:0,1,0,1
chr2	233406325	.	G	GGTGCTGCCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233406324_T_TA:233406324:0,1,0,1
chr2	233407120	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,4:3,7:3,2,8,3
chr2	233407516	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	233408204	.	C	CCTGCCCAGACTCTTTTTTTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:3,1,0,1
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr2	233408239	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=119,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr2	233408241	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=207,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:233408241_TG_T:233408241:3,1,1,0
chr2	233408252	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=207,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:233408241_TG_T:233408241:3,1,1,0
chr2	233408334	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:13,6,0,2
chr2	233409013	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:8,8:8,7:6,10,6,9
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:6,13:6,5:9,3,11,7
chr2	233429144	.	GTATTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TATTT;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.828:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	233431719	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:12,6:16,0:14,14,0,6
chr2	233439099	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,0:2,9:1,5,0,9
chr2	233620907	.	CTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,167;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	233626188	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:3,0:10,3:3,10,1,3
chr2	233630624	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=115,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:16,9,0,2
chr2	233633473	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:11,0:11,3:11,11,1,2
chr2	233641010	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr2	233652137	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	233655706	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,0;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.231:28:12,3:10,3:13,9,3,3
chr2	233655856	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=149,125;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.403:45:10,8:15,9:11,16,0,18
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	233681609	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=101,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,13:0.242:56:25,13:17,0:27,16,13,0
chr2	233708803	.	GCAA	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:11,3:11,0:13,9,1,2
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:1,15:0,16:0,1,19,13
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=309,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,14,6
chr2	233712212	.	GCAGCAGCAGCTGCCA	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:10,2:7,18,1,1
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,12:0,0,7,18
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,10:0,0,4,17
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,8:0,15:0,0,10,13
chr2	233721525	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:5,6:12,8:7,10,5,9
chr2	233740055	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AG;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	233740227	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,8:0,0,14,10
chr2	233744130	.	GCCCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,8;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	233744141	.	CCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:233744141_CCCA_C:233744141:1,0,1,0
chr2	233744158	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:233744141_CCCA_C:233744141:3,0,1,0
chr2	233746016	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	233750074	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr2	233752639	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	233757860	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	233759362	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	233835005	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,0:14,2:8,14,1,1
chr2	233835018	.	AT	GC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:233835018_AT_GC:233835018:8,14,1,1
chr2	233835022	.	T	TGGTCC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:233835018_AT_GC:233835018:8,13,1,1
chr2	233899424	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:0|1:233899424_C_T:233899424:4,9,1,1
chr2	233899444	.	G	GAAGCTA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:5,1:0|1:233899424_C_T:233899424:1,10,1,1
chr2	233943999	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:4,0,6,1
chr2	233944049	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:12,5,1,2
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	234079308	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.214:29:19,0:3,5:4,18,2,5
chr2	234079315	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:18,0:4,3:2,20,2,1
chr2	234091158	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr2	234104029	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=229,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:2,0,3,4
chr2	234107070	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	234113308	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234113308_G_A:234113308:0,0,0,1
chr2	234113317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234113308_G_A:234113308:0,0,0,1
chr2	234115385	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:6,0:7,5,1,1
chr2	234173503	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr2	234178624	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29,29,30;MFRL=145,180,205,91;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,23,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.41,9.45,16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,6,5,11:0.175,0.205,0.443:26:3,5,1,3:1,1,3,7:4,0,18,4
chr2	234178781	.	AT	A,ATT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=23,20,24;MFRL=151,110,114;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.64,20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,14:0.147,0.441:31:10,2,7:2,1,4:3,9,5,14
chr2	234181593	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr2	234183468	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:1,4,0,4
chr2	234224643	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=85,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:1,3:2,1,2,3
chr2	234227446	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=83,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:9,4:19,0:12,17,4,0
chr2	234227523	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,3:0,16:0,0,5,14
chr2	234227693	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr2	234229480	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:1,5,3,3
chr2	234235749	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=77,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,3:1,2:4,1,4,1
chr2	234238254	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr2	234346770	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	234372767	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:4,3,5,0
chr2	234372985	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,3:1,4:2,3,1,6
chr2	234386018	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,6,2
chr2	234394329	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,30:0.775:38:2,12:6,18:6,2,20,10
chr2	234394487	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,32:0.769:41:4,16:5,16:4,5,17,15
chr2	234396542	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,3:3,10:6,1,12,1
chr2	234396563	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:13,0:14,3:17,10,2,1
chr2	234397006	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.783:16:3,5:0,8:0,3,2,11
chr2	234398195	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr2	234402238	.	TTAAG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=126,100630410;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0|1:234402238_TTAAG_T:234402238:0,10,0,2
chr2	234402246	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=148,100630410;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:3,2:0|1:234402238_TTAAG_T:234402238:0,10,0,2
chr2	234402248	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=153,100630410;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:0|1:234402238_TTAAG_T:234402238:0,8,0,2
chr2	234405374	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	234407160	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:3,6:5,11:5,3,10,7
chr2	234418665	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:3,4:2,6:4,1,6,4
chr2	234421299	.	G	GTATATTATTTTTCTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.614:14:4,5:1,4:1,4,2,7
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:0,4:5,1:3,2,3,2
chr2	234433045	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=242,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:234433045_G_C:234433045:2,1,1,0
chr2	234433050	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:234433045_G_C:234433045:3,1,1,0
chr2	234433055	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:4,2,1,1
chr2	234433124	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=91,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,8:5,5:1,6,8,5
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=109,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:2,5:6,3:1,7,1,7
chr2	234460087	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=118,99;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,8:0.150:58:22,0:28,7:0|1:234460087_G_A:234460087:26,24,7,1
chr2	234460091	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=118,99;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,8:0.166:52:22,0:22,8:0|1:234460087_G_A:234460087:23,21,7,1
chr2	234463227	.	AT	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234463227_AT_TG:234463227:0,1,0,1
chr2	234463230	.	A	AGAAAAGTGCTATTTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234463227_AT_TG:234463227:0,1,0,1
chr2	234469960	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469965	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469969	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,25;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469973	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,29;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,0:0,2:1|0:234469960_A_G:234469960:0,0,0,2
chr2	234469977	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,25;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469981	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234469984	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,24;MFRL=187,200;MMQ=29,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234469960_A_G:234469960:0,2,0,1
chr2	234526871	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,127;MMQ=59,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:5,5:5,5:6,4,6,5
chr2	234545461	.	G	GACAACAGGCCAAGCCCTCATGGTA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=102,9575;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:6,14,0,2
chr2	234580805	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=88,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:14,3:11,4:12,13,2,5
chr2	234580967	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=107,106;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:9,3:13,0:8,14,1,2
chr2	234591339	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,2:11,3:6,12,2,3
chr2	234601821	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=82,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:12,0:7,8:4,15,0,8
chr2	234601919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,3,4
chr2	234628342	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,138;MMQ=50,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:1,5,1,8
chr2	234669601	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:14,3:2,0:7,9,2,1
chr2	234678278	.	GG	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=64,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr2	234687963	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:2,4:3,7:4,1,8,3
chr2	234698126	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:11,3,2,0
chr2	234702518	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	234702555	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=211,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	234704318	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,4:0,16:0,0,12,8
chr2	234704368	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=93,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:12,0:12,6:9,15,0,6
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr2	234707426	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,2:11,1:8,10,1,2
chr2	234708428	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=109,76;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:4,5,1,4
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr2	234713231	.	GAGAAAGATGGGAGCAGATGGAAAGGCATTTGGTGGGCTGGGCACATGAGGAGTTT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.209:22:5,7:3,1:3,10,3,6
chr2	234713588	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=65,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	234713681	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,3:6,3:3,5,4,4
chr2	234716027	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr2	234716557	.	G	GCTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=182,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,0:1,2:0|1:234716557_G_GCTC:234716557:0,4,0,2
chr2	234716559	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=182,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:1,2:0|1:234716557_G_GCTC:234716557:0,4,0,2
chr2	234716563	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:234716557_G_GCTC:234716557:0,3,0,2
chr2	234725453	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:3,0:6,2:0|1:234725453_G_C:234725453:3,6,1,1
chr2	234725457	.	G	GAGTTTACATAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=92,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:234725453_G_C:234725453:5,6,1,1
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=238,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,2:1,9:1,0,6,5
chr2	234727478	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	234732317	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,2:8,5:5,8,3,4
chr2	234737791	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,0:2,3:0,3,0,3
chr2	234740834	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=94,137;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:4,2:13,0:8,9,2,0
chr2	234749401	.	GTCCCTCGTGCCA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:5,0:1,6,1,1
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:2,2:7,2:1,8,0,5
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:0,5,3,1
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr2	234839404	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,4:3,5:2,2,4,5
chr2	234846162	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:234846162_T_C:234846162:2,1,0,1
chr2	234846164	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:234846162_T_C:234846162:2,1,0,1
chr2	234846166	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:234846162_T_C:234846162:1,1,0,1
chr2	234846170	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:234846162_T_C:234846162:1,1,0,1
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	234847573	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	234847758	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:10,1:9,13,1,2
chr2	234847823	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,5:1,6:2,3,3,8
chr2	234862762	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr2	234869368	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=93,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	234869793	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234869795	.	ATC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234869799	.	T	TCACA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234869801	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234869804	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234869805	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234869793_CT_C:234869793:0,1,0,1
chr2	234890355	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,144;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	234890391	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	234904975	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:5,6,1,1
chr2	234916771	.	ATTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=15,14;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:2,0:1,0:2,9,0,3
chr2	234916831	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=142,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr2	234959532	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:6,3,0,2
chr2	235961273	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr2	236403305	.	GCGGCTC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:3,1:1,3:3,1,4,0
chr2	236433161	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.956:44:1,17:0,20:0,1,23,20
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,6:0,0,0,12
chr2	236649683	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=72,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:12,4:15,0:14,13,0,5
chr2	236685665	.	CTTGAGAGGCCAGGCTGGATCCTGCAGAGAAACGAGGAAGTATTAGACAGAAGTGATGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACT	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,13:0.081:76:15,6:12,5:20,43,10,3
chr2	236706557	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=156,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,0:3,8:1,6,0,8
chr2	236817336	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.573:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr2	236877066	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.607:30:6,10:3,5:8,4,13,5
chr2	237029104	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:4,7,1,3
chr2	237076619	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:1,9,0,2
chr2	237105074	.	GGG	TTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=56,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	237149941	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:2,3,5,2
chr2	237168319	.	C	CTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=239,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237168319_C_CTCCT:237168319:0,1,0,1
chr2	237168320	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=239,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237168319_C_CTCCT:237168319:0,1,0,1
chr2	237247036	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,4:0,1:0,1,3,8
chr2	237252454	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=318,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr2	237255303	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,11,16
chr2	237255500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	237307967	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:3,1:15,1:16,2,2,0
chr2	237327791	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.080:71:39,0:26,5:40,26,1,4
chr2	237374309	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:2,4:4,9:4,2,5,8
chr2	237395443	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:2,8:2,8:2,2,10,6
chr2	237395597	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,212;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0,12,0,2
chr2	237489232	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=159,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,31:0.744:41:4,17:6,13:5,5,14,17
chr2	237490276	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,134;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,2:8,2:9,9,1,3
chr2	237995780	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,8:0.131:66:32,8:26,0:28,30,7,1
chr2	238005620	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238005620_G_C:238005620:0,2,0,1
chr2	238005622	.	A	ATTGAGTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238005620_G_C:238005620:0,2,0,1
chr2	238166147	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=261,103;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,9:1,9:0,1,4,14
chr2	238166179	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	238243464	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,13:0,10:0,0,10,13
chr2	238249263	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,162;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:9,0:14,3:12,11,0,3
chr2	238259675	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr2	238261112	.	GC	AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	238263441	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,3:5,0:8,3,3,0
chr2	238266633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	238267058	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	238277658	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,0:7,5:5,11,0,5
chr2	238280538	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:238280538_G_A:238280538:6,10,1,1
chr2	238280542	.	G	GCCCACCTTGGCTTCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:5,2:0|1:238280538_G_A:238280538:7,10,1,1
chr2	238296311	.	C	CTGGTTGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=100,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,1:17,1:8,14,0,2
chr2	238419543	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GT;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr2	238419611	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,6:3,8:2,4,10,4
chr2	238427142	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:1,5:2,6:3,0,5,6
chr2	238428454	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0|1:238428454_T_C:238428454:2,0,3,0
chr2	238428459	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:238428454_T_C:238428454:2,0,2,0
chr2	238494839	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr2	238500554	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=77,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:10,1:7,9,1,1
chr2	238503559	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr2	238536255	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	238629521	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.150:23:13,1:7,2:0|1:238629521_A_C:238629521:4,16,1,2
chr2	238629524	.	T	TTCCTCTC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.150:23:11,1:6,2:0|1:238629521_A_C:238629521:4,16,1,2
chr2	238632138	.	TTGGCAA	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:14,3:6,0:0|1:238632138_TTGGCAA_T:238632138:23,1,3,0
chr2	238632146	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,3:8,0:0|1:238632138_TTGGCAA_T:238632138:15,2,3,0
chr2	238632149	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,3:7,0:0|1:238632138_TTGGCAA_T:238632138:15,2,3,0
chr2	238632151	.	T	TTAAGA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:0|1:238632138_TTGGCAA_T:238632138:14,2,3,0
chr2	238641117	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,6:2,2:1,8,1,7
chr2	238656936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=98,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,2:0,1:3,1,2,1
chr2	238662154	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr2	238664811	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=111,44;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.187:35:13,6:16,0:15,14,6,0
chr2	238667501	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	238671328	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=121,87;MMQ=52,51;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.401:23:6,4:7,5:7,7,4,5
chr2	238680942	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	238688275	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr2	238730522	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:3,10,0,3
chr2	238738145	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=94,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:7,6,0,2
chr2	238896494	.	C	CATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,4:0,1:2,1,5,0
chr2	238896495	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:4,2:1,0:5,0,2,1
chr2	238899045	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:2,4,0,2
chr2	238899125	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=196,160;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238899125_GT_AC:238899125:0,1,0,1
chr2	238899130	.	AA	CG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=196,160;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238899125_GT_AC:238899125:0,1,0,1
chr2	238899137	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=196,160;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238899125_GT_AC:238899125:0,1,0,1
chr2	238899141	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=196,160;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238899125_GT_AC:238899125:0,1,0,1
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr2	238912120	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=86,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:1,6,0,5
chr2	238939370	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	238944441	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=144,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0,1,1,1
chr2	238991796	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:8,5,5,1
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,1:4,3:10,2,1,3
chr2	239002624	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=130,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:4,0:3,0:8,0,0,3
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:1,2:3,2:5,0,3,1
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.432:21:6,3:6,6:7,5,6,3
chr2	239010696	.	G	GCAGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:5,2,1,1
chr2	239010719	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	239010796	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=89,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:6,5,3,4
chr2	239033901	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=68,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr2	239034043	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:4,2:1,7:3,2,3,6
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,5:3,6:0,5,1,10
chr2	239037635	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	239039779	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=72,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr2	239040218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,1:0,2,1,2
chr2	239040223	.	CCCCTGCAGCGGCCCTGAGCCCACAGCACAGCGGCTGGGGTCCCGCT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:0,2:1,6,1,1
chr2	239051429	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.242:33:13,6:12,0:16,9,8,0
chr2	239053436	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	239053685	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	239054504	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,3,14
chr2	239056408	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=57,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:239056408_A_C:239056408:1,1,1,0
chr2	239056416	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,11;MFRL=57,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:239056408_A_C:239056408:1,1,1,0
chr2	239056423	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=57,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:239056408_A_C:239056408:1,3,1,0
chr2	239056746	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=228,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	239073046	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	239077183	.	C	CAAGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:239077183_C_CAAGGT:239077183:1,0,0,1
chr2	239077184	.	C	CTTTGGTAGAACTGGGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0|1:239077183_C_CAAGGT:239077183:1,0,0,1
chr2	239077217	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=88.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,14:0,15:0,0,21,10
chr2	239092474	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	239092842	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=97,163;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr2	239092855	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=97,163;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:239092855_G_A:239092855:1,3,0,2
chr2	239092857	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=97,163;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:239092855_G_A:239092855:1,2,0,2
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:2,6:11,1:12,1,7,1
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=89,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr2	239133980	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:4,3:6,4:8,3,3,5
chr2	239139883	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,3:6,1:0,8,1,3
chr2	239141221	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.339:39:15,8:9,4:12,14,7,6
chr2	239141284	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,113;MMQ=53,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:10,2:12,2:12,11,2,2
chr2	239148970	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,3:3,2:8,3,5,0
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=96.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,15:0,8:0,0,13,10
chr2	239149377	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	239164393	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=82,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:20,0:15,2:0|1:239164393_A_G:239164393:23,20,1,1
chr2	239164405	.	TC	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=99,72;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.056:51:20,0:25,1:0|1:239164393_A_G:239164393:27,22,1,1
chr2	239165533	.	GC	AA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:6,3:11,3,6,2
chr2	239168596	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.225:25:11,4:8,2:14,5,5,1
chr2	239181904	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	239184581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:2,3,0,10
chr2	239185922	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	239229440	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=106,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.706:25:2,11:5,7:4,3,6,12
chr2	239234396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr2	239241445	.	ATT	A,AT	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,26,25;MFRL=91,53,77;MMQ=60,60,60;MPOS=5,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.67,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,4,5:0.121,0.149:35:5,2,3:11,2,2:17,9,5,4
chr2	239241608	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=122,96;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,0:5,7:3,13,0,7
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.714:9:0,4:1,1:0,2,5,2
chr2	239253266	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,1:2,4:1,4,2,3
chr2	239257393	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=158,35;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,2:0|1:239257393_T_C:239257393:5,2,1,1
chr2	239257397	.	T	TGCTTTTGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=158,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:239257393_T_C:239257393:5,2,1,1
chr2	239261953	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=114,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:239261953_C_CA:239261953:0,3,0,1
chr2	239261955	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=114,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:239261953_C_CA:239261953:0,3,0,1
chr2	239344263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	239344663	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=220,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr2	239976581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	239988454	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:6,9,0,3
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr2	240029926	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:3,0:8,12:2,9,0,12
chr2	240062573	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,3:4,0:7,5,3,0
chr2	240066313	.	GACCACTGGCCCGTCTTTCCTGCGTAACAGGGGGCTGCTCCGTCTTTCGGCCACTTTCTGCTTTAGCCTGGACCGTAATTTCAGATTCGGTTCAGAAGCTGCACAAAAAGGAGATGTCATTACAGCCAGGCAGAC	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.056:56:15,1:10,3:0|1:240066313_GACCACTGGCCCGTCTTTCCTGCGTAACAGGGGGCTGCTCCGTCTTTCGGCCACTTTCTGCTTTAGCCTGGACCGTAATTTCAGATTCGGTTCAGAAGCTGCACAAAAAGGAGATGTCATTACAGCCAGGCAGAC_G:240066313:16,35,3,2
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,16:0.949:16:0,9:0,7:1|0:240066313_GACCACTGGCCCGTCTTTCCTGCGTAACAGGGGGCTGCTCCGTCTTTCGGCCACTTTCTGCTTTAGCCTGGACCGTAATTTCAGATTCGGTTCAGAAGCTGCACAAAAAGGAGATGTCATTACAGCCAGGCAGAC_G:240066313:0,0,6,10
chr2	240078488	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:5,4:7,2:1,11,2,4
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	240085674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr2	240111477	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	240111521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	240323660	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=170,118;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:240323660_A_G:240323660:18,0,2,0
chr2	240323661	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,3:0.181:20:8,1:9,2:1|0:240323660_A_G:240323660:17,0,3,0
chr2	240323754	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,4:0.064:66:42,1:19,2:0|1:240323754_G_T:240323754:26,36,1,3
chr2	240323755	.	T	TCTTTCTTTCCTTTCTTCCTTCC	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,3:0.055:68:40,1:23,2:0|1:240323754_G_T:240323754:26,39,1,2
chr2	240323905	.	T	TG	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=136,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,17:0.296:59:29,7:13,9:28,14,7,10
chr2	240500413	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,7,8
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr2	240960720	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:15,0:7,4:12,10,2,2
chr2	240961852	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	240964671	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	240981179	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr2	240982443	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:0|1:240982443_C_T:240982443:2,4,1,3
chr2	240982449	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:1,3:0|1:240982443_C_T:240982443:2,3,1,3
chr2	240984989	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=172,188;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	240985099	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,27;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	240985511	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=191,167;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr2	241073450	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=107,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:3,4,0,4
chr2	241075809	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	241075822	.	CCGGCCGCCGGCGCGTCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=45,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.438:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr2	241079382	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	241079729	.	CATG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=87,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:1,0:0|1:241079729_CATG_C:241079729:4,5,1,1
chr2	241079733	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=87,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:0|1:241079729_CATG_C:241079729:4,5,1,1
chr2	241389219	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,2:0,5:3,1,6,1
chr2	241390002	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr2	241396969	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=199,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:241396969_T_C:241396969:0,1,0,2
chr2	241396978	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=184,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:241396969_T_C:241396969:0,3,0,1
chr2	241396984	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=184,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:241396969_T_C:241396969:0,3,0,1
chr2	241396986	.	G	GTCTCCCACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=184,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:241396969_T_C:241396969:0,3,0,1
chr2	241397335	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241397562	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:2,2:6,8:3,5,4,6
chr2	241401763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,1,2
chr2	241403955	.	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr2	241405400	.	C	CGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	241405454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	241405644	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:241405644_G_C:241405644:0,4,1,0
chr2	241405648	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:241405644_G_C:241405644:0,4,1,0
chr2	241405652	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:241405644_G_C:241405644:0,3,1,0
chr2	241405655	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:241405644_G_C:241405644:0,3,1,0
chr2	241421563	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:8,2,1,1
chr2	241439809	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr2	241446927	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.657:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr2	241447017	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=105,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:10,0:20,2:0|1:241447017_G_C:241447017:15,17,0,2
chr2	241447021	.	G	GAT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=105,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:16,2:0|1:241447017_G_C:241447017:15,14,0,2
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=90,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:6,5,2,2
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=85,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:7,7,2,2
chr2	241465361	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=288,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	241496567	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=122,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:8,2:3,4:7,4,5,2
chr2	241500674	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:3,1,5,1
chr2	241500896	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,5:1,3:3,3,0,8
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	241517231	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:6,0:10,3:8,8,2,1
chr2	241530396	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,5:10,0:12,10,5,0
chr2	241533990	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,0:4,3:12,6,2,1
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr2	241534701	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=116,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:241534701_G_C:241534701:0,3,0,1
chr2	241534703	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=116,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:241534701_G_C:241534701:0,3,0,1
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	241556017	.	T	TAAGTCTGCAGGTGGATATTTGGCCCTCTTTGAGCCCTTCGTTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241569329	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,2:1,2:3,0,3,1
chr2	241569569	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=221,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	241570736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	241619705	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=185,111;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241619705_C_T:241619705:0,1,0,1
chr2	241619711	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=185,111;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241619705_C_T:241619705:0,1,0,1
chr2	241627928	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr2	241631267	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	241659312	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr2	241659368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	241661192	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=109,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr2	241674222	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.407:16:2,4:3,2:5,5,1,5
chr2	241680633	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	241680802	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	241683468	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:7,8,1,1
chr2	241685027	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:2,4,0,5
chr2	241685250	.	GTCCAGGGCAGCA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,2:15,0:17,17,1,1
chr2	241686636	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:8,2:7,1:8,7,1,2
chr2	241688076	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:241688076_C_A:241688076:5,3,1,1
chr2	241688079	.	C	CTCACCCTTGCTATTATAATGCAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:241688076_C_A:241688076:5,3,1,1
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.504:10:2,0:2,5:2,3,3,2
chr2	241697052	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:0|1:241697052_C_T:241697052:12,7,1,1
chr2	241697066	.	GAAC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=153,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:8,2:0|1:241697052_C_T:241697052:10,7,1,1
chr2	241700307	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,5:2,0:0|1:241700307_G_T:241700307:0,2,0,5
chr2	241700318	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:241700307_G_T:241700307:0,1,0,2
chr2	241702571	.	C	CTGTTAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=203,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:241702571_C_CTGTTAA:241702571:2,2,1,1
chr2	241702572	.	C	CAGGTGAAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=178,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:241702571_C_CTGTTAA:241702571:3,2,1,1
chr2	241702576	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=178,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:241702571_C_CTGTTAA:241702571:3,2,1,1
chr2	241710461	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.597:23:4,6:4,5:5,4,8,6
chr2	241713646	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,7:3,1:7,2,4,4
chr2	241721889	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:0,0:0,0:2,0,2,0
chr2	241808825	.	AGGCCTCCCT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCCTCCCT;STR;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:1,4:0,3:0,1,1,7
chr2	241810957	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:5,5:1,7,2,5
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:2,1:2,3:4,2,3,1
chr2	241830944	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr2	241830969	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=119,199;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr2	241831264	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,3:6,7,4,1
chr2	241831296	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:5,4,1,2
chr2	241835421	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0|1:241835421_A_G:241835421:0,1,1,2
chr2	241835428	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:241835421_A_G:241835421:0,0,1,1
chr2	241835432	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:241835421_A_G:241835421:0,0,1,1
chr2	241858105	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241858230	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,2:6,1:6,9,4,0
chr2	241861904	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr2	241889886	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=113,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:9,0:14,10,2,1
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,11:0,0,9,17
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr2	241898969	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=209,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:241898969_A_T:241898969:0,3,0,1
chr2	241898971	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=209,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241898969_A_T:241898969:0,3,0,1
chr2	241898973	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=209,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241898969_A_T:241898969:0,3,0,1
chr2	241898974	.	A	AGCCCTAGGCTGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=209,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241898969_A_T:241898969:0,3,0,1
chr2	241907644	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr2	241929292	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:2,9,0,3
chr2	241932361	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:1,3:3,3:4,0,6,1
chr2	241932596	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	241976679	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=96,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.111:33:15,0:15,3:15,15,1,2
chr2	241988217	.	CTG	AGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241988217_CTG_AGA:241988217:0,1,0,1
chr2	241988222	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241988217_CTG_AGA:241988217:0,1,0,1
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	242021869	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242021869_G_A:242021869:0,0,0,1
chr2	242021876	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:242021869_G_A:242021869:0,0,0,1
chr2	242036062	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,0:10,2:0|1:242036062_GA_G:242036062:23,9,1,1
chr2	242036064	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:20,0:11,2:0|1:242036062_GA_G:242036062:23,9,1,1
chr2	242036066	.	TAAAG	T	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=24,18;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:19,0:11,1:0|1:242036062_GA_G:242036062:26,9,1,1
chr2	242036073	.	G	GCT	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:10,2:0|1:242036062_GA_G:242036062:23,9,1,1
chr2	242036077	.	GAGGGAA	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:10,2:0|1:242036062_GA_G:242036062:25,10,1,1
chr2	242036084	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:18,0:11,2:0|1:242036062_GA_G:242036062:23,8,1,1
chr2	242063410	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=133,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:6,1:10,0:0|1:242063410_G_A:242063410:5,11,1,1
chr2	242063424	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:10,0:0|1:242063410_G_A:242063410:6,11,1,1
chr2	242090815	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=92,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.200:26:11,4:10,0:15,6,5,0
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,8:0,0,3,7
chr2	242135146	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,3:10,0:10,3,3,0
chr2	242138778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:13,1:11,11,2,0
chr2	242139491	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	242151527	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:13,4:4,0:11,7,4,0
chr2	242179437	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,16691;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.292:39:10,11:17,0:16,12,0,11
chr2	242192779	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:14,5:9,0:13,10,5,0
chr2	242204114	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:242204114_A_AG:242204114:0,1,0,1
chr2	242204118	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:242204114_A_AG:242204114:0,1,0,1
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.248:21:13,3:3,1:9,7,4,1
chr2	242283071	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=204,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:8,1:4,2:0,13,0,3
chr2	242344254	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:10,0:21,3:12,19,0,3
chr2	242371269	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,133;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr2	242374519	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr2	242396087	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr2	242402061	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.356:14:4,1:5,4:5,4,3,2
chr2	242423820	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=135,970;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,3:2,0:1,8,0,3
chr2	242429542	.	G	GCCTGACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242429542_G_GCCTGACA:242429542:0,1,0,1
chr2	242429544	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242429542_G_GCCTGACA:242429542:0,1,0,1
chr2	242430609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=214,136;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr2	242430621	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=214,136;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr2	242432704	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:7,2:12,3:16,3,4,1
chr2	242432732	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.125:21:10,2:9,0:0|1:242432732_C_A:242432732:9,10,1,1
chr2	242432737	.	G	GTAGC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:0|1:242432732_C_A:242432732:8,11,1,1
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=191,553;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr2	242435038	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:2,11:10,0:7,6,11,0
chr2	242542298	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	242556732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	242572249	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=255,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:242572249_A_G:242572249:2,0,1,0
chr2	242572272	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,14;MFRL=255,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:242572249_A_G:242572249:2,0,1,0
chr2	242572846	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=379,89;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,8:0,7:0,1,9,6
chr2	242590338	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=251,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	242593114	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr2	242593877	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,3:1,1:2,0,4,1
chr2	242610750	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=108,76;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:15,0:6,4:12,9,0,4
chr2	242610773	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,10,12
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242617792	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	242624293	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr2	242650815	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:7,6:17,0:16,8,6,0
chr2	242650884	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.271:31:10,6:13,2:11,12,3,5
chr2	242651520	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.641:28:4,2:5,16:4,6,6,12
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	242682029	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=187,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:2,4,2,3
chr2	242684115	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr2	242688203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=38,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,2:0,1:1,1,3,0
chr2	242688366	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1,4,0,4
chr2	242695497	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=252,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	242695517	.	C	CAGGAAACCAGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=252,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,14,9
chr2	242707403	.	C	CAAAATGTTGGGATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242707403_C_CAAAATGTTGGGATTA:242707403:0,1,0,1
chr2	242707404	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242707403_C_CAAAATGTTGGGATTA:242707403:0,1,0,1
chr2	242716380	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,11:0,0,16,11
chr2	242743366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr2	242743640	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:242743640_CG_C:242743640:0,3,0,1
chr2	242743650	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:242743640_CG_C:242743640:0,4,0,1
chr2	242743651	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=243,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1|0:242743640_CG_C:242743640:0,1,0,3
chr2	242754604	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=145,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	242755465	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242755599	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	242755822	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	242757328	.	GA	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=169,260;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:4,0,1,0
chr2	242757334	.	GG	CC,AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,12,21;MFRL=0,260,169;MMQ=60,60,60;MPOS=30,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.621:5:0,0,1:0,0,1:0,0,5,0
chr2	242811859	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=261,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	242813124	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr2	242813127	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:11,9,1,1
chr2	242813148	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:8,10,1,1
chr2	242813159	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,1:0|1:242813159_C_A:242813159:10,11,1,1
chr2	242813161	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:0|1:242813159_C_A:242813159:10,11,1,1
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr2	242813276	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,11:0,1:0,0,0,12
chr3	391100	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	430961	.	ACC	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,0:16,2:22,9,1,1
chr3	432533	.	G	GGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:432533_G_GGT:432533:3,4,1,1
chr3	432538	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:432533_G_GGT:432533:4,4,1,1
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr3	440146	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=215,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	440735	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,3:12,0:0|1:440735_G_A:440735:15,11,1,2
chr3	440739	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=92,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,3:12,0:0|1:440735_G_A:440735:16,11,1,2
chr3	1320036	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=190,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	1339680	.	GGTTTTT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTTTTT;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.520:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr3	1413903	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	1415195	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	1415811	.	TAAAAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	1425001	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:1425001_C_T:1425001:7,6,1,1
chr3	1425004	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:1425001_C_T:1425001:7,6,1,1
chr3	1427548	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr3	1445147	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:9,0:2,8:1,10,0,8
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=391,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	3030223	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:3030223_C_A:3030223:0,0,0,7
chr3	3030244	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:3030223_C_A:3030223:0,0,0,1
chr3	3067759	.	ATTGTTTGTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:1,1:2,0:2,2,1,0
chr3	3076218	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=252,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	3076284	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:4,0,4,3
chr3	3076401	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,4:2,8:1,4,6,6
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr3	3081825	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,10:0,6:0,1,8,8
chr3	3081959	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,2,4
chr3	3082003	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	3084147	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr3	3095404	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	3116438	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:2,1,4,3
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,3:1,6:2,0,7,3
chr3	3118328	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.155:29:9,2:15,2:0|1:3118328_A_C:3118328:10,15,2,2
chr3	3118329	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.155:29:10,2:15,2:0|1:3118328_A_C:3118328:10,15,2,2
chr3	3118336	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,1:11,1:0|1:3118328_A_C:3118328:8,14,0,2
chr3	3118368	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:1,8,3,0
chr3	3131980	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=117,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,23:0.728:31:5,14:3,9:4,4,10,13
chr3	3134120	.	G	GGGAAGTTCAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	3137155	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:0,1:0,3,0,3
chr3	3137200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=249,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr3	3140053	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=206,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3140053_A_T:3140053:0,1,0,1
chr3	3140059	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,22;MFRL=206,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3140053_A_T:3140053:0,1,0,1
chr3	3140061	.	GTCGT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=206,248;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3140053_A_T:3140053:0,1,0,1
chr3	3140069	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3140053_A_T:3140053:0,0,0,1
chr3	3170792	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	3171716	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:3171716_A_T:3171716:0,4,0,1
chr3	3171717	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:3171716_A_T:3171716:0,4,0,1
chr3	3171719	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:3171716_A_T:3171716:0,4,0,1
chr3	3171722	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3171716_A_T:3171716:0,3,0,1
chr3	3171723	.	T	TGTC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3171716_A_T:3171716:0,3,0,1
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,2:0,0,5,2
chr3	3194218	.	T	TTAGGTAATTAACA	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,2:0.027:108:17,2:89,0:14,92,0,2
chr3	3194242	.	T	G	.	.	DP=114;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=214.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,68:0.595:114:16,0:30,68:0|1:3194242_T_G:3194242:20,26,0,68
chr3	3194252	.	T	TCAAGTATATCCTCACGCAAGCAAC	.	.	DP=106;ECNT=3;MBQ=20,38;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=217.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,68:0.639:106:13,0:24,68:0|1:3194242_T_G:3194242:18,20,0,68
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,17,9
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr3	3216976	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:0,0:0,3,0,2
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,8:0,1:0,0,4,7
chr3	3887093	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=65174527,102;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:1,1,8,3
chr3	3889067	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33,33;MFRL=141,136,193;MMQ=60,60,60;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.37,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,4:0.385,0.384:10:0,1,2:2,3,1:1,1,6,2
chr3	4345849	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=167,155;MMQ=42,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr3	4355103	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:4355103_T_A:4355103:11,7,1,1
chr3	4355107	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:4355103_T_A:4355103:10,8,1,1
chr3	4355404	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:6,10,1,3
chr3	4403839	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:4403839_TG_T:4403839:8,6,1,1
chr3	4403843	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:4403839_TG_T:4403839:8,6,1,1
chr3	4404020	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4404020_G_C:4404020:0,0,0,1
chr3	4404023	.	GTAGACAGTGCTTC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4404020_G_C:4404020:0,0,0,1
chr3	4418118	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:1,8,0,4
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr3	4461888	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,0:8,3:0,9,0,3
chr3	4562667	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr3	4669417	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=104,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,6:5,0:6,3,3,3
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,2:6,7:2,6,4,5
chr3	4693943	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.473:17:1,2:7,6:0|1:4693943_G_A:4693943:3,6,2,6
chr3	4693953	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,1:7,3:0|1:4693943_G_A:4693943:2,6,1,4
chr3	4693959	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,1:7,2:2,7,0,3
chr3	4693977	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,3:5,3:1,5,0,6
chr3	4704681	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr3	4704958	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=131,103;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0|1:4704958_TG_CA:4704958:0,1,0,2
chr3	4704966	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=131,103;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:4704958_TG_CA:4704958:0,1,0,2
chr3	4704987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=152,116;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:4704987_G_A:4704987:0,1,0,1
chr3	4704991	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,35;MFRL=152,116;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:4704987_G_A:4704987:0,1,0,1
chr3	4712710	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	4716672	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	4726947	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	4738774	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	4738999	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,139;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,22;RU=GT;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.319:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr3	4776784	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,4:3,8:5,1,11,1
chr3	4817057	.	TG	CA,CG	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,24,25;MFRL=0,72,105;MMQ=60,60,60;MPOS=8,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.77,99.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,35:0.117,0.861:39:0,0,15:0,4,20:0,0,19,20
chr3	4829575	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:2,0:9,4,2,0
chr3	4836851	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=148,114;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:10,3:21,0:12,21,0,3
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,9:0,0,10,5
chr3	4878419	.	CTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=24,13;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr3	5164286	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:3,17,1,1
chr3	5164300	.	G	GAGTACTGCAGCCCCACGAGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:5,2:2,18,1,1
chr3	5229614	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,0:2,5:2,5,0,5
chr3	5252769	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:8,8,1,1
chr3	5257617	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:5257617_A_T:5257617:4,3,1,1
chr3	5257619	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:5257617_A_T:5257617:4,3,1,1
chr3	5257620	.	C	CTCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:5257617_A_T:5257617:4,3,1,1
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr3	7348410	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0,11,0,2
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr3	7494245	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27,27;MFRL=145,150,154;MMQ=60,60,60;MPOS=12,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=TG;STR;TLOD=8.90,12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,5:0.333,0.453:11:2,3,3:0,1,2:2,0,8,1
chr3	7494417	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr3	7721997	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=83,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:2,5,3,3
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=65.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,15:0,9:0,0,7,17
chr3	8590451	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:12,0:11,5:12,11,0,5
chr3	8607141	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:4,9,2,0
chr3	8665360	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:4,3:6,3:3,7,1,6
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,5:0,1,7,4
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.746:29:3,10:4,12:5,2,11,11
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.796:9:0,1:1,3:0,1,7,1
chr3	8673827	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:4,8,2,1
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chr3	8977807	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,6:3,3:0,4,0,9
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr3	9032417	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:3,6,0,3
chr3	9034558	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr3	9034775	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,8:0,5:1,0,12,1
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chr3	9068577	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:3,2,3,3
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.605:41:9,7:6,17:8,8,17,8
chr3	9069910	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:9069910_G_A:9069910:0,3,0,1
chr3	9069918	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:0|1:9069910_G_A:9069910:0,3,0,2
chr3	9069936	.	A	ACAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:9069910_G_A:9069910:0,4,0,1
chr3	9069938	.	C	CGCTAACAAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:9069910_G_A:9069910:0,4,0,1
chr3	9089254	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	9102127	.	T	TGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=205,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9102127_T_TGCCC:9102127:1,0,0,1
chr3	9102128	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=205,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9102127_T_TGCCC:9102127:1,0,0,1
chr3	9146455	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:12,4,1,2
chr3	9406704	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr3	9413075	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:22,0:13,4:29,9,2,2
chr3	9422086	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=144,164;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,7:1,0:3,0,7,0
chr3	9476664	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:9476664_T_C:9476664:0,2,0,1
chr3	9476666	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:9476664_T_C:9476664:0,2,0,1
chr3	9476677	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=232,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:9476677_TC_CT:9476677:0,4,0,1
chr3	9476680	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=232,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:9476677_TC_CT:9476677:0,4,0,1
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	9490148	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:20,4:10,0:11,20,4,0
chr3	9490205	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:16,1:17,4:17,16,0,5
chr3	9512090	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:19,5,3,0
chr3	9514856	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=200,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,2,1
chr3	9515263	.	G	GATGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.778:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	9543962	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:13,0:22,3:14,23,3,0
chr3	9691422	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:17,0:21,4:25,13,1,3
chr3	9710465	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:12,0:2,3:0|1:9710465_C_T:9710465:7,7,2,1
chr3	9710473	.	T	TCCCCTTCCAACCTCTTGCACCATG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,2:0|1:9710465_C_T:9710465:10,7,1,1
chr3	9726686	.	A	ATTCTTTTGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:9726686_A_ATTCTTTTGC:9726686:1,3,0,1
chr3	9726687	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:9726686_A_ATTCTTTTGC:9726686:1,3,0,1
chr3	9743398	.	TGGAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	9747087	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=21,11;MFRL=79,138;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.477:14:2,0:2,0:0|1:9747087_A_C:9747087:4,3,7,0
chr3	9747092	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=19,8;MFRL=40,138;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.444:15:1,1:1,0:0|1:9747087_A_C:9747087:4,4,7,0
chr3	9747095	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,17;MFRL=0,138;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.401:10:1,0:2,0:0|1:9747087_A_C:9747087:3,3,4,0
chr3	9747780	.	GT	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	9754852	.	T	TGCTGACTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9757086	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.706:25:3,8:4,10:3,4,11,7
chr3	9757287	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	9757582	.	CCCT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,1:2,6:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:7,2,4,3
chr3	9757586	.	ATGGGCCTCACTT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:6,1:2,6:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:10,4,4,3
chr3	9758664	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	9769008	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=211,150;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,6:1,13:1,0,16,4
chr3	9783133	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9783133_C_T:9783133:0,4,0,1
chr3	9783141	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9783133_C_T:9783133:0,4,0,1
chr3	9783145	.	CTATTTTA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:9783133_C_T:9783133:0,4,0,1
chr3	9783745	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:12,5:17,0:14,15,5,0
chr3	9786050	.	C	CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,140;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=78.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,0:11,20:5,12,0,20
chr3	9788778	.	AGT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:9788778_AGT_A:9788778:6,1,1,1
chr3	9788782	.	A	AAACAGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:9788778_AGT_A:9788778:6,1,1,1
chr3	9788784	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:6,2:1,0:0|1:9788778_AGT_A:9788778:6,1,1,1
chr3	9792865	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=122,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,0:9,2:11,19,1,1
chr3	9792975	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	9799023	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,152;MMQ=54,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,2:8,2:10,0,5,0
chr3	9803083	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:10,3:14,0:16,10,3,0
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=67,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:12,2:12,4:10,15,2,4
chr3	9803351	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.335:28:10,3:8,6:6,13,2,7
chr3	9822275	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	9831112	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=244,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:0,3,1,5
chr3	9841989	.	A	AACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=101,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:2,2,0,1
chr3	9847798	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:6,2,1,1
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,0:6,4:4,10,2,2
chr3	9867625	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,6:0,6:0,1,5,7
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	9920117	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,0:6,3:6,6,3,0
chr3	9932337	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr3	9934605	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:4,9:3,4:5,2,10,3
chr3	9944937	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	9947997	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.725:20:2,7:3,7:3,2,10,5
chr3	9948163	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:9948163_T_C:9948163:0,6,1,1
chr3	9948168	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:9948163_T_C:9948163:0,6,1,1
chr3	9948241	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	9949821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	9951038	.	TAC	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=145,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr3	9951044	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=145,59;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:9951044_C_T:9951044:0,13,1,1
chr3	9951057	.	A	AGGCAGTCGAAAAACTGACTTAGCAAGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=190,59;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:9951044_C_T:9951044:0,13,1,1
chr3	9952788	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=240,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,10:2,7:3,1,14,4
chr3	9956279	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:5,6:0,4:3,2,5,6
chr3	9958947	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	9960070	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,6:2,8:5,3,8,6
chr3	9960076	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,2:8,0:0|1:9960076_T_TG:9960076:11,9,1,1
chr3	9960080	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:9,0:0|1:9960076_T_TG:9960076:10,10,1,1
chr3	9960082	.	A	ATGAGAAAAAAATCT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:9,0:0|1:9960076_T_TG:9960076:10,9,1,1
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,1:0,6:2,0,3,4
chr3	9965745	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	9969932	.	TGG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=74,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,7:2,3:1,1,5,5
chr3	9970081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=280,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr3	10015454	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:4,8,0,5
chr3	10088404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=167,125;MMQ=40,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:7,5:8,3:0|1:10088404_C_T:10088404:6,9,1,7
chr3	10088407	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=167,125;MMQ=40,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:7,5:8,3:0|1:10088404_C_T:10088404:6,9,1,7
chr3	10088409	.	TAAG	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=168,125;MMQ=37,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:7,5:8,3:0|1:10088404_C_T:10088404:6,10,1,7
chr3	10088422	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=168,153;MMQ=40,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:0|1:10088404_C_T:10088404:5,8,1,5
chr3	10088443	.	CA	AG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=160,164;MMQ=34,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:2,6,1,3
chr3	10088461	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=149,164;MMQ=30,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:6,3:2,1:2,6,0,4
chr3	10089723	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=20,23;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:4,7,2,4
chr3	10089738	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=21,23;MFRL=84,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:5,3:2,3:3,5,2,4
chr3	10089749	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=87,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr3	10089825	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10089825_G_T:10089825:0,0,0,1
chr3	10089828	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10089825_G_T:10089825:0,0,0,1
chr3	10089831	.	GGAACT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10089825_G_T:10089825:0,0,0,1
chr3	10091035	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,144;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:14,3:3,0:10,7,2,1
chr3	10094206	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,128;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.252:17:6,0:2,3:7,6,3,1
chr3	10103931	.	CT	C,CTT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=20,20,20;MFRL=135,121,140;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=13.19,6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,13,9:0.270,0.238:41:7,6,5:6,2,1:4,15,6,16
chr3	10105585	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,1818797;MMQ=39,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:13,0:24,3:20,17,0,3
chr3	10107089	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:12,3:8,0:12,8,2,1
chr3	10107273	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=183,270;MMQ=53,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	10115033	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=73.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,29:0.716:40:4,17:7,12:8,3,18,11
chr3	10128824	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=104,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:16,1:12,5:10,18,6,0
chr3	10134846	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=168,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr3	10138194	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:1,6,0,5
chr3	10142939	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=92,81;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.084:45:21,0:20,3:0|1:10142939_C_T:10142939:22,20,1,2
chr3	10142949	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=164,85;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,42:0.936:44:1,21:1,21:0|1:10142939_C_T:10142939:1,1,20,22
chr3	10219510	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=231,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,3:1,6:0,3,0,9
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=109,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,9,1
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr3	10254797	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=191,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	10258687	.	C	CACT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=87,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:8,1:11,0:0|1:10258687_C_CACT:10258687:11,8,0,2
chr3	10258689	.	C	CTCCCTTTCTTCCCAAACAGTG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=87,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.125:21:7,2:11,0:0|1:10258687_C_CACT:10258687:11,8,0,2
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:3,2:1,7:1,3,3,7
chr3	10261294	.	AC	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=113,160;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,3:2,1,4,0
chr3	10264299	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.382:21:10,3:3,4:11,2,4,4
chr3	10268017	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,2:9,4:8,6,4,2
chr3	10268074	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=99,310;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,1:14,1:17,7,2,0
chr3	10276185	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,1:7,1:4,11,1,1
chr3	10283716	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	10290839	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr3	10302369	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=177,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:0,6,1,6
chr3	10302395	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr3	10318230	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.613:11:0,2:4,4:1,3,3,4
chr3	10334448	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=58,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,2:1,2:3,1,4,0
chr3	10353626	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:3,1:11,2:7,7,1,3
chr3	10355269	.	C	CTGTCTCTTCCCCATCTCTGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	10384576	.	GCCAGTGCCAGCGAGGCAAACGTGT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,2:6,0:12,10,1,1
chr3	10387327	.	C	CTTAAATAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	10391906	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10391906_G_T:10391906:0,0,0,1
chr3	10391908	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10391906_G_T:10391906:0,0,0,1
chr3	10391912	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10391906_G_T:10391906:0,0,0,1
chr3	10391914	.	G	GAAATAAGGGAT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10391906_G_T:10391906:0,0,0,1
chr3	10391919	.	G	GGGT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10391906_G_T:10391906:0,0,0,1
chr3	10391989	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=197,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr3	10413715	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:13,3:4,2:10,7,4,1
chr3	10421043	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=127,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr3	10861134	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:8,4,2,2
chr3	10953870	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:1,2:8,5:4,5,0,7
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:6,4,0,2
chr3	11064070	.	CCGCTGGCCACTGGCCATCA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:9,1:15,8,1,1
chr3	11070953	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:11070953_C_T:11070953:3,6,1,1
chr3	11070958	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:11070953_C_T:11070953:3,6,1,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr3	11303368	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:11303368_C_CA:11303368:0,0,0,2
chr3	11303375	.	T	TAAAAAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:11303368_C_CA:11303368:0,0,0,2
chr3	11303965	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:2,12,1,2
chr3	11305228	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305228_C_CG:11305228:0,1,0,1
chr3	11305231	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305228_C_CG:11305228:0,1,0,1
chr3	11305232	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305228_C_CG:11305228:0,1,0,1
chr3	11305235	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305228_C_CG:11305228:0,1,0,1
chr3	11340138	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:16,0,2,0
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	11744584	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	11858583	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=66,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:0,8:3,7:1,2,3,12
chr3	11885618	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:11885618_T_C:11885618:11,10,1,1
chr3	11885622	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=131,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:11885618_T_C:11885618:11,10,1,1
chr3	11885628	.	T	TGTAAGAAC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:13,2:0|1:11885618_T_C:11885618:10,12,1,1
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr3	12046196	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,2
chr3	12046207	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,2
chr3	12046215	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,2
chr3	12195869	.	C	CCCA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,2:12,0:15,12,0,2
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr3	12208829	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:12208829_C_T:12208829:1,8,0,2
chr3	12208831	.	G	GTTTTTATAGGAAGATA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:12208829_C_T:12208829:1,8,0,2
chr3	12225036	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=77,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr3	12434233	.	G	GC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=114,61;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:11,13,2,0
chr3	12458694	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12458694_T_TG:12458694:0,1,0,1
chr3	12458696	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12458694_T_TG:12458694:0,1,0,1
chr3	12458698	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12458694_T_TG:12458694:0,1,0,1
chr3	12545001	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:11,0:8,2:0|1:12545001_G_GT:12545001:11,9,1,1
chr3	12545002	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=108,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:12,0:8,1:0|1:12545001_G_GT:12545001:11,9,1,1
chr3	12574065	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr3	12611623	.	CC	TT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:2,9,1,1
chr3	12611654	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=169,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:12611654_T_A:12611654:0,3,1,1
chr3	12611659	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=169,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:12611654_T_A:12611654:0,3,1,1
chr3	12611663	.	T	TTGA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=169,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:12611654_T_A:12611654:2,3,1,1
chr3	12613612	.	A	AAACC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:17,0:17,2:0|1:12613612_A_AAACC:12613612:13,22,1,1
chr3	12613613	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:18,2:0|1:12613612_A_AAACC:12613612:13,22,1,1
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:5,5:0,7:4,1,4,8
chr3	12618269	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:10,8:7,3:7,10,4,7
chr3	12626188	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,0:7,2:2,8,0,2
chr3	12626347	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=100,82;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,3:13,0:16,10,3,0
chr3	12629136	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:9,10,1,1
chr3	12629145	.	G	GGGCGAGAGAACTCCCT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:8,11,1,1
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr3	12778402	.	AG	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=105,105;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:3,12,1,1
chr3	12780142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,17;MFRL=67,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,0:0|1:12780142_A_G:12780142:3,7,1,1
chr3	12780143	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=67,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:12780142_A_G:12780142:3,7,1,1
chr3	12780145	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=67,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:12780142_A_G:12780142:3,7,1,1
chr3	12780150	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=67,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:12780142_A_G:12780142:3,6,1,1
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	12838179	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:3,0,6,1
chr3	12838371	.	C	CATGTTTTACTTGAAACATAAACTACTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	12854770	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=109,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:0|1:12854770_G_A:12854770:14,9,1,1
chr3	12854772	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=109,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,0:0|1:12854770_G_A:12854770:14,9,1,1
chr3	12868857	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr3	12877617	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=43,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:12877617_C_CA:12877617:2,3,1,1
chr3	12877618	.	C	CAGGGGCCTTACAGTGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=43,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:12877617_C_CA:12877617:2,3,1,1
chr3	12944158	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=212,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.767:6:1,1:0,2:1,0,5,0
chr3	12944170	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	12944216	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.156:42:21,6:14,0:9,27,0,6
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,2:2,0,6,1
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,2:4,4:5,1,7,0
chr3	12961999	.	CG	TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,0:10,2:8,13,1,1
chr3	12966020	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:4,6,2,1
chr3	12966059	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.254:19:6,0:6,0:4,10,5,0
chr3	12976863	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	13368892	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,4:0,16:0,0,11,10
chr3	13370537	.	C	CAAGGTGATGGTATTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13370537_C_CAAGGTGATGGTATTGA:13370537:0,1,0,1
chr3	13370540	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13370537_C_CAAGGTGATGGTATTGA:13370537:0,1,0,1
chr3	13370544	.	ATC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13370537_C_CAAGGTGATGGTATTGA:13370537:0,1,0,1
chr3	13370547	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13370537_C_CAAGGTGATGGTATTGA:13370537:0,1,0,1
chr3	13376986	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=140,119;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,1:0|1:13376986_C_T:13376986:5,12,2,0
chr3	13376996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=142,119;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:0|1:13376986_C_T:13376986:8,12,2,0
chr3	13383176	.	C	CAGAGAATCAACTCAGCCCCACAACAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=223,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr3	13399722	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:3,0:12,2:10,5,0,2
chr3	13399752	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:13399752_G_T:13399752:10,10,1,1
chr3	13399755	.	C	CATT	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:13399752_G_T:13399752:10,11,1,1
chr3	13399758	.	G	GTT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:13399752_G_T:13399752:10,10,1,1
chr3	13399761	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,1:0|1:13399752_G_T:13399752:10,10,1,1
chr3	13399786	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:3,10:0,9:1,2,10,9
chr3	13399948	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:4,3:1,3:1,4,2,4
chr3	13421024	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=153,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:8,2,3,2
chr3	13421305	.	C	CTCTGCCTCCTGGCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	13421320	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	13427992	.	A	ATCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,2:5,1:8,2,2,1
chr3	13522973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	13522978	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=202,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:13522978_G_A:13522978:0,3,0,1
chr3	13522981	.	C	CCTAATCACGATA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=202,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:13522978_G_A:13522978:0,3,0,1
chr3	13539933	.	GGAATGAGTGCAT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:2,2:6,1,2,1
chr3	13546128	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:7,6,2,1
chr3	13612717	.	GA	TT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=166,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:0|1:13612717_GA_TT:13612717:3,3,1,1
chr3	13612721	.	A	AAACGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=176,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:13612717_GA_TT:13612717:3,2,1,1
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=222,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:1,0,8,3
chr3	14166280	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	14166577	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14174146	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:11,3:3,2:7,7,1,4
chr3	14180633	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:6,6,1,1
chr3	14180691	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:9,0:7,11,3,0
chr3	14187699	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr3	14188700	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr3	14188762	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,1:6,1:14,9,2,0
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=170,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,5:9,1:12,8,3,3
chr3	14190268	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=190,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,4:3,4:6,5,5,3
chr3	14197987	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,11,17
chr3	14208580	.	GAGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr3	14220095	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:5,3,0,3
chr3	14519885	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr3	14520164	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,6:2,5:0,2,2,9
chr3	14520560	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,4:1,2,5,3
chr3	14526538	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr3	14526612	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,19,16;MFRL=0,196,70329367;MMQ=60,60,60;MPOS=19,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=5.93,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,0:0,0,0:0,0,0,3
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:1,3:3,1,5,1
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	14545220	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=97,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:14545220_G_A:14545220:0,2,0,1
chr3	14545222	.	G	GCGTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,1:0,0:1|0:14545220_G_A:14545220:0,1,0,1
chr3	14545223	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,22;MFRL=97,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:14545220_G_A:14545220:0,2,0,1
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,4:0,3:0,1,4,3
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	14555739	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=71,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:1,2,3,3
chr3	14555811	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=81,71;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.762:23:3,10:2,8:2,3,12,6
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,6,8
chr3	14563258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=206,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,2:1,9:0,1,3,8
chr3	14563287	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=96,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr3	14583641	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=80,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,5,3
chr3	14703297	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,12,7
chr3	14711519	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.730:20:5,5:0,10:2,3,9,6
chr3	14724413	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,13:0,4:0,0,9,8
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	14731688	.	C	CACATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:14731688_C_CACATT:14731688:1,3,0,1
chr3	14731690	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:14731688_C_CACATT:14731688:1,3,0,1
chr3	14731700	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:14731700_G_GC:14731700:1,2,0,1
chr3	14731701	.	T	TCAGTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:14731700_G_GC:14731700:1,2,0,1
chr3	14755572	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0|1:14768554_G_A:14768554:0,0,3,9
chr3	14768571	.	C	CCTCTCCTCGGAGGGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:1,0:3,2:0|1:14768554_G_A:14768554:0,4,1,1
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	14803201	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=130,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14803201_G_A:14803201:0,2,0,1
chr3	14803203	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=130,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14803201_G_A:14803201:0,2,0,1
chr3	14803207	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=130,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14803201_G_A:14803201:0,2,0,1
chr3	14803214	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:14803214_AG_CA:14803214:0,0,0,1
chr3	14803221	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:14803214_AG_CA:14803214:0,0,0,1
chr3	14862335	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:3,14,0,2
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr3	14939364	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	14939679	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,1:0,0,0,7
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:6,2:5,3:2,9,2,4
chr3	14942510	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:23,0:17,7:19,21,0,7
chr3	14942675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	15065785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr3	15073950	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,0:13,5:11,9,2,3
chr3	15076272	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:0|1:15076272_T_A:15076272:9,9,1,1
chr3	15076277	.	G	GCCTGCTCTGTGTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:5,0:13,2:0|1:15076272_T_A:15076272:9,9,1,1
chr3	15080602	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.255:20:10,2:5,0:15,0,2,3
chr3	15100801	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=68,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.803:4:0,0:1,3:0,1,3,0
chr3	15115270	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr3	15119502	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=152,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr3	15127429	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=104,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,1:13,2:17,7,3,0
chr3	15127522	.	CTAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr3	15253671	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:24,3:21,0:17,28,2,1
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	15283019	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:0|1:15283019_A_T:15283019:11,4,1,1
chr3	15283020	.	GTACAAAC	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=109,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:5,0:0|1:15283019_A_T:15283019:13,9,1,1
chr3	15283031	.	AGGTG	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:7,0:0|1:15283019_A_T:15283019:17,12,1,1
chr3	15283038	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,2:10,0:0|1:15283019_A_T:15283019:17,13,1,1
chr3	15283040	.	GTC	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:19,2:10,0:0|1:15283019_A_T:15283019:17,13,1,1
chr3	15283045	.	CAGGGGGGTG	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,2:10,0:0|1:15283019_A_T:15283019:18,15,1,1
chr3	15287199	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,4:5,1:1,10,1,4
chr3	15288742	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:1,1:9,0,3,0
chr3	15301363	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=104,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,3:11,1:2,18,0,4
chr3	15301367	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,0:4,9:1,14,0,9
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	15345641	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,1:10,1:8,8,1,1
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	15466373	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,2:9,5:12,0,7,0
chr3	15471528	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.457:11:1,1:4,4:2,4,1,4
chr3	15473515	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr3	15475928	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=92,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:11,0:17,4:16,12,2,2
chr3	15495286	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15495286_G_GAA:15495286:4,0,0,1
chr3	15495287	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15495286_G_GAA:15495286:4,0,0,1
chr3	15495291	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15495286_G_GAA:15495286:4,0,0,1
chr3	15495294	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15495286_G_GAA:15495286:4,0,0,1
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=75,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:5,5,5,1
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:2,4,1,5
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:4,2:4,3:1,8,2,3
chr3	15529823	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,0:5,4:2,11,2,2
chr3	15529849	.	GCGTAGGGGAC	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=147,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:0|1:15529849_GCGTAGGGGAC_G:15529849:0,8,0,2
chr3	15529862	.	AGGAAGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=202,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:15529849_GCGTAGGGGAC_G:15529849:0,2,0,2
chr3	15529871	.	C	CGAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=202,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:15529849_GCGTAGGGGAC_G:15529849:0,2,0,2
chr3	15529881	.	G	GCTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	15539976	.	C	CCACACA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=125,63;MMQ=28,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=CA;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.215:19:5,2:9,1:13,2,2,2
chr3	15602462	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:15602462_C_T:15602462:5,12,1,1
chr3	15602467	.	T	TAGGTCTCAAGA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:0|1:15602462_C_T:15602462:5,11,1,1
chr3	15602469	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=176,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:0|1:15602469_G_C:15602469:3,7,1,1
chr3	15602474	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=167,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:15602469_G_C:15602469:3,6,1,1
chr3	15642796	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:2,1:3,1:3,4,2,1
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	15711765	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:0|1:15711765_C_T:15711765:11,8,1,1
chr3	15711777	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=77,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:15711765_C_T:15711765:11,6,1,1
chr3	15711782	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=77,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:15711765_C_T:15711765:9,6,1,1
chr3	15717431	.	G	GTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.241:10:3,2:5,0:0|1:15717431_G_GTA:15717431:4,4,1,1
chr3	15717432	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=145,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:3,1:5,0:0|1:15717431_G_GTA:15717431:4,4,1,1
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=182,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr3	15752837	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	15752863	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	15756039	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30,31;MFRL=0,113,171;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=4.18,12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,8:0.214,0.715:10:0,0,1:0,2,4:0,0,7,3
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,25:0.790:31:1,15:5,10:1,5,0,25
chr3	15762696	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,4:5,4:4,2,5,3
chr3	16242148	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=79,130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,0:5,2:13,4,2,0
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=67,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:7,2,2,1
chr3	16419708	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	16636093	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=107,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.180:28:11,1:10,4:3,20,1,4
chr3	16636203	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=242,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr3	16638399	.	TTTTGAAAAGCAAAAAGAAAAGGCCTATTTTTAGTTC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.113:25:6,1:7,1:13,10,1,1
chr3	16646800	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr3	16926666	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	17052272	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,0:13,4:16,8,2,2
chr3	17053257	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,3:6,0:9,6,1,2
chr3	17053499	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,9,8
chr3	17109488	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:17109488_G_T:17109488:9,8,1,1
chr3	17109494	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:17109488_G_T:17109488:9,9,1,1
chr3	17208267	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=301,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,7:0,7:0,2,9,5
chr3	17209195	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=208,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=123,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr3	17469901	.	GTGTA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=185,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:2,2:4,1:6,2,3,0
chr3	17469938	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=115,636;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:13,0:8,2:7,14,4,0
chr3	17470086	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,334;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	19295183	.	GGG	AAA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=71,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:9,0:18,5,1,1
chr3	19295203	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=71,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,5:11,0:17,6,4,1
chr3	19295208	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=79,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:0|1:19295208_G_A:19295208:15,7,1,1
chr3	19295217	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=86,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:19295208_G_A:19295208:15,9,1,1
chr3	19384166	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=95,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:15,0:7,3:14,10,0,3
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:8,3,2,2
chr3	19551816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=127,108;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,5:9,0:4,8,5,0
chr3	19551883	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=89,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:10,0:15,3:11,14,0,3
chr3	19554410	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr3	19921069	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=82,85;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	19925807	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr3	19940877	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr3	19941074	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	19947296	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr3	19959756	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0,0,9,8
chr3	19962044	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:11,3:5,4:9,7,3,4
chr3	19962078	.	GG	AA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,0:9,11,1,1
chr3	19974700	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=152,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:1,0,8,5
chr3	19975582	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	20017489	.	GG	CC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:2,4:9,2:9,4,4,3
chr3	20017737	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=165,103;MMQ=60,48;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,4:3,0:0,5,3,1
chr3	20113931	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=109,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:12,2:6,15,1,2
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=333,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0|1:20114044_T_C:20114044:0,1,0,3
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=333,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,1,0,2
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,6:3,7:7,0,10,3
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr3	20161138	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=89,99;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:6,5,0,2
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	20190065	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:20190065_C_T:20190065:0,3,1,1
chr3	20190068	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:20190065_C_T:20190065:0,3,1,1
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=155,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:3,6:3,5:3,3,8,4
chr3	20212715	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=99,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:16,3:12,0:14,14,0,3
chr3	21462754	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,11,5
chr3	21462787	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	23959257	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr3	23959565	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=132,81;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.133:50:23,0:21,6:13,31,0,6
chr3	23959912	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,0:21,3:26,16,1,2
chr3	23986930	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	23986983	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	23987002	.	A	AGGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:5,0,2,0
chr3	23996371	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	24006726	.	C	CTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=162,144;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,25;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.437:7:0,1:0,0:0,4,1,2
chr3	24009279	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=237,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	24164510	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:2,4:5,9:4,3,5,8
chr3	24164621	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr3	24168981	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=163,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,8:0,6:1,0,12,2
chr3	24169037	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.385:31:9,10:10,0:10,9,12,0
chr3	24270412	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.100:29:14,2:12,0:12,15,1,1
chr3	25470310	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=99,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:15,0:11,12:9,17,0,12
chr3	25611365	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:15,4:19,10,4,0
chr3	25611472	.	GAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=AC;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.817:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	25622244	.	TGGGGAGGGAGAGAGGGCACCGTGGA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=205,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.405:4:0,1:0,0:0,3,0,1
chr3	25674274	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,0:17,3:14,12,1,2
chr3	25679741	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,4:0.066:73:29,0:37,4:43,26,4,0
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,11,2
chr3	25805873	.	C	CCTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	25832746	.	GAAGAGTAT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=139,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGAGTAT;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:9,16,1,1
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=294,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	27161348	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=73,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:8,11,0,4
chr3	27183124	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr3	27329263	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=101,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,2:11,3:8,10,3,2
chr3	27338698	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:12,4:5,1:10,7,1,4
chr3	27433397	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	27439280	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:5,8,1,1
chr3	27451106	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	27463229	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,2:2,6:0,2,4,4
chr3	27478842	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.348:20:3,1:6,4:5,8,3,4
chr3	27759053	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:17,7,2,0
chr3	27759322	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=9,26;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,0:0,2:0,2,0,3
chr3	28304941	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0,14,0,2
chr3	28373462	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:1,2:0,2:0,1,0,5
chr3	28381887	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,2:0,19:0,1,8,15
chr3	29476304	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=89,54;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:22,2:23,2:24,22,2,2
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,4:0,0,2,16
chr3	29529907	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	29628639	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,19:0.372:52:20,10:11,9:27,6,16,3
chr3	29781458	.	G	GCTTCCCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=10,29;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.515:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	29804487	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:7,2:18,8:6,19,4,6
chr3	29804509	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:5,3:13,6:5,13,2,7
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	29985685	.	T	TCTCTCTCTCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:29985685_T_TCTCTCTCTCTC:29985685:2,0,1,1
chr3	29985687	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:29985685_T_TCTCTCTCTCTC:29985685:2,0,1,1
chr3	30032626	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=61,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.803:18:0,5:3,10:2,1,5,10
chr3	30713895	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,2:11,12,1,1
chr3	30842510	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=111,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:3,0:11,4:10,4,1,3
chr3	30885785	.	TT	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr3	30885806	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:1,0,1,4
chr3	30903008	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	30903304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr3	31638394	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	31641835	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,7:3,2:5,1,8,1
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr3	31677395	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	31725691	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	31789391	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:15,3,2,0
chr3	31917998	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:8,2:0|1:31917998_T_G:31917998:10,8,1,1
chr3	31918003	.	A	ATG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=101,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:31917998_T_G:31917998:8,8,1,1
chr3	31918005	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=101,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:0|1:31917998_T_G:31917998:8,8,1,1
chr3	32022333	.	G	GCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=CA;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr3	32032391	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,111;MMQ=60,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:10,0:12,6:13,11,6,0
chr3	32032702	.	TCA	CTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:13,8,0,2
chr3	32032735	.	TG	CA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:15,3:16,0:17,14,2,1
chr3	32032743	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.147:34:14,5:15,0:15,14,2,3
chr3	32200322	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,3:5,1:7,1,4,1
chr3	32398779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	32433453	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	32544163	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.282:16:7,0:5,4:5,7,3,1
chr3	32571823	.	GAA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.281:17:4,0:3,0:7,6,0,4
chr3	32745362	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=147,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:32745362_C_T:32745362:8,8,1,1
chr3	32745386	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:32745362_C_T:32745362:8,9,1,1
chr3	32745389	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:11,2:0|1:32745362_C_T:32745362:8,9,1,1
chr3	32745391	.	TCAG	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:10,2:0|1:32745362_C_T:32745362:7,8,1,1
chr3	32745396	.	C	CAA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:10,1:0|1:32745362_C_T:32745362:6,6,1,1
chr3	32746522	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	32754953	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32754953_A_C:32754953:0,1,0,1
chr3	32754955	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32754953_A_C:32754953:0,1,0,1
chr3	32754956	.	T	TTACTGCTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32754953_A_C:32754953:0,1,0,1
chr3	32754958	.	A	ATTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,8;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32754953_A_C:32754953:0,1,0,1
chr3	32758763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr3	32761803	.	A	ACAGCTGCCCAGCACATAAATAAAATCATGCTAACTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=0,231;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32761803_A_ACAGCTGCCCAGCACATAAATAAAATCATGCTAACTGCT:32761803:0,1,0,1
chr3	32761806	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=0,231;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32761803_A_ACAGCTGCCCAGCACATAAATAAAATCATGCTAACTGCT:32761803:0,1,0,1
chr3	32776491	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=128,53;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:32776491_C_T:32776491:3,8,1,1
chr3	32776501	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=137,53;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:32776491_C_T:32776491:1,10,1,1
chr3	32776504	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=137,53;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:32776491_C_T:32776491:1,10,1,1
chr3	32776505	.	T	TACTGGC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=137,53;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:32776491_C_T:32776491:1,10,1,1
chr3	32776507	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=137,53;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:32776491_C_T:32776491:1,10,1,1
chr3	32776510	.	G	GGAATGGCCGAA	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=142,53;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:0|1:32776491_C_T:32776491:1,9,1,1
chr3	32811559	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,1:1,0:0|1:32811559_A_G:32811559:0,3,0,1
chr3	32811561	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,1:1,0:0|1:32811559_A_G:32811559:0,3,0,1
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	32933344	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=141,70;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TC;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	32933360	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=140,120;MMQ=52,42;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:1,2:2,0:0|1:32933360_C_CTT:32933360:0,3,0,2
chr3	32933366	.	T	TTCTCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=140,120;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=TC;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0|1:32933360_C_CTT:32933360:0,5,0,2
chr3	32995928	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:0,10:4,6:3,1,5,11
chr3	32997029	.	CAAAAA	C,CAAA,CAAAA,CAAAAAA	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=17,26,17,17,17;MFRL=146,82,93,0,113;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,19,11,10;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,16,17,19;RU=A;STR;TLOD=7.56,8.61,3.10,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:4,6,8,3,14:0.113,0.183,0.098,0.469:35:0,1,1,0,0:1,4,2,1,2:0,4,3,28
chr3	32997096	.	G	GTTT	.	.	DP=96;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=78,109;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.407:17:6,2:4,2:10,0,0,7
chr3	32997119	.	TGA	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=118,56;MMQ=47,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.287:23:7,4:4,2:0|1:32997119_TGA_T:32997119:3,13,7,0
chr3	32997123	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,15;MFRL=118,56;MMQ=47,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.290:23:9,1:5,0:0|1:32997119_TGA_T:32997119:3,13,7,0
chr3	33055760	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:4,2:13,1:7,10,1,2
chr3	33063050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:8,5,4,2
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=116,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,1:3,7:4,2,3,5
chr3	33093487	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:2,4,2,0
chr3	33107060	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=61,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.228:37:19,5:10,3:0|1:33107060_A_G:33107060:6,23,3,5
chr3	33107063	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=66,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:32,3:0.108:35:22,1:10,2:1|0:33107060_A_G:33107060:5,27,2,1
chr3	33107088	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=61,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:10,1:3,2:0|1:33107088_C_A:33107088:2,24,2,1
chr3	33107092	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:10,1:3,2:0|1:33107088_C_A:33107088:2,11,2,1
chr3	33107093	.	C	CTGTTAAATAGGGAACTTTTCCCCATTG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:10,1:3,2:0|1:33107088_C_A:33107088:2,11,2,1
chr3	33110250	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:10,2,2,0
chr3	33161870	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=138,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:33161870_A_C:33161870:7,12,1,1
chr3	33161875	.	T	TAGAGGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=138,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:33161870_A_C:33161870:7,12,1,1
chr3	33161877	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=138,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:33161870_A_C:33161870:7,12,1,1
chr3	33166156	.	CCTGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33166156_CCTGG_C:33166156:0,0,0,1
chr3	33166161	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33166156_CCTGG_C:33166156:0,0,0,1
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	33174156	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.678:29:3,7:6,13:5,4,9,11
chr3	33174168	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:2,7:6,10:5,3,7,10
chr3	33174175	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=118,292;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:11,3:8,11,3,0
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=227,233;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr3	33194990	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=71,146;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:12,1:16,6:17,11,5,2
chr3	33195569	.	A	ATGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr3	33419546	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=76,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:5,7,2,0
chr3	33434954	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:1,2:4,3:0,8,0,5
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.658:30:3,10:7,10:6,4,11,9
chr3	33454342	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=89,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:7,2:2,3:3,6,0,5
chr3	33458266	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.288:36:14,7:12,3:14,12,4,6
chr3	33481400	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr3	33552004	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:8,2:12,3:15,5,5,0
chr3	33592945	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33592945_G_T:33592945:0,1,0,1
chr3	33592949	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33592945_G_T:33592945:0,1,0,1
chr3	33612364	.	TAA	T,TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26,25;MFRL=0,301,162;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.32,7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.334,0.569:6:0,2,3:0,0,1:0,0,0,6
chr3	33614759	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=133,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:12,2:13,2:12,13,1,3
chr3	33617790	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:15,2:15,5:11,19,3,4
chr3	33626193	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,92;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,5,0
chr3	33644388	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=170,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:33644388_C_A:33644388:3,1,1,1
chr3	33644390	.	T	TTCGTAGTATCAGCAGGCAGCAGCAAAGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=170,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:33644388_C_A:33644388:3,1,1,1
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	33663648	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:9,12,1,1
chr3	33894040	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,139;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:12,6:4,0:1,15,0,6
chr3	35748621	.	TGGGCTGACTGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:35748621_TGGGCTGACTGA_T:35748621:0,2,0,1
chr3	35748635	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:35748621_TGGGCTGACTGA_T:35748621:0,2,0,1
chr3	35778841	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:0,8,0,4
chr3	36422126	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0|1:36422126_C_T:36422126:1,0,7,1
chr3	36422135	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=200,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0|1:36422126_C_T:36422126:1,0,8,1
chr3	36422216	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.651:12:1,4:3,4:2,2,4,4
chr3	36526558	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:5,3,0,2
chr3	36526570	.	GGTTGA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTGA;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.240:6:4,1:1,0:4,1,0,1
chr3	36570259	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=109,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.541:9:3,1:1,4:2,2,1,4
chr3	36570547	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36570547_A_T:36570547:0,1,0,1
chr3	36570549	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36570547_A_T:36570547:0,1,0,1
chr3	36570555	.	A	ATCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36570547_A_T:36570547:0,1,0,1
chr3	36570559	.	G	GTCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36570547_A_T:36570547:0,1,0,1
chr3	36873393	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,1,1
chr3	36874909	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:9,9,1,2
chr3	36876178	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	36879871	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,3:10,0:11,3,0,3
chr3	36880287	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,333;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	36884134	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,2:11,1:8,10,2,1
chr3	36887862	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,2:12,1:14,9,2,1
chr3	36893681	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr3	37034946	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr3	37056069	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:3,4,0,5
chr3	37096024	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr3	37154411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:5,6,1,2
chr3	37170507	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.288:25:3,6:15,0:15,3,7,0
chr3	37327678	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=215,139;MMQ=40,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	37337745	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:8,0:3,3:4,7,1,2
chr3	37360696	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:5,9,0,2
chr3	37365584	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:12,4,3,0
chr3	37369129	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:15,0:19,6:27,11,2,4
chr3	37369369	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:37369369_C_CT:37369369:0,1,0,1
chr3	37369375	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37369369_C_CT:37369369:0,1,0,1
chr3	37376565	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.099:56:27,5:24,0:24,27,2,3
chr3	37378659	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:14,2:7,0:7,16,0,3
chr3	37378670	.	CTT	C,CTTTT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,33,21;MFRL=150,118,127;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,15;RU=T;STR;TLOD=3.96,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.245,0.148:11:3,1,2:2,1,0:3,3,0,5
chr3	37378783	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37378783_T_C:37378783:0,0,0,1
chr3	37378785	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37378783_T_C:37378783:0,0,0,1
chr3	37378791	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37378783_T_C:37378783:0,0,0,1
chr3	37459297	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37459297_A_AT:37459297:0,1,0,1
chr3	37459298	.	G	GTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37459297_A_AT:37459297:0,1,0,1
chr3	37459301	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37459297_A_AT:37459297:0,1,0,1
chr3	37459303	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37459297_A_AT:37459297:0,1,0,1
chr3	37459307	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37459297_A_AT:37459297:0,1,0,1
chr3	37476427	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:7,0:11,11:9,9,6,5
chr3	37512646	.	TG	CC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:2,5:0,5,3,3
chr3	37512678	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr3	37550027	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:1,1:6,0,1,1
chr3	37558996	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=95,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:7,3:14,0:12,12,2,1
chr3	37575039	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	37670862	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr3	37774100	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	37791947	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=128,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:6,5,3,0
chr3	37818805	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=261,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr3	37845226	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=178,167;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr3	37845275	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=158,106;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.369:17:1,6:7,0:0|1:37845275_T_C:37845275:10,1,6,0
chr3	37845283	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=149,106;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:5,6:11,0:0|1:37845275_T_C:37845275:10,6,6,0
chr3	38022395	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:4,8,0,2
chr3	38035652	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38035661	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38035670	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38035671	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38035681	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38035683	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38035652_C_T:38035652:0,0,0,1
chr3	38039637	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:12,6,2,0
chr3	38040550	.	G	GACATCATAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:38040550_G_GACATCATAA:38040550:0,1,0,1
chr3	38040552	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38040550_G_GACATCATAA:38040550:0,1,0,1
chr3	38040557	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38040550_G_GACATCATAA:38040550:0,0,0,1
chr3	38044163	.	C	CGATCACTGACGATGGATCCTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38045881	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:9,10,3,0
chr3	38050755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,11:3,0:4,1,11,0
chr3	38087013	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=134,98;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:11,1:11,5,1,1
chr3	38105498	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=198,135;MMQ=41,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.469:7:3,1:0,1:0,4,0,3
chr3	38125705	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,11:0,26:0,0,19,22
chr3	38126715	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:10,4:2,0:8,4,4,0
chr3	38126795	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=96,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.201:46:12,1:24,7:16,21,2,7
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	38135225	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:5,13,2,1
chr3	38151731	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,5,15
chr3	38156542	.	G	GAAACGTGTCCAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr3	38167774	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=79,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:38167774_C_A:38167774:12,11,1,1
chr3	38167782	.	T	TGCCTATG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=79,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:8,2:0|1:38167774_C_A:38167774:13,10,1,1
chr3	38167785	.	GGG	ATC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=79,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:38167774_C_A:38167774:13,11,1,1
chr3	38168065	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,97;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.259:29:8,7:13,0:8,14,6,1
chr3	38170912	.	T	TAGACATGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=268,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	38180608	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=50,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38180608_C_T:38180608:1,1,0,1
chr3	38180616	.	C	CCAGCTGCAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=50,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38180608_C_T:38180608:1,1,0,1
chr3	38182131	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=150,184;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.302:21:9,0:6,6:4,11,0,6
chr3	38207436	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=114,44;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.220:39:16,0:14,8:17,14,0,8
chr3	38257567	.	CTT	C,CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=139,128,103;MMQ=60,60,60;MPOS=10,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.75,5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,6:0.142,0.244:24:9,2,3:2,1,2:10,5,8,1
chr3	38307656	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:2,6,3,2
chr3	38307773	.	G	GGAGTCTTAATTCTGGCTCTAAAGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=81,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,1,1
chr3	38316979	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:5,2,0,2
chr3	38348949	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr3	38350479	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr3	38350519	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,9,13
chr3	38350543	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,6,14
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,2:0,0,5,9
chr3	38354839	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,9,4
chr3	38355184	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr3	38357263	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=209,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38357263_A_AT:38357263:0,1,0,1
chr3	38357266	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38357263_A_AT:38357263:0,2,0,1
chr3	38357275	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38357263_A_AT:38357263:0,2,0,1
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,15,9
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	38407133	.	TG	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,0:9,4:4,14,0,4
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.919:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	38411731	.	G	GCACACACACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=CA;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0,0,0,9
chr3	38519466	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:0|1:38519466_G_A:38519466:13,11,1,1
chr3	38519469	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,2:13,0:0|1:38519466_G_A:38519466:13,11,1,1
chr3	38519806	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=178,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:2,0:2,2:0|1:38519806_C_G:38519806:3,1,1,1
chr3	38519809	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=178,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:38519806_C_G:38519806:3,1,1,1
chr3	38519812	.	A	AAGGCTTAAAAAGGTCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=178,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:38519806_C_G:38519806:3,1,1,1
chr3	38519942	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=101,0;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:2,0:8,3:7,4,1,2
chr3	38523854	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=184,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:4,4,2,0
chr3	38539095	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr3	38597235	.	A	ACTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:7,9,1,1
chr3	38597893	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=33,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:0,1:1,1,2,0
chr3	38598669	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=236,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr3	38601556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	38601665	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr3	38622467	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr3	38627153	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,16;RU=GT;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.963:21:0,4:0,1:0,0,9,12
chr3	38627629	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	38639412	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=106,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr3	38648062	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	38743630	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,0:1,8:0,1,0,8
chr3	38743687	.	A	AAGCCCACTAGTATCTGGATAATTTGAGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=163,271;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	38770293	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:6,3:17,0:6,17,2,1
chr3	38812708	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr3	38888441	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=139,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:38888441_A_T:38888441:8,4,0,2
chr3	38888444	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=139,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:0|1:38888441_A_T:38888441:8,4,0,2
chr3	38888447	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:38888441_A_T:38888441:9,3,0,2
chr3	38888449	.	T	TTCCTTCCTTCC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:38888441_A_T:38888441:9,3,0,2
chr3	38904657	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:6,4,2,1
chr3	38912926	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=217,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:1,1,6,4
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr3	38936042	.	TTGTGTGATGCGC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:8,8,1,1
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,2:0,3:0,0,4,3
chr3	38938644	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:12,9,1,1
chr3	38945654	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	38945672	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38946872	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	38950484	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:8,9,2,0
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	38961537	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	38967103	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	38986952	.	C	CTTGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:0|1:38986952_C_CTTGT:38986952:7,7,0,2
chr3	38986953	.	A	AGTATAGTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:38986952_C_CTTGT:38986952:7,7,0,2
chr3	39111047	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,0,2
chr3	39135551	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=98,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:12,5:18,2:15,15,4,3
chr3	39140237	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,2,0
chr3	39141745	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:4,3:0,0:3,1,4,0
chr3	39159760	.	T	TTTCACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	39166484	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	39167905	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr3	39170370	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=90,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,2:8,4:5,10,3,3
chr3	39174462	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr3	39178437	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,4:5,2:5,2,3,4
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=82.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,14,13
chr3	39185938	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39185938_G_C:39185938:0,2,0,1
chr3	39185941	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:39185938_G_C:39185938:0,3,0,1
chr3	39185944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:39185938_G_C:39185938:0,3,0,1
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	39186038	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	39230439	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:3,3,4,6
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr3	39435865	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=266,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,10:1,4:1,0,8,6
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	39450065	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,16,12
chr3	39450276	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,3:0,5:0,0,0,10
chr3	40192638	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:5,5:16,0:10,12,5,0
chr3	40211675	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,258;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40211675_G_C:40211675:0,2,0,1
chr3	40211680	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=184,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:40211675_G_C:40211675:0,2,0,1
chr3	40223915	.	T	TCTGTGTGTGTGTGTGCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=62,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,0:1,2,0,1
chr3	40223917	.	T	TAAGGTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=185,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	40231525	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,67;MMQ=60,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,0:4,10:4,6,0,10
chr3	40231883	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr3	40251678	.	C	CTTCACAACTAATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	40286017	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,8,9
chr3	40352355	.	ATT	A,AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,26,26;MFRL=165,163,134;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=23.05,19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,16,16:0.415,0.410:38:4,8,8:1,5,6:4,2,26,6
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,1,9
chr3	40352647	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,1,8
chr3	40352884	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=69.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr3	40429495	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=89,161;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:10,7:4,0:7,7,7,0
chr3	40442574	.	AGAGGTCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr3	40468896	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=179,71;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:2,1,4,6
chr3	40498720	.	TACGC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ACGC;STR;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr3	40498904	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,3:4,7:2,4,6,6
chr3	40498933	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,4,11
chr3	40503520	.	A	ACTGCTG,ACTGCTGCTG,ACTGCTGCTGCTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27,22,26;MFRL=0,139,108,196;MMQ=60,34,27,39;MPOS=19,5,0;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,12,13,14;RU=CTG;STR;TLOD=5.35,3.06,5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,2:0.273,0.252,0.386:5:0,1,1,1:0,1,0,0:0,0,5,0
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,0,3
chr3	40519429	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,5,9
chr3	40519532	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,7:1,5:0,3,3,9
chr3	40528492	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:14,0:11,5:14,11,0,5
chr3	40552916	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=95,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,3:3,10:2,1,10,3
chr3	40557309	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=75,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,39:0.849:45:2,12:4,16:0|1:40557309_GT_G:40557309:2,4,19,20
chr3	40557311	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=75,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=107.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,39:0.849:45:2,11:4,15:0|1:40557309_GT_G:40557309:2,4,19,20
chr3	40557456	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,1:8,1:0|1:40557456_C_CA:40557456:6,11,0,2
chr3	40557457	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:0|1:40557456_C_CA:40557456:6,11,0,2
chr3	40567383	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:14,0:19,4:0|1:40567383_G_T:40567383:13,20,2,2
chr3	40567387	.	G	GTT	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=100,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:13,0:16,4:0|1:40567383_G_T:40567383:12,19,2,2
chr3	40567391	.	G	GTTTTTCT	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:10,0:13,3:0|1:40567383_G_T:40567383:10,16,2,1
chr3	40567395	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,1:0|1:40567383_G_T:40567383:8,15,1,1
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr3	41290902	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:4,0,4,0
chr3	41291073	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,3:10,0:9,14,0,3
chr3	41291081	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.827:27:2,14:2,9:1,3,8,15
chr3	41439787	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,137;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	41723151	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:3,3:7,0:4,10,1,2
chr3	41723165	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:8,0:11,9,0,2
chr3	41723169	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:10,0:11,9,0,2
chr3	41877473	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.364:13:2,1:5,3:3,5,1,4
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	41925483	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,3:9,0:5,9,1,2
chr3	41937087	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,100;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,0:7,5:5,14,0,6
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	41939990	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:5,1:12,2:7,11,0,3
chr3	41939993	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.763:21:3,4:2,10:1,4,6,10
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,11,10
chr3	41952899	.	G	GATA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.148:19:6,1:10,1:0|1:41952899_G_GATA:41952899:5,12,0,2
chr3	41952901	.	T	TTTTGTTCTTTTAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=150,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.148:19:6,1:10,1:0|1:41952899_G_GATA:41952899:5,12,0,2
chr3	41960087	.	CTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=163,126;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.382:7:1,2:0,1:0,4,1,2
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr3	42133149	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=53,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:0,6:3,0:0,4,0,6
chr3	42166869	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=218,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr3	42167158	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=112,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42167158_T_C:42167158:0,4,0,1
chr3	42167160	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=112,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42167158_T_C:42167158:0,4,0,1
chr3	42202061	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr3	42234740	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=315,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,1:0,1,2,2
chr3	42235325	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=95,45;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:14,0:7,3:11,10,0,3
chr3	42242589	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:7,1,1,2
chr3	42244321	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:42244321_G_A:42244321:0,0,0,1
chr3	42244337	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42244321_G_A:42244321:0,0,0,1
chr3	42264393	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr3	42264422	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr3	42265270	.	TCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	42305115	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,0:10,3:6,9,2,1
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr3	42445635	.	GG	AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:5,6,1,1
chr3	42560882	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	42569069	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=215,82;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr3	42576784	.	T	TGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,9;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=5,10;RU=G;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:3,0:11,0:14,0,0,3
chr3	42597504	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:17,0:10,4:12,17,0,4
chr3	42598980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr3	42599049	.	TAA	T,TA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,25,25;MFRL=134,162,186;MMQ=60,60,60;MPOS=28,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.09,4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,4:0.170,0.275:15:3,1,2:6,1,2:9,0,5,1
chr3	42599091	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.593:32:6,13:6,6:8,5,10,9
chr3	42599181	.	A	AGTTTATCCTCTCTTC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,2:16,0:13,16,0,2
chr3	42599234	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:3,3:1,4:1,3,0,8
chr3	42660489	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28,29;MFRL=64,134,63;MMQ=60,60,59;MPOS=11,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.86,8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.219,0.322:13:5,1,3:1,1,1:6,0,6,1
chr3	42671947	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr3	42676265	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr3	42678880	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,174;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:10,15:14,0:12,12,15,0
chr3	42679497	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=84,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,8:5,6:4,5,7,7
chr3	42679777	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.754:22:1,6:4,10:4,1,9,8
chr3	42680052	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:15,1,3,0
chr3	42680082	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=125,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:18,3:10,0:25,3,3,0
chr3	42684016	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.107:53:24,0:21,5:29,19,2,3
chr3	42684034	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=80,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,4:0.059:82:27,4:51,0:0|1:42684034_G_A:42684034:54,24,1,3
chr3	42684037	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=80,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,4:0.059:83:26,4:51,0:0|1:42684034_G_A:42684034:55,24,1,3
chr3	42684133	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:2,11:1,6:0,4,2,15
chr3	42701141	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:8,6:8,0:9,7,6,0
chr3	42727928	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=88,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:6,0:8,12,1,1
chr3	42729809	.	GGTGGGGCTGAGCTCCGTGGGGGTGA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,36;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.141:20:6,2:10,0:5,13,1,1
chr3	42734297	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:14,0:1,6:8,7,0,7
chr3	42735150	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr3	42738297	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr3	42738311	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:1,0:3,0:1,4,2,0
chr3	42740259	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:0|1:42740259_G_A:42740259:3,7,3,0
chr3	42740284	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.143:19:8,1:9,1:1|0:42740259_G_A:42740259:9,8,0,2
chr3	42799819	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:3,10,1,1
chr3	42799830	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:42799830_G_T:42799830:2,7,1,1
chr3	42799832	.	TG	CT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:42799830_G_T:42799830:2,6,1,1
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,25427875;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	42827437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,6:1,7:1,0,12,1
chr3	42907386	.	GCTTC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTTC;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr3	42907529	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=299,273;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42907529_C_T:42907529:0,1,0,1
chr3	42907530	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=299,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42907529_C_T:42907529:0,1,0,1
chr3	42908370	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,0:3,1:0,7,0,3
chr3	42917651	.	AGCCC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42917651_AGCCC_A:42917651:0,0,0,1
chr3	42917656	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42917651_AGCCC_A:42917651:0,0,0,1
chr3	42917660	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42917651_AGCCC_A:42917651:0,0,0,1
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	42950351	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=132,11809411;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:5,6,0,2
chr3	42956273	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,14:0,0,12,11
chr3	43074743	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:7,3,0,2
chr3	43385036	.	T	TGAGACGGAGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=214,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	43607224	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=66,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,0:2,4:4,3,2,2
chr3	43618809	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=62,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,0:2,1:0|1:43618809_T_G:43618809:0,2,0,1
chr3	43618814	.	T	TTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=62,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43618809_T_G:43618809:0,2,0,1
chr3	43618817	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43618809_T_G:43618809:0,1,0,1
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=113,108;MMQ=50,52;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.586:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	44283672	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr3	44284330	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=157,117;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:5,5,2,0
chr3	44286735	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,23;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr3	44286775	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,35;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44286775_CA_C:44286775:0,1,0,1
chr3	44286778	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44286775_CA_C:44286775:0,1,0,1
chr3	44286783	.	CC	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44286775_CA_C:44286775:0,1,0,1
chr3	44286787	.	T	TAATGTTCATTCCTTTATTGAATTC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=213,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	44286792	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44286775_CA_C:44286775:0,0,0,1
chr3	44286795	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44286775_CA_C:44286775:0,0,0,1
chr3	44312267	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:44312267_A_G:44312267:9,3,1,1
chr3	44312276	.	C	CTGTGTAAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:44312267_A_G:44312267:9,4,1,1
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:0,2,0,6
chr3	44399459	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=187,232;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	44408864	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	44434417	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:14,4:15,0:11,18,3,1
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=91.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,18,11
chr3	44489027	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=83,264;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:3,2,2,2
chr3	44610019	.	T	TAACAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44610019_T_TAACAACA:44610019:0,0,0,1
chr3	44610020	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44610019_T_TAACAACA:44610019:0,0,0,1
chr3	44612895	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=226,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	44683811	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,274;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,0:7,3:7,8,0,3
chr3	44684118	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:7,0:6,4:6,8,0,4
chr3	44777390	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=102,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:9,4,1,1
chr3	44815871	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.236:14:4,0:6,3:9,2,2,1
chr3	44816815	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:15,8,0,2
chr3	44816969	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44816969_A_G:44816969:0,1,0,1
chr3	44816971	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44816969_A_G:44816969:0,1,0,1
chr3	44835895	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,0:7,5:9,9,0,5
chr3	44839504	.	G	GATATGTTACAGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	44846445	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:8,0,3,0
chr3	44846477	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.287:17:1,2:6,1:11,1,3,2
chr3	44846484	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:6,4:12,0:14,4,4,0
chr3	44867708	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,3:14,0:7,20,1,2
chr3	44868018	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:2,0:1,4,0,3
chr3	44868050	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:1,3,0,2
chr3	44932270	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,0:0,6:0,1,0,6
chr3	44935019	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,5,3
chr3	44943069	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:3,7:1,6:3,1,7,6
chr3	44943389	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=16,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,5:0,2:0,1,6,1
chr3	44943406	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,2:1,0:6,2,1,1
chr3	44948479	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,5:0,10:0,1,5,10
chr3	44948590	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:1,8:6,11:3,4,10,10
chr3	44948770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,4:1,7:2,1,7,4
chr3	44952658	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=76,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,4:1,0:1,3,0,4
chr3	44952942	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	44986817	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:3,7,0,2
chr3	45017904	.	AG	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,2:0,11:0,0,0,13
chr3	45127515	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr3	45133112	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45133112_T_TGA:45133112:0,0,0,1
chr3	45133113	.	C	CATACATAAAAATATGAAATAGAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45133112_T_TGA:45133112:0,0,0,1
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:1,7:2,9:1,2,3,14
chr3	45187671	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=352,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:0,3:1,9:0,1,10,4
chr3	45266555	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	45267449	.	TCC	GGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=11,20;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:45267449_TCC_GGG:45267449:0,1,1,0
chr3	45267453	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,16;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:45267449_TCC_GGG:45267449:0,1,1,0
chr3	45267460	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45267449_TCC_GGG:45267449:0,1,1,0
chr3	45267463	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:45267449_TCC_GGG:45267449:0,1,1,0
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=68.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:2,15:2,9:2,2,17,9
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,1:0,11:0,0,10,2
chr3	45500178	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:2,0:7,3:7,3,3,0
chr3	45515817	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:5,4,1,2
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr3	45532914	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:45532914_G_T:45532914:5,0,1,1
chr3	45532918	.	C	CATAGGACTGAAGAAGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:45532914_G_T:45532914:5,0,1,1
chr3	45557707	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,7:2,3:4,3,5,5
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	45561722	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:5,0:11,2:0|1:45561722_T_C:45561722:10,9,1,1
chr3	45561729	.	G	GGACTCTTTTAACAGTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:14,1:0|1:45561722_T_C:45561722:11,10,1,1
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr3	45637837	.	G	GCAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:0|1:45637837_G_GCAA:45637837:2,7,1,1
chr3	45637838	.	G	GTTCCAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:0|1:45637837_G_GCAA:45637837:2,7,1,1
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=96.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,16:0,6:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,12,11
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=96.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,16:0,7:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,12,11
chr3	45677815	.	G	GAGA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,2:0,2,0,7
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=84,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,0:2,4:3,4,1,3
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0|1:45748429_G_A:45748429:0,0,2,9
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:45748429_G_A:45748429:0,0,1,9
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,4,9
chr3	45763491	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:7,3,2,0
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr3	45763676	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=136,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45763676_T_G:45763676:0,2,0,1
chr3	45763678	.	CT	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:45763676_T_G:45763676:0,3,0,1
chr3	45763681	.	A	AGTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,22;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45763676_T_G:45763676:0,3,0,1
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr3	45776875	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.578:7:2,1:1,1:1,2,1,3
chr3	45776900	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,3,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,3,0
chr3	45800392	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr3	45807289	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=227,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:7,1:3,7,1,2
chr3	45823628	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:6,3:9,6,3,0
chr3	45823750	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=165,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,0:8,3:3,16,2,1
chr3	45977866	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=200,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr3	45988525	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:6,3,1,2
chr3	45989044	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.200:21:7,0:10,3:9,8,2,2
chr3	46008026	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:46008026_G_A:46008026:6,13,1,1
chr3	46008035	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:46008026_G_A:46008026:7,12,1,1
chr3	46016851	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr3	46026259	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:10,3,4,0
chr3	46063359	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:22,0:12,3:21,13,1,2
chr3	46245836	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	46399458	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=69,105;MMQ=46,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:5,0:13,2:0|1:46399458_T_C:46399458:8,11,0,2
chr3	46399461	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=69,105;MMQ=46,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:0|1:46399458_T_C:46399458:8,11,0,2
chr3	46416371	.	GAGGATGGGAAGGAGGGAGGTATTCGTA	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=112,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.110:44:12,1:9,3:24,16,3,1
chr3	46416470	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=94,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,14:0.282:51:17,11:20,3:22,15,6,8
chr3	46417312	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.285:29:14,6:5,1:11,10,6,2
chr3	46449978	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:7,6,1,4
chr3	46479668	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:3,4,0,5
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,3:5,2:8,4,5,0
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr3	46562938	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	46568931	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:5,7,1,2
chr3	46569134	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46569134_G_GGC:46569134:0,1,0,1
chr3	46569135	.	A	ACATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46569134_G_GGC:46569134:0,1,0,1
chr3	46574437	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:3,7,0,2
chr3	46593062	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,5:5,2:1,9,3,4
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	46712369	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	46713087	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=111,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:4,5,0,3
chr3	46713102	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,3:0,0,4,8
chr3	46713764	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	46714797	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr3	46714821	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chr3	46717065	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr3	46717931	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr3	46717957	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	46718298	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	46722692	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr3	46722884	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,3:8,0:6,8,2,1
chr3	46723663	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,4:0,15:0,0,1,18
chr3	46725457	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=79,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:0|1:46725457_G_A:46725457:9,10,1,1
chr3	46725466	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=79,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:6,0:0|1:46725457_G_A:46725457:9,10,1,1
chr3	46725480	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=100,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,4:7,0:9,4,0,4
chr3	46727224	.	ACCTCC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46727224_ACCTCC_A:46727224:0,0,0,1
chr3	46727234	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46727224_ACCTCC_A:46727224:0,0,0,1
chr3	46750553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=386,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr3	46750622	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,2:9,0:8,5,0,2
chr3	46751073	.	TAAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAG;STR;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr3	46783826	.	A	AGGG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:9,5,2,0
chr3	46784566	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	46784570	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	46902129	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	46904708	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:1,1,6,3
chr3	46925184	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46925184_G_C:46925184:0,2,0,1
chr3	46925189	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46925184_G_C:46925184:0,2,0,1
chr3	46935527	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=172,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.609:16:1,7:4,0:2,4,6,4
chr3	46942477	.	G	GGAAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=66,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:46942477_G_GGAAA:46942477:3,3,1,1
chr3	46942479	.	C	CCCGCCCCCGGG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=66,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:46942477_G_GGAAA:46942477:3,3,1,1
chr3	46942480	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=66,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:46942477_G_GGAAA:46942477:3,3,1,1
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:7,2,2,0
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:3,6,0,3
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,4:5,1:1,13,2,3
chr3	47018214	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,19:0,0,10,19
chr3	47035900	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr3	47036628	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr3	47037428	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:13,0:14,4:18,9,0,4
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,2:0,0,6,6
chr3	47039045	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=104,31;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:2,2:0|1:47039045_T_A:47039045:8,6,1,1
chr3	47039052	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=108,31;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:3,2:0|1:47039045_T_A:47039045:11,6,1,1
chr3	47039054	.	A	ATCCTTGTGGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=104,31;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:13,0:3,2:0|1:47039045_T_A:47039045:10,6,1,1
chr3	47040903	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,3:12,0:9,18,3,0
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	47044624	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0|1:47044624_T_C:47044624:0,5,0,2
chr3	47044631	.	TTG	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=173,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,1:1,1:0|1:47044624_T_C:47044624:2,4,0,2
chr3	47044635	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0|1:47044624_T_C:47044624:2,3,0,2
chr3	47045739	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,3:6,4:8,6,2,5
chr3	47045742	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=22,33;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:8,0:7,2:0|1:47045742_A_C:47045742:10,9,0,2
chr3	47045748	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:8,0:6,2:0|1:47045742_A_C:47045742:10,9,0,2
chr3	47045763	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.197:17:3,1:8,1:6,8,2,1
chr3	47046666	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:7,7,2,1
chr3	47046842	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr3	47047358	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:6,0:2,2:3,5,0,2
chr3	47048452	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	47050181	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=124,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:47050181_C_T:47050181:0,2,0,1
chr3	47050185	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=124,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:47050181_C_T:47050181:0,2,0,1
chr3	47050193	.	A	AAAACTCATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47050181_C_T:47050181:0,1,0,1
chr3	47108700	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:4,0:3,4:0,7,0,4
chr3	47125385	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:8,6:10,1:12,6,4,3
chr3	47129781	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:2,1:2,1:0,6,0,2
chr3	47161353	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:47161353_T_TAA:47161353:0,6,1,1
chr3	47161354	.	TTTTTTGG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:47161353_T_TAA:47161353:0,6,1,1
chr3	47161363	.	CAGA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=85,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,2:0|1:47161353_T_TAA:47161353:0,4,1,1
chr3	47161371	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:47161353_T_TAA:47161353:0,3,1,1
chr3	47161378	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,33;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,0:0,1:0|1:47161353_T_TAA:47161353:0,1,1,1
chr3	47163105	.	TAAATTC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=111,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:10,2:13,9,1,1
chr3	47165444	.	GTACTGGTGCTGCCATTAGAACTGTTATTGGTGTATGTGGCAAGGCCACTGGCTCTGT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.083:37:7,1:5,1:20,15,1,1
chr3	47270240	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=144,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:47270240_C_T:47270240:1,6,1,1
chr3	47270250	.	A	ACATGAGACTGTGTTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=176,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:47270240_C_T:47270240:0,6,1,1
chr3	47277458	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr3	47286281	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=127,135;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:10,9,0,4
chr3	47287603	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	47289018	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,2:1,1:2,7,2,1
chr3	47299152	.	A	ACACTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=215,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47299152_A_ACACTGT:47299152:0,1,0,1
chr3	47299154	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=215,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47299152_A_ACACTGT:47299152:0,1,0,1
chr3	47299155	.	C	CATAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=215,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47299152_A_ACACTGT:47299152:0,1,0,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr3	47312635	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAAG;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:2,2:0,1:2,1,2,1
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=83,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:2,7:0,3:2,0,9,1
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr3	47378058	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:7,11,1,1
chr3	47378074	.	G	GTATATCAAGCCAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:12,9,1,1
chr3	47447492	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:9,3:9,8,1,2
chr3	47449222	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=122,272;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:9,0:9,7:8,12,0,7
chr3	47450636	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:5,2:2,5,0,3
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,2:2,6:2,1,6,3
chr3	47451436	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:3,2:6,3:5,5,2,3
chr3	47452087	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,12,10
chr3	47452106	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:13,2:0|1:47452106_T_C:47452106:14,8,1,1
chr3	47452115	.	C	CACCA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:47452106_T_C:47452106:13,6,1,1
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.509:21:2,3:7,4:7,3,5,6
chr3	47452376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr3	47452405	.	T	A,TGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,20,25;MFRL=146,69,122;MMQ=60,60,60;MPOS=33,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:1,1,1:2,1,1,1
chr3	47453485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,154;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:1,6,2,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr3	47455688	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:2,4,2,4
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr3	47456536	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:4,2,2,1
chr3	47459564	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.753:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr3	47459679	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,4:6,0:1,14,2,2
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,9:0,9:0,1,3,15
chr3	47539702	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=259,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=173,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	47618238	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,174;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,2:3,0:7,1,2,0
chr3	47618779	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,32;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:10,14,0,2
chr3	47676629	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=194,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47722113	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47734700	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=204,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,4:2,10:1,1,7,7
chr3	47747797	.	GT	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	47747941	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=91,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,1:8,1:11,19,0,2
chr3	47755839	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=121,85;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:0|1:47755839_T_G:47755839:15,8,1,1
chr3	47755845	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=121,85;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:0|1:47755839_T_G:47755839:15,11,1,1
chr3	47755847	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=120,85;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,2:14,0:0|1:47755839_T_G:47755839:16,11,1,1
chr3	47859614	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=99,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,0:4,2:4,6,0,2
chr3	47883317	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,245;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	47888820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,1:10,2:8,10,0,3
chr3	47910621	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr3	47951229	.	T	TCTTTGCCCCACATCACTCCTCTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:47951229_T_TCTTTGCCCCACATCACTCCTCTC:47951229:3,2,1,1
chr3	47951231	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:47951229_T_TCTTTGCCCCACATCACTCCTCTC:47951229:3,2,1,1
chr3	47956492	.	TG	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47956492_TG_AC:47956492:1,2,0,1
chr3	47956499	.	A	AAATTTCAAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47956492_TG_AC:47956492:1,2,0,1
chr3	47956506	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	47963443	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=117,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:1,1:0,6,0,2
chr3	47963459	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=71,166;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	47969708	.	CA	GC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:4,2:0|1:47969708_CA_GC:47969708:10,6,1,1
chr3	47969711	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:5,2:0|1:47969708_CA_GC:47969708:12,9,1,1
chr3	47969715	.	TA	GG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=138,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:47969708_CA_GC:47969708:12,9,1,1
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr3	48019306	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr3	48200418	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,198;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,9:3,0:7,3,9,0
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	48218969	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,3:6,0:2,14,0,3
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:3,0:9,4:16,5,3,1
chr3	48226193	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=134,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.243:36:17,5:9,4:5,22,3,6
chr3	48265959	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.119:30:13,1:9,0:0|1:48265959_T_G:48265959:17,10,0,3
chr3	48265966	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.143:25:12,1:4,0:0|1:48265959_T_G:48265959:15,7,0,3
chr3	48282651	.	TGCGC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=109,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GC;STR;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,5:6,1:10,9,3,3
chr3	48309828	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:16,0:8,3:9,15,3,0
chr3	48340045	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:3,5,1,4
chr3	48342882	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:1,11,0,7
chr3	48348564	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	48414215	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	48415251	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,42;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:2,10,1,1
chr3	48416779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	48419723	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	48421143	.	C	CAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	48423656	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr3	48450706	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	48451300	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,10,13
chr3	48451331	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=90,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:15,0:11,3:15,13,2,1
chr3	48452039	.	CCACAGGGACACCAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr3	48454468	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,8:0,5:0,1,6,7
chr3	48459298	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:6,1:8,4,1,1
chr3	48462461	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=227,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0,3,2,5
chr3	48463618	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,14,10
chr3	48463711	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,15:0,0,8,11
chr3	48466027	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48466027_C_T:48466027:0,1,0,1
chr3	48466028	.	TGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48466027_C_T:48466027:0,1,0,1
chr3	48473956	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,0:10,3:10,13,0,4
chr3	48481647	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	48500816	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:14,0:17,3:18,13,0,3
chr3	48501852	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr3	48505089	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=103,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,6:9,0:11,6,6,0
chr3	48505302	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr3	48505964	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,13,13
chr3	48557360	.	G	GGCCAGCAAACTAATTTTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	48573941	.	G	GCACACACCCTTGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=286,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr3	48605075	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.807:24:2,8:2,12:2,2,10,10
chr3	48606065	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,2:6,1:0,11,1,2
chr3	48607242	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.751:25:2,3:3,16:4,2,7,12
chr3	48608506	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.519:21:2,3:8,8:5,5,7,4
chr3	48608930	.	GG	AA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,2:19,0:21,11,1,1
chr3	48610925	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=94,144;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=107.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,34:0.876:38:1,10:3,24:2,2,26,8
chr3	48611005	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=113,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.359:36:12,0:11,11:8,15,2,11
chr3	48611390	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:2,1:2,5:3,2,4,3
chr3	48611650	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.717:23:3,7:3,8:4,2,10,7
chr3	48612471	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=81,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:4,2:3,3:5,2,1,4
chr3	48612710	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,6:1,7:0,1,1,13
chr3	48613396	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=86,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:5,5:2,9:3,4,7,8
chr3	48617195	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:2,2:2,1:4,1,2,1
chr3	48619741	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:4,0:9,2:0|1:48619741_C_T:48619741:6,7,1,1
chr3	48619757	.	A	ACCC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:5,0:9,2:0|1:48619741_C_T:48619741:9,9,1,1
chr3	48619760	.	A	AGCCGAGGACCCACCTTCT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:7,0:9,2:0|1:48619741_C_T:48619741:9,9,1,1
chr3	48620148	.	G	GCCCTACCCTCAGGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=254,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr3	48621554	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:2,3,2,7
chr3	48621593	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,0:2,2,2,1
chr3	48622335	.	C	CGGCCGGG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=117,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:9,4:14,0:0|1:48622335_C_CGGCCGGG:48622335:14,10,2,2
chr3	48622337	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:9,2:15,0:0|1:48622335_C_CGGCCGGG:48622335:14,10,2,2
chr3	48624611	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=47,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,3,3
chr3	48625680	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.359:15:4,4:4,1:8,2,4,1
chr3	48628827	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,147;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr3	48629593	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,2:11,1:13,12,2,1
chr3	48629628	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=131,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:6,2:11,1:0|1:48629628_G_A:48629628:12,7,1,2
chr3	48629631	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=113,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:0|1:48629628_G_A:48629628:12,6,1,1
chr3	48637867	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0|1:48637867_C_T:48637867:3,5,2,0
chr3	48637875	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=101,158;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,7:0.346:21:6,7:8,0:1|0:48637867_C_T:48637867:6,8,7,0
chr3	48641917	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	48642201	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:4,9,0,3
chr3	48642205	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:3,11,1,1
chr3	48658467	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.781:30:4,15:2,9:2,4,10,14
chr3	48663692	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,0:11,2:13,11,1,1
chr3	48664113	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr3	48668394	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=66,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:1,10:5,4:4,2,7,7
chr3	48669447	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=89,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.794:17:0,7:3,7:1,2,7,7
chr3	48669648	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=145,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:3,1:0,1:3,1,2,0
chr3	48670827	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:6,4:1,8:3,4,4,9
chr3	48672693	.	CCGAGGCGTCGCAAGCGGAGAATGCCTGCTCCAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=221,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGAGGCGTCGCAAGCGGAGAATGCCTGCTCCAG;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.792:7:0,4:0,2:1,0,5,1
chr3	48678011	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	48678017	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48678017_C_CCG:48678017:0,1,0,1
chr3	48678018	.	AGGGTT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48678017_C_CCG:48678017:0,1,0,1
chr3	48678971	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	48679459	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=112,99;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:5,0:4,5:4,5,0,6
chr3	48679483	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=117,99;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.486:12:3,0:3,4:2,4,0,6
chr3	48681053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=72,138;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,13:0.632:20:1,5:6,6:0|1:48681053_C_T:48681053:4,3,6,7
chr3	48681055	.	CAA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,2:13,0:0|1:48681053_C_T:48681053:9,10,0,2
chr3	48681059	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:11,0:0|1:48681053_C_T:48681053:8,9,0,2
chr3	48681765	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.468:9:3,4:2,0:1,4,1,3
chr3	48682658	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	48683341	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48683341_G_C:48683341:0,1,0,1
chr3	48683347	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48683341_G_C:48683341:0,1,0,1
chr3	48683349	.	G	GTTCTTCATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:48683341_G_C:48683341:0,1,0,1
chr3	48684390	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:3,11,0,2
chr3	48688718	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr3	48689192	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,4:1,8:0,2,5,7
chr3	48689787	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr3	48691316	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:2,4:6,11:4,4,9,6
chr3	48694147	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	48694354	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:14,3:11,0:8,17,1,2
chr3	48719149	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:48719149_G_A:48719149:8,14,1,1
chr3	48719155	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,72;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,2:10,0:0|1:48719149_G_A:48719149:8,15,1,1
chr3	48719442	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	48720303	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,3:0,12:1,0,8,9
chr3	48729015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,256;MMQ=46,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	48732480	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,8:1,3:4,2,7,4
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr3	49044767	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr3	49051490	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,0:7,4:6,7,2,2
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,13:0,9:0,0,11,11
chr3	49055226	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=133,32;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr3	49055706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=62,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr3	49060339	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,0:10,4:10,7,2,2
chr3	49064576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr3	49065613	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49065613_T_A:49065613:0,0,1,0
chr3	49065625	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:49065613_T_A:49065613:1,0,1,0
chr3	49066031	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=82,311;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:1,7,3,0
chr3	49067987	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:20,0:18,4:23,15,2,2
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	49081876	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,1:13,2:12,11,0,3
chr3	49095075	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=71,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:8,6,1,1
chr3	49114214	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.436:37:11,16:9,0:0|1:49114214_T_A:49114214:8,13,15,1
chr3	49114222	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=117,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,15:0.421:36:11,12:10,0:0|1:49114214_T_A:49114214:8,13,15,0
chr3	49114544	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	49135961	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr3	49136090	.	G	GGGCCATGCTCTTTCTGAAGCCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,1:4,6,1,1
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr3	49139303	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:15,3:6,0:10,11,3,0
chr3	49139931	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:8,2:13,0:0|1:49139931_A_C:49139931:9,13,1,1
chr3	49139932	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:8,2:13,0:0|1:49139931_A_C:49139931:9,13,1,1
chr3	49139933	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:0|1:49139931_A_C:49139931:9,13,1,1
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,4,4
chr3	49142153	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=87,63;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.178:60:14,10:34,0:25,25,10,0
chr3	49146656	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.353:9:2,1:4,2:3,3,2,1
chr3	49147781	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:7,2:0|1:49147781_C_T:49147781:7,7,1,1
chr3	49147784	.	A	ACAGGGAACTCCAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=134,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:49147781_C_T:49147781:7,5,1,1
chr3	49147788	.	G	GTCATTGAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=134,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,0:7,2:0|1:49147781_C_T:49147781:7,5,1,1
chr3	49148284	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:5,10,1,1
chr3	49148304	.	G	GATTACAGGCAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:4,0:0|1:49148304_G_GATTACAGGCAT:49148304:5,8,1,1
chr3	49148306	.	A	AGC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=141,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,1:4,0:0|1:49148304_G_GATTACAGGCAT:49148304:5,7,1,1
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	49151506	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,0:13,3:13,11,0,3
chr3	49154146	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,0:0|1:49154146_A_C:49154146:1,8,2,0
chr3	49154152	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:4,1:0|1:49154146_A_C:49154146:1,7,2,0
chr3	49154155	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:5,0:0|1:49154146_A_C:49154146:2,9,2,0
chr3	49155197	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:10,12,1,1
chr3	49155483	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:49155483_G_T:49155483:1,8,1,1
chr3	49155487	.	G	GACCCTGACGATGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:49155483_G_T:49155483:1,8,1,1
chr3	49155490	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:49155483_G_T:49155483:1,8,1,1
chr3	49155491	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:49155483_G_T:49155483:1,8,1,1
chr3	49156676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49159698	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,2:11,1:13,10,2,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr3	49169149	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:4,1:2,5:1,5,0,7
chr3	49212541	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=85,48;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:0|1:49212541_G_A:49212541:7,13,1,1
chr3	49212546	.	ACT	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=85,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:12,2:0|1:49212541_G_A:49212541:9,15,1,1
chr3	49212549	.	T	TGGGGTC	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=85,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:49212541_G_A:49212541:8,15,1,1
chr3	49212556	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:4,0:11,2:0|1:49212541_G_A:49212541:6,15,1,1
chr3	49212560	.	TCC	GGA	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=111,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:4,0:9,2:0|1:49212541_G_A:49212541:6,14,1,1
chr3	49215000	.	CCTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,1,0
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	49292991	.	CTTTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:0,1:2,3:1,3,0,4
chr3	49293518	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:49293518_T_C:49293518:1,0,0,1
chr3	49293521	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49293518_T_C:49293518:1,0,0,1
chr3	49293526	.	G	GTCTGGTAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49293518_T_C:49293518:1,0,0,1
chr3	49318128	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr3	49335483	.	A	ACATTGAGTAGCAGTGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	49335489	.	CTCATACTCAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,1,5
chr3	49373045	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,7:6,0:2,5,2,5
chr3	49395673	.	GGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.859:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	49450449	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,18,12
chr3	49450485	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.139:38:16,4:17,0:21,12,5,0
chr3	49452415	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	49463287	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,8,5
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	49463962	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=259,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr3	49548008	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	49592122	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	49662632	.	GCACCCCCACATCACCCTACTCCGTCCCTCAGATCGCCCCCCTTCCCAGCAGCACGCTGTGTCCCATATGCAAGACTTCGGACCTCACGTCGACCCCCAGCCAGCCAAACTTCAA	G	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=83,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.132:39:7,2:9,2:12,23,2,2
chr3	49662636	.	C	CCTTTCCTTCT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:5,3:11,0:2,14,2,1
chr3	49662707	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=52,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,0:3,2:7,5,1,1
chr3	49662719	.	CGTCG	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=80,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:5,0:3,2:0|1:49662719_CGTCG_C:49662719:4,4,1,1
chr3	49662725	.	C	CTAG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=80,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:5,0:3,2:0|1:49662719_CGTCG_C:49662719:4,4,1,1
chr3	49680644	.	T	TGTGCGAGGGCAACTCAGTTTTCACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:49680644_T_TGTGCGAGGGCAACTCAGTTTTCACC:49680644:0,1,0,1
chr3	49680649	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49680644_T_TGTGCGAGGGCAACTCAGTTTTCACC:49680644:0,1,0,1
chr3	49689576	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:8,4,2,1
chr3	49692178	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,4:3,0:6,3,4,0
chr3	49694176	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=147,51;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:8,6,0,4
chr3	49698337	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=130,87;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:3,11,0,3
chr3	49699390	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=96,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:7,0:9,7:7,9,1,7
chr3	49699677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,0,2
chr3	49701404	.	C	CAGCAGAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=267,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	49712568	.	CCAGGAGTAG	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,0;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,16:0.458:35:7,0:9,0:0|1:49712568_CCAGGAGTAG_C:49712568:14,5,16,0
chr3	49712583	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.485:33:7,16:10,0:0|1:49712568_CCAGGAGTAG_C:49712568:12,5,16,0
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	49715064	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,57;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:19,3:9,0:15,13,3,0
chr3	49716998	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:6,3,2,0
chr3	49719729	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,5:0,7:1,0,7,5
chr3	49722356	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=95,120;MMQ=47,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:11,6:9,8:11,10,11,3
chr3	49723750	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=150,170;MMQ=27,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.363:14:1,3:8,1:5,4,3,2
chr3	49724048	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=134,124;MMQ=53,25;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,4:3,0:2,4,2,2
chr3	49724962	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=110,125;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.307:19:4,0:6,1:8,5,6,0
chr3	49725948	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=147,115;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,4:13,0,9,2
chr3	49726028	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=146,129;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.239:37:16,7:12,2:11,17,2,7
chr3	49726070	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,151;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,4:8,3:6,9,0,7
chr3	49726178	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,160;MMQ=52,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:2,4,4,7
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:1,5:0,5:1,0,5,6
chr3	49742647	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr3	49742667	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49744392	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr3	49759116	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:49759116_TG_T:49759116:0,0,1,1
chr3	49759118	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:49759116_TG_T:49759116:0,0,1,1
chr3	49760107	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,0:12,3:13,9,1,2
chr3	49764970	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,3:8,0:11,8,2,1
chr3	49785476	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:7,10,0,2
chr3	49828911	.	GAA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.268:16:6,1:4,3:2,10,1,3
chr3	49830032	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:10,2:3,2:7,8,2,2
chr3	49831505	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:0|1:49831505_A_AG:49831505:0,6,1,1
chr3	49831511	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:49831505_A_AG:49831505:0,6,1,1
chr3	49831514	.	G	GTGACTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:2,0:0|1:49831505_A_AG:49831505:0,6,1,1
chr3	49836713	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=74,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:5,0:0|1:49836713_G_A:49836713:18,5,1,1
chr3	49836716	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=74,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:19,1:5,0:0|1:49836713_G_A:49836713:20,5,1,1
chr3	49846352	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,12:6,0:12,2,12,0
chr3	49847222	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,12:2,4:2,2,10,6
chr3	49847797	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=81,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,2:12,0:9,8,1,2
chr3	49897830	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=84,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr3	49898273	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,71;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,7:7,1:8,2,5,3
chr3	49898318	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:11,3:12,3:15,9,3,3
chr3	49898781	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=184,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr3	49928614	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=72,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:1,1,2,0
chr3	49932804	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=61,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:8,6,2,2
chr3	49933514	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr3	49935382	.	C	CTCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:49935382_C_CTCTTTA:49935382:1,1,0,2
chr3	49935385	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:49935382_C_CTCTTTA:49935382:1,1,0,2
chr3	49940688	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:4,3:10,2,3,0
chr3	49948948	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=205,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	50005840	.	GGCATTCAGAAGGGAGAATTTGA	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:14,2:14,0:18,17,0,2
chr3	50006203	.	CTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=28,18;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50085631	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:4,4,1,2
chr3	50095289	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,205;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:16,4:9,0:12,14,4,0
chr3	50096082	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50096082_T_TCA:50096082:0,1,0,1
chr3	50096084	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50096082_T_TCA:50096082:0,1,0,1
chr3	50098993	.	C	CTTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=230,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=24,28;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:0,2:0,1,2,1
chr3	50112545	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=155,161;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	50112589	.	CA	C,CAA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,30,31;MFRL=145,128,105;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=8.45,7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,8:0.286,0.273:28:3,3,1:3,4,5:10,1,8,9
chr3	50112600	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.114:40:16,4:20,0:17,19,4,0
chr3	50129374	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	50129399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	50142544	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,3:18,0:23,12,3,0
chr3	50144951	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:3,6:2,14:2,3,11,9
chr3	50148192	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:7,0:19,4:11,15,0,4
chr3	50148305	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr3	50152879	.	TACAGTGGTG	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:11,2:20,0:15,20,1,1
chr3	50153048	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:8,8,0,2
chr3	50197097	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=88,115;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,9:4,9:3,3,14,4
chr3	50212512	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.312:27:9,4:8,4:7,12,5,3
chr3	50214174	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=64,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,0,2
chr3	50219676	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:7,0:0|1:50219676_C_A:50219676:12,3,1,1
chr3	50219680	.	CA	AG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,2:10,0:0|1:50219676_C_A:50219676:12,4,1,1
chr3	50220402	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,0,2
chr3	50221085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=109,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:7,1,6,0
chr3	50224050	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:9,0:15,5:14,10,0,5
chr3	50224225	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,6:0,5:1,2,1,10
chr3	50225154	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:8,6,1,1
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	50255749	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=99,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,0:11,3:0|1:50255749_T_C:50255749:8,12,1,2
chr3	50255752	.	T	TTTTTCCCAATGCCATCACCAGCCTAGTGGGCCTGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=99,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:0|1:50255749_T_C:50255749:8,12,1,2
chr3	50257637	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr3	50289635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr3	50290016	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=82,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,1:0,5,0,5
chr3	50294431	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:12,11,1,1
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=94,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	50310634	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	50310922	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:1,1,2,1
chr3	50311557	.	GT	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=244,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:50311557_GT_TC:50311557:0,3,0,1
chr3	50311562	.	C	CCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=244,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50311557_GT_TC:50311557:0,3,0,1
chr3	50311563	.	T	TGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=244,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50311557_GT_TC:50311557:0,3,0,1
chr3	50316689	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,1:0|1:50316689_C_T:50316689:2,11,0,2
chr3	50316714	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:50316689_C_T:50316689:1,10,0,2
chr3	50324662	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=15,12;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:50324662_T_G:50324662:1,3,0,1
chr3	50324664	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,12;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:50324662_T_G:50324662:1,3,0,1
chr3	50324666	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,12;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:50324662_T_G:50324662:1,3,0,1
chr3	50324670	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:50324662_T_G:50324662:1,3,0,1
chr3	50324677	.	G	GCC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:0,0:0|1:50324662_T_G:50324662:1,3,0,1
chr3	50324681	.	A	AGGGGGAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=195,1249;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,1,0
chr3	50327110	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=73,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,1:14,2:11,11,1,2
chr3	50339622	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,7:2,4:3,3,2,9
chr3	50340321	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,0:14,7:10,15,0,7
chr3	50357653	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.092:51:20,4:27,0:27,20,2,2
chr3	50368955	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	50378010	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr3	50379256	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr3	50380058	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:50380058_G_C:50380058:1,3,0,1
chr3	50380059	.	C	CTCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:50380058_G_C:50380058:1,3,0,1
chr3	50380426	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:23,2:14,2:19,19,2,2
chr3	50385305	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,0:15,3:12,13,2,1
chr3	50413040	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=152,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50413040_A_C:50413040:0,2,1,0
chr3	50413044	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:50413040_A_C:50413040:1,2,1,0
chr3	50413047	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:50413040_A_C:50413040:1,2,1,0
chr3	50413053	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=112,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:50413040_A_C:50413040:1,3,1,0
chr3	50415316	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:1,4,5,0
chr3	50418584	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50418584_G_C:50418584:1,0,0,1
chr3	50418587	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50418584_G_C:50418584:1,0,0,1
chr3	50418588	.	G	GGCGCGATCATGGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50418584_G_C:50418584:1,0,0,1
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,13,5
chr3	50614488	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=79,89;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:12,7:11,0:13,11,6,1
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,8,9
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr3	50683227	.	T	TGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:5,1:8,1:0|1:50683227_T_TGC:50683227:7,7,2,0
chr3	50683232	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:3,1:5,1:0|1:50683227_T_TGC:50683227:7,7,2,0
chr3	50683256	.	TTACCCCCACTGTGAGCCCTCAGGACCACTTCTGTCCCCC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:3,2:1,7,1,1
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,17,2
chr3	50685452	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:50685452_C_T:50685452:6,13,1,1
chr3	50685456	.	A	ACT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=105,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:11,1:0|1:50685452_C_T:50685452:6,13,1,1
chr3	50685553	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50685553_GG_AA:50685553:0,2,0,1
chr3	50685574	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50685553_GG_AA:50685553:0,0,0,1
chr3	50971440	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,4:14,0:8,15,4,0
chr3	51246360	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=88,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:3,2:0,8:1,2,7,3
chr3	51284160	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:12,3:5,0:6,11,1,2
chr3	51367743	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=90,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51367743_C_T:51367743:0,1,0,1
chr3	51367744	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=90,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51367743_C_T:51367743:0,1,0,1
chr3	51367748	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=90,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:51367743_C_T:51367743:0,1,0,1
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr3	51394624	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=94,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51394624_G_T:51394624:0,2,0,1
chr3	51394626	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=94,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51394624_G_T:51394624:0,2,0,1
chr3	51394628	.	CA	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=94,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51394624_G_T:51394624:0,2,0,1
chr3	51411954	.	TGCCCACATACCGGGACC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:9,2:11,8,1,1
chr3	51418636	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=43,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,1:2,5:5,1,3,3
chr3	51422766	.	G	GGAGGAGGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGGAGGAT;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.830:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr3	51430637	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:11,0:14,2:0|1:51430637_C_T:51430637:14,11,1,1
chr3	51430646	.	A	ATTG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,2:0|1:51430637_C_T:51430637:5,9,1,1
chr3	51430647	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,2:0|1:51430637_C_T:51430637:5,9,1,1
chr3	51432654	.	C	CCCCAAATAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=75,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,1:7,1:6,15,0,2
chr3	51456076	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51456076_G_C:51456076:0,0,1,0
chr3	51456079	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51456076_G_C:51456076:0,0,1,0
chr3	51457974	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr3	51467480	.	CTCACCAAGT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,0:9,2:21,5,1,1
chr3	51497244	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,0:2,4:2,4,1,3
chr3	51517684	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:12,2,2,0
chr3	51624505	.	AGAG	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=83,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GAG;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:9,0:8,3:14,12,2,1
chr3	51624549	.	G	GAATTACTGTGTAATGGGTAT	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=89,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,2:0.052:55:22,2:19,0:24,29,1,1
chr3	51624640	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=79,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,3:3,0:1,8,1,2
chr3	51672289	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=111,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,2:10,1:12,8,3,0
chr3	51677927	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,2:8,1:7,12,0,3
chr3	51690069	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:14,2:0|1:51690069_C_T:51690069:6,15,1,1
chr3	51690078	.	T	TCATC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:51690069_C_T:51690069:7,12,1,1
chr3	51697476	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	51718683	.	GACA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=189,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:51718683_GACA_G:51718683:2,3,1,1
chr3	51718689	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=189,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:51718683_GACA_G:51718683:2,3,1,1
chr3	51733560	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:10,5:2,0:7,5,5,0
chr3	51812953	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:9,8:3,5:0,12,4,9
chr3	51864882	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51864882_C_CA:51864882:0,1,0,1
chr3	51864884	.	C	CCGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51864882_C_CA:51864882:0,1,0,1
chr3	51864886	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51864882_C_CA:51864882:0,1,0,1
chr3	51895769	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,6:4,0:0|1:51895769_C_A:51895769:5,5,6,0
chr3	51895772	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,6:4,0:0|1:51895769_C_A:51895769:5,5,6,0
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,14:0,0,13,7
chr3	51908012	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:51908012_C_T:51908012:8,6,1,1
chr3	51908021	.	TCCTCCG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:51908012_C_T:51908012:7,5,1,1
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,13:0,0,6,15
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr3	51970296	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,1:10,6:6,8,4,3
chr3	51970349	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=107,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:51970349_C_T:51970349:11,12,1,1
chr3	51970364	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=98,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:0|1:51970349_C_T:51970349:9,10,1,1
chr3	51970365	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=98,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:51970349_C_T:51970349:9,10,1,1
chr3	51970369	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:51970349_C_T:51970349:8,8,1,1
chr3	51970605	.	T	TATCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,23;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:0,0:0,3,0,1
chr3	51971298	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:5,3:12,4:9,8,4,4
chr3	51978062	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,0:0,0:0|1:51978062_T_A:51978062:0,0,1,0
chr3	51978070	.	CAGCCAGCCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=70,256;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:1,0:0|1:51978062_T_A:51978062:2,1,1,0
chr3	51978571	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,154;MMQ=60,21;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,0:4,6:2,6,0,6
chr3	51981961	.	AGGGGCTGGGACATTTTCAGGGAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.722:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	51982503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:1,9,1,1
chr3	51990315	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	51991116	.	CAA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,2:7,0:7,9,1,1
chr3	51992976	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,86;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:9,3:9,13,1,2
chr3	51993207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr3	51994724	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=237,139;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr3	52004036	.	AGCCAGGGGCCGTGAGGAAGGGCAGGGAGTACATGCCACTCAGTGATGGACTGATCACAACCGGGGGGCCCAGCTCCAAGGCATCCACCACAGCCGCCAGGAAGCT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,6:0.047:67:10,4:10,2:30,31,3,3
chr3	52029444	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:16,1:24,1:18,23,1,1
chr3	52109841	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr3	52130771	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52130771_T_G:52130771:0,1,0,1
chr3	52130773	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52130771_T_G:52130771:0,1,0,1
chr3	52188308	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,2:5,1:8,4,3,0
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=78,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,21:0.276:76:24,9:31,11:19,36,9,12
chr3	52237910	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:18,2:14,0:15,18,1,1
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=225,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=260,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr3	52239866	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:17,3:28,1:33,14,3,1
chr3	52256085	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:52256085_C_T:52256085:10,9,1,1
chr3	52256086	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:0|1:52256085_C_T:52256085:10,9,1,1
chr3	52256697	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:3,1:5,4:3,6,2,3
chr3	52257439	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:0|1:52257439_C_T:52257439:3,7,0,2
chr3	52257445	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:52257439_C_T:52257439:3,8,0,2
chr3	52257640	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:0|1:52257640_C_CA:52257640:10,13,0,2
chr3	52257643	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,1:10,1:0|1:52257640_C_CA:52257640:10,13,0,2
chr3	52257913	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=97,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:7,0:19,4:21,6,0,4
chr3	52259475	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:8,6,0,5
chr3	52265933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:5,4,1,1
chr3	52265952	.	G	GTGCCTGTAACATA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=83,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:20,0:6,1:19,8,1,1
chr3	52282601	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=82,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,8:6,0:10,4,8,0
chr3	52282615	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=78,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:16,8:12,0:22,6,9,0
chr3	52282631	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:27,5:13,0:33,8,5,0
chr3	52283767	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:13,3:2,0:10,5,1,2
chr3	52294415	.	G	A	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,4:0.046:105:40,1:59,3:35,66,2,2
chr3	52324924	.	GGGAGGAGAGGAGTCCACCCCATCTCTTGCGTGCTGACCTTTCCCTCCCCAGGGAGATGCTGCTGAAGCCACATAGCCGTGTCCAGGTATTCGAGGGTGC	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=104,39;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:2,0:2,2:19,14,1,1
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,3:6,5:6,7,3,5
chr3	52327048	.	TCTGCTGCCTCCAGGGTGGGGCACAC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:4,2:10,5,0,2
chr3	52357874	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:8,0:7,2:5,10,1,1
chr3	52366244	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr3	52384536	.	AAGGTCATGGATGACTACC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=113,39;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,0:8,2:10,9,2,0
chr3	52386802	.	C	CCCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=239,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52386802_C_CCCCT:52386802:0,1,0,1
chr3	52386804	.	G	GTACAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=239,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52386802_C_CCCCT:52386802:0,1,0,1
chr3	52390645	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr3	52404728	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=113,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr3	52412697	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,0;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:4,0:13,0:0|1:52412697_G_C:52412697:8,10,3,0
chr3	52412704	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=123,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:4,3:16,0:0|1:52412697_G_C:52412697:7,13,3,0
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	52425030	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=78,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.211:36:5,0:24,7:19,10,0,7
chr3	52429117	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52429117_T_C:52429117:0,1,0,1
chr3	52429124	.	CCTGGGT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52429117_T_C:52429117:0,1,0,1
chr3	52429135	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=284,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:52429117_T_C:52429117:0,1,0,1
chr3	52429137	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=284,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52429117_T_C:52429117:0,1,0,1
chr3	52429141	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=284,90;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52429117_T_C:52429117:0,1,0,1
chr3	52438553	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.814:20:1,6:2,6:2,1,8,9
chr3	52442134	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:17,1:15,1:5,27,0,2
chr3	52442520	.	A	AT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.094:62:35,5:21,0:28,29,5,0
chr3	52443467	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,0:0,7:5,0,7,0
chr3	52448051	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:3,5:1,5:3,1,5,6
chr3	52456973	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr3	52456983	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr3	52471942	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	52474618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=169,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:52474618_G_A:52474618:1,3,1,1
chr3	52474620	.	G	GACAGGGGCCCATCGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=169,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:52474618_G_A:52474618:1,3,1,1
chr3	52478896	.	A	ATAAAATAACCCTCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:0|1:52478896_A_ATAAAATAACCCTCT:52478896:5,7,1,1
chr3	52478898	.	G	GGGTAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:4,0:0|1:52478896_A_ATAAAATAACCCTCT:52478896:5,7,1,1
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,8,2
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,3,12
chr3	52507719	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr3	52512490	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:11,0:11,6:9,13,6,0
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	52521455	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.069:56:21,2:30,2:35,17,2,2
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52536308	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,329;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr3	52538893	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:12,4:8,0:9,11,0,4
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	52548206	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:52548206_G_C:52548206:7,4,1,1
chr3	52548213	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:52548206_G_C:52548206:7,5,1,1
chr3	52548215	.	A	AGCCGTCTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:52548206_G_C:52548206:7,5,1,1
chr3	52548216	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:52548206_G_C:52548206:7,5,1,1
chr3	52548808	.	C	CGGCTCTATCCTGAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,1,1
chr3	52548818	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=106,180;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,2,0
chr3	52548928	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:52548928_G_A:52548928:5,1,1,1
chr3	52548930	.	A	ACACC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:52548928_G_A:52548928:5,1,1,1
chr3	52549145	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=192,239;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr3	52549151	.	T	TAAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=222,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.373:5:2,1:2,0:0|1:52549151_T_TAAAC:52549151:0,4,0,1
chr3	52549153	.	G	GTCGCAGGTGCCAATACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=222,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.373:5:2,1:0,0:0|1:52549151_T_TAAAC:52549151:0,4,0,1
chr3	52551308	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,2:2,2:0,8,1,3
chr3	52555411	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,2:8,1:9,4,2,1
chr3	52555490	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:8,10,0,2
chr3	52555957	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=225,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,5:5,1:3,3,4,2
chr3	52556890	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,4:8,3:7,8,5,2
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=115,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:3,6,1,3
chr3	52558768	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:11,3:3,1:5,10,2,2
chr3	52558904	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:6,7,1,2
chr3	52559167	.	CGGGG	C,CGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,154,168;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,11;RU=G;STR;TLOD=8.03,5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.508,0.376:5:0,2,0:0,1,2:0,0,5,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:3,6,2,2
chr3	52581997	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52581997_C_T:52581997:0,0,1,0
chr3	52582006	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52581997_C_T:52581997:0,0,1,0
chr3	52582012	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=139,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:52581997_C_T:52581997:1,0,1,0
chr3	52582014	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,15;MFRL=139,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:52581997_C_T:52581997:1,0,1,0
chr3	52584715	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:7,4,1,2
chr3	52584787	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.491:14:2,3:5,4:4,3,4,3
chr3	52588640	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr3	52588756	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,2:5,0:0|1:52588756_C_T:52588756:10,11,1,1
chr3	52588762	.	G	GCCTGTTTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=150,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:4,0:0|1:52588756_C_T:52588756:10,10,1,1
chr3	52623180	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,0:8,2:8,9,0,2
chr3	52637486	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr3	52643307	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,2:9,2:7,6,3,1
chr3	52651593	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52651593_A_T:52651593:0,0,0,1
chr3	52651595	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52651593_A_T:52651593:0,0,0,1
chr3	52651596	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52651593_A_T:52651593:0,0,0,1
chr3	52658987	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:3,8,2,4
chr3	52685928	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=184,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52685928_G_A:52685928:0,1,0,1
chr3	52685931	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=184,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52685928_G_A:52685928:0,1,0,1
chr3	52692124	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=211,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr3	52712487	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:10,3,2,0
chr3	52720080	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:16,4:11,5:15,13,5,4
chr3	52721240	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:14,0:17,5:24,9,5,0
chr3	52721305	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.141:61:31,7:22,1:28,25,5,3
chr3	52727189	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:7,1,2,0
chr3	52728152	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:0|1:52728152_G_A:52728152:12,16,1,1
chr3	52728157	.	G	GTGAAACGCCTTCTC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,0:14,2:0|1:52728152_G_A:52728152:12,15,1,1
chr3	52728160	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=122,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:14,2:0|1:52728152_G_A:52728152:10,14,1,1
chr3	52740347	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52741650	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:15,4,2,0
chr3	52773529	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,2:15,0:10,17,0,2
chr3	52778347	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=174,132724484;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr3	52797634	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:4,2:4,3,0,2
chr3	52812490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=89,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:52812490_C_T:52812490:9,4,1,1
chr3	52812493	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=89,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:4,2:0|1:52812490_C_T:52812490:9,4,1,1
chr3	52813383	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,3:3,0:0|1:52813383_G_A:52813383:8,3,3,0
chr3	52813386	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,3:3,0:0|1:52813383_G_A:52813383:8,3,3,0
chr3	52817406	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=193,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:0|1:52817406_A_T:52817406:0,4,1,1
chr3	52817408	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=193,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:1,1:0|1:52817406_A_T:52817406:0,4,1,1
chr3	52817410	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=220,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:52817406_A_T:52817406:0,3,0,1
chr3	52821177	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:3,7,1,3
chr3	52821992	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.314:20:9,2:5,4:11,3,4,2
chr3	52834906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=70,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr3	52837793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr3	52837855	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=176,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:2,1:14,1:14,2,2,0
chr3	52852538	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:5,4:7,1:7,5,3,2
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	52853460	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.290:36:15,10:10,0:8,18,10,0
chr3	52854186	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr3	52857563	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,275;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	52864584	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:3,3:8,4:8,4,5,2
chr3	52864693	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:4,1:1,5:1,4,2,4
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,15,1
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=190,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:1,2:1,1:2,0,4,1
chr3	52867615	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:8,4,3,0
chr3	52867811	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,3,9
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,1,2
chr3	52874716	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	52876853	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:8,8,1,2
chr3	52877064	.	A	AAGTTCCTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=178,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:0|1:52877064_A_AAGTTCCTCT:52877064:0,5,1,1
chr3	52877067	.	T	TCGCAGCTCTTCCTCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=178,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:52877064_A_AAGTTCCTCT:52877064:0,5,1,1
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,2,0
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,2,0
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr3	52878792	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:6,1,4,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr3	52886605	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,1:12,2:13,3,2,1
chr3	52946644	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=78,88;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:8,13,3,0
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	53125922	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,8,7
chr3	53126143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	53138025	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=99,166;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.115:37:15,0:18,3:17,16,4,0
chr3	53138085	.	A	AG	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:20,0:18,5:21,17,0,5
chr3	53139644	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=78,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:3,7:10,5:9,4,7,5
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	53164356	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:18,3:26,1:23,21,1,3
chr3	53164526	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=223,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,3:6,3:1,6,3,3
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:7,0,6,0
chr3	53213815	.	CGT	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GT;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.273:21:7,4:3,2:2,13,1,5
chr3	53213836	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.230:22:9,3:5,2:2,15,0,5
chr3	53219058	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=159,27;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53219058_A_T:53219058:0,4,0,1
chr3	53219061	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,27;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53219058_A_T:53219058:0,4,0,1
chr3	53220060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:6,9,1,2
chr3	53220129	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=235,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,5:0,3:1,0,2,6
chr3	53220375	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=78,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,10:1,3:2,0,10,3
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	53223286	.	GCTGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr3	53223927	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr3	53224002	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,13:0,5:0,0,9,9
chr3	53260903	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=59,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:3,11:2,9:2,3,6,14
chr3	53262000	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,4,0
chr3	53262400	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,4:1,1:0,2,1,5
chr3	53262472	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,5,2
chr3	53264431	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	53264485	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:1,2,3,3
chr3	53265623	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=69,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr3	53267100	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr3	53267296	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,5:0,3:1,1,3,5
chr3	53267342	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=178,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr3	53269163	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:5,4:4,7:5,4,6,6
chr3	53269275	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=228.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,25:0,26:0,0,8,44
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=89,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:4,8:5,9:1,8,1,16
chr3	53326047	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=232,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:53326047_C_T:53326047:2,0,1,0
chr3	53326053	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=232,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:53326047_C_T:53326047:2,0,1,0
chr3	53326073	.	G	GGGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:53326073_G_GGGGC:53326073:0,0,2,0
chr3	53326077	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:53326073_G_GGGGC:53326073:0,0,2,0
chr3	53338281	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,1:12,1:9,16,0,2
chr3	53685003	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	53685039	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	53694384	.	G	A,GATTTCGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25,34;MFRL=216,114,221;MMQ=60,60,60;MPOS=5,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,1,1:0,1,0,2
chr3	53694386	.	G	GGAAACGGGATTACATATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	53694387	.	A	ATGGACTGAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=219,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	53700601	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53700601_GC_G:53700601:0,1,0,1
chr3	53700605	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53700601_GC_G:53700601:0,1,0,1
chr3	53758049	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,12:0,1:1,3,5,8
chr3	53766212	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,6:1,5:0,2,0,11
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=57,261;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,4,1
chr3	53810976	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,0:7,6:3,8,2,4
chr3	53820748	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53820748_G_C:53820748:1,0,1,0
chr3	53820753	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53820748_G_C:53820748:1,0,1,0
chr3	53820755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53820748_G_C:53820748:1,0,1,0
chr3	53820756	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53820748_G_C:53820748:1,0,1,0
chr3	53820762	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:53820748_G_C:53820748:1,0,1,0
chr3	53821064	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53821064_G_T:53821064:0,1,0,1
chr3	53821065	.	T	TCTTGGCCCTTCCTGAATCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53821064_G_T:53821064:0,1,0,1
chr3	53834487	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=189,195;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:0,2,0,6
chr3	53835292	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=96,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:9,3:17,0:12,14,3,0
chr3	53836226	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,0:14,3:11,15,0,3
chr3	53839187	.	T	TAGTATCTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=213,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:53839187_T_TAGTATCTAA:53839187:0,3,0,1
chr3	53839190	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=213,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:53839187_T_TAGTATCTAA:53839187:0,3,0,1
chr3	53851860	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:2,3,1,2
chr3	53852954	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=85,0;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:10,9,0,2
chr3	53855631	.	G	GTAGGTGAAGAGCGATTATATGTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:4,1,1,1
chr3	53855828	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0|1:53855828_T_A:53855828:1,2,2,2
chr3	53855832	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.564:7:2,0:1,4:0|1:53855828_T_A:53855828:1,2,2,2
chr3	53855853	.	GACTC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=216,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53855853_GACTC_G:53855853:0,2,0,1
chr3	53855860	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=216,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53855853_GACTC_G:53855853:0,2,0,1
chr3	53855864	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=216,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53855853_GACTC_G:53855853:0,2,0,1
chr3	53855866	.	GCGCCC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=200,136;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:53855853_GACTC_G:53855853:0,3,0,1
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=207,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,8:0,10:0,1,12,6
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=64,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:2,11:0,5:1,1,13,4
chr3	53883876	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=155,304;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,0:4,8:2,5,0,8
chr3	53883910	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=223,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	53899003	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:4,1:14,2:9,9,1,2
chr3	54420733	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.755:13:0,10:2,0:1,2,10,0
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:2,4:1,2:3,0,3,3
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	54615971	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr3	54905507	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	54905584	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:1,5:7,0:7,1,5,0
chr3	54913354	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=88,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.627:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr3	54919185	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr3	54919480	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=321,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:1,1,6,4
chr3	54921903	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	54930699	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr3	54930794	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:4,6:2,11:3,3,10,7
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:0,6,0,3
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr3	55041696	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	55514766	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:2,8:1,15:2,1,13,10
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,8:0,0,18,8
chr3	55733477	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=86,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:11,0:9,2:0|1:55733477_G_A:55733477:8,12,1,1
chr3	55733478	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=83,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:55733477_G_A:55733477:7,12,1,1
chr3	55733495	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=83,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:8,2:8,0:7,10,1,1
chr3	55922617	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:3,1:0|1:55922617_A_C:55922617:1,6,0,2
chr3	55922618	.	T	TTCCTTGCTTTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:55922617_A_C:55922617:1,6,0,2
chr3	56052839	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr3	56468580	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:8,7,1,1
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,3:1,7:1,0,7,3
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=17,23;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.838:15:1,3:0,4:2,0,9,4
chr3	56592876	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,4:14,0:19,13,2,2
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0,0,19,10
chr3	56593638	.	TTGACC	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGACC;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:25,0:18,2:21,22,1,1
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=70.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,5,17
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	56597954	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,21:0,0,15,19
chr3	56600531	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	56601175	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,164;MMQ=36,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	56605404	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.923:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	56627598	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,11,12
chr3	56628031	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,8:0,18:0,0,13,13
chr3	56649220	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=118,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.080:59:33,4:22,0:29,26,4,0
chr3	56680994	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,3:15,0:15,11,3,0
chr3	56763362	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=88,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:8,8,4,0
chr3	56787485	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.216:17:8,2:6,1:7,7,0,3
chr3	56807854	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.419:13:3,0:4,5:1,7,0,5
chr3	56808956	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:4,3:7,0,2,1
chr3	56808994	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:8,4:16,0:10,14,4,0
chr3	57130591	.	G	GAAGCAGAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	57131529	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	57132263	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,120;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.203:26:17,4:4,0:12,9,0,5
chr3	57135130	.	AGAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=75,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr3	57135366	.	T	TGTTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:2,9,1,1
chr3	57137026	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr3	57137198	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=158,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.238:17:6,1:7,3:2,11,2,2
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,13,11
chr3	57148632	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr3	57154340	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=87,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,0:8,3:4,8,1,2
chr3	57154459	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=304,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57154459_GGA_G:57154459:0,1,0,1
chr3	57154463	.	A	AGGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=304,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57154459_GGA_G:57154459:0,1,0,1
chr3	57264807	.	G	GT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=98,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.081:49:27,0:17,3:25,21,2,1
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:0,2,1,7
chr3	57276258	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr3	57292954	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=87,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr3	57293835	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,2:4,0:7,1,2,0
chr3	57293887	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:16,2:6,2:12,11,4,0
chr3	57294085	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.752:26:4,8:2,12:2,4,7,13
chr3	57294884	.	CAAATT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATT;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	57301899	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,181;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:57301899_G_C:57301899:0,5,0,2
chr3	57301901	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=167,181;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0|1:57301899_G_C:57301899:0,5,0,2
chr3	57310795	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr3	57327763	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr3	57331098	.	G	GGATATTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57331098_G_GGATATTT:57331098:0,3,0,1
chr3	57331100	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57331098_G_GGATATTT:57331098:0,3,0,1
chr3	57331103	.	T	TAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57331098_G_GGATATTT:57331098:0,3,0,1
chr3	57331105	.	T	TCATACAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:57331098_G_GGATATTT:57331098:0,3,0,1
chr3	57348685	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,2:5,1:1,8,0,4
chr3	57357428	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:4,1,3,0
chr3	57388037	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.708:11:2,6:1,2:3,0,7,1
chr3	57394309	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,0,12
chr3	57401172	.	G	GGATTACAGGCATGAGCCACCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=75,685;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,1:0|1:57401172_G_GGATTACAGGCATGAGCCACCA:57401172:6,11,2,0
chr3	57401174	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=75,685;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,1:0|1:57401172_G_GGATTACAGGCATGAGCCACCA:57401172:6,11,2,0
chr3	57401176	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=75,685;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:57401172_G_GGATTACAGGCATGAGCCACCA:57401172:6,11,2,0
chr3	57414200	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=100,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,3:7,2:5,12,1,4
chr3	57419497	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=61,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:3,6:0,9:2,1,5,11
chr3	57422765	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:5,0:10,9:6,9,0,9
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr3	57431721	.	AAAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAAT;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr3	57431740	.	ATAAATAAATAAT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.577:12:4,3:1,3:5,0,6,1
chr3	57431955	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=83,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,0:7,4:5,10,0,4
chr3	57431985	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,3,8
chr3	57431994	.	AAAACTAAGGACAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:6,4,5,5
chr3	57445508	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:2,2,0,3
chr3	57454541	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=74,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:10,0:1,3:6,6,2,1
chr3	57456093	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,1:1,0,6,0
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,4:2,0,2,4
chr3	57458466	.	CC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:57458466_CC_AG:57458466:0,4,0,1
chr3	57458470	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:57458466_CC_AG:57458466:0,4,0,1
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=96,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=97,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:5,4,8,0
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	57489714	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr3	57582718	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=A;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	57613887	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,3,13
chr3	57632004	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:4,1:8,2:10,2,2,1
chr3	57817093	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=167,124;MMQ=33,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:5,3:14,0:19,0,3,0
chr3	57846577	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:14,1:9,2:4,20,0,3
chr3	58063092	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58063092_C_T:58063092:0,1,0,1
chr3	58063094	.	A	ATTTCTTCTCTCCTGGGTCCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58063092_C_T:58063092:0,1,0,1
chr3	58064521	.	G	GGGCT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,29;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:0|1:58064521_G_GGGCT:58064521:1,7,1,1
chr3	58064522	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,29;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:0|1:58064521_G_GGGCT:58064521:1,7,1,1
chr3	58067574	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:4,15:2,0:1,5,0,15
chr3	58089594	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
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chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr3	58090909	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,308;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:12,3:20,0:11,22,0,3
chr3	58092346	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:3,1,5,2
chr3	58109430	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=9,28;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr3	58109476	.	AC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=207,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:58109476_AC_GG:58109476:0,2,0,1
chr3	58109478	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=207,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:58109476_AC_GG:58109476:0,2,0,1
chr3	58120592	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	58127679	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr3	58132808	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	58140525	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=96,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.239:27:12,5:9,1:13,8,3,3
chr3	58140567	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,3:10,0:6,13,0,3
chr3	58141649	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,8:1,0,3,7
chr3	58155562	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	58156400	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,144;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,0:12,3:18,12,3,0
chr3	58179172	.	A	AAGATGAGTTAGCTTGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,3:6,3:9,7,1,5
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=256,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,2:1,4:1,0,3,3
chr3	58296208	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.642:21:4,6:2,6:0|1:58296208_A_T:58296208:4,4,6,7
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.643:21:6,6:2,7:0|1:58296208_A_T:58296208:4,4,6,7
chr3	58302404	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	58302586	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,6:0,1:2,0,6,1
chr3	58303249	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr3	58351660	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=23,19,20,33;MFRL=161,131,100,122;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,17,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.01,5.74,7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,4,5,8:0.139,0.243,0.297:25:4,1,1,6:4,0,2,0:4,4,6,11
chr3	58355273	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0,4,0,6
chr3	58355310	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=210,139;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr3	58381287	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	58383275	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=134,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,4:0,6:3,1,8,2
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	58389564	.	TTTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=206,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:4,2:9,2,1,1
chr3	58394835	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	58395891	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=109,62;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:2,6,0,4
chr3	58398730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,2,2
chr3	58410431	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,5:3,8:6,0,6,7
chr3	58415567	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,4:3,8:2,2,5,7
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr3	58494546	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	58517422	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:9,4,1,1
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr3	58553160	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	58555343	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:3,0,5,1
chr3	58555442	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,3:6,0:6,5,2,1
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	58622058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,0,1
chr3	58622222	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58622222_G_A:58622222:0,1,0,1
chr3	58622224	.	C	CCCCCGGGGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58622222_G_A:58622222:0,1,0,1
chr3	58622225	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58622222_G_A:58622222:0,1,0,1
chr3	58625975	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=227,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,0:1,0,3,0
chr3	58631407	.	GGAGA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:10,2:2,0:0|1:58631407_GGAGA_G:58631407:0,12,0,2
chr3	58631415	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=165,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:2,0:0|1:58631407_GGAGA_G:58631407:0,12,0,2
chr3	58635197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	58728323	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:3,0:3,0:0|1:58728323_C_G:58728323:3,3,1,1
chr3	58728333	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:1,1:2,0:0|1:58728323_C_G:58728323:3,1,1,1
chr3	58728341	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58728323_C_G:58728323:1,2,0,1
chr3	58728351	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:58728323_C_G:58728323:1,3,0,1
chr3	58855098	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:9,0:2,3:6,6,3,0
chr3	58899659	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=61,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0|1:58899659_T_C:58899659:0,2,0,1
chr3	58899665	.	C	CATTTTAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=61,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:58899659_T_C:58899659:0,2,0,1
chr3	58899669	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=61,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:58899659_T_C:58899659:0,2,0,1
chr3	59738123	.	G	GCGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=122,274;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59738123_G_GCGCT:59738123:0,1,0,1
chr3	59738124	.	G	GCGCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=274,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	59738125	.	A	ACTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=122,274;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59738123_G_GCGCT:59738123:0,1,0,1
chr3	59738126	.	G	GGGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=122,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:59738123_G_GCGCT:59738123:0,1,0,1
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=77,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:2,2,2,0
chr3	60522571	.	C	A,CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25,32;MFRL=101,67,99;MMQ=60,60,60;MPOS=3,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.78,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,3:0.307,0.249:15:2,1,2:2,3,0:3,4,5,3
chr3	60522588	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=75,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,3:10,0:11,9,0,3
chr3	61734539	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=205,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:0,18:1,15:1,0,18,15
chr3	61734709	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=172,71;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:0,9,1,2
chr3	62153605	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,6:1,0,8,3
chr3	62180792	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=91,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,3:5,1:12,5,2,2
chr3	62188930	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,72;MMQ=60,20;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:12,0:5,7:8,9,1,6
chr3	62204587	.	C	CCTAAAGAAGTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:11,10,1,1
chr3	62217067	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:62217067_A_T:62217067:0,2,0,1
chr3	62217068	.	T	TTCACCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:62217067_A_T:62217067:0,2,0,1
chr3	62253152	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=109,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:17,6:8,1:13,13,0,7
chr3	62259586	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=291,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62259586_GT_G:62259586:0,3,0,1
chr3	62259597	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=29366957,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:62259586_GT_G:62259586:0,2,0,1
chr3	62259610	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:62259586_GT_G:62259586:0,2,0,1
chr3	62278265	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr3	62355666	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	62355908	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=112,125;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,1:16,3:14,15,1,3
chr3	62431387	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=82,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.473:10:2,2:1,1:3,2,3,2
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr3	62459828	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	62477869	.	TGTCAAGCCTGTAGTCTGCTTGGGATAAAGACATCTTAGTGATCTGTTTATCTGCACACTACTTAGGAAAGTCAAACA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,262;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.194:18:4,4:1,0:8,5,5,0
chr3	62484775	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,59;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,6:5,0:10,2,6,0
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=185,207;MMQ=54,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=142.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,53:0.720:73:19,40:1,13:17,3,43,10
chr3	62535605	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:16,4:5,0:15,6,2,2
chr3	62543239	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	62631605	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=215,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:62631605_A_AG:62631605:0,1,0,1
chr3	62631607	.	A	AATAACAGGCTGTATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=215,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:62631605_A_AG:62631605:0,1,0,1
chr3	62631612	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:62631605_A_AG:62631605:0,0,0,1
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr3	62739515	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=202,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr3	62860206	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	63264148	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=91,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:6,2:7,0:6,9,1,1
chr3	63264201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=218,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,6:1,6:1,2,8,4
chr3	63264316	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:3,2:3,3:3,4,3,3
chr3	63264492	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	63466585	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=80,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:4,4,1,2
chr3	63638373	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,1,1
chr3	63638426	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=112,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:63638426_T_C:63638426:11,8,1,1
chr3	63638431	.	C	CATCTCCCA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:16,2:0|1:63638426_T_C:63638426:13,9,1,1
chr3	63638433	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:15,2:0|1:63638426_T_C:63638426:13,9,1,1
chr3	63640583	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	63649611	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:10,2:17,0:15,12,1,1
chr3	63649621	.	A	AAGGATCTCTCTGT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,2:22,0:16,16,1,1
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr3	63898360	.	GGCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GCA;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.620:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	63975819	.	A	ATCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCTG;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,2,1
chr3	63981635	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.587:25:8,8:2,5:3,7,3,12
chr3	63982082	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,34:0.796:42:3,17:5,17:3,5,17,17
chr3	63985289	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=87,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:5,2:2,6,1,1
chr3	63985296	.	A	ATTTG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=187,84;MMQ=60,60;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,1:1,1:0|1:63985296_A_ATTTG:63985296:0,3,0,2
chr3	63985297	.	CGAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=187,84;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:63985296_A_ATTTG:63985296:0,3,0,2
chr3	63985310	.	GAAGC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=84,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:63985310_GAAGC_G:63985310:0,2,0,1
chr3	63985319	.	TC	GT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63985310_GAAGC_G:63985310:0,0,0,1
chr3	63996607	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:2,11,1,2
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	64004330	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.084:34:15,0:15,2:0|1:64004330_C_T:64004330:19,13,1,1
chr3	64004352	.	A	AAAT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=68,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:64004330_C_T:64004330:6,13,1,1
chr3	64004409	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:3,2:2,3,1,4
chr3	64133350	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,13:0,0,11,10
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,0,21
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr3	64527066	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0|1:64527066_CAG_C:64527066:2,2,1,1
chr3	64527071	.	TGC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:64527066_CAG_C:64527066:2,2,1,1
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	64532509	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,33;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,2:17,0:0|1:64532509_C_T:64532509:16,13,1,1
chr3	64532518	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=122,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:15,0:0|1:64532509_C_T:64532509:14,11,1,1
chr3	64554254	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr3	64579998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,2:11,1:14,9,3,0
chr3	64580169	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,4:3,1:0,7,0,5
chr3	64582619	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:13,2:0|1:64582619_G_T:64582619:12,16,1,1
chr3	64582625	.	CAACA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:14,2:0|1:64582619_G_T:64582619:11,18,1,1
chr3	64589851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr3	64592826	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592826_T_A:64592826:0,1,0,1
chr3	64592827	.	T	TAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592826_T_A:64592826:0,1,0,1
chr3	64601098	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:0|1:64601098_C_T:64601098:12,12,2,1
chr3	64601118	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:15,2:0|1:64601098_C_T:64601098:10,13,1,1
chr3	64601120	.	A	ATATTTTTTCCTAAAATTTT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,0:14,2:0|1:64601098_C_T:64601098:10,13,1,1
chr3	64601550	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr3	64608121	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=81,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:11,12,0,2
chr3	64617042	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	64617070	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr3	64617423	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	64617690	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:64617690_A_G:64617690:0,0,0,2
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:64617690_A_G:64617690:0,0,0,2
chr3	64667059	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,5:2,3:1,3,3,6
chr3	65344850	.	C	CTTTGGGAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=51,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:65344850_C_CTTTGGGAGG:65344850:0,2,0,1
chr3	65344851	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=51,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:65344850_C_CTTTGGGAGG:65344850:0,2,0,1
chr3	65344856	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=51,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:65344850_C_CTTTGGGAGG:65344850:0,2,0,1
chr3	65350570	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,53;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.159:42:14,0:21,6:16,20,0,6
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	65415692	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,2:3,1:5,5,1,2
chr3	65425560	.	TCTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CTG;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,1:8,0,1,1
chr3	65438890	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:6,9,3,0
chr3	65464522	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,4:0,0,1,7
chr3	65607592	.	T	TCACACACACA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=15,26;MFRL=82,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,17;RU=CA;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.784:16:1,2:0,2:2,1,11,2
chr3	65607621	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=88,96;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.068:53:13,0:26,0:19,30,4,0
chr3	65607637	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=42,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=143.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,54:0.918:58:1,16:3,34:0,4,23,31
chr3	66023592	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	66293688	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,11:0,5:1,1,9,7
chr3	66396898	.	G	GAAGAGTAGA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGAGTAGA;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,1:1,4:0,6,0,5
chr3	66421882	.	C	CACAAATAAGTTTCTGAGAATGCTTCCGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr3	66428188	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,1:6,3:6,10,1,3
chr3	66430972	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:3,4,2,0
chr3	66432680	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=33,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,7,1
chr3	66433312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	66434372	.	T	TCA,TCACACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24,21;MFRL=0,37,93;MMQ=60,60,60;MPOS=17,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,15;RU=CA;STR;TLOD=8.68,5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.475,0.455:8:0,2,1:0,1,2:0,0,6,2
chr3	66444697	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:1,4,1,6
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,8,5
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	66465563	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	67548701	.	T	TAGAGG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:0|1:67548701_T_TAGAGG:67548701:0,3,1,1
chr3	67548702	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:0|1:67548701_T_TAGAGG:67548701:0,3,1,1
chr3	67548704	.	G	T,GATGCTAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,26,31;MFRL=191,115,60;MMQ=60,57,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.375:5:0,1,1:2,0,0:0,2,1,2
chr3	67548706	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=138,115;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:67548706_A_AC:67548706:0,3,0,1
chr3	67548707	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=138,115;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:67548706_A_AC:67548706:0,3,0,1
chr3	67559216	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=95,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,2:7,1:9,11,3,0
chr3	67571139	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	67659817	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:6,1,3,0
chr3	67660040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0|1:67660040_G_A:67660040:0,3,1,2
chr3	67660049	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0|1:67660040_G_A:67660040:0,3,1,2
chr3	68782213	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr3	68801921	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr3	69036707	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:3,6:1,3,1,6
chr3	69059081	.	CAACA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=196,94;MMQ=50,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr3	69059084	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=94,196;MMQ=57,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.480:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr3	69059094	.	A	AAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=188,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr3	69079117	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:8,0:5,3:9,4,1,2
chr3	69097302	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:19,0:21,4:18,22,1,3
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=121.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,15:0,28:0,0,12,31
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,0,23
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,12,5
chr3	69127133	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	69129397	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:3,0:2,2:5,1,0,3
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,16,9
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,15,4
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,18,10
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	69351460	.	AAG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:3,3:6,13:7,3,10,6
chr3	69362706	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr3	69812981	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:12,2:4,0:0|1:69812981_C_A:69812981:12,5,3,0
chr3	69812985	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:0|1:69812981_C_A:69812981:12,5,3,0
chr3	69988438	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0,10,0,3
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,12:0,0,10,6
chr3	71090738	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71090738_CAAA_C:71090738:0,1,0,1
chr3	71090746	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71090738_CAAA_C:71090738:0,1,0,1
chr3	71247257	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,3:3,5:0,3,4,4
chr3	71247304	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	71745577	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,9:3,4:2,4,9,4
chr3	71748808	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:0|1:71748808_T_C:71748808:5,6,1,1
chr3	71748811	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=90,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:71748808_T_C:71748808:4,6,1,1
chr3	71748814	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:71748808_T_C:71748808:3,6,1,1
chr3	71748815	.	CAGG	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:71748808_T_C:71748808:3,6,1,1
chr3	71748820	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=90,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:71748808_T_C:71748808:3,5,1,1
chr3	72428551	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:21,0:10,3:6,25,0,3
chr3	72495593	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,0:5,3:2,4,0,4
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=42,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,46:0.940:48:2,23:0,22:1,1,18,28
chr3	72495778	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=90,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:23,2:21,0:0|1:72495778_G_A:72495778:18,28,1,1
chr3	72495779	.	AGG	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=90,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:21,2:20,0:0|1:72495778_G_A:72495778:18,28,1,1
chr3	72495783	.	G	GTGC	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=91,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:21,2:19,0:0|1:72495778_G_A:72495778:18,26,1,1
chr3	72800057	.	CTTCCAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:72800057_CTTCCAAA_C:72800057:0,2,0,1
chr3	72800066	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=236,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72800057_CTTCCAAA_C:72800057:0,1,0,1
chr3	72800069	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=236,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72800057_CTTCCAAA_C:72800057:0,1,0,1
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.968:25:0,9:0,16:0,0,8,17
chr3	73112378	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.195:44:17,1:18,7:19,17,5,3
chr3	73112469	.	TAAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=9,26;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.514:4:0,1:0,1:0,2,0,2
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,3:4,4:4,9,2,5
chr3	73113916	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr3	73114903	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=450,169;MMQ=44,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,1,0,1
chr3	73114905	.	CATA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=450,169;MMQ=44,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,1,0,1
chr3	73114910	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=450,169;MMQ=44,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,1,0,1
chr3	73114913	.	TCTG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=450,169;MMQ=44,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,1,0,1
chr3	73114919	.	TTTAACA	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,0,0,1
chr3	73114928	.	GTAT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73114903_T_C:73114903:0,0,0,1
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chr3	73433272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:6,2,2,1
chr3	73434086	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,13:0,4:0,0,10,7
chr3	73440108	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=115,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.482:8:4,1:0,2:4,0,4,0
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:2,6,1,5
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr3	74334590	.	A	ATT	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:9,0:16,1:0|1:74334590_A_ATT:74334590:7,18,1,1
chr3	74334592	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:14,2:0|1:74334590_A_ATT:74334590:7,18,1,1
chr3	74334596	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:74334590_A_ATT:74334590:5,18,1,1
chr3	74334602	.	CTGG	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:14,2:0|1:74334590_A_ATT:74334590:5,19,1,1
chr3	74334607	.	T	TAC	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:74334590_A_ATT:74334590:5,16,1,1
chr3	74334608	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=80,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:74334590_A_ATT:74334590:5,16,1,1
chr3	74347107	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:10,0:1,3:7,4,2,1
chr3	74347386	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:4,4,0,2
chr3	74350620	.	A	AAGGAATATT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:74350620_A_AAGGAATATT:74350620:2,2,1,1
chr3	74350621	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=102,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:3,0:0|1:74350620_A_AAGGAATATT:74350620:2,3,1,1
chr3	74350623	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=102,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:74350620_A_AAGGAATATT:74350620:2,3,1,1
chr3	74474166	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr3	75679820	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=206,211;MMQ=47,26;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,6:2,6:3,0,11,1
chr3	75679824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=32,26;MFRL=210,206;MMQ=25,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:6,1:0|1:75679824_G_T:75679824:12,1,2,0
chr3	75679833	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=31,23;MFRL=208,203;MMQ=34,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,3:3,5:0|1:75679833_C_T:75679833:8,2,8,0
chr3	75679836	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=30,25;MFRL=207,206;MMQ=25,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:75679824_G_T:75679824:14,2,2,0
chr3	75679843	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=206,203;MMQ=31,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,2:3,5:0|1:75679833_C_T:75679833:7,2,8,0
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=203,164;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:7,1,1,1
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=147,198;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:4,2,6,0
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=31,28;MFRL=156,145;MMQ=25,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:7,1:10,3:0|1:75679891_G_A:75679891:14,3,3,1
chr3	75679893	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=32,23;MFRL=152,154;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:4,6:9,1,7,3
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=25,28;MFRL=154,145;MMQ=25,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:6,1:9,3:0|1:75679891_G_A:75679891:13,3,3,1
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=24;MBQ=27,29;MFRL=140,143;MMQ=25,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,13:0.298:45:14,6:16,7:0|1:75679930_A_C:75679930:26,6,7,6
chr3	75679937	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=24;MBQ=31,26;MFRL=136,146;MMQ=25,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,14:0.278:52:20,3:17,8:0|1:75679937_G_A:75679937:27,11,10,4
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=24;MBQ=23,30;MFRL=133,136;MMQ=25,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,13:0.254:53:19,6:20,5:0|1:75679930_A_C:75679930:31,9,6,7
chr3	75679944	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=24;MBQ=31,24;MFRL=131,122;MMQ=25,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.156:55:21,4:22,4:28,19,7,1
chr3	75679945	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=24;MBQ=31,24;MFRL=131,101;MMQ=25,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.104:55:24,1:23,4:33,17,2,3
chr3	75679958	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=24;MBQ=30,24;MFRL=129,122;MMQ=27,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,18:0.292:63:21,5:20,12:0|1:75679937_G_A:75679937:21,24,10,8
chr3	75679963	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=24;MBQ=30,24;MFRL=130,117;MMQ=25,37;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,8:0.129:67:28,3:30,5:26,33,4,4
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=24;MBQ=30,23;MFRL=115,162;MMQ=25,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,8:0.123:71:25,6:34,2:0|1:75679965_C_A:75679965:28,35,2,6
chr3	75679973	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=24;MBQ=23,32;MFRL=130,104;MMQ=34,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,31:0.376:83:26,6:25,24:0|1:75679937_G_A:75679937:19,33,10,21
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=24;MBQ=31,25;MFRL=109,136;MMQ=25,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,19:0.230:85:24,9:39,10:0|1:75679975_C_T:75679975:22,44,6,13
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=24;MBQ=23,30;MFRL=109,134;MMQ=25,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,18:0.216:86:26,8:42,9:0|1:75679975_C_T:75679975:24,44,6,12
chr3	75679990	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=24;MBQ=30,23;MFRL=115,132;MMQ=25,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,11:0.133:88:30,4:42,7:0|1:75679990_G_A:75679990:26,51,5,6
chr3	75679993	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=24;MBQ=31,20;MFRL=122,104;MMQ=25,49;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,10:0.126:84:31,3:41,7:23,51,5,5
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=24;MBQ=30,27;MFRL=126,141;MMQ=25,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,4:0.062:78:25,3:43,1:0|1:75679965_C_A:75679965:22,52,1,3
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=24;MBQ=27,26;MFRL=132,146;MMQ=25,32;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.311:59:19,3:19,15:12,29,4,14
chr3	75680011	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=24;MBQ=30,25;MFRL=135,132;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,8:0.148:59:21,3:30,4:0|1:75679990_G_A:75679990:13,38,3,5
chr3	75680035	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=24;MBQ=30,22;MFRL=130,139;MMQ=37,26;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:14,2:13,3:0|1:75679990_G_A:75679990:9,21,1,5
chr3	75680037	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=24;MBQ=30,27;MFRL=132,146;MMQ=27,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:12,2:16,0:0|1:75680037_G_T:75680037:9,22,1,1
chr3	75680044	.	CA	TG	.	.	DP=27;ECNT=24;MBQ=32,31;MFRL=132,132;MMQ=37,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,1:10,2:0|1:75679990_G_A:75679990:8,16,0,3
chr3	75680045	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=24;MBQ=25,25;MFRL=131,146;MMQ=37,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:0|1:75680037_G_T:75680037:7,12,1,1
chr3	75680067	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=24;MBQ=24,33;MFRL=133,132;MMQ=39,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:0|1:75679990_G_A:75679990:3,10,0,3
chr3	75680073	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=24;MBQ=33,24;MFRL=135,132;MMQ=39,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:0|1:75679990_G_A:75679990:3,8,0,3
chr3	75680081	.	TGTG	T	.	.	DP=10;ECNT=24;MBQ=28,31;MFRL=133,169;MMQ=27,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:1,2:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:1,6,0,2
chr3	75680108	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=24;MBQ=23,26;MFRL=159,169;MMQ=33,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:0,4,0,2
chr3	75713466	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=136,216;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0|1:75713466_A_G:75713466:5,3,2,1
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=120,216;MMQ=40,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,2:2,1:0|1:75713466_A_G:75713466:5,2,2,1
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=92,219;MMQ=60,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.248:24:14,4:4,2:12,6,4,2
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=92,210;MMQ=55,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.213:28:18,4:4,2:12,10,5,1
chr3	75713555	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=99,171;MMQ=50,31;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:10,11,2,1
chr3	75713564	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=21,24;MFRL=160,99;MMQ=45,41;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.749:22:2,10:3,6:3,2,6,11
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=99,196;MMQ=43,26;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:8,1:7,13,2,0
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=122,127;MMQ=49,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.472:53:7,10:21,15:9,19,11,14
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=109,127;MMQ=51,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:9,11:15,10:9,15,7,14
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=108,138;MMQ=50,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.305:47:15,7:15,7:13,20,3,11
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=128,109;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.291:46:17,5:15,8:11,22,4,9
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=24,24;MFRL=105,135;MMQ=51,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:11,9:12,9:0|1:75713757_AGG_A:75713757:11,16,4,14
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=104,135;MMQ=50,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.413:44:11,9:13,7:0|1:75713757_AGG_A:75713757:11,15,4,14
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=97,133;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.667:37:3,15:8,10:6,6,5,20
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=24,31;MFRL=105,135;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:8,9:11,2:9,12,2,9
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=185,245;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:3,1,0,3
chr3	75713897	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=154,203;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,0,2
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=108,105;MMQ=50,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.218:30:12,5:12,1:0|1:75714095_G_A:75714095:11,13,1,5
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=120,105;MMQ=50,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:11,5:11,0:0|1:75714095_G_A:75714095:12,10,1,5
chr3	75714118	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=20,24;MFRL=127,111;MMQ=50,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.266:24:8,5:10,1:0|1:75714118_G_A:75714118:7,11,2,4
chr3	75714127	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=132,113;MMQ=49,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:4,3:10,1:0|1:75714118_G_A:75714118:5,10,1,3
chr3	75714139	.	A	C,T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,23,28;MFRL=137,121,132;MMQ=47,25,25;MPOS=5,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.20,5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.209,0.210:16:1,2,2:8,1,1:0,10,2,4
chr3	75714146	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=132,152;MMQ=25,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,2:2,7:2,3,2,8
chr3	75714202	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=34,25;MFRL=192,178;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:6,4,3,0
chr3	75714242	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=152,209;MMQ=36,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:10,2,3,0
chr3	75714251	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=144,198;MMQ=31,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,1:4,1:14,1,2,0
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=147,144;MMQ=44,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,2:7,5:13,3,7,0
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=124,113;MMQ=50,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.443:60:17,15:15,9:23,11,22,4
chr3	75714311	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=123,99;MMQ=50,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,26:0.305:87:33,16:23,10:39,22,17,9
chr3	75714337	.	T	G	.	.	DP=140;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=96,93;MMQ=60,46;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=333.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,97:0.716:135:25,55:13,39:27,11,58,39
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=153;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=93,114;MMQ=52,52;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,30:0.207:147:69,19:44,11:75,42,17,13
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=123;ECNT=11;MBQ=29,30,26;MFRL=101,87,85;MMQ=53,60,36;MPOS=24,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=74.53,67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:60,32,24:0.279,0.206:116:41,18,13:18,14,11:34,26,30,26
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=108;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=105,86;MMQ=54,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,23:0.218:108:52,11:31,9:49,36,7,16
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=103;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=96,99;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=175.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,47:0.475:99:27,32:23,13:0|1:75714391_G_T:75714391:30,22,20,27
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=91;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=105,105;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,43:0.473:91:26,32:20,8:0|1:75714391_G_T:75714391:28,20,19,24
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=89;ECNT=11;MBQ=27,27;MFRL=110,102;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=152.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,40:0.466:86:26,31:20,8:0|1:75714391_G_T:75714391:27,19,18,22
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=30,21;MFRL=124,119;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.289:39:17,4:9,6:7,21,3,8
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=119,129;MMQ=40,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.453:38:9,12:10,5:6,15,3,14
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=25,28;MFRL=0,123;MMQ=31,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,9:1,7:1,4,2,16
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=31,23;MFRL=132,132;MMQ=37,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:2,9,1,9
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=113,132;MMQ=36,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,2:9,3:2,14,1,4
chr3	75714580	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=155,201;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr3	75714608	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=173,114;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,2:3,3:6,2,3,2
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=168,93;MMQ=55,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:6,3:3,4:8,1,4,3
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=155,99;MMQ=55,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:6,3:5,6:9,4,6,3
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=113,142;MMQ=49,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,1:12,3:13,9,3,1
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=178,109;MMQ=60,53;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:5,8:5,14:7,3,10,12
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=147,207;MMQ=60,49;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:15,1:17,3:20,13,1,3
chr3	75714771	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=21,31;MFRL=109,190;MMQ=52,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:14,0:14,3:0|1:75714771_A_G:75714771:14,15,1,2
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=24,29;MFRL=109,190;MMQ=52,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:12,0:16,3:0|1:75714771_A_G:75714771:15,14,1,2
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=24,26;MFRL=141,147;MMQ=52,45;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:10,0:13,5:0|1:75714805_TG_T:75714805:12,12,2,3
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=31,25;MFRL=141,147;MMQ=52,45;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:10,0:13,5:0|1:75714805_TG_T:75714805:12,12,2,3
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=28,23;MFRL=129,196;MMQ=52,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:7,3:14,4:0|1:75714771_A_G:75714771:9,15,5,2
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=109,196;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.222:34:11,3:15,4:0|1:75714771_A_G:75714771:11,16,5,2
chr3	75714824	.	AG	A	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=25,25;MFRL=129,113;MMQ=52,37;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:13,1:16,3:15,17,4,0
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=113,166;MMQ=52,44;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.166:35:13,1:15,4:0|1:75714805_TG_T:75714805:17,13,2,3
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=25,28;MFRL=97,174;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:10,3:16,5:0|1:75714771_A_G:75714771:13,15,6,2
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=13;MBQ=31,24;MFRL=97,151;MMQ=60,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:10,3:16,4:0|1:75714771_A_G:75714771:14,14,6,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=23,30;MFRL=90,124;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.451:40:10,6:11,11:11,11,10,8
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=20,21;MFRL=84,147;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,6:0.149:45:16,1:20,4:0|1:75714805_TG_T:75714805:21,18,2,4
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=20,25;MFRL=102,128;MMQ=57,44;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,9:0.175:55:19,1:25,7:0|1:75714805_TG_T:75714805:25,21,3,6
chr3	75715099	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=103,112;MMQ=60,36;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:25,0:16,4:23,18,3,1
chr3	75715118	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=105,98;MMQ=50,55;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,22:0.489:45:11,11:9,7:0|1:75715118_G_A:75715118:11,12,14,8
chr3	75715124	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=105,97;MMQ=50,55;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,24:0.510:47:11,17:11,6:0|1:75715118_G_A:75715118:11,12,16,8
chr3	75715173	.	CT	TG	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=91,141;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,14:0.312:46:19,8:13,5:0|1:75715173_CT_TG:75715173:16,16,7,7
chr3	75715181	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=89,149;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,11:0.279:41:17,5:12,6:0|1:75715173_CT_TG:75715173:15,15,4,7
chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=20,32;MFRL=93,165;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,4:2,5:0|1:75715173_CT_TG:75715173:4,5,2,7
chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=211,149;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:0|1:75715261_C_T:75715261:0,3,1,8
chr3	75715268	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=211,149;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:0|1:75715261_C_T:75715261:0,3,1,7
chr3	75785936	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=17;MBQ=30,24;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr3	75785942	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=17;MBQ=30,27;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	75785959	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=17;MBQ=32,27;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:10,0,3,1
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=32,25;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,28:0.744:37:3,14:6,14:8,1,26,2
chr3	75785999	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.436:37:10,7:11,9:0|1:75785999_A_G:75785999:18,3,16,0
chr3	75786007	.	CA	TG	.	.	DP=43;ECNT=17;MBQ=31,24;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,19:0.465:41:10,7:11,12:0|1:75785999_A_G:75785999:18,4,18,1
chr3	75786013	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.199:43:15,5:20,3:31,4,6,2
chr3	75786019	.	GG	CA	.	.	DP=47;ECNT=17;MBQ=31,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:16,2:20,2:37,6,3,1
chr3	75786031	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:17,4:20,3:0|1:75786031_A_C:75786031:32,5,6,3
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=48;ECNT=17;MBQ=31,31;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=84.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,26:0.599:43:10,13:7,12:0|1:75786035_G_GA:75786035:13,4,21,5
chr3	75786036	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,9:0.204:47:19,6:16,3:0|1:75786031_A_C:75786031:32,6,6,3
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=92.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,30:0.544:55:16,14:9,15:0|1:75786035_G_GA:75786035:21,4,25,5
chr3	75786059	.	CA	TA,TG	.	.	DP=78;ECNT=17;MBQ=32,23,26;MFRL=146,106,174;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=67.00,34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,31,14:0.428,0.200:73:20,12,10:8,19,2:23,5,30,15
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=95;ECNT=17;MBQ=31,26;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=138.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,41:0.437:94:35,18:14,18:0|1:75786071_C_A:75786071:40,13,26,15
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=96;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,18:0.193:96:43,14:30,4:53,25,13,5
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=102;ECNT=17;MBQ=31,22;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=138.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,42:0.421:100:37,20:19,22:0|1:75786071_C_A:75786071:42,16,28,14
chr3	75786080	.	G	T,A	.	.	DP=101;ECNT=17;MBQ=28,24,24;MFRL=145,112,137;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.87,59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,19,31:0.283,0.448:68:14,9,20:4,10,11:13,5,34,16
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=150;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=103,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=126.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,56:0.390:144:46,31:42,25:45,43,28,28
chr3	75786163	.	C	T	.	.	DP=131;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,46:0.375:123:33,25:42,20:27,50,18,28
chr3	75786175	.	C	A	.	.	DP=130;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=115,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,18:0.147:126:53,8:53,10:42,66,1,17
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=121;ECNT=19;MBQ=27,33;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,16:0.138:121:47,3:54,12:0|1:75786202_TG_CA:75786202:39,66,3,13
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=117;ECNT=19;MBQ=25,29;MFRL=104,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=154.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,51:0.448:114:23,25:38,26:0|1:75786211_A_G:75786211:20,43,20,31
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=19;MBQ=31,24;MFRL=102,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,13:0.125:110:45,3:48,9:0|1:75786202_TG_CA:75786202:35,62,2,11
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=114;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,25:0.232:107:38,7:36,16:28,54,10,15
chr3	75786230	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=19;MBQ=31,26;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,23:0.213:107:35,15:42,8:28,56,10,13
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=19;MBQ=31,26;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=167.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,44:0.459:96:22,15:26,27:0|1:75786211_A_G:75786211:20,32,10,34
chr3	75786244	.	A	T	.	.	DP=95;ECNT=19;MBQ=24,27;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,9:0.098:92:34,2:45,7:26,57,2,7
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=93;ECNT=19;MBQ=26,26;MFRL=104,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=164.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,43:0.463:93:23,15:27,26:0|1:75786211_A_G:75786211:18,32,9,34
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=89;ECNT=19;MBQ=31,26;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,4:0.056:87:31,1:43,2:22,61,0,4
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=19;MBQ=31,29;MFRL=110,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,39:0.471:83:20,11:19,25:0|1:75786211_A_G:75786211:15,29,7,32
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=19;MBQ=28,25;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=150.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,39:0.500:78:19,11:19,26:0|1:75786211_A_G:75786211:12,27,8,31
chr3	75786261	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=19;MBQ=31,27;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,19:0.247:79:23,9:35,9:15,45,5,14
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=19;MBQ=25,31;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=188.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,46:0.691:66:11,17:8,27:0|1:75786278_A_C:75786278:7,13,12,34
chr3	75786288	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=24,31;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,13:0.195:63:19,6:29,6:0|1:75786288_A_G:75786288:13,37,3,10
chr3	75786298	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=19;MBQ=27,31;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.200:51:15,4:21,5:0|1:75786288_A_G:75786288:11,30,1,9
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=19;MBQ=31,24;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:11,8:11,15:3,20,6,17
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=40;ECNT=19;MBQ=31,31;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=109.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,27:0.667:40:10,11:3,13:0|1:75786278_A_C:75786278:2,11,4,23
chr3	75786337	.	G	A,T	.	.	DP=30;ECNT=19;MBQ=30,23,28;MFRL=138,175,192;MMQ=60,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.70,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,5,4:0.199,0.166:27:11,3,1:6,2,3:3,15,1,8
chr3	75786354	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:14,2:2,5:5,12,2,5
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=24;MBQ=26,30;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,8:1,4:3,2,5,7
chr3	75786381	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=24;MBQ=27,31;MFRL=183,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:4,1:7,8,1,1
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=24;MBQ=34,31;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,7:0,5:2,1,6,6
chr3	75786387	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=24;MBQ=25,30;MFRL=157,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:6,1:10,6,1,1
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=24;MBQ=23,30;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,5:3,9:5,0,12,5
chr3	75786421	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=24;MBQ=30,23;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,1:11,2:17,5,3,0
chr3	75786423	.	T	TTC	.	.	DP=24;ECNT=24;MBQ=24,26;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TC;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:14,3,3,1
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=24;MBQ=31,26;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:7,4:10,2:14,4,5,1
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=24;MBQ=32,27;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.677:29:4,9:4,10:7,2,14,6
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=24;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,14:0,0,23,7
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=24;MBQ=28,28;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:6,10:5,12:7,4,16,6
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=24;MBQ=33,26;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:6,10:4,12:7,4,16,6
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=24;MBQ=32,28;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:18,4:13,3:17,15,7,1
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=24;MBQ=31,27;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,11:0.207:56:25,7:15,3:25,20,9,2
chr3	75786483	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=24;MBQ=31,27;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,18:0.302:61:26,11:13,7:26,17,11,7
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,15:0.225:69:28,8:21,6:30,24,13,2
chr3	75786499	.	CA	TG	.	.	DP=75;ECNT=24;MBQ=31,24;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.109:74:37,4:23,3:39,27,5,3
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=76;ECNT=24;MBQ=25,26,27;MFRL=123,163,121;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=66.37,93.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,19,26:0.278,0.379:69:15,11,15:8,7,10:11,13,30,15
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=24;MBQ=25,30;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,27:0.359:76:27,16:18,9:32,17,15,12
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	.	.	DP=86;ECNT=24;MBQ=28,28,26;MFRL=123,120,117;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=193.29,27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,49,9:0.562,0.125:82:14,29,3:8,14,6:11,13,37,21
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=83;ECNT=24;MBQ=24,31;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,24:0.294:83:37,14:22,9:30,29,17,7
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=24;MBQ=31,27;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,24:0.294:83:36,14:22,10:30,29,17,7
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=88;ECNT=24;MBQ=24,31;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,26:0.307:86:33,18:25,7:33,27,14,12
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=79;ECNT=24;MBQ=31,31;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=244.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,61:0.827:73:6,34:6,22:4,8,33,28
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=17;MBQ=26,28;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,28:0.426:66:19,14:16,14:20,18,16,12
chr3	75786586	.	G	T	.	.	DP=77;ECNT=17;MBQ=31,26;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,5:0.067:76:33,3:32,2:0|1:75786586_G_T:75786586:43,28,2,3
chr3	75786593	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,6:0.079:77:38,2:30,3:0|1:75786586_G_T:75786586:46,25,2,4
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=17;MBQ=30,26;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,25:0.321:79:29,11:21,12:0|1:75786597_C_T:75786597:32,22,15,10
chr3	75786598	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=17;MBQ=28,26;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,5:0.074:79:40,2:29,3:0|1:75786586_G_T:75786586:46,28,2,3
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=17;MBQ=30,25;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,25:0.295:86:28,12:27,12:0|1:75786597_C_T:75786597:36,25,14,11
chr3	75786608	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=17;MBQ=31,30;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,4:0.056:87:39,2:38,2:0|1:75786586_G_T:75786586:49,34,1,3
chr3	75786610	.	T	G	.	.	DP=84;ECNT=17;MBQ=24,32;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,24:0.291:84:30,12:29,12:0|1:75786597_C_T:75786597:34,26,13,11
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=17;MBQ=24,27;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,23:0.270:87:32,12:30,10:0|1:75786597_C_T:75786597:33,31,13,10
chr3	75786620	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=17;MBQ=31,26;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,4:0.056:88:42,2:38,2:0|1:75786586_G_T:75786586:45,39,1,3
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=99;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,35:0.399:88:28,17:23,18:28,25,19,16
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=99;ECNT=17;MBQ=23,30;MFRL=117,190;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:96,3:0.040:99:53,1:39,2:0|1:75786662_A_T:75786662:40,56,0,3
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=17;MBQ=30,26;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,44:0.473:93:29,24:20,20:20,29,19,25
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=17;MBQ=31,30;MFRL=118,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,4:0.052:94:47,2:35,2:0|1:75786662_A_T:75786662:38,52,1,3
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=17;MBQ=20,25;MFRL=91,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=231.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,61:0.776:78:12,32:5,26:8,9,23,38
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=17;MBQ=30,27;MFRL=114,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,4:0.061:80:42,2:28,2:0|1:75786662_A_T:75786662:31,45,1,3
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=17;MBQ=24,27;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,9:0.124:78:37,6:29,3:30,39,2,7
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=25;MBQ=26,27;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,35:0.545:64:21,16:8,16:16,13,18,17
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=31,35;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,7:0.113:69:34,5:21,2:0|1:75786740_CA_GG:75786740:33,29,5,2
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=25;MBQ=26,29;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,26:0.437:60:22,13:10,11:0|1:75786741_A_G:75786741:21,13,11,15
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=25;MBQ=31,25;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,13:0.187:73:33,7:26,5:0|1:75786748_C_T:75786748:32,28,9,4
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=25;MBQ=28,24;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,25:0.323:78:27,15:21,9:29,24,15,10
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=25;MBQ=28,27;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,8:0.110:80:39,6:29,2:0|1:75786740_CA_GG:75786740:41,31,5,3
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=25;MBQ=25,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,39:0.461:85:24,21:14,16:26,20,21,18
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=85;ECNT=25;MBQ=27,25;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,14:0.174:84:38,8:25,6:0|1:75786748_C_T:75786748:35,35,10,4
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=87;ECNT=25;MBQ=26,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,8:0.101:87:45,6:26,2:0|1:75786740_CA_GG:75786740:40,39,5,3
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=84;ECNT=25;MBQ=26,25;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,31:0.376:84:36,14:13,16:0|1:75786741_A_G:75786741:32,21,14,17
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=25;MBQ=26,28;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,4:0.066:74:33,2:28,1:0|1:75786740_CA_GG:75786740:36,34,2,2
chr3	75786802	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=25;MBQ=25,24;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,25:0.455:56:15,10:13,14:0|1:75786741_A_G:75786741:20,11,10,15
chr3	75786827	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=25;MBQ=25,26;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=132.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,34:0.583:58:12,20:12,12:10,14,16,18
chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=31,26;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,49:0.794:62:6,26:7,20:6,7,23,26
chr3	75786833	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=25;MBQ=32,26;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,9:0.149:65:28,5:24,3:28,28,4,5
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=25;MBQ=27,31;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,58:0.756:76:6,31:12,21:7,11,33,25
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=25;MBQ=26,26;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,36:0.456:79:19,21:23,15:24,19,22,14
chr3	75786866	.	G	T	.	.	DP=87;ECNT=25;MBQ=31,23;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,16:0.191:87:31,6:35,9:0|1:75786866_G_T:75786866:40,31,12,4
chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=25;MBQ=29,26;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,12:0.117:103:37,5:45,5:0|1:75786888_C_T:75786888:57,34,6,6
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=104;ECNT=25;MBQ=27,30;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,17:0.170:104:39,7:39,9:0|1:75786866_G_T:75786866:50,37,12,5
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=105;ECNT=25;MBQ=30,30;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,14:0.136:105:35,6:45,6:0|1:75786888_C_T:75786888:53,38,8,6
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=99;ECNT=25;MBQ=24,31;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,23:0.238:99:33,8:38,12:0|1:75786866_G_T:75786866:47,29,12,11
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=124;ECNT=25;MBQ=30,24;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:96,28:0.230:124:45,11:41,14:0|1:75786866_G_T:75786866:51,45,13,15
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=129;ECNT=25;MBQ=24,27;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,30:0.248:129:46,12:40,15:0|1:75786866_G_T:75786866:49,50,13,17
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=127;ECNT=25;MBQ=30,24;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,21:0.172:127:48,10:49,11:51,55,8,13
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=129;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=105,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,47:0.396:119:32,18:38,29:0|1:75786965_C_T:75786965:22,50,16,31
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=114.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,36:0.440:82:21,8:20,26:0|1:75786965_C_T:75786965:19,27,8,28
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=103.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,28:0.414:68:29,12:11,14:0|1:75787032_T_C:75787032:27,13,11,17
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=81;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=132.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,35:0.439:80:30,15:12,19:0|1:75787032_T_C:75787032:29,16,16,19
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=85;ECNT=8;MBQ=22,26;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=138.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,37:0.441:84:25,15:12,17:0|1:75787032_T_C:75787032:29,18,17,20
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=72;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,13:0.197:69:34,8:20,5:30,26,9,4
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=21,25;MFRL=90,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=148.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,39:0.597:65:17,23:8,15:14,12,26,13
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=64;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=108,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,22:0.383:58:20,13:13,9:17,19,14,8
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=21;MBQ=30,23;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,29:0.545:53:7,13:11,14:0|1:75787186_C_T:75787186:9,15,17,12
chr3	75787202	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=99,146;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:19,0:20,2:0|1:75787202_G_T:75787202:21,20,0,2
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chr3	75787221	.	CA	TG	.	.	DP=46;ECNT=21;MBQ=29,26;MFRL=72,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,17:0.375:46:12,6:17,8:0|1:75787186_C_T:75787186:13,16,7,10
chr3	75787224	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=21;MBQ=24,26;MFRL=72,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,14:0.333:43:9,7:16,6:0|1:75787218_T_A:75787218:13,16,6,8
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=21;MBQ=20,29;MFRL=82,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,15:0.340:45:15,5:12,9:0|1:75787186_C_T:75787186:16,14,6,9
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=21;MBQ=22,30;MFRL=87,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,15:0.340:45:15,5:13,9:0|1:75787186_C_T:75787186:15,15,6,9
chr3	75787265	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=21;MBQ=30,28;MFRL=76,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,12:0.245:51:23,3:15,6:0|1:75787186_C_T:75787186:16,23,4,8
chr3	75787269	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=21;MBQ=29,24;MFRL=76,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,11:0.231:50:24,4:15,6:0|1:75787186_C_T:75787186:15,24,5,6
chr3	75787279	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=21;MBQ=20,27;MFRL=83,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,12:0.250:50:20,3:10,9:0|1:75787186_C_T:75787186:17,21,5,7
chr3	75787288	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=23,32;MFRL=94,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,13:0.304:44:20,3:8,9:0|1:75787186_C_T:75787186:14,17,6,7
chr3	75787298	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=21;MBQ=21,28;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,14:0.300:48:22,4:10,9:0|1:75787186_C_T:75787186:15,19,7,7
chr3	75787304	.	AC	TT	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=22,26;MFRL=108,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.261:44:19,3:12,8:0|1:75787186_C_T:75787186:15,18,6,5
chr3	75787306	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=27,20;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:19,0:12,4:17,20,2,2
chr3	75787321	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=21;MBQ=31,26;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,1:20,2:17,23,2,1
chr3	75787347	.	TCCC	T	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=27,24;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,10:0.262:40:9,5:15,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:13,17,6,4
chr3	75787352	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=21;MBQ=26,24;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,10:0.250:42:13,5:16,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:14,18,6,4
chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=21;MBQ=30,27;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,10:0.250:42:14,5:16,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:14,18,6,4
chr3	75787372	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=21;MBQ=23,24;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.551:42:9,13:8,10:8,11,15,8
chr3	75787382	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=27,25;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=90.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,32:0.716:44:9,14:3,15:8,4,14,18
chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.378:43:14,8:13,7:0|1:75787405_C_T:75787405:12,15,8,8
chr3	75787416	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=31,26;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.191:50:21,6:19,3:18,23,5,4
chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=27,31;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,33:0.645:51:4,20:11,11:7,11,18,15
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=26,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,26:0.510:51:11,16:13,9:0|1:75787405_C_T:75787405:12,13,14,12
chr3	75787455	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=22,27;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,5:0.102:57:19,1:30,3:0|1:75787455_A_G:75787455:21,31,1,4
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=16;MBQ=29,25;MFRL=126,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.117:57:16,3:31,3:21,30,2,4
chr3	75787462	.	GC	AT	.	.	DP=58;ECNT=16;MBQ=29,26;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,4:0.083:58:19,0:31,4:0|1:75787455_A_G:75787455:23,31,1,3
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=30,24;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,30:0.556:54:9,10:14,18:0|1:75787464_C_T:75787464:10,14,13,17
chr3	75787474	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=31,26;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,4:0.085:57:20,0:23,4:0|1:75787455_A_G:75787455:23,30,1,3
chr3	75787476	.	C	T,A	.	.	DP=54;ECNT=16;MBQ=30,20,26;MFRL=143,75,152;MMQ=60,60,60;MPOS=8,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.96,14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,15,5:0.272,0.105:54:15,5,0:18,8,4:13,21,9,11
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.521:46:11,6:11,17:9,13,9,15
chr3	75787490	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=16;MBQ=25,29;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:15,1:23,4:0|1:75787455_A_G:75787455:15,24,1,4
chr3	75787511	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=16;MBQ=29,26;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:19,2:18,4:0|1:75787455_A_G:75787455:16,22,1,5
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=31,30;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.395:41:10,7:13,8:0|1:75787464_C_T:75787464:10,15,6,10
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=38;ECNT=16;MBQ=30,24;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,15:0.410:37:9,8:11,4:0|1:75787464_C_T:75787464:10,12,5,10
chr3	75787520	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=24,31;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.287:22:8,3:8,3:0|1:75787455_A_G:75787455:9,7,1,5
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=25,29;MFRL=111,171;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:21,4:20,4:23,19,5,3
chr3	75787637	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,19:0.465:41:10,9:12,9:0|1:75787637_C_T:75787637:13,9,8,11
chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=68.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,20:0.477:42:11,11:11,9:0|1:75787637_C_T:75787637:12,10,9,11
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=25,31;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,10:3,3:6,11,7,6
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=27,24;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.535:33:13,8:1,8:7,8,8,10
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.535:41:13,9:4,12:9,9,11,12
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=189,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=197.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,49:0.847:57:3,28:4,17:3,5,24,25
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=27,26;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,8:0.150:58:27,4:20,2:25,25,3,5
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,24:0.387:62:21,13:17,10:20,18,10,14
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=282.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,32:0,32:0,0,31,38
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=12;MBQ=23,30;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=212.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,59:0.800:73:7,29:6,28:6,8,27,32
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=71;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,28:0.408:69:22,11:15,15:18,23,10,18
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=12;MBQ=25,31;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,39:0.597:65:16,17:9,21:10,16,17,22
chr3	75787812	.	C	CT	.	.	DP=69;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.095:68:30,4:30,1:26,36,3,3
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=66;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=174.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,43:0.657:65:11,21:8,19:0|1:75787869_CA_TG:75787869:9,13,18,25
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=12;MBQ=30,25;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=162.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,41:0.636:64:14,24:9,13:0|1:75787869_CA_TG:75787869:9,14,18,23
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=12;MBQ=23,30;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.286:61:28,8:16,9:19,25,7,10
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=26,27;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,20:0.345:59:21,11:16,8:17,22,7,13
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=12;MBQ=23,31;MFRL=176,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,32:0.646:49:10,17:5,14:0|1:75787927_A_G:75787927:7,10,11,21
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,25:0.603:41:9,12:6,10:0|1:75787927_A_G:75787927:9,7,8,17
chr3	75787961	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=24,31;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:10,5:7,4:10,10,2,7
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=30,31;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:11,5:9,2:9,11,3,4
chr3	75787996	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.302:31:12,5:9,4:0|1:75787996_C_T:75787996:14,8,6,3
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,15:0,14:0|1:75787996_C_T:75787996:0,0,19,15
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,21:0.509:41:11,12:9,8:0|1:75787996_C_T:75787996:12,8,11,10
chr3	75788028	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,9:0.204:47:22,5:14,4:0|1:75787996_C_T:75787996:22,16,5,4
chr3	75788040	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,6:0.131:51:26,4:16,2:0|1:75787996_C_T:75787996:23,22,4,2
chr3	75788068	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,15:0.288:54:26,9:11,6:0|1:75787996_C_T:75787996:19,20,12,3
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=23,31;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,36:0.662:54:14,23:4,12:0|1:75787996_C_T:75787996:9,9,22,14
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=16;MBQ=29,28;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,45:0.685:65:13,28:6,12:9,11,35,10
chr3	75788130	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=123.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,38:0.494:76:26,20:7,12:0|1:75788130_C_A:75788130:23,15,30,8
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=98;ECNT=16;MBQ=24,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=156.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,49:0.497:98:32,32:10,16:0|1:75788130_C_A:75788130:25,24,33,16
chr3	75788152	.	T	G,C	.	.	DP=97;ECNT=16;MBQ=20,31,30;MFRL=117,122,143;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=67.29,161.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,25,49:0.271,0.503:95:15,17,28:5,6,16:9,12,49,25
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=16;MBQ=23,27;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,39:0.440:89:35,19:15,20:24,26,14,25
chr3	75788226	.	CA	AG,GG	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=31,25,30;MFRL=122,124,114;MMQ=60,60,60;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=159.53,62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,44,20:0.523,0.244:83:11,15,11:7,28,8:7,12,28,36
chr3	75788230	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=16;MBQ=31,25;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,20:0.250:82:22,12:37,7:0|1:75788230_C_T:75788230:25,37,9,11
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=16;MBQ=31,24;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,18:0.250:74:20,12:35,6:0|1:75788230_C_T:75788230:28,28,7,11
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=16;MBQ=32,25;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=228.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,59:0.790:74:8,25:7,31:0|1:75788258_C_A:75788258:5,10,29,30
chr3	75788260	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=31,28;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,8:0.118:74:29,2:32,6:0|1:75788260_C_A:75788260:29,37,5,3
chr3	75788270	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=16;MBQ=24,20;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,12:0.157:81:32,2:31,8:0|1:75788260_C_A:75788260:34,35,6,6
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=16;MBQ=24,26;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=225.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,55:0.718:76:11,22:6,29:0|1:75788258_C_A:75788258:9,12,28,27
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=20,31;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=126.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,33:0.479:69:14,14:17,17:0|1:75788291_AT_GA:75788291:14,22,19,14
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=20,20;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,13:0.369:36:11,3:9,9:0|1:75788260_C_A:75788260:9,14,4,9
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=23,20;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,13:0.206:66:24,3:24,9:0|1:75788260_C_A:75788260:27,26,4,9
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=31,24;MFRL=107,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,37:0.551:67:11,14:19,22:0|1:75788291_AT_GA:75788291:11,19,18,19
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=72;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,13:0.188:72:30,3:29,9:20,39,3,10
chr3	75788376	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,7:0.131:59:24,2:24,5:18,34,0,7
chr3	75788411	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:14,2:11,2:5,20,0,4
chr3	75788434	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,2:3,4:0,8,1,6
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:0,2:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,1,0,2
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,1,0,2
chr3	75788532	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,1,0,1
chr3	75788545	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,0;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,0,0,1
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=20;MBQ=29,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=103.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.812:30:3,7:2,13:5,0,21,4
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=20;MBQ=25,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=111.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,28:0.806:34:4,9:2,19:5,1,25,3
chr3	75790394	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:11,2:20,4:27,11,6,0
chr3	75790405	.	TG	AA	.	.	DP=55;ECNT=20;MBQ=24,24;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,12:0.227:55:16,2:23,7:32,11,7,5
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=20;MBQ=30,31;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.545:45:7,9:12,15:15,5,18,7
chr3	75790409	.	TG	CA,CT	.	.	DP=56;ECNT=20;MBQ=23,31,34;MFRL=103,128,115;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=123.56,38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,32,12:0.579,0.228:54:5,10,4:5,21,7:7,3,31,13
chr3	75790419	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=20;MBQ=24,31;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,8:0.150:58:19,0:26,5:32,18,5,3
chr3	75790427	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=20;MBQ=31,24;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,8:0.136:64:21,2:29,6:36,20,5,3
chr3	75790444	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=20;MBQ=31,25;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:26,1:34,3:36,28,3,1
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=71;ECNT=20;MBQ=31,23;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,26:0.375:70:19,9:23,14:25,19,15,11
chr3	75790448	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=20;MBQ=23,31;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,12:0.180:70:22,5:31,7:35,23,5,7
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=20;MBQ=31,23;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,26:0.369:71:18,13:26,12:27,18,15,11
chr3	75790479	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=20;MBQ=29,26;MFRL=103,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,22:0.287:78:24,11:30,11:29,27,10,12
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=20;MBQ=20,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,58:0.975:59:1,28:0,27:0,1,25,33
chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=20;MBQ=26,25;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,16:0.319:51:19,6:15,10:15,20,5,11
chr3	75790542	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=20;MBQ=31,25;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=93.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:7,13:7,13:5,10,9,19
chr3	75790554	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=32,26;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,7:9,10:3,11,5,13
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=31,26;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,6:6,7:1,9,3,11
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,5:6,7:1,9,3,11
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=31,26;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,2,5
chr3	75790668	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=29,22;MFRL=180,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:1,3:3,0,4,0
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:3,9:2,7:5,1,15,1
chr3	75790705	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:0|1:75790705_C_T:75790705:19,1,1,1
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=91.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,22:0.742:29:4,11:2,8:0|1:75790717_G_A:75790717:5,2,19,3
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:15,5:12,2:21,6,7,0
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=26,30;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,28:0.784:35:4,16:3,11:0|1:75790717_G_A:75790717:5,2,24,4
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=28,23;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,29:0.789:36:4,17:3,11:0|1:75790717_G_A:75790717:5,2,25,4
chr3	75790733	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:16,6:10,3:0|1:75790705_C_T:75790705:23,3,7,3
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,21:0.710:29:3,12:5,9:0|1:75790717_G_A:75790717:6,2,18,3
chr3	75790783	.	G	GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=119.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,29:0.795:47:7,5:9,2:0|1:75790783_G_GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA:75790783:12,6,17,12
chr3	75790798	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=24,27;MFRL=91,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,2:6,9:0|1:75790783_G_GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA:75790783:6,4,8,3
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=27,25;MFRL=114,93;MMQ=55,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.556:23:2,6:7,6:7,3,8,5
chr3	75790824	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=31,24;MFRL=93,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.371:26:7,2:9,7:0|1:75790783_G_GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA:75790783:9,8,6,3
chr3	75790972	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=60,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:1,2:3,6:1,3,3,5
chr3	75832567	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=96,53;MMQ=49,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:75832567_G_T:75832567:7,9,1,1
chr3	75832572	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=118,53;MMQ=47,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:75832567_G_T:75832567:5,8,1,1
chr3	75832573	.	G	GACAGTACATCTTGCTTTTCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=47,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:7,2:0|1:75832567_G_T:75832567:5,8,1,1
chr3	77147109	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77147109_C_T:77147109:3,0,1,0
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:77147109_C_T:77147109:3,0,1,0
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=254,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,3:0,3:1,0,7,1
chr3	77614098	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:6,3:5,10,2,1
chr3	77626681	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=75,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:6,7,2,0
chr3	77644436	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr3	77645946	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=19,31;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,3:0,1:0,1,0,4
chr3	77645980	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:77645980_A_C:77645980:0,4,0,1
chr3	77645983	.	AAA	CTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:77645980_A_C:77645980:0,4,0,1
chr3	77645984	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	77657037	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=98,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.165:26:6,3:14,1:7,15,4,0
chr3	78663956	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.655:3:0,0:0,2:0|1:78663956_G_A:78663956:0,1,0,2
chr3	78663958	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=77,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.528:4:0,0:1,1:0|1:78663956_G_A:78663956:0,2,0,2
chr3	78666765	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	78676422	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,12:0,2:0,0,13,1
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,18:1,5:1,0,16,7
chr3	78708987	.	T	TGTCTCTCCGGCTTTTGATTCTGCTCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr3	78717508	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,2,6
chr3	78737962	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=8,26;MFRL=221,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.899:12:0,6:0,5:1,0,1,10
chr3	78796078	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr3	81630269	.	AAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,1,1
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0|1:81810702_A_AG:81810702:0,0,0,5
chr3	81810725	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=301,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:81810702_A_AG:81810702:0,2,0,2
chr3	85984830	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	86996313	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86996313_A_ACC:86996313:0,1,0,1
chr3	86996315	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86996313_A_ACC:86996313:0,1,0,1
chr3	87018004	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=141,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:87018004_C_T:87018004:5,12,0,2
chr3	87018011	.	CATATGG	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=139,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:0|1:87018004_C_T:87018004:5,11,0,2
chr3	87018019	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:4,0:0|1:87018004_C_T:87018004:5,8,0,2
chr3	87018021	.	TAGGATGGGC	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=113,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:4,0:0|1:87018004_C_T:87018004:5,8,0,2
chr3	87027856	.	TCTC	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=110,32283663;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTC;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:4,1:15,1:0|1:87027856_TCTC_T:87027856:6,13,0,2
chr3	87027882	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=122,110;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,5:0.229:24:9,0:10,4:1|0:87027856_TCTC_T:87027856:3,16,0,5
chr3	87309014	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,7:6,0:10,1,0,7
chr3	87313353	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	88041626	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:8,7,0,2
chr3	88041650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:5,2:6,5,2,2
chr3	88042501	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr3	88104747	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,4:11,0:10,13,1,3
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=63.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,13,10
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=141.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,24:0,0,31,16
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=68,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=80.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,40:0.935:43:2,14:1,25:2,1,23,17
chr3	88199298	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=203,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,14:1,15:0,1,7,22
chr3	89259664	.	TGCCAAG	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=123,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:0|1:89259664_TGCCAAG_T:89259664:10,13,0,2
chr3	89259671	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=123,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:89259664_TGCCAAG_T:89259664:10,13,0,2
chr3	89259674	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=116,242;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:7,2:0|1:89259664_TGCCAAG_T:89259664:9,13,0,2
chr3	89259676	.	AGCCT	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=116,242;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:89259664_TGCCAAG_T:89259664:9,13,0,2
chr3	89259684	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=123,242;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:5,2:0|1:89259664_TGCCAAG_T:89259664:7,12,0,2
chr3	89390268	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89390268_C_T:89390268:0,4,0,1
chr3	89390269	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89390268_C_T:89390268:0,4,0,1
chr3	89390272	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89390268_C_T:89390268:0,4,0,1
chr3	89390288	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,27;MFRL=82,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89390288_T_A:89390288:1,0,0,1
chr3	89390290	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=82,269;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89390288_T_A:89390288:1,0,0,1
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=77,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:6,3,3,6
chr3	89462238	.	ATTGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	89462464	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,1:4,6:2,3,3,4
chr3	89468545	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:4,2:7,0:0,13,0,2
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	93615551	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,58;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:10,0:24,4:6,28,1,3
chr3	93692688	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	93722735	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,1:12,1:4,12,2,0
chr3	93754286	.	GT	G,GTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31,26;MFRL=142,152,77;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.16,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,6:0.289,0.313:18:3,2,0:2,3,5:2,5,4,7
chr3	93758880	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr3	93768420	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:1,0:0,2:0,15,0,2
chr3	96706607	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.202:28:11,5:10,0:7,16,5,0
chr3	97198316	.	T	TCAAAAGGAAAAGAACCAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	97329684	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.201:32:17,6:9,0:8,18,5,1
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr3	97466432	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=127,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,2:3,3:2,2,1,4
chr3	97467361	.	ATCTCTC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=68,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=TC;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,3:2,0:3,2,2,1
chr3	97596488	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=107,35;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:8,5,2,0
chr3	97605460	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.179:23:9,3:9,1:12,7,4,0
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=133.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,12:0,0,15,16
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr3	97664725	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr3	97686019	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,3:7,3:6,2,3,3
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:7,2,2,1
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=119,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,2:9,4,3,3
chr3	97731434	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	97731443	.	C	CCTCGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=178,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	97753686	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=130,178;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:6,2,2,0
chr3	97806548	.	TATTTCTACTGTGAAATTTTACAACTGTTCAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=194,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:3,2:4,4,1,1
chr3	97806700	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.197:16:5,0:7,3:10,3,1,2
chr3	97868174	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,160;MMQ=57,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:4,0,6,0
chr3	97868616	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=137,184;MMQ=50,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,3:7,3:3,6,4,2
chr3	97868656	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=122,102;MMQ=50,48;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:9,2:14,4:12,11,3,3
chr3	97868795	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=102,185;MMQ=60,46;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:14,1:7,3:13,8,1,3
chr3	97983257	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,5:3,2:5,4,5,2
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=157,137;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:4,3:2,2:5,4,2,3
chr3	97983942	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,93;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:2,2:5,1:5,3,0,3
chr3	98001676	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=251,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	98002419	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:1,3:2,9:2,1,7,5
chr3	98072828	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=96,63;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:14,0:17,6:15,16,0,6
chr3	98110247	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=124,118;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:11,6:4,0:9,6,6,0
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.921:13:1,4:1,6:2,1,7,3
chr3	98240259	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:19,0:19,4:19,19,1,3
chr3	98487206	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:9,0,9,1
chr3	98507134	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=100,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,8:0,3:1,2,2,9
chr3	98518160	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	98527042	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.100:27:10,1:15,1:0|1:98527042_G_A:98527042:11,14,0,2
chr3	98527045	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:9,0:13,1:0|1:98527042_G_A:98527042:10,14,0,2
chr3	98539180	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.126:45:12,0:4,5:0|1:98539180_T_G:98539180:5,35,0,5
chr3	98539185	.	C	CCACACCCTCCACCCCTTCAAGACTGG	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,38;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:17,0:21,5:0|1:98539180_T_G:98539180:2,37,0,5
chr3	98540982	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	98541116	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,3:2,5:4,6,4,4
chr3	98541422	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,6:2,2:3,0,8,0
chr3	98541609	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.133:32:12,0:15,3:9,19,0,4
chr3	98541633	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:2,7,1,7
chr3	98544123	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=26,30,28,31;MFRL=96,146,130,75;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,6,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.18,4.43,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,5:0.133,0.154,0.238:21:3,0,0,5:3,3,2,0:6,4,9,2
chr3	98544262	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:12,0:4,3:0|1:98544262_G_A:98544262:0,16,0,3
chr3	98544272	.	C	CCTTAT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:12,0:6,3:0|1:98544262_G_A:98544262:0,18,0,3
chr3	98544274	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:0|1:98544262_G_A:98544262:0,18,0,3
chr3	98544304	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0|1:98544304_T_C:98544304:1,6,0,3
chr3	98544323	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:98544304_T_C:98544304:1,4,0,3
chr3	99569744	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=83,110;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:21,0:21,3:0|1:99569744_T_C:99569744:18,25,0,3
chr3	99569748	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=82,110;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:19,0:19,3:0|1:99569744_T_C:99569744:18,24,0,3
chr3	99648973	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:99648973_A_G:99648973:0,1,0,1
chr3	99648974	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:99648973_A_G:99648973:0,1,0,1
chr3	99895257	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=89,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.165:21:8,1:9,2:6,12,1,2
chr3	100014096	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:10,1:6,2:8,8,2,1
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,2,16
chr3	100015166	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,2,2
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=181,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:2,2:3,1:5,0,2,2
chr3	100020974	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:17,3:25,0:25,17,3,0
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	100053530	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100053530_T_TGGGGGGG:100053530:0,0,1,0
chr3	100053535	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100053530_T_TGGGGGGG:100053530:0,0,1,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	100057922	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:100057922_T_TA:100057922:14,5,1,1
chr3	100057924	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:100057922_T_TA:100057922:14,5,1,1
chr3	100058629	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,1:4,1:6,2,2,0
chr3	100060075	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,201020;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:1,12,2,0
chr3	100065156	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=84,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:0|1:100065156_G_A:100065156:1,9,0,2
chr3	100065166	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=100,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:2,1:0|1:100065156_G_A:100065156:1,11,0,2
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr3	100087080	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:2,1:0|1:100087080_GA_G:100087080:0,4,0,1
chr3	100087082	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:100087080_GA_G:100087080:0,4,0,1
chr3	100087085	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:100087080_GA_G:100087080:0,4,0,1
chr3	100087093	.	C	CATATCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=242,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100087080_GA_G:100087080:0,2,0,1
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,8
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,8
chr3	100100679	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	100148585	.	AGAT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=118,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAT;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:23,0:10,4:24,12,2,2
chr3	100148679	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:32,0:20,4:22,30,0,4
chr3	100170600	.	A	ATCCTAGAAGGCATTCTCATGAGGACCAGGAATTCCGATGCCGATCGTCTGACCGTCT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.937:23:5,2:5,3:3,7,6,7
chr3	100170628	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,57;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.219:12:4,0:6,2:0|1:100170628_A_G:100170628:5,5,1,1
chr3	100170634	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,57;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:4,0:4,2:0|1:100170628_A_G:100170628:6,4,1,1
chr3	100170825	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,21:0,0,17,14
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0,0,2,12
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:1,6,0,4
chr3	100362387	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:6,7:11,0:7,10,7,0
chr3	100368475	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,3:6,0,3,0
chr3	100368668	.	G	GGGCAGACTGGAGATTGTACGCCTGGC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:0,12,1,1
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	100438784	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,10:0,0,13,1
chr3	100438797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,30,27;MFRL=140,126,125;MMQ=60,60,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.21,4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,6:0.193,0.215:26:1,1,3:14,4,2:11,4,8,3
chr3	100447791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=268,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr3	100455609	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	100463651	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,26,23;MFRL=108,149,135;MMQ=60,60,60;MPOS=28,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=TG;STR;TLOD=4.57,7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,2,5:0.070,0.131:37:17,1,1:10,1,4:23,7,6,1
chr3	100471889	.	T	TCTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=183,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100471889_T_TCTCC:100471889:0,1,0,1
chr3	100471891	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=183,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100471889_T_TCTCC:100471889:0,1,0,1
chr3	100515197	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.400:16:6,0:4,6:7,3,5,1
chr3	100566555	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:0,3,0,8
chr3	100566621	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:100566621_T_TA:100566621:0,1,0,1
chr3	100566623	.	G	GACTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100566621_T_TA:100566621:0,1,0,1
chr3	100567581	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:5,6:2,0:7,1,6,0
chr3	100567592	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:10,4:1,1:11,0,3,2
chr3	100567799	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=94,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr3	100567811	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr3	100570787	.	T	TAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	100570801	.	A	AAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100570801_A_AAAC:100570801:0,2,0,1
chr3	100570802	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100570801_A_AAAC:100570801:0,2,0,1
chr3	100570804	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100570801_A_AAAC:100570801:0,2,0,1
chr3	100581261	.	AT	A,ATT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,24,23;MFRL=205,94,172;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.19,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.336,0.410:9:1,3,0:0,0,3:1,1,4,3
chr3	100585694	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:2,5:8,4:7,3,4,5
chr3	100593748	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:8,10,0,2
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,7:6,6:7,7,10,3
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr3	100617680	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:3,5:26,3:22,7,3,5
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr3	100621646	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	100645259	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:12,5:18,0:16,14,5,0
chr3	100963462	.	GG	TA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:12,0:10,16,1,1
chr3	100964785	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:5,9,1,1
chr3	100995616	.	GA	TC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:17,0:17,2:11,23,1,1
chr3	101062815	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr3	101070563	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:10,2:0|1:101070563_T_C:101070563:10,16,1,1
chr3	101070568	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:10,2:0|1:101070563_T_C:101070563:10,17,1,1
chr3	101070576	.	GT	AA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:9,2:0|1:101070563_T_C:101070563:8,17,1,1
chr3	101070579	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:101070563_T_C:101070563:5,17,1,1
chr3	101070583	.	TTCAAAGTCTAC	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:7,2:0|1:101070563_T_C:101070563:5,21,1,1
chr3	101080605	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.120:56:14,6:36,0:29,21,5,1
chr3	101083864	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:5,2:4,8,1,1
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	101085683	.	TAAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	101091066	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:101091066_C_CT:101091066:1,1,0,1
chr3	101091069	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101091066_C_CT:101091066:1,1,0,1
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:3,1:0,6,0,6
chr3	101220087	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,0:1,8:0,1,0,8
chr3	101232060	.	A	AGGTGAAATGAAATGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=191,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.485:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	101370544	.	A	AAGAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=263,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:101370544_A_AAGAAAG:101370544:0,2,0,1
chr3	101370549	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=263,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101370544_A_AAGAAAG:101370544:0,2,0,1
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:4,2:0,7:4,0,8,1
chr3	101378927	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr3	101383817	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,0:17,2:0|1:101383817_T_A:101383817:21,15,1,1
chr3	101383821	.	G	GACAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:16,0:18,2:0|1:101383817_T_A:101383817:20,15,1,1
chr3	101399910	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.272:24:6,2:9,4:11,7,5,1
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr3	101446131	.	GTGTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	101540149	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr3	101572636	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.074:64:26,4:33,0:30,30,1,3
chr3	101573345	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr3	101573577	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:6,0:7,2:1,12,0,3
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:7,1,3,1
chr3	101575877	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,3:8,0:0|1:101575877_AT_A:101575877:14,1,3,0
chr3	101575881	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.245:20:7,1:6,4:15,0,4,1
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.605:20:4,5:4,7:7,1,12,0
chr3	101575883	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:0|1:101575877_AT_A:101575877:19,2,3,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=177.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,18:0,16:0,0,16,24
chr3	102189169	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,3,1
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,15,2
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.279:19:6,2:7,2:11,3,5,0
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:4,0,3,1
chr3	105252466	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:18,5:14,0:20,12,5,0
chr3	105264025	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,3:4,3:5,1,4,2
chr3	105266412	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr3	105271355	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=93,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:19,1:23,2:21,21,1,2
chr3	105271389	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=86,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.087:51:16,0:31,4:26,21,1,3
chr3	105378022	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=97,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:19,2:15,0:17,17,2,0
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	105438957	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:5,3:7,5:6,6,5,4
chr3	105438988	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=128,115;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:0|1:105438988_C_T:105438988:14,9,0,2
chr3	105438995	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=124,115;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:0|1:105438988_C_T:105438988:15,8,0,2
chr3	105439026	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:7,7:5,3:6,6,6,4
chr3	105439145	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,1,9
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr3	105459357	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:13,8,2,0
chr3	105470204	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:8,0,2,0
chr3	105470416	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:25,1:22,2:17,31,3,0
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr3	107508709	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.125:62:35,0:19,7:30,25,0,7
chr3	107770917	.	T	TAAAATATGAAAAGTGATACTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	107770938	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,2:1,7:0,4,0,9
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	107925396	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:7,0,8,1
chr3	107932777	.	C	CACACACACACACA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:17,3:9,0:11,16,2,2
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	107937544	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=108,973;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=167,267;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.469:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr3	107938240	.	GG	CA,CG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,33,29;MFRL=112,117,157;MMQ=60,60,60;MPOS=3,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.27,49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,18:0.115,0.570:31:3,2,7:7,1,11:7,3,10,11
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	108072425	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,1:6,5:4,8,1,5
chr3	108072524	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=98,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:12,10:5,1:8,9,7,4
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	108076759	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:12,18,2,0
chr3	108094730	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=219,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:108094730_T_A:108094730:0,2,0,1
chr3	108094732	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=219,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:108094730_T_A:108094730:0,2,0,1
chr3	108094734	.	GGCC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=120,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108094730_T_A:108094730:0,1,0,1
chr3	108094739	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=120,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108094730_T_A:108094730:0,1,0,1
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr3	108100387	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=116,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:7,3:17,0:15,10,3,0
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	108107925	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:1,4,2,6
chr3	108107951	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,1,4
chr3	108117694	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,5:8,0:4,10,3,2
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,0,8,1
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=188,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.836:10:0,6:0,3:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,1,8,1
chr3	108135680	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,3:8,4:8,7,2,5
chr3	108135799	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr3	108139955	.	GTCTTT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:6,11,0,2
chr3	108140148	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.838:17:0,3:2,8:2,0,14,1
chr3	108147662	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:13,0:13,3:10,16,2,1
chr3	108147728	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=539,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,3:1,5:1,2,2,6
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr3	108158621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:108158621_C_T:108158621:4,5,1,1
chr3	108158630	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:108158621_C_T:108158621:5,5,1,1
chr3	108158645	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=40,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:5,2:0|1:108158645_T_A:108158645:1,9,1,1
chr3	108158648	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=80,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:6,2:0|1:108158645_T_A:108158645:4,9,1,1
chr3	108158650	.	G	GAAC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=80,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:8,2:0|1:108158645_T_A:108158645:4,9,1,1
chr3	108158652	.	G	GCCA	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:8,1:0|1:108158645_T_A:108158645:4,8,1,1
chr3	108159977	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:6,8:9,8:5,10,5,11
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:4,0,7,3
chr3	108175734	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.202:23:5,3:11,1:5,14,1,3
chr3	108179201	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=126,159;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:10,0:19,3:19,11,0,3
chr3	108179219	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:1,3:4,2:1,6,1,5
chr3	108188993	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,5:7,8:5,7,5,8
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr3	108195406	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:2,3,0,8
chr3	108211869	.	A	AAAGG,AAAGGAAGGAAGGAAGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28,17;MFRL=94,162,97;MMQ=60,45,48;MPOS=17,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,10;RU=AAGG;STR;TLOD=23.83,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,5:0.497,0.355:14:1,4,0:1,3,0:2,0,12,0
chr3	108224632	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:15,3:28,0:26,19,3,0
chr3	108224685	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=153,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.652:11:0,0:3,3:0,4,1,6
chr3	108229437	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=88,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.730:20:3,6:0,1:2,3,7,8
chr3	108271012	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=55,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,2:0,5:1,1,6,1
chr3	108284358	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=181,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:0,0:6,2:0|1:108284358_T_C:108284358:0,6,1,1
chr3	108284361	.	G	GGTATGGAAGTAAGCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=167,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:4,2:0|1:108284358_T_C:108284358:0,5,1,1
chr3	108284363	.	C	CTA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=167,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:0,0:5,2:0|1:108284358_T_C:108284358:0,5,1,1
chr3	108286947	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,7:0,0,10,3
chr3	108327076	.	A	AAAAGCCTTTTATGTATAATTCAGAGTTATTCTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	108344636	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.807:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26,34;MFRL=0,90,135;MMQ=60,60,60;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.55,34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,14:0.223,0.730:18:0,3,4:0,1,8:0,0,2,16
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr3	108363318	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:5,0:6,5,2,0
chr3	108403198	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.353:23:12,4:3,3:3,12,2,6
chr3	108474567	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.653:15:3,6:2,4:4,1,9,1
chr3	108549716	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108549716_G_A:108549716:0,1,0,1
chr3	108549720	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108549716_G_A:108549716:0,1,0,1
chr3	108557820	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	108635099	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:1,2,1,3
chr3	108678002	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr3	108682212	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:5,2,2,0
chr3	108682218	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	108688427	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr3	108688654	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=216,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108688654_A_T:108688654:0,1,0,1
chr3	108688655	.	G	GAATGTACTAATCCTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=216,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:108688654_A_T:108688654:0,1,0,1
chr3	108690076	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=159,218;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,5:2,0:6,1,5,0
chr3	108690221	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=197,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,11:0,8:0,1,10,9
chr3	108703518	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr3	108703548	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr3	108703702	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=96,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.850:20:3,9:0,7:2,1,12,5
chr3	108724093	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:12,0:14,6:15,11,0,6
chr3	108725848	.	ATTGC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:0,0,8,1
chr3	108725862	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:0,0,8,1
chr3	108725984	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	108746836	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	108754146	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:6,2,4,1
chr3	108754320	.	T	TA,TAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28,27;MFRL=0,135,155;MMQ=60,60,41;MPOS=24,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.34,12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.274,0.642:8:0,0,2:0,2,4:0,0,1,7
chr3	108754404	.	G	GTTTCAGAGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=286,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:108754404_G_GTTTCAGAGGC:108754404:0,1,0,1
chr3	108754406	.	T	TAATTATTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=286,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108754404_G_GTTTCAGAGGC:108754404:0,1,0,1
chr3	108773772	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,3,20
chr3	108778730	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.360:17:3,3:8,2:3,8,1,5
chr3	108782160	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=94,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:5,3,6,1
chr3	108833323	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:108833323_GG_CA:108833323:1,3,0,1
chr3	108833326	.	G	GATTATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:108833323_GG_CA:108833323:1,3,0,1
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	109027215	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:109027215_C_CT:109027215:0,0,0,1
chr3	109027231	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=214,225;MMQ=47,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109027215_C_CT:109027215:0,1,0,1
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr3	109047928	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:13,9:10,6:15,8,9,6
chr3	109049720	.	C	CTAAGGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr3	109052935	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr3	110791113	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	110830802	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,2:12,0:16,0,2,0
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.396:10:3,1:3,2:0,6,0,4
chr3	111313854	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,10,12
chr3	111316886	.	C	CTTATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr3	111319654	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=147,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,3:13,0:0|1:111319654_A_T:111319654:15,12,3,0
chr3	111319659	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,3:13,0:0|1:111319654_A_T:111319654:16,12,3,0
chr3	111439813	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr3	111564839	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,16,5
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	111651285	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:3,5,5,6
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,19,11
chr3	111672825	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,9:3,2:6,2,5,6
chr3	111685374	.	G	GGT,GGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31,24;MFRL=128,103,126;MMQ=60,60,46;MPOS=18,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,14;RU=GT;STR;TLOD=10.48,7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,3:0.445,0.292:11:2,2,1:0,3,0:2,1,7,1
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	111688578	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.301:41:16,1:13,9:0|1:111688578_C_T:111688578:18,11,7,5
chr3	111688588	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=105,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,12:0.324:38:16,1:9,10:0|1:111688578_C_T:111688578:17,9,7,5
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.270:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.559:14:2,6:4,2:6,0,7,1
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,6:0,0,6,3
chr3	111730573	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,2:10,0:13,6,0,2
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,15,10
chr3	111730766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:0,5,0,5
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,25,5
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,6,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:9,5:6,4:3,12,3,6
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:6,4:8,5:5,9,3,6
chr3	111795940	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,37;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:12,3:20,1:12,21,3,1
chr3	111799845	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,28:0,25:0,0,22,31
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,4:4,4:2,8,1,7
chr3	111821782	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,22:0.402:55:15,14:18,8:20,13,9,13
chr3	111821825	.	TATA	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:16,0:8,2:5,20,1,1
chr3	111828384	.	G	GT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.502:38:10,7:9,12:11,8,8,11
chr3	111828476	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:12,11:3,7:5,10,5,13
chr3	111828513	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:3,0:3,20:0,6,0,20
chr3	111842298	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=101,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.468:32:9,14:7,0:13,4,0,15
chr3	111842363	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.244:43:15,10:18,0:17,16,10,0
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=145,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:12,12:7,6:10,9,11,7
chr3	111860114	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:11,0:24,2:12,25,1,1
chr3	111860222	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	111873902	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.750:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr3	111888172	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:4,9,0,3
chr3	111899418	.	A	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,21:0.261:82:20,20:37,0:31,30,21,0
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:3,3:12,6:12,3,7,2
chr3	111926950	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	111936207	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr3	111958679	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:5,1,4,0
chr3	111958862	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=109,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:2,6,0,5
chr3	111981878	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=98,102;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:11,2:9,5:11,9,4,3
chr3	111981924	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.328:31:12,4:8,5:5,16,3,7
chr3	111983157	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=48,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.592:47:1,12:18,16:10,9,14,14
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:11,3:13,6:5,19,3,6
chr3	111985006	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:5,11:4,0:0|1:111985006_G_T:111985006:8,2,11,0
chr3	111985013	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:7,11:4,0:0|1:111985006_G_T:111985006:9,2,11,0
chr3	111985048	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=127,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:7,1:5,5:7,5,5,1
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,2:1,6:3,0,7,1
chr3	111993915	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:7,4:3,5:4,6,0,9
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	112066360	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:7,5:8,5:13,3,8,2
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.482:18:4,3:5,4:2,8,0,8
chr3	112253233	.	AAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,6:0,0,14,4
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,8:0,0,15,4
chr3	112325924	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:112325924_T_A:112325924:1,0,1,0
chr3	112325933	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:112325924_T_A:112325924:2,0,1,0
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	112545910	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,7,9
chr3	112647613	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	112647832	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:7,3:5,8:2,10,4,7
chr3	112650079	.	G	GCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=71,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112650079_G_GCCT:112650079:1,2,0,1
chr3	112650083	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=71,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:112650079_G_GCCT:112650079:1,2,0,1
chr3	112650085	.	C	CAACTTAACATAACAGTGGCTTTGATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=124,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	112666859	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	112693753	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,2,0
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr3	112710242	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,1:4,4:0,11,1,4
chr3	112732309	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,0:0,3:0,2,0,4
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	112969733	.	C	CTCAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	112969736	.	C	CCATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0|1:112969736_C_CCATG:112969736:0,1,0,1
chr3	112969740	.	G	GGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112969736_C_CCATG:112969736:0,1,0,1
chr3	112969743	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112969736_C_CCATG:112969736:0,1,0,1
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	113003578	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.193:18:9,1:6,2:9,6,2,1
chr3	113004155	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr3	113005754	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=220,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr3	113084787	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,2:1,0:4,6,2,0
chr3	113098098	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=160,297;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113098098_A_T:113098098:2,0,1,0
chr3	113098106	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=160,297;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:113098098_A_T:113098098:2,0,1,0
chr3	113099664	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	113099813	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:6,0:9,2:0|1:113099813_A_C:113099813:8,9,1,1
chr3	113099818	.	A	AACT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=137,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,1:0|1:113099813_A_C:113099813:9,11,1,1
chr3	113115401	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:1,2:7,0:3,5,1,1
chr3	113118798	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=127,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.191:45:22,0:15,8:17,20,0,8
chr3	113118827	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.154:56:31,0:17,8:19,29,0,8
chr3	113119301	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	113125768	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:13,7,0,2
chr3	113145106	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:13,0:12,6:0|1:113145106_G_A:113145106:10,17,0,6
chr3	113145108	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:13,0:11,6:0|1:113145106_G_A:113145106:10,17,0,6
chr3	113164109	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,13:0,1:0,0,11,3
chr3	113169352	.	T	TTTGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,0:5,2:3,10,1,1
chr3	113169372	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=18,16,17;MFRL=121,93,55;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.59,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,2:0.409,0.214:11:0,0,0:0,2,0:0,4,1,6
chr3	113175944	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	113207758	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=108,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:2,4:0,9:1,1,10,3
chr3	113211957	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	113213069	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,3,0,1
chr3	113213071	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,3,0,1
chr3	113213074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,2,0,1
chr3	113213078	.	A	ATTCAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,25;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,2,0,1
chr3	113213080	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,2,0,1
chr3	113213082	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113213069_G_C:113213069:0,2,0,1
chr3	113218206	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr3	113222099	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=82,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.307:20:1,3:11,2:3,11,2,4
chr3	113285185	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27,25;MFRL=97,0,115;MMQ=60,47,60;MPOS=12,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=TG;STR;TLOD=4.55,9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.272,0.558:8:0,1,2:1,1,1:1,0,5,2
chr3	113285423	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=94,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,1:1,7:1,3,2,6
chr3	113300183	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,8,8
chr3	113300351	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:2,3,0,3
chr3	113300390	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr3	113302425	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr3	113338691	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=175,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	113346580	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chr3	113376110	.	TTGCTGCTGC	T,TTGCTGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26,28;MFRL=139,170,234;MMQ=60,60,60;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,11;RU=TGC;STR;TLOD=9.90,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.482,0.239:5:1,2,1:0,1,0:0,1,2,2
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr3	113442402	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,5:0,4,0,5
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.321:20:5,1:8,5:6,8,1,5
chr3	113497507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr3	113497562	.	CTTAT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTAT;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,2:5,0:17,0,2,0
chr3	113497611	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:24,0:14,2:20,19,1,1
chr3	113503001	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,144;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:8,6:4,0:10,2,7,0
chr3	113503354	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	113507801	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113507801_T_C:113507801:0,0,0,1
chr3	113507806	.	T	TAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113507801_T_C:113507801:0,0,0,1
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=67,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr3	113517024	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,3:4,0:14,0,3,0
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.765:21:3,8:2,8:1,4,8,8
chr3	113524271	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,2:18,0:0|1:113524271_G_A:113524271:15,21,1,1
chr3	113524274	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:17,2:18,0:0|1:113524271_G_A:113524271:16,20,1,1
chr3	113528102	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=149,153;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	113528146	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,5:9,0:9,8,5,0
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr3	113634534	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=88,164;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:7,6,4,0
chr3	113655096	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	113656833	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=188,156;MMQ=46,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr3	113664183	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,5:1,1:2,0,5,1
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	113723671	.	GCCTTTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=193,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113723671_GCCTTTT_G:113723671:0,1,0,1
chr3	113723678	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=193,133;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113723671_GCCTTTT_G:113723671:0,1,0,1
chr3	113737568	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=98,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,5:5,8:9,2,5,8
chr3	113750509	.	TTTCAATTTCCTTTTTCTTTCCTTCACCATTTTTTCCTCATCTG	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:15,0:5,2:0|1:113750509_TTTCAATTTCCTTTTTCTTTCCTTCACCATTTTTTCCTCATCTG_T:113750509:21,23,1,1
chr3	113750555	.	AG	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:21,0:4,2:0|1:113750509_TTTCAATTTCCTTTTTCTTTCCTTCACCATTTTTTCCTCATCTG_T:113750509:14,16,1,1
chr3	113750557	.	AATGTGAG	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:20,0:6,2:0|1:113750509_TTTCAATTTCCTTTTTCTTTCCTTCACCATTTTTTCCTCATCTG_T:113750509:14,19,1,1
chr3	113750567	.	CTTTG	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:19,0:10,2:0|1:113750509_TTTCAATTTCCTTTTTCTTTCCTTCACCATTTTTTCCTCATCTG_T:113750509:15,19,1,1
chr3	113750725	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=250,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	113755447	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=110,104;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.103:41:19,3:17,0:24,13,4,0
chr3	113755477	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=109,104;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.125:45:22,4:18,0:17,23,4,1
chr3	113785149	.	ATATGT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=96,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.311:43:14,6:16,6:14,16,5,8
chr3	113795834	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:0,4,1,5
chr3	113795865	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	113804837	.	G	GACTCTTCTGGATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	113858350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,6,3
chr3	113858630	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113858630_G_T:113858630:0,2,0,1
chr3	113858632	.	GC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=167,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113858630_G_T:113858630:0,2,0,1
chr3	113955055	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=105,133;MMQ=27,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,5:0,2:1,0,6,1
chr3	113955164	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:113955164_T_G:113955164:0,0,5,10
chr3	113955187	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:0|1:113955164_T_G:113955164:4,4,2,6
chr3	114069662	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,9:4,0:4,7,0,9
chr3	114070529	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,0:15,2:0|1:114070529_T_A:114070529:17,10,1,1
chr3	114070533	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:13,2:0|1:114070529_T_A:114070529:17,10,1,1
chr3	115342448	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,11:4,0:11,0,11,0
chr3	115439576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,1,1
chr3	115529068	.	ATCTC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=89,0;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=TC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	115529176	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:18,3:2,0:8,12,0,3
chr3	115805476	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:0,10,0,2
chr3	116163868	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,0:7,9:8,10,1,8
chr3	118621506	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:5,7,3,0
chr3	118865366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=222,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,5:2,5:0,2,8,2
chr3	118865801	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=331,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,1:1,8:0,1,9,0
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	118867047	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,12,14
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr3	118905637	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=81,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:11,11,0,2
chr3	118906560	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.223:13:0,1:3,1:10,0,3,0
chr3	118906921	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	118913318	.	T	TGGTCCAAAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=225,251;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118913318_T_TGGTCCAAAATC:118913318:0,1,0,1
chr3	118913321	.	G	GTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=225,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118913318_T_TGGTCCAAAATC:118913318:0,1,0,1
chr3	118918089	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	118922650	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,5:0,15:0,0,16,4
chr3	118948618	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	118948716	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,5:6,4:7,5,6,4
chr3	119101039	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	119101885	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,1:2,1,4,0
chr3	119101925	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=86,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:5,6:1,3:4,3,8,1
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=88,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:5,4:7,4:0|1:119128628_A_G:119128628:4,9,3,5
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=88,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:6,4:7,5:0|1:119128628_A_G:119128628:5,9,3,6
chr3	119134043	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=110,101;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:7,9,0,2
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=106,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,2:9,9:9,8,9,2
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:5,6:10,5:9,6,9,2
chr3	119204063	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,158;MMQ=54,44;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.579:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	119222543	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=31814727,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:119222543_GTT_G:119222543:0,2,0,1
chr3	119222546	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=31814727,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:119222543_GTT_G:119222543:0,2,0,1
chr3	119222554	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:119222543_GTT_G:119222543:0,1,0,1
chr3	119222556	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:119222543_GTT_G:119222543:0,1,0,1
chr3	119246741	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr3	119263392	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:10,8,2,0
chr3	119301062	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,2:12,0:0|1:119301062_G_A:119301062:15,14,1,1
chr3	119301069	.	GGTACTACAA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=124,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,2:9,0:0|1:119301062_G_A:119301062:14,13,1,1
chr3	119305075	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:3,3:6,6:6,3,6,3
chr3	119305379	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr3	119306727	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr3	119348345	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.200:12:2,0:1,2:2,8,0,2
chr3	119361250	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.749:22:3,6:2,10:5,0,17,0
chr3	119361412	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=98,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:3,3,4,6
chr3	119367390	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr3	119373257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:1,0,11,4
chr3	119378941	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,0:12,6:15,12,0,6
chr3	119379186	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:1,10:2,6:1,2,9,7
chr3	119379369	.	C	CTACCACACACACACACCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	119394168	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=212,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	119526349	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=207,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	119526372	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=155,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	119533733	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:1,1,2,0
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,2,2
chr3	119533910	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr3	119562014	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=185,75;MMQ=44,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:8,0,1,1
chr3	119562149	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:25,3:14,0:14,25,1,2
chr3	119631738	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=110,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr3	119666266	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	119892121	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:4,0,7,1
chr3	119892378	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,0:5,6:0,6,0,6
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,8:1,2:3,4,5,5
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:2,2:1,3,3,4
chr3	120050123	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.115:32:15,3:12,0:0|1:120050123_G_A:120050123:18,11,1,2
chr3	120050126	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.119:31:15,1:12,0:0|1:120050123_G_A:120050123:17,11,1,2
chr3	120118888	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=141,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120118888_C_CTT:120118888:0,1,0,1
chr3	120118889	.	A	ACTATCTTTAACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=141,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120118888_C_CTT:120118888:0,1,0,1
chr3	120130883	.	GACACACACACACACATACATGC	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=196,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.237:20:10,0:4,4:0,16,0,4
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.855:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	120130930	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=-14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	120134720	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=45,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:7,4,2,0
chr3	120134883	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,2:4,5:3,7,2,5
chr3	120169641	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	120369575	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=224,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr3	120371369	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.940:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr3	120394647	.	C	CACGT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:120394647_C_CACGT:120394647:5,4,1,1
chr3	120394649	.	GGC	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:120394647_C_CACGT:120394647:5,4,1,1
chr3	120394652	.	AGG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:120394647_C_CACGT:120394647:5,4,1,1
chr3	120394662	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:0|1:120394647_C_CACGT:120394647:5,4,1,1
chr3	120400843	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	120489531	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=97,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:7,2,3,0
chr3	120495543	.	C	CCAAGGTAATTTTCTATGTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	120628480	.	GGCAGTGGTAGCA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:10,0:15,16,1,1
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	121126500	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=217,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,10:3,1:2,5,5,6
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:1,2,1,4
chr3	121151703	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=169,84;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,0:8,6:0|1:121151703_G_C:121151703:15,1,0,6
chr3	121151705	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,84;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,0:10,6:0|1:121151703_G_C:121151703:15,1,0,6
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	121195302	.	TACAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:0,0:0,3:2,0,3,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	121202433	.	TA	T,TAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,28,22;MFRL=130,166,77;MMQ=60,60,60;MPOS=26,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=5.23,5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,8,7:0.272,0.234:28:7,4,2:4,2,3:4,9,5,10
chr3	121208833	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=89,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,7:1,1:1,3,3,5
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	121230865	.	A	AAGTAACAGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr3	121239025	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121239025_C_T:121239025:1,1,0,1
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121239025_C_T:121239025:1,1,0,1
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,10,0
chr3	121340849	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=112,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:18,4:8,0:11,15,1,3
chr3	121341097	.	AGCAGCAGGACGTTCGTACAGCCATGGAAACCACAGGGCTTGCCCCTTG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,2:8,0:10,12,1,1
chr3	121350772	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.113:25:12,0:7,2:11,12,1,1
chr3	121351315	.	G	GGGCTCAGGCTCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GGCTCA;STR;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:2,2:2,4:2,2,2,5
chr3	121351338	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:4,7,0,3
chr3	121352068	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:4,1:5,2:4,8,2,1
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,5,17
chr3	121353291	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,6:4,2:1,4,0,8
chr3	121363604	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:121363604_G_C:121363604:10,3,1,1
chr3	121363612	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,2:9,0:0|1:121363604_G_C:121363604:11,5,1,1
chr3	121363680	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,4:5,5:5,4,4,5
chr3	121383297	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:3,5:3,3:4,2,5,3
chr3	121396051	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	121400725	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:1,3,1,4
chr3	121412838	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:11,3:13,0:18,7,4,0
chr3	121412854	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:15,6,3,0
chr3	121414061	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:3,5,4,5
chr3	121415720	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,32:0.601:53:9,18:12,14:13,8,12,20
chr3	121416721	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:23,7:20,0:22,22,7,0
chr3	121437312	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:8,14,2,1
chr3	121448675	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:6,1,1,1
chr3	121449851	.	A	ACACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=109,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:121449851_A_ACACC:121449851:1,3,0,1
chr3	121449852	.	G	GCATGTTCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=109,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:121449851_A_ACACC:121449851:1,2,0,1
chr3	121449854	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=109,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121449851_A_ACACC:121449851:1,2,0,1
chr3	121507371	.	CTTTTTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=215,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr3	121508903	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:5,6:4,8:7,2,14,0
chr3	121526152	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.427:23:7,7:6,3:7,6,8,2
chr3	121547527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=150,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr3	121554103	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=98,73;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.157:42:16,6:20,0:23,13,4,2
chr3	121554338	.	TGTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=213,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr3	121563285	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr3	121613297	.	GGA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GA;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:5,2:13,3,1,1
chr3	121631841	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,2:6,3,5,3
chr3	121634171	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=75,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:4,3:7,3:5,6,3,3
chr3	121634179	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:0|1:121634179_G_C:121634179:7,8,1,1
chr3	121634181	.	G	GTCTATTCTCTCTCT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:121634179_G_C:121634179:7,8,1,1
chr3	121634410	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr3	121641528	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	121641693	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:11,3:5,3:5,12,3,3
chr3	121642048	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=92,79;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,5:6,1:9,6,3,3
chr3	121643143	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.773:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr3	121643170	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:1,4:0,1:0,1,3,2
chr3	121643303	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:3,5,0,6
chr3	121643337	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr3	121643699	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	121643893	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=74,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,4:5,6:1,7,2,8
chr3	121646495	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,258;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	121646759	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=261,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	121647322	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:121647322_C_T:121647322:3,12,1,1
chr3	121647326	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:0|1:121647322_C_T:121647322:3,12,1,1
chr3	121647782	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:2,1,3,0
chr3	121648168	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=78,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,5:9,2:6,6,3,4
chr3	121658346	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=113,133;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:6,0:20,12:8,18,0,12
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,5:1,10:0,1,8,9
chr3	121828255	.	GGTGA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGA;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:6,0:6,11,1,1
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=80.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,11:0,13:0,0,6,18
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=209,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr3	122001099	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,6:7,3:8,5,5,4
chr3	122004098	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	122078800	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=115,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:24,4:15,0:12,27,0,4
chr3	122086960	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:6,2,4,1
chr3	122121563	.	T	TTTTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=159,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTC;STR;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.470:17:6,3:3,4:8,1,6,2
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:5,8:10,5:9,6,6,7
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	122168341	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,3,1
chr3	122172658	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=103,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.294:32:9,8:12,0:0|1:122172658_T_G:122172658:10,13,8,1
chr3	122172662	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=105,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:11,8:13,0:0|1:122172658_T_G:122172658:11,13,8,1
chr3	122259745	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:2,2:0,7,0,5
chr3	122259782	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,3:0,1:0,5,0,4
chr3	122269380	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	122269640	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.192:45:23,0:13,8:12,25,0,8
chr3	122345898	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:13,3:7,11,3,0
chr3	122354037	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:7,12:9,4:10,6,8,8
chr3	122354052	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,8:8,1:8,7,2,7
chr3	122354792	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:5,2:7,5:10,3,4,3
chr3	122414252	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.338:15:3,2:6,3:8,2,5,0
chr3	122414602	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	122418750	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:7,5:11,8:9,9,6,7
chr3	122422624	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:14,7,1,3
chr3	122432171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=366,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr3	122437321	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr3	122446642	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr3	122459290	.	G	GAGA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=87,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.289:22:9,3:7,3:6,10,1,5
chr3	122459732	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:5,3,3,5
chr3	122471407	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=22,27,27;MFRL=127,154,131;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.29,16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,15:0.078,0.569:27:5,2,9:2,0,1:4,6,11,6
chr3	122471578	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:13,2:0|1:122471578_A_T:122471578:1,21,0,2
chr3	122471579	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:122471578_A_T:122471578:1,21,0,2
chr3	122471581	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:122471578_A_T:122471578:1,21,0,2
chr3	122471585	.	GA	AC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:0|1:122471578_A_T:122471578:0,20,0,2
chr3	122471618	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr3	122474284	.	TAAA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:4,2:11,1:2,19,1,2
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:3,9:6,2:2,9,1,11
chr3	122478032	.	C	CCACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,70;MMQ=60,28;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,0:3,2:4,0,2,1
chr3	122512474	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.057:49:25,1:21,1:23,24,1,1
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	122598291	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr3	122598310	.	G	GTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0|1:122598310_G_GTC:122598310:0,3,0,1
chr3	122598312	.	A	ATTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:0,0:0|1:122598310_G_GTC:122598310:0,3,0,1
chr3	122598313	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,21;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:122598310_G_GTC:122598310:0,3,0,1
chr3	122629656	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,12;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,1:7,0:6,11,1,1
chr3	122658417	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:1,2,0,7
chr3	122667277	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.427:11:4,3:2,2:5,1,5,0
chr3	122679994	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=83,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:12,3:9,13,0,3
chr3	122680141	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,5:4,3:2,3,2,6
chr3	122680171	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,12,3
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,2,13
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,7,16
chr3	122829925	.	C	CAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=74,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	122843204	.	G	GTGTGCA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.166:31:12,4:14,1:0|1:122843204_G_GTGTGCA:122843204:8,18,2,3
chr3	122843211	.	TCA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.153:34:11,3:8,1:0|1:122843204_G_GTGTGCA:122843204:8,21,2,3
chr3	122864979	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:7,4:9,0:7,9,2,2
chr3	122873792	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=101,156;MMQ=60,28;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,6:9,0:12,3,6,0
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	122880696	.	TTCTC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TC;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:8,1,1,1
chr3	123003684	.	C	CTTATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=224,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	123008519	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:0,3:1,0,7,0
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,4:1,8:0,1,5,8
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	123018963	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:1,0,5,6
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0,0,11,3
chr3	123036946	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.194:22:7,0:11,3:9,9,0,4
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	123039651	.	A	AACT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:123039651_A_AACT:123039651:0,3,0,1
chr3	123039652	.	G	GGATGTTTAATATAAGAGTGTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:3,1:0,0:0|1:123039651_A_AACT:123039651:0,3,0,1
chr3	123039671	.	T	TATAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123039671_T_TATAAA:123039671:0,1,0,1
chr3	123039673	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123039671_T_TATAAA:123039671:0,1,0,1
chr3	123044395	.	G	GAGATGTCTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123044395_G_GAGATGTCTTTT:123044395:0,2,0,1
chr3	123044397	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123044395_G_GAGATGTCTTTT:123044395:0,2,0,1
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.431:19:4,3:6,5:9,2,7,1
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,5:0,6:0,1,3,8
chr3	123049678	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:2,1:5,10:5,2,11,0
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=96,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:8,3:6,5:11,4,7,2
chr3	123049938	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	123049949	.	C	CAAAACCAAGAAGGCCAGTGAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=76,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,3:0,3:0,1,8,0
chr3	123332875	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.632:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr3	123356963	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:123356963_C_T:123356963:11,7,1,1
chr3	123356968	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:123356963_C_T:123356963:11,7,1,1
chr3	123385217	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,1,5
chr3	123419680	.	TCTCCACGCGCCTCTTCAGCACCCCTCGCACGTCCTCGCCGTCTTC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=117,137;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.105:29:9,0:12,2:11,16,1,1
chr3	123426545	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:8,3,2,1
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,8,10
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	123444785	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:11,13:11,6:12,10,8,11
chr3	123452838	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=98,171;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:2,6:7,8:4,5,7,7
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr3	123458849	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:123458849_C_T:123458849:7,13,1,1
chr3	123458858	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=126,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:123458849_C_T:123458849:4,14,1,1
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,15:0,3:0,0,12,6
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=181,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.839:10:0,4:1,4:0|1:123650432_A_G:123650432:0,1,0,9
chr3	123650447	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.719:5:0,0:1,4:0|1:123650432_A_G:123650432:0,1,0,4
chr3	123650452	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0|1:123650432_A_G:123650432:0,1,0,3
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr3	123674879	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=25,25,25;MFRL=149,162,147;MMQ=60,60,60;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=11.49,8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,8,8:0.188,0.194:41:13,3,5:9,5,3:16,9,10,6
chr3	123699390	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr3	123983422	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=80,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.176:43:19,0:16,7:16,20,0,7
chr3	123988039	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.627:19:1,2:5,10:5,2,5,7
chr3	124045086	.	G	GCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,166;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	124048765	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:8,10,2,0
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr3	124132263	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr3	124132568	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr3	124175595	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:7,12,2,2
chr3	124180812	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:124180812_T_A:124180812:2,17,1,1
chr3	124180820	.	T	TGTATGTTCATGAAATTACA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,1:0|1:124180812_T_A:124180812:1,15,1,1
chr3	124181454	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,4:3,8:2,4,5,7
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	124201699	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:5,9:7,10:8,4,9,10
chr3	124207198	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:11,0:3,3:6,8,1,2
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,6:1,4:1,2,5,5
chr3	124351300	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.222:43:18,0:16,9:24,10,0,9
chr3	124376322	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,5:13,0:16,15,5,0
chr3	124385378	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:9,0:14,4:11,13,4,0
chr3	124397193	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=79,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,0:8,9:1,11,0,9
chr3	124578277	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:16,5,2,1
chr3	124642579	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	124642586	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124646594	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:8,9:12,10:10,10,10,9
chr3	124646705	.	A	AAAG	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=156.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,18:0,20:0,0,8,30
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	124696822	.	G	GCACTTTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:124696822_G_GCACTTTCA:124696822:0,4,0,1
chr3	124696825	.	G	GCTTAGTTCATTGCTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:124696822_G_GCACTTTCA:124696822:0,4,0,1
chr3	124696839	.	A	AATTAAACTAATTCATAAGCAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124696839_A_AATTAAACTAATTCATAAGCAAT:124696839:0,1,0,1
chr3	124696843	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124696839_A_AATTAAACTAATTCATAAGCAAT:124696839:0,1,0,1
chr3	124721234	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124721234_T_C:124721234:0,1,0,1
chr3	124721238	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124721234_T_C:124721234:0,1,0,1
chr3	124731485	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=70,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,6:9,4:10,6,8,3
chr3	124732618	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:13,7:3,1:9,7,4,4
chr3	124738107	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=114,80;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.347:20:5,3:8,2:7,6,4,3
chr3	124739596	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:124739596_C_G:124739596:6,0,1,1
chr3	124739597	.	A	AAG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:124739596_C_G:124739596:6,0,1,1
chr3	124739600	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:124739596_C_G:124739596:6,0,1,1
chr3	124739603	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:124739596_C_G:124739596:6,0,1,1
chr3	124739604	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:124739596_C_G:124739596:6,0,1,1
chr3	124739617	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,2:2,0:5,0,1,1
chr3	124746314	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,0:12,3:9,19,1,2
chr3	124746347	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,3:8,1:4,10,1,3
chr3	124807206	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.094:42:19,3:17,0:0|1:124807206_A_G:124807206:20,19,2,1
chr3	124807212	.	A	AGGCAGGAGAATCACTTGTACCAGGGAGGCGAGGT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:19,3:16,0:0|1:124807206_A_G:124807206:19,20,2,1
chr3	124811132	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:124811132_A_AT:124811132:0,0,0,1
chr3	124811137	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124811132_A_AT:124811132:0,0,0,1
chr3	124837684	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,15:0,15:0,0,17,13
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	124854636	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,4:1,5:0,6,3,6
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr3	124930044	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	124952480	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,0:8,5:8,3,5,0
chr3	124998098	.	C	CAA,CAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=63,138,146;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.69,18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,10:0.304,0.558:17:1,1,2:1,4,6:0,2,7,8
chr3	125172851	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.229:12:3,0:6,3:0,9,2,1
chr3	125179711	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:3,9,0,3
chr3	125179732	.	C	CATAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	125216334	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	125223456	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:7,10:16,7:11,12,7,10
chr3	125250956	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	125257511	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:1,3:5,4:1,6,1,6
chr3	125297715	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	125301711	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,6:4,9:5,5,11,4
chr3	125651602	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34,34;MFRL=89,132,161;MMQ=60,45,41;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.16,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,4:0.159,0.211:21:6,2,1:6,1,2:7,7,2,5
chr3	125701078	.	AGTAACTTTCTCCTCATTTTAT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,110;MMQ=52,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:3,0:8,3,1,1
chr3	125727574	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=99,700;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:8,7,2,0
chr3	125734272	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	125734465	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,1,4
chr3	125741592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr3	125775321	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:5,5,3,5
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=73,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:8,2,2,0
chr3	125786829	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=99,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:8,7,0,2
chr3	125786852	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=21,23;MFRL=86,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.802:23:3,8:1,11:2,2,12,7
chr3	125786879	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,14:0,0,14,17
chr3	125787126	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=230,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	125831787	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:0,3,0,1
chr3	125831789	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:0,3,0,1
chr3	125831791	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:0,3,0,1
chr3	125831794	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:0,3,0,1
chr3	125831802	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:0,3,0,1
chr3	125831805	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=139,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:125831787_C_T:125831787:1,2,0,1
chr3	125843400	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.551:13:2,2:2,5:4,2,4,3
chr3	125850193	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=196,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,2:2,0:5,0,2,0
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:3,4,3,3
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,0,3
chr3	125865736	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,0:5,3:5,6,1,2
chr3	125865755	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:5,6,1,2
chr3	125869428	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:0|1:125869428_T_C:125869428:3,10,0,2
chr3	125869436	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,141;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:125869428_T_C:125869428:2,10,0,2
chr3	125874388	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.616:3:1,0:0,2:0|1:125874388_C_A:125874388:0,1,1,1
chr3	125874392	.	C	CTAGATAATTTTTTGGATTTTTAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:125874388_C_A:125874388:0,1,1,1
chr3	125877277	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.229:15:5,0:7,3:6,6,1,2
chr3	126137503	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=169,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,1:9,2:8,5,2,1
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr3	126142181	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=144,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:10,0:5,15,1,3
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=114,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,0:2,5:2,5,2,3
chr3	126153259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr3	126158622	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	126160601	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=217,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr3	126180820	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,6:9,4:6,10,5,5
chr3	126181071	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	126190742	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:11,0,5,0
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	126216829	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	126219733	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr3	126219816	.	A	AGTGGCTTTATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	126220078	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=194,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,6:0,3,4,9
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	126261422	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,2:6,1:1,11,1,2
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	126423259	.	GGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=74,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr3	126451937	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:10,4:3,4:8,6,4,4
chr3	126452133	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr3	126676348	.	C	CTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,27;MMQ=60,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,2:9,0:0|1:126676348_C_CTT:126676348:8,10,1,1
chr3	126676349	.	G	GCCCCATTACTCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=113,27;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,2:8,0:0|1:126676348_C_CTT:126676348:8,10,1,1
chr3	126707647	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,2:6,5:6,7,3,4
chr3	126710433	.	G	GGCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=190,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:126710433_G_GGCTC:126710433:0,2,0,1
chr3	126710436	.	G	GCCTGTAATCACAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=190,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0|1:126710433_G_GGCTC:126710433:0,2,0,1
chr3	126710497	.	T	TAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	126722304	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,5,12
chr3	126733774	.	T	TCCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	126737466	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	126746843	.	GG	AA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,1:11,0:8,13,1,1
chr3	126751607	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:126751607_G_C:126751607:5,5,1,1
chr3	126751609	.	A	AGG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:126751607_G_C:126751607:5,5,1,1
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,2:0,15:0,0,7,10
chr3	126751702	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:5,2:0|1:126751702_G_A:126751702:4,8,1,1
chr3	126751708	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:126751702_G_A:126751702:3,8,1,1
chr3	126751710	.	T	TCAAACTCCTAATTTCA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:5,2:0|1:126751702_G_A:126751702:3,7,1,1
chr3	127294501	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:2,4,3,1
chr3	127295582	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=153,33381426;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:6,2:12,4,2,0
chr3	127295717	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:13,3:14,1:13,14,2,2
chr3	127298792	.	CCCTCA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	127335872	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,3:6,0:10,7,2,1
chr3	127335892	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,2:11,0:13,10,1,1
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr3	127381195	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,0:3,5:5,6,0,5
chr3	127387986	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:9,0:14,5:9,14,5,0
chr3	127388104	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,0:3,7:3,7,1,6
chr3	127388150	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	127395817	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:5,1,4,3
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	127396343	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=180,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,2:5,1:7,7,3,0
chr3	127410959	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,18192529;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	127775780	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=199,184;MMQ=50,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.223:7:1,0:0,0:0,6,0,1
chr3	127816365	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=173,35;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.319:9:2,0:3,2:0|1:127816365_GC_G:127816365:0,7,1,1
chr3	127816368	.	A	ACCTTCGGCTGACCGCAGGGCTTTGGCGGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=173,35;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:0|1:127816365_GC_G:127816365:0,5,1,1
chr3	127816373	.	A	AAGACCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=175,35;MMQ=60,42;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:127816365_GC_G:127816365:0,4,0,1
chr3	128181537	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,6:1,8:3,1,2,13
chr3	128181982	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:16,2:19,0:18,17,1,1
chr3	128182879	.	C	CGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:128182879_C_CGG:128182879:1,2,0,1
chr3	128182880	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:128182879_C_CGG:128182879:1,2,0,1
chr3	128182885	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr3	128292060	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr3	128292213	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,22:0,0,19,17
chr3	128292904	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:6,3:8,4:4,10,2,6
chr3	128348735	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	128363845	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,7:6,9:2,10,5,11
chr3	128369622	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	128614075	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,0:0,1:0,0,2,4
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,7,9
chr3	128624880	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	128629505	.	C	CTGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr3	128690137	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,2:18,0:0|1:128690137_G_A:128690137:13,22,1,1
chr3	128690142	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,2:21,0:0|1:128690137_G_A:128690137:13,23,1,1
chr3	128749461	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=147,8495060;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	128751840	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr3	128755814	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,5:2,9:2,3,6,9
chr3	128755953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr3	128755971	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	128840281	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,211;MMQ=60,32;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:11,0:13,5:0|1:128840281_G_T:128840281:6,18,0,5
chr3	128840287	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,211;MMQ=60,32;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:11,0:12,5:0|1:128840281_G_T:128840281:5,18,0,5
chr3	128849063	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:0,1:3,1:0|1:128849063_T_A:128849063:1,2,1,1
chr3	128849066	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:128849063_T_A:128849063:1,2,0,1
chr3	128849071	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:128849063_T_A:128849063:1,2,0,1
chr3	128849075	.	C	CATCTGTACATTACCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:0|1:128849063_T_A:128849063:1,2,0,1
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,17,1
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=101.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,5:0,13:0,0,16,8
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	128890350	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.981:46:0,23:0,23:0,0,19,27
chr3	128968642	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,9:4,5:0,9,4,10
chr3	128973978	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,1:8,2:3,8,0,3
chr3	128976451	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=109,173;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.316:23:7,4:9,3:7,9,6,1
chr3	128987730	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=72,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.489:25:6,12:5,0:7,6,12,0
chr3	128987899	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.687:23:3,6:3,9:3,4,5,11
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,12,5
chr3	129120716	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,0:2,14,0,2
chr3	129120743	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:0,3,0,4
chr3	129134161	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,63;MMQ=60,20;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.211:26:13,0:8,5:10,11,0,5
chr3	129137025	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	129140489	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,2:6,1:6,7,2,1
chr3	129147418	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:4,7:3,10:1,6,2,15
chr3	129151927	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:10,0:5,6:6,9,4,3
chr3	129152089	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:11,1:3,11:6,8,7,5
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	129153036	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr3	129155414	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.691:27:5,12:3,7:3,5,10,9
chr3	129156536	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:3,2:9,6:6,7,5,3
chr3	129168854	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34,34;MFRL=155,168,109;MMQ=60,60,60;MPOS=28,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=4.68,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.379,0.334:8:1,0,0:1,3,2:0,2,0,6
chr3	129179623	.	C	CTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=108,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,3:6,0,4,0
chr3	129180097	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:23,0:15,3:21,18,0,3
chr3	129183700	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr3	129185641	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,4,2
chr3	129185924	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:3,2:0,6,0,2
chr3	129197108	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr3	129198818	.	G	GAGGATGATGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=113,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	129202316	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:18,6:8,6:12,14,7,5
chr3	129207309	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,191;MMQ=43,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	129214511	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,2,2
chr3	129218944	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:1,4,3,6
chr3	129236447	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:21,0:11,6:17,15,1,5
chr3	129239055	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:0|1:129239055_C_CTT:129239055:7,3,1,1
chr3	129239056	.	A	AAATCTGAGAAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:129239055_C_CTT:129239055:7,3,1,1
chr3	129247551	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,3:3,3:3,1,5,2
chr3	129249728	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,72;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.191:29:15,0:9,5:13,11,1,4
chr3	129251263	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=152,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:3,5,2,1
chr3	129251275	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,0:2,1:5,1,0,4
chr3	129252604	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr3	129262076	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=111,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:6,6,2,1
chr3	129266162	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,0:4,3:4,2,3,1
chr3	129267976	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,0:21,3:28,15,0,3
chr3	129269963	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:8,0:20,4:0|1:129269963_C_T:129269963:13,16,2,2
chr3	129269969	.	C	CTGAAGAGAAGGGAAGAAAGGGATGA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:9,0:21,4:0|1:129269963_C_T:129269963:14,17,2,2
chr3	129275403	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr3	129275606	.	T	TTTAAGATGTAGTAGAGACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr3	129275619	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	129277481	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,16:0,7:0,0,13,10
chr3	129281832	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,0:4,4:3,5,2,2
chr3	129281866	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr3	129281980	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,3:0,0,8,6
chr3	129284415	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr3	129286531	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.330:22:6,2:9,5:2,13,5,2
chr3	129289831	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,8:4,2:6,5,6,4
chr3	129290104	.	GGGACGGGCAGGTGATGAGGGTGGAGTTGAGAACCTTGCAGAGCTGGTGCAGGAGAGCCAGGGGCCCAGGCCGGGATGCAGGAT	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.087:48:13,1:12,4:26,16,4,2
chr3	129290187	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=158,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:2,2:3,5:2,4,2,5
chr3	129293256	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,12,8
chr3	129294456	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:4,3:1,0:4,2,1,2
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	129546729	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,4:0,11:0,0,5,11
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr3	129695538	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr3	129695617	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=55,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:5,1,1,2
chr3	129695645	.	G	GAGAGAAAGAGGAGGAAAAGGAGGAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:7,1,1,1
chr3	129696105	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=75,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=118,139;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:12,3:4,2:10,6,3,2
chr3	129800823	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=114,181;MMQ=56,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:14,4:5,3:11,9,3,4
chr3	129800888	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=20,27;MFRL=118,147;MMQ=49,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:14,2:10,6:0|1:129800888_G_A:129800888:12,12,5,3
chr3	129800895	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=20,26;MFRL=110,147;MMQ=43,27;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.281:30:14,2:7,6:0|1:129800888_G_A:129800888:10,12,5,3
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=104,127;MMQ=38,28;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,2:4,4:0|1:129800934_C_G:129800934:2,8,2,6
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=104,127;MMQ=38,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,1:4,6:0|1:129800934_C_G:129800934:2,8,2,6
chr3	129800939	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=106,117;MMQ=29,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,4:7,3:3,8,1,6
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=202,143;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:3,4:0,6,1,4
chr3	129810976	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=136,117;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:22,4:17,0:21,18,3,1
chr3	129811872	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,166;MMQ=57,58;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.766:5:0,0:1,3:1,0,2,2
chr3	129815035	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr3	130095739	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=218,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:130095739_T_TGA:130095739:0,1,1,1
chr3	130095744	.	CC	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=218,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:130095739_T_TGA:130095739:0,1,1,1
chr3	130095747	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=218,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:130095739_T_TGA:130095739:0,1,1,1
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	130116972	.	G	GTTTTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=13,27;MFRL=177,142;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=20,25;RU=T;STR;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.833:9:0,7:0,0:0,1,3,5
chr3	130117031	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=141,155;MMQ=58,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,2:2,0:0,12,0,2
chr3	130122552	.	TACACAC	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=AC;STR;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:7,13:2,5:2,8,6,13
chr3	130124575	.	CTCCCTCAT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:130124575_CTCCCTCAT_C:130124575:0,2,0,1
chr3	130124589	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130124575_CTCCCTCAT_C:130124575:0,1,0,1
chr3	130124981	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,0:7,4:7,12,2,2
chr3	130132940	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:10,2:9,0:9,10,1,1
chr3	130134533	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=111,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:19,4:19,0:20,18,3,1
chr3	130135744	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr3	130139884	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	130142584	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr3	130142843	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr3	130145175	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr3	130148421	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,152;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,0:6,8:6,3,0,8
chr3	130148510	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,3:0,6:0,1,2,7
chr3	130162395	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,7,14
chr3	130187817	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr3	130188051	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,347;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:14,0:7,4:11,11,4,0
chr3	130202929	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	130282567	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=232,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr3	130284531	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=210,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:130284531_G_A:130284531:0,3,0,1
chr3	130284538	.	GGC	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=232,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130284531_G_A:130284531:0,1,0,1
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:8,3,2,2
chr3	130287090	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=95,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:130287090_C_T:130287090:6,8,1,1
chr3	130287100	.	A	ACAGTACATAGCATTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:9,2:0|1:130287090_C_T:130287090:6,9,1,1
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	130290229	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:1,12,1,2
chr3	130293255	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,0:17,2:12,14,0,2
chr3	130300413	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:4,1,4,4
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	130318670	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=87,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,3:11,0:10,11,1,2
chr3	130345313	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=105,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:15,7,1,1
chr3	130353391	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:6,0:8,7,0,2
chr3	130360600	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,0:2,4:2,3,2,3
chr3	130361715	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,3:6,1:8,5,3,1
chr3	130399602	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,73;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:5,0:6,7:3,8,1,6
chr3	130426048	.	T	TGTTTAATGATGGTCATCCTGAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	130426055	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130426055_G_A:130426055:0,1,0,1
chr3	130426057	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130426055_G_A:130426055:0,1,0,1
chr3	130426060	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130426055_G_A:130426055:0,1,0,1
chr3	130426061	.	G	GTTATTATTATCCATTCTTAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130426055_G_A:130426055:0,1,0,1
chr3	130447544	.	AAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:0,2:5,0:0|1:130447544_AAAG_A:130447544:0,5,0,2
chr3	130447553	.	A	AAATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:130447544_AAAG_A:130447544:0,5,0,2
chr3	130660344	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,0:7,11:0|1:130660344_T_A:130660344:8,1,12,0
chr3	130660350	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=47.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:2,0:5,12:0|1:130660344_T_A:130660344:7,1,12,0
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	130675110	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:130675110_G_T:130675110:0,3,0,1
chr3	130675111	.	G	GAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:130675110_G_T:130675110:0,3,0,1
chr3	130675112	.	C	CCTCTCTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:130675110_G_T:130675110:0,3,0,1
chr3	130675118	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:130675110_G_T:130675110:0,3,0,1
chr3	130688084	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,188;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,3:6,0:13,2,3,0
chr3	130733305	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	130733316	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:130733316_G_A:130733316:0,1,0,1
chr3	130733319	.	TCT	ATG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=230,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:130733316_G_A:130733316:0,2,0,1
chr3	130733325	.	C	CAGGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=230,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:130733316_G_A:130733316:0,2,0,1
chr3	130737345	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=91,148;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:13,3:2,0:9,6,3,0
chr3	130737360	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=108,148;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.136:24:16,2:5,0:13,8,3,0
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,1,5
chr3	130737648	.	C	CAATCCCTATCAAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:130737648_C_CAATCCCTATCAAAA:130737648:1,2,0,1
chr3	130737652	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:130737648_C_CAATCCCTATCAAAA:130737648:1,2,0,1
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,13:0,9:0,1,6,17
chr3	130947435	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=96,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,5:4,3,4,2
chr3	130947625	.	G	GCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	130992385	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:4,4:2,6:4,2,4,6
chr3	131101912	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,7:2,0:9,1,7,0
chr3	131102020	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,0:13,2:0|1:131102020_G_C:131102020:15,21,1,1
chr3	131102029	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:19,0:13,2:0|1:131102020_G_C:131102020:16,21,1,1
chr3	131102053	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=92,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.558:23:3,3:7,9:4,6,5,8
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	131271180	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	131404625	.	A	AAC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.636:12:1,3:3,4:3,1,6,2
chr3	131404641	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:12,2:5,7:16,2,5,4
chr3	131415340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:9,4,2,1
chr3	131418898	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=96,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0,2,0,1
chr3	132050652	.	T	TAGTTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=87,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:2,3:1,6:1,3,2,7
chr3	132068925	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=228,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=97,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:4,4,1,5
chr3	132166148	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.242:46:11,8:6,4:31,3,9,3
chr3	132173004	.	ATT	A,AT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=25,22,22;MFRL=107,162,110;MMQ=60,60,60;MPOS=30,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.42,9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,3,12:0.070,0.219:49:6,1,5:22,1,7:12,22,6,9
chr3	132179280	.	AT	A,ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,14,19;MFRL=206,139,208;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=8.63,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.464,0.327:7:0,0,1:0,1,0:0,1,0,6
chr3	132181477	.	G	GTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	132203441	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,0:11,4:10,11,2,2
chr3	132221076	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29,34;MFRL=0,178,193;MMQ=60,60,60;MPOS=8,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=16.20,5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,2:0.690,0.229:9:0,3,2:0,4,0:0,0,8,1
chr3	132221095	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:5,0:8,6,2,0
chr3	132294689	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,2:11,1:8,13,2,1
chr3	132297771	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:1,9,0,3
chr3	132324142	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132324142_T_G:132324142:0,1,0,1
chr3	132324144	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132324142_T_G:132324142:0,1,0,1
chr3	132401505	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,2:6,4:16,1,5,1
chr3	132402229	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,2:16,0:17,9,2,0
chr3	132427173	.	T	TCACCCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:132427173_T_TCACCCA:132427173:0,1,0,1
chr3	132427174	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132427173_T_TCACCCA:132427173:0,1,0,1
chr3	132435532	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,0:3,6:2,1,5,1
chr3	132438719	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	132438747	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	133099048	.	C	CGGGACAGGGCGTGATGAATTACCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	133099403	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,42;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:11,8,1,1
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:2,1,2,4
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	133114927	.	A	ATGTGGGGAAACTGATCTCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=223,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	133119496	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=239,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133119496_G_A:133119496:0,3,0,1
chr3	133119499	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=239,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133119496_G_A:133119496:0,3,0,1
chr3	133167363	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,3:0,2:2,2,0,5
chr3	133185848	.	ACT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=128,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	133327438	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:17,0:8,2:11,14,0,2
chr3	133329865	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,0:15,2:0|1:133329865_C_T:133329865:21,11,1,1
chr3	133329870	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,0:14,2:0|1:133329865_C_T:133329865:19,12,1,1
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,1:0,5:0,4,0,6
chr3	133341988	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:6,5:7,13:5,8,6,12
chr3	133368362	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=125,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:5,10:7,2:7,5,3,9
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	133379911	.	T	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,40:0.569:70:9,13:21,27:17,13,25,15
chr3	133467190	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:10,0,2,0
chr3	133476852	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,0,9
chr3	133483696	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr3	133485133	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr3	133489517	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:133489517_T_C:133489517:0,2,0,1
chr3	133489522	.	CTTCAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133489517_T_C:133489517:0,2,0,1
chr3	133494561	.	T	TGTGAGTACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=282,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	133525366	.	ACTTCTGTGAATTTCCCCACCCCAGCCATGCACATATACTGATTCCCAAGGCGTAATTTTTGTTGTTTTTCTCTGTCTATTCCACAGT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.238:40:1,7:1,3:23,6,10,1
chr3	133534447	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=109,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.129:44:20,5:19,0:21,18,5,0
chr3	133553527	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	133556964	.	ACCGTGCCGGGCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=343,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGTGCCGGGCC;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,4:0,1:1,0,7,0
chr3	133558543	.	CA	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133558543_CA_GC:133558543:0,3,0,1
chr3	133558544	.	A	ACAGGGGACTTTTAGGACCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=210,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,1:2,0:1|0:133558543_CA_GC:133558543:0,2,0,1
chr3	133560580	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	133583577	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	133648610	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=88,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,0:8,4:4,7,0,4
chr3	133661352	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	133670073	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,6:8,6:9,6,7,6
chr3	133670225	.	TG	CA,CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20,29;MFRL=143,70,92;MMQ=60,60,60;MPOS=10,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.14,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.187,0.219:11:3,2,0:4,0,2:2,5,1,3
chr3	133674044	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,7,2
chr3	133692743	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr3	133698280	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	133698349	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.709:29:2,14:6,6:3,5,15,6
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:8,1,8,1
chr3	133907834	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:133907834_GG_TA:133907834:0,1,0,1
chr3	133907839	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=251,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133907834_GG_TA:133907834:0,2,0,1
chr3	133907840	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=251,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133907834_GG_TA:133907834:0,2,0,1
chr3	133907842	.	AT	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=251,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133907834_GG_TA:133907834:0,2,0,1
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr3	134085070	.	GAAGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGT;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr3	134085341	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=202,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134085341_C_A:134085341:0,2,0,1
chr3	134085349	.	C	CTCAAGGCACCATCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=202,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:134085341_C_A:134085341:0,2,0,1
chr3	134086349	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:8,1:10,11,0,2
chr3	134086530	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:7,7,2,0
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:4,0,8,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:4,8:1,7:3,2,6,9
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,6:5,6:2,4,2,10
chr3	134264558	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:20,3:26,1:24,22,1,3
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	134266321	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,1,4
chr3	134277195	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=118,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:15,4:11,2:6,20,2,4
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,5,23
chr3	134322791	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:134322791_A_C:134322791:4,0,0,1
chr3	134322814	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:2,1:0|1:134322791_A_C:134322791:5,0,2,1
chr3	134323156	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,8,14
chr3	134329080	.	CCCAGGTGCTGTCCA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:10,2:18,0:19,20,1,1
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,2:2,2:8,2,3,1
chr3	134911443	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:11,0:13,12,0,2
chr3	135720673	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=77,86;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:4,6,2,4
chr3	135721036	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=106,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,3:3,1:10,3,4,0
chr3	135722183	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,131;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,0:9,6:8,7,0,6
chr3	135722197	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=138,131;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:12,0:14,6:11,15,0,6
chr3	135742057	.	G	GTGTTTTGTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=53107628,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TGTTT;STR;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,1,7
chr3	135759669	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.441:16:5,5:3,2:8,1,6,1
chr3	135759837	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,0:6,5:2,6,5,0
chr3	136035737	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr3	136035989	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:136035989_C_T:136035989:0,2,0,1
chr3	136035995	.	C	CTAAGTGACCTCGAATCCTGCACTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:136035989_C_T:136035989:0,2,0,1
chr3	136046628	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	136047762	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr3	136057142	.	AATT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,4:3,8:3,3,6,6
chr3	136059537	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	136088038	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,7,7
chr3	136139878	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	136287803	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=264,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	136574501	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,15:0.301:51:12,12:24,3:17,19,7,8
chr3	136574521	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,14:0.258:56:15,11:27,3:19,23,7,7
chr3	136574578	.	T	TTAA	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=102,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.333:43:16,5:13,9:12,17,7,7
chr3	136664735	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,2:14,1:13,13,2,1
chr3	136664978	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,3:10,1:9,11,3,1
chr3	136701207	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:136701207_T_C:136701207:3,5,1,1
chr3	136701213	.	C	CATATTTGTCTCTCCTTTCTCTGATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:136701207_T_C:136701207:3,5,1,1
chr3	136710947	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:12,0:11,4:7,17,0,4
chr3	136710960	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:9,2:8,0:0|1:136710960_C_G:136710960:5,13,1,1
chr3	136710968	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:136710960_C_G:136710960:3,13,1,1
chr3	137484494	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	137717991	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	137786442	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,10:3,8:4,4,10,8
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,463;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=96,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:1,5,6,4
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:5,4,3,5
chr3	137811400	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:7,5:0,3:3,4,2,6
chr3	137843018	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	137843476	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:7,12:6,10:4,9,12,10
chr3	137850003	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.611:21:1,3:7,10:2,6,5,8
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=86,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.401:42:8,4:18,12:14,12,11,5
chr3	137880743	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,45:0.460:97:23,20:29,25:21,31,15,30
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:0,8,1,6
chr3	137886241	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=248,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137886241_A_AC:137886241:0,1,0,1
chr3	137886245	.	A	AGGACCCCTTTCTCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=248,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137886241_A_AC:137886241:0,1,0,1
chr3	137892556	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	137893625	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,0:10,3:7,7,1,2
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,4:0,3,2,5
chr3	137981525	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:2,5,0,3
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:3,1,5,0
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:0,2,2,4
chr3	138189658	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=234,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr3	138195529	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:2,0,6,1
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:5,4:10,5:10,5,5,4
chr3	138248009	.	G	GAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=130,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.220:15:4,1:6,0:9,3,1,2
chr3	138251302	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,5:8,6:7,6,7,4
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.452:18:7,4:3,4:2,8,3,5
chr3	138256252	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	138289159	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=83,14204284;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:0|1:138289159_C_G:138289159:12,15,1,1
chr3	138289163	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,18:0.594:30:3,11:9,7:1|0:138289159_C_G:138289159:5,7,7,11
chr3	138329862	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=73,65;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:6,9:8,6:5,9,3,12
chr3	138329914	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=88,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,0:9,2:4,16,1,1
chr3	138341284	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=86,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.481:11:2,1:1,2:3,3,1,4
chr3	138400782	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr3	138403390	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr3	138409921	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=126,61;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:14,0:23,4:19,18,0,4
chr3	138409943	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:15,0:24,2:0|1:138409943_C_T:138409943:21,19,1,1
chr3	138409945	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:14,0:24,2:0|1:138409943_C_T:138409943:21,19,1,1
chr3	138409948	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=126,61;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:15,0:22,4:22,15,0,4
chr3	138433568	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,4:5,7:2,7,3,8
chr3	138456737	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,1:0|1:138456737_G_T:138456737:4,13,1,1
chr3	138456744	.	G	GGGATGAGCAGGGCAGGGGAGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:138456737_G_T:138456737:4,13,1,1
chr3	138461459	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,156;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:19,3:32,0:26,25,3,0
chr3	138665744	.	CCC	TGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr3	138738757	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=144,130;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.315:39:15,12:12,0:15,12,12,0
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr3	138763693	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.630:36:5,10:8,12:5,8,12,11
chr3	139074666	.	G	GCCAGAAAAAGAAGGAGGGACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,1:12,0:0|1:139074666_G_GCCAGAAAAAGAAGGAGGGACC:139074666:2,16,0,2
chr3	139074667	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,1:11,0:0|1:139074666_G_GCCAGAAAAAGAAGGAGGGACC:139074666:2,16,0,2
chr3	139077527	.	GA	G,AA,GAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32,23,33;MFRL=160,71,0,170;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,4,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.01,5.01,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,3,3:0.195,0.226,0.181:16:2,1,3,2:3,3,0,1:5,1,6,4
chr3	139081416	.	TTA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=227,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr3	139088481	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=175,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	139090661	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:23,1:14,1:23,15,0,2
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=78,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,0,9
chr3	139094533	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	139094545	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:139094545_TGC_T:139094545:0,3,0,2
chr3	139094548	.	C	CTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:139094545_TGC_T:139094545:0,3,0,2
chr3	139094555	.	CAG	TCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0|1:139094545_TGC_T:139094545:0,1,0,2
chr3	139098357	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,3:7,2:1,7,0,5
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,13,5
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,2:0,0,10,0
chr3	139180989	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,56;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,3:13,0:9,11,1,2
chr3	139195177	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=69,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,1:9,7:8,3,5,3
chr3	139244872	.	A	ATTTAAAACATAGATAAAAACC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,6,0
chr3	139280328	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	139894964	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=99,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	140140190	.	A	AAGGAGAATAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140140190_A_AAGGAGAATAG:140140190:0,3,0,1
chr3	140140192	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140140190_A_AAGGAGAATAG:140140190:0,3,0,1
chr3	140178279	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.943:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	140282861	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,5:0,12:0,0,12,6
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,2,14
chr3	140397431	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:4,2,0,2
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:4,6:4,10:6,2,11,5
chr3	140660950	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.182:36:24,4:5,2:11,19,3,3
chr3	140678384	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,24,28;MFRL=112,140,139;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.70,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,4:0.233,0.216:23:5,6,0:4,0,4:2,10,2,9
chr3	140689662	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	140784929	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	140865985	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=81,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,3:6,0:0|1:140865985_C_T:140865985:9,7,1,2
chr3	140866002	.	TG	AT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=104,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:13,0:0|1:140865985_C_T:140865985:15,13,1,1
chr3	140866008	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=104,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:16,0:0|1:140865985_C_T:140865985:15,12,1,1
chr3	140866011	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,2:16,0:0|1:140865985_C_T:140865985:14,12,1,1
chr3	140979184	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0,0,9,10
chr3	141163487	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,46;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.207:46:19,0:18,9:20,17,0,9
chr3	141164640	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,0:14,2:10,15,0,2
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:5,3:10,2:15,0,5,0
chr3	141277729	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=104,95;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,6:0.090:76:37,6:32,0:44,26,6,0
chr3	141299397	.	T	TACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=182,165;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=AC;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.416:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr3	141328281	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:15,0:22,4:24,13,2,2
chr3	141331222	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,6,21
chr3	141497751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr3	141526707	.	AA	TT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:141526707_AA_TT:141526707:8,9,0,2
chr3	141526710	.	A	AATTACTTTCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=148,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:0|1:141526707_AA_TT:141526707:8,8,0,2
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,17,7
chr3	141644274	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,13:0,18:0,0,23,14
chr3	142030485	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.287:43:12,0:19,12:11,20,0,12
chr3	142030558	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=90,170;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:11,0:10,14,3,0
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	142074229	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:11,3:23,0:21,13,3,0
chr3	142076059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	142094816	.	G	GCACA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=222,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=CA;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.870:12:1,5:0,6:0,1,2,9
chr3	142122451	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,9:0,0,12,2
chr3	142137310	.	T	TTATATA	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=170,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:8,0,1,1
chr3	142137312	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,23;MFRL=169,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:9,0,1,1
chr3	142137318	.	TAAAA	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:6,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:14,1,1,1
chr3	142137324	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:13,2,1,1
chr3	142137326	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:8,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:16,2,1,1
chr3	142137328	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:16,3,1,1
chr3	142137331	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=23,32;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:142137310_T_TTATATA:142137310:16,3,1,1
chr3	142177857	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:18,0:27,2:0|1:142177857_G_A:142177857:25,21,1,1
chr3	142177861	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:18,0:25,2:0|1:142177857_G_A:142177857:25,21,1,1
chr3	142184163	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,0:3,3:0,4,1,2
chr3	142218520	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:17,0:15,5:10,23,1,4
chr3	142222284	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,13:0,21:0,0,12,22
chr3	142241545	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,83;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:17,7:19,0:24,12,7,0
chr3	142241692	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=147,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.241:22:1,0:3,2:3,14,0,5
chr3	142257303	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,7:11,0:20,5,7,0
chr3	142257309	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=113,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:12,7:11,0:19,5,7,0
chr3	142259706	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.258:14:4,2:3,1:8,3,2,1
chr3	142272275	.	A	AAC	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.338:9:1,2:4,1:0,6,0,3
chr3	142272309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=229,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.344:4:0,0:1,1:0|1:142272309_C_T:142272309:0,3,0,1
chr3	142272311	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=175,146;MMQ=40,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.464:2:0,0:1,1:0|1:142272311_T_A:142272311:0,1,0,1
chr3	142272313	.	TGTATCTCCA	T,GGTATCTCCA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,27,28;MFRL=0,175,146;MMQ=60,40,57;MPOS=12,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.59,4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.333,0.456:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr3	142272315	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:142272311_T_A:142272311:0,0,0,1
chr3	142272317	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:142272311_T_A:142272311:0,0,0,1
chr3	142272325	.	ATCCCAG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,25;MFRL=228,175;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:142272309_C_T:142272309:0,1,0,1
chr3	142272335	.	CAAACGGAAATCTACAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=177,175;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:142272309_C_T:142272309:2,1,0,1
chr3	142277365	.	AAAAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAAT;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.896:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	142277520	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:19,0:10,6:0|1:142277520_T_C:142277520:14,17,2,4
chr3	142277524	.	C	CT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:17,0:10,4:0|1:142277520_T_C:142277520:13,18,2,4
chr3	142277536	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,17:0,10:0,0,12,15
chr3	142277575	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,7,16
chr3	142279175	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.182:42:17,0:18,7:20,15,0,7
chr3	142279204	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:13,0:17,7:15,16,0,7
chr3	142402827	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:2,0:2,1:4,0,2,0
chr3	142408606	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,7,9
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	142413438	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=147,111;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:142413438_A_AT:142413438:0,3,0,1
chr3	142413439	.	A	AAGGTCAACT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=147,111;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:142413438_A_AT:142413438:0,3,0,1
chr3	142413442	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=147,111;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:142413438_A_AT:142413438:0,3,0,1
chr3	142423477	.	ATTTTTTTT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=165,184;MMQ=40,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=30,22;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,1:0,0:0|1:142423477_ATTTTTTTT_A:142423477:0,2,1,0
chr3	142423516	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=180,184;MMQ=40,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:142423477_ATTTTTTTT_A:142423477:0,4,1,0
chr3	142455367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:5,1:15,2:9,11,0,3
chr3	142521224	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.570:14:4,2:1,3:1,5,0,8
chr3	142542562	.	A	AATCACTCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=197,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	142548467	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=198,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:142548467_C_T:142548467:9,1,2,0
chr3	142548473	.	TAAA	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:142548467_C_T:142548467:10,0,2,0
chr3	142548478	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:142548467_C_T:142548467:11,0,2,0
chr3	142548482	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:142548467_C_T:142548467:9,0,2,0
chr3	142561669	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr3	142567015	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:3,2:10,0:12,1,2,0
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=439,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,10:1,3:0,1,3,10
chr3	142681759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,2:5,0:0|1:142681759_G_A:142681759:6,7,1,2
chr3	142681763	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:142681759_G_A:142681759:7,8,1,1
chr3	142681766	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:4,0:0|1:142681759_G_A:142681759:6,8,1,1
chr3	142682026	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,1:1,1:1,5,0,2
chr3	142733251	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:21,0:12,6:11,22,0,6
chr3	142756907	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,1:6,4:9,4,3,2
chr3	142761966	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:142761966_G_A:142761966:9,13,1,1
chr3	142761975	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:0|1:142761966_G_A:142761966:8,14,1,1
chr3	142769805	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,431;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:16,0:13,3:17,12,3,0
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:9,7:9,8:12,6,10,5
chr3	142839970	.	GCGCCCAGGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	142985604	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.160:33:7,3:20,1:12,16,4,1
chr3	143214114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	143297474	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,4:5,0:7,4,0,4
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,4:0,9:0,0,4,10
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0,0,7,4
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,3:0,0:1,0,3,1
chr3	145794776	.	CTTTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:145803138_T_C:145803138:0,0,1,8
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:145803138_T_C:145803138:0,0,1,8
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:1,0,11,0
chr3	145809750	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	145820681	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=121,83;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:9,1:9,5:0|1:145820681_C_T:145820681:5,13,0,6
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0|1:145820681_C_T:145820681:0,0,5,19
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	145918947	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,12:1,5:0,2,0,17
chr3	145924591	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	145939916	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.325:16:8,2:2,2:3,8,3,2
chr3	146171822	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,0:15,3:13,11,1,2
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr3	146234802	.	A	AC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.324:32:12,10:10,0:12,10,10,0
chr3	146251430	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=122,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146251430_A_G:146251430:0,2,0,1
chr3	146251433	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146251430_A_G:146251430:0,1,0,1
chr3	146254478	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	146307371	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	147106662	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=107,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.125:45:14,5:25,0:15,25,5,0
chr3	147120444	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:3,2,2,1
chr3	148459908	.	TCGAAAC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=162,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,2:0|1:148459908_TCGAAAC_T:148459908:5,7,1,1
chr3	148459919	.	CCATAAAGTAATTTTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=157,36;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,1:0|1:148459908_TCGAAAC_T:148459908:5,4,1,1
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,5:4,7:5,4,5,7
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr3	148575156	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	148575380	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	148586906	.	G	GGAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	148597612	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,23:0,8:0,0,20,11
chr3	148597735	.	T	TTGCAGCACAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	148709481	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	148711906	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:14,2:5,1:15,5,2,1
chr3	148726974	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=243,304;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,0:0,0:2,0,1,0
chr3	148741850	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=127,152;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.310:30:10,9:11,0:10,11,9,0
chr3	148750252	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=216,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148750252_A_C:148750252:0,1,0,1
chr3	148750259	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=216,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148750252_A_C:148750252:0,1,0,1
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	148756841	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr3	148757290	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	148764090	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr3	148788941	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	148858743	.	AGAGGATGTTGT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=105,353;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:148858743_AGAGGATGTTGT_A:148858743:3,1,1,0
chr3	148858758	.	A	AAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=105,353;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:0,1:4,0:0|1:148858743_AGAGGATGTTGT_A:148858743:3,1,1,0
chr3	148858987	.	C	CTTT,CTTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33,30;MFRL=0,154,128;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,16,17;RU=T;STR;TLOD=11.33,9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,9:0.468,0.491:17:0,5,5:0,2,2:0,0,15,2
chr3	148863395	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	148876356	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,143;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr3	148880176	.	GGAGGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:148880176_GGAGGGA_G:148880176:1,3,0,1
chr3	148880184	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:148880176_GGAGGGA_G:148880176:1,3,0,1
chr3	148880185	.	G	GCCTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:148880176_GGAGGGA_G:148880176:1,3,0,1
chr3	148880196	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:148880196_G_A:148880196:0,1,1,0
chr3	148880200	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:148880196_G_A:148880196:0,1,1,0
chr3	148885779	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,0:1,3:3,4,1,2
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	148891649	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	148894260	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	148896473	.	G	GACCAGCCTGGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=260,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:148896473_G_GACCAGCCTGGCC:148896473:0,3,0,1
chr3	148896476	.	C	CATGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=269,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:148896473_G_GACCAGCCTGGCC:148896473:0,4,0,1
chr3	148896480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=269,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:148896473_G_GACCAGCCTGGCC:148896473:0,4,0,1
chr3	148897532	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,303;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:1,4,0,1
chr3	148899923	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,50;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:148899923_G_A:148899923:4,11,1,1
chr3	148899928	.	A	AGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,50;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:148899923_G_A:148899923:3,11,1,1
chr3	148904373	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:9,1:24,2:21,12,0,3
chr3	148906076	.	CCT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148906076_CCT_C:148906076:0,0,0,1
chr3	148906079	.	A	ACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148906076_CCT_C:148906076:0,0,0,1
chr3	148925459	.	A	AGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=207,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0|1:148925459_A_AGTGT:148925459:0,2,1,1
chr3	148925462	.	G	GTGTGTGTGTGTGTCTGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=207,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0|1:148925459_A_AGTGT:148925459:0,2,1,1
chr3	149050925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,9:0,0,5,21
chr3	149093238	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,17,14
chr3	149093354	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,4:0.088:53:18,0:30,3:0|1:149093354_C_T:149093354:28,21,1,3
chr3	149093366	.	A	AC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,4:0.096:50:19,0:27,3:0|1:149093354_C_T:149093354:27,19,1,3
chr3	149093493	.	GGCCACAGCA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCACAGCA;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:14,0:12,4:20,12,2,2
chr3	149192851	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr3	149216761	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.600:10:2,2:1,4:1,3,0,6
chr3	149290586	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:4,0:6,1,2,0
chr3	149290605	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:2,3:8,0,5,1
chr3	149459413	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=74,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,29:0.682:42:6,13:7,16:4,9,16,13
chr3	149469159	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.610:36:2,7:11,15:9,5,15,7
chr3	149485901	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:3,4:7,3:3,7,3,10
chr3	149488309	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:9,1,4,1
chr3	149498108	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:14,0:12,4:13,14,2,2
chr3	149589883	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=115,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:6,0:0|1:149589883_A_C:149589883:10,10,1,1
chr3	149589888	.	T	TAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=119,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:149589883_A_C:149589883:10,10,1,1
chr3	149613232	.	ATTTT	A,AT,ATT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=18,26,31,28;MFRL=84,161,1023,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,16,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.83,3.61,15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,3,9:0.132,0.148,0.506:19:0,2,3,4:1,0,0,5:1,3,14,1
chr3	149613252	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.148:37:6,1:8,0:21,11,5,0
chr3	149686076	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr3	149686355	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=17,13;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:0,0:2,0:0|1:149686355_G_T:149686355:2,9,0,6
chr3	149686366	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:3,1:5,6:1,7,0,7
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=80,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.658:12:0,4:4,4:0|1:149686355_G_T:149686355:1,3,0,8
chr3	150127745	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:20,9:10,0:21,9,9,0
chr3	150141009	.	G	GCCATTGAAAGCTTGGTAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	150262318	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,12:0,24:0,0,13,26
chr3	150276153	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=130,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:4,4:9,1:11,2,3,3
chr3	150280507	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:150280507_A_C:150280507:0,3,0,1
chr3	150280510	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:150280507_A_C:150280507:0,3,0,1
chr3	150282061	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.353:20:9,3:2,4:9,4,6,1
chr3	150282211	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,6:6,7:1,10,2,11
chr3	150286088	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=119,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:1,8:7,5:3,5,5,8
chr3	150293617	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,156;MMQ=60,47;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr3	150299464	.	A	ACACC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.063:43:16,1:22,0:0|1:150299464_A_ACACC:150299464:24,17,1,1
chr3	150299466	.	G	GGCCCAGACCCCTTGTTCTT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.065:43:17,2:24,0:0|1:150299464_A_ACACC:150299464:24,17,1,1
chr3	150340791	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:14,0,4,0
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr3	150387059	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=64,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:1,4:3,5:2,2,6,3
chr3	150398152	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,6:5,0:4,2,6,0
chr3	150403915	.	A	ATCCTTAAATGTGTTCTAGACC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.241:7:4,0:0,1:2,4,0,1
chr3	150403922	.	C	CAGTGCCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=187,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:150403922_C_CAGTGCCG:150403922:1,2,1,1
chr3	150403926	.	G	GGTCCTGTCTGGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=187,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:3,2:0,0:0|1:150403922_C_CAGTGCCG:150403922:1,2,1,1
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	150661536	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=83,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.258:27:10,5:10,0:9,11,7,0
chr3	150661667	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=109,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,3:9,0:6,7,0,3
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	150881774	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=365,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,11:0,9:0,1,12,8
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150916131_T_TG:150916131:0,0,1,0
chr3	150916144	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,200;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150916131_T_TG:150916131:0,0,1,0
chr3	150916146	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,200;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150916131_T_TG:150916131:0,0,1,0
chr3	150917178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr3	150931231	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:12,2:11,0:0|1:150931231_G_T:150931231:17,8,1,1
chr3	150931248	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:12,0:0|1:150931231_G_T:150931231:20,8,1,1
chr3	150932142	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=140,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:7,0:2,3:4,6,0,3
chr3	151046308	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,36:0,28:0,0,21,45
chr3	151056270	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:7,2:0|1:151056270_G_A:151056270:5,10,1,1
chr3	151056274	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:151056270_G_A:151056270:4,10,1,1
chr3	151073033	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:14,7:5,9:4,15,6,10
chr3	151074925	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:4,2:8,2:9,3,5,0
chr3	151074941	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,6:10,2:12,3,8,0
chr3	151078216	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:3,10:7,4:8,2,8,6
chr3	151085578	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=80,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.312:23:9,2:7,4:8,8,3,4
chr3	151085842	.	AAAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=120,239;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	151090604	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr3	151093758	.	C	CATATATATATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,11;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	151094995	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	151101691	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:2,7,2,6
chr3	151101746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,3,2
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:8,1:15,4,2,0
chr3	151103070	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	151105992	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151105992_C_T:151105992:0,0,0,1
chr3	151105995	.	T	TCTTTACTTTTTCCCACTTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151105992_C_T:151105992:0,0,0,1
chr3	151105998	.	CA	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151105992_C_T:151105992:0,0,0,1
chr3	151107822	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:0|1:151107822_C_CT:151107822:10,8,1,1
chr3	151107823	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,0:12,3:9,8,2,1
chr3	151107825	.	AA	TT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,0:13,2:0|1:151107822_C_CT:151107822:10,10,1,1
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr3	151134104	.	AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT	A	.	.	DP=129;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,52:0.172:129:10,37:8,9:28,49,41,11
chr3	151134142	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.083:31:8,1:20,1:9,20,1,1
chr3	151148244	.	GCTCTCCCAAGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=184,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	151148270	.	T	TGTATCTGACTTTGTCTTGCTCATCTCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	151150497	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=89,181;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:16,4:18,0:21,14,4,0
chr3	151156367	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr3	151165112	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=105,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.088:71:33,0:30,5:28,37,0,6
chr3	151165454	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=93,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:18,2:10,1:15,13,3,0
chr3	151165615	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:151165615_C_T:151165615:12,12,1,1
chr3	151165622	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:151165615_C_T:151165615:12,10,1,1
chr3	151463493	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=193,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,1,2
chr3	151475036	.	T	TCTGCCTGC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:0|1:151475036_T_TCTGCCTGC:151475036:12,13,1,1
chr3	151475039	.	CTGAGAA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:12,2:0|1:151475036_T_TCTGCCTGC:151475036:13,14,1,1
chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:10,4,10,2
chr3	151535422	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,7,5
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,7,5
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,7,5
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr3	152163361	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,0:5,6:0,6,0,6
chr3	152880511	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,138;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:9,1,2,0
chr3	152881453	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,17;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,0:1,0:0,2,0,2
chr3	152881852	.	AT	A,ATT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,27,25;MFRL=104,149,122;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=17.92,7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,12,6:0.236,0.140:48:17,8,2:8,4,3:24,6,13,5
chr3	152883371	.	ATG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.148:24:14,3:5,0:19,2,2,1
chr3	152883395	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,33,30,33;MFRL=118,115,136,117;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,15,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.28,4.52,14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:23,2,3,9:0.060,0.088,0.250:37:13,2,1,6:6,0,2,2:17,6,12,2
chr3	152884152	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=107,193;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:31,6:8,0:24,15,6,0
chr3	153847339	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:153847339_C_T:153847339:13,8,2,0
chr3	153847348	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:12,2:0|1:153847339_C_T:153847339:17,9,2,0
chr3	153847582	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr3	153912542	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,4:10,0:9,7,0,4
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr3	153994502	.	TG	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=89.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.961:21:0,9:0,10:0,0,18,3
chr3	154002357	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.476:21:6,5:4,4:9,2,8,2
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	154010515	.	AACACAC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AC;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.598:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr3	154011642	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,3:6,6:1,9,2,7
chr3	154018690	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr3	154018809	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.195:44:24,6:11,2:24,12,2,6
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,10:0,0,21,6
chr3	154055430	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	154139032	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:0|1:154139032_G_A:154139032:12,12,1,1
chr3	154139039	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:15,2:0|1:154139032_G_A:154139032:16,12,1,1
chr3	154139043	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,3:0.128:29:10,3:16,0:1|0:154139032_G_A:154139032:14,12,3,0
chr3	154139044	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:13,2:0|1:154139032_G_A:154139032:17,13,1,1
chr3	154139046	.	C	CATTCGAT	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:13,2:0|1:154139032_G_A:154139032:17,11,1,1
chr3	154146376	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=286,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:3,2:6,0,1,1
chr3	154802920	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:4,9:9,5:3,10,7,7
chr3	154834379	.	GTA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,1:6,3:9,3,3,1
chr3	154857897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	154865060	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=114,105;MMQ=60,20;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,0:7,3:4,9,0,3
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,4:7,12:6,6,8,8
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=49,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,5:1,6:1,1,5,6
chr3	155210653	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:13,0:9,5:16,8,0,6
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	155222375	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=111,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:11,11,2,1
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr3	155241740	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=78,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:5,3,3,3
chr3	155393710	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,4:9,0:14,7,3,1
chr3	155493722	.	A	AAATATTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:155493722_A_AAATATTGTT:155493722:1,3,0,1
chr3	155493723	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155493722_A_AAATATTGTT:155493722:1,3,0,1
chr3	155551688	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=85,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:22,0:15,4:13,24,2,2
chr3	155551689	.	CTG	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=91,29;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:20,0:14,2:0|1:155551689_CTG_C:155551689:15,26,1,1
chr3	155551693	.	A	ACC	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=88,29;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:19,0:16,2:0|1:155551689_CTG_C:155551689:13,24,1,1
chr3	155551698	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=88,29;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:18,0:16,2:0|1:155551689_CTG_C:155551689:13,22,1,1
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	155621845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:5,0:0,2:0,5,0,3
chr3	155643189	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,2:5,2:12,8,2,2
chr3	156261090	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:7,2:2,10,1,2
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	156413670	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=82,233;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:21,3:12,0:10,24,3,0
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,186;MMQ=50,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:0,9,0,3
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,3:1,4:1,0,5,3
chr3	156870059	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,20:0,0,16,23
chr3	156870816	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,16,13
chr3	156876574	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	156876803	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,8:0,10:0,1,3,16
chr3	156877276	.	CAA	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=187.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,24:0,23:0,0,14,33
chr3	156877357	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr3	156877530	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr3	156877772	.	CCGTCGTGGTCGT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTCGTGGTCGT;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:8,1:11,12,0,2
chr3	156978919	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,6:0,0,12,7
chr3	156983273	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,20,12
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	157146307	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr3	157154727	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:22,7:22,0:30,14,7,0
chr3	157154768	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:15,1:16,6:18,13,3,4
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:10,2:25,14:16,22,8,8
chr3	157160847	.	C	CTCAAATAATTAAAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=155,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:1,0:0|1:157160847_C_CTCAAATAATTAAAA:157160847:0,4,1,1
chr3	157160849	.	G	GGAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:157160847_C_CTCAAATAATTAAAA:157160847:0,4,1,1
chr3	157160852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=173,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:157160847_C_CTCAAATAATTAAAA:157160847:0,3,0,1
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	157188378	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	157289936	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	157296133	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:7,2:10,9,1,1
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr3	158015730	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,0;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:158015730_GA_G:158015730:1,0,1,0
chr3	158015739	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=118,0;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:158015730_GA_G:158015730:3,0,1,0
chr3	158072623	.	ATT	A,AT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=25,26,31;MFRL=80,180,198;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.94,5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,3,5:0.097,0.158:35:12,1,4:14,2,1:18,9,4,4
chr3	158072635	.	T	TGAGACGGAG	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=101,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.126:45:22,1:17,4:22,18,3,2
chr3	158178856	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,4:8,3:1,14,0,7
chr3	158254806	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=108,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:16,5,2,0
chr3	158289035	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,9:4,5:5,3,9,5
chr3	158310153	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,0,16
chr3	158320597	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,15:0,5:0,0,13,7
chr3	158362391	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:7,2:6,6:10,3,8,1
chr3	158362526	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=132.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.956:43:1,21:0,21:0,1,16,26
chr3	158362588	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,2,11
chr3	158366900	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,11,13
chr3	158369798	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr3	158372477	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	158372502	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	158378836	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr3	158384068	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,0:5,9:10,0,7,2
chr3	158384733	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,7:6,2:8,0,8,1
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,3,16
chr3	158386737	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	158388721	.	C	CAAAGAAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGAAA;STR;TLOD=182.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,10:0,20:0,0,18,23
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:2,6:1,12:3,0,15,3
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.958:23:0,13:1,9:1,0,15,7
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,4,15
chr3	158415840	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,1,5
chr3	158422506	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr3	158428642	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=97,95;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:14,10:14,9:19,9,9,10
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr3	158431508	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:5,0,5,0
chr3	158431702	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,3:8,4:5,6,1,6
chr3	158537415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,14,1
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.547:40:9,12:9,10:8,10,9,13
chr3	158539496	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:8,8:9,6:9,9,7,7
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:0,8,1,7
chr3	158980279	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	158980391	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:2,3:7,0:4,5,0,3
chr3	158983034	.	CC	TT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:158983034_CC_TT:158983034:10,5,1,1
chr3	158983039	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:0|1:158983034_CC_TT:158983034:11,5,1,1
chr3	158983049	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,3:7,2:7,8,4,1
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr3	159482454	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:6,0:7,6:7,6,0,6
chr3	159708182	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	159710992	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=120,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr3	159976271	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr3	159976432	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=66,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.776:9:1,2:0,4:1,1,1,6
chr3	160003677	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr3	160021681	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,23:0,13:0,0,22,14
chr3	160102470	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,0:11,2:4,16,1,1
chr3	160130110	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr3	160131236	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.235:25:8,5:9,1:14,5,6,0
chr3	160132338	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,2:5,1:3,14,3,0
chr3	160134208	.	GT	G,GTT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,31,15;MFRL=113,143,86;MMQ=60,60,60;MPOS=24,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.06,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,4,3:0.151,0.145:25:5,0,1:6,3,0:1,17,3,4
chr3	160135428	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	160135718	.	C	CCCCAAACAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:0|1:160135718_C_CCCCAAACAT:160135718:11,9,1,1
chr3	160135724	.	A	ACCCACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,0:9,1:0|1:160135718_C_CCCCAAACAT:160135718:11,7,1,1
chr3	160137363	.	C	CT,CTT	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=31,31,30;MFRL=147,128,173;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=22.46,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,16,5:0.491,0.165:33:6,7,2:5,9,3:3,9,3,18
chr3	160137378	.	A	ATG	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,2:14,0:0|1:160137378_A_ATG:160137378:3,30,0,2
chr3	160137379	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:12,2:15,0:0|1:160137378_A_ATG:160137378:3,33,0,2
chr3	160137382	.	TGTAA	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,2:17,0:0|1:160137378_A_ATG:160137378:3,29,0,2
chr3	160138493	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=168,117;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.338:24:10,7:6,0:15,1,8,0
chr3	160138723	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=139,97;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.223:11:8,0:1,2:0|1:160138723_A_AT:160138723:2,7,1,1
chr3	160138742	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=139,97;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:0|1:160138723_A_AT:160138723:2,7,1,1
chr3	160141147	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	160142618	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:1,12:0,15:0,1,17,10
chr3	160142751	.	C	T	.	.	DP=161;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,10:0.079:120:60,3:46,5:88,22,10,0
chr3	160142810	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=114,144;MMQ=20,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,23;RU=TG;STR;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.882:16:0,2:0,1:0,1,0,15
chr3	160148756	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr3	160149714	.	GCGTGGTGGCTCA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=232,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	160156367	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,1:8,2:11,13,3,0
chr3	160219851	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=167,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,2:7,0:9,4,0,2
chr3	160231966	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:6,0:9,4:7,8,1,3
chr3	160233406	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.251:15:6,2:5,1:5,7,1,2
chr3	160249220	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:3,5:15,2:12,7,5,2
chr3	160283126	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	160395093	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,10:0,14:0,0,17,8
chr3	160395868	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:7,0:4,3:10,1,2,1
chr3	160396176	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:9,6:4,4:4,9,4,6
chr3	160396210	.	TTAAATAAAGCTTTCTTATTCCC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.258:10:3,2:3,0:0,8,1,1
chr3	160679422	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	160783143	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=242,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,1:3,6:6,0,6,2
chr3	160939732	.	A	AATCCCAAC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATCCCAAC;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,2:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:0,0,8,0
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=30,13;RU=T;STR;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,3:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:0,0,10,2
chr3	160939776	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:0,0,9,3
chr3	160942686	.	AAT	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,1:6,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:15,3,1,1
chr3	160942689	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:6,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:16,4,1,1
chr3	160942691	.	GAAAAATTT	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,2:8,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:20,10,1,1
chr3	160942702	.	CCTTT	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,2:12,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:17,11,1,1
chr3	160942708	.	TTTATTAAA	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:14,2:12,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:18,14,1,1
chr3	160942720	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.080:36:18,2:16,0:0|1:160942686_AAT_A:160942686:18,16,1,1
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr3	160955882	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31,28;MFRL=181,87,170;MMQ=60,60,60;MPOS=7,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.80,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.335,0.586:9:0,3,2:0,0,2:1,0,8,0
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,16:0,8:0,0,9,15
chr3	161064033	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:10,12,1,1
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	161221335	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:8,4:11,1:7,12,5,0
chr3	161221651	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:6,3:4,0:5,7,3,0
chr3	163889209	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.501:40:9,20:11,0:11,9,20,0
chr3	163889384	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=85,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:2,7,1,4
chr3	164059309	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:164059309_T_TA:164059309:0,1,0,1
chr3	164059311	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:164059309_T_TA:164059309:0,1,0,1
chr3	164059312	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:164059309_T_TA:164059309:0,1,0,1
chr3	164059314	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:164059309_T_TA:164059309:0,1,0,1
chr3	164059321	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:164059309_T_TA:164059309:0,0,0,1
chr3	164700699	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=129,101;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:8,1:0|1:164700699_A_G:164700699:7,5,2,0
chr3	164700701	.	TG	GT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=140,101;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,1:9,1:0|1:164700699_A_G:164700699:9,5,2,0
chr3	164700704	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=140,101;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,1:11,1:0|1:164700699_A_G:164700699:9,5,2,0
chr3	164700707	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=140,101;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,1:11,1:0|1:164700699_A_G:164700699:9,5,2,0
chr3	164704896	.	TTAAATTTATCTAC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:4,0:11,2:17,7,1,1
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:3,0,4,1
chr3	164737382	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:3,0:0|1:164737382_GT_G:164737382:5,10,1,1
chr3	164737384	.	ACCTACACCAGGGGGTTGGTCTCTTGTG	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,2:3,0:0|1:164737382_GT_G:164737382:14,16,1,1
chr3	164737414	.	CATTCCCCAAGTATTCCAGTT	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,2:12,0:0|1:164737382_GT_G:164737382:18,13,1,1
chr3	164737438	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,2:14,0:0|1:164737382_GT_G:164737382:13,11,1,1
chr3	164737441	.	TCGCTTAA	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:15,0:0|1:164737382_GT_G:164737382:14,11,1,1
chr3	164737557	.	A	AGGCAGGAAGGGGGTTTGTTTTGGG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=110,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.097:28:15,2:11,0:8,18,0,2
chr3	164748665	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,21,30;MFRL=188,144,110;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=10.97,6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,8:0.312,0.378:22:2,3,0:1,1,6:2,4,9,7
chr3	164748687	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=17,23;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.161:36:2,0:5,4:6,25,3,2
chr3	164760771	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr3	164764895	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=251,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:164764895_A_G:164764895:0,2,0,1
chr3	164764900	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=251,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:164764895_A_G:164764895:0,2,0,1
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,4:1,6:6,0,8,2
chr3	164773055	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:7,0:11,4:0|1:164773055_G_T:164773055:11,7,0,4
chr3	164773057	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,8:0.402:20:1,4:11,3:1|0:164773055_G_T:164773055:5,7,4,4
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:15,11:6,1:8,13,6,6
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:5,8,3,2
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.407:20:0,5:12,3:2,10,1,7
chr3	164783252	.	AATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AT;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0|1:164783252_AATAT_A:164783252:0,0,0,1
chr3	164783264	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:164783252_AATAT_A:164783252:0,0,0,1
chr3	164785196	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=92,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:4,5:2,8:4,2,5,8
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,158;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:8,0,4,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:2,4:4,2:0,6,2,4
chr3	164786962	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=119,90;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,11:0.214:54:22,0:21,11:0|1:164786962_A_T:164786962:16,27,0,11
chr3	164786966	.	T	TTG	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=118,90;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,11:0.218:53:21,0:20,11:0|1:164786962_A_T:164786962:15,27,0,11
chr3	164786973	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=90,222;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.133:50:14,6:29,0:13,31,0,6
chr3	166960278	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,1:2,5:3,1,5,1
chr3	167006568	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr3	167006612	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=156,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:4,1,6,1
chr3	167023684	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,173;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:13,0:14,14,2,0
chr3	167034776	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:5,3:7,6:7,5,6,3
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:7,7:1,8:3,5,5,10
chr3	167184878	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr3	167218188	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	167254558	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	167278081	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=235,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:167278081_T_C:167278081:0,2,0,1
chr3	167278087	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=235,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:167278081_T_C:167278081:0,2,0,1
chr3	167508475	.	TGCATTTTGAATGTTTGAGA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	167510602	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr3	167540741	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:6,0:5,2:8,3,2,0
chr3	167742353	.	GTCC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,1:10,7:6,11,3,5
chr3	168269756	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=100,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:3,7:9,2:2,10,3,6
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	168862688	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:14,7:7,0:19,2,7,0
chr3	169485995	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.064:59:26,3:28,0:30,26,2,1
chr3	169486144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr3	169492016	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,2:3,5:10,2,6,1
chr3	169500487	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr3	169539649	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:7,4:6,2:11,2,6,0
chr3	169550759	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,4:4,7:5,5,7,4
chr3	169558133	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:169558133_T_C:169558133:0,1,0,1
chr3	169558134	.	A	AGTGAAACCCCGTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169558133_T_C:169558133:0,1,0,1
chr3	169565841	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,205;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:6,0,0,5
chr3	169566090	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=88,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:3,5,1,1
chr3	169566132	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169566132_C_A:169566132:0,0,0,1
chr3	169566139	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169566132_C_A:169566132:0,0,0,1
chr3	169569374	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:2,1:2,2:5,1,2,1
chr3	169574462	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr3	169642764	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=124,183;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.168:28:13,4:5,0:21,3,4,0
chr3	169644842	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:6,5,1,1
chr3	169654095	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,6:5,3:5,1,7,2
chr3	169684750	.	T	TCCCAGCACTTTGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	169710363	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,6:0,6:0,1,0,12
chr3	169847009	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=128,201;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:15,4:16,0:21,12,4,0
chr3	169854338	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:14,0:10,16,0,2
chr3	169889331	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	169896634	.	ATGG	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGG;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:21,1:18,1:24,16,1,1
chr3	169981325	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr3	169992995	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.378:12:3,0:2,1:0|1:169992995_A_T:169992995:4,3,5,0
chr3	169992997	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.349:13:3,0:2,2:0|1:169992995_A_T:169992995:5,3,5,0
chr3	169993004	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.326:14:5,0:4,0:0|1:169992995_A_T:169992995:4,5,5,0
chr3	170198967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:2,3,3,4
chr3	170204110	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:11,3:13,0:10,14,1,2
chr3	170218862	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=72,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,4:3,3:7,2,6,1
chr3	170244614	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:0|1:170244614_C_T:170244614:9,10,1,1
chr3	170244631	.	A	ACAGCCTAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:170244614_C_T:170244614:7,10,1,1
chr3	170588036	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,3:3,0:2,8,1,2
chr3	170720368	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:0|1:170720368_G_T:170720368:11,9,1,1
chr3	170720375	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:7,0:0|1:170720368_G_T:170720368:11,10,1,1
chr3	170723276	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,7:0,10:0,1,3,14
chr3	170724883	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,7:1,2:1,1,6,3
chr3	170724955	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=104,91;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,12:4,1:5,5,8,5
chr3	170727739	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=77,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.622:32:3,10:7,10:5,7,7,13
chr3	170732300	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:10,2:3,4:9,4,4,2
chr3	170784035	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:170784035_C_T:170784035:9,12,1,1
chr3	170784043	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:170784035_C_T:170784035:9,12,1,1
chr3	170825905	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr3	170825920	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,3:3,4:2,7,3,4
chr3	170846676	.	CAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.320:8:0,0:3,0:1,5,0,2
chr3	170885073	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	170908489	.	G	GAGCCCAGTGACTGCTGTGCCCACAGGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:8,5,1,1
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=118,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:0,3,1,5
chr3	170928820	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr3	171338237	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:3,3,6,5
chr3	171405384	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=98,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:5,5:3,5:2,6,2,8
chr3	171405424	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:1,3,0,7
chr3	171406537	.	TGTCGTCCCACCTTCCATAGGCCAG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:7,2:8,13,1,1
chr3	171442635	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=519,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	171443955	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=199,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	171969077	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,37:0.623:59:11,13:11,24:18,4,27,10
chr3	172003831	.	CTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.218:10:2,0:3,2:0,8,0,2
chr3	172052897	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.514:8:1,0:2,0:1,3,0,4
chr3	172064076	.	C	CATTTAATTT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=49,34;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:172064076_C_CATTTAATTT:172064076:6,0,1,1
chr3	172064077	.	G	GGAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=49,34;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:172064076_C_CATTTAATTT:172064076:6,0,1,1
chr3	172064079	.	A	ATTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=98,34;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:172064076_C_CATTTAATTT:172064076:6,1,1,1
chr3	172064081	.	A	ATGTTTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=98,34;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,0:0|1:172064076_C_CATTTAATTT:172064076:6,1,1,1
chr3	172098780	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,3:14,0:13,17,3,0
chr3	172163215	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.119:53:29,5:17,0:23,24,6,0
chr3	172351358	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:12,0:10,4:11,11,2,2
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.719:23:3,6:3,10:6,0,14,3
chr3	172365634	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.134:42:15,5:20,0:30,7,5,0
chr3	172365913	.	CGAGGGAGGAAATAAA	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=101,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:19,2:20,1:15,24,1,2
chr3	172477880	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,7:0|1:172480173_A_ATT:172480173:0,0,12,3
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0|1:172480173_A_ATT:172480173:0,0,12,3
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	172694861	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:4,1:2,3,1,1
chr3	172835103	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=155,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:0|1:172835103_A_C:172835103:4,12,1,1
chr3	172835111	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:6,2:0|1:172835103_A_C:172835103:8,12,1,1
chr3	172835125	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,7:6,1:7,3,3,5
chr3	172835290	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,32:0.622:51:8,24:11,7:8,11,19,13
chr3	173525554	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:173525554_A_C:173525554:7,15,1,1
chr3	173525560	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:8,2:0|1:173525554_A_C:173525554:8,16,1,1
chr3	173525563	.	TCTTGG	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:173525554_A_C:173525554:8,16,1,1
chr3	173525571	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:173525554_A_C:173525554:8,14,1,1
chr3	173993079	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:5,0,3,1
chr3	173998738	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:3,9,4,0
chr3	174951923	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,4:6,0:5,8,4,0
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	175185060	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=92.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,11:0,10:0|1:175189406_CT_C:175189406:0,0,16,9
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0|1:175189406_CT_C:175189406:0,0,17,11
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,12,15
chr3	175455116	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,10:6,2:5,2,8,4
chr3	175521008	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	176744299	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,147;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:1,0:6,3:0,8,0,3
chr3	176755911	.	GA	CT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,9:0.154:63:28,0:26,9:25,29,1,8
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,18,13
chr3	178546026	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:7,2:9,8,2,0
chr3	178560752	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:3,13,0,2
chr3	178742843	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:6,2:2,1:3,5,3,1
chr3	178745581	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.313:39:11,0:16,11:13,14,0,12
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,13:0,10:0,0,9,14
chr3	178927302	.	T	TCTCTTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=184,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,1,1
chr3	178952220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=183,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	178957861	.	TA	T,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24,20;MFRL=122,155,72;MMQ=60,55,59;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.27,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,6:0.225,0.285:20:2,2,1:7,3,3:2,7,3,8
chr3	178962491	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,0:2,1:2,9,1,2
chr3	178976591	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=143,170;MMQ=52,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr3	178976821	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=89,110;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.334:37:14,6:10,6:19,6,6,6
chr3	179046111	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:7,0:9,2:12,5,1,3
chr3	179083024	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.268:27:8,5:11,1:0|1:179083024_AT_A:179083024:5,15,3,4
chr3	179083038	.	AGG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.140:26:12,0:7,3:1|0:179083024_AT_A:179083024:8,15,0,3
chr3	179083048	.	A	ACAGGTGTGT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.183:20:7,3:9,0:0|1:179083048_A_ACAGGTGTGT:179083048:5,12,2,1
chr3	179083050	.	A	AAATTTGTAAAATTTGGC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:5,0:9,0:0|1:179083048_A_ACAGGTGTGT:179083048:4,12,2,1
chr3	179085438	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=167,286;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179085438_T_C:179085438:0,1,0,1
chr3	179085441	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=167,286;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:179085438_T_C:179085438:0,1,0,1
chr3	179085449	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179085438_T_C:179085438:0,0,0,1
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:0,2:1,1,6,2
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr3	179096508	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,18,12
chr3	179103342	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr3	179122918	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=220,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	179137273	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr3	179288035	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:179288035_A_ATT:179288035:0,4,0,1
chr3	179288038	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:179288035_A_ATT:179288035:0,4,0,1
chr3	179291295	.	GTT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.181:19:4,1:6,2:3,13,1,2
chr3	179291308	.	CT	C,TC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32,27;MFRL=0,118,123;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.73,4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,3:0.766,0.189:17:0,5,2:0,8,1:0,0,2,15
chr3	179304255	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr3	179305654	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.931:17:1,8:0,6:1,0,12,4
chr3	179306782	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,10:0.186:57:23,0:24,10:16,31,0,10
chr3	179320386	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:179320386_CG_C:179320386:0,0,1,0
chr3	179320403	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:179320386_CG_C:179320386:0,0,1,0
chr3	179332901	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	179336320	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:8,9,1,1
chr3	179336338	.	AGAAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,2:6,0:0|1:179336338_AGAAAAT_A:179336338:4,7,1,1
chr3	179336347	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=159,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:3,1:7,0:0|1:179336338_AGAAAAT_A:179336338:3,7,1,1
chr3	179408126	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,200;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.208:35:17,0:10,6:5,23,0,7
chr3	179437803	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,2:11,0:6,10,2,0
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.657:9:0,1:3,5:1,2,1,5
chr3	179463076	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:179463076_A_G:179463076:0,0,1,3
chr3	179463081	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0|1:179463076_A_G:179463076:0,0,0,9
chr3	179469995	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:2,2:1,1:2,1,3,1
chr3	179472674	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr3	179474767	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,5:5,2:9,3,3,4
chr3	179481971	.	CTGTGTG	C,CTGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20,19;MFRL=0,166,140;MMQ=60,60,60;MPOS=28,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=TG;STR;TLOD=5.10,16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.249,0.682:9:0,0,0:0,1,3:0,0,1,8
chr3	179527453	.	GCAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,14;MFRL=102,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1,1,0,1
chr3	179576933	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=117,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:9,0:0|1:179576933_T_G:179576933:6,12,1,1
chr3	179576942	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,54;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:179576933_T_G:179576933:5,10,1,1
chr3	179592053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	179592240	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.624:11:0,1:3,5:1,3,3,4
chr3	179593072	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	179597854	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.145:36:11,4:20,0:16,15,5,0
chr3	179605477	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:14,3:4,0:9,9,3,0
chr3	179605647	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	179689365	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,6:5,3:4,2,6,3
chr3	180320968	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=114,194;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.191:38:22,6:9,0:16,15,7,0
chr3	180332608	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr3	180397174	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,2:10,0:0|1:180397174_C_G:180397174:13,10,0,2
chr3	180397176	.	A	ATTGGGG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,2:9,0:0|1:180397174_C_G:180397174:13,10,0,2
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=76,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.329:38:19,4:4,8:12,14,6,6
chr3	180667223	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=225,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:3,1:0,4,1,1
chr3	180667231	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	180669357	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	180679155	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=194,214;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:180679155_AG_A:180679155:1,0,1,0
chr3	180679157	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=194,214;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:180679155_AG_A:180679155:1,0,1,0
chr3	180679161	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=194,214;MMQ=60,55;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:180679155_AG_A:180679155:1,0,1,0
chr3	180680889	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,0:1,3:0,4,0,3
chr3	180685928	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:24,3:23,0:23,24,2,1
chr3	180688161	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0|1:180688161_AG_A:180688161:0,2,0,1
chr3	180688164	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180688161_AG_A:180688161:0,2,0,1
chr3	180693215	.	G	GT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.529:29:7,9:7,6:4,10,11,4
chr3	180693957	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.148:45:22,6:17,0:26,13,0,6
chr3	181431124	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,35:0.697:50:7,15:7,20:9,6,20,15
chr3	181431226	.	GA	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.106:50:14,4:24,1:30,15,5,0
chr3	182545986	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=108,48;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:33,0:28,4:27,34,0,4
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=114,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:13,11:11,6:5,19,5,12
chr3	182559966	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=124,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.172:19:10,1:5,0:0|1:182559966_G_T:182559966:6,10,1,2
chr3	182559967	.	G	GCAC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:10,2:6,0:0|1:182559966_G_T:182559966:6,12,1,1
chr3	182559969	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:182559966_G_T:182559966:6,13,1,1
chr3	182559972	.	G	GCTCTATTCTGGC	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:0|1:182559966_G_T:182559966:5,13,1,1
chr3	182559974	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:0|1:182559966_G_T:182559966:5,13,1,1
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=101,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,0:6,4:7,7,2,2
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=105,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,2:7,8:9,4,6,4
chr3	182584176	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=135,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:19,0:16,5:14,21,0,5
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,6:5,5:5,9,0,11
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr3	182616448	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,64;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.100:52:25,4:22,0:19,28,4,1
chr3	182631792	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=73,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,3:3,8:4,5,5,6
chr3	182681853	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:0,12,0,4
chr3	182737833	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	182751932	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=165,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:182751932_A_AT:182751932:0,3,0,1
chr3	182751942	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:182751932_A_AT:182751932:0,2,0,1
chr3	182751944	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:182751932_A_AT:182751932:0,2,0,1
chr3	182751947	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:182751932_A_AT:182751932:0,2,0,1
chr3	182755209	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:8,6:8,6:8,8,4,8
chr3	182769980	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:16,0:25,2:0|1:182769980_T_A:182769980:19,23,1,1
chr3	182769990	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:17,0:25,2:0|1:182769980_T_A:182769980:19,25,1,1
chr3	182770043	.	TG	AA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:4,0:11,5:1,14,0,5
chr3	182790249	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,7,16
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,60392855;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr3	182858227	.	AGCAGC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,23;MFRL=203,210;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:0|1:182858227_AGCAGC_A:182858227:1,1,2,0
chr3	182858234	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=203,210;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:182858227_AGCAGC_A:182858227:1,1,2,0
chr3	182858239	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=203,187;MMQ=60,40;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:182858227_AGCAGC_A:182858227:1,1,1,0
chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,11,21
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr3	182871464	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:3,1,3,1
chr3	182871698	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=92,42;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.074:63:29,3:30,1:36,23,1,3
chr3	182871700	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=93,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.072:65:31,2:29,2:35,26,2,2
chr3	182871962	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,31:0,25:0,0,31,27
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	182947413	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr3	182987515	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,6:4,4:3,1,7,3
chr3	183041201	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr3	183056541	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:5,2,2,1
chr3	183210296	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:14,4:26,0:17,24,2,2
chr3	183210346	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.111:33:16,3:14,0:14,16,1,2
chr3	183212115	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:183212115_A_C:183212115:0,2,0,1
chr3	183212117	.	T	TCAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:183212115_A_C:183212115:0,2,0,1
chr3	183212121	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:183212115_A_C:183212115:0,2,0,1
chr3	183212124	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:183212115_A_C:183212115:0,2,0,1
chr3	183212134	.	T	TTGTGAGGCCTCCCCAGCTATGTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=199,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	183273208	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:30,0:35,3:31,35,0,3
chr3	183368291	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:17,5:18,0:12,23,0,5
chr3	183479342	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=99,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.068:41:17,1:22,1:22,17,0,2
chr3	183480131	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183480131_C_CT:183480131:0,1,0,1
chr3	183480133	.	A	AAACATCGTTAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183480131_C_CT:183480131:0,1,0,1
chr3	183480137	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183480131_C_CT:183480131:0,1,0,1
chr3	183493743	.	CGGAGGA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=GGA;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:2,1:2,6,1,1
chr3	183508852	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:183508852_CA_TG:183508852:0,0,0,1
chr3	183508856	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183508852_CA_TG:183508852:0,0,0,1
chr3	183508860	.	CGC	TAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183508852_CA_TG:183508852:0,0,0,1
chr3	183558481	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.129:37:11,3:14,1:16,17,3,1
chr3	183558497	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=19,21;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.477:17:1,3:2,4:0,9,1,7
chr3	183669251	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:13,8,3,0
chr3	183683184	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=75,128;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:183683184_T_C:183683184:9,10,0,2
chr3	183683189	.	A	AGGTCC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=89,128;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:4,2:0|1:183683184_T_C:183683184:6,10,0,2
chr3	183683190	.	A	ATAACTCATTCCTAGTCCTGAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=84,128;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:4,1:0|1:183683184_T_C:183683184:5,10,0,2
chr3	183700649	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,1:12,2:17,12,1,2
chr3	183749612	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,0:4,5:1,7,0,5
chr3	183752875	.	TGGACCAGCCTTGGAAGTGAACAAGGAGAGGGTGGTGGCATG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:8,0:7,2:19,10,1,1
chr3	183754061	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr3	183754695	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=123,123;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:15,0:5,7:14,6,7,0
chr3	183756080	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr3	183774589	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:10,3,1,1
chr3	183774872	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	183776469	.	C	T,CTGTAGTCTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28,30;MFRL=34293371,210,365;MMQ=60,40,60;MPOS=24,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.00,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.448,0.218:6:2,1,1:0,2,0:0,2,0,4
chr3	183776474	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=256,210;MMQ=50,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	183777919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,100;MMQ=52,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	183818480	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	183822504	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=0,258;MMQ=25,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=22,25;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr3	183822519	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=50,120;MMQ=50,26;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr3	183823576	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,11:0,0,7,6
chr3	183823863	.	G	GAAGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=240,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,3:6,1:4,2,3,1
chr3	183824006	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=154,129;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,1:4,0:0|1:183824006_AG_CC:183824006:2,8,3,0
chr3	183824013	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=154,129;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,2:4,0:0|1:183824006_AG_CC:183824006:2,9,3,0
chr3	183824018	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=164,112;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,0:0|1:183824006_AG_CC:183824006:2,10,2,0
chr3	183855424	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,0:4,4:8,4,3,1
chr3	183855428	.	CTACATCTCTCAATGTGGTTCGAATAAT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:7,0:4,2:12,6,1,1
chr3	183857809	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=86,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:1,1:0,1:1,1,2,1
chr3	183858045	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=167,200;MMQ=60,26;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:5,0:1,5:0|1:183858045_T_A:183858045:0,7,0,5
chr3	183858049	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=167,200;MMQ=60,26;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,0:1,5:0|1:183858045_T_A:183858045:0,7,0,5
chr3	183859695	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=111,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,3:16,0:0|1:183859695_C_G:183859695:13,16,3,0
chr3	183859698	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=111,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,3:16,0:0|1:183859695_C_G:183859695:13,16,3,0
chr3	183861243	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,11,11
chr3	183885787	.	C	CTGTCCTGGTATTTGGTGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.222:11:2,2:7,0:6,3,1,1
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=88.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,16,12
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	183901427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,115;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:1,9,0,4
chr3	183903935	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,7:0,0:0,0,5,2
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr3	183911406	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:10,2:15,2:15,10,1,3
chr3	183951431	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=95,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:4,5:3,5:5,3,6,4
chr3	183954144	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=86,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:2,2:2,2,1,1
chr3	183957095	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183957383	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:9,0:6,4:7,8,1,3
chr3	183957467	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:0,4,3,2
chr3	183959787	.	G	GGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:183959787_G_GGA:183959787:4,5,1,1
chr3	183959788	.	C	CCCCAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:183959787_G_GGA:183959787:4,5,1,1
chr3	183960252	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,6:4,2:6,1,7,1
chr3	183962557	.	T	TTTGACTACTTTGGAGACTGGGGAGTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:183962557_T_TTTGACTACTTTGGAGACTGGGGAGTTTG:183962557:0,4,0,1
chr3	183962561	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183962557_T_TTTGACTACTTTGGAGACTGGGGAGTTTG:183962557:0,4,0,1
chr3	183963381	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=101,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:2,8:9,8:9,2,6,10
chr3	183976108	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,71;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.521:15:3,2:4,4:2,5,7,1
chr3	183979076	.	CGGGCGCGGGGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=261,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	183994447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:2,2,0,3
chr3	183994536	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=221,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr3	183994743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:4,6,1,2
chr3	183995912	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:4,0:6,6,3,0
chr3	183996202	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,0:2,1:1,3,2,0
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=198,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,3:2,3:0,2,2,4
chr3	184003194	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	184009086	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:0,0:5,1:5,3,0,6
chr3	184010048	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=134,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.653:18:5,2:1,10:3,3,5,7
chr3	184017273	.	C	CAGGTCTTGTTTGTTCCCACACAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	184017705	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=101,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:26,2:25,1:24,28,2,1
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=74.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0|1:184020100_C_CA:184020100:0,0,20,2
chr3	184020106	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:0|1:184020100_C_CA:184020100:18,2,2,0
chr3	184020209	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:25,4:23,0:21,28,4,0
chr3	184023751	.	G	GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,4:14,0:10,20,4,0
chr3	184024023	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,215;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,0:6,7:5,10,0,7
chr3	184025069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	184026703	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,2:1,2:1,2,0,5
chr3	184037533	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,27:0,25:0,0,32,21
chr3	184038969	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr3	184045799	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:184045799_A_G:184045799:0,0,0,1
chr3	184045808	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:184045799_A_G:184045799:0,0,0,1
chr3	184046355	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=107,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr3	184060110	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:184060110_T_TG:184060110:0,0,0,1
chr3	184060118	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:184060110_T_TG:184060110:0,0,0,1
chr3	184060120	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:184060110_T_TG:184060110:0,0,0,1
chr3	184064502	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:0|1:184064502_G_A:184064502:16,9,0,2
chr3	184064508	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:0|1:184064502_G_A:184064502:15,9,0,2
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=248,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr3	184072632	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:4,9:1,10:2,3,14,6
chr3	184073551	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:9,5:6,5:7,10,5,6
chr3	184075031	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:184075031_T_C:184075031:11,9,1,1
chr3	184075040	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:184075031_T_C:184075031:9,8,1,1
chr3	184075047	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,2:5,4:4,4,3,3
chr3	184076065	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=85,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,19:0.375:51:13,0:19,18:10,22,0,19
chr3	184081371	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:4,8:1,1:0,5,1,9
chr3	184093966	.	CGTGTCTCCTTTCTCTCTCCCCTTCTGTCATGTTTCCATATGGCCCTAGCCCCTCAG	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.076:38:8,2:4,0:21,15,1,1
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	184098466	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr3	184098930	.	AGCTG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,5510;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCTG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=219,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr3	184280192	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184280192_G_A:184280192:0,0,0,1
chr3	184280216	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184280192_G_A:184280192:0,0,0,1
chr3	184289152	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=101,67;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,40:0.568:70:19,34:11,3:13,17,8,32
chr3	184289247	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:184289247_A_T:184289247:0,13,1,1
chr3	184289249	.	C	CTTTCAATTCCACAACAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,1:0|1:184289247_A_T:184289247:0,13,1,1
chr3	184293681	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.158:40:15,5:16,0:18,16,6,0
chr3	184295279	.	GAGGCCTTGGGCTGAGCTGGGCTGAGAAAATTACCCCCGGATCATGATGGGGCCCTTGGGAGCA	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.516:26:4,3:7,0:0|1:184295279_GAGGCCTTGGGCTGAGCTGGGCTGAGAAAATTACCCCCGGATCATGATGGGGCCCTTGGGAGCA_G:184295279:2,11,1,12
chr3	184295363	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:3,11:0,0:0|1:184295279_GAGGCCTTGGGCTGAGCTGGGCTGAGAAAATTACCCCCGGATCATGATGGGGCCCTTGGGAGCA_G:184295279:2,1,0,11
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,3:0,4:0,0,5,4
chr3	184429718	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,7,8
chr3	184566813	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:184566813_C_T:184566813:5,2,1,1
chr3	184566815	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:184566813_C_T:184566813:5,2,1,1
chr3	184580917	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	184588420	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr3	184588622	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:11,3:8,0:5,14,2,1
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	184642700	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:8,0:15,2:0|1:184642700_T_C:184642700:11,13,1,1
chr3	184642706	.	C	CTTGATTGTTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:184642700_T_C:184642700:11,11,1,1
chr3	184642708	.	T	TTTTATTG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:10,2:0|1:184642700_T_C:184642700:11,10,1,1
chr3	184648367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:10,5:1,9:5,6,5,9
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	184658058	.	T	TTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,1:5,0:3,5,0,2
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,3:0,0,12,1
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	184766186	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,2:4,1:5,2,3,0
chr3	184766249	.	TC	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=90,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,3:5,8:3,5,7,5
chr3	184766392	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=183,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr3	184801102	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,0:9,3:8,3,0,3
chr3	184801223	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=138,74;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:6,5:6,0:5,7,5,0
chr3	184910598	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,34;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.216:11:3,0:6,1:7,2,1,1
chr3	184952996	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr3	184971837	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=110,59;MMQ=60,32;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:7,9,0,4
chr3	185146647	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=92,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,0:12,2:15,12,2,0
chr3	185146702	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,12:0,7:0,0,11,8
chr3	185155430	.	C	CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=173,232,153;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.35,6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.375,0.452:8:1,1,3:0,2,1:0,1,2,5
chr3	185155482	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr3	185161138	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,1:1,1:5,1,2,0
chr3	185191612	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185191612_G_C:185191612:0,0,0,1
chr3	185191613	.	TTATAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185191612_G_C:185191612:0,0,0,1
chr3	185195227	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr3	185212466	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=87,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:14,3:22,0:22,14,1,2
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=100,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:185212593_T_C:185212593:0,2,0,2
chr3	185212612	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:185212593_T_C:185212593:0,4,0,1
chr3	185212613	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:185212593_T_C:185212593:0,4,0,1
chr3	185212622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:185212593_T_C:185212593:0,4,0,1
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr3	185234916	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,2:7,1:3,8,1,2
chr3	185241758	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=153,193;MMQ=40,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:12,0,2,0
chr3	185324097	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=138,278;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.282:9:5,0:2,1:5,2,2,0
chr3	185330303	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0|1:185330303_C_T:185330303:3,0,4,0
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1|0:185330303_C_T:185330303:4,0,3,0
chr3	185331165	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:10,3:1,5:6,5,4,4
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr3	185347459	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	185367124	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=110,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:3,2:6,2:8,2,4,0
chr3	185390428	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,14:0.209:68:22,0:31,13:30,24,0,14
chr3	185635643	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,0:5,6:0,7,0,6
chr3	185639844	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:21,2:8,0:0|1:185639844_C_G:185639844:18,12,1,1
chr3	185639848	.	T	TTGCAACAGCTAAATTTC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:18,2:9,0:0|1:185639844_C_G:185639844:18,12,1,1
chr3	185775196	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:11,6:21,0:15,17,4,2
chr3	185783550	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:5,2,2,0
chr3	185797556	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	185882643	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.516:12:1,6:3,0:4,2,4,2
chr3	185905975	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:8,3:8,9,3,0
chr3	185906237	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0|1:185906237_G_A:185906237:0,3,1,1
chr3	185906246	.	CGTGT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1|0:185906237_G_A:185906237:0,1,0,2
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	185975668	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=103,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:14,0:15,1:0|1:185975668_T_A:185975668:15,18,1,1
chr3	185975670	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:19,2:0|1:185975668_T_A:185975668:15,18,1,1
chr3	185975789	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	185979500	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:19,3,2,1
chr3	185982955	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:185982955_G_A:185982955:0,0,6,0
chr3	185982972	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:185982955_G_A:185982955:0,0,9,0
chr3	185990096	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,7:0,13:0,0,10,10
chr3	185997836	.	T	TACAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	185997861	.	G	GCCATGGGGAAGTCCTCAGGAATAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=242,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=83,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.756:10:0,3:2,5:1,1,4,4
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	186015315	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	186256785	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0|1:186256785_G_GA:186256785:0,8,1,1
chr3	186256790	.	C	CAAACACGGCAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0|1:186256785_G_GA:186256785:0,10,1,1
chr3	186274566	.	T	TAA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.112:24:9,2:12,0:0|1:186274566_T_TAA:186274566:11,11,1,1
chr3	186274575	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:14,0:0|1:186274566_T_TAA:186274566:11,12,1,1
chr3	186274582	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:0|1:186274566_T_TAA:186274566:9,11,1,1
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=215,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	186293588	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=100,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:6,2,5,1
chr3	186295417	.	AT	A,ATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,26,25;MFRL=200,156,138;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.77,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,6:0.279,0.496:12:1,2,4:1,1,0:1,1,7,3
chr3	186295482	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.122:38:20,4:14,0:12,22,1,3
chr3	186299138	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=105,157;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=61.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.419:53:14,22:17,0:21,10,22,0
chr3	186299905	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,27:0.779:34:1,7:6,20:1,6,1,26
chr3	186301703	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:3,4,4,4
chr3	186302391	.	A	ATTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,22,17;MFRL=140,35,129;MMQ=60,41,40;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.16,6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.264,0.623:9:1,1,2:0,0,1:0,1,3,5
chr3	186331199	.	G	GCGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,117;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:186331199_G_GCGCC:186331199:0,2,0,1
chr3	186331203	.	C	CACCATGCCCGGCTAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=127,117;MMQ=60,35;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186331199_G_GCGCC:186331199:0,1,0,1
chr3	186334343	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,4:5,7:3,10,4,7
chr3	186336364	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,0:9,3:11,14,0,3
chr3	186337713	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr3	186337827	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	186338382	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr3	186338425	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,14,5
chr3	186362656	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:10,9,3,0
chr3	186370155	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:186370155_C_T:186370155:0,4,0,1
chr3	186370157	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:186370155_C_T:186370155:0,4,0,1
chr3	186370297	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:186370297_C_T:186370297:11,6,1,1
chr3	186370307	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:186370297_C_T:186370297:10,6,1,1
chr3	186386664	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	186393073	.	GGTGTGTGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,87;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=GT;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	186395180	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr3	186395556	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:18,1:13,1:19,13,0,2
chr3	186395572	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=100,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.597:30:7,9:5,9:6,6,9,9
chr3	186395670	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:5,18:14,0:4,16,0,19
chr3	186435583	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:186435583_T_C:186435583:1,0,0,1
chr3	186435591	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:186435583_T_C:186435583:1,0,0,1
chr3	186440147	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	186445186	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,47:0.660:71:14,22:10,25:7,17,11,36
chr3	186502195	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:31,3:24,0:36,21,3,0
chr3	186502222	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:32,3:24,0:30,26,3,0
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr3	186508247	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:0,8,1,4
chr3	186510660	.	AAGCTGCCTGAGC	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:11,0:13,17,1,1
chr3	186522293	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	186570808	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.117:25:12,1:10,1:15,7,2,1
chr3	186572400	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,7:7,0:6,8,7,0
chr3	186768953	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=85,301;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr3	186839137	.	GAGAGAC	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAGAC;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:10,2:11,0:10,13,1,1
chr3	186917841	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.171:27:10,4:10,0:0|1:186917841_T_C:186917841:6,17,0,4
chr3	186917843	.	C	CTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.173:27:11,4:11,0:0|1:186917841_T_C:186917841:6,17,0,4
chr3	186938011	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=114,40;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:7,7,0,2
chr3	186953456	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=213,144;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:1,15:2,0:0|1:186953456_G_A:186953456:3,0,15,0
chr3	186953459	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=213,144;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:1,15:2,0:0|1:186953456_G_A:186953456:3,0,15,0
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	186968161	.	G	GAAGGGAGGGAGAAAGGAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	187009351	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,5:7,1:14,3,3,3
chr3	187009372	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=176,113;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,3:8,1:16,5,1,3
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	187416863	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,0:3,2:2,6,0,2
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	188124184	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=194,304;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:188124184_G_A:188124184:0,3,0,1
chr3	188124191	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=200,304;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:188124184_G_A:188124184:0,2,0,1
chr3	188124199	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	188326926	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,6:5,2:7,0,6,2
chr3	188327518	.	TCCTCCTGGAGCAGGGAACCAGAAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=74,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.128:22:8,2:6,0:9,11,2,0
chr3	188426256	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,4:1,0:0,5,0,4
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr3	188956787	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	189028117	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=96,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,2:5,3:6,1,5,2
chr3	189038648	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,8:4,2:0,8,1,9
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	189507490	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:11,0,10,0
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,9:8,7:13,0,17,0
chr3	189582241	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:2,8,1,3
chr3	189587268	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:189587268_CA_C:189587268:0,1,0,1
chr3	189587274	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:189587268_CA_C:189587268:0,1,0,1
chr3	189590824	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=98,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.400:25:7,3:8,6:5,10,3,7
chr3	189597861	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,0:7,3:14,4,3,0
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:8,1,5,1
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:7,1,5,1
chr3	189607184	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:14,0:9,3:7,16,1,2
chr3	189690816	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=9,25;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.583:11:1,2:0,2:1,4,1,5
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	189702395	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25,25;MFRL=264,111,129;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=5.87,17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,9:0.291,0.596:14:0,4,3:1,0,6:0,1,3,10
chr3	189705268	.	TAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=151,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.547:6:1,1:2,2:2,1,1,2
chr3	189705542	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	189712010	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,7:3,6:4,6,9,4
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=155,138;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr3	189713120	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,0:16,2:15,13,1,1
chr3	189713130	.	T	TACCTAGATGATCCTGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:17,13,1,1
chr3	190030910	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:190030910_T_TG:190030910:0,1,0,1
chr3	190030912	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:190030910_T_TG:190030910:0,1,0,1
chr3	190030914	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:190030910_T_TG:190030910:0,1,0,1
chr3	190030920	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:190030910_T_TG:190030910:0,1,0,1
chr3	190039888	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=94,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.161:45:18,3:20,3:13,25,4,3
chr3	190167647	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:4,4:6,2:5,5,1,5
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=183,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:190322271_T_C:190322271:0,4,2,0
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:190322271_T_C:190322271:0,3,2,0
chr3	190338039	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,5:2,4:2,0,8,1
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:2,8,0,4
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=210,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:3,7:3,2:7,0,10,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=83,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.306:29:9,7:9,2:11,9,4,5
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr3	190578706	.	A	AAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr3	190578743	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	190580505	.	C	CTACCCTCTGCTTTGGCTCCACCAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.316:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr3	190936482	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:10,6:9,3:14,5,7,2
chr3	190993205	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=166,139;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr3	191074796	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.320:11:1,2:5,1:6,2,3,0
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.396:36:15,5:6,9:21,1,13,1
chr3	191097928	.	G	GT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.443:35:10,6:7,8:17,3,12,3
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,24:0.396:61:16,9:19,13:17,20,12,12
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:0,7,0,5
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:9,4:13,7:3,19,4,7
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=189,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr3	191107192	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	191178925	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:5,2,6,2
chr3	191888452	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:0,2,0,3
chr3	192125768	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	192444899	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr3	192516590	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	192516851	.	ACCTCTT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:0|1:192516851_ACCTCTT_A:192516851:2,1,0,2
chr3	192516862	.	AGTAAT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=92,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:1,1:0|1:192516851_ACCTCTT_A:192516851:4,2,0,2
chr3	192973599	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:10,0:6,8:4,13,2,6
chr3	192980924	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,0:14,3:12,16,0,3
chr3	193007624	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:11,9:13,0:19,5,9,0
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,13:0,0,17,4
chr3	193036739	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=90,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:4,1,2,2
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr3	193061804	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=90,109;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,3:16,0:20,10,3,0
chr3	193061839	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:26,0:12,2:17,23,1,1
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,4,11
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=125,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:7,1,3,1
chr3	193069072	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=182,274;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193069072_T_TAG:193069072:0,4,0,1
chr3	193069073	.	T	TTGTCTGGGAGCTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=182,274;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193069072_T_TAG:193069072:0,4,0,1
chr3	193069074	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	193069077	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=182,274;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:193069072_T_TAG:193069072:0,4,0,1
chr3	193080414	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,6:5,2:8,5,5,3
chr3	193081206	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=314,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	193096529	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr3	193120726	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	193128692	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:10,0,3,0
chr3	193151703	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:11,2:3,0:0|1:193151703_T_C:193151703:4,10,1,1
chr3	193151705	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:10,1:3,0:0|1:193151703_T_C:193151703:4,10,1,1
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:0,6:4,3:1,3,2,7
chr3	193156838	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=120,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:3,5,1,1
chr3	193156966	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	193158479	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,0,7
chr3	193159419	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	193174782	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr3	193180510	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,1:5,2:6,3,3,0
chr3	193180661	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,2:0,4:2,3,3,3
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	193182715	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=88,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:1,2,2,2
chr3	193232426	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=87,38;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,0:6,3,2,0
chr3	193272442	.	CGTGTGTGTGT	C,CGT,CGTGT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30,32,30;MFRL=72,108,130,114;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,10,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,12,13,14;RU=GT;STR;TLOD=8.39,9.12,10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,5,5,6:0.238,0.242,0.275:21:0,1,5,2:0,3,0,4:2,3,12,4
chr3	193332764	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:10,1:4,2:7,7,1,2
chr3	193361448	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.396:21:3,6:9,3:3,9,3,6
chr3	193854148	.	TAA	T,TA,TAAA,TAAAA,TAAAAA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=21,21,23,23,26,16;MFRL=102,175,114,218,178,104;MMQ=60,60,60,60,60,60;MPOS=20,17,17,11,22;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17,18,19;RU=A;STR;TLOD=5.34,21.29,5.16,4.19,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4/5:10,9,18,5,4,5:0.118,0.316,0.125,0.135,0.124:51:1,5,8,2,3,1:5,2,7,2,0,1:6,4,27,14
chr3	193855447	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:7,5,1,1
chr3	194062519	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,9:4,3:4,2,8,4
chr3	194062565	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.694:30:3,9:5,10:3,6,8,13
chr3	194063300	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,14,13
chr3	194084117	.	GG	AA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:27,2:29,0:39,22,1,1
chr3	194151936	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=115,80;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:7,9,0,2
chr3	194159720	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=98,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.290:14:5,3:5,0:2,8,1,3
chr3	194165579	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=146,92232241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.099:27:7,0:16,2:0|1:194165579_T_A:194165579:5,20,2,0
chr3	194165585	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,92232241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:16,2:0|1:194165579_T_A:194165579:5,22,2,0
chr3	194169086	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=239,172;MMQ=53,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:194169086_CG_TA:194169086:2,0,1,0
chr3	194169089	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=239,172;MMQ=53,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:194169086_CG_TA:194169086:2,0,1,0
chr3	194169096	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=223,172;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:194169086_CG_TA:194169086:1,0,1,0
chr3	194169388	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr3	194309210	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=87,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:3,4:0,3:2,1,6,1
chr3	194313832	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,23:0,0,22,19
chr3	194324939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,6,8
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr3	194337901	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:5,7:3,7:5,3,6,9
chr3	194346789	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,28:0.879:31:2,26:1,0:0,3,0,28
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	194365537	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:1,3:0,5,0,3
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.641:43:7,15:8,12:8,7,19,9
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:1,4,0,5
chr3	194380865	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:8,11,1,1
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=115,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:3,0,6,1
chr3	194390647	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=153,160;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:1,0:8,2:10,0,2,0
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,5:8,11:9,5,6,10
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,8:9,5:9,6,4,9
chr3	194407972	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,27:0.848:31:1,0:3,26:0,4,0,27
chr3	194408550	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.319:12:2,0:4,1:5,3,0,4
chr3	194409257	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.608:11:2,2:2,2:2,2,3,4
chr3	194790422	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr3	194790434	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	194991782	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:194991782_G_T:194991782:0,1,0,1
chr3	194991787	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=225,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:194991782_G_T:194991782:0,2,0,1
chr3	194991790	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=225,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:194991782_G_T:194991782:0,2,0,1
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	195022931	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,1:5,2:1,11,0,4
chr3	195112846	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=88,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,12:0.166:76:33,12:31,0:30,34,0,12
chr3	195245771	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:5,8:10,0:11,4,5,3
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=142,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:12,10:9,3:10,11,7,6
chr3	195295708	.	G	GGGGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=64,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr3	195295819	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=121,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,1:16,1:6,19,0,2
chr3	195295839	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=99,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.189:30:9,0:13,5:12,13,0,5
chr3	195453064	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.447:38:7,4:14,12:9,12,10,7
chr3	195453093	.	C	CCCCAAGTGAGAGCTGCTTGGGCCAGCCCCAGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,65;MMQ=57,35;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.198:24:2,0:17,4:8,12,3,1
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr3	195480145	.	AGAGGGACGG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:195480145_AGAGGGACGG_A:195480145:1,10,1,1
chr3	195480157	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:195480145_AGAGGGACGG_A:195480145:0,9,1,1
chr3	195480163	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:195480145_AGAGGGACGG_A:195480145:0,5,1,1
chr3	195481263	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:2,7,1,1
chr3	195489009	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:3,3,2,0
chr3	195491904	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:12,1:21,2:19,14,0,3
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr3	195492079	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr3	195506277	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=132,118;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.136:41:21,5:12,0:0|1:195506277_G_A:195506277:16,20,3,2
chr3	195506282	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=133,231;MMQ=40,57;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:19,1:9,0:0|1:195506277_G_A:195506277:16,19,2,1
chr3	195506753	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,33;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,12:0,3:0,0,10,5
chr3	195506934	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=84,64;MMQ=58,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.099:48:27,4:14,0:0|1:195506934_G_C:195506934:23,21,2,2
chr3	195506952	.	TG	CA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=86,67;MMQ=46,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,2:13,0:0|1:195506934_G_C:195506934:19,15,1,1
chr3	195508294	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=90,73;MMQ=51,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:26,4:16,0:0|1:195508294_G_A:195508294:27,18,2,2
chr3	195508299	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=90,73;MMQ=51,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:23,4:16,0:0|1:195508294_G_A:195508294:27,18,2,2
chr3	195508379	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=22,18;MFRL=84,636;MMQ=60,29;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.221:49:15,1:21,5:18,19,11,1
chr3	195510766	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=89,97;MMQ=50,46;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:10,6:5,2:10,10,4,4
chr3	195510773	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=86,91;MMQ=39,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.224:31:11,1:7,0:15,9,3,4
chr3	195511176	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=84,108;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.109:52:26,2:14,2:25,21,3,3
chr3	195512598	.	G	GATA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,57;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.094:49:30,4:14,0:0|1:195512598_G_GATA:195512598:22,23,2,2
chr3	195512599	.	G	GCAT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,57;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.094:49:30,2:14,0:0|1:195512598_G_GATA:195512598:22,23,2,2
chr3	195512885	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=113,162;MMQ=55,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:31,3:17,0:28,27,2,1
chr3	195514503	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195514504	.	G	GCAC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195514505	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195514507	.	A	ACGTAGTAC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195514511	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195514514	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:195514503_G_T:195514503:0,0,0,1
chr3	195515374	.	GGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGCATCGGTGACAT	G	.	.	DP=139;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=88,171;MMQ=52,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,5:0.050:119:26,2:7,1:55,59,2,3
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=82,74;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.285:61:25,9:19,8:27,17,10,7
chr3	195516026	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:15,3:12,0:19,8,1,2
chr3	195518036	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:7,5:15,3:15,7,6,2
chr3	195595632	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	195596440	.	GAGAGAGACGGAGCAGGACAGAGGACAAAGGAGGGAGACGGCCGGACGAGAGGGCAGAGTGT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=92,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.109:28:10,2:9,0:0|1:195596440_GAGAGAGACGGAGCAGGACAGAGGACAAAGGAGGGAGACGGCCGGACGAGAGGGCAGAGTGT_G:195596440:13,13,1,1
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,7:0.897:7:0,2:0,5:1|0:195596440_GAGAGAGACGGAGCAGGACAGAGGACAAAGGAGGGAGACGGCCGGACGAGAGGGCAGAGTGT_G:195596440:0,0,0,7
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=359,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,4:1,0,6,2
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=467,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.882:14:0,7:1,6:1,0,9,4
chr3	195608965	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,3:13,0:13,9,2,1
chr3	195609997	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:195609997_C_CA:195609997:1,0,1,0
chr3	195610003	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:195609997_C_CA:195609997:1,0,1,0
chr3	195610009	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=9,14;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:195609997_C_CA:195609997:1,0,1,0
chr3	195610013	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,33;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:195609997_C_CA:195609997:1,0,1,0
chr3	195615252	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,0:12,2:11,3,1,1
chr3	195779155	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,4:2,2:0|1:195782176_CA_TG:195782176:5,2,4,2
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:4,5:4,1:0|1:195782176_CA_TG:195782176:6,2,4,3
chr3	195789376	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=140,153;MMQ=43,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:2,0:9,5:12,0,5,0
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.458:44:10,6:13,14:10,14,6,14
chr3	195792258	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,11;MFRL=75,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:195792258_A_C:195792258:2,0,1,0
chr3	195792267	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=75,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:195792258_A_C:195792258:2,0,1,0
chr3	195792273	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=75,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:195792258_A_C:195792258:2,0,1,0
chr3	195792278	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=75,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:195792258_A_C:195792258:2,0,1,0
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,23,7
chr3	195801025	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,9:7,6:3,9,5,10
chr3	195804021	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,5:2,12,1,10
chr3	195804073	.	T	TGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=197,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:195804073_T_TGG:195804073:0,8,1,1
chr3	195804074	.	A	ATCAAGCTAGATCAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=197,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:195804073_T_TGG:195804073:0,8,1,1
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.770:8:0,1:2,5:2,0,4,2
chr3	195925137	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:10,0:19,3:18,11,1,2
chr3	195925238	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:14,2:12,0:0|1:195925238_G_A:195925238:16,12,0,2
chr3	195925249	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:13,0:0|1:195925238_G_A:195925238:15,11,0,2
chr3	195925255	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:20,2:13,0:0|1:195925238_G_A:195925238:14,19,0,2
chr3	195925355	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,1:3,2:1,5,0,3
chr3	195935180	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:1,0:2,0:0|1:195935180_G_C:195935180:6,1,2,0
chr3	195935186	.	AT	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:3,1:1,1:0|1:195935180_G_C:195935180:7,0,2,0
chr3	195935207	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	195944901	.	G	GCCATCCTCCTCTTCCAGCTGCTTGCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=99,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.477:9:3,3:3,0:0|1:195944901_G_GCCATCCTCCTCTTCCAGCTGCTTGCT:195944901:1,5,2,1
chr3	195944905	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:195944901_G_GCCATCCTCCTCTTCCAGCTGCTTGCT:195944901:1,3,0,1
chr3	195954625	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=123,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:2,6,1,2
chr3	195955762	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,3:7,3:7,7,3,3
chr3	195975177	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,95;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:5,0:12,5:3,14,0,5
chr3	195975281	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=207,226;MMQ=28,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:195975281_C_T:195975281:0,1,0,1
chr3	195975283	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,33;MFRL=207,226;MMQ=28,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:195975281_C_T:195975281:0,1,0,1
chr3	195975287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=207,226;MMQ=28,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:195975281_C_T:195975281:0,1,0,1
chr3	196023007	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr3	196033781	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=101,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:16,7,0,2
chr3	196044894	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=98,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:3,8:1,8:3,1,12,4
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	196054439	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,15,10
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr3	196054522	.	T	TGGGCTCTGGGGAGGAGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=56,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	196054550	.	CAGACTACAGAAACCGCCACCTT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=284,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0,2,1,1
chr3	196088679	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:13,0:22,12,4,0
chr3	196088809	.	TAA	T,TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27,25;MFRL=127,162,175;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.11,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,4:0.211,0.204:24:4,3,3:7,2,0:0,15,0,9
chr3	196089620	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196089620_C_CA:196089620:0,1,0,1
chr3	196089622	.	G	GAAAACCTCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196089620_C_CA:196089620:0,1,0,1
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:1,6,0,3
chr3	196118849	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0|1:196118849_GAA_G:196118849:0,0,1,0
chr3	196118868	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:196118849_GAA_G:196118849:0,0,1,0
chr3	196118875	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:196118849_GAA_G:196118849:0,0,1,0
chr3	196134294	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=18,28;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:0,0:2,3:0,4,0,5
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,3:0,13:0,0,13,4
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr3	196215451	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.924:21:0,9:2,9:1,1,7,12
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	196242143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	196281023	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr3	196287979	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,0:8,2:11,10,0,2
chr3	196388023	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,1:7,8:8,5,3,6
chr3	196532104	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,6:3,0:7,0,6,0
chr3	196532148	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.502:27:10,7:1,6:10,4,13,0
chr3	196532190	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=125,108;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:27,3:17,0:22,23,3,0
chr3	196541252	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:5,0,7,0
chr3	196547538	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,14,10
chr3	196612186	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.242:38:16,0:12,8:15,14,0,9
chr3	196613075	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,2:1,2:4,2,2,2
chr3	196626690	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,0:3,3:5,8,3,0
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr3	196627356	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,4:6,0:1,6,0,4
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	196650187	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=91,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	196657670	.	CTT	C,CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26,32;MFRL=0,75,140;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=T;STR;TLOD=3.03,65.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,26:0.127,0.843:30:0,2,9:0,2,15:0,0,17,13
chr3	196664291	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	196666214	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:8,7:6,10:10,5,9,8
chr3	196674879	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:7,4,1,1
chr3	196674916	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:0|1:196674916_A_C:196674916:7,5,4,2
chr3	196674919	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:3,4:7,2:0|1:196674916_A_C:196674916:7,5,4,2
chr3	196674972	.	CT	TC,TT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,24,25;MFRL=0,157,164;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.01,28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,13:0.431,0.533:23:0,4,6:0,4,5:0,0,11,12
chr3	196742395	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,2:12,1:8,11,0,3
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,8:0,0,13,6
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,2,13
chr3	196778438	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,4:2,9:2,5,8,5
chr3	196792298	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=120,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.103:29:11,0:14,2:0|1:196792298_TC_T:196792298:12,14,2,1
chr3	196792300	.	TCGTTTTGGTCTAGTTGTATCTTTAACAGAAAAAAACTTGGGAAAGTGTTTAATATTAAAAAAAAAACCACAATAAATCCATTTTCTACTTACA	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=127,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.079:38:11,0:15,2:0|1:196792298_TC_T:196792298:12,23,1,2
chr3	196792356	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.268:9:1,1:4,1:1|0:196792298_TC_T:196792298:0,7,0,2
chr3	196793466	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr3	196796115	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:19,0:17,5:25,11,0,5
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=313,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,8:1,11:0,1,3,16
chr3	196869518	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:1,4:4,5:4,1,8,1
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=65.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,20:0,0,20,14
chr3	197238876	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:18,2:14,0:0|1:197238876_C_T:197238876:16,22,1,1
chr3	197238886	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=116,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:16,2:17,0:0|1:197238876_C_T:197238876:15,21,1,1
chr3	197239266	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	197409435	.	CGTGCTGCCCGTCATCCGGTGAGATGGGCAGTGAGTCAGGAATGGGCAGGAGCTGCAGGAGGAAAGCACAGTTGGGGTAAGCTCGTGTCAGT	C	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=109,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,8:0.105:70:9,5:10,1:27,35,3,5
chr3	197409451	.	CGGTGAGATGGGCAGTGAGTCAGGAATGGGCAGGAGCTGCAGGAGGAAAGCACAGTTGGGGTAAGCTCGTGTCAGTGTGCTGCCCGTCATCT	C	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,27:0.152:79:6,12:6,10:19,33,15,12
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=99.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,13:0,0,21,10
chr3	197495334	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr3	197500394	.	T	TTTTG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.925:8:0,8:0,0:0,0,4,4
chr3	197501028	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:11,12,0,2
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=262.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,66:0.985:66:0,50:0,14:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,0,40,26
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=262.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,66:0.985:66:0,37:0,9:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,0,40,26
chr3	197553895	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=106,96;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:13,1:12,12,1,1
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr3	197562589	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,1:16,2:11,22,0,3
chr3	197566084	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	197574936	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:6,2:3,4:4,7,0,7
chr3	197581147	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr3	197597044	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=87,93;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:9,4:4,0:7,6,2,2
chr3	197616627	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr3	197639590	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=111,89;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:13,12,1,1
chr3	197639659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:1,7,0,3
chr3	197670909	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,0:10,3:8,10,1,2
chr3	197670939	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=142,91;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	197678276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=153,215;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr3	197702016	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr3	197712759	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:0,2,2,7
chr3	197765432	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:9,4:0,8:6,3,9,3
chr3	197765471	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=80,85;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,0:14,3:13,11,1,2
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCA	G,GGCA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33,34;MFRL=91,181,156;MMQ=60,51,27;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=GCA;STR;TLOD=12.44,8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.390,0.350:9:1,2,1:1,2,2:1,1,2,5
chr3	197882580	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,85;MMQ=25,21;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:14,4:15,0:16,13,4,0
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=99,115;MMQ=47,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:18,1:18,3:14,22,4,0
chr4	53428	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=168.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,30:0,29:0,0,19,41
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,8:0,0,0,23
chr4	53503	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:11,3:5,1:0,16,0,4
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,16:0.231:70:31,7:23,8:37,17,9,7
chr4	59469	.	A	G	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,9:0.110:84:40,1:34,7:31,44,2,7
chr4	85562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,12:0,0,13,3
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.968:26:0,10:0,16:0,0,14,12
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=125.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,21:0,0,20,21
chr4	155141	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=120,86;MMQ=60,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,0:11,5:9,13,1,4
chr4	264941	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=77,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.838:22:2,13:1,6:2,1,10,9
chr4	289139	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=197,114;MMQ=58,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:2,0,8,0
chr4	331658	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=136,221;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:0|1:331658_T_C:331658:8,0,2,0
chr4	331666	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=136,221;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:331658_T_C:331658:8,0,2,0
chr4	331675	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=129,221;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,2:2,0:0|1:331658_T_C:331658:8,2,2,0
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr4	331740	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:13,3:9,3:9,13,3,3
chr4	337474	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,147;MMQ=49,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:3,0:11,6:14,0,6,0
chr4	338031	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=28,32;MFRL=331,194;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:338031_A_C:338031:5,0,3,0
chr4	338036	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=27,27;MFRL=331,194;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:338031_A_C:338031:5,0,3,0
chr4	338047	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=32,27;MFRL=113,194;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:0|1:338047_G_A:338047:2,0,3,0
chr4	338054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=21;MBQ=17,30;MFRL=113,172;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:1,2:0|1:338047_G_A:338047:2,0,4,0
chr4	338078	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=27,26;MFRL=135,149;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:2,1:0|1:338078_A_T:338078:5,0,3,0
chr4	338086	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=22,31;MFRL=143,142;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:3,1:3,2:0|1:338078_A_T:338078:6,0,4,0
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chr4	338112	.	AA	TT	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=27,26;MFRL=126,142;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:0|1:338100_ATT_A:338100:11,1,5,1
chr4	338129	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=21;MBQ=26,25;MFRL=114,149;MMQ=60,48;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,7:9,4:12,4,5,6
chr4	338156	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=21;MBQ=22,27;MFRL=100,142;MMQ=59,48;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.374:38:13,8:11,6:16,8,7,7
chr4	338186	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=21;MBQ=32,24;MFRL=100,91;MMQ=60,42;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,17:0.291:58:24,7:17,10:25,16,11,6
chr4	338197	.	T	TGA	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=23,25;MFRL=100,100;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,15:0.258:60:25,5:17,8:0|1:338197_T_TGA:338197:31,14,11,4
chr4	338200	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=101,86;MMQ=60,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,12:0.217:58:27,4:18,6:0|1:338197_T_TGA:338197:33,13,10,2
chr4	338201	.	ATC	A	.	.	DP=62;ECNT=21;MBQ=26,27;MFRL=100,75;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,13:0.219:62:28,4:18,6:0|1:338197_T_TGA:338197:34,15,10,3
chr4	338205	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=21;MBQ=23,30;MFRL=100,75;MMQ=60,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,12:0.206:61:28,4:19,7:0|1:338197_T_TGA:338197:34,15,9,3
chr4	338246	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=31,26;MFRL=105,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,9:0.181:53:21,4:21,5:0|1:338246_G_A:338246:28,16,3,6
chr4	338252	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=21;MBQ=31,24;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,10:0.204:52:20,4:20,6:0|1:338246_G_A:338246:26,16,3,7
chr4	338258	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=21;MBQ=31,24;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:20,3:17,5:0|1:338246_G_A:338246:22,15,1,7
chr4	338260	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=21;MBQ=26,30;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.187:46:20,3:17,5:0|1:338246_G_A:338246:22,16,1,7
chr4	338266	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=31,24;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:18,3:16,4:0|1:338246_G_A:338246:22,15,1,7
chr4	338289	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=21;MBQ=24,28;MFRL=123,133;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:15,1:7,1:10,14,0,2
chr4	367362	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=111,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:15,0:17,4:18,18,0,4
chr4	367381	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.129:37:17,0:15,3:13,20,0,4
chr4	499801	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr4	515807	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	520863	.	C	CCT	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:26,2:23,0:0|1:520863_C_CCT:520863:24,25,1,1
chr4	520868	.	T	TGAG	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:27,2:22,0:0|1:520863_C_CCT:520863:25,25,1,1
chr4	520869	.	C	CTAG	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:24,2:22,0:0|1:520863_C_CCT:520863:25,25,1,1
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr4	648643	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,7,16
chr4	651287	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=94,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:13,3:6,3:0|1:651287_C_T:651287:9,10,4,2
chr4	651290	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=94,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:14,3:6,3:0|1:651287_C_T:651287:10,10,4,2
chr4	651299	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=98,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:9,1:7,2:0|1:651287_C_T:651287:9,8,1,2
chr4	658574	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,124;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:14,0,2,0
chr4	666278	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:14,1:20,3:21,13,4,0
chr4	666385	.	ATTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.222:15:6,0:1,0:7,5,0,3
chr4	667125	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,57;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:28,0:17,3:29,16,0,3
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:0,11:2,8:2,0,17,2
chr4	759709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr4	780536	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:780536_G_GAA:780536:0,4,0,1
chr4	780538	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:780536_G_GAA:780536:0,4,0,1
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,9:0,7:0,2,4,12
chr4	843622	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.921:14:0,6:0,7:0|1:843622_AC_A:843622:0,1,0,13
chr4	843630	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:0,6:1,7:0|1:843622_AC_A:843622:0,1,0,13
chr4	844712	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=196,1730;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:6,4,2,1
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	845841	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	858866	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:4,2,2,1
chr4	858874	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,8,3
chr4	860146	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr4	860192	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,10,7
chr4	862502	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	864526	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,276;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:12,11,2,0
chr4	871624	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,2:5,2:2,11,1,3
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	875671	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:1,9:2,12:1,2,16,5
chr4	877709	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	887373	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	905635	.	A	AGTGTGTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:0,2:0,5,1,1
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr4	941518	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr4	946226	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,14:0,0,32,10
chr4	946310	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=55,126;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr4	946341	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=44,56;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr4	946974	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr4	954741	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	956362	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,18;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:5,12,0,2
chr4	959263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:959263_C_T:959263:9,7,1,1
chr4	959275	.	T	TACAGGTACTTATGGACGTGAGGAGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=145,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:7,0:12,2:0|1:959263_C_T:959263:11,10,1,1
chr4	962705	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:0|1:962705_G_A:962705:8,9,1,1
chr4	962712	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:962705_G_A:962705:7,8,1,1
chr4	996052	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=121,79;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:8,2:17,0:0|1:996052_C_A:996052:17,8,2,1
chr4	996057	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=99,79;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:10,3:18,0:0|1:996052_C_A:996052:21,8,2,1
chr4	1016102	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=164,118;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr4	1016126	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,118;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr4	1016320	.	G	GGTGGGTTCTGCCAAGTGATCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1018792	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:0,0:7,2:0|1:1018792_T_A:1018792:3,4,1,1
chr4	1018796	.	CACCCTG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:1,0:7,1:0|1:1018792_T_A:1018792:3,6,1,1
chr4	1018928	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=137,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,3:2,0:5,4,2,1
chr4	1019054	.	CCACA	C,CCA	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=21,26,31;MFRL=78,73,46;MMQ=60,60,60;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CA;STR;TLOD=7.71,25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,6,12:0.093,0.209:61:7,1,5:29,5,7:24,19,8,10
chr4	1019058	.	ACACACACACACACACACTCT	A	.	.	DP=129;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=77,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,2:0.026:112:18,0:44,2:50,60,1,1
chr4	1019214	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:0,10,0,5
chr4	1067267	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	1084723	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr4	1244267	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,0:1,5:1,0,3,2
chr4	1244629	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,174;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:1,13,0,2
chr4	1244879	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,5:0,5:4,0,8,2
chr4	1245963	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=212,185;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1245963_T_C:1245963:0,1,0,1
chr4	1245966	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=212,185;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1245963_T_C:1245963:0,1,0,1
chr4	1245969	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=212,185;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1245963_T_C:1245963:0,1,0,1
chr4	1245974	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=212,185;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1245963_T_C:1245963:0,1,0,1
chr4	1326743	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,6,3
chr4	1343473	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=151,77;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,4:12,0:13,11,3,1
chr4	1345551	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:16,9:27,0:15,30,6,3
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr4	1349089	.	G	GAGATACTCTCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:1349089_G_GAGATACTCTCAC:1349089:0,1,0,1
chr4	1349092	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:1349089_G_GAGATACTCTCAC:1349089:0,1,0,1
chr4	1360132	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=86,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:20,4:7,0:15,12,3,1
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr4	1373751	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr4	1374040	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1374040_G_A:1374040:0,1,0,1
chr4	1374045	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1374040_G_A:1374040:0,1,0,1
chr4	1374774	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,0,12
chr4	1374789	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:0,1,0,11
chr4	1377615	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr4	1643204	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,5:4,1:5,2,5,1
chr4	1659128	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=73,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr4	1659162	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,0:2,5:2,1,3,2
chr4	1670407	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,0:6,2:10,1,1,1
chr4	1719015	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=89,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr4	1725071	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,3:6,1:11,1,4,0
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=82,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:10,3:14,7:15,9,4,6
chr4	1729764	.	ACAAAGCGGAGACTCCGCACGGAGCCGAGGAAGAATG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=144,173;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.189:26:3,2:8,2:12,10,1,3
chr4	1730215	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,122;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:17,4:11,4:15,13,3,5
chr4	1730254	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.310:23:11,1:5,5:7,9,2,5
chr4	1730299	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,1:8,4:11,8,2,3
chr4	1730537	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1730537_G_C:1730537:0,2,0,1
chr4	1730545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1730537_G_C:1730537:0,1,0,1
chr4	1737071	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,0:6,4:8,5,2,2
chr4	1737108	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:0,3,4,5
chr4	1737404	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,4:0,0,6,1
chr4	1737585	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr4	1739518	.	CGCCATCCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCATCCCT;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.823:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	1742779	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr4	1746229	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,2:4,7:3,1,6,3
chr4	1746844	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	1801475	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,3:8,0:6,5,1,2
chr4	1804785	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:1804785_C_T:1804785:8,13,1,1
chr4	1804792	.	G	GTTTTCAGGTGCGCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:8,0:0|1:1804785_C_T:1804785:6,14,1,1
chr4	1836617	.	T	TGAAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAAGCTAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=128,70;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.124:25:10,2:10,0:10,13,0,2
chr4	1836730	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=86,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:2,4,0,3
chr4	1836740	.	ACTGCT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:1836740_ACTGCT_A:1836740:0,6,1,1
chr4	1836748	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:1836740_ACTGCT_A:1836740:0,6,1,1
chr4	1836751	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:1836740_ACTGCT_A:1836740:0,5,1,1
chr4	1843148	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,3:12,0:4,20,1,2
chr4	1851040	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=169,156;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	1902365	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=98,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,2:11,1:16,7,1,2
chr4	1906147	.	C	CCGTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1906147_C_CCGTG:1906147:1,3,0,1
chr4	1906149	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1906147_C_CCGTG:1906147:1,3,0,1
chr4	1906150	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1906147_C_CCGTG:1906147:1,3,0,1
chr4	1906154	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=123,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1906147_C_CCGTG:1906147:0,3,0,1
chr4	1932454	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:8,8,1,1
chr4	1937004	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,34;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:1937004_G_T:1937004:7,12,1,1
chr4	1937009	.	G	GCCAGGCTGGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=96,34;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:1937004_G_T:1937004:6,13,1,1
chr4	1940313	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,3:5,0:6,9,0,3
chr4	1940317	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:0|1:1940317_G_A:1940317:6,7,0,2
chr4	1940322	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:2,0:0|1:1940317_G_A:1940317:6,5,0,2
chr4	1961128	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:8,2,3,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:7,1,4,1
chr4	1976629	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:11,2:16,2:14,13,2,2
chr4	1986542	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,4:1,2:0|1:1986542_C_T:1986542:6,1,5,1
chr4	1986549	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.265:13:7,3:3,0:1|0:1986542_C_T:1986542:8,2,3,0
chr4	1989594	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:7,1:9,3,2,1
chr4	1989788	.	C	CTCCCAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1989788_C_CTCCCAAAGTG:1989788:0,1,0,1
chr4	1989791	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1989788_C_CTCCCAAAGTG:1989788:0,1,0,1
chr4	1989793	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1989788_C_CTCCCAAAGTG:1989788:0,1,0,1
chr4	2043857	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2097626	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.202:36:14,0:15,6:15,14,0,7
chr4	2159684	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=124,123;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:14,11,0,3
chr4	2159740	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr4	2160894	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=78,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:5,2:13,1:9,9,1,3
chr4	2176506	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=93,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:9,4:13,1:12,10,1,5
chr4	2176551	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=207,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr4	2177929	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:9,2,2,0
chr4	2181016	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,4:9,3:8,7,5,2
chr4	2194946	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:8,2:14,4:0|1:2194946_C_T:2194946:15,8,3,3
chr4	2194953	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:8,2:14,4:0|1:2194946_C_T:2194946:14,8,3,3
chr4	2195089	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:1,7,0,2
chr4	2237914	.	TTTTTTAAAAAGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:4,0,1,0
chr4	2254286	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:2,3:2,0:0|1:2254286_G_A:2254286:1,3,1,2
chr4	2254304	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:2254286_G_A:2254286:1,2,0,2
chr4	2272532	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:8,16,0,2
chr4	2275835	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=79,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,3:6,3:7,9,3,3
chr4	2337393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=192,267;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:1,2,2,0
chr4	2339166	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,0:12,2:8,12,2,0
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=80,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:4,6,0,4
chr4	2498652	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	2513615	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.580:17:4,3:3,7:0|1:2513615_G_C:2513615:4,3,7,3
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,9:0|1:2513615_G_C:2513615:0,0,12,5
chr4	2673972	.	C	CTA	.	.	DP=62;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=142,34;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,2:0.047:62:15,0:43,2:0|1:2673972_C_CTA:2673972:20,40,1,1
chr4	2673974	.	A	ACTCCTCCATCCTCACC	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=137,34;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:12,0:41,2:0|1:2673972_C_CTA:2673972:22,40,1,1
chr4	2673981	.	CT	C	.	.	DP=71;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=126,34;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:19,0:44,2:0|1:2673981_CT_C:2673981:25,44,1,1
chr4	2673983	.	G	C	.	.	DP=70;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=126,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,2:0.042:70:19,0:43,2:0|1:2673972_C_CTA:2673972:25,43,1,1
chr4	2673988	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=126,34;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:20,0:43,2:0|1:2673981_CT_C:2673981:23,42,1,1
chr4	2673993	.	T	A	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=98,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,17:0.271:64:20,0:26,17:20,27,0,17
chr4	2674045	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=90,61;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:16,0:23,3:21,20,0,3
chr4	2691165	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	2692474	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:16,4:18,16,0,4
chr4	2698230	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.742:29:3,9:4,13:2,5,11,11
chr4	2701483	.	GGGA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGA;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.127:32:10,3:18,1:14,14,2,2
chr4	2717690	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:6,1,9,1
chr4	2717840	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,10:2,9:2,2,8,11
chr4	2743983	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=81,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.740:25:5,9:1,9:3,3,8,11
chr4	2743999	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,21:0,13:0,0,15,19
chr4	2744289	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	2746181	.	GCCCGTT	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=118,52;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:16,0:18,4:19,17,2,2
chr4	2746307	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr4	2746501	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,3:6,0:7,3,2,1
chr4	2746766	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=256,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2746766_G_T:2746766:0,1,0,1
chr4	2746771	.	G	GGCTTGATGCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=256,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2746766_G_T:2746766:0,1,0,1
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,0:0,5:2,0,2,3
chr4	2822307	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,5:5,1:2,3,3,3
chr4	2824848	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,4,19
chr4	2829478	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	2831266	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=127,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,3:10,1:6,10,2,2
chr4	2833226	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr4	2833966	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,280;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	2877711	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=85,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,2:15,1:14,10,1,2
chr4	2933031	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,7:3,5:3,0,7,5
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,8:0,0,7,8
chr4	2935251	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,17:0,0,18,12
chr4	2943361	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr4	2949368	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:2,0:11,2:2,12,1,1
chr4	2951804	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,24:0,0,14,27
chr4	2954223	.	T	TTAGCTACTTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	2955145	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	2955192	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=70.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,16,5
chr4	2955463	.	G	GACCAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=180,148;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2955463_G_GACCAAAAA:2955463:0,1,0,1
chr4	2955467	.	A	ACTTTTTTATTCATTTGCAGTGAACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=180,148;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2955463_G_GACCAAAAA:2955463:0,1,0,1
chr4	2965676	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:2965676_C_T:2965676:0,0,7,0
chr4	2965695	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0|1:2965676_C_T:2965676:0,0,6,2
chr4	2965873	.	GA	CC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,1:0|1:2965873_GA_CC:2965873:0,3,2,0
chr4	2965884	.	CAGAGAA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:2965873_GA_CC:2965873:0,5,2,0
chr4	2965914	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	2990375	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	2993898	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,5:7,0:10,1,5,0
chr4	2993980	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,17:0,0,12,18
chr4	2994002	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=169,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,8:1,12:1,0,8,12
chr4	2994107	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	3024044	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,5:0,13:0,0,14,4
chr4	3029588	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr4	3037138	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:10,3:10,13,1,2
chr4	3039311	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr4	3040279	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=239,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,0:0,0:0,2,0,5
chr4	3088663	.	TAGAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGAA;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:13,0:10,2:15,11,1,1
chr4	3101052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,6:6,0:7,6,5,1
chr4	3133569	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr4	3148653	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=88,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.829:27:4,11:0,12:3,1,16,7
chr4	3184267	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=221,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:0|1:3184267_G_GTT:3184267:0,1,0,1
chr4	3184268	.	G	GAACATGATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=221,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:0|1:3184267_G_GTT:3184267:0,1,0,1
chr4	3189690	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=319,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3189690_G_A:3189690:0,1,0,1
chr4	3189693	.	A	AATAAACCTTTATATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=319,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3189690_G_A:3189690:0,1,0,1
chr4	3205766	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:8,5:8,0:9,8,5,0
chr4	3208795	.	AAG	CCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	3208906	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:3208906_C_T:3208906:1,0,2,0
chr4	3208911	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:3208906_C_T:3208906:1,0,2,0
chr4	3215744	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=108,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,3:9,0:5,8,2,1
chr4	3230804	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr4	3240378	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	3240526	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	3240679	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=96,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:3,6,1,2
chr4	3251229	.	GAGATCA	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGATCA;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,0:10,2:15,15,1,1
chr4	3255258	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,3,4
chr4	3257373	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	3265710	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=59,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:8,2:1,3:5,4,1,5
chr4	3317873	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:1,11:3,4:3,1,11,4
chr4	3318726	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:1,1,3,4
chr4	3319805	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr4	3344680	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.778:25:1,10:4,10:2,3,8,12
chr4	3424363	.	C	CTTCGGCACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3424363_C_CTTCGGCACA:3424363:0,1,0,1
chr4	3424368	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3424363_C_CTTCGGCACA:3424363:0,1,0,1
chr4	3429907	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.351:31:5,0:12,2:6,14,11,0
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr4	3445820	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:3445820_A_C:3445820:12,9,0,2
chr4	3445825	.	C	CTGT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:3445820_A_C:3445820:15,11,0,2
chr4	3445826	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:12,2:0|1:3445820_A_C:3445820:15,11,0,2
chr4	3446751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	3446883	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	3446958	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:9,1:0|1:3446958_T_G:3446958:7,7,1,1
chr4	3446960	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:4,0:9,1:0|1:3446958_T_G:3446958:7,7,1,1
chr4	3447156	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	3514607	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=205,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	3521789	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=82,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:6,2:0|1:3521789_C_T:3521789:10,12,1,1
chr4	3521795	.	G	GTA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=85,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:3521789_C_T:3521789:11,12,1,1
chr4	3768766	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:7,6,1,1
chr4	3768772	.	CT	AA	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:7,6,1,1
chr4	3768775	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:7,6,1,1
chr4	3768779	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:8,6,1,1
chr4	3768781	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:8,6,1,1
chr4	3768784	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:3768766_A_T:3768766:8,5,1,1
chr4	3769798	.	T	TTCCCAGAGACCCGGGGAGCTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,4:0,0,8,4
chr4	3770069	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=87,115;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:4,2:1,14:3,2,4,12
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=113,77;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:18,8:9,8:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:17,10,13,5
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=113,77;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:18,9:9,9:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:17,10,13,5
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=116,77;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,18:0.396:46:18,8:10,9:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:17,11,13,5
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	4199315	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.218:24:11,0:8,4:7,12,0,5
chr4	4228273	.	TCCACAGCAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=157,193;MMQ=52,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr4	4228424	.	TT	CC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=113,98;MMQ=60,21;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:4,4,0,3
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=125,162;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:16,3:11,4:0|1:4239516_C_T:4239516:23,7,3,4
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=122,149;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:20,2:21,2:0|1:4239516_C_T:4239516:26,16,0,4
chr4	4242253	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr4	4247938	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,3:7,1:8,4,3,1
chr4	4249483	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	4270433	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=187,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4270433_C_T:4270433:0,2,0,1
chr4	4270435	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4270433_C_T:4270433:0,2,0,1
chr4	4275280	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:3,1,4,2
chr4	4276021	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,2:6,2:6,1,4,0
chr4	4304212	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:0|1:4304212_A_T:4304212:13,13,1,1
chr4	4304218	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=103,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:12,2:0|1:4304212_A_T:4304212:14,15,1,1
chr4	4304637	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:26,1:25,2:32,19,0,3
chr4	4304896	.	T	TTATTATTATTATTATTATTATTATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4304896_T_TTATTATTATTATTATTATTATTATTA:4304896:0,1,0,1
chr4	4304897	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4304896_T_TTATTATTATTATTATTATTATTATTA:4304896:0,1,0,1
chr4	4425216	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:1,1,5,1
chr4	4436436	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	4440116	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,7:2,3:2,1,5,5
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,9,4
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	5141744	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,75;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.177:25:14,4:7,0:3,18,2,2
chr4	5141751	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=114,75;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:2,16,0,2
chr4	5400043	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,12;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:5400043_T_G:5400043:0,4,0,1
chr4	5400048	.	G	GGGGGGCAGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=194,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:5400043_T_G:5400043:0,3,0,1
chr4	5400050	.	T	TACGATAACATCATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,10;MFRL=194,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,0:1,0:0|1:5400043_T_G:5400043:0,3,0,1
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=79,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,5:2,1:2,1,4,2
chr4	5448303	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:0,2:6,0:6,0,2,0
chr4	5468559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,1,1
chr4	5468575	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:7,5,2,1
chr4	5469872	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:5469872_T_C:5469872:0,4,0,1
chr4	5469879	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:5469872_T_C:5469872:0,4,0,1
chr4	5469882	.	CCA	TGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:5469872_T_C:5469872:0,4,0,1
chr4	5500842	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=163,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:5500842_A_T:5500842:7,8,1,1
chr4	5500850	.	CT	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=168,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:5500842_A_T:5500842:4,8,1,1
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,1:0,9:2,0,9,1
chr4	5527115	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,2:6,2:6,8,2,2
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,3:1,6:1,1,1,8
chr4	5528115	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr4	5567126	.	CCTGTAATCCCA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGTAATCCCA;STR;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,1:3,3:1,9,1,3
chr4	5577884	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	5624257	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:10,7,1,1
chr4	5630470	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr4	5642141	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,4,1
chr4	5642161	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr4	5687257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr4	5687263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,3:8,2:4,8,2,3
chr4	5731029	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,0:7,3:10,5,2,1
chr4	5731158	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:2,4,1,2
chr4	5733068	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=137,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr4	5747071	.	GC	AT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,2:10,0:0|1:5747071_GC_AT:5747071:6,10,1,1
chr4	5747072	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:5,0:3,7:3,5,3,4
chr4	5747075	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:8,0:0|1:5747071_GC_AT:5747071:6,10,1,1
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:2,6,3,5
chr4	5754544	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:5,1:7,2:10,2,3,1
chr4	5785442	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,172;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:1,7,2,3
chr4	5803669	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr4	5803904	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	5803922	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=229,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	5806366	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	5810142	.	CATGGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:5810142_CATGGGG_C:5810142:0,2,0,1
chr4	5810149	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:5810142_CATGGGG_C:5810142:0,2,0,1
chr4	5810151	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5810142_CATGGGG_C:5810142:0,2,0,1
chr4	5810154	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5810142_CATGGGG_C:5810142:0,2,0,1
chr4	5812195	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr4	5812817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr4	5843196	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:0,4,1,6
chr4	5851261	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0|1:5851261_G_GC:5851261:0,3,0,1
chr4	5851263	.	A	ACCATGTCCAGCTAATTTTTAATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0|1:5851261_G_GC:5851261:0,3,0,1
chr4	5858111	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	5894525	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=298,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	5966665	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	5966801	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr4	5966905	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	5966943	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr4	5969235	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	5969252	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	5969292	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	5969303	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	6050724	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=156,208;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,0:1,0:0,3,0,2
chr4	6050744	.	TTGTTTGTTTTATTA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=156,231;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:1,1:0,5,0,2
chr4	6051555	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:7,0:17,3:5,19,1,2
chr4	6055633	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,0;MFRL=76,167;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=5,9;RU=AAAG;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:7,0:10,4,2,1
chr4	6055971	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	6062061	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	6062117	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,4,2
chr4	6080817	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr4	6082128	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	6087402	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=229,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6087402_CAA_C:6087402:1,0,0,1
chr4	6087405	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=229,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6087402_CAA_C:6087402:1,0,0,1
chr4	6087407	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=229,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6087402_CAA_C:6087402:1,0,0,1
chr4	6279504	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	6292909	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:6292909_C_T:6292909:0,0,5,0
chr4	6292915	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:6292909_C_T:6292909:0,0,4,0
chr4	6303354	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=239,144;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,6:0,12:1,0,9,10
chr4	6303836	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:11,2,1,1
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,10:1,5:0,1,12,4
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=73,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.609:12:1,5:3,2:4,1,5,2
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr4	6382652	.	CCACCATGCCCGCCTCCCACCTGACTCTGCTCCCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=230,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr4	6382733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=99,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,1:0|1:6382733_C_T:6382733:3,7,1,1
chr4	6382756	.	C	CCTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:6382733_C_T:6382733:6,10,1,1
chr4	6383427	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.744:10:0,6:2,0:1,1,8,0
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:0,1,1,9
chr4	6590685	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr4	6590712	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr4	6594971	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,3:9,0:7,8,1,2
chr4	6596477	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,4:2,1:5,0,1,4
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr4	6596552	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	6606787	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:7,4,1,1
chr4	6606864	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:7,5,1,2
chr4	6611037	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,5:2,5:0,3,3,7
chr4	6611817	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	6612784	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,3:3,8:1,4,4,7
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0,0,6,4
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr4	6698706	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,17:0,0,13,15
chr4	6718831	.	GG	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.278:13:4,0:6,3:7,3,2,1
chr4	6925564	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:13,5:10,7:7,16,7,5
chr4	6956059	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.954:41:1,24:0,14:0,1,23,17
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,4,16
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,10,6
chr4	7002955	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.215:40:13,8:18,0:13,19,7,1
chr4	7027011	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:7,0:6,2:6,7,1,1
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr4	7044155	.	CC	TT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:6,0:14,2:7,19,1,1
chr4	7056680	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:10,7,2,0
chr4	7062617	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:7062617_G_A:7062617:7,10,1,1
chr4	7062629	.	G	GCCCCTACCACATTCCAACAGAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:7,1:11,0:0|1:7062617_G_A:7062617:9,9,1,1
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.860:5:0,3:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,0,2,3
chr4	7064218	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.843:5:0,3:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,0,2,3
chr4	7064220	.	TATA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.843:5:0,2:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,0,2,3
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=229,223;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7064214_T_G:7064214:0,1,0,1
chr4	7064280	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:12,0,2,0
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,0:1,4:0,7,1,3
chr4	7398194	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	7436732	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr4	7436768	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:7,2,3,0
chr4	7663253	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,0:14,2:0|1:7663253_C_T:7663253:9,12,1,1
chr4	7663266	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=133,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:10,2:0|1:7663253_C_T:7663253:10,12,1,1
chr4	7663268	.	TGGAAGCC	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:8,2:0|1:7663253_C_T:7663253:10,11,1,1
chr4	7663277	.	AAGACCTCGGTGGAGGTAAGCC	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:10,2:0|1:7663253_C_T:7663253:16,11,1,1
chr4	7663308	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:9,2:0|1:7663253_C_T:7663253:15,8,1,1
chr4	7684637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=162,63;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:0|1:7684637_C_T:7684637:1,8,1,1
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:7684637_C_T:7684637:0,0,2,9
chr4	7684647	.	C	CAAGGCTAGGAAGAAACTGCAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=162,63;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:7684637_C_T:7684637:1,8,1,1
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,7:0.889:7:0,5:0,2:1|0:7684637_C_T:7684637:0,0,0,7
chr4	7705873	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,4:9,0:9,5,4,0
chr4	7726847	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,2,3
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,3:2,0,7,1
chr4	7728658	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=111,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:4,9:0,8:2,2,4,13
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:7,1,2,0
chr4	7780582	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:0,3,1,7
chr4	7787899	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:6,1:10,2:10,6,2,1
chr4	7817698	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=111,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,3:0,4:2,1,5,2
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.910:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	7820795	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.886:24:0,6:2,14:1,1,14,8
chr4	7840164	.	CAAAATT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=229,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAATT;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr4	7844953	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=68,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.716:26:3,10:4,9:5,2,8,11
chr4	7857275	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:15,0:9,2:0|1:7857275_C_T:7857275:9,15,1,1
chr4	7857284	.	A	ACCCTTTATGAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:7857275_C_T:7857275:8,12,1,1
chr4	7873615	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=186,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr4	7873644	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=111,86428779;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:13,7,0,2
chr4	7873854	.	A	ACATTCAATAAATGTTGATGAAGAGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr4	7984918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr4	7985392	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,0,9
chr4	8006988	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,6:0,3:0,1,3,6
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	8029674	.	C	CACACAATGACACACACACACACAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr4	8031313	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,27,26;MFRL=142,100,179;MMQ=60,60,60;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,21;RU=A;STR;TLOD=4.22,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,6:0.210,0.419:13:1,2,2:2,0,3:3,1,5,4
chr4	8031471	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.627:35:12,10:0,12:2,11,9,13
chr4	8031489	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.271:31:13,8:10,0:10,13,0,8
chr4	8046865	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,7:0,0,8,11
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr4	8062689	.	TG	CA,CG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30,31;MFRL=157,129,103;MMQ=60,60,60;MPOS=8,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.31,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,3:0.500,0.334:9:0,3,1:1,1,2:1,0,5,3
chr4	8062871	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	8089982	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=91,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.410:47:13,19:14,0:14,14,19,0
chr4	8108265	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:15,2:6,0:0|1:8108265_C_T:8108265:11,10,1,1
chr4	8108289	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=144,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:9,0:0|1:8108265_C_T:8108265:11,10,1,1
chr4	8108296	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:8108265_C_T:8108265:9,9,1,1
chr4	8108298	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:8108265_C_T:8108265:9,9,1,1
chr4	8108315	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.756:14:0,7:3,3:2,1,2,9
chr4	8207083	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr4	8211624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=203,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	8216204	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,8:1,4:0,2,8,4
chr4	8216391	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0|1:8216391_C_T:8216391:0,2,1,5
chr4	8216397	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0|1:8216391_C_T:8216391:0,2,1,5
chr4	8218079	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:4,0:2,5:0,6,0,7
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=102.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,11:0,22:0,0,25,11
chr4	8224684	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,261;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:11,1:4,1:4,12,0,2
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	8228894	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr4	8229713	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,0,4
chr4	8233824	.	GCTGGAGGGGCAGCTC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,2:13,0:0|1:8233824_GCTGGAGGGGCAGCTC_G:8233824:6,20,1,1
chr4	8233853	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=92,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:8233824_GCTGGAGGGGCAGCTC_G:8233824:4,14,1,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	8238151	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.840:29:3,14:1,10:2,2,7,18
chr4	8238179	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,0:2,7:2,6,0,7
chr4	8284084	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	8288521	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,8:0,0,2,8
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8293379	.	CT	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	8293974	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	8304137	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=84,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:5,0:6,10:8,3,7,3
chr4	8304266	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:15,1:26,4:18,23,0,5
chr4	8368604	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	8368738	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=121,121;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:13,0:10,5:10,13,0,5
chr4	8368869	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	8390859	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,3,2
chr4	8391049	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	8396463	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=100,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:10,0:19,2:16,13,0,3
chr4	8398881	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	8415982	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=118,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,2:4,1:10,7,2,1
chr4	8472785	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.204:26:5,3:14,2:19,2,3,2
chr4	8588727	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	8601298	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,2,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,3,0
chr4	8602935	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,14,9
chr4	8620103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=91,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:2,0:3,1,2,1
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	8621147	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:9,0:7,3:0|1:8621147_C_T:8621147:9,7,0,3
chr4	8621154	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,38;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:6,3:0|1:8621147_C_T:8621147:10,7,0,3
chr4	8621155	.	C	CAGACGTGGTCAGCTGGCCAGCAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=142,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.186:19:9,0:6,1:0|1:8621147_C_T:8621147:9,7,0,3
chr4	8621392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:2,4:0,1:0,2,1,5
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr4	9785134	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=94,79;MMQ=39,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,28:0.631:44:12,12:4,16:3,13,11,17
chr4	9892378	.	TC	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,13,8
chr4	9998376	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,6:1,8:1,2,10,4
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,1:4,4:11,1,5,0
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,2:8,1:3,8,1,2
chr4	10027509	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.484:20:2,6:7,4:9,1,8,2
chr4	10027542	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.614:34:4,11:8,9:9,4,17,4
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.618:24:7,12:2,3:2,7,4,11
chr4	10084570	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr4	10086015	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:8,2,1,1
chr4	10086188	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:7,2:5,0:5,7,0,3
chr4	10089865	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:4,0:19,4:17,6,3,1
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr4	10099277	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:6,1,2,0
chr4	10099540	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.254:20:6,0:4,0:10,5,0,5
chr4	10099541	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=23,17;MFRL=109,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.215:20:6,2:5,0:9,7,1,3
chr4	10099555	.	AAAAAATCAATCCCAG	A	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:11,0:0|1:10099555_AAAAAATCAATCCCAG_A:10099555:8,15,1,1
chr4	10099575	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:11,0:0|1:10099555_AAAAAATCAATCCCAG_A:10099555:0,15,1,1
chr4	10099579	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:10099555_AAAAAATCAATCCCAG_A:10099555:0,13,1,1
chr4	10099583	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:10099555_AAAAAATCAATCCCAG_A:10099555:0,13,1,1
chr4	10099586	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,1:7,0:0|1:10099555_AAAAAATCAATCCCAG_A:10099555:0,11,1,1
chr4	10445697	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:10445697_A_T:10445697:2,5,1,1
chr4	10445703	.	A	ACATCAACTTTTAATTGTCCTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0|1:10445697_A_T:10445697:2,5,1,1
chr4	10447419	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:9,0:15,3:7,17,0,4
chr4	10447684	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,2:12,0:9,10,1,1
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,2,10
chr4	10509757	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=281,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10509757_TA_CT:10509757:0,1,0,1
chr4	10509762	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=281,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10509757_TA_CT:10509757:0,1,0,1
chr4	10542058	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.376:17:7,3:1,3:9,2,4,2
chr4	10560137	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr4	10566448	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0,8,1,1
chr4	10567681	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=108,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:10567681_A_T:10567681:9,10,1,1
chr4	10567684	.	G	GCCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=108,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:10567681_A_T:10567681:9,10,1,1
chr4	13378240	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,3:16,0:13,17,1,2
chr4	13475850	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	13476124	.	A	ACACTCCAGAATGAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=226,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	13545792	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	13546047	.	CGGGCAGGAGCG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,5:0,0,5,4
chr4	13578483	.	G	GGAGGTCGT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=105,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:12,2:0|1:13578483_G_GGAGGTCGT:13578483:20,8,0,2
chr4	13578490	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,0:13,2:0|1:13578483_G_GGAGGTCGT:13578483:22,9,0,2
chr4	13578493	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:17,0:12,2:0|1:13578483_G_GGAGGTCGT:13578483:22,9,0,2
chr4	13582561	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:9,1,1,1
chr4	13582856	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=139,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:13582856_A_AT:13582856:2,9,0,2
chr4	13582857	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=139,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:13582856_A_AT:13582856:2,9,0,2
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	13589325	.	GGTTC	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,0:17,2:0|1:13589325_GGTTC_G:13589325:17,15,1,1
chr4	13589330	.	ATCTTCT	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:18,2:0|1:13589325_GGTTC_G:13589325:18,15,1,1
chr4	13589343	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=105,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:13,0:24,2:0|1:13589325_GGTTC_G:13589325:19,20,1,1
chr4	13589495	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	13606013	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=103,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:0|1:13606013_C_T:13606013:11,11,0,2
chr4	13606015	.	T	TTTAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=103,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,1:12,0:0|1:13606013_C_T:13606013:11,11,0,2
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,8,22
chr4	13616212	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=96,119;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,0:23,3:19,22,0,3
chr4	15034852	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=145,55;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:15034852_C_T:15034852:5,10,1,1
chr4	15034868	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:15034852_C_T:15034852:5,13,1,1
chr4	15034869	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:15034852_C_T:15034852:5,13,1,1
chr4	15063846	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:16,3:15,0:16,15,1,2
chr4	15443931	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.199:43:18,0:17,8:20,15,0,8
chr4	15444497	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15444497_G_A:15444497:0,1,0,1
chr4	15444500	.	C	CTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15444497_G_A:15444497:0,1,0,1
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:2,11,1,4
chr4	15504043	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=85,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,10:0.141:75:34,10:29,0:27,38,10,0
chr4	15529066	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=219.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,19:0,47:0,0,56,13
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,10,22
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	15589498	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=111,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:16,0:6,4:11,11,1,3
chr4	15589580	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:2,7,1,2
chr4	15602773	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=84.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,8,19
chr4	15638300	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,0:7,2:6,16,0,2
chr4	15642443	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:18,0:17,4:23,12,4,0
chr4	15691147	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=110,136;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:10,2:6,0:0|1:15691147_C_A:15691147:5,13,0,2
chr4	15691149	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=110,136;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:8,2:8,0:0|1:15691147_C_A:15691147:5,13,0,2
chr4	15691151	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=122,136;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:15691147_C_A:15691147:3,13,0,2
chr4	15706466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=70,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:5,3:1,0:5,2,2,1
chr4	15706502	.	G	GTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=90,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:5,2,5,1
chr4	15717321	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:5,3,8,3
chr4	15839867	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	15937988	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=137,161;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:16,3:4,0:9,11,3,0
chr4	15964086	.	C	CAAGTGATTTGAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	15972549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	15981948	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=153,0;MMQ=60,43;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:15981948_T_A:15981948:2,0,1,0
chr4	15981952	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=153,0;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:15981948_T_A:15981948:2,0,1,0
chr4	15981963	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=155,0;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:1,0:0|1:15981948_T_A:15981948:3,0,1,0
chr4	15982163	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	15985984	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=255,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,6:1,8:2,1,5,9
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.808:3:0,1:0,1:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,0,1,2
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.879:6:0,1:0,2:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,0,4,2
chr4	15989190	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0|1:15989190_TC_T:15989190:5,0,2,0
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.903:8:0,5:0,2:1|0:15989190_TC_T:15989190:0,0,8,0
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	16008194	.	C	CAGAGAAAAAGAA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,1:15,0:0|1:16008194_C_CAGAGAAAAAGAA:16008194:16,12,2,0
chr4	16008210	.	GG	TA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:0|1:16008194_C_CAGAGAAAAAGAA:16008194:12,12,1,1
chr4	16008215	.	G	GCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:0|1:16008194_C_CAGAGAAAAAGAA:16008194:11,11,1,1
chr4	16026983	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:0,1,0,9
chr4	16035179	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:0,11,0,4
chr4	16077515	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:2,6:1,12:2,1,8,10
chr4	16077523	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.136:24:6,2:14,0:10,11,1,2
chr4	16077547	.	AAACATGAGGTAGAACTTGGT	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:8,0:0|1:16077547_AAACATGAGGTAGAACTTGGT_A:16077547:6,11,1,1
chr4	16077575	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:4,0:0|1:16077547_AAACATGAGGTAGAACTTGGT_A:16077547:0,8,1,1
chr4	16168512	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.867:20:0,9:2,9:1,1,3,15
chr4	16190073	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=317,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	16204226	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.244:30:7,3:8,3:3,20,0,7
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	16510058	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr4	16597413	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,2:12,1:15,7,2,1
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	17503561	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	17513724	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	17517099	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,16:0,3:0,0,9,10
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,19:0,10:0,0,11,18
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	17590619	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:11,0:5,4:6,10,2,2
chr4	17590671	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,12,11
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,16:0,0,9,13
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=97.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,7,16
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,7,16
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr4	17643620	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	17649233	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=38,32;MFRL=48,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,2:0,10:2,0,8,4
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr4	17660237	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr4	17666242	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:0|1:17666242_T_A:17666242:11,6,1,1
chr4	17666243	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=109,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:0|1:17666242_T_A:17666242:11,6,1,1
chr4	17689974	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	17694880	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	17694916	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr4	17694943	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr4	17694999	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:9,2:3,2:0|1:17694999_A_T:17694999:4,8,2,2
chr4	17695003	.	C	CTTTATTATTTTT	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:16,2:3,2:0|1:17694999_A_T:17694999:4,15,2,2
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chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
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chr4	17824830	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	17836232	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr4	17841620	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=82,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:2,0,7,1
chr4	17841848	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,5:4,8:4,5,5,9
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chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,4:1,9:0,1,3,10
chr4	17847281	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,1:2,2:2,0,4,0
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.788:15:2,3:1,7:3,0,7,5
chr4	17885312	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=77,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:12,6:19,0:18,13,5,1
chr4	18023309	.	AGCGGCGGCG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=GCG;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:8,0:6,14,1,1
chr4	20270600	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	20482461	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:0,7,1,3
chr4	20487711	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,4:1,1,7,0
chr4	20490676	.	A	AAGGCTGGACCAGGGCTCTCACTACCCGGGTGGGAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=162,92;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	20521069	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:12,10,3,0
chr4	20530684	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:8,5,1,1
chr4	20530705	.	C	CAAATCTCACAT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=101,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:20530705_C_CAAATCTCACAT:20530705:8,8,1,1
chr4	20530708	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:6,2:0|1:20530705_C_CAAATCTCACAT:20530705:9,8,1,1
chr4	20530713	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:20530705_C_CAAATCTCACAT:20530705:7,8,1,1
chr4	20530715	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,1:0|1:20530705_C_CAAATCTCACAT:20530705:6,8,1,1
chr4	20533700	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.812:30:4,17:1,7:1,4,11,14
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=57,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:0|1:20541005_AG_A:20541005:4,0,6,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=57,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0|1:20541005_AG_A:20541005:4,0,6,2
chr4	20550196	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,0:8,2:0|1:20550196_T_C:20550196:7,12,1,1
chr4	20550201	.	T	TATCCGGGAGAGTGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:20550196_T_C:20550196:7,12,1,1
chr4	20555358	.	TTG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.809:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr4	20555394	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=179,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:14,0,2,0
chr4	20600037	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:20600037_C_T:20600037:3,10,1,1
chr4	20600045	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:20600037_C_T:20600037:3,10,1,1
chr4	20611561	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr4	20611760	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=111,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:7,6,1,1
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr4	20706067	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25,25;MFRL=184,86,214;MMQ=60,60,44;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.43,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,6,4:0.210,0.182:25:5,1,2:10,3,0:12,3,6,4
chr4	20706536	.	AGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	20711349	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,0:7,2:10,9,2,1
chr4	20714476	.	G	GCATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,2:8,0:10,10,2,1
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=62,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.840:23:2,8:1,10:2,1,8,12
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr4	20884132	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	22437995	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=68,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:0,1:3,2:6,2,3,0
chr4	22439914	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr4	22444251	.	CAA	C,CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,34,31;MFRL=131,129,121;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=11.47,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,6:0.305,0.310:20:3,4,3:3,2,3:7,1,12,0
chr4	22749764	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:5,0:0|1:22749764_G_GA:22749764:0,9,0,2
chr4	22749766	.	G	GAGACATA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:22749764_G_GA:22749764:0,9,0,2
chr4	23815987	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=94,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,5:11,0:5,12,5,0
chr4	23816242	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:0,2:1,3:1,1,1,6
chr4	23886323	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	23891533	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=127,246;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:4,0:6,3,3,0
chr4	24534687	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:2,10:0,6:1,1,2,14
chr4	24538573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	24801354	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr4	24802293	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:2,0:1,1:0,3,1,1
chr4	24802323	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	24824076	.	GA	G,GAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,24,31;MFRL=153,209,135;MMQ=60,60,60;MPOS=3,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.11,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,6:0.191,0.191:30:7,3,3:8,2,2:15,3,10,2
chr4	24824090	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:19,4:19,0:32,15,0,4
chr4	24875440	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=266,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24875440_C_T:24875440:0,1,0,1
chr4	24875443	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=266,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24875440_C_T:24875440:0,1,0,1
chr4	24875447	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=153,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24875447_T_A:24875447:0,1,0,1
chr4	24875451	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24875447_T_A:24875447:0,0,0,1
chr4	24875456	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24875447_T_A:24875447:0,0,0,1
chr4	25028517	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=110,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:16,4:13,21,0,4
chr4	25030204	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,6:0,7:1,3,6,7
chr4	25030275	.	C	CCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	25156866	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25156866_C_CA:25156866:0,0,0,2
chr4	25156867	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25156866_C_CA:25156866:0,0,0,2
chr4	25158424	.	GGT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:7,2:1,1:6,2,2,1
chr4	25160732	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.530:17:2,3:4,6:2,6,1,8
chr4	25262177	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.093:56:24,2:26,2:36,15,5,0
chr4	25390279	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,0:13,4:13,12,0,4
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr4	25395944	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=96,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:23,0:16,4:21,18,2,2
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	25419283	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,11,10
chr4	25665820	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=100,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:3,11:5,0:2,7,14,0
chr4	25673407	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,5,8
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,5,8
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,4,8
chr4	25678396	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=109,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.161:17:5,2:8,0:4,11,0,2
chr4	25759077	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:25759077_AC_A:25759077:0,0,2,0
chr4	25759102	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=109,191;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:25759077_AC_A:25759077:1,0,2,0
chr4	25759109	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=97,191;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:1,0:2,0:0|1:25759077_AC_A:25759077:4,0,2,0
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=105,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.180:26:7,1:14,3:14,8,3,1
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr4	25831876	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25831876_G_C:25831876:0,0,0,1
chr4	25831882	.	T	TAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25831876_G_C:25831876:0,0,0,1
chr4	25831884	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25831876_G_C:25831876:0,0,0,1
chr4	25834994	.	TAGAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:5,1:7,3:1,11,1,4
chr4	26387959	.	AT	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.326:38:14,8:10,4:17,9,9,3
chr4	26407840	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.105:64:28,4:30,2:30,28,0,6
chr4	26483208	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=65,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:0,5:0,2:1,0,6,1
chr4	26483455	.	GCAGGAGGAGGTGTAGGA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=94,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:16,2:8,0:27,9,1,1
chr4	26483866	.	C	CTCTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	26673761	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr4	26673787	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,18,12
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:7,7:2,8:5,4,7,9
chr4	26741549	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:21,0:25,3:23,23,0,3
chr4	26921357	.	T	TGCCTGCCTGCCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=234,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	27000814	.	A	AAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=216,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,5:0,3:0,1,6,2
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,3:7,0:2,7,0,3
chr4	27004011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.869:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	27009116	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=129,89;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,8:5,0:11,1,8,0
chr4	27019670	.	G	GTGT,GAATGGAATGGAATCAACCACAGTGGAATGGAAGGGAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29,21;MFRL=165,116,70;MMQ=60,60,60;MPOS=5,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.336,0.326:3:0,1,1:1,0,0:1,0,0,2
chr4	27019672	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr4	30732343	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:5,0:10,0:8,7,3,0
chr4	31144054	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	36122737	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,2:0,4:5,0,5,1
chr4	36126393	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	36130099	.	T	TACACAC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=95,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=AC;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:1,3:2,3:2,1,11,3
chr4	36130117	.	CACACACACAT	C	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.124:31:7,1:18,2:14,14,2,1
chr4	36130127	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=101,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,35:0.743:48:5,6:4,27:8,5,14,21
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,2,2,7
chr4	36130393	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.725:9:2,1:0,3:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,2,2,5
chr4	36148837	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr4	36149378	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=111,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.213:35:10,3:18,3:9,19,3,4
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr4	36162273	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.861:24:0,9:2,10:0,3,6,15
chr4	36168706	.	CAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	36211914	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	36292302	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36292302_G_GA:36292302:0,0,0,1
chr4	36292306	.	GAATGA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36292302_G_GA:36292302:0,0,0,1
chr4	36292322	.	T	TTCTGTTGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	36307980	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=129,100;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,0:9,11:4,13,0,11
chr4	36317802	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=158,242;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36317802_CTG_C:36317802:2,0,1,0
chr4	36317805	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=158,242;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36317802_CTG_C:36317802:2,0,1,0
chr4	36317808	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=140,242;MMQ=40,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36317802_CTG_C:36317802:1,0,1,0
chr4	36345428	.	T	TTCAATCTACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	36345461	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36345461_T_C:36345461:0,0,0,1
chr4	36345465	.	T	TCCTCCTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36345461_T_C:36345461:0,0,0,1
chr4	36345468	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36345461_T_C:36345461:0,0,0,1
chr4	36345470	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36345461_T_C:36345461:0,0,0,1
chr4	37432416	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr4	37445885	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=92,73;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:4,1:5,3,1,2
chr4	37448688	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.248:26:9,0:11,6:0|1:37448688_C_T:37448688:12,8,2,4
chr4	37448694	.	AGG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.210:31:9,0:15,6:0|1:37448688_C_T:37448688:12,13,2,4
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:4,0:0,2:0,5,0,3
chr4	37632941	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:22,2,2,0
chr4	37636813	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=181,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:37636813_C_T:37636813:1,1,0,1
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chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:6,2:10,3:11,5,3,2
chr4	37841942	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=92,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,2:0,1:1,5,0,3
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,6:2,1:5,2,5,2
chr4	37903669	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=81,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr4	37904082	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.362:23:6,3:9,4:0|1:37904082_T_C:37904082:5,10,3,5
chr4	37904089	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.335:22:6,4:9,3:0|1:37904082_T_C:37904082:5,10,3,4
chr4	38022414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr4	38056045	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=352,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr4	38091800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:1,5,0,2
chr4	38097647	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,77;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:10,6:17,0:21,6,6,0
chr4	38117563	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:14,0:14,6:9,19,5,1
chr4	38134423	.	GT	G,GTT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=152,135,113;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=10.89,8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,14,9:0.274,0.210:44:6,8,5:15,3,3:18,3,17,6
chr4	38134829	.	C	CA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:9,0:23,5:16,16,1,4
chr4	38774785	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:4,2,2,0
chr4	38775255	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.159:55:19,8:25,0:28,19,8,0
chr4	38776491	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,9,8
chr4	38798648	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,131;MMQ=52,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:11,2:11,5:12,10,5,2
chr4	38798935	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,180;MMQ=27,27;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:2,9,1,4
chr4	38799347	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:12,0:9,2:9,12,2,1
chr4	38800214	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.822:26:0,10:4,12:1,3,7,15
chr4	38829163	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:7,14:3,6:4,6,13,8
chr4	38879655	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr4	38879949	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:3,1,8,2
chr4	38880046	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,13:1,4:0,1,8,9
chr4	38880136	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=229,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	38916465	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	38937316	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.336:22:3,3:8,3:12,3,5,2
chr4	38942697	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:1,0:3,2:0,5,0,4
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=238,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr4	38945122	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,0:9,3:15,10,1,2
chr4	38995310	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	39000569	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:39000569_C_T:39000569:0,3,0,2
chr4	39000582	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=189,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:39000569_C_T:39000569:0,2,0,2
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,12,12
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	39114622	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,0:10,3:12,2,3,0
chr4	39114659	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=116,105;MMQ=60,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,2:15,0:15,9,2,0
chr4	39114929	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	39114945	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,13,8
chr4	39116911	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,12:0,0,9,15
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,9,7
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	39196229	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:5,10,3,0
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr4	39226486	.	ATT	A,AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27,29;MFRL=134,98,171;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=7.56,8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,6:0.274,0.296:23:6,3,4:3,2,0:7,3,9,4
chr4	39233719	.	TA	T,TAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26,26;MFRL=0,160,123;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.65,4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.428,0.428:4:0,1,2:0,1,0:0,0,4,0
chr4	39241797	.	TAAAA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39241797_TAAAA_T:39241797:0,0,1,0
chr4	39241824	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:39241797_TAAAA_T:39241797:1,0,1,0
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chr4	39241836	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:39241797_TAAAA_T:39241797:1,1,1,0
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chr4	39304698	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,4,1
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,10,6
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chr4	39321969	.	CAAA	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.403:25:0,3:5,0:3,12,2,8
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chr4	39328336	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=2395,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39328334_T_TAATAGTTCATGGTGGGG:39328334:0,1,0,1
chr4	39328337	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=2395,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39328334_T_TAATAGTTCATGGTGGGG:39328334:0,1,0,1
chr4	39328341	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=2395,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39328334_T_TAATAGTTCATGGTGGGG:39328334:0,1,0,1
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr4	39347193	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	39352910	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,8,17
chr4	39409416	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,2:1,1,3,2
chr4	39448586	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr4	39450068	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=115,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:20,6:15,0:20,15,6,0
chr4	39456258	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=243,165;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:13,0,2,0
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chr4	39456635	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,10:0.649:15:1,3:4,7:1|0:39456624_AGAGGCACTAATTTATTCCATGTAAAACTCCATGCACCAAAAGAACCTTTTCTTAAGATTTTGAGGCC_A:39456624:2,3,2,8
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
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chr4	39474868	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=103,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:0,4,1,4
chr4	39478832	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	39501722	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.633:18:1,5:4,4:1,6,2,9
chr4	39506228	.	C	CAGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:39506228_C_CAGGA:39506228:0,0,0,1
chr4	39506231	.	T	TTGACCAGCAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:39506228_C_CAGGA:39506228:0,0,0,1
chr4	39510329	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=74,8746697;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
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chr4	39553900	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:39553898_G_C:39553898:0,1,0,1
chr4	39553902	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39553898_G_C:39553898:0,0,0,1
chr4	39553905	.	A	ATAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39553898_G_C:39553898:0,0,0,1
chr4	39558266	.	G	GGTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.478:2:0,1:1,0:0|1:39558266_G_GGTC:39558266:0,1,0,1
chr4	39558268	.	T	TCCTTTTTCTTGATATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39558266_G_GGTC:39558266:0,1,0,1
chr4	39747536	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	39779233	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr4	39864448	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	39871117	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr4	39878843	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=240,188;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0,5,0,2
chr4	39878849	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=240,188;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:3,2:0,5,0,2
chr4	39878861	.	T	TGATACTTTTGATACATATTAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=272,189;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr4	39900193	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:1,6,0,3
chr4	39910172	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr4	39918635	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:8,3:9,1:0|1:39918635_TA_T:39918635:18,1,3,1
chr4	39918636	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.839:23:1,9:2,10:3,0,18,2
chr4	39918637	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:8,2:11,1:0|1:39918635_TA_T:39918635:18,1,3,1
chr4	39918685	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.202:42:18,8:16,0:21,13,4,4
chr4	39924390	.	AAT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:9,0:0|1:39924390_AAT_A:39924390:3,8,1,1
chr4	39924394	.	A	ATG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:0|1:39924390_AAT_A:39924390:3,8,1,1
chr4	39928379	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.094:29:8,1:14,1:23,4,2,0
chr4	40114965	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr4	40115146	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,0:13,3:9,15,1,2
chr4	40115239	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr4	40123891	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:23,0:15,4:23,15,0,4
chr4	40124015	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,34;MFRL=189,157;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr4	40155877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr4	40245223	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:1,9,0,2
chr4	40351158	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:40351158_C_CG:40351158:1,5,1,1
chr4	40351159	.	C	CCACCACGCTCAGCTATTTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:40351158_C_CG:40351158:1,5,1,1
chr4	40356422	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,10,10
chr4	40427888	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=82,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:40427888_T_G:40427888:11,8,2,0
chr4	40427894	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=82,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:0|1:40427888_T_G:40427888:11,8,2,0
chr4	40440215	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=232,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:1,3:1,3:1,2,0,6
chr4	40809207	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:2,6,1,1
chr4	40936639	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=131,45;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:12,8:13,1:14,11,0,9
chr4	41015823	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.820:26:1,7:3,13:1,3,6,16
chr4	41015899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,6:1,6:2,2,9,3
chr4	41270067	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:16,0:4,4:9,11,2,2
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	41615594	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.106:44:15,4:25,0:15,25,1,3
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr4	41648507	.	GGA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GA;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:12,3,2,0
chr4	41663621	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	41690035	.	G	GCCTCTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41690035_G_GCCTCTAA:41690035:0,3,0,1
chr4	41690037	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41690035_G_GCCTCTAA:41690035:0,3,0,1
chr4	41690043	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	41956298	.	GTTACA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=229,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:41956298_GTTACA_G:41956298:0,2,0,1
chr4	41956304	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=229,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41956298_GTTACA_G:41956298:0,2,0,1
chr4	41956313	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=229,109;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41956298_GTTACA_G:41956298:0,2,0,1
chr4	41985272	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.829:20:3,7:0,10:1,2,5,12
chr4	41985689	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr4	41986446	.	AAGGATGGCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCCTTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTG	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=128,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.140:24:3,0:4,2:0|1:41986446_AAGGATGGCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCCTTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTG_A:41986446:12,10,1,1
chr4	41986457	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.872:4:0,2:0,2:1|0:41986446_AAGGATGGCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCCTTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTG_A:41986446:0,0,4,0
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=74.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,6:0,12:0,0,5,14
chr4	42003671	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,14,13
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr4	42024988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:42024988_T_C:42024988:1,3,0,1
chr4	42024990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:42024988_T_C:42024988:1,3,0,1
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	42041164	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=168,157;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,0:2,4:0,7,0,4
chr4	42041186	.	TTT	AGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	42119514	.	ACA	GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=194,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,0:5,2,1,1
chr4	42119730	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:7,4:21,0:7,21,3,1
chr4	42146087	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=300,300;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,0:1,8:0,3,0,8
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	42403561	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	42592898	.	C	CTCTCTCTCATTCTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=102,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:6,2:11,0:9,9,1,1
chr4	42592935	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=507,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.799:13:1,1:1,9:0,2,1,10
chr4	42602437	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=123,110;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:19,6,0,2
chr4	42602499	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.148:45:18,0:21,6:16,23,0,6
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,13:0,0,6,13
chr4	42617935	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	42618021	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=59.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.795:27:3,9:2,13:5,0,15,7
chr4	42618138	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr4	42626659	.	GAA	G,GA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,32,19;MFRL=113,127,113;MMQ=60,60,60;MPOS=28,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.75,35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,20:0.185,0.661:31:2,3,4:2,2,5:2,3,8,18
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	42629053	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:13,11:13,0:17,9,9,2
chr4	42895308	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=72,104;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.357:23:6,7:9,1:7,8,2,6
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,3,7
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr4	44177051	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,187;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:5,5:17,0:9,13,4,1
chr4	44626806	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:1,10,2,3
chr4	44626881	.	C	CGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=0,134;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44626881_C_CGAA:44626881:0,1,0,1
chr4	44626882	.	T	TGGAATCATCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=0,134;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44626881_C_CGAA:44626881:0,1,0,1
chr4	44626884	.	A	AAAATGGAATCAAATGGGATCATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=0,134;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44626881_C_CGAA:44626881:0,1,0,1
chr4	44638028	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=101,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:12,7,3,0
chr4	44651968	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.422:13:1,1:4,2:5,3,2,3
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=160,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	44682607	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:7,5,0,2
chr4	44684418	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:13,0:17,5:10,20,0,5
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,8,0
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,8,0
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,2:1,6:2,0,8,1
chr4	44691824	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.161:26:12,0:8,1:9,13,4,0
chr4	44691874	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:0|1:44691874_G_T:44691874:14,16,0,2
chr4	44691877	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:12,2:0|1:44691874_G_T:44691874:14,16,0,2
chr4	44691880	.	TGCACATGGAA	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=95,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:12,2:0|1:44691874_G_T:44691874:15,15,0,2
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,7,13
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,5:3,15:4,2,8,12
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,3:2,7:2,1,3,7
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=168,256;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	44719048	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,7:1,3:2,0,9,1
chr4	46042945	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	46060177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,1,1
chr4	46060207	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,7:1,5:1,1,10,2
chr4	46066356	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	46263862	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:46263862_A_AG:46263862:2,0,2,0
chr4	46263864	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:46263862_A_AG:46263862:2,0,2,0
chr4	46264228	.	G	GCCCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=237,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:46264228_G_GCCCAC:46264228:0,1,0,1
chr4	46264235	.	AAG	CCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46264228_G_GCCCAC:46264228:0,0,0,1
chr4	46930381	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,282;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,0:9,2:5,15,0,2
chr4	46967313	.	A	ACAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,22;MFRL=306,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:46967313_A_ACAC:46967313:0,1,0,1
chr4	46967319	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=306,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46967313_A_ACAC:46967313:0,1,0,1
chr4	46967338	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=299,306;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46967338_TGG_T:46967338:0,1,0,1
chr4	46967342	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=299,306;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46967338_TGG_T:46967338:0,1,0,1
chr4	46967344	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=299,306;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46967338_TGG_T:46967338:0,1,0,1
chr4	46994972	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=74,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.745:5:0,1:0,0:0,1,0,4
chr4	47408709	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,6,11
chr4	47408856	.	C	CCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr4	47524932	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=260,260;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,2:0,1:1,0,3,1
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	47560002	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,5:3,9:3,1,11,4
chr4	47560386	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	47561141	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	47565862	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr4	47582387	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:0,6:1,12:0,1,11,7
chr4	47584046	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:9,2:3,3:5,7,2,3
chr4	47589131	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,0:6,2:9,13,1,1
chr4	47589299	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	47589313	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	47593008	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.709:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	47593283	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr4	47593404	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47593404_C_CTT:47593404:0,0,0,1
chr4	47593406	.	C	CTTCCAGTTGATCAAATCGGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47593404_C_CTT:47593404:0,0,0,1
chr4	47605734	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=183,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr4	47643863	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	47647306	.	ATGTT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=176,94;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	47655730	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr4	47679928	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,6,2
chr4	47680085	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr4	47839929	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:1,9,1,3
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:8,1:2,2:9,2,3,0
chr4	47877375	.	A	AATGGAAACATCAAAGATCACTGATCACAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.386:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr4	47880494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:9,0,4,0
chr4	47886319	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,1:7,3:15,1,4,0
chr4	47886329	.	GT	G,GTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,26,32;MFRL=150,95,39;MMQ=60,60,60;MPOS=8,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.30,3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,4:0.204,0.151:28:9,1,3:8,5,1:16,2,8,2
chr4	47887536	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:5,4:7,3:5,7,5,2
chr4	47887991	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:13,6:8,7:11,10,8,5
chr4	47892812	.	A	AGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	47900186	.	CAAAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:4,4:0,7,0,5
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,12,5
chr4	47938950	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:6,8,2,1
chr4	47939253	.	ATTGCTTGATAGCATCAATTC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=82,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:3,5,1,1
chr4	47942893	.	AAAAAGAAACACTTGTATAAATAAAAAAGAAATGGGGGCCAATTTAAGT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,0:6,3:4,18,2,1
chr4	47944029	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,2:1,0:0,1,2,0
chr4	47945295	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.300:25:7,2:8,5:4,14,1,6
chr4	47945415	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=116,38;MMQ=60,47;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:10,1:5,17,1,1
chr4	47945417	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=118,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,2:8,3:1,12,1,4
chr4	47945455	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,0,9
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,5,13
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr4	47953528	.	TCAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=218,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	48069668	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=92,79;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:10,9,1,3
chr4	48069696	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=111,72;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,4:4,4:8,7,4,4
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.722:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr4	48088704	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:48088704_AT_A:48088704:0,5,0,1
chr4	48088742	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48088704_AT_A:48088704:0,2,0,1
chr4	48088745	.	ACAGAGAGGTTAAAAAATG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48088704_AT_A:48088704:0,2,0,1
chr4	48140703	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=113,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:20,0:10,4:8,23,0,4
chr4	48147164	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:3,2:17,0:9,11,2,0
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=138,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr4	48148507	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:48148507_A_G:48148507:0,0,0,5
chr4	48148518	.	T	TCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=188,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48148507_A_G:48148507:0,2,0,1
chr4	48148520	.	C	CTCGCTCTTCCTCCACCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=188,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48148507_A_G:48148507:0,2,0,1
chr4	48165774	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:48165774_A_T:48165774:4,4,1,1
chr4	48165776	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:48165774_A_T:48165774:4,4,1,1
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,0:2,6:1,2,1,5
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:1,3,1,4
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.283:37:10,3:16,7:16,11,6,4
chr4	48343693	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=77,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,3:0,3:1,1,6,1
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	48381690	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	48384680	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.339:44:9,13:20,0:19,10,15,0
chr4	48487246	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr4	48490519	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,0:8,2:11,7,1,1
chr4	48490531	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:6,2:0|1:48490531_C_T:48490531:13,7,1,1
chr4	48490532	.	C	CTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:0|1:48490531_C_T:48490531:13,7,1,1
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	48517352	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	48529683	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:13,8,0,3
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:8,3:9,2:10,7,5,1
chr4	48543007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=113,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:0,3,0,7
chr4	48558938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=218,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr4	48565101	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,15,6
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	48583061	.	ATTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr4	48596036	.	TAA	T,TA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,25,24;MFRL=133,158,141;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56,8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,8:0.133,0.263:33:8,2,4:12,3,4:6,14,2,11
chr4	48605341	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,631;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:13,1:25,1:20,18,0,2
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	48611149	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:0|1:48611149_A_G:48611149:0,2,3,6
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:48611149_A_G:48611149:0,0,3,7
chr4	48621429	.	A	AAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:48621429_A_AAG:48621429:1,8,1,1
chr4	48621430	.	C	CTTTTTGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:48621429_A_AAG:48621429:1,8,1,1
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=93,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.278:26:4,5:14,3:6,12,5,3
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.972:27:0,10:0,17:0,0,11,16
chr4	48636242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=98,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr4	48636399	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=105,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:16,0:11,2:0|1:48636399_A_C:48636399:13,15,0,2
chr4	48636406	.	G	GTGATTAACTTTTCCACTGACA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=111,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:10,2:0|1:48636399_A_C:48636399:13,13,0,2
chr4	48851937	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=187,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,9:1,5:2,0,9,5
chr4	48906633	.	GG	AA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:1,0:0|1:48906633_GG_AA:48906633:0,5,1,1
chr4	48906638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:48906633_GG_AA:48906633:0,5,1,1
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:5,4:4,2:1,8,2,4
chr4	52744120	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	52752812	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=77,103;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:3,9:3,14:2,4,7,16
chr4	52779651	.	GTTA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,1:1,1:5,2,1,1
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,3:9,1:3,9,1,3
chr4	52926773	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=106,167;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:2,6,0,2
chr4	52928300	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	52928352	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31,27;MFRL=0,156,148;MMQ=60,60,60;MPOS=15,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.23,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.560,0.348:6:0,2,1:0,2,1:0,0,1,5
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	53470732	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,99;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.427:31:7,0:10,13:5,13,0,13
chr4	53497189	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=126,324;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,0,2
chr4	53497214	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=165,324;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:53497214_A_G:53497214:6,5,0,2
chr4	53497218	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=165,324;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:53497214_A_G:53497214:6,5,0,2
chr4	53497222	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,324;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0|1:53497214_A_G:53497214:6,4,0,2
chr4	53525399	.	AGGCC	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=151,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:6,2:0|1:53525399_AGGCC_A:53525399:6,17,1,1
chr4	53525409	.	GC	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=151,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:0|1:53525399_AGGCC_A:53525399:6,17,1,1
chr4	53525415	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=156,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:6,2:0|1:53525399_AGGCC_A:53525399:3,17,1,1
chr4	53525418	.	CG	GA	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=155,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:6,2:0|1:53525399_AGGCC_A:53525399:3,19,1,1
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chr4	53525429	.	C	CCG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CG;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:53525399_AGGCC_A:53525399:1,13,1,1
chr4	53730686	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,0:20,3:16,25,0,3
chr4	53731641	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=116,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:8,3:14,0:0|1:53731641_T_A:53731641:11,11,3,0
chr4	53731644	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=116,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:8,3:13,0:0|1:53731641_T_A:53731641:11,11,3,0
chr4	54011526	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.670:22:6,10:1,5:2,5,9,6
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,30:0,20:0,0,15,35
chr4	54256108	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:1,8,0,5
chr4	54280705	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.865:13:1,3:0,8:1,0,11,1
chr4	54292056	.	TTGATGTTATCGGTCAGACTATAACTATCAGCCGAGTAGAAGGCAGGCGACGGGCAAA	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,2:0.037:79:17,2:30,0:33,44,1,1
chr4	54294215	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:28,4:13,0:25,16,4,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=262,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,7:0,1,9,2
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0,0,11,0
chr4	54325444	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:1,1,1,5
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	54424237	.	G	GAGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	54852693	.	CTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=TTTTA;STR;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.830:7:0,2:0,3:1,0,5,1
chr4	54930269	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr4	54966667	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,1:5,1:4,11,0,2
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,6,0
chr4	55129831	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:4,14:3,5:3,4,11,8
chr4	55129883	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,5:12,0:13,11,3,2
chr4	55131092	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:8,4:17,0:15,10,4,0
chr4	55133788	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=91,67;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.154:31:11,1:14,4:13,12,2,4
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	55141055	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chr4	55143617	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=90,465;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:27,0:33,4:22,38,2,2
chr4	55144447	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG,TTGTATGTCCCTCAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26,23;MFRL=0,161,170;MMQ=60,60,60;MPOS=7,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.24,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.657,0.248:5:0,2,0:0,1,1:0,0,5,0
chr4	55151532	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,94;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:11,2,2,0
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr4	55152172	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr4	55161391	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	55524304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	55564680	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,0:9,3:4,10,2,1
chr4	55570064	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:6,12,0,3
chr4	55595598	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:6,13,0,2
chr4	55597545	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,33;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,0:13,2:12,7,1,1
chr4	55598065	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:18,7:17,0:25,10,7,0
chr4	55598197	.	GTTT	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=92,64;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,1:0|1:55598197_GTTT_G:55598197:19,4,1,1
chr4	55598209	.	TGA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=46,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:0|1:55598197_GTTT_G:55598197:10,2,1,2
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	55955593	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,0,2
chr4	55955949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=72,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,0:4,7:4,4,0,8
chr4	55958965	.	T	TAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=158,284;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	55960883	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr4	55976947	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,18,20,12;MFRL=119,38,163,177;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,17,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.94,14.19,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,4,9,4:0.114,0.439,0.198:22:0,2,0,0:3,0,5,1:1,4,4,13
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.340:15:4,0:5,4:5,5,3,2
chr4	56212570	.	ACCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.235:14:5,1:4,1:10,1,3,0
chr4	56291479	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:1,0,11,0
chr4	56291528	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=99,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.689:30:1,11:8,9:7,2,10,11
chr4	56291620	.	CAA	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=91,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.639:34:3,12:9,9:3,9,10,12
chr4	56301566	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:19,4,0,2
chr4	56301698	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:16,3:16,0:9,23,1,2
chr4	56319350	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:10,3:11,2:5,16,1,4
chr4	56322244	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,1:1,0,4,1
chr4	56329773	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=272,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr4	56336854	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=92,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:14,4:5,4:12,7,4,4
chr4	56337041	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	56342326	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	56428820	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,6:3,4:1,3,1,9
chr4	56435821	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr4	56447146	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=214,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.705:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr4	56448192	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=155,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	56448235	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:3,1,6,0
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr4	56471551	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:1,2,4,7
chr4	56502273	.	GAGCAGCAGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=AGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56726669	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=106,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:19,2:13,1:18,14,1,2
chr4	56726774	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=169,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:5,0:7,2:1,12,0,2
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chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=60,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:2,8:0,12:1,1,6,14
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chr4	56757529	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,76;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,0:9,4:11,9,1,3
chr4	56758700	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,6,1
chr4	56840846	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr4	56865884	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=175,78;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:1,2:0|1:56865884_G_T:56865884:1,7,1,1
chr4	56865889	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,78;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:56865884_G_T:56865884:1,7,1,1
chr4	56865900	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=175,78;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,0:1,1:0|1:56865884_G_T:56865884:1,8,1,1
chr4	56878193	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr4	56884079	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,287;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	57180473	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=90,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.743:21:3,12:2,4:1,4,8,8
chr4	57180563	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,0:3,2:4,6,2,0
chr4	57180576	.	C	CGGAGCGGAGGGAGCGGAG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=GGAGCGGAG;STR;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:1,4:3,3:2,2,3,6
chr4	57180616	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=81,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,4:2,1:1,1,2,3
chr4	57181192	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:6,10:10,0:6,11,10,0
chr4	57181995	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:11,3:1,1:7,5,2,2
chr4	57182107	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:57182107_C_T:57182107:4,8,1,1
chr4	57182109	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:57182107_C_T:57182107:4,8,1,1
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr4	57189614	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=112,209;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,0:11,4:20,8,0,4
chr4	57189636	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=115,209;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:14,0:11,4:0|1:57189636_T_A:57189636:17,11,0,4
chr4	57189643	.	G	GAAATAATCATCAGATAAAAAGAC	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=127,209;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.137:34:11,0:17,4:0|1:57189636_T_A:57189636:20,10,0,4
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	57204476	.	C	CTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr4	57219523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr4	57220398	.	AA	TC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:9,0:0|1:57220398_AA_TC:57220398:5,12,0,2
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chr4	57220405	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:0|1:57220398_AA_TC:57220398:5,12,0,2
chr4	57220871	.	C	CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:15,0:15,15,4,0
chr4	57267406	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	57269363	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,5:2,9:1,2,9,6
chr4	57269591	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:0,1,2,8
chr4	57269646	.	A	AAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	57307878	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:16,0:18,5:22,13,3,2
chr4	57307906	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:20,3:24,0:23,21,3,0
chr4	57318294	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=226,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57318294_T_A:57318294:0,1,0,1
chr4	57318296	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=226,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57318294_T_A:57318294:0,1,0,1
chr4	57318302	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=226,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57318294_T_A:57318294:0,1,0,1
chr4	57318305	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=226,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:57318294_T_A:57318294:0,1,0,1
chr4	57319694	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr4	57389900	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:57389900_A_T:57389900:12,11,1,1
chr4	57389907	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:6,2:0|1:57389900_A_T:57389900:12,11,1,1
chr4	57389909	.	CA	GT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:6,2:0|1:57389900_A_T:57389900:11,11,1,1
chr4	57389913	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:13,0:3,2:0|1:57389900_A_T:57389900:11,7,1,1
chr4	57521972	.	GGCTCAGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:3,0,5,0
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chr4	62778351	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=146,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:13,1,2,1
chr4	62845388	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,7,12
chr4	62864088	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=216,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr4	62936361	.	TGCCGACACTGGCTGGTGTG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:10,0:9,2:12,8,1,1
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,1,5
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,1,4
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,3:1,1:0,6,1,3
chr4	65180308	.	GGTGTGTGTGTGTGTGT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=24,16;RU=GT;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.196:16:1,2:1,1:8,5,3,0
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr4	65240822	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,5:1,7:3,3,10,2
chr4	65240967	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:2,9:1,9:2,1,4,14
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,31:0.866:35:3,16:1,14:1,3,15,16
chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr4	66242755	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.071:44:18,0:20,2:0|1:66242755_G_T:66242755:22,19,2,1
chr4	66242758	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.073:43:18,1:20,2:0|1:66242755_G_T:66242755:22,18,2,1
chr4	66242784	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=84,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.480:60:17,25:13,0:17,14,0,29
chr4	66280171	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=157,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,6:5,3:0,9,5,4
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	66361325	.	A	AGTGCAGAGATGAACGTCCGAGTGG,ATAGGAATTTAGGGAAAGCTGTTTCTGATTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24,22;MFRL=248,123,137;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,1,1:0,0,0:0,3,0,2
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr4	68357814	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr4	68374597	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,14,8
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:1,0,10,1
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr4	68396707	.	A	ATAGTATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:68396707_A_ATAGTATG:68396707:0,4,0,1
chr4	68396713	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:68396707_A_ATAGTATG:68396707:0,4,0,1
chr4	68406601	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=233,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	68411089	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0|1:68411089_A_T:68411089:3,6,1,1
chr4	68411095	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0|1:68411089_A_T:68411089:3,5,1,1
chr4	68436883	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=85,178;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:10,1:23,3:12,21,3,1
chr4	68436917	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=86,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:4,0:21,2:0|1:68436917_C_T:68436917:9,18,1,1
chr4	68436919	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=86,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:4,0:22,2:0|1:68436917_C_T:68436917:9,18,1,1
chr4	68441280	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,0:1,7:0,5,0,7
chr4	68442968	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=89,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.243:39:20,5:10,4:19,11,5,4
chr4	68443006	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.295:18:5,3:4,2:7,6,2,3
chr4	68447040	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,3:11,3:10,9,3,3
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:6,1:7,1:11,2,2,0
chr4	68488673	.	T	TCTCACAGACACACTCA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:6,1:11,1:3,14,0,2
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:0,3,1,7
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:3,2,4,1
chr4	68492244	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	68496281	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=170,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:0,0:0|1:68496281_T_A:68496281:1,5,1,1
chr4	68496283	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=170,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:68496281_T_A:68496281:1,5,1,1
chr4	68496285	.	A	ACAAATAAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=170,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:68496281_T_A:68496281:1,5,1,1
chr4	68501371	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:7,3:0,1:7,0,3,1
chr4	68539452	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=73,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:7,7,1,1
chr4	68539454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=73,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,3:9,0:7,6,1,2
chr4	68539539	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=88,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr4	68543240	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,5:2,8:6,0,11,3
chr4	68610251	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:2,2:0,8:2,0,11,0
chr4	68610384	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,4:13,0:11,11,3,1
chr4	68619561	.	TCCAGG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAGG;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:10,5,1,1
chr4	68700956	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=100,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr4	68780489	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=186,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr4	68784885	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=125,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:4,8:0,11:2,2,8,11
chr4	68810421	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	68928537	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,8:0,0,7,7
chr4	68930746	.	A	ACCCAGGCTGGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	68938002	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	68939711	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:10,0:10,14,1,1
chr4	68964768	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:0,1,6,4
chr4	69078013	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=83,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,6:1,7:3,1,6,7
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=80,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,6:0,1,6,6
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	69098006	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,1:4,6:8,0,6,1
chr4	69101997	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=73,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.576:7:3,0:0,0:1,2,0,4
chr4	69179877	.	T	TTC	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:17,3:18,0:0|1:69179877_T_TTC:69179877:22,15,0,3
chr4	69179888	.	TATCACGTC	T	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:18,3:19,0:0|1:69179877_T_TTC:69179877:24,21,0,3
chr4	69179899	.	CTA	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:17,3:15,0:0|1:69179877_T_TTC:69179877:21,16,0,3
chr4	69179906	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:18,3:15,0:0|1:69179877_T_TTC:69179877:21,16,0,3
chr4	69181942	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	69199195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=201,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr4	69202890	.	TTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCC	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=99,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.097:59:13,0:12,5:28,26,4,1
chr4	69203634	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=130,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.475:9:3,3:1,1:1,4,0,4
chr4	69215349	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=291,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr4	69332537	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=229,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:4,2:12,3:8,8,2,3
chr4	69341957	.	AC	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:12,0:13,2:11,19,0,2
chr4	69342070	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=103,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=162.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,55:0.689:79:16,1:8,52:0|1:69342070_T_C:69342070:11,13,0,55
chr4	69342076	.	G	GGCTCCTGTTACTCCTGTCCTCTGATT	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=29,38;MFRL=103,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=159.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,54:0.639:84:21,0:8,53:0|1:69342070_T_C:69342070:15,15,0,54
chr4	69343287	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:3,9:4,9:3,4,7,11
chr4	69343353	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,12:1,9:0,1,9,12
chr4	69344551	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.116:33:14,1:16,2:23,7,3,0
chr4	69344612	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,14:0.228:63:17,2:29,11:20,29,1,13
chr4	69344733	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,13:0,9:0,0,8,14
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr4	69362527	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:3,14,0,3
chr4	69416353	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:8,2,3,4
chr4	69417450	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	69433714	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.488:49:20,12:5,11:5,20,13,11
chr4	69528890	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,168;MMQ=27,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,1:10,3:5,12,1,3
chr4	69533702	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=128,141;MMQ=52,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,5:3,5:4,1,6,5
chr4	69535563	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:6,0,5,0
chr4	69536084	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,16:0,6:1,0,10,12
chr4	69536386	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,103;MMQ=46,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,79;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,46:0,13:0,0,43,17
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,31:0,10:0,0,21,20
chr4	69696648	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,122;MMQ=52,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:0,5:2,4:0,3,2,7
chr4	69795626	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.240:31:14,6:10,1:11,13,4,3
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr4	69817524	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr4	69964180	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	69964234	.	C	CT,CTT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32,31;MFRL=133,168,172;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=7.23,10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,7:0.322,0.492:13:2,2,4:0,2,3:1,1,9,2
chr4	69964271	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,4:4,6:7,3,7,4
chr4	69964337	.	AT	TC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,47;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,8,16
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chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,0,8
chr4	71232388	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:4,6:0,10:2,2,11,5
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chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=110,187;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:9,2:4,1:11,3,1,2
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:16,2:10,4:11,15,4,2
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr4	71275153	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=97,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.120:32:11,0:17,3:0|1:71275153_A_G:71275153:9,20,2,1
chr4	71275156	.	T	TC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=97,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.117:33:11,0:16,3:0|1:71275153_A_G:71275153:9,21,2,1
chr4	71275159	.	A	AGGTTCAAGCGATC	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=97,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:9,0:15,3:0|1:71275153_A_G:71275153:9,18,2,1
chr4	71275232	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=99,155;MMQ=48,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:0,5:5,6:3,2,4,7
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chr4	71384579	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:14,3:9,2:8,15,3,2
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chr4	71389497	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:1,1,4,0
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chr4	71394353	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=116,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:10,0:11,5,1,2
chr4	71394354	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=132,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.239:17:3,3:10,0:9,4,2,2
chr4	71394361	.	CA	TG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=109,91;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:9,2:16,0:13,12,1,1
chr4	71465241	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,2:7,1:10,5,2,1
chr4	71465361	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=110,53;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:71465361_C_T:71465361:5,10,1,1
chr4	71465369	.	TG	AC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=110,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:71465361_C_T:71465361:5,7,1,1
chr4	71465378	.	TCA	GAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=110,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:71465361_C_T:71465361:4,8,1,1
chr4	71468927	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=111,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:71468927_A_G:71468927:7,2,2,0
chr4	71468933	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:71468927_A_G:71468927:8,2,2,0
chr4	71501501	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,5:6,0:8,2,5,0
chr4	71509411	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,5:8,0:10,2,5,0
chr4	71509431	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:7,5:9,0:13,4,5,0
chr4	71522206	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=101,280;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:7,0:7,4,0,4
chr4	71554607	.	CGAGGAGGATGGCGAG	C	.	.	DP=134;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=95,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,2:0.025:116:58,2:28,0:47,67,1,1
chr4	71554644	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=103,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,2:0.037:79:43,2:31,0:44,33,1,1
chr4	71554690	.	GGGA	G	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGA;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.090:49:15,1:17,3:25,20,1,3
chr4	71554705	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=104,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,8:0.147:59:25,8:26,0:21,30,8,0
chr4	71634451	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:71634451_T_TAC:71634451:0,1,0,1
chr4	71634453	.	T	TTGATCTAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71634451_T_TAC:71634451:0,1,0,1
chr4	71634455	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,29;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:71634451_T_TAC:71634451:0,1,0,1
chr4	71654676	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:9,0:8,11:4,13,0,12
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	71691975	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,9:3,5:3,3,5,9
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,2,13
chr4	71824836	.	T	TTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=63,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:71824836_T_TTCA:71824836:1,2,0,1
chr4	71824840	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=63,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:71824836_T_TTCA:71824836:1,2,0,1
chr4	71824852	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=186,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr4	71888293	.	T	TATGTATGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=13,28;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:0,1:0|1:71888293_T_TATGTATGTG:71888293:0,1,0,1
chr4	71888298	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=8,29;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:71888293_T_TATGTATGTG:71888293:0,1,0,1
chr4	71888302	.	GCC	TGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71888293_T_TATGTATGTG:71888293:0,1,0,1
chr4	71888307	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71888293_T_TATGTATGTG:71888293:0,1,0,1
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr4	72121163	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=104,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:2,1:0,4:1,1,0,5
chr4	72313411	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:6,8:3,10:4,5,8,10
chr4	72316219	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,4:15,0:9,17,4,0
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr4	72317044	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:9,0:15,4:5,19,1,3
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	72423488	.	CCTGCGTCATGTTCCT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,0:9,2:15,14,1,1
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	72429409	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	72429433	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	72433481	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:5,1,1,1
chr4	72433642	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,2:7,4:3,11,1,5
chr4	72618323	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.270:31:12,4:11,4:9,14,5,3
chr4	72618334	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.735:32:3,14:5,9:4,4,11,13
chr4	72618347	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=98,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.162:28:12,4:12,0:12,12,1,3
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=144,171;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TATT;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.456:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr4	72620888	.	TTTA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:72620888_TTTA_T:72620888:0,8,0,2
chr4	72620899	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:72620888_TTTA_T:72620888:0,5,0,2
chr4	72620902	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:72620888_TTTA_T:72620888:0,6,0,2
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,14:0,0,16,6
chr4	72623814	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,3:13,0:9,10,1,2
chr4	72623958	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72623958_C_CG:72623958:0,0,0,1
chr4	72623959	.	T	TCTGCTCGGAGATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72623958_C_CG:72623958:0,0,0,1
chr4	72634975	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr4	72649774	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:5,6:1,6:3,3,5,7
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=179,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:6,2,1,1
chr4	73169678	.	TTTCAATGTCATC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:7,2:7,8,1,1
chr4	73175048	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,11,2
chr4	73178092	.	TGAA	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=105,31;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:26,2:24,0:0|1:73178092_TGAA_T:73178092:23,29,2,0
chr4	73178097	.	T	TCCC	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=105,31;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:27,2:25,0:0|1:73178092_TGAA_T:73178092:23,30,2,0
chr4	73181780	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:73181780_C_T:73181780:0,0,0,1
chr4	73181784	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181780_C_T:73181780:0,0,0,1
chr4	73186404	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	73188652	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	73433100	.	C	CATGGAAAAGAAAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=110,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.113:25:10,1:10,1:12,11,1,1
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=88,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.657:18:1,6:5,6:2,4,7,5
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=68.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,24:0,6:0,0,19,12
chr4	73434534	.	CCA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.408:10:1,2:5,2:0|1:73434534_CCA_C:73434534:0,6,0,4
chr4	73434535	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=62,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,9:0.769:11:1,3:1,6:1|0:73434534_CCA_C:73434534:0,2,0,9
chr4	73930889	.	CTTTTTTTTT	C,CTTTTTTTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29,33;MFRL=150,76,181;MMQ=60,58,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,15,23;RU=T;STR;TLOD=7.00,10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.312,0.419:7:1,0,3:0,2,0:1,1,5,0
chr4	73930894	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,4:0,0:1,1,4,0
chr4	73930902	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=178,76;MMQ=60,58;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,0:0,2:5,1,2,0
chr4	73933671	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	A,ATGTGTGTGTGTGTG,ATGTGTGTGTG,ATGTGTGTGTGTG	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,20,28,24,24;MFRL=67,59,155,108,117;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=6,23,10,9;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=17,8,15,13,14;RU=TG;STR;TLOD=7.90,37.42,3.58,20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,3,17,3,10:0.068,0.488,0.097,0.298:34:0,3,13,0,7:0,0,3,3,3:0,1,32,1
chr4	73956357	.	GCAGAATCT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:7,2:10,0:13,12,1,1
chr4	73956736	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:13,11,2,0
chr4	73964118	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:12,7,1,1
chr4	73964302	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,0:2,4:0,11,0,4
chr4	73991006	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,17:0,24:0,0,17,25
chr4	74007504	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,89;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:18,0:13,4:14,17,0,4
chr4	74007870	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,43586902;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:2,1:5,3,2,0
chr4	74007874	.	AACCCTAATTTAAACAGAAACTGTAAGTGAAAGAATTAGGATAAAGAAGACATACCATAAAATGCTTTAATTTTTAAAATCTT	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.192:45:4,2:1,4:23,9,10,3
chr4	74010546	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=75,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:3,0:10,5,1,1
chr4	74014809	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,2:0,7:0,2,0,9
chr4	74262866	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=86,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:11,8:8,0:7,12,8,0
chr4	74279226	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:14,11,3,0
chr4	74282092	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.303:14:6,2:4,2:2,8,0,4
chr4	74285191	.	G	GTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,0:1,2:3,0,2,1
chr4	74286134	.	C	CATCACCAGCACCTGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:3,1:0,0:0|1:74286134_C_CATCACCAGCACCTGCCA:74286134:1,2,0,1
chr4	74286136	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:74286134_C_CATCACCAGCACCTGCCA:74286134:1,2,0,1
chr4	74286142	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:74286134_C_CATCACCAGCACCTGCCA:74286134:1,2,0,1
chr4	74301953	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:11,1,3,0
chr4	74302151	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr4	74304083	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	74310747	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=141,98;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.297:32:10,9:10,0:19,4,9,0
chr4	74310844	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.257:21:10,3:6,2:7,9,2,3
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=118.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,36:0.928:38:0,14:2,22:1,1,6,30
chr4	74313473	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=190,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74313473_G_A:74313473:0,1,0,1
chr4	74313491	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=91,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74313473_G_A:74313473:1,0,0,1
chr4	74315928	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=164,337116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr4	74318219	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:0|1:74318219_A_ATT:74318219:11,11,1,1
chr4	74318223	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:0|1:74318219_A_ATT:74318219:12,11,1,1
chr4	74318330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,4,6
chr4	74349950	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:8,25:2,0:9,1,25,0
chr4	74352916	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,2:2,1:1,5,0,4
chr4	74361221	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=164,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74361221_A_T:74361221:0,1,0,1
chr4	74361223	.	T	TTTAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74361221_A_T:74361221:0,1,0,1
chr4	74361230	.	G	GTACGTACTGCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=164,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74361221_A_T:74361221:0,1,0,1
chr4	74361233	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=164,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0|1:74361221_A_T:74361221:0,1,0,1
chr4	74363282	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	74364992	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.574:14:2,2:2,4:2,4,3,5
chr4	74367706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=2240301,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	74368696	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=124,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:2,3:12,0:13,1,3,0
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=244,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.851:18:0,7:2,9:0|1:74451073_A_G:74451073:1,1,5,11
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.765:15:0,4:3,7:0|1:74451073_A_G:74451073:1,2,2,10
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.835:22:2,9:1,10:0,3,8,11
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=69,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,2,6
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.857:7:0,1:1,4:1,0,6,0
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	74735524	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,27:0.860:31:0,15:3,11:3,1,14,13
chr4	74736144	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:10,1,2,0
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr4	75147041	.	C	CGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=GT;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.392:6:2,0:1,1:4,0,2,0
chr4	75178850	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:75178850_G_T:75178850:3,15,1,1
chr4	75178856	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:75178850_G_T:75178850:3,13,1,1
chr4	75178859	.	G	GTTTGT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:75178850_G_T:75178850:3,13,1,1
chr4	75178866	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:75178850_G_T:75178850:2,10,1,1
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,5:1,3,1,7
chr4	75310990	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,144;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr4	75482263	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	75485813	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=126,125;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:3,4:3,11:3,3,11,4
chr4	75673455	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	75675841	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.254:45:21,6:13,5:13,21,7,4
chr4	76415985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	76416779	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=113.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,17:0,22:0,0,28,12
chr4	76434352	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:6,3:9,3:12,3,7,0
chr4	76446921	.	G	GATT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=ATT;STR;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,4:1,5:2,0,9,1
chr4	76447022	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=101,50;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.202:37:19,0:11,7:19,11,0,7
chr4	76523378	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:10,0:26,3:15,21,0,3
chr4	76525648	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,14,2
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,5:0,0,11,7
chr4	76715048	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:0|1:76715048_T_G:76715048:4,8,1,1
chr4	76715054	.	G	GGGCA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=167,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:76715048_T_G:76715048:4,7,1,1
chr4	76715056	.	T	TGTTTGCAAAACCTGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:76715048_T_G:76715048:3,7,1,1
chr4	76720885	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr4	76721671	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:1,2:1,1,2,2
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,1:0,0,5,1
chr4	76721849	.	T	TA	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=104,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:28,2:19,0:0|1:76721849_T_TA:76721849:24,24,0,2
chr4	76721852	.	GT	AA	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=30,23;MFRL=103,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:29,2:19,0:0|1:76721849_T_TA:76721849:26,25,0,2
chr4	76721856	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=22,30;MFRL=103,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:30,2:17,0:0|1:76721849_T_TA:76721849:25,26,0,2
chr4	76721883	.	C	CAG	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.106:35:17,3:14,0:0|1:76721883_C_CAG:76721883:13,19,0,3
chr4	76721884	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.106:35:17,3:14,0:0|1:76721883_C_CAG:76721883:13,19,0,3
chr4	76721889	.	T	TCCATACC	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=131,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:13,3:16,0:0|1:76721883_C_CAG:76721883:12,20,0,3
chr4	76721891	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:14,3:16,0:0|1:76721883_C_CAG:76721883:11,20,0,3
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr4	76726516	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:76726516_CTT_C:76726516:0,1,0,1
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:76726516_CTT_C:76726516:0,0,0,3
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:76726516_CTT_C:76726516:0,0,0,4
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,14,17
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,5
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,6
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr4	76804479	.	G	GCAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76804479_G_GCAACA:76804479:0,0,0,1
chr4	76804482	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76804479_G_GCAACA:76804479:0,0,0,1
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	76807942	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=131,86;MMQ=52,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,0:11,4:14,4,3,1
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr4	76809569	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	76811175	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:6,6,2,1
chr4	76839946	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=87,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,0:11,4:13,7,1,3
chr4	76840033	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=215,175;MMQ=55,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	76840055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=215,223;MMQ=55,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	76840057	.	AAGCCGACGT	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=248,223;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr4	76840069	.	G	C,GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,35,31;MFRL=270,223,138;MMQ=60,40,49;MPOS=-2147483648,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.43,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr4	76840072	.	GATTAC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=248,138;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	76841131	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=99,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.169:21:10,3:8,0:0|1:76841131_G_A:76841131:6,12,1,2
chr4	76841134	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=99,34;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:8,0:0|1:76841131_G_A:76841131:6,12,0,2
chr4	76841222	.	C	CAAAAACTCCTTTTACTGAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:5,2:8,2:12,1,2,2
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=107,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=211,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	76943137	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,35:0.735:47:5,20:7,15:5,7,16,19
chr4	76943235	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=129,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,5:3,2:0,7,1,6
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=214,253;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:0,1:1,0,5,0
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,7:1,7:2,0,12,2
chr4	76956188	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=203,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.878:22:1,9:1,11:1,1,15,5
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=89,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,9:2,9:2,3,8,10
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,2,8
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.755:19:0,11:4,4:1,3,6,9
chr4	76996957	.	CG	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,3:3,0:10,0,4,0
chr4	76996981	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=113,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.614:16:3,7:3,3:4,2,9,1
chr4	76997156	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=30,9;MFRL=81,128;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:15,0:9,0:21,4,0,6
chr4	76997157	.	G	GTT	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=93,128;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.158:30:16,1:8,1:21,5,0,4
chr4	76997178	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=134,155;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:11,1:1,1:5,10,0,2
chr4	76997200	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=23,30;MFRL=153,159;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:6,5:0,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,6,0,5
chr4	76997219	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=151,170;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:4,4:0,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,5,0,4
chr4	76997224	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=151,170;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:5,3:0,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,5,0,4
chr4	76997226	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,24;MFRL=151,180;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,5,0,3
chr4	77018688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:2,0:10,0,3,0
chr4	77025840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:0,2,2,5
chr4	77028783	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=207,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	77038837	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:7,3:19,0:15,11,3,0
chr4	77057516	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:12,2:28,0:0|1:77057516_G_A:77057516:25,17,1,1
chr4	77057526	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=98,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:11,2:28,0:0|1:77057516_G_A:77057516:20,19,1,1
chr4	77065476	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,1:2,1:2,7,1,1
chr4	77100769	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=87,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:6,5,2,0
chr4	77116909	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,3:15,0:16,6,0,3
chr4	77189984	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:0,1,2,8
chr4	77192688	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr4	77192946	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,1,1
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr4	77244660	.	AAGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	77249993	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:8,1,0,2
chr4	77272177	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=104,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:77272177_G_A:77272177:12,4,1,1
chr4	77272183	.	G	GCCTACAAATGGAGCAATCATAAAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=107,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,1:0|1:77272177_G_A:77272177:13,4,1,1
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	77663013	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=82,46;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:3,2,1,1
chr4	77675505	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=69,96;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.589:32:3,8:10,11:5,8,10,9
chr4	77677574	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=157,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.338:13:4,0:5,4:9,0,4,0
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chr4	77678093	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:77678067_C_T:77678067:8,9,1,1
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chr4	77678103	.	TG	CT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:77678067_C_T:77678067:5,8,1,1
chr4	77976627	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=259,179;MMQ=36,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	77976633	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=178,340;MMQ=54,24;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	77987316	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=175,0;MMQ=60,38;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr4	78663216	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr4	78666127	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	78694317	.	TT	AA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=14,20;MFRL=87,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:8,2:11,0:9,35,1,1
chr4	78694327	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=91,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.436:22:5,5:6,4:0,12,0,10
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	78804341	.	AAA	TTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	78815272	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.341:19:4,3:6,3:10,3,6,0
chr4	78830584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:2,2:1,5:1,2,2,5
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=95,269;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,2:9,1:15,6,1,2
chr4	78979257	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=27,33,28;MFRL=102,81,90;MMQ=60,60,60;MPOS=30,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=GT;STR;TLOD=4.01,19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,2,9:0.060,0.218:41:21,2,7:9,0,2:13,17,5,6
chr4	79158843	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	79173551	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:6,3:2,0:4,4,3,1
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr4	79187900	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	79188530	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=98,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:17,5:20,0:17,20,4,1
chr4	79188598	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.143:30:16,0:10,3:11,15,0,4
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	79205747	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:3,5:1,5,1,8
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	79229435	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0,10,0,2
chr4	79238448	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=178,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr4	79240063	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,34;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,3:7,1:7,9,1,3
chr4	79291058	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:14,8,0,2
chr4	79295459	.	CA	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79295459_CA_AC:79295459:0,1,0,1
chr4	79295467	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79295459_CA_AC:79295459:0,2,0,1
chr4	79295470	.	ACTC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79295459_CA_AC:79295459:0,2,0,1
chr4	79295475	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79295459_CA_AC:79295459:0,2,0,1
chr4	79305148	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=157,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,2:7,2:13,1,4,0
chr4	79305177	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:17,4:9,2:16,10,4,2
chr4	79343024	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,2:6,1:7,7,1,2
chr4	79345650	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr4	79350200	.	C	CTG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TG;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:5,0:5,1:8,2,2,0
chr4	79350218	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=127,94;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,2:10,0:0|1:79350218_C_G:79350218:9,8,2,0
chr4	79350220	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=126,94;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,1:12,0:0|1:79350218_C_G:79350218:9,9,2,0
chr4	79350233	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=113,94;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:13,0:0|1:79350218_C_G:79350218:9,19,2,0
chr4	79359885	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=232,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:1,3,1,1
chr4	79362481	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr4	79362543	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79362543_A_AT:79362543:0,0,0,1
chr4	79362547	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79362543_A_AT:79362543:0,0,0,1
chr4	79362550	.	AG	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79362543_A_AT:79362543:0,0,0,1
chr4	79366655	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,3:7,1:11,3,3,1
chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:7,2,4,0
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chr4	79391036	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	79391256	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0,0,5,20
chr4	79393269	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.762:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	79394609	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,2:11,0:8,10,2,0
chr4	79394836	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	79396645	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:79396645_G_T:79396645:10,11,1,1
chr4	79396651	.	T	TCTCTAACAAATTAAACCTAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:79396645_G_T:79396645:7,10,1,1
chr4	79403146	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=109,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:4,4,1,1
chr4	79403747	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,0,9
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0,0,6,6
chr4	79420864	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:0,6:3,8:0|1:79420864_T_C:79420864:3,1,9,6
chr4	79420870	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.751:18:0,5:3,9:0|1:79420864_T_C:79420864:3,1,8,6
chr4	79420997	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,2:10,4,1,2
chr4	79428489	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=202,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	79428796	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,1,6
chr4	79432331	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=149,114;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr4	79432455	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,27:0.779:34:4,7:3,20:4,3,13,14
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,1:3,6:5,1,6,1
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.607:6:0,2:2,2:0,2,1,3
chr4	79443774	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	79444029	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	79461678	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,218;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.205:34:16,0:11,7:13,14,1,6
chr4	79462135	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:13,12,2,0
chr4	79462137	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:10,3:13,0:14,9,2,1
chr4	79516694	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=18,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	79754716	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:3,2,4,1
chr4	79832706	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=89,129;MMQ=30,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:6,4:3,5:3,6,7,2
chr4	79832865	.	GG	AA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:9,0:13,13,1,1
chr4	79832870	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:15,3:9,0:11,13,1,2
chr4	79832909	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:8,2:7,0:8,7,1,1
chr4	79847634	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,32;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.342:11:3,0:4,2:6,1,1,3
chr4	80247009	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:4,4:11,0:7,9,4,0
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=58,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,7:5,1:11,1,7,1
chr4	80954677	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,21;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,4:15,0:17,11,3,1
chr4	80957195	.	GAA	G,GA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=18,19,17;MFRL=122,88,123;MMQ=60,60,60;MPOS=13,21;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.89,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,5,5:0.116,0.155:39:4,1,0:5,1,0:5,24,1,9
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=186,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,13:1,7:2,0,14,6
chr4	80993504	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:7,7:18,0:17,8,7,0
chr4	81122995	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,3:9,1:15,0,4,0
chr4	81123013	.	CGT	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.126:36:8,1:10,3:23,9,3,1
chr4	81124596	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,7:9,5:5,8,7,5
chr4	81188216	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,0:8,3:2,12,2,1
chr4	81257132	.	C	CAAACAACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=173,175;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:81257132_C_CAAACAACA:81257132:0,1,0,1
chr4	81257134	.	C	CCACAGGAAAAGGGGGAGAGTACAACATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=173,175;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:81257132_C_CAAACAACA:81257132:0,1,0,1
chr4	81865953	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:22,3:16,0:24,14,3,0
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	81974739	.	TTATGGAC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:4,4:0|1:81974739_TTATGGAC_T:81974739:2,4,2,2
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chr4	82027188	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=191,173;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	82031738	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=102,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,0:11,4:12,4,4,0
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chr4	82073211	.	A	AATTAATT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,50;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:10,2:0|1:82073200_T_A:82073200:7,9,1,1
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chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.793:17:2,6:1,8:3,0,11,3
chr4	82369494	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr4	83276494	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,93;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.180:59:30,10:18,0:28,21,9,1
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chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.713:27:5,8:1,11:1,7,8,11
chr4	83349143	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:13,5:16,0:23,6,5,0
chr4	83372175	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:4,2,0,2
chr4	83411201	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,5:1,5:1,0,8,2
chr4	83423844	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,2:15,1:15,9,2,1
chr4	83552562	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,73;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.358:26:8,8:8,0:6,11,8,1
chr4	83558045	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=73,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:83558045_C_T:83558045:0,2,1,0
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chr4	83742336	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
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chr4	83774929	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=274,263;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:83774926_T_A:83774926:1,3,0,1
chr4	83774947	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=1298,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83774947_T_C:83774947:1,0,0,1
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chr4	83774959	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:83774947_T_C:83774947:0,0,0,1
chr4	83774961	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:83774947_T_C:83774947:0,0,0,1
chr4	83776174	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=104,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:3,13,0,2
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chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	83791621	.	A	AAAATATTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:83791621_A_AAAATATTT:83791621:0,3,0,1
chr4	83791624	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:83791621_A_AAAATATTT:83791621:0,3,0,1
chr4	83791649	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.925:24:1,16:0,7:1,0,18,5
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	83905258	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	83905828	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,335;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.150:44:22,6:16,0:15,23,3,3
chr4	83966920	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:83966920_T_C:83966920:0,4,0,1
chr4	83966929	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=182,95;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:83966920_T_C:83966920:0,3,0,1
chr4	83970297	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34,20;MFRL=135,164,96;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=T;STR;TLOD=4.55,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.158,0.336:14:4,2,1:2,0,3:6,1,4,3
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chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
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chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr4	84243373	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,214;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:14,4:6,0:13,7,4,0
chr4	84352750	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
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chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	84368225	.	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr4	84369852	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,10:0,0,8,15
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.883:15:0,7:2,5:1,1,2,11
chr4	84376610	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=114,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:30,4:19,0:21,29,4,0
chr4	84376794	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:2,7:1,2:0,4,1,8
chr4	84381035	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr4	84382058	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,6:0,22:0,0,16,12
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,4,19
chr4	84403491	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	84406091	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=65,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.919:15:1,4:0,8:0,1,12,2
chr4	84509418	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=98,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:5,0:4,6,1,1
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,5,11
chr4	84511453	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,0:9,3:7,14,1,2
chr4	84515968	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,7:3,5:4,1,9,3
chr4	84518558	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.694:37:8,14:3,12:7,4,15,11
chr4	84519775	.	ATT	A,AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,27,26;MFRL=123,132,125;MMQ=60,60,60;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=11.86,23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,8,16:0.255,0.521:31:2,3,9:4,5,7:5,2,18,6
chr4	84525973	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr4	84525990	.	T	TTTAGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,1:1,1:2,7,0,2
chr4	85414741	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,6:0,0,2,8
chr4	85416797	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	85552882	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:12,0:5,4:16,1,3,1
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	85560000	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=83,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TA;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:2,1:2,3:4,1,4,1
chr4	85562119	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,70;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,0:18,4:13,14,0,4
chr4	85617087	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:2,3:12,0:12,3,3,0
chr4	85634462	.	A	AAAGGTATGCATAAGCACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	85654607	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,0:19,2:15,16,1,1
chr4	85656319	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:85656319_G_C:85656319:0,2,0,1
chr4	85656328	.	A	ACCAAATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:85656319_G_C:85656319:0,2,0,1
chr4	85677988	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=139,183;MMQ=60,28;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr4	85678099	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=131,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,0:13,4:11,11,1,3
chr4	85678117	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:11,2:0|1:85678117_C_T:85678117:8,12,1,1
chr4	85678119	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:85678117_C_T:85678117:8,12,1,1
chr4	85678129	.	GGTTCT	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,0:10,2:0|1:85678129_GGTTCT_G:85678129:8,11,1,1
chr4	85678138	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:85678129_GGTTCT_G:85678129:7,9,1,1
chr4	85693926	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=120,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:7,1,1,1
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr4	85710822	.	ACC	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=57,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.604:5:0,0:2,0:1,1,3,0
chr4	85717872	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:7,5,1,2
chr4	85722906	.	T	TGCCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=100,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:5,0:4,8,2,0
chr4	85730914	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr4	85750276	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.094:40:17,3:18,0:0|1:85750276_A_C:85750276:14,23,3,0
chr4	85750282	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:18,3:22,0:0|1:85750276_A_C:85750276:16,25,3,0
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr4	86898931	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:86898931_C_CTG:86898931:0,1,0,1
chr4	86898934	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=185,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:86898931_C_CTG:86898931:0,2,0,1
chr4	86916474	.	CC	TT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.180:15:5,0:8,2:6,7,1,1
chr4	86916481	.	C	CTCCCTTCTTCTCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:6,6,1,1
chr4	86916775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=126,99;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:7,0:1,9,0,4
chr4	87019838	.	A	ACTCTACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:87019838_A_ACTCTACT:87019838:0,3,0,1
chr4	87019839	.	G	GATATTCCCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:87019838_A_ACTCTACT:87019838:0,3,0,1
chr4	87607900	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,78;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,14:0.295:49:20,0:15,14:17,18,14,0
chr4	87610220	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:13,0:12,12,0,4
chr4	87672108	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:11,3,3,0
chr4	87695543	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=185,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:87695543_T_C:87695543:11,5,1,1
chr4	87695545	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=185,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:0|1:87695543_T_C:87695543:11,5,1,1
chr4	87705788	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	87706506	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=109,176;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:4,4,2,3
chr4	87706532	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=131,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr4	87706617	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	87752909	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=105,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,2:5,2:8,6,3,1
chr4	87770275	.	ATCTCC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87770275_ATCTCC_A:87770275:0,0,0,1
chr4	87770281	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87770275_ATCTCC_A:87770275:0,0,0,1
chr4	87770285	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.707:1:0,1:0,0:0|1:87770275_ATCTCC_A:87770275:0,0,0,1
chr4	87809020	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,8:0,0,9,11
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=82,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.847:12:0,3:2,7:1,1,7,3
chr4	87967330	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=129,144;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:11,0:17,6:0|1:87967330_C_T:87967330:15,14,0,6
chr4	87967340	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,144;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:10,0:16,6:0|1:87967330_C_T:87967330:14,13,0,6
chr4	88005203	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,9:0,0,8,4
chr4	88036253	.	C	CTTCCTTCT	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:7,2:29,0:0|1:88036253_C_CTTCCTTCT:88036253:13,24,1,1
chr4	88036256	.	ACCGC	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=117,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:7,2:29,0:0|1:88036253_C_CTTCCTTCT:88036253:14,25,1,1
chr4	88036263	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:7,2:27,0:0|1:88036253_C_CTTCCTTCT:88036253:12,23,1,1
chr4	88052343	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=116,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:11,11,0,3
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=102,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,8:0,2:0,1,0,10
chr4	88106732	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.311:43:7,13:23,0:23,7,13,0
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	88231322	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,3:2,5:3,4,9,0
chr4	88231338	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.288:24:5,1:5,0:9,8,2,5
chr4	88231339	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.465:25:3,6:7,6:8,5,3,9
chr4	88231392	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=110.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,35:0.857:40:4,20:1,15:1,4,11,24
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	88239609	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,6:0,7:1,0,7,6
chr4	88258483	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,11,15
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:9,0,2,0
chr4	88295956	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.458:33:9,0:9,15:3,15,0,15
chr4	88312251	.	GTTT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:3,1:1,3,0,2
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,11:1,8:2,1,11,8
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:3,0,11,0
chr4	88372958	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr4	88401735	.	CTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	88403768	.	A	ACCCCAACACCACCCCACATCCTCCAGCTCTCTAATGGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=48221316,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	88414851	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=122,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,7:6,0:9,8,0,7
chr4	88414981	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=100,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:6,0:5,7,2,0
chr4	88415636	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,1:3,7:4,7,3,5
chr4	88532182	.	AGT	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=GT;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.416:14:5,4:1,2:0,8,0,6
chr4	88532220	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.225:11:4,2:5,0:0|1:88532220_TA_T:88532220:0,9,0,2
chr4	88532222	.	C	CTCT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:3,0:0|1:88532220_TA_T:88532220:0,9,0,2
chr4	88532223	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:4,0:0|1:88532220_TA_T:88532220:0,9,0,2
chr4	88532228	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:88532220_TA_T:88532220:0,7,0,2
chr4	88533163	.	TTGTGTGTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=TG;STR;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,6:0,1:1,0,7,0
chr4	88533321	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=108,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:6,8,0,3
chr4	88533441	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,5:1,3:0|1:88533441_T_C:88533441:7,1,7,1
chr4	88533445	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:8,6:1,3:0|1:88533441_T_C:88533441:8,1,8,1
chr4	88533641	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:23,3:26,1:31,18,4,0
chr4	88534235	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=83,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.533:30:5,4:9,12:8,6,10,6
chr4	88535101	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.321:48:13,0:19,15:13,20,0,15
chr4	88535623	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=84,80;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.122:55:27,5:18,1:32,17,4,2
chr4	88536460	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=135,104;MMQ=48,54;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.266:27:9,5:11,1:15,5,2,5
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=78,101;MMQ=60,54;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.124:46:21,3:15,1:0|1:88536520_T_C:88536520:23,17,5,1
chr4	88536526	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=78,119;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.073:43:20,1:16,0:0|1:88536520_T_C:88536520:23,17,3,0
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	88584507	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=235,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,7:2,11:4,1,14,4
chr4	88732746	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.742:25:1,9:5,9:0|1:88732746_A_G:88732746:1,5,9,10
chr4	88732763	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,18:0.731:24:1,9:4,8:0|1:88732746_A_G:88732746:1,5,9,9
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	88766409	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=128,122;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:13,0:21,3:16,18,0,3
chr4	88901516	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:17,2:0|1:88901516_C_T:88901516:18,10,1,1
chr4	88901518	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,0:16,2:0|1:88901516_C_T:88901516:18,10,1,1
chr4	88902692	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:11,2:11,4:14,8,4,2
chr4	88957562	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,28;MFRL=72,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.827:13:0,3:1,8:1,1,10,1
chr4	88959706	.	G	GTTGGTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,2:5,0:0|1:88959706_G_GTTGGTTC:88959706:0,10,0,2
chr4	88959707	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,1:5,0:0|1:88959706_G_GTTGGTTC:88959706:0,10,0,2
chr4	88967906	.	ATTATCTTTTGTTTCT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:11,0:11,17,1,1
chr4	88979246	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,186;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:18,3:17,17,0,3
chr4	88996818	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,1:2,0:0|1:88996818_GAA_G:88996818:1,3,0,1
chr4	88996821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:88996818_GAA_G:88996818:1,3,0,1
chr4	88996822	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:88996818_GAA_G:88996818:1,3,0,1
chr4	88996856	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=237,374;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88996856_T_A:88996856:0,1,0,1
chr4	88996857	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=237,374;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88996856_T_A:88996856:0,1,0,1
chr4	88996865	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=237,374;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88996856_T_A:88996856:0,1,0,1
chr4	89013580	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:0,9,0,3
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr4	89016859	.	T	TGGGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:5,3,6,2
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,17,10
chr4	89028478	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	89189843	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:1,1:9,1:5,5,0,2
chr4	89326237	.	T	TATTTATTCACCTTTTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	89334299	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:3,0:10,3:7,6,1,2
chr4	89349948	.	ATGCATTCATATGAT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:89349948_ATGCATTCATATGAT_A:89349948:0,2,0,1
chr4	89349968	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:89349948_ATGCATTCATATGAT_A:89349948:0,3,0,1
chr4	89349970	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:89349948_ATGCATTCATATGAT_A:89349948:0,3,0,1
chr4	89352469	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.260:16:2,2:7,2:5,7,1,3
chr4	89358212	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr4	89360994	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	89363586	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,2:0.037:78:26,0:50,2:0|1:89363586_G_C:89363586:8,68,1,1
chr4	89363593	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:24,0:45,2:0|1:89363586_G_C:89363586:7,66,1,1
chr4	89381178	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:1,0,10,4
chr4	89389640	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.635:6:2,3:0,1:1,1,0,4
chr4	89400435	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31,26;MFRL=194,201,32490343;MMQ=50,60,55;MPOS=30,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.14,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.247,0.391:5:1,0,1:1,1,0:2,0,2,1
chr4	89442679	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	89442803	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,145;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:14,0:13,4:16,11,0,4
chr4	89444586	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	89588689	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr4	89601410	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,178;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:0,5,0,6
chr4	89607932	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=73,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,2:7,5:9,6,2,5
chr4	89618837	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,3,1
chr4	89619052	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:2,2:3,5,1,2
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.293:21:10,2:5,3:9,6,4,2
chr4	89652643	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:89652643_T_TG:89652643:0,3,0,1
chr4	89652646	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:89652643_T_TG:89652643:0,3,0,1
chr4	89652662	.	TGTGCAGAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	89671721	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:9,6:9,6:7,12,4,8
chr4	89702564	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	89711690	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=114,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:8,1:8,1:12,5,2,1
chr4	89726283	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=188,271;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr4	89941750	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,0:14,3:13,13,1,2
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=89,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,1:3,3:8,2,3,1
chr4	90170118	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,1,1
chr4	90647901	.	G	GTCTTGGTGAAAGGCGTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	90647913	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,1,0,1
chr4	90647918	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=20,27;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,1,0,1
chr4	90647920	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=22,26;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,1,0,1
chr4	90647924	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,1,0,1
chr4	90647926	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,2,0,1
chr4	90647933	.	TG	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:90647913_A_C:90647913:0,2,0,1
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=210,149;MMQ=33,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:1,3:1,2:0|1:90743317_T_TC:90743317:11,0,6,0
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=210,136;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.368:22:2,5:12,2:0|1:90743317_T_TC:90743317:13,1,7,1
chr4	90816023	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr4	90856500	.	AGTTTGATGATGCTGCAAAT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:11,2:14,7,1,1
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
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chr4	91645146	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:17,2:0|1:91645141_A_T:91645141:12,16,1,1
chr4	91645151	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,0:17,2:0|1:91645141_A_T:91645141:9,16,1,1
chr4	91645155	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:16,2:0|1:91645141_A_T:91645141:7,15,1,1
chr4	91645157	.	A	AGTTGAAAT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:16,2:0|1:91645141_A_T:91645141:7,15,1,1
chr4	91737018	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr4	91737064	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr4	91760024	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=167,97;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:9,1,4,0
chr4	91760085	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=131,88;MMQ=40,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:16,5:8,1:15,10,1,5
chr4	91760097	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=125,62;MMQ=49,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:23,2:6,0:0|1:91760097_G_T:91760097:16,13,1,1
chr4	91760099	.	A	ATT	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=125,62;MMQ=49,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:22,2:5,0:0|1:91760097_G_T:91760097:16,13,1,1
chr4	91760143	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=177,142;MMQ=50,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:24,3:19,1:32,12,3,1
chr4	94145875	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:9,0:9,13,2,1
chr4	94145883	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:12,2:7,0:7,12,1,1
chr4	94411887	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:0|1:94411887_C_T:94411887:9,17,1,1
chr4	94411892	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:17,2:0|1:94411887_C_T:94411887:9,19,1,1
chr4	94693160	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr4	94693709	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	94751674	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=83,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,6:7,2:7,4,3,5
chr4	94751710	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,1:4,3:6,4,1,3
chr4	94751827	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.383:13:3,0:2,3:5,3,4,1
chr4	95172088	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.632:20:3,0:4,11:1,6,0,13
chr4	95185829	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,2:8,4:14,4,5,1
chr4	95185854	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:3,9:3,14:5,1,16,7
chr4	95194966	.	T	TTGTAAGTTCTGATGGAGCTGCATCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr4	95194967	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:95194967_C_A:95194967:1,1,0,1
chr4	95194968	.	T	TGTGATGTGTTTGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:95194967_C_A:95194967:1,1,0,1
chr4	95199550	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:1,9:7,13:7,1,12,10
chr4	95206252	.	TTATC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,6:1,2:0,2,2,6
chr4	95206291	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr4	95229745	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=137,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=107.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,16:0,0,19,14
chr4	95496882	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.981:46:0,26:0,18:0,0,20,26
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=100.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,16:0,19:0,0,14,21
chr4	95506258	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=176,133;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:9,0:11,7:0,20,0,7
chr4	95508128	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.194:29:2,1:18,3:11,12,6,0
chr4	95508214	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.080:71:31,1:35,4:26,40,0,5
chr4	95561668	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:6,0:4,3:7,3,2,1
chr4	96035796	.	G	GAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	96036978	.	A	AGATTGAGAGAGAACGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=208,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:96036978_A_AGATTGAGAGAGAACGAT:96036978:0,1,0,1
chr4	96036981	.	AT	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=208,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:96036978_A_AGATTGAGAGAGAACGAT:96036978:0,1,0,1
chr4	96046372	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:96046372_A_G:96046372:2,2,0,1
chr4	96046373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:96046372_A_G:96046372:2,2,0,1
chr4	96073753	.	AAAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAT;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:5,0,2,1
chr4	96073956	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr4	96091250	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,3:0,1:1,1,3,1
chr4	96091524	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	96106322	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.830:19:0,8:2,8:1,2,7,9
chr4	96163827	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:96163827_A_C:96163827:0,3,0,1
chr4	96163839	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:96163827_A_C:96163827:0,3,0,1
chr4	96163841	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:96163827_A_C:96163827:0,3,0,1
chr4	96163844	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:96163827_A_C:96163827:0,3,0,1
chr4	96166170	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:9,9,1,1
chr4	96166195	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:12,11,4,0
chr4	96256616	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=81,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,3:1,8:0,2,7,4
chr4	96256673	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr4	96761719	.	A	AAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,2:3,4:6,0,6,0
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr4	99027137	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr4	99027159	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=15,32;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.891:11:0,3:0,7:1,0,4,6
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=83,95;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,8:2,1,4,7
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=83,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,0:0,6:1,1,2,4
chr4	99049593	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=86,88;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:4,1,3,6
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=83,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,9:2,2:1,1,8,3
chr4	99055637	.	CAGATA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGATA;STR;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.842:10:0,7:1,2:0,1,3,6
chr4	99802300	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.381:25:3,6:4,0:5,11,1,8
chr4	99802318	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.151:28:15,0:8,3:5,19,0,4
chr4	99822942	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,58;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr4	99850010	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,14;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:99850010_T_A:99850010:0,1,1,0
chr4	99850016	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99850010_T_A:99850010:0,1,1,0
chr4	99850018	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=103,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:99850010_T_A:99850010:1,1,1,0
chr4	99850021	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99850010_T_A:99850010:2,0,1,0
chr4	99850023	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,0:0|1:99850010_T_A:99850010:2,0,1,0
chr4	99993869	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:1,8:4,9:3,2,7,10
chr4	99995980	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr4	99996252	.	GAAC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	100002644	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.791:21:2,10:2,7:1,3,6,11
chr4	100003333	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,2,7
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,2,7
chr4	100048530	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr4	100052963	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	100057826	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:3,2,0,2
chr4	100057842	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=184,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr4	100062675	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	100131163	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	100131693	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:3,0:10,10:1,13,1,9
chr4	100131746	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,8,4
chr4	100137452	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,3:3,0:0,8,0,3
chr4	100140306	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,12,9
chr4	100201477	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	100205795	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:7,5,1,1
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0|1:100205819_C_A:100205819:0,0,11,9
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0|1:100205819_C_A:100205819:0,0,13,10
chr4	100208652	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=266,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:100212173_A_T:100212173:0,0,0,5
chr4	100212197	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:100212173_A_T:100212173:0,0,0,3
chr4	100212204	.	GT	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100212173_A_T:100212173:0,2,0,1
chr4	100212209	.	A	ACTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100212173_A_T:100212173:0,2,0,1
chr4	100235146	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=122,93;MMQ=55,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:5,6,1,1
chr4	100239112	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	100239203	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=166,57;MMQ=57,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:100239203_C_T:100239203:10,5,1,1
chr4	100239211	.	A	AATACACACAG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=170,57;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:100239203_C_T:100239203:10,4,1,1
chr4	100239319	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,6,14
chr4	100258007	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr4	100263942	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=139,97;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,6:4,5:6,3,5,6
chr4	100263965	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=144,121;MMQ=60,46;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,6:4,8:4,4,4,10
chr4	100264128	.	C	CGCG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=100,14620;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:100264128_C_CGCG:100264128:6,6,0,2
chr4	100264129	.	T	TCCCCCTCTTCCCTTCCATCCCC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=100,14620;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:100264128_C_CGCG:100264128:6,6,0,2
chr4	100264132	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=100,14620;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:100264128_C_CGCG:100264128:6,6,0,2
chr4	100265957	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,2:5,1:5,0,3,0
chr4	100266112	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,166;MMQ=58,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:1,3,5,4
chr4	100266371	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=112,128;MMQ=60,58;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:2,5,4,4
chr4	100268856	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,9,1
chr4	100336723	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:15,3:17,0:0|1:100336723_T_A:100336723:22,10,3,0
chr4	100336726	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.109:35:15,3:16,0:0|1:100336723_T_A:100336723:22,10,3,0
chr4	100340176	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:10,2:0|1:100340176_T_C:100340176:8,8,1,1
chr4	100340178	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,1:0|1:100340176_T_C:100340176:8,8,1,1
chr4	100340180	.	GA	AT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,1:0|1:100340176_T_C:100340176:8,8,1,1
chr4	100342033	.	A	ATATTGCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	100350594	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	100356466	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:1,2,5,6
chr4	100443561	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	100443720	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,14,8
chr4	100445589	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	100445786	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=211,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,1:0,5:0,2,1,5
chr4	100451161	.	T	TTGCCACAGTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=177,181;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:100451161_T_TTGCCACAGTC:100451161:0,3,0,1
chr4	100451163	.	T	TCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=212,181;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:100451161_T_TTGCCACAGTC:100451161:0,3,0,1
chr4	100451164	.	A	AACCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,22;MFRL=212,181;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:0|1:100451161_T_TTGCCACAGTC:100451161:0,3,0,1
chr4	100451197	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	100458721	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	100496076	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,0:14,3:22,12,3,0
chr4	100504575	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.651:38:5,13:8,12:6,7,11,14
chr4	100510903	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,3:6,2:3,3,1,4
chr4	100532253	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,3:2,0:8,1,2,1
chr4	100534225	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:7,11,1,2
chr4	100542482	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	100543853	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,1:13,2:16,8,2,1
chr4	100784118	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.269:35:10,3:16,6:23,3,8,1
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.088:64:23,1:30,4:34,25,3,2
chr4	100784163	.	T	G	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,18:0.256:72:22,8:32,10:29,25,7,11
chr4	100784875	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	100789441	.	T	TCCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100789441_T_TCCCC:100789441:0,1,0,1
chr4	100789442	.	T	TAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100789441_T_TCCCC:100789441:0,1,0,1
chr4	100808539	.	AAAAAAGTTAAAATATAAAATTTT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.136:21:6,1:9,1:0,19,1,1
chr4	101108978	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=93,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:0,5:5,6:0|1:101108978_T_C:101108978:4,1,6,5
chr4	101108992	.	G	GAAACCAGAGGAGAAGCGAC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=111,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,13:0.237:27:6,3:8,10:1|0:101108978_T_C:101108978:9,5,4,9
chr4	101337150	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,1:1,7:1,0,6,2
chr4	101368633	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=155,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr4	101368661	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=253,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,5:0,2:2,1,6,1
chr4	101386639	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=113,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,3:8,0:8,7,1,2
chr4	101947102	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=93,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,3:13,1:10,18,0,4
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr4	102776428	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=180,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:102776428_G_T:102776428:0,11,1,1
chr4	102776434	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:3,2:0|1:102776428_G_T:102776428:0,13,1,1
chr4	102776437	.	GG	TA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,1:0|1:102776428_G_T:102776428:0,14,1,1
chr4	102839126	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:6,3:19,0:21,5,3,0
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	102951223	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,209;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.185:36:15,6:13,0:16,14,6,0
chr4	102965043	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=69,91;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.943:25:1,8:0,16:1,0,13,11
chr4	103174491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr4	103236975	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=103,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,0:11,3:6,11,0,3
chr4	103236996	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=144,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,0:9,3:3,9,0,3
chr4	103504174	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	103505784	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.808:14:0,7:1,5:2,0,11,1
chr4	103506030	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:103506030_G_T:103506030:1,10,1,1
chr4	103506031	.	G	GAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:103506030_G_T:103506030:1,10,1,1
chr4	103514658	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,38:0.669:57:11,22:7,14:13,6,18,20
chr4	103514741	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.680:38:6,11:5,15:2,10,5,21
chr4	103522157	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:6,3:10,5:6,10,3,5
chr4	103534560	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=213,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.822:15:2,6:0,6:2,0,9,4
chr4	103537556	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:10,0:12,5:17,5,0,5
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,0:1,2:2,0,0,5
chr4	103555992	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,4:3,6:1,3,4,6
chr4	103556007	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=127,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:103556007_T_C:103556007:3,5,1,1
chr4	103556009	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=127,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:103556007_T_C:103556007:3,5,1,1
chr4	103556013	.	T	TGGTCTTGAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=132,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:103556007_T_C:103556007:3,4,1,1
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0,4,3,3
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr4	103590216	.	CAAATA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:8,0:6,10,1,1
chr4	103610872	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:1,2:8,2:2,7,0,4
chr4	103611987	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	103720020	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=217,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,3:3,0:4,1,2,1
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.676:35:9,7:0,16:4,7,5,19
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=88,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=79.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,29:0.858:33:3,13:1,16:2,2,17,12
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr4	103790324	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:18,0:5,3:13,11,0,3
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=69,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,2:3,4:2,1,5,1
chr4	103808427	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,141;MMQ=55,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr4	103808458	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=168,150;MMQ=34,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:6,2,3,0
chr4	103822482	.	AAC	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=118,126;MMQ=52,23;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:14,2:15,1:0|1:103822482_AAC_A:103822482:19,14,1,2
chr4	103822492	.	GC	AT	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=108,120;MMQ=52,32;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:15,1:18,1:0|1:103822482_AAC_A:103822482:19,15,0,2
chr4	103822540	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=114,176;MMQ=49,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,4:16,0:12,18,0,4
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr4	103831676	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,85;MMQ=60,49;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,0:11,4:13,7,2,2
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.835:34:4,18:1,11:2,3,14,15
chr4	103870596	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=142,136;MMQ=37,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	104003141	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr4	104003365	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=169,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:104003365_G_GT:104003365:1,3,0,1
chr4	104003366	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=169,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:104003365_G_GT:104003365:1,3,0,1
chr4	104003399	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	104064366	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:7,2,1,2
chr4	104066273	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=103,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.366:31:12,6:6,5:9,11,2,9
chr4	104072542	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0,6,0,2
chr4	104074332	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:10,7,0,2
chr4	104084765	.	CAA	C,CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20,30;MFRL=142,93,153;MMQ=53,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.50,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.280,0.290:13:0,0,1:3,3,2:2,4,1,6
chr4	104097068	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:13,3,2,0
chr4	104510766	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	104511175	.	A	T,ACCCGTTGAGGGTGAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20,23;MFRL=84,64,93;MMQ=60,60,60;MPOS=6,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:2,2,1:1,0,0:0,3,1,2
chr4	104511177	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=89,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:104511177_A_C:104511177:0,4,1,1
chr4	104511178	.	AAAAGT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=89,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:104511177_A_C:104511177:0,4,1,1
chr4	104511185	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=84,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:0|1:104511177_A_C:104511177:0,3,1,1
chr4	106158730	.	TCGTGCATGTTTATTTTTCCCTCTCTTCAGATCCTGTAAAATTTGAATGTATCTGTTTTAGATCAATTCGC	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:11,2:5,0:20,21,1,1
chr4	106159271	.	AGT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,1:6,4:11,6,3,2
chr4	106159644	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr4	106160218	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=103,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:8,6,0,2
chr4	106160231	.	G	GTTTTTTTGTT,GTTTTTTTGTTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,129,138;MMQ=60,55,52;MPOS=17,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.317,0.619:9:0,1,2:0,2,3:0,0,8,1
chr4	106163621	.	AAG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:0|1:106163621_AAG_A:106163621:7,6,0,2
chr4	106163626	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:0|1:106163621_AAG_A:106163621:8,6,0,2
chr4	106190970	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=201,216;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	106190979	.	GGGTAATTTATAA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=187,257;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:106190979_GGGTAATTTATAA_G:106190979:0,2,0,1
chr4	106190996	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106190979_GGGTAATTTATAA_G:106190979:0,0,0,1
chr4	106290829	.	A	ACTTGGGGAAAAAGAGT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.452:15:3,1:5,1:5,3,5,2
chr4	106510421	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,2:11,1:15,5,2,1
chr4	106534691	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=95,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,3:4,1:4,8,0,4
chr4	106603979	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=88,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.096:60:27,0:28,5:25,30,0,5
chr4	106647679	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=232,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	106766496	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	106766745	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=117,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:3,3,2,0
chr4	106861808	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=128,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:0|1:106861808_T_TA:106861808:9,9,1,1
chr4	106861809	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:106861808_T_TA:106861808:9,9,1,1
chr4	106863681	.	TCCA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCA;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.216:14:5,2:6,1:4,7,1,2
chr4	107092169	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	107115960	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,6:2,3:2,4,3,7
chr4	107116029	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	107133861	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=71,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr4	107134053	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,0:7,7:2,9,0,7
chr4	107151570	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,3:9,0:11,9,1,2
chr4	107154273	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=17,35;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,2:0,5:0,2,0,7
chr4	107154309	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=176,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	107157461	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr4	107157699	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,3:0,1,0,12
chr4	107168520	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	107171637	.	TAAATA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=64.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:5,8:1,8:0,6,5,11
chr4	107246136	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=92.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,34:0.877:38:2,16:2,17:4,0,19,15
chr4	107257975	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=214,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,1:2,6:3,0,6,1
chr4	107258228	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,1:2,1:2,6,0,2
chr4	107845395	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:1,4,0,3
chr4	108576120	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:108576120_C_A:108576120:0,2,0,3
chr4	108576123	.	C	CACACACACACACACACACACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:108576120_C_A:108576120:0,2,0,3
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	108608398	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108608398_A_G:108608398:0,1,0,1
chr4	108608400	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108608398_A_G:108608398:0,1,0,1
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	108641300	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,8,15
chr4	108641449	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	108866058	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr4	108931039	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=229.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,29:0,37:0,0,46,20
chr4	108935770	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,5:4,3:3,2,5,6
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr4	108944732	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:4,6:7,0:8,3,2,4
chr4	108944821	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr4	108955483	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=97,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:7,7,0,3
chr4	108985388	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	108991979	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr4	108999300	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	108999366	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr4	108999562	.	T	TGGTGGTGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:7,0:5,10,0,2
chr4	109010207	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	109543251	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:4,13:4,6:4,4,10,9
chr4	109576622	.	C	CAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,12;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.886:7:0,2:0,3:0,0,6,1
chr4	109576843	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr4	109578572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	109670475	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=97,373;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr4	109672227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:1,3,0,2
chr4	109735041	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=107,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:8,0:18,5:15,11,2,3
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,4,12
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,2,10
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	109740580	.	A	ATGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	109745475	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=165,200;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:109745475_G_C:109745475:0,1,0,1
chr4	109745482	.	T	TCCATTAATAATGGCATCGTCATGGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=165,200;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109745475_G_C:109745475:0,1,0,1
chr4	109748227	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr4	109762918	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=77,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,5:3,6:2,1,3,8
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr4	109767453	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	109784543	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,34;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:109784543_C_T:109784543:4,11,1,1
chr4	109784548	.	CACAAATT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,34;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:109784543_C_T:109784543:4,11,1,1
chr4	109784556	.	GCAAAACAGGTAAATGGTCATTCCCCCCA	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:10,2:0|1:109784543_C_T:109784543:3,11,1,1
chr4	109790346	.	CAATAAATA	C,CAATA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,35,32;MFRL=0,166,152;MMQ=60,60,60;MPOS=30,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=AATA;STR;TLOD=13.20,107.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,27:0.164,0.809:32:0,1,12:0,4,14:0,0,2,30
chr4	109810988	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=134,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	109859040	.	ATT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:1,1:7,0:3,8,1,1
chr4	109863480	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,2:8,0:0|1:109863480_T_C:109863480:5,18,0,2
chr4	109863482	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:109863480_T_C:109863480:5,18,0,2
chr4	109863484	.	T	TTTCTAGTAATA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:0|1:109863480_T_C:109863480:5,18,0,2
chr4	109931455	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=62.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,11:0,3:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,12,3
chr4	109931457	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,12:0,3:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,12,3
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,20:0,0,34,14
chr4	109969456	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	109971414	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr4	110384047	.	G	GCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTT;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	110402980	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	110409829	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,122;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr4	110452580	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:8,5,1,1
chr4	110459724	.	CCA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,30;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:18,2:0|1:110459724_CCA_C:110459724:12,14,1,1
chr4	110459728	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,30;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:18,2:0|1:110459724_CCA_C:110459724:12,14,1,1
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr4	110581324	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.636:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr4	110585645	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	110605718	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=94,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:11,0:11,5:0|1:110605718_C_T:110605718:9,14,0,5
chr4	110605724	.	T	TTATGGAACAGGCTTCAAAGAGCTACCTGGA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,38;MFRL=94,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:12,0:10,5:0|1:110605718_C_T:110605718:9,14,0,5
chr4	110606394	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,1:6,1,1,1
chr4	110608674	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:110608674_A_G:110608674:4,5,1,1
chr4	110608676	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:110608674_A_G:110608674:4,5,1,1
chr4	110610608	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:8,4:13,0:11,10,2,2
chr4	110612231	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:110612231_CA_C:110612231:0,3,0,1
chr4	110612236	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=159,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:110612231_CA_C:110612231:0,3,0,1
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,86;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr4	110650711	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:3,0:6,0,2,0
chr4	110650720	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=21,11;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:1,0:9,0,3,0
chr4	110650722	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:4,0:1,0:0|1:110650722_A_C:110650722:11,0,3,0
chr4	110650725	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:3,0:3,0:0|1:110650722_A_C:110650722:11,0,3,0
chr4	110670500	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=197,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0|1:110670500_C_A:110670500:1,1,0,4
chr4	110670503	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=197,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0|1:110670500_C_A:110670500:1,1,0,4
chr4	110670527	.	A	AGTAGTATTCAATACATTTGTTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=225,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr4	110670839	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110670839_C_T:110670839:0,0,0,1
chr4	110670842	.	A	AAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110670839_C_T:110670839:0,0,0,1
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.890:6:0,5:0,1:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,6
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,3
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr4	110737293	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.188:24:11,4:8,1:14,5,4,1
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr4	110745251	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:5,0:8,6:0,13,0,6
chr4	110749141	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:8,2:7,9,2,1
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	110786463	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,0:10,5:9,10,0,5
chr4	110786517	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	110789121	.	CCCATGATCAAAGGAGTTTACTAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:3,2:1,4,1,1
chr4	110790911	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,8,15
chr4	110791097	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:11,1:17,2:0|1:110791097_T_C:110791097:16,12,1,2
chr4	110791105	.	TA	CC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:18,2:0|1:110791097_T_C:110791097:13,24,1,1
chr4	110864584	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,3:11,0:12,13,0,3
chr4	110882228	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110882228_G_GT:110882228:0,0,0,1
chr4	110882229	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110882228_G_GT:110882228:0,0,0,1
chr4	111397495	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,86;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:4,0:1,10,1,2
chr4	111409705	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,1:5,3:4,2,4,1
chr4	111474669	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:111474669_CT_C:111474669:0,1,0,1
chr4	111474673	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:111474669_CT_C:111474669:0,1,0,1
chr4	111474681	.	TTG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111474669_CT_C:111474669:0,0,0,1
chr4	111474684	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111474669_CT_C:111474669:0,0,0,1
chr4	111474690	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111474669_CT_C:111474669:0,0,0,1
chr4	111542552	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:111542552_C_T:111542552:0,4,0,1
chr4	111542567	.	C	CAGACAAATGGTTTAATGAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.389:3:1,1:1,0:1|0:111542552_C_T:111542552:0,2,0,1
chr4	111542571	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,22;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111542552_C_T:111542552:0,1,0,1
chr4	111542574	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111542552_C_T:111542552:0,1,0,1
chr4	111542576	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111542552_C_T:111542552:0,1,0,1
chr4	111542578	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111542552_C_T:111542552:0,1,0,1
chr4	111543323	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	111543596	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:5,3:12,0:7,10,1,2
chr4	111553527	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.271:34:11,8:13,0:11,14,9,0
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	111781853	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	113066831	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr4	113107829	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.359:15:2,2:5,1:9,1,4,1
chr4	113178966	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=105,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.194:27:12,1:9,4:7,15,2,3
chr4	113345240	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=132,189;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:113345240_A_G:113345240:0,1,0,1
chr4	113345254	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113345240_A_G:113345240:0,0,0,1
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	113346918	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:5,6:23,0:10,18,5,1
chr4	113346996	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr4	113347634	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,1:11,2:12,8,1,2
chr4	113352397	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,14,5
chr4	113352628	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=190,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,11:1,8:0,1,11,8
chr4	113353285	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,8,9
chr4	113356259	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,1:2,2:2,4,0,3
chr4	113359703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,4,5
chr4	113362316	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,2:14,2:16,8,3,1
chr4	113462187	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,2,0
chr4	113462369	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,1:5,1:7,10,1,1
chr4	113479549	.	TCAC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113479549_TCAC_T:113479549:0,1,0,1
chr4	113479553	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113479549_TCAC_T:113479549:0,1,0,1
chr4	113479555	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113479549_TCAC_T:113479549:0,1,0,1
chr4	113483446	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	113506774	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:21,4:11,2:12,20,0,6
chr4	113524705	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,0:3,2:9,2,2,0
chr4	113527072	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr4	113533796	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:11,3:2,0:3,10,1,2
chr4	113538691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,2:7,1:8,11,2,1
chr4	113554385	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=49,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.848:24:3,14:0,7:1,2,4,17
chr4	113565835	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,3:8,2:11,1,3,2
chr4	113566101	.	C	CTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=226,200;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=T;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,3:0,1:0,1,0,5
chr4	113568135	.	AAAAAG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:3,2:11,2:7,7,2,2
chr4	113568136	.	AAAAG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.362:16:3,2:7,4:6,4,3,3
chr4	113568318	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,5:4,0:4,4,0,5
chr4	113568544	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.350:35:7,3:16,9:14,9,4,8
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=85,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,11:1,4:6,1,13,2
chr4	113570885	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.725:27:3,7:4,13:1,6,2,18
chr4	113571761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=103,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:6,8:1,10:2,5,4,14
chr4	113574408	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,2:12,1:15,4,3,0
chr4	113578326	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=223,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,24;RU=TG;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:0,5:1,1:1,0,9,3
chr4	113578482	.	GA	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.125:52:25,1:11,6:18,27,2,5
chr4	114028168	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr4	114158396	.	A	AGGCTAGTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	114209453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=204,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr4	114232642	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=265,265;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr4	114279803	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,5:7,0:4,10,5,0
chr4	114279943	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:10,2:0|1:114279943_C_T:114279943:15,10,1,1
chr4	114279949	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:10,2:0|1:114279943_C_T:114279943:16,11,1,1
chr4	114286357	.	ATG	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=24083157,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.692:4:1,1:0,0:1,0,1,2
chr4	114290703	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=53,254;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:4,1,3,0
chr4	114290838	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=100,230;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:14,7:15,0:15,14,0,7
chr4	114375550	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr4	114386855	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114386855_C_G:114386855:0,1,0,1
chr4	114386859	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114386855_C_G:114386855:0,1,0,1
chr4	114386865	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114386855_C_G:114386855:0,1,0,1
chr4	114824549	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.101:28:11,0:15,2:0|1:114824549_A_C:114824549:14,12,1,1
chr4	114824555	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.101:28:9,0:11,2:0|1:114824549_A_C:114824549:15,11,1,1
chr4	114824556	.	T	TTTTTCTTTCTCTTTTCC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:9,0:11,2:0|1:114824549_A_C:114824549:15,9,1,1
chr4	115544654	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,1,1
chr4	115751143	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=206,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	115760796	.	TTTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr4	115997164	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,6:0,0,10,5
chr4	119036202	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119036202_T_A:119036202:0,1,0,1
chr4	119036210	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119036202_T_A:119036202:0,1,0,1
chr4	119036211	.	T	TACTTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119036202_T_A:119036202:0,1,0,1
chr4	119059490	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=201,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119059490_G_T:119059490:0,1,0,1
chr4	119059492	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=201,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119059490_G_T:119059490:0,1,0,1
chr4	119059494	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=201,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0|1:119059490_G_T:119059490:0,1,0,1
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	119064756	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:119064756_T_C:119064756:7,12,1,1
chr4	119064764	.	A	ATTGAGAACACCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=106,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:119064756_T_C:119064756:5,9,1,1
chr4	119147975	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	119161795	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,3,3
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr4	119176703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	119219909	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=47,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.841:17:1,8:1,6:1,1,8,7
chr4	119252846	.	CAAAACAAGAGTAGTA	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:6,2:20,0:27,7,1,1
chr4	119256617	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.864:14:2,7:0,5:1,1,10,2
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,14:0,27:0,0,32,9
chr4	119609182	.	CTTTTT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,31,20;MFRL=135,136,101;MMQ=60,44,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.98,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,2:0.181,0.157:16:2,1,1:3,1,1:1,10,1,4
chr4	119609246	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr4	119610701	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	119613041	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=204,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:119613041_G_C:119613041:1,0,2,0
chr4	119613045	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=204,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:119613041_G_C:119613041:1,0,3,0
chr4	119615543	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=206,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:3,0,6,1
chr4	119621742	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=108,129;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,3:13,1:23,11,4,0
chr4	119621786	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=80,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:20,0:17,4:21,17,0,4
chr4	119625000	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=274,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr4	119625273	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	119653822	.	GG	CA,CG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31,31;MFRL=72,152,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.44,20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,8:0.175,0.543:14:3,1,3:0,1,5:3,1,7,3
chr4	119661760	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr4	119666217	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:2,1:5,3:7,6,1,6
chr4	119666232	.	ACCC	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,0:13,2:0|1:119666232_ACCC_A:119666232:5,17,0,2
chr4	119666236	.	A	ATTCATTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:119666232_ACCC_A:119666232:5,17,0,2
chr4	119674051	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.538:17:6,4:2,4:2,6,1,8
chr4	119689362	.	TCTCCTTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCCTTC;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:8,2:17,0:19,7,1,1
chr4	119718988	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:8,4:4,0:0|1:119718988_C_T:119718988:2,10,1,3
chr4	119718998	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=162,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:119718988_C_T:119718988:2,9,0,2
chr4	119726966	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,6:3,0:7,1,6,0
chr4	119736095	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,11,7
chr4	119736796	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:12,5:11,1:0|1:119736796_A_C:119736796:11,13,4,2
chr4	119736805	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:12,0:0|1:119736796_A_C:119736796:11,15,1,1
chr4	119736806	.	G	GCGATCTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=93,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:119736796_A_C:119736796:10,15,1,1
chr4	119947961	.	AAAG	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=98.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.712:36:2,8:7,18:3,7,13,13
chr4	119948420	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:22,4:12,0:13,21,4,0
chr4	119951185	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=104,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:24,0:14,3:23,15,0,3
chr4	119951448	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=94,250;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,20:0.304:67:19,0:28,20:22,25,0,20
chr4	119952489	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,0:4,8:2,7,0,8
chr4	119958405	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:1,4,1,7
chr4	120072233	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:120072233_G_C:120072233:0,0,0,4
chr4	120072238	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:120072233_G_C:120072233:0,0,0,4
chr4	120072275	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,15,10
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=84,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.696:31:5,11:4,10:6,3,9,13
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,1:2,4:0,3,0,6
chr4	120181673	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=135,186;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:5,5:21,0:18,8,5,0
chr4	120189328	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	120192834	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.137:31:10,0:17,3:15,12,4,0
chr4	120194718	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.834:26:3,9:1,13:3,1,19,3
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:7,1:4,3:5,6,0,4
chr4	120221425	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr4	120240131	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,3:7,6:10,4,9,0
chr4	120240802	.	CATA	C,CATAATA,CATAATAATA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31,32,26;MFRL=0,164,111,110;MMQ=60,60,60,60;MPOS=33,28,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,9,11,12;RU=ATA;STR;TLOD=5.66,3.15,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,2:0.345,0.219,0.335:5:0,2,1,2:0,0,0,0:0,0,0,5
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr4	120422414	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=120,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,4:12,4:13,11,5,3
chr4	120422470	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:5,2:1,7,0,2
chr4	120422477	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:5,2:1,7,0,3
chr4	120422496	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=145,144;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr4	120423719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,2:5,1:0|1:120423719_C_T:120423719:8,3,3,0
chr4	120423729	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:0|1:120423719_C_T:120423719:8,4,2,1
chr4	120425777	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:12,4:13,2:12,13,2,4
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=92,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.463:7:0,2:1,1:1,3,0,3
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	120481431	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:4,1:17,3:11,10,1,3
chr4	120488246	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=115,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:15,7:7,0:11,11,7,0
chr4	120549777	.	GGCT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCT;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:5,1:3,1:4,4,1,1
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=129,94;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=103.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.971:34:0,8:1,25:0,1,13,20
chr4	121631375	.	G	GAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:5,1:7,1,2,0
chr4	121720771	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:3,3:8,3,1,2
chr4	121720781	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,7:4,3:1,3,7,3
chr4	121737548	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=90,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,4:4,0:9,2,4,0
chr4	121737648	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=102,110;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.277:27:10,0:9,7:12,8,0,7
chr4	121737686	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:9,3,2,0
chr4	121738121	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:8,0:13,9:5,16,0,9
chr4	121738182	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr4	121828519	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	121828715	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=90,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,2:13,0:6,16,1,1
chr4	121957559	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,71;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,3:9,0:11,9,1,2
chr4	121957734	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr4	121958091	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:4,2,6,2
chr4	121958187	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:1,16:0,8:0,1,11,13
chr4	121958447	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:121958447_C_T:121958447:10,8,1,1
chr4	121958450	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:8,2:0|1:121958447_C_T:121958447:10,8,1,1
chr4	121966807	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	122053910	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=113421768,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.696:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr4	122062981	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:8,2:4,0:10,2,0,2
chr4	122063897	.	TCTAG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=117,98;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,0:7,4:10,8,0,4
chr4	122082376	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=18,34;MFRL=101,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,0:0,2:0,3,0,3
chr4	122082430	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:122082430_T_C:122082430:0,0,0,1
chr4	122082431	.	ACTG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:122082430_T_C:122082430:0,0,0,1
chr4	122082436	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:122082430_T_C:122082430:0,0,0,1
chr4	122254311	.	C	CCTAGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=260,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	122261782	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr4	122590883	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:2,3:2,0:1,4,2,2
chr4	122593733	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=115,109;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,2:12,0:10,9,2,0
chr4	122599755	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	122602912	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=102,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:8,0:13,14:8,13,0,14
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr4	122683055	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.487:39:10,0:10,19:8,12,0,19
chr4	122722693	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,5,20
chr4	122732897	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:122732897_T_C:122732897:0,4,0,1
chr4	122732898	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:122732897_T_C:122732897:0,4,0,1
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1|0:122732897_T_C:122732897:0,1,0,4
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	122737487	.	CTT	C,CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,30,29;MFRL=141,120,123;MMQ=60,60,60;MPOS=7,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.10,8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,8:0.172,0.318:25:5,1,4:7,3,2:11,2,9,3
chr4	122737588	.	T	G	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=97,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,17:0.189:93:38,0:38,17:25,51,0,17
chr4	122739183	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	122743734	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:122743734_C_T:122743734:5,12,1,1
chr4	122743737	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:122743734_C_T:122743734:5,12,1,1
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	122776067	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	122791472	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:15,0:14,14,0,3
chr4	122791601	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	122824052	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,1:10,3:8,9,3,1
chr4	122828794	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	123113352	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,6:6,1:7,4,5,2
chr4	123128865	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123128865_A_T:123128865:0,1,0,1
chr4	123128870	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123128865_A_T:123128865:0,1,0,1
chr4	123128873	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123128865_A_T:123128865:0,1,0,1
chr4	123128875	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123128865_A_T:123128865:0,1,0,1
chr4	123130886	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,6,16
chr4	123145751	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:6,8:3,9:4,5,11,6
chr4	123151238	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:17,0:16,3:15,18,2,1
chr4	123166379	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	123185660	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123185660_G_A:123185660:0,1,0,1
chr4	123185663	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123185660_G_A:123185660:0,1,0,1
chr4	123185666	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123185660_G_A:123185660:0,1,0,1
chr4	123185670	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123185660_G_A:123185660:0,1,0,1
chr4	123185673	.	C	CCCATATGTGCTACA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123185660_G_A:123185660:0,1,0,1
chr4	123187869	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	123192383	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,7:2,7:3,1,8,6
chr4	123193214	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	123222417	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.732:15:3,9:1,2:3,1,10,1
chr4	123246971	.	GT	G,GTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27,26;MFRL=137,162,255;MMQ=60,60,45;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.58,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,2:0.222,0.132:20:7,3,0:5,1,1:10,3,3,4
chr4	123264485	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr4	123277756	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:10,6,4,0
chr4	123333671	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	123342616	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=265,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	123377651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,0:1,7:0,4,0,7
chr4	123664204	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:5,3:12,2:12,6,3,2
chr4	123665302	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.316:39:11,12:16,0:18,9,12,0
chr4	123666156	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr4	123747942	.	G	GTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=156,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:123747942_G_GTGTGT:123747942:4,1,1,1
chr4	123747944	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:123747942_G_GTGTGT:123747942:4,1,1,1
chr4	123747946	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:123747942_G_GTGTGT:123747942:4,1,1,1
chr4	123814227	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:12,0:3,2:0|1:123814227_A_G:123814227:8,8,1,1
chr4	123814234	.	A	AGCATATTTTCCAGTAGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,0:5,2:0|1:123814227_A_G:123814227:10,8,1,1
chr4	123838758	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,3:11,3:7,12,4,2
chr4	123838791	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:5,3:14,1:9,11,2,2
chr4	123844476	.	TGGGAGACTAGAGGCCGAGGGGGCGCAACCTGAGGGGC	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.150:33:10,0:6,3:10,19,2,2
chr4	123859395	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=99,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:10,2:0|1:123859395_C_G:123859395:10,11,1,1
chr4	123859399	.	G	GGAAT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=99,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:10,0:11,2:0|1:123859395_C_G:123859395:10,11,1,1
chr4	123859428	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,0:10,4:4,13,0,4
chr4	123949267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr4	123949594	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:0|1:123949594_C_CT:123949594:3,4,0,2
chr4	123949597	.	AA	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:123949594_C_CT:123949594:3,4,0,2
chr4	124323738	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=81,93;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.567:51:11,17:11,12:13,9,17,12
chr4	124323783	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.677:26:3,10:5,7:1,7,7,11
chr4	124324400	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=128,272;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,3:2,0:4,6,3,0
chr4	125592217	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:6,3,1,1
chr4	126238616	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=111,67;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:5,12,4,0
chr4	126241871	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	126319857	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=160,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr4	126369554	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=277,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,7,1
chr4	126370082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:126370082_A_G:126370082:4,0,1,0
chr4	126370086	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:126370082_A_G:126370082:4,0,1,0
chr4	126370100	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr4	126371284	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:4,2:0|1:126371284_C_T:126371284:5,3,2,0
chr4	126371288	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.287:11:3,0:5,2:0|1:126371284_C_T:126371284:5,3,2,1
chr4	126372323	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.703:25:4,12:3,5:3,4,9,9
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	126398381	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,74;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,3:13,0:7,10,3,0
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	126402921	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr4	126411568	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=93,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr4	126412634	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:3,10:5,3:4,4,8,5
chr4	128584673	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:6,0:12,2:6,12,0,2
chr4	128688444	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,1:1,6:1,2,0,7
chr4	128723154	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128723154_G_GC:128723154:0,1,0,1
chr4	128723155	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128723154_G_GC:128723154:0,1,0,1
chr4	128751775	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr4	128753898	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:16,0:7,4:12,11,4,0
chr4	128807097	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=82,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:7,0:0|1:128807097_A_C:128807097:9,7,2,0
chr4	128807100	.	CTG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=82,295;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:128807097_A_C:128807097:9,6,2,0
chr4	128807103	.	ATGTTTGGTC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=82,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:7,0:0|1:128807097_A_C:128807097:9,8,2,0
chr4	128807948	.	C	CAGTCAGAATTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128807948_C_CAGTCAGAATTA:128807948:0,0,0,1
chr4	128807950	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128807948_C_CAGTCAGAATTA:128807948:0,0,0,1
chr4	128812230	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=89,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.480:17:3,8:6,0:6,3,6,2
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29,27;MFRL=111,168,130;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.55,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,3:0.205,0.191:19:7,2,0:5,2,2:9,3,7,0
chr4	128814777	.	TTA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:7,0:7,4:4,10,2,2
chr4	128817905	.	GTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:8,2,2,0
chr4	128842730	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,262;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:10,6:10,0:15,5,6,0
chr4	129035902	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=96,56;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:15,0:13,3:8,21,0,3
chr4	129043256	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,179;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.334:37:10,0:15,12:13,12,0,12
chr4	129100620	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.209:46:22,9:13,0:18,19,9,0
chr4	129193532	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,0:15,4:18,10,4,0
chr4	129193571	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:17,0:18,4:20,16,4,0
chr4	129752821	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=152,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,2:1,3:7,1,4,1
chr4	129770163	.	TTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTG	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:11,0:12,2:16,20,1,1
chr4	129776983	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.703:21:3,7:3,6:0,6,2,13
chr4	129778495	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.143:37:17,4:15,0:15,17,4,1
chr4	129783299	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,142;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:7,7:6,0:7,6,8,0
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=67,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.619:11:3,2:1,5:2,2,1,6
chr4	129809801	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:6,3:1,2:6,2,5,0
chr4	129867280	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:6,6:5,7,4,7
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:0,9,1,2
chr4	129880841	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:21,13:2,2:18,6,10,5
chr4	129965026	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=95,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.628:8:0,1:1,3:2,1,3,2
chr4	130030652	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:0,14:3,4:1,2,14,4
chr4	134111298	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=88,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,21:0.314:68:12,21:33,0:37,10,21,0
chr4	138442780	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr4	138442809	.	A	ATTGGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:138442809_A_ATTGGAT:138442809:0,3,0,1
chr4	138442812	.	G	GAAGAAATTCTAACCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:138442809_A_ATTGGAT:138442809:0,3,0,1
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=51,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.769:15:2,8:1,4:1,2,4,8
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	139103504	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:16,5:20,0:18,18,5,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr4	139157506	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:20,2:20,0:24,16,0,2
chr4	139966663	.	A	ATTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=25,28;RU=T;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.904:6:0,3:0,0:0,0,1,5
chr4	140046235	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=80,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:0|1:140046235_T_G:140046235:2,0,6,0
chr4	140046241	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:2,6:1,0:0|1:140046235_T_G:140046235:3,0,6,0
chr4	140196613	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:140196613_T_TG:140196613:0,1,0,1
chr4	140196616	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140196613_T_TG:140196613:0,1,0,1
chr4	140196617	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140196613_T_TG:140196613:0,1,0,1
chr4	140262318	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=198,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	140270589	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:11,1:1,2:11,1,3,0
chr4	140291541	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,127;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.073:65:37,0:24,4:25,36,1,3
chr4	140309028	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=90,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.739:25:4,9:2,10:4,2,16,3
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	140587253	.	TGTGTGTGCGC	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=87,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.390:29:11,5:5,6:12,6,4,7
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	140641469	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr4	140647056	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,122;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:11,3:1,18,0,3
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.854:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,10:0,0,13,15
chr4	140810700	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,29:0,26:0,0,28,27
chr4	140811135	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,10,12
chr4	140812164	.	A	ACTGCAACCATTGACAGGAAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	140812195	.	TTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140812195_TTGC_T:140812195:0,1,0,1
chr4	140812200	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140812195_TTGC_T:140812195:0,1,0,1
chr4	141073958	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141073958_C_T:141073958:1,0,1,0
chr4	141073974	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:141073958_C_T:141073958:2,0,1,0
chr4	141264721	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,4:7,0:12,1,4,0
chr4	141311960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	141446510	.	C	CTAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=87,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr4	141446767	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:0,3,0,5
chr4	141456996	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:141456996_T_C:141456996:4,12,1,1
chr4	141456998	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:141456996_T_C:141456996:4,12,1,1
chr4	141481098	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:9,0:10,4:11,8,4,0
chr4	141543359	.	ATGGCCGAGATTTCATAGTCAC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=93,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:9,2:8,15,1,1
chr4	141545564	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=232,245;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	141607679	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	141847077	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr4	141847110	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,9,7
chr4	141847279	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,11:0,12:0,1,18,5
chr4	142152686	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,8:3,7:0,6,2,13
chr4	142153740	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=131,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:13,0:22,4:16,19,4,0
chr4	142153788	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:16,5:22,0:17,21,2,3
chr4	142153856	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0,5,0,2
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr4	142641719	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:8,8,1,2
chr4	142651190	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:142651190_TG_T:142651190:0,1,0,1
chr4	142651196	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:142651190_TG_T:142651190:0,1,0,1
chr4	142651199	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:142651190_TG_T:142651190:0,1,0,1
chr4	142654084	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=253,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,10:0,0,11,5
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	143029391	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:1,4,0,3
chr4	143033641	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr4	143044427	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,6:2,5:4,0,7,4
chr4	143081671	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:3,9,2,0
chr4	143081684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:11,2:2,0:3,10,2,0
chr4	143129487	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	143158979	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=86,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.836:16:1,9:1,5:1,1,13,1
chr4	143181731	.	TAA	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,0:6,3:6,21,0,3
chr4	143181748	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.519:31:3,11:11,5:1,14,2,14
chr4	143181750	.	TTGAGAACAATCAAA	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:11,3:13,0:3,27,0,3
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:1,2,0,3
chr4	143226784	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	143326312	.	AAGAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=92,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AG;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:1,0:2,3:2,3,1,2
chr4	143326515	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr4	144109080	.	G	GGTCTTACTAAT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,1:6,0:6,12,0,2
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	144130642	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,0:2,1:4,1,1,1
chr4	144133611	.	T	TGGATC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0|1:144133611_T_TGGATC:144133611:1,4,1,1
chr4	144133613	.	G	GGCAGGAGGGTATC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:144133611_T_TGGATC:144133611:1,4,1,1
chr4	144134903	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,99;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:4,7,2,0
chr4	144136193	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	144336663	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=198,99;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,4:9,0:11,3,4,0
chr4	144361555	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,0:6,7:5,10,0,7
chr4	144378777	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144378777_C_A:144378777:2,0,1,0
chr4	144378784	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:144378777_C_A:144378777:3,1,1,0
chr4	144380530	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:7,2,2,1
chr4	144380621	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:144380621_T_C:144380621:6,11,1,1
chr4	144380627	.	C	CTGTTGCCCAGGCTG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:144380621_T_C:144380621:4,11,1,1
chr4	144381711	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=186,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144381711_T_C:144381711:0,1,0,1
chr4	144381718	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=186,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144381711_T_C:144381711:0,1,0,1
chr4	144381720	.	TATC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=186,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144381711_T_C:144381711:0,1,0,1
chr4	144381725	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=186,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144381711_T_C:144381711:0,1,0,1
chr4	144446554	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr4	144449208	.	A	ATTTACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:144449208_A_ATTTACC:144449208:0,3,0,1
chr4	144449210	.	G	GTGAGTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:144449208_A_ATTTACC:144449208:0,3,0,1
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	144801662	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:19,3:9,6:13,15,4,5
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=109,143;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:19,1:11,3:12,20,2,2
chr4	144801728	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=143,185;MMQ=56,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:2,10,0,2
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr4	144920579	.	GAT	G	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=22,0;MFRL=108,45;MMQ=60,55;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:21,0:19,0:0|1:144920579_GAT_G:144920579:22,20,1,1
chr4	144920588	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=121,45;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,2:12,0:0|1:144920579_GAT_G:144920579:17,16,1,1
chr4	144920594	.	C	CAT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=116,45;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,2:11,0:0|1:144920579_GAT_G:144920579:17,13,1,1
chr4	144920596	.	GTTTCTCCTATAAAGCAAAA	G,ATTTCTCCTATAAAGCAAAA	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=0,29,24;MFRL=0,45,116;MMQ=60,55,60;MPOS=14,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.98,79.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,28:0.081,0.890:30:0,2,16:0,0,12:0,0,17,13
chr4	144920621	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=119,45;MMQ=45,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:11,2:8,0:0|1:144920579_GAT_G:144920579:11,8,1,1
chr4	144920638	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,18,6
chr4	145039801	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=122,98;MMQ=40,55;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.177:25:16,4:4,0:13,8,1,3
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	145041577	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	145041750	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	145041814	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=150,105;MMQ=39,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,2:3,0:1,6,0,2
chr4	145061898	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=161,90;MMQ=48,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145061898_T_A:145061898:0,2,0,1
chr4	145061901	.	CT	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,90;MMQ=48,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145061898_T_A:145061898:0,2,0,1
chr4	145573954	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr4	145580744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr4	145659064	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr4	146030233	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,4:6,0:10,0,4,0
chr4	146031236	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.342:14:3,2:4,2:7,2,4,1
chr4	146031678	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,0;MMQ=60,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:10,2:7,1:0,17,0,3
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=120,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.150:32:15,3:12,1:0|1:146046123_AT_A:146046123:19,9,3,1
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.973:36:0,16:0,14:0|1:146046123_AT_A:146046123:0,0,24,12
chr4	146048554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr4	146076632	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.149:29:12,1:12,3:6,19,2,2
chr4	146080577	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,4,1
chr4	146085350	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,324;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:6,13,0,2
chr4	146086269	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:12,3:9,4:13,8,6,1
chr4	146435938	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:14,8:20,0:16,19,8,0
chr4	146461174	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=87,60;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.121:55:25,0:24,6:15,34,2,4
chr4	146475258	.	TTTG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0|1:146475258_TTTG_T:146475258:0,6,0,2
chr4	146475263	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:146475258_TTTG_T:146475258:0,6,0,2
chr4	146572140	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	146576418	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,7:3,9:2,4,8,8
chr4	146601349	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,21,2
chr4	146650499	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,193;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr4	146686364	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=127,98;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:146686364_G_A:146686364:1,2,0,1
chr4	146686368	.	A	ATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=164,98;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:1,0:2,1:0|1:146686364_G_A:146686364:1,3,0,1
chr4	146770389	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=231,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,3:3,0:1,7,1,2
chr4	147179847	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,151;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:7,5,3,0
chr4	147204333	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:11,8,3,0
chr4	147204408	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:15,2:0|1:147204408_C_T:147204408:14,16,1,1
chr4	147204418	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:147204408_C_T:147204408:11,15,1,1
chr4	147214029	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr4	147215153	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:11,4:19,0:15,15,2,2
chr4	147364021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=135,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:4,0:8,3:1,11,0,3
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr4	147431302	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr4	148463729	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.248:41:13,1:18,8:14,17,2,8
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=48,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr4	148545906	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=99,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:3,1,1,1
chr4	148575791	.	C	CTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148575791_C_CTGT:148575791:0,0,0,1
chr4	148575794	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148575791_C_CTGT:148575791:0,0,0,1
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr4	148604881	.	TTTC	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:7,2:9,1:9,7,3,0
chr4	148604886	.	G	GTA,A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,17,14;MFRL=0,139,107;MMQ=60,60,55;MPOS=-2147483648,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.36,14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.197,0.756:15:0,0,1:0,0,2:0,0,8,7
chr4	148744225	.	TT	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.708:19:4,6:0,5:3,2,9,5
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr4	148827697	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,4:1,0:3,0,5,0
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,4:0,0,10,6
chr4	148827804	.	GAC	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=105,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:9,0:0|1:148827804_GAC_G:148827804:14,11,0,2
chr4	148827810	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=105,108;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:148827804_GAC_G:148827804:12,10,0,2
chr4	148827973	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	148886159	.	A	AT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.119:41:20,3:16,1:20,17,2,2
chr4	148968104	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:12,7,1,1
chr4	148984246	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,126;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:9,1,2,0
chr4	148984321	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:1,5:2,14:1,2,8,11
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=115,258;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr4	148993291	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=158,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr4	149002585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:5,6,2,0
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=174,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr4	151161512	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:1,1,6,3
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:1,2,0,5
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	151198919	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,221;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,1:2,0:5,0,1,0
chr4	151231371	.	TG	CA,CG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,30;MFRL=0,127,175;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.75,24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.213,0.717:11:0,2,8:0,0,1:0,0,7,4
chr4	151242610	.	CAGGAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr4	151336831	.	T	TTCTTTGTTTTGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=279,332;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	151356708	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:6,2:7,2:9,5,1,3
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=69,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:0,6:1,5:0,4,0,13
chr4	151505856	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:4,4:0,9,0,4
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr4	151770575	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,5:11,0:15,7,5,0
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr4	151829852	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:10,0:0|1:151829852_G_A:151829852:7,9,1,1
chr4	151829854	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:0|1:151829852_G_A:151829852:6,9,1,1
chr4	151835502	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=19,31;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.358:21:3,2:2,3:3,11,2,5
chr4	151835581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	151850226	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.370:17:4,3:2,0:0|1:151850226_GA_G:151850226:2,9,0,6
chr4	151850241	.	CATTAAAAG	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=114,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.145:19:8,2:2,0:0|1:151850226_GA_G:151850226:1,16,0,2
chr4	151850250	.	CATTAGTATCCTCAATATCACTATA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:151850226_GA_G:151850226:0,14,0,2
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=93.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,19,3
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,5:1,2:1,0,6,2
chr4	152096494	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=71,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:8,0:8,8:8,8,0,8
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGGT;STR;TLOD=52.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,7:1,5:1,4,6,8
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	152203664	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr4	152550795	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=217,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr4	152583907	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=85,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.484:11:4,4:1,1:4,2,2,3
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,0:2,2:1,7,0,3
chr4	152601146	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=90,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	152609939	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=141,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:2,14,0,2
chr4	152610006	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	152610011	.	TCTGAGACAGCCA	T,ACTGAGACAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28,24;MFRL=0,117,172;MMQ=60,60,60;MPOS=9,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr4	152629128	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.257:32:18,7:6,0:15,9,8,0
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,2:12,1:18,2,3,0
chr4	153253888	.	T	TATCCAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:153253888_T_TATCCAA:153253888:1,10,1,1
chr4	153253890	.	G	GTTCTCCATCTCAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:153253888_T_TATCCAA:153253888:1,10,1,1
chr4	153268227	.	CA	C,CAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,25,24;MFRL=73,151,87;MMQ=60,60,60;MPOS=24,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.56,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,6:0.181,0.270:21:4,0,3:3,2,2:8,3,2,8
chr4	153549654	.	C	T	.	.	DP=156;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:142,10:0.070:152:66,0:71,9:113,29,10,0
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=13,24;MFRL=62,102;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.980:46:0,20:0,24:1,0,22,23
chr4	153549752	.	A	AAC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=124,153;MMQ=40,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.739:23:2,5:3,12:0,6,0,17
chr4	153564136	.	GTTC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr4	153564332	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.227:23:6,4:12,0:3,15,1,4
chr4	153565645	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,10:1,13:0,1,5,18
chr4	153574119	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:2,7:1,8:0,3,1,14
chr4	153750918	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:1,3,2,1
chr4	153802060	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:8,0,2,1
chr4	153802293	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:13,3:14,0:15,12,3,0
chr4	153804042	.	A	AGGGTCTCAAGGAAAATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1,8,1,1
chr4	153896765	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,9:1,8:1,0,11,6
chr4	154191710	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr4	154214357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr4	154237002	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:10,0:14,5:14,10,1,4
chr4	154256165	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:6,4:14,0:7,13,1,3
chr4	154276771	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,7:5,4:4,2,7,4
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,0:10,6:8,6,3,3
chr4	154502068	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=83.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,31:0.842:36:4,17:1,13:5,0,18,13
chr4	154505917	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,16,0
chr4	154512437	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr4	154514843	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154514843_C_T:154514843:1,0,1,0
chr4	154514851	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154514843_C_T:154514843:1,0,1,0
chr4	154514860	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=140,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,0,1
chr4	154514918	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:3,6:1,6:2,2,7,6
chr4	154519658	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=72,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:0,4:0|1:154519658_A_G:154519658:2,0,5,0
chr4	154519666	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:154519658_A_G:154519658:1,0,5,0
chr4	154519679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0|1:154519658_A_G:154519658:2,0,3,0
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.948:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr4	154544267	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=86,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:10,1,3,0
chr4	154624836	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:6,6,1,1
chr4	154627073	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:19,3:15,0:11,23,3,0
chr4	154627305	.	C	CTGTCTCGCTGTCTCTGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr4	154669945	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=62,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,38:0.756:50:8,17:3,20:7,5,22,16
chr4	154702535	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	155156207	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,6:1,6:2,1,5,7
chr4	155157932	.	G	GCCACCTCTGAGACAGCAAGACCAACCCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:3,5,1,1
chr4	155160483	.	T	TGAATTTAG	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0|1:155160483_T_TGAATTTAG:155160483:1,6,1,1
chr4	155160485	.	G	GTCTCATGGACTA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:155160483_T_TGAATTTAG:155160483:1,6,1,1
chr4	155160538	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:155160538_T_TG:155160538:0,2,0,1
chr4	155160540	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155160538_T_TG:155160538:0,2,0,1
chr4	155160552	.	T	TGTGATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:1,9:0,11:1,0,13,8
chr4	155180997	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=126,176;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:155180997_CA_TG:155180997:1,3,0,1
chr4	155181008	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=160,176;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:155180997_CA_TG:155180997:0,3,0,1
chr4	155219373	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,2:10,2:8,8,2,2
chr4	155219756	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:155219756_G_A:155219756:7,15,1,1
chr4	155219766	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:0|1:155219756_G_A:155219756:7,15,1,1
chr4	155219959	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A,AAAACAAACAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24,31;MFRL=147,116,56;MMQ=60,60,44;MPOS=10,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,9;RU=AAAC;STR;TLOD=7.13,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.335,0.401:5:0,0,1:1,2,0:1,0,3,1
chr4	155237240	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=238,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	155243573	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,4:2,8:1,2,8,4
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=71,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.709:25:5,11:1,7:4,3,11,7
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=105,95;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.797:21:2,8:1,9:2,2,6,11
chr4	155250915	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr4	155252683	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:8,5,2,1
chr4	155252934	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr4	155252960	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=184,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155252960_A_G:155252960:0,2,0,1
chr4	155252967	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=184,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:155252960_A_G:155252960:0,2,0,1
chr4	155253867	.	G	GGATGT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=114,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:155253867_G_GGATGT:155253867:4,3,1,1
chr4	155253871	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=163,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:155253867_G_GGATGT:155253867:4,5,1,1
chr4	155253874	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:155253867_G_GGATGT:155253867:4,5,1,1
chr4	155253876	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:155253867_G_GGATGT:155253867:4,5,1,1
chr4	155254513	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:8,4:12,0:11,9,0,4
chr4	155255992	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr4	155278271	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=151,17572001;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	155287317	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr4	155287535	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr4	155287551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:8,0:3,1:0|1:155287551_C_T:155287551:6,5,1,1
chr4	155287554	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:0|1:155287551_C_T:155287551:6,5,1,1
chr4	155295154	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.838:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=74,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,3,2
chr4	155407680	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=54,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,4:2,10:3,1,9,5
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=70,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:0|1:155410407_C_G:155410407:2,1,5,2
chr4	155410409	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.302:11:3,1:5,2:1|0:155410407_C_G:155410407:5,3,2,1
chr4	155410512	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:9,6,0,2
chr4	155410909	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:5,2:10,2:9,6,1,3
chr4	155411653	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr4	155458671	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr4	155461013	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=168,207;MMQ=60,56;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,6:1,0:4,0,6,0
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr4	155462148	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,3:0,4:1,1,8,0
chr4	155465583	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:16,4:16,0:21,11,2,2
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.819:20:1,8:2,9:2,1,15,2
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:2,0,7,4
chr4	155469959	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=86,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.446:14:3,5:2,0:4,4,5,1
chr4	155486470	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr4	155490649	.	TTTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:0,1:3,0,2,0
chr4	155491759	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.263:32:11,1:13,7:14,10,3,5
chr4	155505668	.	AAGCTTCATTCCCAGCCCAGT	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:5,2:0|1:155505668_AAGCTTCATTCCCAGCCCAGT_A:155505668:16,7,0,2
chr4	155505692	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:5,2:0|1:155505668_AAGCTTCATTCCCAGCCCAGT_A:155505668:12,8,0,2
chr4	155505697	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:4,2:0|1:155505668_AAGCTTCATTCCCAGCCCAGT_A:155505668:10,8,0,2
chr4	155505971	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:155505971_GG_TC:155505971:0,4,0,1
chr4	155505977	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:155505971_GG_TC:155505971:0,3,0,1
chr4	155506926	.	C	CACATACTGTATGCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=205,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:155506926_C_CACATACTGTATGCTTTA:155506926:1,1,1,1
chr4	155506930	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=205,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155506926_C_CACATACTGTATGCTTTA:155506926:1,1,0,1
chr4	155507236	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=102,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:11,0:13,9:14,10,0,9
chr4	155507253	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:155507253_C_T:155507253:7,10,1,1
chr4	155507257	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,1:0|1:155507253_C_T:155507253:7,10,1,1
chr4	155507479	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:9,2,1,1
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	155526026	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=95,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:155526026_T_A:155526026:6,9,1,1
chr4	155526033	.	GG	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=95,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:155526026_T_A:155526026:7,10,1,1
chr4	155530909	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=124,157;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:155530909_T_A:155530909:8,10,2,0
chr4	155530919	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=121,157;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:0|1:155530909_T_A:155530909:10,8,2,0
chr4	155670202	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=99,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:8,8,3,0
chr4	155719007	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:9,12,2,0
chr4	155720695	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0|1:155720695_C_A:155720695:2,5,1,1
chr4	155720696	.	AGT	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=124,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0|1:155720695_C_A:155720695:2,5,1,1
chr4	155720702	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:4,0:0|1:155720695_C_A:155720695:2,4,1,1
chr4	156135676	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr4	156136027	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,7,5
chr4	156136639	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,0:3,4:2,1,0,4
chr4	156136866	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,1:5,2:10,6,1,2
chr4	156273768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr4	156274218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr4	156276841	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	156281666	.	ACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	156283227	.	CTGG	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,2:16,0:14,11,1,1
chr4	156283302	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr4	156289631	.	AAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,2:9,0:15,5,1,1
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:3,3,0,3
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:13,3:5,4:9,10,6,1
chr4	156643183	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.677:29:4,13:5,7:7,2,9,11
chr4	156721016	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,3:16,6,3,0
chr4	156723537	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,3:6,0:12,6,2,1
chr4	156724848	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:2,2:0|1:156724848_A_T:156724848:6,4,1,1
chr4	156724851	.	TGCCACCTG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:156724848_A_T:156724848:7,5,1,1
chr4	156725681	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	156750983	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:5,7,2,0
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,4:0,4:1,0,7,2
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr4	156784970	.	CG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	156787214	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr4	156825225	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:5,3:12,0:8,10,2,1
chr4	156825270	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:7,8,1,1
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,17,5
chr4	156832715	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=179,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.783:15:2,4:0,8:1,2,4,8
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	156839462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.942:13:0,8:0,5:0|1:156847230_A_G:156847230:0,0,3,10
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0|1:156847230_A_G:156847230:0,0,3,11
chr4	157731944	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.382:29:9,10:9,0:11,7,11,0
chr4	157999090	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr4	158041896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	158043620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr4	158057605	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:0,2,4,2
chr4	158065038	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr4	158074016	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:5,0:9,4:7,7,4,0
chr4	158091588	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,1,1
chr4	158256938	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=88,24;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:18,2:5,0:16,8,1,1
chr4	158262448	.	G	GTGTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:12,0:12,17,0,2
chr4	159076679	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	159493938	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=96,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:5,9,1,1
chr4	159493959	.	C	CACTCCAGACT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=96,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:159493959_C_CACTCCAGACT:159493959:2,6,1,1
chr4	159493961	.	G	GCAACAGAGCGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=99,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:159493959_C_CACTCCAGACT:159493959:2,7,1,1
chr4	159514454	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	159514466	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	159538183	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=226,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr4	159538329	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=123,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,2:13,0:10,8,0,2
chr4	159548100	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr4	159567857	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr4	159590922	.	TA	T,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,25,18;MFRL=131,126,154;MMQ=60,60,60;MPOS=30,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.05,4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.160,0.266:13:4,2,1:1,1,0:1,6,0,6
chr4	159603463	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.143:25:10,2:12,0:9,13,2,1
chr4	159630817	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr4	159631991	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0,1,4,4
chr4	159640428	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=59,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:5,5:2,4:1,6,3,7
chr4	159642576	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=67.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.564:51:13,14:9,14:9,13,13,16
chr4	159644494	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=235,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:159644494_G_C:159644494:0,2,0,7
chr4	159644501	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=235,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:159644494_G_C:159644494:0,2,0,7
chr4	159756683	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,132;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:6,3:2,10,0,3
chr4	159780244	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,12:1,9:0,1,10,11
chr4	159881352	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:5,0,7,0
chr4	159894305	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr4	160189200	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr4	160251417	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TG;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	160253611	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,118;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:17,3:5,0:17,6,3,0
chr4	160264135	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=88,281;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:13,5:10,0:17,7,5,0
chr4	160264521	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:9,2:19,0:14,14,1,2
chr4	160264574	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,10;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:11,0:9,0:0|1:160264574_A_G:160264574:7,15,1,1
chr4	160264579	.	CACGTGTGAGAGTAGAGAAGGTTAAATTTAGAGCTTCCCAATAAATGATTTTTTTAAAGTTTGAGTATTTATATTTGTAGT	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=123,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:6,2:9,0:0|1:160264574_A_G:160264574:6,21,1,1
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.309:13:4,1:4,3:9,0,2,2
chr4	160274998	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.202:17:7,0:7,3:9,5,1,2
chr4	160279312	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=85,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,3:6,0:9,4,1,2
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr4	162577430	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	162680768	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	163032491	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:6,0:10,7:9,7,0,7
chr4	164050106	.	TGGTGGAGGGGGAGGGGGTGGGGGTAGGGAGTATGGTAAGTTAAGTAATGGATGAGCAGCCATGTTTGGTGTAGCCCAACCCATGTTTACAGGTGGGGGTGGTGGTGGG	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,20:0.111:76:14,18:3,1:42,14,11,9
chr4	164058512	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	164067105	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=137,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	164069619	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,0:15,2:0|1:164069619_T_C:164069619:1,17,1,1
chr4	164069621	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=149,102;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,7:0.364:20:3,0:10,7:1|0:164069619_T_C:164069619:2,11,0,7
chr4	164069623	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,0:15,2:0|1:164069619_T_C:164069619:1,17,1,1
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	164393117	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,16:0,4:0,0,12,8
chr4	164394976	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:11,2:7,14,1,2
chr4	164436399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr4	164440461	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32,31;MFRL=132,147,144;MMQ=60,60,60;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.18,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,3:0.267,0.179:20:1,4,2:8,2,1:7,4,8,1
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr4	164534405	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	165118066	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,205;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	165118129	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=106,102;MMQ=51,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,5:8,0:13,7,4,1
chr4	165118285	.	TTCC	T	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=85,130;MMQ=60,26;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.064:48:13,1:29,2:10,35,1,2
chr4	165961746	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,57;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.392:13:2,5:6,0:4,4,4,1
chr4	165981094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=49,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,6:0,4:1,2,3,7
chr4	165981233	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=103,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr4	166129015	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:6,2,0,2
chr4	166150086	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=135,82;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.153:42:21,4:15,2:14,22,2,4
chr4	166215636	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=86,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:15,0:8,6:13,12,0,6
chr4	166215662	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,34,33;MFRL=91,191,75;MMQ=60,60,60;MPOS=31,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.19,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,2:0.232,0.182:14:4,1,1:4,2,1:2,7,0,5
chr4	166231753	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.537:37:9,19:8,0:12,5,19,1
chr4	166231868	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=66,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.274:38:15,5:13,5:14,14,5,5
chr4	166243082	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr4	166262901	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:15,0:15,12,3,0
chr4	166321799	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=126,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,3:8,1:7,8,2,2
chr4	166408585	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,136;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr4	166976446	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	167012539	.	G	GCATGAAAAATCATAAAGATGGAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr4	167020606	.	GCTAT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=90,155;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.230:21:5,4:10,0:0|1:167020606_GCTAT_G:167020606:12,4,1,4
chr4	167020612	.	ACTATGTGGAGCTCTTTGATGGTCTTGATTCAACAGCTGTGGGG	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=94,155;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:6,4:8,0:0|1:167020606_GCTAT_G:167020606:22,15,0,4
chr4	167656116	.	CTTCATCTTCATCATCATCTTCAAT	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=98,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.079:49:11,2:20,1:22,24,2,1
chr4	167656176	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:17,0:22,4:21,19,0,4
chr4	167658778	.	TA	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	168155343	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:168155343_C_A:168155343:0,2,0,1
chr4	168155344	.	G	GAATATCATTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:168155343_C_A:168155343:0,2,0,1
chr4	169049241	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=114,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:21,4:17,0:13,25,2,2
chr4	169083855	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:169083855_A_G:169083855:0,3,0,1
chr4	169083867	.	A	ATAGGGAATTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:169083855_A_G:169083855:0,2,0,1
chr4	169138098	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:6,2:0,0:0|1:169138098_A_G:169138098:4,3,1,1
chr4	169138099	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:5,2:1,0:0|1:169138098_A_G:169138098:4,4,1,1
chr4	169138105	.	CCA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:169138098_A_G:169138098:3,4,1,1
chr4	169138108	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:169138098_A_G:169138098:3,4,1,1
chr4	169227472	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=233,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr4	169282404	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=104,127;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:4,0:12,7:5,11,0,7
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,13,9
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr4	169312800	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.445:9:2,1:1,3:0|1:169312800_GA_G:169312800:1,4,0,4
chr4	169312801	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=74,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.829:7:1,1:0,1:1,0,0,6
chr4	169312802	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.445:9:4,0:1,1:0|1:169312800_GA_G:169312800:1,4,0,4
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr4	169315760	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0|1:169315760_C_A:169315760:0,0,5,9
chr4	169315763	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:0|1:169315760_C_A:169315760:3,6,2,2
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.965:27:0,9:0,13:0|1:169317279_C_T:169317279:0,0,8,19
chr4	169317284	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.550:14:0,3:6,4:0|1:169317279_C_T:169317279:0,6,1,7
chr4	169340639	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	169341435	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=150.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,22:0,27:0,0,27,23
chr4	169341608	.	TACACATACACACACACACACAC	T,TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25,28;MFRL=0,188,171;MMQ=60,50,40;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.05,11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.340,0.576:6:0,2,1:0,0,3:0,0,0,6
chr4	169369820	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr4	169369853	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,16,16
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	169382822	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=120,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr4	169393179	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	169393972	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	169432777	.	A	ACTCTGTGCACATACATTTGAAAACTTACAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.172:23:7,0:9,3:12,8,2,1
chr4	169433326	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:5,1:6,3:0|1:169433326_TG_CA:169433326:6,6,3,1
chr4	169433333	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,1:5,3:0|1:169433326_TG_CA:169433326:6,5,3,1
chr4	169612461	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:10,3:6,1:6,11,0,4
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=97,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:9,2:4,5:10,3,6,2
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.244:35:12,5:14,3:10,17,3,5
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:6,3:10,5:10,10,3,6
chr4	169923221	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:19,0:27,4:32,14,4,0
chr4	169927825	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=143,4216808;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:9,3:12,2:0|1:169931268_G_A:169931268:9,12,3,3
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.251:22:5,1:10,4:0|1:169931268_G_A:169931268:4,13,2,3
chr4	169931326	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,1:2,1:0,10,0,2
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:7,5:7,3:3,11,1,7
chr4	170017878	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:7,2:0|1:170017878_A_AT:170017878:1,16,1,1
chr4	170017880	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:170017878_A_AT:170017878:1,16,1,1
chr4	170038575	.	AA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=90,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,10:0,3:2,0,13,0
chr4	170043323	.	CCAG	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAG;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:9,0:27,3:17,21,2,1
chr4	170077459	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:1,2:1,5:3,0,7,0
chr4	170077540	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:3,7:1,15:4,0,11,11
chr4	170077930	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=311,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	170321281	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	170428345	.	T	TGAATGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	170429025	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=176,169;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:170429025_T_G:170429025:0,1,0,1
chr4	170429027	.	A	AATGCTCATCATCACTGGCCATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=176,169;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:170429025_T_G:170429025:0,1,0,1
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	170506717	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:1,12,0,2
chr4	170510679	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,34,20,20;MFRL=168,147,83,66;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,24,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.59,4.66,7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,2,3,5:0.120,0.155,0.251:19:6,0,3,0:3,2,0,3:0,9,3,7
chr4	170510702	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=147,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:0|1:170510702_T_C:170510702:0,14,0,2
chr4	170510706	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=161,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:0|1:170510702_T_C:170510702:0,12,0,2
chr4	170601172	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,20:0,3:0,0,16,7
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	170658964	.	T	TTGGAAAAGAATATGTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	170674764	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.461:17:4,6:5,0:9,0,8,0
chr4	170912913	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:170912913_G_T:170912913:7,12,1,1
chr4	170912922	.	C	CTTTCTTCCCTTTGCTCTTTCAAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:0|1:170912913_G_T:170912913:8,12,1,1
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=94,159;MMQ=27,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.537:42:17,16:2,5:0,19,6,17
chr4	173232949	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=115,186;MMQ=60,26;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:30,6:10,2:7,34,0,8
chr4	173269638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=57,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	173803914	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=38,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:0,4:2,3:1,1,5,2
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr4	174169338	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=120,91;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:8,9,0,2
chr4	174216642	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:25,1:18,3:17,27,1,3
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	174537221	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=84,147;MMQ=51,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:2,10,5,0
chr4	174537888	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,129;MMQ=52,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:1,4,4,5
chr4	175184065	.	C	CAT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:11,2:13,0:0|1:175184065_C_CAT:175184065:12,13,1,1
chr4	175184069	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:0|1:175184065_C_CAT:175184065:14,13,1,1
chr4	175184075	.	AAA	TTT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,1:14,0:0|1:175184065_C_CAT:175184065:16,14,1,1
chr4	175231263	.	TGATTGTTATATGTGTA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=218,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:3,2:0,6,0,3
chr4	175414246	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175443424	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	175598536	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,140;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:175598536_G_A:175598536:0,2,0,2
chr4	175598541	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=183,140;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:175598536_G_A:175598536:0,2,0,2
chr4	175604103	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:8,0:0|1:175604103_T_A:175604103:1,13,0,2
chr4	175604106	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:175604103_T_A:175604103:1,13,0,2
chr4	175604110	.	A	ACACAGG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:0|1:175604103_T_A:175604103:1,12,0,2
chr4	175604113	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:3,0:0|1:175604103_T_A:175604103:1,12,0,2
chr4	175688097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=100,43;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,0:7,4:11,2,4,0
chr4	175688274	.	TACAC	T,TACACACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28,28;MFRL=0,218,166;MMQ=60,60,47;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,18;RU=AC;STR;TLOD=3.71,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.430,0.396:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr4	175897448	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,161;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:11,2:4,0:8,8,2,0
chr4	176556040	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:3,6:11,0:10,5,6,0
chr4	176733450	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,3,2
chr4	176733452	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,3,2
chr4	177049906	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=106,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:15,7:12,1:14,13,2,6
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,5:0,1:1,0,7,0
chr4	177083333	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:4,9:2,6:1,5,1,14
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,2:6,3:8,3,4,1
chr4	177095908	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:2,8,1,2
chr4	177098383	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,183;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0,0,15,1
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,9:2,4:4,0,11,2
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	177116779	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=220,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	177142488	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,5,14
chr4	177142776	.	CA	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	177143417	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr4	177648989	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr4	178231152	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:7,13:6,10:4,9,13,10
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	178260872	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=72,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	178262613	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr4	178262784	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,4:5,11:5,5,3,12
chr4	178262805	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:4,3,0,7
chr4	178262811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:0,8,1,3
chr4	178262834	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr4	178274377	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr4	178274750	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,13:0,18:0,0,19,13
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:178353046_G_C:178353046:0,0,0,6
chr4	178353059	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:178353046_G_C:178353046:0,4,0,1
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,2,8
chr4	178357489	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:1,0:1,6,1,1
chr4	178357566	.	A	ATAATTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATTG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	178360928	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	178361414	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,16,6
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.894:17:0,10:1,5:1,0,14,2
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr4	183267728	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.835:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=327,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,3:1,1:1,0,5,0
chr4	183549738	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr4	183600752	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr4	183601563	.	T	TAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=205,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183601563_T_TAGG:183601563:1,1,0,1
chr4	183601564	.	C	CAGAACAGAGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=205,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183601563_T_TAGG:183601563:1,1,0,1
chr4	183601590	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=249,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0,2,2,0
chr4	183609358	.	TGGGGGGGACGTGTCGCTGTGAAGAAGGCTGGACGGGCCCAGCCTGTAATCAGAGAGCCTGCCACCCCCGCTGTGCCGAGCAC	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.061:50:12,4:4,0:20,26,3,1
chr4	183659722	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	183664593	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr4	183673226	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:2,2:3,5:0|1:183673226_T_TA:183673226:1,8,3,6
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,7:0,8:0|1:183673226_T_TA:183673226:0,0,4,14
chr4	183676316	.	C	CCAAGAGGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183676316_C_CCAAGAGGAA:183676316:0,0,0,1
chr4	183676318	.	G	GAACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183676316_C_CCAAGAGGAA:183676316:0,0,0,1
chr4	183676320	.	T	TATGTCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183676316_C_CCAAGAGGAA:183676316:0,0,0,1
chr4	183814344	.	G	GAAGTAAAATTGCTTTGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=187,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:1,2,4,4
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,10,2
chr4	184186197	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=81,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:16,2:20,2:18,18,0,4
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,3:0,3,1,7
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,8:2,10:2,3,14,4
chr4	184192183	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,4:2,0:2,0,4,0
chr4	184201909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:4,1,5,1
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	184204099	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	184210867	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,4:1,0:0,1,1,4
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,1:2,4:3,0,8,0
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:1,7:1,11:1,2,11,7
chr4	184426387	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=86,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:3,10:2,8:3,2,15,4
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,7,13
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=93,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.201:28:9,3:9,2:11,12,4,1
chr4	184572341	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.885:24:1,12:0,9:0,2,13,9
chr4	184585267	.	CTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=215,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	184619035	.	CGTGT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=GT;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.527:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	184626078	.	TAGTTTAAAAAGATGTTTAAAAAG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=70,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.095:30:5,2:4,0:21,7,1,1
chr4	184922669	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr4	184930289	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,0:5,0:6,3,0,2
chr4	184930307	.	TCA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=84,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:8,2:7,1:3,16,3,0
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	184938431	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:11,13,1,1
chr4	185074686	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=225,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr4	185552345	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=91,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:0,1:7,3:4,4,0,4
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,11:0,15:0,0,7,19
chr4	185553353	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=112,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr4	185556618	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:0,10,0,8
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,7,8
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr4	185599572	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,38:0.737:51:7,14:6,24:4,9,17,21
chr4	185603503	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=72,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:20,0:10,2:0|1:185603503_A_T:185603503:17,13,1,1
chr4	185603509	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=85,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:9,2:0|1:185603503_A_T:185603503:16,11,1,1
chr4	185603514	.	T	TTA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:185603503_A_T:185603503:15,9,1,1
chr4	185603515	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:9,2:0|1:185603503_A_T:185603503:15,9,1,1
chr4	185612627	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31,29;MFRL=97,127,135;MMQ=60,60,60;MPOS=5,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.68,16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,10:0.224,0.492:21:3,4,4:1,1,6:5,1,15,0
chr4	185616497	.	TCGGCTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:7,2:13,12,1,1
chr4	185619013	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:185619013_T_TAC:185619013:0,1,0,1
chr4	185619015	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:185619013_T_TAC:185619013:0,1,0,1
chr4	185619016	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:185619013_T_TAC:185619013:0,1,0,1
chr4	185619021	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:185619013_T_TAC:185619013:0,1,0,1
chr4	185622046	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:2,5:4,14:2,4,8,11
chr4	185631288	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:15,2:14,2:21,8,2,2
chr4	185631338	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=86,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:2,11,1,1
chr4	185637523	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:5,1,2,0
chr4	185650154	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,9:0.172:56:20,3:27,6:16,31,6,3
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,2:2,3:0,3,0,6
chr4	185652224	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr4	185655192	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,3:9,2:2,18,2,3
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr4	185684247	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr4	185686948	.	AAC	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,1:4,1:9,2,2,0
chr4	185686983	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:185686983_G_A:185686983:17,6,2,0
chr4	185686989	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,2:12,0:0|1:185686983_G_A:185686983:16,8,2,0
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr4	185694776	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=95,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.325:26:9,6:7,2:11,7,6,2
chr4	185694877	.	TAA	T,TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=21,25,22;MFRL=112,113,127;MMQ=60,60,60;MPOS=8,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.84,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,5:0.172,0.204:25:7,3,3:5,1,2:8,8,4,5
chr4	185940260	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,4:8,1:11,10,0,5
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=254,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	185940952	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:6,9:1,7:4,3,5,11
chr4	186085087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=159,169;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr4	186097170	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:18,4:8,0:16,10,4,0
chr4	186097219	.	C	CA,CAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32,23;MFRL=138,156,111;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=11.97,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,4:0.419,0.313:12:3,1,1:0,2,2:0,3,1,8
chr4	186168382	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,2:4,1:14,0,3,0
chr4	186185526	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,0:6,3:8,0,3,0
chr4	186209273	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=85,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:0,3:5,6:1,4,4,6
chr4	186245033	.	CC	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186245033_CC_AG:186245033:0,0,0,1
chr4	186245037	.	ATTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186245033_CC_AG:186245033:0,0,0,1
chr4	186272773	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	186288457	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.768:5:0,1:1,1:0,1,0,4
chr4	186291747	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=86,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:4,1,5,1
chr4	186294198	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=90,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,9:1,6:0,2,7,8
chr4	186296670	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	186299260	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:2,8:1,9:2,1,11,7
chr4	186320079	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:10,4:9,2:11,9,4,2
chr4	186336791	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=95,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	186346870	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr4	186366101	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,2:9,1:8,7,3,0
chr4	186366181	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=69,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:4,8:12,4:9,7,8,4
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:2,3,0,3
chr4	186370676	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,21,24,24;MFRL=157,105,148,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=5,27,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.71,4.61,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,4,3,3:0.177,0.170,0.175:20:3,2,0,1:7,2,3,2:8,2,9,1
chr4	186379371	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr4	186379899	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.800:28:1,13:4,10:2,3,13,10
chr4	186380243	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:4,4:4,3:4,4,3,4
chr4	186380515	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,5:3,6:4,5,3,8
chr4	186392915	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	186392941	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=233,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	186435884	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,4:8,0:10,8,0,4
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	186508958	.	G	GAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr4	186539779	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:9,8,1,2
chr4	186541394	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr4	186545210	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,200;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,3:18,0:15,17,3,0
chr4	186545719	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	186570855	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:9,2:10,3:4,15,1,5
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	186583240	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=85,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:10,7,0,4
chr4	186598511	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.087:43:18,3:22,0:20,20,1,2
chr4	186611576	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	186998271	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr4	186998289	.	AAGGAAATAAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr4	186998307	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	187003378	.	CAAAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=27,15;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	187004074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:7,5,0,2
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,1:0,0,3,7
chr4	187005865	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=76,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=67.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.817:30:5,12:0,13:2,3,13,12
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	187077206	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,15,12
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=247,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:1,3,0,5
chr4	187083964	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=115,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.705:6:1,1:0,3:1,1,3,1
chr4	187083989	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=94,549;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:5,0:5,0:0|1:187083989_C_G:187083989:1,10,2,0
chr4	187083991	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=94,549;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:5,0:5,0:0|1:187083989_C_G:187083989:1,10,2,0
chr4	187084869	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:187084869_G_A:187084869:0,0,0,1
chr4	187084872	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:187084869_G_A:187084869:0,0,0,1
chr4	187088054	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr4	187088206	.	ACCCTGGAACGGTTGTCAAGG	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:13,2:17,0:14,22,1,1
chr4	187092960	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	187093006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:0|1:187093006_C_T:187093006:3,2,1,1
chr4	187093010	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:187093006_C_T:187093006:3,3,1,1
chr4	187093018	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=73,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:1,1,2,3
chr4	187126379	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=131,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:187126379_T_A:187126379:12,7,1,1
chr4	187126386	.	GTCC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:8,2:0|1:187126379_T_A:187126379:17,9,1,1
chr4	187153508	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr4	187171480	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:10,9:15,0:11,14,1,8
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	187205348	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:1,9,1,1
chr4	187209073	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=176,160;MMQ=60,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:14,0:3,3:0,17,0,3
chr4	187454951	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:7,0:4,11,2,1
chr4	187455490	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=127,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:12,2:13,1:13,12,2,1
chr4	187509685	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr4	187516789	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,3:1,8:3,0,9,2
chr4	187517022	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,356;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	187518871	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=58,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,60:0.849:70:4,29:6,31:8,2,36,24
chr4	187518980	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,11:0,0,7,16
chr4	187523961	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr4	187532981	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,46110143;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.271:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr4	187534542	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr4	187535550	.	A	ACCAGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	187539839	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:17,4:8,0:14,11,3,1
chr4	187540860	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:187540860_C_T:187540860:8,10,1,1
chr4	187540870	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:187540860_C_T:187540860:8,11,1,1
chr4	187557347	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:7,2:13,0:0|1:187557347_T_G:187557347:12,15,1,1
chr4	187557351	.	T	TGGGGCA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.098:29:10,2:15,0:0|1:187557347_T_G:187557347:12,15,1,1
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	187629497	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,5,11
chr4	187629770	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr4	187630619	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,0:16,2:17,15,0,2
chr4	189012728	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:3,8:1,6:2,2,7,8
chr4	189013006	.	C	CGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=79,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:3,6,1,1
chr4	189063361	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=0,123,108;MMQ=35,60,60;MPOS=26,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,19;RU=GT;STR;TLOD=6.25,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.201,0.544:6:0,2,3:1,0,0:1,0,5,0
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0|1:189065104_T_G:189065104:5,1,2,3
chr4	189065128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0|1:189065104_T_G:189065104:7,0,2,2
chr4	189067987	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:5,0:12,3,1,2
chr4	190862083	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.630:33:3,10:9,11:11,1,15,6
chr4	190862155	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=14;MBQ=20,30;MFRL=93,96;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,42:0.694:60:6,18:12,24:7,11,17,25
chr4	190862182	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=14;MBQ=27,21;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,37:0.717:51:4,16:10,21:5,9,19,18
chr4	190862285	.	CG	C	.	.	DP=38;ECNT=14;MBQ=25,33;MFRL=127,146;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:13,4:14,4:0|1:190862285_CG_C:190862285:9,19,1,7
chr4	190862287	.	C	T,CTCG	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=30,25,33;MFRL=104,135,146;MMQ=60,60,42;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=48.23,27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,19,8:0.535,0.225:35:3,10,4:4,9,4:1,7,8,19
chr4	190862288	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=14;MBQ=24,30;MFRL=135,163;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,1:17,0:0|1:190862288_A_G:190862288:9,26,0,3
chr4	190862289	.	AC	A	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=24,26;MFRL=131,146;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:15,3:13,4:0|1:190862285_CG_C:190862285:8,22,1,7
chr4	190862290	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=30,20;MFRL=127,163;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.115:32:13,2:14,1:0|1:190862288_A_G:190862288:8,21,0,3
chr4	190862302	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=138,136;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:15,1:17,1:0|1:190862288_A_G:190862288:4,29,0,4
chr4	190862307	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=30,26;MFRL=140,136;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:17,3:16,1:0|1:190862288_A_G:190862288:4,29,0,4
chr4	190862318	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=25,27;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,7:0.174:44:19,3:16,3:0|1:190862288_A_G:190862288:4,33,0,7
chr4	190862319	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=31,26;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:21,1:17,1:0|1:190862319_G_A:190862319:3,36,0,2
chr4	190862330	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=31,23;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:17,4:13,3:0|1:190862288_A_G:190862288:2,28,0,7
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=28,28;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.337:33:11,9:11,1:0,22,1,10
chr4	190862342	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=30,23;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:18,2:12,1:0|1:190862319_G_A:190862319:1,29,0,3
chr4	190864371	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,60;MMQ=60,32;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.148:55:18,3:27,4:23,24,6,2
chr4	190873254	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=214,116;MMQ=25,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:3,4:1,2:14,1,4,2
chr4	190873293	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=133,189;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:15,0:29,2:31,14,2,0
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=11;MBQ=30,25;MFRL=124,135;MMQ=48,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,29:0.370:79:26,15:23,11:35,15,14,15
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=120;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=117,138;MMQ=49,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,19:0.166:117:55,10:41,9:65,33,11,8
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=148;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=116,130;MMQ=49,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,19:0.133:148:61,9:58,10:0|1:190874199_T_A:190874199:79,50,15,4
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=158;ECNT=11;MBQ=22,28;MFRL=114,124;MMQ=49,43;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:135,21:0.133:156:68,10:63,10:0|1:190874199_T_A:190874199:79,56,17,4
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=175;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=107,99;MMQ=49,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,17:0.096:170:80,9:67,8:77,76,3,14
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=172;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=95,114;MMQ=50,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:138,26:0.160:164:66,16:69,10:57,81,12,14
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=110;ECNT=11;MBQ=23,24;MFRL=110,140;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,21:0.215:100:42,12:35,9:30,49,5,16
chr4	190874315	.	TA	GT	.	.	DP=76;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=141,123;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,23:0.304:73:20,19:28,4:13,37,4,19
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=132,132;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:14,3:14,1:0|1:190874352_G_C:190874352:5,24,0,4
chr4	190874370	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=154,130;MMQ=60,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,2:7,5:5,9,0,8
chr4	190874381	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=26,24;MFRL=136,134;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:0|1:190874352_G_C:190874352:4,9,0,2
chr4	190876195	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=31,24;MFRL=91,121;MMQ=52,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,10:1,4:3,1,11,3
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=137;ECNT=12;MBQ=30,20;MFRL=120,94;MMQ=60,32;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=257.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,98:0.750:130:15,47:17,51:19,13,62,36
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=166;ECNT=12;MBQ=20,20;MFRL=92,99;MMQ=43,42;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:151,15:0.095:166:79,5:66,10:0|1:190876256_C_T:190876256:88,63,7,8
chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=144;ECNT=12;MBQ=20,20;MFRL=97,99;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,15:0.109:144:71,6:57,9:0|1:190876256_C_T:190876256:66,63,6,9
chr4	190876293	.	C	A	.	.	DP=112;ECNT=12;MBQ=30,22;MFRL=98,86;MMQ=40,36;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,9:0.089:110:54,2:41,6:0|1:190876256_C_T:190876256:40,61,2,7
chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=93;ECNT=12;MBQ=31,22;MFRL=116,98;MMQ=40,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,7:0.086:91:46,2:28,5:0|1:190876301_C_A:190876301:27,57,1,6
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=23,28;MFRL=121,98;MMQ=40,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,7:0.094:83:43,2:27,5:0|1:190876301_C_A:190876301:24,52,1,6
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=25,28;MFRL=151,123;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.519:52:12,19:13,6:6,19,1,26
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=151,190;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:23,2:14,1:0|1:190876335_T_C:190876335:5,32,2,1
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=155,173;MMQ=40,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,2:11,0:0|1:190876335_T_C:190876335:4,26,1,1
chr4	190876349	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=161,151;MMQ=40,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:11,9:6,4:4,14,0,13
chr4	190876359	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=171,154;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,11:3,5:1,8,0,16
chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=23,26;MFRL=126,133;MMQ=43,38;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:17,1:23,3:32,10,2,2
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=12;MBQ=22,31;MFRL=114,171;MMQ=43,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.297:52:11,8:21,7:26,11,11,4
chr4	190878472	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=12;MBQ=24,29;MFRL=157,130;MMQ=43,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:23,3:30,5:35,18,6,2
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=12;MBQ=30,28;MFRL=106,187;MMQ=44,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,16:0.333:49:14,8:19,8:18,15,11,5
chr4	190878494	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=30,20;MFRL=167,77;MMQ=43,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.134:49:21,2:21,4:27,16,2,4
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=158,170;MMQ=41,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.157:36:14,2:15,3:0|1:190878504_C_T:190878504:16,15,3,2
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=162,171;MMQ=59,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.573:33:7,6:6,11:7,7,12,7
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=167,170;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:11,2:11,2:0|1:190878504_C_T:190878504:13,10,3,2
chr4	190878538	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=25,23;MFRL=118,173;MMQ=52,39;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.555:18:5,5:3,3:4,4,4,6
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=161,151;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:23,2:13,3:23,13,4,1
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=25,35;MFRL=155,159;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.245:55:22,8:19,5:28,14,12,1
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=143,155;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,27:0.378:72:23,16:22,11:36,9,19,8
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=175;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=112,98;MMQ=40,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,44:0.256:173:55,23:68,21:57,72,21,23
chr4	190878658	.	G	A	.	.	DP=180;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=113,78;MMQ=40,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:164,15:0.086:179:73,7:86,8:65,99,8,7
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=183;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=105,146;MMQ=42,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:136,44:0.246:180:66,18:69,26:56,80,14,30
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=185;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=117,89;MMQ=40,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=120.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,50:0.281:179:60,24:68,26:50,79,19,31
chr4	190878742	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=144,186;MMQ=46,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:2,5,0,7
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=158,149;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:11,1,9,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=112,101;MMQ=27,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.391:49:22,7:8,11:15,15,7,12
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=108,122;MMQ=50,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=95.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,26:0.386:68:27,13:15,12:0|1:190881992_T_C:190881992:21,21,8,18
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=108,123;MMQ=50,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=97.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,27:0.394:69:26,15:15,12:0|1:190881992_T_C:190881992:20,22,8,19
chr4	190882097	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:2,8,0,3
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=27,25;MFRL=152,143;MMQ=42,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,7:0.135:57:25,3:21,3:0|1:190882911_A_T:190882911:30,20,4,3
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=149,143;MMQ=40,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,7:0.137:56:27,3:21,4:0|1:190882911_A_T:190882911:29,20,4,3
chr4	190882925	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=16;MBQ=23,33;MFRL=145,155;MMQ=40,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.065:58:29,2:25,1:34,21,3,0
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=30,24;MFRL=136,145;MMQ=42,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.090:63:30,3:27,2:38,20,4,1
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=16;MBQ=23,30;MFRL=134,155;MMQ=49,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,6:0.093:73:36,2:30,4:40,27,6,0
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=21,32;MFRL=96,123;MMQ=52,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.142:54:22,4:20,3:0|1:190882973_A_G:190882973:24,23,3,4
chr4	190882998	.	A	G	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=22,20;MFRL=101,83;MMQ=52,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,12:0.147:83:36,6:33,5:0|1:190882973_A_G:190882973:30,41,6,6
chr4	190883001	.	C	G	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=30,20;MFRL=109,82;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,21:0.251:84:37,9:26,11:28,35,9,12
chr4	190883007	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=20,20;MFRL=97,80;MMQ=51,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.063:88:41,3:37,2:33,50,2,3
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=94;ECNT=16;MBQ=21,25;MFRL=97,129;MMQ=49,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,5:0.062:92:43,4:42,1:36,51,1,4
chr4	190883039	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=16;MBQ=21,20;MFRL=105,97;MMQ=51,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,14:0.160:91:41,7:35,7:34,43,5,9
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=28,24;MFRL=128,91;MMQ=60,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,28:0.446:63:22,13:13,14:20,15,3,25
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=16;MBQ=26,31;MFRL=117,143;MMQ=52,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,4:0.096:50:22,0:22,4:0|1:190883075_C_T:190883075:22,24,0,4
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=44;ECNT=16;MBQ=30,24;MFRL=117,143;MMQ=52,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:18,0:21,2:0|1:190883075_C_T:190883075:22,20,0,2
chr4	190883085	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=30,26;MFRL=117,143;MMQ=51,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:16,0:21,2:0|1:190883075_C_T:190883075:20,19,0,2
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=26,20;MFRL=117,81;MMQ=52,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.233:32:10,6:15,1:11,14,3,4
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,165;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,1:3,1:3,9,0,2
chr4	190884225	.	T	TTTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,120;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:1,6:0,3:1,0,7,3
chr4	190903688	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.750:18:3,11:1,3:0|1:190903688_C_T:190903688:2,2,9,5
chr4	190903695	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=80,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,2:3,0:0|1:190903688_C_T:190903688:7,5,1,1
chr4	190903938	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=76,100;MMQ=50,40;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:4,5,0,3
chr4	190904030	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=100,225;MMQ=25,31;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr4	190904290	.	A	AGGAGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=84,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,2:1,0:0|1:190904290_A_AGGAGGT:190904290:0,1,1,1
chr4	190904293	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=84,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,2:1,0:0|1:190904290_A_AGGAGGT:190904290:0,1,1,1
chr4	190905595	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=186,152;MMQ=25,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr4	190905976	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=131,87;MMQ=55,50;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:7,3,2,0
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=209,84;MMQ=60,49;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,6:0,5:2,1,5,6
chr4	190906052	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=228,88;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr4	190906080	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=190,135;MMQ=56,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr5	163260	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,8,6
chr5	163266	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.346:14:5,5:4,0:6,3,1,4
chr5	169361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=313,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	171569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	173200	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:2,4,1,5
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,0:6,7:5,3,6,1
chr5	182420	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	205360	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:1,6:4,5:4,1,7,4
chr5	224418	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,127;MMQ=53,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,2,2
chr5	224692	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,213;MMQ=45,38;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=221,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:225768_G_C:225768:1,2,0,2
chr5	225774	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=241,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1|0:225768_G_C:225768:0,2,0,2
chr5	226222	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,152;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr5	228221	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=210,89;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,2,1
chr5	228278	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=170,181;MMQ=56,43;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.525:13:2,6:4,1:4,2,6,1
chr5	228362	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=120,154;MMQ=60,55;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:3,3,3,5
chr5	228375	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:7,13,1,1
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,18,14
chr5	231082	.	C	CTAA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=118,132;MMQ=41,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,2:19,0:13,18,0,2
chr5	231111	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=126,117;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.815:19:3,3:0,13:2,1,4,12
chr5	231143	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=114,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.806:22:2,2:1,16:0,4,1,17
chr5	233572	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=79,176;MMQ=59,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=63.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,20:0.657:30:9,20:1,0:0|1:233572_A_G:233572:7,3,18,2
chr5	233576	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=176,73;MMQ=59,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,3:0.121:31:27,3:1,0:1|0:233572_A_G:233572:23,5,3,0
chr5	235548	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:0,1:5,5:1,4,0,7
chr5	236753	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=115,149;MMQ=52,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,3:0|1:236753_C_T:236753:2,0,0,5
chr5	236760	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=115,154;MMQ=52,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0|1:236753_C_T:236753:2,0,0,6
chr5	251419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=223,197;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr5	251469	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=199,155;MMQ=40,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:6,2,5,0
chr5	251541	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=90,157;MMQ=60,59;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:8,10:8,2:8,8,8,4
chr5	251676	.	C	CTCTTTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=169,202;MMQ=50,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:251676_C_CTCTTTCTTT:251676:0,3,0,1
chr5	251677	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=169,202;MMQ=50,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:251676_C_CTCTTTCTTT:251676:0,3,0,1
chr5	251680	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=169,173;MMQ=50,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0|1:251676_C_CTCTTTCTTT:251676:0,3,0,2
chr5	254431	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=137,141;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	254456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=113,141;MMQ=24,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr5	256434	.	ACT	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=143,105;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,1:6,2:10,4,4,0
chr5	256472	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,102;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.611:34:8,9:5,12:6,7,12,9
chr5	256509	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=95,91;MMQ=60,55;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.449:40:13,8:9,9:8,14,8,10
chr5	256514	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=91,123;MMQ=57,43;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.099:40:18,2:17,1:16,20,0,4
chr5	271857	.	CCCGGCCCTGGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr5	306681	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:12,7,3,0
chr5	311478	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=93,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,4:4,3:7,5,4,3
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=91,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1,4,2,3
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:5,4:0,0:5,1,4,0
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,4:8,2:1,11,2,4
chr5	413621	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0,10,1,2
chr5	422752	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	422907	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,3:3,0:5,1,2,1
chr5	423940	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr5	427842	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:4,3,0,5
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:4,3:1,2:1,4,2,3
chr5	432897	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=77,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.454:22:3,5:8,4:3,9,5,5
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=119,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.528:24:7,2:4,8:6,5,3,10
chr5	434086	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:5,0:10,5,0,2
chr5	434700	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr5	434724	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:0,0:0,1,0,3
chr5	442571	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0|1:442571_A_C:442571:1,0,2,2
chr5	442586	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.428:5:2,0:0,2:1|0:442571_A_C:442571:1,2,2,0
chr5	443236	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	456915	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr5	457176	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,1:1,2:0,8,0,3
chr5	457955	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	462465	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,2:1,6:1,4,3,5
chr5	465164	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	481853	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:481853_T_C:481853:0,3,0,1
chr5	481858	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:481853_T_C:481853:0,3,0,1
chr5	481865	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:481853_T_C:481853:0,3,0,1
chr5	482237	.	C	CGCCTGTCGTGAGGACCTGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:8,4,1,1
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=131.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.953:40:1,31:0,8:0,1,32,7
chr5	483564	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.637:25:1,10:7,6:4,5,8,8
chr5	483637	.	C	CAATCTACTAGCCCACATGACGCAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=171,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:0,1:4,1:0,4,1,1
chr5	483675	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr5	485259	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:1,5:6,6:6,1,6,5
chr5	488683	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=233,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=199,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	639381	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:12,0:4,3:0|1:639381_C_T:639381:1,15,0,3
chr5	639388	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:11,0:4,3:0|1:639381_C_T:639381:1,15,0,3
chr5	639390	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,0:4,2:0|1:639381_C_T:639381:1,14,0,3
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	801206	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,69;MMQ=52,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:11,0:3,3:7,7,1,2
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,176;MMQ=40,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	843702	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=119,137;MMQ=27,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:12,4:10,2:12,10,5,2
chr5	843723	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=119,161;MMQ=27,39;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:16,4:11,3:11,16,3,5
chr5	870740	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	878460	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=131,191;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr5	878461	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=143,226;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:6,2,2,0
chr5	878533	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=148,53;MMQ=56,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:5,7,1,2
chr5	893243	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:893243_A_C:893243:0,1,2,0
chr5	893247	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:893243_A_C:893243:0,1,2,0
chr5	1034246	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,19:0,8:0,0,16,11
chr5	1036504	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:0|1:1036504_G_A:1036504:6,14,0,2
chr5	1036512	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:9,0:0|1:1036504_G_A:1036504:6,13,0,2
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,12:0.684:17:3,4:2,8:1|0:1036504_G_A:1036504:0,5,3,9
chr5	1036527	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:1036504_G_A:1036504:2,11,0,2
chr5	1038526	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1052459	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,0:7,2:0|1:1052459_G_A:1052459:5,4,2,1
chr5	1052465	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:7,3:0|1:1052459_G_A:1052459:7,7,2,1
chr5	1052468	.	T	TGC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:6,3:0|1:1052459_G_A:1052459:6,7,2,1
chr5	1052469	.	T	TATAGCACACCAA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,0:7,3:0|1:1052459_G_A:1052459:6,7,2,1
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr5	1053477	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.167:27:9,0:11,4:0|1:1053477_CT_C:1053477:11,12,2,2
chr5	1053479	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.167:27:12,0:11,4:0|1:1053477_CT_C:1053477:11,12,2,2
chr5	1053481	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=121,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.162:28:12,0:11,2:0|1:1053477_CT_C:1053477:11,13,2,2
chr5	1053483	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=121,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:1053477_CT_C:1053477:11,13,0,2
chr5	1057782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	1060379	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=99,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	1060634	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr5	1060654	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	1065307	.	CT	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1065307_CT_GC:1065307:0,0,1,0
chr5	1065313	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=106,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1065307_CT_GC:1065307:1,0,1,0
chr5	1065683	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:1065683_A_C:1065683:0,3,0,4
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0|1:1065683_A_C:1065683:0,0,0,6
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	1074818	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	1076245	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,5,2
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,4:0,0,8,7
chr5	1081767	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,14,14
chr5	1081798	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,1:7,5:4,9,1,5
chr5	1085433	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=86,151;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:20,6:10,0:0|1:1085433_C_G:1085433:12,18,6,0
chr5	1085435	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=87,151;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:20,6:8,2:0|1:1085433_C_G:1085433:12,16,6,2
chr5	1085604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr5	1088534	.	A	AGGAATGTTCAGCTCTGTGAGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=188,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	1093860	.	CC	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr5	1212647	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	1225564	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,5,17
chr5	1232995	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=173,51;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:9,0:8,2:7,13,0,2
chr5	1240757	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:1,5,5,0
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	1243000	.	T	TCTCAAAAAAGCTGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:4,5,0,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr5	1244425	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,8:0,0,9,11
chr5	1254032	.	G	GCTCCAACATCTCCGTATCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	1278822	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:8,2:12,13,0,2
chr5	1278855	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,1:10,2:12,14,1,2
chr5	1279421	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=147,39;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chr5	1280308	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:20,1:8,1:14,14,1,1
chr5	1282663	.	AC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,0:6,6:9,10,0,6
chr5	1293759	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=124,19874;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,1:11,2:12,9,3,0
chr5	1293767	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.425:24:4,6:10,4:9,5,6,4
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,21,6
chr5	1321873	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.686:33:6,16:4,7:3,7,9,14
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr5	1325863	.	T	TCCTG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:10,0:22,2:16,16,1,1
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,16,13
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr5	1409734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,282;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr5	1410059	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr5	1416142	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	1420588	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,4,0
chr5	1432825	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=60,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:2,2,1,5
chr5	1432876	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=60,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:2,4:0,1:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,1,4
chr5	1432881	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=60,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:2,2:0,1:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,1,4
chr5	1442974	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr5	1464028	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr5	1467000	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=162,89;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.360:12:4,3:3,1:0|1:1467000_G_A:1467000:4,4,0,4
chr5	1467004	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0|1:1467000_G_A:1467000:0,0,2,9
chr5	1501790	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	1801432	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	1801689	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,8:0,0:0,0,8,0
chr5	2749005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	2755031	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	3596518	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:5,1:2,2:5,2,2,2
chr5	3596552	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0|1:3596552_GT_G:3596552:2,7,1,1
chr5	3596555	.	GCGGGT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:2,2:0|1:3596552_GT_G:3596552:2,7,1,1
chr5	3599473	.	GAGCACC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:9,2:9,9,1,1
chr5	3600830	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=100,54;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,0:3,8:7,0,0,8
chr5	5140958	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5140958_T_A:5140958:0,0,0,1
chr5	5140970	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5140958_T_A:5140958:0,0,0,1
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr5	5200234	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr5	5200430	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr5	5223073	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	5223083	.	T	TAAACCCATTATTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr5	5239419	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=108,531;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,7:9,0:4,9,0,7
chr5	5240002	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:3,2,2,1
chr5	5262766	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:8,2,0,2
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr5	5440143	.	CATAAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=265,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr5	5461163	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,62;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.277:26:7,0:12,6:8,11,1,6
chr5	5463418	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:6,3,3,0
chr5	5476250	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,10:0,0,5,8
chr5	6600082	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=127,113;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.382:14:4,5:3,0:5,4,5,0
chr5	6604205	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,4:4,0:3,1,3,1
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=85,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:3,2:2,3,2,3
chr5	6607125	.	GAAC	G,AAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30,24;MFRL=217,176,227;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.20,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,2:0.503,0.249:9:1,3,2:1,2,0:1,1,0,7
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=180,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=95,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:1,1,1,3
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr5	6622181	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=84,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:7,11,0,3
chr5	6623432	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,16;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:0,0:1,0:0,3,0,2
chr5	6737555	.	AAGAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr5	6748489	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:5,11:0,0:4,1,6,5
chr5	6748606	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:6,12,0,2
chr5	6750609	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,139;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,3:14,0:8,17,3,0
chr5	6751352	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,0:0,4:1,1,1,3
chr5	6755012	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:4,0:20,3:2,22,0,3
chr5	7520781	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=44861001,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,3:2,0,7,1
chr5	7695845	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,0:4,4:2,2,2,2
chr5	7696028	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,4:0,2:1,1,0,6
chr5	7712909	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:5,2,2,0
chr5	7717396	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,0:2,4:3,6,1,3
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,3:9,8:10,6,7,4
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,11,1
chr5	7817088	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:7817088_G_A:7817088:7,11,1,1
chr5	7817097	.	C	CTGGCAGGCTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:7817088_G_A:7817088:8,10,1,1
chr5	7820592	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=100,196;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:7820592_A_G:7820592:2,1,1,0
chr5	7820599	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=100,196;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:7820592_A_G:7820592:2,1,1,0
chr5	7826945	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:7826945_A_T:7826945:5,7,1,1
chr5	7826948	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:7826945_A_T:7826945:5,7,1,1
chr5	7826950	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:7826945_A_T:7826945:5,7,1,1
chr5	7826951	.	AAGGTC	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,15;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,1:0|1:7826945_A_T:7826945:5,7,1,1
chr5	7826961	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=112,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:2,1:0|1:7826945_A_T:7826945:4,6,1,1
chr5	7835552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:8,0:3,3:0|1:7835552_C_T:7835552:5,6,1,2
chr5	7835555	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.250:14:5,3:6,0:1|0:7835552_C_T:7835552:4,7,2,1
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,3:5,7:5,2,8,2
chr5	7861709	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:7861709_C_T:7861709:8,13,1,1
chr5	7861726	.	G	GGAAGGCAGGTCAGCCCGGTGACCATAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:7861709_C_T:7861709:7,10,1,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:4,4:2,4:6,1,7,1
chr5	7866135	.	TTGAGG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:3,3:2,6,1,6
chr5	7866967	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:7,12:4,4:5,6,7,10
chr5	7868277	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7868277_A_T:7868277:0,0,0,1
chr5	7868280	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7868277_A_T:7868277:0,0,0,1
chr5	7868282	.	C	CAAAAAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7868277_A_T:7868277:0,0,0,1
chr5	7885782	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:5,6:2,1:7,0,8,0
chr5	7891372	.	ATGATT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:0,4:1,0,10,0
chr5	7891518	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=99,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:28,2:23,1:16,35,1,2
chr5	7891546	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:22,3:20,1:11,31,0,4
chr5	7893058	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:3,0:10,7:0|1:7893058_T_C:7893058:3,10,0,7
chr5	7893060	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:3,0:9,7:0|1:7893058_T_C:7893058:3,10,0,7
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr5	7899933	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:7899933_G_A:7899933:2,1,1,0
chr5	7899935	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=181,256;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:7899933_G_A:7899933:2,1,1,0
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	9043220	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=234,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9043220_G_T:9043220:0,1,0,1
chr5	9043221	.	C	CCTGTCATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=234,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9043220_G_T:9043220:0,1,0,1
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr5	9066780	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=239,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9066780_G_T:9066780:0,3,0,1
chr5	9066782	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=239,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9066780_G_T:9066780:0,3,0,1
chr5	9136740	.	A	ATGGT,ATGGTCTAAATGCTC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,24,20;MFRL=127,127,39;MMQ=60,60,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.10,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.271,0.199:13:1,1,2:7,1,0:6,2,1,4
chr5	9136741	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,1:7,3,0,3
chr5	9136743	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=127,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:6,5,1,1
chr5	9136744	.	A	AGAAATGGT,AAAAGATACAGAAATGGT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,24,20;MFRL=127,127,39;MMQ=60,60,60;MPOS=2,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.10,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.271,0.199:13:1,1,2:7,2,0:6,2,1,4
chr5	9136794	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=127,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.260:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr5	9190598	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr5	9197434	.	A	AGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr5	9225088	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=220,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	9380110	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=169,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr5	9629374	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=127,249;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,0:6,3:8,7,0,3
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr5	10227823	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	10236706	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:9,2:5,10,0,2
chr5	10239535	.	T	TCCTCCAAAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10239535_T_TCCTCCAAAGC:10239535:0,4,0,1
chr5	10239538	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10239535_T_TCCTCCAAAGC:10239535:0,4,0,1
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,30:0.913:32:1,15:1,15:2,0,15,15
chr5	10254817	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	10258491	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,0:5,3:9,5,2,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,4
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,4
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,3
chr5	10263474	.	TAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10263474_TAAA_T:10263474:0,1,0,1
chr5	10263480	.	GA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10263474_TAAA_T:10263474:0,1,0,1
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=89,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,3:1,6:0,1,0,9
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	10397473	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.349:14:5,2:3,2:1,8,1,4
chr5	10407359	.	T	TGTGTTGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=256,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10407359_T_TGTGTTGC:10407359:0,1,0,1
chr5	10407361	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=256,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10407359_T_TGTGTTGC:10407359:0,1,0,1
chr5	10407362	.	G	GTCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=256,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10407359_T_TGTGTTGC:10407359:0,1,0,1
chr5	10407368	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=256,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10407359_T_TGTGTTGC:10407359:0,1,0,1
chr5	10407371	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=256,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10407359_T_TGTGTTGC:10407359:0,1,0,1
chr5	10417575	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0,4,2,6
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	10423983	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=128,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:1,11,0,3
chr5	10424022	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=80,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:2,1,0,4
chr5	10433715	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:8,0:15,6,3,0
chr5	10433830	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:12,0:9,13:3,18,0,13
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr5	10761009	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr5	10988172	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,1:1,6:5,0,5,2
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr5	11098884	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=62,70;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:3,5,1,2
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=94,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:2,9:7,1:6,4,6,4
chr5	11384896	.	ATGGTGGAGCTCAGC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:7,2:7,11,1,1
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	11564995	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=138,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:4,0,6,0
chr5	13692279	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr5	13701617	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:13701617_GA_G:13701617:0,0,0,2
chr5	13701630	.	G	GCTAAATCAACTTTAATTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=215,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:13701617_GA_G:13701617:0,2,0,1
chr5	13714740	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:2,1,0,7
chr5	13719089	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:3,4,2,4
chr5	13735147	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:8,3,7,1
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr5	13776487	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	13786323	.	CC	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr5	13786541	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13786541_C_A:13786541:0,1,0,1
chr5	13786543	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13786541_C_A:13786541:0,1,0,1
chr5	13786546	.	A	AATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:13786541_C_A:13786541:0,1,0,1
chr5	13788886	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr5	13788908	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=110,84;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:10,7:7,0:10,8,7,0
chr5	13793685	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,2:5,10,1,1
chr5	13809054	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,3,1
chr5	13811995	.	G	GAGGTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	13811997	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	13812000	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr5	13814682	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr5	13815049	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	13829608	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=74,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,2:7,6:8,3,6,2
chr5	13829799	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:2,3,2,1
chr5	13839446	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,3:3,0:0|1:13839446_G_A:13839446:7,0,4,0
chr5	13839449	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:4,4:3,0:0|1:13839446_G_A:13839446:7,0,4,0
chr5	13842027	.	CAAAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,0:1,1:3,2,0,2
chr5	13842049	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=133,88;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.309:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr5	13842052	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.656:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr5	13844874	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=83,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	13845045	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,1:3,2:7,2,1,2
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:10,0:3,4:1,12,0,4
chr5	13850678	.	C	CTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:2,0:7,0,3,0
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:5,5:4,3:7,3,5,3
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=124,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,5:2,5:3,4,6,4
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,0:0,2:1,1,0,3
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	13864671	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:0|1:13864671_G_A:13864671:7,7,1,1
chr5	13864678	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:13864671_G_A:13864671:7,7,1,1
chr5	13864728	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,5,2
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,3:0,5:5,2,7,1
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,1,6
chr5	13871925	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=254,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:0,3,0,5
chr5	13885334	.	T	TCTCCCTGTCTCTGTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr5	13919348	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:6,0:18,2:16,9,2,0
chr5	13944512	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr5	14290805	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	14291374	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=210,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:14291374_G_GT:14291374:0,4,0,1
chr5	14291376	.	G	GCATGTGCTGGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=210,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:14291374_G_GT:14291374:0,4,0,1
chr5	14291424	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=230,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14291424_G_T:14291424:0,1,0,1
chr5	14291433	.	G	GATTTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=230,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14291424_G_T:14291424:0,1,0,1
chr5	14291437	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=230,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14291424_G_T:14291424:0,1,0,1
chr5	14316620	.	AGG	A	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=135,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.089:32:12,2:15,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:14,16,1,1
chr5	14316626	.	GC	G	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=135,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,2:15,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:14,17,1,1
chr5	14316629	.	AAGATG	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=135,39;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:15,2:16,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:20,19,1,1
chr5	14316638	.	AGT	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=141,39;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,2:15,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:23,14,1,1
chr5	14316641	.	CGCTCCTTG	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=141,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:18,2:17,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:24,13,1,1
chr5	14316652	.	AAGCTCCAGCGGCCCTTGACTCCCGGCAGCTCCGATTCCCTG	A	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=138,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:16,2:14,0:0|1:14316620_AGG_A:14316620:33,16,1,1
chr5	14359665	.	GC	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,1:4,6:3,7,1,6
chr5	14369690	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=171,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	14374420	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:8,1,3,1
chr5	14390989	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,0:12,0,2,1
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr5	14398902	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	14406103	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:4,6,1,2
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,7:6,3:6,4,4,6
chr5	14471666	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=218,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	14474194	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:11,8,0,3
chr5	14474283	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr5	14485161	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:5,3:0,0:6,0,3,0
chr5	14497101	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:15,6:17,0:10,22,5,1
chr5	14508478	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,54;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:14508478_C_T:14508478:7,10,1,1
chr5	14508497	.	A	AAGTTAT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=125,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:14508478_C_T:14508478:8,14,1,1
chr5	14508502	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:14508478_C_T:14508478:8,13,1,1
chr5	14607339	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=165,153;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr5	14610388	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.272:16:5,0:7,4:6,6,0,4
chr5	14678762	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.262:22:7,4:7,1:14,2,5,1
chr5	14741859	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	14749271	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,65;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:8,0:14,3:14,8,1,2
chr5	14769109	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:17,0:11,7:12,16,7,0
chr5	14871620	.	AGGGGCGAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=306,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCGAC;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,1:0,3:0,1,1,4
chr5	15616194	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:8,0:11,2:0|1:15616194_T_C:15616194:9,12,1,1
chr5	15616197	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,1:0|1:15616194_T_C:15616194:9,13,1,1
chr5	15927897	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=140,171;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:0|1:15927897_G_A:15927897:6,0,2,0
chr5	15927900	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=140,171;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:0|1:15927897_G_A:15927897:6,0,2,0
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr5	16177807	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:5,4:10,4:9,6,4,4
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr5	16481062	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,3:5,0:3,2,3,0
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=92,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:6,3:6,4:6,6,6,2
chr5	16676103	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:8,2,6,0
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	16681966	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,10:6,1:4,7,3,8
chr5	16684109	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=162,89;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr5	16684143	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=102,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	16690025	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,89;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,0:8,5:6,10,1,4
chr5	16699512	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,4:3,0:2,1,2,2
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=65,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.660:19:0,5:6,8:0,6,4,9
chr5	16711370	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:5,0:11,5:4,12,0,5
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	16758338	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:5,4,1,1
chr5	16762117	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.213:40:13,0:19,8:28,4,8,0
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr5	16763725	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:11,0:7,3:12,6,2,1
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:1,5:6,5:2,5,3,7
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=88.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,15:0,0,15,15
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	16795027	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	17275982	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:24,2:22,3:31,16,5,0
chr5	17276047	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,6:0.083:80:25,0:46,6:44,30,6,0
chr5	17276053	.	CCTCT	C,CCT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=25,30,31;MFRL=119,91,109;MMQ=60,60,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=CT;STR;TLOD=18.89,34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,17:0.352,0.587:30:1,6,9:1,5,8:1,1,15,13
chr5	17276848	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.768:24:3,6:2,12:3,2,12,7
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	19473863	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	19612539	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,2:5,8:8,6,5,5
chr5	19721490	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,8,15
chr5	21751929	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:14,4:10,0:7,17,2,2
chr5	21755653	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	21755685	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:3,1,5,1
chr5	21760602	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=254,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr5	21765089	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:6,5:18,0:11,15,3,2
chr5	21783537	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=66,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:6,3,0,2
chr5	22078584	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.552:25:6,5:5,8:5,6,5,9
chr5	23509229	.	C	CCCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=102,55;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:23509229_C_CCCA:23509229:1,5,1,1
chr5	23509230	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,55;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:23509229_C_CCCA:23509229:1,5,1,1
chr5	23509233	.	G	GGCCCGC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,55;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:23509229_C_CCCA:23509229:1,5,1,1
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,0,14
chr5	23522372	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:6,2,3,0
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr5	23526835	.	TACAGGGGAGAAGCTCTACGTCTGCAGGGAGTGTGGGCGGGGCTTTAGCTGGAAGTCACACCTCCTCATTCACCAGAGGATACAC	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=104,79;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:13,2:9,0:25,20,1,1
chr5	23526853	.	CGTCTGCAGGGAGTGTGGGCGGGGCTTTAGCTGGAAGTCACACCTCCTCATTCACCAGAGGATACACACAGGGGAGAAGCCCTAT	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=104,161;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.103:41:10,2:7,2:20,17,2,2
chr5	23527777	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=112,191;MMQ=45,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.371:20:5,5:5,2:4,9,2,5
chr5	24491898	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=107,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,0:6,2:4,6,0,2
chr5	24491919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=107,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:24491919_A_G:24491919:2,8,0,2
chr5	24491921	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=107,258;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:24491919_A_G:24491919:2,8,0,2
chr5	24498511	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:16,0:15,2:0|1:24498511_C_T:24498511:15,16,1,1
chr5	24498513	.	TG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:16,0:15,2:0|1:24498511_C_T:24498511:15,16,1,1
chr5	26881634	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:7,5,2,0
chr5	26881770	.	A	AATCATCTTTGCCTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	26885717	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,153;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.389:31:13,11:6,0:8,11,12,0
chr5	26886239	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:1,2:6,0:0|1:26886239_TC_T:26886239:1,6,1,1
chr5	26886241	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:0|1:26886239_TC_T:26886239:1,6,1,1
chr5	26890096	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:26890096_T_G:26890096:5,10,1,1
chr5	26890103	.	T	TTGTATATTCCCTTCTACAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:26890096_T_G:26890096:5,10,1,1
chr5	26906745	.	TAAAATATTTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr5	31317869	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:7,2:10,5,0,3
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	31401447	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:2,0,7,0
chr5	31407139	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	31409115	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=67,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:6,2,3,1
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,18,5
chr5	31483753	.	GAAA	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.385:20:3,2:4,0:0|1:31483753_GAAA_G:31483753:7,6,2,5
chr5	31483770	.	G	GCCAGTAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:7,0:0|1:31483753_GAAA_G:31483753:9,11,0,2
chr5	31486523	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr5	31486540	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr5	31508933	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0|1:31508933_G_GTT:31508933:0,0,0,2
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:31508933_G_GTT:31508933:0,0,0,3
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,1
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,1
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,5:0,4:0,0,9,2
chr5	31534397	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,2:8,0:5,7,1,1
chr5	31538692	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,3,4
chr5	31541007	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,2:3,3:7,0,5,0
chr5	31541142	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.528:36:6,11:11,8:9,8,11,8
chr5	31541212	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=GT;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.823:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	31799826	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=96,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.353:31:7,0:13,9:8,12,0,11
chr5	32000397	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=81,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:0,3:6,0:2,4,2,2
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	32057905	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,0:6,5:6,12,0,5
chr5	32057910	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.229:19:7,1:6,3:9,6,1,3
chr5	32059282	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,22;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:3,6:1,0:1,4,3,3
chr5	32087241	.	GG	AA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=69,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:5,6,1,1
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,4:2,2:2,5,4,2
chr5	32087351	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=112,847;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:9,11,0,2
chr5	32087374	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=96,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:0,5:10,6:6,4,3,8
chr5	32088795	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=189,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,3:10,0:9,5,1,2
chr5	32090400	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=96,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:3,8,1,2
chr5	32098509	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,7:7,0:8,9,7,0
chr5	32101168	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.599:20:3,7:4,5:8,0,10,2
chr5	32101400	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:3,1:0,6:1,2,1,7
chr5	32135599	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	32248989	.	AGAAAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=137,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:5,12,0,2
chr5	32255952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:1,10,0,2
chr5	32263392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr5	32276833	.	CGT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:19,2:28,0:28,21,0,2
chr5	32356065	.	A	ATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.286:8:3,0:3,2:0|1:32356065_A_ATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT:32356065:1,5,0,2
chr5	32356066	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.286:8:3,0:3,2:0|1:32356065_A_ATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT:32356065:1,5,0,2
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=123.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,23:0,0,24,19
chr5	32388485	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	32400266	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=92,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:9,6:5,8:7,7,8,6
chr5	32400394	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr5	32403919	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,5:0,1,0,9
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,4:2,2:4,0,7,0
chr5	32591759	.	A	G	.	.	DP=116;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=121.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,34:0.304:113:39,0:32,32:0|1:32591759_A_G:32591759:52,27,0,34
chr5	32591763	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=121.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,34:0.299:115:45,0:35,32:0|1:32591759_A_G:32591759:54,27,0,34
chr5	32591804	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=29,14,17;MFRL=110,107,152;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=T;STR;TLOD=3.51,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.213,0.358:13:4,1,0:1,0,1:5,1,1,6
chr5	32591863	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=178,165;MMQ=49,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:6,1:0,1:0,6,0,2
chr5	32591892	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=178,203;MMQ=54,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr5	32710965	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.553:7:2,4:1,0:1,2,0,4
chr5	32739085	.	CATGGAGGTGAAAAGTTCAGTTGAGAAACAAGGGCTCAAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:5,1:2,0:5,6,1,1
chr5	32780771	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr5	32786465	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.223:18:6,3:7,1:6,8,3,1
chr5	32789852	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,4:6,6:2,7,5,5
chr5	33546113	.	TAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23,24;MFRL=94,101,148;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.48,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,3:0.200,0.275:12:5,1,0:2,1,3:4,3,4,1
chr5	33561352	.	G	GTGATTTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=258,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	33576267	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,125;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,0:9,10:7,8,0,10
chr5	33576384	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:10,3:28,0:7,31,2,1
chr5	33595996	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr5	33596193	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr5	33596224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	33596243	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:5,2,4,1
chr5	33624496	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.505:14:2,6:4,1:1,6,1,6
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:4,1,5,1
chr5	33637594	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:3,0,4,0
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr5	33643395	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:1,4:3,4:0,4,2,6
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=67,39;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:2,4,4,1
chr5	33648924	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=128,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:33648924_T_C:33648924:4,3,1,1
chr5	33648928	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=86,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:4,2:0|1:33648924_T_C:33648924:6,4,1,1
chr5	33648931	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=85,39;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:33648924_T_C:33648924:5,4,1,1
chr5	33648933	.	T	TGGGGC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=86,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:33648924_T_C:33648924:5,5,1,1
chr5	33648935	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=86,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:33648924_T_C:33648924:5,5,1,1
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:2,8:1,3:2,1,10,1
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:2,2,2,3
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:4,5,7,2
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	34020732	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.295:21:8,2:7,3:8,7,1,5
chr5	34033504	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:5,11,0,2
chr5	34042866	.	A	AAAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAC;STR;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:4,1:9,5:10,3,7,1
chr5	34688210	.	CGACAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:3,5:5,2,6,2
chr5	34757505	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	34807928	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,86;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:6,6:1,8:4,3,5,9
chr5	34813784	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:5,0:7,6:4,9,0,6
chr5	34818976	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.680:16:1,5:3,6:1,4,5,6
chr5	34821825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:3,1,3,2
chr5	34822994	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=138,107;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	34863088	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,160;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:24,5:13,0:18,19,5,0
chr5	34909148	.	A	ATTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	34911852	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:6,0:21,2:9,18,1,1
chr5	34918415	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr5	34922935	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:8,0:5,5:7,6,0,5
chr5	34923418	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:34923418_CT_C:34923418:0,3,0,1
chr5	34923423	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:34923418_CT_C:34923418:0,3,0,1
chr5	34925369	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:12,0:9,3:7,15,1,2
chr5	34937637	.	A	AC	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,4:0.051:96:45,0:47,4:68,24,0,4
chr5	34945797	.	CTT	CTTT,C,CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24,30,30;MFRL=131,91,206,71;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,19,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,13,10,11;RU=T;STR;TLOD=11.95,5.31,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,9,3,6:0.279,0.112,0.173:33:5,5,1,3:5,2,2,3:10,5,14,4
chr5	34954588	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=279,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr5	34954774	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:6,2:15,4:7,15,2,4
chr5	34998778	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	34998811	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:8,5,3,0
chr5	34999024	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=93020609,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34999024_G_C:34999024:0,1,0,1
chr5	34999027	.	T	TACAAAAAAATACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=93020609,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34999024_G_C:34999024:0,1,0,1
chr5	35025770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr5	35026683	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,8:0,0,0,11
chr5	35026713	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:35026713_A_AC:35026713:0,2,0,1
chr5	35026714	.	A	ATAGTATGCTGATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:35026713_A_AC:35026713:0,2,0,1
chr5	35032769	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr5	35032894	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr5	35033706	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr5	35036997	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=60,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.648:9:2,4:0,1:1,2,6,0
chr5	35037230	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	35047807	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=120,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr5	35048031	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:35048031_C_A:35048031:1,3,0,1
chr5	35048034	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:35048031_C_A:35048031:1,3,0,1
chr5	35048040	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=127,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,0:1,4,0,2
chr5	35068983	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=110,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:16,0:17,9:8,25,0,9
chr5	35628761	.	ATA	TCG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	35646972	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=153,258;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	35649629	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	35659289	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	35659355	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	35713007	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr5	35727988	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:35727988_CA_C:35727988:0,4,0,1
chr5	35727991	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:35727988_CA_C:35727988:0,4,0,1
chr5	35727995	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:35727988_CA_C:35727988:0,4,0,1
chr5	35728020	.	ACAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	35753715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:3,2:7,2:6,4,3,1
chr5	35753738	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:2,4:10,0:8,4,3,1
chr5	35763877	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	35800302	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=223,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35800302_A_AT:35800302:0,1,0,1
chr5	35800308	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:35800302_A_AT:35800302:0,0,0,2
chr5	35800310	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:35800302_A_AT:35800302:0,0,0,2
chr5	35800312	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:35800302_A_AT:35800302:0,0,0,2
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=75,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,7:4,2:1,7,2,7
chr5	35857207	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:2,4:3,2:0,5,1,5
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=62916355,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	35861068	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.351:26:4,2:13,6:9,8,3,6
chr5	35861152	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=61,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr5	35871190	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,5:4,7:5,2,4,8
chr5	35874575	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,8:5,2:6,1,7,3
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=79,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:0,2:7,3:3,4,4,1
chr5	35876478	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:1,3,1,1
chr5	35910419	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	35954588	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,2,3
chr5	35955682	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=251,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr5	35956026	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=924,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr5	35957202	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	35965970	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr5	35966016	.	T	TATCTCACCTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35966016_T_TATCTCACCTCC:35966016:0,0,0,1
chr5	35966018	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35966016_T_TATCTCACCTCC:35966016:0,0,0,1
chr5	36049272	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=62,176;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	36116706	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,0:9,6:7,9,0,6
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:3,1,2,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	36147984	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=147,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:7,0:5,3:6,6,2,1
chr5	36147990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=91,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:5,8,2,0
chr5	36166827	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=221,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr5	36168444	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	36207202	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:36207202_G_A:36207202:2,1,1,0
chr5	36207205	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:36207202_G_A:36207202:2,1,1,0
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=55,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,1,5
chr5	36219710	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,3:8,6:6,7,6,3
chr5	36219795	.	GGAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,1,1
chr5	36226765	.	A	AGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	36271516	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=212,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	36271523	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=259,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36271523_T_A:36271523:0,1,0,1
chr5	36271524	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=259,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36271523_T_A:36271523:0,1,0,1
chr5	36271526	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=259,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36271523_T_A:36271523:0,1,0,1
chr5	36271529	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=259,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36271523_T_A:36271523:0,1,0,1
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,3:0|1:36301369_T_G:36301369:2,1,1,2
chr5	36301374	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=124,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0|1:36301369_T_G:36301369:3,1,1,2
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=96,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,4,1
chr5	36301567	.	C	CCACCCTCACCATCCCCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=327,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	36629529	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.335:10:4,2:2,1:0|1:36629529_C_CT:36629529:6,1,3,0
chr5	36629546	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=143,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:2,0:10,0:0|1:36629529_C_CT:36629529:6,13,3,0
chr5	36671364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,3:2,0:1,5,1,2
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr5	37001274	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37001274_T_A:37001274:0,1,0,1
chr5	37001280	.	C	CTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37001274_T_A:37001274:0,1,0,1
chr5	37020756	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:37020756_T_C:37020756:1,5,1,1
chr5	37020758	.	T	TGACGTCCCAACCCCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:37020756_T_C:37020756:1,5,1,1
chr5	37036449	.	GTA	G,GTATA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27,35;MFRL=135,87,141;MMQ=60,60,60;MPOS=6,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=4.25,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,3:0.263,0.263:12:3,3,2:2,0,1:4,2,4,2
chr5	37051861	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.252:13:5,2:5,1:9,1,3,0
chr5	37060898	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr5	37107885	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=100,107;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:17,10,0,3
chr5	37115000	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:1,0:4,1:5,2,1,3
chr5	37121983	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,190;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	37122534	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,0,2
chr5	37125466	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:5,0:13,3:6,13,0,3
chr5	37162603	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=150,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.253:13:6,0:4,3:0|1:37162603_T_A:37162603:4,6,1,2
chr5	37162610	.	C	CCAAGATGTAGTATCTCATCTGTTGGCAGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:0|1:37162603_T_A:37162603:3,6,1,2
chr5	37164327	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:3,2,3,1
chr5	37176087	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,0:3,3:4,5,0,3
chr5	37227470	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=127,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,2:6,1:7,7,1,2
chr5	37231205	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr5	37305217	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:18,0:11,5:15,15,1,4
chr5	37314321	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.217:24:9,4:10,0:12,7,0,5
chr5	37325891	.	AAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=189,248;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:0,0:0|1:37325891_AAAT_A:37325891:3,0,1,0
chr5	37325898	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,14;MFRL=189,248;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:37325891_AAAT_A:37325891:3,0,1,0
chr5	37325901	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=189,248;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:37325891_AAAT_A:37325891:3,0,1,0
chr5	37342755	.	G	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=58.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,30:0.395:76:28,0:18,29:20,26,0,30
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chr5	37351546	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:37351546_A_C:37351546:0,2,0,1
chr5	37351555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:37351546_A_C:37351546:0,2,0,1
chr5	37351557	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:37351546_A_C:37351546:0,2,0,1
chr5	37443389	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=115,99;MMQ=50,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.151:48:21,6:20,0:32,9,7,0
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,21;MFRL=207,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.865:17:0,1:0,11:2,0,12,3
chr5	37697811	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:9,2:8,1:6,11,1,2
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	38352473	.	G	GGT	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:0|1:38352473_G_GGT:38352473:1,3,2,3
chr5	38352476	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:0,1:4,3:0|1:38352473_G_GGT:38352473:1,3,2,3
chr5	38352511	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=120,200;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38352511_C_G:38352511:0,3,0,1
chr5	38352516	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=165,200;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:38352511_C_G:38352511:0,4,0,1
chr5	38352522	.	G	T,A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29,24;MFRL=252,120,200;MMQ=43,60,40;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,0:1,1,1:0,2,0,2
chr5	38352527	.	GATCACAAGGT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=213,120;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr5	38406251	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.955:41:1,27:0,13:0,1,18,22
chr5	38407155	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=129,150;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:6,0:10,8:0|1:38407155_T_A:38407155:8,8,0,8
chr5	38407158	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=135,150;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:6,0:10,7:0|1:38407155_T_A:38407155:8,9,0,8
chr5	38412782	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38412782_A_C:38412782:0,3,0,1
chr5	38412784	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38412782_A_C:38412782:0,3,0,1
chr5	38412786	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38412782_A_C:38412782:0,3,0,1
chr5	38418164	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,3:2,0:4,3,3,0
chr5	38451379	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:8,1,4,0
chr5	38458390	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,67;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:24,0:9,4:22,11,1,3
chr5	38482099	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:13,0:9,6:12,11,0,6
chr5	38482109	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:0|1:38482109_G_A:38482109:10,9,1,1
chr5	38482112	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,2:9,0:0|1:38482109_G_A:38482109:10,9,1,1
chr5	38490271	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,5:7,2:8,8,6,1
chr5	38496602	.	A	AGATAAACCCTGCGCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:2,8,1,1
chr5	38527228	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,1:0,14:0,0,13,2
chr5	38528896	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.099:49:23,0:20,4:0|1:38528896_C_T:38528896:36,9,4,0
chr5	38528919	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=69,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:16,0:11,4:0|1:38528896_C_T:38528896:23,4,4,0
chr5	38528951	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,35,34;MFRL=0,172,121;MMQ=60,60,60;MPOS=22,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=10.10,12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,5:0.362,0.564:9:0,1,1:0,3,4:0,0,0,9
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr5	38881603	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	38904363	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	38917574	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr5	38932466	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	38932551	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=104,61;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:8,8,0,3
chr5	38945219	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0|1:38945219_T_A:38945219:0,1,0,1
chr5	38945221	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38945219_T_A:38945219:0,1,0,1
chr5	38945223	.	G	GACTAGCTACTTGTCTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38945219_T_A:38945219:0,1,0,1
chr5	38945592	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,1:3,3:6,5,3,1
chr5	38949748	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:2,6:8,0:0|1:38949748_C_A:38949748:11,0,6,0
chr5	38949756	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:2,6:9,0:0|1:38949748_C_A:38949748:12,1,6,0
chr5	38953624	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.125:53:25,6:21,0:23,24,4,2
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:5,10:1,8:2,5,7,14
chr5	38953675	.	T	TGACATAC	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.117:30:15,3:10,0:8,19,1,2
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,5,7
chr5	38967188	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:4,2,2,0
chr5	38971912	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	38990957	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	39074185	.	TCGCGGCGCC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=89,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGCGGCGCC;STR;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:2,4:5,5:5,3,6,3
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,9,12
chr5	39108376	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:2,4,0,5
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,12,1
chr5	39202748	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:11,2:23,1:28,8,2,1
chr5	39311552	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39311552_TA_AT:39311552:0,0,0,1
chr5	39311556	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39311552_TA_AT:39311552:0,0,0,1
chr5	39311560	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39311552_TA_AT:39311552:0,0,0,1
chr5	39311562	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39311552_TA_AT:39311552:0,0,0,1
chr5	39311564	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39311552_TA_AT:39311552:0,0,0,1
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:2,4,1,3
chr5	39364474	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:4,2,3,2
chr5	39375082	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:5,11:13,12:10,8,15,8
chr5	39376850	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39376850_C_T:39376850:3,0,1,0
chr5	39376852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:39376850_C_T:39376850:3,0,1,0
chr5	39377418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=80,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,2:1,6:1,2,2,6
chr5	39383004	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	39388523	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,1:0,1:0,6,0,2
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,5,13
chr5	39392565	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=93,206;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,0:4,2:6,11,1,1
chr5	39393392	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:14,9,1,2
chr5	39394493	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	40681465	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,276;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:7,7,2,0
chr5	40681692	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:40681692_C_T:40681692:0,4,0,1
chr5	40681697	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=167,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:40681692_C_T:40681692:0,4,0,1
chr5	40692198	.	CCTGCCAGACCTCTCA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:7,0:9,4:10,8,2,2
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	40728397	.	AGTC	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,28;MFRL=55,109;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:2,3:0|1:40728397_AGTC_A:40728397:5,1,3,0
chr5	40728405	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=109,109;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:3,3:0|1:40728397_AGTC_A:40728397:5,2,3,0
chr5	40728407	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=109,109;MMQ=60,43;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0|1:40728397_AGTC_A:40728397:5,2,3,0
chr5	40728408	.	ACTT	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=109,109;MMQ=60,43;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:0|1:40728397_AGTC_A:40728397:5,2,3,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=95,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.421:14:2,3:6,2:7,1,5,1
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:1,3:3,11:3,1,12,3
chr5	40834182	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	40841795	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:6,14,0,3
chr5	40928792	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr5	40936485	.	GTGATGAAGACAGTGC	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,1:6,2:12,11,2,1
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr5	40950157	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:1,12,1,1
chr5	40950188	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:7,1,4,1
chr5	40964852	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,6:2,3:6,4,6,3
chr5	40976950	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=166,45;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:40976950_C_T:40976950:8,8,1,1
chr5	40976961	.	C	CTTCTCGAGGA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:40976950_C_T:40976950:6,6,1,1
chr5	40976964	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:40976950_C_T:40976950:6,6,1,1
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=156,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:5,2,5,2
chr5	40980102	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	40981768	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=63,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:1,1:1,3,0,2
chr5	40998814	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:4,3:2,1:2,4,1,4
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,5:2,1,3,8
chr5	41000243	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	41004396	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:41004396_G_T:41004396:0,0,3,1
chr5	41004406	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:41004396_G_T:41004396:2,0,1,1
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	41005791	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	41008780	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr5	41009282	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=232,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr5	41012615	.	AA	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,259;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	41012750	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=184,213;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,3:3,0:0|1:41012750_T_G:41012750:4,4,3,0
chr5	41012754	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=184,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:0|1:41012750_T_G:41012750:4,4,3,0
chr5	41018452	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,2:3,0:2,3,2,0
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	41033112	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,14,6
chr5	41033931	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=208,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.924:10:1,1:0,7:1,0,7,2
chr5	41033992	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=96,119;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:3,3:10,7:3,10,4,6
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,9,7
chr5	41046008	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41046008_T_A:41046008:0,1,0,1
chr5	41046009	.	T	TAAACACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41046008_T_A:41046008:0,1,0,1
chr5	41046010	.	G	GAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41046008_T_A:41046008:0,1,0,1
chr5	41047830	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=90,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.187:35:16,6:13,0:16,13,5,1
chr5	41051144	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:14,1:0|1:41051144_A_C:41051144:10,13,1,1
chr5	41051148	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,0:16,2:0|1:41051144_A_C:41051144:10,13,1,1
chr5	41057562	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,4:0,1:0,4,0,5
chr5	41069734	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=207,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr5	41069970	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:1,0:0|1:41069970_C_T:41069970:0,6,0,2
chr5	41069972	.	TTGA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:41069970_C_T:41069970:0,6,0,2
chr5	41070840	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:8,3:3,2:9,3,5,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	41158818	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:0|1:41158818_G_A:41158818:10,10,1,1
chr5	41158825	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:5,1:0|1:41158818_G_A:41158818:8,9,1,1
chr5	41160543	.	C	CATTTCGTTTGATCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,27;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,12,5
chr5	41794927	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41794927_T_A:41794927:0,1,0,1
chr5	41794928	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41794927_T_A:41794927:0,1,0,1
chr5	41805767	.	T	TCTTTCCCTCCCAAGCCCTGACTCAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=168,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr5	41853514	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	41909830	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=142,151,164;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.86,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.246,0.364:10:3,1,2:1,1,2:4,0,6,0
chr5	41927423	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,5:0,4:0,3,1,8
chr5	42700044	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr5	42713472	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	42779686	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=208,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.681:17:2,3:3,9:1,4,4,8
chr5	42779736	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	43161317	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	43161419	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=144,112;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:12,3,0,2
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,0:1,0,5,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,5:1,5:2,1,6,4
chr5	43294357	.	TAAGTAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	43297144	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=107,143;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:2,5:7,7:4,5,7,5
chr5	43297198	.	TATAGGATATTCAG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:11,7,0,2
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	43298951	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:0,2,3,4
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr5	43505993	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=70,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:5,5,3,5
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,2,5
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	43536904	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.617:23:3,9:6,5:6,3,7,7
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=110,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:6,2:2,3:7,1,4,2
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr5	43613046	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:1,6:10,3:7,5,8,1
chr5	43628541	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=241,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	43628566	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=245,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43628566_G_T:43628566:0,2,0,1
chr5	43628569	.	TA	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=245,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43628566_G_T:43628566:0,2,0,1
chr5	43628572	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=245,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43628566_G_T:43628566:0,2,0,1
chr5	43644442	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,6:2,7,1,11
chr5	43644481	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:0,10,0,7
chr5	43644488	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=101,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,3:6,2:0,9,0,5
chr5	43645676	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=151,302;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:43645676_T_G:43645676:0,4,0,1
chr5	43645679	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,302;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:43645676_T_G:43645676:0,4,0,1
chr5	43652044	.	T	TAATC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=117,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,0,6
chr5	43652068	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	43652072	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	43653243	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,8:2,6:2,5,6,8
chr5	43675837	.	C	CCATGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	43702887	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	43704556	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr5	44388822	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:4,6,1,6
chr5	45396801	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=100,42;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,0:6,3:9,9,0,3
chr5	49695048	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,115;MMQ=52,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,13:5,2:6,8,9,6
chr5	49698986	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	49701519	.	CTGT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,88;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGT;STR;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:3,8:6,5:7,5,7,6
chr5	49701755	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	50055456	.	CTT	C,CT,CTTT,CTTTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,33,32,32,34;MFRL=157,173,142,142,106;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=13,13,19,25;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.44,5.82,5.56,7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:8,5,4,4,6:0.145,0.169,0.184,0.220:27:3,4,2,2,3:2,1,2,2,1:5,3,17,2
chr5	50055483	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=106,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.145:45:13,0:12,0:19,17,9,0
chr5	50055626	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,0:8,5:3,16,0,5
chr5	50074015	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50074015_T_C:50074015:0,1,0,1
chr5	50074017	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50074015_T_C:50074015:0,1,0,1
chr5	50084508	.	C	CCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	50118250	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.282:19:8,3:6,2:5,9,1,4
chr5	50122645	.	GTT	G,GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=18,31,20;MFRL=86,99,138;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.29,15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,11:0.291,0.502:22:0,3,2:2,4,5:1,3,5,13
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	52157374	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,8:0,15:0,0,14,10
chr5	52160998	.	A	ACTCCCCAGCAATGGATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=168,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	52161500	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr5	52201834	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:0,0:0|1:52201834_C_A:52201834:0,2,0,1
chr5	52201835	.	A	ATTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52201834_C_A:52201834:0,2,0,1
chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	52204964	.	AAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	52206047	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,58;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:11,0:18,2:14,15,1,1
chr5	52206070	.	A	ATAACCTGGCTGCATTTTGGAGGGCACTGAC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=119,58;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,0:17,2:12,15,1,1
chr5	52221210	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:21,0:11,7:16,17,0,7
chr5	52223350	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:2,1,6,0
chr5	52223385	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:7,0,1,1
chr5	52223516	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.330:25:10,3:5,5:3,14,2,6
chr5	52233337	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=88,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:12,0:13,2:13,12,0,2
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr5	52235854	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	52240950	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	52248291	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.425:45:11,13:15,6:9,17,5,14
chr5	52337908	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr5	52338083	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr5	52344610	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,7:0,0,1,8
chr5	52351413	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,10,12
chr5	52351593	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.907:13:0,4:0,6:1,0,8,4
chr5	52355854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr5	52358669	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,2:11,0:0|1:52358669_C_T:52358669:8,10,0,2
chr5	52358671	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:9,0:0|1:52358669_C_T:52358669:8,10,0,2
chr5	52358673	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:52358669_C_T:52358669:9,8,0,2
chr5	52358676	.	GAC	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,2:11,0:0|1:52358669_C_T:52358669:9,9,0,2
chr5	52358761	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,28,28;MFRL=71,146,167;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.71,5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.275,0.415:7:1,0,0:1,2,3:0,2,0,5
chr5	52361023	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=199,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52361023_A_T:52361023:0,1,0,1
chr5	52361025	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=199,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:52361023_A_T:52361023:0,2,0,1
chr5	52361028	.	A	ACTTGTATAATTAAAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=199,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52361023_A_T:52361023:0,2,0,1
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	52368922	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr5	52379277	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,9,12
chr5	52397918	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=98,98;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,6:7,0:11,3,6,0
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:5,1:7,1,3,1
chr5	52405432	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr5	52779408	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=120,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:17,0:20,8:20,18,0,8
chr5	52779644	.	T	TAAAATCCTGTTGAAGAGACCATAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	52780091	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:11,11,2,0
chr5	52781376	.	GTT	G,GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33,31;MFRL=178,233,148;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.76,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.379,0.377:5:0,1,1:1,1,1:1,0,4,0
chr5	52781597	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr5	52899225	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=103,255;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:9,3,2,0
chr5	52942197	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr5	52954280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:0,5,0,5
chr5	52979097	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=182,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,1:1,4:1,2,1,4
chr5	53450542	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	53751854	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,356;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:6,0:1,4:0|1:53751854_C_CT:53751854:2,5,4,0
chr5	53751856	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=162,356;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:6,0:1,4:0|1:53751854_C_CT:53751854:2,5,4,0
chr5	53751949	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=153,306;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:6,4,0,4
chr5	53751974	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=131,306;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:10,0:10,4:0|1:53751974_A_C:53751974:12,8,0,4
chr5	53751979	.	A	AACCATCTTGTCACAGAAATTTAACAATG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,38;MFRL=131,306;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,0:9,4:0|1:53751974_A_C:53751974:12,8,0,4
chr5	53751988	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,10:0,0,12,8
chr5	53815495	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:3,1,3,8
chr5	53816341	.	G	GGCAGGGAAACCTACTCCTGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCAGGGAAACCTACTCCTGA;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.530:9:2,1:4,1:3,3,2,1
chr5	53816368	.	AAACCTACTGTCCCTGTTTCCTCAGCGGGTCTGGCCTTTACTGGTGAAGTGCTCACTGCCTTTCTGGTGGGCCAGTCCGTTTATGAGC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=108,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:4,0:3,2:9,17,1,1
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr5	54401326	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:54401326_G_A:54401326:7,6,1,1
chr5	54401334	.	G	GTCTGAAAAGAGATCCATGTATA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=127,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:10,0:5,1:0|1:54401326_G_A:54401326:9,6,1,1
chr5	54404057	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,72;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,0:8,2:0|1:54404057_C_A:54404057:8,10,1,1
chr5	54404065	.	A	ACCCACGTGTGGACCGGCC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=130,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.131:20:6,0:9,1:0|1:54404057_C_A:54404057:8,10,1,1
chr5	54404268	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr5	54406080	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0|1:54406080_A_T:54406080:0,0,0,1
chr5	54406084	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54406080_A_T:54406080:0,0,0,1
chr5	54406088	.	C	CTGAGCATTTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54406080_A_T:54406080:0,0,0,1
chr5	54406095	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54406080_A_T:54406080:0,0,0,1
chr5	54410099	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr5	54410120	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr5	54423075	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	54439513	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr5	54528393	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr5	54557146	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=102,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:2,1,9,0
chr5	54569062	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:3,1,5,2
chr5	54581675	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:54581675_G_C:54581675:2,7,1,1
chr5	54581680	.	T	TTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:54581675_G_C:54581675:1,7,1,1
chr5	54594586	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr5	54603822	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=115,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:5,1,5,0
chr5	54623514	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr5	54639378	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54639378_A_T:54639378:0,1,0,1
chr5	54639382	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54639378_A_T:54639378:0,1,0,1
chr5	54646851	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:54646851_G_T:54646851:4,12,1,1
chr5	54646858	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=173,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:54646851_G_T:54646851:4,19,1,1
chr5	54646859	.	T	TAATTC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=173,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:15,1:0|1:54646851_G_T:54646851:4,19,1,1
chr5	54646883	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=173,204;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,0:5,4:0,9,0,4
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0,0,3,6
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,1:0,0,9,5
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,3,1
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	54764065	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=193,322;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54764065_A_ATC:54764065:1,0,0,1
chr5	54764067	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=193,322;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54764065_A_ATC:54764065:1,0,0,1
chr5	54786843	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,34;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:8,13,2,1
chr5	54786848	.	A	AGTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:8,12,1,1
chr5	54830289	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.552:2:0,0:1,1:0|1:54830289_C_T:54830289:1,0,1,0
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.663:3:0,0:1,2:0|1:54830289_C_T:54830289:1,0,2,0
chr5	54931429	.	T	TTGTG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=119,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:6,2:0|1:54931429_T_TTGTG:54931429:12,4,1,1
chr5	54931430	.	C	CATTGCTTATATGCTGGTGA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:6,2:0|1:54931429_T_TTGTG:54931429:13,4,1,1
chr5	54931433	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:9,0:8,2:0|1:54931429_T_TTGTG:54931429:13,4,1,1
chr5	54941810	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	54944945	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr5	54948586	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.943:12:0,7:0,5:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,0,2,10
chr5	54948598	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,0,2,10
chr5	54952715	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54952715_G_A:54952715:0,0,0,1
chr5	54952719	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54952715_G_A:54952715:0,0,0,1
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr5	54968624	.	G	GTTCTTCCATTTATTTATATCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=216,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,12:0,0,7,14
chr5	55086590	.	A	AGTTTAAATAGGTTTCTGATACTTGATTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr5	55109461	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,187;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,2,0
chr5	55112262	.	CTTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.174:25:6,2:10,2:17,4,3,1
chr5	55168151	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,0:11,4:12,9,1,3
chr5	55168328	.	C	CCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr5	55185972	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=86,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:4,8,0,2
chr5	55196023	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	55204148	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,0:3,4:2,3,3,1
chr5	55204487	.	A	AGTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	55209458	.	A	AGTCAACATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	55213023	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	55236862	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,87;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:3,0:10,3:9,4,2,1
chr5	55247322	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:7,2:0|1:55247322_G_T:55247322:7,8,1,1
chr5	55247328	.	C	CTGTAAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:55247322_G_T:55247322:8,8,1,1
chr5	55247329	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:55247322_G_T:55247322:8,6,1,1
chr5	55252984	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.329:15:4,1:4,2:0|1:55252984_CA_C:55252984:8,2,3,2
chr5	55253000	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=124,29707752;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,2:0.087:32:11,1:10,0:1|0:55252984_CA_C:55252984:17,13,1,1
chr5	55256230	.	TATCTTCATAGGTGATCCCACTTGCTTCTTCACTCCAGTCACTCCAGTATCCCTTACC	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=88,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.056:53:8,2:9,0:0|1:55256230_TATCTTCATAGGTGATCCCACTTGCTTCTTCACTCCAGTCACTCCAGTATCCCTTACC_T:55256230:29,22,1,1
chr5	55256282	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=84,84;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,7:0.210:36:11,6:18,1:1|0:55256230_TATCTTCATAGGTGATCCCACTTGCTTCTTCACTCCAGTCACTCCAGTATCCCTTACC_T:55256230:14,15,5,2
chr5	55398217	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,5:0,0,13,3
chr5	55407542	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,18:0,19:0,0,14,23
chr5	55412347	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	55422681	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr5	55423029	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0,5,0,5
chr5	55466689	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=88,34542438;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:55466689_C_A:55466689:1,4,0,2
chr5	55466693	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=88,34542438;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:55466689_C_A:55466689:1,4,0,2
chr5	55479293	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr5	55528815	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	55851872	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:8,1,5,3
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr5	56152603	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=100.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,32:0.767:41:5,28:4,2:5,4,2,30
chr5	56160480	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,3:6,0:6,1,3,0
chr5	56160701	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=98,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:6,0:15,4:6,15,1,3
chr5	56168566	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:16,2:5,0:0|1:56168566_G_A:56168566:10,14,1,1
chr5	56168570	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:7,0:0|1:56168566_G_A:56168566:10,13,1,1
chr5	56168929	.	A	AAAAAACTACTTACCTAATCCATGGCTCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=156,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.932:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:6,5:6,3:0|1:56205643_A_G:56205643:1,11,0,9
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0|1:56205643_A_G:56205643:0,3,0,6
chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr5	56212823	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	56224581	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:11,4:16,0:16,11,4,0
chr5	56224714	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,5,11
chr5	56224788	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	56226447	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=115,100;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:11,7:7,0:15,5,7,0
chr5	56226605	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	56246514	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:4,13,0,2
chr5	56246610	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=209,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:7,8:7,12:6,8,10,10
chr5	56526906	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:9,5,2,0
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,262;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr5	56543078	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=250,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr5	56545147	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,8:2,0:3,0,8,0
chr5	56546749	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=141,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr5	56777677	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:2,1,3,6
chr5	56778687	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=141,141;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr5	57753262	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,8:10,0:11,9,8,0
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:0,6,0,3
chr5	57754076	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:57754076_C_T:57754076:3,2,2,0
chr5	57754084	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:57754076_C_T:57754076:4,1,2,0
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	57754489	.	ACT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=208,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:4,1:9,1,3,1
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=79,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:8,7:13,4:14,7,7,4
chr5	57755013	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,4:1,1:4,1,3,2
chr5	57791821	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=89,89;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:12,3:23,0:18,17,3,0
chr5	57792549	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.544:24:5,7:5,6:6,5,8,5
chr5	57792825	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=95,64;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.261:36:6,0:20,9:0|1:57792825_C_T:57792825:14,13,1,8
chr5	57792846	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=115,64;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.283:33:8,0:15,1:0|1:57792825_C_T:57792825:13,11,1,8
chr5	57913724	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	58021903	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=103,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,4:12,0:10,14,0,4
chr5	58271713	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr5	58286737	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	58334645	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=74,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:2,2:5,6:5,2,6,3
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	58882102	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr5	59995820	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr5	59995880	.	G	GACAGCCATCTGCCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,1,1
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.400:10:5,2:0,2:2,4,1,3
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	60186928	.	T	TAAAATAAAATAAAATAAAATAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=96651819,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60186928_T_TAAAATAAAATAAAATAAAATAA:60186928:0,1,0,1
chr5	60186934	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=96651819,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60186928_T_TAAAATAAAATAAAATAAAATAA:60186928:0,1,0,1
chr5	60186975	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,48326022;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	60194107	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=225,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,2:1,0,3,3
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,8,1
chr5	60218060	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60218060_A_C:60218060:0,1,0,1
chr5	60218062	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60218060_A_C:60218060:0,1,0,1
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr5	60827236	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr5	60837859	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr5	60840168	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60840168_G_C:60840168:1,0,1,0
chr5	60840170	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60840168_G_C:60840168:1,0,1,0
chr5	60982634	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=16,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.778:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr5	60982953	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=0,323;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60982953_TA_CT:60982953:0,1,0,1
chr5	60982956	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=0,323;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60982953_TA_CT:60982953:0,1,0,1
chr5	61602209	.	T	TGCCCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,19;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.699:4:0,0:0,1:0|1:61602209_T_TGCCCC:61602209:1,0,3,0
chr5	61602215	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.699:4:0,0:0,2:0|1:61602209_T_TGCCCC:61602209:1,0,3,0
chr5	61602219	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:61602209_T_TGCCCC:61602209:0,0,2,0
chr5	61602223	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:61602209_T_TGCCCC:61602209:0,2,2,0
chr5	61602230	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:61602209_T_TGCCCC:61602209:0,3,2,0
chr5	61642937	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,19,13
chr5	61643816	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr5	61648394	.	A	AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.197:29:9,1:14,4:19,4,4,2
chr5	61649152	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.152:48:20,1:21,2:17,24,6,1
chr5	61649160	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.079:59:24,4:30,0:22,33,4,0
chr5	61653607	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:61653607_T_G:61653607:2,10,1,1
chr5	61653611	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:61653607_T_G:61653607:2,9,1,1
chr5	61653614	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:61653607_T_G:61653607:2,9,1,1
chr5	61654169	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:61654169_T_TG:61654169:0,6,0,2
chr5	61654174	.	TCA	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:61654169_T_TG:61654169:0,7,0,2
chr5	61654177	.	T	TTG	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:61654169_T_TG:61654169:0,8,0,2
chr5	61654179	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:0|1:61654169_T_TG:61654169:0,8,0,2
chr5	61654187	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	61654209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:61654209_T_C:61654209:0,4,0,1
chr5	61654211	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:61654209_T_C:61654209:0,4,0,1
chr5	61654213	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:61654209_T_C:61654209:0,4,0,1
chr5	61657228	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr5	61657377	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr5	61661212	.	T	TGTATCAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=218,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,1,1
chr5	61673670	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	61676902	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:61676902_G_T:61676902:0,0,5,1
chr5	61676911	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:61676902_G_T:61676902:0,0,6,1
chr5	61684773	.	CAAATACAAA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATACAAA;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:5,2:14,4,1,1
chr5	61684882	.	GA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.951:39:0,16:1,22:0,1,19,19
chr5	61688144	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:61688144_T_C:61688144:0,4,0,2
chr5	61688149	.	A	AATCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:61688144_T_C:61688144:0,4,0,2
chr5	61688152	.	C	CACTTTCCAAACACCTGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61688144_T_C:61688144:0,4,0,1
chr5	61688892	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	61689740	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=60.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,7:0,14:0,0,16,8
chr5	61690221	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,25;MFRL=83,141;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61690221_A_G:61690221:3,1,1,0
chr5	61690225	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=83,141;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:61690221_A_G:61690221:3,1,1,0
chr5	61690227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:61690221_A_G:61690221:2,1,1,0
chr5	61690286	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:0|1:61690286_G_A:61690286:16,11,0,2
chr5	61690288	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,1:15,0:0|1:61690286_G_A:61690286:16,13,0,2
chr5	61690292	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,2:19,0:19,14,0,2
chr5	61697808	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:6,1:13,4,2,1
chr5	61699231	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr5	61699451	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr5	61715040	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	61763172	.	T	TTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	61770267	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.148:38:13,5:20,0:16,17,2,3
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	61783593	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:10,2:7,8,1,1
chr5	61822138	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr5	61832628	.	CATTATATGAA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:8,0:9,9,1,1
chr5	61874619	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,27,26;MFRL=84,72,0;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=A;STR;TLOD=3.43,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,5:0.259,0.395:12:0,3,2:3,0,2:3,1,6,2
chr5	61875419	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,0:10,3:6,17,0,3
chr5	61876377	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,2:16,2:19,9,2,2
chr5	61897752	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr5	62073118	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,6:3,4:0,10,2,8
chr5	63665610	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.185:30:9,0:16,5:10,15,0,5
chr5	63803508	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.386:32:12,5:5,7:6,14,7,5
chr5	64023982	.	TTC	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:16,2:12,0:13,17,0,2
chr5	64036981	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,74;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,2:12,0:7,10,1,1
chr5	64081338	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=99,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:10,1:18,2:15,13,1,2
chr5	64100238	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:64100238_T_A:64100238:6,18,1,1
chr5	64100245	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:64100238_T_A:64100238:5,13,1,1
chr5	64100246	.	T	TATTGCAGGCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:64100238_T_A:64100238:5,12,1,1
chr5	64181311	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,0:16,3:18,13,0,3
chr5	64272965	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=144,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:11,0:8,2:0|1:64272965_C_T:64272965:14,10,1,1
chr5	64272970	.	ACTGCTGAACCAGTTTAAATCTAAACTCACTCAAGCAATTGCTGAAACGCCT	A	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,2:0.045:65:13,0:11,2:0|1:64272965_C_T:64272965:44,19,1,1
chr5	64273018	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.660:45:6,23:8,7:8,7,25,5
chr5	64273026	.	A	AATATCCAAAGATAAAAATAAAAT	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:26,1:16,2:32,13,2,1
chr5	64273028	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:28,0:17,1:32,13,2,1
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	64510784	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr5	64569374	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:6,2:3,3:7,2,3,2
chr5	64756138	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:7,0:3,4:7,3,2,2
chr5	64756160	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=22,30;MFRL=150,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:64756160_A_T:64756160:2,8,0,2
chr5	64756167	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=150,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:64756160_A_T:64756160:2,8,0,2
chr5	64756169	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=150,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:64756160_A_T:64756160:2,8,0,2
chr5	64756170	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=150,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:64756160_A_T:64756160:2,8,0,2
chr5	64824865	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:11,10,2,0
chr5	64825102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,5:2,6:4,2,8,3
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,0:1,9:0,3,1,8
chr5	64848442	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	64863320	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,1:7,8:9,5,8,1
chr5	64863484	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.321:14:3,0:6,4:0,10,0,4
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr5	64881936	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:3,4,4,5
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=61,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:7,3:2,4:4,5,2,5
chr5	64905069	.	CCTG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,2:7,0:14,7,1,1
chr5	64905365	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=211,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64905365_A_G:64905365:0,2,0,1
chr5	64905374	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64905365_A_G:64905365:0,3,0,1
chr5	64905376	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64905365_A_G:64905365:0,3,0,1
chr5	64905379	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64905365_A_G:64905365:0,3,0,1
chr5	64905382	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64905365_A_G:64905365:0,3,0,1
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:7,6,5,3
chr5	64920141	.	C	CTGATGTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:64920141_C_CTGATGTA:64920141:0,3,0,1
chr5	64920143	.	C	CCCTGAACTTAAAAGTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:64920141_C_CTGATGTA:64920141:0,3,0,1
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:7,0,8,0
chr5	64933457	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=17,32,31,24;MFRL=144,94,168,58;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,12,8;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.02,6.41,9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,4,5,9:0.127,0.169,0.316:28:2,3,3,4:2,1,2,2:4,6,12,6
chr5	64933668	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=123,211;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr5	64933695	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,170;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr5	64942852	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:2,3:6,1:6,4,3,1
chr5	64954159	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:4,2,4,1
chr5	64956428	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	64956646	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,0:16,2:0|1:64956646_A_G:64956646:13,12,0,2
chr5	64956650	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,0:18,2:0|1:64956646_A_G:64956646:14,12,0,2
chr5	64960311	.	A	ATCTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TC;STR;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.741:14:1,5:2,6:2,1,8,3
chr5	64968155	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=112,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:4,8,1,1
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.515:8:3,1:1,2:1,3,0,4
chr5	65008946	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=227,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr5	65018321	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr5	65081745	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:1,0:5,1:0|1:65081745_C_CTT:65081745:0,6,1,1
chr5	65081758	.	C	CTTTTATTTTTATTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,1:0|1:65081745_C_CTT:65081745:0,7,1,1
chr5	65088487	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:6,2:5,7,2,1
chr5	65105622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.142:36:17,1:10,4:19,12,4,1
chr5	65317332	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr5	65319231	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.193:21:11,0:6,4:0|1:65319231_G_T:65319231:5,12,0,4
chr5	65319233	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.193:21:11,0:6,4:0|1:65319231_G_T:65319231:5,12,0,4
chr5	65322322	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	65346728	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:17,0:12,6:13,16,0,6
chr5	65350374	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:4,4:3,5:4,3,4,6
chr5	65350866	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=156,165;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:1,0:1,1:0|1:65350866_G_GC:65350866:0,2,0,1
chr5	65350867	.	A	AACCTCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=156,165;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:1,0:1,1:0|1:65350866_G_GC:65350866:0,2,0,1
chr5	65350871	.	T	TTCTCTTTAGGATTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,165;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	65372245	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:5,8,0,2
chr5	65372793	.	CT	C,CTT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31,21;MFRL=170,126,102;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=9.03,25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,6,20:0.153,0.456:42:8,3,8:8,2,11:7,9,10,16
chr5	65459523	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=213,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr5	65465912	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:22,7:11,0:19,14,7,0
chr5	65470710	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:16,5,2,0
chr5	66084418	.	C	CCGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=65,164;MMQ=21,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,0:0,0:0|1:66084418_C_CCGGGGG:66084418:1,0,2,0
chr5	66084419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,14;MFRL=65,164;MMQ=21,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,0:0,0:0|1:66084418_C_CCGGGGG:66084418:1,0,2,0
chr5	66084424	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.761:2:0,0:0,2:0|1:66084418_C_CCGGGGG:66084418:0,0,2,0
chr5	66084676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	66088066	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,54;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:10,6:8,4:10,8,8,2
chr5	66195828	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:23,0:5,2:0|1:66195828_G_T:66195828:5,23,1,1
chr5	66195834	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:17,0:4,2:0|1:66195828_G_T:66195828:2,22,1,1
chr5	66195835	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:5,2:0|1:66195828_G_T:66195828:2,21,1,1
chr5	66195845	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:66195828_G_T:66195828:2,12,1,1
chr5	66195847	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:66195828_G_T:66195828:2,12,1,1
chr5	66198579	.	CTTTTCCAGAGGCATTCCAGCTTCCTAGACAGCTGGATTTTAGCTATTTCTCTTCT	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=89,45;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.134:21:5,2:13,0:9,10,1,1
chr5	66198591	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,0:8,3:5,7,1,2
chr5	66198628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0|1:66198628_C_T:66198628:0,3,0,2
chr5	66198633	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=141,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:66198628_C_T:66198628:0,2,0,2
chr5	66226694	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66226694_TG_T:66226694:0,0,0,1
chr5	66226696	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66226694_TG_T:66226694:0,0,0,1
chr5	66282408	.	A	AGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=76,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:1,6,1,1
chr5	66282444	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=246,0;MMQ=60,38;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	66300721	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:1,3:2,1:3,0,4,1
chr5	66391516	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=83,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:2,2:4,1:3,10,1,3
chr5	66400273	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:12,3:18,0:13,18,1,2
chr5	66416764	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr5	66438174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr5	66448592	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,0:4,2:5,12,2,0
chr5	66456460	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr5	66478626	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr5	66480450	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr5	67522749	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:29,0:27,3:24,32,1,2
chr5	67569391	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr5	67569746	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,10:2,5:5,1,10,5
chr5	67590485	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,2:6,0:12,10,0,2
chr5	67591029	.	G	GC	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:31,0:24,3:22,33,0,3
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:1,7,3,5
chr5	68411010	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:2,7:5,7:4,3,6,9
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,0:3,7:0,7,4,3
chr5	68413042	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:3,8:0,6:3,0,13,1
chr5	68417570	.	TTAGCCATGCCCA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAGCCATGCCCA;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:10,0:16,2:18,15,1,1
chr5	68417755	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:1,9,2,5
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=85,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:5,2,7,0
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,4:0,6,0,6
chr5	68470116	.	GG	AA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=96,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:17,7,1,1
chr5	68485397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=176,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68485397_C_T:68485397:1,0,1,0
chr5	68485400	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=176,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68485397_C_T:68485397:1,0,1,0
chr5	68487739	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=134,91;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:0|1:68487739_G_A:68487739:1,8,0,2
chr5	68487746	.	CTA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=145,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.364:9:2,2:3,1:1|0:68487739_G_A:68487739:0,6,0,3
chr5	68487750	.	C	CTGTT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,3:0.333:10:2,2:3,1:1|0:68487739_G_A:68487739:0,7,0,3
chr5	68487751	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:2,2:0|1:68487739_G_A:68487739:0,5,0,4
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chr5	68661125	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,99;MMQ=60,33;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:9,2:12,1:8,13,1,2
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chr5	68695860	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.439:37:13,15:7,0:16,5,16,0
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chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:1,5:4,0:1,4,1,4
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chr5	68729005	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=315,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68728986_T_C:68728986:0,1,0,1
chr5	68737561	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=171,133;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:15,1:1,1:0,17,0,2
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,101;MMQ=45,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.773:7:0,3:1,3:1,0,3,3
chr5	68868255	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,31;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
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chr5	70308248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=153,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:3,8,1,1
chr5	70308251	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=159,56;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:3,6,1,3
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chr5	70398830	.	GAC	AGT	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=30,25;MFRL=111,133002;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:22,0:0,3:0|1:70398820_CA_TG:70398820:10,14,0,3
chr5	70398836	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=22,34;MFRL=112,133002;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:21,0:0,3:0|1:70398820_CA_TG:70398820:8,13,0,3
chr5	70398861	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=24,30;MFRL=146,143;MMQ=40,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:0|1:70398861_A_G:70398861:0,9,0,2
chr5	70398866	.	GG	AC	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=31,21;MFRL=146,143;MMQ=40,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,1:1,0:0|1:70398861_A_G:70398861:0,9,0,2
chr5	70398867	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=30,25;MFRL=152,121;MMQ=40,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,2:1,0:0,7,0,2
chr5	70398896	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:0|1:70398896_CA_TG:70398896:0,3,0,1
chr5	70398900	.	TTAATATAA	T,CTAATATAA	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=28,27,31;MFRL=173,121,173;MMQ=40,40,40;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr5	70398902	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=23,30;MFRL=173,173;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:70398896_CA_TG:70398896:0,2,0,1
chr5	70398904	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=27,27;MFRL=173,173;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:70398896_CA_TG:70398896:0,2,0,1
chr5	70398905	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=25,29;MFRL=173,173;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:70398896_CA_TG:70398896:0,2,0,1
chr5	70398910	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=23,27;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:70398896_CA_TG:70398896:0,3,0,1
chr5	70398913	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=14;MBQ=28,29;MFRL=183,121;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:70398913_T_C:70398913:0,2,0,1
chr5	70398914	.	TGAAAATA	T	.	.	DP=3;ECNT=14;MBQ=28,26;MFRL=251,121;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:70398913_T_C:70398913:0,2,0,1
chr5	70751818	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,22:0,22:0,0,21,23
chr5	70754508	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:14,0:12,2:0|1:70754508_T_C:70754508:13,16,0,3
chr5	70754510	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,0:12,3:0|1:70754508_T_C:70754508:14,16,0,3
chr5	70754511	.	GTCTAGTGTCAGTGTTC	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:13,0:12,3:0|1:70754508_T_C:70754508:20,15,0,3
chr5	70754529	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=140,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:12,0:12,3:0|1:70754508_T_C:70754508:15,12,0,3
chr5	70779819	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,130;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:0|1:70779819_T_A:70779819:0,6,0,5
chr5	70779823	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=139,130;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:1,0:4,5:0|1:70779819_T_A:70779819:0,6,0,5
chr5	70786726	.	G	GAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr5	70798676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,34;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	70798689	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:70798689_C_T:70798689:0,3,0,1
chr5	70798691	.	CACATACTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:70798689_C_T:70798689:0,3,0,1
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,1:1,5:5,1,6,0
chr5	70805277	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:1,5:6,1:8,0,5,1
chr5	70805460	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:8,1:9,5,1,1
chr5	70806649	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:3,7,2,2
chr5	70806958	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,12:0,0,13,14
chr5	70806984	.	T	TTATA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:9,11,1,1
chr5	70807016	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:0,3,1,3
chr5	70807073	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr5	70808992	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:21,4:17,0:14,24,0,4
chr5	70809130	.	GAATCAGAAAAATATATATATGAGAAGA	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=95,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.083:36:10,0:12,2:0|1:70809130_GAATCAGAAAAATATATATATGAGAAGA_G:70809130:16,18,1,1
chr5	70809169	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=63,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,12:0.315:40:5,7:21,5:1|0:70809130_GAATCAGAAAAATATATATATGAGAAGA_G:70809130:14,14,6,6
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr5	70818329	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=97,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.346:15:4,3:4,2:3,7,0,5
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=159,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:8,10:8,6:7,9,8,8
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.906:13:0,6:0,4:1,0,4,8
chr5	70840433	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=205,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr5	70892027	.	GATTAAGT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:2,5,1,3
chr5	70930966	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=99,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,6:4,4:4,2,8,2
chr5	70939801	.	T	TAAACGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=124,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	70944935	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=104,169;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,7:8,0:12,7,7,0
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:4,2,4,1
chr5	71490962	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=94,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.500:52:12,13:14,13:14,12,14,12
chr5	71491462	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.210:50:23,0:16,10:21,19,0,10
chr5	71492063	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=99,51;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:17,0:17,5:16,18,0,5
chr5	71492220	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:4,3:2,7,0,3
chr5	71492480	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=100,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,1:8,2:9,5,1,2
chr5	71492922	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:71492922_C_G:71492922:8,5,1,1
chr5	71492938	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:71492922_C_G:71492922:11,10,1,1
chr5	71495574	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr5	71500891	.	TTTTTTTTCTCTCCCTGCAGGTGACACTGATCCCAACTCATGACTCAG	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.092:42:8,0:13,3:0|1:71500891_TTTTTTTTCTCTCCCTGCAGGTGACACTGATCCCAACTCATGACTCAG_T:71500891:26,13,0,3
chr5	71500941	.	GTGATGA	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:16,0:6,3:0|1:71500891_TTTTTTTTCTCTCCCTGCAGGTGACACTGATCCCAACTCATGACTCAG_T:71500891:13,14,0,3
chr5	71500949	.	GGAATGGTA	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=109,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:20,0:7,3:13,15,0,3
chr5	71500958	.	CCAGGAGACCCATG	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=112,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.113:35:17,0:5,3:0|1:71500891_TTTTTTTTCTCTCCCTGCAGGTGACACTGATCCCAACTCATGACTCAG_T:71500891:14,18,0,3
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	71524196	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=132,114;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:6,0:8,9:0|1:71524196_C_A:71524196:7,7,0,9
chr5	71524199	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,114;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:6,0:7,9:0|1:71524196_C_A:71524196:7,7,0,9
chr5	71593395	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,1:2,1:7,1,2,0
chr5	71622449	.	TAGAAACTTGAAAA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:5,0:13,9,1,1
chr5	71627005	.	G	GTAATGAAAATGATTCAATGATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71627005_G_GTAATGAAAATGATTCAATGATC:71627005:0,1,0,1
chr5	71627008	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,0:0|1:71627005_G_GTAATGAAAATGATTCAATGATC:71627005:0,1,0,1
chr5	71634466	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=95,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:10,8,2,0
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	71743097	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:7,1,4,1
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,3,0
chr5	72112430	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,3,0
chr5	72182815	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr5	72182857	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr5	72184098	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,14:0,11:0,0,12,13
chr5	72195764	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,10:0.214:49:18,10:21,0:32,7,10,0
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	72302420	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:12,2:0|1:72302420_T_A:72302420:9,17,1,1
chr5	72302423	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:72302420_T_A:72302420:9,17,1,1
chr5	72302452	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:0,13,0,2
chr5	72364660	.	GCTAAATATGTATA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:72364660_GCTAAATATGTATA_G:72364660:0,3,0,1
chr5	72364673	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.819:3:0,2:0,1:1|0:72364660_GCTAAATATGTATA_G:72364660:0,0,0,3
chr5	72378758	.	TAACA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=182,111;MMQ=56,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:4,0:0,10,0,2
chr5	72469128	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=83,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:12,6,1,1
chr5	72469195	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:8,10,0,2
chr5	72798502	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30,36;MFRL=0,201,0;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.50,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.335,0.465:2:0,1,1:0,0,0:0,0,1,1
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	72800117	.	TGGTGAA	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=94,139;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:9,3:8,3:0|1:72800117_TGGTGAA_T:72800117:11,25,6,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=95,139;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:12,0:22,1:0|1:72800117_TGGTGAA_T:72800117:14,27,6,0
chr5	72800129	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=23,14;MFRL=93,182;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:16,0:28,0:0|1:72800117_TGGTGAA_T:72800117:15,32,2,0
chr5	72849242	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,1:3,2:7,4,2,1
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	72853314	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,3:2,6:5,0,9,0
chr5	72864088	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:22,2:22,1:22,22,1,2
chr5	72865307	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:13,5,7,3
chr5	72866469	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,1:5,1:11,8,0,2
chr5	72868395	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:10,2:8,11,1,1
chr5	72868405	.	T	TCTTTCCATATTAGA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:4,1,1,1
chr5	73076457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:5,2:6,4,5,0
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,5:5,6:3,6,6,5
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:0,3,6,3
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,3:3,2:6,2,4,1
chr5	73142178	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:9,1:12,11,1,1
chr5	73153389	.	TACAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AC;STR;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	73154100	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,5:5,1:3,5,2,4
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr5	73169150	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=195,143;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:2,5,2,4
chr5	73197185	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr5	73197200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	73932315	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,10:0,21:0,0,11,21
chr5	73985121	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:4,0,6,0
chr5	73992406	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr5	74034045	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=84,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:74034045_A_G:74034045:2,0,1,0
chr5	74034053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=84,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:74034045_A_G:74034045:2,0,1,0
chr5	74064789	.	CG	TT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:23,2:16,0:23,16,1,1
chr5	74078788	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:74078788_A_T:74078788:6,6,1,1
chr5	74078793	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:74078788_A_T:74078788:7,6,1,1
chr5	74078796	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,1:0|1:74078788_A_T:74078788:7,6,1,1
chr5	74096834	.	GAAACAGATGTTTTATCATGACCTGAGGAGAAAAACAGCA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.129:22:7,2:9,0:6,14,1,1
chr5	74324451	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=59,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr5	74324548	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=93,108;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,1:7,3:8,6,1,3
chr5	74326139	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:4,3,2,6
chr5	74639576	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	74647234	.	TGA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,1128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:10,6:9,0:13,7,0,6
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:2,4,0,4
chr5	74655726	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr5	74655882	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.172:38:18,6:14,0:9,23,6,0
chr5	74677977	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=72,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:3,4:1,9:2,3,5,8
chr5	74695239	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=90,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.096:37:16,3:16,0:0|1:74695239_C_A:74695239:18,16,1,2
chr5	74695241	.	A	AAATATCATTAACATTTT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=90,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.096:37:16,2:15,0:0|1:74695239_C_A:74695239:18,16,1,2
chr5	74872797	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=300,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.509:6:1,1:2,0:0,3,0,3
chr5	74877361	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,0:2,1:0|1:74877361_G_A:74877361:0,2,0,1
chr5	74877368	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=231,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74877361_G_A:74877361:0,1,0,1
chr5	74877369	.	T	TAAAAGGCAAATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=231,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74877361_G_A:74877361:0,1,0,1
chr5	74880496	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	74986241	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,0:11,3:11,5,1,2
chr5	74988369	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	75427518	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr5	75581666	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:4,0:10,2:0|1:75581666_G_GC:75581666:8,8,2,1
chr5	75581672	.	G	GCACTCCATGCTGGCT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,0:10,3:0|1:75581666_G_GC:75581666:8,10,2,1
chr5	75581674	.	T	TTGACAGCAC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,0:9,3:0|1:75581666_G_GC:75581666:8,9,2,1
chr5	75621263	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:75621263_T_G:75621263:10,7,1,1
chr5	75621270	.	C	CTCTGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:75621263_T_G:75621263:9,5,1,1
chr5	75888788	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=90,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.707:25:4,6:3,12:2,5,5,13
chr5	75913305	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=70,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	75923141	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr5	75923285	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=81,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,27:0.670:40:7,18:6,9:7,6,17,10
chr5	75923294	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,24:0,15:0,0,21,18
chr5	75923307	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,24:0,12:0,0,17,19
chr5	75923393	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:2,4,1,10
chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	75927635	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:7,2,2,1
chr5	75932869	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=82,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:1,1:7,4:5,4,3,2
chr5	75932965	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,4:5,7:6,4,8,3
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:4,0,2,1
chr5	75960818	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,2:5,4:0|1:75960818_T_TA:75960818:10,3,4,2
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chr5	75964524	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,100;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.249:33:10,7:15,0:13,12,8,0
chr5	75967862	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr5	75969747	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,17:0,3:0,0,16,4
chr5	75979007	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=92,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.244:43:21,6:12,4:20,13,2,8
chr5	75994052	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=137,32;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:75994052_G_C:75994052:0,2,1,1
chr5	75994055	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,32;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:75994052_G_C:75994052:0,2,1,1
chr5	75994058	.	TA	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=137,32;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:75994052_G_C:75994052:0,2,1,1
chr5	75994065	.	GAAAACTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,32;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:75994052_G_C:75994052:0,2,1,1
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=215,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,6,1
chr5	75997063	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:3,4:5,5:0|1:75997063_A_G:75997063:1,7,2,8
chr5	75997069	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:3,2:5,6:0|1:75997063_A_G:75997063:1,7,2,7
chr5	75998488	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr5	76028946	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:8,10,3,0
chr5	76129704	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	76173592	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:8,10,1,2
chr5	76173722	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=215,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	76173727	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	76173744	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:76173744_C_CTG:76173744:0,3,0,1
chr5	76173747	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:76173744_C_CTG:76173744:0,3,0,1
chr5	76173752	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:76173744_C_CTG:76173744:0,3,0,1
chr5	76249062	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=86,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:4,5,3,2
chr5	76249901	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:7,2,2,2
chr5	76331271	.	GCTTTTTGTGTTTAAATGCCAGTGTTTTGTAGTTAAGTC	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.151:22:4,0:3,2:19,1,2,0
chr5	76332606	.	C	A,T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24,30;MFRL=196,112,171;MMQ=60,50,59;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.27,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.187,0.188:13:4,1,1:5,1,1:0,9,0,4
chr5	76351466	.	G	GTTTTGGTTAAAAAAAAGCCACTAAATCTGA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=129,56;MMQ=60,56;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:17,0:10,1:5,22,1,2
chr5	76351493	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=135,56;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:76351493_G_A:76351493:1,20,0,2
chr5	76351498	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=135,56;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:0|1:76351493_G_A:76351493:1,20,0,2
chr5	76355362	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr5	76359090	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.518:23:4,5:6,5:3,8,2,10
chr5	76359164	.	A	ACACAAAGCCCTCAGGGCCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:76359164_A_ACACAAAGCCCTCAGGGCCT:76359164:0,4,0,2
chr5	76359168	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:76359164_A_ACACAAAGCCCTCAGGGCCT:76359164:0,4,0,2
chr5	76621612	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	76649192	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:5,4:11,0:10,10,2,2
chr5	76704713	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,3:0,4:4,1,4,3
chr5	76704849	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr5	76707438	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr5	76709171	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:76709171_G_GCT:76709171:0,3,0,1
chr5	76709172	.	A	AATTTTTTGTATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:76709171_G_GCT:76709171:0,3,0,1
chr5	76717583	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr5	76722442	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=224,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0|1:76722442_C_T:76722442:0,1,0,3
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr5	76722449	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=147,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:0,1:1|0:76722442_C_T:76722442:0,4,0,1
chr5	76729075	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:4,0:17,2:0|1:76729075_C_T:76729075:9,13,1,1
chr5	76729078	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:2,0:14,2:0|1:76729075_C_T:76729075:7,12,1,1
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=174,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr5	76732243	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:2,3:7,3:0|1:76732243_A_C:76732243:3,6,0,6
chr5	76732249	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:0,2:8,3:0|1:76732243_A_C:76732243:3,6,0,5
chr5	76736734	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:7,11,2,0
chr5	76736884	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr5	76736907	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	76745752	.	ACTC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=208,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,2:10,3:13,4,3,2
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.511:36:8,8:8,8:4,13,4,15
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,2:1,3:1,0,1,5
chr5	76787910	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:76787910_G_A:76787910:2,0,1,1
chr5	76787915	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:76787910_G_A:76787910:2,0,1,1
chr5	76926212	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	76932921	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr5	77004031	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr5	77004229	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr5	77004268	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr5	77471588	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,1:8,2:12,13,2,1
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=92.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,9:0,0,4,22
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr5	77784696	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=58,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	78076288	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:19,2:14,2:21,13,2,2
chr5	78076582	.	G	GTGCATATGGTAGTAATGGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	78135276	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr5	78265041	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr5	78301325	.	C	CTTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=226,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:78301325_C_CTTAA:78301325:0,1,0,1
chr5	78301329	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=226,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78301325_C_CTTAA:78301325:0,1,0,1
chr5	78320041	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,124;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,7:6,0:9,4,7,0
chr5	78340163	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:78340163_C_T:78340163:14,5,1,1
chr5	78340186	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=106,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:78340163_C_T:78340163:11,4,1,1
chr5	78340190	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:78340163_C_T:78340163:10,4,1,1
chr5	78340411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	78347206	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:78347206_C_T:78347206:6,11,1,1
chr5	78347211	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:78347206_C_T:78347206:7,12,1,1
chr5	78347213	.	T	TTTA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:78347206_C_T:78347206:8,10,1,1
chr5	78347217	.	A	AGAACAG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:0|1:78347206_C_T:78347206:7,10,1,1
chr5	78373251	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.812:9:1,8:0,0:1,0,7,1
chr5	78376460	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,107;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,12:6,0:7,1,12,0
chr5	78411822	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=62,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr5	78415203	.	GAGTA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:2,0:2,2:0|1:78415203_GAGTA_G:78415203:0,5,1,1
chr5	78415209	.	A	AGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:78415203_GAGTA_G:78415203:0,5,1,1
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	78416973	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:1,3:3,3,6,0
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:2,0,10,0
chr5	78422039	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=112,112;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:6,11,0,3
chr5	78423735	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=167,134;MMQ=30,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:2,6,2,3
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,312;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:6,1,5,0
chr5	78608354	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=104,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.814:8:0,1:1,4:0,1,0,7
chr5	78693442	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,0:3,6:2,6,0,6
chr5	78693526	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	78742858	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr5	78919267	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:13,7,0,2
chr5	78936972	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.498:46:14,11:9,10:12,11,8,15
chr5	78944371	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr5	78964887	.	A	ATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TG;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	79024949	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:2,6,4,3
chr5	79026125	.	CTACCCATAGCTAT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:7,11,1,1
chr5	79026401	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:0|1:79026401_A_C:79026401:4,6,1,1
chr5	79026406	.	T	TAGCCAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:79026401_A_C:79026401:6,6,1,1
chr5	79027156	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=107,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:7,6:3,0:4,6,6,0
chr5	79029033	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:79029033_A_T:79029033:2,6,1,1
chr5	79029035	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:79029033_A_T:79029033:2,6,1,1
chr5	79029042	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:79029033_A_T:79029033:2,6,1,1
chr5	79029047	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,0:2,1:0|1:79029033_A_T:79029033:2,5,1,1
chr5	79031128	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:3,8,2,0
chr5	79040977	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.527:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr5	79041039	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:16,2:4,0:12,9,2,0
chr5	79286568	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=238,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr5	79361221	.	TTCTGCACTAGG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=105,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:11,2:15,10,1,1
chr5	79363919	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=87,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,2:12,0:9,9,0,2
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	79617357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=75,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:2,3:4,2:4,2,2,3
chr5	79617697	.	AGGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79617697_AGGG_A:79617697:0,0,0,1
chr5	79617704	.	GTTC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79617697_AGGG_A:79617697:0,0,0,1
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr5	79738957	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:8,6,1,2
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	79741303	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=196,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.402:5:1,1:2,0:0|1:79741303_GCT_G:79741303:0,3,0,2
chr5	79741306	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=196,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.402:5:0,1:2,0:0|1:79741303_GCT_G:79741303:0,3,0,2
chr5	79741318	.	TAACAC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:0|1:79741318_TAACAC_T:79741318:0,2,0,1
chr5	79741324	.	TTTGAGCTTCCTAAAATAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=211,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:79741318_TAACAC_T:79741318:0,1,0,1
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,15,7
chr5	79768833	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:79768833_G_A:79768833:0,6,0,2
chr5	79768836	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:3,0:0|1:79768833_G_A:79768833:0,6,0,2
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	79809658	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	79854777	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:10,2:2,0:6,6,1,1
chr5	79855372	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,13,9
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,2:3,5:2,4,2,5
chr5	79933653	.	T	TGAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAA;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,2:0,0,14,0
chr5	79950497	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,0,2,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,0,2,0
chr5	79950699	.	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=109,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:4,5:4,0:4,8,2,3
chr5	79950741	.	GCCCCCAGCT	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=121,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:4,3:1,7,0,6
chr5	79950781	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr5	79952154	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=190,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:4,2:1,2:5,0,3,1
chr5	79952165	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=115,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,3:4,2:8,1,3,2
chr5	79952390	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,3:5,4:1,5,0,7
chr5	79952426	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,2:4,4:0,4,1,5
chr5	79960955	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,2,2
chr5	79961241	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	79965953	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:9,3,2,1
chr5	79966135	.	C	CATG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:20,1:6,1:11,15,0,2
chr5	79966197	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	79968205	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,104;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,0:4,14:3,5,0,14
chr5	79968258	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=55,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr5	79968271	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=55,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:1,2,0,4
chr5	79968496	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=188,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	80021193	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:3,0,3,0
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,3:1,2:5,0,4,1
chr5	80149981	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=207,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,2:3,7:5,2,5,4
chr5	80160596	.	AAATG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr5	80171590	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=114,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,0:14,4:20,9,1,3
chr5	80338594	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr5	80338762	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,115;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,17:0.301:57:21,16:19,0:24,16,17,0
chr5	80366344	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=87,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,1:0|1:80366344_C_T:80366344:9,6,1,1
chr5	80366353	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:80366344_C_T:80366344:9,6,1,1
chr5	80388823	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=240,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,1,4
chr5	80409526	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:2,2,4,4
chr5	80508477	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	80547182	.	A	AAGGTAGAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=172,121;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	80559510	.	T	TTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80559510_T_TTC:80559510:0,3,0,1
chr5	80559511	.	A	ACCATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:80559510_T_TTC:80559510:0,3,0,1
chr5	80562120	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:0,5,0,7
chr5	80604430	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:6,10:5,4:4,7,8,6
chr5	80608389	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=102,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:10,6,2,0
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr5	80640053	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=149,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:2,10,0,3
chr5	80689953	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	80744722	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr5	80744758	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	80756855	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,12,6
chr5	80911184	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	80946059	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,104;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:12,1,3,0
chr5	81283563	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:2,9,1,1
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=220,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:6,1,3,0
chr5	81549240	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,2:8,6:2,10,0,8
chr5	81549262	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:1,9,0,4
chr5	81549280	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=155,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,14:0,0,31,4
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr5	81573711	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,1,5
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr5	81601142	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr5	81601345	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=141,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr5	82360783	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=74,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:10,5:1,4:8,3,6,3
chr5	82360944	.	GAA	G,GA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=18,25,17;MFRL=136,90,165;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58,8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.181,0.344:12:1,1,0:0,0,0:0,6,0,6
chr5	82491802	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,3:0,1:1,3,0,4
chr5	82815158	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:1,1,5,3
chr5	82815170	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:1,3,5,3
chr5	82835724	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:3,5,2,1
chr5	82835934	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,0:9,7:6,9,2,5
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,5:1,1:4,0,6,0
chr5	82868173	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=308,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,3:0,1,1,8
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	82948666	.	A	ATTCACAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chr5	83360521	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=125,121;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,0:10,6:9,6,6,0
chr5	86564564	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:1,11:6,2:1,6,5,8
chr5	86633973	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:0,6,0,8
chr5	86637164	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:5,2:10,4:2,14,3,5
chr5	86667856	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	86674144	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	86679495	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,27,24,27;MFRL=127,96,133,175;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,23,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,15,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.24,3.36,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,3,3:0.182,0.190,0.227:15:2,1,1,1:2,2,2,2:4,2,6,3
chr5	86697598	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	87494728	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.279:22:8,5:6,2:14,1,6,1
chr5	87502320	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:4,2:2,7,0,5
chr5	87502325	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.794:12:0,4:0,5:0,3,2,7
chr5	87516544	.	G	A,GAAAAAAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=15,21,34;MFRL=118,200,0;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.43,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.128,0.628:5:0,0,1:0,1,0:0,2,1,2
chr5	88018388	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.510:11:2,1:2,1:5,1,2,3
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	89814604	.	G	GTGACC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACC;STR;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr5	89815312	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	89815359	.	A	AGGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=221,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	89820984	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,12,10
chr5	89910684	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:16,4:8,0:11,13,0,4
chr5	89914876	.	TATTTTATTTTTGGG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:4,0:11,2,1,1
chr5	89938811	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,2:5,0:0|1:89938811_AG_A:89938811:9,8,1,1
chr5	89938813	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:0|1:89938811_AG_A:89938811:9,8,1,1
chr5	89949802	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89949802_A_C:89949802:0,2,0,1
chr5	89949805	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89949802_A_C:89949802:0,2,0,1
chr5	89949809	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89949802_A_C:89949802:0,2,0,1
chr5	89949812	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89949802_A_C:89949802:0,2,0,1
chr5	89979993	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=53,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	89993008	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr5	89999671	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=153,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89999671_AA_TC:89999671:0,2,0,1
chr5	89999677	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=153,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89999671_AA_TC:89999671:0,2,0,1
chr5	89999688	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,242;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89999671_AA_TC:89999671:0,1,0,1
chr5	90015923	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:8,0:14,6:10,12,0,6
chr5	90021555	.	T	TTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:90021555_T_TTA:90021555:0,2,0,1
chr5	90021556	.	G	GATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:90021555_T_TTA:90021555:0,2,0,1
chr5	90021559	.	G	GTAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:90021555_T_TTA:90021555:0,2,0,1
chr5	90024488	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,166;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,0:9,2:8,6,0,2
chr5	90055411	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:90055411_T_C:90055411:4,10,0,2
chr5	90055413	.	AA	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:90055411_T_C:90055411:4,11,0,2
chr5	90055421	.	CA	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:90055411_T_C:90055411:1,9,0,2
chr5	90070194	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90070194_T_C:90070194:0,3,0,1
chr5	90070200	.	A	ATGAAATAGTGTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90070194_T_C:90070194:0,3,0,1
chr5	90072204	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=116,149;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:5,0:0|1:90072204_T_A:90072204:9,2,3,0
chr5	90072207	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=116,149;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:0|1:90072204_T_A:90072204:9,2,3,0
chr5	90073890	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:14,7,1,1
chr5	90083957	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=106,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.147:42:15,0:20,5:12,24,2,4
chr5	90085633	.	G	GACCACCAGCTGCCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=158,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr5	90086590	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	90107108	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,6:0,0,10,11
chr5	90125073	.	T	TGGAAGAAACAAAACAAGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=64,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.466:18:7,4:3,4:7,3,7,1
chr5	90446094	.	C	CTCTCCTTTCT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.175:26:13,4:8,0:0|1:90446094_C_CTCTCCTTTCT:90446094:5,17,2,2
chr5	90446100	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:90446094_C_CTCTCCTTTCT:90446094:5,18,0,2
chr5	90449018	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:0,0:4,1:0|1:90449018_C_T:90449018:4,0,1,0
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.922:10:0,4:0,6:0|1:90449018_C_T:90449018:0,0,9,1
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	90671274	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:2,6:8,5:9,1,10,1
chr5	92923631	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,1:10,2:12,2,2,1
chr5	93076451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=193,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr5	93217466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	93388777	.	T	TATAG,TATAGATAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21,21;MFRL=0,235,235;MMQ=60,53,43;MPOS=0,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=ATAG;STR;TLOD=6.41,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.587,0.284:4:0,1,0:0,1,1:0,0,4,0
chr5	93732304	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr5	93788579	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=95,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	93805870	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93805870_G_GC:93805870:0,1,0,1
chr5	93805872	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93805870_G_GC:93805870:0,1,0,1
chr5	93805875	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93805870_G_GC:93805870:0,1,0,1
chr5	93855984	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:10,4,3,0
chr5	93856225	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,6:2,1:2,3,4,3
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=197;ECNT=12;MBQ=24,26;MFRL=146,91;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=470.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,145:0.818:177:15,53:15,91:0|1:93905243_T_C:93905243:16,16,40,105
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=144,97;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=312.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,82:0.728:112:14,23:16,40:0|1:93905243_T_C:93905243:15,15,8,74
chr5	93905265	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=148,109;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=213.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,53:0.621:85:14,17:15,32:0|1:93905243_T_C:93905243:15,17,1,52
chr5	93905269	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=144,115;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=190.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,48:0.583:82:14,14:15,30:0|1:93905243_T_C:93905243:15,19,1,47
chr5	93905271	.	GT	CC	.	.	DP=78;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=142,116;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=178.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,45:0.582:77:8,11:17,29:0|1:93905243_T_C:93905243:15,17,1,44
chr5	93905286	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=24,32;MFRL=129,120;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.260:48:7,4:25,8:11,25,0,12
chr5	93905298	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=27,30;MFRL=142,125;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:5,3:11,10:0|1:93905298_T_C:93905298:6,12,1,13
chr5	93905301	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=29,24;MFRL=141,125;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:6,2:12,9:0|1:93905298_T_C:93905298:6,13,1,11
chr5	93905304	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=27,26;MFRL=141,127;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:5,1:12,6:0|1:93905298_T_C:93905298:6,13,1,7
chr5	93905313	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=30,34;MFRL=146,133;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:10,2:0|1:93905313_T_C:93905313:3,14,0,2
chr5	93905319	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=26,35;MFRL=149,133;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:8,2:0|1:93905313_T_C:93905313:0,14,0,2
chr5	93905329	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=25,31;MFRL=156,133;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:0|1:93905313_T_C:93905313:0,12,0,2
chr5	93966532	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93966532_A_ATT:93966532:0,1,0,1
chr5	93966535	.	A	ATATCCCCATTCATAAGTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93966532_A_ATT:93966532:0,1,0,1
chr5	93987532	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:4,6,2,5
chr5	93990281	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:9,3,2,0
chr5	93998112	.	G	GTTA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.383:14:6,0:3,5:4,5,1,4
chr5	94006023	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,3:4,0:0,7,0,3
chr5	94006794	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94006794_T_C:94006794:0,0,0,1
chr5	94006802	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94006794_T_C:94006794:0,0,0,1
chr5	94006805	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94006794_T_C:94006794:0,0,0,1
chr5	94022515	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94022515_TG_CA:94022515:0,0,0,1
chr5	94022520	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=212,199;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94022515_TG_CA:94022515:0,1,0,1
chr5	94022523	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=212,199;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:94022515_TG_CA:94022515:0,1,0,1
chr5	94027209	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:4,0,1,0
chr5	94050447	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,0:3,3:7,3,1,2
chr5	94114937	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,8:2,1:0,5,0,9
chr5	94206957	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,1:1,1:6,0,3,0
chr5	94248611	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:5,6,0,2
chr5	94259621	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:10,5:8,10:7,11,12,3
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:3,3:1,5,1,4
chr5	94749903	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.525:15:4,2:2,6:1,6,2,6
chr5	94803682	.	C	CAGCATCTTCCTGTTTATTGAGGAGTAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr5	94805703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=218,188;MMQ=41,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:94805703_C_T:94805703:0,4,0,2
chr5	94805712	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=218,188;MMQ=41,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:94805703_C_T:94805703:0,4,0,2
chr5	94826510	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,208;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:94826510_A_C:94826510:4,0,1,0
chr5	94826514	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=174,208;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:94826510_A_C:94826510:4,0,1,0
chr5	94834331	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:0,2:0,0:0,3,1,3
chr5	94845231	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,3:10,5:9,5,6,2
chr5	94860349	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	94860356	.	A	ACATGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr5	94863946	.	A	ATCCTTGAAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:94863946_A_ATCCTTGAAAT:94863946:0,0,0,1
chr5	94863953	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:94863946_A_ATCCTTGAAAT:94863946:0,0,0,1
chr5	94863955	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:94863946_A_ATCCTTGAAAT:94863946:0,0,0,1
chr5	94877416	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr5	94936716	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,0:5,2:0|1:94936716_C_T:94936716:3,4,1,1
chr5	94936726	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=177,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:0|1:94936716_C_T:94936716:3,4,1,1
chr5	95124488	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:9,11,1,1
chr5	95224700	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:1,0:1,2,2,2
chr5	95234350	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=97,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:9,4:9,8:14,5,9,3
chr5	95234377	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=109,131;MMQ=60,45;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,12:0.342:36:11,3:11,7:0|1:95234377_C_T:95234377:14,10,9,3
chr5	95234392	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=113,134;MMQ=60,50;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,13:0.350:38:14,3:11,10:0|1:95234377_C_T:95234377:11,14,8,5
chr5	95236459	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:7,4:4,9:0|1:95236459_C_T:95236459:5,6,6,7
chr5	95236474	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,9:0.434:21:3,5:9,4:1|0:95236459_C_T:95236459:4,8,2,7
chr5	95414786	.	T	TTAAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,7:0,0,13,3
chr5	95734621	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:6,5,2,1
chr5	95747963	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=112,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,6:1,2:5,1,6,2
chr5	95757561	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=109,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:9,0:16,8:19,6,8,0
chr5	95759227	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	95761432	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:0,1,2,0
chr5	95768526	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=193,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	96031569	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.334:31:14,6:6,4:15,6,3,7
chr5	96066652	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr5	96077016	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:1,0:14,2:0|1:96077016_T_C:96077016:4,11,1,1
chr5	96077021	.	T	TTGGTTAGTCAGTGAATAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=85,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:1,0:11,1:0|1:96077016_T_C:96077016:4,10,1,1
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr5	96093222	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,10:11,5:14,8,10,5
chr5	96093244	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.201:46:16,8:21,0:18,19,9,0
chr5	96093441	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr5	96097895	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	96101944	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,2,2
chr5	96116940	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:5,1:4,5:0,10,0,6
chr5	96117645	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr5	96119544	.	CACACACACACACACAT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=75,181;MMQ=54,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,2:0,1:3,0,3,0
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,6:1,6:1,1,9,5
chr5	96121715	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	96122210	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=60,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,3:4,5:3,2,4,4
chr5	96122260	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr5	96122281	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr5	96124330	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,8:0,15:0,1,11,12
chr5	96124447	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	96125910	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	96126197	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr5	96127905	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr5	96139066	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:5,1,2,0
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=105,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr5	96231000	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:9,2:11,4:9,11,5,2
chr5	96232142	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=82,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:11,2:11,10:10,12,5,7
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:1,1:2,4:0,3,1,5
chr5	96232250	.	G	T,GAAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,26,34;MFRL=73,89,168;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.222,0.444:6:0,1,0:2,0,3:0,2,0,4
chr5	96232255	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:4,0,6,0
chr5	96232367	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=182,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,0:5,4:11,1,2,2
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,3:2,7:7,1,7,3
chr5	96232663	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96232663_ACC_A:96232663:0,1,0,1
chr5	96232667	.	T	TAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96232663_ACC_A:96232663:0,1,0,1
chr5	96235849	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=143,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:7,11,1,1
chr5	96237114	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	96237287	.	G	GATGTTTTATTTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,2:0,0:3,4,1,1
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	96237971	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:6,2:0|1:96237971_G_C:96237971:14,6,1,1
chr5	96237976	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:1,2:0|1:96237971_G_C:96237971:15,6,1,1
chr5	96237979	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:14,0:3,2:0|1:96237971_G_C:96237971:11,6,1,1
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,4:6,1:3,9,1,4
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,6,1
chr5	96244835	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,6:10,0:9,6,0,6
chr5	96245439	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:5,7:15,0:8,12,2,5
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=97,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr5	96249215	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr5	96253104	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:7,3,4,0
chr5	96253336	.	CG	TA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=109,87;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,0:11,2:8,18,1,1
chr5	96253370	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=157,150;MMQ=49,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0,11,0,2
chr5	96322334	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:8,3:12,0:5,15,1,2
chr5	96322419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr5	96339102	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=86,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:3,3,1,4
chr5	96341964	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=156,151;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:5,0:5,12:3,8,0,12
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,25,24;MFRL=175,152,132;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.97,11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,6:0.313,0.439:13:2,2,2:1,2,4:3,0,9,1
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:3,0,4,2
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr5	96498783	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,7:6,6:7,6,9,4
chr5	96503511	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=95,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:10,0:8,4:8,11,2,2
chr5	96503523	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=137,85;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,3:9,3:9,6,3,3
chr5	96504454	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:6,11:19,0:12,13,10,1
chr5	96508943	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=102,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,7:3,5:5,4,5,7
chr5	96508998	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,2:3,2:3,5,2,2
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	96518792	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.383:34:11,5:10,7:16,5,10,3
chr5	98115579	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:13,3:4,0:8,9,2,1
chr5	98128822	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:7,0:15,7:14,8,0,7
chr5	98129470	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=98,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:0|1:98129470_G_T:98129470:5,7,1,1
chr5	98129477	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=99,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:5,1:0|1:98129470_G_T:98129470:4,8,1,1
chr5	98129479	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=98,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:6,1:0|1:98129470_G_T:98129470:4,7,1,1
chr5	98192164	.	AAGG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=97,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:12,4:4,4:8,8,5,3
chr5	98192465	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,0:1,4:0,4,0,4
chr5	98194589	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=97,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	98194618	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=112,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,0:2,3:4,0,4,0
chr5	98194781	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:1,3,1,6
chr5	98195818	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:0,8,1,3
chr5	98210868	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:4,5:24,7:3,25,2,10
chr5	98221383	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:7,4:2,9:1,8,4,9
chr5	98224945	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr5	98231848	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=256,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr5	98232809	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr5	98236643	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,229;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,0:14,3:8,20,0,3
chr5	101592742	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr5	101593065	.	C	CCTGCAGCCAGATTTATAGCTGTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,267;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	101595831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,4:0,0,4,4
chr5	101596025	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=108,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.446:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=62,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.495:14:8,1:1,4:4,5,0,5
chr5	101596040	.	TATATATATATAATATATATATTATACATATAATATATTATATGTATA	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=173,262;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:3,3:7,0:1,15,0,3
chr5	101596072	.	ATATAT	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATAT;STR;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr5	101627027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	101631510	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr5	101834469	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr5	102249546	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	102295504	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr5	102325878	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	102340782	.	GATTA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr5	102345546	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=259,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,13:1,9:0,1,4,18
chr5	102423576	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,6,0
chr5	102423579	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,6,0
chr5	102486985	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:3,1:7,4:9,1,4,1
chr5	102489511	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr5	102494264	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:4,8,0,3
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	102518877	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=37,30;RU=T;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.735:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	102526665	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:5,6,1,1
chr5	102530642	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,138;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:24,4:29,0:27,27,4,0
chr5	102537200	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,18,1
chr5	102537379	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=109.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.950:36:1,17:0,18:0,1,8,27
chr5	102613375	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,1:9,1:10,9,0,2
chr5	102895839	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=96,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:11,0:19,7:16,14,7,0
chr5	106722971	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,141;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:20,0:29,4:26,24,0,4
chr5	106723105	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=164,136;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106723105_T_C:106723105:1,2,0,1
chr5	106723111	.	T	TCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=164,136;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106723105_T_C:106723105:1,2,0,1
chr5	106723112	.	T	TACAATAAAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=164,136;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106723105_T_C:106723105:1,2,0,1
chr5	106723114	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,35;MFRL=164,136;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106723105_T_C:106723105:1,2,0,1
chr5	106723116	.	T	TGCAAGAATGTGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=164,136;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106723105_T_C:106723105:1,2,0,1
chr5	107356732	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:107356732_T_A:107356732:2,2,0,1
chr5	107356735	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.289:5:2,0:2,1:0|1:107356732_T_A:107356732:2,2,0,1
chr5	107684324	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	107684332	.	TTAAATATTTATGTTACTTGTAAAATAAGATAGAATGTAAGCAATCCATAACTTAAAACAGTACTGTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=186,351;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	107717227	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr5	108168451	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.454:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr5	108171326	.	CAGTTAATACTTTGGAATTTAAGTTCTTGAGCAATTTAAATTTAAACAATTTAATACATTTATGCATTTTGTTTCTTTGACAGGTTACCAAAACAGAATTGGAGA	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.052:58:1,0:0,2:38,17,1,2
chr5	108373293	.	TTAACTAGAACA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=74,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:3,3,1,5
chr5	108521929	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:9,2:11,0:8,12,0,2
chr5	108673108	.	A	AATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:108673108_A_AATGT:108673108:0,4,0,1
chr5	108673109	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:108673108_A_AATGT:108673108:0,4,0,1
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=107.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,16:0,0,16,11
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr5	108714298	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,9,7
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr5	108719204	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:108719204_A_C:108719204:0,5,1,1
chr5	108719208	.	GCC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:108719204_A_C:108719204:0,5,1,1
chr5	109103356	.	A	ACTAAATTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=67,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr5	109125072	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	109152929	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:3,2,3,0
chr5	109202687	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:7,0:14,4:9,12,3,1
chr5	109940954	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=94,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:14,0:18,3:18,14,1,2
chr5	109963430	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,2:2,7:5,0,7,2
chr5	109978164	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	110091058	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:5,1,3,0
chr5	110097535	.	TA	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110097535_TA_AC:110097535:0,0,0,1
chr5	110097538	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110097535_TA_AC:110097535:0,0,0,1
chr5	110097542	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110097535_TA_AC:110097535:0,0,0,1
chr5	110097543	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110097535_TA_AC:110097535:0,0,0,1
chr5	110407273	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.345:19:6,1:7,5:4,9,0,6
chr5	110407507	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,2:1,1:2,3,1,2
chr5	110409131	.	CT	AC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=189,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,1:4,0:0|1:110409131_CT_AC:110409131:7,0,1,1
chr5	110409136	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=189,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:1,1:5,0:0|1:110409131_CT_AC:110409131:7,0,1,1
chr5	110430488	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=2329254,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:3,6,6,3
chr5	110438000	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33,31;MFRL=215,184,169;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.39,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.298:7:0,1,0:3,1,2:3,0,4,0
chr5	110443228	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	110446741	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=211,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:1,1,2,3
chr5	110448751	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	110454681	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=77,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr5	110462521	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,79;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.198:43:23,0:12,8:13,22,0,8
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr5	110710699	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	110712491	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	110842049	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=90,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:15,0:16,4:9,22,0,4
chr5	111066770	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:1,0:9,2:0|1:111066770_G_T:111066770:1,9,0,2
chr5	111066774	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0|1:111066770_G_T:111066770:1,9,0,2
chr5	111071106	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,4:6,2:4,5,5,1
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=87.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.960:21:0,12:0,9:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,5,16
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,9:0,9:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,5,17
chr5	111504479	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,12,16
chr5	111505885	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	111506009	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:8,4,0,3
chr5	111506751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	111519881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr5	111531408	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:111531408_G_C:111531408:4,3,1,1
chr5	111531417	.	A	ATCTTTTAATTTTACCTAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:111531408_G_C:111531408:5,2,1,1
chr5	111545670	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,10:0,0,13,12
chr5	111595745	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	112101970	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,2:1,6:6,1,5,3
chr5	112179655	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=127,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.105:55:20,0:30,5:23,27,0,5
chr5	112196949	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:5,1,7,1
chr5	112214655	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=258,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	112238039	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=89,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,2:1,5:4,1,5,2
chr5	112256814	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.497:22:6,8:5,2:6,5,6,5
chr5	112257366	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,2:4,6:0,9,2,6
chr5	112312749	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.577:22:5,1:4,10:0,9,3,10
chr5	112321572	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,162;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,5:14,0:16,12,5,0
chr5	112339607	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:14,0:10,4:14,10,2,2
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	112346416	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	112364738	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:1,9,1,1
chr5	112364753	.	TCTA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:112364753_TCTA_T:112364753:0,8,1,1
chr5	112364758	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=157,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:112364753_TCTA_T:112364753:0,7,1,1
chr5	112364761	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=157,62;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:0|1:112364753_TCTA_T:112364753:0,7,1,1
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=283,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=283,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	112389747	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr5	112399791	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,9,13
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,4,10
chr5	112629929	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.456:10:3,4:2,0:5,1,4,0
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	112720977	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,2:7,1:0,15,0,3
chr5	112720987	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:10,0:6,4:0,16,0,4
chr5	112824024	.	CGCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCT;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.592:15:2,3:4,6:0,6,3,6
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:0,6,0,6
chr5	112851162	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:4,0,4,0
chr5	112899573	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,7:6,3:5,5,6,4
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	112901619	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=118,212;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:13,5:17,0:17,13,5,0
chr5	112903585	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,1:6,3:1,12,0,4
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:5,2,7,0
chr5	112929013	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:3,3,2,3
chr5	113698631	.	T	TGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCC;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0,1,1,1
chr5	114462355	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	114477018	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,0:7,4:9,5,2,2
chr5	114557727	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,1:4,9:0,10,1,9
chr5	114566753	.	AAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=124,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr5	114603654	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,121;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:2,8,0,3
chr5	114607197	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=93,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:15,1:20,2:12,24,1,2
chr5	114611288	.	AATTAGCTCTTCATATCTAAAATTTTAAAAATAAAGTTTGAATAAGAAGACAATCCAT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.171:16:8,0:2,2:4,10,1,1
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	114916817	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:14,0:8,20,2,2
chr5	115148868	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:11,10,0,3
chr5	115177668	.	G	GAGATTACGAGGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=177,61;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	115177721	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,145;MMQ=52,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:5,4,3,1
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr5	115298518	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr5	115323691	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,9,12
chr5	115341611	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,10,12
chr5	115341638	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=216,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr5	115358190	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,3:3,6:3,6,4,5
chr5	115423139	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,7:7,6:10,4,7,6
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,2:0,3:0,3,0,5
chr5	115628102	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	115782646	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:8,14,1,1
chr5	115803528	.	C	CTGACTAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	115811220	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,4:3,2:2,3,5,1
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:1,12:0,10:1,0,18,4
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,3:5,5:8,4,6,2
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	118176536	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	118176842	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	118451836	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.418:16:5,5:3,2:6,3,6,1
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr5	118479723	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr5	118500981	.	TAAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.367:7:2,0:0,2:2,3,1,1
chr5	118532210	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=165,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.515:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr5	118533724	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=156,274;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:118533724_T_C:118533724:0,3,0,1
chr5	118533727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=156,274;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:118533724_T_C:118533724:0,3,0,1
chr5	118533733	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=156,274;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:118533724_T_C:118533724:0,3,0,1
chr5	118533743	.	G	GTGTGAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=223,156;MMQ=46,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:118533724_T_C:118533724:0,2,0,1
chr5	118533744	.	CAC	TGT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=164,274;MMQ=56,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118533724_T_C:118533724:0,2,0,1
chr5	118533750	.	CT	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=172,274;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:118533724_T_C:118533724:0,1,0,1
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	118569230	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=259,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:118569230_G_A:118569230:0,1,1,1
chr5	118569233	.	T	TTCATTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=259,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:0|1:118569230_G_A:118569230:0,1,1,1
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=225,201;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:3,7:0,2:0|1:118691693_C_A:118691693:2,1,8,1
chr5	118691698	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=198,201;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,5:3,0:0|1:118691693_C_A:118691693:6,2,5,0
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:5,2,7,1
chr5	118788204	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,1:8,2:11,3,2,1
chr5	118788373	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr5	118811314	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=206,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=85,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.245:47:16,6:16,5:3,33,4,7
chr5	118835313	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=154,167;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:1,5,0,3
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=77,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.463:13:1,6:6,0:5,2,4,2
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:1,2,1,5
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:1,5,0,5
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr5	118965648	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=183,177;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	118968423	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=93,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:4,1,4,2
chr5	118969960	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=154,92;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,3:3,6:2,5,6,4
chr5	118970752	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr5	120021819	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,8:0,17:0,0,17,9
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr5	121406308	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:1,10,0,2
chr5	121488473	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:5,0:17,2:10,12,2,0
chr5	121488488	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:7,0:19,3:16,11,1,2
chr5	121488506	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=108,83;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.626:27:3,5:6,12:5,5,7,10
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	121758618	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:19,0:11,4:13,17,0,4
chr5	121787189	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:121787189_G_T:121787189:12,10,1,1
chr5	121787193	.	C	CCTCCGAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:121787189_G_T:121787189:11,9,1,1
chr5	122131082	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,5:6,6:3,4,3,9
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,1:4,3:1,8,0,4
chr5	122281709	.	GT	G,GTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=160,185,160;MMQ=60,60,60;MPOS=27,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.40,15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,7:0.207,0.423:16:4,2,3:2,1,4:6,0,10,0
chr5	122337542	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr5	122435293	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr5	122522744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:6,1:2,4:5,4,4,1
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr5	122700351	.	T	TCAAACAGAATTAACTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=180,297;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,5:5,6:7,0,6,5
chr5	122718341	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	122725660	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:122725660_C_T:122725660:15,5,1,1
chr5	122725665	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=120,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:122725660_C_T:122725660:16,7,1,1
chr5	122725673	.	T	TCC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=120,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:0|1:122725660_C_T:122725660:15,9,1,1
chr5	122725674	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:122725660_C_T:122725660:14,9,1,1
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,4:1,0:4,2,3,1
chr5	122727093	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:0,5,0,8
chr5	122728913	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:5,0,4,0
chr5	122728999	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,8:11,0:11,6,8,0
chr5	122729230	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	122924203	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:7,0:8,2:0|1:122924203_C_T:122924203:2,14,1,1
chr5	122924208	.	A	AGCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:122924203_C_T:122924203:2,13,1,1
chr5	122924210	.	T	TATTTTAAGAAGTAAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:122924203_C_T:122924203:2,13,1,1
chr5	122926339	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122926339_C_A:122926339:0,0,0,1
chr5	122926344	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:122926339_C_A:122926339:0,0,0,1
chr5	122940350	.	ATATG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr5	122941007	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=84,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:4,1:7,4,0,2
chr5	123973692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=164,122;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:123973692_A_G:123973692:0,3,0,1
chr5	123973695	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=169,122;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:123973692_A_G:123973692:0,4,0,1
chr5	123973698	.	CC	AA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=169,122;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:123973692_A_G:123973692:0,4,0,1
chr5	123973701	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=143,174;MMQ=51,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	123973704	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=169,122;MMQ=60,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:123973692_A_G:123973692:0,4,0,1
chr5	123973706	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=169,122;MMQ=60,41;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:123973692_A_G:123973692:0,4,0,1
chr5	123982879	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,0:18,3:17,12,3,0
chr5	123985443	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,1,3
chr5	123985464	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr5	125696036	.	CAGCAAGTCCTACA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:8,2:18,0:22,9,1,1
chr5	125802109	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=82,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:0|1:125802109_T_C:125802109:6,3,1,3
chr5	125802133	.	TTC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:125802109_T_C:125802109:1,2,0,3
chr5	125805324	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:11,0:23,2:26,8,1,1
chr5	125809072	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:3,1:12,3:3,14,0,4
chr5	125809079	.	A	AAAAAAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:4,1:14,2:2,16,1,2
chr5	125819333	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=253,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr5	125820276	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:3,1:2,0:0,5,0,3
chr5	125820291	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.258:9:4,2:3,0:0|1:125820291_T_TG:125820291:0,7,0,2
chr5	125820295	.	C	CGG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:125820291_T_TG:125820291:0,9,0,2
chr5	125820297	.	GCA	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:125820291_T_TG:125820291:0,9,0,2
chr5	125824610	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:0|1:125824610_G_T:125824610:6,10,1,1
chr5	125824616	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:125824610_G_T:125824610:4,10,1,1
chr5	125880589	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=49,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=100,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr5	125891737	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:125891737_GTA_G:125891737:0,2,0,1
chr5	125891741	.	GATAAAT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:125891737_GTA_G:125891737:0,2,0,1
chr5	125891750	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125891737_GTA_G:125891737:0,1,0,1
chr5	125912915	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,9:5,3:2,7,5,7
chr5	125915649	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=164,143;MMQ=60,20;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,5:1,0:4,1,5,0
chr5	125915685	.	TTTAATTG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=62,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAATTG;STR;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.504:14:2,6:3,1:5,2,4,3
chr5	125930657	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:13,2:8,2:16,5,3,1
chr5	125936672	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=110,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:2,3:6,3:6,2,3,4
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	126156538	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:1,1:2,0:3,0,2,0
chr5	126168563	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	126171999	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,7,17
chr5	126206303	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=86,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:3,4:3,9:4,2,7,6
chr5	126734452	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,2:6,1:11,5,2,1
chr5	126754758	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,9:1,0:5,0,9,0
chr5	126755015	.	GTTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:126755015_GTTC_G:126755015:0,0,0,1
chr5	126755023	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126755015_GTTC_G:126755015:0,0,0,1
chr5	126769146	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,4:2,2:5,2,3,3
chr5	126770359	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=90,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,3:1,7:4,3,8,2
chr5	126770604	.	CATGTTTTCAGCTGTCTGCTGGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	126778850	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:1,2,0,4
chr5	126781446	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	126790201	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=73,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,13:4,2:6,3,14,1
chr5	126791256	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:2,1:10,10:9,3,5,6
chr5	126860145	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=273,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,2,2
chr5	126860354	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,13:0.241:56:20,0:22,13:0|1:126860354_G_T:126860354:15,28,0,13
chr5	126860357	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,13:0.246:55:18,0:22,13:0|1:126860354_G_T:126860354:15,27,0,13
chr5	126862258	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,143;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,2:1,0:1,2,2,0
chr5	126865968	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:3,0,7,1
chr5	126869333	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:126869333_A_C:126869333:6,9,1,1
chr5	126869335	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:6,0:0|1:126869333_A_C:126869333:6,9,1,1
chr5	127474364	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=106,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:15,5:13,0:11,17,5,0
chr5	127485599	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	127610260	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:11,7:13,0:14,10,7,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	127622983	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr5	127623051	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:5,6,2,0
chr5	127623165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr5	127625509	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=99,137;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,6:8,0:9,3,6,0
chr5	127626502	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:9,5,0,2
chr5	127638579	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr5	127640861	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	127641556	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,130;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:6,4,2,0
chr5	127648500	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr5	127668822	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	127680042	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,4,2
chr5	127680235	.	G	GATCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:1,4,0,1
chr5	127700293	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=79,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:4,0:7,4:6,5,2,2
chr5	128320980	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=116,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:0|1:128320980_C_CT:128320980:9,11,1,1
chr5	128320982	.	C	CTTTTGAG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=116,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.135:22:9,3:10,0:0|1:128320980_C_CT:128320980:8,11,2,1
chr5	128321021	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:2,4,0,2
chr5	128324428	.	GAA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:10,2:0|1:128324428_GAA_G:128324428:12,20,1,1
chr5	128324433	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,70;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,0:11,2:0|1:128324428_GAA_G:128324428:12,19,1,1
chr5	128326177	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=246,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	128365489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	128430384	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	128441119	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:5,4:2,5:0,7,3,7
chr5	128796864	.	TGGACCCGGCTGGCGGCAGCGGGGGCAGCGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.575:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr5	128863471	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.939:30:1,17:0,11:0,1,15,14
chr5	128977553	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=105,102;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,4:4,0:6,3,4,0
chr5	129015452	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr5	129015705	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr5	129019960	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:4,5,1,1
chr5	129040121	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr5	129241165	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.228:10:3,0:3,0:1,7,2,0
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr5	130506653	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=73,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:11,4:20,0:21,10,4,0
chr5	130726599	.	TAAAATTCTGGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=485,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,3:1,4:1,0,6,1
chr5	130766541	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:5,0:8,4:7,6,2,2
chr5	130788698	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	130940307	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:13,0:15,4:14,14,2,2
chr5	131008401	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=81,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:12,12,0,3
chr5	131052335	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=197,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:131052335_AG_A:131052335:4,4,1,1
chr5	131052337	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=197,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:131052335_AG_A:131052335:4,4,1,1
chr5	131295129	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	131321146	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:4,2:3,0:3,4,2,1
chr5	131322646	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=172,221;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:13,0:2,9:0|1:131322646_A_T:131322646:0,15,0,9
chr5	131322648	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=172,221;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:12,0:2,9:0|1:131322646_A_T:131322646:0,15,0,9
chr5	131322649	.	TAC	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=172,172;MMQ=48,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.192:13:9,2:0,0:0,11,0,2
chr5	131347258	.	GGGCCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGCCC;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr5	131396332	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr5	131396478	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:0,2:8,3:2,6,2,3
chr5	131534176	.	C	CTCTACTTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	131539936	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:0,4,1,7
chr5	131553427	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:5,9:4,3:6,3,10,3
chr5	131606936	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr5	131607942	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,3:2,4:2,7,2,5
chr5	131657784	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr5	131660119	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	131705949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=202,171;MMQ=52,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,3:1,7:1,0,8,2
chr5	131713774	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=142,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:3,2,6,1
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr5	131720070	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	131721174	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,13:0,14:0,0,8,19
chr5	131721204	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,4:0,4:1,0,0,8
chr5	131811574	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:12,5:14,0:16,10,5,0
chr5	131819798	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0|1:131819798_T_C:131819798:0,0,1,12
chr5	131819800	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:131819798_T_C:131819798:0,0,1,12
chr5	131819970	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0|1:131819970_T_C:131819970:0,0,1,2
chr5	131819977	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:131819970_T_C:131819970:0,0,3,2
chr5	131820143	.	CCCTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,0:10,2:15,12,1,1
chr5	131820275	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	131821246	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	131821866	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	131822055	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,5,12
chr5	131822072	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.899:12:0,6:0,5:0,1,4,7
chr5	131822133	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr5	131822224	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,7,5
chr5	131823519	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=416,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	131823788	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	131892357	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,11,12
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,8:0,0,18,8
chr5	131925330	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=83,80;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:22,3:29,0:25,26,3,0
chr5	131953686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	131995316	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=167,157;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:131995316_AG_CC:131995316:2,1,1,0
chr5	131995320	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=167,157;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:131995316_AG_CC:131995316:2,1,1,0
chr5	131995325	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=167,157;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:131995316_AG_CC:131995316:2,1,1,0
chr5	131995328	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=167,157;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:131995316_AG_CC:131995316:2,1,1,0
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,4:1,1:1,1,4,1
chr5	132015519	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:3,6:19,0:6,18,6,0
chr5	132018132	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:0,0:1,1:1,0,0,2
chr5	132018169	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,0:5,5:5,2,2,3
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr5	132036489	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr5	132039132	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,8:7,3:10,4,8,3
chr5	132044738	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:1,10,0,2
chr5	132046590	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:3,3:8,2:8,4,5,0
chr5	132046789	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:0,6,1,4
chr5	132069847	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,0:3,5:2,1,5,0
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	132073002	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:2,4:3,5:6,0,9,0
chr5	132073122	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:21,0:24,4:20,25,0,4
chr5	132084956	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,0:1,6:5,1,5,1
chr5	132099349	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr5	132109742	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	132109966	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,3:3,0:0,3,1,2
chr5	132160828	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:0|1:132160828_C_T:132160828:9,9,3,0
chr5	132160833	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,3:10,0:0|1:132160828_C_T:132160828:10,10,3,0
chr5	132200120	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,0:3,5:6,2,0,5
chr5	132219292	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:132219292_G_T:132219292:1,4,1,1
chr5	132219294	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:132219292_G_T:132219292:1,4,1,1
chr5	132219296	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:132219292_G_T:132219292:1,4,1,1
chr5	132219297	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,2:0|1:132219292_G_T:132219292:1,4,1,1
chr5	132220791	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,28:0.475:59:12,0:17,27:0|1:132220791_T_A:132220791:14,17,0,28
chr5	132220795	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=106.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,28:0.475:59:13,0:18,28:0|1:132220791_T_A:132220791:14,17,0,28
chr5	132228133	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:1,5,0,3
chr5	132234017	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.332:31:6,0:15,10:10,11,0,10
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr5	132270663	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	132335715	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=192,160;MMQ=49,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr5	132388093	.	T	TTCAGGGTTGAAAAGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,1:3,0:0|1:132388093_T_TTCAGGGTTGAAAAGAC:132388093:0,3,0,1
chr5	132388096	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:132388093_T_TTCAGGGTTGAAAAGAC:132388093:0,3,0,1
chr5	132403057	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr5	132403229	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:25,4:16,0:20,21,4,0
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	132408905	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=71,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.314:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr5	132409074	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:2,4,0,4
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=51,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,3:2,0,8,0
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr5	132412299	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=275,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr5	132425415	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=111,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.396:12:2,1:4,0:5,2,0,5
chr5	132426891	.	TTTCAG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=69,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCAG;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:12,11,1,1
chr5	132437531	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=100,81;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,23:0.444:52:17,11:12,12:21,8,17,6
chr5	132437613	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=14,19;MFRL=172,108;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.687:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr5	132552898	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=84,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,2:9,2:7,6,4,0
chr5	132552995	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.196:23:10,0:9,4:13,6,2,2
chr5	132561277	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:6,0,4,1
chr5	132561409	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=108,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:15,7:18,0:15,19,7,0
chr5	132569260	.	GCCT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:1,9,1,3
chr5	132648254	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr5	132736337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	132903012	.	G	GAATTTATAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=188,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:132903012_G_GAATTTATAA:132903012:0,4,1,1
chr5	132903015	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=188,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:132903012_G_GAATTTATAA:132903012:0,4,1,1
chr5	133311542	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,1:17,2:14,17,0,3
chr5	133316343	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,17;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.251:16:5,2:6,0:4,8,4,0
chr5	133316433	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:8,4:15,0:5,18,0,4
chr5	133316462	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=148,182;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:0|1:133316462_G_A:133316462:8,17,0,2
chr5	133316467	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=148,182;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.100:27:11,2:11,0:0|1:133316462_G_A:133316462:8,17,0,2
chr5	133316707	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,21,19;MFRL=128,77,190;MMQ=60,60,60;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=T;STR;TLOD=4.07,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.309,0.270:7:1,1,0:2,1,0:0,3,0,4
chr5	133327915	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,118;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:0,0:10,7:9,1,7,0
chr5	133328560	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=128,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,2:5,6:7,1,6,2
chr5	133473697	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.588:27:5,5:6,11:8,3,14,2
chr5	133474591	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=102,370;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr5	133477802	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,62;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,15,0
chr5	133478059	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478063	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478068	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478071	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478074	.	C	CACA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,35;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478079	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=281,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:133478059_G_A:133478059:0,2,0,1
chr5	133478084	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:133478084_G_A:133478084:0,0,0,2
chr5	133478086	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,23;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:133478084_G_A:133478084:0,0,0,2
chr5	133478341	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr5	133478359	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:2,3:3,2:6,0,3,2
chr5	133478841	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133478841_T_C:133478841:0,2,0,1
chr5	133478845	.	A	ATCACCTGCCAATTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:133478841_T_C:133478841:0,1,0,1
chr5	133480655	.	CC	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	133481467	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,6:6,4:2,7,4,6
chr5	133481953	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.148:35:13,4:17,0:18,12,3,2
chr5	133496649	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:5,3,6,3
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,7,1
chr5	133541548	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr5	133642488	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=224,133;MMQ=50,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:133642488_C_A:133642488:0,3,0,1
chr5	133642494	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=243,133;MMQ=45,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:133642488_C_A:133642488:0,2,0,1
chr5	133644069	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:133644069_T_C:133644069:0,4,1,1
chr5	133644071	.	T	TCACCATGCTGCTCTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:133644069_T_C:133644069:0,4,1,1
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:3,3:5,6:3,6,3,6
chr5	133707164	.	TCGGCGG	T,TCGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27,24;MFRL=178,206,196;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CGG;STR;TLOD=6.75,14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.272,0.529:7:0,2,3:1,0,1:1,0,6,0
chr5	133707247	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.709:18:3,5:2,5:5,0,9,4
chr5	133707392	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,3:13,0:6,18,0,3
chr5	133880106	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.547:14:2,4:4,1:4,2,8,0
chr5	133880124	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:5,2:11,4,3,0
chr5	133896744	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,363;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	133897829	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=230,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=69,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.688:11:0,2:3,4:1,2,3,5
chr5	134011834	.	CTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.252:17:10,3:2,0:6,7,1,3
chr5	134015276	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.247:15:7,1:4,2:8,4,2,1
chr5	134022643	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr5	134023936	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,3:16,0:13,17,1,2
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	134086402	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr5	134086670	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=65,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr5	134094505	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=183,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr5	134094512	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr5	134106506	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr5	134109602	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:1,6,0,4
chr5	134164284	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	134192160	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=154,199;MMQ=45,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:134192160_A_G:134192160:0,2,0,1
chr5	134192168	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,24;MFRL=184,199;MMQ=40,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:134192160_A_G:134192160:0,3,0,1
chr5	134192175	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,23;MFRL=184,199;MMQ=40,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134192160_A_G:134192160:0,3,0,1
chr5	134192176	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,23;MFRL=184,199;MMQ=40,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134192160_A_G:134192160:0,3,0,1
chr5	134192211	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134192211_A_AC:134192211:0,0,0,1
chr5	134192214	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134192211_A_AC:134192211:0,0,0,1
chr5	134192218	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134192211_A_AC:134192211:0,0,0,1
chr5	134192223	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134192211_A_AC:134192211:0,0,0,1
chr5	134192228	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134192211_A_AC:134192211:0,0,0,1
chr5	134192330	.	CAAATAAAT	C,CAAAT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=199,228,99;MMQ=60,60,53;MPOS=5,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=AAAT;STR;TLOD=9.11,18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.222,0.475:11:1,3,2:1,0,3:3,0,6,2
chr5	134229285	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:14,0:6,9:8,12,0,9
chr5	134246113	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=83,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,3:10,0:10,12,3,0
chr5	134305852	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.522:6:2,1:0,2:1,2,0,3
chr5	134331921	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,5:6,1,2,4
chr5	134343661	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:8,4:1,4:6,3,5,4
chr5	134343799	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,8:5,5:4,6,6,7
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	134346304	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr5	134364406	.	TCCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=168,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGCGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr5	134364518	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr5	134782055	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=105,621;MMQ=60,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:19,0:16,5:21,14,5,0
chr5	134785500	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:3,4:9,6:4,8,8,4
chr5	134907409	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=201,239;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr5	134910401	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.234:31:13,0:10,6:10,14,1,6
chr5	135170534	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,3:15,0:17,17,3,0
chr5	135170658	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,6:0,1:0,1,2,5
chr5	135170682	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr5	135178081	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,4:5,3:6,9,2,5
chr5	135178084	.	G	GAAAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=127,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:135178084_G_GAAAA:135178084:7,14,1,1
chr5	135178086	.	A	AAAGAAAGCCAGTGTGTGTGTGG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=127,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:135178084_G_GAAAA:135178084:7,14,1,1
chr5	135186075	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:9,4:4,1:12,2,3,2
chr5	135186256	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=170,186;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.710:12:2,0:1,7:0,3,0,9
chr5	135186286	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=110,186;MMQ=60,56;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,0:3,9:0|1:135186286_A_T:135186286:4,1,0,9
chr5	135186291	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=110,186;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,0:3,9:0|1:135186286_A_T:135186286:4,1,0,9
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr5	135207382	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=117.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,14,16
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.849:22:0,9:3,10:2,1,13,6
chr5	135283267	.	A	ATTCAGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	135290409	.	TTTTAGTCTTCCCCTGAAATCAG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:12,0:10,2:20,13,1,1
chr5	135383070	.	G	GGCTTGAGAGCCCCTGGCTACCC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.239:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr5	135396452	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr5	135396464	.	AATAT	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AT;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:6,2:7,0:7,6,1,1
chr5	135396468	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr5	135396669	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=359,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,3:1,15:0,1,7,11
chr5	135398279	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr5	135398351	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=95,94;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:5,5:11,0:6,10,5,0
chr5	135496473	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:8,0,2,0
chr5	135496820	.	CA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35,31;MFRL=0,144,143;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.80,16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,7:0.228,0.625:10:1,0,3:0,2,2:0,1,0,9
chr5	135498944	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:5,1:6,2,1,1
chr5	135508381	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:1,9:5,2:0,6,2,9
chr5	135510033	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=44,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,6:2,3:4,2,8,1
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,14:0,0,12,12
chr5	135513112	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=107,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:9,0:8,10,0,4
chr5	135561058	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=60,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,2:4,8:2,7,2,8
chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	136320758	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr5	136328367	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	136983368	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:1,2,2,5
chr5	136997803	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AG;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.613:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chr5	137033906	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	137206279	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:137206279_C_T:137206279:3,0,2,0
chr5	137206284	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:137206279_C_T:137206279:3,0,2,0
chr5	137222818	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:6,2,3,0
chr5	137222837	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:7,2,3,0
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	137282029	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,2:3,0:0|1:137282029_T_G:137282029:1,12,0,2
chr5	137282031	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:4,0:0|1:137282029_T_G:137282029:1,12,0,2
chr5	137289957	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:1,3:8,0:2,8,1,2
chr5	137323142	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=131,195;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:7,9:17,0:17,8,9,0
chr5	137346615	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137346615_C_T:137346615:0,0,1,0
chr5	137346621	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137346615_C_T:137346615:0,0,1,0
chr5	137354851	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.644:11:2,1:0,1:0,4,0,7
chr5	137419725	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	137423661	.	GCT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137423661_GCT_G:137423661:0,1,0,1
chr5	137423664	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137423661_GCT_G:137423661:0,1,0,1
chr5	137423667	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:137423661_GCT_G:137423661:0,1,0,1
chr5	137423669	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137423661_GCT_G:137423661:0,0,0,1
chr5	137423672	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137423661_GCT_G:137423661:0,0,0,1
chr5	137426684	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:137426684_G_A:137426684:3,4,1,1
chr5	137426686	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:137426684_G_A:137426684:3,4,1,1
chr5	137480837	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:11,2:0|1:137480837_C_T:137480837:14,11,1,1
chr5	137480840	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:0|1:137480837_C_T:137480837:13,11,1,1
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,10,4
chr5	137497487	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:137497487_C_T:137497487:18,7,1,1
chr5	137497492	.	C	CCAACCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:137497487_C_T:137497487:17,7,1,1
chr5	137497928	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=216,244;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137497928_C_A:137497928:0,1,0,1
chr5	137497934	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=216,244;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137497928_C_A:137497928:0,1,0,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	137501793	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	137507104	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,3:1,6:0,1,3,7
chr5	137513368	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.853:4:0,0:0,1:0|1:137513368_A_AC:137513368:0,0,0,4
chr5	137513369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:137513368_A_AC:137513368:0,0,0,4
chr5	137520612	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,1:1,9:1,3,1,11
chr5	137521891	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,0,3
chr5	137524688	.	G	GAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:19,3:8,0:20,7,3,0
chr5	137527917	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	137548840	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:16,4:27,0:23,20,4,0
chr5	137589876	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.242:22:10,3:2,1:12,5,2,3
chr5	137600306	.	G	GCCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137600306_G_GCCACT:137600306:0,1,0,1
chr5	137600307	.	G	GTGCCCGGCCTTGAATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137600306_G_GCCACT:137600306:0,1,0,1
chr5	137610154	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137610154_T_G:137610154:0,0,0,1
chr5	137610159	.	T	TTCAGGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137610154_T_G:137610154:0,0,0,1
chr5	137622349	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	137622374	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,21;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr5	137622376	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,25;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:137622376_A_T:137622376:0,4,0,1
chr5	137622380	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,27;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:137622376_A_T:137622376:0,4,0,1
chr5	137622387	.	A	AGTGAAT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:137622387_A_AGTGAAT:137622387:0,3,0,1
chr5	137622388	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=180,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	137622389	.	T	TTGGCCCCAGTTCA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:137622387_A_AGTGAAT:137622387:0,3,0,1
chr5	137622393	.	A	ACAGTGT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,22;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:137622387_A_AGTGAAT:137622387:0,3,0,1
chr5	137622416	.	C	CTACTGAGCCCTGAAGAAATAAGT	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=271,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	137625228	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=103,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,4:4,1:6,5,1,4
chr5	137664251	.	G	GTTA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.498:24:8,6:4,6:4,8,3,9
chr5	137665415	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:137665415_C_T:137665415:1,1,0,1
chr5	137665420	.	T	TGTTTTGTTTTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665415_C_T:137665415:0,0,0,1
chr5	137665425	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665415_C_T:137665415:0,0,0,1
chr5	137665430	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665415_C_T:137665415:0,0,0,1
chr5	137677668	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:2,5,0,3
chr5	137682568	.	G	GAGTGTACTTGTGGAAAGGTATGTTTGC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:11,8,1,1
chr5	137756743	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137756743_T_G:137756743:0,1,0,1
chr5	137756749	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137756743_T_G:137756743:0,1,0,1
chr5	137756752	.	C	CAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137756743_T_G:137756743:0,1,0,1
chr5	137762570	.	GAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,186;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=A;STR;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,2:0,0,7,0
chr5	137774972	.	G	GAGGGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=77,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,0:1,2:4,3,1,1
chr5	137780345	.	C	CTACTCCCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:137780345_C_CTACTCCCATT:137780345:1,3,0,1
chr5	137780348	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:137780345_C_CTACTCCCATT:137780345:1,3,0,1
chr5	137781075	.	G	GTACCATCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=181,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	137781095	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,1,0
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=77,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,4:2,6:2,0,9,1
chr5	137803810	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=129,233;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:5,0:7,7:2,11,0,8
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=167,162;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=AC;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:1,0:2,3:7,2,3,0
chr5	137847082	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.934:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr5	137847086	.	CACACAT	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=169,162;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.363:8:2,1:2,2:4,1,2,1
chr5	137892170	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.353:23:9,3:6,4:9,6,6,2
chr5	137897438	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=115,221;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,0:18,3:19,11,3,0
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:5,1,5,1
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:9,3:2,8:12,2,8,3
chr5	137910907	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:12,3:21,0:17,16,3,0
chr5	138208839	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,16;MFRL=115,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.155:45:6,1:20,1:12,24,9,0
chr5	138208948	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:14,4:20,0:12,22,4,0
chr5	138210083	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,2:9,0:0|1:138210083_G_A:138210083:18,8,1,1
chr5	138210091	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:17,2:10,0:0|1:138210083_G_A:138210083:19,8,1,1
chr5	138261139	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:138261139_T_C:138261139:0,4,0,1
chr5	138261141	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:138261139_T_C:138261139:0,4,0,1
chr5	138264851	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	138265056	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:9,3:3,0:4,8,1,2
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	138650440	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=81,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,2:16,0:11,20,1,1
chr5	138658321	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=181,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:8,0:2,3:6,4,1,2
chr5	138700530	.	C	CAATTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	138714474	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=241,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	138718825	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=252,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,3:0,3:0,0,4,4
chr5	138739731	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:0|1:138739731_A_C:138739731:10,11,0,2
chr5	138739732	.	C	CTGGGCTGGCTTTTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:138739731_A_C:138739731:10,11,0,2
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.361:18:4,2:4,4:3,9,2,4
chr5	138857919	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,12:0,9:0|1:138857919_T_C:138857919:0,0,12,12
chr5	138857925	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0|1:138857919_T_C:138857919:0,0,10,11
chr5	138860535	.	ACTC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:2,2:0,6,1,5
chr5	138861078	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=355,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,3:0,12:1,0,7,9
chr5	139189254	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,59;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:7,6,1,1
chr5	139189265	.	C	CCATCCCATTCCGGACCCCTGGCTCCTCTTCAGGCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,59;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.148:19:4,0:11,2:8,9,1,1
chr5	139193889	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=142,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:6,8,2,1
chr5	139202400	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,2,2
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:1,1:4,3,3,1
chr5	139215397	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:139215397_G_T:139215397:3,3,1,1
chr5	139215401	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:139215397_G_T:139215397:2,3,1,1
chr5	139215403	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:139215397_G_T:139215397:1,3,1,1
chr5	139215405	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:139215397_G_T:139215397:1,3,1,1
chr5	139215419	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	139216502	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:3,0:3,6,1,1
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	139219761	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=60,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.184:19:2,0:12,3:0|1:139219761_C_T:139219761:8,8,1,2
chr5	139219769	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.176:20:5,0:9,3:0|1:139219761_C_T:139219761:7,10,1,2
chr5	139219775	.	AT	GC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.176:20:5,0:12,2:0|1:139219761_C_T:139219761:7,10,1,2
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr5	139251498	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:139251498_TGC_T:139251498:1,3,0,1
chr5	139251501	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:139251498_TGC_T:139251498:1,3,0,1
chr5	139251504	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:139251498_TGC_T:139251498:1,3,0,1
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:0,2,6,4
chr5	139266897	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,4:8,0:10,4,4,0
chr5	139267050	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:139267050_C_T:139267050:8,7,1,1
chr5	139267072	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:10,2:0|1:139267050_C_T:139267050:7,7,1,1
chr5	139267079	.	T	TCTTCCTCCTTCTC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=110,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:139267050_C_T:139267050:6,7,1,1
chr5	139494754	.	CCA	C	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.101:36:8,2:22,1:18,15,2,1
chr5	139494769	.	TG	CA	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.197:38:12,1:17,6:0|1:139494769_TG_CA:139494769:18,13,6,1
chr5	139494773	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.208:36:11,1:16,4:0|1:139494769_TG_CA:139494769:16,13,6,1
chr5	139494846	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=24,27,23,27;MFRL=120,123,139,128;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,9,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=6.32,17.05,13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:23,7,13,9:0.109,0.250,0.188:52:14,3,1,4:8,3,11,3:11,12,12,17
chr5	139496404	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,25;MFRL=206,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr5	139497531	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,0:4,2:8,9,1,1
chr5	139498315	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:6,0:14,5:0|1:139498315_G_C:139498315:10,10,2,3
chr5	139498326	.	A	AAGTGCTAAAAGTAGAATAAAGAT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:4,0:15,3:0|1:139498315_G_C:139498315:9,11,2,1
chr5	139503985	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,0:7,4:4,14,0,4
chr5	139505291	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:7,2,1,1
chr5	139725961	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:3,7,1,2
chr5	139740640	.	C	CCTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139740640_C_CCTA:139740640:1,0,0,1
chr5	139740642	.	G	GTTCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139740640_C_CCTA:139740640:1,0,0,1
chr5	139740643	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139740640_C_CCTA:139740640:1,0,0,1
chr5	139740645	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139740640_C_CCTA:139740640:1,0,0,1
chr5	139743077	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,80;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:2,0:12,7:5,9,1,6
chr5	139743413	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=107,37;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:139743413_T_C:139743413:10,12,1,1
chr5	139743422	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=96,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:139743413_T_C:139743413:8,12,1,1
chr5	139743424	.	GG	AT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=84,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:139743413_T_C:139743413:7,12,1,1
chr5	139745154	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,7:5,9:6,6,7,9
chr5	139751997	.	G	GTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:6,2:2,0:0|1:139751997_G_GTGT:139751997:4,4,1,1
chr5	139751999	.	G	GGAAAATCGGTTCTGTTTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:1,0:0|1:139751997_G_GTGT:139751997:4,4,1,1
chr5	139781730	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:3,3,0,2
chr5	139815857	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:13,0:15,7:9,19,0,7
chr5	139921961	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	139928831	.	T	TTTTACC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:18,0:8,3:0|1:139928831_T_TTTTACC:139928831:10,18,0,3
chr5	139928833	.	G	GTCAACTAAAAAAAAAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:19,0:9,3:0|1:139928831_T_TTTTACC:139928831:10,18,0,3
chr5	139931628	.	A	AGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=74,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:5,4:6,10:0|1:139931628_A_AGT:139931628:7,4,7,7
chr5	139931629	.	C	CG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=74,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:5,4:6,10:0|1:139931628_A_AGT:139931628:7,4,7,7
chr5	139931776	.	AGG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=72,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:0|1:139931776_AGG_A:139931776:4,5,0,7
chr5	139931779	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=72,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:0|1:139931776_AGG_A:139931776:4,5,0,7
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:1,1:4,1:3,3,0,2
chr5	139938109	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,12:5,0:11,0,12,0
chr5	139940233	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:4,11:7,3:6,5,8,6
chr5	139940383	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139940383_G_GCA:139940383:0,4,0,1
chr5	139940385	.	C	CAGGCTGAATCCTGATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139940383_G_GCA:139940383:0,4,0,1
chr5	139940388	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139940383_G_GCA:139940383:0,4,0,1
chr5	139940408	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	139940788	.	A	ACACAACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,0:0|1:139940788_A_ACACAACT:139940788:0,1,0,1
chr5	139940791	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139940788_A_ACACAACT:139940788:0,1,0,1
chr5	139940792	.	A	AGCTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,22;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:139940788_A_ACACAACT:139940788:0,1,0,1
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:5,6:8,6:8,5,7,5
chr5	140021391	.	G	GTA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:14,2:0|1:140021391_G_GTA:140021391:9,17,1,1
chr5	140021394	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:13,2:0|1:140021391_G_GTA:140021391:9,17,1,1
chr5	140023818	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:1,6,4,5
chr5	140024115	.	TTGTG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,6:0,2:6,1,7,1
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	140035386	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:7,4,0,3
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=220,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:2,4,0,4
chr5	140041960	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:0,4,1,5
chr5	140050903	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=128,0;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:16,1:18,1:22,12,2,0
chr5	140050907	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=131,138;MMQ=52,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.147:38:15,3:18,2:23,10,5,0
chr5	140050926	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=139,143;MMQ=50,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.213:40:17,5:15,3:21,11,8,0
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=138,109;MMQ=50,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,7:0.127:60:29,1:24,6:30,23,5,2
chr5	140051171	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=183,220;MMQ=53,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr5	140051203	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,9:7,0:6,6,9,0
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,0,2
chr5	140054485	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	140056323	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:9,4,0,2
chr5	140056775	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	140057158	.	CCT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=119,525;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:3,0:9,1,2,0
chr5	140057216	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=92,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:13,6:7,4:12,8,4,6
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr5	140076438	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr5	140077755	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,0:4,4:0,7,0,4
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:10,2:2,2:0,12,0,4
chr5	140174865	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=164,115;MMQ=60,58;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:5,6,3,7
chr5	140176655	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,3:14,0:17,10,1,2
chr5	140180737	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr5	140181734	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:8,1:2,5:5,5,4,2
chr5	140181791	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:140181791_C_T:140181791:10,7,1,1
chr5	140181793	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=145,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:140181791_C_T:140181791:10,7,1,1
chr5	140183058	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,5:6,7:5,9,6,6
chr5	140186978	.	A	AAAGACACC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=109,164;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:14,0:5,2:7,13,0,2
chr5	140187048	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=140,177;MMQ=52,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,2:5,1:8,5,3,0
chr5	140209467	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:2,5:3,1,5,7
chr5	140214381	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,163;MMQ=57,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:5,11,0,3
chr5	140215003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,13938;MMQ=57,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:2,4,0,3
chr5	140215033	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,13938;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:2,3:3,4,0,3
chr5	140216289	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,58;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:140216289_C_T:140216289:2,2,1,1
chr5	140216291	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,58;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:140216289_C_T:140216289:2,2,1,1
chr5	140216295	.	T	TCCGTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,58;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,1:0|1:140216289_C_T:140216289:2,2,1,1
chr5	140216297	.	C	CCCGTGGCCTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=130,58;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,1:0|1:140216289_C_T:140216289:2,2,1,1
chr5	140231436	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,0:3,3:8,5,0,4
chr5	140231967	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=164,189;MMQ=40,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0|1:140231967_A_G:140231967:0,5,0,2
chr5	140231974	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=167,212;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr5	140231987	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=189,169;MMQ=44,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:140231967_A_G:140231967:0,4,0,1
chr5	140232043	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=260,235;MMQ=49,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	140232167	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:6,3:2,1:7,2,4,0
chr5	140232470	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:14,1:15,2:15,16,1,2
chr5	140232485	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=142,75;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:11,2:11,15,1,1
chr5	140233614	.	G	GTGCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=87,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr5	140233625	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=87,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr5	140233650	.	G	GCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	140236461	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,6:10,0:7,8,6,0
chr5	140237020	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,1:15,2:7,17,1,2
chr5	140238183	.	T	TCTGTGGCTCGAAGGATGTGTCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	140251185	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr5	140307154	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,0:6,3:5,11,2,1
chr5	140307284	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,2,3
chr5	140307332	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr5	140307969	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=223,170;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr5	140515469	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=172,159;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:11,4,3,0
chr5	140531175	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,4,6
chr5	140532753	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:5,5,0,2
chr5	140552446	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:9,2:11,10,1,1
chr5	140552450	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=105,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:9,2:11,10,1,1
chr5	140555834	.	T	A	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=119,391;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,4:0.047:101:56,0:41,4:45,52,4,0
chr5	140558522	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:26,3:12,0:25,13,2,1
chr5	140559914	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,8:0,8:0,1,9,7
chr5	140562979	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,1343;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr5	140564982	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=21,25;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.477:13:1,2:4,2:0,7,0,6
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:0,1,0,5
chr5	140565066	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,23;MFRL=256,216;MMQ=53,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140565066_ACC_A:140565066:0,2,0,1
chr5	140565071	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=256,216;MMQ=53,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140565066_ACC_A:140565066:0,2,0,1
chr5	140565078	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=253,216;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140565066_ACC_A:140565066:0,1,0,1
chr5	140565082	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,25;MFRL=253,216;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140565066_ACC_A:140565066:0,1,0,1
chr5	140565083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,35;MFRL=216,253;MMQ=40,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	140565974	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr5	140567477	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,196;MMQ=58,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,4,2
chr5	140567608	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,9:0,17:0,0,11,16
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr5	140569215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,3:2,0:4,6,3,0
chr5	140572917	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=111,2765;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:3,0:3,11,1,1
chr5	140573844	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=321,174;MMQ=22,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,0,3
chr5	140596601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	140597569	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=150,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,1,1
chr5	140597646	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:140597646_C_CCG:140597646:2,0,0,1
chr5	140597648	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:140597646_C_CCG:140597646:2,0,0,1
chr5	140598154	.	G	GTGCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	140598196	.	TTTTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=319,0;MMQ=40,30;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,1,0
chr5	140598230	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=0,319;MMQ=39,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140598230_A_G:140598230:1,2,0,1
chr5	140598238	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=0,319;MMQ=39,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:140598230_A_G:140598230:1,2,0,1
chr5	140598243	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=1404,319;MMQ=39,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140598230_A_G:140598230:0,1,0,1
chr5	140605127	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=126,218;MMQ=55,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr5	140625627	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,3:7,0:5,7,1,2
chr5	140627196	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,48;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,1,1
chr5	140627799	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:140627799_G_A:140627799:5,10,1,1
chr5	140627804	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:9,2:0|1:140627799_G_A:140627799:4,11,1,1
chr5	140627807	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:7,2:0|1:140627799_G_A:140627799:3,10,1,1
chr5	140683652	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	140710705	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr5	140732279	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=99,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:4,5,1,1
chr5	140734676	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=206,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr5	140744408	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,0:6,3:6,9,0,3
chr5	140754431	.	GT	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	140763386	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=96,88;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,5:6,0:5,2,5,0
chr5	140763849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:4,3,2,0
chr5	140764414	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr5	140768276	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,0,2
chr5	140769293	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,174;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:4,4,2,1
chr5	140769584	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,62;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:140769584_G_A:140769584:12,6,1,1
chr5	140769589	.	T	TTTGTAACAACCCCACACACATA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,62;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:140769584_G_A:140769584:12,6,1,1
chr5	140777772	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140779547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,188;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,0:3,2:1,4,2,0
chr5	140780215	.	GT	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:140780215_GT_TC:140780215:0,3,0,1
chr5	140780221	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:140780215_GT_TC:140780215:0,3,0,1
chr5	140780251	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	140784595	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=128,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr5	140785072	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=219,256;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140785072_C_T:140785072:0,1,0,1
chr5	140785078	.	C	CTGGGGTTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140785072_C_T:140785072:0,1,0,1
chr5	140795128	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=86,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:5,5,2,4
chr5	140795359	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140803457	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=103,79;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.249:42:16,10:16,0:18,14,10,0
chr5	140810791	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:140810791_C_T:140810791:7,9,1,1
chr5	140810796	.	C	CCACTGCACTCCATG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:140810791_C_T:140810791:6,10,1,1
chr5	140811787	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,0:14,3:7,10,2,1
chr5	140812836	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140812836_C_A:140812836:0,3,0,1
chr5	140812841	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140812836_C_A:140812836:0,3,0,1
chr5	140812853	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140812853_TAG_T:140812853:0,1,0,1
chr5	140812856	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140812853_TAG_T:140812853:0,1,0,1
chr5	140812859	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140812853_TAG_T:140812853:0,0,0,1
chr5	140857338	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:7,5,4,0
chr5	140868901	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=74,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:19,5:13,0:20,14,0,5
chr5	140871473	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.190:21:9,1:4,1:1,16,0,4
chr5	140885007	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=95,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:9,4:13,8,0,4
chr5	140908212	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:9,2,2,0
chr5	140963623	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,12:0,23:0,0,22,15
chr5	141028499	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,262;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:20,3:10,0:17,13,0,3
chr5	141033813	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,4:10,0:7,13,4,0
chr5	141036337	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,14:0,1:0,0,6,9
chr5	141039115	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,0:0,4:0,3,0,4
chr5	141039584	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=203,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	141041435	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	141049407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,10,10
chr5	141051925	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr5	141052752	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:141052752_G_GC:141052752:0,0,0,1
chr5	141052755	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141052752_G_GC:141052752:0,0,0,1
chr5	141052759	.	C	CCCCATACTCTTTCTACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141052752_G_GC:141052752:0,0,0,1
chr5	141059426	.	G	GACAGAGAGAGAGAGAGAGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,0,2
chr5	141236970	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:9,2:0|1:141236970_G_A:141236970:11,6,1,1
chr5	141236976	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:0|1:141236970_G_A:141236970:12,5,1,1
chr5	141236981	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:141236970_G_A:141236970:12,5,1,1
chr5	141236983	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,1:0|1:141236970_G_A:141236970:10,6,1,1
chr5	141304305	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,1:1,1:0|1:141304305_CT_C:141304305:0,5,0,2
chr5	141304314	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.269:8:2,1:3,0:0,6,0,2
chr5	141304316	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:4,1:2,1:0|1:141304305_CT_C:141304305:0,6,0,2
chr5	141309926	.	G	GTCTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141309926_G_GTCTA:141309926:0,1,0,1
chr5	141309927	.	G	GTCTCGGACGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141309926_G_GTCTA:141309926:0,1,0,1
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CTG;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:1,0:5,2:5,1,2,1
chr5	141335241	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,1:4,6:3,1,4,3
chr5	141335257	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:141335257_G_C:141335257:5,7,1,1
chr5	141335260	.	CA	GC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:5,2:0|1:141335257_G_C:141335257:5,7,1,1
chr5	141335284	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr5	141336421	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:10,0:8,16,2,1
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.143:18:5,2:10,0:1,15,0,2
chr5	141511561	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=206,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	141975067	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr5	142273721	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	142416741	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,17,16
chr5	142421287	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,2:1,0:2,1,2,1
chr5	142421331	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,5:11,0:10,11,5,0
chr5	142437453	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:142437453_G_A:142437453:11,10,1,1
chr5	142437458	.	G	GCACCA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:142437453_G_A:142437453:12,10,1,1
chr5	142437463	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=122,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:0|1:142437453_G_A:142437453:13,10,1,1
chr5	142437697	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr5	142513686	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr5	142526947	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:2,10,0,2
chr5	142545488	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=138,187;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,15:4,0:6,1,15,0
chr5	142545743	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=162,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:142545743_A_T:142545743:0,8,1,1
chr5	142545750	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=148,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:142545743_A_T:142545743:0,7,1,1
chr5	142545751	.	C	CCAAACACATTCCAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:142545743_A_T:142545743:0,7,1,1
chr5	142586694	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:6,1,5,1
chr5	142593652	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr5	142662355	.	T	TAAGTAAACACGGGGTTTACACCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=189,140;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	143541769	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,80;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,4:7,0:17,2,2,2
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=281,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr5	145197411	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	145197441	.	T	TACACACAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=AC;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:7,1,1,1
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,14:0,0,15,6
chr5	145199528	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:11,0:22,4:17,16,4,0
chr5	145199665	.	TTTTTTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTTG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.728:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	145202570	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.157:29:11,2:14,2:19,6,2,2
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,1:4,5:1,3,1,5
chr5	145383674	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:0|1:145383674_G_T:145383674:8,14,1,1
chr5	145383680	.	A	AATTAGGATTGATTTAAATTTAAATCT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:8,2:11,0:0|1:145383674_G_T:145383674:6,13,1,1
chr5	145393364	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,2:4,3:4,7,5,0
chr5	145427527	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr5	145500054	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:3,6,1,2
chr5	145500157	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	145510735	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=266,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:145510735_A_T:145510735:0,2,0,1
chr5	145510742	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=266,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:145510735_A_T:145510735:0,2,0,1
chr5	145512367	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:1,4:2,0,6,0
chr5	145522542	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:11,6,0,2
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr5	145524223	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=84,33;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:8,3:8,7,1,2
chr5	145547889	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=51801422,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145547889_T_TG:145547889:0,1,0,1
chr5	145547891	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=51801422,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145547889_T_TG:145547889:0,1,0,1
chr5	145557046	.	AATAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	145562131	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,0:10,3:6,9,0,3
chr5	145562140	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:4,10,2,1
chr5	145608495	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=115,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,0:11,2:15,11,2,0
chr5	145609214	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=164,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr5	145610420	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=121,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:5,0:10,4:8,7,0,4
chr5	145647151	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:8,0,5,0
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,19,13
chr5	145838471	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:14,3:14,0:14,14,1,2
chr5	145851163	.	AT	A,ATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,23,26;MFRL=131,174,136;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.16,5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,5:0.271,0.273:18:4,4,3:3,0,2:0,8,3,7
chr5	145858010	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=224,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,5:0,3:3,1,8,0
chr5	145878172	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,2:11,1:16,12,3,0
chr5	145883587	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=139,187;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:11,0:4,8:0|1:145883587_A_T:145883587:6,9,0,8
chr5	145883592	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=137,187;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:11,0:5,8:0|1:145883587_A_T:145883587:6,10,0,8
chr5	145895364	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	145895523	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,2:5,1:5,9,3,0
chr5	145972445	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	145980024	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr5	145980061	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=164,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145980061_C_G:145980061:0,1,0,1
chr5	145980064	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=164,256;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145980061_C_G:145980061:0,1,0,1
chr5	145980068	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=164,256;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145980061_C_G:145980061:0,1,0,1
chr5	145980071	.	T	TGGCCATCAGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=164,256;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145980061_C_G:145980061:0,1,0,1
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr5	146435163	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr5	146619136	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=119,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:9,3,1,1
chr5	146658874	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:1,6:3,2:2,2,5,3
chr5	146659038	.	GGGACCT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146659038_GGGACCT_G:146659038:0,1,0,1
chr5	146659047	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146659038_GGGACCT_G:146659038:0,1,0,1
chr5	146728147	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:146728147_T_C:146728147:3,0,4,0
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:1,2:0|1:146728147_T_C:146728147:3,0,4,0
chr5	146730737	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr5	146752686	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:7,1,3,0
chr5	146754830	.	C	CTTCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:146754830_C_CTTCG:146754830:0,3,1,1
chr5	146754833	.	C	CTGTCATTGAGGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:146754830_C_CTTCG:146754830:0,3,1,1
chr5	146754835	.	A	ATGAGTGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:146754830_C_CTTCG:146754830:0,3,1,1
chr5	146775080	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=234,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr5	146778867	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr5	146788284	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=111,111;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.135:50:22,0:21,6:13,31,0,6
chr5	147012186	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=87,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr5	147020419	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr5	147020453	.	C	CAACTATACTGGGACAAATTTTAAATATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=130,132;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	147209048	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:147209048_G_T:147209048:2,0,0,1
chr5	147209055	.	T	TATCCGGACCCGCTGGGAACTGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:147209048_G_T:147209048:2,0,0,1
chr5	147276648	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=146,124;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,0:2,3:0,6,0,4
chr5	147286054	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,10:0,28:0,0,7,31
chr5	147286070	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=117,64;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.560:32:9,0:5,18:5,9,0,18
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,2:7,8:0|1:147444989_G_A:147444989:3,9,3,7
chr5	147445023	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:0|1:147444989_G_A:147444989:0,4,0,7
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:10,11:8,8:9,9,12,7
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr5	147451849	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=127,26;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:4,1:5,1:1,8,1,1
chr5	147466107	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:147466107_C_T:147466107:1,8,1,1
chr5	147466126	.	TAAAAC	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:147466107_C_T:147466107:1,5,1,1
chr5	147466134	.	GTTCTCT	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:147466107_C_T:147466107:1,5,1,1
chr5	147466143	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=197,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:147466107_C_T:147466107:0,2,1,1
chr5	147466145	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=197,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:147466107_C_T:147466107:0,2,1,1
chr5	147468234	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:2,5,1,4
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=22,29;MFRL=126,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.465:48:13,10:10,12:12,14,12,10
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=139,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:5,7:9,4:4,10,4,7
chr5	147475514	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=119,191;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:9,3:11,0:0|1:147475514_G_GT:147475514:6,15,1,2
chr5	147475516	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=119,191;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:8,2:9,0:0|1:147475514_G_GT:147475514:6,15,1,2
chr5	147475518	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=122,199;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:10,0:0|1:147475514_G_GT:147475514:5,15,0,2
chr5	147475522	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=125,199;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:147475514_G_GT:147475514:3,14,0,2
chr5	147477351	.	T	TTTTAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,6:7,6:8,5,6,6
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=105,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:4,3,3,1
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=86,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,3:5,1:7,5,2,2
chr5	147480112	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=100,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,1:7,7:6,5,4,4
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=168,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:4,2:8,3:9,3,3,2
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:6,5:4,14:3,7,7,12
chr5	147484465	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:2,2:0,2:1,2,4,1
chr5	147486818	.	CGT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=145,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	147488367	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=86,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,24:0.410:59:27,14:8,10:17,18,13,11
chr5	147497932	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0|1:147498669_G_A:147498669:0,0,4,9
chr5	147498672	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,6:0|1:147498669_G_A:147498669:0,0,4,7
chr5	147504305	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.730:13:2,3:1,6:0|1:147504305_C_CT:147504305:3,0,10,0
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0|1:147504305_C_CT:147504305:0,0,15,0
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr5	147505247	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=117,65;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:9,4:5,0:6,8,4,1
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,7,3
chr5	147510866	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr5	147693826	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0|1:147693826_G_A:147693826:0,4,2,4
chr5	147693832	.	T	TGTTGCCCAGG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:147693826_G_A:147693826:0,7,1,1
chr5	147693834	.	T	TGA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=164,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:147693826_G_A:147693826:0,7,1,1
chr5	147693836	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=164,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:147693826_G_A:147693826:0,7,1,1
chr5	147695283	.	C	CTCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCA;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,1:0,5:0,2,1,5
chr5	147781732	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr5	147785802	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.372:13:6,1:1,4:7,1,4,1
chr5	147785959	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:11,0:11,2:0|1:147785959_T_A:147785959:7,15,2,1
chr5	147785964	.	A	AACTTCTTCCCGG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=153,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,0:10,3:0|1:147785959_T_A:147785959:7,15,2,1
chr5	147788798	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=75,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.446:25:6,8:8,3:7,7,5,6
chr5	147793666	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.393:10:4,2:1,1:5,1,3,1
chr5	147795661	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=109,72;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:5,0:10,4:5,10,1,3
chr5	147795697	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=225,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr5	147803557	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:3,0,6,3
chr5	147812901	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr5	147819366	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:2,4,3,4
chr5	147819927	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:13,6:5,0:13,5,6,0
chr5	147819983	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=111,52;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:15,0:23,4:18,20,0,4
chr5	147845551	.	A	AG	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,8:0.118:73:35,8:28,0:10,55,1,7
chr5	147845555	.	G	GA	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.130:31:4,1:11,0:2,25,1,3
chr5	147856232	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:7,2,6,0
chr5	147856257	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.407:10:3,3:3,1:5,1,4,0
chr5	147856392	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=144,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr5	147889623	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,9:4,1:2,6,4,6
chr5	147902703	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr5	147902972	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:5,2:2,2:3,4,0,4
chr5	147928225	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.760:19:2,5:2,9:4,0,13,2
chr5	147928502	.	CAAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	148206646	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,7:9,4:6,10,6,5
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,5:8,4:6,6,2,7
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.506:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr5	148406307	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=100,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:148406307_G_A:148406307:7,11,1,1
chr5	148406313	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=100,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:148406307_G_A:148406307:6,11,1,1
chr5	148406338	.	A	AGGC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:2,2:6,0:1,7,1,1
chr5	148407567	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,3:6,0:9,3,2,1
chr5	148420347	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=217,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148420347_T_A:148420347:0,1,0,1
chr5	148420350	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=217,258;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148420347_T_A:148420347:0,1,0,1
chr5	148420353	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=217,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148420347_T_A:148420347:0,1,0,1
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	148580009	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=60,13340077;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:3,4,0,2
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr5	148610276	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=84,168;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:4,3,2,5
chr5	148612822	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=88,81;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:13,4:18,0:20,12,4,0
chr5	148618708	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr5	148618749	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:5,4:9,1:0|1:148618749_C_T:148618749:11,5,3,3
chr5	148618752	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:4,5:11,1:0|1:148618749_C_T:148618749:10,5,3,3
chr5	148620224	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr5	148625972	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,3,0
chr5	148627503	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr5	148631079	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,124;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,0:0,6:0,2,0,6
chr5	148637818	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=105,107218704;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148637818_C_T:148637818:1,2,1,0
chr5	148637820	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=105,107218704;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148637818_C_T:148637818:1,2,1,0
chr5	148637822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=105,107218704;MMQ=60,51;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:148637818_C_T:148637818:1,2,1,0
chr5	148651645	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=231,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:148651645_G_C:148651645:0,1,0,1
chr5	148651647	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=231,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:148651645_G_C:148651645:0,1,0,1
chr5	148679301	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	148681962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:4,0:2,2:5,3,2,0
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	148697532	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=100,59;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:148697532_C_T:148697532:7,9,1,1
chr5	148697554	.	C	CTTGAACTGTATCAAAGTAAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=90,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:148697532_C_T:148697532:4,6,1,1
chr5	148725199	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,12:0,0,19,14
chr5	148725225	.	G	GC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=116,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.401:25:8,6:6,4:5,10,7,3
chr5	148737644	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	148758695	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=83,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:6,11:12,6:11,7,12,5
chr5	148886523	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=187,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,2:7,2:9,0,4,0
chr5	148886526	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=116,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:2,6:4,0,7,0
chr5	148889501	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=130,58;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:11,0:12,2:0|1:148889501_G_C:148889501:4,19,1,1
chr5	148889507	.	T	TTCTTCTTTCTTTCATC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,58;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:148889501_G_C:148889501:4,18,1,1
chr5	148889509	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=152,58;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:9,1:0|1:148889501_G_C:148889501:4,17,1,1
chr5	148977613	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:1,2:9,3:0,10,0,5
chr5	148980639	.	A	ATGGATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr5	148989122	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,6:1,7:4,0,6,7
chr5	148989139	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,221;MMQ=60,52;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:13,4,0,2
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:148989312_A_G:148989312:0,3,1,3
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=136,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0|1:148989312_A_G:148989312:0,3,1,2
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr5	148999881	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:4,2:1,5:4,1,5,2
chr5	149000039	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:5,5,3,2
chr5	149003681	.	TGCAGC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:149003681_TGCAGC_T:149003681:6,10,1,1
chr5	149003689	.	CCTCCCACCACA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.122:24:6,0:9,2:0|1:149003681_TGCAGC_T:149003681:10,11,1,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,1:1,2:1,1,0,4
chr5	149006879	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	149008521	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:5,2:5,2:3,7,0,5
chr5	149213030	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,15;MFRL=102,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,1:8,0:8,10,0,3
chr5	149214251	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,0:9,2:0|1:149214251_C_T:149214251:22,13,1,1
chr5	149214253	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:24,0:11,2:0|1:149214251_C_T:149214251:22,13,1,1
chr5	149214809	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,7:11,0:11,5,7,0
chr5	149226949	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=91,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:14,0:20,4:19,15,1,3
chr5	149226995	.	C	CCCTGCCTCCCTCTTT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.138:26:12,2:11,1:15,8,2,1
chr5	149247435	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=220,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr5	149287017	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=251,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr5	149294684	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=228,217;MMQ=49,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.384:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	149294685	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=236,203;MMQ=55,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	149357932	.	A	AGGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	149359765	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:1,0:2,0,4,0
chr5	149360877	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr5	149374879	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=84.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,10,15
chr5	149406733	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	149416274	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=111,157;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:7,0:16,3:11,12,0,3
chr5	149416463	.	CTTCTCTGTAGCAGCCCATTATTCAAAGGGGGACAAAAGTAAGCACCCCTTAACTCTGCCCCTAGCTACCCCATCCCATTTGGCTCATACTGCTCTTTTCTTCAGAAAACATTAAAACTATAACTGTGAAGATGTTA	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=114,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.049:66:17,0:10,4:28,32,3,3
chr5	149421595	.	C	CACCTATGATCCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=91,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	149424966	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	149433596	.	TG	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr5	149435759	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,7:0,0,6,6
chr5	149437190	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr5	149439268	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr5	149441347	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:9,0:10,4:9,10,2,2
chr5	149452996	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=104,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:8,6:12,0:11,9,7,0
chr5	149456771	.	CT	AA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,5:0,4:1,0,8,1
chr5	149457678	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr5	149460553	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,5,17
chr5	149460571	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:149460571_C_T:149460571:3,12,1,1
chr5	149460576	.	G	GGGGAGGCTGGGGTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:149460571_C_T:149460571:3,10,1,1
chr5	149495253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,4:2,7:3,5,6,5
chr5	149499672	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:0,1:9,2:4,5,0,3
chr5	149509270	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	149513072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	149516480	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=130,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,4,1
chr5	149563267	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr5	149576560	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,21;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:1,2,1,1
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr5	149582103	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=102,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:3,4,3,2
chr5	149583336	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,14:0,0,25,12
chr5	149583383	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=121,129;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=22,25;RU=GT;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.356:3:2,1:0,0:0,2,1,0
chr5	149583424	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=100,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,3:4,0:6,3,0,3
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,4:0,0,7,3
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	149602363	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr5	149610967	.	AAATAAT	A,AAATAATAAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27,23;MFRL=0,138,168;MMQ=60,60,60;MPOS=10,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=AAT;STR;TLOD=19.48,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.528,0.336:6:0,2,1:0,3,0:0,0,0,6
chr5	149624724	.	CT	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:11,3,1,1
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,4:5,0:1,5,1,3
chr5	149627431	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=166,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:149627431_A_C:149627431:1,8,1,1
chr5	149627432	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=166,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:149627431_A_C:149627431:1,8,1,1
chr5	149627433	.	G	GGACACCCTAC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=166,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:2,2:0|1:149627431_A_C:149627431:1,8,1,1
chr5	149629857	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=88,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:149629857_C_A:149629857:11,3,1,1
chr5	149629868	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:149629857_C_A:149629857:11,4,1,1
chr5	149629974	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:149629974_A_AAT:149629974:0,2,0,1
chr5	149629976	.	A	ACTGTTTCTGTCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:149629974_A_AAT:149629974:0,2,0,1
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=79,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:4,6,4,2
chr5	149632955	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:0,0:2,10:1,1,4,6
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=182,199637;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr5	149644597	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,6,15
chr5	149652780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=169,42427556;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	149677977	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.483:23:4,7:7,4:4,8,5,6
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	149753796	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:4,2:6,3,0,2
chr5	149754641	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=133,146;MMQ=60,20;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:6,0:9,6,3,0
chr5	149755421	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=103,174;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,3:3,2:7,3,2,3
chr5	149759049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr5	149767481	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:24,4:15,0:28,11,4,0
chr5	149771142	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,6608641;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,2:13,0:7,10,0,2
chr5	149772237	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:4,1,3,3
chr5	149772932	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,1:5,3,3,3
chr5	149776355	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,5:6,9:9,5,8,6
chr5	149778453	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	149784560	.	T	TGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149784560_T_TGCCCC:149784560:0,1,1,0
chr5	149784564	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149784560_T_TGCCCC:149784560:0,1,1,0
chr5	149784570	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149784560_T_TGCCCC:149784560:0,0,1,0
chr5	149784574	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149784560_T_TGCCCC:149784560:1,0,1,0
chr5	149784576	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149784560_T_TGCCCC:149784560:1,0,1,0
chr5	149786539	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,1:6,2:7,11,1,2
chr5	149825120	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,5:12,0:11,11,4,1
chr5	149826437	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=105,89;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.113:42:19,4:19,0:0|1:149826437_T_G:149826437:13,25,4,0
chr5	149826446	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=105,89;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.118:40:17,4:18,0:0|1:149826437_T_G:149826437:13,23,4,0
chr5	149827132	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=92,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.480:48:16,8:9,15:14,11,12,11
chr5	149900973	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:2,9,2,0
chr5	149901167	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=131,141;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.189:40:9,0:24,7:14,19,0,7
chr5	149901261	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.183:25:14,2:7,2:0|1:149901261_G_T:149901261:6,15,2,2
chr5	149901264	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:12,0:7,2:0|1:149901261_G_T:149901261:6,14,2,2
chr5	149912527	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,2:4,8:5,4,6,4
chr5	149912688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:6,3,7,1
chr5	149914655	.	C	CTACAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:149914655_C_CTACAGT:149914655:0,4,0,1
chr5	149914658	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:149914655_C_CTACAGT:149914655:0,4,0,1
chr5	149921251	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=234,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,2:0,7:0,1,4,5
chr5	149929441	.	AAGTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=217,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGTT;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	149931222	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	149932934	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr5	150028654	.	C	CCGGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:0|1:150028654_C_CCGGGG:150028654:2,7,2,0
chr5	150028655	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:3,0:0|1:150028654_C_CCGGGG:150028654:2,7,2,0
chr5	150029120	.	C	CTGGGAAGGGAGCTGAGCTCTACG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=186,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,2:7,0:4,5,1,1
chr5	150049990	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr5	150051078	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:1,3:2,1:4,1,3,1
chr5	150051269	.	G	GTTTGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr5	150051958	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=358,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr5	150076546	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr5	150078956	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	150098028	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=202,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	150110750	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:4,0:2,10,0,2
chr5	150110887	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=107,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TG;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.566:6:2,2:0,1:3,0,3,0
chr5	150135900	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:12,0,3,0
chr5	150138634	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:0,5,0,6
chr5	150158164	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=97,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:12,5:9,6:13,8,7,4
chr5	150158199	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,75;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:4,7,4,4
chr5	150174892	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	150227916	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,1:10,2:9,11,2,1
chr5	150228173	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,1:8,2,2,0
chr5	150282674	.	AT	A,ATT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,26,26;MFRL=120,99,125;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.68,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,10,4:0.292,0.132:31:7,5,1:10,5,3:7,10,6,8
chr5	150406372	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,13:0,11:0,0,15,9
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	150422054	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	150425467	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=56,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.649:21:3,6:4,5:3,4,10,4
chr5	150429563	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr5	150444492	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.515:19:3,6:5,1:5,4,5,5
chr5	150483095	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr5	150490246	.	CAAGAG	C	.	.	DP=152;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:146,6:0.029:152:75,4:41,2:61,85,3,3
chr5	150490252	.	TCAGAGGAGGTTGGGGAGGCTGGTGCTGGGGCCCTGGGGTGCAGGGTGAGGGGCCTGGCTGGGAGTGGGAGAGGTCCCA	T	.	.	DP=150;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=103,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:144,6:0.029:150:57,3:36,2:57,87,3,3
chr5	150490302	.	GGGCCTGGCTGGGAGTGGGAGAGGTCCCAAGAGA	G	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.073:44:17,1:12,2:8,31,2,3
chr5	150496853	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr5	150497468	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=104,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	150498981	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:4,5,2,4
chr5	150503784	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,14,6
chr5	150506130	.	C	CCCACAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr5	150515775	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,10:4,0:9,0,10,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,4,13
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:4,4:7,1,5,3
chr5	150518988	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:3,5,3,5
chr5	150519670	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:6,2:4,6:10,0,7,2
chr5	150563860	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=96,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,1:11,2:16,9,2,1
chr5	150564975	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=47,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:1,1:6,4:6,2,4,1
chr5	150565008	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=71,103;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:7,5:6,6,4,2
chr5	150565724	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,44;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:4,1:4,5:2,6,1,5
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr5	150567074	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	150603444	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,8,10
chr5	150639409	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,7,8
chr5	150639439	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,3:0,15:0,0,11,8
chr5	150666933	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,9:1,13:0,1,13,9
chr5	150682919	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=113,221;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:6,7,0,2
chr5	150682930	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=115,221;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:0|1:150682930_G_A:150682930:6,5,0,2
chr5	150682933	.	GG	TT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=115,221;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:150682930_G_A:150682930:6,5,0,2
chr5	150682938	.	C	CTAGATTTGAGGATTTCGTTGGAAGCTGG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=115,221;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:150682930_G_A:150682930:5,6,0,2
chr5	150696540	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,17:0,4:0,0,12,9
chr5	150704758	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	150723205	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,146;MMQ=60,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,0:0,6:0,3,0,6
chr5	150838284	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=187,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:150838284_C_G:150838284:3,0,2,0
chr5	150838293	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:150838284_C_G:150838284:2,0,3,0
chr5	150843996	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=145,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	150844037	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=123,185;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr5	150846663	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=107,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr5	150846706	.	AGCATT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=107,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCATT;STR;TLOD=84.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:7,12:3,8:10,1,15,6
chr5	150846882	.	C	A,G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26,27;MFRL=236,208,166;MMQ=60,60,60;MPOS=24,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.57,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.521,0.222:5:1,1,1:0,2,0:0,1,0,4
chr5	150847505	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=388,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:0,4:14,3:0|1:150847505_T_C:150847505:3,11,5,3
chr5	150847509	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=388,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:0,5:15,2:0|1:150847505_T_C:150847505:3,12,5,3
chr5	150847560	.	T	TAATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:150847560_T_TAATA:150847560:1,2,0,1
chr5	150847565	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:150847560_T_TAATA:150847560:1,2,0,1
chr5	150853193	.	CTTTTGCTTTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTGCTTTG;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:0,1:7,3:6,2,3,1
chr5	150856107	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:5,1,3,3
chr5	150867701	.	G	GAAGCCCC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=126,144;MMQ=59,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,2:8,0:0|1:150867701_G_GAAGCCCC:150867701:9,13,0,2
chr5	150867703	.	T	TGCACC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=126,144;MMQ=59,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:150867701_G_GAAGCCCC:150867701:9,13,0,2
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	150887184	.	G	GAGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,3,6
chr5	150889805	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,4:7,3:9,1,7,1
chr5	150892264	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	150901300	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:1,2:1,1,2,1
chr5	150901613	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:3,2,1,3
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=248,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr5	150922433	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:150922433_C_T:150922433:10,4,1,1
chr5	150922438	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:0|1:150922433_C_T:150922433:9,4,1,1
chr5	150925071	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=84,178;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:15,0:14,5:14,15,0,5
chr5	150925144	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:1,11:1,8:1,1,9,10
chr5	150943085	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,10:0,0,15,11
chr5	150945212	.	CACCCTA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:0,0:0|1:150945212_CACCCTA_C:150945212:4,2,2,0
chr5	150945223	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:2,0:5,1:0|1:150945212_CACCCTA_C:150945212:5,3,2,0
chr5	150945329	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:14,0:18,4:11,21,0,4
chr5	150945862	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr5	150946436	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,12:0,0,15,15
chr5	150946773	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,10:0,0,13,13
chr5	150946780	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:9,7:4,6:5,8,7,6
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,2,15
chr5	151047210	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=175,150;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:0,7,0,3
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,1:5,3:4,5,3,1
chr5	151138137	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:7,8,1,1
chr5	151173644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=196,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:151173644_A_G:151173644:6,0,2,0
chr5	151173654	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=181,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:5,3:3,0:0|1:151173644_A_G:151173644:8,0,2,1
chr5	151180318	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,0:9,4:17,6,4,0
chr5	151202482	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=97,106;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,5:7,0:1,12,0,5
chr5	151772055	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr5	151775064	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=84,82;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:4,7:7,9:6,5,9,8
chr5	151784731	.	GAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,0:1,0,0,2
chr5	153029852	.	ACTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	153077760	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	153085381	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.174:26:7,4:15,0:4,18,2,2
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTGTTTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=69,182;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=TTTG;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.459:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr5	153144008	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=82,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.238:35:13,0:12,7:11,16,8,0
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	153181895	.	TTTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=82,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:7,0:10,7,3,0
chr5	153182064	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,0:4,4:2,6,1,3
chr5	153190672	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,0:10,3:9,10,3,0
chr5	153190694	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:153190694_G_A:153190694:7,14,1,1
chr5	153190701	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:15,2:0|1:153190694_G_A:153190694:12,16,1,1
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr5	153374626	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.300:5:3,1:1,0:0|1:153374626_A_T:153374626:1,3,0,1
chr5	153374628	.	A	AGATTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.300:5:1,1:1,0:0|1:153374626_A_T:153374626:1,3,0,1
chr5	153406134	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	153406644	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	153406987	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	153413390	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,11,10
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	153429187	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	153429459	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=194,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,7:0,15:1,0,6,16
chr5	153429487	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:6,9,2,1
chr5	153432450	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,4:1,0,8,1
chr5	153434018	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr5	153435340	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153435340_T_G:153435340:0,0,1,0
chr5	153435348	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153435340_T_G:153435340:0,0,1,0
chr5	153674536	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=13,14,28;MFRL=99,183,149;MMQ=60,60,51;MPOS=27,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=TG;STR;TLOD=8.04,17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.335,0.529:11:0,0,3:0,1,1:0,1,0,10
chr5	153677569	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=99,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:12,8,4,0
chr5	153709043	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	153726681	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:4,6,2,1
chr5	153760239	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:3,9,1,1
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr5	153783587	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.893:16:0,9:1,5:0,1,8,7
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=300,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	153857231	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:6,3:3,0:3,6,1,2
chr5	154092559	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=91,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:12,3:20,0:16,16,3,0
chr5	154174979	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	154191297	.	C	CTGAGAACTGGGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=231,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr5	154200089	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:7,9,0,2
chr5	154200263	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:0|1:154200263_G_A:154200263:2,6,3,3
chr5	154200272	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,4:0.312:14:7,0:3,4:1|0:154200263_G_A:154200263:5,5,0,4
chr5	154210339	.	C	CAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:2,1,4,0
chr5	154243004	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:10,0:10,5:4,16,0,5
chr5	154244979	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr5	154252266	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,0:2,7:0,7,0,7
chr5	154252309	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=182,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	154254818	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,2,1
chr5	154267908	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=79,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.106:44:21,0:18,4:21,19,2,2
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0,6,1,6
chr5	154282770	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=158,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:154282770_G_A:154282770:0,4,1,1
chr5	154282773	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=158,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:154282770_G_A:154282770:0,4,1,1
chr5	154282775	.	T	TCCTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:154282770_G_A:154282770:0,3,1,1
chr5	154284246	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:1,3,1,5
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr5	154307070	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=228,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,3,1
chr5	154311682	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,8:5,0:9,5,6,2
chr5	154311865	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	154336054	.	CCCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:154336054_CCCCT_C:154336054:0,3,0,1
chr5	154336058	.	T	TTGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:154336054_CCCCT_C:154336054:0,2,0,1
chr5	154336066	.	CC	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:154336054_CCCCT_C:154336054:0,2,0,1
chr5	154393952	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:11,0:5,4:8,8,0,4
chr5	154395426	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,4:7,0:12,8,4,0
chr5	154395458	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,11:6,5:3,8,10,6
chr5	154396419	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,66;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:10,11,1,1
chr5	154396440	.	T	TTC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=161,66;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:154396440_T_TTC:154396440:9,12,1,1
chr5	154396442	.	A	AAACAGCCACATGTGAC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=161,66;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,1:0|1:154396440_T_TTC:154396440:9,12,1,1
chr5	154396901	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=105,181;MMQ=60,45;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,0:8,10:0|1:154396901_G_C:154396901:2,12,0,10
chr5	154396906	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=105,181;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,0:8,10:0|1:154396901_G_C:154396901:2,12,0,10
chr5	154397146	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,9:2,7:4,0,9,8
chr5	154397676	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,2,3
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	155771773	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	156349191	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=98,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:5,3:10,0:5,10,2,2
chr5	156375371	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	156375607	.	GAAAAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr5	156464242	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=70,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,4:7,0:4,3,3,1
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=80,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr5	156479424	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=92,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:11,6:7,7:0|1:156479424_A_C:156479424:11,8,11,4
chr5	156479426	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=92,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:10,7:8,8:0|1:156479424_A_C:156479424:11,8,11,4
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=102,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.505:38:6,10:9,9:7,12,10,9
chr5	156479589	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=106,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:20,2:19,0:18,23,1,1
chr5	156525920	.	AAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=95,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:2,2:2,1:1,3,1,2
chr5	156589399	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=68,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:2,2,3,1
chr5	156592676	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,2:6,1:6,8,2,1
chr5	156644765	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=143,211;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:9,0,3,0
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr5	156670641	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:13,4,2,0
chr5	156670770	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=86,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,3:11,0:8,11,1,2
chr5	156671360	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,3:6,2:6,8,3,2
chr5	156672994	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=90,93;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:8,3:17,0:13,12,3,0
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr5	156721850	.	GTTCCCGGGCCATTCCCAGGTGAGACTGTCCTTGTTGTGTGTCTCTTTCCCCTCCAGAGGGCATTACTAACCCCTACTTCA	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.059:53:16,0:16,5:18,30,3,2
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=77.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,15:0,16:0,0,14,17
chr5	156731404	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=74,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:3,4:8,4:2,9,1,7
chr5	156742186	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	156747584	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr5	156750834	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	156751125	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0|1:156751125_T_A:156751125:1,2,1,1
chr5	156751129	.	G	GGAGTGGTGGGACATGAAGTTAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:156751125_T_A:156751125:1,2,1,1
chr5	156765981	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,2:0,9:1,0,8,3
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr5	156898690	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,14:0,0,11,16
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	156898921	.	T	TTGGAAGACTTGTGCTCACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0|1:156898921_T_TTGGAAGACTTGTGCTCACAG:156898921:0,2,0,1
chr5	156898926	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:156898921_T_TTGGAAGACTTGTGCTCACAG:156898921:0,2,0,1
chr5	156899539	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,1:5,2:4,11,2,1
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,0,15
chr5	156908914	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=91,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:5,0:9,3:7,7,1,2
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=81,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.859:18:1,6:0,5:1,1,9,7
chr5	156917340	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.939:30:1,17:0,12:0,1,15,14
chr5	156929777	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,4:8,0:6,9,4,0
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr5	156991459	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=133,57;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:6,8,1,1
chr5	156991471	.	AA	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,57;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:156991471_AA_CC:156991471:5,8,1,1
chr5	156991474	.	G	GTAAACATAACCTCACCCCCATTCCTTTCA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,57;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:4,0:7,2:0|1:156991471_AA_CC:156991471:5,6,1,1
chr5	156997918	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,1:15,2:15,10,1,2
chr5	156997923	.	CTGAAGT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,0:12,2:16,13,1,1
chr5	157053763	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=213,254;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,1:0,1,0,6
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=246,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,4:1,0,6,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,7:0,2:1,0,8,1
chr5	157158657	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:1,9,0,2
chr5	157159944	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:12,5:11,0:10,13,3,2
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr5	157181977	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=91,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,0:4,6:6,5,0,6
chr5	157216486	.	GG	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:11,10,1,1
chr5	157243914	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=145,3;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157243914_G_T:157243914:0,1,1,0
chr5	157243918	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=145,3;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157243914_G_T:157243914:0,1,1,0
chr5	158126222	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:1,0:1,2,0,3
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr5	158204347	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:4,2,5,0
chr5	158511579	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:158511579_C_CA:158511579:0,0,1,0
chr5	158511596	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,11;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:158511579_C_CA:158511579:4,0,1,0
chr5	158511608	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:158511579_C_CA:158511579:4,0,1,0
chr5	158522577	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr5	158526492	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=100,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.174:44:12,0:22,7:23,14,7,0
chr5	158526534	.	TAA	T,TA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,26,26;MFRL=144,145,115;MMQ=60,60,60;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.73,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.339,0.257:17:1,3,1:3,1,2:3,4,2,8
chr5	158588633	.	GAAAAA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,5:0,16:0,0,2,19
chr5	158589858	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=91,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:3,10:6,9:6,3,15,4
chr5	158596843	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=96,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:4,8:7,8:6,5,6,10
chr5	158600921	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:6,0,8,0
chr5	158601086	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,105;MMQ=54,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,6:0.081:82:33,0:43,6:43,33,0,6
chr5	158603571	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,6:3,7:2,2,11,3
chr5	158621845	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:22,0:20,4:11,31,1,3
chr5	158630629	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.284:11:4,0:3,0:2,6,0,3
chr5	158630641	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.248:11:5,2:1,0:0,9,0,2
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,2:7,8:4,9,7,3
chr5	158745990	.	C	CTAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	158750013	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	159344796	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,1:11,2:10,6,3,0
chr5	159478089	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	159661723	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,148;MMQ=55,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,3,0
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,3,0
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,4,1
chr5	159665599	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,10:0,0,12,11
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,5,15
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,4,15
chr5	159776637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=108,126;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,1:2,4:1,1,4,2
chr5	159821299	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:14,4:5,0:9,10,2,2
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	159839530	.	T	TAAAAAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,21;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,4:0,4:0,0,6,4
chr5	159839545	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,4:0,8:0,0,4,9
chr5	159839549	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.373:14:1,4:8,1:0|1:159839549_G_A:159839549:0,9,4,1
chr5	159839553	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:1,1:8,1:0|1:159839549_G_A:159839549:0,9,2,1
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	159841492	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,2:5,3:2,6,1,4
chr5	159842211	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,2:8,1:10,11,2,1
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr5	159912418	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,6:1,5:2,0,7,4
chr5	159912543	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:159912543_T_A:159912543:0,1,0,1
chr5	159912545	.	T	TAGAAAGAAGAGTTGGAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159912543_T_A:159912543:0,1,0,1
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=336,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr5	160061694	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160061694_A_AG:160061694:0,1,0,1
chr5	160061695	.	T	TTAATTTAGCTTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160061694_A_AG:160061694:0,1,0,1
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	160113319	.	A	ATGAAAAAGGAAGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160113319_A_ATGAAAAAGGAAGGG:160113319:0,2,0,1
chr5	160113322	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160113319_A_ATGAAAAAGGAAGGG:160113319:0,2,0,1
chr5	160721176	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=117,98;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:15,0:6,6:0|1:160721176_A_C:160721176:8,13,0,6
chr5	160721183	.	T	TTTTGACATGAACTAATTAGCCTCAGGAGATGAA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,38;MFRL=117,98;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.254:25:12,0:6,6:0|1:160721176_A_C:160721176:6,13,0,6
chr5	160758137	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:2,8,0,2
chr5	160763821	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=147,53;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,2:2,0:0|1:160763821_CA_C:160763821:0,5,0,2
chr5	160763822	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.888:6:0,4:0,1:1|0:160763821_CA_C:160763821:0,0,1,5
chr5	160763823	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=147,53;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0|1:160763821_CA_C:160763821:0,5,0,2
chr5	160972117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:160972117_A_C:160972117:0,0,1,0
chr5	160972123	.	AC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:160972117_A_C:160972117:0,0,1,0
chr5	161113139	.	G	GCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	161119125	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,9:0,0,7,5
chr5	161128761	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr5	161277912	.	T	TTGAAAGCCTGCTCCTGGCTGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr5	161300256	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:6,0:16,3:11,12,0,3
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	161495157	.	G	GCTTGCACAAATGAGCACTAGGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr5	162866615	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	162868910	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:7,13:9,4:7,9,12,5
chr5	162869572	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,77;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:2,0:10,4:3,9,1,3
chr5	162884510	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=124,157;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:4,4:15,0:8,11,4,0
chr5	162887650	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:6,8:5,13:9,2,12,9
chr5	162938940	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,4:5,2:9,0,6,0
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:1,6,4,5
chr5	167302988	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,50;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:16,0:26,2:0|1:167302988_C_T:167302988:33,14,1,1
chr5	167303008	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:27,2:0|1:167302988_C_T:167302988:29,18,1,1
chr5	167419949	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=106,14;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:5,8:11,0:5,11,0,8
chr5	167489049	.	CTT	C,CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=94,157,0;MMQ=60,60,60;MPOS=30,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.83,5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.275,0.400:8:1,0,2:1,2,1:2,1,4,1
chr5	167489093	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:5,4,6,4
chr5	167517505	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	167551952	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:17,2:13,2:19,11,1,3
chr5	167553672	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,1:2,5:2,0,6,1
chr5	167617528	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,62;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:4,0:11,2:0|1:167617528_C_T:167617528:9,7,1,1
chr5	167617532	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,62;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:167617528_C_T:167617528:10,8,1,1
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:167622107_G_T:167622107:0,0,4,0
chr5	167622113	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:167622107_G_T:167622107:3,0,1,0
chr5	167622117	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:167622107_G_T:167622107:3,0,1,0
chr5	167622369	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	167626058	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:7,0:15,3:0|1:167626058_C_G:167626058:16,9,0,3
chr5	167626062	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:7,0:16,3:0|1:167626058_C_G:167626058:16,9,0,3
chr5	167671562	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:6,2:2,6:6,2,3,5
chr5	167671798	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=221,340;MMQ=54,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:167671798_A_G:167671798:0,4,0,1
chr5	167671802	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=221,340;MMQ=54,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:167671798_A_G:167671798:0,4,0,1
chr5	167671805	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=221,340;MMQ=54,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:167671798_A_G:167671798:0,4,0,1
chr5	167687404	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:4,4:7,0:4,7,2,2
chr5	167798585	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=83,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:9,5:2,3:1,10,1,7
chr5	167835539	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=64,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:4,3,6,4
chr5	167837017	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,1:3,2:1,3,3,3
chr5	167855197	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,1,3
chr5	167858462	.	TCTGGCTGG	T,TCTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27,21;MFRL=156,212,255;MMQ=60,60,60;MPOS=6,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=CTGG;STR;TLOD=7.30,7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.379,0.375:5:1,1,1:0,1,0:0,1,0,4
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=237,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	167871549	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=118,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,1:0|1:167871549_GC_G:167871549:9,5,0,2
chr5	167871551	.	A	ATCTG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=118,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:5,0:8,2:0|1:167871549_GC_G:167871549:9,5,0,2
chr5	167881019	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=113,294;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.169:22:9,3:6,0:8,11,3,0
chr5	167891668	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr5	167891830	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,6,14
chr5	167894910	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=85,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:13,8,0,4
chr5	167933135	.	GGC	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:2,2:17,0:0|1:167933135_GGC_G:167933135:10,11,1,1
chr5	167933142	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:2,2:18,0:0|1:167933135_GGC_G:167933135:10,13,1,1
chr5	167933144	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:3,1:20,0:0|1:167933135_GGC_G:167933135:10,13,1,1
chr5	167933673	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:6,3:1,1:6,1,4,0
chr5	167933765	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=74,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.391:39:14,15:9,0:8,16,15,0
chr5	167944040	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr5	167945135	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:167945135_C_CA:167945135:0,3,0,1
chr5	167945139	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:167945135_C_CA:167945135:0,3,0,1
chr5	167945142	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=239,136;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:167945142_A_G:167945142:0,1,0,1
chr5	167945144	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,25;MFRL=239,136;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:167945142_A_G:167945142:0,1,0,1
chr5	167945148	.	G	GCGCGATCTCGAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,30;MFRL=239,136;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:167945142_A_G:167945142:0,1,0,1
chr5	168093781	.	C	CATGGGCCATTGCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168093781_C_CATGGGCCATTGCCT:168093781:0,0,0,1
chr5	168093785	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168093781_C_CATGGGCCATTGCCT:168093781:0,0,0,1
chr5	168093787	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168093781_C_CATGGGCCATTGCCT:168093781:0,0,0,1
chr5	168123524	.	A	AAAGAGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.665:2:1,1:0,0:0|1:168123524_A_AAAGAGTTG:168123524:0,1,0,1
chr5	168123528	.	A	ATCGACAGAGAAAATTAAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=61,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.653:3:0,1:0,0:0|1:168123524_A_AAAGAGTTG:168123524:1,1,0,1
chr5	168180081	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,6:3,5:5,5,5,6
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	168188048	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=199,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.515:19:5,4:4,4:6,3,6,4
chr5	168212951	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr5	168216489	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr5	168222623	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:1,3,1,6
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr5	168244256	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:2,3:6,0,3,1
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,1:2,3:0,2,0,5
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	168620601	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:3,1,3,2
chr5	168671698	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=87,86;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:5,6:9,7:5,10,5,8
chr5	168671728	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=87,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:12,2:4,20,1,1
chr5	168690612	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,70;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,3:5,3:7,5,2,4
chr5	169015456	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,3:21,0:24,15,3,0
chr5	169020337	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.347:17:5,4:6,2:10,1,5,1
chr5	169031150	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,10:0,0,6,7
chr5	169081315	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	169097474	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=67,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr5	169098265	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=97,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr5	169098272	.	A	ACGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:169098272_A_ACGT:169098272:1,3,0,1
chr5	169098277	.	G	GCACAGGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:169098272_A_ACGT:169098272:1,3,0,1
chr5	169098280	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:169098272_A_ACGT:169098272:1,3,0,1
chr5	169126326	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:3,2,5,2
chr5	169138909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,2:8,1:4,6,2,1
chr5	169141270	.	GTACA	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.225:20:8,4:7,0:0|1:169141270_GTACA_G:169141270:6,10,0,4
chr5	169141278	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,2:6,0:0|1:169141270_GTACA_G:169141270:4,12,0,2
chr5	169141280	.	GTA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:10,1:6,0:0|1:169141270_GTACA_G:169141270:6,12,0,2
chr5	169143129	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:169143129_C_T:169143129:2,0,1,0
chr5	169143131	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:169143129_C_T:169143129:2,0,1,0
chr5	169186828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=102,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:8,0:0,3:4,4,0,3
chr5	169186861	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=129,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:169186861_CC_GA:169186861:1,2,0,1
chr5	169186863	.	A	ATTAGGGTTCTGTGTGGTATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=86,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:169186861_CC_GA:169186861:1,3,0,1
chr5	169186870	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=86,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:169186861_CC_GA:169186861:1,3,0,1
chr5	169230307	.	TA	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,323;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	169310213	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,6:6,2:3,9,3,5
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:3,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,2,2,1
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,2,2,1
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,1:0,3:2,0,4,1
chr5	169463421	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	169463466	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr5	169468929	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	169469088	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=70,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:6,4:9,7:7,8,6,5
chr5	169472943	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=90,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr5	169477383	.	AAGAATGCCCCAGGCCAGTGTATCCTTGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.342:7:2,2:2,0:1,4,1,1
chr5	169483792	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=161,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:5,3:5,0:2,8,2,1
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr5	169507132	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:0|1:169507132_G_A:169507132:15,7,1,1
chr5	169507134	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:0|1:169507132_G_A:169507132:15,7,1,1
chr5	169507146	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:169507132_G_A:169507132:14,9,1,1
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr5	169689684	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=90,117;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:21,0:8,4:22,9,0,4
chr5	169695446	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,2:0,0,11,3
chr5	169715038	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=101,126;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:7,9,1,3
chr5	169720270	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:7,4:10,0:11,7,4,0
chr5	169780783	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	169806001	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,2,2
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:5,2,3,1
chr5	170159997	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=106,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:5,1:0,1:4,1,2,0
chr5	170215670	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=88,112;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:5,8,4,4
chr5	170215778	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr5	170215794	.	C	CCAGAAGCCCCTTCAACACCCACCCTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=249,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	170216068	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr5	170224475	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:14,5:6,0:14,7,2,3
chr5	170289028	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	170336614	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	170598381	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=242,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=9,26;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.935:18:0,9:0,8:1,0,11,6
chr5	170640778	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,2:4,0:0|1:170640778_A_C:170640778:3,10,0,2
chr5	170640779	.	C	CTTGTTTGTG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,2:4,0:0|1:170640778_A_C:170640778:3,10,0,2
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	170723118	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	170818906	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=209,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr5	170819887	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:8,7:8,7:9,7,6,8
chr5	170819954	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:6,9,1,2
chr5	170820024	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:1,5,1,3
chr5	170827115	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:2,5:0|1:170827115_C_A:170827115:4,1,7,2
chr5	170827118	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:0|1:170827115_C_A:170827115:3,1,7,2
chr5	170832243	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:5,4:7,5:11,2,8,1
chr5	170847519	.	C	CAGCCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=179,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	170883734	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,6:7,6:10,1,7,6
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,2:5,6:0,7,3,5
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr5	171583610	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,2:3,2,3,1
chr5	171583809	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:3,3,3,2
chr5	171765531	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:11,1:4,2:13,2,2,1
chr5	171765800	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,105;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.251:21:7,2:8,2:6,10,4,1
chr5	171777383	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:5,3,2,1
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:1,7,2,5
chr5	172324978	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,5:0,5:0,0,8,4
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:8,4:10,7:7,11,5,6
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,12,5
chr5	172395425	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,2:18,0:0|1:172395425_C_G:172395425:17,11,1,1
chr5	172395431	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,2:19,0:0|1:172395425_C_G:172395425:18,11,1,1
chr5	172395664	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,11:0,0,20,11
chr5	172421760	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=127,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.355:17:4,0:5,4:6,5,2,4
chr5	172513685	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=179,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:172513685_G_GA:172513685:0,1,0,1
chr5	172513689	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:172513685_G_GA:172513685:0,1,0,1
chr5	172518001	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,2:0|1:172518001_A_C:172518001:10,7,1,1
chr5	172518011	.	A	ACTCTACACATGTTTTATTTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:172518001_A_C:172518001:11,9,1,1
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	172578549	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:3,2:3,0:4,4,2,1
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	172745269	.	AAGAGAGAG	A,AAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=14,24,19;MFRL=103,175,289;MMQ=60,60,57;MPOS=30,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,14;RU=AG;STR;TLOD=6.83,4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.376,0.271:8:1,2,1:0,0,0:0,3,0,5
chr5	172755258	.	CCT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:6,1:5,1:0|1:172755258_CCT_C:172755258:1,11,0,2
chr5	172755263	.	T	TCA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,1:0|1:172755258_CCT_C:172755258:1,11,0,2
chr5	173036292	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:10,11,1,2
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,22:0,20:0,0,21,21
chr5	173316845	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.083:70:18,5:44,0:31,34,5,0
chr5	173317360	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:14,3:20,0:19,16,2,1
chr5	173376692	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:173376692_G_GT:173376692:0,1,0,1
chr5	173376695	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173376692_G_GT:173376692:0,1,0,1
chr5	173380346	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	173383194	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	173428331	.	T	TTCTCCTCTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173428331_T_TTCTCCTCTAC:173428331:0,1,0,1
chr5	173428332	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:173428331_T_TTCTCCTCTAC:173428331:0,1,0,1
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	174870546	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=106,151;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:6,0:10,3:7,10,3,0
chr5	175387115	.	GTACCTCCCATAGTTTGTCCCCTACAGAAAACAATA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,46;MMQ=27,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:0|1:175387115_GTACCTCCCATAGTTTGTCCCCTACAGAAAACAATA_G:175387115:2,7,1,1
chr5	175387130	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=140,171;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:175387115_GTACCTCCCATAGTTTGTCCCCTACAGAAAACAATA_G:175387115:0,1,0,1
chr5	175517429	.	G	GGTCAAGAAAGGTGAGGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	175520358	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,159;MMQ=50,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:2,5,1,1
chr5	175523949	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	175528703	.	A	ATGTCCGGAATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=181,184;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,153;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:3,1,3,1
chr5	175540794	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	175540948	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175540948_TG_T:175540948:0,0,1,0
chr5	175540953	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,223;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175540948_TG_T:175540948:0,0,1,0
chr5	175722020	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,3:21,0:5,28,0,3
chr5	175722302	.	TAG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=69,64;MMQ=52,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:3,2:0|1:175722302_TAG_T:175722302:1,2,1,1
chr5	175722307	.	A	AGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=69,64;MMQ=52,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:1,2:0|1:175722302_TAG_T:175722302:1,2,1,1
chr5	175792605	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	175794920	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:4,5,2,0
chr5	175794952	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:5,9,1,1
chr5	175795138	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175795138_T_A:175795138:1,0,1,0
chr5	175795142	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175795138_T_A:175795138:1,0,1,0
chr5	175815591	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	175923431	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:8,3:3,2:7,5,5,0
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr5	175956516	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,14,5
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	175992519	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	175992674	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=121,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,6:6,0:10,6,6,0
chr5	176001189	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,3:1,0:2,1,3,1
chr5	176002144	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,7,3
chr5	176004866	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	176004898	.	G	GTAGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr5	176004989	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:9,2,2,1
chr5	176005477	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:3,2:5,14:5,3,5,11
chr5	176011318	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=188,176;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:5,5:4,0:5,4,6,0
chr5	176017549	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,2,3
chr5	176018545	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	176022600	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:6,9,2,0
chr5	176024880	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr5	176047761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,5,2
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,9:0,0,12,11
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr5	176069862	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:3,2,0,4
chr5	176069866	.	C	CGCCCG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.701:12:1,4:3,4:3,1,0,8
chr5	176072877	.	AAAGAGCGCCTGGGCCTCTCCCCAAAGACCATCATTGGGTACCAGGCCCATGCAGACACAGCCACC	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.090:62:9,0:20,4:31,27,2,2
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,3,8
chr5	176083970	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	176296047	.	A	ATTCCAAATATGTGGTGATTTCTGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:1,2:3,2,5,2
chr5	176306640	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,2:6,1,2,1
chr5	176308439	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=193,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	176311194	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	176314434	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=251,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:1,1,1,2
chr5	176314459	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=226,89;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,2:0,0:1,0,1,2
chr5	176315299	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=75,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:2,3:2,2,7,2
chr5	176318256	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=97,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,0:4,5:1,7,0,5
chr5	176397790	.	CC	TT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:6,16,1,1
chr5	176517326	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176517941	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,6:11,0:7,9,6,0
chr5	176519287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr5	176522512	.	GCTCCCTCCA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:4,0:10,2:7,9,1,1
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,7,8
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr5	176636703	.	A	AGACACAAAGCCAGGAATTCCAATGCT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:8,15,0,2
chr5	176639228	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=220,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:176639228_A_AT:176639228:0,2,0,2
chr5	176639230	.	A	ATTACTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=220,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:176639228_A_AT:176639228:0,2,0,2
chr5	176719229	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176719229_A_C:176719229:0,1,0,1
chr5	176719234	.	C	CTTCCCAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:176719229_A_C:176719229:0,1,0,1
chr5	176719237	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:176719229_A_C:176719229:0,0,0,1
chr5	176719239	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:176719229_A_C:176719229:0,0,0,1
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr5	176722359	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:15,4:16,0:21,10,4,0
chr5	176722410	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:20,0:9,3:18,11,1,2
chr5	176728885	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:9,4:10,0:11,8,4,0
chr5	176729736	.	ACC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=C;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr5	176730159	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:176730159_C_T:176730159:10,10,1,1
chr5	176730168	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:14,2:0|1:176730159_C_T:176730159:13,17,1,1
chr5	176733341	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=111,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:7,0,3,1
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,161;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,7:1,10:0,1,1,16
chr5	176737720	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=180,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,11:0,1:0,1,5,7
chr5	176738538	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	176759027	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr5	176765395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr5	176795956	.	TTCCTGA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTGA;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,0:4,2:0,14,1,1
chr5	176798040	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=189,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,2,1
chr5	176798070	.	CGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=GGGCCG;STR;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	176798306	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:12,7:5,7:9,8,10,5
chr5	176798387	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:176798387_G_C:176798387:8,11,0,2
chr5	176798388	.	C	CCTCCATCTCTCCCTCATTCTCTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:176798387_G_C:176798387:8,11,0,2
chr5	176798691	.	G	GGCACAGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	176813026	.	CC	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr5	176813218	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:5,7,2,1
chr5	176813404	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:2,2,4,0
chr5	176824137	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr5	176830259	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr5	176830347	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:176830347_G_GA:176830347:0,1,0,1
chr5	176830348	.	G	GATGAAGGTTGCAGTGAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:176830347_G_GA:176830347:0,1,0,1
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	176859848	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr5	176860194	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=120,126;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:22,0:13,2:18,17,0,2
chr5	176861932	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=77,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,6:7,0:13,6,6,0
chr5	176863330	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:2,11,0,2
chr5	176885029	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=17,13;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:0,1:4,0:0|1:176885029_A_C:176885029:7,2,3,0
chr5	176885038	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:6,0:0|1:176885029_A_C:176885029:7,4,3,0
chr5	176885494	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=126,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.105:45:29,1:12,3:0|1:176885494_G_A:176885494:25,16,3,1
chr5	176885499	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.974:32:0,17:0,14:0|1:176885494_G_A:176885494:0,0,16,16
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr5	176894520	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:2,2:11,2:5,8,1,3
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr5	176918180	.	T	TGG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,14;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=G;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,0:7,0:0|1:176918180_T_TGG:176918180:9,0,0,5
chr5	176918186	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:2,1:7,4:0|1:176918180_T_TGG:176918180:10,0,0,6
chr5	176918190	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:1,1:7,6:0|1:176918180_T_TGG:176918180:8,0,0,8
chr5	176918193	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,33;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:0,0:6,6:0|1:176918180_T_TGG:176918180:8,0,0,8
chr5	176923567	.	GGGCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGCA;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:4,0:0,6,1,1
chr5	176930086	.	CGG	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:16,2:9,0:0|1:176930086_CGG_C:176930086:16,10,1,1
chr5	176930089	.	T	TTC	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,2:6,0:0|1:176930086_CGG_C:176930086:16,9,1,1
chr5	176930090	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:0|1:176930086_CGG_C:176930086:16,9,1,1
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,11:0,0,13,11
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=103.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,12,13
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0,0,3,2
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr5	176939884	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=171,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr5	176940190	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=231,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	176940448	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:17,6,1,1
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,7,13
chr5	176942255	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.128:36:15,4:17,0:18,14,2,2
chr5	176949162	.	A	AGTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176949162_A_AGTCT:176949162:0,0,0,1
chr5	176949164	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176949162_A_AGTCT:176949162:0,0,0,1
chr5	176949166	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176949162_A_AGTCT:176949162:0,0,0,1
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176951744	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:4,0:0|1:176951744_C_T:176951744:6,10,1,1
chr5	176951750	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:176951744_C_T:176951744:6,11,1,1
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,7:0,10:0,1,5,12
chr5	177020602	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:4,3:6,7:6,4,9,2
chr5	177031280	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,1:5,8,1,1
chr5	177031295	.	GA	TC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:177031295_GA_TC:177031295:4,8,1,1
chr5	177031298	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:177031295_GA_TC:177031295:3,8,1,1
chr5	177031300	.	G	GAGCCTAGCT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:177031295_GA_TC:177031295:3,7,1,1
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr5	177035691	.	T	TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	177036021	.	G	GCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	177161891	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=86,162;MMQ=45,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr5	177161905	.	A	ACAATAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=187,182;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:177161905_A_ACAATAAT:177161905:0,4,0,1
chr5	177161908	.	G	GTGGCATATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=187,182;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:177161905_A_ACAATAAT:177161905:0,4,0,1
chr5	177161998	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,274;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	177163580	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,27;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=96,99;MMQ=27,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,5:2,5:1,1,9,1
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,0:4,7:5,0,4,3
chr5	177422876	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr5	177422908	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,2:5,6:1,5,3,5
chr5	177466284	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=167,189;MMQ=25,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=247,177;MMQ=39,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr5	177469062	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,199;MMQ=25,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,2,1
chr5	177547247	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:9,7:9,7:11,7,6,8
chr5	177641728	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr5	177642488	.	A	AGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=174,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:177642488_A_AGT:177642488:0,2,0,1
chr5	177642493	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:177642488_A_AGT:177642488:0,2,0,1
chr5	177642495	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:177642488_A_AGT:177642488:0,2,0,1
chr5	177656900	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr5	177657172	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,0,12
chr5	177658625	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr5	177669046	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,3:5,0:6,7,0,3
chr5	177669142	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	177669519	.	C	CTGACATGCCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.294:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	177674589	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr5	177676142	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:4,9,1,1
chr5	177679447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,7:0,0:0,0,8,1
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,4:1,5:0,1,5,4
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:0,1,0,4
chr5	177683377	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,7,12
chr5	177684015	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:177684015_G_C:177684015:0,4,0,1
chr5	177684016	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:177684015_G_C:177684015:0,4,0,1
chr5	177684017	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:177684015_G_C:177684015:0,4,0,1
chr5	177684022	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	177684682	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr5	177688697	.	G	GAATTGTCTTGATGTGAGAAAGGTAGCATGCATAGGGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,1,1
chr5	177688772	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr5	177697279	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,9:0,20:0,0,15,14
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=74.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,11:0,21:0,0,15,17
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,12:0,20:0,0,14,20
chr5	177715581	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,10:0,0,10,17
chr5	177733802	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:9,8,2,1
chr5	177987758	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=99,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.211:27:2,3:9,2:5,17,3,2
chr5	178030911	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:0|1:178030911_G_A:178030911:7,10,1,1
chr5	178030921	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=115,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,0:0|1:178030911_G_A:178030911:5,10,1,1
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	178139311	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,4:8,0:8,13,2,2
chr5	178152362	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=110,114;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:15,6:9,0:15,10,6,0
chr5	178310446	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,19:0,0,15,14
chr5	178358220	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	178391860	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr5	178413772	.	C	CAAGCGCACCTTTGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,2:0,0:3,2,1,1
chr5	178413816	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=42,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:2,3,2,1
chr5	178415937	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.543:22:9,9:1,3:6,4,8,4
chr5	178416063	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:6,9:7,1:5,8,7,4
chr5	178416203	.	CCCCTCCCCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	178416288	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr5	178451932	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:2,0,4,0
chr5	178454670	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	178459169	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:6,4,1,3
chr5	178489073	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:16,3:3,0:11,10,3,0
chr5	178503622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=95,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:178503622_G_A:178503622:0,4,0,1
chr5	178503625	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=95,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:178503622_G_A:178503622:0,4,0,1
chr5	178503626	.	CATCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=113,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:178503622_G_A:178503622:0,4,0,1
chr5	178503640	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	178507069	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=86,127;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:9,5:2,10:5,6,5,10
chr5	178553185	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	178557142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:3,2:1,6,1,3
chr5	178559404	.	G	GAGAAATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178559404_G_GAGAAATA:178559404:0,0,0,1
chr5	178559405	.	C	CCAGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178559404_G_GAGAAATA:178559404:0,0,0,1
chr5	178559410	.	CC	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178559404_G_GAGAAATA:178559404:0,0,0,1
chr5	178562834	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	178579154	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,0:19,2:0|1:178579154_C_T:178579154:16,10,1,1
chr5	178579162	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:178579154_C_T:178579154:7,10,1,1
chr5	178579165	.	C	CCTCTTA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:178579154_C_T:178579154:7,9,1,1
chr5	178585873	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:11,0:9,7:7,13,0,7
chr5	178608262	.	C	CTCACTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=248,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr5	178986987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:4,1,2,1
chr5	178987201	.	TG	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:8,0:13,11,1,1
chr5	178989473	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:7,4:9,6:8,9,3,7
chr5	179004226	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,125;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:0|1:179004226_C_G:179004226:0,5,0,3
chr5	179004231	.	G	GGCGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=170,162;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:6,1:0,0:0|1:179004226_C_G:179004226:0,6,0,2
chr5	179016664	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=106,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,5:9,6:3,11,5,6
chr5	179021784	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=152,224;MMQ=56,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:3,1,1,0
chr5	179021982	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	179028950	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,3:15,0:13,17,0,3
chr5	179032755	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	179034680	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:4,1:2,1:1,6,3,0
chr5	179036357	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.583:15:2,6:4,2:2,4,5,4
chr5	179043041	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=84,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:3,3:6,4:0|1:179043041_C_G:179043041:7,2,6,1
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,13:0,10:0|1:179043041_C_G:179043041:0,0,14,9
chr5	179045142	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=81,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.555:52:13,16:10,13:11,12,16,13
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:2,7:8,1:0,10,2,6
chr5	179050188	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:5,3:1,10,0,5
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.930:10:0,3:0,6:0,0,7,3
chr5	179071958	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,99;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,3:8,4:6,5,5,2
chr5	179132612	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=91,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr5	179132929	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=218,116;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,0:3,4:0,9,0,4
chr5	179135955	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,5:8,4:10,5,6,3
chr5	179136133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:179136133_G_A:179136133:0,3,0,1
chr5	179136137	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,28;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:1,0:0|1:179136133_G_A:179136133:0,3,0,1
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,1:0,1:1|0:179136133_G_A:179136133:0,0,0,2
chr5	179146710	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:16,0:19,4:21,14,4,0
chr5	179153797	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:11,8:8,13:4,15,7,14
chr5	179225479	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=83,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.245:55:10,13:32,0:30,12,13,0
chr5	179226490	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:11,0:1,2:10,2,2,0
chr5	179227154	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr5	179260213	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,3:3,1:2,2,2,2
chr5	179260246	.	GGCAA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:2,0:0|1:179260246_GGCAA_G:179260246:1,2,0,1
chr5	179260255	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:179260246_GGCAA_G:179260246:1,2,0,1
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	179271104	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=143,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:179271104_C_T:179271104:2,0,1,0
chr5	179271109	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=143,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:179271104_C_T:179271104:2,0,1,0
chr5	179271141	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,0:1,2:5,3,2,0
chr5	179280495	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:179280495_G_GTCT:179280495:1,3,0,1
chr5	179280496	.	G	GTTCAGGTTTTAGATTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:179280495_G_GTCT:179280495:1,3,0,1
chr5	179280500	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:179280495_G_GTCT:179280495:1,3,0,1
chr5	179290845	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:6,3,2,5
chr5	179291147	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=158,321;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,2:8,0:0|1:179291147_G_A:179291147:3,9,0,2
chr5	179291148	.	A	ATTTACTGTCATGCGCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=158,321;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,2:8,0:0|1:179291147_G_A:179291147:3,9,0,2
chr5	179292443	.	T	TAAGACAGAGCCAAAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179294509	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=84,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.195:34:16,0:11,6:0|1:179294509_C_T:179294509:14,14,0,6
chr5	179294526	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,38;MFRL=90,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.260:25:10,0:6,6:0|1:179294509_C_T:179294509:8,11,0,6
chr5	179294527	.	G	GATTTGAACACAGACAGAC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:10,0:4,1:0|1:179294509_C_T:179294509:5,11,0,6
chr5	179315076	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:0|1:179315076_C_G:179315076:4,2,2,0
chr5	179315078	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:1,2:4,0:0|1:179315076_C_G:179315076:4,2,2,0
chr5	179315109	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,3:6,0:5,4,2,1
chr5	179318620	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	179321486	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:10,0:11,6,1,2
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr5	179554726	.	G	GAATGGAATGGAATGCAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr5	179555654	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	179563359	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:3,2,4,0
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:0,2,1,8
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr5	179565136	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,25337455;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	179663614	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:1,8,0,3
chr5	179729625	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	179731822	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,99;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:7,0:7,9,2,1
chr5	179732021	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179732021_G_A:179732021:0,3,0,1
chr5	179732023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:179732021_G_A:179732021:0,3,0,1
chr5	179734139	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:3,1:0|1:179734139_T_C:179734139:4,0,3,0
chr5	179734145	.	GTGGGGGTGGGGGC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGGTGGGGGC;STR;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:179734139_T_C:179734139:5,0,3,0
chr5	179734312	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:2,5,1,5
chr5	179734379	.	G	GATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	179739630	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0|1:179739630_T_C:179739630:0,3,0,1
chr5	179739632	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:179739630_T_C:179739630:0,3,0,1
chr5	179739635	.	CC	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:179739630_T_C:179739630:0,3,0,1
chr5	179739637	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:179739630_T_C:179739630:0,3,0,1
chr5	179739645	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=170,186;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	179757787	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,181;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:5,12,2,0
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:3,4:0,5:3,0,9,0
chr5	179765467	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:8,0,7,1
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179980302	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:4,1,5,1
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:1,4,3,6
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	179994815	.	CTG	C,CTGTG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,34,31;MFRL=117,94,199;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=TG;STR;TLOD=10.70,7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,5,4:0.175,0.167:28:8,4,1:7,1,2:15,4,8,1
chr5	179994821	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=117,145;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:18,4:14,0:24,9,4,0
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:1,10,0,4
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,10,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,9:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,11,1
chr5	180043388	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:5,0:5,6:5,6,4,2
chr5	180046209	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr5	180046839	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:0,3,0,5
chr5	180047739	.	C	CGTGT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:1,7:8,7:2,7,6,8
chr5	180047793	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	180048056	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:8,5:4,1:7,5,4,2
chr5	180049927	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180056192	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=109,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr5	180057033	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:7,7,0,2
chr5	180057743	.	C	CTCTCTCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180057743_C_CTCTCTCTCT:180057743:0,2,0,1
chr5	180057745	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:180057743_C_CTCTCTCTCT:180057743:0,2,0,1
chr5	180057858	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180058714	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	180219304	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.402:23:8,7:5,2:8,6,3,6
chr5	180275957	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=142,321;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:10,0:9,3:8,11,3,0
chr5	180276215	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,123;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:8,0:7,4:7,9,0,4
chr5	180276787	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,143;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,4:7,0:8,7,4,0
chr5	180277646	.	GCATTCATAGGGCTTCTCCCCCGTGTGGATCCTTTTGTGGACTCTGAGCCCAGAGCTGTTCCTGAAGGCCTTCCCACACTCACCA	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.102:49:5,2:7,2:21,24,2,2
chr5	180326274	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,3:6,7:6,7,3,7
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:2,9:4,4:3,3,8,5
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=93,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr5	180335734	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,81;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:7,12,1,2
chr5	180335748	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=126,81;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.168:21:6,0:12,3:7,11,1,2
chr5	180335803	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:9,7,0,2
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:3,1,5,2
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:7,2,3,3
chr5	180429676	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:9,5,1,1
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=130,67;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,0:8,4:6,9,2,2
chr5	180430918	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,27840;MMQ=40,29;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr5	180472498	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:3,3,3,2
chr5	180477449	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0,7,0,4
chr5	180481216	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=19,19,19;MFRL=95,91,154;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.69,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,4:0.145,0.218:21:3,0,0:2,1,1:3,11,0,7
chr5	180482518	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,76;MMQ=57,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr5	180482570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,152;MMQ=42,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr5	180482893	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:6,0:10,1,3,0
chr5	180482897	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:6,0:2,4:8,1,5,0
chr5	180485467	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=182,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:5,2:15,1:3,18,1,2
chr5	180486558	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr5	180582604	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:2,6:9,4:4,7,4,6
chr5	180622419	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=188,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180622419_G_A:180622419:0,4,0,1
chr5	180622435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=199,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:180622419_G_A:180622419:0,4,0,1
chr5	180622444	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=207,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180622419_G_A:180622419:0,2,0,1
chr5	180622447	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=207,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180622419_G_A:180622419:0,2,0,1
chr5	180630478	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=133,132;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,4:15,0:17,12,4,0
chr5	180651181	.	GGGA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=97,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.133:27:17,2:7,1:15,9,2,1
chr5	180651374	.	GGAGGAGGACGAGGAGGAAGACCTGGACTACTACTTGGGGGACATGGAGGAGGAGGACCTGAGGGGGGAGGAT	G	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,6:0.077:100:29,4:26,0:46,48,2,4
chr5	180660459	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=93,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:12,1:25,5:22,15,1,5
chr5	180663941	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.203:17:6,0:8,3:11,3,3,0
chr6	292694	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr6	311797	.	GT	G,GTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31,32;MFRL=199,187,163;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.53,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.284,0.235:14:5,0,3:2,4,0:7,0,7,0
chr6	311805	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,2:6,0:13,0,2,0
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:2,4:12,6:4,11,3,7
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:6,3:8,2,2,1
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr6	349016	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,2:5,7:1,10,0,9
chr6	491137	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:16,5:20,0:0|1:491137_G_A:491137:14,23,0,5
chr6	491142	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:17,5:18,0:0|1:491137_G_A:491137:14,23,0,5
chr6	497520	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,3:2,8:1,2,4,7
chr6	532530	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,0:16,4:14,22,0,4
chr6	549364	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=209,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,4:2,5:2,0,8,1
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,2:0,8:1,0,8,2
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr6	619600	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	629965	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,0:4,5:3,9,0,5
chr6	656422	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:1,6,1,1
chr6	656572	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=230,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr6	1313117	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,0:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,2,1
chr6	1313121	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,1,1
chr6	1313470	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,0:5,4:8,5,2,2
chr6	1313766	.	T	TAATC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:1313766_T_TAATC:1313766:2,2,1,1
chr6	1313769	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:1313766_T_TAATC:1313766:2,2,1,1
chr6	1315019	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr6	1315021	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,1,12
chr6	1394859	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=169,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	1395110	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,0:6,4:2,10,1,3
chr6	1612447	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:4,2:18,2:11,12,1,3
chr6	1613975	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=149,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,1:7,1:0|1:1613975_G_A:1613975:15,1,1,1
chr6	1613976	.	G	GAACCTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,1:6,0:0|1:1613975_G_A:1613975:15,1,1,1
chr6	1613977	.	G	GTGTCTA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=149,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,1:6,0:0|1:1613975_G_A:1613975:15,1,1,1
chr6	1624821	.	T	TGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=5,18;RU=G;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,1:3,1:10,1,0,5
chr6	1742908	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	2675271	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:10,6:4,0:10,4,4,2
chr6	2675432	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=328,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr6	2679676	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr6	2685904	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr6	2784588	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:20,1:17,2:14,23,3,0
chr6	2784660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:2784660_T_C:2784660:2,12,0,2
chr6	2784662	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:2784660_T_C:2784660:2,12,0,2
chr6	2784667	.	CACT	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:2784660_T_C:2784660:2,13,0,2
chr6	2784672	.	CTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:2784660_T_C:2784660:2,13,0,2
chr6	2784682	.	TCGTG	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:2784660_T_C:2784660:1,12,0,2
chr6	2955917	.	ACAGAATG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:0|1:2955917_ACAGAATG_A:2955917:4,9,0,3
chr6	2955929	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:0|1:2955917_ACAGAATG_A:2955917:4,6,0,3
chr6	3006807	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=187.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,23:0,32:0,0,38,21
chr6	3006821	.	CT	C,CTT	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=30,30,31;MFRL=107,91,142;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.49,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,6,4:0.160,0.129:33:9,2,4:12,3,0:12,11,6,4
chr6	3006861	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=140,95;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:7,0:0|1:3006861_G_A:3006861:1,19,1,1
chr6	3006865	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=140,95;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,1:6,0:0|1:3006861_G_A:3006861:1,17,1,1
chr6	3006880	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:0,13,0,2
chr6	3010390	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,13:0,0,7,14
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,12,5
chr6	3015790	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,12,11
chr6	3017310	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,32;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	3019654	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr6	3045801	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,0:12,3:10,15,0,3
chr6	3078060	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,0:13,2:12,10,0,2
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	3113418	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=69,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:7,4:12,0:9,10,2,2
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr6	3123983	.	CTGGG	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:12,13,0,2
chr6	3127564	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=93,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.115:28:8,1:16,0:13,12,2,1
chr6	3129208	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,5:2,3:9,1,8,0
chr6	3154871	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr6	3154896	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=129,95;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:3154896_A_AC:3154896:0,3,0,1
chr6	3154899	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=129,95;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:3154896_A_AC:3154896:0,3,0,1
chr6	3154901	.	C	CTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=129,95;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:3154896_A_AC:3154896:0,3,0,1
chr6	3154938	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=175,187;MMQ=33,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr6	3155222	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=160,35445;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,2:1,5,2,0
chr6	3156008	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,11960;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	3263830	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr6	3264502	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr6	3264526	.	CT	TC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,7,8
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	3268020	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr6	3287118	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr6	3410611	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:0|1:3410611_GT_G:3410611:3,8,1,1
chr6	3410613	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:0|1:3410611_GT_G:3410611:3,8,1,1
chr6	3416144	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr6	3738268	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=109,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,1:2,2:1,1,2,2
chr6	3738390	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,7:5,0:3,9,0,7
chr6	3738464	.	C	CGACATAGAGACCAGGCTTAATGAGGTGGAGAAACTGCTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=203,49;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr6	4040922	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,2,1
chr6	4056606	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,53;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:17,3:11,0:15,13,3,0
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:8,9,1,1
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr6	4074634	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,12:1,5:2,0,12,5
chr6	4116340	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr6	4119516	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=69,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,7:1,4:3,1,9,3
chr6	4119553	.	ATT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=26376233,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.689:7:1,0:0,1:0,2,0,5
chr6	4125474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=216,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr6	4125655	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	4130429	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:5,13,0,3
chr6	4133985	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:4133985_T_C:4133985:0,2,0,1
chr6	4133987	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:4133985_T_C:4133985:0,2,0,1
chr6	4133993	.	C	CTACCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:4133985_T_C:4133985:0,2,0,1
chr6	4935888	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=126,94;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:9,5:19,0:10,18,0,5
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	4944004	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,2:0,3:1,0,5,0
chr6	4998930	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:9,5,2,0
chr6	4998963	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:1,12:3,7:4,0,9,10
chr6	5000027	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.841:16:0,8:2,6:1,1,10,4
chr6	5000721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=228,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr6	5000779	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:3,10:5,11:5,4,11,10
chr6	5109592	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr6	5431960	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:2,4,5,8
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	5829166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:1,0,3,4
chr6	5999464	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr6	6146042	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=316,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.943:16:0,7:0,7:0,0,10,6
chr6	6167811	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,2:13,3:9,19,1,4
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr6	6206845	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,73;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:11,0:11,3:13,9,1,2
chr6	6305590	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:4,7,2,0
chr6	6318935	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,28;MFRL=127,63;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:6318935_AG_A:6318935:1,1,1,0
chr6	6318939	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=127,63;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:1,1:0|1:6318935_AG_A:6318935:1,1,1,0
chr6	6318941	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,13;MFRL=174,63;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,0:1,0:0|1:6318935_AG_A:6318935:1,2,1,0
chr6	6318944	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=127,63;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:6318935_AG_A:6318935:1,3,1,0
chr6	6318946	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,13;MFRL=174,63;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:6318935_AG_A:6318935:0,3,1,0
chr6	6318950	.	AGGCATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=174,63;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:6318935_AG_A:6318935:0,3,1,0
chr6	6321128	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=47,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.934:16:0,5:2,8:1,1,4,10
chr6	6626445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	6649974	.	A	AAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	7226664	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:5,2,3,0
chr6	7230501	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7230501_C_G:7230501:0,1,0,1
chr6	7230503	.	AGGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7230501_C_G:7230501:0,1,0,1
chr6	7231675	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:11,0:17,2:19,13,0,2
chr6	7295605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,3:1,6:2,0,9,1
chr6	7295755	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr6	7295810	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:7295810_C_T:7295810:0,3,0,1
chr6	7295814	.	GCTGC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:7295810_C_T:7295810:0,3,0,1
chr6	7298287	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	7303735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=230,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,4:1,6:2,0,9,1
chr6	7313406	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,4:2,9:0,2,1,12
chr6	7334144	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=248,163;MMQ=40,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7334144_A_G:7334144:1,0,1,0
chr6	7334152	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=248,163;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7334144_A_G:7334144:1,0,1,0
chr6	7356446	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	7366201	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:7366201_G_A:7366201:0,4,0,2
chr6	7366203	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:7366201_G_A:7366201:0,5,0,2
chr6	7366204	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:7366201_G_A:7366201:0,5,0,2
chr6	7390333	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:8,11,1,1
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr6	7393449	.	TGAC	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.122:30:18,3:9,0:0|1:7393449_TGAC_T:7393449:12,15,1,2
chr6	7393452	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,38:0.976:38:0,26:0,12:1|0:7393449_TGAC_T:7393449:0,0,19,19
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,16,9
chr6	7398832	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	7401242	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=125,216;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:18,3:12,0:0|1:7401242_A_G:7401242:16,14,3,0
chr6	7401247	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=125,216;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:18,3:12,0:0|1:7401242_A_G:7401242:16,14,3,0
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr6	7403143	.	G	GATGTGTGTGCAGTCTGTTCATATGC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.136:19:8,0:8,2:6,11,1,1
chr6	7413094	.	AT	A,ATT	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=25,25,26;MFRL=115,113,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=18.22,14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,13,9:0.223,0.185:53:11,7,4:18,6,2:22,9,20,2
chr6	7413107	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.059:71:23,3:24,0:45,22,4,0
chr6	7414382	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	7414550	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=107,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,10:0.165:65:24,9:27,1:29,26,9,1
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	7563983	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,11,9
chr6	7565490	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	7567970	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=259,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,10:0,1:2,0,7,4
chr6	7571745	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,85;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:17,0:15,6:17,15,1,5
chr6	7571874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	7572262	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.920:22:0,9:1,12:0,1,12,9
chr6	7575506	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.276:16:7,2:4,1:10,1,3,2
chr6	7577354	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.902:7:0,3:0,3:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,0,7
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,0,5
chr6	7579412	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr6	7580885	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=103,155;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:24,0:26,4:27,23,0,4
chr6	7585142	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=108,132;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,2:17,0:14,19,1,1
chr6	7586049	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=148,232;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:0|1:7586049_G_A:7586049:4,21,0,2
chr6	7586062	.	CTTCCTACTCTTA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=183,232;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:0|1:7586049_G_A:7586049:2,16,0,2
chr6	7590624	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.706:29:6,7:2,11:1,7,8,13
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:0,7,2,9
chr6	7595241	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.237:30:11,4:11,3:21,2,7,0
chr6	7606255	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,8:6,6:6,5,10,4
chr6	7606290	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=114,54;MMQ=60,29;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:23,4:20,0:27,16,5,0
chr6	7879407	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:8,10,0,4
chr6	7889088	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:0,9,1,4
chr6	7889768	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:10,9,0,2
chr6	7891920	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:6,6,1,1
chr6	8026737	.	G	GAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8026737_G_GAAA:8026737:0,1,0,1
chr6	8026739	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8026737_G_GAAA:8026737:0,1,0,1
chr6	8026741	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8026737_G_GAAA:8026737:0,1,0,1
chr6	8073623	.	GTAGAGTAGTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:0,3:1,0,7,2
chr6	8090617	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	8422613	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	8428137	.	A	AAGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,2:10,1:11,3,2,1
chr6	8428173	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:15,0:20,2:19,16,1,1
chr6	9897153	.	GATTACAGCAGTTACTTTGAGCAAGAGTATCCATGGATGACTCATCTCATCCTCCATACAATGCAATGAAGTAGATCTAATTTCCTGTGA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,2:3,0:8,10,1,1
chr6	9900599	.	T	TGAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,6:5,4:6,2,6,4
chr6	9939480	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,1:8,3,2,0
chr6	10419671	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.105:46:22,0:14,4:19,23,0,4
chr6	10529119	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:4,6:2,3:4,2,6,4
chr6	10586184	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	10695136	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	10707742	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=95,1759;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:13,5:7,0:7,14,0,5
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,159;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,4:4,2:1,12,0,6
chr6	10756863	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=81,182;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,2:1,0:0|1:10756863_TA_T:10756863:1,2,0,2
chr6	10756874	.	A	AAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=172,81;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1|0:10756863_TA_T:10756863:0,3,1,1
chr6	10770388	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,0:11,2:16,13,1,1
chr6	10791859	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr6	10802045	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=102,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.865:20:1,10:1,8:1,1,13,5
chr6	10875043	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:7,6,2,1
chr6	10882100	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	10887251	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,10,1
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,10,1
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr6	10891651	.	ATTTT	A,AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26,26;MFRL=179,167,144;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.17,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,6:0.236,0.452:13:3,1,1:0,2,4:4,0,9,0
chr6	10891673	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=13,17;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.464:45:2,2:2,0:26,0,19,0
chr6	10891842	.	CTCTCTGTGTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,140,146;MMQ=60,40,40;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.10,10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,8:0.448,0.545:13:0,5,6:0,0,1:0,0,0,13
chr6	10903147	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr6	10906154	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	10907983	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10907983_C_G:10907983:0,2,0,1
chr6	10907987	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10907983_C_G:10907983:0,2,0,1
chr6	10907990	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10907983_C_G:10907983:0,2,0,1
chr6	10907993	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10907983_C_G:10907983:0,2,0,1
chr6	10907994	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:10907983_C_G:10907983:0,2,0,1
chr6	10913129	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,0,2
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=92,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.744:25:4,9:2,10:3,3,11,8
chr6	10989879	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=161,95;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:4,0:10,8:10,4,8,0
chr6	10990021	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:19,4:11,0:15,15,0,4
chr6	10990078	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:2,9,0,2
chr6	11000440	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=142,203;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr6	11005787	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:5,1:12,2:7,10,1,2
chr6	11094687	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:0|1:11094687_T_G:11094687:0,3,0,1
chr6	11094694	.	T	TTGTTTTTTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:1,1:0|1:11094687_T_G:11094687:0,2,0,1
chr6	11094695	.	T	TGCTATGTCCTTCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	11094702	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11094687_T_G:11094687:0,0,0,1
chr6	11104180	.	AGTTGTCTGAT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:6,11,1,1
chr6	11104496	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:6,10,1,1
chr6	11105763	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.757:35:6,13:2,14:5,3,16,11
chr6	11185533	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:17,4:16,3:14,19,1,6
chr6	11185681	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:14,1:10,3:11,13,3,1
chr6	11185863	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,0:12,2:8,9,1,1
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	11190451	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=91,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:11,4:23,0:0|1:11190451_T_A:11190451:23,13,4,0
chr6	11190457	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=91,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:10,4:24,0:0|1:11190451_T_A:11190451:22,14,4,0
chr6	11192495	.	T	TGGCCC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:0,0,3,0
chr6	11192496	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:0,0,3,0
chr6	11192500	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:0,0,3,0
chr6	11192504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,12;MFRL=93,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,0:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:1,1,3,0
chr6	11192507	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=31,22;MFRL=93,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:2,1:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:2,2,2,0
chr6	11192512	.	CTG	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=83,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:4,0:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:2,3,2,0
chr6	11192516	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=22,12;MFRL=83,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:5,0:0|1:11192495_T_TGGCCC:11192495:2,3,2,0
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=155,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=105.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.868:43:0,21:0,17:5,0,16,22
chr6	11192582	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=26,23;MFRL=86,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:24,5:16,0:17,24,5,0
chr6	11306153	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:3,2:10,3:9,4,4,1
chr6	11714639	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	11717573	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:9,4:9,2:12,7,4,2
chr6	11723538	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr6	11723827	.	G	GCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	11770231	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=99,33;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:16,0:23,0:0|1:11770231_G_A:11770231:24,17,1,1
chr6	11770237	.	CA	AT	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=99,33;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:17,0:25,1:0|1:11770231_G_A:11770231:24,18,1,1
chr6	11770334	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=108,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.866:24:1,8:2,13:0,3,2,19
chr6	11770425	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=201,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	11779088	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	12120445	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.821:20:1,8:1,9:1,2,10,7
chr6	12122645	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,10:0,0,18,9
chr6	12122743	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:4,2:0|1:12122743_T_C:12122743:8,8,1,1
chr6	12122752	.	T	TGTAAAAGAACA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:12122743_T_C:12122743:8,8,1,1
chr6	12129936	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,2:7,3:10,4,4,1
chr6	12161595	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=189,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr6	12292802	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:1,6,0,3
chr6	12294258	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,6:3,1:4,4,3,4
chr6	12749752	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	12933933	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=95,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:11,0:19,3:20,11,3,0
chr6	13206380	.	C	CACCA	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACCA;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.071:39:21,2:16,0:22,15,1,1
chr6	13206385	.	G	A,C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,20,20;MFRL=133,74,37;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.77,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,2,2:0.070,0.070:40:19,2,2:16,0,0:22,14,2,2
chr6	13206390	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:18,2:14,0:22,13,1,1
chr6	13230610	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:13230610_C_A:13230610:0,0,0,1
chr6	13230612	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13230610_C_A:13230610:0,0,0,1
chr6	13230624	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13230610_C_A:13230610:0,0,0,1
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,7,16
chr6	13278662	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:4,16,1,1
chr6	13316780	.	CAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30,26;MFRL=89,180,126;MMQ=60,60,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=6.73,5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,4:0.338,0.274:15:3,2,3:2,3,1:3,3,7,2
chr6	13365913	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=289,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr6	13365940	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=289,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,1,3
chr6	13470113	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr6	13588719	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:4,3:4,0:2,6,1,2
chr6	13592133	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:0|1:13592133_G_A:13592133:2,17,0,2
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,15:0.728:20:5,11:0,4:1|0:13592133_G_A:13592133:0,5,2,13
chr6	13599303	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,5:2,7:1,5,4,8
chr6	13604710	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=94,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:0,4:3,12:1,2,5,11
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr6	13638243	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	13638272	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:13638272_A_ATC:13638272:0,2,0,1
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chr6	13978837	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0,0,5,6
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chr6	15246896	.	CT	AG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.782:16:0,6:3,7:0,3,4,9
chr6	15246915	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,8:2,5:0,2,0,13
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	15487782	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=97,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:5,14:6,8:6,5,4,18
chr6	15496563	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=97,70;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:20,3:24,0:25,19,1,2
chr6	15496571	.	A	AAG	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=93,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:20,0:22,2:0|1:15496571_A_AAG:15496571:24,22,1,1
chr6	15496573	.	CACACAAT	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=98,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:24,0:22,2:0|1:15496571_A_AAG:15496571:25,23,1,1
chr6	15496582	.	TC	T	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=103,35;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:20,0:21,2:0|1:15496571_A_AAG:15496571:21,21,1,1
chr6	15496585	.	G	GGAA	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=101,35;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:20,0:20,2:0|1:15496571_A_AAG:15496571:21,20,1,1
chr6	15496595	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=106,35;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,0:20,2:0|1:15496595_A_G:15496595:17,19,1,1
chr6	15496597	.	AG	TC	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=106,35;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:16,0:18,2:0|1:15496595_A_G:15496595:17,19,1,1
chr6	15501666	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15501666_T_G:15501666:0,0,0,1
chr6	15501672	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15501666_T_G:15501666:0,0,0,1
chr6	15501675	.	CAGGAGTGCGGGAGGAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15501666_T_G:15501666:0,0,0,1
chr6	15507634	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=159,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:8,14,1,1
chr6	15511429	.	C	CCCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	15520561	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15520561_T_TA:15520561:0,1,0,1
chr6	15520563	.	C	CCAGGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15520561_T_TA:15520561:0,1,0,1
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=73,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.737:32:5,9:3,15:6,2,10,14
chr6	15593319	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,20,26,26;MFRL=136,202,116,126;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,25,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.91,5.88,10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,5,6,8:0.174,0.243,0.339:25:3,0,1,2:3,4,4,4:4,2,8,11
chr6	15615637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=182,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:2,2:2,4:1,3,2,5
chr6	15627553	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=80,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:1,1,6,2
chr6	15651642	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=119,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:0,1:3,0:3,7,2,5
chr6	16130979	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:4,15,1,2
chr6	16145325	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=95,77;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.778:29:4,12:2,11:3,3,13,10
chr6	16238998	.	AGAGCC	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGCC;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.070:40:19,2:12,0:0|1:16238998_AGAGCC_A:16238998:20,18,1,1
chr6	16239015	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:25,2:19,0:0|1:16238998_AGAGCC_A:16238998:23,22,1,1
chr6	16239040	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:18,2:16,0:0|1:16238998_AGAGCC_A:16238998:18,16,1,1
chr6	16286045	.	GG	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:4,9,1,1
chr6	16290862	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:6,17:4,3:6,4,6,14
chr6	16290889	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:5,2:0|1:16290889_G_T:16290889:3,17,1,1
chr6	16290891	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:5,2:0|1:16290889_G_T:16290889:3,17,1,1
chr6	17426734	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=169,122;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,3:7,1:8,0,4,0
chr6	17426751	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,159;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:6,1:7,7,2,0
chr6	17539418	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	17539641	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=82,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,1:11,2:6,14,2,1
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr6	17543302	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,24:0,0,20,26
chr6	17600619	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:3,0,5,0
chr6	17602797	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.198:17:7,3:4,0:11,3,3,0
chr6	17605106	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=20,31;MFRL=100,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,2:4,4:3,3,5,1
chr6	17605166	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,0:10,3:8,5,2,1
chr6	17605179	.	AG	GA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=113,108;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.210:22:7,0:11,4:11,7,2,2
chr6	17605195	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=112,108;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:10,0:16,4:16,10,2,2
chr6	17605227	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=108,108;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:14,2:0|1:17605227_A_T:17605227:15,15,0,2
chr6	17605231	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=108,108;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,0:13,2:0|1:17605227_A_T:17605227:15,15,0,2
chr6	17606158	.	GC	CA	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,83;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:17,3:13,1:13,17,2,2
chr6	17606162	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=134,83;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:17,3:10,1:0|1:17606162_C_T:17606162:12,17,2,2
chr6	17606169	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=134,83;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:19,3:12,1:0|1:17606162_C_T:17606162:13,18,2,2
chr6	17606184	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=120,107;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:20,1:12,2:17,16,1,2
chr6	17616493	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	17616503	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:17616503_G_GCA:17616503:1,0,0,1
chr6	17616505	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17616503_G_GCA:17616503:1,0,0,1
chr6	17616508	.	TC	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,21;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17616503_G_GCA:17616503:1,0,0,1
chr6	17616512	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17616503_G_GCA:17616503:1,0,0,1
chr6	17624923	.	G	GAT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:8,2:12,2:7,13,2,2
chr6	17633061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr6	17662088	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,0,2
chr6	17669430	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,204;MMQ=40,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:17669430_C_T:17669430:5,0,2,0
chr6	17669434	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=156,204;MMQ=46,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:2,1:0|1:17669430_C_T:17669430:6,0,2,0
chr6	17675353	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:10,7,0,3
chr6	17761155	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=171,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,3:4,0:0,6,1,2
chr6	17777614	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=79,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.439:17:4,1:6,5:3,7,2,5
chr6	17777654	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,0,7
chr6	17779270	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,1:11,1:11,16,2,0
chr6	17779725	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,21;MFRL=211,207;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:11,0,3,0
chr6	17779731	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=206,212;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,3:9,1:11,0,4,0
chr6	17779761	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=177,153;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.196:19:1,1:15,1:15,1,3,0
chr6	17779783	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=131,85;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:6,2:21,1:20,11,2,1
chr6	17779791	.	CTG	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=123,85;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:7,2:21,0:0|1:17779791_CTG_C:17779791:20,12,1,1
chr6	17779795	.	G	GTT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=114,85;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.089:32:7,2:22,0:0|1:17779791_CTG_C:17779791:17,13,1,1
chr6	17779963	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=177,103;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.271:8:2,0:4,1:0|1:17779963_G_T:17779963:1,5,0,2
chr6	17779970	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=171,103;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.479:4:2,1:0,1:0|1:17779963_G_T:17779963:1,1,0,2
chr6	17779972	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=171,103;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.479:4:2,1:0,1:0|1:17779963_G_T:17779963:1,1,0,2
chr6	17781576	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:17781576_GTTTTT_G:17781576:1,5,1,1
chr6	17781584	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:17781576_GTTTTT_G:17781576:1,5,1,1
chr6	17781586	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:17781576_GTTTTT_G:17781576:1,4,1,1
chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,1,5
chr6	17790145	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:21,1:0|1:17790145_G_T:17790145:16,17,1,1
chr6	17790161	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:14,1:0|1:17790145_G_T:17790145:6,21,1,1
chr6	17790167	.	G	GTAGCAGAAGAAAAGAAATA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:16,2:0|1:17790145_G_T:17790145:6,21,1,1
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,6:1,10:0,1,3,13
chr6	17794494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:7,4,1,1
chr6	17799437	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:6,0,1,2
chr6	17799575	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.802:23:3,10:1,9:1,3,8,11
chr6	17799766	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr6	17800131	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:11,2:8,2:17,2,4,0
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr6	17834213	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=95,77;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.643:23:5,11:3,4:3,5,7,8
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,4:0,2:0,1,1,6
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr6	17834346	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	17850612	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,2:13,2:12,10,2,2
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr6	17873560	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:6,3,3,0
chr6	18122506	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	18134008	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.366:15:3,2:3,2:8,1,5,1
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=101,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.587:22:6,6:2,5:7,2,8,5
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.587:22:5,6:3,5:2,7,4,9
chr6	18143769	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	18148019	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=235,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.941:31:0,8:1,22:1,0,24,6
chr6	18148155	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.223:17:8,1:6,2:3,11,0,3
chr6	18148247	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	18160230	.	C	CTATTCTATTCTATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.361:6:4,2:0,0:1,3,1,1
chr6	18171527	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:10,1,0,2
chr6	18201961	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr6	18205943	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:0|1:18205943_G_T:18205943:6,15,1,1
chr6	18205951	.	G	T,A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,27,20;MFRL=124,73,95;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.10,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.130,0.130:20:13,0,0:3,2,2:4,12,2,2
chr6	18205953	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:18205943_G_T:18205943:5,13,1,1
chr6	18215166	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,6:1,7:0,1,9,4
chr6	18258085	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:1,1:9,0,2,0
chr6	18258299	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:3,3:0,7,0,3
chr6	18258612	.	T	TC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=87,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:20,0:12,5:13,19,0,5
chr6	18264078	.	TTCC	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=115,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.060:46:16,0:28,2:20,24,2,0
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:5,5,1,1
chr6	18427784	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,3:7,1:14,2,3,1
chr6	18457521	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:8,3:4,16,0,3
chr6	18459736	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	18459805	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:8,2,1,1
chr6	18463633	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,0,4
chr6	20113029	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,14;MFRL=213,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:20113029_T_A:20113029:3,0,1,0
chr6	20113031	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:20113029_T_A:20113029:4,0,1,0
chr6	20113034	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:20113029_T_A:20113029:4,0,1,0
chr6	20113036	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:20113029_T_A:20113029:4,0,1,0
chr6	20115611	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	20481678	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=211,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:0,2,2,3
chr6	20548795	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,0:4,3:14,2,2,1
chr6	20739731	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,2:3,1:7,3,3,0
chr6	20758760	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,5:0,10:1,0,11,4
chr6	20758808	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.338:24:7,6:6,2:9,6,5,4
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,3:0,5:0,2,2,7
chr6	21231007	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	21231034	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	21596594	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=108,1340;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:11,0:20,6:9,23,6,0
chr6	21597192	.	GA	G,GAA	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=20,31,20;MFRL=101,43,83;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.90,4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,8,8:0.115,0.106:65:14,2,3:12,5,2:17,32,8,8
chr6	21597201	.	A	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=102,85;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.072:81:27,0:47,5:27,49,0,5
chr6	21597697	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:11,0:20,6:18,15,0,6
chr6	21597753	.	C	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;RPA=19,38;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.810:24:1,1:2,0:0,4,7,13
chr6	21597869	.	CTT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:22,6:20,2:18,24,2,6
chr6	21598561	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=138,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:32,3:25,0:35,26,3,0
chr6	22570151	.	AGG	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:22570151_AGG_A:22570151:9,5,1,1
chr6	22570155	.	CAAGCCGACCCACGCTGGTGGCGGCGGCGACGAAT	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,1:6,0:0|1:22570151_AGG_A:22570151:14,16,1,1
chr6	22570189	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:10,2:9,5:7,12,2,6
chr6	22570245	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,2:5,3:7,6,2,3
chr6	22571356	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:6,0:9,3:4,11,3,1
chr6	22571724	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=119,153;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.218:39:15,0:15,8:20,11,0,8
chr6	24134818	.	G	GGGAATGGCATGGAATGGAATGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	24145989	.	C	CTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:7,0:0|1:24145989_C_CTA:24145989:9,8,0,2
chr6	24145991	.	G	GAC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:8,0:0|1:24145989_C_CTA:24145989:9,8,0,2
chr6	24146103	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:11,0:14,2:0|1:24146103_G_A:24146103:16,10,1,1
chr6	24146111	.	G	GCTGGCT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:24146103_G_A:24146103:12,9,1,1
chr6	24146114	.	AA	GG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:24146103_G_A:24146103:12,9,1,1
chr6	24146581	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,0:3,8:0,7,0,8
chr6	24174955	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=88,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,1:9,2:7,6,2,1
chr6	24278200	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr6	24353881	.	T	TTGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:24353881_T_TTGCA:24353881:0,1,1,1
chr6	24353887	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24353881_T_TTGCA:24353881:0,1,0,1
chr6	24358340	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:8,0:20,4:14,15,4,0
chr6	24358356	.	GCA	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=96,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:5,3:18,2:16,9,3,2
chr6	24358483	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,14:0,0,10,23
chr6	24412431	.	GT	G,GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=120,134,112;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.70,10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,8:0.238,0.519:14:2,1,6:1,2,2:2,1,10,1
chr6	24416562	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr6	24416593	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,3:6,1:14,2,4,0
chr6	24418506	.	AATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=225,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:1,1:1,1,0,4
chr6	24418835	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.212:21:13,3:4,1:2,15,3,1
chr6	24418854	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,3:5,1:1,18,2,2
chr6	24423149	.	C	CTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=77,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:6,7,2,3
chr6	24429249	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,7:0,0,15,6
chr6	24436760	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	24448061	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	24450168	.	G	GCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCT;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	24456902	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr6	24456907	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr6	24460679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	24460681	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:24460681_T_C:24460681:0,4,0,1
chr6	24460685	.	A	AAGAGTGTTTCAAATCTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:24460681_T_C:24460681:0,4,0,1
chr6	24460691	.	T	TGTTTCAAATCTGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr6	24463020	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,1:5,6:3,5,2,5
chr6	24463055	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,3,9
chr6	24463059	.	ACTT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr6	24467366	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:5,2:8,1:7,6,1,2
chr6	24475517	.	TATTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr6	24476553	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr6	24480295	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	24495291	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24495291_C_A:24495291:0,0,0,1
chr6	24495300	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24495291_C_A:24495291:0,0,0,1
chr6	24502774	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:0|1:24502774_G_A:24502774:9,7,1,2
chr6	24502776	.	G	GTCAAGAATC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:10,2:7,0:0|1:24502774_G_A:24502774:10,8,1,1
chr6	24505030	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr6	24515330	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.356:18:8,2:1,4:9,2,0,7
chr6	24547650	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr6	24559433	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=223,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,2,5
chr6	24576558	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24576558_A_T:24576558:1,0,0,1
chr6	24576574	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24576558_A_T:24576558:1,1,0,1
chr6	24651320	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:1,0,3,3
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chr6	24657964	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,4:2,2:2,0,5,1
chr6	24659050	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=177,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.663:4:0,3:1,0:0|1:24659050_A_C:24659050:0,1,2,1
chr6	24659053	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=177,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:24659050_A_C:24659050:0,1,2,1
chr6	24659059	.	A	ATTCTGACCTTGCCAGTGTTGACCAAACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=177,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:24659050_A_C:24659050:0,1,2,1
chr6	24687765	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	24687892	.	C	T	.	.	DP=126;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=84,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,6:0.055:123:48,0:67,6:98,19,6,0
chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=255,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.893:14:1,8:0,5:0,1,0,13
chr6	24780892	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:9,5,2,0
chr6	24818785	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,193;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,2:10,2:10,6,2,2
chr6	24839562	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr6	24843680	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=95,60;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.137:35:12,4:15,0:19,12,4,0
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,7,16
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,6,12
chr6	25092031	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=122,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,11:0,5:0,1,5,11
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr6	25108989	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,0,0,9
chr6	25108991	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,0,0,9
chr6	25280035	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=114,127;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.082:52:20,3:28,0:20,28,4,0
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr6	25420344	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,10,12
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=38,29,30;MFRL=70,147,134;MMQ=54,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=8.29,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,3:0.403,0.235:14:3,5,3:0,1,0:4,1,8,1
chr6	25426646	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=119,70;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:14,2:1,0:13,2,2,0
chr6	25435654	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr6	25450952	.	CTTCCTTCT	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.239:15:5,0:6,3:3,9,1,2
chr6	25450970	.	TCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=198,162;MMQ=40,45;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.604:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	25451011	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,28;MFRL=162,198;MMQ=45,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:25451011_C_T:25451011:0,1,0,1
chr6	25451019	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=162,198;MMQ=45,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25451011_C_T:25451011:0,1,0,1
chr6	25451027	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=162,198;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25451011_C_T:25451011:0,1,0,1
chr6	25488754	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=113,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,1:18,2:8,19,0,3
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr6	25492364	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr6	25509976	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,3:9,2:3,10,2,3
chr6	25510648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	25511008	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr6	25516127	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	25557132	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:4,1:1,9,0,2
chr6	25557149	.	T	A,TAA,TTAA,TTTAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23,25,29,29;MFRL=0,147,126,169,152;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=20,7,16,6;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=3.64,3.41,4.74,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,2,2,2,1:0.269,0.268,0.232,0.154:7:0,2,1,1,0:0,0,1,1,1:0,0,0,7
chr6	25610203	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:5,0,6,1
chr6	25619712	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=74,258;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:9,2:18,0:0|1:25619712_T_C:25619712:20,9,2,0
chr6	25619721	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=74,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,2:19,0:0|1:25619712_T_C:25619712:19,9,2,0
chr6	25652568	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=87,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.677:7:0,3:2,2:1,1,4,1
chr6	25653566	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=181,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr6	25661887	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=75,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:1,4,3,6
chr6	25669636	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=214,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,4:0,1:2,0,5,0
chr6	25682262	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr6	25689487	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr6	25726455	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:6,6,1,1
chr6	25726553	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,0:10,3:4,12,0,3
chr6	25727633	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:25727633_T_TTC:25727633:0,0,0,1
chr6	25727645	.	GC	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25727633_T_TTC:25727633:0,0,0,1
chr6	25727654	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25727633_T_TTC:25727633:0,0,0,1
chr6	25769349	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,18,9
chr6	25769506	.	A	ATGATATCATACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:25769506_A_ATGATATCATACT:25769506:0,0,0,1
chr6	25769508	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25769506_A_ATGATATCATACT:25769506:0,0,0,1
chr6	25770239	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=0,520;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr6	25773677	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,2:3,12,0,3
chr6	25773977	.	TCTGTCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25773977_TCTGTCC_T:25773977:0,0,0,1
chr6	25773985	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25773977_TCTGTCC_T:25773977:0,0,0,1
chr6	25773988	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25773977_TCTGTCC_T:25773977:0,0,0,1
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	25779470	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:3,0:2,3:0|1:25779470_CA_C:25779470:1,4,1,2
chr6	25779472	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:2,3:0|1:25779470_CA_C:25779470:1,5,1,2
chr6	25779476	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:0|1:25779470_CA_C:25779470:1,5,1,2
chr6	25779480	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:0|1:25779470_CA_C:25779470:1,5,1,2
chr6	25779498	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,24;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:25779498_G_A:25779498:1,4,0,1
chr6	25779500	.	CTGAT	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:25779498_G_A:25779498:1,4,0,1
chr6	25779506	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25779498_G_A:25779498:0,3,0,1
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	25811929	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:6,7,1,1
chr6	25819350	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=76,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.080:60:15,0:40,4:37,19,1,3
chr6	25820222	.	GTTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:25820222_GTTC_G:25820222:0,0,0,1
chr6	25820226	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:25820222_GTTC_G:25820222:0,0,0,1
chr6	25845700	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=134,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:25845700_G_A:25845700:7,12,1,1
chr6	25845708	.	GCA	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=133,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:10,2:0|1:25845700_G_A:25845700:8,16,1,1
chr6	25845713	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=132,37;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:25845700_G_A:25845700:9,14,1,1
chr6	25845715	.	G	GACTTTCCAA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:0|1:25845700_G_A:25845700:9,14,1,1
chr6	25915631	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=227,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	25915664	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=203,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	25917404	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=198,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25917404_A_C:25917404:0,1,0,1
chr6	25917406	.	A	ACCCCACTCCACTCTATTCCGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=198,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25917404_A_C:25917404:0,1,0,1
chr6	25918688	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.248:26:7,0:13,5:13,7,3,3
chr6	26021813	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr6	26031984	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=98,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,12:0.232:54:18,0:24,11:21,21,0,12
chr6	26033809	.	T	TAAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=98,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.272:27:5,3:15,4:6,14,1,6
chr6	26087856	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	26091336	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=86,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:9,2:5,1:4,10,2,1
chr6	26104096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	26124243	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=3134796,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,2,1
chr6	26124430	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,43:0.641:67:14,22:9,21:15,9,30,13
chr6	26189312	.	CC	GG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:4,0:0,7,0,5
chr6	26199014	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,28:0.828:33:2,11:3,16:5,0,23,5
chr6	26199524	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=106.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.944:33:1,17:0,15:0,1,3,29
chr6	26199813	.	TGCTCCAAAAAAGG	T	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=111,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,2:0.037:77:29,2:28,0:40,35,1,1
chr6	26199822	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=168.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,56:0.846:66:4,30:5,26:7,3,29,27
chr6	26200256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	26217728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	26234476	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,30:0.795:37:4,14:3,14:5,2,19,11
chr6	26240624	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=267,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,4:5,1,8,1
chr6	26271713	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	26273143	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:10,4:10,0:18,3,2,2
chr6	26368938	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=88,95;MMQ=25,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:16,9:3,6:10,9,8,7
chr6	26369144	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26369144_A_G:26369144:0,0,0,1
chr6	26369146	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,237;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26369144_A_G:26369144:0,0,0,1
chr6	26370474	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	26370605	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,14,11
chr6	26370616	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,110;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:9,4:1,10:5,5,7,7
chr6	26373086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=216,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,2:0,5:1,2,4,3
chr6	26373121	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=178,75;MMQ=56,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.745:10:2,2:0,4:2,0,4,4
chr6	26373150	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,6:2,8:3,2,10,4
chr6	26373347	.	T	TGACCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:26373347_T_TGACCAG:26373347:0,4,0,1
chr6	26373349	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:26373347_T_TGACCAG:26373347:0,4,0,1
chr6	26373350	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=131,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26373347_T_TGACCAG:26373347:0,3,0,1
chr6	26373465	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=131,93;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr6	26373484	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:0,1:8,0:7,2,7,0
chr6	26373495	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=17,20;MFRL=169,47;MMQ=60,34;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,0:4,1:12,4,2,0
chr6	26373507	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:7,3:2,5:8,3,5,5
chr6	26373740	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:0,2,0,9
chr6	26374658	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	26390830	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr6	26391190	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr6	26392515	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,4,0
chr6	26393021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,54;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,11,10
chr6	26407932	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:10,0:9,7,2,0
chr6	26407982	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=129,211;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:8,0:14,6:10,12,0,6
chr6	26408014	.	GG	CT	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=106,211;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:10,0:13,6:13,11,0,6
chr6	26408275	.	C	CCTCCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=123,150;MMQ=59,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26408275_C_CCTCCTG:26408275:0,2,0,1
chr6	26408276	.	A	ACCTCGTGATCCGCCCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,150;MMQ=59,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26408275_C_CCTCCTG:26408275:0,2,0,1
chr6	26411228	.	T	TAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=154,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,28;RU=A;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.875:8:0,1:1,6:1,0,7,0
chr6	26422260	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr6	26423538	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:4,3:4,4,2,1
chr6	26423560	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr6	26428842	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,0:1,8:1,0,6,2
chr6	26451826	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr6	26452466	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=99,111;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,0:10,2:0|1:26452466_C_A:26452466:7,9,0,3
chr6	26452470	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=104,111;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:3,0:10,3:0|1:26452466_C_A:26452466:6,10,0,3
chr6	26465384	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,3:6,1:17,2,2,2
chr6	26466389	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=140,100;MMQ=54,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0|1:26466389_G_A:26466389:1,7,1,3
chr6	26466392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=140,100;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0|1:26466389_G_A:26466389:1,7,1,3
chr6	26468660	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.834:34:3,13:2,16:2,3,13,16
chr6	26501768	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,8:2,1:2,0,6,3
chr6	26505135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr6	26505512	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26505512_G_GCT:26505512:0,1,0,1
chr6	26505513	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26505512_G_GCT:26505512:0,1,0,1
chr6	26508245	.	TTATTATATAAC	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:15,0:10,3:0|1:26508245_TTATTATATAAC_T:26508245:15,18,2,2
chr6	26508259	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=137,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:15,0:11,4:0|1:26508245_TTATTATATAAC_T:26508245:14,13,2,2
chr6	26508269	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:13,0:17,3:0|1:26508245_TTATTATATAAC_T:26508245:16,16,2,2
chr6	26545418	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=84,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,30:0.720:41:4,8:7,21:7,4,14,16
chr6	27100096	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:6,1:8,3:11,3,3,1
chr6	27107610	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.836:26:2,9:1,13:3,1,15,7
chr6	27114230	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,91;MMQ=40,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:34,0:22,2:0|1:27114230_G_A:27114230:30,26,1,1
chr6	27114239	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,91;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:37,0:19,2:0|1:27114230_G_A:27114230:29,30,1,1
chr6	27114910	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,38:0.765:49:6,15:5,23:6,5,21,17
chr6	27216848	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	27277208	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:19,4:11,0:23,7,4,0
chr6	27277665	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=87,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,9:1,2:3,0,5,6
chr6	27279520	.	GTCCTGC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=175,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:27279520_GTCCTGC_G:27279520:3,2,1,1
chr6	27279529	.	GG	AA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=175,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:27279520_GTCCTGC_G:27279520:3,2,1,1
chr6	27279632	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=53,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:3,11:1,6:3,1,7,10
chr6	27293689	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr6	27293712	.	A	ACCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27293712_A_ACCT:27293712:0,1,0,1
chr6	27293713	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27293712_A_ACCT:27293712:0,1,0,1
chr6	27293739	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=176,0;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	27369155	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:27369155_A_C:27369155:0,4,1,1
chr6	27369158	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:27369155_A_C:27369155:0,4,1,1
chr6	27369161	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,1:0|1:27369155_A_C:27369155:0,4,1,1
chr6	27775674	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,50:0.719:69:16,23:3,27:7,12,27,23
chr6	27775697	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,48:0.744:64:15,20:1,28:5,11,23,25
chr6	27775939	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=133,134;MMQ=60,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,1:17,0:0|1:27775939_T_C:27775939:23,6,2,0
chr6	27775941	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=133,163;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:12,1:16,1:0|1:27775939_T_C:27775939:23,6,4,0
chr6	27775947	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=132,131;MMQ=60,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.204:32:10,1:15,5:0|1:27775939_T_C:27775939:20,6,6,0
chr6	27782031	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr6	27782528	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=98,125;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:3,6:5,6:0|1:27782528_T_C:27782528:2,6,6,6
chr6	27782535	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=91,125;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:0|1:27782528_T_C:27782528:2,5,6,3
chr6	27782538	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=91,129;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:0|1:27782528_T_C:27782528:2,5,6,4
chr6	27792221	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,10:0.282:37:17,3:9,7:0|1:27792221_C_T:27792221:18,9,5,5
chr6	27792228	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:17,3:11,5:0|1:27792221_C_T:27792221:17,11,4,5
chr6	27792232	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,27:0.757:35:3,17:5,10:1|0:27792221_C_T:27792221:3,5,15,12
chr6	27799201	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=189,290;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:6,2,0,2
chr6	27833631	.	AAAAGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=85,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	27861724	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=136,133;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:18,0:16,4:0|1:27861724_G_C:27861724:6,30,0,4
chr6	27861727	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=136,133;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.118:40:19,0:15,4:0|1:27861724_G_C:27861724:6,30,0,4
chr6	27879551	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,7:1,1:0,2,2,6
chr6	27925456	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,1:1,9:2,1,4,6
chr6	27925827	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.916:22:0,13:1,5:0,1,8,13
chr6	28094731	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr6	28097193	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:2,3,4,4
chr6	28117443	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr6	28120744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=119,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0|1:28120744_C_T:28120744:4,0,2,0
chr6	28120794	.	GACATT	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,2:0.111:25:13,0:8,1:1|0:28120744_C_T:28120744:17,6,1,1
chr6	28120801	.	GCTTGAT	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.097:29:12,0:9,2:1|0:28120744_C_T:28120744:18,9,1,1
chr6	28120811	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:12,0:10,2:1|0:28120744_C_T:28120744:13,9,1,1
chr6	28121175	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=138,34;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:0|1:28121175_A_C:28121175:10,9,1,1
chr6	28121181	.	GT	AG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:28121175_A_C:28121175:11,10,1,1
chr6	28121185	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=138,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:10,2:0|1:28121175_A_C:28121175:11,10,1,1
chr6	28121565	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,79;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.217:35:9,7:17,0:15,13,7,0
chr6	28134582	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.787:26:3,5:2,16:1,4,12,9
chr6	28217475	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:7,12,1,1
chr6	28219270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=100,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:1,1,10,1
chr6	28219826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	28227633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:1,3,5,2
chr6	28239681	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.846:24:2,10:1,11:3,0,14,7
chr6	28239915	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.766:18:2,6:1,8:2,2,6,8
chr6	28239932	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,6:0,0,8,9
chr6	28251759	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:7,1:7,9,2,0
chr6	28255040	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr6	28265640	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=74,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:0,2,2,7
chr6	28268452	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	28268484	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr6	28268621	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,65;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:6,3:12,6,1,2
chr6	28270008	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:5,9,1,2
chr6	28270064	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=195,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.838:14:0,7:1,5:0,2,6,6
chr6	28297279	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,10:2,5:1,1,9,7
chr6	28297313	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:6,4:4,7:8,2,6,6
chr6	28331094	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=57,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,9:2,8:2,3,10,8
chr6	28331127	.	AA	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:2,6:1,12:0,3,6,12
chr6	28334079	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr6	28359170	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:6,2:1,9:2,5,5,6
chr6	28403225	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,6:0,2:2,0,6,2
chr6	28403603	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,6,2
chr6	28404002	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=157,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:28404002_T_C:28404002:3,4,1,1
chr6	28404005	.	C	CAGCCATAGGAGGTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:3,0:0|1:28404002_T_C:28404002:4,4,1,1
chr6	28502010	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	28543912	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:13,0:8,9:4,17,1,8
chr6	28554332	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=115,98;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,2:16,0:0|1:28554332_A_G:28554332:15,12,2,0
chr6	28554334	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=115,98;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,2:17,0:0|1:28554332_A_G:28554332:15,12,2,0
chr6	28554341	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=115,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,0:15,3:13,12,2,1
chr6	28871924	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:7,9:7,0:0|1:28871924_T_A:28871924:8,8,9,0
chr6	28871926	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,9:8,0:0|1:28871924_T_A:28871924:8,8,9,0
chr6	28876889	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr6	28876965	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	28879504	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=124,68;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,0:13,3:0|1:28879504_G_A:28879504:11,16,1,2
chr6	28879509	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=120,68;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:12,2:0|1:28879504_G_A:28879504:11,15,1,2
chr6	28887932	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=104,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:26,4:17,0:18,27,4,0
chr6	28891423	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:4,6:2,2:2,5,0,8
chr6	28911585	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:2,3,5,0
chr6	28911802	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:1,3,2,6
chr6	28963248	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=216,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.753:18:2,6:2,8:1,3,7,7
chr6	28964086	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:1,6:2,8:2,1,8,6
chr6	28966481	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,179;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,3:16,0:17,10,3,0
chr6	29011927	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	29011960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=84,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:1,0,3,3
chr6	29054353	.	C	CATTTTTCAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=87,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:29054353_C_CATTTTTCAAT:29054353:3,5,1,1
chr6	29054355	.	G	GAGTTGTA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=87,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:29054353_C_CATTTTTCAAT:29054353:3,5,1,1
chr6	29068670	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=206,256;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,7:5,0:7,1,7,0
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,2:6,1:11,8,1,2
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.185:30:14,3:11,2:15,10,3,2
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:12,4:8,3:10,10,3,4
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr6	29080344	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.834:16:0,7:2,7:0|1:29080344_G_A:29080344:2,0,6,8
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:29080344_G_A:29080344:0,0,8,7
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chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,54;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=10507324,141;MMQ=43,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.877:18:1,8:0,8:2,0,11,5
chr6	29142054	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=109,93;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:5,2:11,1:0|1:29142054_C_G:29142054:15,3,2,1
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chr6	29230577	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,3,1
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=117,174;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:8,2:4,1:8,4,3,0
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chr6	29274486	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,7:0.383:19:4,3:7,4:1|0:29274479_A_G:29274479:11,1,5,2
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chr6	29323440	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:10,0:19,4:15,14,0,4
chr6	29323905	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:15,1:5,8:12,8,3,6
chr6	29342777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:10,3,0,2
chr6	29364446	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,2:2,7:5,3,5,4
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,6:2,3,8,3
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=171,122;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.791:22:2,9:2,8:2,2,10,8
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=160,110;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,11:1,5:1,0,5,11
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:2,2,4,5
chr6	29365230	.	GCACCTGTTCTTTT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:3,2:0|1:29365230_GCACCTGTTCTTTT_G:29365230:8,5,1,1
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=76,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,8:0.645:12:4,4:0,4:1|0:29365230_GCACCTGTTCTTTT_G:29365230:2,2,5,3
chr6	29365423	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=220,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr6	29394611	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=82,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:8,4:17,0:14,11,4,0
chr6	29394926	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,2:1,1,5,2
chr6	29407957	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:5,2:0|1:29407957_G_C:29407957:7,9,1,1
chr6	29407961	.	C	CCAGGTCT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:29407957_G_C:29407957:7,9,1,1
chr6	29407970	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:2,5:1,6:2,1,6,6
chr6	29408313	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=227,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:1,3,4,3
chr6	29408528	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=233,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,9:0,10:1,0,9,11
chr6	29431698	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=371,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,4,1
chr6	29432012	.	G	GACAAGGTGCTTTGCTAGAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	29556730	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=74,224;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.180:59:32,0:16,10:36,13,0,10
chr6	29571540	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:29571540_G_T:29571540:2,6,0,2
chr6	29571563	.	AGAGGAAGGGCACAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:29571540_G_T:29571540:0,3,0,1
chr6	29576393	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:12,6:5,4:8,9,5,5
chr6	29581011	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:9,4,9,1
chr6	29581017	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,0:9,3:16,7,3,0
chr6	29581041	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=22,30;MFRL=88,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:14,5:11,5:16,9,8,2
chr6	29581110	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:9,6:9,1:0|1:29581110_A_G:29581110:5,14,3,4
chr6	29581113	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:9,5:10,1:0|1:29581110_A_G:29581110:5,14,3,4
chr6	29591864	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr6	29595216	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=91,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:29595216_T_C:29595216:0,1,3,0
chr6	29595221	.	CGCAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,33;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0|1:29595216_T_C:29595216:0,2,3,0
chr6	29595231	.	CACCT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,0:0|1:29595216_T_C:29595216:1,3,2,0
chr6	29595238	.	CACCCA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:0,0:0|1:29595216_T_C:29595216:1,5,2,0
chr6	29599210	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=155,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:12,0:8,3:9,11,1,2
chr6	29600054	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.215:44:22,7:13,2:16,19,5,4
chr6	29625001	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,9,6
chr6	29625032	.	TTCC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TCC;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:3,3:5,0:3,6,1,2
chr6	29634003	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=75,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,19:0.715:26:2,8:5,11:0|1:29634003_G_C:29634003:2,5,8,11
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chr6	29638675	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=84,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:4,14,1,1
chr6	29643191	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=107,72;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:24,5:8,0:17,16,4,1
chr6	29643879	.	ATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr6	29691303	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.211:36:12,2:16,5:11,18,4,3
chr6	29691390	.	CT	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr6	29691744	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:6,0:10,2:8,9,0,2
chr6	29691772	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,8:1,10:0,3,10,9
chr6	29691857	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=72.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,28:0.724:38:3,16:7,10:7,3,11,17
chr6	29692288	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=186,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	29692729	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:10,4:4,1:5,9,2,3
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=119.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,20:0,23:0,0,20,23
chr6	29693113	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,3:10,5:6,11,5,3
chr6	29693726	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:10,3:2,1:7,6,3,1
chr6	29693938	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:6,14:5,4:5,6,10,8
chr6	29694044	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=138,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	29794906	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:1,1,0,5
chr6	29794933	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	29795636	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=98,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:10,1:2,2:0|1:29795636_G_A:29795636:7,5,0,3
chr6	29795657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:0|1:29795636_G_A:29795636:1,4,0,3
chr6	29795720	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,3,5
chr6	29795747	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:29795747_G_C:29795747:0,0,3,4
chr6	29795751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:29795747_G_C:29795747:0,0,3,4
chr6	29795993	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=143,89;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,1:9,2:8,16,3,0
chr6	29796103	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,1:7,1:8,7,2,0
chr6	29796369	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,0:3,4:5,5,3,1
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:1,2:10,2:2,9,1,3
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:11,2:9,4:11,9,3,3
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:4,1:7,10:7,4,3,9
chr6	29797590	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:10,7,2,0
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=97,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,4:6,4:5,7,3,5
chr6	29798039	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr6	29798083	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=92,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,1:9,2:11,5,3,0
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=83,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:14,2:10,2:12,12,3,1
chr6	29910276	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0|1:29910276_T_G:29910276:0,0,9,2
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0|1:29910276_T_G:29910276:0,0,10,3
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=17;MBQ=20,28;MFRL=99,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.896:26:0,12:2,12:1,1,9,15
chr6	29910378	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=17;MBQ=20,26;MFRL=88,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.801:28:2,11:3,11:3,2,10,13
chr6	29910419	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=17;MBQ=31,20;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:11,2:0|1:29910419_G_T:29910419:7,8,1,1
chr6	29910420	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=17;MBQ=30,20;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:10,2:0|1:29910419_G_T:29910419:7,8,1,1
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=17;MBQ=20,25;MFRL=88,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.843:17:0,3:2,12:0|1:29910429_C_G:29910429:1,1,7,8
chr6	29910437	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=17;MBQ=28,22;MFRL=88,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.850:18:0,2:1,12:0|1:29910429_C_G:29910429:1,1,8,8
chr6	29910450	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=17;MBQ=34,28;MFRL=88,148;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:0,2:1,11:0|1:29910450_G_C:29910450:0,1,6,8
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=17;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0|1:29910450_G_C:29910450:0,0,5,7
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=17;MBQ=25,28;MFRL=234,144;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:0,2:1,9:0|1:29910478_G_C:29910478:1,0,5,6
chr6	29910482	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=17;MBQ=31,27;MFRL=234,144;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.859:12:0,2:1,8:0|1:29910478_G_C:29910478:1,0,5,6
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=17;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,6,3
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=234,124;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,4:1,6:1,0,7,4
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=17;MBQ=32,32;MFRL=234,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.906:19:0,7:1,10:0|1:29910522_G_C:29910522:1,0,10,8
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chr6	29910693	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=24,28;MFRL=154,54672;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.240:48:19,5:17,6:0|1:29910688_A_G:29910688:15,22,6,5
chr6	29910700	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=54671,154;MMQ=54,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=110.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,30:0.687:43:7,11:5,14:0|1:29910700_G_T:29910700:6,7,13,17
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chr6	29910730	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=20,24;MFRL=104,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,36:0.804:44:1,15:6,15:0|1:29910700_G_T:29910700:5,3,14,22
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=25,30;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,42:0.797:52:3,24:7,15:0|1:29910700_G_T:29910700:6,4,16,26
chr6	29910752	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=155.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,40:0.759:52:4,23:8,14:0|1:29910700_G_T:29910700:7,5,13,27
chr6	29910801	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=120,124;MMQ=60,56;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.222:29:9,5:14,1:8,15,2,4
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,6:0,9:0|1:29910820_G_C:29910820:0,0,5,14
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,10:0|1:29910820_G_C:29910820:0,0,4,11
chr6	29910839	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=33,22;MFRL=144,124;MMQ=50,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,2:2,8:0,4,4,6
chr6	29910865	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=28,34;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:2,3,3,2
chr6	29910892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=21,28;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.671:12:0,3:2,5:4,0,5,3
chr6	29910986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=23,27;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:5,5,1,1
chr6	29911000	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr6	29911005	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,2:1,4:0|1:29911005_G_A:29911005:1,0,3,6
chr6	29911011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,23;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,3:1,3:0|1:29911005_G_A:29911005:1,0,4,5
chr6	29911086	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,2:2,6:2,4,2,6
chr6	29911092	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:2,4:8,1:0|1:29911092_G_T:29911092:2,8,3,3
chr6	29911114	.	GG	AC	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:2,7:6,1:0|1:29911092_G_T:29911092:1,7,5,4
chr6	29911119	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=151,130;MMQ=60,56;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:2,7:4,3:0|1:29911092_G_T:29911092:1,7,5,5
chr6	29911154	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=20,27;MFRL=74,129;MMQ=21,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:2,7:1,9:1,2,10,6
chr6	29911190	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=20,24;MFRL=74,127;MMQ=21,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.944:16:1,6:0,9:0|1:29911190_G_A:29911190:0,1,9,6
chr6	29911198	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=21,30;MFRL=74,122;MMQ=21,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.934:14:1,4:0,8:0|1:29911190_G_A:29911190:0,1,7,6
chr6	29911207	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0|1:29911190_G_A:29911190:0,0,9,4
chr6	29911228	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,26;MFRL=156,127;MMQ=40,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.723:16:3,6:0,5:0|1:29911190_G_A:29911190:4,0,6,6
chr6	29911239	.	TT	CA	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=26,32;MFRL=127,156;MMQ=59,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,4:5,0:7,7,4,0
chr6	29911256	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,16:0,2:0,0,12,6
chr6	29911296	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=26,24;MFRL=117,101;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.343:33:16,5:6,5:0|1:29911296_G_A:29911296:9,13,5,6
chr6	29911306	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=25,20;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,15:0.400:38:14,7:9,7:0|1:29911296_G_A:29911296:10,13,6,9
chr6	29911319	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=61.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,17:0.439:39:12,8:10,8:0|1:29911296_G_A:29911296:8,14,6,11
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=26,32;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:1,4,0,4
chr6	29911893	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=122,96;MMQ=53,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,29:0.667:43:5,16:9,13:7,7,22,7
chr6	29912028	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=205,190;MMQ=27,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:29912028_AG_A:29912028:7,3,0,2
chr6	29912030	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=217,190;MMQ=27,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:5,0:0|1:29912028_AG_A:29912028:8,3,0,2
chr6	29912042	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=219,190;MMQ=34,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:0|1:29912028_AG_A:29912028:9,3,0,2
chr6	29912108	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr6	29912147	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=114,123;MMQ=27,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,34:0.833:40:1,18:5,16:5,1,15,19
chr6	29912188	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=130,133;MMQ=54,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=108.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,31:0.781:39:3,16:4,13:0|1:29912188_T_C:29912188:4,4,12,19
chr6	29912204	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=118,143;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.677:32:2,12:7,10:0|1:29912188_T_C:29912188:3,7,10,12
chr6	29912227	.	TGGA	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:3,10:8,6:0|1:29912188_T_C:29912188:4,7,7,9
chr6	29912333	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=30,24;MFRL=105,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,30:0.886:33:2,14:1,14:1,2,20,10
chr6	29912368	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=24,27;MFRL=105,116;MMQ=60,58;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,34:0.888:38:1,18:2,15:2,2,13,21
chr6	29912398	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=20,31;MFRL=85,102;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=96.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,25:0.813:30:1,11:4,14:0|1:29912398_A_G:29912398:3,2,5,20
chr6	29912403	.	G	GTTTT	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=102,62;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,1:18,0:7,21,1,1
chr6	29912410	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=109,73;MMQ=59,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,1:14,3:4,20,2,2
chr6	29912413	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=23,27;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,23:0.762:30:2,10:3,8:0|1:29912398_A_G:29912398:4,3,3,20
chr6	29912451	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=29,23;MFRL=184,162;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,4:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:2,2,0,5
chr6	29912457	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=184,162;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,4:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:2,2,0,5
chr6	29912463	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=27,30;MFRL=184,162;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:4,4:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:2,2,0,5
chr6	29912473	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=184,162;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:4,2:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:2,2,0,5
chr6	29912477	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=27,30;MFRL=184,168;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:4,4:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:2,2,0,5
chr6	29912493	.	GT	AC	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:0,0,0,5
chr6	29912502	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:29912451_C_A:29912451:0,0,0,5
chr6	29912754	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=180,125;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,3:1,6:0|1:29912754_G_A:29912754:1,0,8,2
chr6	29912766	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,16:0.810:19:1,5:2,11:0|1:29912754_G_A:29912754:3,0,10,6
chr6	29912796	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,21;MFRL=75,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:5,5:6,12:9,2,8,10
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,13:0,0,7,12
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=81,141;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.416:22:4,5:9,4:0|1:29912852_T_C:29912852:5,8,7,2
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=22,26;MFRL=97,152;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,6:8,3:0|1:29912852_T_C:29912852:5,7,8,2
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=20,26;MFRL=93,167;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.842:17:0,8:2,7:0|1:29912935_C_T:29912935:1,1,10,5
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=20,32;MFRL=93,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.823:15:0,5:2,6:0|1:29912935_C_T:29912935:1,1,9,4
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,55;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,13,16
chr6	29913067	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.624:30:5,12:6,6:5,6,7,12
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,18:0,14:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,14,19
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,14,18
chr6	29913135	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.769:24:3,9:2,10:5,0,6,13
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=129,135;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:5,7:1,6:2,4,5,8
chr6	29913191	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=145,117;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:6,4:1,11:0|1:29913191_TG_CA:29913191:2,6,5,10
chr6	29913197	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=145,112;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,16:0.654:24:7,6:1,10:0|1:29913191_TG_CA:29913191:2,6,7,9
chr6	29942983	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=95,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:1,7:2,6:1,2,7,8
chr6	29943067	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,4:2,9:2,1,5,8
chr6	29943178	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=78,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:6,7:1,8:4,3,11,4
chr6	29943281	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=124,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.722:30:6,10:2,12:4,4,14,8
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.946:15:0,7:0,8:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,0,0,15
chr6	29943340	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=58.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,0,0,15
chr6	30030114	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr6	30036333	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:7,2:13,2:14,6,4,0
chr6	30036528	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,1:2,3:0,3,0,4
chr6	30041036	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:5,7,0,3
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr6	30075864	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:4,2:5,5,1,5
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,3,5
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,3,5
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:1,5:0,7:0,1,8,5
chr6	30121525	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,6:3,8:5,2,3,11
chr6	30121605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:1,4,0,3
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,11,11
chr6	30124690	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=206,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,4:2,10:6,0,10,4
chr6	30126297	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,170;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,1:10,2:10,13,0,3
chr6	30131682	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:5,0:11,10:15,2,10,0
chr6	30131711	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=95,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:8,9:3,11:10,1,14,6
chr6	30136302	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:2,5,1,2
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,4:7,1:5,9,2,3
chr6	30139794	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr6	30154049	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,22:0.767:28:3,9:3,11:2,4,6,16
chr6	30228230	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:6,2,3,0
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=82,108;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:8,7:11,2:15,6,2,7
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=89,126;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.174:33:14,5:14,0:18,10,0,5
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=92,157;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:13,5:19,0:17,15,0,5
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=123,90;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:5,4:14,3:0|1:30228879_C_T:30228879:7,13,2,5
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=123,90;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:6,4:14,3:0|1:30228879_C_T:30228879:7,13,2,5
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=158,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:8,4,2,0
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=21,26;MFRL=81,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.210:41:11,2:20,6:12,21,6,2
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:8,3:9,4:11,6,5,2
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:11,2:4,3:0|1:30229280_CC_AT:30229280:5,10,1,4
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:14,1:5,3:0|1:30229280_CC_AT:30229280:9,11,1,3
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=111,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,11:0.309:37:11,7:13,4:0|1:30229457_C_T:30229457:7,19,4,7
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:8,8:14,4:0|1:30229457_C_T:30229457:5,18,4,8
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=93,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.326:19:8,5:5,1:3,10,1,5
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:6,4,4,1
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,3:11,1:12,11,2,2
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=66,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=98,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.226:33:17,5:9,2:13,13,3,4
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.185:39:15,4:17,2:16,16,3,4
chr6	30297382	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=112,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.181:31:14,4:10,0:0|1:30297382_C_A:30297382:16,10,5,0
chr6	30297384	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=112,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:14,5:9,0:0|1:30297382_C_A:30297382:16,10,5,0
chr6	30297505	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:10,13:8,8:8,10,11,10
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:12,4:6,4:8,11,3,5
chr6	30303617	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=84,161;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:12,9:8,0:10,10,9,0
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:6,2,1,2
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=107,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,1:8,2:6,6,0,3
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,4:8,1:9,6,3,2
chr6	30313340	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:5,9:1,9:2,4,7,11
chr6	30314270	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,136;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:16,0:15,6:19,12,0,6
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:10,2:13,7:8,16,3,6
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:10,2:10,5:4,16,1,6
chr6	30457732	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=86,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.572:47:11,19:9,8:12,8,9,18
chr6	30458064	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:6,14:6,9:6,6,16,7
chr6	30521024	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr6	30521137	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=96,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.625:38:5,11:9,13:4,10,14,10
chr6	30529587	.	GTC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,1:3,2:4,0,4,0
chr6	30529754	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=104,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:13,6:9,0:12,12,6,0
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:4,11:3,5:0,7,1,15
chr6	30545700	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.490:10:4,4:1,0:1,4,5,0
chr6	30545874	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,1:10,0:16,12,0,2
chr6	30548137	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=146,0;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.630:23:3,2:1,6:8,1,1,13
chr6	30548269	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=99,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,4:0.062:79:41,4:31,0:0|1:30548269_G_A:30548269:37,38,0,4
chr6	30548273	.	GAGAAGGCCA	G	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=103,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,4:0.057:86:40,4:33,0:0|1:30548269_G_A:30548269:40,42,0,4
chr6	30551286	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr6	30552937	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=218,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr6	30553871	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,5:1,0,5,2
chr6	30558420	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:17,4:26,0:17,28,3,1
chr6	30558425	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=101,111;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.134:50:16,6:28,0:19,25,0,6
chr6	30558477	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=70.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.686:33:5,8:5,15:4,6,12,11
chr6	30569489	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=233,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:0,4:4,5:3,1,6,3
chr6	30573637	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29,31;MFRL=109,168,134;MMQ=60,40,53;MPOS=30,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.02,7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.299,0.507:7:1,0,2:0,2,2:1,0,6,0
chr6	30573842	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,25:0.767:32:2,13:5,12:3,4,9,16
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.696:44:9,12:4,18:6,7,15,16
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=100.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,34:0.815:41:2,16:5,18:5,2,21,13
chr6	30587693	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,105;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:15,0:21,4:22,14,0,4
chr6	30590691	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,8:3,5:2,6,4,9
chr6	30619299	.	T	TAATATAGGTACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,11;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	30620953	.	TAATAGGTATTA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:12,0:20,5,1,1
chr6	30622459	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=94,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,2:8,2:8,4,1,3
chr6	30627216	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:2,1,7,1
chr6	30627867	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,9:3,5:4,2,5,9
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	30645118	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.169:21:10,2:8,1:0|1:30645118_T_TG:30645118:2,16,3,0
chr6	30645123	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.225:22:10,2:7,1:0|1:30645118_T_TG:30645118:0,17,5,0
chr6	30645125	.	C	CAGG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.163:22:10,2:6,1:0|1:30645118_T_TG:30645118:2,17,3,0
chr6	30645126	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,11;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.170:21:8,0:6,0:0|1:30645118_T_TG:30645118:2,16,3,0
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr6	30670910	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=122,60;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,0:12,4:17,5,0,4
chr6	30670942	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=138,105;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,2:8,0:15,9,2,0
chr6	30673668	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,3:5,0:6,12,1,2
chr6	30675906	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=88,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:15,4:33,0:23,26,4,0
chr6	30676211	.	G	GTGAAGTGCAACAAGACAGGGTACGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=200,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,17,15
chr6	30680846	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=101,650;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:14,0:17,6:19,13,4,2
chr6	30680916	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=92,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,27:0.803:33:2,9:4,18:4,2,11,16
chr6	30698841	.	CCCGCTGCTCCTCAAT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=129,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:5,0:6,7,1,1
chr6	30708410	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:16,5:19,0:20,15,4,1
chr6	30708611	.	G	GTTTTTTTTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,0;MFRL=0,161;MMQ=35,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=22,33;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,0:1,0,0,3
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=128.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,20:0,17:0,0,21,16
chr6	30857289	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	30862423	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,10,13
chr6	30864829	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,8,12
chr6	30877674	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,220;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:7,5:16,0:17,6,5,0
chr6	30879470	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:10,3:22,0:13,19,1,2
chr6	30881021	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=304,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=131.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.953:39:1,18:0,19:1,0,23,15
chr6	30883476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=200,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	30883878	.	AAAGCAACC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGCAACC;STR;TLOD=97.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,9,13
chr6	30885486	.	CCTGCCTGGCCACACACAGCTTCGA	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=106,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:9,1:18,1:12,21,2,0
chr6	30888161	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=98,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:18,1:12,1:12,19,0,2
chr6	30888541	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,0:5,2:6,5,1,1
chr6	30888617	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	30889388	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.171:22:9,3:4,0:9,10,3,0
chr6	30890195	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=21464094,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,5:0,5:0,1,6,4
chr6	30890431	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr6	30890789	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.848:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr6	30892288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,7,7
chr6	30893754	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:3,0:16,2:0|1:30893754_A_C:30893754:11,9,1,1
chr6	30893760	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:16,2:0|1:30893754_A_C:30893754:11,11,1,1
chr6	30893762	.	G	GGAAGAAACCTT	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:17,2:0|1:30893754_A_C:30893754:11,11,1,1
chr6	30893833	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=166,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr6	30893941	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,4:1,10:1,0,7,8
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=537,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,5:1,5:0,1,3,7
chr6	30899524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,11:0,0,9,4
chr6	30899577	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	30917212	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,5,21
chr6	30917711	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=97,81;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.110:47:28,0:11,4:22,20,1,4
chr6	30918071	.	GGCCAATGAGAACACCACACCATCCCCGGCAGAGCCTACAGAAAATAGAGAAAGGACA	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=88,89;MMQ=46,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.119:54:10,1:15,4:33,16,3,2
chr6	30918898	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=97,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:0|1:30918898_C_T:30918898:17,10,1,1
chr6	30918900	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=87,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:13,2:0|1:30918898_C_T:30918898:19,11,1,1
chr6	30918910	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=92,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:14,0:13,1:0|1:30918898_C_T:30918898:19,10,1,1
chr6	30919101	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=87,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.122:46:16,0:22,5:24,17,1,4
chr6	30919188	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=93,69;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.100:57:22,3:28,2:29,23,3,2
chr6	30919871	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=105,97;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,3:19,0:23,11,3,0
chr6	30954245	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.898:27:1,14:1,10:1,1,12,13
chr6	30954633	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=101,108;MMQ=41,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:8,3:9,6,1,2
chr6	30954829	.	CCCTCCAGTGGGGCCAACACAGCCACCAACTCTGAGTCCAGTACGACCTCCAGTGGGGCCAACACAGCCACCAACTCTGACTCCAGCACAA	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=97,91;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,27:0.169:69:5,14:10,11:23,19,15,12
chr6	30955437	.	T	TTTGCACAGAAGA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:6,12,1,1
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr6	30955738	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:3,1,4,6
chr6	31079236	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,15:0,0,12,12
chr6	31079578	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.904:19:1,11:0,5:1,0,13,5
chr6	31079643	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr6	31079706	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=144,99;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.364:31:8,11:12,0:13,7,11,0
chr6	31079889	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr6	31079894	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:2,9:1,6:2,1,5,10
chr6	31080074	.	G	GAAAATGTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31080074_G_GAAAATGTA:31080074:1,1,0,1
chr6	31080076	.	A	AGTAAAATTAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:31080074_G_GAAAATGTA:31080074:1,2,0,1
chr6	31080081	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=188,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:31080074_G_GAAAATGTA:31080074:1,3,0,1
chr6	31080099	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,27;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr6	31080160	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=193,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr6	31080432	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=266,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr6	31084048	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=63,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.702:28:4,10:4,10:4,4,8,12
chr6	31084075	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=98,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:11,2:10,4:10,12,4,2
chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0|1:31084163_A_G:31084163:2,4,1,4
chr6	31084170	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,2:4,3:0|1:31084163_A_G:31084163:3,5,1,4
chr6	31084288	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,1:7,5,5,1
chr6	31084639	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:10,5:10,0:12,8,3,2
chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:3,7:11,0:8,6,3,4
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=84,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:8,4:18,1:13,14,3,2
chr6	31084942	.	GCTT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:4,8:1,8:2,3,10,6
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,12,12
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=75.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,16:0,0,12,12
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,8:0,0,12,2
chr6	31088145	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:1,4:2,13:2,1,6,11
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,2,9
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,2,8
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,12,20
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	31105769	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=117,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,0:9,2:8,14,2,0
chr6	31105857	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=91,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:6,12:1,6:4,3,7,11
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,12:0,11:0,0,8,16
chr6	31106133	.	CAG	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.267:26:4,1:12,7:5,13,8,0
chr6	31106140	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.452:22:4,0:7,7:2,10,10,0
chr6	31106143	.	CAG	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.280:30:6,1:11,7:0|1:31106143_CAG_C:31106143:8,14,8,0
chr6	31106149	.	CAG	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.265:28:8,1:11,6:0|1:31106143_CAG_C:31106143:10,11,7,0
chr6	31106606	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,1:6,3:5,12,1,3
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:3,12,1,2
chr6	31106877	.	G	GGCACGGAGGGGCTGACTTTCTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=269,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0,9,1,1
chr6	31106893	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=118,269;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0,1,0,8
chr6	31107648	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=30,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,31:0.821:37:2,7:4,23:3,3,12,19
chr6	31107723	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=109,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,6:2,5:0,3,3,8
chr6	31110757	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=114,92;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.211:45:23,9:13,0:18,18,9,0
chr6	31110786	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=73,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.677:38:5,16:7,10:5,7,11,15
chr6	31111180	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:1,9:1,10:1,1,9,10
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,13:0,0,9,10
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,34:0.779:43:5,17:4,17:7,2,27,7
chr6	31113326	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=98.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,36:0.686:52:8,21:8,15:6,10,13,23
chr6	31116220	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:3,5:2,4:3,2,5,5
chr6	31116245	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:4,2:2,8,3,3
chr6	31116526	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=72,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,4:0,3:1,1,2,5
chr6	31117756	.	CAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,11,17
chr6	31122330	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=221,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,33:0.872:37:3,9:1,24:4,0,13,20
chr6	31124897	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.281:23:10,0:7,6:0|1:31124897_A_T:31124897:3,14,0,6
chr6	31124903	.	TTTTCAGGCCACCTTCC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,0;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.249:26:10,0:6,0:0|1:31124897_A_T:31124897:2,18,0,6
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr6	31125137	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=122,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:21,2:15,0:25,11,2,0
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.263:32:14,6:10,2:18,6,4,4
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr6	31129642	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr6	31130313	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.209:27:8,2:12,3:9,13,3,2
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=89.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,6:0,16:0,0,11,12
chr6	31132656	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=109,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:2,5:4,9:1,5,6,8
chr6	31132689	.	T	TGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=58.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,8:0,0,0,15
chr6	31132883	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=63,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:1,1,10,1
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,8:0,0,6,10
chr6	31133577	.	A	AAAGCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	31133620	.	T	TAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,8,17
chr6	31236853	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,8,10
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,5,6
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,6,7
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,7:0,4:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,7,6
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr6	31237087	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,13:0,15:0,0,16,12
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=127.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:1,22:0,19:1,0,26,15
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=54,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=142.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,46:0.980:47:0,27:1,19:0,1,24,22
chr6	31237174	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=97,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.086:40:20,3:15,0:16,21,2,1
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=166.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,21:0,17:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,24,15
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=164.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,19:0,17:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,23,15
chr6	31237250	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=123,178;MMQ=51,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:21,3:25,0:23,23,2,1
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=144.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.980:49:0,21:0,24:0,0,21,28
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=140.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,20:0,12:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,12,22
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=127.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,9,20
chr6	31237353	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=65.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,10:0,0,4,20
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,1,12
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,6,4
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,6,6
chr6	31237723	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,12,6
chr6	31237727	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,4:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,11,6
chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,13,5
chr6	31237769	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,10:0,7:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,16,6
chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,12:0,9:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,17,7
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,15:0,9:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,19,7
chr6	31237776	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,15:0,9:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,18,9
chr6	31237786	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,20:0,9:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,19,12
chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=153.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,23:0,11:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,23,13
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=23,28;MFRL=0,121;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.949:36:1,20:0,15:1,0,21,14
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=102.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,22:0,0,14,19
chr6	31237931	.	CAGA	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,2,15
chr6	31237950	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,2:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,2,7
chr6	31237955	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,2,3
chr6	31237960	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,2,3
chr6	31237962	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,1,3
chr6	31237971	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=14;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,1,2
chr6	31237975	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0|1:31237931_CAGA_C:31237931:0,0,0,2
chr6	31237991	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:31237991_G_T:31237991:0,0,5,0
chr6	31238010	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:31237991_G_T:31237991:0,0,6,3
chr6	31238029	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:31237991_G_T:31237991:0,0,7,3
chr6	31238053	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,3:0|1:31237991_G_T:31237991:0,0,9,4
chr6	31238135	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=88.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,12,9
chr6	31238138	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=95.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,6:0,13:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,14,9
chr6	31238147	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,7:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,12,4
chr6	31238230	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,46;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,20:0,20:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,22,18
chr6	31238234	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=184.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.978:42:0,22:0,20:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,24,18
chr6	31238259	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,25:0,12:0,0,18,20
chr6	31238297	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,23:0,11:0,0,10,25
chr6	31238308	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=112.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,7,20
chr6	31238318	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,13:0,10:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,6,20
chr6	31238372	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=156.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,10:0,24:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,19,17
chr6	31238377	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=165.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,11:0,28:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,21,19
chr6	31238490	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=238.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,54:0.982:54:0,26:0,28:0|1:31238490_T_C:31238490:0,0,29,25
chr6	31238492	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=238.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,54:0.982:54:0,25:0,28:0|1:31238490_T_C:31238490:0,0,29,25
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chr6	31238759	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,5,0
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chr6	31238814	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,33;MFRL=92,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,8:1,3:1,0,11,1
chr6	31238851	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=117,126;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:0,20:1,14:1,0,20,14
chr6	31238909	.	GT	TC	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=167,148;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:10,3:15,1:15,11,2,2
chr6	31238930	.	AG	CA	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=127,194;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,6:5,7:7,3,8,5
chr6	31238942	.	G	A,T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=0,28,24;MFRL=0,130,182;MMQ=60,38,40;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=30.10,33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,9:0.474,0.477:17:0,5,2:0,3,7:0,0,10,7
chr6	31238957	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0,0,10,9
chr6	31238963	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=164,127;MMQ=39,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:7,4:8,5:7,8,5,4
chr6	31238983	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=22,30;MFRL=127,169;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:7,9,4,4
chr6	31238992	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=159,127;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.460:24:7,6:5,5:0|1:31238992_G_C:31238992:8,5,3,8
chr6	31239006	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=160,157;MMQ=40,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:8,5:10,3:0|1:31238992_G_C:31238992:9,9,1,7
chr6	31239101	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0|1:31239101_G_T:31239101:0,0,8,15
chr6	31239108	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0|1:31239101_G_T:31239101:0,0,7,15
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.929:11:0,2:0,8:0|1:31239141_C_T:31239141:0,0,2,9
chr6	31239151	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0|1:31239141_C_T:31239141:0,0,4,10
chr6	31239170	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0|1:31239141_C_T:31239141:0,0,5,9
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,9,8
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,5,7
chr6	31239296	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,6,4
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,9,4
chr6	31239378	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=173,145;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,7:12,0:12,11,4,3
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,26:0.711:36:3,15:6,9:0|1:31239407_G_T:31239407:6,4,15,11
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,27:0.701:38:2,17:9,10:0|1:31239407_G_T:31239407:8,3,14,13
chr6	31239506	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,34:0.745:45:4,14:7,19:5,6,17,17
chr6	31239518	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.265:47:15,3:20,9:17,18,3,9
chr6	31239577	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=140,139;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,2:10,6:6,15,3,5
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=25,22;MFRL=155,127;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:7,1:8,1:7,8,2,2
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr6	31239733	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=131,271;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:7,10,1,1
chr6	31239752	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,10,10
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,13,10
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,12:0,0,13,11
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=0,21;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,11:0,0,15,13
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,13,14
chr6	31239868	.	GT	CC	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,9,17
chr6	31322133	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=27,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,0:6,4:0|1:31322133_A_G:31322133:6,6,2,2
chr6	31322143	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=33,23;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:0|1:31322133_A_G:31322133:6,6,3,2
chr6	31322174	.	CC	GT	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=185,156;MMQ=57,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,6:4,5:1,3,5,6
chr6	31322175	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.938:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr6	31322204	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=34,34;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,1:3,3:0|1:31322204_CA_C:31322204:0,6,0,5
chr6	31322205	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.894:6:0,2:0,3:0|1:31322205_AC_A:31322205:0,0,0,6
chr6	31322207	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:31322204_CA_C:31322204:0,6,0,5
chr6	31322208	.	CACCCCCAGA	C	.	.	DP=11;ECNT=14;MBQ=34,34;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:31322204_CA_C:31322204:0,6,0,5
chr6	31322214	.	CAGA	C	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.879:5:0,2:0,3:0|1:31322205_AC_A:31322205:0,0,0,5
chr6	31322221	.	GCCACCCCA	G	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=30,31;MFRL=141,0;MMQ=54,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0|1:31322205_AC_A:31322205:0,5,0,5
chr6	31322224	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.879:5:0,1:0,3:0|1:31322204_CA_C:31322204:0,0,0,5
chr6	31322229	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.907:7:0,2:0,5:0|1:31322204_CA_C:31322204:0,0,2,5
chr6	31322303	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=29,33;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.178:43:19,4:17,3:21,15,2,5
chr6	31322340	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=14;MBQ=26,26;MFRL=90,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.135:49:27,2:15,4:23,20,1,5
chr6	31322803	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,2:1,1:7,0,2,1
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,27:0.778:34:4,11:3,13:4,3,16,11
chr6	31323039	.	T	TGAAGGGCTCCA	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=28,27;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.816:25:2,13:2,6:1,3,7,14
chr6	31323115	.	TC	CT	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=98,121;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:11,2:17,2:0|1:31323115_TC_CT:31323115:16,13,1,3
chr6	31323128	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=22,30;MFRL=112,126;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:10,1:18,2:0|1:31323115_TC_CT:31323115:15,14,1,2
chr6	31323134	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=9;MBQ=24,32;MFRL=116,127;MMQ=60,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:10,2:20,2:14,18,2,3
chr6	31323143	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=26,28;MFRL=113,127;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.121:39:11,2:21,2:0|1:31323115_TC_CT:31323115:16,19,1,3
chr6	31323202	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=9;MBQ=23,32;MFRL=110,148;MMQ=60,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,10:0.163:65:17,3:36,5:0|1:31323202_T_C:31323202:36,19,5,5
chr6	31323203	.	A	G	.	.	DP=70;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,22:0.358:62:13,7:26,15:28,12,12,10
chr6	31323215	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=23,28;MFRL=112,152;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,9:0.144:67:21,3:34,3:0|1:31323202_T_C:31323202:36,22,4,5
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=111,101;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,30:0.447:67:14,12:23,16:24,13,15,15
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=146.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,23:0,20:0,0,23,20
chr6	31323353	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=78,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,11:0.148:79:49,7:15,4:44,24,5,6
chr6	31323365	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=117,78;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,24:0.301:81:37,24:18,0:24,33,23,1
chr6	31323409	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,20:0,15:0,0,13,22
chr6	31323524	.	TCTC	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=95,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,9:0.129:75:36,3:28,6:27,39,4,5
chr6	31323567	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.201:47:12,3:26,6:18,20,5,4
chr6	31324003	.	TC	GT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=166,103;MMQ=40,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:3,3,4,0
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=136,168;MMQ=51,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,1:4,8:11,2,4,5
chr6	31324025	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=168,136;MMQ=40,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:1,8:8,4:4,5,11,2
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=129,163;MMQ=55,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,0:7,10:13,2,5,5
chr6	31324057	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=29,27;MFRL=118,164;MMQ=55,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:12,1:11,6:17,8,3,4
chr6	31324077	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=24,26;MFRL=104,168;MMQ=55,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.294:32:12,3:9,6:0|1:31324077_C_G:31324077:12,11,5,4
chr6	31324086	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=20,30;MFRL=99,167;MMQ=55,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:10,3:7,3:0|1:31324077_C_G:31324077:8,10,4,2
chr6	31324089	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=23,24;MFRL=121,104;MMQ=44,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,2:10,1:11,9,0,3
chr6	31324100	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=16;MBQ=29,25;MFRL=91,172;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:8,4:4,4:0|1:31324077_C_G:31324077:3,9,6,2
chr6	31324143	.	GT	TA	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=29,26;MFRL=155,187;MMQ=40,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:4,5:5,5:4,5,8,3
chr6	31324144	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=16;MBQ=24,27;MFRL=114,174;MMQ=46,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.863:16:0,6:2,7:1,2,10,3
chr6	31324151	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0,0,13,8
chr6	31324184	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=29,31;MFRL=157,114;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:5,2:3,9:0|1:31324184_C_G:31324184:4,4,7,4
chr6	31324194	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=16;MBQ=28,27;MFRL=155,114;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:4,2:3,7:0|1:31324184_C_G:31324184:4,3,7,3
chr6	31324200	.	GC	CC,CG	.	.	DP=17;ECNT=16;MBQ=0,31,30;MFRL=0,159,114;MMQ=60,60,46;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.88,44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,11:0.345,0.600:16:0,3,3:0,2,8:0,0,9,7
chr6	31324205	.	G	GCC	.	.	DP=16;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=159,114;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:3,3:2,7:0|1:31324184_C_G:31324184:2,3,7,4
chr6	31324206	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=159,131;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:3,2:2,7:0|1:31324184_C_G:31324184:2,3,6,4
chr6	31324207	.	AGG	A	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=27,26;MFRL=153,131;MMQ=55,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.551:18:3,3:2,7:0|1:31324184_C_G:31324184:2,6,6,4
chr6	31324245	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=0,28;MFRL=140,159;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,3:0,7:1,0,1,10
chr6	31324247	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=16;MBQ=24,30;MFRL=188,151;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:3,3:2,4,0,4
chr6	31324415	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=379,134;MMQ=57,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr6	31324488	.	C	CGG	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=20,26;MFRL=78,185;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:0|1:31324488_C_CGG:31324488:6,5,2,4
chr6	31324489	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=20,24;MFRL=78,185;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:4,3:7,2:0|1:31324488_C_CGG:31324488:6,5,2,4
chr6	31324493	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=29,24;MFRL=82,185;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,3:5,3:0|1:31324488_C_CGG:31324488:7,5,2,4
chr6	31324496	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=18;MBQ=30,29;MFRL=105,185;MMQ=60,37;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:0|1:31324488_C_CGG:31324488:6,4,2,4
chr6	31324499	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=18;MBQ=30,30;MFRL=105,185;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,3:5,2:0|1:31324488_C_CGG:31324488:6,4,2,4
chr6	31324506	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=18;MBQ=30,28;MFRL=126,193;MMQ=60,33;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,2:5,0:0|1:31324488_C_CGG:31324488:6,5,0,3
chr6	31324516	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=18;MBQ=27,24;MFRL=126,152;MMQ=60,29;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:31324488_C_CGG:31324488:5,5,0,2
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chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=147,148;MMQ=49,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:8,2:15,5:16,7,3,4
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chr6	31324666	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=25,23;MFRL=151,129;MMQ=52,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:3,4:6,7:0|1:31324664_T_G:31324664:4,7,10,6
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=157,154;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:4,3:3,7:0|1:31324702_C_T:31324702:2,6,1,10
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=26,28;MFRL=157,154;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:4,3:4,8:0|1:31324702_C_T:31324702:2,6,1,10
chr6	31324742	.	TG	CC,CG	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=0,34,25;MFRL=0,159,175;MMQ=60,39,51;MPOS=22,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.66,13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,5:0.636,0.314:18:0,4,3:0,8,2:0,0,4,14
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chr6	31325030	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:31325028_A_G:31325028:0,0,0,5
chr6	31325049	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=30,28;MFRL=130,187;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:31325004_G_A:31325004:0,1,0,2
chr6	31371430	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr6	31378768	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr6	31379168	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=247,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr6	31379220	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=0,691;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31379220_C_T:31379220:0,1,1,0
chr6	31379225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,691;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31379220_C_T:31379220:0,0,1,0
chr6	31379773	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=117,117;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:10,5:8,2:0|1:31379773_C_T:31379773:12,7,3,4
chr6	31379794	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=122,124;MMQ=52,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:0|1:31379773_C_T:31379773:10,7,1,3
chr6	31379807	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=125,127;MMQ=52,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:31379773_C_T:31379773:9,6,1,1
chr6	31379817	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=125,117;MMQ=52,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,3:8,0:0|1:31379773_C_T:31379773:9,6,2,1
chr6	31379823	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=125,117;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:7,4:10,0:0|1:31379773_C_T:31379773:11,6,2,3
chr6	31380091	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:9,2:5,1:7,8,1,2
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chr6	31380194	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.293:32:9,4:11,3:0|1:31380194_T_C:31380194:12,11,5,4
chr6	31380198	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.272:31:10,4:10,3:0|1:31380194_T_C:31380194:12,11,5,3
chr6	31382717	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=73,168;MMQ=44,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:1,1,6,0
chr6	31382770	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,1:10,2:18,4,3,0
chr6	31382882	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.254:29:13,4:8,3:11,11,6,1
chr6	31382911	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.316:20:8,2:4,4:0|1:31382911_A_G:31382911:5,9,3,3
chr6	31382932	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:9,2:7,4:0|1:31382911_A_G:31382911:4,12,2,4
chr6	31382938	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,1:6,4:0|1:31382911_A_G:31382911:4,13,2,4
chr6	31382942	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=21,31;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:10,1:5,5:0|1:31382911_A_G:31382911:3,13,2,4
chr6	31382964	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=146,152;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:31382911_A_G:31382911:0,6,0,4
chr6	31382994	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=108,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:33,2:28,3:32,29,2,3
chr6	31465899	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:0,2:1,9:0|1:31465899_G_C:31465899:1,0,9,2
chr6	31465905	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.859:12:0,2:1,8:0|1:31465899_G_C:31465899:1,0,9,2
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0|1:31465899_G_C:31465899:0,0,9,4
chr6	31466051	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,9:1,5:0,2,0,14
chr6	31466083	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=195,134;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:1,7:0,15:0,1,13,9
chr6	31473830	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=161,94936;MMQ=60,38;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:5,1,3,0
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr6	31477524	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=97,82;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,3:10,4:7,8,5,2
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,9,13
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=50.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr6	31496776	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.858:8:0,4:0,3:0,1,6,1
chr6	31496925	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,5,13
chr6	31497457	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	31497478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr6	31497706	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=82,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.665:28:4,11:5,7:6,3,9,10
chr6	31497744	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,6:0,0,7,8
chr6	31498119	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:10,1:1,1:12,0,2,0
chr6	31498497	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	31502164	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=71,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,9:2,4:2,0,8,5
chr6	31506624	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=229,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.947:34:0,20:1,13:1,0,17,16
chr6	31506648	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=87,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,27:0.700:38:8,12:3,14:4,7,14,13
chr6	31506744	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=229,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,7:1,10:0,1,6,11
chr6	31506854	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr6	31507062	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,0:3,5:4,6,3,2
chr6	31508836	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:10,1,4,0
chr6	31508861	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.356:23:7,4:8,4:14,1,7,1
chr6	31509355	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=101,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,37:0.794:46:4,16:4,19:6,3,25,12
chr6	31509358	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=119,43;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:19,2:27,0:0|1:31509358_A_G:31509358:35,15,1,1
chr6	31509371	.	GGAC	G	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=116,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:22,2:26,0:0|1:31509358_A_G:31509358:33,20,1,1
chr6	31509372	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=158.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,43:0.831:51:3,19:5,23:5,3,28,15
chr6	31509376	.	AGGAAGGTG	A	.	.	DP=70;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=116,43;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,2:0.044:66:23,2:26,0:0|1:31509358_A_G:31509358:41,23,1,1
chr6	31509432	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=20,23;MFRL=92,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,55:0.825:66:2,23:9,30:6,5,25,30
chr6	31513402	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.633:14:3,6:1,3:1,4,4,5
chr6	31513864	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=137.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,27:0,22:0,0,26,24
chr6	31514153	.	GCTGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	31525319	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	31525742	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=60,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.819:7:0,0:1,4:0,1,3,3
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr6	31540481	.	GTC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:8,1:3,2:8,4,3,0
chr6	31541031	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.227:18:5,1:4,1:7,7,4,0
chr6	31555130	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.217:24:7,2:12,2:8,11,2,3
chr6	31556294	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.119:56:22,6:28,0:18,32,0,6
chr6	31556581	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:16,4:8,11:10,14,7,8
chr6	31556656	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr6	31583155	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=100,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:5,4:7,6:10,3,6,4
chr6	31583516	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=93,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:9,0:18,5,1,1
chr6	31583827	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,3:9,1:8,7,3,1
chr6	31592032	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,55;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.086:56:21,0:31,4:38,14,0,4
chr6	31593476	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,281;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:7,0:5,6,1,1
chr6	31593678	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,37;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,16,16
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,6,11
chr6	31597400	.	C	G,T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,16,23;MFRL=138,156,211;MMQ=60,60,60;MPOS=19,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.226:6:0,0,0:2,0,1:3,1,2,0
chr6	31597414	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,14;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.372:8:1,1:3,0:2,3,3,0
chr6	31597456	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=73,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,1:3,0:0|1:31597456_A_C:31597456:1,8,4,0
chr6	31597462	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,1:5,2:0|1:31597456_A_C:31597456:1,9,4,0
chr6	31597468	.	CAAG	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,1:5,2:0|1:31597456_A_C:31597456:1,10,4,0
chr6	31597472	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:5,1:4,2:0|1:31597456_A_C:31597456:1,9,4,0
chr6	31598489	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.720:37:6,20:4,7:4,6,14,13
chr6	31599314	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:15,4:10,15,2,2
chr6	31599348	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:7,0:12,4:6,14,2,2
chr6	31599415	.	G	GCAATACCATTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	31600820	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=245,290;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	31600851	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=245,294;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=129.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,21,20
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,3,5
chr6	31601611	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=105,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:10,4:18,0:21,7,3,1
chr6	31601843	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr6	31602323	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:20,0:11,3:19,12,0,3
chr6	31602585	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,38;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,9:2,5:2,6,8,6
chr6	31603591	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,2:5,1:0,7,1,2
chr6	31603770	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=74,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.602:23:1,3:8,11:6,3,5,9
chr6	31604010	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:6,4:7,2:5,8,3,4
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr6	31604591	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr6	31605199	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.340:39:5,10:21,3:10,16,9,4
chr6	31606901	.	C	CAAAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=82,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.704:21:4,11:2,4:4,2,7,8
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr6	31607096	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,0,3
chr6	31607942	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:2,4:4,12:2,4,15,1
chr6	31609272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,6:2,9:3,1,12,3
chr6	31609759	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:0|1:31609759_C_T:31609759:3,10,1,1
chr6	31609775	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:31609759_C_T:31609759:2,8,1,1
chr6	31609813	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,3:3,7,5,1
chr6	31610529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	31610686	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=147,66;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:6,0:10,2,1,1
chr6	31610697	.	CCTGG	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=149,66;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:9,2,1,1
chr6	31610773	.	G	GGTTGTTTGTT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:31610773_G_GGTTGTTTGTT:31610773:5,14,1,1
chr6	31610776	.	G	GTTTTGGT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=161,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:31610773_G_GGTTGTTTGTT:31610773:5,14,1,1
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr6	31613413	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	31619576	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:5,6:0,7:1,4,3,10
chr6	31624168	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,6:6,0:12,1,6,0
chr6	31624922	.	CA	C,CAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29,29;MFRL=192,188,168;MMQ=60,60,60;MPOS=6,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.04,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.307,0.307:10:1,1,2:3,2,1:4,0,6,0
chr6	31625188	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,2:6,4:4,9,2,4
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,18:0,0,13,13
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.577:31:3,13:9,5:5,8,7,11
chr6	31632134	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,37:0.766:48:6,25:4,11:4,7,20,17
chr6	31634570	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,26:0.631:41:7,11:7,14:10,5,16,10
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	31637710	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:31637710_C_T:31637710:4,14,1,1
chr6	31637716	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:31637710_C_T:31637710:3,14,1,1
chr6	31637718	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:31637710_C_T:31637710:3,14,1,1
chr6	31637719	.	G	GCAAGC	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:31637710_C_T:31637710:3,14,1,1
chr6	31637720	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:31637710_C_T:31637710:2,14,1,1
chr6	31637723	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:31637710_C_T:31637710:2,13,1,1
chr6	31637734	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=23,25;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:0,7,0,3
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,53401313;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	31639144	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31639144_G_A:31639144:0,1,0,1
chr6	31639147	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31639144_G_A:31639144:0,1,0,1
chr6	31639979	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:2,6:4,10:1,5,9,8
chr6	31644640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr6	31647003	.	G	GGGA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=101,258;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,3:16,0:0|1:31647003_G_GGGA:31647003:17,15,0,3
chr6	31647007	.	G	GAAAGA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=101,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,3:18,0:0|1:31647003_G_GGGA:31647003:17,15,0,3
chr6	31648170	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:16,0:10,12:4,22,0,12
chr6	31651194	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr6	31655438	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.718:22:2,4:3,12:4,2,10,6
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,11,16
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:0,3,1,7
chr6	31669149	.	TAC	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=95,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.554:31:2,9:12,8:4,10,5,12
chr6	31669195	.	TCTGAG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=179,182;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:8,3:0,15,0,3
chr6	31675379	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:0|1:31675379_A_C:31675379:6,9,0,2
chr6	31675384	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:31675379_A_C:31675379:6,8,0,2
chr6	31675501	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,6:1,7:3,3,9,4
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr6	31679965	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,2:15,0:0|1:31679965_T_A:31679965:7,17,1,1
chr6	31679987	.	C	CACTCAGCCTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,1:11,0:0|1:31679965_T_A:31679965:1,14,1,1
chr6	31680514	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.152:48:27,6:14,0:37,4,7,0
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,36:0.739:48:6,10:6,25:5,7,20,16
chr6	31688015	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.363:6:0,0:2,0:1,3,0,2
chr6	31691101	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:4,0:4,7,1,3
chr6	31691107	.	AA	CC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:5,0:0|1:31691107_AA_CC:31691107:2,13,2,0
chr6	31691117	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:5,0:2,13,3,0
chr6	31691123	.	CT	GG	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,1:8,0:0|1:31691107_AA_CC:31691107:6,15,2,0
chr6	31691126	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:9,0:9,0:6,15,2,0
chr6	31691657	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:1,9:2,10:2,1,9,10
chr6	31696187	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:7,0:2,0:0|1:31696187_A_C:31696187:2,9,3,0
chr6	31696190	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,0:2,0:0|1:31696187_A_C:31696187:3,9,3,0
chr6	31710968	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,35:0.683:51:5,20:10,15:6,10,19,16
chr6	31712128	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr6	31721510	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=72,360;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.457:5:1,2:0,0:1,2,0,2
chr6	31726688	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:5,3:5,4:2,8,3,4
chr6	31727743	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=92,269;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:8,9,3,0
chr6	31728071	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr6	31728542	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:11,12,1,2
chr6	31731224	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,2:12,0:11,7,2,0
chr6	31733541	.	GCCGGTCC	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,3:7,0:0|1:31733541_GCCGGTCC_G:31733541:10,13,2,2
chr6	31733553	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,2:6,0:0|1:31733541_GCCGGTCC_G:31733541:5,9,2,2
chr6	31733620	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=185,258;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,0,2
chr6	31733650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,5:0,4:3,0,8,2
chr6	31734890	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,3:0,0:2,1,3,0
chr6	31742242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr6	31744524	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.243:20:7,0:6,1:8,7,0,5
chr6	31744528	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:3,3:4,3:5,4,0,7
chr6	31744534	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=62,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:3,0:3,1:4,2,0,8
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr6	31750722	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr6	31751929	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,2:3,0:6,4,1,1
chr6	31760462	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:8,0,1,1
chr6	31765861	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=124,118;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:1,2:1,6:0,3,1,14
chr6	31765891	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=156,104;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:31765891_TC_T:31765891:0,16,0,2
chr6	31765897	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=156,104;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:31765891_TC_T:31765891:0,16,0,2
chr6	31765905	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=151,104;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:31765891_TC_T:31765891:0,15,0,2
chr6	31765940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=200,150;MMQ=56,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr6	31773821	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.669:37:4,11:8,14:5,7,15,10
chr6	31777770	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr6	31777946	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,1:11,2:20,7,3,0
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=125.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,22:0,21:0,0,16,27
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:0,6:2,9:2,0,13,2
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=173.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,28:0,34:0,0,30,33
chr6	31797321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,155;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	31797337	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,155;MMQ=27,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,148;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:22,3:16,1:20,19,3,1
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=96,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=217.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,56:0.781:71:9,22:6,24:8,7,21,35
chr6	31798041	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=53,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:31798041_G_A:31798041:0,6,0,2
chr6	31798061	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=78,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,0:0|1:31798041_G_A:31798041:1,3,0,2
chr6	31831366	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.201:46:16,1:14,5:31,5,0,10
chr6	31832356	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr6	31832401	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.266:31:14,7:8,0:19,4,6,2
chr6	31832810	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=95,44;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.055:69:22,0:43,3:37,29,0,3
chr6	31837066	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:0,3,3,10
chr6	31837250	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	31837277	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr6	31837491	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,1,14
chr6	31837503	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,162;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,6:0,3,0,11
chr6	31838490	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,8:0,0,8,13
chr6	31838545	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,7,8
chr6	31838713	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr6	31838834	.	GGGTGAGGAC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr6	31839309	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=149.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,22:0,16:0|1:31839309_C_T:31839309:0,0,19,19
chr6	31839331	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=133.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,17:0,12:0|1:31839309_C_T:31839309:0,0,13,19
chr6	31842850	.	T	TCAGGGAATATAGATTGAAGGAACAGGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=155,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.374:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr6	31851545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr6	31856423	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:5,6,2,0
chr6	31857284	.	TTCTTCCTCTTCCTCCTCC	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:9,2:20,1:10,22,1,2
chr6	31860118	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:11,0,2,0
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,4,10
chr6	31860526	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=75,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:7,6:5,6:7,5,9,3
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,8,14
chr6	31895619	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=93,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.218:48:24,2:14,8:18,20,2,8
chr6	31895973	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,7,15
chr6	31916354	.	A	AAGGGACCCCTATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=255,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	31916707	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,2:11,4:10,11,1,5
chr6	31917122	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:6,2:14,0:10,11,1,1
chr6	31918468	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:12,2:6,6:9,9,5,3
chr6	31919556	.	A	ATTAAAAAAAATTGTGGAGCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:31919556_A_ATTAAAAAAAATTGTGGAGCT:31919556:3,0,0,1
chr6	31919560	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:31919556_A_ATTAAAAAAAATTGTGGAGCT:31919556:3,0,0,1
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr6	31924576	.	GTT	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,0:17,4:15,18,0,4
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=68.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,13:1,10:1,0,15,8
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,9,11
chr6	31930441	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,9:0,0,18,7
chr6	31931137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	31933518	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=168,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	31933879	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,81;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr6	31935573	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=105,409;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr6	31936054	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31936054_C_T:31936054:1,0,1,0
chr6	31936057	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31936054_C_T:31936054:1,0,1,0
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,15,14
chr6	31937334	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:9,2:0|1:31937334_C_T:31937334:11,6,1,1
chr6	31937343	.	C	CAAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:31937334_C_T:31937334:9,6,1,1
chr6	31938009	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=74,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,14:0.300:49:12,0:16,14:13,22,0,14
chr6	31938305	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,3:7,0:5,10,3,0
chr6	31938412	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.719:23:4,10:2,6:4,2,12,5
chr6	31938451	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.679:35:8,12:2,10:8,3,14,10
chr6	31946837	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr6	31947373	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:31947373_CC_TT:31947373:0,2,0,1
chr6	31947405	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=195,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31947373_CC_TT:31947373:0,4,0,1
chr6	31947409	.	T	TTCTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=195,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31947373_CC_TT:31947373:0,4,0,1
chr6	31962582	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	31964584	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,270;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31965386	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=124,163;MMQ=27,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.157:49:20,7:20,0:34,8,7,0
chr6	31997600	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,109;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr6	32006214	.	CCTGCTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,94;MMQ=27,39;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=CTG;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:5,0,1,1
chr6	32006317	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=99,131;MMQ=27,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:0,4:4,12:0|1:32006317_C_T:32006317:2,3,7,11
chr6	32006337	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=99,131;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:1,4:2,10:0|1:32006317_C_T:32006317:1,2,2,13
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,74;MMQ=46,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,3:2,0:4,4,2,1
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,6,3
chr6	32007063	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	32009487	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=202,154;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,2:0,6:2,0,5,3
chr6	32009651	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=242,246;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32009651_C_T:32009651:0,1,0,1
chr6	32009661	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=242,246;MMQ=27,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32009651_C_T:32009651:0,1,0,1
chr6	32010286	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=125,127;MMQ=57,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:10,2:16,1:14,12,0,3
chr6	32010523	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,294;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32011358	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	32011644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr6	32011714	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	32011926	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=212,105;MMQ=27,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,2:1,4:0,1,2,5
chr6	32011991	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=204,16609;MMQ=51,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:1,2:1,0:0|1:32011991_C_A:32011991:0,2,0,2
chr6	32011993	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=204,16609;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:32011991_C_A:32011991:0,2,0,2
chr6	32011995	.	C	CCTGCCCCTCCCCCTCCGTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=204,16609;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:32011991_C_A:32011991:0,2,0,2
chr6	32011998	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=204,16609;MMQ=51,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:32011991_C_A:32011991:0,2,0,2
chr6	32012755	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	32013033	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,208;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr6	32025980	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.881:23:2,8:0,12:1,1,8,13
chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,5:0,0,0,10
chr6	32026257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	32029226	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,9,5
chr6	32029415	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	32029849	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=164,145;MMQ=59,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,1:1,1:4,0,1,1
chr6	32032743	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,2:1,9:0,1,6,6
chr6	32032833	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=170,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:7,2,1,1
chr6	32035788	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:1,0:3,5,1,1
chr6	32036914	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32036914_C_T:32036914:0,2,0,1
chr6	32036920	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:32036914_C_T:32036914:0,2,0,1
chr6	32036948	.	G	GCTAATCTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr6	32037340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=124,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:3,1:8,1:7,6,1,1
chr6	32047191	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,0:10,2:0,12,0,2
chr6	32049423	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.803:19:3,8:0,1:2,1,3,13
chr6	32049537	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32049537_GG_TT:32049537:0,1,0,1
chr6	32049545	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32049537_GG_TT:32049537:0,0,0,1
chr6	32049546	.	T	TGAGGACCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32049537_GG_TT:32049537:0,0,0,1
chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,3,8
chr6	32050103	.	ACTAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	32052089	.	CTCCAGGAAGCCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32056580	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:7,2:11,5,2,1
chr6	32064565	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:32064565_G_C:32064565:8,3,1,1
chr6	32064568	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:32064565_G_C:32064565:8,3,1,1
chr6	32064570	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:32064565_G_C:32064565:8,3,1,1
chr6	32064572	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:32064565_G_C:32064565:7,3,1,1
chr6	32064574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=26,16;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,0:0|1:32064565_G_C:32064565:7,3,1,1
chr6	32064583	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:32064565_G_C:32064565:8,7,1,1
chr6	32064585	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,1:0|1:32064565_G_C:32064565:8,7,1,1
chr6	32065845	.	C	CTTCACCAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:4,1:13,1:0|1:32065845_C_CTTCACCAA:32065845:9,9,0,2
chr6	32065847	.	T	TCCTCCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,1:12,1:0|1:32065845_C_CTTCACCAA:32065845:9,9,0,2
chr6	32083681	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,1:13,2:7,13,1,2
chr6	32085278	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=215,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:1,3,2,0
chr6	32086962	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,30;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,1,0,1
chr6	32086966	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,2,0,1
chr6	32086967	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,2,0,1
chr6	32086972	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,2,0,1
chr6	32086974	.	TG	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,1,0,1
chr6	32086978	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32086962_A_T:32086962:0,1,0,1
chr6	32089142	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:12,2:2,3:8,6,1,4
chr6	32095981	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,0:10,5:2,14,1,4
chr6	32095988	.	T	TGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,0:11,0:1,14,2,0
chr6	32095995	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:4,0:5,5:0|1:32095995_C_T:32095995:0,10,1,4
chr6	32095996	.	ACC	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:4,0:5,5:0|1:32095995_C_T:32095995:0,10,1,4
chr6	32097290	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.565:51:13,9:9,19:8,14,17,12
chr6	32116994	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=83,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:21,2:13,1:12,22,3,0
chr6	32118749	.	T	TGGTTGGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr6	32119825	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:7,3,1,1
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,9,11
chr6	32122472	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr6	32123480	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:20,2:23,3:25,20,2,3
chr6	32132445	.	AGAGAGAGAGGAAGGCAAGTGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=87,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,2:11,0:9,9,1,1
chr6	32133904	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=77,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:3,5,1,1
chr6	32134510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr6	32134656	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=368,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:1,12:0,29:0,1,9,32
chr6	32137670	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=110,599;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,0:8,4:12,3,4,0
chr6	32138687	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=111,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:9,5:6,0:11,6,3,2
chr6	32138701	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:32138701_G_A:32138701:9,9,0,2
chr6	32138707	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:0|1:32138701_G_A:32138701:10,10,0,2
chr6	32139016	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:10,0:17,3:19,10,2,1
chr6	32139206	.	GGCAGCAGGAAGAGCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGCAGGAAGAGCA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:1,1:1,1:0,5,0,2
chr6	32146492	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	32147217	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,3:14,0:25,8,3,0
chr6	32147291	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.272:38:18,5:6,6:19,8,5,6
chr6	32147468	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=144,185;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:11,3:14,0:10,15,0,3
chr6	32147512	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,63;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:13,3:13,0:16,10,1,2
chr6	32147696	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=82,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=111.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,43:0.725:59:7,18:8,24:8,8,31,12
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=182.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.973:69:1,35:0,33:1,0,30,38
chr6	32148031	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:5,4:4,5:7,3,5,5
chr6	32149500	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=233,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:0|1:32149500_C_CT:32149500:0,3,0,2
chr6	32149518	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=226,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32149500_C_CT:32149500:0,2,0,1
chr6	32150949	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.104:50:29,0:16,4:20,25,0,5
chr6	32151420	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.473:36:12,11:7,6:7,12,9,8
chr6	32151934	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=82,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,30:0.863:34:0,16:4,14:2,2,19,11
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,7,13
chr6	32154285	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:6,7:4,10:3,7,4,13
chr6	32154456	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,52;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:14,2:15,0:11,18,0,2
chr6	32154998	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:7,8:5,7:10,2,10,5
chr6	32155581	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=250,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:1,0,1,3
chr6	32155738	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=96,96;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:9,7:28,0:29,8,7,0
chr6	32157639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,1:5,1:0,10,1,2
chr6	32159956	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=80,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=163.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,58:0.781:74:10,32:5,25:8,8,24,34
chr6	32164869	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:6,3:1,3:0|1:32164869_G_C:32164869:0,7,1,6
chr6	32164874	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:5,3:1,4:0|1:32164869_G_C:32164869:0,7,1,6
chr6	32165146	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:10,6:3,0:11,3,0,6
chr6	32165444	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr6	32166160	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:2,2:6,1:9,2,3,0
chr6	32166174	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.363:17:4,0:4,1:5,6,6,0
chr6	32166920	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=97,202;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.160:60:25,9:26,0:23,28,9,0
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr6	32168771	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,7:6,4:6,7,5,6
chr6	32170464	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	32170470	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,11;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,12,14
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,4,11
chr6	32181517	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:9,1:11,2:13,7,1,3
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr6	32187605	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:0,7:2,6:1,1,1,12
chr6	32187637	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=203,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:7,1:9,0,3,0
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,8:0,0,6,8
chr6	32188642	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=86,103;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,2:10,1:12,12,3,0
chr6	32188678	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,2:2,7:3,1,3,6
chr6	32190217	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=205,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr6	32190620	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,7:0,14:0,1,10,11
chr6	32191581	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=97,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,2:6,3:9,2,3,2
chr6	32191620	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:2,3:3,9:2,3,11,2
chr6	32191658	.	T	TAGCAGCAGC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=AGC;STR;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,1:0,4:0,0,1,7
chr6	32191730	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:0,3,1,2
chr6	32260967	.	C	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=98,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.093:61:27,5:28,0:15,41,5,0
chr6	32261771	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr6	32267694	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=73,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:5,7,0,3
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,9:0,13:1,0,12,10
chr6	32268515	.	GG	AA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:9,14,1,1
chr6	32270500	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,2,2
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,4:1,11:1,3,5,10
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:0,2,2,7
chr6	32291270	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.628:30:4,11:7,8:7,4,9,10
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,8:1,6:1,0,11,3
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.678:4:1,3:0,0:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,1,0,3
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=9,24;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:0,0:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,1,0,3
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,35:0.680:51:9,14:7,21:12,4,25,10
chr6	32298412	.	AACACACACACACAC	A,AACACACACAC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,27,26;MFRL=129,195,108;MMQ=60,60,48;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,13,18;RU=AC;STR;TLOD=17.28,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.375,0.254:11:0,0,1:2,5,1:0,3,0,8
chr6	32299715	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr6	32299873	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,2:2,2:0,2,2,3
chr6	32299941	.	T	TCAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	32306657	.	GAAAGA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:0,5:0,5:6,0,8,2
chr6	32307260	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=69,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr6	32307382	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=57,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.676:35:8,11:3,13:4,7,9,15
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=119,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,5:3,5:2,2,1,9
chr6	32310967	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:6,2,5,2
chr6	32310986	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,7:5,2:6,2,5,5
chr6	32311148	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	32317471	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,1,1
chr6	32323522	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32323522_T_TG:32323522:0,2,0,1
chr6	32323524	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32323522_T_TG:32323522:0,2,0,1
chr6	32333837	.	T	TTTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTC;STR;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.629:14:0,6:5,3:3,2,7,2
chr6	32333955	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=66,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,6:2,12:2,2,6,12
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=161,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.588:18:6,6:1,5:3,4,4,7
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr6	32336520	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=65,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:1,11:3,4:3,1,8,7
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:7,7:4,9:3,8,7,9
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,4:2,4:4,0,7,2
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,7:2,7:1,1,8,6
chr6	32337854	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr6	32339548	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	32362416	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32362416_T_G:32362416:0,0,1,1
chr6	32362425	.	A	ATCAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=109,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32362416_T_G:32362416:2,0,0,1
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,10,7
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,11:0,11:1,0,8,14
chr6	32369517	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:32369517_G_A:32369517:5,4,0,2
chr6	32369521	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:32369517_G_A:32369517:5,4,0,2
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr6	32370807	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=84,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,0:14,4:18,10,0,4
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,5:0,16:0,0,13,9
chr6	32407680	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:12,1,1,2
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=224,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:2,13:2,8:0,4,16,6
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr6	32410893	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:9,1,2,0
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=72.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0,0,15,11
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=172,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=106.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,12:1,26:0,1,19,19
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,22:0,0,21,18
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr6	32411692	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:12,0:6,2:7,11,1,1
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,1,13
chr6	32485889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32485991	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,120;MMQ=25,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr6	32486238	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32486238_C_T:32486238:0,0,2,0
chr6	32486269	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=31,20;MFRL=120,66;MMQ=33,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr6	32486278	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=0,20;MFRL=0,66;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr6	32486291	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,66;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:32486238_C_T:32486238:0,0,5,4
chr6	32486313	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=25,20;MFRL=183,58;MMQ=37,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,5,2
chr6	32486315	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=20,23;MFRL=58,183;MMQ=49,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:0|1:32486315_C_A:32486315:5,2,0,3
chr6	32486319	.	C	A,G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=0,24,20;MFRL=0,183,58;MMQ=60,37,49;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.56,28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,7:0.308,0.615:10:0,3,2:0,0,4:0,0,5,5
chr6	32486324	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=20,23;MFRL=58,183;MMQ=49,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:0|1:32486315_C_A:32486315:5,2,0,3
chr6	32486325	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=31,20;MFRL=120,58;MMQ=37,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,1:1,3:1,4,3,1
chr6	32486332	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=25,30;MFRL=58,183;MMQ=41,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:0|1:32486315_C_A:32486315:3,1,0,3
chr6	32486344	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,266;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:32486238_C_T:32486238:0,0,2,2
chr6	32486358	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,29;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32486238_C_T:32486238:0,0,1,1
chr6	32486437	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,2:0,1:0|1:32486437_TG_CA:32486437:0,0,2,1
chr6	32486444	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=164,194;MMQ=33,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32486444_CTG_C:32486444:1,1,1,0
chr6	32486447	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=18,27;MFRL=194,164;MMQ=21,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.570:3:0,0:0,1:0|1:32486447_G_A:32486447:1,0,1,1
chr6	32486451	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=142,194;MMQ=25,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32486444_CTG_C:32486444:0,1,1,0
chr6	32486456	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32486437_TG_CA:32486437:0,0,1,1
chr6	32486458	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=194,142;MMQ=21,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32486447_G_A:32486447:1,0,0,1
chr6	32486462	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=26,26;MFRL=194,142;MMQ=21,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32486447_G_A:32486447:1,0,0,1
chr6	32486479	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32486479_C_T:32486479:0,0,0,1
chr6	32486484	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32486479_C_T:32486479:0,0,0,1
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chr6	32487054	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=20;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:32487054_T_C:32487054:0,0,3,0
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chr6	32487093	.	GT	CC	.	.	DP=1;ECNT=20;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32487054_T_C:32487054:0,0,1,0
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chr6	32487102	.	G	GACCC	.	.	DP=1;ECNT=20;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32487054_T_C:32487054:0,0,1,0
chr6	32487107	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=20;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32487054_T_C:32487054:0,0,1,0
chr6	32487158	.	G	GCA	.	.	DP=23;ECNT=20;MBQ=20,25;MFRL=92,104;MMQ=43,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:7,3:10,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:6,11,3,3
chr6	32487164	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=20,23;MFRL=92,107;MMQ=43,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:7,3:10,4:0|1:32487158_G_GCA:32487158:6,11,3,4
chr6	32487170	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=20;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,16:0,0,9,17
chr6	32487174	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=20,20;MFRL=93,107;MMQ=43,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:7,3:10,6:0|1:32487158_G_GCA:32487158:7,12,3,6
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=20,20;MFRL=107,92;MMQ=25,43;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:3,7:6,10:3,6,6,11
chr6	32487189	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=20;MBQ=30,25;MFRL=109,107;MMQ=42,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:7,3:10,5:0|1:32487158_G_GCA:32487158:7,11,3,6
chr6	32487193	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=20;MBQ=31,21;MFRL=125,107;MMQ=40,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:6,3:9,5:0|1:32487158_G_GCA:32487158:4,11,2,6
chr6	32487205	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=20;MBQ=34,26;MFRL=113,125;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:2,5:4,6:1,6,3,8
chr6	32487209	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=167,110;MMQ=40,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,0:5,4:0|1:32487158_G_GCA:32487158:3,8,0,4
chr6	32487211	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=25,26;MFRL=169,110;MMQ=40,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,0:5,4:0|1:32487158_G_GCA:32487158:3,7,0,4
chr6	32487214	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=20;MBQ=30,31;MFRL=110,177;MMQ=25,39;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,3:3,4:0,4,3,5
chr6	32487215	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=20;MBQ=26,34;MFRL=183,110;MMQ=37,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,0:4,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:3,4,0,4
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=20;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr6	32489707	.	AC	CA	.	.	DP=54;ECNT=17;MBQ=23,34;MFRL=107,145;MMQ=54,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,11:0.218:53:17,3:21,7:0|1:32489707_AC_CA:32489707:14,28,5,6
chr6	32489724	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=30,26;MFRL=106,151;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:14,3:17,4:0|1:32489707_AC_CA:32489707:9,22,3,5
chr6	32489731	.	GTA	CAC	.	.	DP=33;ECNT=17;MBQ=33,33;MFRL=158,110;MMQ=34,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=108.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,26:0.794:32:3,10:3,16:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:3,3,7,19
chr6	32489743	.	C	CTG	.	.	DP=30;ECNT=17;MBQ=33,31;MFRL=158,110;MMQ=34,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,24:0.781:30:3,9:3,14:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:3,3,7,17
chr6	32489744	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=110,158;MMQ=57,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:8,3:14,3:0|1:32489707_AC_CA:32489707:7,17,3,3
chr6	32489745	.	CGG	C	.	.	DP=29;ECNT=17;MBQ=28,32;MFRL=158,110;MMQ=34,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,23:0.774:29:3,8:3,14:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:3,3,6,17
chr6	32489749	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0,0,6,20
chr6	32489754	.	T	TCC	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=110,159;MMQ=44,34;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:8,2:11,3:0|1:32489707_AC_CA:32489707:3,16,2,4
chr6	32489755	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=110,159;MMQ=44,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:7,3:11,3:0|1:32489707_AC_CA:32489707:3,16,2,4
chr6	32489757	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=31,33;MFRL=110,159;MMQ=44,34;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:8,3:10,3:0|1:32489707_AC_CA:32489707:3,16,2,4
chr6	32489758	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=17;MBQ=29,31;MFRL=183,111;MMQ=40,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,18:0.934:20:1,8:1,10:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:1,1,3,15
chr6	32489766	.	A	T,G	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=0,26,33;MFRL=0,120,158;MMQ=60,40,34;MPOS=4,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=64.33,28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,8:0.607,0.355:24:0,6,5:0,7,3:0,0,8,16
chr6	32489786	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=17;MBQ=26,31;MFRL=158,165;MMQ=40,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:5,2,5,3
chr6	32489787	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=17;MBQ=27,28;MFRL=156,159;MMQ=45,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,1:4,2:0|1:32489707_AC_CA:32489707:9,3,1,2
chr6	32489791	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=17;MBQ=29,26;MFRL=134,165;MMQ=43,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:4,4:1,4:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:5,1,5,3
chr6	32489795	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=17;MBQ=26,26;MFRL=134,172;MMQ=43,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:5,1,5,4
chr6	32489806	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=17;MBQ=33,27;MFRL=134,183;MMQ=43,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:0|1:32489731_GTA_CAC:32489731:5,1,4,4
chr6	32489822	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=24;MBQ=29,24;MFRL=193,74;MMQ=21,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,10:1,2:0,1,7,6
chr6	32489835	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=24;MBQ=28,31;MFRL=193,92;MMQ=21,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:0,10:1,5:0|1:32489835_C_G:32489835:0,1,4,11
chr6	32489839	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=24;MBQ=33,23;MFRL=193,92;MMQ=21,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:0,10:1,4:0|1:32489835_C_G:32489835:0,1,4,11
chr6	32489844	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=24;MBQ=28,28;MFRL=193,92;MMQ=21,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,10:1,4:0|1:32489835_C_G:32489835:0,1,3,11
chr6	32489846	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=24;MBQ=27,25;MFRL=193,92;MMQ=21,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,10:1,3:0|1:32489835_C_G:32489835:0,1,3,11
chr6	32489852	.	AA	GC	.	.	DP=16;ECNT=24;MBQ=25,29;MFRL=193,92;MMQ=21,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:0,10:1,4:0|1:32489835_C_G:32489835:0,1,3,12
chr6	32489856	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=24;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,43;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,3:0|1:32489835_C_G:32489835:0,0,2,12
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chr6	32489943	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=24;MBQ=24,34;MFRL=149,155;MMQ=35,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0|1:32489925_C_T:32489925:0,2,1,2
chr6	32489960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=24;MBQ=23,30;MFRL=149,155;MMQ=35,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0|1:32489960_A_G:32489960:0,2,1,2
chr6	32489964	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=24;MBQ=31,26;MFRL=149,155;MMQ=35,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,2:0|1:32489960_A_G:32489960:0,2,1,2
chr6	32489967	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=24;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,1,3
chr6	32489976	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=24;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,2
chr6	32489981	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=24;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,1
chr6	32490050	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=24;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	32497803	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=17;MBQ=24,32;MFRL=149,267;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,1:4,1:0|1:32497803_T_C:32497803:12,0,2,0
chr6	32497812	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=17;MBQ=27,29;MFRL=155,267;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:9,0:4,1:0|1:32497803_T_C:32497803:13,0,2,0
chr6	32497814	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=17;MBQ=34,24;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:11,0:2,3:13,0,3,0
chr6	32497847	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=25,28;MFRL=45,121;MMQ=51,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.853:25:1,12:1,9:2,1,15,7
chr6	32497863	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=29,25;MFRL=97,123;MMQ=50,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,34:0.780:44:4,15:6,10:8,2,19,15
chr6	32497896	.	A	G	.	.	DP=89;ECNT=17;MBQ=23,21;MFRL=112,29899;MMQ=49,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,14:0.166:88:34,9:38,5:30,44,9,5
chr6	32497900	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=17;MBQ=22,33;MFRL=111,197;MMQ=49,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,5:0.066:89:35,1:41,4:39,45,1,4
chr6	32497901	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=17;MBQ=27,23;MFRL=111,113;MMQ=50,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=200.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,54:0.604:89:16,20:18,27:12,23,27,27
chr6	32497904	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=17;MBQ=28,26;MFRL=111,102;MMQ=49,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,31:0.360:86:20,17:33,13:23,32,10,21
chr6	32497905	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=17;MBQ=31,24;MFRL=101,112;MMQ=50,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,41:0.482:85:20,18:24,23:0|1:32497905_G_A:32497905:14,30,19,22
chr6	32497914	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=17;MBQ=32,24;MFRL=101,117;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,41:0.472:87:20,18:26,23:0|1:32497905_G_A:32497905:14,32,17,24
chr6	32497931	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=17;MBQ=31,22;MFRL=116,96;MMQ=50,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,5:0.066:86:33,2:43,3:29,52,1,4
chr6	32497943	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=17;MBQ=22,29;MFRL=124,119;MMQ=29,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=189.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,48:0.779:61:7,19:6,27:0|1:32497943_A_G:32497943:3,10,18,30
chr6	32497947	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=121,120;MMQ=49,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,14:0.245:59:19,6:25,8:0|1:32497947_G_A:32497947:18,27,3,11
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chr6	32497975	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=20,28;MFRL=116,98;MMQ=50,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:13,1:17,3:0|1:32497947_G_A:32497947:12,19,2,2
chr6	32498011	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=104,129;MMQ=51,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:18,0:17,3:0|1:32498011_C_G:32498011:14,23,2,1
chr6	32498018	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=106,129;MMQ=51,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:20,1:19,3:0|1:32498011_C_G:32498011:13,26,2,3
chr6	32498025	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=13;MBQ=29,23;MFRL=107,155;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:19,1:19,3:0|1:32498011_C_G:32498011:13,27,2,4
chr6	32498028	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=108,155;MMQ=51,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,6:0.149:45:19,2:19,4:0|1:32498011_C_G:32498011:13,26,2,4
chr6	32498031	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=30,31;MFRL=109,123;MMQ=51,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:19,1:20,3:13,28,2,2
chr6	32498033	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=20,24;MFRL=91,163;MMQ=50,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.334:43:13,7:16,7:14,15,1,13
chr6	32498034	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=20,32;MFRL=108,155;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.156:43:18,2:18,4:0|1:32498011_C_G:32498011:13,24,2,4
chr6	32498041	.	CA	TG	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=32,20;MFRL=165,86;MMQ=51,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:9,10:11,9:3,18,8,11
chr6	32498050	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=27,25;MFRL=109,148;MMQ=51,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:15,1:18,1:8,26,0,2
chr6	32498067	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,3,18
chr6	32498071	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=180,113;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,2:7,5:1,10,1,6
chr6	32498094	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	32498099	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=164,113;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	32548050	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,64;MMQ=60,42;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,1:0|1:32548050_G_A:32548050:0,0,3,1
chr6	32548053	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,24;MFRL=0,64;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:32548050_G_A:32548050:0,0,3,1
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chr6	32548080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:32548050_G_A:32548050:0,0,3,3
chr6	32548082	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:32548050_G_A:32548050:0,0,3,3
chr6	32548085	.	TT	CG	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:32548050_G_A:32548050:0,0,2,3
chr6	32548115	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr6	32548176	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:32548176_G_C:32548176:0,0,1,2
chr6	32548178	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:32548176_G_C:32548176:0,0,1,2
chr6	32548426	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0|1:32548426_T_C:32548426:0,0,8,2
chr6	32548458	.	A	G,T	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=28,25,27;MFRL=138,115,128;MMQ=60,44,40;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.70,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,3:0.120,0.160:22:4,0,3:12,2,0:14,3,5,0
chr6	32548470	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=31,23;MFRL=134,124;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:5,7:15,3:0|1:32548470_G_T:32548470:16,5,9,1
chr6	32548488	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=28,26;MFRL=134,120;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,13:0.368:36:7,6:15,5:0|1:32548470_G_T:32548470:15,8,9,4
chr6	32548489	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=31,24;MFRL=120,135;MMQ=59,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,23:0.632:36:6,6:7,14:1|0:32548470_G_T:32548470:9,4,15,8
chr6	32548505	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=30,24;MFRL=120,127;MMQ=59,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,22:0.561:39:9,8:8,12:1|0:32548470_G_T:32548470:13,4,13,9
chr6	32548507	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=173.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,18:0,20:0|1:32548426_T_C:32548426:0,0,26,13
chr6	32548509	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=127,120;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,17:0.439:39:10,9:12,8:0|1:32548470_G_T:32548470:13,9,13,4
chr6	32548515	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=29,26;MFRL=121,116;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,13:0.285:47:14,8:19,5:0|1:32548426_T_C:32548426:21,13,10,3
chr6	32548544	.	TG	GA	.	.	DP=55;ECNT=12;MBQ=23,31;MFRL=109,116;MMQ=59,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,19:0.351:55:16,10:17,8:0|1:32548426_T_C:32548426:18,18,12,7
chr6	32548550	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=12;MBQ=28,26;MFRL=109,126;MMQ=51,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,22:0.387:57:18,10:17,11:0|1:32548426_T_C:32548426:20,15,12,10
chr6	32548581	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=12;MBQ=24,21;MFRL=113,92;MMQ=50,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,20:0.280:72:26,10:25,9:0|1:32548426_T_C:32548426:25,27,8,12
chr6	32548628	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=90,78;MMQ=51,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,24:0.357:68:22,9:20,15:20,24,9,15
chr6	32548632	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=89,91;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,17:0.262:66:19,9:27,8:21,28,7,10
chr6	32548641	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=11;MBQ=20,31;MFRL=78,177;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.162:47:19,2:21,5:18,22,1,6
chr6	32548648	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=32,20;MFRL=126,67;MMQ=51,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,20:0.511:39:9,8:10,11:0|1:32548648_C_A:32548648:4,15,10,10
chr6	32548652	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=27,20;MFRL=126,67;MMQ=51,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,19:0.500:38:9,5:10,11:0|1:32548648_C_A:32548648:4,15,9,10
chr6	32548656	.	GTGA	G	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=28,29;MFRL=104,100;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.231:28:6,3:15,3:8,14,0,6
chr6	32548661	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=30,28;MFRL=100,102;MMQ=41,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=83.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,21:0.760:27:3,3:3,13:0|1:32548661_G_T:32548661:0,6,7,14
chr6	32548667	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=27,29;MFRL=117,117;MMQ=41,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,1:2,8:0|1:32548661_G_T:32548661:0,4,4,8
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,2:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,0,5
chr6	32548683	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,0,3
chr6	32548686	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,0,3
chr6	32549236	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32549259	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=21;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr6	32549270	.	TCAGGGATTAGCACGGTCCCCTTCTTAGTGGGTGAGAAATTTAGGAAGTCAGAAAGCTGCTCACTCCATTCCACTGTGAGAGGGCTTGTCACGCTTGGGTGCTCCACTTGGCAGGTGTAAACCTCTCCACTTCGAGGAACTGTTTCCAGCATCAC	T	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=22,27;MFRL=166,232;MMQ=40,26;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.092:47:0,3:4,0:30,11,2,4
chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=21;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr6	32549331	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=33,27;MFRL=263,144;MMQ=27,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.807:8:1,3:0,4:0|1:32549331_C_A:32549331:1,0,3,4
chr6	32549340	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=34,33;MFRL=235,104;MMQ=27,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.705:8:2,3:0,3:0|1:32549331_C_A:32549331:2,0,3,3
chr6	32549344	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=24,27;MFRL=235,104;MMQ=27,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.705:8:2,2:0,3:0|1:32549331_C_A:32549331:2,0,3,3
chr6	32549345	.	G	GCA	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=25,33;MFRL=104,235;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,2:3,0:0|1:32549345_G_GCA:32549345:3,3,2,0
chr6	32549351	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=21;MBQ=30,31;MFRL=63,235;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0|1:32549345_G_GCA:32549345:2,3,2,0
chr6	32549356	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=21;MBQ=0,30;MFRL=218,176;MMQ=27,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.825:9:0,4:0,3:0|1:32549356_TG_CA:32549356:1,0,5,3
chr6	32549361	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=27,26;MFRL=218,207;MMQ=27,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.807:8:0,2:1,3:0|1:32549356_TG_CA:32549356:1,0,4,3
chr6	32549376	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=21;MBQ=28,34;MFRL=216,258;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0|1:32549376_C_G:32549376:3,0,3,0
chr6	32549380	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=21;MBQ=30,30;MFRL=216,258;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0|1:32549376_C_G:32549376:3,0,3,0
chr6	32549392	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=29,24;MFRL=207,166;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,3:5,0,5,0
chr6	32549396	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=173,204;MMQ=27,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:4,1:5,3:0|1:32549396_C_G:32549396:13,0,4,0
chr6	32549398	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=21;MBQ=26,29;MFRL=166,204;MMQ=27,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.236:19:5,1:8,3:0|1:32549396_C_G:32549396:15,0,4,0
chr6	32549401	.	TC	CT,CC	.	.	DP=22;ECNT=21;MBQ=24,33,30;MFRL=204,162,166;MMQ=43,33,27;MPOS=5,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.14,27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,9:0.318,0.456:19:1,4,3:3,2,6:4,0,15,0
chr6	32549402	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=21;MBQ=30,31;MFRL=159,204;MMQ=27,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:0|1:32549396_C_G:32549396:12,0,4,0
chr6	32549424	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=29,23;MFRL=170,157;MMQ=30,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:8,5:13,2:0|1:32549424_C_T:32549424:18,6,6,1
chr6	32549428	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=21;MBQ=29,23;MFRL=171,157;MMQ=27,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.211:36:13,5:15,2:0|1:32549424_C_T:32549424:20,9,6,1
chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=28;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,20,10
chr6	32549497	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=28;MBQ=25,26;MFRL=135,109;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.309:38:15,8:11,3:16,11,7,4
chr6	32549501	.	A	T,C	.	.	DP=41;ECNT=28;MBQ=0,22,27;MFRL=0,109,135;MMQ=60,40,40;MPOS=10,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.33,84.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,28:0.328,0.650:41:0,10,15:0,3,13:0,0,24,17
chr6	32549525	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=28;MBQ=28,30;MFRL=107,153;MMQ=51,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,19:0.308:63:22,7:22,11:0|1:32549525_C_G:32549525:21,23,14,5
chr6	32549531	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=28;MBQ=23,31;MFRL=107,148;MMQ=51,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,20:0.292:70:25,8:24,11:0|1:32549525_C_G:32549525:20,30,14,6
chr6	32549540	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=28;MBQ=30,23;MFRL=115,95;MMQ=51,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,9:0.120:80:30,5:40,4:29,42,4,5
chr6	32549579	.	TG	T	.	.	DP=75;ECNT=28;MBQ=24,27;MFRL=105,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,18:0.264:70:22,7:29,11:0|1:32549579_TG_T:32549579:21,31,5,13
chr6	32549581	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=28;MBQ=30,24;MFRL=99,128;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,14:0.201:72:25,4:32,10:0|1:32549581_G_A:32549581:23,35,4,10
chr6	32549584	.	C	CT	.	.	DP=71;ECNT=28;MBQ=31,30;MFRL=109,83;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,18:0.260:71:22,7:27,10:0|1:32549579_TG_T:32549579:20,33,5,13
chr6	32549587	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=28;MBQ=25,30;MFRL=99,141;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,13:0.194:70:25,4:31,5:0|1:32549581_G_A:32549581:22,35,3,10
chr6	32549588	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=28;MBQ=28,24;MFRL=99,134;MMQ=59,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,17:0.265:65:22,7:24,9:16,32,7,10
chr6	32549589	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=28;MBQ=24,31;MFRL=99,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,9:0.149:65:22,4:29,5:0|1:32549581_G_A:32549581:21,35,2,7
chr6	32549596	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=28;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,57;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=225.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,23:0,30:0,0,17,39
chr6	32549607	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=28;MBQ=24,33;MFRL=99,174;MMQ=54,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:12,3:24,1:14,25,1,3
chr6	32549611	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=28;MBQ=20,26;MFRL=90,135;MMQ=56,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:7,6:12,9:9,10,3,12
chr6	32549620	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=28;MBQ=30,26;MFRL=112,140;MMQ=52,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:9,4:10,7:0|1:32549620_G_A:32549620:7,13,2,10
chr6	32549622	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=28;MBQ=31,30;MFRL=122,174;MMQ=49,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,3:15,1:7,18,1,3
chr6	32549626	.	AAC	A	.	.	DP=31;ECNT=28;MBQ=23,26;MFRL=115,140;MMQ=51,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:9,2:6,7:0|1:32549620_G_A:32549620:7,12,2,10
chr6	32549628	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=28;MBQ=30,26;MFRL=143,128;MMQ=46,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.653:18:3,7:3,5:0|1:32549628_C_A:32549628:2,4,4,8
chr6	32549631	.	C	T,G	.	.	DP=28;ECNT=28;MBQ=0,31,31;MFRL=0,144,153;MMQ=60,40,43;MPOS=-2147483648,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=40.93,62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,16:0.400,0.567:27:0,3,8:0,6,4:0,0,7,20
chr6	32549636	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=28;MBQ=27,26;MFRL=149,134;MMQ=40,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:5,6:7,2:0|1:32549628_C_A:32549628:1,11,4,6
chr6	32549649	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=28;MBQ=32,29;MFRL=174,159;MMQ=50,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:2,5:0,10:1,1,2,14
chr6	32549670	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=28;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr6	32549679	.	G	GTTT	.	.	DP=10;ECNT=28;MBQ=32,32;MFRL=227,164;MMQ=41,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr6	32549681	.	G	T,GTT	.	.	DP=11;ECNT=28;MBQ=0,27,30;MFRL=0,227,164;MMQ=60,41,52;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.37,14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.464,0.462:8:0,3,1:0,1,3:0,0,1,7
chr6	32549696	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=28;MBQ=34,25;MFRL=188,187;MMQ=40,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:32549696_C_T:32549696:1,4,0,2
chr6	32549702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=28;MBQ=35,27;MFRL=176,187;MMQ=40,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:32549696_C_T:32549696:1,3,0,2
chr6	32549711	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=28;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	32551928	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=130.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,14:0,15:0|1:32551928_G_A:32551928:0,0,13,19
chr6	32551948	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=125.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,15:0,11:0|1:32551928_G_A:32551928:0,0,12,17
chr6	32551953	.	CCG	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CG;STR;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0|1:32551928_G_A:32551928:0,0,12,15
chr6	32551960	.	T	TCC	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0|1:32551928_G_A:32551928:0,0,10,14
chr6	32551970	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=20,30;MFRL=104,117;MMQ=60,45;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,21:0.849:24:0,10:3,9:0|1:32551928_G_A:32551928:2,1,9,12
chr6	32552026	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=20,28;MFRL=105,133;MMQ=56,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:0|1:32552026_C_T:32552026:4,2,0,5
chr6	32552029	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=20,24;MFRL=105,133;MMQ=56,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:3,0:0|1:32552026_C_T:32552026:4,2,0,5
chr6	32552039	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=20,30;MFRL=100,147;MMQ=50,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0|1:32552026_C_T:32552026:1,1,0,4
chr6	32552043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=20,20;MFRL=88,147;MMQ=49,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,0:0|1:32552026_C_T:32552026:0,1,0,4
chr6	32552048	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=19;MBQ=29,27;MFRL=232,120;MMQ=44,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0|1:32552048_C_T:32552048:1,1,2,5
chr6	32552059	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=19;MBQ=27,25;MFRL=232,116;MMQ=44,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0|1:32552048_C_T:32552048:1,1,0,4
chr6	32552067	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=232,120;MMQ=44,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0|1:32552048_C_T:32552048:1,1,0,5
chr6	32552085	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=19;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32552048_C_T:32552048:0,0,0,3
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chr6	32552147	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=19;MBQ=34,27;MFRL=142,132;MMQ=46,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:0,1,0,1
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chr6	32552172	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32552183	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32552190	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32552195	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32552197	.	AG	GA	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32552201	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32552164_A_G:32552164:0,0,0,1
chr6	32557320	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=101,210;MMQ=25,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:0|1:32557320_AC_GT:32557320:1,0,3,0
chr6	32557333	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=15;MBQ=23,28;MFRL=136,202;MMQ=26,35;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,1:1,3:0|1:32557320_AC_GT:32557320:2,0,4,0
chr6	32557338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=136,194;MMQ=26,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:0|1:32557320_AC_GT:32557320:2,0,5,0
chr6	32557344	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=178,240;MMQ=30,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr6	32557370	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=29,24;MFRL=114,185;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0|1:32557370_C_T:32557370:3,2,7,0
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chr6	32557378	.	T	TTGC	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=24,24;MFRL=114,185;MMQ=27,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0|1:32557370_C_T:32557370:3,2,7,0
chr6	32557398	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=27,24;MFRL=137,148;MMQ=27,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.605:13:2,3:3,3:0|1:32557370_C_T:32557370:3,2,7,1
chr6	32557402	.	CC	GT	.	.	DP=14;ECNT=15;MBQ=30,31;MFRL=127,148;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0|1:32557370_C_T:32557370:4,2,7,1
chr6	32557405	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,8:0,0,10,3
chr6	32557414	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=28,23;MFRL=140,126;MMQ=40,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:8,2:0|1:32557414_A_G:32557414:11,4,2,0
chr6	32557418	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=25,30;MFRL=137,168;MMQ=39,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,2:10,1:11,2,1,2
chr6	32557419	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=30,23;MFRL=140,126;MMQ=40,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:32557414_A_G:32557414:10,4,2,0
chr6	32557422	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=30,24;MFRL=137,140;MMQ=27,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,3:3,8:3,2,9,2
chr6	32557435	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=16,30;MFRL=140,137;MMQ=39,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.952:22:0,8:0,12:0,1,15,6
chr6	32557461	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=30;MBQ=26,22;MFRL=125,105;MMQ=47,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=90.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,25:0.377:67:17,7:22,16:27,15,11,14
chr6	32557465	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=30;MBQ=30,22;MFRL=118,111;MMQ=44,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,26:0.355:74:22,6:25,17:29,19,12,14
chr6	32557478	.	C	A	.	.	DP=90;ECNT=30;MBQ=28,23;MFRL=117,113;MMQ=40,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,27:0.311:88:22,15:35,11:35,26,15,12
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=30;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=408.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,93:0.989:93:0,39:0,52:0,0,50,43
chr6	32557487	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=30;MBQ=31,25;MFRL=108,124;MMQ=51,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,27:0.295:93:32,8:33,19:39,27,12,15
chr6	32557497	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=30;MBQ=30,27;MFRL=117,95;MMQ=51,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,15:0.166:94:34,7:44,8:42,37,8,7
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=30;MBQ=24,30;MFRL=104,120;MMQ=49,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,22:0.273:82:21,11:36,11:28,32,13,9
chr6	32557529	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=30;MBQ=25,30;MFRL=95,139;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.297:45:15,3:17,10:14,18,7,6
chr6	32557536	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=30;MBQ=29,27;MFRL=113,141;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:11,3:12,7:12,13,5,7
chr6	32557543	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=30;MBQ=30,30;MFRL=120,142;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:5,0:10,7:5,11,3,6
chr6	32557544	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=30;MBQ=30,28;MFRL=141,120;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:1,4:12,5:4,10,2,7
chr6	32557546	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=30,28;MFRL=120,139;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,0:10,6:4,11,2,5
chr6	32557549	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=30;MBQ=33,35;MFRL=120,144;MMQ=40,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.206:23:4,0:12,3:5,14,0,4
chr6	32557550	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=27,32;MFRL=139,120;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:0,4:10,4:3,10,1,8
chr6	32557552	.	A	C,T	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=0,34,27;MFRL=145,141,121;MMQ=27,40,40;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.99,29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,8:0.409,0.409:19:0,1,2:0,7,4:0,3,2,14
chr6	32557568	.	C	A,CAT	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=34,24,32;MFRL=135,142,123;MMQ=40,39,40;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.25,23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,6:0.267,0.467:12:0,1,3:2,2,3:1,2,0,9
chr6	32557572	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=30;MBQ=32,25;MFRL=139,119;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:3,1:0,5,0,5
chr6	32557583	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=30,31;MFRL=120,143;MMQ=40,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,2:0,4,1,3
chr6	32557585	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=34,30;MFRL=120,119;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	32557586	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=30;MBQ=30,29;MFRL=142,136;MMQ=39,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,0:1,4,0,4
chr6	32557592	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=32,26;MFRL=144,153;MMQ=39,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,0:1,4,0,3
chr6	32557595	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=30;MBQ=31,27;MFRL=144,152;MMQ=39,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr6	32557600	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=30;MBQ=28,27;MFRL=144,152;MMQ=39,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr6	32557601	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=30;MBQ=27,31;MFRL=144,152;MMQ=39,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:1,4,0,2
chr6	32557605	.	AGT	A	.	.	DP=9;ECNT=30;MBQ=26,22;MFRL=145,199;MMQ=43,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:2,1:1,5,0,3
chr6	32557606	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=30;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr6	32557608	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=25,31;MFRL=145,199;MMQ=47,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr6	32557610	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=25,32;MFRL=145,199;MMQ=47,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr6	32557614	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=32,26;MFRL=199,145;MMQ=42,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=31,27;MFRL=160,203;MMQ=48,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:1,5,0,2
chr6	32605207	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr6	32605234	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr6	32605257	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=154,143;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,15:1,9:1,0,18,6
chr6	32605274	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=23,31;MFRL=154,124;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=115.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:0,19:1,18:1,0,23,14
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=13;MBQ=31,24;MFRL=154,115;MMQ=60,45;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.960:48:0,22:1,24:1,0,27,20
chr6	32605326	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=20,25;MFRL=36,108;MMQ=57,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=145.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,37:0.845:43:4,16:1,21:3,3,16,21
chr6	32605332	.	G	GCCGTGTGTGTGTC	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=109,36;MMQ=44,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:16,2:23,0:16,26,1,1
chr6	32605335	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=114,36;MMQ=41,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:14,2:23,0:0|1:32605335_G_A:32605335:14,24,1,1
chr6	32605336	.	G	A,GTCAAGTAC	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=26,24,20;MFRL=171,111,36;MMQ=60,40,57;MPOS=17,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=146.02,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,36,2:0.861,0.070:40:0,14,2:2,20,0:1,1,14,24
chr6	32605341	.	TC	GG	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=26,20;MFRL=115,36;MMQ=42,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,2:21,0:0|1:32605335_G_A:32605335:12,21,1,1
chr6	32605380	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=27,33;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,10:0,1,0,14
chr6	32605400	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	32605418	.	GG	AC	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,7:0,0,0,11
chr6	32609038	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=20,24;MFRL=78,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=138.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,32:0.917:34:2,13:0,18:0|1:32609038_C_T:32609038:1,1,24,8
chr6	32609042	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=10;MBQ=20,25;MFRL=78,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=147.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,34:0.921:36:2,14:0,18:0|1:32609038_C_T:32609038:1,1,26,8
chr6	32609046	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=20,23;MFRL=78,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=153.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,35:0.923:37:2,15:0,20:0|1:32609038_C_T:32609038:1,1,26,9
chr6	32609056	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=20,24;MFRL=78,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,34:0.921:36:2,14:0,20:0|1:32609038_C_T:32609038:1,1,23,11
chr6	32609105	.	GT	AC	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=144.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,14,20
chr6	32609126	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,14:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,8,20
chr6	32609147	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,4,16
chr6	32609169	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,0,7
chr6	32609173	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,34;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,0,6
chr6	32609181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:32609105_GT_AC:32609105:0,0,0,5
chr6	32609671	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,34;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0|1:32609671_G_A:32609671:0,0,4,0
chr6	32609673	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:32609671_G_A:32609671:0,0,4,0
chr6	32609697	.	CT	GC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr6	32609746	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr6	32609855	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	32609997	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=161,209;MMQ=40,44;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,0:3,2:15,0,2,0
chr6	32610008	.	CC	TG	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=226,168;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,12:0,5:1,0,16,1
chr6	32610047	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,13:0,13:1,0,14,12
chr6	32610059	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=226,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.923:23:1,11:0,11:1,0,9,13
chr6	32610099	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:0,7:1,5:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,1,2,10
chr6	32610105	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:0,5:1,5:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,1,2,10
chr6	32610109	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr6	32610314	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	32610330	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr6	32610403	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=104.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,9:0,23:0,0,17,17
chr6	32610405	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=31,24;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:6,2:23,1:15,15,2,1
chr6	32610461	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=16;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr6	32610478	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0|1:32610478_C_G:32610478:0,0,5,10
chr6	32610481	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=16;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,4:0,10:0|1:32610478_C_G:32610478:0,0,6,10
chr6	32610487	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=66.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,2:0,11:0|1:32610478_C_G:32610478:0,0,5,10
chr6	32610495	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0|1:32610478_C_G:32610478:0,0,3,9
chr6	32610535	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr6	32610553	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,11
chr6	32610556	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,11
chr6	32610567	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=16;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,5
chr6	32610574	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,3
chr6	32610576	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,3
chr6	32610581	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=16;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32610553_G_A:32610553:0,0,0,1
chr6	32610618	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32610618_G_GGA:32610618:0,0,0,2
chr6	32610621	.	CGT	C	.	.	DP=2;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32610618_G_GGA:32610618:0,0,0,2
chr6	32627906	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,4,0
chr6	32627923	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,4,1
chr6	32627934	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,5,1
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,7,1
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,8,1
chr6	32627967	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,9,1
chr6	32627969	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,9,1
chr6	32627976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:32627906_T_C:32627906:0,0,9,3
chr6	32627992	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=23,30;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.891:16:0,11:1,4:0|1:32627906_T_C:32627906:1,0,12,3
chr6	32628022	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,17:0,8:0|1:32628022_A_G:32628022:0,0,17,9
chr6	32628030	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,17:0,7:0|1:32628022_A_G:32628022:0,0,14,11
chr6	32628045	.	CAT	GGA	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,9:0,0,17,12
chr6	32628064	.	TC	CG	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,10,13
chr6	32628093	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,6:0|1:32628093_T_C:32628093:0,0,6,14
chr6	32628103	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,6:0,7:0|1:32628093_T_C:32628093:0,0,6,12
chr6	32628122	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0|1:32628122_G_C:32628122:0,0,1,12
chr6	32628127	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,7:0,4:0|1:32628122_G_C:32628122:0,0,1,12
chr6	32628138	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,8:0,4:0|1:32628138_G_A:32628138:0,0,1,12
chr6	32628146	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:32628138_G_A:32628138:0,0,1,11
chr6	32628505	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	32628538	.	GG	TA	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:32628538_GG_TA:32628538:0,0,12,0
chr6	32628549	.	TG	GA	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0|1:32628538_GG_TA:32628538:0,0,15,1
chr6	32628558	.	GTG	ACT	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,13:0,4:0|1:32628538_GG_TA:32628538:0,0,20,1
chr6	32628595	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=131.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,21:0,10:0|1:32628595_T_C:32628595:0,0,20,11
chr6	32628602	.	G	GC	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=140.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0|1:32628595_T_C:32628595:0,0,22,11
chr6	32628621	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=0,111;MMQ=45,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:1,19:0,16:0,1,19,18
chr6	32628698	.	CA	TG	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,16:0,0,8,20
chr6	32628717	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=31,20;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:8,3:3,12,1,2
chr6	32628720	.	AA	TC	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=26,20;MFRL=158,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:32628720_AA_TC:32628720:3,13,1,1
chr6	32628726	.	A	ACTCATCCAT	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=24,20;MFRL=158,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:0|1:32628720_AA_TC:32628720:3,13,1,1
chr6	32628728	.	A	AAC	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=23,20;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:32628720_AA_TC:32628720:2,11,1,1
chr6	32628736	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,0,0,8
chr6	32628741	.	C	CTTAA	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,0,0,7
chr6	32628751	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,0,0,5
chr6	32628764	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr6	32628776	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32628776_C_A:32628776:0,0,0,2
chr6	32628779	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32628776_C_A:32628776:0,0,0,2
chr6	32628784	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32628776_C_A:32628776:0,0,0,2
chr6	32629047	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,21;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32629047_A_AC:32629047:0,0,1,0
chr6	32629053	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32629047_A_AC:32629047:0,0,3,0
chr6	32629064	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	32629091	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr6	32629137	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0|1:32629137_T_G:32629137:0,0,3,8
chr6	32629141	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:32629137_T_G:32629137:0,0,3,8
chr6	32629161	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:32629137_T_G:32629137:0,0,2,7
chr6	32629193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=20,26;MFRL=78,160;MMQ=24,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:2,2,2,2
chr6	32629194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=160,78;MMQ=40,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:2,2,2,2
chr6	32629199	.	T	A,C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=26,20,20;MFRL=160,77,78;MMQ=40,21,27;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.42,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.273:8:1,0,0:3,2,2:2,2,2,2
chr6	32629239	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,78;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32629239_A_G:32629239:0,0,0,2
chr6	32629246	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,78;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32629239_A_G:32629239:0,0,0,2
chr6	32629247	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,78;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32629239_A_G:32629239:0,0,0,2
chr6	32629650	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32629680	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	32629802	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,10:0,0,9,19
chr6	32629889	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr6	32629904	.	AT	GC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr6	32629935	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	32632553	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:32632553_A_G:32632553:1,0,2,0
chr6	32632555	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=27,31;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632553_A_G:32632553:1,0,2,0
chr6	32632578	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=27,28;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632581	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=27,28;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632589	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=30,35;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632592	.	CC	GT	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632599	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=29,34;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632601	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632605	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,20;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632608	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=34,33;MFRL=308,256;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:32632578_T_G:32632578:1,0,2,0
chr6	32632745	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0|1:32632745_G_A:32632745:0,0,4,4
chr6	32632748	.	TA	AT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:32632745_G_A:32632745:0,0,5,5
chr6	32632753	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:32632745_G_A:32632745:0,0,5,5
chr6	32632769	.	TA	CT	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,6:0|1:32632769_TA_CT:32632769:0,0,10,6
chr6	32632775	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0|1:32632769_TA_CT:32632769:0,0,10,7
chr6	32632795	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=23,25;MFRL=308,139;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:1,12:0,15:0,1,17,10
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,12:0,21:0,0,19,15
chr6	32632850	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,6:0,12:0,1,7,11
chr6	32632864	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,5:0,12:0|1:32632864_G_A:32632864:0,0,4,14
chr6	32632870	.	TCAG	T	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,4:0,9:0|1:32632864_G_A:32632864:0,0,3,14
chr6	32632875	.	C	CGG	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,4:0,11:0|1:32632864_G_A:32632864:0,0,2,15
chr6	32632885	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,3:0,6:0|1:32632864_G_A:32632864:0,0,1,13
chr6	32632903	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	32632917	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	32632931	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	32632944	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	32634184	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:32634184_A_G:32634184:0,0,12,0
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chr6	32634300	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=120,150;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=131.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,30:0.940:31:0,12:1,16:0|1:32634300_G_C:32634300:1,0,14,16
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chr6	32634306	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=120,149;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=140.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.945:34:0,13:1,17:0|1:32634300_G_C:32634300:1,0,14,19
chr6	32634318	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=30,23;MFRL=120,159;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.941:32:0,14:1,17:1,0,10,21
chr6	32634331	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=20,32;MFRL=120,153;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,23:0.890:25:0,13:2,10:0|1:32634331_G_C:32634331:1,1,5,18
chr6	32634341	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=20,30;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,21:0.879:23:0,10:2,8:0|1:32634331_G_C:32634331:1,1,4,17
chr6	32634350	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=120,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.913:21:0,9:1,9:0|1:32634331_G_C:32634331:0,1,3,17
chr6	32634373	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=34,28;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,7:1,12:0,1,2,17
chr6	32634387	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,2,14
chr6	32634402	.	AAGC	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,1,14
chr6	32634467	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	32634482	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=13;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32634482_G_A:32634482:0,0,0,1
chr6	32634485	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=13;MBQ=0,26;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32634482_G_A:32634482:0,0,0,1
chr6	32709309	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,6,8
chr6	32709346	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0|1:32709346_T_C:32709346:0,0,4,9
chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,3:0,7:0|1:32709346_T_C:32709346:0,0,2,16
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0|1:32709346_T_C:32709346:0,0,2,15
chr6	32712996	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=111,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.305:43:12,7:18,5:19,11,6,7
chr6	32713030	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=20,28;MFRL=88,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.566:44:11,7:8,18:8,11,15,10
chr6	32713044	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.285:33:9,7:13,2:0|1:32713044_C_G:32713044:14,10,3,6
chr6	32713048	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.270:35:12,5:13,2:0|1:32713044_C_G:32713044:15,11,3,6
chr6	32713061	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,3:12,1:0|1:32713061_C_A:32713061:14,12,0,4
chr6	32713070	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=23,29;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,2:11,1:0|1:32713061_C_A:32713061:13,12,0,3
chr6	32713075	.	TAG	CCA	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=119,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,1:11,1:0|1:32713061_C_A:32713061:12,12,0,3
chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,5,13
chr6	32713466	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=244,306;MMQ=50,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:32713466_T_G:32713466:2,0,1,0
chr6	32713471	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=192,306;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:32713466_T_G:32713466:4,0,1,0
chr6	32713473	.	GT	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=192,306;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:32713466_T_G:32713466:4,0,1,0
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=306,162;MMQ=27,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr6	32713521	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=149,232;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:11,1,2,0
chr6	32713545	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=138,232;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:6,0:15,5,2,0
chr6	32713827	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=85,80;MMQ=52,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.426:59:17,17:17,8:20,14,7,18
chr6	32713863	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=105,69;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.209:36:16,4:13,3:0|1:32713863_C_T:32713863:12,17,2,5
chr6	32713869	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,69;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.161:35:14,2:11,0:0|1:32713863_C_T:32713863:11,19,2,3
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,7,14
chr6	32714091	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=23,26;MFRL=123,123;MMQ=59,21;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:16,2:8,1:10,14,3,0
chr6	32714108	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=30,34;MFRL=121,123;MMQ=45,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:12,2:11,1:0|1:32714108_C_G:32714108:10,13,3,0
chr6	32714111	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=25,31;MFRL=121,123;MMQ=45,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:12,2:8,1:0|1:32714108_C_G:32714108:9,12,3,0
chr6	32714117	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=30,35;MFRL=123,123;MMQ=45,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:10,2:7,1:0|1:32714108_C_G:32714108:10,9,3,0
chr6	32714164	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=27,31;MFRL=111,123;MMQ=59,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:7,2:9,2:0|1:32714164_T_C:32714164:5,11,0,5
chr6	32714168	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=23,29;MFRL=111,123;MMQ=59,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:7,3:8,2:0|1:32714164_T_C:32714164:5,11,0,5
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=123,111;MMQ=31,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,6:2,8:0,5,4,10
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=123,113;MMQ=31,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,6:2,6:0,5,3,10
chr6	32714187	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,25;MFRL=119,123;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:7,3:6,2:0|1:32714187_G_A:32714187:3,12,0,5
chr6	32714197	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=23,28;MFRL=123,123;MMQ=60,31;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,3:6,2:0|1:32714187_G_A:32714187:3,14,0,5
chr6	32714210	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0|1:32714210_G_A:32714210:1,9,0,3
chr6	32714219	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=25,33;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,0:4,2:0|1:32714210_G_A:32714210:1,10,0,3
chr6	32714220	.	CCTCAGTA	C	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:32714210_G_A:32714210:1,10,0,2
chr6	32724143	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,10,3
chr6	32724258	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,9:0,0,6,9
chr6	32724305	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.911:8:0,6:0,2:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,2,6
chr6	32724312	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.888:6:0,4:0,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,1,5
chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,0,1,3
chr6	32724324	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	32725062	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=260,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.941:31:1,17:0,13:0,1,15,15
chr6	32725189	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	32725193	.	ATGTTCT	A,GTGTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,21,32;MFRL=0,138,0;MMQ=60,60,60;MPOS=3,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,1,1:0,0,1:0,0,0,3
chr6	32725485	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=27,33;MFRL=125,211;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0|1:32725485_A_G:32725485:7,1,2,0
chr6	32725497	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=23,32;MFRL=130,211;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:0|1:32725485_A_G:32725485:9,2,2,0
chr6	32725516	.	CT	GC	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=132,211;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:7,1:0|1:32725485_A_G:32725485:12,4,2,0
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.947:16:0,7:0,6:0|1:32725517_T_C:32725517:0,0,12,4
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=25,23;MFRL=211,133;MMQ=30,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=63.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.857:19:1,7:1,10:0|1:32725517_T_C:32725517:2,0,12,5
chr6	32725528	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=25,22;MFRL=132,211;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,1:8,1:0|1:32725485_A_G:32725485:9,5,2,0
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=20,30;MFRL=97,135;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:11,8:9,3:0|1:32725619_TG_CA:32725619:8,12,6,6
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=20,30;MFRL=97,135;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:11,9:9,4:0|1:32725619_TG_CA:32725619:8,12,7,6
chr6	32725653	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=31,28;MFRL=135,107;MMQ=53,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:9,4:5,4:0|1:32725653_C_T:32725653:8,6,0,8
chr6	32725663	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=24,32;MFRL=127,107;MMQ=55,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:11,3:4,3:0|1:32725653_C_T:32725653:8,8,0,6
chr6	32725666	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=31,25;MFRL=134,107;MMQ=57,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:11,1:4,3:0|1:32725653_C_T:32725653:7,8,0,6
chr6	32725672	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0|1:32725672_A_AG:32725672:0,0,6,11
chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,9:0,6:0|1:32725672_A_AG:32725672:0,0,6,11
chr6	32725682	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=31,35;MFRL=117,165;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,1:0|1:32725653_C_T:32725653:6,8,0,2
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	32726682	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=115,170;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.389:44:13,16:14,0:16,11,17,0
chr6	32726697	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=114,170;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.459:37:11,16:9,0:11,9,17,0
chr6	32726769	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=147,120;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.232:28:10,1:12,4:0|1:32726769_A_G:32726769:10,12,5,1
chr6	32726772	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=145,120;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:12,2:12,4:0|1:32726769_A_G:32726769:10,15,5,1
chr6	32726788	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=117,120;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.287:28:11,3:8,5:11,9,5,3
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=23,24;MFRL=91,108;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.573:33:5,11:8,7:8,6,10,9
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=91,108;MMQ=46,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.622:37:7,15:7,8:7,7,12,11
chr6	32726966	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,1,5
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=188,155;MMQ=57,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:3,2:0,4:0,3,1,5
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,4:0,0,2,8
chr6	32729335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	32729381	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=13;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	32729412	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr6	32729459	.	C	G,T	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=0,29,23;MFRL=0,69,153;MMQ=60,52,60;MPOS=6,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.65,18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.250,0.666:9:0,2,3:0,0,3:0,0,4,5
chr6	32729466	.	GC	AA	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=28,24;MFRL=153,55;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:3,0:0|1:32729466_GC_AA:32729466:2,5,1,2
chr6	32729470	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=25,30;MFRL=153,55;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0|1:32729466_GC_AA:32729466:2,5,1,2
chr6	32729490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=24,30;MFRL=150,55;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:2,4,1,2
chr6	32729501	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=25,25;MFRL=168,55;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,3:2,0:0|1:32729501_G_C:32729501:3,5,1,2
chr6	32729506	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=29,30;MFRL=179,55;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:0|1:32729501_G_C:32729501:3,7,1,2
chr6	32729507	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=177,55;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,2:5,0:0|1:32729501_G_C:32729501:4,7,1,2
chr6	32729511	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=27,27;MFRL=177,55;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,3:6,0:0|1:32729501_G_C:32729501:6,7,1,2
chr6	32729518	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=27,31;MFRL=179,55;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,3:6,0:0|1:32729501_G_C:32729501:7,7,1,2
chr6	32729521	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=27,27;MFRL=197,55;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,2:7,0:0|1:32729501_G_C:32729501:6,5,1,2
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,4,12
chr6	32731258	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=281,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:1,16:0,13:0,1,11,18
chr6	32782027	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0|1:32782027_GA_G:32782027:2,0,7,0
chr6	32782030	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0|1:32782027_GA_G:32782027:2,0,7,0
chr6	32782387	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,2:5,11:1,6,5,8
chr6	32783086	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=93,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,3:8,2:5,7,2,4
chr6	32784620	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:0,9:4,8:2,2,10,7
chr6	32784753	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,4:2,10:1,3,2,12
chr6	32784783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,5:1,6:0,2,0,12
chr6	32790167	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,1:0,8:0,1,1,8
chr6	32790220	.	T	TATAAAATATCTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	32796653	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=188,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:2,4:0,1:2,1,4,1
chr6	32796685	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=94,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,6:0,2:1,1,7,1
chr6	32796751	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=191,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,10:0,4:0,2,6,8
chr6	32797109	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0|1:32797109_G_A:32797109:0,0,12,1
chr6	32797115	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,1:0,9:0|1:32797109_G_A:32797109:0,0,11,1
chr6	32797168	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:2,3:2,5:4,1,3,6
chr6	32797297	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,3:5,8:1,8,3,8
chr6	32797361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	32797620	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=107,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=68,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,5:4,6:5,2,8,3
chr6	32797876	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,11,13
chr6	32798452	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,0:15,3:14,11,1,2
chr6	32816920	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=182,131;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:4,0:13,3:1,16,0,3
chr6	32818678	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:10,1:10,4:15,5,3,2
chr6	32825839	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:22,0:15,4:15,22,1,3
chr6	32826233	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:5,9:5,11:5,5,9,11
chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,7:0,23:0,0,15,15
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0,0,6,1
chr6	32916699	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,2,4
chr6	32916756	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:32916756_C_T:32916756:0,4,0,1
chr6	32916759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:32916756_C_T:32916756:0,3,0,1
chr6	32917544	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:4,11:1,9:3,2,11,9
chr6	32937012	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:32937012_G_A:32937012:8,0,1,1
chr6	32937018	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,2:6,0:0|1:32937012_G_A:32937012:8,1,1,1
chr6	32937020	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.222:12:2,2:6,0:0|1:32937012_G_A:32937012:9,1,1,1
chr6	32940978	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=124,72;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:0|1:32940978_G_A:32940978:9,21,0,2
chr6	32940981	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=120,72;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,1:16,0:0|1:32940978_G_A:32940978:9,20,0,2
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=110,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.221:43:19,4:15,5:21,13,5,4
chr6	32943086	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.704:10:0,4:0,2:3,0,6,1
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=93,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,2:9,4:8,7,2,4
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:14,2:5,20,1,2
chr6	32943752	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.272:34:12,6:13,3:8,17,4,5
chr6	32944381	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=166,119;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:7,1,2,0
chr6	32945138	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=191,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr6	32945375	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=135,235;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,15:7,0:7,10,15,0
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=90.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,18:0,0,15,14
chr6	32946133	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,4:10,1:15,8,2,3
chr6	32974551	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=75,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,24:0.833:28:1,6:3,18:1,3,16,8
chr6	32975286	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=95,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,2:9,0:11,16,2,0
chr6	33036388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=107,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,5:2,5:0|1:33036388_C_T:33036388:2,4,8,3
chr6	33036394	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,4:2,6:0|1:33036388_C_T:33036388:2,4,10,5
chr6	33036399	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,19:0.714:26:4,6:2,12:0|1:33036388_C_T:33036388:3,4,12,7
chr6	33036401	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,19:0.714:26:5,6:2,13:0|1:33036388_C_T:33036388:3,4,12,7
chr6	33036435	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,30:0.728:41:6,10:4,20:7,4,20,10
chr6	33036617	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:3,3:0,6:2,1,3,7
chr6	33036630	.	GA	TC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=234,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:2,3:0,3:1,2,1,5
chr6	33036708	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:33036708_CA_TG:33036708:1,0,3,3
chr6	33036717	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,1:0|1:33036708_CA_TG:33036708:1,0,3,3
chr6	33036853	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:2,12:1,8:3,0,9,11
chr6	33036950	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=74,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,23:0.667:34:8,13:2,8:0|1:33036950_CA_TG:33036950:4,7,11,12
chr6	33036959	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=74,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,21:0.647:32:8,11:2,9:0|1:33036950_CA_TG:33036950:4,7,11,10
chr6	33036971	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.691:27:7,12:1,7:2,6,8,11
chr6	33036999	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.698:21:4,9:2,5:4,2,7,8
chr6	33037080	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=79,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:1,7:6,5:0|1:33037080_G_A:33037080:3,4,4,8
chr6	33037082	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=79,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.620:19:1,7:6,5:0|1:33037080_G_A:33037080:3,4,4,8
chr6	33037104	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:2,4,1,8
chr6	33037142	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr6	33037412	.	GC	CA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=77,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:3,8:2,8:2,4,11,6
chr6	33037419	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=58,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.806:29:2,10:3,11:2,3,14,10
chr6	33037424	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=58,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.800:28:2,11:3,12:2,3,12,11
chr6	33037442	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=97,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:16,2:0|1:33037442_A_C:33037442:16,14,1,1
chr6	33037444	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=97,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:14,2:0|1:33037442_A_C:33037442:16,14,1,1
chr6	33037448	.	G	GGTGTCTACACT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,0:16,2:0|1:33037442_A_C:33037442:17,14,1,1
chr6	33037522	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=80,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.804:23:2,13:2,6:2,2,11,8
chr6	33037557	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=37,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=82.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,20:0.809:24:2,11:2,9:0|1:33037557_C_T:33037557:2,2,11,9
chr6	33037560	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=83.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,20:0.840:23:2,10:1,9:0|1:33037557_C_T:33037557:2,1,11,9
chr6	33037579	.	AT	TG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:2,9:1,12:2,1,13,10
chr6	33037675	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,6,12
chr6	33037690	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr6	33041176	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0|1:33041176_C_T:33041176:1,0,6,0
chr6	33041186	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,1:1,5:0|1:33041176_C_T:33041176:2,0,8,0
chr6	33041226	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,4:1,11:1,0,12,3
chr6	33043930	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=92,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,9:1,9:1,2,5,14
chr6	33048348	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,3:0,3:1,0,3,4
chr6	33048371	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:5,6:0,3:6,0,7,4
chr6	33048457	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,17:0.721:23:3,10:3,5:0|1:33048457_C_G:33048457:3,3,9,8
chr6	33048459	.	TTT	GCA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=176,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,18:0.679:26:3,11:3,5:0|1:33048457_C_G:33048457:3,5,9,9
chr6	33048466	.	GG	TT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=176,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,18:0.679:26:4,10:3,7:0|1:33048457_C_G:33048457:3,5,8,10
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=28,27;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:5,11:3,8:5,3,9,11
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=32,23;MFRL=185,111;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:3,8:1,7:0|1:33048599_C_A:33048599:1,3,5,10
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=26,24;MFRL=185,111;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:3,8:1,7:0|1:33048599_C_A:33048599:1,3,5,10
chr6	33048606	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=180,109;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.714:19:3,8:2,6:0|1:33048599_C_A:33048599:1,4,5,9
chr6	33048640	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=182,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:1,4,0,6
chr6	33048686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=30,23;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0|1:33048686_G_A:33048686:2,2,1,3
chr6	33048689	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,24;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,4:2,0:0|1:33048686_G_A:33048686:2,2,1,4
chr6	33048691	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0|1:33048686_G_A:33048686:1,2,1,4
chr6	33048694	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:33048686_G_A:33048686:1,1,1,3
chr6	33052626	.	AAAGGAAGGAAGG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=AAGG;STR;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.711:7:0,1:0,4:2,0,4,1
chr6	33052944	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,145;MMQ=60,29;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,0:11,5:5,14,0,5
chr6	33131671	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:6,0:11,9:0|1:33131671_A_C:33131671:0,17,0,9
chr6	33131674	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:6,0:10,9:0|1:33131671_A_C:33131671:0,17,0,9
chr6	33132338	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	33133602	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=157,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:0|1:33133602_A_G:33133602:7,7,1,1
chr6	33133611	.	T	TACTGAGATGGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=157,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:3,2:9,0:0|1:33133602_A_G:33133602:8,6,1,1
chr6	33134102	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr6	33135611	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,0:13,3:12,8,3,0
chr6	33135630	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=31,23;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,0:7,3:6,3,3,0
chr6	33135691	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=156,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chr6	33135715	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=145,169;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:33135715_T_C:33135715:2,6,0,2
chr6	33135721	.	T	TAC	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=150,169;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:33135715_T_C:33135715:2,5,0,2
chr6	33135728	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=22,30;MFRL=175,169;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr6	33135745	.	G	GTACATCTCCTATC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=230,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:33135745_G_GTACATCTCCTATC:33135745:0,2,0,1
chr6	33135746	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,21;MFRL=230,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:33135745_G_GTACATCTCCTATC:33135745:0,2,0,1
chr6	33136310	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.771:20:2,6:2,8:1,3,5,11
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=181,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,9:0,6:1,0,7,8
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr6	33136675	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.270:16:6,0:5,4:1,11,0,4
chr6	33138200	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.874:18:1,12:0,4:2,0,4,12
chr6	33138469	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:2,1:3,2,2,0
chr6	33139184	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=107,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,5:0,2:2,2,4,3
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:4,4:9,2:6,7,3,3
chr6	33139449	.	GACCCCTCCCCAGT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=101,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:1,3:5,0:0|1:33139449_GACCCCTCCCCAGT_G:33139449:2,8,1,2
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0|1:33139449_GACCCCTCCCCAGT_G:33139449:0,0,4,14
chr6	33139635	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=235,350;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,3:1,10:1,1,1,12
chr6	33139662	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	33140312	.	TTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=109,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:7,8,1,1
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	33141306	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=90,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:6,2:3,6,0,2
chr6	33141356	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:33141356_C_T:33141356:0,0,0,1
chr6	33141361	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33141356_C_T:33141356:0,0,0,1
chr6	33141366	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33141356_C_T:33141356:0,0,0,1
chr6	33141367	.	G	GGCTTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33141356_C_T:33141356:0,0,0,1
chr6	33141371	.	A	ACGTTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33141356_C_T:33141356:0,0,0,1
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	33142012	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.876:13:1,5:0,6:1,0,5,7
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,11:0,0,15,12
chr6	33143756	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=111.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,19:0,0,26,8
chr6	33143948	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,12:1,2:1,0,7,8
chr6	33144243	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=364,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,10:0,7:1,0,10,7
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=242,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:0,1:0,1,2,1
chr6	33144596	.	C	CACT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,2:6,0:7,11,1,1
chr6	33145913	.	GG	AC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:13,0:12,15,2,0
chr6	33146053	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=87,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,1,4
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	33147604	.	CC	TT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:2,5,1,1
chr6	33148878	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:3,3:8,1:8,5,3,1
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,1,16
chr6	33166034	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr6	33166117	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:23,3:11,1:20,16,4,0
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr6	33173748	.	CAGAGAG	C,CAGAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32,35;MFRL=182,161,175;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=AG;STR;TLOD=8.70,8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.351,0.424:8:1,1,0:1,2,3:0,2,1,5
chr6	33173842	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr6	33175575	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr6	33179669	.	G	GATGTGCCTTCAGCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr6	33179848	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	33180209	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=202,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,5:0,9:0,1,4,10
chr6	33232055	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	33232337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr6	33232521	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.733:28:2,10:5,11:6,1,17,4
chr6	33235120	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,0:4,4:3,7,0,4
chr6	33235755	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=94,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.604:31:8,6:4,12:5,7,7,12
chr6	33236788	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:33236788_C_T:33236788:12,6,1,1
chr6	33236796	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.132:20:7,0:11,2:0|1:33236788_C_T:33236788:12,6,1,1
chr6	33248174	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,7,1
chr6	33254556	.	C	CG	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.183:41:16,3:18,4:26,8,5,2
chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,6:10,1:14,6,4,3
chr6	33256096	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.240:26:15,3:5,2:9,11,3,3
chr6	33256471	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr6	33256826	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.152:22:4,0:9,0:0|1:33256826_G_C:33256826:8,11,3,0
chr6	33256833	.	GA	CC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.137:24:5,1:14,0:0|1:33256826_G_C:33256826:9,12,3,0
chr6	33256839	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:12,1:0|1:33256826_G_C:33256826:10,12,2,0
chr6	33256841	.	AG	CC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,1:15,0:0|1:33256826_G_C:33256826:11,12,2,0
chr6	33256984	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,2:10,2:5,14,0,4
chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.248:33:18,4:7,3:15,10,4,4
chr6	33261763	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,0:15,5:0|1:33261763_G_T:33261763:12,11,2,3
chr6	33261768	.	A	AAAGACTCAGACAAAAGCATTTGAC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=107,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.185:30:9,0:15,4:0|1:33261763_G_T:33261763:14,11,2,3
chr6	33261871	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,1,1
chr6	33263451	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.079:35:24,1:8,1:17,16,1,1
chr6	33263730	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,102;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:14,1,2,0
chr6	33264420	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:6,5,5,5
chr6	33269394	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.381:9:3,1:2,2:6,0,3,0
chr6	33269689	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=185,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr6	33272637	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr6	33272712	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=92,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:7,9,1,3
chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,3:8,2:8,8,2,3
chr6	33281842	.	GA	TT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:11,3:10,2:8,15,3,2
chr6	33281858	.	CCTTTCA	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTCA;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:7,0:7,12,1,1
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.231:50:14,5:24,6:21,18,3,8
chr6	33287643	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.260:28:8,0:11,6:9,12,0,7
chr6	33287671	.	AG	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=224,125;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.214:29:4,0:19,6:8,15,0,6
chr6	33287676	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=141,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.281:30:5,0:16,8:0|1:33287676_G_A:33287676:9,13,0,8
chr6	33287677	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=219,125;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.208:30:5,0:19,5:9,15,0,6
chr6	33287683	.	T	TGACAGCTATCTTGACTAATAAA	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=24,38;MFRL=141,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.273:31:6,0:9,8:0|1:33287676_G_A:33287676:10,13,0,8
chr6	33287886	.	TC	T	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.065:63:26,1:32,3:21,38,2,2
chr6	33287892	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=120,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:26,0:33,2:0|1:33287892_T_A:33287892:25,37,0,2
chr6	33287894	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=120,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:28,0:30,2:0|1:33287892_T_A:33287892:24,38,0,2
chr6	33287899	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:18,0:25,2:0|1:33287892_T_A:33287892:25,34,0,2
chr6	33287904	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:20,0:26,2:0|1:33287892_T_A:33287892:23,28,0,2
chr6	33288075	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:3,2,1,3
chr6	33288271	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:5,7,5,3
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.305:47:17,12:16,2:22,11,8,6
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,11:0,13:0,0,5,20
chr6	33365981	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=78,85;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.172:50:26,2:12,6:27,15,2,6
chr6	33371903	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:33371903_G_T:33371903:4,14,1,1
chr6	33371907	.	G	GTGGTGGTGGGGAAGTTCCGT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:33371903_G_T:33371903:4,14,1,1
chr6	33373881	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=103,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	33377484	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:6,6:7,3:4,14,6,4
chr6	33379941	.	GAAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.272:16:6,2:3,2:11,1,4,0
chr6	33380071	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.134:50:22,6:21,0:13,31,0,6
chr6	33382241	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=78,85;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.208:46:13,5:22,4:17,20,4,5
chr6	33382260	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.208:46:21,0:14,9:19,18,0,9
chr6	33382288	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,22:0,18:0,0,16,24
chr6	33382416	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,7:2,5:3,1,8,4
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr6	33383416	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.120:56:26,6:24,0:24,26,6,0
chr6	33385930	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,1:13,2:10,26,0,3
chr6	33399778	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,3:4,1:9,6,1,3
chr6	33402876	.	AGG	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=40,171;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:1,2:2,4,2,0
chr6	33402881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=40,171;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,0:2,4,2,0
chr6	33402885	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=40,171;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,1:0|1:33402885_G_T:33402885:2,6,2,0
chr6	33402890	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=79,171;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,0:0|1:33402885_G_T:33402885:3,6,2,0
chr6	33403422	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,2,4
chr6	33406729	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33406729_G_GAA:33406729:3,0,0,1
chr6	33406731	.	T	TGGCTCGCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33406729_G_GAA:33406729:3,0,0,1
chr6	33408465	.	TTCTC	T,CTCTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,26,34;MFRL=136,71,0;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.34,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.162,0.162:13:7,1,0:0,1,2:6,3,1,3
chr6	33408542	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:5,7:3,6,10,4
chr6	33408908	.	GTGTGTGTGTA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=116,161;MMQ=50,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.416:3:2,1:0,0:1,1,1,0
chr6	33408916	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=182,79;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:33408916_G_GC:33408916:2,0,0,1
chr6	33408917	.	T	TTATATAAATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=182,79;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:33408916_G_GC:33408916:2,0,0,1
chr6	33408922	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=161,79;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33408916_G_GC:33408916:3,0,0,1
chr6	33411600	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:17,0:23,5:22,19,1,4
chr6	33414431	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=105,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:12,0:11,4:10,13,1,3
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,5
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,2
chr6	33419635	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,66;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,4:11,0:9,8,3,1
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=145.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,26:0,0,31,19
chr6	33541719	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=133,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:9,4:9,3:9,10,4,3
chr6	33561072	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=259,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,5,14
chr6	33623536	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:3,0:6,0:1,9,4,0
chr6	33625896	.	G	GATTTTGTCAGGAAGTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr6	33630311	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr6	33630624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr6	33630816	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,3,12
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	33631155	.	TGGGAGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:0,0,10,0
chr6	33631163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:0,0,10,0
chr6	33632618	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	33636232	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	33638372	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=176,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:0|1:33638372_G_A:33638372:15,1,1,1
chr6	33638382	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=180,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,1:5,0:0|1:33638372_G_A:33638372:14,0,1,1
chr6	33639760	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,14:0,3:0,0,12,5
chr6	33640061	.	C	CCAAGATATCCCCTTGAGGCAGAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=8,30;MFRL=203,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:0,0:0|1:33640061_C_CCAAGATATCCCCTTGAGGCAGAGCCA:33640061:0,1,0,1
chr6	33640064	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,25;MFRL=203,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:33640061_C_CCAAGATATCCCCTTGAGGCAGAGCCA:33640061:0,1,0,1
chr6	33641956	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=208,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,9:1,15:1,0,13,11
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,6:0,8:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,9,7
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,8,7
chr6	33645457	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=77,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,5:1,6:1,2,3,8
chr6	33646328	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,13,11
chr6	33647594	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,8,1
chr6	33647651	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,15,9
chr6	33648506	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:33648506_G_GCT:33648506:0,3,0,1
chr6	33648508	.	G	GTATTCATTTATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33648506_G_GCT:33648506:0,3,0,1
chr6	33648554	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=73,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr6	33651104	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,3:5,1:6,7,2,2
chr6	33651129	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,2:5,1:9,7,1,2
chr6	33652102	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,2:2,0:4,3,1,1
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,5,3
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,7:0,0:0,0,1,6
chr6	33654897	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=138,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.195:14:3,1:4,1:4,8,1,1
chr6	33655173	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr6	33656654	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,342;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr6	33656969	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	33658015	.	G	GTAAGGCTTCTTAGCACCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.362:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	33659472	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=99,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:16,4:17,2:23,10,3,3
chr6	33659536	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:8,2:10,4:7,11,2,4
chr6	33659550	.	C	CG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:11,2:14,2:0|1:33659550_C_CG:33659550:8,17,2,2
chr6	33659557	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.157:30:10,2:13,2:0|1:33659550_C_CG:33659550:8,18,2,2
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	33662667	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=232,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:1,0,5,3
chr6	33740449	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.264:36:11,0:15,9:14,13,0,9
chr6	33746154	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:9,0:12,3:3,19,1,2
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.295:32:12,2:10,7:12,11,2,7
chr6	33748998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=127,127;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,0:1,7:1,2,0,7
chr6	33762625	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,1:8,3:5,8,4,0
chr6	33766901	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:17,0:18,2:20,15,1,1
chr6	34101001	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,106;MMQ=60,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:17,0:9,7:11,15,7,0
chr6	34208461	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	34211341	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr6	34212674	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,3:12,1:12,17,4,0
chr6	34212730	.	T	TGC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=145,160;MMQ=50,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.162:20:6,0:10,2:0|1:34212730_T_TGC:34212730:2,15,3,0
chr6	34212734	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=147,194;MMQ=51,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:34212730_T_TGC:34212730:1,17,2,0
chr6	34212737	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,19;MFRL=147,194;MMQ=51,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,1:0|1:34212730_T_TGC:34212730:1,17,2,0
chr6	34212743	.	A	G,C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,30,19;MFRL=0,145,194;MMQ=60,51,35;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.44,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,2:0.809,0.143:18:0,9,0:0,7,1:0,0,3,15
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	34215215	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=99,71;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:10,1:20,2,0,2
chr6	34215224	.	TG	T,GG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,26,33;MFRL=95,166,105;MMQ=60,60,60;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.50,12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,2,5:0.104,0.182:26:10,0,1:9,2,3:18,1,1,6
chr6	34215228	.	G	A,GCA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,27,16;MFRL=0,103,105;MMQ=60,60,60;MPOS=18,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=67.07,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,5:0.772,0.193:26:0,10,1:0,11,1:0,0,19,7
chr6	34496681	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=55,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:34496681_G_T:34496681:1,1,0,1
chr6	34496687	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=55,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34496681_G_T:34496681:1,1,0,1
chr6	34497265	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=104,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:15,2:16,2:17,14,2,2
chr6	34497344	.	GGATGGC	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=143,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,0:10,2:0|1:34497344_GGATGGC_G:34497344:14,12,1,1
chr6	34497352	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,0:6,2:0|1:34497344_GGATGGC_G:34497344:14,8,1,1
chr6	34497360	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:7,2:0|1:34497344_GGATGGC_G:34497344:14,8,1,1
chr6	34507411	.	GGGA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	34511826	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:12,1:10,1:0|1:34511826_G_A:34511826:11,13,0,2
chr6	34511830	.	C	CTTGAAGGA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:14,0:10,1:0|1:34511826_G_A:34511826:11,14,0,2
chr6	34614477	.	CTTGG	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:15,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:13,9,1,1
chr6	34614486	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:11,10,1,1
chr6	34614488	.	A	ACT	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:11,10,1,1
chr6	34614491	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:10,11,1,1
chr6	34614496	.	CACCAT	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:13,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:12,11,1,1
chr6	34614503	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:11,9,1,1
chr6	34614505	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:11,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:12,10,1,1
chr6	34614507	.	T	TCCTGG	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=26,25;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:34614477_CTTGG_C:34614477:11,9,1,1
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,8:0,0,8,2
chr6	34735652	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	34789863	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	34802157	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,4:12,0:12,17,4,0
chr6	34824800	.	CTA	TGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	34834916	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	34838566	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	34848098	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:1,10,1,2
chr6	34949451	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr6	34949495	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=144,119;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,3:9,0:16,8,3,0
chr6	34962019	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr6	34962060	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,14,2
chr6	35047579	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=141,417;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:10,3,2,0
chr6	35047732	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,3:2,1:1,9,1,3
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr6	35088608	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	35088855	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr6	35103937	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,0:13,2:6,14,1,1
chr6	35107682	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	35108553	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	35108718	.	C	CTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=160,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	35209258	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=199,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	35209493	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=197,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr6	35210157	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=250,76;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,0:0,4:1,1,1,3
chr6	35210802	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=109,544;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:15,0:6,5:14,7,6,0
chr6	35216490	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:35216490_A_G:35216490:3,8,0,2
chr6	35216497	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:35216490_A_G:35216490:3,7,0,2
chr6	35259261	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr6	35259413	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,1:3,2:7,3,0,3
chr6	35260558	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr6	35262428	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	35280593	.	T	TTGTAAGACGCATTTCGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=154,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr6	35378767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr6	35437113	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,3:2,10:2,1,8,5
chr6	35437387	.	A	AGTGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:0|1:35437387_A_AGTGG:35437387:0,3,0,1
chr6	35437388	.	A	AGACGGGGCTTCTCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:0|1:35437387_A_AGTGG:35437387:0,3,0,1
chr6	35438585	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35438585_G_T:35438585:0,0,0,1
chr6	35438587	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35438585_G_T:35438585:0,0,0,1
chr6	35447940	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,4:8,3:5,5,3,4
chr6	35474132	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.789:20:3,8:0,8:2,2,1,15
chr6	35477025	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,6,14
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr6	35478612	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr6	35610661	.	TTCTTTATG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:35610661_TTCTTTATG_T:35610661:0,2,0,1
chr6	35610672	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:35610661_TTCTTTATG_T:35610661:0,2,0,1
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	35716226	.	GGGAGTTTAGGCAATAGGAATATACAAGAACAAGAATTTTGTAACTTGCCTA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:0,0:3,2:9,3,1,1
chr6	35745312	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=74,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,5:6,0:7,8,5,0
chr6	35745655	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=74,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:16,3:12,9:13,15,7,5
chr6	35747108	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:8,2,2,0
chr6	35748931	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.200:34:14,1:13,4:16,11,2,5
chr6	35761202	.	C	CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=93,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,0:2,3:3,1,3,5
chr6	35764943	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	35765151	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	35803283	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,1,5
chr6	35825048	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:10,15,2,1
chr6	35836705	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:5,0,8,0
chr6	35943286	.	C	CCCACCACCACGTCCAGCTAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr6	35945219	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=213,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr6	35965551	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:4,2:0|1:35965551_C_T:35965551:7,6,1,1
chr6	35965559	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=146,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:35965551_C_T:35965551:10,7,1,1
chr6	35965564	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=146,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:35965551_C_T:35965551:11,7,1,1
chr6	35967772	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:4,2:11,2:9,6,3,1
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr6	36040642	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=104,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.174:31:17,1:9,4:12,14,2,3
chr6	36075219	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,7:2,10:3,1,13,4
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,16,8
chr6	36103921	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr6	36104803	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr6	36106891	.	C	CTTCCTTCCTTCCTTCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:36106891_C_CTTCCTTCCTTCCTTCCT:36106891:1,3,0,1
chr6	36106895	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:36106891_C_CTTCCTTCCTTCCTTCCT:36106891:1,3,0,1
chr6	36169259	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:18,2:10,2:17,11,3,1
chr6	36172665	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr6	36192983	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	36193036	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,12;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:0,0:1,0:1,1,4,0
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr6	36285066	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr6	36288879	.	G	GGTCTCAGCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr6	36292007	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr6	36294915	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr6	36341165	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=105,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,2:6,1:11,4,2,1
chr6	36359682	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=81,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.608:8:1,1:2,4:1,2,1,4
chr6	36368169	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.762:23:5,16:0,2:3,2,16,2
chr6	36447287	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	36452603	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,20,20,23;MFRL=131,168,83,75;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,28,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.03,5.05,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,7,6:0.191,0.270,0.223:25:4,0,1,2:2,3,3,3:1,6,7,11
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chr6	36483295	.	CCACA	C,CCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33,31;MFRL=130,170,153;MMQ=60,60,60;MPOS=21,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=CA;STR;TLOD=3.79,14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.247,0.620:9:0,1,2:1,1,3:0,1,0,8
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chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:4,0,9,0
chr6	36493330	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,22:0.768:28:2,10:4,12:3,3,9,13
chr6	36508036	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,5:2,4:0,4,3,6
chr6	36711406	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr6	36712962	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=179,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0,10,1,1
chr6	36713357	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:36713357_A_T:36713357:0,4,0,1
chr6	36713360	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:36713357_A_T:36713357:0,4,0,1
chr6	36713365	.	C	CCCAATGCAACTCTTTGAACT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:36713357_A_T:36713357:0,4,0,1
chr6	36714204	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.182:15:7,0:6,2:10,3,1,1
chr6	36733070	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,0:3,3:3,3,2,1
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chr6	36759741	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=203,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,4:1,5:0,1,6,4
chr6	36759768	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=203,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:0,1,5,4
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chr6	36842427	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:4,5:2,11:6,0,16,0
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,2:0,0,5,3
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	36881991	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	36884121	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	36887308	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,6:3,8:3,2,8,6
chr6	36922684	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=87,157;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,4:1,5:1,2,2,7
chr6	36927214	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	36929852	.	G	GGGGGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36929852_G_GGGGGCT:36929852:0,0,0,1
chr6	36929854	.	A	AGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36929852_G_GGGGGCT:36929852:0,0,0,1
chr6	36931287	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,38:0.781:48:4,16:6,22:5,5,21,17
chr6	36976637	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=82,102;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:5,11:6,14:7,4,15,11
chr6	36978834	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:9,2:1,4:0,11,2,4
chr6	36978879	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:2,4,5,6
chr6	37012881	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,116;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,1:16,2:9,15,3,0
chr6	37138362	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:12,5:17,0:11,18,5,0
chr6	37139322	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,5:2,2:0,2,1,7
chr6	37140683	.	TT	AA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=156,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr6	37140994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:9,3:1,0:0,10,0,3
chr6	37141954	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	37186144	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=193,238;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37186144_G_A:37186144:2,0,1,0
chr6	37186149	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=193,238;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37186144_G_A:37186144:2,0,1,0
chr6	37186152	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=193,238;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37186144_G_A:37186144:2,0,1,0
chr6	37237544	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr6	37250112	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,17:0,0,17,16
chr6	37280815	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,1:11,2:9,9,2,1
chr6	37280844	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,6:0,0,5,11
chr6	37281732	.	G	GTGAGATGTGGTTTTGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:37281732_G_GTGAGATGTGGTTTTGA:37281732:2,4,1,1
chr6	37281733	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:37281732_G_GTGAGATGTGGTTTTGA:37281732:2,4,1,1
chr6	37348920	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:0,9:6,2:4,2,5,6
chr6	37411841	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:16,0:21,6:17,20,0,6
chr6	37445506	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37445506_G_T:37445506:0,1,0,1
chr6	37445510	.	GC	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:37445506_G_T:37445506:0,1,0,1
chr6	37448994	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=94,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:37448994_GG_CT:37448994:0,3,0,1
chr6	37449000	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37448994_GG_CT:37448994:0,1,0,1
chr6	37449003	.	G	GCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0|1:37448994_GG_CT:37448994:0,1,0,1
chr6	37449005	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37448994_GG_CT:37448994:0,1,0,1
chr6	37614094	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:0,3,5,5
chr6	37614924	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.574:8:3,3:0,2:0,3,5,0
chr6	37618202	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr6	37620129	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,0:1,3:4,3,1,2
chr6	37620139	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:0|1:37620139_G_A:37620139:2,6,1,1
chr6	37620145	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:37620139_G_A:37620139:1,6,1,1
chr6	37625926	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	38084569	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr6	38565930	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:38565930_G_A:38565930:0,4,0,1
chr6	38565931	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	38565939	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:38565930_G_A:38565930:0,3,0,1
chr6	38565941	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,18;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:38565930_G_A:38565930:0,3,0,1
chr6	38670708	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,5,5
chr6	38670837	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,4:1,5:2,2,4,5
chr6	38697839	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr6	38702212	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:8,0:1,2:6,3,2,0
chr6	38718402	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:5,1:3,3,1,1
chr6	38729458	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,18,5
chr6	38746090	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38746090_A_G:38746090:0,0,1,0
chr6	38746098	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38746090_A_G:38746090:0,0,2,0
chr6	38746263	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,9:0,0,3,10
chr6	38746294	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr6	38749200	.	ACAAATATATCATAT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0|1:38749200_ACAAATATATCATAT_A:38749200:1,5,0,3
chr6	38749211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.853:4:0,2:0,2:1|0:38749200_ACAAATATATCATAT_A:38749200:0,0,1,3
chr6	38750705	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,2:1,0:2,0,1,2
chr6	38759379	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.762:23:4,9:1,9:2,3,12,6
chr6	38771106	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=113,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:10,5:15,1:6,19,1,5
chr6	38771168	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=187,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,1,3
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	38775336	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=233,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,13:0,6:1,0,12,7
chr6	38781931	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr6	38810313	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,3,3
chr6	38810761	.	A	AAAACCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr6	38813486	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=119,111;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:12,2:8,4:10,11,6,0
chr6	38813642	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=211,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr6	38820451	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,14,8
chr6	38820599	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr6	38825329	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,10:0,0,11,11
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.946:14:0,8:0,5:0,0,2,12
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr6	38831703	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,131;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,4:9,0:9,12,4,0
chr6	38843279	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38843279_CC_TT:38843279:0,0,2,0
chr6	38843283	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38843279_CC_TT:38843279:0,0,2,0
chr6	38851308	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=254,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	38864061	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	38873956	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=202,161;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr6	38873960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=161,202;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	38877605	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	38885010	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=79,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:1,3:1,1,2,3
chr6	38885042	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=164,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,2:8,0:5,6,1,1
chr6	38897453	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=117,0;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.449:5:0,1:2,1:2,1,2,0
chr6	38897491	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:38897491_A_T:38897491:1,3,0,1
chr6	38897493	.	A	ATGACAATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:38897491_A_T:38897491:1,3,0,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr6	38906072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	38913223	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=73,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:0,4:3,4:2,1,6,2
chr6	38942360	.	C	CAGGAGAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	38951998	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=337,95;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,9:1,13:1,0,13,9
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr6	38980261	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:7,9,1,2
chr6	38994355	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=80,159;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr6	39024156	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:1,3:3,8:3,1,9,2
chr6	39024238	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,9:1,7:0,1,7,9
chr6	39033595	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.496:26:6,7:7,5:0|1:39033595_G_A:39033595:6,7,7,6
chr6	39033602	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,26:0.933:27:1,12:0,13:0|1:39033595_G_A:39033595:0,1,13,13
chr6	39034084	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=172,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:2,7,1,1
chr6	39040654	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr6	39041502	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr6	39046644	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr6	39046655	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,1:1,2:1,1,3,2
chr6	39077192	.	T	TTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	39161977	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=88,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:20,0:17,6:20,17,0,6
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	39272420	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.231:28:8,0:14,6:9,13,0,6
chr6	39281850	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr6	39284801	.	A	ACTCTAGTGAAAGGGACAGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	39290284	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39290284_A_T:39290284:0,1,0,1
chr6	39290288	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,21;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39290284_A_T:39290284:0,1,0,1
chr6	39290289	.	A	AAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39290284_A_T:39290284:0,1,0,1
chr6	39313578	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=114,61;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,0:6,3:2,11,0,4
chr6	39314427	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	39325034	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=44564442,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,8:2,8:1,1,10,6
chr6	39353295	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	39399031	.	C	CAGCTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	39554281	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	39838258	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr6	39839461	.	T	TTCCACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=116,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39839461_T_TTCCACAC:39839461:0,1,0,1
chr6	39839462	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=116,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39839461_T_TTCCACAC:39839461:0,1,0,1
chr6	39841076	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,184;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:12,0:9,14:11,10,0,14
chr6	39843270	.	GT	CC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=121,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:5,6,1,1
chr6	39851679	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr6	39868083	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39868083_A_ATT:39868083:0,1,0,1
chr6	39868084	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39868083_A_ATT:39868083:0,1,0,1
chr6	39869787	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:5,8,2,1
chr6	39873584	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:7,2:18,0:4,23,0,2
chr6	40399446	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	40400868	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:0,4:2,6:0|1:40400868_C_T:40400868:0,2,1,10
chr6	40400877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:0|1:40400868_C_T:40400868:0,2,0,8
chr6	41021156	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr6	41029088	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,0:14,2:0|1:41029088_C_T:41029088:17,15,1,1
chr6	41029097	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,0:15,2:0|1:41029088_C_T:41029088:14,17,1,1
chr6	41029117	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=133,238;MMQ=60,26;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,3:13,0:13,13,3,0
chr6	41035009	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:7,2,2,0
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	41117718	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	41128974	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=265,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr6	41129340	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:11,0:3,2:7,7,2,1
chr6	41162170	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,0:13,4:17,9,4,0
chr6	41165979	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,104;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,2:13,1:11,15,1,2
chr6	41166078	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.236:32:11,1:13,6:12,13,5,2
chr6	41169021	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,7,2
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,7,4
chr6	41196156	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,12,3
chr6	41196605	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,51;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr6	41196727	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,6:0,16:0,0,11,12
chr6	41197434	.	TG	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:5,8,0,2
chr6	41248646	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,83;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,2:14,0:14,4,2,0
chr6	41248937	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:41248937_A_G:41248937:0,0,0,1
chr6	41248939	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:41248937_A_G:41248937:0,1,0,1
chr6	41248942	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41248937_A_G:41248937:0,1,0,1
chr6	41248950	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41248937_A_G:41248937:1,2,0,1
chr6	41248954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41248937_A_G:41248937:1,2,0,1
chr6	41250443	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:10,0:14,2:4,20,2,0
chr6	41309552	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.853:8:0,2:0,5:0,1,4,3
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:1,0,9,7
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	41533797	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41533797_C_T:41533797:0,2,0,1
chr6	41533802	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41533797_C_T:41533797:0,2,0,1
chr6	41538084	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=111,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:15,0:15,5:14,17,0,6
chr6	41554993	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	41562530	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	41617327	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=72,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:7,6,2,0
chr6	41652604	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,13:0,4:0,0,13,5
chr6	41655005	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	41658524	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:1,8,2,0
chr6	41705398	.	ATTTCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	41721682	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,13,8
chr6	41740483	.	C	CGTGTGTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,22;RU=GT;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.854:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	41752840	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:11,0:20,3:5,26,0,3
chr6	41754370	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	41754415	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,13,16
chr6	41774122	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	41774781	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=168,133;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:41774781_G_A:41774781:1,8,0,2
chr6	41774783	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=168,133;MMQ=60,52;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:41774781_G_A:41774781:1,8,0,2
chr6	41774811	.	T	TATGAGGTCAGCATTAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:41774811_T_TATGAGGTCAGCATTAC:41774811:1,2,0,1
chr6	41774815	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41774811_T_TATGAGGTCAGCATTAC:41774811:1,2,0,1
chr6	41903782	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=260,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.916:14:0,5:0,8:1,0,1,12
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr6	42025058	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr6	42025386	.	AT	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	42036395	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=358,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	42045171	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr6	42075377	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr6	42110263	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr6	42123317	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:5,4,3,1
chr6	42147102	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:8,2:8,9,2,1
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	42156448	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=85,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:8,4,0,3
chr6	42162388	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr6	42162451	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=162,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.405:25:6,0:9,10:0|1:42162451_T_C:42162451:7,8,0,10
chr6	42162456	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,38;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.437:23:4,0:7,10:0|1:42162451_T_C:42162451:6,7,0,10
chr6	42162457	.	G	GTCTTGGAGCTCTTCTCCAACAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=176,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.455:22:5,0:7,1:0|1:42162451_T_C:42162451:5,7,0,10
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	42175927	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.725:5:1,2:0,2:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,1,0,4
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,0,0,6
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,9,16
chr6	42182183	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	42196501	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=189,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:42196501_T_G:42196501:0,4,0,1
chr6	42196503	.	A	AGGTAAGCCGAGATTGCGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=189,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:42196501_T_G:42196501:0,4,0,1
chr6	42210936	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:6,3:7,2:0|1:42210936_T_TG:42210936:14,1,5,0
chr6	42210951	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:9,5:8,2:0|1:42210936_T_TG:42210936:14,3,6,1
chr6	42211054	.	A	ATAGGAGAGGTATGGGAG	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:14,2:15,0:0|1:42211054_A_ATAGGAGAGGTATGGGAG:42211054:15,14,1,1
chr6	42211055	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:14,1:15,0:0|1:42211054_A_ATAGGAGAGGTATGGGAG:42211054:15,14,1,1
chr6	42211098	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,2:9,0:0|1:42211098_A_AT:42211098:2,13,1,1
chr6	42211100	.	C	CTGGAACATAGAG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,2:9,0:0|1:42211098_A_AT:42211098:2,13,1,1
chr6	42222774	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:1,0:1,1:0|1:42222774_G_T:42222774:0,2,0,1
chr6	42222777	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.525:2:0,0:0,1:0|1:42222774_G_T:42222774:0,1,0,1
chr6	42235997	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=109,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:8,13:3,0:9,3,13,0
chr6	42532102	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.269:46:17,7:17,5:15,19,3,9
chr6	42541742	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=205,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42541742_T_TG:42541742:0,4,0,1
chr6	42541745	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=205,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:42541742_T_TG:42541742:0,4,0,1
chr6	42541791	.	C	CCCATCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=194,255;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	42600393	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=92,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:9,0:23,4:21,11,2,2
chr6	42600674	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.441:12:3,2:2,3:0|1:42600674_CT_C:42600674:1,6,1,4
chr6	42600698	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.519:10:3,1:2,2:0|1:42600674_CT_C:42600674:0,5,1,4
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=171,185;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr6	42611872	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr6	42613379	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,6:0,2,1,10
chr6	42618207	.	TAGAGTTTGGTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr6	42625963	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:10,0:8,3:15,6,3,0
chr6	42626341	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:10,4:6,1:13,3,4,1
chr6	42626564	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,22,25;MFRL=211,118,112;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,21;RU=A;STR;TLOD=6.40,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,5:0.330,0.467:10:1,0,1:0,2,3:0,1,2,7
chr6	42627434	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:23,3:16,2:26,15,3,2
chr6	42627459	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,4:17,0:18,17,3,1
chr6	42638354	.	TACATA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATA;STR;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.650:15:4,7:0,3:3,2,7,3
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:8,0:0,3:1,7,0,3
chr6	42644623	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=95,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:5,3:9,4:7,8,2,5
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=43,32;MFRL=73,140;MMQ=49,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:1,7:0,13:0|1:42650766_G_GT:42650766:1,0,16,5
chr6	42650775	.	CC	TT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,37;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:8,2:13,0:1|0:42650766_G_GT:42650766:17,5,1,1
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,4,6
chr6	42658752	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.912:20:1,13:0,6:1,0,11,8
chr6	42666293	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	42672416	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,4:0,3,3,3
chr6	42832779	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,2,0
chr6	42848711	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:42848711_G_C:42848711:8,15,1,1
chr6	42848719	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:42848711_G_C:42848711:7,15,1,1
chr6	42848721	.	A	ATC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=87,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:42848711_G_C:42848711:5,15,1,1
chr6	42848723	.	GA	TC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=87,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:0|1:42848711_G_C:42848711:5,15,1,1
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	42892031	.	GGT	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=129,35;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,1:10,1:0|1:42892031_GGT_G:42892031:5,12,1,1
chr6	42892035	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=129,35;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:8,1:0|1:42892031_GGT_G:42892031:5,12,1,1
chr6	42892039	.	ATAAGAG	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=129,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:8,0:0|1:42892031_GGT_G:42892031:4,13,1,1
chr6	42893318	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.195:34:13,0:13,6:8,20,0,6
chr6	42897357	.	TTGCTGC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TGC;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,0:2,2:6,3,2,0
chr6	42930651	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42930651_C_A:42930651:1,3,0,1
chr6	42930652	.	C	CGTTGGAATCTTAACATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42930651_C_A:42930651:1,3,0,1
chr6	42931224	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=266,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.841:16:2,6:0,8:1,1,5,9
chr6	42931242	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:6,9,1,2
chr6	42931261	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=157,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,7:2,6:2,3,7,6
chr6	42932200	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,3:3,8:0|1:42932200_G_T:42932200:2,4,5,6
chr6	42932202	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,2:3,7:0|1:42932200_G_T:42932200:2,4,5,6
chr6	42932715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,4,3
chr6	42934461	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,14:0.285:50:17,0:18,13:6,30,0,14
chr6	42934462	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=135,135;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.115:51:14,0:24,5:7,39,0,5
chr6	42934500	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=75,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.836:16:0,3:2,11:1,1,4,10
chr6	42934620	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	42935998	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=72,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,28:0.789:35:4,13:3,14:4,3,11,17
chr6	42937805	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42937805_G_A:42937805:2,1,0,1
chr6	42937807	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42937805_G_A:42937805:2,1,0,1
chr6	42942779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr6	42957460	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0|1:42957460_C_G:42957460:4,4,0,2
chr6	42957461	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,2:4,0:0|1:42957460_C_G:42957460:4,6,0,2
chr6	42957464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:4,0:0|1:42957460_C_G:42957460:4,6,0,2
chr6	42957517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr6	42974218	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.200:22:10,0:2,0:0|1:42974218_G_C:42974218:7,11,4,0
chr6	42974223	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,18;MFRL=112,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.184:24:8,2:3,0:0|1:42974218_G_C:42974218:9,11,4,0
chr6	42974229	.	AG	CC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.163:27:8,1:6,1:0|1:42974218_G_C:42974218:12,11,4,0
chr6	42974235	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=104,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.152:22:8,1:8,0:0|1:42974218_G_C:42974218:9,10,3,0
chr6	42975898	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=102,55;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:16,6:12,0:15,13,6,0
chr6	42977212	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=93,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.372:16:4,2:0,0:3,7,1,5
chr6	42981481	.	TACCCGCCCCCTTCTCCCCTCTCCTAGAGGACCCCCTCTGTACCGCCTGACAGATGCCTTTCAGGCCCCATGGGCTCCCCTCAAATGGCCCCAGCTGCAGCGTCCCCC	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.079:52:13,0:9,3:12,37,1,2
chr6	43006739	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:5,2:1,1:2,4,0,4
chr6	43014298	.	TT	CC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=136.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,21:0,10:0,0,16,15
chr6	43017397	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.259:13:6,3:4,0:4,6,1,2
chr6	43020577	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=295,38;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr6	43021958	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=208,187;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,3:1,0:6,0,3,0
chr6	43021976	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=227,187;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=G;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.514:8:3,4:0,0:3,1,4,0
chr6	43033265	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr6	43034839	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=30,9;MFRL=64,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,1:8,0:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,14,10,0
chr6	43034844	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=64,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:5,2:8,2:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,15,9,0
chr6	43034849	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=25,31;MFRL=64,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:5,6:9,2:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,15,9,0
chr6	43034851	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=32,12;MFRL=80,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:6,3:9,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:1,16,9,0
chr6	43034856	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=80,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:6,3:10,2:0|1:43034839_T_TG:43034839:1,16,9,0
chr6	43034858	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=81,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:6,3:10,2:0|1:43034839_T_TG:43034839:1,15,9,0
chr6	43034860	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=30,24;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,4:0.184:25:9,0:8,4:1|0:43034839_T_TG:43034839:10,11,0,4
chr6	43034865	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=23,24;MFRL=80,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:8,3:11,2:0|1:43034839_T_TG:43034839:2,19,7,0
chr6	43034868	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=23,21;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,0:7,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:3,14,6,0
chr6	43038375	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=185,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:7,3:8,2,2,1
chr6	43097099	.	G	GCACAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	43098419	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:43098419_G_GA:43098419:0,7,0,2
chr6	43098422	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:43098419_G_GA:43098419:0,7,0,2
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:3,3:3,4:1,5,0,8
chr6	43113269	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43143496	.	C	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=90,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:25,3:35,0:28,33,3,0
chr6	43146272	.	TACAC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AC;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:5,0:8,2:6,9,1,1
chr6	43155162	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,3:5,0:0,18,2,1
chr6	43164612	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=426,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:43164612_G_GA:43164612:1,1,0,1
chr6	43164614	.	G	GACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=426,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:43164612_G_GA:43164612:1,1,0,1
chr6	43164616	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=426,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:43164612_G_GA:43164612:1,1,0,1
chr6	43164620	.	G	GCGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:43164612_G_GA:43164612:0,0,0,1
chr6	43166665	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=200,193;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:43166665_C_G:43166665:1,3,0,1
chr6	43166672	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=174,193;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:43166665_C_G:43166665:1,2,0,1
chr6	43166677	.	CT	TT,C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,31,22;MFRL=110,193,264;MMQ=60,40,50;MPOS=30,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.222,0.473:4:1,0,0:0,1,1:1,0,0,3
chr6	43166685	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=192,193;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:43166665_C_G:43166665:1,3,0,1
chr6	43167869	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,0:6,4:4,12,3,1
chr6	43168486	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,3:2,0:5,6,3,0
chr6	43221102	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:14,4:14,0:15,13,4,0
chr6	43221264	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=288,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,1,3
chr6	43221320	.	C	CAATAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=85,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr6	43222839	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:11,15,3,0
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43250479	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:25,0:8,4:17,16,2,2
chr6	43250672	.	AAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGATGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGG	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.124:37:3,5:2,5:14,11,8,4
chr6	43267052	.	TCTGGAGAGGAGGAGCTGGTGCCTG	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.102:28:10,2:2,0:12,14,1,1
chr6	43267499	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:15,8,1,1
chr6	43267631	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:22,0:16,3:18,20,0,3
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr6	43270097	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,2,14
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,2:0,8:1,1,7,3
chr6	43273604	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr6	43276390	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr6	43307892	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,125;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,4:10,0:6,9,4,0
chr6	43308726	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=85,309;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:2,1:0|1:43308726_CTT_C:43308726:1,3,0,1
chr6	43308731	.	CAGT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=85,309;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43308726_CTT_C:43308726:1,3,0,1
chr6	43308735	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=85,309;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43308726_CTT_C:43308726:1,3,0,1
chr6	43322602	.	T	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.118:57:24,0:25,6:30,21,0,6
chr6	43325417	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,12,16
chr6	43400889	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:12,12,2,0
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.814:12:1,5:0,5:0,2,4,6
chr6	43403491	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.110:57:19,5:29,0:25,26,6,0
chr6	43411874	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr6	43412914	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:17,2:0|1:43412914_C_T:43412914:13,16,1,1
chr6	43412920	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:17,2:0|1:43412914_C_T:43412914:16,17,1,1
chr6	43412921	.	T	TC	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:18,2:0|1:43412914_C_T:43412914:16,17,1,1
chr6	43412922	.	A	AACATGGG	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:18,1:0|1:43412914_C_T:43412914:16,17,1,1
chr6	43413255	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43413255_T_A:43413255:0,0,1,0
chr6	43413263	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43413255_T_A:43413255:0,1,1,0
chr6	43413267	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43413255_T_A:43413255:0,1,1,0
chr6	43413281	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,0:1,2,2,0
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	43416634	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:6,1:5,1:8,5,0,2
chr6	43468393	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,160;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.346:50:5,17:28,0:29,4,17,0
chr6	43469445	.	GACACACACAC	G	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=113,164;MMQ=46,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=26,21;RU=AC;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.340:12:4,0:0,2:0,9,0,3
chr6	43469519	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,163;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:1,2,1,7
chr6	43472546	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,322;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:13,6,4,0
chr6	43472877	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=146,1285;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:4,0:10,8:7,9,4,4
chr6	43476632	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,1:14,3:5,17,0,4
chr6	43480395	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=225,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,2,3
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr6	43496039	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=71,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:43496039_A_G:43496039:1,2,0,1
chr6	43496042	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=71,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43496039_A_G:43496039:1,2,0,1
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr6	43517640	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:14,8,1,1
chr6	43521261	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,6282945;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:3,1:3,1:0|1:43521261_CAT_C:43521261:0,6,0,2
chr6	43521263	.	TACACACAC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,7;RU=AC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.331:4:1,1:1,0:1|0:43521261_CAT_C:43521261:0,3,0,1
chr6	43533305	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr6	43535076	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=83,35;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:8,1:10,3:4,14,1,3
chr6	43538501	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:1,1:5,1,2,0
chr6	43571677	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=89,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:20,3:10,0:19,11,1,2
chr6	43591762	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,3:10,0:13,11,3,0
chr6	43592551	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:4,3,2,0
chr6	43593037	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,0:6,2:9,1,2,0
chr6	43594565	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=124,138,131;MMQ=60,60,60;MPOS=25,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.93,8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,6,5:0.246,0.220:25:4,2,3:8,4,2:11,3,11,0
chr6	43608326	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43608326_CG_C:43608326:0,1,0,1
chr6	43608328	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43608326_CG_C:43608326:0,1,0,1
chr6	43624275	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,3:12,0:13,5,4,0
chr6	43745107	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr6	43745425	.	G	GTATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=183,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.385:6:2,0:2,2:0|1:43745425_G_GTATT:43745425:0,4,1,1
chr6	43745426	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=183,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.385:6:2,0:2,2:0|1:43745425_G_GTATT:43745425:0,4,1,1
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,32:0.892:35:3,19:0,12:1,2,19,13
chr6	43748384	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:43748384_T_TC:43748384:0,0,1,0
chr6	43748391	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43748384_T_TC:43748384:0,0,1,0
chr6	43748394	.	CT	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43748384_T_TC:43748384:0,0,1,0
chr6	43748400	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43748384_T_TC:43748384:0,0,1,0
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	43749652	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=113,92;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:9,3:3,0:10,2,2,1
chr6	44081957	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	44084234	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,1:10,2:14,11,3,0
chr6	44103129	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,113;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:4,9,0,2
chr6	44107269	.	TCA	T	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:13,0:20,1:0|1:44107269_TCA_T:44107269:19,20,1,1
chr6	44107273	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,0:18,2:0|1:44107269_TCA_T:44107269:14,18,1,1
chr6	44107277	.	CT	AG	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,0:16,2:0|1:44107269_TCA_T:44107269:13,19,1,1
chr6	44107282	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:16,2:0|1:44107269_TCA_T:44107269:14,19,1,1
chr6	44107283	.	GTGGTT	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:17,2:0|1:44107269_TCA_T:44107269:14,19,1,1
chr6	44114653	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,2:8,2:5,12,2,2
chr6	44115264	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,0:9,3:7,6,1,2
chr6	44119592	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:14,9:13,1:15,13,10,0
chr6	44122245	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0|1:44122245_C_CCT:44122245:1,1,0,1
chr6	44122247	.	TAGTC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44122245_C_CCT:44122245:1,1,0,1
chr6	44143930	.	A	AGGAGGAGAACGTCTCCCTGACC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGAGGAGAACGTCTCCCTGACC;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.647:4:0,0:0,3:0,1,1,2
chr6	44144341	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,0:12,4:13,8,0,4
chr6	44144669	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=68,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:5,0:10,3:0|1:44144669_C_A:44144669:7,8,2,1
chr6	44144682	.	A	ACTTCTCCAGGCTCACAGCTTCTCCCCTATCCTTCCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,0:10,3:0|1:44144669_C_A:44144669:6,7,2,1
chr6	44145180	.	C	CCTGCCTTTGTCTTTGAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44145180_C_CCTGCCTTTGTCTTTGAT:44145180:2,2,0,1
chr6	44145181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1|0:44145180_C_CCTGCCTTTGTCTTTGAT:44145180:1,2,1,1
chr6	44147674	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,2:9,0:9,7,3,0
chr6	44148137	.	C	CCCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.373:8:1,1:3,2:0|1:44148137_C_CCCA:44148137:0,5,3,0
chr6	44148138	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.335:9:1,0:3,1:0|1:44148137_C_CCCA:44148137:1,5,3,0
chr6	44149162	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44149162_C_T:44149162:1,2,0,1
chr6	44149167	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44149162_C_T:44149162:1,2,0,1
chr6	44149169	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44149162_C_T:44149162:1,2,0,1
chr6	44151741	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,3,0,1
chr6	44151745	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,3,0,1
chr6	44151747	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,3,0,1
chr6	44151749	.	T	TCTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,2,0,1
chr6	44151752	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,2,0,1
chr6	44151757	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44151741_GC_G:44151741:0,2,0,1
chr6	44216544	.	GT	G,GTT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=20,30,32;MFRL=99,126,197;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=14.96,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,10,3:0.252,0.095:40:15,5,2:11,4,1:10,17,2,11
chr6	44217374	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.294:41:11,8:18,4:15,14,4,8
chr6	44218035	.	A	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,8:0.131:63:20,7:33,0:48,7,8,0
chr6	44218120	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=85,142;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,9:0.136:71:34,2:26,7:28,34,5,4
chr6	44222747	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:9,0:11,4:7,13,2,2
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:9,0:5,3:11,3,4,0
chr6	44232639	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	44232948	.	G	GTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.241:12:5,0:4,2:3,7,1,1
chr6	44243117	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr6	44247951	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr6	44269193	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr6	44270150	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,2:6,0:0|1:44270150_T_C:44270150:15,5,1,1
chr6	44270156	.	A	AAG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,1:8,0:0|1:44270150_T_C:44270150:15,8,1,1
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=356,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,5:0,1,8,3
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr6	44271174	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.219:23:5,2:8,0:9,9,1,4
chr6	44271182	.	G	GTCAATAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,2:5,0:0|1:44271182_G_GTCAATAAA:44271182:8,10,1,1
chr6	44271183	.	G	GCAGCTTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:6,0:0|1:44271182_G_GTCAATAAA:44271182:6,10,1,1
chr6	44272862	.	T	TCTCAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=77,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.362:6:4,1:0,0:0|1:44272862_T_TCTCAA:44272862:2,2,1,1
chr6	44272863	.	G	GGTTCCAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=77,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:4,1:0,0:0|1:44272862_T_TCTCAA:44272862:2,2,1,1
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,10:0,0,15,13
chr6	44274178	.	CTCTCTCCACAACTCTCCCATCAACCCCTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:6,2:11,0:11,16,1,1
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr6	44279279	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,0:8,2:7,11,0,2
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	44357975	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:19,6:18,0:27,10,6,0
chr6	44361393	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:44361393_C_T:44361393:2,1,0,1
chr6	44361395	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:2,1:0|1:44361393_C_T:44361393:2,1,0,1
chr6	44361407	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,94;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr6	44364150	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=116,174;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:6,3:16,0:12,10,3,0
chr6	44364158	.	AAACAATTGGAAGAAGCAAGGTATGTGTGGATATAGGAATAAAAAGCAAAGTGTTTTTCTCACAT	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.103:28:7,0:11,2:10,16,1,1
chr6	44387369	.	A	AAAATCCTCCTATCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr6	45296618	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr6	45399612	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=119,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:15,0:22,3:19,18,3,0
chr6	45459674	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.214:40:20,0:10,8:0|1:45459674_C_T:45459674:21,11,0,8
chr6	45459684	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,8:0.184:47:24,0:13,8:0|1:45459674_C_T:45459674:22,17,0,8
chr6	45479966	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:5,6:12,0:14,3,6,0
chr6	45513104	.	T	TGGACAGTGTTTGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=85114420,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45513104_T_TGGACAGTGTTTGAG:45513104:0,1,0,1
chr6	45513106	.	A	AGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=85114420,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45513104_T_TGGACAGTGTTTGAG:45513104:0,1,0,1
chr6	45870999	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:2,9:3,2:1,4,1,10
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr6	46128967	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	46129345	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=97,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:1,11:3,4:2,2,9,6
chr6	46133314	.	A	AAGGAGGCCTGCTCTTTTCCGCAGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr6	46521444	.	G	GTTACCGGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:2,0:8,2:0|1:46521444_G_GTTACCGGT:46521444:8,2,1,1
chr6	46521447	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:46521444_G_GTTACCGGT:46521444:8,2,1,1
chr6	46554918	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.231:20:8,1:8,2:4,12,0,4
chr6	46593199	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:46593199_T_A:46593199:10,9,1,1
chr6	46593207	.	A	AGATT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=106,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,0:12,2:0|1:46593199_T_A:46593199:10,9,1,1
chr6	46620083	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,120;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr6	46636556	.	GT	G,GTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,30,33;MFRL=64,133,0;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.61,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,6,3:0.247,0.159:25:8,4,1:7,1,2:8,8,1,8
chr6	46644402	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,33;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:8,0:7,2:0|1:46644402_C_T:46644402:6,9,1,1
chr6	46644411	.	C	CAGTATGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,33;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:7,2:0|1:46644402_C_T:46644402:6,12,1,1
chr6	46644412	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:0|1:46644402_C_T:46644402:6,12,1,1
chr6	46649231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr6	46655903	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	46657057	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr6	46657579	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=116,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:13,2:9,0:0|1:46657579_C_CA:46657579:11,13,1,1
chr6	46657580	.	G	GCACATCACTAATGTCCCTCACC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:15,2:8,0:0|1:46657579_C_CA:46657579:11,13,1,1
chr6	46657971	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:0|1:46657971_G_A:46657971:8,8,1,1
chr6	46657975	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:46657971_G_A:46657971:7,8,1,1
chr6	46661937	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,174;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr6	46672203	.	TCTCTCTCTCTCTCACA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=163,278;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr6	46672452	.	TAATC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr6	46679303	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:1,8:3,11:0,4,8,11
chr6	46679431	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr6	46684801	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:17,0:17,2:0|1:46684801_C_G:46684801:14,21,1,1
chr6	46684809	.	A	AACTGCAGCCATG	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:16,0:17,2:0|1:46684801_C_G:46684801:14,21,1,1
chr6	46726441	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=90,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,1:2,5:1,1,6,0
chr6	46766467	.	GG	CC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	46787466	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=128,90;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:4,7,0,3
chr6	46793175	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:12,3:6,1:10,8,3,1
chr6	46797329	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.208:31:12,2:13,4:15,10,2,4
chr6	46802370	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr6	46802901	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,9:1,4:2,0,11,2
chr6	46803345	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,198;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,18:0,0,22,17
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr6	46826508	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr6	46826715	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr6	46826910	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	46832710	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	46836685	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=119,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,3:11,0:11,11,0,3
chr6	46856100	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,13:0,0,14,7
chr6	46856263	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:4,3:1,10,1,4
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,15,9
chr6	46867898	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=149,35;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	46988446	.	T	TTGAGCTAATTAAATGTGTTTTAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=112,97488734;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:11,12,2,0
chr6	47253631	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=98,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:2,0:1,2,3,0
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,4:0,0,6,7
chr6	47522357	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr6	47548672	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	47549629	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr6	47549883	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	47567180	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,4:14,0:15,17,4,0
chr6	47567210	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.286:25:9,4:9,3:5,13,2,5
chr6	47574097	.	T	TTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=162,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	47577064	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	47591856	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	47624299	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	47626998	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=267,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	47646842	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr6	47649573	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,4,7
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	47653851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr6	47654817	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr6	47654831	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,4:0,6:0,1,0,10
chr6	47654864	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr6	47676033	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,2:2,0:3,7,2,0
chr6	47676055	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,14,5
chr6	47678660	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:47678660_C_CT:47678660:1,6,1,1
chr6	47678664	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:4,1:3,0:0|1:47678660_C_CT:47678660:1,6,1,1
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,15,6
chr6	47685061	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.092:35:16,0:16,2:22,10,0,3
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr6	47754435	.	G	GGCCCCCCACCCACCACAT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.356:3:1,0:1,1:0|1:47754435_G_GGCCCCCCACCCACCACAT:47754435:0,2,0,1
chr6	47754437	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.356:3:1,0:1,1:0|1:47754435_G_GGCCCCCCACCCACCACAT:47754435:0,2,0,1
chr6	47754438	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:47754435_G_GGCCCCCCACCCACCACAT:47754435:0,2,0,1
chr6	47754439	.	C	CCTTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47754435_G_GGCCCCCCACCCACCACAT:47754435:0,2,0,1
chr6	47754440	.	A	ACTACATTGCCCAGGCTGATCTTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:47754435_G_GGCCCCCCACCCACCACAT:47754435:0,2,0,1
chr6	47791616	.	GGT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:7,3:10,0:10,7,2,2
chr6	49403282	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,7,9
chr6	49409487	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	49409737	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	49412433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,8,6
chr6	49415351	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.614:9:2,5:1,1:3,0,4,2
chr6	49421241	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	49426983	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,15777305;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,0:15,2:20,10,2,0
chr6	49427207	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	49437853	.	ATT	A,AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,30,27;MFRL=167,161,128;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.91,26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,14:0.259,0.591:24:2,6,4:1,1,9:3,0,18,3
chr6	49438054	.	TG	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=146,150;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:49438054_TG_CA:49438054:0,16,0,2
chr6	49438079	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=158,148;MMQ=40,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.299:8:5,2:1,0:1|0:49438054_TG_CA:49438054:0,6,0,2
chr6	49438083	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=158,148;MMQ=40,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.299:8:5,1:1,0:1|0:49438054_TG_CA:49438054:0,6,0,2
chr6	49439805	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,13:0,20:0,0,15,18
chr6	49440614	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,14:0,22:0,0,10,27
chr6	49479775	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr6	49518599	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=192,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,8:1,6:1,2,5,9
chr6	49519169	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.867:27:3,16:0,8:1,2,12,12
chr6	49519279	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=76,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,11:1,4:2,0,9,6
chr6	49519840	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	49585721	.	T	TATC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=155,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:49585721_T_TATC:49585721:9,0,1,1
chr6	49585723	.	T	TGGAAGTAACTAACTTC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=155,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:49585721_T_TATC:49585721:9,0,1,1
chr6	49585726	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=155,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:49585721_T_TATC:49585721:9,0,1,1
chr6	49663465	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,7:0,2:4,0,9,0
chr6	49663567	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=61,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,38:0.723:52:4,21:10,17:7,7,23,15
chr6	49701624	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=135,202;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:3,3:0,12,0,3
chr6	49705182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr6	49753813	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=109,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:5,19,0,3
chr6	49986738	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr6	50016358	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,0:4,3:2,5,0,3
chr6	50681650	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:50681650_C_T:50681650:0,0,2,0
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chr6	51947259	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:51947258_T_TA:51947258:13,6,0,2
chr6	51947261	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,2:12,0:0|1:51947258_T_TA:51947258:13,8,0,2
chr6	51947263	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:0|1:51947258_T_TA:51947258:13,9,0,2
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chr6	51947273	.	GT	AG	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,22;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:10,0:0|1:51947258_T_TA:51947258:12,9,0,2
chr6	51949836	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr6	52009127	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:2,1:11,2:8,5,1,2
chr6	52101844	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=91,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:2,6,2,0
chr6	52109344	.	T	TCTATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=208,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52109344_T_TCTATC:52109344:0,1,0,1
chr6	52109346	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52109344_T_TCTATC:52109344:0,1,0,1
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chr6	52130959	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=110,62;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,4:10,0:0|1:52130955_G_A:52130955:6,11,0,4
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chr6	52329943	.	A	ACCAAGAAGTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=199,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52329939_G_GTACTA:52329939:0,1,0,1
chr6	52355206	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr6	52373116	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=82,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:52373116_G_T:52373116:12,10,1,1
chr6	52373122	.	GACAA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=82,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:52373116_G_T:52373116:11,9,1,1
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chr6	52541811	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
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chr6	52546789	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	52615532	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=113,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:10,0:4,5:2,12,0,6
chr6	52615550	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,6:0,8,0,6
chr6	52622814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:1,6,1,3
chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	52696853	.	G	GTCTATCTTTCATCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,3,6
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,7
chr6	52701143	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
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chr6	52702529	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr6	52768351	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=196,148;MMQ=42,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:2,1:13,1:15,0,2,0
chr6	52768392	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31,27;MFRL=127,135,100;MMQ=60,60,51;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=14.99,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,4:0.531,0.222:19:0,2,1:3,9,3:2,2,10,5
chr6	52843462	.	A	AGACAGCCTAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	52843477	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	52847551	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,1:2,8:1,3,0,9
chr6	52850293	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,3:15,0:12,17,3,0
chr6	52870125	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:4,13,0,2
chr6	52878654	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,9:0.117:84:27,2:30,6:38,37,6,3
chr6	52938468	.	ATTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=128,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:52938468_ATTT_A:52938468:0,1,0,1
chr6	52938485	.	A	AGAGGGGTAGAGATGGGGGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=237,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:52938468_ATTT_A:52938468:0,2,0,1
chr6	52993495	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,4:12,0:10,14,4,0
chr6	52995661	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=90,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:0|1:52995661_C_T:52995661:13,9,2,1
chr6	52995685	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:52995661_C_T:52995661:12,11,1,1
chr6	52995687	.	C	CCTGAG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:52995661_C_T:52995661:12,11,1,1
chr6	52998788	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	52998856	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	53140928	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr6	53156848	.	A	AAATAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53156848_A_AAATAG:53156848:0,0,0,1
chr6	53156852	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53156848_A_AAATAG:53156848:0,0,0,1
chr6	53159090	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:6,6:3,9:4,5,10,6
chr6	53160383	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr6	53365019	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,8:0,0,11,15
chr6	53365066	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,2:8,1:14,9,1,2
chr6	53365317	.	GG	AA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:2,2:0,5,1,1
chr6	53370648	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,3:9,0:9,13,0,3
chr6	53374130	.	TGGGCAGAGAG	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=134,281;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	53374131	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:53374131_G_A:53374131:0,3,0,1
chr6	53374133	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:2,0:0|1:53374131_G_A:53374131:0,4,0,1
chr6	53374136	.	G	GCACAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:53374131_G_A:53374131:0,3,0,1
chr6	53381023	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:9,0:19,4:8,20,1,3
chr6	53519062	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.863:12:0,4:1,7:0,1,5,6
chr6	53520077	.	A	ATATGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,2,1
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	53660164	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:0|1:53660164_G_C:53660164:3,5,1,1
chr6	53660167	.	T	TTACCTC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:53660164_G_C:53660164:3,5,1,1
chr6	53660169	.	G	GGC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:53660164_G_C:53660164:2,5,1,1
chr6	53660170	.	A	AGCTCGC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:1,0:5,1:0|1:53660164_G_C:53660164:2,5,1,1
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr6	53784275	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,1:0,1:3,0,2,1
chr6	53785373	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:14,4,0,2
chr6	53787615	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=99,138;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:2,6,1,3
chr6	53787644	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=113,138;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:0,0:5,2:0,5,0,3
chr6	53989506	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=76,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:6,1:3,1:4,5,1,1
chr6	53989526	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr6	54054837	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=95,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	54095423	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	54130829	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,25,31,20;MFRL=83,200,135,78;MMQ=60,60,60,60;MPOS=29,30,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.56,3.44,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,3,4:0.144,0.230,0.320:13:0,0,2,0:4,1,1,2:1,3,4,5
chr6	54172959	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr6	54191970	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:6,2:9,5,0,3
chr6	54214728	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=146,97;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,3:0,3,0,4
chr6	54214736	.	A	ATGCTGGGCTCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=97,97;MMQ=60,26;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.301:7:1,0:5,1:0|1:54214736_A_ATGCTGGGCTCT:54214736:0,6,0,1
chr6	54214738	.	A	ATCGCCATTTTTATGAGTAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=97,97;MMQ=60,26;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.301:7:1,0:2,1:0|1:54214736_A_ATGCTGGGCTCT:54214736:0,6,0,1
chr6	54245270	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	54245325	.	TGGGGCACACTGAGA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=84,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:2,2:10,8,1,1
chr6	54735122	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=80,205;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,5:9,0:10,8,3,2
chr6	54805568	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:23,0:19,3:0|1:54805568_C_T:54805568:26,16,2,1
chr6	54805583	.	A	AATTCCC	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:16,0:22,2:0|1:54805568_C_T:54805568:25,17,1,1
chr6	54805584	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:17,0:23,2:0|1:54805568_C_T:54805568:25,17,1,1
chr6	54805588	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:17,0:22,2:0|1:54805568_C_T:54805568:24,17,1,1
chr6	54806737	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,38;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:0|1:54806737_C_T:54806737:8,9,1,1
chr6	54806739	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=132,38;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:54806737_C_T:54806737:8,9,1,1
chr6	55142493	.	C	CAGAGTGATAGGGGATGAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=221,191;MMQ=60,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55142493_C_CAGAGTGATAGGGGATGAAT:55142493:0,1,0,1
chr6	55142497	.	AC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=221,191;MMQ=60,32;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55142493_C_CAGAGTGATAGGGGATGAAT:55142493:0,1,0,1
chr6	55266572	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:7,3,3,1
chr6	55381262	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	55620481	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=99,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.140:55:15,0:32,7:19,29,0,7
chr6	55639060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:3,13,0,3
chr6	55739553	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr6	55739711	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.322:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr6	55739746	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:7,2:2,13,0,3
chr6	55932236	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:55932236_C_T:55932236:0,2,0,1
chr6	55932238	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55932236_C_T:55932236:0,2,0,1
chr6	56029404	.	A	AGACTTGGAACCAACCCAAATGTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr6	56029597	.	AG	CC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:15,0:16,5:20,12,1,4
chr6	56044745	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,47;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:56044745_G_A:56044745:0,13,1,1
chr6	56044752	.	C	CAACATCAAACGGAATCAAGCGTAATTATCAAACGGAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,47;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:56044745_G_A:56044745:0,10,1,1
chr6	56323875	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=85,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,1:10,1:9,12,1,1
chr6	56334594	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:7,0,6,0
chr6	56350339	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	56359034	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	56362143	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr6	56376282	.	G	GTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=310,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56376282_G_GTCT:56376282:0,1,0,1
chr6	56376283	.	CAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=310,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56376282_G_GTCT:56376282:0,1,0,1
chr6	56381912	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=112,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,1,1
chr6	56425284	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	56427095	.	C	CTGAGTGTTGAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	56437562	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:14,5,2,0
chr6	56437664	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:56437664_C_T:56437664:11,12,0,2
chr6	56437689	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=98,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:11,2:0|1:56437664_C_T:56437664:15,12,0,2
chr6	56437690	.	G	GAC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=98,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:11,2:0|1:56437664_C_T:56437664:15,12,0,2
chr6	56437902	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	56462840	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=100,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,1,6
chr6	56463410	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:0|1:56463410_T_C:56463410:4,8,2,5
chr6	56463414	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=121,10191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,3:0.190:19:7,3:9,0:1|0:56463410_T_C:56463410:6,10,0,3
chr6	56464776	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=154,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	56467586	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:56467586_G_A:56467586:3,0,1,0
chr6	56467591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:56467586_G_A:56467586:3,0,1,0
chr6	56468206	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=245,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,2:0,3:0,1,2,3
chr6	56468238	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	56468537	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:1,1,1,5
chr6	56469292	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=111,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:5,5,0,2
chr6	56469411	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=81,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,0:14,3:10,11,2,1
chr6	56471544	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,4:4,0:4,4,4,0
chr6	56471571	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:3,3,3,3
chr6	56473739	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,74;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.228:23:9,4:9,0:10,8,4,1
chr6	56476262	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=175,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:3,0,7,2
chr6	56476456	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr6	56482704	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	56483614	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=98,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:8,3:8,14,1,2
chr6	56485126	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:11,0:13,9:13,11,0,9
chr6	56497718	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,0:10,6:9,6,0,6
chr6	56499136	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr6	56507135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr6	56919727	.	CTT	C,CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34,27;MFRL=173,158,168;MMQ=60,60,60;MPOS=27,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.20,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:2,0,0:0,2,1:0,2,0,4
chr6	56963903	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=96,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,1:10,2:13,9,1,2
chr6	56966921	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:56966921_G_A:56966921:0,2,0,2
chr6	56966930	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56966921_G_A:56966921:0,1,0,1
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chr6	57012240	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:9,2:2,0:0|1:57012235_T_TA:57012235:4,7,1,1
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chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,7,0,4
chr6	57467303	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	57472255	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,10:0,6:1,0,16,0
chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,20:0.368:55:15,11:11,7:30,5,14,6
chr6	57472315	.	AG	GG,GA	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=29,31,31;MFRL=126,117,97;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=49.95,68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,20,22:0.324,0.348:62:14,8,13:5,11,6:17,3,30,12
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.345:54:19,11:15,8:16,19,11,8
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.344:33:8,5:12,6:4,18,2,9
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:7,6:12,6:3,18,2,10
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:10,6:12,3:6,17,0,9
chr6	57472533	.	TT	CC,CT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,31,30;MFRL=190,114,149;MMQ=60,60,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.13,10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,5:0.438,0.375:13:0,4,4:2,2,1:0,2,1,10
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=99,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:0,4:3,0:2,1,4,0
chr6	57498905	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,5:3,0:7,1,5,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:4,6:6,5:10,1,9,2
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,4:6,6:4,12,2,8
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:3,4:3,5:5,1,9,0
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.555:45:14,13:5,12:13,7,19,6
chr6	57512565	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.509:53:12,15:14,12:15,11,13,14
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,36:0.756:47:9,18:2,18:6,5,12,24
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=36;ECNT=9;MBQ=33,24,34;MFRL=127,117,161;MMQ=60,60,60;MPOS=12,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=36.71,30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,16,9:0.447,0.263:35:9,11,2:1,5,7:7,3,8,17
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:16,1:5,5:12,10,2,5
chr6	57512775	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:6,4:1,0:0|1:57512775_T_G:57512775:0,7,2,3
chr6	57512779	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:6,4:1,1:0|1:57512775_T_G:57512775:0,7,2,3
chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=28,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,5:1,1:0|1:57512775_T_G:57512775:0,7,2,4
chr6	57512788	.	T	TTA	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.497:12:5,3:1,0:0|1:57512788_T_TTA:57512788:0,6,2,4
chr6	57512792	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=180,222;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:57512788_T_TTA:57512788:0,6,0,2
chr6	57512793	.	AATT	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=24,24;MFRL=180,222;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0|1:57512788_T_TTA:57512788:0,6,0,2
chr6	62407067	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=63,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.887:24:0,9:2,11:1,1,13,9
chr6	62604767	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr6	62604777	.	A	ACAACGTCCAGTCCAGCTTTCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	62611314	.	A	AAGACTATATCAATTCAAGAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=287,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	62611341	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62611341_A_G:62611341:0,0,0,1
chr6	62611352	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62611341_A_G:62611341:0,0,0,1
chr6	62757987	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	63921360	.	CA	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	63921688	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=99,52;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:7,0:7,5:0|1:63921688_C_T:63921688:4,10,3,2
chr6	63921697	.	C	CGG	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=99,52;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:9,3:0|1:63921688_C_T:63921688:5,10,2,1
chr6	63921699	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=99,52;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:5,0:9,3:0|1:63921688_C_T:63921688:5,10,2,1
chr6	63921701	.	TTA	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=114,52;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:4,0:9,3:0|1:63921688_C_T:63921688:7,10,2,1
chr6	63921709	.	A	AAAATTCCTTGAAGGGCAAAAC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=120,52;MMQ=58,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:9,3:0|1:63921688_C_T:63921688:5,9,2,1
chr6	63922376	.	T	TTGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,15;MFRL=137,144;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:0,1:0|1:63922376_T_TTGG:63922376:1,3,4,0
chr6	63922380	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=128,128;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:2,0:0|1:63922376_T_TTGG:63922376:1,4,3,0
chr6	63922385	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=22,30;MFRL=137,128;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:2,2:3,0:0|1:63922376_T_TTGG:63922376:1,5,3,0
chr6	63922432	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:7,10,3,0
chr6	63922500	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,18,14;MFRL=0,32,114;MMQ=60,45,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,18;RU=T;STR;TLOD=9.94,7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.471,0.471:12:0,1,1:0,2,0:0,0,3,9
chr6	63922916	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=135,116;MMQ=60,57;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,2:9,1:4,7,1,2
chr6	63923011	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	63991199	.	T	TCCCCATCTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	64288710	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	64394481	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0|1:64394481_T_C:64394481:7,3,1,1
chr6	64394484	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:10,2:0|1:64394481_T_C:64394481:7,4,1,1
chr6	64394552	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=134,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:5,9,1,1
chr6	64394567	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=83,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:10,1:8,8,0,2
chr6	64413582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr6	64422025	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,5:2,0:7,2,5,0
chr6	64472270	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=250,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr6	64776136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr6	64940522	.	G	GCCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:0,2:0|1:64940522_G_GCCC:64940522:7,4,1,1
chr6	64940524	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:11,0:0,2:0|1:64940522_G_GCCC:64940522:8,4,1,1
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chr6	66045118	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
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chr6	69785765	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	69786046	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
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chr6	70037605	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:70037596_T_A:70037596:3,0,2,0
chr6	70037631	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr6	70042782	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:13,7,2,1
chr6	70459209	.	T	TA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.192:24:8,3:11,2:13,6,4,1
chr6	70648013	.	G	GCATGTTCTCACTTAT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=84,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:14,2:11,2:9,16,0,4
chr6	70744264	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	70744280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	70778297	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:2,8:4,5:2,4,8,5
chr6	70778333	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=111,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.301:21:5,0:10,6:8,7,0,6
chr6	70812123	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr6	70840124	.	AT	A	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=110,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,13:0.265:50:20,11:14,2:23,14,5,8
chr6	70840136	.	T	G,TG	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=24,33,20;MFRL=118,166,93;MMQ=60,60,60;MPOS=13,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.83,11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,3,5:0.064,0.106:53:33,0,2:11,3,3:22,23,4,4
chr6	70840140	.	TG	CA	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.076:51:31,0:11,3:22,26,2,1
chr6	70840148	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:26,0:9,5:17,21,2,3
chr6	70840156	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=130,135;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:20,1:10,1:0|1:70840156_T_C:70840156:9,22,0,2
chr6	70840159	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=125,135;MMQ=52,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,1:7,1:0|1:70840156_T_C:70840156:5,20,0,2
chr6	70840195	.	AT	GC	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=173,125;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.208:15:6,3:5,0:0,12,0,3
chr6	70850853	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:9,0:14,6:14,9,0,6
chr6	70859982	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:70859982_C_CAT:70859982:2,4,1,1
chr6	70859984	.	G	GAGTAATCTGTTGAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:70859982_C_CAT:70859982:2,4,1,1
chr6	70860000	.	C	CAAAATACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=134,89342209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,1,0
chr6	70875976	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	70878156	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.808:19:2,8:1,8:0,3,2,14
chr6	70878164	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=138,79;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,1:10,0:0|1:70878164_C_T:70878164:1,17,1,1
chr6	70878165	.	A	ACTGTTCTCTAGGGACTTGTTATTTGATTGGAT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=138,79;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.133:21:7,1:10,0:0|1:70878164_C_T:70878164:1,18,1,1
chr6	70894894	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=257,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	70897967	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	70909252	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=75,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	70950375	.	G	GA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.195:22:8,4:8,0:13,5,4,0
chr6	70950484	.	G	GGCGAGAGACTTACAGCTAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:4,14,0,3
chr6	70964733	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:7,2:19,4:0|1:70964733_A_C:70964733:4,22,2,4
chr6	70964735	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:7,2:19,4:0|1:70964733_A_C:70964733:4,22,2,4
chr6	70964737	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:7,2:18,4:0|1:70964733_A_C:70964733:4,22,2,4
chr6	70964741	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:6,2:18,4:0|1:70964733_A_C:70964733:3,22,2,4
chr6	70964743	.	CTGTCTCTT	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:6,2:19,4:0|1:70964733_A_C:70964733:4,24,2,4
chr6	70964759	.	GT	CA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:6,1:20,2:0|1:70964733_A_C:70964733:3,23,0,4
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=97,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr6	70980186	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70980186_G_A:70980186:0,0,0,1
chr6	70980191	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70980186_G_A:70980186:0,0,0,1
chr6	70990650	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=95,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,3:14,0:17,13,0,3
chr6	71009951	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=205,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.344:14:4,2:4,3:4,5,4,1
chr6	71234822	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:8,9,1,1
chr6	71238105	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:6,5,4,3
chr6	71482975	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	71508369	.	GA	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.099:45:11,2:24,2:30,10,4,1
chr6	71666146	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr6	72809786	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	72809825	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	72889472	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=66,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,3:9,1:11,9,4,0
chr6	72889493	.	C	CTTTGT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:0|1:72889493_C_CTTTGT:72889493:10,10,1,1
chr6	72889494	.	C	CCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:10,2:10,0:0|1:72889493_C_CTTTGT:72889493:10,10,1,1
chr6	72889495	.	A	ATT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:10,2:10,0:0|1:72889493_C_CTTTGT:72889493:10,10,1,1
chr6	72945492	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	72945504	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72945504_CA_AT:72945504:0,3,0,1
chr6	72945508	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:72945504_CA_AT:72945504:0,3,0,1
chr6	72962352	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	72968609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	73332040	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	73814920	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,5:2,0:4,1,5,0
chr6	73900470	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,1,2
chr6	73902246	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=107,315;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chr6	73904104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr6	73933501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,4:9,2:6,9,2,4
chr6	73935135	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	74019376	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:5,6,1,3
chr6	74079024	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,7,4
chr6	74079041	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr6	74104199	.	CG	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=75,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:74104199_CG_TA:74104199:0,4,0,1
chr6	74104202	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=75,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:74104199_CG_TA:74104199:0,4,0,1
chr6	74104215	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74104215_T_C:74104215:0,1,0,1
chr6	74104217	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74104215_T_C:74104215:0,1,0,1
chr6	74104557	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	74104724	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:10,2:11,10,1,1
chr6	74104764	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,0:9,3:7,10,2,1
chr6	74116198	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.219:25:12,0:8,5:0|1:74116198_C_T:74116198:6,14,3,2
chr6	74116200	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=95,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.144:25:12,0:8,3:0|1:74116198_C_T:74116198:7,15,2,1
chr6	74116202	.	C	CTCCTTCAGGGATCCTGCTTCTGTTCTTGT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=95,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.150:24:11,0:8,1:0|1:74116198_C_T:74116198:6,15,2,1
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,6,18
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	74161326	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:18,2:29,1:19,28,1,2
chr6	74161330	.	T	TA	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:20,0:32,2:0|1:74161330_T_TA:74161330:22,32,1,1
chr6	74161333	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=122,93;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:20,0:35,1:0|1:74161333_T_C:74161333:24,31,0,2
chr6	74161334	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:19,0:35,2:0|1:74161330_T_TA:74161330:23,33,1,1
chr6	74161336	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=122,93;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.051:56:18,0:35,2:0|1:74161333_T_C:74161333:23,31,0,2
chr6	74171574	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.160:54:28,0:18,8:30,16,1,7
chr6	74183449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:74183449_T_C:74183449:0,3,0,1
chr6	74183451	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:74183449_T_C:74183449:0,3,0,1
chr6	74183467	.	C	CTTAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=235,129;MMQ=53,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74183467_C_CTTAA:74183467:0,1,0,1
chr6	74183469	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=235,129;MMQ=53,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74183467_C_CTTAA:74183467:0,1,0,1
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=164.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.984:56:0,30:0,26:0,0,31,25
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=162.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,26:0,0,24,24
chr6	74304833	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,0:11,2:13,11,1,1
chr6	74310231	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=165,161;MMQ=55,45;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.483:6:0,1:0,1:0,3,0,3
chr6	74320306	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=59,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:1,2,1,7
chr6	74476677	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:8,8:20,0:14,14,8,0
chr6	74481076	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	74490039	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	74493615	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	74497009	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	74497152	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr6	75795122	.	G	GCA,GCACA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,33,30;MFRL=171,135,118;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=CA;STR;TLOD=7.46,13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.287,0.501:11:0,1,2:1,2,3:0,2,1,8
chr6	75795180	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:75795180_T_C:75795180:0,4,0,1
chr6	75795182	.	T	TGGGCAGCAGAGCGAGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:75795180_T_C:75795180:0,4,0,1
chr6	75796364	.	GTATATATA	G,GTATATA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,30,14;MFRL=242,200,192;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,8,11;RU=TA;STR;TLOD=8.93,5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.399,0.301:7:0,1,0:0,1,0:0,2,0,5
chr6	75797302	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=348,90;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,12:0,8:1,0,9,11
chr6	75798722	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	75818699	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:7,3,1,1
chr6	75823512	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:9,5:3,0:0|1:75823512_G_A:75823512:0,12,0,5
chr6	75823522	.	A	AGAAAACAGGAAAGCAAGAAAGCAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:9,2:2,0:0|1:75823512_G_A:75823512:0,12,0,5
chr6	75827028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=234,866;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	75827257	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:75827257_T_A:75827257:3,11,1,1
chr6	75827262	.	CCTGCAAAGTAGCATTT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:6,2:0|1:75827257_T_A:75827257:2,14,1,1
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:1,0,5,4
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,2:1,4,2,4
chr6	75836002	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	75847361	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=10,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:75847361_A_T:75847361:0,3,0,1
chr6	75847362	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=10,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:75847361_A_T:75847361:0,3,0,1
chr6	75848157	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:4,3,1,2
chr6	75848181	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr6	75848376	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	75851748	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,0;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:5,2:5,4,0,3
chr6	75860773	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,8;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75860773_T_TGGGGGGG:75860773:0,0,1,0
chr6	75860778	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75860773_T_TGGGGGGG:75860773:0,0,1,0
chr6	75890933	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:0,3:2,2:0,3,1,4
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	75950109	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.440:9:2,2:2,2:1,4,1,3
chr6	75965723	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=235,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr6	75994443	.	TGCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	76022082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:76022082_A_G:76022082:0,0,4,0
chr6	76022090	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:76022082_A_G:76022082:0,0,5,0
chr6	76343499	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,0:10,2:0,12,0,2
chr6	76369054	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,11,14
chr6	76386712	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr6	76421003	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr6	76423317	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:12,7,3,0
chr6	76527366	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:76527366_G_A:76527366:6,11,1,1
chr6	76527372	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:76527366_G_A:76527366:3,11,1,1
chr6	76538400	.	C	CTGTTATTGATTGATTGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	76550839	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,14,6
chr6	76566734	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	76596728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr6	76599861	.	A	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=98,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,8:0.107:81:44,0:28,8:44,29,0,8
chr6	76617499	.	GTGTGTGTGTGTA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=88,160;MMQ=50,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr6	76617511	.	A	ATGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=TG;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	76624741	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr6	76713721	.	T	TCTGCAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=159,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr6	76713754	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	76715299	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:1,8,1,2
chr6	76717157	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=78,69;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,2:6,2:7,9,2,2
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=92,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,6:0,1,3,9
chr6	76734836	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	76744298	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=76,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr6	78172911	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=102,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,0:18,3:15,13,0,3
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:2,11,1,3
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:10,1:17,7:8,19,3,5
chr6	79664440	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	79672733	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr6	79692742	.	GCTTTCTTGGTTTTATTCTTAGGAA	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:16,2:18,0:15,22,1,1
chr6	79692751	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,28:0.807:34:3,13:3,15:5,1,8,20
chr6	79695003	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=58,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.676:13:2,5:2,4:4,0,9,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=100,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,2:10,1:16,4,3,0
chr6	79707923	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr6	79724731	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:79724731_T_TG:79724731:2,0,3,0
chr6	79724740	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0|1:79724731_T_TG:79724731:3,0,5,0
chr6	79727238	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,43;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:7,0:18,3:12,13,0,3
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr6	79787212	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:6,10,1,1
chr6	79787655	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=223,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,9:1,13:1,0,13,10
chr6	79911556	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79911556_T_TTTA:79911556:0,1,0,1
chr6	79911558	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:79911556_T_TTTA:79911556:0,1,0,1
chr6	79913379	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.641:22:1,3:3,1:3,5,2,12
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	80196848	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:11,2:4,1:11,5,2,1
chr6	80197032	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:80197032_T_G:80197032:4,11,2,0
chr6	80197035	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:80197032_T_G:80197032:4,11,2,0
chr6	80228673	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	80341279	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	80383541	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:80383541_C_CT:80383541:6,5,1,1
chr6	80383543	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:80383541_C_CT:80383541:6,5,1,1
chr6	80629281	.	G	GATCCAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:2,5,1,1
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr6	80657086	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	80720487	.	GCAT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=85,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:8,0:6,2:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:12,8,2,1
chr6	80720491	.	T	TAAAGA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=85,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,0:10,2:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:12,8,2,1
chr6	80723162	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr6	80724156	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,3:3,2:7,3,5,0
chr6	80747582	.	TATAATAATA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=ATA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr6	80747617	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=60,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.190:22:7,3:9,1:12,6,3,1
chr6	80750487	.	C	CATTTATAGAATCCAGAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:0|1:80750487_C_CATTTATAGAATCCAGAAA:80750487:0,3,0,1
chr6	80750491	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:80750487_C_CATTTATAGAATCCAGAAA:80750487:0,3,0,1
chr6	80750493	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=78,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80750487_C_CATTTATAGAATCCAGAAA:80750487:0,2,0,1
chr6	80750505	.	G	GGCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	80752024	.	G	GTTGTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.361:6:3,0:2,1:0|1:80752024_G_GTTGTA:80752024:0,5,0,1
chr6	80752028	.	T	TCCTTGAGGGCAAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:80752024_G_GTTGTA:80752024:0,2,0,1
chr6	80837253	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=246,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr6	80877307	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=290,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	80877371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=1670,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:4,2,2,1
chr6	80910622	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:2,1:4,3,2,0
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	80912977	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr6	82461295	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:4,1:12,1:7,9,0,2
chr6	82461727	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,2:3,1:6,6,1,2
chr6	82882973	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=150,182;MMQ=60,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.309:7:3,1:2,0:5,0,2,0
chr6	82882980	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.408:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr6	82910506	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	82921300	.	ATGTTTAAT	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:19,2:15,0:16,20,1,1
chr6	82921339	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:15,2:6,4:8,13,2,4
chr6	82922388	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:5,3,2,1
chr6	82922571	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	82933309	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=106,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:4,4:10,2:6,8,3,3
chr6	82941656	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=242,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr6	82950268	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	83075914	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr6	83075931	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:5,5,2,0
chr6	83076614	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.426:10:4,3:1,1:5,1,2,2
chr6	83079971	.	A	AATATTCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=212,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:83079971_A_AATATTCAT:83079971:1,2,0,1
chr6	83079972	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=212,124;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:83079971_A_AATATTCAT:83079971:1,2,0,1
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=121.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.970:28:0,12:0,15:0,0,9,19
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chr6	83834957	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,4,7
chr6	83835175	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	83838973	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,11:4,3:2,4,12,2
chr6	83842055	.	C	CTCT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,7,12
chr6	83842101	.	CACAA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.809:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr6	83845381	.	TCTACTAGCTCTGTGGGACAAGCCTGGCTGAACCAAGTC	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.115:34:5,1:8,2:17,14,2,1
chr6	83861930	.	TACAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,4:0,0,12,1
chr6	83863583	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr6	83877496	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=230,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:1,0,5,0
chr6	83880274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr6	83889517	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=89,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.165:19:8,0:7,3:0|1:83889517_C_T:83889517:7,9,1,2
chr6	83889535	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=89,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:9,2:0|1:83889517_C_T:83889517:7,14,1,1
chr6	83889539	.	A	AGCCTGT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=89,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:83889517_C_T:83889517:8,14,1,1
chr6	83896633	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr6	83898300	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=191,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.705:5:1,0:0,2:1,0,2,2
chr6	83933699	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=81,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:83933699_T_C:83933699:0,2,0,1
chr6	83933700	.	TTAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933699_T_C:83933699:0,1,0,1
chr6	84061770	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:16,6,3,0
chr6	84108065	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=82,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:11,4,2,1
chr6	84117633	.	AAC	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:16,1:17,2:2,32,0,3
chr6	84140501	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr6	84235194	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=114,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:84235194_A_C:84235194:9,11,0,2
chr6	84235195	.	ATTATGAATG	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=114,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:84235194_A_C:84235194:9,11,0,2
chr6	84235215	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=140,219;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:84235215_G_C:84235215:4,11,0,2
chr6	84235219	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:84235215_G_C:84235215:4,10,0,2
chr6	84235220	.	C	CCCATCT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:84235215_G_C:84235215:4,10,0,2
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	84284695	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,2:8,0:14,3,1,1
chr6	84284880	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,1,10
chr6	84290137	.	TAAAG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=49,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.792:13:1,5:1,6:2,0,8,3
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	84302757	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:11,0:20,9:8,23,0,9
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,4,8
chr6	84351013	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	84368819	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:4,2:0,1:0,4,1,2
chr6	84563432	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:0|1:84563432_A_AG:84563432:12,11,1,1
chr6	84563433	.	C	CTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:84563432_A_AG:84563432:12,11,1,1
chr6	84569518	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:6,1:8,7,1,1
chr6	84569666	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:3,2:1,0:0|1:84569666_G_C:84569666:1,3,0,2
chr6	84569668	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:1,3,0,2
chr6	84569673	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=165,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:84569666_G_C:84569666:1,3,0,1
chr6	84649701	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=146,200;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,5:5,0:14,1,5,0
chr6	84649734	.	GT	G,GTT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,31,29;MFRL=127,159,53;MMQ=60,60,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.57,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,4:0.185,0.210:18:4,0,1:5,3,2:7,4,3,4
chr6	84649818	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=90,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.255:45:20,11:14,0:9,25,11,0
chr6	84649851	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.302:41:14,12:15,0:11,18,11,1
chr6	84649994	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	84650214	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34,26;MFRL=175,136,130;MMQ=60,60,60;MPOS=15,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.50,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.235:9:3,2,0:2,0,2:4,1,3,1
chr6	84865049	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,2:16,1:21,17,1,2
chr6	84884481	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:84884481_T_C:84884481:15,4,0,2
chr6	84884483	.	A	ATTCTATTCG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:7,2:11,0:0|1:84884481_T_C:84884481:15,4,0,2
chr6	84904821	.	A	ATTCTGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:2,2:0|1:84904821_A_ATTCTGG:84904821:2,4,0,2
chr6	84904823	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:0|1:84904821_A_ATTCTGG:84904821:2,4,0,2
chr6	84911336	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr6	84911559	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:84911559_G_A:84911559:6,12,1,1
chr6	84911568	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:0|1:84911559_G_A:84911559:3,13,1,1
chr6	85473758	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=242,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,3,2
chr6	86199329	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=68,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:13,2:6,2:4,15,2,2
chr6	86217021	.	AAAT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:8,0:13,3:7,16,1,2
chr6	86239964	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:2,2:9,0:4,7,2,0
chr6	86248460	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:7,3:4,4:10,1,7,0
chr6	86282090	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr6	86282113	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:86282113_G_T:86282113:0,8,0,2
chr6	86282117	.	TG	GA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:86282113_G_T:86282113:0,8,0,2
chr6	86350208	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=115,206;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:20,0:10,4:15,16,3,1
chr6	86445472	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,3:4,2:6,5,3,2
chr6	87725084	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:0|1:87725084_G_A:87725084:11,6,2,0
chr6	87725088	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:87725084_G_A:87725084:11,6,2,0
chr6	87925826	.	GACACACACACACACACACACACACAC	G,GACAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,34,26;MFRL=188,159,196;MMQ=40,60,60;MPOS=29,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,11,13;RU=AC;STR;TLOD=7.86,4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.355,0.283:10:0,0,1:1,3,2:0,4,0,6
chr6	87953340	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.275:19:6,3:6,2:2,11,1,5
chr6	87969480	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=98,45;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.117:57:32,3:18,3:37,14,4,2
chr6	87971214	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:4,0:6,11,1,1
chr6	87994572	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.140:30:12,0:14,3:10,16,2,2
chr6	88108048	.	AGAT	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=84,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=159.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,42:0.782:53:6,23:5,19:8,3,30,12
chr6	88108183	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=166,136;MMQ=60,48;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,2:2,1:1,8,0,3
chr6	88109304	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=238,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr6	88126328	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=786,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr6	88144504	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88144504_C_CAG:88144504:0,0,1,0
chr6	88144505	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88144504_C_CAG:88144504:0,0,1,0
chr6	88173724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr6	88210467	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=86,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	88221103	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=94,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:3,3:7,1:7,3,4,0
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=212,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,1,5
chr6	88239448	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,232;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:1,2,0,4
chr6	88258362	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,1:9,2:8,13,2,1
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr6	88315741	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr6	88315804	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88315810	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88315815	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=20,30;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88315817	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88315822	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88315824	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88315804_C_T:88315804:0,1,0,1
chr6	88317292	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:1,6,0,5
chr6	88367803	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=195,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:88367803_A_T:88367803:0,2,0,1
chr6	88367807	.	G	GTTGGTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=195,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:88367803_A_T:88367803:0,2,0,1
chr6	88367809	.	C	CATTGCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=195,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:88367803_A_T:88367803:0,2,0,1
chr6	88367812	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=195,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:88367803_A_T:88367803:0,2,0,1
chr6	88763750	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:15,0:8,7:8,16,0,7
chr6	88769159	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,7:6,0:8,3,7,0
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chr6	88854365	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=115,188;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:3,6:11,0:9,5,6,0
chr6	89322487	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=115,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:22,1:15,2:19,18,2,1
chr6	89638988	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=11,17;MFRL=84,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.479:28:3,0:2,6:4,10,3,11
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	89814736	.	T	TACTGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=0,125;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTGC;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr6	89814750	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=0,125;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89814750_C_T:89814750:1,0,0,1
chr6	89814755	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:89814750_C_T:89814750:1,0,0,1
chr6	89814772	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=225,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,7:1,10:1,0,11,6
chr6	89859203	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	89891582	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr6	89895202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,1:6,2:0|1:89895202_G_A:89895202:4,8,1,2
chr6	89895207	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,1:7,1:0|1:89895202_G_A:89895202:4,8,1,2
chr6	89907793	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=87,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.166:46:16,7:23,0:18,21,7,0
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0|1:89913108_C_G:89913108:2,2,4,1
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:89913108_C_G:89913108:2,2,4,1
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,4:0,8:0,2,3,9
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,2:2,0,7,2
chr6	89975245	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	90024761	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:14,3:13,4:12,16,3,4
chr6	90039670	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr6	90039708	.	TGGCA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0|1:90039708_TGGCA_T:90039708:0,5,0,2
chr6	90039713	.	A	ATCTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:90039708_TGGCA_T:90039708:0,5,0,2
chr6	90048097	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:5,2,0,2
chr6	90276624	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr6	90312820	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:4,6,0,2
chr6	90321955	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,6:0,18:0,0,16,8
chr6	90321970	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=121,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:8,6:20,0:19,9,6,0
chr6	90326207	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=109,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:4,2,2,0
chr6	90333058	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr6	90333239	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=76,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.376:48:16,0:14,17:17,13,2,16
chr6	90333599	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,10,5
chr6	90337410	.	C	CTTCTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.223:11:4,2:5,0:0|1:90337410_C_CTTCTTT:90337410:4,5,1,1
chr6	90337411	.	G	GTGATGTTTGCATTCAACTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.223:11:4,2:5,0:0|1:90337410_C_CTTCTTT:90337410:4,5,1,1
chr6	90338816	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=63,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.723:11:0,5:3,3:2,1,7,1
chr6	90339023	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr6	90348480	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:2,2:3,10,0,2
chr6	90360623	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	90363849	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=88,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,1:7,3:16,4,3,1
chr6	90363939	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:14,7:21,0:21,14,7,0
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:0,2,3,7
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	90382150	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr6	90382449	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0|1:90382449_C_G:90382449:1,8,1,1
chr6	90382451	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=156,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,1:0|1:90382449_C_G:90382449:1,8,1,1
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	90390443	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=90,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.624:14:2,3:2,3:2,3,4,5
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chr6	90395538	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=59,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:90395534_A_AGCACGAACAAGGGGAG:90395534:2,0,1,1
chr6	90397833	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,0:10,4:6,8,0,4
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chr6	90398360	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:10,4:13,0:13,10,1,3
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chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr6	90406069	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=94,188;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:7,12:6,1:8,5,13,0
chr6	90408839	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,338;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90408839_T_G:90408839:0,0,0,1
chr6	90408841	.	A	AAGTTCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,338;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90408839_T_G:90408839:0,0,0,1
chr6	90409248	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=157,132;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,3:0|1:90409248_C_T:90409248:3,1,1,2
chr6	90409251	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,132;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:90409248_C_T:90409248:2,1,1,2
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,12:0,13:0,0,16,9
chr6	90416006	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=15818706,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	90422923	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=147,37;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:90422923_A_C:90422923:6,3,1,1
chr6	90422928	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=147,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,0:4,2:0|1:90422923_A_C:90422923:6,3,1,1
chr6	90422932	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:0|1:90422923_A_C:90422923:7,4,1,1
chr6	90422933	.	G	GGA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:90422923_A_C:90422923:7,4,1,1
chr6	90422935	.	CT	AC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:90422923_A_C:90422923:7,4,1,1
chr6	90422940	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=149,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:0|1:90422923_A_C:90422923:6,4,1,1
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr6	90432621	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=104,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:0,2:2,1:2,0,2,2
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr6	90432919	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90432919_T_G:90432919:0,1,0,1
chr6	90432921	.	A	ACCACAATGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90432919_T_G:90432919:0,1,0,1
chr6	90437541	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=52,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.213:26:14,1:6,2:0|1:90437541_AG_A:90437541:11,10,4,1
chr6	90437546	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=52,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.213:26:15,2:6,3:0|1:90437541_AG_A:90437541:11,10,4,1
chr6	90442416	.	CTG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:7,16,0,2
chr6	90442430	.	T	TGAGAAGTCA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:7,1:9,2:7,9,0,3
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=102,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:3,2:3,10:5,1,7,6
chr6	90453308	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:6,13,2,0
chr6	90453492	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:90453492_AC_A:90453492:0,0,0,4
chr6	90453503	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=165,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:90453492_AC_A:90453492:0,3,0,1
chr6	90453509	.	G	GCAATGGCAAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=185,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:90453492_AC_A:90453492:0,2,0,1
chr6	90453511	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=185,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:90453492_AC_A:90453492:0,2,0,1
chr6	90453514	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=185,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:90453492_AC_A:90453492:0,2,0,1
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	90459011	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,70;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:11,6:14,0:14,11,5,1
chr6	90461123	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:4,9:2,3:5,1,7,6
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	90472135	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,0:11,3:8,9,2,1
chr6	90481458	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=214,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:90481458_T_C:90481458:0,2,0,1
chr6	90481460	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=248,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:90481458_T_C:90481458:0,1,0,2
chr6	90500130	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=166,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr6	90503766	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:1,1:3,2:4,3,2,1
chr6	90556356	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=105,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:21,0:18,3:31,10,3,2
chr6	90556441	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=169,192;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:0,8,0,3
chr6	90556460	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=184,187;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:90556460_TTAA_T:90556460:0,4,0,1
chr6	90556464	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=184,187;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:90556460_TTAA_T:90556460:0,4,0,1
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chr6	90556475	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=196,187;MMQ=60,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:90556460_TTAA_T:90556460:0,4,0,1
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chr6	90583396	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	90642120	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:8,0,3,0
chr6	91269739	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=137,137;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.211:36:10,7:17,0:27,2,7,0
chr6	91278420	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=223,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr6	91296420	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr6	93956564	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=118,217;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:9,13,1,1
chr6	93956769	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	93964319	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:2,8:0,3:1,1,8,3
chr6	93967249	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	93973686	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,1,4
chr6	93973716	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:93973716_A_T:93973716:0,4,0,1
chr6	93973722	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:93973716_A_T:93973716:0,2,0,1
chr6	96034995	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=105,105;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:14,8:18,0:19,13,8,0
chr6	96035160	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:13,0:6,15:7,12,0,15
chr6	96035175	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,3:6,0:7,10,1,2
chr6	96054057	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:6,5,2,0
chr6	96653478	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr6	96654472	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=234,190;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:96654472_A_G:96654472:0,1,0,1
chr6	96654485	.	TGT	CAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=234,190;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:96654472_A_G:96654472:1,1,0,1
chr6	96654493	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=234,190;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:96654472_A_G:96654472:1,1,0,1
chr6	96655105	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,13,2
chr6	96655106	.	TAC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,21;MFRL=125,176;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:3,0:6,4:9,1,4,1
chr6	96656088	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,5:0,0,4,6
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=92,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.865:12:1,5:0,5:1,0,7,4
chr6	96656811	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,3:2,5:3,3,5,4
chr6	96657697	.	T	TGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:1,4,1,1
chr6	96658260	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,11,10
chr6	96658262	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,11,10
chr6	96659191	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr6	96659493	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.815:19:2,12:1,4:1,2,11,5
chr6	96659906	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,1:10,1:6,7,0,2
chr6	96660726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr6	96969917	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr6	96973363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr6	96974386	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	96974406	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=237,148;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr6	96984175	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:18,3:24,0:21,21,2,1
chr6	96999220	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	96999328	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:7,10:10,0:0|1:96999328_G_A:96999328:11,6,10,0
chr6	96999334	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:8,10:10,0:0|1:96999328_G_A:96999328:11,8,10,0
chr6	96999643	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=211,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,2,1
chr6	97058718	.	T	TGGGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:97058718_T_TGGGTGC:97058718:0,0,0,1
chr6	97058722	.	AA	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:97058718_T_TGGGTGC:97058718:0,0,0,1
chr6	97063724	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.728:13:2,5:1,4:0,3,3,7
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chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,6,15
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	99284317	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,71;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,9:0.149:65:32,0:23,9:33,23,8,1
chr6	99285558	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=93.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.960:46:1,22:0,20:0,1,17,28
chr6	99323576	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,1:0|1:99323576_T_A:99323576:5,6,1,1
chr6	99323584	.	A	ATACCTAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:2,2:0|1:99323576_T_A:99323576:5,5,1,1
chr6	99353272	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=50.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.962:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr6	99739692	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:9,0:7,11:7,9,0,11
chr6	99781218	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:10,2:7,3:11,6,4,1
chr6	99796886	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	99817419	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	99817601	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,16:0,0,8,16
chr6	99817712	.	A	AAGCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=129,21534651;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.248:9:5,1:2,1:0|1:99817712_A_AAGCC:99817712:1,6,2,0
chr6	99817713	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=129,21534651;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.248:9:5,0:2,1:0|1:99817712_A_AAGCC:99817712:1,6,2,0
chr6	99819379	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,14,11
chr6	99819482	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=148,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:11,1:4,1:1,14,0,2
chr6	99819545	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:99819545_C_CCT:99819545:0,3,0,1
chr6	99819551	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99819545_C_CCT:99819545:0,3,0,1
chr6	99819556	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	99824070	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:3,10,0,2
chr6	99825227	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,2:1,5:2,0,5,2
chr6	99825348	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=99,72;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:7,9,3,3
chr6	99841907	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:8,1,2,0
chr6	99848839	.	C	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.064:76:36,4:34,0:14,58,4,0
chr6	99849559	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=190,1110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99849559_TA_T:99849559:0,1,1,0
chr6	99849563	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=190,1110;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99849559_TA_T:99849559:0,1,1,0
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,5,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr6	99883694	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:0|1:99883694_T_C:99883694:5,3,3,1
chr6	99883704	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0|1:99883694_T_C:99883694:0,0,8,6
chr6	99883842	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,6:0,14:0,0,10,12
chr6	99924213	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	99935975	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	99951750	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	99955243	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.740:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	99991578	.	G	GCTTTCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99991578_G_GCTTTCTTTT:99991578:0,1,0,1
chr6	99991580	.	G	GAAATCCCTCTTTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0|1:99991578_G_GCTTTCTTTT:99991578:0,1,0,1
chr6	100006244	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	100016240	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr6	100056782	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,109;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	100368893	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:9,5,2,1
chr6	100838965	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	100838995	.	G	GAATAGAAACAGATTAAAATTACTCAGCTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	100841522	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,1:5,8,7,1
chr6	100841535	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:9,7:5,0:5,9,7,0
chr6	100868721	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.677:26:3,11:5,6:5,3,10,8
chr6	100868779	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=95,78;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.820:25:3,9:1,12:1,3,7,14
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=80,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:6,2:1,0:2,5,0,3
chr6	100896343	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=114,69;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.257:33:6,8:18,0:0|1:100896343_C_A:100896343:16,9,7,1
chr6	100896348	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=97,69;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:6,8:22,0:0|1:100896343_C_A:100896343:18,10,7,1
chr6	100901670	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,2:9,1:5,9,1,2
chr6	100966000	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=106,158;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:13,0:4,11:6,11,0,11
chr6	100966068	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100966068_C_T:100966068:0,0,0,1
chr6	100966070	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100966068_C_T:100966068:0,0,0,1
chr6	100988266	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=91,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.445:9:0,1:1,1:1,4,1,3
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr6	101090377	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr6	101094554	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr6	101098581	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=103,104;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr6	101100528	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr6	101109741	.	GAGT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:16,2:5,0:12,10,1,1
chr6	101163293	.	CTAAAAGCAGATAAATAAGTG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,44;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,2:7,0:11,8,1,1
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	101173462	.	C	CCCACTATCCTGTCTTATTTTCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:9,3,1,1
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.935:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr6	101248173	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr6	101296585	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=216,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr6	101296587	.	T	TGCAGACTTCAGTGTGGCTTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=216,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:101296587_T_TGCAGACTTCAGTGTGGCTTG:101296587:0,3,0,1
chr6	101296591	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=216,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:101296587_T_TGCAGACTTCAGTGTGGCTTG:101296587:0,3,0,1
chr6	101296606	.	GTATTA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=247,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101296606_GTATTA_G:101296606:0,1,0,1
chr6	101296613	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=247,216;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101296606_GTATTA_G:101296606:0,1,0,1
chr6	101311908	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=116,112;MMQ=59,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,2,2
chr6	101312104	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,2,2
chr6	101315924	.	A	ACACAGACATGACACAAACACAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,2:6,0:3,4,1,1
chr6	101315938	.	T	TCCTGTTCGGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:101315938_T_TCCTGTTCGGG:101315938:2,5,1,1
chr6	101315939	.	A	ACAAGTCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:101315938_T_TCCTGTTCGGG:101315938:2,5,1,1
chr6	102124470	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,189;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.370:18:4,4:7,2:10,2,6,0
chr6	102130410	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.215:19:5,2:10,1:11,4,2,2
chr6	102247435	.	ACCTC	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=158,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.278:9:3,0:3,2:0|1:102247435_ACCTC_A:102247435:7,0,1,1
chr6	102247441	.	TCCC	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=158,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:102247435_ACCTC_A:102247435:7,0,1,1
chr6	102247448	.	TCCTCCTTGCAAACCATCTAC	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:4,2:0|1:102247435_ACCTC_A:102247435:13,0,1,1
chr6	102247472	.	AAGTTC	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:102247435_ACCTC_A:102247435:10,1,1,1
chr6	102247479	.	ACAAGTTATATTGACTATAAAT	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=103,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.118:24:6,0:4,2:0|1:102247435_ACCTC_A:102247435:15,7,1,1
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	102376517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,3:1,1:3,4,1,3
chr6	105192107	.	TAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,3:8,2:5,9,0,5
chr6	105198124	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=184,231;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr6	105219748	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.660:16:0,4:3,6:0|1:105219748_G_GA:105219748:4,1,9,2
chr6	105219773	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,8:0.280:29:7,1:13,6:1|0:105219748_G_GA:105219748:15,6,6,2
chr6	105224854	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:6,0:10,3:0|1:105224854_C_T:105224854:12,4,2,1
chr6	105224862	.	TCTA	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,2:0.110:25:7,0:14,2:1|0:105224854_C_T:105224854:16,7,1,1
chr6	105232204	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr6	105232233	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr6	105244526	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr6	105281117	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr6	105300103	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr6	105300250	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.785:12:2,5:0,5:0|1:105300250_A_G:105300250:0,2,5,5
chr6	105300262	.	C	CAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.200:13:4,2:7,0:1|0:105300250_A_G:105300250:5,6,0,2
chr6	105307378	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr6	105388405	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	105405238	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:105405238_A_C:105405238:0,2,0,1
chr6	105405243	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:105405238_A_C:105405238:0,2,0,1
chr6	105474289	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=94,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.203:31:11,0:13,5:13,12,0,6
chr6	105526598	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:14,12,1,1
chr6	105549042	.	T	TTCCTTCTTCTTC	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.073:38:13,0:22,2:0|1:105549042_T_TTCCTTCTTCTTC:105549042:23,13,1,1
chr6	105549043	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:22,1:0|1:105549042_T_TTCCTTCTTCTTC:105549042:23,13,1,1
chr6	105564475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=181,4106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0,0,11,5
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr6	105607757	.	GGT	ATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	105776792	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.254:29:11,2:11,5:12,10,4,3
chr6	106534484	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:6,6:7,1:5,11,0,7
chr6	106967635	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=83,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,0:12,3:11,15,0,3
chr6	106967831	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=90,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.254:49:22,6:15,6:20,17,5,7
chr6	106967945	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,0:9,7:6,8,0,7
chr6	106968253	.	CC	TT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:18,0:29,2:30,19,1,1
chr6	106978193	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,4:2,4:2,7,3,5
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=111.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,21:0,0,15,25
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:9,5,1,1
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,13:0,0,15,4
chr6	107069451	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	107096853	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr6	107097067	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=85,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:0|1:107097067_C_T:107097067:5,16,1,1
chr6	107097071	.	C	CTCACCA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=84,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:8,2:0|1:107097067_C_T:107097067:5,15,1,1
chr6	107097123	.	AAC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,1,2
chr6	107110940	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,90;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:10,3:4,0:9,5,2,1
chr6	107351312	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=51,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,6:1,11:0,2,6,11
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr6	107361086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,55;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:7,3:6,9,2,1
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	107372242	.	GTTTTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:12,1:2,2:8,7,2,1
chr6	107390822	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr6	107533481	.	ACTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr6	107585724	.	GA	G,GAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32,25;MFRL=155,148,64;MMQ=60,60,60;MPOS=14,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=A;STR;TLOD=3.14,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,2:0.151,0.161:16:6,1,1:6,1,0:1,11,0,4
chr6	107780588	.	C	CAGCAACATAAACAAGCAAGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=236,26569059;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:7,3:0,3:0,7,2,4
chr6	108066144	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=87,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:0,1:11,4:6,6,2,3
chr6	108068003	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:5,5:2,1:1,6,3,4
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr6	108093580	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=114,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr6	108193148	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
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chr6	108233929	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,28:0,16:0,0,25,19
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chr6	108492720	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=110,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:14,2:0|1:108492715_C_T:108492715:14,15,2,0
chr6	108502203	.	TGCCACCTCACTAATTCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,1:2,0:0,4,0,1
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chr6	108508652	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:108508647_T_TC:108508647:11,8,1,1
chr6	108533548	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=180,237;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr6	108668070	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=211,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr6	108677003	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr6	108768538	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=138,34459869;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:1,8,0,2
chr6	108984603	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.743:29:3,22:4,0:4,3,22,0
chr6	108985766	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=163,191;MMQ=24,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:108985766_G_C:108985766:2,1,0,1
chr6	108985771	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,30;MFRL=163,191;MMQ=24,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:108985766_G_C:108985766:2,1,0,1
chr6	108985773	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=163,191;MMQ=24,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:108985766_G_C:108985766:2,1,0,1
chr6	108985774	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=163,191;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108985766_G_C:108985766:0,1,0,1
chr6	109249257	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:8,3,2,0
chr6	109258284	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	109285587	.	CTTTCATCATTCCTGTGGGGCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:109285587_CTTTCATCATTCCTGTGGGGCA_C:109285587:1,3,0,2
chr6	109285601	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=72,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr6	109285612	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:109285587_CTTTCATCATTCCTGTGGGGCA_C:109285587:0,3,0,2
chr6	109294624	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,162;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.169:43:14,6:22,0:25,11,7,0
chr6	109294752	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:5,4:13,3:4,14,0,7
chr6	109315887	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=135,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	109322701	.	T	TGA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:6,8,1,1
chr6	109323519	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:13,3:19,1:14,18,1,3
chr6	109323648	.	CTT	AGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,0,1
chr6	109466396	.	C	CTATAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAT;STR;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,10:0,0,15,4
chr6	109480681	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=96,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,4:9,0:9,7,1,3
chr6	109665270	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:10,3:17,8,0,3
chr6	109764365	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:5,8,4,0
chr6	109765155	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	109767963	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,112;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:23,3:23,0:23,23,3,0
chr6	109768382	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,4:17,0:20,16,3,1
chr6	109775383	.	G	GTGACGTGTGCCTGTGGTCTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:3,5,1,1
chr6	109788955	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=111,93;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:15,0:15,8:2,28,0,8
chr6	109797336	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:17,0:7,3:17,7,1,2
chr6	109802400	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:10,0:19,4:15,14,2,2
chr6	109830328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=63,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:7,1,2,0
chr6	109954065	.	C	CATAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=292,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=ATAG;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr6	109980572	.	C	CAGTTT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=138,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,3:13,0:0|1:109980572_C_CAGTTT:109980572:6,14,0,3
chr6	109980574	.	G	GTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=138,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=T;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,2:13,0:0|1:109980572_C_CAGTTT:109980572:6,14,0,3
chr6	109980576	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=138,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:7,3:13,0:0|1:109980572_C_CAGTTT:109980572:6,14,0,3
chr6	109996751	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	110048489	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.744:22:5,10:1,5:2,4,3,13
chr6	110053824	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=104,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:1,2:3,1,3,1
chr6	110064255	.	TATTTC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr6	110065049	.	TAAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	110107734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	110110943	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,7:0,0:0,0,2,8
chr6	110301433	.	ACCACACC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=91,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,2:6,0:10,6,1,1
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,7,7
chr6	110429787	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:0|1:110429787_C_T:110429787:8,4,1,1
chr6	110429795	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,0:10,1:0|1:110429787_C_T:110429787:7,6,1,1
chr6	110522765	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,3:6,0:12,8,3,0
chr6	110550223	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=85,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,1:1,8:1,2,2,9
chr6	110567445	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr6	110714532	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=171,142;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:110714532_C_G:110714532:0,3,0,1
chr6	110714538	.	C	CTGGGCTCAAGCAATCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=171,142;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110714532_C_G:110714532:0,1,0,1
chr6	110726024	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=97,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:2,1,4,5
chr6	110726236	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	110736610	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr6	110746526	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,207;MMQ=60,33;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:6,4:2,6:4,5,8,2
chr6	110757008	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=124,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,1:3,1:5,2,2,1
chr6	110757207	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=107,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:110757207_TT_AA:110757207:1,3,0,1
chr6	110757212	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:110757207_TT_AA:110757207:0,3,0,1
chr6	110757215	.	A	ATTCTCCTTACTTACATATC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:110757207_TT_AA:110757207:0,3,0,1
chr6	110757216	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:110757216_A_G:110757216:0,1,0,2
chr6	110757220	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:110757216_A_G:110757216:0,0,0,2
chr6	110777962	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=79,48;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:5,5:13,0:9,10,3,2
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,4,5
chr6	110944589	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:11,3:9,2:6,14,2,3
chr6	110948099	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr6	110988786	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	111211511	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.060:47:21,0:23,2:0|1:111211511_C_T:111211511:19,26,1,1
chr6	111211513	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:22,0:23,2:0|1:111211511_C_T:111211511:19,26,1,1
chr6	111213315	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,34;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:8,7,1,1
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.893:27:2,11:0,11:0,3,11,13
chr6	111280332	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:1,7:3,10:2,2,11,7
chr6	111281584	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.647:27:6,10:3,7:5,4,14,4
chr6	111283750	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:4,8,0,3
chr6	111288941	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:5,8:2,8:2,5,7,11
chr6	111313072	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr6	111318294	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=270,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr6	111329221	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:0,1:2,1,4,0
chr6	111329370	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,8:0,3:1,2,1,10
chr6	111345356	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:13,7:10,0:16,7,7,0
chr6	111499684	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:2,7,1,1
chr6	111527696	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,1,6
chr6	111587055	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr6	111587266	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.885:24:2,10:0,11:2,0,9,13
chr6	111587349	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:111587349_T_G:111587349:12,11,1,1
chr6	111587354	.	T	TCC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=132,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:111587349_T_G:111587349:12,10,1,1
chr6	111587358	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:111587349_T_G:111587349:12,10,1,1
chr6	111631081	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:11,7,2,0
chr6	111632234	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr6	111665071	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	111695073	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,16:0,10:0,0,9,18
chr6	111695887	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr6	111695899	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	111726611	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,4,1
chr6	111896777	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,2:0,10:0|1:111896777_C_T:111896777:0,0,14,0
chr6	111896790	.	CAAAAAA	C,CA,CAA,CAAA	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=16,32,17,30,31;MFRL=58,125,0,111,91;MMQ=60,33,60,60,47;MPOS=27,6,7,19;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=21,15,16,17,18;RU=A;STR;TLOD=4.46,5.00,3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,2,3,3,6:0.095,0.144,0.172,0.340:19:0,1,0,1,1:0,1,1,1,4:0,5,10,4
chr6	111896797	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=98,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.150:24:7,0:12,1:0|1:111896777_C_T:111896777:11,10,1,2
chr6	111896798	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=84,125;MMQ=60,33;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:6,1:19,1:0|1:111896777_C_T:111896777:10,15,2,0
chr6	111901453	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,9,12
chr6	111913073	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:14,6:15,0:10,21,4,2
chr6	112397793	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,27;MFRL=198,220;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112397793_G_A:112397793:0,3,0,1
chr6	112397798	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=204,220;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:112397793_G_A:112397793:0,4,0,1
chr6	112397800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=209,187;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	112397803	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:112397803_C_T:112397803:0,4,0,1
chr6	112397805	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:112397803_C_T:112397803:0,4,0,1
chr6	112397809	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:112397803_C_T:112397803:0,4,0,1
chr6	112397813	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:112397803_C_T:112397803:0,4,0,1
chr6	112435964	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=76,189;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:9,2:3,10,0,2
chr6	112438912	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:1,6:0,0:1,0,4,2
chr6	112443134	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr6	112450351	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	112457390	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,4:1,12:0,3,8,8
chr6	112457471	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:0,1,1,8
chr6	112461039	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:11,5,1,1
chr6	112461997	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=101,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:11,0:10,8,4,0
chr6	112463577	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	112476953	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112476953_G_A:112476953:0,0,0,1
chr6	112476960	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112476953_G_A:112476953:0,0,0,1
chr6	112501132	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=109,201;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:27,0:15,3:24,19,1,2
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,5:0,0,4,15
chr6	112521468	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:112521468_C_G:112521468:0,9,0,2
chr6	112521475	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:112521468_C_G:112521468:0,9,0,2
chr6	112521498	.	G	GCTCCTCACTGACCGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=225,276;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr6	112528242	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,4:11,0:11,10,4,0
chr6	112535278	.	T	TTAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=87,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,1:3,1:7,6,0,2
chr6	112672198	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,4:0,4:2,2,4,4
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,3:1,0,7,0
chr6	114181656	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:114181656_GC_G:114181656:14,3,1,1
chr6	114181659	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:114181656_GC_G:114181656:14,3,1,1
chr6	114265587	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,13:0,3:0,0,3,13
chr6	114266610	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,0:10,4:3,14,0,4
chr6	114279783	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	114292109	.	CCTGCTGCTG	C,CCTGCTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32,29;MFRL=134,87,75;MMQ=60,60,60;MPOS=7,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,5,7;RU=CTG;STR;TLOD=4.94,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.176,0.220:11:1,0,0:5,2,2:6,1,3,1
chr6	114292362	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	114384081	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=213,19395760;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	116264348	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=98,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:8,0:4,6:6,9,3,3
chr6	116264354	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,8:0,0,8,12
chr6	116264386	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=99,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.460:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr6	116264399	.	TG	CC	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:7,0:0,3:0|1:116264399_TG_CC:116264399:0,7,0,3
chr6	116264402	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,0:0,3:0|1:116264399_TG_CC:116264399:0,7,0,3
chr6	116264406	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:0,3:0|1:116264399_TG_CC:116264399:0,4,0,3
chr6	116288912	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.901:6:0,1:0,4:0,0,2,4
chr6	116289710	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=102,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:4,2:10,1,4,0
chr6	116381100	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:7,0:12,2,4,0
chr6	116427506	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.822:8:0,1:1,3:1,0,3,4
chr6	116427541	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,0:6,4:0,9,0,4
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=202,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,1:7,2,3,0
chr6	116442678	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:7,2:0|1:116442678_C_T:116442678:5,9,1,1
chr6	116442687	.	G	GCTCCATAGCACC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:116442678_C_T:116442678:6,9,1,1
chr6	116575344	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	116600465	.	T	TCAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAC;STR;TLOD=77.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr6	116600810	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:3,3,3,1
chr6	116600839	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:7,3,1,1
chr6	116752310	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=128,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:5,1:14,2:9,11,0,3
chr6	116754456	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr6	116756667	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	116756773	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,120;MMQ=24,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,7:1,6:0,1,11,2
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,0:0,9:0,0,5,4
chr6	116836720	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,15,2
chr6	116864570	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,10:0,0,10,19
chr6	116878947	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,17,4
chr6	116879472	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	116901624	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:116901624_G_T:116901624:0,3,0,1
chr6	116901626	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:116901624_G_T:116901624:0,3,0,1
chr6	116901640	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	116911413	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:9,0:4,4:11,2,4,0
chr6	116914112	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30,24;MFRL=98,89,89;MMQ=60,60,60;MPOS=7,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=7.09,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,4:0.342,0.274:15:4,3,1:1,1,2:5,1,6,3
chr6	116938138	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,0,2
chr6	116949571	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:7,2:3,11,1,2
chr6	116980017	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:8,5,2,1
chr6	116982067	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,177;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.244:14:7,0:2,2:0,11,2,1
chr6	117010578	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=114,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:24,6:22,0:20,26,6,0
chr6	117020054	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:0,7,0,3
chr6	117026217	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:6,3:6,0:11,2,3,0
chr6	117073874	.	AATAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AT;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr6	117086265	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	117114403	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr6	117114431	.	C	CTTGAAACACTCTTTTTGAGGAATTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr6	117150127	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,1:6,1:3,5,0,2
chr6	117240361	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:10,7,2,0
chr6	117244397	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,0:9,4:7,14,2,2
chr6	117246576	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.894:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	117249961	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:8,7,2,0
chr6	117622401	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=236,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	117631463	.	T	TTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAA;STR;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:1,4:0,1:0,1,2,3
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,4:0,4:0,1,1,7
chr6	117715510	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,157;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr6	117724462	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:7,3:1,1:2,6,1,3
chr6	117724499	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	117725383	.	C	CA,CAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31,32;MFRL=107,131,150;MMQ=54,50,40;MPOS=16,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=4.35,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,2:0.393,0.156:14:0,0,1:5,4,1:5,1,5,3
chr6	117725410	.	TCT	GGG	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=107,107;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.082:39:13,0:13,0:7,29,3,0
chr6	117730673	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:8,2,3,0
chr6	117730694	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:8,8,3,0
chr6	117735716	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,0:1,1:1,7,1,1
chr6	117739711	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=142,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:4,14,0,3
chr6	117842850	.	TGTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117842850_TGTA_T:117842850:0,1,0,1
chr6	117842855	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117842850_TGTA_T:117842850:0,1,0,1
chr6	117858440	.	AT	GC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:10,0:0|1:117858440_AT_GC:117858440:6,17,1,1
chr6	117858446	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:117858440_AT_GC:117858440:5,17,1,1
chr6	117858514	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=217,182;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr6	117896495	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:4,3:3,8,0,3
chr6	117898578	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,96;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:8,0:25,3:20,13,0,3
chr6	117923172	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=98,55;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:5,0:17,2:0|1:117923172_G_A:117923172:13,9,1,1
chr6	117923186	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,0:17,2:0|1:117923172_G_A:117923172:13,12,1,1
chr6	117923189	.	G	GCC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,0:18,2:0|1:117923172_G_A:117923172:13,12,1,1
chr6	117923193	.	C	CCTCATTCCGTGCCACAGAG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=92,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,0:18,2:0|1:117923172_G_A:117923172:11,14,1,1
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr6	118588164	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:25,5:22,0:22,25,4,1
chr6	118598815	.	T	TTTGGGCTTGTGTCAAATATTGGGGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,14;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr6	118786486	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	118790555	.	A	AAATTTCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	118845168	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=118,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr6	118880110	.	GCTCAGCTATAAGAAGAGCCTCAACCATTGAAATGCCTCAACAAGCACGTCAAAAGCTACAGAATCTATTTATCAATTTCTGT	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=108,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.057:51:7,0:10,2:23,26,1,1
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	119136237	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:13,6:4,0:9,8,6,0
chr6	119136505	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=125,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:3,7,3,0
chr6	119149149	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,4:6,11:6,5,7,8
chr6	119149380	.	T	TTGTAAAAGCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0|1:119149380_T_TTGTAAAAGCCAA:119149380:0,1,0,1
chr6	119149386	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119149380_T_TTGTAAAAGCCAA:119149380:0,1,0,1
chr6	119149391	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119149380_T_TTGTAAAAGCCAA:119149380:0,1,0,1
chr6	119282976	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.136:24:8,0:13,2:0|1:119282976_G_A:119282976:9,12,1,2
chr6	119282982	.	G	GCTTGGAAAACAGACGGGCGGTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:119282976_G_A:119282976:9,12,1,1
chr6	119300477	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr6	119301318	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:27,1:13,4:24,18,0,5
chr6	119301325	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.183:47:19,8:20,0:18,21,8,0
chr6	119323987	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr6	119346004	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr6	119399508	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	119509690	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=91,81;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:9,0:6,6:6,10,5,1
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	121436393	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=108,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:121436393_G_GA:121436393:2,3,1,1
chr6	121436397	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:121436393_G_GA:121436393:2,4,1,1
chr6	121436400	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=29,24;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,0:0|1:121436393_G_GA:121436393:2,4,1,1
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	121436487	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=21,28;MFRL=234,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:121436487_A_T:121436487:0,1,0,1
chr6	121436491	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121436487_A_T:121436487:0,0,0,1
chr6	121436494	.	A	AAAAG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121436487_A_T:121436487:0,0,0,1
chr6	121436495	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121436487_A_T:121436487:0,0,0,1
chr6	121436499	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121436487_A_T:121436487:0,0,0,1
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	121526304	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=125,188;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:15,0:10,5:10,15,0,5
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,6:3,4:2,1,8,2
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr6	122720806	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr6	122720813	.	T	TGCCGTAGCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGTAGCTGCC;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.412:10:3,2:3,1:5,1,4,0
chr6	122733496	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=88,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.233:13:3,1:6,2:6,4,1,2
chr6	122734873	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,3:5,0:0,8,1,2
chr6	122737437	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=63,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:6,13,0,3
chr6	122740474	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr6	122743502	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	122749156	.	G	GTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:1,2,1,8
chr6	122752471	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	122768200	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:0|1:122768200_G_A:122768200:6,6,1,1
chr6	122768203	.	A	AAAAAGTAAAAAAGACAT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:0|1:122768200_G_A:122768200:6,6,1,1
chr6	122768231	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,4:1,7:3,0,8,3
chr6	122768253	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,2:6,2,3,0
chr6	122772898	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=86,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:8,2:13,3,1,1
chr6	122772921	.	A	AATAT,AATATATATATAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27,27;MFRL=69,155,147;MMQ=60,60,40;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,15;RU=AT;STR;TLOD=3.63,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.335,0.326:3:0,0,0:0,1,1:0,1,0,2
chr6	122775195	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr6	122792765	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:2,8:1,6:0|1:122792765_G_C:122792765:2,1,13,2
chr6	122792768	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.801:18:2,9:1,6:0|1:122792765_G_C:122792765:2,1,13,2
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr6	123039201	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	123122385	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=177,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:6,0,2,1
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr6	123539684	.	CT	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr6	123539904	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr6	123545159	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr6	123580660	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	123581789	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.916:12:0,5:0,6:0,1,4,7
chr6	123592174	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=125,136;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,0,2
chr6	123592184	.	C	CTG,CTGTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29,33;MFRL=133,175,125;MMQ=40,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.77,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.300:7:1,0,2:2,2,0:1,2,4,0
chr6	123592213	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=86,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.466:8:0,0:4,0:2,2,4,0
chr6	123594425	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:3,1,13,3
chr6	123600100	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	123600296	.	A	AGTCAACACTTTTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	123600321	.	AATG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=187,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	123658680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	123687432	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	123786154	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,2:9,1:3,18,1,2
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,3:0|1:123851590_G_A:123851590:0,0,11,1
chr6	123851610	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,13:0,6:0|1:123851590_G_A:123851590:0,0,17,3
chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:0,1:2,1:0,6,0,2
chr6	123892044	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=144,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	123957958	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,0:12,3:10,13,3,0
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:1,1:6,3,3,1
chr6	125139603	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,46;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:11,14,2,1
chr6	125366289	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	125366678	.	A	AAGGCACTGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	125379032	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=182,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:0,7:6,0:6,0,8,0
chr6	125598299	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:125598299_C_T:125598299:7,8,2,0
chr6	125598302	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:4,1:0|1:125598299_C_T:125598299:8,8,2,0
chr6	125623130	.	GTCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr6	126072853	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	126075709	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=22,23,23;MFRL=107,80,95;MMQ=60,60,60;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.47,26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,17:0.193,0.686:25:0,2,8:2,3,9:0,3,4,18
chr6	126196142	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:2,11:2,5:1,3,4,12
chr6	126221008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	126242004	.	CG	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr6	126242304	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=190,195;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:126242304_CT_C:126242304:0,3,0,2
chr6	126242307	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=190,195;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:126242304_CT_C:126242304:0,3,0,2
chr6	126248942	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:126248942_A_C:126248942:2,10,1,1
chr6	126248948	.	T	TTATCTAAGTTTGTTTAAGAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:126248942_A_C:126248942:0,8,1,1
chr6	126248950	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:126248942_A_C:126248942:0,6,1,1
chr6	126249755	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.301:21:8,3:6,3:0|1:126249755_CT_C:126249755:12,3,6,0
chr6	126249773	.	CC	AA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,4:0.134:32:14,1:6,1:1|0:126249755_CT_C:126249755:18,10,4,0
chr6	126249779	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=21,19;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,4:0.126:34:13,1:5,1:1|0:126249755_CT_C:126249755:20,10,4,0
chr6	126288023	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr6	126319310	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:4,3:8,6,0,3
chr6	126319881	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	126334041	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr6	126669479	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	127471533	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	127471791	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	127518560	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr6	127609691	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.660:18:2,6:3,6:3,3,4,8
chr6	127768950	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,4:0,7:1,0,9,2
chr6	127796447	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:4,6,1,1
chr6	127836275	.	C	CAGGGACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr6	127836290	.	T	TCTACATATGGCTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=114,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr6	127898305	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=97,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:3,4,2,1
chr6	128040839	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,7:2,1:0,2,6,2
chr6	128176383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	128294862	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:15,2:0|1:128294862_T_C:128294862:8,15,1,1
chr6	128294865	.	C	CACAAT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:17,2:0|1:128294862_T_C:128294862:8,16,1,1
chr6	128297899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:3,0:7,3:5,7,2,2
chr6	128297914	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:128297914_T_C:128297914:3,10,1,1
chr6	128297924	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0|1:128297914_T_C:128297914:1,10,1,1
chr6	128297926	.	CCCTA	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0|1:128297914_T_C:128297914:1,10,1,1
chr6	128297934	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:0,0:8,2:0|1:128297914_T_C:128297914:0,10,1,1
chr6	128297986	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr6	128306769	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	128312114	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	128322437	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,1:9,2:15,5,1,2
chr6	128383439	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,305;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,7:3,0:3,1,7,0
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=76.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.971:28:0,18:0,10:0,0,14,14
chr6	128383586	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:20,6:14,0:16,18,5,1
chr6	128385998	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	128388748	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,164;MMQ=60,20;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:16,0:13,4:16,14,0,4
chr6	128388799	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=76,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,9:0,14:0,1,10,14
chr6	128388921	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=88,97;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:11,3:6,14,1,2
chr6	128388950	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=88,98;MMQ=60,47;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:9,3:5,10,0,3
chr6	128388990	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	129380843	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=89,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.730:5:0,2:1,2:0|1:129380843_C_CG:129380843:1,0,4,0
chr6	129380844	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=89,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.730:5:0,2:1,2:0|1:129380843_C_CG:129380843:1,0,4,0
chr6	129381026	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,16,17
chr6	129612808	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,0:1,5:4,5,2,3
chr6	129637306	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:129637306_C_T:129637306:0,10,1,1
chr6	129637309	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:129637306_C_T:129637306:0,10,1,1
chr6	129674593	.	CTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=67,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr6	129724894	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	129724942	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:129724942_T_A:129724942:1,0,3,0
chr6	129724944	.	CT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0|1:129724942_T_A:129724942:1,0,3,0
chr6	129749025	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr6	129763283	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr6	129802589	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=116,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,0:14,3:8,15,0,3
chr6	129802674	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=147,91;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr6	129828573	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=191,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr6	129920298	.	AAATTTTGGTATTAAAAAAATACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	129927014	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr6	129929153	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:9,0:22,4:19,13,0,4
chr6	129932612	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,1:0|1:129932612_A_T:129932612:2,1,1,1
chr6	129932614	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:129932612_A_T:129932612:2,1,1,1
chr6	129932648	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr6	129937456	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,12:0,6:0,1,3,15
chr6	129950718	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr6	129955117	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=206,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,2:2,0,4,2
chr6	129955171	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,4:0,0,11,2
chr6	129955327	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr6	130164749	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:0|1:130164749_C_T:130164749:3,13,0,3
chr6	130164755	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:8,3:0|1:130164749_C_T:130164749:3,13,0,3
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr6	130167026	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:0,2,3,4
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,10:1,4:1,0,7,7
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr6	130376273	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,4:1,5:3,0,6,4
chr6	130381246	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.627:30:3,10:8,9:8,3,11,8
chr6	130381357	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,0:10,6:0,15,0,6
chr6	130387552	.	TTCTGGGTGAATGCAGACGC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:6,0:13,6,1,1
chr6	130425540	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:16,3,2,0
chr6	130442067	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:11,13,3,0
chr6	130466005	.	C	CCACAGTTAGATACTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	130466384	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=178,223;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:130466384_A_C:130466384:4,0,1,0
chr6	130466389	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=178,223;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:130466384_A_C:130466384:4,0,1,0
chr6	130466390	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=178,223;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:130466384_A_C:130466384:4,0,1,0
chr6	130466396	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=172,223;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:0,1:3,0:0|1:130466384_A_C:130466384:3,0,1,0
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr6	130466676	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,566;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	130530730	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:130530730_C_G:130530730:7,9,1,1
chr6	130530733	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:130530730_C_G:130530730:7,10,1,1
chr6	130530815	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	130763281	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:3,11:7,8:2,8,9,10
chr6	130764203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.303:8:2,0:4,2:0|1:130764203_C_T:130764203:4,2,1,1
chr6	130764220	.	GTTTTCCTTTAAGGTAACATAATTGTAAGAA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,0:4,2:0|1:130764203_C_T:130764203:3,5,1,1
chr6	131184914	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr6	131186851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	131199316	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:20,0:8,2:0|1:131199316_T_A:131199316:12,18,0,2
chr6	131199318	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:21,0:8,2:0|1:131199316_T_A:131199316:12,18,0,2
chr6	131211483	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.687:35:4,11:5,13:9,2,16,8
chr6	131211616	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.725:9:0,1:0,1:0,2,0,7
chr6	131276466	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=242,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.458:8:1,2:3,2:0|1:131276466_GA_G:131276466:0,4,0,4
chr6	131276473	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=240,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.411:9:2,2:3,2:0|1:131276466_GA_G:131276466:0,5,0,4
chr6	131277426	.	TCCTTCTCTC	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:20,0:16,1:21,22,1,1
chr6	131466631	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131466631_TT_AA:131466631:0,3,0,1
chr6	131466634	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131466631_TT_AA:131466631:0,3,0,1
chr6	131466636	.	AGTTG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131466631_TT_AA:131466631:0,3,0,1
chr6	131466642	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131466631_TT_AA:131466631:0,3,0,1
chr6	131466643	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:131466631_TT_AA:131466631:0,3,0,1
chr6	131520671	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:8,11:14,0:9,13,11,0
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,3:2,1:9,0,4,0
chr6	131540763	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,3:14,1:24,3,3,1
chr6	131902329	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,5,1
chr6	131904644	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:12,0:18,7:9,22,0,7
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	131904715	.	C	CGAAACAAGCCAAGGTTATTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=209,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:0|1:131904715_C_CGAAACAAGCCAAGGTTATTG:131904715:0,3,0,1
chr6	131904718	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=202,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131904715_C_CGAAACAAGCCAAGGTTATTG:131904715:0,4,0,1
chr6	131905018	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,3:9,0:6,12,1,2
chr6	131910501	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=189,55;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:11,0,2,0
chr6	131911655	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	131917379	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr6	131941944	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,23;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:1,2:0,1:1,2,0,4
chr6	131944686	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131944686_A_C:131944686:1,0,0,1
chr6	131944688	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131944686_A_C:131944686:1,0,0,1
chr6	131944692	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131944686_A_C:131944686:1,0,0,1
chr6	131948469	.	GAA	G,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=137,111,160;MMQ=60,60,60;MPOS=10,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.12,11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,7,8:0.272,0.406:22:4,5,4:2,1,2:6,1,12,3
chr6	131948815	.	G	T	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,5:0.048:92:25,0:35,1:28,59,0,5
chr6	131948816	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=25,25,25,24;MFRL=116,91,99,92;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,22,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=11.28,17.04,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:19,12,11,7:0.204,0.268,0.137:49:9,3,3,3:8,9,4,2:3,16,4,26
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,11,3
chr6	131973932	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:10,6,1,1
chr6	131974125	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:131974125_A_T:131974125:0,3,0,1
chr6	131974127	.	T	TATATCTGAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:131974125_A_T:131974125:0,3,0,1
chr6	131995209	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	132022589	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,77;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	132043577	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:3,4,1,1
chr6	132045330	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:132045330_CTG_C:132045330:0,0,0,1
chr6	132045334	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132045330_CTG_C:132045330:0,0,0,1
chr6	132045336	.	A	AAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132045330_CTG_C:132045330:0,0,0,1
chr6	132189067	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.242:6:4,1:1,0:5,0,1,0
chr6	132197105	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,0:1,6:1,5,0,6
chr6	132270728	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,2:0,0:1,3,0,3
chr6	132271266	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,0:5,3:7,5,0,3
chr6	132618293	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=119,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:2,9,3,1
chr6	132782916	.	TTTGTTCCGTTCTTCATTCC	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:10,0:16,2:19,15,1,1
chr6	132785075	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=90,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:9,7:15,0:18,6,7,0
chr6	132785224	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,4:0,10:0,1,1,13
chr6	132785231	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:1,13,0,2
chr6	132785254	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr6	132792627	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:8,0:15,6,2,2
chr6	132860522	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	132874153	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:0|1:132874153_AG_A:132874153:10,11,1,1
chr6	132874157	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:132874153_AG_A:132874153:11,12,1,1
chr6	132891756	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=105,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.721:37:5,10:5,17:5,5,7,20
chr6	132891781	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=84,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:15,0:23,7:15,23,0,7
chr6	132891951	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=80,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:5,5,1,2
chr6	132910069	.	TCTTGGCAGCTTTTCTCTCATG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.259:10:3,0:4,1:2,6,1,1
chr6	132910612	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.819:20:2,8:1,9:1,2,7,10
chr6	132910661	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=115,281;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:9,4:6,10,4,0
chr6	132910881	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=281,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=34,32;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,0:0,2,0,2
chr6	132939071	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr6	132939175	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:6,9,1,2
chr6	132939347	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	132966207	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr6	132966716	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:8,12,1,1
chr6	132967052	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,47;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:12,6:9,0:9,12,6,0
chr6	133013744	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:133013744_A_G:133013744:0,0,0,1
chr6	133013748	.	C	CTACTGTACAACTGGACG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133013744_A_G:133013744:0,0,0,1
chr6	133013750	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133013744_A_G:133013744:0,0,0,1
chr6	133032759	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,2:0,5:2,0,7,0
chr6	133032797	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,5:1,4:4,2,8,1
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=127,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,10:1,1:0,1,1,10
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=106,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:2,7:8,3:0|1:133055610_G_T:133055610:5,5,5,5
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=106,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:2,7:8,3:0|1:133055610_G_T:133055610:5,5,5,5
chr6	133072650	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,3,13
chr6	133076949	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=100,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,2:19,0:17,15,1,1
chr6	133093231	.	CAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:1,1:3,1:9,3,2,0
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr6	133136029	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.793:27:2,12:3,9:1,4,14,8
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:13,4:9,2:15,7,4,3
chr6	133138010	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	133138067	.	ATTTT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27,29;MFRL=0,139,166;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,12;RU=T;STR;TLOD=30.93,16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,15,6:0.655,0.305:21:0,9,5:0,6,1:0,0,20,1
chr6	133138217	.	T	TCACTGACTC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=102,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:23,0:13,2:12,25,1,1
chr6	133138249	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,1,18
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,9:0,0,6,20
chr6	133595930	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,1:10,2:8,7,1,2
chr6	133777706	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,0:7,5:7,5,1,4
chr6	133786066	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,2:4,0:0|1:133786066_CA_C:133786066:0,8,1,1
chr6	133786068	.	TATA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:133786066_CA_C:133786066:0,8,1,1
chr6	133786075	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:133786066_CA_C:133786066:0,8,1,1
chr6	133786079	.	AC	TT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:133786066_CA_C:133786066:0,8,1,1
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:6,1,4,1
chr6	133849841	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,3:17,0:10,17,3,0
chr6	134212760	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:134212760_A_C:134212760:0,0,3,0
chr6	134212763	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:134212760_A_C:134212760:0,0,3,0
chr6	134212770	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:134212760_A_C:134212760:0,0,3,0
chr6	134305494	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:20,2:10,4:19,11,5,1
chr6	134305681	.	AATATTT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:11,0:19,9,1,1
chr6	134493397	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,32:0.786:40:6,16:2,16:2,6,15,17
chr6	134493947	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,6:0,6:0,3,1,11
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr6	134528386	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,256;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:12,1,2,0
chr6	135239950	.	TCACCGCACCAAATTTGGG	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:17,0:17,2:19,21,1,1
chr6	135260303	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	135286438	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:1,3:2,2:1,4,0,5
chr6	135357713	.	CTTTT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=99,107;MMQ=59,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:13,4:9,1:12,10,4,1
chr6	135511108	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=67,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:2,2:0,2:0,2,0,5
chr6	135511400	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.130:43:19,5:19,0:15,23,5,0
chr6	135522939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr6	135524516	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,1,4
chr6	135524553	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=97,74;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr6	135539103	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=89,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.794:27:2,7:3,15:2,3,9,13
chr6	135639644	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=72.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,9:0,0,18,7
chr6	135748451	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr6	135748476	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr6	135759522	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:13,9,3,0
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,10:0,0,4,17
chr6	135787468	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:12,0:16,5:12,16,0,5
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr6	136475161	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,5:5,0:11,0,6,0
chr6	136476889	.	T	TCCGCCCCCGCCGGGTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=193,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:136476889_T_TCCGCCCCCGCCGGGTTC:136476889:2,2,1,1
chr6	136476890	.	A	AAGCAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,0:0|1:136476889_T_TCCGCCCCCGCCGGGTTC:136476889:3,2,1,1
chr6	136552582	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:136552582_G_C:136552582:0,4,0,1
chr6	136552584	.	A	AGTTACCCTTGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:136552582_G_C:136552582:0,4,0,1
chr6	136560617	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=114,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:11,9,2,0
chr6	136582113	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=119,142;MMQ=52,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,5:8,4:12,2,9,0
chr6	136582138	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=118,148;MMQ=52,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:13,4:12,2:20,6,6,0
chr6	136582194	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=78;ECNT=4;MBQ=20,25,21;MFRL=103,142,106;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.17,19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,5,14:0.081,0.203:73:23,2,6:29,2,5:28,26,6,13
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=117,106;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,20:0.216:95:39,12:35,7:31,44,7,13
chr6	136590613	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=108,117;MMQ=55,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.140:40:22,3:13,2:21,14,4,1
chr6	136590640	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=108,117;MMQ=60,57;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,7:0.153:50:27,5:15,2:25,18,4,3
chr6	136590698	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=131,150;MMQ=60,31;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:24,1:14,3:8,30,1,3
chr6	136590712	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=138,121;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.124:37:20,1:13,3:4,29,2,2
chr6	136593183	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=93,82;MMQ=60,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.095:60:26,3:29,2:20,35,2,3
chr6	136596794	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=141,109;MMQ=58,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,4:11,0:13,9,1,3
chr6	136681046	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:136681046_A_T:136681046:9,9,1,1
chr6	136681053	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:11,2:0|1:136681046_A_T:136681046:12,9,1,1
chr6	136681056	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:10,2:0|1:136681046_A_T:136681046:12,6,1,1
chr6	136710636	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,0:10,3:2,12,0,3
chr6	136710669	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=50,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:3,0:5,3:0,8,0,4
chr6	136732877	.	TAA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=120,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:11,1:18,1:10,20,0,2
chr6	136878912	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=92,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,1:8,2:9,8,2,1
chr6	136963562	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,3:4,1:6,0,4,0
chr6	137146414	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,4:10,0:8,12,4,0
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,10,4
chr6	137243566	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr6	137294967	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,30;MFRL=215,160;MMQ=45,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:137294967_T_A:137294967:2,0,1,0
chr6	137294973	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=215,160;MMQ=45,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:137294967_T_A:137294967:2,0,1,0
chr6	137295051	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=118,90;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0|1:137295051_A_G:137295051:7,7,1,1
chr6	137295054	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=118,90;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:137295051_A_G:137295051:7,7,1,1
chr6	137295056	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=99,90;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:137295051_A_G:137295051:6,8,1,1
chr6	137295062	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=121,90;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:137295051_A_G:137295051:6,10,1,1
chr6	137295213	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:9,0:7,2:6,10,1,2
chr6	137325901	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=65,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.674:9:0,3:3,3:2,1,2,4
chr6	137325915	.	A	AGGTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.329:9:3,0:3,3:2,4,2,1
chr6	137330690	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=140,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137330690_T_A:137330690:0,1,0,1
chr6	137330692	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=140,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137330690_T_A:137330690:0,1,0,1
chr6	137330698	.	A	AACTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=140,273;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137330690_T_A:137330690:0,1,0,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr6	137469124	.	C	CGGGGGCAAGCGGTGACACCAACTAAAAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	137478041	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:2,8,0,2
chr6	137479640	.	A	AAGAAGGAAGGACAGGAGGGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr6	137815318	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:6,0:12,2:0|1:137815318_G_C:137815318:10,12,1,1
chr6	137815324	.	C	CACGACCTGAACCTA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:137815318_G_C:137815318:8,13,1,1
chr6	138192561	.	A	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=113,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:27,0:30,4:25,33,0,4
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=148.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,40:0.732:54:9,13:5,27:9,5,31,9
chr6	138196093	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,3:0.044:88:39,1:41,2:0|1:138196093_G_A:138196093:42,43,0,3
chr6	138196095	.	A	ACACACACAC	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,3:0.044:88:41,1:42,2:0|1:138196093_G_A:138196093:42,43,0,3
chr6	138196761	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:12,6:14,2:25,1,8,0
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:4,11:6,14:3,7,8,17
chr6	138201320	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.126:53:21,0:26,6:19,28,1,5
chr6	138417415	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr6	138428240	.	ACGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,17;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr6	138531152	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=74,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,0:8,3:10,15,1,2
chr6	138746043	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138746043_G_GC:138746043:0,0,0,1
chr6	138746044	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138746043_G_GC:138746043:0,0,0,1
chr6	138746050	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138746043_G_GC:138746043:0,1,0,1
chr6	138754221	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=110,79;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:4,4:1,5,1,3
chr6	138754251	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=126,79;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:1,2,0,4
chr6	138754323	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=190,88;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr6	138754335	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.437:21:4,9:8,0:8,4,9,0
chr6	138820293	.	CACAG	C	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=90,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,64:0.802:79:6,11:7,50:8,7,34,30
chr6	138820324	.	A	G	.	.	DP=118;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=263.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,98:0.825:118:8,21:12,66:6,14,35,63
chr6	138820343	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=88,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,5:0.055:104:29,4:63,1:22,77,2,3
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:7,1,3,0
chr6	139097474	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr6	139101019	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=96,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:14,1:8,2:11,11,0,3
chr6	139183879	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	139183897	.	A	ACCACAGGCCCAGAGTGCATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=164,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	139186074	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	139207910	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr6	139234163	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	139255579	.	T	TTTTCCCATTTTGTTTCTTCTTAACAACTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	139355740	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=106,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:5,0:4,3:3,6,0,3
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:4,3:4,1:7,2,4,0
chr6	139498137	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,3:12,0:11,11,2,1
chr6	139564338	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=100,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:16,0:14,2:14,16,1,1
chr6	139583990	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	139598061	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:0,5:2,1:1,1,2,4
chr6	139609694	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,0:14,3:17,16,2,1
chr6	142399677	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr6	142409767	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	142510676	.	GTATT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TATT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr6	142623550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:2,3,0,3
chr6	142723290	.	G	GCCAACACCCCGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=214,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	142724918	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:2,1,7,3
chr6	142729305	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,202;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:14,5:20,0:18,16,5,0
chr6	142759335	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:0|1:142759335_A_AT:142759335:5,1,1,1
chr6	142759350	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:2,0:0|1:142759335_A_AT:142759335:5,1,1,1
chr6	142759573	.	TTGATA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:142759573_TTGATA_T:142759573:0,1,0,1
chr6	142759581	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:142759573_TTGATA_T:142759573:0,1,0,1
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	143091263	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr6	143094831	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=103,119;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:5,10,0,3
chr6	143095090	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:7,0:0|1:143095090_A_T:143095090:12,7,0,2
chr6	143095091	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:143095090_A_T:143095090:11,6,0,2
chr6	143381712	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.612:29:3,5:8,12:7,4,12,6
chr6	143382254	.	CGT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=GT;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:3,2:4,3,3,0
chr6	143654559	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=121,89;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:16,2:4,25,0,2
chr6	143654580	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=139,89;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:4,12,0,2
chr6	143654594	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=149,89;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:0|1:143654594_C_T:143654594:3,9,0,2
chr6	143654596	.	GA	AG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=149,89;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:0|1:143654594_C_T:143654594:3,9,0,2
chr6	143654602	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=139,89;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:0|1:143654594_C_T:143654594:2,8,0,2
chr6	143754938	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=220,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:2,0,6,2
chr6	143755161	.	G	GAGTTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143755161_G_GAGTTAA:143755161:0,0,0,1
chr6	143755163	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143755161_G_GAGTTAA:143755161:0,0,0,1
chr6	143765993	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,7:1,0:1,0,6,1
chr6	143772290	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:143772290_A_C:143772290:1,2,1,1
chr6	143772292	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:143772290_A_C:143772290:1,2,1,1
chr6	143772293	.	G	GGTTAGCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,31;MFRL=60,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:143772293_G_GGTTAGCA:143772293:1,1,0,1
chr6	143772297	.	G	GACGAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=60,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:0,1:0,0:0|1:143772293_G_GGTTAGCA:143772293:1,1,0,1
chr6	143772299	.	G	GCGCT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143772293_G_GGTTAGCA:143772293:0,0,0,1
chr6	143772301	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143772293_G_GGTTAGCA:143772293:0,0,0,1
chr6	143780226	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:14,0:15,4:0|1:143780226_A_T:143780226:18,15,2,2
chr6	143780235	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:14,0:20,4:0|1:143780226_A_T:143780226:18,16,2,2
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,4:1,7:2,0,7,4
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	143792078	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr6	143800250	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=95,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:11,2:17,3:14,15,3,2
chr6	143806276	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=213,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:2,9:1,6:2,1,12,3
chr6	143823112	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,3:1,11:4,1,7,7
chr6	143823157	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:4,3:1,11:1,4,8,6
chr6	143823758	.	AG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	143824972	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	143825104	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,2:4,2:8,4,4,0
chr6	143828325	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	143832601	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=117,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:21,2:18,0:0|1:143832601_G_A:143832601:13,26,0,2
chr6	143832607	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=119,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:21,2:19,0:0|1:143832601_G_A:143832601:13,27,0,2
chr6	143929525	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:5,0:2,7,1,2
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr6	144110103	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=46,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:144110103_A_C:144110103:1,1,0,1
chr6	144110107	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:144110103_A_C:144110103:0,3,0,1
chr6	144110110	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:144110103_A_C:144110103:0,3,0,1
chr6	144165809	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.597:13:2,1:2,5:1,4,1,7
chr6	144178419	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:3,8:4,4:4,3,10,2
chr6	144258670	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	144262607	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=84,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:15,0:10,3:15,10,3,1
chr6	144509259	.	ATATTTTGGTAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=189,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:3,2:1,6,1,1
chr6	144509615	.	TTATGGCGGTAGACA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:2,0:4,2:7,10,1,1
chr6	144509862	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19,19;MFRL=184,141,152;MMQ=40,42,40;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=4.79,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.404,0.395:7:0,1,0:0,0,0:0,1,0,6
chr6	144510428	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:11,4,2,0
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr6	144758799	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=62,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,9:4,3:6,1,8,4
chr6	144761429	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:1,7:0,3:1,0,11,0
chr6	144765490	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,3:1,9:2,1,4,8
chr6	144768708	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:10,1,2,0
chr6	144803547	.	GTTA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TTA;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.734:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr6	144809818	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:12,7,3,0
chr6	144809978	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.814:23:1,11:2,8:3,1,9,10
chr6	144810058	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:144810058_CAA_C:144810058:0,4,0,1
chr6	144810061	.	A	ATGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:144810058_CAA_C:144810058:0,4,0,1
chr6	144810069	.	G	GGATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr6	144811163	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.214:17:8,2:5,1:11,3,3,0
chr6	144812106	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr6	144814625	.	GTC	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.322:14:2,2:7,2:4,6,1,3
chr6	144872287	.	A	AATTAGCCAGGC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,26;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr6	144872288	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	144872304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,25;MFRL=182,168;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144872304_C_T:144872304:0,1,0,1
chr6	144872306	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=182,168;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144872304_C_T:144872304:0,1,0,1
chr6	144872311	.	A	ACCCAAGG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=182,168;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144872304_C_T:144872304:0,1,0,1
chr6	144872314	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=182,168;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144872304_C_T:144872304:0,1,0,1
chr6	144872315	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=182,168;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144872304_C_T:144872304:0,1,0,1
chr6	144876085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=96,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.236:15:3,2:9,1:0|1:144876085_C_T:144876085:5,7,0,3
chr6	144876087	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=96,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.236:15:3,2:5,1:0|1:144876085_C_T:144876085:5,7,0,3
chr6	144876090	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=110,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:0|1:144876085_C_T:144876085:2,6,0,3
chr6	144999763	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,0,5
chr6	145095545	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:3,1:3,1:0,8,0,3
chr6	145095557	.	TCCAAG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,3:0|1:145095557_TCCAAG_T:145095557:0,7,0,3
chr6	145095563	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:0|1:145095557_TCCAAG_T:145095557:0,7,0,3
chr6	145095566	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:145095557_TCCAAG_T:145095557:0,7,0,2
chr6	145103357	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,167;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:4,0:1,2:0,5,0,3
chr6	145110517	.	T	TATAATCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145110517_T_TATAATCAG:145110517:0,1,0,1
chr6	145110520	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145110517_T_TATAATCAG:145110517:0,1,0,1
chr6	145156982	.	GCCGCAGAGCCCAGCT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:8,2:11,10,1,1
chr6	145160341	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.193:13:6,0:5,2:5,6,1,1
chr6	145822992	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:0,5:2,14:1,1,8,11
chr6	145823642	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,3,0
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	146125466	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.844:11:0,7:1,2:1,0,4,6
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=50,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:1,1,1,8
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	146234682	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr6	146239245	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,6:2,6:4,1,9,3
chr6	146242543	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:0|1:146242543_G_GT:146242543:1,10,0,2
chr6	146242544	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:6,1:4,0:0|1:146242543_G_GT:146242543:1,10,0,2
chr6	146244012	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,8:1,1:0,1,2,7
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:7,1,3,1
chr6	146247504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	146256315	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.285:18:6,0:2,4:7,6,2,3
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.436:16:3,5:6,1:4,5,5,2
chr6	146275857	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=101,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,2:13,0:16,16,1,1
chr6	146625793	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:19,3:10,0:19,10,3,0
chr6	146708214	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146708214_C_CAAA:146708214:0,1,0,1
chr6	146708215	.	C	CTCTAAGGTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146708214_C_CAAA:146708214:0,1,0,1
chr6	146720686	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:10,0:5,2:6,9,2,0
chr6	146720886	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:146720886_T_TA:146720886:0,0,0,1
chr6	146720887	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:146720886_T_TA:146720886:0,0,0,1
chr6	146875568	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	146875740	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=107,166;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:7,0:4,13,4,1
chr6	146875778	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,147;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:1,9,0,2
chr6	146875796	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=173,147;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr6	146966071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:0,10,0,5
chr6	146975204	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr6	146985514	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=205,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,2,2
chr6	147012191	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=166,249;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:9,0,1,1
chr6	147012307	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:6,2:19,1:13,12,0,3
chr6	147047341	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:6,12:2,5:4,4,9,8
chr6	147049641	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	147049899	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr6	147054241	.	A	ATTAATGTAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=102,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:3,1:3,4:4,2,4,1
chr6	147054256	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:147054256_G_C:147054256:8,5,1,1
chr6	147054258	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:0|1:147054256_G_C:147054256:8,5,1,1
chr6	147054410	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=66,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr6	147054450	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	147062220	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:1,2,5,3
chr6	147062488	.	T	TGATTACTAAACAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=75,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,2:2,7:3,1,8,1
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	147631201	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr6	147631438	.	CCT	AGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr6	147631461	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:147631461_C_T:147631461:0,2,0,1
chr6	147631470	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:147631461_C_T:147631461:0,2,0,1
chr6	147635318	.	T	TAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.809:13:0,9:2,1:2,0,9,2
chr6	147635547	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr6	147635743	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:7,8,2,1
chr6	147649733	.	ATTTTGTCATGTAATATCTTCAGCAGAGATTGTTGTCCCAACCATACCATTCTAGTAT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.092:34:9,0:0,3:23,7,3,1
chr6	147704106	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:3,16,1,3
chr6	147704133	.	AGGTACG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=136,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	148664242	.	T	TGAGCCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGCCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,1,0
chr6	148835416	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:0,1:4,5:3,1,6,1
chr6	148835436	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:6,1,4,1
chr6	148835565	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=78,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:0|1:148835565_G_C:148835565:13,3,0,2
chr6	148835572	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=86,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:148835565_G_C:148835565:12,7,0,2
chr6	148835574	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=94,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:0|1:148835565_G_C:148835565:12,8,0,2
chr6	148835576	.	A	ATGCC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=94,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:148835565_G_C:148835565:12,8,0,2
chr6	148835578	.	A	ATACTTCATAG	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=94,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:148835565_G_C:148835565:12,8,0,2
chr6	148853867	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=93,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr6	148855812	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=114,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,7:2,0:6,0,7,0
chr6	148865257	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr6	148865694	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,14;MFRL=195,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.397:10:2,1:3,0:2,4,4,0
chr6	148869569	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.255:49:19,10:17,0:19,18,12,0
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr6	149394891	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,3,0
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr6	149721690	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=86,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,7:5,7:6,5,8,6
chr6	149772236	.	G	GCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:149772236_G_GCTCT:149772236:0,1,1,1
chr6	149772237	.	A	ATTGCATTGAGGAACTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:149772236_G_GCTCT:149772236:0,1,1,1
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,4,4
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=87.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.750:30:2,11:5,11:3,4,10,13
chr6	149782908	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	149782951	.	ATCTGCTCCAGCATACC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:3,0:6,4,1,1
chr6	149842148	.	CA	C,CAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=142,115,119;MMQ=60,60,40;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=9.64,9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,10,7:0.372,0.300:24:2,2,1:3,6,4:4,3,11,6
chr6	149856878	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=148,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:149856878_T_C:149856878:2,5,1,1
chr6	149856885	.	GG	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:149856878_T_C:149856878:2,4,1,1
chr6	149862453	.	G	GTAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,201;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TAAA;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	149903198	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=107,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:12,3:12,0:0|1:149903198_A_G:149903198:16,11,3,0
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chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr6	149983278	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,118;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:8,9,0,2
chr6	149983353	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=158,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr6	150004595	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=97,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:18,3:18,0:11,25,1,2
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chr6	150064733	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.348:14:1,2:6,2:7,2,3,2
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chr6	150123324	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr6	150158511	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:9,8,2,0
chr6	150174264	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:20,0:21,3:12,30,0,3
chr6	150209849	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=197,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,0:1,4:0,4,0,4
chr6	150210994	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=86,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:8,3:0|1:150210994_T_C:150210994:6,8,2,1
chr6	150210999	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:8,0:8,3:0|1:150210994_T_C:150210994:6,10,3,1
chr6	150212049	.	TAACAGGCAGGAAGCTGGGCGTGTACACATTCACCCTCACTGGTATGGTGAAGAAATGTTATCC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.133:22:3,0:10,3:4,15,1,2
chr6	150239257	.	CCTCCCTCCTCACCCACCTGCCCTTTGCTCCACTCCCAATTCTGCCCCCATACCTGTCA	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=77,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.048:65:5,3:8,0:42,18,3,2
chr6	150240083	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=13958,109;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr6	150244216	.	TGTCTGAATGCAGCCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCTGAATGCAGCCC;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,16,5
chr6	150290562	.	TGAGTGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:0,1:0,5,0,2
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,9,2
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,8:0,2:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,9,3
chr6	150343136	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=157,61;MMQ=29,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0|1:150343136_A_T:150343136:0,4,1,1
chr6	150343137	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,61;MMQ=29,51;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,2:2,0:0|1:150343136_A_T:150343136:0,4,1,1
chr6	150346532	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,17,14
chr6	150385730	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,8:0,12:0,1,13,8
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0|1:150387302_A_T:150387302:0,0,2,8
chr6	150387312	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0|1:150387302_A_T:150387302:0,0,1,7
chr6	150387339	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:150387339_G_A:150387339:0,3,0,1
chr6	150387341	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:150387339_G_A:150387339:0,3,0,1
chr6	150387343	.	A	AGTGTGTGTTTGAGTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:150387339_G_A:150387339:0,3,0,1
chr6	150537981	.	AAACC	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,2:15,0:15,17,1,1
chr6	150570057	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=259,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:150570057_G_T:150570057:0,1,2,2
chr6	150570063	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,26;MFRL=259,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.720:5:0,1:0,1:0|1:150570057_G_T:150570057:0,1,2,2
chr6	151055309	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=209,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:151055309_A_G:151055309:0,1,0,1
chr6	151055310	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=209,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151055309_A_G:151055309:0,1,0,1
chr6	151055312	.	G	GCACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=209,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151055309_A_G:151055309:0,1,0,1
chr6	151055314	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=209,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151055309_A_G:151055309:0,1,0,1
chr6	151089855	.	GATATCTACCACTTCA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,0:9,2:11,17,1,1
chr6	151125710	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:4,3:6,0:8,2,3,0
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:7,6:16,0:6,17,1,5
chr6	151130920	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:3,3,1,1
chr6	151142261	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:12,2:4,4:11,5,6,0
chr6	151142303	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=129,53;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,0:13,2:15,12,1,1
chr6	151142314	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:18,0:12,2:0|1:151142314_T_C:151142314:19,14,1,1
chr6	151142316	.	TG	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:18,0:14,2:0|1:151142314_T_C:151142314:19,13,1,1
chr6	151142318	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,0:14,2:0|1:151142314_T_C:151142314:19,13,1,1
chr6	151152257	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:3,0,4,2
chr6	151152656	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr6	151153274	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:151153274_T_G:151153274:4,6,1,1
chr6	151153275	.	C	CAGGGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:151153274_T_G:151153274:4,6,1,1
chr6	151197152	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=93,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,7:6,6:5,2,9,4
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr6	151258060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,1:6,2:4,7,1,2
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr6	151266717	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,0,6
chr6	151270369	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,13,17
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:2,1,1,5
chr6	151286273	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=131,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151286273_G_A:151286273:0,1,0,1
chr6	151286275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=131,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151286273_G_A:151286273:0,1,0,1
chr6	151331085	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=88,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:7,10,0,2
chr6	151336817	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:12,0:7,7:6,13,0,7
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,156;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:7,2,2,0
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:9,6:13,3:13,9,5,4
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:8,11:11,4:8,11,3,12
chr6	151413798	.	T	TATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	151627096	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=11666103,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,2:1,2:0,2,0,5
chr6	151671235	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,0:17,3:14,12,2,1
chr6	151671843	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=1472,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:151671843_A_ATG:151671843:1,1,0,1
chr6	151671844	.	A	AATCAAGGAACTG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=1472,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:151671843_A_ATG:151671843:1,1,0,1
chr6	151671852	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=166,2765;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151671852_C_T:151671852:1,0,1,0
chr6	151671861	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=166,2765;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151671852_C_T:151671852:1,0,1,0
chr6	151671864	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=155,2765;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:151671852_C_T:151671852:2,0,1,0
chr6	151671866	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=155,2765;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:151671852_C_T:151671852:2,0,1,0
chr6	151671868	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=155,2765;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151671852_C_T:151671852:2,0,1,0
chr6	151673074	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=77,184;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,4:4,3:3,8,1,6
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:2,3:5,1,5,2
chr6	151674744	.	GATGCC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=74,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:7,0:0|1:151674744_GATGCC_G:151674744:5,10,2,0
chr6	151674753	.	GAAGT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=62,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:151674744_GATGCC_G:151674744:5,3,2,0
chr6	151686596	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:9,1,2,0
chr6	151686834	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:13,13,0,2
chr6	151694867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151694867_T_C:151694867:0,1,0,1
chr6	151694869	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151694867_T_C:151694867:0,1,0,1
chr6	151694871	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151694867_T_C:151694867:0,1,0,1
chr6	151694873	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151694867_T_C:151694867:0,1,0,1
chr6	151726300	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,1:9,4:13,4,2,3
chr6	151738376	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,1:6,2:8,7,2,1
chr6	151742541	.	TG	CA,CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32,25;MFRL=0,179,153;MMQ=60,60,60;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.10,26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.213,0.715:11:0,1,5:0,1,4:0,0,0,11
chr6	151743629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=100,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,2:6,1:10,3,3,0
chr6	151766500	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.206:36:17,6:12,1:12,17,5,2
chr6	151785848	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151785848_A_C:151785848:0,0,0,1
chr6	151785850	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151785848_A_C:151785848:0,0,0,1
chr6	151785852	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151785848_A_C:151785848:0,0,0,1
chr6	151790333	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=290,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151790333_G_T:151790333:0,1,0,1
chr6	151790335	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=290,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151790333_G_T:151790333:0,1,0,1
chr6	151790338	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=290,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151790333_G_T:151790333:0,1,0,1
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.687:30:4,10:5,11:7,2,12,9
chr6	151859314	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,8:3,6:2,5,8,6
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=66,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,5:1,4:1,2,7,2
chr6	151894505	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:3,9:0,11:3,0,11,9
chr6	151917745	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,0:2,2:3,7,0,2
chr6	152163752	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,1:7,1:10,4,2,0
chr6	152201875	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,10,10
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr6	152265458	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=119,249;MMQ=60,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,0:6,4:8,11,0,4
chr6	152332874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=80,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr6	152419932	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:16,0:19,7:25,10,0,7
chr6	152461048	.	CTGTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,5:0,3:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:2,2,7,1
chr6	152461061	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.687:14:3,5:1,5:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:2,2,7,3
chr6	152461246	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,47;MMQ=60,35;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:6,0:16,2:0|1:152461246_A_G:152461246:13,11,1,1
chr6	152461251	.	T	TTTAAGCACTTCTCTGTA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,47;MMQ=60,35;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:6,0:16,2:0|1:152461246_A_G:152461246:11,11,1,1
chr6	152466582	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:6,8:3,7:6,3,8,7
chr6	152466779	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:152466779_A_T:152466779:0,3,0,1
chr6	152466780	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:152466779_A_T:152466779:0,3,0,1
chr6	152469534	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=146,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:152469534_A_C:152469534:2,7,1,1
chr6	152469539	.	G	GCTGCCCACCAATGGAGAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:152469534_A_C:152469534:2,7,1,1
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	152489294	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,2,5
chr6	152489328	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=173,94;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	152532720	.	A	ATGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:152532720_A_ATGT:152532720:5,7,1,1
chr6	152532723	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,0:0|1:152532720_A_ATGT:152532720:5,7,1,1
chr6	152534758	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=129,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:9,0:6,2:0|1:152534758_T_TG:152534758:12,3,1,1
chr6	152534765	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:9,0:6,1:0|1:152534758_T_TG:152534758:13,2,1,1
chr6	152534776	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:0|1:152534776_G_A:152534776:9,5,1,1
chr6	152534779	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,1:6,0:0|1:152534776_G_A:152534776:9,5,1,1
chr6	152534946	.	TT	AA,AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25,22;MFRL=0,129,49;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.56,5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.591,0.321:8:0,3,1:0,3,1:0,0,1,7
chr6	152534970	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=176,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:152534970_A_T:152534970:0,4,0,1
chr6	152534973	.	T	TAACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=241,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:152534970_A_T:152534970:0,2,0,1
chr6	152539419	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,3:14,0:5,22,3,0
chr6	152539572	.	TA	T,TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,25,28;MFRL=89,144,0;MMQ=60,60,60;MPOS=15,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.75,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.310,0.412:8:2,3,0:0,0,2:0,2,0,6
chr6	152545865	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	152555112	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr6	152557178	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr6	152560919	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152560919_TG_CA:152560919:1,0,0,1
chr6	152560922	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152560919_TG_CA:152560919:1,0,0,1
chr6	152560936	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr6	152563660	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=172,467;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152563660_C_T:152563660:1,0,0,1
chr6	152563661	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=172,467;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152563660_C_T:152563660:1,0,0,1
chr6	152570415	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr6	152605168	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:5,5,0,3
chr6	152605379	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=295,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152605379_T_A:152605379:0,1,0,1
chr6	152605384	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=295,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152605379_T_A:152605379:0,1,0,1
chr6	152615042	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:4,4,5,1
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=239,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,4:0,10:1,0,11,3
chr6	152629772	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=10,17;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr6	152629815	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	152638209	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	152639230	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,7:7,0:6,7,7,0
chr6	152646525	.	A	ATGGAGGAAAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	152646993	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr6	152647681	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,13:0,0,8,8
chr6	152652034	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr6	152658191	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	152658216	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr6	152668272	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:12,5,2,1
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr6	152671553	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	152671565	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:152671565_A_T:152671565:0,2,0,1
chr6	152671567	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:152671565_A_T:152671565:0,2,0,1
chr6	152671568	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:152671565_A_T:152671565:0,2,0,1
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,5:0,1:0,0,1,7
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=38,31;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	152673147	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.936:14:0,3:0,7:0,0,0,14
chr6	152673543	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=198,165;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.461:6:0,1:2,1:0,3,0,3
chr6	152673556	.	G	GCCATACA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=177,199;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	152673568	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=223,161;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:152673568_CA_TG:152673568:0,3,0,1
chr6	152673571	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=223,161;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:152673568_CA_TG:152673568:0,3,0,1
chr6	152673577	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=223,161;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:152673568_CA_TG:152673568:0,3,0,1
chr6	152675854	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,12,11
chr6	152679528	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=78,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,4:7,0:3,4,4,0
chr6	152683413	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr6	152683553	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.664:4:0,0:1,2:0|1:152683553_G_T:152683553:0,1,2,1
chr6	152683556	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:152683553_G_T:152683553:0,0,2,1
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr6	152694420	.	CT	C,CTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31,22;MFRL=159,206,155;MMQ=55,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,0:1,0,1:0,2,0,2
chr6	152694437	.	TG	CA,CG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,34,27;MFRL=202,183,155;MMQ=60,50,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr6	152694441	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	152694446	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,31;MFRL=202,183;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:152694446_A_G:152694446:0,3,0,1
chr6	152694454	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=202,183;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152694446_A_G:152694446:0,1,0,1
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=178,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr6	152712559	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,197;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,0:8,5:11,8,0,5
chr6	152719872	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:6,0:5,2:3,8,0,3
chr6	152722228	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:5,1,5,0
chr6	152728079	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:2,0,6,1
chr6	152748975	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:0|1:152748975_CAA_C:152748975:1,6,1,1
chr6	152748978	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0|1:152748975_CAA_C:152748975:1,6,1,1
chr6	152751412	.	A	ATC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:0|1:152751412_A_ATC:152751412:0,8,0,3
chr6	152751413	.	CTG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:0|1:152751412_A_ATC:152751412:0,8,0,3
chr6	152751417	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0|1:152751412_A_ATC:152751412:0,8,0,3
chr6	152751421	.	A	AGGTAGG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0|1:152751412_A_ATC:152751412:0,8,0,3
chr6	152771977	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:0|1:152771977_TAA_T:152771977:2,6,0,3
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chr6	154567676	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1|0:154567666_T_G:154567666:4,0,3,0
chr6	154568020	.	TT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	154727408	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,4:3,0:4,0,4,1
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:3,5,1,7
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:1,6:2,12:1,2,11,7
chr6	154762376	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.803:8:1,2:0,3:0|1:154762376_CAA_C:154762376:0,1,5,2
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.850:11:1,2:0,5:0|1:154762376_CAA_C:154762376:0,1,5,5
chr6	154771277	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=79,64;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:15,0:9,5:12,12,3,2
chr6	154831319	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,0:4,5:1,6,0,6
chr6	155116285	.	TTC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:5,8:5,9:4,6,3,14
chr6	155116371	.	T	TCAAAGTGGACACAATAAAATAAAAACAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=279,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	155124583	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=225,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,2:1,4:3,0,5,1
chr6	155129784	.	CCTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:3,1,6,3
chr6	155131256	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:21,3:22,0:19,24,3,0
chr6	155450808	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.232:10:0,2:8,0:0|1:155450808_C_CA:155450808:3,5,1,1
chr6	155450809	.	C	CACATCACCAACCTGGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=167,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.232:10:0,2:8,0:0|1:155450808_C_CA:155450808:3,5,1,1
chr6	155451613	.	G	GTGGTAAAAGTATTGTCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	155470190	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr6	155565089	.	TC	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,7,6
chr6	155565744	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	155569315	.	TGAGGCGGCGGCGGCACCTCCGGGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,1:4,1:0,13,0,2
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,12,9
chr6	155572140	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	155574198	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:0,10:1,4:0|1:155574198_C_T:155574198:0,1,4,10
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0|1:155574198_C_T:155574198:0,0,3,10
chr6	155575546	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,11:0,0,15,12
chr6	155575568	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=159,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:11,0:0|1:155575568_A_G:155575568:11,11,2,0
chr6	155575572	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=153,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:10,0:0|1:155575568_A_G:155575568:10,11,2,0
chr6	155577717	.	TGAGCAGCGGCACCCA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:13,3:11,0:17,16,2,1
chr6	155619642	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=117,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:11,7,3,0
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr6	155775850	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr6	157488357	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	157495951	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.599:16:1,6:4,4:5,1,9,1
chr6	157502302	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=100,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,0:13,2:0|1:157502302_G_C:157502302:16,15,1,1
chr6	157502308	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=100,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,0:14,2:0|1:157502302_G_C:157502302:16,15,1,1
chr6	157502310	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:14,2:0|1:157502302_G_C:157502302:15,15,1,1
chr6	157511407	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157511407_A_C:157511407:0,0,0,1
chr6	157511408	.	CAACAGT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157511407_A_C:157511407:0,0,0,1
chr6	157517485	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,134;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,0:5,4:2,12,0,4
chr6	157527418	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=93,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:0|1:157527418_G_A:157527418:11,13,1,1
chr6	157527427	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:8,2:0|1:157527418_G_A:157527418:11,14,1,1
chr6	158013779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=179,175;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,0,2
chr6	158049365	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,9;MFRL=75,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.262:17:3,0:7,0:6,6,5,0
chr6	158054027	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=169,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:158054027_A_C:158054027:0,4,0,1
chr6	158054034	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=212,243;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:158054027_A_C:158054027:0,4,0,1
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr6	158093661	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093665	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093670	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158093674	.	GTG	CCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:158093661_A_C:158093661:0,0,4,0
chr6	158288564	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,0:4,3:10,4,2,1
chr6	158294104	.	CTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=161,157,104;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.75,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.287,0.394:10:2,1,3:1,2,1:3,0,7,0
chr6	158318081	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr6	158353392	.	C	CTGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:158353392_C_CTGTA:158353392:0,3,0,1
chr6	158353394	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:158353392_C_CTGTA:158353392:0,3,0,1
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,17,14
chr6	158438933	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=243,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr6	158482974	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr6	158499097	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr6	158499302	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,7:1,5:2,1,4,8
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=78,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.740:17:1,3:3,10:3,1,10,3
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr6	158504365	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=84,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:2,1,4,2
chr6	158505088	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,10,10
chr6	158505093	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,39;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:8,2:9,2:8,9,2,2
chr6	158505295	.	G	GAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,2:0,0,7,5
chr6	158565321	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:14,6:8,0:17,5,0,6
chr6	158569886	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.276:20:7,3:6,2:7,8,3,2
chr6	158570024	.	AT	A,ATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23,23;MFRL=206,202,203;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.29,4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.250,0.452:4:1,1,1:0,0,1:0,1,0,3
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr6	158735087	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,12:0,7:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,14,8
chr6	158735090	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,14,8
chr6	158870081	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr6	158870278	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	158882836	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	158901043	.	C	CTCTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:158901043_C_CTCTTT:158901043:0,0,0,1
chr6	158901044	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:158901043_C_CTCTTT:158901043:0,0,0,1
chr6	158902274	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,1:16,1:16,14,0,2
chr6	158910543	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	158915843	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:158915843_G_A:158915843:11,7,1,1
chr6	158915851	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=88,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:158915843_G_A:158915843:10,10,1,1
chr6	158919695	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:17,0:19,4:22,14,1,3
chr6	158922685	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,147;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,8:4,0:4,1,8,0
chr6	158923162	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,0:2,3:1,3,1,2
chr6	158923380	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:9,4,2,1
chr6	158927767	.	G	GTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,3,18
chr6	159028253	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=81,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:7,0:0|1:159028253_TG_T:159028253:8,11,1,1
chr6	159028272	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:159028253_TG_T:159028253:10,12,1,1
chr6	159046206	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=97,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,2:14,1:9,12,1,2
chr6	159046295	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=216,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	159057760	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr6	159128429	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	159184462	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr6	159185427	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr6	159185563	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,1:0,20:0,0,10,12
chr6	159187877	.	GAC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr6	159188282	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:5,2,5,0
chr6	159190492	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	159191788	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=48,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.952:38:0,15:0,19:1,0,20,17
chr6	159191813	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,0:19,2:0|1:159191813_G_T:159191813:18,17,0,2
chr6	159191815	.	C	CTTTTTTTTTT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,12;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,0:18,2:0|1:159191813_G_T:159191813:18,17,0,2
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr6	159197371	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	159205632	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,9:1,8:2,0,16,1
chr6	159205668	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:1,10:0,20:1,0,21,9
chr6	159206251	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr6	159206512	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,2887;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.205:35:12,6:16,0:11,17,3,4
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	159330996	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:4,9:6,0:7,4,9,0
chr6	159398839	.	CAT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:10,0:13,10:6,17,0,10
chr6	159421094	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr6	159459297	.	C	CTTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,27;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr6	159618397	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=3148446,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr6	159620925	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	159644546	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,3:10,1:13,10,3,1
chr6	159646853	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	159647454	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,4:1,3:3,2,4,3
chr6	159653774	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:6,5,4,3
chr6	159654099	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,0:4,4:2,4,2,2
chr6	159655084	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=161,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,5:0,1,6,5
chr6	159655102	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr6	159655326	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr6	159655334	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:3,2,2,0
chr6	159655383	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0|1:159655383_A_G:159655383:0,0,8,5
chr6	159655402	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0|1:159655383_A_G:159655383:0,0,9,7
chr6	159655593	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	159670292	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:159670292_GG_TT:159670292:1,2,0,1
chr6	159670296	.	T	TTTCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:159670292_GG_TT:159670292:1,2,0,1
chr6	159670298	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:159670292_GG_TT:159670292:1,2,0,1
chr6	159670300	.	C	CTGGTACCTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:159670292_GG_TT:159670292:1,2,0,1
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=115,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,2:12,2:9,7,2,2
chr6	159689049	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:6,4,3,0
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,1:9,4:2,12,1,4
chr6	160114311	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	160114366	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	160157277	.	CT	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.121:56:30,5:17,2:36,12,6,2
chr6	160159907	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.746:14:1,4:2,4:3,0,11,0
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=111,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:16,3:8,3:17,8,6,0
chr6	160184137	.	AAC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:3,2:9,3:1,11,0,5
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr6	160200026	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.898:27:2,8:0,17:1,1,16,9
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	160201895	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=280,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:1,12,2,1
chr6	160210414	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.248:25:3,1:9,0:0|1:160210414_A_C:160210414:11,8,6,0
chr6	160210418	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.238:26:6,1:10,1:0|1:160210414_A_C:160210414:12,8,6,0
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,13,4
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,17:0,25:0,0,20,23
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=175.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,24:0,0,20,27
chr6	160211697	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,21:0.734:28:4,11:3,10:0|1:160211697_C_T:160211697:1,6,2,19
chr6	160211700	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,18:0.704:25:4,9:3,8:0|1:160211697_C_T:160211697:1,6,2,16
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr6	160221279	.	GCGTGGGCAGCA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTGGGCAGCA;STR;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,6:1,2:2,0,8,0
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	160225012	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:6,8:14,2:13,7,5,5
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0,0,13,12
chr6	160226923	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:15,1:11,4:12,14,1,4
chr6	160232916	.	TTTTTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.844:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr6	160237662	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,19;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.921:7:0,1:0,1:0,0,2,5
chr6	160237688	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:160237688_G_T:160237688:1,6,0,2
chr6	160237692	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,7,0,2
chr6	160237695	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=22,33;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,7,0,2
chr6	160237697	.	TC	CA	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,7,0,2
chr6	160237704	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,7,0,2
chr6	160237710	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,6,0,2
chr6	160237712	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=24,32;MFRL=165,150;MMQ=60,50;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:160237688_G_T:160237688:0,5,0,2
chr6	160237745	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,21;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr6	160239640	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,114;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:9,7,0,2
chr6	160240026	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=80,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:7,8,2,1
chr6	160240420	.	G	GAGTCTCCTTCATCTTCCCCTCCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	160445793	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr6	160448232	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=99,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,19:0.278:70:27,0:24,19:27,24,0,19
chr6	160448324	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:7,13:3,11:5,5,7,17
chr6	160465752	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160465752_A_C:160465752:0,0,0,1
chr6	160465754	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160465752_A_C:160465752:0,0,0,1
chr6	160482674	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=93,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,0:11,5:11,9,0,5
chr6	160485987	.	G	GATTCCATTCAATGATTCCATTCGGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=84958877,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	160493009	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:2,6:3,11:2,3,9,9
chr6	160495055	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr6	160496786	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160496786_C_T:160496786:1,0,1,0
chr6	160496789	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160496786_C_T:160496786:1,0,1,0
chr6	160505199	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,14,17
chr6	160524946	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:6,0:4,2:1,10,0,3
chr6	160525755	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=84,268;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.255:36:11,8:16,0:12,15,9,0
chr6	160551204	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.302:31:10,5:12,4:9,13,3,6
chr6	160557248	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:13,1:22,1:20,16,1,1
chr6	160557407	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,0:4,2:0|1:160557407_G_T:160557407:0,5,0,2
chr6	160557413	.	G	GCTCCCTCGTGCCCTGCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:160557407_G_T:160557407:0,6,0,2
chr6	160564514	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,3:6,0:12,5,3,0
chr6	160579527	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:9,2:14,3,1,2
chr6	160670282	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,19,17
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	160677614	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=87,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.861:19:2,2:0,15:1,1,10,7
chr6	160769423	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	160829853	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:8,15,0,3
chr6	160858287	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:160858287_A_T:160858287:0,3,0,1
chr6	160858290	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:160858287_A_T:160858287:0,3,0,1
chr6	160863929	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:4,8,1,1
chr6	160863947	.	C	CCATCATCACATCGTCACTATCAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:2,7,1,1
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,0:5,3:7,1,2,1
chr6	160921848	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=81,78;MMQ=56,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:160921848_G_T:160921848:0,4,0,1
chr6	160921850	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=81,78;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:160921848_G_T:160921848:0,4,0,1
chr6	160962240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=158,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	160968863	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,2:4,1,3,2
chr6	160969738	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,183;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,2:0,1,1,4
chr6	160977272	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=100,39583;MMQ=60,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr6	160998148	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=100,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:2,3,1,4
chr6	161012132	.	C	CTCCTCCTAGAAGAATGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	161021873	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	161128922	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	161137663	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,8:2,4:4,0,9,3
chr6	161143376	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,3:2,0,5,1
chr6	161143608	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=121,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,30:0.722:41:7,9:4,21:6,5,6,24
chr6	161152294	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,1,5
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,99;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr6	161173290	.	C	CTCTTCTGGAGACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:2,6,1,1
chr6	161413211	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=68,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,4:1,2,6,5
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=265,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr6	161510565	.	TAA	GTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:161510565_TAA_GTC:161510565:0,4,0,1
chr6	161510574	.	TAA	T,TGTGTGTGTGGGAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,25,28;MFRL=141,136,188;MMQ=60,60,60;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr6	161510575	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:161510565_TAA_GTC:161510565:0,1,0,1
chr6	161510577	.	G	GAGTGGTGTAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:161510565_TAA_GTC:161510565:0,2,0,1
chr6	161510578	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:161510565_TAA_GTC:161510565:0,2,0,1
chr6	161519328	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=157,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:8,6,2,0
chr6	161519350	.	CCTGCTG	C,CCTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,29,31;MFRL=0,124,169;MMQ=60,60,60;MPOS=4,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=CTG;STR;TLOD=9.13,50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,13:0.179,0.776:16:0,1,8:0,2,5:0,0,8,8
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,6:1,1:0,3,1,6
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,27:0.874:30:2,8:1,19:0,3,13,14
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.891:11:0,9:0,1:0,1,2,8
chr6	161560499	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.206:14:6,3:5,0:0|1:161560499_C_T:161560499:4,7,2,1
chr6	161560507	.	A	AGC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:161560499_C_T:161560499:3,7,1,1
chr6	161560511	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:161560499_C_T:161560499:3,7,1,1
chr6	161586837	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161586837_C_T:161586837:0,0,0,1
chr6	161586840	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161586837_C_T:161586837:0,0,0,1
chr6	161587307	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,0:9,6:12,10,0,6
chr6	161587389	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,2:1,0:7,6,1,1
chr6	161966584	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	162622357	.	T	TTTTGCTTTTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:162622357_T_TTTTGCTTTTCC:162622357:0,1,0,1
chr6	162622360	.	T	TTCCTTTTCTTCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162622357_T_TTTTGCTTTTCC:162622357:0,1,0,1
chr6	162683876	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:3,0,7,1
chr6	163149189	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr6	163149497	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,2:0,1,2,4
chr6	163899794	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.460:17:5,3:3,5:6,3,6,2
chr6	165695049	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,14,5
chr6	165706923	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:12,0:13,4:13,12,0,4
chr6	165713961	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr6	165713998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	165715006	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	165715875	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	165826898	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,3,9
chr6	165845027	.	AATATACTATATATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr6	166578025	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr6	166720994	.	G	GGGACTACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:166720994_G_GGGACTACA:166720994:0,3,0,1
chr6	166720998	.	G	GCCCGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:166720994_G_GGGACTACA:166720994:0,3,0,1
chr6	166721073	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,8:0,22:0,0,20,10
chr6	166741921	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr6	166743760	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,11:0,19:0,0,8,23
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	166827436	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,1:0,0,2,10
chr6	166827487	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:166827487_C_A:166827487:0,1,0,1
chr6	166827488	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:166827487_C_A:166827487:0,1,0,1
chr6	166833478	.	C	CGGCTAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,25;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:3,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166833480	.	T	TTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166833482	.	A	ATTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,23;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166833483	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166833485	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,23;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166833487	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,29;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:166833478_C_CGGCTAA:166833478:2,2,0,1
chr6	166862431	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	166864812	.	TGCAAGTCC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,3:1,0:2,7,0,3
chr6	166889331	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:8,1:8,7,1,1
chr6	166889390	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:3,7,1,1
chr6	167352027	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr6	167360104	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr6	167427069	.	GGGC	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:14,2:14,0:0|1:167427069_GGGC_G:167427069:17,12,1,1
chr6	167427073	.	AGAGG	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,2:15,0:0|1:167427069_GGGC_G:167427069:18,13,1,1
chr6	167427079	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:0|1:167427069_GGGC_G:167427069:17,13,1,1
chr6	167427084	.	GC	TG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:15,2:14,0:0|1:167427069_GGGC_G:167427069:17,15,1,1
chr6	167453519	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.444:11:1,2:4,3:0,6,1,4
chr6	167571573	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.335:31:12,10:9,0:10,11,10,0
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	167590541	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,3,5
chr6	167594241	.	C	CTCTGCTGAACGATGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=160,61;MMQ=27,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,3:1,0:0|1:167594241_C_CTCTGCTGAACGATGA:167594241:1,3,2,1
chr6	167594244	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=160,61;MMQ=27,51;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:167594241_C_CTCTGCTGAACGATGA:167594241:1,3,0,1
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=120,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:2,3,3,1
chr6	167719527	.	T	TACACACTTTCAAATAACCAGATCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:5,0:1,6,1,1
chr6	167721253	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr6	167728774	.	TG	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=213,153;MMQ=52,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.794:8:0,3:1,3:1,0,4,3
chr6	167752312	.	G	GTTCC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=114,210;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TTCC;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.770:7:0,1:1,3:0,1,0,6
chr6	167753935	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=82,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.311:25:7,1:10,4:9,8,7,1
chr6	167772869	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:3,6:0,4:2,1,3,7
chr6	167789427	.	CAGTT	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0|1:167789427_CAGTT_C:167789427:0,0,7,0
chr6	167789440	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:0,2:0|1:167789427_CAGTT_C:167789427:0,1,6,0
chr6	167789442	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0|1:167789427_CAGTT_C:167789427:0,1,6,0
chr6	167789488	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:11,9,2,1
chr6	167789615	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,107;MMQ=33,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:0,1,2,7
chr6	167794562	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:167794562_A_T:167794562:0,0,0,1
chr6	167794572	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167794562_A_T:167794562:0,0,0,1
chr6	167796186	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr6	168227073	.	ACCGCCCGTCC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCCCGTCC;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:4,0:4,4,1,1
chr6	168272817	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	168276073	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:4,4:15,0:13,7,2,2
chr6	168291710	.	GTGAGAAAA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:5,0:5,14,0,2
chr6	168317876	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:0|1:168317876_C_A:168317876:9,15,1,1
chr6	168317880	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:10,0:0|1:168317876_C_A:168317876:9,14,1,1
chr6	168344180	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:168344180_G_A:168344180:5,13,1,1
chr6	168344184	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:168344180_G_A:168344180:5,13,1,1
chr6	168363207	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:21,0:30,4:15,37,2,2
chr6	168370704	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168370704_G_C:168370704:0,0,0,1
chr6	168370707	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168370704_G_C:168370704:0,0,0,1
chr6	168376820	.	CTCCCCCTGCAGTGTGTGTGTGGGGAGCAGGAGGCAGTGGGGGTCATTCCCCCTGCAGTGTTGGGGGAGGAGAAGGCAGTGGGGGTCAT	C	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=90,82;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,13:0.088:107:19,11:12,2:62,32,7,6
chr6	168440639	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	168440985	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,217;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	168457966	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,12:0,0:0,0,5,7
chr6	168458072	.	CCG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:168458072_CCG_C:168458072:0,3,0,1
chr6	168458074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.810:3:0,3:0,0:1|0:168458072_CCG_C:168458072:0,0,0,3
chr6	168458080	.	GG	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:168458072_CCG_C:168458072:0,3,0,1
chr6	168459790	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:168459790_G_T:168459790:0,0,2,0
chr6	168459792	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:168459790_G_T:168459790:0,0,2,0
chr6	168463525	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr6	168468186	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	168711797	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	168928225	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr6	168947956	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	168999421	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=173,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:168999421_T_G:168999421:4,0,1,0
chr6	168999427	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0|1:168999421_T_G:168999421:4,1,1,1
chr6	169008822	.	TC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=68,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.261:34:12,4:8,5:4,21,5,4
chr6	169051410	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:7,5,2,0
chr6	169053532	.	T	TGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=165,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	169066961	.	TCTTACTCATA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=198,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.672:10:0,5:3,2:3,0,7,0
chr6	169067051	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=103,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.135:34:11,4:19,0:16,14,2,2
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=106,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.272:49:18,9:11,4:25,11,6,7
chr6	169618044	.	T	TATGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=ATGG;STR;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	169628169	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,2:1,4:1,2,4,3
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,7:1,5:0,2,2,10
chr6	169632378	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=83,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:4,13:3,5:3,4,11,7
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,6:0,2:0,2,0,8
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr6	169637701	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,3:1,7:2,0,7,4
chr6	169639887	.	T	TATCTAGTCCTTTCTGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=318,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	169646226	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,4:8,0:11,2,2,2
chr6	169646451	.	C	CACAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:169646451_C_CACAAAA:169646451:0,4,0,1
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chr6	170047880	.	A	AATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:7,0:7,9,1,1
chr6	170049421	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr6	170058473	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:4,8,1,1
chr6	170058486	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:170058486_AG_A:170058486:2,8,1,1
chr6	170058489	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:170058486_AG_A:170058486:2,8,1,1
chr6	170059145	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,0:6,3:10,5,2,1
chr6	170059627	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,2:7,1:0|1:170059627_G_A:170059627:6,8,1,2
chr6	170059636	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:0|1:170059627_G_A:170059627:6,10,1,1
chr6	170059639	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:0|1:170059627_G_A:170059627:6,10,1,1
chr6	170070836	.	C	CAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:170070836_C_CAAGA:170070836:0,3,0,1
chr6	170070839	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170070836_C_CAAGA:170070836:0,3,0,1
chr6	170110404	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=128,112;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.642:26:5,7:4,9:4,5,8,9
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	170119031	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:3,6:2,10:0,5,2,14
chr6	170144228	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=139,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,2:2,3:0,3,3,2
chr6	170155477	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=90,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.216:44:23,4:12,5:13,22,3,6
chr6	170156890	.	TTCAG	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAG;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:15,0:14,2:14,17,1,1
chr6	170159023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,7:0,1:3,0,7,1
chr6	170162515	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:4,4,5,6
chr6	170181516	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:4,14:2,6:4,2,9,11
chr6	170181708	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr6	170597276	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.706:22:4,5:2,9:5,1,13,3
chr6	170598878	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:10,0:12,9,2,0
chr6	170626483	.	G	GCAGCTCGCGACT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=90,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:17,2:11,0:14,15,1,1
chr6	170627586	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,6:12,2:10,14,5,3
chr6	170697405	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,164;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:12,7:15,0:12,15,7,0
chr6	170852739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=128,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:8,8,0,2
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,9,3
chr6	170871046	.	ACAG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=189,174;MMQ=44,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=CAG;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.767:6:0,1:0,1:1,0,2,3
chr6	170881386	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:13,1:8,13,1,1
chr6	170881396	.	T	TGTTTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=105,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:8,2:3,12,1,1
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr6	170893364	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr7	197267	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:538277_G_C:538277:0,0,8,7
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0|1:538277_G_C:538277:0,0,6,8
chr7	538348	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	540110	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:540110_G_T:540110:4,7,1,1
chr7	540112	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:540110_G_T:540110:4,7,1,1
chr7	551946	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	624221	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr7	720288	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:5,2:6,0:11,0,0,3
chr7	751068	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:6,5:6,4:7,5,8,1
chr7	751220	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:1,0,9,2
chr7	790587	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,145;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:1,7,0,2
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr7	803342	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	810219	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr7	813650	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,12:0,0,9,8
chr7	814612	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,12:0,0,18,6
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,11,4
chr7	881668	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,3:1,5:4,2,5,3
chr7	881828	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:881828_TG_T:881828:0,0,1,0
chr7	881833	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:881828_TG_T:881828:0,0,1,0
chr7	888314	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=261,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	889714	.	T	TAGACTGAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:2,1,7,1
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,6:1,2:0,4,0,8
chr7	893261	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,4,0,1
chr7	893263	.	C	CCG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,4,0,1
chr7	893265	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,4,0,1
chr7	893271	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,4,0,1
chr7	893272	.	TACCA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,4,0,1
chr7	893283	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,34;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:893261_T_C:893261:0,2,0,1
chr7	899710	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=253,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	912298	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=200,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr7	912990	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:10,0:2,5:0,12,0,5
chr7	926614	.	G	GCTGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,2:1,0:0|1:926614_G_GCTGC:926614:2,0,1,1
chr7	926616	.	C	CACCTCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:926614_G_GCTGC:926614:2,0,1,1
chr7	926617	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:926614_G_GCTGC:926614:2,0,1,1
chr7	926621	.	GACGT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=314,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:926614_G_GCTGC:926614:1,0,1,1
chr7	926627	.	C	CCCGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:926614_G_GCTGC:926614:0,0,1,1
chr7	932062	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:6,6:3,4:4,5,9,2
chr7	932122	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=234,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:0,4,0,6
chr7	932151	.	A	ATAGGAAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:932151_A_ATAGGAAT:932151:1,1,0,1
chr7	932153	.	C	CTTGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:932151_A_ATAGGAAT:932151:1,1,0,1
chr7	932154	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:932151_A_ATAGGAAT:932151:1,1,0,1
chr7	933389	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=74,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,0:5,3:9,6,1,2
chr7	933499	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:4,6,1,1
chr7	939007	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:2,4,5,3
chr7	940111	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,212;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:940111_C_G:940111:0,0,2,0
chr7	940113	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,212;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0|1:940111_C_G:940111:0,0,2,0
chr7	940120	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=216,212;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,1:2,0:0|1:940111_C_G:940111:1,1,2,0
chr7	940125	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=216,235;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:940111_C_G:940111:1,1,1,0
chr7	940128	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=216,235;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:940111_C_G:940111:1,1,1,0
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=80,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.309:27:10,2:9,4:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:8,11,3,5
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=74,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.283:30:9,4:9,4:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:11,11,3,5
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr7	966251	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:966251_C_T:966251:6,9,1,1
chr7	966256	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:5,0:0|1:966251_C_T:966251:5,8,1,1
chr7	1028523	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	1133186	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,3:7,0:8,4,1,2
chr7	1192619	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=228,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:2,3,4,0
chr7	1192693	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:9,1:0,1:5,4,2,0
chr7	1192922	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,198;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:2,7,0,2
chr7	1197246	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:11,0:9,5,2,1
chr7	1474328	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:1474328_T_TG:1474328:1,5,1,1
chr7	1474330	.	A	AAGGGAAGGATGTTTCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:1474328_T_TG:1474328:1,5,1,1
chr7	1474342	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=83,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr7	1478714	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	1482101	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,7:5,0:4,5,4,3
chr7	1482134	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:2,2,0,3
chr7	1484572	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr7	1487384	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:2,4:8,3:3,7,3,4
chr7	1510520	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,10:5,0:4,5,9,1
chr7	1511253	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,0:5,2:0|1:1511253_A_G:1511253:7,4,1,1
chr7	1511258	.	A	AGACCTGCTGGAGGTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:1511253_A_G:1511253:7,4,1,1
chr7	1511967	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,25;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:7,4,1,1
chr7	1513789	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=250,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr7	1518191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	1519011	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	1519361	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0|1:1519361_A_G:1519361:0,1,0,3
chr7	1519370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1519361_A_G:1519361:0,2,0,1
chr7	1519372	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1519361_A_G:1519361:0,2,0,1
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.695:11:2,5:1,3:0|1:1522157_T_C:1522157:2,1,7,1
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:1522157_T_C:1522157:0,0,8,3
chr7	1525072	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=91,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,2:1,4:2,6,3,3
chr7	1526167	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=166,154;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	1526174	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=162,151;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:1526174_G_T:1526174:2,0,1,0
chr7	1526180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=79,151;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:1526174_G_T:1526174:3,1,1,0
chr7	1526181	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=151,79;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr7	1526903	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=264,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,1:2,4:1,1,5,0
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.881:18:0,1:3,4:4,0,9,5
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,3:4,6:6,3,6,4
chr7	1533544	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:7,12,1,1
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:2,2,0,6
chr7	1534425	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=64,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,1,1
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr7	1538499	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,1,5
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	1538548	.	T	TCCTCATGTTGCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	1538877	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:1,1,3,2
chr7	1540049	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	1543476	.	T	TCCCCAAAGAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCCAAAGAC;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.658:7:1,2:2,1:3,0,0,4
chr7	1579877	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,2:0,0:2,2,0,2
chr7	1586866	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	1589083	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	1589417	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,1:0,6:0,0,4,4
chr7	1589535	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:1589535_G_A:1589535:9,7,1,1
chr7	1589544	.	GC	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,2:0|1:1589535_G_A:1589535:8,12,1,1
chr7	1589547	.	A	AGATGCGTTTTTGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:1589535_G_A:1589535:8,11,1,1
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
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chr7	1608681	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=180,176;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:1608677_GC_AT:1608677:3,0,1,0
chr7	1608684	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=180,176;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:1608677_GC_AT:1608677:3,0,1,0
chr7	1608690	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=180,167;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:1608677_GC_AT:1608677:3,0,2,0
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chr7	1787537	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=106,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:8,3:16,1:0|1:1787537_G_A:1787537:10,23,4,0
chr7	1787538	.	ACTATGTCTACTT	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=99,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.103:46:7,3:19,0:0|1:1787537_G_A:1787537:13,29,4,0
chr7	1787677	.	C	CACGTCTTCTGTTTGTCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr7	1787691	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=136,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	1855811	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=110,88;MMQ=52,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,3:12,0:10,9,3,0
chr7	1878377	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=124,179;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:2,3,1,4
chr7	1887037	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.814:10:0,5:0,2:0,2,0,8
chr7	1976432	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,5,0
chr7	1997241	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr7	2020423	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	2041589	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,263;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:3,0,3,0
chr7	2108982	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,0,5
chr7	2255498	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=66,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:8,2:11,3:11,8,4,1
chr7	2257562	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:10,4,1,1
chr7	2257658	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=80,69;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.341:36:11,0:13,12:6,18,1,11
chr7	2259134	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr7	2260715	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=91,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr7	2278854	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=109,431;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,0:11,2:13,13,2,0
chr7	2278940	.	C	CCTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,1,1
chr7	2281754	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	2290685	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	2294787	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=65,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,0:2,3:5,6,1,2
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr7	2304191	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	2309209	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=72,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.649:29:5,8:4,8:1,9,6,13
chr7	2309336	.	G	GGCTGCAGCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:2309336_G_GGCTGCAGCC:2309336:0,4,0,2
chr7	2309338	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:2309336_G_GGCTGCAGCC:2309336:0,4,0,2
chr7	2400306	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr7	2402813	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=133,57;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:2402813_T_C:2402813:3,8,1,1
chr7	2402820	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,57;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:2402813_T_C:2402813:2,7,1,1
chr7	2402826	.	A	ATG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=133,57;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:2402813_T_C:2402813:1,6,1,1
chr7	2402831	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=146,57;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:2402813_T_C:2402813:0,6,1,1
chr7	2402833	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=146,57;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,1:0|1:2402813_T_C:2402813:0,6,1,1
chr7	2403911	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.701:15:2,5:2,4:4,0,10,1
chr7	2405885	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	2406152	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:9,14,0,3
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr7	2473085	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,6,1
chr7	2473743	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.251:14:7,1:2,0:0|1:2473743_G_C:2473743:1,10,3,0
chr7	2473747	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.237:15:7,1:1,1:0|1:2473743_G_C:2473743:1,11,3,0
chr7	2473751	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:8,2:2,0:0|1:2473743_G_C:2473743:0,10,3,0
chr7	2473755	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,0:0|1:2473743_G_C:2473743:0,10,2,0
chr7	2473759	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,0:0|1:2473743_G_C:2473743:0,10,2,0
chr7	2474183	.	C	CCAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:2474183_C_CCAGT:2474183:0,1,0,2
chr7	2474186	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2474183_C_CCAGT:2474183:0,1,0,1
chr7	2474188	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2474183_C_CCAGT:2474183:0,1,0,1
chr7	2552859	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=103,157;MMQ=60,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:22,8:8,0:20,10,8,0
chr7	2552934	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,2:14,0:9,15,1,2
chr7	2552970	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=93,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:6,0:2,17,2,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,14:0,3:0,0,3,14
chr7	2559674	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2559674_C_T:2559674:0,0,1,0
chr7	2559686	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2559674_C_T:2559674:0,0,1,0
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=503,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,6:1,4:0,1,5,6
chr7	2577691	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr7	2578237	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	2582774	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr7	2582967	.	GACCCCAGAGAGAAAAATTACTCCCCCACCCTCAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=85,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.364:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr7	2583165	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	2583196	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=180,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2583196_C_T:2583196:2,0,1,0
chr7	2583199	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=180,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:2583196_C_T:2583196:2,0,1,0
chr7	2583617	.	G	GGGTAGACTGGTTCTTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	2584523	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:2,6:3,2:4,2,5,3
chr7	2587122	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,5:0,3:1,6,2,6
chr7	2611878	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,6:3,4:4,2,6,4
chr7	2618070	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:8,4:3,6:6,5,4,6
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=205,183;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr7	2621740	.	TTCC	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:12,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:11,17,0,2
chr7	2621746	.	AAATAGAGGGGAG	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,2:11,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:9,18,0,2
chr7	2621761	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:8,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:6,15,0,2
chr7	2621792	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:1,13,0,2
chr7	2621794	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:1,13,0,2
chr7	2621796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=-1073741837;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.169:16:6,2:7,0:0|1:2621740_TTCC_T:2621740:1,13,0,2
chr7	2623801	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,5:1,0:3,1,4,1
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	2627578	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,2,3
chr7	2636521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=147,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr7	2636735	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:2,4:11,3:6,7,3,4
chr7	2638278	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=70,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.712:11:1,3:1,5:2,1,2,6
chr7	2638347	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=224,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	2640985	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr7	2644650	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=98,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.638:12:3,5:1,2:1,3,4,4
chr7	2644671	.	C	CATTTTTAAATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=195,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2644671_C_CATTTTTAAATT:2644671:1,4,1,1
chr7	2644673	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=195,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2644671_C_CATTTTTAAATT:2644671:1,4,1,1
chr7	2645552	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=119,199;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.324:23:9,3:5,4:6,10,2,5
chr7	2645596	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:5,1:4,6,2,0
chr7	2646723	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr7	2647048	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr7	2671862	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:2,6:1,3:3,0,7,2
chr7	2686455	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	2686761	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,5:0,0:0,0,4,3
chr7	2689472	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	2689543	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,5:1,3:4,2,5,3
chr7	2691736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=189,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,1,2
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=55,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.919:11:1,3:0,7:0,1,4,6
chr7	2748664	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=287,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:1,1,6,2
chr7	2748697	.	ATC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:2,2,4,2
chr7	2749472	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:8,6:11,2:9,10,4,4
chr7	2751998	.	C	T,CCATAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28,29;MFRL=128,175,176;MMQ=60,60,60;MPOS=13,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.80,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,1:0.364,0.182:8:1,2,0:3,1,1:2,2,1,3
chr7	2752059	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,0:2,4:1,2,0,5
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr7	2802173	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr7	2854547	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:3,4,2,2
chr7	2946360	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,0:10,4:11,6,2,2
chr7	2946364	.	A	G,T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,10,20;MFRL=129,98,33;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.39,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,2,2:0.120,0.115:22:3,0,0:10,0,2:12,6,2,2
chr7	2946366	.	A	ATGATC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=132,33;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:14,1:11,8,1,1
chr7	2946461	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr7	2946552	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr7	2951933	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=52,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr7	2951961	.	GCACGA	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:2951961_GCACGA_G:2951961:1,6,1,1
chr7	2951968	.	GTGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:2951961_GCACGA_G:2951961:1,6,1,1
chr7	2951975	.	TG	AA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:2951961_GCACGA_G:2951961:0,6,1,1
chr7	2951981	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:2951961_GCACGA_G:2951961:0,6,1,1
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr7	2955097	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr7	2956918	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:0,3:4,2:3,1,5,1
chr7	2958298	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	2962241	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:2,2,4,0
chr7	2962870	.	G	GATCTCGGCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:3,2,1,1
chr7	2969689	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,4:5,3:6,7,4,3
chr7	2977732	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr7	2985389	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=47,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:4,0:2,4,4,1
chr7	2985622	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:2985622_T_A:2985622:1,3,0,1
chr7	2985623	.	A	AGTGGGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:2985622_T_A:2985622:1,3,0,1
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,2,4
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,5
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,5
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr7	3187009	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr7	3188549	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	3188576	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	3188712	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,20:0,0,13,24
chr7	3188738	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=72.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,6,18
chr7	3991646	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	4002204	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	4050731	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:1,3:7,2:2,6,1,5
chr7	4056739	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr7	4089103	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:3,8,2,3
chr7	4153919	.	C	CAGTGTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=103,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	4166959	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=204,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr7	4172109	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	4172135	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,7:2,1:1,1,1,7
chr7	4189035	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,4:7,0:8,8,4,0
chr7	4214041	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4214041_C_T:4214041:0,0,0,1
chr7	4214046	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4214041_C_T:4214041:0,0,0,1
chr7	4214063	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4214063_T_G:4214063:0,0,0,1
chr7	4214069	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4214063_T_G:4214063:0,0,0,1
chr7	4214073	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4214063_T_G:4214063:0,0,0,1
chr7	4215298	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	4266963	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr7	4272915	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:8,3:1,0:6,3,3,0
chr7	4304727	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	4824043	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=83,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr7	4830550	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=281,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	4839131	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,11;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:8,0:4,0:0|1:4839131_A_T:4839131:7,5,0,2
chr7	4839134	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:3,1:4,0:0|1:4839131_A_T:4839131:6,5,0,2
chr7	4839781	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4839781_C_T:4839781:0,0,1,0
chr7	4839784	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4839781_C_T:4839781:0,0,1,0
chr7	4839993	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr7	4841313	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=101,175;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:4841313_A_G:4841313:2,1,2,0
chr7	4841318	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=111,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,0:0|1:4841313_A_G:4841313:2,2,2,0
chr7	4841655	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:2,2,1,2
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr7	4950849	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:3,2,1,1
chr7	4950855	.	GGCCCAGCTCCCGAAGGTTCAGCCTGGGAGAGAAAGA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:4,0:4,3,1,1
chr7	4998636	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:2,4:3,2:2,3,3,3
chr7	5024765	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,171;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:1,6,1,5
chr7	5026169	.	TTA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=176,177;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:0,2:5,0,3,0
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=195,177;MMQ=40,27;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.825:10:0,6:0,3:1,0,9,0
chr7	5036428	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr7	5096958	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=162,100;MMQ=40,47;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.725:27:5,9:2,11:4,3,14,6
chr7	5104359	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr7	5112009	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr7	5112530	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr7	5112554	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,8:0,1:0,1,6,3
chr7	5262151	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=152,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,3:3,0,4,0
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,1,6
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr7	5331307	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,15,4
chr7	5334472	.	C	CCT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.659:21:3,9:4,4:7,0,10,4
chr7	5334518	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=110,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,4:13,0:13,10,4,0
chr7	5334582	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.687:24:3,8:4,2:3,4,5,12
chr7	5334598	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,4:6,0:5,9,0,4
chr7	5336903	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	5342388	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=153,73;MMQ=40,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:3,2,2,2
chr7	5342413	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=112,160;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:5,4:0,3:1,4,3,4
chr7	5348468	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=25,15;MFRL=152,178;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.318:7:2,0:1,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:3,2,2,0
chr7	5348472	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=135,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,2:1,1:0|1:5348472_CAA_C:5348472:1,2,4,0
chr7	5348478	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:5348472_CAA_C:5348472:1,2,3,0
chr7	5348482	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=26,12;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,1:0|1:5348472_CAA_C:5348472:1,2,3,0
chr7	5348485	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:1,1:0|1:5348472_CAA_C:5348472:1,2,3,0
chr7	5348488	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0|1:5348472_CAA_C:5348472:0,2,3,0
chr7	5348491	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,24;MFRL=173,139;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:2,2,1,0
chr7	5348494	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=23,28;MFRL=164,139;MMQ=55,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:2,2,1,0
chr7	5348497	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=20,33;MFRL=164,139;MMQ=55,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:2,2,1,0
chr7	5354856	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:5354856_G_A:5354856:0,2,0,2
chr7	5354859	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=225,271;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:5354856_G_A:5354856:0,3,0,1
chr7	5354860	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=240,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:5354856_G_A:5354856:0,3,0,1
chr7	5363981	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=157,62;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:0,7,1,3
chr7	5364645	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=227,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr7	5385289	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:7,7,0,2
chr7	5396459	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=146,315;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr7	5399044	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,58;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:6,7,3,3
chr7	5401230	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:5,5,1,2
chr7	5402343	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=109,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,2:6,2:6,9,2,2
chr7	5409937	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=279,233;MMQ=54,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	5415871	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	5429989	.	C	CAAAAAAAAAAA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=132,112;MMQ=46,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,32;RU=A;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.317:13:2,0:3,2:5,4,2,2
chr7	5430011	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=111,147;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:6,0:10,0:0|1:5430011_G_C:5430011:4,16,5,0
chr7	5430015	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=111,147;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:9,0:14,1:0|1:5430011_G_C:5430011:5,19,5,0
chr7	5430018	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=112,140;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,0:15,0:0|1:5430011_G_C:5430011:5,20,4,0
chr7	5430097	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.153:37:16,0:15,5:0|1:5430097_C_T:5430097:8,24,0,5
chr7	5430120	.	T	TACCTTC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.097:29:9,2:14,0:1|0:5430097_C_T:5430097:8,19,0,2
chr7	5430283	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:2,6,0,5
chr7	5434135	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=101,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.454:33:7,12:11,2:9,9,5,10
chr7	5529736	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=127,114;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:26,0:12,4:14,27,0,4
chr7	5529750	.	T	TGG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=127,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.107:25:7,2:14,0:0|1:5529750_T_TGG:5529750:10,13,0,2
chr7	5529753	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=127,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:14,0:0|1:5529750_T_TGG:5529750:10,13,0,2
chr7	5529754	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=127,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:0|1:5529750_T_TGG:5529750:10,13,0,2
chr7	5535515	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:11,2:15,4:12,14,1,5
chr7	5540769	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr7	5541009	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,4:1,0:3,3,2,2
chr7	5541231	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:9,4,2,1
chr7	5567386	.	C	A	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,7:0.079:99:54,0:35,7:34,58,0,7
chr7	5567396	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=143,152;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,6:0.069:98:45,6:45,0:32,60,0,6
chr7	5568361	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.159:20:7,1:10,2:0|1:5568361_G_C:5568361:5,12,2,1
chr7	5568363	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.159:20:6,1:10,2:0|1:5568361_G_C:5568361:5,12,2,1
chr7	5643278	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:0,5:3,2:2,1,2,5
chr7	5645114	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.843:11:1,1:0,5:0,1,1,9
chr7	5691982	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,4:1,5:4,0,7,2
chr7	5754906	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=271,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	5769150	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=95,131;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.593:30:5,11:7,7:4,8,9,9
chr7	5770257	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=123,95;MMQ=60,28;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:12,1,2,0
chr7	5770273	.	TAAC	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=93,93;MMQ=57,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAC;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,3:7,1:15,6,2,2
chr7	5770330	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=122,93;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.543:20:6,6:2,5:3,6,3,8
chr7	5770454	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=153,243;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr7	5770520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=135,84;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr7	5778847	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.438:16:7,2:2,4:7,2,6,1
chr7	5780721	.	TTCATCATCA	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:4,1:0|1:5780721_TTCATCATCA_T:5780721:7,5,1,1
chr7	5780732	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:0|1:5780721_TTCATCATCA_T:5780721:7,4,1,1
chr7	5780737	.	AA	GT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=185,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:3,1:0|1:5780721_TTCATCATCA_T:5780721:6,4,1,1
chr7	5780741	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0|1:5780721_TTCATCATCA_T:5780721:7,3,1,1
chr7	5780745	.	G	GGA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=176,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,1:0|1:5780721_TTCATCATCA_T:5780721:7,4,1,1
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	5920406	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=211,142;MMQ=52,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr7	5940492	.	C	CTTTGTTTTCACACCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=145,138;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	5940517	.	G	GATAAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=200,128;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	5941411	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,104;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,3:7,2:1,9,3,2
chr7	5944687	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=105,161;MMQ=43,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:6,2,7,2
chr7	5949599	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=92,121;MMQ=49,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr7	5965214	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,118;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.224:33:11,1:15,6:13,13,5,2
chr7	5967738	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,138;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr7	5968053	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,135;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,1,2
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	5983494	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,151;MMQ=27,48;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.154:25:7,1:11,2:9,13,1,2
chr7	5983553	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=105,161;MMQ=53,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,2:9,4:8,7,0,6
chr7	6022372	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=142,192;MMQ=33,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,3:7,1:12,1,4,0
chr7	6022377	.	TT	AA	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=159,166;MMQ=27,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:6,4:9,0:27,2,3,1
chr7	6022386	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=158,166;MMQ=27,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:22,4:12,0:27,7,3,1
chr7	6022389	.	TG	CA	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=135,379646;MMQ=29,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:28,2:12,0:31,9,2,0
chr7	6036980	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=97,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,37:0.611:60:9,20:14,15:16,7,18,19
chr7	6037057	.	GAA	G,TAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,16,9;MFRL=155,119,101;MMQ=60,60,60;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.45,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,10:0.312,0.401:18:0,1,1:3,0,0:3,0,1,14
chr7	6043541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=119,125;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr7	6064357	.	GG	AA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:10,14,1,1
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:10,4:5,5:12,4,5,4
chr7	6071115	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=99,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.588:34:4,11:9,9:7,7,12,8
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:2,4,0,5
chr7	6080853	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=60,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:1,2:2,1,1,2
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:0|1:6088339_T_C:6088339:5,0,3,0
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.360:9:4,3:2,0:0|1:6088339_T_C:6088339:6,0,3,0
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr7	6089752	.	T	TCAGCTAAGACTCAATTACAGCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	6094433	.	A	AATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6156611	.	TCCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCTC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	6179725	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=86,77;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,2:11,1:13,13,3,0
chr7	6180694	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,0:5,8:1,10,0,9
chr7	6185164	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,4:4,7:8,3,7,4
chr7	6185679	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=138,146;MMQ=50,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6185679_T_A:6185679:2,0,1,0
chr7	6185684	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=142,146;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:6185679_T_A:6185679:3,0,1,0
chr7	6185688	.	ATC	GAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=142,146;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6185679_T_A:6185679:3,0,1,0
chr7	6189577	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=69,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0|1:6189577_C_T:6189577:3,9,1,1
chr7	6189599	.	C	CCAGGGCTACTCTCTCTCTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:2,0:0|1:6189577_C_T:6189577:3,3,1,1
chr7	6189913	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:6189913_G_C:6189913:1,1,1,1
chr7	6189914	.	C	CCTCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:6189913_G_C:6189913:1,1,1,1
chr7	6193521	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr7	6210105	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	6426941	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.416:46:19,8:8,11:10,17,5,14
chr7	6426954	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.376:38:16,6:7,8:8,16,3,11
chr7	6431690	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.666:25:2,8:6,9:3,5,8,9
chr7	6442103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=165,76;MMQ=40,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:1,5,2,0
chr7	6442156	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr7	6449947	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:26,2:10,2:12,24,0,4
chr7	6461534	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	6485740	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:5,2:1,19,1,2
chr7	6505901	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,6,14
chr7	6514013	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=8,31;MFRL=210,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:6514013_C_CTT:6514013:0,1,0,1
chr7	6514016	.	G	GTTCCAATGTGTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=210,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6514013_C_CTT:6514013:0,1,0,1
chr7	6537655	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr7	6542623	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,10:5,0:8,3,10,0
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	6547895	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=121,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:8,0:4,3:12,0,3,0
chr7	6547994	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=125,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:2,4:9,5:6,6,1,8
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:1,2,5,1
chr7	6566442	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	6631289	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:4,0:14,3:10,8,1,2
chr7	6631530	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=187,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,0:9,2:2,14,1,1
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:3,0,4,3
chr7	6647738	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=96,127;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:2,4,1,3
chr7	6660980	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:8,0:18,5:12,14,1,4
chr7	6661284	.	AACAGTTACAGCAGCAACAGTTTCAACAGCAGCAGGAACAGTTACAGCAGCAGCAGCAGCTACTATTGCTGCAGCAGCAGGG	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:7,0:9,4:11,21,2,2
chr7	6661752	.	AGCAGCTGGAGCAGCAGGAGGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=181,37;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:1,0:0,1:1,1,1,1
chr7	6737484	.	GC	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,23;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:6737484_GC_AA:6737484:0,2,0,1
chr7	6737488	.	ATAG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,22;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:6737484_GC_AA:6737484:0,2,0,1
chr7	6737489	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=196,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6737493	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	6737503	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=266,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6737503_TA_CT:6737503:0,1,0,1
chr7	6737507	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,22;MFRL=266,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6737503_TA_CT:6737503:0,1,0,1
chr7	6737510	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,21;MFRL=266,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6737503_TA_CT:6737503:0,1,0,1
chr7	6797636	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=131,395608;MMQ=34,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.144:18:9,0:7,2:0|1:6797636_A_G:6797636:8,8,0,2
chr7	6797638	.	TTTCA	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=131,395608;MMQ=34,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:5,2:0|1:6797636_A_G:6797636:8,8,0,2
chr7	6797646	.	T	TCC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=146,395608;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:6797636_A_G:6797636:5,9,0,2
chr7	6797649	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=131,215;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,0:4,3:5,9,0,3
chr7	6797652	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=127,215;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr7	6838176	.	G	GCTACTATATAATCTAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	6845553	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=139,95;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.435:18:3,3:7,5:6,4,5,3
chr7	6854512	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,195;MMQ=52,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,5:3,7:2,3,1,11
chr7	6861880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,107;MMQ=57,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	7278013	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=106,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:8,0:18,3:12,15,0,3
chr7	7278043	.	T	TGAAAACATTTATAAAGTAAAAAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:9,0:12,3:7,15,0,3
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr7	7399973	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr7	7400070	.	G	GCAGGTGGAGGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:11,12,1,1
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	7412738	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:7412738_C_T:7412738:7,3,1,1
chr7	7412740	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:7412738_C_T:7412738:7,3,1,1
chr7	7415217	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr7	7459572	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,2:18,0:6,16,1,1
chr7	7459585	.	CTGAAA	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:3,2:16,0:0|1:7459585_CTGAAA_C:7459585:5,17,1,1
chr7	7459592	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,2:17,0:0|1:7459585_CTGAAA_C:7459585:5,16,1,1
chr7	7459616	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,1:3,3:0,4,0,4
chr7	7459630	.	TTATG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.437:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr7	7480382	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,1:0,5:1,0,6,1
chr7	7491861	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:7491861_A_G:7491861:0,0,2,0
chr7	7491865	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:7491861_A_G:7491861:0,0,2,0
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:7491861_A_G:7491861:0,0,2,0
chr7	7491908	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=88,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,3,0
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,20,3
chr7	7545691	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=76.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.621:42:8,3:6,23:7,9,7,19
chr7	7551288	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,5,0
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	7561416	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	7613689	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=202,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	8043504	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=175,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:2,0,7,2
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	8110780	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr7	8110836	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,2:2,0:1,3,0,2
chr7	8125958	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:0|1:8125958_G_A:8125958:6,9,1,1
chr7	8125964	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,7:0.470:15:4,3:4,4:1|0:8125958_G_A:8125958:4,4,3,4
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	8181561	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:8181561_A_ACG:8181561:0,2,0,1
chr7	8181563	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CG;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:8181561_A_ACG:8181561:0,2,0,1
chr7	8181568	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:8181561_A_ACG:8181561:0,2,0,1
chr7	8181571	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr7	8183564	.	T	TGTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=182,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:2,2:4,1:0|1:8183564_T_TGTC:8183564:2,4,2,2
chr7	8183568	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=182,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:2,2:4,2:0|1:8183564_T_TGTC:8183564:2,4,2,2
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,9,13
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.239:18:6,3:6,1:4,10,1,3
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.856:18:2,9:0,7:2,0,3,13
chr7	8196581	.	AAAAG	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.423:16:7,4:3,2:0,10,5,1
chr7	8198313	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:3,1:0|1:8198313_C_CAA:8198313:0,3,0,1
chr7	8198314	.	C	CTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:8198313_C_CAA:8198313:0,3,0,1
chr7	8198347	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	8258145	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr7	8790549	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr7	8790800	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,2:6,0:5,5,2,1
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,2:1,4:1,3,0,6
chr7	10977630	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr7	11021935	.	TTG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:7,0:15,4,2,0
chr7	11022186	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=105,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:11022186_A_G:11022186:6,1,1,1
chr7	11022193	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=173,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:11022186_A_G:11022186:6,1,1,1
chr7	11022202	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:11022186_A_G:11022186:7,1,1,1
chr7	11022230	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr7	11030274	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr7	11075263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=110,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr7	11075413	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=92,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:5,9,0,2
chr7	11076331	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:0,7,2,0
chr7	11076514	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr7	11076803	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,0:3,8:0,8,0,8
chr7	11078498	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:2,2,2,1
chr7	11082439	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=226,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chr7	11082469	.	T	TCCCATAAGGTTTCTCACTCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0,6,1,1
chr7	11091270	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:9,3:14,6,1,2
chr7	11101306	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr7	11151137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	11209141	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,4:0,6,3,7
chr7	11418670	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:7,1,1,1
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	11441358	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	11446902	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:2,1,3,1
chr7	11450974	.	A	ATTCTTTTTTTTGAAAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=186,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.411:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr7	11451046	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:11451046_T_TG:11451046:0,2,0,1
chr7	11451049	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:11451046_T_TG:11451046:0,2,0,1
chr7	11452204	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	11464297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr7	11500458	.	G	GTAGGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=241,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:11500458_G_GTAGGAA:11500458:0,4,0,1
chr7	11500460	.	A	AAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=241,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:11500458_G_GTAGGAA:11500458:0,4,0,1
chr7	11500479	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=145,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	11521542	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=110,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:4,4,1,7
chr7	11581121	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.810:8:0,2:1,4:1,0,3,4
chr7	11581134	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,3:1,7:1,3,3,7
chr7	11630216	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.132:22:12,2:6,0:9,10,2,1
chr7	11871406	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:2,2,2,1
chr7	12264109	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	12370702	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,6:3,3:3,1,7,3
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,7:4,5:6,3,5,7
chr7	12395919	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=108,196;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,0:9,7:10,12,0,7
chr7	12400837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:1,5,3,1
chr7	12407172	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=188,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:12407172_A_C:12407172:1,5,1,1
chr7	12407175	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=188,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:0|1:12407172_A_C:12407172:1,5,1,1
chr7	12407179	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:12407172_A_C:12407172:0,3,0,1
chr7	12407183	.	A	ACATCCGATGCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:12407172_A_C:12407172:0,3,0,1
chr7	12412792	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,0:5,5:4,9,0,5
chr7	12412853	.	G	GATGTCCCTGCAGGACCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	12414232	.	TATAAAACAATACACTGTTTAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=133,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.346:13:2,0:5,4:9,0,2,2
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr7	12428493	.	ACACT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,5:3,2:7,4,5,2
chr7	12428741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,5:0,1:1,0,4,2
chr7	12428976	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:4,6,1,4
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	12644342	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=198,110;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr7	12644348	.	G	GGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=110,233;MMQ=39,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	12668804	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=149,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:12668804_A_C:12668804:5,2,1,1
chr7	12668807	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=148,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:1,0:0|1:12668804_A_C:12668804:6,2,1,1
chr7	12668809	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=148,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:12668804_A_C:12668804:6,2,1,1
chr7	12668812	.	C	CCCAGGTTCAAGCAA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:12668804_A_C:12668804:5,2,1,1
chr7	12675805	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=270,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12675805_G_C:12675805:0,1,1,0
chr7	12675808	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=270,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12675805_G_C:12675805:0,1,1,0
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chr7	12684378	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=188,150;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12684378_T_C:12684378:0,2,0,1
chr7	12684385	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=188,150;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12684378_T_C:12684378:0,2,0,1
chr7	12684389	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=172,150;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12684378_T_C:12684378:0,3,0,1
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,158;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:3,5:6,1,7,1
chr7	12729868	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=114,157;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.110:43:24,3:14,1:0|1:12729868_C_T:12729868:25,14,4,0
chr7	12729893	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=109,157;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:24,3:13,2:0|1:12729868_C_T:12729868:30,12,5,0
chr7	12729925	.	GTT	GT,G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,33,33;MFRL=101,129,122;MMQ=60,60,60;MPOS=29,14;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,12;RU=T;STR;TLOD=16.09,9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,9,6:0.313,0.208:31:7,5,3:5,4,1:9,7,11,4
chr7	12730426	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,4:2,10:4,3,9,5
chr7	14016939	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:7,0,4,0
chr7	14016993	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,135;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.231:28:11,6:9,0:16,6,6,0
chr7	14017007	.	CC	TG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:17,4:5,6:16,7,6,4
chr7	14017126	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,2:2,2:1,4,1,3
chr7	14026357	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr7	14027855	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=69,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:0|1:14027855_G_A:14027855:0,6,0,5
chr7	14027861	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:0|1:14027855_G_A:14027855:0,5,0,4
chr7	14027863	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:3,4:0|1:14027855_G_A:14027855:0,5,0,4
chr7	14027865	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=69,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,3:0|1:14027855_G_A:14027855:0,4,0,4
chr7	14027867	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=69,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:3,2:0|1:14027855_G_A:14027855:0,4,0,3
chr7	14028220	.	GA	G,GAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29,31;MFRL=198,103,115;MMQ=60,60,40;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.69,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.419,0.328:9:1,3,1:1,0,1:2,0,6,1
chr7	14028245	.	G	GA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,30:0.846:35:2,2:2,4:1,4,9,21
chr7	14028707	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,2:5,2:5,8,1,3
chr7	14216612	.	A	ATGAAGCTGACTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	14217788	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:2,2,1,6
chr7	14249292	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14249292_A_AT:14249292:0,1,0,1
chr7	14249295	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14249292_A_AT:14249292:0,1,0,1
chr7	14620406	.	GTTTCT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTCT;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:4,1:24,4,0,2
chr7	14646986	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	14653054	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.931:10:0,1:0,9:0,0,7,3
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=100,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.779:7:1,4:0,2:0|1:14775821_TG_T:14775821:0,1,1,5
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0|1:14775821_TG_T:14775821:0,0,2,7
chr7	14797176	.	TACATAC	T,CACATAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26,28;MFRL=0,155,134;MMQ=60,60,60;MPOS=30,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.30,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.288,0.560:3:0,1,0:0,0,2:0,0,3,0
chr7	15430259	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr7	15430413	.	TGTAAA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAAA;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:2,3,2,4
chr7	15430599	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	15470714	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:15470714_G_A:15470714:7,8,0,2
chr7	15470721	.	A	AGAAGCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:15470714_G_A:15470714:7,8,0,2
chr7	15470722	.	T	TCCTACCCCCACACCAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,1:0|1:15470714_G_A:15470714:7,8,0,2
chr7	15725552	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:2,1,1,1
chr7	15725797	.	ATGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=154,334;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGG;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,4:2,0:0,2,0,5
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	16317702	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr7	16317853	.	T	TAAGTTTATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr7	16348059	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr7	16445673	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=179,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,10:3,4:2,2,8,6
chr7	16505341	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	16566632	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr7	16605861	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr7	16621083	.	C	CTAACAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:16621083_C_CTAACAA:16621083:0,5,1,1
chr7	16621087	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=161,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:16621083_C_CTAACAA:16621083:0,6,1,1
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	16640566	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr7	16640596	.	T	TACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	16676036	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:18,5:20,0:14,26,0,5
chr7	16676082	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,25;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:1,1:4,8,0,3
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=67,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:2,1:1,1:2,3,0,3
chr7	16720937	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr7	16720956	.	A	ACGTCGTGCTCTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=191,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr7	16725501	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,16;MFRL=94,123;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.623:6:1,1:0,0:1,2,2,1
chr7	16734363	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr7	16736479	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr7	16793504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr7	16815786	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr7	16818799	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=408,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	16832682	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=194,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	16839501	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr7	16901695	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,3:3,1:0|1:16901695_A_G:16901695:3,4,0,4
chr7	16901697	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:0|1:16901695_A_G:16901695:3,4,0,4
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	17370282	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,123;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr7	17833966	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17833966_G_T:17833966:0,1,0,1
chr7	17833975	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17833966_G_T:17833966:0,1,0,1
chr7	17833998	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,24;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17833998_A_AC:17833998:0,1,0,1
chr7	17834000	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17833998_A_AC:17833998:0,1,0,1
chr7	17838349	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=92,76;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:10,2:10,0:0|1:17838349_G_A:17838349:12,10,1,1
chr7	17838356	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=92,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:0|1:17838349_G_A:17838349:10,9,1,1
chr7	17855990	.	A	ATTTATTAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17855990_A_ATTTATTAAT:17855990:0,1,0,1
chr7	17855994	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17855990_A_ATTTATTAAT:17855990:0,1,0,1
chr7	17855995	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17855990_A_ATTTATTAAT:17855990:0,1,0,1
chr7	17855998	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17855990_A_ATTTATTAAT:17855990:0,1,0,1
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	17879706	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:0,1,0,5
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr7	17915440	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:4,3:8,0:4,9,1,2
chr7	18067295	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:13,0:12,9,2,0
chr7	18067479	.	ACT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	18631098	.	ATGTG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=TG;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,2:0,1:0,0,3,2
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	18767343	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,3:12,1:3,13,3,1
chr7	18914155	.	T	TAGAGAAGCTTCCTGGGGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:2,3,3,2
chr7	19739961	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=195,117;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,3,0,1
chr7	19739963	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=195,117;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,3,0,1
chr7	19739966	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=195,117;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,3,0,1
chr7	19739968	.	C	CATCTATTTACAGAGCCTGA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=195,117;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,3,0,1
chr7	19739972	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,24;MFRL=195,117;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,3,0,1
chr7	19739973	.	T	TGGTA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=261,117;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19739961_G_C:19739961:0,2,0,1
chr7	19768960	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:2,0,4,3
chr7	19813338	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr7	20371608	.	C	CAGCTCTGCGCCTGTGGCTGTGCAGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,16:0,6:0,0,7,15
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	20444533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr7	20445813	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,0:5,6:2,7,0,6
chr7	20668236	.	T	TTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr7	20685508	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:5,10,2,0
chr7	20689742	.	A	ATTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=93,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr7	20691013	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:1,2:6,8:7,0,7,3
chr7	20739632	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:1,3:1,0:2,0,1,2
chr7	20739672	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,7:1,2:5,0,9,0
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr7	20739839	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr7	20762609	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	20762646	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:0,5:5,1:2,3,4,2
chr7	20762937	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	20768175	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,203;MMQ=56,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:0|1:20768175_G_A:20768175:0,4,0,1
chr7	20768179	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=161,203;MMQ=56,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:0|1:20768175_G_A:20768175:0,4,0,1
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	20778849	.	C	CCTGGCTCAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20778849_C_CCTGGCTCAAG:20778849:0,0,0,1
chr7	20778855	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20778849_C_CCTGGCTCAAG:20778849:0,0,0,1
chr7	21550851	.	A	ACC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,0:6,2:0|1:21550851_A_ACC:21550851:5,8,0,2
chr7	21550852	.	A	ACC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:21550851_A_ACC:21550851:5,8,0,2
chr7	21550854	.	T	TGC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:21550851_A_ACC:21550851:5,8,0,2
chr7	21550858	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:21550851_A_ACC:21550851:5,8,0,2
chr7	21582963	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:6,3:0|1:21582963_GA_TT:21582963:4,7,5,1
chr7	21582986	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=171,164;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,3:0.199:18:6,3:8,0:1|0:21582963_GA_TT:21582963:9,6,3,0
chr7	21598659	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=208,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:21598659_CCA_C:21598659:0,3,0,1
chr7	21598665	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:21598659_CCA_C:21598659:0,4,0,1
chr7	21621453	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr7	21639815	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=162,244;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21639815_T_G:21639815:0,2,0,1
chr7	21639818	.	TG	CT,CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34,26;MFRL=0,244,162;MMQ=60,40,60;MPOS=29,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,1:0,1,1:0,0,0,3
chr7	21639821	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=162,244;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21639815_T_G:21639815:0,2,0,1
chr7	21639830	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=162,244;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21639815_T_G:21639815:0,2,0,1
chr7	21641218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:6,2:11,3:6,12,2,3
chr7	21678643	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,5:5,5:5,8,3,7
chr7	21695416	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	21723573	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,3,4
chr7	21727186	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	21744037	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:21744037_T_A:21744037:5,2,1,1
chr7	21744039	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.455:9:1,3:4,1:1|0:21744037_T_A:21744037:2,3,4,0
chr7	21744048	.	C	CTTCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,0:3,2:6,3,1,1
chr7	21744293	.	GGA	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=140,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	21745061	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,4:2,6:3,0,5,5
chr7	21750363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr7	21757636	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	21765452	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:2,2,5,2
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	21779331	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:2,0:6,2:0,8,2,1
chr7	21781807	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr7	21784223	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=176,42;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:1,6,1,1
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:3,3,2,4
chr7	21813318	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr7	21813391	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,2:10,3:9,10,2,3
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	21893993	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,13,6
chr7	21906179	.	C	CAGAAAAAGACAAAAGAAAAAAAGAAAGAATATTATGAAAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,36;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.147:22:11,0:8,2:11,9,1,1
chr7	21907452	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0|1:21907452_G_GT:21907452:0,0,12,5
chr7	21907458	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0|1:21907452_G_GT:21907452:0,0,12,5
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0,0,0,7
chr7	21924120	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21924120_CTT_C:21924120:0,1,0,1
chr7	21924128	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21924120_CTT_C:21924120:0,0,0,1
chr7	21932044	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr7	21934377	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=154,35;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:21934377_T_G:21934377:5,5,1,1
chr7	21934379	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,35;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:21934377_T_G:21934377:5,5,1,1
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=67.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,11,5
chr7	21945086	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	21948063	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=142,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0|1:21948063_A_T:21948063:12,7,0,2
chr7	21948069	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:21948063_A_T:21948063:11,7,0,2
chr7	21948074	.	C	CTTCTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:21948063_A_T:21948063:9,6,0,2
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=120.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,16:0,25:0,0,27,14
chr7	22162134	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr7	22179782	.	C	CTTTAGTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	22184733	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=134,86;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:6,6,0,4
chr7	22190130	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=88,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.568:7:2,2:1,2:0|1:22190130_TG_T:22190130:2,1,0,4
chr7	22190132	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=88,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.568:7:2,1:1,0:0|1:22190130_TG_T:22190130:2,1,0,4
chr7	22197507	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr7	22206774	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:8,3:7,0:6,18,0,3
chr7	22259670	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,7,19
chr7	22330862	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:1,2:4,0:4,3,1,2
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr7	22357753	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=264,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.551:4:1,0:0,0:0|1:22357753_C_G:22357753:1,1,0,2
chr7	22357755	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=264,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.550:4:1,1:0,0:0|1:22357753_C_G:22357753:1,1,0,2
chr7	22357757	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=264,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.550:4:1,0:0,0:0|1:22357753_C_G:22357753:1,1,0,2
chr7	22478435	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:22478435_C_CCA:22478435:0,2,0,1
chr7	22478438	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:22478435_C_CCA:22478435:0,2,0,1
chr7	22769452	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:6,2:0,0:3,3,1,1
chr7	22770988	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:8,4:2,2:4,6,3,3
chr7	22857682	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=94,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:6,4:6,1:6,7,2,3
chr7	22861739	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,9,8
chr7	23239872	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:10,12,2,0
chr7	23293793	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.184:20:4,3:11,0:0|1:23293793_C_T:23293793:9,8,2,1
chr7	23293799	.	CA	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:0|1:23293793_C_T:23293793:9,6,1,1
chr7	23300362	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:23300362_C_T:23300362:0,4,1,1
chr7	23300364	.	C	CGACGAAACCTTCCTCAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:23300362_C_T:23300362:0,4,1,1
chr7	23300368	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:23300362_C_T:23300362:0,4,0,1
chr7	23306141	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:5,6,2,1
chr7	23309669	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=78,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:12,7,0,2
chr7	23309857	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=178,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:1,9,0,2
chr7	23313745	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:6,5:10,11:6,10,4,12
chr7	23347582	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=102,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,14:0.326:44:18,0:11,14:0|1:23347582_G_C:23347582:11,19,0,14
chr7	23347586	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=102,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=49.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,14:0.313:46:19,0:11,14:0|1:23347582_G_C:23347582:11,21,0,14
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr7	23381906	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	23387430	.	GCAAAGTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23387430_GCAAAGTC_G:23387430:0,1,0,1
chr7	23387440	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23387430_GCAAAGTC_G:23387430:0,1,0,1
chr7	23545119	.	TAA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=124,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:2,1:4,3:5,2,3,1
chr7	23556222	.	ACATATATCCCTAACTATTCTCAGGTCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	23724364	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	23728916	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=79,107;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:4,3,2,3
chr7	23737891	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:6,8:6,2:5,7,4,6
chr7	23740388	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr7	23741732	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=94,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:13,5:21,0:19,15,4,1
chr7	23775454	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=76,71;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr7	23792541	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23792541_C_T:23792541:0,1,0,1
chr7	23792543	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23792541_C_T:23792541:0,1,0,1
chr7	23792544	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23792541_C_T:23792541:0,1,0,1
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	23826538	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:23826538_T_C:23826538:3,13,0,3
chr7	23826542	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:7,3:0|1:23826538_T_C:23826538:3,13,0,3
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:9,9:2,3:5,6,5,8
chr7	23871775	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=87,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:8,0:12,5:9,11,1,4
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	24331434	.	T	TTACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24331434_T_TTACC:24331434:0,0,0,1
chr7	24331437	.	T	TTTTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24331434_T_TTACC:24331434:0,0,0,1
chr7	24331438	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24331434_T_TTACC:24331434:0,0,0,1
chr7	24708148	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,0:2,2:4,6,1,1
chr7	24718710	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,1,1
chr7	24718839	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:3,2:8,1:8,3,2,1
chr7	24742436	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,1:0,3:2,0,0,4
chr7	24746022	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=138,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,0,2
chr7	24747082	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,0,2
chr7	24747120	.	C	CAGCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:24747120_C_CAGCACA:24747120:0,3,0,1
chr7	24747127	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=131,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:24747120_C_CAGCACA:24747120:0,1,0,1
chr7	24747910	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,0:0,2:2,3,1,1
chr7	24758645	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:5,3,2,3
chr7	24784403	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr7	24839983	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=244,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr7	24844080	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:1,3,0,5
chr7	24859912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr7	24888620	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:5,1,5,1
chr7	24902762	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	24903107	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:5,3:5,2:3,7,2,4
chr7	24904889	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,3:2,2:3,0,5,1
chr7	25181912	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr7	25181922	.	C	CATACCTGCCTATATTAGT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:5,4,1,1
chr7	25182001	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	25182172	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr7	25194665	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr7	25194753	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,19:0,0,14,19
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr7	25198077	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,3:6,0:10,0,1,2
chr7	25198240	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=182,172;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:25198240_T_TA:25198240:0,3,0,1
chr7	25198242	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=182,172;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:25198240_T_TA:25198240:0,3,0,1
chr7	25198244	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=188,172;MMQ=57,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:25198240_T_TA:25198240:0,4,0,1
chr7	25200976	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	25268094	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr7	26217668	.	AATG	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=125,106;MMQ=58,49;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATG;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:15,1:9,1:9,16,1,1
chr7	26224777	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,2:10,1:7,7,2,1
chr7	26225380	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=132,124;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.272:23:4,5:12,1:6,11,4,2
chr7	26236037	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:17,6:15,0:19,13,5,1
chr7	26242668	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,76;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,5:9,0:9,10,4,1
chr7	26247984	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.282:30:12,5:9,3:14,8,7,1
chr7	26248268	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=201,133;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26248268_C_G:26248268:1,2,0,1
chr7	26248269	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:26248268_C_G:26248268:1,2,0,1
chr7	26248270	.	TG	T,CG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26,28;MFRL=38002754,201,133;MMQ=60,60,40;MPOS=10,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:1,1,0,2
chr7	26248274	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=199,133;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26248268_C_G:26248268:0,2,0,1
chr7	26248276	.	TGTC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=165,201;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:26248268_C_G:26248268:0,2,0,1
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=242,181;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:7,8:23,7:4,26,8,7
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,8:8,7:6,9,6,9
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=102,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:2,7,1,6
chr7	26411423	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:8,0,2,0
chr7	26678966	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=80,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26678966_A_G:26678966:1,2,0,1
chr7	26678969	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=80,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26678966_A_G:26678966:1,2,0,1
chr7	26678982	.	G	GAACAAATGAAATACAGGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26678982_G_GAACAAATGAAATACAGGA:26678982:0,0,0,1
chr7	26678984	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26678982_G_GAACAAATGAAATACAGGA:26678982:0,0,0,1
chr7	26724274	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:0|1:26724274_C_T:26724274:6,0,2,0
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:26724274_C_T:26724274:0,0,8,0
chr7	26764976	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:5,0:3,2:7,2,2,0
chr7	26779603	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:0,0:3,2:1,5,0,2
chr7	26883761	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.239:18:5,1:7,3:0,14,0,4
chr7	27135307	.	GGGGTGGCGA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:11,2:1,0:0|1:27135307_GGGGTGGCGA_G:27135307:9,5,1,1
chr7	27135314	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,15:0.940:15:0,12:0,1:1|0:27135307_GGGGTGGCGA_G:27135307:0,0,9,6
chr7	27147451	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=118,183;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr7	27147472	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,13;MFRL=102,183;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:1,0:3,0:6,2,2,0
chr7	27147481	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,13;MFRL=120,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:1,0:2,0:0|1:27147481_G_A:27147481:3,5,3,0
chr7	27147490	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=135,259;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:3,1:5,0:0|1:27147481_G_A:27147481:5,6,2,0
chr7	27147494	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=135,259;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,0:4,0:0|1:27147481_G_A:27147481:5,6,2,0
chr7	27147932	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:27147932_A_G:27147932:1,2,1,0
chr7	27147936	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:27147932_A_G:27147932:1,2,1,0
chr7	27169251	.	G	GGGCGTGTCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27169251_G_GGGCGTGTCTT:27169251:0,0,0,1
chr7	27169252	.	A	ACCGAGCGTGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27169251_G_GGGCGTGTCTT:27169251:0,0,0,1
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:27170145_T_G:27170145:0,0,5,1
chr7	27170159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=267,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:27170145_T_G:27170145:3,1,2,0
chr7	27196069	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:13,7:5,4:9,9,5,6
chr7	27196082	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=131,72;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:14,5:10,0:10,14,3,2
chr7	27196113	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:6,8:7,4:5,8,6,7
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr7	27205159	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	27209212	.	CCCG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr7	27224740	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:0,12,0,2
chr7	27566053	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	27582783	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	27671899	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr7	27833853	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	27839662	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:16,0:23,4:21,18,0,4
chr7	27886171	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:1,2,6,3
chr7	28031704	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,2,9
chr7	28220228	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,5:3,0:1,2,1,4
chr7	28319234	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,12,11
chr7	28547271	.	C	CAGCAGGCGACCCCGGATCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,1,1
chr7	28844112	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=99,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:21,2:20,3:8,33,1,4
chr7	28857606	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,0:2,2:4,0,3,0
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	28997596	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	28997691	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,1:4,3:4,2,3,1
chr7	29070281	.	TA	CT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:10,0:8,12,1,1
chr7	29070320	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:8,4:1,5:4,5,5,4
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	29103877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr7	29103944	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr7	29112099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:0,2,6,3
chr7	29135840	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:1,1:10,2:0|1:29135840_G_T:29135840:5,6,1,2
chr7	29135845	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,1:9,2:0|1:29135840_G_T:29135840:4,6,1,2
chr7	29135846	.	GTAA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,1:9,1:0|1:29135840_G_T:29135840:4,6,1,2
chr7	29160434	.	CAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=20,10;RU=A;STR;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr7	29234543	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:2,3,2,2
chr7	29234636	.	CG	TT	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:3,3,1,1
chr7	29234639	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:1,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:3,3,1,1
chr7	29234643	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=161,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:2,2,1,1
chr7	29234645	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=165,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:1,2,1,1
chr7	29234648	.	C	CTTCACA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=21,20;MFRL=158,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:1,1,1,1
chr7	29234649	.	G	GGTGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=19,20;MFRL=158,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:1,1,1,1
chr7	29234651	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=158,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:29234636_CG_TT:29234636:1,1,1,1
chr7	29407667	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=274,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	29438109	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,2:1,3:0,2,1,5
chr7	29440268	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,0:4,3:3,7,2,1
chr7	29523456	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	29544337	.	GTC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:0,4:3,1:2,1,2,3
chr7	29544468	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,4:3,3:1,2,2,6
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr7	29918729	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=95,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:8,5,1,2
chr7	29923977	.	TC	GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr7	29924072	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=64,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:1,2,2,5
chr7	29980417	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=105,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:6,10,0,3
chr7	30030005	.	CTGTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=159,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=TG;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	30092275	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:3,1,1,0
chr7	30113604	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr7	30113862	.	T	TTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=157,175;MMQ=59,57;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.613:6:0,3:1,0:0,2,0,4
chr7	30485741	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.496:28:8,4:6,9:9,5,10,4
chr7	30491571	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:6,0:2,1:0|1:30491571_G_A:30491571:3,7,1,1
chr7	30491573	.	C	CGAGCAGTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:5,0:3,2:0|1:30491571_G_A:30491571:3,7,1,1
chr7	30536874	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:1,6,1,6
chr7	30536916	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr7	30537600	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	30634599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr7	30634834	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30634834_T_C:30634834:0,0,0,1
chr7	30634836	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30634834_T_C:30634834:0,0,0,1
chr7	30639590	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=106,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:10,0:10,12,2,0
chr7	30655498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=47,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:8,6,2,0
chr7	30665757	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:9,0,3,0
chr7	30666596	.	CAAA	C,CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=19,20,26;MFRL=98,146,74;MMQ=60,60,43;MPOS=2,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.93,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,2:0.164,0.143:19:1,0,1:4,2,0:4,10,2,3
chr7	30693089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:5,5,1,2
chr7	30695646	.	ATGG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:30695646_ATGG_A:30695646:2,1,0,1
chr7	30695650	.	G	GATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:30695646_ATGG_A:30695646:2,1,0,1
chr7	30739525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=100,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.454:11:6,1:0,3:4,2,3,2
chr7	30795436	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	30805849	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,4:0,1:4,0,5,0
chr7	30825647	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,0:1,5:0,5,0,5
chr7	30830977	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,156;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:2,0:18,2:4,16,0,2
chr7	30830988	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:2,0:6,13:5,4,0,13
chr7	30876366	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:15,4:10,15,1,3
chr7	30879021	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:30879021_GA_TT:30879021:1,1,0,1
chr7	30879022	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:30879021_GA_TT:30879021:1,0,0,1
chr7	30879025	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:30879021_GA_TT:30879021:1,0,0,2
chr7	30879027	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30879021_GA_TT:30879021:1,1,0,1
chr7	30879029	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30879021_GA_TT:30879021:1,0,0,1
chr7	30879033	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30879021_GA_TT:30879021:1,0,0,1
chr7	30890209	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:3,5,0,2
chr7	30899008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr7	30915185	.	G	GAATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:6,6,1,1
chr7	30921882	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=99,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:4,6,0,4
chr7	30922686	.	G	GTAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	30961242	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=126,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,11:6,6:5,7,6,11
chr7	30962119	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=90,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,4:7,0:5,6,4,0
chr7	30962219	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=94,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:30962219_T_C:30962219:5,16,1,1
chr7	30962222	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=94,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:30962219_T_C:30962219:5,16,1,1
chr7	31015565	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:3,2:0,17:0,3,0,19
chr7	31015588	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=180,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,0:3,13:0,6,0,13
chr7	31016018	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:4,1,3,3
chr7	31018834	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=81,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,3:8,1:6,9,1,3
chr7	31123750	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=130,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:11,1:10,7,2,0
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	31126074	.	T	TCGTGTCTATTTACTAGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:7,2,1,1
chr7	31126547	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=74,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:0|1:31126547_G_A:31126547:7,4,1,1
chr7	31126553	.	CCAGGG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=74,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:31126547_G_A:31126547:7,6,1,1
chr7	31377946	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:31377946_G_GA:31377946:3,3,1,1
chr7	31377947	.	G	GTACTAATACC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=149,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:31377946_G_GA:31377946:3,3,1,1
chr7	31377950	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=132,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:31377946_G_GA:31377946:4,4,1,1
chr7	31377952	.	CG	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=132,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:31377946_G_GA:31377946:4,4,1,1
chr7	31378258	.	GGTA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:2,0:0|1:31378258_GGTA_G:31378258:3,7,1,1
chr7	31378266	.	GTA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:4,0:0|1:31378258_GGTA_G:31378258:5,7,1,1
chr7	31378269	.	G	GGA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:4,0:0|1:31378258_GGTA_G:31378258:4,7,1,1
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr7	31594258	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=88,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,8:5,2:3,4,6,4
chr7	31683410	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.539:22:6,5:4,6:4,6,2,10
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=202,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr7	31735277	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,22;MFRL=182,326;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31735277_C_A:31735277:0,3,0,1
chr7	31735280	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=182,326;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:31735277_C_A:31735277:0,3,0,1
chr7	31735283	.	A	G,AAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,33,23;MFRL=192,326,88;MMQ=60,60,60;MPOS=1,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:0,2,0,2
chr7	31735284	.	C	CTGCCACGTGATCACCCAGCTAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=202,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr7	31746952	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:31746952_C_T:31746952:0,6,0,2
chr7	31746958	.	GAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,38;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=A;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:31746952_C_T:31746952:0,5,0,2
chr7	31746962	.	A	ATTTGGT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:31746952_C_T:31746952:0,6,0,2
chr7	31792935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr7	31793128	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=124,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:10,5,2,0
chr7	31815325	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=100,94;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.247:21:8,0:8,4:9,7,0,5
chr7	31815336	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=87,94;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:8,0:7,4:6,9,0,5
chr7	31829896	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31829896_G_GT:31829896:0,1,0,1
chr7	31829899	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31829896_G_GT:31829896:0,1,0,1
chr7	31829902	.	TG	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:31829896_G_GT:31829896:0,1,0,1
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr7	31920559	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	32209359	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr7	32209459	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:3,2:3,3:4,2,5,1
chr7	32338157	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=292,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32338157_AG_CC:32338157:1,0,1,0
chr7	32338162	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=292,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32338157_AG_CC:32338157:1,0,1,0
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	32530198	.	AA	TC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,13,8
chr7	32535300	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,1:3,0:0|1:32535300_T_TG:32535300:7,4,2,0
chr7	32535302	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,0:0|1:32535300_T_TG:32535300:7,4,2,0
chr7	32535309	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:32535300_T_TG:32535300:6,4,2,0
chr7	32535312	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:5,0:0|1:32535300_T_TG:32535300:7,5,2,0
chr7	32535437	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.426:17:1,5:8,2:3,7,0,7
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	32593271	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.754:18:3,7:1,7:2,2,12,2
chr7	32594278	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.617:24:5,6:4,9:5,4,4,11
chr7	32598087	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr7	32598138	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:1,6:1,7:1,1,6,8
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,3:2,2:4,1,3,2
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.439:12:2,4:3,1:5,2,4,1
chr7	32620325	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	32620354	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=211,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:6,7:16,0:20,3,7,0
chr7	32623384	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,3:8,0:8,3,3,0
chr7	32909182	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:4,7,1,4
chr7	32914557	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=187,130;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32914557_TG_T:32914557:2,0,1,0
chr7	32914561	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,130;MMQ=50,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32914557_TG_T:32914557:2,0,1,0
chr7	33016165	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=94,249;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33016165_G_A:33016165:1,0,0,1
chr7	33016168	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=94,249;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33016165_G_A:33016165:1,0,0,1
chr7	33016174	.	T	TTTTTATGTCATCTTGACTAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=94,249;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:33016165_G_A:33016165:1,1,0,1
chr7	33019138	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,59;MMQ=58,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:11,0:13,11,2,2
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.774:7:0,4:0,1:0|1:33059407_A_G:33059407:1,0,0,6
chr7	33059416	.	C	CCTTGCTTAAAGGAACCATTTTCTTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.708:5:0,4:1,0:0|1:33059407_A_G:33059407:1,0,0,4
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr7	33303985	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=119,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:12,0:12,2:10,14,1,1
chr7	33380598	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:2,3,2,3
chr7	33380673	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	33388829	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:7,1:1,1:2,6,0,2
chr7	33407505	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:6,14,0,3
chr7	33644941	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:33644941_T_C:33644941:0,0,2,2
chr7	33644948	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:33644941_T_C:33644941:0,0,0,2
chr7	34009946	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=20,25;MFRL=93,75;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:9,2:12,4:8,13,3,3
chr7	34009948	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=93,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:8,4:15,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:8,15,2,2
chr7	34009951	.	TC	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=22,20;MFRL=89,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:8,4:16,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:10,17,2,2
chr7	34009953	.	ACAGAGTC	A	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:8,4:16,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:14,18,2,2
chr7	34009962	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:9,4:19,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:13,17,2,2
chr7	34009964	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:8,4:17,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:13,17,2,2
chr7	34009967	.	GCGC	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:8,4:20,0:0|1:34009948_T_TA:34009948:13,17,2,2
chr7	34091441	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=182,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:3,8:2,5:3,2,8,5
chr7	34094687	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr7	34101562	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=82,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.355:10:4,2:2,1:6,1,3,0
chr7	34697982	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	34724357	.	T	TCCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	34818201	.	A	ACACCAACTTTCTAACAGCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr7	34917783	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=147,198;MMQ=49,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:8,0:0,3:5,3,3,0
chr7	34917843	.	C	CTCTCAAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=125,207;MMQ=40,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.480:2:1,0:0,1:0|1:34917843_C_CTCTCAAAT:34917843:1,0,0,1
chr7	34917847	.	C	CACACAGGCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=125,207;MMQ=40,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34917843_C_CTCTCAAAT:34917843:1,0,0,1
chr7	34979082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	34979748	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=81,117;MMQ=55,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.526:5:2,0:0,1:2,0,1,2
chr7	34981591	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	34982196	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=104,77;MMQ=47,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:2,3:14,0:8,8,2,1
chr7	34994414	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=146,1167249;MMQ=45,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:6,0:7,2:0|1:34994414_A_T:34994414:4,9,0,2
chr7	34994415	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=146,1167249;MMQ=45,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:6,0:7,2:0|1:34994414_A_T:34994414:4,9,0,2
chr7	34994419	.	G	GTAAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=169,1167249;MMQ=45,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:34994414_A_T:34994414:3,9,0,2
chr7	34994421	.	T	TAAATGAAAATGGAG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=169,1167249;MMQ=45,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:34994414_A_T:34994414:3,9,0,2
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=142,124;MMQ=52,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,6:0,9:0,1,5,10
chr7	35280693	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr7	35280723	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=168,104;MMQ=59,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35280723_A_G:35280723:0,4,0,1
chr7	35280727	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=168,104;MMQ=59,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35280723_A_G:35280723:0,4,0,1
chr7	35288276	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:3,4,5,2
chr7	35288458	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	35673946	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=99,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:11,6:10,0:12,9,6,0
chr7	35673985	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,5:7,0:12,5,4,1
chr7	35709772	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=82,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,17,13
chr7	35872551	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.681:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr7	36194843	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:36194843_G_GA:36194843:3,6,1,1
chr7	36194849	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:36194843_G_GA:36194843:2,6,1,1
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr7	36338589	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=78,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr7	36338597	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,0:6,2,4,0
chr7	36338749	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr7	36366569	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr7	36366598	.	C	CGTCACTTTCGGGTACACCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,12,5
chr7	36396664	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:6,2,2,5
chr7	36397257	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36397257_A_AG:36397257:0,1,0,1
chr7	36397258	.	C	CATCCAATAAAAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36397257_A_AG:36397257:0,1,0,1
chr7	36429533	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,123;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:10,1,3,0
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:5,2:3,2:5,3,2,2
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=210,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	36450070	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr7	36456614	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=100,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.815:9:1,7:0,1:1,0,8,0
chr7	36458828	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=92,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:0,2:6,5:2,4,5,2
chr7	36462205	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=79,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr7	36463335	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	36464044	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	36465192	.	TGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,1:5,0,3,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.364:36:16,3:7,9:11,12,8,5
chr7	36465606	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.629:21:5,11:2,2:5,3,3,10
chr7	36466572	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,1:14,2:19,10,0,3
chr7	36466669	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.583:15:3,3:3,5:0,6,2,7
chr7	36492045	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=99,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr7	36492212	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,2:3,3:1,2,2,3
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	36588161	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=108,201;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:5,1,4,0
chr7	36656147	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr7	36671633	.	TATAC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAC;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,2:14,0:11,18,1,1
chr7	36763560	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	36763646	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:10,3,1,1
chr7	36763688	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,6:0,0,14,11
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:7,2:7,2,3,3
chr7	37252929	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,9,9
chr7	37253093	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	37256392	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=207,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,1,4
chr7	37256405	.	A	AAAAATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37256405_A_AAAAATC:37256405:0,2,0,1
chr7	37256406	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37256405_A_AAAAATC:37256405:0,2,0,1
chr7	37262140	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr7	37262376	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37262376_G_C:37262376:0,2,0,1
chr7	37262379	.	C	CCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37262376_G_C:37262376:0,2,0,1
chr7	37298865	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.473:34:10,16:8,0:10,8,16,0
chr7	37299056	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr7	37780966	.	G	GAGTGTAGATCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	37889768	.	T	TCTTCTTTTTCCTATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=168,283;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr7	37889786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.592:4:2,0:0,2:0|1:37889786_A_G:37889786:2,0,2,0
chr7	37889800	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.592:4:2,0:0,1:0|1:37889786_A_G:37889786:2,0,2,0
chr7	37890081	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	37890267	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:3,3,4,0
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,3:0,10:0,0,8,5
chr7	37903846	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	37903918	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=133,65;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,3:6,0:11,5,3,0
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr7	37905323	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,5,0
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:5,7:0,5:2,3,9,3
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=124,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:3,1:2,2,1,3
chr7	37933983	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	37934146	.	TA	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr7	37934234	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	37947222	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:11,2:0|1:37947222_G_C:37947222:7,11,1,1
chr7	37947227	.	GAACTGT	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:37947222_G_C:37947222:7,13,1,1
chr7	37947236	.	TCC	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:37947222_G_C:37947222:5,13,1,1
chr7	37947242	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=140,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:37947222_G_C:37947222:4,13,1,1
chr7	37947245	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=140,53;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:37947222_G_C:37947222:4,13,1,1
chr7	37953720	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	37953840	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:9,8:5,5:8,6,7,6
chr7	37954064	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,0:6,7:4,8,1,6
chr7	37960262	.	AAGGCAGTGGCAGC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=96,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCAGTGGCAGC;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.323:17:3,2:5,3:6,6,4,1
chr7	37989775	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=99,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,1:6,4:4,3,4,1
chr7	38305043	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=110,209;MMQ=53,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:2,6,2,0
chr7	38424539	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:0,2,3,7
chr7	38429370	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=73,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:3,4,4,5
chr7	38431644	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	38471937	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	38530568	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	38530807	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	38782944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	38812213	.	AAAAGTGATTCCCCTTCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr7	38816441	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	38835242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=162,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38835242_T_C:38835242:0,2,0,1
chr7	38835244	.	C	CCCTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=162,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38835242_T_C:38835242:0,2,0,1
chr7	38857364	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	38860933	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=195,294;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr7	38948615	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:38948615_T_TA:38948615:1,0,1,0
chr7	38948624	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:38948615_T_TA:38948615:2,0,1,0
chr7	38948628	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:38948615_T_TA:38948615:4,0,1,0
chr7	38948632	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:38948615_T_TA:38948615:4,0,1,0
chr7	38948636	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,11;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:38948615_T_TA:38948615:4,0,1,0
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=72,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr7	39243963	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr7	39243978	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	39379287	.	CCAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=221,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAG;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr7	39379401	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.338:9:2,0:4,2:1,5,3,0
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr7	39605959	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=239,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,5,2
chr7	39736485	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:11,2:4,0:4,11,0,2
chr7	40027942	.	C	CGCTTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	40087320	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	40134678	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	40220507	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr7	40221629	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:6,0:3,8,0,4
chr7	40228033	.	CAAAAA	C,CAAAAAA,CAAAAAAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31,31,20;MFRL=120,105,205,0;MMQ=40,56,40,60;MPOS=4,28,3;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,16,22,23;RU=A;STR;TLOD=4.35,4.80,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,5,4:0.080,0.377,0.285:16:0,0,2,1:4,2,2,0:4,1,5,6
chr7	40228228	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:1,12,0,3
chr7	40229072	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr7	40234742	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:1,2:0,3:1,0,1,4
chr7	40356315	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr7	40723798	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40723798_T_TC:40723798:0,1,0,1
chr7	40723801	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40723798_T_TC:40723798:0,1,0,1
chr7	40723807	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40723798_T_TC:40723798:0,1,0,1
chr7	42018411	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42018411_G_A:42018411:0,1,0,1
chr7	42018414	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42018411_G_A:42018411:0,1,0,1
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr7	42066010	.	G	GCAGCCTGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=64,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:5,1:4,6,0,2
chr7	42262668	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=85,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr7	42966284	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,0,5
chr7	42966321	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=180,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	43283410	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,4:2,0:6,0,4,0
chr7	43283411	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=114,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:7,0,2,0
chr7	43400557	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:24,5:9,0:28,5,5,0
chr7	43400654	.	TGC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.191:14:4,1:5,0:0|1:43400654_TGC_T:43400654:0,12,0,2
chr7	43400662	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.204:13:5,2:5,0:0|1:43400654_TGC_T:43400654:0,11,0,2
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	43490623	.	C	CTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43490623_C_CTTA:43490623:0,1,0,1
chr7	43490624	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:0,1:1,0:0|1:43490623_C_CTTA:43490623:0,1,0,1
chr7	43495878	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=81,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:5,3:8,4:7,6,4,3
chr7	43503477	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr7	43506261	.	T	TCATCATTTCCTTAGTAGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	43540264	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:6,1,3,2
chr7	43540871	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,16;MFRL=97,45;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,0:0|1:43540871_A_G:43540871:9,4,1,1
chr7	43540881	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:43540871_A_G:43540871:9,4,1,1
chr7	43540886	.	G	GTTCCTGGCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=97,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:43540871_A_G:43540871:7,4,1,1
chr7	43540887	.	A	AAGTGC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=97,45;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:43540871_A_G:43540871:7,4,1,1
chr7	43548516	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr7	43622806	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:6,7:2,7:4,4,8,7
chr7	43684803	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr7	43685044	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	43685075	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43685075_C_A:43685075:0,1,0,1
chr7	43685082	.	A	ATAGAATAGGTTTCTAATTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43685075_C_A:43685075:0,1,0,1
chr7	43687296	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,11:0,0,17,10
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	43918132	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,90;MMQ=60,54;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,0:2,5:0,2,1,4
chr7	43918525	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,0:12,3:8,17,0,3
chr7	43982615	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:8,1:4,2:4,8,1,2
chr7	44047218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=161,117;MMQ=32,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44047218_G_A:44047218:0,2,0,1
chr7	44047220	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=161,117;MMQ=32,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:44047218_G_A:44047218:0,2,0,1
chr7	44089736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=74,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr7	44096438	.	G	GTGT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.253:8:4,2:2,0:0|1:44096438_G_GTGT:44096438:2,4,1,1
chr7	44096441	.	C	CTGACCTAAGGGGAGTCCCTTGGGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:44096438_G_GTGT:44096438:2,5,1,1
chr7	44105205	.	TCCCA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:0,1:0|1:44105205_TCCCA_T:44105205:0,1,1,0
chr7	44105216	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44105205_TCCCA_T:44105205:0,1,1,0
chr7	44105220	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44105205_TCCCA_T:44105205:0,1,1,0
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.921:12:1,6:0,3:0,1,4,7
chr7	44148388	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	44148553	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr7	44148716	.	AAAGGAGGACAGCAGCCCC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:6,2:6,8,1,1
chr7	44148807	.	TGGGTCCCTGTGGGG	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,2:0,0:0|1:44148807_TGGGTCCCTGTGGGG_T:44148807:3,6,1,1
chr7	44148826	.	AT	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,0:0|1:44148807_TGGGTCCCTGTGGGG_T:44148807:4,4,1,1
chr7	44148942	.	T	TTTGCTGCAAGATCGATGCTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=51,336;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:0,0:2,1,0,1
chr7	44150312	.	TC	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=136,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44150312_TC_CT:44150312:3,0,1,0
chr7	44150316	.	C	CATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44150312_TC_CT:44150312:3,0,1,0
chr7	44150438	.	G	GCAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:44150438_G_GCAA:44150438:3,4,1,1
chr7	44150440	.	T	TGCCCCAGCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:44150438_G_GCAA:44150438:3,4,1,1
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,2,1
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr7	44152234	.	CGAG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=107,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:17,0:4,2:0|1:44152234_CGAG_C:44152234:11,10,1,1
chr7	44152238	.	CGGCTAGTATCCTACCCCTACGATATGGCCCGCACGCCTACCCAGG	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:4,2:0|1:44152234_CGAG_C:44152234:12,14,1,1
chr7	44153764	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=120,83;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.306:34:14,0:10,10:10,14,0,10
chr7	44153780	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:4,5,2,7
chr7	44153825	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:6,1:12,3:5,14,1,3
chr7	44153926	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=177,9004705;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	44154564	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:12,0:7,10:5,14,0,10
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,8,7
chr7	44178626	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,488;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	44180495	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44180495_T_A:44180495:2,0,0,1
chr7	44180497	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44180495_T_A:44180495:2,0,0,1
chr7	44180500	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44180495_T_A:44180495:2,0,0,1
chr7	44180502	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44180495_T_A:44180495:2,0,0,1
chr7	44186092	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:3,0,1,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:2,1,3,3
chr7	44190468	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr7	44192100	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,0:0,1:0|1:44192100_A_C:44192100:0,0,0,1
chr7	44192103	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44192100_A_C:44192100:0,0,0,1
chr7	44192106	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44192100_A_C:44192100:0,0,0,1
chr7	44192108	.	C	CATCTAAACTATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44192100_A_C:44192100:0,0,0,1
chr7	44197583	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,7:1,2:3,1,6,3
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr7	44270749	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,0;MFRL=241,132;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,0:1,1,0,1
chr7	44270764	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	44272575	.	GAGCCTGCGAGAAAGAAGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=192,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr7	44280476	.	A	ACCACCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=209,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr7	44281475	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr7	44281744	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:4,0,3,0
chr7	44281840	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:13,5:4,0:0|1:44281840_C_A:44281840:12,6,5,0
chr7	44281847	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:16,5:5,0:0|1:44281840_C_A:44281840:14,7,5,0
chr7	44282868	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0|1:44282868_A_G:44282868:2,2,5,2
chr7	44282877	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0|1:44282868_A_G:44282868:2,2,2,3
chr7	44364970	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,4:4,0:2,2,2,2
chr7	44524669	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,3:13,0:13,15,3,0
chr7	44530060	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr7	44530193	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=81,80;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:1,7:3,4:2,2,5,6
chr7	44555573	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.274:12:4,1:3,1:3,6,3,0
chr7	44556784	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,3:20,0:15,19,3,0
chr7	44561367	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=127,775;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:11,0:17,5,0,2
chr7	44561600	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr7	44571913	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44571913_C_CGG:44571913:0,1,0,1
chr7	44571914	.	C	CACCTCTGCTTGAGTTTTACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44571913_C_CGG:44571913:0,1,0,1
chr7	44573130	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=61,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,2:10,0:9,7,1,1
chr7	44573176	.	C	CAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:1,2:5,0:0|1:44573176_C_CAG:44573176:0,6,1,1
chr7	44573178	.	G	GGGTATAGTGCAGATTCCCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:0|1:44573176_C_CAG:44573176:0,6,1,1
chr7	44575429	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:44575429_C_A:44575429:8,2,1,1
chr7	44575437	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:4,2:8,0:0|1:44575429_C_A:44575429:10,4,1,1
chr7	44576399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=76,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr7	44580963	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	44606217	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	44609537	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=141,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:4,7,2,0
chr7	44610490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=536,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,4:1,8:0,1,5,7
chr7	44611077	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr7	44612347	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr7	44612454	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,16,3
chr7	44612532	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.126:45:19,0:20,5:22,18,2,3
chr7	44613103	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	44613611	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	44619302	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	44687175	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.609:15:3,7:4,0:7,0,7,1
chr7	44713506	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,2:11,1:6,9,0,3
chr7	44721365	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:7,4,0,4
chr7	44737315	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr7	44739638	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=200,171;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44739638_G_GCT:44739638:3,0,1,0
chr7	44739641	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=209,171;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:44739638_G_GCT:44739638:4,0,1,0
chr7	44739648	.	AA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=209,171;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:44739638_G_GCT:44739638:4,0,1,0
chr7	44741235	.	C	CTGAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=0,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,2:6,0:5,4,1,1
chr7	44741247	.	GG	AA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:4,3,1,1
chr7	44807061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr7	44836433	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:0|1:44836433_T_G:44836433:0,6,0,2
chr7	44836438	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0|1:44836433_T_G:44836433:0,6,0,2
chr7	44836449	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr7	44840785	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	44840864	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,2:7,7:7,7,6,3
chr7	45004063	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:3,2,4,6
chr7	45009325	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:5,2:7,2,2,3
chr7	45009341	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=105,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,5:7,3:7,5,3,5
chr7	45009761	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.523:11:2,0:3,1:5,0,0,6
chr7	45009766	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.366:11:2,0:2,0:5,2,0,4
chr7	45010173	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr7	45010753	.	G	GATGTTCTATTTTACTGTGGCTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45010753_G_GATGTTCTATTTTACTGTGGCTAA:45010753:0,0,0,1
chr7	45010755	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45010753_G_GATGTTCTATTTTACTGTGGCTAA:45010753:0,0,0,1
chr7	45011905	.	G	A,C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,21,19;MFRL=179,90,253;MMQ=60,60,60;MPOS=-1,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,1,0:2,0,0:0,4,0,2
chr7	45104131	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr7	45108117	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=93,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:2,7,0,2
chr7	45114089	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	45120248	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=60,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:4,3,5,3
chr7	45120915	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr7	45122324	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:7,1:0,1:3,4,1,1
chr7	45122415	.	G	GACACTTCGAGGCTAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=173,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr7	45122447	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr7	45122464	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr7	45125166	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:12,4:1,1:5,8,2,3
chr7	45142145	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	45142834	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	45143090	.	G	GGACAGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:1,3,2,3
chr7	45143093	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.548:9:2,0:2,4:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:1,3,2,3
chr7	45144109	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=105,224;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,13:5,0:8,3,13,0
chr7	45662332	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:45662332_A_AG:45662332:2,3,1,1
chr7	45662333	.	A	ACAAGAGAGTCAATGCTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:45662332_A_AG:45662332:2,3,1,1
chr7	45662336	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,0:0|1:45662332_A_AG:45662332:2,3,1,1
chr7	45697295	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0|1:45697295_C_G:45697295:1,0,2,0
chr7	45697297	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:45697295_C_G:45697295:1,0,2,0
chr7	45724696	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=88,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,6:4,0:2,5,1,5
chr7	45743128	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:3,3,3,1
chr7	45743403	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	45744027	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	45744055	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,5:3,0:6,1,4,1
chr7	45747933	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=53,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:2,4,2,1
chr7	45954563	.	A	ACT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=121,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:3,4,1,1
chr7	47317711	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:47317711_A_G:47317711:11,7,1,1
chr7	47317716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:47317711_A_G:47317711:11,7,1,1
chr7	47317732	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,4:7,0:10,7,2,2
chr7	47319723	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr7	47384723	.	T	TTCAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	47408029	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:0,2:1,1,6,0
chr7	47408974	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr7	47436558	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=266,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.619:8:0,2:2,3:0,3,2,3
chr7	47436589	.	C	CCCCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=158,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:0,0:3,0:1,2,0,1
chr7	47439910	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47439910_T_A:47439910:1,0,1,0
chr7	47439917	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:47439910_T_A:47439910:3,0,1,0
chr7	47451295	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr7	47463809	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:0,0:0|1:47463809_GT_G:47463809:0,3,0,1
chr7	47463812	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:47463809_GT_G:47463809:0,3,0,1
chr7	47463815	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,22;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:47463809_GT_G:47463809:0,4,0,1
chr7	47463817	.	AGT	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=151,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47463809_GT_G:47463809:0,3,0,1
chr7	47463824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=177,86;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:47463809_GT_G:47463809:0,4,0,1
chr7	47463842	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	47467864	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=240,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:1,2,6,0
chr7	47475028	.	CGG	TAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:47475028_CGG_TAA:47475028:1,5,1,1
chr7	47475033	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:47475028_CGG_TAA:47475028:1,5,1,1
chr7	47475037	.	T	TGTGTTGTGGGAGGGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:47475028_CGG_TAA:47475028:1,5,1,1
chr7	47814864	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47814864_A_C:47814864:1,1,0,1
chr7	47814868	.	C	CTACCTCCCGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:47814864_A_C:47814864:1,3,0,1
chr7	47840510	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr7	47851654	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:1,7,1,2
chr7	47853498	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr7	47859239	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,2,2
chr7	47869751	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:1,7,2,2
chr7	47870992	.	TC	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=284,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:47870992_TC_CT:47870992:0,2,0,2
chr7	47870995	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=284,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:47870992_TC_CT:47870992:0,2,0,2
chr7	47874062	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	47884555	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,5,0
chr7	47886707	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:1,1,1,5
chr7	47894878	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=52,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr7	47894952	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:47894952_C_CT:47894952:0,0,0,2
chr7	47894955	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:47894952_C_CT:47894952:0,0,0,2
chr7	47898222	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	47898347	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:8,0:3,2:0|1:47898347_A_G:47898347:9,5,1,1
chr7	47898353	.	C	CTTAAATATTGGATG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:47898347_A_G:47898347:8,5,1,1
chr7	47904737	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:7,1,7,1
chr7	47904970	.	C	CTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	47906182	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr7	47906253	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:47906253_C_CA:47906253:0,4,1,1
chr7	47906254	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:47906253_C_CA:47906253:0,4,1,1
chr7	47913412	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	47917087	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=82,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,1:3,5:6,4,3,3
chr7	47927744	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:1,5,1,4
chr7	47930148	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr7	47947863	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:1,5,3,6
chr7	47969094	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,162;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:13,0:14,7:17,10,0,8
chr7	47971626	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=79,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:7,3:1,2:4,5,2,3
chr7	47979716	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	47982954	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr7	47988121	.	A	ACTTTCTCCAATTCTACATTTATTTGCAGGAAATGATCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=112,110;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	48016442	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:4,3,1,4
chr7	48046714	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,0:5,4:6,1,2,2
chr7	48086077	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr7	48086161	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chr7	48089394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	48141620	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr7	48237802	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,6:0,0,7,3
chr7	48266815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr7	48266842	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.410:13:4,3:4,2:7,1,4,1
chr7	48279044	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:48279044_GTT_G:48279044:1,5,1,1
chr7	48279048	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:48279044_GTT_G:48279044:1,5,1,1
chr7	48285485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr7	48312081	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.236:22:8,0:9,4:9,8,0,5
chr7	48314468	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:11,8,0,2
chr7	48335265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	48412017	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=101,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:10,12,2,1
chr7	48431694	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.180:18:7,0:8,2:8,7,0,3
chr7	48520780	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=91,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr7	48559580	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	48559666	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=95,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr7	48559696	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,1:3,5:4,2,5,1
chr7	48559905	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=156,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:4,6:1,5:1,4,4,7
chr7	48563752	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	48563913	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=103,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:5,4:2,4:3,4,6,2
chr7	48684185	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=19,30;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:0,0:1,4:0,3,4,0
chr7	48684206	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.306:13:4,0:3,0:4,5,4,0
chr7	49815390	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=324,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr7	49842377	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,2:2,3,2,4
chr7	49977232	.	G	GGGACAGAGTGCCCAGACCAGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:6,2:2,0:0|1:49977232_G_GGGACAGAGTGCCCAGACCAGC:49977232:1,7,1,1
chr7	49977235	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=154,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:6,1:1,0:0|1:49977232_G_GGGACAGAGTGCCCAGACCAGC:49977232:1,7,1,1
chr7	50023122	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	50070921	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:50070921_C_G:50070921:0,0,0,3
chr7	50070929	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50070921_C_G:50070921:0,3,0,1
chr7	50070932	.	CACAA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50070921_C_G:50070921:0,3,0,1
chr7	50129341	.	GATATTCTAAA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0,9,1,1
chr7	50135775	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,5:2,4:3,0,3,6
chr7	50135970	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=105,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:5,10,4,0
chr7	50143810	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr7	50144059	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	50175654	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr7	50198626	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr7	50444514	.	C	CTTTTTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=125,334;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:6,1:5,1:0|1:50444514_C_CTTTTTG:50444514:3,10,0,2
chr7	50444519	.	G	GGCTAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=129,334;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,1:6,1:0|1:50444514_C_CTTTTTG:50444514:3,11,0,2
chr7	50454980	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr7	50468168	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:50468168_G_A:50468168:7,5,1,1
chr7	50468172	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:50468168_G_A:50468168:8,6,1,1
chr7	50512929	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	50513791	.	TTACTGGAGGTCCATGATCCATAATCTCATTCATAATAAGTTCAATCATCTTTGGCTCCAAGTTCTTCAGACGCTCATCAACTGGATGTGCTGG	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.105:39:4,1:10,3:21,13,0,5
chr7	50537677	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.854:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	50544211	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:4,3,2,1
chr7	50544269	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr7	50547584	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,5:6,0:4,2,4,1
chr7	50547661	.	AGCCCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCCT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr7	50566762	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	50571779	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:1,3,2,7
chr7	50672907	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	50673189	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50673189_G_A:50673189:0,2,0,1
chr7	50673195	.	GGGAGCAGGGAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:50673189_G_A:50673189:0,3,0,1
chr7	50694429	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	50694457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr7	50694567	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:10,2:9,6,1,1
chr7	50737559	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:8,0:3,3:4,9,2,1
chr7	50742118	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr7	50799889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	51085127	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	51097063	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr7	51097216	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=154,234;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,2,3
chr7	51153024	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,10
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,10
chr7	51287470	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=69,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:4,5:5,5:5,5,3,7
chr7	53104078	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr7	53104378	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=44,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,0:3,0:1,5,2,0
chr7	54614698	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr7	54618010	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	54621526	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,10,1
chr7	54819993	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:6,1:3,1:8,2,2,1
chr7	54820186	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	55214443	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:2,4,3,4
chr7	55221655	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr7	55228053	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	55233153	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:2,10,1,1
chr7	55237977	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:3,2,1,2
chr7	55238268	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,2:2,4:3,2,3,4
chr7	55242609	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=50,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:2,1,0,4
chr7	55249057	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=113,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:0|1:55249057_C_T:55249057:5,11,0,2
chr7	55249063	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.444:18:6,2:4,5:0|1:55249057_C_T:55249057:2,8,3,5
chr7	55268192	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55268192_GC_TT:55268192:0,4,0,1
chr7	55268195	.	TCCCTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55268192_GC_TT:55268192:0,4,0,1
chr7	55268916	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=68,94;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:4,6:2,7:3,3,10,3
chr7	55269069	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=101,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:9,2:0|1:55269069_T_C:55269069:4,11,1,1
chr7	55269075	.	TCTCAA	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=101,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:55269069_T_C:55269069:3,12,1,1
chr7	55269081	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:6,2:0|1:55269069_T_C:55269069:1,12,1,1
chr7	55269088	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=158,41;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0|1:55269069_T_C:55269069:0,8,1,1
chr7	55496130	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=81,379;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.233:14:1,2:9,0:5,6,3,0
chr7	55499058	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=121,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr7	55499072	.	TG	GA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=221,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55499072_TG_GA:55499072:0,2,0,1
chr7	55499076	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=221,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55499072_TG_GA:55499072:0,2,0,1
chr7	55499080	.	A	AACC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,23;MFRL=221,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55499072_TG_GA:55499072:0,2,0,1
chr7	55499083	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,21;MFRL=221,104;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55499072_TG_GA:55499072:0,2,0,1
chr7	55499112	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:55499112_A_AGG:55499112:0,0,0,1
chr7	55499115	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55499112_A_AGG:55499112:0,0,0,1
chr7	55499116	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55499112_A_AGG:55499112:0,0,0,1
chr7	55540707	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=77,132;MMQ=27,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:1,6:4,1:2,3,4,3
chr7	55540720	.	G	GTGGTCT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=87,63;MMQ=60,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:55540720_G_GTGGTCT:55540720:9,7,1,1
chr7	55540722	.	C	CTGG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=90,63;MMQ=60,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,1:0|1:55540720_G_GTGGTCT:55540720:9,8,1,1
chr7	55540791	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr7	55912185	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,3:2,2:1,1,4,1
chr7	55991292	.	GT	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,6:5,1,4,5
chr7	56006716	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,0:11,3:12,9,0,3
chr7	56007576	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,77;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:2,2,2,4
chr7	56020955	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,74;MMQ=58,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:7,10,1,1
chr7	56052410	.	CAAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56052410_CAAAA_C:56052410:0,0,1,0
chr7	56052430	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:56052410_CAAAA_C:56052410:1,0,1,0
chr7	56052440	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:56052410_CAAAA_C:56052410:1,0,1,0
chr7	56082622	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:3,1:12,3:14,1,4,0
chr7	56119730	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.474:7:1,1:0,2:0,4,0,3
chr7	56122058	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=115,110;MMQ=52,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,4:8,1:9,6,3,2
chr7	56125862	.	T	TTTGTTTGTTTGTTTTTTAAACTAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr7	56129587	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=120,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:5,1:12,1:2,16,0,2
chr7	56136260	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr7	56144656	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr7	56149306	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,140;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:4,3,4,0
chr7	56151489	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=264,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	56155261	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=200,63;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr7	56169419	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,134;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:2,2,2,5
chr7	56173970	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=118,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	56174115	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=141,141;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:3,8:7,11:5,5,4,15
chr7	56174140	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.723:19:1,7:3,5:1,4,3,11
chr7	57187449	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=146,2864893;MMQ=25,26;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:57187449_C_T:57187449:7,0,2,0
chr7	57187463	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=137,2864893;MMQ=25,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:57187449_C_T:57187449:6,0,2,0
chr7	57187474	.	CT	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=143,2864893;MMQ=25,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:57187449_C_T:57187449:8,0,2,0
chr7	57188016	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,107;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.452:20:3,5:7,3:8,3,5,4
chr7	57199906	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,2,1
chr7	57529392	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=104,194;MMQ=58,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr7	63506002	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:11,12:12,0:17,7,12,0
chr7	63529956	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr7	63537638	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr7	63537849	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr7	63667497	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:8,2:1,3:6,3,4,1
chr7	63673455	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27,31,33;MFRL=101,99,123,133;MMQ=60,60,60,51;MPOS=18,15,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.25,9.87,8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,4,6,6:0.152,0.237,0.248:25:3,4,4,4:4,0,2,1:7,2,12,4
chr7	63673608	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr7	63673691	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	63679733	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,49;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,15,11
chr7	63680133	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:4,5:0,6:3,1,7,4
chr7	63680367	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=160,219;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:0,1:1,0:0|1:63680367_T_C:63680367:1,2,0,1
chr7	63680369	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,21;MFRL=160,219;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:0,1:1,0:0|1:63680367_T_C:63680367:1,2,0,1
chr7	63720784	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,168;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,5:1,0:0|1:63720784_GT_G:63720784:0,3,0,5
chr7	63720786	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=137,168;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:0|1:63720784_GT_G:63720784:0,3,0,5
chr7	63721251	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=111,188;MMQ=47,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,4,1
chr7	63727295	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63727295_T_C:63727295:0,0,0,1
chr7	63727298	.	T	TTGTAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63727295_T_C:63727295:0,0,0,1
chr7	63982897	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:63982897_A_C:63982897:0,3,0,1
chr7	63982899	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:63982897_A_C:63982897:0,3,0,1
chr7	63986715	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,2:1,0:4,0,2,0
chr7	64004874	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=92,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:64004874_G_T:64004874:0,1,0,1
chr7	64004881	.	T	TGAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64004874_G_T:64004874:0,0,0,1
chr7	64004884	.	T	TGGGGAGGAAGCG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64004874_G_T:64004874:0,0,0,1
chr7	64004885	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64004874_G_T:64004874:0,0,0,1
chr7	64023371	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,9:2,3:1,3,5,7
chr7	64152353	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=75,90;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,6:3,4:8,4,5,5
chr7	64166642	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	64168386	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=132,56;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:10,0:14,4:0|1:64168386_T_C:64168386:15,12,2,2
chr7	64168394	.	A	AT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=129,56;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:12,0:18,3:0|1:64168386_T_C:64168386:19,13,2,2
chr7	64168395	.	G	GAAGGAAAGGCA	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,56;MMQ=60,55;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:12,0:18,2:0|1:64168386_T_C:64168386:19,14,2,2
chr7	64168397	.	T	TTTACTCCCAA	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:13,0:20,1:0|1:64168386_T_C:64168386:19,14,2,1
chr7	64275284	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,11:0,0,15,6
chr7	64276089	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr7	64291225	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr7	64291244	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr7	64291267	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr7	64291333	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,12:0,0,7,16
chr7	64389089	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=201,64;MMQ=60,54;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:64389089_A_C:64389089:0,2,1,1
chr7	64389105	.	T	TGTAATCCCAACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=201,64;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:64389089_A_C:64389089:0,2,1,1
chr7	64389107	.	T	TTTGGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=201,64;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:64389089_A_C:64389089:0,2,1,1
chr7	64389111	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=201,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:64389089_A_C:64389089:0,2,0,1
chr7	64438396	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=136,293;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:64438396_T_G:64438396:1,3,1,0
chr7	64438403	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=293,136;MMQ=45,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1|0:64438396_T_G:64438396:1,0,1,3
chr7	64438404	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=136,293;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:64438396_T_G:64438396:1,3,1,0
chr7	64438410	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=136,293;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:64438396_T_G:64438396:0,4,1,0
chr7	64439938	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	64441726	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:8,2:1,10:5,4,7,5
chr7	64852790	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=106,89;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.277:23:9,1:6,5:0|1:64852790_TTG_T:64852790:11,6,3,3
chr7	64852812	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.104:27:12,0:12,2:1|0:64852790_TTG_T:64852790:13,12,2,0
chr7	64852818	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=117,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:9,0:14,2:1|0:64852790_TTG_T:64852790:11,14,2,0
chr7	64863711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=184,116;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr7	64864800	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:0,1:7,2:3,4,0,3
chr7	65425839	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=184,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:2,1:1,1:1,2,2,1
chr7	65426054	.	CAA	C,AAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29,18;MFRL=165,60,139;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.51,3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,8:0.157,0.322:18:0,0,2:4,2,2:4,4,0,10
chr7	65429359	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,166;MMQ=47,46;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:4,5,3,4
chr7	65439879	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:1,5:5,3:2,4,6,3
chr7	65444359	.	T	TGA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,5:9,2:7,3,5,2
chr7	65541185	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.490:10:1,3:4,1:0,5,2,3
chr7	65546928	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,398;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:8,11,0,2
chr7	65552230	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,129,195;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,15,18;RU=GT;STR;TLOD=7.93,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.509,0.332:3:0,0,0:0,2,1:0,0,3,0
chr7	65552497	.	AT	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	65552614	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	65552862	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	65554352	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,5,10
chr7	65556977	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,0:3,2:3,1,1,1
chr7	65556988	.	C	CCTGATTACCACATAAAGACAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr7	65557155	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65557155_G_C:65557155:0,1,0,1
chr7	65557156	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65557155_G_C:65557155:0,1,0,1
chr7	65557161	.	C	CCGCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65557155_G_C:65557155:0,1,0,1
chr7	65557162	.	A	ACGGACAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65557155_G_C:65557155:0,1,0,1
chr7	65557448	.	GAA	G,GA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31,33;MFRL=146,0,148;MMQ=60,37,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:1,0,2,0
chr7	65557464	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,14;MFRL=73,148;MMQ=49,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:65557464_A_T:65557464:2,0,1,0
chr7	65557474	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=15,16;MFRL=146,0;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:1,0:1|0:65557464_A_T:65557464:3,0,1,0
chr7	65557486	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=15,15;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:65557464_A_T:65557464:3,0,1,0
chr7	65557488	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=146,0;MMQ=60,37;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:1,0:1|0:65557464_A_T:65557464:3,0,1,0
chr7	65557491	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:65557464_A_T:65557464:3,0,1,0
chr7	65599196	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr7	65599246	.	CTT	C,CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33,34;MFRL=0,182,121;MMQ=60,60,60;MPOS=16,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.55,6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.509:5:0,2,2:0,0,1:0,0,5,0
chr7	65599386	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,3:8,0:5,6,0,3
chr7	66094008	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=127,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr7	66098482	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr7	66136372	.	G	GACC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,98;MMQ=52,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,1:3,2:5,1,2,2
chr7	66136549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	66147697	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr7	66262284	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	66262293	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33,30;MFRL=146,216,121;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=3.08,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.222,0.305:4:1,1,0:1,0,1:2,0,2,0
chr7	66262309	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.276:12:3,2:3,1:5,4,3,0
chr7	66458112	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	66459145	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=165,197;MMQ=46,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr7	66459256	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=113,158;MMQ=57,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.483:19:4,7:6,2:5,5,2,7
chr7	66474559	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,207;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:2,4:4,2:6,0,5,1
chr7	66474695	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=122,205;MMQ=52,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:1,2,2,3
chr7	66520726	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=126,154;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr7	66520792	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=123,150;MMQ=46,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:11,15,3,0
chr7	66520886	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.154:30:11,0:14,4:0|1:66520886_G_C:66520886:8,18,0,4
chr7	66520888	.	T	TTC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:10,0:15,4:0|1:66520886_G_C:66520886:8,19,0,4
chr7	66520892	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:7,0:16,4:0|1:66520886_G_C:66520886:7,18,0,4
chr7	66532235	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=179,204;MMQ=51,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	66563734	.	T	TTGTTTAAAAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,55;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr7	66582460	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:6,1,8,2
chr7	66648091	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=81,98;MMQ=58,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:8,5,3,0
chr7	66648272	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=122,2722872;MMQ=52,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:1,6,0,2
chr7	66648275	.	TGC	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=122,2722872;MMQ=52,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:1,6,0,2
chr7	66648280	.	C	CCCCT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=122,2722872;MMQ=52,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:1,6,0,2
chr7	66648282	.	T	TGGCC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=122,2722872;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:1,6,0,2
chr7	66648286	.	C	CATGG	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=122,2722872;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:1,6,0,2
chr7	66648290	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=149,2722872;MMQ=52,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:66648272_TG_T:66648272:0,6,0,2
chr7	66660078	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=112,156;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:6,1,5,2
chr7	66660202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=98,238;MMQ=39,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:6,8,2,0
chr7	66660242	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=124,148;MMQ=53,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:6,2,0,4
chr7	66703238	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,150;MMQ=33,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr7	66774157	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,177;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:1,3,1,5
chr7	66785029	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,172;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:4,4,2,3
chr7	69583231	.	TAAA	T,TAAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,21,26;MFRL=149,161,101;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,19,23;RU=A;STR;TLOD=17.22,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,3:0.585,0.278:10:0,0,1:1,3,1:1,0,1,8
chr7	70231070	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=84,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:2,4:9,6:6,5,5,5
chr7	70233007	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:11,8,0,2
chr7	70233139	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr7	70249868	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,0:3,4:6,3,3,1
chr7	70249908	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:4,5,5,3
chr7	70252185	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:0,11:1,19:0,1,20,11
chr7	70254674	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.795:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr7	70598059	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	70885883	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr7	70886065	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=75,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:1,4,1,6
chr7	70886107	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	71036473	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	71134899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:2,1,1,0
chr7	71142177	.	G	GGT	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.273:16:4,3:8,1:0|1:71142177_G_GGT:71142177:3,9,4,0
chr7	71142183	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=22,15;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:3,0:7,0:0|1:71142177_G_GGT:71142177:4,10,3,0
chr7	71142185	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=25,14;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:3,0:9,0:0|1:71142177_G_GGT:71142177:4,10,3,0
chr7	71142192	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=30,14;MFRL=92,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:3,0:7,0:0|1:71142177_G_GGT:71142177:2,9,3,0
chr7	71142219	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=21,28;MFRL=47,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:5,4,1,6
chr7	71142241	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:6,5,1,1
chr7	71142252	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:8,2:0|1:71142252_C_T:71142252:6,6,1,1
chr7	71142259	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:71142252_C_T:71142252:6,7,1,1
chr7	71142263	.	T	TTCTGA	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:8,2:0|1:71142252_C_T:71142252:6,7,1,1
chr7	71176919	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,3,2
chr7	71177177	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:0,2,3,5
chr7	72023966	.	T	TTGCCTCCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=133,217;MMQ=33,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72023966_T_TTGCCTCCTCCC:72023966:0,1,0,1
chr7	72023968	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=133,217;MMQ=33,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72023966_T_TTGCCTCCTCCC:72023966:0,1,0,1
chr7	72023972	.	TAT	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=133,217;MMQ=33,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72023966_T_TTGCCTCCTCCC:72023966:0,1,0,1
chr7	72081634	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=157,163;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	72094075	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	72193864	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,6:0|1:72193864_T_C:72193864:0,0,9,6
chr7	72193867	.	CG	AA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=0,109;MMQ=60,55;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:1,6:0,6:0|1:72193864_T_C:72193864:0,1,9,7
chr7	72209527	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,140;MMQ=27,45;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,3:3,7:3,0,7,4
chr7	72209630	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=186,2838715;MMQ=40,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:72209630_A_C:72209630:0,6,0,2
chr7	72209640	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=200,2838715;MMQ=27,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:72209630_A_C:72209630:0,4,0,2
chr7	72209643	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=200,2838715;MMQ=27,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:72209630_A_C:72209630:0,4,0,2
chr7	72209644	.	C	CCCATTGTACAG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=200,2838715;MMQ=27,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:72209630_A_C:72209630:0,4,0,2
chr7	72209647	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=200,2838715;MMQ=27,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:2,2:0|1:72209630_A_C:72209630:0,4,0,2
chr7	72277630	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr7	72280978	.	G	GTGTGTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,4:1,2:1,0,6,1
chr7	72280984	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:3,1:0|1:72280984_G_T:72280984:8,1,2,0
chr7	72280987	.	TGTAC	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:0|1:72280984_G_T:72280984:9,1,2,0
chr7	72413575	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=139,945;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,25:0.564:44:6,24:12,0:12,7,0,25
chr7	72413581	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=945,73;MMQ=25,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.111:50:30,3:13,2:11,34,3,2
chr7	72413593	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=945,73;MMQ=25,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,10:0.186:57:30,5:15,5:12,35,5,5
chr7	72416333	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr7	72416862	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=15056719,91;MMQ=54,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr7	72419402	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=199,143;MMQ=42,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.726:24:3,8:2,7:3,3,7,11
chr7	72722804	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=150,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:3,8,1,2
chr7	72732790	.	A	AATGTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=128,174;MMQ=50,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,2:8,0:9,5,0,2
chr7	72738350	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	72738749	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,6,15
chr7	72738762	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,5,11
chr7	72742181	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr7	72742627	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,135;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr7	72864098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:72864098_T_C:72864098:0,2,0,1
chr7	72864114	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72864098_T_C:72864098:0,1,0,1
chr7	72879898	.	G	T,GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,10,13;MFRL=169,142,127;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.20,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.469,0.346:7:0,0,0:0,0,0:0,1,0,6
chr7	72891380	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,131;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.208:32:11,0:15,6:12,14,0,6
chr7	72966422	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=212,149;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr7	72984929	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,0:3,2:6,4,2,0
chr7	72987387	.	C	A,CTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25,29;MFRL=165,193,190;MMQ=60,60,60;MPOS=9,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:0,2,0,2
chr7	72987393	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:72987393_A_T:72987393:0,2,0,1
chr7	72987395	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:72987393_A_T:72987393:0,2,0,1
chr7	73008372	.	G	GACCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:73008372_G_GACCCTTT:73008372:0,1,0,1
chr7	73008373	.	G	GCTCCTCTCTCCTCGTGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:73008372_G_GACCCTTT:73008372:0,1,0,1
chr7	73010916	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73010916_C_A:73010916:0,1,1,0
chr7	73010923	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:73010916_C_A:73010916:1,1,1,0
chr7	73011879	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=127,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.319:7:1,0:2,0:0|1:73011879_T_G:73011879:3,2,0,2
chr7	73011895	.	A	ATTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73011879_T_G:73011879:0,2,0,1
chr7	73011896	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73011879_T_G:73011879:0,2,0,1
chr7	73019975	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,2,2
chr7	73020210	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	73020439	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=82,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,0,3
chr7	73083889	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:8,2:5,2:7,7,2,2
chr7	73083957	.	GGGGGC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:4,0:0|1:73083957_GGGGGC_G:73083957:3,6,1,1
chr7	73083963	.	AGT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:5,0:0|1:73083957_GGGGGC_G:73083957:3,6,1,1
chr7	73096993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=301,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	73097845	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=138,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr7	73106822	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	73112057	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr7	73114870	.	G	GTTCCCATGCAGAAGAACACGTAGCTCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr7	73115025	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:7,9:1,0:7,2,9,0
chr7	73117336	.	G	GATTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr7	73122985	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:5,8,3,1
chr7	73151220	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=135,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr7	73184473	.	CGACG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GACG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	73245519	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr7	73245948	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:22,0:14,3:17,21,0,3
chr7	73246461	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,5:5,5:3,2,5,5
chr7	73246496	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.530:28:3,6:10,7:6,7,8,7
chr7	73246724	.	GGAGGGGGCCA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,3:3,0:0|1:73246724_GGAGGGGGCCA_G:73246724:10,3,0,3
chr7	73246742	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:11,2:3,0:0|1:73246724_GGAGGGGGCCA_G:73246724:10,5,0,3
chr7	73246745	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:3,0:0|1:73246724_GGAGGGGGCCA_G:73246724:9,7,0,2
chr7	73246747	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:0|1:73246724_GGAGGGGGCCA_G:73246724:9,7,0,2
chr7	73254910	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,2:2,2:1,3,1,3
chr7	73275501	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,4:3,1:3,3,3,2
chr7	73275565	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:11,3:5,2:7,9,4,1
chr7	73279233	.	C	CAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=64,164;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,0:1,1:2,1,1,0
chr7	73458238	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=59,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:8,5,1,2
chr7	73467650	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=188,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=TG;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.387:7:3,1:0,1:0,4,0,3
chr7	73469169	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr7	73470684	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:9,15,1,2
chr7	73470714	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,3:9,6:7,10,3,6
chr7	73470782	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr7	73470809	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr7	73472050	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:5,4,1,5
chr7	73477591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:4,3,0,2
chr7	73481174	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr7	73511446	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:11,1:11,5:11,11,6,0
chr7	73530046	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	73649795	.	GC	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=120,104;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:7,8,1,1
chr7	73666736	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31,30;MFRL=159,152,0;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.55,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,3:0.316,0.267:13:1,1,1:4,2,2:4,1,5,3
chr7	73666801	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:8,0:18,3:7,20,3,0
chr7	73752766	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=70,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:2,5,3,0
chr7	73791071	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:4,12,1,2
chr7	73932683	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,0:2,2:2,2,0,2
chr7	73934091	.	A	ACCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr7	73943969	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=198,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73943969_G_A:73943969:2,0,1,0
chr7	73943977	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=198,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73943969_G_A:73943969:2,0,1,0
chr7	73949427	.	T	TTTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=71,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:2,7,1,1
chr7	73950636	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr7	73959018	.	GA	CT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,37;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:3,2:0|1:73959018_GA_CT:73959018:7,4,1,1
chr7	73959021	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=135,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:73959018_GA_CT:73959018:7,4,1,1
chr7	73959025	.	G	GGCCGCGCGTCCTCACT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=133,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:73959018_GA_CT:73959018:7,5,1,1
chr7	73959029	.	TG	AC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=130,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,1:0|1:73959018_GA_CT:73959018:7,6,1,1
chr7	73969541	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,80;MMQ=60,42;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr7	73974113	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	74105219	.	ATGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:7,0,6,0
chr7	74105424	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.533:41:8,7:11,14:11,8,8,14
chr7	74105455	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=147,161;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:13,0:16,4:19,12,0,4
chr7	74119475	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=109,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.467:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr7	74173262	.	C	CAGATCAAGCAAGAACCAGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=91,65;MMQ=50,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:3,2:1,3,1,1
chr7	74193620	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,155;MMQ=25,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,5:9,2:9,5,3,4
chr7	74301295	.	ACCCTCTCTCCAAACTCACTTTCCATCCTACCAGTTAACT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=98,692658;MMQ=30,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.140:30:14,0:8,3:9,18,0,3
chr7	74310202	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=134,177;MMQ=20,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	74482666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:74482666_C_T:74482666:0,4,0,2
chr7	74482676	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:74482666_C_T:74482666:0,4,0,2
chr7	74482679	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,34;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:74482666_C_T:74482666:0,5,0,2
chr7	74482682	.	A	ATTCCCTTCCCTAGTTTT	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:74482666_C_T:74482666:0,5,0,2
chr7	74482685	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:74482666_C_T:74482666:0,4,0,2
chr7	74482696	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74482696_A_G:74482696:0,2,0,1
chr7	74482698	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74482696_A_G:74482696:0,2,0,1
chr7	74482701	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74482696_A_G:74482696:0,2,0,1
chr7	74524942	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,149;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.146:24:13,2:8,1:4,17,0,3
chr7	74524955	.	T	TTAG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=128,144;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:4,20,0,2
chr7	74536839	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=340,170;MMQ=39,25;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.768:6:0,5:0,0:0,1,5,0
chr7	74538891	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,127;MMQ=40,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:4,2:14,0:9,11,2,0
chr7	74564260	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=184,108;MMQ=28,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr7	74824239	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=168,92;MMQ=25,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr7	74824305	.	G	GTCCTCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=215,142;MMQ=26,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr7	74824312	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=262,199;MMQ=27,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74824312_C_T:74824312:1,0,0,1
chr7	74824317	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=262,199;MMQ=27,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74824312_C_T:74824312:1,0,0,1
chr7	75048245	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,169;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,1:3,5,1,2
chr7	75048750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=65,127;MMQ=48,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,2:10,1:6,11,0,3
chr7	75048804	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=210,168;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr7	75051238	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=179,120;MMQ=49,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:0|1:75051238_G_A:75051238:9,3,0,3
chr7	75051243	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=173,126;MMQ=52,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:0|1:75051238_G_A:75051238:9,4,0,2
chr7	75053499	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=96,158;MMQ=45,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:9,5:13,9:9,13,5,9
chr7	75054266	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,172;MMQ=52,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:7,4:4,6:8,4,8,2
chr7	75054944	.	G	GGCTCTCTGACTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=113,74;MMQ=27,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:5,6,0,2
chr7	75145411	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:75145411_T_C:75145411:0,0,1,3
chr7	75145419	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=150,199;MMQ=25,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:75145411_T_C:75145411:1,2,0,1
chr7	75145422	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=150,199;MMQ=25,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:75145411_T_C:75145411:1,2,0,1
chr7	75155143	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.347:14:2,0:5,4:8,1,4,1
chr7	75183403	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:6,1:6,3:8,5,2,2
chr7	75185985	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	75188945	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr7	75191382	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=100,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:75191382_A_T:75191382:14,7,1,1
chr7	75191385	.	C	CTTTTCCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:75191382_A_T:75191382:14,8,1,1
chr7	75191388	.	G	GTCTGCCTC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:11,2:0|1:75191382_A_T:75191382:14,8,1,1
chr7	75216189	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:75216189_G_C:75216189:6,11,1,1
chr7	75216194	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:75216189_G_C:75216189:6,10,1,1
chr7	75398998	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,2:10,3:7,11,3,2
chr7	75441108	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=109,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,2:6,1:0|1:75441108_C_T:75441108:4,5,3,1
chr7	75441111	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=109,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:3,2:6,1:0|1:75441108_C_T:75441108:4,5,3,1
chr7	75442855	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr7	75508445	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=109,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,7:4,3:6,5,6,4
chr7	75511134	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=70,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.490:27:7,3:5,10:9,5,7,6
chr7	75513062	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr7	75513091	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr7	75513261	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75513261_GT_G:75513261:0,0,0,1
chr7	75513264	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75513261_GT_G:75513261:0,0,0,1
chr7	75513267	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75513261_GT_G:75513261:0,0,0,1
chr7	75583457	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:75583457_G_A:75583457:8,3,1,1
chr7	75583463	.	A	AGCCAGGCGTAGTGGTGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:75583457_G_A:75583457:9,3,1,1
chr7	75608674	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,0:0,6:1,0,6,0
chr7	75608843	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,3:6,0:5,7,2,1
chr7	75609837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,2:4,0:0|1:75609837_C_T:75609837:8,5,1,1
chr7	75609847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=178,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:75609837_C_T:75609837:6,4,1,1
chr7	75610763	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr7	75612770	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=198,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:2,1:0|1:75612770_C_G:75612770:2,2,3,1
chr7	75612783	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:75612770_C_G:75612770:1,4,4,1
chr7	75613998	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=104,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr7	75614029	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=52,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:0,4:2,0,4,0
chr7	75614082	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,1:5,7:7,2,3,5
chr7	75614496	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr7	75614863	.	TG	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,5:1,3:1,0,6,2
chr7	75614953	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,8:3,5:3,3,6,7
chr7	75616778	.	AC	TA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:6,0:8,6:10,6,3,3
chr7	75616817	.	GGACA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACA;STR;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,11:0,0,9,8
chr7	75617727	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:2,1:4,2:7,1,0,4
chr7	75621661	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr7	75630274	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr7	75633209	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr7	75651085	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr7	75677430	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	75684283	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,0:4,6:2,5,0,7
chr7	75689887	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr7	75692764	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=126,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:75692764_G_T:75692764:5,4,1,1
chr7	75692766	.	GCAGCT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=130,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:75692764_G_T:75692764:5,5,1,1
chr7	75692775	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,37;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:0|1:75692764_G_T:75692764:3,5,1,1
chr7	75692927	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:2,2:10,4:5,8,2,4
chr7	75693009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	75694079	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=102,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:2,1,2,1
chr7	75694345	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr7	75896535	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:0,1:1,1,1,2
chr7	75914934	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=85.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,11,15
chr7	75958799	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75958799_C_CA:75958799:0,0,1,0
chr7	75958800	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:75958799_C_CA:75958799:0,1,1,0
chr7	75958803	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,14;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75958799_C_CA:75958799:0,1,1,0
chr7	75958806	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75958799_C_CA:75958799:0,1,1,0
chr7	75958810	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:75958799_C_CA:75958799:0,2,1,0
chr7	75958816	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:75958799_C_CA:75958799:1,2,1,0
chr7	76023088	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	76023131	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,5:0,0,9,3
chr7	76029694	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:4,9,0,2
chr7	76030261	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=95,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:13,7,1,1
chr7	76033673	.	G	GAGAGAGGACATTTAAATGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:76033673_G_GAGAGAGGACATTTAAATGAA:76033673:5,3,1,1
chr7	76033675	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:76033673_G_GAGAGAGGACATTTAAATGAA:76033673:5,3,1,1
chr7	76063431	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=131,112;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,0:0|1:76063431_A_T:76063431:0,3,0,1
chr7	76063438	.	A	AGTGTACTTTCATTTTCAATATATCCCTGCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=281,112;MMQ=21,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76063431_A_T:76063431:0,1,0,1
chr7	76112248	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=98,116;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:5,20,0,2
chr7	76131564	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=146,131;MMQ=39,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:6,3,1,1
chr7	76131586	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr7	76131597	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=157,128;MMQ=30,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:8,2,0,4
chr7	76131812	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr7	76132858	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,18;MFRL=104,128;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr7	76132862	.	CGGGACCA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=128,119;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	76132898	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	76132962	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr7	76140307	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,131;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:0,5:5,5:5,0,8,3
chr7	76140449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	76142473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:9,10,2,1
chr7	76142536	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr7	76143441	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:76143441_T_A:76143441:0,4,0,1
chr7	76143443	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:76143441_T_A:76143441:0,4,0,1
chr7	76143445	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:76143441_T_A:76143441:0,4,0,1
chr7	76144455	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr7	76144483	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr7	76144560	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr7	76255063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,89;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr7	76883806	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=113,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr7	76883989	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	76903952	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.149:35:17,0:13,4:11,19,0,5
chr7	76908199	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:2,3,1,6
chr7	76908488	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr7	76924171	.	A	ATCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	76941547	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=104,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:76941547_C_A:76941547:2,5,0,4
chr7	76941549	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=104,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,1:4,2:0|1:76941547_C_A:76941547:2,5,0,4
chr7	76942959	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr7	76950035	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,2:9,5:12,2,5,2
chr7	76958730	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,19:0,13:0,0,14,19
chr7	77003308	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr7	77006092	.	C	CAAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=49,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,0:1,3:1,3,1,5
chr7	77006717	.	CAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.796:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr7	77010678	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=229,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77010678_AAG_A:77010678:2,2,0,1
chr7	77010682	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=229,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77010678_AAG_A:77010678:2,2,0,1
chr7	77200392	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,30:0.500:60:8,13:22,17:20,10,21,9
chr7	77212979	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr7	77214959	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr7	77214982	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr7	77215010	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77215010_GG_TT:77215010:0,3,0,1
chr7	77215014	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77215010_GG_TT:77215010:0,3,0,1
chr7	77215015	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77215010_GG_TT:77215010:0,3,0,1
chr7	77215018	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:77215010_GG_TT:77215010:0,3,0,1
chr7	77227241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=201,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,4:1,7:1,3,4,8
chr7	77240037	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:5,4:13,0:8,10,4,0
chr7	77255941	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr7	77266313	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,2:8,3:13,4,3,2
chr7	77268009	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,0:15,4:8,22,1,3
chr7	77397906	.	ATAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	77398181	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0|1:77398181_TTA_T:77398181:0,2,0,3
chr7	77398185	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0|1:77398181_TTA_T:77398181:0,2,0,3
chr7	77469486	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:5,7:1,4:5,1,8,3
chr7	77558660	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:0|1:77558660_T_TA:77558660:3,6,1,1
chr7	77558662	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:77558660_T_TA:77558660:3,6,1,1
chr7	77558673	.	G	GTTCAGAAAAGTAGTGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=88,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77558673_G_GTTCAGAAAAGTAGTGAC:77558673:1,2,0,1
chr7	77558675	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=88,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77558673_G_GTTCAGAAAAGTAGTGAC:77558673:1,2,0,1
chr7	77558678	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=88,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77558673_G_GTTCAGAAAAGTAGTGAC:77558673:1,2,0,1
chr7	77567008	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=87,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.315:13:3,2:4,2:6,3,3,1
chr7	77567159	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=150,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:77567159_AG_A:77567159:0,12,1,1
chr7	77567164	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=150,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:77567159_AG_A:77567159:0,12,1,1
chr7	77567167	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=150,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,2:0|1:77567159_AG_A:77567159:0,12,1,1
chr7	77567171	.	TT	CA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=150,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:77567159_AG_A:77567159:0,11,1,1
chr7	77567175	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:77567159_AG_A:77567159:0,10,1,1
chr7	77569559	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:9,15:8,4:7,11,9,10
chr7	77581042	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=93,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,3:5,9:4,8,3,9
chr7	77762445	.	A	ATGGGTGTGTGTGCCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=64,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr7	77762457	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	77764591	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	77797480	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:77797480_T_C:77797480:0,2,0,1
chr7	77797482	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:77797480_T_C:77797480:0,2,0,1
chr7	77797490	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77797480_T_C:77797480:0,1,0,1
chr7	77824289	.	TGAAGGGCAGGTGG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:5,2:9,13,1,1
chr7	78119199	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr7	78119221	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=94,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.656:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr7	78256468	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:7,0:7,3:9,5,2,1
chr7	78256643	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	80088022	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:13,1,2,0
chr7	80088114	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:7,0:8,4:0|1:80088114_T_C:80088114:5,11,0,4
chr7	80088116	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:7,0:9,4:0|1:80088114_T_C:80088114:5,11,0,4
chr7	80141069	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr7	80290369	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr7	80293792	.	T	TTC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=136,38;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:0|1:80293792_T_TTC:80293792:4,16,1,1
chr7	80293793	.	CGA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:80293792_T_TTC:80293792:4,16,1,1
chr7	80293799	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=143,38;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:80293792_T_TTC:80293792:4,15,1,1
chr7	80374342	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,13:0,3:0,0,7,9
chr7	80378148	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr7	80378175	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr7	80387766	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,3:7,6:4,7,4,5
chr7	80418787	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=84,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:17,0:4,4:17,5,0,4
chr7	80433531	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:0|1:80433531_T_C:80433531:11,7,1,1
chr7	80433535	.	G	GGTGATCAGTGCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:80433531_T_C:80433531:11,7,1,1
chr7	80434918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	80456708	.	GTTTTT	G,GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,34,35;MFRL=0,150,139;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,18,19;RU=T;STR;TLOD=4.33,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,4:0.380,0.396:10:1,3,3:0,1,0:1,1,7,1
chr7	80456841	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=121.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,16:0,23:0,0,10,31
chr7	81346626	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,3:9,0:5,12,1,2
chr7	81374500	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	81591716	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=100,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.463:22:3,7:8,3:9,3,10,0
chr7	81601231	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:1,2:12,5:3,10,0,7
chr7	81603945	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.708:1:0,1:0,0:0|1:81603945_AT_A:81603945:0,0,0,1
chr7	81603966	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81603945_AT_A:81603945:0,0,0,1
chr7	81612686	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.447:15:4,3:2,4:1,7,3,4
chr7	81620403	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	81634822	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=14,19;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.352:19:0,0:2,3:2,10,0,7
chr7	81641570	.	G	GAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,0:0,1,1,4
chr7	81642949	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	81695853	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:81695853_A_G:81695853:0,4,0,1
chr7	81695855	.	A	AGTTGGAATTAGCTGAGTTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:81695853_A_G:81695853:0,4,0,1
chr7	81746444	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:6,1:6,5,1,2
chr7	81964574	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:81964574_G_T:81964574:0,4,0,1
chr7	81964576	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:81964574_G_T:81964574:0,4,0,1
chr7	81964578	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:81964574_G_T:81964574:0,4,0,1
chr7	82452049	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82452049_T_A:82452049:0,1,0,1
chr7	82452051	.	C	CTGCTCAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:82452049_T_A:82452049:0,1,0,1
chr7	82475786	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	82531882	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=103,175;MMQ=44,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr7	82531887	.	TATA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=172,225;MMQ=46,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATA;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:1,1:3,0,2,0
chr7	82544411	.	AGAGGAAGGTCTG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGGAAGGTCTG;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr7	82545129	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=166,10;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr7	82579030	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:82579030_G_A:82579030:10,13,1,1
chr7	82579033	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:82579030_G_A:82579030:10,13,1,1
chr7	82581488	.	T	TTCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr7	82764729	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=99,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:7,0:0|1:82764729_G_A:82764729:14,8,0,2
chr7	82764732	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=90,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:82764729_G_A:82764729:13,8,0,2
chr7	82784017	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:1,0,5,3
chr7	83021799	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,22,26;MFRL=0,160,146;MMQ=60,60,60;MPOS=5,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=A;STR;TLOD=15.71,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.600,0.300:7:0,1,2:0,4,0:0,0,7,0
chr7	83021819	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:2,0:6,0,2,0
chr7	83023587	.	TAC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=59,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.948:16:1,8:0,7:0,1,10,5
chr7	83026100	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	83029280	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	83029639	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	83031907	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	83032187	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	83034754	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr7	83034899	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr7	83035177	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	83036367	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	83036602	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	83037677	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,7:3,0:5,4,8,0
chr7	83037751	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr7	83047666	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	83095934	.	A	AAAATAAAAAGCTGCAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=162,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	83098696	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	83098714	.	CTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	83277699	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:3,1:6,2:0|1:83277699_CT_C:83277699:10,2,3,0
chr7	83277718	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.411:17:2,1:5,0:0|1:83277699_CT_C:83277699:7,3,7,0
chr7	83606353	.	T	TGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GA;STR;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr7	83606501	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=103,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:83606501_C_CA:83606501:13,8,1,1
chr7	83606510	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=105,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:0|1:83606501_C_CA:83606501:11,9,1,1
chr7	83610710	.	A	AACTATATATTGGTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=84,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:8,8,1,2
chr7	83614801	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.691:30:6,16:3,5:3,6,13,8
chr7	83643681	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=99,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:83643681_A_T:83643681:0,1,0,2
chr7	83643687	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=99,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:83643681_A_T:83643681:0,1,0,2
chr7	83739762	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=238,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.799:11:0,6:1,3:1,1,8,1
chr7	83764309	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	84628872	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=115,118;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:12,0:20,5:15,19,5,0
chr7	84644346	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=184,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,2,1
chr7	84647477	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:1,2:1,5:1,1,5,2
chr7	84647700	.	T	TATGTTGCCCAGACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,28;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr7	84671609	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	84685146	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84685146_G_C:84685146:2,2,0,1
chr7	84685148	.	ATG	TCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84685146_G_C:84685146:2,2,0,1
chr7	84685164	.	T	TAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84685164_T_TAAAAG:84685164:2,2,0,1
chr7	84685168	.	T	TAAGCTGCCAAAGA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84685164_T_TAAAAG:84685164:2,2,0,1
chr7	84685170	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:84685164_T_TAAAAG:84685164:2,2,0,1
chr7	84685172	.	G	GTAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:84685164_T_TAAAAG:84685164:2,1,0,1
chr7	86415987	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr7	86468254	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=67,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:1,1,3,2
chr7	86479627	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr7	86526984	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86526984_G_GT:86526984:0,1,0,1
chr7	86526985	.	C	CAATATTATCATCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86526984_G_GT:86526984:0,1,0,1
chr7	86554921	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,2:5,0:0|1:86554921_T_G:86554921:4,8,1,1
chr7	86554922	.	T	TCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:5,0:0|1:86554921_T_G:86554921:4,8,1,1
chr7	86567490	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,2:8,0:7,3,1,1
chr7	86594255	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:2,6:10,0:10,3,6,0
chr7	86594379	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:2,0:1,3:1,2,2,3
chr7	86594423	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=81,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	86688756	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86688756_C_T:86688756:0,0,0,1
chr7	86688758	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86688756_C_T:86688756:0,0,0,1
chr7	86688767	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86688756_C_T:86688756:0,0,0,1
chr7	86688768	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86688756_C_T:86688756:0,0,0,1
chr7	86795947	.	TAG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:5,3:2,9,1,5
chr7	86800351	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:5,3,4,3
chr7	86808983	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=112,146;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,0:7,3:0|1:86808983_G_T:86808983:9,11,0,3
chr7	86808988	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=112,146;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,0:6,3:0|1:86808983_G_T:86808983:6,11,0,3
chr7	86813873	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=102,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:5,2:0|1:86813873_C_T:86813873:4,10,1,1
chr7	86813881	.	A	ATC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=101,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:86813873_C_T:86813873:5,11,1,1
chr7	86813885	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:0|1:86813873_C_T:86813873:4,10,1,1
chr7	86823002	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=173,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:9,1,4,0
chr7	86825982	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=97,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:86825982_T_A:86825982:7,13,1,1
chr7	86825989	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=102,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.154:20:6,1:11,2:0|1:86825982_T_A:86825982:5,12,1,2
chr7	86978347	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,10,1
chr7	86988493	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:3,3:8,2:10,1,3,2
chr7	86998842	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr7	87004988	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=94,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:7,2:10,0:0|1:87004988_G_A:87004988:9,9,1,1
chr7	87004992	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:11,0:0|1:87004988_G_A:87004988:9,11,1,1
chr7	87004998	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:0|1:87004988_G_A:87004988:9,12,1,1
chr7	87005287	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,4:0,4:0,0,3,7
chr7	87011349	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr7	87022024	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr7	87032613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,2,9
chr7	87035747	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=75,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:12,8:8,0:10,10,8,0
chr7	87051561	.	A	AAAACTATTAAACCCATATAACCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:0|1:87051561_A_AAAACTATTAAACCCATATAACCT:87051561:7,17,1,1
chr7	87051563	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,1:13,0:0|1:87051561_A_AAAACTATTAAACCCATATAACCT:87051561:7,17,1,1
chr7	87053150	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	87053206	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr7	87069758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr7	87072942	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr7	87160561	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:0,2:4,1:5,0,3,0
chr7	87165750	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:3,3,2,2
chr7	87168478	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:87168478_A_G:87168478:1,0,1,0
chr7	87168485	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87168478_A_G:87168478:1,0,1,0
chr7	87168749	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	87174416	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	87178626	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=60,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr7	87195298	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=448,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	87195330	.	G	GTTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=155,895;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:87195330_G_GTTA:87195330:3,0,1,0
chr7	87195332	.	G	GCTCCCCAACATCGTGCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=155,895;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:87195330_G_GTTA:87195330:3,0,1,0
chr7	87195334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=155,895;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:87195330_G_GTTA:87195330:3,0,1,0
chr7	87215041	.	T	TTTACTTTAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:87215041_T_TTTACTTTAATC:87215041:0,1,0,1
chr7	87215045	.	A	ACACCGAGACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:87215041_T_TTTACTTTAATC:87215041:0,1,0,1
chr7	87329719	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr7	87329909	.	T	TTTGAGATGAAGTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=268,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:87329909_T_TTTGAGATGAAGTCC:87329909:0,1,0,1
chr7	87329912	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=268,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:87329909_T_TTTGAGATGAAGTCC:87329909:0,1,0,1
chr7	87465475	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr7	87465489	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:7,0,5,0
chr7	87530226	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=153,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:8,0:1,7:0,9,0,7
chr7	87563741	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=172,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:87563741_G_C:87563741:1,0,0,1
chr7	87563744	.	C	CAAGAAGGGCACGGACACAGCCACTGCCGCCTGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=165,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.484:3:0,0:1,1:0|1:87563741_G_C:87563741:2,0,0,1
chr7	87564294	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=91,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,3:4,0:8,6,2,1
chr7	87737473	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=98,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr7	87795061	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr7	87849408	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	88389420	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0|1:88389420_A_G:88389420:0,2,0,5
chr7	88389431	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.276:5:0,1:4,0:1|0:88389420_A_G:88389420:0,4,0,1
chr7	88424291	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=95,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:3,2:3,4:4,2,2,5
chr7	88424365	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr7	88847450	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,3:2,3:0|1:88847450_TA_T:88847450:5,1,4,2
chr7	88847453	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.501:12:4,3:2,3:0|1:88847450_TA_T:88847450:5,1,4,2
chr7	88963064	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:9,2:11,3:13,7,5,0
chr7	88964313	.	TT	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:88964313_TT_CA:88964313:5,9,0,2
chr7	88964319	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:88964313_TT_CA:88964313:4,9,0,2
chr7	88965393	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:4,5,1,1
chr7	89791252	.	TGGATTGAGCATGATGTTTGGAGAATGGAGATTTATGTGTCTCTGGGAATTGTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=133,49;MMQ=27,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:1,0:5,2:13,13,1,1
chr7	89792250	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr7	89793716	.	AGCATATCCAGATGAGGTAGGATGGGATAAACTCTTATTGAACCAATCTTCACCAATTTTGTTTTTCTTTTGCAGAGCAAGCTAGGAATTGTTTCCCTTCTACTGGGCACAATACAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=145,236;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.163:15:0,0:0,4:7,4,4,0
chr7	89861623	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:3,2:4,1,4,1
chr7	89867446	.	T	TCTG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTG;STR;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.443:34:5,6:12,9:6,13,8,7
chr7	89887587	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	89901039	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,2,3
chr7	89927012	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr7	89927191	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr7	89929337	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:13,1:3,2:11,5,2,1
chr7	89938588	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.350:26:9,4:8,4:9,8,6,3
chr7	89939340	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:0,3:4,2:3,1,2,3
chr7	89939634	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	89982116	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:6,0:0,2:6,0,1,1
chr7	90012230	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=105,75;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.274:16:8,4:4,0:8,4,3,1
chr7	90014111	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	90014408	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=81,171;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,0,6
chr7	90014441	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:90014441_TA_T:90014441:1,5,1,1
chr7	90014444	.	TA	CC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:90014441_TA_T:90014441:1,5,1,1
chr7	90014447	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:90014441_TA_T:90014441:1,5,1,1
chr7	90225928	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr7	90338943	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr7	90356175	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	90528765	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	90613532	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:0,11:10,0:4,6,10,1
chr7	90747278	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=202,306;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90747278_T_C:90747278:3,0,1,0
chr7	90747285	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=202,306;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:90747278_T_C:90747278:3,0,1,0
chr7	90747315	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	90895968	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=207,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,0:0|1:90895968_G_C:90895968:3,4,2,0
chr7	90895971	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,18;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:5,0:0|1:90895968_G_C:90895968:3,5,2,0
chr7	90895973	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:5,0:0|1:90895968_G_C:90895968:3,5,2,0
chr7	90895977	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:5,0:0|1:90895968_G_C:90895968:3,5,2,0
chr7	90895980	.	CAT	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:90895968_G_C:90895968:3,5,2,0
chr7	90897680	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:1,13,2,0
chr7	90897696	.	GTGTGCTCCTCTTTTGGATTTACAGAAATGTGTCAAATGTAAATCTTTCAAAGCCATTTAAAAATATTCACTTTAGTTCTC	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.064:48:7,0:5,3:21,23,2,2
chr7	90899217	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:10,0:14,2:12,12,1,1
chr7	90899314	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=114,140;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:13,10:12,0:10,15,10,0
chr7	90899491	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,1:3,1:2,5,2,0
chr7	91570290	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	91621621	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:0|1:91621621_T_C:91621621:0,3,0,5
chr7	91621627	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:0|1:91621621_T_C:91621621:0,3,0,5
chr7	91621635	.	A	AAGAGCATTGTC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.468:2:1,1:0,0:0|1:91621635_A_AAGAGCATTGTC:91621635:0,1,0,1
chr7	91621639	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91621635_A_AAGAGCATTGTC:91621635:0,1,0,1
chr7	91621645	.	AA	TC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91621635_A_AAGAGCATTGTC:91621635:0,0,0,1
chr7	91670318	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	91672185	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	91707169	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:4,0:11,3:4,11,0,3
chr7	91714092	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.431:11:2,3:3,2:2,4,3,2
chr7	91725931	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=169,113;MMQ=53,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:91725931_G_A:91725931:2,0,1,0
chr7	91725933	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=169,113;MMQ=53,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:91725931_G_A:91725931:2,0,1,0
chr7	91725941	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=123,113;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91725931_G_A:91725931:1,0,1,0
chr7	91725944	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=123,113;MMQ=60,52;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91725931_G_A:91725931:1,0,1,0
chr7	91761053	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.558:18:7,5:1,5:5,3,4,6
chr7	91780106	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0|1:91780106_G_GA:91780106:0,0,0,1
chr7	91780107	.	G	GCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91780106_G_GA:91780106:0,0,0,1
chr7	91852354	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	92020452	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:4,3:5,1:8,2,4,0
chr7	92021430	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,171;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	92027187	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	92080148	.	C	CCAGGATTTCCCATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:1,10,1,1
chr7	92119284	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr7	92129161	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	92131289	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,13,9
chr7	92147234	.	G	GAGAAGAAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr7	92147584	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr7	92195455	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,134;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr7	92207022	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,54;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:14,0:11,14,0,2
chr7	92244422	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr7	92247333	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:3,1,1,1
chr7	92730951	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,1,3
chr7	92733766	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=84,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:3,4:5,4,7,3
chr7	92733788	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=99,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:6,10,2,0
chr7	92734983	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,2:7,3:6,8,2,3
chr7	92826772	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,2:10,0:10,16,1,2
chr7	92848640	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=92,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,0:6,2:9,7,0,2
chr7	92855628	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=183,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,1:2,2:2,0,3,1
chr7	92855690	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:3,6:8,0:8,3,3,3
chr7	92886812	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr7	92887684	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=99,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:10,9:4,9:5,9,8,10
chr7	92935095	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:92935095_T_A:92935095:3,0,2,0
chr7	92935103	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:92935095_T_A:92935095:3,0,2,0
chr7	93063715	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:93063715_G_GTT:93063715:0,3,0,1
chr7	93063716	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:93063715_G_GTT:93063715:0,3,0,1
chr7	93063731	.	TCT	GAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=213,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	93065577	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93065577_A_AT:93065577:0,0,0,1
chr7	93065583	.	TA	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93065577_A_AT:93065577:0,0,0,1
chr7	93067334	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,13,6
chr7	93073147	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:93073147_C_G:93073147:0,0,0,1
chr7	93073150	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:93073147_C_G:93073147:0,0,0,1
chr7	93098196	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:0,1:0|1:93098196_TA_T:93098196:0,2,0,1
chr7	93098199	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:93098196_TA_T:93098196:0,2,0,1
chr7	93113214	.	TACAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACAA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr7	93540194	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=89,69;MMQ=53,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:23,0:5,4:17,11,1,3
chr7	93551428	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,8,8
chr7	93555311	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=330,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	93555613	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,3:0|1:93555613_G_T:93555613:0,3,0,4
chr7	93555618	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:93555613_G_T:93555613:0,3,0,4
chr7	93628644	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr7	94034069	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,2:11,0:15,12,1,1
chr7	94037034	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=205,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	94038677	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,0:9,5:9,6,1,4
chr7	94039032	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,3:5,5:4,6,6,2
chr7	94040133	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	94041334	.	TGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.113:28:4,0:2,2:16,8,3,1
chr7	94041368	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:4,2,2,1
chr7	94047879	.	GTTT	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=74,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,2:0|1:94047879_GTTT_G:94047879:10,10,2,0
chr7	94047886	.	T	TAGA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=71,60;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:94047879_GTTT_G:94047879:10,8,2,0
chr7	94047888	.	T	TAAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,0;MFRL=71,60;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,0:0|1:94047879_GTTT_G:94047879:10,8,2,0
chr7	94052495	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr7	94056355	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:0,5,6,0
chr7	94057157	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:3,2:0|1:94057157_A_C:94057157:6,6,1,1
chr7	94057161	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:94057157_A_C:94057157:6,8,1,1
chr7	94057694	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:8,8,1,1
chr7	94146975	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,3:10,3:5,8,1,5
chr7	94156393	.	TAAATC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=70,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:2,2:4,3,3,0
chr7	94156462	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:12,7,0,2
chr7	94166901	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,0:8,12:8,7,0,12
chr7	94174854	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=86,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:2,2,2,4
chr7	94175073	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	94176469	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,0:5,2:9,10,0,2
chr7	94178749	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=245,301;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:94178749_T_C:94178749:1,0,2,0
chr7	94178761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=163,301;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.609:3:1,1:0,1:0|1:94178749_T_C:94178749:1,0,2,0
chr7	94185003	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=204,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:3,2:4,4,0,2
chr7	94228331	.	GGTCATCAATTTGAAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	94248080	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=88,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,4:9,0:14,8,4,0
chr7	94293348	.	C	CTAAGGATTTGGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr7	94297293	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=70,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,5:4,0:3,3,3,2
chr7	94297384	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,3:9,0:9,5,2,1
chr7	94298102	.	A	ATGCGTGGTTTTTAACCATAATCAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:8,0:4,10,0,2
chr7	94298491	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=184,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:0|1:94298491_G_A:94298491:4,8,1,1
chr7	94298497	.	C	CAGCATAGGACATGTGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=194,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:94298491_G_A:94298491:2,8,1,1
chr7	94539572	.	GGGCTCCCAGCAGAGCAGGGGGAGGAAATAT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:9,2:4,0:10,13,1,1
chr7	94539819	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,0,2
chr7	94915671	.	T	TGATGTTTGTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:94915671_T_TGATGTTTGTGTTC:94915671:0,1,0,1
chr7	94915673	.	A	ACTTCAGGAATTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:94915671_T_TGATGTTTGTGTTC:94915671:0,1,0,1
chr7	94931700	.	A	AATGGGAGTTTGCTCATGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	94931739	.	T	TGGAATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	94989444	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:6,11,0,2
chr7	94989494	.	T	TCGAAGGAAGGCCTCACAGTGGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr7	94991681	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=102,0;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr7	95045719	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95045719_G_A:95045719:0,0,0,1
chr7	95045728	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95045719_G_A:95045719:0,0,0,1
chr7	95054007	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,240;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr7	95165753	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,4:8,0:7,4,4,0
chr7	95216247	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	95216262	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	95216394	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=100,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,7:3,5:2,2,9,3
chr7	95217027	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=78,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,1:5,5:4,3,3,4
chr7	95222131	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,4:5,0:0|1:95222131_T_G:95222131:3,9,4,0
chr7	95222138	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:6,4:3,0:0|1:95222131_T_G:95222131:3,7,4,0
chr7	95434186	.	GGAAAA	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:10,0:7,4:1,17,2,2
chr7	95434209	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:95434209_G_T:95434209:0,4,0,1
chr7	95434214	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:95434209_G_T:95434209:0,4,0,1
chr7	95709602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr7	95709666	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,3:3,8:7,1,9,2
chr7	95799377	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:21,7:14,0:23,12,7,0
chr7	95813831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr7	96338929	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr7	96635235	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:3,1,6,1
chr7	96635409	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr7	96639199	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=175,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,2,2
chr7	96651406	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	97361943	.	T	TGGGGTGACCCC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=85,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:6,6,1,1
chr7	97365522	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr7	97482757	.	AGG	TCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	97486213	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	97488569	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr7	97488627	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=115,195;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,5:10,0:8,11,5,0
chr7	97488733	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	97498316	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=99,89;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:8,3,2,0
chr7	97614410	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,102;MMQ=27,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:97614410_T_A:97614410:0,1,0,1
chr7	97614412	.	G	GACACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=157,102;MMQ=27,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97614410_T_A:97614410:0,1,0,1
chr7	97614414	.	C	CCAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=157,102;MMQ=27,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97614410_T_A:97614410:0,1,0,1
chr7	97619468	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,78;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.364:13:1,4:7,1:3,5,3,2
chr7	97788764	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=104,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:2,4,4,1
chr7	97788809	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr7	97820247	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr7	97822849	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:2,3:8,0:5,5,2,1
chr7	97833048	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:2,13,0,3
chr7	97846856	.	CGAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr7	97850869	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=213,120;MMQ=56,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,0,1
chr7	97851109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	97866291	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr7	97872690	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr7	97872707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:5,2:0,1:6,0,3,0
chr7	97874094	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr7	97875334	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:7,9,1,2
chr7	97875499	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:7,3:1,0:1,7,2,1
chr7	97920623	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=137,150;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr7	97939817	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr7	97946444	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=186,222;MMQ=50,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	97949682	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=130,146;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,2:0|1:97949682_C_CT:97949682:4,8,0,2
chr7	97949685	.	TCGC	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=136,146;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:3,2:0|1:97949682_C_CT:97949682:4,10,0,2
chr7	97949705	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=164,146;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:97949705_A_C:97949705:0,9,0,2
chr7	97949707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=164,146;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:97949705_A_C:97949705:0,9,0,2
chr7	97949710	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=164,146;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:97949705_A_C:97949705:0,9,0,2
chr7	97991730	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:13,0:12,5:12,13,0,5
chr7	98479740	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98479740_A_AT:98479740:0,1,0,1
chr7	98479742	.	A	ACCACCCTTCTACTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98479740_A_AT:98479740:0,1,0,1
chr7	98479743	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98479740_A_AT:98479740:0,1,0,1
chr7	98500956	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr7	98507835	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr7	98513300	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:0,2:2,2:3,0,3,1
chr7	98519439	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:5,2:7,10,1,2
chr7	98522833	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,2:2,0:6,5,1,1
chr7	98533390	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98533390_T_A:98533390:0,1,0,1
chr7	98533391	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98533390_T_A:98533390:0,1,0,1
chr7	98534857	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=68,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr7	98535378	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:9,4:9,0:8,10,2,2
chr7	98548682	.	C	CTGTG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=TG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,2:0,0:0,3,0,3
chr7	98553739	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:1,4:2,1,5,1
chr7	98556962	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,10:2,3:2,3,6,7
chr7	98558880	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=91,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:4,5,5,2
chr7	98564640	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:9,1:3,2:6,6,2,1
chr7	98576540	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr7	98582058	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:98582058_C_CT:98582058:0,3,0,1
chr7	98582060	.	G	GGGGGCTTAGAGAAATCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=168,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:98582058_C_CT:98582058:0,3,0,1
chr7	98587990	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	98589888	.	G	GCAGCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=197,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0|1:98589888_G_GCAGCAT:98589888:0,2,1,1
chr7	98589891	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=197,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:98589888_G_GCAGCAT:98589888:0,2,1,1
chr7	98602990	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=63,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:0,8:2,5:1,1,5,8
chr7	98609099	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=90,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.242:19:8,0:4,4:8,7,3,1
chr7	98609668	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:6,3,2,1
chr7	98637916	.	ACG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CG;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr7	98638016	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:12,0:3,5:7,8,0,5
chr7	98643300	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,9:3,6:6,2,10,5
chr7	98648517	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=190,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr7	98655223	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr7	98658130	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr7	98659566	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:98659566_C_CAT:98659566:0,5,0,2
chr7	98659567	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:98659566_C_CAT:98659566:0,5,0,2
chr7	98659570	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:98659566_C_CAT:98659566:0,5,0,2
chr7	98775453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	98775511	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=193,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,5,5
chr7	98779740	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	98991549	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=252,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	98995465	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr7	99006187	.	TGCG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCG;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:2,4:3,3,2,2
chr7	99017724	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=91,91;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,3:11,0:11,11,3,0
chr7	99021566	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,67;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:16,6:1,0:7,10,5,1
chr7	99027455	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:9,0:7,2:0|1:99027455_G_A:99027455:8,10,1,1
chr7	99027460	.	C	CTGATGATGGATT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:8,0:7,2:0|1:99027455_G_A:99027455:7,10,1,1
chr7	99027461	.	C	CCCGTGTGCCGCAACATG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=157,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:8,0:6,2:0|1:99027455_G_A:99027455:7,10,1,1
chr7	99056986	.	CTCTGGCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=235,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	99091331	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:0|1:99091331_C_CA:99091331:11,8,2,2
chr7	99091333	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:0|1:99091331_C_CA:99091331:11,8,2,2
chr7	99091767	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=93,467;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:13,0:9,11,0,2
chr7	99128679	.	C	CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,142;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:3,0:3,1:5,2,1,1
chr7	99129309	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:10,9,2,1
chr7	99144210	.	T	TCGGACTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99144210_T_TCGGACTCC:99144210:0,0,1,0
chr7	99144214	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99144210_T_TCGGACTCC:99144210:0,0,1,0
chr7	99144889	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,0:10,3:10,8,2,1
chr7	99171145	.	A	ACCAAATCTACGTCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	99171202	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,833257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99171202_T_C:99171202:0,0,1,0
chr7	99171203	.	C	CCAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,833257;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99171202_T_C:99171202:0,0,1,0
chr7	99171206	.	G	GTGCTCACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,833257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99171202_T_C:99171202:0,0,1,0
chr7	99261809	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:99261809_T_A:99261809:0,1,0,1
chr7	99261810	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99261809_T_A:99261809:0,1,0,1
chr7	99261813	.	A	ATGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99261809_T_A:99261809:0,1,0,1
chr7	99270157	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr7	99273743	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:7,17:6,0:8,5,17,0
chr7	99273794	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=117,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:11,8,0,3
chr7	99303094	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr7	99303206	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.132:21:5,0:12,2:0|1:99303206_A_G:99303206:7,12,1,1
chr7	99303217	.	A	AGAGAACAC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=96,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:7,0:11,2:0|1:99303206_A_G:99303206:8,14,1,1
chr7	99306566	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	99314986	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	99365943	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,9:0,0:0,0,7,2
chr7	99445220	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:0,1:3,0:1,3,0,1
chr7	99453341	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=98,70;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,0:8,5:9,12,5,0
chr7	99454514	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=105,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:15,0:7,4:8,14,1,3
chr7	99474729	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	99501313	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=225,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,1,2
chr7	99514417	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.682:35:3,16:7,8:2,9,11,13
chr7	99514431	.	CC	TT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:11,2:9,19,1,1
chr7	99569394	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,14:0,0,15,13
chr7	99654600	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,25887575;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	99654689	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	99661845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,0:14,2:0|1:99661845_C_T:99661845:8,13,1,1
chr7	99661851	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:15,2:0|1:99661845_C_T:99661845:9,14,1,1
chr7	99661857	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:0|1:99661845_C_T:99661845:7,10,1,1
chr7	99668946	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=107,69;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:10,4:17,0:8,19,1,3
chr7	99672845	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,0:8,3:8,10,1,2
chr7	99673359	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	99686873	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.940:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr7	99687972	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=97,181;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:2,2:3,5,2,0
chr7	99691241	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,300;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,0:8,4:11,7,4,0
chr7	99691740	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:1,0,8,3
chr7	99692993	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=39,26;MFRL=239,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,16:0,7:0,1,10,13
chr7	99695787	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:14,4:20,0:13,21,5,0
chr7	99695813	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:17,5:20,0:15,22,5,0
chr7	99696370	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=378,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,2:1,9:0,1,3,8
chr7	99699436	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,2:2,3,2,2
chr7	99699626	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=117.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,19:0,19:0,0,19,19
chr7	99701176	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr7	99701640	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,14:0,4:0,0,16,2
chr7	99701867	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=148,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:2,6,1,2
chr7	99701881	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=148,89;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr7	99703568	.	AC	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:19,0:2,2:13,9,1,1
chr7	99703631	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=124,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,3:4,0:4,9,1,2
chr7	99704157	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.352:9:1,0:4,1:0|1:99704157_A_C:99704157:1,5,3,0
chr7	99704163	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:1,0:4,0:0|1:99704157_A_C:99704157:1,5,2,0
chr7	99704796	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	99704827	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr7	99704847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=102,1314;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:5,3,3,0
chr7	99707712	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=200,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:0,12:1,6:1,0,7,11
chr7	99707950	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr7	99708670	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=399,64;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr7	99710465	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:20,3:9,0:10,19,0,3
chr7	99710584	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr7	99711461	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr7	99717385	.	GG	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:27,2:9,0:24,12,1,1
chr7	99719799	.	TCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr7	99746689	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	99751017	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,8,10
chr7	99753121	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr7	99755426	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,3:11,0:14,4,1,2
chr7	99764217	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=117,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:7,6,3,0
chr7	99764280	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:12,0:11,9,1,1
chr7	99768957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:7,3:1,2:5,4,2,3
chr7	99769855	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=76,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,0:9,7,1,1
chr7	99772298	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr7	99773182	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:99773182_C_T:99773182:4,1,2,0
chr7	99773195	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=136,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:99773182_C_T:99773182:6,2,2,0
chr7	99773584	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=68,100;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:3,7,0,3
chr7	99778227	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=146,112;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.484:25:2,7:10,5:4,9,6,6
chr7	99780283	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,5:4,0:7,0,5,0
chr7	99780464	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=111,52;MMQ=52,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:0|1:99780464_T_C:99780464:5,11,1,1
chr7	99780472	.	T	TGGG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=110,52;MMQ=52,53;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:6,0:0|1:99780464_T_C:99780464:5,10,1,1
chr7	99780474	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=144,52;MMQ=51,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:99780464_T_C:99780464:4,7,1,1
chr7	99787019	.	TCCTCTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=219,165;MMQ=43,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr7	99796452	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=97,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,11:0.222:52:19,11:22,0:15,26,11,0
chr7	99799011	.	G	GTGTATGCACACATGCAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.286:8:1,1:3,0:1,5,1,1
chr7	99802812	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=78,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:2,1,1,4
chr7	99811313	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:0,1:3,1,2,1
chr7	99811464	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,11,14
chr7	99818137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:4,0:1,2:2,3,1,2
chr7	99818940	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	99821381	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr7	99821470	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=65,157;MMQ=52,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.869:21:1,10:1,8:1,1,9,10
chr7	99956295	.	A	AG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,120;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=83.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.706:32:5,20:4,0:9,0,23,0
chr7	99956508	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,45;MMQ=52,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:12,0:13,2:0|1:99956508_C_CA:99956508:15,11,1,1
chr7	99956509	.	T	TTCCATTCCAC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,45;MMQ=52,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:13,0:13,2:0|1:99956508_C_CA:99956508:15,11,1,1
chr7	100004446	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=21,29;MFRL=133,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:4,1:0,5:0|1:100004446_C_T:100004446:1,3,2,4
chr7	100004462	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=90,144;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:100004446_C_T:100004446:1,2,0,1
chr7	100004468	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,17;MFRL=90,144;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:100004446_C_T:100004446:1,2,0,1
chr7	100004473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=0,144;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:100004446_C_T:100004446:1,2,0,1
chr7	100004476	.	C	CCACTGTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=0,144;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:100004446_C_T:100004446:1,2,0,1
chr7	100004478	.	C	CTCTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=55,144;MMQ=60,30;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100004446_C_T:100004446:0,2,0,1
chr7	100006376	.	TA	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=220,112;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:0,1:1,0:0|1:100006376_TA_CC:100006376:0,2,0,1
chr7	100006382	.	C	CCTCCTACATCCCAGGATCCATCATCTGGGCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=270,112;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100006376_TA_CC:100006376:0,1,0,1
chr7	100061685	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=67,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:0|1:100061685_G_T:100061685:12,6,1,1
chr7	100061690	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=67,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:5,1:0|1:100061685_G_T:100061685:12,6,1,1
chr7	100064719	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:4,2:3,9:3,5,5,6
chr7	100064891	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,0:5,9:0,8,9,0
chr7	100075225	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:100075225_T_A:100075225:0,2,1,1
chr7	100075226	.	G	GCAAAGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:100075225_T_A:100075225:0,2,1,1
chr7	100075229	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:100075225_T_A:100075225:0,3,0,1
chr7	100075692	.	TGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=G;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100075692_TGGGG_T:100075692:0,1,0,1
chr7	100075697	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100075692_TGGGG_T:100075692:0,1,0,1
chr7	100075701	.	G	GCAGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100075692_TGGGG_T:100075692:0,0,0,1
chr7	100075702	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=225,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100075692_TGGGG_T:100075692:0,1,0,1
chr7	100075706	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=225,112;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100075692_TGGGG_T:100075692:0,1,0,1
chr7	100148183	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,213;MMQ=60,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr7	100150983	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=158,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:3,0:0|1:100150983_G_A:100150983:7,3,1,1
chr7	100150997	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:100150983_G_A:100150983:7,3,1,1
chr7	100160264	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr7	100161500	.	G	GTTTA,GCCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29,32;MFRL=116,142,168;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:0,1,0:4,0,1:2,2,0,2
chr7	100173481	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,5:2,1:0,2,1,6
chr7	100174484	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=109,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:4,2:3,3,2,0
chr7	100175253	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=191,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr7	100175331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=157,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr7	100175626	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=187,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr7	100197594	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:2,1,2,0
chr7	100197599	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,1:1,1:0|1:100197594_A_C:100197594:2,1,2,0
chr7	100204334	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100204334_A_G:100204334:0,2,0,1
chr7	100204350	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:100204334_A_G:100204334:0,2,0,1
chr7	100205066	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:7,6:4,0:9,4,6,0
chr7	100205714	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:7,0:2,3:5,5,1,2
chr7	100225721	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:6,7,1,2
chr7	100225790	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=23,13;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.417:9:2,0:2,0:0|1:100225790_A_C:100225790:1,4,4,0
chr7	100225797	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,18;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:100225790_A_C:100225790:0,4,2,0
chr7	100225803	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:100225790_A_C:100225790:1,4,2,0
chr7	100225806	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,0:0|1:100225790_A_C:100225790:2,4,2,0
chr7	100225808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,10;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,0:0|1:100225790_A_C:100225790:2,4,2,0
chr7	100227067	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr7	100238896	.	GGGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.433:4:2,2:0,0:0|1:100238896_GGGT_G:100238896:1,1,0,2
chr7	100238901	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100238896_GGGT_G:100238896:1,1,0,1
chr7	100240771	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	100245124	.	C	CTTCTTCTTCTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:6,1:6,2,1,2
chr7	100252821	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=178,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:100252821_G_A:100252821:0,2,0,1
chr7	100252823	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=178,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100252821_G_A:100252821:0,2,0,1
chr7	100252827	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=178,255;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100252821_G_A:100252821:0,2,0,1
chr7	100252828	.	C	CAGATGTGGGAAGGAGGTGCTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=178,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100252821_G_A:100252821:0,2,0,1
chr7	100275171	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:9,7,1,2
chr7	100280896	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr7	100281570	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,0:0|1:100281570_C_G:100281570:1,2,0,1
chr7	100281592	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100281570_C_G:100281570:0,2,0,1
chr7	100281594	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100281570_C_G:100281570:0,2,0,1
chr7	100282052	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,0:3,4:3,1,2,2
chr7	100284334	.	CCCT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCT;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:2,3:2,2,1,2
chr7	100284510	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr7	100284913	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	100285974	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	100319680	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=79,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.450:11:1,2:5,3:3,3,2,3
chr7	100344359	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,1:5,3:7,6,0,4
chr7	100348940	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:2,2:0,3:0,2,0,6
chr7	100352747	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	100353013	.	TACA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACA;STR;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:1,1,3,5
chr7	100358154	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:6,3:8,0:2,12,1,3
chr7	100359797	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,3:2,1:2,2,1,3
chr7	100361856	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:0,7,2,1
chr7	100364105	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	100366203	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,1:5,5:4,7,3,3
chr7	100369720	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100371100	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:2,3,2,5
chr7	100371107	.	C	CATGGCTTCAACAAAGGGTAAATATTTTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr7	100371114	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr7	100373178	.	A	ATCTTTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100373178_A_ATCTTTGC:100373178:0,2,0,1
chr7	100373181	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100373178_A_ATCTTTGC:100373178:0,2,0,1
chr7	100373187	.	A	AACATGGTGAAACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr7	100374245	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,51;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.192:13:3,0:6,2:0|1:100374245_C_CT:100374245:2,9,1,1
chr7	100374251	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,51;MMQ=60,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:100374245_C_CT:100374245:2,9,1,1
chr7	100383570	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,0:0,5:4,0,4,1
chr7	100391644	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr7	100395003	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,24:0.715:33:3,7:6,17:4,5,11,13
chr7	100401270	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	100402872	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=114,25;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:11,0:26,2:0|1:100402872_C_T:100402872:25,17,0,2
chr7	100402874	.	AAGCCAC	A	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=22,23;MFRL=114,25;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:9,0:21,2:0|1:100402872_C_T:100402872:25,18,0,2
chr7	100402882	.	CG	C	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=114,25;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:9,0:25,2:0|1:100402872_C_T:100402872:22,15,0,2
chr7	100402886	.	CACAGAGCCAAA	C	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=111,25;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:9,0:29,2:0|1:100402872_C_T:100402872:24,20,0,2
chr7	100402900	.	C	CAT	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=111,25;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,0:16,2:0|1:100402872_C_T:100402872:18,20,0,2
chr7	100402902	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=117,25;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,0:13,2:0|1:100402872_C_T:100402872:11,20,0,2
chr7	100402905	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=117,25;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:12,2:0|1:100402872_C_T:100402872:11,18,0,2
chr7	100410597	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=127,208;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,0:2,4:2,4,0,4
chr7	100410657	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:6,4,4,2
chr7	100414727	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100414727_G_A:100414727:0,0,1,0
chr7	100414728	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100414727_G_A:100414727:0,0,1,0
chr7	100414731	.	A	ATTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100414727_G_A:100414727:0,0,1,0
chr7	100414737	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100414727_G_A:100414727:0,0,1,0
chr7	100414919	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:6,6,2,1
chr7	100421781	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:2,1,7,2
chr7	100451919	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,12:9,0:7,6,12,0
chr7	100454396	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=0,0;MMQ=33,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100454396_A_G:100454396:0,1,0,1
chr7	100454404	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,0;MMQ=33,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:100454396_A_G:100454396:0,1,0,1
chr7	100459215	.	AGCTGGTGGGGCGGTGGGGAAATGGGAGGTGGTCAAAGAACCCCCTCTCTCTTTGGCTGGAGTTGGTGCTCCCGTCCAGGAGGC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.128:26:8,0:3,2:14,7,2,3
chr7	100459585	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=102,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.388:6:2,1:2,0:0,4,0,2
chr7	100465619	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.283:29:11,5:10,2:10,11,5,3
chr7	100465636	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:11,4:11,0:9,14,4,0
chr7	100467975	.	C	CCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,6:0,0,9,8
chr7	100470759	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=141,125;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:4,0:8,3,1,1
chr7	100478854	.	CA	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=176,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,0:11,3,1,1
chr7	100482039	.	CAGG	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AGG;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.130:20:6,2:8,0:13,5,2,0
chr7	100482225	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=187,106;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100482225_G_A:100482225:1,1,0,1
chr7	100482226	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=187,106;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:100482225_G_A:100482225:1,1,0,1
chr7	100482237	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=231,106;MMQ=60,48;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100482237_C_A:100482237:1,0,0,1
chr7	100482239	.	A	AGTGAGAGCGCAACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=231,106;MMQ=60,48;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100482237_C_A:100482237:1,0,0,1
chr7	100485781	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,4:12,0:11,18,0,4
chr7	100486035	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:5,4:5,6:5,5,5,5
chr7	100486110	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.599:48:8,15:11,13:11,8,19,10
chr7	100486656	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:4,5:9,11:8,5,5,12
chr7	100488658	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:4,12:6,5:5,5,13,4
chr7	100663602	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100663602_G_A:100663602:0,3,0,1
chr7	100663605	.	GT	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100663602_G_A:100663602:0,3,0,1
chr7	100663606	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=198,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	100675293	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,187;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,0:7,3:6,3,0,3
chr7	100675976	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=99,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,1:10,2:10,4,1,2
chr7	100679235	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,73;MMQ=49,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:5,6,0,3
chr7	100679902	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,114;MMQ=54,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:2,1,4,1
chr7	100680463	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr7	100681762	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,89;MMQ=60,53;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,1:6,6:3,4,3,4
chr7	100685305	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:0|1:100685305_C_A:100685305:8,11,1,1
chr7	100685307	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,1:0|1:100685305_C_A:100685305:8,12,1,1
chr7	100685311	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:8,0:0|1:100685305_C_A:100685305:8,11,1,1
chr7	100685489	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=145,44;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:100685489_A_G:100685489:3,5,1,1
chr7	100685505	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=50,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:100685489_A_G:100685489:7,8,1,1
chr7	100685507	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=50,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:100685489_A_G:100685489:7,8,1,1
chr7	100685510	.	ACACC	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=50,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0|1:100685489_A_G:100685489:7,7,1,1
chr7	100685515	.	T	TAGTG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=50,44;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:100685489_A_G:100685489:7,7,1,1
chr7	100693849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,77;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:6,4,1,2
chr7	100694812	.	TCA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CA;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	100695058	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,3:4,1:1,3,2,2
chr7	100696801	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=120,117;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100696801_C_CT:100696801:0,2,0,1
chr7	100696803	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=120,117;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100696801_C_CT:100696801:0,2,0,1
chr7	100696806	.	T	TTG,C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,27,28;MFRL=0,123,117;MMQ=60,60,40;MPOS=8,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr7	100696807	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=117,123;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:100696801_C_CT:100696801:0,1,0,1
chr7	100696808	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:100696801_C_CT:100696801:0,0,0,1
chr7	100696814	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=22,30;MFRL=123,117;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100696801_C_CT:100696801:0,1,0,1
chr7	100696815	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:100696801_C_CT:100696801:0,0,0,1
chr7	100731505	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100731775	.	C	CACTTCAGCCTGGGCAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=64,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:100731775_C_CACTTCAGCCTGGGCAA:100731775:8,5,1,1
chr7	100731777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=64,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,0:0|1:100731775_C_CACTTCAGCCTGGGCAA:100731775:8,5,1,1
chr7	100775087	.	A	AAAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,2:0,9:0,0,10,4
chr7	100780176	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	100800635	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=12022472,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,1:1,4:1,1,4,2
chr7	100800737	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=77,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,1:4,1:5,8,0,2
chr7	100815279	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	100815387	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=100,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,7:6,0:3,9,7,0
chr7	100816527	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr7	100816812	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=233,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	100843808	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=92,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:11,2:0|1:100843808_G_A:100843808:6,13,0,2
chr7	100843810	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=92,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:100843808_G_A:100843808:6,13,0,2
chr7	100849760	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr7	100865847	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,2:12,0:11,4,2,0
chr7	100866043	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:14,0:7,3:11,10,1,2
chr7	100866744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr7	100883498	.	C	CAGG	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,15;MFRL=99,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:10,0:0|1:100883498_C_CAGG:100883498:18,7,1,1
chr7	100883501	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=118,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,2:11,0:0|1:100883498_C_CAGG:100883498:20,9,1,1
chr7	100883503	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:11,0:0|1:100883498_C_CAGG:100883498:20,12,1,1
chr7	100883504	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=96,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.179:31:15,4:11,1:17,9,3,2
chr7	100883505	.	GTA	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:18,2:12,0:0|1:100883498_C_CAGG:100883498:21,13,1,1
chr7	100883508	.	CTTTAAGG	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=110,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,2:11,0:0|1:100883498_C_CAGG:100883498:23,14,1,1
chr7	100965096	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr7	101063284	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=104,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:10,13,0,2
chr7	101183108	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr7	101187190	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr7	101194424	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,1:2,4:1,1,2,3
chr7	101194461	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	101196488	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	101196632	.	A	AGTCG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:101196632_A_AGTCG:101196632:3,5,1,1
chr7	101196633	.	A	AGATTTGCT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:101196632_A_AGTCG:101196632:3,5,1,1
chr7	101200595	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr7	101200669	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=135,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,4,2
chr7	101200835	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr7	101256802	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=147,147;MMQ=44,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:28,0:5,4:6,27,0,4
chr7	101256833	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,5,3
chr7	101257075	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr7	101265350	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr7	101267435	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr7	101459278	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:6,5,3,2
chr7	101671294	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=10,28;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,2:0|1:101671294_G_A:101671294:1,0,3,0
chr7	101671302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:101671294_G_A:101671294:1,0,3,0
chr7	101713590	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr7	101740606	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:9,2:2,3:0|1:101740606_T_G:101740606:9,3,3,2
chr7	101740610	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.369:17:9,2:2,4:0|1:101740606_T_G:101740606:8,3,3,3
chr7	101740827	.	T	TTC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.627:28:4,7:5,10:4,6,3,15
chr7	101754865	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr7	101758584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:3,8,2,7
chr7	101833044	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr7	101844851	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,4:6,5:3,5,2,7
chr7	101845313	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.251:12:5,1:2,0:6,3,3,0
chr7	101870599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr7	101892328	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	101917521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=173,115;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr7	101917647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	101917660	.	C	CTGTTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:101917660_C_CTGTTA:101917660:0,4,0,1
chr7	101917661	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:101917660_C_CTGTTA:101917660:0,4,0,1
chr7	101917664	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:101917660_C_CTGTTA:101917660:0,4,0,1
chr7	101917670	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:101917660_C_CTGTTA:101917660:0,4,0,1
chr7	101926087	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:1,1:1,4,0,3
chr7	101926104	.	C	CCTCTCCTCTTTCTTCTACACCCCTAACT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=138,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr7	101928585	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,7,14
chr7	102036769	.	CGGAGACTGCGTATGCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	102038153	.	CTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=20,31,33;MFRL=69,123,126;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=8.91,45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,18:0.148,0.737:28:3,3,7:2,1,9:2,3,8,15
chr7	102046359	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	102107697	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	102107886	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:2,6,0,2
chr7	102108900	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=247,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr7	102109609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr7	102110366	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	102113093	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,1:1,10:1,0,8,3
chr7	102116770	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	102119322	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,55;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,6:0,0,8,17
chr7	102119398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:102119398_G_A:102119398:0,0,0,1
chr7	102119410	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:102119398_G_A:102119398:0,0,0,2
chr7	102136550	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr7	102210271	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=164,283;MMQ=24,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,0,2
chr7	102213012	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=167,180;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,9:4,6:1,6,2,13
chr7	102213065	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=183,167;MMQ=27,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,5:2,1:0,3,1,5
chr7	102235850	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=100,84;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	102246402	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=138,106;MMQ=41,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:8,4:4,0:5,7,2,2
chr7	102246447	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=108,90;MMQ=49,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:7,1:2,2:3,6,2,1
chr7	102389721	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=125,67;MMQ=52,53;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:0|1:102389721_TG_T:102389721:5,8,1,1
chr7	102389724	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,67;MMQ=52,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:7,0:0|1:102389721_TG_T:102389721:5,9,1,1
chr7	102398410	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34,33,34;MFRL=99,178,144,156;MMQ=60,33,26,21;MPOS=20,22,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.94,22.81,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,12,3:0.128,0.421,0.124:28:4,2,4,1:5,1,6,2:4,6,4,14
chr7	102495365	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=186,443;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr7	102518909	.	A	AGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:0,3,1,6
chr7	102553603	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:9,4:0,3:7,2,3,4
chr7	102574920	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=95,205;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:4,5,2,4
chr7	102574999	.	TGAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=75,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,3:0,0:1,1,3,1
chr7	102668056	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=210,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr7	102669013	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,4794;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,4:6,0:14,5,0,4
chr7	102669087	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,2:9,0:8,8,2,0
chr7	102732854	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102732854_C_G:102732854:0,1,1,0
chr7	102732877	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102732854_C_G:102732854:0,1,1,0
chr7	102739043	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,27778319;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	102760511	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,6:5,0:5,7,3,3
chr7	102760722	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	102940642	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:2,3:4,3,2,1
chr7	102944332	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,1:10,7,1,1
chr7	102948040	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,5:3,2:3,4,6,1
chr7	102950752	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=111,180;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:4,1,4,0
chr7	102962567	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr7	102964972	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,2:5,1:4,7,1,2
chr7	103003261	.	GA	TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.264:19:7,2:3,1:6,8,5,0
chr7	103018016	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr7	103019613	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr7	103030946	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=106,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:4,12,1,1
chr7	103032227	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:4,4:0,8,0,4
chr7	103033573	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr7	103050737	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	103053435	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=52,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,3:3,6:3,2,7,2
chr7	103123385	.	CCA	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr7	103124370	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	103124380	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,29;MFRL=199,147;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,4,0,2
chr7	103124385	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=199,143;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,4,0,1
chr7	103124389	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=201,143;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,3,0,1
chr7	103124396	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,22;MFRL=201,143;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,3,0,1
chr7	103138517	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr7	103138727	.	TAAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr7	103155705	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=128,91;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,3:9,1:7,6,3,1
chr7	103162370	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	103163919	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=36,34;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr7	103163992	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=96,73;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,3:1,0:3,5,2,1
chr7	103175965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	103179860	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103179860_T_G:103179860:0,0,0,1
chr7	103179864	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103179860_T_G:103179860:0,0,0,1
chr7	103180872	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=124,198;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:0,1:10,2:2,8,1,3
chr7	103191493	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr7	103205912	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:103205912_G_T:103205912:10,13,1,1
chr7	103205918	.	T	TCTGTTGC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:103205912_G_T:103205912:10,13,1,1
chr7	103205919	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:0|1:103205912_G_T:103205912:10,13,1,1
chr7	103207234	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr7	103251983	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,1:0,0,7,0
chr7	103275803	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr7	103293287	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,26;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:103293287_A_AC:103293287:0,1,0,1
chr7	103293288	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103293287_A_AC:103293287:0,1,0,1
chr7	103293290	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103293287_A_AC:103293287:0,1,0,1
chr7	103293292	.	T	TATGAAGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103293287_A_AC:103293287:0,1,0,1
chr7	103363713	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103363713_G_T:103363713:0,3,0,1
chr7	103363715	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103363713_G_T:103363713:0,3,0,1
chr7	103363718	.	G	GATGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:103363713_G_T:103363713:0,3,0,1
chr7	103363723	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:103363723_A_AG:103363723:0,3,0,1
chr7	103363725	.	A	AAAGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103363723_A_AG:103363723:0,3,0,1
chr7	103363744	.	G	GAGAGAGAGAGAGAAACAGACAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=186,229;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	103417134	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:103417134_G_T:103417134:0,0,0,4
chr7	103417139	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:103417134_G_T:103417134:0,0,0,4
chr7	103557697	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	103629770	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=298,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103629770_G_GT:103629770:0,1,0,1
chr7	103629771	.	G	GGTGGCTCATGCCTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=298,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103629770_G_GT:103629770:0,1,0,1
chr7	103629773	.	A	ATCCCAGCACTTCGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=298,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103629770_G_GT:103629770:0,1,0,1
chr7	103629776	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=298,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103629770_G_GT:103629770:0,1,0,1
chr7	103807202	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:4,4:0,3:3,1,5,2
chr7	103824631	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=130,170;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:103824631_G_A:103824631:5,12,0,2
chr7	103824635	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=130,170;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:103824631_G_A:103824631:5,12,0,2
chr7	103835732	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0,4,1,3
chr7	103835762	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:103835762_T_C:103835762:0,4,0,1
chr7	103835765	.	C	CAGTATCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:103835762_T_C:103835762:0,4,0,1
chr7	103838120	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,6:1,2:5,0,6,2
chr7	103838270	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:4,4,0,3
chr7	103844557	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,6:8,2:7,2,4,4
chr7	103848413	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,3:4,4:0,4,2,5
chr7	104707158	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=100,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:3,2:2,1:2,3,3,0
chr7	104715018	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,2:3,2:3,0,4,1
chr7	104715312	.	A	ATTCATTAATTAAATTATTATGTTGAGAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=124,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:3,13,0,2
chr7	104716518	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,0:9,3:7,6,2,1
chr7	104717319	.	TTGTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=TG;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.748:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	104717977	.	CTACATG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=240,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr7	104742054	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:1,5,2,3
chr7	104746314	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:15,4:6,0:10,11,3,1
chr7	104746522	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:2,1,0,2
chr7	104747318	.	A	AGAGAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104747318_A_AGAGAGGC:104747318:0,1,0,1
chr7	104747319	.	T	TGGTGTCAAGGAAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104747318_A_AGAGAGGC:104747318:0,1,0,1
chr7	104747798	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:2,2,2,0
chr7	104753345	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=23,14;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.204:31:6,0:16,0:0|1:104753345_A_C:104753345:2,23,6,0
chr7	104753351	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.181:35:7,1:17,0:0|1:104753345_A_C:104753345:4,25,6,0
chr7	104753354	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.181:35:10,2:15,0:0|1:104753345_A_C:104753345:4,25,6,0
chr7	104753360	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=28,12;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.162:33:12,0:15,0:0|1:104753345_A_C:104753345:6,22,5,0
chr7	104753363	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=79,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:12,2:17,0:0|1:104753345_A_C:104753345:8,23,3,0
chr7	104753366	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:13,0:18,0:0|1:104753345_A_C:104753345:8,26,3,0
chr7	104753369	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=23,24;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:11,2:19,0:0|1:104753345_A_C:104753345:9,27,3,0
chr7	104753372	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:15,0:20,0:0|1:104753345_A_C:104753345:9,28,3,0
chr7	104767526	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=88,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:2,4:9,0:5,6,2,2
chr7	104773626	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:104773626_G_T:104773626:0,4,0,1
chr7	104773628	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:104773626_G_T:104773626:0,4,0,1
chr7	104783619	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=99,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:13,0:14,12,0,2
chr7	104800939	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:5,1,5,0
chr7	104807980	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=115,362;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,0:6,4:0,15,0,4
chr7	104808386	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:0,8:3,3:2,1,8,3
chr7	104844278	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=102,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr7	105122891	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,0:2,1:0,4,0,3
chr7	105146593	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr7	105148749	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:105148749_C_T:105148749:5,15,1,1
chr7	105148752	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:105148749_C_T:105148749:5,15,1,1
chr7	105177174	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:105177174_G_A:105177174:8,8,1,1
chr7	105177184	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:105177174_G_A:105177174:7,7,1,1
chr7	105192056	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:19,2:8,0:0|1:105192056_C_T:105192056:15,12,2,0
chr7	105192059	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:17,2:9,0:0|1:105192056_C_T:105192056:16,12,2,0
chr7	105207654	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=113,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:5,8,3,0
chr7	105250904	.	AG	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=92,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:4,3,2,0
chr7	105250905	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,8:0,0,6,3
chr7	105305790	.	C	CTACACACACATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,1:1,4,0,1
chr7	105305807	.	C	CGCACATCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr7	105603850	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=80,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,0:4,2:3,9,2,0
chr7	105621512	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=102,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,7:8,5:8,7,7,5
chr7	105655747	.	G	GCCAAACCTCTTTTCTTTATAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	105658574	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105658574_C_CA:105658574:0,1,0,1
chr7	105658577	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105658574_C_CA:105658574:0,1,0,1
chr7	105661042	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=196,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105661042_T_A:105661042:2,3,1,1
chr7	105661043	.	T	TAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=196,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105661042_T_A:105661042:2,3,1,1
chr7	105733619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr7	105738368	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=101,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr7	105894932	.	G	GAAA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=115,123;MMQ=50,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.081:34:16,2:16,0:0|1:105894932_G_GAAA:105894932:15,17,0,2
chr7	105894933	.	T	TCA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=115,123;MMQ=50,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:16,2:16,0:0|1:105894932_G_GAAA:105894932:15,17,0,2
chr7	105894934	.	T	TAACCCCCAGTACC	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=115,123;MMQ=50,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,1:15,0:0|1:105894932_G_GAAA:105894932:15,17,0,2
chr7	105904150	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr7	105910666	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=113,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:11,4:11,8:14,9,9,3
chr7	106301644	.	C	CATGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:106301644_C_CATGAT:106301644:0,2,0,1
chr7	106301646	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:106301644_C_CATGAT:106301644:0,2,0,1
chr7	106508978	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,20:0,6:0|1:106508978_A_G:106508978:0,0,13,13
chr7	106508987	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0|1:106508978_A_G:106508978:0,0,13,10
chr7	106519943	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,13,8
chr7	106522592	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:4,3,6,3
chr7	106523446	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=49,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr7	106762532	.	G	GTCAAAATAATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=3192,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:106762532_G_GTCAAAATAATT:106762532:0,1,0,1
chr7	106762533	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=3192,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:106762532_G_GTCAAAATAATT:106762532:0,1,0,1
chr7	106768839	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	106781214	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr7	106781445	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr7	106786928	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=108,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr7	106786952	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr7	106851757	.	C	CCTTCCTCCTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106851757_C_CCTTCCTCCTA:106851757:0,1,0,1
chr7	106851761	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106851757_C_CCTTCCTCCTA:106851757:0,1,0,1
chr7	106851763	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106851757_C_CCTTCCTCCTA:106851757:0,1,0,1
chr7	106851766	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106851757_C_CCTTCCTCCTA:106851757:0,1,0,1
chr7	106851768	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106851757_C_CCTTCCTCCTA:106851757:0,1,0,1
chr7	106888946	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,1:2,1:0,5,1,1
chr7	106898870	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=161,169;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TC;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:1,0:0,3,0,2
chr7	106924223	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=258,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106924223_C_A:106924223:0,1,0,1
chr7	106924230	.	C	CCAGCATCAGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=258,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106924223_C_A:106924223:0,1,0,1
chr7	107053127	.	T	TGAGCAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=224,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:107053127_T_TGAGCAAGA:107053127:0,4,0,1
chr7	107053130	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=224,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:107053127_T_TGAGCAAGA:107053127:0,4,0,1
chr7	107115810	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:10,5:4,3:6,9,4,4
chr7	107167661	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.362:11:3,2:4,2:6,1,3,1
chr7	107194851	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr7	107214229	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:5,2:13,1:8,10,1,2
chr7	107216738	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	107217068	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,1:0,3:0,0,1,5
chr7	107218033	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	107262104	.	A	AGAACATTTCCAGGTTCCAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:7,2:7,0:4,10,1,1
chr7	107315380	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,4:8,0:10,7,4,0
chr7	107398751	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=92,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:107398751_C_T:107398751:12,9,1,1
chr7	107398757	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=92,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:107398751_C_T:107398751:11,9,1,1
chr7	107399375	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.374:35:11,0:11,12:6,16,1,12
chr7	107407975	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:7,3,2,0
chr7	107414419	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,11:0,9:0,1,12,8
chr7	107414448	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=76,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,4:13,0:13,10,3,1
chr7	107531832	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.918:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	107542100	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=210,124;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:5,2:1,0:7,0,2,0
chr7	107545799	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:8,3:1,4:6,3,6,1
chr7	107555937	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:6,3:6,5:9,4,7,2
chr7	107559732	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,7:3,3:1,2,0,10
chr7	107564366	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,6:2,8:5,2,11,3
chr7	107564539	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.472:13:3,3:3,1:0|1:107564539_G_A:107564539:1,6,2,4
chr7	107564542	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.472:13:3,4:3,2:0|1:107564539_G_A:107564539:1,6,2,4
chr7	107575792	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=170,137;MMQ=56,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=26,25;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:0|1:107575792_GT_G:107575792:1,1,1,0
chr7	107575820	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=63,238;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.423:4:2,1:0,0:0|1:107575792_GT_G:107575792:0,2,2,0
chr7	107575826	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,18;MFRL=63,238;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:107575792_GT_G:107575792:0,2,2,0
chr7	107575830	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=63,238;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:107575792_GT_G:107575792:0,2,2,0
chr7	107580839	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr7	107591667	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=107,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,3:15,0:22,8,3,0
chr7	107604954	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:12,10:12,0:0|1:107604954_C_A:107604954:13,12,9,1
chr7	107604958	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:13,10:12,0:0|1:107604954_C_A:107604954:13,12,9,1
chr7	107613379	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,2:4,4:11,2,5,1
chr7	107615870	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,154;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:2,0:3,7:0,5,0,7
chr7	107688443	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=76,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,0:12,4:15,7,4,0
chr7	107688630	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,222;MMQ=40,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,4:0,3,1,4
chr7	107696269	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:4,8,2,0
chr7	107710387	.	A	ATGGAGTGGAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=162,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	107720271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=92,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,5:1,4,4,5
chr7	107732925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	107738754	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,226;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0|1:107738754_G_C:107738754:7,0,2,0
chr7	107738756	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=164,226;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0|1:107738754_G_C:107738754:7,0,2,0
chr7	107747081	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr7	107748169	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:7,8,1,1
chr7	107790331	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:4,1,3,0
chr7	107791018	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	107800953	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr7	107808639	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	107815858	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr7	107820911	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr7	107822198	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,18:0,0,24,3
chr7	107822396	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,8,11
chr7	107825108	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	107825142	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:107825142_A_ATG:107825142:0,2,0,1
chr7	107825143	.	C	CCAATTAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:107825142_A_ATG:107825142:0,2,0,1
chr7	107834613	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,6,7
chr7	107834624	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,8,7
chr7	107834734	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,20,10
chr7	107836117	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	107875143	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:0,3:0,0:0,2,1,3
chr7	107875170	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr7	108137829	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr7	108212110	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:4,1,7,0
chr7	111372244	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.531:17:6,6:1,3:6,2,6,3
chr7	111372394	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=135,91;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0,7,0,3
chr7	111372415	.	G	GCCCCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	111379582	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	111381283	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.190:14:7,1:5,1:7,5,0,2
chr7	111382249	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111382249_CT_AA:111382249:0,1,0,1
chr7	111382253	.	G	GGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111382249_CT_AA:111382249:0,1,0,1
chr7	111386511	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:3,3:2,4:1,4,1,6
chr7	111398802	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:0|1:111398802_C_T:111398802:9,12,1,1
chr7	111398814	.	C	CTCTCTTTCTTTTCTTTTCTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:111398802_C_T:111398802:8,11,1,1
chr7	111423066	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	111423989	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:13,2:0|1:111423989_G_A:111423989:10,11,1,1
chr7	111423991	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:11,2:0|1:111423989_G_A:111423989:10,11,1,1
chr7	111428838	.	C	CTGTCTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:3,0:0|1:111428838_C_CTGTCTCT:111428838:1,4,1,1
chr7	111428841	.	T	TTCTCTTCTTCTCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=135,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:111428838_C_CTGTCTCT:111428838:1,5,1,1
chr7	111430621	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:111430621_G_GT:111430621:5,3,1,1
chr7	111430623	.	G	GTGAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:111430621_G_GT:111430621:5,4,1,1
chr7	111430625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:111430621_G_GT:111430621:5,4,1,1
chr7	111430627	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:111430621_G_GT:111430621:5,4,1,1
chr7	111487026	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:7,2,5,2
chr7	111503660	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=86,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr7	111509676	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=88,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,1:5,1:4,8,2,0
chr7	111512630	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:7,4:3,6,2,3
chr7	111541788	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,163;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,0:6,4:11,9,0,4
chr7	111575587	.	ACACTCACCTGCATTGGAGCCAGTCAAGTTATAACGTGCATTCAGCTTTTTGATGATGTTCTCATGGATTTGGTAC	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=94,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:4,0:12,2:20,13,1,1
chr7	111617377	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr7	111624438	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:6,0:7,3:6,9,0,3
chr7	111629054	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr7	111634368	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	111927212	.	C	CAGTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:111927212_C_CAGTGA:111927212:0,2,0,1
chr7	111927215	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:111927212_C_CAGTGA:111927212:0,2,0,1
chr7	111958339	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=60,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,1:3,4:1,6,2,3
chr7	111958341	.	G	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:2,8,1,1
chr7	111958382	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	112095782	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr7	112096880	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr7	112097121	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.493:13:5,3:1,3:2,5,2,4
chr7	112101907	.	ATT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.362:26:6,4:7,4:10,7,8,1
chr7	112107999	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,1:8,2:7,2,3,0
chr7	112130009	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=242,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,0,4
chr7	112472650	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,3:12,0:11,7,1,2
chr7	112724170	.	G	GTCCAGCAAGGGCTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:5,5,1,1
chr7	113519719	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr7	113520159	.	T	TTGTTTCTGTGAAGCTG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=95,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,2:9,0:0|1:113520159_T_TTGTTTCTGTGAAGCTG:113520159:4,7,1,1
chr7	113520163	.	T	TTTAG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=121,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,2:9,0:0|1:113520159_T_TTGTTTCTGTGAAGCTG:113520159:4,8,1,1
chr7	113520166	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=147,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:0|1:113520159_T_TTGTTTCTGTGAAGCTG:113520159:4,7,1,1
chr7	113520195	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=200,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:113520195_A_T:113520195:2,4,1,1
chr7	113520196	.	C	CAGATGTGAGTAGCTTTAAGG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=200,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:113520195_A_T:113520195:2,4,1,1
chr7	113520256	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	114210814	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr7	114271686	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=153,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:114271686_T_C:114271686:10,15,0,2
chr7	114271689	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=153,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:114271686_T_C:114271686:10,15,0,2
chr7	114271692	.	T	TCACTTGAACATAC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:114271686_T_C:114271686:10,15,0,2
chr7	114271696	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:114271686_T_C:114271686:10,15,0,2
chr7	114302166	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=108,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:16,0:3,2:0|1:114302166_T_A:114302166:12,7,1,1
chr7	114302168	.	G	GAA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:16,0:3,2:0|1:114302166_T_A:114302166:12,8,1,1
chr7	114302174	.	G	GGCAAAA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:18,0:4,2:0|1:114302166_T_A:114302166:14,9,1,1
chr7	114302175	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:18,0:5,2:0|1:114302166_T_A:114302166:14,9,1,1
chr7	114303471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr7	114303491	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,3:2,0,7,0
chr7	114303617	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.725:13:1,3:2,7:1,2,1,9
chr7	114304563	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	114562947	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=101,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:9,4:12,0:15,6,3,1
chr7	114619598	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr7	114655872	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=100,143;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:7,2:6,0:3,10,2,0
chr7	115580893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:2,2:6,1:5,3,1,2
chr7	115624288	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:5,0,2,2
chr7	115889152	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:11,12,3,0
chr7	115890187	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,5:5,3:5,2,5,3
chr7	115890202	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:115890202_C_T:115890202:8,5,1,1
chr7	115890211	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:115890202_C_T:115890202:9,5,1,1
chr7	115890613	.	T	TAAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:115890613_T_TAAGA:115890613:0,4,0,2
chr7	115890614	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:115890613_T_TAAGA:115890613:0,4,0,2
chr7	115891736	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:3,1,2,0
chr7	116140076	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr7	116140275	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	116140508	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.506:12:4,4:1,2:3,3,2,4
chr7	116145937	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	116165322	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:10,7,0,3
chr7	116165360	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=65,151;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.929:13:0,7:0,4:1,0,4,8
chr7	116339282	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=81,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,2:3,13:5,5,5,11
chr7	116340002	.	G	GACAGCTCCCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr7	116381121	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=211,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:2,2:2,2:2,2,2,3
chr7	116381154	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr7	116395510	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=124,115;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,5:13,0:11,11,5,0
chr7	116409675	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	116409950	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,7:1,3:2,2,4,6
chr7	116421967	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr7	116556008	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	116606301	.	CT	C,CTTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22,13;MFRL=0,176,183;MMQ=60,60,60;MPOS=26,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,24;RU=T;STR;TLOD=3.13,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.247,0.621:4:0,0,0:0,1,0:0,0,0,4
chr7	116607501	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	116660747	.	C	CAATTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,1:8,1:5,11,0,2
chr7	116660803	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	116759702	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,2,0
chr7	116769814	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:5,2,2,2
chr7	116778443	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr7	116811037	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=67,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:5,3,0,3
chr7	116811049	.	T	TTAG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.413:5:1,0:1,2:0|1:116811049_T_TTAG:116811049:0,3,1,1
chr7	116811053	.	T	TGATGATAGTGGTGG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,0:2,1:0|1:116811049_T_TTAG:116811049:0,4,1,1
chr7	116811056	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:116811049_T_TTAG:116811049:0,4,0,1
chr7	116829485	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr7	116849935	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=119,37;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:116849935_C_T:116849935:6,7,2,0
chr7	116849937	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=119,37;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:116849935_C_T:116849935:6,7,2,0
chr7	116937753	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,0:7,7:8,3,0,7
chr7	116938020	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	116963026	.	A	ATATTTGATTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=48,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:2,2,1,1
chr7	117120141	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=51,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,5:5,1:5,4,1,5
chr7	117176689	.	GGAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,5:5,0:6,3,2,3
chr7	117188660	.	A	ATG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TG;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.384:16:5,4:4,2:8,2,6,0
chr7	117188736	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=131,152;MMQ=40,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:16,0:8,2:8,17,2,0
chr7	117188850	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,210;MMQ=51,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.130:22:10,1:8,1:9,11,1,1
chr7	117235055	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,5:6,10:5,5,8,7
chr7	117235196	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	117250479	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=69,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	117358197	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=237,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	117361244	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=71,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:117361244_A_C:117361244:0,2,0,1
chr7	117361246	.	T	TACTCTGTTTCTCTGCCTGCCTGTCTGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=71,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:117361244_A_C:117361244:0,2,0,1
chr7	117368294	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=94,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:117368294_C_T:117368294:11,9,1,1
chr7	117368311	.	T	TGTAGTCCCAGCTACTCG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:14,0:0|1:117368294_C_T:117368294:10,13,1,1
chr7	117386224	.	T	TATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	117431373	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:12,3:15,2:8,19,5,0
chr7	117450792	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr7	117824239	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,15:0,20:0,0,22,13
chr7	117825834	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr7	117832138	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	117865028	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:1,4,5,5
chr7	117865064	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=96,137;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,3:5,0:6,7,0,3
chr7	117867945	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=82,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr7	117867960	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=57,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr7	117874476	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,7:2,3:2,2,3,7
chr7	117874610	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=251,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,2:2,5:1,2,3,4
chr7	117880076	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	119915684	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:119915684_TG_T:119915684:0,4,0,1
chr7	119915687	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:119915684_TG_T:119915684:0,4,0,1
chr7	119915691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:119915684_TG_T:119915684:0,4,0,1
chr7	120428607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr7	120429040	.	A	ACTAAATTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	120446750	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.233:24:3,2:16,3:8,11,1,4
chr7	120450601	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,0:13,3:19,8,3,0
chr7	120450658	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,7:0,0,6,14
chr7	120450678	.	T	TCACA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=CA;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.903:6:0,1:0,2:0,0,0,6
chr7	120591135	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,11;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.535:11:2,0:1,0:3,2,6,0
chr7	120591328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=190,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr7	120613419	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	120687122	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	120739962	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=96,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.362:11:4,0:0,4:4,3,3,1
chr7	120740225	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	120773783	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:2,1,6,0
chr7	120776097	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:4,4:2,1:2,4,3,2
chr7	120884297	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=95,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:4,10,0,2
chr7	120965429	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=76,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:3,1,1,0
chr7	120979089	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,2:1,3:0,1,2,5
chr7	121000021	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr7	121000084	.	A	AAAGTTTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.263:9:3,2:3,0:5,2,1,1
chr7	121002876	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:1,1:4,1:0|1:121002876_A_G:121002876:6,1,3,1
chr7	121002884	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:0|1:121002876_A_G:121002876:6,1,3,1
chr7	121002910	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=77,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:7,4,6,6
chr7	121624196	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr7	121644627	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:20,3:15,0:17,18,3,1
chr7	121653150	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,2,0
chr7	121653374	.	GTGA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.880:5:0,2:0,3:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:0,0,0,5
chr7	121653398	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:2,2,0,5
chr7	121653922	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,32;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:17,2:9,2:14,12,2,2
chr7	121684478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=171,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:121684478_G_A:121684478:2,3,1,1
chr7	121684480	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=171,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:121684478_G_A:121684478:2,3,1,1
chr7	121698827	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,3,2
chr7	121699750	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	121699895	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=107,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:0|1:121699895_G_A:121699895:11,8,0,2
chr7	121699906	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=107,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:0|1:121699895_G_A:121699895:11,9,0,2
chr7	121716703	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0|1:121716703_G_C:121716703:0,2,0,1
chr7	121716713	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=228,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:121716703_G_C:121716703:0,1,0,1
chr7	121719586	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,0:3,5:5,1,4,1
chr7	121719823	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:1,2,0,5
chr7	121726287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr7	121731868	.	CCC	AAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:2,4,1,1
chr7	121753773	.	G	GTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=62,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:1,2:3,0:0|1:121753773_G_GTTT:121753773:1,3,1,1
chr7	121753775	.	C	CTCAGACTTTCCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=62,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:1,1:3,0:0|1:121753773_G_GTTT:121753773:1,3,1,1
chr7	121757026	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	121758290	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr7	121942832	.	G	GACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr7	121942847	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr7	121943929	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:121943929_G_A:121943929:8,9,1,1
chr7	121943935	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=115,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:121943929_G_A:121943929:8,9,1,1
chr7	121943937	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:121943929_G_A:121943929:9,9,1,1
chr7	121943939	.	AG	TT	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:121943929_G_A:121943929:9,9,1,1
chr7	121943943	.	GG	TT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:7,2:0|1:121943929_G_A:121943929:9,11,1,1
chr7	121943949	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:0|1:121943929_G_A:121943929:8,9,1,1
chr7	121944527	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr7	121944563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:0,0:1,2,0,2
chr7	121960407	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr7	121960438	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	121965550	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr7	122303229	.	AAATACTTCATGTTCATTCCACGAGTCAGACAGGGGAAGGGAAAATATCAGAGACCACTTACCTGACATGCATTATAAAGGAGCTGGTGTTCCAGTTTTTT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=140,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.109:27:2,2:3,0:14,10,1,2
chr7	122303263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,2:4,0:5,0,0,2
chr7	122338991	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,0:5,12:4,4,0,12
chr7	122342596	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:6,9,0,3
chr7	122634843	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,4,2
chr7	122635024	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,2:5,1:8,6,2,1
chr7	122757505	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.406:13:4,1:4,2:6,2,5,0
chr7	122769380	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.703:19:2,10:2,3:6,0,13,0
chr7	122787374	.	A	ATGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=168,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr7	122808313	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr7	122809111	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr7	122809234	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:9,11:5,8:9,5,10,10
chr7	123109499	.	G	GTTGATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,137;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:123109499_G_GTTGATC:123109499:0,3,0,1
chr7	123109501	.	T	TTTCAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=133,137;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:123109499_G_GTTGATC:123109499:0,3,0,1
chr7	123142588	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr7	123190493	.	A	ACTGGATACCACAAATC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=77,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,4:2,5:5,2,8,3
chr7	123269118	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr7	123269976	.	G	GGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	123296124	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=98,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,9:8,0:5,4,9,0
chr7	123296320	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.685:11:1,2:2,4:0,3,4,4
chr7	123301994	.	AGAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:0,2:5,0:3,3,1,1
chr7	123302363	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:7,8,1,1
chr7	123324546	.	AATAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AT;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:4,1:8,1,2,0
chr7	123324745	.	CCAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=1819,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr7	123329243	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=84,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:1,5,0,3
chr7	123332378	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr7	123334696	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr7	123336626	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.244:43:21,10:12,0:24,9,10,0
chr7	123336804	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	123344548	.	CTTACTAATGTATGGTACATGTTTCCACAAGGATTAACATGTAAAAGATACTAAATA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.251:22:0,3:1,3:12,3,6,1
chr7	123349300	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,43;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.132:20:11,0:7,2:0|1:123349300_C_T:123349300:8,10,1,1
chr7	123349307	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,43;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:123349300_C_T:123349300:6,9,1,1
chr7	123349308	.	T	TTCTATAGGAAGATATATCCTATTCTACCATTGACC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,43;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:123349300_C_T:123349300:6,9,1,1
chr7	123508600	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:123508600_T_C:123508600:4,8,0,2
chr7	123508604	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:123508600_T_C:123508600:4,9,0,2
chr7	123514710	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123514710_G_C:123514710:0,0,1,0
chr7	123514718	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=189,144;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:123514710_G_C:123514710:1,0,1,0
chr7	123610217	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr7	124116893	.	G	GGTATCGCAGTGACCTTATTTGTCGGACAGTTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,167;MMQ=27,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr7	124386655	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:3,6,0,2
chr7	124387294	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=56,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:124387294_C_T:124387294:4,9,1,1
chr7	124387301	.	C	CCCATCAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=56,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:124387294_C_T:124387294:4,10,1,1
chr7	124387329	.	GG	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=67,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr7	124465509	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	124469267	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr7	124475296	.	TAAACA	T,TAAACAAAACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23,23;MFRL=0,171,149;MMQ=60,60,60;MPOS=26,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,5,7;RU=AAACA;STR;TLOD=3.34,12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.286,0.577:4:0,0,1:0,1,2:0,0,4,0
chr7	124481245	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,1:7,2:0,8,0,3
chr7	124499002	.	AT	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:2,4:2,2,4,1
chr7	124503733	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:124503733_A_T:124503733:0,4,0,1
chr7	124503737	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:124503733_A_T:124503733:0,4,0,1
chr7	124503743	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:124503733_A_T:124503733:0,3,0,1
chr7	126079144	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,4,2
chr7	126410171	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=85,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:2,3,1,5
chr7	126544012	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=156,193;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr7	126746842	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126746842_G_A:126746842:0,0,0,1
chr7	126746847	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126746842_G_A:126746842:0,0,0,1
chr7	127014620	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:127014620_A_T:127014620:11,10,1,1
chr7	127014624	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:127014620_A_T:127014620:10,10,1,1
chr7	127014629	.	T	TAG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:127014620_A_T:127014620:10,8,1,1
chr7	127014632	.	T	TATTGA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:7,2:0|1:127014620_A_T:127014620:9,8,1,1
chr7	127017391	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,1:2,2:0,7,0,3
chr7	127031575	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,3:11,0:11,6,0,3
chr7	127223352	.	T	TACACAGAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:127223352_T_TACACAGAC:127223352:2,3,1,1
chr7	127223355	.	A	AAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:127223352_T_TACACAGAC:127223352:2,3,1,1
chr7	127224193	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:5,2:5,2,2,1
chr7	127225206	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=125,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:3,11,1,1
chr7	127225217	.	T	TACCCACTTCCAGATAC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:2,9,1,1
chr7	127225245	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:127225245_TGA_T:127225245:0,3,0,1
chr7	127225248	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:127225245_TGA_T:127225245:0,3,0,1
chr7	127235385	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,4:2,0,5,6
chr7	127236338	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=63,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:3,2,4,0
chr7	127253714	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr7	127253944	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=65,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:127253944_G_T:127253944:3,5,1,1
chr7	127253947	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=65,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:127253944_G_T:127253944:3,5,1,1
chr7	127254019	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=65,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,0:3,4:0,3,1,4
chr7	127254457	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	127326632	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:9,7:7,0:12,4,8,0
chr7	127341360	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=171,219;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,12:0.238:53:32,0:6,12:14,27,0,12
chr7	127347733	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:5,5,5,2
chr7	127361269	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	127447499	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=76,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr7	127484309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,2:0|1:127484309_C_T:127484309:5,0,1,1
chr7	127484318	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:0|1:127484309_C_T:127484309:6,1,1,1
chr7	127569328	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,3:16,0:11,16,2,1
chr7	127669857	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,109;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,1:1,6:4,3,4,3
chr7	127721507	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=220,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:0,12:1,6:0,1,8,12
chr7	127721515	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:6,11,1,2
chr7	127892146	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:11,0:5,8:0|1:127892146_A_G:127892146:8,9,0,8
chr7	127892148	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:10,0:6,8:0|1:127892146_A_G:127892146:8,9,0,8
chr7	127892156	.	GATGACACCA	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,42;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.273:31:10,0:8,8:0|1:127892146_A_G:127892146:12,11,0,8
chr7	127894598	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:7,2:0|1:127894598_C_T:127894598:7,6,2,1
chr7	127894606	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:3,0:8,3:0|1:127894598_C_T:127894598:6,5,2,1
chr7	127957893	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr7	127976104	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=207,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr7	127976119	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	127991133	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:127991133_G_A:127991133:3,5,0,2
chr7	127991139	.	C	CACAG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:127991139_C_CACAG:127991139:1,5,1,1
chr7	127991142	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.438:7:2,2:1,0:1|0:127991133_G_A:127991133:0,4,1,2
chr7	127991144	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:127991139_C_CACAG:127991139:0,5,1,1
chr7	127992437	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	127999959	.	G	GTAAGGTATCTTTCGAAATCGTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr7	128000091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	128000099	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128000099_G_C:128000099:0,3,0,1
chr7	128000100	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128000099_G_C:128000099:0,3,0,1
chr7	128000105	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128000099_G_C:128000099:0,3,0,1
chr7	128049968	.	G	GAGAGAACATTTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	128098268	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.598:33:10,12:3,8:9,4,10,10
chr7	128117010	.	G	GCCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,136;MMQ=27,33;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC;STR;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.742:6:0,2:1,1:0,1,3,2
chr7	128128286	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,167;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:1,2,3,1
chr7	128140982	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=83,153;MMQ=59,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:9,2:1,2:5,5,2,2
chr7	128141083	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=151,208;MMQ=60,38;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr7	128142033	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	128142058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	128317558	.	C	CAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,21;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,2:0,0,3,3
chr7	128317931	.	CTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=71,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,1:0,4,0,2
chr7	128359126	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,71;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,0:6,3:7,9,1,2
chr7	128363287	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:5,6:2,2:5,3,5,3
chr7	128394426	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=104,94;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,2:12,1:13,17,3,0
chr7	128394548	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.154:23:12,2:8,1:8,12,1,2
chr7	128399130	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:128399130_C_T:128399130:2,7,1,1
chr7	128399138	.	G	GAGAGAGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:128399130_C_T:128399130:1,6,1,1
chr7	128415269	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128415269_T_G:128415269:0,4,0,1
chr7	128415270	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128415269_T_G:128415269:0,4,0,1
chr7	128415273	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128415269_T_G:128415269:0,4,0,1
chr7	128415306	.	G	GTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128415306_G_GTGCCA:128415306:0,1,0,1
chr7	128415308	.	G	GATGCCTTACAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128415306_G_GTGCCA:128415306:0,1,0,1
chr7	128447689	.	G	GATTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,34;MFRL=288,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:128447689_G_GATTTTCA:128447689:0,1,0,1
chr7	128447690	.	G	GTGCCCACAGGCAGTGCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=288,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128447689_G_GATTTTCA:128447689:0,1,0,1
chr7	128449490	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr7	128453002	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr7	128470808	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,181;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,2:14,0:10,12,0,2
chr7	128478138	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr7	128478541	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=138,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:1,1,0,1
chr7	128478549	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:1,0,0,1
chr7	128478552	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:2,0,0,1
chr7	128478554	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:2,0,0,1
chr7	128478556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:2,0,0,1
chr7	128478560	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:2,0,0,1
chr7	128478562	.	AG	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=170,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:128478541_G_A:128478541:2,0,0,1
chr7	128482640	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=121,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,13:6,0:7,4,13,0
chr7	128488563	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:128488563_A_C:128488563:0,2,1,0
chr7	128488566	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:128488563_A_C:128488563:1,2,1,0
chr7	128488571	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:128488563_A_C:128488563:1,2,1,0
chr7	128488899	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:1,9,0,2
chr7	128490147	.	GGCGATGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=70,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr7	128497400	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=99,189;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:6,3,0,2
chr7	128517689	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=107,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:4,0:18,2:0|1:128517689_C_T:128517689:9,13,0,2
chr7	128517696	.	A	ACCTTCAGCCCAGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=106,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:3,0:18,2:0|1:128517689_C_T:128517689:8,13,0,2
chr7	128518612	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=92,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,0:10,4:8,6,3,1
chr7	128524800	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,0:2,0:0|1:128524800_A_C:128524800:4,3,3,0
chr7	128524809	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,0:0|1:128524800_A_C:128524800:5,4,2,0
chr7	128525425	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	128530276	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=55,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,4:2,9:2,0,10,3
chr7	128533514	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr7	128543934	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr7	128547533	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	128548676	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=167,254;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128548676_C_T:128548676:0,4,0,1
chr7	128548682	.	CTGGGTTCTGT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:128548676_C_T:128548676:0,3,0,1
chr7	128550672	.	GCGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128550672_GCGC_G:128550672:0,0,1,0
chr7	128550678	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128550672_GCGC_G:128550672:0,0,1,0
chr7	128582058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr7	128582082	.	ACCTGCAGACCTGCTGAGGCTCCCCTCTGGCTTTCT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:4,0:1,2:6,5,1,1
chr7	128588795	.	G	GATATTTAGTATTGTTTTTTGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr7	128615983	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,0:10,4:0|1:128615983_T_C:128615983:6,9,0,4
chr7	128615986	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,0:9,4:0|1:128615983_T_C:128615983:6,9,0,4
chr7	128618963	.	GA	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,239;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr7	128618975	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,239;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,1,0
chr7	128629993	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=74,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,4,2
chr7	128630227	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=96,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr7	128645275	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	128655265	.	G	GACAGTGTTTTTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	128657995	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:4,4:6,2:6,4,5,1
chr7	128658089	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,121;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:10,0:13,6:13,10,0,6
chr7	128801510	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:13,6:6,0:9,10,6,0
chr7	128804474	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr7	128804496	.	T	TGTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	128807732	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:2,6,3,1
chr7	128843169	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr7	128845018	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,1:6,2:5,3,4,0
chr7	128845907	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=86,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	128846469	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr7	128852382	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=273,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128852382_G_T:128852382:0,1,0,1
chr7	128852386	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=273,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128852382_G_T:128852382:0,1,0,1
chr7	128852393	.	A	ACAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=273,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128852382_G_T:128852382:0,1,0,1
chr7	129029093	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.438:11:3,1:3,4:0,6,1,4
chr7	129037029	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:4,2,3,4
chr7	129040128	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:15,0:12,4:13,14,2,2
chr7	129040145	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,3:13,0:19,14,3,0
chr7	129062654	.	ATGCTGTACT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:10,9,1,1
chr7	129091615	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=241,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,5:1,3:0,1,4,4
chr7	129094195	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr7	129098439	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	129102920	.	G	GCGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=263,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129102920_G_GCGCCTC:129102920:0,1,0,1
chr7	129102922	.	A	ACAGGCCTGGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=263,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129102920_G_GCGCCTC:129102920:0,1,0,1
chr7	129297507	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:0,0:0,6,0,2
chr7	129297512	.	C	T,CTCTTCCTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24,31;MFRL=178,114,121;MMQ=60,60,32;MPOS=7,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.220,0.220:6:4,1,1:0,0,0:0,4,0,2
chr7	129330353	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:4,5:3,4:3,5,4,6
chr7	129414845	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,143;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr7	129497498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	129498661	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=86,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,6:3,3:3,1,8,1
chr7	129592302	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.287:8:2,0:4,2:0|1:129592302_G_GC:129592302:3,3,2,0
chr7	129592309	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.260:9:3,0:3,0:0|1:129592302_G_GC:129592302:4,3,2,0
chr7	129592313	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.259:9:2,0:4,1:0|1:129592302_G_GC:129592302:4,3,2,0
chr7	129592403	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,1:0|1:129592403_C_T:129592403:4,7,0,2
chr7	129592425	.	GG	TC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:129592403_C_T:129592403:1,6,0,2
chr7	129592430	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,2:0|1:129592403_C_T:129592403:1,5,0,2
chr7	129592433	.	TG	CT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:0,2:0|1:129592403_C_T:129592403:1,6,0,2
chr7	129592438	.	CG	AA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:129592403_C_T:129592403:1,6,0,2
chr7	129658655	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	129664155	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,2:4,0:5,6,2,0
chr7	129736880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr7	129806441	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	129815280	.	TG	CA,CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,27,32;MFRL=139,147,128;MMQ=60,43,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:1,0,2,0
chr7	129815288	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr7	129815289	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=128,147;MMQ=60,43;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:129815289_A_G:129815289:3,0,1,0
chr7	129815294	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=128,147;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:129815289_A_G:129815289:3,0,1,0
chr7	129825039	.	GCGGCTTGTTTAGAGCTGAGAT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,2:2,0:8,7,1,1
chr7	129842560	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	129855980	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=74,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:0,0:9,3:3,6,2,1
chr7	129919414	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:129919414_A_T:129919414:10,10,1,1
chr7	129919423	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:129919414_A_T:129919414:9,10,1,1
chr7	129938758	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr7	129940561	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	129940654	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=93,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:9,5,1,1
chr7	129946780	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,4:1,1:1,0,2,3
chr7	129950740	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:7,3:5,1:8,4,3,2
chr7	129950879	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=83,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:2,4,1,2
chr7	129962360	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr7	129987755	.	GT	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:129987755_GT_AA:129987755:0,4,0,1
chr7	129987759	.	T	TCTACTTCTACCTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:129987755_GT_AA:129987755:0,4,0,1
chr7	129987764	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=229,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	130002199	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,2:2,1:3,0,3,0
chr7	130002467	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=354,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	130007164	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	130007459	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=104,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:1,6,2,5
chr7	130007901	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	130007913	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	130008285	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:5,2,6,2
chr7	130008513	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0|1:130008513_T_G:130008513:0,5,0,3
chr7	130008516	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=149,218;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:0|1:130008513_T_G:130008513:0,5,0,3
chr7	130022041	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:3,4,3,5
chr7	130022051	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:2,1:4,5,0,3
chr7	130023370	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:3,3,0,2
chr7	130023539	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:1,0:3,7:1,4,2,5
chr7	130135349	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr7	130135435	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130135435_G_T:130135435:0,1,0,1
chr7	130135442	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130135435_G_T:130135435:0,2,0,1
chr7	130135445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130135435_G_T:130135435:0,2,0,1
chr7	130135449	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130135435_G_T:130135435:0,2,0,1
chr7	130135970	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.205:13:7,0:4,2:0|1:130135970_A_G:130135970:3,8,1,1
chr7	130135980	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.204:13:7,0:3,2:0|1:130135970_A_G:130135970:3,8,1,1
chr7	130136107	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	130136902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr7	130137692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	130138155	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,7,12
chr7	130139660	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.425:10:3,1:3,2:6,0,3,1
chr7	130140766	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr7	130147307	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr7	130148498	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=106,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:1,0:10,4:5,6,2,2
chr7	130148502	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:12,2:0|1:130148502_T_C:130148502:6,8,1,1
chr7	130148504	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:2,0:11,2:0|1:130148502_T_C:130148502:6,8,1,1
chr7	130148507	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,7,8
chr7	130148562	.	T	TTCTTAGGAAGTG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	130295854	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:15,0:4,2:0|1:130295854_G_T:130295854:4,15,1,1
chr7	130295861	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:130295854_G_T:130295854:4,15,1,1
chr7	130295864	.	TCA	CTG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:4,2:0|1:130295854_G_T:130295854:6,15,1,1
chr7	130295870	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:17,0:3,1:0|1:130295854_G_T:130295854:5,15,1,1
chr7	130297131	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:130297131_T_G:130297131:0,2,0,2
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chr7	130297135	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:130297131_T_G:130297131:0,2,0,2
chr7	130298550	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	130353554	.	C	CTGGAGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0|1:130353554_C_CTGGAGT:130353554:1,7,1,1
chr7	130353556	.	C	CAGTGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0|1:130353554_C_CTGGAGT:130353554:1,7,1,1
chr7	130354106	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr7	130356691	.	CTTTAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTTAT;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.721:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	130370156	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	130562185	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:12,0:8,5:14,7,0,5
chr7	130827699	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,3:8,0:9,8,2,1
chr7	131060277	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=104,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,4:6,5:5,7,2,7
chr7	131073727	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,2:7,0:6,7,2,0
chr7	131099560	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=G;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.705:1:0,0:0,0:0|1:131099560_TGGG_T:131099560:0,0,0,1
chr7	131099566	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131099560_TGGG_T:131099560:0,0,0,1
chr7	131113756	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:7,0,2,0
chr7	131155588	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=115,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,7:3,1:4,4,5,3
chr7	131190554	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	131190696	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:2,6,1,2
chr7	131191252	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=112,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr7	131191536	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr7	131191554	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	131195535	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,2:7,4:6,6,3,3
chr7	131195712	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.531:26:5,9:7,5:6,6,8,6
chr7	131241029	.	GGGCGAC	G,GGGCGACGGCGAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34,31;MFRL=0,107,101;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,3,5;RU=GGCGAC;STR;TLOD=8.35,11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.397,0.488:6:0,3,0:0,0,2:0,0,3,3
chr7	131241085	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr7	131815220	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,12:0,0,10,9
chr7	131815310	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,4,10
chr7	131815343	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	131825440	.	C	CCCACTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:4,7,1,1
chr7	131832627	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr7	131849835	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=89,75;MMQ=60,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:6,3,3,1
chr7	131849875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=80,236;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:2,0:3,8,2,0
chr7	131859496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr7	131859723	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=194,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:131859723_C_T:131859723:1,3,1,1
chr7	131859725	.	AG	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=194,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:131859723_C_T:131859723:1,3,1,1
chr7	131864379	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	131866102	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,17;MFRL=108,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:131866102_T_G:131866102:1,2,1,0
chr7	131866108	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,17;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:131866108_CC_GG:131866108:0,3,2,0
chr7	131866116	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=108,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:131866102_T_G:131866102:1,3,1,0
chr7	131866120	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,21;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:131866108_CC_GG:131866108:0,3,2,0
chr7	131866124	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:131866108_CC_GG:131866108:0,3,2,0
chr7	131866972	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,4:4,1:2,5,3,3
chr7	131895686	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:4,5,3,0
chr7	131908468	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	131911104	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	131913082	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=17,13;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:2,0:1,0:0|1:131913082_A_C:131913082:3,4,4,0
chr7	131913087	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,14;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,1:4,0:0|1:131913082_A_C:131913082:3,4,4,0
chr7	131913094	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,0:3,1:0|1:131913082_A_C:131913082:3,6,4,0
chr7	131913097	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,11;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:3,0:3,0:0|1:131913082_A_C:131913082:3,6,3,0
chr7	132169701	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=83,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:132169701_C_T:132169701:5,10,1,1
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chr7	132169783	.	A	ACATTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,2:6,0:1,6,1,1
chr7	132192231	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr7	132192949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:3,3,4,0
chr7	132570358	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	132709293	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,5:6,7:6,4,6,6
chr7	132766584	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr7	132938039	.	C	CCCTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr7	133041304	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=92,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:11,9:15,0:14,12,2,7
chr7	133502387	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	133580436	.	A	AATCTTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0|1:133580436_A_AATCTTG:133580436:2,3,1,1
chr7	133580439	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:133580436_A_AATCTTG:133580436:2,3,1,1
chr7	133580545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	133682181	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	133692667	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	133861905	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	133863397	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=14,34;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,0:0,1:0|1:133863397_T_G:133863397:0,1,0,1
chr7	133863400	.	G	GGATCATATTTATTCACTGCTGAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0|1:133863397_T_G:133863397:0,1,0,1
chr7	133868507	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr7	133868667	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=104,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr7	133881919	.	ATG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=88,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	133932457	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr7	133979545	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=119,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:7,3:1,3:0|1:133979545_A_T:133979545:8,1,6,0
chr7	133979552	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=108,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,4:3,4:0|1:133979545_A_T:133979545:8,2,6,2
chr7	133979578	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:6,6:2,6:4,5,6,6
chr7	133981227	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=128,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:6,4:3,6:3,6,4,6
chr7	133981295	.	AGAC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=181,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	133981309	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	133984432	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	133984878	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=84,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,1:3,2:4,5,2,1
chr7	133991411	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:10,4:11,0:12,9,3,1
chr7	134132184	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:4,3:0|1:134132184_C_A:134132184:2,6,0,3
chr7	134132186	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=20,26;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,0:4,3:0|1:134132184_C_A:134132184:2,6,0,3
chr7	134132189	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=22,26;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.320:10:3,0:3,3:0|1:134132184_C_A:134132184:2,5,0,3
chr7	134132192	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=27,26;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:4,0:1,3:1,5,0,3
chr7	134132194	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:1,5,0,2
chr7	134132198	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0|1:134132184_C_A:134132184:0,4,0,3
chr7	134132200	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0|1:134132184_C_A:134132184:0,4,0,3
chr7	134132211	.	ACC	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=65,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:1,3:0|1:134132211_ACC_A:134132211:0,4,0,4
chr7	134132214	.	T	TTA	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=65,175;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0|1:134132211_ACC_A:134132211:0,4,0,4
chr7	134136584	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	134143690	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr7	134212611	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr7	134212741	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr7	134217912	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=222,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134217912_G_T:134217912:0,3,0,1
chr7	134217913	.	C	CACAACCATTTACCCA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=222,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134217912_G_T:134217912:0,3,0,1
chr7	134217932	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,35;MFRL=208,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,1,0,1
chr7	134217934	.	A	ATCAGTCC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=23,26;MFRL=208,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,1,0,1
chr7	134217938	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,2,0,1
chr7	134217939	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,2,0,1
chr7	134217942	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,2,0,1
chr7	134217945	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134217932_T_C:134217932:0,2,0,1
chr7	134221826	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	134250320	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:134250320_C_T:134250320:0,0,2,10
chr7	134250322	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,4:0|1:134250320_C_T:134250320:0,0,2,10
chr7	134250349	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	134261785	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=110,149;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,9:6,0:7,7,9,0
chr7	134576441	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.801:30:1,15:3,8:2,4,11,13
chr7	134576456	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=75,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:3,2:0|1:134576456_C_T:134576456:6,11,1,1
chr7	134576466	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=74,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.203:13:6,0:4,2:0|1:134576456_C_T:134576456:4,7,1,1
chr7	134576469	.	T	TTTTTC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=37,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:4,0:3,1:0|1:134576456_C_T:134576456:3,7,1,1
chr7	134626034	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:0,0:1,0:1,3,0,2
chr7	134673958	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr7	134678463	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,2:5,1:2,8,0,3
chr7	134701856	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr7	134718989	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr7	134730151	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	134744060	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	134820096	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:134820096_CCT_C:134820096:0,2,0,1
chr7	134820106	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:134820096_CCT_C:134820096:0,2,0,1
chr7	134849213	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,3:7,5:5,8,4,4
chr7	134849242	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.240:31:9,5:15,2:9,15,6,1
chr7	134849280	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr7	134852399	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr7	134852432	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr7	134852637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:1,8,0,5
chr7	134872019	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,14;MFRL=231,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0,2,0,1
chr7	134873355	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	134877935	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr7	134878237	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	134878324	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=105,102;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.117:28:11,2:13,0:11,14,3,0
chr7	134878350	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:10,0:8,10,0,2
chr7	134878479	.	A	AAGAGAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr7	134879830	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.537:22:3,4:7,6:3,7,6,6
chr7	134879860	.	C	CGAAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:134879860_C_CGAAG:134879860:1,7,1,1
chr7	134879861	.	T	TGGGCGGATCACTTGAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,0:0|1:134879860_C_CGAAG:134879860:1,7,1,1
chr7	134880884	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,180;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:3,3,1,1
chr7	134882680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:134882680_A_G:134882680:0,0,4,1
chr7	134882693	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:134882680_A_G:134882680:0,0,3,1
chr7	134882837	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:6,4:4,0:4,8,4,0
chr7	134889141	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,2:5,5:5,10,6,1
chr7	134889271	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,0:3,4:1,4,0,5
chr7	134893847	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134893847_G_T:134893847:0,1,0,1
chr7	134893850	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134893847_G_T:134893847:0,1,0,1
chr7	134896155	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:13,2:13,11,1,1
chr7	134925241	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=214,111;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.644:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr7	134925411	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=112,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.677:20:2,4:4,8:1,5,4,10
chr7	134928033	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=95,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr7	134930169	.	A	AGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=180,132;MMQ=37,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GAG;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:0,1:0,0:0,1,0,3
chr7	134936728	.	T	TCAGAGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=116,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAGAGA;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:4,0:2,5,0,6
chr7	134943235	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:14,5,1,1
chr7	134943267	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:7,0:12,3:11,8,2,1
chr7	134943328	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,1:2,5:0,3,0,7
chr7	135047691	.	G	GTGAGTGAGTCCTGCCTATTCAAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:135047691_G_GTGAGTGAGTCCTGCCTATTCAAAT:135047691:8,0,0,2
chr7	135047693	.	G	GGTGAGTGCCCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.245:11:3,0:4,0:0|1:135047691_G_GTGAGTGAGTCCTGCCTATTCAAAT:135047691:9,0,0,2
chr7	135047703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr7	135080571	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:14,0:13,5:13,14,0,5
chr7	135080656	.	A	AACAACCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0|1:135080656_A_AACAACCCC:135080656:1,1,1,1
chr7	135080658	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,20;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:135080656_A_AACAACCCC:135080656:1,1,1,1
chr7	135080661	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,21;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:0,0:0|1:135080656_A_AACAACCCC:135080656:1,1,0,1
chr7	135095270	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr7	135099044	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=170,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,1:2,1:5,0,2,0
chr7	135099901	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:5,5,2,7
chr7	135255994	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=123,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,3:10,0:17,7,3,0
chr7	135256027	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.347:10:3,0:1,2:2,5,2,1
chr7	135262533	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=137,6788647;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr7	135285788	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr7	135289224	.	GC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:22,0:10,2:18,14,0,2
chr7	135311132	.	T	TCGTTTACAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:2,2:0|1:135311132_T_TCGTTTACAG:135311132:2,5,1,1
chr7	135311134	.	G	GTGGGTCCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:0|1:135311132_T_TCGTTTACAG:135311132:2,5,1,1
chr7	135311167	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	135322900	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=190,214;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:135322900_A_G:135322900:0,2,0,1
chr7	135322902	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=190,214;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:135322900_A_G:135322900:0,2,0,1
chr7	135322906	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=106,168;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	135323423	.	C	CACTGACATGACA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:0|1:135323423_C_CACTGACATGACA:135323423:6,16,1,1
chr7	135323425	.	C	CCCTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,1:12,0:0|1:135323423_C_CACTGACATGACA:135323423:6,16,1,1
chr7	135328110	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:0,3:5,1:2,4,0,5
chr7	135347300	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=138,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,1:10,4,1,1
chr7	135375921	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.324:16:6,1:5,4:0|1:135375921_C_A:135375921:8,3,3,2
chr7	135375925	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.492:20:5,3:4,6:0|1:135375921_C_A:135375921:8,2,6,4
chr7	135376214	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	135378854	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,5:2,0:3,3,4,1
chr7	135387495	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	135392876	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:6,2,8,2
chr7	135393032	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,3:4,9:1,7,5,7
chr7	135412273	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,2,2
chr7	135418921	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:135418921_G_A:135418921:9,4,1,1
chr7	135418924	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,2:3,0:0|1:135418921_G_A:135418921:9,4,1,1
chr7	135421790	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr7	135433178	.	T	TCAAAAGGTGAAAAATCGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=156,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:135433178_T_TCAAAAGGTGAAAAATCGA:135433178:4,0,1,1
chr7	135433184	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:135433178_T_TCAAAAGGTGAAAAATCGA:135433178:4,0,1,1
chr7	135614289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:2,11,2,0
chr7	136588109	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr7	136701401	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:14,12,1,1
chr7	136939582	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,5,2
chr7	137082250	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137082250_T_G:137082250:0,1,0,1
chr7	137082255	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:137082250_T_G:137082250:0,2,0,1
chr7	137082256	.	G	GCCACTGTCATCTCCCTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:137082250_T_G:137082250:0,2,0,1
chr7	137092745	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	137092781	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=219,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	137170188	.	A	AAGAATCAATTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:3,2:7,0:2,8,1,1
chr7	137284480	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	137308390	.	G	GTAGTTTTAAATTATCTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr7	137531147	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr7	137590369	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	137612835	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,7:3,1:4,0,4,4
chr7	137612913	.	CTGG	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=91,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:7,6:4,7:6,5,14,2
chr7	137773291	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	137773563	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr7	137782593	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	137790151	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,0:12,3:6,14,0,3
chr7	137790178	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:4,5,0,3
chr7	137792420	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	137798593	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr7	137801413	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr7	137801444	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	138189189	.	GCTCTT	G,GT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,20,13;MFRL=0,86,162;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=34.95,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,15,2:0.767,0.198:17:0,7,0:0,5,0:0,0,9,8
chr7	138189201	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=101,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.538:26:6,6:4,5:6,6,9,5
chr7	138200117	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,8:0,0,11,8
chr7	138200138	.	TA	CT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:138200138_TA_CT:138200138:6,8,1,1
chr7	138200145	.	CCCCGT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:4,2:0|1:138200138_TA_CT:138200138:4,9,1,1
chr7	138210065	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=100,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:22,2:0|1:138210065_A_T:138210065:17,18,1,1
chr7	138210069	.	A	AC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=100,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:22,2:0|1:138210065_A_T:138210065:17,18,1,1
chr7	138239737	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:9,0:3,10:3,9,0,10
chr7	138258159	.	AATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	138305743	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr7	138305782	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0|1:138305782_T_C:138305782:0,0,5,9
chr7	138305806	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:138305782_T_C:138305782:0,0,6,9
chr7	138310629	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	138333917	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:5,2:4,9,1,2
chr7	138333933	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	138344676	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:6,3:12,0:0|1:138344676_G_A:138344676:12,7,3,0
chr7	138344678	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:7,3:12,0:0|1:138344676_G_A:138344676:12,7,3,0
chr7	138347915	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=113,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,0:11,3:6,8,1,2
chr7	138356730	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,2:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,9,0
chr7	138356733	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,9,0
chr7	138391505	.	AAA	TGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr7	138394575	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,0:5,15:3,9,0,15
chr7	138413697	.	A	ATGCTACTGGGCATGCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	138440415	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:6,3,1,1
chr7	138454053	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:138454053_C_CT:138454053:1,2,0,1
chr7	138454062	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:138454053_C_CT:138454053:1,2,0,1
chr7	138454070	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:138454053_C_CT:138454053:1,2,0,1
chr7	138566426	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,315;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	138579233	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:9,7,1,1
chr7	138583840	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:6,2:6,5:7,6,3,4
chr7	138595835	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,5:3,5:6,0,9,1
chr7	138601473	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:1,5:6,3:7,0,5,4
chr7	138602417	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:2,1:3,8:4,2,1,8
chr7	138603644	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:9,7,2,0
chr7	138713715	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr7	138719194	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	138719231	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr7	138732274	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	138740139	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138740139_G_GAA:138740139:0,1,0,1
chr7	138740146	.	A	AGAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138740139_G_GAA:138740139:0,1,0,1
chr7	138768839	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	138819377	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:9,2,1,1
chr7	138826989	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.166:17:7,2:7,1:0|1:138826989_A_AT:138826989:7,7,0,3
chr7	138827000	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.159:18:7,2:6,0:0|1:138826989_A_AT:138826989:7,8,0,3
chr7	138865873	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,2:3,0:0|1:138865873_C_CA:138865873:2,7,1,1
chr7	138865876	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:138865873_C_CA:138865873:2,7,1,1
chr7	138865879	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=159,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0|1:138865873_C_CA:138865873:2,6,1,1
chr7	138865880	.	T	TTTTTGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=159,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0|1:138865873_C_CA:138865873:2,6,1,1
chr7	138874051	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,163;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:4,2:8,7,0,2
chr7	138874083	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:7,0:10,12,3,0
chr7	138943426	.	T	TCTCAAATGTCAGTGTGCATTACAATCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	138950972	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.586:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	139094349	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=90,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:22,2:10,2:18,14,2,2
chr7	139226789	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:3,2:0,3,2,0
chr7	139257642	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139257648	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139257652	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139257656	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139257658	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139257660	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139257642_C_T:139257642:0,0,1,0
chr7	139311502	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.164:20:5,0:11,2:5,12,1,2
chr7	139636029	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:11,0:5,6:6,11,1,5
chr7	139734069	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:11,2:6,8:8,9,6,4
chr7	139737421	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	139754451	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr7	139757770	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,2:11,1:11,8,3,0
chr7	139757800	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,2:14,1:14,10,3,0
chr7	139757876	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:1,0:5,9:0|1:139757876_T_C:139757876:1,5,0,9
chr7	139757879	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.589:15:1,0:5,8:0|1:139757876_T_C:139757876:1,5,0,9
chr7	139757911	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr7	139762273	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:139762273_A_G:139762273:0,0,2,0
chr7	139762282	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:139762273_A_G:139762273:0,0,2,0
chr7	139791000	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.396:38:13,0:10,14:8,15,0,15
chr7	139791851	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=67,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:4,0:3,4,1,2
chr7	139794009	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr7	139796335	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,1:1,4:3,0,3,2
chr7	139801777	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,4,4
chr7	139810796	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	139820354	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:1,6,0,5
chr7	139826654	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=128,85;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:6,2:2,7,0,2
chr7	139839084	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	139876490	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:3,1:7,2:9,2,2,1
chr7	139876827	.	C	CGCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,554;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	140036999	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr7	140037053	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,30,33;MFRL=66,133,142;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=17.37,19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,10:0.357,0.489:20:2,1,6:0,6,4:1,2,15,2
chr7	140043163	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=79,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:4,1,4,2
chr7	140044979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:6,5,7,1
chr7	140045668	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,3:18,0:17,13,0,3
chr7	140048444	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:14,9,1,2
chr7	140048471	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:14,2:14,14,2,0
chr7	140051063	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:3,2:3,4,4,0
chr7	140051091	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,101;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,5:6,6:5,8,9,2
chr7	140051790	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:3,3:3,1,6,0
chr7	140051848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,1:3,3:3,5,2,2
chr7	140052008	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=99,108;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,0:5,6:1,5,0,6
chr7	140055425	.	CAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=87,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.257:17:4,1:8,3:10,3,3,1
chr7	140069361	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr7	140082363	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr7	140110677	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	140111859	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=279,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:140111859_T_C:140111859:0,2,0,1
chr7	140111865	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=279,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140111859_T_C:140111859:0,2,0,1
chr7	140218464	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,6,8
chr7	140221610	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	140255586	.	TGC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140255586_TGC_T:140255586:0,1,0,1
chr7	140255591	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140255586_TGC_T:140255586:0,1,0,1
chr7	140255596	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140255586_TGC_T:140255586:0,1,0,1
chr7	140255607	.	ATGTTTC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140255586_TGC_T:140255586:0,3,0,1
chr7	140255623	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	140257841	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	140257907	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr7	140301534	.	G	GTTTTTCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:4,2,1,1
chr7	140301708	.	TG	AA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:12,4,1,1
chr7	140374018	.	TGGCCACCAACCTGA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:5,0:7,10,1,1
chr7	140390498	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:5,1,1,1
chr7	140396730	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=113,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr7	140402754	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=71,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,1:12,2:13,13,0,3
chr7	140404619	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:11,12:5,0:8,8,12,0
chr7	140434587	.	AAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAAAAAG;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.794:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	140507658	.	T	TAAGCCAGGAAATATCAGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=227,305;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	140706157	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=486,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	141341633	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:7,5,2,1
chr7	141349136	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=98,126;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:11,0:21,3:15,17,0,3
chr7	141362431	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	141362693	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,2:1,1:0,2,0,5
chr7	141374030	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.505:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr7	141386264	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	141420707	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr7	141429510	.	C	CAGGAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:2,7,1,1
chr7	141429515	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr7	141478679	.	AGG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=110,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:141478679_AGG_A:141478679:8,6,0,2
chr7	141478684	.	G	GCCGCCTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=110,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,2:5,0:0|1:141478679_AGG_A:141478679:8,6,0,2
chr7	141536964	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:8,3,0,2
chr7	141619697	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	141635538	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	141635634	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=91,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:12,2:6,2:7,11,2,2
chr7	141705515	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	141705540	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr7	141719058	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:6,7,1,1
chr7	141730618	.	CTG	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.796:7:1,4:0,2:1,0,0,6
chr7	141732750	.	T	TCTCCTCAGCCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr7	141733994	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr7	141734585	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:5,8,0,2
chr7	141750172	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:141750172_T_C:141750172:0,2,0,1
chr7	141750178	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:141750172_T_C:141750172:0,2,0,1
chr7	141750182	.	AACTT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:141750172_T_C:141750172:0,2,0,1
chr7	141752733	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=106,127;MMQ=52,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,6:5,7:4,1,5,8
chr7	141759994	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=99,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr7	141760040	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,141;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr7	141760228	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,7:2,4:2,5,1,10
chr7	141764164	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr7	141764323	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,43;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	141794763	.	ATTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=237,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.549:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	141795281	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr7	141796250	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr7	141797564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	141799550	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=107,190;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:9,0:7,7:0|1:141799550_A_C:141799550:4,13,0,7
chr7	141799556	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=108,190;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:8,0:4,6:0|1:141799550_A_C:141799550:4,10,0,7
chr7	141800668	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:15,0:11,4:13,14,2,2
chr7	141805535	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:10,1,2,0
chr7	141954976	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:4,3,3,2
chr7	142458371	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=164,75;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,2:5,4:5,7,3,3
chr7	142458451	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=87,82;MMQ=60,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.377:27:9,5:8,5:8,9,4,6
chr7	142460226	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=155,161;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:4,2:7,1,3,0
chr7	142460238	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=144,161;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr7	142460250	.	TAC	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=135,161;MMQ=60,35;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,1:7,4:0|1:142460250_TAC_T:142460250:8,3,4,1
chr7	142460254	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=135,161;MMQ=60,35;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,1:8,3:0|1:142460250_TAC_T:142460250:8,3,4,1
chr7	142460261	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=161,119;MMQ=37,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:3,7:6,9:7,2,11,5
chr7	142460394	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=108,154;MMQ=60,31;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:19,2:10,3:0|1:142460394_T_C:142460394:16,15,0,7
chr7	142460412	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=21,34;MFRL=111,173;MMQ=60,21;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,1:12,2:0|1:142460394_T_C:142460394:14,14,0,3
chr7	142460415	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=108,173;MMQ=60,21;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,1:11,2:0|1:142460394_T_C:142460394:12,13,0,3
chr7	142460428	.	CCAA	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=132,173;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,1:9,2:0|1:142460394_T_C:142460394:7,12,0,3
chr7	142460642	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=175,152;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr7	142460660	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=23,32;MFRL=202,152;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:0|1:142460660_T_C:142460660:8,2,2,0
chr7	142460669	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=203,152;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0|1:142460660_T_C:142460660:8,2,2,0
chr7	142460671	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=25,34;MFRL=203,152;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:0|1:142460660_T_C:142460660:8,2,2,0
chr7	142460712	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=92,69;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:10,6:12,1:13,10,5,2
chr7	142460744	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=115,126;MMQ=60,44;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:6,5:14,5:0|1:142460744_G_C:142460744:12,8,4,6
chr7	142460752	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=100,147;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:4,5:12,4:0|1:142460744_G_C:142460744:10,7,3,6
chr7	142460764	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=115,103;MMQ=60,35;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:4,4:14,1:12,6,2,4
chr7	142460778	.	TG	CT	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=23,31;MFRL=92,104;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:5,2:16,1:12,10,0,3
chr7	142460801	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=26,29;MFRL=85,103;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:7,1:21,0:15,13,0,2
chr7	142460865	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,15,12
chr7	142562537	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,0:5,1:0|1:142562537_A_C:142562537:2,12,2,0
chr7	142562540	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,1:0|1:142562537_A_C:142562537:2,13,2,0
chr7	142562544	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:5,2:0|1:142562537_A_C:142562537:1,14,2,0
chr7	142567599	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=104,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,6:9,0:9,6,6,0
chr7	142567937	.	CCAT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAT;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:5,0:8,5,1,1
chr7	142571883	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=84,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,3:11,0:15,9,2,1
chr7	142572443	.	G	GATA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=230,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr7	142574486	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=98,45;MMQ=45,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:0|1:142574486_T_C:142574486:3,3,1,1
chr7	142574490	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=98,45;MMQ=45,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:0|1:142574486_T_C:142574486:3,3,1,1
chr7	142574844	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=333,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr7	142583330	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	142627162	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=74,44;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:7,0:14,6:8,13,0,6
chr7	142627199	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,75;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:8,3:4,5,1,2
chr7	142627585	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:142627585_G_A:142627585:1,3,0,1
chr7	142627592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:142627585_G_A:142627585:1,2,0,1
chr7	142640045	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:142640045_A_G:142640045:4,8,1,1
chr7	142640049	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:142640045_A_G:142640045:4,8,1,1
chr7	142640894	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.171:20:10,3:7,0:13,4,3,0
chr7	142649798	.	G	GTCCTCCGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142649798_G_GTCCTCCGTGTT:142649798:0,1,0,1
chr7	142649800	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142649798_G_GTCCTCCGTGTT:142649798:0,1,0,1
chr7	142651477	.	C	CTGTTTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=189,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr7	142724020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:142724020_G_A:142724020:4,5,1,1
chr7	142724029	.	TGG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=107,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:142724020_G_A:142724020:5,6,1,1
chr7	142724034	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:142724020_G_A:142724020:5,5,1,1
chr7	142750032	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:4,3:11,0:6,9,1,2
chr7	142829330	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:2,9,0,2
chr7	142920179	.	CCACTTCTGCCTTTGCCTCAGGTAGAACTCTCTCCTCACCCGTCTCTTCTCTCCCAAACCTGCTCTGA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.284:12:1,4:3,1:0|1:142920179_CCACTTCTGCCTTTGCCTCAGGTAGAACTCTCTCCTCACCCGTCTCTTCTCTCCCAAACCTGCTCTGA_C:142920179:3,3,0,6
chr7	142920190	.	TTTGC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=165,79674157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.394:3:0,0:2,1:1|0:142920179_CCACTTCTGCCTTTGCCTCAGGTAGAACTCTCTCCTCACCCGTCTCTTCTCTCCCAAACCTGCTCTGA_C:142920179:1,1,1,0
chr7	142961828	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=197,278;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:142961828_A_AAC:142961828:0,1,0,1
chr7	142961829	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=8,26;MFRL=197,278;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:0,0:0|1:142961828_A_AAC:142961828:0,1,0,1
chr7	142961831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,22;MFRL=197,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:142961828_A_AAC:142961828:0,1,0,1
chr7	142983162	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:7,13,0,2
chr7	142983647	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,50;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr7	142983735	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,2:11,1:7,10,2,1
chr7	142988861	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr7	142989901	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=181,190;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0,9,0,2
chr7	142997350	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:6,10,0,2
chr7	143000780	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:3,2,2,0
chr7	143001988	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,4:10,0:0|1:143001988_A_T:143001988:14,7,4,0
chr7	143001992	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,4:10,0:0|1:143001988_A_T:143001988:14,7,4,0
chr7	143017009	.	AGGTACAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:143017009_AGGTACAGG_A:143017009:0,1,0,1
chr7	143017021	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:143017009_AGGTACAGG_A:143017009:0,1,0,1
chr7	143017023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:143017009_AGGTACAGG_A:143017009:0,1,0,1
chr7	143017026	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,21;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:143017009_AGGTACAGG_A:143017009:0,1,0,1
chr7	143017960	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=191,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr7	143018443	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:143018443_C_T:143018443:6,3,1,1
chr7	143018447	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:143018443_C_T:143018443:6,3,1,1
chr7	143018450	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:143018443_C_T:143018443:6,3,1,1
chr7	143018453	.	C	CCCATCACT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:143018443_C_T:143018443:7,3,1,1
chr7	143020625	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,2:2,6:4,3,6,2
chr7	143020649	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=100,103;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:9,3:4,7:7,6,7,4
chr7	143020780	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=96,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,0:2,8:0,3,2,7
chr7	143020944	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=108,56;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:2,5,0,6
chr7	143029967	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:9,5:4,0:5,8,0,5
chr7	143036318	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,4:1,12:0,1,11,6
chr7	143036337	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,7:1,13:0,1,13,7
chr7	143036548	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr7	143039311	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	143042552	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:4,1,3,1
chr7	143042926	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:143042926_G_T:143042926:0,1,0,1
chr7	143042929	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:143042926_G_T:143042926:0,1,0,1
chr7	143042931	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143042926_G_T:143042926:0,0,0,1
chr7	143043240	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,9,9
chr7	143043347	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:143043347_G_A:143043347:0,3,0,1
chr7	143043348	.	A	AACTCACAT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,23;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:143043347_G_A:143043347:0,3,0,1
chr7	143043371	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=22,28;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:143043371_A_C:143043371:0,2,0,1
chr7	143043373	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,34;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0|1:143043371_A_C:143043371:0,2,0,1
chr7	143043377	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	143043404	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,24;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:143043404_G_A:143043404:0,1,0,3
chr7	143043409	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=17,23;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:0,0:0|1:143043404_G_A:143043404:0,1,0,3
chr7	143043607	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr7	143043890	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr7	143043902	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr7	143043939	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=117,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,0:5,3:3,3,2,1
chr7	143054585	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	143054604	.	G	GACCTCCATGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=137,158;MMQ=41,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143054604_G_GACCTCCATGA:143054604:0,1,0,1
chr7	143054606	.	T	TCTTTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=137,158;MMQ=41,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143054604_G_GACCTCCATGA:143054604:0,1,0,1
chr7	143078928	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	143079806	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,3,15
chr7	143084855	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:17,5:4,0:10,11,0,5
chr7	143088526	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr7	143088823	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr7	143094635	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr7	143095256	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr7	143141253	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:143141253_GC_G:143141253:2,9,1,1
chr7	143141260	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:143141253_GC_G:143141253:2,10,1,1
chr7	143174892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr7	143175154	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=172,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,5:1,1:0,2,4,2
chr7	143400342	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=185,43;MMQ=25,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:143400342_C_CT:143400342:1,1,1,1
chr7	143400345	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=185,43;MMQ=25,49;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:143400342_C_CT:143400342:1,1,1,1
chr7	143400355	.	G	GCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=185,43;MMQ=25,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:143400342_C_CT:143400342:1,1,1,1
chr7	143400356	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=185,43;MMQ=25,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:143400342_C_CT:143400342:1,1,1,1
chr7	143421438	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=278,188;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	143453710	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=127,223;MMQ=22,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:2,5,0,2
chr7	143554447	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=181,159;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:143554447_G_A:143554447:1,0,1,0
chr7	143554451	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=181,159;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:143554447_G_A:143554447:1,0,1,0
chr7	143632554	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,106;MMQ=57,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:13,2:11,11,0,3
chr7	143632618	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,161;MMQ=40,44;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:3,6,2,2
chr7	143657801	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,4:10,4:6,11,7,1
chr7	143701516	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=66,174;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:7,2,5,1
chr7	143701884	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,80;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,5:0,1:0,2,3,3
chr7	143747870	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr7	143747993	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,68;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:143747993_C_T:143747993:12,8,1,1
chr7	143748007	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:143747993_C_T:143747993:10,8,1,1
chr7	143771937	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,6,7
chr7	143793162	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:20,1:0,2:0,20,0,3
chr7	143806688	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=63,152;MMQ=60,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:6,3,5,1
chr7	143807666	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:1,5,2,2
chr7	143807674	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=89,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:2,1:1,2,1,3
chr7	143807695	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:143807695_A_ATC:143807695:0,3,0,1
chr7	143807697	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:143807695_A_ATC:143807695:0,3,0,1
chr7	143826603	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,54;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
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chr7	143956742	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=115,193;MMQ=57,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:2,4,2,3
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chr7	144068163	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	144070422	.	AAC	TCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=141,109;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	144076915	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	144096138	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=246,37;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,1,1,1
chr7	144096139	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=246,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,1,1,1
chr7	144096141	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=22,20;MFRL=246,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,1,1,1
chr7	144096144	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=246,37;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,1,1,1
chr7	144096146	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=21,20;MFRL=246,37;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,1,1,1
chr7	144096152	.	GA	AC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:144096138_G_GA:144096138:0,0,1,1
chr7	144096327	.	GG	CT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=20,33;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:144096327_GG_CT:144096327:2,1,0,1
chr7	144096332	.	C	CTCTTCA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=20,32;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:144096327_GG_CT:144096327:1,1,0,1
chr7	144096334	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=20,30;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:144096327_GG_CT:144096327:1,1,0,1
chr7	144096598	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr7	144097309	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=90,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,1:6,1:7,4,1,1
chr7	144097426	.	TGTGAGGAGGACAAATGCCAGTGACAGGTAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	144098896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	144099113	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=113,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144099113_T_A:144099113:0,1,0,1
chr7	144099115	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=113,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144099113_T_A:144099113:0,1,0,1
chr7	144099119	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=113,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144099113_T_A:144099113:0,1,0,1
chr7	144099120	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=113,75;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144099113_T_A:144099113:0,1,0,1
chr7	144101831	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	144107255	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:3,4:8,2:1,11,4,2
chr7	144150707	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:4,3,3,5
chr7	144245543	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.398:16:3,1:5,3:6,4,1,5
chr7	144288642	.	C	CAA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,1:8,1:0|1:144288642_C_CAA:144288642:4,15,0,2
chr7	144288646	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0|1:144288642_C_CAA:144288642:4,15,0,2
chr7	144288647	.	T	TTGGATTACAGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0|1:144288642_C_CAA:144288642:4,15,0,2
chr7	144304246	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=191,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	146536949	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,2,0
chr7	146805220	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr7	146997203	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=111,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,3,1
chr7	147259374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr7	147259438	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	147335933	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20,32;MFRL=104,110,77;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=5.47,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.367,0.390:11:1,2,1:1,3,2:0,2,4,5
chr7	147336243	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,1:6,4:5,9,2,3
chr7	147336262	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=118,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,0:6,4:4,10,2,2
chr7	147600595	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:147600595_T_G:147600595:4,0,0,1
chr7	147600597	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:147600595_T_G:147600595:4,0,0,1
chr7	147674880	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	147674912	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr7	147674948	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=94,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:5,3,2,2
chr7	147674978	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,1:1,3:7,2,1,3
chr7	147815310	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:147815310_A_T:147815310:2,6,1,1
chr7	147815312	.	CATT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:147815310_A_T:147815310:2,7,1,1
chr7	147844770	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:0|1:147844770_C_T:147844770:8,10,1,1
chr7	147844773	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:0|1:147844770_C_T:147844770:8,10,1,1
chr7	148080647	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr7	148106475	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:148106475_C_CTT:148106475:2,2,1,1
chr7	148106477	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:148106475_C_CTT:148106475:2,2,1,1
chr7	148106490	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:148106475_C_CTT:148106475:4,3,1,1
chr7	148131686	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,6:7,0:4,5,6,0
chr7	148131858	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=222,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	148311115	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	148312382	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr7	148312520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr7	148463860	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,5:0,2:2,1,0,7
chr7	148464675	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=244,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr7	148483760	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	148484067	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=166,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,0:3,2:3,3,1,1
chr7	148486994	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:148486994_G_A:148486994:0,1,0,1
chr7	148486998	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:148486994_G_A:148486994:0,2,0,1
chr7	148487000	.	C	CAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:148486994_G_A:148486994:0,3,0,1
chr7	148487003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:148486994_G_A:148486994:0,3,0,1
chr7	148487395	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:6,0,7,3
chr7	148494794	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr7	148495782	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:8,13,0,2
chr7	148504716	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=85,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:2,1:4,4:5,2,1,4
chr7	148504860	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:148504860_A_G:148504860:0,3,1,1
chr7	148504863	.	AC	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,1:0|1:148504860_A_G:148504860:0,3,1,1
chr7	148504870	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:148504870_A_T:148504870:0,2,0,1
chr7	148504872	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:148504870_A_T:148504870:0,2,0,1
chr7	148504874	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:148504870_A_T:148504870:0,2,0,1
chr7	148506064	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	148508833	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:1,2,1,4
chr7	148543525	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:3,3:3,1,3,2
chr7	148543693	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=85,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:1,0:1,4:0,2,0,6
chr7	148700818	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,2:1,2:0|1:148700818_C_G:148700818:6,1,3,1
chr7	148700820	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:0|1:148700818_C_G:148700818:6,1,3,1
chr7	148702157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr7	148702486	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=212,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0|1:148702486_A_G:148702486:1,4,1,2
chr7	148702496	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=225,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:148702486_A_G:148702486:1,5,1,1
chr7	148705221	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr7	148705273	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:10,2:11,0:13,9,1,1
chr7	148705287	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:11,10,1,1
chr7	148705306	.	T	TGGACAAGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:11,11,1,1
chr7	148705490	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=214,282;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	148712092	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:6,3,1,2
chr7	148768724	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148768724_C_A:148768724:0,1,0,1
chr7	148768749	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148768724_C_A:148768724:0,0,0,1
chr7	148801091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=67,195;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr7	148809430	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,36;MFRL=242,197;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148809430_T_C:148809430:0,1,0,1
chr7	148809433	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=242,197;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148809430_T_C:148809430:0,1,0,1
chr7	148809435	.	AATTTTTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=242,197;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:148809430_T_C:148809430:0,1,0,1
chr7	148809451	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148809430_T_C:148809430:0,0,0,1
chr7	148823366	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	148851039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=118,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:1,4:3,4,4,1
chr7	148863169	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr7	148863414	.	CAGCTCCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,2,3
chr7	148873497	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr7	148873541	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=104,248;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:11,0:13,4:9,15,2,2
chr7	148876942	.	A	ATGAC,ACCTAAGAGGACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,24,25;MFRL=175,163,229;MMQ=60,60,60;MPOS=4,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr7	148876944	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	148903984	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr7	148904343	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	148904624	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	148907825	.	AGGGAGGGGAG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GGGAG;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:2,0:7,2:6,10,1,1
chr7	148907849	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,3:5,7:2,3,3,7
chr7	148921668	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=193,46993185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:148921668_C_T:148921668:1,1,0,1
chr7	148921675	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=193,46993185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:148921668_C_T:148921668:1,1,0,1
chr7	148936762	.	A	ACGGCGG,ACGGCGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,104,99;MMQ=60,60,60;MPOS=9,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,8,9;RU=CGG;STR;TLOD=3.01,18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.217,0.682:6:0,0,2:0,1,3:0,0,6,0
chr7	149129829	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr7	149190098	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:5,3:1,1:3,4,1,3
chr7	149191027	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,14,6
chr7	149317062	.	C	CAGCCAGACAGTGGGCACTCAGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,63612;MMQ=52,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:6,10,0,2
chr7	149318610	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=103,135;MMQ=40,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.397:33:11,0:9,13:0|1:149318610_T_A:149318610:6,14,0,13
chr7	149318616	.	G	GATCTGCAGCATAGTCTACACTGCT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,38;MFRL=103,135;MMQ=40,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.436:30:9,0:8,13:0|1:149318610_T_A:149318610:6,11,0,13
chr7	149417128	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=120,207;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:149417128_TTC_T:149417128:9,2,0,2
chr7	149417133	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=120,207;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:149417128_TTC_T:149417128:9,2,0,2
chr7	149418590	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,1:2,2:5,1,3,0
chr7	149419519	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:0|1:149419519_C_T:149419519:11,9,1,1
chr7	149419527	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=81,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:149419519_C_T:149419519:10,9,1,1
chr7	149419529	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:0|1:149419519_C_T:149419519:9,9,1,1
chr7	149419908	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=135,61;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:3,0:12,10:0|1:149419908_C_T:149419908:7,8,0,10
chr7	149419918	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,61;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:3,0:12,10:0|1:149419908_C_T:149419908:8,9,0,10
chr7	149420820	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=81,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.700:11:2,2:1,5:2,1,3,5
chr7	149423118	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:149423118_C_T:149423118:7,8,1,1
chr7	149423120	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:6,0:0|1:149423118_C_T:149423118:7,8,1,1
chr7	149425678	.	T	TTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=201,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:1,0:0|1:149425678_T_TTTA:149425678:3,2,1,1
chr7	149425679	.	G	GAGCTTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=201,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:1,0:0|1:149425678_T_TTTA:149425678:3,2,1,1
chr7	149426305	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr7	149466369	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	149475230	.	GGCT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=207,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149475230_GGCT_G:149475230:0,1,0,1
chr7	149475234	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=207,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149475230_GGCT_G:149475230:0,1,0,1
chr7	149475918	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=94,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:4,4:6,1:5,7,3,2
chr7	149476666	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr7	149486574	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	149489406	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	149492368	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:149492368_T_A:149492368:2,4,1,1
chr7	149492370	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:149492368_T_A:149492368:2,4,1,1
chr7	149492373	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:149492368_T_A:149492368:2,4,1,1
chr7	149495259	.	C	CAGGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr7	149499318	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	149500472	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	149500992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:4,2,3,1
chr7	149506211	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr7	149506578	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,22;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:0,0:0|1:149506578_A_AC:149506578:1,0,0,1
chr7	149506581	.	T	TCACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:149506578_A_AC:149506578:1,0,0,1
chr7	149514720	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr7	149515959	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr7	149523420	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149523420_G_T:149523420:0,2,0,1
chr7	149523425	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149523420_G_T:149523420:0,2,0,1
chr7	149523434	.	G	GGACAATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149523434_G_GGACAATT:149523434:0,1,0,1
chr7	149523437	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149523434_G_GGACAATT:149523434:0,1,0,1
chr7	149525062	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:149525062_G_C:149525062:0,1,0,1
chr7	149525068	.	C	CTCTGCACCTCAATCCCTGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:149525062_G_C:149525062:0,1,0,1
chr7	149541926	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=130,39;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr7	149543219	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34,23;MFRL=144,174,92;MMQ=60,60,60;MPOS=23,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=6.25,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.243,0.269:14:4,3,1:2,0,3:6,1,5,2
chr7	149556489	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:1,9:4,0:4,2,9,0
chr7	149556580	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=131,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,2:0|1:149556580_C_T:149556580:3,6,1,1
chr7	149556586	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=117,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:0|1:149556580_C_T:149556580:4,7,1,1
chr7	149556588	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=117,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0|1:149556580_C_T:149556580:4,7,1,1
chr7	149558612	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=215,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0|1:149558612_G_A:149558612:0,5,3,0
chr7	149558616	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=222,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0|1:149558612_G_A:149558612:1,6,3,0
chr7	149572735	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:8,0:0|1:149572735_G_A:149572735:14,7,1,1
chr7	149572738	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:0|1:149572735_G_A:149572735:14,9,1,1
chr7	149572842	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=190,190397;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	149575747	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:1,2,3,0
chr7	149575884	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=175,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.796:11:0,3:1,5:0,2,1,8
chr7	149576818	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	150028980	.	G	GCAAGGCACCACAGCACCTGC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:2,1:6,0:4,4,1,1
chr7	150071168	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:150071168_G_C:150071168:0,3,0,1
chr7	150071169	.	A	AGTGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:150071168_G_C:150071168:0,3,0,1
chr7	150085531	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.286:32:14,4:9,4:14,9,4,5
chr7	150164155	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,0:7,6:8,3,4,2
chr7	150168058	.	A	AGAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	150171228	.	C	CCA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:5,12,0,2
chr7	150174547	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=115,42;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:150174547_C_T:150174547:13,9,1,1
chr7	150174556	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:150174547_C_T:150174547:14,7,1,1
chr7	150174560	.	T	TATA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=134,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:7,2:0|1:150174547_C_T:150174547:14,8,1,1
chr7	150174562	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:150174547_C_T:150174547:13,8,1,1
chr7	150217335	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=79,137;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:3,5,4,3
chr7	150217351	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:3,7:0,2:1,2,3,6
chr7	150269542	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=80,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:5,6,5,3
chr7	150269758	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:2,0:12,2:8,6,0,2
chr7	150269917	.	GC	AC,AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,26,23;MFRL=91,118,138;MMQ=60,60,60;MPOS=28,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.81,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,13,2:0.359,0.069:37:10,8,2:12,5,0:14,8,8,7
chr7	150384193	.	CGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=78,117;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=GT;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.644:7:2,0:1,4:2,1,0,4
chr7	150437927	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:9,0:8,5:8,9,2,3
chr7	150438089	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:1,6,1,2
chr7	150446820	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=79,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr7	150446936	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:8,2:4,5:7,5,4,3
chr7	150447071	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:8,3:12,2:6,14,1,4
chr7	150490151	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=106,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:2,1:8,1:5,5,2,0
chr7	150490376	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,2:7,5:6,4,2,5
chr7	150490797	.	GGACA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GACA;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	150493442	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,5:1,4,4,4
chr7	150499267	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,1:2,6:1,2,6,3
chr7	150500455	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:4,2:4,3:6,2,3,3
chr7	150500520	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:2,5,6,4
chr7	150501363	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150502016	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr7	150554255	.	G	GAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=139,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr7	150554785	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:4,7:0,5:2,2,5,7
chr7	150556055	.	CG	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr7	150557748	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,0:1,1,1,2
chr7	150645500	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=8,31;MFRL=151,264;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:0,0:0,1:0|1:150645500_G_C:150645500:1,0,1,0
chr7	150645504	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=151,264;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:0,0:0,0:0|1:150645500_G_C:150645500:1,0,1,0
chr7	150645509	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150645500_G_C:150645500:0,0,1,0
chr7	150645514	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150645514_T_C:150645514:0,0,1,0
chr7	150645516	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:150645514_T_C:150645514:0,0,1,0
chr7	150645519	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150645514_T_C:150645514:0,0,1,0
chr7	150645525	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=200,264;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150645514_T_C:150645514:1,0,1,0
chr7	150645682	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=237,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr7	150647237	.	CCC	GGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,1,0
chr7	150647569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	150647960	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=52,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,2,0
chr7	150649531	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=110,181;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,2:9,3:6,7,4,1
chr7	150649803	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:0|1:150649803_C_T:150649803:9,9,1,1
chr7	150649813	.	G	GCTGCAGGCACCGCGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=157,55;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:150649803_C_T:150649803:8,9,1,1
chr7	150650014	.	TGCCGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150650014_TGCCGGG_T:150650014:0,1,0,1
chr7	150650025	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150650014_TGCCGGG_T:150650014:0,1,0,1
chr7	150652419	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	150654622	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	150655624	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150655624_T_C:150655624:0,0,0,1
chr7	150655643	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150655624_T_C:150655624:0,0,0,1
chr7	150690894	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,4:10,0:8,9,2,2
chr7	150693691	.	A	ATACTCAGGAGGCGGAAGCAAGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	150696111	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:4,1:7,5,0,2
chr7	150698587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=85,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,0:6,4:5,3,0,4
chr7	150698764	.	A	AGCGCCCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr7	150706383	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:3,3:3,2:2,5,1,5
chr7	150706412	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=134,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:150706412_ACC_A:150706412:0,4,0,1
chr7	150706419	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=134,91;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:150706412_ACC_A:150706412:0,4,0,1
chr7	150708089	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,5:2,3:3,3,6,2
chr7	150710754	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:150710754_G_C:150710754:0,1,1,0
chr7	150710761	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:150710754_G_C:150710754:0,1,1,0
chr7	150710766	.	CGCG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150710754_G_C:150710754:0,1,1,0
chr7	150710773	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:150710754_G_C:150710754:0,1,1,0
chr7	150713318	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=150,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr7	150713902	.	G	GC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=99.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.970:28:0,15:0,13:0,0,15,13
chr7	150714029	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150714029_GGC_G:150714029:0,0,0,1
chr7	150714033	.	G	GAGAAACTCATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=104,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:150714029_GGC_G:150714029:1,0,0,1
chr7	150714035	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=104,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150714029_GGC_G:150714029:1,0,0,1
chr7	150714039	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,21;MFRL=134,98;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:150714029_GGC_G:150714029:2,0,0,1
chr7	150715077	.	AC	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:150715077_AC_GT:150715077:8,7,1,1
chr7	150715086	.	G	GCTAAGTTGTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:150715077_AC_GT:150715077:8,8,1,1
chr7	150720902	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:0,3:3,2:2,1,1,4
chr7	150731338	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=26,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:4,2,3,0
chr7	150731933	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.223:11:2,0:6,2:0|1:150731933_C_CT:150731933:4,5,1,1
chr7	150731934	.	C	CACACCTGTAAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:6,2:0|1:150731933_C_CT:150731933:4,6,1,1
chr7	150733212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:8,6,2,0
chr7	150737711	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:7,2:6,8,0,2
chr7	150741039	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:5,0:4,5,1,1
chr7	150742455	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:150742455_T_G:150742455:1,6,1,1
chr7	150742458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:150742455_T_G:150742455:1,5,1,1
chr7	150742462	.	T	TGTCCTCGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,0:4,2:0|1:150742455_T_G:150742455:1,6,1,1
chr7	150747215	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=215,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr7	150747718	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.259:9:3,2:3,0:0|1:150747718_A_AT:150747718:3,4,1,1
chr7	150747719	.	C	CCTCTCCAGCACCTGTTGTTTTCTGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:4,2:3,0:0|1:150747718_A_AT:150747718:3,4,1,1
chr7	150748869	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=83,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	150751411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:0|1:150751411_G_A:150751411:9,6,1,1
chr7	150751416	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:150751411_G_A:150751411:8,5,1,1
chr7	150752066	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,3:6,4:4,3,5,2
chr7	150752433	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=78,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr7	150752947	.	GAGGGAGA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:7,0:5,10,1,1
chr7	150763555	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	150767355	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr7	150771716	.	C	CTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	150773072	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=91,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:8,2,4,1
chr7	150773807	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=111,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,4:3,1:4,3,2,3
chr7	150775226	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr7	150813963	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,1:7,2:4,17,2,1
chr7	150814637	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,113;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,3:4,0:5,8,3,0
chr7	150825567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr7	150825839	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr7	150864057	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	150873608	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:9,4:9,5:10,8,5,4
chr7	150878466	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:7,0:9,5:6,11,0,5
chr7	150883892	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,2:4,3,4,2
chr7	150905240	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:2,2:2,0:0|1:150905240_G_T:150905240:3,1,1,1
chr7	150905243	.	G	GCAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,1:1,0:0|1:150905240_G_T:150905240:3,1,1,1
chr7	150905245	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=112,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:150905240_G_T:150905240:2,1,0,1
chr7	150912057	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,105;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:11,3:10,12,2,1
chr7	150913063	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=83,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,3:14,0:11,6,2,1
chr7	150913083	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:4,2:15,0:0|1:150913083_G_T:150913083:12,8,1,1
chr7	150913086	.	TT	CC	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:12,0:0|1:150913083_G_T:150913083:11,7,1,1
chr7	150913089	.	T	TAATAACCC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,2:10,0:0|1:150913083_G_T:150913083:11,6,1,1
chr7	150913121	.	AA	TC	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=168,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:4,0:2,2:5,18,1,1
chr7	150915354	.	A	ACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150915354_A_ACCC:150915354:0,1,0,1
chr7	150915355	.	A	AAATGTTAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150915354_A_ACCC:150915354:0,1,0,1
chr7	150916114	.	CAGG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:6,4,1,1
chr7	150923575	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=90,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:150923575_G_C:150923575:6,7,1,1
chr7	150923580	.	AGGGAGCC	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:4,2:0|1:150923575_G_C:150923575:6,9,1,1
chr7	150923589	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:150923575_G_C:150923575:5,9,1,1
chr7	150923593	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,1:0|1:150923575_G_C:150923575:5,9,1,1
chr7	150932639	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:2,5,0,2
chr7	150933648	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:8,0:12,2:6,14,1,1
chr7	150934975	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:1,5,2,3
chr7	150937377	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr7	150938690	.	TGCAGCCCCA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,2:5,0:6,7,1,1
chr7	150939193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:1,6:7,0:6,2,4,2
chr7	150939359	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,6,14
chr7	150939396	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr7	150939408	.	G	GAGGCCTGGGGAGACCCTTGTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	150940657	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	150940728	.	CT	AG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:7,5,1,1
chr7	150940730	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=137,76755494;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:7,2:3,0:7,3,0,3
chr7	150940867	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr7	150945673	.	CA	TT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,113;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:3,15,0,2
chr7	151048484	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=80,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.349:38:16,4:9,9:13,12,8,5
chr7	151049818	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:4,2,8,2
chr7	151053043	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,4:3,4:2,2,2,6
chr7	151137104	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	151164348	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=47,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,6:2,4:1,3,3,7
chr7	151168415	.	CAAT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:1,9:7,10:9,2,15,4
chr7	151254175	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=410,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	151254445	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	151262305	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr7	151266006	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	151273615	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=167,190;MMQ=59,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr7	151273648	.	ACC	GTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=179,196;MMQ=56,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	151292395	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	151478602	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	151483445	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	151483577	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,0:1,4:5,4,1,3
chr7	151573549	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:1,0,6,0
chr7	151668224	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	151668225	.	A	AGAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=126,170;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr7	151680313	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=206,141;MMQ=36,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,1,0,1
chr7	151680323	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=206,141;MMQ=36,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,1,0,1
chr7	151680326	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=193,141;MMQ=38,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,2,0,1
chr7	151680328	.	TC	AT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=193,141;MMQ=38,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,2,0,1
chr7	151680332	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=193,141;MMQ=38,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,2,0,1
chr7	151680338	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=193,141;MMQ=38,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151680313_A_C:151680313:0,2,0,1
chr7	151684168	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	151815907	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=206,279;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr7	151818777	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,7,17
chr7	151842413	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,0:2,6:0,4,0,6
chr7	151860089	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:10,6,2,0
chr7	151871413	.	A	ACTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=221,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151871413_A_ACTGG:151871413:0,1,0,1
chr7	151871415	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=221,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151871413_A_ACTGG:151871413:0,1,0,1
chr7	151871417	.	T	TACACTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=221,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:151871413_A_ACTGG:151871413:0,1,0,1
chr7	151917904	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=211,62;MMQ=55,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:151917904_G_T:151917904:1,3,1,1
chr7	151917906	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=211,62;MMQ=55,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:151917904_G_T:151917904:1,3,1,1
chr7	151917909	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=189,62;MMQ=50,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:151917904_G_T:151917904:1,2,1,1
chr7	151917915	.	T	TTGTCCAGAGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=189,62;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151917904_G_T:151917904:1,2,0,1
chr7	151919159	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:4,1:8,2:2,10,0,3
chr7	151921099	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=159,165;MMQ=49,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:17,4:6,1:13,10,4,1
chr7	151921606	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=116,83;MMQ=49,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:15,0:7,4:10,13,2,2
chr7	151921636	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,83;MMQ=27,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.268:16:7,0:5,4:6,6,2,2
chr7	151921652	.	A	AGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=164,83;MMQ=27,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:4,3,0,2
chr7	151926935	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=126,166;MMQ=40,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,5:1,5:2,1,10,0
chr7	151926945	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=136,172;MMQ=24,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,5:9,4:15,1,9,0
chr7	151926977	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=146,163;MMQ=24,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.357:54:17,11:18,8:29,6,16,3
chr7	151927021	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=130,126;MMQ=24,24;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,33:0.597:55:13,11:8,18:13,9,25,8
chr7	151927023	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=127,127;MMQ=24,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.102:56:22,3:27,2:35,16,4,1
chr7	151927025	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=127,132;MMQ=24,24;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.125:58:23,3:26,3:37,14,5,2
chr7	151927026	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=132,126;MMQ=24,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.492:59:16,11:13,16:20,10,22,7
chr7	151927067	.	T	C	.	.	DP=117;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=116,112;MMQ=24,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,22:0.192:117:44,11:51,11:52,43,12,10
chr7	151927127	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=9;MBQ=23,31;MFRL=126,131;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.455:62:15,9:18,19:1,33,0,28
chr7	151932808	.	TTA	T	.	.	DP=65;ECNT=9;MBQ=24,22;MFRL=134,113;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.179:59:26,6:19,4:38,11,4,6
chr7	151932819	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=24,28;MFRL=137,122;MMQ=52,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,25:0.394:64:25,11:13,14:27,12,20,5
chr7	151932824	.	A	T	.	.	DP=65;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=146,119;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,17:0.272:64:22,13:24,4:38,9,8,9
chr7	151932830	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=28,23;MFRL=133,144;MMQ=48,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,5:0.091:64:36,0:22,5:0|1:151932830_A_T:151932830:41,18,3,2
chr7	151932846	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=138,134;MMQ=48,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.099:58:30,0:21,5:0|1:151932830_A_T:151932830:36,17,3,2
chr7	151932876	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=134,201;MMQ=48,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:17,2:24,2:21,20,3,1
chr7	151932897	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=150,85;MMQ=38,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.220:43:13,2:21,7:13,21,6,3
chr7	151932908	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=24,35;MFRL=134,146;MMQ=49,30;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.261:40:11,3:19,7:18,12,0,10
chr7	151932923	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=27,27;MFRL=144,151;MMQ=40,30;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:13,1:23,3:20,17,0,4
chr7	151935730	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=117,170;MMQ=52,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,0:15,3:24,7,2,1
chr7	151935780	.	AATTTTATTTACCACTTTGATGCTCC	A	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=27,20;MFRL=142,62;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:17,0:15,2:0|1:151935780_AATTTTATTTACCACTTTGATGCTCC_A:151935780:23,22,1,1
chr7	151935798	.	GA	TG	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=34,26;MFRL=154,124;MMQ=40,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:12,6:6,4:7,11,6,4
chr7	151935809	.	TGGCAC	T	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=26,20;MFRL=142,62;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:20,0:14,2:0|1:151935780_AATTTTATTTACCACTTTGATGCTCC_A:151935780:16,21,1,1
chr7	151935817	.	CCAGGAAGCTGCCTGGGTTTAAAAATTTCCCGACCTTCTGAAATGTCTGGGGACCAGGAAGGTGGGCTCACTGTATTATGGGTACTCCAAGCCCCCTAGGATATGGCAGTTGAGAAAATAGATGTGTAAAACTCAGCAACATAAAAGGTCAAAGCCAGCAACTAAGGAATTTTAGAACAGCAAAAACAAATGCAAACGT	C	.	.	DP=89;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=134,62;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,2:0.033:89:22,0:15,2:0|1:151935780_AATTTTATTTACCACTTTGATGCTCC_A:151935780:33,54,1,1
chr7	151935866	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=20,23;MFRL=82,116;MMQ=50,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.406:35:13,5:8,9:0|1:151935866_G_A:151935866:10,11,5,9
chr7	151935871	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=25,22;MFRL=84,116;MMQ=50,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:14,5:8,9:0|1:151935866_G_A:151935866:9,13,5,9
chr7	151935888	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=27,22;MFRL=108,97;MMQ=50,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:11,3:6,5:8,9,3,5
chr7	151935906	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=27,26;MFRL=135,144;MMQ=37,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,2:6,1:8,6,1,2
chr7	151935962	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=24,28;MFRL=128,164;MMQ=25,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:7,1:2,9,1,1
chr7	151935992	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=26,31;MFRL=154,283;MMQ=25,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:1,8,0,2
chr7	151944981	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=157,197;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,4:9,4:20,0,8,0
chr7	151945007	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=131,145;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.291:39:15,4:13,7:23,5,9,2
chr7	151945071	.	G	GT	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=131,131;MMQ=52,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.204:62:32,6:18,6:29,21,6,6
chr7	151945101	.	G	C	.	.	DP=100;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=135,98;MMQ=49,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,33:0.349:95:38,19:24,14:32,30,17,16
chr7	151945140	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=105,107;MMQ=51,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,18:0.197:94:48,12:28,6:32,44,8,10
chr7	151945167	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=108,104;MMQ=49,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.248:46:25,8:10,3:13,22,4,7
chr7	151962068	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=185,137;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0|1:151962068_T_C:151962068:8,0,3,0
chr7	151962077	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=171,137;MMQ=56,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0|1:151962068_T_C:151962068:8,0,3,0
chr7	151962113	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=133,100;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,1:11,3:14,2,3,1
chr7	151970705	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=138,150;MMQ=39,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:20,1,2,0
chr7	151970758	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=119,124;MMQ=52,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,4:0.058:83:37,2:41,2:56,23,3,1
chr7	151970775	.	C	G	.	.	DP=98;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=113,134;MMQ=52,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,13:0.147:93:37,8:43,5:53,27,7,6
chr7	151970777	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=114,147;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,5:0.060:95:45,1:45,4:59,31,2,3
chr7	151971043	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=154,99;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.756:10:1,5:1,3:0,2,4,4
chr7	151971052	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=158,85;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,5:0,3:0,1,4,5
chr7	152346007	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:4,0:6,6,2,1
chr7	152373233	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,4:2,2:1,1,0,6
chr7	152511598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	152511781	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=154,151;MMQ=40,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr7	152550499	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr7	153750131	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	154002608	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:5,3,2,0
chr7	154143370	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:13,2:8,16,1,1
chr7	154172171	.	CC	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:154172171_CC_GA:154172171:0,4,1,0
chr7	154172176	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:154172171_CC_GA:154172171:1,2,0,1
chr7	154172177	.	T	TCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:154172171_CC_GA:154172171:1,2,0,1
chr7	154172180	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:154172171_CC_GA:154172171:0,3,1,0
chr7	154429657	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	154561026	.	G	GTGACTTCATTGGTGGATACAGATGCTAGTTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=39,20;MFRL=42,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.572:12:9,3:0,0:1,8,2,1
chr7	154587678	.	A	ACCATGAGAAATACATTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr7	154593192	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr7	154645406	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr7	154645576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	154667643	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,2:4,1:10,3,2,2
chr7	154681142	.	CTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.684:7:0,1:1,4:1,1,0,5
chr7	154681161	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=-1;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:1,3:0|1:154681161_G_GA:154681161:1,2,0,5
chr7	154681162	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:1,4:0|1:154681161_G_GA:154681161:1,2,0,5
chr7	154681165	.	A	AGG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0|1:154681161_G_GA:154681161:1,2,0,5
chr7	154760540	.	TTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTGAAAATGGATGCGGCGGCTGCTGGGGGTAAGGTTGCTGAGAGATCTGCTGC	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.091:41:13,2:12,0:0|1:154760540_TTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTGAAAATGGATGCGGCGGCTGCTGGGGGTAAGGTTGCTGAGAGATCTGCTGC_T:154760540:13,26,1,1
chr7	154760558	.	TTGCTGTGAAAATGGATGCGGCGGCTGCTGGGGGTAAGGTTGCTGAGAGATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGAGCTGCATTATCTGCTGGGGCTGAAGGTGTAAAACCGGGTGCTGCTGCTGC	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:35,7:0.119:42:4,0:6,4:1|0:154760540_TTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTGAAAATGGATGCGGCGGCTGCTGGGGGTAAGGTTGCTGAGAGATCTGCTGC_T:154760540:20,15,2,5
chr7	154782860	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	154782876	.	A	AAGATCAAGGCACTGGCAGATTCAGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=198,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	154794674	.	CCGGCCCCG	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,2:0|1:154794674_CCGGCCCCG_C:154794674:0,6,1,1
chr7	154794686	.	ACCC	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:154794674_CCGGCCCCG_C:154794674:0,5,1,1
chr7	154794691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=209,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:154794674_CCGGCCCCG_C:154794674:0,3,1,1
chr7	154988759	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154988759_G_GC:154988759:0,2,0,1
chr7	154988762	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154988759_G_GC:154988759:0,2,0,1
chr7	154988763	.	G	GGGATCCTCCCACCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154988759_G_GC:154988759:0,2,0,1
chr7	154988781	.	G	GCCCCAGCCTCCCAAAGTGCTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=204,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	155090410	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155090410_G_A:155090410:0,4,0,1
chr7	155090412	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155090410_G_A:155090410:0,4,0,1
chr7	155093200	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:5,1,2,0
chr7	155095452	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr7	155150443	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,4:0,15:0,0,9,11
chr7	155150460	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,3:0,14:0,0,6,11
chr7	155150472	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,4:0,13:0,0,7,11
chr7	155151498	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,0,4
chr7	155151510	.	C	CCCCTTTGTCCTTCCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:155151510_C_CCCCTTTGTCCTTCCT:155151510:0,2,0,1
chr7	155151514	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:155151510_C_CCCCTTTGTCCTTCCT:155151510:0,2,0,1
chr7	155151517	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,0,3
chr7	155187691	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr7	155187889	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,8:0,6:0,1,4,10
chr7	155255241	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:7,9,2,0
chr7	155295851	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155295851_C_T:155295851:0,1,0,1
chr7	155295853	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155295851_C_T:155295851:0,1,0,1
chr7	155458014	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:1,6,2,2
chr7	155500021	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:155500021_A_AT:155500021:4,6,1,1
chr7	155500023	.	G	GTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:155500021_A_AT:155500021:4,6,1,1
chr7	155531080	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.295:32:12,4:10,5:5,18,3,6
chr7	155532444	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=92,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:3,0:7,2:7,7,0,2
chr7	155532589	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=96,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,2:15,0:0|1:155532589_C_T:155532589:12,11,1,1
chr7	155532611	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=80,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:14,2:20,0:0|1:155532589_C_T:155532589:18,17,1,1
chr7	155537990	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,0:11,6:5,12,0,6
chr7	155538094	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:6,3,2,0
chr7	155592856	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:10,2:6,0:10,6,0,2
chr7	155593413	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=113,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155593413_G_A:155593413:0,1,0,1
chr7	155593416	.	G	GCCTATGGCAGAAGCGGCCTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=113,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:155593413_G_A:155593413:0,1,0,1
chr7	155599300	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr7	156469096	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=191,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:3,1,6,1
chr7	156476903	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:7,0:2,12:3,7,0,12
chr7	156476931	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=148,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0|1:156476931_AG_CA:156476931:0,5,0,1
chr7	156476934	.	G	GTATGGGTTGGGACT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=150,257;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:0|1:156476931_AG_CA:156476931:0,4,0,1
chr7	156476950	.	A	AGACAGAAGCAATCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=213,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	156518540	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:21,3:10,0:17,14,3,0
chr7	156554959	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,1,4
chr7	156685519	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	156685545	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	156743483	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156743483_G_T:156743483:0,2,0,1
chr7	156743485	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156743483_G_T:156743483:0,2,0,1
chr7	156743488	.	A	ACTCTTTATCCAATTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156743483_G_T:156743483:0,2,0,1
chr7	156743490	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156743483_G_T:156743483:0,2,0,1
chr7	156743495	.	A	AGAACGTAGATTGTGAAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=228,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	156761751	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=115,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,5:3,3,5,1
chr7	156761913	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,2,3
chr7	156762248	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:5,5,5,2
chr7	156798328	.	GTCGTCC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=111,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCGTCC;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:5,2:6,6,1,1
chr7	156963176	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,0,2
chr7	156974127	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr7	156974375	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:5,5,4,0
chr7	156994360	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,2:3,0:1,9,3,0
chr7	157023721	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:6,3,2,1
chr7	157041345	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,1,5
chr7	157049530	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr7	157049809	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr7	157049834	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:157049834_A_G:157049834:1,2,0,1
chr7	157049835	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:157049834_A_G:157049834:1,2,0,1
chr7	157049837	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:157049834_A_G:157049834:1,2,0,1
chr7	157060350	.	C	CCTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:7,6,1,1
chr7	157060371	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:9,4:4,0:6,7,2,2
chr7	157156043	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:3,1:3,3:0,7,0,4
chr7	157202451	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	157208617	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	157333376	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,4:3,0:5,3,1,3
chr7	157333542	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.677:17:4,2:1,7:3,2,5,7
chr7	157361564	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=101,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:2,2,5,4
chr7	157367205	.	T	TGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GA;STR;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr7	157369564	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	157370645	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,4,1
chr7	157406819	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=50,121;MMQ=24,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:19,6:2,3:5,16,5,4
chr7	157873975	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,10:0,1,9,5
chr7	157903478	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr7	157926273	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	157926819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr7	157926826	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.650:1:0,1:0,0:0|1:157926826_C_CCT:157926826:0,0,0,1
chr7	157926829	.	G	GGGTCGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157926826_C_CCT:157926826:0,0,0,1
chr7	157926830	.	A	ACGTCTGGGCCCCGGGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157926826_C_CCT:157926826:0,0,0,1
chr7	157929223	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	157929246	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	157929294	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:4,2,4,1
chr7	157984992	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,2:2,4,2,2
chr7	157997792	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,2:3,0:7,0,2,0
chr7	157998054	.	CATTAAGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=234,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	158325310	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=A;STR;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,3:0|1:158325310_C_CAA:158325310:0,0,5,0
chr7	158325316	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=81,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:0|1:158325310_C_CAA:158325310:1,0,6,0
chr7	158325338	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=81,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,4:2,1,7,0
chr7	158325572	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	158424508	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	158438186	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr7	158444975	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=58,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:0,5:1,0,7,3
chr7	158445032	.	CCAA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:158445032_CCAA_C:158445032:2,6,1,1
chr7	158445039	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:0,0:6,2:0|1:158445032_CCAA_C:158445032:2,6,1,1
chr7	158445267	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	158450965	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,12,5
chr7	158451115	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,2:7,0:0|1:158451115_AG_A:158451115:0,11,1,1
chr7	158451120	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:0|1:158451115_AG_A:158451115:0,12,1,1
chr7	158455089	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	158473339	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	158476148	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	158482600	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,1:8,1:13,5,1,1
chr7	158528158	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	158528170	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr7	158534163	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr7	158552331	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	158555706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	158555739	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:10,2,1,2
chr7	158566108	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:1,8,0,3
chr7	158566138	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr7	158586330	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:2,5,2,0
chr7	158590547	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,153;MMQ=40,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	158591851	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	158664074	.	TGAAGGAGAA	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=75,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:13,2:0|1:158664074_TGAAGGAGAA_T:158664074:12,17,1,1
chr7	158664084	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=72,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:158664074_TGAAGGAGAA_T:158664074:9,13,1,1
chr7	158672476	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,28:0,22:0,0,31,19
chr7	158715219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr7	158718793	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	158726798	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,4:0,0,10,1
chr7	158727015	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr7	158727276	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	158727303	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=136,127;MMQ=42,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr7	158727316	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=131,154;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:158727316_A_G:158727316:0,3,0,1
chr7	158727321	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=154,123;MMQ=56,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:158727321_G_C:158727321:0,3,0,1
chr7	158727323	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=131,154;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:158727316_A_G:158727316:0,3,0,1
chr7	158727324	.	TGC	ACA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=154,123;MMQ=56,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:158727321_G_C:158727321:0,3,0,1
chr7	158738374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=194,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr7	158823501	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=198,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.553:7:1,2:2,2:0,3,2,2
chr7	158827326	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=71,93;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,5:3,5:4,2,8,2
chr7	158827332	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=100,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,0:7,2:0|1:158827332_A_T:158827332:11,5,1,1
chr7	158827333	.	T	TGTTCTA	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=100,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:7,2:0|1:158827332_A_T:158827332:11,5,1,1
chr7	158827401	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr7	158827414	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	158828751	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=131,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:0,6,0,3
chr7	158835631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	158935333	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	158937397	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=82,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158937397_T_C:158937397:0,1,0,1
chr7	158937400	.	CGGGCGCACTCACGGGGGCGAGCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=82,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158937397_T_C:158937397:0,1,0,1
chr8	194596	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.621:11:2,2:2,4:3,1,4,3
chr8	400168	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=61,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr8	413193	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr8	417836	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:4,1:1,4:0,6,2,3
chr8	418858	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr8	494658	.	GGGCGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GGC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	623413	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,333;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.274:29:9,0:12,6:10,11,8,0
chr8	623698	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=132,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,2:9,1:5,18,3,0
chr8	642658	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.229:46:15,0:21,10:10,26,0,10
chr8	1497432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=91,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr8	1616675	.	CGGA	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:9,2:16,0:0|1:1616675_CGGA_C:1616675:14,12,1,1
chr8	1616680	.	AGCCT	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:14,0:0|1:1616675_CGGA_C:1616675:15,11,1,1
chr8	1616690	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,1:11,0:0|1:1616675_CGGA_C:1616675:14,8,1,1
chr8	1624817	.	CCGAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=183,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGAG;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr8	1645536	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr8	1791638	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:9,2:1,1:4,6,0,3
chr8	1791663	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:7,2:1,1:0|1:1791663_G_A:1791663:2,6,0,3
chr8	1791672	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,1:2,1:0|1:1791663_G_A:1791663:1,7,0,3
chr8	1806309	.	A	AGTCCCCAGGTGGGTCCCCAGGTGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=76,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=GTCCCCAGGTGG;STR;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.824:16:0,7:2,5:1,1,2,12
chr8	1812544	.	CCAGAAGTCA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:10,2:16,7,1,1
chr8	1817314	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:13,4:9,10:12,10,12,2
chr8	1828178	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:4,3,2,3
chr8	1830794	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.619:40:5,14:10,11:11,4,14,11
chr8	1830928	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr8	1833690	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=60617123,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=T;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr8	1846688	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,4:2,3:1,2,5,2
chr8	1857432	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:1,2:7,3:7,2,4,1
chr8	1857542	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:11,1:15,2:15,13,2,1
chr8	1857693	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:5,2:3,3:0|1:1857693_A_G:1857693:2,6,0,6
chr8	1857701	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,1:2,4:0|1:1857693_A_G:1857693:2,5,0,5
chr8	1873540	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=108,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:6,4,5,6
chr8	1900855	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr8	1953194	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,9:5,5:6,6,6,8
chr8	1953642	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr8	1953759	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,5:2,9:3,0,9,5
chr8	1998864	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=77,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,2:8,3:8,8,2,3
chr8	2005675	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:1,1,3,1
chr8	2007230	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	2017705	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=0,174;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr8	2024207	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,3:0,0,10,6
chr8	2024405	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,2:2,6:1,1,2,6
chr8	2024437	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=69,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0|1:2024437_C_T:2024437:0,1,0,2
chr8	2024446	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:2024437_C_T:2024437:0,0,0,2
chr8	2040104	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:2,0,3,2
chr8	2040298	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=75,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,8:2,9:4,3,7,10
chr8	2040401	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=290,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	2044363	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:0,2,0,8
chr8	2046880	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr8	2048640	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.748:18:1,6:3,7:3,1,11,3
chr8	2050383	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr8	2053942	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr8	2054012	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0,0,8,5
chr8	2054171	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:2,8,2,4
chr8	2054195	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:1,6,3,3
chr8	2056569	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,2:2,6:1,4,5,3
chr8	2057090	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	2063920	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr8	2064105	.	T	TGTCAAACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr8	2064121	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	2065625	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:7,3,3,1
chr8	2065675	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.262:32:8,8:16,0:8,16,8,0
chr8	2071261	.	A	AGAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,3:0,2,3,6
chr8	2071306	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0|1:2071306_A_G:2071306:1,2,4,1
chr8	2071309	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0|1:2071306_A_G:2071306:1,2,4,1
chr8	2077072	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,2:3,6:6,1,6,2
chr8	2088705	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:10,7,1,1
chr8	2091402	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,0:9,3:5,19,1,2
chr8	2796277	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr8	2813083	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:2,2:13,3:10,5,4,1
chr8	2836102	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:5,1,2,4
chr8	2876231	.	CCAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=291,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAAA;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	2909992	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,2:8,3:6,10,3,2
chr8	2910020	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr8	2910223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	2954348	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr8	2964003	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr8	2964206	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,4:0,0:0,5,0,4
chr8	2965209	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr8	2965244	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:6,0:3,9:3,7,5,4
chr8	2966072	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr8	2966328	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=77,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr8	2967639	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr8	2967905	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	2999929	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	3000081	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:0|1:3000081_G_A:3000081:10,9,1,1
chr8	3000087	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:8,2:0|1:3000081_G_A:3000081:11,9,1,1
chr8	3000088	.	G	GGTGGAAGTATATGT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:9,2:0|1:3000081_G_A:3000081:11,9,1,1
chr8	3008901	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=177,99;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr8	3045394	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=94,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,3:15,0:7,17,3,0
chr8	3047380	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	3057329	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=84,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr8	3072302	.	T	TACCTGTGTATGTCTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=212,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.440:2:1,1:0,0:0|1:3072302_T_TACCTGTGTATGTCTG:3072302:0,1,0,1
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chr8	3087809	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr8	3141586	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
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chr8	3165777	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:4,1,3,0
chr8	3165814	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,8,4
chr8	3200977	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,8:4,2:0,9,2,8
chr8	3201012	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr8	3201034	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	3224476	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr8	3224784	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=285,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3224784_CGG_C:3224784:0,1,0,1
chr8	3224793	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=285,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3224784_CGG_C:3224784:0,1,0,1
chr8	3224797	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,29;MFRL=285,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3224784_CGG_C:3224784:0,1,0,1
chr8	3224798	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=285,138;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3224784_CGG_C:3224784:0,1,0,1
chr8	3226696	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=223,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr8	3226741	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:7,0:1,4:7,1,1,3
chr8	3226899	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:4,13,0,2
chr8	3226919	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr8	3263528	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,8,5
chr8	3351264	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,3:9,3:6,9,1,5
chr8	3432560	.	C	CAAGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:0|1:3432560_C_CAAGG:3432560:9,10,1,1
chr8	3432561	.	C	CTATGAATTG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:12,2:7,0:0|1:3432560_C_CAAGG:3432560:9,10,1,1
chr8	3474342	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:1,5,0,3
chr8	3566106	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	3855369	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.714:8:0,3:2,2:2,0,5,1
chr8	3855658	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,1:0,6,1,3
chr8	4277591	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:4277591_A_T:4277591:0,0,0,1
chr8	4277593	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=176,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4277591_A_T:4277591:0,1,0,1
chr8	4277597	.	A	ATGTGCTTTATGCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=176,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4277591_A_T:4277591:0,1,0,1
chr8	4495081	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,8,0,2
chr8	4495083	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,8,0,2
chr8	4495085	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=26,33;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,9,0,2
chr8	4495087	.	G	GTT	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,9,0,2
chr8	4495089	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=34,25;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,9,0,2
chr8	4495093	.	ACACACAC	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=25,22;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:4495081_C_T:4495081:0,7,0,2
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chr8	4495124	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4495118_TG_CT:4495118:0,3,0,1
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chr8	6266774	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.695:34:5,12:5,12:5,5,15,9
chr8	6272185	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	6272399	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:7,7:2,3:5,4,4,7
chr8	6272457	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr8	6272477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:6272477_A_G:6272477:0,0,0,5
chr8	6272481	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:6272477_A_G:6272477:0,0,0,5
chr8	6296550	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,7,8
chr8	6299532	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:7,1,2,0
chr8	6335208	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr8	6357307	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr8	6371114	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=200,203;MMQ=40,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr8	6371129	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=200,186;MMQ=40,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:6371129_C_T:6371129:2,0,3,0
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chr8	6372112	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr8	6372172	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=100,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:4,1,6,2
chr8	6378763	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=98,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.593:30:7,10:4,8:6,6,11,7
chr8	6389889	.	C	A,G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28,20;MFRL=0,137,86;MMQ=60,60,60;MPOS=17,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=36.04,24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,12:0.519,0.447:26:0,11,4:0,3,8:0,0,15,11
chr8	6390095	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=235,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr8	6420534	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	6478986	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:8,2:10,14,2,0
chr8	6500544	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=178,77;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:3,4:1,5:4,0,5,4
chr8	6582485	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=99.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,15,17
chr8	6588392	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.628:9:3,1:0,4:0,3,0,6
chr8	6614606	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr8	6673377	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,16,12
chr8	6682861	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,4:6,3:3,13,2,5
chr8	6690173	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr8	6690215	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,11,7
chr8	6735423	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,15:0.728:20:4,9:1,6:0|1:6735423_C_G:6735423:0,5,5,10
chr8	6735431	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.737:17:2,6:0,6:0|1:6735423_C_G:6735423:0,4,3,10
chr8	6735485	.	A	AAGTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,22;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	6783622	.	T	TGTGATAACTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr8	6793540	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,13,6
chr8	6793581	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,4,4
chr8	6794207	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:1,0,5,2
chr8	6873446	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=182,172;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr8	6913125	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	7191503	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=126,71;MMQ=29,28;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:5,2,1,1
chr8	7191554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=63,141;MMQ=30,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:7191554_C_T:7191554:3,1,0,1
chr8	7191556	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=63,141;MMQ=30,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7191554_C_T:7191554:3,1,0,1
chr8	7191558	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=63,141;MMQ=30,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:7191554_C_T:7191554:3,1,0,1
chr8	7230810	.	A	ATCAACAGAGAGCCAAATCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=171,102;MMQ=27,28;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	7308798	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=122,188;MMQ=34,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,0:2,6:0,2,0,6
chr8	7320334	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=238,104;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr8	7340323	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=143,148;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:13,2:5,2:8,10,0,4
chr8	7343806	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,139;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	7686317	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=131,137;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:5,1:1,0:0|1:7686317_C_T:7686317:3,3,0,2
chr8	7686323	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=131,137;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0|1:7686317_C_T:7686317:0,3,0,2
chr8	7698527	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr8	8185816	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:6,11,0,3
chr8	8234113	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=51,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,3:5,3:7,4,3,3
chr8	8234868	.	C	CGCCGCT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCCGCT;STR;TLOD=90.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.925:23:0,12:1,9:0,1,14,8
chr8	8559832	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	8559898	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,3,2
chr8	8560197	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr8	8560536	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=228,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr8	8560602	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr8	8561312	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=95,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:6,7:8,9:6,8,9,7
chr8	8561391	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.488:18:4,3:5,6:7,2,5,4
chr8	8561399	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:7,3,6,4
chr8	8561442	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.647:29:5,9:5,8:0|1:8561442_A_G:8561442:3,7,9,10
chr8	8561452	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:5,9:4,9:0|1:8561442_A_G:8561442:3,7,11,8
chr8	8655023	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=196,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,6:1,8:0,3,4,10
chr8	8747537	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=89,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.682:23:4,6:3,10:5,2,9,7
chr8	8750467	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,1,1
chr8	8869035	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.189:28:12,2:11,2:11,12,4,1
chr8	8869277	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr8	8887542	.	TAAC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=206,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,2,6
chr8	8887566	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=139,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr8	8999187	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:1,5,3,6
chr8	9413536	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,0:8,3:0,11,0,3
chr8	9563797	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31,33,33;MFRL=47,91,144,127;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,14,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.79,9.32,40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,4,6,22:0.089,0.168,0.620:36:0,3,3,11:4,1,2,10:2,2,14,18
chr8	9577794	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,4:0|1:9577794_A_AT:9577794:0,0,7,0
chr8	9577804	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:9577794_A_AT:9577794:0,0,7,0
chr8	9593048	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:1,9,0,2
chr8	9593081	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	9609355	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:0|1:9609355_A_T:9609355:0,13,1,1
chr8	9609362	.	T	TCGGGGATAAAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:9609355_A_T:9609355:0,8,1,1
chr8	9619232	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9619232_A_AAT:9619232:0,1,0,1
chr8	9619236	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9619232_A_AAT:9619232:0,1,0,1
chr8	9620621	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,85;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:9,6,3,0
chr8	9623993	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:0,0:0,1:0,5,1,2
chr8	9761073	.	A	ATGAAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr8	9912220	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,6:0,1:0,1,1,6
chr8	9953537	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=94,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:7,4:15,0:9,13,2,2
chr8	10285810	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=188,75;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,3,4
chr8	10285825	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr8	10383335	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10383335_C_A:10383335:0,1,0,1
chr8	10383342	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10383335_C_A:10383335:0,1,0,1
chr8	10383345	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10383335_C_A:10383335:0,1,0,1
chr8	10388749	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:4,9:3,5:6,2,10,4
chr8	10396054	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:0,4,3,4
chr8	10396398	.	A	AGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10396398_A_AGTGC:10396398:1,0,0,1
chr8	10396399	.	A	AGTGGCGCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,23;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:10396398_A_AGTGC:10396398:1,0,0,1
chr8	10465012	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=95,79;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.460:32:13,2:3,9:7,10,9,6
chr8	10465097	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,95;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.306:43:12,5:18,7:14,16,7,6
chr8	10465748	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,41:0.655:63:4,21:15,20:0|1:10465748_T_C:10465748:12,10,26,15
chr8	10465771	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=202.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,60:0.984:60:0,26:0,27:0|1:10465748_T_C:10465748:0,0,31,29
chr8	10467589	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=79,76;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,25:0.473:58:6,5:16,14:0|1:10467589_T_C:10467589:8,25,8,17
chr8	10467604	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=79,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.479:55:11,6:16,15:0|1:10467589_T_C:10467589:8,23,6,18
chr8	10467652	.	GC	CT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,1:11,4:0|1:10467652_GC_CT:10467652:1,22,0,5
chr8	10467673	.	CC	AT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=104,59;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,1:0|1:10467652_GC_CT:10467652:2,19,0,2
chr8	10467890	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=92,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:19,0:13,3:13,19,0,3
chr8	10468500	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=84,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:0|1:10468500_G_A:10468500:10,9,1,1
chr8	10468509	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=84,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:9,1:9,0:0|1:10468500_G_A:10468500:9,9,1,1
chr8	10468979	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=244,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,3:0,0:2,1,1,2
chr8	10469415	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=150,196;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,0:7,4:7,8,4,0
chr8	10474128	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=262,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:2,2:0,3,0,2
chr8	10480755	.	G	GAATAATAAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	10480798	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	10532355	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr8	10532401	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.908:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	10583203	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr8	10583506	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=96,108;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:8,7:13,7:12,9,9,5
chr8	10677601	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	10683623	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=26160723,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,1:1,6:0,2,6,2
chr8	10683776	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:2,4:1,3:0,3,1,6
chr8	10689142	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,4,0
chr8	10689291	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=116,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:10689291_T_C:10689291:1,11,0,2
chr8	10689293	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=116,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:10689291_T_C:10689291:1,11,0,2
chr8	10689295	.	T	TGGCCAACAGC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=116,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:10689291_T_C:10689291:1,11,0,2
chr8	10690319	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr8	10690543	.	CAGA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr8	10692158	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,20,7
chr8	10692359	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:10692359_C_T:10692359:0,0,0,4
chr8	10692362	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=214,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:10692359_C_T:10692359:0,2,0,1
chr8	10782431	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10782431_A_C:10782431:0,1,0,1
chr8	10782433	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10782431_A_C:10782431:0,1,0,1
chr8	10782438	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10782431_A_C:10782431:0,1,0,1
chr8	10782440	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=229,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10782431_A_C:10782431:0,1,0,1
chr8	11142389	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,3:3,2:4,0,2,3
chr8	11142625	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:0,1,3,7
chr8	11157460	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=69,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr8	11157601	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:18,0:8,22,0,2
chr8	11281829	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=183,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:2,1,3,1
chr8	11281964	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=94,47;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:19,0:21,3:22,18,0,3
chr8	11282020	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:14,0:11,6:9,17,0,6
chr8	11301473	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:3,0:5,1,3,0
chr8	11301479	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:3,0:6,1,3,0
chr8	11301483	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,3:3,0:0|1:11301483_C_G:11301483:7,1,3,0
chr8	11301485	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,3:3,0:0|1:11301483_C_G:11301483:7,1,3,0
chr8	11301558	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=98,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:12,5:13,0:10,15,0,5
chr8	11301837	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:8,3:10,7,3,0
chr8	11301859	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,0:10,4:9,14,3,1
chr8	11400680	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr8	11405437	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	11406593	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,11,6
chr8	11415572	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,4,9
chr8	11415597	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr8	11418766	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:5,0,7,0
chr8	11629119	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.848:11:1,7:0,3:0|1:11629119_T_C:11629119:0,1,0,10
chr8	11629129	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0|1:11629119_T_C:11629119:0,5,0,5
chr8	11637396	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=103,106;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:14,5:14,0:15,13,5,0
chr8	11640611	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=191,163;MMQ=56,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,4:1,3:5,3,6,1
chr8	11666451	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	11687938	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:11687938_G_C:11687938:0,0,3,9
chr8	11687959	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0|1:11687938_G_C:11687938:1,3,1,5
chr8	11689228	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=85,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr8	11695872	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,299;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.780:25:1,6:4,14:3,2,19,1
chr8	11703191	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=96,41;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:10,7,1,1
chr8	11705139	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:3,1:7,1,4,0
chr8	11705342	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,11,16
chr8	11705380	.	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr8	11705677	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:3,8,1,7
chr8	11708355	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=99,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:3,3:6,3:6,5,5,2
chr8	11710301	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	11710974	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=59,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,0,9
chr8	11831948	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	11851511	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=103,57;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:11851511_A_C:11851511:6,7,0,2
chr8	11851515	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=103,57;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:11851511_A_C:11851511:6,7,0,2
chr8	11851583	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=74,240;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:4,0:5,3:4,5,0,4
chr8	11853805	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:6,3:10,0:5,12,1,2
chr8	11995938	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=176,141;MMQ=24,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,6,1
chr8	12044145	.	A	AGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,128;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	12580568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=164,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:2,2,3,3
chr8	12583221	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,6:8,0:10,8,6,0
chr8	12589179	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr8	12592956	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,3,14
chr8	12598337	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr8	12600622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr8	12870160	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr8	12870438	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	12878807	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr8	12878821	.	G	GTCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,2:1,0:2,5,1,1
chr8	12879062	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr8	12879099	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr8	12879334	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr8	12879539	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr8	12879694	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=213,94;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,6:0,6:0,1,6,7
chr8	12879707	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr8	12880105	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,19:0,6:0,0,13,12
chr8	12880521	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,14:0,18:0,0,16,17
chr8	12881554	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=106,96;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:12881554_T_G:12881554:11,3,1,1
chr8	12881559	.	T	TGTGTTG	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=106,96;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.191:14:6,0:3,1:0|1:12881554_T_G:12881554:10,2,1,1
chr8	12881645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=203,168;MMQ=51,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:12881645_C_T:12881645:0,4,0,1
chr8	12881648	.	GT	AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,22;MFRL=203,168;MMQ=51,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:12881645_C_T:12881645:0,4,0,1
chr8	12881653	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=203,168;MMQ=51,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:12881645_C_T:12881645:0,4,0,1
chr8	12881678	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=227,201;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12881678_A_G:12881678:0,1,0,1
chr8	12881681	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=227,201;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12881678_A_G:12881678:0,1,0,1
chr8	12883488	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.236:14:5,2:6,1:5,6,1,2
chr8	12883507	.	GATTTTAAATTAAATTAATACATATATAC	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=145,44;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:5,2:0|1:12883507_GATTTTAAATTAAATTAATACATATATAC_G:12883507:10,8,1,1
chr8	12883537	.	AGTTTGGAGGAGAACAGAAGTTCTAACTCAGTACTTGAACTTGGTGGGG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.122:23:7,0:4,2:0|1:12883507_GATTTTAAATTAAATTAATACATATATAC_G:12883507:13,8,1,1
chr8	12884653	.	CCTGCTGTGTGCTGGATACACAGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=189,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.418:15:5,2:3,4:4,5,3,3
chr8	12885317	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr8	12950088	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,2:7,0,6,0
chr8	12952174	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.612:13:2,4:3,4:5,0,8,0
chr8	12956181	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	12957597	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:12957597_C_T:12957597:9,4,1,1
chr8	12957606	.	GA	TC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:8,2:0|1:12957597_C_T:12957597:12,5,1,1
chr8	12957613	.	T	TCAGCCTCCTGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,0:9,2:0|1:12957597_C_T:12957597:12,5,1,1
chr8	13251235	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr8	13258936	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	13356802	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr8	13356818	.	TT	CG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr8	13356835	.	G	GATCTTCCCGGCCTGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:13356835_G_GATCTTCCCGGCCTGAC:13356835:1,2,0,1
chr8	13356839	.	T	TGCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:13356835_G_GATCTTCCCGGCCTGAC:13356835:1,2,0,1
chr8	13356840	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:13356835_G_GATCTTCCCGGCCTGAC:13356835:1,2,0,1
chr8	13357587	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr8	13424583	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr8	13425353	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,12,10
chr8	13965581	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	14094993	.	A	AAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=142,142;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAC;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,0:1,3:2,0,4,0
chr8	14095199	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:8,4:6,9:0,14,2,11
chr8	14095250	.	A	T,AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29,23;MFRL=0,163,173;MMQ=60,60,60;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.06,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.407,0.512:7:0,0,2:0,3,2:0,0,0,7
chr8	14412381	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=86,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:23,0:27,3:35,15,0,3
chr8	15508200	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=77,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:5,3:1,11:4,2,8,6
chr8	15615179	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:4,3:7,0,4,0
chr8	15978189	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr8	16007649	.	GTATATATATATA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,133;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,10;RU=TA;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:0,1:2,1:4,2,2,0
chr8	16026443	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=561,200;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026443_C_T:16026443:0,1,0,1
chr8	16026448	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=561,200;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026443_C_T:16026443:0,1,0,1
chr8	16026459	.	CCGTT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=561,200;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026443_C_T:16026443:0,1,0,1
chr8	16026468	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=561,200;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026443_C_T:16026443:0,1,0,1
chr8	16850498	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	16942829	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=110,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:13,2:0|1:16942829_T_C:16942829:12,17,1,1
chr8	16942836	.	A	AAC	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:12,2:0|1:16942829_T_C:16942829:11,17,1,1
chr8	16942837	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=95,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:5,7:12,2:7,10,2,7
chr8	16942849	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:4,7:10,3:5,9,1,9
chr8	16976298	.	TATTTGTCTAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:7,2:6,11,1,1
chr8	17042416	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=121,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr8	17063335	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:4,4:0,5:0,4,1,8
chr8	17067574	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:2,10,1,6
chr8	17068013	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=94,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.591:9:0,2:3,3:2,2,2,3
chr8	17089890	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr8	17092164	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr8	17100456	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=67,125;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.410:17:4,4:2,0:6,4,2,5
chr8	17132331	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:16,4:15,0:16,15,4,0
chr8	17143830	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,3:1,8:1,0,7,4
chr8	17159812	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:4,10,0,6
chr8	17170740	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr8	17270763	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,7,18
chr8	17396450	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,80;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,0:9,3:4,9,0,3
chr8	17401878	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	17406183	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,19,6
chr8	17406367	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.895:16:1,8:0,6:1,0,2,13
chr8	17421277	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:2,0:5,2:0|1:17421277_C_T:17421277:1,8,0,2
chr8	17421279	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:17421277_C_T:17421277:0,0,1,10
chr8	17421292	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:0|1:17421277_C_T:17421277:0,7,0,2
chr8	17422434	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr8	17434641	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	17447164	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:4,5,2,0
chr8	17486282	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr8	17503431	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,19,8
chr8	17504626	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:5,2:2,1:1,8,0,3
chr8	17532619	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	17611721	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,89;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:22,4:23,0:30,15,4,0
chr8	17612198	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:35,0:23,4:22,36,3,1
chr8	17612237	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=149,159;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,0:8,3:9,16,0,3
chr8	17726019	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr8	17731605	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:10,1:4,2:7,7,1,2
chr8	17732084	.	GC	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	17742929	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr8	17743020	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr8	17797409	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	17804665	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,13:0,9:0,0,22,0
chr8	17814915	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,7,13
chr8	17818042	.	C	CTTTTT,CTTTTTTTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,19,20;MFRL=0,158,148;MMQ=60,52,40;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,14,18;RU=T;STR;TLOD=3.27,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.293,0.607:4:0,0,0:0,0,1:0,0,0,4
chr8	17819761	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr8	17824623	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.150:44:18,6:19,0:17,21,6,0
chr8	17827260	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=99.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,6,23
chr8	17829756	.	C	CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr8	17863854	.	AG	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,16:0.234:71:28,0:27,16:19,36,0,16
chr8	17868029	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,1:0,7:0,0,7,2
chr8	17868230	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:3,0:4,7,2,0
chr8	17868245	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,2:0,0,4,9
chr8	17868919	.	G	GAGATAGAGTCTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	17871598	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=10,24;MFRL=217,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.919:21:0,10:0,8:0,1,6,14
chr8	17871604	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=12,24;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.345:15:2,1:0,3:0,10,1,4
chr8	17871619	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=39,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:4,5:1,4:0,5,1,9
chr8	17872361	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17872361_T_C:17872361:0,1,0,1
chr8	17872363	.	ACAT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:17872361_T_C:17872361:0,1,0,1
chr8	17872369	.	CC	AA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17872361_T_C:17872361:0,0,0,1
chr8	17872375	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,31;MFRL=260,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:17872361_T_C:17872361:0,1,0,1
chr8	17882872	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:8,2:9,5,3,3
chr8	17885091	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,14:0,0,15,9
chr8	17916224	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	17920807	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:17920807_A_G:17920807:0,0,1,11
chr8	17920820	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:17920807_A_G:17920807:0,0,0,8
chr8	17921921	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,8,3
chr8	17928753	.	G	GAAATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAATA;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	18074322	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	18074536	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr8	18080641	.	TAAA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr8	18080644	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,7:0,6:1,0,5,8
chr8	18080651	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,8,11
chr8	18080747	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr8	18393159	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr8	18393565	.	G	GTAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0|1:18393565_G_GTAC:18393565:0,0,0,1
chr8	18393568	.	GT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18393565_G_GTAC:18393565:0,0,0,1
chr8	18413875	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr8	18430201	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:6,2:2,1:2,6,1,2
chr8	18430219	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,1:0,1:0,6,0,2
chr8	18432578	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr8	18432714	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:15,0:7,3:11,11,0,3
chr8	18656875	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:12,0:5,4:4,14,0,4
chr8	18656888	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:6,6:2,2:1,7,2,6
chr8	18658750	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.418:22:8,5:5,4:11,2,6,3
chr8	18658929	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:18658929_C_A:18658929:0,0,0,4
chr8	18658950	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=119,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:18658929_C_A:18658929:0,1,0,3
chr8	18661932	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=224,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr8	18666210	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,15,8
chr8	18730331	.	T	TAAGTCAACACATTAGGATGCAGGAATGCCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	18793697	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,1,8
chr8	19230957	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	19252189	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr8	19277789	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:6,1,1,1
chr8	19277817	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr8	19277829	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=144,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr8	19362768	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=80,98;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:3,10:6,8:4,5,9,9
chr8	19363307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr8	19363425	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=284,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr8	19677253	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr8	19680736	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr8	19680979	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=199,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr8	19681583	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=97,80;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,0:8,4:5,16,1,3
chr8	19681647	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr8	19682545	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	19689633	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,3:4,9:2,4,3,9
chr8	19709396	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=206,48162952;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr8	19813404	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:7,3:11,0:9,9,2,1
chr8	20003431	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=110,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.635:22:5,11:3,3:1,7,3,11
chr8	20005274	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=235,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:20005274_AG_A:20005274:0,4,0,1
chr8	20005277	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=235,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:20005274_AG_A:20005274:0,4,0,1
chr8	20005439	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,0:3,8:4,1,5,3
chr8	20007100	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=CT;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr8	20008364	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=221,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr8	20028553	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.195:44:28,5:8,3:32,4,6,2
chr8	20028830	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr8	20028958	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=96,96;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:6,3:17,0:15,9,3,0
chr8	20030708	.	C	CTTTTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20030708_C_CTTTTTA:20030708:0,0,0,1
chr8	20030710	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20030708_C_CTTTTTA:20030708:0,0,0,1
chr8	20036018	.	G	GAA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.466:26:4,1:5,0:4,10,1,11
chr8	20036043	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,13:0,0,0,21
chr8	20036095	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr8	20037017	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:1,1:4,2:1,4,1,3
chr8	20068163	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,7,10
chr8	20068191	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=155,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:1,4,1,6
chr8	20068619	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:4,2,3,0
chr8	20068903	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr8	20069273	.	A	AAGTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.312:17:5,2:6,3:2,10,1,4
chr8	20077915	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,9:3,2:5,5,2,9
chr8	21550711	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr8	21550768	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr8	21550800	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,7,7
chr8	21767522	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,192;MMQ=60,20;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	21827673	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:9,9:18,0:17,10,9,0
chr8	21827880	.	AACAC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,72;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AC;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:0,0:5,2:0,6,0,2
chr8	21856156	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	21859716	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:10,0:13,7:11,13,1,6
chr8	21859730	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.245:31:10,0:10,7:10,14,1,6
chr8	21862430	.	TAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=110,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.585:4:2,0:0,1:1,1,0,2
chr8	21862505	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=94,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:7,2:14,0:6,15,0,4
chr8	21890581	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:21890581_T_C:21890581:0,0,4,1
chr8	21890589	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=67,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:0|1:21890581_T_C:21890581:1,1,2,0
chr8	21890820	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=182,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21890820_G_T:21890820:0,1,0,1
chr8	21890822	.	ATTCTTG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=182,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21890820_G_T:21890820:0,1,0,1
chr8	21891939	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,12,13
chr8	21891968	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,18,16
chr8	21900488	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:21900488_C_T:21900488:7,9,1,1
chr8	21900505	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=63,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,0:1,2:0|1:21900488_C_T:21900488:5,8,1,1
chr8	21900703	.	A	AATTCAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr8	21904212	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	21924743	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr8	21924778	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
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chr8	21925249	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr8	21930007	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,6:2,1:0,7,1,6
chr8	21931141	.	CAAAAAAA	CA,C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,31,31;MFRL=156,135,164;MMQ=44,50,40;MPOS=28,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,16,15;RU=A;STR;TLOD=14.84,8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.402,0.315:10:0,0,1:2,2,2:2,1,5,2
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chr8	21931170	.	AAAAAAAAAAGAG	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.796:20:1,3:3,12:2,3,2,13
chr8	21931200	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=135,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:4,7:15,9:5,15,6,12
chr8	21931426	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr8	21937667	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,1:6,6:9,3,5,2
chr8	21937870	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,3,1
chr8	21938850	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:3,8,2,0
chr8	21938983	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.525:27:2,4:8,9:5,8,8,6
chr8	21955552	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:5,12:3,4:3,5,10,6
chr8	21956885	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=113,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.252:34:9,0:15,8:11,15,0,8
chr8	21957440	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,0:7,7:2,9,0,7
chr8	21958333	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr8	21959191	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,7,4
chr8	21959877	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr8	21964802	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,17,6
chr8	21965260	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=85,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:21,3:23,0:26,19,3,0
chr8	21966700	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:21966700_GC_G:21966700:0,0,1,1
chr8	21966707	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:21966700_GC_G:21966700:0,0,1,1
chr8	21973970	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr8	21974032	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=206,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr8	21976367	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	21976872	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:1,3,0,5
chr8	21985319	.	G	GTCTTGAGCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21985319_G_GTCTTGAGCAT:21985319:0,1,0,1
chr8	21985322	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21985319_G_GTCTTGAGCAT:21985319:0,1,0,1
chr8	22011638	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:8,0:5,9:7,7,0,9
chr8	22020066	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,17,7
chr8	22020294	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,9:0,0,6,10
chr8	22021388	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:3,5:7,6:7,3,8,5
chr8	22051704	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=95,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.342:32:12,9:9,0:10,11,2,9
chr8	22053123	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,7:0,0,7,8
chr8	22056731	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,1:2,1:6,3,0,2
chr8	22056948	.	A	AGGTTGCAGCAACAGCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	22059321	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:5,2:6,0:4,7,3,0
chr8	22069018	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	22079167	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:15,6:10,0:13,12,5,1
chr8	22081708	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr8	22104691	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:5,5:4,8:3,6,11,3
chr8	22105286	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr8	22105502	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,9,19
chr8	22147333	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:13,1:4,6:13,4,6,1
chr8	22161634	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,1:7,1:7,9,0,2
chr8	22167667	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0|1:22167667_T_A:22167667:0,1,0,1
chr8	22167670	.	TCTTTTTTGA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22167667_T_A:22167667:0,0,0,1
chr8	22167681	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22167667_T_A:22167667:0,0,0,1
chr8	22167685	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22167667_T_A:22167667:0,0,0,1
chr8	22172702	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:6,3:10,3:6,10,3,3
chr8	22175836	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=104,159;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:8,4:4,0:8,7,0,4
chr8	22211756	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:8,4,5,0
chr8	22272241	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,6:7,0:8,5,6,0
chr8	22275426	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:22275426_A_T:22275426:0,4,0,1
chr8	22275438	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:22275426_A_T:22275426:0,4,0,1
chr8	22275441	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.421:5:1,1:2,1:1|0:22275426_A_T:22275426:0,3,0,2
chr8	22275446	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:22275426_A_T:22275426:0,3,0,1
chr8	22332442	.	AATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATT;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:6,0,1,2
chr8	22385061	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,0:1,3:1,5,0,3
chr8	22412320	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0|1:22412320_T_TG:22412320:3,0,2,0
chr8	22412324	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:2,0:0|1:22412320_T_TG:22412320:3,0,2,0
chr8	22412328	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:2,0:0|1:22412320_T_TG:22412320:3,0,2,0
chr8	22412332	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:2,1:0|1:22412320_T_TG:22412320:3,0,2,0
chr8	22418810	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:8,5:6,0:13,2,5,0
chr8	22419555	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr8	22421395	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	22422150	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	22422923	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=116,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,1:4,1:2,7,0,2
chr8	22423808	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=161,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	22424014	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=95,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:15,4:11,0:14,13,2,2
chr8	22424489	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=95,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr8	22424490	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:0,3:1,3,0,3
chr8	22426767	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:10,2:0|1:22426767_T_C:22426767:7,9,1,1
chr8	22426773	.	T	TTACAGAGATC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:10,2:0|1:22426767_T_C:22426767:7,9,1,1
chr8	22428658	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	22438859	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,1,2
chr8	22442287	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:3,2,5,3
chr8	22447170	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=104,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:0|1:22447170_C_T:22447170:15,11,2,0
chr8	22447192	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:22447170_C_T:22447170:15,8,2,0
chr8	22460069	.	ACAAGGT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAGGT;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:9,0:19,2:19,12,1,1
chr8	22463248	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,115;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:9,4:5,0:12,2,4,0
chr8	22463371	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=110,70;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,0:15,2:5,17,1,1
chr8	22463376	.	C	T,CCCTGAAACTTCTAACGCTAGAGACTTCTAAGG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,31,34;MFRL=149,109,70;MMQ=60,60,57;MPOS=22,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.08,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,6,2:0.261,0.114:23:6,0,0:9,5,1:5,10,1,7
chr8	22463389	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:4,0:7,6:5,7,0,6
chr8	22473093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:5,6,3,0
chr8	22473814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22473814_T_C:22473814:0,3,0,1
chr8	22473816	.	TA	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22473814_T_C:22473814:0,3,0,1
chr8	22475807	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,6:5,1:5,3,5,2
chr8	22479095	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:4,3:2,3,1,3
chr8	22481479	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:0|1:22481479_G_T:22481479:11,9,1,1
chr8	22481489	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:22481479_G_T:22481479:8,11,1,1
chr8	22487388	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,15,1
chr8	22487422	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,18,10
chr8	22487956	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:6,3:15,0:11,11,1,2
chr8	22548956	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=96,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,16:0.268:62:22,0:18,16:19,27,0,16
chr8	22570783	.	T	TA,TTA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,26,26;MFRL=226,162,220;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.92,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.285,0.460:8:2,1,2:0,1,2:2,0,6,0
chr8	22570844	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.733:28:3,13:4,8:7,0,13,8
chr8	22570907	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.482:34:13,8:5,7:10,9,6,9
chr8	22570911	.	TTGTGCTTGGGCTCGCTGGCCCTTTCTCTGGGAGCCTGGAGGGTTGGTGAGTCCTGGTAGTTCTGGGTCATGAACTGG	T	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,2:0.041:71:21,2:11,0:30,39,1,1
chr8	22570935	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=98,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.485:35:12,8:6,8:9,9,5,12
chr8	22571113	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=52,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:1,2,0,4
chr8	22584838	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:0|1:22584838_G_A:22584838:2,9,0,2
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chr8	22785013	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	22785047	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	22863004	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr8	22863017	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,3,15
chr8	22865320	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	22874876	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:14,4:21,0:21,14,4,0
chr8	22880162	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,0:2,4:4,2,3,1
chr8	22881852	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr8	22885109	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr8	22885154	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=89,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,6:0,7:2,0,12,1
chr8	22885331	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr8	22886020	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:6,5:10,2:10,6,2,5
chr8	22886130	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:2,9,3,4
chr8	22888407	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,6:4,0:1,8,1,5
chr8	22926498	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:1,7:11,3:0,12,0,10
chr8	22960553	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:6,5:12,2:6,12,3,4
chr8	22960678	.	TCGCGGTCCTGCTGCCAGTGAGTCCCGGC	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=105,124;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.083:35:11,0:13,2:0|1:22960678_TCGCGGTCCTGCTGCCAGTGAGTCCCGGC_T:22960678:13,20,1,1
chr8	22960704	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=193,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,24:0.927:25:0,14:1,9:1|0:22960678_TCGCGGTCCTGCTGCCAGTGAGTCCCGGC_T:22960678:0,1,7,17
chr8	22960711	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.540:25:6,5:5,4:4,7,3,11
chr8	22974529	.	G	GGTTCCGCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:1,0:9,2:0|1:22974529_G_GGTTCCGCT:22974529:0,10,0,2
chr8	22974532	.	T	TAAAATTTATTCTCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0|1:22974529_G_GGTTCCGCT:22974529:0,10,0,2
chr8	23054779	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr8	23059265	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,3:6,2:0|1:23059265_TC_T:23059265:10,1,5,1
chr8	23059280	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.379:19:4,4:7,2:0|1:23059265_TC_T:23059265:11,1,5,2
chr8	23069574	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr8	23104195	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:7,4:3,5:9,1,9,1
chr8	23106665	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:4,0,5,0
chr8	23116431	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr8	23117643	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=81,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,1:7,5:5,2,4,2
chr8	23118155	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,2,3
chr8	23148003	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,5:10,4:7,11,3,6
chr8	23150772	.	CTGCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCT;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:6,1:5,5,1,3
chr8	23151000	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=192,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	23152233	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,1:4,1:9,3,2,0
chr8	23152449	.	C	CGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=132,107;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.233:10:5,1:2,0:0,8,0,2
chr8	23152462	.	C	CTAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,107;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,0:0,9,0,2
chr8	23155706	.	G	GATGAGCTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	23156281	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr8	23156313	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=155,75;MMQ=60,26;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,4:6,0:10,3,1,3
chr8	23160778	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,4:3,3,2,2
chr8	23174425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr8	23177619	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=233,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,1,4
chr8	23190899	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:5,6:2,7:7,0,8,5
chr8	23217830	.	A	AATGAACCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23217830_A_AATGAACCCT:23217830:0,0,0,1
chr8	23217832	.	T	TTTGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:23217830_A_AATGAACCCT:23217830:0,0,0,1
chr8	23225745	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=96,77;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:9,1:6,11:7,8,4,9
chr8	23294797	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.236:12:5,0:4,2:0,9,0,3
chr8	23301340	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,5:0,15:0,0,14,6
chr8	23302164	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr8	23429448	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=224,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	23711987	.	GCAGAAGCACTGATCACCAGCAC	G	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:14,0:22,2:33,12,1,1
chr8	23712000	.	TCACCAG	T	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=23,23;MFRL=94,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACCAG;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:10,0:19,4:21,11,4,0
chr8	23712021	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=95,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.233:45:13,0:21,10:22,13,2,8
chr8	23712066	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,1:10,2:5,8,1,2
chr8	23712076	.	T	TTTGTTGTTG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:5,0:10,2:0|1:23712076_T_TTTGTTGTTG:23712076:6,9,0,2
chr8	23712079	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:9,2:0|1:23712076_T_TTTGTTGTTG:23712076:6,9,0,2
chr8	24187399	.	T	TGAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=GA;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	24193245	.	C	CAAGGTTGCTAGCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr8	24193246	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:24193246_T_C:24193246:0,4,0,1
chr8	24193250	.	C	CCACAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24193246_T_C:24193246:0,2,0,1
chr8	24196937	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=95,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:3,1,5,1
chr8	24207318	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:10,1,2,0
chr8	24208649	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,11,2
chr8	24208847	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.960:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr8	24211884	.	A	ATGTC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=177.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,23:0,0,23,18
chr8	24211993	.	ACTAT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=86.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,9:0,11:0,0,3,17
chr8	24212040	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:0,8,0,3
chr8	24253182	.	TAC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:5,2:12,1:17,3,2,1
chr8	24255306	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,1:0,5:2,2,1,5
chr8	24256579	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=97,52;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:2,3,2,2
chr8	24261547	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:14,2:15,2:13,16,3,1
chr8	24262767	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,5:1,7:1,1,9,3
chr8	24300077	.	T	TTCCTTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:0|1:24300077_T_TTCCTTC:24300077:4,8,1,1
chr8	24300079	.	A	AGCACTGC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:7,2:5,0:0|1:24300077_T_TTCCTTC:24300077:4,8,1,1
chr8	24339896	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:0,2:0,4,0,3
chr8	24344883	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=81,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:4,0:2,2:0|1:24344883_G_T:24344883:2,4,1,1
chr8	24344887	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=81,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:0|1:24344883_G_T:24344883:2,4,1,1
chr8	24344895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:24344883_G_T:24344883:1,2,1,1
chr8	24344897	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:24344883_G_T:24344883:1,2,1,1
chr8	24348286	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:18,0:9,4:21,6,4,0
chr8	24348319	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=119,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:30,0:5,5:19,16,5,0
chr8	24350188	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr8	24359137	.	T	TTGAGACGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:2,1:4,2:0,6,1,2
chr8	24365119	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr8	24365157	.	TCA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:1,5,0,7
chr8	24771399	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr8	24772252	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:6,12,3,0
chr8	24774683	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,12,9
chr8	24775489	.	G	GTTGGTATCTAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,144;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:0|1:24775489_G_GTTGGTATCTAAA:24775489:8,8,0,2
chr8	24775491	.	A	AGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=152,144;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:5,2:0|1:24775489_G_GTTGGTATCTAAA:24775489:8,8,0,2
chr8	24810434	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=90,94;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:11,0:21,4:6,26,0,4
chr8	24811007	.	CCTCCTCTTCCTCGGCCTCTTCCTTGTCCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:1,2:7,2,0,2
chr8	24811064	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,12:0,0,9,10
chr8	25042515	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:3,4:2,4:0,5,5,4
chr8	25158026	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	25158072	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,12,4
chr8	25159835	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:25159835_C_T:25159835:9,9,1,1
chr8	25159843	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:10,2:0|1:25159835_C_T:25159835:10,10,1,1
chr8	25159885	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:8,1:19,3:15,12,2,2
chr8	25166486	.	G	GTTGATGGTCGAGTGGGAGTTTCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr8	25174495	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,6:1,2:2,2,6,2
chr8	25174710	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,10
chr8	25174723	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0|1:25174710_C_T:25174710:0,4,0,5
chr8	25181356	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,12:0,0,18,7
chr8	25182969	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=89,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,29:0.681:42:7,18:6,10:11,2,13,16
chr8	25189795	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=97,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:25189795_T_C:25189795:11,10,1,1
chr8	25189800	.	A	AAT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=97,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:25189795_T_C:25189795:10,11,1,1
chr8	25189801	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=97,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:9,2:0|1:25189795_T_C:25189795:10,11,1,1
chr8	25189804	.	C	CACTGG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=99,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:25189795_T_C:25189795:9,9,1,1
chr8	25189963	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr8	25202915	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr8	25209144	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	25220638	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,130;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,2:17,0:11,11,2,0
chr8	25224513	.	GG	TT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:5,4:5,3:2,9,1,6
chr8	25225804	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:2,4,1,7
chr8	25226225	.	ATGGCAATTTCCATATGGTAAGAAG	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=109,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,2:12,0:13,19,1,1
chr8	25227226	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr8	25227229	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:25227229_T_G:25227229:0,2,0,2
chr8	25227234	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:25227229_T_G:25227229:0,2,0,2
chr8	25227255	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	25230267	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=128,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:4,7,2,3
chr8	25231044	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr8	25231117	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.465:19:8,6:2,3:5,5,4,5
chr8	25237801	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=90,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,4:4,3:3,1,5,2
chr8	25237815	.	CTG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=112,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:25237815_CTG_C:25237815:10,5,1,1
chr8	25237818	.	A	ACC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:25237815_CTG_C:25237815:10,4,1,1
chr8	25237963	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr8	25246705	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:10,0:9,2:0|1:25246705_T_C:25246705:13,7,1,1
chr8	25246710	.	C	CTGCACTCCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,0:10,2:0|1:25246705_T_C:25246705:13,7,1,1
chr8	25247821	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=29437,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.660:7:1,0:1,3:0,2,1,4
chr8	25249545	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.494:18:6,4:3,4:3,6,3,6
chr8	25250235	.	CCCTGGGAATTGACCAACATTTCATGTTTTCCT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTGGGAATTGACCAACATTTCATGTTTTCCT;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.189:20:2,1:3,2:11,6,1,2
chr8	25250423	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=189,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:2,0:3,6:1,5,1,5
chr8	25257531	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,5:4,4:4,5,6,3
chr8	25258442	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr8	25261203	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:0|1:25261203_T_C:25261203:12,11,1,1
chr8	25261215	.	G	GCTCCTGAACCAGGTCCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:10,2:11,0:0|1:25261203_T_C:25261203:11,10,1,1
chr8	25261281	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,2:1,7,4,4
chr8	25267675	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,0,2
chr8	25267749	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=164,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr8	25280666	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr8	25287556	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:1,7,1,3
chr8	25290787	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr8	25293858	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,9:4,3:7,2,9,3
chr8	25296743	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=51,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr8	25296930	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,7:6,3:7,7,6,4
chr8	25301759	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,33,32;MFRL=150,0,122;MMQ=60,60,51;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,19;RU=T;STR;TLOD=5.51,8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.369,0.436:9:0,2,3:1,1,1:1,1,7,0
chr8	25301791	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.246:20:2,0:11,0:8,7,5,0
chr8	25315676	.	CGA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.291:10:2,3:3,0:0|1:25315676_CGA_C:25315676:1,6,3,0
chr8	25315684	.	GG	CC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.245:12:5,2:2,0:0|1:25315676_CGA_C:25315676:1,8,3,0
chr8	25315792	.	CCGCCACCCTCCCACCTGGTCCTCCTCCCACCTTTTTCTCCTCCCGCCCTTCCCCTCCCTCCACCCACTCGGATT	C	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=112,165;MMQ=52,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.046:65:16,2:29,0:21,42,1,1
chr8	25317691	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr8	25325656	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,27;MFRL=253,172;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:0,3:0|1:25325656_G_A:25325656:1,0,3,0
chr8	25325661	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=185,172;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:2,0:0,3:0|1:25325656_G_A:25325656:3,0,3,0
chr8	25325730	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:13,3:1,3:11,3,2,5
chr8	25337645	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:1,13,0,3
chr8	25343410	.	G	GGCTGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=159,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:0|1:25343410_G_GGCTGC:25343410:0,5,1,1
chr8	25343412	.	T	TAAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=159,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:25343410_G_GGCTGC:25343410:0,5,1,1
chr8	25343416	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:25343410_G_GGCTGC:25343410:0,5,1,1
chr8	25360810	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr8	25364331	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,5:2,9:1,4,10,4
chr8	25365169	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=77,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr8	25365245	.	A	AGAAAGGGAGGGAAAGAAGGAAAGAGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=75,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr8	25744257	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=104,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,5:9,2:8,7,4,3
chr8	25890765	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25890765_G_C:25890765:0,0,0,1
chr8	25890769	.	GG	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25890765_G_C:25890765:0,0,0,1
chr8	25890776	.	TCACCA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:25890765_G_C:25890765:0,1,0,1
chr8	25890782	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25890765_G_C:25890765:0,1,0,1
chr8	25897674	.	A	AGCAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=184,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:25897674_A_AGCAC:25897674:0,2,0,1
chr8	25897678	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=179,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25897674_A_AGCAC:25897674:0,1,0,1
chr8	25897679	.	G	GTTATGAATCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=179,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25897674_A_AGCAC:25897674:0,1,0,1
chr8	25897682	.	A	AAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=179,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25897674_A_AGCAC:25897674:0,1,0,1
chr8	25902264	.	C	CATATCTCCCCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.162:22:7,0:12,3:0|1:25902264_C_CATATCTCCCCT:25902264:10,9,1,2
chr8	25902265	.	G	GAAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:7,0:11,2:0|1:25902264_C_CATATCTCCCCT:25902264:10,9,1,2
chr8	25902346	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:0|1:25902346_T_A:25902346:9,7,1,1
chr8	25902349	.	T	TCCATATACTACAAAAAGAGCGTTTCAAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:25902346_T_A:25902346:9,7,1,1
chr8	26149442	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:14,2:6,1:6,14,1,2
chr8	26240646	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,29,8
chr8	26249018	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	26265907	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,16:0,0,9,20
chr8	26441275	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,25:0.721:34:4,12:5,12:7,2,17,8
chr8	26441562	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,5:0,4:0,2,0,9
chr8	26481771	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,23:0,0,17,31
chr8	26484064	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:3,4:2,8:5,0,10,3
chr8	26509860	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=116,118;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:16,3:6,0:11,13,3,0
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chr8	26513313	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26513308_T_TC:26513308:0,1,0,1
chr8	26513317	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:26513308_T_TC:26513308:0,1,0,1
chr8	26513318	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26513308_T_TC:26513308:0,1,0,1
chr8	26513323	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26513308_T_TC:26513308:0,1,0,1
chr8	26623477	.	C	CTTGTGAAAAGAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr8	27099100	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	27099879	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:0,1:5,4:3,2,4,2
chr8	27101204	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0|1:27101204_T_A:27101204:0,0,6,4
chr8	27101206	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,7:0,2:0|1:27101204_T_A:27101204:0,0,6,4
chr8	27146852	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:4,8,0,2
chr8	27255080	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,1:5,11:5,3,8,4
chr8	27255263	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.271:31:10,4:13,4:13,10,3,5
chr8	27255325	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,3:7,4:8,8,3,4
chr8	27277657	.	G	GAAGCTGTGCGTGGGCAACCAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=105,84;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.240:14:5,3:6,0:1,10,0,3
chr8	27287997	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=82,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:2,4,0,3
chr8	27288033	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=147,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	27289935	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,931;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr8	27291557	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,19,4
chr8	27294532	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	27294823	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:0,3:1,5:0,1,7,1
chr8	27295109	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=245,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr8	27297696	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	27308585	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr8	27310546	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr8	27310716	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:27310716_G_GAA:27310716:1,5,1,1
chr8	27310717	.	GGGTT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=144,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:27310716_G_GAA:27310716:1,5,1,1
chr8	27312232	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=235,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	27315726	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	27319292	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,1:1,5:2,4,0,6
chr8	27321597	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr8	27326838	.	AGG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=105,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:11,4,1,2
chr8	27369334	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,19:0,6:0,0,13,12
chr8	27373918	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:10,0:12,11:9,13,0,11
chr8	27382781	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27382781_C_T:27382781:2,0,1,0
chr8	27382791	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27382781_C_T:27382781:3,0,1,0
chr8	27456249	.	TG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27456249_TG_AA:27456249:0,0,0,1
chr8	27456253	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27456249_TG_AA:27456249:0,0,0,1
chr8	27462008	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr8	27507374	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,1,1
chr8	27509153	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:4,3,2,3
chr8	27516688	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:5,2,0,3
chr8	27605733	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=84,95;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:20,0:18,5:10,28,0,5
chr8	27630117	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,5:5,4:4,6,3,6
chr8	27630131	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=154,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:3,5,2,5
chr8	27630152	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr8	27637666	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:13,3,2,1
chr8	27641609	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,6,11
chr8	27649426	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:5,3:3,2:7,1,4,1
chr8	27660805	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:11,3:18,0:18,11,3,0
chr8	27660816	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,65;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:16,0:13,3:20,9,1,2
chr8	27680576	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.599:28:7,4:4,13:8,3,9,8
chr8	27680809	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr8	27685521	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	27737097	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=193,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,3:4,0:8,0,2,1
chr8	27762235	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=80,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,1:6,3:6,2,1,3
chr8	27764627	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:5,3,4,3
chr8	27764841	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27764841_G_GT:27764841:0,0,0,1
chr8	27764842	.	G	GATTCTCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27764841_G_GT:27764841:0,0,0,1
chr8	27767305	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr8	27767339	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=147,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	27779296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	27824058	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=92,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:0|1:27824058_A_T:27824058:5,12,1,1
chr8	27824067	.	A	AGGAC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=92,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:27824058_A_T:27824058:5,10,1,1
chr8	27824068	.	T	TAGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:27824058_A_T:27824058:5,9,1,1
chr8	27880826	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=73,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:13,4:3,3:7,9,6,1
chr8	27880851	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,2:6,2:7,6,2,2
chr8	27886700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr8	27903187	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,267;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:1,14,0,2
chr8	27915650	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,160;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:6,0,2,0
chr8	27925204	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=100,75;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:4,10:4,10:4,4,6,14
chr8	27927154	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:5,9,1,2
chr8	27931875	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:10,3:2,5:8,4,5,3
chr8	27950670	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=78,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:10,6:13,7:18,5,7,6
chr8	27965604	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:27965604_T_A:27965604:0,3,0,1
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chr8	27965607	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:27965604_T_A:27965604:0,3,0,1
chr8	27967856	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:11,5:6,7:11,7,8,4
chr8	28013579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:2,9,1,3
chr8	28017877	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:13,2:15,1:18,10,2,1
chr8	28186831	.	TCCTCCTCCCTGACTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr8	28210613	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr8	28214363	.	C	CCGAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr8	28286174	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=116,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,5:4,7:6,4,6,6
chr8	28310046	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,1:6,1:0,16,0,2
chr8	28310089	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=203,143;MMQ=41,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:28310089_A_T:28310089:0,4,0,1
chr8	28310092	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=203,143;MMQ=41,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:28310089_A_T:28310089:0,4,0,1
chr8	28341058	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,1,5
chr8	28360797	.	T	TTTGCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:28360797_T_TTTGCTG:28360797:0,2,0,2
chr8	28360802	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:28360797_T_TTTGCTG:28360797:0,2,0,2
chr8	28360806	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:28360797_T_TTTGCTG:28360797:0,2,0,2
chr8	28409027	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:28409027_C_T:28409027:1,0,1,0
chr8	28409033	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28409027_C_T:28409027:1,0,1,0
chr8	28575410	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,75;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:10,0:11,10:11,10,1,9
chr8	28628420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	28651296	.	C	CAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.447:10:4,3:2,0:5,1,3,1
chr8	28651557	.	TATAAAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	28692997	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28692997_T_C:28692997:0,1,0,1
chr8	28692999	.	C	CTATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28692997_T_C:28692997:0,1,0,1
chr8	28695361	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr8	28967467	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:0|1:28967467_C_T:28967467:8,6,1,1
chr8	28967469	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:28967467_C_T:28967467:9,6,1,1
chr8	28967477	.	C	CAGCCTCT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:28967467_C_T:28967467:9,7,1,1
chr8	28967480	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:28967467_C_T:28967467:9,7,1,1
chr8	28967679	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr8	28974612	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=296,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28974612_A_G:28974612:0,1,0,1
chr8	28974614	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=296,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28974612_A_G:28974612:0,1,0,1
chr8	28974617	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=296,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28974612_A_G:28974612:0,1,0,1
chr8	28984572	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,17,2
chr8	28984672	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.118:48:14,4:26,1:20,23,3,2
chr8	28989789	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,2:2,7:7,3,4,5
chr8	28997691	.	GTGCAGCCGACCTGCCACC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:5,2:5,15,0,2
chr8	28998179	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,1,2
chr8	29005093	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr8	29005128	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,30;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,6:0,2:0,1,1,7
chr8	29006063	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=95,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:4,5:13,7:8,9,7,5
chr8	29035113	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:4,12,0,2
chr8	29053761	.	TAA	T,TA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,25,27;MFRL=104,120,150;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.24,29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,15:0.188,0.607:25:4,4,7:1,1,8:0,5,5,15
chr8	29195982	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:29195982_C_A:29195982:5,17,1,1
chr8	29195990	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:29195982_C_A:29195982:4,15,1,1
chr8	29195991	.	G	GTTCA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:29195982_C_A:29195982:4,15,1,1
chr8	29923619	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:11,2:15,2:13,13,2,2
chr8	29923732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr8	29931375	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,20:0,0,19,12
chr8	29940271	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr8	29989738	.	T	TTTTTTTATGTCCTCACA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:14,0:10,14,1,1
chr8	29996256	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,6,17
chr8	29996313	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	30001915	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	30013787	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,0:2,0:0|1:30013787_G_C:30013787:0,3,4,0
chr8	30013792	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,0:2,0:0|1:30013787_G_C:30013787:0,3,4,0
chr8	30013796	.	CGGCTCCG	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=116,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:1,2:2,2:0|1:30013787_G_C:30013787:3,5,4,0
chr8	30242747	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,5:1,4:0,6,1,8
chr8	30464719	.	CA	C,CAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,35,34;MFRL=143,150,110;MMQ=60,60,60;MPOS=29,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.71,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,4:0.238,0.182:23:4,2,2:7,4,1:0,13,2,8
chr8	30469805	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr8	30472043	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	30537223	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20,25;MFRL=142,128,107;MMQ=60,59,40;MPOS=25,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.15,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,3:0.437,0.311:10:1,1,0:1,2,1:0,2,1,7
chr8	30539623	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	30546636	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr8	30546811	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=118,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:13,0:21,3:16,18,1,2
chr8	30567423	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.410:8:1,0:2,2:1,4,0,3
chr8	30569609	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.251:34:9,8:10,1:10,15,4,5
chr8	30601610	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr8	30601805	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=144.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,32:0,18:0,0,17,34
chr8	30609061	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:30609061_T_G:30609061:0,0,3,7
chr8	30609078	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0|1:30609061_T_G:30609061:0,0,1,11
chr8	30620840	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr8	30620964	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	30623996	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	30651447	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=112,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:15,3:17,0:15,17,2,1
chr8	30695124	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=117,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:10,0:10,8,2,1
chr8	30854033	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr8	30890326	.	A	ATTAGTATACACAAAGACACAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr8	30916085	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr8	30922346	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	30933816	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.329:29:15,2:5,7:4,16,2,7
chr8	30933859	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr8	30933886	.	A	ACTGATTTTTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	30941317	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=144,137;MMQ=49,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,3,1
chr8	30949510	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	30958353	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,9,3
chr8	30977717	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr8	30999123	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,12,12
chr8	30999394	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	31000243	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,11,13
chr8	31004529	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:4,2,5,0
chr8	31004717	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,0:9,7:0,14,0,7
chr8	31005017	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr8	31030487	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:4,0,1,0
chr8	32474317	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr8	32579646	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr8	32616890	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=83,29043735;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:0|1:32616890_T_C:32616890:10,15,1,1
chr8	32616895	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=78,29043735;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:32616890_T_C:32616890:7,16,1,1
chr8	32616978	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:3,7,0,3
chr8	33246591	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:6,5:2,5:3,5,5,5
chr8	33354872	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:4,0:0|1:33354872_AC_A:33354872:1,9,2,0
chr8	33354878	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:6,0:0|1:33354872_AC_A:33354872:1,11,2,0
chr8	33354884	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=159,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,0:0|1:33354872_AC_A:33354872:1,9,2,0
chr8	33355886	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr8	33356191	.	GT	G,GTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=13,15,23;MFRL=152,121,158;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=6.83,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.516,0.296:7:0,0,0:0,1,1:0,1,0,6
chr8	33356825	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.287:18:1,2:6,3:5,8,2,3
chr8	33356852	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=135,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.218:13:5,0:5,2:1,9,2,1
chr8	33361053	.	C	CTCT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:0|1:33361053_C_CTCT:33361053:5,10,0,2
chr8	33361054	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:0|1:33361053_C_CTCT:33361053:5,10,0,2
chr8	33361057	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:5,0:0|1:33361053_C_CTCT:33361053:5,10,0,2
chr8	33361103	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:33361103_G_A:33361103:1,3,0,1
chr8	33361105	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=19,32;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:33361103_G_A:33361103:1,3,0,1
chr8	33361472	.	A	ATGGAACGGAATGACAGGGAATGGAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,2:6,0:4,5,1,1
chr8	33367497	.	CAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.602:5:1,0:1,2:1,1,0,3
chr8	33406892	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=113,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:17,7,2,0
chr8	33449695	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:8,3:8,8,1,2
chr8	33449746	.	C	CAGAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=AG;STR;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr8	33451026	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,1,2
chr8	33451309	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,3:6,3:4,5,1,7
chr8	35093427	.	C	CAGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	35407089	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr8	35407099	.	AA	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:35407099_AA_GT:35407099:0,3,0,1
chr8	35407102	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:35407099_AA_GT:35407099:0,3,0,1
chr8	35606044	.	GCCTCCAGTCAGATGGCTCTGAGGTGCTCCTGAGTCCTGAAGTCACCTGTGGT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:8,2:3,0:17,9,1,1
chr8	35624438	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=105,108;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,0:16,3:17,14,0,3
chr8	36645034	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,1:4,1:0,5,0,2
chr8	36661686	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=109,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:3,3,1,1
chr8	36662680	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=85,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr8	36666183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,1,1
chr8	36691189	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.364:39:12,6:13,8:9,16,6,8
chr8	36693933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:36693933_T_C:36693933:0,4,0,1
chr8	36693936	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:36693933_T_C:36693933:0,4,0,1
chr8	36693937	.	C	CTATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:36693933_T_C:36693933:0,4,0,1
chr8	36698552	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=22,37;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.847:10:0,4:1,3:0,1,5,4
chr8	36746422	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=113,156;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:19,0:7,2:12,17,0,2
chr8	36746427	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=118,143;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:15,1:7,1:6,16,0,2
chr8	36746428	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=116,161;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:6,16,0,2
chr8	36746436	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:6,0:0|1:36746436_A_T:36746436:0,15,0,2
chr8	36746437	.	C	CTCTCTCTCT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:0|1:36746436_A_T:36746436:0,15,0,2
chr8	36746594	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=196,244;MMQ=44,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:4,0,0,1
chr8	36767085	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr8	36768517	.	T	TGGGGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,0:3,0:2,13,3,0
chr8	36768589	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=68,47;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:7,3,0,2
chr8	36776267	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr8	36780209	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr8	36788479	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:5,6:0,7:1,4,9,4
chr8	36788574	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:19,4:10,0:22,10,0,4
chr8	36788693	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,5,13
chr8	36790339	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=227,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr8	36792966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr8	37556214	.	AG	CC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=80,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,3:4,1:2,11,4,0
chr8	37608062	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=177,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:1,0:0|1:37608062_A_AAC:37608062:0,4,1,1
chr8	37608063	.	G	GAATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=177,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,1:1,0:0|1:37608062_A_AAC:37608062:0,4,1,1
chr8	37620076	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	37686549	.	C	CAGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37686549_C_CAGG:37686549:0,2,0,1
chr8	37686550	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37686549_C_CAGG:37686549:0,2,0,1
chr8	37686559	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37686559_T_A:37686559:0,1,0,1
chr8	37686561	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37686559_T_A:37686559:0,1,0,1
chr8	37686565	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37686559_T_A:37686559:0,0,0,1
chr8	37686749	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,5:6,1:5,3,3,3
chr8	37686930	.	CACA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:37686930_CACA_C:37686930:1,2,0,1
chr8	37686937	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:37686930_CACA_C:37686930:1,2,0,1
chr8	37686938	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:37686930_CACA_C:37686930:1,2,0,1
chr8	37686941	.	TGCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:37686930_CACA_C:37686930:2,2,0,1
chr8	37691711	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	37693183	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:8,1:7,4,1,1
chr8	37693302	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,8,17
chr8	37693347	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr8	37696584	.	C	CAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:4,3:12,0:0|1:37696584_C_CAG:37696584:8,8,1,2
chr8	37696585	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:4,2:12,0:0|1:37696584_C_CAG:37696584:8,8,1,2
chr8	37697616	.	G	GACCTCACACTGCACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=206,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr8	37698379	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=91,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.236:18:3,0:11,1:0|1:37698379_T_C:37698379:0,14,4,0
chr8	37698383	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=91,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:2,0:10,0:0|1:37698379_T_C:37698379:0,12,3,0
chr8	37698387	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=94,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,1:10,2:0|1:37698379_T_C:37698379:0,13,3,0
chr8	37698391	.	C	CCCCCCCCCCACAAAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=104,87;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:2,1:11,2:0|1:37698379_T_C:37698379:0,14,3,0
chr8	37702122	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,0:8,6:11,6,0,6
chr8	37706016	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=165,104;MMQ=48,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:9,0,3,0
chr8	37706031	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=134,122;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:14,0:16,7,2,0
chr8	37706049	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=137,104;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.098:37:15,3:18,0:17,17,1,2
chr8	37720498	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:14,7:14,0:16,12,3,4
chr8	37728017	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0|1:37728017_A_G:37728017:0,0,8,11
chr8	37728019	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,13:0,5:0|1:37728017_A_G:37728017:0,0,8,11
chr8	37729162	.	TTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr8	37730368	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,13:0,0,11,10
chr8	37730723	.	G	GAATAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=205,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:37730723_G_GAATAAA:37730723:0,4,0,1
chr8	37730724	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=205,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:37730723_G_GAATAAA:37730723:0,4,0,1
chr8	37730750	.	G	GGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,29;MFRL=200,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr8	37792083	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=46,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr8	37795341	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=119,123;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:2,0:3,1:0,6,0,3
chr8	37821683	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,3:6,0:8,9,3,0
chr8	37823797	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:7,3:9,8,1,2
chr8	37964024	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=136,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr8	37985804	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=88.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,34:0.815:41:5,3:2,30:5,2,32,2
chr8	37985897	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.933:27:1,13:0,13:0,1,14,12
chr8	37986561	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	38003380	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,175;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:5,16:1,0:6,0,16,0
chr8	38003787	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,16,8
chr8	38003990	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=107,93;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,0:8,4:9,12,1,3
chr8	38004029	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=179,0;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:2,2:1,6,2,0
chr8	38004038	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=155,95;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr8	38004055	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:38004055_G_A:38004055:0,0,0,1
chr8	38004062	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38004055_G_A:38004055:0,0,0,1
chr8	38004064	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38004055_G_A:38004055:0,0,0,1
chr8	38005653	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,2:6,1:9,1,2,1
chr8	38005664	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:5,3:5,1:8,3,3,1
chr8	38006330	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	38099827	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,86;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:13,7:14,0:9,18,5,2
chr8	38103495	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr8	38133901	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.267:47:16,12:17,0:22,13,12,0
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chr8	38172076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=246,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:2,0,1,0
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chr8	38369831	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr8	38370074	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=64,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:21,0:6,5:18,12,0,5
chr8	38370200	.	GAGACACAGAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGACACAGAC;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	38385795	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,6:0,0,16,7
chr8	38646402	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.574:17:5,7:2,2:0,7,1,9
chr8	38677880	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=88,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.163:30:14,3:10,2:16,9,1,4
chr8	38684758	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,48;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:18,0:14,3:21,11,1,2
chr8	38693779	.	G	GGAGAGCTTTTACCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr8	38693806	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:38693806_G_A:38693806:0,5,1,1
chr8	38693809	.	A	ATTACCAAAGAGATTGAAGCAAATGAATAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:38693806_G_A:38693806:0,5,1,1
chr8	38697649	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr8	38697902	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:38697902_T_A:38697902:0,2,0,1
chr8	38697904	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38697902_T_A:38697902:0,2,0,1
chr8	38697910	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=192,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38697902_T_A:38697902:0,3,0,1
chr8	38697912	.	G	GGACAGATGACTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=192,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38697902_T_A:38697902:0,3,0,1
chr8	38699791	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=182,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:9,4,2,1
chr8	38700890	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:17,2:0|1:38700890_C_T:38700890:18,17,1,1
chr8	38700894	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:16,2:0|1:38700890_C_T:38700890:16,17,1,1
chr8	38704154	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,6:3,0:5,1,6,0
chr8	38809663	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,14,8
chr8	38815018	.	T	TCAACCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=257,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	38827185	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,12:0,0,10,9
chr8	38827325	.	G	GTCAAAGAAATGGATCTAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,0,1
chr8	38835456	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,18,13
chr8	38835666	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr8	38835700	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:2,2,0,1
chr8	38836787	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:24,0:15,2:0|1:38836787_T_C:38836787:24,19,1,1
chr8	38836789	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:25,0:17,2:0|1:38836787_T_C:38836787:24,19,1,1
chr8	38840591	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=80,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,4:4,10:3,6,3,11
chr8	38845638	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,2:2,7:0,3,0,12
chr8	38845644	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=16,19,11;MFRL=131,116,125;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.49,7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,5:0.350,0.427:12:1,0,1:0,2,1:0,3,0,9
chr8	38845716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	38851204	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:4,11,4,6
chr8	38853983	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=129,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:8,7:10,9:5,13,9,8
chr8	38854041	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,0,4
chr8	38871463	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,143;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:11,5:13,1:17,8,6,0
chr8	38876466	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:0|1:38876466_T_C:38876466:2,6,3,3
chr8	38876468	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:0|1:38876466_T_C:38876466:2,6,3,3
chr8	38879054	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,162;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,1,0
chr8	38884342	.	G	GTTCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=81.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,7:0,0,7,12
chr8	38884379	.	T	TGAAATCTCAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr8	38911953	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0,0,17,1
chr8	38913072	.	TTA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:15,0:15,13,2,0
chr8	38959363	.	A	ATT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=102,20252485;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:10,0:11,2:21,0,2,0
chr8	38959498	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,5:9,7:2,10,4,8
chr8	38965271	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,4:3,2:1,4,3,3
chr8	38975580	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,30,21;MFRL=217,156,76;MMQ=60,60,60;MPOS=16,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.10,5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,2,8:0.079,0.263:35:7,0,3:14,2,5:20,5,7,3
chr8	39004620	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:6,6:2,1:7,1,6,2
chr8	39009165	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,278;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr8	39022522	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,2:5,5:8,4,3,4
chr8	39068890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,1,5
chr8	39091316	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	39091526	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.620:27:6,6:4,11:4,6,10,7
chr8	39114949	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	39128387	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=97,100;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,30:0.644:46:11,19:5,11:10,6,17,13
chr8	39128510	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr8	39128540	.	A	ACTTCCTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr8	39138698	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:17,0:17,4:14,20,0,4
chr8	39142456	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:39142456_T_C:39142456:0,2,0,2
chr8	39142459	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:39142456_T_C:39142456:0,2,0,2
chr8	39442314	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39442314_T_A:39442314:0,1,0,1
chr8	39442316	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39442314_T_A:39442314:0,1,0,1
chr8	39442319	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39442314_T_A:39442314:0,1,0,1
chr8	39468132	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:16,0:15,5:13,18,0,5
chr8	39487022	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=108,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,2:2,8:0,3,1,9
chr8	39505826	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,4:5,1:7,0,4,1
chr8	39521419	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=98,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,1:7,5:5,8,3,3
chr8	39602260	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=175,200;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:39602260_T_C:39602260:3,0,1,0
chr8	39602265	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=175,200;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:39602260_T_C:39602260:3,0,1,0
chr8	39602270	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=164,200;MMQ=50,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:39602260_T_C:39602260:4,0,1,0
chr8	39607105	.	C	CATGT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr8	39618637	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr8	39618865	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr8	39678723	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:0,5,0,7
chr8	39776288	.	AC	A	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=114,145;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.438:27:4,0:11,10:1,14,10,2
chr8	39776292	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=100,148;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,11:0.263:42:7,0:19,6:0|1:39776292_C_A:39776292:5,26,10,1
chr8	39776295	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=82,148;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.241:43:9,0:21,10:0|1:39776292_C_A:39776292:5,27,10,1
chr8	39776298	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=63,148;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,10:0.218:44:9,0:21,4:0|1:39776292_C_A:39776292:5,29,9,1
chr8	39776301	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=33,17;MFRL=59,107;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.133:42:11,0:21,3:0|1:39776301_C_A:39776301:6,30,5,1
chr8	39776304	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=63,107;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.120:46:14,0:24,4:0|1:39776301_C_A:39776301:8,32,5,1
chr8	39777529	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr8	39780922	.	CAAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,1:1,0,2,0
chr8	39781072	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,3:20,0:11,32,0,3
chr8	39781104	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.295:42:22,11:8,1:9,21,0,12
chr8	39785321	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=176,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr8	39785443	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,74;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:5,0:19,5:13,12,1,4
chr8	39843129	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.501:24:5,5:7,7:0|1:39843129_T_C:39843129:3,9,0,12
chr8	39843139	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:1,5:3,7:0|1:39843129_T_C:39843129:0,7,0,12
chr8	39871010	.	TCA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,2:4,9:7,2,8,3
chr8	39871036	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,13,10
chr8	39871298	.	T	TTTAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr8	39872668	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr8	39872676	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr8	39872866	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr8	39872935	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=22,22;MFRL=105,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:2,4:8,6:0|1:39872935_T_A:39872935:6,4,6,4
chr8	39872948	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=98,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.143:19:5,1:12,1:1|0:39872935_T_A:39872935:11,6,0,2
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chr8	41469580	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,0,2
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chr8	41517958	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,9:0,0,7,9
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chr8	41519338	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:3,0:13,2:8,8,0,2
chr8	41519462	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,5:1,7:0,1,5,7
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chr8	41530247	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:6,10,1,2
chr8	41545641	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,5:2,2:7,1,5,2
chr8	41546072	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:11,1:11,2:11,11,2,1
chr8	41547683	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr8	41550787	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr8	41552046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:4,2:1,1:5,1,4,0
chr8	41552771	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:9,0:5,3:9,5,1,3
chr8	41552917	.	G	GCCATGCTCCTCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr8	41555509	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr8	41555736	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:41555736_C_T:41555736:0,3,1,2
chr8	41555740	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:41555736_C_T:41555736:0,3,1,2
chr8	41562029	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,1,5
chr8	41566438	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.261:20:10,1:5,3:7,8,3,2
chr8	41571802	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:7,3:1,2:1,7,1,4
chr8	41573311	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:17,1:7,1:10,14,0,2
chr8	41573337	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.149:21:14,3:4,0:8,10,1,2
chr8	41575630	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:9,5,2,1
chr8	41577121	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr8	41580607	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,7,5
chr8	41580636	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=110,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,7:5,2:10,5,4,5
chr8	41583441	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr8	41585571	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=297,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr8	41615712	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41615712_C_CT:41615712:0,0,0,1
chr8	41615714	.	C	CCGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41615712_C_CT:41615712:0,0,0,1
chr8	41655164	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr8	41790564	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=85,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,3:10,0:9,7,0,3
chr8	41790824	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr8	41795026	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:19,2:12,1:15,16,2,1
chr8	41814731	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:25,2:25,0:0|1:41814731_T_G:41814731:28,26,1,1
chr8	41814733	.	TGC	T	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:27,2:24,0:0|1:41814731_T_G:41814731:27,27,1,1
chr8	41814738	.	A	ACC	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=110,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:23,1:22,0:0|1:41814731_T_G:41814731:26,29,1,1
chr8	41814743	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=25,19;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:26,1:26,0:0|1:41814731_T_G:41814731:26,26,1,1
chr8	42033482	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=101,105;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:19,5:16,0:22,13,5,0
chr8	42033642	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:8,0:15,22:9,14,0,22
chr8	42036577	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,7:7,3:6,6,4,6
chr8	42037924	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr8	42045527	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=192,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,1,1
chr8	42045536	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:3,2:1,6,0,2
chr8	42045538	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:2,0:3,2:0|1:42045538_T_C:42045538:1,4,0,2
chr8	42045540	.	AAGTATAAAAAAGGAAG	A,CAGTATAAAAAAGGAAG	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=27,30,30;MFRL=173,166,96;MMQ=60,60,60;MPOS=-8,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.20,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,1:0.231,0.213:7:1,0,1:3,2,0:1,3,0,3
chr8	42045558	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:42045538_T_C:42045538:0,4,0,2
chr8	42045560	.	CTAATGA	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=-1073741838;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:42045538_T_C:42045538:0,4,0,2
chr8	42045572	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:42045538_T_C:42045538:0,5,0,2
chr8	42048923	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=105,76;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:10,0:26,3:17,19,1,2
chr8	42162675	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,3:9,2:9,6,3,2
chr8	42171902	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,2:14,1:18,12,2,1
chr8	42172017	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	42173677	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr8	42174286	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=101,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:14,3:17,0:14,17,3,0
chr8	42175227	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:14,4:22,0:23,13,4,0
chr8	42175303	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=119.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,19:0,0,14,27
chr8	42186579	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:42186579_T_C:42186579:2,0,2,0
chr8	42186584	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:42186579_T_C:42186579:2,0,2,0
chr8	42188334	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr8	42188550	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr8	42196441	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,6:4,6:9,1,10,2
chr8	42202365	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=200,243;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:6,0:8,0,3,0
chr8	42202382	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=185,243;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,3:4,0:0|1:42202382_G_A:42202382:9,0,3,0
chr8	42202385	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,9;MFRL=185,243;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,0:5,0:0|1:42202382_G_A:42202382:8,0,3,0
chr8	42251820	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:27,0:7,3:13,23,0,3
chr8	42252582	.	TTG	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=84,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.079:47:20,1:20,2:38,6,2,1
chr8	42287691	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,1:13,1:12,9,2,0
chr8	42294940	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=77,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:10,9:15,6:14,11,12,3
chr8	42296992	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.734:17:1,6:3,5:3,1,6,7
chr8	42317567	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,0:3,9:0,11,0,9
chr8	42323207	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,138;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.707:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	42552633	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr8	42608232	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=233,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:42608232_G_GA:42608232:2,0,1,1
chr8	42608233	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=233,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:42608232_G_GA:42608232:2,0,1,1
chr8	42608237	.	A	ATGGGGTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=233,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:42608232_G_GA:42608232:2,0,0,1
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chr8	43002052	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:0,2:4,0,5,0
chr8	43013931	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=174,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,3:7,0:0|1:43013931_C_T:43013931:7,7,3,0
chr8	43013936	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=232,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,8:0.562:14:3,3:2,5:1|0:43013931_C_T:43013931:5,1,5,3
chr8	43037272	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=91,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:11,0:9,4:14,6,3,1
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chr8	43152167	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr8	48192420	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.218:15:6,2:6,1:9,3,3,0
chr8	48320563	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,5:7,1:3,6,1,5
chr8	48686730	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr8	48689366	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,3:2,5:3,2,5,3
chr8	48711763	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=45,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,2:9,2:7,7,3,1
chr8	48729959	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr8	48731947	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,2:15,3:21,9,5,0
chr8	48771028	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:4,1,6,0
chr8	48772312	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,5:5,2:2,4,1,6
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chr8	48772383	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48772382_C_CCA:48772382:0,2,0,1
chr8	48772385	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48772382_C_CCA:48772382:0,2,0,1
chr8	48776189	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,6:3,5,0,10
chr8	48798437	.	TGCAAGACTCTGTCTCAAACAAACAAACAAACAAAAAAAACAGTTTATTTAAAGGGAAACTTTGTTACCATTTTGGTATTATCCACTGAAGACTGCATGAGCTCCAATACA	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.047:64:2,2:4,0:34,26,1,3
chr8	48800017	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	48805816	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,8,8
chr8	48843310	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:4,16:5,13:4,5,14,15
chr8	48846519	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr8	48874811	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:2,6:5,5:2,5,7,5
chr8	48880065	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=72,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.783:15:1,7:1,5:1,2,4,8
chr8	48887422	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:7,3:11,4,0,3
chr8	48962335	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:6,1,3,0
chr8	48973184	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,3,1
chr8	49641784	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr8	49643126	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:8,0:18,4:17,9,3,1
chr8	49643243	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr8	49987826	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:2,6,2,3
chr8	51306704	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr8	51314749	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.453:13:4,2:3,3:6,1,5,1
chr8	51363078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,8,6
chr8	51465775	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr8	51664541	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr8	51664713	.	T	TTTAGGCCAAGGAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:51664713_T_TTTAGGCCAAGGAA:51664713:0,4,0,1
chr8	51664716	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:51664713_T_TTTAGGCCAAGGAA:51664713:0,4,0,1
chr8	51664728	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,22;MFRL=136,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:51664728_AC_A:51664728:0,3,0,1
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chr8	52258536	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,5:0,2:0,1,2,5
chr8	52284654	.	C	T,CA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28,31;MFRL=112,179,112;MMQ=60,60,60;MPOS=10,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.57,10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,7:0.128,0.215:34:16,0,3:3,4,4:0,22,1,11
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chr8	52396233	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:14,0:17,2:0|1:52396233_C_T:52396233:12,20,1,1
chr8	52396242	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=84,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:52396233_C_T:52396233:7,19,1,1
chr8	52396243	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=81,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0|1:52396233_C_T:52396233:6,19,1,1
chr8	52567361	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=148,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
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chr8	52732958	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=118,62;MMQ=51,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,6:0.116:57:27,3:21,3:31,20,4,2
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chr8	53477864	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,2,0
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chr8	53555069	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:4,6:6,8:6,5,6,8
chr8	53555092	.	CAAG	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=117,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:13,2:11,14,0,2
chr8	53569730	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=183,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,0:3,7:1,8,7,0
chr8	53570386	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=85,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:16,1:12,2:15,13,2,1
chr8	53570529	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,9,3
chr8	53597869	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr8	53852731	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:53852731_G_C:53852731:8,4,1,1
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chr8	53852741	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:53852731_G_C:53852731:7,4,1,1
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chr8	55542540	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,3:4,4:7,6,7,0
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chr8	57078933	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,5:3,1:7,4,4,2
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chr8	57295200	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,0:3,5:2,4,2,3
chr8	57353826	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=111,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:4,2,3,1
chr8	57358325	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:7,0,5,4
chr8	57358563	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:1,8,1,3
chr8	59059981	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.254:49:19,12:18,0:15,22,11,1
chr8	59060698	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,4:3,1:1,5,1,4
chr8	59060739	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=73,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,0:1,4,6,0
chr8	59060814	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=92,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:10,0:9,12,0,4
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chr8	59346928	.	ATTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=68,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.557:13:6,4:0,2:6,0,4,3
chr8	59409812	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	59411042	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:3,2,2,2
chr8	59484899	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,4:1,4:2,6,4,4
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chr8	59490843	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:59490839_G_GCTTGCTCTATAT:59490839:0,4,0,1
chr8	59498190	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=77,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,4:9,2:6,5,2,4
chr8	59498614	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr8	59499237	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr8	59500356	.	T	TAAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=243,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59500356_T_TAAGAAA:59500356:0,1,0,1
chr8	59500357	.	T	TTCGTCATTCGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=243,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59500356_T_TAAGAAA:59500356:0,1,0,1
chr8	59502578	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,0:13,2:14,11,2,0
chr8	59508076	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:9,9:14,9:16,7,16,2
chr8	59508244	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.550:29:7,8:6,7:1,12,1,15
chr8	59511756	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,2:6,2:10,4,4,0
chr8	59515756	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,2:1,6:7,0,6,2
chr8	59518439	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.290:33:7,0:8,7:7,17,4,5
chr8	59518611	.	A	AAAATAATAAAAT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATAATAAAAT;STR;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.524:24:5,0:6,12:1,10,3,10
chr8	59535859	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:1,5,5,3
chr8	59555731	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=682,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr8	59739333	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:6,3,4,2
chr8	59764368	.	CAATA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=130,56;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AATA;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.640:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	59852168	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr8	59872615	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,5:0,0,6,13
chr8	61135203	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.599:28:4,17:7,0:10,1,17,0
chr8	61144790	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr8	61504675	.	T	TCCCCTCCCTTCTGGAACTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=142,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	61504690	.	G	GGAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=142,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61504690_G_GGAAC:61504690:0,1,0,1
chr8	61504692	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=142,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61504690_G_GGAAC:61504690:0,1,0,1
chr8	61654746	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,143;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:10,13,0,2
chr8	61655690	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	61707725	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	61713126	.	A	ATGGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGACT;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	61714245	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr8	61732521	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	61732576	.	AGCTTTTTAAT	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:5,1:0|1:61732576_AGCTTTTTAAT_A:61732576:11,14,2,0
chr8	61732589	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:5,2:0|1:61732576_AGCTTTTTAAT_A:61732576:12,14,2,0
chr8	61734295	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	61734587	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:14,0:9,6:9,14,5,1
chr8	61748893	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr8	61750860	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	61757621	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:7,0:4,12,0,2
chr8	62411925	.	G	GAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	62415998	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=99,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:62415998_A_C:62415998:6,10,1,1
chr8	62416002	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=99,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:62415998_A_C:62415998:7,10,1,1
chr8	62416074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr8	62438506	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,0:5,2:6,3,1,1
chr8	62438530	.	A	G,C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31,20;MFRL=0,140,67;MMQ=60,60,60;MPOS=12,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=30.35,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.716,0.213:11:0,2,0:0,7,2:0,0,8,3
chr8	62475276	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,9,4
chr8	62475518	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	62479934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr8	62496421	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.649:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr8	62531670	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	62555359	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=180,232;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:2,0:13,3:15,0,3,0
chr8	62555416	.	GA	G,AA	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=24,28,20;MFRL=107,130,104;MMQ=57,60,60;MPOS=20,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.04,10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,6,18:0.126,0.318:51:9,2,4:8,2,6:23,4,5,19
chr8	62555482	.	GA	G,GAA	.	.	DP=108;ECNT=4;MBQ=32,31,20;MFRL=119,113,106;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=8.63,7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:77,9,8:0.091,0.081:94:17,5,1:44,4,3:11,66,1,16
chr8	62555525	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:16,0:24,4:1,40,0,4
chr8	62556084	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	62563764	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr8	62593664	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,3:3,5:2,7,0,8
chr8	62602295	.	CA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.255:32:3,4:14,4:5,19,1,7
chr8	62626962	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.886:7:0,3:0,1:0,0,1,6
chr8	62627004	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	63939866	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0,13,0,2
chr8	63948134	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr8	63948185	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.692:14:1,4:2,4:3,1,4,6
chr8	63948198	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,5:5,4:5,2,4,6
chr8	63976754	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=73,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:5,3,4,2
chr8	63978658	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr8	64081981	.	AT	A,ATT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=23,22,23;MFRL=124,104,104;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=15.00,11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,13,9:0.199,0.148:61:23,6,5:15,6,2:14,25,4,18
chr8	64098729	.	A	AG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=101.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,14,15
chr8	65494020	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=156,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr8	65495903	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=102,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:18,0:23,3:27,16,0,3
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chr8	66539706	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=111,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66539704_C_CTT:66539704:0,1,0,1
chr8	66616849	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr8	66631472	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=166,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,2,0
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chr8	66635837	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=122,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:14,2:0|1:66635834_AT_TA:66635834:12,18,1,1
chr8	66635839	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=122,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:7,14,1,1
chr8	66635850	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=123,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:5,2:13,2:0|1:66635850_AT_A:66635850:5,13,2,2
chr8	66635855	.	TC	CT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=123,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,2:11,2:0|1:66635850_AT_A:66635850:4,13,2,2
chr8	66639485	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,0:15,3:14,14,0,3
chr8	66992601	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=95,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.118:40:20,4:15,0:0|1:66992601_T_A:66992601:17,19,4,0
chr8	66992606	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=95,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:21,4:12,0:0|1:66992601_T_A:66992601:17,20,4,0
chr8	67039735	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67039735_A_G:67039735:0,2,0,1
chr8	67039741	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67039735_A_G:67039735:0,2,0,1
chr8	67039744	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0|1:67039735_A_G:67039735:0,2,0,1
chr8	67062047	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:18,1:5,2:9,14,1,2
chr8	67064891	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr8	67066241	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=85,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.295:11:6,2:2,1:7,1,2,1
chr8	67344690	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,3,0
chr8	67357073	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,170;MMQ=30,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr8	67357690	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=81,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr8	67361018	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=261,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr8	67361056	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr8	67361264	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=280,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	67380677	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	67488146	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	67514761	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,0:2,18,1,1
chr8	67514782	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:67514782_A_C:67514782:1,13,1,1
chr8	67514783	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:67514782_A_C:67514782:1,13,1,1
chr8	67578094	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=111,1209;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.267:43:17,11:14,0:17,15,0,11
chr8	67578614	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:4,12:12,0:10,6,13,0
chr8	67710676	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30,31;MFRL=2525,143,189;MMQ=60,60,60;MPOS=31,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.21,5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.376:5:0,0,0:2,1,2:2,0,3,0
chr8	67743575	.	G	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.052:92:61,0:26,4:48,40,0,4
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chr8	67759618	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:67759616_TT_CC:67759616:1,6,1,1
chr8	67786633	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,4:5,2:7,6,3,3
chr8	67795930	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,0,2
chr8	67813633	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr8	67817429	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,4,1
chr8	67900761	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,3:4,3:2,4,2,4
chr8	67970243	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr8	67999123	.	CT	C,CTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=18,20,20;MFRL=95,142,80;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.15,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,10:0.197,0.558:17:2,2,0:0,0,7:3,1,5,8
chr8	68030495	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=114,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:68030495_G_C:68030495:6,12,1,1
chr8	68030500	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=114,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:68030495_G_C:68030495:6,13,1,1
chr8	68030501	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:68030495_G_C:68030495:6,12,1,1
chr8	68030502	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:68030495_G_C:68030495:6,12,1,1
chr8	68049760	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=103,98;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,9:0.185:52:18,9:24,0:18,25,9,0
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chr8	70967727	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	70971086	.	C	CTTGCTACAATTCTGACCTGATAACTCTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=150,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.367:7:0,2:4,0:1,4,1,1
chr8	70981475	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:16,3:12,0:14,14,2,1
chr8	71037103	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,2:2,1:2,5,0,3
chr8	71038986	.	AACACTGGGGG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:2,0:5,3,1,1
chr8	71044202	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=103,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:12,0:9,4:7,14,0,4
chr8	71071695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr8	71075161	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=156,189;MMQ=53,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:71075161_T_A:71075161:0,4,0,1
chr8	71075163	.	T	TATACTCAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=156,189;MMQ=53,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:71075161_T_A:71075161:0,4,0,1
chr8	71075773	.	TGCC	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:14,0:0|1:71075773_TGCC_T:71075773:10,15,1,1
chr8	71075778	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:14,0:0|1:71075773_TGCC_T:71075773:9,15,1,1
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chr8	71487343	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,156;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr8	71499307	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=97,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.174:36:14,5:16,0:22,8,6,0
chr8	71499484	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=125,178;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	71499488	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71499488_A_G:71499488:0,3,0,1
chr8	71499490	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71499488_A_G:71499488:0,3,0,1
chr8	71499500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=77,152;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr8	71499504	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=125,178;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.378:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	71499510	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.381:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	71499511	.	AC	CT,TC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,34,24;MFRL=63,178,153;MMQ=60,24,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.49,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.324,0.327:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr8	71506634	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr8	71510093	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,9,1
chr8	71512349	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr8	71512377	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr8	71550058	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,15,11
chr8	71550708	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:10,2,4,0
chr8	71550879	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,23:0.378:61:27,0:11,22:8,30,0,23
chr8	71550895	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,6:1,6:0,2,3,9
chr8	71570217	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	71593198	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr8	71593663	.	CTTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	71619094	.	AATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=278,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr8	71646461	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=67,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,1:6,4:4,4,3,2
chr8	72111669	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=176,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,1:0|1:72111669_A_T:72111669:2,6,1,1
chr8	72111675	.	A	ATGAAGCAGTTTTTTTTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=176,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:72111669_A_T:72111669:2,6,1,1
chr8	72127737	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,147;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,0:9,7:8,7,0,7
chr8	72184154	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,0:14,3:8,16,0,3
chr8	72211295	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=105,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:10,9:4,7:9,5,13,3
chr8	72211834	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr8	72755040	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:1,5,1,7
chr8	72935039	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:72935039_C_T:72935039:0,0,1,0
chr8	72935045	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72935039_C_T:72935039:0,0,1,0
chr8	72938357	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	72942154	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=132,125;MMQ=51,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:11,7,2,0
chr8	72942210	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=135,144;MMQ=27,51;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:4,3,3,8
chr8	72946622	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.242:19:6,2:7,2:5,10,0,4
chr8	72958691	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,23,16;MFRL=138,181,112;MMQ=40,45,47;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.39,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.271,0.308:7:2,0,0:1,2,1:3,0,3,1
chr8	72962985	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=92,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:1,1,3,1
chr8	72965973	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=95,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:4,9:2,3:4,2,7,5
chr8	72965997	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:8,0:7,12,1,1
chr8	72966002	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,22;MFRL=95,119;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:4,5:4,4,5,7
chr8	72966015	.	CTTCAAATTAGTATCA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:8,0:6,12,1,1
chr8	72966124	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,2,2
chr8	72967790	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=155,41;MMQ=48,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:0|1:72967790_A_T:72967790:8,14,1,1
chr8	72967796	.	GTCTTGTAGGAGC	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,41;MMQ=51,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:72967790_A_T:72967790:8,13,1,1
chr8	72967811	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,41;MMQ=39,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:2,2:0|1:72967790_A_T:72967790:4,10,1,1
chr8	72969263	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr8	72971570	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:8,3:1,2:0|1:72971570_C_T:72971570:6,3,5,0
chr8	72971579	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:7,3:1,3:0|1:72971570_C_T:72971570:6,3,6,0
chr8	72974955	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr8	72975779	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:72975779_A_C:72975779:7,11,1,1
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chr8	73951274	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,12,1
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chr8	74204653	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=287,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr8	74495084	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.663:26:2,9:3,8:3,6,11,6
chr8	74495118	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:0,2:2,1:2,10,0,5
chr8	74585325	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:0,5:1,1:0,1,5,1
chr8	74791162	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=182,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0,8,1,3
chr8	74893716	.	AAAAC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:9,2:17,0:16,12,1,1
chr8	75262841	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr8	75262858	.	A	ATGGAACCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:75262858_A_ATGGAACCTG:75262858:0,4,0,1
chr8	75262861	.	A	AAGCCAGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:75262858_A_ATGGAACCTG:75262858:0,4,0,1
chr8	75272282	.	AATG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr8	75272356	.	T	TGTGTGTGCGTGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,1:6,7,1,1
chr8	75275312	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr8	75276468	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:75276468_A_C:75276468:4,5,1,1
chr8	75276470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:0|1:75276468_A_C:75276468:4,5,1,1
chr8	75276588	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=146,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr8	76452420	.	A	AACTTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	76463571	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr8	76465522	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	76468139	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr8	76468282	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,15:0,19:0,0,13,21
chr8	76468309	.	GTT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.937:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr8	76472560	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,13,5
chr8	77619912	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:7,2,1,2
chr8	77619973	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,0,2
chr8	77690380	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,562;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr8	77754940	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:15,9,2,0
chr8	77764017	.	GG	AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=107,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:5,0:5,5,0,2
chr8	77766149	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:8,4,0,3
chr8	77766403	.	AG	CC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=105,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:11,1:20,3:26,9,1,3
chr8	77775437	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:7,0:18,3:8,17,0,3
chr8	77775732	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:11,2:8,0:0|1:77775732_A_G:77775732:7,12,1,1
chr8	77775736	.	C	CTATGAGTTTTAAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:7,0:0|1:77775732_A_G:77775732:7,11,1,1
chr8	77776848	.	TA	T	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=102.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,32:0.894:35:1,8:1,21:0|1:77776848_TA_T:77776848:0,3,2,30
chr8	77776859	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=195,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,3:0.102:37:9,2:24,1:1|0:77776848_TA_T:77776848:2,32,0,3
chr8	77776860	.	A	AC	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=195,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,3:0.103:37:10,2:23,1:1|0:77776848_TA_T:77776848:2,32,0,3
chr8	77776862	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=34,21;MFRL=195,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,3:0.102:37:8,2:24,1:1|0:77776848_TA_T:77776848:2,32,0,3
chr8	77776873	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=170,195;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.438:30:8,0:9,13:0|1:77776873_C_T:77776873:1,16,0,13
chr8	77776883	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,21;MFRL=183,195;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:2,0:7,13:0|1:77776873_C_T:77776873:0,12,0,13
chr8	77896389	.	T	TGTCTCTC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=110,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:3,17,0,2
chr8	79598666	.	GTTTA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TTTA;STR;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.863:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	79601420	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	79610792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=90,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr8	79610815	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0|1:79610815_T_C:79610815:0,3,0,1
chr8	79610818	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79610815_T_C:79610815:0,2,0,1
chr8	79610820	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79610815_T_C:79610815:0,2,0,1
chr8	79610828	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79610815_T_C:79610815:0,2,0,1
chr8	79627651	.	GCTATTTATAGAA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	80678062	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=235,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr8	80831393	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr8	80962814	.	T	TCCTGACCTCAGGTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	81399047	.	TGTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=85,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:2,3:3,2,2,4
chr8	81430865	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:4,10,0,2
chr8	81571857	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=80,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.093:62:24,5:30,0:26,31,5,0
chr8	81577080	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=70,60;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,3:24,0:26,22,3,0
chr8	81605263	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:6,11,1,1
chr8	81889106	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=114,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:81889106_T_G:81889106:5,16,1,1
chr8	81889115	.	A	AGACAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=114,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:81889106_T_G:81889106:5,16,1,1
chr8	81889117	.	T	TTTAAATC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:81889106_T_G:81889106:4,16,1,1
chr8	81897188	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.138:41:21,5:15,0:18,18,5,0
chr8	82395312	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=90,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,0:0|1:82395312_C_CA:82395312:7,4,1,1
chr8	82395316	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:82395312_C_CA:82395312:8,4,1,1
chr8	82395318	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=95,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:82395312_C_CA:82395312:8,4,1,1
chr8	82443387	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr8	82606180	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,3:2,8,0,4
chr8	82606967	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=102,240;MMQ=60,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.380:40:14,15:11,0:14,11,15,0
chr8	82713846	.	A	ATGTGGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:1,1:6,3:2,5,0,4
chr8	82713853	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:82713853_C_A:82713853:0,5,2,0
chr8	82713857	.	TC	AA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:82713853_C_A:82713853:0,5,2,0
chr8	82713930	.	A	AGAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	82727515	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:1,5:4,5:0|1:82727515_C_T:82727515:4,1,11,0
chr8	82727520	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:0|1:82727515_C_T:82727515:4,1,10,0
chr8	82727623	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:7,0:13,3:0|1:82727623_T_A:82727623:4,16,0,3
chr8	82727629	.	G	GCACTCTGCAAAAAATCAAAACAAA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,41;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:7,0:9,3:0|1:82727623_T_A:82727623:4,15,0,3
chr8	82727640	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:4,3:1,5,0,4
chr8	82741576	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	82751822	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:3,0,7,3
chr8	82752291	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	85097243	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.216:37:15,0:12,6:21,8,0,8
chr8	85441636	.	A	AATTAGTAGATTAGGTAACTGTTGAAAT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:8,2:14,0:0|1:85441636_A_AATTAGTAGATTAGGTAACTGTTGAAAT:85441636:9,15,0,2
chr8	85441638	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,2:13,0:0|1:85441636_A_AATTAGTAGATTAGGTAACTGTTGAAAT:85441636:9,15,0,2
chr8	85441856	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:2,3:2,2:1,3,3,2
chr8	85686975	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr8	85716963	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=86,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:7,4:18,8:11,14,7,5
chr8	85774738	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr8	85799827	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,1:12,2:7,12,2,1
chr8	86048000	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr8	86050404	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,210;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.109:62:25,6:31,0:19,37,6,0
chr8	86114525	.	T	TTTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr8	86121311	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr8	86126827	.	C	CAACATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=126.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,11:0,0,17,14
chr8	86158217	.	TTAAAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	86163230	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,3:0,0:0,0,0,5
chr8	86171786	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr8	86171816	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	86180906	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	86180944	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	86240893	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=94,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:16,1:7,4:8,16,2,3
chr8	86250709	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	86253982	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	86354323	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:6,3:5,4,2,1
chr8	86357400	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:21,2:10,0:0|1:86357400_G_T:86357400:20,11,1,1
chr8	86357402	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:21,2:10,0:0|1:86357400_G_T:86357400:20,11,1,1
chr8	86360458	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	86386697	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=72,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr8	86388200	.	G	GTTTTTTGTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=229,176;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:86388200_G_GTTTTTTGTCC:86388200:0,1,0,1
chr8	86388201	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=229,176;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:86388200_G_GTTTTTTGTCC:86388200:0,1,0,1
chr8	86389586	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	87060672	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=206,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:2,0,2,1
chr8	87076150	.	C	A,G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20,25;MFRL=0,67,336;MMQ=60,60,60;MPOS=17,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.428,0.429:4:0,0,1:0,2,1:0,0,3,1
chr8	87076164	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=179,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr8	87076694	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:10,6,1,1
chr8	87151606	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr8	87151702	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,6:8,0:8,5,6,0
chr8	87414157	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr8	87440101	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr8	87460609	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=124,71;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.220:34:18,7:9,0:16,11,6,1
chr8	87460668	.	A	ATCAT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:24,0:8,2:15,17,1,1
chr8	87464759	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.361:20:5,5:8,2:12,1,7,0
chr8	87543280	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=51,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,3,2
chr8	87544832	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:11,5:5,8:4,12,6,7
chr8	87552426	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.333:43:14,10:15,4:19,10,10,4
chr8	87557153	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=116,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	87567031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	87567291	.	TTGTCA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87567291_TTGTCA_T:87567291:0,1,0,1
chr8	87567301	.	AC	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87567291_TTGTCA_T:87567291:0,1,0,1
chr8	87568644	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	87570665	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr8	87570728	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	87590947	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,0:6,2:10,8,1,1
chr8	87679098	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr8	87680406	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:2,1:0,6,0,3
chr8	87751848	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.579:9:4,4:0,1:3,1,5,0
chr8	87751911	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=73,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.120:44:18,2:20,2:9,30,0,5
chr8	87755872	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,0:4,3:6,9,1,2
chr8	87878846	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=82,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr8	88218202	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:5,3:1,2:6,0,5,0
chr8	88218392	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:10,2:3,1:0|1:88218392_T_TG:88218392:1,12,0,3
chr8	88218396	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=130,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:10,2:3,1:0|1:88218392_T_TG:88218392:1,13,0,3
chr8	89081541	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr8	89081611	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=108,105;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,4:8,0:6,8,3,1
chr8	89081730	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=71,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:8,5:0,3:4,4,2,6
chr8	89128923	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=99,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:18,0:19,4:17,21,0,4
chr8	89198831	.	CAAAAAAAAA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=96,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=24,15;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,0:1,1:3,7,1,1
chr8	89339490	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=140,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:2,8,0,2
chr8	89339507	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:89339507_C_CAA:89339507:0,3,0,1
chr8	89339510	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:89339507_C_CAA:89339507:0,3,0,1
chr8	90782136	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,124;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,3:14,0:14,19,3,0
chr8	90936965	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr8	90955624	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,7:1,5:0,3,1,11
chr8	90958530	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=76,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:8,8:2,3:7,4,3,8
chr8	90959972	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.183:17:8,2:6,1:12,2,2,1
chr8	90967711	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.577:36:5,7:10,12:6,9,10,11
chr8	90967862	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	90970862	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=303,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr8	90970935	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,3:3,2:7,2,4,1
chr8	91031074	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,8,1
chr8	91031349	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,3:16,0:13,16,3,0
chr8	91064036	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,8:6,6:7,3,7,7
chr8	91094983	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.427:33:11,4:8,10:5,14,3,11
chr8	91657389	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=86,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:91657389_G_C:91657389:12,11,1,1
chr8	91657391	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=86,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:91657389_G_C:91657389:12,11,1,1
chr8	91937797	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:8,6,1,1
chr8	91963460	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=117,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:0|1:91963460_T_C:91963460:7,15,1,1
chr8	91963466	.	CTTTTGT	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:0|1:91963460_T_C:91963460:6,15,1,1
chr8	91963473	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:8,0:0|1:91963460_T_C:91963460:2,14,1,1
chr8	91963475	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:7,0:0|1:91963460_T_C:91963460:1,13,1,1
chr8	92082753	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,2,12
chr8	92090573	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr8	92139254	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr8	92307795	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:8,0:8,3:9,7,2,1
chr8	92307978	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,1,6
chr8	92374655	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:15,0:16,12,4,0
chr8	93088151	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr8	94715965	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:1,10,2,7
chr8	94730995	.	TGATGAA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=109,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GATGAA;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:5,2:21,0:12,14,1,1
chr8	94746698	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=98,81;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.484:25:4,7:8,5:7,6,7,5
chr8	94767290	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:13,8:25,0:17,21,9,0
chr8	94772083	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=213,155;MMQ=59,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr8	94794804	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	94808165	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,26:0,25:0,0,14,37
chr8	94816007	.	T	TATGGTTCAGAACTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr8	94822199	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=193,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:2,0:1,5,1,1
chr8	94934317	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=99,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.184:30:16,0:8,4:0|1:94934317_T_C:94934317:12,13,0,5
chr8	94934323	.	CC	TT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=98,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:14,0:6,1:0|1:94934317_T_C:94934317:11,13,0,5
chr8	94934326	.	T	TGGAAGACAGATTTTCATGATGTAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=98,67;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:6,1:0|1:94934317_T_C:94934317:10,10,0,2
chr8	94937549	.	G	GT,GTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32,28;MFRL=97,108,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=22.25,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,16,6:0.535,0.174:31:6,9,1:3,4,3:4,5,8,14
chr8	95140401	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=218,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,1,1
chr8	95142979	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=115,189;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:0|1:95142979_G_C:95142979:9,8,0,3
chr8	95142984	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=115,189;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:0|1:95142979_G_C:95142979:9,8,0,3
chr8	95158146	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=71,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,6:0,1:2,1,5,2
chr8	95160898	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=111,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr8	95160949	.	GTTT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:3,0:4,1,2,1
chr8	95161007	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=95,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:11,3:22,3:15,20,0,6
chr8	95172338	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=93,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:9,4:21,0:14,17,0,4
chr8	95182986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.690:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr8	95186142	.	ATTCT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:8,2:9,8,1,1
chr8	95186295	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr8	95186382	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.237:23:10,2:8,3:9,9,3,2
chr8	95186403	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:10,0:10,3:13,8,3,0
chr8	95189780	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:3,5:5,0,4,3
chr8	95206799	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=85,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:6,1,4,2
chr8	95390921	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	95419600	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:95419600_C_T:95419600:2,0,1,0
chr8	95419606	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:95419600_C_T:95419600:2,0,1,0
chr8	95423551	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:7,2:13,0:3,18,1,3
chr8	95423564	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:8,3:11,0:0|1:95423564_C_G:95423564:6,13,0,3
chr8	95423566	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:8,3:10,0:0|1:95423564_C_G:95423564:6,13,0,3
chr8	95448941	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=94,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,2:15,0:13,13,2,0
chr8	95470697	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr8	95504224	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	95521853	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,23,23;MFRL=100,42,0;MMQ=60,60,60;MPOS=5,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=AC;STR;TLOD=3.28,6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,3:0.111,0.167:21:1,1,0:12,1,3:12,4,3,2
chr8	95524209	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,5:0,0,10,7
chr8	95541223	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr8	95541663	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	95547005	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.706:11:2,7:1,0:1,2,6,2
chr8	95547119	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,17,2
chr8	95565515	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.376:27:6,4:10,5:14,3,10,0
chr8	95565538	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,27,5
chr8	95655497	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.140:20:12,0:6,2:10,8,1,1
chr8	95658526	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,2,14
chr8	95658562	.	A	AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr8	95674432	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr8	95674823	.	GT	G,GTT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=17,24,32;MFRL=149,118,114;MMQ=60,56,60;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.16,24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,19:0.148,0.689:27:1,4,9:1,0,4:1,3,14,9
chr8	95676987	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:9,1:20,2:8,21,2,1
chr8	95677132	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr8	95718028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	95746828	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=102,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:3,2:5,1,2,0
chr8	95750546	.	CA	C,CAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31,33;MFRL=127,198,132;MMQ=60,40,40;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.06,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,5:0.288,0.224:22:5,3,2:2,3,2:7,3,11,1
chr8	95750744	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=175,141;MMQ=51,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:3,0:1,5,1,5
chr8	95750766	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=193,195;MMQ=58,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:14,0:3,2:1,16,0,2
chr8	95773915	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:9,0:11,2,1,1
chr8	95780612	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=128,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,5:9,0:12,5,5,0
chr8	95780667	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:21,0:12,2:0|1:95780667_C_T:95780667:16,17,1,1
chr8	95780690	.	C	CCTTTCGGGTTCAA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:25,0:15,2:0|1:95780667_C_T:95780667:18,23,1,1
chr8	95793284	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0|1:95793284_AT_A:95793284:4,0,3,0
chr8	95793310	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=42,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.302:11:2,0:3,0:0|1:95793284_AT_A:95793284:4,4,3,0
chr8	95800325	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr8	95844438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	95850943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr8	95853708	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,3:4,5:6,3,6,2
chr8	95853907	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	95861785	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.448:32:6,9:11,5:6,12,7,7
chr8	95861825	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:0,8,1,6
chr8	95866213	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,1:5,1:0,16,0,2
chr8	95866218	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:7,5:2,4:0,9,0,9
chr8	95866234	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=156,133;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:5,2:5,0:0|1:95866234_T_A:95866234:0,12,0,2
chr8	95866236	.	TG	CC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=156,133;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:95866234_T_A:95866234:0,12,0,2
chr8	95878253	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr8	95906554	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	95952477	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr8	95952492	.	G	GGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=84,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr8	95952508	.	A	AGGCCTGTTGATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	96047621	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:2,0,8,0
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chr8	99045454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	99045978	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	99048049	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr8	99054796	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr8	99057150	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=116,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:7,13:3,3:5,5,11,6
chr8	99057526	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=61,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:6,5,5,2
chr8	99102324	.	G	GGCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=34637749,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99102324_G_GGCACA:99102324:1,0,0,1
chr8	99102326	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=34637749,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99102324_G_GGCACA:99102324:1,0,0,1
chr8	99102331	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=34637749,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99102324_G_GGCACA:99102324:1,0,0,1
chr8	99114970	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,2:2,1:4,0,3,0
chr8	99115144	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,31;MFRL=85,169;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:8,3:3,4:5,6,3,4
chr8	99115173	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=145,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0|1:99115173_C_T:99115173:3,7,1,1
chr8	99115176	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=145,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:3,2:0|1:99115173_C_T:99115173:3,7,1,1
chr8	99115181	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:99115173_C_T:99115173:2,4,1,1
chr8	99115183	.	AC	TT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:99115173_C_T:99115173:2,4,1,1
chr8	99115187	.	T	TAAAA	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,1:0|1:99115173_C_T:99115173:2,4,1,1
chr8	99118654	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	99121035	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=124,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.803:8:1,1:0,5:0|1:99121035_GC_G:99121035:0,1,0,7
chr8	99121038	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=124,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0|1:99121035_GC_G:99121035:0,1,0,7
chr8	99140544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr8	99146337	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr8	99146931	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr8	99152269	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.334:28:10,8:8,1:15,4,8,1
chr8	99153126	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=90,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:6,2:5,3:6,6,1,4
chr8	99153160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr8	99158778	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,6:9,4:8,10,7,3
chr8	99160957	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr8	99162823	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:2,3:11,4:6,8,3,4
chr8	99162888	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=81,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr8	99170045	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=153,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:99170045_T_C:99170045:8,7,1,1
chr8	99170051	.	G	GCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,0:9,2:0|1:99170045_T_C:99170045:8,7,1,1
chr8	99170300	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0,5,2,0
chr8	99205612	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=152,91;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.470:36:8,9:11,7:11,8,11,6
chr8	99208065	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr8	99440949	.	G	GAAGACCC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:99440949_G_GAAGACCC:99440949:5,9,0,2
chr8	99440951	.	G	GCTCAGCACTGAGTA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,0:6,2:0|1:99440949_G_GAAGACCC:99440949:5,9,0,3
chr8	99442005	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.095:47:18,1:25,3:19,24,3,1
chr8	100287517	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.869:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr8	100287579	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	100454928	.	T	TCATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,26;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:100454928_T_TCATC:100454928:0,1,0,1
chr8	100454930	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,21;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100454928_T_TCATC:100454928:0,1,0,1
chr8	100479795	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,1:11,5:10,9,2,4
chr8	100514124	.	GTCCC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=93,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCCC;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr8	100779180	.	A	AACC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=138,52;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.241:12:5,2:4,0:0|1:100779180_A_AACC:100779180:4,6,1,1
chr8	100779181	.	T	TTCTGAAGTTCATCCCAGTATTCCAAGCTACAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,52;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.241:12:4,2:4,0:0|1:100779180_A_AACC:100779180:4,6,1,1
chr8	100844816	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,3:8,0:4,14,1,2
chr8	100865808	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=99,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:5,0:12,5:12,6,0,5
chr8	100871768	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100871768_A_AT:100871768:0,1,0,1
chr8	100871769	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100871768_A_AT:100871768:0,1,0,1
chr8	100871771	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100871768_A_AT:100871768:0,1,0,1
chr8	100974901	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:9,8,1,1
chr8	100975002	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr8	101016427	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	101020539	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,3:12,0:14,2,1,2
chr8	101020597	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:19,5:19,0:19,20,5,0
chr8	101075803	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:5,0:10,4:11,4,2,2
chr8	101083863	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=240,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	101105704	.	CT	AC	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:23,0:22,2:19,27,1,1
chr8	101117554	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=105,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.747:17:2,6:2,7:2,2,8,5
chr8	101117734	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr8	101174426	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr8	101203737	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=79,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:10,7:3,4:5,8,4,7
chr8	101206459	.	A	AGAC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.557:50:12,13:10,13:11,11,11,17
chr8	101206531	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.605:36:10,10:4,12:3,11,7,15
chr8	101226230	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:5,2:1,0:0,7,0,2
chr8	101232421	.	TCAGTACTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=208,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:3,0,7,1
chr8	101232701	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:4,6:3,5:1,6,4,8
chr8	101253092	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,20,29;MFRL=100,101,128;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=3.51,6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.307,0.291:19:5,1,2:2,4,3:7,0,7,5
chr8	101271244	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,5:0.068:86:44,5:36,0:47,34,5,0
chr8	101271552	.	G	GGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,2416;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101271552_G_GGTGC:101271552:0,1,1,0
chr8	101271555	.	GAAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=190,2416;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101271552_G_GGTGC:101271552:0,1,1,0
chr8	101273915	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:20,0:24,4:26,20,3,1
chr8	101280922	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=118,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr8	101281238	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,0,17
chr8	101281271	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,3:6,1:0,6,0,4
chr8	101596486	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr8	101612741	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr8	101625336	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,0:1,5:1,2,1,4
chr8	101661603	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:5,4,7,2
chr8	101661634	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,3,1
chr8	101717109	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:9,1,2,0
chr8	101725026	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.389:29:5,6:6,4:3,14,3,9
chr8	101725036	.	G	GA,A,GAA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=17,16,27,18;MFRL=141,123,158,101;MMQ=60,60,60,59;MPOS=24,14,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.07,9.26,7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,13,10:0.124,0.452,0.371:28:0,0,2,2:0,0,9,1:0,1,4,23
chr8	101725251	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:2,5:2,7:2,2,10,2
chr8	101937057	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr8	101960857	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.373:33:11,6:9,6:6,15,3,9
chr8	101965250	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.685:8:1,0:0,2:0,2,0,6
chr8	102212183	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:2,3:4,2:5,1,5,0
chr8	102212398	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr8	102213785	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	102504950	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:30,0:23,2:0|1:102504950_C_T:102504950:35,20,0,2
chr8	102504952	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.050:57:31,0:24,2:0|1:102504950_C_T:102504950:35,20,0,2
chr8	102504974	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,36:0,31:0,0,37,30
chr8	102555655	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:8,10,1,1
chr8	102585806	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr8	103220351	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=85.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,20,9
chr8	103230953	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=211,189;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr8	103231180	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr8	103236414	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:0,3:2,0:0,3,0,3
chr8	103244557	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr8	103244623	.	G	GAGTTTTGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=193,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103244623_G_GAGTTTTGTTCT:103244623:0,1,0,1
chr8	103244625	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=193,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103244623_G_GAGTTTTGTTCT:103244623:0,1,0,1
chr8	103250930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=266,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr8	103271415	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=212,84;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr8	103289116	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr8	103293576	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:12,2:5,0:0|1:103293576_G_A:103293576:6,11,1,1
chr8	103293586	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:11,1:3,0:0|1:103293576_G_A:103293576:4,10,1,1
chr8	103297772	.	T	TTCTC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:13,2:8,0:0|1:103297772_T_TTCTC:103297772:11,10,0,2
chr8	103297778	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:0|1:103297772_T_TTCTC:103297772:11,10,0,2
chr8	103317265	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:8,3,3,0
chr8	103323792	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr8	103323901	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr8	103326234	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr8	103339881	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr8	103358718	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr8	103372743	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	103373304	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:6,5:4,2:8,2,7,0
chr8	103564198	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:14,2:3,6:5,13,2,6
chr8	103572992	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.357:21:7,2:7,5:0|1:103572992_C_G:103572992:8,6,3,4
chr8	103573010	.	CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.304:31:4,3:8,5:0|1:103572992_C_G:103572992:12,10,3,6
chr8	103665649	.	TTATAG	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,16:0.321:51:15,6:17,10:22,13,11,5
chr8	103842245	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=164,206;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:2,0:1,1:0,3,0,3
chr8	104054513	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:6,4:9,1:15,0,5,0
chr8	104068005	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=149,155;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,4:4,0:10,1,4,0
chr8	104331088	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr8	104336672	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,4,0
chr8	104343822	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	104383896	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:5,0,4,0
chr8	104388007	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.140:41:12,5:19,0:19,17,5,0
chr8	104388288	.	TAAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=A;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	104394631	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr8	104394744	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=90,86;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.310:43:21,11:9,2:17,13,2,11
chr8	104426910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr8	104427745	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=130,42041311;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:1,7,0,2
chr8	104452281	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr8	104452313	.	C	CAAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0,0,6,2
chr8	104452554	.	A	ATAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	104453603	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:5,1,4,0
chr8	104513343	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:1,4,3,4
chr8	104709594	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr8	104778619	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:104778619_T_TG:104778619:13,10,1,1
chr8	104778621	.	A	AAACTGAACAACCT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:0|1:104778619_T_TG:104778619:13,10,1,1
chr8	104897660	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:8,1,3,4
chr8	104898270	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=110,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:6,0:13,3:12,8,0,3
chr8	104898305	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,0:16,2:11,15,2,0
chr8	104927643	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr8	104930646	.	C	CT,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26,34;MFRL=124,83,191;MMQ=60,60,60;MPOS=10,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=15.27,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,13,3:0.491,0.153:25:5,6,3:4,5,0:7,2,11,5
chr8	104934028	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,16854229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr8	104948947	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,3:9,2:6,7,2,3
chr8	104949032	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=233,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr8	105026943	.	T	TTTTATTTTGTTTTCCCTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=210,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	105360983	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,5:7,2:8,3,1,6
chr8	105367096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr8	105459793	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr8	105463690	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr8	105502896	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,1:17,2:19,10,2,1
chr8	105601198	.	A	ACGCCGCCGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=CGC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.465:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	106646683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr8	106813474	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.299:34:13,9:11,0:14,10,0,10
chr8	107371924	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr8	107531104	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:10,1,3,0
chr8	107670141	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=203,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.601:11:3,2:1,2:4,0,7,0
chr8	107754583	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr8	107782026	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=80,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,0:11,3:8,10,1,2
chr8	108315576	.	TTTTCCTCCCTTTAGTAAAACTGCAAAAAAAAAAAAAAAGATTGCAATATGTGAATATCAGTACCATTAGTAGCCAAACTGACTCCAATAATAGCTAAGCATGTCTTCA	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=108,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,8:0.116:53:17,2:14,1:15,30,0,8
chr8	108509885	.	G	GCTATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr8	108970264	.	T	TCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,2,4
chr8	108970367	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,14,10
chr8	109214083	.	GT	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,186;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,2:18,1:23,15,2,1
chr8	109215368	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=67,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:1,3,0,3
chr8	109229529	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr8	109254003	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=114,7812691;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:2,2:8,4,2,0
chr8	109260776	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.194:17:8,1:5,1:10,4,2,1
chr8	109260983	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,3:7,0:0,9,1,2
chr8	109455802	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr8	109456058	.	GCTGAGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	109462791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=378,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,8:0,3:0,1,0,11
chr8	109468230	.	T	TAGAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr8	109491399	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	109498656	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	109498717	.	C	CTTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=58,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=T;STR;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.817:13:1,3:1,4:2,0,6,5
chr8	109796657	.	AG	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:4,8,0,2
chr8	110100230	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr8	110100543	.	GAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.492:5:0,0:3,2:0|1:110100543_GAAA_G:110100543:2,1,1,1
chr8	110100548	.	TCC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=153,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.496:5:0,0:2,2:0|1:110100543_GAAA_G:110100543:2,1,1,1
chr8	110100622	.	C	CACCTTCAGACAACTAAATCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	110293184	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.525:12:5,2:1,4:3,3,6,0
chr8	110305602	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=102,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.288:43:13,0:18,12:15,16,1,11
chr8	110376861	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=83,62;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,1:3,4:7,2,3,2
chr8	110397738	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr8	110400698	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.375:37:11,8:12,6:12,11,8,6
chr8	110413824	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,10:0,0,10,19
chr8	110417448	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr8	110417449	.	G	C,GCATATCATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33,32;MFRL=91,169,181;MMQ=60,60,60;MPOS=10,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr8	110417453	.	A	AT,AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,22,26;MFRL=91,169,181;MMQ=60,60,60;MPOS=6,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr8	110425552	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr8	110425594	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr8	110439150	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,149;MMQ=55,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr8	110439166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=83,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,2:3,0,3,0
chr8	110439478	.	T	TCTGACTCCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	110448635	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:5,4:3,6:3,5,5,6
chr8	110448763	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:110448763_C_CT:110448763:0,3,0,1
chr8	110448766	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:110448763_C_CT:110448763:0,3,0,1
chr8	110448770	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,27;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:110448763_C_CT:110448763:0,3,0,1
chr8	110453466	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:2,4:9,4:9,3,6,2
chr8	110454460	.	C	CTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,9;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:110454460_C_CTTTT:110454460:0,3,0,1
chr8	110454466	.	C	CTTTTTTTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:110454460_C_CTTTT:110454460:0,3,0,1
chr8	110454523	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	110457937	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	110461518	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr8	110471796	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr8	110473907	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	110473965	.	AA	TT,ATA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26,30;MFRL=0,142,136;MMQ=60,60,60;MPOS=10,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.16,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.615,0.302:7:0,3,2:0,2,0:0,0,6,1
chr8	110473966	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.905:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr8	110491840	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:7,11:4,3:3,8,8,6
chr8	110491877	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=168,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.579:22:5,10:4,2:0,9,6,7
chr8	110491964	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	110495192	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,5:3,7:8,3,5,7
chr8	110499063	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,6:1,2:0,2,1,8
chr8	110504088	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=73,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:1,4:1,1,3,3
chr8	110505886	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:1,8:2,5:2,1,9,4
chr8	110510963	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:7,16,0,3
chr8	110516527	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,6:4,5:3,2,11,0
chr8	110519814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=164,417;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr8	110523207	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:2,4,1,5
chr8	110527556	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr8	110587744	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=123,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.174:32:10,5:17,0:17,10,4,1
chr8	110588229	.	C	CTGACACCATGTTGGTGAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr8	110656746	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=85,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr8	110656773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr8	113254070	.	TGC	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=115,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:2,1:3,5,0,3
chr8	113254073	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=CA;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.239:10:4,0:3,2:1,7,0,2
chr8	113254085	.	ACG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=126,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr8	113254087	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	113266554	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:13,2:0|1:113266554_C_T:113266554:7,14,1,1
chr8	113266560	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:113266554_C_T:113266554:7,13,1,1
chr8	113266567	.	A	AAAATGAAGGGCGACTACAGAC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:113266554_C_T:113266554:5,13,1,1
chr8	113293518	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:18,3:18,0:17,19,3,0
chr8	113301548	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	113305008	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:113305008_A_AAC:113305008:0,3,0,1
chr8	113305009	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:113305008_A_AAC:113305008:0,3,0,1
chr8	113308243	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:3,6:1,3:1,3,1,9
chr8	113314099	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=101,34;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:3,0:12,2:0|1:113314099_C_T:113314099:5,11,1,1
chr8	113314107	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=115,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:10,1:0|1:113314099_C_T:113314099:5,9,1,1
chr8	113318473	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	113323406	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=80,323;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:0,0:3,0:0,6,0,2
chr8	113326701	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:7,7,2,0
chr8	113363350	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr8	113363511	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,6:5,0:2,5,3,3
chr8	113364574	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	113420495	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr8	113485014	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=190,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr8	113516209	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:2,1:0,7:0,2,2,6
chr8	113585637	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr8	113697567	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	113702131	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,4:8,3:6,9,3,4
chr8	113842039	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=50,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,3,2
chr8	113959958	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr8	113988440	.	A	ATCTGAGAACCTCAGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=107,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr8	114111250	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	116427166	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,3:11,0:15,11,3,0
chr8	116427216	.	CA	GC	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=94,106;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.085:57:27,4:24,0:25,28,4,0
chr8	116599199	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=235,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr8	116599863	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,0:2,11:0,4,0,11
chr8	116616195	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:18,0:19,6:23,14,2,4
chr8	116616346	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=143,136;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:7,5:10,0:0|1:116616346_G_A:116616346:7,11,5,0
chr8	116616356	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=143,136;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:8,5:10,0:0|1:116616346_G_A:116616346:6,12,5,0
chr8	116617008	.	GAT	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.092:32:15,2:12,1:0|1:116617008_GAT_G:116617008:13,16,1,2
chr8	116617011	.	GGACT	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.082:36:15,2:12,1:0|1:116617008_GAT_G:116617008:15,18,1,2
chr8	116617018	.	TTAGAGTTTTTCTCTGAAGGTTTTGCAACCTCAGAGGAGGGGAGA	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=111,44;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.060:49:16,2:13,1:0|1:116617008_GAT_G:116617008:21,25,1,2
chr8	116635872	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.447:16:5,2:4,5:4,5,3,4
chr8	116635942	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	117779046	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=79,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr8	117782385	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr8	117861310	.	AA	TT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:2,3:4,0:0|1:117861310_AA_TT:117861310:0,7,0,3
chr8	117861314	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:0|1:117861310_AA_TT:117861310:0,7,0,3
chr8	117864952	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.291:20:5,1:5,3:1,13,2,4
chr8	117868531	.	TAAAA	T,TAAA	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=9,28,26;MFRL=0,106,125;MMQ=60,60,60;MPOS=26,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,19,22;RU=A;STR;TLOD=6.00,17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,10:0.212,0.679:14:0,0,6:0,3,3:0,1,3,10
chr8	117868556	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=30,15;MFRL=131,0;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.195:18:4,1:11,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,15,3,0
chr8	117868559	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=34,13;MFRL=131,0;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.195:18:4,0:11,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,15,3,0
chr8	117868566	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=32,16;MFRL=147,62;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,17,2,0
chr8	117868571	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=155,62;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,18,2,0
chr8	117868576	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=163,62;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:9,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,17,2,0
chr8	117868579	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=33,22;MFRL=163,62;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,1:7,0:0|1:117868556_T_A:117868556:0,15,2,0
chr8	118165149	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr8	118169942	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=106,47;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.101:55:22,0:27,5:23,27,5,0
chr8	118183499	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=189,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	118184889	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:9,0:9,8:11,8,0,8
chr8	118533382	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr8	118540863	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=74,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,4,2
chr8	118819578	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,11,10
chr8	118830820	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr8	118832020	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:0,7:5,4:3,2,4,7
chr8	118834871	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr8	119451983	.	ATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr8	119592918	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:5,0,6,1
chr8	119936882	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,1:11,1:12,11,1,1
chr8	119938725	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:8,4,1,1
chr8	119940920	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,4:1,2:6,0,5,1
chr8	119941173	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=95,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,5:1,6:0,1,2,9
chr8	119945166	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:3,4,6,1
chr8	120102007	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:4,15,1,2
chr8	120103566	.	ACCTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120103566_ACCTT_A:120103566:0,0,0,1
chr8	120103571	.	GAAGCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=225,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:120103566_ACCTT_A:120103566:0,1,0,1
chr8	120428697	.	CAGGGGGAAGGCGAGCAGTGCCAATCTACAGCGAAGAAAGTCTCGTTTGGTAAAAGCGAG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.117:33:5,0:2,3:19,6,6,2
chr8	120429282	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr8	120580546	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.782:15:0,5:2,3:0,3,1,11
chr8	120581643	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr8	120583148	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	120602908	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0|1:120602908_C_T:120602908:0,0,5,13
chr8	120602914	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,5:0,8:0|1:120602908_C_T:120602908:0,0,2,14
chr8	120613747	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=135,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,6:0,6:0,1,5,7
chr8	120631657	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	120790351	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=137,52;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:8,7,0,3
chr8	120793215	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=153,176;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,0:5,1,2,0
chr8	120795815	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,0:8,5:6,6,0,5
chr8	120797354	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr8	120797383	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:9,1,5,0
chr8	120797500	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:15,2:2,0:0|1:120797500_T_C:120797500:1,16,0,2
chr8	120797503	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:15,2:2,0:0|1:120797500_T_C:120797500:1,16,0,2
chr8	120797506	.	C	CTCCTCCTTCTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,2:2,0:0|1:120797500_T_C:120797500:1,16,0,2
chr8	120843934	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:4,18,0,3
chr8	120867793	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=204,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,0:2,1:0|1:120867793_C_T:120867793:3,0,1,0
chr8	120867795	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=204,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,0:2,1:0|1:120867793_C_T:120867793:3,0,1,0
chr8	120940800	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,2:16,1:15,11,1,2
chr8	120941953	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=214,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr8	121013770	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,1:1,0,2,1
chr8	121061912	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,2:13,0:0|1:121061912_T_C:121061912:13,19,1,1
chr8	121061923	.	A	AGTCCAGCTTC	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:13,0:0|1:121061912_T_C:121061912:11,22,1,1
chr8	121219213	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:19,2:14,2:17,16,2,2
chr8	121262775	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr8	121267617	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,16:0,3:0,0,6,13
chr8	121290573	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr8	121292407	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	121292858	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=86,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,2,0
chr8	121293142	.	CTTTT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33,30;MFRL=150,107,144;MMQ=60,60,60;MPOS=24,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.61,28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,12:0.123,0.652:18:1,2,7:2,0,4:3,1,14,0
chr8	121293331	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr8	121301986	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.097:48:30,0:13,4:28,16,2,2
chr8	121309679	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr8	121309862	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,7:0,0,10,11
chr8	121313142	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=216,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:121313142_T_A:121313142:0,1,0,1
chr8	121313144	.	C	CGCCAGGCATAGCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=216,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:121313142_T_A:121313142:0,1,0,1
chr8	121313147	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=216,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:121313142_T_A:121313142:0,1,0,1
chr8	121353651	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr8	121353692	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	121354505	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	121382723	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121382723_T_G:121382723:0,1,0,1
chr8	121382728	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121382723_T_G:121382723:0,1,0,1
chr8	121382730	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121382723_T_G:121382723:0,1,0,1
chr8	121383048	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,4:0,16:0,0,7,15
chr8	121383082	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,0,15
chr8	121426425	.	AGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr8	121455558	.	GA	G,GAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,17,16;MFRL=160,109,166;MMQ=60,60,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.89,5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,6:0.379,0.352:17:0,0,1:2,3,1:1,3,1,12
chr8	121455573	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:5,1:10,1:2,16,1,1
chr8	121471361	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr8	121483196	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	121509825	.	C	CTTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,3,21
chr8	121518868	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=59,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	121530061	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	121530384	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr8	121561201	.	GGA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.323:10:1,1:4,2:1,6,2,1
chr8	123964038	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:5,5:3,3:8,3,3,5
chr8	123964767	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:5,3:8,6:6,8,5,5
chr8	123966114	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:10,8:10,6:11,9,7,7
chr8	123966159	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:8,5:9,6:9,9,4,7
chr8	124031595	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:124031595_A_AT:124031595:0,3,0,1
chr8	124031597	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:124031595_A_AT:124031595:0,3,0,1
chr8	124031599	.	A	ACATTTTACTGCCTGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:124031595_A_AT:124031595:0,3,0,1
chr8	124140805	.	C	CATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATA;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.793:2:0,0:0,2:0|1:124140805_C_CATA:124140805:0,0,0,2
chr8	124140840	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:124140805_C_CATA:124140805:0,2,0,1
chr8	124154697	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:9,2:6,10:7,9,5,8
chr8	124156923	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,3:7,0:14,1,3,0
chr8	124157166	.	ATTTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,23;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:0,2:0,0:0,4,0,2
chr8	124203952	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	124206394	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=99,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,6:1,4:1,3,4,6
chr8	124251343	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=101,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:25,3:14,0:16,23,3,0
chr8	124382128	.	TTCTTCTCCATCTTCTTCATCTTCATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATCATCGTCATCATCATCATCA	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,2:0.054:56:12,0:9,2:34,20,1,1
chr8	124384978	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=121,274;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:124384978_TTA_T:124384978:0,1,0,1
chr8	124384984	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=121,274;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124384978_TTA_T:124384978:0,1,0,1
chr8	124384987	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=121,274;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124384978_TTA_T:124384978:0,1,0,1
chr8	124440316	.	GAAGCTAAATTAAAAAAAAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:124440316_GAAGCTAAATTAAAAAAAAAA_G:124440316:0,2,0,1
chr8	124440336	.	A	AAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,2:0,0:1|0:124440316_GAAGCTAAATTAAAAAAAAAA_G:124440316:0,0,0,2
chr8	124442119	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,199;MMQ=40,43;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=A;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.730:5:0,2:1,2:0|1:124442119_C_CAA:124442119:1,0,4,0
chr8	124442138	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=151,199;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.378:12:0,0:1,0:0|1:124442119_C_CAA:124442119:1,7,4,0
chr8	124448689	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chr8	124449618	.	A	AAATCTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:9,0:5,10,0,2
chr8	124526607	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:1,2:1,4,0,3
chr8	124659121	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,8:5,0,11,2
chr8	124659329	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,1:0,2,0,6
chr8	124664130	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,79;MMQ=60,52;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,1:5,3:6,2,4,0
chr8	124664792	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:6,5:1,8:4,3,3,10
chr8	124664820	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:10,0:0|1:124664820_A_AT:124664820:11,15,1,1
chr8	124664822	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,2:10,0:0|1:124664820_A_AT:124664820:11,15,1,1
chr8	124664825	.	TAG	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:11,0:0|1:124664820_A_AT:124664820:12,15,1,1
chr8	124664830	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,2:9,0:0|1:124664820_A_AT:124664820:13,14,1,1
chr8	124664834	.	GGCGGC	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,2:13,0:0|1:124664820_A_AT:124664820:14,15,1,1
chr8	124693410	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=101,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr8	124693444	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,19,7
chr8	124693641	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr8	124707914	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=68,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.673:41:6,13:7,14:7,6,15,13
chr8	124710807	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,0:8,3:10,8,1,2
chr8	124749610	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,13:0,0,8,19
chr8	124749651	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.950:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr8	124749704	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr8	124817582	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=120,134;MMQ=60,26;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:8,0:7,3:7,11,0,3
chr8	124817605	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:3,1:0,2:0,4,0,3
chr8	124820704	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=244,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124820704_TT_CA:124820704:0,1,0,1
chr8	124820708	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=10,28;MFRL=244,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:124820704_TT_CA:124820704:0,1,0,1
chr8	124822507	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.285:32:4,4:13,6:10,12,6,4
chr8	124968414	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=189,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr8	124982215	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr8	124985780	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,8:1,8:1,1,4,12
chr8	124987332	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,125;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,12:4,0:8,2,12,0
chr8	125015531	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:9,9,2,1
chr8	125035788	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,6:3,7:3,4,5,8
chr8	125072709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr8	125083954	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:125083954_T_TTA:125083954:0,3,0,1
chr8	125083962	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:125083954_T_TTA:125083954:0,3,0,1
chr8	125088636	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,6:0,0:0,0,1,6
chr8	125107201	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0|1:125107201_G_A:125107201:0,0,8,12
chr8	125107207	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,15:0,2:0|1:125107201_G_A:125107201:0,0,7,11
chr8	125339633	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,0:13,3:16,16,0,3
chr8	125463544	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=78,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:10,9:7,10:5,12,6,13
chr8	125463949	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=96,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.119:56:25,4:25,2:23,27,3,3
chr8	125500982	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr8	125516495	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.354:43:9,15:19,0:15,13,15,0
chr8	125520615	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=111,143;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:9,9:6,0:13,2,9,0
chr8	125520940	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,0:8,3:2,11,2,1
chr8	125534492	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.343:10:4,3:3,0:3,4,0,3
chr8	125565478	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:12,1:6,0:0|1:125565478_G_A:125565478:8,10,1,1
chr8	125565483	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:10,2:6,0:0|1:125565478_G_A:125565478:8,9,1,1
chr8	125568162	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	125580771	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=87,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:16,1:15,4:15,16,1,4
chr8	125580779	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=84,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:14,0:9,4:16,11,0,4
chr8	125601780	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr8	125711882	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,1,4
chr8	125990107	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:125990107_A_AT:125990107:0,4,0,1
chr8	125990109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:125990107_A_AT:125990107:0,4,0,1
chr8	125990133	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	126030809	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr8	126033079	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=90,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.075:50:28,0:19,3:30,17,1,2
chr8	126037033	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=209,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr8	126044437	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:6,1:2,5:8,0,4,2
chr8	126056215	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,16,12
chr8	126085363	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:11,0,3,1
chr8	126369898	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr8	126370010	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:7,0:12,1:9,11,1,1
chr8	126445505	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr8	126448367	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,139;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.235:41:10,9:19,0:16,16,9,0
chr8	128428061	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr8	128428518	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=86,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.119:24:9,0:13,2:0|1:128428518_C_T:128428518:10,12,1,1
chr8	128428524	.	A	AATGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:0|1:128428518_C_T:128428518:9,12,1,1
chr8	128428795	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,10,13
chr8	128428823	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,50;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr8	128428888	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=127,58;MMQ=54,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.213:40:19,0:13,8:12,20,1,7
chr8	128429262	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,11,9
chr8	128429405	.	ACTTTTTTCTTAAATAAAGAAGCCTGGGACACAGTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGTAACATAATTGAGTAATAATTTTTTAAGTGTGGTAAAATGTGTGGCACGTAGTAGGTATTCAATAAATACTTG	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=124,132;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.084:48:18,4:7,3:23,17,5,3
chr8	128429439	.	T	TAAA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=17,26;MFRL=208,146;MMQ=47,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,0:0,3:0,1,0,7
chr8	128429456	.	G	GAAAGA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=208,154;MMQ=47,45;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGA;STR;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.829:9:0,4:0,4:0,1,0,8
chr8	128429510	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0|1:128429510_G_A:128429510:0,0,0,6
chr8	128429519	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.877:5:0,3:0,2:0|1:128429510_G_A:128429510:0,0,0,5
chr8	128748947	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr8	128752698	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:17,7:19,0:20,16,7,0
chr8	128752953	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=114,116;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.104:65:21,6:37,0:26,33,0,6
chr8	129021179	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr8	129021262	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr8	130761616	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=167,100;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:8,0,3,0
chr8	130761644	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,2,2
chr8	130763708	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr8	130772905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr8	130788548	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=136,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:1,5,1,2
chr8	130789767	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:3,8,1,2
chr8	130874390	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:9,0,3,0
chr8	130874614	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0,4,0,2
chr8	131104420	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,2:9,0:0|1:131104420_A_G:131104420:4,18,1,1
chr8	131104422	.	TA	GG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,1:10,0:0|1:131104420_A_G:131104420:4,18,1,1
chr8	131124559	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,5:0,13:0,1,6,12
chr8	131127831	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,19,4
chr8	131128024	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=123,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:5,3:2,5:2,5,2,6
chr8	131130594	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:3,4,0,2
chr8	131165086	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,2,3
chr8	131172127	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,250;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:5,0:17,3:15,7,0,3
chr8	131181348	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,3:4,1:1,11,0,4
chr8	131192905	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr8	131193153	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,3:0,0,1,6
chr8	131199416	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr8	131414083	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr8	131414257	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=264,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr8	131792607	.	C	CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=68,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=A;STR;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.848:7:1,3:0,2:1,0,5,1
chr8	131812577	.	C	CAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.258:10:5,0:0,1:0|1:131812577_C_CAAA:131812577:7,1,2,0
chr8	131812590	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,15;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.256:10:5,0:0,0:0|1:131812577_C_CAAA:131812577:7,1,2,0
chr8	131848465	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=324,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	131859768	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.546:11:4,4:1,2:4,1,3,3
chr8	131897082	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	131916318	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr8	131916374	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	131922186	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,21;MFRL=179,166;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:1,1:0|1:131922186_C_CT:131922186:0,1,0,2
chr8	131922206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=210,135;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:131922186_C_CT:131922186:0,3,0,1
chr8	131955726	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=59,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131955726_G_T:131955726:0,2,0,1
chr8	131955729	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=59,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131955726_G_T:131955726:0,2,0,1
chr8	131955730	.	G	GTCCAAAAGTGTGTGACTGCGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=59,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131955726_G_T:131955726:0,2,0,1
chr8	131955732	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=59,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131955726_G_T:131955726:0,2,0,1
chr8	132002576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,7:2,1,6,4
chr8	132002676	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=105,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.281:24:11,4:6,0:12,5,7,0
chr8	132002814	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=70,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,3:7,1:4,9,2,2
chr8	132052163	.	C	CACATTTACCCCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:132052163_C_CACATTTACCCCT:132052163:2,3,1,1
chr8	132052164	.	G	GAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:132052163_C_CACATTTACCCCT:132052163:2,3,1,1
chr8	132952727	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	132958887	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:0|1:132958887_A_T:132958887:2,8,1,1
chr8	132958892	.	T	TCAGTCGTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:132958887_A_T:132958887:2,8,1,1
chr8	132966272	.	T	TGTGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132966272_T_TGTGC:132966272:0,1,0,1
chr8	132966275	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132966272_T_TGTGC:132966272:0,1,0,1
chr8	132966278	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132966272_T_TGTGC:132966272:0,1,0,1
chr8	132966279	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132966272_T_TGTGC:132966272:0,1,0,1
chr8	132980709	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr8	132991328	.	TTAAG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr8	132996599	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	132997353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,1:1,2:0,9,0,3
chr8	133008823	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	133023163	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,2,13
chr8	133041242	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr8	133046977	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr8	133048593	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,1:8,3:7,5,1,3
chr8	133048619	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=98,169;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:4,9,1,4
chr8	133049810	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:7,3:0,1:4,3,1,3
chr8	133051419	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133051419_C_CG:133051419:0,1,0,1
chr8	133051421	.	A	ACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,22;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133051419_C_CG:133051419:0,1,0,1
chr8	133051423	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:133051419_C_CG:133051419:0,1,0,1
chr8	133067265	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,3:4,3:5,8,2,4
chr8	133067364	.	TTCCCATGAAAGAACCCATGGGACCCCCATGTCCTTTCTTGG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:5,0:1,2:0,8,1,1
chr8	133088639	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133088639_A_C:133088639:0,0,1,0
chr8	133088644	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133088639_A_C:133088639:0,0,1,0
chr8	133088647	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:133088639_A_C:133088639:0,0,1,0
chr8	133088873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr8	133089975	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:2,2:1,2,2,4
chr8	133107893	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,8:0,0,13,10
chr8	133111307	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	133112392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr8	133116251	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr8	133116310	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:0,4:2,4:1,2,4,4
chr8	133117493	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=117,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr8	133117603	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	133141822	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,3:1,5:2,2,4,4
chr8	133142310	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	133144597	.	A	ATGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133144597_A_ATGGC:133144597:0,1,0,1
chr8	133144599	.	AGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133144597_A_ATGGC:133144597:0,1,0,1
chr8	133144603	.	ATCGTTCTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133144597_A_ATGGC:133144597:0,1,0,1
chr8	133146499	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chr8	133150103	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=83,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,7:4,1:4,2,5,3
chr8	133152470	.	A	AGCACAGCGTGCATGAGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133152470_A_AGCACAGCGTGCATGAGCC:133152470:0,3,0,1
chr8	133152472	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:0,0:0|1:133152470_A_AGCACAGCGTGCATGAGCC:133152470:0,3,0,1
chr8	133584698	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:0|1:133584698_G_C:133584698:7,18,1,1
chr8	133584704	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:133584698_G_C:133584698:6,17,1,1
chr8	133584707	.	T	TCTGGTTGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:9,2:0|1:133584698_G_C:133584698:6,17,1,1
chr8	133634814	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:0,9:3,2:3,0,7,4
chr8	133723166	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,4:2,10:2,2,9,5
chr8	133740244	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:19,1:12,1:12,21,0,2
chr8	133769422	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,197;MMQ=60,38;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:16,0:23,5,2,0
chr8	133769554	.	TGA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:9,1:12,5:3,18,3,3
chr8	133790249	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=157,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr8	133811469	.	G	GTCTTTATCTCTCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	133816999	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=92,208;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,1:12,0:6,24,0,3
chr8	133817010	.	G	GGAGAC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,2:12,2:3,24,2,2
chr8	133844508	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=138,86;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:5,13:2,3:5,2,8,8
chr8	133858009	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=90,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:5,7:3,2:3,5,5,4
chr8	133880334	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,19,6
chr8	133881952	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:3,3:8,4,3,0
chr8	133899322	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,299;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.248:37:18,0:10,8:14,14,0,9
chr8	133900386	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,6:2,6:4,2,8,4
chr8	133900840	.	A	ATG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.580:9:3,1:1,4:0,4,0,5
chr8	133906177	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:11,3:11,0:7,15,0,3
chr8	133906210	.	GC	AA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr8	133909847	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,7:3,7:8,0,12,2
chr8	133910388	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,10:4,5:5,2,12,3
chr8	133913525	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr8	133920411	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	133920518	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr8	133920624	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr8	133920641	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	133923741	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=97,86;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:7,0:10,15:7,10,1,14
chr8	133925209	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr8	133931748	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr8	133935499	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr8	133945753	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.811:14:2,3:0,8:2,0,5,7
chr8	133960936	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	133960991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,6:0,0,16,4
chr8	133961237	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	133975406	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr8	133983954	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr8	134025781	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:134025781_A_T:134025781:0,0,4,0
chr8	134025783	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:134025781_A_T:134025781:0,0,4,0
chr8	134031751	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr8	134034478	.	C	CCAAAAACTTCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=250,248;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:134034478_C_CCAAAAACTTCCA:134034478:0,4,0,1
chr8	134034483	.	GC	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=250,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:134034478_C_CCAAAAACTTCCA:134034478:0,4,0,1
chr8	134034495	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=316,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr8	134050678	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr8	134052198	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34,33;MFRL=117,313,99;MMQ=60,60,60;MPOS=31,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=CA;STR;TLOD=3.88,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.336,0.444:6:0,1,1:1,1,2:1,0,4,1
chr8	134062983	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr8	134107223	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,6:2,2:6,1,8,0
chr8	134108718	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=104,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr8	134125682	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:5,3,5,5
chr8	134143990	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,142;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:22,3:24,0:43,3,3,0
chr8	134144113	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.532:45:9,9:12,15:7,14,7,17
chr8	134145671	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:7,9:1,6:5,3,13,3
chr8	134146001	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=225,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr8	134225068	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=232,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,3,3
chr8	134225357	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:13,12,1,2
chr8	134225396	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,11,9
chr8	134225434	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr8	134237578	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr8	134237867	.	A	ACCTCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:134237867_A_ACCTCAT:134237867:0,3,0,1
chr8	134237868	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:134237867_A_ACCTCAT:134237867:0,3,0,1
chr8	134251307	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=144,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.226:32:12,4:13,2:18,7,6,1
chr8	134251449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	134270548	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,5:0,4:2,1,8,2
chr8	134271506	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,3:2,3:3,3,1,5
chr8	134274226	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr8	135524938	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	135577530	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=103,281;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:3,1:0|1:135577530_G_A:135577530:7,1,2,0
chr8	135577533	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=103,281;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:0|1:135577530_G_A:135577530:7,1,2,0
chr8	135649760	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:0|1:135649760_A_T:135649760:16,10,1,1
chr8	135649766	.	C	CCAGAACTGTCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=148,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:12,2:0|1:135649760_A_T:135649760:16,9,1,1
chr8	135725058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr8	135812876	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:3,7,1,2
chr8	136561153	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:1,3:6,8:1,6,3,9
chr8	136657198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	136659195	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:4,10:3,5:6,1,10,5
chr8	136659426	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	139144764	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	139144986	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:5,10,0,2
chr8	139149510	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:0,2,2,6
chr8	139158169	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:2,1,4,1
chr8	139158317	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr8	139161010	.	G	GATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139161010_G_GATT:139161010:0,1,0,1
chr8	139161011	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139161010_G_GATT:139161010:0,1,0,1
chr8	139161013	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139161010_G_GATT:139161010:0,1,0,1
chr8	139164233	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:1,7,2,0
chr8	139189502	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	139190943	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr8	139190957	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr8	139263328	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	139323246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	139603851	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=215,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	139606539	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	139609087	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,1:5,4:3,2,3,2
chr8	139611212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr8	139614436	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,5,11
chr8	139617046	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr8	139618754	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr8	139618794	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:139618794_C_CAA:139618794:0,2,0,1
chr8	139618796	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:139618794_C_CAA:139618794:0,2,0,1
chr8	139618800	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:139618794_C_CAA:139618794:0,2,0,1
chr8	139620267	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr8	139626156	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=72,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:139626156_G_A:139626156:3,8,1,1
chr8	139626164	.	C	CTCCAAAATCATTGTTTATTTAGTA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=72,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:139626156_G_A:139626156:5,9,1,1
chr8	139626176	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr8	139626219	.	G	GAGAAC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=95,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,0:3,2:3,5,1,1
chr8	139631650	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,16:0,5:0,0,14,7
chr8	139635883	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	139635890	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=85,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139635890_C_T:139635890:2,0,1,0
chr8	139635900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:139635890_C_T:139635890:3,1,1,0
chr8	139635920	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr8	139642831	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=244,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:139642831_G_T:139642831:4,0,1,0
chr8	139642835	.	GC	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=249,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:139642831_G_T:139642831:3,0,1,0
chr8	139642846	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:139642831_G_T:139642831:2,0,1,0
chr8	139647262	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,7,11
chr8	139648892	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,14,1
chr8	139658747	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr8	139668032	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	139668300	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	139672602	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr8	139674213	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,5:0,0,10,11
chr8	139675869	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr8	139676082	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	139688697	.	A	AAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,149;MMQ=45,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.601:13:3,0:3,7:0|1:139688697_A_AAAGG:139688697:6,0,7,0
chr8	139688701	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,180;MMQ=43,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,6:0.331:15:1,3:7,3:1|0:139688697_A_AAAGG:139688697:8,1,6,0
chr8	139696635	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,14,11
chr8	139701209	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,4:2,6:4,2,6,4
chr8	139705850	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:7,1:4,1:10,1,3,0
chr8	139715523	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:6,9,3,0
chr8	139733089	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr8	139737800	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:139737800_T_A:139737800:0,2,0,1
chr8	139737802	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:139737800_T_A:139737800:0,2,0,1
chr8	139767349	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,1:0,0,7,3
chr8	139774831	.	GCACACACACA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=190,0;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,6;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr8	139790667	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,2:6,2:8,9,3,1
chr8	139808946	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	139819949	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,1,3
chr8	139820120	.	G	GCTAAAAATCTCCTTCTTCTTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	139889972	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr8	140630730	.	C	CGGTGGG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=210,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:1,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:3,5,1,1
chr8	140630734	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=216,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:3,4,1,1
chr8	140630736	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=216,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:3,4,1,1
chr8	140630738	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=210,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:4,4,1,1
chr8	140630740	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=210,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:4,4,1,1
chr8	140630743	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=204,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:140630730_C_CGGTGGG:140630730:5,4,1,1
chr8	140630990	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,8,5
chr8	140898240	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=73.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,29:0.473:61:17,0:15,27:12,20,0,29
chr8	140998947	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:7,4:7,4:10,5,5,3
chr8	141231581	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,187;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,0:4,2:8,9,1,1
chr8	141297613	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr8	141297807	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:12,0:9,4:9,13,2,2
chr8	141301003	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr8	141301186	.	T	TACACACACAC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,9;RU=AC;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:6,5:7,0:5,8,0,5
chr8	141310486	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=263,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	141436826	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr8	141445349	.	AAGAAAACAAAAAACAAAAACC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAAACAAAAAACAAAAACC;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.623:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr8	141524675	.	T	TCATAAAAGCAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:141524675_T_TCATAAAAGCAG:141524675:0,0,0,1
chr8	141524678	.	C	CATAGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:141524675_T_TCATAAAAGCAG:141524675:0,0,0,1
chr8	141524680	.	C	CACCAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:141524675_T_TCATAAAAGCAG:141524675:0,0,0,1
chr8	141525306	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:17,0:17,6:19,16,0,7
chr8	141545592	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,3:17,0:22,11,3,0
chr8	141549346	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr8	141549553	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:19,0:20,2:16,23,0,2
chr8	141557497	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr8	141561393	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:6,1,3,1
chr8	141561494	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:141561494_C_T:141561494:9,9,1,1
chr8	141561506	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:141561494_C_T:141561494:11,10,1,1
chr8	141561509	.	C	CTTACAGCTGAGGTTTCCA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:0|1:141561494_C_T:141561494:11,10,1,1
chr8	141568699	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:3,9,0,3
chr8	141572497	.	GG	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr8	141582896	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:3,7:6,9:3,6,9,7
chr8	141582902	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,1:13,2:11,11,2,1
chr8	141583108	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=168,160;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,0:1,0:0,1,0,3
chr8	141669818	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.607:21:1,9:5,4:1,7,3,10
chr8	141669830	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,0:5,4:3,13,1,3
chr8	141669863	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:141669863_AA_CC:141669863:0,2,0,1
chr8	141669868	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:1,0:0,1:0|1:141669863_AA_CC:141669863:0,2,0,1
chr8	141685506	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=104,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:5,3,6,2
chr8	141685545	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=97,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:11,3:10,5,0,3
chr8	141685641	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=82,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,3:6,4:5,8,2,5
chr8	141754888	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=105,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,0:2,3:5,0,2,3
chr8	141774282	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:1,3:3,3:3,1,6,1
chr8	141810472	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=224,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:141810472_A_G:141810472:2,0,1,0
chr8	141810474	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=224,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:141810472_A_G:141810472:2,0,1,0
chr8	141840739	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr8	142146708	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr8	142161064	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:1,9,1,7
chr8	142161666	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=91,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,2:8,4:18,3,6,1
chr8	142170884	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:9,10:11,6:8,12,8,8
chr8	142176507	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr8	142176578	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=183,393;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:142176578_G_A:142176578:0,1,0,1
chr8	142176584	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=183,393;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:142176578_G_A:142176578:0,1,0,1
chr8	142178718	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=191,180;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr8	142185580	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:5,7:1,8,1,13
chr8	142188238	.	CC	TT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=171,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:11,14,1,1
chr8	142222234	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,2,3,0
chr8	142222237	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,2,3,0
chr8	142222241	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,4,2,0
chr8	142222245	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:142222234_G_C:142222234:0,4,2,0
chr8	142366986	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,4,2
chr8	142444771	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.299:5:2,0:0,1:0|1:142444771_TG_T:142444771:0,4,0,1
chr8	142444780	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=94,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.434:3:2,0:0,1:0|1:142444771_TG_T:142444771:0,2,0,1
chr8	142445055	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=104,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,1:2,3,1,5
chr8	142445062	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,1:0,0,2,4
chr8	142445095	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:142445095_C_T:142445095:1,1,1,1
chr8	142445097	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:142445095_C_T:142445095:1,1,1,1
chr8	142450540	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,19;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.526:8:0,0:0,2:0,4,0,4
chr8	142451177	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr8	142451399	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:2,2,0,6
chr8	142457961	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=227,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr8	142458039	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:3,6,4,2
chr8	142458053	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:5,3,1,10
chr8	142458183	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:4,1:4,1:5,3,0,2
chr8	142476424	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=206,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0|1:142476424_G_A:142476424:4,0,3,0
chr8	142476426	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=206,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0|1:142476424_G_A:142476424:4,0,3,0
chr8	142476474	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=84,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:5,2,2,1
chr8	142476555	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:5,4:13,4:7,11,5,3
chr8	142476611	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,3:8,2:5,4,3,2
chr8	142480610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr8	142484416	.	TCACCACTGGGGCTTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	142488662	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,6,2
chr8	142489981	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,0:0,0,3,2
chr8	142490067	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:3,5,0,2
chr8	142490079	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr8	142490574	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=97,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:7,0:2,4:6,5,0,4
chr8	142498637	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:4,0:3,3,0,3
chr8	142505386	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr8	142506461	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:3,4:8,4:8,3,5,3
chr8	142517130	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=241,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.638:4:0,2:1,0:1,0,2,1
chr8	142517222	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:9,2:2,2:0|1:142517222_A_G:142517222:6,6,3,2
chr8	142517227	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:10,3:2,2:0|1:142517222_A_G:142517222:6,6,3,2
chr8	142867526	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=205,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr8	143310815	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,24:0.759:31:5,11:2,13:3,4,16,8
chr8	143365913	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr8	143381810	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	143399860	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr8	143412377	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr8	143413234	.	T	TATGGGGACACATGTTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr8	143425271	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,2:1,7:3,1,6,3
chr8	143427178	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=100,117;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:8,6:8,4:8,8,8,3
chr8	143436034	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,4:3,9:4,3,5,8
chr8	143558671	.	AGCCAGGGCAGCGGGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCAGGGCAGCGGGGG;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.731:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	143566039	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:2,0:0|1:143566039_T_A:143566039:7,1,4,0
chr8	143566044	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0|1:143566039_T_A:143566039:7,1,4,0
chr8	143566064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,4:6,0:8,3,4,0
chr8	143599631	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.929:10:0,6:0,4:0|1:143599631_A_G:143599631:0,0,2,8
chr8	143599634	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,2:0|1:143599631_A_G:143599631:0,0,2,8
chr8	143599651	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr8	143603269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	143603318	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	143603540	.	C	CCTCCTTCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=219,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:143603540_C_CCTCCTTCTG:143603540:0,1,0,1
chr8	143603545	.	CA	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=219,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:143603540_C_CCTCCTTCTG:143603540:0,1,0,1
chr8	143614641	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=197,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr8	143618474	.	CCC	GAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,0:1,2:0|1:143618474_CCC_GAG:143618474:0,3,1,1
chr8	143618479	.	C	CAGTGGCATGATCTCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:143618474_CCC_GAG:143618474:0,3,1,1
chr8	143620812	.	GCCCC	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:143620812_GCCCC_G:143620812:7,12,1,1
chr8	143620818	.	TGCATGGCCCCACTCCACGCCTCCGCCTGTGCCTCCCCCACATCACCCATCCCTGTCC	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:6,0:9,2:0|1:143620812_GCCCC_G:143620812:8,16,1,1
chr8	143620822	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.782:16:1,5:2,8:0,3,4,9
chr8	143620877	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=110,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0|1:143620812_GCCCC_G:143620812:1,5,1,1
chr8	143620886	.	CCCCCACCCACACCCAG	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,0:2,2:0|1:143620886_CCCCCACCCACACCCAG_C:143620886:0,4,1,1
chr8	143620905	.	A	ATGAGGGAAGGAGGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:143620886_CCCCCACCCACACCCAG_C:143620886:0,3,1,1
chr8	143623703	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:15,4:8,0:10,13,3,1
chr8	143740167	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	143746050	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr8	143746069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr8	143746087	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CA;STR;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr8	143746416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=238,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,5:1,15:1,0,10,10
chr8	143762932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr8	143763618	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143763618_C_G:143763618:0,0,0,1
chr8	143763622	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143763618_C_G:143763618:0,0,0,1
chr8	143781858	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	143782044	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.575:31:6,11:7,7:7,6,9,9
chr8	143784500	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:5,3,2,2
chr8	143823858	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,1,3
chr8	143831773	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,0:2,3:3,6,0,3
chr8	143831926	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=78,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.637:13:3,3:2,5:2,3,1,7
chr8	143832373	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,3:0,0:0,0,5,0
chr8	143832592	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:4,8,0,3
chr8	143845950	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=202,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:143845950_A_G:143845950:1,0,2,0
chr8	143845953	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:143845950_A_G:143845950:0,0,3,0
chr8	143846388	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr8	143857265	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr8	143857441	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	143867157	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr8	143867841	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,4:1,0,6,1
chr8	143867849	.	C	CCCCCCCCCCG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr8	143927896	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:5,2,0,3
chr8	143928139	.	C	CAACCCTCCTGACACAGCCCCACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=210,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr8	143955875	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=97,136;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:14,0:3,8:5,12,0,8
chr8	143955916	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=70,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:2,4,3,4
chr8	143956776	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=227,151;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:1,0,0,5
chr8	143956808	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=352,175;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr8	143957856	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr8	143957886	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr8	143958342	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=159,130;MMQ=59,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,1:1,1,1,2
chr8	143958427	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,12,4
chr8	143960597	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=103,161;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:5,0:0,6:1,4,4,3
chr8	143993915	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:143993915_A_AGG:143993915:0,0,1,0
chr8	143993918	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:143993915_A_AGG:143993915:0,0,1,0
chr8	143994321	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=20,30;MFRL=91,117;MMQ=40,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:1,2,2,1
chr8	143994349	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	143994361	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=180,134;MMQ=48,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr8	143994388	.	GA	TG,CA	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=34,31,34;MFRL=161,117,202;MMQ=27,48,46;MPOS=2,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.222,0.333:6:0,0,1:3,1,1:0,3,0,3
chr8	143994391	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=148,202;MMQ=38,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:3,1:0|1:143994391_G_C:143994391:0,4,0,2
chr8	143994396	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=205,202;MMQ=42,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:143994391_G_C:143994391:0,2,0,2
chr8	143994398	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=205,202;MMQ=42,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:143994391_G_C:143994391:0,2,0,2
chr8	143994944	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=178,180;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:5,0:1,3:1,5,0,3
chr8	143995743	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:9,9:7,8:8,8,10,7
chr8	143995761	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=58,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.975:38:1,16:0,19:1,0,18,19
chr8	143995820	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:143995820_G_A:143995820:5,7,1,1
chr8	143995825	.	C	CAAGTCTCATCAGAT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:143995820_G_A:143995820:5,6,1,1
chr8	143998638	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:2,1,1,5
chr8	144124512	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:2,7:9,5:8,4,7,5
chr8	144124548	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:2,5:10,6:1,12,2,9
chr8	144126244	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr8	144130550	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr8	144297052	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=110,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:1,4,2,2
chr8	144332012	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,16,1
chr8	144333256	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.429:16:3,2:6,3:7,2,6,1
chr8	144333315	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.419:36:8,6:12,8:11,10,9,6
chr8	144357975	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0|1:144357975_C_T:144357975:0,0,5,0
chr8	144357992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0|1:144357975_C_T:144357975:0,0,7,0
chr8	144358651	.	GG	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,1:5,5,1,1
chr8	144378184	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,1:8,2:5,5,0,3
chr8	144391728	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,3,17
chr8	144391796	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr8	144392368	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:3,4,1,1
chr8	144397798	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr8	144398029	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,7:0,0,5,8
chr8	144398123	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.722:9:1,5:1,0:0|1:144398123_G_C:144398123:1,1,5,2
chr8	144398132	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.917:9:0,5:0,2:0|1:144398123_G_C:144398123:0,0,6,3
chr8	144398396	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	144399856	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr8	144399885	.	AG	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr8	144400089	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,4:2,7:2,2,9,2
chr8	144403292	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr8	144403617	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=88,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.666:11:2,1:2,5:2,3,0,6
chr8	144406627	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:2,2,4,0
chr8	144406881	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	144411614	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:7,0:18,4:8,17,0,4
chr8	144413454	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,70;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:14,0:14,4:14,15,1,3
chr8	144416901	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.358:18:4,4:5,2:8,4,3,3
chr8	144417051	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	144460569	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	144462169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr8	144463686	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr8	144464024	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:12,6:3,4:8,7,7,3
chr8	144520147	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr8	144522386	.	TGAGGAGGAGGAG	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,58;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=GAG;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:19,0:9,2:13,22,1,2
chr8	144523228	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=94,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:4,2:4,3:4,4,3,3
chr8	144523323	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144590112	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=93,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	144618379	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	144641753	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,3,11
chr8	144642143	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:26,1:28,2:33,21,1,2
chr8	144642151	.	G	GAGGGCAGGGCAGGGC	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=AGGGC;STR;TLOD=72.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.542:36:4,9:12,6:6,10,9,11
chr8	144642178	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,4,24
chr8	144642986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	144643169	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,5:0,0:2,0,4,2
chr8	144643321	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.704:15:2,5:2,5:0,4,2,9
chr8	144643815	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=225,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr8	144644583	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:3,2,2,3
chr8	144649601	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	144649625	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	144649650	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=318,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr8	144649690	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=106,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,6,0
chr8	144653218	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,7:0,0,7,16
chr8	144654430	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,128;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr8	144654573	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:144654573_C_T:144654573:0,0,1,0
chr8	144654582	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:144654573_C_T:144654573:0,0,2,0
chr8	144654586	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:144654573_C_T:144654573:0,0,4,0
chr8	144654594	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=273,198;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0|1:144654573_C_T:144654573:0,1,4,0
chr8	144657269	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=137.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,21:0,23:0,0,29,15
chr8	144659608	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr8	144660189	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	144672186	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=192,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr8	144681875	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr8	144688736	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr8	144695867	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=75.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,5:0,17:0,0,6,17
chr8	144697041	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,21:0,18:0,0,19,21
chr8	144732026	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,16,5
chr8	144735346	.	A	AATG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=110,158;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.110:26:8,2:13,0:0|1:144735346_A_AATG:144735346:14,10,0,2
chr8	144735347	.	C	CAAT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,158;MMQ=60,54;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:9,2:13,0:0|1:144735346_A_AATG:144735346:15,10,0,2
chr8	144735349	.	G	GAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=111,158;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:11,2:13,0:0|1:144735346_A_AATG:144735346:16,9,0,2
chr8	144735977	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr8	144772151	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	144773800	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:17,2:0|1:144773800_C_T:144773800:16,13,1,1
chr8	144773810	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:11,0:18,2:0|1:144773800_C_T:144773800:17,14,1,1
chr8	144776713	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,4,8
chr8	144799972	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.086:38:21,0:11,1:23,12,0,3
chr8	144800004	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,8,12
chr8	144800420	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,1:6,2:9,3,3,0
chr8	144800552	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr8	144801347	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,23;MFRL=66,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.624:6:1,0:0,3:0|1:144801347_AC_A:144801347:1,1,1,3
chr8	144801353	.	C	CAAATTCCCTTGCCTATTATTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:0,2:4,0:1|0:144801347_AC_A:144801347:1,3,1,1
chr8	144801554	.	TGGGGGAGATGCTGC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:8,2:9,9,1,1
chr8	144801681	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr8	144802341	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr8	144803616	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr8	144808003	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr8	144873666	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr8	144873779	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,11,6
chr8	144873924	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=102,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,3:11,0:16,10,2,1
chr8	144873997	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	144874366	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr8	144875031	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,17;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:0,2:0,2,1,3
chr8	144886206	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.195:28:12,0:11,5:10,13,2,3
chr8	144886225	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:6,2:18,0:0|1:144886225_G_A:144886225:9,16,4,0
chr8	144886235	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=104,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:5,4:18,0:0|1:144886225_G_A:144886225:10,14,4,0
chr8	144894486	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:0|1:144894486_C_T:144894486:9,6,2,1
chr8	144894496	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.956:21:0,15:0,6:0|1:144894486_C_T:144894486:0,0,13,8
chr8	144894641	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	144896138	.	AGA	CCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:4,0:2,0:0|1:144896138_AGA_CCC:144896138:1,7,4,0
chr8	144896145	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:2,3:3,1:0|1:144896138_AGA_CCC:144896138:0,5,4,0
chr8	144900228	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:5,12,0,2
chr8	144900443	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:7,7,1,2
chr8	144900756	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr8	144902714	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=84,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,4,0
chr8	144917790	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	144940069	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,78;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0|1:144940069_C_CA:144940069:0,0,1,1
chr8	144940081	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,78;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:144940069_C_CA:144940069:0,0,1,1
chr8	144940117	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr8	144940300	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=120,126;MMQ=55,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,71:0.584:121:26,38:24,29:24,26,44,27
chr8	144941181	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr8	144946345	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr8	144946750	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.482:10:3,0:2,3:3,2,3,2
chr8	144946783	.	C	CAGATTTAATATCAAAGCTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr8	144946818	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	144992900	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:1,0,7,4
chr8	144995483	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=155,155;MMQ=45,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:8,9:4,2:6,6,9,3
chr8	144996091	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=252,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:144996091_A_T:144996091:0,2,0,1
chr8	144996094	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=252,214;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144996091_A_T:144996091:0,2,0,1
chr8	145004546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr8	145008134	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:0,0:0,1:0|1:145008134_T_TAC:145008134:3,0,1,0
chr8	145008138	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,12;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.680:4:0,0:0,1:0|1:145008134_T_TAC:145008134:1,0,3,0
chr8	145008142	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=12,12;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.549:5:0,0:0,0:0|1:145008134_T_TAC:145008134:2,0,3,0
chr8	145008647	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=114,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:3,2:1,4,2,0
chr8	145018965	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=221,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:145018965_G_C:145018965:0,3,0,1
chr8	145018972	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:145018965_G_C:145018965:0,2,0,1
chr8	145057868	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,2:3,5:4,2,3,4
chr8	145058169	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:12,23:9,0:13,8,23,0
chr8	145058852	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=104,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:16,0:8,8:10,14,0,8
chr8	145060647	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	145065712	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:145065712_C_T:145065712:1,9,0,2
chr8	145065720	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:145065712_C_T:145065712:0,9,0,2
chr8	145065721	.	C	CCCTTCCCTT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:145065712_C_T:145065712:0,8,0,2
chr8	145065725	.	AA	TT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:145065712_C_T:145065712:0,8,0,2
chr8	145065829	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:14,4,2,0
chr8	145066886	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,13,17
chr8	145086777	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:6,6:17,4:11,12,5,5
chr8	145095995	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,4:9,0:3,10,0,4
chr8	145096346	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=166,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:145096346_G_C:145096346:0,1,0,1
chr8	145096351	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145096346_G_C:145096346:0,0,0,1
chr8	145138477	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:1,2,0,5
chr8	145150101	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	145151665	.	TGG	T,TCTGTTCAACGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29,28;MFRL=0,160,167;MMQ=60,60,60;MPOS=15,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr8	145151668	.	CAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr8	145158503	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr8	145161576	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=85,42;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:13,0:10,6:6,18,0,6
chr8	145161823	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,7,13
chr8	145161896	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=100.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,19:0,0,18,12
chr8	145223191	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chr8	145234508	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr8	145245631	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr8	145245905	.	C	CCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=167,296;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:2,0:1,1:0|1:145245905_C_CCAA:145245905:2,1,0,1
chr8	145245906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=167,296;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:145245905_C_CCAA:145245905:2,1,0,1
chr8	145245907	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=167,296;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:145245905_C_CCAA:145245905:2,1,0,1
chr8	145246735	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,0:2,6:1,4,6,0
chr8	145247168	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	145254159	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr8	145255324	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:15,3,1,1
chr8	145278115	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:6,6,1,1
chr8	145512816	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.166:52:20,8:23,0:29,15,8,0
chr8	145540825	.	TCA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,2:6,1:16,3,3,0
chr8	145542316	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:7,4,7,1
chr8	145556791	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145556791_T_G:145556791:0,0,1,0
chr8	145556793	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145556791_T_G:145556791:0,0,1,0
chr8	145617576	.	G	GAATCAGAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:2,2:2,0:0|1:145617576_G_GAATCAGAC:145617576:2,3,1,1
chr8	145617580	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:145617576_G_GAATCAGAC:145617576:2,2,1,1
chr8	145620400	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:5,8,0,2
chr8	145620764	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=70,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,6:7,1:6,4,1,6
chr8	145620791	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:145620791_G_T:145620791:1,2,1,1
chr8	145620793	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:145620791_G_T:145620791:1,2,1,1
chr8	145620799	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:145620791_G_T:145620791:1,2,1,1
chr8	145625524	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=C;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:145625524_GC_G:145625524:0,1,0,2
chr8	145625533	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:145625524_GC_G:145625524:0,1,0,2
chr8	145638032	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:11,0:14,17:9,16,1,16
chr8	145639320	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:5,3,2,3
chr8	145639521	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr8	145641552	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=218,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:145641552_C_T:145641552:0,2,0,1
chr8	145641558	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=218,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:145641552_C_T:145641552:0,2,0,1
chr8	145641564	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	145650314	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,1:7,1:9,7,2,0
chr8	145652216	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=142,149;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:6,0:8,5,2,0
chr8	145652408	.	G	GGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.911:20:0,11:1,8:0|1:145652408_G_GGT:145652408:0,1,6,13
chr8	145652412	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0|1:145652408_G_GGT:145652408:0,0,5,13
chr8	145654794	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	145656607	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=177,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr8	145658994	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,8:10,0:9,4,7,1
chr8	145659644	.	AG	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=123,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:4,5,1,1
chr8	145660569	.	CGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCT;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	145660833	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=55,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,7:0,5:1,1,6,6
chr8	145660885	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:10,4:5,0:9,7,2,3
chr8	145662053	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=119,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:2,8,2,0
chr8	145663814	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	145665637	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,4:0,4:0,1,3,5
chr8	145665699	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=172,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr8	145666578	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	145667354	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr8	145667405	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,13,4
chr8	145668042	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr8	145677973	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	145689658	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.270:19:7,4:6,1:2,12,3,2
chr8	145690308	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr8	145690348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	145691915	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	145692296	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	145692762	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,9,7
chr8	145692812	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,15:0,4:0,0,11,8
chr8	145693720	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,17,11
chr8	145693781	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:145693781_C_T:145693781:8,18,1,1
chr8	145693787	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:13,2:0|1:145693781_C_T:145693781:7,18,1,1
chr8	145693788	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:14,2:0|1:145693781_C_T:145693781:7,18,1,1
chr8	145693790	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:10,2:0|1:145693781_C_T:145693781:7,18,1,1
chr8	145694552	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.344:7:2,1:1,1:4,1,2,0
chr8	145697244	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr8	145698489	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:145698489_C_G:145698489:2,1,1,0
chr8	145698494	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:145698489_C_G:145698489:2,1,1,0
chr8	145699601	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr8	145700098	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.449:11:0,1:4,1:4,2,0,5
chr8	145700103	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=141,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.339:12:0,0:4,2:4,4,0,4
chr8	145730102	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.426:7:1,0:3,0:0|1:145730102_A_C:145730102:0,4,3,0
chr8	145730110	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=68,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.345:9:1,0:3,1:0|1:145730102_A_C:145730102:0,6,3,0
chr8	145730116	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:2,1:0|1:145730102_A_C:145730102:0,5,2,0
chr8	145730466	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:21,2:20,2:22,20,1,3
chr8	145732398	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=70,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:1,5,0,5
chr8	145735730	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:2,0,3,2
chr8	145738767	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr8	145739218	.	A	G,T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31,21;MFRL=0,67,144;MMQ=60,49,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.33,14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,8:0.312,0.619:12:0,4,1:0,0,5:0,0,11,1
chr8	145746048	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:0|1:145746048_C_T:145746048:2,10,1,1
chr8	145746058	.	C	CTCCTCCATT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:3,2:0|1:145746048_C_T:145746048:1,9,1,1
chr8	145746060	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:4,2:0|1:145746048_C_T:145746048:1,8,1,1
chr8	145759590	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:145759590_G_A:145759590:9,8,1,1
chr8	145759599	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:0|1:145759590_G_A:145759590:8,8,1,1
chr8	145772748	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145773963	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=192,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.420:6:2,2:1,0:0|1:145773963_C_G:145773963:0,4,1,1
chr8	145773965	.	C	CAGCCAGCACTCACCCAGCCTGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=201,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:145773963_C_G:145773963:0,3,1,1
chr8	145806307	.	GTCGGGC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=91,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCGGGC;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:2,2:3,2,1,1
chr8	145806681	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr8	145830878	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=122,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:7,3,1,1
chr8	145830894	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr8	145979138	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=199,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.818:31:2,9:3,17:3,2,13,13
chr8	145980059	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=70,216;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,11:0.203:57:21,9:23,0:0|1:145980059_G_A:145980059:30,16,11,0
chr8	145980069	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=71,216;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:21,11:21,0:0|1:145980059_G_A:145980059:31,17,11,0
chr8	145999535	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:9,2:0|1:145999535_C_T:145999535:7,10,1,1
chr8	145999545	.	AC	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:145999535_C_T:145999535:10,12,1,1
chr8	145999549	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:145999535_C_T:145999535:11,12,1,1
chr8	146029559	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:15,0:5,2:10,10,1,1
chr8	146033347	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	146068594	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	146157854	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,1:8,2:9,5,1,2
chr9	14710	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=241,172;MMQ=47,32;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	118172	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.919:9:0,4:0,4:0|1:118172_C_CG:118172:0,0,4,5
chr9	118173	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0|1:118172_C_CG:118172:0,0,4,5
chr9	118418	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=238,235;MMQ=26,32;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr9	118449	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,24;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr9	118629	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=121,174;MMQ=60,35;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,3:16,0:10,16,0,3
chr9	118856	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,357;MMQ=60,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118856_A_T:118856:0,0,0,1
chr9	118860	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,357;MMQ=60,22;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118856_A_T:118856:0,0,0,1
chr9	118862	.	CCAAGATG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,357;MMQ=60,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118856_A_T:118856:0,0,0,1
chr9	118872	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,357;MMQ=60,22;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:118856_A_T:118856:0,0,0,1
chr9	173380	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=109,157;MMQ=27,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:8,0:16,3:15,11,0,3
chr9	289481	.	C	CAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,9:0,0,13,9
chr9	316998	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,4:3,9:2,2,8,6
chr9	317195	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	325817	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	327996	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=184,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,3,2
chr9	370370	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr9	372358	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:372358_T_TG:372358:0,0,0,1
chr9	372360	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:372358_T_TG:372358:0,0,0,1
chr9	376929	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr9	379965	.	TG	CG,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25,36;MFRL=0,141,150;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.66,4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.556,0.333:6:0,3,0:0,1,2:0,0,0,6
chr9	407157	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	418272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=64,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.497:8:3,3:1,1:0|1:418272_T_C:418272:1,3,0,4
chr9	418276	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=64,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0|1:418272_T_C:418272:1,3,0,4
chr9	418291	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:418291_A_T:418291:0,4,0,1
chr9	418297	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:418291_A_T:418291:0,4,0,1
chr9	422157	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,14,16
chr9	432140	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=99,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:1,1,5,0
chr9	432330	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:1,6,1,4
chr9	433978	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=66,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:12,2:1,2:6,8,2,2
chr9	441816	.	ACTCAGTGGCTC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.477:17:4,2:2,5:6,3,5,3
chr9	441827	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.926:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr9	441952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr9	442030	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr9	446352	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.224:25:5,0:14,5:11,9,1,4
chr9	449700	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr9	449874	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:12,7:3,2:3,12,4,6
chr9	452149	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,2,5
chr9	713324	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:11,3:10,9,1,2
chr9	731332	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr9	734679	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:1,1:4,5:3,3,5,1
chr9	734854	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,4:2,5:2,7,3,7
chr9	734887	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,2:2,0:1,7,0,2
chr9	735654	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=171,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr9	735789	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=81,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:735789_T_A:735789:0,4,0,1
chr9	735792	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=81,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:735789_T_A:735789:0,4,0,1
chr9	735794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=81,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:735789_T_A:735789:0,4,0,1
chr9	735797	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=81,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:735789_T_A:735789:0,4,0,1
chr9	735798	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=81,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:735789_T_A:735789:0,4,0,1
chr9	735802	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:735789_T_A:735789:0,3,0,1
chr9	738238	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:4,1,6,1
chr9	742342	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr9	744433	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:15,2:5,1:16,4,3,0
chr9	745289	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:2,2:2,3:1,3,2,3
chr9	967981	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:5,3:4,5:7,2,6,2
chr9	968041	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:16,0:13,5:15,14,0,5
chr9	1051854	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1051854_C_G:1051854:0,0,0,1
chr9	1051859	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1051854_C_G:1051854:0,1,0,1
chr9	1057318	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr9	1057351	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr9	2028942	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=210,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	2056869	.	C	CAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=348,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:0,0:0|1:2056869_C_CAAAAG:2056869:0,1,0,1
chr9	2056871	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=348,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:2056869_C_CAAAAG:2056869:0,1,0,1
chr9	2058475	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:2,0:11,2:4,9,1,1
chr9	2070483	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:2070483_TC_T:2070483:5,10,1,1
chr9	2070485	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:2070483_TC_T:2070483:5,10,1,1
chr9	2073162	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:6,1,3,1
chr9	2073514	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,5:6,2:10,5,5,2
chr9	2077875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr9	2082090	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	2083325	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.450:11:4,2:0,3:4,2,4,1
chr9	2083398	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=89,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:10,5:13,0:10,13,0,5
chr9	2158831	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:14,0,2,0
chr9	2161821	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:21,0:16,6:25,13,3,3
chr9	2170512	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,5:1,4:0,6,3,6
chr9	2641396	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:0|1:2641396_A_G:2641396:16,4,1,1
chr9	2641400	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:2641396_A_G:2641396:16,5,1,1
chr9	2651537	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:6,0:1,11:0,7,0,11
chr9	2652034	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=156,888;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2652034_C_CT:2652034:0,1,1,0
chr9	2652035	.	C	CTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,888;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2652034_C_CT:2652034:0,1,1,0
chr9	2729470	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,2:11,1:9,18,0,3
chr9	2810326	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,3,2
chr9	2820046	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:8,5,11,3
chr9	2827161	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:8,1:10,1:4,14,2,1
chr9	2831149	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,2,2
chr9	2837461	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr9	2923116	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=154,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr9	2943518	.	A	ACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,2:0,9:0,0,9,3
chr9	2948062	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	2992542	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:10,0:17,3:0|1:2992542_A_T:2992542:14,13,0,3
chr9	2992543	.	C	CAGATA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:10,0:17,3:0|1:2992542_A_T:2992542:14,13,0,3
chr9	2992546	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=97,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:10,0:14,3:0|1:2992542_A_T:2992542:14,12,0,3
chr9	2992547	.	T	TTA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=97,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:9,0:12,3:0|1:2992542_A_T:2992542:14,12,0,3
chr9	3014254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr9	3053325	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:17,0:24,5:24,17,4,1
chr9	3053328	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=82,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:9,9:13,18:15,7,15,12
chr9	3247690	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	3330166	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr9	3829212	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr9	3855963	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,11,8
chr9	3856070	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,212;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.249:42:18,10:14,0:17,15,10,0
chr9	3879693	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	3932283	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,15,2
chr9	3932521	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	4117713	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr9	4118821	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4118821_C_CA:4118821:0,1,0,1
chr9	4118823	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4118821_C_CA:4118821:0,1,0,1
chr9	4125633	.	A	AGTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=GT;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,1:0,0,7,1
chr9	4561349	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:9,0,1,1
chr9	4561374	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	4561421	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:3,3,2,1
chr9	4561596	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr9	4566183	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4566183_G_T:4566183:0,1,0,1
chr9	4566184	.	C	CGAATGGAATCGAAGAGAATCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4566183_G_T:4566183:0,1,0,1
chr9	4566210	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	4576076	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:8,9,0,2
chr9	4576774	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:0,6,1,2
chr9	4576851	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr9	4585309	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:0|1:4585309_C_T:4585309:6,10,1,1
chr9	4585316	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:9,1:0|1:4585309_C_T:4585309:5,11,1,1
chr9	4618171	.	G	GAGTTCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0|1:4618171_G_GAGTTCA:4618171:0,3,0,1
chr9	4618173	.	G	GTCCTGAATATCTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:4618171_G_GAGTTCA:4618171:0,3,0,1
chr9	4618175	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:4618171_G_GAGTTCA:4618171:0,3,0,1
chr9	4618185	.	G	GCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=148,123;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4618185_G_GCTCTT:4618185:0,2,0,1
chr9	4618186	.	A	AGGCTATAGTTTGAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,23;MFRL=148,123;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4618185_G_GCTCTT:4618185:0,2,0,1
chr9	4618188	.	A	ACTGATTTAGTTGATT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=148,123;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4618185_G_GCTCTT:4618185:0,2,0,1
chr9	4626603	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=102,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:1,9,0,2
chr9	4626656	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:1,5,0,2
chr9	4661853	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:6,0,7,1
chr9	4662065	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,4:8,7:2,12,1,10
chr9	4663208	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=20,23;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.157:30:12,3:13,0:0|1:4663208_G_T:4663208:12,14,2,2
chr9	4663220	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:9,3:10,0:0|1:4663208_G_T:4663208:9,13,2,1
chr9	4663221	.	C	CTA	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=99,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:0|1:4663208_G_T:4663208:9,12,2,1
chr9	4663223	.	A	AAGATGCAGT	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:8,3:11,0:0|1:4663208_G_T:4663208:9,12,2,1
chr9	4663226	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=118,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,3:12,0:0|1:4663208_G_T:4663208:9,11,2,1
chr9	4663228	.	G	GCCA	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=129,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:7,3:12,0:0|1:4663208_G_T:4663208:10,11,2,1
chr9	4663231	.	CCGG	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=130,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:7,1:13,0:0|1:4663208_G_T:4663208:11,13,2,1
chr9	4679906	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.659:27:4,8:5,10:2,7,3,15
chr9	4701841	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr9	4713080	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,0:10,3:13,9,0,3
chr9	4722462	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,3,2
chr9	4722685	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr9	4793254	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,2,15
chr9	4834165	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:8,0:11,3:7,12,0,3
chr9	4834291	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:4,2:1,12,0,3
chr9	4844507	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=90.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,15,17
chr9	4844704	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:3,5,1,6
chr9	4849625	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=74,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0|1:4849625_G_GC:4849625:0,2,0,1
chr9	4849627	.	G	GTAGTAGCGTATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=74,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4849625_G_GC:4849625:0,2,0,1
chr9	4850421	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0|1:4850421_C_G:4850421:0,0,11,8
chr9	4850436	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,4:0|1:4850421_C_G:4850421:0,0,8,7
chr9	4860300	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,1:3,2:3,7,1,2
chr9	5069837	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr9	5122932	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=182,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:0,1:2,0,2,1
chr9	5335639	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr9	5431844	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=129,111;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,7:5,0:13,1,7,0
chr9	5456173	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:11,7:13,9:11,14,5,11
chr9	5467797	.	AG	CC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=103,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:14,3,1,1
chr9	5467955	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,0,5
chr9	5522575	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=92,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.385:29:12,4:5,7:8,10,3,8
chr9	5557670	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:15,1:0|1:5557670_C_T:5557670:14,19,1,1
chr9	5557672	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,14,18
chr9	5557674	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,0:15,2:0|1:5557670_C_T:5557670:14,17,1,1
chr9	5656558	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.630:8:1,3:1,2:2,1,4,1
chr9	5720172	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,4:6,5:6,1,7,3
chr9	5738552	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:4,0:6,3:0|1:5738552_T_G:5738552:5,5,0,4
chr9	5738558	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:0|1:5738552_T_G:5738552:5,4,0,4
chr9	5743038	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr9	5743784	.	ATTTTTCTTCCCT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=101,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr9	5754988	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:4,1:0,1:0,5,0,2
chr9	5762512	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=127,160;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:14,7:7,0:17,4,7,0
chr9	5762533	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:5,15:4,4:9,0,14,5
chr9	5787260	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr9	5805001	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr9	5892551	.	AGTAAGTTCAAAACCAGACCCAGCAGGGCTTCCAGTTTGCCGTTTGCTGACACAGCCTGCTGACTTCCACCAGTACATGCCTGCTC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=74,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.181:16:3,1:7,2:5,8,2,1
chr9	5920465	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,4:10,0:0|1:5920465_G_A:5920465:10,10,4,0
chr9	5920470	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:9,4:13,0:0|1:5920465_G_A:5920465:11,12,4,0
chr9	5920580	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=112,88;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:23,5:17,0:20,21,5,0
chr9	5920603	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=112,88;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.132:51:24,6:20,0:23,22,5,1
chr9	5923326	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr9	5929167	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr9	5968027	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=125,64;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:16,0:13,5:0|1:5968027_T_A:5968027:19,12,1,4
chr9	5968029	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=125,64;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:17,0:14,5:0|1:5968027_T_A:5968027:19,12,1,4
chr9	5968037	.	GTTTT	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,38;MFRL=147,64;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.150:38:17,0:11,5:0|1:5968027_T_A:5968027:21,12,1,4
chr9	5969517	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:5969517_C_T:5969517:0,0,0,3
chr9	5969525	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:5969517_C_T:5969517:0,2,0,2
chr9	5988333	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr9	6014045	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:23,0:18,4:23,19,3,1
chr9	6014080	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:14,1:21,3:16,20,2,2
chr9	6252795	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr9	6255881	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	6328996	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:6,6:4,3:5,5,5,4
chr9	6329941	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=65,221;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.444:32:6,0:11,14:6,12,0,14
chr9	6330915	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr9	6421081	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,255;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,5:14,0:15,13,5,0
chr9	6422753	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=261,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	6422761	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=261,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6422761_C_T:6422761:0,1,0,1
chr9	6422769	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=261,261;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6422761_C_T:6422761:0,1,0,1
chr9	6475319	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:5,4:0,1:4,1,4,3
chr9	6475537	.	T	TATGTGGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,2:5,0:2,8,0,2
chr9	6481766	.	GGTA	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:11,0:0|1:6481766_GGTA_G:6481766:8,16,0,2
chr9	6481770	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:0|1:6481766_GGTA_G:6481766:8,15,0,2
chr9	6481984	.	TCTTGTAGGGAATGG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:9,0:10,8,1,1
chr9	6499821	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.466:11:3,2:3,3:2,4,2,3
chr9	6499994	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr9	6533010	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,91;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:1,6:9,6:6,4,5,8
chr9	6534845	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=236,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr9	6550734	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr9	6554798	.	GG	AT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:5,11,1,1
chr9	6554844	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	6554858	.	G	GTCAGAGTGAGAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	6556242	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=121,179;MMQ=51,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr9	6593037	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.496:20:4,0:6,9:1,9,0,10
chr9	6594978	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	6595148	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=110,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:6595148_C_T:6595148:3,3,1,1
chr9	6595151	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=110,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:1,2:0|1:6595148_C_T:6595148:3,3,1,1
chr9	6595152	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=143,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:6595148_C_T:6595148:1,3,1,1
chr9	6606746	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=252,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr9	6644758	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr9	6849596	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=127,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:9,5:7,8:12,4,7,6
chr9	6880130	.	T	TAGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=183,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:0,9,1,1
chr9	6984479	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	6990351	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.324:24:12,1:2,6:16,0,7,1
chr9	6990412	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.095:51:18,1:21,3:27,20,3,1
chr9	6990548	.	ATTT	A,ATTTT	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=18,20,24;MFRL=95,121,85;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,18;RU=T;STR;TLOD=4.89,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,8:0.287,0.605:19:1,2,4:0,4,3:0,2,10,7
chr9	7016001	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr9	7076371	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:4,3,4,1
chr9	7076557	.	T	TTTGTATTTTTTTGTAAAATGGGGTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	7103599	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr9	7105548	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr9	7127964	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7127964_CCA_C:7127964:0,1,1,0
chr9	7127967	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7127964_CCA_C:7127964:0,1,1,0
chr9	7128000	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=228,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr9	7798518	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,19,8
chr9	7799606	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:2,9,0,2
chr9	7799627	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=180,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:1,4,1,2
chr9	8338847	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=104,86;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,17;RU=AG;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.854:11:1,2:0,2:1,0,7,3
chr9	8341146	.	A	ATGCAATTCTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:8341146_A_ATGCAATTCTG:8341146:11,4,0,2
chr9	8341149	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:8341146_A_ATGCAATTCTG:8341146:11,4,0,2
chr9	8341152	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:8341146_A_ATGCAATTCTG:8341146:11,4,0,2
chr9	8389364	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:2,5,2,3
chr9	8436703	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:0,6,1,3
chr9	8470930	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr9	8470974	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,1:4,4:2,3,4,1
chr9	8484023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr9	8484222	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,73;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:10,0:13,9:12,11,2,7
chr9	8499903	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=203,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8499903_T_TTC:8499903:0,1,0,1
chr9	8499904	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=203,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8499903_T_TTC:8499903:0,1,0,1
chr9	8636922	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8636922_A_C:8636922:0,3,0,1
chr9	8636928	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:8636922_A_C:8636922:0,3,0,1
chr9	8636931	.	A	AGCAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:8636922_A_C:8636922:0,3,0,1
chr9	8636939	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1|0:8636922_A_C:8636922:0,3,0,1
chr9	8636940	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1|0:8636922_A_C:8636922:0,3,0,1
chr9	12704725	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=58,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,2,4
chr9	12708910	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr9	12708958	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=89,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:2,3:4,3:5,1,5,2
chr9	12775861	.	TGGC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:1,0:1,6,1,1
chr9	13109093	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.319:14:5,1:4,3:0|1:13109093_T_TA:13109093:1,9,0,4
chr9	13109111	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0|1:13109093_T_TA:13109093:0,0,1,12
chr9	13110688	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0|1:13110688_G_T:13110688:3,6,1,1
chr9	13110690	.	GTC	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:13110688_G_T:13110688:3,6,1,1
chr9	13110694	.	TGCCC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:13110688_G_T:13110688:2,6,1,1
chr9	13110699	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:13110688_G_T:13110688:2,6,1,1
chr9	13112116	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr9	13115422	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	13123291	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:7,12,0,2
chr9	13125130	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr9	13125201	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=55,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:2,1,2,2
chr9	13126470	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:6,1,6,0
chr9	13133799	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:13133799_C_T:13133799:7,2,2,0
chr9	13133803	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:0|1:13133799_C_T:13133799:7,2,2,0
chr9	13140176	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:8,0:10,0:0|1:13140176_T_C:13140176:4,15,1,1
chr9	13140181	.	A	ATTTGCTTAATGTCATGCATATCTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:13140176_T_C:13140176:3,15,1,1
chr9	13143530	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=135,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:9,9,0,2
chr9	13147723	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr9	13168401	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:12,0:7,2:8,11,1,1
chr9	13168420	.	T	TATTCATGGAGGTGCCATTAGTCGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:9,7,1,1
chr9	13175715	.	TGAG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=87,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:5,1:5,6,0,2
chr9	13176220	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,92;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:9,3:14,0:7,16,3,0
chr9	13188953	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:4,3:4,7:4,5,5,5
chr9	13192320	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,1,10
chr9	13193153	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=91,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr9	13193320	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=81,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.394:6:0,1:1,1:1,3,0,2
chr9	13219680	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,57;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,3:12,0:9,14,3,0
chr9	13221472	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=97,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:11,0:24,3:10,25,0,3
chr9	13224467	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=131,67;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:14,0:11,3:0|1:13224467_C_A:13224467:11,15,1,2
chr9	13224476	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,0:13,1:0|1:13224467_C_A:13224467:10,15,1,2
chr9	13927980	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.350:41:14,7:12,7:17,10,11,3
chr9	13928080	.	TATTC	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.373:49:16,9:14,8:14,17,7,11
chr9	14120655	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,2,22
chr9	14155769	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.660:39:6,13:7,13:10,3,23,3
chr9	14306944	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr9	14307038	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=109,138;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.144:46:18,6:22,0:26,14,6,0
chr9	14619168	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr9	14640055	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	14720361	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,6:3,2:2,3,2,6
chr9	14722477	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,3:4,2:2,5,0,5
chr9	14722637	.	G	GCCGCTGCCACTTCTGGGGAAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	14737506	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,8,7
chr9	14737616	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	14740300	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	14747133	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr9	14750155	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,147;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:5,0:7,15:7,6,0,16
chr9	14756483	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=159,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:0,6,0,6
chr9	14759725	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr9	14770658	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr9	14775705	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr9	14784665	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr9	14788886	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=101,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,0:6,4:9,3,3,1
chr9	14792944	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14792944_A_T:14792944:0,1,0,1
chr9	14792946	.	T	TACATGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14792944_A_T:14792944:0,1,0,1
chr9	14806902	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	14813099	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14813099_A_C:14813099:0,2,0,1
chr9	14813102	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14813099_A_C:14813099:0,2,0,1
chr9	14813105	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14813099_A_C:14813099:0,2,0,1
chr9	14824709	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=153,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr9	14841387	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	14842241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr9	14842267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr9	14842336	.	C	CTCCT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:0|1:14842336_C_CTCCT:14842336:5,7,2,2
chr9	14842340	.	AT	CG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=125,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:0|1:14842336_C_CTCCT:14842336:5,8,2,2
chr9	14845994	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,2:11,1:12,8,3,0
chr9	14846122	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.669:19:3,5:3,8:2,4,5,8
chr9	14848799	.	ACACACTG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=93,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:14848799_ACACACTG_A:14848799:4,1,1,1
chr9	14848811	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=93,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:14848799_ACACACTG_A:14848799:4,1,1,1
chr9	14851598	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,0:2,5:0,8,0,5
chr9	14851617	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=38,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr9	14868653	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	14868791	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:14868791_A_C:14868791:8,12,1,1
chr9	14868793	.	T	TTCC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:14868791_A_C:14868791:8,12,1,1
chr9	14868797	.	A	ATCG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:14868791_A_C:14868791:7,12,1,1
chr9	14868799	.	T	TAATCAAAAATG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,1:0|1:14868791_A_C:14868791:7,12,1,1
chr9	15189782	.	C	CCTTTCCTTTCCTTTCCTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:6,1:6,1:2,10,0,2
chr9	15190494	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,5,3
chr9	15192720	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=55,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:1,4:0,3:1,0,0,7
chr9	15199813	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,36:0.436:83:21,15:25,21:7,40,8,28
chr9	15203775	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=60,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:4,2,4,0
chr9	15423239	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr9	15433462	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=253,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	15458080	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.822:15:3,3:0,6:2,1,2,10
chr9	15471394	.	T	TGCAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	15472769	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=111,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,3:14,0:6,16,0,3
chr9	15473914	.	AAAAAAAAAAAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAAAAAAC;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.527:7:1,2:1,2:2,1,4,0
chr9	15486958	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr9	15591477	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:7,8,3,0
chr9	15623473	.	G	GCACACACA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=CA;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:0,1:2,1:0,2,1,2
chr9	15623512	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=93,93;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr9	15678995	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr9	15695318	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:6,0:9,11,1,1
chr9	15695341	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=114,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:0|1:15695341_T_G:15695341:6,8,1,1
chr9	15695343	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:15695341_T_G:15695341:5,8,1,1
chr9	15695418	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	15727859	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:2,2:0|1:15727859_TC_T:15727859:7,2,1,1
chr9	15727861	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:0|1:15727859_TC_T:15727859:7,2,1,1
chr9	15727900	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,0:6,1:11,11,1,1
chr9	15729855	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr9	15779179	.	T	TCAGGCTGAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=270,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.386:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr9	15784496	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,8:0,0,13,8
chr9	16215171	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,2,0
chr9	16215728	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr9	16436736	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.121:35:16,0:15,3:10,21,2,2
chr9	16437069	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:7,0:17,5:10,14,0,5
chr9	16699165	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,31;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,2:9,0:7,7,1,1
chr9	16699287	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=83,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0|1:16699287_C_T:16699287:0,2,1,2
chr9	16699292	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:16699287_C_T:16699287:0,1,1,2
chr9	16727693	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16727693_A_G:16727693:0,0,1,0
chr9	16727698	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:16727693_A_G:16727693:0,0,4,0
chr9	16727994	.	G	GTCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:16727994_G_GTCTT:16727994:0,3,0,2
chr9	16727995	.	A	ACTCTCCTTCTCTGCCTGTCCGTCTGTCTGTCTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:16727994_G_GTCTT:16727994:0,3,0,2
chr9	16738307	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,8,0
chr9	16738312	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,8,0
chr9	16738338	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.850:19:1,8:1,8:2,0,12,5
chr9	16738556	.	C	CTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	17167077	.	AT	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	17235642	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,13,4
chr9	17273878	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr9	17308968	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr9	17309336	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr9	17330558	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=190,2161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	17330812	.	GACATTT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:2,2:8,0:0|1:17330812_GACATTT_G:17330812:3,9,1,1
chr9	17330821	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,0:0|1:17330812_GACATTT_G:17330812:2,8,1,1
chr9	17342357	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:17342357_C_A:17342357:11,11,1,1
chr9	17342366	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:12,2:0|1:17342357_C_A:17342357:14,12,1,1
chr9	17342383	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr9	17342517	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	17366568	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,8:6,1:8,4,8,1
chr9	17394432	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=204,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	17394465	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	17394996	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr9	17395108	.	C	T,CCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27,30;MFRL=0,141,89;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.18,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.666,0.222:6:0,5,1:0,0,0:0,0,0,6
chr9	17409556	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	17457512	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,15:0,5:0,0,17,3
chr9	17464402	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	17579301	.	GGTGCGT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:6,4,1,1
chr9	17579370	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	17761379	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr9	18680566	.	T	TACCACCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	18721748	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr9	18795304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	18817246	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr9	18826261	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.919:14:0,7:1,6:1,0,7,6
chr9	18826500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr9	18887753	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr9	18889544	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:5,5:9,5:9,5,5,5
chr9	18889789	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=273,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	18906984	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	18950787	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,10:0,0,11,9
chr9	18950980	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	19033035	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	19050138	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=149,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:6,12,1,2
chr9	19050263	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,102;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:7,4,0,5
chr9	19051028	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,0,5
chr9	19058776	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,0:16,2:11,15,1,1
chr9	19058791	.	A	AAAAGAGGATAC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=144,63;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:7,14,1,1
chr9	19078116	.	CAA	C,CA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33,31;MFRL=132,159,112;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.75,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,6:0.192,0.295:23:6,2,3:4,2,3:10,2,11,0
chr9	19078320	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=91,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:11,11,0,2
chr9	19080556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=188,105;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,3,0,2
chr9	19080558	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=188,105;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,3,0,2
chr9	19080562	.	GA	TC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=183,105;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,2,0,2
chr9	19080570	.	T	TCCCAAGTAGCTGG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=176,105;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,3,0,2
chr9	19080574	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=176,105;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,3,0,2
chr9	19080575	.	A	ACAGG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=171,105;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:19080556_T_C:19080556:8,2,0,2
chr9	19086618	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,133;MMQ=55,55;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr9	19089375	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr9	19093098	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr9	19094328	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,56;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.068:43:21,0:18,2:0|1:19094328_A_T:19094328:22,19,1,1
chr9	19094331	.	C	CATTTGACTCTATTCAATTCGATTTGATTCT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,56;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.068:43:19,0:19,2:0|1:19094328_A_T:19094328:22,19,1,1
chr9	19094439	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr9	19096832	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:0,10,0,3
chr9	19120949	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:23,0:13,2:0|1:19120949_C_T:19120949:15,22,1,1
chr9	19120957	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:23,0:12,2:0|1:19120949_C_T:19120949:15,22,1,1
chr9	19123745	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	19126476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr9	19295941	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	19299209	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,27,30;MFRL=145,162,169;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.23,6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,2,5:0.082,0.184:30:7,1,1:9,0,2:11,12,3,4
chr9	19299362	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,6:3,4:0,3,0,10
chr9	19299382	.	G	GGGGGGAGTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr9	19305443	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:19305443_G_A:19305443:8,10,1,1
chr9	19305446	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:10,0:0|1:19305443_G_A:19305443:8,10,1,1
chr9	19324535	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:2,2:6,0:2,8,1,1
chr9	19326053	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:10,4:5,7:11,5,8,3
chr9	19332082	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:13,1:14,11,2,0
chr9	19335007	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=91,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.175:27:12,4:7,0:10,13,4,0
chr9	19335038	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,4:9,0:6,12,4,0
chr9	19346480	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:10,0:2,3:5,7,2,1
chr9	19350926	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.171:16:7,2:7,0:8,6,1,1
chr9	19352260	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	19357230	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr9	19357276	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	19357980	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=86,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:5,3:15,0:12,9,3,0
chr9	19360567	.	TAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGC;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	19369764	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,125;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.350:13:5,3:4,1:9,0,4,0
chr9	19369778	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr9	19369941	.	CAA	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.124:38:18,2:16,2:0|1:19369941_CAA_C:19369941:16,18,0,4
chr9	19369947	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.124:38:18,2:15,2:0|1:19369941_CAA_C:19369941:16,18,0,4
chr9	19376255	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:6,7:11,4:0|1:19376255_A_C:19376255:11,6,10,1
chr9	19376258	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.437:30:6,9:10,4:0|1:19376255_A_C:19376255:11,6,11,2
chr9	19379367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,3:7,9:7,5,9,3
chr9	19409206	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:6,9,2,1
chr9	19424714	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,73;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,0:6,4:5,11,2,2
chr9	19435162	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	19516082	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,73;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	19550257	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=53,58;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:19550257_C_T:19550257:11,12,1,1
chr9	19550280	.	AGAGGT	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=90,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:19550257_C_T:19550257:6,16,1,1
chr9	19550291	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,18;MFRL=90,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:7,1:0|1:19550257_C_T:19550257:5,15,1,1
chr9	19550294	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=67,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:19550257_C_T:19550257:4,11,1,1
chr9	19550296	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=96,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,1:0|1:19550257_C_T:19550257:3,10,1,1
chr9	19550308	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr9	19577086	.	GGTATGTGGCCTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=234,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	19786172	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=95,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:19786172_T_A:19786172:3,5,1,1
chr9	19786179	.	T	TCAAACCTCACCCCACCAAGCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=95,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:19786172_T_A:19786172:3,5,1,1
chr9	20620596	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr9	20720599	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=90,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr9	20740355	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,1:2,4:0,4,2,3
chr9	20764921	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:11,9,2,1
chr9	20765097	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=116,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:1,2,1,5
chr9	20765127	.	TT	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr9	20778631	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,1:1,1:6,2,2,0
chr9	20781979	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr9	20862797	.	CTGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TGT;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	20882117	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	20885240	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,5:3,7:1,7,5,7
chr9	20907333	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=95,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	20923579	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr9	20944558	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=78,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:2,8:3,7:4,1,14,1
chr9	20978306	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=93,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.369:17:2,5:9,1:0|1:20978306_A_G:20978306:7,4,5,1
chr9	20978312	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0|1:20978306_A_G:20978306:0,0,13,5
chr9	20982328	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,4:6,6:8,5,6,4
chr9	20982503	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr9	20986265	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.407:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr9	20990173	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=116,171;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:16,0:11,4:9,19,0,4
chr9	20990203	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=121,171;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,0:10,4:8,12,0,4
chr9	21166004	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=88,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.602:28:8,10:2,7:6,5,11,6
chr9	21186931	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=92,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:2,10:9,6:7,4,9,8
chr9	21187311	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=93,104;MMQ=60,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,8:0,9:1,0,12,5
chr9	21187700	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=164,184;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr9	21187705	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=178,9784;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr9	21187734	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=214,9784;MMQ=44,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	21206427	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=303,138;MMQ=46,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:3,5:4,3:3,5,7,1
chr9	21206928	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=147,12386;MMQ=60,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,4:8,0:7,4,0,4
chr9	21206978	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=151,163;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:4,8,1,1
chr9	21207000	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0|1:21207000_C_G:21207000:0,0,3,6
chr9	21207005	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:21207000_C_G:21207000:0,0,3,6
chr9	21216728	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,7:6,3:9,4,7,3
chr9	21217159	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=94,120;MMQ=51,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0|1:21217159_T_G:21217159:3,5,4,3
chr9	21217166	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=120,94;MMQ=60,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,8:0.529:15:2,5:4,3:1|0:21217159_T_G:21217159:4,3,3,5
chr9	21217320	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=105,115;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.375:38:7,10:17,4:10,14,8,6
chr9	21227942	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=131,128;MMQ=40,53;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:3,2,2,2
chr9	21227963	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=93,115;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,6:1,2:3,4,2,6
chr9	21228002	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=111,131;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:1,7,3,4
chr9	21228040	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=135,111;MMQ=24,29;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:3,0,3,2
chr9	21228289	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,182;MMQ=49,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:0,4:1,8:1,0,2,10
chr9	21239942	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:21239942_C_T:21239942:9,12,1,1
chr9	21239950	.	TGCTGC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=106,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:0|1:21239942_C_T:21239942:8,13,1,1
chr9	21239958	.	GGCTGGTTGA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:6,2:0|1:21239942_C_T:21239942:8,13,1,1
chr9	21304803	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,19:0,6:0,0,10,15
chr9	21333159	.	TATTTCTGGACA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,2:11,0:14,15,1,1
chr9	21334061	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=116,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:17,1:12,2:12,17,1,2
chr9	21334099	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:13,10,1,1
chr9	21334123	.	TCA	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=144,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:13,2:0|1:21334123_TCA_T:21334123:13,12,1,1
chr9	21334128	.	AG	TC	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=142,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:21334123_TCA_T:21334123:15,11,1,1
chr9	21334131	.	G	GTATTTCCT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=145,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:0|1:21334123_TCA_T:21334123:15,9,1,1
chr9	21335321	.	CTGGGCCTGGGCT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:2,2:6,5:5,8,1,6
chr9	21368036	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:0|1:21368036_C_G:21368036:3,5,3,5
chr9	21368047	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:21368036_C_G:21368036:5,12,1,1
chr9	21368061	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:21368036_C_G:21368036:5,11,1,1
chr9	21368318	.	ATATC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATC;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:3,2:0,9,4,4
chr9	21384801	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=107,76;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:8,0:26,5:29,8,1,4
chr9	21410117	.	ATTCT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:3,3,5,2
chr9	21440535	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=88,148;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:2,6,0,5
chr9	21440994	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=138,131;MMQ=40,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr9	21441116	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=70,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,8:9,5:6,9,5,8
chr9	21482276	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=138,30;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,2:15,0:15,12,1,1
chr9	21815589	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:1,6:0,2:0,1,1,10
chr9	21816646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	21837824	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	21859306	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:16,0:0|1:21859306_C_T:21859306:7,15,1,1
chr9	21859309	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,2:13,0:0|1:21859306_C_T:21859306:6,15,1,1
chr9	21861902	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.202:23:10,1:9,3:17,2,4,0
chr9	21968380	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr9	23701552	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.318:42:16,13:13,0:13,16,0,13
chr9	24545957	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0|1:24545957_G_C:24545957:0,0,6,11
chr9	24545976	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=157,134;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:5,0:9,2:0|1:24545957_G_C:24545957:4,10,0,2
chr9	25677731	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:12,0:5,2:13,5,2,0
chr9	25678887	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=105,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,1,2
chr9	26980590	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.180:37:14,6:16,0:17,14,6,0
chr9	26999697	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:18,0:16,4:25,10,1,3
chr9	26999768	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=123,172;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.425:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr9	26999793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=227,172;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr9	27036584	.	T	TTGGTAGTTCTCGCGTGTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=65,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27036584_T_TTGGTAGTTCTCGCGTGTTTCA:27036584:0,2,0,1
chr9	27036588	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=65,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27036584_T_TTGGTAGTTCTCGCGTGTTTCA:27036584:0,2,0,1
chr9	27047246	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr9	27047425	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	27047460	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=156,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	27168433	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr9	27172838	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	27173180	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,6:1,1:3,0,5,2
chr9	27185504	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,4:8,0:10,5,2,2
chr9	27190569	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,67;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:8,10,2,1
chr9	27192677	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=82,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:2,0,1,4
chr9	27206618	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,157;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:4,11:11,0:10,5,11,0
chr9	27212725	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:10,1:20,6:17,14,1,6
chr9	27217791	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.421:12:4,1:3,4:1,6,1,4
chr9	27218726	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:12,2:6,6:9,9,4,4
chr9	27290933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=103,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr9	27290984	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr9	27296595	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	27296870	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=178,26;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:11,1,1,1
chr9	27330514	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=94,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr9	27455095	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:5,4,6,1
chr9	27455584	.	CG	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=110,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,2:5,2:0,5,0,4
chr9	27455585	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.905:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr9	27550552	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:27550552_G_A:27550552:15,0,2,0
chr9	27550555	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=177,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:27550552_G_A:27550552:15,0,2,0
chr9	27556763	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,0:14,2:0|1:27556763_C_T:27556763:10,13,1,1
chr9	27556771	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=115,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:14,2:0|1:27556763_C_T:27556763:7,13,1,1
chr9	27556773	.	G	GGGAACTGGATAA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,0:13,2:0|1:27556763_C_T:27556763:6,13,1,1
chr9	27556776	.	C	CCAT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=122,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:4,0:13,2:0|1:27556763_C_T:27556763:5,12,1,1
chr9	27556858	.	A	AAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27556858_A_AAAC:27556858:0,3,0,1
chr9	27556859	.	T	TTTATCTATTTATTGTACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:3,0:0,1:0|1:27556858_A_AAAC:27556858:0,3,0,1
chr9	27561465	.	A	ATGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	27562352	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,12,6
chr9	27567145	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr9	28888841	.	T	TGACCATTGTTGA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:11,0:4,1:13,3,1,1
chr9	28889060	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	32418237	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.595:30:8,9:4,9:4,8,6,12
chr9	32420874	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=78.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.469:58:14,27:16,0:19,12,27,0
chr9	32440404	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr9	32472895	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr9	32476913	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr9	32480142	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr9	32485288	.	C	CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:1,3,1,1
chr9	32500848	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=105,98;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:13,3:13,10,0,3
chr9	32525969	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=140,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr9	32526233	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr9	32567943	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,86;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:2,7,2,0
chr9	32568010	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=180,197;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:1,1:12,1:12,2,2,0
chr9	32568024	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.615:14:0,1:5,8:4,1,7,2
chr9	32568692	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=208,287;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:32568692_A_G:32568692:0,1,0,1
chr9	32568712	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=208,287;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:32568692_A_G:32568692:0,1,0,1
chr9	32571096	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,0:11,8:3,20,0,8
chr9	32632159	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=74,146;MMQ=60,31;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:10,6:12,0:0|1:32632159_C_T:32632159:11,14,6,0
chr9	32632165	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=75,146;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:8,6:7,0:0|1:32632159_C_T:32632159:8,11,6,0
chr9	32634580	.	ATCATCGTGATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:9,0:7,12,1,1
chr9	32635452	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:12,2:13,1:14,11,2,1
chr9	32635705	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,14;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	32789230	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=220,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32789230_G_C:32789230:0,1,0,1
chr9	32789233	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=220,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32789230_G_C:32789230:0,1,0,1
chr9	32973706	.	T	TTAAGACTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=209,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr9	32974372	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	32974570	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr9	32986053	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:0,2:0,4,0,2
chr9	33034415	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=198,145;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:33034415_T_G:33034415:1,1,0,1
chr9	33034416	.	T	TGATGAATAAAATGGATAACGCAGAGAAGCAGAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=198,145;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:33034415_T_G:33034415:1,1,0,1
chr9	33034418	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=198,145;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:33034415_T_G:33034415:1,1,0,1
chr9	33036688	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,2:8,2:6,15,2,2
chr9	33071661	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.458:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr9	33076645	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.382:29:11,6:7,4:6,12,3,8
chr9	33135085	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=238,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	33255055	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,2:18,0:0|1:33255055_CA_C:33255055:14,12,1,1
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chr9	33255079	.	ACC	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=87,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:9,2:19,0:0|1:33255055_CA_C:33255055:18,14,2,1
chr9	33255083	.	GTGTGAGAGTAGGA	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=87,66;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:10,1:20,1:0|1:33255055_CA_C:33255055:19,15,1,1
chr9	33255100	.	TTG	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=89,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.110:33:10,1:18,2:0|1:33255055_CA_C:33255055:17,13,1,2
chr9	33255987	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:2,11,0,2
chr9	33264540	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	33270748	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,6,13
chr9	33290532	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,10,9
chr9	33290688	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	33295142	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:7,0:11,3,4,0
chr9	33307255	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:18,3:8,0:11,15,3,0
chr9	33313736	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:33313736_T_A:33313736:11,8,1,1
chr9	33313743	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:33313736_T_A:33313736:9,7,1,1
chr9	33313744	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:33313736_T_A:33313736:9,7,1,1
chr9	33344252	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr9	33352818	.	A	AATGTAATGTAATGTAGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=171,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr9	33352826	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	33354070	.	TTTTTA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=165,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,6:3,3:3,5,6,3
chr9	33354098	.	C	CCACTGAACCTCCAAGCTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:9,3:8,0:8,9,1,2
chr9	33385089	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=90,108;MMQ=60,31;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.247:31:12,6:7,0:13,11,7,0
chr9	33385600	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=150,73;MMQ=60,45;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,1:0|1:33385600_G_A:33385600:4,6,1,1
chr9	33385602	.	AC	CT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=150,73;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:3,1:0|1:33385600_G_A:33385600:4,6,1,1
chr9	33385667	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=106,114;MMQ=50,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.233:24:8,1:8,4:11,8,3,2
chr9	33385784	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=145,184;MMQ=60,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:4,1:10,3:0|1:33385784_C_G:33385784:8,6,4,1
chr9	33385786	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=145,184;MMQ=60,23;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:4,2:8,3:0|1:33385784_C_G:33385784:8,6,4,1
chr9	33385808	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=172,149;MMQ=60,23;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:0|1:33385808_G_T:33385808:8,10,2,1
chr9	33385815	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=172,149;MMQ=60,23;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:8,3:0|1:33385808_G_T:33385808:7,10,2,1
chr9	33385919	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=208,184;MMQ=51,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:0|1:33385919_C_A:33385919:4,2,0,3
chr9	33385929	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=211,188;MMQ=49,23;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:33385919_C_A:33385919:3,2,0,2
chr9	33386284	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=93,80;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:6,1:1,2:4,4,2,1
chr9	33386378	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=161,206;MMQ=40,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,1:3,2:0|1:33386378_C_T:33386378:6,1,3,0
chr9	33386387	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=136,204;MMQ=40,29;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:33386378_C_T:33386378:7,2,2,0
chr9	33386393	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=175,202;MMQ=40,29;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.263:14:4,0:5,2:0|1:33386378_C_T:33386378:9,2,3,0
chr9	33386395	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,29;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr9	33386399	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=175,177;MMQ=40,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.210:13:4,0:6,2:0|1:33386378_C_T:33386378:9,2,2,0
chr9	33386887	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=153,145;MMQ=48,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:1,2:4,2,2,0
chr9	33386940	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=123,119;MMQ=47,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.306:34:6,1:17,8:0|1:33386940_G_A:33386940:17,7,7,3
chr9	33386944	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=123,119;MMQ=47,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.306:34:6,2:17,8:0|1:33386940_G_A:33386940:16,8,7,3
chr9	33386947	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=132,125;MMQ=47,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.323:35:6,2:18,8:0|1:33386940_G_A:33386940:17,7,7,4
chr9	33386951	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=132,125;MMQ=48,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,11:0.306:37:8,3:17,8:0|1:33386940_G_A:33386940:18,8,7,4
chr9	33386989	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=115,77;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,17:0.332:52:14,6:21,11:17,18,6,11
chr9	33387004	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=115,113;MMQ=60,53;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.332:40:12,5:15,8:11,16,4,9
chr9	33387047	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=152,124;MMQ=60,46;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.284:33:7,4:17,5:14,10,4,5
chr9	33391340	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=201,160;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr9	33391401	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=138,106;MMQ=32,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr9	33391417	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=128,106;MMQ=38,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:2,2:6,1:5,3,3,1
chr9	33395031	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=65,16943407;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:33395031_G_A:33395031:5,2,1,1
chr9	33395039	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=97,16943407;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:33395031_G_A:33395031:5,3,1,1
chr9	33442952	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,6,11
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chr9	33466105	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=87,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:6,0:13,2:6,13,2,0
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chr9	33468682	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	33469406	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr9	33473893	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
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chr9	33541274	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,135;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:9,7:6,8:6,9,3,12
chr9	33550329	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,166;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr9	33555695	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,156;MMQ=27,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.523:23:5,7:6,5:8,3,9,3
chr9	33558025	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,10,2
chr9	33571170	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=193,130;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:3,1,5,0
chr9	33571221	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=20,25,24;MFRL=95,118,120;MMQ=60,60,60;MPOS=20,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=37.10,29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,18,14:0.502,0.422:35:0,10,5:2,8,6:1,2,23,9
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chr9	33629238	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr9	33629249	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
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chr9	33794915	.	TTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=22,27;MFRL=129,201;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:2,2:11,1:0|1:33794906_TTGAAACA_T:33794906:6,9,0,3
chr9	33794923	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=26,33;MFRL=118,176;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:2,6,0,4
chr9	33794926	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=118,201;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,2:7,1:0|1:33794906_TTGAAACA_T:33794906:3,7,0,3
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chr9	33794942	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=27,31;MFRL=129,177;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:33794906_TTGAAACA_T:33794906:0,3,0,3
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chr9	33794965	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=151,177;MMQ=60,42;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:33794955_GG_TC:33794955:0,5,0,3
chr9	33794981	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=179,177;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	33795475	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=133,149;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33795475_A_G:33795475:2,1,0,1
chr9	33795478	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=108,149;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:33795475_A_G:33795475:2,2,0,1
chr9	33795703	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=161,154;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr9	33795707	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=149,163;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,1,1
chr9	33795731	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=183,154;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:33795731_A_G:33795731:0,3,0,1
chr9	33795735	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=183,154;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:33795731_A_G:33795731:0,3,0,1
chr9	33795739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=183,154;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:33795731_A_G:33795731:0,3,0,1
chr9	33795742	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr9	33796690	.	TGAG	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=62.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:4,8:3,9:4,3,8,9
chr9	33796777	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=105,177;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:15,2:19,2:20,15,4,1
chr9	33796785	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=126,175;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.163:41:16,3:18,2:20,15,5,1
chr9	33796799	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=9;MBQ=20,26;MFRL=79,163;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:17,3:8,5:12,13,5,3
chr9	33796827	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=90,145;MMQ=53,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:12,3:9,4:7,14,3,4
chr9	33796858	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=30,23;MFRL=143,157;MMQ=49,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,4:9,4:4,12,1,7
chr9	33796889	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=154,169;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.440:20:3,5:8,4:0|1:33796889_A_G:33796889:3,8,0,9
chr9	33796896	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=154,169;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.486:18:1,4:4,4:0|1:33796889_A_G:33796889:3,6,0,9
chr9	33796898	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=34,24;MFRL=174,164;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.484:16:1,4:7,3:0|1:33796889_A_G:33796889:2,6,0,8
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chr9	33798079	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=144,122;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:2,14,1,2
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chr9	33798998	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=113,118;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:11,0:0|1:33798998_T_C:33798998:20,7,2,0
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chr9	33799026	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=106,109;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.084:46:23,3:17,0:0|1:33798998_T_C:33798998:23,20,2,1
chr9	33799163	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=108,127;MMQ=60,50;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:17,3:10,1:0|1:33799163_C_A:33799163:15,12,3,1
chr9	33799181	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=89,127;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:14,3:8,1:0|1:33799163_C_A:33799163:17,8,3,1
chr9	33799186	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=108,127;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.155:30:14,3:12,1:0|1:33799163_C_A:33799163:18,8,3,1
chr9	33912094	.	TAG	CCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,1,1
chr9	33924342	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:1,3,1,2
chr9	33927899	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,18:0,5:0,0,17,9
chr9	33932688	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,1:3,4:0,5,2,3
chr9	33932702	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr9	33933705	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	33948652	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr9	33953507	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,0:7,6:4,8,0,6
chr9	33955983	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,4:6,0:8,0,4,0
chr9	33960778	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=111,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:1,3:4,0:4,7,3,2
chr9	33973201	.	CCTTCCTGCCCCTCTCCCTCTGCCACGTCCAAATCCTTTAAAAAAACACACAATTATAGTATAAAATAATACTTATGTCCTACACAATTACA	C	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,22:0.038:106:19,12:25,8:32,52,5,17
chr9	33973324	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,0:2,5:0,2,0,5
chr9	33986751	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,4:6,8:7,4,9,3
chr9	33989201	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,190;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,0:0,1:0,0,0,4
chr9	33989223	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=187,199;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr9	34017015	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=98,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.354:19:6,5:4,1:10,2,5,2
chr9	34096597	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	34098257	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=207,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:0,3:1,0,5,0
chr9	34107310	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,7:0,7:1,0,11,3
chr9	34124966	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.151:45:17,6:21,0:26,13,6,0
chr9	34255267	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	34256266	.	CCA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,0:6,10,0,2
chr9	34269380	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:9,10,0,2
chr9	34306289	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:11,12,1,1
chr9	34311020	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,8,10
chr9	34343227	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,1:11,0:11,13,0,2
chr9	34370701	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr9	34372783	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,12:0,1:0,0,7,6
chr9	34379692	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,16,15
chr9	34382581	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	34385560	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=149,183;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,0:0,1:0|1:34385560_G_A:34385560:0,1,2,0
chr9	34385562	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=149,183;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:1,0:0,0:0|1:34385560_G_A:34385560:0,1,2,0
chr9	34402173	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	34489444	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:3,8,0,2
chr9	34500802	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:6,7,1,1
chr9	34500821	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.424:14:4,1:4,4:4,4,1,5
chr9	34521867	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,9:0,0,7,13
chr9	34521892	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:6,1:0|1:34521892_A_T:34521892:3,10,0,2
chr9	34521895	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,1:0|1:34521892_A_T:34521892:3,10,0,2
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chr9	34556286	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.219:24:9,4:10,0:11,8,5,0
chr9	34564659	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=106,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:4,0:9,11,0,2
chr9	34564806	.	C	CTAGAGTGCAATGGCACCATCTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:5,0:1,2:0,6,1,1
chr9	34621491	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.166:33:11,0:14,2:0|1:34621491_T_G:34621491:25,3,0,5
chr9	34621497	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.153:36:12,0:15,0:0|1:34621491_T_G:34621491:26,5,0,5
chr9	34623338	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,0:2,0,2,0
chr9	34635598	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr9	34650404	.	C	CAGCTTGTTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,2:18,1:14,16,0,3
chr9	34655734	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.291:19:9,1:2,4:5,9,1,4
chr9	34656953	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,154;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,5:9,0:6,7,5,0
chr9	34662080	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=120,75;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:12,5:18,0:0|1:34662080_G_A:34662080:14,17,4,1
chr9	34662086	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=121,75;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.153:37:12,5:18,0:0|1:34662080_G_A:34662080:13,19,4,1
chr9	34690400	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=191,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.236:22:4,3:13,1:1,16,2,3
chr9	34709800	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,377;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:6,13,1,1
chr9	34723181	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,6:1,4:4,2,8,2
chr9	34724987	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=105,111;MMQ=52,47;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:21,2:12,2:16,17,4,0
chr9	34725467	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,114;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:34725467_C_T:34725467:0,1,1,1
chr9	34725470	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,114;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:34725467_C_T:34725467:0,1,1,1
chr9	34726777	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,108902;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:16,3:14,11,0,3
chr9	34729452	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=72,131;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,6:3,4:2,5,3,7
chr9	34835861	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:2,0:3,2,1,1
chr9	34837574	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,3,1
chr9	34838495	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr9	34996942	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	34996969	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=206,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:34996969_C_T:34996969:3,0,0,1
chr9	34996971	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=206,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:34996969_C_T:34996969:3,0,0,1
chr9	34996979	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=231,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:34996969_C_T:34996969:4,0,0,1
chr9	35042785	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=271,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	35044866	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	35059052	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:10,6,2,2
chr9	35060302	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr9	35060746	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr9	35060830	.	CCTCTAGGCCCCCGATGTCTTCCCAGGTTACCTGTGGCACCTCTACCACGGTTTCCCGCAGTGCTGATGGGTTACTCTGG	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.138:44:10,0:11,5:17,22,4,1
chr9	35060955	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,8:0,0,5,9
chr9	35061477	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,0:3,2:7,0,2,0
chr9	35061693	.	G	GACAGTACACAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAGTACACAA;STR;TLOD=62.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,4:0,10:0,0,6,9
chr9	35062972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr9	35066579	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=55,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.766:11:1,5:1,3:2,0,8,1
chr9	35066855	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:0|1:35066855_C_T:35066855:5,10,1,1
chr9	35066868	.	T	TCACGCTAAGCTCTGACGACAGCCTCA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=84,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:6,0:0|1:35066855_C_T:35066855:3,9,1,1
chr9	35068201	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=241,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr9	35074917	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,1:9,6:12,7,4,3
chr9	35077203	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,3:1,5:0,2,5,3
chr9	35077441	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr9	35079361	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,11,2
chr9	35089048	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr9	35092423	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=104,105;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:12,0:16,3:19,10,0,3
chr9	35093020	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=88,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,8:3,3:4,4,5,6
chr9	35095344	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.293:23:5,0:11,4:7,9,0,7
chr9	35100002	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr9	35100569	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,13,8
chr9	35101383	.	GCA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr9	35101870	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=153.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,18:0,29:0,0,26,23
chr9	35106485	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:13,1:14,1:14,13,2,0
chr9	35107554	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.166:27:7,0:5,0:7,16,0,4
chr9	35107573	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.177:19:7,0:4,0:5,11,0,3
chr9	35231111	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:35231111_T_TA:35231111:5,4,1,1
chr9	35231116	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:35231111_T_TA:35231111:5,4,1,1
chr9	35295984	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr9	35370286	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,4:1,8:0,2,7,5
chr9	35375988	.	A	AC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:1,2:21,0:21,2,2,0
chr9	35381188	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,2:14,1:10,10,2,1
chr9	35381504	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:6,3,4,0
chr9	35382565	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=138,111;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:1,2,0,1
chr9	35382569	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=138,111;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:1,2,0,1
chr9	35382573	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=138,111;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:1,2,0,1
chr9	35382578	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=194,111;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:1,1,0,1
chr9	35382581	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=249,111;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:0,1,0,1
chr9	35382591	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,24;MFRL=249,111;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:0,1,0,1
chr9	35382598	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35382565_T_TG:35382565:0,0,0,1
chr9	35385866	.	C	CTGGTCTAATTGTGGGCAGGCCTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=102,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr9	35386218	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=125,47;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,2:14,0:0|1:35386218_G_A:35386218:13,13,0,2
chr9	35386223	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:14,0:0|1:35386218_G_A:35386218:12,14,0,2
chr9	35396378	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,521;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:6,0,5,0
chr9	35396677	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	35400208	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=69,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr9	35400220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr9	35556250	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:0,1,6,2
chr9	35560989	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,0:9,3:7,6,2,1
chr9	35561275	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,2:7,1:5,14,2,1
chr9	35562316	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,18;MFRL=109,339;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:1,0:3,2,2,0
chr9	35562320	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=109,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:3,0:2,1:3,2,1,0
chr9	35562322	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=138,339;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,0:4,2,2,0
chr9	35562328	.	TACAA	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=91,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:2,2:3,2,1,2
chr9	35562549	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:1,4,2,5
chr9	35606175	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:13,0:14,3:10,17,0,3
chr9	35606738	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=96,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr9	35606884	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,11:3,3:5,1,5,9
chr9	35609123	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=86,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.352:23:6,4:9,3:5,10,4,4
chr9	35609153	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:35609153_C_T:35609153:0,9,1,1
chr9	35609162	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:35609153_C_T:35609153:0,7,1,1
chr9	35609163	.	C	CTCTTGACCCCT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:35609153_C_T:35609153:0,7,1,1
chr9	35609165	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:35609153_C_T:35609153:0,7,1,1
chr9	35610523	.	CCCCTGCTCTGAGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTGCTCTGAGT;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,2:2,0:4,0,1,1
chr9	35611983	.	A	ATAACACACCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	35616583	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:5,8:5,4:8,4,10,3
chr9	35618403	.	G	GACCCCGCCTCCTTTCTAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	35650458	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,15,17
chr9	35650564	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:9,0:15,2:0|1:35650564_G_T:35650564:8,18,1,1
chr9	35650571	.	A	ATGAGGAAGCAGT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:15,2:0|1:35650564_G_T:35650564:8,18,1,1
chr9	35660444	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:22,5:18,0:21,21,5,0
chr9	35662823	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=133,119;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:15,0:2,5:11,6,0,5
chr9	35663113	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,0:6,6:2,7,0,6
chr9	35664330	.	AAAGGT	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,2:12,0:22,8,1,1
chr9	35664421	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=120,84;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:9,14,1,3
chr9	35664423	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=119,63;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:10,15,0,2
chr9	35677702	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0|1:35677702_T_A:35677702:0,0,6,2
chr9	35677711	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:35677702_T_A:35677702:0,0,6,4
chr9	35684822	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	35698426	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:35698426_T_A:35698426:6,11,1,1
chr9	35698431	.	G	GGCAATGCCGCCAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:35698426_T_A:35698426:5,11,1,1
chr9	35699941	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:11,5,0,2
chr9	35700150	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr9	35700168	.	AATGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:3,0,0,1
chr9	35706270	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:13,0:2,5:8,9,5,0
chr9	35707164	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:5,2:5,8,1,1
chr9	35711806	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,10:0,7:1,0,6,11
chr9	35713181	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr9	35718880	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:12,0:12,7:10,14,1,6
chr9	35721639	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,3:14,0:16,9,3,0
chr9	35721771	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.112:29:9,2:17,0:18,8,0,3
chr9	35722760	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr9	35733349	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:16,0:13,3:15,14,1,2
chr9	35735469	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35735469_C_CA:35735469:0,1,0,1
chr9	35735470	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35735469_C_CA:35735469:0,1,0,1
chr9	35739115	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr9	35739709	.	CC	TT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,0:18,2:16,17,1,1
chr9	35739876	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,1,4
chr9	35740048	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=167,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,2:4,3:5,5,3,2
chr9	35740590	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=73,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.195:40:20,7:13,0:0|1:35740590_G_A:35740590:15,18,7,0
chr9	35740600	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=76,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.167:47:18,7:20,0:0|1:35740590_G_A:35740590:23,17,7,0
chr9	35751221	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,18,8
chr9	35752093	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=93,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:7,0:16,4:15,8,0,4
chr9	35792611	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,10:7,0:7,6,10,0
chr9	35806550	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,0:5,3:2,8,0,3
chr9	35810692	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=83,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:3,1:4,13,1,1
chr9	35810958	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:6,1:28,2:20,15,2,1
chr9	35821574	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:12,9,2,0
chr9	35821607	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:10,9,3,0
chr9	35825413	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr9	35830030	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:4,0:4,5:1,8,0,6
chr9	35830053	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:35830053_A_AGG:35830053:0,3,0,1
chr9	35830054	.	T	TAACAGTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:35830053_A_AGG:35830053:0,3,0,1
chr9	35830063	.	A	AGTTACTGGTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=207,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	35834942	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=289,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,11:0,5:1,0,13,3
chr9	35845929	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr9	35906347	.	CCTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr9	35957355	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr9	36063688	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr9	36063743	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr9	36080488	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	36109947	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,13,9
chr9	36110137	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	36110157	.	G	GGTGTTACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=254,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0|1:36110157_G_GGTGTTACT:36110157:0,1,0,1
chr9	36110160	.	T	TAGCCACAATTTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=254,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36110157_G_GGTGTTACT:36110157:0,1,0,1
chr9	36118771	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:7,2,2,1
chr9	36121658	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=64,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:7,1:7,10,2,1
chr9	36121753	.	G	GTGGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr9	36123078	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.420:32:5,0:10,12:5,14,0,13
chr9	36170290	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=104,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr9	36191346	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=229,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	36210609	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:16,7,1,1
chr9	36210615	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:36210615_C_CT:36210615:15,7,1,1
chr9	36210620	.	A	AACATTTCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:36210615_C_CT:36210615:15,8,1,1
chr9	36210623	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.095:29:16,0:10,2:0|1:36210615_C_CT:36210615:16,11,1,1
chr9	36249282	.	T	TCTTTAATCTTTCTGTGCTGCTGA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=132,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:18,9,0,2
chr9	36249320	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:19,0:22,1:0|1:36249320_C_A:36249320:23,18,2,0
chr9	36249322	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:19,0:22,2:0|1:36249320_C_A:36249320:23,18,2,0
chr9	36276857	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,12:0,0,12,10
chr9	36276978	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:12,2:10,0:0|1:36276978_A_T:36276978:9,15,1,1
chr9	36276986	.	G	GAAAGAGGGCTTTGTTTAGGGC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:0|1:36276978_A_T:36276978:9,15,1,1
chr9	36345032	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36345032_C_T:36345032:0,1,0,1
chr9	36345037	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36345032_C_T:36345032:0,1,0,1
chr9	36345041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36345032_C_T:36345032:0,1,0,1
chr9	36369646	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,5:1,7:1,0,9,3
chr9	36369788	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:9,16,1,1
chr9	36594691	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:24,5:13,0:19,19,1,4
chr9	36643036	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=104,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.093:51:22,0:25,4:28,19,4,0
chr9	36651765	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,8:11,0:13,10,8,0
chr9	36669228	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	36674842	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,12,5
chr9	36840623	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,3:3,6:4,4,2,7
chr9	36846910	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=95,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,5:3,3:5,6,4,4
chr9	36923387	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:2,6,1,1
chr9	36923495	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=79,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:0|1:36923495_C_G:36923495:1,1,0,1
chr9	36923503	.	T	TCTTCTCCCTGTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=79,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:36923495_C_G:36923495:0,1,0,1
chr9	37033972	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.132:43:17,1:21,4:23,15,5,0
chr9	37034095	.	C	CTTTTTTTTTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=28,39;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr9	37304168	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:5,6:6,2:7,4,5,3
chr9	37305481	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=83,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,5,0
chr9	37426524	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr9	37426684	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,103;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:4,14,1,1
chr9	37428413	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr9	37429661	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr9	37486383	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr9	37486528	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,11:0.168:69:22,0:30,10:25,33,1,10
chr9	37489232	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,145;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0|1:37489232_C_CA:37489232:3,0,2,0
chr9	37489257	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.281:14:7,0:3,0:0|1:37489232_C_CA:37489232:9,1,4,0
chr9	37501752	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=77,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:2,1,4,3
chr9	37503176	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,1,2
chr9	37503222	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr9	37503241	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr9	37512734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:2,3,1,3
chr9	37512808	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr9	37529286	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr9	37529344	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=243,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr9	37531872	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr9	37537060	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=83,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr9	37537434	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=82,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:37537434_A_C:37537434:7,6,1,1
chr9	37537438	.	T	TCTCTCTAACTCCTCCTCACTTTC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=90,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:37537434_A_C:37537434:7,7,1,1
chr9	37707392	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr9	37708572	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	37711499	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr9	37711510	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr9	37724195	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:5,5,6,3
chr9	37733588	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=85,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,3:10,0:11,10,1,2
chr9	37733925	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	37737283	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	37745362	.	AAGAGAC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:9,0:11,13,1,1
chr9	37745413	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr9	37746333	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0|1:37746333_T_A:37746333:5,2,1,1
chr9	37746335	.	TT	GC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:37746333_T_A:37746333:5,2,1,1
chr9	37746340	.	AA	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=105,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:37746333_T_A:37746333:5,2,1,1
chr9	37780931	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=192,477;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr9	37784020	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=100,120;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.182:36:9,0:20,6:18,12,0,6
chr9	37859980	.	CTTTGATGAACTGCCTTAGTTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:5,1:20,3,2,0
chr9	37887570	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.323:7:1,0:2,2:0|1:37887570_T_TAA:37887570:2,3,2,0
chr9	37887588	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=125,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:1,0:5,0:0|1:37887570_T_TAA:37887570:3,7,2,0
chr9	37956126	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr9	37974743	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,2:1,7:2,1,3,6
chr9	38068532	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	38398304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,62;MMQ=50,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:5,5:1,2:0,6,5,3
chr9	38398421	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=325,225;MMQ=55,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38398421_CC_TT:38398421:0,1,0,1
chr9	38398425	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=325,225;MMQ=55,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38398421_CC_TT:38398421:0,1,0,1
chr9	38411345	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	38414067	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,14,15
chr9	38414269	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr9	38414276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38414276_G_A:38414276:0,3,0,1
chr9	38414277	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38414276_G_A:38414276:0,3,0,1
chr9	38414279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:38414276_G_A:38414276:0,3,0,1
chr9	38414284	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38414284_C_CTG:38414284:0,2,0,1
chr9	38414285	.	CCG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:38414284_C_CTG:38414284:0,2,0,1
chr9	38414292	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=203,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38414284_C_CTG:38414284:0,1,0,1
chr9	38575637	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,7:2,8:4,1,7,8
chr9	38615779	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,139;MMQ=46,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,8:4,4:2,6,3,9
chr9	38622214	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38622214_T_C:38622214:0,0,0,1
chr9	38622220	.	T	TACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38622214_T_C:38622214:0,0,0,1
chr9	42368313	.	G	GACACAGAGATAAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=128,82;MMQ=24,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42368313_G_GACACAGAGATAAGA:42368313:3,1,0,1
chr9	42368315	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=128,82;MMQ=24,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42368313_G_GACACAGAGATAAGA:42368313:3,1,0,1
chr9	42368353	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=94,56;MMQ=24,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:42368353_G_A:42368353:5,4,1,1
chr9	42368360	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=78,56;MMQ=25,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:42368353_G_A:42368353:4,4,1,1
chr9	42410325	.	GGAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=183,188;MMQ=22,20;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAAA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr9	43737545	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,114;MMQ=25,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,4:5,0:7,10,1,3
chr9	43822762	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=200,161;MMQ=25,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr9	43844359	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=144,86;MMQ=39,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:5,5:11,5:7,9,3,7
chr9	43849658	.	GC	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,100;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,6,0
chr9	43875942	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=140,122;MMQ=25,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,5:1,5:3,2,6,4
chr9	44869216	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=203,141;MMQ=30,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr9	45733509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr9	45733681	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=127,129;MMQ=23,23;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,7:3,6:6,0,10,3
chr9	45733796	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=90,119;MMQ=37,23;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:2,12:4,7:3,3,4,16
chr9	45733817	.	AAACC	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=24,20;MFRL=143,90;MMQ=23,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:9,2:10,4:1,19,3,3
chr9	45733818	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=156,137;MMQ=23,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.235:19:5,4:10,0:0|1:45733818_A_C:45733818:1,14,0,4
chr9	45733820	.	CCG	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=156,137;MMQ=23,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.235:19:4,4:10,0:0|1:45733818_A_C:45733818:1,14,0,4
chr9	45733824	.	CAGAGAGAGGGAA	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=135,137;MMQ=23,23;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:5,4:14,0:0|1:45733818_A_C:45733818:4,16,0,4
chr9	45733838	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=155,137;MMQ=23,23;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:5,4:11,0:0|1:45733818_A_C:45733818:4,14,0,4
chr9	45733840	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=156,137;MMQ=23,23;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,4:9,0:0|1:45733818_A_C:45733818:3,14,0,4
chr9	46386704	.	CT	AA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46386704_CT_AA:46386704:0,0,0,1
chr9	46386707	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46386704_CT_AA:46386704:0,0,0,1
chr9	46386711	.	TCTCTC	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46386704_CT_AA:46386704:0,0,0,1
chr9	46386721	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,23;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46386704_CT_AA:46386704:0,0,0,1
chr9	46386723	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,123;MMQ=60,23;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46386704_CT_AA:46386704:0,0,0,1
chr9	46386910	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=127,142;MMQ=27,23;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr9	46386956	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=147,128;MMQ=27,29;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:3,6,2,2
chr9	46387008	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=187,142;MMQ=27,23;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:1,6,1,4
chr9	46390592	.	ACACACACACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	66553722	.	CATTGTCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=126,109;MMQ=23,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:66553722_CATTGTCCG_C:66553722:1,1,0,1
chr9	66553727	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,22;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	66553732	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=126,109;MMQ=23,22;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:66553722_CATTGTCCG_C:66553722:1,1,0,1
chr9	67938651	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=132,136;MMQ=23,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:4,1:10,1:0|1:67938651_G_C:67938651:10,5,2,1
chr9	67938655	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=22,33;MFRL=127,136;MMQ=23,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,1:11,1:0|1:67938651_G_C:67938651:9,5,1,1
chr9	67938664	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=134,136;MMQ=23,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:4,2:10,1:8,6,3,1
chr9	67938673	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=24,29;MFRL=127,136;MMQ=23,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:4,2:10,1:8,6,3,1
chr9	67938721	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=135,100;MMQ=24,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr9	67938741	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=156,118;MMQ=23,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr9	67938748	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=151,136;MMQ=22,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr9	67968418	.	T	TTATATA	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=105,12779350;MMQ=35,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:28,2:19,0:22,25,0,2
chr9	67968419	.	C	CTTTTCAAGGGCAGCATTTGT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=105,12779350;MMQ=35,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:28,2:19,0:22,25,0,2
chr9	69247450	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=310,268;MMQ=23,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr9	69256741	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	69423615	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=126,82;MMQ=24,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:19,0:8,3:11,16,2,1
chr9	69423627	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,82;MMQ=24,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.183:30:17,0:8,5:10,15,3,2
chr9	69423637	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=131,149;MMQ=24,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:4,12,1,1
chr9	69423700	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=153,142;MMQ=23,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1,4,5,0
chr9	69423703	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=153,142;MMQ=23,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,4:3,1:1,4,5,0
chr9	69423721	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=159,140;MMQ=23,22;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:1,2,6,0
chr9	69423755	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=134,150;MMQ=24,22;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:2,1,3,3
chr9	69423792	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=110,164;MMQ=37,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:2,2,1,3
chr9	69423834	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=212,85;MMQ=24,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69423834_A_ATG:69423834:1,0,0,1
chr9	69423836	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=212,85;MMQ=24,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69423834_A_ATG:69423834:1,0,0,1
chr9	70919034	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=184,208;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr9	70993067	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	71081186	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.744:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	71094531	.	T	TGAGGCCACAGTTCCTGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=109,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr9	71114312	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=89,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:1,2:1,4,0,5
chr9	71144586	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:13,2:0|1:71144586_C_T:71144586:9,11,1,1
chr9	71144598	.	C	CAGTTTTCTCCACCTGAGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:5,0:12,2:0|1:71144586_C_T:71144586:7,14,1,1
chr9	71395786	.	GGT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=103,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:6,2:18,0:17,9,1,1
chr9	71397711	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=78,131;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,5:5,0:7,5,5,0
chr9	71397734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,13,3
chr9	71397747	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr9	71398839	.	TATTA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=110.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,9:0,16:0,0,9,16
chr9	71399228	.	CATTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTT;STR;TLOD=63.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,15,8
chr9	71555492	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr9	71555522	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr9	71628454	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:3,6,1,6
chr9	71629038	.	C	CGCGGCGGCG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=GCG;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,2:0,0,0,5
chr9	71668197	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0,0,8,4
chr9	71668210	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.360:6:1,2:2,0:0|1:71668210_C_CT:71668210:3,1,1,1
chr9	71668212	.	C	CCATTATTTTTCCCTACT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:71668210_C_CT:71668210:3,1,1,1
chr9	71687440	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	71687554	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=98,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:12,7,2,0
chr9	71687755	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.884:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr9	71714693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr9	71789386	.	T	TCGTGAG	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGTGAG;STR;TLOD=83.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.620:35:7,7:5,8:7,6,9,13
chr9	71827618	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr9	71831398	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr9	71831475	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=209,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	71835736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=198,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,0:3,0,2,0
chr9	71835954	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=128,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:10,12,0,2
chr9	71836486	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr9	71843023	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,3:0,0,2,9
chr9	71849278	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=137,195;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr9	71849314	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,0:1,3:1,2,2,5
chr9	71849495	.	GGTGGGGGTGGGGA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:4,0:1,2:5,0,1,1
chr9	71851208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr9	71852760	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,3:2,8:3,3,8,3
chr9	71854769	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	71855122	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	71865932	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr9	71869200	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:12,2:8,2:11,9,3,1
chr9	71986315	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:6,1,4,0
chr9	71990645	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,1:0,6:1,0,7,0
chr9	72000679	.	CTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	72002817	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr9	72006803	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr9	72046338	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=164,287;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:9,3:5,0:6,8,0,4
chr9	72064749	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=61,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:2,4:1,3:2,1,1,7
chr9	72071410	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:72071410_C_T:72071410:1,10,1,1
chr9	72071412	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,0:5,2:0|1:72071410_C_T:72071410:1,10,1,1
chr9	72338180	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr9	72338442	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:8,6,3,1
chr9	72374677	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr9	72374702	.	T	TGGACGCTTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGACGCTTG;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr9	72374941	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr9	72435862	.	CC	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:5,10,1,1
chr9	72472743	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,6:6,1,7,4
chr9	72501698	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,2:3,1:8,2,3,0
chr9	72723469	.	A	ACATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=219,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72723469_A_ACATC:72723469:0,1,0,1
chr9	72723472	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=219,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72723469_A_ACATC:72723469:0,1,0,1
chr9	72741021	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	72758645	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.231:50:23,11:16,0:22,17,11,0
chr9	72783608	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr9	72873989	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,2:16,0:18,8,2,0
chr9	72879159	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr9	72893349	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr9	72901096	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=62.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,1,17
chr9	72933958	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr9	72961963	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,3:4,1:8,6,3,1
chr9	72965425	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=98,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr9	72965438	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	72965451	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:72965451_G_T:72965451:0,4,0,1
chr9	72965460	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=178,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:72965451_G_T:72965451:0,3,0,1
chr9	72965461	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=178,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:72965451_G_T:72965451:0,3,0,1
chr9	73002648	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr9	73150918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=94,178;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:2,2:7,3:6,4,2,3
chr9	73168035	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,133;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:4,3:13,0:0|1:73168035_C_T:73168035:10,7,3,0
chr9	73168040	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=98,133;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:4,3:13,0:0|1:73168035_C_T:73168035:10,7,3,0
chr9	73213610	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr9	73213644	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr9	73230832	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=88,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:20,0:21,3:22,19,0,3
chr9	73234066	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	73240312	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,1:0,12:0,0,9,5
chr9	73240556	.	ACAAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73240556_ACAAGG_A:73240556:0,2,0,1
chr9	73240566	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:73240556_ACAAGG_A:73240556:0,1,0,2
chr9	73255432	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr9	73296400	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,7:5,4:3,4,7,4
chr9	73376414	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,4:6,2:3,13,0,6
chr9	73391314	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=86,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,2:9,1:10,7,2,1
chr9	73391409	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.685:11:2,1:1,7:0,3,5,3
chr9	73408518	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr9	73408649	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:0|1:73408649_GAA_G:73408649:4,9,0,2
chr9	73408650	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,8:0.504:15:2,2:5,6:1|0:73408649_GAA_G:73408649:2,5,2,6
chr9	73442724	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,9,7
chr9	73457832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr9	73457861	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr9	73458045	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.690:8:0,1:1,2:0,2,1,5
chr9	73461558	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	73479441	.	C	CAA,CAAAAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25,24;MFRL=0,0,141;MMQ=60,38,43;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,18,22;RU=A;STR;TLOD=3.56,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,7:0.331,0.584:10:0,0,1:0,2,4:0,0,3,7
chr9	74061697	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,4:9,0:15,8,2,2
chr9	74300640	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,9:1,5:1,0,9,5
chr9	74326961	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr9	74327135	.	A	AAGGGCCTCATTAGCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=53,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:5,0:7,2:4,9,1,1
chr9	74331376	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,4:0,16:0,0,15,5
chr9	74332970	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:9,5:2,5:5,7,3,7
chr9	74349917	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.867:12:0,3:0,7:0,1,0,11
chr9	74365382	.	A	AACTAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:74365382_A_AACTAAAT:74365382:0,3,0,1
chr9	74365385	.	TT	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:74365382_A_AACTAAAT:74365382:0,3,0,1
chr9	74477617	.	TAAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr9	74526647	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,247;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:21,0:14,7:19,18,7,0
chr9	74561883	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr9	74587782	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=108,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:22,0:12,3:0|1:74587782_G_A:74587782:23,13,2,1
chr9	74587788	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=109,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,0:12,2:0|1:74587782_G_A:74587782:23,12,1,1
chr9	74587798	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:19,0:11,1:0|1:74587782_G_A:74587782:19,15,1,1
chr9	74587857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=189,172;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:0,8,0,2
chr9	74675343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr9	74764627	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	74817632	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0|1:74817632_G_C:74817632:1,4,1,1
chr9	74817633	.	C	CTAATAATCCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:2,0:0|1:74817632_G_C:74817632:1,4,1,1
chr9	74817731	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74817731_TAA_T:74817731:0,0,0,1
chr9	74817734	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74817731_TAA_T:74817731:0,0,0,1
chr9	74838023	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=101,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.303:18:7,3:5,2:9,4,2,3
chr9	74838040	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,2:8,1:8,11,2,1
chr9	74838158	.	TC	GA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:74838158_TC_GA:74838158:2,7,1,1
chr9	74838167	.	G	GCTTTTTTTCTTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:0|1:74838158_TC_GA:74838158:2,7,1,1
chr9	74838193	.	T	TTTTTCTTGTCTTATTACACTGTAGAACTTCCAATA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=146,129;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr9	74840757	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr9	74842876	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,0:12,3:10,6,1,2
chr9	74845949	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr9	74862221	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:7,1,4,0
chr9	74974534	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr9	74975492	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,3:6,3:6,1,6,0
chr9	74975711	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,3,12
chr9	74979593	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr9	75303653	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=68,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:7,6:2,4:4,5,6,4
chr9	75355167	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:4,19,0,2
chr9	75387472	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,0:10,4:2,13,2,2
chr9	75403450	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr9	75420231	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	75420339	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=107,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:13,5:20,0:21,12,4,1
chr9	75420448	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27,32;MFRL=118,108,147;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.12,5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.268,0.349:15:3,3,4:3,1,1:3,3,2,7
chr9	75445343	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=144,62;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,2:4,1:7,2,0,3
chr9	75445357	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=126,31;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:75445357_T_C:75445357:11,7,0,2
chr9	75445360	.	AA	GC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=119,31;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:0|1:75445357_T_C:75445357:12,7,0,2
chr9	75450824	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr9	75521060	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	75539077	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:5,3:7,5:1,11,1,7
chr9	75541942	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,3:4,3:10,3,5,1
chr9	75543974	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	75544038	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=234,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	75554982	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	75769366	.	C	CCTTCCTCCTGTTTGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:5,1:1,1:1,5,0,2
chr9	75773599	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,4:5,0:10,3,4,0
chr9	75778563	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75778563_TA_CC:75778563:0,1,0,1
chr9	75778566	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75778563_TA_CC:75778563:0,1,0,1
chr9	75778569	.	T	TCCCTCGACCCAGGACCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:75778563_TA_CC:75778563:0,1,0,1
chr9	75780055	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:4,1:9,11:6,8,6,6
chr9	75781032	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:7,10,1,2
chr9	75782510	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,2:7,3:2,10,1,4
chr9	75783937	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:13,5:4,2:12,5,5,2
chr9	77245162	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	77286876	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,3:3,0:1,6,1,2
chr9	77339497	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=111,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr9	77343118	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,159;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,10:1,0:2,1,10,0
chr9	77353300	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:1,4:15,2:15,1,5,1
chr9	77377410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,4,2
chr9	77391060	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr9	77397519	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr9	77403723	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0|1:77403723_G_C:77403723:0,1,0,1
chr9	77403730	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:77403723_G_C:77403723:0,2,0,1
chr9	77403735	.	G	GGAACTGCAGTACAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77403723_G_C:77403723:0,2,0,1
chr9	77407736	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	77423134	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,0:6,5:2,11,0,5
chr9	77425638	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,3:1,4:1,0,6,1
chr9	77427173	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr9	77442616	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:6,5,2,1
chr9	77456988	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:2,0:10,2:12,0,2,0
chr9	77457023	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=135,74;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.109:26:6,1:10,0:0|1:77457023_G_A:77457023:16,8,1,1
chr9	77457027	.	CG	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.176:31:7,4:9,0:0|1:77457023_G_A:77457023:17,9,4,1
chr9	77457028	.	GAA	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.133:27:8,2:4,1:14,10,2,1
chr9	77457271	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:7,14,0,3
chr9	77563175	.	GTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr9	77567244	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	77567268	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	77684690	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=102,105;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,2:1,9:2,3,5,6
chr9	77692555	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	77693316	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=67,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:5,5:1,1:2,4,1,6
chr9	77697929	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,4:9,5:8,7,6,3
chr9	77745424	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr9	78638564	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=248,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78638564_G_GA:78638564:1,0,1,0
chr9	78638585	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=210,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:78638564_G_GA:78638564:2,1,1,0
chr9	78638589	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=210,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:78638564_G_GA:78638564:2,1,1,0
chr9	78638593	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,13;MFRL=210,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,0:0|1:78638564_G_GA:78638564:2,1,1,0
chr9	78748973	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,3:1,1:1,0,3,2
chr9	78772118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:1,2,1,4
chr9	78790138	.	AAATGGAATGGAATGAAATGG	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=137,199;MMQ=60,43;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.534:6:2,1:0,2:0,3,0,3
chr9	78790177	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=137,202;MMQ=60,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr9	78790182	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=217,202;MMQ=60,43;MPOS=-2;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.620:3:1,1:0,1:0|1:78790182_G_C:78790182:0,1,0,2
chr9	78790187	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=208,202;MMQ=60,43;MPOS=-7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.507:4:1,1:1,1:0|1:78790182_G_C:78790182:0,2,0,2
chr9	78790236	.	CAGAAT	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAT;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	78790242	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=160,122;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr9	78799566	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr9	78803466	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr9	78803931	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=259,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr9	78804151	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=177,172;MMQ=46,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr9	78804163	.	C	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=172,212;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	78804206	.	G	GAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	78842609	.	C	CTCATGCAAGGTCCTCTATTTCCTTTACAGACCTTGACTGTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	78848383	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=93,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:5,4,1,1
chr9	78848542	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr9	78848554	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr9	78907134	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,2:4,0:6,3,2,1
chr9	78917015	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr9	78925814	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	78936437	.	C	CATTCGGTAACCTGGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:1,5,1,1
chr9	78936564	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr9	78965836	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=136,120;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,0:7,3:0|1:78965836_G_A:78965836:5,13,0,3
chr9	78965839	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,120;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,0:8,3:0|1:78965836_G_A:78965836:5,13,0,3
chr9	78973483	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:78973483_C_T:78973483:11,9,1,1
chr9	78973491	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:78973483_C_T:78973483:9,9,1,1
chr9	78973503	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=98,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:78973483_C_T:78973483:8,9,1,1
chr9	78973505	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:9,2:0|1:78973483_C_T:78973483:7,9,1,1
chr9	78973507	.	T	TAGCTCA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:78973483_C_T:78973483:4,8,1,1
chr9	79003413	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:7,3:1,1:6,2,4,0
chr9	79003440	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr9	79007418	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.136:38:16,2:14,3:17,16,2,3
chr9	79009106	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,12,16
chr9	79009139	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:1,6,2,7
chr9	79009204	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr9	79118172	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=98,105;MMQ=60,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:12,8,4,0
chr9	79118388	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,256;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:16,0:11,5:13,14,0,5
chr9	79118631	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=187,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr9	79118903	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:10,9:7,9:6,11,8,10
chr9	79119184	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=124,8445662;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:12,1:23,1:0|1:79119184_G_T:79119184:16,20,2,0
chr9	79119189	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=127,8445662;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:13,1:21,1:0|1:79119184_G_T:79119184:15,19,2,0
chr9	79119829	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:3,1:7,6:9,3,6,1
chr9	79120552	.	C	CAGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGT;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,0:8,4,2,0
chr9	79121298	.	TAGAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=168,192;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:79121298_TAGAAA_T:79121298:0,3,0,1
chr9	79121305	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=168,192;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:79121298_TAGAAA_T:79121298:0,3,0,1
chr9	79121384	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=184,222;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,4,1
chr9	79121596	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:9,3:2,0:4,7,4,0
chr9	79240050	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	79259592	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr9	79259850	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=245,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,15:1,6:0,1,3,18
chr9	79306919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	79318367	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr9	79318375	.	GGTGACAGCCTGCAAC	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr9	79318471	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,3,10
chr9	79319050	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr9	79320848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.259:13:4,0:6,3:7,3,2,1
chr9	79321276	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chr9	79321871	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr9	79323659	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:8,12,1,1
chr9	79324135	.	A	ATGACTGTTGCAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTGTTGCAG;STR;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,6:0,4:0,0,7,7
chr9	79324179	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr9	79324396	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:9,2,2,0
chr9	79324741	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr9	79325615	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=259,147;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.835:9:0,5:1,3:1,0,5,3
chr9	79326199	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=94,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.164:26:8,3:14,0:13,9,4,0
chr9	79461439	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=167,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr9	79469100	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,0:12,1:7,11,1,1
chr9	79520956	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr9	79635185	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=66,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:2,3,0,2
chr9	79635233	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=261,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:79635233_G_T:79635233:1,0,0,2
chr9	79635236	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=261,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:79635233_G_T:79635233:1,0,0,2
chr9	79635238	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=261,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:79635233_G_T:79635233:1,0,0,2
chr9	79814799	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:6,0,4,0
chr9	79820141	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,8,0
chr9	79820202	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,1:4,2:7,3,3,0
chr9	79828023	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr9	79829126	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.493:4:2,1:0,1:0|1:79829126_G_A:79829126:1,1,2,0
chr9	79829140	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1|0:79829126_G_A:79829126:9,0,1,1
chr9	79835101	.	TT	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,1,2
chr9	79843002	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:6,2,7,0
chr9	79867082	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr9	79888146	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,2,0
chr9	79895012	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=228,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	79897218	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr9	79910414	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	79922839	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=86,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr9	79930988	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	79936057	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr9	79946961	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:9,13:9,7:11,7,10,10
chr9	79954410	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=69,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,1:2,3:6,3,4,0
chr9	79955528	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr9	79966342	.	GG	AA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,2:12,0:21,6,2,0
chr9	79968293	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=36,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.512:16:5,7:3,1:7,1,8,0
chr9	79974399	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	79999547	.	GTGATGATGATGATGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,6;RU=TGA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr9	80020712	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr9	80022415	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:3,3:5,4,9,1
chr9	80022630	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:4,0:2,3:2,5,0,3
chr9	80040680	.	G	GCAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.241:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr9	80046322	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:2,8,0,2
chr9	80336298	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,57;MMQ=45,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:0|1:80336298_A_T:80336298:14,7,1,1
chr9	80336302	.	A	AAAGAAAAAAGAAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,57;MMQ=45,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,2:13,0:0|1:80336298_A_T:80336298:14,7,1,1
chr9	80343587	.	G	GAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.505:8:1,1:2,2:1,3,1,3
chr9	80409345	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	80537326	.	C	CTCTGGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	80851350	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr9	80851527	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=76.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,17:0,0,16,10
chr9	80863088	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	80877777	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	80880897	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,0:5,5:3,9,0,5
chr9	80915403	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr9	80915649	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:8,1:4,0:0|1:80915649_A_G:80915649:2,12,3,0
chr9	80915651	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.196:17:8,1:3,0:0|1:80915649_A_G:80915649:2,12,3,0
chr9	80915653	.	GCA	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.208:16:9,1:3,0:0|1:80915649_A_G:80915649:2,11,3,0
chr9	80915685	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=167,181;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:2,1:0,12,0,2
chr9	80919955	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr9	80921288	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:9,10,1,2
chr9	80921446	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr9	80932574	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr9	80932789	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	80932791	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr9	82264838	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:9,5:3,0:0,12,0,5
chr9	82264854	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:10,3:3,0:0|1:82264854_A_G:82264854:0,13,0,3
chr9	82264856	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:10,3:2,0:0|1:82264854_A_G:82264854:0,13,0,3
chr9	82264893	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr9	82267732	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:2,4,2,1
chr9	82268956	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:16,2:19,1:19,16,3,0
chr9	82320887	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=188,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,13:1,16:0,1,10,19
chr9	82335294	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:82335294_T_G:82335294:0,0,0,1
chr9	82335296	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:82335294_T_G:82335294:0,0,0,1
chr9	84205860	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.414:39:11,5:12,10:10,13,6,10
chr9	84235255	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr9	84248203	.	CGTGTGTGTGTGTGT	C,CGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34,31;MFRL=0,97,132;MMQ=60,60,60;MPOS=24,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,11,12;RU=GT;STR;TLOD=10.80,9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,6:0.429,0.446:12:0,5,4:0,0,2:0,1,8,3
chr9	84249103	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:4,5:9,6:6,7,7,4
chr9	84300694	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:5,8:14,8:11,8,12,4
chr9	84560016	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,264;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr9	84605502	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=189,124;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84605502_G_T:84605502:0,1,0,1
chr9	84605505	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=95,124;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:84605502_G_T:84605502:0,2,0,1
chr9	84605509	.	G	GCGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=95,124;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:84605502_G_T:84605502:0,2,0,1
chr9	84605511	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=95,124;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:84605502_G_T:84605502:0,2,0,1
chr9	84605912	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=154,45055;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:9,0:14,5:5,18,5,0
chr9	84606318	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,53103;MMQ=60,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:12,4:11,0:9,14,0,4
chr9	84607602	.	T	TTTTTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=180,37795;MMQ=42,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:0|1:84607602_T_TTTTTG:84607602:9,4,0,2
chr9	84607603	.	C	CATCTGTGTTCATG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=180,37795;MMQ=42,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:0|1:84607602_T_TTTTTG:84607602:9,4,0,2
chr9	84607758	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr9	85597720	.	CAGAGAG	C,CAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32,26;MFRL=74877053,192,144;MMQ=59,60,60;MPOS=27,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=AG;STR;TLOD=5.57,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.383,0.378:5:1,2,1:0,0,1:0,1,0,4
chr9	85612105	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85612105_C_CA:85612105:0,1,0,1
chr9	85612107	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85612105_C_CA:85612105:0,1,0,1
chr9	85612108	.	A	ATAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85612105_C_CA:85612105:0,1,0,1
chr9	85613470	.	G	GTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=167,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85613470_G_GTAA:85613470:0,1,0,1
chr9	85613471	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85613470_G_GTAA:85613470:0,1,0,1
chr9	85619329	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	85619351	.	ATTTAC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	85624504	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	85630621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr9	85630822	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=119,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.387:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr9	85677254	.	AGG	A,AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25,26;MFRL=0,174,151;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=6.06,14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.333,0.588:9:0,1,3:0,1,3:0,0,9,0
chr9	85905666	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=196,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0,6,3,3
chr9	85912766	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:3,5,0,2
chr9	85926893	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,16;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,0:1,0:2,6,0,5
chr9	85958114	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=126,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.691:33:4,12:5,10:5,5,11,12
chr9	85964530	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr9	85987879	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:1,1:0,1:1,5,0,3
chr9	86238086	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr9	86243933	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	86256431	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,1:3,8:7,5,5,5
chr9	86276863	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,16;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:2,0:3,0:0,8,0,3
chr9	86278817	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:6,2,5,1
chr9	86279015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:86279015_C_T:86279015:0,0,1,9
chr9	86279025	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0|1:86279015_C_T:86279015:0,3,0,5
chr9	86294939	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,2:6,0:9,9,3,0
chr9	86354663	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.525:9:4,1:0,4:0,4,2,3
chr9	86457387	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:86457387_G_GT:86457387:0,3,0,3
chr9	86457411	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=164,164;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	86457416	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=149,194;MMQ=59,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:0,0:1|0:86457387_G_GT:86457387:0,4,0,1
chr9	86468715	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr9	86474115	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:13,6:6,1:10,9,2,5
chr9	86485628	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,198;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr9	86503542	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=190,126;MMQ=52,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr9	86506303	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=113,189;MMQ=57,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.170:37:13,0:17,5:17,14,0,6
chr9	86517937	.	AAAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr9	86518796	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:10,9:5,5:11,4,8,6
chr9	86568874	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,1:3,4:0,10,0,5
chr9	86584222	.	TA	T,TAA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=23,26,25;MFRL=107,160,127;MMQ=60,45,40;MPOS=28,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.25,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,5,3:0.167,0.140:27:9,5,0:8,0,2:14,5,5,3
chr9	86584304	.	A	ACT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,81;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:23,1:30,2:26,27,0,3
chr9	86586799	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,18:0.345:53:16,9:19,8:19,16,14,4
chr9	86586990	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,212;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:10,6,0,3
chr9	86588185	.	ATT	A,AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,28,28;MFRL=87,118,150;MMQ=60,60,60;MPOS=12,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=12.91,15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,8,9:0.253,0.317:30:7,3,5:6,4,4:11,2,15,2
chr9	86592026	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,8:8,3:2,7,2,9
chr9	86617961	.	CTT	C,CT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=34,20,19;MFRL=179,150,162;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=12.12,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,6:0.353,0.217:26:0,2,2:10,3,0:0,11,1,14
chr9	86617971	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:19,0:9,10:8,20,0,10
chr9	86618023	.	AT	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:1,11,0,2
chr9	86924566	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:14,0:16,3:0|1:86924566_C_T:86924566:7,23,0,3
chr9	86924585	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:13,3:0|1:86924566_C_T:86924566:9,17,0,3
chr9	86924587	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,0:13,3:0|1:86924566_C_T:86924566:9,17,0,3
chr9	86924589	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:13,3:0|1:86924566_C_T:86924566:9,17,0,3
chr9	87563562	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,8,10
chr9	87570409	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr9	88201870	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,0:11,3:12,15,0,3
chr9	88201899	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,3:8,14,0,3
chr9	88236269	.	T	TATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=129,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88236269_T_TATTC:88236269:0,1,0,1
chr9	88236272	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=129,262;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:88236269_T_TATTC:88236269:0,1,0,1
chr9	88236274	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88236269_T_TATTC:88236269:0,0,0,1
chr9	88557140	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.090:52:19,4:28,0:23,25,2,2
chr9	88577170	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:88577170_C_CTG:88577170:0,0,0,1
chr9	88577171	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:88577170_C_CTG:88577170:0,0,0,1
chr9	88577180	.	CA	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88577170_C_CTG:88577170:0,0,0,1
chr9	88577191	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88577170_C_CTG:88577170:0,0,0,1
chr9	88601521	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:88601521_CGA_C:88601521:0,0,0,2
chr9	88601524	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:88601521_CGA_C:88601521:0,0,0,2
chr9	88601527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:88601521_CGA_C:88601521:0,0,0,2
chr9	88611351	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:13,2:0|1:88611351_C_A:88611351:14,10,1,1
chr9	88611357	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:88611351_C_A:88611351:14,10,1,1
chr9	88611380	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,1:11,2:12,15,1,2
chr9	88618462	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:4,8:5,4:5,4,10,3
chr9	88628863	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	88650029	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=65,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,4:1,1:2,2,4,1
chr9	88667582	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	88842418	.	C	CCTTCCTTCCTTCCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:88842418_C_CCTTCCTTCCTTCCTT:88842418:0,4,0,1
chr9	88842420	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:88842418_C_CCTTCCTTCCTTCCTT:88842418:0,4,0,1
chr9	88842902	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=98,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:5,0:15,4:9,12,2,2
chr9	88886830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr9	88924057	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr9	88924985	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=50,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:0,2:4,2:2,2,1,4
chr9	88924999	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:3,0:3,2:1,7,2,1
chr9	88925534	.	ATG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	88925774	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:2,5,0,3
chr9	88933921	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:4,1:9,7:8,6,3,5
chr9	88934537	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:5,9,2,1
chr9	88934624	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.625:9:2,1:1,5:0,3,1,5
chr9	88937696	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	88937851	.	ATTT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.401:38:11,5:11,9:13,10,6,9
chr9	88938899	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=163,257;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:0,0:1,1:0|1:88938899_G_A:88938899:0,1,0,1
chr9	88938904	.	ATCCATCTCT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=163,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:88938899_G_A:88938899:0,1,0,1
chr9	88938920	.	GT	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88938899_G_A:88938899:0,0,0,1
chr9	88938927	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88938899_G_A:88938899:0,0,0,1
chr9	88956017	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,3:3,0:3,5,1,2
chr9	88967768	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=62.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,23:0.360:65:19,0:22,23:12,30,0,23
chr9	89561866	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,145;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:19,0:14,3:19,14,0,3
chr9	89763574	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	89763851	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,3,9
chr9	90256827	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr9	90258412	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,4:3,4:0|1:90258412_CTT_C:90258412:0,6,4,5
chr9	90258415	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,4:2,5:0|1:90258412_CTT_C:90258412:0,6,4,5
chr9	90261426	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:5,11,2,0
chr9	90264980	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:6,0:8,4:6,8,2,2
chr9	90312173	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=101,259;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:90312173_C_T:90312173:0,4,0,1
chr9	90312178	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=124,259;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:90312173_C_T:90312173:0,3,0,1
chr9	90312182	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90312173_C_T:90312173:0,1,0,1
chr9	90313717	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:5,0:2,3:4,3,0,5
chr9	90316710	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=69,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:6,4:13,2:10,9,5,1
chr9	90320954	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,0:1,5:1,0,3,2
chr9	90322023	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:8,3:0,2:6,2,2,3
chr9	90342675	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,8:1,1:0,2,3,7
chr9	90343865	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90343865_CT_C:90343865:0,1,0,1
chr9	90343867	.	GAGCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90343865_CT_C:90343865:0,1,0,1
chr9	90343876	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90343865_CT_C:90343865:0,1,0,1
chr9	90343880	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:90343865_CT_C:90343865:0,1,0,1
chr9	90388480	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:6,13,1,2
chr9	90401638	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:5,2:3,2,0,2
chr9	90401790	.	C	CTCAGGAAACTTAGAAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=115,64;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:8,8,1,1
chr9	90500671	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=141,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:6,4,4,1
chr9	90500911	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr9	90500934	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=229,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90500934_C_CA:90500934:1,0,0,1
chr9	90500935	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=229,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90500934_C_CA:90500934:1,0,0,1
chr9	90501219	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,0:8,5:8,1,0,5
chr9	90502852	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:6,1:9,7:8,7,3,5
chr9	90502939	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=142,100;MMQ=60,44;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.377:21:5,0:8,6:7,6,0,8
chr9	90534205	.	G	GCGTCATCT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:12,5:17,1:14,15,1,5
chr9	90535658	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=210,161;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,4,2
chr9	90535853	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=207,215;MMQ=33,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr9	90537856	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,27;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	90586043	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,4,2
chr9	90588814	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr9	90588970	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:2,5,1,4
chr9	90589016	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=19,30;MFRL=190,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,4:0,3:0,1,2,5
chr9	90589039	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=190,33;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:90589039_A_C:90589039:1,2,1,1
chr9	90589042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=190,33;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:90589039_A_C:90589039:1,2,1,1
chr9	91083260	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=89,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.537:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr9	91609242	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:12,1:0|1:91609242_C_T:91609242:15,7,1,1
chr9	91609244	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:0|1:91609242_C_T:91609242:15,7,1,1
chr9	91609485	.	AACACCTCCTGGCTCAGACGCACTTGCCTTCCCAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.346:7:1,0:0,2:2,3,1,1
chr9	91610683	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,3:8,0:14,13,0,3
chr9	91611105	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:0,0:0,1:0|1:91611105_A_C:91611105:0,1,0,1
chr9	91611106	.	C	CCTCCATGCCCTCTGTGAGATTCTAATTCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:0,0:0,1:0|1:91611105_A_C:91611105:0,1,0,1
chr9	91617563	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:91617563_A_C:91617563:2,10,1,1
chr9	91617571	.	T	TAGGTGCCACACCATCATCTCCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:0|1:91617563_A_C:91617563:2,9,1,1
chr9	91628546	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr9	91666911	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=130,736;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:91666911_C_T:91666911:1,0,1,0
chr9	91666921	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=123,736;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:91666911_C_T:91666911:3,0,1,0
chr9	91667136	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr9	91680531	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr9	91680600	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	91771916	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.229:15:7,0:5,3:5,7,1,2
chr9	91934787	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	91965838	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=143,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:91965838_A_AT:91965838:1,3,1,1
chr9	91965842	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=143,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:91965838_A_AT:91965838:1,3,1,1
chr9	91996032	.	GT	TG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:18,0:17,3:14,24,0,3
chr9	92014294	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr9	92020413	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=101,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:92020413_C_T:92020413:1,2,0,1
chr9	92020419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=101,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:92020413_C_T:92020413:0,3,0,1
chr9	92020433	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	92219921	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:92219921_A_C:92219921:0,0,4,0
chr9	92219945	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0|1:92219921_A_C:92219921:4,0,8,0
chr9	93606309	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,3:5,9:5,5,6,6
chr9	93606676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	93629347	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr9	93636664	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:93636664_G_A:93636664:0,0,0,4
chr9	93636671	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=204,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0|1:93636664_G_A:93636664:0,2,0,2
chr9	93637027	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,3:15,0:17,10,3,0
chr9	93639803	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr9	93639846	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.497:36:10,9:8,8:12,6,9,9
chr9	93639849	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=84,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.427:33:9,8:8,6:9,10,9,5
chr9	93641193	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,9:5,3:4,8,2,10
chr9	93641296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	93650920	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:5,10,0,3
chr9	93657761	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr9	93978286	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr9	94487428	.	A	AACTGTTTATAAGCTACCTAGAGGTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr9	94493470	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,2,3
chr9	94518256	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:8,1,2,0
chr9	94797172	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:5,5:6,2:4,8,2,5
chr9	94800660	.	A	AAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AC;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr9	94808269	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=106,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,1:8,7:7,7,4,4
chr9	94830340	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=104,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:10,12,2,0
chr9	94841811	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=93,169;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr9	94841980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr9	94874651	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr9	94973193	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,164;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,6:2,3:0,2,0,9
chr9	95002921	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=87,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,3:19,0:17,17,1,2
chr9	95004467	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:9,2,2,0
chr9	95005546	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,2:10,1:9,15,1,2
chr9	95018903	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	95019080	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,84;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:95019080_C_T:95019080:6,9,1,1
chr9	95019082	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,84;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:95019080_C_T:95019080:6,9,1,1
chr9	95019087	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:0|1:95019080_C_T:95019080:5,10,1,2
chr9	95022422	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:14,1:15,3:17,12,3,1
chr9	95027436	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr9	95027468	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:95027468_TG_AA:95027468:0,4,0,1
chr9	95027473	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=207,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:95027468_TG_AA:95027468:0,3,0,1
chr9	95063977	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:23,0:20,3:0|1:95063977_C_T:95063977:16,29,2,1
chr9	95063980	.	T	TTTTCTGCGTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTG	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:24,0:21,3:0|1:95063977_C_T:95063977:16,29,2,1
chr9	95147840	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr9	95155563	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr9	95177859	.	T	TTGGCTTTTCTCTATTTTTGGCTCAGGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	95237024	.	C	CTCA,CTCATCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30,34;MFRL=187,164,126;MMQ=60,60,60;MPOS=10,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=TCA;STR;TLOD=9.37,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.382,0.375:8:0,1,0:2,2,2:0,2,1,5
chr9	95237222	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr9	95274229	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:1,4:4,0:3,2,5,0
chr9	95274261	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr9	95277131	.	CCCT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=77,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCT;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,2:9,1:11,10,1,2
chr9	95279985	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr9	95279995	.	TCC	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=178,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:6,2:0|1:95279995_TCC_T:95279995:15,3,1,1
chr9	95279998	.	C	CTGGT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=178,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:95279995_TCC_T:95279995:15,3,1,1
chr9	95280246	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	95285222	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	95397418	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr9	95404971	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,2,0
chr9	95411792	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:12,11:11,0:8,15,11,0
chr9	95481415	.	C	CATCTCCCAGGTTCACGCCA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,3:11,0:0|1:95481415_C_CATCTCCCAGGTTCACGCCA:95481415:4,21,2,1
chr9	95481418	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,2:0.100:28:14,0:10,2:1|0:95481415_C_CATCTCCCAGGTTCACGCCA:95481415:6,20,0,2
chr9	95481422	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:9,2:11,0:0|1:95481415_C_CATCTCCCAGGTTCACGCCA:95481415:3,18,2,1
chr9	95618605	.	T	TAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.592:15:2,5:4,4:1,5,4,5
chr9	95618618	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:6,0:5,2:0|1:95618618_C_A:95618618:2,12,3,0
chr9	95618622	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.219:16:6,0:5,0:0|1:95618618_C_A:95618618:2,11,3,0
chr9	95618687	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	95637213	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:12,0,2,1
chr9	95766471	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr9	95780390	.	GCTTTGTT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTGTT;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:12,5,1,1
chr9	95782784	.	G	GATCAGTAGGGCTGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr9	95840077	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	95869904	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr9	95869943	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,3:5,0:5,3,3,0
chr9	95874070	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr9	95874251	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:8,14,1,1
chr9	95874319	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=174,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:95874319_C_T:95874319:0,3,0,1
chr9	95874322	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:95874319_C_T:95874319:0,2,0,1
chr9	95874325	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:95874319_C_T:95874319:0,2,0,1
chr9	95874329	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:95874319_C_T:95874319:0,2,0,1
chr9	95896330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr9	95896586	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	95992213	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr9	96000622	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,5,9
chr9	96002020	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:9,5:12,0:0|1:96002020_T_G:96002020:9,12,5,0
chr9	96002022	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:8,5:12,0:0|1:96002020_T_G:96002020:9,12,5,0
chr9	96015377	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr9	96015398	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	96024384	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,164;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:10,0:3,6:5,8,0,6
chr9	96024481	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=178,302;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr9	96024859	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.936:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr9	96025771	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	96030230	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,11:0,0,7,12
chr9	96031262	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	96052179	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	96061269	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr9	96080450	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:96080450_A_C:96080450:0,1,0,1
chr9	96080452	.	T	TTGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:96080450_A_C:96080450:0,1,0,1
chr9	96081541	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr9	96209987	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,21;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.638:15:0,2:1,6:0,5,1,9
chr9	96213146	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:3,5:5,2:4,5,3,4
chr9	96238490	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:6,0,5,2
chr9	96259883	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:11,4:2,2:5,8,4,4
chr9	96261118	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:5,0:17,2:8,14,1,1
chr9	96278474	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=151,152;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:12,9:14,1:14,12,4,6
chr9	96291878	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.206:40:14,7:18,0:20,12,8,0
chr9	96294541	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=114,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,3:11,0:0|1:96294541_G_T:96294541:14,11,3,0
chr9	96294546	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=114,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:17,2:11,0:0|1:96294541_G_T:96294541:14,14,3,0
chr9	96305745	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,5:3,4:4,6,2,7
chr9	96313012	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	96321098	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:96321098_T_G:96321098:0,2,0,1
chr9	96321100	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:96321098_T_G:96321098:0,2,0,1
chr9	96392439	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	96398831	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr9	96407983	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:3,5,4,0
chr9	96411414	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.528:30:6,7:8,8:7,7,9,7
chr9	96415715	.	G	GTCCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCCC;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	96420390	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	96422420	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr9	96425138	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr9	96428067	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=112,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:12,5,0,2
chr9	96428094	.	C	CCCACTCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=115,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:10,6,0,2
chr9	96428243	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=124,79;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:5,3:4,13:4,5,13,3
chr9	96429297	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,0:2,3:6,1,3,0
chr9	96435927	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,69;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,0:1,3:5,4,2,1
chr9	96439801	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:96439801_A_C:96439801:1,0,1,0
chr9	96439807	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:96439801_A_C:96439801:2,1,1,0
chr9	96439809	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:96439801_A_C:96439801:2,1,1,0
chr9	96439811	.	CACG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:96439801_A_C:96439801:2,1,1,0
chr9	96440051	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	96863846	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,4:6,0:8,4,4,0
chr9	97055310	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=117,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:3,4:6,8:3,7,7,6
chr9	97055335	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:9,11,0,2
chr9	97063097	.	GCACCAGAGGACACACACAGGGGAGAAGCCTTACCTGTGCCCCCAGTGTGGGCGGGGTTTTAGCCAGAAGGTCACCCTCATTGGA	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.144:64:6,0:7,3:17,17,15,15
chr9	97081795	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=136,161;MMQ=45,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr9	97177603	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,169;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr9	97209066	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=100,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,6,3
chr9	97209208	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,132;MMQ=60,20;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.174:32:17,0:10,5:10,17,0,5
chr9	97218715	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,11;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:97218715_A_C:97218715:0,3,1,0
chr9	97218719	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:97218715_A_C:97218715:0,2,1,0
chr9	97221434	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,6:8,9:8,6,7,9
chr9	97321127	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	97321220	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,0:8,6:14,5,1,5
chr9	97321508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	97349666	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr9	97365642	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,8,10
chr9	97365720	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0|1:97365720_T_C:97365720:0,0,13,12
chr9	97365734	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,66;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:15,0:7,2:0|1:97365720_T_C:97365720:13,9,1,1
chr9	97365741	.	C	CTATCTGATACGCTATTTAGTTTTCTTATTTA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,66;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:97365720_T_C:97365720:12,11,1,1
chr9	97369083	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,9,0
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chr9	97888845	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:15,0:12,3:0|1:97888845_G_A:97888845:17,12,2,1
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chr9	97933252	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr9	98218718	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,1:0|1:98218718_C_T:98218718:3,15,1,1
chr9	98218724	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,1:0|1:98218718_C_T:98218718:2,14,1,1
chr9	98218725	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:98218718_C_T:98218718:2,14,1,1
chr9	98218727	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:98218718_C_T:98218718:1,14,1,1
chr9	98221861	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=78,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:5,3,8,4
chr9	98224360	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=68,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr9	98229389	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,4:9,10:12,5,9,5
chr9	98231008	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,9:5,3:6,7,8,4
chr9	98232245	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,0:7,3:1,8,2,1
chr9	98239190	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=87,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:2,5,0,6
chr9	98239730	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	98241317	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=101,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.160:33:12,4:16,0:14,14,4,1
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chr9	98278958	.	TTTC	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:17,0:20,3:3,36,0,3
chr9	98669335	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,6:2,4:4,2,9,1
chr9	98677849	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=260,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr9	98678164	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	98734269	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:6,10:10,2:7,9,6,6
chr9	98775235	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=80,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,6:5,12:3,4,9,9
chr9	99003264	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	99006578	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:4,4:12,8:13,4,8,4
chr9	99013663	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr9	99060750	.	AAA	CCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,2:8,0:3,7,1,1
chr9	99064425	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=121,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:2,5,2,3
chr9	99084181	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:5,0,3,0
chr9	99086282	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr9	99086492	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:2,5,0,5
chr9	99086550	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr9	99130516	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,6:4,7:4,4,10,3
chr9	99130669	.	TAAAC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:4,1:0,8,0,6
chr9	99150758	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=200,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,3:1,8:0,2,5,6
chr9	99180156	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,1:2,0:0|1:99180156_C_G:99180156:0,4,2,0
chr9	99180159	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,1:2,0:0|1:99180156_C_G:99180156:0,4,2,0
chr9	99233431	.	CTT	C,CT	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=22,33,30;MFRL=146,86,103;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.03,25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,13:0.077,0.420:32:5,0,6:11,3,6:3,13,3,13
chr9	99233451	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:12,1:11,1:0|1:99233451_A_AG:99233451:1,23,0,2
chr9	99233452	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,1:10,1:0|1:99233451_A_AG:99233451:1,23,0,2
chr9	99233455	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,1:0|1:99233451_A_AG:99233451:1,21,0,2
chr9	99521275	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,95;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:18,0:20,2:0|1:99521275_C_T:99521275:17,21,1,1
chr9	99521279	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,95;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:19,0:19,2:0|1:99521275_C_T:99521275:18,21,1,1
chr9	99521659	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr9	99521949	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,4:2,0:7,3,2,2
chr9	99538415	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:0|1:99538415_C_A:99538415:1,13,0,2
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chr9	99799114	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr9	99799882	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=103,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:3,13,1,1
chr9	100056448	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:100056448_T_A:100056448:0,4,1,1
chr9	100056450	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:100056448_T_A:100056448:0,4,1,1
chr9	100056454	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:100056448_T_A:100056448:0,3,1,1
chr9	100056461	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:100056448_T_A:100056448:0,3,1,1
chr9	100058125	.	G	GGATTTTTTTGTTTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=247,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	100077249	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=77,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:100077249_G_A:100077249:8,11,1,1
chr9	100077263	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:100077249_G_A:100077249:7,11,1,1
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chr9	100092525	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:12,2:23,0:12,24,1,1
chr9	100092552	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=171,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:100092552_G_A:100092552:12,12,1,1
chr9	100092556	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:100092552_G_A:100092552:11,7,1,1
chr9	100093029	.	GAG	ATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100093029_GAG_ATA:100093029:1,0,0,1
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chr9	100124684	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:6,4:16,0:12,10,4,0
chr9	100125968	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=92,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:15,0:9,2:0|1:100125968_C_T:100125968:10,14,1,1
chr9	100125977	.	TATGGC	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=92,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:16,0:9,2:0|1:100125968_C_T:100125968:10,17,1,1
chr9	100125984	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=97,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:100125968_C_T:100125968:9,13,1,1
chr9	100125986	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=97,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:100125968_C_T:100125968:9,12,1,1
chr9	100193198	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:3,1,1,0
chr9	100194610	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100194610_ATT_A:100194610:0,1,0,1
chr9	100194617	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100194610_ATT_A:100194610:0,1,0,1
chr9	100194618	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100194610_ATT_A:100194610:0,1,0,1
chr9	100249465	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,4:10,0:13,11,4,0
chr9	100361864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr9	100365155	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=94,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:6,9,0,3
chr9	100366953	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:1,0:0,4:1,0,3,1
chr9	100388197	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.551:22:3,6:5,6:6,4,5,7
chr9	100405590	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=105,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:19,1:11,2:15,15,1,2
chr9	100617375	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr9	100617479	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:4,5,3,3
chr9	100618323	.	T	TTAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:8,10,0,2
chr9	100666931	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=62,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr9	100672513	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.144:53:11,0:35,7:25,21,6,1
chr9	100684645	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,3:8,4:13,6,6,1
chr9	100689693	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:10,9:3,6:7,6,10,5
chr9	100700242	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.598:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr9	100745902	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,33:0.504:66:10,15:20,18:18,15,20,13
chr9	100756891	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=95,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.517:37:9,4:8,13:8,10,8,11
chr9	100767530	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr9	100774646	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:5,0,6,1
chr9	100777784	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	100777813	.	A	ACATTATTTTCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr9	100819070	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:4,3:4,6:6,2,7,2
chr9	100819160	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=119,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:13,2:0|1:100819160_G_A:100819160:12,15,1,1
chr9	100819166	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:100819160_G_A:100819160:13,15,1,1
chr9	100849465	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr9	100849584	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:21,2:23,0:19,25,1,1
chr9	100849682	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:0,5,1,8
chr9	100894454	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:12,0,0,2
chr9	100961641	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:13,3:12,0:17,8,3,0
chr9	100961830	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=124,207;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,1:9,3:7,15,0,4
chr9	100962504	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,6:0,1:3,0,7,0
chr9	100965472	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr9	100970881	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr9	100973178	.	A	AGAGGCCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGGCCT;STR;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:1,1:4,3:0,5,0,5
chr9	100983566	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr9	101006210	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:2,3:0|1:101006210_T_C:101006210:5,0,4,0
chr9	101006216	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0|1:101006210_T_C:101006210:5,0,4,0
chr9	101006436	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:0|1:101006436_C_A:101006436:1,7,2,7
chr9	101006443	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,2:5,4:0|1:101006436_C_A:101006436:1,8,2,4
chr9	101053076	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=91,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.427:29:11,3:3,9:3,14,2,10
chr9	101056009	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=189,5804;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	101056122	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:4,4:6,8:3,7,6,6
chr9	101061584	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=89,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:11,5:30,0:29,12,4,1
chr9	101061639	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,1,14
chr9	101068580	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,10,12
chr9	101068609	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=114,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,0:7,4:9,9,0,4
chr9	101068649	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr9	101151307	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:1,5,0,9
chr9	101243364	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	101258803	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:4,4,3,2
chr9	101258881	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr9	101304348	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=231,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr9	101340234	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=135,81;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,3:4,0:5,4,3,0
chr9	101539601	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr9	101552955	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,4,19
chr9	101585444	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	101585796	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:101585796_G_T:101585796:0,1,0,1
chr9	101585802	.	T	TTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:101585796_G_T:101585796:0,1,0,1
chr9	101593963	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,8:2,0:3,0,8,0
chr9	101599211	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,3:1,2:2,1,5,0
chr9	101606549	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=84,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,4:1,5:1,3,1,8
chr9	101608278	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:11,5:4,0:8,8,5,0
chr9	101747942	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=77,77;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:26,0:20,3:14,35,0,3
chr9	101751609	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=120,323;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr9	101759456	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101759456_A_ATT:101759456:0,1,0,1
chr9	101759460	.	AAC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101759456_A_ATT:101759456:0,1,0,1
chr9	101763307	.	T	TCACGAGTGTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:101763307_T_TCACGAGTGTA:101763307:0,4,0,1
chr9	101763310	.	C	CATATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:101763307_T_TCACGAGTGTA:101763307:0,4,0,1
chr9	101778265	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,4:6,9:5,3,7,6
chr9	101796906	.	T	TCTCCCTC	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=86,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCCTC;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.293:17:8,2:4,2:2,10,1,4
chr9	101814626	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,4,2
chr9	101817702	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,0:1,8,0,2
chr9	101818725	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:2,3:1,5,0,3
chr9	101829116	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr9	101830927	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=113,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,2:13,2:13,16,3,1
chr9	101831000	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:3,1:3,1:0|1:101831000_G_T:101831000:0,6,0,2
chr9	101831007	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=162,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,1:0|1:101831000_G_T:101831000:0,3,0,2
chr9	101831008	.	C	CCTTGAGGGTTATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=162,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:101831000_G_T:101831000:0,3,0,1
chr9	101894753	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,14:5,0:7,2,14,0
chr9	101911436	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr9	101984936	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:1,2,0,8
chr9	101990343	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr9	102067317	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr9	102068912	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:1,5,1,2
chr9	102590615	.	TCACCAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=CAC;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr9	102591042	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102591042_A_G:102591042:0,0,0,1
chr9	102591054	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102591042_A_G:102591042:0,0,0,1
chr9	102595685	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.360:37:10,4:13,9:10,14,6,7
chr9	102625834	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:0,1:3,1:4,0,1,1
chr9	102691042	.	CTTCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,1:2,5:0,4,3,3
chr9	102713580	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:6,2:2,4:1,7,2,4
chr9	102730697	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr9	102769824	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:3,4,4,0
chr9	102769839	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=134,78;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:7,2:7,0:9,5,2,0
chr9	102820002	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=202,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:1,2:3,3:4,0,5,1
chr9	102888898	.	T	TCAGGCAAAAAAGTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=43407867,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr9	102888919	.	A	AGTGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=86815584,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102888919_A_AGTGAG:102888919:0,1,0,1
chr9	102888922	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=86815584,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102888919_A_AGTGAG:102888919:0,1,0,1
chr9	103015184	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:9,1,8,5
chr9	103015418	.	G	GTGTTTCAAACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	103027226	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,20,30,33;MFRL=87,74,91,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,23,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=6.79,4.44,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,4,5,5:0.231,0.274,0.280:18:1,4,2,5:2,0,2,0:3,1,12,2
chr9	103027250	.	CT	AG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=14,18;MFRL=89,74;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:3,1:2,0:12,4,1,1
chr9	103059476	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	103060332	.	TG	AA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:103060332_TG_AA:103060332:1,6,1,1
chr9	103060336	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:0|1:103060332_TG_AA:103060332:1,5,1,1
chr9	103060386	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr9	103062992	.	G	GGAGCTTCCCTATCAGTGGAAGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=201,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr9	103064530	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr9	103065884	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr9	103091630	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr9	103108941	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr9	103111705	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr9	103114793	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr9	103204349	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:5,2,3,1
chr9	103271486	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103271486_GT_TC:103271486:1,3,0,1
chr9	103271490	.	G	GAATTACACATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103271486_GT_TC:103271486:1,3,0,1
chr9	103275561	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:22,0:16,5:28,10,5,0
chr9	103275675	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=218,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.531:9:3,0:1,4:1,3,1,4
chr9	103275689	.	TTTTAAATCAGC	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=135,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,2:8,0:2,8,0,2
chr9	103275692	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr9	103309973	.	ATTGTGAAATATTTTTG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:4,2:10,1,2,0
chr9	103340369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	103340875	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,6,12
chr9	104075042	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr9	104124664	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	104133628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr9	104133719	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=224,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:104133719_G_T:104133719:0,2,0,1
chr9	104133738	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104133719_G_T:104133719:0,1,0,1
chr9	104152929	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,6:10,0:7,11,6,0
chr9	104153005	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,2:15,1:19,8,1,2
chr9	104160709	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.247:9:3,0:2,1:0|1:104160709_C_T:104160709:6,1,2,0
chr9	104160711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.247:9:4,0:3,1:0|1:104160709_C_T:104160709:6,1,2,0
chr9	104170134	.	TGTTTG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:104170134_TGTTTG_T:104170134:2,2,1,1
chr9	104170140	.	CCCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=198,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:104170134_TGTTTG_T:104170134:2,2,1,1
chr9	104170148	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=200,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:104170134_TGTTTG_T:104170134:3,2,1,1
chr9	104189680	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	104238142	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,1:2,7:5,3,7,1
chr9	104239493	.	A	AAAACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAAC;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	104297693	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=119,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,7:8,3:5,10,8,2
chr9	104297708	.	G	GGTAAAGTTTTTTTTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:10,0:14,11,0,2
chr9	104302690	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr9	104303240	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:11,3:12,11,0,3
chr9	104306988	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=139,178;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:1,2,1,0
chr9	104312891	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,117;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:17,7:11,0:17,11,7,0
chr9	104314071	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=73,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:0|1:104314071_G_A:104314071:8,5,1,1
chr9	104314073	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=73,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:0|1:104314071_G_A:104314071:8,5,1,1
chr9	104315116	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104315116_A_AT:104315116:0,1,0,1
chr9	104315118	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104315116_A_AT:104315116:0,1,0,1
chr9	104315121	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104315116_A_AT:104315116:0,1,0,1
chr9	104316952	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:3,2,5,2
chr9	104324769	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:104324769_A_G:104324769:0,0,0,1
chr9	104324773	.	C	CCCAGGTTCAAGCGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:104324769_A_G:104324769:0,0,0,1
chr9	104335586	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,3:7,3:8,7,2,4
chr9	104335690	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=91,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.342:30:10,7:9,3:5,15,6,4
chr9	104340171	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:104340171_A_G:104340171:1,4,0,2
chr9	104340181	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=109,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:104340171_A_G:104340171:0,4,0,1
chr9	104385688	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,2:17,0:0|1:104385688_G_A:104385688:14,12,1,1
chr9	104385694	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,2:18,0:0|1:104385688_G_A:104385688:12,13,1,1
chr9	104385712	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=72,116;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.666:25:3,5:5,11:3,5,9,8
chr9	104432293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr9	104433235	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr9	104433347	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr9	104448861	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0|1:104448861_G_A:104448861:1,1,6,1
chr9	104448878	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.213:12:5,0:5,2:1|0:104448861_G_A:104448861:6,4,1,1
chr9	104449294	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,6:0,0,12,7
chr9	105340650	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,6:2,6:3,3,7,5
chr9	105340677	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,5:0,7:1,1,6,6
chr9	105757558	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:105757558_A_G:105757558:3,0,1,0
chr9	105757562	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:105757558_A_G:105757558:3,0,1,0
chr9	105757756	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr9	105763740	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,9:4,0:7,0,9,0
chr9	105765610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	105767622	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=117,71;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.160:60:26,9:24,0:32,19,8,1
chr9	106857908	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr9	106862077	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=189,541;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,1,0
chr9	106864570	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr9	106885332	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr9	106888838	.	ATTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	106894211	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr9	106896874	.	T	TATATTATAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATATTATAA;STR;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,4:0,0,5,10
chr9	107266844	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:5,6,3,3
chr9	107267304	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:6,2,1,1
chr9	107331648	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,201;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:4,0:16,7:9,11,0,7
chr9	107332491	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=259,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:107332491_A_C:107332491:0,1,0,1
chr9	107332504	.	A	ATATTGGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=259,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:107332491_A_C:107332491:0,1,0,1
chr9	107457759	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr9	107510145	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr9	107510178	.	AGGGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGC;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	107521716	.	G	GATAGTTAAGGCCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=219,154;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr9	107521723	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	107526619	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr9	107531361	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	107558492	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:5,0:9,3:6,8,1,2
chr9	107558550	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,0,2
chr9	107558654	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=88,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:15,6:8,0:18,5,6,0
chr9	107562087	.	CAGCCACACTTACAG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=94,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,0:10,2:11,16,1,1
chr9	107566877	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr9	107566930	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:3,9:6,5:4,5,6,8
chr9	107571852	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:11,3:14,0:11,14,1,2
chr9	107574991	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:3,9,1,2
chr9	107582117	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=248,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,5,0
chr9	107593408	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:4,0:4,2:2,6,2,2
chr9	107594095	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,74;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:9,0:11,10:9,11,0,10
chr9	107645244	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr9	107651526	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,2:3,8:2,4,6,4
chr9	107665978	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=89,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,5:1,3,2,8
chr9	107666035	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr9	108125138	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=93,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:15,5,2,1
chr9	108126896	.	ACATGTGGTGGTAC	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=94,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.069:52:18,1:16,1:28,21,1,2
chr9	108147627	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr9	108151302	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=81,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:9,6,1,2
chr9	108151421	.	T	TGTGTGTGGCACAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	108151443	.	T	TGGCACAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=106,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	108152237	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,2:12,0:0|1:108152237_C_G:108152237:20,10,1,1
chr9	108152240	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,2:12,0:0|1:108152237_C_G:108152237:19,11,1,1
chr9	108223813	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:16,6:7,0:14,9,5,1
chr9	108268672	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,1:0,0:4,0,2,0
chr9	108363647	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108363647_A_ATT:108363647:0,1,0,1
chr9	108363648	.	G	GTTTGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108363647_A_ATT:108363647:0,1,0,1
chr9	108382308	.	G	GAACAGTTCTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:5,8,1,1
chr9	108456888	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=193,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:2,5:2,3:4,0,8,2
chr9	108483741	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,4,0
chr9	109685961	.	T	TCTAGATTACTCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=277,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	109687812	.	AACAGCCACCGCAGCCACCACCACCGCCGCCGCCACCACCACCATCACAGCCACAGCCACTGCAGCAGCCACAGCCACCACAGCTGCAGCCACCACATCAGGTGCCACCCCAGCCACAAACACAGCCACCACCAACGCAGCAGCC	A	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,8:0.027:121:8,2:15,2:49,64,6,2
chr9	109689700	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.216:33:9,2:14,1:0|1:109689700_A_C:109689700:2,24,7,0
chr9	109689704	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=115,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:11,3:15,1:0|1:109689700_A_C:109689700:3,25,5,0
chr9	109689709	.	CATA	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:12,3:15,1:0|1:109689700_A_C:109689700:5,23,4,0
chr9	110045992	.	G	GGGGGCA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGGCA;STR;TLOD=66.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.461:41:13,7:9,9:7,15,9,10
chr9	110047132	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0,0,18,7
chr9	110047290	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=122,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:18,0:10,4:7,22,4,0
chr9	110047316	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:0,6,0,9
chr9	110062399	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=142,162;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:26,4:29,0:0|1:110062399_A_C:110062399:32,24,4,0
chr9	110062404	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=142,162;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,4:0.078:62:25,4:31,0:0|1:110062399_A_C:110062399:33,25,4,0
chr9	110080967	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr9	110081018	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,6:3,8:3,2,8,6
chr9	110084261	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=88,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:9,6:5,3:12,2,5,4
chr9	110084417	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:5,1:8,4:2,11,2,3
chr9	110084447	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:110084447_G_T:110084447:0,3,0,1
chr9	110084449	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:110084447_G_T:110084447:0,3,0,1
chr9	110084451	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:110084447_G_T:110084447:0,3,0,1
chr9	110084454	.	A	ATTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,23;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:110084447_G_T:110084447:0,4,0,1
chr9	110084456	.	A	ATTC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,22;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110084447_G_T:110084447:0,4,0,1
chr9	110086149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:1,14:0,6:0,1,15,5
chr9	110087333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr9	110087343	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=158,175;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:0,6,0,4
chr9	110087362	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=22,28;MFRL=199,189;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	110087366	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=198,259;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:110087366_CA_TG:110087366:0,4,0,1
chr9	110087370	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,23;MFRL=167,259;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:110087366_CA_TG:110087366:0,3,0,1
chr9	110087378	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=228,167;MMQ=40,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:0|1:110087378_C_T:110087378:0,1,0,1
chr9	110087384	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=21,29;MFRL=224,167;MMQ=40,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,1:0|1:110087378_C_T:110087378:0,2,0,1
chr9	110093970	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=18,33,31,20;MFRL=155,169,129,86;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,11,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.54,6.26,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,5,9:0.152,0.278,0.471:18:0,1,2,6:0,2,3,1:0,1,9,8
chr9	111618003	.	T	TGGCTGAGTGAGCAGGGGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=72,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:111618003_T_TGGCTGAGTGAGCAGGGGGG:111618003:2,2,1,1
chr9	111618005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=72,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:111618003_T_TGGCTGAGTGAGCAGGGGGG:111618003:2,2,1,1
chr9	111618602	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:5,2,4,6
chr9	111618617	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:3,5:5,2:4,5,4,3
chr9	111618926	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=104,157;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,1:6,1:12,7,2,0
chr9	111619266	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.468:15:3,5:4,1:2,6,2,5
chr9	111624770	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:10,8,0,2
chr9	111637304	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	111637319	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=156,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr9	111637331	.	CC	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	111637338	.	A	ATACAAAAAAACT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	111640304	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=82,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:7,9,0,2
chr9	111651497	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:111651497_T_C:111651497:0,0,6,1
chr9	111651499	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:111651497_T_C:111651497:0,0,6,1
chr9	111653460	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr9	111658963	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr9	111659021	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr9	111662726	.	CG	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	111668652	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr9	111674612	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=109,133;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:14,0:22,6:17,20,0,6
chr9	111679747	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:2,2:0,0:2,0,2,1
chr9	111681623	.	ACTCATGCTAAAAAGGGGAACAAACACCAATATTACTGGGGGACCTTAAGTATCCCAGAATCAAACAAGC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.136:27:7,5:8,1:3,17,3,4
chr9	111701430	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=199,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,2:19,0:0|1:111701430_G_A:111701430:28,8,1,1
chr9	111701433	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=199,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,2:19,0:0|1:111701430_G_A:111701430:27,9,1,1
chr9	111701795	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,0:9,3:11,7,3,0
chr9	111705900	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr9	111706087	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,4:13,0:9,13,2,2
chr9	111798745	.	CAACAACTTCCAACAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr9	111798757	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=183,205;MMQ=41,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:111798757_A_AG:111798757:0,2,0,1
chr9	111798761	.	AA	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:111798757_A_AG:111798757:0,3,0,1
chr9	111800397	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=142,100;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,0:10,3:5,17,0,3
chr9	111822756	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=110,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:4,6,0,2
chr9	111868777	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr9	111899928	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.488:14:2,2:5,3:3,4,0,7
chr9	111936732	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	111936788	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,6:2,0:5,2,3,3
chr9	111945049	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=73,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:3,6:5,2:3,6,3,5
chr9	111945166	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	111947704	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=99,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr9	111947761	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=112,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:1,3:6,4:6,1,2,6
chr9	111956494	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=164,148;MMQ=56,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:5,3,1,1
chr9	111962418	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	112025473	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	112170701	.	T	TAAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.405:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr9	112170758	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	112172477	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,2:3,5:3,1,5,3
chr9	112184972	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:3,1,6,0
chr9	112199350	.	T	TTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112199350_T_TTTC:112199350:0,0,0,1
chr9	112199354	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112199350_T_TTTC:112199350:0,0,0,1
chr9	112199355	.	A	ATCAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112199350_T_TTTC:112199350:0,0,0,1
chr9	112225531	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	112225774	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	112686057	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,9;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:7,0:9,5:10,6,5,0
chr9	112899123	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=138,552;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,0:12,3:11,6,3,0
chr9	112899301	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=142,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,6:7,10:8,6,13,3
chr9	112899361	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:1,7,0,7
chr9	112918581	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:5,1,3,1
chr9	113066861	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,0:3,3:5,6,0,3
chr9	113100012	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:5,1,6,3
chr9	113128844	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=76,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.559:9:3,0:0,1:1,3,1,4
chr9	113137558	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr9	113137656	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.112:43:17,0:21,4:0|1:113137656_C_T:113137656:28,11,4,0
chr9	113137659	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.103:47:19,0:23,4:0|1:113137656_C_T:113137656:32,11,4,0
chr9	113141815	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:1,7,0,3
chr9	113166697	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,3:8,4:10,4,6,1
chr9	113166792	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=86,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:2,3:7,5:7,3,4,4
chr9	113168612	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=114,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:11,9,1,1
chr9	113169908	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:5,0:5,2:0|1:113169908_C_CA:113169908:5,5,1,1
chr9	113169915	.	TC	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,0:5,1:0|1:113169908_C_CA:113169908:5,7,1,1
chr9	113191325	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=149,287;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:113191325_A_G:113191325:3,0,1,0
chr9	113191329	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=149,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113191325_A_G:113191325:3,0,1,0
chr9	113191338	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=149,287;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113191325_A_G:113191325:4,0,1,0
chr9	113192229	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,2,3
chr9	113192467	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr9	113212454	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,3:3,5:3,2,4,6
chr9	113213726	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	113219727	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr9	113233956	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	113234507	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=165,83;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:7,4:0,3:6,1,3,4
chr9	113234618	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:7,6:5,0:4,8,2,4
chr9	113234657	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=91,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr9	113261483	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,3:4,4:7,7,4,3
chr9	113312431	.	T	TCGTGCCCTTTGAGATGAGGAATTTCCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	113445108	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr9	113496433	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	113547001	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	113547322	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr9	113550168	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,11:0,18:0,0,16,13
chr9	113550311	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	114089972	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=88,171;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:7,0:6,3:6,7,0,4
chr9	114125835	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr9	114128759	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,5370579;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:8,1,2,0
chr9	114132912	.	AGGGTCCATACAAAAGCATCAGAAGTTAATAAAGGCTGCAGTTTTC	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.083:35:15,0:4,2:21,12,1,1
chr9	114136169	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=234,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr9	114146686	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	114152053	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	114155899	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:4,1,4,3
chr9	114177027	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	114187606	.	CT	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=138,34;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:6,0,1,1
chr9	114188192	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114188192_G_C:114188192:0,1,0,1
chr9	114188193	.	ACCTT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114188192_G_C:114188192:0,1,0,1
chr9	114188201	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114188192_G_C:114188192:0,1,0,1
chr9	114295951	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,2:2,1:5,1,3,0
chr9	114325562	.	A	AGGGAGCTAGTTTATGAGTAGTCATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr9	114326557	.	TTTATTATTATTA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=114,267;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=TTA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.386:9:2,2:2,1:1,5,0,3
chr9	114332503	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,3:5,0:3,8,2,1
chr9	114332515	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=76,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,0:3,3:4,6,0,3
chr9	114332538	.	A	ACAGGGTTCTGCCTCCATCCTGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=221,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	114341033	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr9	114341239	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=9,13;MFRL=131,126;MMQ=50,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr9	114348513	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	114355266	.	CAAAAAAAAAAAAA	C,CAAAAAAAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,17,17;MFRL=0,0,227;MMQ=60,60,24;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=31,18,26;RU=A;STR;TLOD=19.10,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,1:0.606,0.205:11:0,3,0:1,1,0:1,0,1,9
chr9	114356629	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:114356629_GG_AT:114356629:0,3,0,1
chr9	114356633	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114356629_GG_AT:114356629:0,3,0,1
chr9	114356634	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114356629_GG_AT:114356629:0,3,0,1
chr9	114356637	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114356629_GG_AT:114356629:0,3,0,1
chr9	114356659	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	114365471	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114365471_T_G:114365471:0,2,0,1
chr9	114365474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114365471_T_G:114365471:0,2,0,1
chr9	114365478	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114365471_T_G:114365471:0,2,0,1
chr9	114366028	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=206,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	114371322	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=75,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:7,2:2,6:4,5,3,5
chr9	114371590	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:4,5,2,3
chr9	114371624	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,3:3,4:3,4,2,5
chr9	114429290	.	T	TCCAAGCAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:114429290_T_TCCAAGCAC:114429290:0,3,0,1
chr9	114429291	.	T	TTCGTCAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:114429290_T_TCCAAGCAC:114429290:0,3,0,1
chr9	114429294	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:114429290_T_TCCAAGCAC:114429290:0,3,0,1
chr9	114449219	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.865:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr9	114467442	.	AAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AT;STR;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	114469078	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	114476919	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=105,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:2,6,0,3
chr9	114484682	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,9,3
chr9	114486219	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr9	114490198	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:19,0:11,3:9,22,0,3
chr9	114490229	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,20:0,15:0,0,14,22
chr9	114490308	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,13:0,6:0,1,7,12
chr9	114510272	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	114510283	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:114510283_C_T:114510283:3,0,1,0
chr9	114510285	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:114510283_C_T:114510283:3,0,1,0
chr9	114521630	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr9	114543148	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:3,16:1,0:4,0,16,0
chr9	114685325	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114685325_T_A:114685325:0,1,0,1
chr9	114685327	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114685325_T_A:114685325:0,1,0,1
chr9	114685328	.	GTTTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114685325_T_A:114685325:0,1,0,1
chr9	114687253	.	G	GCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=227,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr9	114688807	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.523:17:6,4:2,4:1,7,3,6
chr9	114688843	.	A	AGTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=206,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr9	114803631	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=202,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr9	114874970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr9	114886669	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,54;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:7,5,1,1
chr9	114886686	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=97,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:10,11,1,1
chr9	114904845	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.344:9:2,0:4,2:0,6,0,3
chr9	114904873	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	114919707	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	114989616	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr9	114990844	.	CT	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=271,243;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr9	114993790	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	114997288	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	115024695	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr9	115038100	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr9	115060100	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,10:0,0,11,9
chr9	115092624	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,18,1
chr9	115092866	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=160,93;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:6,0:9,3:0,17,0,3
chr9	115142330	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr9	115142507	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=211.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,39:0,28:0,0,31,37
chr9	115216201	.	TGGTGGCAAGTCTGTCCTGCTGATTAATTAATTCTGTGTGGGGTCCTTCACTGCCAAGCATTAAGGTCATTTGCTTCAATAATATCTTATA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=68,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.257:9:1,1:0,0:6,0,3,0
chr9	115216222	.	GATTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	115249478	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115249478_G_A:115249478:0,0,0,1
chr9	115249480	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115249478_G_A:115249478:0,0,0,1
chr9	115249483	.	C	CTGCATCCAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115249478_G_A:115249478:0,0,0,1
chr9	115336778	.	GA	TG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:11,0:14,14,2,1
chr9	115421512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=211,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:5,1,4,0
chr9	115567015	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	115593239	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	115598447	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,1,2
chr9	115600827	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:6,4:2,3:5,3,2,6
chr9	115600848	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:0,1,8,6
chr9	115601074	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	115626718	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr9	115631066	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=100,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:8,7:6,7:9,5,8,7
chr9	115631240	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=283,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr9	115759444	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,0:6,4:9,8,1,3
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chr9	115931703	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.493:28:6,6:8,6:8,6,6,8
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chr9	115932149	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=113,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:115932128_C_T:115932128:3,10,1,1
chr9	115932151	.	T	TCC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:115932128_C_T:115932128:3,9,1,1
chr9	115934022	.	A	AACCTGGATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr9	115935949	.	T	TCGGCCTCCCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=246,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr9	115936903	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	115941144	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr9	115946500	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:5,1,6,1
chr9	115946892	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr9	115948734	.	G	GACAGGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	115956320	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=92,89;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:11,12,4,0
chr9	115959199	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=66,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,2:9,2:10,9,2,2
chr9	115959282	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:13,12,3,0
chr9	115961059	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr9	115964834	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,0:16,2:17,17,0,2
chr9	115965339	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	115968678	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr9	115968711	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:3,1,3,1
chr9	115968797	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:4,3:2,4:3,3,4,3
chr9	115968951	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	115969423	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:1,2:5,5:5,1,6,1
chr9	115969433	.	T	TAGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,10,5
chr9	115969448	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:0,5:8,3:5,3,7,2
chr9	116028510	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=140,147;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,1:7,0:0|1:116028510_C_T:116028510:8,1,2,0
chr9	116028512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=140,147;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,1:6,1:0|1:116028510_C_T:116028510:8,1,2,0
chr9	116045846	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr9	116085309	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:9,1:13,8,2,1
chr9	116093432	.	A	ATAGCTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:116093432_A_ATAGCTG:116093432:0,4,0,1
chr9	116093435	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:116093432_A_ATAGCTG:116093432:0,4,0,1
chr9	116093440	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=183,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:116093432_A_ATAGCTG:116093432:0,3,0,1
chr9	116093446	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116093432_A_ATAGCTG:116093432:0,1,0,1
chr9	116093451	.	GGG	TTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:116093432_A_ATAGCTG:116093432:0,1,0,1
chr9	116122954	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,7,16
chr9	116124523	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr9	116131873	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr9	116131899	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:4,1,5,0
chr9	116131921	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=108,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,6:1,0:4,2,6,0
chr9	116136100	.	G	GCCGGACCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:0|1:116136100_G_GCCGGACCC:116136100:11,8,0,2
chr9	116136105	.	A	ATTTTCCAGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:8,1:0|1:116136100_G_GCCGGACCC:116136100:11,8,0,2
chr9	116152082	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=84,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.634:25:1,0:7,16:4,5,0,16
chr9	116152581	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=167,232;MMQ=45,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr9	116153250	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,2,3
chr9	116155669	.	T	TCCCCAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCCAA;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:3,2:4,3,0,2
chr9	116171241	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=118,96;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:16,0:24,6:14,26,0,6
chr9	116176080	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.123:30:12,2:15,1:0|1:116176080_G_A:116176080:10,17,2,1
chr9	116176092	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.102:27:13,0:10,2:1|0:116176080_G_A:116176080:10,15,1,1
chr9	116176106	.	A	ATATTCTTGGCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=130,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.119:23:11,0:9,2:1|0:116176080_G_A:116176080:8,13,1,1
chr9	116183301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=211,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	116191169	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=92,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr9	116224171	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=112,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:4,5:3,3:2,5,3,5
chr9	116241707	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:9,4,4,1
chr9	116246535	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:2,4:8,3:5,6,3,4
chr9	116260364	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:0|1:116260364_G_T:116260364:4,15,1,1
chr9	116260386	.	G	GCC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:2,0:0|1:116260364_G_T:116260364:1,11,1,1
chr9	116260389	.	C	CAAGCCTGGGCAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:0|1:116260364_G_T:116260364:1,10,1,1
chr9	116264014	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	116267702	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:11,0:13,11,4,0
chr9	116267829	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,1:3,5:1,5,2,4
chr9	116269520	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:2,4,3,0
chr9	116279880	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,10:7,7:4,7,8,9
chr9	116346118	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.556:45:10,9:9,16:11,9,13,12
chr9	116346236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:3,2,6,1
chr9	116764832	.	TTTTGCAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr9	116822610	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr9	116822620	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:6,2:5,5:3,8,3,5
chr9	116822650	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,1,6
chr9	116840338	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:3,5,3,4
chr9	116857234	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr9	116858625	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,8:7,3:7,3,7,4
chr9	116858839	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr9	116861277	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:3,4:10,0:5,8,4,0
chr9	116918394	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	116940489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:5,1,1,1
chr9	116945454	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	116958283	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,0:5,4:5,8,3,1
chr9	116971622	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr9	116971790	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:8,13,0,3
chr9	116971810	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,0:5,3:6,8,1,2
chr9	116973361	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,2:3,3:3,5,1,4
chr9	116980052	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr9	116997994	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	116999334	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:7,10,2,0
chr9	117005821	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:5,1:6,8,1,1
chr9	117027876	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=231,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	117044458	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=185,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr9	117044538	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,13,9
chr9	117044654	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.458:18:5,5:3,3:1,9,0,8
chr9	117050998	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,33:0.680:48:6,23:9,10:8,7,19,14
chr9	117051586	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.618:35:5,13:8,9:6,7,5,17
chr9	117051614	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:10,5:5,5:4,14,6,4
chr9	117053012	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=90,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr9	117053215	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,2:3,7:1,5,2,7
chr9	117053273	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=220,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr9	117054393	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,4:12,0:20,9,1,3
chr9	117063651	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:117063651_G_A:117063651:3,0,0,1
chr9	117063653	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:117063651_G_A:117063651:3,0,0,1
chr9	117063655	.	GGGCTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:117063651_G_A:117063651:4,0,0,1
chr9	117063935	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,89;MMQ=60,22;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,0:14,4:16,14,0,4
chr9	117073006	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr9	117086271	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=102,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.498:22:4,8:7,3:7,4,6,5
chr9	117092869	.	ATTC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=136,84;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:117092869_ATTC_A:117092869:0,3,0,1
chr9	117092873	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=152,84;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:117092869_ATTC_A:117092869:1,3,0,1
chr9	117092879	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=152,84;MMQ=27,27;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117092869_ATTC_A:117092869:1,3,0,1
chr9	117094159	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=101,136;MMQ=57,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,0:12,3:10,15,0,3
chr9	117108122	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr9	117108329	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,0,2
chr9	117121840	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr9	117136330	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0|1:117136330_C_T:117136330:2,2,4,1
chr9	117136331	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.249:10:4,1:4,1:1|0:117136330_C_T:117136330:5,3,1,1
chr9	117139280	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:5,7:0,3:4,3,6,4
chr9	117143282	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=80,176;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:2,1:1,2:3,6,3,1
chr9	117166246	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,5:7,1:6,4,4,2
chr9	117169033	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,13:0,5:0,1,5,13
chr9	117188714	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0|1:117188714_T_C:117188714:1,5,2,3
chr9	117188717	.	A	ACACACACACACAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:117188714_T_C:117188714:2,7,1,1
chr9	117188718	.	G	GCCCCACCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=165,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:117188714_T_C:117188714:2,7,1,1
chr9	117354943	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=90,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:8,10:8,6:7,9,6,10
chr9	117390300	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr9	117390401	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:16,1:17,2:0|1:117390401_G_T:117390401:22,13,2,1
chr9	117390402	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,0;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,2:0.075:38:17,0:19,0:1|0:117390401_G_T:117390401:23,13,1,1
chr9	117390405	.	A	AGTC	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,0:17,1:21,12,1,1
chr9	117399394	.	C	CCAGGGAGGGTCCCACCCGTAGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	117568049	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr9	117666678	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr9	117668142	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:2,7:6,8:3,5,6,9
chr9	117783414	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:117783414_C_T:117783414:9,5,1,1
chr9	117783428	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:117783414_C_T:117783414:9,7,1,1
chr9	117786295	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=128,176;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:12,5:16,0:14,14,5,0
chr9	117791617	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:3,2,4,5
chr9	117792583	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr9	117798409	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=118,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:20,7:4,0:0|1:117798409_T_A:117798409:11,13,9,0
chr9	117798414	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=118,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:18,9:4,0:0|1:117798409_T_A:117798409:11,13,9,0
chr9	117798547	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:4,0:1,2:1,5,0,3
chr9	117803185	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,28,25;MFRL=129,90,55;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=AC;STR;TLOD=9.00,38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,17:0.232,0.675:25:3,3,9:0,2,5:2,1,15,7
chr9	117819464	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=76,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:15,7,1,1
chr9	117825508	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:7,2:3,11,1,2
chr9	117836188	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	117838624	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,1:2,4:9,0,3,2
chr9	117838677	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:14,5:19,0:18,16,5,0
chr9	117844215	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr9	117846450	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,3,0
chr9	117849641	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr9	118164375	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.398:22:4,1:9,8:9,4,7,2
chr9	118949654	.	A	AAAGCAACCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=200,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118949654_A_AAAGCAACCAGG:118949654:0,1,0,1
chr9	118949657	.	G	GGGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=200,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118949654_A_AAAGCAACCAGG:118949654:0,1,0,1
chr9	118969686	.	T	TTATTTAAATAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:5,1:0,2:4,1,3,1
chr9	119109417	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.448:36:13,0:7,14:10,10,0,16
chr9	119116074	.	T	TTC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:119116074_T_TTC:119116074:12,8,0,2
chr9	119116075	.	A	AAGCGATTCTTTTGCCTC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:119116074_T_TTC:119116074:12,8,0,2
chr9	119116112	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:119116112_T_C:119116112:8,8,0,2
chr9	119116114	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:119116112_T_C:119116112:8,8,0,2
chr9	119116117	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:119116112_T_C:119116112:6,8,0,2
chr9	119129826	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr9	119129995	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=94,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:9,2:8,11,2,1
chr9	119188005	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:2,4,0,6
chr9	119199820	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr9	119382768	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=167,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr9	119495697	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr9	119582872	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,1:0,4:2,3,4,1
chr9	119738890	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr9	119770480	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,17,14
chr9	119770551	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr9	119903807	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	119977051	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	119977077	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	120053532	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr9	120466929	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=73,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr9	120471058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	121976247	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:121976247_G_A:121976247:12,6,1,1
chr9	121976253	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:121976247_G_A:121976247:13,7,1,1
chr9	121976255	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:121976247_G_A:121976247:13,7,1,1
chr9	122001054	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr9	122001089	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	122011405	.	C	CATTGGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=172,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr9	123152099	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,8:3,7:4,4,7,8
chr9	123156761	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr9	123162939	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr9	123166489	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=213,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123166489_T_C:123166489:0,2,0,1
chr9	123166497	.	CACACA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=213,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123166489_T_C:123166489:0,2,0,1
chr9	123166503	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=213,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123166489_T_C:123166489:0,2,0,1
chr9	123170733	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,1,7
chr9	123171545	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:4,8,1,2
chr9	123171672	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=235,315;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	123223026	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	123280746	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=99,77;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:16,0:20,4:18,19,1,3
chr9	123280907	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:4,0:14,4:7,11,0,4
chr9	123280950	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,2,10
chr9	123308099	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:2,2:0|1:123308099_C_A:123308099:2,8,0,2
chr9	123308101	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:123308099_C_A:123308099:2,8,0,2
chr9	123308104	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:123308099_C_A:123308099:2,7,0,2
chr9	123313246	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	123313264	.	T	TTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:123313264_T_TTC:123313264:0,3,0,1
chr9	123313267	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:123313264_T_TTC:123313264:0,3,0,1
chr9	123342275	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,17:0,0,18,15
chr9	123342297	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,1:16,1:9,16,0,2
chr9	123370345	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr9	123374639	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	123421556	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	123527043	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,1:9,0:0|1:123527043_G_A:123527043:7,11,1,1
chr9	123527053	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:0|1:123527043_G_A:123527043:8,10,1,1
chr9	123533860	.	AATG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=291,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:123533860_AATG_A:123533860:0,1,0,1
chr9	123533866	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=291,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123533860_AATG_A:123533860:0,1,0,1
chr9	123538510	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,1:14,1:5,16,0,2
chr9	123540541	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.350:11:5,4:2,0:7,0,4,0
chr9	123540808	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.107:53:19,5:29,0:19,29,0,5
chr9	123550027	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0,0,26,9
chr9	123583192	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr9	123628465	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=206,206;MMQ=36,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:13,0:5,6:0,19,0,6
chr9	123631642	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr9	123632829	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr9	123636447	.	T	TCAATCCCATCTCTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=211,304;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.388:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr9	123667591	.	AGCTGTGCTCCACACCTACTGCCTGTGCAGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr9	123676067	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:123676067_G_GT:123676067:0,2,0,1
chr9	123676071	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123676067_G_GT:123676067:0,2,0,1
chr9	123676081	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:123676081_T_TCA:123676081:0,0,0,1
chr9	123676082	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123676081_T_TCA:123676081:0,0,0,1
chr9	123676396	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=227,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr9	123676482	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,14:0,2:0,0,8,8
chr9	123722642	.	T	TCGATAGCATTTTCCTTCAGGGGATCAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=108,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.272:12:4,3:5,0:0|1:123722642_T_TCGATAGCATTTTCCTTCAGGGGATCAC:123722642:4,5,2,1
chr9	123722644	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=108,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.272:12:4,1:5,0:0|1:123722642_T_TCGATAGCATTTTCCTTCAGGGGATCAC:123722642:4,5,2,1
chr9	123751800	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	123758425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr9	123760086	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.830:3:0,3:0,0:0|1:123760086_AT_A:123760086:0,0,0,3
chr9	123760107	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:123760086_AT_A:123760086:0,0,0,5
chr9	123780005	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr9	123787697	.	T	TACACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=295,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=AC;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:0,0:0,1,4,0
chr9	123789634	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	123794296	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=187,170;MMQ=40,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr9	123800094	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	123850770	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,2:6,6:8,6,2,6
chr9	123857085	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=254,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr9	123888242	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,6:1,1:3,4,2,5
chr9	123908345	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,4,0
chr9	123908584	.	G	GGAAGTAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123908584_G_GGAAGTAAA:123908584:0,0,0,1
chr9	123908586	.	G	GATTTCATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123908584_G_GGAAGTAAA:123908584:0,0,0,1
chr9	123908588	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123908584_G_GGAAGTAAA:123908584:0,0,0,1
chr9	123922400	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.204:21:9,2:8,2:17,0,4,0
chr9	123927477	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr9	123928486	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:1,4,1,5
chr9	123929710	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:8,0,5,0
chr9	123930296	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	123930367	.	TATTAAG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:4,0,1,0
chr9	123939336	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.588:10:1,2:3,3:2,2,5,1
chr9	123945206	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:17,0:16,2:14,19,0,2
chr9	123945227	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:16,1:17,1:11,22,0,2
chr9	123945505	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,154;MMQ=41,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,0:4,5:7,0,5,0
chr9	123949265	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:5,13,0,3
chr9	123955756	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:1,9:3,3:0|1:123955756_G_A:123955756:1,3,0,12
chr9	123955765	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:0,7:4,4:0|1:123955756_G_A:123955756:0,4,0,11
chr9	124044505	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:24,0:23,5:26,22,0,5
chr9	124044898	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.215:23:8,3:10,0:9,9,5,0
chr9	124045579	.	CT	C,TT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=19,19,27;MFRL=202,169,191;MMQ=60,60,40;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.26,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,5:0.537,0.205:15:0,2,2:0,1,1:0,3,1,11
chr9	124045949	.	GTTCATTCA	G,GTTCA	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,24,31;MFRL=132,210,139;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=TTCA;STR;TLOD=5.10,25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,8:0.090,0.300:27:8,1,3:7,0,5:10,7,4,6
chr9	124045957	.	ATT	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,17:0.439:39:11,9:11,7:0|1:124045957_ATT_A:124045957:7,15,10,7
chr9	124045960	.	CATTCATTCATTCAT	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,17:0.400:43:13,9:11,8:0|1:124045957_ATT_A:124045957:9,17,10,7
chr9	124046722	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.711:18:2,6:2,7:1,4,3,10
chr9	124046830	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=86.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,16:0,0,19,11
chr9	124047246	.	A	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,40:0.519:77:25,20:12,20:24,13,14,26
chr9	124047415	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:14,0:17,4:16,17,1,3
chr9	124073176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	124073196	.	A	ATAAGCATTCCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:124073196_A_ATAAGCATTCCCT:124073196:0,4,0,1
chr9	124073198	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:124073196_A_ATAAGCATTCCCT:124073196:0,4,0,1
chr9	124074719	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,3:9,0:7,12,1,2
chr9	124081116	.	C	CGCCAGCACACCCCACCCATCCT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.086:32:15,1:15,0:14,16,1,1
chr9	124083614	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=99,137;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.496:20:7,3:3,6:4,6,9,1
chr9	124083704	.	G	GGATGTTCTTCC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,2:10,0:11,11,1,1
chr9	124088768	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:2,7:3,9:3,2,11,5
chr9	124089173	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:1,6,0,5
chr9	124094656	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,142;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:6,3:7,0:12,1,4,0
chr9	124094680	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,142;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,4:9,0:15,4,4,0
chr9	124103671	.	C	CAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:124103671_C_CAG:124103671:2,9,0,2
chr9	124103672	.	T	TTCAACCCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:124103671_C_CAG:124103671:2,9,0,2
chr9	124103759	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	124111396	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.165:46:24,7:15,0:31,8,7,0
chr9	124116776	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:0|1:124116776_C_A:124116776:6,0,4,0
chr9	124116793	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:0|1:124116776_C_A:124116776:6,0,7,0
chr9	124118253	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,3:1,5:3,0,7,1
chr9	124118484	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:3,0:7,2:0,10,0,3
chr9	124530976	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=272,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr9	124534854	.	TT	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:9,5,2,0
chr9	124535461	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr9	124622565	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=85,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:2,1,1,0
chr9	124632735	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=481,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,5:0,9:1,0,11,3
chr9	124633096	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	124855499	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	124855733	.	A	AAAAAAAACAAGTCAAACATATTTAACTTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	124906456	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	124906723	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr9	124906736	.	G	GAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=93,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr9	124910582	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:3,7,2,2
chr9	124929006	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=70,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:2,3,1,1
chr9	124929211	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=101,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,1,2
chr9	124962239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,27492897;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:3,5,2,0
chr9	124972042	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	124976152	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	124989726	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr9	125149105	.	C	CAGATTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:125149105_C_CAGATTA:125149105:0,3,0,1
chr9	125149108	.	A	AAATTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:125149105_C_CAGATTA:125149105:0,3,0,1
chr9	125239253	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr9	125288673	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr9	125315376	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.569:10:1,2:3,3:4,0,4,2
chr9	125316139	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:14,3:28,0:0|1:125316139_A_C:125316139:20,22,3,0
chr9	125316141	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:13,3:26,0:0|1:125316139_A_C:125316139:20,22,3,0
chr9	125316179	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=128,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,6:6,7:6,9,5,8
chr9	125330678	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=94,116;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:3,1,3,2
chr9	125377409	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,2,0
chr9	125377505	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr9	125377584	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=109,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:10,1:7,10,1,1
chr9	125378014	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	125391026	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr9	125391127	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,0:4,4:4,3,3,1
chr9	125391241	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:7,1:11,3:11,7,3,1
chr9	125391770	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.421:10:2,1:4,1:2,4,1,3
chr9	125424424	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=94,51;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:7,5,2,0
chr9	125512795	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	125512826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr9	125524063	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,175;MMQ=39,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	125562527	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=84,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,8:5,5:5,6,4,9
chr9	125585530	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=162,197;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125585530_C_T:125585530:0,1,0,1
chr9	125585533	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=162,197;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:125585530_C_T:125585530:0,1,0,1
chr9	125585555	.	T	TTGAGACCAGCCAAGCCAACATGGAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	125613762	.	CA	TT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=152,89;MMQ=51,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr9	125613783	.	GTCTCCCTCTCCCTC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=167,161;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	125613804	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=147,161;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:125613804_CA_AC:125613804:0,2,0,1
chr9	125613809	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=167,161;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:125613804_CA_AC:125613804:0,1,0,1
chr9	125616204	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:10,12,0,2
chr9	125620105	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	125620416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr9	125655266	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,31;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,2:5,0:0|1:125655266_CA_C:125655266:6,4,1,1
chr9	125655268	.	CCTAGA	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,31;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,2:5,0:0|1:125655266_CA_C:125655266:6,4,1,1
chr9	125655276	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=112,31;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:125655266_CA_C:125655266:6,4,1,1
chr9	125659520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr9	125673051	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,19,4
chr9	125681897	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:15,3:9,0:10,14,0,3
chr9	125681961	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=134,124;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,4:10,0:6,8,3,1
chr9	125746836	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:10,0:11,3:12,9,1,2
chr9	125747038	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	125760863	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,13:0,0,17,2
chr9	125761051	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr9	125827868	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0|1:125827868_T_G:125827868:0,10,0,2
chr9	125827869	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0|1:125827868_T_G:125827868:0,10,0,2
chr9	125861695	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr9	125861888	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,0,12
chr9	125861911	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=190,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	125865379	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:6,2,2,0
chr9	125874200	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=71,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:6,3,2,3
chr9	125874636	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,12,11
chr9	125875138	.	A	AAGGGGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGGGC;STR;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,9,2
chr9	125875449	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,79;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:6,0:16,3:9,13,1,2
chr9	125875541	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr9	125877437	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=136,79;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,0:9,5:10,9,4,1
chr9	125890607	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:125890607_C_T:125890607:7,14,1,1
chr9	125890609	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:125890607_C_T:125890607:7,14,1,1
chr9	125890616	.	C	CTACAACTCTGAGACTAGTTCTGT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:125890607_C_T:125890607:7,11,1,1
chr9	125898643	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.425:19:8,4:3,4:8,3,6,2
chr9	125909956	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr9	125920799	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125920799_G_GC:125920799:0,0,0,1
chr9	125920806	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125920799_G_GC:125920799:0,0,0,1
chr9	125921462	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:6,13,0,3
chr9	125932152	.	CATAT	C,CATATATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31,29;MFRL=159,171,138;MMQ=60,60,60;MPOS=11,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,11;RU=AT;STR;TLOD=3.19,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.249,0.294:4:2,1,1:0,0,0:2,0,2,0
chr9	126118517	.	AGCAGAGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGAGC;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	126118665	.	GGAGAGGGTCT	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.257:11:5,2:2,1:0|1:126118665_GGAGAGGGTCT_G:126118665:2,6,2,1
chr9	126118680	.	CCCAAGACAGATACCCCAAGCCT	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=-32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.281:10:5,2:2,1:0|1:126118665_GGAGAGGGTCT_G:126118665:2,5,2,1
chr9	126118704	.	GGCTGC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=101,55;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:126118665_GGAGAGGGTCT_G:126118665:0,2,1,1
chr9	126118715	.	TGGTGGGTG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=97,55;MMQ=60,57;MPOS=-1073741833;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:126118665_GGAGAGGGTCT_G:126118665:0,1,1,1
chr9	126118729	.	GTCCGCGT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,55;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:126118665_GGAGAGGGTCT_G:126118665:0,0,0,1
chr9	126129756	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr9	126132822	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=132,89;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:7,5,0,2
chr9	126133873	.	CGGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGT;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:1,5,0,2
chr9	126135864	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	126137676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0,3,1,6
chr9	126145907	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr9	126202551	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	126429404	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=85,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,0:17,3:11,19,0,3
chr9	126554885	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=99,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:11,8,1,2
chr9	126783331	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr9	127064225	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:5,8,2,0
chr9	127083725	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,3:0,1:2,2,3,1
chr9	127089775	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	127159079	.	TC	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.057:50:18,2:26,0:0|1:127159079_TC_T:127159079:22,26,1,1
chr9	127159083	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=100,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.057:50:18,2:27,0:0|1:127159079_TC_T:127159079:22,26,1,1
chr9	127177736	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.613:19:6,6:1,4:2,5,4,8
chr9	127215772	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,6:1,0:0|1:127215772_C_G:127215772:3,1,2,5
chr9	127215778	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.644:12:3,8:1,0:0|1:127215772_C_G:127215772:3,1,3,5
chr9	127217247	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,2:1,0:5,2,0,2
chr9	127230118	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:5,4:0,6,1,3
chr9	127230427	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=115,309;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr9	127231042	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr9	127231659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:127231659_G_A:127231659:7,2,0,2
chr9	127231668	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0|1:127231659_G_A:127231659:6,2,0,2
chr9	127244955	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr9	127253296	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,0:0|1:127253296_A_C:127253296:0,3,2,0
chr9	127253300	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:127253296_A_C:127253296:0,3,2,0
chr9	127253304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:127253296_A_C:127253296:0,3,2,0
chr9	127253308	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=180,245;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:127253296_A_C:127253296:0,3,1,0
chr9	127255448	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr9	127306173	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=87,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,0:7,3:3,6,0,3
chr9	127495508	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr9	127557371	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:10,3:8,0:8,10,1,2
chr9	127561559	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,13,15
chr9	127561868	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=252,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	127563364	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,17:0,7:0,0,16,8
chr9	127563476	.	G	GGGTGATAGAGTGAGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	127563919	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:12,0:0|1:127563919_A_T:127563919:9,18,1,1
chr9	127563925	.	T	TGG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,2:9,0:0|1:127563919_A_T:127563919:11,18,1,1
chr9	127563927	.	A	AGGGCTGGAGGGAGATGTTTCAG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,1:10,0:0|1:127563919_A_T:127563919:10,18,1,1
chr9	127566378	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr9	127572232	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:13,2:8,0:0|1:127572232_G_A:127572232:10,12,1,1
chr9	127572253	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:4,2:6,0:0|1:127572232_G_A:127572232:4,8,1,1
chr9	127615705	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	127616537	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:3,6:9,8:5,7,9,5
chr9	127618776	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,9,6
chr9	127619625	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,9,12
chr9	127619922	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr9	127620141	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr9	127637215	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr9	127643989	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr9	127644882	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr9	127652621	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:3,0,7,0
chr9	127661521	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,5,0
chr9	127661526	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,5,0
chr9	127674175	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=92,147;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,3:12,0:16,11,3,0
chr9	127674200	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,12,12
chr9	127757310	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,2:5,7:4,3,5,4
chr9	127765856	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=160,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0,2,1,1
chr9	127781259	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:1,6,2,2
chr9	127782873	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr9	127791946	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:9,14,2,0
chr9	127905805	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:127905805_G_A:127905805:0,0,1,0
chr9	127905808	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:127905805_G_A:127905805:0,0,1,0
chr9	127951072	.	C	CAATAAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AAT;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:0,0:2,2:1,1,3,0
chr9	127969785	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=214,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	127975583	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr9	127982775	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=55,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:1,2:5,9:5,1,8,3
chr9	127982849	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=90,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:15,0:17,3:13,20,0,3
chr9	127995120	.	GC	G,AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32,23;MFRL=158,111,141;MMQ=50,40,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr9	127995122	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=143,111;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	128000342	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=167,131;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,0:0|1:128000342_C_T:128000342:8,0,2,0
chr9	128000347	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=152,135;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,2:4,1:0|1:128000342_C_T:128000342:8,0,3,0
chr9	128000359	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=135,123;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:8,0:13,2,2,0
chr9	128000374	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:12,0:15,6,2,1
chr9	128001448	.	TTCTCCACCCAGATGAGTA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=124,107;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:11,2:14,16,1,1
chr9	128001871	.	A	AAGAAAATTGGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	128064242	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33,32;MFRL=144,1255856,183;MMQ=60,48,60;MPOS=12,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.42,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.402:7:1,2,2:0,0,1:2,0,5,0
chr9	128070114	.	TCTCCAGCAACCA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=89,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:18,0:14,2:18,16,1,1
chr9	128086167	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:14,6:15,0:16,13,6,0
chr9	128088606	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr9	128092318	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:16,5:13,0:15,15,4,1
chr9	128117205	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	128201098	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr9	128206717	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	128246786	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:7,2,1,6
chr9	128327891	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,18:0,0,25,2
chr9	128328020	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:0,0:0,2:0,3,2,1
chr9	128677877	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr9	128711772	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=139,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:3,6,0,2
chr9	128711809	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.424:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr9	128725421	.	GGTAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:5,2:7,0:2,10,1,1
chr9	129097817	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr9	129143242	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	129143315	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=93,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:4,4:0,2:3,1,5,1
chr9	129154509	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,3:6,4:2,10,1,6
chr9	129158002	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:6,4:8,2:5,10,1,5
chr9	129265397	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:5,0,7,1
chr9	129265612	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	129377894	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,2:0,1:1,1,0,4
chr9	129595262	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:1,1,3,4
chr9	129595401	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=170,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:5,3:13,0:10,8,2,1
chr9	129597498	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:7,1:7,9,1,1
chr9	129599108	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:129599108_CAT_C:129599108:0,3,0,1
chr9	129599111	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:129599108_CAT_C:129599108:0,3,0,1
chr9	129599401	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.203:23:7,2:8,0:6,12,5,0
chr9	129600004	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:26,0:27,4:28,26,0,4
chr9	129600117	.	CTT	C,CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,26,20;MFRL=207,290,110;MMQ=60,60,60;MPOS=30,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=6.56,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,7:0.195,0.284:22:7,1,2:1,2,3:5,6,6,5
chr9	129643364	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=99,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:9,2:9,12,1,1
chr9	129646728	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.091:64:34,0:23,5:34,25,0,5
chr9	129646763	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.213:16:10,0:3,3:6,7,1,2
chr9	129647669	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:1,8:7,6:0,8,6,9
chr9	129740101	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr9	129831455	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr9	129851133	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=165,77;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,0:10,0,2,1
chr9	129856144	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:7,13:5,3:4,8,6,11
chr9	129930892	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:4,2:7,0,5,0
chr9	129940200	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=67,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:10,10,0,2
chr9	129946337	.	GCT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,0:5,2:0|1:129946337_GCT_G:129946337:0,9,1,1
chr9	129946343	.	A	ATG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:129946337_GCT_G:129946337:0,9,1,1
chr9	129975276	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:6,8,2,0
chr9	129977042	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=98,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,5:8,0:7,6,2,3
chr9	130027348	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:8,0:11,10:1,18,0,10
chr9	130075672	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=48,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:3,3:0,2:2,1,6,0
chr9	130098413	.	AGGAAACGCCACATT	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:15,2:11,0:16,21,1,1
chr9	130100305	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr9	130119406	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr9	130127691	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:5,1:6,5:3,9,0,6
chr9	130149403	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,8:1,2:1,0,9,3
chr9	130155331	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr9	130160373	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=123,33;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:0|1:130160373_G_A:130160373:4,3,1,1
chr9	130160381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=123,33;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,0:2,1:0|1:130160373_G_A:130160373:4,3,1,1
chr9	130164818	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	130166382	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr9	130167338	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	130169874	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr9	130197414	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,14,8
chr9	130198100	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	130198342	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	130206295	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr9	130210111	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=373,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.944:20:0,5:0,13:0,1,7,12
chr9	130212023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	130213110	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=431,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:1,12:0,18:1,0,11,19
chr9	130213508	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=156.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.965:55:0,29:1,25:1,0,41,13
chr9	130216951	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr9	130219669	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=73,147;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,7:0,12:0,1,10,9
chr9	130219743	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:0,1,0,13
chr9	130221388	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr9	130236243	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=75,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:2,5:0,4:1,1,3,6
chr9	130241374	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	130241822	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr9	130242109	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	130243434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=81,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:0,0:10,3:8,2,3,0
chr9	130243534	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0|1:130243534_AT_A:130243534:1,2,3,0
chr9	130243556	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=123,88;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,1:0.250:6:2,0:3,1:1|0:130243534_AT_A:130243534:2,3,0,1
chr9	130248161	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr9	130259618	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:130259618_A_C:130259618:0,0,1,3
chr9	130259627	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=182,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130259618_A_C:130259618:0,1,0,1
chr9	130264965	.	CAAAA	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=119,145;MMQ=40,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:0,2:6,0:6,4,2,0
chr9	130264990	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.301:31:3,0:2,4:7,14,1,9
chr9	130269786	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr9	130271326	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=80,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:4,2:6,1:4,7,2,1
chr9	130286150	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,9:0,1:0,0,3,7
chr9	130289615	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr9	130289629	.	G	GCATCCTAAAGGGTCAAGTTACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:1,1,1,1
chr9	130331257	.	CCCGCTCCCG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGCTCCCG;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	130341095	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr9	130341253	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,5:7,4:2,10,3,6
chr9	130374766	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:3,0:4,7,1,2
chr9	130477768	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:4,2:9,10:8,5,11,2
chr9	130482481	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,58;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:130482481_C_T:130482481:10,9,1,1
chr9	130482494	.	C	CTCCACTACACTCCCCTCCATTCCATTTCATTCCATTCCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,58;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:130482481_C_T:130482481:7,8,1,1
chr9	130485618	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:2,9:6,0:2,8,3,6
chr9	130486384	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,297;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:130486384_C_T:130486384:8,2,1,1
chr9	130486385	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=125,297;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:130486384_C_T:130486384:8,2,1,1
chr9	130488494	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=61,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,3:4,5:5,1,6,2
chr9	130489189	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,4:4,1:3,2,3,2
chr9	130489743	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=83,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr9	130491998	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,1:0,2:2,5,0,3
chr9	130494800	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=144,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130494800_TG_T:130494800:1,0,1,0
chr9	130494811	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130494800_TG_T:130494800:2,0,1,0
chr9	130523815	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr9	130524817	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	130533494	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:6,2:5,7:1,10,4,7
chr9	130536196	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,179;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.549:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr9	130536717	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,5:1,5:4,3,3,7
chr9	130540769	.	GAGAAAA	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=87,26;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,1:9,0:0|1:130540769_GAGAAAA_G:130540769:18,9,0,2
chr9	130540780	.	AAAT	A	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=87,26;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:13,0:0|1:130540769_GAGAAAA_G:130540769:22,10,0,2
chr9	130540788	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=87,26;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:19,2:14,0:0|1:130540769_GAGAAAA_G:130540769:24,10,0,2
chr9	130540790	.	GTGATGA	G	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=78,26;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:19,2:15,0:0|1:130540790_GTGATGA_G:130540790:37,22,0,2
chr9	130540798	.	GAAACAGATGC	G	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=79,26;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:21,2:21,0:0|1:130540769_GAGAAAA_G:130540769:36,22,0,2
chr9	130540814	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=79,26;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:29,2:26,0:0|1:130540790_GTGATGA_G:130540790:33,24,0,2
chr9	130540951	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:3,13,0,2
chr9	130569280	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:13,9,0,2
chr9	130570918	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:0|1:130570918_C_T:130570918:1,6,1,1
chr9	130570922	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:130570918_C_T:130570918:1,6,1,1
chr9	130570990	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=167,287;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:1,0:0,4:0,3,4,0
chr9	130575633	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=105,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.458:7:0,1:3,0:1,3,3,0
chr9	130575637	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=23,18;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.278:9:1,1:3,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,4,2,0
chr9	130575642	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.307:8:0,0:3,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,3,2,0
chr9	130575644	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.307:8:1,0:4,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,3,2,0
chr9	130575647	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.307:8:1,0:3,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,3,2,0
chr9	130575654	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,16;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,0:0|1:130575637_A_C:130575637:2,4,2,0
chr9	130579599	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=345,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr9	130586618	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:9,6,1,2
chr9	130588826	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,0:11,4:11,10,0,4
chr9	130592011	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=87,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:9,5:15,0:13,11,3,2
chr9	130592205	.	C	CCACTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=311,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	130630233	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr9	130634969	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,30;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:11,4,1,1
chr9	130635060	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:6,8,0,2
chr9	130649111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr9	130653399	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130653399_A_AC:130653399:0,0,0,1
chr9	130653403	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130653399_A_AC:130653399:0,1,0,1
chr9	130657020	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr9	130670652	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr9	130670903	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr9	130672221	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,12,3
chr9	130676955	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:16,0:19,3:0|1:130676955_T_A:130676955:19,17,0,3
chr9	130676957	.	TA	CC	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:16,0:18,3:0|1:130676955_T_A:130676955:20,17,0,3
chr9	130676962	.	A	ACCTC	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:14,0:16,3:0|1:130676955_T_A:130676955:18,16,0,3
chr9	130690877	.	C	CCTTCCTTCCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	130692216	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130692216_A_G:130692216:0,1,0,1
chr9	130692218	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130692216_A_G:130692216:0,1,0,1
chr9	130706858	.	AG	CC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=24,18;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,1:3,1:0|1:130706858_AG_CC:130706858:2,11,4,0
chr9	130706862	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,2:4,1:0|1:130706858_AG_CC:130706858:2,11,4,0
chr9	130706867	.	GA	CC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,1:5,1:0|1:130706858_AG_CC:130706858:2,11,3,0
chr9	130706870	.	GA	CC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:5,0:0|1:130706858_AG_CC:130706858:3,11,2,0
chr9	130706876	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,14;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,0:0|1:130706858_AG_CC:130706858:3,12,2,0
chr9	130708013	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:12,5:19,0:11,20,0,5
chr9	130710726	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr9	130710791	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr9	130715922	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,15:0,0,20,13
chr9	130825915	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:16,3:11,0:20,8,2,1
chr9	130830779	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130830779_C_T:130830779:0,0,0,1
chr9	130830784	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130830779_C_T:130830779:0,0,0,1
chr9	130854052	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	130854083	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	130854127	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,10:0,0,16,2
chr9	130860866	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,14:0,7:0,0,14,9
chr9	130861039	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr9	130863763	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=127,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130863763_GA_G:130863763:0,1,0,1
chr9	130863769	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=127,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130863763_GA_G:130863763:0,1,0,1
chr9	130864782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:130864782_C_T:130864782:8,6,1,1
chr9	130864799	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:130864782_C_T:130864782:5,8,1,1
chr9	130868612	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,1:9,2:8,4,2,1
chr9	130868831	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	130869219	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=191,426;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr9	130869499	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0,0,11,6
chr9	130883511	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,13,10
chr9	130886906	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr9	130889705	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,3,3
chr9	130889763	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	130914170	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr9	130914434	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,5,7
chr9	130915309	.	TCA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=166,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:0,2:3,0:0|1:130915309_TCA_T:130915309:4,2,1,1
chr9	130915330	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:130915309_TCA_T:130915309:5,8,1,1
chr9	130915331	.	GCA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.166:16:5,0:8,2:1|0:130915309_TCA_T:130915309:6,8,0,2
chr9	130915438	.	G	GCAGTGAGCCCAGATAGCACCAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:6,7,0,3
chr9	130932396	.	AAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr9	130938661	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,10,5
chr9	130940121	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	130940822	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=308,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,0:0,6:0,1,4,3
chr9	130942972	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:0,8:1,0,7,5
chr9	130947797	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:0,3:0|1:130947797_G_C:130947797:1,1,4,0
chr9	130947801	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:0,3:0|1:130947797_G_C:130947797:1,2,4,0
chr9	130947807	.	AT	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:2,1:0|1:130947797_G_C:130947797:2,3,3,0
chr9	130953145	.	G	GACAGAAGAATTCTCAGTAACTTCCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr9	130981064	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	130982416	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr9	130982666	.	A	AGCCCAGAGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=203,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr9	130984430	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=248,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.865:13:1,2:0,8:0,1,9,3
chr9	131008812	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=168,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:5,2:0|1:131008812_G_C:131008812:2,11,1,1
chr9	131008817	.	CCCAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:6,2:0|1:131008812_G_C:131008812:2,12,1,1
chr9	131015279	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr9	131015318	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.286:14:4,2:2,0:2,8,4,0
chr9	131020566	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr9	131020758	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:12,0:11,3:0|1:131020758_C_T:131020758:11,13,2,2
chr9	131020779	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:5,0:10,4:0|1:131020758_C_T:131020758:6,10,2,2
chr9	131022447	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr9	131022545	.	C	CGCTTGTAGCTGCTGCTCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=225,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr9	131022830	.	C	CAACTCTCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:0|1:131022830_C_CAACTCTCA:131022830:6,6,1,1
chr9	131022831	.	G	GAGTTTAACT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,2:7,0:0|1:131022830_C_CAACTCTCA:131022830:6,6,1,1
chr9	131025046	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,164;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:2,6,0,2
chr9	131029390	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr9	131029456	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,0:11,2:10,8,0,2
chr9	131050814	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	131051113	.	T	TCCAACCTGGGTGACACAGTGAGACCCAGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131076261	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	131077735	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr9	131084088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	131087588	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,4:1,1:2,5,0,5
chr9	131095906	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.218:12:3,2:5,0:0|1:131095906_C_T:131095906:1,9,1,1
chr9	131095919	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:3,2:3,0:0|1:131095906_C_T:131095906:1,6,1,1
chr9	131095921	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=180,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:131095906_C_T:131095906:1,5,1,1
chr9	131112519	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:9,2,3,0
chr9	131112864	.	GGGCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr9	131115557	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,122;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr9	131117731	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:10,8:7,0:9,8,6,2
chr9	131151713	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,130;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,0:9,4:9,4,0,4
chr9	131185295	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:131185295_G_C:131185295:0,1,2,1
chr9	131185296	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:131185295_G_C:131185295:2,1,0,1
chr9	131185298	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:131185295_G_C:131185295:2,1,0,1
chr9	131185302	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:3,1:1|0:131185295_G_C:131185295:3,1,0,1
chr9	131185308	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:131185295_G_C:131185295:3,1,0,1
chr9	131185638	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr9	131186328	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=114,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr9	131186401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr9	131186581	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=161,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.596:13:3,6:2,1:0|1:131186581_C_T:131186581:2,3,2,6
chr9	131186586	.	G	GGAGATGGACAACT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:131186581_C_T:131186581:2,7,1,1
chr9	131186956	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:131186956_A_G:131186956:0,1,0,3
chr9	131186961	.	C	CCCCAGCCTGCCCGAACTCCTCTGATGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:131186956_A_G:131186956:0,3,0,1
chr9	131186969	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131186956_A_G:131186956:0,2,0,1
chr9	131186972	.	C	CGAACTCCTCTGATGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131186956_A_G:131186956:0,2,0,1
chr9	131193605	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,5:5,0:4,5,2,3
chr9	131193665	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	131196468	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:6,4:5,6:4,7,2,8
chr9	131196615	.	TAGGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131196615_TAGGAG_T:131196615:0,0,0,1
chr9	131196622	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131196615_TAGGAG_T:131196615:0,0,0,1
chr9	131196627	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131196615_TAGGAG_T:131196615:0,0,0,1
chr9	131196905	.	TGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr9	131197853	.	G	GCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr9	131197896	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,3:0,3:0,0,6,2
chr9	131231633	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,2:4,0:0|1:131231633_G_A:131231633:6,11,1,1
chr9	131231642	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:131231633_G_A:131231633:3,10,1,1
chr9	131245175	.	CTT	C,CT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=22,20,33;MFRL=182,81,130;MMQ=45,44,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=5.15,3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.392,0.379:9:1,1,3:0,1,0:0,2,4,3
chr9	131245260	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,25;MFRL=231,161;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.314:5:2,1:2,0:0|1:131245260_T_C:131245260:0,4,0,1
chr9	131245262	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=231,161;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.318:5:1,1:2,0:0|1:131245260_T_C:131245260:0,4,0,1
chr9	131245267	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=255,161;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:131245260_T_C:131245260:0,3,0,1
chr9	131245270	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=255,161;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:131245260_T_C:131245260:0,3,0,1
chr9	131245272	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=255,161;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131245260_T_C:131245260:0,3,0,1
chr9	131246376	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	131246383	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131246383_T_C:131246383:0,1,0,1
chr9	131246386	.	G	GACTACTGAGCTTAAACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131246383_T_C:131246383:0,1,0,1
chr9	131247176	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,4:5,2:5,6,1,5
chr9	131247626	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,2:4,11:5,1,9,4
chr9	131250111	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=189,100;MMQ=54,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,0:3,3:6,0,2,1
chr9	131256737	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr9	131284914	.	TAA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=146,145;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:0,1:1,4:1,2,5,0
chr9	131284960	.	TATGGCAGGAGGAGCAGGAGAGGAAGGTGCAAGCCCTCTCGGAGATGGCATCTGAACAACTGAAGCGGTTTGATGA	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.049:60:7,0:13,2:21,37,0,2
chr9	131285955	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,5:6,1:4,4,4,2
chr9	131287501	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:8,0:19,2:16,11,1,1
chr9	131289600	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr9	131295727	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=208,0;MMQ=60,28;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:2,2,1,0
chr9	131298590	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:4,3,4,2
chr9	131303522	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr9	131337389	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=218,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,2,1
chr9	131337661	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	131340306	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	131346479	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr9	131347165	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0|1:131347165_G_A:131347165:0,0,4,10
chr9	131347169	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0|1:131347165_G_A:131347165:0,0,3,8
chr9	131360750	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:3,3:7,8:3,7,5,7
chr9	131367684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:8,7,2,0
chr9	131369811	.	TCTGTTTTCCTGGGCAGAAGATCTCCTTACCAGGTAATATAATAGCTATTTTTCTGGGGTG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=137,55;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:1,0:4,6:13,5,1,5
chr9	131374165	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr9	131375676	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=92,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,3:6,0:10,9,2,1
chr9	131375701	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,17:0,5:0,0,10,12
chr9	131379967	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=77,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,7:3,5:3,6,7,5
chr9	131380225	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr9	131380312	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,2:7,2:10,7,2,2
chr9	131381317	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,6:1,2:2,5,3,5
chr9	131388643	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	131389060	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131389746	.	A	AAC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=135,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.150:31:13,2:14,1:0|1:131389746_A_AAC:131389746:10,17,2,2
chr9	131389750	.	C	CAGGTGG	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:14,2:14,1:0|1:131389746_A_AAC:131389746:10,18,2,2
chr9	131389752	.	T	TTGGCACCCTGACA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:14,1:13,0:0|1:131389746_A_AAC:131389746:10,18,2,1
chr9	131390184	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=102,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:16,0:30,3:15,31,0,3
chr9	131392553	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr9	131396734	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=197,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr9	131397125	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:5,4:9,4:6,8,4,5
chr9	131397479	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,7:3,7:3,5,6,8
chr9	131398343	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr9	131398348	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:131398348_T_A:131398348:0,0,1,0
chr9	131398354	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:131398348_T_A:131398348:3,0,1,0
chr9	131453331	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:131453331_G_A:131453331:0,0,9,1
chr9	131453355	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,3:0.137:27:9,3:15,0:1|0:131453331_G_A:131453331:21,3,3,0
chr9	131454120	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,16:0,0,26,12
chr9	131455903	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,10:0,0,15,13
chr9	131456385	.	G	GTA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:5,5:2,4:0,7,0,9
chr9	131465284	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	131468251	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	131475951	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	131477544	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr9	131479023	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,16,14
chr9	131482467	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,10,7
chr9	131484410	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:4,7:1,10:3,2,5,12
chr9	131502112	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	131502440	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr9	131502460	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr9	131505092	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	131513370	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr9	131550695	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:4,13,1,1
chr9	131550722	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=75,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,6:1,1:0,1,2,5
chr9	131553768	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr9	131565554	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:9,6:4,7:8,5,7,7
chr9	131566453	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	131570178	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=95,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:131570178_T_C:131570178:6,4,2,0
chr9	131570183	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:131570178_T_C:131570178:0,0,6,4
chr9	131570265	.	G	GCCTCTCACTCCATCTACACCGTTCTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=234,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	131581269	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr9	131583170	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr9	131585205	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	131585994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr9	131586374	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=89,87;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:4,7:11,5:11,4,7,5
chr9	131587240	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.454:22:6,6:6,3:6,6,10,0
chr9	131588813	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:5,9:2,8:1,6,6,11
chr9	131589234	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr9	131599008	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=165,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	131600111	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,6:7,3:4,6,1,8
chr9	131600681	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.624:14:1,9:4,0:1,4,1,8
chr9	131602897	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=81,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.569:9:3,2:1,2:3,1,4,1
chr9	131669667	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,0:9,3:6,12,1,2
chr9	131671561	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:4,6:4,4:3,5,3,7
chr9	131698720	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:13,0:16,11,3,0
chr9	131702695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=109,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:13,1:6,10,0,2
chr9	131709246	.	C	CGACCGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131709246_C_CGACCGGCT:131709246:0,1,0,1
chr9	131709248	.	A	ATTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131709246_C_CGACCGGCT:131709246:0,1,0,1
chr9	131709424	.	G	GCCCTTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:131709424_G_GCCCTTTT:131709424:4,5,1,1
chr9	131709426	.	C	CCAGCTTCACCTTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:0|1:131709424_G_GCCCTTTT:131709424:4,5,1,1
chr9	131715001	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.474:13:2,3:3,3:4,3,6,0
chr9	131718797	.	G	GTTTCTTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.767:2:0,0:0,2:0|1:131718797_G_GTTTCTTTTC:131718797:0,0,0,2
chr9	131718807	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=204,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:131718797_G_GTTTCTTTTC:131718797:0,1,0,2
chr9	131721308	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=89,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:12,2:12,11,2,0
chr9	131735559	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:2,6:3,8:0,5,5,10
chr9	131743701	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.443:9:2,0:3,4:0|1:131743701_CT_C:131743701:1,4,0,4
chr9	131743716	.	A	AGACGGAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.330:7:0,2:5,0:1|0:131743701_CT_C:131743701:0,5,0,2
chr9	131745394	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=233,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr9	131745548	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,0:4,4:3,6,3,1
chr9	131750002	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=50538516,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr9	131756793	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:131756793_G_T:131756793:0,4,0,1
chr9	131756795	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:131756793_G_T:131756793:0,4,0,1
chr9	131756798	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:131756793_G_T:131756793:0,4,0,1
chr9	131756814	.	C	CTCCCTCCTTTCTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=253,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	131757616	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=152,310;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,5:6,0:6,6,5,0
chr9	131761417	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=141,94;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,0:7,4,1,2
chr9	131761427	.	TG	AA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=144,94;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:7,7,1,1
chr9	131761437	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,8:1,4:1,3,6,7
chr9	131761659	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr9	131761899	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=95,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:4,1,5,3
chr9	131770958	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,5:11,0:15,4,5,0
chr9	131771013	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.140:20:8,0:9,2:0|1:131771013_C_T:131771013:6,12,1,1
chr9	131771019	.	C	CCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:131771013_C_T:131771013:7,11,1,1
chr9	131771020	.	G	GTTTTTATGTGA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:9,1:0|1:131771013_C_T:131771013:7,11,1,1
chr9	131772389	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.559:25:7,9:3,5:4,7,5,9
chr9	131798891	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,12,5
chr9	131821458	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:22,0:14,3:19,17,0,3
chr9	131821608	.	GGAGAAGTTGCGAGA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr9	131825446	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:3,1:0|1:131825446_A_C:131825446:4,2,2,0
chr9	131825453	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,0:0|1:131825446_A_C:131825446:6,3,2,0
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chr9	131825931	.	G	GCGT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.354:3:2,1:0,0:0|1:131825929_G_GATCACTCTT:131825929:2,0,0,1
chr9	131825933	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:131825929_G_GATCACTCTT:131825929:2,0,0,1
chr9	131825935	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:131825929_G_GATCACTCTT:131825929:2,0,0,1
chr9	131825936	.	A	ATCTGGAGAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0|1:131825929_G_GATCACTCTT:131825929:2,0,0,1
chr9	131830681	.	C	CTTTTTTCTGGCTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131830681_C_CTTTTTTCTGGCTAG:131830681:0,1,0,1
chr9	131830684	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:131830681_C_CTTTTTTCTGGCTAG:131830681:0,1,0,1
chr9	131846957	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,11:0,21:0,0,13,19
chr9	131848382	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	131849036	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,2:13,1:9,7,3,0
chr9	131857742	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:9,3:3,0:10,3,3,0
chr9	131862073	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr9	131862705	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr9	131862781	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	131865230	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=138,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:7,6:6,0:11,5,7,0
chr9	131866388	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr9	131871144	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr9	131871435	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,16:0,8:0,0,14,10
chr9	131873222	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.956:21:0,9:0,8:0|1:131873222_G_A:131873222:0,0,12,9
chr9	131873234	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,18:0.632:28:5,10:5,7:0|1:131873222_G_A:131873222:5,5,10,8
chr9	131882761	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,3:0,0,5,4
chr9	131882776	.	AT	A,ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25,32;MFRL=141,148,134;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=3.63,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.217,0.217:11:3,1,2:3,1,0:6,1,2,2
chr9	131882961	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr9	131897221	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	131898880	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr9	131899846	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,34:0.922:36:0,17:2,17:2,0,15,19
chr9	131900180	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chr9	132084885	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=74,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,5:3,6:1,2,5,6
chr9	132375432	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,5:6,2:4,7,4,3
chr9	132377728	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=91,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:3,2,6,2
chr9	132381749	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,2:3,1:2,1,2,1
chr9	132382113	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=82,82;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:18,1:22,4:16,25,0,5
chr9	132395245	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr9	132396281	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr9	132396629	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:132396629_G_C:132396629:0,5,1,1
chr9	132396633	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:132396629_G_C:132396629:0,5,1,1
chr9	132396638	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:132396629_G_C:132396629:0,5,1,1
chr9	132396651	.	T	TCCCGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=79,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr9	132396655	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	132400557	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=156,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:7,4,1,4
chr9	132401824	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr9	132404304	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr9	132515081	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr9	132569442	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:11,8:8,5:13,6,7,6
chr9	132571818	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:12,3:7,0:10,10,3,0
chr9	132580842	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=100,189;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:21,3:23,0:23,21,3,0
chr9	132584944	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,258;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:11,9,2,0
chr9	132590352	.	AG	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=157,128;MMQ=58,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr9	132590431	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:16,7:11,11:4,23,6,12
chr9	132591425	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr9	132591509	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.547:46:6,15:13,10:13,8,11,14
chr9	132593212	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:10,0:23,3:15,19,0,3
chr9	132595664	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=81,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,3:3,3:5,3,7,0
chr9	132595685	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=77,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:9,5:7,7:10,6,9,3
chr9	132596031	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:2,4:1,5:0,4,0,9
chr9	132596071	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr9	132596899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr9	132618578	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:4,2,4,0
chr9	132620224	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	132620458	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:132620458_C_A:132620458:0,2,0,3
chr9	132620464	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:132620458_C_A:132620458:0,2,0,3
chr9	132620707	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,2:1,3:8,1,4,1
chr9	132623917	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=172,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,2,5
chr9	132625417	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:8,4,4,0
chr9	132625586	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=187,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.057:48:19,0:27,2:0|1:132625586_G_A:132625586:11,35,1,1
chr9	132625591	.	A	AGACCATGTTCCACCACT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=187,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:16,0:27,2:0|1:132625586_G_A:132625586:11,35,1,1
chr9	132625602	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=139,187;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.697:44:6,11:7,20:8,5,0,31
chr9	132627480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr9	132627723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:1,2,2,4
chr9	132630231	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	132630664	.	TGAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:1,4:4,4:3,3,2,6
chr9	132631680	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.622:16:4,2:1,8:1,5,4,6
chr9	132632162	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:1,6:6,3:1,6,1,8
chr9	132632178	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,1:3,4:0,8,0,5
chr9	132632653	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr9	132635653	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:3,0,9,2
chr9	132635705	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:23,2:16,0:16,23,3,0
chr9	132635776	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:15,3:16,0:15,17,0,3
chr9	132635944	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=73,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:3,3,1,3
chr9	132636920	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=98,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,9:3,4:4,2,9,4
chr9	132640726	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=67,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:5,4:9,8:5,9,5,7
chr9	132652677	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GA;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:132652677_G_GGA:132652677:2,0,2,0
chr9	132652694	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.364:9:4,2:2,1:1|0:132652677_G_GGA:132652677:6,0,3,0
chr9	132652699	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.416:10:3,2:2,2:1|0:132652677_G_GGA:132652677:6,0,4,0
chr9	132658044	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	132665205	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,3:15,0:12,15,3,0
chr9	132671359	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr9	132678195	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,13:0,0,22,7
chr9	132686186	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,17:0,0,28,16
chr9	132686252	.	A	AGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.227:10:3,0:5,2:0|1:132686252_A_AGG:132686252:6,2,0,2
chr9	132686255	.	G	GAGCACGTGTGTTTTTATGA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.230:10:3,0:5,2:0|1:132686252_A_AGG:132686252:6,2,0,2
chr9	132689605	.	CCA	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:0|1:132689605_CCA_C:132689605:8,15,0,2
chr9	132689611	.	C	CTCTTTCTTTTCTTTT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:132689605_CCA_C:132689605:7,14,0,2
chr9	132689614	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:132689605_CCA_C:132689605:6,14,0,2
chr9	132689616	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:7,2:0|1:132689605_CCA_C:132689605:6,14,0,2
chr9	132689671	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	132719740	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=138,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:8,13,2,0
chr9	132720650	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=216,195;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr9	132720720	.	G	A,GA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,24,31;MFRL=0,0,141;MMQ=60,60,60;MPOS=7,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.44,29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.212,0.736:15:0,3,3:0,0,8:0,0,10,5
chr9	132720869	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,0:5,8:3,8,2,6
chr9	132816398	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr9	132838016	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:11,13:11,5:11,12,13,5
chr9	132838063	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=19,15;MFRL=109,179;MMQ=60,35;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:0,0:1,0:1,2,1,3
chr9	132838831	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=164,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr9	132841808	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	132845723	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr9	132845986	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr9	132848653	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0,0,11,3
chr9	132861672	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,2,2
chr9	132861720	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=100,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:11,7,3,0
chr9	132862830	.	AA	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	132863035	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:2,4,0,3
chr9	132866883	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	132866906	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	132872743	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=109,208;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,0:15,3:11,10,0,3
chr9	132887094	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr9	132887249	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.767:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr9	132887285	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	132891065	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=83,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:7,5:4,2:6,6,1,6
chr9	132891115	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	132897231	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr9	132962801	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,5:0,0,12,2
chr9	132962816	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr9	132963115	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,7,1
chr9	132963129	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,9,1
chr9	132963350	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,5,15
chr9	132980035	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=103,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr9	132985048	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=92,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:4,2:0|1:132985048_T_A:132985048:10,11,0,2
chr9	132985053	.	G	GAGGTTGCAGTGAGCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=92,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:6,2:0|1:132985048_T_A:132985048:9,10,0,2
chr9	132985258	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:132985258_GC_G:132985258:1,0,2,0
chr9	132985262	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:132985258_GC_G:132985258:1,0,2,0
chr9	133067054	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,2:6,4,2,1
chr9	133072344	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=122,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:133072344_A_T:133072344:5,14,1,1
chr9	133072350	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=122,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:4,2:0|1:133072344_A_T:133072344:5,14,1,1
chr9	133224133	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:133224133_T_TGG:133224133:0,4,0,1
chr9	133224134	.	T	TGGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:133224133_T_TGG:133224133:0,4,0,1
chr9	133231691	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:133231691_C_G:133231691:0,1,0,1
chr9	133231700	.	GTG	AGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133231691_C_G:133231691:0,1,0,1
chr9	133233386	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:1,7,2,0
chr9	133234635	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	133300977	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr9	133301395	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,764;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	133302964	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,133;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,0:7,5:8,8,0,5
chr9	133333686	.	TGGCCCCGTATAGGTCTCAGCTAGCTGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,1:5,1,1,1
chr9	133346379	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	133346983	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	133352335	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:10,5,1,2
chr9	133352381	.	T	TGGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:3,0:5,8,0,2
chr9	133355874	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr9	133355902	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr9	133364632	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133364632_A_T:133364632:0,0,1,0
chr9	133364644	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:133364632_A_T:133364632:0,0,1,0
chr9	133472156	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr9	133498017	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=122,114,105;MMQ=60,60,57;MPOS=26,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.27,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,6:0.212,0.375:15:4,1,2:2,2,3:6,0,8,1
chr9	133498229	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr9	133540318	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	133543464	.	A	AGTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=GT;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr9	133543700	.	GGT	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.191:23:8,2:10,2:11,8,2,2
chr9	133554040	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:8,0:2,5:4,7,0,5
chr9	133554065	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,5:0,0:0,1,1,4
chr9	133573460	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=167,178;MMQ=45,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr9	133579152	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=77,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.678:26:2,9:6,8:2,6,9,9
chr9	133710804	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0|1:133710804_T_C:133710804:0,0,11,2
chr9	133710819	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0|1:133710804_T_C:133710804:0,0,10,3
chr9	133729419	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133729419_TTC_T:133729419:1,0,1,0
chr9	133729437	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=116,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133729419_TTC_T:133729419:2,0,1,0
chr9	133747698	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr9	133750533	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.701:1:0,0:0,0:0|1:133750533_C_CT:133750533:0,0,0,1
chr9	133750539	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=227,138;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:133750533_C_CT:133750533:0,2,0,1
chr9	133759979	.	G	GAGGGAGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=91,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr9	133769254	.	A	AT,AGTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,22,24;MFRL=170,126,102;MMQ=60,60,60;MPOS=6,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.248,0.247:5:0,1,1:2,0,0:0,3,0,2
chr9	133769255	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr9	133769258	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=163,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr9	133769259	.	C	T,CAGTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25,29;MFRL=170,126,102;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:0,3,0,2
chr9	133805305	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:9,0:7,3:4,13,0,3
chr9	133813919	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133813919_G_A:133813919:1,0,1,0
chr9	133813924	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133813919_G_A:133813919:1,0,1,0
chr9	133901752	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,3:5,8:4,7,5,6
chr9	133901819	.	CC	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,1:4,3:5,8,2,2
chr9	133914321	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.384:14:3,4:5,0:5,4,1,4
chr9	133932240	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	133936334	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	133936381	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr9	133942624	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	133942660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	133944510	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:133944510_G_GC:133944510:0,2,0,1
chr9	133944511	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:133944510_G_GC:133944510:0,2,0,1
chr9	133944522	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:133944522_C_T:133944522:0,0,0,3
chr9	133944525	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:133944522_C_T:133944522:0,0,0,3
chr9	133961194	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,0:5,8:0,10,0,8
chr9	133962853	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.334:34:11,6:11,5:15,8,8,3
chr9	133963101	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,0:5,4:7,3,3,1
chr9	133967266	.	A	AAATCAAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	133972065	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	133996460	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,14:0,0,11,11
chr9	133996503	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,8,10
chr9	134014666	.	AGA	TTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=0,103;MMQ=60,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,0:1,4,2,0
chr9	134019580	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,0:3,5:3,0,5,0
chr9	134020092	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,9:0,0,10,10
chr9	134049623	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:7,0:16,2:0|1:134049623_G_C:134049623:11,13,1,1
chr9	134049629	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,0:15,2:0|1:134049623_G_C:134049623:13,15,1,1
chr9	134049633	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:19,2:0|1:134049623_G_C:134049623:13,16,1,1
chr9	134049636	.	C	CAACCTCATCAGTT	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,0:18,2:0|1:134049623_G_C:134049623:13,17,1,1
chr9	134062770	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=175,60;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.736:5:0,2:0,0:0,1,1,3
chr9	134064345	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr9	134076929	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=155,160;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.286:9:2,0:3,2:7,0,2,0
chr9	134076950	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=74,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,3:1,6:1,1,6,6
chr9	134105939	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,4:0,0,10,1
chr9	134140113	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=133,159;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.516:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr9	134140136	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=141,137;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.348:7:1,1:2,0:0|1:134140136_A_G:134140136:0,5,0,2
chr9	134140139	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=187,98;MMQ=50,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:134140136_A_G:134140136:0,2,0,1
chr9	134165733	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:3,9,0,3
chr9	134166494	.	G	GGTGCTTACGTTAAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,2:0,0:5,2,1,1
chr9	134323240	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr9	134340444	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=82,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:2,4:3,4:4,2,2,6
chr9	134346087	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	134346424	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr9	134349152	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr9	134349210	.	C	CCTAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	134354774	.	A	ATCAGGATTTGGACCTGTGGTTGTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=155,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,0:2,2:2,5,1,1
chr9	134354794	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr9	134358108	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr9	134358657	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr9	134367015	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr9	134367743	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr9	134385745	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:134385745_C_CT:134385745:4,14,1,1
chr9	134385749	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=91,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:134385745_C_CT:134385745:4,14,1,1
chr9	134386675	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr9	134390993	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr9	134393649	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:10,0:15,3:15,11,0,3
chr9	134393671	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:10,0:22,3:15,17,0,3
chr9	134394301	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:16,0:14,14,1,2
chr9	134397624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=140,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,1:7,1:1,6,2,0
chr9	134400570	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,9:8,0:8,8,7,2
chr9	134454872	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=70,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,1:8,1:11,12,0,2
chr9	134463039	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=198,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr9	134465398	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.749:7:2,3:0,1:0|1:134465398_T_C:134465398:0,2,0,5
chr9	134465410	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.749:7:2,5:0,0:0|1:134465398_T_C:134465398:0,2,1,4
chr9	134467578	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr9	134477380	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=166,0;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134477380_CT_C:134477380:3,0,1,0
chr9	134477383	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=166,0;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134477380_CT_C:134477380:3,0,1,0
chr9	134477384	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=166,0;MMQ=60,45;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134477380_CT_C:134477380:3,0,1,0
chr9	134477387	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=166,0;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134477380_CT_C:134477380:3,0,1,0
chr9	134477579	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:3,4,1,1
chr9	134479293	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	134480272	.	GGTGT	G,GGT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34,32;MFRL=147,110,215;MMQ=60,60,60;MPOS=3,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=GT;STR;TLOD=5.39,10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.261,0.381:11:3,2,2:0,1,2:3,1,6,1
chr9	134494595	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=87,163;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,10:0.157:68:30,0:26,10:0|1:134494595_T_A:134494595:43,15,0,10
chr9	134494601	.	AC	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=94,163;MMQ=60,47;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,10:0.167:64:25,0:25,10:0|1:134494595_T_A:134494595:39,15,0,10
chr9	134497450	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr9	134501410	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:10,4:4,6:6,9,4,6
chr9	134504556	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:15,0:15,3:19,11,2,1
chr9	134514251	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:0,11,0,6
chr9	134735932	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,76;MMQ=58,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:7,4,1,1
chr9	134814870	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=105,93;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:7,7,0,3
chr9	134952790	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=95.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,24,6
chr9	135042515	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=164,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0|1:135042515_T_TG:135042515:1,5,1,1
chr9	135042518	.	A	AAGCCGGGAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=164,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0|1:135042515_T_TG:135042515:1,5,1,1
chr9	135106054	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr9	135139770	.	ACA	GGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:10,2:0|1:135139770_ACA_GGG:135139770:5,17,1,1
chr9	135139774	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:135139770_ACA_GGG:135139770:5,17,1,1
chr9	135140068	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,91;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,4:16,0:14,16,3,1
chr9	135140308	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,0:13,2:0|1:135140308_C_T:135140308:7,13,1,1
chr9	135140314	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,0:12,2:0|1:135140308_C_T:135140308:7,13,1,1
chr9	135161879	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:135161879_C_T:135161879:4,8,0,2
chr9	135161882	.	CTGG	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:135161879_C_T:135161879:4,8,0,2
chr9	135203409	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr9	135205547	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,130;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:135205547_C_T:135205547:5,9,0,2
chr9	135205552	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=122,130;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:135205547_C_T:135205547:5,9,0,2
chr9	135206932	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	135211609	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr9	135221597	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	135271987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr9	135273507	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	135273607	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,10:0,15:0,0,13,12
chr9	135273759	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr9	135275561	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=109,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:6,0:11,6:7,11,0,6
chr9	135278266	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,19;MFRL=145,173;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:135278266_G_A:135278266:0,3,0,1
chr9	135278268	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=23,31;MFRL=145,173;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:135278266_G_A:135278266:0,3,0,1
chr9	135278274	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=23,32;MFRL=287,159;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:135278274_A_G:135278274:0,1,0,2
chr9	135278277	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=216,173;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:135278266_G_A:135278266:0,2,0,1
chr9	135278281	.	CG	C,TG	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,34,28;MFRL=145,173,287;MMQ=60,40,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr9	135278282	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=287,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	135278283	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=31,25;MFRL=216,173;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:135278266_G_A:135278266:0,2,0,1
chr9	135278284	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=159,287;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:135278274_A_G:135278274:0,2,0,1
chr9	135278286	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=159,287;MMQ=50,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:135278274_A_G:135278274:0,2,0,1
chr9	135278288	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=159,287;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:135278274_A_G:135278274:0,2,0,1
chr9	135278292	.	GA	AT	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=28,22;MFRL=159,287;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1|0:135278274_A_G:135278274:0,2,0,1
chr9	135470176	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr9	135521487	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr9	135522454	.	AAAGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr9	135523692	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:4,5,1,2
chr9	135536489	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr9	135553706	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,2,3
chr9	135554792	.	TTGTGGAAACCCACCCA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,0:7,2:8,14,1,1
chr9	135601354	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr9	135601367	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr9	135602874	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=86,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:8,0:14,2:0|1:135602874_G_C:135602874:8,15,1,1
chr9	135602879	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=91,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:135602874_G_C:135602874:9,9,1,1
chr9	135602892	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:9,8,0,2
chr9	135702490	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	135703284	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=146,260;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	135703514	.	G	GTGGCATGATCTCAACT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=111,265;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr9	135703515	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,26;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:135703515_C_A:135703515:1,2,0,1
chr9	135703517	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:135703515_C_A:135703515:1,2,0,1
chr9	135703518	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:135703515_C_A:135703515:1,1,0,1
chr9	135703583	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=245,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:135703583_C_CA:135703583:0,2,0,1
chr9	135703586	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=245,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:135703583_C_CA:135703583:0,2,0,1
chr9	135739226	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	135762991	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr9	135764081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	135776034	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr9	135777039	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:20,0:12,2:0|1:135777039_T_C:135777039:11,23,1,1
chr9	135777045	.	CCGCAGCTCCGCAAT	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:21,0:11,2:0|1:135777039_T_C:135777039:16,28,1,1
chr9	135777930	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=177,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,0:2,5:7,1,5,0
chr9	135781435	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:8,2:10,2:6,12,2,2
chr9	135861998	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	135862632	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=90,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr9	135864586	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr9	135894851	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135894851_A_T:135894851:0,0,1,0
chr9	135894869	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135894851_A_T:135894851:0,0,1,0
chr9	135906221	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.284:37:8,10:17,0:19,8,10,0
chr9	135931437	.	CT	AG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:135931437_CT_AG:135931437:6,2,1,1
chr9	135931441	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:8,2:0|1:135931437_CT_AG:135931437:9,2,1,1
chr9	135931444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:8,2:0|1:135931437_CT_AG:135931437:10,4,1,1
chr9	135931446	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=88,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:135931437_CT_AG:135931437:10,4,1,1
chr9	135942631	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.328:9:1,0:2,0:0,6,0,3
chr9	135942638	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:1,0:1,0:0,4,0,4
chr9	135944001	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=93,152;MMQ=57,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,5:9,2:11,6,6,1
chr9	135944286	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=209,183;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr9	135946121	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,126;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,4:6,3:4,12,0,7
chr9	135977075	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:6,4,1,1
chr9	135977583	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,1:6,2:1,5,1,2
chr9	135978153	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr9	135979751	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:3,12,2,5
chr9	135982391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=226,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:135982391_T_C:135982391:3,1,2,0
chr9	135982395	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:135982391_T_C:135982391:3,1,1,0
chr9	135985166	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr9	135985796	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,4:3,2:2,5,2,4
chr9	136031259	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=55,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:5,9,2,0
chr9	136081173	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=164,146;MMQ=57,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:5,2:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:14,1,6,0
chr9	136081176	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=30,23;MFRL=169,146;MMQ=55,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,2:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:15,1,6,0
chr9	136081180	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=169,155;MMQ=55,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,2:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:15,1,6,0
chr9	136081185	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=24,30;MFRL=159,155;MMQ=52,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,3:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:14,2,6,0
chr9	136081186	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=159,155;MMQ=52,30;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,3:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:14,2,6,0
chr9	136081191	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=24,26;MFRL=154,155;MMQ=52,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:6,3:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:13,2,6,0
chr9	136081193	.	G	GCA	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=154,141;MMQ=52,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:5,3:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:13,2,6,1
chr9	136081196	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=144,141;MMQ=52,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:5,4:9,3:0|1:136081173_CA_TG:136081173:12,2,6,1
chr9	136081261	.	AG	A	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=130,107;MMQ=49,33;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.359:34:8,4:12,8:7,15,6,6
chr9	136081283	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=31,20;MFRL=121,100;MMQ=50,50;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:13,5:13,8:0|1:136081283_C_T:136081283:8,18,7,6
chr9	136081289	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=120,100;MMQ=49,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.333:37:13,5:12,6:0|1:136081283_C_T:136081283:9,16,6,6
chr9	136081829	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:6,5:3,2:6,4,3,4
chr9	136083638	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=112,139;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:16,4:5,5:6,15,1,8
chr9	136083693	.	TG	CC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=117,164;MMQ=58,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:6,1:1,10,1,1
chr9	136083801	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr9	136101557	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr9	136133380	.	CGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	136133506	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr9	136133531	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=272,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,10:1,9:0,1,12,8
chr9	136133582	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,13:0,3:0,0,11,6
chr9	136135096	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:136135096_A_G:136135096:0,0,5,0
chr9	136135108	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:136135096_A_G:136135096:0,0,4,1
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0,0,6,2
chr9	136135195	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,16:0,5:0,0,9,12
chr9	136135237	.	AT	GC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,5:0,0,13,9
chr9	136135365	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	136137607	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:16,0:4,4:1,19,0,4
chr9	136211248	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	136213382	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.352:14:3,0:3,0:0|1:136213382_A_C:136213382:2,7,5,0
chr9	136213387	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=97,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.310:16:4,2:4,1:0|1:136213382_A_C:136213382:4,7,5,0
chr9	136213393	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,2:5,0:0|1:136213382_A_C:136213382:6,11,4,0
chr9	136213396	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:12,0:6,0:0|1:136213382_A_C:136213382:8,12,3,0
chr9	136213479	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=109,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.160:39:15,2:18,3:15,18,2,4
chr9	136215996	.	G	GGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr9	136219062	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	136220799	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:4,2:3,11,1,1
chr9	136221903	.	A	AGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	136223043	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr9	136227144	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:12,1:8,10,2,0
chr9	136232758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	136234124	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,13,12
chr9	136260696	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr9	136262452	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,0:4,7:1,5,0,7
chr9	136269245	.	C	CTGGCACCTTGATCTTGGACTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.374:5:0,1:2,0:0,4,0,1
chr9	136276236	.	A	ACACACACACACAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=106,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:0|1:136276236_A_ACACACACACACAC:136276236:3,10,0,3
chr9	136276237	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=106,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,1:7,1:0|1:136276236_A_ACACACACACACAC:136276236:3,10,0,3
chr9	136289456	.	CTG	AAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:136289456_CTG_AAA:136289456:6,2,1,1
chr9	136289462	.	T	TTTCCCCAACCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:4,0:0|1:136289456_CTG_AAA:136289456:6,2,1,1
chr9	136298729	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:12,4,1,1
chr9	136311017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	136325160	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=554,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,8,0
chr9	136330413	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:5,4,3,0
chr9	136341606	.	A	ACTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	136343495	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,0:9,2:0|1:136343495_C_T:136343495:9,15,1,1
chr9	136343500	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.114:24:11,2:10,0:1|0:136343495_C_T:136343495:8,14,1,1
chr9	136343509	.	GC	CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=124,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:8,2:0|1:136343495_C_T:136343495:8,15,1,1
chr9	136385351	.	G	GC	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=84,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:16,2:0|1:136385351_G_GC:136385351:18,12,1,1
chr9	136385353	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=22,20;MFRL=84,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:0|1:136385351_G_GC:136385351:18,12,1,1
chr9	136385356	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=86,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:13,0:17,2:0|1:136385351_G_GC:136385351:18,13,1,1
chr9	136385357	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=86,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:13,0:17,2:0|1:136385351_G_GC:136385351:18,13,1,1
chr9	136385359	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=91,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,1:16,2:17,11,1,2
chr9	136385437	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr9	136385453	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr9	136401853	.	TGTTCCTGCTGGGCCTG	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:21,0:24,2:27,34,1,1
chr9	136409529	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,4,1
chr9	136409580	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=71,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:4,9:7,2:7,4,7,4
chr9	136412346	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr9	136421107	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=222,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr9	136426443	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr9	136433708	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,147;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,2:1,12:0,1,16,0
chr9	136439803	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	136507512	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:0|1:136507512_C_T:136507512:5,10,1,1
chr9	136507526	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0|1:136507512_C_T:136507512:2,9,1,1
chr9	136508772	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:136508772_T_TG:136508772:0,1,0,1
chr9	136508774	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:136508772_T_TG:136508772:0,1,0,1
chr9	136509312	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=275,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,4:1,9:1,0,9,4
chr9	136509370	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=166,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:5,4,3,6
chr9	136509451	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=140,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:1,4,4,5
chr9	136512992	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:136512992_G_A:136512992:5,2,1,1
chr9	136512994	.	T	TGTTTTACCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:136512992_G_A:136512992:5,2,1,1
chr9	136523477	.	A	AGCCTCAGTTTACCTCCTGCCCCCTTCCTTG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.275:34:8,2:10,3:8,13,7,6
chr9	136535677	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:7,7:4,6:6,6,6,7
chr9	136536876	.	C	CCTGGGCCCCCAGTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.359:3:2,0:0,1:0|1:136536876_C_CCTGGGCCCCCAGTG:136536876:1,1,0,1
chr9	136536880	.	G	GACTCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:136536876_C_CCTGGGCCCCCAGTG:136536876:1,1,0,1
chr9	136561467	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=88,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:0|1:136561467_A_G:136561467:11,16,1,1
chr9	136561481	.	G	GCCCC	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:136561467_A_G:136561467:8,15,1,1
chr9	136561554	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:136561554_G_A:136561554:0,3,0,1
chr9	136561565	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136561554_G_A:136561554:0,1,0,1
chr9	136561567	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136561554_G_A:136561554:0,1,0,1
chr9	136569974	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr9	136570004	.	GT	AC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.901:8:0,3:0,3:0,0,5,3
chr9	136578271	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,2,2
chr9	136594864	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:2,0,3,2
chr9	136596397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=76,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,2,1
chr9	136599315	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr9	136629277	.	TAAGCA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,0:1,3:0|1:136629277_TAAGCA_T:136629277:3,6,0,3
chr9	136629283	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,0:2,3:0|1:136629277_TAAGCA_T:136629277:3,6,0,3
chr9	136629298	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr9	136635409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr9	136635579	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=101,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:10,3:9,14,2,1
chr9	136637177	.	A	ACACACGGCCCCGGCGGTCACTGCGTGAGGGC	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=95.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,29:0.773:36:4,7:2,6:2,5,4,25
chr9	136640153	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=164,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:136640153_C_T:136640153:6,7,1,1
chr9	136640159	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:0|1:136640153_C_T:136640153:7,7,1,1
chr9	136640164	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:136640153_C_T:136640153:5,6,1,1
chr9	136640166	.	C	CCCA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:136640153_C_T:136640153:5,6,1,1
chr9	136640168	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:3,2:0|1:136640153_C_T:136640153:5,6,1,1
chr9	136640226	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr9	136641235	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr9	136641313	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	136645079	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=102,49;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:9,1:3,1:7,5,0,2
chr9	136648535	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	136648565	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr9	136648606	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=110,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr9	136648611	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,2:1,0,9,0
chr9	136648807	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:0,7,0,4
chr9	136652438	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:11,9,2,2
chr9	136652465	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr9	136675302	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=79,95;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,5:6,4:9,2,7,2
chr9	136804211	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,2:8,5:6,8,7,0
chr9	136898922	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	136905283	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=114,96;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:136905283_T_C:136905283:6,10,1,1
chr9	136905287	.	CTTG	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,96;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:8,2:0|1:136905283_T_C:136905283:8,10,1,1
chr9	136905295	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=116,96;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:136905283_T_C:136905283:8,7,1,1
chr9	136905304	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=117,96;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:7,0:9,1:0|1:136905283_T_C:136905283:10,6,1,1
chr9	136907108	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=96,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,8:5,1:2,6,0,9
chr9	137004907	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	137005734	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr9	137013582	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,333;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	137017051	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=201,30;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:6,2:1,6:7,1,5,3
chr9	137017079	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,0:6,3:14,4,1,2
chr9	137019511	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr9	137020995	.	A	AGCTAATTTTTTGTATCTTTAATAGAGAGGAGGTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,283;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137020995_A_AGCTAATTTTTTGTATCTTTAATAGAGAGGAGGTTT:137020995:0,0,0,1
chr9	137020999	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,283;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137020995_A_AGCTAATTTTTTGTATCTTTAATAGAGAGGAGGTTT:137020995:0,0,0,1
chr9	137021803	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr9	137218504	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:137218504_C_T:137218504:1,2,1,1
chr9	137218523	.	CGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=14,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0|1:137218504_C_T:137218504:1,2,1,1
chr9	137582724	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=88,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,9:5,4:4,2,7,6
chr9	137592961	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	137622038	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr9	137630568	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr9	137630587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr9	137655678	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=344,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr9	137658730	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	137659296	.	A	ACGTGTTCCTTCCTGGTCGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	137659300	.	T	TCCCAGTGTCCAGCGTGACTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	137674391	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	137674488	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,2:1,6:3,1,4,4
chr9	137674524	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.090:48:22,0:21,5:30,13,4,1
chr9	137674616	.	G	GAGATGCCTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr9	137681100	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:0,6,1,2
chr9	137687038	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,19:0,0,12,23
chr9	137688305	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.711:8:2,4:0,2:0,2,3,3
chr9	137688577	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr9	137688624	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:4,2:1,5:3,2,5,2
chr9	137688657	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:5,3:8,4,2,2
chr9	137688780	.	GCCTGTCCCCTCCAAAACCCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr9	137690318	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:4,11:9,5:6,7,6,10
chr9	137702200	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.477:19:2,3:6,6:0|1:137702200_G_C:137702200:3,7,3,6
chr9	137702209	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.555:16:3,4:4,4:0|1:137702200_G_C:137702200:1,6,3,6
chr9	137704620	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:9,8:4,5:0,13,1,12
chr9	137707925	.	T	TACTGGCTACTGGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:2,11,0,2
chr9	137707942	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0,5,1,4
chr9	137708803	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:2,1,5,1
chr9	137708934	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,5:5,5:2,4,5,5
chr9	137708960	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=95,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,6:3,4:2,4,4,6
chr9	137708973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,4:2,3:1,4,3,4
chr9	137709529	.	CCA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:2,3:6,0:7,3,3,0
chr9	137709795	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	137710961	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,2,1
chr9	137711997	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=211,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:2,1:2,7:2,2,5,4
chr9	137714027	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=248,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr9	137715150	.	AT	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	137715313	.	C	CAGAACCAATCCAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,2:7,0:4,6,1,1
chr9	137717610	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr9	137734232	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	137772599	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:6,2:2,4:8,0,5,1
chr9	137772643	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:14,0:15,5:14,16,0,5
chr9	137772664	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=212,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,34:0.923:36:1,16:1,17:0,2,12,22
chr9	137772792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr9	137775084	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,8,7
chr9	137775212	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr9	137777599	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:3,0:8,2:0|1:137777599_C_T:137777599:9,6,1,1
chr9	137777603	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:9,2:0|1:137777599_C_T:137777599:9,6,1,1
chr9	137779026	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr9	137779306	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	137801800	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr9	137803107	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,0:12,3:12,15,3,0
chr9	137803188	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	137804360	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=42,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,7:0,6:1,0,7,6
chr9	137804830	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr9	137806329	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:137806329_T_TC:137806329:0,0,0,2
chr9	137806334	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:137806329_T_TC:137806329:0,0,0,2
chr9	137806344	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137806329_T_TC:137806329:0,0,0,1
chr9	137806487	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr9	137968919	.	G	GAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,5:0,14:0,0,11,9
chr9	137968996	.	GCA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:5,0:6,3:4,7,2,1
chr9	137979983	.	G	GACATC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,1,1
chr9	137982220	.	A	ATGTG	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TG;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.301:13:5,2:2,0:4,5,1,3
chr9	137982232	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.601:10:3,3:1,2:1,3,2,4
chr9	137982234	.	G	GTT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.294:14:7,2:1,2:4,6,1,3
chr9	138236031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=132,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr9	138236051	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=99,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr9	138379992	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:5,1:18,3:11,12,3,1
chr9	138438189	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138438189_G_T:138438189:0,0,0,1
chr9	138438193	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138438189_G_T:138438189:0,0,0,1
chr9	138438919	.	GCA	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,21;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	138439005	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr9	138439086	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=116,136;MMQ=54,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,0,3
chr9	138439109	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=138,193;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:1,0:8,0:0|1:138439109_G_C:138439109:1,9,2,0
chr9	138439117	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=136,193;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:2,1:8,0:0|1:138439109_G_C:138439109:1,10,2,0
chr9	138439189	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:138439189_G_GC:138439189:0,0,0,2
chr9	138439190	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:138439189_G_GC:138439189:0,0,0,2
chr9	138439904	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	138440726	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:138440726_C_T:138440726:0,0,0,5
chr9	138440728	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:138440726_C_T:138440726:0,0,0,5
chr9	138440756	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,1179916;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	138441685	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=115,128;MMQ=36,45;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:2,0,5,4
chr9	138441760	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=123,158;MMQ=45,51;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,4:3,3:2,5,3,5
chr9	138441845	.	AGGGGCTCGCACCGGCTCCCT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr9	138453792	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:138453792_G_T:138453792:4,2,1,1
chr9	138453811	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:0,3:0|1:138453792_G_T:138453792:1,0,0,5
chr9	138454301	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,2:4,2:0,6,1,3
chr9	138454643	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,6:6,6:5,3,6,6
chr9	138516531	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=54,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,8:6,2:6,4,5,5
chr9	138516570	.	CTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=23,11;RU=T;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	138517853	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	138518114	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr9	138523411	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0|1:138523411_C_T:138523411:0,0,0,4
chr9	138523415	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:138523411_C_T:138523411:0,2,0,2
chr9	138523417	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:138523411_C_T:138523411:0,2,0,2
chr9	138523418	.	A	ATCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:138523411_C_T:138523411:0,2,0,2
chr9	138557150	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,68;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,0:6,4:6,5,1,3
chr9	138557254	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:138557254_T_C:138557254:0,2,0,1
chr9	138557256	.	C	T,CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31,31;MFRL=0,174,130;MMQ=60,60,60;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.69,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,0:0,2,1:0,0,0,3
chr9	138557258	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:138557254_T_C:138557254:0,2,0,1
chr9	138586309	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr9	138586854	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr9	138588359	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,0:0,2:0,0,6,0
chr9	138590138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr9	138590221	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:10,0:9,8,2,1
chr9	138590347	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:0,5:2,4:1,1,4,5
chr9	138591230	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr9	138594229	.	GCCCTCCCCACGCGGGGAGGCCCCGGTCTAACCTAAGACCCCCAAGTTCCCCCTCAGGCTCCCGCA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.152:21:1,0:10,3:4,13,2,2
chr9	138594266	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr9	138647041	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:0,2:0|1:138647041_C_CT:138647041:0,3,1,1
chr9	138647043	.	GA	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:138647041_C_CT:138647041:0,2,1,1
chr9	138656783	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	138656838	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr9	138657053	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,2:2,0:3,1,2,1
chr9	138676476	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:138676476_T_C:138676476:2,12,1,1
chr9	138676490	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=165,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:138676476_T_C:138676476:2,8,1,1
chr9	138678168	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:138678168_G_C:138678168:0,3,0,1
chr9	138678176	.	T	TTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:138678168_G_C:138678168:0,3,0,1
chr9	138678177	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:138678168_G_C:138678168:0,3,0,1
chr9	138678179	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:138678168_G_C:138678168:0,2,0,1
chr9	138678184	.	C	CCAAGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:138678168_G_C:138678168:0,2,0,1
chr9	138679911	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:2,2,5,1
chr9	138707727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr9	138710152	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr9	138715095	.	T	TGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=G;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:6,2:4,0:0|1:138715095_T_TGG:138715095:3,7,1,1
chr9	138715099	.	A	AAATATTAATTAAGCTGTCTCTTTTTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:0|1:138715095_T_TGG:138715095:3,7,1,1
chr9	138715195	.	AA	GG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	138715935	.	A	ATAAAAGCACCAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=87,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0|1:138715935_A_ATAAAAGCACCAAT:138715935:1,6,0,2
chr9	138715938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=87,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:138715935_A_ATAAAAGCACCAAT:138715935:1,6,0,2
chr9	138773632	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=106,190;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:4,6,2,0
chr9	138831422	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=0,78;MMQ=46,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0|1:138831422_T_A:138831422:1,2,1,1
chr9	138831426	.	CACAG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=0,78;MMQ=39,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:1,2:0|1:138831422_T_A:138831422:2,2,1,1
chr9	138836941	.	GCCT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,2:5,2,3,2
chr9	138837113	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,280;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr9	138847184	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,0:12,3:8,9,2,1
chr9	138852789	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr9	138852814	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr9	138903635	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:0,2,2,4
chr9	138903671	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,1:1,1:3,5,1,1
chr9	138908250	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:4,9,1,3
chr9	139008803	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	139100726	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:4,3:12,0:8,8,2,1
chr9	139101134	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.114:25:13,2:7,0:0|1:139101134_G_T:139101134:10,13,1,1
chr9	139101142	.	G	GAATATCTTCACATAAAAACTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,2:6,0:0|1:139101134_G_T:139101134:9,13,1,1
chr9	139108359	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr9	139108591	.	G	GGGTTCA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=126,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr9	139108607	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108612	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108613	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108619	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108623	.	CACCG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,30;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108631	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139108633	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139108607_A_G:139108607:0,1,0,1
chr9	139113734	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=94,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:10,0:12,4:12,10,2,2
chr9	139230585	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	139232452	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr9	139235481	.	TC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:1,7:0,12:0,1,14,10
chr9	139244287	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=252,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:139244287_C_CAG:139244287:0,1,0,1
chr9	139244290	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=252,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139244287_C_CAG:139244287:0,1,0,1
chr9	139244294	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=252,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139244287_C_CAG:139244287:0,1,0,1
chr9	139244299	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=252,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139244287_C_CAG:139244287:0,1,0,1
chr9	139252413	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	139257411	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,9,2
chr9	139257422	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,13,7
chr9	139261991	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139265950	.	A	ACACAGCTAGAGGGTACG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.317:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr9	139273288	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,3:4,1:8,1,1,3
chr9	139273790	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr9	139273825	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:139273825_C_CT:139273825:0,3,0,1
chr9	139273827	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:139273825_C_CT:139273825:0,3,0,1
chr9	139275294	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,4:0,3,3,7
chr9	139276680	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:5,1,4,1
chr9	139281845	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=85,170;MMQ=56,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:139281845_GC_G:139281845:2,0,1,0
chr9	139281847	.	T	A,C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,15,32;MFRL=0,170,85;MMQ=60,60,56;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,1:0,0,1:0,0,3,0
chr9	139281850	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,17;MFRL=85,170;MMQ=56,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:139281845_GC_G:139281845:2,0,1,0
chr9	139281857	.	CC	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:139281845_GC_G:139281845:1,0,1,0
chr9	139281938	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:6,0:10,2:8,8,2,0
chr9	139288682	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=118,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,2:4,6:0|1:139288682_C_CT:139288682:3,3,2,6
chr9	139288688	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,2:4,7:0|1:139288682_C_CT:139288682:4,3,3,6
chr9	139288692	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:3,2:4,7:0|1:139288682_C_CT:139288682:4,4,3,6
chr9	139290011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,1,1
chr9	139290251	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:2,2,0,5
chr9	139298665	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:19,0:9,3:12,17,2,2
chr9	139298678	.	A	AGAGT	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:14,0:11,3:0|1:139298678_A_AGAGT:139298678:10,19,2,1
chr9	139298681	.	T	TGGGGTGGGAACGGGCACA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:14,0:10,3:0|1:139298678_A_AGAGT:139298678:8,18,2,1
chr9	139298732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,2:0,3,1,5
chr9	139299637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,123;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:4,7,2,7
chr9	139301583	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,10:4,3:8,1,9,4
chr9	139302049	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,2:5,6:0,6,0,8
chr9	139302094	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr9	139302311	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:5,6,2,1
chr9	139307194	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:5,4:3,6:7,1,6,4
chr9	139313403	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,1,3
chr9	139324265	.	GAGGAGGAGGGGGCGTTAGGAGGGCACCCAGGGCC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.435:5:1,2:0,0:0|1:139324265_GAGGAGGAGGGGGCGTTAGGAGGGCACCCAGGGCC_G:139324265:1,2,2,0
chr9	139324279	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.314:4:1,1:1,0:1|0:139324265_GAGGAGGAGGGGGCGTTAGGAGGGCACCCAGGGCC_G:139324265:2,1,0,1
chr9	139324740	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:3,4,3,4
chr9	139325641	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,2:1,3,1,2
chr9	139327439	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=83,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,5:6,1:0|1:139327439_A_G:139327439:5,7,3,3
chr9	139327449	.	A	AGGAGCTC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:7,0:0|1:139327439_A_G:139327439:8,10,1,1
chr9	139328551	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=64,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,0:1,1,0,3
chr9	139333049	.	GCCCT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCT;STR;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr9	139336269	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=109,245;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:4,0:4,6,1,1
chr9	139341529	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr9	139341543	.	C	CTTAACATAGCTAAAGGAGGGCAAAGAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,0,2
chr9	139342115	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=103,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr9	139354634	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.197:20:6,0:9,2:1,15,0,4
chr9	139357678	.	G	GCCATCAAATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139357678_G_GCCATCAAATT:139357678:0,1,0,1
chr9	139357682	.	G	GGCCTCTTCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139357678_G_GCCATCAAATT:139357678:0,1,0,1
chr9	139357685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139357678_G_GCCATCAAATT:139357678:0,1,0,1
chr9	139358059	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:5,9:4,10:6,3,8,11
chr9	139360354	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr9	139360808	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:9,2:14,2:10,13,2,2
chr9	139371234	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:8,5:2,2:4,6,5,3
chr9	139379644	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,55;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:12,7,1,1
chr9	139379656	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=137,55;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:139379656_C_A:139379656:8,9,1,1
chr9	139379659	.	C	CGCTCTGCACCCTCCGCGGAAGGAGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,55;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:139379656_C_A:139379656:8,9,1,1
chr9	139380086	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,501;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:9,5:17,0:11,16,0,5
chr9	139393442	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:2,4:7,5:2,7,4,5
chr9	139396408	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,4:1,5:1,1,6,4
chr9	139396733	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:4,0:1,2:6,2,2,0
chr9	139400134	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:12,2:0|1:139400134_G_A:139400134:14,12,1,1
chr9	139400138	.	C	CATCTATCT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:11,2:0|1:139400134_G_A:139400134:14,12,1,1
chr9	139401504	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:0,6,0,10
chr9	139402663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,5:6,2:5,2,5,2
chr9	139402908	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr9	139403268	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,4:0,0:1,0,3,1
chr9	139403554	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	139405093	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,0:3,3:8,2,2,1
chr9	139405261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:5,3:2,2:0,7,2,4
chr9	139408892	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr9	139410177	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,27;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.539:4:0,1:0,1:0,2,0,2
chr9	139410424	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr9	139411622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	139411714	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.477:15:1,5:5,2:7,1,6,1
chr9	139411880	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr9	139412197	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr9	139418260	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,36:0,18:0,0,28,27
chr9	139564474	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr9	139566823	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr9	139571366	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139571366_G_C:139571366:0,0,1,0
chr9	139571369	.	CAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139571366_G_C:139571366:0,0,1,0
chr9	139571377	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139571366_G_C:139571366:0,0,1,0
chr9	139572068	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr9	139639532	.	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	139639725	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:0|1:139639725_G_T:139639725:5,15,1,1
chr9	139639729	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=109,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,2:8,0:0|1:139639725_G_T:139639725:5,13,1,1
chr9	139642961	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr9	139649580	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,12:0,0,9,9
chr9	139650060	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	139656618	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	139656706	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=111,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.526:38:12,14:6,6:9,9,12,8
chr9	139658051	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=205,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr9	139685722	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	139686289	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:2,3:1,2:1,3,2,3
chr9	139686357	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=192,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,7:6,3:5,3,7,3
chr9	139686556	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,1:1,2:1,1,2,2
chr9	139687415	.	TG	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=232,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	139690738	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:0,5:4,3:3,1,6,3
chr9	139690840	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=83,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:8,6:12,8:10,10,7,7
chr9	139694997	.	G	GATCACTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:139694997_G_GATCACTT:139694997:0,2,0,1
chr9	139694998	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:139694997_G_GATCACTT:139694997:0,2,0,1
chr9	139697061	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=71,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:2,1:2,1,3,0
chr9	139697116	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=110,124;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,7:8,0:8,7,7,0
chr9	139699190	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=97,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:2,0:3,0:2,5,2,0
chr9	139699964	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	139701983	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	139723795	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,6:1,0:7,0,6,0
chr9	139724041	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,0:3,8:0,4,0,8
chr9	139726210	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:0|1:139726210_C_T:139726210:13,10,1,1
chr9	139726216	.	C	CTAACTGATCAATATACTTTGTA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:139726210_C_T:139726210:12,10,1,1
chr9	139726239	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr9	139726722	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=75,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,3:5,0:8,6,1,2
chr9	139730129	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr9	139730220	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,0:12,3:11,8,2,1
chr9	139731531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,236;MMQ=52,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	139746992	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	139749067	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr9	139754579	.	G	GCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr9	139757057	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139757057_G_T:139757057:0,0,0,1
chr9	139757060	.	G	GGCATGGACTTGAGGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139757057_G_T:139757057:0,0,0,1
chr9	139757063	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139757057_G_T:139757057:0,0,0,1
chr9	139757066	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139757057_G_T:139757057:0,0,0,1
chr9	139758418	.	C	CCCACCAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139758418_C_CCCACCAAA:139758418:0,1,0,1
chr9	139758419	.	T	TTATCCATAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139758418_C_CCCACCAAA:139758418:0,1,0,1
chr9	139804274	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,5,0
chr9	139804346	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,10,5
chr9	139820421	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	139837990	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr9	139839904	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=294,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.965:55:1,28:0,22:1,0,24,30
chr9	139839918	.	TTGGGGGGGGTAGAGGGAGGCAGGTAGAAGTTGTGGGAGGGGTAGAGGGAGACAGGTAGAAGTTGTTGCGGGGGAGAGGGAAGCAGGTGAAGTTG	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=122,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.069:53:15,7:12,1:21,22,4,6
chr9	139840471	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,6:0,0,13,13
chr9	139840859	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr9	139841056	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=94,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:7,0:13,4:9,11,0,4
chr9	139846836	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:139846836_C_T:139846836:1,5,1,1
chr9	139846844	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:139846836_C_T:139846836:0,5,0,1
chr9	139847268	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr9	139847312	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:1,0:1,1:1,2,1,0
chr9	139847570	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr9	139848273	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:139848273_A_G:139848273:0,0,5,4
chr9	139848278	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:139848273_A_G:139848273:0,0,5,4
chr9	139864524	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:139864524_C_T:139864524:8,16,1,1
chr9	139864531	.	G	GATGGAT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:11,2:0|1:139864524_C_T:139864524:7,16,1,1
chr9	139864535	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:139864524_C_T:139864524:7,14,1,1
chr9	139864539	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:0|1:139864524_C_T:139864524:6,12,1,1
chr9	139865569	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr9	139865577	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0|1:139865577_T_C:139865577:0,7,0,2
chr9	139865580	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:0|1:139865577_T_C:139865577:0,7,0,2
chr9	139865602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr9	139875318	.	C	CCATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CATT;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.843:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr9	139878828	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr9	139879067	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,10:0,4:0,1,1,13
chr9	139879113	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr9	139887042	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr9	139887251	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr9	139887621	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139887621_A_T:139887621:1,3,0,1
chr9	139887623	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139887621_A_T:139887621:1,3,0,1
chr9	139889355	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:139889355_T_C:139889355:0,1,1,0
chr9	139889359	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139889355_T_C:139889355:0,1,1,0
chr9	139889363	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139889355_T_C:139889355:0,1,1,0
chr9	139889367	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:139889355_T_C:139889355:0,1,1,0
chr9	139890105	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:5,2:9,4:9,6,5,1
chr9	139902786	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	139902797	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	139903086	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=150,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:139903086_C_T:139903086:3,0,1,0
chr9	139903092	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=149,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:139903086_C_T:139903086:4,0,1,0
chr9	139903352	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	139903876	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=255,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139903876_A_T:139903876:1,0,0,1
chr9	139903884	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=161,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139903876_A_T:139903876:1,0,0,1
chr9	139904197	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=22,12;MFRL=112,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.394:15:4,0:3,0:0|1:139904197_A_C:139904197:2,7,6,0
chr9	139904204	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.304:17:5,1:5,0:0|1:139904197_A_C:139904197:4,8,5,0
chr9	139904208	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,0:6,0:0|1:139904197_A_C:139904197:4,8,4,0
chr9	139905355	.	C	CAACATGTATTATTACAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	139906513	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr9	139906686	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr9	139908265	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr9	139909185	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:8,6,4,1
chr9	139910648	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr9	139912178	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr9	139912484	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,7,8
chr9	139916485	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:139916485_GT_G:139916485:0,0,3,2
chr9	139916488	.	TGGGGGGC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,0:0|1:139916485_GT_G:139916485:0,0,3,2
chr9	139918425	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,289;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,3:7,0:2,8,3,0
chr9	139927778	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=235,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	139929558	.	G	GACTTACAGTGGCCCAGAGGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	139937795	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,5:0,15:0|1:139937795_T_C:139937795:0,0,9,13
chr9	139937799	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,4:0,13:0|1:139937795_T_C:139937795:0,0,8,12
chr9	139944312	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.739:10:0,3:2,1:1,1,3,5
chr9	139944496	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,7:0,11:0|1:139944496_T_C:139944496:0,0,12,10
chr9	139944509	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=75,70;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,26:0.845:30:1,10:3,13:0|1:139944496_T_C:139944496:3,1,12,14
chr9	139945051	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	139945566	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr9	139946804	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr9	139960178	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,7:0,1,1,10
chr9	139960894	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr9	139973186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr9	139973582	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:10,3:9,11,2,1
chr9	139973614	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,4:7,3:1,7,2,5
chr9	139973629	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0|1:139973629_A_C:139973629:0,0,2,11
chr9	139973652	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:139973629_A_C:139973629:0,0,7,10
chr9	139975108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr9	139975195	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:7,2,2,1
chr9	139977195	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr9	139990906	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr9	139994102	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr9	140001341	.	G	GAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	140001629	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:7,0,2,0
chr9	140001978	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr9	140002501	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	140002754	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr9	140002989	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr9	140006202	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.350:41:12,8:14,6:11,16,4,10
chr9	140006255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,4:6,0:7,12,0,4
chr9	140006288	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:11,4:3,0:1,13,0,4
chr9	140006491	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,2:2,5:2,6,3,4
chr9	140007521	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:140007521_C_T:140007521:7,6,1,1
chr9	140007527	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:140007521_C_T:140007521:5,8,1,1
chr9	140007530	.	G	GTGCCCGCTGCAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:140007521_C_T:140007521:5,9,1,1
chr9	140008934	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:8,3,2,5
chr9	140034286	.	C	CTCCTTGGCACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:0,0:0|1:140034286_C_CTCCTTGGCACA:140034286:0,2,0,1
chr9	140034289	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:140034286_C_CTCCTTGGCACA:140034286:0,2,0,1
chr9	140034294	.	C	CCCTCAGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140034294_C_CCCTCAGTTTT:140034294:0,1,0,1
chr9	140034296	.	G	GTTTGAAAGATTATCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140034294_C_CCCTCAGTTTT:140034294:0,1,0,1
chr9	140040156	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,1:0,4:0,0,6,2
chr9	140051041	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,0:1,5:1,1,5,0
chr9	140055703	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:9,6:2,4:8,4,6,4
chr9	140055876	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,8:0,0,10,11
chr9	140063440	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=224,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr9	140074578	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:7,1,6,0
chr9	140074888	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=159,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:6,10,0,2
chr9	140075181	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr9	140076325	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140076325_G_A:140076325:0,3,0,1
chr9	140076332	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:140076325_G_A:140076325:0,3,0,1
chr9	140077729	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,3:9,6:6,9,4,5
chr9	140080583	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr9	140083320	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	140084376	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,3:6,8:1,7,1,10
chr9	140094359	.	TCGGGGTCCCGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:140094359_TCGGGGTCCCGG_T:140094359:1,3,0,1
chr9	140094377	.	GG	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:140094359_TCGGGGTCCCGG_T:140094359:1,3,0,1
chr9	140094382	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140094359_TCGGGGTCCCGG_T:140094359:0,1,0,1
chr9	140106930	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:6,1,3,0
chr9	140107113	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=209,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr9	140108915	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0,0,5,10
chr9	140110274	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,2,5
chr9	140115482	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.134:44:18,0:15,0:25,13,0,6
chr9	140115491	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.136:46:20,1:14,0:26,14,0,6
chr9	140115496	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.164:41:11,1:11,0:21,13,0,7
chr9	140115501	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.145:37:18,1:10,0:18,13,0,6
chr9	140137817	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=156,120;MMQ=40,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:8,4:15,0:10,14,1,3
chr9	140139600	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:4,5,1,1
chr9	140139628	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:140139628_G_A:140139628:2,1,0,1
chr9	140139629	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:140139628_G_A:140139628:2,1,0,1
chr9	140139633	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=164,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:140139628_G_A:140139628:3,1,0,1
chr9	140139757	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr9	140146296	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr9	140146488	.	G	GGTAAGACTCCTGTCTCAAAAAAAAAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:9,4:13,0:12,10,2,2
chr9	140147094	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,1:4,0,4,0
chr9	140157429	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr9	140157460	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:1,6:1,3:2,1,6,3
chr9	140157701	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr9	140158708	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=91,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,1:6,2:6,8,2,1
chr9	140158871	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	140161334	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:3,0,4,0
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:1,2:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:5,0,4,0
chr9	140161871	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr9	140174821	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,3:15,1:17,13,2,2
chr9	140202194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	140245557	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=114,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,2:0|1:140245557_C_A:140245557:9,8,0,2
chr9	140245560	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=114,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:140245557_C_A:140245557:9,8,0,2
chr9	140245562	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=114,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:140245557_C_A:140245557:9,8,0,2
chr9	140245815	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:6,0:9,4:9,7,4,0
chr9	140246050	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr9	140249253	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	140250633	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	140250903	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=226,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140250903_C_CA:140250903:0,1,0,1
chr9	140250905	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=226,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140250903_C_CA:140250903:0,1,0,1
chr9	140250909	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,27;MFRL=101,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:140250909_T_A:140250909:0,1,0,1
chr9	140250916	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140250909_T_A:140250909:0,0,0,1
chr9	140250917	.	ACC	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140250909_T_A:140250909:0,0,0,1
chr9	140250921	.	C	CCCGTAG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140250909_T_A:140250909:0,0,0,1
chr9	140277826	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=61,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,6:7,3:8,3,3,6
chr9	140289696	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:3,1:1,3,0,3
chr9	140318169	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	140320617	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,3,1
chr9	140320763	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.185:30:11,0:13,5:10,15,1,4
chr9	140325631	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,167;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:5,3,0,2
chr9	140327493	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,5:9,0:4,9,5,0
chr9	140329618	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr9	140330569	.	A	ATTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:10,6,1,1
chr9	140331833	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr9	140344315	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=149,285;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:9,2,3,0
chr9	140346922	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,1:2,2:0|1:140346922_A_C:140346922:1,5,5,0
chr9	140346927	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,1:2,1:0|1:140346922_A_C:140346922:3,5,5,0
chr9	140346933	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,0:0|1:140346922_A_C:140346922:3,5,2,0
chr9	140346939	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=97,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.251:9:4,0:2,0:2,5,2,0
chr9	140348820	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=124,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.208:19:6,1:4,0:0|1:140348820_A_C:140348820:4,11,4,0
chr9	140348829	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,0:0|1:140348820_A_C:140348820:7,12,2,0
chr9	140351947	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.520:30:5,0:9,12:3,11,0,16
chr9	140356765	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,40;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,0:11,3:8,12,0,3
chr9	140358903	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:3,9,0,3
chr9	140361847	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,6:5,5:3,6,6,5
chr9	140379136	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:4,3:11,0:6,10,1,3
chr9	140387452	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,5:6,0:8,2,0,6
chr9	140392494	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr9	140395309	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,0:3,4:2,6,2,2
chr9	140396212	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.391:33:10,3:10,8:11,9,5,8
chr9	140399983	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	140400262	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:140400262_C_T:140400262:0,2,1,1
chr9	140400271	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:140400262_C_T:140400262:0,3,1,1
chr9	140400275	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1|0:140400262_C_T:140400262:1,2,0,2
chr9	140441915	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,0:5,5:2,6,0,5
chr9	140446919	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=171,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.134:21:6,0:9,2:0|1:140446919_A_T:140446919:7,12,1,1
chr9	140446924	.	TACCCCAGGAACTTCCTGCGCTAGCTGGGCGGGGGAGGGGCGGCCTGCCCTCATCTCATTTCTATTAAACGCCTTTGCCAGCTATACG	T	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:6,0:9,2:0|1:140446919_A_T:140446919:25,29,1,1
chr9	140447016	.	T	TCTG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:140446919_A_T:140446919:11,13,1,1
chr9	140477349	.	CCCCGCGGTGGAGGGCAAGATCCCAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=96,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:0,1:3,1,1,2
chr9	140477533	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,2:12,1:15,11,0,3
chr9	140509361	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:10,3:14,6,1,2
chr9	140510658	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=240,278;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140510658_A_T:140510658:0,1,0,1
chr9	140510664	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=240,278;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140510658_A_T:140510658:0,1,0,1
chr9	140510666	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=240,278;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140510658_A_T:140510658:0,1,0,1
chr9	140605334	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	140605355	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,4,3
chr9	140622895	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:13,6:9,6:13,9,9,3
chr9	140669772	.	C	CCTATCTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=201,101;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140669772_C_CCTATCTT:140669772:0,2,0,1
chr9	140669777	.	C	CTTACTCTGTTTCCTTGCCTGCCTGCCTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=201,101;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	140669779	.	T	TAACTGGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=135,233;MMQ=59,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1|0:140669772_C_CCTATCTT:140669772:0,2,0,1
chr9	140686492	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:8,11,2,1
chr9	140695459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:8,0:0,2:3,5,0,2
chr9	140707681	.	G	GGCCAATATTAAGTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=290,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr9	140711795	.	T	TCCCAGTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:140711795_T_TCCCAGTG:140711795:3,0,1,1
chr9	140711798	.	T	TGCACCCCACCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,1:0|1:140711795_T_TCCCAGTG:140711795:3,0,1,1
chr9	140711799	.	T	TCCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140711795_T_TCCCAGTG:140711795:3,0,0,1
chr9	140773451	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:5,0:7,3,1,1
chr9	140777370	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=91,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.887:15:1,10:0,4:1,0,3,11
chr9	140777432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,0:3,4:0,8,0,4
chr9	140809047	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr9	140811899	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=102,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr9	140878566	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,2:4,8:5,2,8,2
chr9	140881070	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=223,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,1,2
chr9	140938183	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,3,2
chr9	140943642	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,7:4,1:7,4,5,3
chr9	140997349	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr9	141000226	.	A	AAAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:141000226_A_AAAC:141000226:4,1,1,1
chr9	141000230	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:141000226_A_AAAC:141000226:4,1,1,1
chr9	141008876	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,4,3
chr9	141009015	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=209,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	141010061	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,78;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:10,0:17,6:13,14,0,6
chr9	141013012	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr9	141015019	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr9	141015351	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr9	141016262	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr9	141107536	.	GGCAGCAGCAGCAGCA	G,GGCA,GGCAGCAGCAGCAGCAGCA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=25,30,28,28;MFRL=106,130,129,96;MMQ=60,47,48,40;MPOS=25,25,20;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,7,8,13;RU=GCA;STR;TLOD=7.50,22.80,38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,4,11,17:0.076,0.187,0.424:44:7,2,6,8:5,2,5,7:8,4,14,18
chr9	141111336	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=159,125;MMQ=52,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr10	93732	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=132,168;MMQ=60,30;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:8,8,2,0
chr10	93744	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=122,168;MMQ=49,30;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:8,5,2,0
chr10	93945	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=135,147;MMQ=24,36;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,4:9,1:6,4,5,0
chr10	93978	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=147,132;MMQ=37,24;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:9,2:12,5:11,10,5,2
chr10	94026	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=42,146;MMQ=23,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,9:0.138:70:43,3:16,6:10,51,4,5
chr10	94083	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=142,156;MMQ=40,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:1,2,1,7
chr10	94136	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	94545	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,112;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,9:0,0,10,6
chr10	94864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr10	94870	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,35;MFRL=122,182;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:94870_A_G:94870:1,3,0,1
chr10	94872	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,35;MFRL=122,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:94870_A_G:94870:1,3,0,1
chr10	95074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=174,171;MMQ=49,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.290:11:1,1:7,1:0|1:95074_G_A:95074:8,0,3,0
chr10	95096	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,174;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,10:0.733:13:1,2:2,8:1|0:95074_G_A:95074:3,0,10,0
chr10	95226	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=95,132;MMQ=27,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=122.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,29:0.909:31:0,14:2,15:0|1:95226_A_T:95226:2,0,10,19
chr10	95229	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=95,132;MMQ=27,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=122.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,29:0.909:31:0,12:2,12:0|1:95226_A_T:95226:2,0,10,19
chr10	95237	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=28,22;MFRL=137,95;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:95237_G_T:95237:8,18,2,0
chr10	95258	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=23,30;MFRL=141,112;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:11,2:0|1:95237_G_T:95237:2,17,1,1
chr10	95261	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=151,112;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:95237_G_T:95237:1,17,1,1
chr10	95263	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=153,112;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:95237_G_T:95237:0,17,1,1
chr10	95289	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=162,142;MMQ=60,32;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:1,11,0,2
chr10	282897	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=71.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,19:0,8:0,0,10,17
chr10	285479	.	G	GTGTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.940:12:0,10:0,0:0,0,3,9
chr10	292927	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr10	293374	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,2:20,0:14,17,0,2
chr10	294354	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,105;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:8,10,3,0
chr10	294953	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,19,19
chr10	329182	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.490:14:5,1:2,6:0|1:329182_TG_T:329182:5,2,4,3
chr10	329188	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=161,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,8:0.499:16:2,5:6,2:1|0:329182_TG_T:329182:5,3,5,3
chr10	329191	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=161,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,9:0.525:17:2,6:6,3:1|0:329182_TG_T:329182:5,3,5,4
chr10	332154	.	G	GTCCGAGACCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,33;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,0:3,2,1,1
chr10	334476	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:334476_T_TG:334476:0,1,0,1
chr10	334480	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:334476_T_TG:334476:0,1,0,1
chr10	334483	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:334476_T_TG:334476:0,1,0,1
chr10	370977	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	371001	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	375570	.	GGGAGCTCAGCAAGGCT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGCTCAGCAAGGCT;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.653:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	387060	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	387174	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:7,3:7,0:8,6,3,1
chr10	394714	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr10	395266	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr10	395463	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	402468	.	AGGATCAGGCTGTGCGGTT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=73,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:3,0:7,7,1,1
chr10	402500	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=64,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:9,0:0,2:0|1:402500_C_T:402500:4,6,1,1
chr10	402504	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=65,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:1,2:0|1:402500_C_T:402500:4,7,1,1
chr10	402506	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=64,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:0|1:402500_C_T:402500:3,7,1,1
chr10	410502	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=95,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:4,9,1,2
chr10	410825	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	411023	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:411023_C_T:411023:4,11,1,1
chr10	411030	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:3,2:0|1:411023_C_T:411023:4,11,1,1
chr10	411031	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:411023_C_T:411023:3,11,1,1
chr10	411034	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,0:3,1:0|1:411023_C_T:411023:3,10,1,1
chr10	412150	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:11,3,4,0
chr10	412179	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,0:9,4:13,7,4,0
chr10	412449	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=211,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	428503	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	435880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr10	436743	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.445:25:7,0:6,11:0|1:436743_T_C:436743:6,8,0,11
chr10	436746	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:5,0:6,11:0|1:436743_T_C:436743:6,7,0,11
chr10	436848	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr10	444997	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:2,1,2,2
chr10	459940	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:3,6:11,1:8,6,2,5
chr10	461810	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,3:5,0:8,12,0,3
chr10	461912	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=95,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr10	468748	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	518547	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr10	530644	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:530644_G_A:530644:0,0,1,0
chr10	530653	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:530644_G_A:530644:0,0,1,0
chr10	708932	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,14:0.287:50:24,0:12,14:7,29,0,14
chr10	860917	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:6,8,2,1
chr10	861110	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	863889	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr10	863923	.	C	CTGAACTCTAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	875287	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr10	910013	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,329;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:4,8:6,0:10,1,9,0
chr10	910225	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=94,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:2,4,3,6
chr10	930548	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:930548_G_A:930548:0,1,0,1
chr10	930550	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:930548_G_A:930548:0,1,0,1
chr10	930552	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:930548_G_A:930548:0,1,0,1
chr10	1042023	.	A	AAAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0,0,13,13
chr10	1043058	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	1046712	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=106,84;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:3,4:9,3:8,4,4,3
chr10	1046851	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=96,44;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,2:19,0:13,19,2,0
chr10	1047035	.	A	ATTCCTTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:1,1:0|1:1047035_A_ATTCCTTC:1047035:0,5,0,2
chr10	1047038	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:1047035_A_ATTCCTTC:1047035:0,5,0,2
chr10	1047040	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:1047035_A_ATTCCTTC:1047035:0,5,0,2
chr10	1055055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr10	1056503	.	TATAGTAGTATTGCTGGAAG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,0:9,2:5,11,1,1
chr10	1068802	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=108,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr10	1070461	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=74,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	1094762	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:7,5,2,1
chr10	1132411	.	G	GTTTAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr10	1142032	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=104,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,0:10,2,3,0
chr10	1142208	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr10	1262872	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	1577067	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr10	1577218	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=98,133;MMQ=33,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:3,8:19,5:1,21,3,10
chr10	1779349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:1,2,1,2
chr10	3109784	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:5,0:0|1:3109784_C_G:3109784:8,3,1,1
chr10	3109786	.	C	CAGAGCTCACCAAGACCCTGGATGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=112,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:7,0:0|1:3109784_C_G:3109784:8,3,1,1
chr10	3124516	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr10	3141616	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=167,167;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:17,0:7,4:0,24,0,4
chr10	3141637	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=217,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr10	3143283	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=253,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	3143643	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,8,14
chr10	3143673	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,2:9,8:10,8,6,4
chr10	3145885	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:6,0,5,2
chr10	3145906	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,1:2,8:10,0,5,4
chr10	3146180	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,0:5,6:0,6,1,5
chr10	3147501	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:0|1:3147501_C_T:3147501:5,1,2,1
chr10	3147508	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:3147501_C_T:3147501:0,0,9,4
chr10	3147518	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.505:14:5,2:2,5:0|1:3147501_C_T:3147501:4,3,5,2
chr10	3147654	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,0:12,4:13,13,3,1
chr10	3154339	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,5:0,3:2,1,6,2
chr10	3154534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,2,11
chr10	3155217	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	3155237	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	3155263	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr10	3155408	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=184,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:3,2,3,1
chr10	3155428	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:3,3,3,3
chr10	3155540	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.547:24:5,4:4,9:10,1,8,5
chr10	3155753	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	3160913	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,16:0.607:26:5,7:5,7:0|1:3160913_G_A:3160913:7,3,10,6
chr10	3160917	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,18:0.623:28:5,10:4,7:0|1:3160913_G_A:3160913:7,3,11,7
chr10	3161131	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:0,4,0,8
chr10	3161148	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=226,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0,4,0,8
chr10	3162033	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,1:0,3:3,1,3,1
chr10	3167465	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	3174499	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr10	3177969	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=105,134;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:17,7:16,0:19,16,7,0
chr10	3178017	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:9,5:12,14:9,12,10,9
chr10	3178076	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,1,6
chr10	3179663	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=87,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:1,1,6,2
chr10	3179842	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:1,3,0,5
chr10	3181003	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:2,6,8,5
chr10	3181282	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	3183747	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,9:6,3:4,3,10,2
chr10	3185798	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:2,3,4,6
chr10	3186458	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,4:5,7:6,4,8,3
chr10	3187749	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,4:3,3:3,0,8,0
chr10	3187924	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,1:4,5:1,3,1,5
chr10	3189380	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:1,11:7,3:3,5,6,8
chr10	3190265	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.751:38:4,12:5,16:4,5,16,13
chr10	3190298	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:1,7:4,11:1,4,6,12
chr10	3193430	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:24,0:10,2:0|1:3193430_C_T:3193430:15,19,2,0
chr10	3193439	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:22,0:9,1:0|1:3193430_C_T:3193430:15,18,2,0
chr10	3193467	.	A	ATAGCAGCT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=119,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:24,0:16,2:23,20,1,1
chr10	3199555	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	3200164	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=73,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:3200164_C_T:3200164:1,0,1,0
chr10	3200174	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=73,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:0|1:3200164_C_T:3200164:2,1,1,0
chr10	3200249	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=98,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:6,8:6,3:9,3,7,4
chr10	3201010	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,1:2,3:4,0,4,1
chr10	3201097	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:4,6:4,11:4,4,11,6
chr10	3201252	.	G	GAA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:19,1:24,1:21,24,0,2
chr10	3202140	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:1,9:3,3:1,3,8,4
chr10	3205851	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr10	3206027	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,4:4,6:4,3,7,4
chr10	3208557	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=98,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:4,1,5,1
chr10	3208581	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0|1:3208581_G_GA:3208581:3,4,2,1
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0|1:3208581_G_GA:3208581:3,4,2,1
chr10	3214995	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,3:2,5:2,2,3,6
chr10	3823906	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,19:0.323:58:20,11:19,5:21,18,10,9
chr10	3824426	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3824426_G_GA:3824426:0,0,0,1
chr10	3824429	.	G	GTTCCTCGGAGCTGTCAGAGGATTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3824426_G_GA:3824426:0,0,0,1
chr10	4868445	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	4868565	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=85,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.643:11:0,3:2,4:1,3,4,3
chr10	4872886	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.159:48:19,7:22,0:19,22,7,0
chr10	4872930	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=111,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.260:43:13,5:19,5:18,14,4,7
chr10	4873106	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=108,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,2:3,3:0,6,0,5
chr10	4877814	.	T	TTTTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=99,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:6,5:1,3:5,2,8,1
chr10	4884784	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	4889525	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr10	4889732	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.511:41:13,19:7,2:7,13,18,3
chr10	5014545	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=172,172;MMQ=27,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.354:18:4,3:8,3:5,7,0,6
chr10	5014678	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,151;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,3:2,2:6,1,3,2
chr10	5014992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,185;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr10	5032284	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=164,89;MMQ=27,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.268:24:9,4:9,2:0|1:5032284_C_T:5032284:6,12,2,4
chr10	5032286	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=89,164;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,18:0.731:24:4,9:2,9:1|0:5032284_C_T:5032284:2,4,6,12
chr10	5037718	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=103,115;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:1,3,2,3
chr10	5037913	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=118,96;MMQ=52,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,3:4,0:7,3,3,0
chr10	5041375	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=207,192;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr10	5045834	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=199,222;MMQ=27,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:0,4,4,0
chr10	5144657	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,192;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr10	5147909	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=193,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,6:1,3:1,2,5,4
chr10	5196273	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:5,2:0,7:4,1,7,3
chr10	5196479	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr10	5200739	.	T	TAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,1:2,1,7,0
chr10	5201979	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,9:3,2:5,1,10,1
chr10	5202241	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr10	5203579	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	5203944	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=71,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.486:21:2,2:8,7:3,8,3,7
chr10	5205042	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5205042_TC_T:5205042:0,1,0,1
chr10	5205050	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5205042_TC_T:5205042:0,1,0,1
chr10	5242346	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,22:0,3:0,0,3,22
chr10	5247631	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,3:3,0:0|1:5247631_G_A:5247631:3,1,2,1
chr10	5247634	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:0|1:5247631_G_A:5247631:3,1,2,1
chr10	5247701	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=62,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:6,4:9,1:10,5,2,4
chr10	5260553	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	5260786	.	GTC	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,5:7,3:4,13,3,5
chr10	5260812	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr10	5436487	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	5443124	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5443124_G_T:5443124:0,0,0,1
chr10	5443125	.	T	TTTAGATCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5443124_G_T:5443124:0,0,0,1
chr10	5446632	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	5446794	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr10	5495351	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:3,6,2,4
chr10	5497128	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr10	5498248	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=100,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr10	5541181	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.536:13:4,3:1,3:0|1:5541181_T_C:5541181:3,3,5,2
chr10	5541183	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.536:13:4,4:2,3:0|1:5541181_T_C:5541181:3,3,5,2
chr10	5567695	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,17:0,0,17,13
chr10	5682641	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,13:0,0,14,8
chr10	5682855	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	5683649	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr10	5693379	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr10	5766337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,18,3
chr10	5773235	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5773235_G_A:5773235:0,0,0,1
chr10	5773241	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5773235_G_A:5773235:0,0,0,1
chr10	5773246	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5773235_G_A:5773235:0,0,0,1
chr10	5773255	.	AAC	GGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5773235_G_A:5773235:0,0,0,1
chr10	5773260	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5773235_G_A:5773235:0,0,0,1
chr10	5781969	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr10	5784151	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:9,7:11,4:12,8,7,5
chr10	5784509	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:1,6:5,3:2,5,4,5
chr10	5788110	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	5788259	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=115,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:12,10,0,2
chr10	5789132	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:10,10,2,0
chr10	5790420	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,2:0,0,5,10
chr10	5798730	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,6:2,4:1,3,4,6
chr10	5799555	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,1:15,1:13,15,1,1
chr10	5800875	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:21,1:5,2:15,11,3,0
chr10	5803455	.	ACTCAGTTAATGC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=205,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	5804455	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:9,0,9,0
chr10	5804471	.	G	GTTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,15,0
chr10	5804474	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr10	5804633	.	T	TTC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:12,5:3,5:2,13,4,6
chr10	5804949	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.243:38:11,0:18,8:19,10,9,0
chr10	5808086	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:12,4:13,9:13,12,7,6
chr10	5827074	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:3,4:3,5:6,1,6,3
chr10	5827329	.	ATCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr10	5837038	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=228,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr10	5853767	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:3,7:11,5:14,0,10,2
chr10	5853923	.	TA	T,TAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=25,25,26;MFRL=155,158,112;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=15.57,12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,13,11:0.356,0.300:36:8,4,6:2,7,4:1,11,2,22
chr10	5920121	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr10	5922186	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	5924942	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:5924942_C_G:5924942:0,0,3,1
chr10	5924950	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:5924942_C_G:5924942:2,1,2,1
chr10	5926079	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr10	5932408	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:3,1:4,1:3,5,0,3
chr10	5951025	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,2:4,5:2,8,4,3
chr10	5952854	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr10	5957270	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=220,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr10	5960209	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr10	5966192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	5966541	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=155,131;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:5966541_T_A:5966541:0,4,0,1
chr10	5966558	.	TA	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=155,131;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:5966541_T_A:5966541:0,4,0,1
chr10	5966561	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=155,131;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:5966541_T_A:5966541:0,4,0,1
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chr10	6008030	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr10	6054912	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.402:40:13,11:11,4:8,16,4,12
chr10	6054951	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,6:3,2:2,8,0,8
chr10	6054967	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=173,103;MMQ=42,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:7,2:0,0:0|1:6054967_A_AT:6054967:0,7,0,2
chr10	6054974	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=181,103;MMQ=45,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,1:1,0:0|1:6054967_A_AT:6054967:0,8,0,2
chr10	6061277	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,4:0,7:0,0,7,4
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chr10	6061499	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,4:10,1:4,12,2,3
chr10	6061781	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,19,10
chr10	6063383	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	6063674	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr10	6066200	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,30:0.689:43:5,20:8,10:8,5,17,13
chr10	6139152	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:14,3:7,0:8,13,1,2
chr10	6150611	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=99,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,7:0.084:93:39,7:44,0:45,41,6,1
chr10	6155488	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,100;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:18,4:14,0:21,11,3,1
chr10	6156118	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,20:0,13:0,0,7,26
chr10	6258015	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr10	6258052	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0,0,13,6
chr10	6258796	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr10	6258840	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr10	6258997	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=131,136;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,7:11,0:14,9,7,0
chr10	6259239	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,2:0,0,1,11
chr10	6261704	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:0,4,1,8
chr10	6472671	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,85;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:2,0:7,0,1,1
chr10	6472962	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	6498799	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=49,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr10	6533625	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,2:4,3:3,3,3,3
chr10	6552999	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:14,1:12,12,1,1
chr10	7214649	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.431:35:6,7:14,8:6,14,9,6
chr10	7214671	.	G	C,GT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,31,27;MFRL=118,102,81;MMQ=60,60,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.81,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,2,2:0.141,0.141:18:5,2,0:8,0,2:3,11,0,4
chr10	7214673	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=109,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:3,13,0,2
chr10	7214674	.	ATG	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,21;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:7214674_ATG_A:7214674:3,13,0,2
chr10	7214677	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:8,0:0|1:7214674_ATG_A:7214674:3,12,0,2
chr10	7230524	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr10	7325903	.	CCAACCAACTGGTCGAAGTCTGTAATCCAAGTAAAA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.126:30:6,0:7,3:12,15,2,1
chr10	7423801	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:15,0:14,4:19,10,4,0
chr10	7423960	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	7605053	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:8,10,1,1
chr10	7605067	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,8,13
chr10	7605077	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=65.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,9,12
chr10	7605101	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:1,11:0,9:0,1,9,11
chr10	7608322	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,63;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,0:3,3:5,8,0,3
chr10	7618993	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.837:10:1,3:0,6:0|1:7618993_G_A:7618993:0,1,1,8
chr10	7618997	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0|1:7618993_G_A:7618993:0,1,1,8
chr10	7622047	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=132,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7622047_A_G:7622047:1,0,0,1
chr10	7622069	.	AC	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=266,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7622047_A_G:7622047:1,2,0,1
chr10	7622075	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr10	7682806	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=89,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:8,0:6,9:3,11,5,4
chr10	7683873	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr10	7697483	.	ACAAGCAACTTTATATGTTTTGGAGGATCTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:2,1,1,0
chr10	7745492	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:2,3,3,4
chr10	7763734	.	A	ATATGTAATGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=98,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,2:11,0:0|1:7763734_A_ATATGTAATGT:7763734:3,10,1,1
chr10	7763735	.	C	CTGTAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=98,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:2,2:11,0:0|1:7763734_A_ATATGTAATGT:7763734:3,10,1,1
chr10	7769074	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:8,12,1,1
chr10	7769094	.	G	GTAGATGAGGGTTATGTGGGAGTGGGTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:5,10,1,1
chr10	7769101	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,1,6
chr10	7769604	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr10	7769837	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=166,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:7769837_T_A:7769837:1,6,1,1
chr10	7769844	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:7769837_T_A:7769837:1,4,1,1
chr10	7769846	.	A	ATCAGCAGCCAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=105,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:7769837_T_A:7769837:1,4,1,1
chr10	7774539	.	A	AAACACACACCTCGTAAGATTACACCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	7785087	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,7:4,3:10,2,9,1
chr10	7785303	.	TCAGCTTAATAGAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:7785303_TCAGCTTAATAGAAG_T:7785303:0,2,0,1
chr10	7785322	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7785303_TCAGCTTAATAGAAG_T:7785303:0,1,0,1
chr10	7788495	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	7798150	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr10	7807947	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr10	7808086	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr10	7820704	.	A	AAACAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAC;STR;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr10	7821081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	7830319	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr10	7838208	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,7:3,6:0,4,1,12
chr10	7839128	.	A	ATGTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0|1:7839128_A_ATGTTT:7839128:2,4,1,1
chr10	7839131	.	G	GAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,1:5,0:0|1:7839128_A_ATGTTT:7839128:2,5,1,1
chr10	7844195	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:6,0,4,3
chr10	7844906	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=240,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,3:0,11:0,1,1,13
chr10	7849054	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	7849496	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=116,179;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7849496_G_A:7849496:2,0,1,0
chr10	7849498	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=116,179;MMQ=60,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:7849496_G_A:7849496:2,0,1,0
chr10	7849688	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,8:4,2:4,6,3,7
chr10	7866195	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=137,306;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,0,2
chr10	7866268	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,17:0,0,20,9
chr10	7866539	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=99,146;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,0:4,3:2,5,0,3
chr10	7866557	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	7866576	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=212,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr10	8006798	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:4,5,2,0
chr10	8051259	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=122,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:9,4,2,0
chr10	8100768	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr10	8111409	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr10	8111485	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:8,0:15,3:16,8,0,3
chr10	11290997	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr10	11299607	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=261,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr10	11316909	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	11316987	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr10	11330525	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr10	11356093	.	T	TTTTG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,14:0,0,15,11
chr10	11360673	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=103,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.539:17:5,3:3,6:6,2,4,5
chr10	11362789	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=162,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:0,2:0,2,3,1
chr10	11367780	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.519:27:4,8:9,6:7,6,9,5
chr10	11543086	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,5:4,6,4,4
chr10	11567368	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:12,7,2,1
chr10	11789250	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	11789290	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,11,4
chr10	11789511	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr10	11797322	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,150;MMQ=40,41;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.707:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr10	11797619	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr10	11894221	.	GAC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,4:4,4:4,7,4,4
chr10	11973548	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr10	11978499	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=73.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,16,6
chr10	11984837	.	T	TCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	11985225	.	C	CACATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=220,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11985225_C_CACATA:11985225:0,1,0,1
chr10	11985228	.	G	GATCTTACTCTTTCTCACTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=220,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11985225_C_CACATA:11985225:0,1,0,1
chr10	11990272	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=176,196;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr10	11990275	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,16;MFRL=187,174;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr10	11990278	.	A	T,G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,15,16;MFRL=177,196,174;MMQ=60,40,40;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:1,0,0:3,0,2,0
chr10	11990282	.	C	G,T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,17,14;MFRL=177,196,174;MMQ=60,40,40;MPOS=6,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.23,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.256,0.250:5:1,0,0:1,0,0:3,0,2,0
chr10	11990285	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,14;MFRL=177,185;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:11990285_A_T:11990285:3,0,2,0
chr10	11990287	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=177,185;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:11990285_A_T:11990285:3,0,2,0
chr10	11990289	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,14;MFRL=177,185;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:1,0:1,0:0|1:11990285_A_T:11990285:3,0,2,0
chr10	11994085	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,4:10,0:19,6,3,1
chr10	12009320	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=71,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.447:43:10,14:13,5:12,12,16,3
chr10	12020981	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr10	12039804	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,4:5,5:0,6,1,8
chr10	12041840	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,3,2
chr10	12046455	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=164,38;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:2,4:5,0:7,0,3,1
chr10	12046498	.	TTAATG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:3,2:1,6:5,1,5,4
chr10	12055986	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=96,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:4,8:4,4:8,1,8,4
chr10	12056244	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=225,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr10	12071535	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:2,4,1,6
chr10	12123666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,3:1,2:3,5,3,2
chr10	12126490	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	12131218	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:3,4,2,4
chr10	12136350	.	T	TCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:12136350_T_TCAGTA:12136350:0,3,0,1
chr10	12136352	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:12136350_T_TCAGTA:12136350:0,3,0,1
chr10	12136356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,33;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:12136350_T_TCAGTA:12136350:0,3,0,1
chr10	12136359	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:12136350_T_TCAGTA:12136350:0,3,0,1
chr10	12136367	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=24,34;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:12136350_T_TCAGTA:12136350:0,3,0,1
chr10	12136375	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=22,30;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12136375_A_G:12136375:0,1,0,1
chr10	12136378	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=20,29;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12136375_A_G:12136375:0,1,0,1
chr10	12136380	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,22;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:12136375_A_G:12136375:0,1,0,1
chr10	12136384	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:12136375_A_G:12136375:0,0,0,1
chr10	12140030	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr10	12142301	.	G	GTCTTTTTGGTGCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=108,205;MMQ=38,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:0,1:0|1:12142301_G_GTCTTTTTGGTGCT:12142301:0,2,0,1
chr10	12142303	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=108,205;MMQ=38,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:2,0:0,1:0|1:12142301_G_GTCTTTTTGGTGCT:12142301:0,2,0,1
chr10	12142328	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=161,110;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:1,3,0,1
chr10	12148259	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr10	12148286	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,8,6
chr10	12149808	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr10	12149939	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,6:6,3:8,4,4,5
chr10	12159647	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,14,11
chr10	12159668	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.540:35:6,8:10,11:10,6,8,11
chr10	12160647	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=163,140;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:12160647_C_T:12160647:4,0,1,0
chr10	12160649	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,140;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:12160647_C_T:12160647:4,0,1,0
chr10	12162276	.	C	T	.	.	DP=102;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,4:0.051:94:41,4:48,0:61,29,4,0
chr10	12162324	.	TTC	T	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=130,126;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:25,0:20,2:15,32,0,2
chr10	12162355	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=133,126;MMQ=42,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,0:6,2:0,22,0,2
chr10	12162371	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=138,111;MMQ=40,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:15,1:1,1:1,16,0,2
chr10	12178257	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:1,6:7,0:0,9,0,7
chr10	12197259	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	12203197	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr10	12203208	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:0|1:12203208_C_A:12203208:0,10,0,3
chr10	12203209	.	GCT	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,2:3,0:0|1:12203208_C_A:12203208:0,11,0,3
chr10	12203212	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=168,123;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:12203208_C_A:12203208:0,10,0,2
chr10	12203217	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=168,123;MMQ=60,57;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:12203208_C_A:12203208:0,10,0,2
chr10	12206420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,3:6,0:8,10,2,1
chr10	12215870	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,34,26,33;MFRL=129,167,120,159;MMQ=42,60,48,60;MPOS=22,18,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.27,5.55,19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,4,10:0.112,0.199,0.480:21:1,1,0,5:3,1,2,5:1,4,2,14
chr10	12221101	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:18,0:9,3:12,15,0,3
chr10	12226870	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:4,3:5,1:7,2,4,0
chr10	12227067	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	12238325	.	TGGGA	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.342:30:11,3:8,7:8,12,2,8
chr10	12240640	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:8,0,11,0
chr10	12240668	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=126,160;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.170:45:22,7:16,0:28,10,7,0
chr10	12240691	.	GT	G	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,35:0.600:58:16,19:7,16:13,10,20,15
chr10	12252217	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:7,0,6,0
chr10	12288302	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,5:5,2:3,9,1,6
chr10	12292286	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:5,3:9,2,3,2
chr10	12595127	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr10	12595147	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,3:4,5:9,1,7,1
chr10	12595443	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	12866356	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr10	12867598	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,12,4
chr10	12870714	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr10	12870900	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:1,0:2,0:0|1:12870900_T_G:12870900:2,1,0,2
chr10	12870907	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=96,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.548:5:1,0:1,0:0|1:12870900_T_G:12870900:2,0,0,3
chr10	12870913	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.590:3:0,0:1,0:0|1:12870900_T_G:12870900:1,0,0,2
chr10	12870923	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.590:3:0,0:1,0:0|1:12870900_T_G:12870900:1,0,0,2
chr10	12940377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,12,5
chr10	13151165	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:5,2:8,4,1,1
chr10	13152272	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=109,166;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:12,6:21,0:19,14,6,0
chr10	13152504	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=97,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,1:4,2:1,8,0,4
chr10	13166076	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0,0,5,7
chr10	13167860	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr10	13214812	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:0,7,1,6
chr10	13214844	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=150,189;MMQ=60,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr10	13230837	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,2:6,4:6,7,2,4
chr10	13230934	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=82,54;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:7,0:0|1:13230934_C_T:13230934:7,6,1,1
chr10	13230941	.	C	CAGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=84,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:13230934_C_T:13230934:8,6,1,1
chr10	13234227	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=114,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,0:5,5:9,3,0,5
chr10	13234323	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=79,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:4,0:13,4:11,6,0,4
chr10	13237015	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=103,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:7,0,4,3
chr10	13275514	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,4:0,3:0,0,6,2
chr10	13275676	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=384,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:0,1,3,5
chr10	13275691	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	13276179	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,11,14
chr10	13320411	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr10	13330291	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=133,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr10	13330333	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=202,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:0|1:13330333_C_T:13330333:14,8,1,1
chr10	13330338	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=195,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:0|1:13330333_C_T:13330333:16,9,1,1
chr10	13340293	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:3,7,1,10
chr10	13340339	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=164,137;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13340339_G_A:13340339:0,2,0,1
chr10	13340354	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=234,137;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13340339_G_A:13340339:0,1,0,1
chr10	13340356	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=234,137;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13340339_G_A:13340339:0,1,0,1
chr10	13341378	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,4:2,4:5,4,5,3
chr10	13361421	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	13365013	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,0:15,3:13,15,1,2
chr10	13370315	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:4,6:3,5:5,2,9,2
chr10	13371809	.	T	TATCATCCTATACCATTCCTGACATCGAAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:10,2:8,0:6,12,0,2
chr10	13378446	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:13378446_G_T:13378446:0,3,0,1
chr10	13378447	.	A	AATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:13378446_G_T:13378446:0,3,0,1
chr10	13378449	.	T	TGGAAAAGGATTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:13378446_G_T:13378446:0,3,0,1
chr10	13483825	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:2,11,1,2
chr10	13534554	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,599;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr10	13538896	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=237,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr10	13541724	.	T	TAAAAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,11:0,0,13,10
chr10	13541999	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,4:7,0:13,8,2,2
chr10	13633928	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,33,33,32;MFRL=100,122,176,89;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,33,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.67,3.37,6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,6,3,6:0.174,0.119,0.212:30:5,3,1,2:9,3,2,4:8,7,5,10
chr10	13658335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	13696570	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	13699133	.	CCGCCCCCCG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=115,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CGCCCCCCG;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	13702231	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr10	13702281	.	AGGCCTCATTT	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:2,0:10,7,1,1
chr10	13702342	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:17,11,2,1
chr10	13717076	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr10	13743251	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr10	13779970	.	A	AAATCTCCACTTTGCGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=219,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr10	13782110	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:13782110_A_C:13782110:0,0,7,1
chr10	13782124	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0|1:13782110_A_C:13782110:0,0,8,4
chr10	13782605	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	13803557	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr10	14563097	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr10	14572298	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,253;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:3,2,0,2
chr10	14709793	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=170,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:1,6,0,3
chr10	14882040	.	A	AATAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AT;STR;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:2,2:4,5:3,3,3,5
chr10	14885400	.	GC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=93,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:9,10,0,2
chr10	14909299	.	G	GCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:7,2:0|1:14909299_G_GCT:14909299:4,15,1,1
chr10	14909309	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:14909299_G_GCT:14909299:1,12,1,1
chr10	14943302	.	T	TTTCAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	14943340	.	A	AAAGAAAAGAAAAAAAGACTGAAGATCTGTAAGTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=169,188;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr10	14976326	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,31,26,31;MFRL=152,146,136,106;MMQ=60,60,60,40;MPOS=18,5,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.91,3.53,9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,4,3,8:0.156,0.125,0.359:23:1,1,1,1:6,2,1,5:7,1,11,4
chr10	14976343	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=99,154;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.135:45:10,2:19,1:14,25,5,1
chr10	14976860	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=215,184;MMQ=40,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	15008554	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=79,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.488:43:5,14:17,7:11,11,13,8
chr10	15014440	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr10	15106441	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,9,11
chr10	15107559	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=102,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:12,6:15,0:17,10,6,0
chr10	15138264	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=214,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr10	15145948	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.282:22:5,2:11,3:8,8,4,2
chr10	15151319	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15151319_A_T:15151319:0,2,0,1
chr10	15151324	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15151319_A_T:15151319:0,2,0,1
chr10	15151340	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	15154974	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr10	15161274	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr10	15172394	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	15256611	.	AGA	CTC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:15256611_AGA_CTC:15256611:0,6,0,2
chr10	15256615	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:15256611_AGA_CTC:15256611:0,6,0,2
chr10	15256618	.	ATC	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:0|1:15256611_AGA_CTC:15256611:0,6,0,2
chr10	15256625	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:15256611_AGA_CTC:15256611:0,5,0,2
chr10	15256628	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:15256611_AGA_CTC:15256611:0,5,0,2
chr10	15317834	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=92,132;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.168:28:2,2:22,2:20,4,4,0
chr10	15590372	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	15590457	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=101,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:13,2:22,0:0|1:15590457_G_A:15590457:21,14,1,1
chr10	15590464	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:14,2:22,0:0|1:15590457_G_A:15590457:23,13,1,1
chr10	15647722	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:7,3:12,0:10,9,2,1
chr10	15648243	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr10	15685983	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr10	15697366	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,6:8,0:9,5,6,0
chr10	15697514	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=178,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	15701093	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:5,2:5,6:3,7,2,6
chr10	15713507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr10	15713541	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:0,6:7,3:4,3,6,3
chr10	15720830	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0|1:15720830_A_T:15720830:1,9,1,1
chr10	15720836	.	T	TGGTCTCGCAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:15720830_A_T:15720830:1,8,1,1
chr10	15729919	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=96,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:13,0:17,3:0|1:15729919_C_T:15729919:16,14,0,3
chr10	15729923	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,16:0.552:29:5,6:7,10:1|0:15729919_C_T:15729919:2,11,10,6
chr10	15761527	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr10	15876503	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,184;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:8,2,2,0
chr10	15879289	.	ATTCTGGTAAAC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=105,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:5,0:6,11,1,1
chr10	16528662	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=208,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:16528662_AT_CA:16528662:0,3,0,1
chr10	16528669	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=208,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:16528662_AT_CA:16528662:0,3,0,1
chr10	16562440	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr10	16736977	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr10	16794490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=116,97;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,3,1
chr10	16794623	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=185,114;MMQ=60,58;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,0:3,5:4,1,2,3
chr10	16797033	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,183;MMQ=57,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,1:1,0,1,3
chr10	16878204	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,15,8
chr10	16911556	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:16911556_T_TG:16911556:0,0,1,0
chr10	16911567	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16911556_T_TG:16911556:0,0,1,0
chr10	16943511	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr10	16945905	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr10	16948177	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,18,5
chr10	16949447	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	16967445	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr10	16996406	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,1:6,2:9,6,1,2
chr10	17007847	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr10	17024404	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	17026010	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr10	17032559	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,1,13
chr10	17032561	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,1,13
chr10	17085976	.	C	CTATTTCAAGGTCAATTGATTAGCAATCTTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.196:21:7,3:9,0:5,13,2,1
chr10	17089680	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	17089683	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:17089683_TAA_T:17089683:0,4,0,1
chr10	17089686	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:17089683_TAA_T:17089683:0,4,0,1
chr10	17107464	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,5:3,0:6,3,5,0
chr10	17110595	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=77,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.337:36:12,8:11,3:20,4,6,6
chr10	17126545	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=179,240;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CA;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0,2,0,2
chr10	17141952	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	17145173	.	TAAC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:9,13,0,2
chr10	17146652	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=128,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.666:10:0,2:3,5:0|1:17146652_C_A:17146652:0,3,0,7
chr10	17146667	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:17146652_C_A:17146652:0,0,0,7
chr10	17147574	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:0|1:17147574_C_CA:17147574:1,9,2,2
chr10	17147578	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,4:4,0:0|1:17147574_C_CA:17147574:1,9,2,2
chr10	17147580	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:0|1:17147574_C_CA:17147574:1,8,2,2
chr10	17147581	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,2:4,0:0|1:17147574_C_CA:17147574:1,8,2,2
chr10	17147583	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:17147574_C_CA:17147574:1,8,0,2
chr10	17152855	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,2:1,3:5,0,4,1
chr10	17157630	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,3,9
chr10	17164760	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=252,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,4:1,5:1,0,8,3
chr10	17164772	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.710:8:0,3:2,2:1,1,4,2
chr10	17171265	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr10	17199419	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr10	17199830	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	17202381	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:3,3:2,0:4,10,0,5
chr10	17204139	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,20,2
chr10	17204246	.	TA	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.247:27:6,3:11,4:4,16,4,3
chr10	17210965	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:0|1:17210965_G_A:17210965:3,6,1,1
chr10	17210969	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,1:4,0:0|1:17210965_G_A:17210965:3,6,1,1
chr10	17214135	.	A	AATGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr10	17243480	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr10	17278281	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,3:18,0:19,11,3,0
chr10	17279211	.	GT	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.115:38:17,2:15,2:25,9,4,0
chr10	17362784	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	17363329	.	CC	AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0,11,0,2
chr10	17365012	.	TT	AA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,3:8,0:9,5,3,0
chr10	17365044	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:6,6:9,2:8,7,7,1
chr10	17365169	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.502:20:6,5:4,5:6,4,4,6
chr10	17373617	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	17636182	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,3,1
chr10	17636309	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.593:35:9,12:5,8:7,7,12,9
chr10	17645814	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.641:9:0,3:3,3:2,1,4,2
chr10	17659131	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:17659131_C_A:17659131:0,0,2,2
chr10	17659149	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:17659131_C_A:17659131:0,0,0,2
chr10	17686433	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:13,3:9,20,0,3
chr10	17726573	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	17726648	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:4,5:5,2:8,1,7,1
chr10	17735359	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=244,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	18122716	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	18122833	.	T	TTTGGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=120,172;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	18145098	.	CAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=125,118;MMQ=33,27;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:18145098_CAAAAA_C:18145098:3,1,1,0
chr10	18145121	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=97,118;MMQ=39,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,0:1,0:0|1:18145098_CAAAAA_C:18145098:1,2,1,0
chr10	18183335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr10	18198213	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=101,112;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,4:1,1:0,3,1,4
chr10	18198237	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=159,101;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	18242422	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.105:44:12,4:27,0:21,19,3,1
chr10	18254317	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	18254655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr10	18266783	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr10	18270422	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=64,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:3,2,2,3
chr10	18289521	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:7,8:3,0:0|1:18289521_T_C:18289521:11,2,8,0
chr10	18289526	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:8,8:5,0:0|1:18289521_T_C:18289521:11,2,8,0
chr10	18439747	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	18787325	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:8,0:16,3:7,17,0,3
chr10	18789724	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:2,0,6,1
chr10	18828601	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=27,22;MFRL=139,66;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.178:43:15,3:20,4:15,21,0,7
chr10	18828635	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:5,3:3,7:4,4,4,6
chr10	18828663	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,3:0,4:0,1,5,5
chr10	18828670	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.782:9:1,2:1,2:1,1,4,3
chr10	18828678	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=169,35;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr10	18828721	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	18836957	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	18840813	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=95,77;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:20,0:7,4:13,14,1,3
chr10	18840919	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=93,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:2,4,1,7
chr10	18875071	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:18875071_T_C:18875071:1,2,0,1
chr10	18875089	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:18875071_T_C:18875071:1,3,0,1
chr10	18898701	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:6,1,4,0
chr10	18898960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr10	18931512	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=93,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0,7,0,3
chr10	18937579	.	A	AAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr10	18937625	.	G	GATCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	18940157	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:11,5:4,8:9,6,5,8
chr10	18940185	.	G	GTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:4,2:4,3,2,2
chr10	18957647	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:1,4,3,3
chr10	19492832	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr10	19493214	.	T	TTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.172:16:7,1:6,1:8,6,2,0
chr10	19493215	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=134,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.469:16:4,4:4,4:7,1,3,5
chr10	19493415	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr10	19498270	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:8,3:11,0:0|1:19498270_G_A:19498270:16,3,2,1
chr10	19498278	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0|1:19498270_G_A:19498270:0,0,19,5
chr10	19546796	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr10	19571941	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:5,5:2,9:2,5,6,8
chr10	19571975	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=129,131;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:9,13,0,2
chr10	19572207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	19641239	.	CTG	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	19641270	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19641270_A_AC:19641270:0,4,0,1
chr10	19641271	.	A	AGGCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19641270_A_AC:19641270:0,4,0,1
chr10	19641275	.	T	TATCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:19641270_A_AC:19641270:0,4,0,1
chr10	19641281	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:19641281_G_T:19641281:0,4,0,1
chr10	19641283	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19641281_G_T:19641281:0,3,0,1
chr10	19676781	.	G	GTTGCAATATACGGTAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=229,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	19678602	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=11854170,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0|1:19678602_T_C:19678602:2,0,0,3
chr10	19678608	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=141,23708170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1|0:19678602_T_C:19678602:0,3,1,0
chr10	19678610	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=141,23708170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1|0:19678602_T_C:19678602:0,3,1,0
chr10	19739366	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=88,190;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:6,0:13,4:11,9,0,4
chr10	19739459	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr10	19780463	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:7,4:4,2:10,1,6,1
chr10	19787382	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=168,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,7:6,8:7,3,9,6
chr10	19787418	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.607:31:7,9:5,10:8,4,9,10
chr10	19856496	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=91,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:9,6:7,5:7,9,7,4
chr10	19896691	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.468:7:1,1:0,2:3,1,3,0
chr10	19896830	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:2,7,2,3
chr10	20105996	.	TGGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGC;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:5,2,2,0
chr10	20357050	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:13,4:7,1:14,7,4,1
chr10	20357233	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:1,3,0,6
chr10	20436838	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,3:10,3:6,9,2,4
chr10	20500710	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,2:5,1:6,10,1,2
chr10	20506326	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,1:4,3:6,1,4,0
chr10	20506418	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=98,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:16,4:7,15:14,9,12,7
chr10	20506530	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=119,59;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.188:13:6,0:4,2:0|1:20506530_T_G:20506530:6,5,1,1
chr10	20506533	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=128,59;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:20506530_T_G:20506530:4,5,1,1
chr10	20506536	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=124,59;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:20506530_T_G:20506530:3,5,1,1
chr10	20506551	.	T	TGAGACGAGAGCCTCG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=170,59;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:20506530_T_G:20506530:0,5,1,1
chr10	20534333	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=76,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:5,2:12,5:11,6,5,2
chr10	20568616	.	GTGTTTTC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:8,0:13,11,1,1
chr10	21074724	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,5:3,3:8,0,5,3
chr10	21076222	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=162,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr10	21076249	.	A	ATTGAATATTGGGTATTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:21076249_A_ATTGAATATTGGGTATTTT:21076249:1,3,0,1
chr10	21076250	.	C	CATTTAAAGATAAATGATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:21076249_A_ATTGAATATTGGGTATTTT:21076249:1,3,0,1
chr10	21098879	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr10	21101933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21101933_T_C:21101933:0,4,0,1
chr10	21101935	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21101933_T_C:21101933:0,4,0,1
chr10	21101947	.	T	TTCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21101947_T_TTCC:21101947:0,1,0,1
chr10	21101948	.	A	AGCCGTGCTAATGTGCTTGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21101947_T_TTCC:21101947:0,1,0,1
chr10	21101951	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21101947_T_TTCC:21101947:0,1,0,1
chr10	21112052	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=216,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr10	21112261	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=116,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,2,0
chr10	21115347	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:4,3,2,0
chr10	21120116	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,3,2
chr10	21129766	.	T	TCTTCATCCCTTCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=79,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr10	21141469	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	21148584	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,4:1,7:2,2,11,0
chr10	21157492	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	21157763	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	21176945	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr10	21177156	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.570:33:6,15:8,4:5,9,6,13
chr10	21178974	.	G	GAAAGACATGCAGAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:21178974_G_GAAAGACATGCAGAAC:21178974:0,1,0,1
chr10	21178978	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21178974_G_GAAAGACATGCAGAAC:21178974:0,1,0,1
chr10	21185821	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr10	21185922	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,0:7,3:6,7,2,1
chr10	21806019	.	AGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:0,1:6,0,2,0
chr10	21807779	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34,30;MFRL=110,78,120;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.65,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.287,0.250:14:4,4,1:0,0,1:5,2,6,1
chr10	21845658	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:13,2:18,2:13,18,2,2
chr10	21875205	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.523:17:2,5:3,3:4,4,8,1
chr10	21962228	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,8;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21962228_T_TGGGGGGG:21962228:0,0,1,0
chr10	21962230	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21962228_T_TGGGGGGG:21962228:0,0,1,0
chr10	22030966	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:2,11,0,2
chr10	22048252	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,1:14,2:16,13,0,3
chr10	22193422	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,17,5
chr10	22292078	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:22292078_A_C:22292078:10,0,2,0
chr10	22292081	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:0|1:22292078_A_C:22292078:10,0,2,0
chr10	22616625	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:8,4:8,14,0,4
chr10	22826093	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=100,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,8:5,2:7,2,6,4
chr10	22830719	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=55,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,4:3,8:5,0,9,3
chr10	23220883	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:4,4:7,2:6,5,6,0
chr10	23244917	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	23257504	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0|1:23257504_CTG_C:23257504:0,1,0,1
chr10	23257508	.	AGCCT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23257504_CTG_C:23257504:0,1,0,1
chr10	23303092	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:2,6,3,4
chr10	23321985	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=158,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr10	23326495	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=10,24;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:23326495_T_A:23326495:0,1,0,1
chr10	23326499	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23326495_T_A:23326495:0,1,0,1
chr10	23408272	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=141,148;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.515:27:6,0:7,13:0|1:23408272_G_A:23408272:8,5,14,0
chr10	23408278	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,47;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,5:0,23:0|1:23408272_G_A:23408272:0,0,21,7
chr10	23556026	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	23607969	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=226,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:0|1:23607969_A_G:23607969:0,3,0,1
chr10	23607977	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=226,239;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:23607969_A_G:23607969:0,3,0,1
chr10	23611437	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:23611437_C_T:23611437:7,8,1,1
chr10	23611456	.	G	GTAAGGTGGGTGAAACTCAGGTGAGCCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:0|1:23611437_C_T:23611437:3,8,1,1
chr10	23622202	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	23632970	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,5:3,2:0,6,0,7
chr10	23730901	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.603:23:4,5:4,8:4,5,7,7
chr10	23731003	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=138,88;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:9,3:22,0:19,12,3,0
chr10	24762518	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:3,7,1,2
chr10	24783350	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=195,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr10	24783384	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,0:4,3:0|1:24783384_T_C:24783384:4,1,4,1
chr10	24783393	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:0|1:24783384_T_C:24783384:5,1,4,1
chr10	24784014	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27,27,24;MFRL=158,168,190,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,26,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.22,12.21,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,5,2:0.200,0.441,0.217:10:1,2,4,0:0,0,0,2:1,0,9,0
chr10	24813375	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:14,0:12,4:13,14,0,4
chr10	24834956	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,167;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.130:52:14,6:29,0:20,26,6,0
chr10	24874411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,211;MMQ=51,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:5,7,1,1
chr10	24874708	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.064:59:40,3:16,0:30,26,1,2
chr10	24878129	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=97,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,3:5,3:3,2,4,2
chr10	24880712	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,1,2
chr10	24884779	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.579:26:6,5:5,10:6,5,8,7
chr10	24889901	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:2,7,0,4
chr10	24890828	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.180:48:12,5:25,3:40,0,7,1
chr10	24959306	.	TCCATC	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=153,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,0:13,2:0|1:24959306_TCCATC_T:24959306:5,22,1,1
chr10	24959315	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=153,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:8,2:0|1:24959306_TCCATC_T:24959306:3,15,1,1
chr10	25140411	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=224,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.717:7:0,2:0,2:0,2,0,5
chr10	25140436	.	T	TAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:1,1:0|1:25140436_T_TAAAAA:25140436:0,3,0,1
chr10	25140438	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:25140436_T_TAAAAA:25140436:0,3,0,1
chr10	25231171	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	25241554	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:25241554_G_T:25241554:0,6,1,1
chr10	25241559	.	CGA	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:25241554_G_T:25241554:0,6,1,1
chr10	25241563	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:25241554_G_T:25241554:0,6,1,1
chr10	25241565	.	CTGCGTG	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:25241554_G_T:25241554:0,6,1,1
chr10	25241576	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=21,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:25241554_G_T:25241554:0,3,1,1
chr10	25241582	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:25241554_G_T:25241554:0,2,0,1
chr10	25241584	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25241554_G_T:25241554:0,1,0,1
chr10	25273304	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:1,0:1,2:0|1:25273304_C_T:25273304:2,2,1,1
chr10	25273322	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,1,1
chr10	25273324	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,1,1
chr10	25273329	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,1,1
chr10	25273331	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,0,1
chr10	25273334	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,21;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,0,1
chr10	25273338	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25273304_C_T:25273304:0,3,0,1
chr10	25465225	.	G	GAATCCATTCCATTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,8457565;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:3,6,2,0
chr10	25465327	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	25755732	.	CACAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr10	25840066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,158;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,9:1,6,0,9
chr10	26240966	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr10	26243710	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	26310410	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr10	26310679	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr10	26355862	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,5,1
chr10	26355872	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,8,1
chr10	26355906	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr10	26355992	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr10	26356014	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr10	26356037	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	26356066	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	26357625	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	26357747	.	CG	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr10	26357820	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr10	26359180	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,9,9
chr10	26359200	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,14,7
chr10	26385446	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:0|1:26385446_C_A:26385446:9,12,0,2
chr10	26385448	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,1:11,1:0|1:26385446_C_A:26385446:9,13,0,2
chr10	26385450	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:11,1:0|1:26385446_C_A:26385446:8,13,0,2
chr10	26436287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	26443646	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr10	26462790	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,15:0,6:0,0,8,13
chr10	26463130	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,12,5
chr10	26463569	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	26463587	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	26465798	.	TTCCTGAATGGGAAGGAAATGCCAGATACTTTGTTTATTAGTTTCCCACCATTATTCTATGGCAGATTTGAGGAGCCTGTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.452:6:1,3:1,0:1,2,1,2
chr10	26482064	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26482064_C_T:26482064:0,0,1,0
chr10	26482072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26482064_C_T:26482064:1,0,1,0
chr10	26490362	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=189,139;MMQ=58,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr10	26508300	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26508300_T_TTG:26508300:0,0,0,1
chr10	26508308	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26508300_T_TTG:26508300:0,0,0,1
chr10	26534809	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,5,0
chr10	26575221	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=163,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr10	26589625	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=206,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr10	26781355	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr10	26781388	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	26785421	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26785421_C_A:26785421:0,0,0,1
chr10	26785423	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26785421_C_A:26785421:0,0,0,1
chr10	26785425	.	ATGAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26785421_C_A:26785421:0,0,0,1
chr10	26789722	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:0|1:26789722_A_T:26789722:11,3,3,0
chr10	26789731	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:0|1:26789722_A_T:26789722:11,2,3,0
chr10	26792292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0,11,0,2
chr10	26792303	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=168,144;MMQ=56,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr10	26802633	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,23,23,22;MFRL=93,173,131,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,28,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.31,4.95,5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,3,5:0.185,0.224,0.329:15:1,2,1,2:3,0,1,1:1,3,1,10
chr10	26802651	.	AC	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0,12,0,2
chr10	26993725	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0|1:26993725_G_A:26993725:0,0,1,1
chr10	26993737	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:26993725_G_A:26993725:0,0,1,1
chr10	26994150	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr10	26994345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr10	27009334	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr10	27037487	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr10	27044553	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,7:1,5:4,0,9,3
chr10	27065976	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,8:4,1:7,1,5,4
chr10	27294449	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	27317778	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=65.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:8,9:3,13:5,6,12,10
chr10	27318370	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=246,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	27322372	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=245,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0|1:27322372_TTA_T:27322372:0,2,0,6
chr10	27322391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=246,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:0,3:0|1:27322372_TTA_T:27322372:0,1,0,5
chr10	27324133	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:6,9,3,0
chr10	27324781	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr10	27326014	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0|1:27326014_C_T:27326014:3,0,2,0
chr10	27326017	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1|0:27326014_C_T:27326014:2,0,3,0
chr10	27326765	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=224,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr10	27326999	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	27328995	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,3:8,0:13,9,3,0
chr10	27329167	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	27333121	.	TA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.221:32:14,1:5,6:8,17,1,6
chr10	27350090	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:0|1:27350090_A_C:27350090:6,5,1,1
chr10	27350093	.	C	CCTTCAAGCTCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:27350090_A_C:27350090:6,5,1,1
chr10	27375559	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr10	27375626	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	27382236	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=277,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr10	27382440	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=120,364;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:0|1:27382440_G_C:27382440:5,10,0,2
chr10	27382445	.	G	GCTCTTGCCTGGAATTTGTTAGATTTTT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=120,364;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:5,0:6,2:0|1:27382440_G_C:27382440:4,9,0,2
chr10	27382519	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr10	27382528	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,2,2
chr10	27382586	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=87,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,6:2,8:3,2,9,5
chr10	27382804	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	27389197	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,12:0,0,6,10
chr10	27389314	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr10	27400861	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,8,1
chr10	27401056	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr10	27403635	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	27404927	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr10	27405096	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr10	27405310	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr10	27405360	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27405360_G_GC:27405360:0,0,0,1
chr10	27405370	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,156;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27405360_G_GC:27405360:0,0,0,1
chr10	27406481	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=85,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:14,4:23,0:19,18,1,3
chr10	27409555	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	27412647	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:3,8,0,2
chr10	27412669	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr10	27423744	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,5:0,0,11,7
chr10	27437964	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:3,7:4,7:2,5,4,11
chr10	27437994	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr10	27442121	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:9,8:11,12:9,11,11,9
chr10	27443012	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,4:4,7:5,1,9,2
chr10	27443072	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:10,15:18,12:15,13,15,12
chr10	27443083	.	A	T	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.494:65:18,10:14,22:20,13,16,16
chr10	27444329	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,6:0,0,21,0
chr10	27444344	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=96.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,19:0,8:0,0,26,1
chr10	27456003	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,8,4
chr10	27470094	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=190,126;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:27470094_G_A:27470094:0,4,0,1
chr10	27470095	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=190,126;MMQ=45,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:27470094_G_A:27470094:0,4,0,1
chr10	27499676	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:11,0,1,1
chr10	27499709	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:8,4:6,5:8,6,5,5
chr10	27499771	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:16,1:7,4:11,12,3,2
chr10	27499804	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.297:32:11,2:10,6:10,13,6,3
chr10	27506854	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	27506961	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:2,3:13,3:11,5,3,4
chr10	27507119	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr10	27507142	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	27508600	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr10	27508621	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:3,6:10,0:10,4,4,2
chr10	27508837	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	27512014	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr10	27523967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,4:2,2:6,1,6,0
chr10	27529549	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:10,5:7,8:11,6,9,5
chr10	27529565	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,28,16
chr10	27687965	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:6,1:8,7:7,8,4,4
chr10	27687994	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:3,4:3,5,3,3
chr10	27688238	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	27692062	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=71,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr10	27692099	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=73,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:6,5,4,2
chr10	27692279	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=86,71;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:3,6,2,3
chr10	27700887	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:2,4:5,13:1,6,2,15
chr10	27702256	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=91,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.559:20:3,6:6,4:3,6,3,8
chr10	27815665	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:3,7:0,3:3,0,11,0
chr10	27964241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:27964241_C_T:27964241:5,9,1,1
chr10	27964250	.	T	TTGTA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:27964241_C_T:27964241:6,9,1,1
chr10	27964307	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=167,49;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,0:4,5,3,0
chr10	28032136	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr10	28149593	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:6,8,1,1
chr10	28225877	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28225877_G_A:28225877:0,2,0,1
chr10	28225880	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28225877_G_A:28225877:0,2,0,1
chr10	28225882	.	C	CCCCTTCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28225877_G_A:28225877:0,2,0,1
chr10	28225899	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	28233120	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,2:3,5:2,1,5,2
chr10	28233380	.	A	AAGGTGCGGAAGAGAATGGTTTAAGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr10	28233931	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:5,2:1,2:0|1:28233931_G_A:28233931:2,4,1,4
chr10	28233933	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:0|1:28233931_G_A:28233931:2,4,1,4
chr10	28247860	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=105,67;MMQ=60,49;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.518:29:5,4:8,11:7,7,8,7
chr10	28247957	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr10	28258034	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr10	28276273	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr10	28345336	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr10	28345370	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=89,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.746:14:1,3:2,6:1,2,8,3
chr10	28347615	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr10	28378758	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:6,2:0,3:4,2,1,4
chr10	28409532	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=92,66;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:20,4:16,0:22,14,4,0
chr10	28436534	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:1,4,3,2
chr10	28436557	.	A	AGTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:28436557_A_AGTC:28436557:0,3,0,1
chr10	28436559	.	A	AGGAGTTCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:28436557_A_AGTC:28436557:0,3,0,1
chr10	28438835	.	TCTGCA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	28439099	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	28527548	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:6,4,1,2
chr10	28527633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr10	28872481	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.514:10:0,0:2,3:0,5,0,5
chr10	28879838	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr10	28903400	.	G	GTCTTCTTTAAAACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:2,0,3,0
chr10	28966856	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr10	28971341	.	TC	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.124:23:14,0:7,2:0|1:28971341_TC_T:28971341:7,14,1,1
chr10	28971343	.	TGAACTACACTTACTGAACAGCTTGAAGGCCTTTTGAGTTCTGCTGGACAGGAGCACTTTATC	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:7,2:0|1:28971341_TC_T:28971341:7,22,1,1
chr10	29137085	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr10	29137302	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:29137302_C_T:29137302:5,10,1,1
chr10	29137308	.	A	ATTTCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:29137302_C_T:29137302:5,9,1,1
chr10	29169046	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:5,7:1,1:6,2,7,1
chr10	29169383	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr10	29580712	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=116,63;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:14,7,2,0
chr10	29580735	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=94,151;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:10,1:6,2:0|1:29580735_C_T:29580735:9,8,2,2
chr10	29580743	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=104,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,2:9,2:0|1:29580735_C_T:29580735:10,11,2,2
chr10	29581493	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=124,124;MMQ=52,52;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,3:5,6:7,6,1,8
chr10	29747155	.	GCTC	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=52.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,10:7,5:11,5,7,8
chr10	29747221	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=97,111;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.533:32:7,8:7,8:8,7,9,8
chr10	29754535	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=136,153;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.413:39:11,6:11,9:16,7,7,9
chr10	29754609	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=77,110;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.584:36:5,10:9,11:8,7,13,8
chr10	29754675	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=113,178;MMQ=57,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:5,4:18,4:12,11,2,6
chr10	29759174	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,3:2,4:4,3,4,3
chr10	29760209	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:3,2,1,4
chr10	29762997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	29769589	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,3:6,0:4,11,1,2
chr10	29769647	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=220,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,4:3,3:1,6,3,4
chr10	29770551	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:7,9:1,7:5,3,8,8
chr10	29770730	.	A	AAGCTGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=142,109;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	29770741	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=158,126;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29770741_A_T:29770741:0,1,0,1
chr10	29770746	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=158,126;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29770741_A_T:29770741:0,1,0,1
chr10	29770750	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=158,126;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29770741_A_T:29770741:0,1,0,1
chr10	29776289	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=218,188;MMQ=40,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr10	29777558	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,160;MMQ=52,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,4:2,8:2,1,5,7
chr10	29777681	.	A	ATCACC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,60;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:29777681_A_ATCACC:29777681:3,5,1,1
chr10	29777682	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,60;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:29777681_A_ATCACC:29777681:3,5,1,1
chr10	29782066	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	29782400	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=208,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,0:1,3:0,3,2,1
chr10	29783813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,8:2,2:4,2,9,1
chr10	29783984	.	GAAACT	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=83,176;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,1,6
chr10	29784003	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=83,187;MMQ=39,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:4,2:5,6,1,3
chr10	29784004	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=176,83;MMQ=39,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:2,7,4,2
chr10	29784072	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=93,258;MMQ=52,33;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:8,4,1,2
chr10	29784114	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,3,8
chr10	29784188	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:29784188_A_G:29784188:0,0,2,4
chr10	29784190	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:29784188_A_G:29784188:0,0,2,4
chr10	29801848	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=154,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr10	29801887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	29812602	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:6,5,3,1
chr10	29818604	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:4,7:4,7:8,1,12,2
chr10	29818827	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,6:0,0:0,3,0,6
chr10	29818851	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:8,2:0,0:0|1:29818851_GCA_G:29818851:0,8,0,2
chr10	29818855	.	T	TGC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,2:0,0:0|1:29818851_GCA_G:29818851:0,7,0,2
chr10	29818857	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:7,1:0,0:0|1:29818851_GCA_G:29818851:0,7,0,2
chr10	29820070	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr10	29821162	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:1,4:1,6,0,7
chr10	29821201	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr10	29821523	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:3,10:4,9:3,4,10,9
chr10	29833998	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0|1:29833998_A_G:29833998:0,0,6,11
chr10	29834003	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0|1:29833998_A_G:29833998:0,0,6,12
chr10	29834105	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=259,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29834105_C_T:29834105:0,1,0,1
chr10	29834114	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=259,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29834105_C_T:29834105:0,1,0,1
chr10	29839513	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr10	29840038	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,16:0,0,22,13
chr10	29843775	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,0:6,3:7,7,1,2
chr10	29843833	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,12,8
chr10	29844067	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr10	29891321	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=95,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:0,3,1,4
chr10	30316318	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	30317073	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,6:0,17:0,0,10,13
chr10	30336469	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,1:16,2:14,15,2,1
chr10	30602521	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=119,28750;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:30602521_A_T:30602521:15,2,0,2
chr10	30602525	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=119,28750;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:30602521_A_T:30602521:15,2,0,2
chr10	30605169	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:1,1:2,0:2,3,1,3
chr10	30611614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	30615392	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=97,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:22,0:26,2:0|1:30615392_T_A:30615392:28,20,1,1
chr10	30615395	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:21,0:21,2:0|1:30615392_T_A:30615392:26,19,1,1
chr10	30615638	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	30625998	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=187,116;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:30625998_C_A:30625998:0,4,0,1
chr10	30626000	.	G	GTGGAATTCTATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=187,116;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:30625998_C_A:30625998:0,4,0,1
chr10	30626002	.	T	TATTACCTTTTCTGTGATTGTGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=187,116;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:30625998_C_A:30625998:0,4,0,1
chr10	30629082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	30637995	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:3,2:6,7:8,1,8,1
chr10	30638075	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,8:0.098:89:39,0:40,8:56,25,8,0
chr10	30638208	.	T	TAAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=162,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,25;RU=A;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.556:22:2,3:2,4:3,7,5,7
chr10	30638218	.	A	AAAC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.380:31:6,5:12,7:8,11,3,9
chr10	30728361	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.200:22:8,1:9,3:3,15,0,4
chr10	30739306	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:17,8:10,0:17,10,8,0
chr10	30748225	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.208:30:9,0:15,5:18,6,0,6
chr10	30901722	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.462:13:3,1:4,5:5,2,3,3
chr10	30901756	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:8,3:8,6:7,9,5,4
chr10	30915260	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	30918486	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=111,0;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:0|1:30918486_G_A:30918486:7,6,0,2
chr10	30918492	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=111,0;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:0|1:30918486_G_A:30918486:7,6,0,2
chr10	31137513	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=97,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.297:45:20,13:12,0:17,15,13,0
chr10	31138531	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=118,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,3:8,0:10,13,1,2
chr10	31138817	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=37,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.638:28:7,13:2,5:8,2,9,9
chr10	31608075	.	GGGGGGAGGGGTGGAGGCGGAGGGGTGGGGGGGAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=112,156;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,3:1,0:16,0,3,0
chr10	31791529	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31791529_A_G:31791529:0,1,0,1
chr10	31791535	.	T	TCAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31791529_A_G:31791529:0,1,0,1
chr10	31791537	.	G	GCTTTGTGATGTTTGTTTTCCACTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31791529_A_G:31791529:0,1,0,1
chr10	31803516	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:0|1:31803516_G_A:31803516:6,1,5,3
chr10	31803541	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,3:0.180:20:11,2:5,1:1|0:31803516_G_A:31803516:10,7,2,1
chr10	31809834	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=66,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.604:28:5,6:5,11:6,5,7,10
chr10	31809845	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=126,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,1:12,0:0|1:31809845_G_A:31809845:7,15,1,1
chr10	31809849	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:0|1:31809845_G_A:31809845:7,15,1,1
chr10	31812911	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,217;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,3:12,0:17,5,3,0
chr10	31813130	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=265,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr10	32106657	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	32197683	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=105,203;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,0:2,7:0,7,0,7
chr10	32307534	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,0,8
chr10	32307536	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,0,8
chr10	32311969	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr10	32326999	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=151,127;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:0,2:11,1:11,0,3,0
chr10	32327037	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=145,93;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.498:16:5,2:2,4:5,3,6,2
chr10	32573852	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,2:10,1:13,6,2,1
chr10	32742256	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,13,4
chr10	32745314	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr10	32751526	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,4:6,4:10,3,7,1
chr10	32751901	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,17,8
chr10	32759918	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr10	32760089	.	TTGAAGAAC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,2:10,0:7,13,1,1
chr10	32806972	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:0,1:0,5,0,3
chr10	32806991	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	32832214	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:11,8:12,3:14,9,8,3
chr10	32833066	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:7,0,5,0
chr10	32854400	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr10	32912848	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:32912848_G_A:32912848:1,2,0,2
chr10	32912853	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:32912848_G_A:32912848:1,2,0,2
chr10	32974969	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,11:0,24:0,0,18,17
chr10	33015625	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:10,0:3,4:13,1,2,2
chr10	33015782	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr10	33015855	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	33017775	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=88,55;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.145:46:8,5:31,0:0|1:33017775_A_C:33017775:27,13,6,0
chr10	33017793	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=84,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:51,2:0.054:53:16,0:32,2:1|0:33017775_A_C:33017775:34,17,1,1
chr10	33017805	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=85,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:52,2:0.054:54:14,0:21,2:1|0:33017775_A_C:33017775:37,15,1,1
chr10	33018333	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:8,0:17,6:11,14,0,6
chr10	33018351	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,7,13
chr10	33093858	.	TAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.543:13:0,3:2,4:6,0,7,0
chr10	33103382	.	G	GAAAATCCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:2,4,1,1
chr10	33134696	.	T	TAC,TACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26,23;MFRL=0,147,138;MMQ=60,60,50;MPOS=27,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=AC;STR;TLOD=4.65,3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.442,0.437:4:0,1,1:0,1,1:0,0,4,0
chr10	33136818	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,3:5,3:3,4,2,4
chr10	33165226	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:4,2:11,4:10,6,6,0
chr10	33196108	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,1:2,2:0,7,0,6
chr10	33201123	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr10	33209266	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,5:0,15:0,0,9,11
chr10	33219008	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=16,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:1,0,1,3
chr10	33496576	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,5:6,7,4,3
chr10	33496676	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,31,17;MFRL=89,176,66;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.81,7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.240,0.478:10:0,0,1:2,2,0:1,2,2,5
chr10	33545464	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr10	33552518	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:33552518_A_C:33552518:1,0,3,0
chr10	33552522	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0|1:33552518_A_C:33552518:1,0,3,0
chr10	33619562	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	34408745	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,4:1,4:0,2,0,8
chr10	34420456	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,5:8,0:10,8,4,1
chr10	34606110	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=114,75;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,0:13,3:17,17,0,3
chr10	34619946	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:34619946_A_C:34619946:3,0,2,0
chr10	34619958	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:34619946_A_C:34619946:4,0,1,0
chr10	34636784	.	TTACATTAATATTACACTAATAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	34661555	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr10	34663981	.	AACACAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=226,3685;MMQ=57,43;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=AC;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	34666864	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr10	34671547	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=113,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,0:14,2:0|1:34671547_C_CA:34671547:17,19,1,1
chr10	34671551	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:20,0:17,2:0|1:34671547_C_CA:34671547:17,20,1,1
chr10	34688287	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,20:0,0,26,8
chr10	34690880	.	G	GAGAT	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.194:13:0,2:11,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:3,8,0,2
chr10	34690882	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:0,2:11,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:3,8,0,2
chr10	34690883	.	T	TTCCGTC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:0,2:11,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:3,8,0,2
chr10	34690891	.	CT	TA	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,24;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,2:6,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:0,7,0,2
chr10	34690895	.	CT	GG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:0,6,0,2
chr10	34690898	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=35,21;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0|1:34690880_G_GAGAT:34690880:0,6,0,2
chr10	34985197	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33,33;MFRL=171,93,126;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.86,11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.199,0.582:11:0,1,3:2,1,2:2,0,7,2
chr10	35314130	.	TAA	T,TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,24,27;MFRL=51,99,141;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.56,16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,10:0.361,0.527:21:2,4,3:1,3,7:2,1,4,14
chr10	35320355	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr10	35320383	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr10	35322024	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr10	35324076	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,30:0.915:32:0,15:2,14:1,1,22,8
chr10	35327766	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr10	35328088	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	35333599	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:6,0:13,2:9,10,0,2
chr10	35343497	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=95,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,7:1,4:1,1,1,10
chr10	35343525	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr10	35360310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr10	35437239	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:5,5:2,0:6,1,3,2
chr10	35437491	.	T	TGTCTCTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	35464778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:11,1:7,4:11,7,3,2
chr10	35484949	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,14:0,0,19,8
chr10	35490525	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr10	35805573	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:15,0:6,2:0|1:35805573_C_T:35805573:16,6,1,1
chr10	35805577	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,0:5,2:0|1:35805573_C_T:35805573:16,6,1,1
chr10	35819078	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:9,11,2,1
chr10	35842179	.	C	CATGT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:35842179_C_CATGT:35842179:1,7,0,2
chr10	35842181	.	T	TTTC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:35842179_C_CATGT:35842179:1,7,0,2
chr10	35842184	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:35842179_C_CATGT:35842179:1,7,0,2
chr10	35842186	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:35842179_C_CATGT:35842179:1,6,0,2
chr10	35894666	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr10	35897533	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=100,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,0:12,8:13,8,3,5
chr10	35928224	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr10	35930463	.	G	GTGTGTGGGAGAATGACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	36812344	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=105,44;MMQ=52,57;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:12,2:8,1:9,12,1,2
chr10	36812350	.	T	TCCCA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=128,44;MMQ=52,57;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:9,0:10,13,1,1
chr10	36812362	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=162,92;MMQ=52,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:11,6:6,4:10,7,6,4
chr10	36813180	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.534:28:9,9:3,6:0|1:36813180_T_A:36813180:5,8,3,12
chr10	36813198	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=108.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,16:0,9:0|1:36813180_T_A:36813180:0,0,2,24
chr10	36813218	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.616:24:6,7:3,8:0|1:36813180_T_A:36813180:0,9,0,15
chr10	37414827	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,0,2
chr10	37440893	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,63;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:4,1,1,1
chr10	37441072	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.353:29:12,4:7,6:8,11,5,5
chr10	37447358	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:8,3,1,1
chr10	37451644	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=103,147;MMQ=52,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,2:8,4:8,9,2,4
chr10	37454048	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,117;MMQ=55,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:7,8:1,12:5,3,10,10
chr10	37505099	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr10	37505179	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.260:44:18,6:14,5:20,13,7,4
chr10	37508450	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=79,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:7,6:3,2:6,4,3,5
chr10	38120813	.	TTTCTCCCCTGTGTGTGTTCTCTGATGCACAGTGAGGGCTGATCTGTGGCAGAAGGATTTCCCACATGCATTACATTCATAGGGC	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,22:0.134:70:5,9:8,10:25,23,10,12
chr10	38121743	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:3,6:0,8:1,2,8,6
chr10	38246545	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	38260574	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,2:8,0:0|1:38260574_C_A:38260574:10,7,2,0
chr10	38260617	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.110:52:23,5:16,0:0|1:38260574_C_A:38260574:13,34,2,3
chr10	38301353	.	G	GTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=128,152;MMQ=45,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=22,28;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.831:5:1,1:0,0:0,1,0,4
chr10	38344413	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,3:15,0:6,15,1,2
chr10	38385441	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:4,3:5,3:8,2,4,2
chr10	38407222	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=128,48;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:38407222_G_A:38407222:5,11,1,1
chr10	38407234	.	CT	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=141,48;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:38407222_G_A:38407222:5,8,1,1
chr10	38407239	.	CA	TT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=148,48;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:38407222_G_A:38407222:4,7,1,1
chr10	38672116	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,71;MMQ=33,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,2:6,1:7,10,1,2
chr10	38672144	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=134,152;MMQ=33,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:3,3:2,8:1,4,9,2
chr10	38681866	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=146,148;MMQ=24,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr10	38682079	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=95,130;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr10	42905431	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=238,203;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr10	42905510	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr10	42905741	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr10	42922568	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:0|1:42922568_A_G:42922568:5,0,6,0
chr10	42922579	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,2:3,0,5,0
chr10	42922595	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0|1:42922568_A_G:42922568:6,0,3,0
chr10	42924560	.	TCACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:7,3:8,3:9,10,1,5
chr10	42928605	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=72,208;MMQ=53,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr10	42928759	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:16,2:8,1:0|1:42928759_G_T:42928759:17,8,0,3
chr10	42928764	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:17,2:7,1:0|1:42928759_G_T:42928759:14,10,0,3
chr10	42941685	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	43132232	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:6,1:1,1:7,0,2,0
chr10	43232419	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,166;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr10	43280057	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,0:0,7:0,0,1,6
chr10	43291861	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:10,0,4,1
chr10	43291992	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.181:53:23,0:21,9:15,29,8,1
chr10	43292637	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:8,15,1,1
chr10	43292830	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:4,3,3,3
chr10	43312227	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=163,168;MMQ=45,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr10	43313010	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr10	43316170	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=101,140;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:4,3:11,3:6,9,3,3
chr10	43318776	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=145,209;MMQ=40,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr10	43325664	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=115,117;MMQ=52,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:4,5:11,4:10,5,7,3
chr10	43595836	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.516:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr10	43600689	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:1,4,1,4
chr10	43606687	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr10	43607651	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,0;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:12,3:18,0:17,15,0,3
chr10	43607756	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,2:2,4:0|1:43607756_G_A:43607756:1,3,1,6
chr10	43607759	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0|1:43607756_G_A:43607756:1,4,1,4
chr10	43609862	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	43612205	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:1,0:1,1:0|1:43612205_C_T:43612205:2,1,1,0
chr10	43612208	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=78,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:0,1:0|1:43612205_C_T:43612205:1,1,1,0
chr10	43613843	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:9,3:7,3:9,7,5,2
chr10	43614000	.	CCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,4:1,4:0,2,0,9
chr10	43620396	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=98,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:7,4:9,0:9,7,2,2
chr10	43622217	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:4,5,0,3
chr10	43659536	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,4:1,1:1,5,1,4
chr10	43671378	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.509:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	43671404	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:2,0:5,0:3,4,3,0
chr10	43671415	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:4,0:6,0:7,5,2,0
chr10	43694363	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,2:8,3:4,6,3,2
chr10	43695049	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	43696086	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr10	43698240	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	43698863	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=112,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:19,0:16,3:22,13,1,2
chr10	43870059	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:21,0:9,4:9,22,0,4
chr10	43871112	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=105,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.308:21:7,6:5,0:12,3,6,0
chr10	43882543	.	G	GTAAGTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,0:6,0,1,1
chr10	43883388	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.505:8:2,2:1,1:0,4,0,4
chr10	43932479	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	43971168	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=90,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:8,4:12,0:10,10,3,1
chr10	43976983	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=73,85;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,7:3,6,4,7
chr10	44104230	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,0:14,7:4,21,1,6
chr10	44104894	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=118,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr10	44868856	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr10	44871548	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	44873992	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr10	44874216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,2,1
chr10	44876243	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,57;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,4:4,0:8,7,4,0
chr10	45423282	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=247,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,5,2
chr10	45430065	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr10	45430394	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:7,3,4,5
chr10	45430462	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.688:27:4,10:4,8:4,4,13,6
chr10	45430605	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr10	45473552	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=250,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr10	45479557	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:45479557_C_T:45479557:2,6,1,1
chr10	45479567	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=144,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:45479557_C_T:45479557:1,6,1,1
chr10	45479568	.	G	GAAAAAAAATGTGAATGGGGTATGTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,2:0|1:45479557_C_T:45479557:1,6,1,1
chr10	45499712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=98,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,0:5,3:7,9,2,1
chr10	45499886	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:45499886_TC_T:45499886:0,0,10,1
chr10	45499897	.	A	AAAAATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=60.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,5:0,4:0|1:45499886_TC_T:45499886:0,0,11,3
chr10	45500391	.	AG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=118,151;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=62.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:7,0:13,19:12,8,0,19
chr10	45869895	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0|1:45869895_A_G:45869895:2,4,1,6
chr10	45869903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:1,3:0|1:45869895_A_G:45869895:2,3,1,4
chr10	45877899	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,1:6,4:4,3,4,1
chr10	45877991	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:11,3,2,1
chr10	45878050	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:10,10:7,7:10,7,10,8
chr10	45919510	.	CC	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:13,0:7,2:12,8,1,1
chr10	45924023	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr10	45924256	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr10	45938389	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=221,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:45938389_C_CT:45938389:1,0,3,0
chr10	45938394	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=221,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:45938389_C_CT:45938389:1,0,3,0
chr10	45939136	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr10	45941191	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr10	46121592	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:12,0:17,6:12,17,0,6
chr10	46960084	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,94;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:3,6,0,2
chr10	46963738	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,197;MMQ=34,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	46965988	.	C	CTAGAGGGATAGCTAAAGCATCCAAATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	46967616	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:12,3:18,2:15,15,3,2
chr10	46967672	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:6,7:13,10:6,13,10,8
chr10	46968762	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=188,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr10	46969496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=220,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr10	46999577	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=93,168;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:4,2:5,0:8,2,2,1
chr10	46999591	.	C	CATGAGGGAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGAGGGAG;STR;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,3:2,1,6,2
chr10	46999596	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,3:5,1:8,2,2,2
chr10	46999604	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr10	47000071	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,6:4,6,4,8
chr10	47000079	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,4:6,5:3,9,3,7
chr10	47086978	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,10:0.128:83:45,8:26,2:49,24,5,5
chr10	47086994	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=118,121;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,8:0.108:81:46,8:27,0:43,30,8,0
chr10	47087037	.	TCTCTGACTTC	T	.	.	DP=57;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:19,1:20,1:0|1:47087037_TCTCTGACTTC_T:47087037:16,34,0,2
chr10	47087054	.	TGCCTC	T	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:17,1:19,1:0|1:47087037_TCTCTGACTTC_T:47087037:9,31,0,2
chr10	47087064	.	GCCAGCCGCTGACCGCCGTC	G	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:13,1:18,1:0|1:47087037_TCTCTGACTTC_T:47087037:11,32,0,2
chr10	47087075	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.212:36:12,0:11,7:8,21,0,7
chr10	47087085	.	ACACCATCATGGACTACTGGATCTTTGGAGAGACCCTCTGCAAGATGTCGGCCTTCATCCAGTGCATGTC	A	.	.	DP=53;ECNT=7;MBQ=23,24;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=-33;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.056:52:12,1:11,1:23,27,0,2
chr10	47087474	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,6:1,10:1,1,7,9
chr10	47087680	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=69,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,25:0.809:31:0,10:4,15:3,3,13,12
chr10	47746978	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,138;MMQ=27,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:3,0,5,2
chr10	47747092	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,142;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:5,5,1,6
chr10	47755942	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=109,294;MMQ=49,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,2,0
chr10	47756004	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr10	47756145	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr10	47911707	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47911707_A_G:47911707:0,0,0,1
chr10	47911710	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47911707_A_G:47911707:0,0,0,1
chr10	47911714	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,250;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47911707_A_G:47911707:0,0,0,1
chr10	47946825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,179;MMQ=27,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr10	48373576	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.550:14:1,3:5,5:4,2,5,3
chr10	48373663	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,4:1,8:1,1,4,8
chr10	48383977	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,2:10,1:12,12,0,3
chr10	48386110	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr10	48388062	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.190:14:3,0:7,2:2,10,1,1
chr10	48414570	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	48426798	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr10	48429650	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	48438734	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,2:0,6:0,0,3,10
chr10	48771423	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	49207873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,254;MMQ=24,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	49319261	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=120,68;MMQ=40,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:49319261_C_T:49319261:8,9,1,1
chr10	49319270	.	GG	CA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,68;MMQ=37,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:5,2:0|1:49319261_C_T:49319261:7,8,1,1
chr10	49319300	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	49319323	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	49380938	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	49386122	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=115,81;MMQ=25,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:11,8,0,3
chr10	49392575	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr10	49415071	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49415071_C_CAT:49415071:0,0,0,1
chr10	49415073	.	T	TACTTATTCATAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49415071_C_CAT:49415071:0,0,0,1
chr10	49450443	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	49457214	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.648:23:1,6:6,9:5,3,6,9
chr10	49633873	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:49633873_T_TAC:49633873:0,0,3,0
chr10	49633875	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:49633873_T_TAC:49633873:0,0,3,0
chr10	49633877	.	A	AATACATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:49633873_T_TAC:49633873:0,0,4,0
chr10	49633879	.	T	TTGTAAATG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0|1:49633873_T_TAC:49633873:0,0,5,0
chr10	49639156	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,176;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:2,0:0|1:49639156_A_C:49639156:7,2,2,0
chr10	49639158	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=142,176;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:49639156_A_C:49639156:7,2,2,0
chr10	49654342	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	49654403	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,7,2
chr10	49654555	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:17,4:33,0:38,13,3,1
chr10	49654570	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,7:0.153:50:24,7:18,0:22,21,6,1
chr10	49658248	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr10	49661341	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,14,11
chr10	49667713	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr10	49668017	.	GTTAGGGCTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	49687556	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	49687594	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,16:0,1:0,0,15,2
chr10	49732268	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	49791266	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=223,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr10	49917927	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:7,7,2,0
chr10	49929339	.	GGTGGAAGGGGGAC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,0:13,2:15,16,1,1
chr10	49939077	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr10	49939139	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,7:3,4:4,2,6,5
chr10	49939261	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,12:10,0:7,8,12,0
chr10	49983890	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,5:0,10:0,0,2,13
chr10	49985130	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr10	49998063	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:5,3:2,7:1,6,3,7
chr10	49998707	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr10	49998712	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr10	49998768	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=112,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:11,5:10,0:13,8,5,0
chr10	49998824	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:7,2:5,10:8,4,7,6
chr10	50031212	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.371:9:2,2:4,0:2,4,3,0
chr10	50036976	.	G	GTAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.343:4:2,1:1,0:3,0,0,1
chr10	50038720	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,3:0,0:1,2,2,1
chr10	50038800	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=109,76;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.892:25:0,10:2,13:1,1,11,12
chr10	50038919	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:5,2:0|1:50038919_A_C:50038919:10,5,1,1
chr10	50038924	.	T	TTGAGAGCAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:5,2:0|1:50038919_A_C:50038919:10,5,1,1
chr10	50040562	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	50040610	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr10	50075209	.	TGT	AAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=157,59;MMQ=52,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,1,1
chr10	50075461	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,2,3
chr10	50085267	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=78,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,2,5
chr10	50098566	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr10	50121425	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:1,1,4,0
chr10	50165411	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	50177158	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr10	50186317	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr10	50227870	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr10	50256687	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:0,1:0,3,0,2
chr10	50293956	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:8,3:10,0:16,2,2,1
chr10	50373832	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:3,6,6,4
chr10	50374819	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr10	50376106	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=256,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr10	50530618	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:13,8:10,0:12,11,8,0
chr10	50532683	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr10	50574479	.	G	GCCCTGTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,2:4,0:0|1:50574479_G_GCCCTGTTA:50574479:0,5,1,1
chr10	50574481	.	G	GAGTATGGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,1:3,0:0|1:50574479_G_GCCCTGTTA:50574479:0,5,1,1
chr10	50667283	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,0:5,9:0,7,0,9
chr10	50679068	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:50679068_G_A:50679068:6,5,1,1
chr10	50679072	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:4,0:0|1:50679068_G_A:50679068:7,5,1,1
chr10	50680422	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,7:1,6:1,2,10,3
chr10	50680523	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,39050873;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,0:1,2:1,7,0,2
chr10	50681138	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=220,195;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.295:42:25,0:3,12:0,30,0,12
chr10	50691009	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr10	50691360	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr10	50701156	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,11:0,14:0,0,19,7
chr10	50820345	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,5:0,4:0,0,6,5
chr10	50820375	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=174,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0|1:50820375_C_CA:50820375:2,6,1,1
chr10	50820376	.	C	CACACAAACACACAAACACACAAA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=174,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0|1:50820375_C_CA:50820375:2,6,1,1
chr10	50820378	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,0:0|1:50820375_C_CA:50820375:2,6,1,1
chr10	50822192	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	50822226	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr10	50824117	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr10	50824561	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=57,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:8,5,1,1
chr10	50824573	.	A	AGCAGCATCACCTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:11,2:8,8,1,1
chr10	50828506	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	50828612	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:50828612_C_T:50828612:7,9,1,1
chr10	50828620	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=117,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:50828612_C_T:50828612:6,8,1,1
chr10	50856738	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=213,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50856738_TA_CT:50856738:0,1,0,1
chr10	50856745	.	AGATG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=196,109;MMQ=56,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:50856738_TA_CT:50856738:1,1,0,1
chr10	50856752	.	TTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,22;MFRL=179,109;MMQ=51,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50856738_TA_CT:50856738:1,0,0,1
chr10	50863083	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	50863565	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	50887651	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	50901809	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,9,7
chr10	50916484	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,11,16
chr10	50943186	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	50944009	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	50944215	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:1,2:3,0:0|1:50944215_T_A:50944215:2,4,1,1
chr10	50944218	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,1:3,0:0|1:50944215_T_A:50944215:3,4,1,1
chr10	50944613	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	50945905	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:50945905_C_A:50945905:6,6,1,1
chr10	50945911	.	GGGAAATACACGCC	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:4,2:0|1:50945905_C_A:50945905:6,8,1,1
chr10	50945928	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:50945905_C_A:50945905:3,5,1,1
chr10	50945982	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,2:2,0:6,4,0,2
chr10	50946315	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=125,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:0|1:50946315_GC_G:50946315:2,7,0,2
chr10	50946319	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=125,249;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:50946315_GC_G:50946315:2,7,0,2
chr10	50947918	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	50952851	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=74,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:2,7:1,4:1,2,1,10
chr10	50959782	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	51225563	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=124,101;MMQ=50,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:2,3,1,3
chr10	51361763	.	G	GTCATCCTCCTGCCTCGGGCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,135738;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,0,2
chr10	51465131	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=203,178;MMQ=22,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	51549496	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr10	51556921	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr10	51573343	.	CA	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.092:64:8,0:37,5:38,21,3,2
chr10	51582964	.	T	TCCTCATCTCTACC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=169,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr10	51585564	.	GGA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=109,0;MMQ=60,32;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr10	51585565	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr10	51586514	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=393,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,4:0,2:1,1,6,0
chr10	51620278	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	51620499	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=184,146;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr10	51623024	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=150,137;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.723:27:3,7:4,13:6,1,15,5
chr10	51623052	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=150,138;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=120.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,30:0.689:43:4,13:8,15:0|1:51623052_C_CT:51623052:10,3,19,11
chr10	51623061	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=148,134;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,35:0.655:53:7,18:11,17:0|1:51623052_C_CT:51623052:13,5,21,14
chr10	51843781	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=176,133;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr10	51853687	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=129,150;MMQ=25,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51853687_G_A:51853687:1,0,1,0
chr10	51853692	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=129,150;MMQ=25,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51853687_G_A:51853687:1,0,1,0
chr10	51859927	.	T	TGTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	51970696	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=111,107;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr10	51978313	.	T	TGTAAATCATCCCAGTCAGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,189;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr10	51978399	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=315,70;MMQ=29,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr10	52003078	.	CC	TT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:9,14,1,1
chr10	52086939	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:5,3,3,1
chr10	52502801	.	TGC	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:34,0:15,2:0|1:52502801_TGC_T:52502801:29,22,1,1
chr10	52502810	.	G	GCA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=86,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:24,0:15,2:0|1:52502801_TGC_T:52502801:20,22,1,1
chr10	52502828	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,0:10,2:0|1:52502801_TGC_T:52502801:5,24,1,1
chr10	52576068	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr10	52610352	.	TTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,2:1,0:8,0,1,1
chr10	52619620	.	TGTGCGCTGGACCA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,2:7,0:16,11,1,1
chr10	52751070	.	A	AGCC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GCC;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.278:12:3,1:4,2:0|1:52751070_A_AGCC:52751070:9,0,3,0
chr10	52751088	.	C	CGCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,10:0.478:21:3,3:8,7:1|0:52751070_A_AGCC:52751070:8,3,8,2
chr10	53059494	.	C	CAACATGGTGAAACCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=200,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	53667443	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	53814229	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:2,1,5,1
chr10	53814383	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,2:0,9,0,3
chr10	53921754	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr10	54031047	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=134,128;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr10	54041861	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr10	54074660	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.585:39:14,15:2,7:8,8,14,9
chr10	54076271	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:9,8:7,4:3,13,8,5
chr10	54076649	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:1,7,0,4
chr10	54528266	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,260;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr10	54528298	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=192,312;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	55566406	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.736:32:2,6:6,18:3,5,12,12
chr10	55566438	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,24:0.715:33:4,10:5,14:4,5,11,13
chr10	55568875	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:17,2:26,3:19,25,1,4
chr10	55581979	.	AGAAATGAAGCTGAAGGAGGTGGAGGGCAAGGAATAGAAGGAGGTGGTGGAGGAAGAGGAGTTG	A	.	.	DP=161;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=90,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,3:0.025:156:40,0:17,3:100,53,0,3
chr10	55591313	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr10	55663119	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:5,2:0|1:55663119_T_C:55663119:6,11,1,1
chr10	55663121	.	GCTGTATTGCCTGGAGGACAAGAAACGA	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=97,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:10,0:3,2:0|1:55663119_T_C:55663119:6,12,1,1
chr10	55663158	.	T	TCCCCCATGA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=126,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr10	55663192	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:55663192_G_A:55663192:0,2,0,1
chr10	55663198	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=286,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55663192_G_A:55663192:0,1,0,1
chr10	55663202	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=286,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55663192_G_A:55663192:0,1,0,1
chr10	55719578	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:0|1:55719578_C_T:55719578:10,14,1,1
chr10	55719580	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:8,0:16,2:0|1:55719578_C_T:55719578:10,14,1,1
chr10	55719652	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr10	55779915	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr10	55782747	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.229:37:10,0:19,8:17,12,3,5
chr10	55826470	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr10	55892600	.	T	TAC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.431:21:7,4:5,5:9,3,4,5
chr10	55943184	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr10	55973889	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	55996761	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	56076975	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr10	56077209	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,3,7
chr10	56089263	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	56129066	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,2:1,5:0,2,1,6
chr10	56367784	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56367784_A_C:56367784:1,0,0,1
chr10	56367790	.	T	TTTTGTCTCCAAGTCTCAGTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56367784_A_C:56367784:1,0,0,1
chr10	56424102	.	A	AAGAGTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr10	58118808	.	A	AGGATTAGGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	58119976	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr10	58121034	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:1,2,2,4
chr10	59958956	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,1:2,2:7,3,2,1
chr10	59975862	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:2,2,2,0
chr10	59975889	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=98,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:3,3,2,1
chr10	59997644	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=39,29;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr10	60027099	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:7,3:4,2:11,0,5,0
chr10	60027122	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:12,6:11,3:17,6,9,0
chr10	60029163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	60036815	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,8:5,0:8,1,7,1
chr10	60094912	.	C	CACCCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=109,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,1,1
chr10	60121081	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,4:5,2:12,3,5,1
chr10	60145919	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:5,4:8,0:0|1:60145919_A_T:60145919:10,3,5,0
chr10	60145924	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,4:6,0:0|1:60145919_A_T:60145919:11,3,5,0
chr10	60148676	.	T	TTTGGGCTGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	60273121	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:1,8,2,0
chr10	60273189	.	ACGGC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	60548276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=148,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr10	60558125	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	60559047	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=224,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,1,2
chr10	60560115	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=125,59;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,0:13,2:7,14,1,1
chr10	60560126	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=144,59;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:10,2:0|1:60560126_A_G:60560126:5,13,1,1
chr10	60560128	.	T	TGG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=154,59;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:11,2:0|1:60560126_A_G:60560126:4,14,1,1
chr10	60560130	.	G	GTATAGGAATGCTTCT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=154,59;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:60560126_A_G:60560126:4,14,1,1
chr10	60563062	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	60588553	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=78,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,5:0,3:3,3,6,2
chr10	60937456	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,5:5,3:3,8,3,5
chr10	60996453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	61007534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr10	61007592	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	61014056	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr10	61022485	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:61022485_C_G:61022485:0,0,0,1
chr10	61022486	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61022485_C_G:61022485:0,0,0,1
chr10	61022489	.	T	TTTTCTCTATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61022485_C_G:61022485:0,0,0,1
chr10	61022490	.	G	GCATTCATC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61022485_C_G:61022485:0,0,0,1
chr10	61062538	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:2,3:8,1:8,3,3,1
chr10	61083690	.	A	AGTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	61122268	.	T	TTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,4,13
chr10	61412528	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=87,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:7,6:4,5:5,6,8,3
chr10	61412677	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=97,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:3,6:4,11:3,4,8,9
chr10	61412702	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:0|1:61412702_A_C:61412702:2,11,0,2
chr10	61412704	.	C	CTTTTTAAAGCTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:5,1:0|1:61412702_A_C:61412702:2,11,0,2
chr10	61412717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,6:1,5:0,1,1,10
chr10	61413929	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,8:4,6:4,3,11,3
chr10	61414007	.	C	CTCAGTCTGTCTTCTGCTGTTGTA	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=100,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:20,0:37,2:31,30,1,1
chr10	61423910	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr10	61424114	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:7,3:0,7:4,3,3,8
chr10	61432427	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,8:0,2:2,0,9,1
chr10	61443808	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,3,1
chr10	61552692	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=77,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.528:30:7,8:7,7:9,5,12,4
chr10	61552714	.	AGTAGGCTGCGAGGTGGCTGCTGAGGG	A	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,5:0.080:73:27,2:21,0:0|1:61552714_AGTAGGCTGCGAGGTGGCTGCTGAGGG_A:61552714:43,25,1,4
chr10	61552748	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,5:0.105:55:28,5:21,0:0|1:61552714_AGTAGGCTGCGAGGTGGCTGCTGAGGG_A:61552714:36,14,1,4
chr10	61552968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	61574357	.	AAC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=82,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AC;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.194:22:8,0:8,4:10,8,0,4
chr10	61612466	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.666:9:1,3:2,3:1,2,2,4
chr10	61665886	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,3:5,5:6,4,6,2
chr10	61718749	.	T	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=113,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.063:75:19,0:49,4:44,27,0,4
chr10	61718801	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.510:53:14,13:12,14:9,17,8,19
chr10	61719232	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,2,2
chr10	61719444	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=98,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.180:42:20,7:15,0:12,23,7,0
chr10	61719471	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=117,37;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:27,2:13,0:19,22,0,2
chr10	61802342	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr10	61802353	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	61802374	.	AA	TT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr10	61802550	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,13:0,9:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,9,14
chr10	61802561	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,7:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,7,13
chr10	61802577	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,2,7
chr10	61815335	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	61819049	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr10	61819276	.	C	CCTCATCTATGACCATGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	61823109	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	61828636	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:14,2:12,13,2,1
chr10	61831126	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.311:8:3,0:3,2:0|1:61831126_T_A:61831126:0,6,1,1
chr10	61831132	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.280:9:3,0:4,2:0|1:61831126_T_A:61831126:0,7,1,1
chr10	61831502	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:3,5,1,3
chr10	61832924	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,3:8,6:9,4,2,7
chr10	61833441	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:4,0:5,3:5,5,2,1
chr10	61834566	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=90,196;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:24,4:7,0:13,18,4,0
chr10	61835027	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:17,2:11,1:15,13,2,1
chr10	61846526	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:18,3:10,0:15,13,3,0
chr10	61846677	.	C	CTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=T;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,0:2,0:0,3,0,4
chr10	61900067	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=135,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:20,4:20,0:20,21,3,1
chr10	61926728	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr10	61932718	.	C	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,30:0.508:59:11,16:18,14:10,19,18,12
chr10	61965458	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr10	62021664	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:6,7,2,1
chr10	62444453	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=106,87;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,0:17,3:13,13,0,3
chr10	62444965	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:4,7,1,5
chr10	62445137	.	ATAAAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,2:0|1:62445137_ATAAAAC_A:62445137:1,4,0,2
chr10	62445147	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:62445137_ATAAAAC_A:62445137:1,4,0,2
chr10	62445150	.	GAGTGAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:0,2:0|1:62445137_ATAAAAC_A:62445137:1,5,0,2
chr10	62445174	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	62540063	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr10	62551762	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,0:7,4:8,10,1,3
chr10	62551889	.	AA	GT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=56.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.635:28:4,10:6,8:7,3,13,5
chr10	62551890	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=234,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.930:29:0,15:1,13:1,0,19,9
chr10	62553763	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:2,8:7,9:3,6,3,14
chr10	62631225	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=94,160;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:62631225_T_G:62631225:14,7,2,0
chr10	62631230	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=94,160;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:62631225_T_G:62631225:15,8,2,0
chr10	62671305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.527:15:6,4:1,4:2,5,2,6
chr10	63170292	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.601:38:7,15:8,8:8,7,9,14
chr10	63196058	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=92,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	63422754	.	G	GGGGCCGACCCCGGCA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=104.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,9:0,11:0,0,14,11
chr10	63520006	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:0,6,0,6
chr10	63520698	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,9:0,25:0,0,14,20
chr10	63699879	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:11,4:7,0:16,2,4,0
chr10	63699895	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=114.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,12:0,0,24,9
chr10	63700228	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	63700245	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	63760087	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:1,2:5,1:2,5,2,3
chr10	63943986	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	63944176	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr10	63944188	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,2:2,3:0,4,0,6
chr10	63977011	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,16;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:1,0:1,3,1,2
chr10	63977980	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:5,4,2,4
chr10	64005711	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:6,8:11,9:14,3,14,3
chr10	64136697	.	T	TATA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:64136697_T_TATA:64136697:0,3,0,1
chr10	64136700	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:64136697_T_TATA:64136697:0,3,0,1
chr10	64136702	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:64136697_T_TATA:64136697:0,3,0,1
chr10	64136706	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:64136697_T_TATA:64136697:0,3,0,1
chr10	64136710	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr10	64136751	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	64148125	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr10	64148369	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,13:0,3:0,0,2,14
chr10	64158580	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=71,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,8:5,2:5,5,3,7
chr10	64239709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr10	64403852	.	CCAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	64414530	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=159,109;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:2,2:7,1:8,2,3,0
chr10	64415031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr10	64426056	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr10	64566571	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,1:14,1:9,9,2,0
chr10	64573312	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=238,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:0,4,3,3
chr10	64911870	.	TGAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,5:5,6:6,2,8,3
chr10	64911911	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.497:26:5,7:8,5:8,5,11,2
chr10	64913266	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:6,0,9,0
chr10	64914016	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=105,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:0,2:5,5:1,4,2,5
chr10	64937415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:4,0,7,1
chr10	64937501	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:5,2:11,10,2,0
chr10	64937628	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,3:4,0:0,7,0,3
chr10	64944317	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	64953311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	64967915	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.092:41:25,0:12,3:0|1:64967915_C_T:64967915:22,16,0,3
chr10	64967921	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:40,2:0.068:42:23,2:16,0:1|0:64967915_C_T:64967915:21,19,1,1
chr10	64967924	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:40,2:0.068:42:24,2:14,0:1|0:64967915_C_T:64967915:21,19,1,1
chr10	64974271	.	TTTTGCA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTGCA;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,0:10,2:7,12,1,1
chr10	64976886	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr10	65140040	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:5,4:6,0,3,1
chr10	65225244	.	GA	CG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:3,0,6,3
chr10	65225245	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.925:12:0,8:0,3:0,0,9,3
chr10	65357965	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=130,150;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:65357965_T_C:65357965:0,1,0,1
chr10	65357967	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=130,150;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:65357965_T_C:65357965:0,1,0,1
chr10	65357974	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=130,150;MMQ=60,46;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:65357965_T_C:65357965:0,1,0,1
chr10	65370041	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=65,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,17:0.315:55:8,5:30,12:28,10,8,9
chr10	67726514	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=91,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,1:1,5:1,5,1,5
chr10	68040325	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,2:1,2,4,5
chr10	68526204	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr10	68940115	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,1:6,1:8,7,1,1
chr10	69281585	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:2,4:6,2:7,2,6,1
chr10	69571176	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr10	69583206	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	69583216	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=165,138;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:69583216_T_C:69583216:0,3,0,1
chr10	69583219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=165,138;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:69583216_T_C:69583216:0,3,0,1
chr10	69583240	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=95,165;MMQ=56,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69583240_A_G:69583240:0,2,0,1
chr10	69583242	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=95,165;MMQ=56,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69583240_A_G:69583240:0,2,0,1
chr10	69647143	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=122,121;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.209:36:15,6:13,1:15,14,7,0
chr10	69647332	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr10	69648569	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	69651125	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr10	69666142	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	69682637	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=144,140;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,3:4,0:6,2,3,0
chr10	69684966	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=130,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,0:6,7:1,9,0,7
chr10	69692330	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr10	69716602	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:2,2:6,2:7,1,4,0
chr10	69726631	.	AGACG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=263,230;MMQ=58,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr10	69726652	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=203,273;MMQ=50,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	69750213	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=80,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.747:7:1,3:0,1:1,1,2,3
chr10	69750788	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.952:16:0,6:0,7:0,0,7,9
chr10	69799100	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,14;MFRL=85,81;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.197:31:9,0:6,3:9,15,4,3
chr10	69804176	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:16,0:7,2:14,9,2,0
chr10	69902766	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:7,1:8,12,1,1
chr10	69925493	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:11,5:7,0:14,6,5,0
chr10	69926097	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,26:0.730:35:6,9:3,16:3,6,15,11
chr10	69926222	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:13,0:10,6:11,12,0,6
chr10	69934354	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=73,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,0:10,4:9,14,0,4
chr10	69935059	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,8:3,2:5,2,6,4
chr10	69935235	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr10	69954301	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=264,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr10	69955140	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:4,0,4,2
chr10	69959097	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:8,2,7,2
chr10	69961501	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,9,0
chr10	69961537	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:1,1:4,4:5,2,5,0
chr10	69969986	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr10	69970222	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr10	70043916	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:2,5:5,11:7,0,8,8
chr10	70044937	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:8,2:10,0,4,0
chr10	70045201	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr10	70051808	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=48,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.627:17:5,7:1,3:3,3,6,5
chr10	70051810	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:9,4:5,1:8,6,2,3
chr10	70051928	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:3,2,2,1
chr10	70055967	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.447:20:4,5:7,4:7,4,6,3
chr10	70056600	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr10	70056619	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:2,0:5,2:6,2,2,1
chr10	70123791	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:12,0:8,4:14,6,2,2
chr10	70123836	.	CC	TT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:16,10,1,1
chr10	70143774	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,4:4,3:5,2,5,2
chr10	70153014	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr10	70174885	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:4,11:13,9:9,8,10,10
chr10	70174962	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.387:9:2,2:3,1:0,6,0,3
chr10	70179713	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	70182680	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr10	70196837	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:6,7,1,1
chr10	70206033	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=63,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,3:1,1:3,1,3,2
chr10	70243422	.	TG	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=0,226;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:70243422_TG_CT:70243422:0,3,0,1
chr10	70243426	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=0,226;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:70243422_TG_CT:70243422:0,3,0,1
chr10	70243433	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70243433_G_C:70243433:0,4,0,1
chr10	70243434	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70243433_G_C:70243433:0,4,0,1
chr10	70243439	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,0:2,1:0|1:70243433_G_C:70243433:0,4,0,1
chr10	70246874	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:5,6:3,4:5,3,5,5
chr10	70252822	.	GA	G,GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=152,89,96;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=9.67,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,4:0.445,0.232:18:3,5,2:1,2,1:4,1,10,3
chr10	70252947	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=91,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:0|1:70252947_AC_A:70252947:5,11,0,2
chr10	70252952	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=91,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:70252947_AC_A:70252947:5,11,0,2
chr10	70252960	.	T	TCTATGG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:0|1:70252947_AC_A:70252947:4,9,0,2
chr10	70253113	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	70266523	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=231,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr10	70266546	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr10	70332066	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:8,1,3,1
chr10	70332168	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:17,0:16,2:0|1:70332168_A_C:70332168:16,18,2,0
chr10	70332170	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:11,0:16,2:0|1:70332168_A_C:70332168:16,18,2,0
chr10	70333612	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,104;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:5,4,3,0
chr10	70333894	.	A	AAATATTTTGGATGAGTATAAAGAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=130,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr10	70446128	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:5,4,2,1
chr10	70446345	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:13,5:10,0:19,5,5,0
chr10	70496589	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:13,2:0|1:70496589_T_G:70496589:24,6,1,1
chr10	70496590	.	CTTAATCTTGATTTTTATTTTT	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=113,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:12,0:17,2:0|1:70496589_T_G:70496589:32,19,1,1
chr10	70497482	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=425,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr10	70502426	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr10	70506902	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=136,110,61;MMQ=60,60,60;MPOS=28,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=T;STR;TLOD=3.14,10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,10:0.106,0.305:31:10,2,5:6,1,3:10,8,8,5
chr10	70507105	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:7,6,3,0
chr10	70507170	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=110,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,3:21,0:27,13,3,0
chr10	70507390	.	A	ATTTTTCCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.485:2:1,0:0,0:0|1:70507390_A_ATTTTTCCTT:70507390:0,1,0,1
chr10	70507392	.	T	TTTTTTTACTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:70507390_A_ATTTTTCCTT:70507390:0,1,0,1
chr10	70508874	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:7,1,6,0
chr10	70517203	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:70517203_G_A:70517203:0,5,0,1
chr10	70517210	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:70517203_G_A:70517203:0,4,0,1
chr10	70546223	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	70645376	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,8,7
chr10	70646264	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:12,7,2,0
chr10	70646393	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=138,208;MMQ=53,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	70646439	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=171,208;MMQ=45,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr10	70646456	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=229,171;MMQ=43,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:70646456_G_A:70646456:0,1,0,2
chr10	70646459	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,18;MFRL=227,171;MMQ=42,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:0|1:70646456_G_A:70646456:0,2,0,2
chr10	70646466	.	CGAGGTCAAGAGA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=227,206;MMQ=42,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:70646456_G_A:70646456:0,2,0,1
chr10	70652272	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr10	70670776	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,1:7,4:8,2,5,0
chr10	70696908	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	70716106	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,7,18
chr10	70719513	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=167,201;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:11,5:3,0:0|1:70719513_T_A:70719513:14,0,0,5
chr10	70719520	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=159,201;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:10,5:3,0:0|1:70719513_T_A:70719513:12,1,0,5
chr10	70723322	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	70727051	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=162,211;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70727051_A_T:70727051:0,1,0,1
chr10	70727054	.	CTAGT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=162,211;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70727051_A_T:70727051:0,1,0,1
chr10	70727060	.	A	AAGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70727051_A_T:70727051:0,0,0,1
chr10	70731779	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=115,88;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,0:13,4:14,12,0,4
chr10	70731840	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,2:3,2:1,5,2,2
chr10	70734589	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr10	70734596	.	TTTAAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=182,135;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70734596_TTTAAAA_T:70734596:0,4,0,1
chr10	70734599	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.841:4:0,2:0,2:1|0:70734596_TTTAAAA_T:70734596:0,0,0,4
chr10	70742641	.	GCAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr10	70856760	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr10	70857079	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,191;MMQ=54,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr10	70928277	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:14,2:21,0:21,14,2,0
chr10	70946101	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	70960077	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:4,2,1,1
chr10	70962381	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	70968506	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=108,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,0:11,4:13,8,0,4
chr10	70968804	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:3,1:3,4,0,3
chr10	70987024	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:17,5:14,4:18,13,5,4
chr10	70992716	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr10	70992912	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:5,3,0,4
chr10	70992949	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=94,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,1:2,1:1,6,0,2
chr10	70992970	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,0,4
chr10	70998738	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,2:0,4:3,1,5,1
chr10	71010026	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,5,5
chr10	71018660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,5,11
chr10	71055459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr10	71060696	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,10:0,0,4,11
chr10	71060707	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr10	71103597	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=46,130;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:5,6:8,4:4,9,3,7
chr10	71129194	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:7,8:8,4:8,7,4,8
chr10	71136857	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,0:11,2:9,8,1,1
chr10	71142420	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:4,8:8,6:3,9,10,4
chr10	71144263	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr10	71144324	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr10	71144702	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,8:0,4:0,3,4,8
chr10	71154941	.	GAC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:71154941_GAC_G:71154941:0,4,1,1
chr10	71154944	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:71154941_GAC_G:71154941:0,4,1,1
chr10	71154946	.	T	TTAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=133,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,2:0|1:71154941_GAC_G:71154941:0,4,1,1
chr10	71154949	.	G	GCTCGTCCTCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:71154941_GAC_G:71154941:0,3,1,1
chr10	71174674	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=61,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:4,8:8,7:6,6,10,6
chr10	71211484	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:1,1:3,1:3,5,0,4
chr10	71243640	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.583:15:0,5:6,3:1,5,5,4
chr10	71264325	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:1,4,0,4
chr10	71267407	.	GTT	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=T;STR;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.807:9:0,6:1,0:1,1,0,7
chr10	71267414	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,5:2,0:0|1:71267414_T_G:71267414:1,2,0,7
chr10	71267419	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0|1:71267414_T_G:71267414:1,2,0,6
chr10	71391241	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=81,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,6:12,0:15,12,5,1
chr10	71392495	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,0:0|1:71392495_T_A:71392495:0,0,2,2
chr10	71392501	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:71392495_T_A:71392495:0,0,2,2
chr10	71583757	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	71634912	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=100,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:14,4:11,0:13,12,4,0
chr10	71640255	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=62,91;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.446:31:7,1:8,10:5,12,1,13
chr10	71647196	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=104,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:5,0:4,4:9,2,2,2
chr10	71648222	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr10	71649064	.	GGGGGGCAGGGAGGAGCACA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr10	71649286	.	A	ACAATACCAGCTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr10	71649309	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	71655420	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:71655420_A_T:71655420:0,3,0,1
chr10	71655423	.	T	TCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:71655420_A_T:71655420:0,3,0,1
chr10	71655443	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=114,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	71658512	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,7,20
chr10	71664661	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33,31;MFRL=71,123,140;MMQ=60,60,60;MPOS=12,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.20,9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.185,0.497:11:2,2,0:0,0,3:0,4,7,0
chr10	71665418	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr10	71665676	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	71678837	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:9,0:0|1:71678837_G_A:71678837:13,11,1,1
chr10	71678844	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:17,2:10,0:0|1:71678837_G_A:71678837:14,14,1,1
chr10	71682594	.	G	GAGAAGAGTAGGGGTGATCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:3,2,1,1
chr10	71682603	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:71682603_CT_C:71682603:2,2,1,0
chr10	71682608	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:71682603_CT_C:71682603:2,2,1,0
chr10	71685532	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,6,6
chr10	71686790	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:71686790_C_T:71686790:9,4,1,1
chr10	71686793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,0:6,2:0|1:71686790_C_T:71686790:9,4,1,1
chr10	71686909	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.201:18:10,3:1,0:0|1:71686909_G_A:71686909:5,10,1,2
chr10	71686916	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=86,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.244:14:10,3:1,0:1|0:71686909_G_A:71686909:3,8,1,2
chr10	71697318	.	GA	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=54,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:71697318_GA_TC:71697318:3,4,1,1
chr10	71697321	.	C	CTCCCCTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=54,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:71697318_GA_TC:71697318:3,4,1,1
chr10	71706950	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:5,1:0,1:7,0,2,0
chr10	71849775	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr10	71851429	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34,34;MFRL=193,240,171;MMQ=60,60,51;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=4.38,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.330,0.349:6:1,2,2:1,0,0:2,0,4,0
chr10	71868763	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,16,6
chr10	71868953	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:8,10,0,2
chr10	71877722	.	T	TCACACACAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=105,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:71877722_T_TCACACACAC:71877722:4,10,0,2
chr10	71877723	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=105,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:71877722_T_TCACACACAC:71877722:4,10,0,2
chr10	71877726	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=105,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:0|1:71877722_T_TCACACACAC:71877722:4,10,0,2
chr10	71880757	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	71880770	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71880770_C_T:71880770:3,0,1,0
chr10	71880774	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71880770_C_T:71880770:3,0,1,0
chr10	71880791	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=194,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:1,0,5,1
chr10	71883590	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.769:7:0,1:1,1:1,0,6,0
chr10	71921503	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=140,326;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,0:11,3:9,9,0,3
chr10	71965991	.	G	GT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=101,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.094:51:13,1:33,1:33,13,2,3
chr10	71969062	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,4:6,0:2,6,0,4
chr10	71970259	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:1,3,3,5
chr10	71978658	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:71978658_C_T:71978658:0,3,0,1
chr10	71978662	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:71978658_C_T:71978658:0,3,0,1
chr10	71978664	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=212,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:71978658_C_T:71978658:0,2,0,1
chr10	71990196	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:6,6:4,4:4,6,2,8
chr10	72015382	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:9,0:0|1:72015382_G_A:72015382:11,11,1,1
chr10	72015389	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:9,0:0|1:72015382_G_A:72015382:10,12,1,1
chr10	72026241	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=198,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr10	72061079	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr10	72100533	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr10	72100541	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,0:2,1:0|1:72100541_T_TG:72100541:1,2,0,1
chr10	72100542	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,0:2,1:0|1:72100541_T_TG:72100541:1,2,0,1
chr10	72289126	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:1,5,1,5
chr10	72289778	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=93,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:6,3:0,7:3,3,4,6
chr10	72291304	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	72293850	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:3,3,1,4
chr10	72298631	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr10	72306978	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr10	72324143	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr10	72326521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:1,3,0,1
chr10	72358577	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:2,5:5,8:1,6,8,5
chr10	72358655	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=80,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,4:0,0:0,2,2,2
chr10	72468326	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:8,9,1,1
chr10	72492155	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=9977920,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,0,7
chr10	72492212	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr10	72495092	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr10	72503963	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=122,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.169:20:3,0:6,1:2,15,0,3
chr10	72504920	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,11,2
chr10	72520259	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,1:8,4:10,0,3,3
chr10	72531154	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:12,5:14,0:9,19,2,3
chr10	72532238	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:7,5:3,4:8,2,4,5
chr10	72532443	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr10	72533910	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr10	72535065	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=173,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,6:3,5:1,3,5,6
chr10	72539292	.	AGCCTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:7,0,1,1
chr10	72541621	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=98,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,3:19,0:17,23,3,0
chr10	72620134	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31,31,32;MFRL=112,161,130,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,23,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.13,9.66,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,3,6,4:0.094,0.169,0.130:34:12,2,3,1:9,1,3,3:10,11,7,6
chr10	72630990	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:2,1:0,3,1,1
chr10	72631626	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:6,2,3,4
chr10	72635143	.	ATT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.458:15:5,5:3,2:6,2,4,3
chr10	72636450	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=113,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:4,7,1,2
chr10	72643671	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.608:8:3,3:0,2:2,1,3,2
chr10	73045193	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=202,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr10	73046531	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:8,0:18,3:13,13,2,1
chr10	73047610	.	C	CTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	73050915	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=110,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,0:9,5:3,9,0,5
chr10	73103904	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,3,1
chr10	73111258	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	73111632	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=242,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73111632_T_C:73111632:0,1,0,1
chr10	73111634	.	T	TGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=242,280;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73111632_T_C:73111632:0,1,0,1
chr10	73111638	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=242,280;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73111632_T_C:73111632:0,1,0,1
chr10	73115914	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,2:10,1:8,12,2,1
chr10	73115941	.	TG	CA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,9,11
chr10	73121645	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr10	73121913	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=185,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:1,10:0,14:0,1,14,11
chr10	73121945	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,12,19
chr10	73199501	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	73199674	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,3:4,6:3,2,1,8
chr10	73206178	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:6,3:2,1:1,7,2,3
chr10	73269866	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=108,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:2,4:8,6:5,5,4,6
chr10	73269897	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.387:23:5,5:9,2:5,9,4,5
chr10	73270982	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,7,11
chr10	73270987	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:2,5,5,6
chr10	73270995	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,7:0,8:0,1,6,9
chr10	73437153	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:11,6,5,0
chr10	73439101	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.892:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr10	73450228	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:2,4,2,2
chr10	73455273	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr10	73455308	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr10	73468995	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:1,5,0,2
chr10	73494159	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:4,4:0,8,0,5
chr10	73501374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:3,0,7,0
chr10	73515103	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:10,2,5,4
chr10	73520511	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr10	73520632	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,18:0,0,21,16
chr10	73521473	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,0:13,4:18,11,3,1
chr10	73521830	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=224,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr10	73560558	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=70,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73560558_T_G:73560558:1,1,0,1
chr10	73560560	.	G	GCCTTATTAGGCTATGAGCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=70,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.364:3:1,1:1,0:0|1:73560558_T_G:73560558:1,1,0,1
chr10	73563067	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:5,4,0,4
chr10	73566064	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=227,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr10	73569749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:4,4,2,2
chr10	73570357	.	CCTGT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:5,9,1,1
chr10	73571581	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=194,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr10	73571665	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=73,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr10	73578704	.	AAGTCTC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr10	73582525	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr10	73590909	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:18,4:9,0:16,11,4,0
chr10	73594358	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=256,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,3:1,1:0,1,0,5
chr10	73765773	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr10	73765796	.	C	CTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr10	73822507	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,1:7,6:5,3,6,1
chr10	73822957	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=79,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.427:14:6,3:2,2:2,6,3,3
chr10	73823019	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	73827292	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	73832032	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,2:9,1:8,14,2,1
chr10	73846826	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,8:0,0,1,9
chr10	73848075	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr10	73848105	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	73862032	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr10	73956553	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=56,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:14,5:5,9:14,5,8,6
chr10	73964243	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:2,10:6,3:6,3,2,11
chr10	73970451	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:7,4:1,5:6,2,6,3
chr10	73972957	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.580:43:12,18:6,7:10,8,16,9
chr10	73990224	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,16:0.708:22:1,7:5,9:0|1:73990224_G_A:73990224:2,4,6,10
chr10	73990248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:73990224_G_A:73990224:3,6,1,1
chr10	73990251	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:3,0:0|1:73990224_G_A:73990224:2,6,1,1
chr10	73990255	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:73990224_G_A:73990224:1,6,1,1
chr10	74033899	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr10	74095633	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:10,0:27,2:0|1:74095633_C_T:74095633:21,17,1,1
chr10	74095648	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:13,0:26,2:0|1:74095633_C_T:74095633:24,18,1,1
chr10	74097975	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=100,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:5,1:15,2:7,13,1,2
chr10	74100642	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:12,2:9,5:8,13,2,6
chr10	74100775	.	A	AGCCGT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,2:9,0:0|1:74100775_A_AGCCGT:74100775:12,11,0,2
chr10	74100779	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:74100775_A_AGCCGT:74100775:12,11,0,2
chr10	74100781	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:8,0:0|1:74100775_A_AGCCGT:74100775:13,10,0,2
chr10	74100783	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:74100775_A_AGCCGT:74100775:12,10,0,2
chr10	74182917	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr10	74293584	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr10	74673100	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:8,8,3,1
chr10	74684417	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,1:0,15:1,0,1,15
chr10	74695287	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	74714177	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.703:18:4,6:1,7:3,2,9,4
chr10	74714490	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74714490_TG_CC:74714490:0,3,0,1
chr10	74714493	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74714490_TG_CC:74714490:0,3,0,1
chr10	74776489	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=197,164;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr10	74776781	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	74790081	.	A	AATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,0,1
chr10	74803642	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.234:45:16,0:19,10:20,15,10,0
chr10	74831994	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,116;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr10	74834468	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr10	74834651	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=77,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.591:32:5,5:7,13:8,5,8,11
chr10	74874262	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,8:1,3:0,5,4,7
chr10	74882120	.	A	AAGGGAGAAAAGCAAAACACAAGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr10	74886392	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,5:1,4:0,1,6,3
chr10	74886598	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:0,4,3,2
chr10	74890449	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=107,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,8:6,5:4,4,8,5
chr10	74894258	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=259,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr10	74894375	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=141,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.518:39:5,12:12,8:14,5,8,12
chr10	74894612	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=217,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:1,0:2,10:0,3,11,0
chr10	74896581	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=87,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:18,0:21,2:0|1:74896581_G_A:74896581:16,23,1,1
chr10	74896585	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=86,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:15,0:21,2:0|1:74896581_G_A:74896581:16,22,1,1
chr10	74896664	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=89,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,2:5,10:3,6,3,9
chr10	74897691	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=80,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:5,3,3,1
chr10	74897816	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,4:8,8:5,7,5,7
chr10	74898974	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=332,268;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0|1:74898974_CAA_C:74898974:1,0,1,0
chr10	74898992	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=221,268;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:74898974_CAA_C:74898974:3,0,1,0
chr10	74899134	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:4,3,4,4
chr10	74912004	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:3,1,3,1
chr10	74916002	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	74916173	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,4:2,5,5,2
chr10	74923562	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,8:6,4:5,8,7,5
chr10	74923791	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr10	74928066	.	TGAG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GAG;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,0:3,3:8,8,3,2
chr10	74934442	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=91,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,2:1,4:4,3,6,0
chr10	74937506	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr10	74953412	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	74968564	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,4:1,6,2,5
chr10	74992614	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	74994513	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=173,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr10	74995086	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:2,8:3,7:2,3,7,8
chr10	75000698	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:9,3,6,2
chr10	75000739	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,6:7,2:9,6,4,4
chr10	75003271	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:24,3:16,0:18,23,0,3
chr10	75003649	.	CTTTCTGCTCA	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=107,84;MMQ=59,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:15,0:21,2:16,24,1,1
chr10	75006437	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.533:41:8,8:11,13:10,9,13,9
chr10	75006804	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=114,149;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.611:31:2,9:9,10:9,3,15,4
chr10	75009107	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,6:6,8:2,11,0,14
chr10	75012122	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr10	75013883	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:2,2,0,4
chr10	75029508	.	G	GACGCTGTTAAGCCCTCAACTGTCGCCATTGGGTCCTCCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,67;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.289:9:2,2:4,0:3,4,1,1
chr10	75032697	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:8,7,3,0
chr10	75032855	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	75034177	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr10	75035257	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:2,5,2,3
chr10	75036973	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:5,3,7,1
chr10	75051701	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:7,12,1,1
chr10	75053105	.	AT	GG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=140,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,2:7,0:0|1:75053105_AT_GG:75053105:8,6,1,1
chr10	75053109	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=140,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:8,0:0|1:75053105_AT_GG:75053105:8,6,1,1
chr10	75053202	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr10	75056737	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=272,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	75056863	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=78,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:5,4:3,3:4,4,4,3
chr10	75059331	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:6,3,4,0
chr10	75059348	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:9,5,2,0
chr10	75069872	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,2:0,6:1,2,5,3
chr10	75071579	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,6:2,2:2,3,6,2
chr10	75072199	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,9:9,3:11,3,9,3
chr10	75072409	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:75072409_A_AC:75072409:7,9,1,1
chr10	75072416	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:75072409_A_AC:75072409:6,10,1,1
chr10	75072418	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:0|1:75072409_A_AC:75072409:6,10,1,1
chr10	75095253	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,4:4,2:5,2,2,4
chr10	75095349	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	75108146	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:4,2,8,1
chr10	75114394	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,2:2,0:0|1:75114394_G_A:75114394:4,0,1,1
chr10	75114395	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:75114394_G_A:75114394:4,0,1,1
chr10	75114397	.	A	AAAAATTAACT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:0|1:75114394_G_A:75114394:4,0,1,1
chr10	75135833	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=108,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.311:18:2,2:10,4:9,3,5,1
chr10	75147544	.	G	GGAA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=44,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=57.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.484:31:9,4:7,10:8,8,7,8
chr10	75147579	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.355:23:9,2:5,5:6,9,3,5
chr10	75147604	.	CTTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=88,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.249:6:2,0:1,0:0,5,0,1
chr10	75148116	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.665:25:3,9:5,7:7,1,10,7
chr10	75156854	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	75160439	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	75160478	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=95,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:4,3,7,1
chr10	75185704	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:8,7,0,2
chr10	75187284	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,117;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:0|1:75187284_G_A:75187284:9,0,2,0
chr10	75187292	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=149,117;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:3,1:0|1:75187284_G_A:75187284:8,0,2,0
chr10	75199554	.	ACACACCCACAGGACATTCTCTGATGCCCACC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:3,0:7,2:9,10,1,1
chr10	75234826	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:3,0,3,5
chr10	75260488	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.102:57:24,5:24,0:32,20,0,5
chr10	75276481	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=198,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr10	75286524	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:9,2,2,0
chr10	75286592	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:75286592_A_C:75286592:1,1,0,1
chr10	75286593	.	T	TCCGCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0|1:75286592_A_C:75286592:1,1,0,1
chr10	75286597	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=209,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75286592_A_C:75286592:0,1,0,1
chr10	75294262	.	TG	CA,CG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31,33;MFRL=136,209,149;MMQ=60,60,40;MPOS=9,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,1:1,0,0:4,0,2,0
chr10	75294272	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr10	75302488	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=207,139;MMQ=51,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	75393648	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,2,0
chr10	75406912	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=77,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.545:29:8,4:5,11:6,7,6,10
chr10	75407290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,35;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,0:6,0,2,2
chr10	75407649	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,4:3,7:3,6,7,4
chr10	75413952	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:15,0:16,4:12,20,0,4
chr10	75415677	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=312,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,2,6
chr10	75490916	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.159:34:10,5:18,0:18,11,4,1
chr10	75506674	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:3,9:3,7:4,2,11,5
chr10	75510914	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:9,8,1,1
chr10	75519322	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,5,4
chr10	75525993	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:0|1:75525993_T_C:75525993:2,2,2,1
chr10	75525999	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:75525993_T_C:75525993:0,0,5,3
chr10	75526324	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	75527708	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:4,7:1,6:3,3,6,7
chr10	75528508	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,0:10,4:14,3,4,0
chr10	75529982	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=135,108;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:6,7:11,0:14,4,0,7
chr10	75530013	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:5,6:9,7:2,12,11,2
chr10	75545844	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:4,0:4,11,0,2
chr10	75549916	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,38:0.786:48:4,6:5,31:8,2,7,31
chr10	75555486	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=191,156;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75555486_C_T:75555486:0,3,0,1
chr10	75555489	.	GCAGA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75555489_GCAGA_G:75555489:0,3,0,1
chr10	75555491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=208,156;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:75555486_C_T:75555486:0,2,0,1
chr10	75555495	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=191,156;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:75555486_C_T:75555486:0,3,0,1
chr10	75555496	.	G	GATCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:75555489_GCAGA_G:75555489:0,4,0,1
chr10	75559077	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.699:21:2,11:4,4:2,4,7,8
chr10	75559208	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=59,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,1:10,1:4,11,2,0
chr10	75559413	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75559413_G_A:75559413:0,1,0,1
chr10	75559421	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=11,29;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:75559413_G_A:75559413:0,1,0,1
chr10	75559426	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,25;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:75559413_G_A:75559413:0,1,0,1
chr10	75559440	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75559413_G_A:75559413:0,1,0,1
chr10	75560383	.	T	TTATC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATC;STR;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:0,5:2,4:2,0,7,4
chr10	75560463	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:3,1:1,6,1,1
chr10	75561166	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=85,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:16,0:13,3:13,16,1,2
chr10	75561374	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	75562161	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr10	75562793	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:18,4:5,0:10,13,0,4
chr10	75564660	.	AT	A,ATT	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=15,16,20;MFRL=113,133,83;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=8.42,10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,7,11:0.245,0.423:26:2,1,3:1,1,3:2,6,6,12
chr10	75564716	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=178,111;MMQ=54,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.139:20:11,2:7,0:0|1:75564716_A_G:75564716:0,18,0,2
chr10	75564717	.	T	TGGC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=178,111;MMQ=54,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.139:20:11,2:7,0:0|1:75564716_A_G:75564716:0,18,0,2
chr10	75566525	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:16,1:9,3:15,11,1,3
chr10	75566829	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:6,6:8,6:8,7,10,2
chr10	75574734	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.539:17:1,9:5,0:7,1,9,0
chr10	75576736	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr10	75607696	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	75612881	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=95,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:3,2:1,7:5,1,7,2
chr10	75620589	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:13,0:26,3:20,19,2,1
chr10	75620591	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=132,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:21,0:26,2:0|1:75620591_T_C:75620591:21,27,1,1
chr10	75620596	.	G	GT	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=130,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:18,0:25,2:0|1:75620591_T_C:75620591:21,28,1,1
chr10	75620598	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:24,2:0|1:75620591_T_C:75620591:17,30,1,1
chr10	75620599	.	T	TCTC	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:20,0:24,2:0|1:75620591_T_C:75620591:17,30,1,1
chr10	75620612	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,0:18,3:13,28,0,3
chr10	75671776	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:18,5:15,0:14,20,0,5
chr10	75672105	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=198,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:75672105_G_A:75672105:0,3,0,1
chr10	75672118	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=198,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75672105_G_A:75672105:0,1,0,1
chr10	75672607	.	C	CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,173;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr10	75672961	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:5,2,2,4
chr10	75673731	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,4:8,3:8,4,5,2
chr10	75673958	.	C	CAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75673958_C_CAAG:75673958:0,1,0,1
chr10	75673960	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75673958_C_CAAG:75673958:0,1,0,1
chr10	75673963	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:75673958_C_CAAG:75673958:0,2,0,1
chr10	75673965	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=18,28;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:75673958_C_CAAG:75673958:0,2,0,1
chr10	75674740	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,5:0,0:0,5,1,4
chr10	75832703	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31,29;MFRL=0,191,137;MMQ=60,54,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.24,4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.446,0.426:5:0,2,1:0,0,1:0,0,2,3
chr10	75842152	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr10	75843100	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:7,1,5,1
chr10	75849178	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75849178_T_C:75849178:0,0,0,1
chr10	75849180	.	C	CTGTCTCTGTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75849178_T_C:75849178:0,0,0,1
chr10	75849789	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:6,2:0|1:75849789_T_G:75849789:6,10,1,1
chr10	75849793	.	GATCC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:75849789_T_G:75849789:7,10,1,1
chr10	75849800	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:75849789_T_G:75849789:7,10,1,1
chr10	75850023	.	CCTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTTT;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr10	75855322	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:75855322_TG_CA:75855322:3,0,1,1
chr10	75855325	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0|1:75855322_TG_CA:75855322:3,0,1,1
chr10	75863750	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr10	75865065	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=72,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,4:6,4:5,7,4,4
chr10	75866929	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=242,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr10	75867005	.	CTGGA	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=113,34;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:7,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:15,7,1,1
chr10	75867012	.	CAGGATATCGGAT	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=112,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:6,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:13,10,1,1
chr10	75867026	.	CTGGGAGCTGTGGCCAAGGT	C	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=103,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:10,0:8,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:15,13,1,1
chr10	75867048	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=103,34;MMQ=60,60;MPOS=-29;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:13,11,1,1
chr10	75867049	.	AGAAGC	A	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=106,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:12,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:13,12,1,1
chr10	75867056	.	TTCCAACCTC	T	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=20,20;MFRL=102,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:7,0:13,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:14,15,1,1
chr10	75867067	.	GGAGCCTGACTTCCCGCC	G	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=104,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:9,0:15,2:0|1:75867005_CTGGA_C:75867005:12,18,1,1
chr10	75867193	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr10	75868802	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:9,3:8,10,2,1
chr10	75868816	.	G	GCATTACATATTAC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:10,11,1,1
chr10	75868866	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:12,0:14,11,1,1
chr10	75873892	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=264,19;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,1,6
chr10	75874166	.	CGTGTGTGTGT	C,CGT	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=25,25,25;MFRL=134,137,132;MMQ=60,60,60;MPOS=25,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,9,10;RU=GT;STR;TLOD=5.98,16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,7:0.121,0.271:27:6,2,6:8,1,0:1,16,3,7
chr10	75874192	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.397:28:8,7:7,3:3,14,1,10
chr10	75874196	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:15,0:4,6:3,18,0,6
chr10	75874585	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:75874585_G_C:75874585:14,8,1,1
chr10	75874593	.	TC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:75874585_G_C:75874585:15,11,1,1
chr10	75889760	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr10	75896601	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr10	75910996	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=90,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,30:0.510:59:22,25:6,5:12,17,15,15
chr10	76158177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr10	76285223	.	TTTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	76285258	.	TTAGAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76285258_TTAGAAA_T:76285258:0,1,0,1
chr10	76285268	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76285258_TTAGAAA_T:76285258:0,1,0,1
chr10	76285272	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76285258_TTAGAAA_T:76285258:0,1,0,1
chr10	76349020	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:13,3:11,5:15,13,7,1
chr10	76429870	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr10	76781771	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.170:23:13,2:5,0:13,6,4,0
chr10	76781828	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=136,92;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.172:26:11,4:9,0:15,7,3,1
chr10	76854531	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=85,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,0:6,4:4,5,4,0
chr10	76854564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=79,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:1,3,4,2
chr10	76855326	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,2:6,5:7,3,6,1
chr10	76857716	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=91,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	76861680	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,6:7,5:6,7,3,8
chr10	76861779	.	C	CCCAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:76861779_C_CCCAA:76861779:0,2,0,1
chr10	76861786	.	ACTC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,1:0,1:0|1:76861786_ACTC_A:76861786:0,1,0,2
chr10	76861793	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:76861779_C_CCCAA:76861779:0,1,0,1
chr10	76861795	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:76861779_C_CCCAA:76861779:0,0,0,1
chr10	76861798	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76861786_ACTC_A:76861786:0,0,0,1
chr10	76924328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=100,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr10	76995133	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr10	77158621	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,3:3,0:5,4,2,1
chr10	77159442	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr10	77159844	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=123,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:77159844_CG_C:77159844:0,2,2,0
chr10	77159847	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=123,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:77159844_CG_C:77159844:0,2,2,0
chr10	77159854	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,2:0|1:77159844_CG_C:77159844:0,5,2,0
chr10	77159857	.	A	ACC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,21;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,1:0|1:77159844_CG_C:77159844:0,5,2,0
chr10	77159866	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=138,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.217:16:7,0:6,2:0|1:77159844_CG_C:77159844:7,6,2,1
chr10	77160892	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:19,3:27,1:22,24,3,1
chr10	77167098	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:12,3:15,4:8,19,5,2
chr10	77167227	.	CTGCCTGGCAG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCCTGGCAG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:9,0:13,12,1,1
chr10	77312184	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.403:14:2,1:1,4:5,4,3,2
chr10	77542634	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,1,1
chr10	77542753	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,4:7,3:6,8,2,5
chr10	77807065	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.130:25:10,0:12,2:0|1:77807065_A_G:77807065:11,11,1,2
chr10	77807066	.	G	GC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:77807065_A_G:77807065:12,13,1,1
chr10	77818558	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=122,47;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:3,0:10,5:0|1:77818558_C_T:77818558:4,9,0,5
chr10	77818567	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=133,47;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,0:6,4:0|1:77818558_C_T:77818558:2,7,0,5
chr10	78317107	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr10	78646999	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:6,8:12,0:13,5,9,0
chr10	78649399	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr10	78704750	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=123,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,1:5,1:0|1:78704750_AC_A:78704750:6,13,0,2
chr10	78704752	.	A	AGAAGAAGAAAAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=123,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,1:5,1:0|1:78704750_AC_A:78704750:6,13,0,2
chr10	78709180	.	A	AGGTACTGGGAGAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:78709180_A_AGGTACTGGGAGAC:78709180:0,3,0,1
chr10	78709183	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:78709180_A_AGGTACTGGGAGAC:78709180:0,3,0,1
chr10	78711836	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:12,0:4,3:7,9,0,3
chr10	78711966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=93,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr10	78729669	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:3,1:21,2:24,0,2,2
chr10	78734197	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr10	78734335	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:10,3:6,11,1,2
chr10	78772237	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:6,0:17,2:0|1:78772237_C_T:78772237:13,10,1,1
chr10	78772246	.	A	ATGGGATCC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,0:14,2:0|1:78772237_C_T:78772237:13,9,1,1
chr10	78778734	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr10	78839127	.	AGTGTGTGT	A,AGTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28,27;MFRL=138,233,127;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,15;RU=GT;STR;TLOD=6.11,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.339,0.262:5:0,1,0:2,1,1:2,0,3,0
chr10	78839262	.	G	GGGTAATAATCTTGGACAAAATATTTGAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.113:34:18,0:12,3:10,21,0,3
chr10	78844504	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr10	78868165	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr10	78868381	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=296626,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:78868381_G_T:78868381:0,2,1,1
chr10	78868383	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=296626,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:78868381_G_T:78868381:0,2,1,1
chr10	78868386	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=296626,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:78868381_G_T:78868381:0,2,1,1
chr10	78868389	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=593047,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:78868381_G_T:78868381:0,1,1,1
chr10	78870177	.	C	CACAAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=215,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	78872155	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=92,42;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:10,6,1,1
chr10	78872167	.	T	TAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=98,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:78872167_T_TAA:78872167:11,8,1,1
chr10	78872169	.	TGG	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=101,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:78872167_T_TAA:78872167:10,8,1,1
chr10	78944763	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr10	79552151	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=82,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr10	79553673	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	79553688	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr10	79554711	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,11;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.212:25:13,0:4,0:11,9,0,5
chr10	79554716	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,11;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.194:22:10,0:4,0:0|1:79554716_T_G:79554716:8,10,0,4
chr10	79554723	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.236:18:7,1:3,0:0|1:79554716_T_G:79554716:6,8,0,4
chr10	79554730	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:4,0:2,0:5,5,0,3
chr10	79565684	.	T	TGGCCTTGCCCTCACCCTGCACTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=229,198;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	79567630	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:8,4,2,0
chr10	79571893	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,1,3
chr10	79577686	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr10	79579047	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,5:0,1:4,0,5,1
chr10	79581097	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.438:9:1,1:2,1:1,4,0,4
chr10	79584178	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,5:2,4:4,3,5,4
chr10	79588620	.	GCTCCAGC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:8,7:3,6:7,4,7,6
chr10	79589072	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=102,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:7,3,3,0
chr10	79589089	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=89,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,0:4,3:10,4,3,0
chr10	79595473	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=211,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr10	79614158	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr10	79741825	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=169,196;MMQ=60,35;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:79741825_G_A:79741825:1,0,2,0
chr10	79741828	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=169,196;MMQ=60,35;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0|1:79741825_G_A:79741825:1,0,2,0
chr10	79745763	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=98,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:12,3:11,0:7,16,2,1
chr10	79769840	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79769840_G_A:79769840:0,1,0,1
chr10	79769844	.	A	AACTTTTTTTTTTTCCTATAAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79769840_G_A:79769840:0,1,0,1
chr10	79782212	.	T	TCCTTCTTAGCATGTGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=233,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	79785353	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:8,10,3,0
chr10	79785883	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,2:9,0:6,7,1,1
chr10	80029858	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=85,14;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:8,7,3,0
chr10	80037596	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:0,1,4,0
chr10	80037648	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:6,3,5,4
chr10	80961519	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	81051825	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:81051825_C_T:81051825:12,0,2,0
chr10	81051829	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:81051825_C_T:81051825:13,0,2,0
chr10	81053094	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.211:35:10,4:12,2:22,5,6,2
chr10	81053475	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr10	81056273	.	ACCCAGCCAGGCCAGTACCCAGCCCCCAACCCCCCGAGGCCACTCACCTCCCCCAACTACCCAGGACAGAGGATG	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,15:0.039:96:14,6:16,5:24,57,10,5
chr10	81060472	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.145:25:14,0:8,3:0|1:81060472_C_T:81060472:14,8,2,1
chr10	81060474	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=116,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,10:0.366:28:9,6:8,4:1|0:81060472_C_T:81060472:10,8,6,4
chr10	81063886	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:16,2:12,3:9,19,3,2
chr10	81064956	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=91,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,2:7,1:11,13,2,1
chr10	81065201	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	81065774	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	81108956	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr10	81146302	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,2:5,1:2,9,2,1
chr10	81154268	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr10	81192577	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	81204896	.	A	ACGGTGGGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=223,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CGGTGGGG;STR;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,1:0,1:1,0,4,0
chr10	81273169	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32,31;MFRL=84,114,158;MMQ=53,40,40;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.56,8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,5:0.225,0.375:14:3,1,2:2,2,1:3,3,2,6
chr10	81273650	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,189;MMQ=27,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:8,5:9,0:0|1:81273650_G_A:81273650:9,9,0,5
chr10	81273662	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=146,189;MMQ=27,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,5:8,0:0|1:81273650_G_A:81273650:9,9,0,5
chr10	81316936	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,3,1
chr10	81318551	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:2,0,2,1
chr10	81318621	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:4,3,4,2
chr10	81318820	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,108;MMQ=56,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:2,2,2,5
chr10	81319247	.	G	GTCTC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=196,26213;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0|1:81319247_G_GTCTC:81319247:2,5,2,0
chr10	81319248	.	G	GCCCGCCCTGCCTC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=196,26213;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0|1:81319247_G_GTCTC:81319247:2,5,2,0
chr10	81319267	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr10	81371294	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,164;MMQ=56,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:1,1,5,1
chr10	81372231	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=255,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,4:1,10:0,2,1,13
chr10	81373674	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,188;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr10	81373943	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=181,28586;MMQ=60,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr10	81374651	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	81374887	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,6:5,8:3,5,7,7
chr10	81701181	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,0:14,2:0|1:81701181_C_CT:81701181:12,9,1,1
chr10	81701185	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=108,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,0:14,2:0|1:81701181_C_CT:81701181:12,11,1,1
chr10	81701193	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:16,2:0|1:81701181_C_CT:81701181:12,12,1,1
chr10	81701722	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr10	81838793	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.132:44:9,1:16,2:20,19,0,5
chr10	81846069	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:14,1:2,2:4,12,1,2
chr10	81904022	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=137,105;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:6,2,0,2
chr10	81904097	.	G	GAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,1:1,4,0,3
chr10	81904638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr10	81915647	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=106,76;MMQ=60,23;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:14,8:11,0:16,11,8,0
chr10	81917320	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:5,0,6,0
chr10	81917629	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:3,6,4,3
chr10	81917884	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=190,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:81917884_C_T:81917884:0,2,0,1
chr10	81917893	.	A	AACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=224,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:81917884_C_T:81917884:0,1,0,1
chr10	81921810	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr10	81923456	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr10	81923477	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr10	81923959	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,2:3,2:2,5,0,5
chr10	81923961	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:0,5,2,5
chr10	81925785	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,1:1,0:0|1:81925785_C_T:81925785:2,0,3,0
chr10	81925793	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.374:6:2,1:1,1:1|0:81925785_C_T:81925785:4,0,1,1
chr10	81925795	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=90,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0|1:81925785_C_T:81925785:4,1,4,0
chr10	81925798	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.514:10:1,2:4,3:0|1:81925785_C_T:81925785:4,1,5,0
chr10	81925982	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.491:21:2,5:5,4:3,8,1,9
chr10	81926718	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:4,3,1,3
chr10	81926750	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:4,4,1,2
chr10	81932453	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr10	81932509	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=302,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:0,1,1,1
chr10	81932680	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr10	82033683	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr10	82034262	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr10	82034854	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr10	82036354	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	82040162	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr10	82040346	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	82040602	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	82043576	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr10	82045354	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,0:5,5:5,7,1,4
chr10	82049036	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr10	82049251	.	T	TTTC,TTTCTTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28,31;MFRL=0,56,111;MMQ=60,60,60;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,8;RU=TTC;STR;TLOD=5.39,11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.200,0.393:14:2,2,1:5,0,4:0,7,1,6
chr10	82122253	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,71;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:19,9:11,0:15,15,8,1
chr10	82126808	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,38;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr10	82182296	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,11,13
chr10	82182328	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr10	82191643	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	82269015	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.301:25:7,7:8,0:14,4,7,0
chr10	82269238	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr10	82280701	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr10	82298124	.	CCCGAGCTCCTTG	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:9,0:19,11,1,1
chr10	82300812	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82300812_A_G:82300812:1,1,0,1
chr10	82300820	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:82300812_A_G:82300812:1,1,0,1
chr10	82330136	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr10	82331347	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:2,5,2,3
chr10	82363284	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr10	82363300	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:6,3,8,2
chr10	82363404	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:5,3:4,9,0,4
chr10	82363405	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,8:3,5:0,4,4,9
chr10	82394019	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr10	83635798	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:1,1:3,7:1,3,3,5
chr10	83992569	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=92,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:16,11:12,0:16,12,11,0
chr10	84625107	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=88,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,6:2,2:3,0,7,1
chr10	84738856	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=31,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:3,5,0,3
chr10	84745256	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,2:4,7:3,5,5,4
chr10	85903888	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,2:6,7:3,8,1,8
chr10	85908688	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=75,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,2:2,6:0,2,0,8
chr10	85909830	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,10:6,0:8,6,10,0
chr10	85933772	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	85936160	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr10	85954603	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr10	85955440	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,3:0,0:0,4,0,4
chr10	85957456	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	85957681	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr10	85958739	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr10	85960296	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr10	85962650	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	85974381	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	85974403	.	T	TAACCCCATCCCCTTCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	85978809	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=129,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,2:1,0:4,2,1,1
chr10	85991937	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,0:8,4:4,11,2,2
chr10	85994142	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr10	85996968	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,3:0,6:3,2,7,2
chr10	85997228	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr10	85997250	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,22;MFRL=94,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:85997250_G_A:85997250:2,1,0,1
chr10	85997256	.	C	CCGGCCCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=94,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:85997250_G_A:85997250:2,2,0,1
chr10	85997258	.	G	GGCACCGACTCTCGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=94,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:85997250_G_A:85997250:2,2,0,1
chr10	85997508	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	86004736	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	86004873	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:10,10:5,2:8,7,7,5
chr10	86012713	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=106,173;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:1,8,3,2
chr10	86014215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=91,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,5:2,5:0,2,5,5
chr10	86018432	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=103,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr10	86018460	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	86185654	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,5,13
chr10	87362121	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:9,1:9,12,0,3
chr10	87379811	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=276,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,2:0,1:0,1,1,2
chr10	87407252	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr10	87628735	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,2:4,0:7,4,0,2
chr10	87966429	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=184,50;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:87966429_G_T:87966429:0,6,1,1
chr10	87966432	.	G	GTAAGAGAAAGAAAGGAAAGACAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=184,50;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:87966429_G_T:87966429:0,6,1,1
chr10	88024443	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,7979244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	88126056	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,5:0,0,4,5
chr10	88197320	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=102,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:4,0:7,2:8,3,1,2
chr10	88203208	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	88211869	.	TTTATCAGCAGACCTAAGCCCTTCAAAAAGTTTAAAAGACACATA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:7,2:10,0:10,10,1,1
chr10	88220866	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	88230874	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr10	88233628	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,15,1
chr10	88256943	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr10	88259900	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:7,6,0,2
chr10	88277907	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=138,309;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:0|1:88277907_T_A:88277907:1,4,0,3
chr10	88277909	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=138,309;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:0|1:88277907_T_A:88277907:1,4,0,3
chr10	88281346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr10	88414566	.	T	TGC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,21;MFRL=84,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:4,0:0|1:88414566_T_TGC:88414566:2,9,2,0
chr10	88414570	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:6,0:0|1:88414566_T_TGC:88414566:1,11,2,0
chr10	88414573	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,0:0|1:88414566_T_TGC:88414566:1,10,2,0
chr10	88414578	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:4,0:0|1:88414566_T_TGC:88414566:2,10,2,0
chr10	88414583	.	CAAGAG	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:4,0:0|1:88414566_T_TGC:88414566:1,9,2,0
chr10	88419012	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=221,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr10	88419258	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0|1:88419258_G_GTT:88419258:0,2,1,1
chr10	88419261	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=12,20;MFRL=164,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:0|1:88419258_G_GTT:88419258:0,3,1,1
chr10	88419641	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=80,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,4:6,6:3,3,6,4
chr10	88441248	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr10	88445385	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,8:3,2:1,3,7,3
chr10	88445486	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=58,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:5,6:2,6:2,5,5,8
chr10	88446767	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr10	88446803	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=73,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:4,4,5,3
chr10	88446985	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:5,3:5,4:4,6,4,4
chr10	88447075	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=109,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.446:7:3,1:1,2:0|1:88447075_G_A:88447075:1,3,0,3
chr10	88447082	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:88447075_G_A:88447075:0,3,0,3
chr10	88451869	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,3:2,7:1,3,1,9
chr10	88458996	.	TTCTCTCTCTC	T,TTCTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,20,24;MFRL=82,94,110;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,9,11;RU=TC;STR;TLOD=8.03,13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,5:0.181,0.309:18:1,1,0:5,2,4:4,6,4,4
chr10	88469587	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr10	88476512	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=148,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:11,2:7,1:4,14,1,2
chr10	88486102	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr10	88492713	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:4,2:16,2:9,11,1,3
chr10	88649763	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=125,263;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr10	88679080	.	TGG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=125,121;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:88679080_TGG_T:88679080:11,10,1,1
chr10	88679083	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,121;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:88679080_TGG_T:88679080:11,10,1,1
chr10	88683122	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=85,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:5,2:8,10:8,5,7,5
chr10	88702350	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr10	88703160	.	TG	CC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:4,0:0|1:88703160_TG_CC:88703160:7,5,0,2
chr10	88703163	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:0|1:88703160_TG_CC:88703160:7,5,0,2
chr10	88704172	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=86,74;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:0|1:88704172_T_G:88704172:6,9,1,1
chr10	88704174	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=86,74;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:88704172_T_G:88704172:6,9,1,1
chr10	88705432	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.299:34:13,0:10,9:14,10,0,10
chr10	88705504	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:88705504_C_A:88705504:0,10,1,1
chr10	88705509	.	G	GACAGGGAT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:88705504_C_A:88705504:0,9,1,1
chr10	88718436	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr10	88722473	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=296,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,4,3
chr10	88722658	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=100,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:1,5:5,3:5,1,6,3
chr10	88722776	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,3:8,6:7,10,5,4
chr10	88730106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:0,2:7,2:1,6,1,3
chr10	88730177	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=139,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:5,0,3,3
chr10	88730312	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=90,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.313:49:18,8:16,7:18,16,7,8
chr10	88768253	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr10	88768657	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.984:62:0,28:0,33:0,0,36,26
chr10	88782169	.	G	GTGCGAGCGGGTGTTAGGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,97;MMQ=29,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	88817578	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,0:0,0,1,5
chr10	88834244	.	CA	C	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=123,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.253:53:13,5:15,7:25,13,11,4
chr10	88834273	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,4:0.047:101:38,0:56,4:42,55,4,0
chr10	88854095	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,5:4,6:8,2,7,4
chr10	88912075	.	A	ACTGCTCTGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,262;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88912075_A_ACTGCTCTGTG:88912075:0,0,0,1
chr10	88912078	.	AG	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,262;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88912075_A_ACTGCTCTGTG:88912075:0,0,0,1
chr10	88912081	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,262;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88912075_A_ACTGCTCTGTG:88912075:0,0,0,1
chr10	88917974	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	88930582	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=91,112;MMQ=25,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,34:0.604:56:21,17:1,17:17,5,17,17
chr10	88935590	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,21:0,7:0,0,20,8
chr10	88939962	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr10	88940096	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	88946977	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=136,141;MMQ=40,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr10	88988731	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	89117957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,80;MMQ=30,23;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,0:2,2:6,5,1,1
chr10	89118125	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=111,112;MMQ=33,36;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.592:47:10,14:9,14:9,10,16,12
chr10	89265383	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=210,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	89273012	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.322:19:5,5:8,1:3,10,1,5
chr10	89419638	.	C	CGCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GCT;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr10	89419673	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=158,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:89419673_C_T:89419673:6,1,2,0
chr10	89419683	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=131,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:3,0:4,2:0|1:89419673_C_T:89419673:6,2,2,0
chr10	89419873	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:0,4,0,7
chr10	89474547	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,2:16,0:0|1:89474547_A_G:89474547:14,15,1,1
chr10	89474570	.	T	TTC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,2:14,0:0|1:89474547_A_G:89474547:15,15,1,1
chr10	89552369	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:89552369_A_C:89552369:1,1,2,0
chr10	89552375	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:89552369_A_C:89552369:1,1,2,0
chr10	89622938	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.186:41:11,1:12,1:13,20,8,0
chr10	89622944	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=30,9;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.268:40:12,0:12,1:7,22,11,0
chr10	89622949	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.121:41:12,0:12,2:13,23,5,0
chr10	89622951	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.127:40:13,0:13,1:12,23,5,0
chr10	89623232	.	TCGCCTCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=238,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGCCTCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	89692961	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,228;MMQ=52,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,0:14,3:16,17,0,3
chr10	89711956	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,148;MMQ=52,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,3:8,0:11,9,0,3
chr10	90342004	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.123:46:21,0:18,5:0|1:90342004_G_T:90342004:18,23,2,3
chr10	90342011	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.128:44:16,0:17,1:0|1:90342004_G_T:90342004:15,24,2,3
chr10	90353779	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=120,87;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:15,7:18,0:16,18,7,0
chr10	90427050	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:12,12,1,2
chr10	90433537	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=197,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	90435280	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr10	90435936	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:90435936_A_G:90435936:13,2,1,1
chr10	90435943	.	T	TTTTTTGAGACAGAGTCTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:90435936_A_G:90435936:14,3,1,1
chr10	90484243	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:5,1,5,3
chr10	90484420	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.779:16:0,5:2,8:0|1:90484420_C_A:90484420:0,3,4,9
chr10	90484422	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:0|1:90484420_C_A:90484420:0,3,4,9
chr10	90491902	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:12,4,3,0
chr10	90492273	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=118,49;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:6,0:16,3:9,13,1,2
chr10	90492280	.	TAACAA	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.165:23:6,0:13,3:0|1:90492280_TAACAA_T:90492280:8,12,2,1
chr10	90492288	.	CTTT	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:5,0:12,3:0|1:90492280_TAACAA_T:90492280:8,12,2,1
chr10	90492293	.	CAGGCGAGTAGTTAAGGTATGTGA	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:5,0:13,3:0|1:90492280_TAACAA_T:90492280:7,15,2,1
chr10	90492319	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,0:7,2:0|1:90492280_TAACAA_T:90492280:1,9,2,1
chr10	90497385	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:10,4,0,3
chr10	90499924	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90499924_A_C:90499924:0,1,0,1
chr10	90499927	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90499924_A_C:90499924:0,1,0,1
chr10	90499929	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90499924_A_C:90499924:0,1,0,1
chr10	90499935	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:90499924_A_C:90499924:0,2,0,1
chr10	90503155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr10	90512248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr10	90530726	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:8,3:6,14,2,1
chr10	90530806	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:7,0:2,3:1,9,1,2
chr10	90534135	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr10	90537910	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=73,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,4:6,4:4,9,3,5
chr10	90538064	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	90572967	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:11,1:19,2:16,15,1,2
chr10	90574222	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	90577589	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:11,5:15,0:16,11,5,0
chr10	90682085	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,146;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:6,9:9,0:13,3,9,0
chr10	90682237	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:2,6,2,9
chr10	90701497	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0|1:90701497_TG_T:90701497:6,4,2,0
chr10	90701505	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:0|1:90701497_TG_T:90701497:5,4,2,0
chr10	90701729	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr10	90762734	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:4,2:4,1:8,0,2,1
chr10	90767395	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr10	90767482	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=93,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.667:31:7,9:3,12:5,5,11,10
chr10	90770439	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:2,5,6,2
chr10	90771760	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:14,0:0|1:90771760_G_A:90771760:8,11,1,1
chr10	90771762	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:13,0:0|1:90771760_G_A:90771760:8,11,1,1
chr10	90974619	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:9,0:1,2:5,5,2,0
chr10	91065662	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=209,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr10	91065689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr10	91066595	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,0:8,4:7,11,0,4
chr10	91087729	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:2,4:4,10:4,2,11,3
chr10	91092278	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=94,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:5,6:5,6:9,2,10,2
chr10	91099943	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr10	91137826	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:2,6:10,3:6,7,6,3
chr10	91172431	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=73,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	91177029	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,7:3,5:3,1,6,6
chr10	91178000	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=68,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.539:28:8,7:5,8:7,6,7,8
chr10	91193063	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr10	91222287	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0,1,1,4
chr10	91359300	.	A	ACAAAAATG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:91359300_A_ACAAAAATG:91359300:0,16,0,2
chr10	91359302	.	A	ACAGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:91359300_A_ACAAAAATG:91359300:0,16,0,2
chr10	91359306	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:91359300_A_ACAAAAATG:91359300:0,13,0,2
chr10	91371445	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr10	91371844	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	91469232	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=145,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:12,4:13,0:1,24,1,3
chr10	91470725	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:9,9,1,1
chr10	91483908	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr10	91498626	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	91505768	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	91522605	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr10	92508955	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=121,183;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,1:12,1:9,17,0,2
chr10	92654446	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	92656002	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:8,4,2,0
chr10	92678870	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.204:18:4,1:11,2:4,11,2,1
chr10	92680767	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:0|1:92680767_T_A:92680767:15,12,1,1
chr10	92680773	.	CA	AG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:13,2:0|1:92680767_T_A:92680767:15,14,1,1
chr10	93170365	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	93242872	.	A	AGAGCAGTGGGCTTGTGATGTAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=96,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	93579003	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,30,31,33;MFRL=153,132,146,93;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.05,37.43,12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,21,11:0.075,0.517,0.255:41:4,1,10,7:2,2,7,3:6,0,30,5
chr10	93579117	.	CTT	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.282:34:9,2:7,3:9,16,2,7
chr10	93579617	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:0|1:93579617_A_G:93579617:4,0,4,0
chr10	93579619	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:0|1:93579617_A_G:93579617:4,0,4,0
chr10	93588201	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.965:22:0,12:0,10:0|1:93588201_G_C:93588201:0,0,3,19
chr10	93588208	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0|1:93588201_G_C:93588201:0,0,2,19
chr10	93601285	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr10	93604600	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	93611176	.	A	ATATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATG;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	93617306	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,10,16
chr10	93619444	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:4,7,1,1
chr10	93702405	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr10	93713405	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr10	93716899	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr10	93719497	.	GTATATATA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=185,221;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=TA;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:1,0:6,1,3,0
chr10	93719507	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=190,221;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:2,0:5,1,3,0
chr10	93719865	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:12,9,3,0
chr10	93722199	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,1:0,1:5,1,2,0
chr10	93767797	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.425:24:2,4:11,6:13,1,10,0
chr10	93768096	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,5:1,1:1,4,2,4
chr10	93768815	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=97,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,2:7,0:0|1:93768815_G_C:93768815:14,8,1,1
chr10	93768816	.	A	AATTTATTGCTCTC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=96,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:15,2:6,0:0|1:93768815_G_C:93768815:15,8,1,1
chr10	93771192	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.602:23:6,6:3,8:4,5,3,11
chr10	93773792	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:6,3:6,1:3,9,2,3
chr10	93776240	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:3,8:2,1:3,4,5,4
chr10	93776316	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=127,121;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93776316_ACC_A:93776316:0,1,0,1
chr10	93776319	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=127,121;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93776316_ACC_A:93776316:0,1,0,1
chr10	93778472	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,171;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,3:6,0:6,0,3,0
chr10	93778520	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.441:18:6,3:3,5:7,3,5,3
chr10	93786557	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:1,6,0,2
chr10	93788516	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=97,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,1:2,1,3,0
chr10	93812171	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:93812171_T_C:93812171:4,8,1,1
chr10	93812174	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:93812171_T_C:93812171:4,8,1,1
chr10	93812183	.	GGCTTTACTT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=114,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:93812171_T_C:93812171:2,7,1,1
chr10	93841035	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=90,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:7,2,4,0
chr10	93851714	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr10	94214359	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr10	94215457	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=154,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:1,3:1,0:0,7,1,3
chr10	94229912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	94250297	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:0|1:94250297_A_T:94250297:11,12,1,1
chr10	94250303	.	C	CGAATACA	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:10,2:0|1:94250297_A_T:94250297:11,12,1,1
chr10	94250305	.	T	TCCCTC	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:9,2:0|1:94250297_A_T:94250297:12,12,1,1
chr10	94250308	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:94250297_A_T:94250297:9,12,1,1
chr10	94250310	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,1:0|1:94250297_A_T:94250297:7,12,1,1
chr10	94250373	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=160,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:3,0:9,2:4,8,1,1
chr10	94268578	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=87,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:14,3:9,0:0|1:94268578_G_A:94268578:11,12,0,3
chr10	94268592	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=87,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:10,3:6,0:0|1:94268578_G_A:94268578:9,8,0,3
chr10	94274809	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,0:8,7:6,10,3,4
chr10	94366347	.	AT	A,ATT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=148,213,165;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.41,8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,7:0.188,0.420:16:5,2,5:1,1,2:6,0,10,0
chr10	94372942	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,3:3,5:0,3,3,5
chr10	94390159	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr10	94392513	.	A	ATAATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=180,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATT;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	94397369	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,0:5,9:1,7,0,9
chr10	94594601	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:0|1:94594601_T_C:94594601:4,19,1,1
chr10	94594607	.	G	GGTTTTAATTTGCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:94594601_T_C:94594601:3,18,1,1
chr10	94608319	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,6:4,5:5,4,6,5
chr10	94659423	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=78,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:24,0:11,9:9,27,0,9
chr10	94695617	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:2,8:6,3:0|1:94695617_C_T:94695617:0,8,4,7
chr10	94695632	.	A	AGAAACC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,2:8,0:0|1:94695617_C_T:94695617:1,12,1,1
chr10	94695633	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,1:8,0:0|1:94695617_C_T:94695617:1,12,1,1
chr10	94700474	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=79,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:7,0:7,0:8,6,3,0
chr10	94715527	.	GAAATT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr10	94774082	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.222:26:11,4:9,1:7,14,0,5
chr10	94816807	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr10	94816859	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr10	94824261	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,39;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:2,12,2,0
chr10	94826081	.	TCCTGCCG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCTGCCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	95066624	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:8,1,3,0
chr10	95073046	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr10	95083034	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:95083034_C_T:95083034:11,12,1,1
chr10	95083041	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:13,2:0|1:95083034_C_T:95083034:12,15,1,1
chr10	95083046	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=92,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:10,2:0|1:95083034_C_T:95083034:8,16,1,1
chr10	95083047	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=92,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:11,2:0|1:95083034_C_T:95083034:8,16,1,1
chr10	95088574	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,2:12,2:8,14,2,2
chr10	95095600	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	95097537	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=84,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:2,5:0,8:1,1,9,4
chr10	95097715	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=153,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,0:0|1:95097715_T_TC:95097715:0,6,1,1
chr10	95097716	.	T	TATGCTGCTATGGGTGGAGAATCGACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=153,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:95097715_T_TC:95097715:0,6,1,1
chr10	95099822	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr10	95099849	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,15,7
chr10	95107324	.	A	AAAAAAAAAAAAG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAAAAAAAG;STR;TLOD=91.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.916:30:1,3:1,13:0,4,4,22
chr10	95109539	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:7,4,1,1
chr10	95113491	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	95115294	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr10	95115339	.	A	AAAAAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAT;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr10	95121135	.	CCA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr10	95123754	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,2:9,1:5,9,1,2
chr10	95132905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:95132905_C_T:95132905:0,0,0,4
chr10	95132914	.	TGCAGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0|1:95132905_C_T:95132905:0,3,0,1
chr10	95132921	.	TGGACC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:95132905_C_T:95132905:0,2,0,1
chr10	95132933	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95132905_C_T:95132905:0,1,0,1
chr10	95132936	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95132905_C_T:95132905:0,1,0,1
chr10	95139744	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:0|1:95139744_C_T:95139744:3,11,1,1
chr10	95139760	.	G	GAGGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:95139744_C_T:95139744:1,7,1,1
chr10	95152624	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr10	95156872	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	95162525	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:3,5:2,6:5,0,10,1
chr10	95163883	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:3,7:11,1:7,7,5,3
chr10	95164040	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:95164040_A_G:95164040:0,0,0,1
chr10	95164057	.	C	CCCAAAGCTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95164040_A_G:95164040:0,1,0,1
chr10	95185769	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr10	95241999	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr10	95266683	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,6:2,3:5,2,3,6
chr10	95276673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	95276743	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.145:26:13,3:9,0:17,6,0,3
chr10	95276753	.	TC	AA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,2:13,0:19,10,0,3
chr10	95278558	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:5,3:2,0:8,0,3,0
chr10	95278829	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0|1:95278829_A_G:95278829:0,5,0,5
chr10	95278841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:0|1:95278829_A_G:95278829:0,5,0,5
chr10	95279561	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:6,6,0,2
chr10	95279653	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	95287643	.	G	A,GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26,31;MFRL=213,211,0;MMQ=60,60,60;MPOS=4,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.50,10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,5:0.281,0.375:14:2,0,2:2,4,2:4,1,7,2
chr10	95336077	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	95346879	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr10	95346938	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr10	95347381	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	95353488	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=293,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:2,0,3,0
chr10	95360109	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr10	95360380	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:4,3:2,2:6,1,5,1
chr10	95360396	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,4:2,4:6,0,7,1
chr10	95360411	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,4:2,6:5,0,6,4
chr10	95360474	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=132,184;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.244:34:15,5:9,2:11,15,0,8
chr10	95360650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,2:2,2:4,1,2,2
chr10	95360846	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.347:4:0,1:2,0:0|1:95360846_C_CA:95360846:0,3,0,1
chr10	95360848	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.347:4:1,1:2,0:0|1:95360846_C_CA:95360846:0,3,0,1
chr10	95360849	.	C	CTTCTTCCTACCCTGGAAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.347:4:1,1:1,0:0|1:95360846_C_CA:95360846:0,3,0,1
chr10	95360853	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:95360846_C_CA:95360846:0,2,0,1
chr10	95360863	.	T	TCACCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CACCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	95380790	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,2:1,2:0,5,2,2
chr10	95388914	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	95389041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,2,4
chr10	95394455	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	95395245	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:3,8:4,3:0|1:95395245_C_T:95395245:6,1,8,3
chr10	95395247	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=77,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.853:18:0,11:2,5:0|1:95395245_C_T:95395245:1,1,13,3
chr10	95405665	.	CTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr10	95405814	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:2,7:1,2,6,3
chr10	95422002	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=155,172;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr10	95422003	.	C	CTT,CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30,29;MFRL=161,155,172;MMQ=40,40,40;MPOS=5,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,1:0,0,0:0,2,0,2
chr10	95422362	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:16,5:16,1:12,21,0,6
chr10	95429631	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:3,0:12,3:1,14,0,5
chr10	95443688	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=287,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	95459817	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:9,4:8,6:13,4,7,3
chr10	95517877	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:11,3,3,0
chr10	95552653	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr10	95658258	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	95721367	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=222,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	95791031	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:7,2:4,5,0,2
chr10	96006121	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=101,125;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:13,7,0,3
chr10	96014622	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr10	96018510	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr10	96022371	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:12,0:9,7:15,6,0,7
chr10	96022511	.	GCA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:4,11,0,2
chr10	96025491	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:2,5:8,3:3,7,3,5
chr10	96039708	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:6,2:2,0:3,5,1,1
chr10	96043732	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr10	96053239	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr10	96058433	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:1,4,1,4
chr10	96064168	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr10	96068480	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr10	96073118	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,0:0|1:96073118_G_GA:96073118:6,7,1,1
chr10	96073120	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=105,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:8,0:0|1:96073118_G_GA:96073118:7,8,1,1
chr10	96073125	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=105,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:96073118_G_GA:96073118:7,8,1,1
chr10	96084372	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=277,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	96087866	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr10	96104086	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,0:2,3:4,0,1,2
chr10	96108988	.	TAA	T,TA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,22,21;MFRL=104,90,121;MMQ=60,60,60;MPOS=0,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.59,12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,7:0.152,0.248:32:7,0,1:10,5,6:13,7,9,3
chr10	96109034	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=133,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:10,0:19,3:20,13,3,0
chr10	96112233	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr10	96112261	.	AAAAAAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAAAAC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	96114848	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,0:8,5:0|1:96114848_T_G:96114848:5,9,0,5
chr10	96114852	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,0:8,5:0|1:96114848_T_G:96114848:4,9,0,5
chr10	96116419	.	GA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,1,3
chr10	96121433	.	TCCTTTGGGTTCTCCAATGGAATGGGTTTCTTAGACACA	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=110,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,3:0.059:66:27,0:20,3:0|1:96121433_TCCTTTGGGTTCTCCAATGGAATGGGTTTCTTAGACACA_T:96121433:36,27,1,2
chr10	96121475	.	TCTTTCACA	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:20,0:8,3:0|1:96121433_TCCTTTGGGTTCTCCAATGGAATGGGTTTCTTAGACACA_T:96121433:17,19,1,2
chr10	96121486	.	TTGCCTTAG	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.109:35:21,0:8,3:0|1:96121433_TCCTTTGGGTTCTCCAATGGAATGGGTTTCTTAGACACA_T:96121433:15,17,1,2
chr10	96201820	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:4,4:2,5,0,4
chr10	96201839	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=96,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,1:2,0:1,2,0,2
chr10	96201842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	96253108	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.254:16:7,2:5,2:9,3,2,2
chr10	96256984	.	CT	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.347:23:3,4:11,4:0,15,0,8
chr10	96260051	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:11,10,1,1
chr10	96271298	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	96306327	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,228;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:5,0:8,5:2,11,0,5
chr10	96317838	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=76,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,4:5,4:5,3,5,3
chr10	96353422	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=165,78;MMQ=50,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	96354708	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:96354708_C_T:96354708:0,3,0,1
chr10	96354710	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:96354708_C_T:96354708:0,3,0,1
chr10	96361417	.	A	ACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=167,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,1:2,1:0|1:96361417_A_ACT:96361417:0,3,0,2
chr10	96361419	.	A	AATCGTTTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=167,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:96361417_A_ACT:96361417:0,3,0,2
chr10	96447496	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,2:6,1:11,1,2,1
chr10	96447764	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=137,172;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:10,4,2,0
chr10	96447775	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=137,172;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:5,0:0|1:96447775_G_A:96447775:12,3,2,0
chr10	96447778	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,172;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:96447775_G_A:96447775:12,3,2,0
chr10	96448040	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.157:30:12,2:14,2:4,22,0,4
chr10	96448129	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	96522497	.	CATGTTTGCT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:8,0:10,14,0,2
chr10	96698690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr10	96701850	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=106,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:5,5,3,1
chr10	96702012	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=144,83562;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:0|1:96702012_G_T:96702012:12,8,0,2
chr10	96702015	.	A	AAAATGGCATCTCTTTTC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=143,83562;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:96702012_G_T:96702012:12,9,0,2
chr10	96702176	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,116;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr10	96824738	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=111,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:5,3:3,3:2,6,2,4
chr10	96827178	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr10	96954473	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.668:16:2,9:3,2:0|1:96954473_A_T:96954473:1,4,1,10
chr10	96954479	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=113,158;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,8:2,1:0|1:96954473_A_T:96954473:0,4,1,9
chr10	96954511	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	96966954	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=87,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:2,1:6,1:3,5,2,0
chr10	96970361	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:3,0,7,1
chr10	96974518	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr10	96974552	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:2,3:4,0,6,1
chr10	96974803	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,7:2,6:0,4,0,13
chr10	96979830	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=264,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr10	96985181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr10	96985198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	96997589	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	96997670	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:9,3,4,0
chr10	96997820	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:9,1:21,3:7,23,0,4
chr10	96998458	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,2:5,7:5,7,3,6
chr10	96998519	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=521,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr10	97023552	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:7,4,4,0
chr10	97082535	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,0:3,2:0|1:97082535_G_A:97082535:6,6,1,1
chr10	97082537	.	C	CCAGCCCCCAAGCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:97082535_G_A:97082535:6,7,1,1
chr10	97101532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	97110879	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	97117036	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	97117379	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=89,88;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:18,3:12,0:16,14,3,0
chr10	97143881	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,3:4,0:5,10,3,0
chr10	97154682	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=368,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:1,0,10,1
chr10	97154698	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=368,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,8:0,5:1,0,11,2
chr10	97158713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr10	97192138	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,5:3,0:7,3,5,0
chr10	97200820	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:11,0:16,12,0,2
chr10	97366746	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,1,1
chr10	97369939	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,6:6,2,5,1
chr10	97370989	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=80,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:7,4,5,1
chr10	97373966	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,116686;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr10	97380691	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=146,80;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr10	97381077	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.622:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr10	97387248	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,6:1,2:4,3,5,3
chr10	97397227	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr10	97423943	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:17,1:6,1:13,10,2,0
chr10	97440280	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:13,0:7,3:0|1:97440280_C_T:97440280:11,9,2,1
chr10	97440281	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.118:23:11,2:10,0:1|0:97440280_C_T:97440280:12,9,1,1
chr10	97442995	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:2,9,0,4
chr10	97447399	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,88;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,4:15,0:11,18,1,3
chr10	97602091	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,11:0,0,15,3
chr10	97605057	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr10	97607165	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:7,1,3,2
chr10	97698370	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,18:0,26:0,0,24,20
chr10	97786880	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr10	97920099	.	T	TC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.966:23:0,15:0,8:0,0,9,14
chr10	97922667	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,20,12
chr10	97923072	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,4:0,0,6,6
chr10	97923257	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.440:39:5,8:17,8:11,11,7,10
chr10	97975167	.	GTATA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TA;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr10	97983526	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=239,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	97983656	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:13,0:18,4:17,15,0,4
chr10	97987144	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:1,2,5,0
chr10	97987378	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr10	98031216	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,1:5,2:2,13,2,1
chr10	98078127	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr10	98078239	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr10	98082517	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr10	98084231	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	98088387	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	98095667	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:11,5,2,0
chr10	98095794	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr10	98105673	.	TCTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:4,3:4,2,2,2
chr10	98111279	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=1060,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	98113272	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,9:2,1:5,4,2,8
chr10	98138640	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	98144312	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr10	98145933	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:5,2:0|1:98145933_A_C:98145933:5,5,1,1
chr10	98145937	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:98145933_A_C:98145933:5,4,1,1
chr10	98145939	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:98145933_A_C:98145933:5,4,1,1
chr10	98146610	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=76,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr10	98180613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr10	98180644	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr10	98240035	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:98240035_A_T:98240035:0,0,4,0
chr10	98240045	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:98240035_A_T:98240035:1,0,4,0
chr10	98240143	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:12,7:7,0:10,10,7,0
chr10	98282160	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr10	98287094	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr10	98287258	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,0:7,0:12,16,0,2
chr10	98287261	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.613:25:5,10:5,5:3,7,4,11
chr10	98311190	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr10	98319367	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:3,3,3,2
chr10	98321928	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,9:0,0,2,13
chr10	98325237	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr10	98336625	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=68,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	98369698	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=166,128;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.267:10:3,0:4,2:0|1:98369698_C_T:98369698:0,8,0,2
chr10	98369702	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=166,128;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,2:0|1:98369698_C_T:98369698:0,7,0,2
chr10	98369704	.	C	CTACCCGCTCCCTT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=166,128;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:98369698_C_T:98369698:0,6,0,2
chr10	98369708	.	C	CCATTCTCTTTATGCA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=166,128;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:98369698_C_T:98369698:0,5,0,2
chr10	98369714	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=83,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1|0:98369698_C_T:98369698:0,4,0,1
chr10	98369720	.	A	ATTCAGTAGTTTCAGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=83,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:98369698_C_T:98369698:0,4,0,1
chr10	98380174	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.262:32:8,8:16,0:10,14,8,0
chr10	98380363	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr10	98383329	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	98386433	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,18,6
chr10	98386558	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr10	98392872	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	98416533	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:3,5,6,0
chr10	98741189	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:13,9,0,2
chr10	98742021	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:7,5,1,1
chr10	98742050	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=95,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0|1:98742050_G_A:98742050:6,7,1,1
chr10	98742054	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,2:6,0:0|1:98742050_G_A:98742050:6,5,1,1
chr10	98742087	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=93,167;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:11,3:6,12,0,3
chr10	98742088	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=98,68;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,1:9,6:3,12,3,4
chr10	98743679	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,111;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.240:29:9,2:13,3:12,10,6,1
chr10	98745253	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,274;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:10,9,0,2
chr10	98745977	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:5,0:2,3:0,9,0,3
chr10	98762191	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,12;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr10	98762196	.	A	C,AT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,12,26;MFRL=195,175,158;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,0,1:0,1,1,1
chr10	98762199	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,21;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr10	98762201	.	A	C,T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,11,29;MFRL=195,175,158;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,0,1:0,1,1,1
chr10	98762203	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,29;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:98762203_A_T:98762203:1,1,0,1
chr10	98762205	.	AG	CC,TG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,12,30;MFRL=195,175,158;MMQ=60,60,60;MPOS=8,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,0,1:0,1,1,1
chr10	98762207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,29;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:98762203_A_T:98762203:1,1,0,1
chr10	98762210	.	AC	CC,CT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,24,32;MFRL=195,175,158;MMQ=60,60,60;MPOS=3,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,1,1:0,1,1,1
chr10	98764495	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:4,6,0,2
chr10	98764614	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=96,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:15,0:8,5:12,11,1,4
chr10	98778512	.	CCTCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98778512_CCTCAG_C:98778512:0,1,0,1
chr10	98778521	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98778512_CCTCAG_C:98778512:0,1,0,1
chr10	98778523	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98778512_CCTCAG_C:98778512:0,1,0,1
chr10	98778525	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98778512_CCTCAG_C:98778512:0,1,0,1
chr10	98778528	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98778512_CCTCAG_C:98778512:0,1,0,1
chr10	98778941	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,5:4,0:0,7,1,5
chr10	98781002	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=119,44;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:5,0:10,1:0|1:98781002_C_T:98781002:9,6,2,1
chr10	98781007	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:5,0:10,3:0|1:98781002_C_T:98781002:9,6,2,1
chr10	98797351	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:98797351_A_G:98797351:0,0,3,0
chr10	98797359	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=96,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:98797351_A_G:98797351:2,0,1,0
chr10	98797361	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=96,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:98797351_A_G:98797351:2,0,1,0
chr10	98803252	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,3:3,12:3,3,9,7
chr10	98806888	.	G	GCTGTATCAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:98806888_G_GCTGTATCAAA:98806888:0,4,0,1
chr10	98806890	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:98806888_G_GCTGTATCAAA:98806888:0,4,0,1
chr10	98817080	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=124,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.234:14:9,2:1,0:0|1:98817080_A_C:98817080:1,10,2,1
chr10	98817081	.	C	CTCTTCCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,33;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,2:2,0:0|1:98817080_A_C:98817080:2,10,1,1
chr10	98824516	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:5,2,0,2
chr10	98824725	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	98825940	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	98989454	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr10	99019111	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:9,3:13,2,2,1
chr10	99019144	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,15,5
chr10	99019177	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,16,13
chr10	99025611	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,2:0,11:0,0,7,7
chr10	99080246	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=79.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,13,12
chr10	99081587	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:0|1:99081587_G_T:99081587:4,10,2,1
chr10	99081591	.	T	TTGAGACAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:99081587_G_T:99081587:4,9,1,1
chr10	99081593	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,1:0|1:99081587_G_T:99081587:4,9,1,1
chr10	99093817	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr10	99118834	.	G	GATGTTAAACTCTAACATTTCTGCTGGGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.360:6:0,0:4,1:0,5,0,1
chr10	99118857	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=429,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	99125949	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,10:0,0,10,10
chr10	99126521	.	GCTC	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=92,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTC;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:11,1:4,1:8,7,0,2
chr10	99130161	.	CCCCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=221,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCA;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr10	99140602	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:15,0:15,5:17,14,0,5
chr10	99197095	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr10	99197123	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,111;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr10	99198507	.	A	AT	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=87,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.414:20:5,5:6,2:6,5,4,5
chr10	99198572	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=164,144;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:5,2:4,0:0|1:99198572_CA_TG:99198572:0,9,0,2
chr10	99198576	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=186,144;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:99198572_CA_TG:99198572:0,8,0,2
chr10	99198578	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=186,144;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:99198572_CA_TG:99198572:0,8,0,2
chr10	99214420	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=141,45987772;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,2:8,0:8,6,0,2
chr10	99220445	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=89,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:20,4:19,0:14,26,1,3
chr10	99225613	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=85,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:6,5,0,2
chr10	99225738	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr10	99240193	.	AA	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:99240193_AA_GC:99240193:0,3,0,1
chr10	99240196	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99240193_AA_GC:99240193:0,1,0,1
chr10	99240198	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99240193_AA_GC:99240193:0,1,0,1
chr10	99240201	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	99240758	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0,0,19,16
chr10	99349747	.	T	TCACACCCTACA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:6,2:14,0:0|1:99349747_T_TCACACCCTACA:99349747:9,11,0,2
chr10	99349748	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=118,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:6,2:14,0:0|1:99349747_T_TCACACCCTACA:99349747:9,11,0,2
chr10	99350644	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:12,2:0|1:99350644_C_T:99350644:9,17,1,1
chr10	99350656	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:99350644_C_T:99350644:9,13,1,1
chr10	99359062	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=95,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,1:1,1:2,4,0,2
chr10	99359738	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr10	99359933	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,2:9,0:7,10,0,2
chr10	99377076	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.138:19:8,1:9,1:9,8,0,2
chr10	99498234	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr10	99504706	.	A	AGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:99504706_A_AGTC:99504706:0,2,0,1
chr10	99504710	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=222,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:99504706_A_AGTC:99504706:0,3,0,1
chr10	99504725	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	99508142	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,2:0,5,1,6
chr10	99508145	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,0:0,10,1,1
chr10	99508197	.	AGAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=231,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99508197_AGAGG_A:99508197:0,1,0,1
chr10	99508204	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=231,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99508197_AGAGG_A:99508197:0,1,0,1
chr10	99510068	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr10	99510284	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,2:0,0,0,7
chr10	99512978	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr10	99516955	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr10	99517355	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr10	99518874	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr10	99518901	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,6,4
chr10	99519097	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr10	99655606	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,0:1,4:2,2,4,0
chr10	99664381	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=148,98;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.192:13:3,1:6,0:10,1,1,1
chr10	99664385	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=124,98;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:3,2:7,0:9,1,1,1
chr10	99664403	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=98,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,6:10,0:12,5,6,0
chr10	99677277	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:6,2:0|1:99677277_G_A:99677277:11,11,1,1
chr10	99677283	.	G	GGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:99677277_G_A:99677277:11,10,1,1
chr10	99677477	.	T	TTTATGCATCTTTGCACCTGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	99677484	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr10	99682981	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr10	99968058	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,119;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:4,11,0,2
chr10	99968533	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr10	99969475	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=74,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:1,7:3,3:1,3,7,4
chr10	99969498	.	G	GCAATCAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr10	99995773	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=298,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,3:3,8:2,2,9,2
chr10	100003785	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:5,1,4,2
chr10	100012011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	100013563	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:1,2:4,5:1,4,3,5
chr10	100015325	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:6,3,4,0
chr10	100021983	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:5,5,1,1
chr10	100022446	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr10	100146895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=279,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	100147060	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.365:25:5,3:11,5:8,8,2,7
chr10	100147097	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=102,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:4,2:4,4,0,3
chr10	100148058	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=128,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr10	100148245	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=109,43;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:12,11,0,4
chr10	100148308	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:0,1:2,2:0,3,0,4
chr10	100148353	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	100150775	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,1:0|1:100150775_T_C:100150775:4,3,1,1
chr10	100150779	.	T	TGGTAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:100150775_T_C:100150775:6,3,1,1
chr10	100155253	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,0:7,6:2,7,0,6
chr10	100157329	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=92,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:0,0:0,2,0,2
chr10	100167276	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr10	100170762	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.431:19:6,8:4,0:7,4,4,4
chr10	100170853	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	100182095	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:2,0:4,4:1,6,4,0
chr10	100182100	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:4,0:5,0:0|1:100182100_T_C:100182100:3,8,2,0
chr10	100182105	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:100182100_T_C:100182100:2,8,2,0
chr10	100182285	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,2:2,2:0,2,2,3
chr10	100185838	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,35;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr10	100190264	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr10	100193679	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr10	100195583	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=71,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,5:1,1:1,2,2,4
chr10	100219262	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,5:1,8:2,0,9,5
chr10	100219314	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,10:10,8:10,8,8,10
chr10	100219519	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:2,5:3,3:1,4,2,6
chr10	100250019	.	GACACACACAC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=AC;STR;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.827:9:0,5:0,3:0,1,0,8
chr10	101090428	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,8:0,0,12,8
chr10	101090629	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:10,11,1,1
chr10	101090652	.	A	AAGACACTCACAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,0:8,2:7,13,1,1
chr10	101117472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr10	101120787	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	101124815	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr10	101137063	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	101150235	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr10	101150256	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr10	101293035	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,8,15
chr10	101372411	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr10	101373688	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:4,1:13,2:0|1:101373688_T_A:101373688:5,12,1,2
chr10	101373689	.	T	TGCCCCA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:4,1:13,2:0|1:101373688_T_A:101373688:5,12,1,2
chr10	101373691	.	C	CAAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:4,0:13,2:0|1:101373688_T_A:101373688:5,12,1,2
chr10	101373764	.	TG	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	101419786	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:5,5,0,2
chr10	101439252	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr10	101448472	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:13,6,1,1
chr10	101451259	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=265,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.904:29:1,9:1,17:0,2,8,19
chr10	101455733	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,86;MMQ=60,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:15,3:19,0:24,11,3,0
chr10	101455751	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=99,86;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:15,4:21,0:22,16,3,1
chr10	101458408	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=122,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:14,4:19,0:0|1:101458408_A_G:101458408:14,21,4,0
chr10	101458416	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:17,4:15,0:0|1:101458408_A_G:101458408:15,19,4,0
chr10	101462193	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	101462412	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,0:17,3:13,15,3,0
chr10	101474475	.	C	CAGAAATACATTTTACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=254,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.384:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	101474499	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	101489216	.	CAAAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30,35;MFRL=0,259,144;MMQ=60,40,40;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,13,17;RU=A;STR;TLOD=3.71,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.420,0.405:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr10	101489239	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=144,259;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:3,0,1,0
chr10	101489246	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=163,259;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr10	101489547	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:101489547_A_T:101489547:1,3,0,1
chr10	101489549	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:101489547_A_T:101489547:1,3,0,1
chr10	101495994	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:13,8:19,0:20,12,8,0
chr10	101515316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	101544447	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0|1:101544447_A_T:101544447:0,0,7,12
chr10	101544454	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=98,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:13,0:8,2:0|1:101544447_A_T:101544447:8,13,1,1
chr10	101551902	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	101553857	.	C	CTGGGCAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	101560363	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,0:4,9:1,8,0,9
chr10	101565086	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=150,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.374:9:3,0:1,3:6,0,2,1
chr10	101567193	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,3:16,0:12,17,3,0
chr10	101569997	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr10	101591944	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr10	101610367	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,6:10,0:13,7,6,0
chr10	101610380	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:8,6:8,0:10,6,6,0
chr10	101610511	.	TCACCATCGCCCACAGGCTGCA	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,0:13,2:18,14,1,1
chr10	101823543	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=85,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	101825160	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:1,4,2,4
chr10	101829702	.	C	CGG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:101829702_C_CGG:101829702:0,7,0,2
chr10	101829704	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:101829702_C_CGG:101829702:0,7,0,2
chr10	101829713	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr10	101829718	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr10	101835581	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr10	101841153	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,14:0,0,13,10
chr10	101912194	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr10	101933888	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,97;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr10	101945271	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=106,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:17,4:27,0:27,17,4,0
chr10	101953705	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,10:0,5:1,0,12,3
chr10	101977883	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.719:23:3,9:3,7:1,5,8,9
chr10	101980459	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,10:0,0,5,11
chr10	101992923	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=167,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,3:1,3:3,1,6,0
chr10	102016268	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=217,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:0,6,1,3
chr10	102027407	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,4:5,0:4,5,1,3
chr10	102054313	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=77,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:9,2:18,2:14,14,2,2
chr10	102054314	.	A	ATTAGCC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=77,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:12,0:17,2:0|1:102054314_A_ATTAGCC:102054314:15,16,1,1
chr10	102054317	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=74,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:18,2:0|1:102054314_A_ATTAGCC:102054314:14,16,1,1
chr10	102054452	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=172,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr10	102054968	.	G	GGAGAGGCAGCCAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.482:2:0,1:1,0:0|1:102054968_G_GGAGAGGCAGCCAGC:102054968:0,1,0,1
chr10	102054971	.	TT	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102054968_G_GGAGAGGCAGCCAGC:102054968:0,1,0,1
chr10	102055791	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29,30;MFRL=149,103,152;MMQ=60,60,56;MPOS=7,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.88,4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,3:0.178,0.271:12:2,1,1:5,1,2:7,0,5,0
chr10	102088906	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,1:0,7:3,0,8,0
chr10	102089181	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=296,286;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102089181_G_GT:102089181:0,1,0,1
chr10	102089182	.	C	CGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=296,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102089181_G_GT:102089181:0,1,0,1
chr10	102089608	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=89,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:8,2:4,0:4,8,3,0
chr10	102112224	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:9,0:6,2:5,13,0,2
chr10	102114463	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	102242020	.	C	CCTTTTACTAACTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=133,262;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr10	102247752	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,5:9,0:8,2,5,0
chr10	102247955	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:1,9,0,3
chr10	102248589	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=116,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:16,3:8,0:12,12,3,0
chr10	102248802	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=229,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr10	102250005	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,0:10,8,3,0
chr10	102259413	.	C	CCGAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.311:4:3,1:0,0:0|1:102259413_C_CCGAT:102259413:0,3,0,1
chr10	102259416	.	A	AAGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:102259413_C_CCGAT:102259413:0,3,0,1
chr10	102259417	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:102259413_C_CCGAT:102259413:0,3,0,1
chr10	102259420	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:102259413_C_CCGAT:102259413:0,3,0,1
chr10	102265064	.	CACACACACACACACACACAA	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=92,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.053:54:9,2:12,0:24,28,1,1
chr10	102265084	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=94,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.169:55:11,7:28,2:21,25,4,5
chr10	102267692	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:9,4:4,0:6,7,2,2
chr10	102275780	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,360;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr10	102276077	.	G	GTCTCGAACTCCCAGGCTCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	102283911	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=65,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,16:0.178:91:58,1:16,14:39,36,0,16
chr10	102286193	.	C	CTAATTGTTTTTTTA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:15,4:15,0:17,14,2,2
chr10	102295645	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr10	102306218	.	C	CAGCCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:102306218_C_CAGCCAG:102306218:3,0,1,0
chr10	102306220	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:102306218_C_CAGCCAG:102306218:4,0,1,0
chr10	102306228	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=71,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:2,3,2,1
chr10	102506070	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,5:0,0,8,10
chr10	102506103	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:2,4,1,3
chr10	102540905	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr10	102546817	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.219:11:8,0:1,2:7,2,1,1
chr10	102584665	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=83,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:6,11,0,3
chr10	102587540	.	C	CTCTCAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	102676237	.	TTTAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr10	102684471	.	ACCTTCAGATAAAGCC	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:3,0:8,2:11,13,1,1
chr10	102689504	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,4:3,2:6,0,7,0
chr10	102703953	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.444:9:5,2:0,2:0|1:102703953_TA_T:102703953:0,5,0,4
chr10	102703978	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,0:0|1:102703953_TA_T:102703953:0,0,0,7
chr10	102703981	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:102703953_TA_T:102703953:0,0,0,7
chr10	102710537	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.256:40:15,0:15,9:13,17,1,9
chr10	102716195	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:11,10:15,0:25,1,11,0
chr10	102734642	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=241,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:102734642_G_T:102734642:3,0,1,0
chr10	102734643	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=241,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:102734642_G_T:102734642:3,0,1,0
chr10	102737456	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,0:6,3:9,9,1,2
chr10	102739143	.	A	AT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.656:25:4,11:3,5:2,7,7,9
chr10	102739841	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:1,2,3,1
chr10	102740692	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=122,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:4,0:2,4:3,4,0,4
chr10	102743964	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102743964_G_T:102743964:0,0,0,1
chr10	102743967	.	A	AGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102743964_G_T:102743964:0,0,0,1
chr10	102743969	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102743964_G_T:102743964:0,0,0,1
chr10	102748966	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:22,3:21,0:28,15,1,2
chr10	102749069	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:8,7:17,5:6,19,3,9
chr10	102750844	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102750844_C_T:102750844:0,2,0,1
chr10	102750852	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102750844_C_T:102750844:0,0,0,1
chr10	102750856	.	GAC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102750844_C_T:102750844:0,0,0,1
chr10	102750859	.	T	TAAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102750844_C_T:102750844:0,0,0,1
chr10	102753273	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,0:8,5:2,12,3,2
chr10	102765398	.	CTGGAGCGGCGCTGCGCCACCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:5,2:9,0:9,9,1,1
chr10	102765510	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=101,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:1,1:4,2:2,3,0,3
chr10	102772065	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:102772065_TG_T:102772065:2,4,1,1
chr10	102772067	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:102772065_TG_T:102772065:2,4,1,1
chr10	102775349	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr10	102775621	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=137,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr10	102775653	.	G	GCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:102775653_G_GCC:102775653:0,2,0,1
chr10	102775654	.	T	TGTCATGCACCCCCCAGCCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:102775653_G_GCC:102775653:0,2,0,1
chr10	102780265	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr10	102780312	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,2:2,0,3,2
chr10	102780354	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:4,7:3,4:3,4,7,5
chr10	102780489	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:2,0:1,3,0,2
chr10	102783678	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,7:4,2:3,4,6,3
chr10	102792295	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:1,8:8,11:3,6,6,13
chr10	102795731	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:3,11:11,5:7,7,7,9
chr10	102796774	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:2,0,6,1
chr10	102798276	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr10	102827757	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:3,8:6,8:4,5,7,9
chr10	102891560	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:2,3,2,1
chr10	103221870	.	CAGG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr10	103298099	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=108,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.444:36:10,8:10,7:7,13,9,7
chr10	103298236	.	A	AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=179,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	103345189	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=75,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:11,4:19,0:16,16,4,0
chr10	103372161	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,3:4,0:2,4,3,0
chr10	103531129	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	103535605	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	103542959	.	CC	GG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,15,3
chr10	103558807	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,187;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:15,5:11,0:17,9,5,0
chr10	103565703	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103565703_CT_C:103565703:3,0,1,0
chr10	103565706	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:0|1:103565703_CT_C:103565703:5,0,1,0
chr10	103569876	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr10	103573222	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,11,1
chr10	103577488	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	103717493	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.492:15:5,3:2,4:0,7,2,6
chr10	103761876	.	CTAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103761876_CTAA_C:103761876:0,1,0,1
chr10	103761880	.	CACTTCT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103761876_CTAA_C:103761876:0,1,0,1
chr10	103761891	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103761876_CTAA_C:103761876:0,0,0,1
chr10	103766365	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,1:7,2:12,10,0,3
chr10	103769742	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:5,5:15,0:11,9,2,3
chr10	103771457	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=16,30,21,26;MFRL=103,117,144,96;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,5,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.45,6.63,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,2,4,6:0.115,0.198,0.285:20:2,1,2,3:1,1,0,1:3,5,8,4
chr10	103827589	.	CCTGGAGGCTTGCTTGGGA	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:8,2:12,0:17,14,1,2
chr10	103893074	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	103904763	.	TC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,18:0,7:0,0,14,11
chr10	103919072	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=92,612;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:16,0:21,3:15,24,3,0
chr10	103919728	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=128,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:3,0:9,3:4,8,0,4
chr10	103921560	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=122,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:6,5:9,0:10,5,5,0
chr10	103991561	.	T	TTCTAGCTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,29;MFRL=277,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr10	103991562	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=167,293;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103991562_G_A:103991562:0,3,0,1
chr10	103991570	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=222,293;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:103991562_G_A:103991562:0,2,0,1
chr10	104110989	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:12,4,3,0
chr10	104119969	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=91,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:6,0:12,1:0|1:104119969_C_T:104119969:13,5,1,1
chr10	104119977	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:11,2:0|1:104119969_C_T:104119969:13,8,1,1
chr10	104120731	.	C	CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=A;STR;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,0:0,1:0,0,1,4
chr10	104123029	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	104126341	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=166,186;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.634:6:0,1:0,0:0,2,1,3
chr10	104127171	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr10	104128954	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,5:0,0,6,10
chr10	104140350	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=94,148;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,4:8,1:10,7,4,1
chr10	104142096	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=185,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:7,3:4,10,1,2
chr10	104156911	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:1,3,2,1
chr10	104157727	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,20,6
chr10	104157947	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.270:31:15,4:8,4:14,9,4,4
chr10	104158972	.	CAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:3,1,1,0
chr10	104160517	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,85;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.098:69:30,0:32,6:23,40,6,0
chr10	104161967	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=95.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,16,15
chr10	104163287	.	GGTGCCCACCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	104164888	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:3,0:4,2:2,5,0,3
chr10	104172362	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=185,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:104172362_G_GA:104172362:0,5,1,1
chr10	104172363	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=185,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:104172362_G_GA:104172362:0,5,1,1
chr10	104180962	.	A	ATCTGAAAGCTTTTCG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,2:8,0:0,13,0,2
chr10	104184189	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:5,4:2,5:3,5,7,2
chr10	104185032	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:104185032_C_CTT:104185032:0,2,0,1
chr10	104185033	.	C	CCTTTTATTCATCCCTAATTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:104185032_C_CTT:104185032:0,2,0,1
chr10	104229785	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr10	104230930	.	TTCGGTGCTGGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr10	104231234	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	104232522	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr10	104232716	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,20:0,19:0,0,22,17
chr10	104232809	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr10	104241683	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=59,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:7,6:4,11:6,5,11,6
chr10	104241983	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	104250278	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,5:6,6,5,2
chr10	104263980	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:5,3,2,0
chr10	104264107	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,14:0,0,20,22
chr10	104352397	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,155;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr10	104356822	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr10	104386863	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:1,2:8,0:8,1,2,0
chr10	104387019	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=174.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,28:0,23:0,0,17,35
chr10	104389932	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr10	104415093	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,7:5,4:4,8,4,7
chr10	104415810	.	GCTCTCCCTGGA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,0:3,4:12,7,2,2
chr10	104416160	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:10,2:6,0:0|1:104416160_C_T:104416160:11,6,1,1
chr10	104416185	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,2:9,0:0|1:104416160_C_T:104416160:6,7,1,1
chr10	104416188	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,2:8,0:0|1:104416160_C_T:104416160:4,7,1,1
chr10	104416190	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:1,2:5,0:0|1:104416160_C_T:104416160:2,7,1,1
chr10	104445828	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0|1:104445828_CTTTT_C:104445828:0,2,0,1
chr10	104445840	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1|0:104445828_CTTTT_C:104445828:0,2,0,1
chr10	104445844	.	T	TTACTGTTATGTTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1|0:104445828_CTTTT_C:104445828:0,2,0,1
chr10	104449586	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:5,2:6,2:10,2,4,0
chr10	104459079	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr10	104474046	.	CCCT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CCT;STR;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.489:20:4,2:5,8:6,4,6,4
chr10	104474107	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr10	104486304	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=214,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr10	104486811	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:12,5:12,0:12,12,5,0
chr10	104489011	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,0:0,4:3,0,4,0
chr10	104492707	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=81,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:3,3,1,2
chr10	104493444	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:3,9,1,4
chr10	104572276	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	104592249	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.570:16:4,7:1,2:4,3,6,3
chr10	104592675	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,5,0
chr10	104594021	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=96,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.135:42:21,0:16,5:13,24,1,4
chr10	104596981	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,5:5,0:4,9,3,2
chr10	104597152	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr10	104629465	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:1,2:2,1,4,1
chr10	104632110	.	CGGAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=213,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGAG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr10	104633053	.	A	ATTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:2,0:0,1:0,2,0,2
chr10	104636855	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	104638203	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,1:17,2:9,21,3,0
chr10	104650251	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,2:2,5:2,0,5,2
chr10	104660256	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr10	104809663	.	GTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:104809663_GTTT_G:104809663:0,0,0,1
chr10	104809667	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:104809663_GTTT_G:104809663:0,0,0,1
chr10	104809671	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:104809663_GTTT_G:104809663:0,0,0,1
chr10	104809674	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:104809663_GTTT_G:104809663:0,0,0,1
chr10	104836047	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=87,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:11,3:2,2:8,5,2,3
chr10	104836940	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,1:2,8:4,3,3,6
chr10	104849435	.	TTCC	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.121:30:11,0:14,3:13,14,1,2
chr10	104849468	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=93,59;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.317:42:10,6:19,7:9,20,8,5
chr10	104850632	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr10	104850820	.	C	CCTCTTGCCTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=88,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:104850820_C_CCTCTTGCCTCT:104850820:0,2,0,1
chr10	104850823	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=88,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:104850820_C_CCTCTTGCCTCT:104850820:0,2,0,1
chr10	104850826	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=88,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:104850820_C_CCTCTTGCCTCT:104850820:0,2,0,1
chr10	104851285	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.411:37:13,7:8,8:7,15,5,10
chr10	104855656	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,4:8,6:10,6,8,2
chr10	104855670	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.338:51:13,8:21,9:23,11,10,7
chr10	104857205	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=106,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:4,2:0,1:1,3,1,2
chr10	104857218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=64,251;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:1,2,1,2
chr10	104858783	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:7,0:12,9:5,15,0,9
chr10	104859831	.	A	AAAATCCAGAAGCCAAACACCATCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=235,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr10	105005683	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:0,4:2,5:2,0,9,0
chr10	105006436	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,1:11,3:15,11,1,3
chr10	105007471	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=249,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.789:11:0,5:2,3:0,2,8,1
chr10	105046981	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=220,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	105108810	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=83,161;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,0:1,1,0,2
chr10	105128134	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr10	105143102	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:12,0:19,5:12,19,2,3
chr10	105144986	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	105169582	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=109,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,3:4,1:1,3,1,4
chr10	105173052	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.385:32:9,12:10,0:9,11,12,0
chr10	105174911	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=86,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:14,0:0|1:105174911_G_A:105174911:16,13,1,1
chr10	105174919	.	TG	CA	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=83,34;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:11,0:0|1:105174919_TG_CA:105174919:15,11,1,1
chr10	105174920	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=94,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,2:13,0:0|1:105174911_G_A:105174911:14,10,1,1
chr10	105174923	.	G	GTGCTAGGATTACA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=83,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,2:13,0:0|1:105174919_TG_CA:105174919:15,11,1,1
chr10	105176179	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr10	105177645	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=75,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:6,2,8,5
chr10	105178481	.	G	GCAGTTCTTTTGTATCTAGAATGTAGTTATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.365:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	105181200	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,3:17,0:18,9,0,3
chr10	105181343	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,14;MFRL=221,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:3,0:0,0:0|1:105181343_A_T:105181343:0,3,0,3
chr10	105181351	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=221,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,2:0,0:0|1:105181343_A_T:105181343:0,3,0,3
chr10	105181357	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=262,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,0:0,0:0|1:105181343_A_T:105181343:0,1,0,3
chr10	105182807	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:0|1:105182807_C_T:105182807:10,9,3,0
chr10	105182810	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=82,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.122:22:9,1:10,1:1|0:105182807_C_T:105182807:13,7,0,2
chr10	105199641	.	TTCTCTC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=TC;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:16,0:8,2:9,17,1,1
chr10	105202289	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr10	105202944	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,78;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,5:15,0:12,15,4,1
chr10	105214932	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	105215016	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr10	105218252	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0|1:105218252_A_G:105218252:0,0,10,8
chr10	105218254	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,5:0,9:0|1:105218252_A_G:105218252:0,0,10,8
chr10	105361816	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:3,3:5,0:3,6,3,1
chr10	105362209	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.285:40:9,10:20,1:12,17,4,7
chr10	105365570	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:12,2:13,8,1,1
chr10	105382393	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:105382393_TG_T:105382393:0,0,0,1
chr10	105382395	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105382393_TG_T:105382393:0,0,0,1
chr10	105382402	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105382393_TG_T:105382393:0,0,0,1
chr10	105428453	.	CAG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:12,3:9,2:12,10,0,5
chr10	105452739	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.585:19:2,4:4,7:4,4,5,6
chr10	105527018	.	C	CCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105527018_C_CCT:105527018:0,0,0,1
chr10	105527020	.	A	ATCTGTTCCCGCACCCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105527018_C_CCT:105527018:0,0,0,1
chr10	105614884	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	105615074	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,1,5
chr10	105615105	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	105657316	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,16,10
chr10	105659750	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr10	105727656	.	AAG	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=60.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.627:38:7,6:7,18:6,8,12,12
chr10	105752229	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	105752331	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.844:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr10	105752503	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr10	105752715	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.166:35:16,2:12,3:23,7,4,1
chr10	105752849	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,3:12,0:8,15,1,2
chr10	105759749	.	A	ATCTC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.377:27:8,3:8,6:3,14,1,9
chr10	105761264	.	TGAAGTAACA	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=76,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,2:11,0:13,20,1,1
chr10	105761274	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=81,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:21,3:9,0:14,16,0,3
chr10	105762042	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=87,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,3:8,1:8,10,1,3
chr10	105762209	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:8,9,0,2
chr10	105762591	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,5:6,1:8,8,3,3
chr10	105765235	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:10,0,5,0
chr10	105768013	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,11:0.217:53:15,7:27,4:19,23,10,1
chr10	105768158	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=88,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,4:1,10:0,1,1,13
chr10	105777989	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,165;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,13:0.206:66:24,13:29,0:23,30,13,0
chr10	105778129	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0,4,0,8
chr10	105781532	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:1,5,0,5
chr10	105785462	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:12,11,0,3
chr10	105791929	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:2,1,4,0
chr10	105792077	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:1,5,1,3
chr10	105792539	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:3,3,4,3
chr10	105793173	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr10	105796399	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,8:4,2:1,6,4,6
chr10	105796449	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	105796474	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:105796474_G_GT:105796474:0,3,0,1
chr10	105796475	.	C	CTCTTAAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105796474_G_GT:105796474:0,3,0,1
chr10	105796477	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,22;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105796474_G_GT:105796474:0,3,0,1
chr10	105796481	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105796474_G_GT:105796474:0,3,0,1
chr10	105796738	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr10	105797378	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=54,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,5:2,11:4,0,12,5
chr10	105797600	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=250,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:105797600_C_CCT:105797600:0,1,0,1
chr10	105797602	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=250,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105797600_C_CCT:105797600:0,1,0,1
chr10	105797604	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=250,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105797600_C_CCT:105797600:0,1,0,1
chr10	105797611	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=250,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105797600_C_CCT:105797600:0,1,0,1
chr10	105799524	.	C	CCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=96,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=CA;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.801:6:1,2:0,2:1,0,0,5
chr10	105799599	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:6,2,2,1
chr10	105805436	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	105805497	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=86,77;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,2:1,6:1,2,6,2
chr10	105810651	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:21,0:17,4:18,21,1,3
chr10	105810753	.	CATAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:3,0:0,8,0,2
chr10	105811826	.	G	GTTCCTCTCCCCTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.494:6:3,3:0,0:0|1:105811826_G_GTTCCTCTCCCCTCT:105811826:3,0,2,1
chr10	105811827	.	G	GCAGCATTTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.494:6:3,3:0,0:0|1:105811826_G_GTTCCTCTCCCCTCT:105811826:3,0,2,1
chr10	105812690	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr10	105816685	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr10	105816916	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,35:0.735:47:5,18:7,16:4,8,13,22
chr10	105817891	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,6:6,1:6,4,3,4
chr10	105820137	.	A	ATGGTTGCAATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr10	105821136	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,3:3,0:2,1,2,1
chr10	105821294	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=88,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:3,0:0,2:3,1,1,1
chr10	105822076	.	GCA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=102,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:14,0:14,4:12,16,0,4
chr10	105831714	.	GCA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=81,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.219:25:4,2:8,3:11,9,5,0
chr10	105882055	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:6,4:1,3:0,7,0,7
chr10	105883395	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr10	105885279	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:16,8:5,13:14,7,13,8
chr10	105885525	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=200,170;MMQ=56,58;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:1,1:1,0:0|1:105885525_C_CT:105885525:0,4,0,1
chr10	105885546	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=200,170;MMQ=56,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:105885525_C_CT:105885525:0,4,0,1
chr10	105885551	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=200,170;MMQ=56,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:105885525_C_CT:105885525:0,4,0,1
chr10	105885561	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=211,199;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr10	105903090	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	105905380	.	TGAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,1457;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,1,1
chr10	105921673	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=73,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr10	105922056	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:9,4:6,6:10,6,4,6
chr10	105926405	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:105926405_T_A:105926405:11,13,1,1
chr10	105926410	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:11,2:0|1:105926405_T_A:105926405:12,12,1,1
chr10	105926411	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:9,1:0|1:105926405_T_A:105926405:9,12,1,1
chr10	105927502	.	G	GAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:4,0:0|1:105927502_G_GAA:105927502:1,11,1,1
chr10	105927511	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:0|1:105927502_G_GAA:105927502:1,13,1,1
chr10	105932074	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr10	105938913	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AG;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.835:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr10	105942304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	105956776	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	105957613	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr10	105967624	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=111,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:3,6:1,3,3,4
chr10	105973981	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:7,9:4,4:8,3,7,6
chr10	105978536	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=93,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:8,1:7,5:8,8,2,4
chr10	105978690	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	105991884	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,6:0,18:0,0,15,10
chr10	105991895	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:2,4:12,7:5,9,10,2
chr10	106014764	.	CCGG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGG;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:5,3:4,7,0,4
chr10	106022869	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=216,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,2:0,1,1,5
chr10	106037742	.	C	CATG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:16,2:19,0:16,19,1,1
chr10	106037894	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,6,13
chr10	106039185	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr10	106039303	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	106058901	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,3:8,4:7,6,2,5
chr10	106058928	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:11,2:7,12,1,1
chr10	106074608	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:10,0:2,3:4,8,1,2
chr10	106124660	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,8:1,4:0,2,4,9
chr10	106130674	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=85,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:14,0:14,5:22,7,1,4
chr10	106151943	.	GCACAGATGGGCTATTTAAC	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:4,5:10,6:10,6,8,3
chr10	106159305	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=116,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr10	106159333	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:106159333_C_T:106159333:0,4,0,1
chr10	106159337	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:106159333_C_T:106159333:0,2,0,1
chr10	106166570	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:3,9,0,3
chr10	106401708	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106401708_G_A:106401708:0,1,0,1
chr10	106401716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106401708_G_A:106401708:0,1,0,1
chr10	106602496	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr10	106675585	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:8,2,3,2
chr10	106849515	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=111,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,0:17,2:14,11,0,2
chr10	106899305	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:2,3,0,3
chr10	106907320	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr10	106916819	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr10	106918679	.	A	ATCTCCAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=99,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:4,0:1,5,1,1
chr10	106924196	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:106924196_T_C:106924196:0,2,0,1
chr10	106924203	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:106924196_T_C:106924196:0,2,0,1
chr10	106924205	.	C	CCTTCCTCCTTCCCCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:106924196_T_C:106924196:0,2,0,1
chr10	107012633	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:12,6:6,0:11,7,6,0
chr10	108336925	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=138,96;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:3,2:0|1:108336925_A_T:108336925:10,1,0,2
chr10	108336934	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=120,96;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:8,0:3,2:0|1:108336925_A_T:108336925:9,2,0,2
chr10	108371571	.	A	AGTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTTT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	108378087	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:108378087_G_GAA:108378087:0,0,0,1
chr10	108378088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:108378087_G_GAA:108378087:0,0,0,1
chr10	108389218	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr10	108427594	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,2:3,5:3,1,2,5
chr10	108427624	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:108427624_A_G:108427624:0,0,0,2
chr10	108427644	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:108427624_A_G:108427624:0,0,0,3
chr10	108434775	.	AAGGCTGGACCACATCATACTTTTCAACTTACGTCATGATGAGAGTCTCTTCTCC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=111,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:3,2:4,0:19,7,1,1
chr10	108439103	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr10	108466412	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr10	108469022	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=91,78;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.218:24:8,4:11,0:12,7,4,1
chr10	108469161	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr10	111625108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr10	111629860	.	C	CACTCGATGGCATTCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr10	111630731	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	111633025	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	111633282	.	A	AGTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:111633282_A_AGTTT:111633282:0,4,0,1
chr10	111633283	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:111633282_A_AGTTT:111633282:0,4,0,1
chr10	111633287	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:111633282_A_AGTTT:111633282:0,4,0,1
chr10	111633291	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:111633282_A_AGTTT:111633282:0,3,0,1
chr10	111646147	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,9:0,0,4,10
chr10	111647738	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	111651598	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:0,1:4,2:1,10,0,4
chr10	111702672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:111702672_G_A:111702672:0,2,0,1
chr10	111702679	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:111702672_G_A:111702672:0,2,0,1
chr10	111881854	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:12,5,3,0
chr10	111881877	.	CTAGCAGGTGCAGGTGGAGTAGACAATCTCCATGTACTGGACTTTCAGAAGTATAAAGCTTTCACTTACACTG	C	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,19:0.061:102:25,3:10,6:47,36,16,3
chr10	111892134	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:6,6:5,2:4,8,3,5
chr10	111988180	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:0,8,0,4
chr10	112004562	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29,30;MFRL=131,153,146;MMQ=60,60,60;MPOS=8,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.21,8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.216,0.308:17:2,0,1:3,4,3:5,3,9,0
chr10	112004577	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:1,0:10,0:13,7,5,0
chr10	112004579	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.253:25:1,0:10,0:12,7,6,0
chr10	112044560	.	T	TTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:9,2:2,1:9,2,3,0
chr10	112054908	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,2:3,8:5,2,10,0
chr10	112057358	.	GCCTT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCTT;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:11,12,1,1
chr10	112258099	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	112266822	.	GC	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,5,15
chr10	112266978	.	GATGC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:112266978_GATGC_G:112266978:0,1,0,1
chr10	112266984	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112266978_GATGC_G:112266978:0,1,0,1
chr10	112327678	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,4,14
chr10	112328838	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr10	112333333	.	C	CTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,362;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	112338548	.	G	GTTGGCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:112338548_G_GTTGGCCT:112338548:1,2,0,1
chr10	112338550	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:112338548_G_GTTGGCCT:112338548:1,2,0,1
chr10	112343096	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:9,0,0,5
chr10	112353051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=187,150;MMQ=50,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:112353051_T_C:112353051:0,2,0,1
chr10	112353058	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=187,150;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:112353051_T_C:112353051:0,2,0,1
chr10	112353067	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=187,150;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:112353051_T_C:112353051:0,2,0,1
chr10	112356331	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr10	112357802	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=260,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	112360246	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,5:0.077:74:32,0:37,5:41,28,5,0
chr10	112360315	.	GT	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=60,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,5:3,2:5,3,4,6
chr10	112360405	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	112361853	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=108,117;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:19,3:23,0:26,17,3,0
chr10	112361870	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,54;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,18,15
chr10	112362019	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr10	112404384	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112404384_C_T:112404384:0,3,0,1
chr10	112404390	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:112404384_C_T:112404384:0,4,0,1
chr10	112543217	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr10	112544063	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=77,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr10	112544655	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=98,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,10:5,0:5,8,4,6
chr10	112570243	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,11,14
chr10	112572458	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr10	112583189	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=27,14;RU=T;STR;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,4:0,4:0,0,9,3
chr10	112590810	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,19,6
chr10	112590911	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:7,4:5,0:6,6,2,2
chr10	112641215	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:15,4:9,0:15,9,4,0
chr10	112650390	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:24,0:29,4:25,28,0,4
chr10	112748806	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112748806_T_C:112748806:0,3,0,1
chr10	112748814	.	ATATT	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:112748806_T_C:112748806:0,3,0,1
chr10	112748820	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=71,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:112748806_T_C:112748806:0,2,0,1
chr10	112748824	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=81,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:112748824_C_T:112748824:0,2,0,1
chr10	112748828	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112748824_C_T:112748824:0,1,0,1
chr10	112748832	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112748824_C_T:112748824:0,1,0,1
chr10	112748834	.	A	AATACTGTAATCTGG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112748824_C_T:112748824:0,1,0,1
chr10	113917967	.	GCA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:113917967_GCA_G:113917967:0,0,1,0
chr10	113917972	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:113917967_GCA_G:113917967:0,0,1,0
chr10	113918076	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,0:7,3:5,14,2,1
chr10	113921354	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr10	113923557	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:113923557_T_A:113923557:7,8,1,1
chr10	113923561	.	C	CAGCTGTTCAGAATATACT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:113923557_T_A:113923557:6,10,1,1
chr10	113924369	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,0:12,3:12,11,0,3
chr10	113926059	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=176,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr10	113932699	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,5:12,1:13,5,4,2
chr10	113940329	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=93,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:3,3:5,4:2,6,3,4
chr10	114059303	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:1,7:4,3:2,3,6,4
chr10	114059330	.	TCTCTGTTTTC	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGTTTTC;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:2,3:3,2:1,10,1,5
chr10	114061979	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	114154662	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.125:36:21,0:10,3:19,13,1,3
chr10	114169190	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr10	114181683	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,17,9
chr10	114186624	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,4:0,16:0,0,9,12
chr10	114192285	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:1,3,2,4
chr10	114197982	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr10	114724473	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr10	114799886	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.093:51:25,3:21,1:18,29,1,3
chr10	114901120	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=156,9648897;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr10	114903859	.	CTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=TG;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.803:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr10	114910667	.	GT	G,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,74,194;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.69,12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.273,0.638:8:0,1,2:0,1,4:0,0,8,0
chr10	114919608	.	TTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:4,2:9,1,1,1
chr10	115327193	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,15,7
chr10	115334124	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:3,5,4,2
chr10	115335843	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	115338305	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	115338615	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr10	115343822	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr10	115345678	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,0:6,4:2,11,2,2
chr10	115345694	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=155,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,0:4,4:1,12,2,2
chr10	115345719	.	T	TCACAGTTGGAGATTGGCAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:2,2:0,8,0,2
chr10	115349397	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr10	115349643	.	C	CTTGCCAGTGAGCTGAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	115355293	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr10	115370134	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=21,15;MFRL=202,158;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:3,0:0,0:0|1:115370134_G_A:115370134:6,1,2,0
chr10	115370137	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=24,13;MFRL=196,158;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,0:1,0:0|1:115370134_G_A:115370134:6,4,2,0
chr10	115370141	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,18;MFRL=190,158;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:4,0:4,1:0|1:115370134_G_A:115370134:6,5,2,0
chr10	115370148	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=29,15;MFRL=190,158;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,0:4,0:0|1:115370134_G_A:115370134:8,5,2,0
chr10	115370152	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,18;MFRL=159,158;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:5,1:0|1:115370134_G_A:115370134:8,7,2,0
chr10	115370156	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=150,158;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.144:18:6,0:8,0:0|1:115370134_G_A:115370134:9,7,2,0
chr10	115373851	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	115380552	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115380552_G_C:115380552:0,1,0,1
chr10	115380557	.	G	GTTGGTTTTTCAAACACACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:115380552_G_C:115380552:0,1,0,1
chr10	115381721	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,2:9,1:8,9,0,3
chr10	115381747	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,5:7,4:5,9,2,7
chr10	115383335	.	A	AGGCTGTGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,0:9,1:14,11,1,1
chr10	115388588	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	115388763	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:10,0:10,7:10,10,0,7
chr10	115389267	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=73,59;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr10	115391450	.	G	GAAACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	115401031	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	115401081	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr10	115401264	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr10	115405605	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=116,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,1:13,2:17,13,3,0
chr10	115405615	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,6:7,5:9,7,7,4
chr10	115405664	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:7,3:2,5:3,6,1,8
chr10	115405703	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=109,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.504:6:2,0:0,1:0,3,0,3
chr10	115412651	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=86,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr10	115412686	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr10	115413901	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,1:5,7:2,7,3,5
chr10	115413917	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,0:7,2:0|1:115413917_C_T:115413917:4,11,1,1
chr10	115413922	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:115413917_C_T:115413917:1,11,1,1
chr10	115423141	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=96,77;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:11,0:9,4:7,15,0,4
chr10	115423747	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr10	115480974	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:3,2:3,0:0|1:115480974_C_CT:115480974:0,6,1,1
chr10	115480979	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:0|1:115480974_C_CT:115480974:0,6,1,1
chr10	115481610	.	C	CAAGGTCAGGAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,87;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0|1:115481610_C_CAAGGTCAGGAGA:115481610:1,7,0,2
chr10	115481612	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=164,87;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,0:0|1:115481610_C_CAAGGTCAGGAGA:115481610:1,7,0,2
chr10	115515120	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr10	115525175	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,9,19
chr10	115527276	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,0:8,3:2,9,0,3
chr10	115533975	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=88,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,1:4,3:4,1,2,2
chr10	115534139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:115534139_T_C:115534139:0,7,1,1
chr10	115534141	.	A	ACCTGGGCATGTGGAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:115534139_T_C:115534139:0,7,1,1
chr10	115540311	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr10	115612622	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:12,0:5,3:11,6,0,4
chr10	115612716	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,56;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.124:54:22,6:26,0:26,22,6,0
chr10	115618246	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,2:2,5:4,0,7,0
chr10	115644004	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:9,0:21,4:18,12,2,2
chr10	115644015	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=103,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:11,0:22,2:0|1:115644015_C_CT:115644015:21,15,1,1
chr10	115644017	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=104,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:11,0:24,2:0|1:115644015_C_CT:115644015:20,15,1,1
chr10	115644040	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:5,4:9,11:7,7,8,7
chr10	115668231	.	C	CCCTCTTTTCTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,94;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:3,10,0,2
chr10	115805528	.	G	GT	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.130:59:26,4:21,5:31,19,5,4
chr10	115805559	.	CTTTTT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.438:10:2,1:1,1:1,5,1,3
chr10	115806499	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:13,6,2,1
chr10	115904185	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr10	115963126	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:1,4:0,8:1,0,6,6
chr10	115963813	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr10	115966147	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr10	115973032	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.847:4:0,2:0,2:0|1:115973032_TG_T:115973032:0,0,4,0
chr10	115973040	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:115973032_TG_T:115973032:0,0,5,0
chr10	115980324	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr10	115985784	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,12,3
chr10	115986065	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	115991124	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:115991124_G_A:115991124:0,0,4,0
chr10	115991133	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:115991124_G_A:115991124:0,0,6,0
chr10	115991227	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=395,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,6:0,6:0,1,8,4
chr10	116013312	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr10	116058933	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	116060194	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0,0,10,12
chr10	116068176	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.838:16:0,5:2,9:1,1,6,8
chr10	116075228	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr10	116075271	.	T	TCC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.933:17:0,8:1,6:1,0,11,5
chr10	116083061	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=97,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,0:0,6:2,2,1,5
chr10	116091555	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,11:0,0,16,14
chr10	116100320	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr10	116203974	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr10	116205267	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr10	116209970	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=13,16;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.358:15:2,1:2,1:1,9,0,5
chr10	116209983	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:8,2:1,16,0,2
chr10	116210010	.	A	AACAGATAT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=142,229;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:9,0:0|1:116210010_A_AACAGATAT:116210010:1,14,0,2
chr10	116210012	.	C	CACTGAGGCAACA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=142,229;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:9,0:0|1:116210010_A_AACAGATAT:116210010:1,14,0,2
chr10	116222749	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,9:7,3:5,5,9,3
chr10	116225365	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=196,40167844;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr10	116228048	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,151;MMQ=55,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.424:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr10	116228105	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,197;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr10	116233731	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:116233731_T_G:116233731:3,5,1,1
chr10	116233734	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=167,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:116233731_T_G:116233731:2,5,1,1
chr10	116233735	.	T	TATAAAAACATCTAACATAGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=167,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:116233731_T_G:116233731:2,5,1,1
chr10	116251686	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:1,5,1,2
chr10	116307504	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=147,96;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,3:1,5:0,1,5,4
chr10	116335443	.	CACCCTGTGATCTCAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,262;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	116593175	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,3:1,2:0,3,3,2
chr10	116593212	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=163,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr10	116596071	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,3:0,5:0,1,0,8
chr10	116605103	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:10,3,7,3
chr10	116606173	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr10	116608350	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:4,1:11,0,2,1
chr10	116621154	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,3:5,4:5,8,4,3
chr10	116719543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:7,6:3,3:7,3,7,3
chr10	116925503	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	116930999	.	GG	AA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:16,4:11,0:13,14,2,2
chr10	116931101	.	C	CTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=95.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,19:0,6:0,0,9,17
chr10	117075175	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr10	117075182	.	G	GATGGAATTA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.388:8:3,2:2,0:0|1:117075182_G_GATGGAATTA:117075182:1,4,2,1
chr10	117075184	.	T	TGAATAAGAATCTCAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.388:8:2,3:2,0:0|1:117075182_G_GATGGAATTA:117075182:1,4,2,1
chr10	117075239	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=194,142;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:117075239_G_C:117075239:0,2,0,1
chr10	117075245	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=194,142;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:117075239_G_C:117075239:0,2,0,1
chr10	117075250	.	A	ATTCAGAAAGGATGATCTTAGTCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=131,142;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117075239_G_C:117075239:0,1,0,1
chr10	117278783	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr10	117308880	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	117309098	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=172,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr10	117486763	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=94,166;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,4:4,2:8,4,5,1
chr10	117486910	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,1,3
chr10	117856288	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:117856288_A_T:117856288:1,3,1,1
chr10	117856292	.	GGGGTGGGGGGTGGAAATGTGCTTT	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=147,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:4,2:0|1:117856288_A_T:117856288:1,4,1,1
chr10	117856298	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.383:3:0,0:2,1:0|1:117856298_G_T:117856298:0,2,0,1
chr10	117856305	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:117856298_G_T:117856298:0,2,0,1
chr10	117856307	.	AA	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:117856298_G_T:117856298:0,2,0,1
chr10	117856313	.	C	CGTGTGTGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:117856298_G_T:117856298:0,2,0,1
chr10	118030658	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,0:2,0,0,2
chr10	118031376	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr10	118031566	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:1,1:6,0:3,6,3,0
chr10	118031619	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:1,6,0,5
chr10	118084525	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,2:5,0:7,4,2,0
chr10	118084694	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118084694_C_A:118084694:0,0,0,1
chr10	118084695	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118084694_C_A:118084694:0,0,0,1
chr10	118084697	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118084694_C_A:118084694:0,0,0,1
chr10	118187399	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr10	118187405	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr10	118215150	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	118231363	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,13:0,0,11,15
chr10	118231406	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,5,12
chr10	118231414	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=79,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:3,9,1,3
chr10	118236735	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:118236735_TC_T:118236735:0,4,0,1
chr10	118236736	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:1,1:2,0:1|0:118236735_TC_T:118236735:0,3,0,1
chr10	118236739	.	GACCAA	G,GGTTACCAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30,30;MFRL=165,104,87;MMQ=60,60,60;MPOS=5,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:0,3,0,2
chr10	118236740	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=165,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:118236735_TC_T:118236735:0,3,0,1
chr10	118236747	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:118236735_TC_T:118236735:0,3,0,1
chr10	118307047	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=127,142;MMQ=56,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:118307047_G_A:118307047:0,2,0,1
chr10	118307049	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=127,142;MMQ=56,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:118307047_G_A:118307047:0,2,0,1
chr10	118351905	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,0,2
chr10	118354295	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:118354295_C_T:118354295:6,9,1,1
chr10	118354307	.	CTA	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:118354295_C_T:118354295:6,9,1,1
chr10	118354310	.	C	CCAGA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:118354295_C_T:118354295:7,9,1,1
chr10	118354312	.	C	CCCGCGGGGCGCAGCAG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:5,0:10,1:0|1:118354295_C_T:118354295:6,9,1,1
chr10	118357490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr10	118359548	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,6,8
chr10	118368493	.	CCAAAA	C,ACAAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,96,113;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.33,12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,9:0.310,0.627:13:0,0,7:0,4,2:0,0,7,6
chr10	118380345	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	118380387	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr10	118380629	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	118380707	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118380707_CT_GG:118380707:1,0,1,0
chr10	118380712	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,17;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,0:1,0:0|1:118380707_CT_GG:118380707:1,0,1,0
chr10	118380714	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,14;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:118380707_CT_GG:118380707:1,0,1,0
chr10	118380838	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:118380838_CG_C:118380838:5,6,1,1
chr10	118380840	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:118380838_CG_C:118380838:5,6,1,1
chr10	118383462	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:118383462_G_A:118383462:9,4,1,1
chr10	118383463	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,5:0,8:0|1:118383462_G_A:118383462:0,0,10,5
chr10	118386325	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr10	118387454	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	118394551	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr10	118396278	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=87,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.750:18:2,8:3,5:3,2,8,5
chr10	118398046	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr10	118427645	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	118434310	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=129,5770794;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,0:1,2:6,2,1,1
chr10	118452001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:118452001_C_T:118452001:2,5,1,1
chr10	118452011	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:118452001_C_T:118452001:1,6,1,1
chr10	118452015	.	GC	AG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:118452001_C_T:118452001:1,6,1,1
chr10	118633548	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr10	118646129	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr10	118699971	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=92,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.124:37:15,4:18,0:18,15,3,1
chr10	118897605	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=228,99;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	118960885	.	A	AGGGAAGAAGAGAGGGAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118960885_A_AGGGAAGAAGAGAGGGAGAG:118960885:0,1,0,1
chr10	118960888	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118960885_A_AGGGAAGAAGAGAGGGAGAG:118960885:0,1,0,1
chr10	118969073	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.179:25:13,3:8,1:10,11,2,2
chr10	119001151	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	119014023	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr10	119014833	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:19,4:9,0:16,12,0,4
chr10	119014931	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:6,3:6,0:0|1:119014931_C_T:119014931:5,8,1,3
chr10	119014948	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=154,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.367:17:4,3:7,2:0|1:119014931_C_T:119014931:6,5,3,3
chr10	119017297	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,0:9,3:6,7,2,1
chr10	119026401	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,10,2
chr10	119027123	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr10	119027177	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:9,3,2,1
chr10	119029515	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=124,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	119029744	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,4,16
chr10	119029762	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=166,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,0:6,2:2,9,0,2
chr10	119029965	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:4,0:5,12,0,2
chr10	119042761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr10	119049738	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=158,150;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:6,6,3,0
chr10	119133791	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr10	119134753	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=263,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr10	119768551	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,9,10
chr10	119799704	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,97;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,0:5,4:9,6,0,4
chr10	120070843	.	G	GGA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.960:19:0,6:0,8:0,0,3,16
chr10	120095037	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,15,7
chr10	120354169	.	C	CCCTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120354169_C_CCCTCA:120354169:0,0,0,1
chr10	120354171	.	C	CTGACAGTGTTGAACCTTTGTTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120354169_C_CCCTCA:120354169:0,0,0,1
chr10	120445794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr10	120445804	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:120445804_AAT_A:120445804:0,4,0,1
chr10	120445808	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:120445804_AAT_A:120445804:0,4,0,1
chr10	120445810	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:120445804_AAT_A:120445804:0,4,0,1
chr10	120790372	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=102,241;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:15,5:12,0:13,14,0,5
chr10	120791476	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,0:18,2:17,16,0,2
chr10	120791493	.	T	TCTGTCTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:13,4:18,0:15,17,0,4
chr10	120791778	.	TAAATACC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:4,8:10,3:6,8,7,5
chr10	120792297	.	G	GCTA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTA;STR;TLOD=96.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,11:0,0,13,10
chr10	120792684	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,11:0,0,17,0
chr10	120793384	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26,26;MFRL=165,128,132;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,12;RU=A;STR;TLOD=19.47,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,10,4:0.509,0.221:19:0,7,2:5,3,2:1,4,10,4
chr10	120795795	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,2,2
chr10	120803746	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	120810623	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	120817450	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr10	120820224	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	120832872	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	120833266	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.055:52:28,0:22,2:28,22,1,1
chr10	120833283	.	G	GAAAC	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.054:54:26,0:23,2:27,25,1,1
chr10	120867694	.	TA	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=111,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.112:61:35,4:19,2:29,26,4,2
chr10	120877231	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:0,13,0,3
chr10	120877248	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=162,152;MMQ=40,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,4:1,6:0,1,0,11
chr10	120883117	.	CTTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=80,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.499:7:1,1:0,1:1,3,0,3
chr10	120900786	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,0:11,3:6,9,1,2
chr10	120905709	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:10,3:5,0:12,4,3,0
chr10	120905940	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,145;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=GT;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,1:1,0:1,2,1,0
chr10	120907475	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=192,159;MMQ=53,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0,4,0,2
chr10	120907480	.	TG	CG,CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24,35;MFRL=192,155,163;MMQ=53,40,40;MPOS=7,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,0:1,0,1:0,4,0,2
chr10	120914692	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr10	120917269	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,16:0,13:0,0,17,12
chr10	120917616	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,11:0,3:0,0,5,9
chr10	120921864	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:19,4:25,0:21,23,2,2
chr10	120922017	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr10	120923552	.	C	CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,159;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,27;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:1,0,1,1
chr10	120923780	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.728:8:0,1:2,0:0,2,0,6
chr10	120933901	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,13,1
chr10	120936689	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,3:4,0:2,9,1,2
chr10	120967508	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:3,8:8,4:3,8,7,6
chr10	121140467	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,45;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:121140467_C_A:121140467:8,12,1,1
chr10	121140480	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:121140467_C_A:121140467:4,11,1,1
chr10	121140481	.	G	GAAGTAGAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=103,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:5,0:0|1:121140467_C_A:121140467:4,10,1,1
chr10	121156151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr10	121189779	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:3,0,1,1
chr10	121190040	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=189,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,2,2
chr10	121196062	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=302,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr10	121196099	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chr10	121196269	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=79,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:10,7,2,0
chr10	121199189	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr10	121199310	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:2,1:4,1:4,4,2,0
chr10	121199365	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:1,1,0,2
chr10	121201616	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:6,1:2,11:0|1:121201616_C_T:121201616:5,3,7,5
chr10	121201626	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,10:0.458:22:1,7:11,3:1|0:121201616_C_T:121201616:6,6,7,3
chr10	121214467	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.282:19:7,2:4,1:0|1:121214467_A_C:121214467:4,10,5,0
chr10	121214473	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.246:22:9,0:6,0:0|1:121214467_A_C:121214467:7,10,5,0
chr10	121214479	.	AG	CC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.196:28:11,0:9,0:0|1:121214467_A_C:121214467:11,12,5,0
chr10	121274949	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:5,1,1,1
chr10	121275074	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=129,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,3:12,0:14,11,2,1
chr10	121287019	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	121338401	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr10	121338428	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr10	121347839	.	TTTTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTC;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.597:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	121431941	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:0|1:121431941_G_C:121431941:15,11,1,1
chr10	121431947	.	AA	GT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:12,2:0|1:121431941_G_C:121431941:13,13,1,1
chr10	121431951	.	C	CTCAAATGA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:0|1:121431941_G_C:121431941:12,12,1,1
chr10	121435955	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr10	121436495	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:13,7:14,0:18,9,7,0
chr10	121551311	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	121557940	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	121569742	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:9,0:7,2:0|1:121569742_A_T:121569742:5,12,1,1
chr10	121569747	.	TTTTCTTTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:7,0:5,2:0|1:121569742_A_T:121569742:4,12,1,1
chr10	121569757	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:121569742_A_T:121569742:1,7,1,1
chr10	121569764	.	T	TTATTTATC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=160,74;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:121569764_T_TTATTTATC:121569764:1,7,0,2
chr10	121569770	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=160,74;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:3,1:0|1:121569764_T_TTATTTATC:121569764:1,7,0,2
chr10	121571507	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr10	121582047	.	A	AGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=158,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:0|1:121582047_A_AGC:121582047:1,8,1,1
chr10	121582049	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=158,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,1:4,0:0|1:121582047_A_AGC:121582047:1,8,1,1
chr10	121582556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=153,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,2:4,4:0|1:121582556_T_C:121582556:6,1,5,1
chr10	121582563	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.185:14:4,0:8,2:1|0:121582556_T_C:121582556:10,2,2,0
chr10	121583298	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,137;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:7,3,6,0
chr10	121586882	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,2:3,9:1,6,7,4
chr10	121586913	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=97,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:9,11,2,0
chr10	121596308	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:121596308_C_A:121596308:0,0,1,0
chr10	121596311	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121596308_C_A:121596308:1,0,1,0
chr10	121607030	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121607030_GA_G:121607030:1,0,1,0
chr10	121607035	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:121607030_GA_G:121607030:2,0,1,0
chr10	121607039	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:121607030_GA_G:121607030:2,0,1,0
chr10	121618653	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,10:0.159:67:29,0:27,10:19,38,0,10
chr10	121618787	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AC;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	121652266	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:10,5:10,4:17,3,8,1
chr10	121658479	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=73,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr10	121662335	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:9,2:3,1:7,5,1,2
chr10	121675238	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,2:2,0:4,0,3,1
chr10	121678072	.	CTGAACAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,2:4,0:0|1:121678072_CTGAACAAT_C:121678072:0,7,1,1
chr10	121678083	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:121678072_CTGAACAAT_C:121678072:0,7,1,1
chr10	121678896	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=210,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr10	121679013	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,7:6,2:2,5,5,4
chr10	122358463	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,4:0,10:1,0,9,6
chr10	122358656	.	A	AGTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:122358656_A_AGTG:122358656:0,0,1,4
chr10	122358657	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:122358656_A_AGTG:122358656:0,0,1,4
chr10	122358661	.	G	GTGGCACTCACTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=200,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:122358656_A_AGTG:122358656:1,3,0,1
chr10	122626312	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,3:4,0:0|1:122626312_G_T:122626312:0,10,0,3
chr10	122626315	.	TCCTG	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:0|1:122626312_G_T:122626312:0,10,0,3
chr10	122630877	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.427:15:4,1:4,5:3,6,1,5
chr10	123243197	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:9,4:1,13:6,4,10,7
chr10	123247037	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=239,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0|1:123247037_C_T:123247037:0,3,0,6
chr10	123247044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:123247037_C_T:123247037:0,0,0,7
chr10	123279745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr10	123503431	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=207,181;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=23,25;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.765:6:0,1:0,2:0,1,1,4
chr10	123549619	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=107,176;MMQ=60,53;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:6,3:5,0:7,4,4,0
chr10	123658575	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=276,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123658575_T_C:123658575:0,1,0,1
chr10	123658580	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=299,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123658575_T_C:123658575:0,2,0,1
chr10	123658582	.	C	CCTGAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=299,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123658575_T_C:123658575:0,2,0,1
chr10	123724701	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.829:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr10	123724767	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr10	123724925	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.255:29:9,2:12,5:2,20,1,6
chr10	123730501	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=102,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:12,5,2,1
chr10	123730564	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=86,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:14,0:16,4:18,14,0,4
chr10	123730685	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=11,28;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:0,2:0,2,0,2
chr10	123842065	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	123843856	.	A	ACCCAAGGGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=228,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:5,2:3,0:0|1:123843856_A_ACCCAAGGGG:123843856:1,7,0,2
chr10	123843859	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=228,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:123843856_A_ACCCAAGGGG:123843856:1,7,0,2
chr10	123844503	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,3:4,2:7,4,2,3
chr10	123845211	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,4:6,2:4,10,1,5
chr10	123847204	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:7,6,1,1
chr10	123847496	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr10	123892118	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:123892118_C_T:123892118:11,13,1,1
chr10	123892120	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:123892118_C_T:123892118:11,13,1,1
chr10	123954628	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:0,0:7,5:0,7,0,5
chr10	123970012	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,4:6,0:6,10,1,3
chr10	123972839	.	TTTGTCTTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=93,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:14,2:18,7,1,1
chr10	124001539	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr10	124008959	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=244,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr10	124013604	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr10	124034528	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.642:16:3,6:2,4:5,1,9,1
chr10	124034703	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:2,3,3,5
chr10	124036226	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr10	124036494	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr10	124050745	.	C	CAGGCAGATCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr10	124066652	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,11,2
chr10	124090744	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,1:7,3:8,11,2,2
chr10	124091855	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr10	124091921	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr10	124095982	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr10	124096209	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,1,13
chr10	124152936	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	124183687	.	GTTTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,79;MMQ=58,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr10	124183732	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,10:0,5:0,0,12,10
chr10	124189263	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:17,4:16,0:16,17,0,4
chr10	124214328	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.184:23:8,3:11,0:13,6,2,2
chr10	124214559	.	C	CTGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124214559_C_CTGTG:124214559:0,1,0,1
chr10	124214560	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124214559_C_CTGTG:124214559:0,1,0,1
chr10	124266905	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,2:19,1:28,13,3,0
chr10	124266991	.	GTTGT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTGT;STR;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.922:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr10	124268260	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=121,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,0:3,3:5,2,0,3
chr10	124271589	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0|1:124271589_G_A:124271589:0,0,5,11
chr10	124271595	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0|1:124271589_G_A:124271589:0,0,4,12
chr10	124320194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr10	124325409	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr10	124325569	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,6,11
chr10	124325631	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	124329580	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:124329580_C_A:124329580:0,0,2,1
chr10	124329583	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0|1:124329580_C_A:124329580:0,0,3,1
chr10	124329801	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	124331722	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr10	124331944	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,3
chr10	124331957	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,3
chr10	124331963	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,3
chr10	124333308	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,9,11
chr10	124335866	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr10	124336333	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124336333_A_T:124336333:0,1,0,1
chr10	124336336	.	CG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124336333_A_T:124336333:0,1,0,1
chr10	124339139	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=101,19408;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,2:15,0:11,9,2,0
chr10	124345847	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=112,151;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:11,12,2,0
chr10	124353101	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,64;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.089:29:12,0:15,2:16,11,1,1
chr10	124358652	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=130,211;MMQ=52,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,23:0.748:31:1,0:5,23:0|1:124358652_G_T:124358652:1,7,0,23
chr10	124358657	.	T	TCCAAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,38;MFRL=135,211;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,23:0.749:30:2,0:5,23:0|1:124358652_G_T:124358652:0,7,0,23
chr10	124359573	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:11,0:19,4:16,15,2,2
chr10	124360598	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,297;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124360598_G_T:124360598:0,0,0,1
chr10	124360600	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124360598_G_T:124360598:0,0,0,1
chr10	124360602	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,297;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124360598_G_T:124360598:0,0,0,1
chr10	124360604	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,297;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124360598_G_T:124360598:0,0,0,1
chr10	124360605	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,297;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124360598_G_T:124360598:0,0,0,1
chr10	124378826	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:10,3:12,0:13,9,1,2
chr10	124380603	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=115,98;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:8,5:12,0:9,12,5,0
chr10	124390551	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=76,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:0|1:124390551_G_A:124390551:8,8,1,1
chr10	124390561	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=76,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:124390551_G_A:124390551:7,10,1,1
chr10	124395638	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:11,8,2,1
chr10	124396908	.	G	GTAATAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,239;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	124399959	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,3,0,1
chr10	124399961	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,3,0,1
chr10	124399965	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,2,0,1
chr10	124399967	.	TAAGGA	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,2,0,1
chr10	124399979	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,3,0,1
chr10	124399981	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:124399959_G_GTT:124399959:0,3,0,1
chr10	124399985	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	124402944	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:0,4,0,6
chr10	124458066	.	A	ACCAGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,26;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:124458066_A_ACCAGCC:124458066:0,1,0,1
chr10	124458070	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124458066_A_ACCAGCC:124458066:0,1,0,1
chr10	124458073	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124458066_A_ACCAGCC:124458066:0,1,0,1
chr10	124458077	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124458066_A_ACCAGCC:124458066:0,1,0,1
chr10	124597084	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,86;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:8,14,2,1
chr10	124672333	.	TG	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,0:15,2:0|1:124672333_TG_GT:124672333:17,12,0,2
chr10	124672342	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:11,0:16,2:0|1:124672333_TG_GT:124672333:17,12,0,2
chr10	124697198	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=101,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,3:7,2:5,3,4,1
chr10	124711632	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr10	124742586	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr10	124742836	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:10,0:15,4:10,15,1,3
chr10	124742858	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=96,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,4:6,4:8,6,3,5
chr10	124746801	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:4,1,6,2
chr10	124749965	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,6:2,3:1,5,0,9
chr10	124758211	.	GG	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:124758211_GG_TT:124758211:0,2,0,1
chr10	124758216	.	A	AGTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124758211_GG_TT:124758211:0,1,0,1
chr10	124758218	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124758211_GG_TT:124758211:0,1,0,1
chr10	124758222	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124758211_GG_TT:124758211:0,1,0,1
chr10	124758226	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124758211_GG_TT:124758211:0,1,0,1
chr10	124794065	.	C	CTCTCATCCCTTTGGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	124810558	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=111,89;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.215:21:9,4:8,0:0|1:124810558_G_A:124810558:12,5,4,0
chr10	124810580	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=101,67;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,3:0.113:33:13,3:17,0:1|0:124810558_G_A:124810558:17,13,3,0
chr10	124810744	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:0,0:1,0:0,2,0,2
chr10	124810746	.	C	CT,CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32,34;MFRL=0,161,190;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.64,4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.433,0.427:4:0,0,0:0,2,2:0,0,0,4
chr10	124812487	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	124812685	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.881:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr10	124813167	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=106,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:8,5:3,10:6,5,8,7
chr10	124896555	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=123,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr10	124896668	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:124896668_G_A:124896668:12,7,1,1
chr10	124896670	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:124896668_G_A:124896668:12,7,1,1
chr10	125426627	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr10	125447705	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=108,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr10	125514232	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:7,0:12,6,0,2
chr10	125521533	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,16,4
chr10	125521590	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,14,10
chr10	125521721	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr10	125521751	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	125526689	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr10	125602021	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,0:6,3:5,6,1,2
chr10	125622250	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,2:3,3:1,5,2,3
chr10	125650793	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr10	125769671	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,2:15,1:15,15,2,1
chr10	125780752	.	CGGG	C,CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=147,112,68;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,10;RU=G;STR;TLOD=12.22,4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.524,0.289:7:0,3,1:0,1,1:1,0,6,0
chr10	125801761	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:2,1,4,3
chr10	125801809	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.660:18:4,5:1,7:3,3,6,6
chr10	126090430	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=103,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.603:18:2,6:5,5:4,3,6,5
chr10	126090465	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=103,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.516:10:3,1:2,3:1,4,3,2
chr10	126092374	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,0:20,2:0|1:126092374_C_T:126092374:22,16,1,1
chr10	126092385	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:17,0:22,2:0|1:126092374_C_T:126092374:22,19,1,1
chr10	126093991	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=87,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:6,4,4,4
chr10	126136251	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:6,0:8,2:5,9,2,0
chr10	126185451	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr10	126185618	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,6,16
chr10	126185707	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	126186771	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,2:2,5:1,1,1,6
chr10	126395123	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	126490581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	126505062	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.668:9:0,3:3,3:2,1,6,0
chr10	126517989	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:9,4:3,10:5,7,7,7
chr10	126519851	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr10	126520037	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:1,8,1,2
chr10	126523151	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=82,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.265:47:13,0:21,12:21,14,0,12
chr10	126660781	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	126673560	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:3,2:9,1:0,14,0,4
chr10	126678021	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=26,29;MFRL=164,151;MMQ=27,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:5,0:0|1:126678021_T_A:126678021:6,3,2,0
chr10	126678023	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=22;MBQ=34,27;MFRL=164,151;MMQ=27,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:126678021_T_A:126678021:6,3,2,0
chr10	126678039	.	TCTCTTGG	T	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=26,26;MFRL=134,151;MMQ=27,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:4,0:0|1:126678039_TCTCTTGG_T:126678039:7,3,2,0
chr10	126678055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=22;MBQ=33,28;MFRL=139,151;MMQ=27,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:126678039_TCTCTTGG_T:126678039:8,5,2,0
chr10	126678063	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=22;MBQ=33,31;MFRL=150,142;MMQ=27,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:5,0:9,6,3,0
chr10	126678065	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=22;MBQ=33,28;MFRL=145,142;MMQ=27,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:12,3:6,0:0|1:126678039_TCTCTTGG_T:126678039:11,9,3,0
chr10	126678075	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=22;MBQ=27,33;MFRL=143,142;MMQ=39,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:16,3:7,0:13,11,3,0
chr10	126678087	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=22;MBQ=31,23;MFRL=124,122;MMQ=33,28;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.180:37:22,1:6,4:0|1:126678087_C_T:126678087:13,18,3,3
chr10	126678092	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=22;MBQ=30,24;MFRL=121,122;MMQ=37,28;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:24,1:7,5:0|1:126678087_C_T:126678087:13,19,3,3
chr10	126678102	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=22;MBQ=30,20;MFRL=127,117;MMQ=27,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,8:0.196:44:23,5:13,2:0|1:126678102_G_A:126678102:13,23,2,6
chr10	126678112	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=22;MBQ=27,26;MFRL=124,117;MMQ=33,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:21,4:16,3:0|1:126678102_G_A:126678102:12,25,2,6
chr10	126678122	.	GT	G	.	.	DP=48;ECNT=22;MBQ=30,20;MFRL=127,110;MMQ=40,31;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.256:43:22,2:9,9:0|1:126678122_GT_G:126678122:7,25,4,7
chr10	126678128	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=22;MBQ=27,24;MFRL=127,110;MMQ=40,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.256:43:21,2:9,9:0|1:126678122_GT_G:126678122:7,25,4,7
chr10	126678133	.	TG	T	.	.	DP=46;ECNT=22;MBQ=28,28;MFRL=121,142;MMQ=32,46;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.182:41:16,3:16,3:11,23,1,6
chr10	126678147	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=22;MBQ=27,27;MFRL=133,104;MMQ=33,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.145:34:16,1:11,4:7,22,1,4
chr10	126678148	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=22;MBQ=28,31;MFRL=124,151;MMQ=31,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:12,4:13,2:7,18,0,6
chr10	126678163	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=22;MBQ=32,22;MFRL=140,167;MMQ=40,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,2:9,1:0|1:126678163_G_A:126678163:7,10,0,3
chr10	126678171	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=22;MBQ=27,31;MFRL=138,185;MMQ=40,41;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,1:0|1:126678163_G_A:126678163:7,9,0,2
chr10	126678177	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=22;MBQ=31,31;MFRL=151,136;MMQ=40,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:9,0:2,3:0|1:126678177_G_T:126678177:6,5,0,3
chr10	126678180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=22;MBQ=32,27;MFRL=151,136;MMQ=40,37;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,0:2,2:0|1:126678177_G_T:126678177:6,5,0,3
chr10	126678189	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=27,35;MFRL=146,150;MMQ=40,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:126678177_G_T:126678177:6,4,0,2
chr10	126678196	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=22;MBQ=32,26;MFRL=151,150;MMQ=40,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:126678177_G_T:126678177:6,3,0,2
chr10	126681215	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:2,6:6,0:7,2,5,1
chr10	126681219	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:6,3:0,6:5,1,7,2
chr10	126681688	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr10	126681868	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=123,53;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.238:61:20,8:27,6:18,29,3,11
chr10	126681872	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,52;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.093:60:25,2:30,3:18,37,2,3
chr10	126681901	.	A	AAAGGGCT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=122,63;MMQ=60,33;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:12,1:13,4:8,17,1,4
chr10	126682435	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=152,0;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:8,3:9,2:0|1:126682435_T_C:126682435:10,8,3,2
chr10	126682443	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=130,59;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.311:30:7,4:14,5:0|1:126682435_T_C:126682435:12,9,6,3
chr10	126682468	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=140,69;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.376:32:5,5:15,6:9,11,6,6
chr10	126682483	.	G	GAT	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=20,25;MFRL=106,30;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.183:36:7,4:22,2:0|1:126682483_G_GAT:126682483:12,18,3,3
chr10	126682484	.	GCT	G	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=28,24;MFRL=106,30;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.183:36:8,4:22,2:0|1:126682483_G_GAT:126682483:12,18,3,3
chr10	126682485	.	CT	TG	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=109,69;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.336:36:6,6:18,6:9,15,6,6
chr10	126682493	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=109,69;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:4,4:18,5:7,15,5,6
chr10	126683071	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=16;MBQ=30,30;MFRL=128,133;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,17:0.273:64:23,8:24,9:25,22,17,0
chr10	126683075	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=23,30;MFRL=130,125;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,9:0.142:68:28,7:29,2:37,22,9,0
chr10	126683087	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=23,30;MFRL=143,122;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,25:0.371:68:20,10:22,12:22,21,22,3
chr10	126683092	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=31,28;MFRL=129,172;MMQ=47,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,6:0.092:70:26,1:34,5:0|1:126683092_G_A:126683092:40,24,5,1
chr10	126683099	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=130,172;MMQ=45,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,6:0.087:74:29,1:38,5:0|1:126683092_G_A:126683092:41,27,5,1
chr10	126683103	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=16;MBQ=28,23;MFRL=140,112;MMQ=45,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,15:0.209:74:21,10:38,5:37,22,11,4
chr10	126683123	.	A	C	.	.	DP=88;ECNT=16;MBQ=27,31;MFRL=144,112;MMQ=52,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,36:0.428:84:18,16:29,17:25,23,21,15
chr10	126683132	.	A	T	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=25,24;MFRL=125,135;MMQ=52,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.203:86:30,6:36,10:35,34,12,5
chr10	126683146	.	C	A	.	.	DP=82;ECNT=16;MBQ=31,25;MFRL=123,129;MMQ=52,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,17:0.225:78:25,9:35,8:0|1:126683146_C_A:126683146:26,35,10,7
chr10	126683150	.	AC	GT	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=26,22;MFRL=129,99;MMQ=52,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,23:0.288:81:24,9:31,12:28,30,8,15
chr10	126683151	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=29,27;MFRL=135,112;MMQ=52,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,20:0.250:73:20,9:28,10:28,25,8,12
chr10	126683152	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=28,26;MFRL=122,129;MMQ=52,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=50.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,16:0.198:84:26,6:37,7:0|1:126683146_C_A:126683146:28,40,9,7
chr10	126683162	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=16;MBQ=28,28;MFRL=129,110;MMQ=51,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=93.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,26:0.360:73:19,14:28,12:26,21,6,20
chr10	126683166	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=16;MBQ=28,26;MFRL=128,99;MMQ=52,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,18:0.263:70:21,8:29,10:26,26,4,14
chr10	126683178	.	GCAAGTAGGGGTCATAAAATATGACGCTGAATC	G	.	.	DP=90;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=124,128;MMQ=52,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,11:0.145:81:21,5:30,5:29,41,5,6
chr10	126683190	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=16;MBQ=31,24;MFRL=143,110;MMQ=52,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.253:48:14,6:22,5:19,17,3,9
chr10	126686646	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=125,97;MMQ=60,28;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:12,4:11,0:0|1:126686646_C_G:126686646:14,12,4,0
chr10	126686649	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=29,34;MFRL=126,99;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:12,4:14,0:0|1:126686646_C_G:126686646:17,13,4,1
chr10	126686656	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=24,34;MFRL=126,97;MMQ=60,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:17,5:17,1:0|1:126686646_C_G:126686646:18,16,4,2
chr10	126686659	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=27,31;MFRL=126,99;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.177:43:16,5:15,1:0|1:126686646_C_G:126686646:17,19,4,3
chr10	126686665	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=31,23;MFRL=126,89;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:20,1:17,4:0|1:126686665_G_T:126686665:17,21,3,2
chr10	126686666	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=31,23;MFRL=127,99;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.177:43:14,6:19,1:0|1:126686646_C_G:126686646:16,20,4,3
chr10	126686672	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=118,89;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:17,1:16,4:0|1:126686665_G_T:126686665:17,20,3,2
chr10	126686680	.	A	C,T	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=27,25,31;MFRL=119,99,89;MMQ=60,31,57;MPOS=20,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.78,6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,7,3:0.182,0.093:40:13,6,0:16,1,3:15,15,5,5
chr10	126686682	.	A	G,T	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=26,20,23;MFRL=120,99,89;MMQ=60,31,57;MPOS=22,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.78,15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,7,5:0.182,0.136:41:11,6,1:17,1,4:14,15,7,5
chr10	126686687	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=25,31;MFRL=118,94;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.304:44:12,7:17,6:17,14,8,5
chr10	126686690	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=14;MBQ=31,26;MFRL=106,89;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:17,1:20,4:0|1:126686665_G_T:126686665:23,17,3,2
chr10	126686692	.	CC	TG	.	.	DP=47;ECNT=14;MBQ=30,24;MFRL=106,89;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.127:45:17,1:21,4:0|1:126686665_G_T:126686665:23,17,3,2
chr10	126686693	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=14;MBQ=28,20;MFRL=106,97;MMQ=60,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.219:39:11,5:20,2:18,13,5,3
chr10	126686762	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=24,20;MFRL=84,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:4,6:7,4:3,8,4,7
chr10	126686827	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=39,24;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr10	126691471	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr10	126691575	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=24,31;MFRL=116,64;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,15:0.281:55:18,8:18,7:0|1:126691575_T_C:126691575:19,21,6,9
chr10	126691577	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=23,30;MFRL=116,64;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,15:0.281:55:21,8:17,7:0|1:126691575_T_C:126691575:19,21,6,9
chr10	126691579	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=25,28;MFRL=102,86;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,7:0.143:54:25,3:20,4:24,23,1,6
chr10	126691580	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=112,60;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,8:0.164:53:23,5:21,3:18,27,5,3
chr10	126691595	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=112,60;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,8:0.143:61:24,4:25,3:0|1:126691595_G_A:126691595:25,28,5,3
chr10	126691598	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=13;MBQ=29,26;MFRL=108,60;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,8:0.141:62:25,5:26,3:0|1:126691595_G_A:126691595:26,28,5,3
chr10	126691605	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=133,78;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=90.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,25:0.413:61:18,11:16,12:17,19,10,15
chr10	126691608	.	CT	TT,TG	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=31,27,25;MFRL=134,91,30;MMQ=60,41,56;MPOS=12,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=57.43,17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,17,6:0.297,0.109:58:19,7,1:16,10,3:17,18,9,14
chr10	126691614	.	GT	AA	.	.	DP=58;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=123,64;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:26,0:27,2:23,32,2,1
chr10	126691617	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=126,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.137:56:23,3:24,4:22,27,2,5
chr10	126691631	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=26,27;MFRL=130,85;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,16:0.340:48:16,5:14,11:0|1:126691631_T_A:126691631:19,13,6,10
chr10	126691634	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=130,79;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,15:0.326:47:14,5:16,10:0|1:126691631_T_A:126691631:19,13,6,9
chr10	126691660	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=30,22;MFRL=134,103;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.199:43:19,5:15,3:20,15,3,5
chr10	126691950	.	AC	A	.	.	DP=56;ECNT=14;MBQ=23,27;MFRL=130,78;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.093:49:19,2:25,2:21,24,1,3
chr10	126691952	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=14;MBQ=25,33;MFRL=130,78;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:19,2:26,2:21,24,1,3
chr10	126691979	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=14;MBQ=31,30;MFRL=141,100;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.221:43:15,3:19,6:8,26,2,7
chr10	126691994	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=148,106;MMQ=55,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.230:37:12,3:16,5:0|1:126691994_G_C:126691994:8,21,1,7
chr10	126691997	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=32,30;MFRL=148,106;MMQ=55,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:12,3:16,5:0|1:126691994_G_C:126691994:8,21,1,7
chr10	126692000	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=30,26;MFRL=148,106;MMQ=58,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:11,3:16,5:0|1:126691994_G_C:126691994:7,21,1,7
chr10	126692009	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=28,24;MFRL=148,106;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:7,2:13,5:0|1:126691994_G_C:126691994:6,18,1,7
chr10	126692017	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=33,25;MFRL=143,116;MMQ=60,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.194:29:9,2:14,3:0|1:126691994_G_C:126691994:7,17,0,5
chr10	126692019	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=14;MBQ=33,24;MFRL=147,116;MMQ=60,23;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:9,2:15,3:0|1:126691994_G_C:126691994:7,18,0,5
chr10	126692022	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=27,26;MFRL=148,114;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:6,1:12,3:0|1:126691994_G_C:126691994:6,18,0,4
chr10	126692029	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=149,111;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,1:10,2:0|1:126691994_G_C:126691994:7,15,0,3
chr10	126692035	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=32,26;MFRL=150,251;MMQ=60,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,1:11,1:0|1:126691994_G_C:126691994:8,13,0,2
chr10	126692037	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=33,26;MFRL=152,251;MMQ=60,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,1:0|1:126691994_G_C:126691994:8,11,0,2
chr10	126692066	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=31,30;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:4,4,4,1
chr10	126715469	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:7,15,1,1
chr10	126715478	.	C	CCACTTGAATATTCTTGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:5,15,1,1
chr10	126727602	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=24,23;MFRL=120,83;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=102.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,27:0.560:48:10,12:9,14:0|1:126727602_T_A:126727602:9,12,11,16
chr10	126727604	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=120,83;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,27:0.560:48:9,13:11,13:0|1:126727602_T_A:126727602:9,12,11,16
chr10	126727614	.	CA	C	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=110,83;MMQ=52,46;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.243:46:18,4:14,7:12,23,4,7
chr10	126727630	.	T	C,G	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=28,20,30;MFRL=130,85,74;MMQ=52,46,48;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.47,63.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,8,21:0.196,0.494:42:4,2,12:8,6,9:3,10,11,18
chr10	126727635	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=94,74;MMQ=51,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.140:40:15,2:19,3:9,26,4,1
chr10	126727647	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=110,94;MMQ=51,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,4:12,3:7,13,1,7
chr10	126727690	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=159,134;MMQ=60,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,0:3,4:3,4,0,4
chr10	127371675	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:127371675_C_T:127371675:0,3,0,1
chr10	127371678	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:127371675_C_T:127371675:0,3,0,1
chr10	127426430	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr10	127426452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=145,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr10	127426588	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,7,13
chr10	127426835	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr10	127427007	.	G	GTT	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,0:15,2:0|1:127427007_G_GTT:127427007:7,25,0,2
chr10	127427008	.	GACAA	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:11,0:20,2:0|1:127427007_G_GTT:127427007:7,26,0,2
chr10	127427015	.	G	GAT	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:18,2:0|1:127427007_G_GTT:127427007:8,28,0,2
chr10	127427019	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,0:19,2:0|1:127427007_G_GTT:127427007:8,27,0,2
chr10	127427021	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.369:36:14,0:9,13:7,16,0,13
chr10	127436411	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,4:0,16:0,0,18,2
chr10	127441573	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	127456366	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=146,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr10	127460952	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:1,2:4,3:2,4,2,4
chr10	127462458	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr10	127483396	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=59,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.476:8:1,1:3,3:1,3,4,0
chr10	127483573	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:2,4:3,7:2,3,4,7
chr10	127484617	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=90,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:1,1,4,2
chr10	127484653	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=60,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.393:15:3,1:6,3:6,3,4,2
chr10	127491704	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:127491704_C_CTA:127491704:0,4,0,1
chr10	127491706	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:127491704_C_CTA:127491704:0,4,0,1
chr10	127491709	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr10	127500718	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr10	127504660	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	127515069	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,6:1,1:3,1,6,1
chr10	127522572	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:0,2,0,6
chr10	127524612	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:3,0,7,1
chr10	127548587	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=96,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,6:7,0:3,5,1,5
chr10	127569430	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:4,1:0,0:0|1:127569430_C_A:127569430:0,4,0,1
chr10	127569433	.	GCAA	G,ACAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29,23;MFRL=133,232,145;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.221,0.218:6:4,1,1:0,0,0:0,4,0,2
chr10	127569435	.	A	ACCCCTGTGATAAAGTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=19,23;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,1:0,0:0|1:127569430_C_A:127569430:0,4,0,1
chr10	127585090	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=95,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0|1:127585090_C_A:127585090:4,2,3,0
chr10	127585091	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,2:2,1:0|1:127585091_G_A:127585091:4,1,3,1
chr10	127585097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,3:1,3:0|1:127585097_T_C:127585097:2,1,5,1
chr10	127585099	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=89,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0|1:127585097_T_C:127585097:1,1,5,1
chr10	127585112	.	TC	CC,CT	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=23,34,30;MFRL=100,130,97;MMQ=60,60,60;MPOS=4,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.07,18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.278,0.333:15:4,2,1:2,1,4:3,3,7,2
chr10	127585120	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=26,32;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:0|1:127585090_C_A:127585090:8,5,4,0
chr10	127585125	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=99,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:10,1:4,4:0|1:127585091_G_A:127585091:10,4,3,2
chr10	127585150	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=20,20;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:9,4:4,3:8,5,6,2
chr10	127585173	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:6,5:3,4:7,3,5,5
chr10	127585179	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=156,100;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:3,8:1,7:3,1,9,10
chr10	127585195	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,1:8,2:9,11,0,3
chr10	127585307	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr10	127585360	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:127585360_C_A:127585360:0,2,0,3
chr10	127585363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:127585360_C_A:127585360:0,2,0,3
chr10	127668863	.	TGAA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.593:15:3,3:3,6:2,4,4,5
chr10	127677146	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,3:20,0:18,16,3,0
chr10	127693432	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,10,12
chr10	127731535	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	127734513	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	127753274	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr10	127753361	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:5,2,2,0
chr10	127753466	.	GTGCAGGTACACGTTGGCTGGGCAGTGAGGGCTGGCCCCTGTGCAGAACTCTGGGAGGTCACAGGAGTTGCTGGAGTCCCTGCACGCTGTTCC	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:4,2:12,13,0,2
chr10	127753478	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:3,8:2,1:2,3,5,4
chr10	127786969	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=86,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,8:0,6:1,0,9,5
chr10	127787142	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	127824044	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=65,278;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	127967660	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	128193369	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:5,3:8,5,2,1
chr10	128209769	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr10	128209797	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,13,4
chr10	128209959	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:0,3:0,1,1,5
chr10	128785910	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,0:5,4:0,7,0,4
chr10	128788633	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr10	128797717	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:2,7,2,4
chr10	128798495	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:10,5:4,4:7,7,4,6
chr10	128798502	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:7,12,1,1
chr10	128807078	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:0,4:11,1:0|1:128807078_G_A:128807078:5,6,2,3
chr10	128807096	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:0|1:128807078_G_A:128807078:2,6,1,1
chr10	128821616	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,8,18
chr10	128821636	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr10	128822873	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	128822886	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr10	128830336	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr10	128836112	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:0,0:0,1,1,1
chr10	128836153	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr10	128840842	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=422,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.930:27:0,11:1,15:1,0,15,11
chr10	128841245	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr10	128908472	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:16,1:3,1:17,2,1,1
chr10	128908681	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=232,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:1,3,0,4
chr10	128925995	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:15,2:15,2:13,18,2,2
chr10	128926013	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:7,8:11,5:10,8,4,9
chr10	128952265	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr10	128974620	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=117,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0|1:128974620_A_T:128974620:0,8,0,2
chr10	128974621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,112;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:3,3:5,0:1|0:128974620_A_T:128974620:0,8,0,3
chr10	128974713	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:128974713_C_T:128974713:0,0,0,2
chr10	128974716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:128974713_C_T:128974713:0,0,0,2
chr10	129182958	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	129183015	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=248,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,12:0,6:1,0,12,6
chr10	129207514	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chr10	129209084	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:12,5:6,8:12,6,9,4
chr10	129216658	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=98,182;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:1,4,3,4
chr10	129237305	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=82,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:129237305_C_T:129237305:12,6,1,1
chr10	129237309	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=78,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:129237305_C_T:129237305:13,7,1,1
chr10	129237572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr10	129242555	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:2,3:9,4:3,8,0,7
chr10	129249662	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,9,15
chr10	129249676	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=266,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.910:20:1,10:0,9:0|1:129249676_C_T:129249676:0,1,7,12
chr10	129249693	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=266,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:1,6:0,9:0|1:129249676_C_T:129249676:0,1,2,13
chr10	129249701	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr10	129535861	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:6,3:6,1,1,2
chr10	129681892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=150,0;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:7,3,0,2
chr10	129681917	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:5,1,4,5
chr10	129682211	.	C	A,CAGTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25,29;MFRL=150,190,287;MMQ=60,60,60;MPOS=13,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:1,1,1:1,3,0,2
chr10	129682220	.	TAGTGAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr10	129845903	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.433:21:6,5:6,4:8,4,4,5
chr10	129846010	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,14:0,23:0,0,22,17
chr10	129854369	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=93,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.336:22:5,2:9,5:10,5,6,1
chr10	129864515	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=77,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:1,5,0,8
chr10	129866651	.	GA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=244,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr10	129869233	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr10	129904560	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=81,89;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,43:0.620:69:19,30:7,12:8,18,8,35
chr10	129904977	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=68,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:16,0:19,4:14,21,0,4
chr10	129905111	.	CTG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=92,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.209:31:13,2:8,4:20,5,3,3
chr10	129905147	.	TGAGCTTGCCAACTGCTAGGAGCTCTTCTTTCACGCCCACTTTCCCCAGGGATGTCTTGAGCCGTCGCTTG	T	.	.	DP=132;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=114,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,4:0.041:121:20,0:13,3:49,68,2,2
chr10	129905595	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=99,43;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,7:0.105:74:36,7:31,0:35,32,7,0
chr10	129905946	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=80,44;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.137:56:24,7:25,0:22,27,0,7
chr10	129906948	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=80,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,2:13,1:13,15,3,0
chr10	131265665	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	131565170	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:5,3:5,4,5,5
chr10	131638436	.	G	GCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,18;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	131638448	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=119,181;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:131638448_A_C:131638448:2,0,2,0
chr10	131638450	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=119,181;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:131638448_A_C:131638448:2,0,2,0
chr10	131638611	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:22,0:18,3:19,23,2,1
chr10	131639229	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=85,52;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,2:4,0:0|1:131639229_C_T:131639229:10,10,1,1
chr10	131639244	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=89,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:15,2:7,0:0|1:131639229_C_T:131639229:11,11,1,1
chr10	131641361	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr10	131671715	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:10,3:15,5,2,1
chr10	131676117	.	TA	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,150;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,0:8,3:1,10,0,3
chr10	131958422	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr10	131969744	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:3,1:0,0:4,0,1,0
chr10	132891465	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,11:2,5:6,2,8,8
chr10	132902431	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=139,193;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:3,0,0,3
chr10	132915050	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:3,4,2,1
chr10	132915202	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:2,7,1,2
chr10	132944958	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=72,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr10	132961555	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	133058715	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:4,2:5,6:6,3,1,7
chr10	133107647	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=100,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:133107647_T_TCA:133107647:0,2,0,1
chr10	133107656	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=100,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:133107647_T_TCA:133107647:0,2,0,1
chr10	133758787	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=59,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,2:3,2:7,1,1,3
chr10	133758984	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:3,6,0,3
chr10	133769482	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,4:2,1:1,2,0,5
chr10	133782119	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr10	133786642	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.470:24:12,0:1,10:4,9,0,11
chr10	133795391	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr10	133918466	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:1,2,2,6
chr10	133946882	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:7,3:6,6,1,2
chr10	133949610	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr10	133951501	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	133951718	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:6,2,2,2
chr10	133955385	.	CTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:2,4:4,1,8,0
chr10	133955569	.	C	CCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CG;STR;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr10	133958541	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	133958720	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr10	133961564	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,8:4,0:3,5,3,5
chr10	133961636	.	C	CTGAACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TGAACA;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	133963056	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133963056_C_CTT:133963056:0,1,0,1
chr10	133963057	.	A	AGCAGCAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133963056_C_CTT:133963056:0,1,0,1
chr10	133963449	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=75,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr10	133967593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr10	133976706	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=113,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:6,3,4,1
chr10	134013816	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=23,22;MFRL=197,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:5,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:7,1,1,1
chr10	134013819	.	AGGTGGTCGGTG	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=197,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:6,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:9,1,1,1
chr10	134013834	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=200,56;MMQ=60,60;MPOS=-1073741808;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:8,1,1,1
chr10	134013836	.	CCTCTCAT	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=200,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:8,1,1,1
chr10	134013844	.	GGGCCT	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=194,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:7,2,1,1
chr10	134013850	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:134013816_TG_T:134013816:8,2,1,1
chr10	134013856	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=26,24;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:6,2,4,2
chr10	134013990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,2:4,5:4,3,1,7
chr10	134016115	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:4,1,0,2
chr10	134021740	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	134022480	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr10	134036053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134036053_G_A:134036053:1,0,1,0
chr10	134036057	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134036053_G_A:134036053:1,0,1,0
chr10	134036073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr10	134036193	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:2,7,5,1
chr10	134038647	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	134038715	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=98,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.796:11:0,2:1,7:1,1,8,1
chr10	134121028	.	CC	TA,TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20,26;MFRL=123,106,146;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.32,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.214,0.215:11:3,0,1:4,2,1:4,3,3,1
chr10	134145392	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	134146958	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,1,1
chr10	134165291	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr10	134210667	.	CCGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CGG;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	134218962	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr10	134563122	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,3:12,0:13,15,3,0
chr10	134563147	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:5,13,2,0
chr10	134563150	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,2:7,0:6,11,1,1
chr10	134563334	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=93,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:4,0:15,4:13,6,1,3
chr10	134563366	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=57,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:1,4:3,10:2,2,9,5
chr10	134623959	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:2,3,3,1
chr10	134626453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr10	134647453	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr10	134650440	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=36,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:2,3,0,2
chr10	134659751	.	G	GGACCTGGTGGGAGGTCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	134659754	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	134664903	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=271,213;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	134674306	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.093:28:18,0:7,2:0|1:134674306_G_A:134674306:12,14,1,1
chr10	134674314	.	G	GTGTATATGTGCC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=89,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:16,0:4,2:0|1:134674306_G_A:134674306:9,12,1,1
chr10	134674332	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,2:5,0:8,11,1,1
chr10	134681071	.	C	CTTCGTTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	134722791	.	G	GCCCCCATGTGT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr10	134722819	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=199,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:134722819_A_G:134722819:0,4,0,1
chr10	134722821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=199,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:134722819_A_G:134722819:0,4,0,1
chr10	134722822	.	C	CATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=199,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:134722819_A_G:134722819:0,4,0,1
chr10	134726108	.	CCT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CT;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	134726335	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr10	134726369	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	134726841	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=233,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr10	134740393	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,9,6
chr10	134740618	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	134741099	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	134748299	.	C	CATGGTTCAGGCATCTGGTCCAAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=200,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr10	134748331	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr10	134752007	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr10	134755298	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	134902314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	134912314	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=67,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,3:0,2,1,7
chr10	134941801	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr10	134981690	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	134997384	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=131,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,2:6,2:7,6,2,2
chr10	134997480	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,3:3,4:1,2,2,5
chr10	134997514	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:134997514_A_G:134997514:0,0,0,4
chr10	134997524	.	T	TCTTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:134997514_A_G:134997514:0,0,0,3
chr10	134999397	.	TGGGAGGAGAGGGGAGGGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,58;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGAGGAGAGGGGAGGGGC;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	135010662	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=233,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr10	135012162	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:3,3,2,3
chr10	135012429	.	TT	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	135012789	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr10	135020296	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,2:19,0:0|1:135020296_G_A:135020296:13,12,1,1
chr10	135020298	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:5,2:19,0:0|1:135020296_G_A:135020296:13,12,1,1
chr10	135020315	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,8,13
chr10	135020326	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:10,0:6,11,2,0
chr10	135020338	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:5,2:3,10,3,0
chr10	135024109	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:3,0:6,3:3,6,2,1
chr10	135025132	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr10	135027210	.	A	AGCCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:2,6,1,1
chr10	135038088	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,3:1,7:2,1,9,1
chr10	135038196	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.170:20:8,1:9,2:2,15,0,3
chr10	135053123	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr10	135061112	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,8,5
chr10	135076523	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:4,1,7,0
chr10	135076596	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.674:31:7,9:2,12:5,5,12,9
chr10	135076758	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:2,2,2,8
chr10	135077311	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,3:8,2:5,6,0,5
chr10	135081684	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr10	135082346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:1,1,2,6
chr10	135083812	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:1,1,4,0
chr10	135084232	.	C	CAGA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,7:3,3:5,5,7,3
chr10	135084601	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,2:5,2:2,3,1,3
chr10	135086203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr10	135086421	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:5,1:7,2:0|1:135086421_G_T:135086421:7,9,0,3
chr10	135086424	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,1:8,2:0|1:135086421_G_T:135086421:8,9,0,3
chr10	135086427	.	GG	TC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,1:8,1:0|1:135086421_G_T:135086421:9,9,0,3
chr10	135086431	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,1:10,1:0|1:135086421_G_T:135086421:9,9,0,2
chr10	135090183	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	135096784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,3:0,4:0,5,0,7
chr10	135102510	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:13,2:0|1:135102510_C_T:135102510:6,14,1,1
chr10	135102516	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:135102510_C_T:135102510:3,14,1,1
chr10	135102518	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:10,2:0|1:135102510_C_T:135102510:3,17,1,1
chr10	135102521	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:135102510_C_T:135102510:2,17,1,1
chr10	135102529	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,1:0|1:135102510_C_T:135102510:2,17,1,1
chr10	135103311	.	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.570:24:5,4:5,2:6,4,11,3
chr10	135103415	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:19,4:22,0:18,23,2,2
chr10	135105991	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=1330,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,2,2
chr10	135122507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,2:1,2:5,0,5,0
chr10	135123555	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,155;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,0:7,7:13,5,6,1
chr10	135123814	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=189,157;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:9,0:3,4:0|1:135123814_C_T:135123814:1,11,0,4
chr10	135123824	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,157;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,0:3,3:0|1:135123814_C_T:135123814:1,9,0,4
chr10	135139635	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.752:21:3,10:1,6:1,4,9,7
chr10	135140360	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.274:22:4,0:6,0:8,8,6,0
chr10	135141572	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr10	135160950	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,6:4,5:2,3,6,5
chr10	135165790	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,9,4
chr10	135171364	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	135178087	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	135179458	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr10	135182627	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=240,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	135183980	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	135194890	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	135197419	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr10	135202594	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,13,17
chr10	135204799	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,16:0,16:0,0,17,17
chr10	135209105	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	135211892	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr10	135215756	.	CGGGGCT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGGCT;STR;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.811:13:0,5:1,3:1,1,5,6
chr10	135232934	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr10	135233541	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,8:0,12:0,1,15,5
chr10	135236940	.	GCCCGCGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135236940_GCCCGCGGC_G:135236940:0,0,0,1
chr10	135236951	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135236940_GCCCGCGGC_G:135236940:0,0,0,1
chr10	135236955	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135236940_GCCCGCGGC_G:135236940:0,0,0,1
chr10	135237003	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	135237060	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	135237166	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:5,2:6,2:5,6,2,2
chr10	135237196	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,71;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,2:9,4:7,7,3,3
chr10	135340866	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr10	135346443	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=330,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135346443_G_GCA:135346443:0,1,0,1
chr10	135346444	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=330,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135346443_G_GCA:135346443:0,1,0,1
chr10	135350490	.	A	AGATGGGTGGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GATGGGTGGAT;STR;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,1:0,4:0,0,6,1
chr10	135351174	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	135352509	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0|1:135352509_T_A:135352509:0,0,5,15
chr10	135352514	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=227,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:0,9:1,8:0|1:135352509_T_A:135352509:1,0,3,14
chr10	135369054	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr10	135371357	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.294:22:10,4:6,2:6,10,4,2
chr10	135371466	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr10	135438929	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=123,122;MMQ=52,27;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,3:9,2:9,9,3,2
chr10	135438951	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=133,127;MMQ=52,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:8,4:4,4:0|1:135438951_G_A:135438951:8,4,3,5
chr10	135438955	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=129,127;MMQ=52,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.392:21:9,4:4,4:0|1:135438951_G_A:135438951:8,5,3,5
chr10	135438967	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=129,132;MMQ=52,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:6,2:5,6:0|1:135438967_C_T:135438967:6,5,4,5
chr10	135438977	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=150,132;MMQ=52,29;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:5,2:3,8:0|1:135438967_C_T:135438967:4,4,3,7
chr10	135439138	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=149,184;MMQ=27,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr10	135439159	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=181,184;MMQ=27,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr10	135439321	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=134,140;MMQ=27,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.494:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr10	135439339	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=123,142;MMQ=27,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr10	135440159	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=145,128;MMQ=25,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr10	135440203	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=23,23;MFRL=105,112;MMQ=25,26;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:23,4:15,0:22,18,3,1
chr10	135440214	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=95,114;MMQ=27,25;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.220:48:18,9:19,1:21,17,6,4
chr10	135440216	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=95,119;MMQ=27,25;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,11:0.235:49:17,10:20,1:20,18,7,4
chr10	135440222	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=105,97;MMQ=32,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.303:54:18,11:19,5:19,19,9,7
chr10	135440270	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=102,105;MMQ=32,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:5,3:9,9:0|1:135440270_G_A:135440270:4,10,4,8
chr10	135440278	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=122,108;MMQ=27,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.334:19:4,2:8,4:0|1:135440270_G_A:135440270:3,10,0,6
chr11	180116	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	193065	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,4:8,2:12,3,6,0
chr11	193096	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=66,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:5,9:4,10:7,2,14,5
chr11	193863	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,22:0.561:39:11,10:6,12:0|1:193863_T_C:193863:13,4,15,7
chr11	193865	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,22:0.561:39:10,10:6,12:0|1:193863_T_C:193863:13,4,15,7
chr11	193979	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,1:9,3:3,11,0,4
chr11	194332	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:5,2:1,4:4,2,5,2
chr11	197557	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr11	206089	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr11	207254	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,3393;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207254_CG_C:207254:0,0,1,0
chr11	207275	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,3393;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207254_CG_C:207254:0,0,1,0
chr11	207283	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,3393;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207254_CG_C:207254:0,0,1,0
chr11	209894	.	ACCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=C;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr11	212749	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:8,0:6,6:4,10,0,6
chr11	214163	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,4:1,3:0|1:214163_G_A:214163:1,0,6,2
chr11	214169	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0|1:214163_G_A:214163:1,0,6,2
chr11	214421	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:5,5:1,6,1,5
chr11	219089	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:1,6,0,5
chr11	233067	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=114,171;MMQ=60,59;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.494:52:10,11:16,12:9,17,21,5
chr11	233298	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.384:14:5,3:2,1:7,2,4,1
chr11	243987	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=121,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:6,2,4,0
chr11	244414	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:10,7:11,2:12,9,5,4
chr11	244490	.	ATACCTTTTAG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TACCTTTTAG;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:8,3:8,7,1,2
chr11	247200	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,190;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr11	280816	.	AT	TC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,9:0,0,19,8
chr11	282813	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=59,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:8,1:1,6:3,6,1,6
chr11	284538	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr11	293001	.	A	AG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,3:7,4:8,11,3,6
chr11	298736	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.261:9:3,0:4,2:0|1:298736_G_T:298736:1,6,1,1
chr11	298738	.	C	CCAGTCAACAGAGGATGCCATGA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.261:9:3,0:4,2:0|1:298736_G_T:298736:1,6,1,1
chr11	298758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:0,1,0,6
chr11	308178	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.382:27:10,4:6,6:10,7,8,2
chr11	308290	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,5:5,4:6,4,2,7
chr11	308314	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=128,172;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,4:8,3:8,5,3,4
chr11	320024	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,89;MMQ=40,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:320024_C_T:320024:4,8,1,1
chr11	320027	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,89;MMQ=40,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:320024_C_T:320024:4,8,1,1
chr11	320836	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=134,154;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:0,10,4,5
chr11	372095	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,7:6,0:9,4,4,3
chr11	372225	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=118,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:8,4:11,4:8,11,2,6
chr11	372799	.	C	CACG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,0,1
chr11	373317	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr11	373364	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr11	373382	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:373382_G_C:373382:1,0,0,1
chr11	373388	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:373382_G_C:373382:1,0,0,1
chr11	379598	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,7:0,3:1,0,6,5
chr11	380774	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=189,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr11	380798	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,6:4,0:4,1,6,0
chr11	396701	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr11	397706	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:5,4:3,6,1,5
chr11	397732	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr11	399099	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:7,0:13,3:15,5,2,2
chr11	399280	.	C	CATTTCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:399280_C_CATTTCTA:399280:0,0,0,1
chr11	399282	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:399280_C_CATTTCTA:399280:0,0,0,1
chr11	403203	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:0,8:6,3:1,5,4,7
chr11	403880	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=273,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr11	403939	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	404468	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:1,5:8,2:7,2,3,4
chr11	406615	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	409720	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr11	409815	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:2,9:4,2:3,3,7,5
chr11	418812	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=138,118;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,11:6,0:7,5,11,0
chr11	418995	.	G	GAAAGAAGGAACCCTTGCGTT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:4,2:20,0:3,22,1,1
chr11	419019	.	G	GTTGTGGTTGTGGTTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:419019_G_GTTGTGGTTGTGGTTGT:419019:2,0,0,1
chr11	419023	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:419019_G_GTTGTGGTTGTGGTTGT:419019:2,0,0,1
chr11	421128	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,6:1,6:2,0,6,6
chr11	428767	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=111,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:16,6:16,0:14,18,4,2
chr11	433554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=216,154;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.472:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr11	433995	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:2,4,0,2
chr11	441806	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	474062	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=244,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:474062_T_G:474062:0,1,0,2
chr11	474065	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=244,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:474062_T_G:474062:0,1,0,2
chr11	479031	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:15,3:22,0:30,7,3,0
chr11	488099	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr11	494812	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,7;RU=G;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:4,1:0,0:0|1:494812_T_TGGGGGG:494812:1,6,2,0
chr11	494814	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,1:3,0:0|1:494812_T_TGGGGGG:494812:1,6,2,0
chr11	499782	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,118;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:8,4,3,0
chr11	499965	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=162,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:4,9,1,2
chr11	540726	.	C	CGCAGGGTGGAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:5,4,1,1
chr11	540775	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:4,2:6,6,0,2
chr11	544851	.	G	GTGTGAGTGTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:544851_G_GTGTGAGTGTGTAT:544851:0,0,0,1
chr11	544853	.	G	GTGAGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:544851_G_GTGTGAGTGTGTAT:544851:0,0,0,1
chr11	544855	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:544851_G_GTGTGAGTGTGTAT:544851:0,0,0,1
chr11	550028	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr11	551287	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,1:5,8:3,5,2,8
chr11	552547	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,6:0,0,7,7
chr11	552756	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	552787	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr11	553866	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	554299	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	556457	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,8,4
chr11	557342	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=397,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr11	558995	.	G	GGTTAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	559016	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	559466	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,2:0,2:0,2,0,5
chr11	561691	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=168,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr11	592729	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:2,9,0,3
chr11	606656	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	608498	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.382:29:7,9:11,1:7,11,1,10
chr11	608923	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,4:1,2:2,2,4,2
chr11	617537	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,20:0,23:0,0,17,27
chr11	618172	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr11	619285	.	CACCTGTGGAGGGGGGCTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=87,0;MMQ=60,46;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr11	639374	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	640583	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	654091	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=175,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr11	674454	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,3:2,4:0|1:674454_G_T:674454:1,1,8,0
chr11	674458	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:0,3:2,6:0|1:674454_G_T:674454:1,1,9,0
chr11	674499	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,7:3,9:4,2,11,5
chr11	688091	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,6:5,2:4,3,3,5
chr11	691636	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.678:14:1,5:3,4:0,4,1,9
chr11	695932	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	698807	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.781:30:3,11:3,12:2,4,13,11
chr11	700247	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:1,4,0,6
chr11	700526	.	CA	C,CAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=151,121,113;MMQ=60,60,40;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.33,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.325,0.329:9:3,2,0:0,1,3:3,0,6,0
chr11	703175	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:1,5:6,14:2,5,4,15
chr11	710558	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.547:7:3,1:0,2:0|1:710558_G_A:710558:0,3,1,3
chr11	710567	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:710558_G_A:710558:0,3,0,3
chr11	710597	.	TGCCG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr11	710600	.	CG	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr11	720274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr11	720958	.	CCCGGCAGGGGAGGGGAGGAG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGGCAGGGGAGGGGAGGAG;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	721877	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,8:4,1,11,2
chr11	722202	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr11	723429	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr11	726178	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,9,18
chr11	726231	.	T	TGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=G;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,3:1,0,5,0
chr11	726581	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,6:1,0,9,0
chr11	726814	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,4:3,10:6,1,10,4
chr11	758927	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=110,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:8,7:3,9:5,6,8,8
chr11	763998	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr11	764481	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:18,0:5,4:5,19,2,2
chr11	773727	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,4407045;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr11	793502	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,5:2,4:2,2,7,2
chr11	800485	.	TC	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	801178	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,214;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:4,0:10,7:6,9,0,7
chr11	801631	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,18;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:1,1:5,3,3,5
chr11	801644	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=202,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:5,6:1,1:2,4,6,2
chr11	802115	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr11	802125	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr11	802902	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr11	804027	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,6,0
chr11	821887	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=114,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.336:7:3,0:1,1:0|1:821887_T_G:821887:5,0,0,2
chr11	821893	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=114,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,0:1,0:0|1:821887_T_G:821887:5,0,0,2
chr11	824496	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=302,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:0,3,1,1
chr11	824789	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	828784	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.408:23:8,3:3,6:8,6,6,3
chr11	829539	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:7,3:0,1:4,3,1,3
chr11	831122	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=205,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr11	836023	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,5:0,0,13,2
chr11	836227	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr11	838110	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,7:9,6:8,8,6,7
chr11	840319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:6,2,3,1
chr11	840363	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:5,7,2,2
chr11	842543	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:14,5:9,1:9,15,1,5
chr11	862652	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=61,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.957:25:0,12:1,12:0,1,9,15
chr11	865447	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr11	865503	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,4:0,3:0,0,2,7
chr11	866044	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=75,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr11	866498	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	866727	.	C	CCAGGTATTCCCTCCTAGAATGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	870446	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=75,97;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:4,5,5,6
chr11	870467	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,6:5,4:4,3,5,5
chr11	870475	.	G	GTATGTTTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:870475_G_GTATGTTTT:870475:8,6,1,1
chr11	870478	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,2:8,0:0|1:870475_G_GTATGTTTT:870475:8,6,1,1
chr11	884002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.460:9:1,1:2,2:3,2,4,0
chr11	884193	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:0,2,0,4
chr11	900894	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr11	900929	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:2,2,2,3
chr11	901048	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr11	902939	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:7,4,2,4
chr11	903070	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr11	970373	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr11	970405	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	970410	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:970410_C_A:970410:0,4,0,1
chr11	970412	.	G	GCCTAGTTTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:970410_C_A:970410:0,4,0,1
chr11	977036	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,5:0,0,9,1
chr11	992691	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,12:0,0,15,13
chr11	1000330	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	1003642	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr11	1009416	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=128,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.577:36:5,8:8,10:6,9,10,11
chr11	1009622	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=108,150;MMQ=56,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.736:5:0,0:1,3:2,0,2,1
chr11	1010694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr11	1016609	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=98,92;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,18:0.287:64:27,11:19,7:31,15,11,7
chr11	1016640	.	G	A	.	.	DP=122;ECNT=13;MBQ=31,23;MFRL=124,92;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,25:0.209:122:64,15:29,8:0|1:1016640_G_A:1016640:64,33,13,12
chr11	1016654	.	T	C	.	.	DP=135;ECNT=13;MBQ=26,34;MFRL=105,163;MMQ=59,25;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,7:0.058:134:76,5:44,2:81,46,6,1
chr11	1016655	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=13;MBQ=32,22;MFRL=112,94;MMQ=60,41;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,26:0.200:133:65,13:38,5:0|1:1016640_G_A:1016640:75,32,13,13
chr11	1016662	.	G	A	.	.	DP=142;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=109,151;MMQ=59,38;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,12:0.091:139:72,8:40,4:78,49,9,3
chr11	1016665	.	C	T	.	.	DP=148;ECNT=13;MBQ=28,26;MFRL=124,105;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,49:0.357:138:52,33:35,14:59,30,29,20
chr11	1016693	.	G	C	.	.	DP=157;ECNT=13;MBQ=31,23;MFRL=112,55;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:145,4:0.028:149:82,3:58,1:90,55,1,3
chr11	1016704	.	C	A	.	.	DP=166;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=113,132;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:148,14:0.087:162:86,10:52,4:88,60,8,6
chr11	1016713	.	T	C	.	.	DP=155;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=113,122;MMQ=60,45;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:138,17:0.112:155:86,11:40,4:80,58,9,8
chr11	1016715	.	T	C	.	.	DP=158;ECNT=13;MBQ=26,25;MFRL=117,102;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:138,15:0.103:153:87,8:39,6:0|1:1016715_T_C:1016715:81,57,9,6
chr11	1016719	.	T	G	.	.	DP=158;ECNT=13;MBQ=25,31;MFRL=117,102;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:140,16:0.107:156:87,10:41,6:0|1:1016715_T_C:1016715:81,59,9,7
chr11	1016722	.	T	G	.	.	DP=155;ECNT=13;MBQ=26,31;MFRL=117,107;MMQ=60,35;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,24:0.158:154:84,15:39,7:76,54,12,12
chr11	1016724	.	A	G	.	.	DP=153;ECNT=13;MBQ=25,31;MFRL=117,118;MMQ=60,33;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,29:0.195:152:83,19:38,9:71,52,18,11
chr11	1016750	.	C	G	.	.	DP=167;ECNT=25;MBQ=32,34;MFRL=124,156;MMQ=48,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:156,5:0.037:161:89,3:55,2:0|1:1016750_C_G:1016750:94,62,2,3
chr11	1016753	.	CA	TG	.	.	DP=168;ECNT=25;MBQ=32,30;MFRL=128,149;MMQ=45,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:162,6:0.041:168:93,3:56,2:0|1:1016750_C_G:1016750:98,64,3,3
chr11	1016756	.	G	A,T	.	.	DP=167;ECNT=25;MBQ=31,30,28;MFRL=128,130,149;MMQ=48,40,40;MPOS=13,24;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.50,14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:144,12,6:0.078,0.041:162:91,10,4:52,2,2:84,60,14,4
chr11	1016770	.	G	A	.	.	DP=179;ECNT=25;MBQ=31,25;MFRL=128,165;MMQ=40,36;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:164,4:0.029:168:103,3:51,1:0|1:1016770_G_A:1016770:104,60,1,3
chr11	1016773	.	G	T	.	.	DP=172;ECNT=25;MBQ=31,26;MFRL=128,165;MMQ=40,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:168,4:0.029:172:112,3:54,1:0|1:1016770_G_A:1016770:104,64,1,3
chr11	1016776	.	C	T	.	.	DP=179;ECNT=25;MBQ=30,26;MFRL=128,132;MMQ=40,42;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,73:0.434:168:57,54:37,19:61,34,42,31
chr11	1016777	.	G	A	.	.	DP=181;ECNT=25;MBQ=28,29;MFRL=128,139;MMQ=40,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:173,8:0.049:181:107,5:54,3:0|1:1016750_C_G:1016750:107,66,5,3
chr11	1016779	.	G	A	.	.	DP=182;ECNT=25;MBQ=32,24;MFRL=129,115;MMQ=40,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:170,11:0.066:181:110,5:55,5:0|1:1016779_G_A:1016779:108,62,4,7
chr11	1016785	.	G	T	.	.	DP=206;ECNT=25;MBQ=31,26;MFRL=121,139;MMQ=40,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:197,8:0.043:205:123,5:64,3:0|1:1016750_C_G:1016750:121,76,5,3
chr11	1016787	.	A	T	.	.	DP=216;ECNT=25;MBQ=27,28;MFRL=120,165;MMQ=40,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:212,4:0.023:216:126,3:67,1:0|1:1016770_G_A:1016770:128,84,1,3
chr11	1016789	.	T	A	.	.	DP=224;ECNT=25;MBQ=25,24;MFRL=120,143;MMQ=40,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:210,14:0.066:224:127,6:66,7:0|1:1016779_G_A:1016779:127,83,6,8
chr11	1016795	.	C	G	.	.	DP=234;ECNT=25;MBQ=31,33;MFRL=113,164;MMQ=43,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:218,11:0.028:229:132,8:77,3:131,87,5,6
chr11	1016800	.	GG	AG,AC	.	.	DP=262;ECNT=25;MBQ=31,24,20;MFRL=114,134,79;MMQ=42,47,43;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.00,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:239,17,4:0.068,0.019:260:133,6,2:76,9,2:140,99,10,11
chr11	1016802	.	T	A	.	.	DP=260;ECNT=25;MBQ=23,24;MFRL=112,134;MMQ=43,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:242,17:0.069:259:135,8:77,9:0|1:1016779_G_A:1016779:141,101,8,9
chr11	1016809	.	G	T	.	.	DP=264;ECNT=25;MBQ=30,20;MFRL=107,72;MMQ=49,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:260,3:0.015:263:150,1:96,2:149,111,1,2
chr11	1016810	.	G	T	.	.	DP=265;ECNT=25;MBQ=30,23;MFRL=107,153;MMQ=48,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:246,16:0.064:262:139,9:91,5:142,104,8,8
chr11	1016818	.	A	G	.	.	DP=266;ECNT=25;MBQ=24,28;MFRL=107,100;MMQ=49,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:241,17:0.069:258:141,6:84,11:0|1:1016818_A_G:1016818:137,104,8,9
chr11	1016819	.	G	T	.	.	DP=270;ECNT=25;MBQ=30,24;MFRL=107,104;MMQ=49,56;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:220,35:0.137:255:122,25:90,9:122,98,20,15
chr11	1016822	.	A	C	.	.	DP=273;ECNT=25;MBQ=24,20;MFRL=106,95;MMQ=50,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:252,19:0.073:271:141,10:91,9:0|1:1016822_A_C:1016822:143,109,10,9
chr11	1016825	.	G	A	.	.	DP=289;ECNT=25;MBQ=30,26;MFRL=102,98;MMQ=50,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:268,6:0.025:274:148,4:105,2:150,118,5,1
chr11	1016833	.	G	T	.	.	DP=301;ECNT=25;MBQ=31,23;MFRL=101,98;MMQ=57,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:275,26:0.089:301:156,15:106,11:0|1:1016822_A_C:1016822:151,124,13,13
chr11	1016834	.	G	A	.	.	DP=301;ECNT=25;MBQ=31,23;MFRL=101,97;MMQ=51,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:220,75:0.255:295:123,52:95,22:119,101,40,35
chr11	1016835	.	A	G	.	.	DP=323;ECNT=25;MBQ=25,26;MFRL=102,92;MMQ=57,45;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:283,16:0.056:299:167,5:107,10:0|1:1016818_A_G:1016818:154,129,8,8
chr11	1016836	.	A	T	.	.	DP=366;ECNT=25;MBQ=25,23;MFRL=101,98;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:276,26:0.089:302:161,15:107,11:0|1:1016822_A_C:1016822:151,125,13,13
chr11	1016842	.	T	G	.	.	DP=375;ECNT=25;MBQ=25,29;MFRL=106,107;MMQ=57,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:318,47:0.128:365:185,34:113,13:153,165,25,22
chr11	1016869	.	AG	CA,TG	.	.	DP=296;ECNT=22;MBQ=26,27,26;MFRL=121,89,106;MMQ=60,60,51;MPOS=22,24;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.31,507.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:90,18,172:0.064,0.616:280:55,10,109:34,7,51:44,46,96,94
chr11	1016887	.	G	A	.	.	DP=209;ECNT=22;MBQ=31,20;MFRL=116,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:195,12:0.058:207:104,8:83,2:0|1:1016887_G_A:1016887:108,87,6,6
chr11	1016890	.	G	A	.	.	DP=206;ECNT=22;MBQ=31,27;MFRL=105,130;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:180,22:0.112:202:94,11:70,11:101,79,10,12
chr11	1016894	.	G	A	.	.	DP=192;ECNT=22;MBQ=30,25;MFRL=118,127;MMQ=57,52;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=189.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:127,61:0.322:188:66,29:56,21:0|1:1016894_G_A:1016894:68,59,35,26
chr11	1016906	.	G	T	.	.	DP=143;ECNT=22;MBQ=31,27;MFRL=129,103;MMQ=47,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:138,5:0.041:143:64,3:57,1:0|1:1016887_G_A:1016887:68,70,2,3
chr11	1016910	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=22;MBQ=31,26;MFRL=126,140;MMQ=50,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,27:0.223:124:50,14:36,9:0|1:1016894_G_A:1016894:44,53,14,13
chr11	1016912	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=22;MBQ=32,23;MFRL=130,184;MMQ=44,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,3:0.032:121:61,2:41,0:0|1:1016887_G_A:1016887:53,65,1,2
chr11	1016914	.	G	T	.	.	DP=112;ECNT=22;MBQ=31,26;MFRL=135,129;MMQ=47,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,29:0.273:108:49,11:25,18:0|1:1016914_G_T:1016914:35,44,11,18
chr11	1016928	.	C	G	.	.	DP=100;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=132,139;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,43:0.445:97:31,20:20,19:21,33,16,27
chr11	1016933	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=22;MBQ=28,27;MFRL=135,140;MMQ=51,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,20:0.212:97:46,10:30,7:0|1:1016914_G_T:1016914:30,47,8,12
chr11	1016957	.	T	G	.	.	DP=105;ECNT=22;MBQ=26,30;MFRL=132,131;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,12:0.121:105:51,5:29,7:0|1:1016914_G_T:1016914:46,47,3,9
chr11	1016959	.	T	C	.	.	DP=108;ECNT=22;MBQ=27,25;MFRL=131,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:95,13:0.127:108:56,4:33,7:0|1:1016914_G_T:1016914:48,47,3,10
chr11	1016960	.	G	T	.	.	DP=110;ECNT=22;MBQ=32,24;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,20:0.200:102:49,11:30,9:37,45,10,10
chr11	1016963	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=22;MBQ=32,26;MFRL=121,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,13:0.121:114:57,4:35,4:0|1:1016914_G_T:1016914:53,48,3,10
chr11	1016968	.	T	G	.	.	DP=115;ECNT=22;MBQ=25,34;MFRL=121,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,11:0.103:115:59,4:39,5:0|1:1016914_G_T:1016914:57,47,2,9
chr11	1016976	.	T	G	.	.	DP=122;ECNT=22;MBQ=26,34;MFRL=107,152;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,9:0.081:122:64,4:44,5:0|1:1016914_G_T:1016914:62,51,1,8
chr11	1016978	.	T	A	.	.	DP=126;ECNT=22;MBQ=25,23;MFRL=106,152;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,9:0.078:126:59,3:43,5:0|1:1016914_G_T:1016914:61,56,1,8
chr11	1016988	.	ATGT	A	.	.	DP=136;ECNT=22;MBQ=26,24;MFRL=95,139;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:128,8:0.065:136:62,4:45,4:0|1:1016914_G_T:1016914:71,57,1,7
chr11	1016995	.	T	C	.	.	DP=126;ECNT=22;MBQ=23,26;MFRL=90,139;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,8:0.071:125:66,2:41,4:0|1:1016914_G_T:1016914:66,51,1,7
chr11	1017029	.	T	G	.	.	DP=119;ECNT=22;MBQ=27,31;MFRL=100,93;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,59:0.515:115:36,34:17,24:18,38,32,27
chr11	1017069	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=22;MBQ=26,26;MFRL=99,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,27:0.252:108:34,18:44,9:46,35,16,11
chr11	1017084	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=22;MBQ=32,26;MFRL=96,89;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,34:0.303:113:38,13:40,21:40,39,20,14
chr11	1017110	.	C	T	.	.	DP=150;ECNT=16;MBQ=28,27;MFRL=90,98;MMQ=60,57;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:120,27:0.188:147:59,13:53,13:0|1:1017110_C_T:1017110:62,58,14,13
chr11	1017112	.	GT	CC	.	.	DP=148;ECNT=16;MBQ=30,29;MFRL=90,98;MMQ=60,57;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,27:0.192:144:57,14:53,13:0|1:1017110_C_T:1017110:61,56,14,13
chr11	1017113	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=16;MBQ=25,28;MFRL=90,103;MMQ=60,53;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,30:0.263:116:44,13:32,15:0|1:1017113_T_C:1017113:46,40,14,16
chr11	1017135	.	G	A	.	.	DP=120;ECNT=16;MBQ=30,25;MFRL=94,128;MMQ=60,48;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,16:0.139:120:49,6:49,10:0|1:1017113_T_C:1017113:53,51,6,10
chr11	1017154	.	T	G	.	.	DP=115;ECNT=16;MBQ=23,29;MFRL=97,149;MMQ=60,39;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,9:0.085:115:41,5:55,2:0|1:1017113_T_C:1017113:59,47,1,8
chr11	1017158	.	G	T	.	.	DP=110;ECNT=16;MBQ=31,28;MFRL=98,160;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,9:0.089:110:42,6:55,1:0|1:1017113_T_C:1017113:56,45,0,9
chr11	1017161	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=16;MBQ=26,28;MFRL=97,160;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,9:0.085:115:39,7:55,1:0|1:1017113_T_C:1017113:61,45,0,9
chr11	1017169	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=16;MBQ=30,24;MFRL=98,160;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,9:0.088:112:40,7:55,2:0|1:1017113_T_C:1017113:53,50,0,9
chr11	1017173	.	G	A	.	.	DP=113;ECNT=16;MBQ=31,25;MFRL=109,148;MMQ=60,57;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,21:0.212:100:37,10:40,10:37,42,11,10
chr11	1017183	.	G	T	.	.	DP=102;ECNT=16;MBQ=32,24;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,23:0.244:96:36,6:35,17:35,38,13,10
chr11	1017186	.	A	G	.	.	DP=97;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=109,163;MMQ=60,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,8:0.091:97:36,5:47,1:0|1:1017113_T_C:1017113:48,41,0,8
chr11	1017200	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=16;MBQ=31,25;MFRL=109,165;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,7:0.085:81:26,7:43,0:40,34,2,5
chr11	1017220	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=16;MBQ=25,27;MFRL=98,150;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,30:0.356:85:32,16:19,10:0|1:1017220_T_C:1017220:29,26,13,17
chr11	1017231	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=16;MBQ=25,31;MFRL=107,157;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,32:0.309:105:34,17:22,13:0|1:1017220_T_C:1017220:46,27,17,15
chr11	1017239	.	CG	TA,TG	.	.	DP=104;ECNT=16;MBQ=29,26,28;MFRL=108,161,227;MMQ=45,40,40;MPOS=13,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.59,7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,20,4:0.209,0.048:98:37,13,3:34,7,1:50,24,16,8
chr11	1017240	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=16;MBQ=25,28;MFRL=109,124;MMQ=45,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,13:0.116:92:41,8:36,5:49,30,11,2
chr11	1017280	.	G	T	.	.	DP=175;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=91,132;MMQ=40,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:167,7:0.045:174:90,4:71,2:0|1:1017280_G_T:1017280:92,75,6,1
chr11	1017294	.	A	T	.	.	DP=200;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=102,132;MMQ=40,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:191,7:0.040:198:102,5:78,2:0|1:1017280_G_T:1017280:95,96,6,1
chr11	1017302	.	G	C	.	.	DP=207;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=82,136;MMQ=50,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:176,28:0.141:204:95,20:74,7:0|1:1017302_G_C:1017302:77,99,24,4
chr11	1017307	.	G	A	.	.	DP=215;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=101,91;MMQ=40,30;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:188,19:0.094:207:103,14:73,4:97,91,7,12
chr11	1017317	.	G	T	.	.	DP=210;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=91,131;MMQ=55,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:169,41:0.198:210:96,25:61,10:0|1:1017302_G_C:1017302:74,95,32,9
chr11	1017325	.	A	C	.	.	DP=206;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=102,84;MMQ=40,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,55:0.285:194:85,33:44,22:74,65,30,25
chr11	1017337	.	TC	CA	.	.	DP=234;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=93,120;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=255.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:143,75:0.345:218:80,49:49,22:0|1:1017302_G_C:1017302:72,71,39,36
chr11	1017363	.	C	G	.	.	DP=288;ECNT=34;MBQ=30,30;MFRL=99,89;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:265,17:0.061:282:146,8:115,9:140,125,12,5
chr11	1017381	.	G	C	.	.	DP=246;ECNT=34;MBQ=30,28;MFRL=102,97;MMQ=60,49;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,54:0.231:230:102,32:71,20:86,90,27,27
chr11	1017384	.	G	C	.	.	DP=231;ECNT=34;MBQ=30,30;MFRL=102,96;MMQ=60,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=282.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,92:0.410:225:85,44:47,41:70,63,40,52
chr11	1017386	.	C	T	.	.	DP=226;ECNT=34;MBQ=31,20;MFRL=102,98;MMQ=60,50;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:197,25:0.111:222:112,18:75,7:97,100,13,12
chr11	1017421	.	G	T	.	.	DP=134;ECNT=34;MBQ=30,26;MFRL=112,112;MMQ=60,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,43:0.328:132:58,25:30,16:0|1:1017421_G_T:1017421:42,47,27,16
chr11	1017440	.	C	T	.	.	DP=136;ECNT=34;MBQ=27,27;MFRL=109,155;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:100,36:0.268:136:64,18:32,12:0|1:1017440_C_T:1017440:54,46,23,13
chr11	1017443	.	C	G,A	.	.	DP=136;ECNT=34;MBQ=25,31,27;MFRL=107,155,131;MMQ=60,39,30;MPOS=12,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=124.34,18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:81,41,8:0.312,0.067:130:51,19,3:25,14,5:42,39,31,18
chr11	1017451	.	G	C	.	.	DP=122;ECNT=34;MBQ=31,33;MFRL=116,68;MMQ=51,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,4:0.040:122:74,4:39,0:62,56,3,1
chr11	1017458	.	A	G	.	.	DP=120;ECNT=34;MBQ=25,30;MFRL=107,171;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,17:0.148:120:64,9:29,7:0|1:1017421_G_T:1017421:56,47,9,8
chr11	1017461	.	G	T	.	.	DP=118;ECNT=34;MBQ=31,26;MFRL=107,168;MMQ=51,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,16:0.142:118:64,8:30,6:0|1:1017421_G_T:1017421:54,48,8,8
chr11	1017464	.	T	C,G	.	.	DP=116;ECNT=34;MBQ=24,33,33;MFRL=105,160,68;MMQ=60,45,35;MPOS=18,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=69.69,9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:89,21,4:0.189,0.042:114:56,11,4:25,10,0:45,44,15,10
chr11	1017466	.	T	A,C	.	.	DP=130;ECNT=34;MBQ=26,28,32;MFRL=112,171,68;MMQ=46,45,35;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.43,9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:111,15,4:0.120,0.038:130:61,9,3:30,5,0:65,46,11,8
chr11	1017470	.	GC	TC,TT	.	.	DP=124;ECNT=34;MBQ=29,27,28;MFRL=112,149,135;MMQ=48,43,41;MPOS=9,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.15,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:113,8,3:0.071,0.031:124:61,5,2:45,2,0:66,47,8,3
chr11	1017474	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=34;MBQ=30,28;MFRL=112,168;MMQ=48,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,8:0.071:125:68,4:42,1:0|1:1017421_G_T:1017421:70,47,7,1
chr11	1017483	.	T	G	.	.	DP=129;ECNT=34;MBQ=23,31;MFRL=106,157;MMQ=49,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,8:0.069:129:61,7:49,1:0|1:1017440_C_T:1017440:77,44,7,1
chr11	1017489	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=34;MBQ=31,29;MFRL=99,100;MMQ=49,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,5:0.046:128:66,5:51,0:0|1:1017421_G_T:1017421:81,42,5,0
chr11	1017498	.	C	T,G	.	.	DP=129;ECNT=34;MBQ=31,26,30;MFRL=80,111,113;MMQ=60,27,27;MPOS=20,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.61,134.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:67,7,47:0.061,0.391:121:42,6,12:19,1,32:40,27,38,16
chr11	1017504	.	G	A	.	.	DP=133;ECNT=34;MBQ=30,30;MFRL=105,162;MMQ=50,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,10:0.081:133:56,8:57,2:0|1:1017421_G_T:1017421:77,46,7,3
chr11	1017514	.	A	G	.	.	DP=134;ECNT=34;MBQ=24,30;MFRL=85,111;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,57:0.431:133:44,31:30,19:37,39,34,23
chr11	1017522	.	T	G	.	.	DP=129;ECNT=34;MBQ=25,24;MFRL=100,95;MMQ=57,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,6:0.053:125:66,1:51,5:63,56,2,4
chr11	1017528	.	T	A	.	.	DP=131;ECNT=34;MBQ=23,31;MFRL=99,255;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:128,3:0.030:131:66,3:54,0:0|1:1017528_T_A:1017528:67,61,2,1
chr11	1017529	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=34;MBQ=31,22;MFRL=105,85;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,14:0.114:127:63,3:41,10:56,57,10,4
chr11	1017530	.	G	A	.	.	DP=134;ECNT=34;MBQ=30,22;MFRL=99,90;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,4:0.037:134:68,3:53,1:0|1:1017530_G_A:1017530:70,60,1,3
chr11	1017536	.	G	T	.	.	DP=134;ECNT=34;MBQ=30,24;MFRL=96,90;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,4:0.037:134:68,3:55,1:0|1:1017530_G_A:1017530:68,62,1,3
chr11	1017543	.	G	A	.	.	DP=137;ECNT=34;MBQ=29,22;MFRL=99,90;MMQ=60,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:133,4:0.036:137:66,3:55,1:0|1:1017530_G_A:1017530:71,62,1,3
chr11	1017545	.	G	T	.	.	DP=135;ECNT=34;MBQ=29,27;MFRL=99,255;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:128,3:0.030:131:64,3:58,0:0|1:1017528_T_A:1017528:68,60,2,1
chr11	1017556	.	G	A	.	.	DP=129;ECNT=34;MBQ=30,24;MFRL=105,126;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:120,8:0.066:128:63,4:52,3:0|1:1017556_G_A:1017556:66,54,3,5
chr11	1017566	.	G	A	.	.	DP=133;ECNT=34;MBQ=30,20;MFRL=109,68;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,3:0.030:132:69,2:53,0:0|1:1017530_G_A:1017530:71,58,1,2
chr11	1017573	.	G	C	.	.	DP=120;ECNT=34;MBQ=29,33;MFRL=99,128;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,14:0.121:120:56,6:42,6:0|1:1017556_G_A:1017556:59,47,5,9
chr11	1017575	.	C	T	.	.	DP=117;ECNT=34;MBQ=26,28;MFRL=99,154;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,18:0.166:112:46,10:41,7:55,39,6,12
chr11	1017579	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=34;MBQ=30,28;MFRL=99,274;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,2:0.028:105:52,1:49,1:0|1:1017579_C_T:1017579:57,46,0,2
chr11	1017581	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=34;MBQ=25,30;MFRL=99,274;MMQ=60,38;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,2:0.028:107:50,1:46,1:0|1:1017579_C_T:1017579:59,46,0,2
chr11	1017591	.	CG	GC	.	.	DP=101;ECNT=34;MBQ=28,33;MFRL=98,129;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,11:0.117:100:49,5:37,5:0|1:1017556_G_A:1017556:55,34,3,8
chr11	1017597	.	T	G	.	.	DP=102;ECNT=34;MBQ=25,34;MFRL=99,128;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,10:0.108:100:51,4:35,5:0|1:1017556_G_A:1017556:51,39,3,7
chr11	1017691	.	C	G	.	.	DP=235;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,96;MMQ=60,57;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,96:0.239:223:86,58:38,36:56,71,59,37
chr11	1017784	.	GC	CT	.	.	DP=194;ECNT=41;MBQ=30,31;MFRL=108,133;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:183,3:0.021:186:96,2:79,1:0|1:1017784_GC_CT:1017784:97,86,1,2
chr11	1017789	.	A	C	.	.	DP=185;ECNT=41;MBQ=24,34;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,18:0.103:177:83,10:70,8:79,80,12,6
chr11	1017792	.	GT	CG	.	.	DP=182;ECNT=41;MBQ=30,26;MFRL=104,133;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,3:0.022:182:91,2:81,0:0|1:1017784_GC_CT:1017784:90,89,1,2
chr11	1017833	.	C	T	.	.	DP=147;ECNT=41;MBQ=28,27;MFRL=108,100;MMQ=60,43;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,14:0.102:143:70,5:56,9:0|1:1017833_C_T:1017833:66,63,2,12
chr11	1017834	.	G	A	.	.	DP=144;ECNT=41;MBQ=28,26;MFRL=104,109;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,9:0.061:144:73,4:57,5:63,72,5,4
chr11	1017844	.	TC	CG	.	.	DP=148;ECNT=41;MBQ=26,24;MFRL=111,100;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:140,8:0.060:148:69,4:56,3:0|1:1017833_C_T:1017833:71,69,1,7
chr11	1017845	.	C	G	.	.	DP=144;ECNT=41;MBQ=28,31;MFRL=111,117;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,30:0.219:130:52,12:45,13:49,51,16,14
chr11	1017858	.	A	G	.	.	DP=151;ECNT=41;MBQ=26,27;MFRL=119,127;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=136.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,44:0.308:144:53,19:44,18:53,47,24,20
chr11	1017883	.	C	T,A	.	.	DP=216;ECNT=41;MBQ=30,26,27;MFRL=115,128,131;MMQ=60,47,49;MPOS=29,24;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.29,171.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:138,10,62:0.050,0.294:210:69,6,29:64,4,28:74,64,55,17
chr11	1017891	.	GCA	G,TGA	.	.	DP=232;ECNT=41;MBQ=32,30,26;MFRL=117,221,130;MMQ=52,40,40;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.72,29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:214,5,11:0.026,0.051:230:108,4,6:92,1,5:135,79,5,11
chr11	1017893	.	A	G	.	.	DP=230;ECNT=41;MBQ=27,28;MFRL=116,128;MMQ=54,42;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:187,34:0.153:221:101,19:84,15:115,72,23,11
chr11	1017894	.	T	TGC	.	.	DP=232;ECNT=41;MBQ=25,28;MFRL=117,221;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:225,5:0.026:230:115,4:99,1:0|1:1017894_T_TGC:1017894:140,85,0,5
chr11	1017898	.	T	G	.	.	DP=239;ECNT=41;MBQ=25,31;MFRL=117,221;MMQ=51,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:227,5:0.026:232:121,4:96,1:0|1:1017894_T_TGC:1017894:141,86,0,5
chr11	1017899	.	A	T	.	.	DP=239;ECNT=41;MBQ=25,27;MFRL=117,130;MMQ=51,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:228,11:0.050:239:122,6:91,5:0|1:1017899_A_T:1017899:140,88,5,6
chr11	1017900	.	G	T	.	.	DP=237;ECNT=41;MBQ=31,26;MFRL=116,122;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:212,23:0.101:235:118,14:92,8:0|1:1017900_G_T:1017900:129,83,13,10
chr11	1017911	.	TG	CT	.	.	DP=223;ECNT=41;MBQ=27,31;MFRL=114,110;MMQ=49,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:197,21:0.092:218:123,9:73,12:115,82,16,5
chr11	1017912	.	G	A	.	.	DP=220;ECNT=41;MBQ=32,24;MFRL=111,120;MMQ=49,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:199,13:0.064:212:118,6:71,7:118,81,8,5
chr11	1017917	.	A	T	.	.	DP=199;ECNT=41;MBQ=26,27;MFRL=113,131;MMQ=49,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:189,10:0.055:199:103,5:72,5:0|1:1017899_A_T:1017899:108,81,4,6
chr11	1017921	.	C	A,T	.	.	DP=191;ECNT=41;MBQ=31,22,26;MFRL=110,89,114;MMQ=51,46,40;MPOS=26,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=47.37,47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:153,16,16:0.091,0.088:185:89,6,10:60,9,6:84,69,17,15
chr11	1017929	.	C	G	.	.	DP=178;ECNT=41;MBQ=31,31;MFRL=106,106;MMQ=50,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:171,6:0.039:177:91,3:68,2:0|1:1017929_C_G:1017929:91,80,3,3
chr11	1017932	.	CA	TG	.	.	DP=165;ECNT=41;MBQ=31,27;MFRL=105,124;MMQ=51,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:143,20:0.127:163:74,15:62,5:66,77,14,6
chr11	1017935	.	A	G,C,T	.	.	DP=162;ECNT=41;MBQ=24,31,33,26;MFRL=101,115,148,106;MMQ=52,34,42,25;MPOS=8,16,22;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=93.32,41.53,14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:110,30,14,6:0.186,0.091,0.042:160:58,11,11,4:45,18,3,2:47,63,26,24
chr11	1017939	.	G	C	.	.	DP=153;ECNT=41;MBQ=29,33;MFRL=107,148;MMQ=46,42;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:138,14:0.097:152:70,10:52,3:57,81,11,3
chr11	1017941	.	G	T	.	.	DP=140;ECNT=41;MBQ=31,22;MFRL=107,102;MMQ=46,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,24:0.176:140:65,12:44,11:0|1:1017941_G_T:1017941:45,71,13,11
chr11	1017945	.	A	G	.	.	DP=132;ECNT=41;MBQ=24,33;MFRL=104,117;MMQ=46,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:126,5:0.045:131:76,2:46,2:0|1:1017900_G_T:1017900:54,72,1,4
chr11	1017955	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=41;MBQ=25,31;MFRL=105,118;MMQ=46,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,9:0.085:115:59,3:34,5:45,61,2,7
chr11	1017956	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=41;MBQ=28,21;MFRL=111,98;MMQ=44,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,13:0.119:115:57,8:35,4:0|1:1017929_C_G:1017929:43,59,6,7
chr11	1017963	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=41;MBQ=30,23;MFRL=104,111;MMQ=42,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,20:0.206:100:48,12:28,6:0|1:1017941_G_T:1017941:28,52,12,8
chr11	1017964	.	G	T	.	.	DP=100;ECNT=41;MBQ=31,20;MFRL=111,89;MMQ=43,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,15:0.158:99:51,10:29,4:0|1:1017929_C_G:1017929:33,51,7,8
chr11	1017968	.	T	A	.	.	DP=96;ECNT=41;MBQ=26,24;MFRL=106,111;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,21:0.224:96:42,12:25,5:0|1:1017941_G_T:1017941:26,49,13,8
chr11	1017981	.	T	A	.	.	DP=79;ECNT=41;MBQ=28,25;MFRL=132,114;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,22:0.287:78:38,13:18,9:0|1:1017941_G_T:1017941:15,41,15,7
chr11	1017988	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=41;MBQ=30,25;MFRL=118,153;MMQ=40,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.130:74:38,9:24,0:27,38,5,4
chr11	1018001	.	A	C	.	.	DP=71;ECNT=41;MBQ=24,20;MFRL=121,76;MMQ=41,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,12:0.181:70:36,9:19,3:0|1:1018001_A_C:1018001:25,33,5,7
chr11	1018012	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=41;MBQ=24,30;MFRL=77,222;MMQ=47,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:39,2:18,1:30,27,0,3
chr11	1018015	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=41;MBQ=24,20;MFRL=117,76;MMQ=51,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,12:0.197:64:32,9:15,3:0|1:1018001_A_C:1018001:28,24,5,7
chr11	1018024	.	CC	GA	.	.	DP=70;ECNT=41;MBQ=29,31;MFRL=75,147;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,12:0.183:69:27,9:16,3:0|1:1018024_CC_GA:1018024:25,32,10,2
chr11	1018025	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=41;MBQ=25,24;MFRL=75,77;MMQ=60,33;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,5:0.097:59:24,2:14,1:0|1:1018001_A_C:1018001:26,28,1,4
chr11	1018031	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=41;MBQ=31,25;MFRL=64,153;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,16:0.250:66:30,12:18,4:23,27,10,6
chr11	1018042	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=41;MBQ=24,31;MFRL=64,107;MMQ=58,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,18:0.271:68:29,9:20,6:0|1:1018024_CC_GA:1018024:21,29,10,8
chr11	1018048	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=41;MBQ=24,31;MFRL=64,78;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,19:0.282:69:29,10:18,8:0|1:1018024_CC_GA:1018024:21,29,11,8
chr11	1018059	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=41;MBQ=30,23;MFRL=64,65;MMQ=60,48;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,23:0.308:76:25,15:14,6:0|1:1018024_CC_GA:1018024:24,29,12,11
chr11	1018295	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=94,98;MMQ=60,44;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,15:0.273:57:20,9:19,6:21,21,10,5
chr11	1018314	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=78,137;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.102:56:29,2:21,3:25,26,3,2
chr11	1018316	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=76,96;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,11:0.205:56:25,6:18,5:24,21,5,6
chr11	1018374	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=0,26;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.981:49:0,24:0,25:0|1:1018374_T_A:1018374:0,0,23,26
chr11	1018385	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=12;MBQ=26,26;MFRL=81,93;MMQ=60,50;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:53,7:0.110:60:25,3:25,4:1|0:1018374_T_A:1018374:25,28,4,3
chr11	1018419	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=90,89;MMQ=48,38;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,10:0.121:85:42,3:33,6:44,31,6,4
chr11	1018428	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=12;MBQ=24,23;MFRL=89,100;MMQ=44,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,2:0.033:90:49,0:35,2:0|1:1018428_C_T:1018428:49,39,2,0
chr11	1018436	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=12;MBQ=20,20;MFRL=90,100;MMQ=44,25;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,2:0.032:92:51,0:35,2:0|1:1018428_C_T:1018428:49,41,2,0
chr11	1018456	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=12;MBQ=20,23;MFRL=85,98;MMQ=48,33;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,30:0.385:78:28,16:19,11:26,22,22,8
chr11	1018459	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=28,22;MFRL=90,96;MMQ=40,40;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,14:0.177:80:37,9:26,4:0|1:1018459_G_T:1018459:38,28,11,3
chr11	1018462	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=12;MBQ=24,28;MFRL=93,92;MMQ=42,35;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,10:0.149:71:32,6:18,4:40,21,2,8
chr11	1018473	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=24,28;MFRL=85,114;MMQ=50,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,5:0.107:54:26,5:20,0:0|1:1018459_G_T:1018459:25,24,1,4
chr11	1018483	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=77,99;MMQ=52,34;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,18:0.352:52:20,10:14,7:0|1:1018483_C_G:1018483:23,11,5,13
chr11	1018496	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=12;MBQ=27,20;MFRL=76,99;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,14:0.273:53:24,8:14,5:0|1:1018483_C_G:1018483:27,12,5,9
chr11	1018523	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=27,20;MFRL=98,99;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.239:51:26,6:12,5:24,15,3,9
chr11	1019375	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,19:0,15:0,0,19,17
chr11	1021368	.	CTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,19,20;MFRL=148,159,200;MMQ=60,52,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=T;STR;TLOD=3.15,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.433,0.286:5:0,0,1:0,0,0:0,1,0,4
chr11	1023622	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=70.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,25:0.683:36:7,19:4,5:3,8,20,5
chr11	1023752	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr11	1027221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:2,6,1,2
chr11	1028272	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=133,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:9,8,2,1
chr11	1036573	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,0:4,3,2,1
chr11	1078393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,3,3
chr11	1079809	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr11	1079879	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr11	1081807	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,672;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.305:21:8,0:7,6:0|1:1081807_G_A:1081807:6,9,3,3
chr11	1081813	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=123,672;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,0:6,6:0|1:1081807_G_A:1081807:5,8,3,3
chr11	1082582	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,3:6,0:11,2,3,0
chr11	1083136	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=169,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,1:1,1:4,3,0,2
chr11	1083620	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:5,0:2,0:0|1:1083620_G_C:1083620:1,6,3,0
chr11	1083624	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,1:2,1:0|1:1083620_G_C:1083620:1,6,3,0
chr11	1083629	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,16;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:4,0:2,1:0|1:1083620_G_C:1083620:0,6,3,0
chr11	1083633	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:1083620_G_C:1083620:0,7,2,0
chr11	1083638	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=22,16;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:1083620_G_C:1083620:0,7,2,0
chr11	1086163	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=297,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr11	1087804	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr11	1088666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,7:3,0:4,1,7,0
chr11	1093512	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.750:29:4,4:2,16:5,2,9,13
chr11	1097108	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=176,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr11	1100944	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=107,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr11	1103137	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr11	1103786	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr11	1155533	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,2:10,1:12,4,3,0
chr11	1155688	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,3:7,0:10,6,3,0
chr11	1157651	.	AGGGGTTGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=201,90;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:1,2,0,1
chr11	1159133	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	1159150	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	1161268	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:5,9,0,2
chr11	1162445	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	1248491	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr11	1248726	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	1248885	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:11,0:4,4:9,7,2,2
chr11	1250016	.	C	CTTTCCGGGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	1253843	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,1:5,2:0|1:1253843_C_T:1253843:2,5,3,1
chr11	1253848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:5,2:0|1:1253843_C_T:1253843:3,6,3,1
chr11	1253858	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=203,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,3:8,2:0|1:1253843_C_T:1253843:5,7,5,2
chr11	1253859	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=203,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:4,4:7,3:0|1:1253843_C_T:1253843:5,7,6,2
chr11	1253863	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=201,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:4,6:6,3:0|1:1253843_C_T:1253843:6,7,7,4
chr11	1253866	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=203,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:5,7:5,4:0|1:1253843_C_T:1253843:6,6,7,4
chr11	1253869	.	C	CCT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=205,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,7:5,3:0|1:1253843_C_T:1253843:5,6,7,4
chr11	1253942	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,4,3
chr11	1253969	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:2,2:3,1:0|1:1253969_A_G:1253969:3,5,0,3
chr11	1253976	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,2:5,1:0|1:1253969_A_G:1253969:3,7,0,3
chr11	1253980	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:0|1:1253969_A_G:1253969:3,7,0,3
chr11	1258192	.	AT	TC	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:7,3:7,0:0|1:1258192_AT_TC:1258192:8,8,2,2
chr11	1258197	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:7,4:7,3:0|1:1258192_AT_TC:1258192:9,8,4,3
chr11	1258199	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:0|1:1258192_AT_TC:1258192:9,8,4,3
chr11	1258217	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=23,31;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:9,7:9,4:8,11,6,5
chr11	1258226	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=157,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:5,9:9,4:4,10,7,6
chr11	1258240	.	CA	TG	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,7:6,5:5,10,4,8
chr11	1258249	.	T	TGGTTATCTCATAATAAATA	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=153,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:8,2:8,15,1,1
chr11	1258283	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:3,5:2,7,3,6
chr11	1262084	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,0:11,2:0|1:1262084_C_G:1262084:11,5,1,1
chr11	1262086	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:0|1:1262084_C_G:1262084:11,5,1,1
chr11	1265475	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=134,197;MMQ=40,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:0,0:1,1:0,1,2,1
chr11	1269553	.	CCCACGGCCACCATGTCCACAGCCACACCCTCCTCCACTCCAGAGACTGCCCACACCTCCACAGTGCTTACCA	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=120,1989;MMQ=50,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:4,0:6,3:24,13,0,3
chr11	1272235	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=90,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,28:0.444:63:15,0:19,26:16,19,1,27
chr11	1272509	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,9:0.135:72:25,0:38,9:30,33,0,9
chr11	1272701	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:1272701_C_T:1272701:8,3,1,1
chr11	1272717	.	CACTCTGGGAA	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:8,0:0|1:1272701_C_T:1272701:13,6,1,1
chr11	1273575	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:9,6,5,0
chr11	1278941	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1281334	.	GCCCCTGCCTGGGAGTCCTTGTCCATCAGGGAGGCCCAA	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.311:11:6,3:2,0:0|1:1281334_GCCCCTGCCTGGGAGTCCTTGTCCATCAGGGAGGCCCAA_G:1281334:0,8,0,3
chr11	1281370	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.694:1:0,0:0,1:1|0:1281334_GCCCCTGCCTGGGAGTCCTTGTCCATCAGGGAGGCCCAA_G:1281334:0,0,0,1
chr11	1281372	.	A	AGTGAGTGGAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=338,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.492:2:0,0:0,1:1|0:1281334_GCCCCTGCCTGGGAGTCCTTGTCCATCAGGGAGGCCCAA_G:1281334:0,1,0,1
chr11	1281374	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1|0:1281334_GCCCCTGCCTGGGAGTCCTTGTCCATCAGGGAGGCCCAA_G:1281334:0,4,0,1
chr11	1281464	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1281464_G_T:1281464:0,0,0,1
chr11	1281468	.	CCGCCCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=218,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:1281464_G_T:1281464:1,0,0,1
chr11	1281476	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=218,49;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:1281464_G_T:1281464:1,0,0,1
chr11	1309956	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,12,12
chr11	1411501	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr11	1411664	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1463777	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=81,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:7,14,2,1
chr11	1464683	.	C	CAAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr11	1464903	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1464903_CG_C:1464903:0,0,0,1
chr11	1464906	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1464903_CG_C:1464903:0,0,0,1
chr11	1466720	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr11	1471154	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	1471764	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=146,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:1471764_G_C:1471764:4,0,1,0
chr11	1471771	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=100,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:1471764_G_C:1471764:4,0,1,0
chr11	1471775	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=100,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:1471764_G_C:1471764:4,0,1,0
chr11	1472050	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,2:1,6:1,1,4,4
chr11	1472475	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:3,3:0,1:3,0,3,1
chr11	1475706	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=60,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:2,3:3,5:3,2,8,0
chr11	1477768	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=126,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:3,2,3,0
chr11	1491341	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	1491403	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr11	1491445	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:1491445_C_T:1491445:3,8,1,1
chr11	1491457	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:2,4:2,4,1,3
chr11	1491458	.	C	CTCTTTTTCTTTTCTA	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:1491445_C_T:1491445:3,7,1,1
chr11	1491459	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,22;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:2,2:3,5,0,2
chr11	1501521	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr11	1501563	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr11	1502097	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,1:5,3:7,7,2,2
chr11	1579018	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:6,10:9,9:11,4,7,12
chr11	1585009	.	TGCCCCA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=273,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCCCCA;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:1585009_TGCCCCA_T:1585009:2,0,1,1
chr11	1585037	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:6,2:4,0:0|1:1585009_TGCCCCA_T:1585009:7,3,1,1
chr11	1628844	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,14,4
chr11	1629537	.	CGGAGCCACAGCCCCCACAGCT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=94,104;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGCCACAGCCCCCACAGCT;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.262:10:4,1:1,1:6,2,1,1
chr11	1629676	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,121;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:2,6:4,4,3,7
chr11	1643228	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=170,66;MMQ=39,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:1,1:0,0:0,1,1,2
chr11	1643252	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=156,37679;MMQ=51,26;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.480:10:5,4:0,0:4,2,4,0
chr11	1651228	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,81;MMQ=60,54;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	1775247	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr11	1776332	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr11	1782782	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:0,8,1,2
chr11	1785106	.	T	TGTGATGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,2:2,0:2,6,1,1
chr11	1855854	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,8:0,0,13,10
chr11	1857042	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr11	1857173	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,8:0,9:0,1,8,9
chr11	1857258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:8,5,0,2
chr11	1857930	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr11	1858572	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	1862029	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0|1:1862029_G_C:1862029:2,4,2,0
chr11	1862035	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=21,18;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:2,1:2,0:0|1:1862029_G_C:1862029:3,7,2,0
chr11	1862037	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:3,0:0|1:1862029_G_C:1862029:3,7,2,0
chr11	1874292	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.742:6:1,1:0,2:1,0,4,1
chr11	1890810	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:2,3,5,0
chr11	1890990	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,10:0,0,7,11
chr11	1891034	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:1891034_G_GA:1891034:1,3,0,2
chr11	1891035	.	G	A,GA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,23,32;MFRL=0,163,174;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.82,5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.550,0.338:6:0,2,1:0,1,1:0,0,1,5
chr11	1891037	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:3,1:1,1:0,4,1,1
chr11	1891053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=220,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:1891034_G_GA:1891034:0,3,0,1
chr11	1891561	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1891561_G_C:1891561:0,0,0,1
chr11	1891562	.	C	CAGTCAAGTTCCATTCTGGAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1891561_G_C:1891561:0,0,0,1
chr11	1901467	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	1902635	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:5,2,4,1
chr11	1904717	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=66,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,0:11,2:13,6,1,1
chr11	1904820	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=76,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr11	1904871	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:1904871_G_T:1904871:0,1,1,1
chr11	1904872	.	G	GTCTGTTTTTTATA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:1904871_G_T:1904871:0,1,1,1
chr11	1904874	.	C	CAGTA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:1904871_G_T:1904871:0,1,1,1
chr11	1904877	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1904871_G_T:1904871:0,1,0,1
chr11	1905292	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,2:0,12:0,0,6,11
chr11	1905553	.	GGTCT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,90;MMQ=54,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GTCT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,2:12,0:6,16,1,1
chr11	1907940	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,111;MMQ=58,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.368:25:11,2:5,7:11,5,4,5
chr11	1908794	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,5:8,0:6,7,4,1
chr11	1944202	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,1:3,4:2,3,2,4
chr11	1944251	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:1944251_CTT_C:1944251:2,7,1,1
chr11	1944262	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:1944251_CTT_C:1944251:3,5,1,1
chr11	1944265	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:1944251_CTT_C:1944251:3,5,1,1
chr11	1946362	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr11	1946481	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=82,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:9,0:12,9:7,14,0,9
chr11	1947575	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr11	1947793	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,0,2
chr11	1950302	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:0,3:7,2:4,4,3,2
chr11	1950906	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:1950906_T_G:1950906:3,0,2,0
chr11	1950925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:1950906_T_G:1950906:3,0,2,0
chr11	1955184	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:8,1:12,2:8,12,1,2
chr11	1956212	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=59,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr11	1956221	.	G	GCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=82,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr11	1968490	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	1968738	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr11	1976988	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	1983701	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	2156536	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=204,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	2167618	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:0|1:2167618_A_G:2167618:3,3,5,3
chr11	2167626	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=125,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:9,0:0|1:2167618_A_G:2167618:8,6,1,1
chr11	2181060	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr11	2182004	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr11	2182224	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr11	2186438	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=55,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:6,0,0,2
chr11	2187071	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr11	2187398	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	2187938	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:10,0:3,2:0|1:2187938_G_T:2187938:7,6,1,1
chr11	2187946	.	G	GGATCCTGGGAGGTGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:2187938_G_T:2187938:6,7,1,1
chr11	2188566	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	2189185	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr11	2191155	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,333;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr11	2292080	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,4:0,5:0,0,7,6
chr11	2320989	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.360:31:9,0:11,10:7,13,0,11
chr11	2321650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2321650_A_G:2321650:2,0,1,0
chr11	2321674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:2321650_A_G:2321650:2,0,1,0
chr11	2323528	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr11	2329995	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,7,3
chr11	2330077	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	2330479	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	2337012	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	2407299	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.203:42:16,8:18,0:23,11,8,0
chr11	2423900	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:9,3:12,4,2,1
chr11	2427364	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr11	2432538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr11	2432820	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	2433501	.	A	ATGTGTGTGCATGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr11	2434628	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	2434684	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,3,5
chr11	2434840	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:3,8:7,10:3,7,8,11
chr11	2435946	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr11	2435967	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:5,1,2,1
chr11	2438963	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.665:12:3,4:1,3:1,3,2,6
chr11	2441646	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,5:0,7:0,2,5,7
chr11	2441686	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,1:0,2,1,7
chr11	2444094	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr11	2542605	.	TA	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	2549329	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	2591932	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:9,4:6,0:3,12,2,2
chr11	2594211	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:12,0:10,2:0|1:2594211_G_T:2594211:6,17,1,1
chr11	2594215	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:7,2:0|1:2594211_G_T:2594211:5,16,1,1
chr11	2606518	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:13,2:10,2:11,12,2,2
chr11	2798305	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,1:6,2:10,9,1,2
chr11	2799253	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:6,8,2,0
chr11	2906220	.	GCCGCGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	2920666	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,17,11
chr11	2924514	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=183,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:2,2:6,0,2,0
chr11	2924780	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:5,0:11,2:0|1:2924780_C_A:2924780:3,13,1,1
chr11	2924786	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,1:0|1:2924780_C_A:2924780:2,10,1,1
chr11	2929552	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,22:0,20:0,0,17,25
chr11	2930395	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	2930987	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	2938242	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.547:49:18,14:4,12:11,11,16,11
chr11	2938300	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.953:16:0,8:0,7:0,0,3,13
chr11	2939392	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,1,14
chr11	2940236	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:0,7:6,11:5,1,8,10
chr11	2940492	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr11	2946522	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=222,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,2,5
chr11	2973159	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=98,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	2979798	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr11	2986044	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	2992723	.	C	CATT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:7,2:16,0:0|1:2992723_C_CATT:2992723:8,16,1,1
chr11	2992724	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,2:16,0:0|1:2992723_C_CATT:2992723:8,16,1,1
chr11	2999507	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=80,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:5,5:16,10:12,9,9,6
chr11	3000330	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=97,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:8,5:2,5:8,2,10,1
chr11	3022356	.	TCCATTCTGGG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,0:10,2:14,13,1,1
chr11	3023260	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,0:12,3:14,15,0,3
chr11	3026692	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,14:0,19:0|1:3026692_T_G:3026692:0,0,13,20
chr11	3026712	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:4,9:7,7:0|1:3026692_T_G:3026692:4,7,4,12
chr11	3028270	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	3036933	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.582:17:4,3:2,6:5,2,8,2
chr11	3050210	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,0:8,9:6,5,4,5
chr11	3050636	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,0,2
chr11	3050690	.	AAAAATC	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:3050690_AAAAATC_A:3050690:2,10,0,2
chr11	3050698	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:3050690_AAAAATC_A:3050690:2,9,0,2
chr11	3050701	.	AGCGGGC	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,21;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:3050690_AAAAATC_A:3050690:2,10,0,2
chr11	3109403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:3109403_A_G:3109403:0,0,3,1
chr11	3109408	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:3109403_A_G:3109403:0,0,3,2
chr11	3109426	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr11	3110976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	3113596	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr11	3123001	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr11	3123399	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=173,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,1:4,2:4,3,2,2
chr11	3123540	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:4,2:4,5,0,3
chr11	3123586	.	G	GCCAGCAGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr11	3128774	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	3128915	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=224,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr11	3381843	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=242,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr11	3382043	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:22,0:20,5:16,27,0,5
chr11	3382069	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,5,21
chr11	3392351	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3392351_T_C:3392351:0,1,0,1
chr11	3392357	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3392351_T_C:3392351:0,1,0,1
chr11	3392745	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:9,0,3,1
chr11	3392972	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,5:4,1:1,7,1,5
chr11	3398795	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,18,6
chr11	3398953	.	C	CTCCTAGTCTCTCTGACTCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr11	3400334	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,3:10,3:4,13,1,5
chr11	3661510	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=106,31;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:6,9,0,2
chr11	3661565	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3661565_G_A:3661565:1,0,0,1
chr11	3661585	.	A	ATGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3661565_G_A:3661565:0,0,0,1
chr11	3682720	.	C	CTTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,152;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,30;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr11	3682756	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=209,94;MMQ=40,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	3688934	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr11	3712680	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:17,2:7,0:0|1:3712680_G_A:3712680:11,13,1,1
chr11	3712688	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,1:8,0:0|1:3712680_G_A:3712680:12,13,1,1
chr11	3712806	.	G	T,C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,31,23;MFRL=153,300,175;MMQ=59,30,60;MPOS=31,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:4,0,1:0,1,0:1,3,0,2
chr11	3712808	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=175,175;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:0,3,1,2
chr11	3712810	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=175,300;MMQ=59,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:3712810_G_T:3712810:0,4,0,1
chr11	3712815	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=175,300;MMQ=58,30;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3712810_G_T:3712810:0,3,0,1
chr11	3716604	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3716604_C_T:3716604:1,0,1,0
chr11	3716608	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3716604_C_T:3716604:1,0,1,0
chr11	3726480	.	G	GTACTGAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:12,13,1,1
chr11	3733832	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,3:11,0:15,12,1,2
chr11	3744757	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=212,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:0|1:3744757_G_A:3744757:0,7,0,2
chr11	3744759	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=212,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:5,0:0|1:3744757_G_A:3744757:0,7,0,2
chr11	3829419	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,2:4,1:8,2,3,0
chr11	3838489	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=213,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr11	3844254	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=119,158;MMQ=54,47;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=30,17;RU=T;STR;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.327:27:11,3:0,3:10,9,3,5
chr11	3844289	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=144,276;MMQ=40,46;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:4,1:4,18,0,2
chr11	3844311	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,4:0,0,0,22
chr11	3877449	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=196,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr11	3988868	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.173:32:8,0:18,5:12,15,3,2
chr11	4045269	.	G	GACAGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	4104060	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr11	4104087	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,15:0,3:0,0,11,8
chr11	4104745	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr11	4116335	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr11	4123345	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr11	4133317	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr11	4139450	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31,34;MFRL=136,180,119;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.54,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.243,0.317:11:5,1,2:0,2,1:5,0,6,0
chr11	4159324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	4389404	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,9:0,3:0,2,7,6
chr11	4409511	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,1,2
chr11	4592708	.	C	CAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,3:0,5:2,2,3,5
chr11	4592920	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4592920_G_A:4592920:0,0,0,1
chr11	4592922	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4592920_G_A:4592920:0,0,0,1
chr11	4592925	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4592920_G_A:4592920:0,0,0,1
chr11	4594504	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,3,1
chr11	4594739	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:4594739_C_T:4594739:0,0,0,5
chr11	4594741	.	T	TATAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=139,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:4594739_C_T:4594739:0,3,0,1
chr11	4608207	.	TTGGC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=117,111;MMQ=49,27;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGC;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:5,2:9,5,1,1
chr11	4615234	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr11	4615390	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr11	4621485	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,6:0,0,8,6
chr11	4621925	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.353:23:7,2:8,5:8,7,4,4
chr11	4621960	.	GGCAGTTTCTGGTTGGTGTCTCCATAGTGCACACGTTTTCTGTCCTCAGACACGATGAGACGGGAGTAA	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.087:45:15,0:14,3:23,19,1,2
chr11	4622159	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	4624394	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr11	4661233	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr11	4674420	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=109,108;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:10,3:8,12,0,3
chr11	4674575	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,3:7,2:9,8,3,2
chr11	4674660	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,3:8,7,2,1
chr11	4675158	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,5:5,2:3,6,3,4
chr11	4676748	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	4791230	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr11	4791244	.	T	TCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	4825566	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,1:5,1:7,3,2,0
chr11	4870332	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.515:29:8,0:6,15:6,8,0,15
chr11	4929340	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:7,0:16,12:12,12,0,12
chr11	4944857	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=112,38;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:10,0:8,2:0|1:4944857_C_T:4944857:10,9,1,1
chr11	4944864	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=127,38;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:4944857_C_T:4944857:9,9,1,1
chr11	4944866	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=130,38;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:6,2:0|1:4944857_C_T:4944857:10,10,1,1
chr11	4944871	.	GTG	AAT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=124,38;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:4944857_C_T:4944857:11,11,1,1
chr11	4944875	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,38;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:4944857_C_T:4944857:11,12,1,1
chr11	4944877	.	G	GCTTAT	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,38;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:4944857_C_T:4944857:11,12,1,1
chr11	4945196	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr11	4945335	.	TGGAAAGGCAAAGGCCTAAGTCTGTGACAGCTAGCATGCCCAAGAAATAGTACATGGGTCCATGGAGAGTGGCATCAGTACAAATGACGTGGAGAATGGTGAGGTTCCCCAAGATAACTGTCAGGTAGATGAAGCAGAAG	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=127,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,7:0.092:57:5,6:7,0:25,25,4,3
chr11	4967468	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,91;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:2,10:4,12:4,2,13,10
chr11	4976809	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,58;MMQ=27,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:4976809_G_T:4976809:1,2,1,1
chr11	4976812	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=170,58;MMQ=27,53;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:4976809_G_T:4976809:1,2,1,1
chr11	4976816	.	C	CCAATTCTTATTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=176,58;MMQ=40,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0|1:4976809_G_T:4976809:1,1,1,1
chr11	5012075	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr11	5012826	.	G	GAAAGGATACAGAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	5013169	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr11	5013421	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.762:11:1,4:1,3:1,1,6,3
chr11	5020416	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr11	5067984	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=79,75;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,1:9,4:12,10,2,3
chr11	5068297	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:1,7,3,1
chr11	5080844	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,159;MMQ=60,52;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr11	5141876	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,3:0,3:1,0,3,3
chr11	5141902	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:5,6:0,4:4,1,7,3
chr11	5172786	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,15,10
chr11	5172819	.	AG	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:8,8,1,1
chr11	5173206	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=105,45;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:7,7:19,0:17,9,6,1
chr11	5173928	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:0,2:0,6,0,2
chr11	5221392	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:5,2:7,0:0|1:5221392_A_C:5221392:6,6,1,1
chr11	5221395	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:3,2:6,0:0|1:5221392_A_C:5221392:5,6,1,1
chr11	5221397	.	A	AGAAAAGTGCCCAGGCAGGAGT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.205:12:3,1:7,0:0|1:5221392_A_C:5221392:4,6,1,1
chr11	5221594	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=153,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:11,2,1,1
chr11	5221603	.	A	ACCAAGACC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=189,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:8,4,1,1
chr11	5247791	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr11	5269582	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,11,4
chr11	5269584	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,11,5
chr11	5269586	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,12,5
chr11	5269799	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	5274452	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=146,130;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	5289896	.	A	AAAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr11	5322899	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=51,55;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:22,3:9,0:19,12,3,0
chr11	5344552	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,3,0
chr11	5344561	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,3,0
chr11	5344847	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,11:0,0,9,8
chr11	5345128	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,9,10
chr11	5364742	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=196,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr11	5364753	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:0|1:5364753_A_ATT:5364753:0,6,1,1
chr11	5364756	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,1:0|1:5364753_A_ATT:5364753:0,6,1,1
chr11	5364776	.	T	TGTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=273,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTC;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	5372641	.	TCTTATGAACA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:5372641_TCTTATGAACA_T:5372641:1,0,1,0
chr11	5372658	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:5372641_TCTTATGAACA_T:5372641:1,0,2,0
chr11	5372690	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	5372718	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,3,1
chr11	5372751	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=99,94;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,2,3
chr11	5372856	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,8:5,1:4,3,6,3
chr11	5372977	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5372977_A_G:5372977:1,0,0,1
chr11	5372980	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5372977_A_G:5372977:1,0,0,1
chr11	5372983	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5372977_A_G:5372977:1,0,0,1
chr11	5373170	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,68;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:1,3,2,4
chr11	5373311	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,93;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,3:1,1:1,3,2,2
chr11	5373334	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,6:1,1:1,2,3,4
chr11	5410899	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	5410934	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr11	5411239	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,6:1,4:1,0,5,5
chr11	5423775	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:5423775_G_A:5423775:0,0,3,2
chr11	5423779	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=105,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.629:6:2,3:0,1:0|1:5423775_G_A:5423775:1,1,2,2
chr11	5423931	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=117,44;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:8,3:5,1:9,5,3,1
chr11	5424387	.	T	TTATC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=76,286650;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATC;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:2,1:6,1:4,4,1,1
chr11	5424838	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	5443442	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.617:24:8,9:1,6:5,4,11,4
chr11	5443700	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:5,6,5,5
chr11	5443739	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=105,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,4:6,9:1,6,2,11
chr11	5443838	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=99,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,0:13,4:7,15,4,0
chr11	5443867	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=88,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,3:8,7:5,9,7,3
chr11	5443963	.	G	A,T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,23,29;MFRL=141,107,155;MMQ=60,60,60;MPOS=23,3;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.66,16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,11,5:0.425,0.214:25:3,6,0:6,4,5:3,6,4,12
chr11	5443966	.	C	CTCTCTCTCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:7,0:11,5:7,15,0,5
chr11	5475342	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=82,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:5,3:6,9,2,1
chr11	5510239	.	GG	AA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=77,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:7,8,1,1
chr11	5510497	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr11	5510540	.	G	GGGCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=208,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCT;STR;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,4:1,7:1,1,5,7
chr11	5510626	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,4:2,0:2,1,2,2
chr11	5510928	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr11	5537469	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:4,4,2,1
chr11	5566030	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:4,2:6,7:0|1:5566030_A_G:5566030:3,7,2,8
chr11	5566051	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:5,4:7,7:0|1:5566030_A_G:5566030:4,8,3,9
chr11	5566112	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:13,2:2,3:3,12,4,1
chr11	5566365	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=59,179;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:3,2,0,4
chr11	5602275	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:3,5,4,3
chr11	5602438	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,4:2,6:1,2,6,4
chr11	5602605	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:0|1:5602605_G_A:5602605:1,2,1,3
chr11	5602615	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:5602605_G_A:5602605:1,2,1,3
chr11	5602679	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr11	5602928	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=98,88;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:11,3:11,4:0|1:5602928_G_C:5602928:9,13,3,4
chr11	5602929	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=102,86;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,21:0.709:29:4,10:3,11:1|0:5602928_G_C:5602928:3,5,9,12
chr11	5626675	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=101,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,3:11,0:0|1:5626675_A_G:5626675:13,7,3,0
chr11	5626678	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=101,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,3:11,0:0|1:5626675_A_G:5626675:13,7,3,0
chr11	5626894	.	C	CTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5626894_C_CTTT:5626894:0,0,0,1
chr11	5626895	.	A	ACCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5626894_C_CTTT:5626894:0,0,0,1
chr11	5631479	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=106,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,6:2,4:3,4,3,7
chr11	5631972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:3,3,1,1
chr11	5653417	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	5655150	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr11	5656085	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:0,9,1,1
chr11	5662319	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,3:0,8:0,0,6,6
chr11	5663575	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,2,1
chr11	5663706	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=61,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:8,4:13,2:19,2,3,3
chr11	5663818	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=258,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:5663818_A_G:5663818:0,1,0,1
chr11	5663822	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=237,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5663818_A_G:5663818:1,1,0,1
chr11	5663825	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=237,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5663818_A_G:5663818:1,1,0,1
chr11	5663829	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=237,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5663818_A_G:5663818:1,1,0,1
chr11	5663831	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=237,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5663818_A_G:5663818:1,1,0,1
chr11	5663837	.	AG	TT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=237,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5663818_A_G:5663818:1,1,0,1
chr11	5663920	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr11	5664356	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0|1:5664356_T_TA:5664356:0,0,2,0
chr11	5664357	.	T	TATATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0|1:5664356_T_TA:5664356:0,0,2,0
chr11	5664974	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	5686888	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:4,6,0,3
chr11	5688940	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:12,11:5,3:8,9,5,9
chr11	5719788	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,4:4,3:4,5,0,7
chr11	5730248	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	5757927	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:17,5:9,0:10,18,5,0
chr11	5775903	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=179,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:5775903_G_GTT:5775903:1,0,1,0
chr11	5775927	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=179,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:5775903_G_GTT:5775903:3,0,1,0
chr11	5775932	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=179,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:5775903_G_GTT:5775903:3,0,1,0
chr11	5776579	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,4:11,0:9,10,4,0
chr11	5776595	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=94,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.530:17:1,4:7,5:3,5,4,5
chr11	5799468	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,3:4,10:6,2,5,8
chr11	5799651	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:8,0:10,3:9,9,1,2
chr11	5809548	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr11	5842276	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:12,3,1,1
chr11	5842356	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:9,6:13,1:15,7,3,4
chr11	5862503	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=92,457;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:5,4:11,1:8,9,1,4
chr11	5878130	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,2:9,1:7,8,1,2
chr11	5906192	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=96,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:8,3,3,1
chr11	5906203	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:8,4,3,4
chr11	5969313	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:5,2:0|1:5969313_G_C:5969313:5,7,1,1
chr11	5969321	.	TT	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:5969313_G_C:5969313:5,7,1,1
chr11	5989521	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=105,132;MMQ=52,20;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.325:50:22,16:12,0:14,20,16,0
chr11	6007144	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,7:3,3:3,1,6,4
chr11	6007272	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,16:0,6:0,0,13,9
chr11	6007360	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=104,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,0:10,8:9,8,0,8
chr11	6129715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:4,2,1,1
chr11	6129837	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=87,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,2:4,4:4,4,4,3
chr11	6220376	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	6231461	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:6231461_T_A:6231461:11,6,1,1
chr11	6231466	.	C	CATGTGATCCTCCTGCCTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:6231461_T_A:6231461:11,5,1,1
chr11	6231731	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,5,6
chr11	6232076	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=114,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr11	6232112	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:6,4,3,0
chr11	6238960	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr11	6239739	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=239,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:2,0,1,0
chr11	6239741	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,14;MFRL=239,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:2,0,1,0
chr11	6239748	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=15,23;MFRL=239,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:2,0,1,0
chr11	6239754	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=19,12;MFRL=239,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:2,0,1,0
chr11	6239757	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=19,14;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:0,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:3,1,1,0
chr11	6239759	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:6239739_CT_C:6239739:3,1,1,0
chr11	6240358	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=192,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr11	6243843	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr11	6243982	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr11	6244451	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,3:8,0:4,10,1,2
chr11	6245295	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:6245295_G_A:6245295:8,12,0,2
chr11	6245297	.	G	GCTTATTTTTTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:0|1:6245295_G_A:6245295:8,12,0,2
chr11	6261526	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,2:14,1:10,20,2,1
chr11	6262909	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=89,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,9:6,2:7,5,4,7
chr11	6281108	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	6291120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=238,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,5:0,5:1,0,6,4
chr11	6291659	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,317;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr11	6291896	.	T	TTTTG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:16,0:0|1:6291896_T_TTTTG:6291896:17,11,1,1
chr11	6291897	.	C	CTA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:16,0:0|1:6291896_T_TTTTG:6291896:17,11,1,1
chr11	6291903	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=119,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:17,9,1,1
chr11	6341748	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr11	6341776	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6341776_TG_T:6341776:0,3,0,1
chr11	6341778	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6341776_TG_T:6341776:0,3,0,1
chr11	6341785	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6341776_TG_T:6341776:0,3,0,1
chr11	6411935	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=187,207;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr11	6415392	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=49,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,7:5,3,5,4
chr11	6417004	.	CTAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr11	6422358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr11	6422379	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:6422379_G_C:6422379:2,6,0,2
chr11	6422386	.	G	GGCTAATTTGGTCACCACCA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:6422379_G_C:6422379:2,6,0,2
chr11	6424856	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=183,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,2:1,6:1,1,4,4
chr11	6453332	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	6458508	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	6459766	.	ACTGTGCATCCCCAGATACTGCCACTCTGCATTTACACACATTTTTTATCTACTGTGCTTATACGATATCCTC	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=99,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,32:0.265:53:9,6:9,25:4,17,0,32
chr11	6459838	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.863:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr11	6462087	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,2:2,4:5,4,2,4
chr11	6462225	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr11	6470492	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,41;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,2,0
chr11	6471722	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=102,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,4:2,2:2,2,5,1
chr11	6477775	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:10,5,2,1
chr11	6499215	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr11	6500309	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr11	6503061	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=77,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:5,10,2,1
chr11	6503127	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=100,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr11	6519363	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:0,3:4,1:3,1,4,0
chr11	6520015	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:0,1:7,6:2,5,2,5
chr11	6520255	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:6520255_T_TAA:6520255:0,4,0,1
chr11	6520258	.	G	GGGGAATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:6520255_T_TAA:6520255:0,4,0,1
chr11	6520267	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=162,212;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:6520255_T_TAA:6520255:0,3,0,1
chr11	6520271	.	A	AAGGGGTCTCAGGATCCTGCAATTGCTGTGCAGACTCCACTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=200,162;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	6541202	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:12,11:11,0:10,13,9,2
chr11	6541580	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=34,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:1,1,3,5
chr11	6550309	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:3,4,0,4
chr11	6560141	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	6567384	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=167,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,2:9,1:8,8,2,1
chr11	6567895	.	C	CTGCCCTACTGCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,7:0,0,7,5
chr11	6579106	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,2,2
chr11	6579539	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	6580004	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6580004_T_C:6580004:0,1,0,1
chr11	6580006	.	C	CCTGTCTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6580004_T_C:6580004:0,1,0,1
chr11	6585502	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr11	6585659	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=102,414;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,6:5,0:6,7,0,6
chr11	6588045	.	G	GCCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr11	6588059	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=260,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:6588059_G_C:6588059:0,3,0,1
chr11	6588065	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=260,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6588059_G_C:6588059:0,3,0,1
chr11	6588346	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,1,1
chr11	6589017	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:6589017_CA_C:6589017:0,7,1,1
chr11	6589021	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:6589017_CA_C:6589017:0,7,1,1
chr11	6622073	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,3:4,0:2,9,0,3
chr11	6622206	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:6622206_A_T:6622206:16,7,1,1
chr11	6622210	.	A	ATTGCCATTTATTATAT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:6622206_A_T:6622206:15,7,1,1
chr11	6629530	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:4,5,1,3
chr11	6630028	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,9,12
chr11	6631704	.	AGGCCTTC	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:24,2:17,0:22,23,1,1
chr11	6632349	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=119,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:8,2:8,6:15,2,1,7
chr11	6632857	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr11	6635799	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,1:17,1:13,20,1,1
chr11	6635934	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,134;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,0:9,4:8,14,0,4
chr11	6636106	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=78,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:8,9:9,8:8,10,8,9
chr11	6636861	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:1,0:2,4,0,2
chr11	6637504	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:4,3,2,1
chr11	6637518	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,8,5
chr11	6637552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=100,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:4,0:7,3,2,1
chr11	6637715	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:0,0:2,1:0|1:6637715_C_T:6637715:2,3,0,2
chr11	6637722	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:3,0:0|1:6637715_C_T:6637715:2,3,0,2
chr11	6637739	.	ATTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,30;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:0,0:0,2,1,0
chr11	6637761	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=311,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,0:0,2,1,0
chr11	6638506	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=80,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,8:5,9:4,3,13,4
chr11	6638767	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=231,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:1,3:11,0:3,10,3,0
chr11	6646108	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:5,8,3,2
chr11	6647622	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	6648767	.	GAGCTGGCTGGCCTCCATCCCGGGCCTCTATCCTCAGCTGGAA	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,39;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.084:35:7,2:9,0:17,16,1,1
chr11	6648833	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,39;MMQ=60,60;MPOS=-1073741817;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:4,4:14,0:9,10,2,2
chr11	6651948	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=215,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr11	6654613	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:10,1:1,5:5,6,4,2
chr11	6655332	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=170,222;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,1,2
chr11	6703892	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr11	6789207	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:2,10:4,4:5,1,8,6
chr11	6790028	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=134,110;MMQ=60,59;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.372:17:5,4:6,2:0|1:6790028_C_G:6790028:6,5,3,3
chr11	6790049	.	AGGAGCAGC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=118,108;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:9,1:0|1:6790028_C_G:6790028:10,11,0,2
chr11	6790060	.	ACCATTGCTGG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=118,108;MMQ=60,42;MPOS=-1073741825;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:8,1:0|1:6790028_C_G:6790028:12,11,0,2
chr11	6807243	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,5:0,1:0,1,1,5
chr11	6816875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:3,5,4,4
chr11	6866834	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	6867894	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=105,222;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,2,1
chr11	6867910	.	T	TCCAAATCTTCCTGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:6867910_T_TCCAAATCTTCCTGC:6867910:0,3,0,1
chr11	6867913	.	A	ACCCCCCTTTCCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:6867910_T_TCCAAATCTTCCTGC:6867910:0,3,0,1
chr11	6867950	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	6898408	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=134,309;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.221:42:17,0:14,8:20,13,0,9
chr11	6913127	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,5,5
chr11	6913741	.	T	TTCCTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:6913741_T_TTCCTAA:6913741:0,1,0,1
chr11	6913745	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6913741_T_TTCCTAA:6913741:0,1,0,1
chr11	6942476	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,12,16
chr11	6943300	.	T	TATACTTAATACATCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.374:5:1,1:2,0:0|1:6943300_T_TATACTTAATACATCAA:6943300:0,4,0,1
chr11	6943302	.	G	GACAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:0,1:2,0:0|1:6943300_T_TATACTTAATACATCAA:6943300:0,3,0,1
chr11	6962957	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	6977175	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,6:1,1:1,2,1,6
chr11	6977805	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6977805_C_A:6977805:0,0,0,1
chr11	6977806	.	T	TTAATGTAAAAAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6977805_C_A:6977805:0,0,0,1
chr11	6977808	.	A	AAAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6977805_C_A:6977805:0,0,0,1
chr11	7063755	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,15,7
chr11	7065289	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr11	7070866	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=99,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:5,4,1,2
chr11	7071031	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr11	7079680	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:7079680_G_C:7079680:2,6,1,1
chr11	7079683	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=144,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:7079680_G_C:7079680:2,7,1,1
chr11	7079687	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=144,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:7079680_G_C:7079680:2,7,1,1
chr11	7079778	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	7091772	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=197,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	7110751	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,463;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	7111852	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:4,2:6,5,3,0
chr11	7111878	.	ATCTGCTCACCTAAAATGGAAAAACGGATCAT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.145:19:9,0:3,1:11,6,1,1
chr11	7439093	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=260,338;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	7441952	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	7487951	.	CAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=146,148;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	7509354	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,2:5,0:6,1,1,1
chr11	7570840	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:2,2:1,8,0,4
chr11	7614282	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr11	7614492	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,4:8,2:7,11,3,3
chr11	7614531	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr11	7618876	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.129:44:14,0:24,5:17,22,0,5
chr11	7649640	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr11	7650607	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	7652220	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:7,9,0,2
chr11	7663726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr11	7669775	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:3,3,3,4
chr11	7670752	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:3,9:3,9:2,4,8,10
chr11	7671998	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr11	7686584	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=95,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:5,9:4,5:0|1:7686584_A_T:7686584:6,4,8,6
chr11	7686596	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=95,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,17:0.621:27:5,12:4,5:0|1:7686584_A_T:7686584:6,4,11,6
chr11	7687669	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.367:31:8,4:10,7:16,4,5,6
chr11	7687715	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=93,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.547:38:7,9:10,11:5,12,10,11
chr11	7689633	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr11	7690627	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr11	7693837	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,0:6,4:7,5,0,4
chr11	7693853	.	G	GCACACA,GCACACACACA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=170,187,153;MMQ=60,60,60;MPOS=8,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,13,15;RU=CA;STR;TLOD=8.51,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.434,0.288:10:3,3,1:1,1,0:3,1,5,1
chr11	7694039	.	T	TCTGGCTGGG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:7,4:15,0:0|1:7694039_T_TCTGGCTGGG:7694039:15,8,0,4
chr11	7694043	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:7,4:17,0:0|1:7694039_T_TCTGGCTGGG:7694039:16,9,0,4
chr11	7694047	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.150:31:9,4:15,0:0|1:7694039_T_TCTGGCTGGG:7694039:17,10,0,4
chr11	7716855	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,10,15
chr11	7720159	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	7720426	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	7721743	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr11	7721870	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr11	7723171	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	7723683	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,15,7
chr11	7847208	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,12,12
chr11	7847523	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr11	7847607	.	TATCTATTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7847607_TATCTATTTA_T:7847607:0,1,0,1
chr11	7847618	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7847607_TATCTATTTA_T:7847607:0,1,0,1
chr11	7949192	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.390:10:2,0:4,2:6,0,4,0
chr11	7960045	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	7961128	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7961128_T_A:7961128:0,1,0,1
chr11	7961130	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7961128_T_A:7961128:0,1,0,1
chr11	7981521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:2,2,4,3
chr11	7982930	.	C	CCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7982930_C_CCAGG:7982930:0,1,0,1
chr11	7982932	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7982930_C_CCAGG:7982930:0,1,0,1
chr11	8013767	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr11	8061100	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	8061360	.	AGT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	8111540	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	8115699	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=144,268;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.397:26:7,1:7,9:9,7,8,2
chr11	8115730	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,512;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.279:30:10,0:12,8:11,11,4,4
chr11	8115762	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,11:0,0,3,11
chr11	8117228	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=92.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,6,22
chr11	8118185	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,11,2
chr11	8118200	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,14,5
chr11	8119063	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	8120367	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.138:48:14,0:28,6:10,32,0,6
chr11	8122234	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	8148287	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=166,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.777:16:2,8:1,4:2,1,6,7
chr11	8159857	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=118,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:10,6:14,8:13,12,6,8
chr11	8159961	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr11	8161552	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,13:0.264:51:18,13:20,0:23,15,13,0
chr11	8248440	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=212,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr11	8248482	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,2:3,2:4,0,5,0
chr11	8284838	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	8284860	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr11	8284981	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,1,6
chr11	8284995	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	8414080	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:11,12,1,1
chr11	8434972	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr11	8435077	.	CA	TC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,7:8,3:6,7,3,7
chr11	8476298	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=79,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:8476298_T_G:8476298:5,8,1,1
chr11	8476300	.	TAAG	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=79,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:5,2:0|1:8476298_T_G:8476298:6,9,1,1
chr11	8476307	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=79,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:8476298_T_G:8476298:5,8,1,1
chr11	8476312	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=79,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:8476298_T_G:8476298:5,8,1,1
chr11	8476322	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,34;MFRL=79,51;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,1:0|1:8476298_T_G:8476298:5,6,1,1
chr11	8483335	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.722:20:2,4:3,7:4,1,11,4
chr11	8486310	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=86,104;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,1:5,8:4,6,5,4
chr11	8486449	.	CTCACCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=189,310;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8486449_CTCACCCA_C:8486449:0,1,0,1
chr11	8486460	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=189,310;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8486449_CTCACCCA_C:8486449:0,1,0,1
chr11	8494757	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:23,2:10,1:14,19,3,0
chr11	8641501	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	8646670	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:1,1:4,2,2,0
chr11	8660117	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=259,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	8662090	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	8662516	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=77,104;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,6:9,1:10,7,2,5
chr11	8662752	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8662752_T_TC:8662752:0,1,0,1
chr11	8662753	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8662752_T_TC:8662752:0,1,0,1
chr11	8662755	.	C	CCTCCAGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8662752_T_TC:8662752:0,1,0,1
chr11	8664454	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	8669694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=619,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr11	8669724	.	A	AGCACCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=194,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr11	8670172	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	8705480	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=179,206;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	8716968	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=77,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:5,4,3,1
chr11	8717003	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,77;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:6,6:3,6:6,3,8,5
chr11	8717201	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8717201_A_T:8717201:1,2,0,1
chr11	8717203	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8717201_A_T:8717201:1,2,0,1
chr11	8720615	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr11	8724345	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=227,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr11	8735662	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	8736258	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=94,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:8,0:7,12,1,1
chr11	8739531	.	G	GCTCAAGTCATCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	8751587	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:20,2:13,0:0|1:8751587_G_A:8751587:16,18,1,1
chr11	8751590	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:20,2:14,0:0|1:8751587_G_A:8751587:16,19,1,1
chr11	8934101	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,15:0,6:0,0,6,15
chr11	8938934	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr11	8950949	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:9,3,2,0
chr11	8953797	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:3,7,1,4
chr11	9005036	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,15:0,3:0,0,12,6
chr11	9005660	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:9005660_T_C:9005660:7,5,1,1
chr11	9005664	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:9005660_T_C:9005660:7,5,1,1
chr11	9005667	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:9005660_T_C:9005660:7,5,1,1
chr11	9025348	.	GG	AA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:13,12,1,1
chr11	9047458	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr11	9049145	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:9049145_TG_CA:9049145:0,5,0,1
chr11	9049148	.	C	CTGGGA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.245:6:3,1:1,0:0|1:9049145_TG_CA:9049145:0,5,0,1
chr11	9049170	.	A	AGTGTCTTGCACAAGGCAGGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	9049202	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9049202_A_G:9049202:0,1,0,1
chr11	9049207	.	G	GACTGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9049202_A_G:9049202:0,1,0,1
chr11	9051385	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	9072140	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=80,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:4,4:4,2:2,6,5,1
chr11	9075219	.	C	CACAAGACCATAGGTAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,2:6,0:4,8,1,1
chr11	9081926	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=94,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,1:4,3:5,4,2,2
chr11	9087605	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:9087605_A_T:9087605:0,3,0,1
chr11	9087612	.	A	AGCACTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:9087605_A_T:9087605:0,3,0,1
chr11	9090984	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:2,0,5,5
chr11	9096189	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr11	9111471	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,0;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr11	9164272	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,3:7,0:7,9,2,1
chr11	9167399	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr11	9171775	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=97,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.703:15:3,6:1,3:2,2,4,7
chr11	9172248	.	ATCC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:9,0:15,6,1,1
chr11	9182405	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:9182405_C_A:9182405:5,15,0,2
chr11	9182407	.	C	CATCATCATCA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.119:22:9,2:9,0:0|1:9182405_C_A:9182405:5,15,0,2
chr11	9192359	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:6,2:0|1:9192359_A_T:9192359:1,9,0,2
chr11	9192363	.	A	ATTGGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=168,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:7,2:0|1:9192359_A_T:9192359:0,9,0,2
chr11	9199650	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:3,7:2,12:3,2,13,6
chr11	9286671	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr11	9309405	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	9310169	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:0,8,0,5
chr11	9316937	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr11	9336071	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr11	9457722	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr11	9519420	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=165,144;MMQ=49,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:0,1,0,6
chr11	9522567	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr11	9595732	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	9603236	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=57,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,9:3,4:0,4,3,10
chr11	9610232	.	A	ATTATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9610232_A_ATTATC:9610232:0,1,0,1
chr11	9610235	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9610232_A_ATTATC:9610232:0,1,0,1
chr11	9610236	.	T	TTGATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9610232_A_ATTATC:9610232:0,1,0,1
chr11	9685852	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:0|1:9685852_A_C:9685852:0,16,2,0
chr11	9685856	.	GA	CC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,1:5,0:0|1:9685852_A_C:9685852:0,16,2,0
chr11	9715628	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr11	9715646	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr11	9746137	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr11	9746201	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=107,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:8,2:3,1:10,1,2,1
chr11	9749552	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,0:0,1:0|1:9749552_CT_C:9749552:1,1,1,1
chr11	9749554	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,0:0,2:0|1:9749552_CT_C:9749552:1,1,1,1
chr11	9751089	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr11	9759713	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,15,6
chr11	9759918	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	9769514	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=87,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.256:41:13,10:17,0:14,17,1,9
chr11	9769562	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,10,14
chr11	9801925	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr11	9802952	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=232,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	9806919	.	A	AACCCTGCTCGCTGTGCTGAAGACTTCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr11	9810796	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=98,69;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,4:9,0:13,9,3,1
chr11	9812236	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,9,14
chr11	9830548	.	AGC	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:15,2:0|1:9830548_AGC_A:9830548:11,19,1,1
chr11	9830551	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,0:15,2:0|1:9830548_AGC_A:9830548:11,19,1,1
chr11	9830595	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:0,11,3,4
chr11	9833988	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	9861009	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr11	9875353	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	9917620	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr11	9989930	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=105,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:15,0:23,4:19,19,0,4
chr11	10050157	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	10327858	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=209,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr11	10508938	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.607:23:2,6:6,8:4,5,6,8
chr11	10516556	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:5,2:11,0:12,4,1,1
chr11	10518289	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr11	10518521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=289,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,1,3
chr11	10518540	.	T	TAGATGGATTGGAGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=233,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10518540_T_TAGATGGATTGGAGAG:10518540:0,4,0,1
chr11	10518542	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=233,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10518540_T_TAGATGGATTGGAGAG:10518540:0,4,0,1
chr11	10522978	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr11	10524230	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=142,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr11	10526060	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,19,13
chr11	10546723	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=83,174;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:7,6,5,1
chr11	10622611	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=62,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr11	10622702	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=90,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr11	10655438	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:8,4:5,0:14,0,4,0
chr11	10773049	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:1,2,0,5
chr11	10776448	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=213,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr11	10778489	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr11	10786023	.	A	AAGTTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTTG;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,5,2
chr11	10795803	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	10797276	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTT;STR;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr11	10800368	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,1:16,2:12,19,2,1
chr11	10819405	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:10,0:9,10,1,2
chr11	10820663	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.480:12:3,3:0,2:3,3,2,4
chr11	10821055	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr11	10821381	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	10822202	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCATAATTTAACATTTGTTGCCTAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,76;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.944:21:2,0:0,2:3,2,9,7
chr11	10823815	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr11	10824540	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,13:0,4:0,0,10,7
chr11	10824731	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr11	10827418	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr11	10828490	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr11	11292700	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,7:4,4:3,1,7,4
chr11	11314538	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:3,8:3,6:5,1,10,4
chr11	11348675	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=89,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:8,5,2,1
chr11	11354393	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr11	11362576	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=193,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:8,0:3,3:1,12,0,3
chr11	11362606	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=147,59104940;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:0,5,1,1
chr11	11398698	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	11905993	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.833:22:1,10:2,8:2,1,13,6
chr11	11944265	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=109,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,24:0.736:32:2,14:6,9:4,4,15,9
chr11	11959808	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:10,3:2,0:7,5,1,2
chr11	11964125	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:6,0:3,5:3,7,1,4
chr11	11969414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	11969473	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=111,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.227:16:8,1:5,1:9,4,1,2
chr11	11969971	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,3:1,5:3,1,7,1
chr11	11989899	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	12183670	.	CGCCGCACCACT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:4,2:10,6,1,1
chr11	12234704	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	12264140	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=207,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,3:0,0:1,1,1,2
chr11	12265674	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=79,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.313:49:15,0:17,15:5,29,1,14
chr11	12279991	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,5,0
chr11	12313614	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr11	12313887	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,4,14
chr11	12315407	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,9,5
chr11	12345459	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	12379792	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	12495607	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr11	12495623	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	12499465	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:8,5:10,0:9,9,3,2
chr11	12518066	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:11,9,0,3
chr11	12530288	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr11	12534808	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,10,9
chr11	12535468	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,3,0
chr11	12535485	.	CACAGGCTCCTGCACTA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=73,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:2,1:0,1:0,2,2,1
chr11	12951623	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	12951926	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	12951944	.	C	CAGGGGGTGAATG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12951944_C_CAGGGGGTGAATG:12951944:0,4,0,1
chr11	12951947	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12951944_C_CAGGGGGTGAATG:12951944:0,4,0,1
chr11	12951949	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12951944_C_CAGGGGGTGAATG:12951944:0,4,0,1
chr11	12951950	.	A	AAAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12951944_C_CAGGGGGTGAATG:12951944:0,4,0,1
chr11	12951954	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:12951944_C_CAGGGGGTGAATG:12951944:0,4,0,1
chr11	13378584	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:13378584_G_T:13378584:10,13,1,1
chr11	13378592	.	C	CCCTGAGACAGAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:13378584_G_T:13378584:11,11,1,1
chr11	13382001	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:4,5:7,6:3,8,2,9
chr11	13382075	.	T	TGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	13393840	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=100,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:8,12,0,2
chr11	13395817	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13395817_C_A:13395817:0,0,0,1
chr11	13395818	.	T	TTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13395817_C_A:13395817:0,0,0,1
chr11	13398129	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	13399791	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=366,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr11	13400051	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr11	13407184	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,6:1,8:1,1,9,5
chr11	13443459	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	13514202	.	ACA	TTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:2,7,1,1
chr11	13514263	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:3,1,3,3
chr11	13514417	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,1,2
chr11	13514505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=187,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	13716490	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,0:14,3:15,15,1,2
chr11	13729687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=194,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr11	13749265	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=127,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:13749265_C_T:13749265:2,6,1,1
chr11	13749267	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=127,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:13749265_C_T:13749265:2,6,1,1
chr11	13750164	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:9,3:7,5,3,0
chr11	14063190	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=95,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:8,10,2,1
chr11	14101493	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,12,11
chr11	14279179	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	14284580	.	G	GAGAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=281,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	14303282	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:9,4:4,1:1,12,1,4
chr11	14315915	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=100,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr11	14315918	.	A	AT,ATT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,24,25;MFRL=100,167,214;MMQ=60,60,60;MPOS=8,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=16.48,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,2:0.616,0.230:10:1,4,2:0,3,0:1,0,9,0
chr11	14317441	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14317441_C_T:14317441:0,3,0,1
chr11	14317451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=187,139;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:14317441_C_T:14317441:0,2,0,2
chr11	14317458	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=145,146;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1|0:14317441_C_T:14317441:0,4,0,1
chr11	14317467	.	C	CCCAACA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=145,146;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:14317441_C_T:14317441:0,4,0,1
chr11	14317469	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:14317441_C_T:14317441:0,4,0,1
chr11	14317470	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=145,146;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:14317441_C_T:14317441:0,4,0,1
chr11	14480027	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:4,1,8,0
chr11	14480292	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:1,2:0,3,0,5
chr11	14497269	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr11	14501296	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	14504774	.	CCACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=167,279;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr11	14512060	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	14516003	.	TT	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	14520549	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:1,6:1,1:0,3,0,7
chr11	14520566	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr11	14532338	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr11	14535078	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:1,0:2,2:3,1,2,4
chr11	14539315	.	TAA	T,TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,26,23;MFRL=188,227,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.41,13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,9:0.217,0.559:16:1,2,2:2,1,7:3,0,5,8
chr11	14540620	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.666:31:7,9:3,12:0,10,1,20
chr11	14540671	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr11	14852490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr11	14883009	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	14901962	.	AAAAGGCAGGATGCCAATCCATGG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:1,1:5,3,2,0
chr11	14913575	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=103,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,28:0.708:39:8,18:3,10:7,4,10,18
chr11	14992637	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=44,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:5,1,2,1
chr11	15096419	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr11	15096608	.	TC	AA	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=65,99;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:13,0:10,5:15,9,0,5
chr11	15096626	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:15,0:14,2:0|1:15096626_C_T:15096626:18,14,1,1
chr11	15096646	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:18,2:0|1:15096626_C_T:15096626:15,17,1,1
chr11	15096648	.	AA	TG	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:18,2:0|1:15096626_C_T:15096626:14,18,1,1
chr11	15096651	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=123,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:18,2:0|1:15096626_C_T:15096626:15,20,1,1
chr11	15134044	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:24,2:13,1:31,6,3,0
chr11	15134199	.	G	GTGGTGTGAGTCTGGAGGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	15170644	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr11	15170807	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=223,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:1,2,0,4
chr11	15197186	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	15198772	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr11	15243053	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,0:16,2:0|1:15243053_C_T:15243053:19,12,1,1
chr11	15243059	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.698:31:5,9:4,12:5,4,13,9
chr11	15243061	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:15,2:0|1:15243053_C_T:15243053:17,12,1,1
chr11	15257090	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.516:25:2,12:10,0:9,3,13,0
chr11	15267597	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=106,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:2,7:0,4:0,2,2,9
chr11	16068172	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:8,11,0,2
chr11	16117684	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.350:19:2,1:0,0:2,10,0,7
chr11	16205323	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	16205595	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	16760244	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,16:0,4:0,0,16,4
chr11	16838747	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:8,4:15,0:0|1:16838747_C_T:16838747:9,15,2,2
chr11	16838769	.	CCGAG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:11,0:0|1:16838747_C_T:16838747:7,15,1,1
chr11	16838774	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:11,0:0|1:16838747_C_T:16838747:7,15,1,1
chr11	16863130	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=118,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:7,1:4,3:8,4,2,2
chr11	16872653	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr11	16892730	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=69,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:7,2:0|1:16892730_C_T:16892730:12,12,1,1
chr11	16892731	.	TAAAGAG	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=69,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAGAG;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:0|1:16892730_C_T:16892730:13,12,1,1
chr11	17035493	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr11	17035801	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:4,2:0|1:17035801_G_C:17035801:0,5,3,0
chr11	17035804	.	CGG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:3,2:0|1:17035801_G_C:17035801:0,5,3,0
chr11	17035812	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0|1:17035801_G_C:17035801:0,7,2,0
chr11	17096040	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=116,101;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:11,0:18,6:5,24,0,6
chr11	17096059	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:3,2:11,4:1,13,0,6
chr11	17111272	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.243:27:9,5:11,1:14,7,2,4
chr11	17112806	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr11	17113483	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr11	17124341	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:7,0:10,2:5,13,1,1
chr11	17126670	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr11	17139255	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,2:4,2:8,1,2,2
chr11	17140293	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:5,0:10,12:3,12,0,12
chr11	17167488	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=96,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:0|1:17167488_G_T:17167488:9,7,1,1
chr11	17167512	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:17167488_G_T:17167488:7,10,1,1
chr11	17167517	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,0:12,2:0|1:17167488_G_T:17167488:7,10,1,1
chr11	17167521	.	A	ATTC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:0|1:17167488_G_T:17167488:5,11,1,1
chr11	17167523	.	CCA	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:11,2:0|1:17167488_G_T:17167488:5,10,1,1
chr11	17167527	.	T	TGC	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:9,1:0|1:17167488_G_T:17167488:3,10,1,1
chr11	17191096	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.135:42:23,0:14,5:16,21,0,5
chr11	17323441	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:3,2:1,4,0,2
chr11	17323485	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:17323485_G_T:17323485:0,3,0,1
chr11	17323488	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:17323485_G_T:17323485:0,3,0,1
chr11	17333377	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	17351873	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,6,21
chr11	17352477	.	TACA	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACA;STR;TLOD=168.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,14:0,27:0,0,23,18
chr11	17352547	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=123,182;MMQ=60,20;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:19,0:12,4:0|1:17352547_G_T:17352547:14,17,0,4
chr11	17352548	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=123,182;MMQ=60,20;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:19,0:12,4:0|1:17352547_G_T:17352547:14,17,0,4
chr11	17408404	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	17410144	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=80.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,13:0,20:0,0,19,14
chr11	17410283	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	17414757	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr11	17415190	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr11	17416883	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,1,2
chr11	17424308	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=97,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:6,3,0,2
chr11	17426094	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:14,7,1,1
chr11	17429922	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	17436936	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr11	17448704	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	17452603	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	17481948	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	17491571	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,1:2,11:2,0,12,0
chr11	17517235	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,11,12
chr11	17527483	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.275:23:8,6:9,0:8,9,4,2
chr11	17533635	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:1,6,0,6
chr11	17542872	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:9,4:12,3:11,10,5,2
chr11	17545091	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:3,6,3,1
chr11	17548015	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=205,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr11	17548401	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.622:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr11	17548626	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.296:14:7,1:3,1:0|1:17548626_G_C:17548626:0,10,4,0
chr11	17548630	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.260:13:7,0:3,1:0|1:17548626_G_C:17548626:0,10,3,0
chr11	17548634	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.260:13:7,0:3,2:0|1:17548626_G_C:17548626:0,10,3,0
chr11	17553105	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,3:0,4:3,1,2,5
chr11	17554930	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr11	17578898	.	GGGTGTTGGTGGGGATGGGGGACAGGTCAGGCTGGGA	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=76,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:5,0:7,3:6,8,0,4
chr11	17578916	.	G	GAATGGGGTTGAAGATGAGAAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=126,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.266:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr11	17578934	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,0;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr11	17579913	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=65,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr11	17581030	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=96,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	17590830	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:11,0:7,2:10,8,1,1
chr11	17591717	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:4,1,3,0
chr11	17591961	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:2,1,1,8
chr11	17596313	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=161,47;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,3:1,1:3,0,2,2
chr11	17598187	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,2:0,2:0|1:17598187_G_A:17598187:1,2,2,3
chr11	17598191	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0|1:17598187_G_A:17598187:1,2,2,3
chr11	17598495	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=79,452;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:2,4,1,1
chr11	17612972	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,7:1,5:2,1,7,5
chr11	17615203	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:2,5,3,5
chr11	17615728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=93,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,7:0,1,4,7
chr11	17623729	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=62,193;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:0|1:17623729_G_A:17623729:2,2,6,0
chr11	17623739	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=62,193;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:3,6:1,0:0|1:17623729_G_A:17623729:2,2,6,0
chr11	17632082	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,4,7
chr11	17633012	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr11	17655463	.	G	GGTTTCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	17656571	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=107,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr11	17656686	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=205,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:2,2:0,5:2,1,3,4
chr11	17662649	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	17663742	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr11	17663841	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=157,52548947;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:17663841_G_A:17663841:0,4,0,1
chr11	17663849	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=171,52548947;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:17663841_G_A:17663841:0,3,0,1
chr11	17663856	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:17663856_G_GT:17663856:0,4,0,1
chr11	17663857	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:17663856_G_GT:17663856:0,4,0,1
chr11	17663862	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=52548947,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr11	17665060	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=36,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:17665060_GA_G:17665060:2,1,1,1
chr11	17665062	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=36,36;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:17665060_GA_G:17665060:2,1,1,1
chr11	17665065	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=36,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,0:0,2:0|1:17665060_GA_G:17665060:0,1,1,1
chr11	17665071	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:17665060_GA_G:17665060:0,0,1,1
chr11	17665074	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:17665060_GA_G:17665060:0,0,1,1
chr11	17741768	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,148;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:12,3:9,13,0,3
chr11	17742555	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:0|1:17742555_G_T:17742555:6,15,1,1
chr11	17742559	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:17742555_G_T:17742555:6,14,1,1
chr11	17793959	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,1:10,2:4,14,0,3
chr11	17794093	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,152;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:17,12:15,0:22,10,12,0
chr11	17899795	.	TA	T,TAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20,28;MFRL=123,100,134;MMQ=60,60,60;MPOS=24,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.96,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,7,3:0.203,0.144:26:6,4,0:8,2,3:2,14,4,6
chr11	18026180	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=200,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr11	18042553	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:7,5,1,1
chr11	18042577	.	ACT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:18042577_ACT_A:18042577:10,6,1,1
chr11	18042583	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:0|1:18042577_ACT_A:18042577:10,6,1,1
chr11	18044295	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,138;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:18044295_G_A:18044295:5,0,2,0
chr11	18044304	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:18044295_G_A:18044295:0,0,9,0
chr11	18045438	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:11,4,2,0
chr11	18047255	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr11	18054726	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=208,159;MMQ=54,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr11	18054777	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,17,2
chr11	18054799	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:7,3:17,1:16,11,3,1
chr11	18111872	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:5,0:2,2:4,3,1,3
chr11	18158884	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,74;MMQ=52,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,1:12,2:9,15,2,1
chr11	18159169	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr11	18195348	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=116,143;MMQ=60,53;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,5:9,6:11,8,6,5
chr11	18261584	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr11	18267431	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=105,98;MMQ=27,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,18:0.543:33:6,6:6,11:0|1:18267431_C_T:18267431:11,4,10,8
chr11	18267434	.	AA	GG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=120,98;MMQ=27,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,18:0.528:34:8,6:7,11:0|1:18267431_C_T:18267431:12,4,10,8
chr11	18267463	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=127,96;MMQ=27,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.432:49:9,7:18,14:17,11,9,12
chr11	18267471	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=99,158;MMQ=49,27;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:14,1:28,3:19,24,3,1
chr11	18267478	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=127,95;MMQ=27,27;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.438:43:8,6:16,11:12,12,6,13
chr11	18290737	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	18290859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr11	18290874	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0|1:18290874_T_C:18290874:0,0,5,1
chr11	18290880	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,0:0|1:18290874_T_C:18290874:0,0,5,1
chr11	18290902	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:18290902_TT_CC:18290902:0,0,3,0
chr11	18290906	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:18290902_TT_CC:18290902:0,0,3,0
chr11	18301605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	18303404	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	18305521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr11	18308088	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:4,1:4,2:6,2,3,0
chr11	18312953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr11	18314579	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr11	18316679	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,1:7,0:0|1:18316679_C_T:18316679:11,12,1,1
chr11	18316688	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:8,0:0|1:18316679_C_T:18316679:10,13,1,1
chr11	18316692	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:9,0:0|1:18316679_C_T:18316679:9,12,1,1
chr11	18317458	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	18317699	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.949:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr11	18333059	.	T	TTA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,156;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.358:22:8,0:5,6:2,12,0,8
chr11	18333080	.	CT	TG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=171,166;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,0:11,2:0,26,0,2
chr11	18357270	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,20,11
chr11	18357281	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:17,2:15,2:19,14,2,2
chr11	18357342	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,0:19,3:16,15,1,2
chr11	18379446	.	CA	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.298:37:9,6:14,6:18,7,8,4
chr11	18379629	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr11	18382354	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	18424437	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=120,211;MMQ=41,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,1:10,2:6,15,3,0
chr11	18424451	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=245,130;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:0,1,2,10
chr11	18424590	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,2,13
chr11	18428637	.	A	ATTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=T;STR;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,6:0,0,10,3
chr11	18456235	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=2168,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr11	18487425	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	18524163	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:2,2:5,1:0,8,0,3
chr11	18524208	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	18524220	.	T	TCTTACACAGTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr11	18600438	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=194,165;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:18600438_G_A:18600438:0,2,0,1
chr11	18600441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=194,165;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:18600438_G_A:18600438:0,2,0,1
chr11	18600453	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=194,165;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:18600438_G_A:18600438:0,2,0,1
chr11	18632984	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=93,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,3:7,1:10,4,4,0
chr11	18730895	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	18732035	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=210,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr11	18732119	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	18732426	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	18732446	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=4724159,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr11	18733579	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	18735321	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	18735396	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	18735534	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:2,3:13,0:7,8,0,3
chr11	18735753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.901:10:1,5:1,3:2,0,4,4
chr11	18736942	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	18738603	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr11	18739668	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr11	18741714	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=128,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:9,0:15,4:0|1:18741714_G_A:18741714:12,12,0,4
chr11	18741717	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=128,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:9,0:15,4:0|1:18741714_G_A:18741714:12,12,0,4
chr11	18751041	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:18751041_C_T:18751041:0,0,1,1
chr11	18751053	.	C	CCTTGCGTCTCCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:18751041_C_T:18751041:0,0,0,1
chr11	18764113	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	18793360	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	18793399	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=235,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,4,4
chr11	18793594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	19169319	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=217,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	19191922	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,91;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,1:0,1:0|1:19191922_C_CT:19191922:2,1,2,0
chr11	19191945	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=35,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.228:13:3,0:4,2:0|1:19191922_C_CT:19191922:2,8,2,1
chr11	19197349	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=119,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.433:9:2,1:2,3:5,0,3,1
chr11	19204403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	19206426	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	19246239	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:9,1:7,1:10,7,1,1
chr11	19247429	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr11	19256250	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr11	19256469	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:10,0:9,3:10,9,1,2
chr11	19261797	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,1,5
chr11	19372616	.	G	GGA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,4,13
chr11	19735396	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:7,3,3,2
chr11	19853992	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,0:6,4:8,0,2,2
chr11	19864356	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=96,96;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:22,0:5,8:22,5,8,0
chr11	19901474	.	AAGC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:5,0:8,2:8,6,1,1
chr11	19954780	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:10,0:14,4:10,14,2,2
chr11	19955785	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.262:32:9,0:15,8:5,19,0,8
chr11	19967872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr11	20005892	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	20065673	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:5,8:1,9:4,2,8,10
chr11	20072779	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,26:0,6:0,0,28,8
chr11	20072868	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=92,93;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,2:13,0:14,17,1,1
chr11	20099005	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	20099449	.	CG	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	20101744	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr11	20101769	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,2:3,6:4,5,1,7
chr11	20104794	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=108,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20104794_G_A:20104794:0,1,0,1
chr11	20104796	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=108,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20104794_G_A:20104794:0,1,0,1
chr11	20117364	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:2,13,2,0
chr11	20119233	.	G	GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:8,0:18,4:15,11,0,4
chr11	20119373	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr11	20122392	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr11	20122488	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,0:12,3:13,11,1,2
chr11	20127046	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr11	20178551	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.596:6:2,2:0,1:2,0,3,1
chr11	20180877	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,21663386;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:6,1:4,1:1,9,1,1
chr11	20181532	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,2:14,2:17,15,2,2
chr11	20385983	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=120,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,0:6,4:0,13,0,4
chr11	20398034	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr11	20403825	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,2,12
chr11	20404502	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.270:13:5,1:2,1:0|1:20404502_CT_C:20404502:6,4,3,0
chr11	20404506	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.727:13:1,3:2,4:3,0,6,4
chr11	20404507	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.270:13:6,1:4,2:0|1:20404502_CT_C:20404502:6,4,3,0
chr11	20404757	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr11	20409169	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	20409196	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=169,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:20409196_C_G:20409196:2,0,1,0
chr11	20409218	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=144,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20409196_C_G:20409196:1,0,1,0
chr11	20411199	.	TAAAAA	T,TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,22,21;MFRL=0,163,199;MMQ=60,60,60;MPOS=6,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,11;RU=A;STR;TLOD=11.95,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.531,0.368:6:0,2,0:0,2,1:0,0,6,0
chr11	20411218	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.409:6:2,0:2,0:4,0,2,0
chr11	20411418	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,2,4
chr11	20411424	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,1,4
chr11	20411436	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=135,180;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:20411436_A_G:20411436:0,3,0,1
chr11	20411451	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=135,180;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:20411436_A_G:20411436:0,3,0,1
chr11	20411457	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=124,180;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20411436_A_G:20411436:0,2,0,1
chr11	20411463	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=124,180;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:20411436_A_G:20411436:0,2,0,1
chr11	20429454	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=100.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,22:0,11:0,0,26,8
chr11	20473655	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,12,8
chr11	20515555	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,13,17
chr11	20621320	.	G	GAATAGGAAAGTGATTTTTTAGTAGTAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.669:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	20623042	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	20628479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=117,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr11	20629164	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=164,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,2:1,8:3,0,3,7
chr11	20639457	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr11	20648418	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	20658679	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=67,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:6,4:0,2:4,2,4,2
chr11	20668492	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=79,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:20668492_G_T:20668492:5,12,1,1
chr11	20668498	.	T	TTAAAACATTGATCCATCCAGCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=77,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:20668492_G_T:20668492:5,10,1,1
chr11	20699394	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr11	20699690	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:20699690_C_G:20699690:0,2,0,1
chr11	20699692	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:20699690_C_G:20699690:0,2,0,1
chr11	20869062	.	GA	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=213,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20869062_GA_CC:20869062:3,1,0,1
chr11	20869066	.	G	GTCTTTGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20869062_GA_CC:20869062:3,1,0,1
chr11	20959429	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr11	20959479	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=186,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr11	20959482	.	G	C,T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32,24;MFRL=0,186,105;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,1,1
chr11	20968970	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=102,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:12,4:11,1:8,16,2,3
chr11	20968991	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=68,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.240:26:13,0:7,5:7,13,0,6
chr11	21135108	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:11,4,3,0
chr11	21581665	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr11	21592228	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	22225333	.	T	TAC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:0|1:22225333_T_TAC:22225333:5,12,2,2
chr11	22225335	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,2:9,2:0|1:22225333_T_TAC:22225333:5,13,2,2
chr11	22225338	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,2:8,2:0|1:22225333_T_TAC:22225333:5,12,2,2
chr11	22283766	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:7,1,1,1
chr11	22284606	.	A	AGACAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0|1:22284606_A_AGACAT:22284606:4,6,1,1
chr11	22284611	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:22284606_A_AGACAT:22284606:4,6,1,1
chr11	22291978	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:5,8,1,2
chr11	22296094	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,7;RU=T;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr11	22297606	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=75,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.818:13:2,5:0,5:2,0,10,1
chr11	22364758	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	22382587	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=116,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr11	22382597	.	AAATT	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:1,5,0,2
chr11	22382608	.	A	AAAAAGTTAACTTGACAATTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=199,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:22382608_A_AAAAAGTTAACTTGACAATTT:22382608:0,2,0,1
chr11	22382611	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,21;MFRL=199,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:22382608_A_AAAAAGTTAACTTGACAATTT:22382608:0,2,0,1
chr11	22382613	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=199,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:22382608_A_AAAAAGTTAACTTGACAATTT:22382608:0,2,0,1
chr11	22391534	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr11	22747745	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	22851409	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	24784922	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,2:3,5:0,3,0,7
chr11	24936173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	24998252	.	CAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,19;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr11	25004827	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:25004827_G_T:25004827:1,12,0,2
chr11	25004828	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:25004827_G_T:25004827:1,12,0,2
chr11	26353991	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=216,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr11	26547348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:26547348_G_A:26547348:0,0,0,3
chr11	26547353	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:26547348_G_A:26547348:0,0,0,3
chr11	26552702	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.622:2:1,1:0,0:0|1:26552702_T_C:26552702:0,1,0,1
chr11	26552706	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.622:2:1,0:0,0:0|1:26552702_T_C:26552702:0,1,0,1
chr11	26563464	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=75,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:5,2,2,0
chr11	26563652	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,3:2,2:0,6,0,6
chr11	26568966	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,1:3,2:9,4,1,2
chr11	26574740	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	26574782	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	26584625	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,2:8,4:5,6,5,1
chr11	26586801	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,5:8,3:6,5,2,6
chr11	26586915	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=105,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:11,2:15,13,0,2
chr11	26586933	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=105,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:9,2:0|1:26586933_A_C:26586933:16,8,0,2
chr11	26586936	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=105,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:9,2:0|1:26586933_A_C:26586933:17,8,0,2
chr11	26587133	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=115,98;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:10,6:8,9:10,8,6,9
chr11	26587150	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=110,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,1:17,1:15,18,2,0
chr11	26621117	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=100,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,5:10,3:12,9,3,5
chr11	26645894	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	26656643	.	C	CCTGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:26656643_C_CCTGT:26656643:4,4,1,1
chr11	26656644	.	A	ATTCCCAGCTACTCG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:6,0:2,2:0|1:26656643_C_CCTGT:26656643:4,4,1,1
chr11	26677867	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:2,2,7,3
chr11	26692594	.	TTG	T,TTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,27,22;MFRL=0,77,74;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,14;RU=TG;STR;TLOD=44.47,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,10:0.593,0.375:26:0,12,2:0,4,3:0,0,16,10
chr11	26692631	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=82,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.432:57:20,11:12,9:12,20,10,15
chr11	26705310	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr11	26705404	.	G	GGAGGGGCTCCCAACTCATTTATTTGGCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=80,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr11	26708173	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26708173_G_GCC:26708173:0,0,0,1
chr11	26708174	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26708173_G_GCC:26708173:0,0,0,1
chr11	26708177	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26708173_G_GCC:26708173:0,0,0,1
chr11	27016619	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr11	27379127	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,2,14
chr11	27389894	.	CAATGGAAAAAATATCAGAGTAACAGACTTCATTATTTCGGGGCTGATAGAGATTGCAGTGATCAATGGTGCA	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.079:37:6,0:5,2:13,22,2,0
chr11	27390317	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,174;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:7,4,0,2
chr11	27393813	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.895:25:2,15:0,7:1,1,17,6
chr11	27401743	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr11	27401927	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	27401940	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	27412535	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr11	27412782	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.794:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr11	27414071	.	GAAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:1,2:5,0:5,5,1,3
chr11	27523164	.	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGTTAAAATTTCAGGC;STR;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:0,3:0,2:1,0,0,8
chr11	27523186	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr11	27679662	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr11	27679916	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr11	27681176	.	C	CTG,CTGTG,CTGTGTG	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,20,31,31;MFRL=138,98,182,142;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,29,21;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=TG;STR;TLOD=3.42,5.16,38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,3,15:0.139,0.163,0.670:22:1,1,1,10:0,2,2,5:0,1,4,17
chr11	27681221	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:0,13,0,3
chr11	28045260	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:4,2:5,4:7,3,5,1
chr11	28098482	.	GAAAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	28098501	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:28098501_AAG_A:28098501:3,0,1,0
chr11	28098508	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:28098501_AAG_A:28098501:3,0,1,0
chr11	28098511	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:28098501_AAG_A:28098501:3,0,1,0
chr11	28104605	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=222,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,1,2
chr11	28112110	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:7,0,3,0
chr11	28113094	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:0,1:0,5,0,2
chr11	30032255	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:10,2,1,1
chr11	30034871	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:10,7,0,2
chr11	30253666	.	C	CCAACGAAATCCTCAAAGAGGCCCAAATATCCACTTGCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=183,109;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	30352473	.	C	CAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,14:0,0,22,2
chr11	30517135	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:30517135_CTG_C:30517135:0,3,0,1
chr11	30517144	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30517135_CTG_C:30517135:0,3,0,1
chr11	30601733	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=94,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.577:16:4,4:3,5:5,2,7,2
chr11	30900263	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=111,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.612:6:1,1:1,2:0,2,0,4
chr11	30902893	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:3,5:2,2:2,4,1,6
chr11	30922081	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,1,3
chr11	30926811	.	T	TGTTTGTTTGTTTTTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=270,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	30928245	.	T	TAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:0|1:30928245_T_TAC:30928245:1,5,1,1
chr11	30928246	.	T	TTCTGAGGCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:30928245_T_TAC:30928245:1,5,1,1
chr11	30930393	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr11	30933064	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=209,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr11	31287088	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.344:47:20,0:11,15:14,17,0,16
chr11	31287103	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=104,71;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,4:12,0:12,15,3,1
chr11	31561346	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,0:0,2:0|1:31561346_A_G:31561346:1,4,0,2
chr11	31561349	.	T	TCTTTTATACAGTTGTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:31561346_A_G:31561346:1,4,0,2
chr11	31648801	.	TGGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	31653956	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr11	31811460	.	CTTT	C,CTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,19,20;MFRL=70,139,58;MMQ=58,60,60;MPOS=7,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,20,25;RU=T;STR;TLOD=4.19,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.276,0.464:10:0,1,1:1,0,0:1,1,1,7
chr11	31812215	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	32113057	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr11	32118744	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=132,140;MMQ=50,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:10,15,0,2
chr11	32118925	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr11	32122003	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr11	32122020	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr11	32122259	.	A	AGCCTTGACCTCCCAGACTCAAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	32122268	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	32125855	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	32410774	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr11	32417945	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:3,4:1,3,5,4
chr11	32437914	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	32438188	.	GA	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32438188_GA_TT:32438188:0,0,0,1
chr11	32438191	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32438188_GA_TT:32438188:0,0,0,1
chr11	32449661	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:1,3,1,5
chr11	32451950	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	32451994	.	G	GGTTGTCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,19;MFRL=98,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,0:1,0:0|1:32451994_G_GGTTGTCAC:32451994:1,1,1,0
chr11	32451997	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=98,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:0,1:0|1:32451994_G_GGTTGTCAC:32451994:1,1,1,0
chr11	32452001	.	GGAGA	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=67,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=GA;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.351:8:0,1:2,1:1,4,2,1
chr11	32461059	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=235,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr11	32462206	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:2,3,3,4
chr11	32462576	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,4:0,3:1,1,4,3
chr11	32608473	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr11	32610726	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.445:9:2,1:2,3:0,5,0,4
chr11	32615352	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr11	32622213	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,9:0,3:1,0,9,3
chr11	32623419	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:2,7,2,6
chr11	32657266	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,8:0,7:0,1,7,8
chr11	32674627	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=95,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,2:2,3:4,1,5,0
chr11	32674852	.	C	CATATTTCCACATGGAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:32674852_C_CATATTTCCACATGGAAT:32674852:0,1,0,1
chr11	32674855	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32674852_C_CATATTTCCACATGGAAT:32674852:0,1,0,1
chr11	32697291	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr11	32705177	.	C	CGGTGATCTATGGGTAAATTTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=121,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	32956244	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr11	33050100	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr11	33054562	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr11	33054596	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	33054754	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	33065394	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,16,13
chr11	33065547	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr11	33078643	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr11	33079445	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr11	33079752	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	33080496	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=151.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,23:0,23:0,0,22,24
chr11	33106616	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,18,8
chr11	33106908	.	C	CTTTATAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	33113910	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,7:1,3:0,1,1,9
chr11	33117987	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:0,6,1,4
chr11	33118529	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr11	33121254	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,139;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,11:0.226:51:22,0:17,10:19,21,0,11
chr11	33127721	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=182,174;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr11	33307937	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=13,30,31;MFRL=119,147,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=15.76,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,3:0.581,0.283:11:0,2,2:0,3,1:0,1,9,1
chr11	33360886	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,17:0,0:0,0,12,5
chr11	33362723	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	33370884	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	33373210	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.261:40:15,0:15,10:12,18,2,8
chr11	33581262	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=17,24;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.942:20:0,6:0,13:1,0,14,5
chr11	33581537	.	GCCACATACTA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	33583113	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	33596397	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=100,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:10,11:6,0:7,10,0,11
chr11	33667595	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:17,0:6,2:0|1:33667595_T_A:33667595:8,15,1,1
chr11	33667596	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,7:0.297:25:12,5:6,2:1|0:33667595_T_A:33667595:7,11,2,5
chr11	33667599	.	A	ACTC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:6,2:0|1:33667595_T_A:33667595:8,15,1,1
chr11	33680249	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	33680263	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr11	33689502	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:1,0:9,2:7,3,1,2
chr11	33744049	.	A	ATATGAGGGAGCTAGCAGCCAAGATGGCCGAAT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.152:33:8,0:20,2:6,24,2,1
chr11	33881016	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.762:23:3,10:2,8:2,3,9,9
chr11	33886080	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr11	34093349	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=78.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,21:0,9:0,0,16,15
chr11	34101334	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:4,2:6,0:0|1:34101334_A_AT:34101334:6,6,0,2
chr11	34101335	.	C	CCCATTGTCTATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:4,2:8,0:0|1:34101334_A_AT:34101334:6,6,0,2
chr11	34107785	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr11	34135183	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31,30;MFRL=112,172,159;MMQ=40,40,40;MPOS=32,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,20,21;RU=A;STR;TLOD=4.57,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.189,0.305:10:1,0,0:3,2,3:4,1,5,0
chr11	34135209	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=114,139;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.085:38:12,0:16,0:12,23,3,0
chr11	34149199	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	34153077	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:9,2:0|1:34153077_C_T:34153077:4,10,1,1
chr11	34153099	.	C	CCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:34153077_C_T:34153077:1,10,1,1
chr11	34154641	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,11:0,21:0,0,16,16
chr11	34154768	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:34154768_A_ATG:34154768:0,3,0,1
chr11	34154771	.	G	GGGAGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:34154768_A_ATG:34154768:0,3,0,1
chr11	34154773	.	G	GAGGCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:34154768_A_ATG:34154768:0,3,0,1
chr11	34158336	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,149;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,0:11,4:10,13,0,4
chr11	34158411	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr11	34158431	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr11	34163443	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr11	34163710	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	34167811	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34167811_A_C:34167811:0,1,0,1
chr11	34167814	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34167811_A_C:34167811:0,1,0,1
chr11	34167816	.	T	TTTTATAATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34167811_A_C:34167811:0,1,0,1
chr11	34176214	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr11	34176370	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=85,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:6,0:7,2:5,8,0,3
chr11	34181646	.	G	GACTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr11	34184326	.	T	TTGTAGGGTTTCTGCAGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=165,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,0:3,2:0,4,1,1
chr11	34188981	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr11	34189564	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	34192412	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=119,190;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,8:1,0:2,3,0,8
chr11	34192436	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=121,190;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,8:3,0:4,3,0,8
chr11	34194881	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.205:27:16,2:5,0:0|1:34194881_G_T:34194881:11,11,3,2
chr11	34194885	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,9;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.198:28:16,1:5,0:0|1:34194881_G_T:34194881:11,12,3,2
chr11	34460472	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr11	34460541	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=94,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.929:25:0,9:1,15:1,0,15,9
chr11	34460711	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	34501787	.	C	CTCTCCTCCCACAGTGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,4:10,0:9,9,2,2
chr11	34527152	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:5,1:7,4,1,3
chr11	34670713	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34670713_G_GA:34670713:0,0,0,2
chr11	34670717	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34670713_G_GA:34670713:0,0,0,2
chr11	34670719	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34670713_G_GA:34670713:0,0,0,2
chr11	34670722	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34670713_G_GA:34670713:0,0,0,2
chr11	34670728	.	G	GTGAGCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34670713_G_GA:34670713:0,0,0,2
chr11	34673051	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,1:0|1:34673051_AG_A:34673051:6,1,2,0
chr11	34673053	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0|1:34673051_AG_A:34673051:6,1,2,0
chr11	34680053	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:4,2,5,1
chr11	34904399	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,3,18
chr11	34905145	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	34909827	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,11,1
chr11	34909833	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,12,1
chr11	34909926	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,13:0,0,8,13
chr11	34910217	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	34910397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr11	34910433	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr11	34911967	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	34912013	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr11	34916484	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	34916710	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	34937697	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	34937813	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,18:0,26:0,0,28,19
chr11	34937884	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,11:0,12:0,1,7,16
chr11	34937901	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0,0,6,11
chr11	34937931	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=329,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,3:1,0,0,7
chr11	34953088	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.770:18:2,7:1,4:0,4,0,14
chr11	34978892	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr11	34979160	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:3,3:7,1:2,8,0,4
chr11	34982146	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:34982146_T_G:34982146:0,0,0,10
chr11	34982148	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:34982146_T_G:34982146:0,0,0,10
chr11	35198032	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=271,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	35201969	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=116,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:20,0:20,4:19,21,4,0
chr11	35223158	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:1,0,10,1
chr11	35244044	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr11	35282334	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr11	35323200	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,3:2,7:0,4,1,9
chr11	35327825	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,4:3,5:0,3,0,10
chr11	35334032	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=60,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:1,2,0,6
chr11	35338893	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:3,5:0,4:2,1,6,3
chr11	35338902	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=66,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:7,0:9,6,2,1
chr11	35456453	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,262;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	35492104	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,3:7,3,2,1
chr11	35496342	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:35496342_AG_A:35496342:0,3,0,1
chr11	35496345	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:35496342_AG_A:35496342:0,3,0,1
chr11	35496351	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35496342_AG_A:35496342:0,2,0,1
chr11	35515875	.	CTTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTTG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	35641844	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:0,6,3,4
chr11	35642080	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,3:17,0:18,7,3,0
chr11	35642247	.	GAA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.430:22:3,7:7,2:9,4,4,5
chr11	35642430	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:12,4:16,5:4,24,0,9
chr11	35642462	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,2:7,3:2,13,0,5
chr11	35706796	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.094:31:17,0:11,2:15,13,2,1
chr11	36057626	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:6,4,2,0
chr11	36103381	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	36251013	.	T	TTCAGGTGTCACTGAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=400,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	36298555	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=75,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,5:0,7:1,1,7,5
chr11	36302165	.	TT	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	36302410	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr11	36302488	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	36311014	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.691:27:6,6:2,13:3,5,4,15
chr11	36397569	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:1,0:1,1:0|1:36397569_G_T:36397569:3,0,1,0
chr11	36397575	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36397569_G_T:36397569:3,0,1,0
chr11	36425013	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr11	36453506	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,5,13
chr11	36458960	.	T	TTGA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=105,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:14,1:15,0:0|1:36458960_T_TTGA:36458960:12,19,1,1
chr11	36458964	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=105,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:16,2:14,0:0|1:36458960_T_TTGA:36458960:12,19,1,1
chr11	36458972	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=106,75;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,3:0.126:30:13,3:12,0:1|0:36458960_T_TTGA:36458960:11,16,1,2
chr11	36459109	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36459109_A_G:36459109:0,0,0,1
chr11	36459111	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36459109_A_G:36459109:0,0,0,1
chr11	36459112	.	T	TGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36459109_A_G:36459109:0,0,0,1
chr11	36514085	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.201:20:7,2:7,1:13,3,1,3
chr11	36514290	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	36518824	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=230,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,3:1,9:0,1,3,9
chr11	36518881	.	C	CAAGTACCAAGCAGCAGCCG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=168,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:2,0:3,2:0|1:36518881_C_CAAGTACCAAGCAGCAGCCG:36518881:0,5,1,1
chr11	36518884	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=168,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:36518881_C_CAAGTACCAAGCAGCAGCCG:36518881:0,5,1,1
chr11	36518885	.	T	TGACA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=168,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:36518881_C_CAAGTACCAAGCAGCAGCCG:36518881:0,5,1,1
chr11	36519958	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr11	36595177	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=91,22;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:4,10,1,1
chr11	36597512	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,128;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,8:4,0:6,3,8,0
chr11	36601096	.	CT	C,CTT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,29,20;MFRL=154,100,48;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.66,18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,7:0.296,0.268:27:7,6,2:4,3,5:4,7,8,8
chr11	36601111	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,1:5,2:0|1:36601111_A_G:36601111:9,14,2,3
chr11	36601112	.	T	TCTCCC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:12,2:9,2:0|1:36601111_A_G:36601111:9,14,2,3
chr11	36614588	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.322:26:8,8:10,0:10,8,8,0
chr11	36669778	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	36680765	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	36680826	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	43345174	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=131,81;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,0:3,4:3,7,0,4
chr11	43413157	.	TTTGCG	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=121,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGCG;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.437:36:11,12:9,4:0|1:43413157_TTTGCG_T:43413157:4,16,7,9
chr11	43413158	.	TTGCG	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=69,87;MMQ=24,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,41:0.881:47:2,25:4,16:1|0:43413157_TTTGCG_T:43413157:2,4,11,30
chr11	43428601	.	TAAGAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr11	43436355	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43436355_AA_TC:43436355:0,2,0,1
chr11	43436360	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:43436355_AA_TC:43436355:1,2,0,1
chr11	43436363	.	CAGCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43436355_AA_TC:43436355:1,2,0,1
chr11	43436374	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43436355_AA_TC:43436355:1,2,0,1
chr11	43465592	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:4,11:2,7:3,3,7,11
chr11	43465854	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:0,1:0|1:43465854_T_A:43465854:0,2,0,1
chr11	43465855	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43465854_T_A:43465854:0,2,0,1
chr11	43465858	.	A	ACTGGTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43465854_T_A:43465854:0,2,0,1
chr11	43472895	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	43511968	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:43511968_T_C:43511968:0,4,0,1
chr11	43511970	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:43511968_T_C:43511968:0,4,0,1
chr11	43511995	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43511995_T_C:43511995:0,0,0,1
chr11	43511997	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43511995_T_C:43511995:0,0,0,1
chr11	43511998	.	T	TTGTTAGGAGCCAGACCG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43511995_T_C:43511995:0,0,0,1
chr11	43515304	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=177,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:4,5:5,8:6,3,7,6
chr11	43702581	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	43702615	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	43772415	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:14,4,0,2
chr11	43775734	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr11	43852448	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:14,2:5,0:15,5,2,0
chr11	43876435	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=100,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,2:4,4:2,5,1,5
chr11	43905440	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:1,4:1,3:3,0,7,0
chr11	43911232	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:7,0:10,1,2,0
chr11	43940566	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	43940602	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:3,4,3,0
chr11	43940644	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:2,2,2,4
chr11	44077623	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,3:6,0:6,7,2,1
chr11	44080210	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.713:19:0,5:5,8:2,3,8,6
chr11	44080228	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:3,3:13,0:8,9,2,1
chr11	44089161	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,8,5
chr11	44089544	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=153,125;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:1,1:0,0:0|1:44089544_A_AC:44089544:0,3,0,1
chr11	44089546	.	C	CACCACAGGACCAGAACCTAACCCATGGACCCTTGTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=191,125;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44089544_A_AC:44089544:0,2,0,1
chr11	44094965	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	44096238	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,49:0.674:72:12,22:11,23:17,6,36,13
chr11	44096284	.	CTCTTTCTT	C	.	.	DP=57;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=141,112;MMQ=55,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TCTT;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.339:19:7,4:5,1:4,9,1,5
chr11	44096322	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=113,166;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:6,6:2,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:2,7,0,7
chr11	44096330	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=115,166;MMQ=57,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:6,5:1,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:1,7,0,7
chr11	44096334	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=115,188;MMQ=52,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:7,4:1,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:1,9,0,6
chr11	44096338	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=115,166;MMQ=52,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,3:1,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:1,9,0,5
chr11	44098990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:1,2,0,3
chr11	44104701	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr11	44104885	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=82,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:1,5,3,8
chr11	44104981	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=60,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:5,8:0,4:2,3,8,4
chr11	44146257	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	44219286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	44228479	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,4:12,0:8,13,2,2
chr11	44265881	.	G	GAGACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr11	44296828	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=238,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr11	44297253	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:44297253_A_G:44297253:0,0,0,4
chr11	44297255	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44297253_A_G:44297253:0,3,0,1
chr11	44297277	.	G	GTGGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44297253_A_G:44297253:0,2,0,1
chr11	44297278	.	A	ACCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44297253_A_G:44297253:0,2,0,1
chr11	44616209	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.264:43:18,11:13,0:18,14,11,0
chr11	44626727	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.208:27:10,0:10,5:7,15,0,5
chr11	44636776	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=82,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:18,2:18,1:25,11,2,1
chr11	44639921	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:2,1:0|1:44639921_C_T:44639921:2,4,1,1
chr11	44639923	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:44639921_C_T:44639921:2,4,1,1
chr11	44640016	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr11	44940665	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	44950784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	44959061	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.650:32:5,13:5,6:8,3,11,10
chr11	44959206	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.732:13:1,6:2,3:0|1:44959206_C_A:44959206:1,2,5,5
chr11	44959213	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=123,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.283:12:6,1:3,2:1|0:44959206_C_A:44959206:4,5,1,2
chr11	44959924	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr11	45265645	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=124,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr11	45672594	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	45868850	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr11	45877529	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,5:0,0,10,6
chr11	45877688	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr11	45891508	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	45907495	.	CG	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=94,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.427:8:3,4:1,0:2,2,2,2
chr11	45923850	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=93,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr11	45926280	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,93;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:45926280_C_T:45926280:11,4,1,1
chr11	45926284	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,93;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:4,0:11,2:0|1:45926280_C_T:45926280:10,5,1,1
chr11	45926445	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr11	45926867	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr11	45931772	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,0:2,1:0|1:45931772_A_C:45931772:0,7,2,0
chr11	45931777	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,0:0|1:45931772_A_C:45931772:0,8,2,0
chr11	45931782	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:45931772_A_C:45931772:0,8,2,0
chr11	45931784	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=22,13;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:2,0:0|1:45931772_A_C:45931772:1,8,2,0
chr11	45931788	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,0:0|1:45931772_A_C:45931772:2,7,2,0
chr11	45935955	.	ATGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	45936035	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	45944985	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=203,253;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	45944994	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	45945969	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr11	45949682	.	C	CCTCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	45957301	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,217;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	45959669	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr11	46001229	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr11	46001356	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=98,145;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,17:0.236:72:31,0:24,15:40,15,17,0
chr11	46105688	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr11	46337899	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=102,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:17,0:13,2:0|1:46337899_A_G:46337899:17,14,1,1
chr11	46337907	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:46337899_A_G:46337899:15,11,1,1
chr11	46342081	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr11	46342259	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=54,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.935:22:2,5:0,15:1,1,10,10
chr11	46355063	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:46355063_G_T:46355063:1,4,1,1
chr11	46355065	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:46355063_G_T:46355063:1,4,1,1
chr11	46355067	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:46355063_G_T:46355063:1,4,1,1
chr11	46401517	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=119,110;MMQ=46,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.405:30:5,5:13,7:7,11,6,6
chr11	46404248	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:19,0:24,4:25,18,3,1
chr11	46404338	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,0:1,0:0,2,1,1
chr11	46404348	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:46404348_C_CG:46404348:1,1,0,1
chr11	46404355	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46404348_C_CG:46404348:0,1,0,1
chr11	46407546	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,4:7,0:11,5,4,0
chr11	46455264	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46455264_T_TCCA:46455264:0,1,0,1
chr11	46455266	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46455264_T_TCCA:46455264:0,1,0,1
chr11	46455271	.	T	TCCTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46455264_T_TCCA:46455264:0,1,0,1
chr11	46456388	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,50;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:15,1:12,11,2,0
chr11	46564336	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=102,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:20,0:14,4:18,16,0,4
chr11	46565671	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=133,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr11	46567205	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:10,4:9,0:11,9,2,2
chr11	46568603	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,131;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,2:3,0:5,2,2,0
chr11	46569434	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,31,21;MFRL=81,177,122;MMQ=60,60,60;MPOS=29,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.65,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.277,0.300:10:0,1,1:1,1,0:0,4,0,6
chr11	46671967	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46671967_G_GCA:46671967:0,1,0,1
chr11	46671968	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46671967_G_GCA:46671967:0,1,0,1
chr11	46690018	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=78,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:6,5:14,0:11,9,5,0
chr11	46722731	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr11	46726892	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,2:5,0:9,8,0,2
chr11	46742450	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:1,3,3,6
chr11	46744925	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr11	46760756	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.941:11:0,9:0,2:0,0,6,5
chr11	46773096	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=223,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	46774220	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,2:7,1:10,4,2,1
chr11	46776697	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	46799714	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.251:21:7,1:8,3:10,6,1,4
chr11	46802094	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	46822686	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	46831047	.	C	CACACACACACA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:2,13,0,2
chr11	46880951	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46880951_G_A:46880951:0,0,0,1
chr11	46880952	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46880951_G_A:46880951:0,0,0,1
chr11	46880956	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46880951_G_A:46880951:0,0,0,1
chr11	46880961	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46880951_G_A:46880951:0,0,0,1
chr11	46889713	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr11	46890165	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr11	46897152	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=119,86;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:6,4:13,0:0|1:46897152_C_A:46897152:10,10,3,1
chr11	46897160	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=113,86;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,4:12,0:0|1:46897152_C_A:46897152:10,9,3,1
chr11	46897253	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,2,4
chr11	46897995	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr11	46898991	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	46907827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr11	46911457	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	46911704	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr11	46914598	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,11,9
chr11	46917672	.	A	ATTTAGAAAGGAGGCGGGGTCAGAGGAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	46917983	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	46920241	.	A	ACACACACACACACACACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,0:2,2:1,7,0,2
chr11	46921531	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,0:4,9:2,7,0,9
chr11	46924277	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,28;MFRL=205,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:0,1:2,0,1,1
chr11	46958467	.	G	GGAAAGTCGCCTGCCGGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46958467_G_GGAAAGTCGCCTGCCGGTGCT:46958467:0,1,0,1
chr11	46958472	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46958467_G_GGAAAGTCGCCTGCCGGTGCT:46958467:0,1,0,1
chr11	47182947	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	47187067	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=86,89;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.519:23:6,6:5,4:0|1:47187067_G_A:47187067:5,6,7,5
chr11	47187071	.	GAA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=86,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.541:22:4,4:2,4:0|1:47187067_G_A:47187067:5,5,7,5
chr11	47187865	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=106,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:20,3:22,1:24,18,3,1
chr11	47193779	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:8,5:20,0:17,11,5,0
chr11	47193983	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=99,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr11	47201095	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=90,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:2,11,1,1
chr11	47204175	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,4:0,0,5,7
chr11	47238665	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:0,6:1,6:0,1,1,11
chr11	47264767	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:11,4:5,0:11,5,2,2
chr11	47267436	.	T	TGTGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:1,3,0,2
chr11	47282279	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47282279_G_A:47282279:0,0,0,1
chr11	47282285	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47282279_G_A:47282279:0,0,0,1
chr11	47298201	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr11	47298360	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,4,21
chr11	47307174	.	TGTTCC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:1,8,0,2
chr11	47312216	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.202:46:16,8:20,0:20,17,8,1
chr11	47330316	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47330316_CA_TC:47330316:0,1,0,1
chr11	47330324	.	A	AGATACGATGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47330316_CA_TC:47330316:0,1,0,1
chr11	47333401	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr11	47355611	.	G	GAGCATTAGTGCAAAACTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr11	47360148	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:47360148_T_C:47360148:8,15,1,1
chr11	47360160	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:8,2:0|1:47360148_T_C:47360148:7,16,1,1
chr11	47360164	.	C	CTATCTTAAGTAGATAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=137,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:0|1:47360148_T_C:47360148:7,16,1,1
chr11	47361285	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=113,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:9,6,2,0
chr11	47362431	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	47362543	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:5,8,1,1
chr11	47364301	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:12,2:6,0:0|1:47364301_C_T:47364301:6,19,1,1
chr11	47364317	.	AAGTG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,1:4,0:0|1:47364301_C_T:47364301:6,16,1,1
chr11	47364324	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:5,0:0|1:47364301_C_T:47364301:6,14,1,1
chr11	47364762	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	47365004	.	CACCT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47365004_CACCT_C:47365004:0,0,1,0
chr11	47365011	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47365004_CACCT_C:47365004:0,0,1,0
chr11	47365014	.	CGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=121,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:47365004_CACCT_C:47365004:0,1,1,0
chr11	47365199	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	47365213	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,2:7,0:0,7,0,2
chr11	47369126	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:6,0:4,2:0|1:47369126_GC_G:47369126:5,6,1,1
chr11	47369129	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:47369126_GC_G:47369126:5,6,1,1
chr11	47371484	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr11	47371578	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,3:16,2:15,10,4,1
chr11	47372221	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr11	47374162	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=90,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:3,3:13,0:10,7,3,0
chr11	47374189	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.143:23:7,2:13,0:5,15,3,0
chr11	47380593	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,8:0,0,10,10
chr11	47397353	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr11	47431966	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,2,7
chr11	47436384	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr11	47436531	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	47446270	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:2,7,0,2
chr11	47446292	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr11	47447528	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:19,0:20,3:10,29,0,3
chr11	47459691	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	47462837	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	47463483	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	47494863	.	C	CACG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47494863_C_CACG:47494863:0,1,0,1
chr11	47494864	.	T	TCTGACTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47494863_C_CACG:47494863:0,1,0,1
chr11	47494867	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:47494863_C_CACG:47494863:0,1,0,1
chr11	47496886	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=150,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:3,0:8,2:3,9,2,1
chr11	47497010	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,53;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:7,0:13,8,3,0
chr11	47505869	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.281:21:1,1:7,5:14,1,5,1
chr11	47587577	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.792:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr11	47591507	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=216,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:47591507_GC_G:47591507:0,1,0,1
chr11	47591509	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=216,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47591507_GC_G:47591507:0,1,0,1
chr11	47591514	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=216,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:47591507_GC_G:47591507:0,1,0,1
chr11	47597058	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31,33;MFRL=173,187,169;MMQ=60,50,40;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.02,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.200,0.294:11:1,0,2:5,2,1:6,0,5,0
chr11	47597071	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=165,187;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:13,2,2,0
chr11	47599373	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:11,3:9,0:8,12,2,1
chr11	47599528	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,0:22,3:14,23,0,3
chr11	47600352	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	47601977	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	47606044	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr11	47611316	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	47611960	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47611960_G_A:47611960:0,0,1,0
chr11	47611985	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47611960_G_A:47611960:1,0,1,0
chr11	47612225	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,0:11,4:8,13,0,4
chr11	47640429	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr11	47644270	.	AC	CT	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=135,3994;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.061:63:17,0:42,3:0|1:47644270_AC_CT:47644270:22,38,1,2
chr11	47644274	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=135,3994;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.060:65:17,0:42,3:0|1:47644270_AC_CT:47644270:21,41,1,2
chr11	47644277	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=128,3994;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,3:0.059:66:18,0:41,3:0|1:47644270_AC_CT:47644270:22,41,1,2
chr11	47644289	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=135,3994;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.060:63:16,0:44,3:19,41,1,2
chr11	47647171	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,0:3,1,2,0
chr11	47660287	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=21,20;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:18,2:14,4:0|1:47660287_T_C:47660287:18,16,2,4
chr11	47660294	.	CA	TG	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:17,2:16,4:0|1:47660287_T_C:47660287:17,17,2,4
chr11	47660301	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=23,25;MFRL=99,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:19,2:16,4:0|1:47660287_T_C:47660287:19,16,2,4
chr11	47660326	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=25,22;MFRL=109,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,8:0.166:52:28,4:14,4:0|1:47660326_G_A:47660326:22,22,3,5
chr11	47660328	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=25,22;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.094:51:26,2:17,2:0|1:47660328_G_A:47660328:23,24,2,2
chr11	47660334	.	CA	TG	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=103,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.103:46:24,2:17,1:0|1:47660328_G_A:47660328:20,22,2,2
chr11	47660338	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:22,2:15,1:0|1:47660328_G_A:47660328:20,20,1,2
chr11	47660341	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:21,2:14,0:0|1:47660326_G_A:47660326:18,20,1,2
chr11	47681681	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,3:2,6:3,0,6,3
chr11	47712018	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=110,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,5:11,0:10,13,5,0
chr11	47736314	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr11	47746195	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=81,50;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:22,0:8,4:0|1:47746195_G_T:47746195:23,9,0,4
chr11	47746197	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=81,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:24,0:8,4:0|1:47746195_G_T:47746195:23,9,0,4
chr11	47746423	.	T	TCTTCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=242,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	47755552	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr11	47772401	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr11	47772497	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,211;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,1:15,1:10,11,0,2
chr11	47776047	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr11	47813436	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,18,8
chr11	47819561	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:47819561_A_C:47819561:2,2,0,1
chr11	47819562	.	C	CTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:47819561_A_C:47819561:2,2,0,1
chr11	47834585	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr11	47834592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr11	47834832	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr11	47837638	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr11	47843813	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr11	48142528	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,30,28;MFRL=93,103,122;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.34,6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,7:0.113,0.313:22:3,1,3:8,1,3:10,3,8,1
chr11	48145063	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr11	48145247	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,6,14
chr11	48157610	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=85,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:13,0:3,2:0|1:48157610_C_T:48157610:10,6,1,1
chr11	48157616	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=85,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:2,2:0|1:48157610_C_T:48157610:12,8,1,1
chr11	48157618	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=83,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:3,2:0|1:48157610_C_T:48157610:12,7,1,1
chr11	48157622	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=77,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:48157610_C_T:48157610:12,5,1,1
chr11	48157624	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=77,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:48157610_C_T:48157610:12,5,1,1
chr11	48157869	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr11	48170870	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	48171793	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr11	48184971	.	CCTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:0,0,7,2
chr11	48184983	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:0,0,7,2
chr11	48238283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0|1:48238283_C_T:48238283:4,0,2,0
chr11	48238302	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:48238283_C_T:48238283:0,0,8,1
chr11	48266582	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	48266835	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:6,15,1,1
chr11	48267589	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,612;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr11	48267615	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	48285842	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=38,32;MFRL=67,146;MMQ=54,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,5:1,0,5,7
chr11	48285856	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,1:0,0,6,6
chr11	48285981	.	CCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=93.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,9,13
chr11	48346423	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=13;MBQ=28,31;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:48346423_A_G:48346423:1,0,3,0
chr11	48346427	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=13;MBQ=23,31;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0|1:48346423_A_G:48346423:1,0,3,0
chr11	48346450	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=26,30;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:4,2:0|1:48346423_A_G:48346423:6,4,2,1
chr11	48346458	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=115,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:0|1:48346423_A_G:48346423:9,5,1,1
chr11	48346487	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=25,27;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:8,1:8,3:0|1:48346487_TC_T:48346487:11,6,2,2
chr11	48346513	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=21,34;MFRL=101,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:11,1:6,4:0|1:48346487_TC_T:48346487:10,8,2,3
chr11	48346523	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=20,29;MFRL=80,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:6,3:0|1:48346487_TC_T:48346487:9,6,2,2
chr11	48346535	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=29,28;MFRL=45,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:7,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:7,8,2,2
chr11	48346541	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=23,29;MFRL=45,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:0|1:48346487_TC_T:48346487:7,8,1,1
chr11	48346547	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=45,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:0|1:48346487_TC_T:48346487:5,8,1,1
chr11	48346551	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=45,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,1:0|1:48346487_TC_T:48346487:5,8,1,1
chr11	48346588	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=27,28;MFRL=97,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:9,2:0|1:48346588_A_C:48346588:8,5,0,2
chr11	48346604	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=22,30;MFRL=90,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:4,3:10,3:0|1:48346588_A_C:48346588:9,5,4,3
chr11	48346615	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,3:9,6:9,6,5,4
chr11	48346660	.	TTTGCTGATC	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:9,11:8,3:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:8,10,11,5
chr11	48346681	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=100,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,20:0.539:37:9,10:6,8:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:9,8,13,7
chr11	48346791	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:3,5,3,6
chr11	48346822	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.661:21:2,7:4,7:4,3,6,8
chr11	48346924	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.606:31:2,7:8,12:0|1:48346924_T_C:48346924:4,8,9,10
chr11	48346932	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,21:0.647:32:2,9:9,12:0|1:48346924_T_C:48346924:4,7,10,11
chr11	48346961	.	AA	TG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=118,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:4,7:5,14:4,5,9,12
chr11	48346999	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.790:26:3,9:2,12:2,3,7,14
chr11	48347100	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:9,3:8,8:11,6,5,6
chr11	48347124	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:8,7:6,5:0|1:48347124_A_G:48347124:13,7,5,7
chr11	48347130	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,11:0.316:36:10,6:12,4:0|1:48347124_A_G:48347124:16,9,4,7
chr11	48347140	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,11:0.300:38:13,7:13,4:0|1:48347124_A_G:48347124:15,12,4,7
chr11	48347142	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=117,65;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.309:40:11,7:14,4:0|1:48347124_A_G:48347124:16,12,5,7
chr11	48347144	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=117,65;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,12:0.317:39:12,5:14,5:0|1:48347124_A_G:48347124:16,11,5,7
chr11	48347306	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=111,76;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:12,2:7,3:9,10,2,3
chr11	48347342	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=118,177;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:7,1:9,3:0|1:48347342_G_A:48347342:8,9,0,4
chr11	48347346	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,0:7,3:0|1:48347342_G_A:48347342:7,8,0,4
chr11	48347358	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:0|1:48347358_C_T:48347358:4,8,0,3
chr11	48347363	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:5,3:0|1:48347358_C_T:48347358:4,8,0,3
chr11	48366812	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=75,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr11	48366895	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:3,3,4,2
chr11	48367050	.	T	TAG	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=23,25;MFRL=96,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:4,9:11,3:9,6,6,6
chr11	48367073	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,12,19
chr11	48367097	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=22,31;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,5:8,2:5,11,3,4
chr11	48367133	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=27,27;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:7,7:7,2:0|1:48367133_C_A:48367133:7,7,5,4
chr11	48367136	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=24,26;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:7,6:7,2:0|1:48367133_C_A:48367133:7,7,5,4
chr11	48367155	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=23,26;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:5,8:7,2:0|1:48367155_T_A:48367155:7,6,7,3
chr11	48367159	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:5,6:7,2:0|1:48367155_T_A:48367155:6,6,6,3
chr11	48367163	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=23,33;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:5,6:7,2:0|1:48367155_T_A:48367155:8,6,5,3
chr11	48367170	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:6,6:5,2:0|1:48367155_T_A:48367155:7,6,5,3
chr11	48367190	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,25;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:6,8:2,1:0|1:48367190_A_T:48367190:4,4,6,3
chr11	48367195	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=33,24;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:6,5:2,1:0|1:48367190_A_T:48367190:4,4,5,3
chr11	48367363	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=30,24;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:3,3:11,5:8,6,2,7
chr11	48367387	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=34,23;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,5:7,7:4,7,4,8
chr11	48367419	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=20,25;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.484:29:5,5:9,9:0|1:48367419_G_A:48367419:7,8,5,9
chr11	48367424	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,4:8,8:0|1:48367419_G_A:48367419:7,7,5,9
chr11	48367455	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=27,25;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:6,1:4,5:5,7,2,4
chr11	48367469	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=28,35;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.427:12:4,1:3,4:0|1:48367469_TG_CA:48367469:1,6,1,4
chr11	48367474	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=23,32;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0|1:48367469_TG_CA:48367469:1,6,1,4
chr11	48367499	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=23,32;MFRL=144,70;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr11	48367508	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=31,25;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48367508_G_A:48367508:1,3,0,1
chr11	48367511	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=28,29;MFRL=144,70;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr11	48367514	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=24,31;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48367508_G_A:48367508:1,3,0,1
chr11	48367517	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=22,20;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48367508_G_A:48367508:1,3,0,1
chr11	48367518	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=22,35;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:48367508_G_A:48367508:1,3,0,1
chr11	48373632	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	48373748	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.233:41:14,4:18,5:16,16,6,3
chr11	48373770	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=99,101;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.312:46:14,4:15,10:16,16,9,5
chr11	48373797	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=33,23;MFRL=92,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.344:41:12,4:14,9:0|1:48373797_C_T:48373797:14,13,6,8
chr11	48373805	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,16:0.358:45:12,4:17,8:0|1:48373797_C_T:48373797:16,13,7,9
chr11	48373815	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=80,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,15:0.372:41:12,8:13,6:0|1:48373797_C_T:48373797:16,10,7,8
chr11	48373817	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=77,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,15:0.381:40:12,8:13,6:0|1:48373797_C_T:48373797:16,9,7,8
chr11	48373820	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=77,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,16:0.386:42:13,9:12,6:0|1:48373797_C_T:48373797:17,9,8,8
chr11	48373827	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=77,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.395:41:11,9:13,5:0|1:48373797_C_T:48373797:18,7,9,7
chr11	48373833	.	GA	AG	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=77,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.349:41:10,9:15,3:0|1:48373797_C_T:48373797:18,9,9,5
chr11	48373976	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:8,3:9,2:0|1:48373976_T_G:48373976:5,12,2,3
chr11	48373986	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:0|1:48373976_T_G:48373976:3,8,1,3
chr11	48374000	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr11	48374031	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr11	48374041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=142,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr11	48510777	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,94;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,11,16
chr11	49170334	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr11	49176057	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	49192667	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr11	49192905	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=17,21;MFRL=129,212;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,0:0,2:2,3,0,3
chr11	49192921	.	AGT	A,AT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,22,24;MFRL=181,54,130;MMQ=55,50,60;MPOS=7,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.54,5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.200,0.200:12:2,1,1:6,0,1:1,7,2,2
chr11	49192924	.	C	A,T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,30,25;MFRL=181,54,130;MMQ=55,50,60;MPOS=4,-1073741824;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.54,5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.200,0.200:12:2,1,1:6,1,1:1,7,2,2
chr11	49195090	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr11	49195123	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49195123_G_A:49195123:0,0,0,1
chr11	49195124	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49195123_G_A:49195123:0,0,0,1
chr11	49195125	.	C	CACAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49195123_G_A:49195123:0,0,0,1
chr11	49208141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=104,81;MMQ=37,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr11	49974737	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=153,84;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:49974737_G_A:49974737:3,6,0,2
chr11	49974739	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=148,84;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:49974737_G_A:49974737:4,6,0,2
chr11	49974742	.	CA	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=148,84;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:3,0:0|1:49974737_G_A:49974737:4,6,0,2
chr11	49974931	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	51411460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=109,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,7:0,4:1,0,7,4
chr11	51412453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr11	51516255	.	TTAGGGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=173,218;MMQ=33,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51516255_TTAGGGA_T:51516255:0,2,0,1
chr11	51516265	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=173,218;MMQ=33,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51516255_TTAGGGA_T:51516255:0,2,0,1
chr11	55033273	.	CAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,19,17;MFRL=104,84,107;MMQ=40,31,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.37,5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.216,0.401:8:0,1,0:2,0,0:1,2,1,4
chr11	55035809	.	AT	A,ATT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,23,24;MFRL=120,155,148;MMQ=60,60,50;MPOS=10,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.60,7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,9,6:0.303,0.219:28:7,1,1:5,8,5:11,2,13,2
chr11	55111238	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:3,3:10,2:6,7,4,1
chr11	55339752	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,3:15,0:14,10,3,0
chr11	55339793	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=22,33;MFRL=111,7000573;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,0:20,2:17,16,1,1
chr11	55339798	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:7,6:13,6:10,10,6,6
chr11	55339829	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=403,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:0,10:1,14:0,1,9,15
chr11	55339848	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:2,13,2,5
chr11	55541098	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,15:0,4:0,0,6,13
chr11	55563978	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55563978_C_G:55563978:0,1,0,1
chr11	55563981	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55563978_C_G:55563978:0,1,0,1
chr11	55563982	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55563978_C_G:55563978:0,1,0,1
chr11	55579116	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,33;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:11,0:12,4:12,11,2,2
chr11	55579469	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=89,90;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,0:14,4:10,14,0,4
chr11	55579940	.	AGGCACAGTGTTG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=169,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0|1:55579940_AGGCACAGTGTTG_A:55579940:0,5,1,1
chr11	55579955	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:55579940_AGGCACAGTGTTG_A:55579940:0,4,1,1
chr11	55606818	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,4:7,3:7,10,2,5
chr11	55655616	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=59,79;MMQ=51,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:9,0:5,3:8,7,2,2
chr11	55656345	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=171,173;MMQ=50,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,5:9,0:12,2,5,0
chr11	55656437	.	ATT	A,AT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,26,25;MFRL=94,157,109;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.17,5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,3,6:0.109,0.204:30:12,0,2:6,3,4:12,9,5,4
chr11	55656483	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,16:0,0,10,24
chr11	55657394	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0|1:55657394_A_G:55657394:0,0,6,8
chr11	55657399	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0|1:55657394_A_G:55657394:0,0,5,8
chr11	55681336	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,7:5,10:3,6,9,8
chr11	55682111	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	55860780	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,13:0,0,14,7
chr11	55872876	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr11	55873247	.	TCATCTCTTGGGAGTCAC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=147,85;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,3:11,0:12,10,1,2
chr11	55873475	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,170;MMQ=59,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr11	55873494	.	T	TGAGCTAAGAACCAGAGACCATGAACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=163,191;MMQ=59,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr11	55889790	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr11	55944048	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,2:1,2:4,0,3,1
chr11	55999979	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=119,112;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:4,2:14,0:12,7,0,2
chr11	56057881	.	TGGACACATAGGATGCAGATATTGTGATAAG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,159;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:7,0:2,2:7,6,1,1
chr11	56086147	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=99,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:4,4,2,2
chr11	56128081	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,13:4,4:8,1,7,10
chr11	56128145	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=105,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:5,14,0,2
chr11	56143125	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=28,22;MFRL=122,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:6,1:12,3:12,6,3,1
chr11	56143156	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,26:0.643:40:4,9:10,10:0|1:56143156_C_T:56143156:8,6,14,12
chr11	56143158	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=25,28;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,26:0.643:40:4,11:10,14:0|1:56143156_C_T:56143156:8,6,14,12
chr11	56143198	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=68.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,19:0.444:43:8,12:16,7:0|1:56143198_C_T:56143198:8,16,13,6
chr11	56143204	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=29,26;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,19:0.435:44:9,10:16,8:0|1:56143198_C_T:56143198:10,15,12,7
chr11	56143207	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,19:0.417:46:8,11:18,6:0|1:56143198_C_T:56143198:11,16,11,8
chr11	56143216	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=31,25;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,19:0.454:42:5,11:17,8:0|1:56143198_C_T:56143198:10,13,11,8
chr11	56143225	.	CT	TC	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=30,25;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=74.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,20:0.477:42:5,9:16,9:0|1:56143198_C_T:56143198:9,13,11,9
chr11	56143250	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=30,28;MFRL=98,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:4,5:9,5:0|1:56143250_G_A:56143250:7,8,6,6
chr11	56143252	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.589:32:4,6:9,7:6,7,10,9
chr11	56143255	.	T	TGA	.	.	DP=37;ECNT=13;MBQ=24,25;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:6,8:12,8:0|1:56143250_G_A:56143250:8,10,10,9
chr11	56143257	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=77.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:6,9:11,10:0|1:56143250_G_A:56143250:8,10,10,10
chr11	56143259	.	AGT	A	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=26,26;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,20:0.500:40:6,9:10,10:0|1:56143250_G_A:56143250:9,11,10,10
chr11	56143434	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=34,25;MFRL=63,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,4:1,4:3,1,4,4
chr11	56143489	.	AT	GA	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=22,32;MFRL=104,44;MMQ=60,45;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,2:3,2:5,8,1,3
chr11	56143501	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=22,31;MFRL=104,44;MMQ=60,45;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,2:5,2:0|1:56143501_T_G:56143501:5,7,1,3
chr11	56143508	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=21,27;MFRL=104,44;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,2:5,2:0|1:56143501_T_G:56143501:5,7,1,3
chr11	56143510	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=22,31;MFRL=104,44;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,1:5,2:0|1:56143501_T_G:56143501:5,7,1,3
chr11	56143528	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=21,30;MFRL=104,87;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.302:12:4,2:4,1:3,6,0,3
chr11	56143592	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:2,2:6,2:3,6,3,1
chr11	56143690	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=20;MBQ=31,24;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.366:39:10,4:15,10:0|1:56143690_C_A:56143690:10,15,9,5
chr11	56143696	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=20;MBQ=31,24;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,14:0.333:43:13,4:15,8:0|1:56143690_C_A:56143690:12,17,8,6
chr11	56143699	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=20;MBQ=27,32;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.302:41:12,4:15,6:0|1:56143690_C_A:56143690:12,17,6,6
chr11	56143716	.	TG	CA	.	.	DP=39;ECNT=20;MBQ=26,33;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:16,2:14,6:0|1:56143690_C_A:56143690:14,17,4,4
chr11	56143723	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=20;MBQ=24,34;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.244:39:16,3:11,6:0|1:56143690_C_A:56143690:15,15,5,4
chr11	56143725	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,9:0.250:38:17,2:9,6:0|1:56143690_C_A:56143690:15,14,5,4
chr11	56143729	.	CC	TG	.	.	DP=36;ECNT=20;MBQ=28,27;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.250:34:14,2:8,5:0|1:56143690_C_A:56143690:13,13,4,4
chr11	56143762	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=26,27;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:7,4:5,3:0|1:56143762_C_T:56143762:5,7,4,3
chr11	56143767	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=20;MBQ=29,27;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:9,2:6,2:0|1:56143762_C_T:56143762:6,9,3,2
chr11	56143782	.	T	TGA	.	.	DP=23;ECNT=20;MBQ=22,26;MFRL=68,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,3:7,2:0|1:56143762_C_T:56143762:7,11,2,3
chr11	56143784	.	CAT	C	.	.	DP=23;ECNT=20;MBQ=30,34;MFRL=67,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:8,3:7,2:0|1:56143762_C_T:56143762:6,12,2,3
chr11	56143795	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=28,26;MFRL=65,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:7,2:9,3:0|1:56143762_C_T:56143762:5,13,1,5
chr11	56143803	.	AG	GC	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=24,32;MFRL=74,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,3:8,3:0|1:56143762_C_T:56143762:5,11,1,5
chr11	56143807	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=30,26;MFRL=74,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,3:9,3:0|1:56143762_C_T:56143762:5,11,1,5
chr11	56143810	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=28,33;MFRL=74,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:6,2:10,2:0|1:56143762_C_T:56143762:6,10,0,5
chr11	56143816	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=74,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:6,2:9,2:0|1:56143762_C_T:56143762:6,10,0,5
chr11	56143819	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=30,31;MFRL=74,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:7,2:9,2:0|1:56143762_C_T:56143762:5,11,0,5
chr11	56143823	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=32,24;MFRL=74,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:7,3:9,2:0|1:56143762_C_T:56143762:5,11,0,5
chr11	56143858	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,2:7,1:0|1:56143858_G_C:56143858:5,8,0,3
chr11	56143864	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=20;MBQ=31,17;MFRL=130,67;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,0:0|1:56143858_G_C:56143858:5,9,0,2
chr11	56310222	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,75;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,8:4,5:3,6,5,8
chr11	56310497	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,5,3
chr11	56344654	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=125,96;MMQ=40,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:4,0:10,2:0|1:56344654_G_A:56344654:12,4,0,2
chr11	56344656	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=125,96;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:56344654_G_A:56344654:12,4,0,2
chr11	56344661	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=125,96;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:56344654_G_A:56344654:12,4,0,2
chr11	56344852	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=103,131;MMQ=60,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr11	56380008	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,3:4,7:8,3,5,5
chr11	56380523	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,49;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:10,3:9,9,0,3
chr11	56380553	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=121,49;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,0:7,3:5,5,0,3
chr11	56380937	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,601;MMQ=60,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:10,0:9,15,0,3
chr11	56431834	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=124,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.176:22:13,0:5,3:10,8,3,1
chr11	56467810	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,3:0,0:0|1:56467810_A_T:56467810:5,0,3,0
chr11	56467813	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,3:0,0:0|1:56467810_A_T:56467810:6,0,3,0
chr11	56467816	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=35,27;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:6,3:0,0:0|1:56467810_A_T:56467810:6,0,3,0
chr11	56467819	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:6,3:0,0:0|1:56467810_A_T:56467810:6,0,3,0
chr11	56467833	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.356:11:7,4:0,0:6,1,4,0
chr11	56468020	.	TG	CA,CG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,33,32;MFRL=0,147,161;MMQ=60,40,59;MPOS=7,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.63,26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,10:0.458,0.499:20:0,2,7:0,7,3:0,0,10,10
chr11	56468044	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=116,158;MMQ=51,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:10,4:5,4:0|1:56468044_T_G:56468044:9,6,2,6
chr11	56468047	.	AC	GT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=116,151;MMQ=51,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:9,5:5,4:0|1:56468044_T_G:56468044:9,6,3,6
chr11	56468048	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.954:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr11	56468198	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=106,142;MMQ=60,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:0|1:56468198_A_G:56468198:9,5,7,2
chr11	56468200	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=115,142;MMQ=60,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:6,3:7,6:0|1:56468198_A_G:56468198:9,6,7,2
chr11	56468202	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=130,163;MMQ=60,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,3:6,6:0|1:56468198_A_G:56468198:8,6,8,2
chr11	56468212	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=96,163;MMQ=60,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:0|1:56468198_A_G:56468198:6,8,9,3
chr11	56468416	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,12:5,5:3,4,11,6
chr11	56468448	.	AA	GT	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,16:0.405:40:11,10:11,6:0|1:56468448_AA_GT:56468448:9,15,9,7
chr11	56468452	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,16:0.405:40:13,10:10,6:0|1:56468448_AA_GT:56468448:9,15,9,7
chr11	56468493	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=21,28;MFRL=84,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.412:56:14,14:19,8:13,20,13,10
chr11	56468554	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=87,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,20:0.583:34:3,9:11,9:0|1:56468554_A_C:56468554:5,9,9,11
chr11	56468560	.	TA	CG	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=89,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,20:0.539:37:3,9:13,9:0|1:56468554_A_C:56468554:6,11,8,12
chr11	56468694	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0|1:56468694_C_T:56468694:0,5,1,4
chr11	56468699	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,4:3,1:0|1:56468694_C_T:56468694:0,5,1,4
chr11	56468704	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0|1:56468694_C_T:56468694:0,4,1,4
chr11	56468720	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:0,2,1,3
chr11	56468817	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=214,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56468817_G_T:56468817:0,1,0,1
chr11	56468819	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=214,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56468817_G_T:56468817:0,1,0,1
chr11	56468828	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=214,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56468817_G_T:56468817:0,1,0,1
chr11	56508619	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr11	56949641	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=114,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:5,2:3,0:0|1:56949641_G_C:56949641:4,4,1,1
chr11	56949646	.	T	TTTGCACAACAACTCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:0|1:56949641_G_C:56949641:6,3,1,1
chr11	57004344	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr11	57070332	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	57070348	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	57070373	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57070373_C_T:57070373:0,0,0,1
chr11	57070379	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57070373_C_T:57070373:0,0,0,1
chr11	57089449	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,0:3,2:0,6,0,3
chr11	57094250	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:26,1:25,1:21,37,2,0
chr11	57094376	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr11	57095728	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:1,1:2,0:2,4,3,0
chr11	57095740	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:6,1:5,7,2,0
chr11	57095825	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=106,44;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:24,0:15,2:0|1:57095825_C_T:57095825:19,23,0,2
chr11	57095832	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=106,44;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:24,0:14,2:0|1:57095825_C_T:57095825:18,22,0,2
chr11	57106195	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:1,7,0,2
chr11	57117385	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr11	57118166	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57118166_A_C:57118166:0,1,1,0
chr11	57118172	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=151,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:57118166_A_C:57118166:1,2,1,0
chr11	57118467	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	57135663	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr11	57137538	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	57145338	.	G	GAATCCTCAAAGCAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	57147016	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:0,1,4,4
chr11	57148053	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,10:0,0,24,5
chr11	57148175	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,10:0,26:0,0,20,16
chr11	57177391	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=37,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.448:20:7,4:4,4:5,6,5,4
chr11	57182006	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=103,181;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:57182006_G_C:57182006:3,1,1,0
chr11	57182007	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=103,181;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:57182006_G_C:57182006:3,1,1,0
chr11	57184159	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,0:1,10:2,1,3,7
chr11	57184218	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	57243588	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,12,14
chr11	57244395	.	G	GGGGAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	57254550	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=141,65;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:1,0:5,0:7,2,2,0
chr11	57256699	.	A	AAG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=97,55;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:10,2:15,0:0|1:57256699_A_AAG:57256699:15,10,1,1
chr11	57256703	.	G	GAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=97,55;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:15,0:0|1:57256699_A_AAG:57256699:14,11,1,1
chr11	57256709	.	GAT	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=92,55;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.120:27:9,2:13,1:0|1:57256699_A_AAG:57256699:11,13,2,1
chr11	57258617	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	57258813	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:20,0:8,2:0|1:57258813_G_T:57258813:11,17,1,1
chr11	57258826	.	T	TGGAAAGCAGCCAGGTCCA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:7,2:0|1:57258813_G_T:57258813:8,17,1,1
chr11	57265400	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr11	57265421	.	GCCCCAAGGTAAAACA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr11	57296298	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,0:11,4:13,13,0,4
chr11	57313659	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr11	57320044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr11	57321811	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	57365895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	57379170	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr11	57413943	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	57414387	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr11	57414511	.	GGGGCAGATAGCTGCGGAAAGTCTTGGTGGGGAGGCAGGCAGGGCCCGGACCGGGGTCACAGCT	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,9:0.141:70:19,8:16,0:29,32,8,1
chr11	57427068	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.074:60:33,0:23,4:30,26,1,3
chr11	57428485	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=132,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:12,4:22,0:17,17,1,3
chr11	57460073	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:13,3,2,1
chr11	57461473	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,14;MFRL=197,156;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr11	57463500	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr11	57464193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=55,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:2,4,2,0
chr11	57466147	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,136;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.191:40:17,0:16,7:7,26,0,7
chr11	57472185	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=146.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,15:0,31:0,0,13,34
chr11	57479731	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.563:5:1,3:1,0:0|1:57479731_CG_C:57479731:0,2,0,3
chr11	57479732	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.869:6:0,5:0,1:1|0:57479731_CG_C:57479731:0,0,0,6
chr11	57480325	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:5,1:6,9,2,1
chr11	57506806	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=120,343;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:57506806_A_ACC:57506806:1,2,0,1
chr11	57506807	.	T	TTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=120,343;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:57506806_A_ACC:57506806:1,2,0,1
chr11	57506810	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=120,343;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:57506806_A_ACC:57506806:1,2,0,1
chr11	57506818	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=120,343;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:57506806_A_ACC:57506806:1,2,0,1
chr11	57506823	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=273,343;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:57506806_A_ACC:57506806:0,2,0,1
chr11	57509429	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr11	57564551	.	G	GCTTTTTTTTTTTCCACATTCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57564551_G_GCTTTTTTTTTTTCCACATTCAC:57564551:0,1,0,1
chr11	57564552	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57564551_G_GCTTTTTTTTTTTCCACATTCAC:57564551:0,1,0,1
chr11	57571336	.	TA	T,TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,10,13;MFRL=215,153,206;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.74,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:0,0,0:0,0,0:0,2,0,4
chr11	57886155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr11	57949036	.	T	TAAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=87,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,27;RU=A;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.703:12:2,5:2,2:3,1,6,2
chr11	57957960	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:4,5,1,2
chr11	57970893	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,113;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:6,6,0,2
chr11	57970923	.	G	GCGTTAGAGAGTTTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,113;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:6,7,0,2
chr11	57971581	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.385:37:9,0:14,14:5,18,0,14
chr11	57982229	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=71,102;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr11	57983027	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,58;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:9,0:4,2:0|1:57983027_G_A:57983027:9,7,1,1
chr11	57983047	.	C	CATATTTTAATTTAGAAATACA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=133,58;MMQ=40,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:57983027_G_A:57983027:3,7,1,1
chr11	57995330	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,7,0
chr11	57995777	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.170:25:6,3:15,0:9,12,3,1
chr11	58035245	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=141,146;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:6,4:8,6,0,4
chr11	58126305	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=46,83;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:4,4:6,6:3,8,4,6
chr11	58170143	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,0,4
chr11	58170738	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=37,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,6:4,6:1,3,7,5
chr11	58170927	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	58190136	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr11	58190747	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr11	58207203	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,8:6,4:2,8,8,4
chr11	58207204	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr11	58317316	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:9,7:11,0:11,9,7,0
chr11	58345470	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,11:0.144:81:20,0:49,11:43,27,1,10
chr11	58378382	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr11	58379265	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,0:9,12:1,14,0,12
chr11	58380192	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.549:8:2,1:1,2:4,0,4,0
chr11	58381686	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,6:0,0,8,6
chr11	58391501	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=107,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:3,2:5,2:6,3,4,0
chr11	58478026	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	58478039	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr11	58480367	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:2,6:5,9:0,7,3,12
chr11	58492073	.	GTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	58605922	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	58605937	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:58605937_AC_A:58605937:0,2,0,1
chr11	58605939	.	AAGAAGTATAGGAGG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:58605937_AC_A:58605937:0,3,0,1
chr11	58710971	.	GAAACT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,1,0
chr11	58711108	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=144,60;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,0:13,0:7,11,1,1
chr11	58711113	.	A	ATCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=144,60;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:13,0:7,10,1,1
chr11	58722668	.	T	TAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,57;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,4:14,0:9,19,2,2
chr11	58723328	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,0:7,4:8,11,3,1
chr11	58893754	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:9,0:14,4:12,12,2,2
chr11	58893972	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=319,240;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58893972_TA_T:58893972:0,1,0,1
chr11	58893975	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=24,28;MFRL=319,240;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58893972_TA_T:58893972:0,1,0,1
chr11	58893976	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=319,240;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58893972_TA_T:58893972:0,1,0,1
chr11	58893982	.	AT	GG	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=23,30;MFRL=319,240;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58893972_TA_T:58893972:0,1,0,1
chr11	58893991	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,29;MFRL=0,280;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:58893972_TA_T:58893972:0,0,0,2
chr11	58893998	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=220,319;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:58893972_TA_T:58893972:1,0,0,1
chr11	58894002	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=22,24;MFRL=220,319;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:58893972_TA_T:58893972:1,0,0,1
chr11	58894010	.	TAAACAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=26,27;MFRL=202,319;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:58893972_TA_T:58893972:2,0,0,1
chr11	58894018	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=23,24;MFRL=202,319;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:58893972_TA_T:58893972:2,0,0,1
chr11	58894022	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=202,319;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:58893972_TA_T:58893972:2,0,0,1
chr11	58920310	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=110,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.635:20:3,4:4,7:2,5,5,8
chr11	58949279	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:11,6:10,0:0|1:58949279_G_T:58949279:18,9,6,0
chr11	58949281	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:12,6:15,0:0|1:58949279_G_T:58949279:18,9,6,0
chr11	58962910	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	58979085	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=78,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,1:10,2:14,11,2,1
chr11	58980549	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	59132705	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:4,2:4,3,0,2
chr11	59132882	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	59189405	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	59210550	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	59210783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:7,4,1,4
chr11	59210809	.	CCATCTGCACACACCCATGTACTTCTTCCTAAGCAACTTATCTTTCATTGA	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:5,0:8,2:14,13,1,1
chr11	59211188	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	59271637	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:2,9:2,10:2,2,10,10
chr11	59361540	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,1:14,1:13,10,1,1
chr11	59368218	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=14,29,20;MFRL=114,184,128;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.67,8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.249,0.390:13:0,2,1:1,0,1:1,4,2,6
chr11	59369401	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	59405982	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:59405982_A_C:59405982:0,1,0,1
chr11	59405988	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59405982_A_C:59405982:0,0,0,1
chr11	59419995	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:11,0:22,3:15,18,1,2
chr11	59420589	.	A	AGATGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59420589_A_AGATGG:59420589:0,0,0,1
chr11	59420592	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59420589_A_AGATGG:59420589:0,0,0,1
chr11	59423525	.	TAAAAAAA	T,TAAAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,14,19;MFRL=114,128,135;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,13,17;RU=A;STR;TLOD=6.96,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.275,0.360:12:4,0,1:0,1,1:4,0,0,8
chr11	59424944	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr11	59427010	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,0;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	59436328	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=87,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,1:0|1:59436328_G_T:59436328:13,4,1,1
chr11	59436336	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:59436328_G_T:59436328:15,5,1,1
chr11	59480951	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,11,12
chr11	59626477	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=283,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:59626477_TA_T:59626477:1,0,1,0
chr11	59626493	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=283,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59626477_TA_T:59626477:1,0,1,0
chr11	59829854	.	TCCTTTCTGAGGAAAATTAAAATGGCCTGTTTTCAGTGTCCACTTTAGTATATGACTGTTACGCCTTTTTCC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.192:15:0,2:1,1:8,4,2,1
chr11	59830103	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=65,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:2,5:5,4:3,6,5,4
chr11	59834685	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,200;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr11	59837001	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,7:6,0:7,6,7,0
chr11	59837721	.	T	TTATGAAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:3,7:3,5:3,3,3,10
chr11	59857792	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr11	59858036	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=352,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	59860178	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr11	59861027	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:10,1:5,1:0|1:59861027_C_T:59861027:6,10,2,0
chr11	59861030	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:9,1:6,1:0|1:59861027_C_T:59861027:6,9,2,0
chr11	59940396	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr11	59940400	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:59940400_C_T:59940400:0,0,4,0
chr11	59940403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:59940400_C_T:59940400:0,0,4,0
chr11	59940407	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:59940400_C_T:59940400:0,0,3,0
chr11	59942815	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=352,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	59943098	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,1:4,1:0,6,1,1
chr11	59943109	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=352,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,0:1,5:0,1,0,6
chr11	59945745	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=136,101;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:5,8:1,2:1,5,6,5
chr11	59947252	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=115,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,4:1,0:5,1,3,1
chr11	60059810	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=89,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,3:5,6:4,6,4,5
chr11	60073702	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,2,15
chr11	60105199	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,6:4,0:4,1,5,2
chr11	60107257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:60107257_C_T:60107257:0,1,1,0
chr11	60107262	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=84,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:60107257_C_T:60107257:1,1,1,0
chr11	60107290	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=160,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr11	60107470	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0,1,3,3
chr11	60152482	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr11	60157107	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr11	60157166	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	60161438	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:1,0:0,2,1,2
chr11	60163958	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	60164204	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0|1:60164204_G_A:60164204:0,0,3,8
chr11	60164211	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:2,3:4,0:0|1:60164204_G_A:60164204:2,5,0,3
chr11	60165352	.	ATT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr11	60182970	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:5,4:7,5:5,7,5,4
chr11	60200025	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=177,187;MMQ=48,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:60200025_CCA_C:60200025:0,3,0,1
chr11	60200026	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=201,152;MMQ=54,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	60200030	.	A	G,AGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,31,24;MFRL=177,152,187;MMQ=48,40,40;MPOS=11,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr11	60200032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=165,187;MMQ=44,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:60200025_CCA_C:60200025:0,2,0,1
chr11	60200035	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=165,187;MMQ=44,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:60200025_CCA_C:60200025:0,2,0,1
chr11	60200041	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,21;MFRL=165,187;MMQ=44,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:60200025_CCA_C:60200025:0,2,0,1
chr11	60201232	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:7,2,5,1
chr11	60264755	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,3,1
chr11	60264987	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:9,8,0,3
chr11	60265002	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=72,100;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,4:7,8:6,10,5,7
chr11	60265164	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=166,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	60268679	.	G	C,T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,30,20;MFRL=0,131,0;MMQ=60,60,60;MPOS=7,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=84.11,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,24,2:0.867,0.101:26:0,18,0:0,6,2:0,0,3,23
chr11	60268681	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:18,0:5,2:2,22,1,1
chr11	60271325	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:2,6,2,3
chr11	60291413	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr11	60291437	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:6,0:0|1:60291437_A_C:60291437:3,9,1,1
chr11	60291439	.	G	GCCC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:7,0:0|1:60291437_A_C:60291437:3,9,1,1
chr11	60309947	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr11	60310083	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0|1:60310083_A_T:60310083:0,0,9,10
chr11	60310087	.	C	CTTTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:60310083_A_T:60310083:8,10,1,1
chr11	60310089	.	G	GAGGGCTGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:7,0:0|1:60310083_A_T:60310083:8,10,1,1
chr11	60482938	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=239,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60482938_C_T:60482938:0,3,0,1
chr11	60482941	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=249,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60482938_C_T:60482938:0,2,0,1
chr11	60531346	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr11	60557811	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:10,0,2,0
chr11	60558038	.	G	GCTGGGGCCGGTGCAGGAAGGGAAGCTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=91,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.456:5:0,1:1,0:1,3,0,1
chr11	60558375	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr11	60561613	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	60562975	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr11	60562989	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chr11	60567230	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr11	60567275	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,13,9
chr11	60617646	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr11	60617834	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,0:0,0,1,5
chr11	60636632	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:60636632_C_CTT:60636632:5,11,1,1
chr11	60636633	.	G	GTGACCGGC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:60636632_C_CTT:60636632:5,11,1,1
chr11	60636635	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:60636632_C_CTT:60636632:5,11,1,1
chr11	60637164	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,85;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,32:0.718:44:3,18:9,14:7,5,14,18
chr11	60638470	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr11	60642325	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=186,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:3,0,7,1
chr11	60642973	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:9,2:6,2:7,8,2,2
chr11	60665795	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr11	60666116	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:2,3:1,12:0,3,5,10
chr11	60668000	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr11	60668856	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,2:6,0:5,6,1,1
chr11	60670057	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:19,0:11,4:17,13,0,4
chr11	60697905	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,4:0,3:0,1,5,2
chr11	60700950	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	60700991	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,4:2,4:4,2,7,1
chr11	60703260	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr11	60703777	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=96,143;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:13,4:13,3:7,20,1,6
chr11	60704213	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,4:0,6:0,1,7,3
chr11	60706864	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr11	60714106	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=100,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.089:32:8,2:19,0:0|1:60714106_G_A:60714106:20,10,1,1
chr11	60714135	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.142:26:5,2:17,1:1|0:60714106_G_A:60714106:13,10,2,1
chr11	60774168	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=84,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:3,6,2,1
chr11	60775007	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.839:23:3,11:0,8:2,1,15,5
chr11	60776334	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr11	60778526	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,2:15,1:25,6,3,0
chr11	60778701	.	G	GTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr11	60783107	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=160,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:60783107_C_CTG:60783107:3,1,1,0
chr11	60783108	.	C	T,CCCATCCAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,27,30;MFRL=0,140,225;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.50,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.667,0.222:6:0,3,0:0,1,1:0,0,5,1
chr11	60783126	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:60783107_C_CTG:60783107:0,0,6,2
chr11	60783135	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0|1:60783107_C_CTG:60783107:0,0,6,5
chr11	60786752	.	A	ATGACTCTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,18;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:4,1:5,0:0|1:60786752_A_ATGACTCTT:60786752:4,6,1,1
chr11	60786754	.	C	CCAGAGATCTTTTCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:5,1:5,0:0|1:60786752_A_ATGACTCTT:60786752:4,6,1,1
chr11	60869910	.	C	CCG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:60869910_C_CCG:60869910:0,0,1,0
chr11	60869912	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:60869910_C_CCG:60869910:0,0,1,0
chr11	60869916	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:60869910_C_CCG:60869910:0,0,1,0
chr11	60870150	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:60870150_CC_TG:60870150:1,3,0,1
chr11	60870154	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:60870150_CC_TG:60870150:1,3,0,1
chr11	60870157	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:60870150_CC_TG:60870150:1,1,0,1
chr11	60885975	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60885975_G_C:60885975:0,0,0,1
chr11	60885977	.	GCAC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60885975_G_C:60885975:0,0,0,1
chr11	60886519	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=132,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr11	60889368	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=92,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:60889368_T_A:60889368:8,9,1,1
chr11	60889374	.	C	CTGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:6,2:0|1:60889368_T_A:60889368:8,11,1,1
chr11	60889376	.	T	TGAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:60889368_T_A:60889368:8,11,1,1
chr11	60890563	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr11	60891310	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	60901618	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:8,7,1,2
chr11	60971833	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=175,198;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60971833_T_G:60971833:0,1,0,1
chr11	60971835	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=175,198;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60971833_T_G:60971833:0,1,0,1
chr11	61017354	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=120,62;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:12,10,1,1
chr11	61017371	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=111,62;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,1:0|1:61017371_A_T:61017371:11,10,1,1
chr11	61017372	.	C	CTTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=111,62;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:61017371_A_T:61017371:10,10,1,1
chr11	61017374	.	C	CTTCTTTCCT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=111,62;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:10,2:0|1:61017371_A_T:61017371:10,10,1,1
chr11	61058811	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:7,2:11,2:0|1:61058811_C_T:61058811:8,11,2,2
chr11	61058821	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=98,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,11:0.333:34:9,11:13,0:1|0:61058811_C_T:61058811:11,12,11,0
chr11	61067750	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0|1:61067750_G_GA:61067750:0,6,1,1
chr11	61067751	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:61067750_G_GA:61067750:0,6,1,1
chr11	61081601	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=93,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:17,5:24,0:30,12,4,1
chr11	61081990	.	A	ACCTGCCCTAATCCCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=58657667,3272008;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61081990_A_ACCTGCCCTAATCCCCT:61081990:0,1,1,0
chr11	61081993	.	C	CCCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=58657667,3272008;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61081990_A_ACCTGCCCTAATCCCCT:61081990:0,1,1,0
chr11	61081994	.	A	ACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=58657667,3272008;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61081990_A_ACCTGCCCTAATCCCCT:61081990:0,1,1,0
chr11	61083874	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:3,4,0,2
chr11	61091690	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:1,11,0,3
chr11	61100308	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	61106525	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr11	61110169	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,2:0,12:0,0,7,7
chr11	61113867	.	A	ACTACAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=174,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:8,2,1,1
chr11	61123965	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,1:0,12:0,0,11,3
chr11	61165731	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:3,5:7,8:0|1:61165731_C_CA:61165731:3,8,4,9
chr11	61165741	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:3,4:7,8:0|1:61165731_C_CA:61165731:3,7,3,9
chr11	61183675	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=96,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:13,12:11,0:12,12,12,0
chr11	61197173	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	61205434	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=127,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.722:9:2,2:0,3:2,0,7,0
chr11	61205560	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:20,0:20,3:0|1:61205560_C_T:61205560:19,22,2,1
chr11	61205566	.	T	TTATAGATGTAAGCCACCATGCCTAGCGAGTC	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:19,0:17,3:0|1:61205560_C_T:61205560:17,20,2,1
chr11	61205676	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr11	61249383	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=87,63;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:3,1:0,4:2,1,3,3
chr11	61253200	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,0:1,5:5,0,4,1
chr11	61253973	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=51,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:2,2,4,2
chr11	61254376	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr11	61254630	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:61254630_T_A:61254630:5,4,1,1
chr11	61254635	.	C	CAGATGCAGAGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:61254630_T_A:61254630:5,4,1,1
chr11	61286136	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:5,4,2,0
chr11	61348289	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	61487804	.	C	CCGTCGAGCTTCACAGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	61490486	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	61491097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr11	61504849	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	61505696	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr11	61511599	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,44;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:13,0:12,4:10,15,1,3
chr11	61511871	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:8,3,2,1
chr11	61522888	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:17,2:13,2:15,15,3,1
chr11	61536706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:3,2:0,5,1,1
chr11	61537622	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61537622_C_T:61537622:0,0,1,0
chr11	61537628	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61537622_C_T:61537622:0,0,1,0
chr11	61543499	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,14,3
chr11	61543961	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,0,7
chr11	61547068	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr11	61547237	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=354,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,6,1
chr11	61548559	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	61549025	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr11	61549245	.	C	CCCCTGGATAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:61549245_C_CCCCTGGATAA:61549245:0,5,1,1
chr11	61549247	.	C	CCTCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:61549245_C_CCCCTGGATAA:61549245:0,5,1,1
chr11	61550984	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:11,5:10,0:13,8,4,1
chr11	61550985	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:61550985_A_G:61550985:16,9,1,1
chr11	61550992	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=109,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:0|1:61550985_A_G:61550985:16,8,1,1
chr11	61551927	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	61560081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,10:0,0,3,10
chr11	61564164	.	TCC	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=146,111;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:14,3:16,2:16,14,0,5
chr11	61569830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=214,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,4,2
chr11	61570783	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,4:0,0,9,1
chr11	61578566	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0|1:61578566_C_CTT:61578566:0,0,0,1
chr11	61578567	.	A	AGGGGAAAAAAAGAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0|1:61578566_C_CTT:61578566:0,0,0,1
chr11	61580836	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:7,0:11,7,2,1
chr11	61582708	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr11	61615803	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.827:25:2,14:1,5:2,2,10,11
chr11	61624414	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr11	61624885	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,1:5,3:5,2,1,3
chr11	61625035	.	G	GCAC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:61625035_G_GCAC:61625035:3,4,1,1
chr11	61625037	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:61625035_G_GCAC:61625035:3,4,1,1
chr11	61625056	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,1:2,0:0|1:61625056_G_A:61625056:1,3,1,1
chr11	61625058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,1:2,0:0|1:61625056_G_A:61625056:1,3,1,1
chr11	61641211	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr11	61641325	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=119,26689310;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:8,1:0|1:61641325_C_T:61641325:10,7,2,0
chr11	61641338	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=60,26689310;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:61641325_C_T:61641325:9,7,2,0
chr11	61643680	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:8,10,1,1
chr11	61643866	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:5,6,2,0
chr11	61658629	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=126,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:2,2,2,5
chr11	61670037	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr11	61674118	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:5,7,1,5
chr11	61723159	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=17,13;MFRL=197,237;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.518:4:0,0:0,0:0|1:61723159_T_C:61723159:2,0,2,0
chr11	61723161	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=8,10;MFRL=197,237;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:61723159_T_C:61723159:2,0,2,0
chr11	61723166	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=19,21;MFRL=177,237;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:0,1:0|1:61723159_T_C:61723159:4,0,2,0
chr11	61723168	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,19;MFRL=187,237;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,1:0|1:61723159_T_C:61723159:3,0,2,0
chr11	61723175	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=187,237;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:61723159_T_C:61723159:3,0,2,0
chr11	61723180	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=23,18;MFRL=97,237;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0|1:61723159_T_C:61723159:2,1,2,0
chr11	61724292	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=45,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:4,7:1,9:4,1,13,3
chr11	61724514	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,0,16
chr11	61725599	.	A	ATCCTCCTCC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=TCC;STR;TLOD=104.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,11:0,0,16,9
chr11	61726871	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr11	61730036	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,13:0,26:0,0,25,25
chr11	61730471	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,229;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.181:53:16,0:28,9:20,24,0,9
chr11	61731462	.	CAAAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,0:3,2:6,3,1,1
chr11	61906374	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=91,69;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,2:7,4,4,0
chr11	61906538	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	61907631	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr11	61909015	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:18,0:11,2:0|1:61909015_G_A:61909015:12,17,1,1
chr11	61909022	.	C	CTCCCAACACAGCTATTTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:19,0:10,2:0|1:61909015_G_A:61909015:11,18,1,1
chr11	61914260	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,6,7
chr11	61960763	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr11	61960809	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,10,6
chr11	61960827	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr11	61977858	.	CTTTTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=22,13;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0|1:61977858_CTTTTTTTTT_C:61977858:0,0,1,0
chr11	61977882	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,0:0,0:0|1:61977858_CTTTTTTTTT_C:61977858:0,0,1,0
chr11	61978089	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,0:10,7:7,10,0,7
chr11	62012291	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	62063899	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr11	62064844	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	62105391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr11	62105441	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,3:1,8:0,2,5,6
chr11	62123989	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0|1:62123989_T_A:62123989:0,1,0,5
chr11	62123994	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:62123989_T_A:62123989:0,4,0,1
chr11	62158924	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr11	62159187	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	62186542	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=67,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:4,5:5,10:8,1,8,8
chr11	62186652	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:7,11,1,2
chr11	62189742	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:62189742_C_T:62189742:7,9,1,1
chr11	62189757	.	C	CCCCAAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:62189742_C_T:62189742:11,11,1,1
chr11	62201458	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,5:3,2:0,3,0,8
chr11	62284179	.	TTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr11	62286666	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:3,3,2,1
chr11	62287639	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=141,0;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:5,3:12,0:0|1:62287639_G_A:62287639:9,9,0,3
chr11	62287641	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=141,0;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:5,1:12,0:0|1:62287639_G_A:62287639:9,9,0,3
chr11	62292388	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,73;MMQ=50,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:0,2:12,0:0|1:62292388_A_G:62292388:10,4,1,1
chr11	62292391	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=125,73;MMQ=50,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:0,2:15,0:0|1:62292388_A_G:62292388:11,5,1,1
chr11	62292395	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,73;MMQ=50,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:1,2:14,0:0|1:62292388_A_G:62292388:11,5,1,1
chr11	62292882	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr11	62293905	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:62293905_G_T:62293905:8,11,1,1
chr11	62293911	.	CA	GG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:0|1:62293905_G_T:62293905:7,11,1,1
chr11	62293948	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=118,147;MMQ=52,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:5,2:12,2:5,12,2,2
chr11	62294907	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,0:13,2:9,13,2,0
chr11	62299061	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=78,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,2:9,1:0|1:62299061_G_A:62299061:10,12,2,1
chr11	62299063	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=78,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:10,2:11,1:0|1:62299061_G_A:62299061:10,13,2,1
chr11	62299069	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=78,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,2:12,1:0|1:62299061_G_A:62299061:11,13,2,1
chr11	62300364	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,8:7,5:9,5,5,8
chr11	62302722	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr11	62303367	.	CACCGA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	62339201	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:7,0:15,6:12,10,0,6
chr11	62343590	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=103,121;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:13,0:27,2:10,30,0,2
chr11	62346131	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:6,2:10,5:6,11,3,4
chr11	62356737	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:2,1:13,2:4,12,0,3
chr11	62365665	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr11	62371773	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr11	62373609	.	CTG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:8,0:19,2:15,14,2,0
chr11	62373722	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.695:24:1,0:5,14:0,7,0,17
chr11	62373730	.	G	GAAATCCACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr11	62378635	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,5,0
chr11	62380732	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr11	62381106	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,7:0,0,15,10
chr11	62383321	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:4,2:1,6,1,1
chr11	62397177	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr11	62400697	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=99,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,13:0.197:69:25,0:30,13:40,16,1,12
chr11	62401716	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr11	62401858	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.154:38:16,0:16,4:12,20,0,6
chr11	62414050	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.223:37:13,0:16,7:12,17,0,8
chr11	62415383	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,2:6,9,1,2
chr11	62416020	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:7,12,0,2
chr11	62416831	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:19,0:15,3:21,14,1,2
chr11	62458663	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:3,2,3,4
chr11	62459994	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr11	62460066	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	62470118	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:62470118_CT_C:62470118:0,1,0,1
chr11	62470122	.	TCTCA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:62470118_CT_C:62470118:0,2,0,1
chr11	62483471	.	GT	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=173,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,0:0,5,1,1
chr11	62484399	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:18,2,2,0
chr11	62488916	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,2:2,4:1,2,0,8
chr11	62488917	.	G	GGA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:3,2:0,8,1,2
chr11	62488987	.	T	TTTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	62488996	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=174,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	62489267	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr11	62502792	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:6,2,3,0
chr11	62533261	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=19,20,20;MFRL=171,162,210;MMQ=40,40,51;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.06,6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.256,0.350:12:1,1,1:1,1,1:1,4,0,7
chr11	62534050	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr11	62553832	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.147:43:16,0:20,5:18,19,0,6
chr11	62555086	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	62561829	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=104,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:23,3:30,1:25,28,4,0
chr11	62562350	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=77,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,3:3,5:4,1,7,1
chr11	62562388	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,4:7,0:11,9,2,2
chr11	62564556	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:1,1:3,2:5,1,4,0
chr11	62564623	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.126:45:24,3:13,1:6,34,0,5
chr11	62564778	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=90,68;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:15,0:21,6:21,16,0,6
chr11	62566059	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:21,0:19,5:14,28,0,5
chr11	62571204	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=139,327;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,14:4,0:9,1,14,0
chr11	62603191	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:12,0:15,4:14,13,1,3
chr11	62603606	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=209,127;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr11	62648473	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:12,3:21,0:24,10,3,0
chr11	62649266	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,114;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,0,1
chr11	62652063	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,15,16
chr11	62655843	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:7,4:1,1:6,3,4,1
chr11	62744899	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0|1:62744899_A_G:62744899:0,2,0,3
chr11	62744904	.	G	GGTAACCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:62744899_A_G:62744899:0,4,0,1
chr11	62747145	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr11	62748554	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=147,105;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:5,0:5,13:2,8,0,14
chr11	62751954	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:7,4,2,0
chr11	62761164	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:4,4,0,2
chr11	62762309	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,343;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	62847352	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:3,4,2,1
chr11	62847562	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	62848367	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr11	62848487	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=167,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,2:2,6:2,3,0,8
chr11	62848995	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr11	62886319	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr11	62886494	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:62886494_G_T:62886494:6,11,1,1
chr11	62886498	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:62886494_G_T:62886494:6,11,1,1
chr11	62886503	.	TAG	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=78,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:0|1:62886494_G_T:62886494:7,10,1,1
chr11	62886609	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,3:2,5:3,0,6,3
chr11	62886629	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=184,279;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,8:6,0:12,2,8,0
chr11	62910849	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,6:2,2:4,3,8,0
chr11	62910858	.	C	CTTAAAATATTTACT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:62910858_C_CTTAAAATATTTACT:62910858:10,4,1,1
chr11	62910860	.	A	AGCTCTTGT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:62910858_C_CTTAAAATATTTACT:62910858:10,4,1,1
chr11	62931414	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,43;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,0:6,2:13,10,1,1
chr11	62931427	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=84,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:10,2:0|1:62931427_C_A:62931427:15,10,1,1
chr11	62931428	.	A	AGGAAGGGAGGGAGGG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=86,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:62931427_C_A:62931427:14,10,1,1
chr11	62995875	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	63057925	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=110,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:7,7:6,1:3,10,5,4
chr11	63059150	.	G	GCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:63059150_G_GCTC:63059150:0,3,1,1
chr11	63059152	.	A	ATTGGTCTAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:63059150_G_GCTC:63059150:0,3,1,1
chr11	63064970	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=122,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:6,5:0,5:4,2,7,3
chr11	63067138	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,5:2,2:1,3,1,6
chr11	63069715	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	63071521	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:11,0,3,0
chr11	63072118	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:4,1:0,3:4,0,3,1
chr11	63072310	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:0,8:3,8:2,1,6,10
chr11	63138791	.	C	CCCCATTCAGAGAATTTTCTCTCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=39,30;MFRL=262,264;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0|1:63138791_C_CCCCATTCAGAGAATTTTCTCTCCTTT:63138791:0,2,0,1
chr11	63138793	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=262,264;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0|1:63138791_C_CCCCATTCAGAGAATTTTCTCTCCTTT:63138791:0,2,0,1
chr11	63141185	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=103,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:14,2:0|1:63141185_G_T:63141185:15,14,1,1
chr11	63141189	.	CCCA	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=103,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:16,2:0|1:63141185_G_T:63141185:16,17,1,1
chr11	63141200	.	CATTTACTG	C	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,0:17,2:0|1:63141185_G_T:63141185:14,17,1,1
chr11	63141211	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:8,0:17,2:0|1:63141185_G_T:63141185:11,17,1,1
chr11	63141214	.	TACGC	T	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:8,0:18,2:0|1:63141185_G_T:63141185:12,19,1,1
chr11	63141222	.	T	TTCC	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=109,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,0:14,2:0|1:63141185_G_T:63141185:7,16,1,1
chr11	63141224	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=-14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:63141185_G_T:63141185:6,14,1,1
chr11	63176298	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:4,0:11,2:0|1:63176298_T_C:63176298:10,8,1,1
chr11	63176305	.	A	ACTCATCACCATGCCTTGAAAT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:63176298_T_C:63176298:11,8,1,1
chr11	63176367	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:5,7,3,2
chr11	63177242	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:6,5:10,4:12,4,6,3
chr11	63235989	.	A	AGGAAAAACAAATGGGAAAATTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=289,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	63258416	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,9:0,0,13,11
chr11	63279125	.	G	GGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:63279125_G_GGTC:63279125:0,0,1,0
chr11	63279127	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63279125_G_GGTC:63279125:0,0,1,0
chr11	63283220	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	63313644	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,11,12
chr11	63320622	.	C	CTTTACCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.659:3:0,1:2,0:0|1:63320622_C_CTTTACCT:63320622:0,2,0,1
chr11	63320626	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63320622_C_CTTTACCT:63320622:0,0,0,1
chr11	63320627	.	C	CGTTCTCCTGTAACGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:63320622_C_CTTTACCT:63320622:0,0,0,1
chr11	63357919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	63381350	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	63381438	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.585:5:1,0:0,1:0|1:63381438_AG_CC:63381438:1,1,3,0
chr11	63381444	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:0,1:0|1:63381438_AG_CC:63381438:2,2,3,0
chr11	63381448	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:1,1:0|1:63381438_AG_CC:63381438:3,3,3,0
chr11	63381454	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:3,1:0|1:63381438_AG_CC:63381438:3,6,3,0
chr11	63398530	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,0:5,2:5,6,2,0
chr11	63413962	.	AAAAT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=121.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,18,11
chr11	63531558	.	C	CTATCCACTAATAAACCTTAATCTGCATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:2,5,1,1
chr11	63594383	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:7,7,3,1
chr11	63594517	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:7,7,2,1
chr11	63662682	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,2:8,0:4,11,0,2
chr11	63663158	.	TGAG	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.225:29:8,2:2,2:0|1:63663158_TGAG_T:63663158:0,22,7,0
chr11	63663163	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.208:28:17,0:3,1:0|1:63663158_TGAG_T:63663158:0,22,6,0
chr11	63665853	.	A	ATTTTATTACTGTTATTATTATTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	63668557	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	63669729	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,0:10,3:0|1:63669729_C_T:63669729:5,15,2,2
chr11	63669739	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,0:9,3:0|1:63669729_C_T:63669729:5,12,2,2
chr11	63670635	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=91,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr11	63673603	.	C	CTG,CTGTG	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,27,33;MFRL=0,84,63;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.58,17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,9:0.301,0.659:13:0,2,6:0,2,2:0,0,6,7
chr11	63675899	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	63679369	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr11	63679806	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=107,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.140:41:19,5:15,0:13,23,5,0
chr11	63679909	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:3,9,0,2
chr11	63680045	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	63680297	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr11	63681768	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,0:7,4:7,5,1,3
chr11	63682312	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.964:24:0,12:0,11:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,11,13
chr11	63682315	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,12:0,11:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,11,13
chr11	63682317	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=102.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,11,12
chr11	63682319	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,11,12
chr11	63682696	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=132,0;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:15,4,3,0
chr11	63683815	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=171,42;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:63683815_C_T:63683815:8,2,1,1
chr11	63683820	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=163,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:63683815_C_T:63683815:9,2,1,1
chr11	63683822	.	CTG	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=163,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:63683815_C_T:63683815:9,2,1,1
chr11	63683827	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=170,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:63683815_C_T:63683815:9,1,1,1
chr11	63683830	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=170,42;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0|1:63683815_C_T:63683815:9,1,1,1
chr11	63706474	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	63706504	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr11	63706656	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=132,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr11	63719884	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=94,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,4:14,0:11,12,4,0
chr11	63720086	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr11	63755961	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=151,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr11	63764302	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:2,4:7,3:5,4,3,4
chr11	63766298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr11	63767096	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,2:2,3,2,3
chr11	63884027	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:5,1,4,5
chr11	63885704	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=87,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,7:2,8:2,2,6,9
chr11	63885796	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr11	63886066	.	GTT	G,GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=117,104,107;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=9.68,14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,9,12:0.305,0.407:29:4,4,5:4,5,6:4,4,10,11
chr11	63886399	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr11	63962152	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:63962152_T_C:63962152:0,3,0,2
chr11	63962162	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=206,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:63962152_T_C:63962152:0,2,0,2
chr11	63964657	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr11	63964865	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=103,138;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:14,0:15,4:0|1:63964865_A_T:63964865:11,18,0,4
chr11	63964871	.	T	TTCGTTACATGGCTAGTTTATGTAATGCC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=119,138;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:10,0:13,4:0|1:63964865_A_T:63964865:9,17,0,4
chr11	63965534	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:4,0:0,0:0,4,0,4
chr11	63967324	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=186,119;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:10,1,2,0
chr11	63967770	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr11	63967805	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:63967805_C_T:63967805:1,1,0,1
chr11	63967807	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:63967805_C_T:63967805:1,1,0,1
chr11	63978067	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,2:9,2:6,6,2,2
chr11	63986713	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,5,4
chr11	63987329	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,2:19,0:0|1:63987329_G_A:63987329:12,17,1,1
chr11	63987332	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:10,2:20,0:0|1:63987329_G_A:63987329:12,18,1,1
chr11	63987339	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=85,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,9:0.370:25:9,1:7,8:1|0:63987329_G_A:63987329:5,11,6,3
chr11	63990996	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	63994696	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	63996705	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.342:4:0,0:0,0:3,0,1,0
chr11	63999240	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr11	63999331	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.557:32:6,14:8,3:7,7,10,8
chr11	64000410	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr11	64003843	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,3,6
chr11	64004557	.	AAGAGAGAGAGAGAGAG	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=87,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,11;RU=AG;STR;TLOD=84.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.739:28:0,12:0,8:4,3,10,11
chr11	64010085	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:3,3,1,5
chr11	64011385	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=106,97;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,8:0.127:69:22,0:38,8:30,31,0,8
chr11	64012784	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=112,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr11	64023752	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	64024048	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=109,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.460:13:4,3:3,2:0|1:64024048_G_C:64024048:6,1,4,2
chr11	64024056	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1|0:64024048_G_C:64024048:3,2,4,1
chr11	64026108	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:5,0:10,5:7,8,0,6
chr11	64026144	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=94,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:0,0:8,5:4,4,3,4
chr11	64026169	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=74,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:1,0:9,2:6,5,0,2
chr11	64026461	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:5,0:0|1:64026461_G_A:64026461:6,3,1,1
chr11	64026469	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:64026461_G_A:64026461:4,4,1,1
chr11	64026634	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:0|1:64026634_C_T:64026634:3,4,1,2
chr11	64026639	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:64026634_C_T:64026634:2,5,0,2
chr11	64027643	.	GGATGAGGAGGAA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:12,2:6,0:0|1:64027643_GGATGAGGAGGAA_G:64027643:15,10,1,1
chr11	64027676	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,2:19,0:0|1:64027643_GGATGAGGAGGAA_G:64027643:18,16,1,1
chr11	64030944	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr11	64032495	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.418:17:4,1:6,4:0|1:64032495_A_C:64032495:0,10,7,0
chr11	64032500	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:4,3:6,2:0|1:64032495_A_C:64032495:0,10,6,0
chr11	64032505	.	CACTGGATGCCT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,12;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.334:16:4,0:6,0:0|1:64032495_A_C:64032495:0,11,5,0
chr11	64034773	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=103,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,3:2,5:3,3,3,6
chr11	64051639	.	TG	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=156,30343706;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,0:2,0:0|1:64051639_TG_GT:64051639:5,2,0,2
chr11	64051645	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=154,30343706;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,1:2,0:0|1:64051639_TG_GT:64051639:6,2,0,2
chr11	64065133	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=111,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:64065133_C_T:64065133:8,8,1,1
chr11	64065140	.	CTTGTGCTGCACTTT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=113,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:4,0:0|1:64065133_C_T:64065133:9,9,1,1
chr11	64065160	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,0:0|1:64065133_C_T:64065133:3,6,1,1
chr11	64065162	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:64065133_C_T:64065133:3,6,1,1
chr11	64067937	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:19,0:20,2:0|1:64067937_G_A:64067937:21,18,1,1
chr11	64067943	.	AC	CT	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=95,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:12,0:18,2:0|1:64067937_G_A:64067937:21,22,1,1
chr11	64067945	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=97,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.129:44:19,0:20,5:19,20,2,3
chr11	64067948	.	CC	TT	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=95,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:17,0:22,2:0|1:64067937_G_A:64067937:19,22,1,1
chr11	64070930	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,6:2,4:4,3,7,3
chr11	64082437	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr11	64082807	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=117,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,1:3,3:0,4,0,4
chr11	64083252	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=141,167;MMQ=60,36;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,10:0.224:47:21,7:11,3:0|1:64083252_T_C:64083252:23,14,8,2
chr11	64083269	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=142,188;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,7:0.167:46:20,4:18,3:0|1:64083252_T_C:64083252:25,14,5,2
chr11	64083276	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=27,27;MFRL=142,190;MMQ=60,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,6:0.149:45:20,4:17,2:0|1:64083252_T_C:64083252:23,16,4,2
chr11	64083290	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=142,177;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:19,3:16,1:0|1:64083252_T_C:64083252:20,15,3,3
chr11	64083293	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=142,167;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.140:41:19,3:16,1:0|1:64083252_T_C:64083252:20,16,2,3
chr11	64083295	.	CGGG	C	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=142,167;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:15,4:17,1:0|1:64083252_T_C:64083252:24,16,2,3
chr11	64083300	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,23;MFRL=141,167;MMQ=60,28;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:17,1:15,1:0|1:64083252_T_C:64083252:24,11,3,3
chr11	64083318	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=11;MBQ=25,25;MFRL=131,167;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.109:44:15,2:20,2:0|1:64083252_T_C:64083252:23,17,1,3
chr11	64083320	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=134,167;MMQ=60,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.106:45:14,2:22,2:0|1:64083252_T_C:64083252:25,16,1,3
chr11	64083328	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=141,167;MMQ=60,31;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:17,2:20,2:0|1:64083252_T_C:64083252:22,20,1,3
chr11	64083331	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=28,24;MFRL=134,166;MMQ=55,31;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:17,2:20,2:0|1:64083252_T_C:64083252:18,19,1,4
chr11	64085074	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr11	64085938	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	64088435	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,16,16
chr11	64089216	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=85,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:0,2,0,11
chr11	64107735	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:7,1:4,8:6,5,4,6
chr11	64108262	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=62,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,1:1,1:0,4,1,1
chr11	64109118	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:3,2,3,3
chr11	64110805	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.464:28:9,6:6,6:3,12,2,11
chr11	64110932	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:3,0:0,5:3,0,5,0
chr11	64111928	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:5,3:3,1:2,7,1,3
chr11	64116341	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr11	64120435	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr11	64120800	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:9,2,3,1
chr11	64121657	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:5,6:1,2:1,5,3,6
chr11	64124980	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=122,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,2:9,1:9,8,0,3
chr11	64127570	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,0:1,0:0,2,5,0
chr11	64127881	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr11	64127902	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:1,5:3,6:1,3,8,3
chr11	64135541	.	GTC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:2,4,4,0
chr11	64136304	.	AAGGGGCAGGCGGCGGGGCTTGGGGGCACTATGGGCGGGATCT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=95,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.459:9:4,0:1,3:3,3,2,1
chr11	64137370	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr11	64137875	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=168,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,3:8,1:2,10,0,4
chr11	64138001	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=105,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	64138905	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr11	64323599	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:5,2:0|1:64323599_C_T:64323599:10,5,1,1
chr11	64323609	.	C	CTGGAGTACAGTGGAGCGAGCAGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:64323599_C_T:64323599:11,8,1,1
chr11	64337211	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:10,7,1,1
chr11	64360247	.	TCAGTGG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,33;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:3,5,1,1
chr11	64360274	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr11	64361094	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:5,8,1,1
chr11	64365943	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr11	64367050	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,65083343;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64367050_A_G:64367050:0,0,1,0
chr11	64367056	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,65083343;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:64367050_A_G:64367050:0,0,1,0
chr11	64387932	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64418160	.	G	GTTGTCATTAACT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=185,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr11	64418171	.	TGAG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,16;MFRL=217,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:64418171_TGAG_T:64418171:0,2,0,1
chr11	64418183	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=217,120;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64418171_TGAG_T:64418171:0,2,0,1
chr11	64418900	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr11	64421249	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=19,13;MFRL=93,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.465:7:0,0:2,1:1,3,0,3
chr11	64421291	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64421291_GG_AA:64421291:0,4,0,1
chr11	64421296	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64421291_GG_AA:64421291:0,4,0,1
chr11	64421298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64421291_GG_AA:64421291:0,4,0,1
chr11	64421302	.	C	CAATGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64421291_GG_AA:64421291:0,4,0,1
chr11	64428125	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=326,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:64428125_C_A:64428125:1,0,0,1
chr11	64428127	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=326,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64428125_C_A:64428125:1,0,0,1
chr11	64428132	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=326,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64428125_C_A:64428125:1,0,0,1
chr11	64497161	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr11	64497189	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=39,30;MFRL=106,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.863:20:2,7:0,10:2,0,12,6
chr11	64503179	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,3:0,2:0,0,0,7
chr11	64503496	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	64503543	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64507315	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr11	64507680	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,1:0,11:0,0,4,8
chr11	64507799	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.787:2:0,0:0,2:0|1:64507799_G_C:64507799:0,0,1,1
chr11	64507806	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,17;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:1,0:3,1,2,0
chr11	64507816	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.399:8:2,0:1,0:1|0:64507799_G_C:64507799:4,1,3,0
chr11	64520942	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	64521280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=142,277;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,0:1,0:0|1:64521280_G_A:64521280:1,2,1,0
chr11	64521286	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,11;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.403:5:2,0:1,0:0|1:64521280_G_A:64521280:1,2,2,0
chr11	64521292	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=91,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.241:6:3,0:1,0:0|1:64521280_G_A:64521280:1,4,1,0
chr11	64522066	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	64522672	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=145,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr11	64525216	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr11	64525464	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,0,4
chr11	64525644	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	64534327	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.391:8:0,0:5,2:0|1:64534327_A_C:64534327:0,5,3,0
chr11	64534333	.	AT	CC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:4,0:0|1:64534327_A_C:64534327:0,6,2,0
chr11	64534338	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:6,0:0|1:64534327_A_C:64534327:0,6,2,0
chr11	64534342	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,1:0|1:64534327_A_C:64534327:1,7,2,0
chr11	64534348	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,1:0|1:64534327_A_C:64534327:1,9,2,0
chr11	64535357	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	64535849	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr11	64536866	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,8,6
chr11	64559798	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0|1:64559798_A_C:64559798:0,7,4,0
chr11	64559800	.	CAGG	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:2,2:4,2:0|1:64559798_A_C:64559798:0,10,4,0
chr11	64563934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr11	64566771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr11	64567047	.	GCA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CA;STR;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:1,8:0,8:1,0,7,9
chr11	64568725	.	G	GTAATCATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	64572467	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:64572467_C_T:64572467:3,0,0,2
chr11	64572469	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:64572467_C_T:64572467:3,0,0,2
chr11	64572478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:2,2,1,0
chr11	64572557	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr11	64572602	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,12,11
chr11	64573253	.	AGTGGGGTCTCTGTAGGGTCTGAAGGGGTCTCACCATCGGGGGTAGCCCCAGGGACCTGGCGGGGGATGGAGCCCCCAGGGGCTGGGGGAGTAG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=123,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.151:36:9,8:7,1:7,17,5,7
chr11	64594346	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	64594490	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr11	64597574	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	64598944	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr11	64601933	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr11	64602529	.	TGTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=72,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr11	64602757	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr11	64604177	.	C	CCGGGG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=172,96;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,1:0,1:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:3,0,2,0
chr11	64604178	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:0,0,6,0
chr11	64604183	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.436:5:2,2:1,0:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:3,0,2,0
chr11	64604195	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=15,31;MFRL=172,191;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:0,1:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:3,0,1,0
chr11	64604199	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=12,31;MFRL=172,191;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:3,0,1,0
chr11	64604214	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,16;MFRL=159,191;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:64604177_C_CCGGGG:64604177:2,2,1,0
chr11	64604418	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:6,0:13,5:11,8,5,0
chr11	64605689	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,6:0,0:0,0,0,7
chr11	64606279	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:0|1:64606279_G_A:64606279:5,7,1,1
chr11	64606284	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,1:2,0:0|1:64606279_G_A:64606279:6,5,1,1
chr11	64606765	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	64607042	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=121,143;MMQ=60,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,0:4,2:0|1:64607042_C_T:64607042:4,9,0,2
chr11	64607047	.	G	GGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=121,143;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:4,2:0|1:64607042_C_T:64607042:4,11,0,2
chr11	64622419	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64622789	.	CG	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:5,0:6,7,1,1
chr11	64627812	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:2,9:2,7:1,3,2,14
chr11	64658836	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=64,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:14,1:3,1:8,11,0,2
chr11	64669417	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	64670194	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=30,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:2,2,0,1
chr11	64673948	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=142,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,0:10,2:0|1:64673948_G_A:64673948:10,13,1,1
chr11	64673956	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:12,0:10,2:0|1:64673948_G_A:64673948:11,13,1,1
chr11	64674676	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:2,0,5,3
chr11	64676634	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=135,26591038;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:1,0:5,2:2,5,2,0
chr11	64676668	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=196,315;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:1,6,2,1
chr11	64681349	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,0:10,3:9,9,3,1
chr11	64695961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:1,1:0|1:64695961_G_A:64695961:1,3,0,1
chr11	64695963	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:64695961_G_A:64695961:1,3,0,1
chr11	64695965	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:64695961_G_A:64695961:1,3,0,1
chr11	64700530	.	GGAATGCTGTA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=101,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64700530_GGAATGCTGTA_G:64700530:1,0,0,1
chr11	64700542	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=101,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64700530_GGAATGCTGTA_G:64700530:1,0,0,1
chr11	64700546	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=101,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:0,0:1,1:0|1:64700530_GGAATGCTGTA_G:64700530:1,0,0,1
chr11	64700767	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.618:7:3,2:0,2:1,2,2,2
chr11	64702200	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr11	64702765	.	C	CTCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr11	64707978	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,2:2,4:2,1,4,2
chr11	64715248	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=102,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:28,0:25,3:35,18,3,0
chr11	64717801	.	C	CAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=166,95;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=A;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.567:10:0,2:4,1:4,0,3,3
chr11	64717826	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=104,129;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.118:39:16,0:13,0:0|1:64717826_C_A:64717826:11,24,4,0
chr11	64717834	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=98,104;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.075:49:22,0:18,0:0|1:64717826_C_A:64717826:12,34,3,0
chr11	64722365	.	G	GGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr11	64756526	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,4:5,2:9,1,5,1
chr11	64781848	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0,4,0,4
chr11	64794918	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=211,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,3:1,7:4,0,10,0
chr11	64799789	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:2,10:0,2:0,2,11,2
chr11	64799894	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:0,3:5,6:4,1,6,3
chr11	64799998	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=77,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.627:22:5,5:3,9:4,4,9,5
chr11	64802267	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	64807294	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.556:23:5,1:5,11:0,10,4,9
chr11	64814878	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:14,0:7,3:16,5,3,0
chr11	64820654	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.776:16:2,7:1,4:2,1,9,4
chr11	64824987	.	C	CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	64825562	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:6,6,2,1
chr11	64851305	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr11	64851453	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=82.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,20:0,0,14,18
chr11	64854269	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:6,1:12,2:0|1:64854269_G_A:64854269:3,15,1,2
chr11	64854271	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:64854269_G_A:64854269:5,16,1,1
chr11	64854274	.	GG	AC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:64854269_G_A:64854269:5,14,1,1
chr11	64854279	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:64854269_G_A:64854269:4,12,1,1
chr11	64881116	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.468:10:2,1:1,1:1,4,0,5
chr11	64883626	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=215,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr11	64883864	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	64895873	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,193;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:12,6:1,0:8,5,6,0
chr11	64897453	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr11	64897844	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:16,3:19,0:15,21,1,2
chr11	64898200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr11	64898357	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	64950843	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,0:0,5:0,1,5,0
chr11	64953611	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr11	64955369	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.348:25:8,2:5,2:12,4,3,6
chr11	64972354	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:1,5,0,5
chr11	64973960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,78;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr11	64977424	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.348:15:6,2:2,2:2,8,2,3
chr11	64977937	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:1,5:2,0:1,3,2,4
chr11	65003812	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	65004301	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,7,10
chr11	65055357	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:65055357_G_T:65055357:0,3,1,1
chr11	65055362	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:65055357_G_T:65055357:0,2,1,1
chr11	65108939	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,2:15,3:18,12,3,2
chr11	65113063	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=89,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr11	65143967	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:4,2:9,1:11,4,1,2
chr11	65144075	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr11	65147114	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=79,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr11	65147294	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr11	65147618	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:2,6:7,3:6,3,4,6
chr11	65161129	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr11	65161738	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=111,76;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:6,3:14,0:11,9,2,1
chr11	65178620	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	65212083	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr11	65293532	.	G	GGTTGCA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.262:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr11	65294427	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:14,0:22,1:0|1:65294427_C_T:65294427:16,20,1,1
chr11	65294439	.	A	ATGACTTGCCTATTAC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:19,2:0|1:65294427_C_T:65294427:16,20,1,1
chr11	65294441	.	A	AC	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=126,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:13,0:16,2:0|1:65294427_C_T:65294427:15,20,1,1
chr11	65300232	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:7,3:22,0:12,17,3,0
chr11	65304443	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,0:4,3:0|1:65304443_C_T:65304443:7,8,2,1
chr11	65304466	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,0:5,1:0|1:65304443_C_T:65304443:4,5,2,1
chr11	65304470	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:1,0:4,2:0|1:65304443_C_T:65304443:3,6,2,1
chr11	65315502	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.204:27:16,0:6,5:9,13,2,3
chr11	65320780	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,6,8
chr11	65340366	.	CCCGCAGCCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65340366_CCCGCAGCCGG_C:65340366:0,0,0,1
chr11	65340384	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65340366_CCCGCAGCCGG_C:65340366:0,0,0,1
chr11	65346659	.	G	GAAAGGTGAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr11	65348466	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=152,137;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:5,7:3,0:9,1,8,0
chr11	65348900	.	TCACCCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=181,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:3,0,0,1
chr11	65349063	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.916:22:0,9:1,9:0,1,9,12
chr11	65352045	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=95,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,0:14,4:14,18,1,3
chr11	65352491	.	T	TTCCTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:65352491_T_TTCCTTC:65352491:1,3,1,1
chr11	65352492	.	A	AGGAGCTCTTTTAGGGTAGGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:65352491_T_TTCCTTC:65352491:1,3,1,1
chr11	65357697	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr11	65359366	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:9,0:0|1:65359366_C_T:65359366:5,14,1,1
chr11	65359373	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:7,0:0|1:65359366_C_T:65359366:5,13,1,1
chr11	65359376	.	GAC	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:6,0:0|1:65359366_C_T:65359366:5,13,1,1
chr11	65359379	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=175,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:65359366_C_T:65359366:5,10,1,1
chr11	65359625	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	65365868	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:19,2:17,0:23,14,2,0
chr11	65373621	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	65380461	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,0:2,0:2,3,2,0
chr11	65380472	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:6,0:4,4,2,0
chr11	65381245	.	G	GAGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65381245_G_GAGT:65381245:0,0,0,1
chr11	65381249	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65381245_G_GAGT:65381245:0,0,0,1
chr11	65389631	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=259,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr11	65391317	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	65394498	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=138,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:7,0:11,2:0|1:65394498_A_T:65394498:9,13,0,2
chr11	65394502	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=138,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:9,0:14,2:0|1:65394498_A_T:65394498:10,15,0,2
chr11	65394504	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=138,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:14,2:0|1:65394498_A_T:65394498:9,15,0,2
chr11	65397218	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:0,11,0,3
chr11	65415028	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65423082	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	65425928	.	CG	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:16,0:17,2:0|1:65425928_CG_C:65425928:14,20,1,1
chr11	65425930	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:15,0:18,2:0|1:65425928_CG_C:65425928:14,20,1,1
chr11	65427568	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=119.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,23:0,18:0,0,20,21
chr11	65480596	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,1,7
chr11	65480791	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,14:0,0,16,6
chr11	65480978	.	C	CTTT	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:10,10,1,1
chr11	65480981	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:10,10,1,1
chr11	65480983	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:9,10,1,1
chr11	65480984	.	GCAA	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=178,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:10,12,1,1
chr11	65480992	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:12,10,1,1
chr11	65480995	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:12,10,1,1
chr11	65481000	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=166,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:11,8,1,1
chr11	65481002	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=166,37;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:65480978_C_CTTT:65480978:11,8,1,1
chr11	65481166	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,15:0,0,17,15
chr11	65482152	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,2:13,1:16,9,3,0
chr11	65482157	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:12,2:19,7,1,1
chr11	65482178	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:21,0:9,2:0|1:65482178_G_T:65482178:19,14,1,1
chr11	65482179	.	T	TTCAG	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,0:9,2:0|1:65482178_G_T:65482178:20,15,1,1
chr11	65482181	.	CGG	C	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:22,0:12,1:0|1:65482178_G_T:65482178:20,16,1,1
chr11	65546478	.	C	CAGGGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:65546478_C_CAGGGA:65546478:10,9,0,2
chr11	65546479	.	T	TGAAGCTCTTTGC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:65546478_C_CAGGGA:65546478:10,9,0,2
chr11	65561468	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,19,9
chr11	65562257	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr11	65562784	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=238,64;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,2,0
chr11	65562852	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	65562893	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	65601644	.	GGTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.965:20:0,7:0,10:0,0,11,9
chr11	65617324	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr11	65623347	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr11	65625705	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=12,19;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.350:10:2,1:0,0:0,7,0,3
chr11	65628334	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,9:0,0,10,5
chr11	65628655	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr11	65629932	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0|1:65629932_T_C:65629932:0,0,12,10
chr11	65629934	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0|1:65629932_T_C:65629932:0,0,12,10
chr11	65630101	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr11	65630695	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:2,1:2,9,2,2
chr11	65630698	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,2:0,0,1,8
chr11	65630723	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:65630723_G_GT:65630723:1,3,0,1
chr11	65630724	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:65630723_G_GT:65630723:1,3,0,1
chr11	65630727	.	A	AACTGGGCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:65630723_G_GT:65630723:1,3,0,1
chr11	65631247	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,21:0.283:76:30,21:23,0:24,31,21,0
chr11	65631879	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:65631879_C_A:65631879:0,0,3,1
chr11	65631881	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:65631879_C_A:65631879:0,0,3,1
chr11	65635559	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	65636053	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0,0,8,14
chr11	65637273	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr11	65637984	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,19:0,5:0,0,13,13
chr11	65639374	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	65647260	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	65647796	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31,30;MFRL=119,130,0;MMQ=60,46,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.77,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,5:0.140,0.180:28:8,2,0:7,2,5:8,11,6,3
chr11	65651126	.	A	AGGTGTGGTGGTTCACGCCTATAATCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	65651830	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr11	65655259	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	65684855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,7,2
chr11	65684929	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,13,12
chr11	65684956	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=121,216;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:10,3:11,13,3,0
chr11	65687134	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:65687134_ATG_A:65687134:1,0,0,1
chr11	65687138	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65687134_ATG_A:65687134:1,0,0,1
chr11	65687144	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65687134_ATG_A:65687134:1,0,0,1
chr11	65687193	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr11	65687888	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.126:36:18,4:14,0:0|1:65687888_G_A:65687888:15,17,2,2
chr11	65687890	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.126:36:17,2:14,0:0|1:65687888_G_A:65687888:15,17,2,2
chr11	65688101	.	A	ATTCCTCT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:28,0:22,1:18,33,1,1
chr11	65688188	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=179,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:2,5,0,2
chr11	65688959	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:0,13,1,2
chr11	65688996	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=161,287;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr11	65732090	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,1136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:7,6,0,2
chr11	65732800	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:3,7:4,3:3,4,4,6
chr11	65733289	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=109,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,7:3,4:2,2,7,4
chr11	65734995	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,81;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:3,11,1,3
chr11	65744275	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr11	65744421	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr11	65744469	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,0:7,4:13,6,2,2
chr11	65766915	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,2:14,0:0|1:65766915_C_T:65766915:11,9,1,1
chr11	65766932	.	CAGCTG	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:12,0:0|1:65766915_C_T:65766915:10,7,1,1
chr11	65766939	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,2:10,0:0|1:65766915_C_T:65766915:9,6,1,1
chr11	65767153	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,5,20
chr11	65767215	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	65770658	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,13:0,4:0,0,15,2
chr11	65771050	.	TCACTGAG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACTGAG;STR;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,3:3,7:5,1,8,2
chr11	65780702	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr11	65787627	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.707:22:3,6:3,9:1,5,7,9
chr11	65788072	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,18:0,6:0,0,8,16
chr11	65788375	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=136,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.095:38:17,3:15,0:0|1:65788375_G_A:65788375:21,14,2,1
chr11	65788384	.	C	CAAATGGTATTTCTAATTCT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,3:13,0:0|1:65788375_G_A:65788375:18,8,2,1
chr11	65788388	.	T	TCC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=136,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:13,3:10,0:0|1:65788375_G_A:65788375:19,6,2,1
chr11	65793055	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:11,1:11,2:10,12,2,1
chr11	65810209	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	65811208	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	65824222	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,1,0
chr11	65824700	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,0:15,3:22,8,1,2
chr11	65829424	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:10,11,0,3
chr11	65838058	.	CGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=198,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,0,1
chr11	65983522	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr11	66006345	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:5,10,0,3
chr11	66010633	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr11	66010667	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:10,8,1,2
chr11	66029130	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	66031450	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr11	66032712	.	T	TGGGGC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=37,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGGC;STR;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:3,1:1,2:3,1,4,0
chr11	66032728	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,0:4,0,0,2
chr11	66033871	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:5,3:5,2,3,4
chr11	66043253	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,7:0,0,4,5
chr11	66043465	.	GCTCTCCCCTCCTCTT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=115,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTCCCCTCCTCTT;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:4,1:7,1:12,7,2,0
chr11	66046097	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	66050948	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,14,2
chr11	66055025	.	CGA	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.354:15:6,1:4,2:0|1:66055025_CGA_C:66055025:0,10,5,0
chr11	66055032	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:6,3:3,2:0|1:66055025_CGA_C:66055025:1,11,5,0
chr11	66055037	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=23,22;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:7,1:4,1:0|1:66055025_CGA_C:66055025:1,11,5,0
chr11	66055040	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,2:4,1:0|1:66055025_CGA_C:66055025:1,11,4,0
chr11	66055041	.	CGTT	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=117,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,1:4,1:0|1:66055025_CGA_C:66055025:2,11,3,0
chr11	66055050	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=113,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,0:0|1:66055025_CGA_C:66055025:2,10,2,0
chr11	66063126	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	66099973	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,0:9,6:4,8,0,6
chr11	66099987	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=97,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,4:4,4:2,3,4,4
chr11	66100695	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr11	66101974	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,2:1,8:0,1,5,6
chr11	66102088	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr11	66102784	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=243,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr11	66103046	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr11	66105194	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,6:2,2:3,0,7,2
chr11	66105817	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,4:3,1:0,5,4,2
chr11	66107499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=146,301;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:66107499_C_T:66107499:3,0,1,0
chr11	66107506	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=146,301;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:66107499_C_T:66107499:3,0,1,0
chr11	66107527	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr11	66108660	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,5:3,7:3,1,6,6
chr11	66108894	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:5,3,3,2
chr11	66109527	.	C	CTGTG,CTGTGTG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34,30;MFRL=143,0,0;MMQ=60,60,60;MPOS=3,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,12;RU=TG;STR;TLOD=7.88,7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.327,0.322:13:4,2,2:2,1,0:6,1,3,3
chr11	66131906	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr11	66133311	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	66133336	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr11	66135179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=237,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,1:2,3:0,3,4,1
chr11	66138894	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr11	66191642	.	GCCCCATCAGCCAGGAGGCTGTGCCTTCCTCTTCAGCCTCCATGAGCCCTTCCAGACCCATTTGCCCA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=107,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:5,1:7,7,2,0
chr11	66191912	.	CACCTTCCCAGAGCCTCTGGGCAGCCCTGCCCATGAACAGCTGACTCCTCCCAGCACAGCATTCCAAGCACACCTGGACAGCCCCAGCCAA	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=107,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.180:27:8,1:1,3:11,12,3,1
chr11	66238701	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,2:18,1:18,11,2,1
chr11	66252770	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr11	66254873	.	C	CAGCAACAGAGACCCTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:66254873_C_CAGCAACAGAGACCCTGT:66254873:0,3,0,1
chr11	66254876	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:66254873_C_CAGCAACAGAGACCCTGT:66254873:0,3,0,1
chr11	66254878	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:66254873_C_CAGCAACAGAGACCCTGT:66254873:0,3,0,1
chr11	66258916	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:3,4,6,5
chr11	66259112	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=134,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,0:6,0:0|1:66259112_A_C:66259112:0,9,2,0
chr11	66259116	.	CACCTG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=147,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0|1:66259112_A_C:66259112:0,9,2,0
chr11	66259340	.	T	TCCCCAGAGTGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66259340_T_TCCCCAGAGTGTG:66259340:0,0,0,1
chr11	66259342	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66259340_T_TCCCCAGAGTGTG:66259340:0,0,0,1
chr11	66262606	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,9:2,3:3,0,8,4
chr11	66262806	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr11	66263287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=203,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66263287_C_T:66263287:0,1,0,1
chr11	66263307	.	C	CTGACCTGGAAAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66263287_C_T:66263287:0,1,0,1
chr11	66264764	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:10,4,1,1
chr11	66276575	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:8,4:13,0:11,10,2,2
chr11	66278059	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	66278262	.	TCG	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:13,0:0|1:66278262_TCG_T:66278262:3,22,1,1
chr11	66278270	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=157,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:9,0:0|1:66278262_TCG_T:66278262:1,22,1,1
chr11	66297247	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=208,0;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.438:5:0,0:2,0:0|1:66297247_A_C:66297247:2,1,2,0
chr11	66297254	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=213,0;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:0,1:2,0:0|1:66297247_A_C:66297247:3,1,2,0
chr11	66297260	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=208,0;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:0,0:4,0:0|1:66297247_A_C:66297247:4,1,2,0
chr11	66298484	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=82,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:16,0:17,5:13,22,0,5
chr11	66299515	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,0:3,3:3,5,1,2
chr11	66318972	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:3,1,2,1
chr11	66319048	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=78,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:10,4:11,0:12,11,4,0
chr11	66321927	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=99,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.594:9:0,2:2,2:2,2,3,2
chr11	66325297	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=109,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.157:30:17,4:8,0:15,11,4,0
chr11	66325694	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66325694_TG_AA:66325694:0,1,0,1
chr11	66325697	.	TGT	GAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:66325694_TG_AA:66325694:0,1,0,1
chr11	66325705	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66325694_TG_AA:66325694:0,1,0,1
chr11	66325709	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66325694_TG_AA:66325694:0,1,0,1
chr11	66328877	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:3,4,2,4
chr11	66335602	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0|1:66335602_C_A:66335602:0,5,1,2
chr11	66335611	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0|1:66335602_C_A:66335602:0,5,1,2
chr11	66335614	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,21;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,0:0|1:66335602_C_A:66335602:0,5,1,2
chr11	66335617	.	TG	GC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=171,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:66335602_C_A:66335602:0,5,0,2
chr11	66393101	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:3,5,0,2
chr11	66436584	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:5,8,2,0
chr11	66456371	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr11	66456379	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=101,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.543:3:0,0:1,2:0|1:66456379_A_T:66456379:0,1,1,1
chr11	66456387	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=101,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.543:3:0,0:0,2:0|1:66456379_A_T:66456379:0,1,1,1
chr11	66458696	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:2,2:4,0,2,1
chr11	66469032	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=46,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.687:30:3,6:6,13:3,6,10,11
chr11	66472015	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:66472015_C_G:66472015:0,0,1,0
chr11	66472022	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=104,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66472015_C_G:66472015:0,1,1,0
chr11	66481264	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	66483265	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr11	66512290	.	G	GGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GGC;STR;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,3:0,3:2,0,8,0
chr11	66568482	.	AGCTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCTTT;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:4,0:5,4,1,1
chr11	66583694	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=242,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:2,2,0,2
chr11	66612642	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,18:0.292:63:16,18:29,0:25,20,18,0
chr11	66612659	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,18:0.273:67:18,17:30,0:28,21,18,0
chr11	66616818	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,5:8,0:8,11,2,3
chr11	66617096	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:66617096_C_T:66617096:13,4,1,1
chr11	66617115	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=106,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:18,2:11,0:0|1:66617096_C_T:66617096:16,13,1,1
chr11	66618403	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,0:6,4:3,4,2,2
chr11	66618711	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:1,5,1,1
chr11	66639309	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=219,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr11	66833327	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:2,3:5,3:4,4,4,2
chr11	66833350	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:1,0:9,0:0|1:66833350_G_C:66833350:3,9,2,0
chr11	66833354	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:1,0:9,0:0|1:66833350_G_C:66833350:1,10,2,0
chr11	66837965	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr11	66995603	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,18:0,12:0,0,12,18
chr11	67018287	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:19,2:12,0:10,21,0,2
chr11	67047319	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:17,1:21,2:17,21,1,2
chr11	67049077	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:2,10,0,3
chr11	67049840	.	A	AGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,16;RU=G;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.166:19:9,0:7,1:0|1:67049840_A_AGGGGGGGGGGGGGGG:67049840:3,13,3,0
chr11	67049842	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.169:19:7,0:6,1:0|1:67049840_A_AGGGGGGGGGGGGGGG:67049840:3,13,3,0
chr11	67052288	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.553:34:7,6:8,12:7,8,13,6
chr11	67052466	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr11	67069720	.	GAGCAGGAGGAGCGGGAGCGGCGCGGGC	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.115:43:17,4:10,0:22,17,2,2
chr11	67076810	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	67079246	.	AGCAGGGGCAGGG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GCAGGG;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,1:5,1:17,8,2,0
chr11	67141148	.	ATT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	67160933	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=73,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:1,3:4,4:3,2,7,0
chr11	67174202	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=192,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:67174202_G_A:67174202:2,9,1,1
chr11	67174209	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:0|1:67174202_G_A:67174202:2,7,1,1
chr11	67177321	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,871;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	67196536	.	A	AGC	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=83,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,2:12,0:0|1:67196536_A_AGC:67196536:20,4,1,1
chr11	67196539	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=30,18;MFRL=81,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,1:12,0:0|1:67196536_A_AGC:67196536:22,7,1,1
chr11	67196540	.	GGA	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=84,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:13,2:12,0:23,10,1,1
chr11	67196544	.	C	CACACG	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=88,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,2:13,0:0|1:67196536_A_AGC:67196536:23,11,1,1
chr11	67196546	.	GGGGA	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=91,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:14,1:16,0:0|1:67196536_A_AGC:67196536:25,13,1,1
chr11	67196635	.	T	TTA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=132,112;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:20,0:10,3:16,14,0,3
chr11	67202156	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:5,4:6,1:5,6,3,2
chr11	67203803	.	C	CACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=168,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	67205978	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=81,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:5,2:14,2:11,8,2,2
chr11	67207197	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,2:0,1:2,2,3,0
chr11	67208619	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:8,4,1,1
chr11	67232614	.	G	GACACA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=56,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:1,0:0|1:67232614_G_GACACA:67232614:2,3,1,1
chr11	67232615	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=56,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,1:2,0:0|1:67232614_G_GACACA:67232614:2,3,1,1
chr11	67232616	.	G	GAC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,29;MFRL=56,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,1:1,0:0|1:67232614_G_GACACA:67232614:2,3,1,1
chr11	67232633	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr11	67232682	.	G	GGTTAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	67234994	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:17,4:22,0:24,16,4,0
chr11	67256941	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0,11,0,2
chr11	67257556	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:5,1:10,2:9,6,3,1
chr11	67257823	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr11	67258391	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr11	67262282	.	C	CGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:67262282_C_CGA:67262282:0,0,4,0
chr11	67262289	.	G	GCGAGTGGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:67262282_C_CGA:67262282:0,0,5,0
chr11	67263138	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:67263138_G_A:67263138:0,4,0,1
chr11	67263145	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:67263138_G_A:67263138:0,4,0,1
chr11	67264729	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:7,2:7,1:7,7,2,2
chr11	67265675	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:5,9,2,1
chr11	67287326	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:0|1:67287326_CG_C:67287326:4,11,0,2
chr11	67287327	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.171:15:6,0:7,2:1|0:67287326_CG_C:67287326:3,10,1,1
chr11	67290083	.	C	CACAGTTAGGGAGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:2,9,1,1
chr11	67351529	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=65.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0|1:67351529_A_AG:67351529:0,0,15,2
chr11	67351540	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,9:0,6:0|1:67351529_A_AG:67351529:0,0,16,3
chr11	67351585	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=258,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:1,16:0,21:0,1,15,22
chr11	67378610	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:18,2:0|1:67378610_T_A:67378610:16,11,0,2
chr11	67378613	.	ACC	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:4,0:17,2:0|1:67378610_T_A:67378610:16,11,0,2
chr11	67378616	.	ACCCTT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:3,0:17,2:0|1:67378610_T_A:67378610:12,12,0,2
chr11	67378712	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=49,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:67378712_TGC_T:67378712:3,1,0,1
chr11	67378717	.	A	ACTTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=49,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:67378712_TGC_T:67378712:3,1,0,1
chr11	67378721	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=49,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:67378712_TGC_T:67378712:3,1,0,1
chr11	67399735	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,12,5
chr11	67399970	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr11	67400612	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,2:0,1:0|1:67400612_G_A:67400612:0,2,0,3
chr11	67400614	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,2:1,0:0|1:67400612_G_A:67400612:0,2,0,3
chr11	67412203	.	CCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CA;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.459:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr11	67412495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr11	67414246	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,29:0.716:40:5,16:6,13:8,3,17,12
chr11	67414437	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr11	67414522	.	TGGGGTGCAGAACCTG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=208,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	67430698	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr11	67430762	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,35:0.858:40:4,22:1,13:3,2,21,14
chr11	67430806	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:21,0:13,6:18,16,0,6
chr11	67430829	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:9,10,0,3
chr11	67431110	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr11	67433708	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,3,2
chr11	67434416	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,7:1,7:0,2,3,11
chr11	67434442	.	C	CCTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:2,2:4,0:0|1:67434442_C_CCTT:67434442:0,6,1,1
chr11	67434444	.	T	TATTTAAAATATCAAC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:67434442_C_CCTT:67434442:0,6,1,1
chr11	67765163	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr11	67765998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr11	67786064	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr11	67786398	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr11	67787140	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:2,0,10,0
chr11	67789293	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=70.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,7,14
chr11	67790006	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr11	67790278	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr11	67795378	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	67799926	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr11	67800494	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,13,8
chr11	67804074	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,5:7,6:4,11,3,8
chr11	67804156	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	67810341	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:2,1:2,5,1,1
chr11	67811262	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.347:20:8,0:5,5:8,5,5,2
chr11	67812419	.	ACCCAGATGGAGGAGGGAGTGAGTGCCGTGGCTCACCGCATCCCCTGCCGGGACATGCCC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=121,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:1,0:4,0:7,6,1,1
chr11	67829386	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=98,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.189:20:4,2:10,1:13,4,3,0
chr11	67834052	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	67837771	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=114,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr11	67842369	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr11	67934746	.	G	GAATAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	67938516	.	TTTCTCCAAAGAACCCATCTCCATAATAACAAGAAATTTC	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.072:41:15,2:9,0:23,16,1,1
chr11	67941390	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,3:1,2:0,1,1,5
chr11	67941430	.	T	TTAGGGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=196,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	67957518	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,14:0,20:0,0,14,21
chr11	68029495	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,2:7,8,2,1
chr11	68131167	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,7,6
chr11	68133035	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,105;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:5,1,7,0
chr11	68153712	.	GCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=232,1532929;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr11	68154188	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,4:0,0:0,3,0,4
chr11	68177318	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,1:2,2:3,2,3,0
chr11	68177708	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	68190906	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=92,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,1:7,1:9,10,2,0
chr11	68192518	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr11	68216402	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=23,15;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,1:4,0:0|1:68216402_A_C:68216402:6,8,3,0
chr11	68216407	.	TA	GC	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=23,8;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,0:4,0:0|1:68216402_A_C:68216402:4,8,3,0
chr11	68216412	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=21,12;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,0:4,0:0|1:68216402_A_C:68216402:4,10,3,0
chr11	68216418	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=23,34;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:0|1:68216402_A_C:68216402:2,7,3,0
chr11	68216422	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=23,33;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,2:4,1:0|1:68216402_A_C:68216402:1,9,3,0
chr11	68216424	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:4,0:0|1:68216402_A_C:68216402:1,9,3,0
chr11	68216429	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:4,1:0|1:68216402_A_C:68216402:1,9,3,0
chr11	68216431	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=24,12;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:4,1:0|1:68216402_A_C:68216402:1,9,3,0
chr11	68318571	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,0:10,3:7,10,2,1
chr11	68326236	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=215,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr11	68334460	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,37;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:15,3,1,1
chr11	68341693	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:5,3:9,0:3,11,1,2
chr11	68341722	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=94,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr11	68343593	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr11	68355527	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:9,0:8,6:4,13,0,6
chr11	68358106	.	CTTTTA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:9,8:1,3:5,6,3,8
chr11	68382067	.	CTTA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,8:5,7:6,2,7,8
chr11	68382193	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,90;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,6:3,2:1,5,1,7
chr11	68456410	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:4,7,1,3
chr11	68527600	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	68529240	.	AAT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr11	68529250	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr11	68530318	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr11	68548260	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	68549340	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=34,89;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.958:25:2,17:0,6:1,1,11,12
chr11	68552232	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr11	68560885	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.398:18:3,0:8,7:0|1:68560885_T_G:68560885:6,5,0,7
chr11	68560891	.	A	AGAGGCGCAGTTTGACTACACAGT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,38;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:1,0:8,7:0|1:68560885_T_G:68560885:4,5,0,7
chr11	68560893	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:1,0:7,1:0|1:68560885_T_G:68560885:4,5,0,7
chr11	68566647	.	GAAA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,8,1
chr11	68566651	.	A	ACGCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,8,1
chr11	68566839	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr11	68575177	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr11	68582779	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:6,1,2,0
chr11	68658686	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr11	68667980	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,299;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:15,8:14,0:13,16,8,0
chr11	68675512	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=66,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.338:22:3,1:10,6:4,11,5,2
chr11	68700701	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=95,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr11	68704533	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=179,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0|1:68704533_C_G:68704533:0,2,1,1
chr11	68704555	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=225,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0|1:68704533_C_G:68704533:0,1,1,1
chr11	68705674	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,6:3,8:4,2,6,8
chr11	68705876	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=278,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	68772969	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,1:11,0:0|1:68772969_G_A:68772969:8,15,1,1
chr11	68772977	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:12,2:12,0:0|1:68772969_G_A:68772969:9,17,1,1
chr11	68773488	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:5,0:5,2:4,6,1,2
chr11	68773740	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=227,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr11	68816370	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	68822739	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=93,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,12:1,7:1,0,2,17
chr11	68825037	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,4:0,16:0,0,11,9
chr11	68831293	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=73.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,25,0
chr11	68834968	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,5,0
chr11	68838042	.	G	GCCCCAGCATCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,50145563;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr11	68839415	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=88,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,2:10,1:10,10,2,1
chr11	68839525	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:68839525_G_A:68839525:0,3,0,1
chr11	68839527	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:68839525_G_A:68839525:0,3,0,1
chr11	68839538	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr11	68840014	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	68845867	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	68846098	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr11	68846519	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	68851466	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,13,18
chr11	68851510	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,2:7,0:0|1:68851510_C_T:68851510:5,11,1,1
chr11	68851528	.	G	GATGGTGATGGTGGTGTTTAT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:68851510_C_T:68851510:3,12,1,1
chr11	68853033	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	68855233	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr11	69063136	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,0:7,4:6,8,1,3
chr11	69063728	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=78,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,4:7,6:6,7,5,5
chr11	69465973	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=112,31;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:15,2:0|1:69465973_G_A:69465973:13,16,1,1
chr11	69465977	.	AGGAG	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=124,31;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:12,0:13,2:0|1:69465973_G_A:69465973:13,18,1,1
chr11	69465984	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=124,31;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,0:15,2:0|1:69465973_G_A:69465973:13,16,1,1
chr11	69465989	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=125,31;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:16,2:0|1:69465973_G_A:69465973:11,15,1,1
chr11	69466115	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	69588020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:1,3:2,0:3,0,1,2
chr11	69588729	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=232,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,6:0,1:2,0,6,1
chr11	69625385	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.614:19:2,7:5,3:4,3,4,8
chr11	69625511	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr11	69949135	.	GCC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:4,0:1,11:4,1,6,6
chr11	69949370	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=216,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,1:0,1:0,1,1,3
chr11	69950315	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr11	69951988	.	A	AGGCCAGCGAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:0|1:69951988_A_AGGCCAGCGAGG:69951988:0,1,0,1
chr11	69951992	.	C	CTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69951988_A_AGGCCAGCGAGG:69951988:0,1,0,1
chr11	69951994	.	G	GGTGGGAGAGCGCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69951988_A_AGGCCAGCGAGG:69951988:0,1,0,1
chr11	69954412	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr11	69957917	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:8,0:0,2:3,5,0,2
chr11	69957940	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	69962642	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr11	69970412	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr11	69970637	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,506;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	69995755	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,22,26;MFRL=121,146,179;MMQ=60,60,50;MPOS=6,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.51,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.303,0.264:9:0,1,0:2,2,2:2,2,4,1
chr11	69995971	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69995971_T_TC:69995971:0,2,0,1
chr11	69995972	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69995971_T_TC:69995971:0,2,0,1
chr11	69998470	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.337:45:12,2:17,12:4,26,6,9
chr11	69999122	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr11	69999228	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=98,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.294:39:8,9:18,2:12,16,0,11
chr11	69999252	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,9,14
chr11	70001976	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr11	70002012	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,7:2,3:3,3,0,11
chr11	70002184	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr11	70002185	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=73,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.704:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	70002987	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,18:0.703:25:2,12:5,5:0|1:70002987_G_A:70002987:4,3,12,6
chr11	70002996	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:19,1:10,1:0|1:70002987_G_A:70002987:17,12,1,1
chr11	70007311	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr11	70007484	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr11	70007865	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr11	70009427	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:11,2:3,0:0|1:70009427_G_T:70009427:6,8,1,1
chr11	70009430	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,2:3,0:0|1:70009427_G_T:70009427:6,8,1,1
chr11	70013454	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:5,16,1,1
chr11	70013574	.	G	GTTGTAATCCACCTCGTACCGCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=203,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0,4,1,1
chr11	70016922	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:70016922_C_T:70016922:2,0,5,0
chr11	70016944	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=117,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,1:0|1:70016922_C_T:70016922:4,1,4,1
chr11	70031775	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=69,134;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:2,0:9,3:3,8,0,3
chr11	70049523	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr11	70118251	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr11	70179672	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,5,12
chr11	70194614	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=228,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.297:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr11	70194624	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=300,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr11	70200594	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:70200594_C_T:70200594:0,0,0,4
chr11	70200602	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:70200594_C_T:70200594:0,4,0,1
chr11	70200604	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:70200594_C_T:70200594:0,4,0,1
chr11	70200605	.	T	TTGAACTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:70200594_C_T:70200594:0,4,0,1
chr11	70208311	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,4,6
chr11	70208350	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr11	70218338	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,0:9,3:10,3,2,1
chr11	70218702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr11	70222604	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,8:0,0,14,6
chr11	70253586	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,3:0,0,3,10
chr11	70261808	.	C	CAGGGAGCTG	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.126:37:18,0:15,4:0|1:70261808_C_CAGGGAGCTG:70261808:17,16,2,2
chr11	70261812	.	C	CTGGTCGCAGATTGTGG	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:18,0:13,4:0|1:70261808_C_CAGGGAGCTG:70261808:18,16,2,2
chr11	70267720	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.402:13:5,0:3,1:0|1:70267720_GA_CC:70267720:0,8,5,0
chr11	70267725	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.402:13:5,0:3,0:0|1:70267720_GA_CC:70267720:0,8,5,0
chr11	70275299	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,11:0.221:51:22,0:17,10:13,27,0,11
chr11	70331696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:3,9,1,1
chr11	70332395	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,0:2,3:3,2,1,2
chr11	70349061	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr11	70507826	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,0,2
chr11	70544792	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=74,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,0:8,2:7,5,2,1
chr11	70544937	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr11	70829858	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:5,1,2,1
chr11	71149069	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=222,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	71149856	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr11	71152258	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=85,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:4,2,5,0
chr11	71155255	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:8,15,1,1
chr11	71155265	.	C	CCTCAATTTCGACTCCTGCCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:7,13,1,1
chr11	71155984	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=138,126;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:19,11:6,0:9,16,0,11
chr11	71166054	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr11	71174553	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:2,4:4,4:3,3,4,6
chr11	71174589	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr11	71183645	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	71184498	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:2,1,4,3
chr11	71185357	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,6:2,4:3,0,9,1
chr11	71193135	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=214,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr11	71201895	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr11	71202088	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	71238370	.	AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.193:21:9,1:4,1:6,11,1,3
chr11	71238453	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=113,119;MMQ=37,53;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:6,7:4,11:6,4,4,14
chr11	71238459	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=129,75;MMQ=43,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,1:15,0:6,17,1,1
chr11	71249125	.	A	AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=0,173;MMQ=60,45;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.773:3:0,0:0,0:0,0,2,1
chr11	71276592	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=122,38136;MMQ=49,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:23,0:12,3:18,17,3,0
chr11	71276632	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,47;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,17:0,0,23,21
chr11	71276681	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=17,32;MFRL=147,131;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.567:14:2,4:0,3:0|1:71276681_T_C:71276681:4,2,3,5
chr11	71276702	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,133;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.492:10:4,1:1,2:0|1:71276681_T_C:71276681:3,2,2,3
chr11	71277647	.	CCGCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGCT;STR;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	71302464	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=146,61;MMQ=49,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:71302464_T_A:71302464:4,5,1,1
chr11	71302466	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,61;MMQ=49,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:71302464_T_A:71302464:4,5,1,1
chr11	71302685	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	71304932	.	TTCG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	71498694	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	71504475	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr11	71507186	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=123,69;MMQ=60,46;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:19,4:13,1:14,18,3,2
chr11	71507311	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=160,187;MMQ=48,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr11	71668362	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr11	71707334	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=107,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.141:26:16,0:7,3:0|1:71707334_C_T:71707334:12,11,0,3
chr11	71707340	.	C	CGCACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,38;MFRL=107,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:14,0:6,3:0|1:71707334_C_T:71707334:11,10,0,3
chr11	71711656	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71711656_C_CA:71711656:0,0,0,1
chr11	71711657	.	G	GTTTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71711656_C_CA:71711656:0,0,0,1
chr11	71711661	.	T	TCTATTCTGCAAGCCACAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71711656_C_CA:71711656:0,0,0,1
chr11	71711664	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71711656_C_CA:71711656:0,0,0,1
chr11	71712175	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	71712274	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=106,715;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:9,4:10,0:12,7,0,4
chr11	71714526	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=108.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,10:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,9,18
chr11	71714528	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,9,18
chr11	71715215	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,10,2
chr11	71715218	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,10,2
chr11	71727422	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr11	71728908	.	AGTCAAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr11	71730662	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:5,9,1,2
chr11	71730715	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	71732290	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=71,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,2:11,1:8,8,1,2
chr11	71733519	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	71734211	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr11	71740378	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	71804625	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:15,0:15,4:13,17,1,3
chr11	71805893	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr11	71806551	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,5:17,0:13,15,0,5
chr11	71806656	.	T	TAAGATTTATAGGATATTGTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.473:4:0,1:1,0:0|1:71806656_T_TAAGATTTATAGGATATTGTTTC:71806656:0,3,0,1
chr11	71806659	.	CT	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.487:3:0,1:1,0:0|1:71806656_T_TAAGATTTATAGGATATTGTTTC:71806656:0,2,0,1
chr11	71808815	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	71809016	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:10,0:6,2:0|1:71809016_C_T:71809016:8,8,1,1
chr11	71809022	.	A	AGGAAGGGAATGTAATGGAATGTAATGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=133,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:71809016_C_T:71809016:8,9,1,1
chr11	71810379	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,111;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,0:3,4:2,7,0,4
chr11	71819183	.	C	CGTATAATTGGA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:9,2:0|1:71819183_C_CGTATAATTGGA:71819183:6,16,1,1
chr11	71819184	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,0:9,1:0|1:71819183_C_CGTATAATTGGA:71819183:5,14,1,1
chr11	71821075	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=141,201;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,3:10,0:11,10,3,0
chr11	71932120	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr11	71940240	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=173,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0|1:71940240_C_T:71940240:2,6,1,1
chr11	71940256	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:71940240_C_T:71940240:1,6,1,1
chr11	71941381	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,4:7,4:6,5,3,5
chr11	71942573	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:7,9,3,0
chr11	71943581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,1,0
chr11	71945376	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=86,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,0:13,3:11,9,0,3
chr11	71945759	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.591:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr11	72019637	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:8,2:0|1:72019637_T_C:72019637:9,8,1,1
chr11	72019642	.	C	CCTGTCCCCTGATCTTGTGTGTTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:72019637_T_C:72019637:9,8,1,1
chr11	72287998	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:72287998_ACT_A:72287998:0,1,0,1
chr11	72288003	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72287998_ACT_A:72287998:0,1,0,1
chr11	72288006	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72287998_ACT_A:72287998:0,1,0,1
chr11	72288652	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	72289176	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	72289659	.	TC	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,26;MFRL=263,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr11	72289676	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=317,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:72289676_G_T:72289676:1,1,0,1
chr11	72289677	.	CCG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=317,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:72289676_G_T:72289676:1,1,0,1
chr11	72289680	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=317,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:72289676_G_T:72289676:1,1,0,1
chr11	72291629	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=88,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,1:11,1:13,15,2,0
chr11	72291883	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr11	72292353	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr11	72292860	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr11	72293039	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr11	72293079	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	72293602	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,2,6
chr11	72294510	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,0:8,3:9,7,1,3
chr11	72295203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=106,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:2,0,2,0
chr11	72295209	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=106,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:2,0,2,0
chr11	72295211	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,13;MFRL=106,245;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:2,0,1,0
chr11	72295220	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,35;MFRL=127,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.217:7:2,1:0,0:6,0,1,0
chr11	72295227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=127,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.218:7:4,1:1,0:6,0,1,0
chr11	72295906	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,8:0,17:0,0,13,12
chr11	72295936	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=90,52;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:13,0:21,2:15,21,1,1
chr11	72296039	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.748:18:1,6:3,7:1,3,5,9
chr11	72296353	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,1,2
chr11	72296700	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr11	72296706	.	T	TCAGCCTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:72296706_T_TCAGCCTG:72296706:0,8,0,2
chr11	72296709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:72296706_T_TCAGCCTG:72296706:0,8,0,2
chr11	72307742	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,3:5,0:4,10,1,2
chr11	72308725	.	C	CTTGAGCAAGACCCCAAACCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72308725_C_CTTGAGCAAGACCCCAAACCTCTG:72308725:0,1,0,1
chr11	72308728	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72308725_C_CTTGAGCAAGACCCCAAACCTCTG:72308725:0,1,0,1
chr11	72326210	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=77,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,3:8,3:3,6,2,4
chr11	72342150	.	GG	TC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:12,11,1,1
chr11	72396800	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:2,2,2,3
chr11	72397009	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=64,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	72398404	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,106;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr11	72399607	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=72,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr11	72407770	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	72407977	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	72408134	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr11	72408156	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=206,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:2,4,0,2
chr11	72408266	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr11	72408657	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:4,3:5,2:3,7,3,2
chr11	72412641	.	TGCAGCCGTGACCAGATGCCATGGGCTAAAGCAGAGTCTGGGGTGGCACCCACCTTCCCGGGCCCGGCGGTCCTGTAGCAGCTTGCCG	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.131:23:3,2:1,0:0|1:72412641_TGCAGCCGTGACCAGATGCCATGGGCTAAAGCAGAGTCTGGGGTGGCACCCACCTTCCCGGGCCCGGCGGTCCTGTAGCAGCTTGCCG_T:72412641:17,3,1,2
chr11	72412675	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,9:0.914:9:0,7:0,2:1|0:72412641_TGCAGCCGTGACCAGATGCCATGGGCTAAAGCAGAGTCTGGGGTGGCACCCACCTTCCCGGGCCCGGCGGTCCTGTAGCAGCTTGCCG_T:72412641:0,0,8,1
chr11	72415329	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:1,3,4,5
chr11	72421581	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=185,540;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,4:2,0:0,8,2,2
chr11	72421708	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	72425268	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,76;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,0:4,0,5,1
chr11	72527903	.	GGCTGCCTGTGCTGGGGCCCTGCCCCT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,52;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.186:21:7,2:10,0:8,10,1,2
chr11	72532621	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	72537297	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:10,0:7,7:7,11,0,7
chr11	72538141	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr11	72554407	.	A	AGGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:6,4,1,4
chr11	72598704	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	72611445	.	A	ACACACACACACACACACACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr11	72633014	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=182,177;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:72633014_T_A:72633014:1,5,0,2
chr11	72633019	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=166,177;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:72633014_T_A:72633014:0,5,0,2
chr11	72726896	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=111,55;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.126:53:24,0:23,6:19,28,0,6
chr11	73022673	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:73022673_C_T:73022673:5,10,1,1
chr11	73022678	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:73022673_C_T:73022673:6,10,1,1
chr11	73067246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,100;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:7,7,0,2
chr11	73074782	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:10,6,1,2
chr11	73100085	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,37;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr11	73118587	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:8,8,2,0
chr11	73122490	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.234:45:15,7:15,0:21,13,0,11
chr11	73122493	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=106,92;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:26,0:14,4:21,20,0,4
chr11	73362766	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr11	73390772	.	GAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr11	73429952	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=157,147;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:9,0:18,9:3,25,0,9
chr11	73429958	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:3,1:2,1:1,12,0,4
chr11	73441772	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,15,7
chr11	73556083	.	TAAAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,1:5,1:0|1:73556083_TAAAC_T:73556083:1,7,0,2
chr11	73556088	.	TAGGC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:73556083_TAAAC_T:73556083:1,7,0,2
chr11	73584333	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,0:17,3:14,12,1,2
chr11	73675859	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=93,166;MMQ=50,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,5:1,3:1,1,11,1
chr11	73686112	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.119:39:16,4:19,0:17,18,0,4
chr11	73688885	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,1:7,1:7,2,2,0
chr11	73712663	.	G	GTGCAGGGCAGTCTCCCAGCTCGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	73715666	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,3:1,3,6,2
chr11	73717024	.	AT	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,1,2
chr11	73748551	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,0:8,3:10,14,0,3
chr11	73765787	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=145,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr11	73789277	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:15,2:13,1:16,12,1,2
chr11	73789777	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr11	73796608	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,4:0,15:0,0,18,1
chr11	73796917	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,4:4,5:6,5,3,6
chr11	73803398	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=84,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:6,3,3,0
chr11	73803594	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=130,34;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:7,0:9,2:0|1:73803594_T_C:73803594:4,12,1,1
chr11	73803599	.	C	CTAG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,34;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:73803594_T_C:73803594:4,12,1,1
chr11	73803601	.	A	AAAGGGAAAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=130,34;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:73803594_T_C:73803594:4,12,1,1
chr11	73814570	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,3:3,7,0,3
chr11	73814681	.	C	CCCCTCTCCAATAATCATTGTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=81,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:3,4,1,1
chr11	73820283	.	T	TCCCTTCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr11	73824724	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	73825015	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73825015_T_A:73825015:0,1,0,1
chr11	73825021	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73825015_T_A:73825015:0,1,0,1
chr11	73950250	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=112,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:14,2:19,0:14,22,2,0
chr11	73997508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=140,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73997508_T_C:73997508:1,1,0,1
chr11	73997516	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=140,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73997508_T_C:73997508:1,1,0,1
chr11	74000156	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.076:63:32,4:26,0:25,34,0,4
chr11	74000180	.	T	TA	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.143:40:19,1:13,5:12,22,2,4
chr11	74009449	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	74013528	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=83,55;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:13,9,1,1
chr11	74013551	.	G	GATTC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=83,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:11,10,1,1
chr11	74047683	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=88,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:1,0:8,3:4,6,1,2
chr11	74053485	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	74054512	.	T	TGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:74054512_T_TGC:74054512:0,3,1,1
chr11	74054513	.	A	AGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:74054512_T_TGC:74054512:0,3,1,1
chr11	74057931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=196,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr11	74085420	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=104,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:8,4:13,2:9,12,2,4
chr11	74109271	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=13,29;MFRL=198,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:74109271_T_TCC:74109271:0,3,0,1
chr11	74109272	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=198,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74109271_T_TCC:74109271:0,3,0,1
chr11	74109275	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=201,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:74109271_T_TCC:74109271:0,4,0,1
chr11	74109279	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=201,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74109271_T_TCC:74109271:0,4,0,1
chr11	74303841	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=78.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,0,22
chr11	74329615	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,3:8,8:6,7,4,7
chr11	74330980	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=83,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:1,1,2,1
chr11	74340196	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,5,0
chr11	74340320	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=95,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,3:6,0:10,8,3,0
chr11	74345550	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr11	74407676	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr11	74408384	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr11	74412730	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=235,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr11	74413872	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,5:5,2:4,4,7,1
chr11	74419357	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.663:10:2,3:1,3:0|1:74419357_C_T:74419357:3,0,4,3
chr11	74419379	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=121,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,0:7,3:0|1:74419357_C_T:74419357:6,7,2,1
chr11	74419498	.	G	GGCGGCGCTGCCGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	74429820	.	TG	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=107,238;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:6,3:6,8,0,3
chr11	74429922	.	C	CTAGAATTTAAGTTTTATAGTATTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=93,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:74429922_C_CTAGAATTTAAGTTTTATAGTATTTT:74429922:0,3,1,1
chr11	74429923	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=93,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:74429922_C_CTAGAATTTAAGTTTTATAGTATTTT:74429922:0,3,1,1
chr11	74528746	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:74528746_G_A:74528746:9,7,1,1
chr11	74528758	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:0|1:74528746_G_A:74528746:10,7,1,1
chr11	74556213	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.282:30:11,1:10,7:10,12,0,8
chr11	74556239	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:7,2:16,0:10,14,2,1
chr11	74562067	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr11	74562335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=199,331;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:74562335_T_C:74562335:0,1,0,1
chr11	74562348	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,331;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74562335_T_C:74562335:0,0,0,1
chr11	74660292	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:6,1:6,6,3,1
chr11	74660504	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:0,11,0,2
chr11	74676857	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,89;MMQ=40,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:3,4,2,0
chr11	74705696	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,5:7,5,1,6
chr11	74800829	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	74862356	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,3:5,5:5,6,4,4
chr11	74862391	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr11	74880279	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,1:0|1:74880279_G_T:74880279:9,11,1,1
chr11	74880284	.	C	CACTTCCTGCCCAGGGCCAGGGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:74880279_G_T:74880279:9,12,1,1
chr11	74907574	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=119,51;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,3:15,0:15,12,0,3
chr11	74914109	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr11	74978770	.	G	GTCTGCCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=1148,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:74978770_G_GTCTGCCTT:74978770:1,0,1,1
chr11	74978772	.	G	GCCTCCCAAAGTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=1148,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:74978770_G_GTCTGCCTT:74978770:1,0,1,1
chr11	74982882	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	74984056	.	C	CGGGTGAGTGCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr11	74988021	.	G	GTCCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCCC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr11	74988347	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.349:6:0,0:4,1:4,0,2,0
chr11	74989875	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=224,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:74989875_A_C:74989875:0,2,0,1
chr11	74989876	.	A	AGCCTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=224,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:74989875_A_C:74989875:0,2,0,1
chr11	74995350	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=104,53;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:5,2:12,7:6,11,7,3
chr11	74995420	.	T	TGTTTTTTGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:74995420_T_TGTTTTTTGA:74995420:0,3,0,1
chr11	74995422	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:74995420_T_TGTTTTTTGA:74995420:0,3,0,1
chr11	74995424	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:74995420_T_TGTTTTTTGA:74995420:0,3,0,1
chr11	74995426	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:74995420_T_TGTTTTTTGA:74995420:0,3,0,1
chr11	74998498	.	G	GCATCCAAGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=199,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0|1:74998498_G_GCATCCAAGC:74998498:0,7,1,1
chr11	74998500	.	G	GCTTTCCAGGATGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=199,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,1:5,0:0|1:74998498_G_GCATCCAAGC:74998498:0,7,1,1
chr11	75001116	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:6,7,2,1
chr11	75111888	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:16,0:23,3:17,23,1,2
chr11	75160213	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:3,7,1,3
chr11	75167704	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=131,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr11	75188569	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=223,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,1,3
chr11	75278040	.	G	GTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TCC;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	75282816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=173,126;MMQ=60,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,6:2,0:3,0,0,6
chr11	75298086	.	TGTGTCAAGGGGTGA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:4,2:11,9,1,1
chr11	75298666	.	TCCTTGACAGGTGCTGGGACTATGGGACCTTCAC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=84,153;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.254:19:5,1:4,1:6,9,0,4
chr11	75316787	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr11	75319218	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=63,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:3,10:3,10:2,4,11,9
chr11	75319238	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=127,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:14,0:9,2:0|1:75319238_G_T:75319238:9,14,1,1
chr11	75319242	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,0:7,1:0|1:75319238_G_T:75319238:8,13,1,1
chr11	75378674	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	75442099	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr11	75501768	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,0:8,3:0|1:75501768_C_T:75501768:7,12,1,2
chr11	75501774	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,0:7,3:0|1:75501768_C_T:75501768:7,12,1,2
chr11	75501852	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr11	75623082	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr11	75718684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:7,1:0,12,1,2
chr11	75727903	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=120,207;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:18,3:15,19,0,3
chr11	75826962	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:75826962_T_C:75826962:2,1,1,0
chr11	75826966	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:75826962_T_C:75826962:2,1,1,0
chr11	75902539	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=315,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr11	75902571	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr11	75907438	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	76183924	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr11	76227182	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,9:4,9:4,4,12,6
chr11	76237725	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr11	76257215	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:4,4,1,1
chr11	76261037	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=51,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,5:8,4:4,13,4,5
chr11	76261231	.	C	CAACTCTTTCAGCCCTGCTGGTTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	76370792	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,17,10
chr11	76376949	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,1:14,2:16,13,0,3
chr11	76508330	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:7,6:5,0:9,4,6,0
chr11	76637730	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr11	76637785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	76670048	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:11,5:3,0:6,8,5,0
chr11	76687448	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	76701540	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:76701540_A_C:76701540:7,7,0,2
chr11	76701542	.	AA	TT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=108,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:5,2:0|1:76701540_A_C:76701540:8,8,0,2
chr11	76701545	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=108,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:76701540_A_C:76701540:8,8,0,2
chr11	76701657	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,5,8
chr11	76727866	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,2:3,0:0,5,0,2
chr11	76796159	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	76814095	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=173,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:12,3:2,0:3,11,1,2
chr11	76827223	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:7,1,4,1
chr11	76827360	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:14,1:6,6:9,11,4,3
chr11	76853783	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=57,99;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,2:4,1:5,5,1,2
chr11	76870634	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr11	76873359	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,2:15,0:14,8,1,1
chr11	76877216	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=102,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:5,9,1,2
chr11	76877217	.	G	GCTCGTCCTCCAGCTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:5,10,1,1
chr11	76885779	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=302,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.693:8:0,2:2,2:2,0,5,1
chr11	76890242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	76891585	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr11	76892344	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr11	76892368	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=138,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,4,1
chr11	76893025	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=91,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:8,5,3,0
chr11	76893280	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	76893401	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	76894235	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,5:1,2:2,4,3,4
chr11	76895770	.	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:0,5:5,5,4,5
chr11	76901927	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:3,2,0,3
chr11	76905604	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=34027946,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr11	76916424	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr11	76917198	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0|1:76917198_AG_A:76917198:3,5,1,1
chr11	76917200	.	ACCACC	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,0:4,2:0|1:76917198_AG_A:76917198:5,8,1,1
chr11	76917209	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:6,2:0|1:76917198_AG_A:76917198:5,8,1,1
chr11	76917220	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=116,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:3,5,3,3
chr11	76918322	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:1,0,4,3
chr11	76918497	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr11	76919619	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:76919619_G_A:76919619:1,1,1,1
chr11	76919629	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:76919619_G_A:76919619:1,1,0,1
chr11	76919865	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr11	76922868	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,1,2
chr11	76923017	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,6:1,1:1,0,2,5
chr11	76924051	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:10,5,0,3
chr11	76924130	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr11	76925040	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr11	76925075	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	76925720	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=118,268;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,1:8,11,0,2
chr11	76954898	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr11	76979465	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,17,4
chr11	76979889	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr11	76979900	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr11	76980986	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0|1:76980986_C_T:76980986:10,10,1,1
chr11	76980993	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:76980986_C_T:76980986:9,9,1,1
chr11	76980996	.	C	CTTTCAATAAAGTTTTTG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=109,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:76980986_C_T:76980986:8,9,1,1
chr11	76996291	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:76996291_TTC_T:76996291:0,1,0,1
chr11	76996296	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:76996291_TTC_T:76996291:0,1,0,1
chr11	76996298	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76996291_TTC_T:76996291:0,0,0,1
chr11	77051820	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,11:0,0,7,11
chr11	77051892	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	77090211	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	77301739	.	A	AGTATCACTGAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	77320254	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=284,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	77335982	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,13,10
chr11	77336682	.	GTGTGTGTGTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:2,0:6,2,1,1
chr11	77348815	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=239,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0|1:77348815_C_T:77348815:0,2,1,1
chr11	77348821	.	AC	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=217,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:2,1:0|1:77348815_C_T:77348815:0,4,1,1
chr11	77348827	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=217,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77348815_C_T:77348815:0,4,0,1
chr11	77378163	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:8,8,1,1
chr11	77378614	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77378614_C_CA:77378614:0,0,0,1
chr11	77378618	.	C	CACCCCCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77378614_C_CA:77378614:0,0,0,1
chr11	77387954	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,17;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:12,0:9,0:0|1:77387954_T_G:77387954:11,14,4,0
chr11	77387956	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=22,14;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:11,0:7,0:0|1:77387954_T_G:77387954:11,14,4,0
chr11	77387961	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,3:7,0:0|1:77387954_T_G:77387954:10,15,4,0
chr11	77387966	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:7,0:0|1:77387954_T_G:77387954:9,16,2,0
chr11	77387970	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:7,0:0|1:77387954_T_G:77387954:8,14,2,0
chr11	77389238	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr11	77389292	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=177,152;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77389292_T_TTG:77389292:0,3,0,1
chr11	77389295	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=177,152;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77389292_T_TTG:77389292:0,3,0,1
chr11	77389301	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=177,152;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77389292_T_TTG:77389292:0,3,0,1
chr11	77389302	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=177,152;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:77389292_T_TTG:77389292:0,3,0,1
chr11	77396033	.	GAAAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAAT;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	77413343	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=113,84;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,0:15,4:13,16,1,3
chr11	77413361	.	T	TG	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=113,84;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:13,0:14,3:0|1:77413361_T_TG:77413361:14,14,0,3
chr11	77413368	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=125,84;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,0:8,3:0|1:77413361_T_TG:77413361:13,9,0,3
chr11	77531810	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	77614645	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=117,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:8,1:15,2:12,12,2,1
chr11	77614770	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=341,183;MMQ=53,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr11	77618740	.	A	AAATGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AATGG;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,1:9,1,1,1
chr11	77639634	.	AC	GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,87;MMQ=44,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.114:27:12,0:12,3:11,13,1,2
chr11	77639646	.	GC	AT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=87,91;MMQ=50,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.176:25:8,0:12,4:7,14,1,3
chr11	77652131	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr11	77669770	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,46;MMQ=50,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:16,6:17,0:17,16,6,0
chr11	77671281	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:4,0,7,0
chr11	77734157	.	GA	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr11	77775455	.	G	GAGCCAAAACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:77775455_G_GAGCCAAAACA:77775455:0,2,0,1
chr11	77775459	.	C	CTGCTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:77775455_G_GAGCCAAAACA:77775455:0,2,0,1
chr11	77775460	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:77775455_G_GAGCCAAAACA:77775455:0,2,0,1
chr11	77775462	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=211,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:77775455_G_GAGCCAAAACA:77775455:0,1,0,1
chr11	77775466	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	77781173	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr11	77790863	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr11	77811990	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	77815196	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	77824907	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.403:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr11	77832076	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	77884782	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	77885188	.	G	GACAACCAA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=107,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:0|1:77885188_G_GACAACCAA:77885188:9,13,0,2
chr11	77885190	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=101,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:10,0:0|1:77885188_G_GACAACCAA:77885188:9,14,0,2
chr11	77885193	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=100,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:77885188_G_GACAACCAA:77885188:9,15,0,2
chr11	77920457	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:4,0,8,0
chr11	77920563	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=90,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:7,10:2,6:6,3,8,8
chr11	77921247	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,6:4,0:2,4,2,5
chr11	77924607	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	77924656	.	TTCTAAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTAAG;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	77924870	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=70,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr11	77930345	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=91,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,2,3
chr11	77930499	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:2,4,2,5
chr11	77931346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:2,2:2,11:3,1,7,6
chr11	77936064	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=207,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr11	77961479	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:1,10,1,1
chr11	78128797	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	78154810	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,25;MFRL=69,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:1,0:1,3,0,2
chr11	78180179	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	78189558	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,6:5,4:3,6,3,8
chr11	78372536	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=100,56;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.452:20:7,4:4,5:4,7,5,4
chr11	78380745	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=119,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:3,7,2,0
chr11	78381678	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	78413549	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	78419637	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=247,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:78419637_C_CA:78419637:0,2,0,1
chr11	78419638	.	T	TGGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=247,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:78419637_C_CA:78419637:0,2,0,1
chr11	78419641	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=247,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78419637_C_CA:78419637:0,2,0,1
chr11	78423772	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,2:9,0:2,10,1,1
chr11	78437210	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:12,7,0,2
chr11	78440736	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr11	78443618	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=127,1200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:10,0:10,4:10,12,4,0
chr11	78482216	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=90,111;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:8,4:7,7,0,4
chr11	78489600	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:7,2:8,1:12,6,3,0
chr11	78489793	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=189,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:78489793_C_A:78489793:0,2,0,4
chr11	78489798	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=189,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:78489793_C_A:78489793:0,2,0,4
chr11	78516290	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	78523143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=241,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr11	78573947	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:4,1,3,0
chr11	78780837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:3,2,4,4
chr11	82443417	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,22,0
chr11	82560312	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr11	82560858	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr11	82561151	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.723:5:0,2:1,1:0|1:82561151_G_GAA:82561151:0,1,0,4
chr11	82561158	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.723:5:0,2:1,2:0|1:82561151_G_GAA:82561151:0,1,0,4
chr11	82561339	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr11	82564152	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr11	82564357	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=9,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,3:1,10:0,1,1,12
chr11	82570926	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr11	82595975	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,8,14
chr11	82611228	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr11	82641157	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr11	82641364	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr11	82643611	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,8:5,2:5,7,4,6
chr11	82645172	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=126,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:0,1:9,4:3,7,5,0
chr11	82705268	.	CT	GG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0|1:82705268_CT_GG:82705268:0,0,0,1
chr11	82705271	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:82705268_CT_GG:82705268:0,0,0,1
chr11	82893999	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=112,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:7,0:13,8,3,0
chr11	83180169	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,0;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr11	83585608	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=125,112;MMQ=51,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83585608_T_C:83585608:0,1,0,1
chr11	83585622	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=164,112;MMQ=46,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:83585608_T_C:83585608:0,2,0,1
chr11	83691501	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr11	83810113	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:2,7,0,3
chr11	83878075	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=84,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:4,6,1,3
chr11	83962251	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:8,4,3,4
chr11	84822798	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,4:8,1:3,9,0,5
chr11	84865713	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr11	85345259	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,169;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:9,7,0,2
chr11	85346865	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=229,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr11	85366762	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:3,2:1,4,1,5
chr11	85367289	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr11	85374467	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr11	85397187	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,2:8,0:3,7,0,2
chr11	85418591	.	AACAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr11	85420276	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	85432075	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:85432075_G_A:85432075:0,3,0,1
chr11	85432081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=189,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85432075_G_A:85432075:0,2,0,1
chr11	85435001	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr11	85437268	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:13,1:6,1:8,11,0,2
chr11	85445734	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:3,4:6,1:4,5,1,5
chr11	85447555	.	G	GTCACGTAACAAGTCACAGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:7,2,1,1
chr11	85447611	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr11	85447704	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	85456703	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:10,3:9,3:8,11,3,3
chr11	85576113	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr11	85576127	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr11	85584303	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.689:30:5,12:4,9:4,5,6,15
chr11	85593529	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:8,0,5,1
chr11	85593756	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.684:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	85606306	.	T	TCAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:8,3,1,1
chr11	85609962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:2,0,5,3
chr11	85610109	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	85626569	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=141,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:0,3:5,2:0,5,1,4
chr11	85627039	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:5,1,9,3
chr11	85630411	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.656:30:4,13:6,7:5,5,9,11
chr11	85692672	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=19,13;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:85692672_G_C:85692672:2,0,1,0
chr11	85692674	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.589:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr11	85692680	.	ATCTC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,22;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:85692672_G_C:85692672:4,0,1,0
chr11	85692685	.	T	TAAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:85692672_G_C:85692672:4,0,1,0
chr11	85692689	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=209,128;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,0:0|1:85692672_G_C:85692672:3,0,1,0
chr11	85695008	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=83,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:37,0:22,3:19,42,0,3
chr11	85701411	.	ATC	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=113,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:15,0:16,14,0,2
chr11	85737502	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	85956478	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=35221435,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,2:0,1:1,0,0,4
chr11	85966177	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr11	85968589	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,2:9,0:9,4,1,1
chr11	85977117	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,18,10
chr11	85979636	.	C	CGTGTGTGT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=GT;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.566:13:4,4:0,0:0,5,0,8
chr11	85989556	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:22,5:15,1:18,19,4,2
chr11	86013447	.	CGCCGGCTTCAGGTCACT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:3,0:15,6,1,1
chr11	86013604	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.498:20:7,4:3,6:0,10,3,7
chr11	86108867	.	G	GACGAAGGGAATAATTTTCCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=68861150,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	86111872	.	G	GGATGTGGCCATT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=198,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86111872_G_GGATGTGGCCATT:86111872:1,1,0,1
chr11	86111874	.	A	AGTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=198,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:86111872_G_GGATGTGGCCATT:86111872:1,3,0,1
chr11	86111876	.	T	TATAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=198,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:86111872_G_GGATGTGGCCATT:86111872:1,3,0,1
chr11	86111879	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=243,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:86111872_G_GGATGTGGCCATT:86111872:0,3,0,1
chr11	86119342	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:3,3,1,2
chr11	86119396	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=156,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr11	86123357	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	86131047	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr11	86133784	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:1,5,3,5
chr11	86159330	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=154,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:4,5,1,1
chr11	86176041	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	86176339	.	G	GTTTAACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=201,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:86176339_G_GTTTAACA:86176339:0,3,0,1
chr11	86176340	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=188,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86176339_G_GTTTAACA:86176339:0,4,0,1
chr11	86176343	.	G	GAAACTGAGGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=188,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86176339_G_GTTTAACA:86176339:0,4,0,1
chr11	86209110	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,7:4,3:4,2,5,5
chr11	86519880	.	T	TCAG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:14,0:14,2:16,12,1,1
chr11	86519925	.	CGTGT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GT;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.432:12:4,2:3,3:1,6,2,3
chr11	86662573	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.310:30:13,0:8,9:9,12,0,9
chr11	86663105	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,6:6,0:5,8,6,0
chr11	86749111	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:10,0:14,4:14,10,3,1
chr11	86868361	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.314:26:6,5:9,3:18,0,7,1
chr11	86947752	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:4,15,1,1
chr11	86947765	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,9:5,2:2,6,2,9
chr11	87006776	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:4,6:8,3:9,3,4,5
chr11	87032215	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	87908346	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,2,0
chr11	88027697	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:88027697_T_G:88027697:0,2,0,1
chr11	88027699	.	G	GCATGATGATACCATA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:88027697_T_G:88027697:0,2,0,1
chr11	88027701	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:88027697_T_G:88027697:0,2,0,1
chr11	88027706	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:88027706_C_T:88027706:0,2,0,1
chr11	88027710	.	G	GAAGAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:88027706_C_T:88027706:0,2,0,1
chr11	88033661	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,5:6,0,4,2
chr11	88045583	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,76;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,8:4,7:5,2,10,5
chr11	88045815	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=256,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr11	88061405	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr11	88061433	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:88061433_TA_T:88061433:0,2,0,1
chr11	88061438	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:88061433_TA_T:88061433:0,2,0,1
chr11	88061442	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:88061433_TA_T:88061433:0,2,0,1
chr11	88068004	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr11	88068052	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:3,5:1,2:4,0,7,0
chr11	88242024	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.471:23:9,4:3,5:5,7,6,5
chr11	88242767	.	TGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:88242767_TGGG_T:88242767:0,1,0,1
chr11	88242771	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88242767_TGGG_T:88242767:0,1,0,1
chr11	88242773	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88242767_TGGG_T:88242767:0,1,0,1
chr11	88300800	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=89,94;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.320:38:16,11:10,0:14,12,12,0
chr11	88338165	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	89133449	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,39;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,5,8
chr11	89223616	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr11	89224326	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,17:0,14:0,0,16,15
chr11	89224453	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.925:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	89403480	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=200,20103572;MMQ=60,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr11	89407164	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,169;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,3:3,4:10,3,6,1
chr11	89420607	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=133,138;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,6:5,7,5,5
chr11	89531540	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,90;MMQ=56,43;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,3:3,8:4,6,10,2
chr11	89531801	.	CAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=124,144;MMQ=45,27;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:1,2:1,6,1,1
chr11	89729470	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=255,169;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89729470_T_G:89729470:0,1,0,1
chr11	89729472	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=255,169;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89729470_T_G:89729470:0,1,0,1
chr11	89730432	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	89732471	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,95;MMQ=27,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr11	89732600	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89732600_T_C:89732600:0,0,0,1
chr11	89732615	.	C	CCAGGCCTTCCATGCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89732600_T_C:89732600:0,0,0,1
chr11	89885614	.	G	GAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:6,2:0|1:89885614_G_GAA:89885614:3,7,1,1
chr11	89885616	.	G	GCAATGGAATGGAATCTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:6,2:0|1:89885614_G_GAA:89885614:3,7,1,1
chr11	89892527	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:3,8,0,6
chr11	89909096	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.293:10:5,2:2,1:0|1:89909096_ATG_A:89909096:5,2,3,0
chr11	89909118	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=95,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.127:21:10,2:9,0:1|0:89909096_ATG_A:89909096:9,10,0,2
chr11	89914852	.	A	AATT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:23,2:12,0:0|1:89914852_A_AATT:89914852:21,16,1,1
chr11	89914853	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:24,2:12,0:0|1:89914852_A_AATT:89914852:21,15,1,1
chr11	89914894	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,28,25,28;MFRL=138,200,181,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,25,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.14,4.22,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,2,3,4:0.136,0.201,0.233:17:2,1,2,0:5,1,1,3:1,7,1,8
chr11	89935586	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,23:0,0,21,18
chr11	89943676	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=96.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,23:0.923:24:0,13:1,9:0|1:89943676_A_T:89943676:1,0,14,9
chr11	89943681	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=155,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,23:0.923:24:0,14:1,9:0|1:89943676_A_T:89943676:1,0,14,9
chr11	89951367	.	GA	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.249:41:5,4:2,3:4,26,2,9
chr11	92531134	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:8,6,2,1
chr11	92532806	.	TGCC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=106,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:11,7,0,2
chr11	92538562	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=88,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,3:13,0:4,14,0,3
chr11	92564767	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	92570812	.	TC	AA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:3,5:4,3,6,4
chr11	92571020	.	T	TGTGTTTTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:0|1:92571020_T_TGTGTTTTG:92571020:0,6,1,1
chr11	92571021	.	C	CAAATATTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:0|1:92571020_T_TGTGTTTTG:92571020:0,6,1,1
chr11	92573910	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=134,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:5,3:12,0:0|1:92573910_C_T:92573910:5,12,2,1
chr11	92573911	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,4:0.224:20:7,1:9,3:1|0:92573910_C_T:92573910:6,10,1,3
chr11	92577031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr11	92577070	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,4:4,7:7,1,7,4
chr11	92577381	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.304:34:12,4:12,6:14,10,6,4
chr11	92592536	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=98,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr11	92599851	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	92616096	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:1,10,1,2
chr11	92620160	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:13,0:7,5:10,10,4,1
chr11	92620376	.	T	TTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92620376_T_TTTC:92620376:0,0,0,1
chr11	92620378	.	AACC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92620376_T_TTTC:92620376:0,0,0,1
chr11	92702950	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr11	92702962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr11	92703172	.	T	TAGTCC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=93,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:3,0:0,1:0|1:92703172_T_TAGTCC:92703172:1,2,0,1
chr11	92703174	.	G	GCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=93,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:92703172_T_TAGTCC:92703172:1,2,0,1
chr11	92703178	.	C	CGTCTGCCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:92703172_T_TAGTCC:92703172:0,2,0,1
chr11	92703198	.	GCCTTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92703198_GCCTTTT_G:92703198:0,0,0,1
chr11	92703208	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:92703198_GCCTTTT_G:92703198:0,0,0,1
chr11	92915962	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:12,2,2,0
chr11	92917596	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:13,4:7,0:13,9,4,0
chr11	93118515	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr11	93129482	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,1:5,2:3,7,3,1
chr11	93170909	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.656:10:2,0:1,5:0,3,0,7
chr11	93170925	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr11	93400052	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	93412774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=302,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:93412774_A_G:93412774:0,1,0,3
chr11	93412775	.	GGA	CTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,302;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:93412774_A_G:93412774:0,3,0,1
chr11	93432141	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:1,6,0,3
chr11	93436185	.	AAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr11	93458848	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:6,2:0|1:93458848_C_T:93458848:6,8,1,1
chr11	93458854	.	G	GGACTAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=163,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:93458848_C_T:93458848:7,9,1,1
chr11	93462607	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,20:0,13:0,0,16,17
chr11	93463145	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=174,160;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:6,0:3,2:0|1:93463145_A_AT:93463145:4,5,1,1
chr11	93463162	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=174,160;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:3,1:0|1:93463145_A_AT:93463145:6,5,1,1
chr11	93463332	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=157.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,20,27
chr11	93480708	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.809:3:0,3:0,0:0|1:93480708_T_C:93480708:0,0,0,3
chr11	93480717	.	A	ATATCTTACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATCTTACT;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:93480708_T_C:93480708:0,0,0,3
chr11	93487008	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr11	93494878	.	AAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:0,4,1,4
chr11	93521142	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr11	93521405	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	93527219	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr11	93527282	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr11	93534929	.	T	TGA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,11,0
chr11	93534930	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,11,0
chr11	93534990	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,20,9
chr11	93554400	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:6,8,1,1
chr11	93583590	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:2,4,7,2
chr11	93583617	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,4:5,2:8,4,3,3
chr11	93754508	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr11	93797619	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,19:0,2:0,0,12,9
chr11	93803717	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr11	93803771	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	93806416	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,13,5
chr11	93806688	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,0:3,10:1,6,0,10
chr11	93808607	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	93839203	.	C	CTGACAAGATCATAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.182:14:5,0:7,2:0|1:93839203_C_CTGACAAGATCATAT:93839203:9,3,1,1
chr11	93839208	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:93839203_C_CTGACAAGATCATAT:93839203:11,3,1,1
chr11	93843972	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=204,399;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr11	93844034	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	93844735	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:7,2:16,1:6,17,1,2
chr11	93862493	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr11	93886838	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	94038717	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:4,0:0,2:5,0,0,2
chr11	94129686	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:6,2:0|1:94129686_C_T:94129686:10,11,1,1
chr11	94129690	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:5,2:0|1:94129686_C_T:94129686:10,11,1,1
chr11	94133940	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:94133940_C_T:94133940:3,0,1,0
chr11	94133948	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:94133940_C_T:94133940:3,0,1,0
chr11	94134472	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	94169179	.	A	ACTGTTTGTTGCTTTGTTTCCTTGCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=186,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr11	94179125	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr11	94194303	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	94197260	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr11	94200962	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=98,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:12,6:1,8:8,5,7,7
chr11	94203868	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	94212048	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,3:0,5:0,2,3,6
chr11	94225807	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	94279400	.	A	AGG	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:23,2:17,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:21,22,1,1
chr11	94279402	.	TC	T	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:25,2:17,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:22,23,1,1
chr11	94279405	.	TCAC	T	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:24,2:16,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:22,26,1,1
chr11	94279411	.	CCTTGGCTCCTGAGA	C	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:26,2:16,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:22,34,1,1
chr11	94279428	.	GGTGA	G	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=117,54;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:23,2:15,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:11,30,1,1
chr11	94279436	.	GG	AT	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:23,1:17,0:0|1:94279400_A_AGG:94279400:10,32,1,1
chr11	94281335	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.315:20:8,3:6,3:7,7,2,4
chr11	94281413	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.699:11:2,4:1,3:2,1,1,7
chr11	94310693	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:1,9,0,2
chr11	94320237	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:9,1,2,1
chr11	94337220	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,3:11,2:8,8,3,2
chr11	94354019	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,0:2,4:3,4,3,1
chr11	94354030	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,4:3,4,3,2
chr11	94501849	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	94533373	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,7:6,2:4,8,3,6
chr11	94533501	.	C	CGTGTGGTTTAATCAAGGATGACCATGTTTTTGTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94533501_C_CGTGTGGTTTAATCAAGGATGACCATGTTTTTGTCA:94533501:0,1,0,1
chr11	94533507	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94533501_C_CGTGTGGTTTAATCAAGGATGACCATGTTTTTGTCA:94533501:0,1,0,1
chr11	94602309	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,24,28;MFRL=104,140,156;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.74,4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,4:0.192,0.257:13:3,0,4:4,2,0:6,1,6,0
chr11	94699391	.	TACACACACAC	T,TACACACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=22,26,22;MFRL=77,92,135;MMQ=40,60,40;MPOS=2,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,16,22;RU=AC;STR;TLOD=17.48,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.552,0.269:8:0,3,0:1,2,1:1,0,5,2
chr11	94699444	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=24,14;MFRL=92,97;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.080:46:13,0:23,0:14,29,3,0
chr11	94699493	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.090:42:17,3:17,0:0|1:94699493_GA_G:94699493:13,26,0,3
chr11	94699496	.	GG	CT	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:19,3:16,0:0|1:94699493_GA_G:94699493:13,27,0,3
chr11	94699507	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=103.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,13:0,0,10,21
chr11	94704037	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	94704092	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:94704092_T_A:94704092:0,0,11,1
chr11	94704094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:94704092_T_A:94704092:0,0,11,1
chr11	94704689	.	A	AAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,1:2,2:0,3,0,5
chr11	94732302	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:8,0:6,2:0|1:94732302_C_T:94732302:9,6,1,1
chr11	94732306	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:94732302_C_T:94732302:9,7,1,1
chr11	94800902	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,4:0,12:0,0,10,9
chr11	94801599	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:26,2:23,0:0|1:94801599_G_A:94801599:24,27,1,1
chr11	94801602	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:21,2:25,0:0|1:94801599_G_A:94801599:24,26,1,1
chr11	94801633	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=100.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,15:0,14:0,0,10,20
chr11	94802827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,8:5,8:3,4,5,11
chr11	94802863	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:3,8:3,5:3,3,6,7
chr11	94803487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=222,223;MMQ=53,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr11	94803525	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=210,139;MMQ=40,39;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,3:5,7:5,0,10,0
chr11	94803531	.	C	CAAA,CAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31,31;MFRL=0,97,126;MMQ=60,40,40;MPOS=10,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,19,28;RU=A;STR;TLOD=5.14,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.203,0.750:12:0,2,1:0,0,6:0,0,10,2
chr11	94861491	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	94861718	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:8,0:17,9:9,17,0,9
chr11	94908658	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:6,5:13,2:12,8,4,3
chr11	94911981	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:4,6,0,3
chr11	94918550	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:4,2:8,5,1,1
chr11	94918574	.	A	AGCCGCG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=137,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:9,2:0|1:94918574_A_AGCCGCG:94918574:12,5,1,1
chr11	94918575	.	A	AGCTGCTGCTGCAGTG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,0:10,2:0|1:94918574_A_AGCCGCG:94918574:12,5,1,1
chr11	94924635	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:17,0:16,4:18,15,4,0
chr11	95509037	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:4,2:1,3:5,1,4,1
chr11	95519195	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:10,0,4,0
chr11	95520695	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr11	95520960	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.405:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	95551110	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:95551110_GT_G:95551110:0,6,0,2
chr11	95551136	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.326:7:3,0:1,2:1|0:95551110_GT_G:95551110:0,5,0,2
chr11	95561265	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:0,4,0,5
chr11	95562327	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=101,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr11	95562535	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.378:17:1,0:1,0:0,11,0,6
chr11	95580926	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.385:37:12,5:10,9:8,15,5,9
chr11	95595457	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=110,286;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.250:25:10,5:9,0:8,11,0,6
chr11	95621522	.	T	TAGAAAGGCTTATCTTCGTAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	95718902	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=241,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr11	95825374	.	TTGCTGCTGC	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=88,148;MMQ=21,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=TGC;STR;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.876:13:0,6:1,3:1,0,8,4
chr11	96092376	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:1,4,1,8
chr11	96106661	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=82,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,7:2,3,2,11
chr11	96116538	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.308:33:10,9:13,0:8,15,0,10
chr11	96117812	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:7,4:11,2:6,12,1,5
chr11	96123734	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:7,0,9,1
chr11	96125127	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.266:32:13,8:10,0:18,6,8,0
chr11	96125435	.	CTT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=104,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=65.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:4,5:4,12:3,5,6,11
chr11	96126288	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.734:12:2,3:1,4:2,1,7,2
chr11	99427084	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:99427084_C_T:99427084:0,4,0,1
chr11	99427090	.	T	TAAAATCTAGACAGAGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:99427084_C_T:99427084:0,4,0,1
chr11	99690175	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=204,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:99690175_A_T:99690175:3,0,1,1
chr11	99690178	.	A	AGGGCTGCTGTATCGTGGTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=204,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:99690175_A_T:99690175:3,0,1,1
chr11	99690450	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:18,1:12,3:8,23,0,4
chr11	99690461	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,4:8,5:3,14,0,9
chr11	99690483	.	C	CAACTGAGGAACCAGGCA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.371:14:4,2:4,2:0|1:99690483_C_CAACTGAGGAACCAGGCA:99690483:0,10,0,4
chr11	99690485	.	T	TATTTTGTCGATAGATC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.380:12:3,1:3,0:0|1:99690483_C_CAACTGAGGAACCAGGCA:99690483:0,8,0,4
chr11	99715874	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:0|1:99715874_A_G:99715874:7,2,1,1
chr11	99715875	.	TAGATGGCAC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:1,0:0|1:99715874_A_G:99715874:8,3,1,1
chr11	99715887	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:1,0:0|1:99715874_A_G:99715874:8,4,1,1
chr11	99827785	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:99827785_G_A:99827785:1,7,0,2
chr11	99827795	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:99827785_G_A:99827785:0,5,0,2
chr11	99941157	.	C	CAACGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=87,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.496:6:2,0:1,3:0|1:99941157_C_CAACGA:99941157:1,2,2,1
chr11	99941160	.	C	CGTGGGTCTGGGTTTTCCAGTAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=120,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0|1:99941157_C_CAACGA:99941157:2,2,2,1
chr11	99941322	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr11	100168289	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr11	100168320	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:1,0,10,3
chr11	100169829	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	100226962	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=35263025,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,8:1,6:0,2,4,10
chr11	100730213	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,18,1
chr11	100784127	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr11	100792175	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr11	100792335	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=101,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:7,9:4,6:3,8,7,9
chr11	100812456	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:3,2,3,0
chr11	100814402	.	T	TACATTCTGTAAATGTTCCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:100814402_T_TACATTCTGTAAATGTTCCCC:100814402:3,0,0,1
chr11	100814405	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:100814402_T_TACATTCTGTAAATGTTCCCC:100814402:3,0,0,1
chr11	100814409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	100814609	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr11	100819098	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	100819305	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,5,18
chr11	100820725	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr11	100830579	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr11	100830756	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	100830780	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	100847050	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,52;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,3:0,13:0,0,8,8
chr11	100847069	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,4:3,9:1,5,6,7
chr11	100847484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=198,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,6:3,3:7,1,9,1
chr11	100847500	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,9:3,4:4,2,9,4
chr11	100863319	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:1,1,5,2
chr11	100864058	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=84,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AT;STR;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,5:1,7:1,0,12,0
chr11	100864744	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	100909809	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,2:1,5:2,0,5,2
chr11	100909811	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=183,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:100909811_C_T:100909811:6,1,1,1
chr11	100909825	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:100909811_C_T:100909811:8,1,1,1
chr11	100909991	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:3,5:3,13:3,3,11,7
chr11	100920575	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	100922202	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,22:0.768:28:3,8:3,14:3,3,14,8
chr11	100998076	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	101341931	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,1:10,3:11,8,2,2
chr11	101342150	.	A	ACTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	101353963	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:101353963_T_C:101353963:0,6,0,2
chr11	101353966	.	ATGCAAGAATAAACATCTG	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:5,0:0|1:101353963_T_C:101353963:0,6,0,2
chr11	101353989	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:101353963_T_C:101353963:0,4,0,2
chr11	101353994	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,28;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:0|1:101353963_T_C:101353963:0,3,0,2
chr11	101359799	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:8,0:10,19:10,8,0,19
chr11	101375549	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr11	101771248	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,19:0,0,13,18
chr11	101771381	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	101775663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,1,3
chr11	101778710	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr11	101818728	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:3,10:5,3:5,3,13,0
chr11	101832478	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr11	101848990	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	101868415	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	101918686	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=83,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,1:2,3,2,6
chr11	102080325	.	GAA	G,GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,21,34;MFRL=78,126,106;MMQ=60,60,60;MPOS=12,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.84,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.400,0.363:9:0,1,2:0,3,0:0,2,3,4
chr11	102098267	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.083:45:29,3:13,0:13,29,1,2
chr11	102098354	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=107,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,3:1,0:1,6,2,1
chr11	102199589	.	TTA	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TA;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.395:24:7,6:7,3:14,0,9,1
chr11	102199608	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.210:36:18,3:10,4:0|1:102199608_TA_T:102199608:22,7,7,0
chr11	102199610	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.211:36:18,3:9,4:0|1:102199608_TA_T:102199608:22,7,7,0
chr11	102207024	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	102269501	.	T	TGAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,1,1
chr11	102272800	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.254:57:23,10:19,4:27,16,7,7
chr11	102323377	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	102394087	.	AAAGAATGGCCAAGTTCATGAGTTGCAGCATACAGGAAGTTAATCCCTACAACCG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=102,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.131:22:5,2:8,0:7,13,1,1
chr11	102395859	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102395859_T_C:102395859:0,1,0,1
chr11	102395865	.	T	TCCAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102395859_T_C:102395859:0,1,0,1
chr11	102464420	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102464420_A_T:102464420:0,1,0,1
chr11	102464422	.	T	TAATATGATCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102464420_A_T:102464420:0,1,0,1
chr11	102465428	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=116,99;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:26,4:27,0:35,18,4,0
chr11	102465502	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,17,17;MFRL=133,124,133;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.24,5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.347,0.447:9:0,0,1:2,0,0:2,0,0,7
chr11	102477377	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,26:0,0,23,26
chr11	102477395	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,47:0.961:48:1,20:0,25:0,1,19,28
chr11	102495959	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:1,13:5,10:4,2,13,10
chr11	102567207	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,13,14
chr11	102567626	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr11	102573396	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	102573451	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.633:22:3,7:4,7:7,1,12,2
chr11	102584023	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr11	102584466	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=32,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.653:18:6,0:0,12:4,2,5,7
chr11	102584607	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=109,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,6:5,3:1,6,4,5
chr11	102587164	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=78,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:20,0:8,1:21,8,0,4
chr11	102592049	.	T	TTGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TG;STR;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.697:11:1,5:2,2:3,0,8,0
chr11	102592590	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	102593248	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:5,6:3,14:6,2,12,8
chr11	102595492	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=98,83;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:10,9:3,16:8,5,14,11
chr11	102595514	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:12,4:21,0:17,20,0,4
chr11	102595518	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.115:40:13,4:23,0:17,19,0,4
chr11	102595666	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=288,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	102642716	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr11	102643505	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	102647310	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,3:0,0,9,3
chr11	102647536	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,7:1,8:0,3,7,8
chr11	102647552	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,9:1,5:0,3,3,11
chr11	102649543	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	102661080	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:8,3,4,2
chr11	102665973	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.813:30:1,14:4,10:1,4,17,8
chr11	102666043	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:0,2,2,8
chr11	102666183	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=106,121;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:5,2:2,11,0,2
chr11	102668652	.	ATTACATTACTGCAGAAAAATACAAACTAAAAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=172,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:1,0:3,2:7,4,1,1
chr11	102668656	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr11	102668702	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=176,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.805:13:1,4:1,7:2,0,6,5
chr11	102706904	.	T	TTAC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=111,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.095:29:8,2:17,0:0|1:102706904_T_TTAC:102706904:16,11,1,1
chr11	102706907	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:10,2:17,0:0|1:102706904_T_TTAC:102706904:16,13,1,1
chr11	102706909	.	T	TCTTCACAGTTGGAG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=108,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,2:16,0:0|1:102706904_T_TTAC:102706904:16,12,1,1
chr11	102707339	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.589:13:2,1:3,7:0,5,0,8
chr11	102711338	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	102713620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr11	102733970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=239,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr11	102735056	.	C	CCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102735056_C_CCAGAA:102735056:0,1,0,1
chr11	102735057	.	T	TCCAGGGGCGGGGTCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102735056_C_CCAGAA:102735056:0,1,0,1
chr11	102738793	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,1,7
chr11	102738795	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,1,7
chr11	102745469	.	GCAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CAAA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	102814948	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=192,184;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:102814948_A_T:102814948:5,1,2,0
chr11	102814953	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=186,184;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:102814948_A_T:102814948:6,1,2,0
chr11	102824826	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0|1:102824826_T_C:102824826:0,0,10,1
chr11	102824835	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0|1:102824826_T_C:102824826:7,3,1,1
chr11	102824837	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:102824826_T_C:102824826:7,3,1,1
chr11	102825027	.	GG	TC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:14,0:8,2:0|1:102825027_GG_TC:102825027:8,18,0,2
chr11	102825031	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:9,2:0|1:102825027_GG_TC:102825027:8,18,0,2
chr11	102825033	.	GG	CA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:0|1:102825027_GG_TC:102825027:6,18,0,2
chr11	102825091	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr11	102953590	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,2:17,0:5,20,1,1
chr11	102953934	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:9,4,3,0
chr11	102985018	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,3:4,0:0,4,0,3
chr11	102991218	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:7,5,3,0
chr11	102996095	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=217,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,1:0,1,1,1
chr11	103013954	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr11	103014086	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=108,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:10,0:10,12:7,13,0,12
chr11	103022842	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:1,5:0,0:1,0,5,0
chr11	103026040	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=211,143,94;MMQ=60,60,60;MPOS=17,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.11,18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,9:0.249,0.553:16:2,2,4:1,2,5:3,0,12,1
chr11	103029373	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,10:0,7:0,0,16,2
chr11	103033914	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:5,5:1,6:1,5,2,10
chr11	103039533	.	CC	TT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:11,10,1,1
chr11	103041040	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr11	103041620	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:16,2:8,1:19,5,3,0
chr11	103048249	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:8,0,4,1
chr11	103050028	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	103052558	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=109,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.620:40:9,16:6,9:8,7,9,16
chr11	103060309	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	103062366	.	GTATCT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=84,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:21,3:5,1:12,14,0,4
chr11	103074349	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	103086399	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr11	103091546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	103092981	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	103101903	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:103101903_A_G:103101903:2,0,3,0
chr11	103101918	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:103101903_A_G:103101903:2,0,3,0
chr11	103101926	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:0|1:103101903_A_G:103101903:1,1,2,1
chr11	103104930	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,3,8
chr11	103123938	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,7,1
chr11	103123999	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,12:0,10:0,0,15,8
chr11	103126996	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:1,5,2,2
chr11	103127034	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103127034_A_C:103127034:0,4,0,1
chr11	103127036	.	A	ATGCTTGGTTGGTAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103127034_A_C:103127034:0,4,0,1
chr11	103127038	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103127034_A_C:103127034:0,4,0,1
chr11	103128510	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,789;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr11	103130762	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	103130778	.	A	ATTTATAAATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103130778_A_ATTTATAAATAT:103130778:0,1,0,1
chr11	103130779	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103130778_A_ATTTATAAATAT:103130778:0,1,0,1
chr11	103151034	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:4,4:7,1:8,3,4,2
chr11	103174038	.	A	AGCCTAACAGCGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.378:8:4,3:1,0:0,5,1,2
chr11	103182803	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,21;MFRL=174,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr11	103182834	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103182834_G_A:103182834:0,0,0,1
chr11	103182838	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103182834_G_A:103182834:0,0,0,1
chr11	103182853	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103182834_G_A:103182834:0,0,0,1
chr11	103182862	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=313,161;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103182834_G_A:103182834:0,1,0,1
chr11	103229110	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:4,3,1,4
chr11	103229149	.	C	CACCACCATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103229149_C_CACCACCATG:103229149:0,3,0,1
chr11	103229152	.	C	CAGATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103229149_C_CACCACCATG:103229149:0,3,0,1
chr11	103229173	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr11	103270607	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,3:5,2:3,8,1,4
chr11	103306594	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr11	103339406	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:9,2:0|1:103339406_C_T:103339406:9,8,1,1
chr11	103339408	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:103339406_C_T:103339406:9,8,1,1
chr11	103780609	.	C	CATCAAGAGGAGGGGTAGAGCTAAGACCATGGCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:103780609_C_CATCAAGAGGAGGGGTAGAGCTAAGACCATGGCT:103780609:0,5,1,1
chr11	103780610	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:3,0:1,2:1|0:103780609_C_CATCAAGAGGAGGGGTAGAGCTAAGACCATGGCT:103780609:1,4,0,2
chr11	103870755	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:4,2,6,1
chr11	103870761	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.478:13:2,2:4,3:3,4,5,1
chr11	103871039	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	103908166	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,0:9,5:6,9,1,4
chr11	103909897	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,7:5,2:4,9,4,5
chr11	104819384	.	CCACAGTTCCCCACGGTTTGCTATGGAGACATTAACTTTCTGCACACTGCTGTGCCTCCCACAGAATGGCTGT	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,61;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.176:45:11,0:16,7:19,19,3,4
chr11	104819425	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.169:21:5,3:13,0:7,11,1,2
chr11	104866384	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr11	104868190	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:9,2:9,7,2,0
chr11	104870945	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:4,9:2,9:5,1,15,3
chr11	104871322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=171,236;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	104872981	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,2,14
chr11	104879686	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:3,1,0,2
chr11	104971210	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=108,141;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:8,1:12,5:13,7,4,2
chr11	104972101	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:7,8:19,4:11,15,6,6
chr11	104972190	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=90,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:4,8:10,10:5,9,9,9
chr11	105009698	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=200,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:6,3:3,5,3,0
chr11	105009725	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:2,2:5,4:6,2,3,3
chr11	105732669	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:8,0,5,0
chr11	105795448	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:16,2:11,2:0|1:105795448_G_A:105795448:15,12,2,2
chr11	105795459	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=104,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:105795448_G_A:105795448:15,13,1,1
chr11	105795464	.	T	TC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:18,0:10,2:0|1:105795448_G_A:105795448:13,16,1,1
chr11	105795466	.	T	TTAGTTTTGTC	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:10,2:0|1:105795448_G_A:105795448:13,15,1,1
chr11	105924096	.	T	TGCCTGGGTCCTGTCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr11	105965214	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=169,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	106680653	.	CAATTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	106680897	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=103,163;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:8,4,0,3
chr11	106849520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	106856863	.	GAAT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=80,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAT;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0,3,1,0
chr11	106856883	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:106856883_A_T:106856883:1,1,0,1
chr11	106856884	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:106856883_A_T:106856883:1,1,0,1
chr11	107197536	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	107197606	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr11	107197869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=199,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	107207441	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=9,26;MFRL=59,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:0,0:1,3,1,1
chr11	107286893	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr11	107299623	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=82,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.422:24:6,8:6,2:0|1:107299623_A_C:107299623:7,7,5,5
chr11	107299631	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,16:0.566:28:8,10:3,6:1|0:107299623_A_C:107299623:7,5,8,8
chr11	107304541	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	107326340	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr11	107375598	.	ACC	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:107375598_ACC_A:107375598:7,11,0,2
chr11	107375602	.	G	GAATGAATCAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:107375598_ACC_A:107375598:6,11,0,2
chr11	107375604	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:107375598_ACC_A:107375598:7,11,0,2
chr11	107375608	.	C	CTGTGGAGAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:0|1:107375598_ACC_A:107375598:6,11,0,2
chr11	107375942	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:19,2:0|1:107375942_C_T:107375942:9,20,1,1
chr11	107375956	.	CA	TT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:9,0:19,2:0|1:107375942_C_T:107375942:6,24,1,1
chr11	107375959	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=91,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,0:17,2:0|1:107375942_C_T:107375942:5,23,1,1
chr11	107381765	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,1:3,10:1,4,4,7
chr11	107396158	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:7,5,2,2
chr11	107402995	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,6:1,4:5,2,9,1
chr11	107403202	.	TAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	107431637	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:1,4,1,3
chr11	107462977	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	107463228	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr11	107506422	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0|1:107506422_A_T:107506422:6,8,1,1
chr11	107506429	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:107506422_A_T:107506422:5,6,1,1
chr11	107521169	.	T	TGTGCAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	107535844	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=97,156;MMQ=60,20;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:8,9,3,0
chr11	107578619	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:14,4,1,2
chr11	107673628	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr11	107675467	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,10:6,4:5,5,3,11
chr11	107675566	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	107676228	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=80,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:5,10,2,0
chr11	107677399	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0,0,14,2
chr11	107904646	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr11	107925303	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr11	107925327	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr11	107948858	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr11	107960386	.	A	AGTTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=243,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	107960393	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	107969300	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,1:0,2:0,0,1,5
chr11	108006047	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	108012510	.	A	AAAGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr11	108013093	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=192,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr11	108013322	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:0|1:108013322_C_G:108013322:0,9,0,2
chr11	108013326	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:2,0:0|1:108013322_C_G:108013322:1,9,0,2
chr11	108014684	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=C;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	108014799	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr11	108059000	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	108098459	.	TAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=131.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,13,19
chr11	108100105	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr11	108114661	.	AT	A,ATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29,31;MFRL=119,174,37;MMQ=60,60,60;MPOS=28,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=16.32,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,9,4:0.431,0.207:21:7,5,1:1,4,0:7,1,11,2
chr11	108114868	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=134,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:108114868_T_A:108114868:9,11,1,1
chr11	108114874	.	G	GATTTCTAGATTCTCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:13,2:0|1:108114868_T_A:108114868:9,13,1,1
chr11	108119615	.	CA	C,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34,26;MFRL=205,178,209;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.79,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:0,2,0:2,0,2:2,0,4,0
chr11	108122848	.	T	TGTGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=1100,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108122848_T_TGTGC:108122848:1,1,0,1
chr11	108122850	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=1100,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108122848_T_TGTGC:108122848:1,1,0,1
chr11	108122852	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=1100,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108122848_T_TGTGC:108122848:1,1,0,1
chr11	108122855	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=1100,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108122848_T_TGTGC:108122848:1,1,0,1
chr11	108129657	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,5:0,0,12,4
chr11	108129889	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	108138009	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:10,7,1,1
chr11	108141701	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr11	108141955	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr11	108143182	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr11	108151707	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr11	108183311	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108183311_T_C:108183311:0,1,0,1
chr11	108183315	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108183311_T_C:108183311:0,1,0,1
chr11	108188266	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.254:22:5,1:7,4:3,13,2,4
chr11	108195976	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=103,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.677:5:0,2:0,2:0,1,4,0
chr11	108196301	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=193,188;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr11	108196712	.	CATT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATT;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	108201008	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:3,9:2,10:2,3,12,7
chr11	108218196	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	108224697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	108225483	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr11	108225661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	108256661	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:108256661_GA_G:108256661:4,4,1,1
chr11	108256665	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:108256661_GA_G:108256661:5,4,1,1
chr11	108256670	.	CTTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:108256661_GA_G:108256661:6,3,1,1
chr11	108345515	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=86.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,8:0,0,18,6
chr11	108345650	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,0:14,3:13,11,1,2
chr11	108348426	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=94,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,0:8,3:2,12,2,1
chr11	108352160	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr11	108380335	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=107,123;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,19:0.691:27:0,8:0,11:0|1:108380335_T_C:108380335:8,0,9,10
chr11	108380342	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,8:0.289:29:10,8:11,0:1|0:108380335_T_C:108380335:10,11,8,0
chr11	108547940	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=140,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:108547940_C_T:108547940:8,12,1,1
chr11	108547952	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:108547940_C_T:108547940:7,12,1,1
chr11	108547954	.	TC	CA	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:108547940_C_T:108547940:7,13,1,1
chr11	108547959	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:108547940_C_T:108547940:7,13,1,1
chr11	108547961	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:108547940_C_T:108547940:7,13,1,1
chr11	108547971	.	GT	AC	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,1:0|1:108547940_C_T:108547940:6,13,1,1
chr11	108593970	.	GGAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr11	108722851	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=74.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,14,8
chr11	108788634	.	GTGA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TGA;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:3,1:7,1,1,1
chr11	109295007	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=90,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,0:8,4:5,6,3,1
chr11	109295018	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,0:9,3:5,7,3,2
chr11	109296012	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25,23;MFRL=169,195,152;MMQ=60,60,60;MPOS=16,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.47,6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.236,0.368:13:2,1,2:3,2,2:2,3,4,4
chr11	109964079	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:109964079_C_A:109964079:0,0,2,0
chr11	109964089	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:109964079_C_A:109964079:0,0,2,0
chr11	109964187	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr11	110023628	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:2,6:3,3:4,2,5,4
chr11	110030066	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,81;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,0:13,5:11,16,0,5
chr11	110035191	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=65,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:4,2,0,2
chr11	110036109	.	CCTTATTCCCGCCAGGAAGGCCTGGGAAGCTGGGAGAGGCCAGGCTATGGGATCGACGCCTATGGGTACCGGCAGA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:10,0:3,2:15,17,1,1
chr11	110106746	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	110124888	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr11	110128925	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.424:10:3,1:3,2:0,6,0,4
chr11	110150486	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=132,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:3,3:1,0:1,3,1,2
chr11	110450875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:6,5,1,1
chr11	110451838	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=114,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:8,10,2,1
chr11	110452999	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:110452999_C_A:110452999:0,0,5,0
chr11	110453009	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:110452999_C_A:110452999:0,0,3,0
chr11	110453250	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	110485336	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,4:4,0:6,9,2,2
chr11	110486206	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:9,4:6,0:11,5,3,1
chr11	111152263	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	111156676	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,143;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:14,12,3,0
chr11	111156836	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr11	111167206	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=245,258;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:0,0:2,1:0|1:111167206_C_CA:111167206:2,0,1,0
chr11	111167227	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=217,258;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:111167206_C_CA:111167206:3,1,1,0
chr11	111167557	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,10:0,25:0,0,12,24
chr11	111168128	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=95,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:9,0:5,3:6,8,1,2
chr11	111179054	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,10,15
chr11	111229421	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr11	111229470	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr11	111249819	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	111366028	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,0:9,6:6,8,0,6
chr11	111368231	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,191;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr11	111368957	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=253,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111368957_C_CT:111368957:0,1,0,1
chr11	111368960	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=253,284;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111368957_C_CT:111368957:0,1,0,1
chr11	111383789	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr11	111385835	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	111407611	.	C	CACAGAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	111414899	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:11,0:12,10:4,21,0,10
chr11	111487106	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr11	111575835	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,229;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.143:30:12,3:14,0:9,17,4,0
chr11	111591693	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:15,3:19,0:18,16,1,2
chr11	111592651	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0|1:111592651_A_T:111592651:4,8,0,2
chr11	111592657	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:111592651_A_T:111592651:3,8,0,2
chr11	111594226	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=92,33;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:10,2:15,0:0|1:111594226_G_GA:111594226:17,15,1,1
chr11	111594229	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=92,33;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:10,2:18,0:0|1:111594226_G_GA:111594226:18,15,1,1
chr11	111594230	.	A	AC	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=93,33;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:11,2:22,0:0|1:111594226_G_GA:111594226:19,15,1,1
chr11	111594234	.	GA	AC	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=93,33;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:10,2:21,0:0|1:111594226_G_GA:111594226:17,15,1,1
chr11	111623088	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,2:5,2:1,5,1,3
chr11	111624225	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,0:12,3:9,13,1,2
chr11	111624389	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=182,208;MMQ=57,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:111624389_T_C:111624389:0,3,0,1
chr11	111624396	.	GC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=182,208;MMQ=57,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:111624389_T_C:111624389:0,3,0,1
chr11	111631620	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:5,2:18,0:12,11,0,2
chr11	111637117	.	T	TCCCGCCCCGCGCCCAGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,0;MFRL=110,138;MMQ=50,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCCGCCCCGCGCCCAGGC;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.476:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr11	111728500	.	A	ACCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	111728503	.	T	TTTACCCCACACCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	111741023	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,7:0.080:96:41,0:47,7:65,24,7,0
chr11	111741084	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.076:50:18,0:25,3:0|1:111741084_C_T:111741084:29,18,3,0
chr11	111741086	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:17,0:26,3:0|1:111741084_C_T:111741084:29,18,3,0
chr11	111746305	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:111746305_CA_C:111746305:3,4,1,1
chr11	111746308	.	CCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:111746305_CA_C:111746305:3,4,1,1
chr11	111746315	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:111746305_CA_C:111746305:3,4,1,1
chr11	111747427	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,1,2
chr11	111749265	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,6:5,0:7,0,6,0
chr11	111753407	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111753407_AT_A:111753407:0,1,0,1
chr11	111753411	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111753407_AT_A:111753407:0,1,0,1
chr11	111753414	.	C	CGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111753407_AT_A:111753407:0,1,0,1
chr11	111795085	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.421:10:4,0:1,4:2,4,2,2
chr11	111795148	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=134,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr11	111848361	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr11	111848531	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=85,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.175:47:24,6:15,1:30,9,4,4
chr11	111853106	.	G	GC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=100.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,18:0,0,18,17
chr11	111857702	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=117,2387128;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:3,1:6,9,2,0
chr11	111857711	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=123,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:10,1:1,2:4,8,1,2
chr11	111889635	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr11	111889654	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:4,2,1,2
chr11	111897028	.	GTT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.264:11:1,1:2,0:2,6,1,2
chr11	111907935	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:13,5,2,0
chr11	111915765	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr11	111916001	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr11	111931798	.	GG	AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:7,2:4,0:6,5,1,1
chr11	111933088	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:6,1:7,3,4,0
chr11	111946421	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:17,1:5,1:5,17,0,2
chr11	111948967	.	T	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,8:0.113:78:21,8:48,0:47,23,8,0
chr11	112050299	.	ATTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=291,282;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	112064339	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,3:13,0:11,11,1,2
chr11	112064346	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:13,9,1,1
chr11	112064431	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,8,14
chr11	112071294	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr11	112071570	.	AA	TT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr11	112087101	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	112088499	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,6:0,0,10,5
chr11	112099294	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=108,69,129;MMQ=60,60,60;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.55,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.272,0.545:8:1,2,3:0,0,1:1,0,6,1
chr11	112101084	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,233;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.189:13:8,0:2,2:0,11,0,2
chr11	112104002	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:1,10,1,1
chr11	112126399	.	C	CTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	112832276	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:5,1:4,3:9,4,4,0
chr11	112832307	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=113.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,11:0,22:0,0,18,17
chr11	112832339	.	GC	G	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=181.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,18:0,24:0,0,29,17
chr11	112832353	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=52,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,42:0.937:44:0,17:2,22:1,1,23,19
chr11	112832358	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,18:0,0,21,17
chr11	112832391	.	ATT	A,AT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=24,25,23;MFRL=111,117,108;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.34,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.187,0.216:16:5,1,2:5,2,1:1,9,0,6
chr11	113073066	.	T	TTTTTGTTTTGTTTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=218,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=TTTTG;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,3:2,0,8,0
chr11	113076982	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	113078582	.	AGACGATGAGAAGTACATCTTCAGC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,105;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,2:6,0:14,9,1,1
chr11	113085192	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=112,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:113085192_A_T:113085192:4,7,1,1
chr11	113085199	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:113085192_A_T:113085192:4,7,1,1
chr11	113085244	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=106,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,5:3,2:2,1,3,4
chr11	113105979	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113105979_A_C:113105979:0,0,0,1
chr11	113105981	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113105979_A_C:113105979:0,0,0,1
chr11	113105984	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:113105979_A_C:113105979:0,0,0,1
chr11	113111665	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr11	113126598	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:10,3:10,0:0|1:113126598_G_A:113126598:10,10,1,2
chr11	113126612	.	A	ACTCCAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=136,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:4,2:4,0:0|1:113126598_G_A:113126598:7,8,1,2
chr11	113126615	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,37;MFRL=124,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:113126598_G_A:113126598:4,7,0,2
chr11	113133676	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=177,50;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:5,0:2,2:4,5,1,1
chr11	113141142	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:113141142_C_T:113141142:4,4,1,1
chr11	113141148	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:1,2:0|1:113141142_C_T:113141142:4,7,1,1
chr11	113141154	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,0:1,1:0|1:113141142_C_T:113141142:4,8,1,1
chr11	113141158	.	G	GATGA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,0:1,2:0|1:113141142_C_T:113141142:4,8,1,1
chr11	113196409	.	A	AGAACAAAGCTGTGCGGTGTTTTTCTGATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	113209428	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr11	113210150	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:8,12,3,0
chr11	113221865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	113230800	.	T	TGTTTTGTTTTGTTTTAGTTGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=109,103;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.627:2:1,1:0,0:0|1:113230800_T_TGTTTTGTTTTGTTTTAGTTGA:113230800:0,1,0,1
chr11	113230803	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=109,103;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.645:2:1,1:0,0:0|1:113230800_T_TGTTTTGTTTTGTTTTAGTTGA:113230800:0,1,0,1
chr11	113230806	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=109,103;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.645:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	113233059	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr11	113234679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=77,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr11	113239082	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr11	113239320	.	C	CAGCCTTCTCTGCCCCCAGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:113239320_C_CAGCCTTCTCTGCCCCCAGGG:113239320:1,2,0,1
chr11	113239323	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:113239320_C_CAGCCTTCTCTGCCCCCAGGG:113239320:1,2,0,1
chr11	113264470	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	113265850	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,0:3,11:3,4,2,9
chr11	113266001	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,0,2
chr11	113266702	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr11	113268834	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.481:2:0,0:1,1:0|1:113268834_T_TC:113268834:0,1,0,1
chr11	113268840	.	G	GCACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113268834_T_TC:113268834:0,1,0,1
chr11	113268841	.	G	GCCAGCCCCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113268834_T_TC:113268834:0,1,0,1
chr11	113269792	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,4:0,5:3,2,6,3
chr11	113269869	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=184,275;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:11,3:5,10,3,0
chr11	113269944	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:5,6,1,2
chr11	113271065	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	113281397	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr11	113283459	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,19:0,8:0,0,14,13
chr11	113283477	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,5:0,0,14,8
chr11	113294998	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	113561054	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0|1:113561054_A_G:113561054:0,0,9,19
chr11	113561057	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,13:0,13:0|1:113561054_A_G:113561054:0,0,9,19
chr11	113563730	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:1,2:3,0,3,0
chr11	113566195	.	G	GATGCAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=175,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,0,1
chr11	113566207	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr11	113570456	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=175,119;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=84.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,21:0.629:33:4,0:8,21:0|1:113570456_T_A:113570456:0,12,0,21
chr11	113570461	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=175,119;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=84.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,21:0.629:33:4,0:8,21:0|1:113570456_T_A:113570456:0,12,0,21
chr11	113570490	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=38,34;MFRL=182,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr11	113576932	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=91,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,45:0.941:47:2,16:0,28:1,1,25,20
chr11	113609854	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	113618470	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:113618470_T_A:113618470:0,4,0,2
chr11	113618493	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,2,0,1
chr11	113618496	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,2,0,1
chr11	113618499	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,1,0,1
chr11	113618500	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,1,0,1
chr11	113618503	.	AAT	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,22;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,1,0,1
chr11	113618506	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,27;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113618470_T_A:113618470:0,1,0,1
chr11	113618968	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr11	113629433	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:5,11,1,2
chr11	113631408	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113631408_C_CAG:113631408:2,2,0,1
chr11	113631411	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:113631408_C_CAG:113631408:2,2,0,1
chr11	113639461	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=219,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:113639461_G_GT:113639461:2,0,1,1
chr11	113639463	.	T	TGCAATATGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=219,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:113639461_G_GT:113639461:2,0,1,1
chr11	113639467	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=219,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:113639461_G_GT:113639461:2,0,0,1
chr11	113639472	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:113639461_G_GT:113639461:4,0,0,1
chr11	113644261	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr11	113670052	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr11	113672497	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	113677357	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=173,82;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:2,0:1,1:0|1:113677357_A_AT:113677357:0,4,0,1
chr11	113677358	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=156,82;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:113677357_A_AT:113677357:0,3,0,1
chr11	113677361	.	G	GACACTTCTCGAAATAAAACATACATGCGGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=156,82;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:113677357_A_AT:113677357:0,3,0,1
chr11	113678924	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	113680018	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr11	113680052	.	T	TTCAGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=190,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.349:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	113680062	.	TTATCTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	113684721	.	A	AACTCTAAGCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	113688357	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr11	113697927	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.363:15:3,1:2,4:5,5,3,2
chr11	113723125	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	113802547	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=115,121;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:11,11,1,1
chr11	113802600	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=107,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:3,1:7,8:3,7,4,5
chr11	113802601	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,4:0,14:0,0,6,12
chr11	113813607	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr11	113846006	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.773:10:1,3:0,4:1,1,5,3
chr11	113848184	.	G	GCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	113856681	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	113857765	.	T	TGTAACTACTTAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=187,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:113857765_T_TGTAACTACTTAC:113857765:0,3,1,1
chr11	113857768	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=187,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:113857765_T_TGTAACTACTTAC:113857765:0,3,1,1
chr11	113860207	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=100,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,4:3,0:7,5,2,2
chr11	114120999	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	114167476	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr11	114182857	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=122,35;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:9,12,1,1
chr11	114182858	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=122,35;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:9,12,1,1
chr11	114182862	.	C	CCCAT	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=134,35;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:9,12,1,1
chr11	114182866	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=135,35;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:9,11,1,1
chr11	114182867	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=135,35;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:9,11,1,1
chr11	114182870	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,35;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:114182857_C_CA:114182857:7,11,1,1
chr11	114273673	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,1:7,5:2,9,1,5
chr11	114276552	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr11	114315188	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,152;MMQ=39,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	114393244	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:114393244_G_C:114393244:1,2,0,1
chr11	114393247	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:114393244_G_C:114393244:1,2,0,1
chr11	114393253	.	A	AAATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:114393244_G_C:114393244:0,3,0,1
chr11	114393314	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	114393652	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr11	114398627	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr11	114451129	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	114452339	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=221,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr11	114453613	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=112,26127;MMQ=46,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:114453613_A_G:114453613:5,15,0,2
chr11	114453616	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=112,26127;MMQ=46,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:114453613_A_G:114453613:5,13,0,2
chr11	114550334	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr11	114568943	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=108,98;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:9,10,1,2
chr11	114569054	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,5:0,12:0,1,8,10
chr11	114569359	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=103,138;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:11,0:4,10,3,0
chr11	114574819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr11	115049311	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,3,0
chr11	115102022	.	TATCTGCTAGAATCAGCTAACTACTTCAGTGTGTGGCA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:4,2:11,0:18,7,1,1
chr11	115102224	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:1,4,3,5
chr11	115375053	.	CGCCGCCGCCGCCGCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:6,0:8,2:0,16,1,1
chr11	116628396	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:116628396_C_T:116628396:4,0,2,0
chr11	116628401	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:116628396_C_T:116628396:3,1,2,0
chr11	116629153	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr11	116629734	.	T	TA,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24,25;MFRL=172,133,132;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=13.90,6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,5:0.536,0.317:16:0,5,3:2,4,1:2,0,11,3
chr11	116631391	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr11	116631426	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:15,3:4,0:11,8,2,1
chr11	116631535	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:15,2:4,0:0|1:116631535_G_A:116631535:11,8,1,1
chr11	116631548	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:15,2:6,0:0|1:116631535_G_A:116631535:11,10,1,1
chr11	116631690	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:4,8,3,2
chr11	116631707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr11	116633281	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=95,55;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,3:11,0:11,11,3,0
chr11	116633362	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,163;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:6,21:12,0:10,8,21,0
chr11	116640768	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=158,163;MMQ=52,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,1:4,2:5,1,3,0
chr11	116640772	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=222,155;MMQ=57,42;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.686:8:0,0:2,4:2,0,4,2
chr11	116641028	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=240,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	116658647	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=181,271;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:116658647_G_A:116658647:0,4,0,1
chr11	116658654	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=184,271;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:116658647_G_A:116658647:0,4,0,1
chr11	116661826	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	116662331	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,4:1,2,3,4
chr11	116662407	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,6:3,4:2,3,5,5
chr11	116662702	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr11	116691511	.	GGACA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GACA;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	116692518	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=97,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:4,7,0,3
chr11	116693464	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=38,95;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:5,6:0,5:0|1:116693464_C_T:116693464:1,4,4,7
chr11	116693465	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=96,38;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:10,2:5,0:1|0:116693464_C_T:116693464:5,11,1,1
chr11	116693466	.	T	TCTAAA	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=96,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:10,2:5,0:1|0:116693464_C_T:116693464:5,11,1,1
chr11	116693467	.	G	GAT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=96,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:10,2:5,0:1|0:116693464_C_T:116693464:5,11,1,1
chr11	116693469	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=97,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.158:17:10,2:5,0:1|0:116693464_C_T:116693464:5,10,1,1
chr11	116693471	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=97,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.158:17:10,2:4,0:1|0:116693464_C_T:116693464:5,10,1,1
chr11	116703640	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:4,4:12,3:3,14,1,6
chr11	116708020	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=80,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr11	116732058	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=86,211;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.122:24:12,0:6,2:0|1:116732058_T_A:116732058:15,7,0,2
chr11	116732060	.	G	GTCGCGGTAACGGTCTTTTTCGGCTATGGTGTTCACCGGC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=97,211;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:5,2:0|1:116732058_T_A:116732058:14,6,0,2
chr11	116732064	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=113,211;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:2,2:0|1:116732058_T_A:116732058:12,5,0,2
chr11	116732512	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:3,2,4,2
chr11	116741196	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr11	116746782	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=238,8649864;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:1,4,2,0
chr11	116824884	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:4,4:8,6:4,8,1,9
chr11	117030624	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr11	117030672	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:12,4:12,0:16,8,1,3
chr11	117030796	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr11	117034388	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=194,228;MMQ=55,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,12;RU=A;STR;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr11	117034421	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=208,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:6,5:0,4:6,1,7,3
chr11	117034619	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=84,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:3,9:6,6:3,6,4,12
chr11	117052069	.	GTCTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:1,1:0|1:117052069_GTCTCT_G:117052069:2,1,1,0
chr11	117052080	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:117052069_GTCTCT_G:117052069:2,1,1,0
chr11	117053165	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=194,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr11	117057226	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:9,1,6,0
chr11	117059347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	117059552	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,1:8,3:6,11,1,3
chr11	117060611	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr11	117061317	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,5:10,0:11,8,5,0
chr11	117064583	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,0:10,3:0|1:117064583_G_T:117064583:12,10,1,2
chr11	117064604	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:15,0:11,3:0|1:117064583_G_T:117064583:13,14,1,2
chr11	117064693	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:1,7,2,4
chr11	117074229	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=184,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr11	117079845	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=246,220;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:117079845_A_C:117079845:0,2,0,1
chr11	117079847	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=246,220;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:117079845_A_C:117079845:0,2,0,1
chr11	117090225	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=202,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr11	117090558	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,4:0,0:0,3,1,3
chr11	117094756	.	GAC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:14,1,1,1
chr11	117095361	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,7:4,8:4,3,10,5
chr11	117098988	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=98,55;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:12,0:22,3:15,20,1,2
chr11	117151014	.	AGTTT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=160,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GTTT;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr11	117152540	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=230,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	117163765	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,14,20
chr11	117222444	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=130,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr11	117222647	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.271:17:2,2:3,1:5,8,3,1
chr11	117222754	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,4:6,0:2,8,0,5
chr11	117234165	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:11,3:2,0:6,7,1,2
chr11	117241760	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr11	117244566	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=132,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:8,0:8,6:0|1:117244566_C_T:117244566:6,12,2,6
chr11	117244588	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=143,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:7,0:5,6:0|1:117244566_C_T:117244566:3,10,2,6
chr11	117251521	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr11	117252489	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=332,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:1,8:0,12:1,0,13,8
chr11	117258198	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr11	117258202	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:117258202_C_A:117258202:1,3,0,1
chr11	117258204	.	G	GCTTGGCAATTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=274,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117258202_C_A:117258202:0,3,0,1
chr11	117266754	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr11	117266901	.	GCTGGGGGCTGGGGC	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=81,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGGGGGCTGGGGC;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:3,0:3,3:6,1,1,2
chr11	117266951	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.595:3:0,0:1,2:0|1:117266951_G_GGT:117266951:1,0,1,1
chr11	117266954	.	AGGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:117266951_G_GGT:117266951:1,0,1,1
chr11	117267962	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=123,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:10,2:0|1:117267962_C_T:117267962:9,11,2,0
chr11	117267969	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:117267962_C_T:117267962:8,12,2,0
chr11	117282757	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=180,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr11	117282780	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=104,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:7,2,1,1
chr11	117282800	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr11	117299015	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:7,3:4,1:8,3,4,0
chr11	117303242	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=60,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:4,4:2,9:2,4,8,6
chr11	117306291	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	117308130	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:17,0:11,2:0|1:117308130_C_T:117308130:21,7,1,1
chr11	117308136	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:17,0:10,2:0|1:117308130_C_T:117308130:20,7,1,1
chr11	117321175	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	117332352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr11	117351986	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr11	117351998	.	C	CTTCGGGCCCCCTCTCCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:5,3,1,1
chr11	117375832	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=191,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117375832_CTG_C:117375832:0,1,0,1
chr11	117375837	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=191,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117375832_CTG_C:117375832:0,1,0,1
chr11	117376190	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=57557674,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr11	117395481	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:2,2,2,1
chr11	117403017	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	117691375	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.706:32:2,5:7,18:2,7,8,15
chr11	117692934	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	117695340	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=69,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:12,3:7,7:11,8,3,7
chr11	117698687	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:21,2:16,0:0|1:117698687_G_A:117698687:16,21,1,1
chr11	117698703	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:15,0:0|1:117698687_G_A:117698687:14,13,1,1
chr11	117698731	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:10,0:12,10:8,14,1,9
chr11	117773110	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	117774291	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	117774857	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	117776471	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.816:25:3,13:1,8:0,4,9,12
chr11	117776507	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,2:4,0:2,9,0,2
chr11	117780595	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:5,1:12,2:11,8,2,1
chr11	117781435	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,13:0,0,15,12
chr11	117784434	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr11	117785260	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr11	117789312	.	CGGGCTGGAGATGCCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCTGGAGATGCCT;STR;TLOD=64.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.952:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr11	117799923	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr11	117800083	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,4,9
chr11	117864063	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:4,7:4,5:5,3,5,7
chr11	117975620	.	C	CCTGCTCCCTCTCGTCACCCTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr11	117988223	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	118007819	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=100,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:13,0:8,6:7,14,0,6
chr11	118011860	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,3:7,2,7,2
chr11	118014873	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr11	118016039	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=282,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	118067426	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr11	118067621	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	118071097	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	118071299	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:16,4:19,0:26,12,4,0
chr11	118074117	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr11	118081116	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	118081468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,2,9
chr11	118083664	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=185,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.952:38:1,18:0,19:0,1,20,17
chr11	118108003	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr11	118111093	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,669;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:24,0:20,7:13,31,3,4
chr11	118134785	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0,0,16,14
chr11	118210106	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=72,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:15,1:13,4:21,9,4,1
chr11	118215075	.	AGGCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGCT;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:2,1:3,2,2,0
chr11	118221336	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=97,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:3,2:13,1:0|1:118221336_T_C:118221336:11,5,1,2
chr11	118221340	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=84,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,2:13,0:0|1:118221336_T_C:118221336:13,8,1,1
chr11	118221341	.	G	GGAGACCAAGGCAGGTGGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=84,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:0|1:118221336_T_C:118221336:11,8,1,1
chr11	118221474	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr11	118240332	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr11	118243700	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr11	118245971	.	CTG	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.257:13:4,2:6,1:2,8,1,2
chr11	118255278	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.513:11:2,3:3,2:5,0,5,1
chr11	118255662	.	TAAAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,0:2,1:1,4,0,1
chr11	118255756	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=282,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118255756_C_CG:118255756:0,1,0,1
chr11	118255758	.	T	TAGGGGACACAAAATGTTTTCGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=282,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118255756_C_CG:118255756:0,1,0,1
chr11	118261609	.	TAA	CTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=188,127;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:1,1:3,0:0|1:118261609_TAA_CTG:118261609:0,4,0,1
chr11	118261618	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=199,127;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118261609_TAA_CTG:118261609:0,2,0,1
chr11	118343887	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=192,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:118343887_T_G:118343887:0,1,1,1
chr11	118343889	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=192,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:118343887_T_G:118343887:0,1,1,1
chr11	118345040	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118345040_TC_GG:118345040:0,2,0,1
chr11	118345048	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118345040_TC_GG:118345040:0,0,0,1
chr11	118362414	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=92,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,5:1,1:4,1,6,0
chr11	118367048	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:16,0:11,17,0,2
chr11	118403054	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,170;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:11,3:14,0:0|1:118403054_T_C:118403054:12,15,3,0
chr11	118403059	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=150,170;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:0|1:118403054_T_C:118403054:11,14,3,0
chr11	118403205	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.570:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr11	118404284	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:7,7,0,2
chr11	118405343	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=337,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,1,3
chr11	118416073	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:7,5,2,0
chr11	118416253	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:1,8,1,3
chr11	118422385	.	CAAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.242:6:4,1:0,0:4,1,1,0
chr11	118485261	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=60,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:8,5,2,0
chr11	118526282	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=123,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr11	118528932	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=21,27;MFRL=103,101;MMQ=58,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:5,8:5,0:8,2,8,0
chr11	118529017	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,13,10
chr11	118529044	.	C	CG	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,14,9
chr11	118529069	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,13:0,11:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,14,12
chr11	118529078	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,13,13
chr11	118532728	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr11	118625609	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr11	118626215	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr11	118651809	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,7:6,2:6,5,7,2
chr11	118766482	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:8,2:9,8,2,1
chr11	118769032	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	118769559	.	AGGGGGCTGAGCCTTG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.135:23:10,2:6,1:14,6,1,2
chr11	118770857	.	TGGCGGGAGGTGCTGAGGAGCTGCTCCGGGGGCCGCTA	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:16,2:9,0:17,24,1,1
chr11	118842780	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	118851138	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,5:1,1,5,6
chr11	118852057	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0|1:118852057_G_A:118852057:0,4,0,2
chr11	118852081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:118852057_G_A:118852057:0,0,0,3
chr11	118868842	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	118883880	.	AT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.250:46:13,8:18,3:27,7,9,3
chr11	118883899	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.082:70:35,0:29,5:47,18,5,0
chr11	118884009	.	AT	A,ATT	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=20,23,27;MFRL=121,127,128;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=16.57,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,15,5:0.298,0.127:45:9,7,2:6,2,1:14,11,11,9
chr11	118884097	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=168,177;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:9,3:2,0:0|1:118884097_T_C:118884097:0,11,0,3
chr11	118884099	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=175,177;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,1:2,0:0|1:118884097_T_C:118884097:0,12,0,3
chr11	118885668	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=117,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:0,2:2,1,5,0
chr11	118886472	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:9,0:20,1,2,1
chr11	118889058	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:4,7,3,7
chr11	118889114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr11	118896782	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=97,67;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:23,0:20,3:20,23,1,2
chr11	118897445	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=75,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:0,0:2,2:1,2,1,1
chr11	118898435	.	AC	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=92.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,18:0,14:0,0,15,17
chr11	118899223	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:118899223_G_T:118899223:1,0,0,1
chr11	118899227	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118899223_G_T:118899223:1,0,0,1
chr11	118899233	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:118899223_G_T:118899223:1,1,0,1
chr11	118899236	.	TG	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118899223_G_T:118899223:1,1,0,1
chr11	118918982	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:118918982_T_A:118918982:6,2,1,1
chr11	118918984	.	ATCCTC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,20;MFRL=82,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:1,2:0|1:118918982_T_A:118918982:6,3,1,1
chr11	118919770	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:14,1:15,12,0,2
chr11	118920453	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,9:0,0,17,7
chr11	118922591	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=101,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:17,4:9,0:14,13,3,1
chr11	118926720	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,6:0,0,14,4
chr11	118939939	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,16,9
chr11	118942419	.	CG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:10,1:13,7,0,2
chr11	118942638	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:118942638_A_C:118942638:0,0,0,2
chr11	118942654	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:118942638_A_C:118942638:0,0,0,2
chr11	118944675	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,4:2,1:5,2,3,2
chr11	118949331	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.553:23:9,6:1,4:5,5,7,6
chr11	118949799	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,7:5,8:3,3,11,4
chr11	118952371	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:2,11:5,5:1,6,7,10
chr11	118955679	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:12,2:4,4:14,3,5,1
chr11	118958869	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=80,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,8:1,5:1,0,12,1
chr11	118959732	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:0,4:3,3:2,1,5,2
chr11	118961076	.	G	GGGAATCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	118962764	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:8,2,1,3
chr11	118963291	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:2,6,1,4
chr11	118966067	.	GCGCGGGCCTTGC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,2:11,0:6,11,1,1
chr11	118970875	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:118970875_T_C:118970875:0,0,9,0
chr11	118970878	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:118970875_T_C:118970875:4,0,4,0
chr11	118971251	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=181,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr11	118973112	.	AA	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,13:0,0,6,16
chr11	118973133	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,3:5,1:2,8,0,4
chr11	118984287	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr11	118984629	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=136,147;MMQ=60,26;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.164:32:12,4:15,0:14,13,5,0
chr11	118985151	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr11	118997869	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr11	119001478	.	TC	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=108,192;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.275:27:13,0:6,7:0|1:119001478_TC_T:119001478:9,11,0,7
chr11	119001487	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=108,192;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:13,0:5,7:0|1:119001478_TC_T:119001478:9,11,0,7
chr11	119003322	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:4,4:7,4:4,8,5,3
chr11	119004009	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr11	119004026	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,194;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,0,6
chr11	119005132	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:1,1:4,4:3,2,4,1
chr11	119025118	.	TCACC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr11	119027159	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=116,106;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.228:32:15,0:9,6:13,12,0,7
chr11	119031136	.	G	GCACGCCAATAACCACGTGGGACATGAACC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr11	119031841	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr11	119054488	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr11	119057354	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=107,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,2:8,0:0|1:119057354_C_T:119057354:17,9,2,0
chr11	119057359	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,2:9,0:0|1:119057354_C_T:119057354:17,11,2,0
chr11	119059404	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,14,5
chr11	119060086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=103,117;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,3:7,0:10,5,3,0
chr11	119060963	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr11	119063875	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:12,10,2,0
chr11	119064525	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=101,102;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.195:39:16,0:15,5:0|1:119064525_C_T:119064525:10,22,0,7
chr11	119064530	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=102,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,7:0.182:42:16,0:17,7:0|1:119064525_C_T:119064525:11,24,0,7
chr11	119145705	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	119146659	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr11	119148573	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,6:0,19:0,0,10,15
chr11	119155618	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr11	119167814	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	119167819	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:119167819_C_A:119167819:0,1,0,1
chr11	119167821	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:119167819_C_A:119167819:0,1,0,1
chr11	119167824	.	T	TCAGA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119167819_C_A:119167819:0,0,0,1
chr11	119167830	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119167819_C_A:119167819:0,0,0,1
chr11	119167832	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119167819_C_A:119167819:0,0,0,1
chr11	119180484	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:119180484_C_A:119180484:1,1,2,0
chr11	119180494	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:119180484_C_A:119180484:3,2,2,0
chr11	119181170	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr11	119181236	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119181236_C_CT:119181236:0,0,0,1
chr11	119181237	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119181236_C_CT:119181236:0,0,0,1
chr11	119181674	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr11	119182715	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,14;MFRL=99,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:119182715_A_AG:119182715:0,2,1,0
chr11	119182721	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:119182715_A_AG:119182715:0,3,1,0
chr11	119182725	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:119182715_A_AG:119182715:0,3,1,0
chr11	119182730	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:119182715_A_AG:119182715:0,2,1,0
chr11	119182734	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:119182715_A_AG:119182715:0,2,1,0
chr11	119183019	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:12,8:14,0:12,14,8,0
chr11	119183050	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=94,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.138:26:15,2:8,1:11,12,1,2
chr11	119185133	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr11	119185347	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=127,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.328:31:6,3:14,6:11,10,6,4
chr11	119205735	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.830:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr11	119205830	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,21,4
chr11	119206375	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,16:0,13:0,0,13,16
chr11	119210936	.	CGCCGTCGCG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCGTCGCG;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:6,3,1,1
chr11	119214771	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	119215253	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=198,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0|1:119215253_G_C:119215253:6,1,2,1
chr11	119215256	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=198,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:5,1:0|1:119215253_G_C:119215253:6,1,2,1
chr11	119216159	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:119216159_G_T:119216159:9,14,1,1
chr11	119216161	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:0|1:119216159_G_T:119216159:9,14,1,1
chr11	119216504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=61,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:1,6:2,1,6,2
chr11	119216866	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:8,2:7,0:0|1:119216866_C_T:119216866:6,12,1,1
chr11	119216873	.	C	CAAGACTCACATGGAGTGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=118,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:11,2:5,0:0|1:119216866_C_T:119216866:5,12,1,1
chr11	119217254	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,5,16
chr11	119217311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr11	119227844	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	119229374	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,3,1
chr11	119229964	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,17:0,0,18,11
chr11	119234652	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:119234652_A_C:119234652:1,3,0,1
chr11	119234653	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:119234652_A_C:119234652:1,3,0,1
chr11	119234657	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:119234652_A_C:119234652:1,2,0,1
chr11	119290034	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	119291480	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	119291688	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.926:16:0,6:0,8:0,1,7,8
chr11	119535771	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.262:43:18,10:13,0:19,13,11,0
chr11	119545224	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=77,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.459:16:5,3:4,4:7,2,7,0
chr11	119986167	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr11	119989107	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	119993586	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=193,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:119993586_G_C:119993586:11,0,1,1
chr11	119993593	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=187,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:119993586_G_C:119993586:12,0,1,1
chr11	119993594	.	G	GGCAACTTCAAGGACGACCTGCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=187,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:119993586_G_C:119993586:12,0,1,1
chr11	119996672	.	T	TGGTAGCAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119996672_T_TGGTAGCAAA:119996672:0,0,0,1
chr11	119996676	.	AG	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119996672_T_TGGTAGCAAA:119996672:0,0,0,1
chr11	120007889	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,6:1,4:1,0,11,0
chr11	120097498	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:6,2:3,4:7,3,4,3
chr11	120099658	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,3:0,6:0|1:120099658_A_G:120099658:0,0,6,5
chr11	120099679	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0|1:120099658_A_G:120099658:0,0,6,4
chr11	120111111	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.667:31:5,14:5,7:3,7,10,11
chr11	120175661	.	A	ACACTTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:3,0,0,1
chr11	120176310	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=95,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:6,3:1,4:4,4,6,1
chr11	120178232	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,0:10,2:0|1:120178232_C_T:120178232:11,8,1,1
chr11	120178242	.	G	GCATGAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:120178232_C_T:120178232:11,8,1,1
chr11	120292570	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,10,19
chr11	120319152	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120319152_G_T:120319152:0,1,0,1
chr11	120319153	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120319152_G_T:120319152:0,1,0,1
chr11	120348001	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:16,4:19,0:17,18,4,0
chr11	120348051	.	A	ATTTTCTTTTTTTTCTTTTTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:12,2:4,0:0|1:120348051_A_ATTTTCTTTTTTTTCTTTTTT:120348051:6,11,0,2
chr11	120348053	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,2:5,0:0|1:120348051_A_ATTTTCTTTTTTTTCTTTTTT:120348051:6,11,0,2
chr11	120349188	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=206,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	120351955	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:120351955_G_C:120351955:4,6,1,1
chr11	120351960	.	T	TCTTTAAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:120351955_G_C:120351955:6,6,1,1
chr11	120530973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	120707644	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	120776001	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	120776235	.	G	GCCAGGTAGGCCTGTTCTGACAGGAACCCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.386:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	120823528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr11	120831520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	120831878	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:0,2,0,6
chr11	120833231	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:5,6,1,1
chr11	120983712	.	GAGGACCTCCTTGGGGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:0,2:5,1,1,1
chr11	120996338	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:6,8,2,0
chr11	121008194	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:7,0:9,4:3,13,2,2
chr11	121023574	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,4:9,0:14,4,4,0
chr11	121037529	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr11	121367557	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr11	121391385	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=90,103;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:10,1,2,0
chr11	121393212	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	121403229	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,10:1,11:1,0,11,10
chr11	121403345	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	121414476	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,0,0,4
chr11	121414478	.	GGAC	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,4,0,1
chr11	121414484	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,4,0,1
chr11	121414485	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,4,0,1
chr11	121414487	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,4,0,1
chr11	121414492	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,3,0,1
chr11	121414498	.	A	ATTATCTAGTATGG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,3,0,1
chr11	121414500	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:121414476_G_T:121414476:0,3,0,1
chr11	121416187	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr11	121425851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:6,0,3,1
chr11	121426091	.	C	CCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=187,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:121426091_C_CCG:121426091:0,3,0,1
chr11	121426092	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=187,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:121426091_C_CCG:121426091:0,3,0,1
chr11	121429540	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=102,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.128:22:12,2:7,0:12,8,0,2
chr11	121437571	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=93,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr11	121445084	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr11	121460664	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	121475798	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr11	121476115	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=108,44;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:13,3:7,0:10,11,2,1
chr11	121477689	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=100,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:9,13,1,1
chr11	121477703	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:121477703_G_GC:121477703:6,7,1,1
chr11	121477706	.	G	GCGCC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:121477703_G_GC:121477703:6,7,1,1
chr11	121477707	.	T	TGTAGTCCCA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=102,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:3,0:0|1:121477703_G_GC:121477703:6,7,1,1
chr11	121478958	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=191,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	121483401	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:4,8:5,5:8,2,12,1
chr11	121489416	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr11	121493001	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=92,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,2:4,3:1,4,1,4
chr11	121493072	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	121970657	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	121986895	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121986895_T_TCC:121986895:0,1,0,1
chr11	121986898	.	T	TCCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121986895_T_TCC:121986895:0,1,0,1
chr11	121986903	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121986895_T_TCC:121986895:0,1,0,1
chr11	122526788	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:4,2:4,0:6,2,3,0
chr11	122650172	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr11	122680599	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr11	122709178	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	122720892	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,1:7,2:8,9,1,2
chr11	122724592	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr11	122738062	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr11	122775227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	122795782	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr11	122795816	.	T	TTAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=198,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:122795816_T_TTAAAAG:122795816:0,2,0,1
chr11	122795819	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=198,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0|1:122795816_T_TTAAAAG:122795816:0,2,0,1
chr11	122805316	.	GAACCAGAATAACCCTCCCAGGCAGCAACAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:4,2:8,5,1,1
chr11	122817187	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.406:10:3,3:3,1:2,4,3,1
chr11	122848653	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,34;MFRL=278,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:122848653_T_C:122848653:0,1,0,1
chr11	122848656	.	C	CACCTGACCTGCCCAGTTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=278,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122848653_T_C:122848653:0,1,0,1
chr11	122928934	.	GAAAA	G,GAA,GAAAAAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30,31,33;MFRL=118,112,143,100;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,8,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,16,20;RU=A;STR;TLOD=5.82,3.11,9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,3,6:0.115,0.170,0.311:18:3,1,2,3:2,1,1,2:5,1,10,2
chr11	122929624	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=75,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:4,2:0,1:1,3,1,2
chr11	123447994	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,2:3,0:11,0,2,0
chr11	123448213	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.324:41:10,0:18,13:8,20,1,12
chr11	123454978	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr11	123464721	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=104,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr11	123477240	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	123479329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.329:15:8,3:2,0:9,1,4,1
chr11	123480981	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=89,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,5:2,6:3,4,5,6
chr11	123484359	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:7,13,0,2
chr11	123485444	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=71,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:3,1,7,2
chr11	123485561	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,5:2,1,5,6
chr11	123504959	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr11	123513124	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:6,1:5,3,2,0
chr11	123598941	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr11	123601691	.	G	GCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123601691_G_GCCTC:123601691:0,1,0,1
chr11	123601695	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123601691_G_GCCTC:123601691:0,1,0,1
chr11	123625191	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=78,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:0|1:123625191_C_A:123625191:3,8,1,1
chr11	123625206	.	G	GAAGGGATATTTGGGAATGC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:5,0:0|1:123625191_C_A:123625191:3,9,1,1
chr11	123677115	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	123754073	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr11	123777497	.	GC	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,11:0,0,13,10
chr11	123777536	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,16:0,0,7,19
chr11	123778031	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr11	123778173	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	123813940	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,12:0,1:0,0,6,7
chr11	123814489	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr11	123847392	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr11	123886307	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=205,136;MMQ=31,53;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,4:1,3:0|1:123886307_CA_TG:123886307:0,2,4,4
chr11	123886308	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.829:3:0,2:0,1:1|0:123886307_CA_TG:123886307:0,0,0,3
chr11	123886320	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=136,205;MMQ=51,31;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.200:13:8,1:3,1:1|0:123886307_CA_TG:123886307:7,4,0,2
chr11	123893801	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,83;MMQ=52,25;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.210:31:18,4:7,2:11,14,4,2
chr11	123894234	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,130;MMQ=57,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:8,2:3,4:5,6,2,4
chr11	123894402	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=73,136;MMQ=46,29;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	123894403	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=136,73;MMQ=29,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:123894403_C_A:123894403:0,4,0,1
chr11	123894404	.	ACCTCAGAGG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=136,73;MMQ=29,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:123894403_C_A:123894403:0,4,0,1
chr11	123909259	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=135,178;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:0|1:123909259_AC_A:123909259:4,12,0,2
chr11	123909261	.	TGAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=137,178;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:10,1:0|1:123909259_AC_A:123909259:5,12,0,2
chr11	123909342	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=111,121;MMQ=53,47;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.272:16:6,1:6,3:5,7,2,2
chr11	123909650	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,24;MFRL=66,113;MMQ=51,47;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0|1:123909650_C_G:123909650:2,2,4,3
chr11	123909653	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=72,113;MMQ=51,47;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.574:12:1,4:2,3:0|1:123909650_C_G:123909650:3,2,4,3
chr11	123909656	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=72,113;MMQ=50,47;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.670:10:0,4:3,3:0|1:123909650_C_G:123909650:2,1,4,3
chr11	123909682	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=136,103;MMQ=56,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,3:7,0:4,6,2,1
chr11	123909695	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr11	124016740	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	124134743	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:6,5,3,0
chr11	124134752	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:3,3:8,6,2,1
chr11	124179656	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr11	124180082	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.222:28:13,4:9,1:15,7,5,1
chr11	124189729	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,3,3
chr11	124253181	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=105,58;MMQ=53,52;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.289:22:9,2:7,4:7,9,3,3
chr11	124266697	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,144;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:0,2:2,4:0,2,1,5
chr11	124293767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	124294703	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:4,5,1,2
chr11	124309966	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	124413459	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=94,42;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,2:16,0:8,13,0,2
chr11	124440617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:3,4:7,2:5,6,4,2
chr11	124489891	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:124489891_G_GT:124489891:0,4,1,1
chr11	124489893	.	A	ACCATTACCATC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,17;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,1:0|1:124489891_G_GT:124489891:0,4,1,1
chr11	124489897	.	T	TCCCACCCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:124489891_G_GT:124489891:0,4,1,1
chr11	124494780	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=63.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,16:0,8:0,0,19,5
chr11	124501234	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:7,3:7,8,1,2
chr11	124501403	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	124519557	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:0|1:124519557_G_A:124519557:13,5,1,1
chr11	124519563	.	G	GCAT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:0|1:124519557_G_A:124519557:14,3,1,1
chr11	124519649	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:11,0:5,5:7,9,0,5
chr11	124610108	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124610108_C_A:124610108:0,0,0,1
chr11	124610111	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124610108_C_A:124610108:0,0,0,1
chr11	124619766	.	CAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=125,100;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:1,2:2,4,0,2
chr11	124622020	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr11	124631950	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.239:44:10,0:24,10:18,16,0,10
chr11	124632003	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:15,0:8,12:14,9,0,12
chr11	124637910	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=117,102;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:9,3:5,10,0,3
chr11	124735496	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:7,5,2,1
chr11	124739332	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	124739938	.	GTGCGGCAGCTGAAGTCATGGTACTGGGTAGGCACAGGGAATTTTGACATTATGGGAACAGGTAGCC	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=92,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.107:27:7,2:12,0:9,16,1,1
chr11	124739988	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:1,2,1,3
chr11	124740410	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr11	124740691	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr11	124741090	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124741090_C_T:124741090:0,0,0,1
chr11	124741093	.	C	CCTTTCTCCTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,99;MMQ=27,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124741090_C_T:124741090:0,1,0,1
chr11	124743852	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr11	124745283	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	124745288	.	GAG	TCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr11	124745294	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124745294_G_T:124745294:0,0,0,1
chr11	124745296	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124745294_G_T:124745294:0,0,0,1
chr11	124748185	.	TCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.709:15:3,5:1,6:3,1,7,4
chr11	124750232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	124750495	.	A	ACC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,0:0|1:124750495_A_ACC:124750495:1,5,1,1
chr11	124750497	.	G	GAACAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:124750495_A_ACC:124750495:1,5,1,1
chr11	124763789	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.388:29:10,6:7,5:8,10,4,7
chr11	124764022	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,76;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,2:4,0:6,5,2,0
chr11	124764943	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:8,6,2,0
chr11	124790583	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:124790583_A_AG:124790583:0,2,0,2
chr11	124790589	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:124790583_A_AG:124790583:0,2,0,2
chr11	124790595	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:124790583_A_AG:124790583:0,2,0,2
chr11	124790604	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=189,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:124790583_A_AG:124790583:0,3,0,2
chr11	124792289	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,1:14,2:11,10,2,1
chr11	124794837	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:124794837_T_G:124794837:4,9,0,2
chr11	124794839	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:124794837_T_G:124794837:4,9,0,2
chr11	124856563	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33,29;MFRL=155,162,135;MMQ=60,60,60;MPOS=4,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.77,6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.285,0.320:10:4,3,2:0,0,1:4,0,5,1
chr11	124856951	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	124861432	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:16,0:8,2:15,9,1,1
chr11	124946809	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	124947051	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	124949044	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:5,8:5,3:6,4,5,6
chr11	124949665	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,94;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.668:19:3,8:3,4:0|1:124949665_A_G:124949665:2,4,7,6
chr11	124949690	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:0,3:0|1:124949665_A_G:124949665:1,2,2,5
chr11	124951781	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=85,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:16,0:13,3:18,11,2,1
chr11	124952131	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,50;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:10,0:12,5:12,10,0,5
chr11	124954282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	124954652	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr11	124955274	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=199,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,1:2,6:1,2,4,3
chr11	124955977	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	124957994	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,3:12,0:9,13,3,0
chr11	124958122	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr11	124958132	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124958132_CT_C:124958132:0,3,0,1
chr11	124958134	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124958132_CT_C:124958132:0,3,0,1
chr11	124958146	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:124958146_T_C:124958146:0,2,0,1
chr11	124958148	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:124958146_T_C:124958146:0,2,0,1
chr11	124967487	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,9:5,8:7,2,12,5
chr11	124967515	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=114,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:0|1:124967515_A_T:124967515:16,13,1,1
chr11	124967521	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:14,2:0|1:124967515_A_T:124967515:13,13,1,1
chr11	124967631	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:124967631_C_A:124967631:5,9,1,1
chr11	124967636	.	TCTGGAG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=76,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:124967631_C_A:124967631:5,8,1,1
chr11	124967643	.	A	AAC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=76,54;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:124967631_C_A:124967631:5,6,1,1
chr11	124967678	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=104,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr11	124972208	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr11	125280111	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:23,3:27,0:36,15,3,0
chr11	125280794	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=132,76;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,4:8,0:8,9,1,3
chr11	125298871	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr11	125316073	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr11	125323965	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr11	125326026	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=101,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr11	125359606	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=97,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.220:30:11,3:11,3:14,10,6,0
chr11	125359813	.	C	CTCTGCAATGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr11	125365342	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=142,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,3:13,0:6,16,0,3
chr11	125365540	.	G	GTGATGTTGAGAGAAGCAGGTAAGTTTAAGGGCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr11	125442503	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.263:19:5,3:8,2:2,12,2,3
chr11	125452300	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,4:0,0,10,8
chr11	125452313	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:6,7:5,2:4,7,4,5
chr11	125478209	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.509:24:5,5:5,7:6,6,7,5
chr11	125479496	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:3,5,2,6
chr11	125484163	.	GA	TC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:9,2:0|1:125484163_GA_TC:125484163:12,5,0,2
chr11	125484170	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:125484163_GA_TC:125484163:13,5,0,2
chr11	125484174	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:125484163_GA_TC:125484163:15,7,0,2
chr11	125484175	.	T	TGAGTGAGGCAG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:125484163_GA_TC:125484163:15,7,0,2
chr11	125490764	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=46,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.736:9:0,4:2,2:2,0,5,2
chr11	125496627	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=87,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:22,0:22,7:25,19,7,0
chr11	125497466	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:4,5:1,3:5,1,6,2
chr11	125616483	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,12:0,5:0|1:125616483_G_T:125616483:0,0,18,1
chr11	125616502	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0|1:125616483_G_T:125616483:0,0,22,3
chr11	125617376	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	125617606	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:0|1:125617606_G_A:125617606:8,1,3,0
chr11	125617610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,9:0.714:12:2,2:1,7:1|0:125617606_G_A:125617606:3,0,8,1
chr11	125618394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	125647712	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,3,4
chr11	125648503	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,10,11
chr11	125659423	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,5:0,0,1,5
chr11	125708198	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr11	125765567	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,1:7,2:6,11,2,1
chr11	125765759	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,7:0,0:1,0,7,0
chr11	125766044	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=61,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,43:0.939:45:0,26:2,17:1,1,23,20
chr11	125766173	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,4,16
chr11	125766204	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,1,12
chr11	125766207	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,0,12
chr11	125769354	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,12,9
chr11	125770605	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	125770618	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr11	125770639	.	CT	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=262,168;MMQ=45,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	125778074	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,7:1,0,11,3
chr11	125780194	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	125788426	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125788426_T_TGGG:125788426:0,0,1,0
chr11	125788427	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:125788426_T_TGGG:125788426:0,0,1,0
chr11	125788431	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:125788426_T_TGGG:125788426:0,0,1,0
chr11	125788437	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=249,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:125788426_T_TGGG:125788426:3,0,1,0
chr11	125830970	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:8,4:18,2:15,11,1,5
chr11	125850881	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr11	125851055	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr11	125865013	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:125865013_A_G:125865013:0,0,0,4
chr11	125865024	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=225,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:125865013_A_G:125865013:0,2,0,1
chr11	125865030	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=225,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:125865013_A_G:125865013:0,2,0,1
chr11	125867053	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr11	125871554	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr11	126080757	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:5,8:1,8:5,1,7,9
chr11	126081336	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,7:6,3:6,3,8,3
chr11	126124161	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,133;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.347:35:14,11:9,0:20,3,12,0
chr11	126126841	.	A	ACACAATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr11	126131993	.	T	TGATGTTA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:14,2:11,0:0|1:126131993_T_TGATGTTA:126131993:11,15,0,2
chr11	126131994	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:14,2:11,0:0|1:126131993_T_TGATGTTA:126131993:11,15,0,2
chr11	126131996	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:12,0:0|1:126131993_T_TGATGTTA:126131993:11,15,0,2
chr11	126132001	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:126131993_T_TGATGTTA:126131993:9,16,0,2
chr11	126146244	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,16,5
chr11	126146378	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:19,0:11,2:0|1:126146378_G_C:126146378:13,17,1,1
chr11	126146385	.	T	TGATTTTTTTTGA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:9,2:0|1:126146378_G_C:126146378:11,16,1,1
chr11	126160765	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=90,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:7,4:13,0:14,6,2,2
chr11	126163691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	126174242	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	126176376	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr11	126213395	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	126278203	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,7:8,5:8,6,6,6
chr11	126279277	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=84,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,0:18,2:14,24,0,2
chr11	126301481	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr11	126315024	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.679:16:2,8:2,3:1,4,2,9
chr11	126316610	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr11	126396674	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr11	128350396	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.518:6:0,3:2,0:1,2,0,3
chr11	128443083	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,3:0|1:128443083_G_C:128443083:0,0,0,5
chr11	128443099	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.637:3:0,1:0,1:0|1:128443083_G_C:128443083:0,1,0,2
chr11	128638216	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr11	128652012	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr11	128679211	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	128709366	.	GG	AA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:1,0:4,2,1,1
chr11	128709907	.	GA	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,0:6,8:6,6,0,8
chr11	128786294	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,13,14
chr11	128839526	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr11	128850575	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,0:13,4:12,14,0,4
chr11	129727235	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=102,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,3:14,0:15,10,3,0
chr11	129740100	.	G	GTGCTTCC	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.072:39:16,0:20,2:0|1:129740100_G_GTGCTTCC:129740100:22,15,1,1
chr11	129740101	.	A	ATGCACCAT	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,0:20,2:0|1:129740100_G_GTGCTTCC:129740100:23,15,1,1
chr11	129740103	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,0:21,2:0|1:129740100_G_GTGCTTCC:129740100:23,15,1,1
chr11	129740107	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,0:21,2:0|1:129740100_G_GTGCTTCC:129740100:23,14,1,1
chr11	129754714	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,3:18,0:14,14,0,3
chr11	129795054	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:129795054_G_T:129795054:9,11,1,1
chr11	129795060	.	C	CGG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:129795054_G_T:129795054:8,13,1,1
chr11	129795061	.	CACA	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:10,2:0|1:129795054_G_T:129795054:9,14,1,1
chr11	129795066	.	TGCAAGCA	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,1:0|1:129795054_G_T:129795054:8,14,1,1
chr11	129805108	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:7,8,1,1
chr11	129816975	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:8,0,2,0
chr11	129939776	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	129980462	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,74;MMQ=60,31;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.129:35:18,4:13,0:16,15,3,1
chr11	129998900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=298,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,6:0,10:1,0,13,3
chr11	130058408	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=124,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,0:6,2:5,1,2,0
chr11	130058437	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,1:6,9:5,4,6,4
chr11	130060612	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:3,1:1,5:1,4,1,5
chr11	130064223	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,3,12
chr11	130064647	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=90,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.725:9:2,3:0,3:0,2,3,4
chr11	130064705	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	130066335	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=206,75;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.570:10:2,1:2,3:3,1,2,4
chr11	130066372	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=191,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:2,1,1,4
chr11	130068134	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:6,1,2,0
chr11	130068554	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,3:2,6:0,3,0,9
chr11	130069790	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	130078612	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=157,44;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:0|1:130078612_G_A:130078612:6,15,0,2
chr11	130078614	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=157,44;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,2:6,0:0|1:130078612_G_A:130078612:6,15,0,2
chr11	130106934	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=102,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,2:14,1:12,9,0,3
chr11	130275735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:130275735_C_T:130275735:9,2,1,1
chr11	130275744	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:130275735_C_T:130275735:11,4,1,1
chr11	130275747	.	TG	AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:130275735_C_T:130275735:10,4,1,1
chr11	130278924	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=84,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr11	130281477	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=196,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:130281477_A_T:130281477:3,9,1,1
chr11	130281486	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=194,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:0|1:130281477_A_T:130281477:3,10,1,1
chr11	130281488	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=67,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,6:2,7:1,1,3,10
chr11	130284344	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,5,1
chr11	130332547	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:5,4,0,2
chr11	130584073	.	G	GCTACAATTGTGGGCCGAAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	130749601	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=110,118;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:10,7:15,0:7,19,0,7
chr11	130773076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr11	130775782	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr11	130776454	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr11	130776613	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=107,136;MMQ=60,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:6,8,0,2
chr11	130776646	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.233:14:3,1:7,1:2,9,0,3
chr11	130776690	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr11	130780270	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr11	130781721	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=240,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr11	131531000	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr11	131531015	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr11	132081873	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,5,3
chr11	132177563	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=109,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:4,1,3,2
chr11	132179916	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=136,143;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:9,0,3,0
chr11	132179950	.	CA	C,CAAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31,33;MFRL=105,0,143;MMQ=55,54,50;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,21;RU=A;STR;TLOD=4.39,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.245,0.374:12:3,0,1:0,2,1:3,2,4,3
chr11	132290253	.	C	CTCACTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	132306153	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=132,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr11	132306188	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr11	132306201	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:132306201_T_TA:132306201:0,3,0,1
chr11	132306204	.	A	ACCATACCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:132306201_T_TA:132306201:0,3,0,1
chr11	132527270	.	G	GCGAAGGTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:132527270_G_GCGAAGGTCAGC:132527270:0,1,0,1
chr11	132527274	.	T	TAAACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:132527270_G_GCGAAGGTCAGC:132527270:0,0,0,1
chr11	132527275	.	T	TGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:132527270_G_GCGAAGGTCAGC:132527270:0,0,0,1
chr11	132813046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:1,8,1,2
chr11	133712041	.	G	GGTTCCAGTGCCTCCTCCTGCAGGGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,1,1
chr11	133712043	.	C	CCCAATGAGCAGCTCCAAGCAGTGCTGAAATGTCTAGGCCGTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,58;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:3,4,1,1
chr11	133712327	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:4,0:1,0:0,5,5,0
chr11	133712534	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	133714543	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:2,2,0,6
chr11	133788869	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=256,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,3,3
chr11	133790339	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:0|1:133790339_A_AT:133790339:1,3,0,2
chr11	133790341	.	G	GCAAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:2,1:2,1:0|1:133790339_A_AT:133790339:1,4,0,2
chr11	133790697	.	GGCTGCT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GCT;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr11	133792021	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=90,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,2:10,7:6,6,4,5
chr11	133814054	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr11	133814334	.	G	GCCGACTGCGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=87,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133814334_G_GCCGACTGCGCCT:133814334:1,0,0,1
chr11	133814337	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=87,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133814334_G_GCCGACTGCGCCT:133814334:1,0,0,1
chr11	133939125	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=164,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:133939125_G_A:133939125:0,5,1,1
chr11	133939126	.	C	CACT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=164,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:133939125_G_A:133939125:0,5,1,1
chr11	134014259	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,0:7,2:12,10,0,2
chr11	134018732	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:134018732_T_A:134018732:4,11,1,1
chr11	134018737	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:8,2:0|1:134018732_T_A:134018732:4,11,1,1
chr11	134022869	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:4,2:14,0:0|1:134022869_G_A:134022869:8,11,1,1
chr11	134022872	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:14,0:0|1:134022869_G_A:134022869:8,11,1,1
chr11	134038966	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=96,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:6,0:14,2:0|1:134038966_A_G:134038966:9,11,1,1
chr11	134038970	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=87,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:11,1:0|1:134038966_A_G:134038966:7,11,1,1
chr11	134046272	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=155,163;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:10,9,0,4
chr11	134047342	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=155,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:134047342_G_T:134047342:4,8,0,2
chr11	134047344	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=155,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:134047342_G_T:134047342:4,8,0,2
chr11	134047348	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=155,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:134047342_G_T:134047342:4,8,0,2
chr11	134047353	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=157,257;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:134047342_G_T:134047342:4,9,0,2
chr11	134047355	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=157,257;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:134047342_G_T:134047342:4,9,0,2
chr11	134048771	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=87,43;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,0:7,4:10,9,0,4
chr11	134055484	.	G	GTATA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr11	134055492	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0|1:134055492_A_T:134055492:0,0,0,1
chr11	134055502	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134055492_A_T:134055492:0,0,0,1
chr11	134055504	.	TCAA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134055492_A_T:134055492:0,0,0,1
chr11	134055508	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134055492_A_T:134055492:0,0,0,1
chr11	134072616	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=70,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	134072804	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:9,2:10,0:5,14,0,2
chr11	134073154	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,4:0,19:0,0,8,15
chr11	134073796	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:3,7,1,2
chr11	134074718	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:0,0:5,3:5,0,4,0
chr11	134093658	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=145,141;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:134093658_A_C:134093658:1,1,2,0
chr11	134093663	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=169,141;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:134093658_A_C:134093658:2,2,2,0
chr11	134093669	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=168,141;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:134093658_A_C:134093658:2,3,2,0
chr11	134093672	.	GG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=168,141;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:134093658_A_C:134093658:2,3,2,0
chr11	134093802	.	GGCCCCGCAAC	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:15,1:24,0:20,24,1,1
chr11	134105030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	134118382	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,3:8,0:3,16,1,2
chr11	134128313	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	134147196	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=67,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:134147196_C_G:134147196:4,5,1,1
chr11	134147201	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=67,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:134147196_C_G:134147196:4,5,1,1
chr11	134147371	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,0:0,11:0,0,3,8
chr11	134152030	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=84,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,3:4,3:6,7,2,4
chr11	134158817	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:3,1:1,3,1,1
chr11	134177023	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:6,7:11,0:6,11,7,0
chr11	134180874	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	134182856	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr11	134182887	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:134182887_T_TG:134182887:0,4,0,1
chr11	134182889	.	C	CCAGCTCTGATTCAGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:134182887_T_TG:134182887:0,4,0,1
chr11	134188851	.	A	AT,ATT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=23,30,31;MFRL=143,52,136;MMQ=60,60,60;MPOS=22,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.42,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.195,0.216:15:3,1,3:4,2,0:1,8,5,1
chr11	134188871	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=138,143;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.176:19:9,0:5,3:0|1:134188871_T_C:134188871:5,11,1,2
chr11	134188880	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=140,181;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:3,2:0|1:134188871_T_C:134188871:3,11,0,2
chr11	134188883	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=141,181;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:2,2:0|1:134188871_T_C:134188871:3,12,0,2
chr11	134202087	.	A	AGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:134202087_A_AGAG:134202087:2,1,1,1
chr11	134202089	.	C	CCCACAGCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:134202087_A_AGAG:134202087:2,1,1,1
chr11	134202095	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,1:2,0:0|1:134202087_A_AGAG:134202087:2,2,1,1
chr11	134212715	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,0:9,3:8,7,3,0
chr11	134214407	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr11	134214445	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	134234406	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=262,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr11	134237113	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,7:4,0:2,4,5,2
chr11	134240142	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=90,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,2:2,3:6,5,5,0
chr11	134241094	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=205,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,2:2,5:2,2,3,4
chr11	134244912	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,1:6,4:7,9,0,5
chr11	134251777	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr12	247900	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	266883	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr12	271022	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	271043	.	ACCCTCCCT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:0,0:2,0,1,0
chr12	274572	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr12	274647	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:3,13:1,5:3,1,8,10
chr12	274839	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=210,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,3,4
chr12	275065	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,3:2,5:2,3,2,6
chr12	301843	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,5,11
chr12	305254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	309753	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,1:0,4:2,1,4,1
chr12	310901	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:2,11:3,1:4,1,8,4
chr12	310920	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=105,42;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.186:23:15,3:4,0:11,8,4,0
chr12	311816	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	331846	.	C	CCTTGTCTCTTTGTGTCAGCTGTTCCCG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:331846_C_CCTTGTCTCTTTGTGTCAGCTGTTCCCG:331846:1,5,1,1
chr12	331848	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,0:0|1:331846_C_CCTTGTCTCTTTGTGTCAGCTGTTCCCG:331846:1,5,1,1
chr12	332362	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=84,96;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,4:4,4:5,4,3,5
chr12	351711	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,1:4,2:6,2,2,1
chr12	352824	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:0|1:352824_G_A:352824:5,4,2,1
chr12	352843	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,0:7,3:0|1:352824_G_A:352824:11,5,2,1
chr12	352846	.	C	CCACTGTGGTATCTCCACCAGGCTTTTTTAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:0|1:352824_G_A:352824:11,4,2,1
chr12	404828	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=120,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,1:12,2:12,12,3,0
chr12	405043	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:3,1:5,3:1,7,1,4
chr12	405050	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=167,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:1,9,0,2
chr12	416046	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	418916	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:6,5:3,2:5,4,6,1
chr12	419000	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.087:65:23,0:37,5:31,29,3,2
chr12	427575	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,4:9,3:6,7,5,2
chr12	432376	.	C	CAAAAAAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=29,36;RU=A;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.923:8:0,3:0,0:0,0,3,5
chr12	432666	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr12	438161	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:0,1:8,1:3,5,2,0
chr12	441081	.	AG	TT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=109,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,1:11,13,1,1
chr12	441175	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:441175_AT_GC:441175:0,3,0,1
chr12	441180	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:441175_AT_GC:441175:0,3,0,1
chr12	441182	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:441175_AT_GC:441175:0,3,0,1
chr12	441193	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	442620	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:4,3:2,0:6,0,2,2
chr12	464254	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	495217	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	518695	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:518695_T_G:518695:0,2,0,1
chr12	518697	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:518695_T_G:518695:0,2,0,1
chr12	518707	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:518707_A_G:518707:0,2,0,1
chr12	518712	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,31;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:518707_A_G:518707:0,1,0,1
chr12	518714	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:518707_A_G:518707:0,1,0,1
chr12	537841	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	540994	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,16,4
chr12	550911	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.836:5:1,3:0,1:0|1:550911_CTT_C:550911:1,0,4,0
chr12	550929	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=138,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.619:7:1,0:2,1:0|1:550911_CTT_C:550911:2,1,4,0
chr12	569661	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:569661_A_C:569661:3,5,1,1
chr12	569665	.	G	GGGAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:569661_A_C:569661:3,5,1,1
chr12	569668	.	A	AAAAGTTGTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0|1:569661_A_C:569661:3,5,1,1
chr12	653957	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr12	653984	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr12	655707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr12	658871	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=239,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:1,0,10,0
chr12	661656	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=13,31;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.972:38:0,20:0,16:1,0,14,23
chr12	661772	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr12	667682	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=79,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,0:10,4:9,8,3,1
chr12	667698	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=82,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:6,0:11,2:0|1:667698_T_A:667698:10,8,1,1
chr12	667704	.	C	CAACTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=85,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:6,0:9,2:0|1:667698_T_A:667698:9,7,1,1
chr12	667819	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,17;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:667819_G_GA:667819:0,4,0,1
chr12	667822	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:667819_G_GA:667819:0,4,0,1
chr12	667823	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=255,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr12	667827	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:667819_G_GA:667819:0,4,0,1
chr12	667831	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:667819_G_GA:667819:0,4,0,1
chr12	667910	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:667910_A_G:667910:0,0,0,1
chr12	667915	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:667910_A_G:667910:0,0,0,1
chr12	668373	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr12	674512	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:10,7,1,2
chr12	675441	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	772673	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:5,1:4,6,0,3
chr12	862641	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	862707	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,9:3,4:4,2,11,2
chr12	863517	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr12	936468	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,6,14
chr12	939077	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=177,106;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.452:14:4,0:1,6:8,0,6,0
chr12	968400	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.292:28:14,7:6,0:11,9,5,3
chr12	970093	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.870:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr12	970596	.	GT	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:970596_GT_TC:970596:0,2,0,1
chr12	970601	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:970596_GT_TC:970596:0,2,0,1
chr12	970605	.	T	TTGAGGAGATAAGCCTTGGGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:970605_T_TTGAGGAGATAAGCCTTGGGAA:970605:0,1,0,1
chr12	970608	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:970605_T_TTGAGGAGATAAGCCTTGGGAA:970605:0,1,0,1
chr12	978847	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:978847_G_T:978847:0,3,0,1
chr12	978849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:978847_G_T:978847:0,3,0,1
chr12	987533	.	C	CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.447:9:0,3:3,1:0,5,2,2
chr12	988641	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=187,1218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,0,3
chr12	988679	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=151,212;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr12	988712	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:4,0:5,0:4,6,4,0
chr12	988714	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,15;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:5,1:5,5,4,1
chr12	988719	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,15;MFRL=101,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.234:19:6,1:5,0:0|1:988719_G_T:988719:5,10,4,0
chr12	988725	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=99,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.186:19:7,0:8,0:0|1:988719_G_T:988719:5,11,3,0
chr12	989050	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=92,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:5,0:6,2:0|1:989050_G_A:989050:6,6,1,1
chr12	989054	.	C	CCACCTCCCAGGTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=74,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:989050_G_A:989050:6,7,1,1
chr12	989800	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr12	991306	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=100,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,0,5
chr12	992026	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:992026_G_T:992026:0,1,1,0
chr12	992029	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:992026_G_T:992026:1,1,1,0
chr12	992037	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:992026_G_T:992026:3,1,1,0
chr12	993930	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.772:33:2,12:5,14:5,2,16,10
chr12	995291	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=262,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	998254	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr12	1017197	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr12	1017230	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:8,1:2,1:0,10,1,2
chr12	1022679	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=208,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr12	1022689	.	G	GTGGCAAACGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=214,597;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr12	1042118	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,1:4,1:4,5,2,0
chr12	1192634	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,148;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.141:23:8,0:12,2:13,7,0,3
chr12	1219484	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.216:29:10,5:13,0:9,14,0,6
chr12	1292462	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=105,714;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:18,0:7,2:17,9,2,0
chr12	1703322	.	A	AGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GCC;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	1755061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:4,9,0,2
chr12	1889823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr12	1895114	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:21,0:5,3:17,14,0,3
chr12	1902766	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr12	1919543	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,4:0,0,4,9
chr12	1943384	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,4,1
chr12	1943446	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:1943446_C_CT:1943446:6,8,1,1
chr12	1943451	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=100,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:1943446_C_CT:1943446:6,7,1,1
chr12	1950011	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr12	1955664	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1955664_G_T:1955664:0,0,2,0
chr12	1955668	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1955664_G_T:1955664:0,0,2,0
chr12	1955890	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	1965313	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:5,3,0,3
chr12	1967864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=95,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr12	1969262	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,5:2,2:2,0,5,2
chr12	1993337	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,3,3
chr12	1994319	.	G	GTTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1994319_G_GTTTGCT:1994319:0,1,0,1
chr12	1994322	.	G	GAATGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:1994319_G_GTTTGCT:1994319:0,1,0,1
chr12	1995042	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=39,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,4:4,4:2,2,7,1
chr12	1995622	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	2055266	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,0:6,2:5,1,2,0
chr12	2058245	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:8,2:6,6:7,7,4,4
chr12	2062135	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,9:2,5:5,0,8,7
chr12	2064666	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,6:2,8:3,4,8,6
chr12	2113348	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=289,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	2614192	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=129,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr12	2614198	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2614198_G_C:2614198:0,2,0,1
chr12	2614199	.	C	CTGTCTGTCTGTCTCTCCCTCCCTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2614198_G_C:2614198:0,2,0,1
chr12	2614204	.	A	C,T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,29,25;MFRL=205,113,96;MMQ=60,60,60;MPOS=5,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr12	2614207	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=205,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr12	2659082	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=76,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:2,4:7,5:6,3,7,2
chr12	2659214	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=74,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:8,1:5,1:6,8,0,2
chr12	2659241	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,0:1,2:0|1:2659241_GA_G:2659241:0,4,1,1
chr12	2659252	.	GAA	TTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=193,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,1:0|1:2659241_GA_G:2659241:0,3,1,1
chr12	2675557	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:3,1:3,1:6,2,2,0
chr12	2675822	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=669,88;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2675822_C_T:2675822:0,1,0,1
chr12	2675830	.	G	GAGAGAACAGTTTTTGTAAAATGCAAACATGAAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=423,88;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.483:3:0,0:0,1:0|1:2675822_C_T:2675822:0,2,0,1
chr12	2676683	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	2692186	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr12	2706720	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,3,2
chr12	2721203	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	2757719	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,16;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:7,1:0|1:2757719_T_C:2757719:1,13,1,1
chr12	2757721	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,17;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,1:0|1:2757719_T_C:2757719:1,13,1,1
chr12	2757726	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=109,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:2757719_T_C:2757719:1,11,1,1
chr12	2757756	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	2757769	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	2757782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	2760708	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr12	2760970	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	2774668	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	2788879	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,5,8
chr12	2789731	.	C	CTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:3,4,0,2
chr12	2791130	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:2791130_C_T:2791130:0,0,10,2
chr12	2791132	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0|1:2791130_C_T:2791130:0,0,10,2
chr12	2791205	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr12	2795255	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	2797963	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=193,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr12	2797986	.	C	CGGGGCACTCACCTGTTGCTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=221,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr12	2910237	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,0:2,8:3,0,8,0
chr12	2926543	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:2926543_A_G:2926543:0,0,0,5
chr12	2926556	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:2926543_A_G:2926543:0,0,0,3
chr12	2926586	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	2926958	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,305;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr12	2930645	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,5,2
chr12	2932177	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr12	2943949	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:9,0:8,3:5,12,1,2
chr12	2967887	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=121,208;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,10:0.250:42:18,0:13,9:0|1:2967887_C_T:2967887:19,13,0,10
chr12	2967895	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=121,208;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,10:0.244:43:16,0:15,10:0|1:2967887_C_T:2967887:19,14,0,10
chr12	2968169	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,7,3
chr12	2973615	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=46,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,11:2,4:2,2,12,3
chr12	2994727	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,26,3
chr12	3018675	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=81,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.751:12:1,4:2,5:1,2,7,2
chr12	3018802	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,8:1,2,3,8
chr12	3031358	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr12	3039319	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	3042597	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=112,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:3042597_C_A:3042597:6,4,1,1
chr12	3042599	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=112,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:3042597_C_A:3042597:6,4,1,1
chr12	3042602	.	AG	GT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=112,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:3042597_C_A:3042597:6,4,1,1
chr12	3042609	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=115,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.217:12:5,0:4,2:0|1:3042597_C_A:3042597:6,4,1,1
chr12	3042611	.	A	AGAACT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=115,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:3042597_C_A:3042597:6,4,1,1
chr12	3046911	.	T	TA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.230:46:25,0:11,10:17,19,0,10
chr12	3047466	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=37,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:3,4:0,8:1,2,3,11
chr12	3049698	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.813:19:0,10:3,6:2,1,11,5
chr12	3049938	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:3,1,0,5
chr12	3126490	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:5,3,7,2
chr12	3127645	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3127645_C_T:3127645:0,0,1,0
chr12	3127652	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3127645_C_T:3127645:0,0,1,0
chr12	3130938	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr12	3131206	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,2:0,3,3,4
chr12	3131238	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	3147080	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr12	3310439	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr12	3310482	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr12	3387521	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	3387555	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,6,6
chr12	3387853	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3387853_C_T:3387853:0,1,0,1
chr12	3387860	.	A	ATCACTCCACCATCCAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3387853_C_T:3387853:0,1,0,1
chr12	3387865	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:3387865_C_A:3387865:0,0,0,1
chr12	3387868	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:3387865_C_A:3387865:0,0,0,1
chr12	3387876	.	T	TTAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3387865_C_A:3387865:0,0,0,1
chr12	3387877	.	C	CATCT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3387865_C_A:3387865:0,0,0,1
chr12	3388290	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=188,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,2,0
chr12	3392351	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	3600967	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	3677776	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.822:14:0,7:2,5:1,1,12,0
chr12	3678745	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:0,1,5,5
chr12	3702219	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,233;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,0:1,2:4,2,2,0
chr12	3736734	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:4,4,1,2
chr12	3736745	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=103,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,3:8,0:6,5,1,2
chr12	3736940	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr12	3751046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:1,0,0,9
chr12	3757548	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	3768705	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=165,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr12	3788145	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:5,4,2,3
chr12	3788188	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,2:5,2:7,3,3,1
chr12	3788222	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.356:14:4,2:5,2:3,6,4,1
chr12	3789551	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=200,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:0,2,1,3
chr12	3789562	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr12	3923375	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=146,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3923375_G_C:3923375:0,8,1,1
chr12	3923383	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=146,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:3,2:0|1:3923375_G_C:3923375:1,7,1,1
chr12	3923385	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:3923375_G_C:3923375:1,5,1,1
chr12	3923392	.	A	ACT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:3923375_G_C:3923375:1,5,1,1
chr12	3923393	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:3923375_G_C:3923375:1,5,1,1
chr12	3923396	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:3923375_G_C:3923375:1,5,1,1
chr12	3982461	.	AT	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=90,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,11:0.200:48:12,10:9,1:8,29,5,6
chr12	3982475	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=74,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.704:35:8,16:2,8:4,6,9,16
chr12	4383158	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:4383158_T_C:4383158:0,0,4,0
chr12	4383168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=116,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:4383158_T_C:4383158:3,1,2,0
chr12	4385140	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,0:4,1:0,7,3,0
chr12	4385147	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=103,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,0:4,2:3,10,3,0
chr12	4385405	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:1,8,0,3
chr12	4398257	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=289,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	4408983	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr12	4430547	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	4430561	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	4446116	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,6:1,1:3,0,5,2
chr12	4446347	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,195;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr12	4460439	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:13,5:11,0:16,8,4,1
chr12	4481907	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr12	4488681	.	C	CCAAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	4543437	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=106,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:8,1:12,2:8,12,1,2
chr12	4554680	.	CTGCA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:4554680_CTGCA_C:4554680:2,3,1,1
chr12	4554687	.	C	CCCACA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:4554680_CTGCA_C:4554680:2,4,1,1
chr12	4554689	.	T	TGG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:4554680_CTGCA_C:4554680:2,4,1,1
chr12	4554692	.	T	TTCTTGAACACATCAG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,1:0|1:4554680_CTGCA_C:4554680:2,4,1,1
chr12	4634597	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=183,55;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:5,0:8,2:0|1:4634597_A_G:4634597:6,8,1,1
chr12	4634620	.	C	CCATCCAAAAACAAGAGTATCAAGA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,55;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:10,0:12,2:0|1:4634597_A_G:4634597:13,11,1,1
chr12	4705698	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr12	4737318	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr12	4737459	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,6,8
chr12	4737715	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,12,13
chr12	4758188	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=204,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:3,2:4,0:6,1,3,0
chr12	4763400	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,1:3,0,4,0
chr12	4764137	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,2,5
chr12	4766940	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:4766940_T_TGC:4766940:4,1,1,1
chr12	4766942	.	T	TAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:4766940_T_TGC:4766940:4,1,1,1
chr12	4768103	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	4768193	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,6:1,3:4,1,6,3
chr12	4771682	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:9,3:13,3:16,6,5,1
chr12	4853915	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	4870166	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:10,8:14,0:13,11,2,6
chr12	4870363	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr12	4881766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:4881766_C_T:4881766:0,1,1,4
chr12	4881775	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0|1:4881766_C_T:4881766:0,1,1,3
chr12	4922030	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:5,3:8,1:6,7,2,2
chr12	4922945	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=164,113;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:9,4,2,0
chr12	4922975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=182,113;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:8,7,2,0
chr12	4923049	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,4:6,1:5,6,2,3
chr12	4923250	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=160,172;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:3,5,3,0
chr12	5021577	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:7,7,1,1
chr12	5021984	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,13,9
chr12	5022041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,6:1,6:0,1,6,6
chr12	5023807	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:7,6,2,1
chr12	5025094	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:1,10:1,11:1,2,14,7
chr12	5025726	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:5025726_G_T:5025726:10,13,1,1
chr12	5025730	.	T	TGAGCCCAG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:10,0:11,2:0|1:5025726_G_T:5025726:10,13,1,1
chr12	5026471	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,3:8,4:8,4,4,3
chr12	5027459	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr12	5027465	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr12	5603935	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:8,6:4,5:6,6,5,6
chr12	5672745	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=100,77;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:3,0:5,5:3,5,1,6
chr12	5687250	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=139,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:0,0:0,3,1,1
chr12	5687259	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr12	5687262	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:5687262_G_T:5687262:0,3,0,1
chr12	5687265	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=212,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5687262_G_T:5687262:0,2,0,1
chr12	5721962	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr12	5756795	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	5756824	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr12	5757029	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	5963243	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:6,2:4,7,2,2
chr12	6060960	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:9,4,3,1
chr12	6061069	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:3,6,2,3
chr12	6061491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	6061769	.	G	GCTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0|1:6061769_G_GCTCCT:6061769:0,0,0,1
chr12	6061771	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:6061769_G_GCTCCT:6061769:0,0,0,1
chr12	6062853	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr12	6078616	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr12	6085181	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	6085445	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,2:6,1:7,7,0,3
chr12	6085513	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	6091000	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr12	6091164	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:5,4,1,2
chr12	6092361	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,58;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:8,3,0,6
chr12	6094845	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr12	6094904	.	C	CCTTGCACCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:6094904_C_CCTTGCACCT:6094904:0,2,0,2
chr12	6094907	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:6094904_C_CCTTGCACCT:6094904:0,2,0,2
chr12	6103800	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:4,8,0,2
chr12	6105387	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=109,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,3:7,5:5,6,4,4
chr12	6127535	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,141;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:1,0:5,2,2,0
chr12	6128388	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=170,110;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:2,2,5,4
chr12	6134987	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,4,1
chr12	6135265	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=203,149;MMQ=58,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:0,1,1,5
chr12	6138595	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:6,6,1,1
chr12	6145529	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,3:1,1,3,3
chr12	6145653	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=94,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,2:5,1:9,9,1,2
chr12	6153659	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr12	6161792	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:5,7,0,2
chr12	6161858	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:6161858_G_C:6161858:3,2,1,1
chr12	6161865	.	T	TTTC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:6161858_G_C:6161858:4,3,1,1
chr12	6161867	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:6161858_G_C:6161858:4,3,1,1
chr12	6161869	.	C	CCATTCCACT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,18;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,1:0|1:6161858_G_C:6161858:4,3,1,1
chr12	6161963	.	G	GAGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr12	6161990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr12	6174414	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:0|1:6174414_T_G:6174414:3,5,3,0
chr12	6174423	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0|1:6174414_T_G:6174414:2,2,3,0
chr12	6182828	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:13,3,2,1
chr12	6204615	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:1,5:1,4:0,2,4,5
chr12	6230288	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=287,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr12	6232426	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:5,2:0,5:1,4,4,4
chr12	6344600	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,3:5,1:11,3,3,1
chr12	6422272	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,8,1
chr12	6426981	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr12	6427003	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:0,0:1,0:5,0,4,0
chr12	6427181	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=72,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:5,2:2,7:5,2,1,8
chr12	6428116	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr12	6428362	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr12	6435571	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0|1:6435571_A_G:6435571:0,0,15,5
chr12	6435575	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:6435571_A_G:6435571:0,0,16,5
chr12	6435753	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr12	6437171	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,3,1
chr12	6437389	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr12	6437418	.	C	CCCTTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=180,306;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	6442346	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=96,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,4:8,2:8,6,3,3
chr12	6442890	.	TG	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=98,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:17,2:31,0:28,23,2,0
chr12	6458084	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,18,13
chr12	6483463	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,2:1,15:1,0,15,2
chr12	6493901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:0|1:6493901_G_A:6493901:0,7,0,2
chr12	6493907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0|1:6493901_G_A:6493901:0,7,0,2
chr12	6495275	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:13,2:4,8:7,10,4,6
chr12	6495635	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,3:11,1:12,11,1,3
chr12	6497693	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=88,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:12,2:4,0:0|1:6497693_T_A:6497693:5,11,1,1
chr12	6497696	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=88,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:4,0:0|1:6497693_T_A:6497693:5,11,1,1
chr12	6497723	.	G	GGTCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=138,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,1:2,0:0|1:6497723_G_GGTCA:6497723:0,2,0,1
chr12	6497728	.	TT	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=138,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6497723_G_GGTCA:6497723:0,2,0,1
chr12	6500114	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	6554429	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr12	6554668	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:7,0:7,3:7,8,0,4
chr12	6554784	.	T	TAAAGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6554784_T_TAAAGG:6554784:0,2,0,1
chr12	6554787	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6554784_T_TAAAGG:6554784:0,2,0,1
chr12	6554790	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:6554784_T_TAAAGG:6554784:0,2,0,1
chr12	6560573	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0,0,4,21
chr12	6562753	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr12	6562823	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,5:0|1:6562823_C_T:6562823:0,0,6,10
chr12	6562836	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0|1:6562823_C_T:6562823:0,0,3,10
chr12	6562931	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	6567787	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr12	6567795	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr12	6569983	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr12	6570163	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr12	6571347	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,4:1,5:2,3,4,5
chr12	6573716	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,6,19
chr12	6573749	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=211,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,7:1,4:0,1,2,10
chr12	6575191	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,2,11
chr12	6579565	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr12	6579757	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,8,20
chr12	6604415	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:4,13,1,2
chr12	6623389	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,0:4,4:5,3,3,1
chr12	6623860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:3,2,0,6
chr12	6627091	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,2:13,1:11,7,2,1
chr12	6632550	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.179:18:9,0:4,0:0|1:6632550_C_A:6632550:5,10,0,3
chr12	6632553	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.179:18:9,0:3,0:0|1:6632550_C_A:6632550:5,10,0,3
chr12	6635274	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=74,114;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:4,5,3,3
chr12	6635374	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,4:3,1:3,2,3,2
chr12	6635567	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=105,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:1,1:8,3:2,7,1,3
chr12	6639088	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:10,4:2,1:7,6,1,4
chr12	6640150	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=92,91;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.264:35:11,0:15,8:13,13,9,0
chr12	6640677	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr12	6666422	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,105;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:17,6:15,0:16,16,4,2
chr12	6669257	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr12	6671154	.	ATT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=100,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.169:20:7,2:3,1:9,8,3,0
chr12	6671185	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,89;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:2,9,0,2
chr12	6675941	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:9,0:14,2:0|1:6675941_A_T:6675941:12,11,1,1
chr12	6675945	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:15,2:0|1:6675941_A_T:6675941:12,12,1,1
chr12	6680045	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=94,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:26,2:7,0:17,16,0,2
chr12	6690190	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.253:57:14,5:29,9:21,22,8,6
chr12	6690348	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.194:20:8,2:8,2:7,9,4,0
chr12	6691452	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:1,7,1,1
chr12	6692446	.	TTGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:10,2:2,0:6,6,1,1
chr12	6702040	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6702040_T_A:6702040:0,0,0,1
chr12	6702042	.	T	TGCTCAAGGAAATAAGAGAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6702040_T_A:6702040:0,0,0,1
chr12	6703855	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	6707526	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=94,230;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:2,8,1,1
chr12	6715635	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	6747578	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr12	6748035	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:3,0,3,1
chr12	6749765	.	GGGCCCTGCA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0|1:6749765_GGGCCCTGCA_G:6749765:0,1,0,1
chr12	6749776	.	A	ATTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6749765_GGGCCCTGCA_G:6749765:0,1,0,1
chr12	6756240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	6756418	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:6,7:5,0:8,3,7,0
chr12	6756445	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,9:9,0:12,5,7,2
chr12	6761893	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,2:8,5:7,5,1,6
chr12	6762026	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	6777069	.	TTGC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TGC;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.847:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr12	6778210	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:10,0:6,4:11,5,2,2
chr12	6804199	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:15,5:10,0:19,6,5,0
chr12	6804902	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	6805767	.	G	GATTGTGTGTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:6805767_G_GATTGTGTGTGA:6805767:0,3,0,1
chr12	6805769	.	T	TGTGCCTGGGACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:6805767_G_GATTGTGTGTGA:6805767:0,3,0,1
chr12	6840126	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=110,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:2,0:5,0,3,0
chr12	6840209	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=206,89;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:1,11:0,13:1,0,12,13
chr12	6840256	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:17,0:5,2:0|1:6840256_C_T:6840256:6,16,1,1
chr12	6840259	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=100,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:4,2:0|1:6840256_C_T:6840256:6,10,1,1
chr12	6859528	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=133,380;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6859528_G_A:6859528:0,1,1,0
chr12	6859538	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=133,380;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6859528_G_A:6859528:0,1,1,0
chr12	6879662	.	T	TGGGGGGGGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=G;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,1:0,0:1,0,0,5
chr12	6882120	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,0:6,3:1,8,1,2
chr12	6882372	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:6,4,3,2
chr12	6882492	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:8,9,1,1
chr12	6882514	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=93,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:6882514_C_T:6882514:8,7,1,1
chr12	6882516	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=93,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:6882514_C_T:6882514:7,7,1,1
chr12	6882519	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=93,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,1:0|1:6882514_C_T:6882514:7,7,1,1
chr12	6882521	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=82,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:6882514_C_T:6882514:7,5,1,1
chr12	6883670	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6883670_G_C:6883670:0,0,1,0
chr12	6883679	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=160,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0|1:6883670_G_C:6883670:3,0,1,1
chr12	6883700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=87,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr12	6909380	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0|1:6909380_TG_T:6909380:0,0,8,4
chr12	6909388	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,2:0|1:6909380_TG_T:6909380:0,0,8,5
chr12	6909442	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr12	6926363	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=167,148;MMQ=27,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,7:3,8:3,1,13,2
chr12	6926409	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=94,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.115:37:16,3:16,0:10,23,4,0
chr12	6928075	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,28:0.881:31:2,19:1,9:2,1,10,18
chr12	6928120	.	G	GAGGTAAGATCTTCATGGGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr12	6928135	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	6928400	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=88,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,3:4,2:10,3,3,2
chr12	6928586	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr12	6933589	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:6,10:1,4:4,3,6,8
chr12	6941021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.788:20:0,8:3,8:2,2,11,5
chr12	6942672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	6946545	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	6948316	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:6948316_G_A:6948316:0,4,0,1
chr12	6948319	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:6948316_G_A:6948316:0,4,0,1
chr12	6948692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	6955865	.	C	CCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=CA;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr12	6959095	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	6964876	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,1:9,2:15,6,2,1
chr12	6965502	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=99,38;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.208:30:10,2:14,3:15,9,1,5
chr12	6965805	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	6969731	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	6973799	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:6973799_G_C:6973799:0,0,1,0
chr12	6973801	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6973799_G_C:6973799:0,0,1,0
chr12	6978808	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:13,1:0|1:6978808_C_T:6978808:17,8,1,1
chr12	6978812	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:12,0:12,2:0|1:6978808_C_T:6978808:17,8,1,1
chr12	6979336	.	GCTGAGGACTAGA	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:14,0:13,18,1,1
chr12	7023277	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr12	7026893	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr12	7043230	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=14,18;MFRL=98,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.171:40:10,1:6,1:16,17,0,7
chr12	7043829	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7043829_TC_T:7043829:0,0,0,1
chr12	7043834	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7043829_TC_T:7043829:0,0,0,1
chr12	7043840	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7043829_TC_T:7043829:0,0,0,1
chr12	7043842	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7043829_TC_T:7043829:0,0,0,1
chr12	7044647	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	7045891	.	ACAG	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,94;MMQ=60,55;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CAG;STR;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:3,2:4,4:2,7,0,6
chr12	7053205	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	7053362	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,29:0.729:39:6,14:4,12:2,8,13,16
chr12	7054859	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr12	7065281	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,14,6
chr12	7065406	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,3:0,16:0,0,6,13
chr12	7065576	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,8,11
chr12	7066792	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	7069620	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr12	7069654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr12	7073246	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:14,1:13,1:13,14,2,0
chr12	7076236	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr12	7076503	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:7076503_CAG_C:7076503:1,2,0,1
chr12	7076507	.	T	TTTAAAGTCCTTTCTCCAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:7076503_CAG_C:7076503:1,2,0,1
chr12	7080210	.	A	AG	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=216.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,21:0,27:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,27,23
chr12	7080212	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=216.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.982:50:0,23:0,27:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,27,23
chr12	7090659	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	7170167	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=152,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr12	7175800	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:10,6:21,0:9,24,5,1
chr12	7249074	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,3:11,0:10,9,3,0
chr12	7261597	.	GA	TT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,326;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:0,0,1,0
chr12	7261600	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,326;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:0,0,1,0
chr12	7261603	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,326;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:0,0,1,0
chr12	7261606	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=174,326;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:1,0,1,0
chr12	7261617	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,14;MFRL=174,326;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:1,0,1,0
chr12	7261621	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,34;MFRL=174,326;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7261597_GA_TT:7261597:1,0,1,0
chr12	7277370	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=80,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.382:3:1,0:1,1:0|1:7277370_A_T:7277370:0,2,0,1
chr12	7277371	.	C	CCGCCTGGGCCAAGCTTGCTGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=80,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0|1:7277370_A_T:7277370:0,2,0,1
chr12	7283328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,3:1,0:6,0,2,2
chr12	7287886	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr12	7287914	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=75.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,13:0,0,22,6
chr12	7288933	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=95,131;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:9,5,0,2
chr12	7288976	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,2:6,1:8,11,1,2
chr12	7289771	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=191,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr12	7289793	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	7295377	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:5,1,0,4
chr12	7302145	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=73,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,4:7,12,0,4
chr12	7351764	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=96,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:7351764_C_T:7351764:1,3,0,1
chr12	7351784	.	C	CTAGCTCTCCTAGGTTCCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7351764_C_T:7351764:0,1,0,1
chr12	7360229	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,1,1
chr12	7361841	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7361841_TT_CA:7361841:0,3,0,1
chr12	7361849	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7361841_TT_CA:7361841:0,2,0,1
chr12	7361853	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:7361841_TT_CA:7361841:0,2,0,1
chr12	7362236	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,0:0|1:7362236_G_T:7362236:1,0,3,0
chr12	7362243	.	C	CGGTGGAGTAATGTGCAGAGTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:7362236_G_T:7362236:2,0,3,0
chr12	7362831	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=19740631,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr12	7457217	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,1:0,7:0,2,0,8
chr12	7459325	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:0|1:7459325_C_T:7459325:3,11,1,1
chr12	7459329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:7459325_C_T:7459325:3,10,1,1
chr12	7470584	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=92,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:8,7:16,0:19,5,6,1
chr12	7470762	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,2:5,0:3,13,2,0
chr12	7473343	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:11,11,1,1
chr12	7475955	.	C	CATGCG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7475955_C_CATGCG:7475955:0,1,0,1
chr12	7475957	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7475955_C_CATGCG:7475955:0,1,0,1
chr12	7475961	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:7475955_C_CATGCG:7475955:0,1,0,1
chr12	7476034	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:2,2,2,0
chr12	7526206	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=165,137;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.246:22:6,0:11,5:0|1:7526206_G_C:7526206:5,12,0,5
chr12	7526211	.	A	AGT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,38;MFRL=165,137;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,0:9,5:0|1:7526206_G_C:7526206:4,11,0,5
chr12	7526213	.	T	TATGTGTGTCCTTAAACCTAGG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=165,137;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,0:8,1:0|1:7526206_G_C:7526206:4,11,0,5
chr12	7551022	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr12	7551050	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr12	7586142	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,0:11,6:9,8,0,6
chr12	7596855	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	7633862	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr12	7638020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=66,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:1,5,1,4
chr12	7655137	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=93,174;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:12,3:11,2:13,12,0,5
chr12	7656332	.	T	TACAACCAATAACACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:7656332_T_TACAACCAATAACACA:7656332:2,3,1,1
chr12	7656334	.	C	CTACAATA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:7656332_T_TACAACCAATAACACA:7656332:2,3,1,1
chr12	7803562	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr12	7807138	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr12	7868777	.	A	AT,ATT	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,25,24;MFRL=0,127,131;MMQ=60,60,60;MPOS=13,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=T;STR;TLOD=62.12,36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,30,19:0.596,0.386:49:0,16,6:0,14,13:0,0,33,16
chr12	7868865	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,31,33;MFRL=186,147,131;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.01,10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,9:0.314,0.548:17:3,1,2:0,4,7:0,3,5,9
chr12	7869612	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,72;MMQ=52,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:9,4:9,0:11,7,2,2
chr12	7869701	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	7883379	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,0:10,3:6,6,2,1
chr12	7893983	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,3:2,0:6,1,3,0
chr12	7922615	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=111,240;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.161:41:25,6:10,0:21,14,6,0
chr12	7942279	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=89,130;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:0|1:7942279_A_C:7942279:10,14,0,2
chr12	7942280	.	C	CCCTCCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=89,130;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:0|1:7942279_A_C:7942279:10,14,0,2
chr12	7945829	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,7,13
chr12	7945871	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=161,111;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr12	7947017	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,5:3,7:3,1,10,2
chr12	7947386	.	ACCTGGAGCAACCAGACCCAGAACATCCAGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=158,106;MMQ=25,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr12	7966908	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=127,170;MMQ=21,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,1,1
chr12	7970377	.	CAGATACATAGAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGATACATAGAT;STR;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:4,2:2,3:7,3,2,3
chr12	7973835	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,88;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:5,9,2,0
chr12	7980035	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr12	7980310	.	G	GATAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=232,60;MMQ=34,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:0,0:0|1:7980310_G_GATAAA:7980310:1,1,1,1
chr12	7980312	.	G	GAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=232,60;MMQ=34,21;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:7980310_G_GATAAA:7980310:1,1,1,1
chr12	8075685	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr12	8077148	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,197;MMQ=21,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	8083246	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,143;MMQ=52,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:7,0:13,5:7,13,0,5
chr12	8085504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,39516;MMQ=60,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:8,0,3,0
chr12	8088766	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	8192637	.	GCTATGCCACTCTCATCAC	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:13,0:17,8,1,1
chr12	8192708	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=144,170;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,3:13,0:10,17,0,3
chr12	8196445	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=205,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,1,4
chr12	8203273	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	8276432	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,19,3
chr12	8288098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr12	8289300	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,28966328;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	8329574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=211,150;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,3:4,4:3,1,2,5
chr12	8329652	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=194,151;MMQ=34,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:2,0,6,3
chr12	8329676	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=216,128;MMQ=60,42;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:0,3,8,2
chr12	8374770	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr12	8374781	.	C	CACG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,138;MMQ=43,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.898:27:1,10:1,11:1,1,7,18
chr12	8376110	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=174,150;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:2,1,7,6
chr12	8376181	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=172,159;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0|1:8376181_C_G:8376181:0,1,1,7
chr12	8376205	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=172,159;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0|1:8376181_C_G:8376181:0,1,0,4
chr12	8376535	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	8612336	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr12	8617982	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=211,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr12	8666378	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,3:3,8:3,2,5,6
chr12	8667837	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=140,155;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:16,4:12,0:19,9,4,0
chr12	8667897	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,5:4,10:5,6,4,11
chr12	8693240	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,3:0|1:8693240_C_A:8693240:0,0,13,0
chr12	8693245	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=58.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,3:0,3:0|1:8693240_C_A:8693240:0,0,14,0
chr12	8693419	.	T	TTCTC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=79.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.959:19:0,10:0,6:0,0,5,14
chr12	8757421	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,4:0.061:78:31,0:41,4:44,30,4,0
chr12	8757481	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,19:0,22:0,0,24,17
chr12	8757522	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.832:11:0,2:1,3:0,2,3,6
chr12	8759445	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,4:3,4:3,0,8,0
chr12	8765447	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	8807197	.	TT	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=243,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr12	8807969	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=138,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,1:0|1:8807969_C_T:8807969:14,3,1,1
chr12	8807975	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=138,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,1:0|1:8807969_C_T:8807969:14,3,1,1
chr12	8808006	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,10:0,0,15,5
chr12	8813345	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.751:5:0,1:0,3:0,1,4,0
chr12	8813509	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=111,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:6,3:17,0:11,12,0,4
chr12	8813525	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=111,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:4,4:15,0:8,11,0,4
chr12	8906544	.	TCGCCATGAAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=118,110;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:7,6,1,1
chr12	8926119	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=96,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:5,7,1,3
chr12	8926469	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8926469_G_A:8926469:0,0,0,1
chr12	8926472	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8926469_G_A:8926469:0,0,0,1
chr12	8988777	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,5,2
chr12	8990059	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=99,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:8990059_T_C:8990059:6,8,1,1
chr12	8990063	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:8990059_T_C:8990059:6,7,1,1
chr12	8990069	.	G	GGTT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:8990059_T_C:8990059:5,7,1,1
chr12	8990072	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:8990059_T_C:8990059:4,6,1,1
chr12	8990244	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=164,162;MMQ=45,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:8990244_G_A:8990244:0,6,0,2
chr12	8990246	.	GAT	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=157,162;MMQ=46,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:8990244_G_A:8990244:0,7,0,2
chr12	8990249	.	G	GCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=157,162;MMQ=46,47;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:8990244_G_A:8990244:0,7,0,2
chr12	8994212	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	8998166	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,1:7,1:0|1:8998166_A_G:8998166:5,9,1,2
chr12	8998171	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=145,62;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:0|1:8998166_A_G:8998166:1,11,1,1
chr12	9002945	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=163,105;MMQ=55,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,1:1,0:0|1:9002945_CT_C:9002945:0,4,0,1
chr12	9002947	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=163,105;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:0|1:9002945_CT_C:9002945:0,4,0,1
chr12	9002968	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=163,84;MMQ=55,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr12	9004632	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=183,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0|1:9004632_CA_C:9004632:2,1,1,1
chr12	9004634	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=183,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0|1:9004632_CA_C:9004632:2,1,1,1
chr12	9004892	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,9,12
chr12	9007486	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:10,0:4,2:12,9,1,2
chr12	9007492	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.631:11:3,4:0,3:0,4,3,4
chr12	9008031	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr12	9009779	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:6,3:3,5:5,4,6,2
chr12	9009975	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:2,10,2,0
chr12	9009999	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=167,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:6,11,2,0
chr12	9010671	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=90,143;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:3,5,4,1
chr12	9020489	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,4:2,1:3,4,1,4
chr12	9020912	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:4,8:5,7:6,3,8,8
chr12	9020954	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,3:11,0:0|1:9020954_G_A:9020954:11,8,1,2
chr12	9020956	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,2:10,0:0|1:9020954_G_A:9020954:11,8,1,2
chr12	9021021	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,26;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:0,2:0|1:9021021_T_C:9021021:1,1,1,2
chr12	9021034	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:9021021_T_C:9021021:1,1,0,2
chr12	9021040	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:9021021_T_C:9021021:1,1,0,2
chr12	9021053	.	C	CGTGT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	9021283	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr12	9021316	.	T	TAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr12	9085099	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,23361237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr12	9086683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	9087872	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:9087872_A_AG:9087872:1,0,0,1
chr12	9087874	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:9087872_A_AG:9087872:1,0,0,1
chr12	9087906	.	ATAG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	9092047	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=173,168;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9092047_G_A:9092047:0,2,0,1
chr12	9092049	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=173,168;MMQ=27,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9092047_G_A:9092047:0,2,0,1
chr12	9094548	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	9097933	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	9225165	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	9244063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:9244063_G_A:9244063:0,5,0,2
chr12	9244065	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:9244063_G_A:9244063:0,5,0,2
chr12	9244068	.	A	ATGATTTTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:9244063_G_A:9244063:0,5,0,2
chr12	9248332	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:1,0,2,6
chr12	9258821	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr12	9303295	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=64,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:5,3,0,3
chr12	9305473	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=215,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,9:1,14:0,1,12,11
chr12	9307415	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,0:10,4:8,13,2,2
chr12	9310008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	9310959	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr12	9311164	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:9,12,0,2
chr12	9311265	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	9313530	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	9316907	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	9334728	.	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTGAGACAAAATGGTCATA;STR;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.795:8:1,4:0,1:0,1,2,5
chr12	9346900	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=73,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	9352908	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr12	9353660	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:9353660_A_C:9353660:2,3,1,1
chr12	9353662	.	G	GTGGATGAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0|1:9353660_A_C:9353660:2,3,1,1
chr12	9353828	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	9353875	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,8,4
chr12	9571619	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	9571803	.	TGA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=123,51;MMQ=27,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:9571803_TGA_T:9571803:3,4,1,1
chr12	9571806	.	CCCATCAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,51;MMQ=27,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:9571803_TGA_T:9571803:3,4,1,1
chr12	9571851	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,283;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	9572788	.	C	CGCACCTGGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	9572944	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr12	9573223	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr12	9574117	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=173,245;MMQ=40,33;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:0|1:9574117_T_TG:9574117:0,3,0,1
chr12	9574119	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=245,173;MMQ=33,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1|0:9574117_T_TG:9574117:0,1,0,3
chr12	9574122	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=173,245;MMQ=40,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9574117_T_TG:9574117:0,3,0,1
chr12	9574125	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=173,245;MMQ=40,33;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:9574117_T_TG:9574117:0,3,0,1
chr12	9574128	.	G	GCATCTTGACAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=178,245;MMQ=40,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9574117_T_TG:9574117:0,4,0,1
chr12	9574344	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr12	9577310	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	9578570	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	9580170	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=117,225;MMQ=45,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:3,2,2,0
chr12	9580203	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr12	9583294	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,80;MMQ=52,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:4,0:7,4,1,2
chr12	9583430	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	9584916	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	9585487	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	9590651	.	A	ACTGAGTAAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=148,110;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGAGTAAC;STR;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.498:18:4,4:5,4:4,5,4,5
chr12	9596091	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	9751035	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,2:0,0,11,1
chr12	9754221	.	A	AAAAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.907:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	9885526	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:5,4,2,1
chr12	9885707	.	A	ATAAGT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAGT;STR;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:4,3:3,2:3,4,4,2
chr12	9906067	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,13,9
chr12	9980243	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	9994445	.	GTGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:0,4:2,0,3,5
chr12	10006040	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:10006040_T_A:10006040:2,8,1,1
chr12	10006046	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=179,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:10006040_T_A:10006040:2,7,1,1
chr12	10010006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,3,1
chr12	10015082	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:12,6:16,6:13,15,6,6
chr12	10085035	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=228,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:10085035_AT_A:10085035:0,5,0,2
chr12	10085037	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=228,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:10085035_AT_A:10085035:0,5,0,2
chr12	10124336	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	10124373	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	10131511	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:16,2,3,0
chr12	10131684	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,5,17
chr12	10131865	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr12	10137645	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr12	10149406	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	10149657	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	10151642	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr12	10151762	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr12	10167277	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=148.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,34:0,12:0,0,13,33
chr12	10205420	.	GT	G,GTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=13,23,30;MFRL=152,157,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.89,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,3:0.482,0.251:12:1,0,2:0,3,0:1,2,2,7
chr12	10215582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr12	10217326	.	C	CTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=125.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,19:0,12:0,0,17,14
chr12	10241829	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,20:0,0,15,25
chr12	10251385	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,5:0,24:0,0,18,11
chr12	10271055	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr12	10282622	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,0:17,4:17,18,2,2
chr12	10312878	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	10339044	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:13,0:8,3:13,8,0,4
chr12	10339086	.	T	TTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:5,2:9,0:0|1:10339086_T_TTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTC:10339086:9,6,0,2
chr12	10339087	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:0|1:10339086_T_TTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTC:10339086:9,6,0,2
chr12	10339210	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,1,5
chr12	10365867	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:1,1,0,2
chr12	10460543	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	10461883	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr12	10525644	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,1:2,7:4,1,7,1
chr12	10525878	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.596:18:4,7:3,4:0,7,1,10
chr12	10531226	.	T	TATTTTTCCTTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:8,2:10,1:8,11,2,1
chr12	10532434	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr12	10560824	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	10562025	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=122,85;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:8,8:11,2:8,11,5,5
chr12	10562089	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=59,165;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,4:9,3:10,7,3,4
chr12	10571024	.	T	TCTTG	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=124,12261;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:0|1:10571024_T_TCTTG:10571024:9,14,2,0
chr12	10571030	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=31,22;MFRL=124,12261;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:0|1:10571024_T_TCTTG:10571024:9,14,2,0
chr12	10571042	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,9,13
chr12	10571091	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0|1:10571091_T_G:10571091:0,0,4,6
chr12	10571106	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=190,192;MMQ=48,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:0,5:0|1:10571091_T_G:10571091:0,1,3,4
chr12	10571111	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=180,211;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:3,3,0,2
chr12	10571158	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,6
chr12	10571177	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,5
chr12	10571514	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	10571536	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	10572982	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr12	10583696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:8,4,2,1
chr12	10586956	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=147,162;MMQ=27,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:7,0,4,0
chr12	10586961	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=155,147;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr12	10586978	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=141,156;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,7:4,2:11,0,9,0
chr12	10587158	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=122,127;MMQ=45,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,5:5,3:6,8,2,6
chr12	10587250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=149,221;MMQ=27,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr12	10588647	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,141;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:1,7,0,8
chr12	10600282	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,218;MMQ=51,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,0:3,2:0,4,0,2
chr12	10602624	.	TTTTAAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr12	10603670	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,11,12
chr12	10746385	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,9,4
chr12	10759032	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr12	10763236	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=100,85;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.199:53:22,8:21,2:19,24,4,6
chr12	10777551	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10777551_A_AAT:10777551:0,1,0,1
chr12	10777554	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10777551_A_AAT:10777551:0,1,0,1
chr12	10786757	.	T	TGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr12	10786797	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr12	10854537	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:6,4,3,0
chr12	10856698	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=119,154;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:10,0:8,8:11,8,0,8
chr12	10856799	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,1,2
chr12	10865971	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr12	10871667	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr12	10959632	.	ACA	TTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	10999780	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,15:0,0,10,14
chr12	10999812	.	TGGGGGAGGATGGCGGTGATGGCCTCCTGGTTTTGGTGGTCTCTGCTGAGGACCATCATCTTGGTTACCACTATCACCAG	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=93,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.083:36:4,0:4,2:19,15,1,1
chr12	11035368	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,72;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:11035368_T_G:11035368:0,0,1,2
chr12	11035376	.	CG	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,17;MFRL=72,194;MMQ=51,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:11035368_T_G:11035368:1,1,0,1
chr12	11035380	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=72,194;MMQ=51,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11035368_T_G:11035368:1,1,0,1
chr12	11035533	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	11083677	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,162;MMQ=57,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr12	11090913	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,0:6,4:7,5,2,2
chr12	11091432	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr12	11138683	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=98,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,9:0,8:0,1,10,7
chr12	11139227	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=193,194;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:4,3,4,0
chr12	11139254	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,194;MMQ=60,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,4:5,0:4,7,4,0
chr12	11149532	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=73,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,7:3,3:2,1,6,4
chr12	11150536	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=233,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	11174261	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=95,174;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:13,2:0|1:11174261_C_G:11174261:10,5,2,0
chr12	11174264	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=95,174;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:13,2:0|1:11174261_C_G:11174261:10,5,2,0
chr12	11174271	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=95,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:3,0:13,3:0|1:11174261_C_G:11174261:12,6,4,0
chr12	11174276	.	GT	AT,AC	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=20,26,28;MFRL=95,80,172;MMQ=60,60,60;MPOS=2,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.68,12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,7,4:0.285,0.179:25:3,0,0:11,6,4:10,4,7,4
chr12	11174282	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=21,30;MFRL=95,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:3,0:15,4:0|1:11174261_C_G:11174261:12,8,4,0
chr12	11174286	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=20,27;MFRL=84,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:4,0:9,4:0|1:11174261_C_G:11174261:6,8,4,0
chr12	11174302	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=82,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:5,0:10,4:5,11,4,0
chr12	11174327	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=20,24;MFRL=83,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:9,2:6,5:7,9,6,1
chr12	11174372	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=86,132;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:0|1:11174372_C_G:11174372:8,4,2,3
chr12	11174380	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=70,132;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:0|1:11174372_C_G:11174372:8,5,2,3
chr12	11174390	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=86,132;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,3:3,2:0|1:11174372_C_G:11174372:8,5,2,3
chr12	11174397	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=125,174;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:6,1:2,3:0|1:11174372_C_G:11174372:6,3,1,4
chr12	11174416	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=125,175;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:4,1,0,3
chr12	11174475	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=168,168;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr12	11174660	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=116,148;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:12,2:3,0:0|1:11174660_C_T:11174660:7,8,0,2
chr12	11174662	.	T	TTGTATTGTATTGTATTGTATTG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=116,148;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,2:3,0:0|1:11174660_C_T:11174660:7,8,0,2
chr12	11174753	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,84;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,10,13
chr12	11174765	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=84,90;MMQ=51,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:9,2:14,2:8,15,2,2
chr12	11182998	.	CA	TC	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=88,129;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:22,4:15,2:23,14,4,2
chr12	11183042	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=72,158;MMQ=60,26;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:14,3:14,2:0|1:11183042_C_G:11183042:14,16,0,5
chr12	11183046	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=66,158;MMQ=60,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:13,3:13,1:0|1:11183042_C_G:11183042:14,13,0,5
chr12	11183052	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=66,149;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:13,3:12,1:0|1:11183042_C_G:11183042:12,13,0,4
chr12	11183066	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=82,149;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:11,3:11,1:0|1:11183042_C_G:11183042:10,12,0,4
chr12	11183217	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=122,147;MMQ=60,50;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:10,1:3,4:8,6,3,2
chr12	11183676	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:8,7:11,7:4,15,6,9
chr12	11183697	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=156,150;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:10,8:4,3:5,9,5,7
chr12	11183708	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=151,163;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.324:29:12,5:7,4:10,10,4,5
chr12	11183722	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=144,150;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.224:28:11,4:11,1:15,7,1,5
chr12	11183747	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=144,492;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:14,10,2,0
chr12	11183752	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=145,144;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,4:12,0:17,8,1,3
chr12	11183827	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=118,206;MMQ=55,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,2:16,0:0|1:11183827_G_C:11183827:12,17,1,1
chr12	11183832	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=145,98;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.354:32:5,9:15,1:6,15,7,4
chr12	11183836	.	AA	GG	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=111,206;MMQ=58,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,2:16,0:0|1:11183827_G_C:11183827:12,19,1,1
chr12	11199734	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	11214066	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=26,31;MFRL=135,123;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:12,2:8,2:0|1:11214066_T_C:11214066:11,10,3,1
chr12	11214074	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=26,34;MFRL=110,118;MMQ=60,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,2:7,1:0|1:11214066_T_C:11214066:10,11,2,1
chr12	11214080	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=119,123;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:13,2:8,1:0|1:11214066_T_C:11214066:9,13,2,2
chr12	11214082	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=25,34;MFRL=110,123;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:13,2:6,2:0|1:11214066_T_C:11214066:9,12,2,2
chr12	11214091	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=30,34;MFRL=119,128;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:13,3:6,2:0|1:11214066_T_C:11214066:9,11,2,3
chr12	11214101	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=108,118;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.248:22:9,3:7,2:0|1:11214066_T_C:11214066:8,9,1,4
chr12	11214133	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=130,143;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,4:8,1:0|1:11214133_C_T:11214133:5,9,2,3
chr12	11214137	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=124,143;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:0|1:11214133_C_T:11214133:4,7,2,3
chr12	11214153	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=191,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:7,4:21,0:0|1:11214153_C_T:11214153:11,20,2,2
chr12	11214156	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=191,182;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:6,3:23,0:0|1:11214153_C_T:11214153:11,20,2,2
chr12	11214161	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=183,236;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:7,2:23,0:0|1:11214153_C_T:11214153:10,20,2,1
chr12	11214167	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=192,236;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:7,3:22,0:0|1:11214153_C_T:11214153:9,20,2,1
chr12	11214299	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,31;MFRL=147,135;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,2:5,1:4,9,2,1
chr12	11214324	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=33,25;MFRL=145,135;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,3:12,2:0|1:11214324_C_T:11214324:9,11,3,2
chr12	11214326	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=145,135;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,3:12,2:0|1:11214324_C_T:11214324:9,11,3,2
chr12	11214330	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=34,24;MFRL=141,134;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:6,3:11,2:0|1:11214324_C_T:11214324:7,11,4,2
chr12	11214336	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=27,23;MFRL=143,134;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:5,2:11,3:0|1:11214324_C_T:11214324:7,10,4,2
chr12	11214351	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=118,135;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.274:27:6,3:10,3:0|1:11214351_G_C:11214351:12,8,4,3
chr12	11214360	.	C	A,T	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,27,24;MFRL=118,132,98;MMQ=60,40,60;MPOS=10,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.17,11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,6,6:0.226,0.225:28:4,2,4:12,3,2:9,7,7,5
chr12	11214363	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=24,28;MFRL=111,132;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:8,2:13,3:0|1:11214351_G_C:11214351:13,10,2,3
chr12	11214368	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=105,132;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,2:13,3:0|1:11214351_G_C:11214351:11,9,2,3
chr12	11214386	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=105,131;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:10,1:12,4:0|1:11214386_T_G:11214386:10,12,3,2
chr12	11214392	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=20,25;MFRL=105,130;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:10,1:9,5:0|1:11214386_T_G:11214386:10,11,3,3
chr12	11244067	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=22,26;MFRL=134,115;MMQ=52,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:3,3:16,0:0|1:11244067_A_ATT:11244067:11,10,2,1
chr12	11244070	.	TCC	T	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=21,25;MFRL=134,115;MMQ=60,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:4,3:16,0:0|1:11244067_A_ATT:11244067:13,10,2,1
chr12	11244091	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=31,25;MFRL=103,106;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:8,5:14,0:0|1:11244091_C_T:11244091:11,11,5,1
chr12	11244096	.	TG	CA	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=22,32;MFRL=103,105;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:8,7:13,0:0|1:11244091_C_T:11244091:11,10,5,2
chr12	11244102	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=101,106;MMQ=60,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:9,7:11,1:0|1:11244091_C_T:11244091:9,11,6,2
chr12	11244126	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=102,131;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.138:40:22,2:13,3:19,16,2,3
chr12	11244149	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=30,23;MFRL=130,101;MMQ=48,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:10,11:7,8:8,9,6,13
chr12	11244166	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=103,142;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.503:33:8,10:8,7:3,13,9,8
chr12	11244169	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=32,22;MFRL=142,103;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.496:33:10,8:7,8:9,8,3,13
chr12	11244190	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=25,30;MFRL=141,101;MMQ=41,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:7,4:11,2:0|1:11244190_A_G:11244190:10,8,0,6
chr12	11244194	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=101,142;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.750:22:3,6:2,11:0,5,9,8
chr12	11244199	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=31,29;MFRL=142,101;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:5,3:11,2:0|1:11244190_A_G:11244190:9,8,0,5
chr12	11244294	.	CAGTCATATTTGAAAAGTACATTGCACTCTTCAATTTGATCTTCCA	C	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:11,0:3,2:10,15,1,1
chr12	11244299	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,24;MFRL=95,104;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:10,2:5,0:0|1:11244299_A_G:11244299:6,9,1,1
chr12	11244303	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=98,104;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:5,0:0|1:11244299_A_G:11244299:7,9,1,1
chr12	11244309	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=98,104;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,2:6,0:0|1:11244299_A_G:11244299:7,9,1,1
chr12	11244321	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=24,29;MFRL=101,104;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:0|1:11244321_T_G:11244321:7,10,1,1
chr12	11244323	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=101,104;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:0|1:11244321_T_G:11244321:7,10,1,1
chr12	11244390	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=94,73;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:15,2:3,1:15,4,2,1
chr12	11244602	.	TT	CA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=149,118;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:6,6,4,0
chr12	11244634	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=135,122;MMQ=59,40;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:7,4:6,4,6,0
chr12	11244646	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=125,122;MMQ=58,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,2:9,4:8,5,6,0
chr12	11244687	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=96,117;MMQ=52,49;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,1:11,6:12,11,1,6
chr12	11244721	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=20,32;MFRL=93,119;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:14,1:8,4:0|1:11244721_G_C:11244721:10,12,0,5
chr12	11244723	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=21,29;MFRL=90,119;MMQ=60,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:14,1:7,1:0|1:11244721_G_C:11244721:10,13,0,5
chr12	11244725	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=131,93;MMQ=45,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.884:24:1,14:0,8:0,2,9,13
chr12	11244793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=63,191;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:2,2:10,0:0|1:11244793_C_T:11244793:5,7,1,1
chr12	11244797	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=31,18;MFRL=63,191;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,1:9,0:0|1:11244793_C_T:11244793:5,6,1,1
chr12	11244805	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=65,191;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,2:7,0:0|1:11244793_C_T:11244793:6,6,1,1
chr12	11244814	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=110,191;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:5,0:0|1:11244793_C_T:11244793:6,5,1,1
chr12	11285909	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=114,101;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:5,4:7,1:8,4,2,3
chr12	11285924	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=102,136;MMQ=60,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:11,1:17,6,1,1
chr12	11285974	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=24,0;MFRL=113,110;MMQ=60,27;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,13:0.240:56:22,0:19,0:0|1:11285974_A_G:11285974:26,17,13,0
chr12	11285980	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=113,110;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,13:0.236:57:21,10:20,3:0|1:11285974_A_G:11285974:26,18,13,0
chr12	11286713	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=105,138;MMQ=58,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,2:18,1:12,17,3,0
chr12	11286736	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=128,88;MMQ=59,23;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:9,2:15,1:0|1:11286736_G_C:11286736:12,14,1,2
chr12	11286745	.	AA	GG	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=119,88;MMQ=60,23;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:9,2:17,1:0|1:11286736_G_C:11286736:13,14,1,2
chr12	11286760	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=119,88;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,2:12,2:13,12,2,2
chr12	11286790	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=22,25;MFRL=95,136;MMQ=58,31;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.157:29:15,3:10,1:11,14,1,3
chr12	11286797	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=98,75;MMQ=59,25;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:18,0:7,2:9,17,1,1
chr12	11338514	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34,30;MFRL=311,208,338;MMQ=60,44,60;MPOS=34,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.84,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,1,0:1,0,1:1,0,3,0
chr12	11338539	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr12	11338555	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,3:0,0,5,5
chr12	11338613	.	CA	GG	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,12,15
chr12	11421721	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	11422583	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,7:5,9:0,7,7,9
chr12	11461292	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,15:0,4:0,0,14,5
chr12	11461470	.	A	G,T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28,20;MFRL=0,100,71;MMQ=60,33,23;MPOS=12,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.13,6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,2:0.754,0.186:13:0,3,2:0,8,0:0,0,5,8
chr12	11461477	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=70,71;MMQ=28,23;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:5,0:2,5,1,1
chr12	11461596	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=74,63;MMQ=37,28;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,5:5,1:2,15,2,5
chr12	11461836	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,4,17
chr12	11506211	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,29;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,15:0,0,17,18
chr12	11506244	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=91,96;MMQ=48,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:13,2:25,0:0|1:11506244_C_T:11506244:22,21,0,2
chr12	11506246	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=91,96;MMQ=48,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:16,2:25,0:0|1:11506244_C_T:11506244:22,21,0,2
chr12	11506249	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=106,96;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:15,0:0|1:11506244_C_T:11506244:12,20,0,2
chr12	11506347	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,26;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	11506669	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,31;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr12	11506893	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,82;MMQ=60,56;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,8:0,0,12,4
chr12	11803220	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.925:9:0,5:0,4:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,9
chr12	11803228	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,2:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,9
chr12	12232620	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=106,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:5,4:23,0:15,15,4,0
chr12	12240199	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,19,15
chr12	12247594	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.765:19:4,6:0,9:1,3,6,9
chr12	12247616	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,4:0,8:2,2,5,8
chr12	12278203	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:8,3,2,1
chr12	12288264	.	AGGAGGGGGAGT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.427:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr12	12301898	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,13,8
chr12	12315203	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.774:29:4,14:2,9:4,2,13,10
chr12	12318268	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=76,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr12	12334405	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	12397668	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,0,2
chr12	12397670	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,0,2
chr12	12483528	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.137:54:24,0:22,5:17,29,0,8
chr12	12483927	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	12491367	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.174:36:15,5:15,0:17,13,6,0
chr12	12495959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	12588791	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=278,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:12588791_A_G:12588791:2,3,0,2
chr12	12588798	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=160,278;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1|0:12588791_A_G:12588791:0,5,2,0
chr12	12618690	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.756:9:0,3:1,4:1,1,0,7
chr12	12618715	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr12	12633360	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr12	12790577	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.108:30:13,2:12,0:18,9,0,3
chr12	12790724	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=129,152;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:9,0:1,2:0,10,0,2
chr12	12814818	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr12	12814842	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=155,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,4:7,0:0|1:12814842_TG_T:12814842:9,4,2,2
chr12	12814847	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=163,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:6,4:6,0:0|1:12814842_TG_T:12814842:9,5,2,2
chr12	12814850	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=163,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,4:5,0:0|1:12814842_TG_T:12814842:8,4,2,2
chr12	12814853	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=176,41;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,0:0|1:12814842_TG_T:12814842:8,2,2,2
chr12	12878897	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=142,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:14,0:9,5:0|1:12878897_C_T:12878897:21,5,5,0
chr12	12878920	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=148,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.145:39:17,0:15,5:0|1:12878897_C_T:12878897:29,5,5,0
chr12	12879057	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=146.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,24:0,23:0,0,34,14
chr12	12966291	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:17,2:0|1:12966291_C_T:12966291:14,9,1,1
chr12	12966300	.	A	ATCGGCTGGGACGCTTCGGTCG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:3,0:21,2:0|1:12966291_C_T:12966291:16,9,1,1
chr12	12966380	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:8,0:24,3:9,23,0,4
chr12	12966967	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr12	12974842	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.203:18:8,1:7,2:7,8,2,1
chr12	13061896	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=117,106;MMQ=60,20;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:6,0:5,7:4,7,0,7
chr12	13093801	.	CCA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=88,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr12	13140291	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:5,10,1,1
chr12	13142174	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,6:0,6:1,0,9,3
chr12	13142408	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=236,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	13211495	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:3,4:0,3,1,8
chr12	13215685	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr12	13219556	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=98,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,4,2
chr12	13221606	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr12	13237739	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,116;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr12	13242169	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:2,0:13,2:4,11,1,1
chr12	13256353	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr12	13366658	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,0:10,5:5,9,0,5
chr12	13366671	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=65,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:3,0:11,5:7,7,0,5
chr12	13717096	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:6,3:37,2:36,7,2,3
chr12	13717508	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=285,79;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,7:0,10:0,1,7,10
chr12	13720272	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	13768354	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr12	13769664	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	14018777	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr12	14590981	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	14591220	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr12	14599904	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,19,30;MFRL=79,94,177;MMQ=60,60,60;MPOS=10,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=T;STR;TLOD=12.81,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,9,3:0.554,0.178:16:3,3,0:0,1,2:3,1,8,4
chr12	14599919	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.136:24:3,0:7,1:10,11,3,0
chr12	14610285	.	TCTCTTTTCTTACA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14610285_TCTCTTTTCTTACA_T:14610285:0,1,0,1
chr12	14610307	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:14610285_TCTCTTTTCTTACA_T:14610285:0,0,0,1
chr12	14664695	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr12	14689423	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=185,247;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,7:4,0:7,0,7,0
chr12	14767865	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:14,0:15,4:15,14,0,4
chr12	14769468	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	14769613	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=95,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:10,15,2,0
chr12	14774249	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr12	14774849	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	14781503	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	14794062	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,8,11
chr12	14798314	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=214,290;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14798314_A_T:14798314:0,1,0,1
chr12	14798315	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=214,290;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14798314_A_T:14798314:0,1,0,1
chr12	14798320	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=212,290;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:14798314_A_T:14798314:0,2,0,1
chr12	14804994	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,2,8
chr12	14822855	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	14829801	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=90,71;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:22,0:12,5:23,11,2,3
chr12	14829835	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=97,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:19,0:19,4:22,16,1,3
chr12	14834421	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,0,6
chr12	14834427	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,0,6
chr12	14928493	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,4,3
chr12	14930014	.	T	TTTTTTTTTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.151:17:8,0:7,2:0|1:14930014_T_TTTTTTTTTG:14930014:5,10,1,1
chr12	14930024	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.237:15:5,1:6,2:0|1:14930014_T_TTTTTTTTTG:14930014:3,9,2,1
chr12	14930265	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:8,0:5,8:0|1:14930265_C_G:14930265:4,10,0,8
chr12	14930267	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:8,0:5,8:0|1:14930265_C_G:14930265:4,10,0,8
chr12	14947675	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:1,10,1,2
chr12	14949720	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.422:14:4,4:4,2:6,2,4,2
chr12	14949807	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,0:10,3:12,13,2,1
chr12	14950006	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	14958898	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=95,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:8,3:6,3,2,1
chr12	14982353	.	AGATGCAATAGCTATAGGATCAGG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:21,0:8,2:19,16,1,1
chr12	14993966	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,159;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:7,0:10,5,3,0
chr12	14994099	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:8,0:3,12,0,3
chr12	14994181	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	15034996	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	15037187	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=58.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,29:0.914:32:2,11:1,15:1,2,7,22
chr12	15038788	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,12:3,5:2,3,6,11
chr12	15067843	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=193,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	15090837	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr12	15095707	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr12	15131995	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	15264345	.	GTTGATTCTAAGGGAATGAGCAAATAAAAAAGACAAAAAGATAAATAAATGCAAGATTTAAT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.133:25:5,3:11,0:6,14,2,3
chr12	15370323	.	C	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.125:48:18,1:23,3:28,14,4,2
chr12	15652330	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chr12	15656832	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,2:0,4:0,0,6,2
chr12	15661441	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	15669848	.	C	CATGCCCAGCCTGTTCTATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr12	15702007	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=110,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,7:3,9:5,4,12,4
chr12	15702059	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:16,0:7,2:0|1:15702059_C_T:15702059:18,8,1,1
chr12	15702066	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:19,0:9,2:0|1:15702059_C_T:15702059:17,12,1,1
chr12	15702082	.	A	AAG	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:20,0:7,2:0|1:15702059_C_T:15702059:14,14,1,1
chr12	15702083	.	C	CCCCAAAACAGTCACACACCCCACTG	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:20,0:8,2:0|1:15702059_C_T:15702059:14,14,1,1
chr12	15704425	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	15710441	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=122,72;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:7,6:11,0:8,10,5,1
chr12	15731724	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr12	15731744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:2,2,5,3
chr12	15731900	.	TAACA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:3,2:0|1:15731900_TAACA_T:15731900:2,5,1,1
chr12	15731908	.	AT	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:3,2:0|1:15731900_TAACA_T:15731900:2,5,1,1
chr12	15742313	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.665:15:2,1:3,8:5,0,9,1
chr12	15742341	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=118,217;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:10,7:22,0:17,15,7,0
chr12	15748020	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	15776229	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.293:18:5,0:6,3:0|1:15776229_A_G:15776229:4,9,2,3
chr12	15776234	.	A	AGGGAGTAGGGCTGGATGAGCCAGAT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.217:16:6,0:4,3:0|1:15776229_A_G:15776229:4,9,0,3
chr12	15776261	.	A	ACTAGAGAGAAGCGTTGTCAGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	15784481	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.204:52:26,0:15,10:21,21,0,10
chr12	15799990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr12	15803992	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,0,8
chr12	15807288	.	T	TAACATAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	15818880	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,2,18
chr12	15822229	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr12	15822244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr12	15834192	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,13:6,7:8,3,15,5
chr12	15834239	.	GTAA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TAA;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr12	16035846	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr12	16050808	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,12:0,11:0,0,15,9
chr12	16052742	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	16055926	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr12	16185463	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=0,133457;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr12	16713487	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.352:11:5,1:1,3:1,6,1,3
chr12	16713529	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr12	16753829	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	18234461	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	18242324	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	18443955	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.572:21:3,5:5,7:4,5,2,10
chr12	18499777	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,9,17
chr12	18534809	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:7,0:10,2:0|1:18534809_C_T:18534809:6,12,1,1
chr12	18534826	.	G	GCCCAGGATTCAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=69,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:18534809_C_T:18534809:7,10,1,1
chr12	18574024	.	A	ATGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr12	18576899	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:3,2,4,3
chr12	18641326	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	18720057	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=12452,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr12	18747387	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=112,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:4,7:1,1:4,1,8,0
chr12	18747528	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=84,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:5,9:5,5:4,6,2,12
chr12	18762450	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=77,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr12	18801017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	18837298	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	18849071	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	18849256	.	CTATATATA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=TA;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	18854540	.	ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC	A,ATCC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,26,26;MFRL=132,154,129;MMQ=60,60,60;MPOS=34,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,8,9;RU=TCC;STR;TLOD=6.34,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.230,0.245:11:3,0,0:0,2,2:3,4,0,4
chr12	18889149	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=104,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,1:8,2:9,4,2,1
chr12	18890272	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:0|1:18890272_AG_A:18890272:9,6,1,1
chr12	18890277	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:0|1:18890272_AG_A:18890272:9,6,1,1
chr12	19282670	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=282,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,7,1
chr12	19283135	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	19406863	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr12	19418588	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	19418874	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	19427349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19427349_G_A:19427349:0,0,0,1
chr12	19427351	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19427349_G_A:19427349:0,0,0,1
chr12	19440475	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,166;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:16,0:12,7:13,15,0,7
chr12	19498654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=142,141;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:19498654_G_A:19498654:5,1,2,0
chr12	19498660	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=142,141;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:19498654_G_A:19498654:5,1,2,0
chr12	19500133	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	19500162	.	C	CAGCCTCCCAAGTAGCTGGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.596:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	19511281	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=113,132;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,0:13,4:10,15,0,4
chr12	19512563	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	19646943	.	CTGGTGTATTTCA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,5:2,3:0,4,0,8
chr12	19670944	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,2:10,3:14,6,5,0
chr12	19671157	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	20522124	.	CGTGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=GT;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,4:0,1:2,0,5,0
chr12	20522838	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,74;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:8,2:4,0:4,8,1,2
chr12	20709733	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr12	20783099	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr12	20786787	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	20801855	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr12	20801861	.	C	CTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=13,17;MFRL=121,118;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.842:6:0,0:0,0:0,1,3,2
chr12	20803323	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr12	20803549	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr12	20854257	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,312;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:6,11,3,0
chr12	20859008	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,0:5,3:8,9,0,3
chr12	20870033	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.477:10:2,2:3,3:4,1,2,3
chr12	20870265	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	20874968	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=200,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:20874968_A_C:20874968:1,2,1,1
chr12	20874970	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=200,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:20874968_A_C:20874968:1,2,1,1
chr12	20876227	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr12	20886111	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	20889942	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr12	20893052	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	20893108	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,6:0,4:0,0,8,3
chr12	20893354	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	20903520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	20903757	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr12	20903865	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr12	20968828	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	21008037	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,208;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:2,0:11,4:7,7,0,4
chr12	21011296	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	21011310	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr12	21011581	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr12	21013948	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr12	21014136	.	T	TAAAACACTCTCTTGTCTCGATAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=163,1313;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,1,0
chr12	21014139	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	21014163	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	21015610	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr12	21028093	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr12	21036270	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,27;MFRL=0,234;MMQ=46,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:0,1,4,0
chr12	21036411	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=82,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,27:0.874:30:3,15:0,11:0|1:21036411_A_G:21036411:3,0,16,11
chr12	21036418	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,3:0.120:31:17,3:10,0:1|0:21036411_A_G:21036411:16,12,3,0
chr12	21051489	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr12	21069151	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:9,0:6,10,0,2
chr12	21175691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	21175703	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	21175719	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	21176247	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,3,12
chr12	21201572	.	A	ATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,178;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=TG;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr12	21207346	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr12	21220333	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=54,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.764:15:3,3:0,8:0|1:21220333_A_G:21220333:1,2,4,8
chr12	21220349	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0|1:21220333_A_G:21220333:0,0,4,11
chr12	21243125	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=141,181;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21243125_T_C:21243125:0,1,0,1
chr12	21243130	.	T	TCTGTATTTCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=141,181;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21243125_T_C:21243125:0,1,0,1
chr12	21243135	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21243125_T_C:21243125:0,0,0,1
chr12	21243136	.	T	TGAATG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21243125_T_C:21243125:0,0,0,1
chr12	21243138	.	T	TGGCCTGCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21243125_T_C:21243125:0,0,0,1
chr12	21331599	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:3,3:11,2:7,7,2,3
chr12	21375331	.	AATATATAT	A,AATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26,20;MFRL=0,151,146;MMQ=60,40,40;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,13;RU=AT;STR;TLOD=3.55,7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,0:0,1,1:0,0,0,3
chr12	21457434	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:5,10:2,11:4,3,10,11
chr12	21459764	.	GTGTTTAGTTATAAGTTCGCTGAACAAAAATCAATACAATGAAGTAGACAACCTGATGGATCCTGCGTTGGTCTTAAAATCTGGGTTCCATTTTCCATACACAAGAAAC	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.061:50:5,4:6,0:27,19,3,1
chr12	21531437	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	21590621	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=121,96;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,3:12,1:14,10,2,2
chr12	21590788	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,0:5,3:0,5,1,2
chr12	21593404	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,5,16
chr12	21598264	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:2,8:0,10:2,0,13,5
chr12	21605157	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=133,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:3,13,0,2
chr12	21608011	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:7,1,4,0
chr12	21608043	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:12,6:3,1:13,2,4,3
chr12	21609127	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	21613923	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:7,4,1,1
chr12	21615750	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,89;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:4,7,1,2
chr12	21620435	.	T	TGACCCCCCACC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=117,204;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:7,7,0,2
chr12	21623122	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,118;MMQ=52,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.678:32:3,5:7,17:6,4,12,10
chr12	21624309	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=32,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.656:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr12	21627745	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,6:3,4:4,1,7,3
chr12	21628628	.	CC	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:10,2:8,7,1,1
chr12	21628791	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=186,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	21628812	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	21629987	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:21629987_T_C:21629987:0,0,0,4
chr12	21629993	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:21629987_T_C:21629987:0,2,0,2
chr12	21639528	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.265:20:2,0:0,1:2,13,0,5
chr12	21644667	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,7:3,8:0,4,2,13
chr12	21652641	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr12	21680609	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr12	21689882	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:3,4,4,2
chr12	21692166	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=214,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.794:8:0,5:1,2:1,0,4,3
chr12	21711111	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr12	21712545	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr12	21712574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,8,7
chr12	21712728	.	GACATTCTTTGAAATT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATTCTTTGAAATT;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	21713308	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,15,9
chr12	21713402	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	21715801	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr12	21716055	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	21716098	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr12	21721986	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,133;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr12	21727315	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	21728874	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:6,5,0,2
chr12	21789968	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	21791272	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,14,4
chr12	21791379	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.863:27:1,8:2,16:1,2,8,16
chr12	21791410	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,28,21;MFRL=60,83,84;MMQ=60,60,60;MPOS=32,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.23,8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,8:0.351,0.589:14:1,1,2:0,4,4:1,0,3,10
chr12	21791455	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr12	21794865	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr12	21796814	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	21799803	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr12	21799999	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	21807432	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr12	21807640	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr12	21807687	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	21919439	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr12	21919451	.	GA	TT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:2,5,0,3
chr12	21919492	.	ATCCTCCCT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=175,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	21998717	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:2,3,0,5
chr12	22016004	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:1,1:0,1:0,2,1,5
chr12	22017486	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr12	22028546	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr12	22035873	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	22040908	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:13,0:9,4:4,18,0,4
chr12	22047151	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr12	22063737	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr12	22063749	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr12	22066006	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=14,16;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:0,0:0|1:22066006_GA_G:22066006:1,4,0,1
chr12	22066032	.	T	TATGTTGATCTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:22066006_GA_G:22066006:1,3,0,1
chr12	22215194	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=92,110;MMQ=41,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.559:4:0,1:1,1:1,1,1,1
chr12	22602796	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.891:25:2,14:0,9:0,2,5,18
chr12	22606738	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	22606895	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:8,3,1,3
chr12	22610078	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=104,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:13,0:13,2:12,14,0,2
chr12	22610098	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=104,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:22610098_A_AG:22610098:4,10,0,2
chr12	22610100	.	A	AACC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:22610098_A_AG:22610098:4,11,0,2
chr12	22610103	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:5,2:0|1:22610098_A_AG:22610098:2,11,0,2
chr12	22631455	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=81,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr12	22631501	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=0,162;MMQ=53,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:22631501_T_C:22631501:1,2,0,1
chr12	22631503	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=0,162;MMQ=53,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:22631501_T_C:22631501:1,2,0,1
chr12	22631506	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=0,162;MMQ=53,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:22631501_T_C:22631501:1,2,0,1
chr12	22631507	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=87,0;MMQ=56,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr12	22677557	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr12	22796804	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=76,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.860:26:3,17:0,6:2,1,12,11
chr12	22796994	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	23689301	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	23737566	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr12	23998888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr12	24102665	.	CCTCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=CT;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	24736924	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:9,4:3,5:9,3,6,3
chr12	25031449	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,12,5
chr12	25054891	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr12	25147192	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=65,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:2,1,3,3
chr12	25147213	.	C	CCACAGCCTCGCCAGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:6,2:4,4,1,1
chr12	25147300	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	25147391	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	25149373	.	ATTTC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	25150145	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=120,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:25150145_G_A:25150145:12,2,1,1
chr12	25150147	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=120,35;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:25150145_G_A:25150145:12,2,1,1
chr12	25150149	.	GTGGGGGGGGGTCT	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=134,35;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:6,0:0|1:25150145_G_A:25150145:12,5,1,1
chr12	25150164	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=136,35;MMQ=54,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:25150145_G_A:25150145:4,4,1,1
chr12	25150170	.	TTG	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=149,35;MMQ=44,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:25150145_G_A:25150145:3,5,1,1
chr12	25150173	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=136,35;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:25150145_G_A:25150145:2,6,1,1
chr12	25150175	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=136,35;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:25150145_G_A:25150145:2,6,1,1
chr12	25150177	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=136,35;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:3,0:0|1:25150145_G_A:25150145:2,6,1,1
chr12	25232120	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr12	25232235	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=109,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:20,0:22,4:0|1:25232235_T_G:25232235:20,23,3,2
chr12	25232239	.	GT	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.117:49:19,0:22,5:0|1:25232235_T_G:25232235:20,24,3,2
chr12	25240988	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,4:8,2:15,2,3,3
chr12	25242443	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	25243046	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:11,0:4,4:8,7,4,0
chr12	25249785	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr12	25261735	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr12	25267688	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=128,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,2:8,1:4,6,1,2
chr12	25272297	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr12	25274593	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	25299921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr12	25699505	.	AGAAAGAAGTAACCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr12	26231843	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	26231898	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	26275555	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr12	26553172	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=120,187;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.306:34:8,0:16,10:7,17,0,10
chr12	26568456	.	TAAGAAAAGA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=107,187;MMQ=60,23;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=130.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,31:0.844:36:1,23:3,5:2,3,2,29
chr12	26592288	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=64,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,3:1,2:1,2,0,5
chr12	26596618	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr12	26777379	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:0,6,0,6
chr12	26809153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr12	26809309	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:7,6,1,1
chr12	26834804	.	T	TACTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,2:0,5:2,1,5,2
chr12	26848410	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr12	26848663	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr12	27059149	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	27064047	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:11,0:0|1:27064047_G_T:27064047:13,5,1,1
chr12	27064049	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:11,0:0|1:27064047_G_T:27064047:13,6,1,1
chr12	27064051	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:27064047_G_T:27064047:13,6,1,1
chr12	27066350	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,1:2,2:7,3,3,0
chr12	27066607	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:12,0:12,9:6,18,7,2
chr12	27068877	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27068877_C_G:27068877:3,0,1,0
chr12	27068881	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27068877_C_G:27068877:3,0,1,0
chr12	27109412	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AT;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:5,2:7,1,3,0
chr12	27152666	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,1,6
chr12	27175640	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	27179551	.	CTTATT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	27461984	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr12	27471036	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,0:0,1:0|1:27471036_A_T:27471036:0,2,0,1
chr12	27471041	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:27471036_A_T:27471036:0,2,0,1
chr12	27471042	.	G	GCAGAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27471036_A_T:27471036:0,2,0,1
chr12	27529219	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=94,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:7,5,2,0
chr12	27533367	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr12	27533396	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:0,11,0,5
chr12	27553794	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	27623490	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	27625823	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr12	27625879	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27625879_G_A:27625879:0,0,0,1
chr12	27625887	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27625879_G_A:27625879:0,0,0,1
chr12	27628742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	27786415	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=118,101;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:7,4:5,6,1,3
chr12	27786499	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=174,234;MMQ=52,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr12	27800576	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:1,3:3,1,6,0
chr12	27800617	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=90,99;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.326:41:14,13:14,0:17,11,13,0
chr12	27800746	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,7,12
chr12	27809736	.	A	AGGCATAGTGTTTGTTTCTAAAGACTGTAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=150,254650;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.179:17:8,2:4,0:3,12,0,2
chr12	27811649	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	27813754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr12	27813844	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=126,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:8,4:10,0:10,9,4,0
chr12	27813903	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,3,12
chr12	27813961	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:27813961_A_G:27813961:0,0,0,5
chr12	27813973	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:27813961_A_G:27813961:0,0,0,6
chr12	27813981	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:27813961_A_G:27813961:0,0,0,5
chr12	27817408	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr12	27820302	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	27826780	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0,0,11,18
chr12	27830000	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:4,10,2,1
chr12	27877135	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=94,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,0:6,6:4,10,0,6
chr12	27877196	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=165,145;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27877196_GCA_G:27877196:0,1,0,1
chr12	27877200	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=165,145;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27877196_GCA_G:27877196:0,1,0,1
chr12	27877209	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=202,145;MMQ=40,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27877196_GCA_G:27877196:0,1,0,1
chr12	27890540	.	GG	AA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,2:18,0:17,10,0,2
chr12	27908031	.	GAAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr12	27915585	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	27933782	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:3,3,2,0
chr12	27950851	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,0:7,4:6,7,3,1
chr12	28412398	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.624:8:1,1:2,4:1,2,0,5
chr12	28412415	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:0,2:2,5:0,2,1,7
chr12	28603331	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,0:14,3:13,11,0,3
chr12	28605370	.	G	GCAGT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGT;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:8,5,3,0
chr12	29423508	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=155,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,0:8,7:7,4,0,7
chr12	29423524	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=159,254;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,0:8,7:7,5,0,7
chr12	29423583	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:0,3:3,2:3,0,1,4
chr12	29423636	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr12	29462224	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr12	29485449	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	29486715	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:2,2:12,5:5,10,4,3
chr12	29486745	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:0,1:4,8:2,2,3,6
chr12	29496224	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:2,1,2,3
chr12	29510749	.	A	ATCTCACATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:29510749_A_ATCTCACATG:29510749:0,3,0,1
chr12	29510751	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:29510749_A_ATCTCACATG:29510749:0,3,0,1
chr12	29510755	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:29510749_A_ATCTCACATG:29510749:0,3,0,1
chr12	29510756	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:29510749_A_ATCTCACATG:29510749:0,3,0,1
chr12	29523183	.	CAGAATTAAAACAATAAAAAAAGCAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,2:2,0:0,6,1,1
chr12	29524365	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	29586810	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,3:1,2:0,3,0,5
chr12	29596467	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:29596467_T_C:29596467:0,7,1,1
chr12	29596471	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:29596467_T_C:29596467:0,7,1,1
chr12	29596473	.	AC	TT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:29596467_T_C:29596467:0,8,1,1
chr12	29596479	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:29596467_T_C:29596467:0,6,1,1
chr12	29596481	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:29596467_T_C:29596467:0,6,1,1
chr12	29596485	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0|1:29596467_T_C:29596467:0,6,1,1
chr12	29597306	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	29598373	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:1,4,0,4
chr12	29607811	.	T	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=94,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.068:71:38,4:26,0:40,27,4,0
chr12	29607931	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr12	29627922	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr12	29628205	.	TA	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:29628205_TA_CC:29628205:0,1,0,1
chr12	29628208	.	T	TCTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29628205_TA_CC:29628205:0,1,0,1
chr12	29628210	.	A	ACGTAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29628205_TA_CC:29628205:0,1,0,1
chr12	29628212	.	C	CTGCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29628205_TA_CC:29628205:0,1,0,1
chr12	29628215	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29628205_TA_CC:29628205:0,1,0,1
chr12	29630081	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr12	29640888	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr12	29642542	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,9:1,5:3,0,8,6
chr12	29642573	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,6:1,5:3,1,7,4
chr12	29648275	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=67,85;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.768:15:0,8:3,4:0|1:29648275_G_A:29648275:1,2,7,5
chr12	29648294	.	G	GAGATCTTTCCTGTTTTGGTTAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=85,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.152:17:6,2:7,0:0|1:29648275_G_A:29648275:7,8,1,1
chr12	29650702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	29659951	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=78,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:1,4,1,4
chr12	29786212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:11,2:0|1:29786212_C_T:29786212:7,7,1,1
chr12	29786219	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:29786212_C_T:29786212:5,8,1,1
chr12	29786223	.	G	GCGATT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:29786212_C_T:29786212:5,8,1,1
chr12	29908580	.	A	ATTGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,1:0,0,5,0
chr12	29920745	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	29920790	.	C	CACAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr12	30783743	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,2:0,1:3,1,3,1
chr12	30783956	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	30787104	.	CC	TT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=86,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:17,0:20,1:19,18,2,1
chr12	30814043	.	CTATTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr12	30814259	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr12	30818081	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,90;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr12	30827086	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=59,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.512:9:0,2:4,3:1,3,0,5
chr12	30837448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr12	30843377	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.799:23:1,11:3,7:3,1,17,2
chr12	30848675	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:1,5,0,4
chr12	30867794	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	30878859	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=90,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:2,1,3,1
chr12	30879088	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	30886581	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:30886581_C_CT:30886581:7,2,1,1
chr12	30886585	.	C	CCTTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:30886581_C_CT:30886581:7,2,1,1
chr12	30887816	.	ACACACT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=100,225;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,0:5,1:0|1:30887816_ACACACT_A:30887816:6,2,2,0
chr12	30887820	.	ACT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CT;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,10:0.630:15:2,2:3,7:1|0:30887816_ACACACT_A:30887816:4,1,8,2
chr12	30893875	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,2:2,6:2,0,8,0
chr12	30906675	.	GCTTGAGATA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:5,13,1,1
chr12	31132479	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr12	31135408	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,8:9,0:11,6,7,1
chr12	31135478	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.941:31:0,19:1,10:1,0,12,18
chr12	31135665	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,30;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:5,6,1,1
chr12	31135905	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=64,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr12	31144884	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=112,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,1:9,2:6,10,0,3
chr12	31241942	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=92,90;MMQ=58,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:10,4:4,0:7,7,4,0
chr12	31241956	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=104,67;MMQ=55,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.213:21:13,2:4,2:10,7,3,1
chr12	31242181	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,87;MMQ=60,29;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:3,4,0,2
chr12	31250987	.	TTGGGAGAGATGCATTATCAGTCCTGTTCTCTCC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=106,106;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr12	31256995	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=232,152;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,3,4
chr12	31435608	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=114,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.331:15:2,3:8,2:6,4,2,3
chr12	31440813	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr12	31542191	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr12	31545381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	31545682	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	31551350	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	31566452	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:5,8,2,1
chr12	31568221	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	31613335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,1,5
chr12	31632449	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	31632584	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr12	31633159	.	T	TGCCTTCTCCCTTGATTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	31633202	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31633202_GA_G:31633202:0,0,0,1
chr12	31633224	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31633202_GA_G:31633202:0,0,0,1
chr12	31648723	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,13,5
chr12	31648728	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,11,6
chr12	31648948	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	31820564	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.497:14:2,4:4,2:6,1,6,1
chr12	31945146	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:14,4:17,0:15,16,0,4
chr12	32137852	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:8,4:7,3:11,4,4,3
chr12	32138924	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	32138974	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	32260520	.	C	CTGCCTTATCTGATAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	32446871	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=210,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr12	32446939	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=148,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,6:12,0:13,4,6,0
chr12	32481143	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=84,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,3:6,0:12,6,2,1
chr12	32481147	.	AGAG	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=91,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:9,0:17,8,2,0
chr12	32490511	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:9,0:10,4:9,10,2,2
chr12	32490735	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:2,0:10,2:0|1:32490735_G_T:32490735:5,7,1,1
chr12	32490739	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:32490735_G_T:32490735:5,7,1,1
chr12	32490742	.	G	GGC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:32490735_G_T:32490735:5,7,1,1
chr12	32490743	.	A	ACCACCATGG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:32490735_G_T:32490735:5,7,1,1
chr12	32755058	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	32777416	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=193,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.744:9:1,3:1,3:1,1,1,6
chr12	32778039	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr12	32778649	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=91,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:32778649_T_G:32778649:14,6,0,2
chr12	32778651	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=91,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:32778649_T_G:32778649:14,6,0,2
chr12	32786594	.	GAAGAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAGAA;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr12	32793164	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	32793315	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:32793315_G_A:32793315:10,7,1,1
chr12	32793317	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:32793315_G_A:32793315:10,7,1,1
chr12	32832206	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr12	32860302	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.823:26:2,13:2,9:2,2,17,5
chr12	32863824	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=118,1281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr12	32866399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:0,0:1,3:0|1:32866399_G_A:32866399:0,1,0,3
chr12	32866403	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:32866399_G_A:32866399:0,1,0,2
chr12	32871481	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	32884741	.	A	AAAAAAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAAAAC;STR;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.689:7:1,0:1,4:0,2,2,3
chr12	32886673	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=109,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:16,4:9,0:13,12,3,1
chr12	32886824	.	AACTATAAAAT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:32886824_AACTATAAAAT_A:32886824:0,2,0,1
chr12	32886839	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32886824_AACTATAAAAT_A:32886824:0,1,0,1
chr12	32886842	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32886824_AACTATAAAAT_A:32886824:0,1,0,1
chr12	32890161	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr12	32896365	.	GA	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=38,163;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,2:1,2,3,2
chr12	32896394	.	C	CATAGCCCTTCCAATTCTGGGTCCATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=155,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr12	32903635	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,5,2
chr12	32949029	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=94,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:9,0:10,2:9,10,2,1
chr12	32974218	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	33003622	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	33003746	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,71;MMQ=58,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:5,0:0|1:33003746_C_T:33003746:6,14,1,1
chr12	33003759	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=109,71;MMQ=55,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,2:5,0:0|1:33003746_C_T:33003746:6,13,1,1
chr12	34178732	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:11,0,2,0
chr12	38710957	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.323:13:4,0:4,3:1,8,0,4
chr12	39064676	.	A	ACTCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,1:4,0:0,5,0,1
chr12	39087687	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:39087687_A_C:39087687:0,0,0,5
chr12	39087690	.	T	TTTC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39087687_A_C:39087687:0,4,0,1
chr12	39087694	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39087687_A_C:39087687:0,4,0,1
chr12	39087695	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39087687_A_C:39087687:0,4,0,1
chr12	39087697	.	A	AGATAAT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39087687_A_C:39087687:0,4,0,1
chr12	39087704	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39087687_A_C:39087687:0,3,0,1
chr12	39124173	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr12	39154733	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr12	39233794	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=101,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:6,0:14,4:7,13,2,2
chr12	39233821	.	ATTT	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,0:4,2:0|1:39233821_ATTT_A:39233821:2,4,0,2
chr12	39233825	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:39233821_ATTT_A:39233821:2,4,0,2
chr12	39233828	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:39233821_ATTT_A:39233821:2,3,0,2
chr12	39703326	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	39705428	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:39705428_G_T:39705428:0,2,0,1
chr12	39705448	.	A	AAATATATCCTAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:39705428_G_T:39705428:0,0,0,1
chr12	39724090	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.760:27:3,4:3,17:2,4,6,15
chr12	39750808	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,369;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	39751230	.	T	TGGAGAAGACACAGGTTATTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,27;MFRL=97,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39751230_T_TGGAGAAGACACAGGTTATTTCTG:39751230:0,1,0,1
chr12	39751235	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:39751230_T_TGGAGAAGACACAGGTTATTTCTG:39751230:0,2,0,1
chr12	39751321	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=266,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:39751321_A_C:39751321:0,2,0,1
chr12	39751327	.	CT	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=266,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39751321_A_C:39751321:0,2,0,1
chr12	39751336	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=266,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39751321_A_C:39751321:0,2,0,1
chr12	39751338	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=266,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39751321_A_C:39751321:0,2,0,1
chr12	39751339	.	G	GTGGTGGCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=266,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:39751321_A_C:39751321:0,2,0,1
chr12	39757013	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0|1:39757013_C_T:39757013:1,7,1,2
chr12	39757022	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,1:0|1:39757013_C_T:39757013:0,7,1,2
chr12	40012883	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=89,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.233:32:11,7:14,0:13,12,7,0
chr12	40013354	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr12	40037727	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,2:6,4:7,10,1,5
chr12	40078601	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	40078713	.	A	ATCGGTCAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:7,2:1,0:3,5,1,1
chr12	40345185	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.403:9:5,0:0,2:0,5,0,4
chr12	40590585	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:9,8:5,13:10,5,11,10
chr12	40618918	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,4:11,0:10,5,4,0
chr12	40619082	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr12	40619301	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,14,6
chr12	40619542	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	40626230	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr12	40626285	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	40629595	.	G	GGGTATATATATATATATATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,34;MFRL=160,197;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:0,1:0|1:40629595_G_GGGTATATATATATATATATA:40629595:0,3,0,1
chr12	40629605	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=218,197;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:40629595_G_GGGTATATATATATATATATA:40629595:0,4,0,1
chr12	40643738	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.248:16:7,0:5,2:6,6,0,4
chr12	40657537	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	40657771	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	40668636	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:4,0:7,4,3,0
chr12	40681142	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr12	40699569	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,149;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:2,3:2,0:3,2,3,0
chr12	40702846	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr12	40703087	.	C	CGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=230,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GT;STR;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,0:0,1,0,4
chr12	40708922	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	40709185	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr12	40713759	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=72,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,5:4,3:2,4,3,5
chr12	40714009	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr12	40714785	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:6,1,2,1
chr12	40715013	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr12	40716015	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr12	40716260	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,2:2,5:3,3,2,5
chr12	40745347	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=108,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,3:10,0:10,7,3,0
chr12	40753044	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.812:9:0,4:1,3:1,0,7,1
chr12	40753303	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	40758833	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=91,62;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:6,20,0,3
chr12	40761358	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	40787385	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	40805830	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=70,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:9,5:3,0:4,8,3,2
chr12	40820445	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr12	40821156	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=77,110;MMQ=52,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr12	40821176	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,42;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr12	40821216	.	T	TAAATCATTCTACCATAA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=135,34;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:40821216_T_TAAATCATTCTACCATAA:40821216:3,2,0,2
chr12	40821217	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=135,34;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:40821216_T_TAAATCATTCTACCATAA:40821216:3,2,0,2
chr12	40821221	.	C	CCATGCACA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=135,34;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:40821216_T_TAAATCATTCTACCATAA:40821216:3,2,0,2
chr12	40821911	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=112,1087;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,1:10,1:7,18,1,1
chr12	40826543	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:8,2:10,0:0|1:40826543_C_CA:40826543:8,10,1,1
chr12	40826546	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:8,2:7,0:0|1:40826543_C_CA:40826543:8,10,1,1
chr12	40827479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	40829824	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,155;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr12	40829844	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=158,87;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:3,0:1,3,1,0
chr12	40830599	.	CGTGT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=GT;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:2,1:2,2,0,3
chr12	40834918	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,2:9,5:13,5,4,3
chr12	40835026	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr12	40840435	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=74,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:1,2:2,3,2,5
chr12	40857214	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=81,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr12	40857943	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr12	40859036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,8:2,6:2,4,5,9
chr12	40903026	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:6,2,7,6
chr12	40903076	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=0,120;MMQ=46,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.836:20:1,12:1,5:1,2,6,11
chr12	40903100	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:0,9:3,3:1,2,5,7
chr12	40904082	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=86,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:4,6,1,2
chr12	40904612	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=24,31;MFRL=106,2772;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:3,0:9,5,2,0
chr12	40904642	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=30,18;MFRL=98,105;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:5,1:8,5,3,1
chr12	40904680	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=24,22;MFRL=69,86;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.215:29:12,1:11,4:11,12,4,2
chr12	40904696	.	GG	AA	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=24,26;MFRL=115,86;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.249:34:12,3:12,4:0|1:40904696_GG_AA:40904696:8,18,4,4
chr12	40904699	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=25,25;MFRL=115,86;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.250:34:12,3:14,5:0|1:40904696_GG_AA:40904696:8,18,4,4
chr12	40904702	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=28,23;MFRL=115,86;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.243:35:12,3:14,5:0|1:40904696_GG_AA:40904696:9,18,4,4
chr12	40904718	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=128,86;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,1:9,2:0|1:40904718_C_T:40904718:5,14,1,3
chr12	40904725	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=33,26;MFRL=127,86;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,1:9,3:0|1:40904718_C_T:40904718:5,12,1,3
chr12	40904730	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=26,28;MFRL=128,88;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,1:9,2:0|1:40904718_C_T:40904718:3,10,0,3
chr12	40904742	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=26,25;MFRL=138,119;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:0|1:40904742_T_A:40904742:5,11,0,2
chr12	40904746	.	TG	CT	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=27,29;MFRL=128,119;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:0|1:40904742_T_A:40904742:6,11,0,2
chr12	40904752	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=128,119;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:8,0:0|1:40904742_T_A:40904742:6,10,0,2
chr12	40925545	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:2,2:10,3:6,6,4,1
chr12	40925908	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr12	40927890	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr12	40928587	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:1,1:1,2:2,1,2,2
chr12	40930284	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:5,6,0,2
chr12	40935517	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,2:4,4:3,5,4,2
chr12	40936512	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:5,3,3,4
chr12	40938427	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0|1:40938427_T_C:40938427:6,3,1,1
chr12	40938435	.	GC	TT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=149,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:1,2:0|1:40938427_T_C:40938427:5,3,1,1
chr12	40938438	.	T	TTTCTAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,1:0|1:40938427_T_C:40938427:5,2,1,1
chr12	40938897	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=113,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:8,0:13,4:11,10,3,1
chr12	40938944	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=104,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,5:4,9:2,5,2,12
chr12	40940217	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=101,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:8,3:13,0:11,10,1,2
chr12	40941507	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr12	40942463	.	GTT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=78,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:3,0:3,6:1,5,0,6
chr12	40951623	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:9,2,1,1
chr12	40952934	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:40952934_A_G:40952934:0,0,3,0
chr12	40952943	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:40952934_A_G:40952934:0,1,3,0
chr12	40954299	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=227,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr12	40955086	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=52,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,5:0,6:3,1,7,4
chr12	40955182	.	G	GATCACGTAAAGAGGCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=242,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.288:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr12	40957272	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,6:0,1:0,1,4,3
chr12	40957440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40957440_A_G:40957440:0,3,0,1
chr12	40957442	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:40957440_A_G:40957440:0,3,0,1
chr12	40957444	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40957440_A_G:40957440:0,3,0,1
chr12	40957449	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40957440_A_G:40957440:0,3,0,1
chr12	40957450	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1|0:40957440_A_G:40957440:0,1,0,3
chr12	40957452	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:40957440_A_G:40957440:0,4,0,1
chr12	40961597	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr12	40964192	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40964192_G_T:40964192:0,0,1,0
chr12	40964206	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40964192_G_T:40964192:0,0,1,0
chr12	40964494	.	A	AATTGTGATGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=100,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	41303825	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:5,1,0,3
chr12	41303874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=43,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:4,3:3,0:3,5,1,2
chr12	41330531	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr12	41330774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=147,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	41421732	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,199;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:13,10,0,2
chr12	41946453	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,13,8
chr12	41949660	.	T	TCCTACTCCCTTTAACAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41949660_T_TCCTACTCCCTTTAACAAGAG:41949660:0,1,0,1
chr12	41949663	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=226,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41949660_T_TCCTACTCCCTTTAACAAGAG:41949660:0,1,0,1
chr12	41966306	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=83,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:15,3:6,1:13,8,1,3
chr12	42481609	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=111,109;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:0|1:42481609_G_A:42481609:8,8,1,2
chr12	42481617	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=111,109;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:10,2:7,1:0|1:42481609_G_A:42481609:8,10,1,2
chr12	42481627	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=114,109;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:9,2:10,1:0|1:42481609_G_A:42481609:9,10,1,2
chr12	42481803	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=115,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	42499692	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=27,23;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:11,0:0|1:42499692_A_T:42499692:10,7,2,0
chr12	42499694	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=25,23;MFRL=179,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:11,1:0|1:42499692_A_T:42499692:12,7,2,0
chr12	42499701	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=30,28;MFRL=179,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:7,2:12,1:0|1:42499692_A_T:42499692:12,7,3,0
chr12	42499711	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=29,29;MFRL=179,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:7,2:10,2:0|1:42499692_A_T:42499692:10,7,4,2
chr12	42499714	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=24,20;MFRL=179,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:7,5:9,2:0|1:42499692_A_T:42499692:10,7,4,3
chr12	42499730	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=182,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:9,5:10,2:0|1:42499730_G_T:42499730:12,7,4,3
chr12	42499738	.	TC	CT	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=26,20;MFRL=183,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,5:9,2:0|1:42499730_G_T:42499730:11,4,4,3
chr12	42499763	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=25,31;MFRL=182,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,5:3,2:9,2,2,5
chr12	42499766	.	G	GGCTTCATCTACTCT	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=168,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:4,0:10,6,1,1
chr12	42499802	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=31,24;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:7,1:8,10,0,2
chr12	42503325	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,23,24;MFRL=111,133,55;MMQ=60,60,60;MPOS=7,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=A;STR;TLOD=6.23,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,6:0.331,0.382:15:2,1,2:1,2,1:3,1,4,7
chr12	42503504	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.627:20:3,5:4,7:1,6,3,10
chr12	42503505	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,5,17
chr12	42512805	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=147,113;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,2:7,0:8,2,2,0
chr12	42512817	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=147,77;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,4:9,1:11,3,2,3
chr12	42512830	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=147,77;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.368:20:5,5:6,2:11,2,3,4
chr12	42512910	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=147,99;MMQ=51,45;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,3:7,1:7,8,1,3
chr12	42512924	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=106,99;MMQ=40,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:6,9,0,3
chr12	42538470	.	T	TCGCCGCCGCCGCCGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,10;RU=CGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	42707437	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	42717961	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=352,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:0,7:1,7:0,1,1,13
chr12	42718013	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=183,185;MMQ=58,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr12	42726620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr12	42781178	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:3,0,6,1
chr12	42835374	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42835374_TG_T:42835374:0,1,0,1
chr12	42835377	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42835374_TG_T:42835374:0,1,0,1
chr12	42859961	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,3:2,6:2,2,5,4
chr12	43824289	.	TAGATA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:43824289_TAGATA_T:43824289:1,3,0,1
chr12	43824299	.	AA	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:2,0:0|1:43824289_TAGATA_T:43824289:1,2,0,1
chr12	43846272	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	43847820	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,2:11,1:13,7,3,0
chr12	43856812	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=85,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43856812_A_C:43856812:1,1,0,1
chr12	43856818	.	A	ACTGCAGAAAAAAAAAATACACGTACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=85,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43856812_A_C:43856812:1,1,0,1
chr12	43945603	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr12	44142377	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:12,0:9,4:12,9,2,2
chr12	44338039	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,2:8,2:9,12,2,2
chr12	44338153	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,6,11
chr12	44537508	.	GA	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	45059237	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:5,1,2,1
chr12	45108438	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=132,179;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:5,0:5,9,3,0
chr12	45170006	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr12	45269439	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=18,18;MFRL=179,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr12	45269451	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:45269451_A_AT:45269451:0,3,0,1
chr12	45269453	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:45269451_A_AT:45269451:0,3,0,1
chr12	45269459	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:45269451_A_AT:45269451:0,3,0,1
chr12	45269463	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,34;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45269451_A_AT:45269451:0,2,0,1
chr12	45269466	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45269451_A_AT:45269451:0,2,0,1
chr12	45444264	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	45444693	.	G	GTGGAGAAATGCGAACAGTGAGTGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:1,5,1,1
chr12	45567074	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,71;MMQ=52,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:0|1:45567074_C_T:45567074:7,6,1,1
chr12	45567081	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=160,71;MMQ=52,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,1:0|1:45567074_C_T:45567074:7,6,1,1
chr12	45567468	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,0,2
chr12	45695735	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr12	45771787	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr12	45803109	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,7,2
chr12	45810657	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0|1:45810657_AG_A:45810657:6,8,1,1
chr12	45810664	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,2:7,0:0|1:45810657_AG_A:45810657:6,8,1,1
chr12	45815023	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:8,7,0,3
chr12	45816858	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:45816858_TG_CC:45816858:1,2,0,1
chr12	45816861	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:45816858_TG_CC:45816858:1,2,0,1
chr12	45816866	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:45816858_TG_CC:45816858:1,2,0,1
chr12	45816869	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:45816858_TG_CC:45816858:1,2,0,1
chr12	46149795	.	T	TCTTATA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=203,179;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	46149824	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=14629840,199;MMQ=38,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46149824_A_G:46149824:0,1,0,1
chr12	46149826	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=14629840,199;MMQ=38,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46149824_A_G:46149824:0,1,0,1
chr12	46149832	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=14629840,199;MMQ=38,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46149824_A_G:46149824:0,1,0,1
chr12	46149834	.	GTGTGC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=14629840,199;MMQ=38,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46149824_A_G:46149824:0,1,0,1
chr12	46149841	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,21;MFRL=14629840,199;MMQ=38,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46149824_A_G:46149824:0,1,0,1
chr12	46215163	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr12	46254499	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr12	46285896	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=117,146;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:13,0:9,4:11,11,4,0
chr12	46298213	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,98;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:46298213_C_T:46298213:5,8,1,1
chr12	46298215	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,98;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:46298213_C_T:46298213:5,8,1,1
chr12	46317004	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=243,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	46319836	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=174,978;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,0:1,7:3,0,7,0
chr12	46327044	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,8234672;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr12	46592420	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:10,9:9,0:12,7,8,1
chr12	46598475	.	C	CTGCATGCACTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	46601056	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr12	46601260	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,6:1,9:2,0,11,4
chr12	46623484	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr12	46759017	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=115.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,16:0,24:0,0,9,31
chr12	46759057	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr12	46760557	.	C	CTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr12	47163306	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	47170829	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=133,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr12	47170887	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	47172581	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr12	47173662	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr12	47178307	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,13,4
chr12	48081637	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,2:9,1:15,5,3,0
chr12	48090209	.	G	GCCTAAAGCAAAAATATTGAGTAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr12	48104746	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr12	48105379	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=511,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr12	48107201	.	G	GTGAAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:48107201_G_GTGAAGT:48107201:1,0,1,1
chr12	48107203	.	G	GCCAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:48107201_G_GTGAAGT:48107201:1,0,1,1
chr12	48110325	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr12	48110608	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.921:11:0,7:0,4:0|1:48110608_A_G:48110608:0,0,11,0
chr12	48110613	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=69,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.873:14:0,8:1,5:0|1:48110608_A_G:48110608:1,0,11,2
chr12	48112083	.	G	GGCAGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:48112083_G_GGCAGAC:48112083:0,1,0,1
chr12	48112086	.	A	AGGAGCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48112083_G_GGCAGAC:48112083:0,1,0,1
chr12	48131728	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:7,2:1,1:7,1,2,1
chr12	48132451	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr12	48132889	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=87,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:3,9:0,4:3,0,12,2
chr12	48134214	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,0:3,3:2,6,1,2
chr12	48134381	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:1,2:6,2,3,1
chr12	48134695	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:7,6,0,3
chr12	48141447	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=85,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:48141447_G_GT:48141447:0,4,1,1
chr12	48141448	.	C	CGTAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=85,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:48141447_G_GT:48141447:0,4,1,1
chr12	48141798	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr12	48142418	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr12	48142774	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,0:2,7:2,4,0,7
chr12	48143360	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr12	48143472	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:6,0:5,4:7,4,2,2
chr12	48144243	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,3:6,9:6,4,4,8
chr12	48174232	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,0:7,3:16,7,3,0
chr12	48174351	.	C	T,CT	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=22,27,19;MFRL=202,165,192;MMQ=50,41,40;MPOS=3,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.16,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,5:0.335,0.466:13:1,4,0:0,2,1:0,2,1,10
chr12	48174380	.	TA	CG	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=165,172;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr12	48174408	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=188,184;MMQ=41,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0|1:48174408_A_G:48174408:0,4,0,3
chr12	48174410	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=188,184;MMQ=41,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,2:0,0:0|1:48174408_A_G:48174408:0,4,0,3
chr12	48174413	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=188,167;MMQ=41,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,0:0|1:48174408_A_G:48174408:0,4,0,2
chr12	48181778	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr12	48185167	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=68,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.676:16:5,4:0,7:1,4,3,8
chr12	48185192	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:1,5,2,1
chr12	48185356	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.702:14:2,6:1,4:3,1,10,0
chr12	48188644	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:10,0:7,1:0|1:48188644_C_T:48188644:7,12,1,1
chr12	48188646	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:0|1:48188644_C_T:48188644:7,12,1,1
chr12	48191074	.	G	GGCCC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,21;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:1,1,2,0
chr12	48191077	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,23;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:1,1,2,0
chr12	48191083	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,16;MFRL=86,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,1,2,0
chr12	48191087	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=86,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,1,2,0
chr12	48191091	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=20,20;MFRL=86,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,1,1,0
chr12	48191095	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,20;MFRL=86,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,1,1,0
chr12	48191097	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,20;MFRL=86,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,1,1,0
chr12	48191099	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,12;MFRL=43,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,2,1,0
chr12	48191102	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,14;MFRL=43,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:48191074_G_GGCCC:48191074:0,2,1,0
chr12	48240365	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=187,161;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr12	48251533	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:48251533_C_T:48251533:0,0,1,7
chr12	48251542	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=288,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0|1:48251533_C_T:48251533:1,4,0,3
chr12	48358279	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	48359527	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr12	48360620	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	48367829	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr12	48368444	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=122,506;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:0,0:4,7:4,1,7,0
chr12	48373718	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	48374513	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	48374826	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr12	48375250	.	A	AAGTGTTTTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr12	48375268	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	48376969	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,1,8
chr12	48377596	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=240,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	48377805	.	T	TCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,18;RU=C;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,1:0,1:1,0,6,0
chr12	48377809	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,3:1,0,6,0
chr12	48377820	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.720:5:1,2:0,1:0|1:48377820_T_C:48377820:1,0,4,0
chr12	48377823	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.660:4:1,2:0,1:0|1:48377820_T_C:48377820:1,0,3,0
chr12	48377970	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=226,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,3:1,10:1,0,6,7
chr12	48378778	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=79,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:9,4,2,2
chr12	48379399	.	G	GGCGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:0,3,1,1
chr12	48379753	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,32;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,1,1
chr12	48379840	.	A	AGTGAAAATAGAGAAGTCTTGTTTGTACAAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=87,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr12	48386553	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,8,0
chr12	48386577	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr12	48387926	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48387926_C_T:48387926:0,2,0,1
chr12	48387927	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48387926_C_T:48387926:0,2,0,1
chr12	48387931	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48387926_C_T:48387926:0,2,0,1
chr12	48387934	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48387926_C_T:48387926:0,2,0,1
chr12	48389737	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,0:6,3:2,12,1,2
chr12	48392183	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,106;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:17,6:13,0:18,14,5,1
chr12	48393747	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:6,5:13,0:10,9,2,3
chr12	48393850	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:14,0:14,2:0|1:48393850_C_T:48393850:17,12,1,1
chr12	48393858	.	CATCCTT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:11,0:18,2:0|1:48393850_C_T:48393850:15,18,1,1
chr12	48398002	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr12	48491845	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:15,1:10,3:17,9,2,2
chr12	48491885	.	CCT	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=92,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:13,1:14,1:12,17,0,2
chr12	48491981	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=222,159;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	48491992	.	A	AAAGCTGTATGACCATCTGTACCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=222,159;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48491992_A_AAAGCTGTATGACCATCTGTACCC:48491992:0,1,0,1
chr12	48491995	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=222,159;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48491992_A_AAAGCTGTATGACCATCTGTACCC:48491992:0,1,0,1
chr12	48491998	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=222,159;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0|1:48491992_A_AAAGCTGTATGACCATCTGTACCC:48491992:0,1,0,1
chr12	48528658	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:12,5,0,4
chr12	48533728	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:2,0:5,2:4,4,0,2
chr12	48535636	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,0:6,2:0|1:48535636_T_TC:48535636:6,10,1,1
chr12	48535638	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,0:7,2:0|1:48535636_T_TC:48535636:6,10,1,1
chr12	48536530	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,0:2,1:0|1:48536530_C_T:48536530:5,1,2,1
chr12	48536535	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0|1:48536530_C_T:48536530:5,1,2,1
chr12	48537597	.	GG	AA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,2:16,0:13,17,1,1
chr12	48537624	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,11,12
chr12	48539043	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,1:12,1:12,16,2,0
chr12	48539183	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=208,226;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:2,1:1,3,2,0
chr12	48539482	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr12	48547128	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,15,9
chr12	48547131	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=115,184;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.259:24:7,4:11,1:10,8,5,1
chr12	48578448	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:9,1:7,2:8,8,2,1
chr12	48579410	.	GTGT	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=96,179;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.057:50:19,1:26,1:0|1:48579410_GTGT_G:48579410:22,26,1,1
chr12	48579414	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=96,179;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:19,1:29,1:0|1:48579410_GTGT_G:48579410:23,30,1,1
chr12	48579421	.	GTCTACT	G	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=97,179;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:19,1:26,1:0|1:48579410_GTGT_G:48579410:22,32,1,1
chr12	48596395	.	GAGGATGGTGGCC	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,0:11,2:14,12,1,1
chr12	48723324	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr12	48738479	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:48738479_T_TG:48738479:10,6,1,1
chr12	48738486	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:48738479_T_TG:48738479:9,6,1,1
chr12	48738555	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=84,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.594:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	48738556	.	AAAAAAAAATAC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=117,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr12	48741219	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	48741967	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=94,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:48741967_A_G:48741967:0,2,0,1
chr12	48741975	.	GC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=94,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:48741967_A_G:48741967:0,2,0,1
chr12	48880381	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr12	48880550	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=112.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,40:0.934:42:2,14:0,24:1,1,8,32
chr12	48884535	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr12	48888763	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	48919893	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=129,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:14,10,0,3
chr12	48961853	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=69,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:3,8,1,1
chr12	48961876	.	A	AGTAGGTTTGTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=44,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr12	49048738	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:0|1:49048738_G_T:49048738:8,5,3,0
chr12	49048741	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.166:16:8,0:6,2:1|0:49048738_G_T:49048738:10,4,1,1
chr12	49048869	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,177;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,0:6,5:3,6,0,5
chr12	49089805	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,2:6,0:10,11,2,0
chr12	49091972	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=65,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.684:22:3,3:1,4:4,3,7,8
chr12	49093719	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:49093719_G_A:49093719:0,3,0,2
chr12	49093729	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:49093719_G_A:49093719:0,2,0,2
chr12	49110223	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:0|1:49110223_C_A:49110223:2,1,3,0
chr12	49110225	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:49110223_C_A:49110223:2,1,3,0
chr12	49110248	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:3,4:7,1,4,1
chr12	49165851	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=293,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	49219230	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=125,172;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr12	49219285	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:5,7,0,2
chr12	49219298	.	G	GTGGATGCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=101,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr12	49224446	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=138,71;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:49224446_G_A:49224446:10,8,1,1
chr12	49224451	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=135,71;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:49224446_G_A:49224446:12,8,1,1
chr12	49224456	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,71;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:49224446_G_A:49224446:12,8,1,1
chr12	49230035	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:8,4,2,1
chr12	49231922	.	C	CCAAAAAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	49254744	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:6,2,2,0
chr12	49255941	.	T	TGAGAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=321,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	49258644	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,3:10,1:7,10,4,0
chr12	49298340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr12	49308213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,2,1
chr12	49315737	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr12	49315926	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.311:24:9,0:6,7:10,7,1,6
chr12	49317663	.	A	AGAGGCT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=102,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:5,2:9,1:5,9,0,3
chr12	49318793	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr12	49319036	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:1,5:4,6:2,3,10,2
chr12	49333562	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:12,1:10,5:9,13,1,5
chr12	49362779	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:2,0,6,1
chr12	49364391	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	49397499	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr12	49398862	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:8,2:7,4:9,6,5,2
chr12	49398950	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=135,164;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.332:34:12,0:11,11:11,12,0,11
chr12	49421179	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	49424865	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,2,2
chr12	49426649	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:49426649_G_A:49426649:4,6,1,1
chr12	49426652	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,2:5,0:0|1:49426649_G_A:49426649:4,6,1,1
chr12	49431773	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:8,2:0|1:49431773_C_T:49431773:5,7,1,1
chr12	49431776	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:49431773_C_T:49431773:5,7,1,1
chr12	49432049	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:5,4,2,0
chr12	49435186	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr12	49435411	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=71,45;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:9,6,1,1
chr12	49435417	.	CCCCAG	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=70,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCAG;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,2:9,0:8,9,1,1
chr12	49435430	.	C	CTGT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=71,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:9,10,1,1
chr12	49435504	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:49435504_C_T:49435504:4,7,1,1
chr12	49435510	.	C	CTGG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:49435504_C_T:49435504:4,7,1,1
chr12	49437753	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=102,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,1:13,2:9,9,2,1
chr12	49437784	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:3,3:13,0:5,11,1,2
chr12	49439659	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr12	49440656	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=162,120;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:49440656_T_C:49440656:0,4,0,1
chr12	49440659	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=162,120;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:49440656_T_C:49440656:0,4,0,1
chr12	49440668	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=160,200;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.384:5:3,1:0,1:0|1:49440668_C_G:49440668:0,3,0,2
chr12	49440670	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=160,200;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.384:5:3,1:0,1:0|1:49440668_C_G:49440668:0,3,0,2
chr12	49442553	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=120,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:49442553_CTG_C:49442553:0,3,0,1
chr12	49442556	.	ATGG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=120,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:49442553_CTG_C:49442553:0,3,0,1
chr12	49444365	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=91,168;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,1:4,8:5,3,0,9
chr12	49444545	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=95,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,3:4,3:8,3,3,3
chr12	49445012	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:16,0:14,2:16,17,2,0
chr12	49445019	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=75,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.094:37:17,1:12,2:15,17,3,2
chr12	49445351	.	TGAGTCCTCAGGTGGTGGGGATGTGGGG	T	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=80,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.062:47:20,3:9,0:29,15,2,1
chr12	49445372	.	TGTGGGGGAGTCCTCAGGTGGTGGGGAGAGGCGTGAAGCCTCAGGTGGAGGGGAC	T	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=81,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:14,3:10,1:36,26,2,2
chr12	49445381	.	GTCCTCAGGTGGTGGGGAGAGGCGTGAAGCCTCAGGTGGAGGGGACGTGGGAGAC	G	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=82,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.096:61:21,3:8,2:31,25,3,2
chr12	49445546	.	TTCAGGTGGTGGGGACATAGGCGAGTCCTCAGGTGGTGGGGACAGGCGTGATGCCTCAGGTGGTGGGGAAAGGGGAGACTCC	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=92,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.055:73:12,3:9,0:45,25,3,0
chr12	49446040	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=103,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:10,1:9,5:7,12,2,4
chr12	49446560	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,1158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,1,1
chr12	49447957	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:5,9,0,2
chr12	49448552	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=116,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:13,2:19,0:0|1:49448552_T_C:49448552:11,23,1,1
chr12	49448568	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,2:15,0:0|1:49448552_T_C:49448552:9,19,1,1
chr12	49448584	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.661:21:2,8:4,6:0|1:49448552_T_C:49448552:2,5,3,11
chr12	49460448	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:13,6:13,0:14,13,6,0
chr12	49460672	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:9,1,2,0
chr12	49483723	.	GAG	CGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=162,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0|1:49483723_GAG_CGC:49483723:3,5,1,1
chr12	49483730	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=185,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:49483723_GAG_CGC:49483723:2,4,1,1
chr12	49494304	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,0:4,7:4,3,2,5
chr12	49495238	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:3,3:15,0:9,9,1,2
chr12	49496699	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:11,0:12,2:15,8,2,0
chr12	49497643	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:0,2,1,1
chr12	49497657	.	A	ATTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:49497657_A_ATTGC:49497657:1,0,0,1
chr12	49497660	.	G	GACTAGATAGATGTGTGGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49497657_A_ATTGC:49497657:1,0,0,1
chr12	49498751	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	49500398	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,0:3,4:9,0,2,2
chr12	49500509	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,2:8,8:6,12,5,5
chr12	49500903	.	AA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=143,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49500903_AA_TC:49500903:1,0,0,1
chr12	49500906	.	T	TTGGGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=143,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49500903_AA_TC:49500903:1,0,0,1
chr12	49521672	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:12,1:3,2:15,0,3,1
chr12	49521710	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,30:0.757:39:6,19:3,11:8,1,21,9
chr12	49522578	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,134;MMQ=54,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:12,1:15,4:9,18,5,0
chr12	49523523	.	GAT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr12	49525008	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,3:12,4:17,6,6,1
chr12	49582692	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.235:23:11,2:7,3:13,5,3,2
chr12	49663579	.	CCCT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCT;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:10,1:6,1:13,9,1,1
chr12	49666617	.	CCGTGGTGA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=98,60;MMQ=50,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:8,0:18,2:20,13,1,1
chr12	49666618	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=93,282;MMQ=50,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:8,0:17,3:15,10,3,0
chr12	49721138	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=92,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:16,0:5,3:8,13,0,3
chr12	49742649	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr12	49883371	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=112,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:1,5,1,1
chr12	49893815	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35,33;MFRL=134,170,165;MMQ=60,60,60;MPOS=21,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=7.02,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,2:0.268,0.183:14:5,4,1:2,0,1:7,1,6,0
chr12	49908461	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	49916459	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:3,1:10,3:10,3,3,1
chr12	49937654	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=60,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:3,2:5,2:6,2,3,1
chr12	49937921	.	ACCTCCCTC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CCTC;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	49948105	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:7,1,1,1
chr12	49952394	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:7,3,5,3
chr12	49960551	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:1,6,1,3
chr12	49993678	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:8,4:12,2:8,13,2,4
chr12	49993680	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:7,16,1,1
chr12	49993690	.	G	GGAGCATCAGGAGAAGCTGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:6,16,1,1
chr12	49994085	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,133;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,4:5,0:9,6,4,0
chr12	49997056	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:10,0:6,3:4,12,2,1
chr12	49999304	.	CCA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:49999304_CCA_C:49999304:1,5,1,1
chr12	49999308	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:49999304_CCA_C:49999304:1,5,1,1
chr12	50025223	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,42;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:5,2:4,0:1,10,0,2
chr12	50027200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr12	50028372	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:2,1:5,2:3,4,1,2
chr12	50030585	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:15,3:15,0:16,14,3,0
chr12	50031265	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:6,3:4,9,1,3
chr12	50039734	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:1,11,0,2
chr12	50040999	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,0:10,3:12,0,2,1
chr12	50045793	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,4:7,0:9,7,4,0
chr12	50047138	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr12	50146173	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr12	50149347	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr12	50149422	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=116,63;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:50149422_G_C:50149422:12,12,1,1
chr12	50149429	.	GT	TC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=124,63;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:50149422_G_C:50149422:10,11,1,1
chr12	50149433	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=119,63;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,1:0|1:50149422_G_C:50149422:9,10,1,1
chr12	50149436	.	T	TTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTCC	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=119,63;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:8,0:11,1:0|1:50149422_G_C:50149422:9,10,1,1
chr12	50149544	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=100,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:9,2:4,3:9,5,2,3
chr12	50149604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr12	50149609	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,1:0,6,0,2
chr12	50149639	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=222,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.264:8:2,0:3,2:0,6,0,2
chr12	50151977	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=80,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.601:43:11,12:6,14:7,10,13,13
chr12	50152376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:3,3,0,4
chr12	50189953	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr12	50232319	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:50232319_C_T:50232319:13,8,1,1
chr12	50232328	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:50232319_C_T:50232319:14,8,1,1
chr12	50232353	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,2:11,0:11,10,1,1
chr12	50232377	.	TC	AG	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,2:12,0:15,13,1,1
chr12	50281071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr12	50284499	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:12,2:9,0:10,11,1,1
chr12	50284545	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=104,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.363:11:2,0:2,0:2,5,0,4
chr12	50290728	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr12	50291735	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=354,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,4:0,1,7,3
chr12	50297670	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr12	50344778	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,4:6,0:6,10,2,2
chr12	50349090	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr12	50349123	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=238,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.844:11:0,5:1,2:1,0,10,0
chr12	50349143	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,9,1
chr12	50356174	.	TGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=G;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr12	50357939	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,0:16,2:9,31,0,2
chr12	50367446	.	CAAAGGAGGAAACAAGTCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=192,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	50386015	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,18,7
chr12	50393372	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr12	50452708	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr12	50471025	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:11,7:10,0:8,13,0,7
chr12	50473660	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,14,6
chr12	50473906	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr12	50473928	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	50473933	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr12	50474602	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,27;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50474602_T_A:50474602:0,1,0,1
chr12	50474606	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50474602_T_A:50474602:0,1,0,1
chr12	50474610	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50474602_T_A:50474602:0,1,0,1
chr12	50482465	.	A	AACCAGATCCCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=182,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:50482465_A_AACCAGATCCCTC:50482465:1,5,1,1
chr12	50482467	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=182,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:50482465_A_AACCAGATCCCTC:50482465:1,5,1,1
chr12	50498379	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,2:14,1:11,11,1,2
chr12	50500197	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,3:6,0:2,6,2,1
chr12	50501390	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:11,4,2,0
chr12	50514053	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:5,12,2,0
chr12	50529736	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=89,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:2,9:7,10:3,6,10,9
chr12	50529936	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=390,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr12	50529941	.	T	TTTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50529941_T_TTTAA:50529941:0,4,0,1
chr12	50529942	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50529941_T_TTTAA:50529941:0,4,0,1
chr12	50570957	.	GATTCTGAGTAGTGA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:5,2:10,12,1,1
chr12	50571465	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:8,4:7,0:5,10,2,2
chr12	50589665	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=59,82;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:50589665_AG_A:50589665:9,5,1,1
chr12	50589670	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=59,82;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,0:6,2:0|1:50589665_AG_A:50589665:8,5,1,1
chr12	50599709	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:5,0,7,1
chr12	50616346	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.799:8:1,4:0,2:0,1,0,7
chr12	50625598	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=203,215;MMQ=60,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0|1:50625598_TG_CA:50625598:0,3,0,1
chr12	50625605	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=203,215;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50625598_TG_CA:50625598:0,3,0,1
chr12	50625609	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=215,203;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50625609_GGT_G:50625609:0,3,0,1
chr12	50625613	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=215,203;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50625609_GGT_G:50625609:0,3,0,1
chr12	50625619	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=203,215;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr12	50625620	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=215,203;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50625609_GGT_G:50625609:0,3,0,1
chr12	50628076	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=216,129;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:50628076_C_CT:50628076:0,3,0,1
chr12	50628077	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=216,129;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:50628076_C_CT:50628076:0,3,0,1
chr12	50721323	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=183,185;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr12	50724607	.	C	CCAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:50724607_C_CCAGA:50724607:0,1,0,1
chr12	50724609	.	T	TCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:50724607_C_CCAGA:50724607:0,1,0,1
chr12	50744060	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr12	50744094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr12	50744119	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:12,4:3,1:8,7,3,2
chr12	50748075	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=94,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:22,0:12,6:15,19,0,6
chr12	50749141	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:13,2:2,0:0|1:50749141_G_T:50749141:8,7,1,1
chr12	50749156	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:3,0:0|1:50749141_G_T:50749141:9,6,1,1
chr12	50749157	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:4,0:0|1:50749141_G_T:50749141:10,7,1,1
chr12	50749159	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:4,0:0|1:50749141_G_T:50749141:10,7,1,1
chr12	50749162	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:4,0:0|1:50749141_G_T:50749141:9,7,1,1
chr12	50749221	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:50749221_G_C:50749221:0,0,14,5
chr12	50749227	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,10:0|1:50749221_G_C:50749221:0,0,15,5
chr12	50749294	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:2,2,6,8
chr12	50750040	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	50824232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,0:2,3:6,3,2,1
chr12	50829263	.	T	TTATTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,13:0,0,17,4
chr12	50855195	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	50856259	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	51034720	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	51076844	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	51088979	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr12	51089572	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr12	51089616	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr12	51100373	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=76,90;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:14,5:6,0:11,10,4,1
chr12	51121629	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	51126252	.	TCGGGCTGTCCCCG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,1:11,1:9,21,1,1
chr12	51128832	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,10:3,4:2,5,9,5
chr12	51135167	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr12	51135275	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,8,18
chr12	51203226	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr12	51203371	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=84,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.751:18:3,7:1,7:0|1:51203371_C_T:51203371:1,3,3,11
chr12	51203376	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:3,7:1,7:0|1:51203371_C_T:51203371:1,3,3,12
chr12	51236802	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,7:3,1:3,8,3,5
chr12	51237795	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:4,7,0,2
chr12	51319346	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr12	51323672	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr12	51382232	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr12	51386527	.	AAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=59,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAG;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.521:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr12	51386530	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=256,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.884:11:0,6:1,4:1,0,3,7
chr12	51389513	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:10,3:22,0:17,15,3,0
chr12	51399050	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	51447741	.	GAGGTTATCAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	51458264	.	A	ATGGCGCGATCCACCACAACCTCCGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:2,0:2,2:2,3,1,1
chr12	51461425	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=103,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,2:0,10:1,0,9,3
chr12	51461793	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr12	51467596	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr12	51504799	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr12	51589937	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=124,46;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:51589937_C_T:51589937:3,3,1,1
chr12	51589948	.	TC	CG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,2:0|1:51589937_C_T:51589937:2,3,1,1
chr12	51589954	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:51589937_C_T:51589937:2,3,1,1
chr12	51589960	.	G	GCCCTGGGC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:51589937_C_T:51589937:2,3,1,1
chr12	51634279	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,3:6,0:4,17,0,3
chr12	51681846	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	51681903	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,11,1
chr12	51685274	.	C	CTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,172;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr12	51685831	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr12	51693357	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr12	51722311	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:4,4,8,2
chr12	51733580	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=140,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:1,9:6,0:6,1,9,0
chr12	51735022	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:2,8:3,7:3,2,8,7
chr12	51739717	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:51739717_A_T:51739717:1,0,0,1
chr12	51739722	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.427:3:0,1:0,0:0|1:51739717_A_T:51739717:0,2,0,1
chr12	51740387	.	ACTGG	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:3,2:8,1:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:10,4,4,1
chr12	51740388	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,12:0.937:12:0,4:0,8:1|0:51740387_ACTGG_A:51740387:0,0,8,4
chr12	51740393	.	CCATATCCACTT	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:5,3:8,2:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:11,5,4,1
chr12	51740407	.	CATAA	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,3:7,2:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:11,3,4,1
chr12	51740415	.	A	AAG	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,3:6,2:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:10,3,4,1
chr12	51740416	.	C	CG	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.301:18:6,3:6,2:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:10,3,4,1
chr12	51748326	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr12	51748345	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=84,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51748345_C_A:51748345:0,4,0,1
chr12	51748346	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=84,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51748345_C_A:51748345:0,4,0,1
chr12	51754629	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=98,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:1,3:3,4:2,2,4,4
chr12	51773179	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=90,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.305:36:17,0:8,9:7,18,0,11
chr12	51847566	.	G	GTTCTTTGTGATGATTGCATTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51847566_G_GTTCTTTGTGATGATTGCATTC:51847566:0,0,0,1
chr12	51847569	.	TA	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51847566_G_GTTCTTTGTGATGATTGCATTC:51847566:0,0,0,1
chr12	51863643	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	51868311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=141,162;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:51868311_C_T:51868311:0,2,0,1
chr12	51868318	.	G	GCAGCTCTGCCCCTGTGGTTTTGCAGTGTACAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=160,162;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51868311_C_T:51868311:0,1,0,1
chr12	51882561	.	C	CAAATCTGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:51882561_C_CAAATCTGT:51882561:4,4,1,1
chr12	51882563	.	A	AAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=148,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:5,0:0|1:51882561_C_CAAATCTGT:51882561:6,4,1,1
chr12	51882565	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=148,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:0|1:51882561_C_CAAATCTGT:51882561:6,4,1,1
chr12	51887512	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=108,122;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:10,0:8,10,4,0
chr12	52099153	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr12	52100566	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	52156255	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	52159438	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr12	52163789	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr12	52163861	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=184,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:52163861_CAG_C:52163861:0,3,1,1
chr12	52163866	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=184,43;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:52163861_CAG_C:52163861:0,3,1,1
chr12	52168199	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,21113339;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:0,1:6,1:0,6,0,2
chr12	52184271	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,13:0,0,14,12
chr12	52200028	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,7,2
chr12	52282094	.	A	AGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:52282094_A_AGCC:52282094:3,3,1,1
chr12	52282095	.	T	TTCCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=98,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:52282094_A_AGCC:52282094:3,3,1,1
chr12	52284447	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr12	52306221	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:5,2:8,2:6,9,3,1
chr12	52306377	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr12	52310068	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52310068_C_G:52310068:1,1,0,1
chr12	52310073	.	G	GGGCTGGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52310068_C_G:52310068:1,1,0,1
chr12	52312944	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0|1:52312944_T_C:52312944:0,1,0,5
chr12	52312959	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:52312959_GG_TT:52312959:0,3,0,1
chr12	52312963	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:52312959_GG_TT:52312959:0,3,0,1
chr12	52312964	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0|1:52312944_T_C:52312944:0,1,0,3
chr12	52312966	.	G	GCTTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=76,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:52312959_GG_TT:52312959:0,2,0,1
chr12	52314720	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52314720_G_C:52314720:0,0,0,1
chr12	52314722	.	G	GACGGATCAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52314720_G_C:52314720:0,0,0,1
chr12	52314724	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52314720_G_C:52314720:0,0,0,1
chr12	52314726	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52314720_G_C:52314720:0,0,0,1
chr12	52314729	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52314720_G_C:52314720:0,0,0,1
chr12	52345465	.	GGC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GC;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr12	52345497	.	TGCG	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr12	52369300	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=70,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.660:30:3,7:6,12:4,6,12,8
chr12	52374908	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:17,5:10,0:12,15,0,5
chr12	52381026	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	52404618	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:13,2:9,3:13,10,4,1
chr12	52448409	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.829:11:0,6:1,3:0,2,5,4
chr12	52452529	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,1:6,2:4,10,1,2
chr12	52565322	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=12,23;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.950:23:0,7:0,11:0,1,13,9
chr12	52565499	.	TGGGGGTGGGGGACGG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=82,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:5,3:7,0:9,5,2,1
chr12	52574780	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chr12	52585437	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:23,0:19,8:22,20,1,7
chr12	52585482	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=115,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.083:45:26,0:16,3:23,19,1,2
chr12	52627007	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr12	52627215	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.728:8:1,2:0,4:1,1,2,4
chr12	52631242	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:3,3,8,1
chr12	52631313	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=95,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,40:0.838:47:2,18:5,20:4,3,27,13
chr12	52631394	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.809:19:2,11:1,3:2,1,1,15
chr12	52632573	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,6:1,6:1,0,4,8
chr12	52635443	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=65,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,8:1,7:0,2,2,13
chr12	52642099	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr12	52679937	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=260,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr12	52680008	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:1,5:0,6:2,0,8,3
chr12	52681282	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr12	52681533	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=193,136;MMQ=50,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:0,2,1,9
chr12	52681714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr12	52681733	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,129;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:1,0,7,2
chr12	52681925	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,48;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,5,12
chr12	52681968	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	52695630	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr12	52699213	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:0,2,2,8
chr12	52700100	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr12	52708420	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.620:24:4,11:4,3:7,2,8,7
chr12	52708978	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=169,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,4,0
chr12	52709032	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=86,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:2,6:0,5:1,1,7,4
chr12	52709197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=202,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52709197_G_A:52709197:0,4,0,1
chr12	52709202	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=202,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52709197_G_A:52709197:0,4,0,1
chr12	52710198	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,1:0,6:2,0,7,0
chr12	52710246	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=42,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.733:27:4,6:2,14:2,5,11,9
chr12	52710897	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr12	52711416	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr12	52711450	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,7,3
chr12	52711624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=128,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,4,2
chr12	52711776	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr12	52712898	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=52,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,6:1,9:2,0,11,4
chr12	52713199	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,0,7
chr12	52758171	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=82,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:0,5:3,5:1,2,3,7
chr12	52776679	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr12	52778772	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=217,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:1,0,9,1
chr12	52779420	.	G	GCTGGCTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52779420_G_GCTGGCTGGCT:52779420:0,1,0,1
chr12	52779421	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52779420_G_GCTGGCTGGCT:52779420:0,1,0,1
chr12	52789509	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=93,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,28:0.854:32:3,17:1,11:3,1,16,12
chr12	52789597	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,17:0.818:20:1,7:2,10:0|1:52789597_A_G:52789597:1,2,10,7
chr12	52789605	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=23,26;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:1,5:3,7:0|1:52789597_A_G:52789597:1,3,9,6
chr12	52789641	.	CCCG	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:52789641_CCCG_C:52789641:4,7,1,1
chr12	52789646	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:52789641_CCCG_C:52789641:4,7,1,1
chr12	52789691	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0|1:52789691_A_C:52789691:0,1,1,6
chr12	52789693	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0|1:52789691_A_C:52789691:0,1,1,6
chr12	52789744	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=156,82;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr12	52795201	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr12	52797618	.	T	TCTGTCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:52797618_T_TCTGTCC:52797618:5,4,1,1
chr12	52797623	.	C	CTGATCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:52797618_T_TCTGTCC:52797618:5,4,1,1
chr12	52818504	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,5,10
chr12	52821992	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	52824302	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr12	52824352	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,1:12,4:12,8,3,2
chr12	52824562	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr12	52825758	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,10:0.262:40:8,10:19,0:0|1:52825758_C_T:52825758:20,10,10,0
chr12	52825762	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,10:0.262:40:9,9:20,0:0|1:52825758_C_T:52825758:20,10,10,0
chr12	52827534	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	52827818	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,12,13
chr12	52840954	.	TGA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:52840954_TGA_T:52840954:13,3,1,1
chr12	52840967	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:12,2:0|1:52840954_TGA_T:52840954:16,5,1,1
chr12	52841500	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=211,77;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr12	52842830	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,266;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	52843666	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr12	52843729	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=122,99;MMQ=39,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:12,6:17,4:0|1:52843729_G_C:52843729:15,14,4,6
chr12	52843733	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=122,99;MMQ=39,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:12,6:16,4:0|1:52843729_G_C:52843729:15,14,4,6
chr12	52844216	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,55;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:9,4:16,7,0,4
chr12	52844477	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,152;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr12	52845435	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,113;MMQ=27,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,13:0.258:52:28,9:11,4:20,19,6,7
chr12	52845801	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,9,4
chr12	52845896	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:13,3:11,0:4,20,1,2
chr12	52845952	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr12	52862767	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr12	52862770	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr12	52863091	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,6:0,3:0,1,3,7
chr12	52863160	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=67,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:0,4:2,6:1,1,6,4
chr12	52863168	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=152,67;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:52863168_G_C:52863168:5,3,1,1
chr12	52863172	.	G	GGT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=146,67;MMQ=51,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:52863168_G_C:52863168:5,4,1,1
chr12	52865548	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=89,177;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:6,2:12,3:7,11,4,1
chr12	52865592	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=52,144;MMQ=55,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr12	52865837	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	52866145	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	52866930	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	52867568	.	C	CAAAAGAATCCTTTGAACCAGGGAGGTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,19332;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:8,0:8,13,0,3
chr12	52881428	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,18471;MMQ=60,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,11,0
chr12	52882094	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:2,0,6,1
chr12	52882410	.	T	TGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	52883888	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=168,236;MMQ=25,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	52883947	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	52884283	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	52884557	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,3:0,13:0,0,5,11
chr12	52886424	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=208,103;MMQ=50,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:3,7:0,10:2,1,10,8
chr12	52886490	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,13,15
chr12	52886911	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,136;MMQ=50,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.864:12:1,5:0,6:1,0,4,7
chr12	52911736	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=94,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:18,3:15,0:15,18,1,2
chr12	52913029	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=153,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr12	52913517	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.169:33:14,1:13,4:15,13,3,2
chr12	52942998	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr12	52944060	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:6,2:11,2:3,14,0,4
chr12	52946346	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,6:1,1:2,0,7,0
chr12	52946764	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:4,8,3,0
chr12	52946890	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=183,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:0,3,5,3
chr12	52963779	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=139,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:3,8,0,2
chr12	52964402	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0|1:52964402_C_A:52964402:0,0,7,3
chr12	52964417	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0|1:52964402_C_A:52964402:0,0,9,4
chr12	52965869	.	A	AAGTGTTCTCTCTACTTCTGGGAGAAATTATGGAGAATTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=144,123;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr12	52965877	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	52966137	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr12	52966387	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=123,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:11,0:6,3:9,9,0,3
chr12	52966512	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	52967080	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:2,2,6,5
chr12	52967117	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=111,90;MMQ=60,52;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:9,7,2,4
chr12	52981453	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:9,5,1,1
chr12	52981676	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	52985159	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=168,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.277:9:2,0:5,2:0|1:52985159_A_C:52985159:7,0,1,1
chr12	52985166	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0|1:52985159_A_C:52985159:0,0,8,2
chr12	52985172	.	A	AATCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:7,2:0|1:52985159_A_C:52985159:8,1,1,1
chr12	52985337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=113,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:8,1:12,6,0,3
chr12	52986132	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,5:0,0,10,4
chr12	53002956	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr12	53007580	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:0|1:53007580_G_A:53007580:9,10,1,1
chr12	53007586	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:53007580_G_A:53007580:9,9,1,1
chr12	53043636	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr12	53043696	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,2:12,0:0|1:53043696_A_T:53043696:12,17,0,2
chr12	53043697	.	C	CTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:15,2:13,0:0|1:53043696_A_T:53043696:12,17,0,2
chr12	53045777	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr12	53045869	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	53069222	.	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,1:0,2:0,0,3,2
chr12	53071338	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr12	53071382	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.787:17:1,5:2,9:2,1,9,5
chr12	53071560	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr12	53072621	.	A	ACTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:53072621_A_ACTCT:53072621:0,1,0,1
chr12	53072623	.	C	CAAAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:53072621_A_ACTCT:53072621:0,1,0,1
chr12	53072625	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53072621_A_ACTCT:53072621:0,0,0,1
chr12	53072629	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53072621_A_ACTCT:53072621:0,0,0,1
chr12	53073471	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=87,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,3:2,3:1,1,6,0
chr12	53089460	.	GACCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	53091566	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:2,8:0,7:0,2,8,7
chr12	53091764	.	ACATC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=266,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr12	53096913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,9:0,0,6,11
chr12	53162773	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:5,2,0,2
chr12	53162861	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=84,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:13,2:0|1:53162861_C_T:53162861:11,9,1,1
chr12	53162881	.	A	ATGCTTACTC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:53162861_C_T:53162861:9,5,1,1
chr12	53163467	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	53164969	.	T	TGG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=90,30;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:14,13,2,0
chr12	53165621	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:4,2,3,0
chr12	53165862	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:4,3,2,4
chr12	53167313	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr12	53169071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=215,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr12	53170812	.	A	ATAT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=137,62;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:11,2:17,0:0|1:53170812_A_ATAT:53170812:6,23,1,1
chr12	53170816	.	C	CTGGTATAAGTTAATTCAGAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,62;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:12,2:15,0:0|1:53170812_A_ATAT:53170812:5,24,1,1
chr12	53171144	.	AGACT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:53171144_AGACT_A:53171144:0,1,0,1
chr12	53171153	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53171144_AGACT_A:53171144:0,1,0,1
chr12	53171154	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53171144_AGACT_A:53171144:0,0,0,1
chr12	53171157	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53171144_AGACT_A:53171144:0,0,0,1
chr12	53184619	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.446:16:6,3:3,4:5,4,3,4
chr12	53184711	.	G	GTCTGAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=63,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53184711_G_GTCTGAC:53184711:0,4,0,1
chr12	53184716	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=63,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53184711_G_GTCTGAC:53184711:0,4,0,1
chr12	53186277	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:53186277_A_C:53186277:0,0,0,1
chr12	53186280	.	GA	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53186277_A_C:53186277:0,0,0,1
chr12	53186997	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:53186997_C_T:53186997:6,5,1,1
chr12	53187014	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:53186997_C_T:53186997:4,5,1,1
chr12	53187016	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=108,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:53186997_C_T:53186997:3,5,1,1
chr12	53187106	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=230,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,0:3,15:1,4,0,15
chr12	53187122	.	TCTCAGATGAGCACATCC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=202,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr12	53188209	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	53189409	.	GACCACCAAAGCCACCAGCCCCTCCAAAGCCACCAGCCCCTCCAAAGCCACCAGCTCCACCAAAGCCACCTCCCATTCCTCTGCCACCACCAAAGCC	G	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=83,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,5:0.066:96:14,1:12,3:50,41,3,2
chr12	53189509	.	ACCAAAGCCACCTCCATAGCCGCTC	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=96,91;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:13,0:25,3:22,32,1,2
chr12	53201413	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	53202540	.	T	TGGA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=101,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:10,2:0|1:53202540_T_TGGA:53202540:11,15,1,1
chr12	53202542	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=101,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:9,2:0|1:53202540_T_TGGA:53202540:11,15,1,1
chr12	53202546	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=112,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:53202540_T_TGGA:53202540:9,12,1,1
chr12	53204614	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,6,11
chr12	53207321	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	53207583	.	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=50,88;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=106.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.898:28:2,3:0,12:1,1,13,13
chr12	53217056	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr12	53218225	.	CCCAGGT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=207,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53218225_CCCAGGT_C:53218225:0,1,0,1
chr12	53218234	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=207,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53218225_CCCAGGT_C:53218225:0,1,0,1
chr12	53218237	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=207,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:53218225_CCCAGGT_C:53218225:0,1,0,1
chr12	53227753	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=81,300;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:6,7,0,2
chr12	53227803	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,1:0,7:0,0,5,6
chr12	53237817	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=184,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,8:0,0:4,0,8,0
chr12	53240476	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=182,194;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:53240476_C_G:53240476:5,0,2,0
chr12	53240479	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=182,194;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:0|1:53240476_C_G:53240476:5,0,2,0
chr12	53241626	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	53294516	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53294516_C_CA:53294516:0,0,0,1
chr12	53294517	.	C	CAACTGTTCCCAGTCTCTGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53294516_C_CA:53294516:0,0,0,1
chr12	53295058	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=76.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0|1:53295058_G_C:53295058:0,0,9,9
chr12	53295063	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0|1:53295058_G_C:53295058:0,0,8,11
chr12	53295079	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0|1:53295079_G_A:53295079:0,0,7,10
chr12	53295081	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0|1:53295079_G_A:53295079:0,0,7,10
chr12	53295109	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr12	53295112	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,31;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:53295112_A_C:53295112:0,3,0,1
chr12	53295115	.	CAGGAT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:53295112_A_C:53295112:0,3,0,1
chr12	53295121	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:53295112_A_C:53295112:0,3,0,1
chr12	53295551	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	53295917	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	53298769	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=190,174;MMQ=56,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr12	53298835	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	53343461	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	53344267	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=236,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:53344267_G_A:53344267:0,3,0,2
chr12	53344272	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=236,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:53344267_G_A:53344267:0,3,0,2
chr12	53400172	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:5,4,1,1
chr12	53400178	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.855:13:0,3:0,7:2,0,5,6
chr12	53412486	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=225,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr12	53416251	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,21:0,0,29,14
chr12	53421507	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr12	53421746	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=274,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.900:17:0,8:1,8:0,1,4,12
chr12	53422038	.	T	TTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=224,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	53432088	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,17,9
chr12	53432107	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=106,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:15,0:4,4:11,8,2,2
chr12	53432936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	53433077	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=155,47;MMQ=49,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:4,0:13,2:8,9,1,1
chr12	53433089	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=47,119;MMQ=23,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,9:0,12:0,1,9,12
chr12	53434105	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=170,89;MMQ=25,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr12	53442956	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,5:2,5:2,2,7,3
chr12	53447980	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:5,0:11,3,2,0
chr12	53449735	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr12	53452263	.	CCAGGTGGCAGG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAGGTGGCAGG;STR;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,3:5,1:3,5,1,3
chr12	53452598	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:53452598_G_A:53452598:0,7,0,2
chr12	53452611	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:53452598_G_A:53452598:0,2,0,2
chr12	53457269	.	AG	CC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=109,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:4,3:6,4:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,11,7,0
chr12	53457275	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,2:5,3:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,9,6,0
chr12	53457281	.	GG	CC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,10,6,0
chr12	53457287	.	GG	CC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,1:7,1:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,10,4,0
chr12	53457309	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=131,203;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:3,12,0,3
chr12	53457580	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:10,5,3,0
chr12	53467038	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:53467038_CAG_C:53467038:0,3,1,0
chr12	53467045	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:53467038_CAG_C:53467038:0,3,1,0
chr12	53497489	.	A	ACTCACAGAAGAAAGAAAACACCAGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,2:0,0:1,0,1,2
chr12	53498062	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0|1:53498062_GA_G:53498062:7,3,2,0
chr12	53498064	.	TAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0|1:53498062_GA_G:53498062:7,3,2,0
chr12	53498068	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:53498062_GA_G:53498062:7,3,2,0
chr12	53499250	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=0,511;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:53499250_A_C:53499250:2,1,1,0
chr12	53499254	.	C	CACTGACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=46,511;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:53499250_A_C:53499250:2,2,1,0
chr12	53512027	.	CC	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr12	53514763	.	CATG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	53552380	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=105,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,1:6,2:7,9,1,2
chr12	53564374	.	G	GTTTCTTCAACAAAAAAAAAAACTCTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=69,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr12	53567038	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,151;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:15,0,2,0
chr12	53567447	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:13,5,2,0
chr12	53578915	.	C	CAAAGTGCTGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=269,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53578915_C_CAAAGTGCTGGGG:53578915:0,1,0,1
chr12	53578917	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=269,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53578915_C_CAAAGTGCTGGGG:53578915:0,1,0,1
chr12	53580334	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:2,8,1,1
chr12	53580365	.	C	CCAGCCTGGGTGATAAAGTGAGACT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=194,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	53580371	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53580371_T_A:53580371:0,1,0,1
chr12	53580372	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	53580376	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53580371_T_A:53580371:0,0,0,1
chr12	53580378	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53580371_T_A:53580371:0,0,0,1
chr12	53589480	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=92,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.217:24:12,2:7,2:6,13,2,3
chr12	53590542	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=74,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,11:0.175:66:37,4:18,7:39,16,5,6
chr12	53591175	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr12	53594118	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:8,10,1,1
chr12	53607190	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=292,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr12	53607515	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.599:20:5,0:1,12:5,3,0,12
chr12	53609429	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=75,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,0:7,4:9,6,2,2
chr12	53646662	.	TCCTG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTG;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:8,2:11,8,1,1
chr12	53662624	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,10,12
chr12	53662660	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,0:11,2:5,11,0,2
chr12	53662735	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=252,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,8,3
chr12	53662974	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,6:9,0:12,7,6,0
chr12	53663899	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.123:23:8,1:4,0:7,14,0,2
chr12	53664099	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:6,3,5,0
chr12	53664148	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,10,8
chr12	53666691	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr12	53666713	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	53671549	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr12	53673424	.	T	TTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=110,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:2,0,1,0
chr12	53673425	.	A	ACCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=110,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:2,0,1,0
chr12	53676814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	53677072	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr12	53677089	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr12	53679779	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:2,4,2,0
chr12	53681883	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,10,11
chr12	53681984	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=140,50;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:8,6,1,1
chr12	53681999	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:8,7,0,2
chr12	53682003	.	G	GTGT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:7,9,1,1
chr12	53682031	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=140,146;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:6,0:7,7:5,9,0,7
chr12	53682267	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	53685961	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:53685961_AG_GT:53685961:0,0,0,1
chr12	53685967	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53685961_AG_GT:53685961:0,0,0,1
chr12	53685969	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53685961_AG_GT:53685961:0,0,0,1
chr12	53685971	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53685961_AG_GT:53685961:0,0,0,1
chr12	53685977	.	CTC	TAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53685961_AG_GT:53685961:0,0,0,1
chr12	53691962	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,3:0,14:0,0,5,13
chr12	53692955	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr12	53693532	.	AA	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,9:0,0,14,1
chr12	53700706	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:4,4:6,0:3,7,1,3
chr12	53701295	.	TG	CA	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=97,28;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:13,0:13,2:0|1:53701295_TG_CA:53701295:20,11,2,0
chr12	53701299	.	GC	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=101,28;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:14,0:16,2:0|1:53701295_TG_CA:53701295:20,12,2,0
chr12	53701302	.	GAAC	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=97,28;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:12,0:16,2:0|1:53701295_TG_CA:53701295:20,14,2,0
chr12	53701307	.	GGTGGT	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=97,28;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,0:16,2:0|1:53701295_TG_CA:53701295:21,14,2,0
chr12	53701529	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=223,163;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,4:4,0:2,4,4,0
chr12	53702371	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	53708011	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr12	53714290	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr12	53714496	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,6,11
chr12	53714509	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr12	53773961	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=63,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr12	53774020	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0,11,0,2
chr12	53776583	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=116,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:21,0:21,4:21,22,1,3
chr12	53817981	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr12	53819724	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:0,0:3,1:0|1:53819724_ATG_A:53819724:0,3,0,1
chr12	53819742	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53819724_ATG_A:53819724:0,4,0,1
chr12	53819767	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	53858476	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=160,157;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,4:4,0:9,1,4,0
chr12	53861636	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,3:4,1:1,7,0,4
chr12	53862687	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=117,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:2,2,0,2
chr12	53862690	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=117,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:53862687_AG_A:53862687:2,2,0,2
chr12	53862693	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,1,0,2
chr12	53862695	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,0,0,2
chr12	53862698	.	AC	TT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,1,0,2
chr12	53862701	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=19,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:0,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,1,0,2
chr12	53862705	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=79,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,2,0,2
chr12	53862712	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=79,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:53862687_AG_A:53862687:0,2,0,2
chr12	53873087	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:6,2:8,2,1,1
chr12	53877562	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,5:0,0,1,11
chr12	53895360	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr12	53911097	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,106;MMQ=60,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:13,5:14,0:10,17,5,0
chr12	53994853	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:4,1:0,1:0,4,0,3
chr12	54063610	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,13;MFRL=105,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.194:19:2,0:8,1:6,10,3,0
chr12	54063755	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,2:5,0:0|1:54063755_G_A:54063755:7,14,1,1
chr12	54063759	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:0|1:54063755_G_A:54063755:6,15,1,1
chr12	54105668	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=76,208;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:9,0,5,0
chr12	54109171	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=162,192;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:2,0:3,3:0|1:54109171_T_C:54109171:1,5,0,3
chr12	54109175	.	C	CATCATACCCAATGGGCAAAAACTGGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=162,192;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,0:2,3:0|1:54109171_T_C:54109171:1,5,0,3
chr12	54339052	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,5,8
chr12	54339085	.	T	TGATGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	54367690	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,3,5
chr12	54367700	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=122,252;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr12	54367783	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	54369140	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=114,128;MMQ=60,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:6,12,0,2
chr12	54379670	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=74,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,24:0.807:29:3,8:2,15:0|1:54379670_C_T:54379670:1,4,12,12
chr12	54379678	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,5:0.164:32:9,2:15,1:1|0:54379670_C_T:54379670:12,15,1,4
chr12	54405147	.	GGA	CCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=83,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	54426885	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.830:16:1,9:1,5:0,2,8,6
chr12	54448087	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=88,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:4,2:13,1:11,6,3,0
chr12	54448168	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=96,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.412:12:3,1:3,0:1,6,5,0
chr12	54449069	.	AATAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AT;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.725:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	54575800	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,1:3,2:6,0,3,0
chr12	54635588	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,2:10,0:5,20,0,2
chr12	54651471	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.880:14:1,7:0,6:0,1,2,11
chr12	54675113	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=89,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.744:33:2,12:6,13:5,3,16,9
chr12	54676881	.	GCC	G	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.110:43:26,2:12,2:0|1:54676881_GCC_G:54676881:24,15,2,2
chr12	54676885	.	T	TTTGGC	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=113,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.109:44:24,1:10,2:0|1:54676881_GCC_G:54676881:24,16,2,2
chr12	54676888	.	T	TGG	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:19,2:10,2:0|1:54676881_GCC_G:54676881:21,13,2,2
chr12	54677980	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,25,18
chr12	54686468	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=108,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,1:10,2:9,7,1,2
chr12	54687043	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=104,219;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.160:54:32,7:14,0:27,19,8,0
chr12	54687232	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr12	54734289	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:4,3:2,2:3,3,3,2
chr12	54764962	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	54767981	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=108,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	54797091	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:5,0:6,8,3,0
chr12	54799450	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,14:0,0,8,10
chr12	54802090	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	54802485	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=160,97;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:54802485_C_T:54802485:4,0,1,0
chr12	54802487	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=160,97;MMQ=40,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:54802485_C_T:54802485:4,0,1,1
chr12	54802504	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=100,97;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:54802485_C_T:54802485:4,5,1,1
chr12	54802508	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=125,97;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:54802485_C_T:54802485:4,6,1,1
chr12	54805744	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=96,2389;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr12	54805765	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,2:3,0:3,3,1,2
chr12	54905864	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:3,10,0,2
chr12	54910837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=78,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,1:0,8:0,2,2,7
chr12	54917645	.	A	AAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=101,164;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:13,8,0,2
chr12	54917832	.	T	TACTAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr12	54932788	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr12	54943753	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:54943753_A_AG:54943753:6,2,1,1
chr12	54943754	.	T	TGATTGCACACAGCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:54943753_A_AG:54943753:6,2,1,1
chr12	54960962	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=65,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr12	54963491	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=184,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.630:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	54969983	.	G	GGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	54970454	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=90,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,4:7,1:7,7,5,0
chr12	55025633	.	GAGCAGAACAATCACATC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:1,2:6,0:3,7,1,1
chr12	55038920	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:10,2,2,0
chr12	55250549	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=91,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:6,8:0,6:4,2,12,3
chr12	55250612	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,11:0,5:0,1,10,7
chr12	55250714	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr12	55368368	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	55422966	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr12	55523860	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=226,207;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr12	55641622	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=131,73;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:1,7:8,0:4,5,5,2
chr12	55642007	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=143,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:55642007_A_T:55642007:3,7,1,1
chr12	55642013	.	C	CGAATGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:55642007_A_T:55642007:3,7,1,1
chr12	55642015	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:4,1:0|1:55642007_A_T:55642007:3,7,1,1
chr12	55688267	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr12	55714406	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,7,2
chr12	55715119	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr12	55758978	.	T	TCATCCCCCTACACCTGGAGAAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,46;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:0|1:55758978_T_TCATCCCCCTACACCTGGAGAAG:55758978:7,6,1,1
chr12	55758981	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=112,46;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:12,1:0|1:55758978_T_TCATCCCCCTACACCTGGAGAAG:55758978:7,7,1,1
chr12	55759878	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	55794264	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	55794671	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:12,8,1,1
chr12	55819944	.	T	TAGAACATCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=288,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	55820121	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.662:16:3,5:2,5:2,3,8,3
chr12	55820202	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:3,5,0,2
chr12	55845993	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=74,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:5,2,4,1
chr12	55944926	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr12	55945119	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,9,9
chr12	56079084	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr12	56082559	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:6,0:0|1:56082559_G_A:56082559:12,5,1,1
chr12	56082575	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,2:10,0:0|1:56082559_G_A:56082559:12,16,1,1
chr12	56082663	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,90;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:8,0:14,5:9,13,1,4
chr12	56082785	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	56087178	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=0,121;MMQ=44,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56087178_GGA_G:56087178:0,1,0,1
chr12	56087183	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=0,121;MMQ=44,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56087178_GGA_G:56087178:0,1,0,1
chr12	56087184	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=0,121;MMQ=44,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56087178_GGA_G:56087178:0,1,0,1
chr12	56088206	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	56088773	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr12	56089209	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=191,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr12	56089274	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,18;MFRL=249,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:56089274_C_G:56089274:0,1,2,0
chr12	56089277	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=249,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:56089274_C_G:56089274:0,1,2,0
chr12	56089283	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=165,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0|1:56089274_C_G:56089274:2,2,2,0
chr12	56089357	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=55,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.898:27:2,13:0,11:1,1,16,9
chr12	56090038	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	56091617	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,10:0,17:1,0,15,13
chr12	56093817	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=366,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,6:1,9:0,1,3,12
chr12	56094869	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,0:10,3:7,8,1,2
chr12	56095068	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:11,4,3,0
chr12	56095225	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=100,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:8,0:9,4:3,16,0,4
chr12	56096816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,8,6
chr12	56096994	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:56096994_C_CT:56096994:0,4,0,1
chr12	56096995	.	A	AAATTACTAGTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=177,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:56096994_C_CT:56096994:0,4,0,1
chr12	56097025	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	56105977	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=193,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:7,2:6,3:7,6,1,4
chr12	56115233	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	56120124	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=129,125;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:56120124_T_TG:56120124:2,1,0,1
chr12	56120131	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=140,125;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:56120124_T_TG:56120124:1,1,0,1
chr12	56121001	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:13,4:19,0:20,12,2,2
chr12	56137534	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.572:3:1,0:0,1:0,1,1,1
chr12	56137545	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56137545_AG_CC:56137545:0,1,0,1
chr12	56137548	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56137545_AG_CC:56137545:0,1,0,1
chr12	56137550	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56137545_AG_CC:56137545:0,1,0,1
chr12	56197527	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=109,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:0|1:56197527_AT_A:56197527:3,6,0,3
chr12	56197528	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,10:0.787:12:2,6:0,4:1|0:56197527_AT_A:56197527:1,1,2,8
chr12	56211520	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=138,69;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:2,0:12,5:5,9,1,4
chr12	56213978	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,4:1,0:4,0,3,1
chr12	56214199	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=90,40;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.154:30:16,0:10,4:0|1:56214199_C_T:56214199:9,17,2,2
chr12	56214208	.	CA	GT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,0;MFRL=90,40;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.176:26:8,0:7,0:0|1:56214199_C_T:56214199:8,14,2,2
chr12	56224638	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,60;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr12	56233313	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:8,8,3,1
chr12	56233518	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,8:3,2:1,3,4,6
chr12	56236043	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr12	56236318	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	56236531	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,6:1,5:1,0,3,8
chr12	56295734	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,5,11
chr12	56295787	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,0:8,3:10,9,2,1
chr12	56320951	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.641:37:4,1:9,23:1,12,0,24
chr12	56346430	.	CTGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56346430_CTGG_C:56346430:0,0,1,0
chr12	56346441	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56346430_CTGG_C:56346430:0,0,1,0
chr12	56350802	.	TAGCTGTGGTCTCCACCCACTCTGTAGTTGTTACCTGTGC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.160:18:6,0:5,2:9,7,0,2
chr12	56352476	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	56355288	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=112,105;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,0:5,5:4,3,0,5
chr12	56380950	.	GT	G,GTT	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=30,31,20;MFRL=142,135,83;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.16,8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,9,4:0.365,0.194:22:8,3,4:0,5,0:0,9,4,9
chr12	56380963	.	T	TTG	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=143,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.146:25:15,3:6,0:0|1:56380963_T_TTG:56380963:4,18,0,3
chr12	56380967	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,3:4,0:0|1:56380963_T_TTG:56380963:3,17,0,3
chr12	56380971	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,1:4,0:0|1:56380971_G_GT:56380971:1,15,1,1
chr12	56380973	.	C	CAGACTTGACTTCTAA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,18;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,1:3,0:0|1:56380971_G_GT:56380971:1,15,1,1
chr12	56396542	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=140,148;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,3:3,16,0,4
chr12	56396544	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=140,163;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:9,0:9,4:0|1:56396544_T_C:56396544:3,17,0,4
chr12	56396547	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=148,89;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:2,20,1,1
chr12	56396549	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=140,163;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,0:9,4:0|1:56396544_T_C:56396544:3,17,0,4
chr12	56396575	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=116,111;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:56396575_A_T:56396575:0,7,0,2
chr12	56396577	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=116,111;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:56396575_A_T:56396575:0,7,0,2
chr12	56397322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=137,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:56397322_G_A:56397322:2,2,1,0
chr12	56397324	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=137,253;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:56397322_G_A:56397322:2,2,1,0
chr12	56397330	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=116,253;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56397322_G_A:56397322:1,2,1,0
chr12	56398454	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr12	56417403	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr12	56420473	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:56420473_C_CA:56420473:0,0,2,0
chr12	56420493	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=154,228;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:0|1:56420473_C_CA:56420473:2,0,2,0
chr12	56420495	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=154,212;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr12	56420499	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=128,212;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:56420473_C_CA:56420473:3,0,1,0
chr12	56420503	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=128,212;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:56420473_C_CA:56420473:3,0,1,0
chr12	56426577	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	56428344	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,17,8
chr12	56435929	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,27:0,0,25,21
chr12	56438065	.	AGT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	56477694	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,10:0,7:0,1,4,13
chr12	56477711	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:0|1:56477711_CAA_C:56477711:2,8,0,2
chr12	56477717	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=103,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:56477711_CAA_C:56477711:2,7,0,2
chr12	56477719	.	TC	CT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:56477711_CAA_C:56477711:2,8,0,2
chr12	56477725	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=127,177;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:56477711_CAA_C:56477711:1,6,0,2
chr12	56481686	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,6:1,5:2,1,5,6
chr12	56492367	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,44;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:6,0:5,8:5,6,4,4
chr12	56492721	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:3,0:2,2:5,5,0,2
chr12	56492733	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:1,11,0,2
chr12	56492739	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=19,19;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:0,0:1,1:0,8,0,3
chr12	56493822	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,2:0,8:0,1,6,4
chr12	56495887	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=159,277;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56495887_C_A:56495887:0,1,0,1
chr12	56495889	.	T	TCTGATTAATGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=159,277;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:56495887_C_A:56495887:0,1,0,1
chr12	56500502	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:7,4:3,3:1,12,0,7
chr12	56503179	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,203;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56503179_GG_AA:56503179:0,2,0,1
chr12	56503192	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,203;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56503179_GG_AA:56503179:0,1,0,1
chr12	56504143	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,2,1
chr12	56510943	.	AA	TT	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=23,9;MFRL=88,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.099:45:22,0:12,0:0|1:56510943_AA_TT:56510943:15,26,4,0
chr12	56510947	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=88,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,4:0.089:50:19,0:15,0:0|1:56510943_AA_TT:56510943:18,28,4,0
chr12	56510949	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=86,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.085:52:21,0:15,0:0|1:56510943_AA_TT:56510943:19,29,4,0
chr12	56510952	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=83,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,4:0.079:56:21,0:16,0:0|1:56510943_AA_TT:56510943:21,31,4,0
chr12	56514496	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,50;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:11,7,2,0
chr12	56515399	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:5,0:0|1:56515399_A_C:56515399:0,9,2,0
chr12	56515402	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,0:0|1:56515399_A_C:56515399:0,10,2,0
chr12	56515408	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:5,1:0|1:56515399_A_C:56515399:0,11,2,0
chr12	56515414	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,19;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,1:0|1:56515399_A_C:56515399:0,11,2,0
chr12	56515416	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,0:0|1:56515399_A_C:56515399:0,11,2,0
chr12	56515599	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=124,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:5,10,0,5
chr12	56526669	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=159,237;MMQ=40,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr12	56526686	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=173,163;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:56526686_C_CCT:56526686:0,4,0,1
chr12	56526692	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,163;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:56526686_C_CCT:56526686:0,4,0,1
chr12	56530725	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0|1:56530725_TTC_T:56530725:2,4,1,1
chr12	56530731	.	GGTATTA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:56530725_TTC_T:56530725:2,4,1,1
chr12	56530740	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:56530725_TTC_T:56530725:2,3,1,1
chr12	56551173	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:9,5:16,2:21,10,7,2
chr12	56551339	.	C	CAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=A;STR;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.401:28:9,7:6,2:5,12,1,10
chr12	56553984	.	CACTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:8,1:10,8,2,0
chr12	56558252	.	G	GATTTTGTTAGCCAT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:15,2:8,0:15,8,0,2
chr12	56558582	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,179;MMQ=56,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr12	56564056	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	56565159	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=93,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:13,5:13,0:12,14,3,2
chr12	56565392	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	56575742	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr12	56579000	.	T	TTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=152,209;MMQ=56,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:56579000_T_TTG:56579000:1,6,0,2
chr12	56579002	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=152,209;MMQ=56,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:1,0:0|1:56579000_T_TTG:56579000:1,6,0,2
chr12	56579003	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,209;MMQ=53,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:56579000_T_TTG:56579000:1,7,0,2
chr12	56579912	.	T	TAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:1,2:4,0:3,3,1,1
chr12	56604416	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:56604416_GAT_G:56604416:0,0,0,2
chr12	56604420	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:56604416_GAT_G:56604416:0,0,0,2
chr12	56607897	.	T	TTCTGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=68,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:56607897_T_TTCTGGG:56607897:0,2,0,1
chr12	56607898	.	A	ATTGCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=68,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:56607897_T_TTCTGGG:56607897:0,2,0,1
chr12	56607927	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	56619206	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:19,5:19,0:15,24,4,1
chr12	56619583	.	CTGTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGTT;STR;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.637:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr12	56625045	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr12	56629276	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	56641284	.	TGGAGGGCAGTGCGGCCCC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:8,8,1,1
chr12	56650742	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,18,4
chr12	56667668	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=240,181;MMQ=56,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:56667668_AG_CA:56667668:0,2,0,1
chr12	56667672	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=179,181;MMQ=51,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:56667668_AG_CA:56667668:0,3,0,1
chr12	56667675	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=179,181;MMQ=51,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:56667668_AG_CA:56667668:0,3,0,1
chr12	56667680	.	TG	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=181,179;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	56676427	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56676427_A_AT:56676427:0,4,0,1
chr12	56676428	.	A	ATTTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56676427_A_AT:56676427:0,4,0,1
chr12	56676432	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56676427_A_AT:56676427:0,4,0,1
chr12	56676461	.	C	CCACTGCCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=216,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:56676461_C_CCACTGCCA:56676461:1,2,0,2
chr12	56676464	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=200,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:56676461_C_CCACTGCCA:56676461:2,2,0,2
chr12	56676466	.	T	TGCTCAGCTGAAG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=200,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:56676461_C_CCACTGCCA:56676461:2,2,0,2
chr12	56694057	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,90;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,0:17,3:5,28,0,3
chr12	56715969	.	G	GACAAATGGAGCATTCACATCAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr12	56719079	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,2:10,8,1,2
chr12	56721331	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:14,0:18,4:14,18,4,0
chr12	56721363	.	A	AGACCTCCGTACTTTTAAGGTGGAACATG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.089:33:11,0:19,2:10,21,0,2
chr12	56722060	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,9,8
chr12	56726518	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr12	56743044	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=89,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,5,2
chr12	56744104	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=113,76;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:6,3:3,0:6,4,4,0
chr12	56749274	.	GCTGGCTCTCCACAGGTGTTTCGAGAA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.110:35:14,2:10,1:16,16,1,2
chr12	56812228	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	56814570	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	56814859	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=105,385;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,0:13,2:8,17,0,3
chr12	56815900	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,69;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:4,0:13,3:7,10,2,1
chr12	56815922	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,15:0,0,12,10
chr12	56816018	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:2,4,0,3
chr12	56816596	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.746:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr12	56816603	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:56816603_A_C:56816603:0,0,2,0
chr12	56816607	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,0:1,1:0|1:56816603_A_C:56816603:1,0,2,0
chr12	56817075	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,0:10,10,1,1
chr12	56818538	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:12,5:7,2:12,7,5,2
chr12	56821998	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr12	56822378	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr12	56822641	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	56824163	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	56825311	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=58,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.874:21:2,10:0,9:1,1,8,11
chr12	56826061	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr12	56826737	.	C	CAA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=116,139;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,23;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:0,1:2,5:2,3,5,1
chr12	56826757	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:5,1:19,6:11,14,0,7
chr12	56826765	.	TC	AA	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=96,135;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:6,0:21,0:0|1:56826765_TC_AA:56826765:1,29,3,0
chr12	56826771	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=92,135;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:6,0:23,1:0|1:56826765_TC_AA:56826765:2,29,3,0
chr12	56827825	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:8,2:2,2:4,6,3,1
chr12	56827974	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,15,9
chr12	56844970	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr12	56845296	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	56848393	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:4,0:7,23:3,8,0,26
chr12	56848481	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	56869577	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:1,2,3,2
chr12	56915782	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr12	56956213	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,15:0,18:0,0,19,14
chr12	56962772	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=105,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,3:16,0:16,15,3,0
chr12	56965399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr12	56982883	.	C	CTGCCTGCCTACTACTCACCCCTTAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.456:5:1,1:0,0:0,4,0,1
chr12	56992630	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:4,2,0,2
chr12	56993714	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:14,6,3,1
chr12	56994990	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:56994990_T_C:56994990:9,12,1,1
chr12	56994993	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:56994990_T_C:56994990:9,12,1,1
chr12	56998127	.	G	GGAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	56999207	.	ATTTT	A,ATTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,22,26;MFRL=0,215,207;MMQ=60,60,60;MPOS=34,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr12	57000123	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,270;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,0:4,4:1,10,0,4
chr12	57005746	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=100,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=52.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,21:0.400:53:17,21:14,0:19,13,21,0
chr12	57005840	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=100,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,19:0.244:80:27,8:33,11:27,34,19,0
chr12	57011257	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=95,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:18,0:12,4:16,15,3,1
chr12	57030026	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.195:23:11,3:8,1:8,11,1,3
chr12	57034015	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,49;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	57065713	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,1:2,7:0,2,0,8
chr12	57106810	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:5,11:5,10:6,4,11,10
chr12	57109931	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,39:0.723:53:5,26:8,6:4,10,26,13
chr12	57111301	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:14,3:8,0:16,7,2,1
chr12	57112123	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=86,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,0:9,3:16,8,1,2
chr12	57112858	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=98,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:19,3:22,0:20,21,1,2
chr12	57115065	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=80,165;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.191:35:13,0:14,6:17,12,6,0
chr12	57132186	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=205,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.673:16:3,4:1,7:4,1,8,3
chr12	57140622	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,4:8,0:9,9,0,4
chr12	57323282	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:13,8,0,3
chr12	57324078	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,8:7,4:6,5,6,6
chr12	57345955	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=120,87;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:14,11:7,2:10,11,12,2
chr12	57346129	.	C	CAAACCTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=214,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	57346828	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr12	57390473	.	T	TAGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=724,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	57432683	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,69;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,6:6,0:8,9,5,1
chr12	57440550	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:9,2,1,1
chr12	57441868	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=103,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:17,0:9,4:13,14,0,4
chr12	57453738	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:8,13:14,0:14,8,13,0
chr12	57453926	.	T	TGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	57486647	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:9,6,3,2
chr12	57498911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=84,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,3:8,3,3,0
chr12	57499160	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=193,292;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,0:6,4:4,5,0,4
chr12	57499428	.	G	C,GGTATAATTCTTACTGGGGATGATGGAGCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33,30;MFRL=302,221,243;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.03,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr12	57499932	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.528:9:2,0:1,0:2,2,5,0
chr12	57539295	.	T	TCCTGAGTAGCTGGGATTACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=142,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.365:6:1,2:2,0:1,3,1,1
chr12	57550509	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,0:2,2:2,1,1,1
chr12	57556813	.	G	GGTAATTAACTGTACCACGAGCCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	57559809	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,3,2
chr12	57560080	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=142,270;MMQ=31,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57560080_A_G:57560080:1,0,0,1
chr12	57560086	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=142,270;MMQ=31,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57560080_A_G:57560080:1,0,0,1
chr12	57567180	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,7:1,2:0,2,3,6
chr12	57567762	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:5,8:0,5:3,2,3,11
chr12	57569513	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,2:1,1,0,5
chr12	57572896	.	C	CTCACTCTGTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	57573647	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:57573647_G_T:57573647:6,8,1,1
chr12	57573653	.	TGT	AAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:6,2:0|1:57573647_G_T:57573647:8,9,1,1
chr12	57573943	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,14;MFRL=53,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,1:0|1:57573943_A_C:57573943:1,2,3,0
chr12	57573945	.	C	CTTCCATTCCTCCTTCTTCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=64,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1|0:57573943_A_C:57573943:3,1,1,1
chr12	57573948	.	CACAG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=91,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:0|1:57573943_A_C:57573943:0,2,3,0
chr12	57573957	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,18;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.672:4:1,1:0,0:0|1:57573943_A_C:57573943:0,1,3,0
chr12	57577319	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=113,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:2,2:4,9,0,2
chr12	57578100	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:5,0:10,1:5,12,4,0
chr12	57578288	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,3:0,5,0,7
chr12	57578964	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=79,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:18,4:14,0:20,13,0,4
chr12	57579727	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.572:10:3,0:1,4:1,3,1,5
chr12	57581028	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr12	57581339	.	C	CGGCGGGGCGCGACGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr12	57586767	.	G	GCAGATTGCCTGAGCTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=244,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,0,1
chr12	57587804	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=98,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:0|1:57587804_C_T:57587804:5,20,1,1
chr12	57587824	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:5,0:0|1:57587804_C_T:57587804:1,12,1,1
chr12	57587839	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,0:2,2:0,5,1,2
chr12	57588049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	57588977	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,5:0,1:1,1,5,1
chr12	57589859	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=160,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:57589859_C_T:57589859:3,5,1,1
chr12	57589865	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:57589859_C_T:57589859:3,5,1,1
chr12	57590735	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	57590758	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=81,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:1,0,6,0
chr12	57591226	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr12	57591398	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=142,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:57591398_C_T:57591398:7,7,1,1
chr12	57591407	.	G	GCTAATTTGTTGTTAGA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:57591398_C_T:57591398:6,7,1,1
chr12	57591454	.	CG	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	57591458	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr12	57592987	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,239;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,3:6,0:9,2,3,0
chr12	57594955	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr12	57594962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:57594962_C_T:57594962:1,7,1,1
chr12	57594967	.	G	GTGGTGGTGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:57594962_C_T:57594962:1,7,1,1
chr12	57602815	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr12	57603417	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr12	57605168	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr12	57606386	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	57618619	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	57624882	.	CAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	57627079	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:8,0:0|1:57627079_G_T:57627079:14,13,1,1
chr12	57627090	.	AA	TC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:11,0:0|1:57627079_G_T:57627079:15,13,1,1
chr12	57627717	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:4,7,2,2
chr12	57629571	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=107,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:17,1:21,1:18,20,0,2
chr12	57630768	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=89,180;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,13:0.233:58:24,0:20,13:25,20,13,0
chr12	57638333	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=86,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:14,3:21,0:19,16,0,3
chr12	57643318	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:3,1:3,1:7,0,3,1
chr12	57689320	.	A	AACACACTAT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=81,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:3,6,1,1
chr12	57689347	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:57689347_A_AG:57689347:0,3,0,1
chr12	57689349	.	C	CCACAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:57689347_A_AG:57689347:0,3,0,1
chr12	57691990	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=102,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,2:1,1:2,3,0,3
chr12	57693060	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	57704005	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.864:13:1,4:0,7:1,0,8,4
chr12	57843014	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	57843711	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=80,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:1,2,2,2
chr12	57858414	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=107,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:3,3,4,1
chr12	57865821	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:1,7,0,3
chr12	57865928	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	57867726	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr12	57869241	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr12	57869447	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:2,7,1,3
chr12	57869476	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:57869476_G_A:57869476:3,3,1,3
chr12	57869486	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0|1:57869476_G_A:57869476:4,2,1,3
chr12	57869500	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr12	57869530	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=113,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,3:5,1:8,5,3,1
chr12	57870121	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	57870447	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:10,2:13,0:0|1:57870447_G_A:57870447:14,13,1,1
chr12	57870454	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:13,0:0|1:57870447_G_A:57870447:14,13,1,1
chr12	57870463	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=114,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,3:0.153:24:9,1:11,2:1|0:57870447_G_A:57870447:12,9,1,2
chr12	57870648	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=126.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,28,12
chr12	57871555	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	57881797	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:13,2,2,0
chr12	57882764	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.326:26:6,6:11,2:12,6,7,1
chr12	57883413	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr12	57883801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	57894085	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=69,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,1:4,1:12,4,1,1
chr12	57905687	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr12	57906662	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:11,3:14,0:9,16,4,0
chr12	57911177	.	A	AATGTAGAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr12	57920262	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr12	57928297	.	G	GTTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57928297_G_GTTAA:57928297:0,1,0,1
chr12	57928298	.	G	GAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57928297_G_GTTAA:57928297:0,1,0,1
chr12	57928303	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57928297_G_GTTAA:57928297:0,0,0,1
chr12	57940749	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr12	57963726	.	GCTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTT;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:8,0,1,1
chr12	57970592	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,2,0
chr12	57975155	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=105,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	57975570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	57977003	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=110,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,0,3
chr12	57977040	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=55,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0,2,0,2
chr12	58000378	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,7:0,0,9,9
chr12	58002599	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr12	58003922	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr12	58008952	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	58009202	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr12	58013993	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr12	58014273	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=254,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr12	58016816	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=100,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,4:10,0:10,7,2,2
chr12	58017701	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,5,5
chr12	58018979	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.820:31:2,15:3,10:3,2,10,16
chr12	58019472	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr12	58023981	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=97,50;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:11,3:11,3:9,14,2,4
chr12	58109510	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=98,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:12,4,2,0
chr12	58111728	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=84,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:18,6:13,0:14,17,0,6
chr12	58114250	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:0|1:58114250_G_C:58114250:6,9,1,1
chr12	58114257	.	GA	TC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:58114250_G_C:58114250:6,8,1,1
chr12	58114260	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:58114250_G_C:58114250:6,8,1,1
chr12	58127766	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr12	58129209	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.341:38:9,0:16,11:11,14,0,13
chr12	58129302	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	58131040	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,0:6,3:5,5,2,1
chr12	58135659	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr12	58139656	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.769:24:4,10:1,9:2,3,7,12
chr12	58142491	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=236,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.242:6:0,0:4,1:1,4,0,1
chr12	58143298	.	AAGGGATATAAGGTAGCAGTCATTTTCAAAGATATCTTAGTTGAATGGTTACTGCTTAGTGGCTCAAAATAGGAAGTAT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=146,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.098:40:11,1:14,2:13,24,2,1
chr12	58144665	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=251,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,12:2,6:1,3,9,10
chr12	58145300	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=94,157;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.145:53:18,7:27,0:23,23,7,0
chr12	58145513	.	G	GCCCGTGATCCCCACAGTGGCCACTTTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.360:8:1,0:2,2:0,6,1,1
chr12	58149446	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr12	58157988	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,2:3,5:4,2,1,7
chr12	58162739	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:0,4:4,3:3,1,6,1
chr12	58165085	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:1,10:2,7:1,2,5,12
chr12	58165122	.	T	TTTTGGGTTGACTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	58177379	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.694:14:3,3:2,3:3,2,3,6
chr12	58177437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,7:0,6:0,1,0,13
chr12	58195094	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:58195094_G_A:58195094:0,1,0,1
chr12	58195100	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58195094_G_A:58195094:0,1,0,1
chr12	58195108	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58195094_G_A:58195094:0,1,0,1
chr12	58196229	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=1101,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	58197263	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:58197263_C_T:58197263:10,9,1,1
chr12	58197271	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:58197263_C_T:58197263:10,9,1,1
chr12	58201021	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.545:6:0,1:0,2:3,0,3,0
chr12	58201523	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:15,2:5,0:8,12,2,0
chr12	58203354	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:4,4,8,1
chr12	58204747	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=112,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,5:7,0:11,8,4,1
chr12	58217345	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=162,204;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:10,0,2,0
chr12	58217356	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=147,204;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:0|1:58217356_G_T:58217356:11,0,2,0
chr12	58217364	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=132,204;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,1:8,1:0|1:58217356_G_T:58217356:11,1,2,0
chr12	58217366	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=130,204;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:8,0:0|1:58217356_G_T:58217356:10,1,2,0
chr12	58217370	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=132,204;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:0|1:58217356_G_T:58217356:10,2,2,0
chr12	58217696	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=25,24;MFRL=196,103;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:8,3:12,4:0|1:58217696_G_T:58217696:18,3,5,2
chr12	58217698	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=196,103;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:9,3:11,4:0|1:58217696_G_T:58217696:18,3,5,2
chr12	58217705	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=197,60;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.391:33:9,3:10,10:0|1:58217696_G_T:58217696:17,3,6,7
chr12	58217707	.	T	C,G	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=23,30,34;MFRL=173,96,0;MMQ=60,60,30;MPOS=21,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.16,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,6,2:0.182,0.079:35:10,2,0:13,4,2:20,7,4,4
chr12	58217737	.	GGGTC	G	.	.	DP=44;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=130,30;MMQ=60,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.208:41:10,2:19,6:24,9,2,6
chr12	58217738	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,13:0.419:32:7,3:11,10:0|1:58217738_G_A:58217738:16,3,7,6
chr12	58217741	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=30,24;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.385:35:9,3:12,10:0|1:58217738_G_A:58217738:18,4,7,6
chr12	58217744	.	T	TTC,C	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=24,29,31;MFRL=145,30,88;MMQ=60,35,60;MPOS=-2147483648,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.34,33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,8,11:0.205,0.273:41:9,2,3:10,6,8:18,4,8,11
chr12	58217762	.	GC	AT	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=143,60;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.282:38:11,2:16,8:18,10,3,7
chr12	58217774	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=145,44;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:14,1:17,3:20,13,2,2
chr12	58217780	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=26,24;MFRL=145,88;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:12,2:16,2:19,10,1,3
chr12	58220801	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=20,23;MFRL=89,0;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:11,11,1,1
chr12	58220809	.	G	C,T	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=20,29,25;MFRL=96,86,0;MMQ=60,60,37;MPOS=8,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.66,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,10,2:0.367,0.100:27:6,6,1:9,3,1:6,9,6,6
chr12	58220811	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=25,26;MFRL=86,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:11,2:13,1:11,14,2,1
chr12	58220816	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=20,30;MFRL=101,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:6,7:8,9:8,8,9,7
chr12	58220819	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=23,30;MFRL=86,0;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:11,3:15,1:17,12,1,3
chr12	58220823	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=31,23;MFRL=106,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:6,7:8,9:9,8,9,7
chr12	58220831	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=31,25;MFRL=86,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:16,0:13,3:12,18,3,0
chr12	58220841	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=31,26;MFRL=87,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.463:39:12,8:9,9:0|1:58220841_C_T:58220841:8,13,10,8
chr12	58220844	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=31,24;MFRL=87,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.463:39:12,9:9,9:0|1:58220841_C_T:58220841:8,13,10,8
chr12	58220872	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=20,25;MFRL=80,36;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:10,2:11,2:12,10,1,3
chr12	58221371	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=83,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,3:10,1:11,8,3,1
chr12	58335417	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	58340931	.	T	TAGGAAATCTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=65,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr12	58345606	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:3,13:6,6:6,3,14,5
chr12	58347320	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=229,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr12	58350631	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,8,9
chr12	59307848	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:5,5:4,3:3,7,1,7
chr12	59308003	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,6:1,0,8,2
chr12	59313151	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:1,1,7,0
chr12	62261077	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=59,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,0:1,2:1,1,2,1
chr12	62777877	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=157,159;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,6:4,0:7,1,6,0
chr12	62778065	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,7:3,3:2,3,1,9
chr12	62778108	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=104,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.748:5:0,0:0,1:0,1,1,3
chr12	62785524	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr12	62861111	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:2,4,4,6
chr12	62887608	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:2,1,3,0
chr12	62888729	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	62892905	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr12	62894636	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=91,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:2,9:7,7:4,5,8,8
chr12	62918336	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:11,6:14,0:15,10,6,0
chr12	62928747	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	62965127	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=78,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr12	63083613	.	GAAACACGCACACAGTGAAAGCATCCCATTCCAGTGCAGCTGCCTGGGCTAGGAACAACC	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.119:24:14,0:4,2:8,13,1,2
chr12	63083662	.	T	TGTAGAAACCTTCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.361:6:3,1:1,0:0,4,0,2
chr12	63087706	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:3,4,0,2
chr12	63087837	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.361:6:1,2:3,0:0|1:63087837_C_CTG:63087837:0,4,1,1
chr12	63087838	.	C	CTCAAATGTATTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:1,2:3,0:0|1:63087837_C_CTG:63087837:0,4,1,1
chr12	63131195	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr12	63544204	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:63544204_G_A:63544204:1,2,1,1
chr12	63544209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:63544204_G_A:63544204:0,0,2,2
chr12	63964640	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=63,204;MMQ=37,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr12	64011062	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=133,105;MMQ=52,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:10,4:8,2:10,8,2,4
chr12	64011866	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=101,252;MMQ=25,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:4,3,3,1
chr12	64011878	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=101,282;MMQ=25,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:4,3,1,2
chr12	64012093	.	A	ACTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,282;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	64020310	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=127,82;MMQ=37,37;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.496:10:2,0:3,3:0|1:64020310_T_TA:64020310:2,3,1,4
chr12	64020319	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=119,139;MMQ=39,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:2,0:10,2:4,9,1,1
chr12	64020320	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=78,199;MMQ=37,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.284:10:1,1:7,1:3,5,0,2
chr12	64020321	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=64,106;MMQ=53,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.916:14:1,3:0,10:0|1:64020310_T_TA:64020310:1,0,4,9
chr12	64020330	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=119,135;MMQ=39,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:2,0:5,3:0,7,2,3
chr12	64038351	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,159;MMQ=27,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	64038369	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	64055269	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=88,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:4,5:4,15:3,5,8,12
chr12	64057559	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=119,65;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:9,0:37,2:0|1:64057559_C_T:64057559:24,24,1,1
chr12	64057574	.	T	TGGAGTCTTCTCTGTCACCCAGGCTG	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=122,65;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:9,0:33,1:0|1:64057559_C_T:64057559:22,23,1,1
chr12	64057703	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=184,218;MMQ=55,46;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr12	64057726	.	T	TATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=89,244;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATA;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr12	64062023	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=97,180;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:10,2:5,3:7,9,2,3
chr12	64173956	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	64196280	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=116,77;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr12	64202890	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,292;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr12	64383660	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=108,53;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,4:10,0:12,9,4,0
chr12	64383670	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=99,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:3,11:5,9:4,4,13,7
chr12	64383813	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,0:8,3:7,8,2,1
chr12	64474003	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,60;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	64474023	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr12	64480925	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64480925_T_C:64480925:0,0,0,1
chr12	64480931	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64480925_T_C:64480925:0,0,0,1
chr12	64480932	.	A	ACTCATTTCTCATTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64480925_T_C:64480925:0,0,0,1
chr12	64480934	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:64480925_T_C:64480925:0,0,0,1
chr12	64491151	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:7,0:11,12,0,2
chr12	64609562	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,10:0,0,15,9
chr12	64664530	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64664530_T_A:64664530:0,1,0,1
chr12	64664533	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64664530_T_A:64664530:0,1,0,1
chr12	64664538	.	A	ACTGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64664530_T_A:64664530:0,1,0,1
chr12	64664540	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64664530_T_A:64664530:0,1,0,1
chr12	64664542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64664530_T_A:64664530:0,1,0,1
chr12	64669018	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	64671411	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.427:4:1,1:1,1:0|1:64671411_C_CAT:64671411:2,0,1,1
chr12	64671412	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.425:4:1,1:1,1:0|1:64671411_C_CAT:64671411:2,0,1,1
chr12	64679694	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.436:9:2,3:2,1:5,0,3,1
chr12	64811811	.	CTCTA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:13,0:12,12,0,2
chr12	64818310	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr12	64818341	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	64819152	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,57;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:8,2:0|1:64819152_C_T:64819152:10,16,1,1
chr12	64819155	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,57;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:7,2:0|1:64819152_C_T:64819152:10,16,1,1
chr12	64838752	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr12	64858100	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,2:1,0,7,0
chr12	64860691	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=103,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,5:10,0:15,5,5,0
chr12	64878356	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	64883880	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=118,99;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.166:46:30,0:9,7:16,23,0,7
chr12	65004387	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	65130897	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:4,0:9,2:0|1:65130897_A_C:65130897:2,11,1,1
chr12	65130905	.	A	ACTCAAACACATTACAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:65130897_A_C:65130897:1,9,1,1
chr12	65133344	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=126,170;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.521:4:1,0:0,1:1,1,1,1
chr12	65133366	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=201,189;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:65133366_C_A:65133366:0,2,1,0
chr12	65133372	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=201,189;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:65133366_C_A:65133366:0,2,1,0
chr12	65133376	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=201,189;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:65133366_C_A:65133366:0,2,1,0
chr12	65445346	.	T	TCATTTTTTCCCTAATACAAGAGATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=245,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	65449071	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	65514266	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:5,3,0,3
chr12	65604804	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr12	65609675	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=113,201,155;MMQ=60,60,60;MPOS=30,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.21,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.213,0.300:11:1,1,0:4,1,2:5,1,5,0
chr12	65612499	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr12	65639615	.	ATTTT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:3,5:0,8:2,1,5,8
chr12	65762703	.	ACC	A,AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,21,15;MFRL=0,0,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=7.08,11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.387,0.535:10:0,0,1:0,2,0:0,0,0,10
chr12	65762768	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,0:8,3:7,6,1,2
chr12	65856899	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:13,3:1,1:10,4,3,2
chr12	66232173	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30,28;MFRL=96,145,131;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.68,9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.308,0.463:10:1,1,1:1,2,3:2,0,7,1
chr12	66517828	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr12	66522628	.	CAAAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:2,1:11,1:11,21,2,0
chr12	66531694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr12	66531903	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.164:34:12,5:17,0:10,19,3,2
chr12	66597701	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:5,1:10,2:6,9,2,2
chr12	66603919	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:13,8:17,0:0|1:66603919_T_A:66603919:20,10,8,0
chr12	66603922	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:12,8:15,0:0|1:66603919_T_A:66603919:20,10,8,0
chr12	66603980	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=111,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.241:43:19,7:14,3:7,26,4,6
chr12	66605228	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,20,9
chr12	66621999	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:6,5:13,2:13,6,7,0
chr12	66698438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,28;MFRL=217,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:0,2:0,0:1,0,3,0
chr12	66698954	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr12	66707993	.	GTTAGTTGGTTGTTTACACCAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.657:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr12	66715869	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	66717692	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	66717716	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=75,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,5:0,3:3,1,5,3
chr12	66731912	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr12	66747400	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:1,2,1,6
chr12	66770804	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:12,0:2,6:8,6,0,6
chr12	66771121	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=178,187;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr12	66771139	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=186,203;MMQ=40,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr12	66786073	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	66786091	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:3,0,3,1
chr12	66786341	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr12	66786644	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr12	66838380	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:15,3:15,1:10,21,0,4
chr12	66849302	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:1,4,0,2
chr12	66909389	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	67692817	.	TGATGAA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GATGAA;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:7,2:7,12,1,1
chr12	67696052	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	67701103	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	67706666	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	68052970	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.690:24:3,7:4,8:4,3,10,7
chr12	68054141	.	GA	G,GAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33,19;MFRL=117,140,98;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.77,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,6,5:0.188,0.165:34:8,2,0:7,2,2:15,8,4,7
chr12	68054877	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:1,3:5,2,4,1
chr12	68055199	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,12,9
chr12	68549213	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr12	68549356	.	AGTATTCCTTTAAAAAATGGACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	68552041	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.854:12:0,6:1,3:1,0,2,9
chr12	68595719	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:0,6:5,5:2,3,4,7
chr12	68595787	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=81,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,5:1,7:1,1,9,3
chr12	68646521	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=168,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,2:7,2:8,3,3,1
chr12	68647307	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	68710058	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:1,1,2,6
chr12	69042454	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.405:14:6,3:1,3:7,1,5,1
chr12	69080728	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.712:18:2,8:2,4:4,1,13,0
chr12	69082669	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr12	69083237	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	69090753	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=190,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,1,2
chr12	69090754	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr12	69090779	.	TA	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69090779_TA_AG:69090779:0,2,0,1
chr12	69090788	.	A	ATTCGACGGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69090779_TA_AG:69090779:0,2,0,1
chr12	69096626	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=171,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.394:11:2,0:1,0:0,7,0,4
chr12	69096676	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=230,148;MMQ=43,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr12	69103803	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:6,2,4,1
chr12	69103940	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr12	69109344	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=160,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:5,1,3,1
chr12	69115698	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=67,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,9:3,3:3,3,5,8
chr12	69125513	.	GG	TT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,4:2,4:0,4,5,4
chr12	69125578	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr12	69202260	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,118;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,3:11,0:13,17,3,0
chr12	69233682	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69233682_T_C:69233682:0,1,0,1
chr12	69233684	.	A	AGTTTGCCCCGTAATGCCATTGAACCTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69233682_T_C:69233682:0,1,0,1
chr12	69250548	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	69260835	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=116,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,0:10,4:10,15,0,4
chr12	69633379	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,14:0,1:0,0,12,3
chr12	69646914	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.967:55:0,30:1,22:0,1,33,21
chr12	69652336	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr12	69652345	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:69652345_TC_T:69652345:1,1,2,0
chr12	69652347	.	TCTCTTTCTCC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:69652345_TC_T:69652345:2,1,2,0
chr12	69652363	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:1,0:2,1:0|1:69652345_TC_T:69652345:2,1,2,0
chr12	69653146	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	69656228	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.164:26:11,0:11,3:11,11,0,4
chr12	69753830	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr12	69753847	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr12	69759551	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,18,12
chr12	69764388	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	69764850	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr12	69965028	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.723:15:0,6:3,5:3,1,7,4
chr12	69966042	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=107,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,0:6,2:1,9,0,2
chr12	69980028	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=99,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,2:10,3:10,7,3,2
chr12	69980141	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:8,2:11,5:7,12,3,4
chr12	69980183	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=179,149;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:3,2:0,9,0,3
chr12	69981862	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:2,2,0,2
chr12	69982129	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,1,2
chr12	69985771	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:3,2:9,0,2,0
chr12	69991627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:1,1,2,0
chr12	70049069	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,0:2,7:4,2,0,7
chr12	70049439	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:8,8,2,0
chr12	70065126	.	CTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=99,168,163;MMQ=60,60,60;MPOS=1,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=11.06,5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,3:0.529,0.318:10:1,4,2:0,2,1:1,0,9,0
chr12	70070942	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,5:0,2:0,1,2,5
chr12	70072479	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=117,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr12	70087754	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr12	70188242	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:11,0:17,8:16,12,1,7
chr12	70195293	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	70195341	.	A	ATATTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTTT;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr12	70195518	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=78,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:6,7,2,3
chr12	70724007	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,6:0,2:1,1,7,1
chr12	70740194	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	70747679	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=32,22;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.071:53:34,0:16,3:45,5,2,1
chr12	70747693	.	T	TAA	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.328:17:3,2:4,3:1,11,4,1
chr12	70747719	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.290:23:4,0:8,1:1,16,4,2
chr12	70747769	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=167,198;MMQ=60,26;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,19:0.625:30:6,0:5,19:0|1:70747769_C_T:70747769:0,11,0,19
chr12	70747774	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=183,198;MMQ=60,26;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:6,0:4,19:0|1:70747769_C_T:70747769:0,10,0,19
chr12	70747780	.	A	AAACTCTATACCCATTAAACAATCACTTC	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=23,38;MFRL=200,198;MMQ=60,26;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=77.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,19:0.690:27:4,0:2,19:0|1:70747769_C_T:70747769:0,8,0,19
chr12	70915347	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	70915349	.	GCTGTTT	G	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=173,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:2,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:1,4,0,1
chr12	70915358	.	GAAAATTACCAATGTGAA	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=185,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:1,0,0,1
chr12	70915382	.	GCAGAAACATATAGCTCAACCTA	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=199,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:0,2,0,1
chr12	70915406	.	TTTAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=199,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:0,2,0,1
chr12	70915415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=199,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:0,2,0,1
chr12	70915416	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=199,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:0,2,0,1
chr12	70915421	.	T	TACCC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,23;MFRL=199,110;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70915349_GCTGTTT_G:70915349:0,2,0,1
chr12	70925931	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:8,16,1,1
chr12	70925943	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.134:27:9,1:13,2:0|1:70925943_C_T:70925943:7,17,1,2
chr12	70925945	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.135:27:11,1:13,2:0|1:70925943_C_T:70925943:7,17,1,2
chr12	70925948	.	G	GCCAATGAGATTCGAGCT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=119,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:6,18,1,1
chr12	70928724	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr12	70933687	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0,0,9,7
chr12	70938279	.	AGAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=229,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr12	70946893	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70946893_TC_T:70946893:0,0,0,1
chr12	70946897	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70946893_TC_T:70946893:0,0,0,1
chr12	70946899	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70946893_TC_T:70946893:0,0,0,1
chr12	70949082	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70949082_AG_GA:70949082:0,1,0,1
chr12	70949086	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70949082_AG_GA:70949082:0,1,0,1
chr12	70949090	.	C	CTAATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:70949082_AG_GA:70949082:0,1,0,1
chr12	70949606	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,1:8,1:9,0,2,0
chr12	70953277	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,3:7,3:9,6,3,3
chr12	70953456	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=206,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	70956935	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,0:1,3:3,2,1,2
chr12	70956987	.	A	C,AATTTCCAAAGAAGGTGAAGGAAGAAGAGGAGCATGATGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31,24;MFRL=245,113,121;MMQ=60,60,54;MPOS=8,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr12	70964713	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	70965764	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,4:2,5:3,1,3,6
chr12	70970425	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=57,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:2,0:2,2:0|1:70970425_A_T:70970425:1,3,1,1
chr12	70970429	.	T	TGCGCCTGTGCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=57,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:2,1:0|1:70970425_A_T:70970425:1,3,1,1
chr12	70975022	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,3:13,0:15,9,2,1
chr12	70984026	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,0:3,8:1,5,0,8
chr12	71002865	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,3:9,1:8,3,2,2
chr12	71002893	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,2:9,2:8,6,2,2
chr12	71029640	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:71029640_A_C:71029640:7,4,1,1
chr12	71029645	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:71029640_A_C:71029640:7,4,1,1
chr12	71050666	.	A	AATTCCTACATTCTTTACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	71078135	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr12	71523043	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:6,2:10,0,3,1
chr12	71523199	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.311:24:8,5:8,2:2,15,0,7
chr12	71526564	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,0:10,3:5,10,1,2
chr12	71960208	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,9,9
chr12	71960329	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr12	71960533	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	71960584	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr12	72008246	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=103,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,6,0
chr12	72013832	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=101,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:8,0:19,2:12,17,1,1
chr12	72019989	.	T	TAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.857:11:1,5:0,5:1,0,9,1
chr12	72023336	.	T	TACACACACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=156,187;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=18,23;RU=AC;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.471:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr12	72026097	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,28:0.853:32:3,16:1,11:2,2,16,12
chr12	72026219	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr12	72028607	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28,27;MFRL=169,205,210;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.65,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.175,0.236:14:2,1,1:3,1,2:3,6,2,3
chr12	72030252	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:14,3,3,0
chr12	72058416	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.651:29:3,9:6,10:7,3,9,10
chr12	72067966	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	72091025	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr12	72094530	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.520:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	72163723	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20,19;MFRL=163,139,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.08,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.404,0.297:7:1,2,0:0,0,0:0,2,0,5
chr12	72164395	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:0,10:3,6:0,3,7,9
chr12	72332929	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr12	72366376	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=71,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:4,6,0,3
chr12	72366443	.	CTA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=92,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:72366443_CTA_C:72366443:3,2,1,1
chr12	72366446	.	C	CCCTGATG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=92,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:72366443_CTA_C:72366443:3,2,1,1
chr12	72366449	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=92,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:72366443_CTA_C:72366443:3,2,1,1
chr12	72388374	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr12	73015593	.	G	GCCACATAGGATCATAATTGGGCTGTAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=216,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	73015616	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=182,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	73015621	.	A	AGAGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=250,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73015621_A_AGAGCC:73015621:0,1,0,1
chr12	73015625	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=250,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73015621_A_AGAGCC:73015621:0,1,0,1
chr12	73050608	.	A	ATGAGTTTGGAATTCATAAACAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr12	74931832	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr12	74931989	.	TT	GG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,132;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:15,7:8,0:11,12,7,0
chr12	74933166	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0,0,8,6
chr12	74933853	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=92,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.873:25:3,7:0,9:1,3,7,14
chr12	74934634	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.939:13:0,6:0,7:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,4,9
chr12	74934637	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.939:13:0,6:0,7:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,4,9
chr12	75601389	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:4,0,5,6
chr12	75678847	.	G	GGAACC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=190,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:0|1:75678847_G_GGAACC:75678847:1,4,1,1
chr12	75678849	.	A	ACT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=190,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:0|1:75678847_G_GGAACC:75678847:1,4,1,1
chr12	75678850	.	G	GAGCCAACCGGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=190,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,2:3,0:0|1:75678847_G_GGAACC:75678847:1,4,1,1
chr12	75706720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=89,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.345:12:3,1:5,2:3,5,1,3
chr12	75723692	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=92,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,3:10,0:3,9,1,2
chr12	75785100	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:15,4:11,4:16,10,6,2
chr12	75785131	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,129;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:11,0:8,5:8,12,0,5
chr12	75816814	.	G	GACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:4,8,1,2
chr12	75875576	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,0:10,3:11,3,3,0
chr12	75897715	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.083:57:28,4:24,0:19,34,3,1
chr12	75900396	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	75901978	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:75901978_C_A:75901978:0,1,1,0
chr12	75901984	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75901978_C_A:75901978:0,1,1,0
chr12	76424937	.	TTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	76425095	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:7,2:0|1:76425095_G_GT:76425095:7,8,1,1
chr12	76425098	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:76425095_G_GT:76425095:7,9,1,1
chr12	76444510	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	76447640	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=107,55;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:18,0:11,2:0|1:76447640_T_C:76447640:11,18,1,1
chr12	76447649	.	A	ATTCTC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=115,55;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,0:5,2:0|1:76447640_T_C:76447640:6,16,1,1
chr12	76447651	.	A	AGGAAAGAAACAT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=123,55;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:5,2:0|1:76447640_T_C:76447640:6,15,1,1
chr12	76449900	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=101,120;MMQ=60,52;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,32:0.752:42:5,12:4,19:7,3,18,14
chr12	76453861	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr12	76453873	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	76461137	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:2,7:1,4:0|1:76461137_T_C:76461137:3,0,8,3
chr12	76461145	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,14:0.790:17:2,10:1,4:0|1:76461137_T_C:76461137:3,0,10,4
chr12	76462612	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=45,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,8:2,4:2,2,7,5
chr12	76749886	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:76749886_AG_A:76749886:0,0,0,1
chr12	76749888	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:76749886_AG_A:76749886:0,0,0,1
chr12	76749891	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76749886_AG_A:76749886:0,0,0,1
chr12	76750599	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:76750599_T_TA:76750599:0,1,0,1
chr12	76750602	.	G	GCTCTTATTTTAATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76750599_T_TA:76750599:0,1,0,1
chr12	76762923	.	A	AAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=209,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,9:0,3:2,0,11,2
chr12	76767065	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=72,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr12	76769209	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr12	76772414	.	A	ACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr12	76786349	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:2,3,6,4
chr12	77199250	.	AACTTG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	77202798	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr12	77209613	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.519:16:5,1:1,5:6,2,5,3
chr12	77209887	.	A	AGTTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77209887_A_AGTTTT:77209887:0,0,0,1
chr12	77209892	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77209887_A_AGTTTT:77209887:0,0,0,1
chr12	77209896	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77209887_A_AGTTTT:77209887:0,0,0,1
chr12	77209898	.	AC	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:77209887_A_AGTTTT:77209887:0,0,0,1
chr12	77216330	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=60,138;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.812:10:1,2:0,1:1,1,3,5
chr12	77235768	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=80,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,28:0.808:34:3,15:3,13:3,3,16,12
chr12	77239420	.	AAAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	77239551	.	TCATCATTGCC	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=88,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,2:10,0:13,18,1,1
chr12	77239590	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=103,87;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,4:9,0:7,15,3,1
chr12	77253236	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr12	77254074	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,56;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:12,6,1,1
chr12	77254089	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:77254089_G_C:77254089:13,6,1,1
chr12	77254094	.	A	ATCCCT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:77254089_G_C:77254089:13,6,1,1
chr12	77254207	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr12	77419578	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:11,11,0,3
chr12	77424135	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	77426776	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=69,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,1,2
chr12	77438607	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr12	78225186	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr12	78400256	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:8,7,1,1
chr12	78511755	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr12	78513397	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,37;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:6,0:8,3:10,5,3,0
chr12	78516230	.	GATA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78516230_GATA_G:78516230:0,1,0,1
chr12	78516234	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78516230_GATA_G:78516230:0,1,0,1
chr12	78530979	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr12	78531207	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=15,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr12	78540174	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27,24;MFRL=59,181,159;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=A;STR;TLOD=3.16,23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,9:0.175,0.731:12:0,1,4:1,1,5:0,1,3,8
chr12	78542594	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.695:21:3,8:3,6:0|1:78542594_T_G:78542594:4,2,10,5
chr12	78542602	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=102,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=64.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,20:0.683:29:5,11:4,9:0|1:78542594_T_G:78542594:6,3,13,7
chr12	78553009	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=99,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:78553009_G_A:78553009:6,9,1,1
chr12	78553011	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=99,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:78553009_G_A:78553009:6,9,1,1
chr12	78562687	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	78569059	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr12	78570914	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr12	78582362	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr12	78582566	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr12	78590946	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	78591249	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	78593070	.	AAATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATTT;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr12	78598891	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,5,9
chr12	79611374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,1:2,5:0,3,2,4
chr12	79685913	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:2,3,5,4
chr12	79693314	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr12	79747462	.	G	A,T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24,27;MFRL=0,159,108;MMQ=60,60,60;MPOS=27,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.76,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.406,0.402:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr12	79747463	.	G	GAATCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	79813170	.	A	AACTCTAGGCAGTATCTTAGAAGGACAGACAATATAACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.662:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr12	79990481	.	C	CCTACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	80190489	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr12	80202287	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:11,8,2,0
chr12	80215965	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:80215965_T_C:80215965:8,10,1,1
chr12	80215970	.	CCT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:80215965_T_C:80215965:6,12,1,1
chr12	80216060	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr12	80645799	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr12	80648399	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	80648769	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,7:3,0:10,0,7,0
chr12	80648803	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,0:3,3:7,3,2,1
chr12	80655692	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	80661187	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=183,161;MMQ=56,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr12	80661189	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=152,183;MMQ=56,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr12	80663825	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:0,2:0,1,3,0
chr12	80663952	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=71,110;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:3,7:0,6:1,2,6,7
chr12	80665397	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr12	80707236	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr12	80712290	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0|1:80712290_T_G:80712290:1,0,2,0
chr12	80712307	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:80712290_T_G:80712290:0,0,5,1
chr12	80730561	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,5:1,5:1,0,8,2
chr12	80733088	.	T	TAGCTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	80735996	.	A	AGGCTAGACAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	80746234	.	G	GAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr12	80750741	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.786:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	80752210	.	A	ATAAATGGTGTATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=237,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.487:3:0,1:2,0:0|1:80752210_A_ATAAATGGTGTATAT:80752210:1,1,0,1
chr12	80752213	.	A	AAAGAAGAAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=268,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:80752210_A_ATAAATGGTGTATAT:80752210:1,0,0,1
chr12	80761411	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr12	80762163	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=C;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	80765683	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:80765683_TG_T:80765683:0,0,4,0
chr12	80765685	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0|1:80765683_TG_T:80765683:0,0,4,0
chr12	80765945	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	80838012	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	80839585	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=211,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	80862469	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr12	80862573	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=93,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.662:24:4,5:3,11:1,7,8,8
chr12	80878174	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.832:4:0,3:0,0:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,3,1
chr12	80878181	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,4,2
chr12	80889100	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:80889100_C_T:80889100:7,4,1,1
chr12	80889105	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=129,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:80889100_C_T:80889100:8,4,1,1
chr12	80889165	.	TTTG	T,TTTGTTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31,28;MFRL=0,128,129;MMQ=60,60,60;MPOS=33,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,5,7;RU=TTG;STR;TLOD=3.30,8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.284,0.559:3:0,0,2:0,1,0:0,0,0,3
chr12	80889948	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:80889948_C_A:80889948:2,1,0,1
chr12	80889949	.	A	AAGTAGTATTGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:80889948_C_A:80889948:2,1,0,1
chr12	80890325	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr12	80900058	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr12	80900335	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=336,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr12	80900348	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=336,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,1:1,7:1,0,6,2
chr12	80900488	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=133,68;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:9,0:2,9:1,10,1,8
chr12	80900495	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.925:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr12	80927983	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:3,5,1,2
chr12	80933465	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	80933785	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	80935345	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,18,7
chr12	80935471	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0|1:80935471_C_T:80935471:14,11,1,1
chr12	80935478	.	G	GAAAATAATTAAAATGAAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:0|1:80935471_C_T:80935471:12,11,1,1
chr12	80943505	.	CTGAAACAGGTAACTAACG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.258:10:4,2:3,0:1,7,1,1
chr12	81007547	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,0:11,3:4,14,3,0
chr12	81009907	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr12	81046635	.	G	GGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,2:6,1:6,9,0,4
chr12	81062958	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr12	81063264	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	81066851	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	81102237	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:81102237_A_C:81102237:0,1,2,0
chr12	81102242	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:81102237_A_C:81102237:0,2,2,0
chr12	81102246	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=63,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:81102237_A_C:81102237:1,3,2,0
chr12	81112882	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr12	81226432	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:81226432_G_A:81226432:0,0,4,2
chr12	81226436	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:81226432_G_A:81226432:0,0,4,1
chr12	81239711	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:81239711_A_AT:81239711:1,2,0,1
chr12	81239712	.	C	CTAATTTTTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:81239711_A_AT:81239711:1,2,0,1
chr12	81239714	.	G	GTCTCAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,1:1,0:0|1:81239711_A_AT:81239711:1,2,0,1
chr12	81239719	.	C	CCAGGCTGGAGTGCAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,33;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,0,1
chr12	81329672	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	81503499	.	TTATATATG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=175,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATATATG;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr12	81627231	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:11,1:3,2:0|1:81627231_C_T:81627231:9,6,1,2
chr12	81627238	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:3,8:3,2:0|1:81627231_C_T:81627231:4,2,5,5
chr12	81655692	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=125,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:0,1:2,2,2,0
chr12	81655777	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=184,39102608;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:4,4,1,1
chr12	81655913	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr12	81655930	.	C	CCTGATATGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=191,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:81655930_C_CCTGATATGG:81655930:0,4,0,1
chr12	81655932	.	T	TTGGCTGTGTCCCTACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=191,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:81655930_C_CCTGATATGG:81655930:0,4,0,1
chr12	81661919	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=156,117;MMQ=27,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0|1:81661919_T_C:81661919:0,2,0,5
chr12	81661924	.	T	TCTATGTATATGAGTGTATTAGTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,38;MFRL=156,117;MMQ=27,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0|1:81661919_T_C:81661919:0,2,0,5
chr12	81661945	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	81675151	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=81,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:4,6,1,1
chr12	81799629	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:2,4,1,2
chr12	81839562	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=149,198;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:81839562_A_C:81839562:0,2,0,1
chr12	81839567	.	C	CTCCCAACTAAACAGAGGCAGAACTTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=149,198;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:81839562_A_C:81839562:0,2,0,1
chr12	81851719	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=238,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	82751062	.	TATC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr12	82751955	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr12	82752627	.	GGG	TTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=202,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr12	82752633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	82783668	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,9,15
chr12	82793251	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:82793251_C_T:82793251:0,2,0,1
chr12	82793259	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:82793251_C_T:82793251:0,2,0,1
chr12	82793264	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82793251_C_T:82793251:0,2,0,1
chr12	82793268	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:82793251_C_T:82793251:0,2,0,1
chr12	82828426	.	T	TATAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATAAG;STR;TLOD=78.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0,0,11,7
chr12	82832418	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	82850427	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	83289741	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,138;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:19,0:19,8:24,14,0,8
chr12	83289754	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=118,138;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:18,0:17,8:23,12,0,8
chr12	83290509	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:83290509_A_ATC:83290509:0,0,0,1
chr12	83290514	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:83290509_A_ATC:83290509:0,1,0,1
chr12	83290516	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:83290509_A_ATC:83290509:0,1,0,1
chr12	83358930	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=83,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr12	85285937	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0|1:85285937_AC_A:85285937:0,8,0,2
chr12	85285939	.	TCCCTTATG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:85285937_AC_A:85285937:0,8,0,2
chr12	85423743	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr12	85432040	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,82;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:8,9,2,1
chr12	85434471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	85439774	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr12	85441320	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr12	85441332	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr12	85451017	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	85492094	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	85531790	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr12	85554331	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:1,9:0,3:0,1,11,2
chr12	85638645	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.704:11:2,4:1,4:1,2,6,2
chr12	86229888	.	CACACACAGAG	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=93,31870953;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,2:14,0:13,13,0,2
chr12	86276246	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	88379566	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	88444042	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	88449344	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=89,91;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:13,0:7,3:11,9,2,1
chr12	88453608	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr12	88454594	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr12	88473049	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr12	88476980	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:8,9,0,2
chr12	88478316	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	88481609	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:22,3:17,0:7,32,0,3
chr12	88496576	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	88496838	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr12	88510750	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,207;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:3,2:4,2,2,1
chr12	88520219	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:7,1:8,2:0|1:88520219_G_A:88520219:6,9,1,3
chr12	88520223	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:0|1:88520219_G_A:88520219:6,8,1,2
chr12	88522823	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr12	88525048	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	88546982	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	88547277	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr12	88560264	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:16,3:19,1:21,14,3,1
chr12	88589340	.	ACAAAAGACAT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.126:36:13,2:12,2:17,15,2,2
chr12	88910307	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	88926290	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.715:18:1,2:3,5:1,4,2,11
chr12	89853387	.	CA	C,CAA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=23,34,32;MFRL=111,93,123;MMQ=60,60,60;MPOS=24,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=5.49,8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,7:0.274,0.531:12:1,2,1:0,1,4:1,1,8,2
chr12	89853408	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,8,11
chr12	89853410	.	CT	AA	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,21;MFRL=88,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:6,1:0|1:89853410_CT_AA:89853410:6,13,2,0
chr12	89853412	.	T	TAA	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=23,14;MFRL=91,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:6,0:0|1:89853410_CT_AA:89853410:7,13,2,0
chr12	89853414	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,15;MFRL=88,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:9,0:0|1:89853410_CT_AA:89853410:7,14,2,0
chr12	89853417	.	TGG	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=88,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:11,0:0|1:89853410_CT_AA:89853410:8,17,2,0
chr12	89866054	.	TAGAAAGAAGA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAAGAAGA;STR;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr12	89885648	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=91,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr12	89993087	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:1,3,4,7
chr12	90003641	.	CAACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AACA;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,1:2,0:3,0,1,0
chr12	90015579	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	90028912	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,0:12,3:12,11,1,2
chr12	91348640	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:12,2:8,2:8,12,2,2
chr12	91445224	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,2:10,0:8,10,0,2
chr12	91502089	.	T	TAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.239:15:7,2:5,0:0|1:91502089_T_TAA:91502089:5,7,2,1
chr12	91502090	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.239:15:7,3:5,0:0|1:91502089_T_TAA:91502089:5,7,2,1
chr12	91540029	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:5,0:6,16:5,6,0,17
chr12	91572073	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=90,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:3,4:9,0:11,2,4,0
chr12	92539344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.792:11:0,5:0,2:0,2,1,8
chr12	92821860	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:1,1:6,3:3,4,2,2
chr12	93100871	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=87,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:4,0:0,2:0|1:93100871_G_C:93100871:2,2,1,1
chr12	93100879	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=57,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,2:0|1:93100871_G_C:93100871:2,4,1,1
chr12	93100881	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=54,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:93100871_G_C:93100871:2,2,1,1
chr12	93100882	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=54,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:93100871_G_C:93100871:2,2,1,1
chr12	93100947	.	T	TTTATGCCCCACACACTTTAGCCATGGTCCTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=0,115;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	93171278	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr12	93202726	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,2:0,2:0,0,4,2
chr12	93206878	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr12	93206936	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93206936_A_ACC:93206936:0,1,0,1
chr12	93206938	.	T	TCTCTTGCCTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93206936_A_ACC:93206936:0,1,0,1
chr12	93236402	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr12	93258808	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr12	93322834	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:15,0:14,8:13,17,0,8
chr12	93805167	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:93805167_CAT_C:93805167:0,3,0,1
chr12	93805170	.	A	AGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:93805167_CAT_C:93805167:0,3,0,1
chr12	93863162	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	93870893	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93870893_T_C:93870893:0,1,0,1
chr12	93870895	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93870893_T_C:93870893:0,1,0,1
chr12	93870900	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93870893_T_C:93870893:0,1,0,1
chr12	93870903	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93870893_T_C:93870893:0,1,0,1
chr12	93870905	.	T	TAGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93870893_T_C:93870893:0,1,0,1
chr12	93873089	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93873089_C_CA:93873089:0,0,1,0
chr12	93873110	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=182,115;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:93873089_C_CA:93873089:1,0,1,0
chr12	93894823	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr12	94562875	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,7,0
chr12	94563134	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=251,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,3:1,6:0,4,0,9
chr12	94575207	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.252:29:7,4:9,1:9,13,5,2
chr12	94580286	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,1:1,9:1,2,2,8
chr12	94603300	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,1:5,7:11,1,6,2
chr12	94603559	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	94614010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr12	94618183	.	A	ATATCTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:94618183_A_ATATCTCTTT:94618183:0,1,0,1
chr12	94618184	.	G	GGTTATCTGAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:94618183_A_ATATCTCTTT:94618183:0,1,0,1
chr12	94648910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr12	94649103	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:4,9:2,10:2,4,2,17
chr12	94653227	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr12	94653375	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=121,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,8:4,0:11,1,8,0
chr12	94653579	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:94653579_G_C:94653579:0,3,0,1
chr12	94653588	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:94653579_G_C:94653579:0,3,0,1
chr12	94653592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=208,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,0:1,1:1|0:94653579_G_C:94653579:0,2,0,1
chr12	94653594	.	T	C,A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,34,25;MFRL=218,198,126;MMQ=60,60,60;MPOS=2,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,0:0,1,1:0,1,0,2
chr12	94658920	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.203:47:20,6:18,3:28,10,4,5
chr12	94659065	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr12	94673500	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr12	94673509	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	94697508	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=49,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.300:5:0,0:0,1:0,4,1,0
chr12	94965544	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=177,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,1:0,1:0,4,2,0
chr12	94972400	.	T	TATTCACAGCAGTAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	94976084	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=100,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.697:31:5,15:4,6:4,5,12,10
chr12	95424289	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr12	95452311	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr12	95453784	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:1,0:0,1:0|1:95453784_G_A:95453784:0,1,2,0
chr12	95453789	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95453784_G_A:95453784:0,1,1,0
chr12	95453794	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:95453784_G_A:95453784:0,1,1,0
chr12	95461244	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	95603009	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:8,0:11,4:12,8,3,1
chr12	95645792	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=95,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.107:53:24,5:24,0:24,24,1,4
chr12	95660410	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95660410_T_A:95660410:0,1,0,1
chr12	95660412	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95660410_T_A:95660410:0,1,0,1
chr12	95660416	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95660410_T_A:95660410:0,1,0,1
chr12	95660423	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95660410_T_A:95660410:0,1,0,1
chr12	95689736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=403,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,3,1
chr12	95690008	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,108;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:4,3:15,0:6,13,3,0
chr12	95702161	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:2,10:14,0:12,4,10,0
chr12	95702385	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	95877138	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=110,149;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:0|1:95877138_G_A:95877138:0,8,0,2
chr12	95877150	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=133,132;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:95877138_G_A:95877138:0,4,0,1
chr12	95877165	.	TT	CC,TCGGGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31,28;MFRL=153,115,132;MMQ=60,40,40;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,0:1,0,1:0,2,0,2
chr12	95877167	.	G	GAGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=151,132;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:95877138_G_A:95877138:0,3,0,1
chr12	95877170	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=151,115;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:95877138_G_A:95877138:0,3,0,1
chr12	95888969	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=178,78;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:0,6,1,2
chr12	95897997	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr12	95914758	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:4,1,3,2
chr12	96063947	.	TGTTA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTA;STR;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.728:16:0,6:3,6:0,4,6,6
chr12	96104138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	96104488	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=222,166;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:2,1:0|1:96104488_T_A:96104488:0,2,0,1
chr12	96104489	.	AGGATGAGTT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=222,166;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96104488_T_A:96104488:0,2,0,1
chr12	96104503	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=271,170;MMQ=60,50;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:96104488_T_A:96104488:0,1,0,2
chr12	96104506	.	C	CACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=222,166;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96104488_T_A:96104488:0,2,0,1
chr12	96104508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=219,173;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:96104488_T_A:96104488:0,2,0,1
chr12	96131895	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:2,7:2,6:1,3,6,7
chr12	96131936	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:1,6,1,2
chr12	96184031	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=147,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:2,6,1,1
chr12	96252808	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,322;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.190:24:12,4:7,0:0|1:96252808_C_T:96252808:15,5,2,2
chr12	96252817	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,3:0.136:27:15,3:9,0:1|0:96252808_C_T:96252808:15,9,2,1
chr12	96253003	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	96254880	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,1:3,3:5,2,2,2
chr12	96259951	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:0,3,1,5
chr12	96266295	.	C	CAAAAGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96266295_C_CAAAAGAA:96266295:0,0,0,1
chr12	96266296	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96266295_C_CAAAAGAA:96266295:0,0,0,1
chr12	96288860	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=84,124;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:3,4,2,2
chr12	96292280	.	G	GAAAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAC;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.255:13:9,0:1,1:4,6,1,2
chr12	96312570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	96330311	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.900:17:1,8:0,8:0,1,4,12
chr12	96356048	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr12	96356060	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr12	96356280	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=185,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:1,6,1,1
chr12	96356308	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=89,756;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr12	96359426	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:5,1:4,2,2,0
chr12	96370190	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=82,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,10:4,0:7,4,10,0
chr12	96370214	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=110,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:6,0:0|1:96370214_T_C:96370214:18,5,1,1
chr12	96370219	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=110,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:5,0:0|1:96370214_T_C:96370214:18,4,1,1
chr12	96370504	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,3:3,0:2,7,1,2
chr12	96371894	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	96374554	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,9:0,13:0|1:96374554_G_A:96374554:0,0,8,15
chr12	96374563	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0|1:96374554_G_A:96374554:0,0,9,14
chr12	96374614	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr12	96374672	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr12	96374683	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:2,5,0,3
chr12	96379806	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,9:1,8:1,1,9,8
chr12	96380975	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,1:10,3:7,13,2,2
chr12	96384345	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=195,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:1,2,2,6
chr12	96386383	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=177,111;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:4,2,5,0
chr12	96386646	.	G	GCCCTCCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=105,93;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=CCCT;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	96402748	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	96414976	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	96415978	.	C	CTCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:9,2:8,0:0|1:96415978_C_CTCA:96415978:6,12,0,2
chr12	96415982	.	A	AGCGCC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:0|1:96415978_C_CTCA:96415978:6,13,0,2
chr12	96653501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=76,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,4:2,2:3,3,3,3
chr12	96676322	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=101,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:9,5:18,0:13,14,3,2
chr12	96694162	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,14,13
chr12	96694172	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=134,72;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.285:8:1,0:4,2:1,5,1,1
chr12	97078749	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,6,0
chr12	97079040	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr12	97079043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	97079068	.	G	GTAGCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=151,328;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	97085107	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr12	97098415	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	97098549	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,12,15
chr12	97098574	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:1,9:3,8:1,3,8,9
chr12	97098695	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	97102578	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,14:0,24:0,0,7,31
chr12	97114430	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	97133737	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=107,193;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr12	97133758	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr12	97147503	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=79,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,2:1,7:2,2,6,3
chr12	97158126	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	97158772	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,4:0,5:3,0,9,0
chr12	97303522	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=82,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.613:42:14,18:2,7:8,8,17,9
chr12	97303693	.	AAC	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.251:26:7,2:12,5:1,18,0,7
chr12	97311376	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.445:14:4,4:3,1:7,1,5,1
chr12	97311541	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,10:3,3:0,3,0,13
chr12	97328714	.	TGCTTATAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:2,1,4,3
chr12	97331219	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.768:19:3,7:1,7:1,3,2,13
chr12	97339388	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr12	98921562	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=210,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr12	98925650	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,5:1,3:0,2,3,5
chr12	98927636	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:10,5,0,2
chr12	98938416	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	98989187	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:4,0:8,4:9,4,4,0
chr12	98991842	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=183,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:3,3,1,10
chr12	99007745	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,1:19,2:17,21,3,0
chr12	99019718	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:13,0:19,8,3,0
chr12	99116919	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	99129497	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr12	99166805	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,7:1,2:4,2,4,5
chr12	99175840	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr12	99447139	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	99478626	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	99478889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr12	99640349	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:4,3:13,0:8,9,2,1
chr12	99793439	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:14,1:4,1:9,9,2,0
chr12	99898220	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,3:2,0:6,1,3,0
chr12	100041939	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.450:9:2,3:3,0:0|1:100041939_AT_A:100041939:4,1,2,2
chr12	100041942	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.450:9:2,4:3,0:0|1:100041939_AT_A:100041939:4,1,2,2
chr12	100042163	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,2:6,6:8,2,5,3
chr12	100169519	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr12	100200338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:100200338_G_A:100200338:5,7,1,1
chr12	100200348	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,0:0|1:100200338_G_A:100200338:6,7,1,1
chr12	100219207	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr12	100219262	.	T	TAAACACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,24;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr12	100433524	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,3:3,0:3,8,2,1
chr12	100452517	.	T	TCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr12	100476840	.	ATTAGC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAGC;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,2:9,0:15,11,1,1
chr12	100480158	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr12	100676960	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,3:2,4:1,6,2,5
chr12	100685209	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:11,0,3,0
chr12	100706498	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=327,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100706498_A_AC:100706498:0,1,0,1
chr12	100706500	.	A	ACATGTGCTCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=327,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100706498_A_AC:100706498:0,1,0,1
chr12	100722974	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:5,1,2,1
chr12	100728036	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=186,42;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:100728036_A_C:100728036:0,3,1,1
chr12	100728039	.	G	GCCTGGGCAACATAGTCAGTCCCTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=186,42;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:100728036_A_C:100728036:0,3,1,1
chr12	100732997	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100732997_G_GCC:100732997:0,2,0,1
chr12	100733001	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100732997_G_GCC:100732997:0,2,0,1
chr12	100774823	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=172,272;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:100774823_T_C:100774823:0,5,0,2
chr12	100774830	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,272;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:100774823_T_C:100774823:0,5,0,2
chr12	100930213	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr12	101017445	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,21,13
chr12	101017912	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.138:41:16,0:19,5:11,25,0,5
chr12	101333029	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,5,0
chr12	101365007	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	101413867	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:10,14,0,2
chr12	101491375	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=92,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,4,1
chr12	101505550	.	A	ACCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101505550_A_ACCC:101505550:0,0,0,1
chr12	101505553	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101505550_A_ACCC:101505550:0,0,0,1
chr12	101505555	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101505550_A_ACCC:101505550:0,0,0,1
chr12	101505557	.	CAGAAG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101505550_A_ACCC:101505550:0,0,0,1
chr12	101505569	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101505550_A_ACCC:101505550:0,0,0,1
chr12	101520648	.	C	CTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:1,3:1,3:1,1,5,1
chr12	101520822	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:5,2:0|1:101520822_A_C:101520822:7,5,1,1
chr12	101520830	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:101520822_A_C:101520822:8,6,1,1
chr12	101520831	.	C	CTGTATTGTTTGGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:101520822_A_C:101520822:8,6,1,1
chr12	101551211	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=111,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,0:2,3:1,3,0,3
chr12	101603254	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,0:3,0:0|1:101603254_C_G:101603254:1,5,3,0
chr12	101603256	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:2,1:0|1:101603254_C_G:101603254:1,5,3,0
chr12	101603262	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0|1:101603254_C_G:101603254:1,5,3,0
chr12	101603265	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,0:3,0:0|1:101603254_C_G:101603254:1,5,3,0
chr12	101683969	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=119,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:15,0:0|1:101683969_C_T:101683969:20,13,1,1
chr12	101683973	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:15,2:16,0:0|1:101683969_C_T:101683969:21,12,1,1
chr12	101685422	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	101685968	.	A	ACCACTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101685968_A_ACCACTG:101685968:0,0,0,1
chr12	101685971	.	A	AACACCATATT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101685968_A_ACCACTG:101685968:0,0,0,1
chr12	101685975	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101685968_A_ACCACTG:101685968:0,0,0,1
chr12	101685977	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101685968_A_ACCACTG:101685968:0,0,0,1
chr12	101711362	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:14,7,2,0
chr12	101715368	.	AAACAGCCCACCGAGCAGATCTATTTCCTATTCTGATGAGGTATTTATGCTGTTCAAACACTGATTTTTAAAAAGTTAAT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.132:25:8,2:5,0:0|1:101715368_AAACAGCCCACCGAGCAGATCTATTTCCTATTCTGATGAGGTATTTATGCTGTTCAAACACTGATTTTTAAAAAGTTAAT_A:101715368:6,14,3,2
chr12	101715442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.329:7:4,2:1,0:1|0:101715368_AAACAGCCCACCGAGCAGATCTATTTCCTATTCTGATGAGGTATTTATGCTGTTCAAACACTGATTTTTAAAAAGTTAAT_A:101715368:1,4,0,2
chr12	101750875	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=71,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr12	101774912	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:3,3:5,0:5,4,3,0
chr12	101777489	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr12	101779964	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	101795009	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.792:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	101870804	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,30;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr12	102023383	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=160,226;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:102023383_C_G:102023383:0,3,0,1
chr12	102023391	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=160,226;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:102023383_C_G:102023383:0,3,0,1
chr12	102023407	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=160,226;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.344:4:2,0:1,1:0|1:102023407_C_T:102023407:0,3,0,1
chr12	102023409	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=160,226;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.344:4:2,0:1,1:0|1:102023407_C_T:102023407:0,3,0,1
chr12	102023413	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,22;MFRL=192,226;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:102023407_C_T:102023407:0,2,0,1
chr12	102023414	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=256,226;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102023407_C_T:102023407:0,1,0,1
chr12	102023419	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=256,226;MMQ=60,41;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102023407_C_T:102023407:0,1,0,1
chr12	102041757	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=79,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:9,4,3,0
chr12	102043288	.	G	GC,GTTGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29,33;MFRL=147,193,213;MMQ=60,60,60;MPOS=5,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,0:1,0,1:0,3,0,2
chr12	102043291	.	T	TAA,TAAAAAATGTACGAATCAATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23,28;MFRL=147,193,213;MMQ=60,60,60;MPOS=2,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,0:1,0,1:0,3,0,2
chr12	102043292	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	102046394	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=225,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr12	102046595	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,3,12
chr12	102053696	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=122,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:102053696_A_AT:102053696:0,1,0,1
chr12	102053701	.	C	CCAGTGAAGCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=122,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:102053696_A_AT:102053696:0,1,0,1
chr12	102057166	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:3,1,4,1
chr12	102060670	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=150,176;MMQ=47,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.649:3:1,0:0,0:0|1:102060670_CAT_C:102060670:0,1,0,2
chr12	102060678	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,9;MFRL=150,176;MMQ=47,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.647:3:1,0:0,0:0|1:102060670_CAT_C:102060670:0,1,0,2
chr12	102064118	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,7,13
chr12	102074308	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:12,3:8,2:9,11,1,4
chr12	102133307	.	C	CCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=289,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	102142778	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	102147088	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,2:0,4:4,0,2,4
chr12	102147142	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:7,4:12,1:8,11,2,3
chr12	102154900	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,12,9
chr12	102179949	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.135:50:25,6:17,0:16,28,6,0
chr12	102182427	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=174,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:102182427_A_C:102182427:2,2,1,1
chr12	102182430	.	A	AGCACATTTAAATGTTTTTTGTTGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=174,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:102182427_A_C:102182427:2,2,1,1
chr12	102190611	.	A	ATTTCTTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=193,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102190611_A_ATTTCTTTCTT:102190611:0,1,0,1
chr12	102190616	.	A	ATTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=193,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:102190611_A_ATTTCTTTCTT:102190611:0,1,0,1
chr12	102224491	.	AGCC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=253,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.896:16:0,10:1,5:0,1,2,13
chr12	102295218	.	TC	CC,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30,20;MFRL=0,119,90;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=31.14,4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,3:0.711,0.233:14:0,5,3:0,6,0:0,0,5,9
chr12	102301874	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	102301898	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr12	102301910	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,5:2,1:0|1:102301910_T_C:102301910:2,0,6,2
chr12	102301915	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.752:10:0,6:2,2:0|1:102301910_T_C:102301910:2,0,6,2
chr12	102308095	.	CG	TA,TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,28;MFRL=0,56,148;MMQ=60,60,60;MPOS=21,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.56,15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.299,0.604:7:0,2,3:0,0,2:0,0,0,7
chr12	102433811	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	102468734	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,3:5,1:5,2,4,0
chr12	102470470	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr12	102479614	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:15,0:14,2:0|1:102479614_A_C:102479614:10,19,1,1
chr12	102479620	.	T	TAGAA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:13,2:0|1:102479614_A_C:102479614:10,19,1,1
chr12	102479623	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:13,2:0|1:102479614_A_C:102479614:10,17,1,1
chr12	102479624	.	A	AGCATTG	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:12,2:0|1:102479614_A_C:102479614:10,17,1,1
chr12	102559689	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr12	102569361	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:102569361_G_C:102569361:13,8,1,1
chr12	102569365	.	T	TGCTTATCCAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:102569361_G_C:102569361:14,8,1,1
chr12	102576307	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=122,156,123;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.43,4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,3:0.150,0.214:16:5,0,3:3,2,0:10,1,5,0
chr12	102576427	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,95;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:15,3:5,20,0,3
chr12	102813547	.	C	CCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102813547_C_CCTT:102813547:0,1,0,1
chr12	102813550	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102813547_C_CCTT:102813547:0,1,0,1
chr12	102813551	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102813547_C_CCTT:102813547:0,1,0,1
chr12	103233031	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=187,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:0,4,2,3
chr12	103238232	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:3,7,0,2
chr12	103240630	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr12	103271193	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,1,1
chr12	103306550	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr12	103310787	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=261,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,6,2
chr12	103310987	.	A	ATTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=163,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,1,1
chr12	104014402	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AC;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:2,1:0,5,0,3
chr12	104015999	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr12	104044316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,1:11,2:10,10,2,1
chr12	104054434	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:9,6,3,2
chr12	104071158	.	TTCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:1,0:7,0,3,0
chr12	104086709	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:3,8,0,2
chr12	104092929	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:7,2:0|1:104092929_A_T:104092929:9,8,1,1
chr12	104092935	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:104092929_A_T:104092929:9,8,1,1
chr12	104092938	.	A	AAGC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:104092929_A_T:104092929:8,7,1,1
chr12	104092940	.	G	GCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:104092929_A_T:104092929:8,7,1,1
chr12	104099469	.	TATTGGGTGCCAGCCAAAATGTGTGAGAACCGTCATTGTGAGTACAATAATTGAATCATACTAACTACTGCAGCACC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:4,2:7,6,1,1
chr12	104099544	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=221,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr12	104109490	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=116,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0|1:104109490_C_T:104109490:0,1,6,0
chr12	104109497	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=116,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:104109490_C_T:104109490:0,1,6,0
chr12	104111687	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,1:0,1,1,5
chr12	104124061	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:0,3:3,7:1,2,4,6
chr12	104131352	.	TTCTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=TC;STR;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	104131635	.	T	TAGTCCCAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	104133338	.	TG	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=274,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	104140517	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr12	104144592	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104144592_A_G:104144592:0,1,0,1
chr12	104144593	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:104144592_A_G:104144592:0,1,0,1
chr12	104144597	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:104144592_A_G:104144592:0,0,0,1
chr12	104146964	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr12	104147207	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	104149022	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	104149251	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr12	104149520	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr12	104152140	.	A	ATTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:104152140_A_ATTGC:104152140:0,1,0,1
chr12	104152144	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104152140_A_ATTGC:104152140:0,1,0,1
chr12	104152147	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104152140_A_ATTGC:104152140:0,1,0,1
chr12	104156091	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:13,5:11,0:13,11,6,0
chr12	104156152	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=93,99;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,0:8,4:8,14,4,0
chr12	104174121	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=93,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:16,0:10,17,1,2
chr12	104174156	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=193,82;MMQ=54,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:6,0:26,6:0,32,1,5
chr12	104179271	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:7,2:4,11,0,3
chr12	104187092	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,3:5,1:4,8,1,3
chr12	104190854	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:3,4,1,2
chr12	104332141	.	GGAGGAAGAAGAAGCAGCCAAAGAAGAGAAAGAAGAATCTGATGATGAAGCTGCAGTA	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=87,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,2:0.046:64:20,2:27,0:34,28,1,1
chr12	104335720	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:104335720_G_A:104335720:0,3,0,1
chr12	104335721	.	GGTT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:104335720_G_A:104335720:0,3,0,1
chr12	104335736	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=233,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:104335736_C_CA:104335736:0,3,0,1
chr12	104335738	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=233,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:104335736_C_CA:104335736:0,3,0,1
chr12	104335750	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	104359931	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=400,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,3:0,1,0,10
chr12	104373728	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=122,98;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.304:40:12,1:16,11:11,17,2,10
chr12	104376760	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:3,6,0,3
chr12	104377014	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=105,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:11,3:11,9,1,2
chr12	104391377	.	T	TTGAAACCAGGGTAAACCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=11,14;MFRL=88,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr12	104413534	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=75,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104413534_C_CTTA:104413534:0,2,0,1
chr12	104413535	.	C	CAATCCATTGTTCACGTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=75,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104413534_C_CTTA:104413534:0,2,0,1
chr12	104476264	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr12	104517232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=123,174;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,0:5,7:4,6,0,7
chr12	104645363	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr12	104645405	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr12	104697851	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,4:3,8:4,1,8,4
chr12	104705149	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.759:27:3,9:3,11:2,4,8,13
chr12	104707151	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,7:1,2:0,1,2,8
chr12	104707180	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	104712858	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.266:19:5,3:8,2:5,9,2,3
chr12	104714847	.	CTT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.406:20:5,1:5,7:9,3,5,3
chr12	104720178	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:40,3:30,1:43,27,4,0
chr12	104720238	.	A	ATTTTTTTT	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=80,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=22,30;RU=T;STR;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.816:20:2,10:1,5:3,0,15,2
chr12	104721464	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=128,123;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.208:41:16,0:17,8:9,24,0,8
chr12	104742276	.	T	TTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=221,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	104995800	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.772:17:2,7:2,5:1,3,3,10
chr12	105238475	.	AG	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:105238475_AG_GC:105238475:0,4,0,1
chr12	105238478	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:105238475_AG_GC:105238475:0,4,0,1
chr12	105260159	.	TACACAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=135,0;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AC;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,0:1,0:3,0,0,1
chr12	105431813	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=113,120;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr12	105431835	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=50,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,3:1,6:2,2,5,4
chr12	105432049	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=173,196;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:105432049_CA_GG:105432049:0,2,0,1
chr12	105432055	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=183,196;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:2,0:1,1:0|1:105432049_CA_GG:105432049:0,3,0,1
chr12	105432057	.	AACACAC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=AC;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.736:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	105433463	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,6:2,7:3,2,10,3
chr12	105433607	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:1,6,1,10
chr12	105434533	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr12	105445798	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=214,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr12	105446552	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=109,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,7:3,1:6,1,7,1
chr12	105446719	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,9:2,10:1,3,5,14
chr12	105464316	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.289:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr12	105464326	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,7:9,0:10,2,7,0
chr12	105504971	.	A	ACGCTGGG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:8,2:3,0:5,6,1,1
chr12	105509527	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:0|1:105509527_A_C:105509527:1,8,1,1
chr12	105509529	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:105509527_A_C:105509527:1,8,1,1
chr12	105509533	.	C	CCCTTAGTCACAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:4,0:0|1:105509527_A_C:105509527:0,8,1,1
chr12	105519849	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,0:13,4:12,10,4,0
chr12	105540322	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.257:13:6,2:3,1:2,8,0,3
chr12	105543326	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,2:3,6:4,0,8,0
chr12	105550965	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:2,2:3,0,1,1
chr12	105556485	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:0,1,7,0
chr12	105558046	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,193;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,0:2,4:3,4,0,4
chr12	105582245	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,6:3,3:0,8,1,8
chr12	105582316	.	T	TCACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	105583877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=183,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,2:1,5:0,3,3,4
chr12	105591448	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	105601047	.	C	CATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=280,113;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105601047_C_CATTG:105601047:0,1,0,1
chr12	105601049	.	T	TTAAAGAATCAGAGTCAACACTTGGGGCAAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=280,113;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105601047_C_CATTG:105601047:0,1,0,1
chr12	105601052	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=280,113;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105601047_C_CATTG:105601047:0,1,0,1
chr12	105601906	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.218:41:8,7:23,0:17,15,8,1
chr12	105602071	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:105602071_C_CCA:105602071:0,1,0,1
chr12	105602076	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105602071_C_CCA:105602071:0,1,0,1
chr12	105611333	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	105611577	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105611577_G_T:105611577:0,2,0,1
chr12	105611580	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105611577_G_T:105611577:0,2,0,1
chr12	105611588	.	A	ATTGTTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105611577_G_T:105611577:0,2,0,1
chr12	105629865	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	105742241	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=96,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr12	106461228	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=139,44;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:106461228_T_A:106461228:3,15,1,1
chr12	106461234	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:6,2:0|1:106461228_T_A:106461228:5,14,1,1
chr12	106461236	.	TTGGGAGGA	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:6,2:0|1:106461228_T_A:106461228:6,15,1,1
chr12	106461247	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=141,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:106461228_T_A:106461228:5,13,1,1
chr12	106464785	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	106480450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr12	106500160	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=154,129;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.649:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr12	106633761	.	G	GATT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=214,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:5,0:10,2:0|1:106633761_G_GATT:106633761:7,8,0,2
chr12	106633763	.	T	TGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=214,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:5,0:10,2:0|1:106633761_G_GATT:106633761:7,8,0,2
chr12	106708278	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=120.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,23:0,19:0,0,30,13
chr12	106717224	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr12	106717490	.	TTTAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAAA;STR;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.885:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	106730031	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.231:15:8,1:3,2:0|1:106730031_AG_A:106730031:4,8,0,3
chr12	106730034	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:8,1:4,2:0|1:106730031_AG_A:106730031:4,8,0,3
chr12	106763013	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr12	106763268	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr12	106763477	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr12	106853198	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	106895255	.	C	CA,CACGCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34,32;MFRL=256,138,146;MMQ=60,60,60;MPOS=18,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.13,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,1,1:1,1,0:0,1,0,3
chr12	106895258	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:106895258_G_GAA:106895258:0,3,0,1
chr12	106895260	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:106895258_G_GAA:106895258:0,3,0,1
chr12	106898070	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,135;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr12	107078562	.	A	AAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=288,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,2,4
chr12	107080617	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:107080617_CTTT_C:107080617:0,0,1,1
chr12	107080638	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:107080617_CTTT_C:107080617:0,0,1,1
chr12	107083031	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,16,10
chr12	107126931	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:2,4,2,0
chr12	107144459	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr12	107177829	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=79,52;MMQ=60,38;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:21,0:18,3:0|1:107177829_C_T:107177829:18,22,2,1
chr12	107177845	.	GAA	G	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=79,52;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:23,0:18,3:0|1:107177829_C_T:107177829:14,30,2,1
chr12	107177851	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=82,52;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:25,0:16,3:0|1:107177829_C_T:107177829:14,27,2,1
chr12	107177853	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=82,52;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:23,0:16,3:0|1:107177829_C_T:107177829:14,27,2,1
chr12	107177865	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=21,27;MFRL=76,52;MMQ=60,38;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:24,0:13,1:0|1:107177829_C_T:107177829:10,27,2,1
chr12	107177866	.	T	TGTG	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=76,52;MMQ=60,38;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:23,0:12,1:0|1:107177829_C_T:107177829:10,27,2,1
chr12	107177929	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,0:2,8:0,9,0,8
chr12	107209002	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=80,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,2:9,1:8,8,2,1
chr12	107236494	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=124,51;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:9,0:11,5:13,7,0,5
chr12	107360876	.	GT	G,GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30,31;MFRL=150,150,117;MMQ=60,60,60;MPOS=20,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.32,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.246,0.185:13:5,2,1:2,1,1:3,5,2,3
chr12	107364873	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	107391546	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=305,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:107391546_TC_CT:107391546:1,0,0,1
chr12	107391549	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=305,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:107391546_TC_CT:107391546:1,0,0,1
chr12	107391553	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107391546_TC_CT:107391546:0,0,0,1
chr12	107393854	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.204:42:14,0:20,8:18,16,8,0
chr12	107395106	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,15:0,16:0,0,16,15
chr12	107398862	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=73,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.459:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr12	107416010	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:12,0:7,5:3,16,0,5
chr12	107713939	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,217;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,0:1,2:0,8,0,2
chr12	108003911	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	108006465	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=232,1849;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr12	108029186	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=99,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr12	108029229	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:108029229_A_G:108029229:0,4,0,1
chr12	108029231	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:108029229_A_G:108029229:0,4,0,1
chr12	108029232	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,34;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:108029229_A_G:108029229:0,4,0,1
chr12	108104329	.	TAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,152;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.790:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	108104384	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	108133389	.	A	AGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	108150609	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,42;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,0:9,2:6,8,1,1
chr12	108600237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:2,3:0,2:0,3,0,5
chr12	108634114	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:2,4:5,0:6,1,4,0
chr12	108686588	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,0:7,3:8,4,0,3
chr12	108912308	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,2:6,9,1,2
chr12	108912453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:10,2,1,1
chr12	108913352	.	A	AAAAAGAGAGAAAGAAATCACCTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	108918319	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=73,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr12	108918330	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr12	108919390	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,6,6
chr12	108931347	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:5,9,1,2
chr12	108932053	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	108932916	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	108938230	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:8,0:13,4:14,7,1,3
chr12	108943028	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr12	108954823	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,10:0,0,17,12
chr12	108954863	.	TCAGCCTTGGGCC	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:10,0:8,2:4,22,1,1
chr12	108960906	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	109017405	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=91,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,7:0.101:57:20,0:22,1:23,27,5,2
chr12	109017408	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=86,76;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.071:60:17,1:26,1:26,29,3,2
chr12	109051247	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:109051247_A_G:109051247:0,4,0,1
chr12	109051251	.	G	GATCTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:109051247_A_G:109051247:0,4,0,1
chr12	109095137	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr12	109185913	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:13,4:6,0:9,10,3,1
chr12	109186599	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=87,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:15,0:10,6:16,11,1,5
chr12	109194580	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=102,129;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.250:42:20,0:12,10:17,15,0,10
chr12	109194765	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=145,197;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,0:4,8:0,6,0,8
chr12	109217007	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:4,4:7,5:7,5,6,3
chr12	109221013	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=67,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,1:9,6:8,7,4,3
chr12	109278747	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:8,1,4,1
chr12	109306390	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:10,4,2,1
chr12	109306400	.	A	ATTACAGGCATGAG	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:12,3,1,1
chr12	109306525	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=119,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:0|1:109306525_A_T:109306525:6,9,1,1
chr12	109306531	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=120,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:109306525_A_T:109306525:5,9,1,1
chr12	109306532	.	C	CCGGTCGGGGT	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:109306525_A_T:109306525:4,9,1,1
chr12	109306533	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:109306525_A_T:109306525:4,9,1,1
chr12	109311757	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr12	109311968	.	T	TTGATCTGTTTCCTCCCCGAAACTCATTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	109331162	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=206,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.860:19:2,11:0,6:0,2,0,17
chr12	109490426	.	C	CCGGCGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CGG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	109511144	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	109511256	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr12	109520715	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,0:5,2:8,7,2,0
chr12	109520910	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=192,45;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:109520910_C_T:109520910:0,8,0,2
chr12	109520916	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=192,45;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:109520910_C_T:109520910:0,8,0,2
chr12	109530538	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=102,79;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:10,0:21,7:14,17,1,6
chr12	109535634	.	C	CTAGCTTGCGGAGTTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr12	109540613	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:6,2:6,2:12,1,4,0
chr12	109605898	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr12	109609528	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr12	109614010	.	GAGGGA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGGA;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,2:10,0:5,11,1,1
chr12	109623516	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,1:7,7:3,10,4,4
chr12	109634772	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=200,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr12	109635031	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr12	109637188	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=233,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,3,1
chr12	109660369	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,2:10,2:7,7,2,2
chr12	109670468	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr12	109675196	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:3,10,0,2
chr12	109675211	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:7,0:2,3:1,8,0,4
chr12	109683575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,7,4
chr12	109685545	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,13:0,0,7,14
chr12	109691991	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr12	109696838	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,10,9
chr12	109702212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,276;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:1,6,0,3
chr12	109704177	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr12	109717697	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,5:0,0,10,9
chr12	109717807	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.436:3:2,1:0,0:0|1:109717807_G_A:109717807:0,2,0,1
chr12	109717812	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.436:3:2,1:0,0:0|1:109717807_G_A:109717807:0,2,0,1
chr12	109719638	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109719638_A_AC:109719638:0,0,0,1
chr12	109719642	.	A	AGCCACTGATGACCCTGTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109719638_A_AC:109719638:0,0,0,1
chr12	109723049	.	CGT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=GT;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.508:4:0,0:1,2:0|1:109723049_CGT_C:109723049:2,0,2,0
chr12	109723077	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:5,0:8,3:0|1:109723049_CGT_C:109723049:12,2,3,0
chr12	109723079	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:6,0:6,3:0|1:109723049_CGT_C:109723049:12,2,3,0
chr12	109724565	.	GGGGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGCA;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.515:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	109725601	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	109831351	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	109835686	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	109838955	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,1:9,1:7,8,2,0
chr12	109839059	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:6,6,1,2
chr12	109844613	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=83,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:6,4:4,7,3,1
chr12	109844702	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=25064000,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr12	109845778	.	C	CATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr12	109848610	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:109848610_C_CA:109848610:0,2,1,1
chr12	109848612	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:109848610_C_CA:109848610:0,2,1,1
chr12	109878668	.	GG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109878668_GG_AT:109878668:0,1,0,1
chr12	109878672	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:109878668_GG_AT:109878668:0,2,0,1
chr12	109924409	.	GC	AA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=133,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:0|1:109924409_GC_AA:109924409:0,6,4,0
chr12	109924415	.	CC	AA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=136,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:109924409_GC_AA:109924409:0,7,2,0
chr12	109927687	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:4,2,3,0
chr12	109948150	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:8,3,2,0
chr12	110006724	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.446:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr12	110019311	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=74,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,2:8,1:4,7,2,1
chr12	110024441	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	110205829	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:110205829_C_CT:110205829:3,1,1,1
chr12	110205831	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:110205829_C_CT:110205829:3,1,1,1
chr12	110205833	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:110205829_C_CT:110205829:3,1,1,1
chr12	110205834	.	G	GTAATC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:110205829_C_CT:110205829:3,1,1,1
chr12	110205837	.	A	AGCACTT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:0,0:4,2:0|1:110205829_C_CT:110205829:3,1,1,1
chr12	110207172	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	110230121	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:1,1,5,10
chr12	110231717	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:12,2,2,0
chr12	110293396	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,11;MFRL=83,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:4,0:7,0:9,4,0,3
chr12	110296663	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr12	110340946	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,2:17,1:8,21,2,1
chr12	110341793	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=98,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:12,5:12,0:10,14,4,1
chr12	110403332	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:15,0:9,4:13,11,1,3
chr12	110421143	.	CCCAGAG	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:3,1:6,0:0|1:110421143_CCCAGAG_C:110421143:9,6,1,2
chr12	110421152	.	A	ACT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=22,21;MFRL=116,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:0|1:110421143_CCCAGAG_C:110421143:9,7,1,2
chr12	110421153	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=22,22;MFRL=116,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:0|1:110421143_CCCAGAG_C:110421143:9,7,1,2
chr12	110421156	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,2:9,0:0|1:110421143_CCCAGAG_C:110421143:9,8,1,2
chr12	110421158	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:0|1:110421143_CCCAGAG_C:110421143:8,8,1,2
chr12	110456171	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:16,4:6,0:11,11,0,4
chr12	110475449	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=333,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110475449_C_G:110475449:0,1,0,1
chr12	110475451	.	C	CGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=333,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110475449_C_G:110475449:0,1,0,1
chr12	110475452	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=333,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110475449_C_G:110475449:0,1,0,1
chr12	110565423	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=224,314;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr12	110566765	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:9,20,2,1
chr12	110570264	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31,28;MFRL=158,171,172;MMQ=60,50,40;MPOS=18,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.51,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,3:0.265,0.263:12:4,2,2:2,1,1:6,0,6,0
chr12	110581327	.	GATCTTCTTGAACTTGAATCTAAAGTAAGTGAGAATCATCTTTTTATAGCTCTCAATTTT	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,49;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.088:45:12,9:14,1:15,20,2,8
chr12	110600926	.	ATTAGTGTGTTTGACTTTC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	110765556	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:7,7,1,1
chr12	110781238	.	CTGTGAGTACAATTTTTTTATATTACTGATTTTTAAACAAAATGTT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,0:11,2:9,19,1,1
chr12	110812101	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=109,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.225:20:6,4:10,0:0|1:110812101_G_GT:110812101:5,11,2,2
chr12	110812102	.	C	CTCTCT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=109,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:6,3:9,0:0|1:110812101_G_GT:110812101:5,11,2,2
chr12	110812105	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=92,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:9,0:0|1:110812101_G_GT:110812101:6,11,1,1
chr12	110812107	.	C	CACTTTCTTT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,16;MFRL=92,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:7,0:0|1:110812101_G_GT:110812101:6,11,1,1
chr12	110812110	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=92,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:10,0:0|1:110812101_G_GT:110812101:6,9,1,1
chr12	110815331	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,113;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:17,10,0,3
chr12	110819761	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,3:1,0,2,2
chr12	110819763	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,0:1,3:1,0,2,2
chr12	110878241	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,2:12,0:6,17,1,1
chr12	110905869	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,16:0,0,24,2
chr12	110910780	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=69,121;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=29,27;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.279:17:0,2:2,3:0|1:110910780_CAA_C:110910780:1,11,5,0
chr12	110910812	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=90,121;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,5:0.075:59:15,0:37,1:0|1:110910780_CAA_C:110910780:10,44,5,0
chr12	110910817	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=94,121;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.060:64:19,0:41,0:0|1:110910780_CAA_C:110910780:11,50,3,0
chr12	110927975	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:0|1:110927975_A_G:110927975:7,5,1,1
chr12	110927982	.	G	GGATGGCTCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:110927975_A_G:110927975:6,5,1,1
chr12	110939894	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr12	110969275	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=205,177;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:110969275_A_G:110969275:2,0,1,0
chr12	110969277	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=205,177;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:110969275_A_G:110969275:2,0,1,0
chr12	111087918	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:3,1:10,1:12,2,2,0
chr12	111159966	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:13,0:6,2:0|1:111159966_C_T:111159966:10,9,1,1
chr12	111159989	.	T	TCCGACCACTTCTGCCCTTTAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:8,0:16,2:0|1:111159966_C_T:111159966:11,17,1,1
chr12	111160513	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:1,1:1,1:0,5,0,2
chr12	111168337	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:5,1:2,4:5,2,3,2
chr12	111290721	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=78,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:11,11:5,4:6,10,12,3
chr12	111291444	.	G	GAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	111317756	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,0:4,3:3,4,2,1
chr12	111351033	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=88,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:3,2:5,7,2,0
chr12	111701486	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,7:1,3:2,3,8,3
chr12	111701732	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:1,1:2,0:0|1:111701732_G_GAT:111701732:0,4,0,1
chr12	111701735	.	GA	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:111701732_G_GAT:111701732:0,4,0,1
chr12	111733203	.	CC	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:8,2:6,8,1,1
chr12	111733274	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=117,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr12	111748004	.	C	CACGGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.430:7:1,0:3,3:0|1:111748004_C_CACGGGCGG:111748004:1,3,2,1
chr12	111748008	.	G	GAGGGTGAGTCGAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0|1:111748004_C_CACGGGCGG:111748004:1,3,2,1
chr12	111748273	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:0|1:111748273_A_C:111748273:11,11,1,1
chr12	111748279	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:111748273_A_C:111748273:11,11,1,1
chr12	111760251	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr12	111760280	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	111800524	.	C	CGTTATCACAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:0|1:111800524_C_CGTTATCACAT:111800524:2,1,1,1
chr12	111800526	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:111800524_C_CGTTATCACAT:111800524:2,1,1,1
chr12	111800529	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:111800524_C_CGTTATCACAT:111800524:2,1,0,1
chr12	111894060	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:3,17,1,2
chr12	111923633	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:17,0:5,2:7,15,1,1
chr12	111956173	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:3,7,2,0
chr12	112036753	.	GGCT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCT;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	112036797	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,147;MMQ=60,57;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr12	112037000	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	112103559	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,224;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:13,5:7,0:11,10,5,0
chr12	112119530	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,2:14,0:0|1:112119530_C_T:112119530:12,14,1,1
chr12	112119538	.	C	CACT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.091:30:11,2:17,0:0|1:112119530_C_T:112119530:13,15,1,1
chr12	112130774	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112130774_G_C:112130774:0,3,0,1
chr12	112130781	.	A	AAGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:112130774_G_C:112130774:0,2,0,1
chr12	112130782	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:112130774_G_C:112130774:1,2,0,1
chr12	112130785	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:112130774_G_C:112130774:1,2,0,1
chr12	112167783	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:112167783_C_T:112167783:0,3,1,1
chr12	112167801	.	G	GAGGAGCAAAGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:112167783_C_T:112167783:0,2,1,1
chr12	112171882	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:7,9,1,1
chr12	112171892	.	G	GGTGATGATTTGGACTTGTGATAGAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:6,8,1,1
chr12	112185189	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=90,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:0|1:112185189_G_T:112185189:8,11,1,1
chr12	112185200	.	T	TCTC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=90,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,0:14,2:0|1:112185189_G_T:112185189:7,12,1,1
chr12	112185201	.	A	ACTCACCCCAC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=83,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:0|1:112185189_G_T:112185189:6,12,1,1
chr12	112185203	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=75,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:112185189_G_T:112185189:6,11,1,1
chr12	112186139	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=102,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:15,1:5,2:11,9,1,2
chr12	112186360	.	C	CTTTTGAAATAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	112303216	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112303216_C_G:112303216:0,1,0,1
chr12	112303218	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112303216_C_G:112303216:0,1,0,1
chr12	112306512	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.236:26:6,0:6,5:13,7,3,3
chr12	112481429	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:112481429_C_T:112481429:4,6,1,1
chr12	112481438	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:112481429_C_T:112481429:4,7,1,1
chr12	112481732	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=214,150;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr12	112481753	.	AC	TG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=178,189;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:112481753_AC_TG:112481753:0,3,0,1
chr12	112481758	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=168,189;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:112481753_AC_TG:112481753:0,4,0,1
chr12	112481761	.	TTG	TCATG,T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,29,28;MFRL=178,123,189;MMQ=40,50,60;MPOS=7,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr12	112481762	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=178,123;MMQ=40,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:0|1:112481762_TGA_T:112481762:0,3,0,1
chr12	112481764	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=178,174;MMQ=30,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0|1:112481764_A_C:112481764:0,1,0,2
chr12	112481770	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=178,123;MMQ=40,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:112481762_TGA_T:112481762:0,3,0,1
chr12	112481771	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=151,174;MMQ=40,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0|1:112481764_A_C:112481764:0,2,0,2
chr12	112491521	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr12	112498035	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,115;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:9,4,3,0
chr12	112568308	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.121:23:13,0:7,2:0|1:112568308_T_A:112568308:10,11,1,1
chr12	112568314	.	G	GAATAA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:7,2:0|1:112568308_T_A:112568308:9,12,1,1
chr12	112568315	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:6,2:0|1:112568308_T_A:112568308:7,12,1,1
chr12	112572584	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=113,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:7,7,0,2
chr12	112572596	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:7,5,0,2
chr12	112572850	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=105,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:19,4:10,0:16,13,4,0
chr12	112587640	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:6,1:12,0:0|1:112587640_C_A:112587640:10,8,1,1
chr12	112587649	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:0|1:112587640_C_A:112587640:8,11,1,1
chr12	112589933	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:112589933_A_AG:112589933:0,4,0,1
chr12	112589934	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:112589933_A_AG:112589933:0,4,0,1
chr12	112600867	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,0:7,1,1,1
chr12	112600949	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=91,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:12,14,0,2
chr12	112610714	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	112642517	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112642517_GG_AA:112642517:0,0,0,1
chr12	112642521	.	TC	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112642517_GG_AA:112642517:0,0,0,1
chr12	112642526	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112642517_GG_AA:112642517:0,0,0,1
chr12	112654974	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:20,1:21,2:32,9,0,3
chr12	112666130	.	T	TAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	112673084	.	A	AGGTATTTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr12	112685781	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	112708290	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:112708290_A_G:112708290:0,4,0,1
chr12	112708298	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=228,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:112708290_A_G:112708290:0,2,0,1
chr12	112743879	.	AAATGTCCATGAAGACAG	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=92,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,0:9,2:15,14,1,1
chr12	112743891	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=82,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,1:10,1:12,11,0,2
chr12	112744087	.	G	GCTTTTCCCCCCGTACACATGTACAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112744087_G_GCTTTTCCCCCCGTACACATGTACAT:112744087:0,3,0,1
chr12	112744090	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112744087_G_GCTTTTCCCCCCGTACACATGTACAT:112744087:0,3,0,1
chr12	112888265	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=125,227;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,4:11,0:14,6,0,4
chr12	112888295	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=120,227;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:5,4:9,0:6,8,0,4
chr12	112893867	.	G	GAGTCCGT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=113,193;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:20,2:13,0:19,15,0,2
chr12	112893920	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:2,9,0,2
chr12	112915442	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:112915442_C_A:112915442:9,6,1,1
chr12	112915447	.	T	TGGTTTTGTTGCAATTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:112915442_C_A:112915442:10,6,1,1
chr12	112915891	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112915891_G_GTC:112915891:0,1,0,1
chr12	112915892	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112915891_G_GTC:112915891:0,1,0,1
chr12	112927062	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=193,279;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:112927062_G_A:112927062:0,3,0,1
chr12	112927068	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=190,279;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:112927062_G_A:112927062:0,2,0,1
chr12	113266157	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=86,28;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:6,2:5,6,1,1
chr12	113319463	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113319463_C_T:113319463:0,0,1,0
chr12	113319471	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:113319463_C_T:113319463:0,0,2,0
chr12	113319758	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:113319758_A_C:113319758:0,2,0,1
chr12	113319764	.	A	ACAACAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113319758_A_C:113319758:0,1,0,1
chr12	113332528	.	AGCCACATAGCCATTAAATATGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	113345022	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=99,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:21,0:23,3:29,15,0,3
chr12	113345036	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=111,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:14,0:19,4:21,13,2,2
chr12	113345088	.	TGA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=107,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:0,1:4,1:0,7,0,2
chr12	113376320	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr12	113376331	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,8,4
chr12	113376543	.	C	CCAAAGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAAAGGG;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	113384720	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:17,0:6,2:10,13,1,1
chr12	113384733	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:5,9,1,2
chr12	113385918	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chr12	113386624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr12	113386950	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0,0,5,13
chr12	113399141	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=61021276,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	113402104	.	C	CTCAGCCTCT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=81,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,2:18,0:10,12,0,2
chr12	113402314	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	113403497	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	113405181	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	113405454	.	CAC	GCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	113416653	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr12	113425154	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,10,11
chr12	113435293	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr12	113435450	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,11,12
chr12	113440921	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr12	113444117	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	113444418	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr12	113530899	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr12	113531295	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113531295_T_C:113531295:0,0,1,0
chr12	113531305	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:113531295_T_C:113531295:0,0,2,0
chr12	113531311	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=43,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:2,1,1,1
chr12	113531518	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=146,123;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,0:13,2:0|1:113531518_C_T:113531518:6,11,0,2
chr12	113531523	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=117,123;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:11,2:0|1:113531518_C_T:113531518:5,10,0,2
chr12	113533050	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,7,14
chr12	113537633	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	113538355	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,147;MMQ=44,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr12	113539725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:2,8,0,3
chr12	113539822	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr12	113541940	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr12	113542136	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:113542136_TGG_T:113542136:0,2,0,1
chr12	113542143	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,24;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:113542136_TGG_T:113542136:0,2,0,1
chr12	113544874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr12	113553408	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,4:0,0,8,1
chr12	113565637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,3:1,1:5,1,0,4
chr12	113565932	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:3,0:16,2:13,7,1,1
chr12	113587776	.	C	CATGGTAGGCAGTGTAAGGTTACCAACAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=162,31;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.284:10:3,1:3,0:4,4,2,0
chr12	113592980	.	G	C,GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,17,34;MFRL=152,113,197;MMQ=60,60,60;MPOS=6,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.02,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.310,0.254:9:1,1,2:3,0,0:4,0,3,2
chr12	113595487	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:3,6,1,1
chr12	113603424	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,2,0
chr12	113607763	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr12	113612767	.	G	GACAAGAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:3,4,1,1
chr12	113617169	.	G	GACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=74,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:113617169_G_GACA:113617169:1,0,0,1
chr12	113617171	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=74,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113617169_G_GACA:113617169:1,0,0,1
chr12	113629710	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr12	113645803	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,57;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:11,0:5,5:10,6,0,5
chr12	113645829	.	T	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=107,57;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:19,0:8,5:15,12,0,5
chr12	113703960	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:7,6:8,0:9,7,6,0
chr12	113710933	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:5,9:6,0:9,2,9,0
chr12	113711538	.	G	GGCTGTTGGCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=234,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	113723632	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,4:0,6:2,1,10,1
chr12	113724836	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=166,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:4,3,2,0
chr12	113729721	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:6,1:14,5:9,12,3,3
chr12	113754404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,2:11,1:6,10,1,2
chr12	113759217	.	A	ACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113759217_A_ACG:113759217:0,4,0,1
chr12	113759218	.	TCTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113759217_A_ACG:113759217:0,4,0,1
chr12	113810423	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,21;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr12	113810427	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:1,0:2,0:0|1:113810427_T_A:113810427:4,0,1,0
chr12	113810434	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:113810427_T_A:113810427:4,0,1,0
chr12	113810438	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.224:6:1,0:2,1:0|1:113810427_T_A:113810427:4,1,1,0
chr12	113810444	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:0|1:113810427_T_A:113810427:4,1,1,0
chr12	113812820	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=82,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:4,0:0|1:113812820_G_T:113812820:6,7,1,1
chr12	113812841	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=83,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:113812820_G_T:113812820:5,7,1,1
chr12	113812843	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=83,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:113812820_G_T:113812820:5,7,1,1
chr12	113823157	.	T	TAGCTCTCACCATCGCTCTTCTACTATGAACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	113836454	.	G	GAGAAAGGAAGGAACCATCACACATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=106,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,0:1,0:1,0,0,1
chr12	113865953	.	TGCCAGGAG	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=100,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.133:24:14,0:5,3:0|1:113865953_TGCCAGGAG_T:113865953:16,4,2,2
chr12	113865963	.	TGAGGGTGTGTGGGAAGGAGGGGAGAAGTGAGGTTGTGCAGGAGGGAGGGAAGAGTGAGGGGTGTGGGCTGGGGACGGGTTCGGG	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.110:27:9,0:6,2:0|1:113865953_TGCCAGGAG_T:113865953:15,9,1,2
chr12	113866037	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,24;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:113865953_TGCCAGGAG_T:113865953:0,1,0,1
chr12	113866038	.	C	CATCTCCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:113865953_TGCCAGGAG_T:113865953:0,1,0,1
chr12	113867035	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:7,7,0,2
chr12	114282496	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,4:0,4:2,1,2,6
chr12	114282678	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	114296745	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:114296745_C_T:114296745:0,0,0,4
chr12	114296753	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=133,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:114296745_C_T:114296745:0,2,0,1
chr12	114296759	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:114296745_C_T:114296745:0,3,0,1
chr12	114296761	.	AA	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:114296745_C_T:114296745:0,3,0,1
chr12	114362483	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,11,10
chr12	114362621	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	114362632	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	114378061	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	114383559	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	114388025	.	G	GTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	114393028	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr12	114395571	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,9:0,0,18,9
chr12	114793727	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:3,0:4,6,1,1
chr12	114832510	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr12	115114036	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	116404062	.	ATC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:1,6,1,1
chr12	116412921	.	AT	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,8:0,0,14,0
chr12	116420476	.	G	GTAACAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	116424049	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=63,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:1,1,7,1
chr12	116424323	.	GCT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr12	116425094	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr12	116443854	.	G	GATGCTTCTCAATGTAAAATTTTATTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr12	116445207	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.252:22:9,5:6,0:14,3,5,0
chr12	116445450	.	C	CAAA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=109,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=20,23;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.613:7:0,0:2,1:1,2,0,4
chr12	116445499	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:116445499_A_T:116445499:0,14,0,2
chr12	116445508	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:116445499_A_T:116445499:0,13,0,2
chr12	116445513	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:116445499_A_T:116445499:0,12,0,2
chr12	116445516	.	AAAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:116445499_A_T:116445499:0,12,0,2
chr12	116445525	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:116445499_A_T:116445499:0,8,0,2
chr12	116446259	.	ACCC	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=80,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:116446259_ACCC_A:116446259:8,11,1,1
chr12	116446263	.	T	TTCAG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=80,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:116446259_ACCC_A:116446259:8,11,1,1
chr12	116446836	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,2:7,0:10,11,1,1
chr12	116457017	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=102,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:12,0:14,10,4,0
chr12	116457638	.	CTCTTTCGATTCT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:11,0:19,2:22,18,1,1
chr12	116460456	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=113,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:116460456_G_T:116460456:0,2,0,1
chr12	116460477	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:116460456_G_T:116460456:0,2,0,1
chr12	116549320	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:5,1:4,1:6,7,2,1
chr12	116586414	.	CTATA	C,CTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34,20;MFRL=141,188,142;MMQ=60,60,60;MPOS=21,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TA;STR;TLOD=6.38,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.248,0.299:11:3,2,2:2,1,1:0,5,1,5
chr12	117013730	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr12	117014131	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=131,115;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=85.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:1,21:0,17:1,0,21,17
chr12	117014174	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,127;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=63.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.938:29:1,11:0,17:0,1,10,18
chr12	117160976	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.637:25:4,7:4,9:4,5,5,11
chr12	117274132	.	A	ATTAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	117290601	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	117402755	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	117423264	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr12	117465238	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=109,122;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:2,8:12,0:6,8,8,0
chr12	117603487	.	A	AGTGAATAAATGGAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	117611950	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,159;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,5:12,0:14,4,5,0
chr12	117612076	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=121,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:6,12,0,3
chr12	117627168	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:19,1:4,2:4,19,0,3
chr12	117657806	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:117657806_C_T:117657806:4,0,1,0
chr12	117657812	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:117657806_C_T:117657806:3,0,1,0
chr12	117657926	.	C	CTGTTCCAGGGCACCATGTCCTCACG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=100,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:4,5,1,1
chr12	117660467	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,1:4,0,5,1
chr12	117660477	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=192,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,0:1,0:0|1:117660477_A_T:117660477:7,0,0,2
chr12	117660485	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=150,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0|1:117660477_A_T:117660477:11,0,0,2
chr12	117665264	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:4,4,2,1
chr12	117669950	.	AGGCAGGT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:117669950_AGGCAGGT_A:117669950:1,2,0,1
chr12	117669963	.	GTGGGTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:117669950_AGGCAGGT_A:117669950:1,2,0,1
chr12	117680525	.	ACAACAGTCTTCCTGAGAAGGGGTTGAATGTTCCATTAAAAACTCCCCAGGTGGGGCAACGTGGCTCACGCCCATAATCC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=145,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.193:15:6,2:2,1:1,11,2,1
chr12	117681141	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,3:16,0:8,15,3,0
chr12	117685138	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:1,9:6,8:4,3,7,10
chr12	117685270	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=47,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,2:2,8:0,2,3,7
chr12	117696164	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=79,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,6:2,7:1,1,8,5
chr12	117701714	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,2:9,2:7,6,2,2
chr12	117703324	.	G	GGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:117703324_G_GGCT:117703324:0,3,1,1
chr12	117703326	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:117703324_G_GGCT:117703324:0,3,1,1
chr12	117715724	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=64,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,4:0,1:1,0,4,1
chr12	117718473	.	G	GGGTAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr12	117718686	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=83,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,1:10,2:9,6,1,2
chr12	117914371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr12	117922242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:117922242_G_A:117922242:7,16,1,1
chr12	117922247	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:13,2:11,0:0|1:117922242_G_A:117922242:9,16,1,1
chr12	117963087	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=217,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:117963087_T_TA:117963087:0,3,0,1
chr12	117963089	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=217,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117963087_T_TA:117963087:0,3,0,1
chr12	117963094	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=125,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117963087_T_TA:117963087:0,1,0,1
chr12	117963095	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	118105524	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr12	118457453	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,218;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,5:9,0:10,9,5,0
chr12	118458852	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr12	118464688	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,6:0,3:3,1,6,3
chr12	118467457	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	118481053	.	GGAAGGCCACGGGCT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:2,8,1,1
chr12	118506327	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=86,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TCC;STR;TLOD=60.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.827:25:2,6:1,15:2,2,5,16
chr12	118508796	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:2,4:6,15:4,4,11,8
chr12	118509086	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	118509148	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,22;MFRL=20,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:3,3:0,1:0|1:118509148_C_T:118509148:1,3,4,2
chr12	118509157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=20,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.617:11:3,3:1,4:0|1:118509148_C_T:118509148:1,3,5,2
chr12	118509191	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=80,88;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:2,3:5,7:4,3,7,3
chr12	118511412	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	118519846	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:118519846_C_A:118519846:3,0,1,0
chr12	118519849	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:118519846_C_A:118519846:3,0,1,0
chr12	118519856	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,16;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:118519846_C_A:118519846:3,0,1,0
chr12	118519977	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:8,4:10,0:8,10,1,3
chr12	118582434	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,60;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,1:6,1:10,10,0,2
chr12	118582576	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:9,1:4,2:0|1:118582576_C_T:118582576:4,9,1,2
chr12	118582581	.	A	AACATGAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:8,1:5,2:0|1:118582576_C_T:118582576:4,10,1,2
chr12	118588904	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:4,12,3,0
chr12	118590131	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=73,49;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:16,0:7,2:0|1:118590131_G_T:118590131:16,8,1,1
chr12	118590152	.	T	TTCTCCTATCAATCATCAAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=113,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:118590131_G_T:118590131:9,11,1,1
chr12	118598168	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:118598168_G_GA:118598168:0,3,0,1
chr12	118598170	.	A	AAGGTGGTACCTCATTGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:118598168_G_GA:118598168:0,3,0,1
chr12	118599500	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr12	118610285	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=100,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:9,9,2,0
chr12	118673483	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,2:0,3:0,1,3,6
chr12	118675984	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:1,1:3,2:1,9,0,3
chr12	118681158	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr12	118814513	.	TGCTGGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,61;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:118814513_TGCTGGCC_T:118814513:0,0,1,1
chr12	118814523	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,61;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:118814513_TGCTGGCC_T:118814513:0,0,1,1
chr12	118814526	.	C	CTGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,61;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:118814513_TGCTGGCC_T:118814513:0,0,1,1
chr12	118814530	.	GCCCA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,61;MMQ=60,54;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118814513_TGCTGGCC_T:118814513:0,0,0,1
chr12	119563084	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr12	119563128	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=65,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:3,6:1,5:3,1,7,4
chr12	119563269	.	CA	GC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:0|1:119563269_CA_GC:119563269:4,12,0,2
chr12	119563273	.	C	CCCCGA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:119563269_CA_GC:119563269:4,11,0,2
chr12	119563288	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr12	119563325	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:1,1,0,7
chr12	119568421	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	119568670	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	119568691	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	119568721	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	119588962	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr12	119594354	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:8,11,0,2
chr12	119617576	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119617576_CG_C:119617576:0,1,0,1
chr12	119617580	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119617576_CG_C:119617576:0,1,0,1
chr12	119617584	.	CAGTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=69,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:119617576_CG_C:119617576:1,1,0,1
chr12	119937983	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr12	119958068	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	119960852	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=85,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr12	119960878	.	G	GTGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:119960878_G_GTGAA:119960878:0,2,0,1
chr12	119960882	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=91,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119960878_G_GTGAA:119960878:0,1,0,1
chr12	119961663	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=23,20;MFRL=174,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:119961663_A_C:119961663:0,4,1,1
chr12	119961666	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=31,20;MFRL=209,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:0,0:0|1:119961663_A_C:119961663:0,5,1,1
chr12	119961668	.	G	GAAAGGTGA	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=30,20;MFRL=214,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:119961663_A_C:119961663:0,4,1,1
chr12	119961677	.	A	AATCT	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=23,22;MFRL=163,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr12	119961685	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961688	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961692	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961695	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=24,23;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961696	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961703	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	119961708	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=23,27;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119961685_GC_G:119961685:0,1,0,1
chr12	120067727	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	120078577	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr12	120112099	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.322:26:13,3:4,5:10,8,4,4
chr12	120114507	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:3,2:2,6,0,3
chr12	120126074	.	A	AAGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:6,2:8,2:5,9,0,4
chr12	120135717	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=198,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:2,4,3,1
chr12	120152156	.	TAAAAAATCATTAGAGTACTGCAAATGATCCCATCAGGAAAGTGAAAAGACAACCCACAGAAAGGG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:4,0:8,2:2,14,1,1
chr12	120152239	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=48,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr12	120158203	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr12	120171995	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr12	120172129	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:120172129_G_C:120172129:1,18,1,1
chr12	120172135	.	TG	GC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:5,2:0|1:120172129_G_C:120172129:1,14,1,1
chr12	120172138	.	A	ACAAAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:120172129_G_C:120172129:1,12,1,1
chr12	120189879	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=62,79;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,20:0.782:25:3,11:2,8:0|1:120189879_A_G:120189879:4,1,11,9
chr12	120189888	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,17:0.819:20:1,9:2,8:0|1:120189879_A_G:120189879:3,0,10,7
chr12	120190083	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:120190083_T_A:120190083:1,0,0,1
chr12	120190101	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120190083_T_A:120190083:0,0,0,1
chr12	120195082	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr12	120195354	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=92,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:4,1:6,6:3,8,3,4
chr12	120196295	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr12	120208672	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,0:17,2:0|1:120208672_T_G:120208672:16,21,1,1
chr12	120208678	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:17,0:16,2:0|1:120208672_T_G:120208672:16,19,1,1
chr12	120208770	.	C	CTACCAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr12	120220282	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,6:1,3:1,2,6,3
chr12	120220536	.	C	CCAGGCTGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr12	120221636	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr12	120270528	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,9:3,6:4,0,12,3
chr12	120499446	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.586:15:4,6:2,2:6,0,7,2
chr12	120502726	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr12	120510368	.	C	CTTACATA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,2:13,0:0|1:120510368_C_CTTACATA:120510368:13,10,1,1
chr12	120510370	.	T	TTTA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,1:13,0:0|1:120510368_C_CTTACATA:120510368:13,10,1,1
chr12	120527944	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120527944_T_A:120527944:0,1,0,1
chr12	120527946	.	A	ACGCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120527944_T_A:120527944:0,1,0,1
chr12	120575549	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr12	120576528	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,4;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:7,10,4,0
chr12	120582048	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:4,0,1,0
chr12	120582610	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=89,165;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.207:38:9,6:20,2:14,15,8,1
chr12	120588852	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	120591658	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,3:9,3:11,8,1,5
chr12	120592754	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=102,49;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,2:12,0:7,10,1,1
chr12	120592776	.	G	GTTTTCTTAATTCTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=102,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.111:28:7,2:15,0:9,16,1,2
chr12	120606153	.	A	ACCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	120606163	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr12	120615351	.	C	CCATTTTATCCTATT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:120615351_C_CCATTTTATCCTATT:120615351:2,8,0,2
chr12	120615353	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:120615351_C_CCATTTTATCCTATT:120615351:2,8,0,2
chr12	120615360	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr12	120616787	.	G	GCAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr12	120628027	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:2,2:4,2,3,0
chr12	120628045	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=168,129;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,4:8,0:8,4,4,0
chr12	120628284	.	T	TGAGTTTGGAAGTATTCTCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr12	120637198	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=122,120;MMQ=60,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,0:12,2:9,16,0,2
chr12	120741313	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr12	120750239	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,15,8
chr12	120762765	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.645:37:10,9:2,14:7,6,12,12
chr12	120783561	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	120785330	.	GGATGGGCACATCAGCATGGCGGTGAGGGGCAGA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=84,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.098:29:10,0:6,2:8,19,1,1
chr12	120794653	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	120794896	.	CTTTATTAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTATTAAT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	120796703	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	120800823	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=233,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,7:0,10:0,1,11,6
chr12	120806129	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	120882691	.	GG	AC	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:25,0:12,2:0|1:120882691_GG_AC:120882691:23,15,1,1
chr12	120882695	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:25,0:10,2:0|1:120882691_GG_AC:120882691:23,13,1,1
chr12	120882697	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:23,0:9,2:0|1:120882691_GG_AC:120882691:22,13,1,1
chr12	120882835	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr12	120897652	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=178,151;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.821:20:0,7:3,10:3,0,16,1
chr12	120902007	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr12	120902024	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:120902024_A_AC:120902024:0,4,0,1
chr12	120902025	.	A	ACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:120902024_A_AC:120902024:0,4,0,1
chr12	120903610	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=65,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:3,1:0,5:1,2,0,6
chr12	120934407	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=81,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:3,11:2,5:2,4,1,15
chr12	120942824	.	T	TTGCCTCATTTGTAAAATAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=136,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,1,1
chr12	120947788	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,3:1,9:1,3,7,5
chr12	120947948	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr12	120959924	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,8037228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr12	120966659	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=109,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,7:1,5:3,1,11,1
chr12	120966966	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,4:7,2:10,6,1,5
chr12	120995325	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=90,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:13,0:7,2:10,10,1,1
chr12	120995332	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=58,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:0,14:0,6:1,1,10,10
chr12	120998443	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=177,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr12	120998481	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr12	121000846	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=65,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.387:42:13,7:12,9:12,14,8,8
chr12	121001489	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr12	121002899	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:11,0:14,5:13,12,0,5
chr12	121004564	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30,30,30;MFRL=224,160,112,128;MMQ=60,45,60,53;MPOS=26,10,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,15,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.53,17.13,13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,10,8:0.120,0.454,0.353:23:1,1,1,1:0,3,7,4:1,0,16,6
chr12	121004590	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=88,102;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.699:44:3,8:7,7:4,9,21,10
chr12	121004712	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:19,0:7,4:10,17,0,4
chr12	121004743	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=88,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:8,0:13,9,3,0
chr12	121009187	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	121017171	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr12	121017243	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=100,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.811:16:1,6:1,7:1,2,6,7
chr12	121017264	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.209:21:7,1:9,3:8,9,2,2
chr12	121017439	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	121017474	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=208,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,4,2
chr12	121017815	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,128;MMQ=53,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0|1:121017815_C_T:121017815:0,2,0,1
chr12	121017818	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=158,128;MMQ=53,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,1:1,0:0|1:121017815_C_T:121017815:0,2,0,1
chr12	121018862	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121018862_C_T:121018862:0,1,1,0
chr12	121018865	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121018862_C_T:121018862:0,1,1,0
chr12	121094110	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,2:1,7:0,1,2,7
chr12	121097622	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,2:0,0,8,6
chr12	121098191	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	121133037	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr12	121154624	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:10,2:5,2:10,5,0,4
chr12	121175560	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,2:0,1:4,2,3,0
chr12	121202984	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:121202984_A_G:121202984:0,2,0,1
chr12	121202988	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:121202984_A_G:121202984:0,2,0,1
chr12	121220375	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr12	121222411	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=72,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:3,4,2,9
chr12	121248584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,11,11
chr12	121426545	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	121426594	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr12	121431225	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	121431272	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr12	121431300	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:3,1,6,0
chr12	121434630	.	C	CTCATTCAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=TCAT;STR;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,4:0,0,8,3
chr12	121434833	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr12	121435427	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=99,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,1:2,4:2,1,4,2
chr12	121435475	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=95,127;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:2,3,3,5
chr12	121437221	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chr12	121438844	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=50,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,3:0,4:1,2,5,2
chr12	121444023	.	AAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=236,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:1,2:2,0:0|1:121444023_AAAG_A:121444023:3,0,2,0
chr12	121444025	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,4:0.356:12:0,1:1,3:1|0:121444023_AAAG_A:121444023:8,0,4,0
chr12	121448987	.	A	AGAGTAAGAGTTGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=165,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr12	121454313	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr12	121471216	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr12	121471363	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,1:6,3:5,8,1,3
chr12	121593870	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=86,80;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:17,0:7,3:9,15,0,3
chr12	121594056	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:7,1:2,2:1,8,0,3
chr12	121600180	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.427:7:4,2:0,0:3,1,1,2
chr12	121600253	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=170,44;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:2,5,1,3
chr12	121605355	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=194,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.856:19:0,9:2,6:1,1,5,12
chr12	121613281	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:25,3:13,0:13,26,3,0
chr12	121622611	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=115,80;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,1:16,1:13,12,1,1
chr12	121622626	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.138:19:9,0:8,1:8,9,1,1
chr12	121622641	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:3,11,0,2
chr12	121659999	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:0,4:4,2:1,4,1,6
chr12	121666258	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=192,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	121666476	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=79,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:12,3:3,3:7,8,5,1
chr12	121682051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=263,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr12	121682322	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121682322_A_C:121682322:1,0,1,0
chr12	121682326	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:121682322_A_C:121682322:3,0,1,0
chr12	121682333	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:121682322_A_C:121682322:2,0,1,0
chr12	121690548	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0|1:121690548_T_C:121690548:0,0,7,16
chr12	121690555	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,11:0|1:121690548_T_C:121690548:0,0,7,13
chr12	121701819	.	CAAAAGGTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr12	121706533	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr12	121711768	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,1:2,1:5,0,3,0
chr12	121746426	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:1,10:1,3:1,1,6,7
chr12	121757571	.	ATCAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAT;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:8,6,1,1
chr12	121764799	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	121768579	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	121773552	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,1:1,6:1,1,0,7
chr12	121789887	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=232,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr12	121789927	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=232,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,5,1
chr12	121855587	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:17,7:15,0:16,16,7,0
chr12	121858507	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:9,0:7,2:8,8,0,2
chr12	121861424	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:3,2:7,2:0,10,0,4
chr12	121879109	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=211,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121879109_C_T:121879109:0,1,0,1
chr12	121879119	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=224,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,1:0|1:121879109_C_T:121879109:0,2,0,1
chr12	121879989	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=95,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.184:34:7,5:21,0:13,15,6,0
chr12	121880885	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,0:8,4:9,5,2,2
chr12	121947412	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=116,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:12,1:19,1:19,13,2,0
chr12	121947445	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:9,0:14,3:12,11,2,1
chr12	122012525	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=93,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:12,12,0,2
chr12	122017894	.	GAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.612:6:0,1:1,0:0,2,2,2
chr12	122018830	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:9,2:10,5:5,14,2,5
chr12	122064773	.	CCCGCCA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCCA;STR;TLOD=72.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr12	122150904	.	TG	CT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,1:7,1:0|1:122150904_TG_CT:122150904:7,16,0,2
chr12	122150908	.	CG	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,1:8,1:0|1:122150904_TG_CT:122150904:7,16,0,2
chr12	122150910	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,1:7,1:0|1:122150904_TG_CT:122150904:7,15,0,2
chr12	122150914	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,1:6,1:0|1:122150904_TG_CT:122150904:4,15,0,2
chr12	122181461	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.445:9:1,0:4,3:4,1,4,0
chr12	122186239	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:10,5,0,3
chr12	122188337	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:15,0:13,4:16,12,2,2
chr12	122188378	.	ACCTCACACCGCCCC	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:6,0:3,3:0|1:122188378_ACCTCACACCGCCCC_A:122188378:2,8,2,2
chr12	122188398	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:0|1:122188378_ACCTCACACCGCCCC_A:122188378:1,7,2,2
chr12	122188404	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,3:0|1:122188378_ACCTCACACCGCCCC_A:122188378:0,4,2,2
chr12	122188455	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=247,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:122188455_C_CA:122188455:0,1,0,2
chr12	122188457	.	A	ACTATACACACATGCT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=247,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:122188455_C_CA:122188455:0,1,0,2
chr12	122208989	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	122211480	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:122211480_C_T:122211480:0,4,0,1
chr12	122211486	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:122211480_C_T:122211480:0,4,0,1
chr12	122211487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:122211480_C_T:122211480:0,4,0,1
chr12	122212525	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:4,0:7,4,2,1
chr12	122212659	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=102,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,5:11,2:7,9,3,4
chr12	122212663	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,2:9,2:6,12,2,2
chr12	122217491	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:8,7,1,1
chr12	122231368	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr12	122231450	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr12	122257787	.	C	CATCCCTAGCTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:1,7,1,1
chr12	122261015	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	122261692	.	G	GCCTCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122261692_G_GCCTCTGT:122261692:0,0,0,1
chr12	122261693	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122261692_G_GCCTCTGT:122261692:0,0,0,1
chr12	122284715	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,1:2,1:5,2,2,0
chr12	122295335	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:0|1:122295335_T_C:122295335:4,9,2,3
chr12	122295344	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:0|1:122295335_T_C:122295335:3,9,3,3
chr12	122295688	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=106,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:9,7,1,2
chr12	122296779	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=245,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,3,7
chr12	122359172	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:5,5:11,0:13,3,4,1
chr12	122359397	.	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,15:0.266:56:22,8:17,0:21,20,6,9
chr12	122361929	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr12	122380419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr12	122380535	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=80,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0|1:122380535_C_T:122380535:2,3,1,1
chr12	122380548	.	C	CCTGACTTGGAGGATTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=80,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:122380535_C_T:122380535:2,3,1,1
chr12	122396424	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=110,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:3,8,1,3
chr12	122439369	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,3:8,2:10,7,4,1
chr12	122492853	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:11,4:15,0:17,10,4,0
chr12	122497001	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr12	122517092	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:14,0:14,6:13,15,0,6
chr12	122611797	.	T	TTGTCTCTCCTGGACGGTGATTCTCCATG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=115,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.116:26:14,0:7,2:14,10,1,1
chr12	122612325	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	122612350	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	122613599	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=236,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr12	122614058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr12	122614060	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	122614209	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:3,2:1,1:1,3,1,2
chr12	122614387	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=304,293;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr12	122615314	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr12	122616759	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=136,160;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:122616759_G_A:122616759:5,1,2,0
chr12	122616766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=128,142;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,1:0|1:122616759_G_A:122616759:5,2,2,1
chr12	122616988	.	C	CAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=224,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122616988_C_CAAAA:122616988:0,1,0,1
chr12	122616992	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=224,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122616988_C_CAAAA:122616988:0,1,0,1
chr12	122617989	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:5,2,1,2
chr12	122620050	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.159:33:11,1:17,3:15,13,4,1
chr12	122658383	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0,0,10,7
chr12	122674848	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:6,8,1,1
chr12	122684966	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr12	122689073	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=12,24;MFRL=125,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr12	122689109	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CCG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr12	122691738	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr12	122701001	.	TA	T,AA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24,26;MFRL=131,123,192;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,3:0.171,0.233:15:8,0,1:2,2,2:7,3,4,1
chr12	122723309	.	CATATACAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.229:15:2,0:4,2:3,9,2,1
chr12	122794283	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,34;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,3:8,5:7,5,6,2
chr12	122812503	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.853:25:1,12:2,10:3,0,18,4
chr12	122817507	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr12	122838956	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.916:34:2,11:0,21:2,0,15,17
chr12	122839605	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=143,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:4,3:7,1:11,0,3,2
chr12	122839941	.	C	CGCTTGAATCCAGGAGGTGGAGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	122962294	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=167,144;MMQ=50,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr12	122964708	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,1:6,3:8,2,4,0
chr12	122964951	.	T	TTTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	123024332	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=115,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:0,0:1,1:1,2,0,2
chr12	123028839	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,138;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.401:28:9,0:8,11:6,11,0,11
chr12	123031255	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,1:4,1:3,7,1,1
chr12	123031910	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,172;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:8,1,1,1
chr12	123034283	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:9,7,3,0
chr12	123036276	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=154,416;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:1,12,3,0
chr12	123036300	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,416;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:0,9,3,0
chr12	123047328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=166,142;MMQ=57,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:12,2:3,0:0|1:123047328_G_A:123047328:0,16,0,2
chr12	123047331	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=160,142;MMQ=55,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,1:4,0:0|1:123047328_G_A:123047328:0,17,0,2
chr12	123047340	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=150,170;MMQ=58,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:123047340_C_T:123047340:0,12,0,2
chr12	123047343	.	G	GGT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=150,170;MMQ=58,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:4,0:0|1:123047340_C_T:123047340:0,12,0,2
chr12	123068810	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:1,1:5,2:4,3,1,2
chr12	123071365	.	AT	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr12	123089519	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=89,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:123089519_G_T:123089519:4,9,1,1
chr12	123089525	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:0|1:123089519_G_T:123089519:4,10,1,1
chr12	123089529	.	G	GAAGC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:123089519_G_T:123089519:4,9,1,1
chr12	123095296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	123187267	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:8,0:19,4:15,12,2,2
chr12	123201039	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.185:41:17,3:17,4:21,13,4,3
chr12	123201282	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=153,207;MMQ=52,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:6,0:16,4:13,10,4,0
chr12	123201445	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=9,12;MFRL=155,90;MMQ=52,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.570:13:0,3:0,0:0,5,3,5
chr12	123215223	.	C	CCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,16;MFRL=137,240;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:123215223_C_CCCT:123215223:0,1,0,1
chr12	123215225	.	A	AGTCACTTGCCAAATGCCATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=137,240;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123215223_C_CCCT:123215223:0,1,0,1
chr12	123215228	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=137,240;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123215223_C_CCCT:123215223:0,1,0,1
chr12	123238416	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:1,13,2,1
chr12	123246766	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=108,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.188:40:18,5:13,3:7,25,4,4
chr12	123246781	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.378:27:9,9:7,1:0|1:123246781_T_A:123246781:4,13,2,8
chr12	123246797	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:8,6:4,1:0|1:123246781_T_A:123246781:2,10,1,6
chr12	123246869	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr12	123247506	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=81,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,2:4,3:3,7,1,4
chr12	123265688	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,2:2,5:3,2,4,3
chr12	123265952	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr12	123281967	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	123282532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	123297718	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	123333065	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,5:1,4:2,4,3,6
chr12	123333352	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:0|1:123333352_G_T:123333352:8,4,1,1
chr12	123333353	.	A	AAGTCCCTCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,2:8,0:0|1:123333352_G_T:123333352:8,4,1,1
chr12	123335287	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,215;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	123335483	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr12	123335488	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:0,1,6,3
chr12	123335527	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr12	123339343	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=136,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:123339343_CA_TG:123339343:3,0,2,0
chr12	123339344	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,5:0.862:5:0,4:0,1:1|0:123339343_CA_TG:123339343:0,0,5,0
chr12	123339712	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr12	123340453	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,5:1,4:3,1,9,1
chr12	123341289	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=95,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.766:15:1,9:2,2:0|1:123341289_A_C:123341289:1,2,1,11
chr12	123341297	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=95,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,8:1,1:0|1:123341289_A_C:123341289:0,1,0,9
chr12	123341833	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr12	123341863	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	123342628	.	CCTCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=84,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:3,2,2,0
chr12	123342885	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:3,3:15,5:8,10,3,5
chr12	123343571	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=211,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:1,5:0,0:1,0,2,4
chr12	123343572	.	G	GGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.774:7:1,6:0,0:1,0,2,4
chr12	123344910	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr12	123345347	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chr12	123345360	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,6,10
chr12	123345736	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr12	123345756	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:0,3,3,5
chr12	123345787	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:7,3,2,2
chr12	123352179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=87,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr12	123424887	.	ATGCCCTGACCTTGGACACAGGTGGG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr12	123429052	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=111,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:123429052_C_T:123429052:8,12,1,1
chr12	123429062	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=110,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:123429052_C_T:123429052:7,12,1,1
chr12	123429065	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=110,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:123429052_C_T:123429052:7,12,1,1
chr12	123429067	.	C	CTACAGAGAAACCTTTAG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=107,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:123429052_C_T:123429052:7,11,1,1
chr12	123433137	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,10,8
chr12	123460823	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	123461080	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,4:0,3:2,1,2,5
chr12	123466304	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=79,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,2:12,1:19,3,3,0
chr12	123471402	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	123472521	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:123472521_T_C:123472521:0,0,0,1
chr12	123472525	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=257,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123472521_T_C:123472521:0,1,0,1
chr12	123472528	.	C	CAGAATGCTCCTCCTTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=257,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123472521_T_C:123472521:0,1,0,1
chr12	123473254	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr12	123480293	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	123645323	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:3,4,2,1
chr12	123647725	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,3:0,2:0,2,0,5
chr12	123651162	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:4,2,6,3
chr12	123679240	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123679240_C_CT:123679240:0,0,0,1
chr12	123679241	.	C	CATTGCCAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123679240_C_CT:123679240:0,0,0,1
chr12	123679244	.	C	CCCAGGAACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123679240_C_CT:123679240:0,0,0,1
chr12	123679247	.	C	CTAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123679240_C_CT:123679240:0,0,0,1
chr12	123687612	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,3:8,1:3,10,0,4
chr12	123694574	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=189,45822734;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,0,2
chr12	123694724	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:2,3:2,4:0,4,2,6
chr12	123699245	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr12	123703103	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=223,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr12	123703135	.	C	CGGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:123703135_C_CGGT:123703135:0,4,0,1
chr12	123703136	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:123703135_C_CGGT:123703135:0,4,0,1
chr12	123751726	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.777:19:1,4:2,11:1,3,10,5
chr12	123794022	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr12	123798074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=90,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.585:5:2,3:0,0:1,1,3,0
chr12	123801672	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	123810662	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,4:0,0,9,5
chr12	123812207	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr12	123812611	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	123813493	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	123815739	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,2:8,0:9,1,1,1
chr12	123816007	.	T	TATGTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	123820996	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=90,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,0:15,4:19,11,1,3
chr12	123821057	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=95,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:9,3,2,2
chr12	123832710	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr12	123832746	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	123868826	.	G	GCTCACACTAATGCTCTGAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.202:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr12	123874010	.	AGGCGGC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,665;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GGC;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	123875394	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,3:3,0:0,8,0,3
chr12	123879666	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=111,77;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.187:46:18,1:19,7:0|1:123879666_A_G:123879666:16,22,6,2
chr12	123879668	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=111,77;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.187:46:18,1:19,5:0|1:123879666_A_G:123879666:16,22,6,2
chr12	123879768	.	AA	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,187;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:13,2:11,8,0,2
chr12	123880862	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,3:9,0:10,1,2,1
chr12	123880923	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=129,0;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:7,2:11,4:11,8,2,4
chr12	123892017	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:0,4:3,10:3,0,9,5
chr12	123892186	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,120;MMQ=27,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.296:42:11,4:18,8:14,16,2,10
chr12	123900395	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,1:9,2:13,8,1,2
chr12	123907626	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=98,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,0:14,3:16,14,3,0
chr12	123968633	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,250;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	123983941	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=112,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:10,2:5,3:11,4,4,1
chr12	123984023	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:4,12:2,11:2,4,9,15
chr12	124008073	.	AT	GC,GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28,29;MFRL=0,169,111;MMQ=60,60,60;MPOS=6,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.56,48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,19:0.192,0.770:23:0,1,11:0,3,8:0,0,10,13
chr12	124069111	.	GGGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGC;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	124071507	.	AT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.176:41:11,3:23,4:16,18,4,3
chr12	124075039	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,3:7,0:0,11,0,3
chr12	124081088	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=143,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr12	124086620	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	124086656	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=225,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr12	124090605	.	ACT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.817:20:1,9:1,8:3,0,9,8
chr12	124090655	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.345:18:5,4:7,2:4,8,3,3
chr12	124090727	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	124094574	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=103,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.240:41:18,0:11,2:17,12,0,12
chr12	124099704	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:6,3:6,4,4,1
chr12	124101041	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=125,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,2:5,3:6,4,1,4
chr12	124102216	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:5,1,5,0
chr12	124102433	.	CGTTTTCAGATAGAATGCCTA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,3:6,0:4,11,2,1
chr12	124104049	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=109,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:7,4:15,1:10,12,3,2
chr12	124104089	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:11,0:11,2:10,13,1,1
chr12	124111062	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:6,7,1,1
chr12	124111723	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=72,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:4,5,0,2
chr12	124130128	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,3:5,1:4,8,0,4
chr12	124137418	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=260,175;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	124144395	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.276:34:11,2:14,7:15,10,5,4
chr12	124144572	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:5,2:8,4:5,8,4,2
chr12	124144793	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=91,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,2:4,2:4,6,2,2
chr12	124156252	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	124156762	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr12	124158080	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr12	124158439	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,0,0,1
chr12	124158445	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=309,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,1,0,1
chr12	124158447	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,32;MFRL=309,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,1,0,1
chr12	124158450	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=309,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,1,0,1
chr12	124158452	.	C	CCACAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=309,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,1,0,1
chr12	124158454	.	A	AAGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=309,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124158439_C_T:124158439:0,1,0,1
chr12	124163749	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:12,0:13,2:12,13,1,1
chr12	124163926	.	TGAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=199,181;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:124163926_TGAG_T:124163926:1,2,0,1
chr12	124163931	.	T	TAGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=104,181;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:124163926_TGAG_T:124163926:1,1,0,1
chr12	124171323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr12	124172497	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=164,178;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr12	124172555	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:5,2,3,0
chr12	124172731	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=106,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:12,3:6,3:0|1:124172731_G_A:124172731:11,7,1,5
chr12	124172746	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:10,3:6,1:0|1:124172731_G_A:124172731:11,5,1,4
chr12	124179620	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=175,327;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:0,4,1,1
chr12	124179739	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr12	124209332	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:124209332_T_C:124209332:0,0,2,11
chr12	124209352	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:124209332_T_C:124209332:0,0,2,11
chr12	124218556	.	G	GCACAGTGCCAGGCACTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0,6,1,1
chr12	124220055	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr12	124228294	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,2:7,0:4,4,0,2
chr12	124236949	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,1:16,1:0|1:124236949_G_T:124236949:9,17,0,2
chr12	124236951	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,1:14,0:0|1:124236949_G_T:124236949:9,17,0,2
chr12	124257461	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:11,5,0,3
chr12	124267615	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,1:2,3:7,1,2,2
chr12	124267638	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,5:0,0,10,6
chr12	124268458	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr12	124274758	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	124281440	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.303:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr12	124288213	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=202,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr12	124352455	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr12	124352479	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:10,10,0,3
chr12	124358126	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:0|1:124358126_T_C:124358126:8,8,1,1
chr12	124358129	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:124358126_T_C:124358126:8,8,1,1
chr12	124358133	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,1:0|1:124358126_T_C:124358126:8,8,1,1
chr12	124358337	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=76,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr12	124362280	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:10,4:10,0:10,10,2,2
chr12	124363724	.	GTGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	124366150	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr12	124371898	.	C	CTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124371898_C_CTTG:124371898:0,1,0,1
chr12	124371902	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124371898_C_CTTG:124371898:0,1,0,1
chr12	124387574	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:0|1:124387574_G_A:124387574:8,2,1,2
chr12	124387586	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0|1:124387574_G_A:124387574:7,3,1,2
chr12	124398843	.	A	ACTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,4,2
chr12	124417974	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:2,2:14,1:8,8,1,2
chr12	124420076	.	C	CAGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr12	124498659	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=82,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:12,1:5,9:11,6,5,5
chr12	124500029	.	G	GGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124500029_G_GGC:124500029:0,0,0,1
chr12	124500030	.	T	TCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124500029_G_GGC:124500029:0,0,0,1
chr12	124500031	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124500029_G_GGC:124500029:0,0,0,1
chr12	124810174	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=102,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:0,6:2,9:0,2,2,13
chr12	124810968	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	124812040	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:17,0:4,2:0|1:124812040_G_C:124812040:7,14,0,2
chr12	124812044	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:17,0:4,2:0|1:124812040_G_C:124812040:7,14,0,2
chr12	124812047	.	G	GGGAAAAATGGTTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:17,0:4,2:0|1:124812040_G_C:124812040:7,15,0,2
chr12	124824721	.	C	CGCCGCTGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCGCTGCT;STR;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,3:0,0,0,11
chr12	124832474	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr12	124832492	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr12	124835352	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	124838591	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=227,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	124838772	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:124838772_C_G:124838772:0,0,0,10
chr12	124838774	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.595:10:1,3:2,3:0|1:124838772_C_G:124838772:0,4,0,6
chr12	124839150	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=80,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,4,5
chr12	124839165	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=80,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:1,3,2,4
chr12	124839899	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	124839945	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,1:2,6:2,1,5,3
chr12	124841421	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	124848137	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr12	124859045	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,18:0,0,15,23
chr12	124862769	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:11,3:13,1:19,5,3,1
chr12	124862856	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=112,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,0:18,3:14,26,1,2
chr12	124885249	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	124885290	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	124887058	.	GGCTGCT	G,GGCTGCTGCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29,34;MFRL=282,129,107;MMQ=60,42,47;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=GCT;STR;TLOD=4.69,7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.272,0.444:5:1,1,1:0,1,1:0,1,2,2
chr12	124915067	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=295,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	124915091	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	124934459	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr12	124934466	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:1,9,1,1
chr12	124941580	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0|1:124941580_T_A:124941580:0,3,1,0
chr12	124941584	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:124941580_T_A:124941580:0,3,1,0
chr12	124968349	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	124979833	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr12	125263204	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	125279821	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,5:7,1:5,10,4,2
chr12	125284624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=124,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:1,2,1,1
chr12	125284748	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,10:0,0,15,9
chr12	125348263	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:0,9,0,3
chr12	125396165	.	T	TAAAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=0,158;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,25;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.896:11:1,5:0,3:1,0,7,3
chr12	125396283	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,8:0.101:86:44,8:33,0:27,51,0,8
chr12	125396630	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=226,169;MMQ=24,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125396630_TGG_T:125396630:0,1,0,1
chr12	125396633	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=226,169;MMQ=24,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125396630_TGG_T:125396630:0,1,0,1
chr12	125397553	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=97,164;MMQ=52,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.216:44:17,3:18,6:18,17,6,3
chr12	125434434	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	125434580	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=86,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,7:4,4:4,4,6,5
chr12	125435156	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:2,1,4,3
chr12	125435388	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=7897732,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,7:2,5:0,2,4,8
chr12	125436897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	125437019	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=214,90;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,2:2,8:2,1,5,5
chr12	125437142	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:3,3,2,3
chr12	125438336	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	125438414	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr12	125438516	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=44,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:0|1:125438516_T_C:125438516:2,1,4,5
chr12	125438523	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=44,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.751:14:3,7:0,4:0|1:125438516_T_C:125438516:2,1,4,7
chr12	125438549	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=51,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:4,5:2,6:3,3,2,10
chr12	125444975	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.310:24:7,2:8,5:8,9,3,4
chr12	125449190	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0|1:125449190_G_GA:125449190:4,4,1,1
chr12	125449194	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=148,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,2:4,0:3,5,2,0
chr12	125449195	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:125449190_G_GA:125449190:4,7,1,1
chr12	125449197	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:125449190_G_GA:125449190:3,7,1,1
chr12	125449470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:5,1,4,2
chr12	125450416	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=235,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr12	125453235	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	125456004	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr12	125456048	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr12	125457151	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:2,3:0,6:2,0,6,4
chr12	125461922	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.126:21:3,0:16,2:14,5,1,1
chr12	125461938	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:7,0:23,2:0|1:125461938_G_C:125461938:19,12,1,1
chr12	125461939	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:7,0:23,2:0|1:125461938_G_C:125461938:19,12,1,1
chr12	125461943	.	CGG	TAT	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:9,0:24,2:0|1:125461938_G_C:125461938:21,17,1,1
chr12	125461947	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:10,0:25,2:0|1:125461947_C_T:125461947:19,17,1,1
chr12	125461949	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:10,0:25,2:0|1:125461947_C_T:125461947:19,17,1,1
chr12	125465188	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr12	125465269	.	ACTC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr12	125466987	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:1,4:0,1:2,0,4,1
chr12	125473454	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,2:6,3:7,7,5,1
chr12	125509502	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:7,5,5,2
chr12	125510061	.	C	CATCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125510061_C_CATCTCA:125510061:0,1,0,1
chr12	125510064	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125510061_C_CATCTCA:125510061:0,1,0,1
chr12	125587350	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:125587350_C_T:125587350:8,7,1,1
chr12	125587354	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:125587350_C_T:125587350:8,7,1,1
chr12	125587387	.	G	GAGTGCCCCACGTCTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:125587350_C_T:125587350:1,2,0,1
chr12	125587727	.	T	TGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125587727_T_TGGA:125587727:0,1,0,1
chr12	125587728	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125587727_T_TGGA:125587727:0,1,0,1
chr12	125587732	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125587727_T_TGGA:125587727:0,1,0,1
chr12	125587733	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125587727_T_TGGA:125587727:0,1,0,1
chr12	125591844	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	125612839	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,3:0,7:0,2,2,8
chr12	125619308	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr12	125619349	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:5,3:7,3,2,1
chr12	125621419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr12	125811056	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=141,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	125834450	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:6,1,3,0
chr12	126003934	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr12	126004156	.	C	CGGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=156,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:126004156_C_CGGCA:126004156:0,4,1,1
chr12	126004159	.	C	CACAACAGAGGCGTCCTGGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=156,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:126004156_C_CGGCA:126004156:0,4,1,1
chr12	126068417	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,51;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr12	126068506	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=88,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:8,10,2,0
chr12	126128871	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	126135195	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	129028469	.	GTC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=90,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:7,0:10,4:12,5,3,1
chr12	129028708	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=230,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr12	129028712	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=230,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	129180674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:1,5,0,4
chr12	129181701	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	129182056	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=231,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:129182056_T_TC:129182056:0,1,0,1
chr12	129182057	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=231,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129182056_T_TC:129182056:0,1,0,1
chr12	129182058	.	A	AGCAGGATGACG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=231,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129182056_T_TC:129182056:0,1,0,1
chr12	129189556	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	129189591	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr12	129190474	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,5,1
chr12	129299675	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	129308517	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	129373100	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	129383939	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:1,7,0,4
chr12	129429893	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,3:15,0:19,10,4,0
chr12	129429937	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:8,0:19,2:0|1:129429937_C_T:129429937:12,17,1,1
chr12	129429954	.	A	AGACGCTGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:6,0:15,2:0|1:129429937_C_T:129429937:7,16,1,1
chr12	129467605	.	CAGGAAGCTGGA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=85,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:6,2:0,0:2,4,1,1
chr12	129467688	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129467688_C_A:129467688:0,1,0,1
chr12	129467689	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129467688_C_A:129467688:0,1,0,1
chr12	129566284	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=70,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr12	130649316	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:1,1:3,3:2,5,1,4
chr12	130649962	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=90,89;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:5,8:1,9:3,3,11,6
chr12	130827271	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr12	130830906	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr12	130832597	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr12	130834476	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:130834476_C_T:130834476:6,7,1,1
chr12	130834481	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:3,2:0|1:130834476_C_T:130834476:6,5,1,1
chr12	130839645	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	130921423	.	GGCCAT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:5,2:0|1:130921423_GGCCAT_G:130921423:4,3,1,1
chr12	130921431	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:0,0:5,2:0|1:130921423_GGCCAT_G:130921423:4,3,1,1
chr12	130923045	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.179:25:10,0:8,1:12,9,0,4
chr12	130935710	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	130940960	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	130940993	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=78,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:1,0:10,2:6,5,1,1
chr12	130963655	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	131280714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	131285663	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr12	131306419	.	GGA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=217,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	131311629	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	131439210	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:131439210_G_A:131439210:4,12,1,1
chr12	131439216	.	T	TCCTATTTCTCCACA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:7,1:0|1:131439210_G_A:131439210:5,12,1,1
chr12	131471608	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr12	131471956	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	131475588	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,0:9,1:4,8,1,1
chr12	131475605	.	AT	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:7,2:4,9,1,1
chr12	131485025	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:0,8:2,1:2,0,5,4
chr12	131485082	.	TCA	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=193,112;MMQ=40,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr12	131485101	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=196,151;MMQ=55,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131485101_TG_CA:131485101:0,4,0,1
chr12	131485106	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=196,151;MMQ=55,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131485101_TG_CA:131485101:0,4,0,1
chr12	131490483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=184,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr12	131498946	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	131593248	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:7,5,1,2
chr12	131603031	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:2,5,1,6
chr12	131621586	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,0:2,9:3,3,0,9
chr12	132199498	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:13,0:0|1:132199498_G_A:132199498:11,14,0,2
chr12	132199500	.	T	TCAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=21,22;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:11,0:0|1:132199498_G_A:132199498:11,14,0,2
chr12	132199502	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:132199498_G_A:132199498:11,14,0,2
chr12	132209932	.	ATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=61.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:0,5:1,13:1,0,13,5
chr12	132237750	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:16,2:6,9:14,8,5,6
chr12	132237816	.	CACCGCCCCACCACCTCCTGGGACCACACCACT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=132,33;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:10,0:5,2:0|1:132237816_CACCGCCCCACCACCTCCTGGGACCACACCACT_C:132237816:13,12,1,1
chr12	132237848	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.951:17:0,10:0,7:1|0:132237816_CACCGCCCCACCACCTCCTGGGACCACACCACT_C:132237816:0,0,7,10
chr12	132239100	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr12	132240937	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=217,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr12	132241229	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	132241262	.	C	CGTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132241262_C_CGTG:132241262:0,1,0,1
chr12	132241263	.	A	ATCCGCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132241262_C_CGTG:132241262:0,1,0,1
chr12	132241265	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132241262_C_CGTG:132241262:0,1,0,1
chr12	132241269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132241262_C_CGTG:132241262:0,1,0,1
chr12	132249089	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:132249089_C_G:132249089:11,12,1,1
chr12	132249091	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:132249089_C_G:132249089:11,12,1,1
chr12	132250839	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=76,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:132250839_C_T:132250839:1,3,0,1
chr12	132250848	.	G	GTCTCTGTCTCCATCTTCACACGGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=86,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132250839_C_T:132250839:0,1,0,1
chr12	132262730	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,3:14,0:17,10,1,2
chr12	132283704	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,0:2,4:3,4,2,2
chr12	132323089	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr12	132323294	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,25;MFRL=201,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,5:0,1:0,1,1,5
chr12	132326298	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,6:1,4:0,3,5,5
chr12	132329553	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	132329807	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr12	132335486	.	CCG	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:6,0:16,2:0|1:132335486_CCG_C:132335486:7,18,1,1
chr12	132335489	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:7,0:15,2:0|1:132335486_CCG_C:132335486:7,18,1,1
chr12	132397901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,136;MMQ=58,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:132397901_C_T:132397901:0,2,0,1
chr12	132397915	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=200,136;MMQ=58,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:132397901_C_T:132397901:0,2,0,1
chr12	132398247	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.249:30:10,3:11,4:13,9,3,5
chr12	132398255	.	AC	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.553:31:8,7:5,11:6,7,10,8
chr12	132398256	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,18:0,22:0,0,18,22
chr12	132403161	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr12	132414769	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	132445086	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,3:4,6:5,0,9,0
chr12	132464350	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:2,10:5,9:1,6,8,11
chr12	132472512	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr12	132498260	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:0,2,2,5
chr12	132508440	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,0:11,3:3,15,1,2
chr12	132510236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:6,9,2,1
chr12	132512612	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:16,4,3,0
chr12	132514490	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr12	132534945	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:8,1:15,1:10,14,0,2
chr12	132535219	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=92,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:5,10,0,2
chr12	132539451	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,8:3,7:3,3,12,4
chr12	132539468	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=78,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.248:21:9,2:6,2:10,6,2,3
chr12	132547029	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=212,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:132547029_C_CT:132547029:3,0,0,2
chr12	132547032	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=212,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:132547029_C_CT:132547029:3,0,0,2
chr12	132547231	.	GGG	CCC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,3:9,0:10,14,0,3
chr12	132549251	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:5,2:5,9,1,1
chr12	132562305	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=369,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	132593231	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:3,5,4,3
chr12	132624310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr12	132625105	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=241,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,2:0,4:0,1,6,1
chr12	132625239	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=210,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:2,6,1,2
chr12	132625643	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	132626191	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr12	132626355	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,0:9,5:8,8,1,4
chr12	132629606	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=191,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr12	132631767	.	C	CCACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=205,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:132631767_C_CCACA:132631767:5,0,1,1
chr12	132631768	.	T	TGGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=205,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:132631767_C_CCACA:132631767:5,0,1,1
chr12	132631772	.	G	GAAAACCCTCCTGT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=205,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:1,0:3,2:0|1:132631767_C_CCACA:132631767:5,0,1,1
chr12	132633270	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr12	132633412	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr12	132635521	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr12	132635903	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	132635989	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	132682300	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,1,0
chr12	132683853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr12	132685826	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr12	132685837	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr12	132685894	.	CAAGTGCCCTCACAGGAGCAGCCTCCCCCCCAGTATTCAGATGCTGAGGCCCCATCCAGTTGGGA	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=-208;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.281:11:3,0:3,3:1,6,0,4
chr12	132685899	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr12	132824363	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,24;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:132824363_C_T:132824363:1,0,1,0
chr12	132824369	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,24;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:132824363_C_T:132824363:1,0,1,0
chr12	132824378	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=11,29;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:132824363_C_T:132824363:1,0,1,0
chr12	133084973	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	133104575	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,4:10,0:6,8,4,0
chr12	133151222	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133151222_CA_C:133151222:0,1,0,1
chr12	133151224	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133151222_CA_C:133151222:0,1,0,1
chr12	133158632	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr12	133196037	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:7,4:0,7:4,3,6,5
chr12	133208910	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:2,2:11,2:5,9,2,2
chr12	133210914	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=110,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:8,3:11,11,0,3
chr12	133212518	.	CC	TT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:6,6,1,1
chr12	133233705	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=72,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:0,7:4,1:1,3,6,2
chr12	133237753	.	GAA	G,GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,18,16;MFRL=166,775,215;MMQ=60,60,60;MPOS=26,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.64,8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.330,0.472:6:0,0,0:0,0,0:0,1,0,5
chr12	133245032	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,10:1,3:2,2,9,4
chr12	133252513	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	133252796	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	133253310	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	133254083	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr12	133256904	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	133263825	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	133272380	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	133277983	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr12	133278020	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	133291679	.	A	ATCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr12	133293998	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=165,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr12	133303980	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=89,84;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:10,6:12,0:8,14,5,1
chr12	133310887	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr12	133311944	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr12	133324385	.	TAAAG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:7,1:14,2,2,0
chr12	133349620	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,9:0,0,10,1
chr12	133349893	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	133354470	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	133372342	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=159,152;MMQ=58,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr12	133372395	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,0:6,3:7,1,3,0
chr12	133372783	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:133372783_T_C:133372783:2,3,1,1
chr12	133372784	.	C	CGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:133372783_T_C:133372783:2,3,1,1
chr12	133372786	.	C	CGGTGGGTCAGTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,2:3,0:0|1:133372783_T_C:133372783:2,3,1,1
chr12	133374905	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:5,2,4,0
chr12	133378389	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=78,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:4,3,0,2
chr12	133383923	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	133384864	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,2:6,5:6,5,3,4
chr12	133393323	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=92,92;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,2:5,4:3,9,5,1
chr12	133393340	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:6,8,2,0
chr12	133418069	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,1,2
chr12	133418098	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,78;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,0:10,3:11,4,2,1
chr12	133420521	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=188,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.196:18:3,2:11,0:0|1:133420521_G_A:133420521:15,0,2,1
chr12	133420533	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.415:10:3,1:3,3:1|0:133420521_G_A:133420521:5,1,4,0
chr12	133438274	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	133447195	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=148,114;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	133447242	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr12	133448815	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=244,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr12	133503084	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:11,0:14,6:0|1:133503084_C_T:133503084:15,11,0,6
chr12	133503089	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:9,0:14,6:0|1:133503084_C_T:133503084:14,13,0,6
chr12	133509562	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr12	133587248	.	TGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGC	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.083:41:4,4:3,3:20,14,1,6
chr12	133587980	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr12	133625288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,0:0,5:3,0,5,0
chr12	133633459	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr12	133634567	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:10,10,0,4
chr12	133683261	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	133727549	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr12	133764701	.	C	CT,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31,34;MFRL=150,149,143;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.61,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.365,0.269:8:2,1,1:1,1,1:0,3,1,4
chr13	19600069	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,170;MMQ=58,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,5:0,5:0,1,6,4
chr13	19600326	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,11,9
chr13	19601129	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr13	19601182	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	19751747	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=58,141;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.089:65:15,0:44,5:0|1:19751747_C_A:19751747:16,44,0,5
chr13	19751751	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=58,141;MMQ=60,46;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:13,0:44,5:0|1:19751747_C_A:19751747:16,44,0,5
chr13	19752625	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr13	19753438	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr13	19756026	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	20000702	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr13	20004762	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr13	20004798	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr13	20006551	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr13	20006777	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,158;MMQ=59,44;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,1:2,2,0,4
chr13	20039289	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	20041323	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,11,5
chr13	20041493	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=9,14;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.800:9:0,1:0,1:0,2,2,5
chr13	20041563	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr13	20048218	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,5;RU=AAAT;STR;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.947:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr13	20067081	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,127;MMQ=25,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,2:4,2:3,6,0,4
chr13	20067104	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,146;MMQ=26,25;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr13	20216380	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,98;MMQ=54,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:4,7,1,1
chr13	20220999	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=96,58;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.075:69:28,4:35,0:35,29,3,2
chr13	20240743	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr13	20244574	.	A	ATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr13	20245479	.	A	ATCTTCCAGGTTAGCCATCCACAGCAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr13	20277291	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=126,107;MMQ=53,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:23,2:9,0:0|1:20277291_A_G:20277291:18,14,1,1
chr13	20277293	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=126,107;MMQ=53,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:22,1:9,0:0|1:20277291_A_G:20277291:18,14,1,1
chr13	20325625	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,4,8
chr13	20333581	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:16,0:14,7:11,19,0,7
chr13	20346613	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:25,1:13,1:23,17,1,1
chr13	20346628	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:31,0:13,3:21,24,0,3
chr13	20356941	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,350;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	20398669	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,5:0,19:0,0,15,10
chr13	20567113	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	20608354	.	T	TTTTCTTGAGGTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,2:0,7:0,0,10,6
chr13	20656138	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=68,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.816:17:0,6:1,7:1,2,11,3
chr13	20657188	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=163.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,24:0,23:0,0,26,22
chr13	20716885	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,3:9,2:10,5,3,2
chr13	20762956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	21006475	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr13	21013670	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.726:9:1,3:1,2:3,0,3,3
chr13	21013772	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:20,5:28,0:18,30,0,5
chr13	21086599	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,1:4,3:7,5,2,2
chr13	21099828	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	21156999	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:3,0,5,0
chr13	21157257	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	21170193	.	G	GTAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAAAA;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr13	21179059	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=186,92;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21179059_C_G:21179059:3,0,0,1
chr13	21179063	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=186,92;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:3,0:0,1:0|1:21179059_C_G:21179059:3,0,0,1
chr13	21189941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:4,3,4,3
chr13	21190019	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:12,3:2,0:5,9,0,3
chr13	21205124	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:6,0,2,1
chr13	21205140	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:6,0,3,1
chr13	21331779	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:2,7,1,6
chr13	21358061	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=166,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:0,6,3,6
chr13	21370424	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.349:8:1,1:3,1:0|1:21370424_G_T:21370424:1,4,2,1
chr13	21370425	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=176,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.349:8:1,1:2,0:0|1:21370424_G_T:21370424:1,4,2,1
chr13	21373572	.	A	ACACATATAATACACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr13	21374536	.	T	TACGGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=194,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	21416945	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr13	21418094	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	21429874	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=52,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,2:3,5:4,4,4,3
chr13	21549560	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,1,0,1
chr13	21549562	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,1,0,1
chr13	21549565	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,0,0,1
chr13	21549567	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,0,0,1
chr13	21549569	.	G	GAAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,0,0,1
chr13	21549572	.	A	ACAC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21549560_G_A:21549560:0,0,0,1
chr13	21553769	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=139,264;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:7,1,2,0
chr13	21563451	.	G	GTATCATTCATAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:7,0:3,12,1,1
chr13	21565592	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:1,13,0,2
chr13	21714920	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,4:4,3:4,4,4,3
chr13	21729952	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:2,0:1,4:0,7,2,2
chr13	21730012	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr13	21735874	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,135;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,4:7,0:17,3,4,0
chr13	21742303	.	T	TAAGA	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=118,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.048:59:35,2:22,0:0|1:21742303_T_TAAGA:21742303:28,29,1,1
chr13	21742305	.	C	CACGTCTTTGTTTTGTTTTG	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=118,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.048:59:35,2:22,0:0|1:21742303_T_TAAGA:21742303:28,29,1,1
chr13	21746453	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:4,3:3,8:7,1,7,4
chr13	21751494	.	GA	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,166;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:9,0:20,9:15,18,0,9
chr13	21751528	.	A	AC	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.587:39:5,11:11,12:9,7,10,13
chr13	21753255	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=90,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:2,6,0,6
chr13	21952990	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=213,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr13	21987707	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=224,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr13	21987987	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr13	22033122	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr13	22033162	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,5:6,9:9,1,11,3
chr13	22096843	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr13	22113669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=175,211;MMQ=40,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,5:7,2:9,1,7,1
chr13	22113688	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=156,153;MMQ=40,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:11,1:16,1,2,0
chr13	22140911	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=140,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr13	22178258	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=207,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,3:0,1,3,4
chr13	22178308	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	22246073	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.082:70:39,5:25,0:43,22,5,0
chr13	22255167	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,14:5,3:5,2,9,9
chr13	22255301	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,6:9,8:3,13,4,10
chr13	22275583	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,3:0,15:0,0,5,14
chr13	23808914	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=213,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr13	23894736	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr13	23894744	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:0|1:23894744_T_G:23894744:3,1,8,0
chr13	23894746	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:0|1:23894744_T_G:23894744:3,1,8,0
chr13	23894748	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:2,2:2,6:0|1:23894744_T_G:23894744:3,1,8,1
chr13	23894750	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=111,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.627:14:2,2:2,7:0|1:23894744_T_G:23894744:3,2,8,1
chr13	23894752	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=111,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.628:14:3,2:2,7:0|1:23894744_T_G:23894744:3,2,8,1
chr13	23898454	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=77,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,6,0
chr13	23898509	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=82,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.553:27:7,10:5,5:5,7,6,9
chr13	23904341	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=89,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:15,2:0|1:23904341_C_T:23904341:17,13,1,1
chr13	23904348	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=90,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:14,2:0|1:23904341_C_T:23904341:16,14,1,1
chr13	23904351	.	T	TCCCGAGTAGCTGAGACCACAGG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=90,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:0|1:23904341_C_T:23904341:15,12,1,1
chr13	23906983	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:2,2,2,1
chr13	23908034	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:4,4,2,0
chr13	23915895	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:23915895_CAA_C:23915895:1,3,0,1
chr13	23915900	.	A	ATGTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:23915895_CAA_C:23915895:1,3,0,1
chr13	23915903	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:23915895_CAA_C:23915895:1,3,0,1
chr13	23929095	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=103,161;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:6,4:9,7:7,8,5,6
chr13	24164216	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr13	24330751	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=63,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:2,4:4,3:3,4,1,7
chr13	24410278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	24410498	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:0,0:0,1:0,8,1,3
chr13	24468280	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,156;MMQ=30,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:9,5,1,1
chr13	24845130	.	CCT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.228:29:14,4:6,2:1,22,0,6
chr13	24863405	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=145,170;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:3,0:3,5:1,5,0,5
chr13	24865057	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:0,4,2,7
chr13	24869025	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=73,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,10:1,8:0,1,5,13
chr13	24869048	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:3,7:2,4:1,4,1,10
chr13	24871690	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:11,2:0|1:24871690_C_T:24871690:9,16,1,1
chr13	24871699	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=90,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:10,0:9,2:0|1:24871690_C_T:24871690:9,14,1,1
chr13	24995324	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=180,191;MMQ=27,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24995324_A_T:24995324:0,1,0,1
chr13	24995327	.	T	TCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=180,191;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24995324_A_T:24995324:0,1,0,1
chr13	25005446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr13	25008903	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr13	25016687	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr13	25016853	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,106;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:5,1:4,9,0,3
chr13	25020757	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:25020757_T_C:25020757:0,0,11,0
chr13	25020782	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0|1:25020757_T_C:25020757:0,0,16,2
chr13	25020863	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,12,18
chr13	25020910	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,6,16
chr13	25021144	.	GTCT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,3:0,11:0|1:25021144_GTCT_G:25021144:0,0,10,8
chr13	25021154	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,33;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,4:0,14:0|1:25021144_GTCT_G:25021144:0,0,10,8
chr13	25023936	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,102;MMQ=60,57;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:9,6:12,7:10,11,7,6
chr13	25024028	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr13	25026579	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:15,2:0|1:25026579_G_A:25026579:11,15,1,1
chr13	25026604	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:25026579_G_A:25026579:10,16,1,1
chr13	25026606	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:14,2:0|1:25026579_G_A:25026579:9,16,1,1
chr13	25026610	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:25026579_G_A:25026579:6,16,1,1
chr13	25026612	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:25026579_G_A:25026579:6,16,1,1
chr13	25026614	.	C	CTCTCTCCCTCCCTTT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,1:0|1:25026579_G_A:25026579:6,15,1,1
chr13	25029113	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=73,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:6,4,2,1
chr13	25029128	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=70,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,2:3,8:5,4,6,4
chr13	25029160	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:25029160_C_A:25029160:11,8,1,1
chr13	25029162	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:25029160_C_A:25029160:11,8,1,1
chr13	25029218	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,21;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:1,1:9,7:4,6,4,4
chr13	25029401	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr13	25030447	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,2:4,2:6,2,1,3
chr13	25033193	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.060:63:29,2:31,0:26,34,1,2
chr13	25033200	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=22,22;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,36:0.588:61:10,23:14,13:10,15,17,19
chr13	25033227	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.511:47:11,16:12,8:11,12,7,17
chr13	25033290	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,10:5,3:1,4,5,8
chr13	25034155	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,52;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:15,5:16,2:19,12,7,0
chr13	25049810	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=176,223;MMQ=38,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:25049810_C_A:25049810:0,2,0,3
chr13	25049812	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:25049810_C_A:25049810:0,0,0,5
chr13	25052420	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:8,2:3,5:5,6,4,3
chr13	25052511	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,178;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr13	25060313	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,129;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,35:0.655:53:13,13:5,22:9,9,15,20
chr13	25060522	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=230,183;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr13	25066563	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,179;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:12,5:11,0:16,9,5,0
chr13	25067861	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:6,0:15,4:12,9,0,4
chr13	25068620	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr13	25068934	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	25072181	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=154,121;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:5,2:4,3:8,2,5,0
chr13	25072200	.	T	A,C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28,30;MFRL=0,109,136;MMQ=60,60,57;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.92,28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,10:0.479,0.479:20:0,7,5:0,3,5:0,0,15,5
chr13	25072403	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,3:0,4:1,4,0,7
chr13	25073399	.	GTTT	G,GT,GTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30,20,33;MFRL=115,137,109,137;MMQ=60,40,42,60;MPOS=6,8,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.25,12.14,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,11,5:0.131,0.394,0.214:26:3,1,1,3:4,2,8,2:5,2,14,5
chr13	25074408	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:4,3,2,3
chr13	25074490	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,10:3,8:2,3,12,6
chr13	25074568	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.670:16:0,3:5,8:2,3,2,9
chr13	25075689	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25075689_C_T:25075689:1,0,1,0
chr13	25075694	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25075689_C_T:25075689:1,0,1,0
chr13	25075720	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr13	25077933	.	TTTAAGGACCCTCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=148,98;MMQ=52,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:5,4,1,1
chr13	25077986	.	A	ATAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=113,102;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:3,1:2,0:0|1:25077986_A_ATAT:25077986:0,5,0,1
chr13	25077987	.	G	GAAGAAGATAATTTCCTTATTCTTTCTCACCGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=113,102;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:1,1:2,0:0|1:25077986_A_ATAT:25077986:0,5,0,1
chr13	25255009	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	25262493	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,0:6,4:11,4,0,4
chr13	25263299	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr13	25264715	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0|1:25264715_G_A:25264715:4,2,2,0
chr13	25264723	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:25264715_G_A:25264715:5,2,2,0
chr13	25265103	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,6:8,7:12,4,5,8
chr13	25265139	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.493:39:10,8:8,11:12,8,6,13
chr13	25266886	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,0:5,3:3,2,3,0
chr13	25266932	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,5:4,3:3,3,6,2
chr13	25267088	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=100,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,1,3
chr13	25268776	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=178,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr13	25272775	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr13	25276157	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:5,2:13,1:7,11,2,1
chr13	25283657	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,1:2,4:4,5,0,5
chr13	25283744	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	25284027	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=106,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:25284027_GC_AT:25284027:1,1,0,1
chr13	25284031	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=106,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:25284027_GC_AT:25284027:1,1,0,1
chr13	25284035	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=106,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25284027_GC_AT:25284027:0,1,0,1
chr13	25284532	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,3:2,0:9,0,3,0
chr13	25284834	.	C	CCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:25284834_C_CCAT:25284834:2,1,0,1
chr13	25284837	.	G	GACACTTCTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:25284834_C_CCAT:25284834:2,1,0,1
chr13	25355965	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	25363776	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr13	25370255	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr13	25373432	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr13	25373515	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,2:7,4:7,6,3,3
chr13	25376420	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	25399677	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	25399752	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr13	25404743	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,3,17
chr13	25417795	.	TATC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	25442921	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr13	25457595	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	25458232	.	AGTT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=101.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,11,15
chr13	25458267	.	G	GAATT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATT;STR;TLOD=138.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,14:0,17:0,0,17,15
chr13	25458650	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr13	25459657	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr13	25466774	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr13	25466955	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.957:43:1,19:0,23:0,1,20,22
chr13	25467010	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=111,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.280:26:2,4:12,2:4,15,0,7
chr13	25480295	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=91,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.326:26:12,2:3,6:10,8,4,4
chr13	25483934	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=99,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:16,4:14,0:14,16,4,0
chr13	25486287	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr13	25486966	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=101,231;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,0:10,4:8,15,4,0
chr13	25671826	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,5:3,6:5,5,7,4
chr13	25672323	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,3:10,0:8,7,3,0
chr13	25673492	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	25716050	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25716050_G_GT:25716050:0,0,0,1
chr13	25716052	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25716050_G_GT:25716050:0,0,0,1
chr13	25716058	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25716050_G_GT:25716050:0,0,0,1
chr13	25716060	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25716050_G_GT:25716050:0,0,0,1
chr13	25825889	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:16,9:6,5:10,12,7,7
chr13	25841842	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr13	25848404	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	25886932	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr13	25893363	.	GTTTATA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTATA;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr13	25901165	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.386:50:14,10:15,9:14,17,7,12
chr13	25905416	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	25911050	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31,28;MFRL=171,148,118;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.26,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,4:0.330,0.279:14:3,5,1:1,0,1:4,1,6,3
chr13	26104305	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:1,7,0,2
chr13	26112040	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr13	26125651	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=99,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:9,6:3,4:3,9,4,6
chr13	26125731	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=275,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr13	26137989	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	26144896	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:6,5:8,7:6,8,6,6
chr13	26155953	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=78,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:3,7:8,8:6,5,9,6
chr13	26273538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr13	26273574	.	T	TCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26273574_T_TCCA:26273574:0,0,0,1
chr13	26273575	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26273574_T_TCCA:26273574:0,0,0,1
chr13	26411271	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=134,79;MMQ=60,53;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:12,4:6,0:14,6,4,0
chr13	26411304	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=120,79;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:21,5:11,0:20,14,4,1
chr13	26535625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr13	26586578	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=220,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.483:4:1,0:0,0:0|1:26586578_C_G:26586578:2,0,2,0
chr13	26586583	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.353:6:0,0:1,0:0|1:26586578_C_G:26586578:4,0,2,0
chr13	26586589	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,14;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:1,0:3,0:0|1:26586578_C_G:26586578:5,1,2,0
chr13	26586775	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr13	26586788	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr13	26789576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,1:9,1:2,9,0,2
chr13	26974562	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr13	26975608	.	CCAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAG;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:8,0,2,0
chr13	27246216	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:27246216_T_C:27246216:0,2,0,1
chr13	27246226	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27246216_T_C:27246216:0,0,0,1
chr13	27250835	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,2:8,1:6,11,1,2
chr13	27259809	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.625:38:7,13:7,11:9,5,18,6
chr13	27745840	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,3:4,9:2,5,1,11
chr13	27827811	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,4:4,5:7,0,9,0
chr13	27828496	.	A	AACCTCTTCTGGAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr13	27829310	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr13	27845855	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:6,3:9,7,2,1
chr13	27999278	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=99,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.092:40:12,0:25,3:9,28,1,2
chr13	27999303	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:9,0:15,4:3,21,0,4
chr13	28003997	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=98,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,22:0.384:58:20,10:14,12:21,15,14,8
chr13	28010117	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	28011158	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,158;MMQ=53,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr13	28011322	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:19,4:23,0:22,20,4,1
chr13	28014154	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=76,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.380:40:9,15:16,0:16,9,15,0
chr13	28134072	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,124;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.090:58:28,0:25,4:14,39,0,5
chr13	28197436	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr13	28367275	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	28367956	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.592:23:7,7:2,4:3,6,4,10
chr13	28498323	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	28519354	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,19:0,0,17,22
chr13	28519376	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=113,105;MMQ=60,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.102:46:25,3:17,1:18,24,0,4
chr13	28537242	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=106,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:7,4,3,0
chr13	28537537	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr13	28539185	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:8,6:2,0:3,7,2,5
chr13	28562677	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:6,5,2,1
chr13	28589267	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:2,4:3,4,6,4
chr13	28589662	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr13	28592546	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,2:7,2:13,1,3,1
chr13	28602226	.	AAGAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AG;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	28602256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr13	28602292	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,3:6,2:5,5,4,2
chr13	28607989	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=266,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:0,9:2,7:2,0,12,4
chr13	28609825	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,4:5,4:4,8,2,6
chr13	28609829	.	AA	CT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:6,1:4,11,0,2
chr13	28609846	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr13	28609991	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0|1:28609991_T_C:28609991:2,0,2,1
chr13	28609997	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:28609991_T_C:28609991:3,0,2,1
chr13	28610085	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:11,0:10,3:13,9,2,1
chr13	28610183	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=107,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,10:7,2:4,7,6,6
chr13	28622356	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr13	28623955	.	T	TAATAACTGTATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,1,1
chr13	28834482	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=168,176;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:9,1:0|1:28834482_G_C:28834482:15,0,2,0
chr13	28834487	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:6,0:9,3:0|1:28834482_G_C:28834482:16,0,3,0
chr13	28834518	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=146,92;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:8,2:23,0:0|1:28834518_A_G:28834518:21,10,1,1
chr13	28834526	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=137,92;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:6,2:22,0:0|1:28834518_A_G:28834518:18,11,1,1
chr13	28834530	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=137,92;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:8,2:23,0:19,12,1,1
chr13	28835527	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr13	28851443	.	CG	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:19,2:20,0:22,20,1,1
chr13	28882948	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr13	28882972	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=81,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:9,1:0|1:28882972_C_T:28882972:9,8,1,1
chr13	28882979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=81,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,0:11,2:0|1:28882972_C_T:28882972:9,10,1,1
chr13	28885672	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr13	28886113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr13	28893484	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=141,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr13	28895524	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	28942721	.	TGATGATGATGATGAC	T	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.111:47:13,4:10,1:37,5,3,2
chr13	28942736	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=128,63;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:17,4:21,0:34,6,4,0
chr13	28942801	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=111,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,4:0.055:89:56,0:27,4:0|1:28942801_C_T:28942801:59,26,4,0
chr13	28942810	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,3:0.049:80:45,0:23,3:0|1:28942801_C_T:28942801:53,24,3,0
chr13	28942840	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=34,21;MFRL=112,97;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:3,2:0,2:3,1,2,6
chr13	28958955	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr13	28980025	.	G	GATTATTTTAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr13	28980036	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	29041007	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:5,0:0,3:3,2,3,0
chr13	29041826	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr13	29236489	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:6,3:6,3:10,3,6,0
chr13	29238576	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:16,8:2,8:18,1,16,0
chr13	29252060	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=236,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29252060_T_C:29252060:1,0,1,0
chr13	29252073	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=240,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:29252060_T_C:29252060:2,0,1,0
chr13	29274977	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr13	29287302	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,2:18,0:0|1:29287302_C_A:29287302:13,17,1,1
chr13	29287306	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,2:20,0:0|1:29287302_C_A:29287302:14,18,1,1
chr13	29291886	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr13	29600660	.	C	CACACACACACACACA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:8,11,0,2
chr13	29608222	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=109,135;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:11,0:18,4:19,11,0,4
chr13	29674840	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr13	29674855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr13	29855822	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr13	29898881	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,4,7
chr13	29898889	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,2,7
chr13	30003042	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=91,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.213:45:10,0:25,9:15,21,0,9
chr13	30014103	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=118,141;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:21,3:12,0:21,13,0,3
chr13	30071310	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr13	30077088	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr13	30090404	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,8,17
chr13	30091516	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr13	30091882	.	A	AGAAGGAGTGTGT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=110,210;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.083:35:17,2:16,0:0|1:30091882_A_AGAAGGAGTGTGT:30091882:17,16,0,2
chr13	30091885	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=110,210;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.083:35:16,2:15,0:0|1:30091882_A_AGAAGGAGTGTGT:30091882:17,16,0,2
chr13	30091886	.	C	CGTGTGTGCGCGTGCGTGTGTGTGTG	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=116,210;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:15,0:0|1:30091882_A_AGAAGGAGTGTGT:30091882:16,16,0,2
chr13	30097307	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr13	30098215	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,6:0,13:0,0,18,2
chr13	30098226	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,6:0,15:0,0,17,4
chr13	30106989	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=95,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.104:36:23,1:10,2:0|1:30106989_G_A:30106989:15,18,1,2
chr13	30106991	.	ATAT	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=108,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:25,0:11,2:0|1:30106989_G_A:30106989:19,20,1,1
chr13	30106998	.	GGG	TTT	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=108,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:26,0:10,2:0|1:30106989_G_A:30106989:18,21,1,1
chr13	30109939	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=196,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,7:0,11:1,0,11,7
chr13	30346392	.	CTATAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	30351248	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=62.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,10:0,10:0,0,16,4
chr13	30521992	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	30782896	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,1:1,4:0,2,1,4
chr13	30804673	.	C	CAACACCCACTTTTCTCAGCCTGGTGAGAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=201,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:3,4,1,1
chr13	30805627	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,6:3,5:0,6,1,10
chr13	30829757	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.339:15:1,2:4,2:4,6,2,3
chr13	31036642	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:15,10:8,16:11,12,18,8
chr13	31036681	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=79,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,36:0.928:38:0,16:2,19:1,1,15,21
chr13	31037608	.	GC	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=135,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.097:37:16,0:15,3:22,12,0,3
chr13	31037611	.	T	TG	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=132,240;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:16,0:15,3:0|1:31037611_T_TG:31037611:25,13,0,3
chr13	31037613	.	C	CA	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=128,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:19,0:17,3:0|1:31037611_T_TG:31037611:29,15,0,3
chr13	31037616	.	AATT	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=123,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:22,0:23,3:0|1:31037611_T_TG:31037611:29,22,0,3
chr13	31037620	.	G	GAAAA	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=109,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:24,0:24,3:0|1:31037611_T_TG:31037611:26,22,0,3
chr13	31037845	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=258,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr13	31037858	.	T	TAATTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=252,217;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	31231513	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:0,2:6,0,4,0
chr13	31231806	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:4,7:7,7:5,6,5,9
chr13	31318308	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:9,3:2,3:5,6,3,4
chr13	31480827	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr13	31531195	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,2:0,7:1,0,3,6
chr13	31540569	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=117,150;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.179:23:11,3:8,0:17,2,0,4
chr13	31722620	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.491:18:2,2:4,6:0,9,0,9
chr13	31725260	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:2,3:7,5:3,7,4,4
chr13	31725732	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:4,6:6,3:5,5,5,4
chr13	31733057	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,3:6,7:1,8,0,10
chr13	31789169	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.443:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr13	31796969	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr13	31821093	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.704:11:3,3:0,5:3,0,6,2
chr13	31821256	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:2,5,3,4
chr13	31821992	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,6:1,9:1,0,8,8
chr13	31835250	.	C	CTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,30;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:31835250_C_CTGA:31835250:0,2,0,1
chr13	31835253	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:31835250_C_CTGA:31835250:0,2,0,1
chr13	31835268	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	31843237	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,2:0,6:1,0,6,2
chr13	31843508	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	31850989	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr13	31903834	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr13	31903841	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:6,4,2,2
chr13	32313941	.	TAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	32340193	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,7:0,0,6,16
chr13	32360691	.	T	TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.477:17:1,4:6,4:5,4,5,3
chr13	32371651	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	32691488	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,2:15,0:25,13,1,1
chr13	32698321	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr13	32705785	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:3,0:6,3:8,1,2,1
chr13	32708993	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:8,2:1,4:8,1,6,0
chr13	32711016	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,0:16,3:14,14,1,2
chr13	32711210	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr13	32721615	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr13	32723799	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=201,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:5,0,6,1
chr13	32731518	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=92,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.245:51:20,0:19,12:21,18,0,12
chr13	32735427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:0,1:2,9:0,2,0,10
chr13	32745077	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,3:3,0:6,0,3,0
chr13	32747558	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:14,4,1,1
chr13	32747731	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:1,5:3,4:0,4,0,9
chr13	32758834	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,14:0,0,15,16
chr13	32768500	.	G	GACACTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32768500_G_GACACTCTTC:32768500:0,1,0,1
chr13	32768503	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32768500_G_GACACTCTTC:32768500:0,1,0,1
chr13	32776253	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr13	32786416	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,14,9
chr13	32786614	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr13	32792814	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,3:0|1:32792814_CA_C:32792814:1,2,3,0
chr13	32792834	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:1,0:4,0:0|1:32792814_CA_C:32792814:2,3,3,0
chr13	32792836	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:0,0:4,1:0|1:32792814_CA_C:32792814:2,3,3,0
chr13	32813818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=252,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	32814013	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:22,4:2,0:10,14,0,4
chr13	32823882	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr13	32825913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chr13	32825941	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:4,2,6,0
chr13	32828553	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.488:31:7,9:8,6:3,13,5,10
chr13	32839688	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,3:9,0:14,9,3,0
chr13	32852585	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:5,8:8,8:8,5,12,4
chr13	32882912	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.365:12:4,1:4,3:3,5,1,3
chr13	32890572	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=122.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,23,17
chr13	32905219	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.266:16:3,2:7,1:2,10,0,4
chr13	32905265	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr13	32907535	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.244:32:6,4:16,4:9,15,1,7
chr13	32915410	.	CAATT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr13	32918875	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,205;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr13	32929232	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:8,6:2,1:6,4,5,2
chr13	32930824	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=309,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:32930824_C_CTT:32930824:0,1,0,1
chr13	32930831	.	T	TGTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=309,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32930824_C_CTT:32930824:0,1,0,1
chr13	32930833	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=309,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32930824_C_CTT:32930824:0,1,0,1
chr13	32936646	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:8,7:9,3:10,7,7,3
chr13	32944995	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=176,146;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr13	32953388	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr13	33012737	.	AAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=168,128;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:9,1,2,0
chr13	33012762	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:5,3:7,2:11,4,5,0
chr13	33012780	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=112,47;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:14,2:17,2:24,8,3,1
chr13	33018238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=111,63;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,0:7,3:1,15,0,3
chr13	33095620	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=482,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,9:0,10:0,1,7,12
chr13	33101731	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	33274021	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:17,2:31,0:0|1:33274021_G_A:33274021:22,26,0,2
chr13	33274026	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:15,2:30,0:0|1:33274021_G_A:33274021:20,27,0,2
chr13	33309350	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=103,115;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:21,0:24,9:23,22,0,9
chr13	33315186	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,18:0,12:0|1:33315186_C_T:33315186:0,0,25,6
chr13	33315189	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.972:32:0,18:0,11:0|1:33315186_C_T:33315186:0,0,26,6
chr13	33329954	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.430:43:10,12:13,7:20,4,15,4
chr13	33334769	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,226;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:20,4:16,0:23,13,4,0
chr13	33338703	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,1:6,0:10,9,0,5
chr13	33344887	.	CA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.178:38:12,4:18,2:12,20,2,4
chr13	33349235	.	C	CTTT,CTTTTTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24,19;MFRL=0,191,122;MMQ=60,60,42;MPOS=25,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,18,22;RU=T;STR;TLOD=3.06,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.293,0.612:4:0,0,0:0,1,1:0,0,0,4
chr13	33590851	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,17,2
chr13	33627829	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	33635939	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	33635976	.	T	TACCGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	33703604	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=90,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:12,0:11,3:9,14,1,2
chr13	33741572	.	AAGCGAAGCAAAATGGGCGAGAAAAAAAAATCTGGAAGTCAAAACACACCACAGGATACGTGTGGTTCATTTTGGATTTATTCTCTGTGTAAG	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.074:39:6,0:1,2:0|1:33741572_AAGCGAAGCAAAATGGGCGAGAAAAAAAAATCTGGAAGTCAAAACACACCACAGGATACGTGTGGTTCATTTTGGATTTATTCTCTGTGTAAG_A:33741572:30,6,3,0
chr13	33741585	.	TGGGCGAGAAAAAAAAATCTGGAAGTCAAAACACACCACAGGATACGTGTGGTTCATTTTGGATTTATTCTCTGTGTAAGAGCGAAGCGAA	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=-48;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:38,18:0.085:56:3,2:1,7:1|0:33741572_AAGCGAAGCAAAATGGGCGAGAAAAAAAAATCTGGAAGTCAAAACACACCACAGGATACGTGTGGTTCATTTTGGATTTATTCTCTGTGTAAG_A:33741572:30,8,18,0
chr13	34398062	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.118:50:16,0:27,5:26,18,3,3
chr13	35615221	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:10,11,2,1
chr13	35618991	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	35692534	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,77;MMQ=53,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,3:10,0:14,11,2,1
chr13	35738430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr13	35747808	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,0:4,11:0,8,0,11
chr13	35806549	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr13	35926497	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr13	36006598	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr13	36050493	.	TT	GC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=128,179;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:10,1:12,3:0|1:36050493_TT_GC:36050493:6,17,1,3
chr13	36050496	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,179;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:8,1:13,2:0|1:36050493_TT_GC:36050493:6,17,1,3
chr13	36051435	.	TCTTTTCTCCATTTGTTGAATCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=96,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr13	36129189	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:4,9,2,1
chr13	36141009	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr13	36167591	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,0:4,3:2,6,0,3
chr13	36224051	.	TACTGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGGG;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	36225929	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,16,10
chr13	36401731	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:1,3:4,3:5,2,5,1
chr13	36401746	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.559:13:1,2:2,5:4,2,4,3
chr13	36402475	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr13	36424985	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,3:2,5:1,2,0,9
chr13	36428595	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr13	36521433	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,5:0,0:1,1,5,0
chr13	36521460	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=92,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,7:1,1:2,2,6,2
chr13	36521479	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.178:17:7,2:4,1:9,5,2,1
chr13	36700350	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	36747798	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr13	36801579	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:36801579_A_G:36801579:0,2,1,3
chr13	36801587	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:0,2:0|1:36801579_A_G:36801579:0,2,1,3
chr13	36805289	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.367:14:6,3:2,2:9,0,4,1
chr13	36822711	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,4:4,0:6,5,2,2
chr13	36822849	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=215,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr13	36827896	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:7,3,6,0
chr13	36828092	.	G	GTTTTGTAAGCA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:0,1:5,2:3,2,0,3
chr13	36857500	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	36869843	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=275,268;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr13	36888507	.	TTACCA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:2,0:13,2:4,11,1,1
chr13	36905540	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=93,27223355;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,0:16,2:20,9,1,1
chr13	36909980	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=160,1119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr13	36940028	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr13	36940051	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=69,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,0:2,1:0|1:36940051_C_T:36940051:0,2,0,1
chr13	36940056	.	A	ACAGTCTTTTACCTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=69,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36940051_C_T:36940051:0,2,0,1
chr13	36940058	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=69,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:36940051_C_T:36940051:0,2,0,1
chr13	37011950	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=100,117;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:12,0:6,15,3,0
chr13	37012148	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,4:5,0:10,4,4,0
chr13	37269835	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,4,12
chr13	37271428	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr13	37271449	.	AAT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.802:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr13	37271609	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,7:0,0,8,10
chr13	37393979	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,184;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.148:52:26,7:19,0:21,24,7,0
chr13	37401917	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,5,13
chr13	37423032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	37526560	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	37539875	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=127,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:4,0:14,2:0|1:37539875_G_T:37539875:5,14,0,2
chr13	37539881	.	A	AATGGACAAACAAAACCACCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=125,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:11,2:0|1:37539875_G_T:37539875:3,11,0,2
chr13	37546214	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:5,15,0,2
chr13	37546280	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr13	37563791	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr13	37569200	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,3,15
chr13	37579962	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,124;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:9,0,2,0
chr13	37580139	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=116,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,33:0.810:40:5,17:2,16:3,4,17,16
chr13	37581051	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr13	37582122	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.358:11:5,3:2,1:6,1,3,1
chr13	37583037	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,2:1,0:0,7,0,2
chr13	37583831	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.518:58:15,19:12,11:18,10,19,11
chr13	37584838	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr13	37584867	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37584867_G_T:37584867:0,2,0,1
chr13	37584872	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37584867_G_T:37584867:0,2,0,1
chr13	37584875	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37584867_G_T:37584867:0,2,0,1
chr13	37593424	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:11,5:7,8:10,8,11,2
chr13	37598113	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	37600284	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,2:7,9:9,3,6,5
chr13	37625770	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr13	37679633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:14,2:5,1:11,8,2,1
chr13	38138689	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,4:6,0:9,6,2,2
chr13	38138730	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr13	38144901	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr13	38148868	.	T	TTTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=157,104;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38148868_T_TTTTTC:38148868:0,3,0,1
chr13	38148873	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=157,104;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38148868_T_TTTTTC:38148868:0,3,0,1
chr13	38148877	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=157,104;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:38148868_T_TTTTTC:38148868:0,3,0,1
chr13	38148879	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=158,104;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38148868_T_TTTTTC:38148868:0,2,0,1
chr13	38152959	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.393:42:5,6:18,10:7,19,2,14
chr13	38153130	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr13	38153351	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=81,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:6,4,3,2
chr13	38154161	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr13	38154189	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr13	38154905	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr13	38164445	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr13	38166357	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,3,17
chr13	38166418	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=224,229;MMQ=49,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr13	38172867	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:2,4,3,6
chr13	38172896	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:1,5,1,3
chr13	38211636	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:14,4:12,0:15,11,4,0
chr13	38213530	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:38213530_T_A:38213530:0,1,0,3
chr13	38213537	.	T	TGCTGTGGGTGCAAAGAAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,38;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:38213530_T_A:38213530:0,1,0,3
chr13	38225639	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=280,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr13	38237872	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,11,16
chr13	38320594	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25,24;MFRL=134,140,189;MMQ=60,60,60;MPOS=31,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.57,10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,5:0.376,0.473:10:1,3,2:0,0,2:0,1,0,9
chr13	38357024	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	38357494	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr13	38924184	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=134,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:26,0:21,4:23,24,0,4
chr13	38924263	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,25:0,11:0,0,11,25
chr13	38932194	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.524:11:2,2:2,4:2,3,6,0
chr13	38932207	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=73,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.338:12:3,1:4,3:2,6,4,0
chr13	38932317	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:25,4:24,0:19,30,0,4
chr13	38933514	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:5,6:3,7:4,4,4,9
chr13	39262390	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:14,8,3,0
chr13	39263023	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,27;MFRL=80,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.610:10:2,5:0,1:1,3,2,4
chr13	39263054	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:3,1:4,9,0,2
chr13	39263714	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr13	39263768	.	TTGAC	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=92,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAC;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:9,2:16,0:16,9,1,1
chr13	39264708	.	TAGTAATG	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:3,0:0|1:39264708_TAGTAATG_T:39264708:5,5,1,1
chr13	39264717	.	AAGGT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=122,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:39264708_TAGTAATG_T:39264708:6,5,1,1
chr13	39264728	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:39264708_TAGTAATG_T:39264708:5,6,1,1
chr13	39264730	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0|1:39264708_TAGTAATG_T:39264708:5,6,1,1
chr13	39265896	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,1:4,2:10,6,3,0
chr13	39266402	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,117;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:5,0:8,3:4,10,0,4
chr13	39338612	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr13	39358942	.	G	GGCACCTGGCAAGTTCCCGACCCAGGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:39358942_G_GGCACCTGGCAAGTTCCCGACCCAGGC:39358942:0,6,1,1
chr13	39358944	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:0|1:39358942_G_GGCACCTGGCAAGTTCCCGACCCAGGC:39358942:0,6,1,1
chr13	39422504	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=229,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr13	39430314	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=81,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.538:33:5,4:10,12:10,5,8,10
chr13	39542531	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,9,8
chr13	39588414	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:26,1:13,2:21,18,0,3
chr13	39598698	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:2,1:3,2:1,4,0,4
chr13	39600540	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:39600540_G_A:39600540:0,4,1,1
chr13	39600543	.	G	GCACTGTTTGCGTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=194,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:39600540_G_A:39600540:0,5,1,1
chr13	39603384	.	TAAA	T,TAAAAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,18,0;MFRL=86,110,49;MMQ=43,60,60;MPOS=11,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,19,36;RU=A;STR;TLOD=3.24,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.173,0.478:5:0,1,0:1,0,0:1,0,1,3
chr13	39608335	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=24,27,20,20;MFRL=124,189,95,81;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,24,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.02,10.35,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,4,8,10:0.102,0.179,0.179:44:6,1,1,7:12,3,7,1:8,14,10,12
chr13	39608357	.	ACAGAG	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:15,2:18,1:0|1:39608357_ACAGAG_A:39608357:8,27,0,3
chr13	39608364	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:14,2:14,1:0|1:39608357_ACAGAG_A:39608357:5,25,0,3
chr13	39612757	.	TC	T	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=128,49;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:26,1:20,0:0|1:39612757_TC_T:39612757:24,22,1,1
chr13	39612760	.	TG	T	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=27,18;MFRL=128,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:24,1:20,0:0|1:39612757_TC_T:39612757:26,23,1,1
chr13	39612764	.	T	TC	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:26,2:18,0:0|1:39612757_TC_T:39612757:25,23,2,1
chr13	39612766	.	CCCG	C	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=128,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:28,2:18,1:0|1:39612757_TC_T:39612757:27,25,2,1
chr13	39612772	.	TGG	T	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=126,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.061:64:31,1:16,1:0|1:39612757_TC_T:39612757:33,28,2,1
chr13	39612775	.	TCATGGCGAGA	T	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=126,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,3:0.057:68:36,1:17,1:0|1:39612757_TC_T:39612757:35,30,2,1
chr13	39612789	.	TG	T	.	.	DP=69;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=126,49;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:37,2:21,0:0|1:39612757_TC_T:39612757:36,30,1,1
chr13	39613202	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39613202_C_T:39613202:2,0,1,0
chr13	39613208	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:39613202_C_T:39613202:1,1,1,0
chr13	39613743	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=82,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:19,3:13,0:21,12,1,2
chr13	39618366	.	TTGTG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,13;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=TG;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.506:8:1,1:1,0:0,4,0,4
chr13	40229724	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:1,2:0,1:2,0,4,0
chr13	40229842	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:2,3:5,1:5,2,3,1
chr13	40230043	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,9:10,9:6,13,8,10
chr13	40233404	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr13	40233691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	40239139	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:1,13:0,14:1,0,21,6
chr13	40254151	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=114,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,8:0.111:77:44,0:24,8:37,32,4,4
chr13	40254281	.	TCAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr13	40256483	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0,8,1,6
chr13	40268930	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:5,8:2,5:2,5,3,10
chr13	40293288	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr13	40298620	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.535:19:5,6:3,3:0|1:40298620_CT_C:40298620:8,1,8,2
chr13	40298622	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.535:19:5,6:4,3:0|1:40298620_CT_C:40298620:8,1,8,2
chr13	40298639	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.335:17:6,1:3,2:6,5,2,4
chr13	40298805	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	40301763	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr13	40325310	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr13	41134831	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=77,127;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:9,11,0,2
chr13	41333256	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=146,67;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,5:8,1:6,11,2,4
chr13	41333302	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,253;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:1,10,0,2
chr13	41340844	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:12,0,2,0
chr13	41495924	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	41515371	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:7,8:9,3:7,9,4,7
chr13	41525586	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,7:2,3:0,3,5,5
chr13	41532969	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:4,0:3,3:3,4,3,0
chr13	41639445	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=199,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:41639445_AAG_A:41639445:0,4,1,0
chr13	41639450	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=199,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:41639445_AAG_A:41639445:0,4,1,0
chr13	41650421	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:41650421_T_G:41650421:0,4,0,1
chr13	41650424	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41650424_T_G:41650424:0,4,0,1
chr13	41650426	.	T	A,G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,24,29;MFRL=153,174,139;MMQ=60,60,60;MPOS=9,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,1:3,1,0:0,3,0,2
chr13	41650428	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41650424_T_G:41650424:0,4,0,1
chr13	41650431	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:41650421_T_G:41650421:0,4,0,1
chr13	41650432	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41650432_T_G:41650432:0,4,0,1
chr13	41650433	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41650432_T_G:41650432:0,4,0,1
chr13	41768731	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr13	41791440	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr13	41807950	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	41814298	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,174;MMQ=52,44;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr13	41828576	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=125,182;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:4,0:0|1:41828576_A_G:41828576:7,0,2,0
chr13	41828586	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=124,182;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0|1:41828576_A_G:41828576:7,2,2,0
chr13	41834578	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	41835076	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr13	41835089	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	41893105	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr13	41949804	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	42043030	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr13	42043086	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	42044508	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr13	42149905	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:9,9,1,1
chr13	42149920	.	T	TTGTTTGTTTTTTAGTA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:16,0:8,2:10,14,1,1
chr13	42161863	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr13	42189232	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,8,12
chr13	42275473	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=233,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:1,0,9,1
chr13	42306139	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr13	42335222	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:8,3,6,4
chr13	42358081	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,235;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,0:5,5:1,5,1,4
chr13	42361743	.	T	TACAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=AC;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.549:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr13	42407759	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr13	42465490	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr13	42465686	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=140,79;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,0:10,3:5,9,0,3
chr13	42465713	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:0,5:7,6:4,3,3,8
chr13	42481712	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,19,8
chr13	42486383	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=249,263;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	42701717	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:6,7:6,2:5,8,3,6
chr13	42701739	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=76,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:2,7,1,5
chr13	42701803	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=80,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr13	42733380	.	C	CTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=T;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,2:0,0,2,4
chr13	42748118	.	T	TGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=135,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GC;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,1:4,5:4,2,4,2
chr13	42748136	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:4,6:4,3:5,6,7,3
chr13	42763290	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:5,6:10,0:8,7,7,0
chr13	42764439	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr13	42769145	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=93,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:8,0:9,2:0|1:42769145_C_T:42769145:4,14,1,1
chr13	42769153	.	G	GGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=93,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:42769145_C_T:42769145:4,12,1,1
chr13	42772717	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=40,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:11,7:12,11:10,13,10,8
chr13	42772774	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,22;MFRL=56,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:0,1:0,1:0,2,0,4
chr13	42774088	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=237,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr13	42780367	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=112,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr13	42783574	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=91,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:19,0:25,4:14,30,0,4
chr13	42784968	.	T	TAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42784968_T_TAGA:42784968:0,1,0,1
chr13	42784969	.	C	CTTTTTAATTTTGGAGCATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42784968_T_TAGA:42784968:0,1,0,1
chr13	42789858	.	TACC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42789858_TACC_T:42789858:0,3,0,1
chr13	42789862	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42789858_TACC_T:42789858:0,3,0,1
chr13	42789865	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:42789858_TACC_T:42789858:0,2,0,1
chr13	42793298	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr13	42793766	.	AGGTTTTTC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:6,0,9,1
chr13	42794004	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:0,6,0,4
chr13	42803130	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr13	42803341	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr13	42869720	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	42873403	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	42873524	.	CC	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:8,6,1,1
chr13	42877050	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:42877050_C_T:42877050:11,9,1,1
chr13	42877056	.	A	ATAAACGTTCTGCTTCTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:42877050_C_T:42877050:12,8,1,1
chr13	42877264	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,4:8,0:8,5,4,0
chr13	42877880	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,6:9,0:8,4,6,0
chr13	42882762	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr13	43155443	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,19:0,0,17,21
chr13	43358176	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:4,1,7,2
chr13	43358274	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=103,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,0:10,2:17,8,3,0
chr13	43358309	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.627:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr13	43462352	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:6,3:5,7:7,4,10,0
chr13	43463299	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,5:9,3:9,5,5,3
chr13	43474371	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr13	43491709	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=90,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:43491709_A_C:43491709:14,8,1,1
chr13	43491714	.	C	CCCTTGAGGGCAGGGGTCT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=90,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:7,2:0|1:43491709_A_C:43491709:14,8,1,1
chr13	43493435	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:43493435_C_T:43493435:8,12,1,1
chr13	43493456	.	GGAT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:43493435_C_T:43493435:10,12,1,1
chr13	43566373	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr13	43597706	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr13	43597932	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr13	43660044	.	C	CATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr13	43681309	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=99,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:13,0:25,3:0|1:43681309_C_T:43681309:31,9,3,0
chr13	43681322	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:15,0:22,2:0|1:43681309_C_T:43681309:25,12,3,0
chr13	43681426	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=64,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.424:18:2,4:5,2:5,6,0,7
chr13	43681427	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,10:0,16:0,0,13,14
chr13	43788031	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=226,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr13	43798348	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr13	43839494	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr13	43843569	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,5,2
chr13	43843812	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:43843812_A_G:43843812:0,0,0,4
chr13	43843814	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0|1:43843812_A_G:43843812:0,0,0,1
chr13	43872419	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr13	43872451	.	C	CAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.528:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr13	43918819	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:13,0:21,4:15,19,0,4
chr13	43930337	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=203,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,2:3,4:0,6,1,6
chr13	43935405	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,3:7,4:6,2,6,1
chr13	43935641	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:43935641_G_C:43935641:0,4,0,1
chr13	43935644	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:43935641_G_C:43935641:0,4,0,1
chr13	44433952	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,4:16,0:13,19,3,1
chr13	44434281	.	TAATG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr13	44443036	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44443036_A_T:44443036:0,0,0,1
chr13	44443039	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44443036_A_T:44443036:0,0,0,1
chr13	44948292	.	GGGTGGGGCGGAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.764:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	45010148	.	TTTAGTATAAATGATTTTTCA	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,2:0.033:88:30,0:32,2:61,25,1,1
chr13	45010283	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=139.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,21:0,21:0,0,7,36
chr13	45010616	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,26:0.509:51:11,13:13,13:19,6,16,10
chr13	45147914	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:13,2:8,2:15,7,2,2
chr13	45148705	.	TTGC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGC;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,1:6,4:3,9,2,3
chr13	45149445	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:13,10:9,0:14,8,10,0
chr13	45150226	.	G	GTTTAGACACAGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	45517486	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25,31;MFRL=92,148,116;MMQ=60,60,60;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=AC;STR;TLOD=4.62,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.276,0.266:9:1,0,1:4,2,0:4,1,4,0
chr13	45533481	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr13	45540136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr13	45556291	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.227:22:10,0:4,5:1,16,1,4
chr13	45589616	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:7,9:10,6:11,6,7,8
chr13	45781539	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.229:28:12,4:8,2:19,3,6,0
chr13	45914957	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=193.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,33:0,33:0,0,28,38
chr13	45964059	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr13	45973231	.	GA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,16,25;MFRL=172,185,167;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.34,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,4:0.420,0.417:9:0,0,0:0,1,2:0,1,1,7
chr13	45976349	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,2:4,8:6,0,8,2
chr13	45985583	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.627:30:6,12:5,7:6,5,10,9
chr13	45985608	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=112,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.577:26:7,7:3,8:4,7,6,9
chr13	46039407	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr13	46050519	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:5,5:8,3:2,11,2,6
chr13	46060612	.	TCCCC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=C;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,2:13,0:12,13,1,1
chr13	46067516	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.180:59:27,10:21,0:25,24,10,0
chr13	46077301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr13	46085864	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,7:0,2:0,0,7,4
chr13	46099243	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,8:0,0,3,13
chr13	46104130	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	46108853	.	TG	CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,22:0,0,17,20
chr13	46115731	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,5:7,5:6,8,5,5
chr13	46115812	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:9,7,2,0
chr13	46115842	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=118,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:4,5,3,2
chr13	46115908	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr13	46137837	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.423:36:12,7:8,8:9,12,8,7
chr13	46288069	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46288069_C_T:46288069:0,0,1,0
chr13	46288092	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46288069_C_T:46288069:0,0,1,0
chr13	46425586	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr13	46539442	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=89,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:7,0:14,4:11,11,2,2
chr13	46543236	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=76,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,21:0.400:53:14,16:18,5:15,17,11,10
chr13	46549610	.	TCC	T	.	.	DP=130;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=95,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,8:0.088:92:34,3:48,5:32,52,3,5
chr13	46549845	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=107,160;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,6:0.087:72:22,0:44,5:20,46,3,3
chr13	46549883	.	A	AT	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.049:58:18,2:38,0:0|1:46549883_A_AT:46549883:11,45,1,1
chr13	46549884	.	C	CCATCCATCCATCCATCATCCATCCA	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.049:58:18,2:38,0:0|1:46549883_A_AT:46549883:11,45,1,1
chr13	46550061	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr13	46577356	.	C	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=109,110;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.144:60:31,8:19,0:30,22,8,0
chr13	46619026	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr13	46619499	.	CCTGTGACTATACTAGTGACAACTCACCTCTGCTGTACTGCCAGTGCTGGGTCCAAGCCTCTCAAATACACTGGGTCTTCGGGATGTGCTATCAGATATAGTCTTGGTATTTTCCA	C	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,6:0.041:77:9,1:9,2:31,40,5,1
chr13	46619578	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:9,4:22,0:9,24,3,1
chr13	46627677	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr13	46629995	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr13	46632226	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr13	46638904	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:1,0:5,8:0|1:46638904_C_T:46638904:1,5,0,8
chr13	46638910	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,0:3,8:0|1:46638904_C_T:46638904:0,4,0,8
chr13	46728924	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:11,11:12,11:13,10,15,7
chr13	46733726	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.141:47:21,2:20,4:25,16,4,2
chr13	46836201	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr13	46919762	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.609:16:2,4:4,5:3,3,1,9
chr13	46919786	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,6:1,4:0,2,1,9
chr13	46923344	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,4:9,0:15,4,3,1
chr13	46930536	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.497:44:12,7:10,14:12,10,11,11
chr13	46937193	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:1,0,3,1
chr13	46942081	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr13	46946289	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,3:11,1:15,14,0,4
chr13	47224560	.	CCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47224560_CCCT_C:47224560:0,4,0,1
chr13	47224564	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47224560_CCCT_C:47224560:0,4,0,1
chr13	47224568	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47224560_CCCT_C:47224560:0,4,0,1
chr13	47224570	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,22;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47224560_CCCT_C:47224560:0,4,0,1
chr13	47224574	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47224560_CCCT_C:47224560:0,4,0,1
chr13	47243357	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr13	47261970	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,7:3,5:4,2,8,4
chr13	47273458	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:7,5,5,0
chr13	47273595	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=113,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:8,0:7,6:10,7,1,5
chr13	47279375	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.526:19:6,6:3,4:3,6,7,3
chr13	47297352	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,13:0,12:0,0,17,10
chr13	47302934	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr13	47315807	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=96,85;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.215:35:13,7:15,0:16,12,7,0
chr13	47345469	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.754:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr13	47365388	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr13	47365450	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:8,8:9,4:12,5,11,1
chr13	47466781	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=127,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:0,9,1,1
chr13	47469883	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:7,10,0,2
chr13	48528178	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	48528267	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=116,115;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:15,6:9,0:18,7,6,0
chr13	48563008	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:6,3:3,3:5,4,4,2
chr13	48571213	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr13	48575292	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.453:62:23,11:11,17:18,16,17,11
chr13	48653957	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:12,5:6,4:9,10,3,6
chr13	48660380	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=97,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,5:5,3:7,1,8,0
chr13	48664556	.	TA	T,TAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,27,23;MFRL=128,121,117;MMQ=60,60,60;MPOS=29,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.68,6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,5:0.161,0.250:22:2,1,1:9,3,2:1,11,1,9
chr13	48828095	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:10,0:14,2:0|1:48828095_G_A:48828095:9,20,1,1
chr13	48828101	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:8,2:0|1:48828095_G_A:48828095:10,18,1,1
chr13	48919358	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	48919401	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=239,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:48919401_G_A:48919401:0,2,0,1
chr13	48919405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=239,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:48919401_G_A:48919401:0,2,0,1
chr13	48921884	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,23,7
chr13	48947469	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr13	48953655	.	C	CA,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,177,145;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.560:6:0,2,1:0,0,3:0,0,6,0
chr13	48953841	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.175:41:25,2:9,4:9,25,3,4
chr13	48954282	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:7,2:8,4:13,5,5,1
chr13	48955676	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr13	48987207	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,0:12,2:16,13,2,0
chr13	49033746	.	CG	TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=149,343;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:49033746_CG_TA:49033746:6,0,2,0
chr13	49033747	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.900:8:0,2:0,6:1|0:49033746_CG_TA:49033746:0,0,8,0
chr13	49033866	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:10,0:21,3:17,14,1,2
chr13	49047437	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:11,3,1,1
chr13	49051012	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr13	49084991	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=222,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:3,0:0,7,0,2
chr13	49283577	.	GGAGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49283577_GGAGGA_G:49283577:0,1,0,1
chr13	49283585	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:49283577_GGAGGA_G:49283577:0,1,0,1
chr13	49684436	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20,30;MFRL=141,90,193;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,12;RU=A;STR;TLOD=3.60,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,4:0.140,0.224:21:5,2,1:7,1,3:9,5,5,2
chr13	49684516	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.120:47:12,5:30,0:23,19,0,5
chr13	49752876	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49752876_T_C:49752876:0,3,0,1
chr13	49752877	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49752876_T_C:49752876:0,3,0,1
chr13	49752882	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:49752876_T_C:49752876:0,3,0,1
chr13	49752894	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,26;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:49752876_T_C:49752876:0,2,0,1
chr13	49752896	.	GC	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	49796521	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:12,2:10,2:10,12,2,2
chr13	49839889	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=199,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr13	49839979	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:10,6:3,5:8,5,8,3
chr13	49842267	.	T	TGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=348,285;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	49852430	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,54;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,6,0
chr13	49865727	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr13	49865748	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr13	49885216	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	49906310	.	A	ATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	49951189	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:19,0:26,2:0|1:49951189_C_T:49951189:23,22,1,1
chr13	49951208	.	G	GTTTTGTTTTGTTCGTGT	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:20,0:22,2:0|1:49951189_C_T:49951189:25,19,1,1
chr13	50035151	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=109,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,6:7,1:11,2,6,1
chr13	50035208	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.360:48:17,11:13,6:20,11,8,9
chr13	50038080	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,200;MMQ=53,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr13	50038209	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.610:31:7,13:4,6:4,8,13,6
chr13	50054308	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr13	50054346	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,20,6
chr13	50056793	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:4,3:6,0,6,0
chr13	50059671	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr13	50065052	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=196,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:0,7:8,5:1,7,7,5
chr13	50065083	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:2,4,2,3
chr13	50065126	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=154,154;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:1,5,0,2
chr13	50065146	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=185,139;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr13	50092127	.	TACTC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:3,11:4,1:7,3,10,3
chr13	50095127	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.426:17:7,3:2,4:3,7,1,6
chr13	50098376	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.514:19:5,1:4,7:5,4,4,6
chr13	50098407	.	TAAAAC	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=143,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:2,3:0,4,0,4
chr13	50098426	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,17;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:0,0:0,0:0,5,0,2
chr13	50100627	.	GTT	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:6,3:2,13:5,5,2,14
chr13	50100637	.	ATATT	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.601:23:6,3:3,11:0|1:50100637_ATATT_A:50100637:4,5,1,13
chr13	50100647	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:4,3:3,9:0|1:50100637_ATATT_A:50100637:3,4,1,13
chr13	50100667	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr13	50102810	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:2,1:2,6:0,4,5,3
chr13	50108252	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,7:6,4:8,4,8,3
chr13	50114981	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:6,10:3,5:6,3,9,6
chr13	50115045	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:18,0:15,6:16,17,1,5
chr13	50115797	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.532:32:7,13:7,4:9,6,8,9
chr13	50123832	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr13	50125622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,1:4,7:3,5,2,6
chr13	50125678	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,2,4
chr13	50126382	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr13	50129599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=215,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr13	50129615	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr13	50134020	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,8,0
chr13	50141276	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:5,8:10,7:13,2,11,4
chr13	50205979	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=82,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.154:29:6,1:12,3:6,19,2,2
chr13	50206269	.	CAAAAACTCA	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:12,2:10,2:13,22,0,4
chr13	50207075	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:6,6,1,1
chr13	50207505	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:16,3:22,0:21,19,3,0
chr13	50236148	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=184,191;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50236148_G_T:50236148:0,2,0,1
chr13	50236153	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=184,191;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50236148_G_T:50236148:0,2,0,1
chr13	50236172	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=178,191;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	50236184	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=178,191;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	50243958	.	AAGACAAGT	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=124,171;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:9,2:9,14,0,2
chr13	50244041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=113,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,4:1,2:0,3,4,3
chr13	50276020	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:0|1:50276020_G_A:50276020:8,11,1,1
chr13	50276022	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:50276020_G_A:50276020:8,11,1,1
chr13	50276707	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:50276707_AG_A:50276707:0,0,0,1
chr13	50276711	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50276707_AG_A:50276707:0,0,0,1
chr13	50276715	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50276707_AG_A:50276707:0,0,0,1
chr13	50296026	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=2167,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr13	50299677	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:1,3,1,5
chr13	50306823	.	GAA	G,GA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=130,149,135;MMQ=60,60,60;MPOS=11,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=8.72,21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,11:0.171,0.404:28:6,2,6:5,3,5:10,2,15,1
chr13	50587140	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:10,5:5,5:9,6,8,3
chr13	50587654	.	C	CTTTTT	.	.	DP=99;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=122,98;MMQ=57,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,27;RU=T;STR;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.598:29:3,10:4,3:6,6,14,3
chr13	50587718	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,21:0,6:0,0,0,27
chr13	50587819	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=228,241;MMQ=47,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr13	50587825	.	AT	A,ACTCTTTTAACT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,22,23;MFRL=243,241,234;MMQ=57,24,40;MPOS=8,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,1:0,0,0:1,1,0,2
chr13	50588447	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=275,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50588447_A_G:50588447:1,0,0,1
chr13	50588449	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=275,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50588447_A_G:50588447:1,0,0,1
chr13	50588452	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=275,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:50588447_A_G:50588447:1,0,0,1
chr13	50590292	.	T	TCTC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.420:36:10,6:11,8:10,11,7,8
chr13	50590999	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=16,26,19;MFRL=52,172,110;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=9.15,8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,5:0.441,0.374:13:0,0,1:0,4,1:0,2,3,8
chr13	50592000	.	AGCCTAATTGGT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:18,2:18,0:22,16,1,1
chr13	51522054	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr13	51530586	.	T	TA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:11,1:17,3:5,25,2,2
chr13	51826139	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:13,4,2,1
chr13	51922626	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	51929359	.	T	TTCCACAGAGCCTTCAGTGGTAAACAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,1:3,1:0,5,0,3
chr13	51929375	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=235,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr13	51940030	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,3:1,6:0,3,1,8
chr13	51948522	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:13,0:7,0:0|1:51948522_A_T:51948522:12,14,3,0
chr13	51948524	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,0:10,0:0|1:51948522_A_T:51948522:13,16,3,0
chr13	51948528	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=22,14;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:14,0:8,1:0|1:51948522_A_T:51948522:13,16,3,0
chr13	51948533	.	GA	TT	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,16;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:15,1:12,0:0|1:51948522_A_T:51948522:13,16,3,0
chr13	51948538	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,17;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:11,0:0|1:51948522_A_T:51948522:12,18,2,0
chr13	51953541	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:3,2,8,1
chr13	51956122	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0|1:51956122_T_C:51956122:0,0,13,5
chr13	51956131	.	CCG	AGA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=166,98;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:14,0:0|1:51956122_T_C:51956122:14,4,1,1
chr13	52025330	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:9,1:5,12,0,3
chr13	52293532	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,3,10
chr13	52343452	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr13	52365407	.	CA	C,CAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=125,189,143;MMQ=60,60,60;MPOS=27,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.93,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.254,0.306:11:1,1,0:4,1,2:0,5,1,5
chr13	52373814	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr13	52439891	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.124:26:14,1:9,1:16,7,3,0
chr13	52508972	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:6,7,2,1
chr13	52511362	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr13	52511606	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr13	52518502	.	A	AGACAAGAATGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	52520690	.	A	AAATACAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=205,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr13	52520704	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	52524304	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr13	52524560	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr13	52534238	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:7,2,0,2
chr13	52536076	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=92,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.264:39:5,1:7,3:7,22,0,10
chr13	52542796	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr13	52544805	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,11,13
chr13	52548140	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,19:0,3:0,0,13,9
chr13	52548770	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,152;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,0:2,5:4,3,0,6
chr13	52585548	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,6,13
chr13	52585591	.	T	TCGGCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGCG;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr13	52602919	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,13,9
chr13	52606127	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=168,210;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:52606127_GAT_G:52606127:0,3,0,1
chr13	52606130	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,210;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:52606127_GAT_G:52606127:0,3,0,1
chr13	52649974	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.289:17:5,5:6,0:5,7,0,5
chr13	52657369	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,3:12,0:10,10,3,0
chr13	52663491	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr13	52684821	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	52701490	.	A	ACTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=81,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,10:0,12:0,1,16,8
chr13	52701637	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr13	52707240	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr13	52707751	.	T	TCACACA,TCACACACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,23,22;MFRL=0,82,155;MMQ=43,45,40;MPOS=17,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,18,19;RU=CA;STR;TLOD=4.26,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.444,0.427:5:0,0,0:1,2,2:1,0,4,0
chr13	52710044	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr13	52710058	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr13	52717950	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	52718050	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.888:15:0,7:1,7:0,1,7,7
chr13	52728146	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:11,2:12,9:12,11,11,0
chr13	52952137	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=103,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:10,6:7,0:11,6,6,0
chr13	52952928	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	52960253	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=84,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:5,5,0,2
chr13	52971737	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=115,82;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.147:38:16,0:17,5:12,21,1,4
chr13	52971752	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=118,82;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:16,0:15,5:12,19,1,4
chr13	52989863	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr13	52990060	.	T	TA	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:22,2:22,3:0|1:52990060_T_TA:52990060:7,39,0,5
chr13	52990070	.	C	CTTGCCAT	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.050:56:24,2:28,0:0|1:52990060_T_TA:52990060:10,44,0,2
chr13	53009048	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr13	53016614	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=163,107;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:10,0:10,13:1,19,0,13
chr13	53016635	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=160,107;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.499:26:9,0:4,13:0|1:53016635_G_A:53016635:0,13,0,13
chr13	53016642	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=172,107;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.608:21:6,0:2,1:0|1:53016635_G_A:53016635:0,8,0,13
chr13	53029770	.	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=GCGGTG;STR;TLOD=86.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.963:21:0,11:0,9:0,0,2,19
chr13	53030565	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr13	53036398	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	53049266	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=146,115;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:0|1:53049266_A_C:53049266:8,9,0,3
chr13	53049269	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=144,115;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:0|1:53049266_A_C:53049266:8,10,0,3
chr13	53217219	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,142;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53217219_G_A:53217219:0,0,0,1
chr13	53217221	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:53217219_G_A:53217219:0,0,0,1
chr13	53232489	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr13	53239754	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.230:22:6,2:10,3:15,2,4,1
chr13	53239956	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:0,6,0,8
chr13	53240884	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr13	53254082	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:0,11:1,13:1,0,17,7
chr13	53254296	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,12,16
chr13	53277639	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,3,1
chr13	53277646	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,3,1
chr13	53282598	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=159,178;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:9,0,2,1
chr13	53282605	.	CAC	TGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=144,214;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:6,0:8,2,2,0
chr13	53608479	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:6,11:12,7:6,12,12,6
chr13	53608700	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=251,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53608700_A_T:53608700:0,1,0,1
chr13	53608703	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=251,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53608700_A_T:53608700:0,1,0,1
chr13	55015081	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,186;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:8,1,5,1
chr13	55015244	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=395,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.948:36:0,25:1,9:0,1,10,25
chr13	55015516	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:0,7,0,5
chr13	58240849	.	GGACAGTGATCAGGCT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:9,2:13,13,1,1
chr13	58240954	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,185;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.261:20:6,0:9,4:1,14,0,5
chr13	58299434	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr13	60385060	.	A	ATTAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,9:0,0,3,20
chr13	60490319	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=142,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.159:19:4,1:10,2:0|1:60490319_AT_A:60490319:6,10,1,2
chr13	60490323	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=142,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.160:19:4,0:11,2:0|1:60490319_AT_A:60490319:6,10,1,2
chr13	60498838	.	CTTAAAGAAAATGAAATCAT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:10,1:8,2:21,8,2,1
chr13	60545112	.	AGGCACAGGACCACTGAATGGCATCCGCATTCCTGGAAGTGGAGGAGGTGGTGGGGGAGGAGGTGGAGGC	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=128,290;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.117:65:20,1:15,8:32,22,2,9
chr13	60590299	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,5,17
chr13	60686409	.	A	ATCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=234,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60686409_A_ATCT:60686409:0,1,0,1
chr13	60686410	.	A	ATTTTGAGGAGGAGGATTCGGAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=234,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60686409_A_ATCT:60686409:0,1,0,1
chr13	60737996	.	TCCGC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	61041312	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:6,1:9,2,2,0
chr13	61057808	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,2,1
chr13	61084936	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,0:1,0:0,3,0,3
chr13	61987052	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr13	61988107	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr13	66879073	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,63;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:66879073_C_T:66879073:5,10,1,1
chr13	66879078	.	A	ATTCCACTGATGTATATACACCATACAGCATTAATT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=150,63;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.148:19:8,0:7,2:0|1:66879073_C_T:66879073:5,12,1,1
chr13	67799622	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:8,2:19,0:16,11,2,0
chr13	67800403	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,105;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.201:23:5,4:8,0:0|1:67800403_C_A:67800403:9,10,4,0
chr13	67800407	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=134,105;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.201:23:9,4:9,0:0|1:67800403_C_A:67800403:9,10,4,0
chr13	67802808	.	G	GGAATGTTAGCTGCGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,332;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr13	70314433	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr13	70456467	.	TTGCATCTACTC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:9,12,1,1
chr13	70535355	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr13	70549942	.	CCA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:7,2:2,11,1,1
chr13	70681598	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,4:3,3:1,10,3,4
chr13	72131184	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:19,0:15,4:16,18,0,4
chr13	72440658	.	TGCCGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=GCC;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.766:2:0,1:0,1:0|1:72440658_TGCCGCC_T:72440658:0,0,2,0
chr13	72440671	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0|1:72440658_TGCCGCC_T:72440658:1,0,2,0
chr13	73302123	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.067:56:33,3:20,0:28,25,1,2
chr13	73302157	.	CT	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=167.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,39:0,18:0,0,30,27
chr13	73320153	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:19,3:9,0:15,13,2,2
chr13	73321187	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,118;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,0:6,3:8,8,0,3
chr13	73336307	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,0:6,6:0,8,0,6
chr13	73345207	.	ATGCAGAAATACCTGTCCACGTCACATTTTAAGGAACACAAGTTAGAGCTAAGCAACTCTGGAACCATGTCAATCCTC	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=98,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,11:0.029:115:34,6:28,3:55,49,10,1
chr13	73345393	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=113,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr13	73346335	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=98,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:6,3:11,9,3,0
chr13	73349452	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:7,0:24,3:13,18,0,4
chr13	73355331	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,7:10,0:13,1,7,0
chr13	73366704	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.502:30:2,6:12,8:4,11,3,12
chr13	73369756	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr13	73409508	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.307:27:8,4:8,4:1,18,0,8
chr13	73491108	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=190,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,3,1
chr13	73636910	.	A	AGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	73638125	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr13	73650112	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:73650112_C_A:73650112:0,0,2,6
chr13	73650117	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:73650112_C_A:73650112:0,0,2,6
chr13	74339104	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,5:5,6:3,3,8,3
chr13	75866505	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=237,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.422:4:1,1:1,1:0|1:75866505_G_T:75866505:0,2,1,1
chr13	75866506	.	T	TTTCTAAGACTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=237,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.422:4:0,1:1,1:0|1:75866505_G_T:75866505:0,2,1,1
chr13	75869183	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=193,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:75869183_T_A:75869183:0,7,1,1
chr13	75869187	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:75869183_T_A:75869183:0,6,1,1
chr13	75873787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr13	75880384	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	75884290	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=100,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:13,10:5,7:4,14,5,12
chr13	75887127	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr13	75894015	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	75900426	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.453:51:15,23:13,0:21,7,23,0
chr13	75900592	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr13	75915215	.	TAT	CCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:6,3,5,2
chr13	75915250	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:7,9:4,8:5,6,7,10
chr13	76055336	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76055336_G_C:76055336:0,0,1,0
chr13	76055341	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76055336_G_C:76055336:1,0,1,0
chr13	76055345	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=152,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:76055336_G_C:76055336:2,0,1,0
chr13	76055348	.	CTGCT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=152,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:76055336_G_C:76055336:2,0,1,0
chr13	76101863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr13	76134860	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,0:5,3:8,1,4,0
chr13	76135028	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,5,16
chr13	76140814	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr13	76164325	.	T	TAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr13	76169234	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	76197560	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,224;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:2,0:0,12,0,2
chr13	76197581	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=173,137;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:0,14,0,2
chr13	76287432	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr13	76335109	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:7,10:9,6:11,5,8,8
chr13	76335196	.	GAT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:2,7,0,5
chr13	76369702	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr13	76370951	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,0:7,3:0,13,0,4
chr13	76382100	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=126,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:7,8:1,6:4,5,7,7
chr13	76382325	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:6,2:0|1:76382325_A_T:76382325:5,9,1,1
chr13	76382330	.	G	GGTGCCTAGGTATGCTAGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:76382325_A_T:76382325:4,9,1,1
chr13	76383280	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:31,4:12,0:24,19,4,0
chr13	76415379	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,2,4
chr13	76417101	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr13	76419421	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr13	76423248	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr13	76429311	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr13	77522725	.	GACTT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:7,11:9,8:7,10,9,10
chr13	77526658	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,2:11,0:0|1:77526658_G_A:77526658:14,6,1,1
chr13	77526662	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=120,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:12,0:0|1:77526658_G_A:77526658:14,7,1,1
chr13	77527707	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,7:7,5:12,2,12,0
chr13	77574518	.	TAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	77589725	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,3,16
chr13	77635527	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	77635925	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=107,134;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,1:2,11,0,2
chr13	77641642	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr13	77644708	.	AAC	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=85,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:4,0:18,3:10,15,2,1
chr13	77644856	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,23;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.399:6:0,2:0,0:0,4,0,2
chr13	77661528	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr13	77663083	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=137,70;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:8,3:18,1:8,18,3,1
chr13	77671856	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:9,5:10,7:11,8,9,3
chr13	77713456	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=88,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,0:12,3:10,15,0,3
chr13	77725106	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr13	77750765	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.323:17:5,0:4,3:3,9,0,5
chr13	77754419	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:2,2:13,2:7,9,2,2
chr13	77792099	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,23,28,26;MFRL=130,100,155,108;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,19,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.46,14.24,7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,4,8,6:0.119,0.285,0.230:27:3,1,1,1:6,3,6,5:4,5,3,15
chr13	77818088	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.152:30:9,0:12,0:0|1:77818088_T_A:77818088:9,17,0,4
chr13	77818098	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=89,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.340:33:8,0:4,5:0|1:77818088_T_A:77818088:8,14,0,11
chr13	77818100	.	CA	C,AA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=16,18,27;MFRL=148,157,118;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.85,25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,11:0.301,0.394:17:0,0,1:1,1,9:0,3,1,13
chr13	77835520	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr13	77835589	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	78137932	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.209:21:13,3:4,1:16,1,4,0
chr13	78178451	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr13	78178547	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=97,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,2:18,1:15,20,1,2
chr13	78182272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:0|1:78182272_T_C:78182272:5,12,0,2
chr13	78182281	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:78182272_T_C:78182272:5,11,0,2
chr13	78183167	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr13	78188124	.	CGT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.135:21:10,0:9,2:0|1:78188124_CGT_C:78188124:5,14,1,1
chr13	78188129	.	AGTAAACCCAAAATTAATAGAAATG	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:9,2:0|1:78188124_CGT_C:78188124:5,18,1,1
chr13	78191824	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr13	78293774	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:7,2:7,1:7,7,2,1
chr13	78317054	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.412:3:2,0:0,1:0|1:78317054_CT_C:78317054:2,0,1,0
chr13	78317072	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:78317054_CT_C:78317054:2,0,1,0
chr13	78318389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=76,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:6,6:5,3:5,6,5,4
chr13	79191011	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=110,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:13,0:12,10:9,16,10,0
chr13	79213020	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:17,3:8,0:14,11,3,0
chr13	79894736	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:1,5:9,8:7,3,11,2
chr13	79894877	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=127,202,42;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=A;STR;TLOD=8.33,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,2:0.420,0.280:10:1,2,1:2,2,1:1,2,1,6
chr13	79915389	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr13	79916792	.	T	TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=89.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0,0,20,11
chr13	79916973	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:13,13:10,6:7,16,5,14
chr13	79916994	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:9,8:5,4:2,12,2,10
chr13	79918323	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:5,2,6,0
chr13	79928477	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr13	79929326	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,8:5,2:3,4,8,2
chr13	79929619	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr13	79932617	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr13	79939921	.	TAAGAGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr13	79940150	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:2,7:3,3:5,1,9,1
chr13	79940863	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:79940863_G_A:79940863:18,4,1,1
chr13	79940867	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:79940863_G_A:79940863:18,4,1,1
chr13	79943166	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=62,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.715:15:1,7:1,4:0,4,0,11
chr13	79946071	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:1,5,0,3
chr13	79946104	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=140,102;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:0,7,0,5
chr13	79946163	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr13	80910851	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	82264345	.	C	T	.	.	DP=196;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=63,53;MMQ=52,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:156,28:0.151:184:80,0:74,26:110,46,0,28
chr13	82265258	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=260,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82265258_A_C:82265258:0,1,0,1
chr13	82265260	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=260,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82265258_A_C:82265258:0,1,0,1
chr13	82265267	.	T	TCTTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=260,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82265258_A_C:82265258:0,1,0,1
chr13	82265268	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=260,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82265258_A_C:82265258:0,1,0,1
chr13	84456496	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,0:0|1:84456496_G_T:84456496:0,1,0,1
chr13	84456498	.	G	GCATGATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:84456496_G_T:84456496:0,1,0,1
chr13	86368395	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:7,0:14,9:10,12,0,9
chr13	86368698	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,364;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:15,0:19,4:17,17,2,2
chr13	86369120	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:7,4:8,2:3,12,1,6
chr13	88330904	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=99,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.457:13:1,0:6,0:0|1:88330904_T_C:88330904:0,7,6,0
chr13	88330910	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=114,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:3,2:6,1:0|1:88330904_T_C:88330904:2,8,5,0
chr13	88330915	.	TG	CC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=128,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:3,1:5,0:0|1:88330904_T_C:88330904:3,6,5,0
chr13	88330921	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:4,1:6,0:0|1:88330904_T_C:88330904:3,7,4,0
chr13	88331241	.	T	TTGTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTA;STR;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,5:6,6:3,7,4,7
chr13	92345387	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,4,2
chr13	92408505	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr13	94938785	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=64,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr13	94938808	.	GAT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	95050959	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	95112499	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=185,193;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:12,0:8,4:2,18,0,4
chr13	95121327	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:4,10,0,2
chr13	95243270	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:7,2:2,10,0,3
chr13	95248273	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:21,5:20,0:20,21,3,2
chr13	95254382	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	95257689	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,173;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:7,9:16,0:11,12,9,0
chr13	95275576	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,2,4
chr13	95279304	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:10,12,1,1
chr13	95363806	.	CGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCAGCGGCCGACTGCGGGAAGAAGACGCGTGCGGCGGCA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.104:28:6,2:14,0:7,19,0,2
chr13	95673939	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr13	95705380	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.413:49:11,7:17,13:22,7,9,11
chr13	95714858	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	95714891	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr13	95714976	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,4:0,16:0,0,10,10
chr13	95715148	.	AAAAG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr13	95725359	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr13	95735604	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	95829870	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	95859974	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:0,3:3,1:3,0,4,0
chr13	95861911	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:95861911_C_A:95861911:0,4,0,1
chr13	95861913	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:95861911_C_A:95861911:0,4,0,1
chr13	95861918	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:95861911_C_A:95861911:0,4,0,1
chr13	95862860	.	AGAGT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr13	95862896	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.642:20:4,8:3,5:3,4,9,4
chr13	95953405	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,2:4,6:5,0,8,0
chr13	96086010	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:6,0,5,0
chr13	96229667	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,180;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,0:2,12:2,3,0,12
chr13	96229682	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=122,180;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,0:2,12:2,2,0,12
chr13	96230279	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:6,6,5,4
chr13	96251524	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:4,2:1,3:6,0,5,0
chr13	96258410	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr13	96285674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,182;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:1,7,0,2
chr13	96293523	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=87,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:10,7:12,8:14,8,9,6
chr13	96294327	.	GGCC	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCC;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:12,4:6,0:5,13,2,2
chr13	96361680	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:1,2:0,4,0,4
chr13	96410115	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:0,0:9,2:1,8,0,2
chr13	96438130	.	GA	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,137;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,4:7,0:13,0,4,0
chr13	96438418	.	T	TAATCCAGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:96438418_T_TAATCCAGTC:96438418:0,3,1,1
chr13	96438420	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:96438418_T_TAATCCAGTC:96438418:0,3,1,1
chr13	96443039	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=156,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:0|1:96443039_A_C:96443039:1,0,1,0
chr13	96443043	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=162,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,1:0|1:96443039_A_C:96443039:2,0,1,0
chr13	96443061	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:96443061_A_C:96443061:2,0,1,0
chr13	96443064	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:96443061_A_C:96443061:2,0,1,0
chr13	96506594	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:11,11,1,1
chr13	96506817	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,1:0,3,0,2
chr13	96513074	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:10,6:8,8:10,8,8,6
chr13	96540141	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0|1:96540141_T_C:96540141:0,0,20,11
chr13	96540143	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0|1:96540141_T_C:96540141:0,0,20,11
chr13	96540204	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:7,8:4,13:3,8,9,12
chr13	96546859	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:18,1:15,2:20,13,0,3
chr13	96599271	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:6,12:5,7:5,6,9,10
chr13	96599433	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0,4,2,6
chr13	96599445	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:0,3,1,5
chr13	96636170	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr13	96638636	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=88,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,8:1,2:1,1,6,4
chr13	97484830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,6:2,5:2,4,6,5
chr13	98087033	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,17;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:14,0:12,1:0|1:98087033_G_T:98087033:7,19,1,1
chr13	98087051	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:98087033_G_T:98087033:2,16,1,1
chr13	98087052	.	C	CCGGGG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:98087033_G_T:98087033:2,15,1,1
chr13	98087054	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,1:0|1:98087033_G_T:98087033:2,15,1,1
chr13	98087096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	98622187	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=168,158;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,4:0,1:0,5,0,5
chr13	98634737	.	ATT	A,AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,21,27;MFRL=142,115,145;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=5.12,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,2:0.330,0.206:12:5,2,2:1,2,0:5,1,4,2
chr13	98637917	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.555:12:0,4:4,3:2,3,0,7
chr13	98637931	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=79,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr13	98658358	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,15,3
chr13	98666549	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	98667952	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.159:42:27,6:8,0:22,14,6,0
chr13	98670641	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	99017533	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,12,1
chr13	99037154	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr13	99038087	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:0,7,1,3
chr13	99040780	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=117,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:3,6,0,2
chr13	99042390	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,3:1,2:4,5,0,5
chr13	99061556	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr13	99076965	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,3:0,2,1,5
chr13	99091147	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:10,4:8,13:8,10,7,10
chr13	99093094	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr13	99098318	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,3:0,10:0,0,7,6
chr13	99098470	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,9:0,0,8,18
chr13	99098882	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr13	99100547	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,12:0,25:0,0,19,19
chr13	99108729	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,5:2,2:3,1,6,1
chr13	99109319	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	99112754	.	TT	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=66.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr13	99114000	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,277;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,2:8,0:12,8,2,0
chr13	99114183	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:4,2:2,10,1,1
chr13	99115927	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,13,6
chr13	99127052	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,4:4,7:3,8,9,2
chr13	99127252	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr13	99127496	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.393:36:8,7:12,6:11,11,5,9
chr13	99134626	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:5,3:0,5,0,6
chr13	99340037	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:0,7,2,6
chr13	99340771	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:11,10:5,2:7,9,5,7
chr13	99361959	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:6,3,3,6
chr13	99364295	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr13	99368224	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,2:5,0:3,10,1,2
chr13	99371503	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr13	99374211	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:99374211_C_CA:99374211:0,3,0,1
chr13	99374217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:99374211_C_CA:99374211:0,3,0,1
chr13	99404743	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99404743_T_A:99404743:0,0,1,0
chr13	99404761	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99404743_T_A:99404743:0,0,1,0
chr13	99447005	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,5,10
chr13	99448608	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr13	99449579	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,12,3
chr13	99449755	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr13	99457161	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr13	99459891	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:7,2,4,0
chr13	99461532	.	GTTTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=T;STR;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:9,1,4,0
chr13	99462593	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:3,3:2,4,0,4
chr13	99482030	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,370;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr13	99483856	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:3,5:7,3:8,2,7,1
chr13	99483948	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=115,263;MMQ=60,35;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,16:0.258:62:21,2:25,12:26,20,0,16
chr13	99484109	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr13	99498109	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:6,0:3,3:6,3,2,1
chr13	99505779	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,8:6,8:5,7,6,10
chr13	99512774	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,7:9,5:4,12,4,8
chr13	99519625	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=87,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:2,1:3,7:6,0,6,2
chr13	99519866	.	A	AAATGCTACTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:99519866_A_AAATGCTACTTT:99519866:0,2,0,1
chr13	99519868	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:99519866_A_AAATGCTACTTT:99519866:0,2,0,1
chr13	99519871	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:99519866_A_AAATGCTACTTT:99519866:0,2,0,1
chr13	99520074	.	TAAAAAAATTAGTAAGGCAGAGCTTTAA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.133:21:1,1:9,0:17,2,1,1
chr13	99520099	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.281:15:4,1:5,3:9,2,4,0
chr13	99520406	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,7:3,7:6,0,12,2
chr13	99534048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr13	99534229	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:9,10,1,2
chr13	99536031	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,0:3,5:2,1,3,2
chr13	99536215	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.693:7:1,3:0,2:0|1:99536215_C_T:99536215:0,2,0,5
chr13	99536220	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,30;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.691:7:1,3:0,2:0|1:99536215_C_T:99536215:0,2,0,5
chr13	99537202	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:8,2,1,2
chr13	99537217	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,2:4,4:6,2,2,5
chr13	99537431	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr13	99538711	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	99538935	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:0,3,0,8
chr13	99540500	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,8:5,8:3,4,7,9
chr13	99549698	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:7,3:12,1,2,2
chr13	99549745	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=88,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:11,7,1,1
chr13	99555187	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr13	99556863	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:2,6:7,4:6,3,8,2
chr13	99574302	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:16,0:21,7:0|1:99574302_C_T:99574302:23,15,2,5
chr13	99574321	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=117,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,7:0.151:51:17,0:26,6:0|1:99574302_C_T:99574302:26,18,2,5
chr13	99629961	.	C	CTTGA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:6,3:1,4:6,1,6,3
chr13	99853310	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,0:5,2:7,11,0,2
chr13	99853912	.	CAGTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr13	99966516	.	CTTTT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:4,0:1,1:5,7,1,1
chr13	99970429	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr13	100008313	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	100008451	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:4,12:9,7:6,7,8,11
chr13	100181915	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr13	100207766	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,72;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,9:0.188:51:26,9:14,0:34,8,8,1
chr13	100515161	.	A	AGACTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr13	100517195	.	CTG	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:9,5:9,0:6,13,2,3
chr13	100518400	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	100523386	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=247,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr13	100537221	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr13	100537232	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr13	100537376	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr13	100537413	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr13	100635010	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,18;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:100635010_A_C:100635010:0,2,2,0
chr13	100635013	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,12;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:100635010_A_C:100635010:0,2,2,0
chr13	100635016	.	A	C,AGAATCCTCT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,18,25;MFRL=175,201,110;MMQ=60,60,60;MPOS=13,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.62,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:1,1,0:0,0,1:0,1,2,1
chr13	100635019	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=22,29;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:100635010_A_C:100635010:0,2,2,0
chr13	100635022	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=22,25;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:100635010_A_C:100635010:0,1,2,0
chr13	100635025	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=21,30;MFRL=88,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:100635010_A_C:100635010:1,1,2,0
chr13	100635028	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=20,12;MFRL=66,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:100635010_A_C:100635010:2,2,2,0
chr13	100635031	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=66,271;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:100635010_A_C:100635010:2,2,1,0
chr13	100809645	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr13	100888122	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=89,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,7:8,4:9,7,9,2
chr13	100888234	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,4:3,1:0,9,0,5
chr13	100921056	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,7,12
chr13	100945603	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=196,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr13	100955077	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	100958135	.	T	TTCCTGAGCTGCCACCTGCTTTTTCACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:0,8,1,1
chr13	101020695	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr13	101020926	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	101143782	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:6,5:9,0,8,0
chr13	101184910	.	A	AAGGGTGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	101258720	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=137,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:1,7,0,3
chr13	101264633	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.527:38:9,9:8,11:9,9,10,10
chr13	101288992	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:5,6:5,7:0,10,5,9
chr13	101289969	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,3:4,7:2,4,2,8
chr13	101289998	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr13	101294428	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=105,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,3:5,6:5,1,7,2
chr13	101308796	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr13	101315175	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,18,4
chr13	101316378	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	101321067	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr13	101712254	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,123;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,0:12,9:5,14,0,9
chr13	101712400	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=301,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:101712400_CT_TA:101712400:0,1,1,1
chr13	101712405	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=301,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:101712400_CT_TA:101712400:0,1,1,1
chr13	101712407	.	C	CACTGGCCACCACCAGTGGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=301,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:101712400_CT_TA:101712400:0,1,1,1
chr13	101717980	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,0:1,1:1,5,0,2
chr13	101720300	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,15,9
chr13	101721029	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	101727071	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,199;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr13	101747878	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr13	101747892	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,12:0,0,19,1
chr13	101757036	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,2,4
chr13	101777099	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,165;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr13	101795373	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:4,1,5,1
chr13	101795422	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:7,3:3,9:7,3,8,4
chr13	101997706	.	T	TCA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:7,7,1,3
chr13	102029124	.	GAAGTAGAAAGAA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:9,2:15,0:14,15,1,1
chr13	102030837	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr13	102106276	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,0:4,4:6,0,4,0
chr13	102106464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:5,4:7,2:5,7,2,5
chr13	102344867	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=218,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr13	102366732	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:8,4,1,2
chr13	102366742	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:3,3,3,7
chr13	102368056	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,14:0,6:0,0,0,20
chr13	103257297	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.282:20:8,3:6,2:4,11,0,5
chr13	103271206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,3:5,8:1,5,5,6
chr13	103290535	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.374:8:4,3:1,0:0|1:103290535_G_C:103290535:4,1,1,2
chr13	103290543	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.307:10:4,3:3,0:0|1:103290535_G_C:103290535:5,2,1,2
chr13	103290574	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:9,5:2,1:7,5,3,3
chr13	103295551	.	CTTCT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTCT;STR;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.719:12:1,5:2,4:3,0,7,2
chr13	103296819	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr13	103297435	.	CTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34,33;MFRL=165,328,103;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=6.31,5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.334,0.333:9:2,0,1:1,3,2:0,3,0,6
chr13	103299517	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr13	103301537	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,6,10
chr13	103301601	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=229,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,0,3
chr13	103309357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:3,2,7,1
chr13	103315948	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=219,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr13	103316113	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:1,7,2,5
chr13	103328579	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,6:3,0:5,0,6,0
chr13	103328619	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:16,11:3,5:16,3,10,6
chr13	103328687	.	G	GACTGGGGAAGTGTTT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:8,2:18,0:17,10,1,1
chr13	103330718	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr13	103339194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr13	103385798	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr13	103386283	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,10,11
chr13	103390838	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=115,1031;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.230:37:16,6:13,0:0|1:103390838_T_C:103390838:13,16,0,8
chr13	103390841	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=118,1031;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.242:35:13,7:13,0:0|1:103390838_T_C:103390838:13,14,0,8
chr13	103394613	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=95,79;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:0,6:4,7:2,2,5,8
chr13	103398619	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,76;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.278:30:12,0:9,8:8,14,1,7
chr13	103400341	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,2:6,6:7,4,5,3
chr13	103401732	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:12,3:11,0:0|1:103401732_G_T:103401732:11,12,2,1
chr13	103401735	.	G	GGTTTTGAAGGAATTTGATTCCTCA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:12,3:11,0:0|1:103401732_G_T:103401732:11,12,2,1
chr13	103418728	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=227,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr13	103420671	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.339:24:7,3:8,5:0|1:103420671_T_TA:103420671:2,14,2,6
chr13	103420680	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.340:24:7,3:9,4:0|1:103420671_T_TA:103420671:2,14,2,6
chr13	103445609	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr13	103449401	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr13	103473497	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,6:3,2:5,6,2,6
chr13	103474031	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr13	103474551	.	ATG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=55,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.131:20:9,0:9,2:5,13,0,2
chr13	103484060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr13	103484107	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr13	103491172	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr13	103506362	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	103514091	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=289,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,9:0,6:0,1,2,13
chr13	103514346	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,213;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:9,0:12,2,0,3
chr13	103514599	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,2:2,0:4,1,0,2
chr13	103518769	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr13	103524762	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr13	103527849	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,5,27
chr13	103528274	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=259,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:103528274_A_G:103528274:0,2,0,1
chr13	103528292	.	C	CAAAAGGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103528274_A_G:103528274:0,0,0,1
chr13	103698630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr13	103703579	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,5,2
chr13	103703809	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:103703809_C_T:103703809:1,6,1,1
chr13	103703816	.	CATG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:103703809_C_T:103703809:1,6,1,1
chr13	103703824	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:103703809_C_T:103703809:1,5,1,1
chr13	103705044	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr13	106118701	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:11,9,0,2
chr13	107165255	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	107823014	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,2:9,1:13,9,0,3
chr13	107862841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr13	108183509	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:108183509_C_T:108183509:5,2,1,1
chr13	108183518	.	G	GGCTAGCTTTGAGGAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:108183509_C_T:108183509:7,3,1,1
chr13	108183631	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr13	108881532	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,2:9,1:17,0,3,0
chr13	108881559	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.102:32:11,2:18,0:21,8,3,0
chr13	108959080	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,2:4,0,7,1
chr13	109446080	.	ATTG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr13	109459020	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:4,12:6,4:6,4,9,7
chr13	109459165	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:0|1:109459165_G_T:109459165:3,12,0,2
chr13	109459167	.	TGA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:109459165_G_T:109459165:3,12,0,2
chr13	109459170	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:9,0:0|1:109459165_G_T:109459165:3,12,0,2
chr13	109472601	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	109472849	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr13	109496601	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=161,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:6,0,3,0
chr13	109496928	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr13	109518676	.	C	CAGTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,8:0,1,1,9
chr13	109535317	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	109777416	.	T	TTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=141,93;MMQ=60,58;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:13,0,2,0
chr13	109779906	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr13	109817294	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,2:9,0:9,6,1,1
chr13	109832084	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	109858890	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	110408608	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,6:0,19:0,0,14,11
chr13	110408745	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=109,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.182:14:5,0:7,2:0|1:110408745_T_C:110408745:2,10,0,2
chr13	110408749	.	A	ACGGCTGGAGCGCAGGGCTCACTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=109,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:110408745_T_C:110408745:2,10,0,2
chr13	110434310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=265,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr13	110435302	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,2:1,4:0,2,0,6
chr13	110807605	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,206;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:13,0:14,9,4,0
chr13	110814539	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,155;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,5:3,0:7,0,6,0
chr13	110819457	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:110819457_A_G:110819457:0,0,12,3
chr13	110819460	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,4:0|1:110819457_A_G:110819457:0,0,12,3
chr13	110824974	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:4,0,4,1
chr13	110827543	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:14,7,1,1
chr13	110827574	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.518:25:8,4:4,9:0|1:110827574_T_A:110827574:6,6,6,7
chr13	110827580	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=100,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.555:25:7,4:3,8:0|1:110827574_T_A:110827574:6,5,7,7
chr13	110828891	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:1,2:8,7:3,6,6,3
chr13	110828922	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.583:15:2,2:4,6:2,4,7,2
chr13	110831451	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr13	110833564	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,7:1,2:2,0,9,0
chr13	110833751	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32,33;MFRL=126,92,141;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=11.31,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,4:0.378,0.205:20:3,2,2:1,6,1:1,7,2,10
chr13	110835460	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.481:29:8,5:7,8:5,10,7,7
chr13	110835659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,2:1,0:1,5,0,2
chr13	110838646	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr13	110838703	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,9:7,6:7,5,4,11
chr13	110839428	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=228,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,7,0
chr13	110844721	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr13	110845314	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr13	110850770	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,10,6
chr13	110850782	.	CC	TT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:8,6,1,1
chr13	110850900	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=89,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.132:20:8,0:10,2:0|1:110850900_C_T:110850900:11,7,2,0
chr13	110850909	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:9,0:9,1:0|1:110850900_C_T:110850900:12,7,2,0
chr13	110857947	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.242:22:9,1:8,4:0,17,1,4
chr13	110857961	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=158,127;MMQ=58,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0,16,0,2
chr13	110857980	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=172,202;MMQ=43,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.264:10:8,1:0,1:0,8,0,2
chr13	110859314	.	C	CA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:11,1:14,0:7,23,0,4
chr13	110859316	.	GA	G,AA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=16,16,26;MFRL=156,149,143;MMQ=60,60,60;MPOS=25,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.16,5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,9,4:0.324,0.138:28:2,0,2:2,2,2:2,13,0,13
chr13	110859690	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,9,1
chr13	110865078	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,0:7,8:0,9,0,8
chr13	110866065	.	C	T,G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24,24;MFRL=0,100,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.10,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,22,3:0.825,0.141:25:0,8,3:0,14,0:0,0,15,10
chr13	110866265	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=106.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,10:0,26:0,0,19,20
chr13	111077197	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr13	111077400	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr13	111077450	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr13	111082157	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr13	111090854	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr13	111090909	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:0|1:111090909_T_C:111090909:7,1,1,3
chr13	111090924	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:0|1:111090909_T_C:111090909:7,1,1,4
chr13	111092222	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,2:9,0:0|1:111092222_A_C:111092222:10,16,1,1
chr13	111092226	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,2:8,0:0|1:111092222_A_C:111092222:9,17,1,1
chr13	111098110	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	111098338	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr13	111099057	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	111099122	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr13	111101952	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:9,1,2,0
chr13	111109960	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=383,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,9:1,10:0,1,9,10
chr13	111110418	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr13	111110666	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0|1:111110666_T_C:111110666:0,0,2,7
chr13	111110674	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0|1:111110666_T_C:111110666:0,0,1,5
chr13	111111023	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:111111023_T_C:111111023:0,0,3,0
chr13	111111043	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,3:0,0:0|1:111111023_T_C:111111023:0,0,3,2
chr13	111111173	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.980:43:0,29:0,14:0,0,27,16
chr13	111111235	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,14,20
chr13	111111382	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	111117745	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,19,10
chr13	111119296	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr13	111119342	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,7:7,4:7,1,6,5
chr13	111120684	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=79,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.265:24:7,3:10,3:9,9,2,4
chr13	111121483	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr13	111121717	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr13	111130519	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:2,6,1,5
chr13	111132490	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:2,5:1,8:3,0,13,1
chr13	111132820	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr13	111134858	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,5:6,2:6,6,4,3
chr13	111137167	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	111137975	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:11,6:7,6:7,11,4,8
chr13	111141839	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=85,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:22,1:20,1:17,26,0,2
chr13	111142038	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.531:28:8,8:5,6:8,5,11,4
chr13	111143755	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:2,3:3,4:0,5,2,6
chr13	111144491	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,2:16,0:12,17,0,2
chr13	111145676	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:4,7:5,6:1,8,3,10
chr13	111153934	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	111154159	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:11,6:4,6:0|1:111154159_C_T:111154159:4,11,4,8
chr13	111154160	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,15:0.551:27:6,11:6,4:1|0:111154159_C_T:111154159:4,8,4,11
chr13	111155428	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr13	111155711	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,3:2,7:6,4,8,2
chr13	111156153	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:3,8:8,7:3,8,8,7
chr13	111159054	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	111164198	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr13	111176598	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=102,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:111176598_C_T:111176598:0,1,0,1
chr13	111176606	.	C	CATATTTATTGGCAACTTTAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=102,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111176598_C_T:111176598:0,1,0,1
chr13	111176613	.	C	CTTTGACTGTATCATTTCTCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	111290880	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr13	111290967	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	111293847	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr13	111294920	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=98,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,4:6,5:0,6,2,8
chr13	111315913	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,633;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:5,14,2,0
chr13	111319884	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr13	111335319	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr13	111340042	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,22:0.646:34:3,8:8,11:6,6,10,12
chr13	111358000	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:2,7,1,5
chr13	111368423	.	C	CTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111368423_C_CTTTCA:111368423:1,0,0,1
chr13	111368426	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111368423_C_CTTTCA:111368423:1,0,0,1
chr13	111368427	.	G	GTCCTGTTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111368423_C_CTTTCA:111368423:1,0,0,1
chr13	111531885	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=221,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr13	111566989	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr13	111567039	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=106.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,22:0,0,25,11
chr13	111811365	.	CCTG	C	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=105,60;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,2:0.045:65:23,2:31,0:0|1:111811365_CCTG_C:111811365:38,25,1,1
chr13	111811371	.	TAG	T	.	.	DP=66;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=105,60;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,2:0.044:66:24,2:36,0:0|1:111811365_CCTG_C:111811365:39,25,1,1
chr13	111811374	.	CT	C	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=94,60;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:26,2:35,0:0|1:111811365_CCTG_C:111811365:40,26,1,1
chr13	111811378	.	TGTTTCCTCCTTCC	T	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=94,60;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,2:0.036:82:29,2:35,0:0|1:111811365_CCTG_C:111811365:44,36,1,1
chr13	111811394	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=89,60;MMQ=60,50;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:35,1:35,0:0|1:111811365_CCTG_C:111811365:38,35,1,1
chr13	111862161	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,272;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:14,6:7,0:15,6,6,0
chr13	111933098	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr13	111935756	.	C	CAGACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	111938619	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:3,2:2,11,1,1
chr13	111944755	.	TTGTCTCTTTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:0|1:111944755_TTGTCTCTTTTA_T:111944755:0,1,0,1
chr13	111944776	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111944755_TTGTCTCTTTTA_T:111944755:0,0,0,1
chr13	111944777	.	T	TAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111944755_TTGTCTCTTTTA_T:111944755:0,0,0,1
chr13	111953841	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=86,159;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:26,0:17,3:16,28,2,1
chr13	111953903	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:9,7:1,7:1,9,3,11
chr13	111955465	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,6,17
chr13	111980478	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,16,5
chr13	111980537	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:11,10:3,7:5,10,11,6
chr13	111980557	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:21,3:12,0:17,16,0,3
chr13	112297403	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,0:1,4:3,3,3,1
chr13	112723682	.	TACC	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ACC;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,2:10,0:9,22,2,0
chr13	112723771	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:2,5,3,0
chr13	112725791	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,0:9,7:9,6,4,3
chr13	112725830	.	CC	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=98,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:2,0:10,2:0|1:112725830_CC_TG:112725830:3,14,1,1
chr13	112725834	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=111,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:2,0:9,2:0|1:112725830_CC_TG:112725830:3,13,1,1
chr13	113032962	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=88,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:5,1:12,4:10,7,4,1
chr13	113052388	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=74,154;MMQ=60,48;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,5:1,2:3,3,6,1
chr13	113153114	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr13	113158861	.	CATAT	C,CAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27,29;MFRL=148,218,146;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=AT;STR;TLOD=3.42,7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.197,0.293:11:1,0,1:3,2,2:6,0,5,0
chr13	113176883	.	G	GTGCACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	113333684	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,7:5,2:3,3,3,6
chr13	113334012	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,0:8,3:0,11,0,3
chr13	113439586	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:4,8:6,5:3,7,6,8
chr13	113479989	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:3,0:0|1:113479989_GTA_G:113479989:0,7,0,2
chr13	113479993	.	G	GGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:113479989_GTA_G:113479989:0,6,0,2
chr13	113489058	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr13	113512040	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=204,163;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,4:2,0:0|1:113512040_A_G:113512040:4,0,4,0
chr13	113512045	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=204,163;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0|1:113512040_A_G:113512040:4,0,4,0
chr13	113525952	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr13	113530322	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	113534907	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:1,5:0,1:0,2,1,5
chr13	113534984	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr13	113634091	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr13	113639671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,2:3,2:3,0,5,0
chr13	113639862	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:0|1:113639862_G_A:113639862:0,7,1,3
chr13	113639869	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,1,11
chr13	113639872	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.858:12:0,7:1,3:0|1:113639862_G_A:113639862:0,1,1,10
chr13	113669061	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,11:3,0:4,5,7,4
chr13	113681243	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,13,12
chr13	113681400	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=172,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr13	113688133	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr13	113688286	.	TC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=71.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,13,14
chr13	113699488	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr13	113708697	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.294:28:9,3:10,4:8,12,3,5
chr13	113733149	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113733149_G_A:113733149:0,0,0,1
chr13	113733157	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113733149_G_A:113733149:0,0,0,1
chr13	113739518	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr13	113741851	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr13	113742642	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:8,8,1,1
chr13	113742805	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,6,10
chr13	113744139	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,10:0,0,8,7
chr13	113745402	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=96,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.598:25:1,9:8,6:6,4,11,4
chr13	113745611	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=68,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr13	113749475	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=307,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr13	113750917	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr13	113765226	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:6,0:2,14:0,8,15,0
chr13	113783711	.	G	GGGAGCCTGGGTGAAGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,4:2,0,4,3
chr13	113792893	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:0,5,0,5
chr13	113794946	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,191;MMQ=60,20;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,5:4,0:2,4,0,5
chr13	113798484	.	G	GGCCAACATAGTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	113801843	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr13	113817293	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=119,38;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:10,0:0|1:113817293_A_C:113817293:4,12,2,0
chr13	113817296	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=119,38;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,1:10,0:0|1:113817293_A_C:113817293:6,12,2,0
chr13	113817301	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=118,38;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:11,0:0|1:113817293_A_C:113817293:6,15,2,0
chr13	113817308	.	AT	CA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=114,38;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.105:27:8,2:12,0:0|1:113817293_A_C:113817293:8,17,2,0
chr13	113817537	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=183,295;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,2:1,1,0,2
chr13	113818817	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,1:1,0,3,3
chr13	113833499	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	113852425	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr13	113854715	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr13	113862325	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.280:47:12,4:22,8:19,15,8,5
chr13	113862801	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	113882221	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,120;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:1,0:2,2:3,0,2,2
chr13	113882307	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,6:6,6:4,10,4,8
chr13	113887483	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,0:7,2:6,1,2,0
chr13	113888201	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,10:0,0,16,11
chr13	113889474	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,15:0,0,17,19
chr13	113891075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr13	113900197	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr13	113917767	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr13	113960925	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:11,0:6,6:7,10,0,6
chr13	113975808	.	A	AGC	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=24,16;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,11:0.377:29:10,2:8,3:0|1:113975808_A_AGC:113975808:1,17,11,0
chr13	113975814	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.390:26:8,4:8,4:0|1:113975808_A_AGC:113975808:1,15,10,0
chr13	113975820	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:7,4:9,2:0|1:113975808_A_AGC:113975808:2,15,8,0
chr13	113975824	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,2:8,0:0|1:113975808_A_AGC:113975808:2,14,6,0
chr13	113975826	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:8,0:7,0:0|1:113975808_A_AGC:113975808:2,14,6,0
chr13	113975828	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.271:20:8,3:7,2:0|1:113975808_A_AGC:113975808:2,13,5,0
chr13	113978969	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr13	114018023	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=244,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr13	114018038	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=244,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.742:6:0,2:1,0:1,0,5,0
chr13	114083421	.	A	AAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AG;STR;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.431:12:4,2:3,3:1,6,3,2
chr13	114107632	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:23,8:15,0:15,23,0,8
chr13	114134912	.	GAAATTCCTTTCTGCT	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,2:15,0:20,13,1,1
chr13	114149891	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:9,5:3,8:5,7,8,6
chr13	114150358	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:4,2:2,7,2,6
chr13	114152755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=76,83;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,7:3,5:4,2,7,5
chr13	114152919	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=172,33605372;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:114152919_A_G:114152919:0,4,1,1
chr13	114152928	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=172,33605372;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:2,1:0|1:114152919_A_G:114152919:0,4,1,1
chr13	114154208	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr13	114155965	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	114155982	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr13	114157823	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=88,77;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.112:60:29,6:23,0:28,26,1,5
chr13	114157952	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr13	114164526	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:6,9:5,4:7,5,7,6
chr13	114174889	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.357:29:10,6:8,4:12,7,7,3
chr13	114188291	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=242,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr13	114193878	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr13	114201611	.	AC	GT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:11,18,1,1
chr13	114201742	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=49,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.651:18:1,5:5,7:0|1:114201742_T_C:114201742:1,5,2,10
chr13	114201746	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,41;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:114201742_T_C:114201742:2,14,1,1
chr13	114201748	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=121,41;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:114201742_T_C:114201742:2,14,1,1
chr13	114202575	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:13,4:7,6:18,2,9,1
chr13	114202592	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=80,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:3,7:10,6:7,6,10,3
chr13	114203662	.	AGACCAGCCCTGTGCTTTCCTGTTGCAGGTGCTAGTCCTGACAGTCTCTGT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:1,2:10,8,1,1
chr13	114203670	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr13	114240067	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31,33;MFRL=172,182,136;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.32,11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,6:0.219,0.401:16:3,2,4:2,2,2:6,0,10,0
chr13	114287613	.	CG	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=119,101;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,2:20,1:21,22,0,3
chr13	114287635	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=123,101;MMQ=45,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:20,1:18,0:18,21,0,2
chr13	114288971	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:1,6,1,6
chr13	114306077	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.169:32:8,1:12,0:7,20,5,0
chr13	114306083	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,0:11,0:3,20,6,0
chr13	114307127	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:5,0:6,2,3,0
chr13	114322289	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,9,14
chr13	114323997	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,5:6,2:12,5,3,4
chr13	114472220	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114472220_C_CAG:114472220:0,1,0,1
chr13	114472221	.	T	TCATGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114472220_C_CAG:114472220:0,1,0,1
chr13	114472223	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114472220_C_CAG:114472220:0,1,0,1
chr13	114498034	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	114502416	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=227,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:1,13:0,17:0,1,14,17
chr13	114503895	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0|1:114503895_A_G:114503895:1,1,2,6
chr13	114503897	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,2:1,3:0|1:114503895_A_G:114503895:1,1,2,6
chr13	114503907	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=19,24;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:1,2:0|1:114503895_A_G:114503895:1,1,1,4
chr13	114507836	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	114514918	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.622:17:4,2:2,8:0,6,4,7
chr13	114524056	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:0,4,0,7
chr13	114538460	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:7,6:4,3:8,3,9,1
chr13	114542858	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=194,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:5,12:0,1:3,3,5,8
chr13	114751040	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:0,1,3,1
chr13	114751359	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=202,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr13	114773126	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr13	114774813	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:6,0,4,3
chr13	114778593	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:4,2,6,1
chr13	114780584	.	C	CCGA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=20,32;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,1,1,0
chr13	114780585	.	TAGTCTAGCCAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,1,1,0
chr13	114780601	.	G	GGATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,1,1,0
chr13	114780603	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,1,1,0
chr13	114780608	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,0,1,0
chr13	114780611	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114780584_C_CCGA:114780584:0,0,1,0
chr13	114780648	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,2,2
chr13	114780764	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,4:5,2:7,7,3,3
chr13	114787031	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr13	114792842	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,4:6,3:12,3,6,1
chr13	115007533	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=95,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:0,1:2,1:2,3,2,0
chr13	115010254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	115015966	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,2:1,2:3,1,5,0
chr13	115047269	.	GCGGGGGCGGTGCGGGCAAACCTCGCGAGGAGAAGAGGACGGCCCTGAGCAAGGTGGGGA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=109,139;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.101:29:16,0:11,2:12,15,1,1
chr13	115047700	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr13	115057210	.	CA	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=101,62;MMQ=46,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,6:0.095:57:23,3:21,3:0|1:115057210_CA_C:115057210:21,30,2,4
chr13	115057222	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,62;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,6:0.079:67:27,3:27,2:0|1:115057210_CA_C:115057210:22,39,2,4
chr13	115064542	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:3,2:4,6:0,7,0,9
chr14	19559239	.	T	TTGGTAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,286;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19559239_T_TTGGTAA:19559239:0,0,0,1
chr14	19559242	.	C	CATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,286;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19559239_T_TTGGTAA:19559239:0,0,0,1
chr14	19559243	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,286;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19559239_T_TTGGTAA:19559239:0,0,0,1
chr14	19573217	.	TGTA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=139,157;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.206:13:3,2:8,0:0|1:19573217_TGTA_T:19573217:5,6,0,2
chr14	19573223	.	CATACGTGATCCTATCATGTAAGTAGCATAAATCA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=154,157;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:1,2:5,0:0|1:19573217_TGTA_T:19573217:2,10,0,2
chr14	20010278	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=184,172;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	20249456	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	20249476	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=132,35;MMQ=60,29;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr14	20295869	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,85;MMQ=58,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:7,9,1,2
chr14	20295979	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:3,4,2,0
chr14	20389265	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=95,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:5,4,2,0
chr14	20403909	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr14	20404026	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:20404026_T_C:20404026:2,10,1,1
chr14	20404033	.	G	GACATA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:0|1:20404026_T_C:20404026:3,11,1,1
chr14	20404108	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:7,5,2,1
chr14	20404736	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr14	20404767	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr14	20482471	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr14	20482630	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,77;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,0:12,3:6,15,1,2
chr14	20501962	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	20502921	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	20528321	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=92,111;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,3:4,1:2,6,2,3
chr14	20528359	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr14	20528362	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=61,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,3,5
chr14	20528448	.	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=22,22;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:5,2:0,4:4,2,5,2
chr14	20528505	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:2,4,2,2
chr14	20529177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:1,6,0,2
chr14	20612532	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:0|1:20612532_G_A:20612532:7,3,1,1
chr14	20612537	.	CTGG	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:20612532_G_A:20612532:7,4,1,1
chr14	20612544	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=144,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,1:0|1:20612532_G_A:20612532:7,4,1,1
chr14	20665887	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr14	20692291	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr14	20692887	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=205,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:20692887_T_A:20692887:1,5,1,1
chr14	20692888	.	GGCCA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=205,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:20692887_T_A:20692887:1,5,1,1
chr14	20692895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=215,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:20692887_T_A:20692887:0,3,1,1
chr14	20711607	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=124,736;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,6:10,0:9,9,3,3
chr14	20757708	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757710	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757713	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757715	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757721	.	C	CCAAGA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757722	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:20757708_T_C:20757708:2,0,2,0
chr14	20757995	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=243,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20757995_C_T:20757995:0,1,0,1
chr14	20757997	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=243,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20757995_C_T:20757995:0,1,0,1
chr14	20760066	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	20763446	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr14	20764585	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr14	20767618	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr14	20767706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	20782045	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr14	20815165	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20815165_G_T:20815165:0,0,0,1
chr14	20815169	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20815165_G_T:20815165:0,0,0,1
chr14	20839382	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=92,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,5:7,0:9,9,4,1
chr14	20840983	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:17,0:3,3:9,11,0,3
chr14	20844037	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,0:3,1:0|1:20844037_C_T:20844037:0,3,0,1
chr14	20844044	.	G	GAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:20844037_C_T:20844037:0,3,0,1
chr14	20845993	.	T	TCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr14	20850014	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr14	20851839	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.467:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr14	20851887	.	T	TGATGTAAC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,2:2,0:0|1:20851887_T_TGATGTAAC:20851887:4,10,1,1
chr14	20851890	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:20851887_T_TGATGTAAC:20851887:4,10,1,1
chr14	20851966	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,6;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20851966_T_A:20851966:0,0,1,0
chr14	20851974	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,6;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20851966_T_A:20851966:0,0,1,0
chr14	20851984	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,6;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20851966_T_A:20851966:0,0,1,0
chr14	20851988	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,6;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20851966_T_A:20851966:0,0,1,0
chr14	20852770	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=80,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:8,0:12,4:8,12,1,3
chr14	20854734	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr14	20857306	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,24,24;MFRL=185,149,63;MMQ=60,60,60;MPOS=30,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.00,13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,8:0.241,0.566:13:1,0,1:1,3,5:2,0,5,6
chr14	20858928	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:20858928_G_A:20858928:3,5,1,1
chr14	20858930	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:1,0:0|1:20858928_G_A:20858928:3,5,1,1
chr14	20859013	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr14	20859084	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,6:1,12:3,0,11,7
chr14	20859112	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:9,12,1,1
chr14	20859205	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:5,8:3,11:2,6,7,12
chr14	20864129	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:20864129_G_A:20864129:4,10,1,1
chr14	20864136	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:20864129_G_A:20864129:4,10,1,1
chr14	20864955	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:20864955_A_G:20864955:1,1,0,1
chr14	20864958	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:20864955_A_G:20864955:1,1,0,1
chr14	20869629	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=100,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:20869629_G_A:20869629:8,10,1,1
chr14	20869631	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:0|1:20869629_G_A:20869629:8,10,1,1
chr14	20871645	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=80,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:1,5,1,2
chr14	20871660	.	GA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:20871660_GA_AT:20871660:0,3,0,1
chr14	20871663	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:20871660_GA_AT:20871660:0,3,0,1
chr14	20871846	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=619,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr14	20873524	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	20874608	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	20876360	.	TGGTTCTCCAAGGAGAGGATGTCTGGGTGGGCAGACACATATCCATGTGGTTTTTCCATGGTCTTCAGGTCAGGAAGCGTGGCTAGGCACTGGTTCTTCAAGGAGAGGATATCTGAGTGGGTAGATACATGCTGATGTAGTTTCTCCAAGGGCTGTAAGTCAGGGAGCATAGCCAGGCACC	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,23:0.177:70:7,9:3,13:16,31,19,4
chr14	20897064	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr14	20916318	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,0:15,3:10,11,2,1
chr14	20916958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr14	20916987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr14	20917442	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,5,9
chr14	20920043	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	20920250	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,19,7
chr14	20920340	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,7,11
chr14	20920360	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,4,8
chr14	20925517	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:4,4:7,2:7,5,4,2
chr14	20942705	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=85,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:0|1:20942705_C_T:20942705:10,15,1,1
chr14	20942707	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=85,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:12,2:0|1:20942705_C_T:20942705:10,15,1,1
chr14	20942744	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,8,10
chr14	20943436	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,0:7,5:6,8,0,5
chr14	20943504	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	21024605	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr14	21024619	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr14	21058452	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr14	21108786	.	T	TTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=149,136;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TC;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr14	21109278	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=53,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:2,2,5,2
chr14	21109295	.	G	GTGTGATCTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=84,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,0:10,2:8,5,1,1
chr14	21109385	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,2:2,3:7,2,3,2
chr14	21109859	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,2,5
chr14	21168796	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:3,7,2,4
chr14	21239059	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=77,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,2:3,3:1,7,3,2
chr14	21250366	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr14	21250676	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr14	21269964	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=112,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr14	21269977	.	T	TCCCTCC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=123,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:9,0:8,2:9,8,0,2
chr14	21269995	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=104,399;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,2:8,0:15,7,0,2
chr14	21458131	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,6,4
chr14	21460790	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,55;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:13,0:4,3:6,12,1,2
chr14	21463430	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr14	21463474	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	21465150	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	21467913	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:4,4,1,7
chr14	21468046	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:21468046_T_TTC:21468046:4,4,1,1
chr14	21468049	.	A	ACCCTGGACTAAGACAAAAATATTT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,17;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:21468046_T_TTC:21468046:4,4,1,1
chr14	21468065	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,10;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:21468065_A_C:21468065:1,3,0,1
chr14	21468069	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:21468065_A_C:21468065:1,3,0,1
chr14	21468076	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:21468065_A_C:21468065:2,2,0,1
chr14	21468156	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=207,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	21486054	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr14	21486442	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr14	21486677	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:2,5,2,3
chr14	21488046	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr14	21488204	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=112,72;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:5,11,1,1
chr14	21488236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=157,136;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr14	21488248	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=166,149;MMQ=43,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,1:0,6,0,3
chr14	21490125	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr14	21490449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	21498682	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21498682_C_T:21498682:1,0,1,0
chr14	21498689	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:21498682_C_T:21498682:1,0,1,0
chr14	21498693	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:21498682_C_T:21498682:1,1,1,0
chr14	21499072	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=231,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr14	21511458	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,10:0,0,2,14
chr14	21511497	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	21525958	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	21544842	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,6:0,5:1,1,4,8
chr14	21555066	.	GAA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.310:14:3,2:6,2:0|1:21555066_GAA_G:21555066:9,1,4,0
chr14	21555087	.	AAATC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0|1:21555066_GAA_G:21555066:0,0,12,1
chr14	21556963	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr14	21561065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:3,6,0,3
chr14	21570273	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,13,11
chr14	21571208	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr14	21623010	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	21679614	.	TCCTCAGCAGAGTCATCTGCACCCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,54;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.442:5:1,0:0,1:2,1,1,1
chr14	21699069	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,4:6,5:5,2,7,2
chr14	21702046	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.216:24:7,1:9,4:14,5,3,2
chr14	21702152	.	TA	CT	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=128,107;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:11,0:19,2:0|1:21702152_TA_CT:21702152:16,15,0,2
chr14	21702158	.	AG	CT	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=128,107;MMQ=51,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:17,2:0|1:21702152_TA_CT:21702152:17,16,0,2
chr14	21702163	.	GG	AA	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=129,111;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:11,2:18,2:0|1:21702163_GG_AA:21702163:17,15,0,4
chr14	21702166	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=129,111;MMQ=51,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:11,2:21,2:0|1:21702163_GG_AA:21702163:17,15,0,4
chr14	21763027	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,154;MMQ=40,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr14	21771564	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=103,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,0:11,4:10,6,0,4
chr14	21775816	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,7:1,2:2,0,7,2
chr14	21776054	.	CATA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=123,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:0|1:21776054_CATA_C:21776054:6,11,0,2
chr14	21776060	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:5,0:0|1:21776054_CATA_C:21776054:4,9,0,2
chr14	21790040	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,6:3,2:5,2,3,5
chr14	21793236	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=231,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,0:1,0,2,1
chr14	21793533	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:3,0:2,5,0,3
chr14	21794054	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:3,7:2,12:2,3,10,9
chr14	21811180	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:2,1:7,2:5,4,3,0
chr14	21819411	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr14	21821821	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,5:5,4:2,5,3,6
chr14	21828520	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr14	21829404	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=100,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:4,5:3,4:3,4,1,9
chr14	21831112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:4,6,3,4
chr14	21831473	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=141,66;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0|1:21831473_T_C:21831473:2,6,1,1
chr14	21831479	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=156,66;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:21831473_T_C:21831473:2,5,1,1
chr14	21831485	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=172,66;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,2:0|1:21831473_T_C:21831473:2,5,1,1
chr14	21831486	.	T	TCCTCC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=149,66;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0|1:21831473_T_C:21831473:2,4,1,1
chr14	21831692	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,0:1,4:1,5,1,3
chr14	21833147	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=85,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,5:1,6:1,1,6,5
chr14	21836400	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,4:4,8:4,5,8,4
chr14	21838672	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,3:7,0:3,11,0,3
chr14	21841524	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,5:8,4:7,6,1,8
chr14	21854022	.	GGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	21859536	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr14	21861211	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	21861871	.	T	TCCCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=146,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:21861871_T_TCCCC:21861871:4,4,1,1
chr14	21861873	.	C	CAGTGTAGTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=146,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:21861871_T_TCCCC:21861871:4,4,1,1
chr14	21862102	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=94,30;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:6,8,1,1
chr14	21863556	.	G	GATGACCTCATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr14	21864124	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=270,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr14	21870017	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=207,155;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:21870017_A_T:21870017:1,0,2,0
chr14	21870020	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=207,155;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:21870017_A_T:21870017:1,0,2,0
chr14	21874068	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr14	21875202	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=154,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	21875222	.	A	AATGTCTAGCCTCTCATTCAGTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	21876732	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.341:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr14	21897259	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=60,123;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,10:0.133:74:27,1:36,7:40,24,8,2
chr14	21899838	.	TAGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr14	21930596	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr14	21936894	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:16,6:20,0:17,21,1,5
chr14	21944955	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:7,3,5,4
chr14	21945415	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,31:0.532:58:20,13:7,17:18,9,19,12
chr14	21955930	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr14	21960408	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:3,5:6,3,4,1
chr14	21960425	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.461:17:0,5:9,3:6,3,4,4
chr14	21960969	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:4,1:4,4,1,2
chr14	21963626	.	A	ACATAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=237,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	21964586	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=201,133;MMQ=50,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr14	21964623	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.218:17:6,1:6,2:9,5,2,1
chr14	21964669	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=83,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,3:15,0:12,14,3,0
chr14	21967133	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:5,2,4,3
chr14	21970000	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.264:36:9,0:16,9:14,13,0,9
chr14	21991144	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,5:0,5:0,2,8,4
chr14	21991853	.	G	GGTGAACTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:3,3,0,2
chr14	22037905	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr14	22038525	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,2:7,0:1,6,1,1
chr14	22038659	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr14	22133416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=115,96;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:3,3:5,9:2,6,4,8
chr14	22133648	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,7,8
chr14	22133997	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr14	22539108	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0|1:22539108_C_T:22539108:2,3,4,4
chr14	22539116	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:1,2:4,6:0|1:22539108_C_T:22539108:3,3,4,4
chr14	22997524	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,7:0,0,11,14
chr14	22997654	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr14	23058084	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,7:7,4:7,6,5,6
chr14	23067084	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=480,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr14	23067309	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:23067309_CTG_C:23067309:0,2,0,1
chr14	23067313	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:23067309_CTG_C:23067309:0,2,0,1
chr14	23072546	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:4,0:0|1:23072546_G_GC:23072546:8,6,1,1
chr14	23072548	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:23072546_G_GC:23072546:8,6,1,1
chr14	23235697	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=83,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:2,6:3,1,5,2
chr14	23239512	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,5:4,4:2,2,4,5
chr14	23239880	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr14	23244802	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=59,345;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr14	23244835	.	C	CTAGTGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=117,635;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr14	23282515	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0|1:23282515_C_T:23282515:3,7,0,2
chr14	23282525	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,2:0|1:23282515_C_T:23282515:2,7,0,2
chr14	23282627	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=254,218;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:23282627_T_C:23282627:0,1,0,1
chr14	23282636	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=218,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:23282627_T_C:23282627:0,1,0,1
chr14	23299068	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23299068_C_G:23299068:0,0,1,0
chr14	23299070	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:23299068_C_G:23299068:0,0,1,0
chr14	23299135	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:3,2,4,3
chr14	23299286	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,11,8
chr14	23302585	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr14	23311042	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:23311042_CT_C:23311042:0,0,7,1
chr14	23311044	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:23311042_CT_C:23311042:0,0,7,1
chr14	23312718	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr14	23312863	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	23313135	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=150,125;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:0|1:23313135_T_C:23313135:1,13,0,2
chr14	23313142	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=151,125;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:23313135_T_C:23313135:0,11,0,2
chr14	23313154	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=159,125;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr14	23313164	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=179,125;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:23313164_A_AG:23313164:0,4,0,2
chr14	23313166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=179,125;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:23313164_A_AG:23313164:0,4,0,2
chr14	23314675	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	23346462	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=63,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:6,7,1,1
chr14	23346474	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=78,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:5,8,1,1
chr14	23346484	.	C	CTCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=78,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:7,7,1,1
chr14	23352464	.	TGCACACGCACAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=87,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GCACAC;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:9,4:7,0:11,8,3,1
chr14	23371055	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:7,9:2,3:4,5,5,7
chr14	23371268	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:1,1:2,4:1,2,1,4
chr14	23373986	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	23375522	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,62;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:19,0:10,2:12,17,1,1
chr14	23375537	.	GA	TC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=131,62;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:0|1:23375537_GA_TC:23375537:9,15,1,1
chr14	23375540	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=125,62;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:0|1:23375537_GA_TC:23375537:8,15,1,1
chr14	23375542	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=136,62;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:8,2:0|1:23375537_GA_TC:23375537:7,16,1,1
chr14	23377612	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=109,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,0:8,2:6,7,1,1
chr14	23391533	.	C	CACAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=266,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr14	23391913	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr14	23394007	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr14	23394069	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,3:8,7:7,4,8,2
chr14	23396680	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:4,4,4,1
chr14	23396776	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=107,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.134:42:22,0:15,5:21,16,4,1
chr14	23396916	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=207,150;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.573:10:1,2:1,3:0,4,1,5
chr14	23420886	.	GG	AA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:4,2:15,0:9,11,1,1
chr14	23424186	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=171,162;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,2:1,7:1,0,9,0
chr14	23443962	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	23444084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:4,8:7,3:6,5,6,5
chr14	23468223	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=111,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:23468223_TG_CA:23468223:2,7,1,1
chr14	23468227	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:23468223_TG_CA:23468223:2,7,1,1
chr14	23468230	.	C	CAACTCCATACTTTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=111,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:0|1:23468223_TG_CA:23468223:2,7,1,1
chr14	23495610	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:0,1:2,5,2,0
chr14	23496860	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr14	23511357	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	23512751	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.432:21:9,4:3,5:3,9,5,4
chr14	23512922	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr14	23513111	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:5,1:6,4,2,0
chr14	23517651	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:5,2:0,1:0|1:23517651_C_CT:23517651:1,4,2,1
chr14	23517654	.	C	CCCGTTTTCTTGCTTTCTTTCTTTCTTTCGTTTCTTTCATGCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:5,2:0,1:0|1:23517651_C_CT:23517651:1,4,2,1
chr14	23518791	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=91,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr14	23519131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=24,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:4,2,5,3
chr14	23523647	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr14	23528501	.	TTC	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=103,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:10,2:7,0:10,9,2,1
chr14	23528525	.	C	CAGATACCT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:20,2:13,0:18,17,1,1
chr14	23531507	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr14	23532865	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr14	23538853	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23538853_G_T:23538853:0,0,0,1
chr14	23538855	.	G	GTAGTGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23538853_G_T:23538853:0,0,0,1
chr14	23548783	.	A	AGAACGT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAACGT;STR;TLOD=53.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.561:28:9,7:3,6:7,5,10,6
chr14	23549379	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,4,15
chr14	23550887	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr14	23551111	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=222,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr14	23567407	.	CG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,1204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:13,1:14,10,0,2
chr14	23568829	.	TGT	CAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=163,151;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr14	23568844	.	CC	TT,CTGCAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,26,29;MFRL=290,177,149;MMQ=60,60,57;MPOS=5,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr14	23568847	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=220,177;MMQ=59,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr14	23596320	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	23600662	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:0,5:9,3:4,5,5,3
chr14	23607246	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,7:0,0:1,1,6,1
chr14	23607271	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:1,4,1,1
chr14	23612489	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:0,5,0,3
chr14	23727848	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,2:10,0:12,7,1,1
chr14	23727902	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,23;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:23727902_CTTT_C:23727902:0,1,0,1
chr14	23727914	.	T	TCAGACAGGGTC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23727914_T_TCAGACAGGGTC:23727914:0,2,0,1
chr14	23727916	.	T	TGCTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23727914_T_TCAGACAGGGTC:23727914:0,2,0,1
chr14	23727918	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23727914_T_TCAGACAGGGTC:23727914:0,2,0,1
chr14	23727919	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:23727902_CTTT_C:23727902:0,1,0,2
chr14	23727921	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23727914_T_TCAGACAGGGTC:23727914:0,2,0,1
chr14	23729188	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:1,5:3,1:0,4,1,6
chr14	23731855	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,16;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.387:14:4,0:3,1:5,4,5,0
chr14	23732091	.	AT	GC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,1:7,4:6,4,4,1
chr14	23732128	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr14	23733449	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,2:9,1:3,14,1,2
chr14	23733725	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=217,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr14	23744800	.	ACAT	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=103,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAT;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.182:19:8,0:6,3:4,12,0,3
chr14	23744826	.	TTCC	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.320:30:7,5:13,4:3,18,2,7
chr14	23744841	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:5,1:13,1:0|1:23744841_C_T:23744841:2,17,0,2
chr14	23744843	.	CCT	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:6,1:12,1:0|1:23744841_C_T:23744841:2,17,0,2
chr14	23792389	.	T	TACATCAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:23792389_T_TACATCAGA:23792389:0,4,0,1
chr14	23792391	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:23792389_T_TACATCAGA:23792389:0,4,0,1
chr14	23794558	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=9,28;MFRL=115,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,1:0,2:0,3,0,3
chr14	23817252	.	A	AGAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23817252_A_AGAT:23817252:0,1,0,1
chr14	23817255	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23817252_A_AGAT:23817252:0,1,0,1
chr14	23817257	.	C	CAAATGAAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23817252_A_AGAT:23817252:0,1,0,1
chr14	23817475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:2,7,1,2
chr14	23820998	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:10,2:0|1:23820998_C_A:23820998:9,9,1,1
chr14	23821005	.	C	CCTTATA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:6,0:11,2:0|1:23820998_C_A:23820998:9,9,1,1
chr14	23826819	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.689:14:4,6:0,3:0|1:23826819_C_T:23826819:3,1,5,5
chr14	23826822	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.687:14:4,6:0,4:0|1:23826819_C_T:23826819:3,1,5,5
chr14	23828553	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=104,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:5,1:4,4:4,5,5,1
chr14	23828893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.550:13:3,5:1,2:3,3,6,1
chr14	23829164	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr14	23829490	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:0,3:6,2:0,6,2,3
chr14	23829767	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:5,0:7,2:0|1:23829767_C_T:23829767:7,6,1,1
chr14	23829790	.	G	GAT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:23829767_C_T:23829767:6,8,1,1
chr14	23829791	.	GGC	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:23829767_C_T:23829767:5,8,1,1
chr14	23829798	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:23829767_C_T:23829767:5,8,1,1
chr14	23830042	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,2:0|1:23830042_T_C:23830042:1,2,1,2
chr14	23830048	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:23830042_T_C:23830042:1,1,1,3
chr14	23834174	.	TGGA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,0:1,9:8,3,5,4
chr14	23842040	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=248,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,2,1
chr14	23844810	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:2,2:7,0:8,1,3,0
chr14	23845056	.	TTG	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,1:7,2:12,14,1,2
chr14	23845150	.	GC	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0,4,1,0
chr14	23848311	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:0,2,6,5
chr14	23851311	.	AGAGGGAGAAGTGTGTGGGGACAAATCCCTGGGGCTTTCAGAGGCCTAAGGGAGATGCCCTTG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=79,30;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.151:19:6,0:6,2:5,12,1,1
chr14	23854155	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=116,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:6,3:1,4:4,3,3,5
chr14	23854324	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	23855320	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,4:4,4:4,4,5,4
chr14	23855426	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr14	23855478	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=274,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,3,1
chr14	23856896	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr14	23857351	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=154,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.361:11:3,0:3,2:6,1,3,1
chr14	23858232	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=66,169;MMQ=53,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.392:10:3,1:3,1:2,4,1,3
chr14	23858271	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,23;MFRL=192,212;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=G;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr14	23861811	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr14	23862843	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chr14	23865885	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=148,80;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:4,2,1,1
chr14	23866713	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=195,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:1,4:1,0:1,1,3,3
chr14	23868285	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=134,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,4:1,2:0,3,0,6
chr14	23870275	.	G	GTGCTACCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr14	23872666	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr14	23873489	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=105,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:8,12:5,0:6,7,12,0
chr14	23874117	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	23882144	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	23883184	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr14	23885425	.	CG	AT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,64;MMQ=51,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:23885425_CG_AT:23885425:8,5,1,1
chr14	23885426	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,67;MMQ=51,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.226:14:8,1:3,2:1|0:23885425_CG_AT:23885425:7,4,2,1
chr14	23885430	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=149,67;MMQ=51,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:9,0:2,2:1|0:23885425_CG_AT:23885425:8,4,1,1
chr14	23886264	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:1,5,2,0
chr14	23886292	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:3,1,0,1
chr14	23888323	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=92,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr14	23888665	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,6,2
chr14	23893901	.	TGTGCAGGGAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=222,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr14	23898616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=167,0;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23898616_G_A:23898616:0,1,1,0
chr14	23898618	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,30;MFRL=167,0;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:23898616_G_A:23898616:0,1,1,0
chr14	23898627	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=167,0;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23898616_G_A:23898616:0,1,1,0
chr14	23898884	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,222;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	23938813	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr14	23940081	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:4,8:4,4:0|1:23940081_A_G:23940081:7,2,9,3
chr14	23940086	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,16,5
chr14	23940089	.	AC	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:3,9:5,4:0|1:23940081_A_G:23940081:7,2,10,4
chr14	23945366	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:5,2,3,6
chr14	23947374	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	24028142	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=242,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24028142_C_T:24028142:0,3,0,1
chr14	24028148	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=218,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24028142_C_T:24028142:0,4,0,1
chr14	24029547	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:6,8,1,2
chr14	24031767	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=74,122;MMQ=60,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,0:12,3:12,7,0,3
chr14	24031797	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=56,122;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,0:10,3:8,7,0,3
chr14	24436381	.	GA	G,GAA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,30,20;MFRL=118,131,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=17.62,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,11,3:0.305,0.106:35:7,2,0:8,7,2:11,10,5,9
chr14	24436435	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,59;MMQ=40,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.156:42:15,6:21,0:9,27,3,3
chr14	24470205	.	C	CTCACCCCT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=129,17666;MMQ=52,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,0:19,2:0|1:24470205_C_CTCACCCCT:24470205:23,14,0,2
chr14	24470208	.	A	ATCCCTTCATCCCCCTACC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=129,17666;MMQ=52,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,0:19,2:0|1:24470205_C_CTCACCCCT:24470205:23,14,0,2
chr14	24473448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=179,133;MMQ=27,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,4:5,0,4,0
chr14	24473478	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=138,115;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.470:9:1,1:3,2:5,0,3,1
chr14	24511866	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=87,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:5,6:6,7:6,5,7,7
chr14	24512897	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	24518106	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24518106_GA_G:24518106:1,2,0,1
chr14	24518108	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:24518106_GA_G:24518106:1,3,0,1
chr14	24518110	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24518106_GA_G:24518106:1,3,0,1
chr14	24518115	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:24518106_GA_G:24518106:1,3,0,1
chr14	24520218	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0,0,1,10
chr14	24522821	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	24522938	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:8,3:3,6:7,5,5,5
chr14	24523355	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=90,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:6,7:9,0:8,8,7,0
chr14	24523594	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr14	24525634	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:0,6:1,6:0,1,3,10
chr14	24525782	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr14	24526250	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=241,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,0:5,3,0,2
chr14	24526287	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr14	24532532	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:24532532_A_AT:24532532:5,10,1,1
chr14	24532535	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,1:0|1:24532532_A_AT:24532532:5,10,1,1
chr14	24533498	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=96,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,3:5,0:7,9,0,3
chr14	24533539	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr14	24533541	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=122,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,3:3,0:1,6,0,3
chr14	24534333	.	C	CAGCAGCCTCTGATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=177,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	24538460	.	C	CTGGGGCTACACAGGTGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr14	24538718	.	G	GCTCGCCCATGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24538718_G_GCTCGCCCATGCCT:24538718:0,1,0,1
chr14	24538721	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24538718_G_GCTCGCCCATGCCT:24538718:0,1,0,1
chr14	24543873	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr14	24544904	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=214,270;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,0:4,8:3,6,0,9
chr14	24545366	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:1,2,3,5
chr14	24545375	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=137,77;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:2,3:3,3,2,2
chr14	24545835	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	24569210	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=98,33;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:11,6,1,1
chr14	24587419	.	C	CTTTTCCTCATACAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=113,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0|1:24587419_C_CTTTTCCTCATACAAAA:24587419:0,3,1,1
chr14	24587421	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=113,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,1:1,0:0|1:24587419_C_CTTTTCCTCATACAAAA:24587419:0,3,1,1
chr14	24587515	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	24587545	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	24587795	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr14	24590301	.	C	CCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	24600780	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=176,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:24600780_G_T:24600780:3,1,1,1
chr14	24600783	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=176,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:24600780_G_T:24600780:3,1,1,1
chr14	24600785	.	C	CAGTTCACT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=176,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:24600780_G_T:24600780:3,1,1,1
chr14	24600787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=189,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:24600780_G_T:24600780:4,0,1,1
chr14	24601318	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	24607839	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=168,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:5,7,1,1
chr14	24608326	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=91,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:16,0:19,7:17,18,7,0
chr14	24618196	.	GAGTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr14	24618631	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:12,0:19,5:15,16,0,5
chr14	24621298	.	T	TGTCTGTCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	24624741	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=100,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,3,3
chr14	24633131	.	GAGC	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:9,3:12,0:3,20,1,2
chr14	24642028	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,2:9,2:6,6,2,2
chr14	24646406	.	G	GGAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=81.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,13,10
chr14	24646469	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:2,6,4,3
chr14	24647902	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:4,7,1,5
chr14	24647957	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:0,3,1,1
chr14	24651624	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr14	24651665	.	TC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24651665_TC_CA:24651665:1,0,0,1
chr14	24651669	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24651665_TC_CA:24651665:0,0,0,1
chr14	24652107	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:3,6,0,2
chr14	24652630	.	A	ACCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,21;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=C;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:4,0:4,1:0|1:24652630_A_ACCC:24652630:0,8,2,0
chr14	24652635	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0|1:24652630_A_ACCC:24652630:0,9,2,0
chr14	24652641	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:3,0:0|1:24652630_A_ACCC:24652630:2,9,2,0
chr14	24652644	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:0|1:24652630_A_ACCC:24652630:2,9,2,0
chr14	24653137	.	A	ACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=219,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24653137_A_ACT:24653137:1,1,0,1
chr14	24653138	.	G	GCAACCTCCGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=219,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24653137_A_ACT:24653137:1,1,0,1
chr14	24653144	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=219,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24653137_A_ACT:24653137:1,1,0,1
chr14	24655523	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,1:10,1:7,14,0,2
chr14	24679877	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,6:4,6:6,3,9,4
chr14	24680606	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,0:0,4,1,1
chr14	24684838	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:10,15,0,2
chr14	24685004	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:19,0:8,3:17,10,2,1
chr14	24707494	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:15,2:0|1:24707494_G_A:24707494:15,14,1,1
chr14	24707496	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:14,2:0|1:24707494_G_A:24707494:15,14,1,1
chr14	24710030	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:18,4:20,0:16,22,2,2
chr14	24718515	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:3,2,2,2
chr14	24727934	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=103,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:1,0:0|1:24727934_T_G:24727934:1,7,0,2
chr14	24727937	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,0:1,0:0|1:24727934_T_G:24727934:1,6,0,2
chr14	24727939	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,11;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:1,0:0|1:24727934_T_G:24727934:1,6,0,2
chr14	24727957	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=17,21;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:0,0:0,5,0,1
chr14	24735624	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:4,4,2,1
chr14	24735928	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,9:0,0:2,0,9,0
chr14	24736831	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,846;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:5,4:16,0:15,6,0,4
chr14	24736961	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:3,5:8,1:5,7,3,3
chr14	24736995	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:2,1:1,4,0,3
chr14	24737195	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=179,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:24737195_C_T:24737195:1,7,1,1
chr14	24737202	.	A	ACTAGATTGCCGGTTGCTTTC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=179,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:24737195_C_T:24737195:0,6,1,1
chr14	24737203	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:3,1:1,2:1|0:24737195_C_T:24737195:1,4,0,3
chr14	24737204	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=179,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0|1:24737195_C_T:24737195:0,6,1,1
chr14	24738055	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:7,3,0,2
chr14	24739365	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=85,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:2,4,3,4
chr14	24739480	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.395:11:1,1:4,3:5,2,4,0
chr14	24740167	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:2,5,2,3
chr14	24760009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:2,1,7,0
chr14	24760255	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:4,4,0,2
chr14	24765622	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=255,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,4,3
chr14	24765684	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=91,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.675:25:4,11:3,6:6,2,7,10
chr14	24769849	.	A	AGAGGAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=GAG;STR;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.535:9:2,2:1,1:0,4,1,4
chr14	24771137	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr14	24772922	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr14	24775269	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,1:6,2:11,7,3,0
chr14	24776656	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:9,3:25,0:14,22,3,0
chr14	24785784	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=205,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr14	24786060	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:15,10:6,5:10,11,7,8
chr14	24786976	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,12,20
chr14	24788065	.	A	AAGGAAGGAAGGAAGGAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr14	24793647	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:7,3:3,5:1,9,3,5
chr14	24795115	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.661:19:4,3:2,8:3,3,6,7
chr14	24795231	.	CCA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr14	24795237	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr14	24795258	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,5:1,2:2,0,5,2
chr14	24795585	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:11,4:2,7:1,12,6,5
chr14	24798393	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:6,9:3,3:6,3,6,7
chr14	24799287	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=214,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,4,1
chr14	24799578	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr14	24799586	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr14	24800382	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,72;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:4,0:18,3:11,11,1,2
chr14	24801635	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	24801956	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:0,3,0,6
chr14	24802263	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr14	24803956	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	24806229	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:1,2,0,5
chr14	24806800	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=251,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:1,0,4,3
chr14	24806852	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=41,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,3,3
chr14	24807302	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:2,7,4,3
chr14	24808168	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr14	24808842	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,3:3,0:1,2,0,3
chr14	24808924	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:1,2,2,0
chr14	24808936	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,3:2,0:2,3,2,1
chr14	24808961	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,5:3,0:3,3,3,2
chr14	24837668	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:0,0:5,2:1,5,0,2
chr14	24843620	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,6:5,3:8,5,3,6
chr14	24845033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=268,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr14	24845154	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=54,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr14	24846757	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	24868663	.	T	TGCCCC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:5,0:8,1:0|1:24868663_T_TGCCCC:24868663:1,12,2,0
chr14	24868668	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,0:7,2:0|1:24868663_T_TGCCCC:24868663:1,11,2,0
chr14	24882440	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	24884063	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr14	24884118	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=157,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,1:8,1:6,3,1,1
chr14	24897206	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	24898355	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr14	24900209	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.850:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	24901276	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,22:0,22:0,0,27,19
chr14	24901844	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr14	24902187	.	TCACACC	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:19,2:17,0:0|1:24902187_TCACACC_T:24902187:26,30,1,1
chr14	24902195	.	TCACGAGTCATGGATGGCAAGAGGATC	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:22,2:17,0:0|1:24902187_TCACACC_T:24902187:23,27,1,1
chr14	24905519	.	GTG	ACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr14	24905533	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr14	24905548	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr14	24909281	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,7,3
chr14	24909731	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr14	24910210	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr14	24910846	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,4:0,5:0,0,5,6
chr14	24910876	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,9,9
chr14	24910973	.	TT	GA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,15:0,0,11,21
chr14	24911852	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,13,3
chr14	24974963	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr14	24975509	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	24976744	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,3:3,0:3,9,0,3
chr14	25042774	.	TCTGTGGACGTTTATTAAGGCTCTGGCAACA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:4,0,1,1
chr14	25076303	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr14	25076702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=209,0;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr14	25076719	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=209,0;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:2,2:3,2,4,0
chr14	25076745	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=168,0;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:1,2:8,1,2,0
chr14	25076753	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=143,0;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:0|1:25076753_G_T:25076753:7,2,3,0
chr14	25076759	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,0;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:0|1:25076753_G_T:25076753:7,2,3,0
chr14	25100247	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=121,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:7,2,3,4
chr14	25100282	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:4,4:8,2:5,7,2,5
chr14	25101548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,175;MMQ=40,34;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,2,0
chr14	25101706	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:3,2:4,2:1,7,2,2
chr14	25103409	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=94,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:1,5:8,3:0|1:25103409_T_C:25103409:7,4,2,6
chr14	25103414	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=88,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:0,5:10,3:0|1:25103409_T_C:25103409:7,5,2,6
chr14	25282077	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr14	26917612	.	GGCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr14	27066769	.	A	AGACGGAGTCTCGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	29236619	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=86,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,0:0,6:0,3,1,5
chr14	29236634	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:29236634_A_AG:29236634:0,2,0,1
chr14	29236635	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29236634_A_AG:29236634:0,2,0,1
chr14	29238110	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0|1:29238110_T_A:29238110:2,3,0,4
chr14	29238113	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0|1:29238110_T_A:29238110:2,3,0,4
chr14	29238203	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,0:2,2:5,3,0,2
chr14	29242041	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:29242041_G_T:29242041:10,10,1,1
chr14	29242047	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=105,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:29242041_G_T:29242041:5,10,1,1
chr14	29242049	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:29242041_G_T:29242041:4,9,1,1
chr14	29242172	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=253,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29242172_ACG_A:29242172:0,1,0,1
chr14	29242179	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,23;MFRL=253,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29242172_ACG_A:29242172:0,1,0,1
chr14	29261307	.	A	AC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:7,10:4,6:0|1:29261307_A_AC:29261307:2,9,10,7
chr14	29261309	.	A	AAC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:7,10:4,5:0|1:29261307_A_AC:29261307:2,9,11,7
chr14	29261553	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=252,153;MMQ=44,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:29261553_T_C:29261553:0,2,0,1
chr14	29261560	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=188,153;MMQ=40,21;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29261553_T_C:29261553:0,1,0,1
chr14	30046661	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=163,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:30046661_T_G:30046661:2,4,1,1
chr14	30046663	.	C	CTAAGCAAAGGGTA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=163,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:3,0:3,2:0|1:30046661_T_G:30046661:2,4,1,1
chr14	30046666	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:30046661_T_G:30046661:2,4,1,1
chr14	30098349	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr14	30102025	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr14	30194897	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30194897_C_A:30194897:0,1,0,1
chr14	30194898	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30194897_C_A:30194897:0,1,0,1
chr14	30194900	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30194897_C_A:30194897:0,1,0,1
chr14	31056067	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:5,0:0,6,0,3
chr14	31061558	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=133,198;MMQ=60,35;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.250:25:9,5:9,0:12,7,6,0
chr14	31077120	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,6363;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:9,4,1,1
chr14	31084591	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,105;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:10,7,3,0
chr14	31164039	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:20,0:5,3:14,12,0,3
chr14	31169558	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31169558_G_C:31169558:0,1,0,1
chr14	31169559	.	CTAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=196,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:31169558_G_C:31169558:0,2,0,1
chr14	31169565	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=196,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31169558_G_C:31169558:0,2,0,1
chr14	31175055	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:31175055_C_T:31175055:8,5,1,1
chr14	31175060	.	AGCTAT	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:31175055_C_T:31175055:8,6,1,1
chr14	31175069	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:8,2:4,0:0|1:31175055_C_T:31175055:7,6,1,1
chr14	31191668	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,1:7,2,3,2
chr14	31344406	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	31348201	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31348201_G_A:31348201:0,2,0,1
chr14	31348204	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=143,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31348201_G_A:31348201:0,1,0,1
chr14	31353904	.	TTATCAGTGATCAGACATGTAAAACAGTATTATGCTATTTTATATGAGC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.244:13:6,1:1,1:1,8,2,2
chr14	31359024	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=128,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr14	31380215	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr14	31404277	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	31424790	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=95,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.262:10:4,0:2,2:4,4,2,0
chr14	31483761	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	31483996	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:1,1:0|1:31483996_A_C:31483996:0,3,0,1
chr14	31483998	.	T	TGCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=10,30;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:31483996_A_C:31483996:0,3,0,1
chr14	31484001	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,21;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31483996_A_C:31483996:0,3,0,1
chr14	31484004	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31483996_A_C:31483996:0,2,0,1
chr14	31535603	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr14	31538984	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr14	31549745	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr14	31554179	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31554179_G_C:31554179:0,4,0,1
chr14	31554182	.	C	CCAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31554179_G_C:31554179:0,4,0,1
chr14	31572167	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:9,15,2,0
chr14	31578713	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:4,12,2,0
chr14	31583616	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr14	31602966	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=226,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31602966_G_A:31602966:0,1,0,1
chr14	31602976	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31602966_G_A:31602966:0,0,0,1
chr14	31638638	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=106,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:1,0:17,2:0|1:31638638_C_T:31638638:9,9,1,1
chr14	31638654	.	T	TTAG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:0,0:14,2:0|1:31638638_C_T:31638638:7,7,1,1
chr14	31638656	.	C	CTTGGTTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:0,0:12,2:0|1:31638638_C_T:31638638:7,7,1,1
chr14	31762838	.	T	TTTCTGAAACC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0|1:31762838_T_TTTCTGAAACC:31762838:0,5,0,2
chr14	31762840	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:31762838_T_TTTCTGAAACC:31762838:0,5,0,2
chr14	31778080	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,178;MMQ=57,58;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:2,1,2,0
chr14	31782394	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:4,7,2,4
chr14	31787579	.	ATTAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	31790886	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=102,61;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr14	31790917	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=71,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:0,3:2,3:1,1,0,6
chr14	31793053	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=203,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	31806844	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr14	31819047	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr14	31819966	.	TTTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTTG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	31828076	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:4,5,2,1
chr14	31841162	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,5:4,6:1,3,1,11
chr14	31858025	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=81,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:6,3,0,4
chr14	32142544	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.169:22:7,3:8,0:9,10,1,2
chr14	32295772	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr14	32295880	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:7,7,2,1
chr14	32296018	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	32563640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr14	32621815	.	T	TCAAGACTTAGGAAGAATAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	33004749	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:4,2,2,1
chr14	33046471	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr14	33069893	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chr14	33165182	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,2:3,7:4,3,7,2
chr14	33242863	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,2,1
chr14	33291446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:33291446_C_T:33291446:4,5,0,2
chr14	33291453	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:33291446_C_T:33291446:4,5,0,2
chr14	33684780	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,0:2,5:2,7,0,5
chr14	34247631	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:1,2:4,3:4,1,5,1
chr14	34270101	.	TCGAC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=140,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:8,0:0|1:34270101_TCGAC_T:34270101:9,5,1,1
chr14	34270107	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,37;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:34270101_TCGAC_T:34270101:8,5,1,1
chr14	34395148	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.699:21:5,10:1,5:1,5,4,11
chr14	34419796	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr14	34985645	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.495:14:4,1:3,5:4,3,5,2
chr14	34993863	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=74,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.509:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr14	34998564	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:5,2,2,0
chr14	35037008	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:1,1:4,8:3,3,6,3
chr14	35037290	.	TCAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr14	35045136	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,0:0,3,0,3
chr14	35062312	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:8,4:2,1:4,6,1,4
chr14	35074713	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,193;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr14	35075022	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=235,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	35182406	.	GATA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATA;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,6:0,11:0,0,2,15
chr14	35222928	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0|1:35222928_C_A:35222928:0,2,0,1
chr14	35222935	.	ATTAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=217,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:35222928_C_A:35222928:0,2,0,1
chr14	35233996	.	GC	TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:9,2:16,0:15,11,1,1
chr14	35263897	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=169,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	35272191	.	A	AACCTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=157,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:35272191_A_AACCTT:35272191:4,6,1,1
chr14	35272194	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:35272191_A_AACCTT:35272191:4,7,1,1
chr14	35272198	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:35272191_A_AACCTT:35272191:4,7,1,1
chr14	35468886	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0|1:35468886_C_G:35468886:2,2,1,5
chr14	35468893	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:0|1:35468886_C_G:35468886:2,2,1,5
chr14	35470049	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	35476673	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr14	35477785	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr14	35482797	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	35488309	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr14	35497274	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr14	35515606	.	TGG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=70.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,5:0,0,13,4
chr14	35546445	.	TT	AA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=208,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:0|1:35546445_TT_AA:35546445:2,5,1,1
chr14	35546449	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=211,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:35546445_TT_AA:35546445:1,5,1,1
chr14	35546451	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=211,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:35546445_TT_AA:35546445:1,5,1,1
chr14	35550329	.	AGAGACAGTGATATCCAGCTCATTTGTGAATGTCAATTTTGAAATGGAGG	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=141,153;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,24:0.132:65:9,9:11,3:19,22,7,17
chr14	35564367	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=80,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:12,3:9,9,3,0
chr14	35576458	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:0,8:5,5:3,2,11,2
chr14	35579232	.	T	TTCAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=208,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35579232_T_TTCAGGAG:35579232:0,1,0,1
chr14	35579235	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=208,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35579232_T_TTCAGGAG:35579232:0,1,0,1
chr14	35579238	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=208,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35579232_T_TTCAGGAG:35579232:0,1,0,1
chr14	35591174	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,7:5,3:9,5,5,5
chr14	35593477	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=153,124;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,4:2,1:0,5,1,5
chr14	35596092	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	35735967	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.271:35:10,6:15,3:18,8,3,6
chr14	35871093	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr14	36004075	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr14	36017601	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:36017601_C_T:36017601:4,0,1,0
chr14	36017603	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:36017601_C_T:36017601:4,0,1,0
chr14	36039877	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,94;MMQ=40,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:8,6,1,2
chr14	36096255	.	GA	G,GAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,23,20;MFRL=124,91,109;MMQ=60,60,60;MPOS=6,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.09,16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,12:0.232,0.504:23:4,3,5:0,2,1:4,1,7,11
chr14	36104901	.	T	TCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=220,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	36121087	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr14	36231816	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr14	36304238	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr14	36334030	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	36768276	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:2,12:1,3:1,2,9,6
chr14	36769898	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr14	36781063	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr14	36781083	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr14	36786029	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=100,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr14	36789775	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.623:11:4,3:0,4:0|1:36789775_A_T:36789775:1,3,2,5
chr14	36789795	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:5,0:0,4:0|1:36789775_A_T:36789775:1,4,2,2
chr14	36789841	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=196,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr14	36982437	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	36986888	.	CCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr14	36986938	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:36986938_TG_T:36986938:6,6,1,1
chr14	36986940	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:36986938_TG_T:36986938:6,6,1,1
chr14	37132048	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:9,0,2,0
chr14	37132061	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,3:2,0:7,1,3,0
chr14	37132769	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	37132805	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr14	37135752	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.462:28:9,6:6,6:8,7,7,6
chr14	37153163	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:0,6,0,8
chr14	37153185	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr14	37203617	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	37203642	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	37344229	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,6:4,7:2,3,2,11
chr14	37344275	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr14	37641419	.	AACGGTTTCAGGACACGCGGTGGGGAAAGCGACTAGCCTCCGGCGGGGCAGGGCGGGCTGTCCTTACCTGCAGAACCACCGGCC	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:7,2:4,0:23,11,1,1
chr14	37717138	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,0:12,4:16,10,1,3
chr14	37736441	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=194,265;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37736441_T_C:37736441:0,3,0,1
chr14	37736457	.	AC	CC,CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,33,34;MFRL=220,265,204;MMQ=50,36,30;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,0:1,1,1:0,2,0,2
chr14	37736467	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=246,235;MMQ=40,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:37736441_T_C:37736441:0,1,0,2
chr14	37736475	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=246,204;MMQ=40,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:37736441_T_C:37736441:0,1,0,1
chr14	38281673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr14	38296526	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,112;MMQ=60,28;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:5,6,0,2
chr14	38310606	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	38311546	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38311546_A_T:38311546:0,2,0,1
chr14	38311548	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38311546_A_T:38311546:0,2,0,1
chr14	38311549	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38311546_A_T:38311546:0,2,0,1
chr14	38311552	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38311546_A_T:38311546:0,2,0,1
chr14	38311554	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38311546_A_T:38311546:0,2,0,1
chr14	38311564	.	G	GGTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	38678638	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:38678638_G_GC:38678638:4,1,1,1
chr14	38678643	.	A	ACTTCATCACC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=151,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:1,2:3,0:0|1:38678638_G_GC:38678638:4,2,1,1
chr14	38680412	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:1,0:3,0:0|1:38680412_T_A:38680412:1,4,2,0
chr14	38680420	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.248:9:0,0:4,0:0|1:38680412_T_A:38680412:2,5,2,0
chr14	38680424	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:38680412_T_A:38680412:1,3,1,0
chr14	38680427	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:38680412_T_A:38680412:1,3,1,0
chr14	38680740	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,2:3,3,2,1
chr14	38681113	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=203,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chr14	38724067	.	G	GATCCTGAGCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,0,1
chr14	38725248	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=83,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr14	39502539	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr14	39502626	.	A	AAATAGAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	39511952	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.624:19:3,8:4,4:4,3,10,2
chr14	39512122	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,2,12
chr14	39532492	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=82,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr14	39554889	.	TATATACACACACACACACAC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:1,1:1,3:9,4,3,1
chr14	39565403	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	39583481	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	39591565	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	39591613	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:3,0,2,0
chr14	39605542	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	39620936	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,18,4
chr14	39627433	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr14	39645863	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	39647188	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=208,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,1:2,3:0,3,0,5
chr14	39650596	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=113,429;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:11,0:8,4:11,8,4,0
chr14	39650762	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:12,0:19,5:13,19,0,5
chr14	39651149	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	39736680	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,11,13
chr14	39748480	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,15,6
chr14	39773435	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=224,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.914:13:0,5:1,6:1,0,12,0
chr14	39773639	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr14	39782647	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=116,60;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:15,0:19,4:0|1:39782647_T_A:39782647:12,22,0,4
chr14	39782651	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=116,60;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:15,0:17,4:0|1:39782647_T_A:39782647:12,22,0,4
chr14	39784004	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=0,112,72;MMQ=56,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,3,4;RU=TA;STR;TLOD=40.61,62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,20,29:0.352,0.614:50:1,6,15:0,12,8:0,1,30,19
chr14	39784965	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr14	39796048	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr14	39817042	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:6,2:2,2:9,3,0,4
chr14	39817046	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=22,19;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:2,1:0|1:39817046_A_T:39817046:1,8,2,0
chr14	39817048	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:5,0:3,0:0|1:39817046_A_T:39817046:1,8,2,0
chr14	39817049	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:6,0:3,0:0|1:39817046_A_T:39817046:1,8,2,0
chr14	39817051	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.235:11:5,0:3,0:0|1:39817046_A_T:39817046:1,8,2,0
chr14	39818222	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr14	39818277	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr14	39871159	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	42360525	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,29;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:6,3,1,1
chr14	44975147	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=97,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,3:5,4:5,4,3,4
chr14	44976241	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,3:1,5:0,6,4,4
chr14	45430189	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr14	45430202	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr14	45430216	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr14	45468761	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=223,349;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr14	45475139	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	45501384	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,4,2
chr14	45535985	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:3,1,0,3
chr14	45565508	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,3:2,0:3,1,3,0
chr14	45576880	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr14	45579491	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0|1:45579491_G_GC:45579491:0,2,0,1
chr14	45579492	.	A	AGACTGCAGCGTTCTGAGAAACATCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,23;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:0,1:0,0:0|1:45579491_G_GC:45579491:0,2,0,1
chr14	45583857	.	A	AAAAGTGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:3,0:2,2:2,3,1,1
chr14	45583883	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	45584031	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:5,6:10,0:9,6,7,0
chr14	45609996	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	45628241	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr14	45628283	.	TTA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,3,2
chr14	45650813	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:2,7,3,2
chr14	45654410	.	TCTTA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTA;STR;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,2:3,4:5,1,4,2
chr14	45665468	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:2,6,5,4
chr14	45686482	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45686482_T_TC:45686482:0,1,0,1
chr14	45686483	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45686482_T_TC:45686482:0,1,0,1
chr14	45697103	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr14	45711316	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:8,5:1,2:3,7,3,4
chr14	45716018	.	ATT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:9,1:3,0:9,4,2,0
chr14	47120357	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:9,0:4,5:7,6,0,5
chr14	47121018	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:4,6:3,1:3,5,2,5
chr14	47314938	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr14	47315127	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr14	47351429	.	A	AGAACATACTGGGAACATTATTCTATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=99,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr14	47530845	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=224,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr14	47687187	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:1,4:7,1:5,3,4,1
chr14	47770560	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr14	47770710	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=82,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,4:7,0:5,7,4,0
chr14	47770841	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	50050396	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,32,20;MFRL=130,137,122;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=14.47,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,5:0.324,0.238:21:4,2,0:0,4,3:0,9,2,10
chr14	50065717	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,15:0,11:0,1,18,8
chr14	50065926	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:4,12,1,2
chr14	50069282	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	50085411	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr14	50094913	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr14	50110319	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:6,4:5,1:6,5,4,1
chr14	50113915	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr14	50114117	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:8,4:3,4:4,7,4,4
chr14	50131932	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	50133033	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,4,2
chr14	50133218	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	50136155	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=257,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr14	50175792	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	50190494	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:5,0,4,0
chr14	50199337	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	50199375	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr14	50238451	.	TGG	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=152,135;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.218:12:5,0:3,2:0|1:50238451_TGG_T:50238451:3,7,0,2
chr14	50238455	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=176,135;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:50238451_TGG_T:50238451:1,8,0,2
chr14	50238457	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=176,135;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,1:0|1:50238451_TGG_T:50238451:1,8,0,2
chr14	50241258	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr14	50244835	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr14	50251369	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,17,13
chr14	50251888	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr14	50251980	.	GCAAACAGTAGTACATCTTCAGGATGTGGCTGGCCTGT	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.082:36:11,2:13,0:19,15,1,1
chr14	50256039	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=114,83;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.364:53:13,0:21,19:10,24,0,19
chr14	50266091	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:5,0,2,0
chr14	50266095	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr14	50266141	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:5,1:3,1:6,2,2,0
chr14	50269557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,471;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:50269557_C_T:50269557:0,7,2,0
chr14	50269560	.	T	TGTTCTAAGAGTATTTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=123,471;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:50269557_C_T:50269557:0,7,2,0
chr14	50272691	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr14	50280823	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=92,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:6,3:6,0:10,7,2,1
chr14	50280843	.	AG	GT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=139,92;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,0:2,1:0|1:50280843_AG_GT:50280843:6,8,1,1
chr14	50280848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=141,92;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:2,2:0|1:50280843_AG_GT:50280843:4,8,1,1
chr14	50281584	.	A	ACAGGAAGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=149,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr14	50296120	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,50;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:9,3:11,11,0,3
chr14	50299051	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.877:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr14	50319327	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr14	50319499	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,9,16
chr14	50459609	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr14	50459673	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	50558405	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:10,0:9,4:10,9,0,4
chr14	50585574	.	C	CA,CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28,32;MFRL=0,112,111;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=7.70,15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,11:0.344,0.610:17:0,3,3:0,3,6:0,0,2,15
chr14	50585616	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr14	50605267	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:5,0,2,1
chr14	50611845	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,17,5
chr14	50612401	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	50612414	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr14	50617046	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	50619927	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:0,7,1,7
chr14	50623654	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:50623654_A_AAT:50623654:1,0,4,0
chr14	50623657	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1|0:50623654_A_AAT:50623654:4,0,1,0
chr14	50623669	.	GTATATATATGTGTATA	G,ATATATATATGTGTATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28,28;MFRL=0,161,150;MMQ=60,60,60;MPOS=10,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.285,0.598:6:0,0,3:0,2,1:0,0,6,0
chr14	50625372	.	G	GATCT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:0|1:50625372_G_GATCT:50625372:7,11,0,2
chr14	50625373	.	G	GTGTTTATAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:50625372_G_GATCT:50625372:7,11,0,2
chr14	50626836	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr14	50641347	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	50641364	.	A	ACACACAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=171,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50641364_A_ACACACAG:50641364:0,2,0,1
chr14	50641366	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=171,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50641364_A_ACACACAG:50641364:0,2,0,1
chr14	50647251	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr14	50670965	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,16,5
chr14	50671133	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,3:4,1:1,5,1,3
chr14	50713679	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	50732042	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:4,4,5,0
chr14	50745123	.	A	ATTACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	50750577	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=82,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:5,5,2,1
chr14	50761040	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50761040_A_T:50761040:0,2,0,1
chr14	50761041	.	ATCATCAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,22;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:50761040_A_T:50761040:0,2,0,1
chr14	50761054	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50761040_A_T:50761040:0,1,0,1
chr14	50778816	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:8,3:4,4:6,7,2,5
chr14	50789578	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	50792273	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr14	50802781	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,0,2
chr14	50802972	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=192,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	50808802	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr14	50844367	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.431:19:4,2:7,6:6,5,8,0
chr14	50844856	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr14	50862418	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.442:21:2,5:8,4:7,5,8,1
chr14	50862436	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,0:17,3:20,8,3,0
chr14	50886897	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr14	50895538	.	ATGT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr14	50895563	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	50904824	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	50914015	.	T	TTCCACTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=195,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.326:8:0,2:5,0:6,0,1,1
chr14	50929508	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,2,17
chr14	50933231	.	A	ATTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:0,0:6,2:6,0,1,1
chr14	50949196	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr14	50949221	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=156,0;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:1,6,1,1
chr14	50952367	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.623:19:1,6:4,6:1,6,3,9
chr14	50971446	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr14	50998585	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,1146367;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr14	51057727	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,7:1,2:1,3,5,4
chr14	51058234	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:5,3,6,2
chr14	51060452	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr14	51062236	.	TTC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=60,101;MMQ=57,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TC;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr14	51062270	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=81,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:5,7:2,2:4,3,6,3
chr14	51089837	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:6,2,5,4
chr14	51096610	.	G	GTTCTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=90,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,11:1,9:2,0,10,10
chr14	51107452	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:2,2,6,3
chr14	51111484	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:17,0:8,7:15,10,0,7
chr14	51111485	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:9,8:10,6:7,12,9,5
chr14	51194380	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:14,0:8,15,2,0
chr14	51194564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51194564_T_C:51194564:0,1,0,1
chr14	51194566	.	A	AGCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51194564_T_C:51194564:0,1,0,1
chr14	51196142	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=103,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr14	51206021	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,8:0,0,15,8
chr14	51208211	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr14	51208236	.	T	TGTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,6,2
chr14	51214773	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:0|1:51214773_T_A:51214773:3,4,1,1
chr14	51214774	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:51214773_T_A:51214773:3,4,1,1
chr14	51214776	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:51214773_T_A:51214773:3,4,1,1
chr14	51214847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr14	51219321	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=102,64;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.081:59:40,0:13,4:21,34,0,4
chr14	51224252	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,0:5,5:5,6,0,5
chr14	51225207	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,2:12,0:7,10,1,2
chr14	51228655	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:2,5,1,3
chr14	51228682	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chr14	51233160	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51233160_T_C:51233160:1,1,0,1
chr14	51233168	.	CCAACACA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51233160_T_C:51233160:1,1,0,1
chr14	51233177	.	C	CTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:51233160_T_C:51233160:1,1,0,1
chr14	51233181	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51233160_T_C:51233160:0,1,0,1
chr14	51233183	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51233160_T_C:51233160:0,1,0,1
chr14	51233187	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51233160_T_C:51233160:0,1,0,1
chr14	51237701	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,3:1,1:0,6,1,3
chr14	51238253	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=208,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr14	51239067	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr14	51289872	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:9,2:5,3:10,4,4,1
chr14	51289873	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=181,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.207:19:7,3:7,1:11,4,3,1
chr14	51289874	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.717:19:2,9:3,5:4,1,10,4
chr14	51289926	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,9:3,5:3,2,7,7
chr14	51297351	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr14	51347107	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	51348281	.	C	CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=57,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=T;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.798:6:1,2:0,1:0,1,3,2
chr14	51353493	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr14	51355517	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,3:2,3:6,3,5,1
chr14	51368495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr14	51370784	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=71,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:9,3:0,1:6,3,4,0
chr14	51372091	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:5,2,2,1
chr14	51372098	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:1,3:4,4:0|1:51372098_CA_C:51372098:6,1,5,2
chr14	51372103	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:0|1:51372098_CA_C:51372098:8,1,5,2
chr14	51374876	.	AATGGGGATCTGATATTAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.342:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr14	51375699	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr14	51378590	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr14	51378675	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=81,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:2,3,4,0
chr14	51378814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:5,4,0,3
chr14	51378831	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:0|1:51378831_C_T:51378831:3,2,0,3
chr14	51378835	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:0|1:51378831_C_T:51378831:3,2,0,3
chr14	51378840	.	G	GGGCCGGTTCACCCCTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:51378831_C_T:51378831:3,1,0,2
chr14	51383432	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:11,5:13,6:9,15,8,3
chr14	51450176	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,0:5,2:0|1:51450176_AC_A:51450176:3,6,1,1
chr14	51450179	.	ACCAGG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:3,0:5,2:0|1:51450176_AC_A:51450176:3,8,1,1
chr14	51450185	.	TTG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:51450176_AC_A:51450176:2,7,1,1
chr14	51475794	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=65,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:3,1,1,3
chr14	51491956	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr14	51492135	.	C	CCACACAGGTGTTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr14	51710508	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	51710551	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.484:8:2,4:2,0:1,3,3,1
chr14	51710732	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=657,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr14	51716161	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.507:16:5,4:3,4:5,3,7,1
chr14	51716188	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:2,4:5,4:4,3,7,2
chr14	51721325	.	T	TATGTTCTGAATGTAGACTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51721325_T_TATGTTCTGAATGTAGACTC:51721325:0,0,0,1
chr14	51721328	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51721325_T_TATGTTCTGAATGTAGACTC:51721325:0,0,0,1
chr14	52167918	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr14	52174716	.	C	CTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0|1:52174716_C_CTGT:52174716:3,0,1,1
chr14	52174722	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:52174716_C_CTGT:52174716:3,0,1,1
chr14	52175047	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	52178333	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=188,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:52178333_T_TA:52178333:3,5,1,1
chr14	52178334	.	G	GCAGTTTACTCACATCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=188,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:52178333_T_TA:52178333:3,5,1,1
chr14	52182081	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,8,7
chr14	52474697	.	A	ACAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=171,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:11,2:5,0:6,10,1,2
chr14	52482063	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=152,114;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:52482063_G_T:52482063:0,4,0,1
chr14	52482065	.	T	TCCTGCCCCAATCCTAGAATCAGTCATTTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,114;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:52482063_G_T:52482063:0,4,0,1
chr14	52495375	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr14	52505771	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr14	52509543	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=109,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:0|1:52509543_G_C:52509543:7,5,1,1
chr14	52509546	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:5,0:5,2:0|1:52509543_G_C:52509543:7,5,1,1
chr14	52520368	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr14	52741499	.	C	CAGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,1:7,0:0|1:52741499_C_CAGG:52741499:11,6,1,1
chr14	52741506	.	G	GAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:0|1:52741499_C_CAGG:52741499:11,5,1,1
chr14	52741746	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=212,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr14	52781195	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	52794234	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	52922247	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:52922247_G_C:52922247:0,2,0,1
chr14	52922250	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:52922247_G_C:52922247:0,2,0,1
chr14	52922258	.	ACAGTGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:52922247_G_C:52922247:0,2,0,1
chr14	52937337	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:8,2:3,0:0|1:52937337_CT_C:52937337:6,8,1,1
chr14	52937341	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:52937337_CT_C:52937337:6,8,1,1
chr14	52985870	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:7,0:11,2,4,0
chr14	53098902	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,8,10
chr14	53100760	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	53101899	.	T	TAATCTCTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53101899_T_TAATCTCTA:53101899:0,1,0,1
chr14	53101904	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53101899_T_TAATCTCTA:53101899:0,1,0,1
chr14	53110384	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr14	53130435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,0:8,4:15,2,4,0
chr14	53133036	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr14	53173840	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,18;MFRL=252,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.539:4:0,1:0,0:2,0,2,0
chr14	53175340	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr14	53177729	.	TGAGTGTTTGGCTTCTAAATATTAAACTCTCGTTA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.969:26:0,8:0,18:0,0,17,9
chr14	53194419	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr14	53197338	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:53197338_A_C:53197338:0,3,0,1
chr14	53197350	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=69,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:0,0:2,1:0|1:53197338_A_C:53197338:0,2,0,1
chr14	53197352	.	C	CCCAGGGGAACCGCGTTGATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=69,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:53197338_A_C:53197338:0,2,0,1
chr14	53213128	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=80,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.301:21:5,3:10,3:9,6,3,3
chr14	53213267	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:53213267_A_AG:53213267:0,5,0,3
chr14	53213269	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:53213267_A_AG:53213267:0,5,0,3
chr14	53213271	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:53213267_A_AG:53213267:0,5,0,3
chr14	53325090	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=42,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.854:11:0,8:1,2:1,0,8,2
chr14	53325305	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	53326454	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	53345266	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr14	53513478	.	AAG	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=102,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.292:39:12,6:14,5:14,14,3,8
chr14	53525392	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	53619261	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:2,0:2,3:2,2,2,2
chr14	53619463	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr14	53619480	.	T	TGCCGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=GCC;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr14	53619730	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr14	54418986	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	54875591	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr14	54894604	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr14	54948112	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:54948112_C_T:54948112:11,5,1,1
chr14	54948137	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:5,2:0|1:54948112_C_T:54948112:12,8,1,1
chr14	54948144	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:8,2:0|1:54948112_C_T:54948112:12,10,1,1
chr14	54948148	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=113,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:0|1:54948112_C_T:54948112:11,11,1,1
chr14	54948149	.	C	CCATGAACCAAAA	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=113,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,1:0|1:54948112_C_T:54948112:11,11,1,1
chr14	54996891	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:10,2:11,2:8,13,2,2
chr14	55218151	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:7,2:8,2:10,5,2,2
chr14	55231236	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=131,15959;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:6,7,0,2
chr14	55243156	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:4,8,2,0
chr14	55251080	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.395:51:17,20:14,0:15,16,0,20
chr14	55313761	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.606:28:4,8:6,9:5,6,11,6
chr14	55326558	.	T	TTAAAAATACATATATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	55429918	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0|1:55429918_G_A:55429918:0,0,1,0
chr14	55429919	.	ATC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55429918_G_A:55429918:0,0,1,0
chr14	55429925	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55429918_G_A:55429918:0,0,1,0
chr14	55473949	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=99,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.543:6:0,0:1,3:2,1,3,0
chr14	55493408	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:13,1,6,0
chr14	55509832	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:13,0:13,3:18,9,2,1
chr14	55511365	.	T	TTTTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.599:23:4,7:5,6:3,6,6,8
chr14	55514721	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=192,175;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:55514721_C_T:55514721:0,4,0,1
chr14	55514730	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=207,175;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:55514721_C_T:55514721:0,3,0,1
chr14	55514794	.	ACGCC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=303,269;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55514794_ACGCC_A:55514794:1,1,0,1
chr14	55514800	.	A	ATCTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=303,269;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55514794_ACGCC_A:55514794:1,1,0,1
chr14	55609234	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	55612006	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=145,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr14	55617578	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.537:18:5,5:3,5:0,8,4,6
chr14	55636060	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=77,40;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.455:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr14	55642750	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr14	55647575	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr14	55647840	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:5,0,6,0
chr14	55648078	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr14	55817156	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:7,3,1,1
chr14	55818320	.	T	TATGGGAGAGGCACTGGGAG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=142,421;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.143:18:10,2:5,0:0|1:55818320_T_TATGGGAGAGGCACTGGGAG:55818320:7,9,0,2
chr14	55818325	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=157,421;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:55818320_T_TATGGGAGAGGCACTGGGAG:55818320:5,9,0,2
chr14	55818326	.	A	AGG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=157,421;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:55818320_T_TATGGGAGAGGCACTGGGAG:55818320:5,9,0,2
chr14	55818327	.	A	AGGACC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=157,421;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:55818320_T_TATGGGAGAGGCACTGGGAG:55818320:5,9,0,2
chr14	55818706	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=87,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,4:4,6:6,6,5,5
chr14	55819316	.	G	GATA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:5,12,1,1
chr14	55819994	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32,32,30;MFRL=127,88,127,203;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,29,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.86,14.58,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,4,8,3:0.175,0.331,0.143:24:6,1,7,1:3,3,1,1:2,7,5,10
chr14	55844476	.	TACA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=147,249;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr14	55847466	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=105,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,4:2,7:0,3,1,10
chr14	55848972	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr14	55878636	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	55902542	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,3:6,4:4,3,6,1
chr14	55902698	.	TAAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr14	55903716	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=83,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:5,3:7,5:8,4,3,5
chr14	55907172	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,3,2
chr14	56085812	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	56100008	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:18,0:7,4:0|1:56100008_A_T:56100008:10,17,0,4
chr14	56100014	.	TAC	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:20,0:6,4:0|1:56100008_A_T:56100008:10,17,0,4
chr14	56103872	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=167,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:0|1:56103872_A_C:56103872:8,0,7,0
chr14	56103882	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,6:0.500:12:4,2:2,4:1|0:56103872_A_C:56103872:6,0,6,0
chr14	56104095	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	56106784	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr14	56107051	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:1,5:4,0:4,1,5,1
chr14	56108033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	56116571	.	G	GAATACCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,41;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:56116571_G_GAATACCT:56116571:2,2,1,0
chr14	56116576	.	ATTTTT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=114,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:1,0:3,1:0|1:56116571_G_GAATACCT:56116571:2,3,1,0
chr14	56120178	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:7,2:4,3:9,2,5,0
chr14	56125366	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr14	56126456	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,3,10
chr14	56133942	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=93,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:6,2,4,2
chr14	56138693	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56138693_AG_A:56138693:0,0,0,1
chr14	56138697	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56138693_AG_A:56138693:0,0,0,1
chr14	56139313	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:7,3:9,3:11,5,5,1
chr14	56146228	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr14	56146357	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,3:7,1:5,7,2,2
chr14	56147540	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	56585301	.	AGCGGCGGCGCGGACTCGGCGGGGATCGCGGCGGAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.170:16:2,1:4,1:14,0,2,0
chr14	56746353	.	AAATGGAATTGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:3,0,1,0
chr14	56755425	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr14	57070501	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,17,1
chr14	57082648	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr14	57083926	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:9,7,3,0
chr14	57101560	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.376:13:1,3:3,0:1,7,3,2
chr14	57101682	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,10,16
chr14	57268443	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=85,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,3,1
chr14	57675560	.	T	TAAAAACAAAGAGGGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr14	57740952	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=169,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr14	57741649	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=220,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr14	57863385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr14	57876265	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr14	57938124	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=84,107;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:5,5,1,3
chr14	57947421	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,7:4,7:5,2,5,9
chr14	57957654	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,2,1
chr14	57957664	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,2,1
chr14	57957882	.	ATTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	57957895	.	T	TTCGTATTCCTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	58030942	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:8,6,1,1
chr14	58056257	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	58060586	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr14	58060598	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=67,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr14	58060862	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,0:2,3:2,6,1,2
chr14	58060939	.	AC	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58060939_AC_GA:58060939:0,0,0,1
chr14	58060942	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58060939_AC_GA:58060939:0,0,0,1
chr14	58063683	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=331,331;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr14	58471355	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	58478873	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=99,65;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.788:29:2,16:4,6:4,2,3,20
chr14	58604808	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=99,349;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:11,2:11,0:8,16,0,2
chr14	58666882	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,2:5,2:6,2,3,1
chr14	58669660	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,1:1,2:3,5,0,3
chr14	58674823	.	CAA	C,CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32,35;MFRL=160,134,182;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.19,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.243,0.258:13:6,1,0:1,2,3:0,7,0,6
chr14	58690427	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.299:12:3,0:4,3:4,5,2,1
chr14	58711590	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,2:13,0:15,12,1,1
chr14	58724817	.	C	CTA,CTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30,33;MFRL=0,177,157;MMQ=60,60,60;MPOS=5,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.20,16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.639:5:0,0,2:0,1,2:0,0,0,5
chr14	58724820	.	CG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr14	58737766	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,15:0,0,21,16
chr14	58737825	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:2,4:0,6,0,4
chr14	58770389	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr14	58771632	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr14	58869510	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr14	58875135	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.326:11:0,1:6,2:5,3,3,0
chr14	58878758	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr14	58917225	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr14	58920240	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	58923395	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,13,4
chr14	58932772	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr14	58932827	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58932827_T_C:58932827:0,0,0,1
chr14	58932842	.	CAGAGTGGTCTGGA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58932827_T_C:58932827:0,0,0,1
chr14	58934371	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	58937416	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr14	58937452	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr14	58938838	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr14	58954588	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.830:10:1,3:0,6:1,0,5,4
chr14	59006941	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:0|1:59006941_C_T:59006941:0,3,0,2
chr14	59006948	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=244,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1|0:59006941_C_T:59006941:0,3,0,2
chr14	59112588	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,1355;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:59112588_C_CA:59112588:3,6,2,0
chr14	59112589	.	G	GCGACTCTGAAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,1355;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:59112588_C_CA:59112588:3,6,2,0
chr14	59113691	.	TGGTCCCAGTTTGTCCAGACTCTGCCCATTCAAACGGTAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,0:6,2:5,11,1,1
chr14	59113785	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,73;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:3,0:10,5:5,8,1,4
chr14	59730422	.	AAGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr14	59787234	.	GGAA	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:20,1:17,2:17,22,2,1
chr14	59787324	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.443:24:6,6:7,5:0|1:59787324_TG_T:59787324:6,7,5,6
chr14	59787325	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.685:30:4,11:5,8:4,5,12,9
chr14	59787326	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.445:24:6,5:6,5:0|1:59787324_TG_T:59787324:6,7,5,6
chr14	59789586	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr14	59790745	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=224,230;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr14	59790813	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr14	59793606	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:4,3,7,1
chr14	59797213	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=85,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:3,6:10,6:10,3,6,6
chr14	59797235	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=85,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:6,8:12,7:14,4,5,10
chr14	59798473	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	59805217	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=55,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:2,0:0,0:0|1:59805217_GT_G:59805217:0,2,0,1
chr14	59805242	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=55,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:59805217_GT_G:59805217:0,2,0,1
chr14	59830597	.	A	ACTCATGCATGCCATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=293,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	59835350	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=200,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,0:1,6:0,1,3,3
chr14	59942953	.	T	TCAAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=214,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr14	59946099	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=107,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:2,5,1,4
chr14	59953379	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr14	59965429	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr14	59965702	.	G	GACAATTAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:59965702_G_GACAATTAAT:59965702:0,3,0,1
chr14	59965704	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:59965702_G_GACAATTAAT:59965702:0,3,0,1
chr14	59965708	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:59965702_G_GACAATTAAT:59965702:0,3,0,1
chr14	60063472	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr14	60072023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	60076783	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=78,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr14	60194289	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=126,444;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,1:7,3:7,10,0,4
chr14	60213179	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60213179_C_CT:60213179:0,0,0,1
chr14	60213180	.	A	ACCTATGGGGAGATAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60213179_C_CT:60213179:0,0,0,1
chr14	60575240	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:9,6:2,5:6,6,1,10
chr14	60576220	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=174,220;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:60576220_A_G:60576220:0,4,0,2
chr14	60576222	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=174,220;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,1:1,0:0|1:60576220_A_G:60576220:0,4,0,2
chr14	60576231	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=180,199;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:60576220_A_G:60576220:0,3,0,1
chr14	60576347	.	CAG	TGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,254;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	60576356	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr14	60576376	.	CC	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=141,167;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.362:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr14	60581673	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:1,1:3,2,3,1
chr14	60587899	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:2,3:0,0:0,2,1,3
chr14	60587947	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=84,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:17,0:8,4:9,17,0,4
chr14	60611585	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=143,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:4,1,2,2
chr14	60611648	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:4,7:3,10:3,4,10,7
chr14	60611675	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.740:17:1,7:3,6:2,2,7,6
chr14	60616042	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=93,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,4:1,4:1,0,4,4
chr14	60616912	.	G	GGC	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.675:41:4,5:4,9:7,6,12,16
chr14	60616914	.	CA	C,AA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=16,24,25;MFRL=108,114,126;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.79,70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,28:0.219,0.664:34:0,1,9:0,1,13:0,2,14,18
chr14	60622944	.	A	AAAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:0,5,0,7
chr14	60712515	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=47,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr14	60752453	.	G	GAGAGACAGAGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.107:25:7,2:15,0:0|1:60752453_G_GAGAGACAGAGA:60752453:12,11,0,2
chr14	60752454	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,2:15,0:0|1:60752453_G_GAGAGACAGAGA:60752453:12,11,0,2
chr14	60752548	.	TGTGTCTTTGACAGCTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=169,0;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr14	60921673	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr14	60928201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr14	60932756	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:4,2:5,2,0,2
chr14	60932765	.	CTTTTATA	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:5,2:0|1:60932765_CTTTTATA_C:60932765:4,4,0,2
chr14	60932774	.	CTAG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:60932765_CTTTTATA_C:60932765:3,4,0,2
chr14	60932781	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:2,0:5,2:0|1:60932765_CTTTTATA_C:60932765:3,5,0,2
chr14	60935281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr14	60944959	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,9,19
chr14	60945203	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	60950625	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	60977811	.	G	GGCCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=162,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:60977811_G_GGCCC:60977811:5,6,1,1
chr14	60977814	.	G	GTGTGTTGTTCACCCCCAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=162,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:60977811_G_GGCCC:60977811:5,6,1,1
chr14	60978071	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	61186648	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:0|1:61186648_G_A:61186648:7,11,1,1
chr14	61186652	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:61186648_G_A:61186648:8,9,1,1
chr14	61278684	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr14	61285352	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	61445967	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr14	61449167	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,7:1,7:1,0,12,2
chr14	61451589	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr14	61482642	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr14	61497058	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	61497147	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,9,15
chr14	61497285	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr14	61746829	.	TC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=81,52;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:8,0:13,2:10,14,0,2
chr14	61748444	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,0:7,3:1,10,1,2
chr14	61748487	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:1,3,0,2
chr14	61748544	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr14	61952124	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:61952124_G_C:61952124:0,0,9,0
chr14	61952133	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:61952124_G_C:61952124:0,0,10,0
chr14	61952429	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr14	61997393	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr14	62194348	.	ATGAAATTTTCTTATTGTGATGAAAGGTAAATTAGATCTAAAATGTGAATT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.133:29:12,1:7,7:4,17,2,6
chr14	62204748	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr14	62205175	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	62208005	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	62211578	.	CGTGT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=GT;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:4,2:0,1:0,6,0,4
chr14	62213553	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	62213848	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr14	62229138	.	A	AGAGGCGTGCGGGCTTCG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGGCGTGCGGGCTTCG;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.387:8:4,3:0,0:4,1,3,0
chr14	62234159	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	62463303	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:62463303_G_A:62463303:0,3,0,3
chr14	62463311	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:62463303_G_A:62463303:0,2,0,2
chr14	62463314	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:62463303_G_A:62463303:0,2,0,2
chr14	62463320	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=229,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62463320_A_C:62463320:0,2,0,1
chr14	62463325	.	GA	AG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=229,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62463320_A_C:62463320:0,2,0,1
chr14	62463328	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62463320_A_C:62463320:0,1,0,1
chr14	62536428	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:9,0:8,11,1,1
chr14	62547469	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr14	62550877	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr14	62551118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=251,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr14	62551171	.	A	AAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=239,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	63174400	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=107,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:4,14,0,2
chr14	63269056	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=153,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,0:7,5:7,2,5,0
chr14	63269317	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr14	63447806	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:8,6,1,2
chr14	63735789	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr14	63735954	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr14	63779846	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=88,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,4:6,2:5,6,2,4
chr14	63784407	.	A	AG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=96.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,14,15
chr14	63784599	.	C	CGTTTCTTTTGATAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	63851349	.	T	TTTCTCCCAACCCAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=281,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr14	63856527	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:63856527_G_GC:63856527:0,7,1,1
chr14	63856528	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=156,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:63856527_G_GC:63856527:0,7,1,1
chr14	63856531	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=156,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:63856527_G_GC:63856527:0,7,1,1
chr14	63856536	.	AT	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=169,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:63856527_G_GC:63856527:0,5,1,1
chr14	64375985	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=205,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr14	64416814	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	64421392	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr14	64428154	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	64460536	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.289:16:1,2:10,2:8,3,4,1
chr14	64470121	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64470121_G_A:64470121:0,3,0,1
chr14	64470125	.	TT	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64470121_G_A:64470121:0,2,0,1
chr14	64470128	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64470121_G_A:64470121:0,2,0,1
chr14	64470145	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64470145_T_C:64470145:0,1,0,1
chr14	64470147	.	C	CTCTGGTGAAACAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64470145_T_C:64470145:0,1,0,1
chr14	64476680	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=252,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:2,0,4,1
chr14	64488063	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=101,717;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:4,6:5,0:3,7,0,6
chr14	64489679	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	64491695	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.802:23:4,10:0,9:2,2,12,7
chr14	64496749	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=87,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:0|1:64496749_C_T:64496749:1,6,7,3
chr14	64496763	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,4:0.311:14:4,2:3,2:1|0:64496749_C_T:64496749:5,5,1,3
chr14	64496872	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	64497930	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,5:8,1:4,7,2,4
chr14	64520416	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr14	64523043	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr14	64532414	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr14	64537295	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=200,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr14	64537657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr14	64542797	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=74,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:8,0:11,4:8,11,0,4
chr14	64542811	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=74,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:64542811_A_C:64542811:9,10,1,1
chr14	64542818	.	G	GGGGCCTGCCTGAGGATGGAGAAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=74,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:64542811_A_C:64542811:7,10,1,1
chr14	64542872	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=229,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr14	64545380	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64545380_T_A:64545380:0,2,0,1
chr14	64545383	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:64545380_T_A:64545380:0,2,0,1
chr14	64545385	.	C	CAACCCAGGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64545380_T_A:64545380:0,1,0,1
chr14	64545388	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64545380_T_A:64545380:0,1,0,1
chr14	64545394	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	64548132	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,4,1
chr14	64548349	.	C	CAACTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:2,3,1,1
chr14	64554670	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=180,196;MMQ=56,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr14	64556271	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=100,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:11,5:9,12:10,10,13,4
chr14	64557567	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:6,3,4,2
chr14	64564680	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,1:4,3:10,2,3,1
chr14	64565582	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	64591854	.	ACAACTGAAGAACTGAAAACCTATACCACC	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:9,2:12,0:15,17,1,1
chr14	64606654	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:6,5,4,4
chr14	64606869	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	64641914	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641918	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641920	.	G	GCTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641921	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641924	.	TGA	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641934	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64641938	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64641914_A_T:64641914:0,2,0,1
chr14	64655448	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=87,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:64655448_G_T:64655448:3,8,1,1
chr14	64655454	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=87,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:1,2:0|1:64655448_G_T:64655448:3,8,1,1
chr14	64656883	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:5,4:10,0:7,8,2,2
chr14	64675725	.	GA	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=213,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr14	64676873	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:5,12,1,1
chr14	64679747	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=55,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,4:0,2,1,6
chr14	64680848	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=206,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr14	64686207	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	64688175	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr14	64691644	.	ATT	A,AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27,28;MFRL=53,157,158;MMQ=60,60,60;MPOS=10,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.20,10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.285,0.481:10:1,1,3:0,2,2:2,0,8,0
chr14	64691853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:64691853_C_T:64691853:0,0,0,3
chr14	64691859	.	T	TCCCCAACAAAATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:64691853_C_T:64691853:0,2,0,1
chr14	64691862	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:64691853_C_T:64691853:0,2,0,1
chr14	64694158	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr14	64694195	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr14	64699991	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,4:13,0:15,13,3,1
chr14	64855041	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=126,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,4:4,2:5,1,5,1
chr14	64891569	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=92,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:6,9,2,1
chr14	64908845	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=76,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,6:7,6:7,5,4,8
chr14	64909151	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	64916249	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,0:10,3:9,7,3,0
chr14	64936270	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,101;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:10,3:4,0:8,6,3,0
chr14	64936652	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,5:7,6,3,4
chr14	64937030	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=123,93;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:16,0:10,2:0|1:64937030_A_G:64937030:9,18,1,1
chr14	64937033	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=107,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,16:0.532:30:11,6:3,10:0|1:64937030_A_G:64937030:5,9,5,11
chr14	64937050	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=125,93;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:64937030_A_G:64937030:4,17,1,1
chr14	64937307	.	C	CAAAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=190,0;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=21,26;RU=A;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:0,1:3,1:2,3,1,2
chr14	64937328	.	A	AAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=73,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:4,1:11,8:5,14,3,8
chr14	64937952	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=224,189;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,3:0,0:0|1:64937952_G_C:64937952:0,1,0,3
chr14	64937956	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=224,232;MMQ=40,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.597:3:1,2:0,0:0|1:64937952_G_C:64937952:0,1,0,2
chr14	64937996	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	64938149	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,91;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,2:10,0:0|1:64938149_CA_TG:64938149:9,5,1,1
chr14	64938162	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=125,91;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,2:15,0:0|1:64938149_CA_TG:64938149:10,11,1,1
chr14	64938165	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,91;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:4,2:19,0:0|1:64938149_CA_TG:64938149:10,13,1,1
chr14	64953591	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,2:3,2:6,3,2,2
chr14	64989682	.	A	AAGGTAGTATGTGGCACATCTGGAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.266:5:0,1:3,0:0|1:64989682_A_AAGGTAGTATGTGGCACATCTGGAG:64989682:3,1,0,1
chr14	64989688	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:64989682_A_AAGGTAGTATGTGGCACATCTGGAG:64989682:3,1,0,1
chr14	64990700	.	GT	G,GTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=145,145,179;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.92,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,6:0.229,0.248:25:7,3,4:6,3,2:7,6,10,2
chr14	65009534	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=53,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,7:1,4:2,2,7,4
chr14	65010051	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr14	65017698	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:65017698_C_T:65017698:4,3,1,1
chr14	65017711	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:65017698_C_T:65017698:4,3,1,1
chr14	65017714	.	A	ACAGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:65017698_C_T:65017698:4,3,1,1
chr14	65031572	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=114,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,3,1
chr14	65032182	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,0:7,3:4,15,0,3
chr14	65032226	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr14	65032278	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:5,2,3,3
chr14	65203499	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=97,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:5,3,2,1
chr14	65208026	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:5,1,3,3
chr14	65208330	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=137,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:2,0:8,2:5,6,1,1
chr14	65208338	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:65208338_C_CTT:65208338:3,8,1,1
chr14	65208340	.	G	GACTCCTGACCC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:65208338_C_CTT:65208338:3,7,1,1
chr14	65208551	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:0|1:65208551_G_GA:65208551:8,2,1,1
chr14	65208553	.	G	GGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:65208551_G_GA:65208551:8,2,1,1
chr14	65209767	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:2,5,0,2
chr14	65234034	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=98,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,4:5,0:0,7,1,3
chr14	65239877	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr14	65239894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr14	65241228	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:1,1:10,3:2,9,1,4
chr14	65245863	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,4:2,0:3,1,2,2
chr14	65246040	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:3,4:0,4,1,3
chr14	65250939	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr14	65258611	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr14	65260039	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:65260039_A_C:65260039:0,0,1,0
chr14	65260048	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65260039_A_C:65260039:0,0,1,0
chr14	65262414	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,34;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:65262414_A_G:65262414:0,3,0,1
chr14	65262422	.	G	GCCTCCCTTTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:65262414_A_G:65262414:0,2,0,1
chr14	65262423	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:65262414_A_G:65262414:0,2,0,1
chr14	65262425	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	65262427	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:65262414_A_G:65262414:0,2,0,1
chr14	65263347	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:5,5,3,2
chr14	65267469	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,18,8
chr14	65268167	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	65268168	.	C	CAAGGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=197,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:65268168_C_CAAGGTG:65268168:0,3,0,1
chr14	65268172	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=199,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:65268168_C_CAAGGTG:65268168:0,4,0,1
chr14	65270272	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:3,0,7,1
chr14	65271634	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=128,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,4:7,2:6,2,5,1
chr14	65271650	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,12,5
chr14	65271870	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=235,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr14	65392892	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65392892_A_AAC:65392892:0,1,0,1
chr14	65392893	.	G	GTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65392892_A_AAC:65392892:0,1,0,1
chr14	65409537	.	C	CTACAGTTTTAAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	65418469	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:65418469_A_AG:65418469:0,2,0,2
chr14	65418471	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:65418469_A_AG:65418469:0,2,0,2
chr14	65499498	.	G	GGGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	65499502	.	T	TCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	65507654	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:6,2:2,1:4,4,1,2
chr14	65510971	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:9,2,3,0
chr14	65543102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr14	65550816	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=262,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr14	65568215	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=86,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:5,6:7,14:9,3,16,4
chr14	65568304	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.186:31:6,0:5,4:5,21,1,4
chr14	66028505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr14	66209190	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	66964769	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=91,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.272:15:5,3:6,1:8,3,4,0
chr14	66965200	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.311:20:6,2:7,3:4,10,3,3
chr14	67389512	.	C	CCCCCAA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,0:1,1:0|1:67389512_C_CCCCCAA:67389512:0,3,0,1
chr14	67389514	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67389512_C_CCCCCAA:67389512:0,3,0,1
chr14	67389517	.	T	TGCTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67389512_C_CCCCCAA:67389512:0,3,0,1
chr14	67389520	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=193,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:67389520_T_TC:67389520:0,2,0,1
chr14	67389521	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=193,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:67389520_T_TC:67389520:0,2,0,1
chr14	67490459	.	G	GAAGACTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr14	67555878	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	67555887	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=57,125;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67555887_C_T:67555887:0,2,0,1
chr14	67555889	.	T	TATGCCAGCACTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=57,125;MMQ=50,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67555887_C_T:67555887:0,2,0,1
chr14	67578620	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:5,14,1,1
chr14	67578727	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr14	67669919	.	G	GAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,32029;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:8,16,2,0
chr14	67746111	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,148;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,0:3,10:6,6,0,10
chr14	67779428	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:13,0:2,5:5,10,0,5
chr14	67790585	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,0:1,1:0|1:67790585_G_A:67790585:0,2,1,1
chr14	67790590	.	A	AGAAAACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67790585_G_A:67790585:0,2,0,1
chr14	67807182	.	C	CTCT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:67807182_C_CTCT:67807182:10,6,0,2
chr14	67807183	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:67807182_C_CTCT:67807182:10,6,0,2
chr14	67807242	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:1,2:1,5,0,5
chr14	67812652	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67812652_A_T:67812652:0,2,0,1
chr14	67812654	.	A	AGCAGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67812652_A_T:67812652:0,2,0,1
chr14	67812657	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67812652_A_T:67812652:0,2,0,1
chr14	67814219	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=91,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.552:10:0,1:3,3:1,4,2,3
chr14	67819567	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	67841156	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,156;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:10,7,3,0
chr14	67848503	.	CAT	AGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	67859152	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=111,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,0:3,3:5,8,0,3
chr14	67859199	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:2,3,0,2
chr14	67878717	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:0,3:2,2:3,0,3,2
chr14	67940666	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr14	68022613	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,130;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:12,2:7,0:6,13,2,0
chr14	68028820	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,5:11,0:7,13,4,1
chr14	68029121	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=81,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr14	68038697	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:0|1:68038697_C_G:68038697:0,1,1,2
chr14	68038717	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=233,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:1,0:0,0:0|1:68038697_C_G:68038697:0,2,1,0
chr14	68040925	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr14	68041124	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr14	68042255	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:1,1,1,3
chr14	68042496	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr14	68044005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr14	68045840	.	C	CTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	68053802	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,6,6
chr14	68053977	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr14	68066949	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=291,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr14	68066979	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	68113475	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,0:1,2:0|1:68113475_T_A:68113475:1,2,1,1
chr14	68113478	.	A	AGAAAGCAGATTGCATACCCACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:68113475_T_A:68113475:1,2,1,1
chr14	68141029	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr14	68144936	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,369;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	68159626	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=105,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,0:1,4:5,0,2,2
chr14	68191109	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	68192962	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68192962_G_A:68192962:0,1,0,1
chr14	68192963	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68192962_G_A:68192962:0,1,0,1
chr14	68192966	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68192962_G_A:68192962:0,1,0,1
chr14	68220468	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=156,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:68220468_T_C:68220468:6,8,1,1
chr14	68220477	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:68220468_T_C:68220468:5,10,1,1
chr14	68220478	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:68220468_T_C:68220468:5,10,1,1
chr14	68222020	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:68222020_T_A:68222020:0,4,0,1
chr14	68222031	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=150,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68222020_T_A:68222020:0,3,0,1
chr14	68233178	.	AAGAAGGGAGAACACACGGTGAGTCCAGGGGCCAGAGCATTCTCCAAAGGCAGCTGGGTGGC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:5,2:14,0:7,18,1,1
chr14	68236522	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr14	68238687	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	68238751	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:6,1:4,5:8,3,3,3
chr14	68241648	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr14	68242903	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68242903_G_GCA:68242903:0,1,0,1
chr14	68242905	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68242903_G_GCA:68242903:0,1,0,1
chr14	68242909	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,32;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:68242909_G_C:68242909:0,1,0,1
chr14	68242913	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:68242909_G_C:68242909:0,0,0,1
chr14	68244202	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr14	68244223	.	CTCCTTACCTTGGATCCCACATACAGCGCCTGGATTTCACGGTGTA	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=102,65;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.118:24:1,2:3,0:8,14,1,1
chr14	68244925	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,0:7,6:10,5,0,6
chr14	68246876	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr14	68248174	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:3,5,2,0
chr14	68248281	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr14	68252852	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,1:8,6:5,6,3,4
chr14	68260887	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:15,8,0,2
chr14	68270907	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:68270907_T_G:68270907:6,7,1,1
chr14	68270910	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:68270907_T_G:68270907:6,7,1,1
chr14	68273430	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=192,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,2:4,2:1,8,1,3
chr14	68274020	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr14	68280848	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr14	68290372	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,3:2,3:1,2,1,5
chr14	68290426	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr14	68301767	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:5,5:0,0:4,1,3,2
chr14	68758612	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,2:4,0:10,5,2,0
chr14	68878204	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,0:4,3:7,5,1,2
chr14	68944343	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=17,19,20;MFRL=58,42,113;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.32,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,5:0.173,0.340:15:1,0,1:2,1,3:6,2,5,2
chr14	68963746	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	69259502	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:7,4:1,5:8,0,9,0
chr14	69259533	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:3,5:1,5:4,0,9,1
chr14	69259662	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:6,3:10,6:6,10,2,7
chr14	69262433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:4,1,8,0
chr14	69262441	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,5:0,0,13,3
chr14	69262461	.	A	ACTTGTAAGT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=100,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:11,0:0|1:69262461_A_ACTTGTAAGT:69262461:13,10,1,1
chr14	69262464	.	G	GAA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=100,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:0|1:69262461_A_ACTTGTAAGT:69262461:13,12,1,1
chr14	69262466	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=100,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:0|1:69262461_A_ACTTGTAAGT:69262461:13,12,1,1
chr14	69263177	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=104,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,0:7,2:1,8,1,1
chr14	69347464	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,78;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr14	69347755	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr14	69376658	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,5:0,20:0,0,12,13
chr14	69392264	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr14	69445646	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr14	69521345	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:3,4,2,4
chr14	69521670	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:17,5:14,0:16,16,2,3
chr14	69541956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr14	69558678	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr14	69676533	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.401:12:5,0:0,1:3,4,0,5
chr14	69676541	.	TAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=15,27;MFRL=133,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:0,1:3,1:0,7,1,1
chr14	69695792	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr14	69697275	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr14	69701783	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=84,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr14	69799756	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=116,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr14	69799806	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=102,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,4:6,5:8,4,4,5
chr14	69805555	.	CCTTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,347;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.515:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	69813678	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	69847225	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,0:0|1:69847225_A_C:69847225:1,5,2,0
chr14	69847230	.	AA	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,19;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:3,1:0|1:69847225_A_C:69847225:2,9,2,0
chr14	69847238	.	CAGTGCTT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,1:5,1:0|1:69847225_A_C:69847225:6,9,2,0
chr14	69864805	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr14	69866117	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:22,3:15,0:19,18,3,0
chr14	69925305	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr14	69925369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	69988954	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:69988954_T_G:69988954:0,0,9,2
chr14	69988973	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=82,53;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:4,3:4,1:0|1:69988954_T_G:69988954:6,2,4,0
chr14	69992873	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr14	69994473	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr14	69995112	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:2,4,2,1
chr14	70175689	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,1:6,1:5,3,0,2
chr14	70238037	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=122,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.112:47:12,4:29,0:21,21,5,0
chr14	70252897	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,1:10,1:5,11,1,1
chr14	70252928	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,3:1,6:2,2,2,7
chr14	70480215	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,1,6
chr14	70490264	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	70496919	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.796:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	70513115	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=192,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	70515779	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=46,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr14	70522633	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,24;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:70522633_AG_A:70522633:0,2,0,1
chr14	70522639	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:70522633_AG_A:70522633:0,2,0,1
chr14	70530706	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,9:0,0:0,0,0,9
chr14	70793097	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:7,0:7,7,0,3
chr14	70795772	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr14	70855407	.	G	GAGAGAGAATAGAAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70855407_G_GAGAGAGAATAGAAAGAA:70855407:0,4,0,1
chr14	70855408	.	C	CAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70855407_G_GAGAGAGAATAGAAAGAA:70855407:0,4,0,1
chr14	70926171	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=135,64;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:70926171_A_T:70926171:8,5,1,1
chr14	70926176	.	G	GCTGGCAGTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,64;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:70926171_A_T:70926171:8,5,1,1
chr14	71051653	.	T	TTAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=88,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:6,2:11,0:0|1:71051653_T_TTAA:71051653:10,10,0,2
chr14	71051656	.	A	AGAAGGGGTAGAATATAGTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=88,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:8,1:12,0:0|1:71051653_T_TTAA:71051653:10,11,0,2
chr14	71199213	.	G	GGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=76,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:71199213_G_GGTT:71199213:2,0,1,1
chr14	71199215	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=76,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:71199213_G_GGTT:71199213:2,0,1,1
chr14	71199492	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:0|1:71199492_CT_C:71199492:6,7,0,2
chr14	71199494	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:71199492_CT_C:71199492:7,8,0,2
chr14	71199497	.	T	TCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:71199492_CT_C:71199492:7,8,0,2
chr14	71202650	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr14	71205195	.	ACAC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71205195_ACAC_A:71205195:0,0,0,1
chr14	71205202	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71205195_ACAC_A:71205195:0,0,0,1
chr14	71208996	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	71209343	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr14	71216685	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:8,2:11,0:0|1:71216685_G_C:71216685:14,5,1,1
chr14	71216691	.	ATAG	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=113,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:71216685_G_C:71216685:13,4,1,1
chr14	71216699	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=117,65;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:9,0:0|1:71216685_G_C:71216685:12,4,1,1
chr14	71216863	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr14	71227913	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr14	71227979	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	71267345	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr14	71462381	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr14	71485692	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr14	71514557	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=81,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:16,3:5,0:11,10,1,2
chr14	71542981	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=105,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:12,9,1,2
chr14	71575808	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,190;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,0:8,4:3,9,0,4
chr14	72055468	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr14	72055792	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.551:36:8,19:8,0:7,9,20,0
chr14	72117057	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.135:42:11,0:26,5:26,11,1,4
chr14	72127984	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:14,5:6,0:12,8,5,0
chr14	72175976	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,29;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:72175976_C_A:72175976:9,5,1,1
chr14	72175985	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,29;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:72175976_C_A:72175976:7,5,1,1
chr14	72175986	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,29;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:72175976_C_A:72175976:7,5,1,1
chr14	72175989	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=115,29;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:4,2:0|1:72175976_C_A:72175976:7,5,1,1
chr14	72191417	.	C	CAGA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,2:13,0:0|1:72191417_C_CAGA:72191417:13,17,1,1
chr14	72191419	.	A	ATGATGGGG	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,2:14,0:0|1:72191417_C_CAGA:72191417:13,17,1,1
chr14	72191420	.	C	CTATTA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:16,1:13,0:0|1:72191417_C_CAGA:72191417:14,17,1,1
chr14	72191634	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	72200610	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72200610_C_A:72200610:0,0,0,1
chr14	72200612	.	CA	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72200610_C_A:72200610:0,0,0,1
chr14	72201985	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:6,5:1,13:2,5,8,10
chr14	72204983	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:12,17,0,2
chr14	72921182	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:3,3:10,4,2,1
chr14	72921308	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=120,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:0|1:72921308_C_T:72921308:2,9,1,1
chr14	72921316	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:72921308_C_T:72921308:1,7,1,1
chr14	72921317	.	C	CTTGGTT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:72921308_C_T:72921308:1,7,1,1
chr14	72921322	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:72921308_C_T:72921308:1,8,1,1
chr14	72921324	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:72921308_C_T:72921308:0,8,1,1
chr14	72939495	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr14	72944943	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:7,9:4,11:6,5,7,13
chr14	73181311	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181311_T_TG:73181311:0,0,0,1
chr14	73181313	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181311_T_TG:73181311:0,0,0,1
chr14	73181315	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181311_T_TG:73181311:0,0,0,1
chr14	73181316	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181311_T_TG:73181311:0,0,0,1
chr14	73181318	.	AAC	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73181311_T_TG:73181311:0,0,0,1
chr14	73198506	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,9:0,0,11,5
chr14	73360819	.	T	TTGTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,5,6
chr14	73404795	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr14	73408355	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	73408369	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	73412739	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=192,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,3,2
chr14	73413965	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=172,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr14	73422350	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:5,3,3,0
chr14	73442508	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73442508_G_A:73442508:0,1,0,1
chr14	73442511	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73442508_G_A:73442508:0,1,0,1
chr14	73465027	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr14	73491270	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr14	73572606	.	AAG	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.162:34:7,4:19,1:18,11,3,2
chr14	73572649	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:8,0:22,5:14,18,4,1
chr14	73574641	.	G	GCA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.257:9:6,2:1,0:0|1:73574641_G_GCA:73574641:2,5,1,1
chr14	73574645	.	T	TCAAAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:73574641_G_GCA:73574641:2,6,1,1
chr14	73574646	.	T	TACTCTCATTCTAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,1:1,0:0|1:73574641_G_GCA:73574641:2,6,1,1
chr14	73576255	.	TC	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=152,131;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,1:6,1:1,14,0,2
chr14	73664686	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr14	73664853	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.577:19:3,4:4,7:1,7,3,8
chr14	73716620	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73716620_G_A:73716620:3,0,1,0
chr14	73716625	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73716620_G_A:73716620:3,0,1,0
chr14	73716633	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:73716620_G_A:73716620:3,1,1,0
chr14	73718879	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr14	73725659	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=82,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.831:16:1,4:1,8:1,1,9,5
chr14	73727509	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=74,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr14	73727528	.	G	GCCTCTAGGAAACCTAAGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:3,2:6,0:4,5,0,2
chr14	73728957	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	73743272	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:11,3,2,0
chr14	73945406	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,3:9,0:10,7,1,2
chr14	73957682	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:2,1,5,1
chr14	73957981	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr14	73958812	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,7:3,7:2,7,7,7
chr14	73985838	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:3,2:0|1:73985838_C_T:73985838:4,9,1,1
chr14	73985844	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:73985838_C_T:73985838:5,10,1,1
chr14	73985847	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:5,2:0|1:73985838_C_T:73985838:5,10,1,1
chr14	73987767	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=119,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:7,0:5,6:3,11,0,6
chr14	74061754	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=100,143;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:5,1:6,9,1,1
chr14	74121468	.	AATAC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATAC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	74153924	.	TTAAACA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAACA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:3,2:6,1,1,1
chr14	74188117	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:10,0:21,5:10,21,0,5
chr14	74192165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	74193427	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr14	74196548	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=96,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:21,2:18,0:25,17,1,2
chr14	74196550	.	A	ACCTAGAC	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=110,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:24,2:20,0:0|1:74196550_A_ACCTAGAC:74196550:25,19,1,1
chr14	74196553	.	G	GAGTGA	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:22,2:16,0:0|1:74196550_A_ACCTAGAC:74196550:26,18,1,1
chr14	74196792	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=92,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:1,2:5,8:3,4,4,6
chr14	74196844	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,1:0,11:0,0,4,8
chr14	74196906	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=105,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74196906_A_AT:74196906:0,1,0,1
chr14	74196913	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=105,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74196906_A_AT:74196906:0,1,0,1
chr14	74203690	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=66,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,5:3,2:8,5,5,2
chr14	74340901	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=74,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:6,8,3,0
chr14	74343612	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr14	74349227	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:5,10:0,1:2,3,2,9
chr14	74362935	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=91,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr14	74363305	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	74370600	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=116,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,5:1,2:2,1,7,0
chr14	74375956	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr14	74407833	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:1,1:0,0:0|1:74407833_TG_AT:74407833:1,0,1,0
chr14	74407836	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74407833_TG_AT:74407833:0,0,1,0
chr14	74411137	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,180;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:10,0:8,17:10,8,0,17
chr14	74416945	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	74420127	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	74426322	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr14	74426323	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=205,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr14	74428000	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:4,4:6,7:4,6,7,4
chr14	74428269	.	CTTAGGTAAGGATTCAGATACTATGGGGAAGTATCCAGAGGTCATATAG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.186:15:7,0:3,2:4,9,1,1
chr14	74428286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr14	74433784	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=125,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,0:1,7:1,4,0,7
chr14	74439495	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=222,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr14	74441537	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr14	74454854	.	CC	AA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=230,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.361:6:2,2:2,0:0|1:74454854_CC_AA:74454854:0,4,1,1
chr14	74454857	.	G	GTGGTCAGGGAATGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=230,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:74454854_CC_AA:74454854:0,4,1,1
chr14	74489740	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:7,0:16,7:9,15,0,7
chr14	74512698	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr14	74512766	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:5,6,3,0
chr14	74512849	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:19,0:7,1:0|1:74512849_C_T:74512849:16,10,1,9
chr14	74512856	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:19,0:7,10:0|1:74512849_C_T:74512849:16,10,1,9
chr14	74512858	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:18,0:7,10:0|1:74512849_C_T:74512849:16,10,1,9
chr14	74533656	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr14	74533671	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=178,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:74533671_AG_CA:74533671:0,4,1,1
chr14	74533677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=211,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:74533671_AG_CA:74533671:0,3,1,1
chr14	74533683	.	C	CTGAGTTGCAAAGAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=226,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.386:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr14	74533690	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=211,241;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	74534247	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=64,41;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:74534247_AT_A:74534247:1,2,1,1
chr14	74534250	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,18;MFRL=64,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:74534247_AT_A:74534247:1,2,1,1
chr14	74534257	.	CATGGTT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:74534247_AT_A:74534247:1,3,1,1
chr14	74534264	.	C	CACA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:74534247_AT_A:74534247:1,3,1,1
chr14	74537885	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=74,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:5,4:5,2:7,3,4,2
chr14	74551769	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:7,7,0,2
chr14	74564468	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,3:4,3:3,3,3,3
chr14	74564605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr14	74564641	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr14	74665543	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr14	74726515	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr14	74753161	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=114,94;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:4,3,2,0
chr14	74753278	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr14	74762018	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=217,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	74766903	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=98,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:15,6:15,0:9,21,0,6
chr14	74766943	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=76,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.185:34:13,5:14,0:15,13,0,6
chr14	74826039	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=77,238;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,4:10,0:12,13,4,0
chr14	74874540	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.549:11:1,1:3,5:3,2,3,3
chr14	74874707	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:3,4,2,6
chr14	74876501	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr14	74960368	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=134,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=G;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr14	74973579	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=149,92;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:0|1:74973579_T_C:74973579:0,5,0,3
chr14	74973581	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=149,92;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:2,2:0|1:74973579_T_C:74973579:0,5,0,3
chr14	74973583	.	C	CGCGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=149,134;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr14	74978052	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:11,7,1,1
chr14	74989433	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:2,2,3,0
chr14	74989637	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,0:4,4:3,6,0,4
chr14	74991943	.	G	GTGGCTAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=123,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr14	74991959	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr14	74992861	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=104,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,1:8,4:4,5,3,2
chr14	74993998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr14	75016482	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr14	75019658	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,0,2
chr14	75078142	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr14	75138024	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=97,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=T;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.846:9:1,1:0,6:1,1,5,2
chr14	75139936	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=86,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:0,4:6,4:0,6,2,6
chr14	75142449	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:6,0:20,3:15,11,1,2
chr14	75143210	.	GTGAATTA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:2,0:0|1:75143210_GTGAATTA_G:75143210:5,1,0,2
chr14	75143212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=187,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr14	75143219	.	GTGTGAGAATAACAGAGAAAGGAGCCAGCTCTCTCTAGCACACAGATAAA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=141,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.180:16:1,2:4,0:0|1:75143210_GTGAATTA_G:75143210:10,3,1,2
chr14	75143522	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=194,217;MMQ=52,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75143530	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=194,217;MMQ=52,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75143536	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=192,217;MMQ=60,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:75143522_TG_CA:75143522:0,3,0,2
chr14	75143538	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=194,217;MMQ=52,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75143539	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=194,217;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75143540	.	C	CCACACT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=194,217;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75143545	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=194,217;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:75143522_TG_CA:75143522:0,4,0,1
chr14	75150260	.	C	CATCTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr14	75152368	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=103,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.219:32:9,0:14,5:8,17,0,7
chr14	75180342	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr14	75181481	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr14	75200697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr14	75264230	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=225,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr14	75265004	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:10,1:3,2:6,7,1,2
chr14	75265596	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:4,7,2,1
chr14	75269333	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,4:13,0:12,13,4,0
chr14	75278302	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,3:0,0,13,3
chr14	75279395	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr14	75282813	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75282813_C_T:75282813:0,0,1,0
chr14	75282816	.	G	GTTTCAGATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75282813_C_T:75282813:0,0,1,0
chr14	75282873	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:0,0:2,1,2,0
chr14	75283802	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,3:7,0:8,6,0,3
chr14	75287730	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:4,2:4,2:9,0,4,1
chr14	75323628	.	A	AG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:10,14,1,1
chr14	75323793	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	75355767	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=84,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.780:20:4,13:0,3:2,2,11,5
chr14	75356103	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,120;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:4,1:4,2:1,7,0,4
chr14	75359730	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	75361177	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr14	75365062	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=91,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:4,6:3,11:4,3,9,8
chr14	75367740	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=78,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:8,5:2,1:10,0,4,2
chr14	75376442	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75376442_G_A:75376442:0,1,1,0
chr14	75376452	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=171,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:75376442_G_A:75376442:0,1,1,0
chr14	75378453	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,1:6,1:12,6,2,0
chr14	75387941	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0|1:75387941_T_TGC:75387941:0,0,3,0
chr14	75387946	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:75387941_T_TGC:75387941:0,0,3,0
chr14	75387950	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=72,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:0,2:0|1:75387941_T_TGC:75387941:0,2,3,0
chr14	75387954	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=144,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:75387941_T_TGC:75387941:0,3,1,0
chr14	75387959	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,0;MFRL=144,210;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:75387941_T_TGC:75387941:0,3,1,0
chr14	75412908	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr14	75415194	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr14	75416000	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	75470446	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,6:0,0,7,14
chr14	75474429	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:6,0:15,3:10,11,2,1
chr14	75485489	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr14	75489446	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	75505008	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0|1:75505008_G_C:75505008:0,0,8,3
chr14	75505016	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:75505008_G_C:75505008:0,0,7,3
chr14	75513085	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=139,426;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,4:8,0:7,4,0,4
chr14	75520065	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	75544101	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	75544189	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr14	75544317	.	AG	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=78,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:3,6,1,1
chr14	75551254	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr14	75551442	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	75553655	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr14	75553983	.	C	CAGGGTGGAAACCCAGAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	75558213	.	T	TTATAGGCACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75558213_T_TTATAGGCACC:75558213:0,0,0,1
chr14	75558216	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:75558213_T_TTATAGGCACC:75558213:0,1,0,1
chr14	75558218	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75558213_T_TTATAGGCACC:75558213:0,1,0,1
chr14	75558227	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	75562201	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:1,2,0,4
chr14	75568531	.	G	GGAAAAAGACACAATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr14	75572559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	75579981	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=106,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,5:2,1:5,4,4,2
chr14	75580152	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr14	75580919	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=105,109;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,1:10,6,2,0
chr14	75587351	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,3:0,11:0,0,2,12
chr14	75590822	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr14	75601737	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr14	75614504	.	A	ACCCG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCCG;STR;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,4:0,0,0,11
chr14	75745626	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:4,1,3,0
chr14	75747407	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:7,4:1,6:2,6,2,8
chr14	75904660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chr14	76045220	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	76045245	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	76045458	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=100,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:4,0:14,2:0|1:76045458_A_T:76045458:6,14,1,1
chr14	76045464	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,0:16,2:0|1:76045458_A_T:76045458:5,14,1,1
chr14	76045466	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,0:16,2:0|1:76045458_A_T:76045458:5,14,1,1
chr14	76045468	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=115,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:2,0:16,2:0|1:76045458_A_T:76045458:5,15,1,1
chr14	76045694	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.193:17:5,0:8,2:7,7,0,3
chr14	76165692	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr14	76165707	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	76173860	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	76184362	.	T	TGTGTATTCAAGTCAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr14	76187038	.	G	GGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:2,7,1,1
chr14	76187085	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr14	76198803	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=175,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:4,7,1,1
chr14	76198818	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:0,2:0,3,0,3
chr14	76201482	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	76232398	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr14	76249643	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=89,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:16,0:17,7:10,23,0,7
chr14	76420888	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76420888_T_TC:76420888:0,1,0,1
chr14	76420890	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76420888_T_TC:76420888:0,1,0,1
chr14	76420893	.	G	GCCCCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76420888_T_TC:76420888:0,1,0,1
chr14	76420896	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76420888_T_TC:76420888:0,1,0,1
chr14	76420898	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:76420888_T_TC:76420888:0,1,0,1
chr14	76429868	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr14	76488788	.	G	GAGTTTACTACCAATTTGATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76488788_G_GAGTTTACTACCAATTTGATA:76488788:1,0,0,1
chr14	76488790	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76488788_G_GAGTTTACTACCAATTTGATA:76488788:1,0,0,1
chr14	76525067	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:3,4,0,2
chr14	76525110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,0:1,6:0,4,0,6
chr14	76548783	.	GGACCTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr14	76948413	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:76948413_A_ATT:76948413:1,4,1,1
chr14	76948415	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:76948413_A_ATT:76948413:1,4,1,1
chr14	76948862	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr14	76957745	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr14	76964976	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	76965009	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	76965075	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=157,1211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,8:2,0:3,1,0,9
chr14	76965198	.	TGGGTGG	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:1,2:0|1:76965198_TGGGTGG_T:76965198:3,2,1,1
chr14	76965205	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,0:2,2:0|1:76965198_TGGGTGG_T:76965198:4,3,1,1
chr14	77229539	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr14	77273769	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:7,1:3,2:2,8,2,1
chr14	77279064	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	77304357	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=95,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.274:8:4,1:2,1:0|1:77304357_G_A:77304357:1,5,1,1
chr14	77304359	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=95,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.278:8:4,1:2,0:0|1:77304357_G_A:77304357:1,5,1,1
chr14	77304383	.	A	AACATGCATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	77319684	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.172:44:17,0:20,7:28,9,6,1
chr14	77492078	.	CG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,2:7,0:7,9,2,0
chr14	77493761	.	TTGCTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TGC;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	77493812	.	CTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=156,269;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,1,0
chr14	77493875	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	77580308	.	TCACCACTGTCCGCTAATTATAGCTCACCTTTATGGGCTGCAGAG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=151,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:4,2:10,7,1,1
chr14	77685380	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77685380_G_A:77685380:0,1,0,1
chr14	77685381	.	G	GCCAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77685380_G_A:77685380:0,1,0,1
chr14	77685383	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:77685380_G_A:77685380:0,0,0,2
chr14	77686303	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	77697967	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr14	77699933	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=149,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	77704974	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr14	77705726	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,4:0,1,7,2
chr14	77708636	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:77708636_G_GC:77708636:0,2,2,0
chr14	77708640	.	A	AGCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,11;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:77708636_G_GC:77708636:0,2,2,0
chr14	77708641	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:77708636_G_GC:77708636:0,2,2,0
chr14	77708804	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=87,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,2:7,2:5,10,2,2
chr14	77709450	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.656:7:1,2:1,1:0,2,1,4
chr14	77709477	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	77712177	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,231;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	77715835	.	CACCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr14	77719635	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,0:2,1:10,3,1,1
chr14	77719650	.	CGAG	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,0:2,2:11,3,1,1
chr14	77732955	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,2:18,0:0|1:77732955_G_A:77732955:19,12,1,1
chr14	77732958	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:12,2:16,0:0|1:77732955_G_A:77732955:19,12,1,1
chr14	77746744	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:3,5,1,1
chr14	77746777	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=110,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:4,3,1,1
chr14	77751272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr14	77751488	.	C	CTGTTGTGCAGAGCTCCTTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	77751729	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=254,311;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr14	77755221	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=76,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr14	77765880	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:13,2:6,2:12,7,2,2
chr14	77771070	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,3:7,0:13,12,2,1
chr14	77772829	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=367,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr14	77794283	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:1,2:5,2:4,2,1,3
chr14	77843363	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	77843917	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=96,98;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.175:38:19,0:13,6:16,16,0,6
chr14	77844869	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.926:25:1,6:0,17:0|1:77844869_A_G:77844869:1,0,20,4
chr14	77844878	.	CC	TT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:7,0:18,1:0|1:77844869_A_G:77844869:20,5,2,0
chr14	77845038	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:7,0:16,3:9,15,0,3
chr14	77846894	.	T	TTTTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr14	77861148	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=132,272;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:9,0:6,3:0|1:77861148_C_T:77861148:4,11,0,5
chr14	77861152	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=132,272;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,0:6,5:0|1:77861148_C_T:77861148:4,11,0,5
chr14	77872961	.	CACACACACACACACACAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.360:5:4,0:0,0:4,0,1,0
chr14	77873878	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:4,2,1,4
chr14	77880524	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,157;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.800:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr14	77889303	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=73,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr14	77900165	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=117.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,16:0,26:0,0,34,9
chr14	77901737	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,9:0.196:49:24,0:11,9:20,20,0,9
chr14	77907545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77907545_C_T:77907545:0,1,0,1
chr14	77907547	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77907545_C_T:77907545:0,1,0,1
chr14	77907551	.	A	ATTTTTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77907545_C_T:77907545:0,1,0,1
chr14	77916205	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	77919587	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr14	77930855	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=234,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr14	77934394	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=92,126;MMQ=47,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr14	77934587	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	77935386	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:0|1:77935386_G_A:77935386:3,5,1,1
chr14	77935395	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,11;MFRL=92,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,0:8,0:0|1:77935386_G_A:77935386:4,7,1,1
chr14	77935441	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=21,20;MFRL=77,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:0|1:77935441_T_C:77935441:11,14,1,1
chr14	77935448	.	CATCGA	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=103,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:11,2:0|1:77935441_T_C:77935441:11,12,1,1
chr14	77935456	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:77935441_T_C:77935441:11,11,1,1
chr14	77935458	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:77935441_T_C:77935441:11,11,1,1
chr14	77941865	.	G	GAGGGCCCTACC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,2:0,0,7,0
chr14	77951124	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,7,6
chr14	77984573	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	78018614	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr14	78023509	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr14	78036899	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=228,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	78036935	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=328,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.574:3:0,0:1,2:0|1:78036935_A_G:78036935:0,1,0,2
chr14	78036949	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.737:2:0,0:0,2:0|1:78036935_A_G:78036935:0,0,0,2
chr14	78063440	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:6,1,2,0
chr14	78170818	.	C	CCTTCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=102,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr14	78170896	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	78285461	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.895:11:1,8:0,2:0,1,3,7
chr14	78288958	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78288958_G_T:78288958:1,0,0,1
chr14	78288963	.	G	GGGTTGGAAAATCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78288958_G_T:78288958:1,0,0,1
chr14	78365612	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,10:0,3:0,1,4,9
chr14	78392325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:2,0:0|1:78392325_C_T:78392325:1,5,1,1
chr14	78392327	.	G	GAACAGCCAGCAGAGCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:78392325_C_T:78392325:1,5,1,1
chr14	78398137	.	A	ATGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=39,22;MFRL=182,182;MMQ=48,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.667:2:1,1:0,0:0|1:78398137_A_ATGAGT:78398137:0,1,0,1
chr14	78398139	.	C	CCCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=182,182;MMQ=48,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0|1:78398137_A_ATGAGT:78398137:0,1,0,1
chr14	78398143	.	C	CCATTATGTATCTCTTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78398137_A_ATGAGT:78398137:0,0,0,1
chr14	79181046	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	79181277	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=85,37;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:4,3,1,1
chr14	79269944	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=123,264;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:79269944_C_T:79269944:2,1,1,0
chr14	79269946	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=123,264;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:79269944_C_T:79269944:2,1,1,0
chr14	79276733	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	79423744	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=79,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,1,4
chr14	80130358	.	T	TTCATATGTGTGGGTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:80130358_T_TTCATATGTGTGGGTGTGTG:80130358:0,1,0,1
chr14	80130365	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80130358_T_TTCATATGTGTGGGTGTGTG:80130358:0,1,0,1
chr14	80271532	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:8,9,1,1
chr14	80328290	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:7,15,1,2
chr14	80669580	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=78,92;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,3:6,12:4,3,13,2
chr14	80669639	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.555:12:2,1:2,4:1,4,3,4
chr14	80677671	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=158,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,2:9,1:12,4,2,1
chr14	80677902	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80677902_G_GT:80677902:0,0,0,1
chr14	80677904	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:80677902_G_GT:80677902:0,0,0,1
chr14	80677905	.	G	GCATGCATGTGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80677902_G_GT:80677902:0,0,0,1
chr14	80971261	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr14	80993330	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr14	81025522	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:6,1,4,1
chr14	81046810	.	A	AACGAGTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACGAGTT;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr14	81297385	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	81302507	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=122,130;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:8,3:6,0:10,4,4,0
chr14	81371088	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr14	81528412	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	81528523	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=82,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,0:10,4:5,15,4,0
chr14	81557305	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:81557305_GTT_G:81557305:0,0,0,1
chr14	81557310	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81557305_GTT_G:81557305:0,0,0,1
chr14	81557311	.	TTCA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81557305_GTT_G:81557305:0,0,0,1
chr14	81574687	.	T	TTCTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:4,3:1,2:4,1,6,0
chr14	81574787	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=96,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:22,0:18,2:0|1:81574787_C_T:81574787:23,20,2,1
chr14	81574811	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=96,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:16,0:12,3:0|1:81574787_C_T:81574787:16,17,2,1
chr14	81574845	.	T	TTTTTTTCTTTTTAC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,2:0,2,2,7
chr14	81606229	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr14	81646716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=142,106;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:2,5,0,3
chr14	81667852	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	81686759	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.709:5:0,0:1,0:0|1:81686759_C_G:81686759:0,1,4,0
chr14	81686763	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.617:6:0,0:2,1:0|1:81686759_C_G:81686759:0,2,4,0
chr14	81686769	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.348:12:0,0:7,1:0|1:81686759_C_G:81686759:5,3,4,0
chr14	81686922	.	CA	C,CAA	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=32,35,31;MFRL=123,55,145;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.61,9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,8:0.170,0.267:31:6,3,0:8,3,7:0,17,3,11
chr14	81686938	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.578:34:4,7:10,10:0,14,3,17
chr14	81737076	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr14	81737290	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	81955485	.	GCTTACAATGGAACAGCCCCACCTGGGCTGACTGGAAGCTAATTAAGGAACATGTCCCTACCTCTCCAGCTGACTGCTCATTAAAGAGAGAATGTCAGACTGAACA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:1,0:2,2:18,6,1,1
chr14	81961566	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr14	86088177	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,3:1,4:1,1,3,4
chr14	86088525	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,0:10,2:12,10,1,1
chr14	86090446	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=103,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,0:5,2,1,1
chr14	86091511	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=88,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:4,3,6,3
chr14	86093024	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:2,5,1,1
chr14	86093375	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:4,0,0,1
chr14	86093378	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:1,1,4,0
chr14	86093921	.	T	TAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=93,479;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.224:15:7,1:4,0:2,10,1,2
chr14	88406404	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr14	88407734	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.834:4:0,0:0,1:0,0,3,1
chr14	88407888	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,7:1,5:1,5,3,9
chr14	88407917	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=76,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,0,2
chr14	88407982	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	88411803	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	88411837	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,27;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr14	88411921	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:5,0:0|1:88411921_A_C:88411921:8,7,1,1
chr14	88411924	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:7,0:0|1:88411921_A_C:88411921:8,7,1,1
chr14	88411930	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:88411921_A_C:88411921:6,6,1,1
chr14	88411947	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr14	88414283	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	88417095	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.884:15:2,4:0,8:1,1,5,8
chr14	88417161	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,0,14
chr14	88429916	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0,4,0,2
chr14	88448451	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,1:2,5:3,0,6,0
chr14	88448486	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:3,5,6,3
chr14	88448643	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,6:10,6:3,14,3,9
chr14	88448695	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:6,1:0,11,0,3
chr14	88450928	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:1,5,0,2
chr14	88452981	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr14	88454469	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:2,4,4,4
chr14	88454910	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr14	88454937	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr14	88478501	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	88651826	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr14	88651934	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:14,0:12,6:9,17,5,1
chr14	88651962	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:5,6:8,4:6,8,4,6
chr14	88652173	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.168:21:9,3:9,0:10,8,1,2
chr14	88658764	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,1:4,3:2,2,0,4
chr14	88729505	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:3,2:1,0:5,1,2,0
chr14	88729524	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr14	88729931	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	88737193	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:1,4,1,3
chr14	88792884	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	88852279	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr14	88857706	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	88892905	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=81,122;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,0:17,5:18,10,0,5
chr14	88895669	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr14	88935925	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=74,177;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,0:2,4:1,1,3,1
chr14	88938652	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:1,7:8,3:4,5,6,5
chr14	88951476	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:16,9:12,0:20,8,9,0
chr14	88962649	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr14	88962815	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:88962815_A_C:88962815:9,9,1,1
chr14	88962821	.	C	CCTATTTCCTAGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:4,0:11,2:0|1:88962815_A_C:88962815:9,12,1,1
chr14	88971758	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,4:2,4,2,4
chr14	88974256	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,3,3
chr14	89016855	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr14	89030044	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,1:8,2:11,9,0,3
chr14	89037482	.	CT	C,CAT,CATT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33,26,30;MFRL=133,181,97,100;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,21,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.12,3.64,19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,13:0.100,0.159,0.469:26:1,1,2,6:6,1,2,7:1,6,7,12
chr14	89042180	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,3:4,5:5,1,7,1
chr14	89063167	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=103,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:3,2,1,5
chr14	89073781	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=183,160;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:89073781_C_A:89073781:0,2,0,1
chr14	89073783	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=183,160;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:89073781_C_A:89073781:0,2,0,1
chr14	89076060	.	TGCACCACCA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=104,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:10,2:13,12,1,1
chr14	89087278	.	TAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.261:10:2,0:5,1:2,6,0,2
chr14	89089149	.	C	CT,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24,34;MFRL=0,176,206;MMQ=60,60,60;MPOS=26,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=9.76,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.603,0.304:7:0,2,0:0,2,2:0,0,0,7
chr14	89100925	.	A	AATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:89100925_A_AATT:89100925:1,3,1,1
chr14	89100926	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:89100925_A_AATT:89100925:1,3,1,1
chr14	89100931	.	A	ACT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,21;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:89100925_A_AATT:89100925:1,3,1,1
chr14	89151343	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:1,1,5,3
chr14	89151524	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,0:1,5:1,5,0,5
chr14	89151536	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr14	89210527	.	CATAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=224,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	89258877	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=120,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,1:0,1,0,5
chr14	89628831	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=96,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:6,8,0,2
chr14	89647178	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:2,0:6,4:2,7,0,4
chr14	89656828	.	A	ATTCTGCTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:89656828_A_ATTCTGCTG:89656828:2,8,1,1
chr14	89656829	.	A	ACAAATGGAAATAAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:6,0:0|1:89656828_A_ATTCTGCTG:89656828:2,8,1,1
chr14	89878232	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.310:10:2,2:4,1:3,4,2,1
chr14	90263500	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=190,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	90263525	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr14	90722824	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	90723000	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr14	90723059	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	90729565	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	90729931	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr14	90729984	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr14	90730265	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr14	90731591	.	AATAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=108,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	90736477	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=101,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:7,2:3,5:10,0,6,2
chr14	90744731	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,130;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:11,13,0,3
chr14	90752800	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:4,4:4,7,3,3
chr14	90752875	.	T	TAAAGTGTTGGGAGACCCCGATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=91,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:90752875_T_TAAAGTGTTGGGAGACCCCGATC:90752875:1,3,0,1
chr14	90752879	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=91,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:90752875_T_TAAAGTGTTGGGAGACCCCGATC:90752875:1,3,0,1
chr14	90752908	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	90754538	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr14	90755236	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:90755236_G_T:90755236:5,6,1,1
chr14	90755245	.	AGACTG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:5,2:0|1:90755236_G_T:90755236:5,7,1,1
chr14	90756800	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:11,5,0,3
chr14	90770210	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	91044574	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:12,9,1,1
chr14	91077278	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr14	91110593	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr14	91113384	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=106,98;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:13,4:8,17,4,0
chr14	91123575	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr14	91123680	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr14	91123690	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=198,188;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:91123690_C_G:91123690:0,4,0,1
chr14	91123693	.	AGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=198,188;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:91123690_C_G:91123690:0,4,0,1
chr14	91123697	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=185,188;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:91123690_C_G:91123690:0,2,0,1
chr14	91123707	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,25;MFRL=209,188;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:91123707_A_AT:91123707:0,3,0,1
chr14	91123708	.	G	GATGTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=209,188;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:91123707_A_AT:91123707:0,3,0,1
chr14	91156061	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=146,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:91156061_G_T:91156061:1,6,1,1
chr14	91156066	.	T	TTCCTACTGAAACTACTCTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:91156061_G_T:91156061:1,5,1,1
chr14	91196633	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	91365646	.	G	GAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=A;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.463:9:1,2:1,2:0|1:91365646_G_GAAA:91365646:2,3,4,0
chr14	91365657	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,75;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.186:14:4,2:8,0:1|0:91365646_G_GAAA:91365646:8,4,2,0
chr14	91372680	.	G	GAGGTATTATTGATTCATGTTAAGTATTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=108,224;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.299:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr14	91467393	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:8,4:6,2:7,9,4,2
chr14	91467570	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr14	91467603	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr14	91467616	.	GGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr14	91633483	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,0;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr14	91639656	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=80,80;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.181:59:23,10:22,0:18,31,10,0
chr14	91642234	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr14	91655270	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,3:5,0:2,5,2,2
chr14	91666018	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	91681775	.	C	CATCTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=92,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:2,2:7,0:5,4,0,2
chr14	91740024	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=163,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,0:4,5:4,6,0,5
chr14	91745716	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=64,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:91745716_T_A:91745716:0,2,0,1
chr14	91745718	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=64,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:91745716_T_A:91745716:0,2,0,1
chr14	91747905	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=127,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,1,3
chr14	91747919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr14	91749595	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr14	91760533	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:7,2:6,8,1,1
chr14	91763572	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	91773332	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TC;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.546:8:0,3:2,1:4,0,4,0
chr14	91806154	.	AAGATGAAGGGAGAGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=227,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:3,0,1,0
chr14	91809984	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=96,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:1,2:3,0:0|1:91809984_T_TA:91809984:1,4,1,1
chr14	91809986	.	T	TTCTTGCAGTGAAGATCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:91809984_T_TA:91809984:1,4,1,1
chr14	91883267	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr14	91925027	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr14	91927717	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.931:27:1,15:0,11:1,0,14,12
chr14	91928301	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	91928336	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=221,9084;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,6:2,0:2,1,0,6
chr14	91928992	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr14	91929281	.	CTTAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAAT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	91931854	.	A	AAAGTACTAAAAGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=191,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr14	91937143	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr14	91942318	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=63.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,5:0,11:0|1:91942318_C_CA:91942318:0,0,5,13
chr14	91942342	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,4:0,10:0|1:91942318_C_CA:91942318:0,0,3,13
chr14	91942407	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	91957236	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	92040589	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	92041075	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=179.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,25:0,29:0,0,36,18
chr14	92058445	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	92074545	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	92088368	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=267,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92088368_T_C:92088368:0,1,0,1
chr14	92088372	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=267,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92088368_T_C:92088368:0,1,0,1
chr14	92088373	.	G	GATCGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=267,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92088368_T_C:92088368:0,1,0,1
chr14	92102759	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=136,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,5:1,7:2,3,6,6
chr14	92136327	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=207,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr14	92140428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,0:2,3:9,0,3,0
chr14	92140530	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:6,2:9,0:7,8,3,0
chr14	92191590	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:92191590_AC_A:92191590:0,1,0,1
chr14	92191594	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:92191590_AC_A:92191590:0,1,0,1
chr14	92191599	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:92191590_AC_A:92191590:0,1,0,1
chr14	92251587	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=72,61;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:5,3,2,4
chr14	92268615	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr14	92279983	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:5,1,7,2
chr14	92336755	.	G	GGA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,2:8,0:0|1:92336755_G_GGA:92336755:3,8,0,2
chr14	92336759	.	GA	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:0|1:92336755_G_GGA:92336755:3,9,0,2
chr14	92336775	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr14	92343764	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr14	92436034	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,3:24,0:30,12,3,0
chr14	92480874	.	GCA	TTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:92480874_GCA_TTT:92480874:3,1,1,1
chr14	92480881	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:92480874_GCA_TTT:92480874:3,1,0,1
chr14	92480884	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:92480874_GCA_TTT:92480874:3,1,0,1
chr14	92481963	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,158;MMQ=40,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr14	92537354	.	C	CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=70786970,147;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;RPA=8,16;RU=CTG;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.661:5:1,1:0,0:0,1,0,4
chr14	92562929	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=191,153;MMQ=41,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr14	92584025	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:5,1:1,1:3,3,0,2
chr14	92584067	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=160,174;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:92584067_TG_CA:92584067:0,2,0,1
chr14	92584075	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=160,174;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:92584067_TG_CA:92584067:0,2,0,1
chr14	92584077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=160,174;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:92584067_TG_CA:92584067:0,2,0,1
chr14	92587935	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,14;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:1,1:1,0:7,1,3,0
chr14	92588155	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:4,1:4,3:2,6,0,4
chr14	92588198	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:92588198_A_AC:92588198:0,4,0,1
chr14	92588199	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:92588198_A_AC:92588198:0,4,0,1
chr14	92588201	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:92588198_A_AC:92588198:0,4,0,1
chr14	92597452	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=76,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:7,3:3,6:6,4,6,3
chr14	92625265	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:92625265_A_G:92625265:3,0,1,0
chr14	92625270	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:92625265_A_G:92625265:3,0,1,0
chr14	92905817	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr14	92909227	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr14	92909712	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,6:2,3:2,1,7,2
chr14	92915625	.	TACACACACACACAC	T,TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25,21;MFRL=0,189,263;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,14,15;RU=AC;STR;TLOD=7.02,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.517,0.378:5:0,3,1:0,0,0:0,0,0,5
chr14	92920371	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,12:3,5:3,2,4,13
chr14	92920423	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:1,5,1,5
chr14	92922681	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,2:0,0,6,0
chr14	92922713	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,14,4
chr14	92960025	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr14	93081792	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:93081792_C_T:93081792:8,9,1,1
chr14	93081798	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:9,2:7,0:0|1:93081792_C_T:93081792:9,9,1,1
chr14	93081800	.	TG	GT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,1:7,0:0|1:93081792_C_T:93081792:8,9,1,1
chr14	93143047	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr14	93154537	.	TGGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr14	93170901	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr14	93171153	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93171153_T_A:93171153:0,0,0,1
chr14	93171157	.	C	CTGTAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93171153_T_A:93171153:0,0,0,1
chr14	93180697	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:93180697_C_T:93180697:6,10,1,1
chr14	93180705	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:93180697_C_T:93180697:6,10,1,1
chr14	93198972	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:5,2,4,1
chr14	93199080	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.587:32:7,11:6,7:7,6,8,11
chr14	93199203	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,2,6
chr14	93273381	.	GT	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=147,173;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.248:6:2,0:2,1:1,4,0,1
chr14	93276806	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	93285962	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	93290856	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=101.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0|1:93290856_T_C:93290856:0,0,14,10
chr14	93290859	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.965:25:0,13:0,11:0|1:93290856_T_C:93290856:0,0,15,10
chr14	93303850	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr14	93303852	.	T	TTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93303852_T_TTCC:93303852:1,2,0,1
chr14	93303854	.	TG	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr14	93303856	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93303852_T_TTCC:93303852:1,2,0,1
chr14	93393143	.	A	ACTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:93393143_A_ACTT:93393143:0,0,0,1
chr14	93393144	.	G	GGGCCCTTTGCCTACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:93393143_A_ACTT:93393143:0,0,0,1
chr14	93412609	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	93649501	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr14	93673580	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,1:2,2:3,0,3,0
chr14	93673655	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:6,2,5,3
chr14	93676372	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:93676372_C_T:93676372:0,4,0,1
chr14	93676375	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:93676372_C_T:93676372:0,4,0,1
chr14	93676378	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:93676372_C_T:93676372:0,3,0,1
chr14	93676382	.	T	TTTTCTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:93676372_C_T:93676372:0,2,0,1
chr14	93684814	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=146,255;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,2:3,0,3,0
chr14	93684870	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,3:3,0:5,2,3,0
chr14	93685097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=89,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:6,7,1,2
chr14	93685167	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=159,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr14	93686568	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=246,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	93761041	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,212;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:6,9,0,2
chr14	93943998	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=73,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,6:3,0:3,5,3,3
chr14	93953904	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:93953904_G_A:93953904:0,0,2,0
chr14	93953907	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:93953904_G_A:93953904:0,0,2,0
chr14	93954053	.	T	TGCTGTAAGGAATTAAGCTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr14	93962691	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr14	93963402	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	93994870	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,3:3,0:3,2,2,1
chr14	93994954	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,67;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:2,3,3,4
chr14	93994957	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:5,5,1,2
chr14	94008753	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr14	94041460	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:12,8:9,0:11,10,8,0
chr14	94046596	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=73,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,6:3,1:1,3,4,3
chr14	94063949	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	94067091	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:94067091_TAA_T:94067091:3,3,1,1
chr14	94067098	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=115,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:94067091_TAA_T:94067091:3,3,1,1
chr14	94079309	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,0:8,3:7,7,1,2
chr14	94088587	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,8:0,1:0,0,6,4
chr14	94097287	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0,0,0,8
chr14	94109829	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	94139786	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,118;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,0:4,5:4,6,0,5
chr14	94149113	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr14	94160611	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	94391590	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:0|1:94391590_C_T:94391590:5,3,2,2
chr14	94391594	.	G	GCAGGTCTCCCCCTTGATGTCTCCCGGCAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:0|1:94391590_C_T:94391590:5,3,2,2
chr14	94394933	.	G	GAATGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:94394933_G_GAATGT:94394933:0,2,0,1
chr14	94394935	.	A	AAGCTGACCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:94394933_G_GAATGT:94394933:0,2,0,1
chr14	94417421	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,4:7,2:6,6,2,4
chr14	94417541	.	A	G,T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,30,30;MFRL=184,147,220;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.53,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,2:0.290,0.200:11:3,2,0:3,1,2:1,5,0,5
chr14	94417546	.	G	GCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=193,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:94417546_G_GCT:94417546:1,8,0,2
chr14	94417549	.	GCA	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:94417546_G_GCT:94417546:1,9,0,2
chr14	94419888	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr14	94419890	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=198,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.287:8:1,2:4,0:0|1:94419890_A_T:94419890:1,5,1,1
chr14	94419892	.	A	ATCCGCCCGCCTCGGCCTCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=198,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:3,0:0|1:94419890_A_T:94419890:1,5,1,1
chr14	94466081	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=109,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr14	94528497	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.286:11:1,1:7,1:4,4,2,1
chr14	94545342	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr14	94563193	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr14	94563438	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr14	94568083	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr14	94568280	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr14	94582130	.	T	TGGCCATGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=247,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,2:2,0,4,1
chr14	94594768	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	94700138	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr14	94700838	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	94708077	.	TTTTGTTTTCAATTGAAATGTTGAGCTAGTTTTTTATA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.105:37:14,3:2,0:21,13,2,1
chr14	94716442	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=218,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr14	94722748	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr14	94722764	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	94725570	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=107,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:7,2,2,0
chr14	94731910	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=247,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,0,4
chr14	94732107	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr14	94732220	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:8,12,2,1
chr14	94732228	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=91,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,5:4,7:5,6,3,9
chr14	94733474	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=128,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr14	94745076	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=134,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0|1:94745076_A_AT:94745076:0,5,0,2
chr14	94745083	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:3,2:1,1:0|1:94745076_A_AT:94745076:0,5,0,3
chr14	94745096	.	T	TTTATTTAACCAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1|0:94745076_A_AT:94745076:0,3,0,2
chr14	94745098	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1|0:94745076_A_AT:94745076:0,3,0,2
chr14	94750292	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:2,4:4,2:5,2,5,1
chr14	94756119	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	94756750	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:3,3,2,4
chr14	94756794	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,11,9
chr14	94770990	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr14	94772429	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:3,4,2,3
chr14	94776034	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	94845824	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=133,88;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:12,8,1,1
chr14	94845829	.	G	GAC	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=133,88;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:12,8,1,1
chr14	94845834	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=117,88;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:10,8,1,1
chr14	94845837	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=115,88;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:10,8,1,1
chr14	94845846	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=115,88;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:9,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:12,12,1,1
chr14	94845850	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=109,88;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:8,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:9,13,1,1
chr14	94845852	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=109,88;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:8,2:0|1:94845824_CCT_C:94845824:9,13,1,1
chr14	94909630	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	94914455	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=81,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr14	94929541	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr14	94929660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,2:5,6:3,4,4,4
chr14	94929708	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr14	94930980	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	94931016	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr14	94933473	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=81,203;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:8,6,3,2
chr14	94933640	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=148,207;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,0,2
chr14	94933649	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:0,2,5,2
chr14	94936110	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=148,26;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,5:6,1,5,1
chr14	94956204	.	CAAAGGTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr14	94963017	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=142,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:94963017_A_ATG:94963017:1,3,0,1
chr14	94963021	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,285;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:94963017_A_ATG:94963017:1,3,0,1
chr14	95053849	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:1,7,0,3
chr14	95053863	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr14	95053890	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr14	95057270	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,8:0,0,8,7
chr14	95057332	.	A	AACTCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=ACTCC;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	95058360	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr14	95058462	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:2,4,2,3
chr14	95058631	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	95058647	.	T	TGGCTGTCTGTTACCCCAAGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:95058647_T_TGGCTGTCTGTTACCCCAAGTC:95058647:0,1,0,1
chr14	95058649	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95058647_T_TGGCTGTCTGTTACCCCAAGTC:95058647:0,1,0,1
chr14	95078677	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr14	95081418	.	A	ACAGTTTTGCGTTTGGCTCCCTAATATCTGCTGTCGATCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=123,47;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr14	95081430	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:95081430_GC_AG:95081430:0,3,1,1
chr14	95081435	.	G	GATATTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=205,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:95081430_GC_AG:95081430:0,2,1,1
chr14	95556747	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	95562546	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:95562546_A_G:95562546:13,7,0,2
chr14	95562550	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:95562546_A_G:95562546:12,6,0,2
chr14	95566103	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.738:1:0,0:0,1:0|1:95566103_AC_A:95566103:0,0,1,0
chr14	95566105	.	ACAC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.744:1:0,0:0,1:0|1:95566103_AC_A:95566103:0,0,1,0
chr14	95570439	.	C	CATGACAACTTCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:4,2:0,4,1,1
chr14	95571309	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	95596392	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:12,4,2,0
chr14	95670804	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.734:12:2,4:1,4:3,0,3,6
chr14	95677235	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=57,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:2,4,2,4
chr14	95688121	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=109,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:3,10,0,3
chr14	95696336	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	95898351	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr14	95898487	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr14	95906054	.	ACCAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAG;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.172:20:7,0:8,1:12,5,1,2
chr14	95912388	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.747:14:0,5:3,4:1,2,5,6
chr14	95916232	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.303:18:1,1:6,2:10,3,5,0
chr14	95916236	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,1:10,3,2,0
chr14	95916243	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:1,0:5,2:10,3,2,0
chr14	95918513	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	95923421	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.823:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	95923470	.	ACTGTC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=79,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:1,3:4,2,3,5
chr14	95923756	.	GGTGTGTGT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=GT;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.456:7:1,1:1,2:0,4,0,3
chr14	95932223	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	95941967	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr14	95942002	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr14	96131432	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr14	96131469	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr14	96136775	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,1,2
chr14	96136794	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:5,1,2,2
chr14	96152728	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr14	96157187	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,7:6,5:8,7,5,7
chr14	96157694	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.368:9:2,2:3,1:0|1:96157694_T_A:96157694:0,6,0,3
chr14	96157698	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:96157694_T_A:96157694:0,0,0,9
chr14	96707090	.	A	AGTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,1,1
chr14	96730373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr14	96752070	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=112,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,2:8,0:10,8,1,1
chr14	96770849	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=99,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:5,0:12,4:6,11,4,0
chr14	96770952	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30,34;MFRL=135,112,0;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=8.00,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.434,0.356:7:0,2,1:1,1,1:0,1,2,4
chr14	96772225	.	G	GACTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96772225_G_GACTCA:96772225:0,1,0,1
chr14	96772226	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96772225_G_GACTCA:96772225:0,1,0,1
chr14	96772227	.	G	GAAGAATGCTATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96772225_G_GACTCA:96772225:0,1,0,1
chr14	96773176	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=85,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:96773176_C_T:96773176:13,6,1,1
chr14	96773181	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=85,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:96773176_C_T:96773176:13,6,1,1
chr14	96776008	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	96779865	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=225,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr14	96781912	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,8,10
chr14	96790282	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:6,0:0|1:96790282_T_A:96790282:5,4,1,1
chr14	96790284	.	GA	AC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:5,0:0|1:96790282_T_A:96790282:5,4,1,1
chr14	96790287	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:96790282_T_A:96790282:5,4,1,1
chr14	96813703	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	96813728	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:96813728_A_AT:96813728:0,2,0,1
chr14	96813729	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:96813728_A_AT:96813728:0,2,0,1
chr14	96848565	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=217,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	96848899	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=121,74;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:1,5,0,2
chr14	96871226	.	C	CATGTCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=97,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr14	96917858	.	A	ATCATCGATTAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,2:6,0:4,4,1,1
chr14	96922602	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=103,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr14	96924483	.	G	GAGAGTGGCAGGTGTAGTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:8,3,1,1
chr14	96944878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=90,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:3,5:6,4:2,7,4,5
chr14	96949584	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=84,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0|1:96949584_G_C:96949584:0,5,1,1
chr14	96949591	.	T	TGCTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:96949584_G_C:96949584:0,3,1,1
chr14	96953412	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=109,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:4,3:5,1:5,4,2,2
chr14	96968826	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,152;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,7:6,0:12,1,7,0
chr14	96987303	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,5:8,1:9,5,5,1
chr14	96987437	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,6:5,1:3,5,3,4
chr14	96991749	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:13,0:7,4:7,13,2,2
chr14	96997773	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:8,2,3,2
chr14	96998640	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.216:20:5,2:10,1:14,2,4,0
chr14	96998643	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:3,3:11,2:13,2,5,0
chr14	97018908	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:9,1:9,2:0|1:97018908_C_T:97018908:10,8,1,2
chr14	97018922	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,44;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:97018908_C_T:97018908:10,10,1,1
chr14	97018924	.	G	GCTGAGGTTCCGGCAGCTGACCATGGAGT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,44;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:97018908_C_T:97018908:10,10,1,1
chr14	97022168	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.448:11:1,4:5,1:5,1,4,1
chr14	97022182	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,5:7,0:9,5,5,0
chr14	97022628	.	TCTTCAGGAAATGCAGCAA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTCAGGAAATGCAGCAA;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,1:8,1:11,13,1,1
chr14	97022769	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:2,12,1,1
chr14	97411723	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=69,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:3,3:10,0:0|1:97411723_G_A:97411723:2,13,1,2
chr14	97411737	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,10:0.611:16:4,0:2,10:1|0:97411723_G_A:97411723:0,6,1,9
chr14	99182626	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=89,141;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:9,5:7,6:6,10,4,7
chr14	99641570	.	C	CTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99641570_C_CTTT:99641570:0,0,0,1
chr14	99641577	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99641570_C_CTTT:99641570:0,0,0,1
chr14	99641579	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=197,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99641570_C_CTTT:99641570:0,1,0,1
chr14	99641584	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=197,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99641570_C_CTTT:99641570:0,1,0,1
chr14	99866370	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:9,2,2,0
chr14	99871613	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,0:13,4:7,14,0,4
chr14	99876638	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.633:20:1,0:6,12:0,7,0,13
chr14	99880224	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,1:15,2:11,15,1,2
chr14	99880296	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.330:31:11,0:10,10:0|1:99880296_C_A:99880296:9,12,1,9
chr14	99880301	.	G	GCTCACGAGTGAGGCCGCCGGGAGA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,38;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.342:30:10,0:9,8:0|1:99880296_C_A:99880296:9,11,1,9
chr14	99927757	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=211,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:99927757_A_T:99927757:0,3,0,1
chr14	99927759	.	GC	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=211,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:99927757_A_T:99927757:0,3,0,1
chr14	99927766	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=211,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:99927757_A_T:99927757:0,3,0,1
chr14	99927768	.	AAC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=211,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:99927757_A_T:99927757:0,3,0,1
chr14	99927775	.	G	T,GCATTACACTATGCACC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,28,30;MFRL=152,92,211;MMQ=60,60,60;MPOS=1,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr14	99927778	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,21;MFRL=152,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:99927757_A_T:99927757:0,3,0,1
chr14	99929801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr14	99961830	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=106,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:8,5:1,4:6,3,4,5
chr14	100002473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr14	100119238	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	100123487	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=131,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:7,5:3,7:4,7,7,5
chr14	100123559	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	100123571	.	G	GCAACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100123571_G_GCAACA:100123571:0,4,0,1
chr14	100123572	.	G	GGGGCTTGATCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100123571_G_GCAACA:100123571:0,4,0,1
chr14	100125921	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr14	100134727	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=194,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100134727_G_A:100134727:0,1,0,1
chr14	100134729	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=194,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100134727_G_A:100134727:0,1,0,1
chr14	100172899	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr14	100174092	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=227,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr14	100363618	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:8,4,1,2
chr14	100363671	.	GA	CG	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:4,1,1,5
chr14	100363696	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=166,276;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr14	100363717	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=177,172;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:100363717_G_C:100363717:0,3,0,2
chr14	100363719	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=177,172;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:100363717_G_C:100363717:0,3,0,2
chr14	100376502	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	100384232	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:100384232_A_C:100384232:0,0,1,6
chr14	100384239	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=181,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0|1:100384232_A_C:100384232:0,4,1,1
chr14	100384240	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=181,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0|1:100384232_A_C:100384232:0,4,1,1
chr14	100387242	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.820:10:2,4:0,4:1,1,1,7
chr14	100402326	.	ATTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr14	100404067	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	100404351	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	100405465	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr14	100405757	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	100592959	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=193,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,4,1
chr14	100599075	.	TC	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:3,2:6,1:0|1:100599075_TC_GT:100599075:2,8,2,1
chr14	100599077	.	A	AGGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,2:7,0:0|1:100599075_TC_GT:100599075:2,8,2,1
chr14	100608003	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr14	100613093	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.418:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr14	100613166	.	A	AAGTAACATTAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,2:9,0:2,8,1,1
chr14	100706019	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:100706019_T_C:100706019:1,4,1,1
chr14	100706022	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,0:0|1:100706019_T_C:100706019:1,4,1,1
chr14	100706025	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:1,1:0|1:100706019_T_C:100706019:1,4,1,1
chr14	100741131	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,3:6,0:1,9,1,2
chr14	100759675	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,2:5,0:0|1:100759675_G_A:100759675:7,6,1,1
chr14	100759698	.	TG	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:100759675_G_A:100759675:3,8,1,1
chr14	100759701	.	A	ATCCAATTGCCTCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:4,0:0|1:100759675_G_A:100759675:3,8,1,1
chr14	100792126	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,2:2,5:2,4,5,3
chr14	100792220	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr14	100793431	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	100801423	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr14	100803364	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:9,0:1,4:7,3,4,0
chr14	100813077	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=71,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,3:3,8:4,5,7,4
chr14	100820980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr14	100847707	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=14,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.935:18:0,6:0,11:1,0,7,10
chr14	100934294	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=122,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:3,2,5,0
chr14	100934479	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,3:5,0:3,8,1,2
chr14	101004791	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,3:3,0:3,7,2,1
chr14	101010374	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=172,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101010374_A_AAG:101010374:0,1,0,1
chr14	101010375	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=172,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101010374_A_AAG:101010374:0,1,0,1
chr14	101010377	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=172,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101010374_A_AAG:101010374:0,1,0,1
chr14	101198600	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101198600_TGG_T:101198600:0,1,0,1
chr14	101198603	.	A	ACAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,23;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101198600_TGG_T:101198600:0,1,0,1
chr14	101198606	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101198600_TGG_T:101198600:0,1,0,1
chr14	101198610	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101198600_TGG_T:101198600:0,1,0,1
chr14	101200445	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr14	101340805	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,16:0,6:0,0,18,5
chr14	101347037	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr14	101348862	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:6,7,1,2
chr14	101349882	.	A	AGTATCTCCAGCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr14	101350670	.	C	CTCT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr14	101350708	.	CAGTGTG	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.254:6:4,0:1,1:0|1:101350708_CAGTGTG_C:101350708:2,3,0,1
chr14	101350718	.	C	CTTCCCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:101350708_CAGTGTG_C:101350708:2,2,0,1
chr14	101350719	.	T	TGCCAGACAACGGCGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=171,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:101350719_T_TGCCAGACAACGGCGC:101350719:1,2,1,1
chr14	101350723	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=171,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:101350719_T_TGCCAGACAACGGCGC:101350719:1,2,0,1
chr14	101492224	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	101492529	.	G	GGGTTCTTGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	101493226	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,150;MMQ=51,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr14	101496145	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	101498483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,3:0,1:0,0,1,5
chr14	101506158	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	101509222	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	101513741	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=95,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:2,6,1,2
chr14	101514903	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GT;STR;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr14	101514956	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=104,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:3,0:16,3:7,13,3,0
chr14	101515020	.	A	ATCTGGGCTTTTGGGTC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:10,3:10,13,0,3
chr14	101515178	.	T	TCTAACCATCCATCCATCACTTCCATGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.654:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr14	101516050	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=175,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:101516050_C_A:101516050:0,3,0,1
chr14	101516053	.	C	CATTAAAATTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,244;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:101516050_C_A:101516050:0,3,0,1
chr14	101518910	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:1,5,0,8
chr14	101533093	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,4,2
chr14	102228198	.	GGGC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.363:15:5,1:3,4:10,0,4,1
chr14	102285427	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:17,3:13,0:18,12,2,1
chr14	102361001	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:102361001_T_A:102361001:1,0,0,1
chr14	102361003	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102361001_T_A:102361001:1,0,0,1
chr14	102361007	.	ATTGC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102361001_T_A:102361001:1,0,0,1
chr14	102361015	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102361001_T_A:102361001:1,0,0,1
chr14	102378890	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:3,0:1,1:0,4,0,3
chr14	102391577	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:6,4:2,4:3,5,2,6
chr14	102449998	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=94,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,5:4,1:4,8,3,4
chr14	102450013	.	TT	CA,CT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20,31;MFRL=155,72,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.09,22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,8:0.176,0.530:14:4,0,7:0,2,1:1,3,3,7
chr14	102450024	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=154,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:11,0:0,2:0|1:102450024_T_A:102450024:2,9,1,1
chr14	102450029	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=154,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:0,1:0|1:102450024_T_A:102450024:2,9,1,1
chr14	102454001	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,0:3,5:1,6,0,5
chr14	102457796	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr14	102460536	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=171,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:4,0:7,3:6,5,1,2
chr14	102461686	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=124,128;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:7,22,0,2
chr14	102466784	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,5:2,2:1,4,1,6
chr14	102474688	.	T	TGGTGTCTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	102476130	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.326:15:3,3:5,1:5,5,4,1
chr14	102476208	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:14,2:14,3:7,21,0,5
chr14	102482788	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr14	102482863	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=134,329;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102482863_G_A:102482863:0,1,0,1
chr14	102482864	.	C	CACTTCCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=134,329;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:102482863_G_A:102482863:0,1,0,1
chr14	102494300	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,5:12,0:10,11,5,0
chr14	102496171	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:12,6,1,1
chr14	102496352	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:2,3:11,2:0,13,1,4
chr14	102499306	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=132,135;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,5:1,0:4,1,5,0
chr14	102500244	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	102507065	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:1,5,3,5
chr14	102507107	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:1,6,0,2
chr14	102508751	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=68,44;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:12,4:4,0:4,13,4,0
chr14	102510874	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,7:1,1:1,3,7,1
chr14	102510952	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,81;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:12,3,2,1
chr14	102514206	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,1:11,2:12,7,2,1
chr14	102515015	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:0,3:2,6:1,1,4,5
chr14	102548224	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr14	102548384	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr14	102549839	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,347;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr14	102550069	.	TA	T,TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27,24;MFRL=111,171,81;MMQ=60,60,60;MPOS=25,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=A;STR;TLOD=6.49,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,4:0.404,0.364:12:1,3,1:1,3,2:2,0,4,6
chr14	102551782	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:14,0:13,5:4,23,0,5
chr14	102551795	.	T	TTAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:2,10,0,5
chr14	102552773	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.319:20:9,3:4,3:0|1:102552773_A_G:102552773:3,11,1,5
chr14	102552775	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.319:20:6,2:5,3:0|1:102552773_A_G:102552773:3,11,1,5
chr14	102676275	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=253,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102676275_G_T:102676275:0,1,0,1
chr14	102676279	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=253,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102676275_G_T:102676275:0,1,0,1
chr14	102695563	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr14	102698250	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102698250_T_TTA:102698250:0,1,0,1
chr14	102698251	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102698250_T_TTA:102698250:0,1,0,1
chr14	102700104	.	C	CTAT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=101,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:0|1:102700104_C_CTAT:102700104:14,5,0,2
chr14	102700106	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:9,0:0|1:102700104_C_CTAT:102700104:22,5,0,2
chr14	102700110	.	G	GTCAGT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:16,0:0|1:102700104_C_CTAT:102700104:22,5,0,2
chr14	102718052	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr14	102718419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	102732122	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr14	102792386	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=91,0;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.351:17:2,2:9,4:5,6,4,2
chr14	102805435	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=109,269;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.326:38:17,12:8,0:12,14,12,0
chr14	102808554	.	CGTGGA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=134,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,5,0,2
chr14	102808562	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,4,0,2
chr14	102843039	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:4,3,4,3
chr14	102874740	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr14	102891464	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:22,0:2,3:14,10,2,1
chr14	102891646	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr14	102894559	.	G	GTTTTTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,0;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=22,30;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,1:2,4:3,0,0,5
chr14	102894593	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.967:29:0,12:0,11:0,0,7,22
chr14	102898363	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,3:1,4:2,1,3,4
chr14	102898442	.	GGAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAA;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr14	102900768	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:2,8:9,9:6,5,9,8
chr14	102915904	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.559:9:1,4:2,1:3,1,3,2
chr14	102917061	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=221,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr14	102918686	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr14	102964408	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:4,2,3,2
chr14	103174724	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=214,205;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr14	103187782	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:2,7,0,2
chr14	103192774	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,3:0,0:0,1,3,0
chr14	103342854	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=86,110;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,0:11,6:9,7,6,0
chr14	103357830	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=142,299;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103357830_A_ATT:103357830:0,1,0,1
chr14	103357831	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=142,299;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103357830_A_ATT:103357830:0,1,0,1
chr14	103357835	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=142,299;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103357830_A_ATT:103357830:0,1,0,1
chr14	103371873	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,3:8,0:10,17,3,0
chr14	103372130	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.222:15:7,2:5,0:6,6,1,2
chr14	103395019	.	CGCGTGGCGTG	C,CGCGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=159,284,116;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,3,4;RU=GCGTG;STR;TLOD=3.07,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.221,0.220:6:3,1,1:1,0,0:4,0,2,0
chr14	103396385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:103396385_G_A:103396385:1,3,1,1
chr14	103396396	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:103396385_G_A:103396385:1,3,1,1
chr14	103396405	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:103396385_G_A:103396385:1,3,1,1
chr14	103397055	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	103406368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr14	103406463	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=128,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:14,0:11,7:11,14,0,7
chr14	103416096	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr14	103420990	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:9,5,1,2
chr14	103425946	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:6,2:6,2:9,4,3,1
chr14	103425979	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:9,4:17,0:0|1:103425979_G_A:103425979:17,9,2,2
chr14	103425985	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:9,4:16,0:0|1:103425979_G_A:103425979:16,9,2,2
chr14	103429545	.	G	GAGC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:103429545_G_GAGC:103429545:0,3,0,1
chr14	103429549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:103429545_G_GAGC:103429545:0,3,0,1
chr14	103429551	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,34;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:103429545_G_GAGC:103429545:0,2,0,1
chr14	103429552	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:103429545_G_GAGC:103429545:0,2,0,1
chr14	103429554	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:103429545_G_GAGC:103429545:0,2,0,1
chr14	103429558	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:103429545_G_GAGC:103429545:0,0,0,1
chr14	103429560	.	G	GCCCTTCCTC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:103429545_G_GAGC:103429545:0,0,0,1
chr14	103440282	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr14	103567020	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=287,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,6:1,6:0,1,1,11
chr14	103568729	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	103571128	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	103574714	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.888:16:0,7:1,6:0,1,10,5
chr14	103576292	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr14	103595997	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr14	103596488	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,2:0,12:0,0,4,10
chr14	103596609	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr14	103597565	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	103599938	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr14	103804986	.	CT	GG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,1,1
chr14	103806973	.	G	GGCTCATTTTAACAGAACTATTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103806973_G_GGCTCATTTTAACAGAACTATTAA:103806973:0,3,0,1
chr14	103806976	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103806973_G_GGCTCATTTTAACAGAACTATTAA:103806973:0,3,0,1
chr14	103915215	.	GTGTT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:1,5:1,4:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:3,0,7,3
chr14	103915225	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.752:14:1,6:1,4:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:2,1,8,3
chr14	103915242	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,32,31;MFRL=152,148,105;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=T;STR;TLOD=4.54,5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,5:0.141,0.275:17:1,0,2:9,2,3:9,1,4,3
chr14	103918182	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	103923414	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr14	103928657	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	103933341	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,161,154;MMQ=60,60,60;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=A;STR;TLOD=3.47,8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.302,0.557:4:0,0,1:0,1,2:0,0,4,0
chr14	103933348	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.558:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr14	103934488	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,11:0,0,9,14
chr14	103934557	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:3,4,0,2
chr14	103946636	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	103964807	.	AT	A,ATT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,25,28;MFRL=129,117,109;MMQ=60,60,60;MPOS=30,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=5.15,6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,8:0.231,0.297:25:1,1,2:7,5,5:10,1,12,2
chr14	103964886	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.373:49:12,7:19,11:7,24,2,16
chr14	103964905	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:18,1:22,1:8,33,1,1
chr14	103964923	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.364:31:9,6:11,5:4,16,0,11
chr14	103996477	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:6,8,1,1
chr14	103996733	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	104001154	.	G	GAGAGCCCACCTGACAAACCCCCCGCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr14	104026308	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,2:5,1:7,8,2,1
chr14	104028196	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:2,3:3,4:4,1,5,2
chr14	104040414	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr14	104053764	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:104053764_C_T:104053764:0,2,0,3
chr14	104053768	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:104053764_C_T:104053764:0,4,0,1
chr14	104053791	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:104053764_C_T:104053764:0,3,0,1
chr14	104053793	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:104053764_C_T:104053764:0,3,0,1
chr14	104129352	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr14	104135966	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=89,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:3,3,0,5
chr14	104136469	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr14	104136633	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:4,6:4,4,3,6
chr14	104139570	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr14	104151400	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.589:39:6,9:9,14:8,8,8,15
chr14	104165908	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,3:8,0:6,7,1,2
chr14	104167513	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,4,0
chr14	104167545	.	G	C,A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30,26;MFRL=0,108,164;MMQ=60,60,60;MPOS=4,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.222,0.667:6:0,1,3:0,0,2:0,0,4,2
chr14	104167564	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr14	104175036	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=82,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr14	104193099	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr14	104195161	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:5,1,4,1
chr14	104198881	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr14	104201549	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=241,96;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,4:2,1,3,3
chr14	104201625	.	T	TTCAAAATTCCACAGATCATTTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	104202304	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=168,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:2,1:5,3:3,4,4,1
chr14	104203938	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr14	104216293	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=176,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,6:0,7:0,1,2,11
chr14	104216349	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr14	104251276	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:2,1,3,6
chr14	104394835	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr14	104394850	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=111,101;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,0:7,2:11,11,0,2
chr14	104429453	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.917:21:0,11:1,9:0,1,8,12
chr14	104431899	.	TGGGA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=46,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGA;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr14	104452673	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr14	104464904	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=160,160;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,2:10,0:12,0,3,0
chr14	104470698	.	GTTTATTTA	GTTTA,G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30,31;MFRL=0,133,268;MMQ=60,60,59;MPOS=24,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,7;RU=TTTA;STR;TLOD=23.84,6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.693,0.234:8:0,3,1:0,2,1:0,0,1,7
chr14	104470763	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,6:0,2:0,1,0,8
chr14	104481016	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	104491086	.	TACACACAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=AC;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.719:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	104498472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	104498510	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:104498510_CT_AA:104498510:0,1,0,1
chr14	104498516	.	TG	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:104498510_CT_AA:104498510:0,1,0,1
chr14	104498519	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:104498510_CT_AA:104498510:0,1,0,1
chr14	104500427	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=70,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,6:0,4:1,0,5,5
chr14	104500449	.	T	TCCCTTTCCTCCTTCCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=163,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	104516020	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:16,2:12,0:0|1:104516020_G_A:104516020:14,14,1,1
chr14	104516022	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,2:12,0:0|1:104516020_G_A:104516020:14,14,1,1
chr14	104518453	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr14	104559990	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr14	104561998	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr14	104562060	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	104563874	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr14	104569801	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	104570904	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr14	104571076	.	C	CAGGTTTGTTACTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:4,4,1,1
chr14	104571826	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr14	104573690	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr14	104575466	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr14	104583836	.	GGCGCGGCGACAGCGACGGAGCGTCCCAC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.146:19:8,2:6,0:5,12,1,1
chr14	104605706	.	A	AATGACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	104624329	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=94,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,0:3,9:4,6,0,10
chr14	104640011	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr14	104642489	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	104643971	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:104643971_G_A:104643971:0,0,0,1
chr14	104643974	.	A	AAAAAAATGGAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:104643971_G_A:104643971:0,0,0,1
chr14	105054814	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	105055118	.	TGACGGGCAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACGGGCAG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	105063253	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=235,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	105063298	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr14	105172315	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,3:1,0:1,0,3,1
chr14	105173844	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1,3,0,1
chr14	105173862	.	ACCCCACCCCCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CCCCAC;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr14	105177351	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:2,1,3,3
chr14	105178089	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,1:1,3:0|1:105178089_T_C:105178089:0,5,0,5
chr14	105178098	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:105178089_T_C:105178089:0,4,0,4
chr14	105204680	.	ACTCTGTCTCTCATGC	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGTCTCTCATGC;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:10,2:5,14,1,1
chr14	105205650	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=4,169;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr14	105207134	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,7,6
chr14	105208393	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	105208425	.	G	GCTGTGTTTTCTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=160,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105208425_G_GCTGTGTTTTCTCA:105208425:0,1,0,1
chr14	105208427	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=160,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105208425_G_GCTGTGTTTTCTCA:105208425:0,1,0,1
chr14	105211221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,5:2,4:1,1,2,7
chr14	105212788	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	105222037	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,2:0,0,4,8
chr14	105223194	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	105238604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	105239146	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	105239192	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	105239894	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,8:7,0:2,7,4,4
chr14	105242228	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	105242966	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr14	105246325	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	105258893	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr14	105270480	.	TGG	T	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.188:18:5,2:5,1:8,7,3,0
chr14	105270483	.	GGGGTGTGT	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.094:31:14,2:9,1:14,14,2,1
chr14	105270484	.	G	GT	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.420:13:4,3:3,3:5,2,3,3
chr14	105270485	.	G	T,GT	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=32,23,34;MFRL=168,203,147;MMQ=60,60,60;MPOS=31,27;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.91,11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,6:0.261,0.463:13:2,1,3:1,2,3:3,1,5,4
chr14	105271061	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	105344293	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=87,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:0|1:105344293_C_T:105344293:3,4,4,4
chr14	105344318	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=87,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,4:1,3:0|1:105344293_C_T:105344293:3,2,3,6
chr14	105344347	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr14	105344761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:2,3,1,5
chr14	105344931	.	CT	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr14	105346632	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:5,2,2,1
chr14	105349220	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	105349877	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:105349877_C_T:105349877:0,0,1,3
chr14	105349886	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:105349877_C_T:105349877:0,0,0,3
chr14	105349897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr14	105350133	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=253,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr14	105350745	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105350745_A_T:105350745:0,0,0,1
chr14	105350748	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105350745_A_T:105350745:0,0,0,1
chr14	105350750	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105350745_A_T:105350745:0,0,0,1
chr14	105351637	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr14	105351673	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr14	105351846	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:105351846_G_C:105351846:0,1,0,1
chr14	105351848	.	C	CCACCACATTTTTTTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105351846_G_C:105351846:0,1,0,1
chr14	105352922	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=183,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr14	105353208	.	C	CGCCTCCTGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=61,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr14	105356137	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	105359306	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr14	105359827	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr14	105360746	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	105396269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr14	105398392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:2,2,2,1
chr14	105398698	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:4,1,1,6
chr14	105398732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=100,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,1:3,5,1,1
chr14	105404384	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,5:4,3:4,8,4,4
chr14	105405741	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:0|1:105405741_G_A:105405741:6,8,1,1
chr14	105405745	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:105405741_G_A:105405741:6,8,1,1
chr14	105408315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,6:4,4:2,4,4,6
chr14	105409959	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=100,129;MMQ=60,57;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,4:8,5:4,7,4,5
chr14	105410411	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,1:3,4:6,3,1,4
chr14	105411781	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:1,4:12,4:8,5,3,5
chr14	105412259	.	GG	CC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,143;MMQ=60,48;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:3,4,4,4
chr14	105413204	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=142,151;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.443:16:5,4:4,3:0|1:105413204_G_T:105413204:3,6,5,2
chr14	105413223	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=140,151;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:3,4:5,2:0|1:105413204_G_T:105413204:4,4,5,1
chr14	105414423	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=120,722;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,9:7,1:8,4,0,10
chr14	105415469	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=98,76;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:7,7:0,6:2,5,6,8
chr14	105415497	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=93,61;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:6,1:5,11,1,2
chr14	105415506	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=93,61;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:105415506_C_T:105415506:6,13,1,1
chr14	105415508	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=114,61;MMQ=59,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:105415506_C_T:105415506:6,12,1,1
chr14	105415510	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=114,61;MMQ=59,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:105415506_C_T:105415506:6,12,1,1
chr14	105415512	.	G	GGAAACGGGTT	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=114,61;MMQ=59,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:105415506_C_T:105415506:6,12,1,1
chr14	105415514	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=93,61;MMQ=58,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,1:8,0:0|1:105415506_C_T:105415506:6,11,1,1
chr14	105416010	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,6:2,4:2,3,5,5
chr14	105417282	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,149;MMQ=46,50;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:3,2,2,3
chr14	105417581	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=170,106;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:8,6:0,2:3,5,6,2
chr14	105417701	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=133,0;MMQ=59,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:15,2:14,0:16,15,1,1
chr14	105417765	.	AG	CA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=129,110;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:0|1:105417765_AG_CA:105417765:3,7,0,3
chr14	105417768	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=133,110;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:7,1:3,2:0|1:105417765_AG_CA:105417765:4,7,0,3
chr14	105417774	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=137,156;MMQ=40,55;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:0|1:105417765_AG_CA:105417765:5,8,0,2
chr14	105417894	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:2,4,4,3
chr14	105417941	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=134,1162;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:6,7:8,0:5,10,0,7
chr14	105418234	.	GA	AT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=106,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:8,3:13,1:0|1:105418234_GA_AT:105418234:10,12,3,1
chr14	105418260	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=113,125;MMQ=60,50;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:0|1:105418234_GA_AT:105418234:13,11,1,1
chr14	105419234	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:14,2:1,4:4,11,2,5
chr14	105419256	.	C	CTCTGCCTTATGACCTTTCAGGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,4087;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:2,8,0,2
chr14	105419551	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=162,147;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0|1:105419551_C_G:105419551:3,2,2,3
chr14	105419557	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=162,147;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:2,4:0|1:105419551_C_G:105419551:3,2,2,3
chr14	105419559	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=162,128;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:0|1:105419551_C_G:105419551:3,2,2,2
chr14	105419568	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=162,128;MMQ=60,34;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,0:2,3:0|1:105419551_C_G:105419551:3,2,2,2
chr14	105420215	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=77,172;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.678:19:1,7:4,6:2,4,4,9
chr14	105420797	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:10,3:10,12,2,1
chr14	105423663	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:105423663_T_C:105423663:0,0,2,0
chr14	105423666	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:105423663_T_C:105423663:0,0,2,0
chr14	105424096	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	105453054	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.142:37:12,0:20,4:17,15,2,3
chr14	105457771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0|1:105457771_A_G:105457771:0,0,4,2
chr14	105457780	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:105457771_A_G:105457771:0,0,3,2
chr14	105460858	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=303,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	105477507	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:5,2:1,1:4,2,2,1
chr14	105477613	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,3:7,2:8,7,3,2
chr14	105612346	.	GCACAGGAGGGTCAGATGCAGGCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.224:7:0,0:3,1:1,5,0,1
chr14	105613159	.	CAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	105614032	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,336;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	105615026	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	105617550	.	C	CGCAGCCCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCAGCCCCA;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr14	105622056	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr14	105624187	.	T	TTGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105624187_T_TTGAG:105624187:1,0,0,1
chr14	105624189	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105624187_T_TTGAG:105624187:1,0,0,1
chr14	105639679	.	C	CACACAATACACACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	105686570	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	105692642	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:5,0:2,2:0|1:105692642_G_A:105692642:0,7,1,1
chr14	105692646	.	A	AGCCATCAGTGGATCTACCATTCTGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:105692642_G_A:105692642:0,7,1,1
chr14	105693131	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.359:6:3,2:1,0:0|1:105693131_G_GA:105693131:0,4,1,1
chr14	105693132	.	T	TGTCTAAATCTCCTGCTAGACTAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:3,2:0,0:0|1:105693131_G_GA:105693131:0,4,1,1
chr14	105715700	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,0:0|1:105715700_G_T:105715700:6,3,1,1
chr14	105715715	.	A	AGAGACTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:105715700_G_T:105715700:7,3,1,1
chr14	105716377	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,107;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:6,3,2,4
chr14	105717279	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,1:9,2:6,10,0,3
chr14	105717448	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	105722726	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr14	105722793	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:105722793_C_T:105722793:3,5,1,1
chr14	105722794	.	TGGTCACAACCCCCA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:4,2:0|1:105722793_C_T:105722793:6,7,1,1
chr14	105752816	.	G	GGTAAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	105821502	.	C	CTATACAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:3,2:0|1:105821502_C_CTATACAA:105821502:1,3,1,1
chr14	105821505	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:105821502_C_CTATACAA:105821502:1,3,1,1
chr14	105851374	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,3:7,1:2,8,1,3
chr14	105858057	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=173,0;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:105858057_A_C:105858057:0,3,1,0
chr14	105858062	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=149,0;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:105858057_A_C:105858057:0,4,1,0
chr14	105858066	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=125,0;MMQ=60,23;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,0:3,0:0|1:105858057_A_C:105858057:1,4,1,0
chr14	105905103	.	AGG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=46,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:105905103_AGG_A:105905103:1,1,1,1
chr14	105905110	.	T	TCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,19;MFRL=46,59;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:0|1:105905103_AGG_A:105905103:1,1,1,1
chr14	105924538	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr14	105924786	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	105927151	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,0,1
chr14	105929443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	105930923	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr14	105935721	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr14	105945865	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=98,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,4:3,0:6,7,2,2
chr14	105945891	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=48,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,4:0,7:1,1,4,7
chr14	105945892	.	C	CTTCCTT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=82,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:4,7,1,1
chr14	105953474	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	105954705	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:2,9:6,9:4,4,12,6
chr14	105995263	.	A	ACCTGCTGGACAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=175,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr14	105996486	.	A	AGTTTATGGCCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	106054300	.	G	GAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=182,237;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106054300_G_GAGAT:106054300:0,1,0,1
chr14	106054303	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=182,237;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106054300_G_GAGAT:106054300:0,1,0,1
chr14	106066411	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,265;MMQ=39,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr14	106067618	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr14	106090724	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:106090724_C_T:106090724:0,0,3,0
chr14	106090728	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:106090724_C_T:106090724:0,0,3,0
chr14	106090741	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	106091519	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:9,0:0|1:106091519_TG_T:106091519:4,10,1,1
chr14	106091525	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:8,0:0|1:106091519_TG_T:106091519:4,10,1,1
chr14	106092260	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=134,217;MMQ=40,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr14	106110330	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr14	106111210	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	106170671	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=210,172;MMQ=21,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	106170722	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr14	106173530	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,104;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:15,6,2,0
chr14	106206543	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,134;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr14	106207798	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,111;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr14	106207822	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=111,213;MMQ=27,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr14	106208073	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=181,58607;MMQ=32,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0|1:106208073_T_G:106208073:3,5,0,2
chr14	106208075	.	T	TTTGCATGATAAAAAGAATAAG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=181,58607;MMQ=32,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:0|1:106208073_T_G:106208073:3,5,0,2
chr14	106208082	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=160,181;MMQ=60,32;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0|1:106208082_G_T:106208082:0,2,3,1
chr14	106208086	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=19,33;MFRL=160,181;MMQ=60,32;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:0,1:0|1:106208082_G_T:106208082:0,2,3,1
chr14	106209031	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	106232168	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr14	106234314	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr14	106237053	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=126,207;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:8,10,2,0
chr14	106237811	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	106303846	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,14,9
chr14	106303948	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr14	106304672	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=108,234;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:3,2,4,0
chr14	106304717	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=113,1014;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:0,10:4,0:2,3,0,12
chr14	106308334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=104,133;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,0:6,3:4,6,0,3
chr14	106311124	.	T	TCAAAATCCCGCAGATAAGATGACC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=141,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:106311124_T_TCAAAATCCCGCAGATAAGATGACC:106311124:4,0,1,1
chr14	106311126	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,1:2,0:0|1:106311124_T_TCAAAATCCCGCAGATAAGATGACC:106311124:5,0,1,1
chr14	106311133	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,0:2,4:4,0,2,2
chr14	106312018	.	AC	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=162,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:106312018_AC_CA:106312018:3,3,1,1
chr14	106312022	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:3,2:0|1:106312018_AC_CA:106312018:3,5,1,1
chr14	106312025	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:106312018_AC_CA:106312018:3,5,1,1
chr14	106312028	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:0|1:106312018_AC_CA:106312018:3,4,1,1
chr14	106318248	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=111,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,5:4,6:4,5,6,5
chr14	106318440	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,2,3
chr14	106318450	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,2,3
chr14	106329435	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.287:12:6,2:3,1:0|1:106329435_T_G:106329435:6,3,2,1
chr14	106329449	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=99,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:0|1:106329435_T_G:106329435:5,3,2,1
chr14	106329450	.	TGTAGTA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=120,77;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GTA;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr14	106330117	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,1:0|1:106330117_G_A:106330117:1,4,1,1
chr14	106330126	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:106330117_G_A:106330117:1,3,1,1
chr14	106330320	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	106330355	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=84,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:3,4,4,1
chr14	106330370	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr14	106330880	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr14	106330960	.	A	ATGTTCTTCTCATTCCACCATGTTGCTCTCTGGCGACGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	106346990	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:2,6,1,2
chr14	106347467	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr14	106349774	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=78,52;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:8,10,1,1
chr14	106349794	.	C	CAGA	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=84,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:106349794_C_CAGA:106349794:10,10,1,1
chr14	106349796	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=84,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:106349794_C_CAGA:106349794:10,10,1,1
chr14	106349798	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=84,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:0|1:106349794_C_CAGA:106349794:10,10,1,1
chr14	106349827	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=66,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:2,3:3,6:2,3,4,5
chr14	106351927	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=106,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,0:9,12:6,7,12,0
chr14	106354325	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:106354325_C_A:106354325:0,0,1,0
chr14	106354334	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=115,181;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:0,0:0,1:0|1:106354325_C_A:106354325:2,2,1,0
chr14	106354337	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=115,181;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:3,0:1,1:0|1:106354325_C_A:106354325:2,2,1,0
chr14	106354343	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:0,2:1,0,3,2
chr14	106354353	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=160,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:2,2:3,2,4,0
chr14	106354450	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=105,160;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,2,5
chr14	106354474	.	TACAGGAG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=105,150;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,0,4
chr14	106356974	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,2,1
chr14	106357128	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=128,153;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0|1:106357128_G_A:106357128:4,6,0,2
chr14	106357136	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=121,153;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:2,0:0|1:106357128_G_A:106357128:3,6,0,2
chr14	106357198	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=140,103;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr14	106357446	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:6,1,5,0
chr14	106357470	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=112,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,4:2,1:6,3,5,0
chr14	106359259	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	106359327	.	GC	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,121;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,1:2,1,2,1
chr14	106360453	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=145,87;MMQ=41,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr14	106361418	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,10,6
chr14	106361561	.	GC	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,8,4
chr14	106361564	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,8,4
chr14	106363748	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.567:21:5,7:4,5:5,4,6,6
chr14	106366544	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=164,285;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:4,2:0,0:3,2,2,0
chr14	106366574	.	TGGGGGCTGGGCTTGTGGGCGGGGTCTCCTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=123,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr14	106368441	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:3,2:6,0:5,4,1,2
chr14	106368604	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:106368604_A_G:106368604:0,0,1,2
chr14	106368614	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:106368604_A_G:106368604:0,0,1,4
chr14	106369534	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,5,9
chr14	106370603	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:3,2,4,4
chr14	106375882	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=0,150;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:106375882_T_TC:106375882:0,1,1,3
chr14	106375884	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,150;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:106375882_T_TC:106375882:0,1,1,3
chr14	106376144	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=86,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	106376354	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.523:17:4,2:4,6:3,5,1,8
chr14	106378258	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,301;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	106380174	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,8,14
chr14	106382685	.	G	GGTTAGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=69,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:5,8,1,1
chr14	106382687	.	C	T,CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25,20;MFRL=74,69,50;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.23,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,2:0.333,0.167:15:5,1,2:3,4,0:4,4,2,5
chr14	106385245	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr14	106385332	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,2,1
chr14	106388221	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=168,132;MMQ=50,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr14	106388345	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,123;MMQ=53,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:10,2,2,0
chr14	106478290	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=103,79;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:11,5:11,0:10,12,5,1
chr14	106478311	.	A	ACCACTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=106,146;MMQ=49,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:3,7,1,1
chr14	106478464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=193,137;MMQ=40,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,5:1,4:2,1,4,5
chr14	106478637	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr14	106494123	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.224:37:15,7:13,0:14,15,8,0
chr14	106518565	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=90,110;MMQ=60,59;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,42:0.814:51:2,34:7,7:4,5,1,41
chr14	106518738	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.631:28:7,5:3,12:5,5,9,9
chr14	106518930	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr14	106573482	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=63,126;MMQ=52,23;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:106573482_T_C:106573482:7,3,0,2
chr14	106573491	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=57,126;MMQ=37,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:106573482_T_C:106573482:8,3,0,2
chr14	106573559	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=107,146;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,0:10,8:10,4,6,2
chr14	106622037	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=116,107;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,0:13,3:10,9,3,0
chr14	106622428	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	106667600	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:4,7,1,1
chr14	106667902	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr14	106668098	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr14	106668130	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	106668156	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,0,5
chr14	106668160	.	C	CATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,0,5
chr14	106691620	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	106691868	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,160;MMQ=42,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:106691868_GC_G:106691868:6,2,0,2
chr14	106691871	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=161,160;MMQ=43,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,1:0|1:106691868_GC_G:106691868:6,3,0,2
chr14	106691875	.	CT	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=168,160;MMQ=40,45;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0|1:106691868_GC_G:106691868:5,1,0,2
chr14	106725145	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=36,125;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,0:1,2:3,1,2,0
chr14	106733216	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=121,115;MMQ=60,47;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:4,6:7,1:0|1:106733216_T_C:106733216:5,6,1,6
chr14	106733223	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=123,115;MMQ=60,46;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,5:6,0:0|1:106733216_T_C:106733216:5,7,1,4
chr14	106733228	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=121,122;MMQ=60,46;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:0|1:106733216_T_C:106733216:3,6,1,4
chr14	106733254	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=114,146;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:0|1:106733254_G_C:106733254:3,10,0,4
chr14	106733261	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=121,146;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:3,2:9,1:0|1:106733254_G_C:106733254:4,9,0,4
chr14	106733287	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=134,184;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:106733287_A_C:106733287:2,5,0,2
chr14	106733289	.	CC	AG	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=134,184;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:106733287_A_C:106733287:2,5,0,2
chr14	106733437	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=90,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:15,3:10,4:0|1:106733437_G_C:106733437:15,10,4,3
chr14	106733458	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=98,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:16,4:8,5:0|1:106733437_G_C:106733437:14,14,4,5
chr14	106733461	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:16,5:9,5:0|1:106733437_G_C:106733437:12,13,4,6
chr14	106733463	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:16,5:9,5:0|1:106733437_G_C:106733437:12,13,4,6
chr14	106733520	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=129,117;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:8,5:9,2:0|1:106733520_C_A:106733520:5,12,5,2
chr14	106733532	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=129,123;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:8,4:8,2:0|1:106733520_C_A:106733520:7,10,5,1
chr14	106733555	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=138,135;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:13,4:7,3:0|1:106733520_C_A:106733520:11,9,4,3
chr14	106733592	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=101,70;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.337:33:9,7:13,3:13,9,5,6
chr14	106733638	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=85,173;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:10,2:19,0:6,25,1,2
chr14	106733653	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=24,31;MFRL=83,173;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,3:8,0:4,8,1,2
chr14	106733679	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=138,173;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,3:6,0:0|1:106733679_G_C:106733679:2,5,1,2
chr14	106733682	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=138,173;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:4,0:0|1:106733679_G_C:106733679:2,5,1,2
chr14	106758130	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:5,9,1,1
chr14	106780996	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=113,167;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:6,3,3,0
chr14	106781030	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=99,106;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.353:9:5,1:1,2:4,2,2,1
chr14	106791119	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=133,144;MMQ=49,57;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:3,5,4,7
chr14	106791200	.	GC	AG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,156;MMQ=27,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:6,3,4,6
chr14	106805202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=136,155;MMQ=50,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:5,0,0,2
chr14	106805212	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=128,155;MMQ=51,39;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:2,4,3,0
chr14	106805242	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=152,136;MMQ=60,39;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:2,2:2,0:2,3,3,0
chr14	106805278	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=181,110;MMQ=60,29;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,2,2
chr14	106805380	.	GT	TG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=104,133;MMQ=60,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0|1:106805380_GT_TG:106805380:5,4,2,0
chr14	106805386	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=103,133;MMQ=60,32;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:6,0:4,2:0|1:106805380_GT_TG:106805380:5,5,2,0
chr14	106805402	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=21,27;MFRL=104,98;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,3:3,2:4,5,3,2
chr14	106805439	.	TA	CG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=109,98;MMQ=40,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:5,2,3,3
chr14	106805440	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr14	106805508	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr14	106805729	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=94,134;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,2:13,1:14,13,3,0
chr14	106805772	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,15:0,6:0,0,11,10
chr14	106815662	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	106815970	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=146,156;MMQ=27,30;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,6:0,3,3,5
chr14	106816057	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=185,178;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr14	106845308	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr14	106845344	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,1:8,1:7,3,2,0
chr14	106866427	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=53,94;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.291:15:3,3:8,1:0|1:106866427_G_A:106866427:9,2,2,2
chr14	106866434	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=75,132466;MMQ=60,29;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:8,1:0|1:106866427_G_A:106866427:9,3,1,1
chr14	106866439	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=97,132466;MMQ=60,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:0|1:106866427_G_A:106866427:8,3,1,1
chr14	106866449	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=97,127;MMQ=60,32;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:3,2:6,1:0|1:106866427_G_A:106866427:8,3,2,1
chr14	106866465	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=97,62;MMQ=60,42;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:9,2:7,4:10,7,3,3
chr14	106866654	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=89,168;MMQ=59,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,0:8,5:4,6,2,3
chr14	106866668	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=177,168;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:2,1:5,3:0|1:106866668_C_A:106866668:5,2,3,2
chr14	106866675	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=177,179;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:0|1:106866668_C_A:106866668:5,2,4,2
chr14	106866748	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=20,23;MFRL=92,31;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.417:29:5,3:11,8:8,9,7,5
chr14	106866810	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=85,107;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:10,4:11,7:11,10,4,7
chr14	106866822	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=83,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,3:8,6:7,8,3,6
chr14	106866865	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=57,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.438:21:4,3:7,6:0|1:106866865_G_C:106866865:5,7,3,6
chr14	106866869	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=27,22;MFRL=57,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.438:21:4,3:7,5:0|1:106866865_G_C:106866865:5,7,3,6
chr14	106866891	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=32,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0|1:106866891_G_T:106866891:3,6,1,4
chr14	106866893	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=28,21;MFRL=32,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,2:4,3:0|1:106866891_G_T:106866891:3,6,1,4
chr14	106877551	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	106877700	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=114,129;MMQ=52,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:7,4,6,0
chr14	106877796	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,6:5,2:3,4,1,7
chr14	106877818	.	CTA	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=131,137;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:3,4:7,0:0|1:106877818_CTA_C:106877818:6,4,0,5
chr14	106877821	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=131,137;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:3,5:7,0:0|1:106877818_CTA_C:106877818:6,4,0,5
chr14	106877836	.	CC	TA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=120,142;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:9,3,0,4
chr14	106878067	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:106878067_T_G:106878067:7,10,1,1
chr14	106878071	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:106878067_T_G:106878067:7,10,1,1
chr14	106878131	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=91,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:4,3:4,7,3,3
chr14	106878169	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=145,130;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:106878169_G_T:106878169:3,4,2,0
chr14	106878179	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=160,130;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:106878169_G_T:106878169:3,3,2,0
chr14	106926145	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=89,189;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:4,5,3,0
chr14	106926167	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=95,174;MMQ=52,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:0|1:106926167_G_A:106926167:4,7,6,0
chr14	106926176	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=107,158;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,4:8,3:0|1:106926167_G_A:106926167:5,9,7,0
chr14	106926206	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=119,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:14,5:11,3:16,9,7,1
chr14	106926223	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=72,128;MMQ=60,43;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.195:34:16,4:11,2:18,10,4,2
chr14	106926388	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=146,193;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:6,3:17,4:13,10,2,5
chr14	106926649	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=78,191;MMQ=60,43;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:11,3:7,4:0|1:106926649_C_A:106926649:6,12,3,4
chr14	106926651	.	TTC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=78,191;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:11,3:6,3:0|1:106926649_C_A:106926649:6,13,3,4
chr14	106963443	.	TA	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,53;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0,10,1,1
chr14	106993757	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,165;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	106993886	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr14	106994184	.	C	CCACACACACATACAAACCACATA,CCACACACACATCGAACACACCACATA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20,21;MFRL=100,37,66;MMQ=60,60,60;MPOS=5,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.53,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,2,2:0.117,0.114:25:7,2,2:14,0,0:7,14,2,2
chr14	107012852	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	107034652	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=199,188;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0|1:107034652_A_T:107034652:4,0,3,0
chr14	107034659	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=197,188;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:1,2:0|1:107034652_A_T:107034652:5,0,3,0
chr14	107034665	.	TCA	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=26,24;MFRL=180,188;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:0|1:107034652_A_T:107034652:6,1,3,0
chr14	107034668	.	T	TCC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=24,24;MFRL=180,188;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:0|1:107034652_A_T:107034652:6,1,3,0
chr14	107034679	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,25;MFRL=158,215;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0|1:107034679_C_T:107034679:6,1,2,0
chr14	107034681	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=158,215;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:107034679_C_T:107034679:6,1,2,0
chr14	107034705	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:107034705_G_A:107034705:8,1,1,1
chr14	107034707	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,1:4,0:0|1:107034705_G_A:107034705:8,1,1,1
chr14	107034807	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,7:8,2:4,7,4,5
chr14	107034822	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:2,6,4,4
chr14	107034846	.	TC	GT	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:6,4:2,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:3,5,3,4
chr14	107034854	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:8,4:2,1:0|1:107034846_TC_GT:107034846:4,7,2,3
chr14	107034863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,23;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,1:5,1:0|1:107034846_TC_GT:107034846:6,7,2,1
chr14	107034869	.	AG	CA	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,3:6,0:0|1:107034846_TC_GT:107034846:6,7,3,2
chr14	107034873	.	GA	CC	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:7,3:7,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:7,8,3,2
chr14	107035002	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=25,29;MFRL=98,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,5:5,1:8,4,3,3
chr14	107035020	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:9,4:5,2:8,6,4,2
chr14	107035038	.	GG	AT	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=94,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:0|1:107035038_GG_AT:107035038:7,5,3,2
chr14	107035042	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=94,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:6,2:5,3:0|1:107035038_GG_AT:107035038:7,5,3,2
chr14	107035064	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:10,1:4,3:0|1:107035064_G_A:107035064:7,7,2,2
chr14	107035066	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=27,28;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:10,1:4,3:0|1:107035064_G_A:107035064:9,7,2,2
chr14	107035068	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,1:5,3:0|1:107035064_G_A:107035064:9,7,2,2
chr14	107035163	.	GA	CC	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=20,31;MFRL=106,120;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,3:8,0:0|1:107035163_GA_CC:107035163:10,9,1,2
chr14	107035168	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=20,23;MFRL=106,120;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:7,3:11,0:0|1:107035163_GA_CC:107035163:10,9,1,2
chr14	107035182	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=20,31;MFRL=86,120;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:7,9,1,2
chr14	107048608	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=140,226;MMQ=40,32;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	107048702	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr14	107048749	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=110,133;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr14	107049033	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=129,118;MMQ=40,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:107049033_GT_AC:107049033:3,0,1,0
chr14	107049037	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,118;MMQ=40,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:107049033_GT_AC:107049033:4,0,1,0
chr14	107078609	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:3,3,2,1
chr14	107082637	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=109,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:4,10:6,4:3,8,10,4
chr14	107083138	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=249,195;MMQ=56,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:107083138_C_A:107083138:2,0,2,0
chr14	107083151	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:0|1:107083138_C_A:107083138:3,0,3,0
chr14	107083453	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=108,115;MMQ=43,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.425:38:16,6:6,10:8,14,8,8
chr14	107083516	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=197,179;MMQ=40,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:2,4,2,0
chr14	107083547	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=175,170;MMQ=34,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr14	107083588	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=162,93;MMQ=32,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:5,5,3,1
chr14	107083591	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=23,25;MFRL=162,93;MMQ=32,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:5,5,3,1
chr14	107083602	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=148,97;MMQ=36,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:9,2:5,4:9,5,3,3
chr14	107083633	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=81,136;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.934:27:0,13:1,13:1,0,15,11
chr14	107083725	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=147,113;MMQ=33,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:12,4:13,4:16,9,3,5
chr14	107083740	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,13,17
chr14	107095297	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=306,77;MMQ=40,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,5,2
chr14	107095319	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=20,25;MFRL=87,92;MMQ=36,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:0,1,5,3
chr14	107095338	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=281,107;MMQ=60,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,4,3
chr14	107095356	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=148,101;MMQ=36,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,2,2
chr14	107095377	.	CC	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=148,150;MMQ=25,38;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr14	107095457	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=148,169;MMQ=25,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:107095457_G_C:107095457:1,2,0,1
chr14	107095467	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=142,169;MMQ=25,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107095457_G_C:107095457:0,2,0,1
chr14	107095498	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,306;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	107095500	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=158,306;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:107095500_T_G:107095500:0,1,0,1
chr14	107095503	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=158,306;MMQ=27,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:107095500_T_G:107095500:0,1,0,1
chr14	107095601	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	107095616	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr14	107113640	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	107113968	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=101,78;MMQ=49,48;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,3:15,0:11,10,1,2
chr14	107114009	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=276,158;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.793:8:0,3:1,4:0,1,4,3
chr14	107114193	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:1,6:0,19:0,1,6,19
chr14	107130977	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,42;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	107131007	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:107131007_G_A:107131007:0,0,2,0
chr14	107131015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:107131007_G_A:107131007:0,0,2,0
chr14	107131034	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:107131034_C_T:107131034:0,0,2,1
chr14	107131037	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:107131034_C_T:107131034:0,0,2,1
chr14	107131089	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=23,21;MFRL=98,88;MMQ=40,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:4,3,1,3
chr14	107131246	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	107131357	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	107131394	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=225,190;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:107131394_G_A:107131394:1,0,2,0
chr14	107131396	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=225,190;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:107131394_G_A:107131394:1,0,2,0
chr14	107131410	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=225,176;MMQ=40,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:107131394_G_A:107131394:1,0,4,0
chr14	107169846	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=221,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:3,2:8,0,4,1
chr14	107170043	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=108,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.373:46:18,0:10,16:8,21,0,17
chr14	107170055	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=38,25;MFRL=73,143;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:13,5:21,3:0|1:107170055_G_A:107170055:5,30,4,4
chr14	107170062	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.398:23:9,6:5,3:0|1:107170055_G_A:107170055:5,9,4,5
chr14	107170077	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:9,8,4,3
chr14	107170398	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr14	107170410	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=69,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,3:0,3:1,1,2,4
chr14	107178748	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,6,0
chr14	107178770	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,9,1
chr14	107178773	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,10,2
chr14	107178775	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,4:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,11,3
chr14	107178795	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,10,6
chr14	107178832	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=70,115;MMQ=60,46;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,28:0.830:33:5,17:0,11:4,1,12,16
chr14	107179106	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,132;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:3,3,2,2
chr14	107198866	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr14	107199077	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.189:18:10,2:5,1:8,7,2,1
chr14	107211211	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0,0,8,4
chr14	107283076	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=77,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,8:7,4:5,6,4,8
chr14	107283105	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,6:0,0,9,12
chr14	107283150	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=35,23;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,11:0,6:1,0,9,9
chr14	107283156	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=21,31;MFRL=105,159;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,6:3,2:0|1:107283156_A_G:107283156:4,4,3,5
chr14	107283160	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=105,159;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,6:5,2:0|1:107283156_A_G:107283156:4,4,3,5
chr15	20636520	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=213,190;MMQ=24,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr15	20642458	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=147,158;MMQ=25,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:3,1,2,0
chr15	20642695	.	A	ACGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,212;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20642695_A_ACGC:20642695:0,0,0,1
chr15	20642697	.	A	ATGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,212;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20642695_A_ACGC:20642695:0,0,0,1
chr15	20642699	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20642695_A_ACGC:20642695:0,0,0,1
chr15	20645902	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,196;MMQ=25,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr15	20657629	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=228,159;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,2:2,0:5,0,3,0
chr15	20657855	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,97;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr15	20666397	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,136;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.563:10:3,2:1,4:3,1,4,2
chr15	20740129	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=146,92;MMQ=39,37;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:2,2,3,1
chr15	22369248	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr15	22382728	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=109,148;MMQ=38,33;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr15	22382739	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	22382828	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=125,198;MMQ=55,43;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:3,4,1,1
chr15	22382897	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:5,5:11,4:8,8,6,3
chr15	22413954	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,110;MMQ=46,47;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,4:8,5:3,8,5,4
chr15	22414005	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=132,110;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,4:2,3:4,6,4,3
chr15	22414393	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31,20;MFRL=69,164,112;MMQ=60,51,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.58,12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,9:0.173,0.616:14:1,2,8:2,0,0:2,1,2,9
chr15	22836143	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:15,0:11,4:16,10,2,2
chr15	22929905	.	CA	GG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=107,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:0,6:4,4:0|1:22929905_CA_GG:22929905:0,5,4,6
chr15	22929907	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=96,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,4:0.294:15:6,0:4,4:1|0:22929905_CA_GG:22929905:4,7,0,4
chr15	22933486	.	C	CTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,0;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=24,27;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr15	22933511	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=74,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:2,1:4,3:0|1:22933511_A_T:22933511:0,7,0,4
chr15	22933528	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=93,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:9,1:4,3:0|1:22933511_A_T:22933511:0,14,0,5
chr15	22933691	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:2,1:1,1:2,1,2,1
chr15	22933727	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,7:2,0:7,0,7,0
chr15	22933932	.	TC	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22933932_TC_CA:22933932:0,1,0,1
chr15	22933936	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22933932_TC_CA:22933932:0,1,0,1
chr15	22940670	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:3,0,5,2
chr15	22955114	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	22955307	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,1:1,3,0,3
chr15	22958104	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr15	22958151	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr15	22960700	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr15	22960868	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,6:6,7:2,5,5,8
chr15	22962184	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:4,3,3,1
chr15	22999239	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=189,251;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	22999254	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=189,251;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22999254_G_A:22999254:1,0,1,0
chr15	22999259	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=189,251;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22999254_G_A:22999254:1,0,1,0
chr15	22999261	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=189,251;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	23000272	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	23006215	.	CCTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=91,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:2,1:5,3,2,2
chr15	23006260	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:4,2:5,15,0,2
chr15	23019824	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:0|1:23019824_A_AG:23019824:2,5,1,1
chr15	23019827	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:23019824_A_AG:23019824:2,5,1,1
chr15	23019829	.	T	TTAAAG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:23019824_A_AG:23019824:2,5,1,1
chr15	23019830	.	C	CCTGTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:23019824_A_AG:23019824:2,5,1,1
chr15	23021113	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	23021285	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,205;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:6,3,0,3
chr15	23048804	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=187,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,1,2
chr15	23052575	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:3,2,2,0
chr15	23060855	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=72,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.197:20:10,0:6,2:8,8,0,4
chr15	23260803	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=207,173;MMQ=27,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:23260803_C_T:23260803:1,6,0,2
chr15	23260816	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=216,173;MMQ=27,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:23260803_C_T:23260803:1,5,0,2
chr15	23811268	.	G	GGTGGACTCTGCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr15	24922328	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=11,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:0|1:24922328_C_T:24922328:3,6,0,2
chr15	24922338	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=75,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0|1:24922328_C_T:24922328:3,5,0,2
chr15	24925129	.	GGTTTGTTTGTTT	G	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=GTTT;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.156:24:13,3:6,0:14,7,1,2
chr15	24925167	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:13,2:1,0:2,12,1,1
chr15	24925286	.	G	GCACC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=240,207;MMQ=56,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24925286_G_GCACC:24925286:0,1,0,1
chr15	24925289	.	T	TCACC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=240,207;MMQ=56,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24925286_G_GCACC:24925286:0,1,0,1
chr15	24925292	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=240,207;MMQ=56,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24925286_G_GCACC:24925286:0,1,0,1
chr15	24925308	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,240;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	24925731	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=129,0;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr15	24925755	.	TTGTG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=159,65;MMQ=60,54;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr15	24926565	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=183,801;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,8:3,0:2,4,0,8
chr15	25219512	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr15	25220734	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:25220734_C_CTT:25220734:1,2,0,1
chr15	25220735	.	C	CGTATGAATCTAGACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:25220734_C_CTT:25220734:1,2,0,1
chr15	25620975	.	TATC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,316;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	25650695	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,3:5,0:2,6,0,3
chr15	25650710	.	A	ATGTCAGCTGGGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr15	25925195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr15	25925918	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=219,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	25937004	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr15	25947018	.	GA	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,140;MMQ=60,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr15	25961964	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr15	25962151	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=203,155;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr15	25963545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=191,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:1,0:2,2:0|1:25963545_C_T:25963545:1,3,1,1
chr15	25963548	.	TGCGGGG	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=194,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:1,0:2,2:0|1:25963545_C_T:25963545:1,5,1,1
chr15	25963599	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	25967085	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr15	25972222	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=146,172;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:3,0,1,0
chr15	25972234	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=154,172;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:5,0,1,0
chr15	25972434	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=110,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,3:6,1:6,13,0,4
chr15	25981190	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr15	25981367	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	26026139	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,5:0,1:0,1,6,0
chr15	26806064	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=62,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,6:5,11:5,2,10,7
chr15	26812922	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26812922_T_C:26812922:0,3,0,1
chr15	26812924	.	G	GGACCAACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26812922_T_C:26812922:0,3,0,1
chr15	26812948	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=231,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26812948_T_A:26812948:0,1,0,1
chr15	26812950	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=231,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26812948_T_A:26812948:0,1,0,1
chr15	26812953	.	T	TGTATAGGCTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=231,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26812948_T_A:26812948:0,1,0,1
chr15	26866707	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,34;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:26866707_G_C:26866707:0,1,0,1
chr15	26866709	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26866707_G_C:26866707:0,1,0,1
chr15	26866711	.	G	GTCTTTTTTAAAAATTGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26866707_G_C:26866707:0,1,0,1
chr15	27185306	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27185306_C_A:27185306:0,0,0,1
chr15	27185309	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27185306_C_A:27185306:0,0,0,1
chr15	27185312	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27185306_C_A:27185306:0,0,0,1
chr15	27185315	.	T	TGAGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27185306_C_A:27185306:0,0,0,1
chr15	27188607	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27188607_C_CCT:27188607:2,1,0,1
chr15	27188610	.	T	TTCCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27188607_C_CCT:27188607:2,1,0,1
chr15	27188613	.	A	AGGTATCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27188607_C_CCT:27188607:2,1,0,1
chr15	27222098	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr15	27572119	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=65,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.271:31:15,0:8,8:8,15,0,8
chr15	27725871	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=94,108;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:8,11,4,0
chr15	27772505	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=243,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:0,4:2,3:2,0,7,1
chr15	28096453	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr15	28096538	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,4:2,4:5,5,3,5
chr15	28116275	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=206,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,8:1,0:4,1,3,5
chr15	28200408	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,10,11
chr15	28211758	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	28228644	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr15	28230378	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,175;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr15	28234888	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	28235773	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,4,5
chr15	28267772	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=66,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr15	28356859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr15	28357230	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr15	28359744	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr15	28361764	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr15	28370102	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr15	28370409	.	CCCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr15	28377196	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	28377246	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:9,3,0,3
chr15	28377772	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr15	28380705	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=81,54;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0|1:28380705_T_C:28380705:6,13,1,1
chr15	28380716	.	A	AGTTGATCGCATCGGCTCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=108,54;MMQ=60,41;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:0|1:28380705_T_C:28380705:6,10,1,1
chr15	28386619	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=97,15;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:11,8,4,0
chr15	28387425	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=101,100;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:21,6:14,0:18,19,6,0
chr15	28387920	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=97,185;MMQ=40,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr15	28391318	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,101;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,7:5,0:10,0,7,0
chr15	28419497	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	28459014	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=148,48;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:28459014_G_T:28459014:9,13,1,1
chr15	28459020	.	G	GTTCACACCATTCTCCTGC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,48;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:0|1:28459014_G_T:28459014:11,13,1,1
chr15	28459022	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=171,48;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:28459014_G_T:28459014:9,13,1,1
chr15	28460029	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=199,230;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28460029_A_C:28460029:0,1,0,1
chr15	28460047	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28460029_A_C:28460029:0,0,0,1
chr15	28460755	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=176,61;MMQ=40,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:28460755_GCA_G:28460755:7,1,1,1
chr15	28460758	.	G	GTAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=176,61;MMQ=40,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:28460755_GCA_G:28460755:7,1,1,1
chr15	28473275	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	28478303	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,140;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:7,7,1,1
chr15	28491835	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:9,2,0,2
chr15	28492022	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,4:13,0:12,11,4,0
chr15	28516084	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	28517539	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=165,159;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:3,3:11,0:0|1:28517539_G_A:28517539:0,14,0,3
chr15	28517546	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=151,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:3,3:10,0:0|1:28517539_G_A:28517539:0,13,0,3
chr15	28517555	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=163,172;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr15	28518102	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=34,78;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0|1:28518102_C_T:28518102:3,3,2,1
chr15	28518112	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=34,78;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0|1:28518102_C_T:28518102:3,3,2,1
chr15	28518114	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=34,78;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,0:4,3:0|1:28518102_C_T:28518102:3,3,2,1
chr15	28518126	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=112,78;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,0:4,3:0|1:28518126_G_A:28518126:2,2,2,1
chr15	28518130	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=157,78;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:28518126_G_A:28518126:2,1,2,1
chr15	28518135	.	CG	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=166,78;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0|1:28518126_G_A:28518126:1,1,2,1
chr15	29385204	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	29386453	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=84,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,6:6,2:5,4,6,2
chr15	29386535	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.175:43:20,0:15,7:22,14,2,5
chr15	29386593	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=64,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.924:24:2,14:0,6:1,1,6,16
chr15	29390858	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	29390871	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29390871_T_G:29390871:0,1,0,1
chr15	29390873	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29390871_T_G:29390871:0,1,0,1
chr15	29390877	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29390871_T_G:29390871:0,1,0,1
chr15	29390881	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29390871_T_G:29390871:0,1,0,1
chr15	29397773	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:0,1:2,0:0|1:29397773_C_A:29397773:0,2,0,1
chr15	29397776	.	C	CACATACACATATATATATACCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:29397773_C_A:29397773:0,2,0,1
chr15	29398781	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,1:2,6:6,1,7,0
chr15	29398919	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:3,6,0,2
chr15	29418573	.	AT	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr15	29418728	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:0|1:29418728_G_A:29418728:6,15,1,1
chr15	29418732	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:0|1:29418728_G_A:29418728:6,15,1,1
chr15	29418745	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr15	29428556	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	29429492	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr15	29444130	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	29561840	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,2,1
chr15	29561866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=88,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,3:3,2:1,2,3,3
chr15	29996321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=205,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:1,1,4,1
chr15	30018553	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr15	30020106	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr15	30025540	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr15	30034910	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,4:10,4:10,8,5,3
chr15	30675629	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=241,127;MMQ=30,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30675629_GG_AA:30675629:0,1,0,1
chr15	30675632	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=241,127;MMQ=30,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30675629_GG_AA:30675629:0,1,0,1
chr15	30923064	.	CT	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=143,129;MMQ=30,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:7,3:3,0:0|1:30923064_CT_TC:30923064:2,9,0,3
chr15	30923068	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=143,129;MMQ=30,27;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,1:4,0:0|1:30923064_CT_TC:30923064:2,11,0,3
chr15	30927829	.	TGTAGGAG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,127;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:2,9,1,1
chr15	31206394	.	C	CTCTCAAATATCTGAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	31212684	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr15	31214545	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.184:24:10,4:10,0:6,14,1,3
chr15	31214649	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr15	31218164	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr15	31220709	.	T	TTGTGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=TG;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.614:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr15	31222930	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:3,10,1,2
chr15	31244263	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:1,1:10,1:2,9,0,2
chr15	31245880	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:0,7,0,6
chr15	31247102	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:9,11,1,1
chr15	31251333	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=143,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.377:17:6,4:4,2:2,9,2,4
chr15	31251355	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:0|1:31251355_CTG_C:31251355:0,13,1,1
chr15	31251359	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=148,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:31251355_CTG_C:31251355:0,13,1,1
chr15	31251364	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=152,58;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:31251355_CTG_C:31251355:0,12,1,1
chr15	31251366	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr15	31267147	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:9,10:8,5:6,11,9,6
chr15	31283136	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr15	31294200	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:10,9,1,3
chr15	31341516	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.647:6:0,2:1,2:2,0,4,0
chr15	31341617	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:5,12,1,2
chr15	31352709	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:7,2,2,0
chr15	31369223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	31793930	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr15	31796007	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr15	31819599	.	G	GCACCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	31862448	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	32393486	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.712:7:1,3:1,1:2,0,2,3
chr15	32393663	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:32393663_C_A:32393663:0,0,0,3
chr15	32393672	.	C	CCCCACACATTGGAACAACTATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32393663_C_A:32393663:0,2,0,1
chr15	32393675	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32393663_C_A:32393663:0,2,0,1
chr15	32403987	.	TCA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:7,0:0|1:32403987_TCA_T:32403987:4,6,1,1
chr15	32403992	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:32403987_TCA_T:32403987:4,5,1,1
chr15	32403993	.	T	TGTGTTTGTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:0|1:32403987_TCA_T:32403987:3,5,1,1
chr15	32451772	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32451772_A_T:32451772:0,0,0,1
chr15	32451774	.	A	AGGGTTAGGGTTAGGGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32451772_A_T:32451772:0,0,0,1
chr15	32915772	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=137,158;MMQ=39,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:3,8,1,1
chr15	32915870	.	T	TGGGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=151,197;MMQ=34,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32915870_T_TGGGTG:32915870:0,2,0,1
chr15	32915872	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=151,197;MMQ=34,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32915870_T_TGGGTG:32915870:0,2,0,1
chr15	32926065	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr15	32926076	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr15	32927959	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:10,3:5,1:14,1,4,0
chr15	32971934	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,4:2,4:4,2,5,3
chr15	32983999	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,18:0.289:60:30,0:12,13:13,29,0,18
chr15	33022948	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=138,29;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:11,0:7,1:8,10,2,1
chr15	33022950	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=130,29;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:7,1:0|1:33022950_C_A:33022950:9,10,1,1
chr15	33022951	.	G	GAT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,29;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:33022950_C_A:33022950:9,10,1,1
chr15	33023623	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=104,263;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:8,4,2,0
chr15	33023951	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr15	33024702	.	A	AGATCACTCAGCTACAAAGTGTGAAACGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=171,66;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:2,3,1,1
chr15	33066478	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,2:4,2:7,6,2,2
chr15	33096543	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:0|1:33096543_A_G:33096543:4,5,2,3
chr15	33096560	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,9:0.527:17:2,5:6,4:1|0:33096543_A_G:33096543:4,4,1,8
chr15	33191023	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:3,0:4,4:3,4,3,2
chr15	33192249	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:0|1:33192249_A_C:33192249:6,7,0,2
chr15	33192251	.	T	TCCCC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,0:5,2:0|1:33192249_A_C:33192249:6,7,0,2
chr15	33200825	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=164,144;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33200825_G_A:33200825:1,1,0,1
chr15	33200827	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=164,144;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:33200825_G_A:33200825:1,1,0,1
chr15	33200830	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=144,168;MMQ=40,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:33200830_G_A:33200830:0,1,0,1
chr15	33200832	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33200830_G_A:33200830:0,0,0,1
chr15	33202602	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=37,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr15	33256217	.	T	TACACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=AC;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,0:0,1:0,0,7,0
chr15	33261011	.	CCAAGTCCAAAGAAGAGTCCAGGGGGAGGTGGGGGTG	C,TCAAGTCCAAAGAAGAGTCCAGGGGGAGGTGGGGGTG	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=30,20,20;MFRL=57,67,76;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.31,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.138,0.216:19:7,0,0:6,2,4:7,6,3,3
chr15	33261040	.	TGGG	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:2,2,0,2
chr15	33261047	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:2,2,0,2
chr15	33261049	.	AAGTCC	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=21,26;MFRL=34,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:3,3,0,2
chr15	33261058	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:1,1,0,2
chr15	33261067	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,31;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:0,1,0,2
chr15	33261070	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:33261040_TGGG_T:33261040:0,1,0,2
chr15	33261413	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:19,2:6,0:0|1:33261413_G_A:33261413:11,14,1,1
chr15	33261423	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:21,2:5,0:0|1:33261413_G_A:33261413:11,15,1,1
chr15	33359208	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.499:28:7,7:7,7:5,9,8,6
chr15	33765761	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	33795775	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=110,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr15	33795950	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=97,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:2,9,5,3
chr15	33833169	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33833173	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33833176	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33833179	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33833181	.	C	CAACTATT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33833184	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33833169_T_A:33833169:0,1,0,1
chr15	33858935	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,6:0,0,9,11
chr15	33872143	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr15	33872438	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	33873656	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr15	33873751	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr15	33873901	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	33893567	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.851:29:1,0:2,23:4,0,24,1
chr15	33893659	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=99,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,3:9,5:6,9,4,4
chr15	33893769	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr15	33893828	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	33905634	.	C	CCATGCCCGGCTAATTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=209,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr15	33920662	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr15	33923314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	33925364	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	33928781	.	C	CACAGAGACCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr15	33938587	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:6,2:4,0:0|1:33938587_G_A:33938587:6,4,1,1
chr15	33938588	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:0|1:33938587_G_A:33938587:6,4,1,1
chr15	33938589	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:0|1:33938587_G_A:33938587:6,4,1,1
chr15	33938592	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=163,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:0|1:33938587_G_A:33938587:5,4,1,1
chr15	33951910	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:5,4,1,5
chr15	33952707	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=243,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	33954652	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr15	33961633	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:7,7,1,2
chr15	33962559	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr15	33990151	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:7,13,1,1
chr15	33990203	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=164,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:0,2:0|1:33990203_G_T:33990203:3,18,1,1
chr15	33990211	.	GA	AG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=164,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:33990203_G_T:33990203:2,17,1,1
chr15	33990250	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr15	33990294	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	33991877	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,3:6,0:6,2,3,0
chr15	34014913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr15	34016274	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=125,97;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:4,2,2,2
chr15	34030865	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	34049612	.	TAAATGAACC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:6,2:17,4,1,1
chr15	34049615	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:2,10:4,2:6,0,10,2
chr15	34060740	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr15	34064043	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	34065638	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=182,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:34065638_C_T:34065638:4,0,1,0
chr15	34065657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=195,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:34065638_C_T:34065638:4,0,1,0
chr15	34065658	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:4,0,1,0
chr15	34065755	.	T	TTTATTCCTCTTTTTTTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=159,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:0|1:34065755_T_TTTATTCCTCTTTTTTTG:34065755:4,5,1,1
chr15	34065757	.	C	CATATGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:6,0:0|1:34065755_T_TTTATTCCTCTTTTTTTG:34065755:4,5,1,1
chr15	34078171	.	A	AATCATCACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34078171_A_AATCATCACT:34078171:2,0,0,1
chr15	34078174	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34078171_A_AATCATCACT:34078171:2,0,0,1
chr15	34078176	.	C	CCCTTAAATGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34078171_A_AATCATCACT:34078171:2,0,0,1
chr15	34080743	.	GTTGTTAACA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34080743_GTTGTTAACA_G:34080743:0,1,0,1
chr15	34080758	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34080743_GTTGTTAACA_G:34080743:0,1,0,1
chr15	34094048	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:4,6,1,1
chr15	34103272	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr15	34105269	.	G	GATTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:34105269_G_GATTA:34105269:0,2,0,2
chr15	34105270	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:34105269_G_GATTA:34105269:0,2,0,2
chr15	34105274	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:34105269_G_GATTA:34105269:0,2,0,2
chr15	34111876	.	AAAATAAATAAATAAATAAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,6;RU=AAAT;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	34112906	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,3:1,0:2,2,3,1
chr15	34113454	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr15	34113536	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=82,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:3,5,5,6
chr15	34113620	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=98,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr15	34115088	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr15	34117914	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:34117914_T_G:34117914:1,3,0,1
chr15	34117916	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:34117914_T_G:34117914:0,3,0,1
chr15	34117947	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr15	34118368	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=102,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,7:1,2:5,0,8,1
chr15	34118396	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:8,10:2,1:8,2,9,2
chr15	34118994	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,1,6
chr15	34119338	.	GGGCAT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr15	34133130	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr15	34133190	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=213,155;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:34133190_T_A:34133190:0,3,0,2
chr15	34133193	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=213,155;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:34133190_T_A:34133190:0,3,0,2
chr15	34133200	.	CTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=190,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0|1:34133200_CTTG_C:34133200:0,2,0,1
chr15	34133204	.	AACCC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=190,116;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34133200_CTTG_C:34133200:0,2,0,1
chr15	34136971	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	34140479	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:2,0,3,2
chr15	34146886	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr15	34146922	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,9,7
chr15	34151901	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=111,84;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:2,5,1,3
chr15	34152697	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr15	34156284	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:2,0,2,3
chr15	34156312	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=205,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:3,0,1,5
chr15	34157277	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr15	34157436	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=73,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr15	34157486	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0|1:34157486_C_T:34157486:0,3,0,2
chr15	34157488	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:34157486_C_T:34157486:0,3,0,2
chr15	34158981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr15	34355643	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=123,114;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,2,0
chr15	34355670	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,114;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr15	34356988	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr15	34380216	.	TAA	T,TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,25,25;MFRL=135,150,105;MMQ=60,60,60;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.41,7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,6:0.135,0.245:26:7,3,3:9,1,3:9,7,7,3
chr15	34397866	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr15	34398281	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,0:4,3:7,4,3,0
chr15	34398504	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=196,225;MMQ=52,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34398504_T_TGGC:34398504:0,1,0,1
chr15	34398508	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,11;MFRL=196,225;MMQ=52,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:34398504_T_TGGC:34398504:0,1,0,1
chr15	34434462	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.176:21:7,3:10,0:0|1:34434462_C_T:34434462:13,5,2,1
chr15	34434467	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.632:22:4,7:5,5:0|1:34434462_C_T:34434462:6,3,9,4
chr15	34517929	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=155,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	34529776	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,4:1,4:0,2,2,6
chr15	34536090	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=1788,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr15	34536143	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:5,1,4,0
chr15	34537435	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr15	34538038	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=95,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:0|1:34538038_C_A:34538038:13,8,1,1
chr15	34538043	.	A	ACC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=95,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:34538038_C_A:34538038:13,9,1,1
chr15	34538044	.	ATT	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=95,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:13,2:0|1:34538038_C_A:34538038:13,10,1,1
chr15	34538050	.	TTT	AAA	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=95,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:12,2:0|1:34538038_C_A:34538038:16,8,1,1
chr15	34538056	.	A	AAAAG	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=95,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:14,2:0|1:34538038_C_A:34538038:14,9,1,1
chr15	34538154	.	G	A,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27,30;MFRL=206,193,132;MMQ=60,40,60;MPOS=31,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:4,0,0:0,1,1:0,4,0,2
chr15	34538166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=206,193;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr15	34542739	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr15	34543055	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:6,2,2,1
chr15	34543298	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr15	34544274	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	34544351	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	34544468	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,1:2,7:3,2,6,2
chr15	34549986	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:34549986_G_A:34549986:0,1,0,1
chr15	34549989	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34549986_G_A:34549986:0,1,0,1
chr15	34549991	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34549986_G_A:34549986:0,1,0,1
chr15	34549993	.	G	GGCGGGCAGATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34549986_G_A:34549986:0,1,0,1
chr15	34551008	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:15,0:3,1:0|1:34551008_C_T:34551008:9,9,1,1
chr15	34551011	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:15,0:3,2:0|1:34551008_C_T:34551008:9,9,1,1
chr15	34610964	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=201,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr15	34628570	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:6,2,5,4
chr15	34634124	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:6,2,5,0
chr15	34634138	.	GT	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,1:6,3:8,4,5,1
chr15	34634324	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=79,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:6,8:11,6:7,10,4,11
chr15	34638198	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:6,5:7,3,4,2
chr15	34643103	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,2,11
chr15	34651409	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=96,49;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,0:14,3:17,20,2,1
chr15	34651433	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=100,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:19,0:12,2:0|1:34651433_T_A:34651433:20,19,1,1
chr15	34651435	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=100,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:21,0:16,2:0|1:34651433_T_A:34651433:20,18,1,1
chr15	34651440	.	C	CTGACCTGTGCAGTGCA	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:19,0:13,4:16,16,2,2
chr15	34651587	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=61,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:1,3,2,3
chr15	34651752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=85,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr15	34654339	.	TTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=97,118;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,1:3,1:10,0,2,0
chr15	34654718	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=102,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:2,4,3,0
chr15	34655092	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr15	34655934	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.171:23:9,0:9,0:0|1:34655934_C_G:34655934:4,15,4,0
chr15	34655936	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.171:23:8,0:8,1:0|1:34655934_C_G:34655934:4,15,4,0
chr15	34655942	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,19;MFRL=102,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.187:21:6,0:9,2:0|1:34655934_C_G:34655934:3,14,4,0
chr15	34656366	.	GAGA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:4,1,7,3
chr15	35045067	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:7,5,0,3
chr15	35045415	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=70,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr15	35045499	.	T	TTTGTGTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=62,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr15	35084843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=108,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35084843_C_T:35084843:0,3,0,1
chr15	35084845	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=108,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:35084843_C_T:35084843:0,3,0,1
chr15	35084847	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=54,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35084843_C_T:35084843:0,2,0,1
chr15	35085771	.	C	CAGGTTCAAGCAATTCT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:35085771_C_CAGGTTCAAGCAATTCT:35085771:4,11,0,2
chr15	35085773	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,1:0|1:35085771_C_CAGGTTCAAGCAATTCT:35085771:4,11,0,2
chr15	35149310	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35149310_A_T:35149310:0,4,0,1
chr15	35149312	.	T	TGGTCCTTTTAACTTATGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35149310_A_T:35149310:0,4,0,1
chr15	35168056	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr15	35185812	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=75,101;MMQ=41,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr15	35196492	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	35207397	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr15	35210428	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr15	35224550	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=103,78;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:4,1:7,1:8,4,1,3
chr15	35230924	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,5,5
chr15	35230934	.	A	ATAGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr15	35240487	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=77,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:3,0:0,1:0|1:35240487_C_T:35240487:2,1,1,0
chr15	35240502	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:35240487_C_T:35240487:1,3,1,0
chr15	35261649	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	35664406	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr15	35834547	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	35834767	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=207,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr15	35834782	.	A	AGTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:35834782_A_AGTT:35834782:0,3,0,1
chr15	35834783	.	A	ATACCTCTTAAAG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:35834782_A_AGTT:35834782:0,3,0,1
chr15	36936582	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=94,156;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:11,0:7,10:5,13,0,10
chr15	36937367	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:8,2,2,0
chr15	36937606	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	36946303	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=85,185;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,1:5,5:6,4,4,2
chr15	36946441	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	36949952	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	36984409	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr15	36984425	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=114,171;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,0:9,3:3,7,0,3
chr15	37184279	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:37184279_TG_T:37184279:7,0,1,1
chr15	37184284	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:37184279_TG_T:37184279:7,0,1,1
chr15	37242440	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.706:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	37242617	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=98,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr15	37388612	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,45;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,0:6,3:7,7,0,3
chr15	37391752	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.275:12:2,1:6,2:3,6,0,3
chr15	38230437	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:5,3:2,7:2,5,5,5
chr15	38591611	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=114,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.187:25:10,0:9,4:11,10,0,4
chr15	38591642	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:10,9,0,4
chr15	38616907	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:10,6,2,0
chr15	38616972	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:13,12,2,1
chr15	38617008	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=102,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.237:39:13,0:17,8:14,16,0,9
chr15	38617113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,1,7
chr15	38617115	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,1,7
chr15	38631920	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr15	38631930	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr15	38632148	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr15	38641773	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,2
chr15	38641774	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,2
chr15	38641777	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,2
chr15	38643574	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	38795437	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:10,3:6,0:12,4,1,2
chr15	38800262	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr15	38804020	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	38808385	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr15	38990803	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,429;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	39545320	.	GT	G,GTT	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,32,22;MFRL=124,138,70;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.34,18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,10:0.147,0.308:31:8,2,3:5,2,5:9,8,7,7
chr15	39545335	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:17,0:14,2:0|1:39545335_A_G:39545335:15,16,2,2
chr15	39545338	.	CT	TG	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:12,0:9,4:0|1:39545335_A_G:39545335:15,17,2,2
chr15	39547023	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,125;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,4:0,4,0,5
chr15	39876412	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,1:0,1:2,2,0,2
chr15	39879717	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,2:9,2:5,10,2,2
chr15	39880507	.	G	GTTTTAATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=235,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39880507_G_GTTTTAATT:39880507:0,1,0,1
chr15	39880509	.	C	CTCTGTTTTTGATTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=235,264;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39880507_G_GTTTTAATT:39880507:0,1,0,1
chr15	39886547	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:3,0:15,1:0|1:39886547_C_T:39886547:10,8,2,0
chr15	39886550	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:4,0:14,2:0|1:39886547_C_T:39886547:9,9,2,0
chr15	39887685	.	T	TCCTCCTCTTCTTTCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:39887685_T_TCCTCCTCTTCTTTCTC:39887685:0,0,0,1
chr15	39887686	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:39887685_T_TCCTCCTCTTCTTTCTC:39887685:0,0,0,1
chr15	39887688	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39887685_T_TCCTCCTCTTCTTTCTC:39887685:0,0,0,1
chr15	40005793	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:0,0:1,1:0,6,0,2
chr15	40030440	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=98,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr15	40030457	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,25;MFRL=204,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr15	40034146	.	TAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	40056206	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0|1:40056206_T_C:40056206:0,4,0,2
chr15	40056209	.	GT	AA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:40056206_T_C:40056206:0,4,0,2
chr15	40056213	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:40056206_T_C:40056206:0,5,0,2
chr15	40056214	.	A	ACAC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:40056206_T_C:40056206:0,5,0,2
chr15	40056219	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr15	40062825	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr15	40062838	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr15	40062855	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	40062884	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	40094028	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.491:20:6,8:4,0:8,2,10,0
chr15	40094201	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:0|1:40094201_A_G:40094201:7,8,1,1
chr15	40094220	.	C	CCTGACACACTGTGTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,2:10,0:0|1:40094201_A_G:40094201:4,9,1,1
chr15	40094499	.	T	TGATGCTATTGCTGCCTATTTGTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	40231625	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=207,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr15	40235562	.	T	TTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=183,80;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0|1:40235562_T_TTTTC:40235562:2,0,1,0
chr15	40235574	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=183,80;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:40235562_T_TTTTC:40235562:1,1,1,0
chr15	40253886	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr15	40254155	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr15	40259504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr15	40265799	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,11,5
chr15	40268998	.	G	GGACGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=GAC;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:3,2,4,0
chr15	40269142	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,30;MFRL=126,147;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:40269142_T_C:40269142:0,1,0,2
chr15	40269146	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=126,147;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:40269142_T_C:40269142:0,1,0,2
chr15	40270214	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr15	40282625	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	40284523	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	40285120	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:40285120_A_G:40285120:0,0,0,2
chr15	40285131	.	G	GCCTGGCAAATCATTTTCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=100,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:40285120_A_G:40285120:0,2,0,1
chr15	40299200	.	TTTTG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,3:2,8:6,2,6,5
chr15	40300214	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:6,1,8,2
chr15	40313083	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr15	40314669	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:3,5:6,2,5,4
chr15	40322552	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr15	40328575	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,15:0,0,21,23
chr15	40328596	.	GTGC	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGC;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.142:18:5,2:10,0:7,9,0,2
chr15	40330629	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:2,2,2,6
chr15	40330693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	40384132	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.687:16:3,4:0,6:0,5,3,8
chr15	40396614	.	G	GCTTCTCTGTTGTCTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=277,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40396614_G_GCTTCTCTGTTGTCTA:40396614:0,1,0,1
chr15	40396617	.	A	ATCTATCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=277,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40396614_G_GCTTCTCTGTTGTCTA:40396614:0,1,0,1
chr15	40397936	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr15	40453307	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:1,1:4,3:6,0,7,0
chr15	40453497	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=92,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.245:43:18,6:14,4:13,20,6,4
chr15	40457197	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr15	40491952	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:2,8:8,8:1,9,7,9
chr15	40493208	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:10,15,1,1
chr15	40493218	.	GAT	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:40493218_GAT_G:40493218:7,14,1,1
chr15	40493222	.	A	AGC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:40493218_GAT_G:40493218:7,14,1,1
chr15	40494952	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=271,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	40494992	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=172,271;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr15	40498722	.	G	GACATTAGCAGTTTACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	40500893	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:40500893_T_C:40500893:10,9,1,1
chr15	40500900	.	C	CAGCCTCCCGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:40500893_T_C:40500893:11,9,1,1
chr15	40500986	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr15	40509600	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=72,263;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	40556952	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=112,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr15	40557021	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:10,6:13,0:16,7,6,0
chr15	40558002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr15	40565055	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,1,3
chr15	40565705	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:5,6:11,4:7,9,5,5
chr15	40582169	.	A	AGTGT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=95,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=GT;STR;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.634:13:3,2:2,4:4,1,5,3
chr15	40582307	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,4:7,0:2,12,0,4
chr15	40582675	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	40582713	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=160,320;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	40583093	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr15	40583297	.	C	CAAAGAGGCAGGACGAGTCCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	40583581	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	40588662	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:4,3,2,0
chr15	40589830	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr15	40594825	.	G	GAAAGGGCAGAGGAGCTCTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=216,31;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr15	40595414	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:3,1,0,2
chr15	40595627	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	40628073	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=124,11582603;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr15	40628822	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:4,2:9,0:0|1:40628822_T_C:40628822:7,8,1,1
chr15	40628830	.	G	GAGAGATC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:40628822_T_C:40628822:11,6,1,1
chr15	40628832	.	G	GTGGTACTGTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:40628822_T_C:40628822:11,6,1,1
chr15	40630913	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,4:6,2:8,3,2,4
chr15	40633030	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:8,5:9,7:9,8,4,8
chr15	40657953	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=96,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:3,0:6,2:0|1:40657953_G_C:40657953:6,4,1,1
chr15	40657955	.	TTGGG	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=131,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.266:9:1,0:4,2:1|0:40657953_G_C:40657953:3,4,1,1
chr15	40657958	.	G	GCT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,0:3,2:0|1:40657953_G_C:40657953:3,3,1,1
chr15	40657961	.	G	T,GAAA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,20,20;MFRL=131,50,41;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.64,6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.300:7:1,0,0:1,2,2:1,2,2,2
chr15	40657962	.	G	GCTGA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:2,2:0|1:40657953_G_C:40657953:2,3,1,1
chr15	40659401	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=98,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:8,11,1,2
chr15	40683780	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,6:3,6:1,4,5,7
chr15	40699940	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,6,14
chr15	40700006	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr15	40700022	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,2,4
chr15	40703609	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	40705105	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	40705159	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	40708422	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr15	40756197	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:9,3:7,8,0,3
chr15	40756742	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=144,0;MMQ=60,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr15	40758337	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:2,6:1,3:0,4,1,8
chr15	40765197	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:14,6:19,0:18,16,6,0
chr15	40849408	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr15	40866170	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,193;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.239:18:10,0:2,3:4,10,0,4
chr15	40900939	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,238;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:40900939_A_G:40900939:2,0,1,0
chr15	40900951	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,238;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:40900939_A_G:40900939:2,1,1,0
chr15	40903814	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,6:0,0:0,1,0,6
chr15	40907698	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr15	40916135	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:40916135_C_T:40916135:0,0,2,0
chr15	40916138	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40916135_C_T:40916135:1,0,1,0
chr15	40916140	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40916135_C_T:40916135:1,0,1,0
chr15	40916234	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:4,3:10,1:0|1:40916234_G_A:40916234:11,4,4,0
chr15	40916237	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,8:0.429:19:5,2:6,6:1|0:40916234_G_A:40916234:9,2,6,2
chr15	40933301	.	A	AAATATACTTGAATTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr15	40942730	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.258:18:5,0:3,0:0|1:40942730_C_A:40942730:5,8,5,0
chr15	40942732	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.257:18:6,0:2,1:0|1:40942730_C_A:40942730:5,8,5,0
chr15	40947266	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=26,30;MFRL=145,180;MMQ=40,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40947266_C_T:40947266:0,3,0,1
chr15	40947267	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=31,24;MFRL=175,81;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40947267_G_A:40947267:0,3,0,1
chr15	40947270	.	TGG	CAA,CAG	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=28,32,32;MFRL=160,81,180;MMQ=50,40,36;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:0,0,0:0,2,0,2
chr15	40947273	.	A	ACTGCT	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=23,23;MFRL=131,145;MMQ=38,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40947273_A_ACTGCT:40947273:0,2,0,1
chr15	40947274	.	TCACCA	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=156,145;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:40947273_A_ACTGCT:40947273:0,3,0,1
chr15	40947276	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=22,22;MFRL=168,81;MMQ=38,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:40947267_G_A:40947267:0,2,0,1
chr15	40947278	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=156,180;MMQ=40,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:40947266_C_T:40947266:0,1,0,1
chr15	40947279	.	AGG	TGG,A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=20,27,23;MFRL=156,81,180;MMQ=40,40,36;MPOS=6,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.43,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr15	40947281	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=29,23;MFRL=156,113;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr15	40947283	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=28,27;MFRL=156,145;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40947273_A_ACTGCT:40947273:0,3,0,1
chr15	40951719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=152,140;MMQ=55,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:40951719_C_T:40951719:1,10,0,2
chr15	40951721	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=152,140;MMQ=55,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:40951719_C_T:40951719:1,10,0,2
chr15	40951725	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=152,140;MMQ=55,41;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:40951719_C_T:40951719:1,10,0,2
chr15	40998342	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=183,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.365:50:11,7:21,11:25,7,13,5
chr15	41029226	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=173,132;MMQ=47,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr15	41030865	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=242,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	41044352	.	CC	TT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:8,9,1,1
chr15	41064743	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	41071867	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.465:7:0,0:2,3:0,4,0,3
chr15	41105188	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr15	41105663	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	41106272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:2,9,1,1
chr15	41106295	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=95,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr15	41108389	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:4,0:6,3:2,8,1,2
chr15	41120686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=59,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:3,5,0,2
chr15	41120766	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,1:10,2:9,8,2,1
chr15	41146166	.	G	GTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:2,2:4,0:1,6,1,1
chr15	41146581	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	41146963	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr15	41148199	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,5,8
chr15	41165739	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=227,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,1,4
chr15	41222283	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:0|1:41222283_C_T:41222283:5,8,1,1
chr15	41222290	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:3,2:0|1:41222283_C_T:41222283:3,7,1,1
chr15	41222295	.	C	CCT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:41222283_C_T:41222283:3,5,1,1
chr15	41222299	.	C	CCTCCTGATCCTG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:41222283_C_T:41222283:2,3,1,1
chr15	41222307	.	C	CATCCTCTCTCGCAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=178,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr15	41222784	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=100,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:1,15,1,1
chr15	41224280	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	41227024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=161,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,0,2
chr15	41275014	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr15	41275305	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.390:8:1,1:0,0:0,5,0,3
chr15	41276147	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=79,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,0,2
chr15	41276158	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=79,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,0,2
chr15	41297711	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=91,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr15	41313064	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=275,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr15	41313356	.	T	TCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=193,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.489:4:1,0:1,2:0|1:41313356_T_TCCC:41313356:0,2,1,1
chr15	41313359	.	C	CCTGTCCATTATTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=18,20;MFRL=193,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:41313356_T_TCCC:41313356:0,2,1,1
chr15	41341542	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr15	41346092	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr15	41361767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=84,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr15	41364243	.	T	TAGCTTAGTTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr15	41377750	.	T	TC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=94,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:0|1:41377750_T_TC:41377750:9,19,1,1
chr15	41377752	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=94,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:0|1:41377750_T_TC:41377750:9,19,1,1
chr15	41476101	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	41482231	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:4,4,2,0
chr15	41483631	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,3,3
chr15	41483636	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,3,3
chr15	41483682	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=197,98;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,5:3,0:1,2,2,3
chr15	41507865	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=179,165;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr15	41507883	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=120,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,3:3,0:7,0,4,0
chr15	41571139	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=157,121;MMQ=59,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,7:0,1:3,2,1,7
chr15	41612013	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0,5,0,8
chr15	41634689	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=68,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:4,3,3,1
chr15	41648162	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	41650416	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=137,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:0|1:41650416_AG_A:41650416:12,7,1,2
chr15	41650422	.	ATTTT	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:10,0:0|1:41650416_AG_A:41650416:16,9,1,1
chr15	41650429	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:8,0:0|1:41650416_AG_A:41650416:16,5,1,1
chr15	41650433	.	C	CATAA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:41650416_AG_A:41650416:15,4,1,1
chr15	41650437	.	ATTCCATGAATG	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:8,0:0|1:41650416_AG_A:41650416:17,7,1,1
chr15	41663884	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.355:17:3,2:8,4:3,8,0,6
chr15	41663896	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:2,4:4,8:1,5,2,11
chr15	41668125	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=136,199;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr15	41687296	.	T	TACTGACATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	41688646	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,114;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:1,4:13,0:12,2,5,0
chr15	41688899	.	T	TCCTAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:5,0:0|1:41688899_T_TCCTAAA:41688899:8,4,1,1
chr15	41688901	.	T	TGC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:41688899_T_TCCTAAA:41688899:8,4,1,1
chr15	41688902	.	T	TGAGACTATA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,2:5,0:0|1:41688899_T_TCCTAAA:41688899:8,4,1,1
chr15	41745314	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=133,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:1,0:11,3:1,11,0,3
chr15	41757131	.	A	AGTGTGTGT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=150,150;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,21;RU=GT;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr15	41766966	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr15	41793882	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=180,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr15	41794454	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr15	41796498	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0,2,4,2
chr15	41797959	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:10,13,1,1
chr15	41797981	.	GA	CT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:41797981_GA_CT:41797981:7,12,1,1
chr15	41797984	.	GAA	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:41797981_GA_CT:41797981:7,12,1,1
chr15	41797987	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:41797981_GA_CT:41797981:7,12,1,1
chr15	41797991	.	G	GGCCAGGC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:41797981_GA_CT:41797981:7,12,1,1
chr15	41799711	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:7,1,6,2
chr15	41805088	.	G	GGATTTTGTTGCCGGGTGGACCCAAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=170,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.292:10:1,0:6,2:3,4,2,1
chr15	41805115	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,2:3,3:0,3,4,2
chr15	41810215	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,8:3,0:5,3,8,0
chr15	41810439	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr15	41814172	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr15	41814368	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,2:10,0:10,8,2,0
chr15	41814496	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr15	41815516	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,3,14
chr15	41815649	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	41816046	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,5:3,0:7,2,5,0
chr15	41816190	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:0,4,2,3
chr15	41817136	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41817136_G_GT:41817136:4,0,1,0
chr15	41817137	.	A	ACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41817136_G_GT:41817136:4,0,1,0
chr15	41817142	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr15	41817367	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=107,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr15	41819283	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,8:1,1:1,1,4,5
chr15	41819322	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:8,2:8,3:13,3,5,1
chr15	41819674	.	GGCTTTTCCTTTTT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:12,0:13,7,1,1
chr15	41819716	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.678:29:4,5:5,15:3,6,11,9
chr15	41819896	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=245,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr15	41822235	.	GTCCCCACCA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0|1:41822235_GTCCCCACCA_G:41822235:1,2,1,1
chr15	41822246	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:41822235_GTCCCCACCA_G:41822235:0,2,1,1
chr15	41822252	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41822235_GTCCCCACCA_G:41822235:0,0,0,1
chr15	41823225	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:11,7:11,0:13,9,0,7
chr15	41827655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	41829230	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,3:6,7:11,4,2,8
chr15	41829378	.	G	GAAGTCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=95,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:41829378_G_GAAGTCC:41829378:1,2,0,2
chr15	41829380	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=95,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:41829378_G_GAAGTCC:41829378:1,2,0,2
chr15	41829382	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:41829378_G_GAAGTCC:41829378:1,1,0,2
chr15	41856543	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	41857216	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,3:2,1:3,3,4,1
chr15	41860411	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:3,2:3,3,4,2
chr15	41861145	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,2:7,1:4,10,2,1
chr15	41863181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	41865651	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=94,69;MMQ=60,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:6,0:9,4:0|1:41865651_G_A:41865651:8,8,2,2
chr15	41865656	.	G	GGTTCATT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=98,69;MMQ=60,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:7,0:9,4:0|1:41865651_G_A:41865651:8,11,2,2
chr15	41865658	.	G	GAAAAATTCCTAGAAAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=94,69;MMQ=60,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.207:22:8,0:9,1:0|1:41865651_G_A:41865651:8,10,2,2
chr15	41961975	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:10,7,0,2
chr15	41991036	.	ATT	A,AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27,25;MFRL=106,99,141;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.25,5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,4:0.159,0.210:22:8,2,1:3,1,2:10,5,6,1
chr15	42003154	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,54;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,3:12,0:9,11,2,1
chr15	42026893	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=219,245;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42026893_T_A:42026893:0,1,0,1
chr15	42026897	.	T	TCCCGAGCAGCTGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=219,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42026893_T_A:42026893:0,1,0,1
chr15	42032141	.	TGGG	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:42032141_TGGG_T:42032141:13,3,1,1
chr15	42032145	.	A	AACCTCAT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:42032141_TGGG_T:42032141:13,4,1,1
chr15	42032148	.	G	GCAAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,48;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:42032141_TGGG_T:42032141:13,4,1,1
chr15	42041712	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr15	42046568	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr15	42059255	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:5,4,0,3
chr15	42103290	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42103290_C_G:42103290:1,0,0,1
chr15	42103297	.	C	CTGGGCTTAGTGGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42103290_C_G:42103290:2,0,0,1
chr15	42105444	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=146,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,1:7,3:12,7,3,1
chr15	42109223	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr15	42110168	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=68,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,0:5,3:8,3,1,2
chr15	42111551	.	TT	GA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:42111551_TT_GA:42111551:2,7,1,1
chr15	42111554	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:42111551_TT_GA:42111551:1,7,1,1
chr15	42111556	.	A	AAGGAAGGGCATGGGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:42111551_TT_GA:42111551:1,7,1,1
chr15	42111753	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,6:0,5:0,0,10,4
chr15	42114338	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42114338_T_A:42114338:1,3,0,1
chr15	42114341	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:42114338_T_A:42114338:1,3,0,1
chr15	42114344	.	G	GCGGATCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:0|1:42114338_T_A:42114338:1,1,0,1
chr15	42114414	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr15	42115426	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr15	42120437	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr15	42127703	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:6,3,2,0
chr15	42131263	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=253,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	42132864	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=122,13127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,1:1,1:0|1:42132864_C_G:42132864:3,7,1,1
chr15	42132866	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=122,13127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,1:1,0:0|1:42132864_C_G:42132864:3,7,1,1
chr15	42132896	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr15	42133885	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr15	42134301	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	42134371	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,10,4
chr15	42134523	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	42134652	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr15	42134839	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.863:9:0,4:0,4:0,1,1,7
chr15	42134865	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=57,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42134865_G_T:42134865:2,2,0,1
chr15	42134868	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=57,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42134865_G_T:42134865:2,2,0,1
chr15	42135988	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,5:0,0,3,10
chr15	42137282	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr15	42137576	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:42137576_C_T:42137576:0,0,0,2
chr15	42137581	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:42137576_C_T:42137576:0,0,0,2
chr15	42138045	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=60,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,2:3,2:1,3,0,4
chr15	42138321	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr15	42139038	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,10:0,4:0,1,7,7
chr15	42143145	.	C	CCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,4:0,0,6,8
chr15	42143227	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr15	42143533	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr15	42143597	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,0,7
chr15	42144332	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	42144979	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr15	42145420	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:1,3:3,6:1,4,5,4
chr15	42146492	.	T	TTTGATTATTCTCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:42146492_T_TTTGATTATTCTCCAA:42146492:0,1,0,1
chr15	42146496	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42146492_T_TTTGATTATTCTCCAA:42146492:0,1,0,1
chr15	42146499	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42146492_T_TTTGATTATTCTCCAA:42146492:0,1,0,1
chr15	42147639	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	42147663	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	42148550	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=87,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:4,4:0,16:3,1,11,9
chr15	42149596	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr15	42149952	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	42155841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr15	42159775	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=58,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:1,2:15,1:7,10,0,3
chr15	42162628	.	C	CGCGCTCCGAGACACCGAGACCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:6,3,2,1
chr15	42164162	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42164162_CT_C:42164162:1,0,0,1
chr15	42164164	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42164162_CT_C:42164162:1,0,0,1
chr15	42167691	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:2,5:9,0:7,5,4,1
chr15	42168844	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=188,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42168844_C_CA:42168844:1,1,0,1
chr15	42168845	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=188,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42168844_C_CA:42168844:1,1,0,1
chr15	42168847	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=188,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42168844_C_CA:42168844:1,1,0,1
chr15	42168849	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=188,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:42168844_C_CA:42168844:1,1,0,1
chr15	42171405	.	C	CAGCTGGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.313:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr15	42171462	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr15	42171877	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr15	42172350	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:0|1:42172350_G_T:42172350:11,14,1,1
chr15	42172355	.	T	TCTCCAAAGC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:8,0:14,2:0|1:42172350_G_T:42172350:11,14,1,1
chr15	42175507	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	42182442	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	42246204	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=110,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:42246204_C_T:42246204:0,2,0,1
chr15	42246213	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=124,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42246204_C_T:42246204:0,1,0,1
chr15	42246227	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42246227_T_C:42246227:0,0,0,1
chr15	42246236	.	A	ACCACAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42246227_T_C:42246227:0,0,0,1
chr15	42279598	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,2:5,2:7,5,2,2
chr15	42280248	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:9,0:18,4:11,16,1,3
chr15	42284925	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr15	42289522	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	42292532	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr15	42297092	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr15	42298133	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr15	42305769	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:42305769_GC_AT:42305769:0,0,4,0
chr15	42305773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:42305769_GC_AT:42305769:0,0,5,0
chr15	42305852	.	A	AGAG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr15	42305998	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:42305998_T_C:42305998:0,0,0,6
chr15	42306015	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:42305998_T_C:42305998:0,0,0,5
chr15	42362173	.	G	GAACTCTAT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=119,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:42362173_G_GAACTCTAT:42362173:4,3,1,1
chr15	42362176	.	A	AACT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=119,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:42362173_G_GAACTCTAT:42362173:4,3,1,1
chr15	42362180	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=119,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:42362173_G_GAACTCTAT:42362173:4,3,1,1
chr15	42362182	.	GG	TA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=119,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:42362173_G_GAACTCTAT:42362173:4,3,1,1
chr15	42362215	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=80,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:1,4,1,3
chr15	42363177	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	42363769	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr15	42364642	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42364642_C_A:42364642:0,4,0,1
chr15	42364644	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42364642_C_A:42364642:0,4,0,1
chr15	42364652	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	42374601	.	A	ATCAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=81,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TCAT;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	42377449	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr15	42377744	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=83,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0|1:42377744_C_G:42377744:1,3,1,3
chr15	42377756	.	A	ATAGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=137,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1|0:42377744_C_G:42377744:1,4,1,1
chr15	42377759	.	A	ACT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=137,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1|0:42377744_C_G:42377744:1,4,1,1
chr15	42434824	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=66,37;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:2,5,3,1
chr15	42435006	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	42436278	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=154,244;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:9,6,2,0
chr15	42437711	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr15	42437783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=117,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:4,1:6,3,2,1
chr15	42442067	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,0:0|1:42442067_T_G:42442067:6,1,0,2
chr15	42442073	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,0:0|1:42442067_T_G:42442067:5,1,0,2
chr15	42442910	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=85,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:6,6,2,0
chr15	42444955	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,0:2,6:2,4,0,6
chr15	42512377	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:6,0:13,5:5,14,0,5
chr15	42519136	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr15	42520829	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	42521051	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42521051_A_T:42521051:1,0,0,1
chr15	42521057	.	CAG	TGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42521051_A_T:42521051:1,0,0,1
chr15	42523341	.	T	TC	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.969:21:0,11:0,10:0,0,18,3
chr15	42528676	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	42531768	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	42553218	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.914:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr15	42560312	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr15	42564369	.	CA	TG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,7,24
chr15	42565580	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:5,0:0|1:42565580_C_T:42565580:6,15,1,1
chr15	42565598	.	TT	AC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:42565580_C_T:42565580:2,16,1,1
chr15	42565603	.	AG	CT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:42565580_C_T:42565580:1,17,1,1
chr15	42565606	.	C	CACGACTACT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,16;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:7,0:0|1:42565580_C_T:42565580:1,15,1,1
chr15	42568630	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,7,18
chr15	42579822	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	42579948	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,10,6
chr15	42580106	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr15	42584909	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr15	42602559	.	A	AAGACTCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,1:13,0:7,14,0,2
chr15	42602943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr15	42603083	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr15	42619508	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr15	42622968	.	CTTTTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=232,271;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=22,13;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr15	42633046	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=167,152;MMQ=53,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:42633046_C_G:42633046:0,4,0,2
chr15	42633050	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=167,156;MMQ=53,56;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0|1:42633046_C_G:42633046:0,4,0,3
chr15	42641626	.	C	CTGACACATGTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:0|1:42641626_C_CTGACACATGTTTTT:42641626:8,5,1,1
chr15	42641628	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:42641626_C_CTGACACATGTTTTT:42641626:8,5,1,1
chr15	42681180	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,1,1
chr15	42694318	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:6,8,2,0
chr15	42694944	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	42698245	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:42698245_C_A:42698245:0,2,0,1
chr15	42698247	.	TG	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42698245_C_A:42698245:0,2,0,1
chr15	42703406	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	42704105	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	42709998	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=92,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,1:6,5:6,3,2,4
chr15	42710177	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:5,3,1,5
chr15	42710219	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr15	42714195	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,1:0,0:0,3,0,2
chr15	42743223	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=97,179;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:42743223_TG_T:42743223:4,16,1,1
chr15	42743227	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,179;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:42743223_TG_T:42743223:4,16,1,1
chr15	42744094	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=77,224;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:1,3,3,3
chr15	42749476	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr15	42820589	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:6,2,5,3
chr15	42821920	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,0:14,2:16,11,0,2
chr15	42837497	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	42850380	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:10,10:7,4:9,8,12,2
chr15	42850512	.	CT	C	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=T;STR;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,26:0.803:33:5,13:0,0:4,3,11,15
chr15	42850528	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.427:50:14,17:8,1:22,7,7,14
chr15	42850561	.	CAGGCTGG	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,137;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCTGG;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:12,3:0,0:0,13,0,3
chr15	42851464	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=137,98;MMQ=40,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.493:14:3,1:4,5:0|1:42851464_C_T:42851464:7,0,5,2
chr15	42851476	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=120,103;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.143:19:2,2:11,0:1|0:42851464_C_T:42851464:13,4,1,1
chr15	42851478	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=107,103;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,2:0.136:20:2,2:14,0:1|0:42851464_C_T:42851464:12,6,1,1
chr15	42851484	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=98,103;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.130:21:3,2:15,0:1|0:42851464_C_T:42851464:10,9,1,1
chr15	42853561	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:2,5,2,2
chr15	43018281	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,3:14,0:11,19,0,3
chr15	43020269	.	G	GCCAAGGTAGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=217,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr15	43020300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:43020300_G_T:43020300:2,1,0,1
chr15	43020302	.	A	ATCTTACTATATTTCTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:43020300_G_T:43020300:2,1,0,1
chr15	43024110	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:43024110_C_CAG:43024110:0,1,0,2
chr15	43024113	.	TT	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=13,31;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:43024110_C_CAG:43024110:0,1,0,2
chr15	43024118	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:43024110_C_CAG:43024110:0,1,0,2
chr15	43024121	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:43024110_C_CAG:43024110:0,1,0,2
chr15	43024124	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:43024110_C_CAG:43024110:0,1,0,2
chr15	43045252	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:1,0:9,2:0|1:43045252_C_T:43045252:5,5,1,1
chr15	43045272	.	T	TTCCTCTCCCTTTCTCCCGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:0|1:43045252_C_T:43045252:5,5,1,1
chr15	43045441	.	G	GCATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43045441_G_GCATTT:43045441:0,2,0,1
chr15	43045446	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43045441_G_GCATTT:43045441:0,2,0,1
chr15	43067999	.	TAATATGGACACAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	43075531	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	43170690	.	T	TAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=0,134;MMQ=23,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=AC;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr15	43252764	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=79,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr15	43252909	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=118,30;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,2:6,0:0|1:43252909_GA_G:43252909:8,6,1,1
chr15	43252913	.	CAAGAG	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=129,30;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:7,0:0|1:43252909_GA_G:43252909:10,8,1,1
chr15	43252923	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=129,30;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:43252909_GA_G:43252909:9,8,1,1
chr15	43252925	.	CAA	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=129,30;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:43252909_GA_G:43252909:9,8,1,1
chr15	43252930	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=107,30;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.201:18:7,3:7,0:0|1:43252909_GA_G:43252909:9,6,1,2
chr15	43256121	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr15	43256262	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr15	43290546	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	43307860	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:6,0:8,2,1,2
chr15	43317071	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:8,11:1,3:7,3,9,5
chr15	43322113	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,7,3
chr15	43324942	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	43328663	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,14,3
chr15	43330175	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	43340699	.	CAAGA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAGA;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1,6,1,1
chr15	43347139	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	43348684	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr15	43352041	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	43360300	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:43360300_AAAAAAG_A:43360300:0,3,0,1
chr15	43360307	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43360300_AAAAAAG_A:43360300:0,3,0,1
chr15	43360312	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43360300_AAAAAAG_A:43360300:0,3,0,1
chr15	43375004	.	T	G,TGAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,11,26;MFRL=213,284,140;MMQ=60,60,60;MPOS=32,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.254:5:2,0,1:1,0,0:0,3,0,2
chr15	43378469	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=47,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:43378469_A_C:43378469:2,1,0,1
chr15	43378477	.	G	GAGCTCATGAAGGAAGCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=113,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43378469_A_C:43378469:1,1,0,1
chr15	43398108	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:12,2:2,2:7,7,3,1
chr15	43430749	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:7,1:3,3:8,3,4,0
chr15	43476812	.	G	GGGGGAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=187,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:43476812_G_GGGGGAC:43476812:1,3,1,1
chr15	43476816	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=187,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:43476812_G_GGGGGAC:43476812:1,3,1,1
chr15	43476819	.	CC	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=187,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:43476812_G_GGGGGAC:43476812:1,3,1,1
chr15	43478113	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	43478511	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	43482701	.	A	ATCGAAATCAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43482701_A_ATCGAAATCAG:43482701:0,0,0,1
chr15	43482703	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43482701_A_ATCGAAATCAG:43482701:0,0,0,1
chr15	43482710	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43482701_A_ATCGAAATCAG:43482701:0,0,0,1
chr15	43483537	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	43499497	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=96,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:9,4:4,14,0,4
chr15	43544969	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,4:4,6:7,4,6,4
chr15	43552541	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:43552541_C_T:43552541:7,3,1,1
chr15	43552551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:2,0:9,2:0|1:43552541_C_T:43552541:7,5,1,1
chr15	43568999	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:4,2,3,0
chr15	43571219	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=107,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr15	43637985	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	43643901	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	43653755	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,7:11,0:7,8,1,6
chr15	43653880	.	GGGTCTCTCTCCCAAGCAA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=104,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:9,2:11,0:22,13,1,1
chr15	43658935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr15	43661143	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=89,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:12,5:17,0:14,16,5,0
chr15	43668246	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=113,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:5,6,2,0
chr15	43677973	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=64,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:2,6:2,2:3,1,6,2
chr15	43699864	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=229,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43699864_G_A:43699864:0,1,0,1
chr15	43699868	.	A	AGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=229,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43699864_G_A:43699864:0,1,0,1
chr15	43699869	.	A	ACCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=229,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43699864_G_A:43699864:0,1,0,1
chr15	43701074	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,5:2,0:7,4,4,1
chr15	43701946	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr15	43702033	.	C	CATCGTTCTTCTGCCTTTCCGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=307,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	43704907	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=99,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr15	43707808	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr15	43712534	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,5:2,0:4,3,1,4
chr15	43720405	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43720405_T_A:43720405:0,3,0,1
chr15	43720410	.	G	GACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43720405_T_A:43720405:0,3,0,1
chr15	43720413	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43720405_T_A:43720405:0,2,0,1
chr15	43730486	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr15	43748304	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr15	43767774	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,12,4
chr15	43773036	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	43773173	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:7,0:0|1:43773173_T_A:43773173:10,8,1,1
chr15	43773180	.	C	CTCTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:43773173_T_A:43773173:8,7,1,1
chr15	43784000	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr15	43784669	.	G	GATATCAGCCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=199,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr15	43785093	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:43785093_A_C:43785093:0,0,2,0
chr15	43785099	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=103,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:43785093_A_C:43785093:1,0,1,0
chr15	43785102	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=103,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43785093_A_C:43785093:1,0,1,0
chr15	43812935	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:8,0:4,2:0|1:43812935_C_T:43812935:6,6,1,2
chr15	43812940	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:7,0:5,3:0|1:43812935_C_T:43812935:6,7,1,2
chr15	43815350	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:8,0:24,3:6,26,2,1
chr15	43816810	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=188,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:43816810_GA_TT:43816810:1,1,0,1
chr15	43816817	.	T	TATTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=188,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43816810_GA_TT:43816810:1,1,0,1
chr15	43817404	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:6,1:3,3:0|1:43817404_G_A:43817404:6,4,2,2
chr15	43817406	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:7,1:3,3:0|1:43817404_G_A:43817404:6,4,2,2
chr15	43818079	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:3,6,5,4
chr15	43819231	.	C	T,CAACCAACGA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26,32;MFRL=106,72,164;MMQ=60,60,60;MPOS=7,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.335,0.331:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr15	43819233	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,22;MFRL=146,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:43819233_T_C:43819233:0,3,0,1
chr15	43819234	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=106,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:43819234_G_C:43819234:0,3,0,1
chr15	43819236	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,30;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43819233_T_C:43819233:0,2,0,1
chr15	43819237	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:43819234_G_C:43819234:1,2,0,1
chr15	43819239	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43819234_G_C:43819234:1,2,0,1
chr15	43820403	.	C	CCTGTACTCCCCACCCACCAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr15	43821360	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:43821360_C_A:43821360:0,3,1,0
chr15	43821363	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0,3,1,0
chr15	43821370	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=69,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43821360_C_A:43821360:0,4,1,0
chr15	43821371	.	A	ACCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=69,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43821360_C_A:43821360:0,4,1,0
chr15	43850958	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	43903198	.	T	TTGTGTGTGTG	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=119,123;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=TG;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.437:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr15	43924492	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=139,191;MMQ=57,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:7,7,0,2
chr15	43925134	.	TT	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=205,172;MMQ=31,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,2,0,1
chr15	43925140	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=205,172;MMQ=31,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,2,0,1
chr15	43925147	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=205,172;MMQ=31,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,2,0,1
chr15	43927353	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=203,175;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:2,2:0,3,0,4
chr15	43931087	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:4,2,3,0
chr15	44038899	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,5:2,8:3,4,7,6
chr15	44053617	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,3:6,7:7,5,7,3
chr15	44053764	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:44053764_G_A:44053764:1,7,1,1
chr15	44053768	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=178,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:44053764_G_A:44053764:1,6,1,1
chr15	44057798	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:11,2:0|1:44057798_T_A:44057798:11,15,1,1
chr15	44057802	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:11,2:0|1:44057798_T_A:44057798:11,15,1,1
chr15	44068125	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,5:11,0:10,13,5,0
chr15	44068160	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=221,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.775:11:0,5:2,4:0,2,4,5
chr15	44084705	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr15	44089593	.	ATTTT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=221,268;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr15	44089636	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=209,124;MMQ=55,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44089636_G_T:44089636:0,1,0,1
chr15	44089651	.	TGTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=209,124;MMQ=55,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44089636_G_T:44089636:0,1,0,1
chr15	44090270	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,57;MMQ=51,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:44090270_CA_TG:44090270:0,4,1,1
chr15	44090278	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=163,57;MMQ=53,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:44090270_CA_TG:44090270:0,5,1,1
chr15	44091351	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,17:0,0,9,16
chr15	44093040	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	44101959	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:15,7:10,0:14,11,7,0
chr15	44119313	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=90,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.497:36:13,9:5,9:10,8,9,9
chr15	44166691	.	G	GGGGTGGAGCTGGGGGAAGGGGCATTTAATGGTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,78;MMQ=60,29;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr15	44166758	.	C	CACCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	44211868	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr15	44487256	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44487256_C_G:44487256:0,0,1,0
chr15	44487259	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44487256_C_G:44487256:0,0,1,0
chr15	44487263	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44487256_C_G:44487256:0,0,1,0
chr15	44487267	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:44487256_C_G:44487256:0,0,1,0
chr15	44581276	.	GTGCTGGTGGTGC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:2,2:6,6,1,1
chr15	44671837	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.574:10:0,2:3,1:2,2,3,3
chr15	44705689	.	C	CAGAGATGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=67,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr15	44789291	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:12,0:8,3:10,10,1,2
chr15	44811329	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.267:21:9,2:4,3:12,4,5,0
chr15	44816224	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr15	44853180	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44853180_A_G:44853180:1,0,1,0
chr15	44853186	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44853180_A_G:44853180:1,0,1,0
chr15	44853431	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44853431_C_A:44853431:0,0,0,1
chr15	44853434	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44853431_C_A:44853431:0,0,0,1
chr15	44853442	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44853431_C_A:44853431:0,0,0,1
chr15	44853445	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44853431_C_A:44853431:0,0,0,1
chr15	44855589	.	T	TACAACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=202,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr15	44855593	.	GA	AT,CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,21,27;MFRL=206,197,240;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr15	44855596	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr15	44858121	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:44858121_G_A:44858121:4,6,1,1
chr15	44858129	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:44858121_G_A:44858121:4,5,1,1
chr15	44858130	.	A	ACCTCGGTTCTACCAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=156,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:44858121_G_A:44858121:4,5,1,1
chr15	44858402	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:8,1:9,7,2,0
chr15	44881669	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:44881669_A_C:44881669:0,3,0,1
chr15	44881675	.	C	CCACAAGGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=9240259,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44881669_A_C:44881669:0,2,0,1
chr15	44881706	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=18480361,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44881706_T_C:44881706:0,1,0,1
chr15	44881708	.	C	CCTGTATACCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=18480361,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44881706_T_C:44881706:0,1,0,1
chr15	44914151	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr15	44941183	.	C	CAAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,115;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,0:7,5:6,9,0,5
chr15	44941257	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr15	44943853	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=83,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:9,0:3,8:7,5,0,8
chr15	44943992	.	C	CAAGAGCAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr15	44952642	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:8,2,2,0
chr15	44961652	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr15	44962101	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr15	44966389	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr15	45028919	.	CT	C,CTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=73,231,131;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.32,7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,6:0.164,0.448:13:1,1,2:4,1,4:0,5,2,6
chr15	45059390	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr15	45249072	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:0|1:45249072_C_G:45249072:5,10,1,1
chr15	45249077	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:45249072_C_G:45249072:6,11,1,1
chr15	45249078	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=107,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:45249072_C_G:45249072:6,11,1,1
chr15	45249082	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:45249072_C_G:45249072:8,10,1,1
chr15	45249084	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:45249072_C_G:45249072:8,11,1,1
chr15	45249088	.	C	CTGAT	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:45249072_C_G:45249072:7,12,1,1
chr15	45249089	.	C	CTGG	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=127,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:45249072_C_G:45249072:7,12,1,1
chr15	45250755	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	45353230	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,12:0,0,14,2
chr15	45357409	.	AT	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=140,139;MMQ=57,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.499:14:3,4:4,3:0|1:45357409_AT_TG:45357409:7,0,5,2
chr15	45357410	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,14:0.937:14:0,7:0,7:1|0:45357409_AT_TG:45357409:0,0,12,2
chr15	45361011	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr15	45361046	.	ATTT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=154,200;MMQ=39,27;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:3,2:0,1:2,1,3,0
chr15	45387550	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	45387662	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=108,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:3,0:7,5,1,1
chr15	45391566	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr15	45391918	.	AGGCACATAGCGGTTGAGGAAAGTCTCTCGCAGGAAGGTTATGAGGTTGC	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.072:51:7,1:15,7:14,27,4,6
chr15	45392075	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,6,12
chr15	45392888	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,235;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,5:3,0:5,5,5,0
chr15	45397924	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:1,1:10,1:5,6,1,1
chr15	45398965	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr15	45399467	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	45400164	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr15	45402940	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,15:0,7:1,0,11,11
chr15	45404979	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	45405463	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr15	45408691	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,6,7
chr15	45408699	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,6,10
chr15	45408710	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr15	45408933	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,3:0,5:0,0,3,7
chr15	45408956	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:45408956_C_T:45408956:1,7,1,1
chr15	45408963	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=146,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45408956_C_T:45408956:1,6,1,1
chr15	45409013	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	45409271	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	45424087	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:6,1,3,1
chr15	45424286	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr15	45426145	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=95,151;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:5,0:11,5:8,8,0,5
chr15	45426179	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:0|1:45426179_G_T:45426179:4,5,1,1
chr15	45426181	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:0|1:45426179_G_T:45426179:4,5,1,1
chr15	45428851	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:5,0:7,2:0|1:45428851_G_GTGTGTGT:45428851:1,11,0,2
chr15	45428852	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:0|1:45428851_G_GTGTGTGT:45428851:1,11,0,2
chr15	45428865	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr15	45430242	.	ATGTGTGTGTGTGCATGCTTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=89,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.220:31:13,3:9,3:0|1:45430242_ATGTGTGTGTGTGCATGCTTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG_A:45430242:14,11,1,5
chr15	45430303	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45430242_ATGTGTGTGTGTGCATGCTTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG_A:45430242:0,2,0,1
chr15	45431463	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr15	45431781	.	C	CCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:3,0:0|1:45431781_C_CCA:45431781:1,4,1,1
chr15	45431784	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=147,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:45431781_C_CCA:45431781:1,4,1,1
chr15	45431829	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,0:0,1:1,1,0,3
chr15	45433646	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=90,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:1,3,3,3
chr15	45439910	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=260,349;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr15	45439918	.	G	GCCTTGTCTCCTCTCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=368,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr15	45440208	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=105,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:0|1:45440208_G_T:45440208:2,1,1,1
chr15	45440209	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=105,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:45440208_G_T:45440208:2,1,1,1
chr15	45440211	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=105,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:45440208_G_T:45440208:2,1,1,1
chr15	45444383	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr15	45444518	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:6,1,3,4
chr15	45446084	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:2,3:1,3:3,0,6,2
chr15	45457195	.	C	CCAAGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45457195_C_CCAAGCA:45457195:0,0,0,1
chr15	45457196	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45457195_C_CCAAGCA:45457195:0,0,0,1
chr15	45457198	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45457195_C_CCAAGCA:45457195:0,0,0,1
chr15	45460422	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	45556829	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr15	45557456	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	45557468	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=118,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	45561808	.	A	ACAGTTAAACGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:45561808_A_ACAGTTAAACGC:45561808:0,1,0,1
chr15	45561814	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45561808_A_ACAGTTAAACGC:45561808:0,1,0,1
chr15	45567740	.	T	TCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTCCCTCCATGTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=101,192;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.196:14:7,2:4,0:4,8,0,2
chr15	45669055	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr15	45694579	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=94.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,26:0,8:0,0,21,13
chr15	45694610	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,26:0,13:0,0,19,20
chr15	45702799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr15	45706739	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr15	45713504	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	45779810	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr15	45779838	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr15	45839302	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=162,184;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr15	45839333	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,34;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:45839333_CGG_C:45839333:2,2,0,1
chr15	45839337	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:45839333_CGG_C:45839333:2,2,0,1
chr15	45839338	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:45839333_CGG_C:45839333:2,2,0,1
chr15	45839342	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:45839333_CGG_C:45839333:2,2,0,1
chr15	45848230	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.422:21:6,6:1,1:8,4,9,0
chr15	45951427	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:8,4:5,0:0|1:45951427_T_TG:45951427:0,13,0,4
chr15	45951429	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,4:5,0:0|1:45951427_T_TG:45951427:0,13,0,4
chr15	45951435	.	T	TATGTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:2,0:0,9,0,2
chr15	45962041	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,5:1,2:4,2,5,2
chr15	45968535	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	45980713	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr15	45983204	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=97,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:17,5:12,0:9,20,3,2
chr15	48053334	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.201:28:14,1:7,4:3,20,2,3
chr15	48054437	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:0|1:48054437_C_T:48054437:6,7,1,2
chr15	48054447	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=110,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:7,1:0|1:48054437_C_T:48054437:6,8,1,2
chr15	48055119	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	48055185	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,0:5,2,2,0
chr15	48059137	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.623:10:0,4:2,3:3,0,7,0
chr15	48059325	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=93,1249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,1:16,1:6,19,1,1
chr15	48414308	.	T	TTGCAGGATAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=113,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	48441494	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:48441494_C_T:48441494:8,8,1,1
chr15	48441498	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:48441494_C_T:48441494:9,6,1,1
chr15	48441505	.	C	CAAATT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:48441494_C_T:48441494:10,8,1,1
chr15	48450517	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	48459603	.	A	AAAAAGAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.312:4:1,1:2,0:0|1:48459603_A_AAAAAGAG:48459603:0,3,0,1
chr15	48459604	.	T	TGCTTCAAAGCTGCTCTCTGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.312:4:1,1:2,0:0|1:48459603_A_AAAAAGAG:48459603:0,3,0,1
chr15	48460786	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	48494185	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:4,1,3,3
chr15	48500390	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,282;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48500390_T_C:48500390:0,2,0,1
chr15	48500398	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=135,282;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:48500390_T_C:48500390:0,2,0,1
chr15	48513142	.	G	GAAGTGAAATGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=69,33;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:4,7,1,1
chr15	48513204	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr15	48518704	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=84,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,5:8,0:4,9,5,0
chr15	48539043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	48541700	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=115,453;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	48544014	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:4,0:5,3:0,9,0,4
chr15	48547976	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=77,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:1,1,2,2
chr15	48559979	.	C	CACGGGAAAGACCGGCCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	48561834	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr15	48566873	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=84,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr15	48580573	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=83,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:3,1,5,1
chr15	48584083	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,2,5
chr15	48593504	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:48593504_GC_G:48593504:3,3,1,1
chr15	48593508	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:48593504_GC_G:48593504:4,3,1,1
chr15	48593511	.	G	GATTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:0|1:48593504_GC_G:48593504:4,3,1,1
chr15	48634319	.	TAA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr15	48704939	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:5,4,1,2
chr15	48720526	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,12,11
chr15	48729648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr15	48730170	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=86,263;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	48736684	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr15	48749005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr15	48757793	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:11,4:12,0:16,7,3,1
chr15	48758132	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	48764849	.	AG	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:3,2:14,0:6,11,1,1
chr15	48764856	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=110,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:2,0:13,4:8,7,0,4
chr15	48766927	.	T	TCCAAAATCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=141,221;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48766927_T_TCCAAAATCAA:48766927:0,1,0,1
chr15	48766928	.	G	GAGTAGGGTGATGTATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=141,221;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48766927_T_TCCAAAATCAA:48766927:0,1,0,1
chr15	48777665	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:13,0:13,7:4,22,0,7
chr15	48779611	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr15	48782036	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,4:4,11:7,3,15,0
chr15	48782234	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:16,0:16,5:10,22,1,4
chr15	48791300	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48791300_GT_G:48791300:0,1,0,1
chr15	48791306	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48791300_GT_G:48791300:0,1,0,1
chr15	48791310	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48791300_GT_G:48791300:0,1,0,1
chr15	48791313	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48791300_GT_G:48791300:0,1,0,1
chr15	48791314	.	A	AGTAAGTCTGTAAAATTGTTTAACTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48791300_GT_G:48791300:0,1,0,1
chr15	48797146	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.709:12:2,6:1,2:3,0,7,2
chr15	48805792	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,123;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:13,0:12,5:12,13,0,5
chr15	49054690	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,171;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:6,18,2,0
chr15	49064657	.	TTTTTTAACTCTATAGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=289,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	49083577	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,0:0,7:0,0,1,6
chr15	49090342	.	G	GCTCTTTGGACATAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	49097734	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=63,177;MMQ=54,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.471:7:1,3:2,0:3,1,3,0
chr15	49118087	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr15	49143373	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:7,3:7,9,2,1
chr15	49143398	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:49143398_T_C:49143398:9,11,1,1
chr15	49143403	.	C	CACTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:49143398_T_C:49143398:8,14,1,1
chr15	49172025	.	CA	TC	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:10,2:0|1:49172025_CA_TC:49172025:10,18,1,1
chr15	49172028	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:49172025_CA_TC:49172025:10,18,1,1
chr15	49172030	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:49172025_CA_TC:49172025:10,17,1,1
chr15	49172031	.	T	TG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:12,2:0|1:49172025_CA_TC:49172025:10,17,1,1
chr15	49172040	.	TG	CA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=131,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:0|1:49172025_CA_TC:49172025:9,15,1,1
chr15	49172044	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,1:0|1:49172025_CA_TC:49172025:9,14,1,1
chr15	49217047	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr15	49284693	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,0:3,3:0,6,1,2
chr15	49288742	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:7,0:5,3:5,7,2,1
chr15	49288880	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	49308830	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,4:5,4:5,8,4,4
chr15	49325289	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,5,11
chr15	49420255	.	G	GGATCC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:9,4,1,1
chr15	49420308	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=124,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:9,0:0,3:4,6,0,3
chr15	49422885	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	49426048	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr15	49663405	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	49867122	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr15	49867148	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr15	49867323	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,2,19
chr15	49869141	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr15	49935503	.	C	CTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=138,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=19,22;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.414:16:2,1:3,0:5,5,0,6
chr15	49935687	.	ATCTTTTATTTTTCTAT	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:18,2:17,0:16,27,1,1
chr15	50154428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:10,1,1,1
chr15	50158755	.	GC	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr15	50189448	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	50190235	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=83,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr15	50226313	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr15	50254280	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr15	50272100	.	A	AAGGAAGAACATTGGGGAGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=185,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	50489677	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr15	50515254	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,0:6,4:7,11,2,2
chr15	50515414	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50515414_T_TGA:50515414:0,1,0,1
chr15	50515417	.	AAAGCCAAGT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50515414_T_TGA:50515414:0,1,0,1
chr15	50515430	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50515414_T_TGA:50515414:0,1,0,1
chr15	50518226	.	AGATGAACCTGTCCGT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:11,0:23,5,1,1
chr15	50521265	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr15	50549560	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,11:1,0:4,0,11,0
chr15	50557738	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	50581788	.	G	GCTAAGGTTTATT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,2:9,0:0|1:50581788_G_GCTAAGGTTTATT:50581788:7,8,0,2
chr15	50581792	.	A	AAAAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.152:17:6,2:8,0:0|1:50581788_G_GCTAAGGTTTATT:50581788:7,8,0,2
chr15	50751273	.	A	AAACCCTAATAATAACT	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:24,2:36,0:0|1:50751273_A_AAACCCTAATAATAACT:50751273:29,32,1,1
chr15	50751275	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:24,1:35,0:0|1:50751273_A_AAACCCTAATAATAACT:50751273:29,32,1,1
chr15	50751276	.	C	CCTAG	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:24,1:36,0:0|1:50751273_A_AAACCCTAATAATAACT:50751273:29,32,1,1
chr15	50754617	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50754617_G_T:50754617:0,1,0,1
chr15	50754623	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50754617_G_T:50754617:0,1,0,1
chr15	50754625	.	A	AGCCATTCAACAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50754617_G_T:50754617:0,1,0,1
chr15	50773755	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr15	50773787	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=68,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,6:5,5:4,9,6,5
chr15	50781963	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr15	50784950	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=133,58;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:12,1:1,3:0|1:50784950_C_T:50784950:7,6,3,1
chr15	50784955	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=132,58;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:10,1:1,3:0|1:50784950_C_T:50784950:6,6,3,1
chr15	50785016	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=119,0;MMQ=52,23;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,2:10,1:10,11,2,1
chr15	50787955	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	50788275	.	A	AAAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=152,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:3,7,1,1
chr15	50789423	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=82,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,1,1
chr15	50791353	.	A	AATCTTTTTCCAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=174,131;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	50821945	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr15	50822215	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	50831098	.	T	TCTGCCTCCCGGGTTCCA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:1,11,0,2
chr15	50878574	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr15	50878630	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:5,5,5,2
chr15	50885976	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	50888568	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=94,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.323:38:20,7:6,5:6,20,6,6
chr15	50888619	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr15	50897114	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,4:5,5:5,7,4,5
chr15	50899309	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,203;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:2,1:2,6:5,0,9,0
chr15	50899487	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,0:18,3:16,11,0,3
chr15	50899520	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,0:12,3:6,13,0,3
chr15	50901929	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:5,2:2,2:3,4,4,0
chr15	50911865	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr15	50924995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	50926523	.	AAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr15	50941108	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr15	50941131	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=71,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,2:6,3:3,3,0,5
chr15	51012080	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	51012100	.	CATAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	51012220	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,296;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:5,0:6,4:6,5,0,5
chr15	51017527	.	AAAAAC	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=99,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=73.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.916:19:0,10:0,8:1,0,1,17
chr15	51017577	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr15	51028748	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	51028988	.	A	AAACGAGGCCAGAAACGGATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=195,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr15	51040459	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr15	51040798	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	51057717	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51057717_C_CG:51057717:0,0,0,1
chr15	51057720	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51057717_C_CG:51057717:0,0,0,1
chr15	51057722	.	C	CAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51057717_C_CG:51057717:0,0,0,1
chr15	51217361	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chr15	51217475	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	51233812	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr15	51240398	.	ATGCAGTGACTT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:4,1:3,7,2,2
chr15	51240405	.	G	GTCACTGGGAGCCCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.313:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr15	51276128	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr15	51285613	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,73;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,4:8,0:7,5,3,1
chr15	51293164	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	51350642	.	T	TTAAGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=265,296;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	51502986	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=62,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:2,4:3,1:2,3,6,0
chr15	51503041	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.232:37:18,8:10,0:18,11,8,0
chr15	51504811	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	51510702	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr15	51510868	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=100,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	51510917	.	G	GCAAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	51510952	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51510952_C_A:51510952:0,0,0,1
chr15	51510953	.	C	CAAAAAAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51510952_C_A:51510952:0,0,0,1
chr15	51519945	.	A	AAAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=76,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,2:3,6:5,2,5,3
chr15	51529112	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,3:2,4:3,6,3,4
chr15	51675625	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=90,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,5:4,4:2,8,3,6
chr15	51675880	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr15	51675932	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=123,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.324:25:6,6:6,2:13,3,7,2
chr15	51689624	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,10:0,0,12,3
chr15	51689647	.	TTC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=144,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:1,2:9,0:4,7,2,0
chr15	51693719	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=158,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr15	51741453	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	51742553	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,1:0,4:0,2,1,4
chr15	51748610	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr15	51749726	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr15	51750846	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,1:8,4:6,4,1,4
chr15	51751091	.	TAGCAGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AGC;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.736:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	51758345	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	51758547	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr15	51770456	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr15	51772917	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=86,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,2:5,0:0|1:51772917_A_T:51772917:13,7,1,1
chr15	51772918	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=86,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,2:5,0:0|1:51772917_A_T:51772917:13,7,1,1
chr15	51773494	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=101,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,0:11,2:0|1:51773494_G_A:51773494:13,8,1,1
chr15	51773499	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=101,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:0|1:51773494_G_A:51773494:13,8,1,1
chr15	51780722	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,12:1,4:4,0,10,6
chr15	51780760	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=97,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:0|1:51780760_A_T:51780760:9,11,0,2
chr15	51780762	.	T	TGGCTGAGGACCATACCATA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=97,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:0|1:51780760_A_T:51780760:9,11,0,2
chr15	51783981	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr15	51787134	.	C	CCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	51829995	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,1,4
chr15	51857220	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,8:3,6:7,0,13,1
chr15	51868373	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=260,65;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr15	51914716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,0:3,5:5,5,3,2
chr15	51914778	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:8,3:4,5:6,7,2,6
chr15	51981593	.	TGG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,28;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:0,0:0,1,0,3
chr15	52005713	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr15	52058760	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,75;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,0:10,5:9,14,1,4
chr15	52069228	.	GCAATCT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:9,8:5,3:7,7,4,7
chr15	52073425	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52073425_TT_CA:52073425:0,1,0,1
chr15	52073428	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52073425_TT_CA:52073425:0,1,0,1
chr15	52073430	.	A	ACCTCATAAGTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52073425_TT_CA:52073425:0,1,0,1
chr15	52181281	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=116,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,2:21,1:19,23,0,3
chr15	52246710	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:13,0:4,3:8,9,0,3
chr15	52258769	.	A	ACAGTGGGGGGAAAAAAATTAGCCAGGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr15	52351056	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr15	52356872	.	GGAAGGATGAACAAGTTGA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:15,2:10,0:18,19,1,1
chr15	52401951	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	52402139	.	AAGGGGGTCCTGAAGAAGTGACAAAAGCCATCCTAC	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=94,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.145:19:9,2:6,0:5,12,1,1
chr15	52402144	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:7,0:4,12,1,1
chr15	52420491	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=82,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:4,2:1,3:4,2,1,4
chr15	52471945	.	GCCTCCCGGCCCGCACTCACGCTCCACATCGTGCAGCTTGGCTCGCTCCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.239:11:2,2:2,0:7,2,1,1
chr15	52487523	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	52497174	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:11,0:19,5:24,9,0,5
chr15	52498128	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=210,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,0:2,4:0,2,1,3
chr15	52504142	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	52505563	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	52515678	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr15	52534344	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,6,4
chr15	52539858	.	G	GCTCTTGCACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	52548759	.	A	AACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,125;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AC;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,1:1,0,3,1
chr15	52548790	.	G	GCGCGCGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=0,82;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.494:10:3,2:2,3:1,4,2,3
chr15	52548903	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:52548903_T_C:52548903:4,14,0,2
chr15	52548906	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:6,2:0|1:52548903_T_C:52548903:4,14,0,2
chr15	52548909	.	GTTTC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:52548903_T_C:52548903:3,10,0,2
chr15	52553007	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr15	52556429	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,5:0,15:0,0,7,14
chr15	52561891	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=97,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr15	52562060	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=71,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,3:3,0:0,6,2,1
chr15	52571270	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,18;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.588:5:1,0:0,1:0,2,0,3
chr15	52640990	.	T	TA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.675:21:0,6:7,2:6,1,7,7
chr15	52656722	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr15	52662670	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:0,4,0,4
chr15	52668822	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=71,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr15	52668842	.	A	AGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=187,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr15	52671784	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,4:3,4,5,2
chr15	52675261	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr15	52681377	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	52681573	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr15	52689631	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,7,6
chr15	52708502	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=158,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,6:2,3:2,5,5,4
chr15	52708534	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:4,1:0,3:0,4,1,3
chr15	52725334	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=114,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:4,2,3,1
chr15	52725436	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=110,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,1:12,1:17,8,2,0
chr15	52892517	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=191,265;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr15	52897478	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	52901433	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=103,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:8,3:12,1:12,8,3,2
chr15	52902662	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr15	52903749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=102,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:1,1,4,0
chr15	52903772	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=102,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:3,2:0,3:1,2,5,0
chr15	53081248	.	C	CCAGATGCCAGCTGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	53081800	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:6,4,3,6
chr15	53230662	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	53889299	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,0:5,3:8,5,0,3
chr15	53992133	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,0:7,5:7,6,0,5
chr15	53994493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr15	53994545	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:53994545_G_T:53994545:0,4,0,1
chr15	53994548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:53994545_G_T:53994545:0,4,0,1
chr15	53998314	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	54015067	.	C	CTCAGCTTAACATTCTTTAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=108,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:3,0:3,2:2,4,1,1
chr15	54305505	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,3:4,0:11,4,3,0
chr15	54306336	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:10,0:5,2:0|1:54306336_C_T:54306336:9,6,1,1
chr15	54306358	.	G	GAC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:54306336_C_T:54306336:8,8,1,1
chr15	54306359	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:54306336_C_T:54306336:8,7,1,1
chr15	54306362	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:54306336_C_T:54306336:8,7,1,1
chr15	54307222	.	GACTCAGAGAGCTACGACTTA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,2:8,0:10,14,1,1
chr15	54307410	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:11,3:10,5,0,3
chr15	54792209	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,3:2,0:7,2,2,1
chr15	54792428	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=71,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr15	54847786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	54915975	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr15	54918943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,14268426;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	55489130	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:0|1:55489130_G_A:55489130:3,14,1,1
chr15	55489133	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:4,0:0|1:55489130_G_A:55489130:3,15,1,1
chr15	55522669	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:6,0:2,2:0|1:55522669_CA_C:55522669:2,6,1,1
chr15	55522671	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:55522669_CA_C:55522669:2,6,1,1
chr15	55522674	.	G	GTTCTTC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:55522669_CA_C:55522669:2,6,1,1
chr15	55611433	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,17,10
chr15	55621889	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,4,1
chr15	55626229	.	A	ACTCTAAGAATGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr15	55710208	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=198,233;MMQ=40,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:2,0,2,0
chr15	55710365	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0|1:55710365_T_C:55710365:0,0,6,16
chr15	55710369	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,6:0|1:55710365_T_C:55710365:0,0,5,13
chr15	55724895	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=205,199;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55724895_A_G:55724895:0,2,0,1
chr15	55724901	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=205,199;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55724895_A_G:55724895:0,2,0,1
chr15	55759193	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	55881111	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	55929543	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:5,9,1,2
chr15	55929545	.	A	ATTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:5,10,1,1
chr15	55974742	.	TTTTATTTATTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=TTTA;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.727:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	56032519	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr15	56032531	.	CAAAATGTAGCAATGA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr15	56032631	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.236:32:12,7:12,0:16,9,7,0
chr15	56032658	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,3:14,0:17,8,1,2
chr15	56032975	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr15	56035010	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:3,1,7,3
chr15	56035147	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56035147_G_A:56035147:0,2,0,1
chr15	56035152	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56035147_G_A:56035147:0,1,0,1
chr15	56122882	.	A	AAGCACCTTGTTGGTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=110,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.470:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	56130286	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,12,6
chr15	56132616	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr15	56144841	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=249,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr15	56152598	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr15	56152729	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr15	56152872	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr15	56164521	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,5,1
chr15	56208645	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=186,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:2,11:5,10:3,4,9,12
chr15	56243778	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=127,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,0:12,4:13,15,2,2
chr15	56243792	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=97,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:2,2:4,1:3,3,1,2
chr15	56243809	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.204:13:5,0:6,1:2,9,1,1
chr15	56258809	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr15	56386577	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr15	56387083	.	GG	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:4,8,1,1
chr15	56394295	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	56535499	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	56657581	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	56680836	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	56704613	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=104,131;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:19,0:16,5:15,22,0,5
chr15	56719797	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,15,21
chr15	56720026	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,0:4,3:0,15,0,3
chr15	56720715	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr15	56721264	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	56721406	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr15	56748627	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.099:39:9,0:17,3:26,10,3,0
chr15	56757231	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,5:1,3,0,5
chr15	56946296	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr15	56968884	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=125,30;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:9,6,1,1
chr15	56971055	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:56971055_T_G:56971055:1,9,0,2
chr15	56971061	.	A	AACTTAGTGGTGGGGCCTTCTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:56971055_T_G:56971055:0,8,0,2
chr15	56981703	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr15	57484587	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=202,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:57484587_C_A:57484587:0,3,0,2
chr15	57484590	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=202,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:57484587_C_A:57484587:0,3,0,2
chr15	57523542	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr15	57524857	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr15	57555523	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr15	57565561	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=76,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr15	57574745	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,26;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:0|1:57574745_C_G:57574745:3,5,1,1
chr15	57574746	.	T	TCAGGCCATCAC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=119,26;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:0|1:57574745_C_G:57574745:3,5,1,1
chr15	57574774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	57574823	.	C	CTTCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr15	57731573	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.659:21:3,6:3,8:3,4,9,5
chr15	57732743	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	57743603	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=219,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	57744396	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=87,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:7,1:6,1:6,7,3,1
chr15	57753884	.	T	TCTCCTTTCTCTGTGGGAGCAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,1,1
chr15	57836823	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	57838258	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,4:0,13:0,0,11,6
chr15	57910444	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	57921996	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:12,0:2,2:0|1:57921996_G_C:57921996:7,7,1,1
chr15	57922001	.	G	GAAAAATCAGTATTACTGC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:3,2:0|1:57921996_G_C:57921996:7,8,1,1
chr15	57924586	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=41,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:3,3,2,2
chr15	57925990	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,4:1,2:0,2,1,5
chr15	57953564	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	57967219	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr15	57967285	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr15	57976583	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr15	58001639	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:1,9,0,2
chr15	58001641	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,9,0,2
chr15	58001644	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,9,0,2
chr15	58001648	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,1:1,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,8,0,2
chr15	58001651	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,23;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,6,0,2
chr15	58001655	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,6,0,2
chr15	58001656	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:58001641_CTT_C:58001641:1,5,0,2
chr15	58004423	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:2,5,1,7
chr15	58004438	.	G	GACTTCCATGCTGGGGGTATACTA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=127,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:6,1:1,9,0,2
chr15	58247494	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,27;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr15	58253062	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=91,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:1,3,0,3
chr15	58253106	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr15	58256296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	58257847	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr15	58287381	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=181,197;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,0:4,7:0|1:58287381_G_A:58287381:5,4,0,7
chr15	58287387	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=181,197;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,0:5,6:0|1:58287381_G_A:58287381:5,4,0,7
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chr15	58838010	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,6:3,6:4,4,8,4
chr15	58838038	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,5:6,4:9,4,4,5
chr15	58840450	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr15	58853079	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,18,10
chr15	58853212	.	GAC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.922:10:0,3:0,6:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,1,9
chr15	58853218	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,1,9
chr15	58861088	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr15	58889894	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=73,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58889894_C_T:58889894:0,2,0,1
chr15	58889912	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,31;MFRL=136,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58889894_C_T:58889894:1,1,0,1
chr15	58889917	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=126,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58889894_C_T:58889894:1,0,0,1
chr15	58889921	.	A	AATCTTTTGGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=126,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58889894_C_T:58889894:1,0,0,1
chr15	58889925	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=126,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58889894_C_T:58889894:1,0,0,1
chr15	58902802	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58902802_G_A:58902802:0,1,0,1
chr15	58902806	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58902802_G_A:58902802:0,1,0,1
chr15	58938436	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr15	58957475	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr15	59094494	.	CT	C,CTT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,20,26;MFRL=134,108,100;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.25,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,9,5:0.213,0.151:33:7,4,2:8,5,1:11,8,9,5
chr15	59094593	.	G	GAGGTGGAGTCTCAC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,2:12,2:7,17,0,4
chr15	59144199	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=228,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr15	59172361	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=170,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:1,6,1,1
chr15	59179443	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:7,5,5,0
chr15	59179465	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=107,11224666;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:16,0:2,2:10,8,1,1
chr15	59182744	.	GAG	ATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59182744_GAG_ATA:59182744:0,0,0,1
chr15	59182760	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:59182744_GAG_ATA:59182744:0,0,0,1
chr15	59185929	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	59190930	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,3:9,6:12,1,9,0
chr15	59190959	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:9,0:21,3:24,7,3,0
chr15	59225818	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=216,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr15	59350763	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr15	59358862	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,513;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	59373523	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:59373523_T_C:59373523:1,4,0,2
chr15	59373531	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=56,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:59373523_T_C:59373523:1,3,0,2
chr15	59373535	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:59373523_T_C:59373523:0,3,0,2
chr15	59397350	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:4,1,4,0
chr15	59407019	.	AGGCTTCTGCAGGAGACTCTGTACAT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,72;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:9,2:12,13,1,1
chr15	59417010	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:2,6:5,7:5,2,9,5
chr15	59429759	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	59453236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:1,2,6,1
chr15	59464310	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	59466086	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:11,0:8,2:0|1:59466086_C_T:59466086:7,13,1,1
chr15	59466092	.	C	CCTTTCTCTTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,1:0|1:59466086_C_T:59466086:7,11,1,1
chr15	59466134	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,0:4,2:1,5,0,3
chr15	59497708	.	G	GAATTTCATTGAACAAAATGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATTTCATTGAACAAAATGT;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr15	59499120	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,0:5,3:4,2,2,1
chr15	59500042	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=223,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:5,3,5,2
chr15	59500842	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,4,2
chr15	59515385	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:13,0:0|1:59515385_G_A:59515385:8,9,1,1
chr15	59515390	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,2:11,0:0|1:59515385_G_A:59515385:8,8,1,1
chr15	59515446	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:0,4,1,2
chr15	59516893	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,3,5
chr15	59524056	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	59548475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr15	59564445	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:6,3,4,0
chr15	59664607	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	59784493	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,1:7,6:4,4,4,3
chr15	59799472	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,2:13,0:0|1:59799472_G_A:59799472:15,16,1,1
chr15	59799475	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:15,2:14,0:0|1:59799472_G_A:59799472:16,16,1,1
chr15	59801093	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:25,0:15,2:0|1:59801093_C_T:59801093:22,19,1,1
chr15	59801106	.	GAGCACCAAACTGAA	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=96,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:24,0:19,2:0|1:59801093_C_T:59801093:22,26,1,1
chr15	59910958	.	A	AACCTGGAGTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:5,5,1,1
chr15	59912448	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:59912448_C_CTT:59912448:0,3,0,1
chr15	59912451	.	CC	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:59912448_C_CTT:59912448:0,3,0,1
chr15	59912469	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59912469_C_A:59912469:0,0,0,1
chr15	59912472	.	TA	GT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59912469_C_A:59912469:0,0,0,1
chr15	59912479	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59912469_C_A:59912469:0,0,0,1
chr15	59913078	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59913078_T_C:59913078:0,0,0,1
chr15	59913084	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59913078_T_C:59913078:0,0,0,1
chr15	59913092	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59913078_T_C:59913078:0,0,0,1
chr15	59931429	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:5,10:5,8:0,10,6,12
chr15	59960261	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.689:30:5,10:4,11:6,3,12,9
chr15	59961570	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.284:16:3,1:9,3:4,8,2,2
chr15	59961579	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:4,9,0,2
chr15	59961646	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=255,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr15	59963303	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=171,247;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:59963303_G_A:59963303:2,0,1,0
chr15	59963304	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=171,247;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:59963303_G_A:59963303:2,0,1,0
chr15	59963308	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,19;MFRL=171,247;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:59963303_G_A:59963303:2,0,1,0
chr15	59963420	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,4:11,0:11,8,4,0
chr15	59963488	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,95;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,1:5,5:4,7,3,3
chr15	59964798	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr15	59964973	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,0:15,4:6,19,4,0
chr15	59964987	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,1:4,10:0,6,2,9
chr15	59970298	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:0,2,0,7
chr15	59972353	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:59972353_G_GT:59972353:0,0,1,0
chr15	59972372	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59972353_G_GT:59972353:0,0,1,0
chr15	59974525	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=105,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:0,2:4,3:10,0,5,0
chr15	59974566	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:1,5:6,7:5,3,4,9
chr15	59974777	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=73,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr15	59981719	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr15	60297110	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr15	60297774	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr15	60639981	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:60639981_T_C:60639981:0,2,0,1
chr15	60639986	.	C	CCTTGGGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:60639981_T_C:60639981:0,2,0,1
chr15	60639988	.	A	AGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:0,1:0|1:60639981_T_C:60639981:0,1,0,1
chr15	60643853	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr15	60644074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:1,2,1,9
chr15	60648214	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,6:4,3:6,5,4,5
chr15	60674672	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr15	60678160	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,2:3,10:5,1,9,3
chr15	60678298	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=20,25;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:6,7:13,15:8,11,8,14
chr15	60678328	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:4,1:7,8:2,10,1,8
chr15	60678350	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:0,1:6,6:0,6,1,6
chr15	60678381	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60678381_T_C:60678381:0,3,0,1
chr15	60678384	.	CATCTGACGATATTGG	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=175,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60678381_T_C:60678381:0,3,0,1
chr15	60715800	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,18:0,6:0,0,16,8
chr15	60728475	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=19,25;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:2,0:0,1:0,11,1,1
chr15	60728489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,0:5,1:0,8,1,1
chr15	60740198	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,95;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:9,7,2,1
chr15	60742063	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr15	60742105	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=171,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60742105_T_TC:60742105:0,1,0,1
chr15	60742109	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=171,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60742105_T_TC:60742105:0,1,0,1
chr15	60745781	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr15	60748755	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	60748783	.	T	TACACAC,TACACACACAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25,24;MFRL=0,134,167;MMQ=60,50,40;MPOS=6,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,16,18;RU=AC;STR;TLOD=4.53,6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.392,0.523:5:0,2,1:0,0,2:0,0,5,0
chr15	60748810	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=148.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,12:0,34:0,0,19,33
chr15	60770096	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,101;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:10,8:10,0:10,10,8,0
chr15	60795086	.	GTTTGGGTCA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTGGGTCA;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr15	60797607	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:0,2:4,0,3,0
chr15	60824108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr15	60850320	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	62147176	.	AG	TC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:8,3:7,12,0,3
chr15	62147207	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=278,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr15	62155732	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:19,0:7,3:9,18,0,3
chr15	62167017	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr15	62167897	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:5,2,4,1
chr15	62169072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr15	62172985	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:2,2:3,6:2,3,6,3
chr15	62173926	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=115,111;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,0:9,5:14,5,5,0
chr15	62173939	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=118,111;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:13,0:14,5:16,14,5,0
chr15	62201333	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	62204280	.	C	CCCACCAGATACAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62204280_C_CCCACCAGATACAT:62204280:0,1,0,1
chr15	62204282	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62204280_C_CCCACCAGATACAT:62204280:0,1,0,1
chr15	62211450	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr15	62239304	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	62243090	.	A	AATAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AT;STR;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,6:0,0,9,2
chr15	62243105	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:8,0:8,3,1,1
chr15	62259637	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,6:5,6:5,7,5,7
chr15	62261741	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62261741_C_CT:62261741:0,0,0,1
chr15	62261742	.	A	AAGTGTTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62261741_C_CT:62261741:0,0,0,1
chr15	62265019	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=167,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	62284087	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62284087_C_CT:62284087:0,1,0,1
chr15	62284101	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62284087_C_CT:62284087:0,1,0,1
chr15	62304420	.	GACACAC	G,GAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34,31;MFRL=188,162,161;MMQ=60,60,60;MPOS=14,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=AC;STR;TLOD=4.83,10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.258,0.500:10:1,0,3:1,2,2:0,2,0,8
chr15	62306020	.	TAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=171,130;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,0:4,8:7,1,8,0
chr15	62327127	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:3,2,8,1
chr15	62361624	.	A	ACCTAGAAGAAAACCTAGGCATTACCAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	62361764	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=159,259;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr15	62361783	.	AAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:2,2,1,0
chr15	62361789	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=130,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:0,0:3,2,1,0
chr15	62456358	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	62457216	.	A	AGAGACCATGAAGAATATACCAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:2,5,1,1
chr15	62939440	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr15	62967342	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	62967395	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr15	62967554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr15	62979016	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr15	62986527	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:8,2:6,0:5,10,1,2
chr15	62990916	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr15	62993464	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:11,2:7,1:2,16,0,3
chr15	62994428	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	62999502	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=155,144;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,2,0,1
chr15	62999508	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=155,144;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,2,0,1
chr15	62999510	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=155,144;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,2,0,1
chr15	62999518	.	T	TCCTA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=213,144;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,3,0,1
chr15	62999520	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=213,144;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,3,0,1
chr15	62999523	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=270,144;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62999502_A_C:62999502:1,2,0,1
chr15	63004025	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	63009733	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr15	63014548	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr15	63030398	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr15	63032955	.	G	GGCC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:63032955_G_GGCC:63032955:9,6,1,1
chr15	63032958	.	G	GGCAAAGAAAATTATATTCTCTA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:63032955_G_GGCC:63032955:10,6,1,1
chr15	63040527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,178;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr15	63044637	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr15	63054439	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	63073476	.	T	TTTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=86,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63073476_T_TTTG:63073476:1,2,0,1
chr15	63073479	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,21;MFRL=86,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:63073476_T_TTTG:63073476:1,2,0,1
chr15	63073483	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,21;MFRL=86,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:63073476_T_TTTG:63073476:1,2,0,1
chr15	63073503	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63073503_A_AG:63073503:0,0,0,1
chr15	63073506	.	C	CGGAAGGAGCTAGACGGCGGTCGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63073503_A_AG:63073503:0,0,0,1
chr15	63075920	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=TG;STR;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.878:15:0,9:0,3:2,0,8,5
chr15	63092489	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,4137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	63132746	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=97,134;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,0:13,4:10,19,4,0
chr15	63336099	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=239,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr15	63349096	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.921:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr15	63349168	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,0:7,3:5,4,3,0
chr15	63351687	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	63351840	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,12:0,0,8,8
chr15	63353581	.	C	CCGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=50,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63353581_C_CCGCA:63353581:0,2,0,1
chr15	63353582	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=50,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63353581_C_CCGCA:63353581:0,2,0,1
chr15	63363401	.	C	CATTTTGTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr15	63414183	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	63414723	.	TGG	CTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	63433766	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,10:0,23:0,0,14,19
chr15	63447932	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=11,25;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.356:22:2,3:2,4:1,13,1,7
chr15	63448764	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:1,13,0,2
chr15	63449543	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr15	63449680	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr15	63548660	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,1:9,1:16,3,2,0
chr15	63554824	.	GTA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr15	63578718	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	63598008	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr15	63848805	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr15	63866279	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:8,0:8,13,3,0
chr15	63901447	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:3,14,0,2
chr15	63904366	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=173,156;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.385:5:1,1:2,0:3,0,2,0
chr15	63904368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=174,116;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr15	63922752	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr15	63932513	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:4,6,7,3
chr15	63935149	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:5,3,6,3
chr15	63937209	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr15	63941906	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=78,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,1:4,8,2,0
chr15	63953153	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0|1:63953153_A_G:63953153:0,0,10,7
chr15	63953156	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=122,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:63953153_A_G:63953153:11,7,1,1
chr15	63953159	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=122,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:63953153_A_G:63953153:11,7,1,1
chr15	63958105	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,3:6,0:5,2,2,1
chr15	63958762	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	63964669	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,129;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:6,5,1,2
chr15	63966513	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=104,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.177:28:6,1:14,3:18,5,3,2
chr15	63984772	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:3,6,2,5
chr15	63998863	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=192,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr15	63998914	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,148;MMQ=43,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:2,3:6,1:8,0,4,0
chr15	64004913	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:6,0,2,1
chr15	64008592	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=84,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:0|1:64008592_C_T:64008592:4,12,0,2
chr15	64008600	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:0|1:64008592_C_T:64008592:3,12,0,2
chr15	64008602	.	T	TTACATG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:9,2:0|1:64008592_C_T:64008592:3,11,0,2
chr15	64011104	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:1,4,1,8
chr15	64017798	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr15	64020073	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr15	64039050	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,5:0,2:2,0,7,1
chr15	64039192	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:9,11,2,1
chr15	64039381	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=203,181;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr15	64039879	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,4:3,8:4,0,8,4
chr15	64039881	.	GCA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:9,1:10,4,2,0
chr15	64046827	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:8,0:15,2:7,17,1,1
chr15	64048599	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:64048599_A_T:64048599:12,2,1,1
chr15	64048613	.	A	AGTAGAGACTGGGTTTCACCATG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:64048599_A_T:64048599:13,4,1,1
chr15	64048990	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	64050300	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr15	64056437	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	64218385	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr15	64231653	.	G	GAACAAAGATTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	64263532	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr15	64263784	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:3,3:0,3:2,2,1,5
chr15	64263795	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:0,2,1,8
chr15	64275645	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=87,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,4:1,0:2,0,4,1
chr15	64367775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr15	64381072	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=166,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr15	64381148	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	64410484	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr15	64410543	.	T	TGGCTTCCTGAGGAGGAAAAGAAATGAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=175,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr15	64415871	.	A	AGTGAAGCTGCACATCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	64418221	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr15	64418483	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	64420093	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=115,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	64428657	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr15	64448247	.	TTCTCCACCTCGATCTTGCCGCAGTCTGCGATGATCACATCCTTCAGGGGTTTATCCCGGCTGTCTGTCTTGGTGC	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=94,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,12:0.087:53:6,1:15,11:20,21,1,11
chr15	64448365	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr15	64496611	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=43,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:1,1:1,3:1,3,3,1
chr15	64508862	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:11,10,1,1
chr15	64658334	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr15	64668942	.	TTTCTCTTTGCTTTTCCTAAGCCACTGCTTCCTGCCTCTTCAGGAATCTGA	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.078:42:12,0:10,4:14,22,3,3
chr15	64680186	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:6,12,0,2
chr15	64689780	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:64689780_T_A:64689780:10,4,1,1
chr15	64689787	.	GA	CT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:64689780_T_A:64689780:10,4,1,1
chr15	64689789	.	T	TTCTTC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:64689780_T_A:64689780:10,4,1,1
chr15	64689790	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:64689780_T_A:64689780:10,4,1,1
chr15	64706259	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr15	64968119	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:8,0:11,5:9,10,0,6
chr15	64972760	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=TG;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr15	64973611	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,4,6
chr15	64983837	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.430:9:0,1:1,1:0,5,1,3
chr15	65054562	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr15	65054571	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	65107804	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	65108652	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65108689	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:65108689_AG_CC:65108689:2,0,1,0
chr15	65108696	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:65108689_AG_CC:65108689:2,0,1,0
chr15	65108707	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	65110362	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr15	65110391	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr15	65110546	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=71,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:4,11,0,2
chr15	65113764	.	CTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,1:1,0:1,0,0,2
chr15	65114363	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=442,90;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr15	65114641	.	A	AGATGGAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=59,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:65114641_A_AGATGGAT:65114641:1,1,0,1
chr15	65114642	.	C	CCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=59,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:65114641_A_AGATGGAT:65114641:1,1,0,1
chr15	65114645	.	C	CTTCCCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=59,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:65114641_A_AGATGGAT:65114641:1,1,0,1
chr15	65157874	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=63,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:5,3:2,9:4,3,5,7
chr15	65209718	.	GTGTC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGTC;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:2,7,1,1
chr15	65235673	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=162,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:65235673_C_T:65235673:2,4,1,1
chr15	65235687	.	A	ACACCCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=162,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,1:0|1:65235673_C_T:65235673:4,6,1,1
chr15	65268979	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr15	65273399	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr15	65295422	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,2:7,1:10,6,2,1
chr15	65312579	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.126:45:23,0:16,5:24,16,5,0
chr15	65344035	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	65350743	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr15	65350968	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,9,12
chr15	65357434	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	65357491	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,7,3
chr15	65370227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr15	65398619	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr15	65411087	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:65411087_C_T:65411087:8,10,1,1
chr15	65411104	.	G	GGA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:10,0:0|1:65411087_C_T:65411087:7,10,1,1
chr15	65411612	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:3,1:6,1,2,0
chr15	65411716	.	G	GGCTGATTCTGTAACTTTCCCTAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:1,2:5,0:3,4,1,1
chr15	65412115	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,148;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,0:15,4:12,17,0,4
chr15	65421402	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=124,44;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:8,2:0|1:65421402_C_T:65421402:11,9,1,1
chr15	65421411	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=128,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:65421402_C_T:65421402:12,11,1,1
chr15	65421414	.	A	ATACGCCTGC	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=130,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:65421402_C_T:65421402:10,12,1,1
chr15	65421418	.	C	CGCT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=130,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:65421402_C_T:65421402:9,13,1,1
chr15	65421420	.	CGT	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=130,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:9,2:0|1:65421402_C_T:65421402:9,15,1,1
chr15	65421423	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=130,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:9,2:0|1:65421402_C_T:65421402:9,15,1,1
chr15	65449169	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,10,15
chr15	65477360	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,0:7,0:1,12,0,2
chr15	65477364	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:2,2:3,4:1,11,0,6
chr15	65489083	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:13,9,1,1
chr15	65491146	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,1,1
chr15	65494398	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=50,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:65494398_G_GA:65494398:2,3,1,1
chr15	65494399	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=50,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:65494398_G_GA:65494398:2,3,1,1
chr15	65563439	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=187,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr15	65621541	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65621541_C_G:65621541:0,0,0,1
chr15	65621542	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65621541_C_G:65621541:0,0,0,1
chr15	65621546	.	TCA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65621541_C_G:65621541:0,0,0,1
chr15	65621551	.	C	CGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65621541_C_G:65621541:0,0,0,1
chr15	65621557	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65621541_C_G:65621541:0,0,0,1
chr15	65624228	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65624509	.	G	GGATTGTCAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:65624509_G_GGATTGTCAA:65624509:1,5,1,1
chr15	65624512	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:0|1:65624509_G_GGATTGTCAA:65624509:1,5,1,1
chr15	65624529	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:65624529_G_GAT:65624529:0,4,0,1
chr15	65624531	.	G	GAGTCTGTGCCCTGGGCTGTGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:65624529_G_GAT:65624529:0,4,0,1
chr15	65667548	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:6,3:6,0:8,5,2,2
chr15	65676617	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=218,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:1,6:10,3:5,6,4,5
chr15	65677417	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	65681707	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:65681707_G_C:65681707:4,8,1,1
chr15	65681713	.	T	TACATCCTAGGCAAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:65681707_G_C:65681707:4,8,1,1
chr15	65682432	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:65682432_A_C:65682432:0,1,2,0
chr15	65682435	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:65682432_A_C:65682432:0,1,2,0
chr15	65682438	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:65682432_A_C:65682432:0,1,2,0
chr15	65682445	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=88,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:65682432_A_C:65682432:1,1,1,0
chr15	65684347	.	T	TTCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=176,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:65684347_T_TTCA:65684347:1,6,1,1
chr15	65684349	.	G	GAATGTCCCCGCAGTTCAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=176,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:65684347_T_TTCA:65684347:1,6,1,1
chr15	65684533	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:5,5:1,5:2,4,5,5
chr15	65685695	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=81,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:1,3:7,1:5,4,2,2
chr15	65686908	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:3,3,1,2
chr15	65689267	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:11,1:0,4:5,7,4,1
chr15	65744267	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:1,2:1,1:2,0,1,3
chr15	65773975	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	65782451	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65799767	.	TA	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=239,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr15	65799783	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=245,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65799783_CTG_C:65799783:0,1,0,1
chr15	65799786	.	C	CAAATCATAGGAATAACAACATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=245,178;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65799783_CTG_C:65799783:0,1,0,1
chr15	65804537	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	65847112	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,168;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr15	65864514	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=199,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr15	65877174	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:2,11:4,6:3,3,8,9
chr15	65892366	.	CTGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=264,164;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.332:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr15	65897436	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr15	65897502	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:7,8,2,0
chr15	65916622	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:9,2:9,10,1,1
chr15	65917815	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,3:15,0:17,16,3,0
chr15	65945236	.	T	TCTCCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	65946081	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	65946276	.	GT	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,1:31,1:0|1:65946276_GT_G:65946276:16,37,1,1
chr15	65946280	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:47,11:0.199:58:25,0:22,11:1|0:65946276_GT_G:65946276:17,30,0,11
chr15	65960548	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=171,221;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.643:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr15	65988762	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:6,14,0,3
chr15	65994320	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	66008028	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	66022043	.	T	TAGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:66022043_T_TAGGAAA:66022043:0,3,1,1
chr15	66022045	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:66022043_T_TAGGAAA:66022043:0,3,1,1
chr15	66249807	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr15	66257236	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,5:0,0,10,6
chr15	66273032	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr15	66386853	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:1,5:12,4:3,10,2,7
chr15	66586033	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	66624166	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=190,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,1:0,3:1,1,2,2
chr15	66625703	.	C	CTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=231,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	66643979	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.701:13:1,0:1,2:1,3,2,7
chr15	66644026	.	GA	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=171,134;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr15	66644521	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr15	66644563	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:11,3:3,3:11,3,3,3
chr15	66679734	.	GGCTCTGCAGTTAACGGGACCA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:11,2:12,0:17,14,1,1
chr15	66727396	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=97,71;MMQ=60,28;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,0:6,4:10,4,2,2
chr15	66727430	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=95,71;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:9,0:9,4:14,6,2,2
chr15	66727444	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=75,298;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,0:9,3:9,9,3,0
chr15	66735551	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr15	66736922	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=172,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr15	66779698	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=101,182;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr15	66779728	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=190,101;MMQ=59,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66779728_G_A:66779728:0,4,0,1
chr15	66779731	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=190,101;MMQ=59,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66779728_G_A:66779728:0,4,0,1
chr15	66781497	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,143;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr15	66782186	.	CCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=221,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:66782186_CCCA_C:66782186:0,3,0,1
chr15	66782191	.	T	TCTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=228,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66782186_CCCA_C:66782186:0,2,0,1
chr15	66782195	.	TCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=228,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66782186_CCCA_C:66782186:0,2,0,1
chr15	66782199	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=228,210;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66782186_CCCA_C:66782186:0,2,0,1
chr15	66792317	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=166,160;MMQ=60,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,1:6,4:8,0,5,0
chr15	66793480	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:0,3,1,6
chr15	66806308	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,2:0,15:0,0,14,3
chr15	66806513	.	C	CCTGTTAAAACAGGTATCAAGCAACATTATACATACACTTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,137;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.317:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr15	66821146	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:5,1:8,0,2,0
chr15	66821174	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,5:4,7:6,2,10,2
chr15	66840985	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=747,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,2:2,0,1,3
chr15	66857791	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=211,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr15	67008737	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=87,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,3:6,1:6,3,1,3
chr15	67008807	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:5,2:14,0:9,10,1,1
chr15	67457480	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=215,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0|1:67457480_T_TC:67457480:1,2,2,2
chr15	67457485	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:67457480_T_TC:67457480:0,0,3,4
chr15	67476970	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr15	67479811	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:4,0:0|1:67479811_G_T:67479811:6,6,1,1
chr15	67479814	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:67479811_G_T:67479811:6,6,1,1
chr15	67479818	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=113,142;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:3,2:5,6,1,1
chr15	67495930	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:2,9,0,2
chr15	67495944	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr15	67528754	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,3:17,0:12,15,3,0
chr15	67687968	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=120,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	67709304	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:6,2:11,5,2,1
chr15	67782440	.	AGGAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr15	67872980	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	67873248	.	T	TCAAAATGACTATAGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	67879311	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=80,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.558:5:1,0:0,1:1,1,1,2
chr15	67893002	.	T	TTTTCTTTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=136,78;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=TTTC;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,1,1
chr15	67923392	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:67923392_A_T:67923392:0,1,0,1
chr15	67923396	.	G	GGGCAGATGTTGAGGGGTCAGGGACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:67923392_A_T:67923392:0,1,0,1
chr15	67933892	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr15	67984705	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	67985931	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr15	68041070	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	68121483	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	68122509	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:4,4:6,3:5,5,4,3
chr15	68124665	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,4:6,2:4,4,3,3
chr15	68124722	.	ACCGAG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,21;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr15	68124724	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,0:1,0:0|1:68124724_C_G:68124724:2,1,0,1
chr15	68124728	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:68124724_C_G:68124724:1,3,0,1
chr15	68124735	.	CC	GG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:68124724_C_G:68124724:0,2,0,1
chr15	68434213	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.419:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr15	68434629	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.183:24:14,2:6,2:12,8,2,2
chr15	68445912	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr15	68473744	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:68473744_T_C:68473744:0,2,0,1
chr15	68473746	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:68473744_T_C:68473744:0,2,0,1
chr15	68492028	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr15	68571032	.	C	CAAATGGCTTGTTCACAGACTATCTAGTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.404:8:0,0:3,2:1,5,1,1
chr15	68583175	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,7,8
chr15	68583184	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:7,7,0,2
chr15	68596273	.	G	GAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:68596273_G_GAAAA:68596273:0,0,0,1
chr15	68596274	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:68596273_G_GAAAA:68596273:0,0,0,1
chr15	68603313	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,0,1
chr15	68603625	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0|1:68603625_C_T:68603625:0,0,8,5
chr15	68603634	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:0|1:68603625_C_T:68603625:4,3,2,2
chr15	68618961	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr15	68624175	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr15	68624641	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr15	68628143	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,3,7
chr15	68631740	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	68632030	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:0|1:68632030_G_GC:68632030:0,3,1,1
chr15	68632032	.	T	TTTTGAATTTAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,1:1,0:0|1:68632030_G_GC:68632030:0,3,1,1
chr15	68649587	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr15	68649600	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=84,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:3,2:0|1:68649600_T_C:68649600:7,7,0,2
chr15	68649602	.	A	AGTCTCTCCTAAAATACGAAAGAT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=84,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:68649600_T_C:68649600:7,7,0,2
chr15	68656960	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	68695448	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=202,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0|1:68695448_T_C:68695448:0,3,0,4
chr15	68695458	.	A	AAGAGAACT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:68695448_T_C:68695448:0,4,0,1
chr15	68695460	.	G	GTATTGTCCTCATTTTTAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:68695448_T_C:68695448:0,4,0,1
chr15	68724262	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr15	69003871	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr15	69006972	.	T	TTCCCACGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:2,2:2,0:0|1:69006972_T_TTCCCACGG:69006972:2,3,1,1
chr15	69006974	.	A	AGGTTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,1:2,0:0|1:69006972_T_TTCCCACGG:69006972:2,3,1,1
chr15	69007656	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr15	69011389	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:69011389_A_C:69011389:0,0,5,0
chr15	69011394	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:69011389_A_C:69011389:0,0,6,0
chr15	69011685	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:4,0,0,2
chr15	69072346	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.533:5:0,2:1,1:2,0,3,0
chr15	69072769	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,130;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.134:50:24,0:20,6:19,25,0,6
chr15	69076644	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=128,254;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:69076644_A_C:69076644:1,0,1,0
chr15	69076651	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=128,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:69076644_A_C:69076644:1,0,1,0
chr15	69076656	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,31;MFRL=128,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:69076644_A_C:69076644:1,0,1,0
chr15	69076787	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=93,64;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.161:54:11,0:33,8:24,22,0,8
chr15	69112971	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CA;STR;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:1,2:0,7:0,1,5,6
chr15	69319004	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=129,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:7,1:0|1:69319004_C_T:69319004:4,10,1,1
chr15	69319009	.	G	GACACAGCCCCCACC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:0|1:69319004_C_T:69319004:3,10,1,1
chr15	69320768	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69320768_C_CA:69320768:0,1,0,1
chr15	69320770	.	A	ATTCTGGTTGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69320768_C_CA:69320768:0,1,0,1
chr15	69323822	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,118;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr15	69327998	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	69329624	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	69331185	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=126,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:3,0:4,6:5,2,2,4
chr15	69339714	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=134,344;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:69339714_A_C:69339714:1,0,1,0
chr15	69339721	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,12;MFRL=136,344;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:69339714_A_C:69339714:2,1,1,0
chr15	69339727	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=135,344;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:69339714_A_C:69339714:3,1,1,0
chr15	69347593	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	69349067	.	A	AGCGGTGGGGGAAAAAACGGCCAAGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=162,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:4,3:2,0:2,4,2,1
chr15	69349087	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	69561518	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr15	69676944	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr15	69692337	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:14,9,1,1
chr15	69696249	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	69709686	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr15	69715488	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,22:0,16:0,0,20,19
chr15	69728183	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr15	69728949	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr15	69732483	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr15	69747675	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr15	70342341	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	70342579	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=21,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:70342579_C_T:70342579:8,11,1,1
chr15	70342584	.	GGTGCA	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:0|1:70342579_C_T:70342579:6,10,1,1
chr15	70342593	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:0|1:70342579_C_T:70342579:4,10,1,1
chr15	70342596	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:70342579_C_T:70342579:3,8,1,1
chr15	70342598	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:70342579_C_T:70342579:2,7,1,1
chr15	70342600	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:70342579_C_T:70342579:2,6,1,1
chr15	70342605	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:70342579_C_T:70342579:2,6,1,1
chr15	70344616	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=124,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr15	70344831	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:70344831_C_A:70344831:2,5,1,1
chr15	70344832	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:70344831_C_A:70344831:2,5,1,1
chr15	70347362	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,3:5,5:5,2,8,1
chr15	70349744	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,4,3
chr15	70350457	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,5:2,3,6,3
chr15	70350558	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=124,21;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:17,4:16,0:19,15,3,1
chr15	70351649	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr15	70351788	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,7,6
chr15	70388449	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.792:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr15	70949559	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=160,135;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.320:5:0,0:3,1:0|1:70949559_C_T:70949559:0,4,0,1
chr15	70949566	.	T	TTTGTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=189,135;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70949559_C_T:70949559:0,2,0,1
chr15	70949567	.	C	CCCTGAGACTTTGCTCAAGTTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=189,135;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70949559_C_T:70949559:0,2,0,1
chr15	70949573	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	70959933	.	AT	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:6,9,1,1
chr15	70961203	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:10,5,0,3
chr15	70963518	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:70963518_T_A:70963518:1,7,0,2
chr15	70963519	.	T	TAATAAAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:0|1:70963518_T_A:70963518:1,7,0,2
chr15	70963520	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:70963518_T_A:70963518:1,7,0,2
chr15	70987539	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70987539_G_A:70987539:0,0,0,1
chr15	70987546	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70987539_G_A:70987539:0,0,0,1
chr15	70991925	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0,0,5,16
chr15	70992028	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:1,2,1,2
chr15	71124892	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:4,0:11,2:6,9,1,1
chr15	71125093	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,9,13
chr15	71125529	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71125529_C_T:71125529:0,3,0,1
chr15	71125534	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:71125529_C_T:71125529:0,3,0,1
chr15	71125537	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:71125529_C_T:71125529:0,2,0,1
chr15	71175296	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr15	71185853	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32,26;MFRL=129,191,148;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.29,8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.194,0.364:16:6,1,4:0,2,1:7,0,7,2
chr15	71185880	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:11,4:6,0:15,4,4,0
chr15	71188217	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=117,96;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:4,4,3,0
chr15	71193188	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	71342009	.	TGCAGGTTATAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	71447337	.	C	CTCTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	71507352	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,7:2,1:4,4,3,5
chr15	71507764	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	71535458	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=88,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:5,6:1,2:5,2,2,6
chr15	71548937	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,2,2
chr15	71704238	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71704238_A_AGT:71704238:0,1,0,1
chr15	71704240	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71704238_A_AGT:71704238:0,1,0,1
chr15	71704243	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71704238_A_AGT:71704238:0,1,0,1
chr15	71839926	.	A	ATCGAGTAGAATGGAAAGGAATGGAATCAACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=230,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	72023422	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr15	72037590	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=86,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:0|1:72037590_C_T:72037590:3,6,1,1
chr15	72037595	.	AGGTCGCCTATTACCG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=99,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:4,2:0|1:72037590_C_T:72037590:2,8,1,1
chr15	72037610	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.888:6:0,0:0,5:1|0:72037590_C_T:72037590:0,0,1,5
chr15	72050163	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	72057455	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:0|1:72057455_T_C:72057455:13,8,0,2
chr15	72057458	.	T	TTCCCTTTCCCCTGGTGATCCAGGTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:15,0:7,2:0|1:72057455_T_C:72057455:14,8,0,2
chr15	72104707	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=69,54;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:6,2:0|1:72104707_C_T:72104707:8,11,1,1
chr15	72104721	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:7,2:0|1:72104707_C_T:72104707:16,12,1,1
chr15	72104722	.	C	CCT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:21,0:7,2:0|1:72104707_C_T:72104707:16,12,1,1
chr15	72104727	.	C	CCT	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:21,0:6,2:0|1:72104707_C_T:72104707:15,12,1,1
chr15	72104728	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:19,0:6,2:0|1:72104707_C_T:72104707:15,13,1,1
chr15	72104732	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:20,0:8,1:0|1:72104707_C_T:72104707:15,13,1,1
chr15	72105928	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,3,3
chr15	72106490	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=1819,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr15	72143717	.	A	ACAAGT	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=24,20;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,4,1,1
chr15	72143720	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=23,20;MFRL=98,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:72143720_A_G:72143720:1,4,1,1
chr15	72143722	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,4,1,1
chr15	72143724	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,35;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,4,1,1
chr15	72143725	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,26;MFRL=98,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,4,1,1
chr15	72143726	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=103,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:72143720_A_G:72143720:0,3,1,1
chr15	72143734	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=21,28;MFRL=88,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,3,0,1
chr15	72143736	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=88,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:72143717_A_ACAAGT:72143717:1,3,0,1
chr15	72168045	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	72191073	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr15	72338400	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=113,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr15	72431883	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,693;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	72432583	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr15	72454729	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,4,4
chr15	72457744	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=94,152;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,0:5,4:5,5,0,4
chr15	72457746	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,2:9,0:0|1:72457746_G_A:72457746:4,9,1,1
chr15	72457751	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:8,0:0|1:72457746_G_A:72457746:5,8,1,1
chr15	72457757	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=147,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:6,0:0|1:72457746_G_A:72457746:4,8,1,1
chr15	72459354	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,128;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,4:14,0:15,13,4,0
chr15	72460817	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=95,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:72460817_C_T:72460817:2,2,1,0
chr15	72460827	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=59,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:0|1:72460817_C_T:72460817:4,3,1,1
chr15	72462165	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr15	72492779	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr15	72543144	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=100,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.308:7:1,0:3,0:0,5,2,0
chr15	72543656	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	72545704	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,63;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:72545704_G_A:72545704:7,0,2,0
chr15	72545713	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=184,63;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:72545704_G_A:72545704:6,0,2,0
chr15	72545876	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr15	72546765	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,5,10
chr15	72552826	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:12,0:10,14,1,1
chr15	72556799	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	72557928	.	ACA	GAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	72608267	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:2,4,0,2
chr15	72637795	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr15	72640361	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.306:8:2,0:2,0:0|1:72640361_A_G:72640361:3,3,2,0
chr15	72640370	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:2,1:1,0:0|1:72640361_A_G:72640361:2,3,2,0
chr15	72700028	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:9,6,2,1
chr15	72859047	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.709:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr15	72864578	.	ATT	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.443:13:4,4:1,1:4,4,1,4
chr15	72864610	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=144,229;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:6,0:3,2:0,11,0,2
chr15	72879653	.	A	ATTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr15	72954508	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr15	73002015	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,76;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:6,3:8,0:11,3,2,1
chr15	73002035	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr15	73004739	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr15	73021855	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=94,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:5,2,4,1
chr15	73028367	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr15	73028375	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	73030010	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,163;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.579:2:1,1:0,0:0|1:73030010_G_GA:73030010:0,1,0,1
chr15	73030011	.	C	CAGAGAAACAGAGAGAAAGACAGAGAGAGCGAGAGAGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=109,163;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.579:2:1,1:0,0:0|1:73030010_G_GA:73030010:0,1,0,1
chr15	73052840	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:0|1:73052840_T_C:73052840:4,2,2,2
chr15	73052845	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:0|1:73052840_T_C:73052840:4,2,2,2
chr15	73409213	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.609:10:3,3:1,1:1,3,3,3
chr15	73428204	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	73528937	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	73545714	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0|1:73545714_AT_A:73545714:0,0,2,1
chr15	73545732	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:73545714_AT_A:73545714:0,0,2,2
chr15	73551250	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr15	73562451	.	GAG	TCC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:0|1:73562451_GAG_TCC:73562451:8,11,0,2
chr15	73562456	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:0|1:73562451_GAG_TCC:73562451:7,11,0,2
chr15	73562459	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:73562451_GAG_TCC:73562451:7,10,0,2
chr15	73562463	.	CATCAGGAT	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:12,2:0|1:73562451_GAG_TCC:73562451:7,11,0,2
chr15	73562474	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,0:14,2:0|1:73562451_GAG_TCC:73562451:8,11,0,2
chr15	73564881	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr15	73566942	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,18,2
chr15	73570615	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr15	73570643	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73570643_A_T:73570643:0,0,0,1
chr15	73570645	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73570643_A_T:73570643:0,0,0,1
chr15	73570649	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73570643_A_T:73570643:0,0,0,1
chr15	73570653	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73570643_A_T:73570643:0,0,0,1
chr15	73570656	.	T	TCTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73570643_A_T:73570643:0,0,0,1
chr15	73585653	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=99,15;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:6,1,0,3
chr15	73585762	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=111,44;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:8,2:11,0:13,7,1,1
chr15	73585775	.	C	CAAACAGGCAAATAGGCCAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,2:11,0:12,6,1,1
chr15	73595087	.	C	CAGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=73,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:73595087_C_CAGA:73595087:1,2,0,1
chr15	73595088	.	T	TGTATA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=73,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:73595087_C_CAGA:73595087:1,2,0,1
chr15	73595089	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=88,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.664:4:1,0:0,3:1|0:73595087_C_CAGA:73595087:0,1,1,2
chr15	73595093	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,22;MFRL=73,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:73595087_C_CAGA:73595087:1,2,0,1
chr15	73595097	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=73,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:73595087_C_CAGA:73595087:1,2,0,1
chr15	73614834	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,11,15
chr15	73616635	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr15	73889752	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.361:13:1,0:0,1:0,8,0,5
chr15	73995077	.	GCCCTGCCCTTGAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,113;MMQ=57,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:4,3,1,1
chr15	73996382	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73996382_A_AT:73996382:0,0,0,1
chr15	73996386	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73996382_A_AT:73996382:0,0,0,1
chr15	74000838	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.373:21:7,8:5,0:0|1:74000838_C_T:74000838:5,8,1,7
chr15	74000839	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,4:0.220:21:12,3:5,1:1|0:74000838_C_T:74000838:4,13,2,2
chr15	74000841	.	GCGCA	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.356:22:6,7:6,0:0|1:74000838_C_T:74000838:5,9,1,7
chr15	74000847	.	GCACACT	G	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.399:18:5,6:4,0:0|1:74000838_C_T:74000838:3,8,0,7
chr15	74000855	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,6:5,0:0|1:74000838_C_T:74000838:2,7,0,6
chr15	74000860	.	TCTTG	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,5:3,0:0|1:74000838_C_T:74000838:1,7,0,5
chr15	74000866	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,4:3,0:0|1:74000838_C_T:74000838:0,6,0,5
chr15	74000869	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=163,168;MMQ=60,55;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,0:0|1:74000838_C_T:74000838:0,5,0,4
chr15	74033033	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=70,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,7:2,2:1,1,2,7
chr15	74043523	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	74176453	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	74177071	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=200,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,2:2,0:3,1,1,1
chr15	74179031	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	74180915	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74180915_TC_T:74180915:0,1,0,1
chr15	74180921	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74180915_TC_T:74180915:0,1,0,1
chr15	74244278	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	74276551	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=224,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:74276551_T_C:74276551:0,3,0,3
chr15	74276560	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:74276551_T_C:74276551:0,2,0,4
chr15	74280867	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=224,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,1:0,2:2,0,3,1
chr15	74282833	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,7:3,0:3,8,1,6
chr15	74284406	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr15	74287181	.	AGGCCCCAGCAGGACCCCGCCC	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.090:32:9,0:11,2:0|1:74287181_AGGCCCCAGCAGGACCCCGCCC_A:74287181:14,16,1,1
chr15	74287199	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,4:0.225:19:8,0:6,2:1|0:74287181_AGGCCCCAGCAGGACCCCGCCC_A:74287181:3,12,4,0
chr15	74287203	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,4:0.194:22:8,0:9,2:1|0:74287181_AGGCCCCAGCAGGACCCCGCCC_A:74287181:4,14,4,0
chr15	74317362	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	74327034	.	G	GCAAGACCAACCCCTCCTCTC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:74327034_G_GCAAGACCAACCCCTCCTCTC:74327034:1,8,0,2
chr15	74327037	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:74327034_G_GCAAGACCAACCCCTCCTCTC:74327034:1,8,0,2
chr15	74327815	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=82,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:74327815_C_CA:74327815:3,4,1,1
chr15	74327816	.	C	CACCTCACCCCCATTACATGCTGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=82,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:74327815_C_CA:74327815:3,4,1,1
chr15	74327820	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=82,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:74327815_C_CA:74327815:3,4,1,1
chr15	74336556	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=234,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.490:5:1,2:1,0:0|1:74336556_G_C:74336556:2,1,1,1
chr15	74336557	.	C	CTTCTCCTCTTCCTCCTTCTTTCTTCTTTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=180,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:74336556_G_C:74336556:1,1,1,1
chr15	74365264	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	74367358	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=179,88;MMQ=24,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr15	74367392	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74367392_A_T:74367392:0,0,0,1
chr15	74367394	.	CCACA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,88;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74367392_A_T:74367392:0,0,0,1
chr15	74427791	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,11;MFRL=108,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.165:44:13,0:10,0:13,23,8,0
chr15	74427951	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=218,272;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:74427951_TC_T:74427951:0,2,0,1
chr15	74427964	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=218,272;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:74427951_TC_T:74427951:0,2,0,1
chr15	74427968	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=234,272;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74427951_TC_T:74427951:0,1,0,1
chr15	74427980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=234,272;MMQ=60,30;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74427951_TC_T:74427951:0,1,0,1
chr15	74429018	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr15	74467977	.	GA	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:74467977_GA_TG:74467977:5,2,1,1
chr15	74467981	.	GG	TT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=89,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:74467977_GA_TG:74467977:5,3,1,1
chr15	74468161	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=224,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr15	74468287	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:10,10,1,1
chr15	74468766	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=165,87;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:2,4,2,3
chr15	74468986	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=72,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:6,4:11,10:11,6,9,5
chr15	74469097	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=76,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.321:42:10,5:16,8:14,15,4,9
chr15	74473073	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=110,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr15	74473302	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:0,1,3,4
chr15	74483415	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr15	74487846	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr15	74487879	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:6,4,4,0
chr15	74494684	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	74528985	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	74529130	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr15	74536285	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30,35;MFRL=217,124,212;MMQ=42,60,60;MPOS=8,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.97,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.469,0.304:6:0,1,1:1,2,1:1,0,4,1
chr15	74536400	.	TAAG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr15	74555001	.	C	CACCAAGTCCCTGTTCCTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=237,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	74564018	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74564018_C_T:74564018:1,0,1,0
chr15	74564024	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:74564018_C_T:74564018:1,2,1,0
chr15	74572242	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	74572917	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	74574184	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:74574184_C_A:74574184:3,4,1,1
chr15	74574185	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:74574184_C_A:74574184:3,4,1,1
chr15	74574188	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:74574184_C_A:74574184:3,4,1,1
chr15	74574191	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:74574184_C_A:74574184:3,4,1,1
chr15	74588024	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr15	74622457	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr15	74623272	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr15	74623302	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr15	74623566	.	TGCTGGAGGACAG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:2,2:4,6,1,1
chr15	74628242	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	74637512	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,58;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr15	74659958	.	C	CTGAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	74702950	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:9,4,1,1
chr15	74703997	.	ACAGGTCCAGGGGCACCTGGCTCACCTCCCACTGGGAGCTCACATACAGCTTCCTCTGGAAGGACAGCAGGATTGGGT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=199,35;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.192:15:4,0:6,2:5,7,1,2
chr15	74706964	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=66,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,3:12,0:21,9,2,1
chr15	74710593	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,10,8
chr15	74749015	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=139,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,4:2,7:1,4,3,9
chr15	74750946	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	74751211	.	T	TGGCTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr15	74751272	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,316;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	74836289	.	TCAGCAGCAGCAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=116,62;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=CAG;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,2:6,0:12,5,1,1
chr15	74836316	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=115,102;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:12,3:4,5:10,6,7,1
chr15	74865409	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr15	74865440	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:2,1,1,1
chr15	74883851	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:3,3:7,4:6,4,2,5
chr15	74912328	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr15	74918387	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74918387_T_C:74918387:0,1,0,1
chr15	74918389	.	A	AGCTCTTTCTTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74918387_T_C:74918387:0,1,0,1
chr15	74919593	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	74924913	.	G	GGTGGGCATCAACTACCACTCGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr15	74948063	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:0,1:1,2:3,0,3,0
chr15	75044238	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr15	75045629	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=98,101;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:9,0:3,5:4,8,0,5
chr15	75108838	.	T	TTTTGGAGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=132,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:0|1:75108838_T_TTTTGGAGA:75108838:15,8,1,1
chr15	75108839	.	C	CAGTTCA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:0|1:75108838_T_TTTTGGAGA:75108838:15,8,1,1
chr15	75114322	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr15	75115126	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75115126_C_T:75115126:0,1,0,1
chr15	75115127	.	C	CTAAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75115126_C_T:75115126:0,1,0,1
chr15	75115895	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr15	75116089	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75116089_T_TC:75116089:0,3,0,1
chr15	75116092	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75116089_T_TC:75116089:0,3,0,1
chr15	75116867	.	G	GACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=90,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr15	75117978	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr15	75120417	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,3:7,0:7,11,1,2
chr15	75120519	.	TC	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=174,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,1:1,5,1,1
chr15	75120555	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75120555_A_C:75120555:0,1,0,1
chr15	75120557	.	GAGACTCACAGGGTAT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75120555_A_C:75120555:0,1,0,1
chr15	75122512	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:9,3:9,13,3,0
chr15	75130015	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,4:1,2:1,0,4,2
chr15	75130523	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:8,6,1,1
chr15	75130573	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,8,10
chr15	75130582	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:2,4,5,4
chr15	75131661	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,7,7
chr15	75132490	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	75140854	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	75142860	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=104,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.133:29:5,2:18,0:14,11,4,0
chr15	75146976	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:6,0:15,3:13,9,0,3
chr15	75183935	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr15	75185670	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr15	75305040	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=80,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:1,8:3,12:2,2,11,9
chr15	75310269	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:16,4:7,0:14,9,4,0
chr15	75310394	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr15	75310710	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr15	75310965	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr15	75630521	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=121,168;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.227:19:5,1:6,2:10,5,0,4
chr15	75631346	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:75631346_A_C:75631346:13,12,1,1
chr15	75631351	.	GGC	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=102,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:14,2:0|1:75631346_A_C:75631346:16,12,1,1
chr15	75631587	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=120,144;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.326:19:7,3:5,2:6,7,2,4
chr15	75645965	.	CCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=58,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,4:8,3:6,8,3,4
chr15	75648297	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:13,0:0|1:75648297_G_A:75648297:9,17,0,2
chr15	75648299	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:12,0:0|1:75648297_G_A:75648297:9,17,0,2
chr15	75650836	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,3:2,4,4,1
chr15	75650972	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:2,3,1,5
chr15	75651022	.	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.489:14:1,3:6,0:5,2,4,3
chr15	75651556	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,13;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75651556_A_C:75651556:0,1,1,0
chr15	75651561	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75651556_A_C:75651556:0,1,1,0
chr15	75651567	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75651556_A_C:75651556:0,1,1,0
chr15	75651573	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=77,156;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:75651556_A_C:75651556:1,1,1,0
chr15	75651576	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=77,156;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:75651556_A_C:75651556:1,1,1,0
chr15	75651581	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=153,156;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:75651556_A_C:75651556:2,1,1,0
chr15	75651583	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=23,14;MFRL=153,156;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:75651556_A_C:75651556:2,1,1,0
chr15	75651724	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:0|1:75651724_G_A:75651724:9,7,1,1
chr15	75651727	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,2:4,0:0|1:75651724_G_A:75651724:9,7,1,1
chr15	75653079	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:75653079_C_CA:75653079:1,3,0,1
chr15	75653081	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:75653079_C_CA:75653079:1,3,0,1
chr15	75653084	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:75653079_C_CA:75653079:1,3,0,1
chr15	75653378	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr15	75668017	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:12,5:10,4:10,12,9,0
chr15	75763072	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=138,222;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,6:9,0:10,6,6,0
chr15	75763095	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,222;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:11,5:12,0:16,7,5,0
chr15	75816649	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:1,4,2,2
chr15	75909933	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,0:3,2,0,2
chr15	75967814	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	75979663	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=66,163;MMQ=46,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:3,4:6,2:3,6,1,5
chr15	75979688	.	T	TAATCCACAAATATAAGATA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=66,166;MMQ=52,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr15	75979705	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=221,66;MMQ=58,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:75979705_C_CA:75979705:0,2,1,1
chr15	75979706	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=221,66;MMQ=58,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:75979705_C_CA:75979705:0,2,1,1
chr15	75979709	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=221,66;MMQ=58,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75979705_C_CA:75979705:0,2,0,1
chr15	75983196	.	G	GGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75983196_G_GGCA:75983196:0,0,0,1
chr15	75983199	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75983196_G_GGCA:75983196:0,0,0,1
chr15	75983202	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75983196_G_GGCA:75983196:0,0,0,1
chr15	75985669	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=149,164;MMQ=27,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr15	76017516	.	C	CTGCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:3,2:8,0:6,5,1,1
chr15	76018560	.	T	TGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,8;MFRL=93,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=4,16;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,0,1
chr15	76171382	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=125,2271;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:2,0:3,2:3,2,1,1
chr15	76175828	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr15	76182949	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	76183191	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=175,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr15	76183198	.	GGCCTTCCCAAGTGGGAATCAGAAATACTACTGTATTTTAGAGATACTTTGTTCTTCTGTAGGGCTGGAGCAGT	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=105,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.103:28:4,0:3,2:22,4,1,1
chr15	76191802	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,7:0,0,9,9
chr15	76191852	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr15	76205523	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=89,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr15	76462286	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=221,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr15	76463491	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:76463491_G_A:76463491:2,4,1,1
chr15	76463493	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:76463491_G_A:76463491:2,4,1,1
chr15	76494681	.	CTTCAAAGCA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=228,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:76494681_CTTCAAAGCA_C:76494681:1,4,1,1
chr15	76494696	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,1:0|1:76494681_CTTCAAAGCA_C:76494681:1,3,1,1
chr15	76494698	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:76494681_CTTCAAAGCA_C:76494681:1,3,0,1
chr15	76518346	.	C	CCCTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	76576182	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.236:17:5,0:5,4:1,12,1,3
chr15	76584686	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=159,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,3:1,5:3,0,3,5
chr15	76629308	.	G	GAGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:14,2:6,0:7,14,0,2
chr15	76630303	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.626:24:2,8:5,6:4,5,4,11
chr15	76632907	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:2,2,2,4
chr15	76673716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=99,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:11,4,2,0
chr15	76797345	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=78,35;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:76797345_CA_TG:76797345:2,4,1,1
chr15	76797353	.	C	CTG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=78,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:76797345_CA_TG:76797345:1,5,1,1
chr15	76797356	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=78,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:76797345_CA_TG:76797345:1,5,1,1
chr15	76797363	.	ACTATAACC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=90,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:76797363_ACTATAACC_A:76797363:0,3,0,1
chr15	76797372	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=90,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:76797363_ACTATAACC_A:76797363:0,3,0,1
chr15	76797375	.	TGATA	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:76797363_ACTATAACC_A:76797363:0,2,0,1
chr15	76957958	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,19,4
chr15	76958035	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.388:42:16,0:8,16:16,10,0,16
chr15	76995150	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:3,1,4,0
chr15	77046310	.	C	CCATGGAAATCAGAAGGTCTTGGCAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.356:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr15	77057474	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=260,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr15	77059199	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr15	77064235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr15	77064297	.	T	TAATACTTAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:77064297_T_TAATACTTAAA:77064297:0,3,0,1
chr15	77064301	.	A	ATACTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:77064297_T_TAATACTTAAA:77064297:0,3,0,1
chr15	77064389	.	TGAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,372;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	77085740	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	77097018	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr15	77234101	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.323:8:2,0:1,2:1,5,0,2
chr15	77236291	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr15	77241568	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr15	77310636	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,5,15
chr15	77310726	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,1:2,1:3,0,2,1
chr15	77310932	.	TAGATGAGGTTTAG	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0|1:77310932_TAGATGAGGTTTAG_T:77310932:0,5,1,1
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chr15	77310951	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:77310932_TAGATGAGGTTTAG_T:77310932:0,5,1,1
chr15	77322029	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr15	77323009	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	77323650	.	G	GGT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,3,6
chr15	77328108	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	77344793	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr15	77406396	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	77450964	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=85,94;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:4,6,3,2
chr15	77471105	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	77472942	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:7,8,2,0
chr15	77764227	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	77907464	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=73,71;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.204:34:15,0:12,5:14,13,1,6
chr15	78295885	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:2,5,1,5
chr15	78337303	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,4:8,7:5,4,7,4
chr15	78337486	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78337486_C_A:78337486:0,4,0,1
chr15	78337489	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78337486_C_A:78337486:0,4,0,1
chr15	78337492	.	A	AGTGGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78337486_C_A:78337486:0,4,0,1
chr15	78390760	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:17,2:2,0:0|1:78390760_G_A:78390760:14,6,1,1
chr15	78390762	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:17,2:3,0:0|1:78390760_G_A:78390760:14,6,1,1
chr15	78398230	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=78,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:1,2:11,5:7,5,3,4
chr15	78401534	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.613:6:1,1:1,3:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,2,0,4
chr15	78401540	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,0,0,6
chr15	78423596	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	78441769	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	78441822	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=6,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78441822_G_A:78441822:1,0,0,1
chr15	78441834	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=6,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78441822_G_A:78441822:1,0,0,1
chr15	78452636	.	AGGCCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=70,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr15	78454795	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	78457242	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr15	78458485	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:5,6:2,1:5,2,4,4
chr15	78463867	.	G	GTGGATGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:6,5,1,1
chr15	78463890	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:4,2:2,3:2,4,3,3
chr15	78466027	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:6,6,1,2
chr15	78466127	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr15	78466919	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:78466919_C_G:78466919:0,2,0,2
chr15	78466930	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:78466919_C_G:78466919:1,3,0,1
chr15	78466940	.	AA	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:78466919_C_G:78466919:1,3,0,1
chr15	78466946	.	A	ACAATCGCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:78466919_C_G:78466919:1,3,0,1
chr15	78471110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,2:1,4:1,2,2,5
chr15	78472157	.	TCACA	T,TCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26,27;MFRL=197,143,133;MMQ=60,60,60;MPOS=28,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=CA;STR;TLOD=6.46,11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.308,0.507:8:1,3,3:0,0,1:0,1,2,5
chr15	78473018	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	78474395	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr15	78485814	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr15	78486175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	78486189	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	78526804	.	CGTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=112,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:1,7,0,2
chr15	78557086	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr15	78558509	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr15	78572359	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr15	78578482	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,4:4,3:2,5,3,4
chr15	78581892	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	78581938	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr15	78585433	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	78587910	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	78633595	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,4,5
chr15	78633768	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78633768_C_CCCT:78633768:0,0,0,1
chr15	78633770	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78633768_C_CCCT:78633768:0,0,0,1
chr15	78633774	.	C	CTCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=201,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78633768_C_CCCT:78633768:0,1,0,1
chr15	78633777	.	CG	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=201,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78633768_C_CCCT:78633768:0,1,0,1
chr15	78758853	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr15	78758902	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=89,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr15	78768468	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	78770558	.	A	AGAGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,205;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr15	78777074	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:5,6:5,0:8,2,6,0
chr15	78777312	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr15	78786410	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr15	78819739	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:10,0:6,16,1,3
chr15	78825917	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.458:24:5,9:8,2:8,5,6,5
chr15	78826035	.	A	AAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:78826035_A_AAT:78826035:1,4,1,1
chr15	78826037	.	T	TCCTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:78826035_A_AAT:78826035:1,4,1,1
chr15	78826040	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=116,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:78826035_A_AAT:78826035:1,4,1,1
chr15	78834311	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,0:17,4:16,17,0,4
chr15	78834689	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr15	78836631	.	CTGA	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=94.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,9:0,0,10,13
chr15	78836661	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=19,20;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:0,1:2,1:0,5,0,3
chr15	78836703	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=152,174;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:1,0:0|1:78836703_G_C:78836703:0,3,0,1
chr15	78836711	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,22;MFRL=166,174;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:78836703_G_C:78836703:0,2,0,1
chr15	78836717	.	GCACGATCT	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=179,174;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78836703_G_C:78836703:0,1,0,1
chr15	78836719	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:78836719_A_G:78836719:0,0,0,1
chr15	78836721	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:78836719_A_G:78836719:0,0,0,1
chr15	78839079	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,3:5,0:4,9,0,3
chr15	78839110	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=190,187;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,1:0,2:1,1,0,7
chr15	78841353	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr15	78873111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=78,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:7,9,2,0
chr15	78873119	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=75,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,6:4,4:4,3,4,7
chr15	78873332	.	A	AATAATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	78909452	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr15	78909480	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr15	78909539	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	78911181	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,8:0,3:2,2,6,5
chr15	78911260	.	G	GCGGGACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr15	78911261	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=77,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr15	78911310	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=184,282;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78911310_C_A:78911310:0,1,0,1
chr15	78911319	.	C	CTTCCCTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=213,282;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:78911310_C_A:78911310:0,2,0,1
chr15	78911343	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78911343_G_A:78911343:0,0,0,1
chr15	78911348	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78911343_G_A:78911343:0,0,0,1
chr15	78913067	.	ACAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=0,0;MMQ=51,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	78917399	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	78917613	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=75,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:4,12,2,0
chr15	78921219	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=70,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr15	78923755	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78923755_G_T:78923755:0,1,0,1
chr15	78923763	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78923755_G_T:78923755:0,1,0,1
chr15	78923769	.	C	CTTCAGGGCACTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78923755_G_T:78923755:0,1,0,1
chr15	79051721	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=169,136;MMQ=40,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	79051759	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=136,169;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr15	79054900	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr15	79054911	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0|1:79054911_A_G:79054911:0,0,0,1
chr15	79054915	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,114;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79054911_A_G:79054911:0,0,0,1
chr15	79056526	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	79058572	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr15	79059449	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=168,203;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr15	79059670	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=202,142;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr15	79059691	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=202,134;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:2,1,3,1
chr15	79059695	.	CG	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=173,134;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,0:0,3:0|1:79059695_CG_TC:79059695:3,2,3,1
chr15	79059703	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0|1:79059695_CG_TC:79059695:3,2,3,2
chr15	79063474	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=98,153;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:3,1,4,1
chr15	79066932	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=86,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:3,4,3,2
chr15	79067233	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=203,173;MMQ=60,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	79069751	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,206;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79069751_C_G:79069751:0,0,1,0
chr15	79069755	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79069751_C_G:79069751:0,0,1,0
chr15	79069757	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79069751_C_G:79069751:0,0,1,0
chr15	79069765	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=176,206;MMQ=40,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:79069751_C_G:79069751:1,0,1,0
chr15	79083376	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr15	79083591	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=132,148;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,0,4
chr15	79083633	.	AACCC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=220,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	79165441	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.350:55:17,9:19,10:12,24,9,10
chr15	79172744	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	79172766	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=213,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr15	79172834	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=121,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.196:19:5,1:9,2:10,6,3,0
chr15	79173005	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:5,2:1,6,0,3
chr15	79187139	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=96,220;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,0:13,4:15,13,4,0
chr15	79217690	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr15	79221720	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=107,53;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:9,3:10,11,1,2
chr15	79227230	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr15	79231518	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,6:0,0,8,13
chr15	79231523	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,120;MMQ=46,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,8:0,3:0,2,4,9
chr15	79231616	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	79237157	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr15	79237180	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr15	79237182	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:5,2,1,1
chr15	79254434	.	TA	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=93,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr15	79254480	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,10,6
chr15	79264097	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	79277247	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr15	79277608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	79282576	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:14,0:3,7:13,5,0,7
chr15	79288011	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr15	79288182	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=93,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:79288182_G_T:79288182:1,2,1,1
chr15	79288184	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=93,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:79288182_G_T:79288182:1,2,1,1
chr15	79288213	.	C	CAGAACCATCTGTGCCAGTCAGATCG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=172,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr15	79290600	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=81,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:3,5,4,3
chr15	79291261	.	G	GGCAGGAGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=76,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:79291261_G_GGCAGGAGGA:79291261:0,2,0,1
chr15	79291266	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79291261_G_GGCAGGAGGA:79291261:0,1,0,1
chr15	79307632	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:5,3,2,1
chr15	79320208	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:79320208_G_T:79320208:4,11,1,1
chr15	79320213	.	GGAA	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=147,46;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:79320208_G_T:79320208:3,10,1,1
chr15	79320220	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=145,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:79320208_G_T:79320208:2,8,1,1
chr15	79320222	.	ACAG	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=145,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:79320208_G_T:79320208:2,8,1,1
chr15	79320227	.	CAGAGACAGG	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=147,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:79320208_G_T:79320208:2,7,1,1
chr15	79320239	.	GCCCCTA	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=148,46;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:79320208_G_T:79320208:1,7,1,1
chr15	79323952	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=127,134;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,0:2,4:0,5,0,5
chr15	79324419	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,1:2,3:2,0,3,2
chr15	79324588	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=96,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:10,10,2,0
chr15	79350840	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=219,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr15	79350861	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:3,2,1,0
chr15	79502096	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,5:4,4:3,1,7,2
chr15	79586102	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=109,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,1:0|1:79586102_C_T:79586102:4,8,1,1
chr15	79586109	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=97,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:79586102_C_T:79586102:4,7,1,1
chr15	79586781	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=116,95;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,3:10,0:8,5,3,0
chr15	79586793	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=95,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:10,5,1,1
chr15	79587574	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:79587574_GA_G:79587574:2,3,1,1
chr15	79587576	.	GTAT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:79587574_GA_G:79587574:2,3,1,1
chr15	79587883	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:12,9,0,3
chr15	79588588	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	79606408	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	79614418	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,6,8
chr15	79749346	.	GGGAACCCCAGAGTCGAAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,0:2,2:3,7,1,1
chr15	80191488	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:8,5:6,3:1,13,2,7
chr15	80216015	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,1:1,6:1,2,3,4
chr15	80259955	.	TGTAA	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,13:0.412:32:6,7:11,5:0|1:80259955_TGTAA_T:80259955:13,6,10,3
chr15	80259964	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.401:33:7,7:11,5:0|1:80259955_TGTAA_T:80259955:13,7,10,3
chr15	80263217	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,31:0.628:49:7,17:11,14:9,9,10,21
chr15	80414173	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr15	80450328	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:6,0,3,0
chr15	80450389	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=95,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,6:3,5:2,1,7,4
chr15	80452075	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:7,4,3,1
chr15	80452268	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,1,3
chr15	80454745	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	80460524	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr15	80464669	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	80464671	.	C	CAGTGTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr15	80465300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=189,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr15	80470040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	80472431	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr15	80762526	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	80806183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,4,2
chr15	80866639	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80866639_T_C:80866639:0,1,0,1
chr15	80866641	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80866639_T_C:80866639:0,1,0,1
chr15	80867480	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,5:2,4,1,6
chr15	80867529	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr15	80884025	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,8:3,2:3,7,3,7
chr15	81171225	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:0|1:81171225_C_CT:81171225:4,7,1,1
chr15	81171227	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:9,0:2,2:0|1:81171225_C_CT:81171225:4,7,1,1
chr15	81171230	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:8,0:2,2:0|1:81171225_C_CT:81171225:4,7,1,1
chr15	81173422	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=103,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:3,0:13,2:0|1:81173422_G_T:81173422:11,6,1,1
chr15	81173440	.	A	AGCATCTAAAGCTGTGCTGTGCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=77,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:2,0:7,2:0|1:81173422_G_T:81173422:5,6,1,1
chr15	81181005	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,220;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,7:4,0:10,3,7,0
chr15	81187286	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.249:16:7,2:4,0:11,1,2,2
chr15	81188346	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0|1:81188346_A_T:81188346:4,4,0,3
chr15	81188350	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:2,3:0|1:81188346_A_T:81188346:4,4,0,3
chr15	81199236	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	81201482	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,113;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:11,9,0,2
chr15	81212608	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	81225770	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:6,6,0,2
chr15	81230154	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=81,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,2:2,0:4,4,1,1
chr15	81234741	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	81235522	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81235522_G_GAC:81235522:0,1,0,1
chr15	81235524	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81235522_G_GAC:81235522:0,1,0,1
chr15	81271557	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.457:13:3,4:4,1:2,5,4,2
chr15	81281900	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,0:4,8:4,0,5,3
chr15	81297465	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:81297465_G_T:81297465:11,6,1,1
chr15	81297470	.	ACCACCCTG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:6,2:0|1:81297465_G_T:81297465:14,9,1,1
chr15	81297484	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:81297465_G_T:81297465:14,9,1,1
chr15	81427705	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.233:36:12,2:12,6:13,14,4,5
chr15	81430305	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	81436149	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,0:3,3:3,4,3,0
chr15	81582868	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=70,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,31:0.628:49:12,15:6,16:9,9,9,22
chr15	81592891	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	81610920	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr15	81631681	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr15	81631870	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr15	81637284	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,9,11
chr15	81641869	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=76,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:4,9,1,1
chr15	81651651	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr15	82335444	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	82431219	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=190,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr15	82444085	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.197:20:5,0:10,2:9,7,0,4
chr15	82444156	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=122,137;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:1,5:14,0:3,12,5,0
chr15	82450268	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr15	82517458	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=134,188;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:7,3,6,0
chr15	82517649	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=112,117;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.297:11:3,2:5,1:2,6,1,2
chr15	82523358	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr15	82530630	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	82532963	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr15	82544927	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	82545214	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	82555242	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.471:43:9,10:12,9:13,10,15,5
chr15	82563853	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,3:6,1,5,0
chr15	82574705	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=135,93;MMQ=40,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,1:2,14,2,0
chr15	83215134	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=95,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:6,1,6,0
chr15	83221392	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr15	83224696	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr15	83226568	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,62;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:16,5:8,0:15,10,5,0
chr15	83240293	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr15	83328756	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr15	83330578	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,42;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr15	83334398	.	G	GTCGGGACTTAGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.266:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr15	83334419	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=224,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr15	83345354	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:7,6,1,2
chr15	83346576	.	A	AAGAGAGAGGGCTCTTTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=200,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,1,1
chr15	83438714	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	83451864	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:83451864_T_TG:83451864:0,3,0,1
chr15	83451865	.	T	TGTGTTTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:83451864_T_TG:83451864:0,3,0,1
chr15	83455557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=84,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:3,4,2,0
chr15	83481880	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=112,98;MMQ=55,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:7,6:9,10:6,10,9,7
chr15	83521036	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr15	83677368	.	TAGCCTCTCCCTCTGATGGAGGTGCTGCAATAGCTACATTTAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.122:24:8,0:8,2:5,17,1,1
chr15	83680426	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	83781474	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr15	83790755	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:6,12,1,2
chr15	83793622	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	83808103	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=95,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,2:0,2,0,5
chr15	83832698	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,3:3,1,8,1
chr15	84227928	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:7,1,2,0
chr15	84245374	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:5,7,0,2
chr15	84324441	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,4:1,1:1,0,5,1
chr15	84373319	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	84473325	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=231,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:0,0:4,1,2,1
chr15	84473531	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr15	84488529	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr15	84488636	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,4:9,1:6,5,3,2
chr15	84554018	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr15	84561457	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=110,117;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:12,3:9,0:0|1:84561457_T_A:84561457:12,9,3,0
chr15	84561459	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=110,117;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:11,3:9,0:0|1:84561457_T_A:84561457:12,9,3,0
chr15	84561492	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=110,117;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:14,9,3,0
chr15	84568504	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:2,5,1,4
chr15	84611630	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,3:1,0:0,1,2,2
chr15	84657643	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=163,166;MMQ=49,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:6,4:3,1:0,9,0,5
chr15	84685118	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:4,3,3,0
chr15	84700147	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=139,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,4:7,0:3,5,3,1
chr15	84700159	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=160,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:2,4:6,0:3,7,3,1
chr15	85165699	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:10,6:1,4:6,5,4,6
chr15	85166485	.	ATTTC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=258,212;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85166485_ATTTC_A:85166485:2,0,1,0
chr15	85166493	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=258,212;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85166485_ATTTC_A:85166485:2,0,1,0
chr15	85166495	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=258,212;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85166485_ATTTC_A:85166485:2,0,1,0
chr15	85186623	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=70,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,1,0
chr15	85186637	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	85186876	.	ACTTGGCTCCGTGTTCCAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTGGCTCCGTGTTCCAT;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.627:5:1,1:1,2:2,0,1,2
chr15	85187045	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85187045_A_T:85187045:0,0,0,1
chr15	85187054	.	AC	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85187045_A_T:85187045:0,0,0,1
chr15	85196085	.	CC	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:0|1:85196085_CC_AG:85196085:5,12,0,2
chr15	85196088	.	T	TTGTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,1:5,1:0|1:85196085_CC_AG:85196085:4,12,0,2
chr15	85200520	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,0:6,6:3,6,3,3
chr15	85259132	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=195,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:6,1,5,0
chr15	85326918	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,5:4,0:5,4,4,2
chr15	85341254	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.277:15:3,0:8,0:0|1:85341254_A_C:85341254:0,11,4,0
chr15	85341258	.	AG	CC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.245:14:3,2:8,0:0|1:85341254_A_C:85341254:0,11,3,0
chr15	85345510	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=96,162;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:4,7:11,13:9,6,9,11
chr15	85382193	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=66,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,5:5,3:2,7,4,4
chr15	85400058	.	AGGATGCAGGGAGAGAAGG	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=82,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGATGCAGGGAGAGAAGG;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:18,0:6,2:15,14,1,1
chr15	85400232	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=88,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:85400232_T_A:85400232:12,9,1,1
chr15	85400233	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=88,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:85400232_T_A:85400232:12,9,1,1
chr15	85400242	.	AGA	TCT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=69,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:85400232_T_A:85400232:11,6,1,1
chr15	85400246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=64,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,1:0|1:85400232_T_A:85400232:11,5,1,1
chr15	85401419	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,2:7,4:4,5,2,4
chr15	85401740	.	G	GGAATCTAGGTTGCATGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	85430954	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,4:3,2:6,5,3,3
chr15	85432142	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,1,0
chr15	85438117	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85438117_GT_AG:85438117:0,0,1,0
chr15	85438131	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=164,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:85438117_GT_AG:85438117:1,1,1,0
chr15	85438311	.	C	CTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=87,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.498:16:3,4:5,4:3,5,5,3
chr15	85448906	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:4,3:15,3:2,17,2,4
chr15	85461818	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:5,11,1,1
chr15	85478574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:7,3,1,1
chr15	85487960	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=114,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.890:8:1,3:0,4:1,0,2,5
chr15	85488298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=202,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr15	85488381	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:7,8,1,3
chr15	85525556	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	85619248	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr15	85656568	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr15	85656606	.	A	ATC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,1:5,0:0|1:85656606_A_ATC:85656606:7,6,1,1
chr15	85656609	.	TT	CA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:7,0:0|1:85656606_A_ATC:85656606:8,6,1,1
chr15	85664026	.	AGGAAACTTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:9,2,1,1
chr15	86029097	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=118,146;MMQ=48,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr15	86087212	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr15	86122654	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,12,17
chr15	86122779	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:0,11:1,20:1,0,15,16
chr15	86123019	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,12,15
chr15	86124179	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:86124179_T_A:86124179:6,10,1,1
chr15	86124184	.	AATTTCATG	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=87,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:86124179_T_A:86124179:6,10,1,1
chr15	86124196	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=82,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:86124179_T_A:86124179:5,9,1,1
chr15	86124483	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,15,8
chr15	86125031	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr15	86189221	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr15	86199049	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr15	86199093	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=253,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86199093_TG_T:86199093:0,1,0,1
chr15	86199098	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=253,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86199093_TG_T:86199093:0,1,0,1
chr15	86199102	.	A	ATGATGTGTTGGACTGACAACTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	86212866	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr15	86227952	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr15	86253768	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,4,4
chr15	86253911	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr15	86260700	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	86261198	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr15	86262501	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:4,0:7,10,1,1
chr15	86262600	.	A	ACTTG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=113,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:86262600_A_ACTTG:86262600:1,6,1,1
chr15	86262601	.	AAGGG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=113,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:86262600_A_ACTTG:86262600:1,6,1,1
chr15	86262608	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=113,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:86262600_A_ACTTG:86262600:1,6,1,1
chr15	86278174	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	86279438	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:2,4,0,2
chr15	86284817	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,314;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	86311188	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr15	86311695	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr15	86685325	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:2,3,2,2
chr15	86687082	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:1,4,0,2
chr15	86697596	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr15	86702076	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:86702076_T_A:86702076:0,0,2,0
chr15	86702077	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0|1:86702076_T_A:86702076:0,0,2,0
chr15	86791089	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=202,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr15	86800209	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:0,3:5,0:1,5,2,1
chr15	86800268	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=78,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:1,2,0,5
chr15	86800299	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,0:0,1:0|1:86800299_A_AGAG:86800299:0,0,0,1
chr15	86800300	.	C	CACATAGAAAGAGGTTGCCTAACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,0:0,1:0|1:86800299_A_AGAG:86800299:0,0,0,1
chr15	86813330	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr15	86815035	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:86815035_G_GCC:86815035:0,0,0,1
chr15	86815037	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=194,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:86815035_G_GCC:86815035:0,1,0,1
chr15	86940622	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=84,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:11,1:4,4:5,10,2,3
chr15	87099537	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=85,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:6,8:0,2:4,2,4,6
chr15	87217488	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,12,5
chr15	87217525	.	G	GGCTC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0|1:87217525_G_GGCTC:87217525:3,4,2,1
chr15	87217526	.	A	ACCCTGTAATCATC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=153,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:5,1:2,0:0|1:87217525_G_GGCTC:87217525:4,4,2,1
chr15	87217721	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr15	87531281	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr15	87531374	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:2,2:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,1,1
chr15	87531375	.	A	ACCACC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,2:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,1,1
chr15	87531378	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,1,1
chr15	87531382	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,1,1
chr15	87531384	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,1,1
chr15	87531387	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=79,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:87531374_A_C:87531374:0,2,0,1
chr15	88423463	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr15	88472686	.	G	GATCGGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=81,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:88472686_G_GATCGGA:88472686:2,3,0,2
chr15	88472694	.	GC	AA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:88472686_G_GATCGGA:88472686:2,4,0,2
chr15	88476289	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,13:3,0:5,4,13,0
chr15	88476318	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,13:8,0:6,8,13,0
chr15	88476354	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=128,50;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:5,11,0,2
chr15	88576185	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:1,3,2,5
chr15	88678715	.	G	GTTTTCTTGCTTTCTTTCTTTCTTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88678715_G_GTTTTCTTGCTTTCTTTCTTTCTTTC:88678715:0,0,0,1
chr15	88678718	.	T	TTCTTTCATGCTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88678715_G_GTTTTCTTGCTTTCTTTCTTTCTTTC:88678715:0,0,0,1
chr15	88679148	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,1:6,2:3,5,1,2
chr15	88679785	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,5:0,6:0,0,6,6
chr15	89079672	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=97,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,0,4
chr15	89172739	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr15	89173556	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr15	89182656	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.156:24:10,1:7,2:14,7,0,3
chr15	89195264	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr15	89195621	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89195621_C_T:89195621:0,1,0,1
chr15	89195623	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89195621_C_T:89195621:0,1,0,1
chr15	89195625	.	C	CGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89195621_C_T:89195621:0,1,0,1
chr15	89386543	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.945:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr15	89390434	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr15	89391323	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr15	89398105	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,3:4,3:2,4,4,2
chr15	89398330	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=74,101;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,5:8,5:4,5,4,6
chr15	89398631	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,2,3
chr15	89400879	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:8,0:11,7,2,1
chr15	89402051	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:1,2,3,2
chr15	89402477	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,140;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,3:5,0:4,7,3,0
chr15	89414673	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,2:10,1:10,7,2,1
chr15	89415247	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,184;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,2:8,0:5,4,1,1
chr15	89421450	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,10:3,0:4,2,0,10
chr15	89449189	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=87,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89449189_T_A:89449189:0,1,0,1
chr15	89449191	.	GGGTTACCTCATCTTCCTCT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=87,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89449189_T_A:89449189:0,1,0,1
chr15	89731347	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	89736558	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:1,5:4,4:2,4,3,6
chr15	89754954	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:3,0,2,0
chr15	89758552	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr15	89762124	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.363:8:3,1:2,0:4,1,0,3
chr15	89804111	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr15	89804127	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:89804127_A_C:89804127:0,4,0,1
chr15	89804129	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:89804127_A_C:89804127:0,4,0,1
chr15	89805103	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:11,12,3,0
chr15	89805189	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr15	89811543	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=181,191;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr15	89811572	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=181,228;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	89816541	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:2,2:2,1,2,0
chr15	89816558	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=149,109;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,1:0|1:89816558_G_A:89816558:7,4,2,0
chr15	89816565	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,109;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:8,1:0|1:89816558_G_A:89816558:10,8,2,0
chr15	89819969	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:12,3:11,10,0,3
chr15	89826496	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=199,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,1:3,8:0,4,2,7
chr15	89836228	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,8:2,5:1,3,4,9
chr15	89838236	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,8,10
chr15	89838252	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:4,3:13,0:6,11,1,2
chr15	89844688	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,5:1,7:1,5,2,10
chr15	89856047	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=186,137;MMQ=31,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,1:0,1:3,0,2,0
chr15	89856057	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,186;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr15	89859932	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=54,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.650:12:3,2:1,4:3,1,7,1
chr15	89860786	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=214,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr15	89862341	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=87,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,3:4,2:4,5,4,1
chr15	89862366	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.409:13:4,1:2,4:4,4,1,4
chr15	89864316	.	G	GCTAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr15	89864368	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=200,270;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr15	89864387	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=241,0;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89864387_C_G:89864387:2,2,1,0
chr15	89864389	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=241,0;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:89864387_C_G:89864387:2,2,1,0
chr15	89866691	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:9,4,1,1
chr15	89866954	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=191,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	89867154	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,4:1,4:2,3,2,6
chr15	89868870	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:1,2,3,5
chr15	89870335	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:1,1,1,1
chr15	89873415	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr15	89873518	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	89873529	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89873529_CA_C:89873529:0,0,0,1
chr15	89873533	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89873529_CA_C:89873529:0,0,0,1
chr15	89876236	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,3:0,6:3,0,8,1
chr15	90020484	.	G	GGGCATGCGGCACAGGTCAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=199,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr15	90026485	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr15	90128966	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=102,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:2,4:10,2:5,7,1,5
chr15	90129188	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr15	90129227	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr15	90135432	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,4:1,6:2,6,4,6
chr15	90144894	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr15	90144913	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr15	90150163	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90150163_AT_A:90150163:0,1,0,1
chr15	90150166	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90150163_AT_A:90150163:0,1,0,1
chr15	90150170	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90150163_AT_A:90150163:0,1,0,1
chr15	90150172	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90150163_AT_A:90150163:0,1,0,1
chr15	90161355	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,8:6,4:8,7,9,3
chr15	90161530	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr15	90164784	.	ATAATGTTTCTG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:2,2:3,6,1,1
chr15	90168108	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:5,3:3,3:2,7,4,2
chr15	90171834	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:0|1:90171834_C_T:90171834:8,8,1,1
chr15	90171848	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:4,0:13,2:0|1:90171834_C_T:90171834:11,10,1,1
chr15	90171851	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:15,2:0|1:90171834_C_T:90171834:11,10,1,1
chr15	90171857	.	C	CTACGGTGAAA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:14,1:0|1:90171834_C_T:90171834:13,9,1,1
chr15	90172133	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=103,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr15	90172523	.	GGGAGGGGGGTGCAGGGCGGGGAAGATGGGGGTGGGGGGGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.490:4:0,1:0,1:2,0,2,0
chr15	90173734	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:0,1,2,2
chr15	90174955	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=82,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,1:7,5:3,4,1,5
chr15	90175011	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,0:4,4:0,5,0,4
chr15	90177159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,1,3
chr15	90188514	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	90190048	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,6:1,0:1,3,3,3
chr15	90190069	.	T	TTCTGTACATAGCCGCCCCTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:4,7,1,1
chr15	90192905	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:5,1,3,1
chr15	90195765	.	AA	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,1:1,5:3,0,5,1
chr15	90208939	.	G	GCTTATTTAAAAGGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	90213134	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	90214663	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr15	90245298	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=93,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:3,6,2,3
chr15	90260256	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=198,140;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr15	90260265	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=166,205;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90260265_TC_T:90260265:0,2,0,1
chr15	90260272	.	CTTTCTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,19;MFRL=191,205;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:90260265_TC_T:90260265:0,3,0,1
chr15	90260296	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=218,205;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90260265_TC_T:90260265:0,1,0,1
chr15	90260305	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=218,205;MMQ=60,40;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90260265_TC_T:90260265:0,1,0,1
chr15	90260309	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=218,205;MMQ=60,40;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90260265_TC_T:90260265:0,1,0,1
chr15	90270567	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=64,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:3,3,1,3
chr15	90270659	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr15	90274809	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=90,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:3,6,1,3
chr15	90276380	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:90276380_AC_A:90276380:2,2,1,1
chr15	90276385	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:90276380_AC_A:90276380:2,2,1,1
chr15	90293776	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,433;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	90328551	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,7:9,4:9,2,8,3
chr15	90328774	.	A	AAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:2,9,1,6
chr15	90334261	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:6,2:11,5,1,1
chr15	90341043	.	CACA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:90341043_CACA_C:90341043:0,0,0,1
chr15	90341049	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90341043_CACA_C:90341043:0,0,0,1
chr15	90346861	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=221,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,6,2
chr15	90347330	.	A	AAAAAGAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=209,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	90378933	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr15	90414642	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,17,5
chr15	90611277	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,2:0|1:90611277_C_T:90611277:13,10,1,1
chr15	90611286	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=109,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:14,2:0|1:90611277_C_T:90611277:18,11,1,1
chr15	90616473	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,0:6,5:5,6,2,3
chr15	90617553	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90617553_G_GT:90617553:0,2,0,1
chr15	90617554	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90617553_G_GT:90617553:0,2,0,1
chr15	90634684	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr15	90760831	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr15	90761136	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=217,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr15	90763177	.	G	GTCTCTCTCTTTATCTCTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	90764202	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=92,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:4,1:8,6:5,9,4,3
chr15	90764348	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:7,1:1,6:0|1:90764348_C_G:90764348:3,5,2,6
chr15	90764357	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:6,2:1,8:0|1:90764348_C_G:90764348:3,4,2,8
chr15	90764359	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:5,2:0,8:0|1:90764348_C_G:90764348:3,4,2,8
chr15	90764537	.	CCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=185,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:90764537_CCTG_C:90764537:2,0,1,1
chr15	90764546	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=185,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:90764537_CCTG_C:90764537:2,0,1,1
chr15	90764550	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=185,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:90764537_CCTG_C:90764537:2,0,1,1
chr15	90764553	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:90764537_CCTG_C:90764537:2,1,1,1
chr15	90765093	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	90766754	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr15	90768156	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr15	90769034	.	C	CTCCTCCCACAATGCTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=148,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:90769034_C_CTCCTCCCACAATGCTT:90769034:0,6,1,1
chr15	90769038	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=148,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:90769034_C_CTCCTCCCACAATGCTT:90769034:0,6,1,1
chr15	90775419	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:9,1,2,1
chr15	90775643	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	90776984	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:2,4,1,7
chr15	90785060	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,77;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:8,0:4,11:5,7,5,6
chr15	90794757	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,2:4,6:4,5,7,1
chr15	90799118	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:8,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:4,11,0,2
chr15	90799119	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:4,11,0,2
chr15	90799121	.	AGTGGGTC	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:10,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:4,13,0,2
chr15	90799132	.	CTTCCCATGCTGA	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:10,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:4,12,0,2
chr15	90799146	.	A	ACC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:1,9,0,2
chr15	90799148	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:6,0:0|1:90799118_G_GC:90799118:1,9,0,2
chr15	90799537	.	ATGCCTCAGGACCATCAGCCTTCCCTAGTCCCCAGCACTGGGC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.211:13:4,2:4,0:4,7,1,1
chr15	90802227	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr15	90809633	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr15	90809678	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr15	90984724	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=86,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.207:20:7,1:9,3:11,5,3,1
chr15	90992762	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,52;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr15	90996141	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,2:4,6:3,5,2,7
chr15	90999633	.	T	TAGTTAGCATGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=254,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr15	91010653	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,4:1,1:1,1,5,1
chr15	91017232	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr15	91025205	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,7:6,0:8,7,7,0
chr15	91034765	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,134;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr15	91043192	.	ATGTTTTGTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=TGTTT;STR;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr15	91137074	.	G	GAAGAGTAAAAAAGGATATTTGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=226,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr15	91147512	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:5,3:0,1:6,0,3,1
chr15	91168976	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=75,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,3:2,1:2,1,2,2
chr15	91184415	.	GA	TC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=119,67;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr15	91184427	.	G	GAGCTTTTGTTTGT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=119,67;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:0|1:91184427_G_GAGCTTTTGTTTGT:91184427:4,5,1,1
chr15	91184429	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=141,67;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,0:4,1:0|1:91184427_G_GAGCTTTTGTTTGT:91184427:3,5,1,1
chr15	91185291	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,5:5,0:4,2,1,4
chr15	91312313	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:6,3,7,1
chr15	91312823	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:1,2:2,9:2,1,3,8
chr15	91334049	.	GAC	ATT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:4,2:12,1:8,8,1,2
chr15	91334113	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:1,9,0,2
chr15	91337623	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,2:3,7:0,7,0,9
chr15	91347302	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	91358271	.	G	GGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	91420940	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	91421283	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=230,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr15	91423459	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=116,171;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,0:11,4:5,11,0,4
chr15	91423543	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	91425208	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	91428521	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=182,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr15	91428636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr15	91430110	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr15	91430243	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:8,11,1,2
chr15	91430647	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr15	91435002	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=243,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	91435846	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	91437388	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=220,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr15	91448498	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=82,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr15	91449015	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=110,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0|1:91449015_A_G:91449015:1,3,5,2
chr15	91449028	.	C	CACCTGGGTCATTGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=169,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.214:12:8,2:1,0:1|0:91449015_A_G:91449015:5,5,1,1
chr15	91449030	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=169,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.214:12:7,1:2,0:1|0:91449015_A_G:91449015:5,5,1,1
chr15	91450159	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr15	91450441	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=252,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr15	91450442	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=215,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	91474569	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.111:52:21,0:25,5:22,25,0,5
chr15	91474738	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=105,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,4:6,9:7,4,9,4
chr15	91474749	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,0:11,4:13,7,3,1
chr15	91483531	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,2:8,2:11,4,3,1
chr15	91485868	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=98,18759061;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,1:6,1:10,11,1,1
chr15	91500611	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	91503049	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	91503708	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	91503752	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	91545415	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr15	91769809	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,1:6,2:13,6,3,0
chr15	91801878	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91801878_C_CT:91801878:0,0,0,1
chr15	91801880	.	G	GCCAGAAAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91801878_C_CT:91801878:0,0,0,1
chr15	91801883	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91801878_C_CT:91801878:0,0,0,1
chr15	91832748	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,0:14,2:0|1:91832748_C_T:91832748:17,6,1,1
chr15	91832754	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=78,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:9,0:2,1:0|1:91832748_C_T:91832748:4,7,1,1
chr15	91833006	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91833006_G_T:91833006:0,0,0,1
chr15	91833008	.	G	GTCTATAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91833006_G_T:91833006:0,0,0,1
chr15	91833009	.	G	GTTTTACTTAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91833006_G_T:91833006:0,0,0,1
chr15	92397106	.	AGCG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	92459187	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:2,5:3,1:5,0,6,0
chr15	92647645	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,6,8
chr15	92663630	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr15	92706174	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:92706174_C_T:92706174:8,9,1,1
chr15	92706175	.	TGAGG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,1:10,0:0|1:92706174_C_T:92706174:9,9,1,1
chr15	92715131	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:2,3,0,4
chr15	92715167	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr15	92937268	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0|1:92937268_G_T:92937268:4,0,3,1
chr15	92937276	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,1:4,2:0|1:92937268_G_T:92937268:4,1,3,0
chr15	92977507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr15	92977544	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=124,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:92977544_C_T:92977544:8,3,1,1
chr15	92977546	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=124,62;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:92977544_C_T:92977544:8,3,1,1
chr15	92977670	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	92988107	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:3,9,2,0
chr15	92988165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:3,2,0,4
chr15	93015278	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	93015321	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=380,334;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	93016128	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr15	93016339	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr15	93016361	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:93016361_GGA_G:93016361:0,2,0,1
chr15	93016364	.	TGACA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:93016361_GGA_G:93016361:0,2,0,1
chr15	93043545	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:5,2,3,5
chr15	93043722	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr15	93198671	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr15	93198678	.	TTGGAGC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGAGC;STR;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,4:0,7:0,0,1,11
chr15	93198784	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	93488926	.	AT	A,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=134,131,136;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.91,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.274,0.284:11:3,1,1:2,2,2:5,0,6,0
chr15	93498808	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr15	93510809	.	GAT	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr15	93510834	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:93510834_T_G:93510834:0,1,0,1
chr15	93510840	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93510834_T_G:93510834:0,0,0,1
chr15	93510842	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93510834_T_G:93510834:0,0,0,1
chr15	93510844	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93510834_T_G:93510834:0,0,0,1
chr15	93514960	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,95;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:8,0:17,5,3,0
chr15	93515485	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,3:3,0:5,4,2,1
chr15	93521651	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr15	93522278	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	93522312	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	93524190	.	GAGAGTCTAACTTTTCTGTAAGAAGATTCTGTT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.276:17:6,4:5,0:0,13,0,4
chr15	93527794	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr15	93536280	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:6,10,0,3
chr15	93540089	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	93552330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr15	93555717	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,2:6,2:0,6,0,4
chr15	93563164	.	C	CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr15	93567527	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	93595251	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,2:0,0:0|1:93595251_GGCA_G:93595251:2,2,1,1
chr15	93595256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:93595251_GGCA_G:93595251:2,2,1,1
chr15	93595260	.	GGCGTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:93595251_GGCA_G:93595251:3,2,1,1
chr15	93595271	.	G	GTGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=140,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:93595251_GGCA_G:93595251:3,1,1,1
chr15	93616283	.	A	AAGG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,11:5,4:1,8,3,13
chr15	94841981	.	CTTTTTTTTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr15	94858889	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr15	94883462	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:10,10,2,0
chr15	94928589	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr15	94942391	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=287,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr15	98509284	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:6,11,0,2
chr15	98514282	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr15	98514489	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	98995052	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr15	98995081	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr15	99024062	.	A	AGAGAAAAAAAAAAAGAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	99029128	.	AA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=69,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:6,7,1,1
chr15	99451888	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:4,0,1,2
chr15	99456253	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,2:4,4:4,7,5,1
chr15	99456553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr15	99467934	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=246,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr15	99472734	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:5,0,7,1
chr15	99478493	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr15	99478505	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,6:0,0,8,5
chr15	99478692	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:99478692_G_A:99478692:2,9,1,1
chr15	99478694	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:99478692_G_A:99478692:2,9,1,1
chr15	99478713	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr15	99482478	.	GCCGGAGAGATTGCAGACGGCATGGCATACCTCAACGCCAATAAGTTCGTCCACAGAGACCTTGCTGC	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.091:32:6,0:5,2:12,18,1,1
chr15	99491986	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:99491986_T_G:99491986:0,4,1,1
chr15	99491987	.	A	AAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0|1:99491986_T_G:99491986:0,4,1,1
chr15	99492003	.	C	CTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr15	99514431	.	GGGGGGGGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	99514486	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr15	99646107	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	99653800	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=74,112;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.721:15:1,8:2,3:2,2,7,4
chr15	99679813	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:99679813_T_C:99679813:3,7,0,2
chr15	99679819	.	A	AAAGAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:99679813_T_C:99679813:4,6,0,2
chr15	99679823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:99679813_T_C:99679813:4,6,0,2
chr15	99696592	.	G	GGGTTGGGCCCATCCCAGCAAAGGCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=222,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:99696592_G_GGGTTGGGCCCATCCCAGCAAAGGCCT:99696592:0,1,1,1
chr15	99696594	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=222,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:99696592_G_GGGTTGGGCCCATCCCAGCAAAGGCCT:99696592:0,1,1,1
chr15	99796089	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr15	100173364	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=90,74;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:21,3:29,0:19,31,2,1
chr15	100243487	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr15	100246834	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	100246936	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,12:0,7:0|1:100246936_T_C:100246936:0,0,13,9
chr15	100246942	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0|1:100246936_T_C:100246936:0,0,12,10
chr15	100247117	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:3,0:1,6,0,2
chr15	100251015	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	100251033	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=197,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100251033_C_CA:100251033:0,2,0,1
chr15	100251036	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=197,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:100251033_C_CA:100251033:0,2,0,1
chr15	100252709	.	CCAGCAG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=CAG;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	100252805	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,4,7
chr15	100269309	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr15	100269343	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:11,8,1,1
chr15	100271829	.	A	AAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=305,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	100514561	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=108,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,2:5,3,3,1
chr15	100533218	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:1,3,5,2
chr15	100589108	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr15	100693032	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31,32,21;MFRL=154,142,166,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,14,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.76,6.51,10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,4,8:0.190,0.265,0.446:16:1,2,2,5:0,1,2,2:0,1,1,14
chr15	100695347	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr15	100739606	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=96,47;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:100739606_C_T:100739606:7,15,1,1
chr15	100739616	.	AA	GG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:100739606_C_T:100739606:6,12,1,1
chr15	100739619	.	T	TTC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:100739606_C_T:100739606:6,12,1,1
chr15	100739719	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100739719_C_CT:100739719:0,1,0,1
chr15	100739721	.	A	ATTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100739719_C_CT:100739719:0,1,0,1
chr15	100739722	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100739719_C_CT:100739719:0,1,0,1
chr15	100821421	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,299;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:2,1:3,0,4,0
chr15	100871087	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,106;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:11,5,3,0
chr15	100942843	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=140,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:0,2:3,0,2,0
chr15	100996076	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr15	101009530	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:8,1,5,1
chr15	101013287	.	A	ATTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:101013287_A_ATTATT:101013287:0,0,0,1
chr15	101013289	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101013287_A_ATTATT:101013287:0,0,0,1
chr15	101019529	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	101019563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=40,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr15	101019693	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,0:1,4:0,5,0,4
chr15	101170069	.	C	CAACA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:10,0:0|1:101170069_C_CAACA:101170069:10,7,1,1
chr15	101170070	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:101170069_C_CAACA:101170069:10,7,1,1
chr15	101440988	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	101441055	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	101448571	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr15	101448783	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr15	101454996	.	T	TCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101454996_T_TCAGGG:101454996:0,1,0,1
chr15	101454997	.	T	TGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101454996_T_TCAGGG:101454996:0,1,0,1
chr15	101455048	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	101464868	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,0:14,5:16,11,0,5
chr15	101529054	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,1:1,4:0,5,2,3
chr15	101550858	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,4:0,0,12,4
chr15	101550861	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33,31,24;MFRL=111,103,133,188;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,20,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=9.41,3.53,9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,2,4:0.322,0.241,0.342:10:0,2,1,1:0,1,1,1:1,0,6,3
chr15	101552180	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.574:7:0,1:2,3:2,1,4,0
chr15	101554679	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=96,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:7,7,0,2
chr15	101561305	.	CTTTGCCTGAACGACAACCACCTCGACACAGTCCCTCCCTCGG	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:4,2:5,0:10,12,0,2
chr15	101561980	.	CGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=GT;STR;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.877:13:0,5:0,6:1,0,10,2
chr15	101566118	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	101569467	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr15	101588923	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=82,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr15	101589765	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	101591857	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	101593051	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=167,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr15	101593078	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,1:0|1:101593078_C_T:101593078:7,4,2,0
chr15	101593082	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:101593078_C_T:101593078:7,4,2,0
chr15	101597266	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	101598200	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:9,1:3,4:8,4,1,4
chr15	101601367	.	C	CACTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTT;STR;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,1:2,2,6,3
chr15	101605945	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,0:12,3:12,9,2,1
chr15	101605960	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:7,1:10,2:0|1:101605960_C_T:101605960:10,9,1,2
chr15	101605969	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:101605960_C_T:101605960:10,8,1,1
chr15	101605972	.	G	GCCACTGCCATCATGTGAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:101605960_C_T:101605960:10,8,1,1
chr15	101606889	.	GC	AA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:7,7:4,3:6,5,3,7
chr15	101718239	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,153;MMQ=58,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.488:37:5,8:14,10:11,8,13,5
chr15	101791262	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	101791359	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr15	101827759	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	101832055	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr15	101853293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	101871941	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr15	101872306	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	101888060	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:101888060_G_GAA:101888060:0,3,0,1
chr15	101888062	.	G	GGGCAAGCATGCTATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:101888060_G_GAA:101888060:0,3,0,1
chr15	101888081	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=212,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	101922323	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:1,5:7,2:3,7,5,2
chr15	101929632	.	ATT	A,AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,151,200;MMQ=60,60,60;MPOS=27,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.62,9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.299,0.599:6:0,1,2:0,1,2:0,0,6,0
chr15	101929825	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr15	101968084	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	101970308	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr15	101970323	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0,1,0,8
chr15	101970336	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr15	102202010	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.121:56:11,0:35,6:34,16,0,6
chr15	102251993	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	102358451	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=90,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:2,7:6,8:5,3,7,8
chr15	102358887	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:2,2:6,2,1,1
chr15	102462413	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,67;MMQ=25,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:0|1:102462413_T_C:102462413:13,10,1,1
chr15	102462416	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,67;MMQ=25,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:0|1:102462413_T_C:102462413:11,10,1,1
chr16	97610	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,4:3,1:0,5,1,4
chr16	97647	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=158,236;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:97647_CA_TG:97647:0,3,0,1
chr16	97651	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=158,236;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:97647_CA_TG:97647:0,3,0,1
chr16	97653	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=176,195;MMQ=50,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:97653_G_A:97653:0,2,0,2
chr16	97657	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=176,195;MMQ=50,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:97653_G_A:97653:0,2,0,2
chr16	103423	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,18,1
chr16	103449	.	C	CG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=72.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,17,5
chr16	103517	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,8,15
chr16	103923	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:6,1,4,1
chr16	105444	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,13,17
chr16	108796	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,3:0,4:0,0,3,5
chr16	109272	.	A	AGGGTCCTTCCTCACCTCCACC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=98,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.190:13:2,2:9,0:8,3,0,2
chr16	109671	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr16	110165	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr16	111344	.	TCCCGCCCCCGCCGGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:1,0:0,1:1,3,1,0
chr16	112513	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	113493	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	113883	.	G	GCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=76.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,7:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,9,9
chr16	113886	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=73.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,8,9
chr16	113970	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr16	114521	.	G	GATACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:114521_G_GATACA:114521:0,3,0,1
chr16	114522	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:0|1:114521_G_GATACA:114521:0,3,0,1
chr16	115041	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr16	115072	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr16	136888	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr16	138772	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr16	143308	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:3,0:7,2:6,4,1,1
chr16	148216	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,4:16,0:15,15,4,0
chr16	160648	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=125,253;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:4,14,0,2
chr16	160668	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr16	202850	.	CACT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=170,122;MMQ=46,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:202850_CACT_C:202850:4,0,1,0
chr16	202855	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=170,122;MMQ=46,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:202850_CACT_C:202850:4,0,1,0
chr16	202858	.	AGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=170,122;MMQ=46,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:202850_CACT_C:202850:4,0,1,0
chr16	216140	.	TGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,17;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:216140_TGGG_T:216140:1,3,1,1
chr16	216146	.	C	CCAT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:216140_TGGG_T:216140:1,3,1,1
chr16	216149	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:216140_TGGG_T:216140:1,3,1,1
chr16	216153	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:216140_TGGG_T:216140:0,3,1,1
chr16	216190	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	216624	.	GAC	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,0:11,2:0|1:216624_GAC_G:216624:10,7,1,1
chr16	216627	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:216624_GAC_G:216624:10,7,1,1
chr16	226818	.	T	TGGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=213,162;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	249251	.	A	AACAGGTTTACCTAATGAAAATATGCTTAGTGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=81,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.351:9:0,2:4,0:2,5,1,1
chr16	256136	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=91,140;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:13,0:4,4:6,11,0,5
chr16	257986	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=147,114;MMQ=47,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:12,0,2,0
chr16	258014	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:13,6,3,0
chr16	309498	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:11,6:12,0:13,10,6,0
chr16	310809	.	T	TCATTTTGGGTCACCCTCTCG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=145,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.416:5:1,2:1,0:0|1:310809_T_TCATTTTGGGTCACCCTCTCG:310809:0,3,1,1
chr16	310814	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=145,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:310809_T_TCATTTTGGGTCACCCTCTCG:310809:0,3,0,1
chr16	310852	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	320468	.	GGA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:4,0:0|1:320468_GGA_G:320468:4,2,1,1
chr16	320474	.	C	CTGCGCTCCATATCGAAGCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:320468_GGA_G:320468:4,2,1,1
chr16	321123	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,126;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:2,5,2,0
chr16	324052	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:2,2,6,1
chr16	331931	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:331931_G_A:331931:0,3,0,1
chr16	331947	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:331931_G_A:331931:0,1,0,1
chr16	332260	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	332558	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	334543	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=202,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,2,5
chr16	337017	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.393:11:2,2:3,2:4,3,1,3
chr16	338332	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr16	339415	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,4:4,1:5,5,3,2
chr16	339478	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:10,7,1,1
chr16	339672	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	348117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr16	348328	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	359953	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:5,5,4,1
chr16	396264	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:10,8:9,8:11,9,6,10
chr16	418429	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:2,3,3,2
chr16	418462	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:5,4,5,4
chr16	418597	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,1:3,1:2,7,1,1
chr16	419283	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	419614	.	C	CCCGACCTGCTCTGCTCGCCTCCCCGACCTGCTCTGCTCGCCTCT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.677:26:5,2:3,5:7,1,12,6
chr16	419733	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	419844	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=253,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr16	419923	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=202,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	421912	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=121,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr16	424420	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	424695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr16	425277	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.579:8:2,0:1,2:3,0,1,4
chr16	425298	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.609:14:4,1:1,4:2,3,3,6
chr16	426476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr16	427013	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:0,2:4,0:5,0,2,0
chr16	427309	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr16	427349	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,4:0,0,10,6
chr16	427479	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,15,13
chr16	427657	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr16	427866	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,10:0,1:0,0,4,7
chr16	427925	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr16	449162	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:6,0,5,2
chr16	449178	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr16	449269	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,2:9,1:11,12,2,1
chr16	449345	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=131,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.435:28:4,5:10,7:7,9,5,7
chr16	450140	.	C	CAG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=135,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:10,2:2,5:7,6,6,3
chr16	450165	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:10,3:3,8:9,4,5,6
chr16	450387	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=204,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:450387_T_A:450387:1,7,0,2
chr16	450388	.	ACCT	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=204,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:450387_T_A:450387:1,7,0,2
chr16	450392	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=204,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:450387_T_A:450387:1,7,0,2
chr16	450394	.	GTCAGC	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=210,249;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:450387_T_A:450387:0,7,0,2
chr16	455023	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,0:11,4:9,11,1,3
chr16	455089	.	CGA	TTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=185,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:455089_CGA_TTT:455089:0,3,0,1
chr16	455096	.	T	TTAATCAAGCA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=185,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:455089_CGA_TTT:455089:0,3,0,1
chr16	455102	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=287,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:455102_G_GC:455102:0,1,0,1
chr16	455103	.	A	AGCTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=14,24;MFRL=287,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:455102_G_GC:455102:0,1,0,1
chr16	455106	.	T	TACATCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=276,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:455102_G_GC:455102:0,2,0,1
chr16	455108	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=21,23;MFRL=276,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:455102_G_GC:455102:0,2,0,1
chr16	455497	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,2,2
chr16	456239	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	456291	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	456429	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,0:2,4:1,1,3,3
chr16	456483	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	460673	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.496:20:4,4:6,5:7,3,6,4
chr16	547207	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:5,2,3,1
chr16	555505	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=89,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr16	570283	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=171,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr16	570454	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=82,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:3,4,2,1
chr16	570557	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr16	602046	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=83.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,13,14
chr16	614821	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=283,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:0,2:4,1:3,1,2,1
chr16	614877	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr16	615326	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr16	619402	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:8,6,2,0
chr16	624114	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,2:0,0,10,0
chr16	626346	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	628994	.	TGGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGC;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,0:0|1:628994_TGGGC_T:628994:0,0,3,0
chr16	629006	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:628994_TGGGC_T:628994:0,0,3,0
chr16	629016	.	GGGGGCGGGGC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=211,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GGGGC;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	630089	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	630367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:630367_C_T:630367:0,0,0,3
chr16	630369	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=228,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:630367_C_T:630367:0,2,0,1
chr16	630902	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,3,1
chr16	632180	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr16	632198	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr16	632225	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:632225_T_C:632225:0,0,4,2
chr16	632230	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:632225_T_C:632225:0,0,4,1
chr16	632233	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:632225_T_C:632225:0,0,3,1
chr16	633117	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0|1:633117_G_A:633117:5,1,1,1
chr16	633125	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0|1:633117_G_A:633117:0,0,6,3
chr16	675611	.	CCCCGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:675611_CCCCGG_C:675611:0,1,0,1
chr16	675618	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:675611_CCCCGG_C:675611:0,1,0,1
chr16	677629	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=90,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.475:15:5,1:1,5:3,5,2,5
chr16	682566	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,4:2,5:5,1,6,3
chr16	682753	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:4,12,2,1
chr16	686178	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=99,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr16	701320	.	G	GCTTGATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:701320_G_GCTTGATC:701320:0,3,0,1
chr16	701323	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:701320_G_GCTTGATC:701320:0,3,0,1
chr16	701578	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=108,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,0:7,3:7,2,3,0
chr16	703721	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,5:1,1:2,2,2,4
chr16	705440	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=8,20;MFRL=208,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,0:0,2:1,0,1,1
chr16	705844	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,119;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,3,2
chr16	707295	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	708419	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr16	709093	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,0:4,8:0,6,0,8
chr16	709152	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:709152_G_A:709152:2,1,0,2
chr16	709157	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:709152_G_A:709152:2,1,0,2
chr16	710808	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=70,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr16	711326	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	711515	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.153:28:10,0:6,0:8,16,0,4
chr16	711545	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.478:15:6,4:2,3:3,5,1,6
chr16	711582	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:3,1,1,2
chr16	711905	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:2,2,0,3
chr16	712127	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	712867	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=273,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr16	716001	.	CAGCGGCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCGGCT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,1,1
chr16	716428	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr16	717057	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,4:0,1:2,4,0,5
chr16	717523	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:6,4:1,2:5,3,2,4
chr16	718415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	720071	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:3,1,2,3
chr16	720152	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:5,1:3,1:5,3,2,1
chr16	720780	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,1:0|1:720780_C_A:720780:4,10,1,1
chr16	720788	.	C	CAAACCTGAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:0|1:720780_C_A:720780:3,11,1,1
chr16	722331	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,186;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,3:8,5:3,8,5,3
chr16	722548	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:7,4:2,3:6,4,5,3
chr16	744967	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr16	771750	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,1,2
chr16	772842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:1,1,2,1
chr16	775947	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:1,5,1,2
chr16	777627	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.738:6:0,2:1,0:1,0,1,4
chr16	782397	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:2,2,0,3
chr16	782425	.	A	AGCCATC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=91,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:782425_A_AGCCATC:782425:1,2,0,1
chr16	782430	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=91,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:782425_A_AGCCATC:782425:1,2,0,1
chr16	782432	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=91,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:782425_A_AGCCATC:782425:1,2,0,1
chr16	782437	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=91,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:782425_A_AGCCATC:782425:1,2,0,1
chr16	815628	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	815762	.	C	CTTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	816294	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr16	817495	.	T	C,A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20,20;MFRL=97,68,81;MMQ=60,60,60;MPOS=4,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.36,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,9,2:0.428,0.123:21:3,8,2:3,0,0:3,7,5,6
chr16	817497	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=69,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:13,1:3,0:7,12,1,1
chr16	818563	.	AAGGTGGGCGGGGCGGCCAGGCCAGGGCTGGGGGCAGAGCTGGGGGCGTGG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.250:21:6,5:4,2:3,8,5,5
chr16	819683	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:819683_CAT_C:819683:0,1,0,1
chr16	819687	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:819683_CAT_C:819683:0,1,0,1
chr16	819690	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:819683_CAT_C:819683:0,1,0,1
chr16	820712	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=247,326;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:820712_A_C:820712:1,0,1,0
chr16	820720	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,16;MFRL=247,326;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:820712_A_C:820712:1,0,1,0
chr16	823283	.	G	GCCGACA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=146,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,1:6,0:0|1:823283_G_GCCGACA:823283:5,7,1,1
chr16	823286	.	G	GTGAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=146,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,1:6,0:0|1:823283_G_GCCGACA:823283:5,7,1,1
chr16	828844	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	830521	.	TGTAGGTGACAGTGTGCACGG	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=103,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAGGTGACAGTGTGCACGG;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.152:19:6,2:6,0:8,9,0,2
chr16	830765	.	A	AAAG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=60,162;MMQ=59,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:7,2:0|1:830765_A_AAAG:830765:7,9,1,1
chr16	830767	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=60,162;MMQ=59,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:0|1:830765_A_AAAG:830765:7,9,1,1
chr16	830926	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,94;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.331:24:11,2:4,4:8,9,5,2
chr16	837310	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	839184	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:3,2:12,8:9,7,6,4
chr16	839262	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,9,13
chr16	840307	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,3,2
chr16	840597	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:4,5,2,3
chr16	842921	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr16	845165	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr16	845901	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.899:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr16	849069	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:2,13:9,0:2,9,0,13
chr16	1004694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=117,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,2:2,3:2,2,1,4
chr16	1021001	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:1,3,1,2
chr16	1032187	.	CGCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr16	1035277	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=106,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:6,6,1,2
chr16	1035456	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1128898	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr16	1131393	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:7,2:6,4,3,1
chr16	1143558	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:6,11,0,3
chr16	1244877	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr16	1245980	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:1245980_C_T:1245980:12,9,1,1
chr16	1246003	.	GCGC	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:1245980_C_T:1245980:6,6,1,1
chr16	1246008	.	ATCAACCGCG	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=111,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:7,2:0|1:1245980_C_T:1245980:5,9,1,1
chr16	1246020	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:9,2:0|1:1245980_C_T:1245980:4,10,1,1
chr16	1250808	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:0|1:1250808_C_G:1250808:5,4,1,1
chr16	1250816	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=150,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:1250808_C_G:1250808:5,3,1,1
chr16	1250819	.	GC	CA	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=150,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:1250808_C_G:1250808:5,3,1,1
chr16	1250822	.	G	GAGTC	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=149,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:1250808_C_G:1250808:4,3,1,1
chr16	1250860	.	G	GTCAA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:1250860_G_GTCAA:1250860:2,1,0,1
chr16	1250861	.	G	GAGCT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:1250860_G_GTCAA:1250860:2,1,0,1
chr16	1250863	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=29,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:1250860_G_GTCAA:1250860:2,1,0,1
chr16	1250866	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:2,0:0|1:1250860_G_GTCAA:1250860:2,1,0,1
chr16	1250867	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:2,0:0|1:1250860_G_GTCAA:1250860:2,1,0,1
chr16	1251947	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	1256194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:3,3,0,2
chr16	1257731	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,4:0,0,11,4
chr16	1259054	.	G	GGCCGTCATTCATTCATTCATTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,0,1
chr16	1259078	.	CCTGGAGCAGCCGGCGCTCCAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:1,1:2,0:2,2,1,0
chr16	1260021	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr16	1260481	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr16	1260528	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,2,3
chr16	1260538	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,0,2
chr16	1260551	.	G	GCACCTGCAGTCCTAGCTACTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=158,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr16	1260710	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=140,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	1261086	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=228,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	1261222	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=94,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,0:9,3:9,5,1,3
chr16	1261282	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr16	1261377	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,181;MMQ=47,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,2:1,4:2,2,1,5
chr16	1268013	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:0,4:4,4:1,3,2,7
chr16	1268699	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,1,2
chr16	1269145	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr16	1269947	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=14,21;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.383:14:2,3:2,1:6,3,5,0
chr16	1270110	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=84,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:3,7:0,0:1,2,0,7
chr16	1270261	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	1270875	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr16	1271938	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=99,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:2,3:6,8:4,5,8,3
chr16	1272426	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1274718	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=202,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr16	1275135	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr16	1275309	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=61,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.722:9:2,3:0,2:1,1,4,3
chr16	1278599	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	1291717	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1292187	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=176,179;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr16	1292254	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=82,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:9,2:4,4:0|1:1292254_T_G:1292254:7,8,2,5
chr16	1292257	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=82,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:11,3:4,4:0|1:1292254_T_G:1292254:7,8,2,5
chr16	1306346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=155,131;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:0|1:1306346_C_T:1306346:4,5,8,1
chr16	1306355	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=156,131;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:0|1:1306346_C_T:1306346:3,5,8,2
chr16	1306377	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=151,109;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:3,5,2,3
chr16	1306559	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=111,148;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr16	1306918	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:5,2:14,3:0|1:1306918_C_T:1306918:11,8,2,3
chr16	1306921	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=180,74;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:3,2:11,3:0|1:1306918_C_T:1306918:9,7,2,3
chr16	1306923	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:3,2:12,3:0|1:1306918_C_T:1306918:9,6,3,3
chr16	1306927	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:3,3:12,2:0|1:1306918_C_T:1306918:9,6,2,3
chr16	1308022	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:1308022_G_T:1308022:3,0,1,0
chr16	1308030	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:1308022_G_T:1308022:4,0,1,0
chr16	1364140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr16	1364281	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,15:0,0,17,15
chr16	1370303	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:1370303_T_C:1370303:0,0,0,6
chr16	1370309	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:1370303_T_C:1370303:0,0,0,5
chr16	1370577	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,3:2,1,6,0
chr16	1370597	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr16	1370614	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr16	1370729	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	1370752	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	1374656	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr16	1374818	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr16	1388888	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr16	1391112	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:1,0:2,2,2,0
chr16	1391221	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=198,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr16	1392877	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,9:1,2:0,1,6,5
chr16	1393442	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=86,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:14,0:14,5:17,11,0,5
chr16	1394551	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr16	1394741	.	AGCCAACAGG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:3,3:3,3:1,6,4,2
chr16	1395331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:1,4,3,2
chr16	1395420	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr16	1397518	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr16	1397746	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,2:5,5,2,1
chr16	1398077	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr16	1399463	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.217:35:19,2:5,5:16,12,7,0
chr16	1400084	.	CTTGGCA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:11,7,1,1
chr16	1417338	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr16	1417408	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	1451519	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:2,2:0,2:2,1,3,2
chr16	1476465	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	1484338	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=79,139;MMQ=58,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr16	1484342	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=149,0;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1484342_C_T:1484342:4,0,1,0
chr16	1484344	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=149,0;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1484342_C_T:1484342:4,0,1,0
chr16	1484348	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=139,79;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr16	1484392	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:1,0,4,2
chr16	1486094	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,99;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,0:4,8:2,6,0,10
chr16	1486499	.	G	GCCT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:0|1:1486499_G_GCCT:1486499:4,3,1,1
chr16	1486501	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:1486499_G_GCCT:1486499:4,3,1,1
chr16	1486598	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr16	1488166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:1488166_C_T:1488166:1,2,2,0
chr16	1488168	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:1488166_C_T:1488166:1,2,2,0
chr16	1488224	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=246,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	1488235	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=213,278;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr16	1493030	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr16	1493750	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	1493759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	1498501	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr16	1500708	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:4,2:3,5:2,5,2,5
chr16	1501694	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=88,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,4:7,0:10,10,3,1
chr16	1502714	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	1504004	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1504004_A_C:1504004:0,0,0,1
chr16	1504006	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1504004_A_C:1504004:0,0,0,1
chr16	1504013	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1504004_A_C:1504004:0,0,0,1
chr16	1504565	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:1504565_C_CAA:1504565:0,0,0,1
chr16	1504568	.	A	ACAAGCTCAAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1504565_C_CAA:1504565:0,0,0,1
chr16	1506201	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=105,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:4,6,2,0
chr16	1506243	.	C	CACCTCCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:1506243_C_CACCTCCA:1506243:1,4,1,1
chr16	1506245	.	T	TTCTGGTGTTACTACCTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:1506243_C_CACCTCCA:1506243:1,4,1,1
chr16	1507737	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,2:4,3:4,2,2,4
chr16	1507778	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,5,10
chr16	1510538	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:2,1:3,4,1,3
chr16	1510567	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr16	1511372	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,1,2
chr16	1511552	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,11:0,0,18,7
chr16	1515162	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,1:1,2:2,0,3,1
chr16	1515415	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr16	1536138	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.666:16:4,7:1,4:0|1:1536138_T_C:1536138:3,2,6,5
chr16	1536140	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.666:16:3,4:1,4:0|1:1536138_T_C:1536138:3,2,6,5
chr16	1536323	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=102,183;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:3,1:3,3:5,2,2,2
chr16	1536357	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:4,2,3,3
chr16	1536380	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:0,2:5,5:4,1,3,4
chr16	1536466	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,3:4,8:5,3,9,2
chr16	1536499	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:6,5:18,4:13,11,5,4
chr16	1536664	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr16	1537455	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:2,6,2,1
chr16	1537874	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,3:6,6:4,4,4,5
chr16	1546948	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=220,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr16	1547220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	1547348	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:1547348_G_C:1547348:13,5,1,1
chr16	1547354	.	C	CTAGAGTTTCTACTGGGAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:7,2:0|1:1547348_G_C:1547348:13,3,1,1
chr16	1547477	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=66,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,2:0,3:1,2,2,3
chr16	1552107	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:3,2,1,5
chr16	1552813	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr16	1552876	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr16	1555463	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:6,10,0,2
chr16	1557090	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	1559732	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1559965	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,2,4
chr16	1568118	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=159,230;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:1568118_A_T:1568118:4,0,1,0
chr16	1568124	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=147,230;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1568118_A_T:1568118:3,0,1,0
chr16	1568126	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=147,230;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1568118_A_T:1568118:3,0,1,0
chr16	1568129	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=147,230;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1568118_A_T:1568118:3,0,1,0
chr16	1568131	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=147,230;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1568118_A_T:1568118:3,0,1,0
chr16	1568133	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=147,230;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1568118_A_T:1568118:3,0,1,0
chr16	1573810	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr16	1584294	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,1:1,4:2,2,4,2
chr16	1592087	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr16	1605051	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	1608177	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	1613934	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr16	1618306	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:3,1:6,2:4,5,3,1
chr16	1634225	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:3,2:1,5:2,2,4,4
chr16	1637141	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=200,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	1637853	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,9:4,0:5,2,9,0
chr16	1637998	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:6,5:3,1:4,6,3,3
chr16	1639793	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:2,6,4,6
chr16	1642423	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,0:4,3,3,1
chr16	1642439	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,1:6,0:0|1:1642439_A_AT:1642439:11,5,1,1
chr16	1642440	.	CAGG	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:1642439_A_AT:1642439:12,5,1,1
chr16	1642448	.	AGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=92,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:9,2:6,0:0|1:1642448_AGGG_A:1642448:10,7,2,1
chr16	1642453	.	AAG	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=106,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:9,2:6,0:0|1:1642448_AGGG_A:1642448:13,9,1,1
chr16	1642458	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:8,0:0|1:1642448_AGGG_A:1642448:13,8,1,1
chr16	1642536	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:10,2:18,0:0|1:1642536_C_T:1642536:16,13,1,1
chr16	1642562	.	CCAA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,2:16,0:0|1:1642536_C_T:1642536:10,13,1,1
chr16	1652614	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	1657284	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr16	1657350	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	1682305	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,2:9,0:7,5,1,1
chr16	1691083	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1691083_A_T:1691083:4,0,1,0
chr16	1691093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:1691083_A_T:1691083:4,0,1,0
chr16	1691106	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr16	1702429	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr16	1702511	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=112,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,1:15,2:12,9,0,3
chr16	1705955	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,8:1,4:2,2,5,7
chr16	1706480	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.507:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr16	1706825	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:16,0:12,12,2,0
chr16	1706950	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,0:2,17:0,4,0,19
chr16	1706998	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=283,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	1714952	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1714952_C_G:1714952:1,0,1,0
chr16	1714955	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1714952_C_G:1714952:1,0,1,0
chr16	1716010	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	1717442	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr16	1717455	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1717455_AG_A:1717455:0,4,0,1
chr16	1717458	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1717455_AG_A:1717455:0,4,0,1
chr16	1720844	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=118,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,3:2,3:1,4,3,3
chr16	1735628	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr16	1779114	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=87,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:11,8,1,2
chr16	1797054	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=116,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,2:5,0:4,4,1,1
chr16	1798182	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr16	1811234	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,58;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,4:8,0:7,2,2,2
chr16	1814964	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr16	1816814	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:6,1,4,4
chr16	1817382	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr16	1817397	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	1817754	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr16	1817768	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,5,5
chr16	1817935	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr16	1818152	.	CT	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr16	1818680	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr16	1822268	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:13,8:3,0:13,3,8,0
chr16	1822599	.	CCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:1822599_CCTT_C:1822599:2,7,1,1
chr16	1822605	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:1822599_CCTT_C:1822599:2,7,1,1
chr16	1824420	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr16	1825198	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=167,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0|1:1825198_A_C:1825198:1,2,1,1
chr16	1825199	.	C	CAGTGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0|1:1825198_A_C:1825198:1,2,1,1
chr16	1825290	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:4,1,3,0
chr16	1836709	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,2,2
chr16	1837900	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	1841329	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=208,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr16	1842085	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=116,71;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,2:5,0:0|1:1842085_T_A:1842085:5,5,2,1
chr16	1842087	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=116,71;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:0|1:1842085_T_A:1842085:5,5,2,1
chr16	1867014	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr16	1867040	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	1867338	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr16	1869104	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=105,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:2,2:4,2,1,1
chr16	1869907	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=90,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:4,3,5,4
chr16	1872479	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	1877175	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=273,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:1,0,8,0
chr16	1878031	.	GC	AT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=177,193;MMQ=53,53;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:0,6,0,8
chr16	1878032	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=526,174;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.873:14:0,7:1,5:0,1,0,13
chr16	1878064	.	C	CTTAA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=198,147;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:3,1:1,0:0|1:1878064_C_CTTAA:1878064:0,4,0,1
chr16	1878065	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=198,147;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:3,1:1,0:0|1:1878064_C_CTTAA:1878064:0,4,0,1
chr16	1878067	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	1878275	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=51,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.725:14:0,3:2,4:2,2,7,3
chr16	1878641	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0|1:1878641_A_C:1878641:0,0,16,14
chr16	1878647	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=140,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:17,0:15,3:0|1:1878641_A_C:1878641:17,15,0,3
chr16	1878924	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr16	1878977	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr16	1879013	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=104,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	1884462	.	C	CTCAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1884462_C_CTCAAG:1884462:0,1,0,1
chr16	1884467	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1884462_C_CTCAAG:1884462:0,1,0,1
chr16	1887887	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=95,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.814:24:1,4:2,16:2,2,4,16
chr16	1887937	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=113,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,3:1,6:0,1,0,9
chr16	1889189	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	1891723	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1894790	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	1894852	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr16	1895030	.	TC	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	1908025	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr16	1912139	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,2:4,5:0,4,1,6
chr16	1994743	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,5:4,3:0|1:1994743_G_A:1994743:8,2,8,0
chr16	1994749	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,5:5,4:0|1:1994743_G_A:1994743:8,4,9,0
chr16	1994931	.	C	CAAGAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,6:4,1:3,11,3,5
chr16	2004718	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,6:1,4:0,1,0,10
chr16	2011126	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,18,7
chr16	2011633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:7,12,0,2
chr16	2011649	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.311:13:3,0:6,1:0|1:2011649_A_C:2011649:0,9,4,0
chr16	2011653	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,18;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.312:13:2,0:6,1:0|1:2011649_A_C:2011649:0,9,4,0
chr16	2011712	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=154,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr16	2013314	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,3,16
chr16	2014424	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,4:0,20:0,0,6,18
chr16	2024474	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=130,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr16	2027469	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr16	2031151	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:2031151_C_T:2031151:8,11,1,1
chr16	2031153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:2031151_C_T:2031151:8,11,1,1
chr16	2036048	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:1,2,1,4
chr16	2049135	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2049135_A_G:2049135:0,0,0,1
chr16	2049142	.	G	GTGTTAAATAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2049135_A_G:2049135:0,0,0,1
chr16	2049882	.	G	GTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TCC;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	2050917	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr16	2059674	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	2059698	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	2059708	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2059708_T_G:2059708:0,0,0,1
chr16	2059710	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2059708_T_G:2059708:0,0,0,1
chr16	2079704	.	T	TGCCCC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=90,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,1:4,0:0|1:2079704_T_TGCCCC:2079704:1,7,2,0
chr16	2079708	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,16;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,0:0|1:2079704_T_TGCCCC:2079704:1,8,2,0
chr16	2079712	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,0;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:4,0:0|1:2079704_T_TGCCCC:2079704:1,8,2,0
chr16	2087460	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,7:2,3:2,1,8,2
chr16	2087658	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,2:2,2:0,2,1,3
chr16	2087785	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:1,2,5,4
chr16	2096045	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,4:2,0:5,0,5,0
chr16	2105335	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=94,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr16	2105400	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:6,4,3,4
chr16	2110571	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:2,1:7,0,3,0
chr16	2111779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr16	2115481	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=36,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,2:2,2:3,3,1,3
chr16	2120402	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,5,2
chr16	2129173	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:7,0:5,9:11,1,2,8
chr16	2129282	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=81,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,1:7,2:8,13,1,2
chr16	2130318	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,4:8,0:9,6,4,0
chr16	2138218	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,6,11
chr16	2138269	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=89,129;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:0,2:5,3:3,4,3,3
chr16	2138398	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:0|1:2138398_C_T:2138398:3,2,6,2
chr16	2138422	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=125,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:0|1:2138398_C_T:2138398:5,2,4,2
chr16	2138584	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr16	2140680	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:4,1,1,2
chr16	2147268	.	G	GAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr16	2147299	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr16	2152651	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.484:25:7,7:5,5:4,9,5,7
chr16	2154461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr16	2162887	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=138,103;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr16	2164330	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=112,72;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:4,6,1,4
chr16	2165630	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,246;MMQ=60,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2165630_T_C:2165630:0,0,0,1
chr16	2165633	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,246;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2165630_T_C:2165630:0,0,0,1
chr16	2199990	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:21,0:17,3:14,24,0,3
chr16	2203456	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,6:0,12:0,0,1,17
chr16	2225971	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:2,4,3,3
chr16	2229758	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	2230368	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=204,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr16	2231733	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr16	2233565	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr16	2233883	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr16	2236611	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	2239276	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:12,6,1,1
chr16	2239402	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.516:17:4,3:4,4:1,7,3,6
chr16	2256047	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:4,1:8,3,5,1
chr16	2256326	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr16	2256461	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,7:3,6:6,3,10,3
chr16	2256681	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:2256681_G_T:2256681:1,2,0,1
chr16	2256683	.	T	TGAGTACACGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2256681_G_T:2256681:1,2,0,1
chr16	2259766	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr16	2259865	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr16	2260612	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:2,1,0,5
chr16	2282256	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,15,5
chr16	2282951	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:8,2:0|1:2282951_T_A:2282951:7,14,0,2
chr16	2282953	.	T	TCATA	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:7,2:0|1:2282951_T_A:2282951:7,14,0,2
chr16	2282956	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:7,2:0|1:2282951_T_A:2282951:7,15,0,2
chr16	2282958	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:7,2:0|1:2282951_T_A:2282951:9,15,0,2
chr16	2282961	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:2282951_T_A:2282951:9,14,0,2
chr16	2288291	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=177,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.353:6:3,1:0,0:0|1:2288291_A_C:2288291:3,1,2,0
chr16	2288298	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:2288291_A_C:2288291:3,1,1,0
chr16	2327972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr16	2330938	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	2331430	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,17,6
chr16	2334976	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr16	2338363	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	2339400	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2339400_T_TC:2339400:0,0,1,0
chr16	2339406	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2339400_T_TC:2339400:0,0,1,0
chr16	2339413	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2339400_T_TC:2339400:0,0,1,0
chr16	2339417	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2339400_T_TC:2339400:0,0,1,0
chr16	2339421	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:2339400_T_TC:2339400:1,1,1,0
chr16	2349459	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,0:7,2:5,5,2,0
chr16	2375961	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr16	2375989	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:11,2,2,0
chr16	2485896	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,12:0,0,14,15
chr16	2487375	.	A	ATCTACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2487375_A_ATCTACC:2487375:0,1,0,1
chr16	2487377	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2487375_A_ATCTACC:2487375:0,1,0,1
chr16	2487379	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2487375_A_ATCTACC:2487375:0,1,0,1
chr16	2488211	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr16	2489533	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr16	2498828	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,2:0,3:0,0,4,4
chr16	2498849	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,7,10
chr16	2499011	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	2499893	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=116,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,2:12,1:14,4,3,0
chr16	2499983	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=185,140;MMQ=45,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0|1:2499983_A_G:2499983:0,3,0,2
chr16	2499988	.	ATTTG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=185,164;MMQ=45,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:2499983_A_G:2499983:0,3,0,1
chr16	2500011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=182,185;MMQ=45,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2500011_C_T:2500011:0,3,0,1
chr16	2500013	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=182,185;MMQ=45,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2500011_C_T:2500011:0,3,0,1
chr16	2500020	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=182,185;MMQ=45,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2500011_C_T:2500011:0,3,0,1
chr16	2505304	.	G	GTGCGGACCAGGGGTTTGGGTCCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=172,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,1,1
chr16	2505496	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,1:6,2:10,10,0,3
chr16	2510570	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=191,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:10,0,1,2
chr16	2510603	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr16	2512616	.	C	CTTAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:2512616_C_CTTAG:2512616:3,4,1,1
chr16	2512618	.	T	TTCATGGGCCATTGCCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:2512616_C_CTTAG:2512616:3,4,1,1
chr16	2627531	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,166;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.130:28:11,3:13,0:0|1:2627531_C_CTTTTTT:2627531:5,20,0,3
chr16	2627536	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=124,166;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,3:13,0:0|1:2627531_C_CTTTTTT:2627531:5,20,0,3
chr16	2647604	.	TTTTG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:4,0:0|1:2647604_TTTTG_T:2647604:9,4,1,1
chr16	2647610	.	TGGG	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:4,0:0|1:2647604_TTTTG_T:2647604:9,5,1,1
chr16	2647616	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:2647604_TTTTG_T:2647604:8,6,1,1
chr16	2647621	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:2647604_TTTTG_T:2647604:4,7,1,1
chr16	2747857	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:7,0,5,2
chr16	2807967	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.380:35:12,4:9,9:7,15,5,8
chr16	2808002	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=135,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:3,17,0,2
chr16	2813073	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=128,4;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:13,3:10,13,3,0
chr16	2818185	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:6,3:7,9:3,11,5,7
chr16	2818276	.	A	AGCCCAGGAGGTCCAGAGCACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=145,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr16	2819012	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=145,35;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr16	2819178	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:3,7:11,9:6,8,9,7
chr16	2820756	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=119,245;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,4:13,0:12,9,4,0
chr16	2821573	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=75,87;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,8:1,2:3,5,4,6
chr16	2821988	.	TC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=82,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.425:33:11,9:5,5:15,4,10,4
chr16	2822174	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=194,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr16	2825594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,2:2,4:0,2,1,6
chr16	2834565	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=128,276;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,6:0,0:2,0,6,0
chr16	2834826	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:3,7,0,6
chr16	2836408	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,3:2,0:3,2,3,0
chr16	2836557	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr16	2836582	.	ACT	CAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:4,2:4,7,1,1
chr16	2848429	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	2848910	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2848910_C_G:2848910:0,0,1,0
chr16	2848913	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2848910_C_G:2848910:0,0,1,0
chr16	2848918	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2848910_C_G:2848910:0,0,1,0
chr16	2848923	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2848910_C_G:2848910:0,0,1,0
chr16	2854907	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=31,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,2:5,6:6,2,6,2
chr16	2867530	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,1124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	2871121	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr16	2880614	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr16	2880870	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr16	2882197	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.830:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chr16	2903850	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:1,2:3,2,1,1
chr16	2906934	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr16	2949248	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	2979640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr16	2983334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:4,2,1,1
chr16	2998629	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=103,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,2:9,3:7,6,4,1
chr16	3016814	.	A	AAGACACTCACTTTAATTCACTTATGTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=148,39;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:3,0:2,5,2,1
chr16	3016885	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr16	3021116	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:8,3:1,0:9,0,3,0
chr16	3065365	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,84;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,4:9,0:8,5,2,2
chr16	3065483	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr16	3065924	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:8,10:8,12:7,9,9,13
chr16	3071420	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	3073240	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=12,24;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.960:28:0,14:0,9:0,1,20,7
chr16	3073301	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=145,36;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:16,0:20,2:0|1:3073301_T_A:3073301:25,14,1,1
chr16	3073305	.	T	TTTCTTAG	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=169,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:15,0:19,2:0|1:3073301_T_A:3073301:34,14,1,1
chr16	3073308	.	A	AGT	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=168,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:23,0:24,2:0|1:3073301_T_A:3073301:32,15,1,1
chr16	3073310	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=157,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.056:52:22,0:14,2:0|1:3073301_T_A:3073301:34,16,1,1
chr16	3073314	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=132,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:25,0:19,1:0|1:3073301_T_A:3073301:26,18,1,1
chr16	3074426	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,6,23
chr16	3075648	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:7,3:2,0:5,5,3,0
chr16	3077260	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=78,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:17,4:25,2:20,23,4,2
chr16	3077710	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,0:0,3:0,0,0,7
chr16	3078530	.	G	GTCAATGGCTTGAGGCTTACTTGTTCACGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=187,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	3078544	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	3078616	.	CATT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	3080502	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr16	3097568	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr16	3097596	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	3106994	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,3:2,1:3,0,3,1
chr16	3117679	.	G	GTCCTCCCTCCCCACTCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	3117937	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=63,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:8,8:5,7:8,5,10,5
chr16	3118330	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=116,195;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:2,19,0,2
chr16	3119270	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=157,157;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:15,0:15,7:11,20,0,7
chr16	3119297	.	C	CG	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=179,123;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.111:32:13,2:15,1:13,16,0,3
chr16	3119304	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=180,123;MMQ=60,39;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,2:16,1:14,16,0,3
chr16	3166587	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,1:3,2,2,2
chr16	3168836	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr16	3254418	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=55,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:6,6:12,8:6,12,7,7
chr16	3282605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=206,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	3293888	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,7:6,2:1,13,4,5
chr16	3293922	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:3,7:6,1:1,9,4,4
chr16	3294154	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.292:12:6,0:1,3:8,1,3,0
chr16	3294678	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	3296429	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=72,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr16	3296616	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:0,5,2,4
chr16	3297073	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:4,5:4,2:4,5,3,4
chr16	3298865	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:4,5:2,1:5,2,4,2
chr16	3339728	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,0:15,4:0|1:3339728_G_T:3339728:17,8,2,2
chr16	3339733	.	G	GTGTGT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:10,0:15,4:0|1:3339728_G_T:3339728:16,9,2,2
chr16	3367719	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=133,154;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,11:0.191:61:14,11:35,0:0|1:3367719_T_G:3367719:28,22,11,0
chr16	3367729	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,154;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,11:0.214:54:13,11:28,0:0|1:3367719_T_G:3367719:23,20,11,0
chr16	3405875	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr16	3406387	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,3:0,0,6,6
chr16	3407312	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=83,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr16	3440394	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,31;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:4,4:10,0:9,5,3,1
chr16	3447242	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=96,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:7,3:8,5:6,9,4,5
chr16	3447282	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=77,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,5:6,3:9,7,1,7
chr16	3451916	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	3452505	.	CCCG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,164;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:1,2:0,8,0,2
chr16	3454512	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:7,1:8,3:10,5,1,3
chr16	3455079	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr16	3458219	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	3458840	.	ACCAGTGTGG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAGTGTGG;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:5,0:6,11,1,1
chr16	3487576	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	3493240	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr16	3526407	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,0:1,0,0,3
chr16	3534892	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr16	3550977	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,28;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:1,3:0,0:3,0,3,0
chr16	3556381	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.109:52:25,0:21,5:25,22,2,3
chr16	3558262	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33,32;MFRL=126,157,180;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=6.42,4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.400,0.344:5:1,2,1:0,0,1:1,0,4,0
chr16	3594162	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=116,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:2,1:4,4,2,0
chr16	3594403	.	A	AACAATTGGCCCTCAAATTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	3599655	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:8,0,4,3
chr16	3600530	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:3600530_C_T:3600530:1,5,1,1
chr16	3600534	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:3600530_C_T:3600530:1,5,1,1
chr16	3600537	.	C	CTACTTCTCCTTGTCTCTGGTTTTTATTATAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:3600530_C_T:3600530:1,5,1,1
chr16	3602227	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,4,8
chr16	3611610	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	3633254	.	CG	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=104,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,1:14,1:10,19,0,2
chr16	3639139	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:2,7:6,5:3,5,10,2
chr16	3645745	.	A	ACCCCCATTAACATGGGTGAAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr16	3645751	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=156,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr16	3646219	.	C	CCGCGGCTGAGGCTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr16	3647932	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:4,2:3,1:1,6,2,2
chr16	3651241	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=131,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr16	3656482	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,1:1,6:2,1,4,3
chr16	3712016	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:5,1,9,0
chr16	3713440	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:3713440_C_T:3713440:4,6,1,1
chr16	3713442	.	A	AAAGGCCTCACCCCCAGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:7,2:0|1:3713440_C_T:3713440:4,6,1,1
chr16	3725507	.	C	CCTGGCATCCACTTGTCATTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	3726160	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr16	3727490	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:9,2:1,1:6,4,2,2
chr16	3739078	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:10,9,1,2
chr16	3741030	.	C	CCTCGCATCAACCTACCAAACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=182,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr16	3777921	.	ACGTGGTGTGGCGAAGGCTGGGGCTGTATC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:12,0:10,2:19,11,1,1
chr16	3778302	.	CGCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr16	3779205	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=1041,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:3779205_G_A:3779205:1,3,0,1
chr16	3779207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=1041,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:3779205_G_A:3779205:1,3,0,1
chr16	3779220	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3779205_G_A:3779205:0,0,0,1
chr16	3779594	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:7,8:3,7:3,7,6,9
chr16	3779598	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:15,1:7,3:9,13,0,4
chr16	3781423	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=84,126;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,4:0,0:5,0,0,4
chr16	3781530	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3781530_G_GC:3781530:0,0,0,1
chr16	3781531	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3781530_G_GC:3781530:0,0,0,1
chr16	3786752	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:12,4:4,0:5,11,4,0
chr16	3786897	.	AG	TA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=216,214;MMQ=59,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.433:2:0,0:1,1:0|1:3786897_AG_TA:3786897:0,1,0,1
chr16	3786900	.	A	ATGTAGCCCCACACACCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=216,214;MMQ=59,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:3786897_AG_TA:3786897:0,1,0,1
chr16	3786904	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3786897_AG_TA:3786897:0,0,0,1
chr16	3786906	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3786897_AG_TA:3786897:0,0,0,1
chr16	3801847	.	C	CTCTCTTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr16	3808052	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr16	3828896	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr16	4015729	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:2,1:0,4:2,0,6,0
chr16	4016676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr16	4027423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr16	4027605	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,15,13
chr16	4027688	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr16	4033436	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:3,6,4,5
chr16	4033518	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr16	4039141	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	4042049	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	4042449	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=323,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr16	4242093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:10,1,2,0
chr16	4242546	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=111,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.123:37:22,2:11,2:17,16,2,2
chr16	4242547	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:22,2:15,0:21,17,1,1
chr16	4245681	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=134,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,2:4,0:8,8,0,2
chr16	4245693	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=66,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,7:1,3:4,5,6,4
chr16	4253130	.	CG	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,4:4,1:6,3,3,2
chr16	4254479	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,1,1
chr16	4254523	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr16	4254725	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	4384894	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,101;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:3,15,0,2
chr16	4405389	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4405389_G_A:4405389:0,0,0,1
chr16	4405405	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4405389_G_A:4405389:0,0,0,1
chr16	4410867	.	TCACTGCTGGCCCCACCTCTCCA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	4411420	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=132,50;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:8,3:11,8,0,3
chr16	4412203	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:4,6,1,1
chr16	4414186	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,378;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:4,1:0,0:4,0,1,0
chr16	4414727	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,4:0,0,6,3
chr16	4414987	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr16	4415410	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr16	4415455	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr16	4431721	.	C	CCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:4431721_C_CCAA:4431721:3,0,1,1
chr16	4431723	.	A	ATGGCGAAACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:4431721_C_CCAA:4431721:3,0,1,1
chr16	4432029	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr16	4432049	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:2,1:1,6,3,0
chr16	4433607	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	4455675	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	4475868	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	4476183	.	G	GAGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.433:5:0,0:1,2:0|1:4476183_G_GAGTGT:4476183:1,2,1,1
chr16	4476187	.	G	GCATGTGATGTGTGCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=191,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:4476183_G_GAGTGT:4476183:0,2,1,1
chr16	4484328	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	4484613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	4494549	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,198;MMQ=41,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr16	4500544	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr16	4516092	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=199,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,1:1,7:1,0,8,0
chr16	4519140	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	4519548	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr16	4524060	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,9:0,3:0,0,8,5
chr16	4559351	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=69,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.386:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr16	4559811	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr16	4562512	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr16	4606983	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,61975897;MMQ=43,30;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr16	4621700	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:3,2:18,0:0|1:4621700_G_A:4621700:3,18,1,1
chr16	4621725	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0|1:4621700_G_A:4621700:0,0,2,11
chr16	4624762	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=106,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:6,4:13,0:7,13,3,1
chr16	4624801	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:3,9,0,2
chr16	4625126	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	4629079	.	G	GACTTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=49,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:4629079_G_GACTTCA:4629079:0,2,1,1
chr16	4629080	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=49,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:4629079_G_GACTTCA:4629079:0,2,1,1
chr16	4629102	.	C	CTTTGTCTGGCCGCTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:4629102_C_CTTTGTCTGGCCGCTG:4629102:0,4,0,1
chr16	4629105	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4629102_C_CTTTGTCTGGCCGCTG:4629102:0,4,0,1
chr16	4630096	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:14,7:4,0:11,7,7,0
chr16	4637080	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,4:11,0:16,7,4,0
chr16	4641814	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,11:0,5:0,0,6,11
chr16	4642481	.	C	CTTTCATCCACCCCTCGCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,278;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	4650359	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr16	4650369	.	T	TAGGAGATTCATAGAGGACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr16	4664833	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,3:0,0,1,9
chr16	4675116	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,0,4
chr16	4707432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=189,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,4:1,0:1,1,0,5
chr16	4707459	.	T	TGAAACATAGTCTTCTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	4714639	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=74,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,2:3,8:7,5,8,2
chr16	4715012	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=62,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:4,0,5,0
chr16	4715267	.	A	ACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr16	4718388	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=190,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,2:3,6:1,4,1,7
chr16	4723451	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=152,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,0:1,4:6,1,3,1
chr16	4747136	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr16	4751045	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.427:26:6,8:9,3:7,8,7,4
chr16	4777127	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0|1:4777127_C_T:4777127:3,4,1,1
chr16	4777135	.	G	GGATGAGTTGACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:4777127_C_T:4777127:3,5,1,1
chr16	4780202	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4780202_G_GA:4780202:0,1,0,1
chr16	4780203	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4780202_G_GA:4780202:0,1,0,1
chr16	4780205	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:4780202_G_GA:4780202:0,1,0,1
chr16	4786456	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr16	4787987	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr16	4788036	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	4790273	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,5:6,0:4,7,3,3
chr16	4792982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr16	4796304	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=263,68032901;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4796304_G_A:4796304:1,0,0,1
chr16	4796310	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=263,68032901;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4796304_G_A:4796304:1,0,0,1
chr16	4796595	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr16	4796871	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	4796952	.	TGAG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=56,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:1,2:3,2,1,1
chr16	4797109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr16	4812209	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:5,1,9,1
chr16	4812816	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:4812816_G_A:4812816:0,0,0,2
chr16	4812826	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=109,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:4812816_G_A:4812816:0,2,0,1
chr16	4812829	.	C	CCCCAAGAATGCTTGCCTTGCATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=109,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:4812816_G_A:4812816:0,2,0,1
chr16	4815501	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,5,3
chr16	4833421	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.393:11:3,2:3,2:3,4,3,1
chr16	4833861	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:5,3:1,1:6,0,4,0
chr16	4833941	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,3:12,0:9,15,1,2
chr16	4833970	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:11,9:6,3:6,11,4,8
chr16	4835728	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=130,172;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	4835794	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,1:0,0,7,7
chr16	4836155	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	4837545	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=84,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:3,3,1,4
chr16	4847421	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:7,0:12,5,4,0
chr16	4849852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr16	4861103	.	TAAA	T,TA,TAA,TAAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,27,27,27,27;MFRL=154,106,131,128,109;MMQ=60,60,60,60,49;MPOS=4,17,19,25;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.64,7.99,7.49,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:4,3,5,5,3:0.148,0.247,0.243,0.158:20:1,2,3,4,2:3,1,2,1,1:4,0,16,0
chr16	4867565	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr16	4872970	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:8,3:3,8:3,8,5,6
chr16	4873743	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr16	4897103	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr16	4897153	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,12,0
chr16	4903243	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr16	4908504	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr16	4908590	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,3:6,0:11,6,1,2
chr16	4908667	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,8:7,6:4,8,5,9
chr16	4911195	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	4918732	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr16	4918913	.	CGTCT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTCT;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.131:20:11,1:6,1:7,11,1,1
chr16	4920345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:6,5,1,1
chr16	4920661	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:3,4:9,7:3,10,4,7
chr16	4920873	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=86,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:14,0:21,7,3,0
chr16	4923091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,8,13
chr16	4927285	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr16	4933301	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	4933363	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr16	4935695	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:3,8,2,1
chr16	4939116	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	4940989	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	4941886	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=119,77;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:11,0:9,8,1,2
chr16	4943478	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,11;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,0:2,1:2,1,2,1
chr16	4945221	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr16	4949440	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=103,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	4950940	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,4:3,10:4,3,7,7
chr16	4960995	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr16	5009232	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr16	5009433	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,4,17
chr16	5040971	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr16	5041778	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	5046787	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=92,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr16	5050554	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	5050897	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:3,3,3,3
chr16	5055864	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30,17;MFRL=97,162,93;MMQ=60,40,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=4.50,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.275,0.467:11:0,0,1:2,3,0:1,2,4,4
chr16	5057586	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	5061085	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:4,4:7,1:5,6,5,1
chr16	5065009	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5065009_G_C:5065009:0,0,0,1
chr16	5065010	.	T	TCAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5065009_G_C:5065009:0,0,0,1
chr16	5065011	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5065009_G_C:5065009:0,0,0,1
chr16	5077256	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:7,1,2,0
chr16	5077395	.	TGGGAGGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGAGGA;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.717:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr16	5078841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr16	5078857	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,4,1
chr16	5083724	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr16	5094345	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:10,1,0,2
chr16	5105406	.	CCA	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:5105406_CCA_C:5105406:3,14,1,1
chr16	5105410	.	TCCCCAG	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:5105406_CCA_C:5105406:3,14,1,1
chr16	5105440	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:2,3:6,3:0,8,0,6
chr16	5112642	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=344,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.556:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr16	5122072	.	G	GGTCT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCT;STR;TLOD=61.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.566:28:9,13:3,3:5,7,6,10
chr16	5123270	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:6,5:1,3:1,6,2,6
chr16	5125365	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,9:0,24:0,0,18,15
chr16	5125404	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=95,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.174:34:9,3:19,1:9,19,1,5
chr16	5125503	.	GG	AA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chr16	5125530	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:0|1:5125530_G_C:5125530:2,9,1,1
chr16	5125536	.	T	TGCAGTCACAATACCCAAAGCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:5125530_G_C:5125530:2,7,1,1
chr16	5127853	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	5128902	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,176;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,0,3
chr16	5143557	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,100;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:12,0:6,2:6,12,1,1
chr16	7657373	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,2,2
chr16	7657432	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,1:5,4:2,5,0,6
chr16	7703785	.	G	GCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CT;STR;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.867:12:0,5:1,4:0,1,10,1
chr16	7704032	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7704032_T_C:7704032:0,0,0,1
chr16	7704041	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7704032_T_C:7704032:0,0,0,1
chr16	7726691	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	7759159	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:3,6,1,2
chr16	7759164	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr16	7759217	.	C	CCTCTTTGATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	8619750	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr16	8620045	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=109,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.367:17:6,3:5,1:0|1:8620045_A_C:8620045:1,10,6,0
chr16	8620050	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.348:18:6,1:4,1:0|1:8620045_A_C:8620045:0,12,6,0
chr16	8620054	.	CAGCA	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.366:17:6,3:5,2:0|1:8620045_A_C:8620045:0,11,6,0
chr16	8620060	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:5,0:0|1:8620045_A_C:8620045:0,11,3,0
chr16	8620065	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=27,14;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,0:4,0:0|1:8620045_A_C:8620045:0,10,3,0
chr16	8620096	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	8722796	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=100,166;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:20,0:11,3:19,12,0,3
chr16	8722810	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=97,185;MMQ=60,37;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:16,4:13,0:19,11,4,0
chr16	8723064	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=212,243;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0,3,6,0
chr16	8728772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	8729220	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=196,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr16	8732882	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr16	8733071	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr16	8735120	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr16	8736028	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,23:0,0,25,16
chr16	8736150	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr16	8736246	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,8,2
chr16	8736499	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	8738350	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr16	8738398	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,18,9
chr16	8738427	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,15:0,0,16,17
chr16	8738622	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr16	8738641	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr16	8829715	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr16	8839954	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,3:3,5:4,7,3,5
chr16	8840025	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=272,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.662:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr16	8842128	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	8851767	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr16	8858580	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr16	8862181	.	C	CACTTTGGGAGGCCGAGGTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=172,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.313:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr16	8862212	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	8862232	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	8862592	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	8866582	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	8875109	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr16	8891403	.	CGCCCCAGCCCTGACCCCGACCCCAAAGAGCATCACCCCCTCAAGGCTCGCCACCCGCCTCCTTACCATG	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.051:58:0,0:4,2:26,30,1,1
chr16	8904877	.	T	TATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATG;STR;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr16	8905054	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr16	8905683	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	8948974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	8949114	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.288:29:13,0:7,8:12,9,0,8
chr16	8952113	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	8953003	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,2:5,0:9,4,1,1
chr16	8988386	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr16	8988761	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,1:0|1:8988761_A_T:8988761:5,10,0,2
chr16	8988763	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:8988761_A_T:8988761:5,10,0,2
chr16	8988764	.	C	CACACACACACACACACACACACA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:8988761_A_T:8988761:4,10,0,2
chr16	8988777	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=319,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=67.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,2:1,18:1,0,5,15
chr16	8989403	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	8992868	.	AC	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr16	8995176	.	C	CTGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=222,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr16	8995177	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	8995927	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr16	8996414	.	GTATATACATATACATATA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=283,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr16	9004564	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr16	9010446	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr16	9010826	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,2:0,0,1,5
chr16	9014350	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr16	9014385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr16	9014928	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr16	9015252	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	9017061	.	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=35,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.919:12:0,4:0,1:0,2,7,3
chr16	9186735	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=165.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,29:0,15:0,0,43,9
chr16	9186749	.	GT	G,GTT	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=31,25,30;MFRL=125,88,89;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=11.00,9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,14,11:0.251,0.205:50:11,7,3:9,5,5:15,10,13,12
chr16	9916326	.	G	GAAAGAAAGAAAGAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:3,0:0,9,0,2
chr16	9943666	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,2:5,6:5,3,5,3
chr16	10524656	.	GGAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=90,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:2,4:2,5,3,2
chr16	10524957	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.472:21:5,4:6,5:4,7,5,5
chr16	10525230	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:6,6,2,3
chr16	10566146	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	10574916	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=210,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10574916_G_GCC:10574916:0,1,0,1
chr16	10574918	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=210,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10574916_G_GCC:10574916:0,1,0,1
chr16	10575756	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=79,175;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:10,3:15,0:14,12,3,0
chr16	10626747	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:10626747_C_T:10626747:8,10,1,1
chr16	10626756	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:10626747_C_T:10626747:8,12,1,1
chr16	10626760	.	C	CTGTAAGAAGTAAAAATT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:10626747_C_T:10626747:8,12,1,1
chr16	10631945	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=106,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:4,3:8,3:4,9,2,5
chr16	10631985	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr16	10632010	.	TCCA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=-74;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.305:6:1,0:3,2:0|1:10632010_TCCA_T:10632010:0,4,1,1
chr16	10632017	.	TAGGTGTGACAGGAGGCAAACAGGAAGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=-78;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.359:5:0,0:1,2:0|1:10632010_TCCA_T:10632010:1,2,1,1
chr16	10637375	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr16	10721707	.	G	GTTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=180,147;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.248:6:4,0:1,1:0,5,0,1
chr16	10721734	.	C	T,CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30,31;MFRL=180,164,147;MMQ=60,40,24;MPOS=8,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:0,1,1:0,4,0,2
chr16	10721739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=180,156;MMQ=50,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	10770075	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=90,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr16	10770091	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,0,5
chr16	10775822	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.604:26:4,4:5,11:9,1,9,7
chr16	10775826	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:4,4:13,5:10,7,8,1
chr16	10775855	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:4,3:13,4:8,9,6,1
chr16	10775932	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=86,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:11,4:4,6:7,8,4,6
chr16	10776063	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr16	10783748	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=176,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:10783748_TG_T:10783748:3,2,2,0
chr16	10783751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=176,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:10783748_TG_T:10783748:3,2,2,0
chr16	10788106	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	10788129	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	10788751	.	C	CTGGATTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	10846511	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,8:3,5,8,7
chr16	10855521	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=212,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.568:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr16	10861914	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,3:4,6:2,3,2,7
chr16	10862964	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:2,4,6,5
chr16	10971253	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,81;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:15,4:25,0:18,22,4,0
chr16	10989346	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10989346_C_A:10989346:1,3,0,1
chr16	10989353	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10989346_C_A:10989346:1,3,0,1
chr16	10989374	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr16	10989385	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=208,258;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr16	10992715	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr16	10995850	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.348:15:2,2:8,3:6,4,4,1
chr16	11001821	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,4,1
chr16	11002060	.	T	TGCAGGCAGTAGTTTGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=102,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr16	11003070	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:9,5:5,0:3,11,5,1
chr16	11004150	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,2,4
chr16	11009587	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr16	11017058	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,1:2,3:3,0,4,1
chr16	11214668	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=192,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr16	11250413	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:2,2,3,2
chr16	11349403	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	11361862	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=113,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:10,4:9,12,0,4
chr16	11361895	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:4,5,5,4
chr16	11362921	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.118:41:21,3:13,0:11,25,0,5
chr16	11367477	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:1,3,2,4
chr16	11369930	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	11444403	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=113,201;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr16	11444430	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=136,186;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:8,2,4,0
chr16	11444454	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,9:0,0,10,10
chr16	11444469	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:11,5:14,3:13,12,4,4
chr16	11643631	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=89,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:9,6:6,7:5,10,3,10
chr16	11650325	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.469:32:11,9:6,6:14,3,12,3
chr16	11771939	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,8:0.151:57:22,0:27,8:27,22,0,8
chr16	11772538	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.546:42:10,7:9,16:5,14,6,17
chr16	11772600	.	T	TTCTGA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,15:0,21:0,0,13,26
chr16	11773743	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	11828018	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr16	11829920	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:15,3:6,0:11,10,3,0
chr16	11850085	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,7:0.129:60:23,7:29,0:14,39,6,1
chr16	11862085	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,3:3,0:11,0,3,0
chr16	11868966	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	11870671	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,60;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:0|1:11870671_C_T:11870671:8,13,1,1
chr16	11870678	.	CC	AG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,60;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:11870671_C_T:11870671:9,12,1,1
chr16	11870683	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,60;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:11870671_C_T:11870671:9,12,1,1
chr16	11870684	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=126,60;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:7,2:0|1:11870671_C_T:11870671:9,12,1,1
chr16	11931815	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=97,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:20,4:16,0:21,15,1,3
chr16	11935823	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:6,8,1,1
chr16	11940390	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,14:0,20:0,0,16,19
chr16	11940764	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr16	11945231	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,18,7
chr16	11966916	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:9,2,2,2
chr16	11976825	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,169;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,5:6,0:10,3,5,0
chr16	11981362	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr16	11984922	.	GTTTCTCTGTT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:8,14,1,1
chr16	12009150	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	12136954	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr16	12140164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,151;MMQ=25,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr16	12142172	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=90,170;MMQ=45,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.578:5:1,1:1,2:0|1:12142172_T_G:12142172:1,1,1,2
chr16	12142175	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=90,170;MMQ=45,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:12142172_T_G:12142172:1,1,1,2
chr16	12145791	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=153,117;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.485:33:6,11:11,5:7,10,6,10
chr16	12172675	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:16,0:9,2:0|1:12172675_C_T:12172675:9,17,1,1
chr16	12172683	.	T	TTATATGTAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:19,0:10,2:0|1:12172675_C_T:12172675:12,17,1,1
chr16	12172873	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	12371915	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:3,5,2,8
chr16	12449925	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	12450163	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:0,1:7,7:4,3,3,5
chr16	12571654	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=92,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:6,10,1,1
chr16	12571675	.	A	ATCTACCC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:12571675_A_ATCTACCC:12571675:4,9,1,1
chr16	12571676	.	G	GCCTC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,1:0|1:12571675_A_ATCTACCC:12571675:4,9,1,1
chr16	12571677	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,1:0|1:12571675_A_ATCTACCC:12571675:4,8,1,1
chr16	12662295	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	12758966	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,7:0,0,7,9
chr16	12759027	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr16	13002359	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,8,3
chr16	13002387	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:5,3,1,1
chr16	13297242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:4,0,4,1
chr16	13306994	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=226,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	13328814	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CT;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:0,1:2,1,3,0
chr16	13329179	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr16	14016109	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.513:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr16	14024841	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0|1:14024841_A_ACT:14024841:0,0,0,1
chr16	14024844	.	A	AATTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:14024841_A_ACT:14024841:0,1,0,1
chr16	14024847	.	T	TGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14024841_A_ACT:14024841:0,1,0,1
chr16	14026007	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,6,3
chr16	14026104	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,91;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,5:1,0:4,2,5,0
chr16	14028081	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=77,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,1:2,3:3,2,2,2
chr16	14031520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	14307587	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14307587_A_C:14307587:0,1,0,1
chr16	14307590	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14307587_A_C:14307587:0,1,0,1
chr16	14403159	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,2:18,0:0|1:14403159_G_A:14403159:14,17,1,1
chr16	14403169	.	GG	AA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,2:17,0:0|1:14403159_G_A:14403159:13,17,1,1
chr16	14403179	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:0|1:14403159_G_A:14403159:16,14,1,1
chr16	14680100	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,87;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:0|1:14680100_G_C:14680100:10,1,2,1
chr16	14680109	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=145,87;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,3:8,0:0|1:14680100_G_C:14680100:10,2,2,1
chr16	14680113	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=144,87;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:7,0:0|1:14680100_G_C:14680100:9,2,1,1
chr16	14698159	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=193,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.297:12:6,3:3,0:0,9,0,3
chr16	14700254	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.769:10:2,4:0,3:2,0,7,1
chr16	14749080	.	ATT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,1:0,3:1,2,1,3
chr16	14951476	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,98;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:7,3:0,0:4,3,2,1
chr16	14958369	.	T	TTATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=124,77;MMQ=25,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14958369_T_TTATTA:14958369:1,0,0,1
chr16	14958371	.	C	CCATTATTTTTGTCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=124,77;MMQ=25,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14958369_T_TTATTA:14958369:1,0,0,1
chr16	14968903	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:9,3,2,1
chr16	14969016	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,138;MMQ=40,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,10:6,8:3,8,5,13
chr16	14978207	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr16	14980690	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=155,104;MMQ=25,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:14980690_C_T:14980690:5,7,2,0
chr16	14980696	.	CCCCCA	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=162,104;MMQ=25,37;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:14980690_C_T:14980690:8,7,2,0
chr16	14980703	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=162,104;MMQ=25,37;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:0|1:14980690_C_T:14980690:8,7,2,0
chr16	14989420	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=108,98;MMQ=43,47;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:8,13:5,3:6,7,8,9
chr16	15091589	.	C	CT	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=98,101;MMQ=51,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.660:35:6,8:5,10:10,2,15,8
chr16	15091621	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=113,66;MMQ=48,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.170:45:18,0:16,5:22,16,3,4
chr16	15091686	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=140,99;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:15091686_G_GA:15091686:9,7,0,2
chr16	15091688	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=144,99;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:8,0:0|1:15091686_G_GA:15091686:11,10,0,2
chr16	15091693	.	AC	CG	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=140,99;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:0|1:15091686_G_GA:15091686:10,10,0,2
chr16	15116521	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,115;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:4,1:4,3:5,4,1,3
chr16	15141966	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=83,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:11,2:7,1:5,13,2,1
chr16	15156971	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=58,153;MMQ=27,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,4,1
chr16	15159022	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20,31;MFRL=118,105,146;MMQ=52,50,45;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=9.21,6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,9,6:0.297,0.222:27:5,0,0:3,6,4:7,5,8,7
chr16	15166809	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:5,3,7,1
chr16	15168760	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr16	15187912	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	15494794	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:15494794_G_T:15494794:0,5,0,2
chr16	15494808	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=215,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:15494794_G_T:15494794:0,3,0,2
chr16	15501728	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=106,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:6,2:7,11,2,0
chr16	15596142	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr16	15705605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=183,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:2,2,3,5
chr16	15705627	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=156,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr16	15705640	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=205,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	15711022	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:4,9,0,2
chr16	15711041	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr16	15714494	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr16	15715698	.	TGTAAGTTTTC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=93,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:14,2:19,0:19,16,1,1
chr16	15718591	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr16	15724113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=177,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr16	15727459	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	15728782	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.177:37:18,0:12,6:11,20,0,6
chr16	15730245	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=147,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr16	15733100	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:11,0:9,4:7,13,2,2
chr16	15758530	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:0,0:1,0:4,1,2,0
chr16	15758744	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.416:21:5,4:3,4:7,5,5,4
chr16	15758803	.	T	TCAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0|1:15758803_T_TCAC:15758803:0,1,0,2
chr16	15758804	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:15758803_T_TCAC:15758803:0,1,0,2
chr16	15758805	.	T	TATAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:15758803_T_TCAC:15758803:0,1,0,2
chr16	15771601	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,0:0,5:2,2,3,2
chr16	15797832	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=110,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,4:16,0:15,25,4,0
chr16	15811023	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,4:5,3:5,6,2,5
chr16	15813633	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=88,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,2:2,4:0,2,1,5
chr16	15813945	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr16	15814758	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:17,1:7,2:16,8,3,0
chr16	15814960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=105,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr16	15818310	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.561:5:2,1:0,1:0|1:15818310_G_A:15818310:0,2,0,3
chr16	15818312	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:15818310_G_A:15818310:0,4,0,1
chr16	15820863	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:9,3:9,3:12,7,4,3
chr16	15821003	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15821003_G_T:15821003:0,0,0,1
chr16	15821005	.	A	AGCATGTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15821003_G_T:15821003:0,0,0,1
chr16	15821009	.	C	CTAGCCTGTTGAAGAGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15821003_G_T:15821003:0,0,0,1
chr16	15831546	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	15838940	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:2,0,6,1
chr16	15843899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr16	15843965	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=98,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,1,1
chr16	15872609	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=266,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,4:2,7:1,2,7,4
chr16	15872748	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=92,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr16	15892479	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=98,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,1:4,3:7,2,1,3
chr16	15892492	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=62,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:4,0:10,1:6,10,3,0
chr16	15917321	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=249,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	16108282	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.697:11:2,3:0,5:3,0,8,0
chr16	16110253	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=196,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	16130515	.	C	CCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=209,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr16	16130524	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	16139878	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=58,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:4,2,0,2
chr16	16161976	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr16	16162019	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr16	16173232	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=115,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:10,6:12,8:7,15,6,8
chr16	16184232	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr16	16184235	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,5,1
chr16	16200756	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,12,13
chr16	16205449	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr16	16218753	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=81,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:17,0:14,2:11,20,1,1
chr16	16218760	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=90,81;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:18,0:10,5:11,17,0,5
chr16	16219596	.	G	GAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,14;RU=A;STR;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,0:0,0,3,1
chr16	16230290	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.733:28:1,14:6,6:3,4,18,3
chr16	16230336	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:16230336_AC_A:16230336:9,12,1,1
chr16	16230338	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:16230336_AC_A:16230336:9,12,1,1
chr16	16232139	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=175,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr16	16244129	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,3:3,5:2,9,3,5
chr16	16251435	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr16	16255195	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr16	16256767	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,0:0,10:0,0,10,0
chr16	16263663	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.389:39:11,8:13,6:16,8,8,7
chr16	16267079	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	16269934	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=98,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:16269934_C_T:16269934:0,21,1,1
chr16	16269952	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:2,2:0|1:16269934_C_T:16269934:0,3,1,1
chr16	16271526	.	GCA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,73;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:2,6,1,1
chr16	16278863	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,3:5,4:6,7,4,3
chr16	16278949	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:1,3,0,4
chr16	16278975	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	16280889	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,376;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16280889_C_T:16280889:0,0,1,0
chr16	16280895	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,376;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16280889_C_T:16280889:0,0,1,0
chr16	16281007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=107,71;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:3,1,3,3
chr16	16281070	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,3:0|1:16281070_T_C:16281070:2,5,2,1
chr16	16281073	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:3,2:0|1:16281070_T_C:16281070:2,5,2,1
chr16	16281079	.	C	CTAGGCAAAACTCTTGGTGG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:3,3:0|1:16281070_T_C:16281070:2,5,2,1
chr16	16282843	.	G	GCGCCTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	16284272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr16	16286614	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr16	16291816	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=148,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr16	16291858	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,3:1,7:4,1,9,1
chr16	16291871	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,2:3,9:6,1,7,4
chr16	16291971	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=97,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:2,3:11,9:8,5,7,5
chr16	16291983	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:2,3:10,8:6,8,7,4
chr16	16292000	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:2,0:15,4:8,9,0,4
chr16	16292128	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=356,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:16292128_C_T:16292128:0,1,1,3
chr16	16292133	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=356,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0|1:16292128_C_T:16292128:0,1,1,1
chr16	16306192	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,131;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,6:2,1:0,3,1,7
chr16	16339110	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,122;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:0,3,2,2
chr16	16345879	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=224,228;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:16345879_G_GT:16345879:1,0,0,1
chr16	16345881	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=224,228;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16345879_G_GT:16345879:1,0,0,1
chr16	16345883	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=224,228;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16345879_G_GT:16345879:1,0,0,1
chr16	16357415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	17221423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	17221460	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=64,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr16	17221755	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	17221813	.	C	CATGTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17221813_C_CATGTTG:17221813:0,0,0,1
chr16	17221814	.	C	CTTTCTCTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17221813_C_CATGTTG:17221813:0,0,0,1
chr16	17451987	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.438:11:1,2:2,1:1,5,0,5
chr16	18532182	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,66;MMQ=25,51;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.234:25:12,5:7,1:12,7,4,2
chr16	18544483	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=97,72;MMQ=25,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:29,0:29,5:0|1:18544483_C_T:18544483:11,50,2,3
chr16	18544490	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=97,72;MMQ=25,46;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:30,0:31,5:0|1:18544483_C_T:18544483:11,50,2,3
chr16	18812705	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:14,0:21,2,3,0
chr16	18839351	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=128,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:18,2:0|1:18839351_A_T:18839351:22,11,1,1
chr16	18839355	.	G	GATTAAAAGGACTTT	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=128,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:19,1:0|1:18839351_A_T:18839351:23,11,1,1
chr16	18839384	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=104,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:18,3:20,0:23,15,3,1
chr16	18840705	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:18840705_G_C:18840705:7,11,1,1
chr16	18840707	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:18840705_G_C:18840705:7,11,1,1
chr16	18853458	.	A	AACGCAGCAACTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr16	18859432	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:18859432_A_T:18859432:0,4,0,1
chr16	18859435	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:18859432_A_T:18859432:0,4,0,1
chr16	18861595	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=146,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:18861595_A_C:18861595:7,4,1,1
chr16	18861599	.	C	CAGACCTTTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:18861595_A_C:18861595:7,4,1,1
chr16	18880565	.	C	CAGTTAAAACTGAATA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,55;MMQ=31,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr16	18882659	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=101,166;MMQ=43,51;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:3,0:2,2:5,1,2,1
chr16	19034373	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=105,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:12,6:19,0:8,25,6,0
chr16	19041491	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr16	19041595	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr16	19041789	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:1,1:0,0:0|1:19041789_G_GC:19041789:0,2,0,1
chr16	19041790	.	A	ATGATTTCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19041789_G_GC:19041789:0,1,0,1
chr16	19041792	.	T	TTCACTGTAACCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19041789_G_GC:19041789:0,1,0,1
chr16	19049378	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr16	19051520	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	19056769	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=172,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:0,14:1,28:1,0,30,13
chr16	19058448	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:8,6,2,1
chr16	19063220	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=180,178;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:4,2:1,2:1,5,0,4
chr16	19067933	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,5:0,15:0,0,13,7
chr16	19079095	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	19083221	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr16	19129728	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=223,300;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr16	19129786	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=168,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr16	19131759	.	CTT	C,CT,CTTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29,22,31;MFRL=113,60,0,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,23,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,17;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.47,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,3,3:0.156,0.219,0.207:15:3,0,0,0:3,2,2,2:5,2,3,5
chr16	19131858	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=121,233;MMQ=50,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:19131858_A_T:19131858:0,2,0,1
chr16	19131861	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=121,233;MMQ=50,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:19131858_A_T:19131858:0,2,0,1
chr16	19131867	.	T	TCCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=242,233;MMQ=40,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131858_A_T:19131858:0,1,0,1
chr16	19131896	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19131896_T_C:19131896:0,0,0,1
chr16	19131907	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19131896_T_C:19131896:0,0,0,1
chr16	19131916	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,22;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19131896_T_C:19131896:0,0,0,1
chr16	19131918	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19131896_T_C:19131896:0,0,0,1
chr16	19184213	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.485:2:0,1:1,0:0|1:19184213_T_TAA:19184213:0,1,0,1
chr16	19184214	.	G	GTTGCCCATAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19184213_T_TAA:19184213:0,1,0,1
chr16	19184793	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:19184793_G_A:19184793:7,5,1,1
chr16	19184802	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:19184793_G_A:19184793:7,4,1,1
chr16	19194990	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.143:30:16,2:10,1:12,14,0,4
chr16	19195026	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=123,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:11,4:12,1:11,12,0,5
chr16	19195038	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,0:9,3:7,10,2,1
chr16	19236181	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr16	19278429	.	T	TAAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=A;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.854:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr16	19278498	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:5,0:1,2:0,6,0,3
chr16	19297219	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=115,94;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:3,5,1,5
chr16	19310092	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr16	19451284	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=108,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,0:4,2:5,1,2,0
chr16	19451371	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:2,5:6,7:4,4,10,2
chr16	19451737	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:10,3,2,0
chr16	19455318	.	AATGGATGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=ATGG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	19455615	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr16	19460842	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,13:0,0,12,9
chr16	19471665	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,7,14
chr16	19481220	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,25;MFRL=154,165;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr16	19483624	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:19483624_G_GT:19483624:0,2,0,1
chr16	19483631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:19483624_G_GT:19483624:0,2,0,1
chr16	19485688	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr16	19498215	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=123,34;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:19498215_CG_C:19498215:6,1,1,1
chr16	19498218	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=130,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:19498215_CG_C:19498215:6,2,1,1
chr16	19498221	.	CTTGTG	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=130,34;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:19498215_CG_C:19498215:6,2,1,1
chr16	19498229	.	TCCG	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=123,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,1:3,0:0|1:19498215_CG_C:19498215:6,3,1,1
chr16	19498241	.	TGAC	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=98,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:4,0:0|1:19498241_TGAC_T:19498241:5,8,1,1
chr16	19498246	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=98,34;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:19498241_TGAC_T:19498241:5,9,1,1
chr16	19498248	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=98,34;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:5,0:0|1:19498241_TGAC_T:19498241:6,9,1,1
chr16	19498252	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=87,34;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:7,0:0|1:19498241_TGAC_T:19498241:6,10,1,1
chr16	19503598	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=82,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,1:1,4:2,5,2,3
chr16	19505730	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:0,6,4,5
chr16	19505751	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr16	19508573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=190,337;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:19508573_A_G:19508573:0,1,0,2
chr16	19508583	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=190,337;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:19508573_A_G:19508573:0,1,0,2
chr16	19509333	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr16	19518945	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	19522101	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=90,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr16	19528429	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.163:41:16,6:17,0:22,13,6,0
chr16	19557267	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr16	19562538	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.231:50:18,11:21,0:19,20,11,0
chr16	19580799	.	GTCC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:8,1:7,1:8,7,1,1
chr16	19592996	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.310:20:8,2:6,1:0|1:19592996_A_C:19592996:0,14,6,0
chr16	19593002	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=148,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.263:20:8,1:6,2:0|1:19592996_A_C:19592996:0,15,5,0
chr16	19593006	.	AG	CC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,0:6,1:0|1:19592996_A_C:19592996:0,14,4,0
chr16	19593010	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,1:6,0:0|1:19592996_A_C:19592996:0,14,2,0
chr16	19619620	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=62,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:19619620_C_T:19619620:0,4,1,0
chr16	19619623	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=62,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:19619620_C_T:19619620:0,4,1,0
chr16	19619625	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=62,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:19619620_C_T:19619620:0,4,1,0
chr16	19640162	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=187,173;MMQ=51,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:19640162_A_G:19640162:0,1,0,1
chr16	19640170	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=173,187;MMQ=30,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	19640174	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=187,173;MMQ=51,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19640162_A_G:19640162:0,1,0,1
chr16	19640175	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=187,173;MMQ=51,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19640162_A_G:19640162:0,1,0,1
chr16	19653636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr16	19656122	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	19718312	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,2:14,1:12,11,1,2
chr16	19775269	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:2,6,3,5
chr16	19883082	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,0:3,0,1,1
chr16	20043507	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:1,0:6,5:6,2,0,5
chr16	20084743	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,3,1
chr16	20322425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	20322439	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	20357398	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	20362137	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=150,322;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0|1:20362137_C_T:20362137:0,1,0,5
chr16	20362145	.	C	CACAGCTCTCACAATACCCTGTGTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,38;MFRL=150,322;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0|1:20362137_C_T:20362137:0,1,0,5
chr16	20371834	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:8,3,2,0
chr16	20410669	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	20439150	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=129,226;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,1:6,2:10,7,3,0
chr16	20439174	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=130,167856;MMQ=52,23;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:4,5:10,0:8,6,5,0
chr16	20441195	.	C	CGTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:20441195_C_CGTT:20441195:0,4,1,1
chr16	20441197	.	C	CAGACTGGCCATAGCCTTCGTA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:20441195_C_CGTT:20441195:0,4,1,1
chr16	20441215	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	20448520	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=94,160;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:0|1:20448520_T_C:20448520:4,6,3,3
chr16	20448527	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=94,142;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:0|1:20448520_T_C:20448520:4,6,4,3
chr16	20448650	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=101,179;MMQ=46,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr16	20480818	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=103,130;MMQ=51,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,3:1,4:1,4,3,4
chr16	20482623	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	20487125	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=119,120;MMQ=46,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:1,1,2,6
chr16	20490034	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,105;MMQ=52,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:20490034_G_A:20490034:2,5,1,1
chr16	20490043	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=145,105;MMQ=52,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:20490034_G_A:20490034:2,5,1,1
chr16	20490062	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=151,53;MMQ=52,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr16	20492304	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=159,184;MMQ=27,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,3:1,1:0|1:20492304_A_T:20492304:0,4,0,4
chr16	20492307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=159,184;MMQ=27,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:1,1:0|1:20492304_A_T:20492304:0,4,0,4
chr16	20492316	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=181,200;MMQ=27,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:20492304_A_T:20492304:0,4,0,2
chr16	20498079	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	20548616	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,76;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:11,11:13,0:13,11,12,1
chr16	20552075	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr16	20570840	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=76,131;MMQ=32,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr16	20636719	.	CATG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,0:7,2:5,5,1,1
chr16	20682954	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:3,0:6,5,0,3
chr16	20748582	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=96,250;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.264:36:15,0:12,9:9,18,0,9
chr16	20750137	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr16	20753123	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr16	20787240	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:6,7:1,6:2,5,5,8
chr16	20792188	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr16	20796508	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	20803249	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	20810757	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:20810757_C_A:20810757:0,2,0,1
chr16	20810759	.	CC	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:20810757_C_A:20810757:0,2,0,1
chr16	20824697	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	20826443	.	AGGGACCAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	20856390	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=104,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:7,0:5,5:8,5,0,5
chr16	20860897	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,1,10
chr16	20873767	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr16	20873796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:6,0:4,9,2,2
chr16	20974989	.	G	GCAACGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:5,3,1,1
chr16	20986506	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr16	20986684	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=91,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:5,2:7,0:3,9,0,3
chr16	20990609	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.250:16:6,2:5,0:6,6,4,0
chr16	20996400	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr16	21008690	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,7,8
chr16	21030897	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	21035826	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	21069450	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,1:8,1:7,7,2,0
chr16	21086941	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:21086941_G_A:21086941:3,7,1,1
chr16	21086947	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:21086941_G_A:21086941:2,7,1,1
chr16	21086948	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:21086941_G_A:21086941:2,7,1,1
chr16	21086952	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:21086941_G_A:21086941:2,7,1,1
chr16	21086953	.	G	GATAAAGA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:21086941_G_A:21086941:2,7,1,1
chr16	21092956	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=97,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:9,5,0,2
chr16	21136477	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,6,3
chr16	21185384	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,11,11
chr16	21185482	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=76,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.315:26:6,0:11,5:8,10,4,4
chr16	21185503	.	TAATCTTTCTAC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,86;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,0:8,4:4,7,0,4
chr16	21211278	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	21216992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:3,3,3,2
chr16	21222546	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	21273286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr16	21273521	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,70;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:3,10,1,1
chr16	21286927	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,6:3,2:4,3,4,4
chr16	21289626	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr16	21396859	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,155;MMQ=57,33;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.284:15:5,1:4,3:8,3,4,0
chr16	21397043	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=154,294;MMQ=25,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:9,7,3,0
chr16	21623944	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.548:14:4,3:1,1:2,5,4,3
chr16	21629387	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:10,3:3,19,0,3
chr16	21689791	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr16	21698988	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.647:9:1,2:0,3:1,2,5,1
chr16	21728129	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	21742180	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=117,816295;MMQ=27,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:12,0:9,6:10,12,6,0
chr16	21747556	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,170;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr16	21763594	.	GTGTGTGTA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,174;MMQ=39,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	21973913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,1:6,7:1,7,0,8
chr16	21991811	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	21992122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	21994411	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:7,6:2,5:8,2,6,5
chr16	22108284	.	ATTTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:2,1,0,1
chr16	22111711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,1:0,1:2,5,2,0
chr16	22128052	.	TT	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr16	22132839	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,31;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:7,3,1,1
chr16	22137706	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	22149612	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TG;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	22149872	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr16	22152887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,0:1,3:9,0,2,1
chr16	22155754	.	TGCAAATGG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=193,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:4,0:0|1:22155754_TGCAAATGG_T:22155754:1,7,1,1
chr16	22155765	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=193,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,1:4,0:0|1:22155754_TGCAAATGG_T:22155754:0,8,1,1
chr16	22262737	.	CT	C,CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,21,19;MFRL=234,155,117;MMQ=60,60,60;MPOS=29,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.25,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.486,0.257:5:0,0,0:1,2,0:0,1,0,4
chr16	22269122	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr16	22276285	.	TGC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=157,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22276285_TGC_T:22276285:0,3,0,1
chr16	22276287	.	C	CCTTCCTCTAGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=195,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:22276287_C_CCTTCCTCTAGGT:22276287:0,2,0,1
chr16	22276288	.	TGCCTGCCCA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=157,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22276285_TGC_T:22276285:0,3,0,1
chr16	22276290	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=195,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:22276287_C_CCTTCCTCTAGGT:22276287:0,2,0,1
chr16	22277911	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22277911_C_A:22277911:0,1,0,1
chr16	22277915	.	C	CACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,33;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22277911_C_A:22277911:0,1,0,1
chr16	22277917	.	CTA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:22277911_C_A:22277911:0,1,0,1
chr16	22277923	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=250,83;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22277911_C_A:22277911:1,0,0,1
chr16	22278105	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,1:5,2:8,8,2,1
chr16	22285146	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:0,4,0,4
chr16	22314351	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:0|1:22314351_C_T:22314351:8,9,1,1
chr16	22314366	.	C	CGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:0|1:22314351_C_T:22314351:8,11,1,1
chr16	22328187	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=223,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr16	22330350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:22330350_T_C:22330350:0,4,0,2
chr16	22330352	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:22330350_T_C:22330350:0,4,0,2
chr16	22330356	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:22330350_T_C:22330350:0,4,0,1
chr16	22330358	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:22330350_T_C:22330350:0,4,0,1
chr16	22343574	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22343574_G_A:22343574:0,2,0,1
chr16	22343577	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22343574_G_A:22343574:0,2,0,1
chr16	22343579	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,35;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22343579_T_C:22343579:0,2,0,1
chr16	22343580	.	AG	TA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,23;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22343574_G_A:22343574:0,2,0,1
chr16	22343582	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22343574_G_A:22343574:0,2,0,1
chr16	22343583	.	G	GATTTCAGACCAGGC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=222,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22343579_T_C:22343579:0,1,0,1
chr16	22343587	.	TT	GG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,34;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:22343579_T_C:22343579:0,2,0,1
chr16	22343590	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22343579_T_C:22343579:0,0,0,1
chr16	22361163	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=130,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,2:12,1:15,8,0,3
chr16	22545340	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,20;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	22826046	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:2,2,1,1
chr16	22826072	.	CCGCCTCCTCGGCG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr16	23079353	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,10,3
chr16	23079731	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:23079731_G_A:23079731:0,1,0,3
chr16	23079734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0|1:23079731_G_A:23079731:0,1,0,3
chr16	23091430	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=96,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,4:9,0:8,13,4,0
chr16	23099227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr16	23117706	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,7:6,4:11,1,9,2
chr16	23160238	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:5,1:1,1:2,5,0,2
chr16	23197545	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,3:4,3:0|1:23197545_C_G:23197545:6,1,5,2
chr16	23197562	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:2,4:4,3:0|1:23197545_C_G:23197545:4,3,6,2
chr16	23203909	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr16	23205657	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:23205657_G_C:23205657:0,0,0,5
chr16	23205660	.	AGTG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:23205657_G_C:23205657:0,3,0,1
chr16	23205666	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:23205657_G_C:23205657:0,3,0,1
chr16	23221183	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:3,3,0,5
chr16	23221238	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	23223300	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr16	23224106	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=107,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.321:20:8,2:3,3:6,8,2,4
chr16	23224481	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=101,91;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:23,0:8,3:12,19,0,3
chr16	23224517	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=78,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,8:3,3:3,3,5,6
chr16	23224594	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=46,177;MMQ=44,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,2:1,1:1,1,0,3
chr16	23225984	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=62,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr16	23390201	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	23400481	.	C	CCAGGAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23400481_C_CCAGGAAG:23400481:0,3,0,1
chr16	23400485	.	T	TCCTTCTGGCCTCCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23400481_C_CCAGGAAG:23400481:0,3,0,1
chr16	23400494	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	23428379	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,198;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,3:11,0:9,9,0,3
chr16	23436365	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=284,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:23436365_T_TCC:23436365:0,3,0,1
chr16	23436366	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=284,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:23436365_T_TCC:23436365:0,3,0,1
chr16	23436367	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=284,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:23436365_T_TCC:23436365:0,3,0,1
chr16	23457290	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.523:6:1,0:1,2:2,1,1,2
chr16	23486197	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.921:24:1,12:0,11:0,1,15,8
chr16	23489910	.	C	CCAAACTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=113,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23489910_C_CCAAACTAT:23489910:1,0,0,1
chr16	23489913	.	A	ATAAAAACCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=113,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:23489910_C_CCAAACTAT:23489910:1,0,0,1
chr16	23506930	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=210,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:23506930_C_T:23506930:1,0,2,0
chr16	23506940	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:23506930_C_T:23506930:0,0,5,1
chr16	23535680	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,6:0,17:0,0,13,10
chr16	23536531	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:6,0,5,1
chr16	23540798	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr16	23541223	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr16	23544179	.	CTG	TCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,184;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr16	23546659	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:0,0:5,2:0|1:23546659_T_G:23546659:1,4,1,1
chr16	23546660	.	G	GTAAGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:0,0:5,2:0|1:23546659_T_G:23546659:1,4,1,1
chr16	23573850	.	GT	AA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=179,115;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr16	23573874	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:23573874_C_A:23573874:16,3,2,0
chr16	23573879	.	GCGCT	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:10,0:0|1:23573874_C_A:23573874:17,4,2,0
chr16	23573886	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:23573874_C_A:23573874:16,4,2,0
chr16	23573889	.	CC	GG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:23573874_C_A:23573874:15,4,2,0
chr16	23578478	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23578478_A_C:23578478:0,1,0,1
chr16	23578488	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:23578478_A_C:23578478:0,1,0,1
chr16	23607371	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:23607371_A_C:23607371:1,0,1,0
chr16	23607377	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=8,12;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:23607371_A_C:23607371:2,0,1,0
chr16	23607384	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,12;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:23607371_A_C:23607371:2,0,1,0
chr16	23607390	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=14,33;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:23607371_A_C:23607371:2,0,1,0
chr16	23607393	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,25;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:23607371_A_C:23607371:2,0,1,0
chr16	23607703	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	23615060	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr16	23625463	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr16	23641027	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,6:6,0:10,2,6,0
chr16	23641059	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,3:10,0:12,8,3,0
chr16	23695402	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=112,44;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:15,2:0|1:23695402_T_C:23695402:6,14,1,1
chr16	23695411	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:10,2:0|1:23695402_T_C:23695402:5,11,1,1
chr16	23695414	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:23695402_T_C:23695402:3,11,1,1
chr16	23695417	.	CAAGGG	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:8,2:0|1:23695402_T_C:23695402:3,11,1,1
chr16	23698870	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:7,0:0|1:23698870_C_A:23698870:8,10,1,1
chr16	23698875	.	C	CCGCCTTCCAGGTGCA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:8,0:0|1:23698870_C_A:23698870:8,11,1,1
chr16	23702271	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:3,4,2,0
chr16	23706778	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr16	23706784	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr16	23706787	.	CT	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr16	23706796	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	23713395	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr16	23717833	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	23721601	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,2,4
chr16	23721929	.	A	AAACACAAAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.286:8:1,2:5,0:0|1:23721929_A_AAACACAAAT:23721929:3,3,1,1
chr16	23721930	.	G	GCACACACACAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:1,1:4,0:0|1:23721929_A_AAACACAAAT:23721929:3,3,1,1
chr16	23767030	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=136,85;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:8,4,3,0
chr16	23767202	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,7:5,4,9,2
chr16	23767302	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,0:3,1:1,4,0,1
chr16	23767305	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr16	23767554	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=140,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr16	23767588	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=214,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23767588_A_C:23767588:1,1,0,1
chr16	23767598	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=214,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23767588_A_C:23767588:1,1,0,1
chr16	23768727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:1,2:1,4:2,0,2,4
chr16	23768802	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,11,14
chr16	23847747	.	TGCGCCCTCC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=264,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGCCCTCC;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:0,2:0,1,0,5
chr16	24104322	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24104322_A_C:24104322:0,1,0,1
chr16	24104328	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24104322_A_C:24104322:0,1,0,1
chr16	24135112	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=123,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,4:7,4:5,3,5,3
chr16	24166274	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=250,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24166274_A_AGG:24166274:0,1,0,1
chr16	24166276	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=250,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24166274_A_AGG:24166274:0,1,0,1
chr16	24185815	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.424:19:2,6:8,2:10,1,7,1
chr16	24196943	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:24196943_T_C:24196943:1,3,1,1
chr16	24196945	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:24196943_T_C:24196943:1,3,1,1
chr16	24196946	.	A	AGCGCCATCCG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:24196943_T_C:24196943:1,3,1,1
chr16	24231461	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr16	24231486	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	24357998	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr16	24564879	.	GTA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:3,5:3,2:0,6,1,6
chr16	24572884	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:2,1:7,1,2,0
chr16	24573473	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:3,0:4,7,1,2
chr16	24574645	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,4:3,9:5,2,2,11
chr16	24574691	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=201,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:24574691_CTT_C:24574691:0,1,1,0
chr16	24574712	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=89,127;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.350:6:2,0:2,0:0|1:24574691_CTT_C:24574691:2,2,2,0
chr16	24578458	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,1:3,2:11,2,1,2
chr16	24583565	.	CAAG	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.091:51:16,3:28,1:32,15,2,2
chr16	24741686	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,0,5
chr16	24762091	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=103,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.326:47:17,15:14,0:12,20,14,1
chr16	24788366	.	TCAGCAGCCACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCCACAGCAGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGCAG	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.101:29:4,0:4,2:0|1:24788366_TCAGCAGCCACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCCACAGCAGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGCAG_T:24788366:16,11,1,1
chr16	24788422	.	AGCAGCCACAGCC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.447:14:3,2:1,2:1|0:24788366_TCAGCAGCCACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCCACAGCAGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGCAG_T:24788366:3,5,4,2
chr16	24801015	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=98,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,1:10,2:7,7,2,1
chr16	24801979	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,89;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.542:35:10,14:5,4:7,9,5,14
chr16	24805023	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=247,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr16	24807165	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr16	24816492	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:8,5:1,4:4,5,0,9
chr16	24816927	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=86,229;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:13,4:3,0:13,4,4,0
chr16	24820823	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.792:8:1,1:0,2:1,0,1,6
chr16	24828330	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=83,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr16	24831727	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr16	24835168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr16	24881192	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,8:2,0:1,1,6,2
chr16	24883637	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:24883637_C_CCA:24883637:0,1,0,2
chr16	24883640	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:24883637_C_CCA:24883637:0,1,0,2
chr16	24902434	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:3,3,3,5
chr16	24920381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:3,8,2,0
chr16	24920491	.	T	TGCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=190,152;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24920491_T_TGCCAC:24920491:0,1,0,1
chr16	24920493	.	A	ACTCTATGGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=190,152;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24920491_T_TGCCAC:24920491:0,1,0,1
chr16	24920495	.	C	CTGAAAGTAGGCATGACCCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=190,152;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24920491_T_TGCCAC:24920491:0,1,0,1
chr16	24965992	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=90,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:9,6,1,2
chr16	24966113	.	C	CCTTAGGCTCCAGCCATTCTGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr16	24975425	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr16	24980178	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=235,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:24980178_A_T:24980178:0,3,0,1
chr16	24980179	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=235,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:24980178_A_T:24980178:0,3,0,1
chr16	24980189	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	24990187	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.484:11:4,1:0,3:3,3,1,4
chr16	25139731	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,2:3,3:6,1,4,2
chr16	25151398	.	A	ACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr16	25163017	.	G	GGTGTGTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=GT;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr16	25180469	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,5:4,0:10,1,4,1
chr16	25180610	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	25235607	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=230,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	25235744	.	AGCAGGGGCAGGTG	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:10,2:10,0:11,15,1,1
chr16	25251408	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr16	25255377	.	TA	GG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=158,9521408;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:0|1:25255377_TA_GG:25255377:6,10,0,2
chr16	25255379	.	GCAC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=158,9521408;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:9,0:0|1:25255377_TA_GG:25255377:6,10,0,2
chr16	25258056	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.309:36:11,9:14,0:16,9,11,0
chr16	25264196	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr16	25264440	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	25266701	.	C	CAGGAGGCTGCCAGAGGATGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=160,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr16	25266720	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=206,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:25266720_A_C:25266720:0,2,0,1
chr16	25266721	.	A	ATTGGTCTTGCAGGCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=206,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:25266720_A_C:25266720:0,2,0,1
chr16	25704145	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	27215380	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=138.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,24:0,0,31,13
chr16	27227168	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=101,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.407:18:2,3:7,4:8,3,5,2
chr16	27238034	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr16	27238110	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=79,86;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,7:8,4:7,8,3,8
chr16	27238116	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=90,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:13,0:6,6:9,11,1,5
chr16	27244367	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.059:48:35,0:11,2:0|1:27244367_C_T:27244367:12,34,1,1
chr16	27244375	.	T	TGCTTC	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:34,0:8,2:0|1:27244367_C_T:27244367:11,32,1,1
chr16	27244548	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=297,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	27268674	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,6:3,0:6,0,0,6
chr16	27373887	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,1:13,2:7,13,0,3
chr16	27374779	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:27374779_C_T:27374779:4,12,1,1
chr16	27374792	.	C	CCGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:0|1:27374779_C_T:27374779:4,12,1,1
chr16	27445867	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:27445867_T_C:27445867:0,0,0,1
chr16	27445869	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27445867_T_C:27445867:0,0,0,1
chr16	27456038	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:1,7,1,1
chr16	27456547	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,0:9,5:13,7,0,5
chr16	27456559	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=92,56;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:10,0:5,5:16,5,0,5
chr16	27472911	.	G	GACCTCAAATCTCTCCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr16	27481359	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr16	27497562	.	C	CAGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=250,279;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	27499980	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:0,0:0,4,0,2
chr16	27501096	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:1,4,2,2
chr16	27509131	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,4:2,5:0,2,0,9
chr16	27510117	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	27512722	.	T	TTTAGACAGAGCAGATTTGAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27512722_T_TTTAGACAGAGCAGATTTGAAA:27512722:0,0,0,1
chr16	27512725	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27512722_T_TTTAGACAGAGCAGATTTGAAA:27512722:0,0,0,1
chr16	27512728	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27512722_T_TTTAGACAGAGCAGATTTGAAA:27512722:0,0,0,1
chr16	27518224	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=101,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:10,0:12,2:0|1:27518224_C_T:27518224:16,7,1,1
chr16	27518238	.	G	GGTGTTGGTAGGATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:0|1:27518224_C_T:27518224:15,7,1,1
chr16	27549686	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr16	27556587	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=107,177;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:3,3,1,1
chr16	27556914	.	T	TAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27556914_T_TAG:27556914:0,1,0,1
chr16	27556915	.	T	TATTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27556914_T_TAG:27556914:0,1,0,1
chr16	27561584	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr16	27629661	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	27689406	.	C	CGTAGACATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	27692930	.	G	GATTCTCTTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=197,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	27709688	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,3:13,0:12,10,2,1
chr16	27751761	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:27751761_C_T:27751761:3,3,0,2
chr16	27751765	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:27751761_C_T:27751761:3,3,0,2
chr16	27784574	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:1,2,0,2
chr16	27784582	.	G	GGAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr16	27788380	.	A	AAAGAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:27788380_A_AAAGAAG:27788380:2,4,1,1
chr16	27788381	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:2,0:0|1:27788380_A_AAAGAAG:27788380:2,4,1,1
chr16	27802825	.	C	CCAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr16	27840027	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=223,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:0,0:3,0,0,2
chr16	27974418	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr16	27974583	.	T	TTCTGTTAGATGCTTTTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=103,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.256:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr16	28113354	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=374,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	28123226	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:14,6:6,4:11,9,6,4
chr16	28132951	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,5:0,5:1,0,6,4
chr16	28133079	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,0:3,4:4,5,0,4
chr16	28133152	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr16	28137248	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr16	28157351	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr16	28181306	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr16	28493876	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=98,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:5,0:13,3:8,12,0,4
chr16	28498982	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.293:28:10,0:10,7:8,12,0,8
chr16	28506872	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=63,82;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,42:0.682:61:12,25:7,16:10,9,24,18
chr16	28507112	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:11,2:12,0:15,10,2,0
chr16	28507644	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.670:19:3,9:2,4:2,4,4,9
chr16	28508447	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,4:5,4:5,4,3,6
chr16	28515216	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:14,10:14,0:0|1:28515216_C_G:28515216:16,13,0,10
chr16	28515226	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:10,10:14,0:0|1:28515216_C_G:28515216:12,13,0,10
chr16	28600480	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:11,1:19,2:13,17,1,2
chr16	28603077	.	GAGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr16	28604686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,3:4,3:5,7,2,4
chr16	28607070	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=178,134;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,8:3,5:3,3,6,7
chr16	28617057	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:6,0,9,1
chr16	28617128	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=81,145;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,5:5,5:3,5,4,6
chr16	28617308	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=197,200;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,3,1
chr16	28617361	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=135,138;MMQ=40,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,2:3,1:3,2,2,1
chr16	28617552	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=20,34;MFRL=55,164;MMQ=49,39;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,2:6,3:3,6,3,2
chr16	28617555	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=101,50;MMQ=40,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:28617555_G_T:28617555:5,7,1,1
chr16	28617557	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=101,50;MMQ=40,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:5,2:0|1:28617555_G_T:28617555:5,7,1,1
chr16	28617561	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=101,50;MMQ=45,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:28617555_G_T:28617555:5,5,1,1
chr16	28617565	.	G	GGCTT	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=132,50;MMQ=40,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:28617555_G_T:28617555:5,6,1,1
chr16	28617574	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=212,135;MMQ=42,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr16	28617595	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=156,132;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr16	28618047	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=156,204;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:5,2,1,1
chr16	28618065	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=100,204;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,1:8,1:0|1:28618065_A_T:28618065:5,7,1,1
chr16	28618068	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=125,193;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:3,1:9,1:0|1:28618065_A_T:28618065:5,8,2,1
chr16	28618071	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=100,193;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:3,1:9,2:0|1:28618065_A_T:28618065:4,8,2,1
chr16	28618237	.	TA	CG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=183,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:0|1:28618237_TA_CG:28618237:2,2,3,6
chr16	28618238	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,12:0.929:12:0,4:0,8:1|0:28618237_TA_CG:28618237:0,0,4,8
chr16	28618446	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,154;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,1:5,6:2,5,2,5
chr16	28619911	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=92,96;MMQ=60,42;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.292:15:6,1:5,3:0|1:28619911_T_C:28619911:6,5,1,3
chr16	28619920	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=92,153;MMQ=60,42;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:3,2:8,2:0|1:28619911_T_C:28619911:9,3,1,3
chr16	28619995	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=135,205;MMQ=57,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,2:13,0:18,11,2,0
chr16	28620025	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=106,202;MMQ=52,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:16,2:10,1:14,12,3,0
chr16	28631314	.	T	TTGTGTG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TG;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:2,4:2,1:4,0,7,0
chr16	28631360	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.689:27:5,10:2,8:5,3,11,8
chr16	28631530	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:1,5,1,9
chr16	28711827	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=89,190;MMQ=45,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr16	28837203	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:1,10,2,0
chr16	28837515	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:7,8:4,3:9,2,9,2
chr16	28841852	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:3,8:2,0:5,0,8,0
chr16	28844068	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr16	28844284	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:0,4,0,8
chr16	28844365	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr16	28844709	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=117,178;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,12:0.199:63:19,12:30,0:31,20,12,0
chr16	28845584	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:4,4,5,2
chr16	28845698	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,95;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:8,0:17,4:19,8,1,3
chr16	28846840	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,1:3,4:2,3,4,1
chr16	28846866	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,4:6,5:3,4,6,3
chr16	28847149	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr16	28847246	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:3,1,3,2
chr16	28847393	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=85,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:2,4,1,1
chr16	28855522	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=95,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.654:18:3,7:3,5:3,3,8,4
chr16	28855727	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:11,11:4,4:11,4,8,7
chr16	28856310	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=113,191;MMQ=60,29;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:18,7,3,0
chr16	28856819	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:5,5:11,9:3,13,8,6
chr16	28857645	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:4,5,1,7
chr16	28878842	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr16	28883087	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:6,2:2,0:7,2,2,0
chr16	28883241	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:3,4,2,3
chr16	28883327	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr16	28883841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=95,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:4,2,1,2
chr16	28890131	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:5,5,2,4
chr16	28890484	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,0:7,2:0,9,1,1
chr16	28890506	.	TCC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0|1:28890506_TCC_T:28890506:0,8,1,1
chr16	28890511	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,0:6,1:0|1:28890506_TCC_T:28890506:0,9,1,1
chr16	28893724	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=93,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,2:4,1,1,2
chr16	28896015	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,24;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.747:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	28898793	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:1,2,4,3
chr16	28898936	.	T	TTCTGGGAGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=37,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr16	28899144	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	28905734	.	T	TTCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:28905734_T_TTCAC:28905734:1,1,0,1
chr16	28905737	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:28905734_T_TTCAC:28905734:1,1,0,1
chr16	28914026	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=63,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0|1:28914026_G_A:28914026:1,1,1,3
chr16	28914030	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:28914026_G_A:28914026:2,3,1,1
chr16	28914032	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:28914026_G_A:28914026:2,3,1,1
chr16	28914039	.	G	GTGTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=60,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:28914026_G_A:28914026:2,2,0,1
chr16	28914041	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=60,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:28914026_G_A:28914026:2,2,0,1
chr16	28915527	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=64,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:3,3,2,4
chr16	28922149	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=223,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr16	28925978	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr16	28931068	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=203,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr16	28943421	.	GGGCA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=74,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:28943421_GGGCA_G:28943421:7,5,1,1
chr16	28943429	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=74,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:28943421_GGGCA_G:28943421:6,5,1,1
chr16	28962294	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,0,1
chr16	28966063	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=86,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:28966063_G_GAA:28966063:0,2,0,1
chr16	28966066	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=86,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:28966063_G_GAA:28966063:0,2,0,1
chr16	28966069	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=86,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:28966063_G_GAA:28966063:0,2,0,1
chr16	28967532	.	TCAAGAGCAACAGGGC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=81,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:4,0:11,12,1,1
chr16	28986877	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.152:26:10,0:11,4:12,10,3,1
chr16	28986886	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,0:9,3:0|1:28986886_G_A:28986886:9,8,2,1
chr16	28986887	.	G	GAAAT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:7,0:9,3:0|1:28986886_G_A:28986886:8,10,2,1
chr16	28986889	.	A	ATATCTTAACATCATTTTAATAATTTG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:7,0:10,3:0|1:28986886_G_A:28986886:8,10,2,1
chr16	28994668	.	TCAGAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:28994668_TCAGAA_T:28994668:0,2,0,1
chr16	28994675	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:28994668_TCAGAA_T:28994668:0,2,0,1
chr16	28998182	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=84,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.106:27:14,2:10,0:13,12,1,1
chr16	29676378	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,34,31,34;MFRL=87,146,95,111;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,13,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.42,13.65,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:31,4,11,6:0.078,0.197,0.120:52:17,0,5,3:11,4,6,3:16,15,6,15
chr16	29677413	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.171:45:23,7:10,0:16,22,7,0
chr16	29677426	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=101,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:19,7:11,0:18,13,7,0
chr16	29678352	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=76,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:29678352_G_GT:29678352:15,6,0,2
chr16	29678354	.	G	GCAGGGCT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=76,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:10,2:0|1:29678352_G_GT:29678352:15,6,0,2
chr16	29678587	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:12,5:8,0:14,6,5,0
chr16	29678863	.	CCA	TTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=216,154;MMQ=53,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:29678863_CCA_TTG:29678863:0,4,0,1
chr16	29678867	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=216,168;MMQ=48,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:29678867_G_A:29678867:0,4,0,1
chr16	29678869	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=236,161;MMQ=51,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	29678873	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,22;MFRL=216,168;MMQ=48,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:29678867_G_A:29678867:0,4,0,1
chr16	29678874	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=236,154;MMQ=51,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:29678863_CCA_TTG:29678863:0,3,0,1
chr16	29678879	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,21;MFRL=216,154;MMQ=53,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:29678863_CCA_TTG:29678863:0,4,0,1
chr16	29679582	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=185,143;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:29679582_T_G:29679582:0,4,0,1
chr16	29679585	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,22;MFRL=185,143;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:29679582_T_G:29679582:0,4,0,1
chr16	29679607	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=190,179;MMQ=60,21;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29679607_CA_TT:29679607:0,3,0,1
chr16	29679613	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=190,179;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29679607_CA_TT:29679607:0,3,0,1
chr16	29679617	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=190,179;MMQ=60,21;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29679607_CA_TT:29679607:0,3,0,1
chr16	29679619	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=190,179;MMQ=60,21;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:29679607_CA_TT:29679607:0,3,0,1
chr16	29679737	.	TTGAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,58;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TGAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	29679926	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=208,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr16	29679989	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	29680036	.	T	TGGGATTATAGGTGTGAGCCA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGATTATAGGTGTGAGCCA;STR;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:1,1:7,0:5,3,3,1
chr16	29680389	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr16	29680524	.	CT	C	.	.	DP=103;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=93,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,17:0.283:58:20,9:11,6:23,18,8,9
chr16	29680967	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=182,197;MMQ=40,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29680967_G_A:29680967:0,3,0,1
chr16	29680996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=196,197;MMQ=40,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:29680967_G_A:29680967:1,3,0,1
chr16	29680999	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=190,278;MMQ=40,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:29680999_A_C:29680999:0,4,1,0
chr16	29681002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=190,278;MMQ=40,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:29680999_A_C:29680999:0,4,1,0
chr16	29681197	.	CA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,20,28,33;MFRL=109,132,120,78;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,10,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.53,15.12,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:19,7,11,6:0.149,0.263,0.143:43:7,3,3,3:9,2,4,1:10,9,14,10
chr16	29681278	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,25:0.287:89:42,0:18,25:18,46,0,25
chr16	29706574	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=75,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr16	29706579	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=75,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr16	29809634	.	TACAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=AC;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.669:4:0,2:0,1:0|1:29809634_TACAC_T:29809634:1,0,3,0
chr16	29809668	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.163:21:8,1:10,1:0|1:29809634_TACAC_T:29809634:15,3,3,0
chr16	29811073	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr16	29814057	.	G	GGGCAGA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:29814057_G_GGGCAGA:29814057:12,6,1,1
chr16	29814059	.	T	TAGATCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:6,0:0|1:29814057_G_GGGCAGA:29814057:12,6,1,1
chr16	29817998	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	29848162	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:29848162_C_T:29848162:5,6,1,1
chr16	29848168	.	G	GGCCAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:29848162_C_T:29848162:4,6,1,1
chr16	29853161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:5,6,2,0
chr16	29872361	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr16	29872546	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=75,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:2,4:7,7:4,5,6,7
chr16	29906546	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr16	29910363	.	C	CTCTCT	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=34,34;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:29910363_C_CTCTCT:29910363:1,5,0,2
chr16	29910368	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=33,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:29910363_C_CTCTCT:29910363:1,5,0,2
chr16	29910369	.	TGC	T	.	.	DP=9;ECNT=15;MBQ=31,28;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0|1:29910363_C_CTCTCT:29910363:1,5,0,2
chr16	29910403	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=34,30;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910405	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910407	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=35,31;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910409	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=35,30;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910411	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=26,30;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910422	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910424	.	T	TCTCTC	.	.	DP=3;ECNT=15;MBQ=31,25;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29910403_C_T:29910403:0,2,0,1
chr16	29910434	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29910434_T_G:29910434:0,1,0,1
chr16	29910437	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=15;MBQ=26,26;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29910434_T_G:29910434:0,1,0,1
chr16	29910439	.	T	TGGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:29910434_T_G:29910434:0,1,0,1
chr16	29910446	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=15;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29910434_T_G:29910434:0,0,0,1
chr16	29912329	.	G	GA	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=112,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.068:56:27,2:25,0:0|1:29912329_G_GA:29912329:26,27,3,0
chr16	29912331	.	ACCGCG	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.065:59:27,3:24,0:0|1:29912329_G_GA:29912329:26,30,3,0
chr16	29912338	.	A	AG	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=112,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.068:57:28,3:21,0:0|1:29912329_G_GA:29912329:24,30,3,0
chr16	29912340	.	G	GA	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=115,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.073:53:26,3:21,0:0|1:29912329_G_GA:29912329:22,28,3,0
chr16	29922453	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=136,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,1:7,2:7,9,2,1
chr16	29934754	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=353,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr16	29937081	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	29974936	.	GCT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,83;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.192:13:5,2:6,0:0|1:29974936_GCT_G:29974936:3,8,1,1
chr16	29974941	.	C	CGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,83;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:5,0:0|1:29974936_GCT_G:29974936:3,9,1,1
chr16	29979247	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr16	29982944	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:29982944_G_A:29982944:0,0,0,1
chr16	29982961	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:29982944_G_A:29982944:0,0,0,1
chr16	29993108	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr16	29993138	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:4,9,0,2
chr16	29994736	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr16	29994922	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,13:0,0,15,12
chr16	29996661	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:12,1:6,2:4,14,1,2
chr16	29998200	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr16	30000901	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,7:0,18:0,0,8,18
chr16	30004583	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,1:10,2:12,9,1,2
chr16	30007602	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:11,14:3,0:14,0,14,0
chr16	30012297	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:8,7,2,0
chr16	30012681	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.273:17:3,0:5,0:7,5,5,0
chr16	30017895	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.889:20:1,7:0,11:1,1,9,9
chr16	30018720	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=292,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,3:1,1:0,2,1,3
chr16	30020972	.	T	TCTCTCTCTCTATATATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	30078492	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr16	30080003	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,3:17,0:14,15,3,0
chr16	30093779	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,16:0,0,11,12
chr16	30093852	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,0:13,2:3,15,1,1
chr16	30093873	.	A	ATGGCGAAACCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.145:18:2,0:13,2:2,14,1,1
chr16	30095122	.	G	GAT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:30095122_G_GAT:30095122:1,5,1,1
chr16	30095124	.	C	CTTGAGGTGAAACTTGA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:30095122_G_GAT:30095122:1,5,1,1
chr16	30095137	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=169,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30095137_C_CA:30095137:0,3,0,1
chr16	30095145	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=169,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30095137_C_CA:30095137:0,3,0,1
chr16	30095147	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=169,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30095137_C_CA:30095137:0,3,0,1
chr16	30096145	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:16,0:16,5:16,16,0,5
chr16	30097506	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:16,4:13,0:22,7,2,2
chr16	30097743	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=245,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.150:42:30,0:6,5:30,6,0,6
chr16	30098189	.	GTGA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGA;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	30100055	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.288:39:10,4:18,6:13,15,0,11
chr16	30100478	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:20,4:20,0:19,21,3,1
chr16	30116091	.	A	AAAGACTCAACTTCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30116091_A_AAAGACTCAACTTCCT:30116091:0,0,0,1
chr16	30116094	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30116091_A_AAAGACTCAACTTCCT:30116091:0,0,0,1
chr16	30119525	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,5,11
chr16	30119598	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.364:19:5,0:4,0:9,3,0,7
chr16	30128317	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,4:4,3:6,7,3,4
chr16	30199935	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	30199962	.	C	CTGAAGGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=234,156;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr16	30206006	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=127,147;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,1:13,3:17,9,3,1
chr16	30366039	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:5,6:3,6:2,6,3,9
chr16	30376959	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=103,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	30386262	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=128,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr16	30390314	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr16	30391206	.	AC	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=107,97;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:6,0:10,3,1,1
chr16	30393425	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=101,125;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.262:44:21,11:10,0:20,13,11,0
chr16	30393771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=183,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,0:2,6:4,1,4,2
chr16	30408765	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,7:3,5:6,4,5,8
chr16	30409769	.	AG	CC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:6,1:0|1:30409769_AG_CC:30409769:0,11,3,0
chr16	30409774	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,1:0|1:30409769_AG_CC:30409769:0,9,3,0
chr16	30409780	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:0|1:30409769_AG_CC:30409769:0,8,3,0
chr16	30409783	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:5,0:0|1:30409769_AG_CC:30409769:1,8,3,0
chr16	30409786	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:6,0:0|1:30409769_AG_CC:30409769:1,8,3,0
chr16	30429013	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	30440370	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.202:37:13,0:16,7:21,9,2,5
chr16	30490854	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	30492666	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=133,177;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.687:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	30505478	.	GGTGTTCTTCCAGCATCCT	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,2:6,0:10,7,1,1
chr16	30505512	.	CA	TG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=86,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:3,10:7,4:6,8,7,9
chr16	30505541	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=108,27;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:13,0:19,4:14,18,1,3
chr16	30510420	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:10,2:0|1:30510420_A_C:30510420:10,16,1,1
chr16	30510425	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:12,2:0|1:30510420_A_C:30510420:11,15,1,1
chr16	30516492	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=85,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.324:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr16	30518041	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:2,2,1,5
chr16	30518096	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,1:4,2:4,8,2,1
chr16	30532727	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:1,3:4,1,3,0
chr16	30545972	.	A	AGATGACCGAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=178,48;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,2:2,0:0|1:30545972_A_AGATGACCGAT:30545972:0,2,1,1
chr16	30545974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=178,48;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,2:1,0:0|1:30545972_A_AGATGACCGAT:30545972:0,2,1,1
chr16	30566854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr16	30596637	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=273,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:3,2,0,5
chr16	30664607	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,1:8,2:11,3,2,1
chr16	30665449	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,133;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	30666367	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,5,1
chr16	30671532	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.559:23:4,8:6,5:10,0,10,3
chr16	30672511	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:22,0:22,11:33,13,8,3
chr16	30672719	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,5:3,7:2,6,1,11
chr16	30674088	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.213:29:9,1:9,0:0|1:30674088_A_C:30674088:5,18,6,0
chr16	30674094	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.178:31:10,0:10,2:0|1:30674088_A_C:30674088:7,19,5,0
chr16	30674099	.	AG	CC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.168:33:9,1:12,1:0|1:30674088_A_C:30674088:7,21,5,0
chr16	30674105	.	AG	CC	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.115:32:10,1:14,1:0|1:30674088_A_C:30674088:8,21,3,0
chr16	30676891	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,0:6,2:7,3,0,2
chr16	30718459	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=99,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GT;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,3:2,0:7,3,3,0
chr16	30718704	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:14,3:1,0:3,12,0,3
chr16	30724221	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	30732635	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:10,8,1,1
chr16	30734963	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,12:0,28:0,0,19,23
chr16	30736317	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:11,0:6,2:6,14,1,1
chr16	30736330	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:30736330_C_T:30736330:2,13,1,1
chr16	30736331	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:0|1:30736330_C_T:30736330:2,12,1,1
chr16	30736335	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:30736330_C_T:30736330:1,11,1,1
chr16	30744631	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=78,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:9,5,2,1
chr16	30745429	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=100,156;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr16	30749246	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:4,4,4,2
chr16	30751101	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:2,6,3,5
chr16	30762640	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr16	30767476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=85,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:4,3:8,6:7,5,7,2
chr16	30768475	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=156,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr16	30768492	.	GCTCTGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGGC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	30768749	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=220,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,5:1,0:3,0,4,1
chr16	30770267	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	30772004	.	GAA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=55.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.584:29:3,8:9,9:3,9,4,13
chr16	30772040	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr16	30773822	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	30780079	.	G	GAATCTGGTTGGCCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=189,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chr16	30785499	.	CA	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,0:6,2:3,7,0,2
chr16	30846507	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=288,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30846507_C_T:30846507:0,1,0,1
chr16	30846521	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=288,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30846507_C_T:30846507:0,1,0,1
chr16	30935935	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=240,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,0:0|1:30935935_C_T:30935935:4,0,1,1
chr16	30935937	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=240,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:30935935_C_T:30935935:4,0,1,1
chr16	30935939	.	G	GCCATGGTCGTATGGCTGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=240,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:30935935_C_T:30935935:4,0,1,1
chr16	30937068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr16	30938811	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,5:2,3:0,6,3,5
chr16	30964873	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:0|1:30964873_C_A:30964873:7,11,1,1
chr16	30964879	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:4,2:14,0:0|1:30964873_C_A:30964873:7,13,1,1
chr16	30974954	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=201,279;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30974954_G_GT:30974954:0,1,0,1
chr16	30974956	.	G	GTTTCCATTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=201,279;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30974954_G_GT:30974954:0,1,0,1
chr16	30974957	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=201,279;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:30974954_G_GT:30974954:0,1,0,1
chr16	30977456	.	ATGCCAATGGCAGCCGAGCCCC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=165,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:2,2:7,4,1,1
chr16	30980853	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:6,6,1,1
chr16	30980902	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=107,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,2:9,6:8,6,4,4
chr16	30990936	.	T	TCTTGCTTTGATC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr16	30995419	.	T	TTCTAGTTTCCATTTTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=212,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	30998046	.	C	CACTTAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=201,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.386:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr16	30998073	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=175,281;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr16	30999142	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:2,3:9,3:7,5,3,3
chr16	31004169	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=78,73;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:8,7:14,6:14,8,10,3
chr16	31004812	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,5:5,3:2,6,4,4
chr16	31012813	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	31021595	.	G	GGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	31044683	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=58,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:1,7:3,6:3,1,7,6
chr16	31044897	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=67,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr16	31049593	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr16	31049909	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:10,0:9,7,2,1
chr16	31088347	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:3,2:4,9:5,2,4,7
chr16	31090061	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,0,2
chr16	31091209	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=110,89;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.478:38:4,7:15,11:15,5,8,10
chr16	31093844	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:7,0:9,6:3,15,0,6
chr16	31095042	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=153,147;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,5:5,0:5,4,5,0
chr16	31095171	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:2,6,1,6
chr16	31095204	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr16	31095251	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr16	31097574	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	31099110	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=105,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,0:8,4:9,9,2,2
chr16	31106864	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=104,101;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,12:0.218:56:22,11:22,0:23,21,12,0
chr16	31120450	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,34;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:31120450_A_C:31120450:2,0,1,0
chr16	31120456	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:31120450_A_C:31120450:1,0,2,0
chr16	31120462	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=16,14;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:31120450_A_C:31120450:2,0,1,0
chr16	31120469	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,0:0|1:31120450_A_C:31120450:3,0,1,0
chr16	31120477	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:31120450_A_C:31120450:3,0,1,0
chr16	31122058	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=70,56;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:10,14,1,1
chr16	31122079	.	C	CCCCTTTTAAACT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:19,2:0|1:31122079_C_CCCCTTTTAAACT:31122079:16,16,1,1
chr16	31122083	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:18,1:0|1:31122079_C_CCCCTTTTAAACT:31122079:17,16,1,1
chr16	31122571	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,6:0,4:0,0,6,7
chr16	31131614	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,17:0,27:0,0,24,22
chr16	31139270	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=223,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr16	31142381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr16	31142601	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:7,0:14,2:8,13,2,0
chr16	31146778	.	AG	CA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:20,0:17,2:0|1:31146778_AG_CA:31146778:19,21,1,1
chr16	31146781	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:22,0:15,2:0|1:31146778_AG_CA:31146778:19,21,1,1
chr16	31146787	.	C	CTAATT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,0:12,2:0|1:31146778_AG_CA:31146778:16,19,1,1
chr16	31150677	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,3:19,0:13,18,3,0
chr16	31151521	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=313,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr16	31152697	.	T	TAAACAAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=AAAC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:31152697_T_TAAACAAAC:31152697:0,0,4,0
chr16	31152717	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:31152697_T_TAAACAAAC:31152697:0,0,4,0
chr16	31153105	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,12:0,0,12,7
chr16	31153780	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr16	31154231	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	31154597	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:7,2,6,3
chr16	31154716	.	A	ACGCCCGGCCCGTTATTGT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.110:24:12,1:9,1:5,17,0,2
chr16	31159627	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	31191482	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,26:0,14:0,0,21,19
chr16	31195604	.	GTGGACAGCAGCAAAGCTA	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=114,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGACAGCAGCAAAGCTA;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.095:51:20,2:14,2:23,24,1,3
chr16	31196402	.	TGGCGGCGGC	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=GGC;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.078:48:21,2:11,1:26,19,3,0
chr16	31202698	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.419:21:8,3:4,4:10,2,5,4
chr16	31230463	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:10,7:7,4:7,10,9,3
chr16	31273129	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:3,6,0,10
chr16	31283164	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.362:31:10,5:10,6:13,7,8,3
chr16	31283323	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.322:47:19,8:13,6:11,21,3,12
chr16	31288099	.	GCAGGGGGTA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=132,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:3,1:9,7,0,2
chr16	31288121	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:2,0:2,2:2,3,0,3
chr16	31308802	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:7,13:12,0:14,5,13,0
chr16	31335906	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,7:5,3:4,3,3,7
chr16	31336519	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=82,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr16	31336888	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,1:4,4:6,5,2,4
chr16	31339389	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr16	31342608	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr16	31343005	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=106,83;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.423:31:5,4:13,9:11,7,7,6
chr16	31343021	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,0:17,2:17,9,1,1
chr16	31343035	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:31343035_C_A:31343035:12,9,1,1
chr16	31343038	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:0|1:31343035_C_A:31343035:11,9,1,1
chr16	31343040	.	CGA	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:31343035_C_A:31343035:10,9,1,1
chr16	31343044	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=22,20;MFRL=111,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:31343035_C_A:31343035:10,8,1,1
chr16	31343049	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=123,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:31343035_C_A:31343035:10,8,1,1
chr16	31371193	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr16	31404791	.	G	GAAAAAAATGTATATTCTGTTGATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,117;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	31405471	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,134;MMQ=54,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:3,0,1,0
chr16	31405736	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr16	31415004	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,1:4,5:1,6,1,5
chr16	31419300	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr16	31439232	.	G	GCGCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGCCC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:31439232_G_GCGCCC:31439232:0,0,0,3
chr16	31439244	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:31439232_G_GCGCCC:31439232:0,0,0,3
chr16	31447112	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:10,0:18,3:15,14,1,2
chr16	31447411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,105;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,7:4,0:6,2,8,0
chr16	31475639	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=44,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.431:7:2,0:1,1:0|1:31475639_A_C:31475639:3,1,3,0
chr16	31475641	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=44,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.349:9:2,1:2,1:0|1:31475639_A_C:31475639:3,3,3,0
chr16	31476458	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=96,107;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,3:4,5:2,6,5,3
chr16	31476563	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:31476563_A_C:31476563:1,5,1,1
chr16	31476567	.	TCAC	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,19;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,1:0|1:31476563_A_C:31476563:1,6,1,1
chr16	31476578	.	AC	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:31476563_A_C:31476563:0,5,1,1
chr16	31476582	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:31476563_A_C:31476563:0,4,1,1
chr16	31477441	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,2:1,0:6,0,2,0
chr16	31485356	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=179,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,1:1,0:2,2,0,1
chr16	31488916	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=85,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr16	31494633	.	G	GAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr16	31500022	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,54;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:0|1:31500022_G_C:31500022:4,8,1,1
chr16	31500029	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,54;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:31500022_G_C:31500022:4,6,1,1
chr16	31501582	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:31501582_AG_A:31501582:7,15,1,1
chr16	31501585	.	AGCTGAGTTC	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,2:8,0:0|1:31501582_AG_A:31501582:8,20,1,1
chr16	31501597	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:5,1:8,0:4,9,1,2
chr16	31503733	.	G	GACTTGGGCTGCTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr16	31503751	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	31508349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	31519048	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr16	31519608	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr16	31539430	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,0:2,5:1,1,3,2
chr16	31539934	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr16	31724836	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,3:2,6:1,6,1,8
chr16	31734717	.	CAGAGATTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=185,123;MMQ=60,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr16	31765202	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=89,48;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.253:28:9,2:12,4:9,12,1,6
chr16	31770696	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=95,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.504:28:10,4:4,10:7,7,6,8
chr16	31770723	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,6:7,7:9,5,7,6
chr16	31885281	.	CTGGGAAAT	C	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=-57;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,18:0.069:85:34,15:30,3:0|1:31885281_CTGGGAAAT_C:31885281:25,42,5,13
chr16	31885292	.	TGAGTGTGCGGGGTCGGGGGTCCCCAGAGGGAGGGAGGGCGGTGGTCGGAAGCGGC	T	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=-58;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,18:0.054:102:27,15:24,3:0|1:31885281_CTGGGAAAT_C:31885281:28,56,5,13
chr16	31926484	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:10,0:4,6:4,10,0,6
chr16	31926817	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,78;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:31926817_C_T:31926817:10,8,1,1
chr16	31926822	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,78;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:31926817_C_T:31926817:10,10,1,1
chr16	31926825	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=123,78;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:7,1:0|1:31926817_C_T:31926817:11,10,1,1
chr16	31927493	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,0:14,2:0|1:31927493_C_T:31927493:15,15,1,1
chr16	31927498	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:14,2:0|1:31927493_C_T:31927493:15,14,1,1
chr16	32859456	.	A	AAATATCCACTTGCAGGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=158,173;MMQ=21,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	33647536	.	G	GGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=146,142;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:33647536_G_GGC:33647536:0,3,0,2
chr16	33647538	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=146,142;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:33647536_G_GGC:33647536:0,3,0,2
chr16	33647541	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=146,142;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:33647536_G_GGC:33647536:0,3,0,2
chr16	33647613	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=237,155;MMQ=34,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:33647613_T_A:33647613:1,1,0,1
chr16	33647616	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=237,155;MMQ=34,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:33647613_T_A:33647613:1,1,0,1
chr16	33965449	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:0,2:7,2:0|1:33965449_G_C:33965449:6,3,3,1
chr16	33965456	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:2,2:8,2:0|1:33965449_G_C:33965449:8,4,3,1
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chr16	33965538	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=15;MBQ=28,25;MFRL=158,124;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=155.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,37:0.776:47:4,13:6,21:0|1:33965533_A_C:33965533:6,4,30,7
chr16	33965539	.	G	GC	.	.	DP=49;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=158,124;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=153.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,37:0.745:49:6,11:6,20:0|1:33965539_G_GC:33965539:7,5,29,8
chr16	33965542	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=15;MBQ=30,28;MFRL=132,150;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:17,2:32,0:0|1:33965542_C_T:33965542:40,14,1,1
chr16	33965554	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=15;MBQ=28,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=268.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,63:0.831:75:7,23:5,34:0|1:33965539_G_GC:33965539:7,5,37,26
chr16	33965560	.	TT	AT,AC	.	.	DP=80;ECNT=15;MBQ=27,23,24;MFRL=155,187,124;MMQ=60,50,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.18,279.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,66:0.060,0.807:80:4,2,25:6,2,31:5,5,40,30
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chr16	33965589	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=15;MBQ=31,26;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=215.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,53:0.871:60:3,22:4,31:1,6,22,31
chr16	33965591	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=15;MBQ=24,28;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=198.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,50:0.809:61:4,19:5,25:0|1:33965591_A_C:33965591:2,9,21,29
chr16	33965593	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=15;MBQ=25,31;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=189.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,45:0.821:54:4,17:5,26:0|1:33965591_A_C:33965591:2,7,18,27
chr16	33965644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=23,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,6,0,2
chr16	33965655	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=25,25;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,6,0,2
chr16	33965666	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=30,24;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,3,0,2
chr16	33965669	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=31,31;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,3,0,2
chr16	33965681	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=15;MBQ=30,32;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,2,0,2
chr16	46615767	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=68,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,2:9,0:0|1:46615767_T_C:46615767:7,5,1,1
chr16	46615769	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=71,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:9,0:0|1:46615767_T_C:46615767:8,6,1,1
chr16	46615771	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:11,0:0|1:46615767_T_C:46615767:8,6,1,1
chr16	46615774	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=74,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:46615767_T_C:46615767:10,6,1,1
chr16	46642114	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr16	46642360	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=155,120;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46642360_G_T:46642360:0,1,0,1
chr16	46642364	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=155,120;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46642360_G_T:46642360:0,1,0,1
chr16	46652088	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:1,0:4,3:4,3,3,0
chr16	46702810	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,101;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:11,8:19,0:20,10,8,0
chr16	46705576	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr16	46715191	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	46723126	.	AAGCCCCGCCCTCTCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:3,0:0,5,1,1
chr16	46743675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	46743677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:46743677_A_G:46743677:0,4,0,1
chr16	46743679	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:46743677_A_G:46743677:0,4,0,1
chr16	46763659	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=211,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:46763659_CTG_C:46763659:0,4,0,1
chr16	46763662	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=211,239;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:46763659_CTG_C:46763659:0,4,0,1
chr16	46764482	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr16	46781672	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:46781672_C_A:46781672:6,2,1,1
chr16	46781673	.	GCCCC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:5,0:0|1:46781672_C_A:46781672:7,2,1,1
chr16	46918908	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	46934724	.	CCCCTA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0|1:46934724_CCCCTA_C:46934724:0,7,1,1
chr16	46934731	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,2:1,0:0|1:46934724_CCCCTA_C:46934724:0,7,1,1
chr16	46993033	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,2:12,0:0|1:46993033_C_T:46993033:7,7,1,1
chr16	46993045	.	A	ACAGTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:1,2:13,0:0|1:46993033_C_T:46993033:6,8,1,1
chr16	47163292	.	A	AGTAC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:47163292_A_AGTAC:47163292:0,3,0,1
chr16	47163294	.	T	TATCTCC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:47163292_A_AGTAC:47163292:0,3,0,1
chr16	47163297	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:47163292_A_AGTAC:47163292:0,3,0,1
chr16	47163315	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	47163331	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47163331_T_C:47163331:0,0,0,1
chr16	47163341	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47163331_T_C:47163331:0,0,0,1
chr16	47163344	.	AC	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47163331_T_C:47163331:0,0,0,1
chr16	47192757	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr16	47196576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,117;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,0:3,2:4,6,0,2
chr16	47271876	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,1,3
chr16	47345091	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr16	47409947	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr16	47485414	.	T	TAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0|1:47485414_T_TAAAAAAA:47485414:0,2,0,1
chr16	47485415	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=181,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:47485414_T_TAAAAAAA:47485414:0,2,0,1
chr16	47486559	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr16	47614308	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:47614308_T_TA:47614308:1,3,1,1
chr16	47614310	.	G	GCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:47614308_T_TA:47614308:1,3,1,1
chr16	47614320	.	T	TCAAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=200,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:47614320_T_TCAAAGAG:47614320:1,2,1,1
chr16	47614321	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=200,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:47614320_T_TCAAAGAG:47614320:1,2,1,1
chr16	47621573	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=76,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:4,4,5,1
chr16	47622775	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr16	47675624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47675624_C_T:47675624:1,6,1,1
chr16	47675626	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:47675624_C_T:47675624:1,6,1,1
chr16	47683010	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=103,143;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:10,0:11,11,2,0
chr16	47683049	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=92,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:6,10,2,1
chr16	47684591	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=278,302;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	47694605	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,0:5,3:9,3,2,1
chr16	47695590	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=107,248;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:5,1,2,0
chr16	47697618	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,2:2,7:4,1,5,4
chr16	47733261	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:14,1:7,3:11,10,3,1
chr16	48118036	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr16	48118081	.	TA	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:48118081_TA_GC:48118081:0,2,0,1
chr16	48118084	.	GACCACAAGAT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:48118081_TA_GC:48118081:0,2,0,1
chr16	48130781	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=88,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:4,6,3,7
chr16	48134741	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	48138174	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:2,7,2,0
chr16	48139304	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=11815422,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr16	48201202	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:8,6:19,0:22,6,6,0
chr16	48201638	.	T	TGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	48204133	.	CG	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,4:5,0:0|1:48204133_CG_GA:48204133:8,6,2,2
chr16	48204139	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,4:5,0:0|1:48204133_CG_GA:48204133:8,9,2,2
chr16	48249178	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=102,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,0:7,4:6,6,0,4
chr16	48258198	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=72,77;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,6:2,0:1,1,1,5
chr16	48286063	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr16	48311157	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=257,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	48333746	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=160,289;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr16	48395742	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,174;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,6:6,0:3,7,0,6
chr16	48576795	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,0:3,3:8,2,1,2
chr16	49412531	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	49433225	.	G	GGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,2:1,0:0|1:49433225_G_GGT:49433225:1,3,1,1
chr16	49433227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=121,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:2,1:1,0:0|1:49433225_G_GGT:49433225:1,2,1,1
chr16	49433229	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=121,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:49433225_G_GGT:49433225:1,2,0,1
chr16	49433269	.	C	CTTTTAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	49557441	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	49557482	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr16	49672413	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=95,0;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:5,6,0,2
chr16	50059279	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	50059314	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	50059500	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr16	50067890	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=160,141;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:50067890_C_T:50067890:3,0,1,0
chr16	50067897	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=178,141;MMQ=42,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:50067890_C_T:50067890:4,0,1,0
chr16	50067905	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	50100253	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr16	50102618	.	G	GAAAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr16	50109478	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr16	50117828	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.870:6:0,1:0,3:0,0,3,3
chr16	50120122	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,7,6
chr16	50128681	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:15,4:4,5:8,12,4,5
chr16	50251590	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr16	50261735	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr16	50327439	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=84,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:1,2,2,4
chr16	50327456	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=84,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:50327456_C_T:50327456:1,1,0,3
chr16	50327462	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=84,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0|1:50327456_C_T:50327456:1,1,0,3
chr16	50328526	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=104,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.400:6:0,1:1,1:4,0,1,1
chr16	50328692	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,3:2,6,0,4
chr16	50335150	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,7:1,0:0,2,1,7
chr16	50338723	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	50343581	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr16	50345778	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=199,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:1,0,1,3
chr16	50346114	.	AGGGGCT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=55,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,1:0,0:2,0,1,1
chr16	50348136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=250,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50348136_G_A:50348136:3,0,1,0
chr16	50348138	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=250,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:50348136_G_A:50348136:3,0,1,0
chr16	50348317	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:2,3,0,2
chr16	50353710	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:50353710_A_G:50353710:2,0,1,0
chr16	50353712	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50353710_A_G:50353710:2,0,1,0
chr16	50355916	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=117,115;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,0:9,3:0|1:50355916_G_A:50355916:10,11,0,4
chr16	50355922	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=117,115;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,0:10,4:0|1:50355916_G_A:50355916:9,12,0,4
chr16	50355996	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,2:3,3:0,6,1,4
chr16	50367633	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr16	50368663	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,125;MMQ=51,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:7,1:0,2:4,3,2,1
chr16	50388657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr16	50402079	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=132,148;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:2,0:0|1:50402079_G_T:50402079:8,4,0,2
chr16	50402082	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=124,148;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:5,0:0|1:50402079_G_T:50402079:9,4,0,2
chr16	50402085	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=117,148;MMQ=53,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:0|1:50402079_G_T:50402079:11,3,0,2
chr16	50402087	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=109,148;MMQ=53,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:7,0:0|1:50402079_G_T:50402079:11,6,0,2
chr16	50402569	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr16	50402618	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.281:24:3,2:5,1:9,8,7,0
chr16	50642293	.	C	CATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr16	50655419	.	TCCAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=207,303;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr16	50707240	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,11:4,0:4,0,11,0
chr16	50709923	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50709923_CAT_C:50709923:0,0,0,1
chr16	50709927	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50709923_CAT_C:50709923:0,0,0,1
chr16	50709929	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50709923_CAT_C:50709923:0,0,0,1
chr16	50709931	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50709923_CAT_C:50709923:0,0,0,1
chr16	50731096	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,1:3,6:4,2,5,2
chr16	50731290	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:8,2:5,13,0,2
chr16	50733374	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,8:4,5:7,1,7,6
chr16	50744888	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.126:34:11,0:19,3:14,16,0,4
chr16	50745926	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,1,4
chr16	50759547	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=215,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr16	50816448	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=186,116;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr16	50816454	.	CGTGTGA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:2,0:0,1:0|1:50816454_CGTGTGA_C:50816454:0,2,0,1
chr16	50816467	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:50816454_CGTGTGA_C:50816454:0,3,0,1
chr16	50816471	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:50816454_CGTGTGA_C:50816454:0,3,0,1
chr16	50827601	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,1,5
chr16	51171175	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr16	51173355	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=86,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:3,8,1,1
chr16	51175655	.	CGCT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=206,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GCT;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:3,1:3,6,3,0
chr16	52497888	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:7,1,0,2
chr16	52502571	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr16	52580461	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	53191470	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,1:9,2:2,11,0,3
chr16	53256494	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:4,0,1,1
chr16	53272216	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=94,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:3,3:0,1:2,1,4,0
chr16	53321988	.	G	GGTCTCGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr16	53326860	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=113,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:7,7,1,1
chr16	53337812	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:14,0:3,2:9,9,0,2
chr16	53338467	.	TTCC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=96,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,4:5,0:2,6,2,2
chr16	53340080	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr16	53348342	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:9,0:8,2:10,7,1,3
chr16	53348361	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,0:6,2:0|1:53348361_G_C:53348361:8,6,0,3
chr16	53348365	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:0|1:53348361_G_C:53348361:8,6,0,3
chr16	53352329	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr16	53476804	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,2:3,4:2,6,3,3
chr16	53480931	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=102,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.255:18:5,4:9,0:10,4,3,1
chr16	53493346	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr16	53496439	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr16	53496598	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:2,2:7,6:2,7,2,6
chr16	53503943	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=93,82;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:4,2:2,3:3,3,3,2
chr16	53513033	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:5,4,3,1
chr16	53513055	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:10,3,2,2
chr16	53526694	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:16,0:6,1:0|1:53526694_T_C:53526694:6,16,2,1
chr16	53526708	.	C	CACCTGTAATCCGAGCACTTCAAGAGGCCGAAGCGGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:14,0:5,3:0|1:53526694_T_C:53526694:5,15,2,1
chr16	53529293	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=216,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr16	53529296	.	ACCACC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=170,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr16	53635933	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr16	53644975	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.417:6:1,0:2,1:0,4,0,2
chr16	53672355	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	53675117	.	G	GCTGGATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr16	53682978	.	TCGG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=104,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:9,4,0,2
chr16	53692238	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	53699003	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	53721906	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	53860481	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	53878247	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=95,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,2:3,2:0,3,0,5
chr16	53913911	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=20,24;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.358:15:2,2:4,1:3,7,0,5
chr16	53913919	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=28,20;MFRL=137,71;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:53913919_T_C:53913919:3,12,1,1
chr16	53913925	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=138,71;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:3,2:0|1:53913919_T_C:53913919:2,12,1,1
chr16	53913930	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=26,24;MFRL=109,156;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,5:3,1:2,6,0,6
chr16	53913938	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=30,26;MFRL=138,125;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:2,2:1,12,0,2
chr16	53913962	.	A	AATG	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=25,23;MFRL=138,185;MMQ=54,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:53913962_A_AATG:53913962:1,6,0,2
chr16	53913964	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=25,25;MFRL=138,185;MMQ=54,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,0:0|1:53913962_A_AATG:53913962:1,6,0,2
chr16	53913984	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=26,30;MFRL=167,214;MMQ=57,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:53913984_A_G:53913984:1,2,0,1
chr16	53913987	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=25,30;MFRL=167,214;MMQ=57,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:53913984_A_G:53913984:1,2,0,1
chr16	53913994	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=26,30;MFRL=167,214;MMQ=57,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:53913984_A_G:53913984:1,2,0,1
chr16	54318102	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0|1:54318102_C_T:54318102:0,0,5,0
chr16	54318108	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:54318102_C_T:54318102:4,0,1,0
chr16	54319571	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	54319994	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr16	54966363	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr16	55359126	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	55360208	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	55362542	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	55363238	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=258,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	55364084	.	ACCTCTGGCAAGCTAATTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:3,0,1,0
chr16	55519114	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,150;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,8:1,0:2,0,8,0
chr16	55525913	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,438;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	55530762	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:55530762_G_T:55530762:0,0,4,0
chr16	55530772	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:55530762_G_T:55530762:0,0,4,1
chr16	55536622	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr16	55536687	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=97,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:3,2,6,3
chr16	55539191	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr16	55543298	.	TGAGGGGGGCCTAGGTCAGAGGGGGGTCCAGGTAAGGGGTGTGGGTCTGAGAGAGGAGGGCGGCC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=64,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.466:16:3,3:1,4:0,4,5,7
chr16	55562257	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	55562572	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	55565747	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr16	55583149	.	T	A,TTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27,24;MFRL=0,202,164;MMQ=60,60,60;MPOS=25,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.97,7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.338,0.550:5:0,1,1:0,1,2:0,0,5,0
chr16	55616919	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=80,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:20,0:8,2:14,15,1,1
chr16	55616941	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=81,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:5,2:0|1:55616941_C_A:55616941:9,10,1,1
chr16	55616945	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:5,2:0|1:55616941_C_A:55616941:9,9,1,1
chr16	55616947	.	C	A,CTCAATCACTAAGAAG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=25,20,29;MFRL=115,60,92;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.66,3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,2:0.130,0.135:19:10,0,2:5,2,0:8,7,1,3
chr16	55616949	.	C	CAAAACTTCACTA	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:12,0:5,1:0|1:55616941_C_A:55616941:8,10,1,1
chr16	55616997	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=216,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,4:0,7:0,2,5,6
chr16	55728081	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	55730124	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:6,1,4,1
chr16	55731946	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=103,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,1:4,5,0,4
chr16	55735912	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	55844609	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:55844609_G_T:55844609:0,0,2,5
chr16	55844617	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:55844609_G_T:55844609:0,0,2,5
chr16	55844926	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=194,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.844:11:1,2:0,8:0,1,4,6
chr16	55846994	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=164,123;MMQ=54,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr16	55847017	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=0,246;MMQ=43,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55847017_CT_C:55847017:0,1,0,1
chr16	55847019	.	G	GCTTTCCAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=0,246;MMQ=43,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55847017_CT_C:55847017:0,1,0,1
chr16	55847023	.	G	GACCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=0,246;MMQ=43,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55847017_CT_C:55847017:0,1,0,1
chr16	55850708	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	55854412	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=157,180;MMQ=57,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:2,1:0,5,3,0
chr16	55854452	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=157,146;MMQ=57,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:55854452_G_A:55854452:0,5,1,1
chr16	55854455	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=157,146;MMQ=57,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:55854452_G_A:55854452:0,5,1,1
chr16	55857396	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	55862583	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=151,148;MMQ=45,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:55862583_G_T:55862583:4,0,1,0
chr16	55862590	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=151,148;MMQ=45,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:55862583_G_T:55862583:4,0,1,0
chr16	55862605	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr16	55866894	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr16	55880323	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr16	55880480	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=105,48;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,6:10,0:4,9,2,4
chr16	55880758	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr16	55883761	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	55886715	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	55886973	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=81,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:55886973_G_A:55886973:0,1,0,1
chr16	55886975	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=81,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55886973_G_A:55886973:0,1,0,1
chr16	55886976	.	AAC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=81,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55886973_G_A:55886973:0,1,0,1
chr16	55886983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=81,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:55886973_G_A:55886973:0,1,0,1
chr16	55890398	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=214,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:0,2,2,4
chr16	55890434	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=216,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr16	55907722	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:13,2:4,1:11,6,1,2
chr16	56362725	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	56377684	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=227,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:1,2:1,1,1,1
chr16	56389037	.	T	TACACACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=140,168;MMQ=42,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,20;RU=AC;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:0,1:2,0:0,3,0,2
chr16	56401294	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr16	56435803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr16	56438844	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,0:8,2:0|1:56438844_G_T:56438844:6,6,1,1
chr16	56438848	.	C	CTCTCAAATAGGATTTACACTCCCA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:0|1:56438844_G_T:56438844:6,6,1,1
chr16	56441862	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,2:0,13:0,0,11,5
chr16	56442066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:7,1:2,10,1,4
chr16	56481955	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	56500176	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=46,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,7:2,5:3,3,5,7
chr16	56500179	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=96,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:56500179_T_C:56500179:7,9,1,1
chr16	56500182	.	TA	AT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=96,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:56500179_T_C:56500179:7,10,1,1
chr16	56500185	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=96,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:56500179_T_C:56500179:7,10,1,1
chr16	56501730	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr16	56504724	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:1,8,0,4
chr16	56530895	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:8,3,2,2
chr16	56531750	.	T	TTCATTATTTCTTTTGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:56531750_T_TTCATTATTTCTTTTGG:56531750:1,6,1,1
chr16	56531752	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:56531750_T_TTCATTATTTCTTTTGG:56531750:1,6,1,1
chr16	56539982	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:0,10:2,5:2,0,8,7
chr16	56540190	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=237,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr16	56545175	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=76,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.453:7:3,0:0,3:0|1:56545175_T_C:56545175:1,3,1,2
chr16	56545188	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=108,32;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:56545175_T_C:56545175:0,3,0,1
chr16	56545191	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,32;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1|0:56545175_T_C:56545175:0,3,0,1
chr16	56553814	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:56553814_A_G:56553814:1,3,0,2
chr16	56553816	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,0:0|1:56553814_A_G:56553814:1,3,0,2
chr16	56667165	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	56667614	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=237,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,3,2
chr16	56667854	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	56672796	.	A	AAAACACAGAATAATATCATTAAAGAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	56673143	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:56673143_A_G:56673143:0,0,6,5
chr16	56673148	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:56673143_A_G:56673143:0,0,6,5
chr16	56686002	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:56686002_G_C:56686002:0,0,2,2
chr16	56686005	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:56686002_G_C:56686002:0,0,2,2
chr16	56686030	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr16	56686380	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr16	56686818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	56686852	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=62,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:1,2,2,2
chr16	56686968	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:4,2:3,3,2,0
chr16	56687039	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:56687039_T_A:56687039:0,1,0,1
chr16	56687044	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56687039_T_A:56687039:0,1,0,1
chr16	56687047	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56687039_T_A:56687039:0,1,0,1
chr16	56687049	.	CCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56687039_T_A:56687039:0,1,0,1
chr16	56873455	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=99,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:18,3:13,0:15,17,4,0
chr16	56901172	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=92,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:6,2:1,0:2,6,0,2
chr16	56904587	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr16	56912998	.	G	GGGGTCAGACCAGGCTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=186,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:3,0:0|1:56912998_G_GGGGTCAGACCAGGCTC:56912998:5,2,1,1
chr16	56913000	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=186,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0|1:56912998_G_GGGGTCAGACCAGGCTC:56912998:5,2,1,1
chr16	56916345	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=106,67;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,0:9,4:11,4,1,3
chr16	56917953	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr16	56919187	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=101,49;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:5,13,1,1
chr16	56919204	.	C	CTAATCTTAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,49;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:56919204_C_CTAATCTTAAA:56919204:2,10,1,1
chr16	56919206	.	G	GTTCCACCTGGGACACTGCTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,49;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:56919204_C_CTAATCTTAAA:56919204:2,10,1,1
chr16	56921829	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,8,10
chr16	56924342	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56924345	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56924349	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56924351	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56924355	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56924357	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56924342_TG_T:56924342:0,1,0,1
chr16	56926176	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	56926828	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr16	56933519	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr16	56936272	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=69,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr16	56938290	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:6,4,1,4
chr16	56973160	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=133,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:6,0:8,3:9,7,0,3
chr16	56973335	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	57003723	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	57003977	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:57003977_T_C:57003977:0,0,0,2
chr16	57003980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:57003977_T_C:57003977:0,0,0,2
chr16	57007451	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr16	57015463	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	57016247	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,241;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr16	57017474	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.363:14:5,0:4,4:5,4,3,2
chr16	57017662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=223,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	57057654	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=66,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr16	57060620	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr16	57068107	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,43;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:5,1:5,2:4,6,2,2
chr16	57071232	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=222,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:0,2:0,1,1,3
chr16	57074451	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	57076018	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=219,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	57077351	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,1:2,3,2,0
chr16	57085547	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.322:32:12,2:10,8:11,11,6,4
chr16	57088574	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:57088574_G_GGC:57088574:1,0,2,0
chr16	57088578	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:0|1:57088574_G_GGC:57088574:1,1,2,0
chr16	57088583	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:57088574_G_GGC:57088574:2,1,2,0
chr16	57088587	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:1,0:2,1:0|1:57088574_G_GGC:57088574:2,1,2,0
chr16	57101811	.	AG	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=195,136;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:0,1:1,0:0,4,0,1
chr16	57111825	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,1:6,5:3,5,3,3
chr16	57113229	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=64,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr16	57114924	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	57116287	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,8:1,0:2,0,5,3
chr16	57144920	.	TG	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=270,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	57147388	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=305,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr16	57153019	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	57161734	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=118,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:8,8,4,0
chr16	57168565	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	57181613	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57181613_C_CAG:57181613:0,1,0,1
chr16	57181614	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57181613_C_CAG:57181613:0,1,0,1
chr16	57181618	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57181613_C_CAG:57181613:0,1,0,1
chr16	57181620	.	A	ACTCACGTTGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57181613_C_CAG:57181613:0,1,0,1
chr16	57255357	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57255357_G_C:57255357:0,1,0,1
chr16	57255362	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:57255357_G_C:57255357:0,2,0,1
chr16	57255364	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=84,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:57255357_G_C:57255357:0,2,0,1
chr16	57283809	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=48,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:3,2:3,1:1,5,1,2
chr16	57394293	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=193,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr16	57465085	.	T	TTTTCC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCC;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:8,2:3,0:0|1:57465085_T_TTTTCC:57465085:2,9,1,1
chr16	57465096	.	C	CTTCCCTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:57465085_T_TTTTCC:57465085:2,9,1,1
chr16	57473200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=144,86;MMQ=58,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:57473200_G_A:57473200:6,4,1,1
chr16	57473209	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=110,86;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:57473200_G_A:57473200:7,4,1,1
chr16	57490640	.	A	AGGCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57490640_A_AGGCAGG:57490640:0,1,0,1
chr16	57490641	.	T	TGAATCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57490640_A_AGGCAGG:57490640:0,1,0,1
chr16	57493513	.	ATC	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,38;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:0|1:57493513_ATC_A:57493513:9,9,1,1
chr16	57493517	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=97,38;MMQ=60,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:57493513_ATC_A:57493513:9,9,1,1
chr16	57496841	.	TGCCCCCCTGCACCAGGGCTTTAGCTTTGGGA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.344:11:3,1:1,2:6,2,3,0
chr16	57497001	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:12,5,1,1
chr16	57497018	.	CGCCCACGGG	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:5,2:0|1:57497018_CGCCCACGGG_C:57497018:8,12,1,1
chr16	57497028	.	TTCCTG	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=188,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:57497018_CGCCCACGGG_C:57497018:3,11,1,1
chr16	57497038	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:57497018_CGCCCACGGG_C:57497018:3,5,1,1
chr16	57503104	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:6,0:0|1:57503104_G_T:57503104:6,6,1,1
chr16	57503106	.	G	GCGTTGACCTGAAGAATCTCTTCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:57503104_G_T:57503104:6,6,1,1
chr16	57503205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=85,47;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,3:5,0:3,3,2,1
chr16	57509375	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=182,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr16	57509606	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=257,146;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57509606_C_CAT:57509606:0,1,0,1
chr16	57509607	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=257,146;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57509606_C_CAT:57509606:0,1,0,1
chr16	57509613	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=257,146;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57509606_C_CAT:57509606:0,1,0,1
chr16	57509617	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=257,146;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57509606_C_CAT:57509606:0,1,0,1
chr16	57602060	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57602060_C_T:57602060:1,2,0,1
chr16	57602069	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:57602060_C_T:57602060:1,1,0,1
chr16	57602084	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57602060_C_T:57602060:0,2,0,1
chr16	57602085	.	G	GTGACTCCT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57602060_C_T:57602060:0,2,0,1
chr16	57602089	.	T	TCTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:57602089_T_TCTA:57602089:0,1,0,1
chr16	57602090	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57602089_T_TCTA:57602089:0,1,0,1
chr16	57602096	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,25;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57602089_T_TCTA:57602089:0,1,0,1
chr16	57625470	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,9,2
chr16	57684303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:6,3,1,1
chr16	57687305	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:57687305_T_TG:57687305:0,3,0,1
chr16	57687309	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57687305_T_TG:57687305:0,3,0,1
chr16	57687310	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57687305_T_TG:57687305:0,3,0,1
chr16	57687314	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=136,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	57690606	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr16	57691265	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,3:2,8:5,0,8,3
chr16	57697407	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:9,0:13,5:0|1:57697407_C_T:57697407:8,14,0,6
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chr16	57697511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:57697479_GTCCAGCCGCATCTAGGCC_G:57697479:0,8,1,1
chr16	57697532	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	57697568	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	57710093	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,8:2,6:1,2,9,5
chr16	57713250	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr16	57714257	.	A	AGCCTGTGCAGGGACAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:3,8,1,1
chr16	57756974	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=103,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:6,0:13,0:9,10,1,1
chr16	57756998	.	T	TTC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,1:12,1:0|1:57756998_T_TTC:57756998:9,11,0,2
chr16	57756999	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,1:12,0:0|1:57756998_T_TTC:57756998:9,11,0,2
chr16	57758698	.	TCA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:5,6,1,1
chr16	57758732	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=91,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:2,3,2,3
chr16	57760226	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.190:17:4,2:10,0:5,9,0,3
chr16	57771126	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,3,1
chr16	57775537	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr16	57778488	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr16	57785138	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:7,4,1,2
chr16	57789106	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:2,2:0|1:57789106_A_T:57789106:3,2,1,1
chr16	57789108	.	C	CGGGGTTCAAGCCATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:57789106_A_T:57789106:3,2,1,1
chr16	57789923	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:57789923_C_A:57789923:0,2,0,1
chr16	57789927	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:57789923_C_A:57789923:0,2,0,1
chr16	57789937	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57789923_C_A:57789923:0,1,0,1
chr16	57789940	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57789923_C_A:57789923:0,0,0,1
chr16	57792688	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	57793146	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=357,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,4,6
chr16	57793595	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	57794599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=131,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr16	57794633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:5,3,2,1
chr16	57803680	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,2:0,0,4,4
chr16	57803911	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	57805048	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	57806030	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	57829099	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	57931899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=188,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57931899_G_A:57931899:0,3,0,1
chr16	57931902	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=188,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57931899_G_A:57931899:0,3,0,1
chr16	57935584	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=112,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr16	57937895	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr16	57951106	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:10,2,2,0
chr16	57951421	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr16	57954306	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=172,35;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:57954306_C_T:57954306:6,5,1,1
chr16	57954315	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=172,35;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:57954306_C_T:57954306:10,7,1,1
chr16	57954317	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=172,35;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:57954306_C_T:57954306:10,7,1,1
chr16	57954321	.	CG	AC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=165,35;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:57954306_C_T:57954306:10,7,1,1
chr16	57954325	.	A	AGG	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=149,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=G;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:57954306_C_T:57954306:9,7,1,1
chr16	57974240	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr16	57984483	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	57991123	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	57991317	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr16	57993734	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=89,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57993734_G_A:57993734:1,1,1,0
chr16	57993752	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=104,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57993734_G_A:57993734:0,2,1,0
chr16	57994876	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=117,178;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr16	57997016	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=170,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:57997016_A_AG:57997016:0,2,0,1
chr16	57997018	.	G	GATCCTCCTCCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:57997016_A_AG:57997016:0,2,0,1
chr16	57998100	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:57998100_T_C:57998100:11,10,1,1
chr16	57998103	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:57998100_T_C:57998100:11,10,1,1
chr16	57998111	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:57998100_T_C:57998100:10,8,1,1
chr16	57998114	.	AGAAT	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:57998100_T_C:57998100:10,8,1,1
chr16	57998122	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:57998100_T_C:57998100:8,8,1,1
chr16	57998218	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr16	57998310	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:57998310_A_C:57998310:3,0,1,0
chr16	57998315	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:57998310_A_C:57998310:3,0,1,0
chr16	57998345	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	58010402	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=89,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:58010402_CT_C:58010402:6,5,1,1
chr16	58010411	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:58010402_CT_C:58010402:8,6,1,1
chr16	58011985	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=117,173;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:1,7,3,0
chr16	58011999	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=117,173;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:1,7,3,0
chr16	58012004	.	A	AGAAG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:4,3,0,2
chr16	58012011	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=173,93;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:3,3,0,2
chr16	58019065	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0|1:58019065_TG_T:58019065:0,0,7,1
chr16	58019070	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0|1:58019065_TG_T:58019065:0,0,7,1
chr16	58019253	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr16	58019368	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:6,2:5,4,1,1
chr16	58021395	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	58032486	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr16	58032521	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=97,151;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr16	58032523	.	AAC	ACAC,A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,21,26;MFRL=0,193,151;MMQ=60,60,54;MPOS=3,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.335,0.329:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr16	58032524	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	58051178	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:6,1:0,2:5,1,2,1
chr16	58072153	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,6:1,1:2,0,4,3
chr16	58075776	.	TCTGGCCCCGCCTCCCATGC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:1,2:4,3,1,1
chr16	58079165	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:58079165_G_A:58079165:0,0,5,6
chr16	58079185	.	G	GTCATTAAGCGGTGTCATTTTGCTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:58079165_G_A:58079165:2,6,1,1
chr16	58149165	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr16	58201759	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr16	58296496	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,236;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:1,3,0,1
chr16	58301360	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:0,5:2,7:1,1,9,3
chr16	58312357	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr16	58312466	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=147,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,4:8,0:5,9,1,3
chr16	58312574	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	58313566	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,17;MFRL=99,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:1,0:3,0:0|1:58313566_T_G:58313566:3,1,0,1
chr16	58313570	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=99,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:0,0:3,1:0|1:58313566_T_G:58313566:3,1,0,1
chr16	58313578	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,0:1,2:2,0,2,1
chr16	58314433	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=98,130;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,4,3
chr16	58314598	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0|1:58314598_C_T:58314598:2,3,2,4
chr16	58314604	.	T	TGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.272:9:4,2:3,0:1|0:58314598_C_T:58314598:1,6,1,1
chr16	58318604	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=45,135;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,5:3,2:3,4,3,4
chr16	58324802	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:58324802_CA_TG:58324802:1,0,6,0
chr16	58324807	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:58324802_CA_TG:58324802:1,0,6,0
chr16	58327742	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr16	58438529	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:8,10,3,0
chr16	58438703	.	A	AAATAAGCCCCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr16	58537897	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr16	58540595	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	58542802	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr16	58549932	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	58550300	.	A	AAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:3,0,3,0
chr16	58550484	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=142,86;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:4,6,2,2
chr16	58566156	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,2:6,2:5,3,2,2
chr16	58566304	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,3,5
chr16	58571185	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:58571185_C_T:58571185:0,5,0,3
chr16	58571189	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:58571185_C_T:58571185:0,5,0,3
chr16	58573901	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr16	58575342	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:7,0,5,0
chr16	58576490	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=64,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr16	58577315	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.496:14:2,2:2,2:3,4,4,3
chr16	58581272	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=148,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:0,11,0,2
chr16	58592278	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr16	58620995	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr16	58712685	.	ACCTGTCAGCTTGC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=104,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:7,2:4,4,0,2
chr16	58743454	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:1,4:0,3,3,4
chr16	58743477	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr16	58757668	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:3,2,4,4
chr16	58757683	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=128,139;MMQ=60,44;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,2:2,6:3,4,5,3
chr16	64981928	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=183,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr16	64985009	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64985009_TC_AG:64985009:0,1,0,1
chr16	64985011	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64985009_TC_AG:64985009:0,1,0,1
chr16	65005462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,4,2
chr16	65016285	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	65022173	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:7,2:0|1:65022173_C_T:65022173:8,6,1,1
chr16	65022179	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:65022173_C_T:65022173:8,7,1,1
chr16	65025658	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,10,10
chr16	65025718	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=107,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:4,4,3,4
chr16	65025849	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr16	66413150	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=241,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr16	66413195	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=84,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,4:2,8:1,1,9,3
chr16	66424235	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	66432303	.	GACCACCCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACCACCCC;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr16	66437013	.	A	AAACCCAGATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,0:7,2:4,4,1,1
chr16	66437131	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	66511627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:2,0:3,2:3,3,0,2
chr16	66547767	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,2:2,5:0|1:66547767_T_C:66547767:4,5,1,7
chr16	66547777	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:7,2:2,5:0|1:66547767_T_C:66547767:4,5,1,6
chr16	66551037	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=110,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,2:20,0:21,16,3,0
chr16	66582866	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=130.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,44:0.683:64:11,20:9,23:9,11,17,27
chr16	66586759	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:4,5:1,3:0,5,1,8
chr16	66600381	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	66600479	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,2:1,6:3,0,7,2
chr16	66600663	.	ACACGCCCACCCCCAAAGCCCACACTCCCACCCCC	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.074:39:8,0:15,2:21,16,1,1
chr16	66600669	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=143,110;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.217:32:6,5:19,0:11,14,7,0
chr16	66600699	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=133,110;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.217:27:5,1:12,0:7,13,7,0
chr16	66613841	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,1:1,3:2,0,4,0
chr16	66622090	.	T	TTTTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:66622090_T_TTTTA:66622090:0,0,0,1
chr16	66622094	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:66622090_T_TTTTA:66622090:0,0,0,1
chr16	66622096	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:66622090_T_TTTTA:66622090:0,0,0,1
chr16	66638849	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	66643502	.	G	GTCTACTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66643502_G_GTCTACTC:66643502:0,0,0,1
chr16	66643503	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66643502_G_GTCTACTC:66643502:0,0,0,1
chr16	66643507	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66643502_G_GTCTACTC:66643502:0,0,0,1
chr16	66646591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=83,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:1,2:10,0:4,7,0,2
chr16	66646611	.	C	CATCAGGGCAGGCCGCGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=168,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:0,0:5,2:1,4,1,1
chr16	66759682	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,2:0,4:2,2,5,1
chr16	66762847	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr16	66762860	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	66770163	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.642:43:6,0:9,26:1,14,0,28
chr16	66776657	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=240,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr16	66783260	.	GG	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:66783260_GG_TT:66783260:0,2,0,1
chr16	66783265	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66783260_GG_TT:66783260:0,2,0,1
chr16	66783266	.	G	GATTATTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66783260_GG_TT:66783260:0,2,0,1
chr16	66792581	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=186,220;MMQ=50,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:66792581_C_T:66792581:2,0,1,0
chr16	66792589	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=186,220;MMQ=50,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:66792581_C_T:66792581:2,0,1,0
chr16	66792592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=159,212;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:66792592_C_T:66792592:3,0,1,0
chr16	66792598	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=165,212;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:66792592_C_T:66792592:4,0,1,0
chr16	66792601	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=165,212;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:66792592_C_T:66792592:4,0,1,0
chr16	66806724	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	66811035	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr16	66842794	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=205,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,5,1
chr16	66847575	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:8,2,2,6
chr16	66847658	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:6,4:3,5:6,4,6,3
chr16	66861836	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=111,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr16	66885281	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,150;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr16	66885652	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=112,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:9,1:4,10:4,9,5,6
chr16	66886581	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,2:8,3:10,3,1,4
chr16	66921682	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66921682_T_C:66921682:0,0,0,1
chr16	66921685	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,258;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66921682_T_C:66921682:0,0,0,1
chr16	66942206	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=326,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr16	66944176	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=75,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:5,4:13,0:9,10,2,2
chr16	66944482	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	66945947	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:2,1:1,2:1,2,2,3
chr16	66947158	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=102,33;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:66947158_A_C:66947158:6,8,1,1
chr16	66947160	.	T	TCCAGC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:66947158_A_C:66947158:6,8,1,1
chr16	66947614	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	66977953	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=170,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr16	67006403	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=89,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:4,7,0,3
chr16	67029430	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=100,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr16	67040813	.	C	CAGCTCGGTGCTGCCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	67179403	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,4,3
chr16	67214472	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,2:0|1:67214472_G_T:67214472:2,0,1,1
chr16	67214476	.	G	GTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,32;MFRL=206,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,1:0|1:67214472_G_T:67214472:1,0,1,1
chr16	67214478	.	C	CAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=191,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:67214472_G_T:67214472:1,2,0,1
chr16	67214480	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=191,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:67214472_G_T:67214472:1,2,0,1
chr16	67221050	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	67234946	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,26;MFRL=196,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:67234946_G_C:67234946:0,1,0,2
chr16	67234965	.	T	TGCTTAGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=196,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:67234946_G_C:67234946:0,1,0,2
chr16	67236241	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=182,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr16	67236352	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=135,278;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:67236352_C_T:67236352:0,1,0,1
chr16	67236358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=182,278;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67236352_C_T:67236352:0,2,0,1
chr16	67236931	.	GGGCAGAGGGCA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCAGAGGGCA;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:0,1:2,0:2,1,0,1
chr16	67242087	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr16	67242717	.	G	GAGAGGAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:67242717_G_GAGAGGAGA:67242717:0,6,1,1
chr16	67242721	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:67242717_G_GAGAGGAGA:67242717:0,6,1,1
chr16	67263991	.	G	GTGTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:6,7,0,2
chr16	67265429	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:7,0:8,10,2,1
chr16	67266108	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:5,0:8,12:5,8,0,12
chr16	67266147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=140,167;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr16	67270898	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:0|1:67270898_C_T:67270898:7,13,1,1
chr16	67270906	.	C	CTGGGTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:0|1:67270898_C_T:67270898:6,13,1,1
chr16	67270907	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:0|1:67270898_C_T:67270898:6,13,1,1
chr16	67272452	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:67272452_A_C:67272452:0,3,0,1
chr16	67272454	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67272452_A_C:67272452:0,3,0,1
chr16	67281105	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=198,53;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:67281105_T_A:67281105:4,0,1,1
chr16	67281107	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=198,53;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:67281105_T_A:67281105:4,0,1,1
chr16	67281112	.	C	CTGTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=198,53;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:67281105_T_A:67281105:4,0,1,1
chr16	67281113	.	C	CACTCAGCCGTCGATACACTGGTCTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=198,53;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:67281105_T_A:67281105:4,0,1,1
chr16	67290507	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=101,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:6,6,1,1
chr16	67293865	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=109,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:7,9,0,2
chr16	67304940	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.351:32:12,0:9,11:10,11,0,11
chr16	67315123	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=93,128;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.160:20:6,1:7,0:6,11,0,3
chr16	67315128	.	CT	C,TT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=19,31,20;MFRL=163,157,128;MMQ=60,60,40;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.28,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,3:0.464,0.208:11:0,1,2:1,2,0:0,3,2,6
chr16	67320544	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,261;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,9:4,0:3,3,9,0
chr16	67322016	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,2,0
chr16	67323517	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:67323517_C_T:67323517:5,4,1,1
chr16	67323532	.	C	CATGCCCCACCCGCCAAGTCTCAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=93,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:4,0:1,2:0|1:67323517_C_T:67323517:3,3,1,1
chr16	67328560	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:2,7,1,1
chr16	67329121	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr16	67381383	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=81,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,2:5,7:3,4,5,4
chr16	67381592	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67381592_C_CAG:67381592:0,1,0,1
chr16	67381594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67381592_C_CAG:67381592:0,1,0,1
chr16	67384073	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,14;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:3,1,1,0
chr16	67405213	.	T	TGTGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=67,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr16	67409403	.	T	TAATTTACATATCTGGTTACTCTATATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	67416244	.	TGC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:67416244_TGC_T:67416244:0,0,0,1
chr16	67416247	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=236,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:67416244_TGC_T:67416244:0,1,0,1
chr16	67418837	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,2:10,1:8,6,1,2
chr16	67433430	.	G	GCTTTCACTAAGGGATGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	67440151	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:0|1:67440151_C_T:67440151:8,8,1,1
chr16	67440159	.	C	CGGGTTGAGAGCCTTGG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,0:4,2:0|1:67440151_C_T:67440151:9,9,1,1
chr16	67440239	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:6,2,0,2
chr16	67472376	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CA;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:2,1:4,1:2,6,0,3
chr16	67572802	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=123,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67572802_T_C:67572802:1,1,0,1
chr16	67572804	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=123,261;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67572802_T_C:67572802:1,1,0,1
chr16	67574276	.	TGTGGGGGCAG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=133,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:2,4:4,0:6,5,2,2
chr16	67576519	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=99,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:9,4:19,0:14,16,4,0
chr16	67576995	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=115,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:2,10,0,3
chr16	67577364	.	T	TGGAGCCACTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=78,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:5,0:1,2:4,2,1,1
chr16	67577414	.	G	GAATGTGTGGAAGTGGATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,34;MFRL=230,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr16	67579557	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:2,2,3,4
chr16	67579944	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67579944_T_A:67579944:0,0,1,0
chr16	67579949	.	ACCC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67579944_T_A:67579944:0,0,1,0
chr16	67579953	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67579944_T_A:67579944:0,0,1,0
chr16	67662473	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:8,0:6,2:0|1:67662473_A_T:67662473:2,12,0,2
chr16	67662479	.	C	CTTCCCCTTCCACAACCTTAACCTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:5,2:0|1:67662473_A_T:67662473:2,11,0,2
chr16	67663372	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=108,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,2:14,1:13,14,1,2
chr16	67670685	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,163;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:18,0:9,7:11,16,0,7
chr16	67680523	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,115;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr16	67690884	.	AGT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	67709948	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=128,128;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,0:9,5:2,18,0,5
chr16	67763278	.	CGAG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:7,2:14,1:13,9,2,1
chr16	67763479	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:67763479_C_CT:67763479:1,2,0,1
chr16	67763480	.	C	CTCTCTCTGACTTGTGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=193,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:67763479_C_CT:67763479:1,2,0,1
chr16	67765538	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:67765538_T_A:67765538:0,0,1,1
chr16	67765543	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:67765538_T_A:67765538:0,0,1,1
chr16	67765545	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:67765538_T_A:67765538:0,0,1,1
chr16	67772070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=251,156;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:67772070_C_T:67772070:0,1,0,1
chr16	67772073	.	C	G,A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33,23;MFRL=0,251,156;MMQ=60,40,40;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr16	67772076	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=258,156;MMQ=50,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:67772070_C_T:67772070:0,2,0,1
chr16	67772077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=264,204;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:67772070_C_T:67772070:0,1,0,2
chr16	67855165	.	A	ATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67855165_A_ATAT:67855165:1,0,0,1
chr16	67855171	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67855165_A_ATAT:67855165:1,0,0,1
chr16	67857455	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:6,3,1,2
chr16	67857701	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=178,132;MMQ=56,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	67857715	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=178,144;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	67857717	.	TG	CA,CG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32,22;MFRL=180,132,144;MMQ=48,40,60;MPOS=14,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr16	67860460	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=184,56;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,0:2,2:0|1:67860460_G_T:67860460:3,6,1,1
chr16	67860466	.	G	GGAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=184,56;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:67860460_G_T:67860460:3,6,1,1
chr16	67860467	.	T	TACAGGCGCACGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,56;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:67860460_G_T:67860460:3,6,1,1
chr16	67861520	.	GGG	TCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,2:11,0:0|1:67861520_GGG_TCT:67861520:12,0,1,1
chr16	67861525	.	C	CACGTCACCAGAGAAAGTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,2:11,0:0|1:67861520_GGG_TCT:67861520:12,1,1,1
chr16	67862355	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=96,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:7,0:8,13:3,12,0,14
chr16	67863451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr16	67864437	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr16	67865721	.	C	CTTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:1,4,1,1
chr16	67865773	.	T	TGTGTGTTTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr16	67904853	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=101,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:67904853_C_T:67904853:7,14,1,1
chr16	67904859	.	T	TTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:67904853_C_T:67904853:6,14,1,1
chr16	67912664	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=113,102;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:7,0:12,8:7,12,8,0
chr16	67913773	.	CAGCAGCAGCGGT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=235,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,0,1
chr16	67914922	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,138;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:4,4,0,2
chr16	67963757	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	67963899	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=83,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.233:41:21,9:10,0:15,17,9,0
chr16	67964646	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:12,9,1,1
chr16	67964798	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr16	67970410	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:4,7,0,2
chr16	67970521	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=230,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:0,1:1,0:1,1,4,0
chr16	67970647	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:67970647_C_T:67970647:5,8,1,1
chr16	67970653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:67970647_C_T:67970647:5,8,1,1
chr16	67979541	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	67984183	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	67985025	.	TAGGCAGGCAGGGCTCACCTGTTACAGAAGGGAAGAAGATGCCGACCAGCACGGTGAAGGATGTGGCGATGTCAGCGACCACGTACAG	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.084:38:8,0:5,4:0|1:67985025_TAGGCAGGCAGGGCTCACCTGTTACAGAAGGGAAGAAGATGCCGACCAGCACGGTGAAGGATGTGGCGATGTCAGCGACCACGTACAG_T:67985025:15,18,4,1
chr16	67985135	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=114,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:0|1:67985025_TAGGCAGGCAGGGCTCACCTGTTACAGAAGGGAAGAAGATGCCGACCAGCACGGTGAAGGATGTGGCGATGTCAGCGACCACGTACAG_T:67985025:2,12,1,1
chr16	68011906	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:10,0:9,12:9,10,0,12
chr16	68025801	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,11,7
chr16	68026555	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:68026555_G_C:68026555:2,3,1,1
chr16	68026558	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:68026555_G_C:68026555:2,3,1,1
chr16	68026559	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:68026555_G_C:68026555:2,3,1,1
chr16	68026561	.	G	GAGCTCATT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:68026555_G_C:68026555:2,2,1,1
chr16	68055385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=211,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr16	68056412	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,3:6,0:5,2,0,3
chr16	68109178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.464:7:1,3:1,0:4,0,3,0
chr16	68156684	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=150,38;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:6,0:9,2:11,4,1,1
chr16	68200989	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=124,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68200989_A_ATT:68200989:0,1,0,1
chr16	68200990	.	A	AGTTGCTGGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=124,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68200989_A_ATT:68200989:0,1,0,1
chr16	68260456	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68260456_C_A:68260456:0,1,0,1
chr16	68260458	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68260456_C_A:68260456:0,1,0,1
chr16	68260462	.	GGT	AAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68260456_C_A:68260456:0,1,0,1
chr16	68265057	.	TCCCCTAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCTAG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:0,1:2,1,1,0
chr16	68265577	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,0:7,2:4,9,1,1
chr16	68265630	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:3,2:6,0:5,4,0,3
chr16	68268061	.	G	GCC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=189,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:68268061_G_GCC:68268061:1,5,1,1
chr16	68268062	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=189,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:68268061_G_GCC:68268061:1,5,1,1
chr16	68268065	.	G	GTCTCCAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=189,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:68268061_G_GCC:68268061:1,5,1,1
chr16	68268068	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=189,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:68268061_G_GCC:68268061:1,5,1,1
chr16	68289206	.	TGG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,0:5,2:5,4,1,1
chr16	68308883	.	CCA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:8,11,2,0
chr16	68309241	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=212,214;MMQ=44,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68309241_A_G:68309241:0,2,0,1
chr16	68309248	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=212,214;MMQ=44,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68309241_A_G:68309241:0,2,0,1
chr16	68321859	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	68325176	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,258;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:9,10,3,0
chr16	68344696	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,10:3,3:1,4,7,6
chr16	68371529	.	G	GGATTCCACCAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr16	68373954	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	68387373	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr16	68387496	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=205,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,1:1,5:0,3,1,5
chr16	68391189	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	68395221	.	TGGGAGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr16	68405034	.	CGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:68405034_CGG_C:68405034:2,2,1,1
chr16	68405037	.	A	ACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:68405034_CGG_C:68405034:2,2,1,1
chr16	68405680	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:6,3,3,0
chr16	68712217	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr16	68712751	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:11,7,1,1
chr16	68718555	.	C	CCTATCTTACCCTACCACAGAAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.261:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr16	68719253	.	G	GATGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=186,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:68719253_G_GATGA:68719253:0,1,0,1
chr16	68719260	.	GC	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=96,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68719253_G_GATGA:68719253:0,2,0,1
chr16	68725828	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=122,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:4,2:0|1:68725828_G_A:68725828:1,6,1,1
chr16	68725831	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:68725828_G_A:68725828:1,6,1,1
chr16	68725834	.	G	GGATACAACAAGAAGCCAGCAGTC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:68725828_G_A:68725828:1,6,1,1
chr16	68732049	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,11,2
chr16	68855852	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr16	68896907	.	A	ATCCCAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=210,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0|1:68896907_A_ATCCCAT:68896907:0,5,1,1
chr16	68896908	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=210,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:68896907_A_ATCCCAT:68896907:0,5,1,1
chr16	68896961	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=201,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr16	68952993	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:6,7:2,0:6,3,0,7
chr16	69074211	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,0:8,3:7,3,0,3
chr16	69152348	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=84,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:11,0:3,4:5,9,2,2
chr16	69155466	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr16	69184857	.	TGTCC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=113,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69184857_TGTCC_T:69184857:0,2,0,1
chr16	69184866	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=113,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69184857_TGTCC_T:69184857:0,2,0,1
chr16	69184869	.	CCACAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=16,29;MFRL=114,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr16	69184884	.	A	ACTCG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69184884_A_ACTCG:69184884:0,0,0,1
chr16	69184886	.	A	AGCGCCTG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69184884_A_ACTCG:69184884:0,0,0,1
chr16	69187608	.	A	ATGTAAGGCTAGAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,2:0,0:0|1:69187608_A_ATGTAAGGCTAGAC:69187608:2,5,1,1
chr16	69187610	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,2:0,0:0|1:69187608_A_ATGTAAGGCTAGAC:69187608:2,5,1,1
chr16	69197149	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69197149_G_A:69197149:0,1,0,1
chr16	69197152	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69197149_G_A:69197149:0,1,0,1
chr16	69197168	.	T	TAGGTTAATTAGATCCCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:69197168_T_TAGGTTAATTAGATCCCA:69197168:0,0,0,1
chr16	69197172	.	G	GTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69197168_T_TAGGTTAATTAGATCCCA:69197168:0,0,0,1
chr16	69197173	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69197168_T_TAGGTTAATTAGATCCCA:69197168:0,0,0,1
chr16	69197178	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69197168_T_TAGGTTAATTAGATCCCA:69197168:0,0,0,1
chr16	69200931	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=74,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:5,1,2,0
chr16	69294010	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=90,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:11,9:7,0:8,10,10,0
chr16	69334642	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr16	69334880	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=269,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	69350069	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr16	69353304	.	T	TACCCCCATTCTTCAACACTAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr16	69354963	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:6,2,6,0
chr16	69363982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:1,1,3,3
chr16	69377553	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=196,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,2:1,5:0,2,1,6
chr16	69390850	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=92,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:11,8,0,2
chr16	69395323	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=120,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:9,11,1,1
chr16	69395434	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr16	69395461	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:69395461_T_C:69395461:0,4,0,1
chr16	69395467	.	A	ACATTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:69395461_T_C:69395461:0,4,0,1
chr16	69419439	.	G	GATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr16	69458556	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.270:46:19,12:15,0:19,15,10,2
chr16	69492973	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.594:14:3,5:3,2:5,1,6,2
chr16	69493004	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.748:29:0,10:6,7:5,2,8,14
chr16	69599712	.	G	GCTCTTCCTTGCCTGGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=130,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	69687192	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:0|1:69687192_G_T:69687192:7,6,1,1
chr16	69687201	.	CT	AA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:69687192_G_T:69687192:5,4,1,1
chr16	69687204	.	T	TCTACCCTTCTTCAC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:69687192_G_T:69687192:5,4,1,1
chr16	69704122	.	C	CTG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:5,4:16,5:14,7,6,3
chr16	69704204	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,1:6,2:3,8,0,3
chr16	69711311	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	69718776	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:8,1:2,1:7,3,2,0
chr16	69718877	.	C	CTTATAATACTTTG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:10,8,0,2
chr16	69718949	.	T	TTTTTATATATATATATA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:69718949_T_TTTTTATATATATATATA:69718949:0,6,0,2
chr16	69718953	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:69718949_T_TTTTTATATATATATATA:69718949:0,6,0,2
chr16	69718955	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:69718949_T_TTTTTATATATATATATA:69718949:0,6,0,2
chr16	69727544	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:4,1:8,1:10,2,0,2
chr16	69747007	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=95,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:14,5:11,0:10,15,0,5
chr16	69752022	.	A	AAGTCCCCAAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:6,2,1,1
chr16	69752464	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	69778839	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,114;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,2:12,2:10,13,1,3
chr16	69786092	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:2,2:9,1:6,6,3,0
chr16	69873992	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:5,2,3,1
chr16	69942608	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr16	69951847	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr16	69951848	.	C	CTCTCCACTTATGGGAGGAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr16	69951867	.	T	TCAGCCTCCCAAATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:69951867_T_TCAGCCTCCCAAATA:69951867:0,2,0,1
chr16	69951871	.	TA	GG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69951867_T_TCAGCCTCCCAAATA:69951867:0,2,0,1
chr16	69959223	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	69963524	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr16	69963932	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr16	69965024	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr16	69965396	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:2,1:6,2:7,3,2,1
chr16	69965509	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=126,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:69965509_T_A:69965509:8,11,1,1
chr16	69965515	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:69965509_T_A:69965509:6,9,1,1
chr16	69965518	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=138,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:69965509_T_A:69965509:6,11,1,1
chr16	69965520	.	C	CTTACAAAAGGCTGGA	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=134,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:69965509_T_A:69965509:5,11,1,1
chr16	69965592	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	69966885	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,5:16,0:6,19,5,0
chr16	69967093	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr16	69967897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=244,153;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,3,3
chr16	69970149	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=347,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr16	69973049	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr16	69973655	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	70161159	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,157;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr16	70161263	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=92,154;MMQ=57,39;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:9,2:16,1:14,11,3,0
chr16	70164248	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=199,174;MMQ=27,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:1,0,4,0
chr16	70166225	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:12,2:14,1:2,24,0,3
chr16	70170004	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=298,214;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:0,0:3,0,1,0
chr16	70170016	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=298,191;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.441:5:0,2:1,0:3,0,1,1
chr16	70172773	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=118,113;MMQ=52,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.256:35:9,3:16,4:17,9,5,4
chr16	70176321	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:3,0:1,5:3,2,3,4
chr16	70176451	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,195;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:4,3,1,3
chr16	70177648	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,204;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr16	70182489	.	ACTTCCCTTCC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CTTCC;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.339:10:3,2:3,1:0,7,0,3
chr16	70187270	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.374:38:11,7:13,7:15,9,8,6
chr16	70187550	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=175,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr16	70190401	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:0,4:7,3:2,5,5,3
chr16	70208912	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=139,19;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr16	70286550	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	70287177	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=391,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.894:17:1,8:0,7:0,1,8,8
chr16	70296220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr16	70299003	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=100,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:9,0:9,2:0|1:70299003_C_T:70299003:5,13,1,1
chr16	70299023	.	A	ACCTTTGTCCATTGTCCACTGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=106,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:70299003_C_T:70299003:4,14,1,1
chr16	70302248	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:2,1:8,2:4,6,1,2
chr16	70303580	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr16	70303599	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=106,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:10,4:13,0:8,15,5,0
chr16	70304215	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,7:2,5:1,1,6,6
chr16	70311049	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:4,0:11,5,1,1
chr16	70333312	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr16	70363125	.	C	CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=95,112;MMQ=50,45;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,24;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:1,0:1,1:1,1,1,2
chr16	70400857	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr16	70417191	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	70500685	.	G	GGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=63,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:70500685_G_GGA:70500685:2,2,1,1
chr16	70500687	.	C	CCGGTGTCAAAGACGACGGTGAAAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=63,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:70500685_G_GGA:70500685:2,2,1,1
chr16	70514828	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	70530359	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr16	70530380	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:70530380_C_T:70530380:0,2,1,0
chr16	70530384	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:70530380_C_T:70530380:0,2,1,0
chr16	70531754	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	70543924	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=81,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:0|1:70543924_C_T:70543924:10,9,1,1
chr16	70543929	.	A	AAATCCCTGACAATGC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=81,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:70543924_C_T:70543924:10,9,1,1
chr16	70543975	.	C	CACGCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr16	70546234	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=286,96;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.921:23:0,11:1,11:0|1:70546234_G_A:70546234:1,0,9,13
chr16	70546244	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:70546234_G_A:70546234:5,10,1,1
chr16	70551490	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,239;MMQ=40,43;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.709:4:0,1:1,1:1,0,2,1
chr16	70557530	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr16	70588281	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	70595458	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	70595628	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=105,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:11,3:8,11,0,3
chr16	70597827	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:13,0:19,9:18,14,0,9
chr16	70599309	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=110,127;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.239:44:16,10:18,0:15,19,0,10
chr16	70601254	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr16	70601471	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:70601471_G_A:70601471:1,2,1,0
chr16	70601479	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:70601471_G_A:70601471:1,2,1,0
chr16	70602491	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	70680850	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr16	70693872	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=157,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.414:7:0,2:2,1:2,2,2,1
chr16	70699543	.	G	GTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	70708201	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:4,1,2,0
chr16	70710869	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=82,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,4:10,0:6,10,1,3
chr16	70711657	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.628:17:4,10:2,0:6,0,11,0
chr16	70713780	.	G	GTTGATGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70713780_G_GTTGATGAA:70713780:0,0,0,1
chr16	70713783	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70713780_G_GTTGATGAA:70713780:0,0,0,1
chr16	70713786	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70713780_G_GTTGATGAA:70713780:0,0,0,1
chr16	70714815	.	G	GAGACTATTACAACATACCTTCTTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.377:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr16	70714821	.	G	GCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,11;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,14;RU=C;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:0,0:2,0:2,0,0,2
chr16	70726940	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr16	70732483	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:4,1,3,1
chr16	70732761	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr16	70796515	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=95,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:3,5:8,2:0|1:70796515_G_A:70796515:5,7,2,5
chr16	70796535	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=95,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:2,3:6,1:0|1:70796515_G_A:70796515:3,5,1,3
chr16	70816893	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=261,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:7,0,1,2
chr16	70841650	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:7,6,1,1
chr16	70841666	.	G	GAAATGTGCAGCTA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:6,2:6,8,1,2
chr16	70841681	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=93,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:4,9,1,1
chr16	70863502	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,12;MFRL=166,167;MMQ=27,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:1,0:0,0:1,2,0,4
chr16	70873882	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,14;MFRL=159,160;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.719:3:1,0:0,0:1,0,2,0
chr16	70883570	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:2,2,4,1
chr16	70884524	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,21:0.668:31:2,5:8,16:0|1:70884524_C_G:70884524:3,7,6,15
chr16	70884534	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=74.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:3,5:5,14:0|1:70884524_C_G:70884524:3,7,6,13
chr16	70884647	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=78,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr16	70889147	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,6:2,5:7,1,6,5
chr16	70891778	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,6:1,10:0,2,6,11
chr16	70893911	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=103,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:3,1,4,0
chr16	70894087	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=95,84;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.217:44:21,6:11,3:12,23,5,4
chr16	70894123	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=98,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:3,8,1,4
chr16	70894752	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,0:18,2:20,12,0,2
chr16	70894880	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0|1:70894880_C_A:70894880:0,2,0,8
chr16	70894889	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.701:8:1,2:1,4:0|1:70894880_C_A:70894880:0,2,0,6
chr16	70895867	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:70895867_G_A:70895867:2,0,1,0
chr16	70895873	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:70895867_G_A:70895867:3,0,1,0
chr16	70896015	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.689:30:4,12:5,8:4,5,13,8
chr16	70896118	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,16:0.654:24:4,10:4,4:0|1:70896118_A_G:70896118:6,2,5,11
chr16	70896122	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,17:0.666:25:4,8:4,6:0|1:70896118_A_G:70896118:6,2,4,13
chr16	70896975	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=90,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:6,8:1,3:4,3,8,3
chr16	70897039	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,7:2,6:3,1,6,7
chr16	70897095	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:12,0:4,3:2,14,1,2
chr16	70900048	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:8,7:5,8:12,1,8,7
chr16	70902559	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:10,3:8,6:0|1:70902559_C_T:70902559:8,11,4,6
chr16	70902568	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:10,4:9,6:0|1:70902559_C_T:70902559:8,11,4,6
chr16	70902683	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:4,4:4,2:4,4,2,6
chr16	70905912	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,3,2
chr16	70908595	.	G	GTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr16	70908684	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=80,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:2,3:7,10:6,3,10,3
chr16	70908736	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=78,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:1,5:6,9:3,4,6,8
chr16	70913130	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr16	70913386	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=20,24;MFRL=93,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,14:5,3:5,4,6,11
chr16	70913400	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:16,0:8,2:0|1:70913400_C_T:70913400:9,16,1,1
chr16	70913421	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:0|1:70913400_C_T:70913400:9,15,1,1
chr16	70913423	.	C	CAGGCTGGAGTACAG	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:70913400_C_T:70913400:9,15,1,1
chr16	70913467	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:5,6:4,2:7,3,5,3
chr16	70913501	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=98,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:5,8:11,3:10,6,7,4
chr16	70916531	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,2:2,2:6,0,4,1
chr16	70916816	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=86,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.601:18:6,6:0,5:0|1:70916816_G_A:70916816:2,5,4,7
chr16	70916819	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=86,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:6,6:0,4:0|1:70916816_G_A:70916816:2,5,4,7
chr16	70916849	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:3,0:0,3:0,3,2,2
chr16	70916896	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	70917785	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:3,8:7,10:8,2,12,6
chr16	70917855	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.614:24:5,6:4,8:3,6,7,8
chr16	70926214	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:1,5:5,5:5,1,10,0
chr16	70926445	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,3:7,3:5,6,1,5
chr16	70926472	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr16	70928259	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,4:2,0,8,0
chr16	70928307	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:3,6:0,8:2,1,10,5
chr16	70930002	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0,5,2,5
chr16	70934817	.	CTGTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,78;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=TG;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.821:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	70935158	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,7:2,0:1,7,1,6
chr16	70935171	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=200,290;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr16	70937994	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,5:3,8:1,2,5,9
chr16	70942103	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=300,389;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70942103_G_T:70942103:1,0,1,0
chr16	70942114	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=300,389;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70942103_G_T:70942103:1,0,1,0
chr16	70942432	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	70942460	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,7,2
chr16	70942688	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=62,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,1:9,9:7,9,5,5
chr16	70952281	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=91,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:7,1:9,3:10,7,1,3
chr16	70952401	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr16	70954434	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:0,5:1,6:0|1:70954434_C_T:70954434:1,0,10,1
chr16	70954452	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=21202142,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.813:14:0,6:2,6:0|1:70954434_C_T:70954434:2,0,9,3
chr16	70954513	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,3:4,5:7,6,1,7
chr16	70954571	.	CT	TA	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:6,13:9,5:8,7,11,7
chr16	70954606	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,12:6,8:7,4,13,7
chr16	70954691	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,6:3,2:2,7,3,6
chr16	70954703	.	GGCGCTCCTTCTCCGT	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.614:16:3,7:1,3:2,4,4,6
chr16	70954774	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,4:2,2:5,1,3,4
chr16	70954809	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,4:5,4,5,3
chr16	70954915	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.979:43:0,24:0,17:0|1:70954915_G_T:70954915:0,0,24,19
chr16	70954945	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,24:0.699:34:5,15:4,8:0|1:70954915_G_T:70954915:4,6,13,11
chr16	70970096	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	70972512	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:12,1,1,1
chr16	70972620	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:14,6:4,1:15,3,1,6
chr16	70972701	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,2,4
chr16	70972709	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=169,866;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr16	70972758	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	70975565	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=73,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:5,11:2,5:4,3,7,9
chr16	70977647	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	70977695	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr16	70986480	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.435:28:10,3:6,9:10,6,4,8
chr16	70989299	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,2:2,3:2,3,3,2
chr16	70989335	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=124,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,3:1,5:1,3,5,3
chr16	70993505	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr16	70995845	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,14,8
chr16	70995975	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.276:45:19,5:14,7:17,16,6,6
chr16	70996023	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.299:38:14,7:13,4:15,12,4,7
chr16	70996115	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,6:2,1:0,2,1,6
chr16	70996127	.	TGAA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=163,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:3,0:1,5,0,2
chr16	70998603	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr16	70998808	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:11,3:3,1:5,9,2,2
chr16	70998881	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr16	71004385	.	A	AAAGGCCAGGAGGATGTTATTGCATGCAGAGAAAAGAGCATGAGTACATAGCAGGGTCCAGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,1:1,0:2,0,5,2
chr16	71004695	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,3:0,3:0,2,1,5
chr16	71007459	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr16	71007657	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr16	71007809	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,3:15,0:18,9,0,3
chr16	71008169	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=160,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,2:5,6:2,4,5,3
chr16	71008389	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,2:1,0,6,1
chr16	71008417	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=113,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:6,3,4,1
chr16	71012789	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:12,4:9,7:15,6,9,2
chr16	71015290	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:7,8:4,9:6,5,10,8
chr16	71015482	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,2:1,9:0,3,5,6
chr16	71015555	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=246,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:0,2,1,6
chr16	71019064	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:1,0,9,4
chr16	71021902	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=100,109;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:23,0:19,3:17,25,0,3
chr16	71025325	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=119,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,3:6,1:5,10,1,3
chr16	71025948	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:5,5:0,2:3,2,7,0
chr16	71026076	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:11,15:2,7:7,6,11,11
chr16	71026098	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:16,3:7,4:12,11,2,5
chr16	71052230	.	T	TAGTTGGTTGGTTGGTTA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:15,2:28,0:0|1:71052230_T_TAGTTGGTTGGTTGGTTA:71052230:22,22,1,1
chr16	71052231	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:15,2:26,0:0|1:71052230_T_TAGTTGGTTGGTTGGTTA:71052230:22,22,1,1
chr16	71054032	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:2,0:4,3:4,3,1,3
chr16	71054061	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.515:20:5,3:2,7:7,3,5,5
chr16	71054178	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=85,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.490:47:12,8:9,15:17,7,12,11
chr16	71061495	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,27:0.780:34:6,15:1,12:4,3,18,9
chr16	71065560	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,5:1,5:4,0,8,2
chr16	71065868	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr16	71065889	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:71065889_C_CT:71065889:0,2,0,2
chr16	71065891	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:71065889_C_CT:71065889:0,2,0,2
chr16	71095987	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr16	71096131	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:15,8,2,1
chr16	71096248	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:1,9,0,4
chr16	71098649	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,10:4,6:3,9,9,7
chr16	71098800	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.813:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	71098817	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	71101200	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:1,4:4,7:0,5,8,3
chr16	71101270	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,7:3,7:2,4,5,9
chr16	71103084	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr16	71103114	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr16	71103269	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=79,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,3:6,7:5,8,5,5
chr16	71103419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:3,5:0,4:1,2,3,6
chr16	71103424	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:0|1:71103424_T_A:71103424:3,5,1,1
chr16	71103427	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:71103424_T_A:71103424:3,5,1,1
chr16	71103430	.	AAAT	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:71103424_T_A:71103424:3,7,1,1
chr16	71103437	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=125,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:1,0:0|1:71103424_T_A:71103424:2,7,1,1
chr16	71113780	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,6:4,5:9,1,9,2
chr16	71122408	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,132;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr16	71127652	.	TATAAG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:2,2:3,2,4,0
chr16	71127700	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,4,3
chr16	71127850	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,2:5,6:3,5,4,4
chr16	71149536	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=94,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,3:2,7:2,1,9,2
chr16	71149782	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,2:0,3,0,4
chr16	71163452	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,4,2
chr16	71163579	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=128,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,6:3,5:6,6,8,3
chr16	71163606	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:10,7:6,9:9,7,9,7
chr16	71163808	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=110,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71163808_C_T:71163808:0,1,1,0
chr16	71163816	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71163808_C_T:71163808:0,0,1,0
chr16	71170977	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=211,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	71170981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	71186740	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:1,6,2,4
chr16	71196410	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=99,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.665:28:6,9:3,9:6,3,11,8
chr16	71220880	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	71318670	.	A	AGTTTCAGATTCTGTTGTC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:9,12,0,2
chr16	71417783	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	71418562	.	CCACA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71418562_CCACA_C:71418562:0,0,0,1
chr16	71418572	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:71418562_CCACA_C:71418562:0,0,0,4
chr16	71418598	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=75,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:5,1:7,3:4,11,2,2
chr16	71419595	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr16	71487206	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr16	71571282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr16	71603912	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr16	71604136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,2:4,2,2,0
chr16	71607384	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr16	71674405	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=91,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:4,3,2,4
chr16	71683302	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=42,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:4,3,2,0
chr16	71690425	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,160;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:3,9:2,0:5,0,0,10
chr16	71692786	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=256,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71692786_A_C:71692786:0,1,0,1
chr16	71692787	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=256,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71692786_A_C:71692786:0,1,0,1
chr16	71697701	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71697701_G_A:71697701:1,0,1,0
chr16	71697705	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71697701_G_A:71697701:1,0,1,0
chr16	71712854	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=134,74;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:2,4,0,2
chr16	71783729	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=176,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr16	71784298	.	CTAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=258,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	71808270	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=160,129;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr16	71808288	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=154,129;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr16	71808578	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71808578_C_T:71808578:0,3,0,1
chr16	71808583	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:71808578_C_T:71808578:0,3,0,1
chr16	71808587	.	TA	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71808587_TA_CC:71808587:0,3,0,1
chr16	71808589	.	A	ACAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,21;MFRL=125,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	71808591	.	G	GTCTTTTCTGGTTAGTAGGCTTTTATTACTGATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:71808587_TA_CC:71808587:0,3,0,1
chr16	71884466	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:71884466_C_T:71884466:10,6,1,1
chr16	71884472	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:71884466_C_T:71884466:9,7,1,1
chr16	71889096	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=73,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,4:2,6:1,1,7,3
chr16	71895676	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:11,13:9,0:12,9,13,0
chr16	71954650	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:5,0:9,6:6,8,0,6
chr16	71956610	.	G	GAAAGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr16	71957274	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:6,9,1,2
chr16	71976936	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr16	71987059	.	CCTAGGTTTAACTATTTACTGAGGAAGTTAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,3:0,6,0,3
chr16	71987948	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.505:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr16	72012121	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr16	72014119	.	GG	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72014119_GG_TC:72014119:0,0,0,1
chr16	72014123	.	T	TGCTGGTTTGGTCTCAGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72014119_GG_TC:72014119:0,0,0,1
chr16	72020294	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=63,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:14,5:6,4:11,9,4,5
chr16	72020323	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:11,4:4,4:9,6,2,6
chr16	72033801	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=95,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:5,4,0,2
chr16	72033922	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,279;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,0:3,4:0|1:72033922_G_T:72033922:2,6,0,5
chr16	72033926	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=118,279;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:5,0:2,5:0|1:72033922_G_T:72033922:2,5,0,5
chr16	72050885	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr16	72055260	.	C	CTTCAAAAGAGATGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72055260_C_CTTCAAAAGAGATGT:72055260:0,0,0,1
chr16	72055263	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72055260_C_CTTCAAAAGAGATGT:72055260:0,0,0,1
chr16	72057373	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=107,50;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:12,6:5,0:10,7,5,2
chr16	72094678	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=110,116;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:4,10:1,9:3,2,11,8
chr16	72108292	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,0:4,4:0|1:72108292_C_G:72108292:4,9,2,2
chr16	72108294	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,0:4,4:0|1:72108292_C_G:72108292:4,9,2,2
chr16	72108296	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=108,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,0:4,4:0|1:72108292_C_G:72108292:4,9,2,2
chr16	72108299	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=108,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,0:4,4:0|1:72108292_C_G:72108292:4,9,2,2
chr16	72124438	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,173;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr16	72131645	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=77,60;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:13,8:15,0:16,12,8,0
chr16	72132741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=205,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,2:1,0:6,1,0,2
chr16	72135142	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:4,0:9,2:0|1:72135142_T_C:72135142:0,13,1,1
chr16	72135147	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,2:0|1:72135142_T_C:72135142:0,11,1,1
chr16	72135148	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,2:0|1:72135142_T_C:72135142:0,11,1,1
chr16	72135151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,1:0|1:72135142_T_C:72135142:0,8,1,1
chr16	72137791	.	G	GCAGTGGCGTGCGCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:5,2,0,2
chr16	72139396	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,1:8,3:15,2,2,2
chr16	72139537	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:2,7,1,2
chr16	72141584	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:3,6,1,1
chr16	72157533	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,1:8,2:8,4,1,2
chr16	72184802	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	72821111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,3:10,0:5,10,0,3
chr16	72821965	.	G	GGTCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=73,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:72821965_G_GGTCA:72821965:3,1,1,1
chr16	72821968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=73,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:72821965_G_GGTCA:72821965:3,1,1,1
chr16	72822784	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:0,2:7,0:1,6,0,2
chr16	72831357	.	CTTGTTG	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TTG;STR;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.807:17:1,9:1,5:1,2,9,5
chr16	72984596	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:8,9,1,1
chr16	72991286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=234,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr16	72993708	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.719:23:0,11:6,5:1,5,11,6
chr16	72993860	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,3,3
chr16	72994134	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=214,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	73164795	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr16	73164881	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=82,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:7,4,1,1
chr16	73165038	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	74334016	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,5:2,6:5,4,6,5
chr16	74339591	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74339591_AG_A:74339591:0,3,0,1
chr16	74339593	.	AGTGATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74339591_AG_A:74339591:0,3,0,1
chr16	74339606	.	A	ACTCAGTCTCCAGCTCCCAGCAAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=87,199;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	74425732	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=128,114;MMQ=40,34;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,10:0.185:57:21,10:25,0:27,20,7,3
chr16	74425769	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=119,136;MMQ=49,49;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,7:0.079:99:37,7:47,0:0|1:74425769_C_T:74425769:43,49,5,2
chr16	74425787	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=124,125;MMQ=50,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,6:0.078:88:40,6:38,0:0|1:74425769_C_T:74425769:38,44,4,2
chr16	74425793	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=128,136;MMQ=48,37;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,6:0.084:81:36,6:33,0:0|1:74425769_C_T:74425769:33,42,3,3
chr16	74425795	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=128,136;MMQ=48,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,6:0.087:78:28,4:33,0:0|1:74425769_C_T:74425769:32,40,3,3
chr16	74443718	.	A	ACGCCTGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=163,186;MMQ=38,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:2,2,0,1
chr16	74443789	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=127,95;MMQ=50,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:8,5:8,4:7,9,3,6
chr16	74444361	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=139,178;MMQ=43,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:4,3:5,5:7,3,8,0
chr16	74444830	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=219,178;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:74444830_C_T:74444830:3,3,2,0
chr16	74444838	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=219,203;MMQ=25,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0|1:74444830_C_T:74444830:2,1,3,2
chr16	74445021	.	CGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GT;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.706:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	74447509	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=105,185;MMQ=50,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:13,9,1,1
chr16	74447514	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=110,95;MMQ=50,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,0:11,3:13,8,1,2
chr16	74451884	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,114;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,4:1,0:3,0,3,2
chr16	74493530	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:0,1:1,0:1,1,1,1
chr16	74496188	.	A	ACAACATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74496188_A_ACAACATG:74496188:0,2,0,1
chr16	74496193	.	A	ACACTTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:74496188_A_ACAACATG:74496188:0,4,0,1
chr16	74503028	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:3,1:0,9,0,2
chr16	74503860	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:5,4,2,2
chr16	74511495	.	A	AACAGATGGGATAAGTAGGATGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=473,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	74528793	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74528793_C_A:74528793:0,1,0,1
chr16	74528796	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74528793_C_A:74528793:0,1,0,1
chr16	74528798	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74528793_C_A:74528793:0,1,0,1
chr16	74530611	.	TACACACACACACACAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=155,70;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,9;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	74566090	.	AAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=152,124;MMQ=55,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr16	74660185	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr16	74662597	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	74664698	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:6,1,3,1
chr16	74666634	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	74670390	.	G	GTGATATCAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr16	74683071	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:21,0:3,3:10,14,1,2
chr16	74694731	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr16	74706349	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,5:2,2:4,4,3,4
chr16	74706385	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:2,4,3,2
chr16	74709206	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:5,1,4,1
chr16	74709233	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=20,23;MFRL=82,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,2:4,1:5,2,2,1
chr16	74709305	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:74709305_A_AG:74709305:1,5,1,1
chr16	74709307	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:74709305_A_AG:74709305:1,5,1,1
chr16	74709311	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:74709305_A_AG:74709305:1,5,1,1
chr16	74709313	.	AC	GG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=23,34;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,1:0|1:74709305_A_AG:74709305:1,5,1,1
chr16	74712905	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,0:0,9:0,0,4,5
chr16	74716759	.	A	ACTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=222,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:74716759_A_ACTTTT:74716759:0,2,0,1
chr16	74716760	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=222,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74716759_A_ACTTTT:74716759:0,2,0,1
chr16	74750405	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,5:0,0,1,9
chr16	74760292	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr16	74908238	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=106,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:13,2:0|1:74908238_G_A:74908238:10,9,1,1
chr16	74908244	.	C	CTCACAACCTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,0:15,2:0|1:74908238_G_A:74908238:10,10,1,1
chr16	74908439	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	74920075	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr16	74920352	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74920352_T_TG:74920352:0,1,0,1
chr16	74920354	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74920352_T_TG:74920352:0,1,0,1
chr16	74920374	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	74922030	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:7,6,3,0
chr16	74923747	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=184,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0|1:74923747_T_A:74923747:0,5,1,1
chr16	74923748	.	G	GCACAGCCAACTCCACA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=184,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0|1:74923747_T_A:74923747:0,5,1,1
chr16	74923751	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=184,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:1,0:0|1:74923747_T_A:74923747:0,5,1,1
chr16	74927507	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:3,1,2,0
chr16	74938052	.	A	ACTCGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74938052_A_ACTCGT:74938052:0,1,0,1
chr16	74938054	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74938052_A_ACTCGT:74938052:0,1,0,1
chr16	74943867	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.497:6:1,1:2,1:0|1:74943867_G_GT:74943867:0,3,1,2
chr16	74943890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:74943867_G_GT:74943867:0,0,0,7
chr16	74955806	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr16	74982566	.	T	TGGAGAAGGAAAGGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	74999617	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=96,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:0|1:74999617_A_C:74999617:4,2,3,2
chr16	74999625	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:0|1:74999617_A_C:74999617:5,2,3,2
chr16	75138796	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=217,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr16	75146711	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,2:3,3:3,3,3,2
chr16	75146828	.	CAGAGGGAAGCCT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=188,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:75146828_CAGAGGGAAGCCT_C:75146828:0,6,1,1
chr16	75146844	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:75146828_CAGAGGGAAGCCT_C:75146828:0,4,1,1
chr16	75148187	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0,3,0,6
chr16	75186727	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	75200595	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	75203757	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:4,0:13,2:0|1:75203757_C_T:75203757:9,9,1,1
chr16	75203777	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:0|1:75203757_C_T:75203757:7,11,1,1
chr16	75203781	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:4,0:15,2:0|1:75203757_C_T:75203757:7,12,1,1
chr16	75204246	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:75204246_T_A:75204246:1,3,0,1
chr16	75204247	.	C	CCTGCCAGCTGAGTGAGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:75204246_T_A:75204246:1,3,0,1
chr16	75204325	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	75239656	.	A	AGCTCTTGCAAGGCAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=169,129;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	75258640	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,47;MMQ=60,57;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:7,4:6,0:8,6,2,2
chr16	75263974	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,0,2
chr16	75267676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr16	75268886	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=95,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:5,4,0,2
chr16	75270721	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr16	75276295	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	75277042	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:11,2:0,0:4,8,0,2
chr16	75327916	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,9:2,5:1,1,6,8
chr16	75338855	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=215,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	75339131	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	75445675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=202,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:3,6:0,0:3,0,6,0
chr16	75445906	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	75448659	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:75448659_A_G:75448659:0,0,0,4
chr16	75448680	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:75448659_A_G:75448659:0,2,0,1
chr16	75448693	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:75448659_A_G:75448659:0,1,0,1
chr16	75481497	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:8,4,0,4
chr16	75564668	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,3:5,5:5,8,3,5
chr16	75565239	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=75,159;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:3,0:3,1:1,9,2,1
chr16	75565284	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=34,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.477:34:7,5:9,11:4,14,3,13
chr16	75565420	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=39,25;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,4:4,1:1,14,3,2
chr16	75565595	.	T	TAAGTAAACTACAAGAGGCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75565595_T_TAAGTAAACTACAAGAGGCCAG:75565595:0,1,0,1
chr16	75565599	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75565595_T_TAAGTAAACTACAAGAGGCCAG:75565595:0,1,0,1
chr16	75573884	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=122,100;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,1:7,4:7,7,1,4
chr16	75575446	.	G	GCACTCAGATTGATTCCATTCCATCCCATTCCATTCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	75576391	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,220;MMQ=48,33;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	75579233	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=89,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:9,3:11,2:9,11,4,1
chr16	75600365	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:5,3:9,1:5,9,1,3
chr16	75642772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,4:3,4:2,1,4,4
chr16	75652661	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	75663539	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=258,155;MMQ=40,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	75665005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr16	75665019	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr16	75665494	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,3:10,2:10,6,3,2
chr16	75674151	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,0:5,4:12,5,1,3
chr16	75674252	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,29;MFRL=146,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:0,2:0,4,0,2
chr16	75675640	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:2,10,0,2
chr16	75681420	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=195,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:2,1,5,3
chr16	75681699	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr16	76311602	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr16	76350438	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr16	76389373	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=93,176;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,0:2,8:4,2,0,8
chr16	76461273	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr16	76461519	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr16	76461588	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	76482691	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=112,134;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.469:22:2,10:7,0:4,8,10,0
chr16	76482719	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=93,134;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:6,10:9,0:6,10,10,0
chr16	76495842	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,3:1,7:2,2,4,6
chr16	76496025	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	76523631	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=78,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:76523631_T_A:76523631:7,9,1,1
chr16	76523636	.	A	AGG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=106,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:5,2:0|1:76523631_T_A:76523631:6,10,1,1
chr16	76523637	.	A	AAACT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=72,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:76523631_T_A:76523631:6,8,1,1
chr16	76523640	.	C	CTCAACATGG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=72,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:76523631_T_A:76523631:6,8,1,1
chr16	76523792	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr16	76528976	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=95,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:3,4,2,5
chr16	76555005	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=219,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0|1:76555005_AT_A:76555005:1,0,4,0
chr16	76555015	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=219,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.802:5:1,3:0,1:0|1:76555005_AT_A:76555005:1,0,4,0
chr16	76587647	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	76592313	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	77232001	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:6,3:6,6,2,1
chr16	77232220	.	A	AGCGTGAGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=132,301;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:77232220_A_AGCGTGAGC:77232220:1,3,0,1
chr16	77232223	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=132,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:77232220_A_AGCGTGAGC:77232220:1,3,0,1
chr16	77232224	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=132,301;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:77232220_A_AGCGTGAGC:77232220:1,3,0,1
chr16	77242035	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr16	77242284	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr16	77242497	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr16	77242513	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	77242520	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=175,375;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77242520_G_T:77242520:0,4,0,1
chr16	77242524	.	A	ACTTTTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=175,375;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77242520_G_T:77242520:0,4,0,1
chr16	77245199	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,2:10,1:4,8,2,1
chr16	77245971	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,6:4,6:5,1,10,2
chr16	77246436	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	77246847	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	77317756	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=24395945,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:0,3:1,3:2,0,6,0
chr16	77318026	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=137,79;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:77318026_T_TG:77318026:0,1,1,1
chr16	77318040	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=137,79;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:77318026_T_TG:77318026:0,1,1,1
chr16	77318043	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=137,79;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:77318026_T_TG:77318026:0,1,1,1
chr16	77318057	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=168,79;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77318026_T_TG:77318026:0,2,0,1
chr16	77318060	.	TA	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=168,79;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:77318026_T_TG:77318026:0,2,0,1
chr16	77325071	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr16	77325325	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,15:0,5:0,0,4,17
chr16	77327226	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	77387727	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:3,0:6,2:0|1:77387727_T_C:77387727:6,5,1,1
chr16	77387733	.	T	TCTTAGTCTTTTGTTACAAATCAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:0|1:77387727_T_C:77387727:6,5,1,1
chr16	77393207	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr16	77395948	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	77398081	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.891:15:0,10:1,4:1,0,7,7
chr16	77401684	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	77465272	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:6,5,2,1
chr16	77756613	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	77769647	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr16	77775917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr16	77910418	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr16	77913219	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:2,7,0,5
chr16	78062157	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78062157_G_GCC:78062157:0,1,0,1
chr16	78062159	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:78062157_G_GCC:78062157:0,1,0,1
chr16	78062190	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	78064733	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,0:5,3:5,5,2,1
chr16	78133857	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:7,10,0,2
chr16	78148794	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr16	78198137	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:78198137_G_A:78198137:6,4,1,1
chr16	78198140	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:78198137_G_A:78198137:6,4,1,1
chr16	78198192	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr16	79245465	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	79628536	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	79633805	.	TGCC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr16	80574886	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,14,9
chr16	80577098	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	80641906	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	80641931	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:80641931_T_C:80641931:0,0,2,0
chr16	80641936	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:80641931_T_C:80641931:0,0,2,0
chr16	80654633	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chr16	80666886	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr16	80718879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:80718879_A_G:80718879:3,0,1,2
chr16	80718891	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.300:8:0,1:6,1:1|0:80718879_A_G:80718879:3,3,1,1
chr16	81015560	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	81047856	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=143,72;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:81047856_G_T:81047856:1,4,1,1
chr16	81047861	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=23,31;MFRL=143,72;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:81047856_G_T:81047856:1,4,1,1
chr16	81047863	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=24,27;MFRL=143,72;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:81047856_G_T:81047856:1,4,1,1
chr16	81047865	.	G	A,GTGCAGC	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=31,21,30;MFRL=135,72,143;MMQ=60,50,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.90,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,1:2,1,0:0,3,1,2
chr16	81047870	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:81047870_C_T:81047870:0,4,0,1
chr16	81047871	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=135,143;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:81047856_G_T:81047856:0,3,0,1
chr16	81047873	.	TC	AG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=26,21;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:81047870_C_T:81047870:0,3,0,1
chr16	81047878	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=26,31;MFRL=135,143;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:81047856_G_T:81047856:0,3,0,1
chr16	81047897	.	T	TGGCAC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,29;MFRL=205,137;MMQ=57,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	81050965	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,4:0,0,8,5
chr16	81051327	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr16	81053682	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.687:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr16	81058354	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:6,1:4,3:2,8,2,2
chr16	81062151	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:81062151_CTT_C:81062151:0,0,8,1
chr16	81062157	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0|1:81062151_CTT_C:81062151:0,0,10,1
chr16	81062171	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0|1:81062151_CTT_C:81062151:0,0,11,9
chr16	81076967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,133;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,0:5,2:5,5,0,2
chr16	81094760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr16	81095203	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=78,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:7,2:12,0:11,9,1,1
chr16	81118289	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr16	81121145	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr16	81145675	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	81145737	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	81155238	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr16	81164274	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	81164343	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	81167342	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	81173030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	81175161	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	81180829	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr16	81180897	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.663:19:0,7:6,4:3,3,7,6
chr16	81181066	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=78,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr16	81181180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=91,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	81181869	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,3:1,6:2,1,4,6
chr16	81181983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	81183266	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr16	81185484	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=105,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:16,7,0,3
chr16	81190413	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr16	81190598	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=47,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,5,2
chr16	81190601	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr16	81190613	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=65,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr16	81197117	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	81197369	.	CC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=206,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	81198441	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=121,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	81199429	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=28,26;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,6,1
chr16	81199520	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	81199538	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=23,28;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0|1:81199538_T_C:81199538:1,3,0,3
chr16	81199544	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:81199538_T_C:81199538:0,3,0,3
chr16	81199554	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:81199538_T_C:81199538:0,3,0,3
chr16	81199569	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:81199569_CT_TA:81199569:0,4,0,1
chr16	81199572	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr16	81199573	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:81199569_CT_TA:81199569:0,4,0,1
chr16	81199574	.	A	AGTAGAGCATGTGGGG	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:81199569_CT_TA:81199569:0,4,0,1
chr16	81201507	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:1,0,1,1
chr16	81204720	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,9:7,7:4,6,13,3
chr16	81219329	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr16	81219396	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	81222672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	81224234	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr16	81232505	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:10,10,2,1
chr16	81232747	.	G	GGGTCAAGTAATCCCCCCAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	81241243	.	G	GGGATCTTCACAAGACATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=96,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr16	81241249	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=209,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr16	81241318	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,22;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr16	81242194	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:81242194_T_C:81242194:0,0,3,5
chr16	81242198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0|1:81242194_T_C:81242194:1,1,2,4
chr16	81254026	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:81254026_A_ACT:81254026:0,4,0,1
chr16	81254028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:81254026_A_ACT:81254026:0,4,0,1
chr16	81254037	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:81254026_A_ACT:81254026:0,4,0,1
chr16	81254043	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:81254043_C_A:81254043:0,3,0,1
chr16	81254052	.	G	A,C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,26,33;MFRL=0,155,100;MMQ=60,60,60;MPOS=12,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.34,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,1,0:0,3,1:0,0,0,5
chr16	81254053	.	T	TACACAACACAGCCAC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:81254043_C_A:81254043:0,4,0,1
chr16	81293500	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81293500_T_TTGTC:81293500:0,1,0,1
chr16	81293502	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81293500_T_TTGTC:81293500:0,1,0,1
chr16	81293504	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81293500_T_TTGTC:81293500:0,1,0,1
chr16	81320830	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr16	81397394	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:12,6:21,0:21,12,6,0
chr16	81397508	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:9,0:10,11:6,13,0,11
chr16	81398520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=79,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,4,1
chr16	81411282	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr16	81528953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr16	81654545	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:8,4,2,1
chr16	81685923	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,1:0|1:81685923_C_T:81685923:9,11,2,0
chr16	81685930	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:10,0:12,4:0|1:81685923_C_T:81685923:10,12,2,2
chr16	81726666	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.276:18:3,3:10,0:11,2,5,0
chr16	81726863	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr16	81730372	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:81730372_G_GT:81730372:0,0,0,1
chr16	81730373	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:81730372_G_GT:81730372:0,0,0,1
chr16	81736324	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=83,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.242:47:11,7:25,4:10,26,1,10
chr16	81737751	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:81737751_TCC_T:81737751:0,1,0,1
chr16	81737756	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:81737751_TCC_T:81737751:0,1,0,1
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chr16	81892043	.	GAAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr16	81914583	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=88,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:12,7:6,2:7,11,3,6
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chr16	81929426	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,3:10,6,1,2
chr16	81939150	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr16	81941319	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr16	81941352	.	A	ACAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=134,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0|1:81941352_A_ACAT:81941352:0,5,1,1
chr16	81941355	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:81941352_A_ACAT:81941352:0,5,1,1
chr16	81941357	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=134,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:81941352_A_ACAT:81941352:0,5,1,1
chr16	81953081	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,8,10
chr16	81962071	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	81971547	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr16	81973474	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr16	81973580	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:7,3,0,2
chr16	81990505	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr16	82101843	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=96,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,6:11,0:10,11,5,1
chr16	82131578	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	82182832	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	82182866	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	82184973	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,5:0,6:3,1,9,2
chr16	82203768	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:2,3,3,3
chr16	82203801	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr16	82660815	.	G	GTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:82660815_G_GTC:82660815:1,2,0,1
chr16	82660816	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:82660815_G_GTC:82660815:1,2,0,1
chr16	82660822	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:82660815_G_GTC:82660815:0,1,0,1
chr16	82660825	.	TC	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0|1:82660815_G_GTC:82660815:1,0,0,1
chr16	83159154	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr16	83520078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	83816828	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr16	83828540	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:1,2:3,1:4,1,3,0
chr16	83828683	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,0:1,2:0,4,0,2
chr16	83841784	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=128,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr16	83843067	.	CTTTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=142,141;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.365:6:2,0:0,0:1,3,0,2
chr16	83948801	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=156,156;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:7,0:1,10,4,0
chr16	83983071	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:5,2:4,7:5,4,7,2
chr16	83992785	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	83993082	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr16	83994379	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83994379_C_T:83994379:0,1,0,1
chr16	83994383	.	G	GACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83994379_C_T:83994379:0,1,0,1
chr16	83994384	.	G	GACTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83994379_C_T:83994379:0,1,0,1
chr16	83994548	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:3,1:2,2,2,2
chr16	83994569	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:3,2,2,2
chr16	83998662	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr16	83999000	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr16	83999033	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	84027847	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr16	84031979	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	84035531	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:4,3,0,2
chr16	84035838	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:0|1:84035838_G_A:84035838:3,1,2,0
chr16	84035844	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0|1:84035838_G_A:84035838:3,0,2,1
chr16	84036011	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=71,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr16	84046499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	84075563	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=90,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:0,7:8,1:3,5,6,2
chr16	84088236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=87,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:3,6,0,2
chr16	84093062	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=201,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr16	84094450	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:4,3:1,1:3,2,3,1
chr16	84100281	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:84100281_T_A:84100281:0,0,0,1
chr16	84100284	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=214,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:84100281_T_A:84100281:0,1,0,1
chr16	84100287	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=214,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84100281_T_A:84100281:0,1,0,1
chr16	84101240	.	C	CACATTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,7:2,2:2,4,6,4
chr16	84101875	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	84104478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr16	84121078	.	CAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,1:0,2:1,2,0,3
chr16	84132628	.	G	GAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr16	84158248	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,18,5
chr16	84183964	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,5:1,3:1,4,3,5
chr16	84188213	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=79,54;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:84188213_C_T:84188213:6,8,1,1
chr16	84188232	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:10,2:0|1:84188213_C_T:84188213:7,7,1,1
chr16	84188235	.	CT	TG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=89,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:10,2:0|1:84188213_C_T:84188213:7,8,1,1
chr16	84188241	.	AGC	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=88,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:11,2:0|1:84188213_C_T:84188213:7,10,1,1
chr16	84188245	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=87,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:2,0:11,2:0|1:84188213_C_T:84188213:7,7,1,1
chr16	84208335	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,5:2,4,3,8
chr16	84208360	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,0:6,5:7,5,0,5
chr16	84208442	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:84208442_T_C:84208442:0,5,0,2
chr16	84208446	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:84208442_T_C:84208442:0,4,0,2
chr16	84213368	.	G	GTATTGATA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:3,2,1,1
chr16	84213652	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,6:1,4:0,1,2,9
chr16	84213748	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr16	84213965	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr16	84215133	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,6:2,1:4,4,2,5
chr16	84215314	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:2,4,1,4
chr16	84215520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=74,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr16	84216093	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:84216093_G_C:84216093:0,3,0,1
chr16	84216094	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:84216093_G_C:84216093:0,3,0,1
chr16	84216097	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:84216093_G_C:84216093:0,3,0,1
chr16	84217062	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr16	84217214	.	TAGCAGGGAGAGGAAGGTCTCAGGAGCGGG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:0,2:8,5,1,1
chr16	84224805	.	G	C,T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29,20;MFRL=0,114,71;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.34,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,3:0.584,0.332:9:0,4,3:0,2,0:0,0,4,5
chr16	84224967	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	84225327	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr16	84228092	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr16	84228199	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=43,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:1,3:1,2:0,2,3,3
chr16	84228237	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr16	84228518	.	C	CTCACCACGTGCTCACCCAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr16	84228612	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr16	84230376	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=131,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr16	84230624	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=148,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr16	84255735	.	CACCAGGTGGTCTATGCGGGGTACCCTTGAGTGTGTTTCAGGCAGGGTGATGGGTTGAGGTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:0,2:5,5,1,1
chr16	84255743	.	GGTCTATGCGGGGTACCCTTGAGTGTGTTTCAGGCAGGGTGATGGGTTGAGGTTACCATGTA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:0,0:5,6,1,1
chr16	84328752	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,4,7
chr16	84328756	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,2:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,4,7
chr16	84358103	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr16	84358121	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr16	84360533	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=59,65;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:1,10:3,2:3,1,7,5
chr16	84441989	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,8:2,2:2,2,6,4
chr16	84444113	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,6:3,7:3,1,8,5
chr16	84444124	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:84444124_C_T:84444124:9,8,2,0
chr16	84444128	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:84444124_C_T:84444124:9,8,2,0
chr16	84444320	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:6,6,0,2
chr16	84444349	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr16	84456705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr16	84472972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,5:3,1:2,1,4,2
chr16	84473004	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,1:5,1:10,3,2,0
chr16	84473137	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr16	84473175	.	A	AGCCACTACCAATTGATCAGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=217,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:84473175_A_AGCCACTACCAATTGATCAGAGTT:84473175:0,1,0,1
chr16	84473178	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=217,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:84473175_A_AGCCACTACCAATTGATCAGAGTT:84473175:0,1,0,1
chr16	84473195	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	84474614	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=95,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:7,1:0,1:2,5,1,1
chr16	84476200	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:5,4:4,4,2,3
chr16	84485446	.	AAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,1:0,2:2,0,3,0
chr16	84485573	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,5:0,13:0,0,7,11
chr16	84485749	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	84486867	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,5:0,1,9,3
chr16	84486903	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=73,149;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,6:7,3:5,7,5,4
chr16	84492683	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr16	84493080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr16	84493092	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr16	84494168	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=202,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	84494251	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=113,62;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:3,3:12,0:9,8,4,0
chr16	84494275	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=125,76;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,4:5,6:3,5,5,5
chr16	84494315	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:1,2:3,2:2,3,2,4
chr16	84494450	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr16	84495509	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:9,2:0,0:6,3,2,0
chr16	84495761	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=254,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr16	84497186	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=99,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:10,4:2,1:7,6,4,1
chr16	84513463	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr16	84514341	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,1,1
chr16	84520537	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,10:0,0,7,15
chr16	84531444	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	84531665	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:8,2:10,7:9,11,1,8
chr16	84531780	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	84690467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=106,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chr16	84792291	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr16	84792428	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr16	84797637	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,16,8
chr16	84797946	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=193,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:84797946_G_A:84797946:1,1,0,1
chr16	84797956	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=239,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:84797946_G_A:84797946:0,1,0,1
chr16	84797967	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	84806310	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=41,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,1:1,2,0,4
chr16	84872013	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	84872051	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	84879324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=238,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	84882911	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=216,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr16	84882974	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr16	84884072	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	84884116	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr16	84884334	.	G	GAGATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr16	84900472	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=230,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	84902464	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:3,4,2,1
chr16	84906738	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:6,2:2,8,1,1
chr16	85009970	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr16	85010073	.	CAT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:0|1:85010073_CAT_C:85010073:10,7,1,1
chr16	85010076	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:9,0:0|1:85010073_CAT_C:85010073:10,7,1,1
chr16	85011480	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,3:0,11:0,0,12,4
chr16	85011576	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=103,158;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:16,5:12,0:13,15,5,0
chr16	85011622	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,11,10
chr16	85023855	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	85105296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=293,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr16	85105348	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr16	85105472	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=100,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:13,0:21,3:13,22,0,3
chr16	85105554	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr16	85106500	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=78,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,4,3
chr16	85111305	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:1,6:0,1:0,2,0,7
chr16	85112002	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:2,4,2,6
chr16	85112097	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=191,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:0,5:2,1:0,3,3,3
chr16	85112689	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	85120609	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr16	85122042	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85122042_A_G:85122042:0,2,0,1
chr16	85122048	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85122042_A_G:85122042:0,2,0,1
chr16	85122049	.	C	CAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85122042_A_G:85122042:0,2,0,1
chr16	85122050	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85122042_A_G:85122042:0,2,0,1
chr16	85141556	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr16	85141789	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	85143950	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:8,3,2,0
chr16	85145977	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,3,2
chr16	85146039	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	85667548	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,0:12,4:17,9,1,3
chr16	85689376	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,9;MFRL=86,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:1,0:6,0:0|1:85689376_A_AC:85689376:1,7,3,0
chr16	85689382	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,18;MFRL=114,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.355:12:1,2:7,0:0|1:85689376_A_AC:85689376:0,8,4,0
chr16	85689387	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,0:7,2:0|1:85689376_A_AC:85689376:1,10,3,0
chr16	85689392	.	CGG	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=101,98;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:3,1:8,1:0|1:85689376_A_AC:85689376:1,11,2,0
chr16	85689396	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=101,98;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,0:0|1:85689376_A_AC:85689376:0,10,2,0
chr16	85690028	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:12,3:10,0:14,9,1,3
chr16	85690878	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,6:1,4:1,1,5,5
chr16	85701887	.	GC	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,1:16,2:8,17,0,3
chr16	85706047	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=153,89;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:4,16:4,2:4,4,7,11
chr16	85721019	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:0,0:2,0:0|1:85721019_A_C:85721019:3,1,1,0
chr16	85721025	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,0:2,0:0|1:85721019_A_C:85721019:3,1,1,0
chr16	85721031	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:85721019_A_C:85721019:2,2,1,0
chr16	85722355	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	85743732	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr16	85775175	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr16	85813963	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr16	85814899	.	T	TAGTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr16	85814995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	85838503	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	85838532	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr16	85838653	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr16	85838804	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	85839543	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	85840510	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,152;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,0:7,3:2,6,0,3
chr16	85936807	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,0:3,6:2,3,0,6
chr16	85945076	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr16	85952097	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr16	85952183	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr16	85953682	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr16	85953845	.	C	CTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.898:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr16	85953909	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr16	86544210	.	ACGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CGG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr16	86575916	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=257,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	86585905	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:2,2,0,3
chr16	86588655	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=132,315;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86588655_G_C:86588655:1,0,0,1
chr16	86588660	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=132,315;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86588655_G_C:86588655:1,0,0,1
chr16	86588663	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=132,315;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86588655_G_C:86588655:1,0,0,1
chr16	86588665	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=132,315;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86588655_G_C:86588655:1,0,0,1
chr16	86603225	.	GAA	G,GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24,25;MFRL=88,154,233;MMQ=60,60,60;MPOS=25,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.31,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.298:7:0,0,1:3,1,0:2,1,2,2
chr16	86613576	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=188,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr16	87369864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=82,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr16	87376623	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	87436720	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr16	87436764	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr16	87445452	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:7,10,2,0
chr16	87452546	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr16	87493685	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=105,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,2:5,0:5,10,2,0
chr16	87493711	.	G	GTCT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=97,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:87493711_G_GTCT:87493711:7,8,0,2
chr16	87493713	.	C	CCTTTTATTTGAATTCCCGCTTCCAACGAAATCCTCCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=97,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:7,0:0|1:87493711_G_GTCT:87493711:7,8,0,2
chr16	87677791	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr16	87678544	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=197,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr16	87742092	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=563,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:0,1,2,9
chr16	87743223	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:87743223_G_A:87743223:4,4,1,1
chr16	87743231	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:6,0:0|1:87743223_G_A:87743223:5,5,1,1
chr16	87748198	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr16	87764079	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr16	87764267	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr16	87874160	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=113,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr16	87903078	.	A	ACG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	87925534	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:4,5:4,3:3,6,2,6
chr16	88008712	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:1,4:2,3,7,3
chr16	88008729	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:9,2:5,2:8,6,2,2
chr16	88012150	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,3,2
chr16	88060989	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr16	88066655	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:88066655_A_G:88066655:0,0,5,1
chr16	88066659	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:88066655_A_G:88066655:0,0,5,2
chr16	88105916	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	88493965	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=246,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88493965_C_A:88493965:0,1,0,1
chr16	88493970	.	C	CTCTATCCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=246,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88493965_C_A:88493965:0,1,0,1
chr16	88494250	.	C	CACCTCCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:88494250_C_CACCTCCT:88494250:0,2,0,1
chr16	88494252	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=191,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:88494250_C_CACCTCCT:88494250:1,2,0,1
chr16	88494254	.	A	AGGGCCGTTGCACAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=191,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:88494250_C_CACCTCCT:88494250:1,2,0,1
chr16	88494281	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr16	88494947	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr16	88494976	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr16	88495407	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	88495438	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=203,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr16	88496008	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr16	88498297	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,8,5
chr16	88498638	.	A	ATCAGGAAAATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=205,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88498638_A_ATCAGGAAAATG:88498638:1,0,0,1
chr16	88498641	.	T	TAGGCAGCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=205,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88498638_A_ATCAGGAAAATG:88498638:1,0,0,1
chr16	88498651	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	88498727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=211,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:88498727_C_T:88498727:1,0,0,1
chr16	88498748	.	G	GACTTCTCCCCTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:88498727_C_T:88498727:3,1,0,1
chr16	88499539	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr16	88500202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=96,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:10,3,2,0
chr16	88501690	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:88501690_CA_C:88501690:3,2,1,1
chr16	88501693	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:88501690_CA_C:88501690:3,2,1,1
chr16	88503291	.	CG	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:88503291_CG_GC:88503291:1,0,0,1
chr16	88503296	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:88503291_CG_GC:88503291:1,0,0,1
chr16	88503301	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88503291_CG_GC:88503291:0,0,0,1
chr16	88504850	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:0,1:4,1:2,3,2,0
chr16	88504906	.	C	CCATACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=219,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr16	88505118	.	GCAGCCAGCCCCAGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr16	88555449	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,10;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:88555449_A_C:88555449:0,2,2,0
chr16	88555455	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:0,1:0|1:88555449_A_C:88555449:1,2,2,0
chr16	88555458	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:88555449_A_C:88555449:1,2,2,0
chr16	88555460	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,11;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:88555449_A_C:88555449:1,2,2,0
chr16	88555463	.	C	CCTCAGATAGGGGGATGAAGGA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:3,1,0,1
chr16	88555464	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,12;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:88555449_A_C:88555449:1,2,2,0
chr16	88555470	.	C	CCCAA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:88555449_A_C:88555449:1,2,2,0
chr16	88555472	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,1:0|1:88555449_A_C:88555449:1,3,2,0
chr16	88593210	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr16	88594387	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	88598415	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:10,4,1,1
chr16	88598997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:6,0:0|1:88598997_C_T:88598997:11,1,2,0
chr16	88599005	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=131,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0|1:88598997_C_T:88598997:10,1,2,0
chr16	88599023	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:10,7,0,2
chr16	88599430	.	G	GAAAATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=104,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88599430_G_GAAAATAT:88599430:0,1,0,1
chr16	88599431	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=104,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88599430_G_GAAAATAT:88599430:0,1,0,1
chr16	88620148	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,3:0,3:1,1,3,3
chr16	88620195	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.707:22:5,9:1,6:5,1,7,9
chr16	88633052	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=87,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:2,3,6,3
chr16	88643457	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	88665008	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=85,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:2,3,2,4
chr16	88688547	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,4:1,5:2,0,8,1
chr16	88688848	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	88691663	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:5,6,1,1
chr16	88695332	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr16	88709712	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	88709737	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	88709828	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	88713473	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	88719877	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr16	88721012	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	88729573	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	88752693	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr16	88766168	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,8:0,0,5,12
chr16	88767861	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	88773528	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:8,1:10,7:10,9,5,3
chr16	88776297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr16	88776499	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:3,2,0,3
chr16	88777995	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,5:6,1:6,2,4,2
chr16	88778133	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=76,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:4,2,2,3
chr16	88778934	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=221,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr16	88779869	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88779869_TGG_T:88779869:0,1,0,1
chr16	88779874	.	G	GTTC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88779869_TGG_T:88779869:0,1,0,1
chr16	88779878	.	AGGAG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=186,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88779869_TGG_T:88779869:0,2,0,1
chr16	88779886	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,29;MFRL=214,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88779869_TGG_T:88779869:0,1,0,1
chr16	88779887	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=214,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:88779869_TGG_T:88779869:0,1,0,1
chr16	88779952	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	88780023	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,1,1
chr16	88780472	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	88780518	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr16	88780568	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:11,4,3,0
chr16	88780634	.	AGGTGTG	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTGTG;STR;TLOD=76.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.944:20:1,12:0,6:0,1,9,10
chr16	88780685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,2:0,0,2,6
chr16	88780923	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr16	88781030	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:3,0:8,2:0|1:88781030_C_T:88781030:6,6,1,1
chr16	88781053	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=78,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:88781030_C_T:88781030:5,7,1,1
chr16	88781419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr16	88781558	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,5:1,1:0,2,6,1
chr16	88783374	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr16	88783521	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr16	88786967	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr16	88788477	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr16	88788903	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr16	88788934	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:88788934_A_G:88788934:0,0,0,2
chr16	88788938	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:88788934_A_G:88788934:0,0,0,2
chr16	88790307	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,0:1,4:4,3,2,2
chr16	88793090	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	88793103	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr16	88793910	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,10489;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	88799752	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:88799752_G_A:88799752:1,5,1,1
chr16	88799771	.	AC	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.266:10:4,2:4,0:0|1:88799752_G_A:88799752:3,5,1,1
chr16	88800295	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=82,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr16	88801152	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:5,5,1,1
chr16	88870967	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:4,10:4,3:5,3,7,6
chr16	88872229	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,5:1,13:0,1,8,10
chr16	88874778	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	88880811	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,3:2,4:6,3,3,4
chr16	88901845	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr16	88902276	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=90,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:4,6,0,4
chr16	88907555	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=117,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:1,7,0,3
chr16	88909095	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:1,1:2,1:2,2,1,1
chr16	88923606	.	C	CAACATAGTAAGTGCGCA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:3,0:3,5,1,1
chr16	88927221	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	88931363	.	A	AGGGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAG;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr16	88931581	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:0,3,1,1
chr16	88931914	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr16	88932860	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=79,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.290:8:3,0:3,2:0|1:88932860_T_TC:88932860:1,5,1,1
chr16	88932864	.	T	TTGTTCCTCCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=80,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:88932860_T_TC:88932860:2,5,1,1
chr16	88958282	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	88958850	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr16	89167792	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,1:11,1:1,12,0,2
chr16	89168935	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	89180664	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr16	89212408	.	C	CGGCAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr16	89238142	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	89246670	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,5,2
chr16	89251776	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=216,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0|1:89251776_G_A:89251776:0,2,0,3
chr16	89251798	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:89251776_G_A:89251776:0,0,0,3
chr16	89258747	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	89259993	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:5,2,1,8
chr16	89260316	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,0:1,7:0,1,2,5
chr16	89261335	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:6,5,3,0
chr16	89287460	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=95,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:1,1,3,1
chr16	89287613	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	89291945	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.405:35:10,9:11,5:0|1:89291945_A_AT:89291945:13,8,7,7
chr16	89291948	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:9,9:11,5:0|1:89291945_A_AT:89291945:14,8,7,7
chr16	89291951	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.405:35:10,7:10,5:0|1:89291945_A_AT:89291945:13,8,7,7
chr16	89293271	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,1:6,2:0|1:89293271_A_C:89293271:8,6,2,1
chr16	89293281	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,14:0.789:17:1,7:2,6:1|0:89293271_A_C:89293271:2,1,8,6
chr16	89293525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=932,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,5:0,2:2,2,3,4
chr16	89293890	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=96,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,3:4,11:5,4,9,5
chr16	89294044	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=94,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,1:8,7:6,6,4,4
chr16	89294184	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,0,5
chr16	89294381	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:3,5,1,4
chr16	89294439	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=156,64;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.302:18:5,5:8,0:0|1:89294439_G_T:89294439:7,6,1,4
chr16	89294459	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.288:19:6,5:8,0:0|1:89294439_G_T:89294439:8,6,1,4
chr16	89294511	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,2:6,3:5,5,4,1
chr16	89345384	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:89345384_T_G:89345384:2,0,1,0
chr16	89345392	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:89345384_T_G:89345384:3,0,1,0
chr16	89345408	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:4,2:1,3:4,1,5,0
chr16	89347708	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:12,5:9,0:9,12,3,2
chr16	89352678	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	89371839	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	89574876	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=198,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr16	89577093	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=187,131;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89577093_GA_AG:89577093:0,1,0,1
chr16	89577098	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=187,131;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89577093_GA_AG:89577093:0,1,0,1
chr16	89577101	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=188,131;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:89577093_GA_AG:89577093:0,2,0,1
chr16	89590586	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=85,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:14,0:2,3:11,5,2,1
chr16	89597057	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,3,2
chr16	89597221	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:6,6:4,6,5,5
chr16	89599125	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:89599125_C_A:89599125:0,3,0,1
chr16	89599133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:89599125_C_A:89599125:0,3,0,1
chr16	89599136	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89599125_C_A:89599125:0,1,0,1
chr16	89613173	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr16	89629218	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	89644049	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:5,2:1,0:0|1:89644049_G_GA:89644049:2,4,1,1
chr16	89644051	.	G	GTTTCTTGTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,1:1,0:0|1:89644049_G_GA:89644049:2,4,1,1
chr16	89645437	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=160,146;MMQ=30,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,3:1,1:0,1,0,5
chr16	89645447	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=152,160;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:89645447_G_C:89645447:0,4,0,1
chr16	89645449	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=152,160;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:89645447_G_C:89645447:0,4,0,1
chr16	89645459	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=158,160;MMQ=60,30;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:89645447_G_C:89645447:0,3,0,1
chr16	89645480	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=168,197;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	89650371	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=353,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:1,0,2,1
chr16	89651983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,147;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr16	89652206	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=144,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr16	89653267	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,196;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:1,3,0,3
chr16	89655276	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr16	89656251	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr16	89657322	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,11;MFRL=227,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:89657322_G_C:89657322:2,0,1,0
chr16	89657329	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89657322_G_C:89657322:1,0,1,0
chr16	89657702	.	G	GAAGGACC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr16	89696988	.	G	GACTGAGTCTGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	89696999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr16	89702336	.	AGCTGCTGGATATGTTCAACAACCG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=137,34;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,0:4,2:8,5,1,1
chr16	89702460	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr16	89715983	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:89715983_G_GT:89715983:0,3,0,1
chr16	89715988	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=170,170;MMQ=52,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:89715983_G_GT:89715983:0,4,0,1
chr16	89715993	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=170,170;MMQ=52,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:89715983_G_GT:89715983:0,4,0,1
chr16	89715998	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=170,170;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:89715983_G_GT:89715983:0,4,0,1
chr16	89717965	.	C	CTGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:15,6,0,2
chr16	89720409	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:3,6:0,2:2,1,4,4
chr16	89724572	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr16	89755660	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,0:7,3:6,13,2,1
chr16	89760552	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:9,1:10,6,3,1
chr16	89760652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,0,6
chr16	89762200	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:1,2,2,0
chr16	89762265	.	T	TAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	89774375	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:13,0:2,2:0|1:89774375_C_T:89774375:6,9,1,1
chr16	89774384	.	C	CAGCTCCACGTAGCTCAGGGCACT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:11,0:2,2:0|1:89774375_C_T:89774375:4,9,1,1
chr16	89774396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:4,5:1,1:0|1:89774396_G_A:89774396:0,5,2,4
chr16	89774411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:0|1:89774396_G_A:89774396:0,5,0,4
chr16	89777724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:3,2,0,2
chr16	89777761	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:3,6,2,2
chr16	89778224	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr16	89779139	.	AGCT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=106,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCT;STR;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:2,2:2,3:2,2,1,5
chr16	89782989	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:10,1:4,2:6,8,2,1
chr16	89783187	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,6:4,1:2,6,4,3
chr16	89795797	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr16	89795813	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:0,7,0,5
chr16	89800011	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr16	89800072	.	T	TGTAGATGGTGGGAAGCTCCTCCCTGCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=210,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	89804335	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,5:0,0,10,9
chr16	89804581	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,1:2,1:2,8,1,1
chr16	89805261	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,13,3
chr16	89805977	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:1,2:4,4:1,5,0,6
chr16	89806343	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=104,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0|1:89806343_C_A:89806343:5,0,1,2
chr16	89806347	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:89806343_C_A:89806343:0,0,7,3
chr16	89807131	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,0:7,4:10,4,3,1
chr16	89809171	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=98,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr16	89809223	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,5:8,3:5,9,5,3
chr16	89813194	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.515:19:2,5:7,3:3,6,6,4
chr16	89815217	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr16	89816314	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=91,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr16	89816333	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr16	89818491	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,2:5,7:4,4,3,7
chr16	89828484	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,3:1,0:1,7,1,2
chr16	89831243	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:3,2,2,1
chr16	89831520	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr16	89831558	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	89836202	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,88;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:89836202_C_G:89836202:4,0,2,0
chr16	89836207	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=202,88;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:89836202_C_G:89836202:5,0,2,0
chr16	89836507	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,361;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	89836865	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=267,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0|1:89836865_A_G:89836865:0,1,6,0
chr16	89836872	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=267,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:89836865_A_G:89836865:0,1,5,0
chr16	89838078	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=41,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:2,5:3,6:3,2,7,5
chr16	89839854	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr16	89845110	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	89845178	.	T	TAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=189,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:6,5,4,1
chr16	89845194	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,12,7
chr16	89845287	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,4:7,0:8,4,2,2
chr16	89846195	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	89849583	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	89857924	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:2,4,1,1
chr16	89857935	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr16	89858024	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	89858505	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr16	89858525	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr16	89859008	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:89859008_G_A:89859008:0,0,1,2
chr16	89859015	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89859008_G_A:89859008:0,0,0,1
chr16	89862434	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=96,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,2:4,0:2,3,1,2
chr16	89866043	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr16	89866160	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	89869761	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr16	89874628	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr16	89877269	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr16	89920957	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,4:9,4:7,4,4,4
chr16	89920976	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:89920976_C_T:89920976:8,6,2,0
chr16	89920980	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:89920976_C_T:89920976:8,6,2,0
chr16	89921119	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:1,2:0|1:89921119_A_C:89921119:0,5,1,4
chr16	89921126	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:89921119_A_C:89921119:0,4,1,3
chr16	89921128	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:89921119_A_C:89921119:0,4,1,3
chr16	89921139	.	TGTTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=214,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,1:0|1:89921119_A_C:89921119:0,2,1,2
chr16	89924960	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=269,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89924960_GA_TC:89924960:0,1,0,1
chr16	89924964	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=269,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89924960_GA_TC:89924960:0,1,0,1
chr16	89925556	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=60,199;MMQ=42,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:2,6,4,1
chr16	89927101	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,2:4,5:2,4,5,2
chr16	89930087	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,1:3,2:3,6,0,3
chr16	89930129	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,4:1,2:2,1,2,5
chr16	89950901	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr16	89950935	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=148,327;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,0:3,7:7,3,7,0
chr16	89954138	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=78,85;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,11:4,1:6,7,4,8
chr16	89958538	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:0,1:3,3:3,0,3,1
chr16	89961593	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:89961593_A_G:89961593:1,5,0,2
chr16	89961597	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:89961593_A_G:89961593:1,5,0,2
chr16	89964952	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,5:5,8,5,6
chr16	89986608	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=94,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,6:8,2:7,5,6,2
chr16	90001229	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=137,54;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,2:7,0:11,11,2,0
chr16	90002290	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr16	90020861	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,1,5
chr16	90021685	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:2,2,1,4
chr16	90032325	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:6,8,2,0
chr16	90038133	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=112,215;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chr16	90038369	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,4:7,1:3,8,3,2
chr16	90038647	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:7,5,8,5
chr16	90038786	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,13:0,5:0,0,9,9
chr16	90075226	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=185,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,0:1,5:2,1,2,3
chr16	90093969	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr16	90095620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.355:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr16	90095949	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,2:6,3:8,4,3,2
chr16	90097979	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	90097995	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	90099061	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr16	90103659	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:0,4,3,4
chr16	90106746	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=211,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:3,4,2,0
chr16	90108832	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	90124871	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=74,127;MMQ=57,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,3:8,3:11,8,2,4
chr16	90129970	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=128,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,4,1
chr16	90141288	.	TA	T,TAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,24,25;MFRL=80,102,106;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.04,9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,7:0.231,0.334:21:2,1,2:7,4,5:4,5,5,7
chr16	90141477	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr17	6115	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,99;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,3:9,7:6,6,5,5
chr17	6157	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:3,6:13,8:9,8,6,8
chr17	11830	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,0:2,6:7,1,4,2
chr17	13905	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.269:23:5,4:12,1:6,11,4,2
chr17	65351	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	65610	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.405:17:5,2:4,3:0,10,1,6
chr17	65632	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:0,6,0,8
chr17	69317	.	C	CTTTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,23;RU=T;STR;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,2:0,0,3,2
chr17	131516	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=71,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:3,2:8,2:7,6,4,0
chr17	295585	.	TA	T,TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,26,26;MFRL=166,151,125;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.69,5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,5:0.164,0.167:32:12,3,3:10,2,2:21,1,8,2
chr17	295777	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=120,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,22:0.347:64:19,19:21,3:0|1:295777_C_T:295777:19,23,9,13
chr17	295782	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:60,3:0.061:63:34,0:20,3:1|0:295777_C_T:295777:22,38,3,0
chr17	295785	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:58,3:0.063:61:30,0:20,3:1|0:295777_C_T:295777:18,40,3,0
chr17	423051	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=98.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,32:0.895:35:1,15:2,17:2,1,18,14
chr17	440487	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.438:5:1,1:1,0:0|1:440487_A_G:440487:0,3,0,2
chr17	440493	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,16;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.518:4:0,0:0,0:0|1:440487_A_G:440487:0,2,0,2
chr17	440497	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:440487_A_G:440487:0,0,0,4
chr17	456555	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,2:5,1:7,6,1,2
chr17	463843	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr17	465993	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.672:19:2,4:4,7:0,6,1,12
chr17	489423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.369:9:1,0:4,1:0|1:489423_C_T:489423:6,0,2,1
chr17	489431	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=178,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:489423_C_T:489423:2,0,3,1
chr17	489544	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.083:44:21,0:20,3:21,20,1,2
chr17	504978	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:1,8:6,13:5,2,16,5
chr17	505129	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.350:41:14,5:12,9:13,14,5,9
chr17	505162	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:1,12:0,11:0,1,6,18
chr17	505227	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=226,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr17	559013	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr17	602469	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr17	617993	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,3:6,7:0,9,0,10
chr17	618039	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr17	636320	.	T	TCTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,6:5,4:6,1,9,1
chr17	644888	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	648498	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr17	649067	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:2,8,2,9
chr17	649935	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr17	650206	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:1,1:9,1:7,3,1,1
chr17	678941	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,5:3,0:7,1,5,0
chr17	686296	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,4:0,8:1,0,11,4
chr17	686589	.	C	CT,CTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,19,20;MFRL=125,138,132;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=15.76,10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,10,5:0.587,0.297:17:0,3,1:1,1,2:0,2,3,12
chr17	686603	.	G	GGAGAGTC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:3,2:3,17,0,2
chr17	695246	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.094:48:22,2:20,2:23,21,3,1
chr17	706862	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	708271	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:0,0:2,1,1,0
chr17	722638	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,2:8,4:13,2,5,1
chr17	729265	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:17,1:16,3:13,20,1,3
chr17	902869	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:8,12:8,8:4,12,7,13
chr17	909451	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:2,11:3,5:1,4,5,11
chr17	910636	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	912914	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:6,2:8,2:6,8,4,1
chr17	914111	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:10,2:0|1:914111_G_A:914111:6,10,1,1
chr17	914118	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:9,2:0|1:914111_G_A:914111:6,10,1,1
chr17	914123	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:9,2:0|1:914111_G_A:914111:5,8,1,1
chr17	914127	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,2:0|1:914111_G_A:914111:2,9,1,1
chr17	915108	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=97,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:4,5,4,2
chr17	916444	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:916444_G_A:916444:5,1,1,1
chr17	916446	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:916444_G_A:916444:5,1,1,1
chr17	916466	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=238,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:0,3:0,1,2,4
chr17	953456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	953741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:3,1,4,1
chr17	962041	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=81,253;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:17,4:14,0:16,16,4,0
chr17	962152	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:2,1:6,5:2,6,1,5
chr17	973180	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=76,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,0:0,2:1,2,0,2
chr17	977000	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=70,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.370:11:3,2:2,1:0|1:977000_A_C:977000:1,6,4,0
chr17	977006	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,0:2,0:0|1:977000_A_C:977000:0,6,3,0
chr17	1183696	.	T	TCGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=215,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	1257506	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,88;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:13,2:18,2:23,8,2,2
chr17	1264611	.	TAA	T,TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28,22;MFRL=115,155,181;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.50,14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,11:0.188,0.644:17:1,1,0:2,2,9:0,3,2,12
chr17	1265304	.	TA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.178:38:16,4:9,3:9,22,1,6
chr17	1326754	.	GAAAA	G,GAAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31,31;MFRL=117,142,99;MMQ=60,60,60;MPOS=25,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,13;RU=A;STR;TLOD=5.39,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,5:0.108,0.251:20:2,1,2:3,1,3:9,4,5,2
chr17	1369158	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=307,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1369158_G_A:1369158:0,1,0,1
chr17	1369160	.	TATA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=307,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1369158_G_A:1369158:0,1,0,1
chr17	1369164	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=307,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1369158_G_A:1369158:0,1,0,1
chr17	1369167	.	T	TCAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=307,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1369158_G_A:1369158:0,1,0,1
chr17	1369174	.	T	TAGAGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=307,146;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1369158_G_A:1369158:0,1,0,1
chr17	1370459	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	1371123	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,8,15
chr17	1371473	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	1371818	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	1372987	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	1373518	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=277,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,33:0.920:35:1,17:1,16:1,1,14,19
chr17	1373612	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr17	1377878	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,6:0,13:0,0,12,8
chr17	1377943	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,7,10
chr17	1378000	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:14,0:0|1:1378000_C_T:1378000:10,14,1,1
chr17	1378005	.	T	TTTGAGCCCTGGGACCCGTCAGTC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=23,17;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,0:14,1:0|1:1378000_C_T:1378000:9,14,1,1
chr17	1380917	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=95,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:3,4,1,1
chr17	1380955	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	1381521	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr17	1387686	.	T	TGCAGGTTTGTTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	1395682	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.454:40:12,7:9,11:10,12,9,9
chr17	1412455	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,5:0,0,12,4
chr17	1412530	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=100,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:22,2:12,2:19,15,1,3
chr17	1413187	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1413187_AG_CC:1413187:0,0,0,1
chr17	1413190	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1413187_AG_CC:1413187:0,0,0,1
chr17	1413193	.	AT	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1413187_AG_CC:1413187:0,0,0,1
chr17	1419853	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	1456248	.	T	TCA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=162,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=CA;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.202:17:9,0:5,3:11,3,2,1
chr17	1480088	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr17	1493999	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	1494027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr17	1494486	.	G	GAAGGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr17	1494957	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,7:0.112:65:35,0:23,6:32,26,0,7
chr17	1495028	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=172,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr17	1496416	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1496416_G_A:1496416:3,0,1,0
chr17	1496421	.	GG	AA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=150,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:2,2:4,0:0|1:1496416_G_A:1496416:5,1,1,2
chr17	1519775	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,269;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr17	1530979	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.893:24:0,9:0,12:2,0,9,13
chr17	1549979	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=289,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0|1:1549979_G_GT:1549979:2,1,1,1
chr17	1549980	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=289,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0|1:1549979_G_GT:1549979:2,1,1,1
chr17	1549984	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=289,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:1549979_G_GT:1549979:2,1,1,1
chr17	1549987	.	T	TTAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=289,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:1549979_G_GT:1549979:2,1,1,1
chr17	1549991	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=145,44;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:1549979_G_GT:1549979:1,1,1,1
chr17	1550106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr17	1551686	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,82;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:16,0:15,9:12,19,0,9
chr17	1561523	.	C	CA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:22,0:16,3:23,15,4,0
chr17	1562935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr17	1576297	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:9,1,2,0
chr17	1576369	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=96,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.468:49:19,4:7,18:15,11,12,11
chr17	1576562	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,0,4
chr17	1577690	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:3,3:1,7:2,2,8,2
chr17	1579768	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:11,1:10,5:7,14,4,2
chr17	1582205	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=72,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,6:2,3:1,2,2,7
chr17	1582706	.	TG	AA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=81,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:17,3:9,0:0|1:1582706_TG_AA:1582706:13,13,1,2
chr17	1582710	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=81,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:9,0:0|1:1582706_TG_AA:1582706:14,14,1,1
chr17	1582712	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=73,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:15,2:8,0:0|1:1582706_TG_AA:1582706:14,13,1,1
chr17	1585055	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=79,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.620:29:4,7:5,10:7,4,11,7
chr17	1585378	.	AACC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=ACC;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,0:6,3:6,10,1,3
chr17	1586906	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=104,136;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,10:0.142:75:32,0:33,10:31,34,0,10
chr17	1635632	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:15,3:12,0:17,10,1,2
chr17	1635811	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:7,4,0,2
chr17	1635883	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,0:0,0,5,4
chr17	1637074	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=192,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,15:1,11:1,0,17,12
chr17	1637088	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.149:32:15,0:10,0:0|1:1637088_C_G:1637088:18,9,0,5
chr17	1637094	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.167:29:7,1:5,1:0|1:1637088_C_G:1637088:17,7,0,5
chr17	1637098	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.236:24:7,0:8,1:0|1:1637088_C_G:1637088:15,3,0,6
chr17	1639074	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr17	1649267	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr17	1657844	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1657844_G_T:1657844:0,1,0,1
chr17	1657845	.	C	CCCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1657844_G_T:1657844:0,1,0,1
chr17	1673104	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=325,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,7:1,3:1,0,7,3
chr17	1673132	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:5,2,7,2
chr17	1674544	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=143,170;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:1,0:0,0:1,2,0,1
chr17	1675127	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	1675451	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	1678256	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr17	1679805	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr17	1684772	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,5,15
chr17	1686410	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,22:0,0,17,28
chr17	1686600	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=108,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,9:0,4:4,0,11,2
chr17	1687796	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	1690302	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:0|1:1690302_CAA_C:1690302:0,8,0,5
chr17	1690303	.	AAG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AG;STR;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr17	1690305	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.932:13:0,5:0,7:0|1:1690302_CAA_C:1690302:0,0,0,13
chr17	1715435	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,4:3,6:3,7,1,9
chr17	1747383	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	1748028	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr17	1756351	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=65,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:3,6:6,6:4,5,9,4
chr17	1756384	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:10,2:11,13,1,1
chr17	1778911	.	GTAGAA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:2,2:4,3,5,0
chr17	1780492	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:22,1:10,3:19,13,2,2
chr17	1782957	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.341:39:15,11:11,2:13,13,6,7
chr17	1792174	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,1:6,4:1,11,2,3
chr17	1841093	.	A	ACCCAGTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1841093_A_ACCCAGTGT:1841093:0,0,0,1
chr17	1841096	.	C	CATCAAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1841093_A_ACCCAGTGT:1841093:0,0,0,1
chr17	1933381	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.389:43:6,6:20,8:16,10,12,5
chr17	1945041	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr17	1945225	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=264,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	1962605	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,1:0|1:1962605_G_C:1962605:0,10,2,0
chr17	1962607	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:1962605_G_C:1962605:0,10,2,0
chr17	1962753	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=97,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:0|1:1962753_C_T:1962753:8,12,1,1
chr17	1962778	.	TC	GT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:1962753_C_T:1962753:9,9,1,1
chr17	1962781	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:1962753_C_T:1962753:9,9,1,1
chr17	1964759	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr17	1964869	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:14,0:17,4:13,18,2,2
chr17	1968983	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr17	1985050	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr17	2091600	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr17	2091765	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=111,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:17,5:14,4:17,14,2,7
chr17	2139917	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:16,2:14,0:18,14,1,1
chr17	2195933	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=86,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:3,3:3,4:2,4,0,7
chr17	2196088	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr17	2196150	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,6:6,9:6,3,11,4
chr17	2202323	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:8,11:9,12:8,9,11,12
chr17	2203348	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,19:0,0,21,14
chr17	2227952	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,202;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:5,3:16,0:11,10,3,0
chr17	2234005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=230,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	2236404	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.744:33:3,15:5,10:1,7,8,17
chr17	2238675	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.692:37:6,14:5,12:6,5,14,12
chr17	2238741	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:2,2:4,3,1,2
chr17	2239034	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=102,41;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr17	2265113	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=59,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:1,3,1,2
chr17	2266235	.	C	CTAGGCTGGAGTGGTAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=112,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.094:29:13,2:14,0:10,17,0,2
chr17	2266709	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr17	2267796	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	2268139	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr17	2268681	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=206,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	2270777	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr17	2276401	.	CTGA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.564:7:0,3:3,0:2,1,1,3
chr17	2278685	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=83,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr17	2278901	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,5:8,0:5,10,0,5
chr17	2281321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr17	2290800	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,0:13,3:0|1:2290800_G_T:2290800:15,10,1,2
chr17	2290805	.	G	GTGTGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,0:10,3:0|1:2290800_G_T:2290800:14,8,1,2
chr17	2297571	.	GCA	G,GCACACA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,20,23;MFRL=179,108,188;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=CA;STR;TLOD=7.28,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,7,16:0.203,0.464:34:4,4,2:5,2,4:4,7,9,14
chr17	2298129	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr17	2310608	.	AGCCG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:2310608_AGCCG_A:2310608:0,2,1,1
chr17	2310613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:2310608_AGCCG_A:2310608:0,2,1,1
chr17	2318695	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=216,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr17	2323953	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr17	2341350	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,5:2,8:5,2,11,2
chr17	2370987	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=161,141;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,1:9,3:12,0,4,0
chr17	2371000	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,4:0,14:0,0,16,2
chr17	2573652	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,11,13
chr17	2584923	.	TTTTTTTTTTAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:8,0,2,0
chr17	2585113	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.521:46:12,11:10,12:6,16,10,14
chr17	2595005	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,0:11,3:12,13,0,3
chr17	2595215	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=245,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr17	2595291	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr17	2597723	.	GCAGCGGGGACA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGCGGGGACA;STR;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	2598114	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:6,0:13,0:0|1:2598114_A_C:2598114:8,14,4,0
chr17	2598117	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.165:28:5,0:10,0:0|1:2598114_A_C:2598114:8,16,4,0
chr17	2598120	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.350:26:5,1:11,4:1,16,9,0
chr17	2598124	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.183:25:6,1:12,2:0|1:2598114_A_C:2598114:4,17,4,0
chr17	2598129	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.151:27:6,1:12,2:0|1:2598114_A_C:2598114:4,19,4,0
chr17	2598132	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:10,1:13,0:0|1:2598114_A_C:2598114:4,19,3,0
chr17	2598627	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,9,11
chr17	2598639	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,5:0,0,7,11
chr17	2598838	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	2599612	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr17	2604125	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.306:17:3,0:8,4:6,6,0,5
chr17	2604375	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	2607560	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	2699935	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=50,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,8:3,5:1,5,5,8
chr17	2703764	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:5,1,4,1
chr17	2866873	.	GA	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:2866873_GA_CT:2866873:0,3,0,1
chr17	2866879	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=15,34;MFRL=117,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:2866873_GA_CT:2866873:0,2,0,1
chr17	2866886	.	GT	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=233,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2866873_GA_CT:2866873:0,1,0,1
chr17	2866890	.	T	TCCTTCCTTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2866873_GA_CT:2866873:0,2,0,1
chr17	2908816	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,3:4,1:0,8,1,3
chr17	2923767	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=113.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,20,15
chr17	2929286	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,17,13
chr17	2929674	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=222,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.956:25:0,16:0,8:1,0,14,10
chr17	2930223	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:10,5:10,5:12,8,5,5
chr17	2930339	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:8,9:7,8:9,6,7,10
chr17	2930438	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr17	2935577	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:2935577_T_G:2935577:0,0,6,0
chr17	2935591	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0|1:2935577_T_G:2935577:0,0,6,0
chr17	2996105	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=118,145;MMQ=52,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:13,2:19,0:16,16,0,2
chr17	3030383	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr17	3101484	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:11,9,0,2
chr17	3119397	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,6:3,3:0,3,1,8
chr17	3181384	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:8,4,5,1
chr17	3181662	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,123;MMQ=27,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,2,4
chr17	3182309	.	GT	AG,TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26,28;MFRL=0,119,154;MMQ=60,60,53;MPOS=24,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.57,5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.640,0.272:8:0,3,1:0,3,1:0,0,1,7
chr17	3195499	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=112,164;MMQ=60,29;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,4:8,0:10,9,0,4
chr17	3195503	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=116,112;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:12,4:6,1:7,11,3,2
chr17	3195546	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=110,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,1:12,2:8,14,2,1
chr17	3195563	.	A	ATGGCTTG	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:11,2:0|1:3195563_A_ATGGCTTG:3195563:9,16,1,1
chr17	3195565	.	G	GGCC	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:12,0:10,1:0|1:3195563_A_ATGGCTTG:3195563:9,15,1,1
chr17	3195823	.	CAGCAGG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:3195823_CAGCAGG_C:3195823:0,4,1,1
chr17	3195833	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:3195823_CAGCAGG_C:3195823:0,4,1,1
chr17	3213545	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr17	3213728	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,29:0.821:35:4,15:1,14:5,1,10,19
chr17	3213862	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,5:3,8:4,4,6,7
chr17	3213911	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:1,8:7,8:5,3,8,8
chr17	3301549	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,118;MMQ=52,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:7,4:12,7:6,14,2,9
chr17	3323988	.	G	GCAGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3323988_G_GCAGTA:3323988:0,0,0,1
chr17	3323991	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3323988_G_GCAGTA:3323988:0,0,0,1
chr17	3336878	.	CTG	TAT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:16,0:20,2:0|1:3336878_CTG_TAT:3336878:19,17,1,1
chr17	3336886	.	T	TGCCCAGGCTGGCCTCGAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:19,2:0|1:3336878_CTG_TAT:3336878:19,15,1,1
chr17	3352294	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.459:44:13,11:10,9:6,18,6,14
chr17	3352455	.	C	CAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr17	3352494	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr17	3372628	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3372628_A_C:3372628:2,6,1,1
chr17	3372630	.	A	ATTCTTCCTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3372628_A_C:3372628:2,6,1,1
chr17	3417123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr17	3419689	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,5,3
chr17	3422089	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,99;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:2,10,2,0
chr17	3424183	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr17	3424310	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=101,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,4:14,0:17,13,4,0
chr17	3427442	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr17	3430146	.	ACAAGACAAAGTGGAACCAGGCATCCGAGAGGATGGACTGCAGATCCGAGGGTCTCAGCAGGAAGATGGCAATGCCCTAAGGCCAGGAAGGAAAGAAACAGTGCACCCTCTTCATGGCCCTCAGCAGGGGAGCTGAGCAGAGGGTGCTTCCCCAGGAC	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=131,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.061:52:8,1:13,3:22,25,3,2
chr17	3430271	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr17	3432367	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=171,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	3432374	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=201,273;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:3432374_CAG_C:3432374:0,1,0,1
chr17	3432378	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=201,273;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3432374_CAG_C:3432374:0,1,0,1
chr17	3432380	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=201,273;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3432374_CAG_C:3432374:0,1,0,1
chr17	3432383	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=201,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	3435872	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=291,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr17	3435935	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr17	3445901	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=280,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,9:0,7:0,1,6,11
chr17	3447914	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,6,6
chr17	3457954	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.873:14:1,4:0,7:1,0,10,3
chr17	3475018	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	3475367	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	3475405	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,7,4
chr17	3475564	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr17	3476911	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=226,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,0:0|1:3476911_A_C:3476911:5,3,2,0
chr17	3476921	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=226,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,0:3,0:0|1:3476911_A_C:3476911:5,3,2,0
chr17	3480396	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:10,2,5,2
chr17	3480948	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:13,0:12,12,2,0
chr17	3483829	.	T	TCTCTGTCACTGTCCCAACCTGTCCCCC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=178,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr17	3483894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=177,48;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:1,4,2,0
chr17	3483931	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3483931_A_C:3483931:0,0,0,1
chr17	3483934	.	C	CACGGGATCACGACCCAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3483931_A_C:3483931:0,0,0,1
chr17	3493200	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr17	3493533	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr17	3493769	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr17	3524797	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	3533412	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=202,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr17	3552038	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	3558417	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr17	3558695	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=254,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.669:10:0,4:3,3:0|1:3558695_A_G:3558695:0,3,1,6
chr17	3558698	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=175,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.286:12:5,0:3,3:1|0:3558695_A_G:3558695:1,8,0,3
chr17	3558700	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:4,2:1,8,0,2
chr17	3559823	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=101,75;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:13,4:14,5:14,13,3,6
chr17	3561396	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,10:0,0,15,13
chr17	3563339	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	3564068	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0|1:3564068_G_A:3564068:0,6,0,7
chr17	3564073	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:4,3:1,4:0|1:3564068_G_A:3564068:0,6,0,7
chr17	3564084	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0|1:3564068_G_A:3564068:0,4,0,6
chr17	3567228	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:5,4:1,5,0,4
chr17	3567461	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr17	3618298	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	3620083	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=127,149;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:4,11,0,2
chr17	3620138	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr17	3620145	.	A	AGACACACAACCACTATAAATGGCCAGCCCTGGGAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=192,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	3627473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr17	3631118	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr17	3635645	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,6:3,5:3,0,7,4
chr17	3635768	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.579:24:5,4:4,9:4,6,4,10
chr17	3638037	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr17	3638344	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=69,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr17	3646977	.	C	CTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.521:19:3,4:6,5:3,6,2,8
chr17	3646999	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=13,19;MFRL=210,139;MMQ=44,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr17	3660511	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr17	3664477	.	A	AATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr17	3665116	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	3665160	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr17	3728336	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:5,9,0,2
chr17	3743591	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=213,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:14,0:3,7:0,17,0,7
chr17	3749544	.	A	ACTTTTTGTAAATTTGGTTCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=167,26;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr17	3776815	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:3,2:0|1:3776815_G_A:3776815:3,9,1,1
chr17	3776821	.	G	GGGCCAGC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:3776815_G_A:3776815:3,9,1,1
chr17	3776867	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr17	3786802	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=73,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:2,4,1,4
chr17	3787593	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,4:4,2,6,0
chr17	3801191	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,0:14,4:12,12,0,4
chr17	3801241	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:6,1:5,0:5,7,4,0
chr17	3806664	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=111,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,1:3,5:0,3,1,5
chr17	3806794	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr17	3808497	.	AA	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr17	3808713	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	3828822	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:3828822_C_T:3828822:0,0,0,2
chr17	3828840	.	C	CAGAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=208,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3828822_C_T:3828822:0,2,0,1
chr17	3831240	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.473:15:4,4:4,3:4,4,5,2
chr17	3833740	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:10,3:3,2:2,11,0,6
chr17	3838626	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	3839685	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,5,6
chr17	3839829	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	3840632	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	3840686	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=324,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:0,5:0,7:0|1:3840686_A_C:3840686:1,0,9,3
chr17	3840694	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=324,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.890:16:1,7:0,8:0|1:3840686_A_C:3840686:1,0,10,5
chr17	3840928	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,28:0.909:30:1,8:1,20:1,1,8,20
chr17	3844671	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr17	3846675	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,6:1,11:1,0,13,6
chr17	3846891	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=362,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0|1:3846891_TG_T:3846891:0,1,0,8
chr17	3846899	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:3846891_TG_T:3846891:0,0,0,9
chr17	3854840	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	3856615	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr17	3936221	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=90,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:6,7,1,1
chr17	3936239	.	A	ACAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=81,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:6,8,1,1
chr17	3947588	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,22:0,0,21,24
chr17	3954112	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:8,6,2,0
chr17	3957561	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0|1:3957561_C_T:3957561:0,3,0,1
chr17	3957563	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:3957561_C_T:3957561:0,4,0,1
chr17	3957567	.	C	CAACAAGTCAACTGTCTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:3957561_C_T:3957561:0,4,0,1
chr17	3961489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:3,6,1,1
chr17	3985832	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr17	3989968	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,6,8
chr17	3994170	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr17	4005770	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	4007875	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr17	4012850	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=233,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	4016011	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:9,2:7,2:9,7,2,2
chr17	4027392	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	4058038	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=73,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:19,0:18,2:18,19,1,1
chr17	4071302	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	4098573	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	4098861	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr17	4100591	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr17	4100959	.	A	AAGCCTCAGGAGCCGATGCGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,171;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr17	4120464	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	4139123	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=104,73;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:18,0:9,9:10,18,1,8
chr17	4145499	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,0:8,3:11,5,2,1
chr17	4186079	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,4:12,0:17,5,4,0
chr17	4199933	.	ATCTT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr17	4337412	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:3,12:5,5:3,5,7,10
chr17	4337555	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr17	4348531	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:4348531_C_CAT:4348531:1,1,0,1
chr17	4348532	.	CCG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:4348531_C_CAT:4348531:1,1,0,1
chr17	4350340	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4350340_G_T:4350340:0,2,0,1
chr17	4350342	.	CG	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4350340_G_T:4350340:0,2,0,1
chr17	4351396	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr17	4351640	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr17	4352539	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr17	4352624	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,4:9,0:4,9,2,2
chr17	4391169	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,0:5,3:12,6,1,2
chr17	4391201	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=131,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.269:23:10,3:7,2:8,9,3,3
chr17	4416638	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:2,4:0,4:0,2,1,7
chr17	4416674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0,2,1,1
chr17	4433924	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,14401226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,0:10,2:10,8,1,1
chr17	4436005	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr17	4437214	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4437214_C_T:4437214:0,0,0,1
chr17	4437218	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4437214_C_T:4437214:0,0,0,1
chr17	4439313	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr17	4439501	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr17	4439532	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr17	4442893	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:14,8:15,0:19,10,8,0
chr17	4443580	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4443580_T_G:4443580:1,0,1,0
chr17	4443586	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4443580_T_G:4443580:1,0,1,0
chr17	4443590	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4443580_T_G:4443580:1,0,1,0
chr17	4443594	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,11;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4443580_T_G:4443580:1,0,1,0
chr17	4443600	.	CC	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,17;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4443580_T_G:4443580:1,0,1,0
chr17	4448853	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=93,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,6:1,10:1,0,10,6
chr17	4452796	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.688:11:1,2:2,4:0,3,1,7
chr17	4457265	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:4,0:3,8,2,0
chr17	4457269	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:5,1:6,0:0|1:4457269_A_C:4457269:4,11,2,0
chr17	4457274	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:7,0:7,0:0|1:4457269_A_C:4457269:4,11,2,0
chr17	4457512	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:17,11,2,0
chr17	4458302	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0|1:4458302_C_A:4458302:0,0,5,12
chr17	4458314	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,12:0|1:4458302_C_A:4458302:0,0,6,14
chr17	4462444	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	4463023	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,5,5
chr17	4497084	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	4498682	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	4500304	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr17	4510600	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:2,1:5,1,2,0
chr17	4535385	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:1,6:2,4:3,1,5,5
chr17	4535402	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,1:6,1:7,4,2,0
chr17	4535413	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:3,2,5,2
chr17	4535444	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,0:7,4:11,9,4,0
chr17	4541995	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=89,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,3:7,4:5,9,5,2
chr17	4542717	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=50,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.559:14:4,4:2,3:3,3,6,2
chr17	4544978	.	G	GAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.854:11:0,5:1,5:0,1,1,9
chr17	4575213	.	TG	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=168,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:2,4,1,1
chr17	4577884	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:1,6:7,3:3,5,5,4
chr17	4578007	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr17	4578698	.	AGTGAGAGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=194,294;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	4579355	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.247:25:13,5:6,0:9,10,4,2
chr17	4579597	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=155,63;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:0|1:4579597_C_T:4579597:7,4,1,1
chr17	4579602	.	T	TGGATGGTCACCTGTAAGGCCTCTCCTGGCCTGGA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=151,63;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.205:12:7,2:3,0:0|1:4579597_C_T:4579597:7,3,1,1
chr17	4579638	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chr17	4580137	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,6:0,18:0,0,10,15
chr17	4586253	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr17	4594847	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	4622071	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,136;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	4623850	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.305:13:1,0:7,0:0|1:4623850_A_C:4623850:0,9,4,0
chr17	4623855	.	CACA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.248:16:2,0:8,2:0|1:4623850_A_C:4623850:0,12,4,0
chr17	4638010	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,3,19
chr17	4638484	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,10:0,10:1,0,17,4
chr17	4638656	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:17,3:26,0:18,26,1,2
chr17	4642069	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,17,9
chr17	4642787	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	4644491	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0,1,1,15
chr17	4646533	.	C	CA,CAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=136,195,143;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.02,13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,9:0.324,0.578:15:0,2,2:1,3,6:1,0,13,1
chr17	4647002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr17	4684095	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,20,11
chr17	4685985	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=121,111;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.275:20:8,0:5,5:1,14,0,5
chr17	4686340	.	TT	GG	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,21:0,19:0,0,29,15
chr17	4686414	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.429:24:6,9:6,1:4,10,3,7
chr17	4686463	.	A	ACGCCTACCTGGCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:0,7:3,5:0,3,3,10
chr17	4688996	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=217,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	4689194	.	AC	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:8,4:7,3:12,4,1,6
chr17	4689572	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	4692493	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=100,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:14,0:10,3:10,15,2,1
chr17	4693342	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4693384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	4701213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:3,3,2,0
chr17	4712395	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,3:8,4:11,6,6,1
chr17	4712420	.	CGAGATGCAGGCAACAGA	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:9,2:17,0:23,14,1,1
chr17	4712563	.	GTC	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.162:28:9,3:15,1:8,16,2,2
chr17	4712757	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:3,7:1,5:1,3,4,9
chr17	4713115	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=111,67;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,0:10,3:10,12,1,2
chr17	4714021	.	G	GGAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAA;STR;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,8:0,0,12,6
chr17	4714115	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=97,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:14,0:7,5:8,13,0,5
chr17	4718027	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.460:46:15,11:9,10:10,15,10,11
chr17	4718776	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=95,97;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.780:25:5,11:0,9:2,3,11,9
chr17	4719027	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=106,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,3:17,0:14,13,2,1
chr17	4720131	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr17	4721376	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:9,1:11,11:12,8,4,8
chr17	4721389	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=112,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.202:36:10,0:18,6:13,16,2,5
chr17	4721622	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,1:8,2:11,13,3,0
chr17	4721940	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.198:21:8,2:9,0:0|1:4721940_A_C:4721940:1,16,4,0
chr17	4721945	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.173:19:6,1:6,0:0|1:4721940_A_C:4721940:1,15,3,0
chr17	4722187	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=18,13;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.399:10:1,0:2,0:1,5,0,4
chr17	4722193	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,13;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.521:11:0,0:2,1:1,4,0,6
chr17	4722299	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	4725250	.	G	GGATTGAGCTCTTAAACCTGTGGAGTCTGATGTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,69;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.372:5:3,1:0,0:2,2,0,1
chr17	4725920	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=74,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr17	4787649	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=91,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.089:53:21,4:28,0:23,26,3,1
chr17	4787782	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,0:8,4:8,15,0,4
chr17	4790979	.	TGCA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=140,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,2:6,0:7,5,2,0
chr17	4794492	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr17	4795619	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr17	4796656	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:6,6:1,6:5,3,4,8
chr17	4796954	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:1,0:2,1:0,7,0,2
chr17	4796965	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr17	4796970	.	C	CCACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=173,167;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr17	4796973	.	T	G,TGCTGAAATTCAGACATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,12,28;MFRL=143,203,167;MMQ=60,60,40;MPOS=17,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.74,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.373,0.250:5:1,0,1:1,0,0:0,2,0,3
chr17	4797718	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:2,2,2,3
chr17	4799236	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,5,2
chr17	4799309	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:17,5:14,0:22,9,3,2
chr17	4801970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=254,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr17	4802329	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:4,5:3,10:4,3,4,11
chr17	4804034	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr17	4804073	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,5:4,2:5,1,6,2
chr17	4837952	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,4:0,0,7,8
chr17	4838365	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=202,207;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr17	4838398	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=129,216;MMQ=39,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr17	4838405	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=141,216;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:4838405_G_A:4838405:1,2,0,1
chr17	4838412	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=126,216;MMQ=44,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4838405_G_A:4838405:1,1,0,1
chr17	4841422	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=137,29;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,1:14,1:7,18,0,2
chr17	4844327	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=110,90;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,9:0.092:107:39,9:51,0:0|1:4844327_G_A:4844327:51,47,8,1
chr17	4844332	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=106,90;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,9:0.091:108:41,9:52,0:0|1:4844327_G_A:4844327:52,47,8,1
chr17	4844460	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.091:63:31,0:27,5:27,31,1,4
chr17	4845768	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.361:33:11,6:10,4:6,15,6,6
chr17	4846340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,194;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:5,2,0,3
chr17	4849142	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=131,122;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.058:50:20,0:24,1:39,9,2,0
chr17	4856179	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:3,8,0,3
chr17	4857216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=204,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr17	4857233	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=247,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4857233_G_GGA:4857233:0,3,0,1
chr17	4857235	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=247,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4857233_G_GGA:4857233:0,3,0,1
chr17	4857237	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=247,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:4857233_G_GGA:4857233:0,3,0,1
chr17	4881776	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,8:8,4:10,4,3,9
chr17	4882952	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.620:16:2,5:3,5:5,1,10,0
chr17	4883275	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=195,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:3,0:5,1:0|1:4883275_C_T:4883275:5,4,1,1
chr17	4883278	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=195,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:4883275_C_T:4883275:5,4,1,1
chr17	4883362	.	GGGC	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:10,0:17,9,1,1
chr17	4883818	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,6:5,0:13,0,5,1
chr17	4885006	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,1:19,1:15,17,0,2
chr17	4885982	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,2:1,2:4,2,3,1
chr17	4886037	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,7:3,0:5,6,4,3
chr17	4889346	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:0,8,5,0
chr17	4893357	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:6,4,2,3
chr17	4897807	.	CTGGAT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:0|1:4897807_CTGGAT_C:4897807:9,15,1,1
chr17	4897814	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:6,2:0|1:4897807_CTGGAT_C:4897807:8,14,1,1
chr17	4906146	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr17	4917051	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:9,4:4,0:6,7,1,3
chr17	4936972	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.303:13:5,1:4,1:4,5,2,2
chr17	4937982	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=192,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr17	4996470	.	CTT	C,CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,124,110;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=10.67,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,5:0.658,0.295:15:0,5,1:0,3,2:0,0,10,5
chr17	4996915	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=72,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.885:14:0,5:0,8:1,0,7,6
chr17	4998948	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:10,5,2,1
chr17	4999672	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr17	5036191	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=123,139;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,2:7,1:15,5,3,0
chr17	5036205	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=132,200;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:15,4:11,0:0|1:5036205_A_C:5036205:18,9,4,0
chr17	5036210	.	TC	GT	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=26,35;MFRL=128,157;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:15,4:12,0:0|1:5036205_A_C:5036205:20,9,5,1
chr17	5036214	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=29,25;MFRL=127,139;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:14,4:13,1:0|1:5036205_A_C:5036205:20,10,5,2
chr17	5036224	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=123,139;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.263:35:12,4:13,4:0|1:5036205_A_C:5036205:16,10,6,3
chr17	5036249	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=31,24;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:20,2:13,2:18,15,4,0
chr17	5036274	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=23,26;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,13:0.424:31:12,5:6,7:0|1:5036274_C_A:5036274:8,10,6,7
chr17	5036281	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=28,29;MFRL=86,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.437:30:12,4:5,8:0|1:5036274_C_A:5036274:8,9,6,7
chr17	5036329	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=22,31;MFRL=128,132;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,3:4,4:1,6,2,5
chr17	5036383	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=26,28;MFRL=199,224;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr17	5036714	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=30,20;MFRL=121,119;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,1:9,1:0|1:5036714_C_T:5036714:14,4,3,0
chr17	5036723	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=31,34;MFRL=120,110;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,4:8,1:0|1:5036714_C_T:5036714:13,4,5,1
chr17	5036728	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=31,24;MFRL=120,110;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,5:7,1:0|1:5036714_C_T:5036714:12,5,5,1
chr17	5036732	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=122,110;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,5:6,1:0|1:5036714_C_T:5036714:11,6,5,1
chr17	5036740	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=139,100;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.364:25:8,6:7,2:0|1:5036714_C_T:5036714:10,6,7,2
chr17	5036748	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=28,23;MFRL=129,100;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,9:0.316:29:12,6:7,2:0|1:5036714_C_T:5036714:12,8,7,2
chr17	5036761	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=26,20;MFRL=122,110;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.326:31:12,7:9,2:13,8,7,3
chr17	5036784	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=28,28;MFRL=122,119;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.255:35:16,7:10,2:14,12,4,5
chr17	5036823	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=27,25;MFRL=112,127;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.124:33:15,4:14,0:13,16,1,3
chr17	5036834	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=28,25;MFRL=117,122;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,2:11,1:0|1:5036834_G_A:5036834:10,18,1,2
chr17	5036838	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=30,22;MFRL=121,122;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,2:12,1:11,16,1,2
chr17	5036843	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=121,122;MMQ=55,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,1:12,1:0|1:5036834_G_A:5036834:9,16,1,2
chr17	5036849	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=22,28;MFRL=89,121;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,6:4,7:5,5,3,10
chr17	5036923	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=34,24;MFRL=129,164;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:5036923_C_A:5036923:1,0,0,2
chr17	5036930	.	GGGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=35,27;MFRL=129,164;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:5036923_C_A:5036923:1,0,0,2
chr17	5036936	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=16;MBQ=32,26;MFRL=129,194;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5036923_C_A:5036923:1,0,0,1
chr17	5038559	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=118,77;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:14,4:10,1:0|1:5038559_C_A:5038559:14,11,3,2
chr17	5038569	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=109,77;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.194:29:14,4:9,1:0|1:5038559_C_A:5038559:13,11,3,2
chr17	5038576	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=118,77;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:15,4:8,1:0|1:5038559_C_A:5038559:12,11,3,2
chr17	5039188	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=87,92;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr17	5039203	.	G	GAACAAATCCTATGTGAAGTTAAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=92,87;MMQ=51,20;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	5039265	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,31;MFRL=87,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0|1:5039265_C_T:5039265:1,2,0,1
chr17	5039275	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=87,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:5039265_C_T:5039265:1,2,0,1
chr17	5039278	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=141,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:5039265_C_T:5039265:0,2,0,1
chr17	5039279	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=141,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:5039265_C_T:5039265:0,2,0,1
chr17	5048207	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,184;MMQ=50,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:2,2,1,3
chr17	5050374	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=116,199;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:24,4:19,0:30,13,4,0
chr17	5058808	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,97;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:6,15:5,4:7,4,11,8
chr17	5066305	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=103,107;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:2,5,4,5
chr17	5072377	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,156;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:2,10,0,2
chr17	5073730	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr17	5087040	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:1,7,3,2
chr17	5087602	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr17	5126674	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=82,94;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,17:0.665:25:3,13:5,3:0|1:5126674_A_G:5126674:1,7,7,10
chr17	5126689	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=82,87;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,16:0.654:24:2,11:5,5:0|1:5126674_A_G:5126674:2,6,6,10
chr17	5126768	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,1:5,1:2,4,1,1
chr17	5249998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=236,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr17	5253683	.	AAAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:7,0:11,3,1,1
chr17	5264701	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:5264701_G_T:5264701:15,11,0,2
chr17	5264703	.	A	AACTGAGCTTTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:15,0:11,2:0|1:5264701_G_T:5264701:15,11,0,2
chr17	5268337	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.299:15:6,0:4,4:10,1,4,0
chr17	5268356	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,23,26;MFRL=117,126,147;MMQ=60,60,60;MPOS=27,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=12.59,10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,7:0.421,0.433:16:1,1,4:1,5,3:2,0,12,2
chr17	5268592	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:21,3:9,0:3,27,0,3
chr17	5283617	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr17	5289676	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr17	5290599	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,2,2
chr17	5290681	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr17	5290703	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=94,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,5:10,2:6,10,4,3
chr17	5290824	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:3,16:7,3:4,6,4,15
chr17	5291276	.	AAAAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr17	5294976	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:5,1:6,3,2,1
chr17	5298320	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:1,4,0,4
chr17	5308279	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr17	5308603	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr17	5312271	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:10,2:1,3:1,10,0,5
chr17	5312308	.	C	CCAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=229,116;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr17	5317532	.	GC	TT,GAGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20,30;MFRL=0,58,178;MMQ=60,60,60;MPOS=7,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.60,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.432,0.283:4:1,0,1:0,2,0:0,1,1,2
chr17	5320044	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,4:0,0:0,2,1,3
chr17	5320082	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr17	5324688	.	C	CT	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.047:61:34,0:20,2:0|1:5324688_C_CT:5324688:24,35,1,1
chr17	5324691	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:35,0:22,2:0|1:5324688_C_CT:5324688:25,36,1,1
chr17	5324693	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:33,0:23,2:0|1:5324688_C_CT:5324688:24,37,1,1
chr17	5324697	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=124,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:35,0:21,2:0|1:5324688_C_CT:5324688:24,38,1,1
chr17	5356863	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,0:1,2:9,0,1,1
chr17	5386048	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:17,8:13,0:26,4,8,0
chr17	5386205	.	GTT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,0:13,2:13,18,0,3
chr17	5393593	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:17,4:17,0:18,17,3,1
chr17	5421005	.	TC	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,15,1
chr17	5424129	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr17	5424376	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	5425159	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr17	5436354	.	C	CAAAGCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr17	5436797	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5436797_G_A:5436797:0,1,0,1
chr17	5436799	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5436797_G_A:5436797:0,1,0,1
chr17	5436800	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5436797_G_A:5436797:0,1,0,1
chr17	5436805	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5436797_G_A:5436797:0,1,0,1
chr17	5991344	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=101,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,3:4,8:5,3,5,6
chr17	5998559	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=55,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr17	6329127	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr17	6331611	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=72,188;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:0,0:0,2:0|1:6331611_C_T:6331611:1,1,2,0
chr17	6331619	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=144,188;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,0:1,2:0|1:6331611_C_T:6331611:2,1,2,0
chr17	6364753	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,1:8,3:7,7,3,1
chr17	6377986	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:6377986_T_C:6377986:0,5,0,3
chr17	6377999	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1|0:6377986_T_C:6377986:0,3,0,3
chr17	6381939	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=96,170;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:3,12:5,5:5,3,10,7
chr17	6387482	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=246,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr17	6428620	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr17	6483046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr17	6493056	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr17	6493391	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	6499630	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.148:38:17,1:14,4:12,21,2,3
chr17	6513329	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,31:0,18:0,0,30,21
chr17	6513350	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.279:49:21,13:14,0:15,21,13,0
chr17	6513387	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=100,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.056:52:27,2:21,0:22,28,0,2
chr17	6515449	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:0|1:6515449_C_T:6515449:7,11,1,2
chr17	6515454	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0|1:6515449_C_T:6515449:0,0,7,12
chr17	6526464	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr17	6531534	.	G	GTT	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:15,2:10,0:0|1:6531534_G_GTT:6531534:14,15,1,1
chr17	6531536	.	G	GTTT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,2:12,0:0|1:6531534_G_GTT:6531534:14,15,1,1
chr17	6531539	.	C	CTTT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:14,2:12,0:0|1:6531534_G_GTT:6531534:15,16,1,1
chr17	6531540	.	A	AGTCTCCCTAGTTC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,2:13,0:0|1:6531534_G_GTT:6531534:14,14,1,1
chr17	6532121	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=255,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6532121_AT_TC:6532121:0,3,0,1
chr17	6532126	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=255,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:6532121_AT_TC:6532121:0,3,0,1
chr17	6553410	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=111,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.218:34:11,2:13,4:10,17,1,6
chr17	6555546	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr17	6591067	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr17	6594105	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:6,4:1,8:7,0,7,6
chr17	6594322	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=224,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.622:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr17	6607435	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr17	6616527	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr17	6616649	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=85,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,0:6,3:4,9,0,8
chr17	6616736	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	6659324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	6661584	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:2,4,0,3
chr17	6663144	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=99,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr17	6663628	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=149,157;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,1:7,1:10,0,2,0
chr17	6663666	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.747:13:1,1:1,2:2,1,1,9
chr17	6663802	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,4:13,0:14,15,0,4
chr17	6684003	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,4:0,6:1,2,1,9
chr17	6690542	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.579:7:0,4:2,0:3,0,4,0
chr17	6899559	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	6899629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr17	6900444	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	6902179	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.564:37:7,10:9,11:7,9,9,12
chr17	6902459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr17	6902743	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr17	6902760	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr17	6905061	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,12,12
chr17	6909377	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.709:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	6915401	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,3:0,11:1,0,13,1
chr17	6915433	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.342:39:12,10:13,3:18,8,9,4
chr17	6917436	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.051:75:25,1:47,2:46,26,1,2
chr17	6917703	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=177,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,4:3,1:0,4,0,6
chr17	6920257	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=87,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.291:46:18,4:15,9:17,16,7,6
chr17	6921431	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=677,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr17	6927350	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,18,5
chr17	6928019	.	CCAG	C,CCAGCAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33,33;MFRL=158,184,145;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=CAG;STR;TLOD=5.87,23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,8:0.155,0.506:15:4,1,1:1,1,7:1,4,2,8
chr17	6941625	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,8:4,3:4,8,2,9
chr17	6942108	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,5:3,10:4,1,8,7
chr17	6945087	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:11,3:5,5:8,8,5,3
chr17	6945327	.	GGCCC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,1:10,0:5,13,1,1
chr17	6945483	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr17	6945940	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:1,6,1,2
chr17	6946287	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.233:37:9,4:16,4:15,14,6,2
chr17	6946330	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:7,2:9,1:5,11,0,4
chr17	6978319	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr17	6978982	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,4:1,0:4,1,4,0
chr17	6979179	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=0,121;MMQ=39,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,8:1,10:1,0,11,8
chr17	6979218	.	AATAGG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAGG;STR;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr17	6981353	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=81,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,14:0.263:55:18,7:22,7:21,20,10,4
chr17	6981397	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,29:0,21:0,0,29,21
chr17	7005056	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:7005056_GT_G:7005056:0,3,0,1
chr17	7005058	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:7005056_GT_G:7005056:0,3,0,1
chr17	7005553	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	7010222	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.379:12:2,4:5,0:7,0,5,0
chr17	7011087	.	T	TACACATTACACACACCGC	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=89,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=96.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,26:0.455:57:16,0:13,8:17,14,11,15
chr17	7011129	.	C	T	.	.	DP=132;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=93,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,40:0.306:132:61,6:30,34:45,47,8,32
chr17	7012219	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,10:5,5:1,5,4,11
chr17	7080111	.	TCACA	T,TCA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,24,26;MFRL=86,83,0;MMQ=60,60,60;MPOS=13,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=CA;STR;TLOD=8.49,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,3:0.170,0.120:30:5,2,1:13,3,2:9,13,2,6
chr17	7096167	.	A	ATTAGTACTCATCCTGGTCTGTGCTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:1,1:2,0:3,1,0,1
chr17	7100206	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:14,2:19,1:18,15,1,2
chr17	7100369	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=150,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:7100369_A_C:7100369:7,11,1,1
chr17	7100375	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=147,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:7100369_A_C:7100369:7,11,1,1
chr17	7100379	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=146,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:7100369_A_C:7100369:7,12,1,1
chr17	7100380	.	GACA	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=146,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:7100369_A_C:7100369:7,12,1,1
chr17	7100384	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,41;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:7100369_A_C:7100369:6,11,1,1
chr17	7111561	.	G	GTCTGTCTGTCTGTCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,4:11,0:4,12,2,2
chr17	7123102	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=282,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr17	7127411	.	G	GAGAAAGGATT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=114,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.094:29:15,1:11,1:0|1:7127411_G_GAGAAAGGATT:7127411:11,16,0,2
chr17	7127413	.	T	TGAA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=119,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:10,1:9,1:0|1:7127411_G_GAGAAAGGATT:7127411:11,17,0,2
chr17	7127418	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=124,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,1:12,1:0|1:7127411_G_GAGAAAGGATT:7127411:11,17,0,2
chr17	7131016	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=119,62;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,13:0.236:57:24,2:20,11:24,20,12,1
chr17	7133458	.	TGCTGGACACATTAGG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,2:13,0:16,15,1,1
chr17	7133605	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:12,7:13,0:15,10,7,0
chr17	7139035	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:11,3:11,0:9,13,2,1
chr17	7139238	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=14,24;MFRL=50,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=134.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,51:0.962:53:0,12:1,35:1,1,28,23
chr17	7140606	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr17	7145492	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,19,0
chr17	7155992	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,3:8,0:10,7,3,0
chr17	7192198	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=127.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,25:0,15:0,0,19,21
chr17	7192250	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=141,148;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:0,12,0,2
chr17	7193055	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.938:13:0,10:0,3:0|1:7193055_GA_G:7193055:0,0,0,13
chr17	7193060	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:7193055_GA_G:7193055:0,0,0,13
chr17	7193255	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr17	7193448	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,11:0,0,8,18
chr17	7194440	.	A	ATC	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:23,2:26,0:0|1:7194440_A_ATC:7194440:25,26,1,1
chr17	7194442	.	A	ACCCTC	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:23,2:24,0:0|1:7194440_A_ATC:7194440:25,26,1,1
chr17	7194443	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:23,1:24,0:0|1:7194440_A_ATC:7194440:25,26,1,1
chr17	7197632	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	7210402	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=99,55;MMQ=60,56;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:21,2:29,0:0|1:7210402_C_G:7210402:24,27,2,0
chr17	7210405	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=102,55;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:20,2:26,0:0|1:7210402_C_G:7210402:23,27,2,0
chr17	7214824	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,27:0,14:0,0,22,19
chr17	7217555	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:3,3:9,0:10,2,4,0
chr17	7220697	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.943:32:0,15:1,16:1,0,15,16
chr17	7221544	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=58,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.916:21:1,9:0,9:0,1,6,14
chr17	7221707	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr17	7224319	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	7224433	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:9,5:9,3:9,9,6,2
chr17	7225149	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,8,6
chr17	7225391	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7225391_CAG_C:7225391:0,1,0,1
chr17	7225394	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:7225391_CAG_C:7225391:0,1,0,1
chr17	7225425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	7228450	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:7228450_C_G:7228450:2,1,0,1
chr17	7228458	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,14;MFRL=204,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.472:4:1,0:0,0:0|1:7228450_C_G:7228450:1,1,0,2
chr17	7228468	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.851:5:0,2:0,3:0|1:7228450_C_G:7228450:0,0,0,5
chr17	7245371	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,3,8
chr17	7245674	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,13:0,0,12,7
chr17	7246940	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=122.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,22:0,17:0,0,24,16
chr17	7246996	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=87,185;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:28,0:18,5:25,22,0,5
chr17	7251370	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:4,4,3,3
chr17	7251605	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr17	7254195	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=138,96;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.103:29:5,2:18,1:0|1:7254195_T_C:7254195:23,3,1,2
chr17	7254197	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=138,96;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.102:29:7,2:19,1:0|1:7254195_T_C:7254195:23,3,1,2
chr17	7254602	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=127.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,46:0.961:47:0,22:1,23:1,0,27,19
chr17	7257847	.	G	GGTGT,GGTGTGT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33,31;MFRL=0,121,105;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=GT;STR;TLOD=12.84,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,7:0.446,0.445:14:1,4,4:0,2,1:0,1,12,1
chr17	7259073	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,22,3
chr17	7286647	.	T	TGTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=115,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:11,2:5,0:8,9,0,2
chr17	7296064	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr17	7297032	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7297032_G_C:7297032:0,3,0,1
chr17	7297036	.	G	GGAGGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:7297032_G_C:7297032:0,2,0,1
chr17	7297037	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:7297032_G_C:7297032:0,2,0,1
chr17	7297041	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:7297032_G_C:7297032:0,2,0,1
chr17	7307103	.	ACC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	7307287	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=251.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,40:0,34:0,0,36,40
chr17	7315363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7315363_A_C:7315363:0,1,1,0
chr17	7315367	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:7315363_A_C:7315363:0,1,1,0
chr17	7317647	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	7318559	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr17	7319017	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=81,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,0:5,3:10,10,0,3
chr17	7324407	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,2:5,7:5,5,5,4
chr17	7330455	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr17	7345819	.	A	AGGTAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr17	7350544	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.464:13:2,3:5,2:1,7,0,5
chr17	7350920	.	T	TAGCCA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=110,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:7350920_T_TAGCCA:7350920:9,10,1,1
chr17	7350922	.	A	AGCTAT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=110,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,1:0|1:7350920_T_TAGCCA:7350920:9,10,1,1
chr17	7350924	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:7350920_T_TAGCCA:7350920:9,11,1,1
chr17	7350931	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=100,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:7350920_T_TAGCCA:7350920:11,10,1,1
chr17	7351863	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:4,4,2,0
chr17	7358803	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=73.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr17	7358861	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=334,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:0,6,4,6
chr17	7360110	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr17	7365386	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.329:46:15,14:16,0:22,9,15,0
chr17	7365408	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.320:48:19,15:14,0:21,12,15,0
chr17	7385222	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:1,1:0,7:1,0,8,0
chr17	7386279	.	TG	CA	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,56;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=257.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,34:0,23:0,0,30,28
chr17	7399561	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:8,0:12,4:13,8,2,2
chr17	7399578	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:10,0:13,4:0|1:7399578_G_C:7399578:14,10,2,2
chr17	7399580	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:11,0:12,4:0|1:7399578_G_C:7399578:14,10,2,2
chr17	7400041	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,3:0,2:0,0,3,5
chr17	7400448	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	7401335	.	G	GGCTCTGGGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,4:1,0,7,1
chr17	7401572	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr17	7402556	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr17	7402875	.	C	CCGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	7403942	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,4:0,19:0,0,19,6
chr17	7404209	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr17	7405074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr17	7406343	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	7406802	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,3:17,0:14,13,2,1
chr17	7411855	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	7411893	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=193,205;MMQ=40,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr17	7412212	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr17	7413038	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	7414958	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr17	7415572	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:7415572_C_T:7415572:11,6,1,1
chr17	7415588	.	C	CTTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=109,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:3,2:0|1:7415572_C_T:7415572:11,4,1,1
chr17	7415590	.	C	CCTCTCTCTGTCT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=109,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:12,0:3,2:0|1:7415572_C_T:7415572:11,4,1,1
chr17	7415970	.	TC	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=297,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:7415970_TC_CT:7415970:0,2,1,1
chr17	7415973	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=297,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:7415970_TC_CT:7415970:0,2,1,1
chr17	7415975	.	A	AAGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=297,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:7415970_TC_CT:7415970:0,2,1,1
chr17	7415977	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=292,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:7415970_TC_CT:7415970:0,2,1,1
chr17	7415981	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=292,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:7415970_TC_CT:7415970:0,2,1,1
chr17	7416683	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=43,94;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,50:0.929:53:2,19:1,25:2,1,27,23
chr17	7416912	.	A	C	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=114,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,21:0.227:95:30,20:41,1:32,42,21,0
chr17	7417086	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,11:0,27:0,0,17,24
chr17	7417349	.	GTACTCGCCCACCAGCCCCACCTACTCGCCCACCTCCCCCAAAGGCTCAACCTACTCTCCCACTTCCCCTGGT	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.131:74:4,4:15,1:22,44,3,5
chr17	7417551	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr17	7452752	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:9,3:13,5:10,12,5,3
chr17	7452805	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr17	7453505	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:6,10:9,5:5,10,8,7
chr17	7460364	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,181;MMQ=60,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:7,2,0,3
chr17	7460743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,1:1,7:0,3,0,8
chr17	7463638	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:11,3:28,0:20,20,3,0
chr17	7464357	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:18,2:17,0:12,23,0,2
chr17	7470285	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=63.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,14,11
chr17	7474277	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=120.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.979:42:0,21:0,18:0,0,14,28
chr17	7481418	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:11,8:8,0:13,6,8,0
chr17	7483303	.	G	T	.	.	DP=175;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=87,75;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:167,6:0.040:173:66,0:89,6:0|1:7483303_G_T:7483303:81,86,1,5
chr17	7483315	.	C	T	.	.	DP=178;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=87,75;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:163,6:0.041:169:71,0:90,5:0|1:7483303_G_T:7483303:72,91,1,5
chr17	7483368	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=107,41;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,4:0.043:113:43,4:61,0:26,83,3,1
chr17	7496351	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:3,1:7,4:8,2,0,7
chr17	7531244	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	7533484	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=168,41;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:7533484_G_A:7533484:12,5,1,1
chr17	7533491	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=165,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:7533484_G_A:7533484:13,5,1,1
chr17	7533492	.	TGG	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=162,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:0|1:7533484_G_A:7533484:14,5,1,1
chr17	7533497	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=155,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:0|1:7533484_G_A:7533484:13,5,1,1
chr17	7533504	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:0|1:7533484_G_A:7533484:12,6,1,1
chr17	7534271	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,470;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	7535249	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,4:12,0:10,11,4,0
chr17	7535393	.	AGGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:7535393_AGGGG_A:7535393:1,2,0,1
chr17	7535398	.	AGTCCAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:7535393_AGGGG_A:7535393:1,2,0,1
chr17	7535412	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7535393_AGGGG_A:7535393:1,1,0,1
chr17	7535415	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7535393_AGGGG_A:7535393:1,1,0,1
chr17	7535419	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7535393_AGGGG_A:7535393:1,1,0,1
chr17	7536220	.	C	CG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:7536220_C_CG:7536220:8,12,0,2
chr17	7536221	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:7536220_C_CG:7536220:8,12,0,2
chr17	7536227	.	TT	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,2:9,0:0|1:7536220_C_CG:7536220:8,13,0,2
chr17	7554772	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr17	7554965	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr17	7572890	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:10,1:6,1:15,1,0,3
chr17	7578115	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	7578226	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:14,0:0|1:7578226_T_C:7578226:17,15,1,1
chr17	7578228	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:14,0:0|1:7578226_T_C:7578226:17,15,1,1
chr17	7578645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	7579643	.	CCCCCAGCCCTCCAGGT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCAGCCCTCCAGGT;STR;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr17	7579801	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr17	7592957	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:14,2:10,2:11,14,2,2
chr17	7606211	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=214,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:3,6,2,5
chr17	7611552	.	C	CGCCCGGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=155,30;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:7611552_C_CGCCCGGCT:7611552:0,2,1,1
chr17	7611554	.	A	ATTTTTTGTATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=155,30;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:7611552_C_CGCCCGGCT:7611552:0,2,1,1
chr17	7623276	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=244,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7623276_G_A:7623276:0,1,0,1
chr17	7623278	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=244,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7623276_G_A:7623276:0,1,0,1
chr17	7626997	.	AGGCAGATGTGGTAGGCTTGGGTCTTCCCTGT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=124,42;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:21,0:10,2:11,28,1,1
chr17	7630365	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	7630497	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:10,0:12,4:12,11,2,2
chr17	7637951	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=99,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:9,4:13,0:8,14,4,0
chr17	7646166	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=245,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr17	7660622	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr17	7673731	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,0:6,2:9,1,1,1
chr17	7678297	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=86,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:3,3,1,1
chr17	7678313	.	A	AGGATTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr17	7678679	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:16,4,1,1
chr17	7679554	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=134,126;MMQ=41,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr17	7679566	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,146;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	7680159	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=101,75;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.386:39:11,7:12,7:12,12,10,5
chr17	7680181	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=84,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:20,0:14,5:25,10,0,5
chr17	7680225	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=84,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:23,0:13,2:17,19,2,0
chr17	7684521	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=105,96;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr17	7690404	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr17	7691474	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=106,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:9,8:14,0:10,13,8,0
chr17	7695710	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0|1:7695710_G_GTT:7695710:0,1,0,1
chr17	7695711	.	G	GAAGGATGTAGTAGAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.479:2:0,0:1,1:0|1:7695710_G_GTT:7695710:0,1,0,1
chr17	7695756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7695756_A_G:7695756:0,1,0,1
chr17	7695758	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7695756_A_G:7695756:0,1,0,1
chr17	7696595	.	G	GATATATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7696595_G_GATATATA:7696595:0,1,0,1
chr17	7696598	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7696595_G_GATATATA:7696595:0,1,0,1
chr17	7701204	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	7702084	.	AGCTGACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7702084_AGCTGACC_A:7702084:0,1,0,1
chr17	7702096	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7702084_AGCTGACC_A:7702084:0,1,0,1
chr17	7702357	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr17	7705045	.	C	CCTCAAACAGAGTATTGATGCCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr17	7707839	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr17	7708797	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	7721030	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,4:6,3:5,3,3,4
chr17	7721199	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.479:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr17	7726665	.	C	CAGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=AG;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	7727809	.	C	CCTATCCCTTAAAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,1,1
chr17	7733555	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr17	7735934	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,35:0.643:54:12,22:7,13:9,10,17,18
chr17	7736030	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=120,222;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.138:41:24,0:12,5:0|1:7736030_G_T:7736030:15,21,0,5
chr17	7736033	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=120,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.140:41:24,0:12,5:0|1:7736030_G_T:7736030:15,21,0,5
chr17	7749153	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:6,9:7,0:0|1:7749153_C_A:7749153:7,6,9,0
chr17	7749162	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,9:7,0:0|1:7749153_C_A:7749153:9,7,9,0
chr17	7750847	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.363:34:8,6:12,6:12,10,7,5
chr17	7751050	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:2,2:4,9:0,6,3,9
chr17	7751778	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,2:9,3:1,10,2,3
chr17	7751982	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=7;MBQ=23,12;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,10:0.116:82:34,3:30,0:0|1:7751982_A_C:7751982:22,50,10,0
chr17	7751985	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=7;MBQ=23,13;MFRL=96,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,10:0.115:83:27,2:25,0:0|1:7751982_A_C:7751982:22,51,10,0
chr17	7751988	.	A	C	.	.	DP=74;ECNT=7;MBQ=23,12;MFRL=100,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,9:0.124:68:21,1:26,0:21,38,9,0
chr17	7751994	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=104,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.098:66:19,4:30,1:27,33,6,0
chr17	7752000	.	CAG	C	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,5:0.086:67:24,4:36,1:0|1:7752000_CAG_C:7752000:26,36,5,0
chr17	7752006	.	GG	CC	.	.	DP=66;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:21,1:31,1:0|1:7752000_CAG_C:7752000:26,35,5,0
chr17	7752010	.	AG	CC	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=24,23;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,4:0.077:62:17,1:23,0:0|1:7752000_CAG_C:7752000:27,31,4,0
chr17	7752393	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:4,4,2,0
chr17	7752593	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,6:0.128:52:24,1:22,5:0|1:7752593_G_A:7752593:20,26,3,3
chr17	7752601	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:41,3:0.086:44:17,3:23,0:1|0:7752593_G_A:7752593:19,22,1,2
chr17	7755168	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr17	7755732	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,4:2,7:6,2,7,4
chr17	7758608	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=140,265;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,0:4,6:0,12,0,6
chr17	7758794	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:7,4:9,0:9,7,2,2
chr17	7760638	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.130:50:12,5:10,0:24,20,6,0
chr17	7762649	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr17	7788357	.	C	CAGGTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=196,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr17	7788409	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	7796550	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=103,103;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:6,9:13,0:19,0,9,0
chr17	7806179	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=196,273;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:6,0:1,4:4,3,4,0
chr17	7808009	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:7808009_A_C:7808009:0,3,0,1
chr17	7808011	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:7808009_A_C:7808009:0,3,0,1
chr17	7811363	.	G	GTTTCTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:8,4:10,0:7,12,2,2
chr17	7811998	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.465:28:4,5:11,8:8,7,9,4
chr17	7812747	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr17	7813881	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:1,11,0,2
chr17	7829503	.	G	GATCTCCCCTCCACACGCCTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	7851078	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:2,7,0,3
chr17	7851347	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr17	7851793	.	GA	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:15,8,1,1
chr17	7943321	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:3,1:6,3,0,2
chr17	7948073	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,0:0,3:0|1:7948073_C_CCT:7948073:0,1,5,0
chr17	7948075	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,11;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:1,0:0,1:0|1:7948073_C_CCT:7948073:0,2,5,0
chr17	7948081	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,16;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:2,1:0|1:7948073_C_CCT:7948073:0,4,4,0
chr17	7948083	.	TC	GG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,2:0|1:7948073_C_CCT:7948073:0,4,4,0
chr17	7948089	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:3,2:0|1:7948073_C_CCT:7948073:1,4,3,0
chr17	7948175	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=106,113;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:5,9,3,1
chr17	7950377	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=232,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr17	7950403	.	CCGTCCCTG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:7950403_CCGTCCCTG_C:7950403:2,0,0,1
chr17	7950412	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7950403_CCGTCCCTG_C:7950403:2,0,0,1
chr17	7951819	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,4:6,1:11,5,3,2
chr17	7977105	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=112,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:5,1:3,3:1,8,1,3
chr17	7979463	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=129,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,1:3,5:7,1,5,1
chr17	7983604	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:13,0:12,2:0|1:7983604_T_C:7983604:12,13,1,1
chr17	7983610	.	A	ATCTCTTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:7983604_T_C:7983604:9,12,1,1
chr17	7983969	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:6,4:12,0:7,11,2,4
chr17	7990569	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=112,149;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.319:15:2,1:8,4:10,0,5,0
chr17	7990577	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=18,27;MFRL=98,98;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,30:0.907:35:0,7:1,21:4,1,17,13
chr17	8000065	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,78;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,0:9,3:17,10,2,1
chr17	8013197	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,6:2,1:3,0,6,2
chr17	8013399	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=219,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:5,6,0,2
chr17	8013883	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:3,2:5,0:0|1:8013883_A_C:8013883:2,7,0,2
chr17	8013884	.	C	CTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:0|1:8013883_A_C:8013883:2,7,0,2
chr17	8015579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,1:3,3:0,7,1,4
chr17	8021783	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,0:10,3:1,11,0,3
chr17	8021833	.	GAATCACTAAACAGTGGAGAGTTGCACTTGGTCATA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.379:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr17	8046772	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,20,5
chr17	8048379	.	C	CCCCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	8050404	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,135;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:2,2:4,7,0,3
chr17	8050737	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr17	8052525	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.765:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr17	8064083	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,22,0
chr17	8064923	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,23:0.248:95:26,0:44,23:0|1:8064923_T_C:8064923:36,36,0,23
chr17	8064929	.	G	GT	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=81.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,23:0.276:85:24,0:38,22:0|1:8064923_T_C:8064923:27,35,0,23
chr17	8079029	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr17	8108473	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=229,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:0,0:0,0:0|1:8108473_A_C:8108473:1,0,3,0
chr17	8108479	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=229,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:0,0:0,1:0|1:8108473_A_C:8108473:1,0,3,0
chr17	8110764	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,7,6
chr17	8113615	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,140;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:0,17,0,4
chr17	8132763	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,26:0,24:0,0,23,31
chr17	8134045	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	8137737	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,10:0,0,18,10
chr17	8138333	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:4,3,1,1
chr17	8138427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=88,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,3,3
chr17	8139327	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,15,6
chr17	8141707	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.973:32:0,18:0,13:0,0,17,15
chr17	8158273	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr17	8159232	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,6,9
chr17	8166172	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:9,4,0,2
chr17	8166378	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr17	8167962	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,337;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr17	8168224	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,13,13
chr17	8168600	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=95,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,3:14,0:11,9,2,1
chr17	8168636	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=90,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:6,3:12,0:12,6,1,2
chr17	8168805	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr17	8169006	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.754:9:1,6:1,1:1,1,3,4
chr17	8172273	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=137,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:9,3,2,0
chr17	8194318	.	GT	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,5:0,0,3,12
chr17	8197663	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	8215618	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:2,9,0,2
chr17	8216364	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,1:2,6,1,1
chr17	8224133	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=63,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,9:2,7:1,3,11,6
chr17	8243469	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=61,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.611:31:6,8:3,11:0|1:8243469_T_C:8243469:5,7,9,10
chr17	8243475	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=83,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:14,0:13,2:1|0:8243469_T_C:8243469:11,17,1,1
chr17	8243482	.	A	ACCAGGAAGG	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=83,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:14,0:10,2:1|0:8243469_T_C:8243469:10,15,1,1
chr17	8243484	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=76,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,2:0.100:28:11,0:10,2:1|0:8243469_T_C:8243469:9,17,1,1
chr17	8243485	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=76,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,2:0.107:26:10,0:10,1:1|0:8243469_T_C:8243469:8,16,1,1
chr17	8243785	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=42,131;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,4:2,5:1,3,5,5
chr17	8285398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,12:0,1:0,0,11,2
chr17	8354072	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:1,2:7,4:4,4,4,2
chr17	8354321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr17	8383344	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	8383894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	8387438	.	G	GATGA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=97.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,7:0,15:0,0,19,4
chr17	8390655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	8393900	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,4:0,5:2,3,3,6
chr17	8396010	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr17	8397208	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr17	8397247	.	A	AACTGCAACCTCCACCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr17	8404355	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8404360	.	A	ATCAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8404361	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8404363	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8404366	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8404367	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8404355_G_T:8404355:0,3,0,1
chr17	8411857	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:11,2:0|1:8411857_G_A:8411857:7,7,0,2
chr17	8411861	.	C	CACCATTGCTATGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,39;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:3,0:12,2:0|1:8411857_G_A:8411857:7,9,0,2
chr17	8411905	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=125,34113409;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:9,6,0,2
chr17	8415819	.	TTTC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,2:8,0:9,7,0,2
chr17	8416901	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:0,15:1,19:1,0,15,19
chr17	8417006	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.881:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr17	8438819	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:8438819_C_T:8438819:9,6,1,1
chr17	8438837	.	C	CTGTGGCAATCTCAACATCACCTGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:8438819_C_T:8438819:6,9,1,1
chr17	8449767	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	8451554	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr17	8451744	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	8455532	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr17	8473182	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr17	8508338	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.240:14:8,2:3,0:0|1:8508338_C_CAT:8508338:1,10,1,2
chr17	8508340	.	CTG	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.242:14:8,2:3,0:0|1:8508338_C_CAT:8508338:1,10,1,2
chr17	8508343	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=185,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:8508338_C_CAT:8508338:1,10,0,2
chr17	8647931	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr17	8656811	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr17	8701529	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,0:4,7:3,7,0,7
chr17	8707542	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0|1:8707542_C_CA:8707542:0,3,0,1
chr17	8707543	.	T	TTTCAAGAGGGACTCGGGCAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0|1:8707542_C_CA:8707542:0,3,0,1
chr17	8725214	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr17	8726827	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:12,0:11,6:9,14,0,6
chr17	8736394	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=224,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr17	8738575	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=250,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr17	8739821	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,3:3,3,1,4
chr17	8740201	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.116:49:22,0:20,5:25,19,2,3
chr17	8740298	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8740298_G_GA:8740298:1,0,0,1
chr17	8740300	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8740298_G_GA:8740298:1,0,0,1
chr17	8740303	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8740298_G_GA:8740298:1,0,0,1
chr17	8740305	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8740298_G_GA:8740298:1,0,0,1
chr17	8784149	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,5:3,6:2,7,3,8
chr17	8784361	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:5,9,2,4
chr17	8785087	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=81,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.343:33:16,5:5,6:0|1:8785087_A_C:8785087:8,14,8,3
chr17	8785092	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=81,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,12:0.361:34:15,5:6,7:0|1:8785087_A_C:8785087:8,14,8,4
chr17	8792029	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:9,1:5,7:6,9,2,6
chr17	8792065	.	G	GATACAGGATGAGACACA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:1,10,0,2
chr17	8794002	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0|1:8794002_T_C:8794002:3,0,2,1
chr17	8794009	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:8794002_T_C:8794002:3,0,2,1
chr17	8794014	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0|1:8794002_T_C:8794002:4,0,3,1
chr17	8796927	.	A	AGTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:9,11,0,2
chr17	9066098	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,11:0,0,11,4
chr17	9083081	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr17	9086228	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr17	9086293	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0,0,8,16
chr17	9086561	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,13:0,0,16,7
chr17	9086676	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:0,10:1,13:1,0,16,8
chr17	9086708	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,8:1,17:0,1,11,16
chr17	9086743	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,7:1,12:0,1,5,14
chr17	9124464	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=88,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.721:9:2,3:0,1:0,2,0,7
chr17	9281903	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=104,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,1:10,2:12,7,2,1
chr17	9408290	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,28;RU=A;STR;TLOD=81.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,2:0,7:0,0,7,13
chr17	9479048	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,12,6
chr17	9515777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,3:2,0:4,7,1,2
chr17	9532040	.	G	GA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.239:40:15,8:16,0:20,11,9,0
chr17	9532180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr17	9538675	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=67,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr17	9546551	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr17	9559656	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:0,3:3,3:3,0,6,0
chr17	9604934	.	CCACCAGTT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:2,0:0|1:9604934_CCACCAGTT_C:9604934:4,5,1,1
chr17	9604945	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:9604934_CCACCAGTT_C:9604934:4,5,1,1
chr17	9604947	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:9604934_CCACCAGTT_C:9604934:4,5,1,1
chr17	9604951	.	GA	CT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:9604934_CCACCAGTT_C:9604934:4,5,1,1
chr17	9729431	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=117,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,0:8,11:9,3,0,13
chr17	9760716	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,3:10,1:9,8,3,1
chr17	9769199	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,3:5,2:3,4,2,3
chr17	9774121	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.257:17:8,2:5,2:8,5,2,2
chr17	9783855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,0:3,3:2,3,0,3
chr17	9791159	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=79,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr17	9801579	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=162,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0|1:9801579_G_A:9801579:0,7,0,2
chr17	9801589	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:9801579_G_A:9801579:0,8,0,2
chr17	9820695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr17	9821249	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr17	9823059	.	T	TAGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,17;MFRL=79,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:9823059_T_TAGAC:9823059:1,1,0,1
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chr17	9823066	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:9823059_T_TAGAC:9823059:1,0,0,1
chr17	9837410	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr17	9872906	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=113,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr17	10205067	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr17	10210220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr17	10213210	.	T	TTTAAGAACGTCTTGGACTTGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=79,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	10214628	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	10216139	.	G	GCCCACTTCAGTAATTTGTACATTTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	10216442	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,8:0,0,12,1
chr17	10219366	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,2,14
chr17	10222061	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr17	10223714	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,8:1,4:0,1,7,5
chr17	10227635	.	A	AATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10227635_A_AATC:10227635:0,1,0,1
chr17	10227638	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10227635_A_AATC:10227635:0,1,0,1
chr17	10227641	.	G	GAAGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10227635_A_AATC:10227635:0,1,0,1
chr17	10227643	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10227635_A_AATC:10227635:0,1,0,1
chr17	10231417	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=86,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:4,8,5,4
chr17	10231498	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.737:6:1,2:0,2:0,1,0,5
chr17	10235360	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:4,1,3,2
chr17	10235498	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:10235498_A_C:10235498:8,6,1,1
chr17	10235503	.	C	CTGGACGAGAAGAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:10235498_A_C:10235498:8,8,1,1
chr17	10236464	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,4:2,3,4,6
chr17	10243589	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:2,7,2,2
chr17	10243789	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	10248934	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:14,0:4,2:0|1:10248934_C_A:10248934:10,8,1,1
chr17	10248937	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=126,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,0:4,2:0|1:10248934_C_A:10248934:10,8,1,1
chr17	10250081	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=167,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:1,0:9,2:0|1:10250081_A_G:10250081:8,4,1,1
chr17	10250086	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,0:8,2:0|1:10250081_A_G:10250081:9,4,1,1
chr17	10250088	.	C	CAGCCAGCCCTGACCAGAAAACTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=167,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,0:9,2:0|1:10250081_A_G:10250081:8,4,1,1
chr17	10254001	.	T	TTTA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.168:15:2,2:10,0:0|1:10254001_T_TTTA:10254001:6,7,1,1
chr17	10254002	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:2,2:11,0:0|1:10254001_T_TTTA:10254001:6,8,1,1
chr17	10254005	.	TGG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,2:10,0:0|1:10254001_T_TTTA:10254001:5,8,1,1
chr17	10254012	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:2,2:10,0:0|1:10254001_T_TTTA:10254001:4,9,1,1
chr17	10258153	.	GT	G,GTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31,34;MFRL=121,140,170;MMQ=60,60,60;MPOS=9,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=23.01,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,7,2:0.421,0.157:16:4,4,1:2,3,1:3,4,4,5
chr17	10258155	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:4,5,3,4
chr17	10263539	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.182:13:5,1:6,1:2,9,0,2
chr17	10265487	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=134,61;MMQ=40,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:10265487_G_A:10265487:10,14,1,1
chr17	10265493	.	CTGG	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=140,61;MMQ=40,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:9,2:0|1:10265487_G_A:10265487:9,14,1,1
chr17	10265497	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=134,61;MMQ=40,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:10265487_G_A:10265487:6,14,1,1
chr17	10265503	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=122,61;MMQ=40,49;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:10265487_G_A:10265487:2,14,1,1
chr17	10265505	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=127,61;MMQ=40,49;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,1:0|1:10265487_G_A:10265487:2,13,1,1
chr17	10267610	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr17	10297658	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,176;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:5,3,1,4
chr17	10299727	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:5,2:0|1:10299727_G_C:10299727:9,9,1,1
chr17	10299731	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=143,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:5,2:0|1:10299727_G_C:10299727:9,10,1,1
chr17	10304495	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:10,6:7,0:0|1:10304495_A_G:10304495:5,12,6,0
chr17	10304498	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:9,6:7,0:0|1:10304495_A_G:10304495:5,12,6,0
chr17	10309962	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	10315659	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=177,47767;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:5,3,3,0
chr17	10317125	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	10318636	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,6,12
chr17	10322438	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:6,3:4,0:0|1:10322438_G_A:10322438:0,11,0,3
chr17	10322443	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,1:4,0:0|1:10322438_G_A:10322438:0,11,0,2
chr17	10348354	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=119,150;MMQ=39,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:4,11:4,2:4,4,8,5
chr17	10348705	.	A	AGAAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=64,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGC;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:2,0:0,1:1,1,0,2
chr17	10354287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=190,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr17	10356528	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,63146;MMQ=60,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.068:70:16,0:50,4:52,14,4,0
chr17	10359782	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr17	10362746	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:1,5,4,5
chr17	10363410	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=186,114;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:3,11:0,7:2,1,10,8
chr17	10364191	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr17	10370095	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=6626348,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,1,0,1
chr17	10370097	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370101	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370103	.	T	TTGAGTG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370107	.	G	GTATGGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370113	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370115	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,21;MFRL=3313250,199;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10370095_G_GA:10370095:0,2,0,1
chr17	10370149	.	A	ACTGGAGATAATGGTC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	10399897	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr17	10408518	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,6:9,0:8,8,6,0
chr17	10409164	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,141;MMQ=40,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,2:13,0:13,18,1,1
chr17	10411301	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=64,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,37:0.494:75:13,21:22,14:18,20,31,6
chr17	10411335	.	G	GT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.593:27:6,10:3,3:7,4,7,9
chr17	10411370	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:10,10:0,1:0,10,0,11
chr17	10411632	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,7:4,7:5,1,8,6
chr17	10411795	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,58;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:8,3:8,11,3,0
chr17	10415632	.	T	TCTATAAGCTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10415632_T_TCTATAAGCTCA:10415632:1,3,0,1
chr17	10415637	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10415632_T_TCTATAAGCTCA:10415632:1,3,0,1
chr17	10415642	.	A	ACAGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=193,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr17	10415840	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr17	10418275	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:1,3,2,9
chr17	10426343	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr17	10428286	.	CA	TT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=131,239;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,3:9,0:0|1:10428286_CA_TT:10428286:9,13,0,3
chr17	10428289	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=131,239;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,3:9,0:0|1:10428286_CA_TT:10428286:9,13,0,3
chr17	10431185	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,3:5,0:4,9,1,2
chr17	10431195	.	TAGAAGAAAAAGTAAA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:1,10,1,1
chr17	10431275	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr17	10434925	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:1,7:7,7:5,3,9,5
chr17	10442954	.	T	TTCTGTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:10442954_T_TTCTGTA:10442954:0,4,0,1
chr17	10442956	.	C	CTACTGATGGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:10442954_T_TTCTGTA:10442954:0,4,0,1
chr17	10442959	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:10442954_T_TTCTGTA:10442954:0,3,0,1
chr17	10442977	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=407,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	10443342	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,0:10,9:6,6,0,9
chr17	10443445	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=69,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10443445_G_GA:10443445:0,2,0,1
chr17	10443449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=69,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10443445_G_GA:10443445:0,2,0,1
chr17	10443455	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=69,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10443445_G_GA:10443445:0,2,0,1
chr17	10443463	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:10443445_G_GA:10443445:0,3,0,1
chr17	10446182	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:4,3:4,5:5,3,6,3
chr17	10446508	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:2,5:3,4:2,3,2,7
chr17	10450816	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=68,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.601:38:7,8:8,15:8,7,12,11
chr17	10532011	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:7,0:19,2:0|1:10532011_G_C:10532011:15,11,1,1
chr17	10532015	.	C	CCCTATCTTCTGACCCT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:7,0:19,2:0|1:10532011_G_C:10532011:15,11,1,1
chr17	10532852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=243,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:10532852_C_T:10532852:3,0,1,0
chr17	10532855	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=243,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:10532852_C_T:10532852:3,0,1,0
chr17	10532884	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr17	10532989	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.155:30:12,0:14,4:0|1:10532989_G_T:10532989:18,8,2,2
chr17	10532994	.	CCT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.171:27:10,0:12,3:0|1:10532989_G_T:10532989:15,8,2,2
chr17	10533595	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.623:27:5,7:5,10:6,4,10,7
chr17	10535349	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr17	10535428	.	TTTTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,81;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTTG;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	10535761	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr17	10536184	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	10541340	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.426:12:0,1:4,0:0|1:10541340_A_C:10541340:3,4,5,0
chr17	10541346	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.350:15:1,0:6,1:0|1:10541340_A_C:10541340:5,5,5,0
chr17	10541351	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.262:13:1,0:9,0:0|1:10541340_A_C:10541340:5,5,3,0
chr17	10541515	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,12,13
chr17	10542803	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,4:1,7:2,0,4,7
chr17	10543122	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=112,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr17	10543183	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	10543218	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr17	10543281	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,69;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	10543444	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,10:0.158:67:31,10:26,0:29,28,10,0
chr17	10543463	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,38:0.565:67:16,29:12,7:13,16,26,12
chr17	10544018	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=91,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:2,5,2,3
chr17	10544416	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:7,10:11,10:14,5,7,13
chr17	10544696	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=59,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.720:10:0,4:2,3:2,1,2,5
chr17	10546103	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=106,48;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:18,4:8,0:17,10,4,0
chr17	10546130	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=115,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.643:34:8,14:5,7:7,6,15,6
chr17	10546149	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=106,72;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:0|1:10546149_G_A:10546149:17,6,1,1
chr17	10546161	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=124,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:0|1:10546149_G_A:10546149:17,5,1,1
chr17	10546175	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=99,101;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.172:32:14,0:11,5:17,10,3,2
chr17	10548992	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=89,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,4:1,2:3,1,4,2
chr17	10549184	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:3,12:2,7:1,4,12,7
chr17	10552000	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.429:27:10,7:5,5:6,9,5,7
chr17	10553046	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,5:0,2,1,7
chr17	10555021	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:6,3:8,8:9,7,7,4
chr17	10555028	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:4,3:6,8:6,6,6,5
chr17	10555061	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:1,1:0,3,0,3
chr17	10555063	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr17	10555969	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=138,133;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:7,2:2,1:0,11,0,3
chr17	10558422	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:4,0:6,5:5,6,0,5
chr17	10608864	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,1:1,0:0|1:10608864_T_A:10608864:0,4,1,1
chr17	10608870	.	TC	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0|1:10608864_T_A:10608864:0,4,1,1
chr17	10608872	.	T	TGAAGTGATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0|1:10608864_T_A:10608864:0,4,1,1
chr17	10626473	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=151,164;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	10626538	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=150,137;MMQ=48,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:8,1,2,0
chr17	11145285	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=189,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:9,2,2,0
chr17	11459012	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr17	11461087	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr17	11511412	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,13:0,3:0,0,12,4
chr17	11513661	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr17	11522764	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	11555990	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	11573049	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=104,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:4,5,0,2
chr17	11583351	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11583351_T_A:11583351:0,4,0,1
chr17	11583352	.	C	CACAAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11583351_T_A:11583351:0,4,0,1
chr17	11583355	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11583351_T_A:11583351:0,4,0,1
chr17	11583370	.	GG	CA,GACAACCCCACCACCAGTGGCATACCTAAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33,30;MFRL=145,172,202;MMQ=60,60,60;MPOS=9,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr17	11583374	.	CAGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:11583374_CAGCA_C:11583374:0,2,0,1
chr17	11583379	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11583374_CAGCA_C:11583374:0,1,0,1
chr17	11603300	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	11604598	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr17	11642380	.	A	ATGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.267:10:3,0:4,2:0|1:11642380_A_ATGG:11642380:1,7,1,1
chr17	11642382	.	A	ATGGAATCTTCCGGAATGCAATGGAATGGAAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:11642380_A_ATGG:11642380:1,6,1,1
chr17	11648332	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr17	11648444	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr17	11660938	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:11,0:15,11,3,0
chr17	11684438	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,2:15,0:0|1:11684438_C_T:11684438:12,18,1,1
chr17	11684455	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,2:15,0:0|1:11684438_C_T:11684438:12,16,1,1
chr17	11701045	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=105,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,2:8,1:11,9,2,1
chr17	11711219	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:14,0:0|1:11711219_G_A:11711219:14,13,1,1
chr17	11711224	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:11711219_G_A:11711219:8,15,1,1
chr17	11713577	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=88,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:5,2,4,3
chr17	11725429	.	G	GATCCACCCCTGCACACTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr17	11738083	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=77,70;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:11,4:19,0:15,15,3,1
chr17	11778240	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,16,6
chr17	11784829	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=292,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,0:0,1:0,2,0,2
chr17	11806266	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=97,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,4:1,3:3,3,0,7
chr17	11827353	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	11833286	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=153,157;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:2,0:11,3:8,5,0,4
chr17	11833287	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=110,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.566:18:1,2:5,9:4,3,5,6
chr17	11833365	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=82,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:0,5:5,7:5,0,8,4
chr17	11837161	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	11872893	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=131,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:11872893_C_CA:11872893:0,2,0,1
chr17	11872896	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=131,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11872893_C_CA:11872893:0,2,0,1
chr17	11887485	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.362:48:16,0:12,17:14,17,0,17
chr17	11887518	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=16,34,20,16;MFRL=100,144,117,126;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,17,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.76,9.47,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,4,8,3:0.205,0.389,0.183:19:1,2,4,0:0,2,1,1:0,4,3,12
chr17	12044440	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:11,0:0|1:12044440_T_A:12044440:11,7,1,1
chr17	12044448	.	T	TGG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:0|1:12044440_T_A:12044440:11,7,1,1
chr17	12620761	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,0:0,10:0,0,3,8
chr17	12647490	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,6:0,10:0,0,6,11
chr17	12659824	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,71;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:17,0:16,3:25,8,1,2
chr17	12663876	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,188;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,4:1,0:6,0,4,0
chr17	12798396	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=165,128;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	12812343	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr17	12852392	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	12859149	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr17	12859336	.	GGGACTGCAGGGCCTGAGCAGGGTGGGCA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=101,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:4,10,0,2
chr17	12877530	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr17	12897669	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,4:0,0:6,0,3,1
chr17	12898454	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=218,1063509;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr17	12898994	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr17	12899839	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,0,2
chr17	12901688	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:9,4:1,4:8,2,7,1
chr17	12903599	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:4,1:3,3:3,4,2,2
chr17	12905574	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=107,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:7,1,3,0
chr17	12905743	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=82,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.426:38:11,4:10,12:13,9,6,10
chr17	12906710	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:6,0,5,0
chr17	12909046	.	A	AATC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:6,5,5,0
chr17	12914920	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,1:5,6:10,0,5,2
chr17	12915009	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:6,6:16,6:10,12,7,5
chr17	12917856	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr17	12920260	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.349:38:9,3:16,8:8,17,5,8
chr17	12920526	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:2,0:2,2:1,13,0,5
chr17	13399486	.	A	AT,ATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=128,139,173;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=8.86,16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,8:0.258,0.377:21:2,2,5:5,3,3:8,0,13,0
chr17	13503752	.	GGAGGGCGAACTGGGGGTCACC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr17	13503878	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr17	13972811	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	13977813	.	C	CTTTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,1:0,11:0,0,1,11
chr17	13980350	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr17	14005373	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,15,2
chr17	14005386	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=97,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:11,7:1,5:11,1,9,3
chr17	14005647	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AT;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	14095639	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=104,132;MMQ=45,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:5,1:18,2:9,15,0,3
chr17	14139565	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,87;MMQ=27,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,30:0.838:35:2,20:3,10:1,4,15,15
chr17	14139774	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	14673431	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=61,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:2,4,2,1
chr17	14673479	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=66,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:20,0:7,2:0|1:14673479_C_T:14673479:18,9,1,1
chr17	14673486	.	CTCA	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=77,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:21,0:6,2:0|1:14673479_C_T:14673479:20,11,1,1
chr17	15138558	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:17,0:13,3:18,16,1,2
chr17	15138584	.	T	TC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:9,0:17,2:15,15,0,2
chr17	15162389	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:6,6:4,7:8,3,9,4
chr17	15217389	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.298:35:11,7:13,3:15,10,3,7
chr17	15217437	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.295:42:14,7:16,5:13,17,5,7
chr17	15217481	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=101,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:30,0:24,3:27,29,3,0
chr17	15222535	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr17	15343524	.	C	CCTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTT;STR;TLOD=86.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,6:0,17:0,0,9,14
chr17	15406123	.	CCTCTCT	C,CCT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,33,31;MFRL=66,91,105;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,9;RU=CT;STR;TLOD=7.64,27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,16:0.221,0.682:23:0,4,2:2,1,11:1,1,13,8
chr17	15498294	.	C	CACAGAAATGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=310,1586963;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:15498294_C_CACAGAAATGTGTG:15498294:0,3,0,2
chr17	15498296	.	C	CCAGACGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=239,1586963;MMQ=50,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.420:6:1,2:2,0:0|1:15498294_C_CACAGAAATGTGTG:15498294:1,3,0,2
chr17	15499737	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=230,290;MMQ=49,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr17	15500031	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,162;MMQ=27,57;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:5,1:1,6,1,2
chr17	15508521	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=107,214;MMQ=51,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,1:8,1:15,11,0,2
chr17	15508721	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=174,211;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15508721_C_CAG:15508721:1,0,0,1
chr17	15508722	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=174,211;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15508721_C_CAG:15508721:1,0,0,1
chr17	15510903	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=118,128;MMQ=43,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,3:15,0:13,10,2,1
chr17	15518919	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=124,97;MMQ=46,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,1:12,0:0|1:15518919_A_G:15518919:13,5,1,1
chr17	15518922	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,97;MMQ=46,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:6,2:12,0:0|1:15518919_A_G:15518919:13,5,1,1
chr17	15519190	.	A	AGTGGTTAT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=122,57;MMQ=27,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:3,2:4,0:0|1:15519190_A_AGTGGTTAT:15519190:1,6,1,1
chr17	15519193	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=122,57;MMQ=27,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:3,2:3,0:0|1:15519190_A_AGTGGTTAT:15519190:1,6,1,1
chr17	15519195	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=122,57;MMQ=27,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:2,0:0|1:15519190_A_AGTGGTTAT:15519190:1,5,1,1
chr17	15519202	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=122,160;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:1,1:0|1:15519202_AT_A:15519202:0,3,0,1
chr17	15519209	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=122,160;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15519202_AT_A:15519202:0,3,0,1
chr17	15532120	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=90,206;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,1:11,2:13,10,2,1
chr17	15532123	.	A	AGCCAGCACC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=95,1553486;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:12,2:0|1:15532123_A_AGCCAGCACC:15532123:13,14,2,0
chr17	15532126	.	C	CCTT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=93,1553486;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:15532123_A_AGCCAGCACC:15532123:12,14,2,0
chr17	15603799	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,151;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,10:5,3:5,6,3,10
chr17	15604395	.	TG	CA,CG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29,30;MFRL=145,114,123;MMQ=59,41,27;MPOS=9,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.00,19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,8:0.221,0.439:18:4,0,4:2,3,4:4,2,11,1
chr17	15604444	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=97,126;MMQ=51,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,16:0.257:64:25,4:23,12:26,22,8,8
chr17	15620481	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,165;MMQ=52,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr17	15620647	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,203;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	15638561	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=169,1453144;MMQ=52,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.294:9:2,2:4,0:0|1:15638561_C_CA:15638561:6,1,2,0
chr17	15638562	.	T	TGAGCAGGTTGATGTCAGAAAATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=169,1453144;MMQ=52,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:15638561_C_CA:15638561:5,1,2,0
chr17	15639041	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,240;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	15641457	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=162,87;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,0:9,3:0|1:15641457_T_C:15641457:1,23,1,2
chr17	15641459	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=162,87;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,0:11,2:0|1:15641457_T_C:15641457:1,23,1,2
chr17	15641462	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=168,87;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:0|1:15641457_T_C:15641457:1,22,1,2
chr17	15641472	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=179,87;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:5,3:0|1:15641457_T_C:15641457:1,9,1,2
chr17	15643382	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=114,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.662:12:0,8:4,0:3,1,5,3
chr17	15878443	.	T	A,C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,26,20;MFRL=78,96,98;MMQ=60,60,60;MPOS=32,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.38,42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,16:0.102,0.462:34:10,0,8:5,2,8:8,7,10,9
chr17	15878449	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=102,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:19,0:14,3:19,17,3,0
chr17	15881327	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:8,3,2,1
chr17	15905390	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15905390_G_GCT:15905390:0,3,0,1
chr17	15905393	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15905390_G_GCT:15905390:0,3,0,1
chr17	15907084	.	CAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr17	15909728	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,2:4,5:8,4,5,2
chr17	15930087	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:1,9,0,3
chr17	15935654	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:13,6:13,0:14,12,4,2
chr17	15935823	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=144,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:1,9,1,6
chr17	15968143	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:3,3:11,4:10,4,7,0
chr17	16046845	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=266,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.194:36:14,1:17,3:28,4,4,0
chr17	16068419	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=107,81;MMQ=51,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,2:0.038:77:35,2:30,0:0|1:16068419_T_C:16068419:43,32,1,1
chr17	16068427	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=104,81;MMQ=52,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,2:0.035:83:42,2:35,0:0|1:16068419_T_C:16068419:46,35,1,1
chr17	16068441	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=102,81;MMQ=52,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,2:0.033:89:41,2:42,0:0|1:16068419_T_C:16068419:47,40,1,1
chr17	16068463	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=107,73;MMQ=60,51;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,15:0.174:89:38,4:35,11:36,38,6,9
chr17	16068506	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=131,113;MMQ=54,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:13,6:15,7:9,19,1,12
chr17	16068545	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=132,166;MMQ=40,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:1,15,0,2
chr17	16089835	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:16089835_TC_T:16089835:18,1,1,1
chr17	16089838	.	TAGA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:16089835_TC_T:16089835:18,1,1,1
chr17	16097870	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=120,74;MMQ=59,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:6,6:12,8:8,10,7,7
chr17	16097899	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=149,143;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:0|1:16097899_C_T:16097899:2,6,0,5
chr17	16097912	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=149,143;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0|1:16097899_C_T:16097899:1,7,0,4
chr17	16097921	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=155,143;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:5,1:5,3:0|1:16097899_C_T:16097899:0,10,0,4
chr17	16120608	.	A	G	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=108,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,14:0.171:86:35,0:35,14:33,39,0,14
chr17	16221271	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	16221303	.	A	ATTCCAAAAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=306,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	16229062	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=101,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,4:7,0:9,3,4,0
chr17	16248083	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:5,4:2,2:0,7,0,6
chr17	16251859	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=90,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:1,0,13,1
chr17	16252085	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16252085_A_ACC:16252085:0,0,0,1
chr17	16252091	.	C	CCCAACCGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16252085_A_ACC:16252085:0,0,0,1
chr17	16256240	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=214,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr17	16285404	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,122;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.390:34:14,7:6,6:8,13,8,5
chr17	16321024	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:12,6:3,9:11,5,8,7
chr17	16323405	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=127,209;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:12,3:16,0:0|1:16323405_A_T:16323405:21,10,3,0
chr17	16323408	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=127,209;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:11,3:19,0:0|1:16323405_A_T:16323405:21,10,3,0
chr17	16323608	.	ATAGT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr17	16326933	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,0:8,4:10,8,2,2
chr17	16330919	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr17	16332072	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=66,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,8,0
chr17	16336979	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,0:14,3:9,17,2,1
chr17	16342524	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.588:47:11,16:7,9:10,9,10,18
chr17	16347222	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,154;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:10,9,0,3
chr17	16456251	.	CCACATTCTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:6,2:9,12,1,1
chr17	16526017	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=135,93;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:10,2:3,0:3,11,1,1
chr17	16612181	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=162,120;MMQ=45,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:7,7,0,2
chr17	16615184	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=129,329;MMQ=24,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:13,2:2,0:0|1:16615184_G_A:16615184:0,15,0,2
chr17	16615188	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=129,329;MMQ=24,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:14,2:2,0:0|1:16615184_G_A:16615184:0,16,0,2
chr17	16615192	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=142,329;MMQ=24,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:14,2:1,0:0|1:16615184_G_A:16615184:0,17,0,2
chr17	16615199	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=137,329;MMQ=24,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:13,2:2,0:0|1:16615184_G_A:16615184:0,16,0,2
chr17	16636078	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	16664972	.	TGAAGAAAGAGCAAGGAAGGAGATA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=108,152;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.102:38:18,2:15,1:16,19,0,3
chr17	16744163	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=145,120;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,4:1,0:1,3,0,4
chr17	16744194	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr17	16745184	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=183,163;MMQ=27,31;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.452:10:1,1:2,3:3,2,2,3
chr17	16745274	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=141,49;MMQ=27,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	16745588	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=280,333;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:16745588_CTG_C:16745588:0,1,1,0
chr17	16745591	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=280,333;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:16745588_CTG_C:16745588:0,1,1,0
chr17	16748666	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr17	16843171	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr17	16852027	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr17	16875383	.	CACTCATT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:12,0:7,16,1,1
chr17	16946073	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	16946343	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.672:13:2,2:2,7:1,3,1,8
chr17	17035036	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,3,4
chr17	17039561	.	CCAG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CAG;STR;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr17	17039613	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=154,164;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,3:4,1:6,4,2,2
chr17	17041137	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=197,0;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17041137_C_G:17041137:2,0,0,1
chr17	17041139	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=197,0;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17041137_C_G:17041137:2,0,0,1
chr17	17041157	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr17	17045861	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=305,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:1,0,9,1
chr17	17049426	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,9:5,6:4,3,7,8
chr17	17050573	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr17	17053401	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,3:2,0:4,1,3,1
chr17	17062241	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=88,153;MMQ=52,57;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.675:38:7,9:5,16:5,7,13,13
chr17	17070442	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=80,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:18,2:0|1:17070442_C_T:17070442:15,22,1,1
chr17	17070444	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=80,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:16,2:0|1:17070442_C_T:17070442:15,22,1,1
chr17	17075043	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,6:0.093:67:28,5:33,0:36,25,1,5
chr17	17075953	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,1:1,1:2,0,4,0
chr17	17118442	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,6:4,5:4,3,9,2
chr17	17120344	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:6,4:3,5,2,3
chr17	17122286	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	17124625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr17	17125015	.	G	GCAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17125015_G_GCAAA:17125015:0,1,0,1
chr17	17125017	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,21;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17125015_G_GCAAA:17125015:0,1,0,1
chr17	17125019	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17125015_G_GCAAA:17125015:0,1,0,1
chr17	17125021	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17125015_G_GCAAA:17125015:0,1,0,1
chr17	17150952	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=235,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr17	17152363	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,2:0,1:0,3,2,2
chr17	17158128	.	G	GAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=65,134;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,30;RU=A;STR;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:0,1:1,8:1,1,10,11
chr17	17158300	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=89,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:7,6:8,4:5,10,2,8
chr17	17158343	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=124,149;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr17	17163768	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,1:15,2:16,14,0,3
chr17	17165431	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=102,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:5,2:6,7:3,8,2,7
chr17	17168053	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr17	17168316	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	17179299	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.959:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr17	17179535	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:1,13,0,3
chr17	17183862	.	AC	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,33:0.452:73:16,10:20,22:0|1:17183862_AC_A:17183862:21,19,11,22
chr17	17183865	.	AAG	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,6:0.098:63:21,2:33,4:0|1:17183862_AC_A:17183862:25,32,5,1
chr17	17183866	.	AG	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,33:0.449:73:15,10:23,22:0|1:17183862_AC_A:17183862:21,19,11,22
chr17	17184097	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	17184399	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=110.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,29,3
chr17	17250048	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,11217759;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr17	17399060	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:17399060_G_T:17399060:0,4,1,1
chr17	17399062	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=171,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:17399060_G_T:17399060:0,4,1,1
chr17	17399065	.	GA	AC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=181,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:17399060_G_T:17399060:1,4,1,1
chr17	17412032	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:3,2:2,3:4,2,5,0
chr17	17415876	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.305:31:11,0:9,8:11,11,0,9
chr17	17425746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=75,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:3,0:2,2:0|1:17425746_C_T:17425746:2,3,1,1
chr17	17425748	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=75,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.326:7:2,0:2,1:0|1:17425746_C_T:17425746:2,3,1,1
chr17	17425761	.	G	GTGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=75,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:17425761_G_GTGA:17425761:2,1,0,1
chr17	17425763	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=75,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17425761_G_GTGA:17425761:2,1,0,1
chr17	17480187	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:6,2:7,2:0|1:17480187_A_G:17480187:8,5,3,1
chr17	17480195	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:6,4:5,4:0|1:17480187_A_G:17480187:7,4,4,4
chr17	17578641	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,61;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:8,1,1,1
chr17	17578768	.	CCTCCACTTCCCCGCAT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:19,2:19,0:20,26,0,2
chr17	17578792	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=112,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:17,3:16,0:14,20,1,2
chr17	17696241	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:5,8,1,1
chr17	17697098	.	AGC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.909:20:0,9:1,10:0|1:17697098_AGC_A:17697098:1,0,12,7
chr17	17697101	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.909:20:0,9:1,10:0|1:17697098_AGC_A:17697098:1,0,12,7
chr17	17713140	.	GCCGACGGC	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.585:10:3,4:1,2:0|1:17713140_GCCGACGGC_G:17713140:4,0,6,0
chr17	17713151	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0|1:17713140_GCCGACGGC_G:17713140:3,0,6,0
chr17	17713154	.	G	GGT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.703:8:0,4:1,2:0|1:17713140_GCCGACGGC_G:17713140:2,0,6,0
chr17	17713156	.	GGAGAC	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.730:9:0,4:1,2:0|1:17713140_GCCGACGGC_G:17713140:2,0,7,0
chr17	17713164	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.732:9:0,5:2,2:0|1:17713140_GCCGACGGC_G:17713140:2,0,7,0
chr17	17719503	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	17722581	.	ATG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=180,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:3,2:10,1:7,6,2,1
chr17	17772622	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,2:2,1:2,1,3,1
chr17	17782842	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr17	17782931	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,89;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,3:12,0:10,12,3,0
chr17	17786098	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,0:16,3:12,17,0,3
chr17	17786208	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:3,13,0,3
chr17	17880877	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.554:29:5,8:7,8:9,4,12,4
chr17	17881131	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,0:2,3:0,8,0,3
chr17	17896090	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,1:3,6:5,1,4,3
chr17	17896205	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=48,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,4:5,11:4,5,8,8
chr17	17897532	.	A	AGCATGGCAGAGGCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCATGGCAGAGGCG;STR;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,1:2,0,4,0
chr17	17897739	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:1,3,1,4
chr17	17919397	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:4,3:12,2:9,7,3,2
chr17	17919583	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:17919583_T_TC:17919583:0,4,0,1
chr17	17919584	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:17919583_T_TC:17919583:0,4,0,1
chr17	17928094	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:0,9,0,3
chr17	17928106	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:5,3:0,7,0,3
chr17	17931884	.	C	CAAAAAAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=124,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,25;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.447:15:0,0:1,4:3,5,2,5
chr17	17931894	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=74,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:3,3:17,0:3,17,3,0
chr17	17948448	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:11,14,0,3
chr17	17948475	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.515:27:6,9:7,5:5,8,6,8
chr17	17962266	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=85,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:13,2:12,10,0,3
chr17	17968672	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17968672_G_A:17968672:0,1,0,1
chr17	17968673	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17968672_G_A:17968672:0,1,0,1
chr17	18003648	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,7:0,12:0|1:18003648_G_A:18003648:0,0,10,12
chr17	18003671	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.965:27:0,14:0,11:0|1:18003648_G_A:18003648:0,0,13,14
chr17	18004951	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=204,95;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr17	18009824	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:7,13,1,1
chr17	18022039	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	18024013	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	18024476	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	18024920	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.267:15:4,3:5,1:0|1:18024920_A_C:18024920:1,10,3,1
chr17	18024924	.	AA	CC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=109,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.269:15:5,3:5,1:0|1:18024920_A_C:18024920:1,10,3,1
chr17	18024927	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.255:13:5,1:5,0:0|1:18024920_A_C:18024920:0,10,2,1
chr17	18024931	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:0|1:18024920_A_C:18024920:1,9,2,0
chr17	18025744	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,11:0,3:0,0,5,10
chr17	18027948	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,1:1,1:0,7,0,2
chr17	18029857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:1,3,0,5
chr17	18034174	.	G	GATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=203,133;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	18034190	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=220,143;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:18034190_C_G:18034190:0,2,0,1
chr17	18034192	.	A	ATCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=220,143;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:18034190_C_G:18034190:0,2,0,1
chr17	18034709	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=185,103;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:18034709_C_T:18034709:13,3,2,0
chr17	18034713	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=185,103;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:5,0:0|1:18034709_C_T:18034709:14,3,2,0
chr17	18036538	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:3,0:10,1,3,0
chr17	18038927	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:5,0,1,0
chr17	18042276	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr17	18042527	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,5:0,2:1,0,7,0
chr17	18042789	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr17	18042976	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr17	18043766	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr17	18043780	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:9,0,3,2
chr17	18043817	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,9:4,6:3,3,10,6
chr17	18044270	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=206,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	18045098	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,5:8,6:5,8,3,8
chr17	18045641	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr17	18046058	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,6:0,0,10,7
chr17	18046898	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=180,100;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.954:40:1,20:0,19:1,0,23,16
chr17	18047772	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr17	18047944	.	C	CCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr17	18051975	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	18052466	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,3:0,0,10,3
chr17	18052480	.	TTCTGGGATCTC	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:5,0:11,10,1,1
chr17	18052867	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.873:21:2,10:0,9:1,1,8,11
chr17	18054692	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.487:14:1,3:6,2:4,3,2,5
chr17	18054868	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr17	18054917	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=162,139;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr17	18057010	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,7,0
chr17	18057016	.	AAT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=152,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:4,1:5,2:10,0,3,0
chr17	18057215	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=87,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:11,0:9,7:9,11,3,4
chr17	18058100	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=192,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:0|1:18058100_G_A:18058100:8,5,1,1
chr17	18058108	.	A	AGACATAAGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=171,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:18058100_G_A:18058100:7,9,1,1
chr17	18058112	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=198,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:18058100_G_A:18058100:6,8,1,1
chr17	18058348	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	18059454	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=73,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,4:2,6:4,1,6,4
chr17	18066565	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:6,0:14,3:0|1:18066565_G_A:18066565:11,9,2,1
chr17	18066573	.	A	ACCAC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=107,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:18066565_G_A:18066565:10,11,1,1
chr17	18069628	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr17	18077175	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,6,15
chr17	18098253	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,3:6,1:10,5,2,2
chr17	18133277	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:6,6,1,3
chr17	18135753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	18137498	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,1:4,5:3,7,2,4
chr17	18139896	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,4:2,6:2,0,7,3
chr17	18140024	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:4,6,1,1
chr17	18141931	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:0|1:18141931_A_T:18141931:4,2,1,1
chr17	18141933	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:18141931_A_T:18141931:4,2,1,1
chr17	18141939	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=111,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:18141931_A_T:18141931:3,0,1,1
chr17	18141960	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,1:2,1,0,3
chr17	18144720	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=12094077,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	18146023	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:3,0:6,0:0|1:18146023_G_C:18146023:1,11,2,0
chr17	18146029	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=130,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:18146023_G_C:18146023:2,12,2,0
chr17	18149854	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr17	18150444	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr17	18154711	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,1:11,2:7,10,0,3
chr17	18156541	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr17	18164404	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.294:38:13,8:14,2:19,8,9,2
chr17	18167397	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=87,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	18167684	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=284,114;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr17	18184011	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:4,5:9,4:4,9,2,8
chr17	18188715	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:7,5:14,6:13,8,5,6
chr17	18188884	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=99,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr17	18194362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr17	18205750	.	TGGAGAGTGAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=197,89;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGAGTGAA;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,2:1,0:1,3,1,1
chr17	18208334	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	18208544	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=95,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:12,2:4,7:6,10,3,6
chr17	18218119	.	C	CTCCTCGCTCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=215,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr17	18218160	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=151,308;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18218160_T_G:18218160:0,1,0,1
chr17	18218164	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=151,308;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18218160_T_G:18218160:0,1,0,1
chr17	18220010	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=97,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.284:44:15,0:16,12:14,18,0,12
chr17	18226177	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:12,4:8,5:9,11,5,4
chr17	18226220	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:8,17,3,0
chr17	18231998	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,3,0
chr17	18239012	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:5,12,1,6
chr17	18259333	.	CAT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.726:16:1,3:3,9:3,1,3,9
chr17	18284262	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr17	18285850	.	TGGGCC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:10,2:11,11,1,1
chr17	18285988	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,3:3,2:3,8,0,5
chr17	18286234	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,272;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr17	18286916	.	AGCGGCAG	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.904:8:0,2:0,3:0|1:18286916_AGCGGCAG_A:18286916:0,0,6,2
chr17	18286930	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0|1:18286916_AGCGGCAG_A:18286916:0,0,5,4
chr17	18286938	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,2:0|1:18286916_AGCGGCAG_A:18286916:0,0,4,4
chr17	18291432	.	TCACAGC	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:0,0,12,2
chr17	18291456	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:0,0,9,5
chr17	18291470	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=20,28;MFRL=77,176;MMQ=33,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.686:17:1,7:4,4:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:3,2,7,5
chr17	18291544	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=173,142;MMQ=27,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,9:1,7:0,1,13,3
chr17	18291559	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=137,130;MMQ=59,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.722:23:3,9:3,8:4,2,11,6
chr17	18291618	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,16:0,0,11,23
chr17	18332389	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=124,133;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:18332389_G_A:18332389:0,4,0,1
chr17	18332393	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=124,133;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:18332389_G_A:18332389:0,4,0,1
chr17	18333164	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr17	18334097	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,174;MMQ=40,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr17	18380154	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=118,101;MMQ=60,53;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.492:59:19,16:11,13:19,11,20,9
chr17	18380163	.	GGA	G	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=93,105;MMQ=42,51;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,23:0.284:82:46,11:13,12:47,12,13,10
chr17	18391123	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.482:37:5,5:14,11:7,12,5,13
chr17	18392175	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,137;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:5,12:11,1:7,9,11,2
chr17	18393938	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	18394552	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,129;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:4,2:4,4:4,4,5,1
chr17	18394706	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=140,147;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr17	18396208	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=147,980175;MMQ=30,29;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:4,1,2,0
chr17	18396246	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=16,34;MFRL=165,197;MMQ=44,21;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.321:11:1,0:3,3:3,5,0,3
chr17	18397711	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,145;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:6,5:9,9:5,10,3,12
chr17	18498497	.	GA	G,GAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=18,32,20;MFRL=145,115,121;MMQ=60,60,40;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.94,32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,24:0.173,0.766:30:0,2,8:0,2,7:0,1,14,15
chr17	18541775	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	18541852	.	ACCCAC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,3:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:0,0,5,1
chr17	18541868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:0,0,5,2
chr17	18542074	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	18542105	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=151,194;MMQ=57,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18542105_G_A:18542105:0,1,0,1
chr17	18542107	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=151,194;MMQ=57,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18542105_G_A:18542105:0,1,0,1
chr17	18544520	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr17	18565699	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=131,125;MMQ=27,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr17	18566637	.	G	GCTTGAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=108,186;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	18584009	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=284,96;MMQ=27,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,2:0,14:1,0,12,6
chr17	18584212	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,237;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	18638151	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=115,125;MMQ=45,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:10,8:5,4:9,6,8,4
chr17	18638449	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,198;MMQ=57,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:12,0:15,7:13,14,0,8
chr17	18638462	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=127,198;MMQ=55,32;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:9,0:15,8:12,12,0,8
chr17	18659554	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,172;MMQ=57,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr17	18671930	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,80;MMQ=49,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:8,0:18,4:10,17,2,2
chr17	18671961	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=185,132;MMQ=34,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,6:2,14:1,1,6,14
chr17	18673147	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr17	18675803	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=135,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:31,4:29,0:35,27,3,1
chr17	18678548	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=80,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,31:0.654:47:12,16:4,13:7,9,9,22
chr17	18684487	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,143;MMQ=56,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr17	18708815	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=126,96;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,16:0.179:87:40,0:30,13:33,38,0,16
chr17	18708830	.	GT	G,GTT	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=31,32,28;MFRL=105,120,127;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=11.88,7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:59,12,7:0.135,0.100:78:22,6,4:26,6,0:24,35,6,13
chr17	18708991	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,228;MMQ=33,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr17	18770733	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,1:5,2:0,7,0,4
chr17	18775867	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=96,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,8:5,2:4,3,8,2
chr17	18775900	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=94,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,7:6,9:6,6,11,5
chr17	18776020	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,6:2,7:1,1,4,9
chr17	18781222	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,3:7,3:3,8,2,4
chr17	18793061	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,9:4,4:9,0,11,2
chr17	18793225	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:2,7:3,8:0,5,3,12
chr17	18814472	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:11,0:10,9,3,0
chr17	18814652	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=229,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr17	18814661	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	18834021	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,4:3,2:1,5,1,6
chr17	18872337	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:8,0,3,0
chr17	18874685	.	C	CGGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:6,3:2,1:6,3,3,1
chr17	18874720	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,201;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:7,2:4,1:9,4,2,1
chr17	18881624	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:13,9,1,1
chr17	18882991	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,6,6
chr17	18923681	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:7,5:4,2:4,7,0,7
chr17	18923818	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr17	18927464	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:0,1:4,1:5,0,2,0
chr17	18991077	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=149,155;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:8,0,4,0
chr17	18991181	.	T	G	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=72,129;MMQ=50,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=216.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,83:0.957:86:2,22:1,54:1,2,44,39
chr17	18991211	.	CTTT	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=130,171;MMQ=28,25;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.177:21:4,0:13,3:3,15,0,3
chr17	19189049	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:8,2:11,2:13,6,2,2
chr17	19213335	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr17	19232787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=103,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr17	19247075	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:5,3,3,2
chr17	19251235	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=175,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:1,6,0,3
chr17	19261179	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=71,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:11,11:10,0:7,14,11,0
chr17	19265797	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,6:3,4:7,2,7,3
chr17	19283162	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:14,0:23,4:22,15,1,3
chr17	19289641	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=97,84;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,14:0.259:54:24,0:15,12:21,19,12,2
chr17	19314611	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	19314917	.	CTTTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30,33,31;MFRL=109,130,126,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,25,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.53,6.31,9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,4,4,8:0.139,0.192,0.346:24:4,1,3,4:3,3,0,1:6,2,12,4
chr17	19319015	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:2,3,2,1
chr17	19458672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19458672_G_A:19458672:0,3,0,1
chr17	19458681	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19458672_G_A:19458672:0,3,0,1
chr17	19470018	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=127,75;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:19470018_A_G:19470018:12,1,1,1
chr17	19470027	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=116,75;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:0|1:19470018_A_G:19470018:12,3,1,1
chr17	19480593	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=224,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:1,3:1,0,5,2
chr17	19552476	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,2:2,2:1,6,0,5
chr17	19555976	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=88,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:5,13:6,13:5,6,9,17
chr17	19559623	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:5,10:3,9:7,1,18,2
chr17	19561011	.	GACTGAATT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGAATT;STR;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,8:3,3:3,1,10,1
chr17	19607432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:2,4,1,5
chr17	19608773	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=190,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.819:18:1,5:1,10:2,1,6,9
chr17	19609947	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,12,7
chr17	19610104	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,5:0,0,4,8
chr17	19641673	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:7,11,1,1
chr17	19641688	.	G	GAAAACAGACACCTACAGAAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:10,10,1,1
chr17	19643731	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr17	19644546	.	TAAATCCA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr17	19687307	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	19699358	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:8,0,7,1
chr17	19699605	.	CAT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.461:15:4,3:2,4:1,7,3,4
chr17	19729495	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,24:0.431:56:17,12:15,12:15,17,14,10
chr17	19744814	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:4,0:9,4:3,11,2,2
chr17	19749952	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31,31;MFRL=194,214,168;MMQ=60,60,46;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=4.04,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.314,0.361:7:1,2,1:1,0,2:2,0,5,0
chr17	19752997	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.643:21:4,3:2,11:6,1,13,1
chr17	19753205	.	A	AGATAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=187,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:19753205_A_AGATAC:19753205:0,4,0,2
chr17	19753208	.	T	TTCTTCTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=187,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:19753205_A_AGATAC:19753205:0,4,0,2
chr17	19769181	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=221,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,4:6,7:0,7,4,7
chr17	19812541	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:1,7:2,6:2,1,7,6
chr17	19827781	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:21,2:19,2:15,25,2,2
chr17	20000131	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.963:22:0,9:0,13:0,0,9,13
chr17	20059591	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=120,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	20107758	.	G	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.204:86:35,17:34,0:25,44,0,17
chr17	20109093	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:21,3:22,0:14,29,3,0
chr17	20130965	.	CA	TG	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=101,117;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.106:45:26,0:14,4:0|1:20130965_CA_TG:20130965:14,27,0,4
chr17	20130970	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=100,117;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.111:43:24,0:14,4:0|1:20130965_CA_TG:20130965:14,25,0,4
chr17	20150715	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,131;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,1,1
chr17	20156870	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=113,80;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:15,3:20,3:14,21,0,6
chr17	20160779	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:15,8,2,0
chr17	20321839	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,41;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:20321839_C_A:20321839:0,0,3,1
chr17	20321855	.	G	GTAGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=145,99;MMQ=49,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:20321839_C_A:20321839:2,0,0,1
chr17	20322051	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr17	20322574	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=224,156;MMQ=25,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20322574_CTT_C:20322574:0,3,0,1
chr17	20322578	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=224,156;MMQ=25,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20322574_CTT_C:20322574:0,3,0,1
chr17	20322594	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,314;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20322594_C_T:20322594:0,0,0,1
chr17	20322605	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,314;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20322594_C_T:20322594:0,0,0,1
chr17	20322612	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,314;MMQ=60,31;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20322594_C_T:20322594:0,0,0,1
chr17	20354747	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=87,167;MMQ=21,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:1,1,4,0
chr17	20370735	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,33;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	20370796	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,2
chr17	20370806	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,21;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,1
chr17	20370815	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,1
chr17	20768730	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=109,111;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:7,1:9,5,0,2
chr17	20768755	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:6,2:0|1:20768755_C_T:20768755:11,9,1,1
chr17	20768759	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:8,1:0|1:20768755_C_T:20768755:11,10,1,1
chr17	20768867	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=21,143;MMQ=39,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:1,2,1,0
chr17	20769832	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=129,108;MMQ=43,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,1:8,3:0|1:20769832_C_T:20769832:11,3,2,3
chr17	20769845	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=32,21;MFRL=119,108;MMQ=51,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:7,2:7,7:0|1:20769832_C_T:20769832:11,4,6,3
chr17	20769862	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=116,109;MMQ=52,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,13:0.359:37:8,3:12,10:0|1:20769832_C_T:20769832:18,6,9,4
chr17	20769866	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=112,109;MMQ=52,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,14:0.384:37:9,3:14,10:0|1:20769832_C_T:20769832:17,6,10,4
chr17	20769896	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=7;MBQ=32,21;MFRL=131,109;MMQ=52,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,28:0.500:56:10,3:17,25:0|1:20769896_G_T:20769896:19,9,16,12
chr17	20769899	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=131,109;MMQ=52,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,29:0.508:57:10,3:18,26:0|1:20769896_G_T:20769896:19,9,17,12
chr17	20769904	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=127,109;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,29:0.500:58:10,3:19,25:0|1:20769896_G_T:20769896:17,12,17,12
chr17	20769954	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=126,139;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=72.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,21:0.400:53:12,3:14,17:0|1:20769954_T_G:20769954:13,19,9,12
chr17	20769964	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=154,142;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,17:0.310:56:23,4:15,12:0|1:20769954_T_G:20769954:9,30,8,9
chr17	20769968	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=154,141;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,16:0.288:57:22,4:16,11:0|1:20769954_T_G:20769954:9,32,7,9
chr17	20769995	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=172,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.263:36:21,2:6,7:0|1:20769995_C_T:20769995:5,22,3,6
chr17	20770002	.	CC	AG	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=166,157;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:5,1:5,6:0|1:20769995_C_T:20769995:2,11,2,5
chr17	20770017	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=162,165;MMQ=52,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,1:9,3:2,14,1,3
chr17	20770042	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=166,153;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,1:5,6:0,8,0,8
chr17	20770088	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=219,185;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr17	20906257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	20906272	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,2:1,4:1,0,7,1
chr17	20907752	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr17	20908325	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr17	20911173	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=48,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,2:7,2:4,4,4,0
chr17	20911204	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=170,85;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,7:3,7:5,1,9,5
chr17	20914556	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=146,98;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.362:37:13,13:9,0:13,11,13,0
chr17	20914635	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,5:2,4:2,4,2,8
chr17	20921492	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	20924620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	20931872	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:10,8,0,2
chr17	21081624	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:13,3:10,0:13,10,3,0
chr17	21147404	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,12,2
chr17	21201667	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:2,1:6,1:6,2,3,0
chr17	21201851	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.703:18:1,7:3,6:1,4,2,11
chr17	21201884	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0|1:21201884_T_C:21201884:0,5,1,5
chr17	21201890	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0|1:21201884_T_C:21201884:0,5,1,6
chr17	21201894	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:0|1:21201884_T_C:21201884:0,4,1,6
chr17	21201907	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:21201884_T_C:21201884:0,4,1,4
chr17	21202237	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=92,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.292:34:6,2:18,6:8,16,3,7
chr17	21202272	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=92,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,5:9,5:7,8,2,8
chr17	21202310	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,4:3,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:2,3,0,5
chr17	21202316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:2,3,0,5
chr17	21202318	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=84,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:2,3,0,4
chr17	21203820	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=98,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:11,3:7,0:0|1:21203820_G_C:21203820:13,8,3,0
chr17	21203825	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=98,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:12,4:7,1:0|1:21203820_G_C:21203820:11,8,5,0
chr17	21203893	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=102,91;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.287:46:20,10:13,2:18,15,5,8
chr17	21203934	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,12:0.295:42:22,7:6,5:0|1:21203934_G_A:21203934:13,17,4,8
chr17	21203941	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:21,3:11,0:14,21,2,1
chr17	21203949	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:19,6:5,3:0|1:21203934_G_A:21203934:8,17,4,6
chr17	21203998	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:4,2:7,3:3,8,1,4
chr17	21204153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=165,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:4,3,4,0
chr17	21204187	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:9,4:10,3:14,8,6,1
chr17	21204290	.	GG	CA	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,0:11,2:12,17,1,1
chr17	21204308	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.304:30:12,3:7,4:8,13,2,7
chr17	21204314	.	TTG	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.238:26:11,2:9,4:0|1:21204314_TTG_T:21204314:7,13,1,5
chr17	21204318	.	A	ACG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.296:24:10,1:5,5:0|1:21204314_TTG_T:21204314:6,11,1,6
chr17	21205360	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=249,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0|1:21205360_G_A:21205360:3,0,3,1
chr17	21205361	.	GGCT	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=249,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0|1:21205360_G_A:21205360:3,0,3,1
chr17	21205396	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:5,2:0,1:0|1:21205396_C_A:21205396:6,0,4,0
chr17	21205406	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:6,4:2,2:0|1:21205396_C_A:21205396:8,1,6,0
chr17	21205592	.	GGC	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.208:27:17,4:5,1:0|1:21205592_GGC_G:21205592:5,17,5,0
chr17	21205604	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.219:21:9,2:4,1:0|1:21205592_GGC_G:21205592:2,15,4,0
chr17	21205606	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,9:2,3:3,2,2,10
chr17	21205642	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:0|1:21205642_T_G:21205642:1,9,0,5
chr17	21205654	.	AT	GA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:2,1:0|1:21205642_T_G:21205642:1,5,0,5
chr17	21206444	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:10,6:5,5:7,9,5,6
chr17	21207649	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr17	21207813	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.203:62:27,8:21,3:26,24,5,7
chr17	21207817	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.080:60:31,4:25,0:26,30,4,0
chr17	21207834	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=8;MBQ=28,22;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.111:51:25,3:19,2:17,29,3,2
chr17	21207835	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=27,24;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.295:52:19,11:18,4:16,21,4,11
chr17	21207844	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=25,23;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.198:48:21,6:18,3:14,25,6,3
chr17	21207908	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=25,22;MFRL=156,124;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:8,3:2,17,0,3
chr17	21207916	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr17	21207945	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:1,5,1,3
chr17	21208317	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.456:24:7,7:6,3:12,1,9,2
chr17	21208331	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=141,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.347:35:14,4:9,7:0|1:21208331_G_A:21208331:20,3,8,4
chr17	21208347	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=30,22;MFRL=142,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,12:0.342:36:13,4:11,8:0|1:21208331_G_A:21208331:20,4,6,6
chr17	21208349	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:12,5:15,3:20,7,5,3
chr17	21208413	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=10;MBQ=28,27;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.344:41:12,9:15,4:14,13,10,4
chr17	21208449	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=31,26;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,12:0.335:37:10,8:13,1:0|1:21208449_G_T:21208449:11,14,5,7
chr17	21208456	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=10;MBQ=27,29;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.378:35:9,9:11,3:0|1:21208449_G_T:21208449:8,14,5,8
chr17	21208465	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:15,0:11,3:0|1:21208465_C_T:21208465:9,17,1,2
chr17	21208481	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=31,23;MFRL=146,37;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:14,1:13,3:0|1:21208465_C_T:21208465:6,23,1,3
chr17	21208484	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=20,12;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.146:30:6,0:6,0:6,19,0,5
chr17	21215424	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:8,8:4,2:0|1:21215424_G_A:21215424:6,6,7,3
chr17	21215434	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=23,23;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:7,9:2,3:0|1:21215424_G_A:21215424:9,7,7,6
chr17	21215446	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:13,11:7,4:0|1:21215424_G_A:21215424:11,9,8,7
chr17	21215483	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:22,2:13,3:0|1:21215483_C_T:21215483:22,13,4,1
chr17	21215498	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:24,3:14,4:0|1:21215483_C_T:21215483:23,17,4,3
chr17	21215537	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=122,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.408:45:15,5:9,11:0|1:21215537_C_A:21215537:11,16,7,11
chr17	21215552	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=122,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,19:0.408:47:14,7:11,8:0|1:21215537_C_A:21215537:11,17,5,14
chr17	21215557	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,13:0.318:42:13,6:13,7:0|1:21215537_C_A:21215537:11,18,5,8
chr17	21215637	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:12,6:6,2:0|1:21215637_G_A:21215637:2,16,2,6
chr17	21215643	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:12,6:6,2:0|1:21215637_G_A:21215637:2,16,2,6
chr17	21216686	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=169,567;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:11,2,2,0
chr17	21216710	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:13,3,2,0
chr17	21216758	.	G	GCTTC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTC;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:8,2:2,2:3,7,5,0
chr17	21216788	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:9,3:5,6:3,11,5,4
chr17	21216891	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr17	21216951	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=176,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr17	21216964	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr17	21217397	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0|1:21217397_A_G:21217397:3,1,4,0
chr17	21217400	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0|1:21217397_A_G:21217397:3,2,4,0
chr17	21217411	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:1,0:7,4:4,4,4,0
chr17	21217513	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=106,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.437:48:12,7:15,13:11,16,10,11
chr17	21217547	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:5,4:7,3:0|1:21217547_T_C:21217547:5,10,5,3
chr17	21217554	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:6,4:8,3:0|1:21217547_T_C:21217547:5,11,4,3
chr17	21217566	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:7,2:3,3:3,8,2,3
chr17	21217586	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:2,2:0|1:21217586_G_T:21217586:1,7,0,4
chr17	21217596	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:21217586_G_T:21217586:0,5,0,2
chr17	21318663	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr17	21318698	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:7,3:8,2:15,1,5,0
chr17	21318741	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.086:34:17,1:14,1:28,4,2,0
chr17	21318918	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,14:0.293:49:16,9:19,5:18,17,9,5
chr17	21318948	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,10:0.314:33:8,4:13,4:0|1:21318948_C_T:21318948:12,11,5,5
chr17	21318951	.	CA	TG	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,10:0.297:35:8,4:15,5:0|1:21318948_C_T:21318948:14,11,5,5
chr17	21318952	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.365:26:5,3:10,6:10,7,4,5
chr17	21318969	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:11,6:18,4:15,14,4,6
chr17	21318981	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.239:40:9,6:20,3:15,16,4,5
chr17	21319272	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.308:33:13,7:10,2:12,11,7,3
chr17	21319285	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=217,168;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:12,6:10,3:12,10,7,2
chr17	21319302	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:8,8:5,6:8,5,9,6
chr17	21319311	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.264:35:14,5:11,3:19,7,5,4
chr17	21319407	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=12;MBQ=25,27;MFRL=134,211;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.137:56:22,5:24,2:20,29,3,4
chr17	21319436	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=27,23;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,11:0.255:45:12,7:20,4:0|1:21319436_G_A:21319436:10,24,3,8
chr17	21319439	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=27,30;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,11:0.255:45:11,6:19,4:0|1:21319436_G_A:21319436:10,24,3,8
chr17	21319452	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=29,21;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,11:0.245:47:15,6:19,3:0|1:21319436_G_A:21319436:12,24,2,9
chr17	21319465	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=162,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,10:0.250:42:14,6:15,3:0|1:21319436_G_A:21319436:11,21,3,7
chr17	21319470	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=27,27;MFRL=168,181;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,11:0.273:42:12,7:16,3:0|1:21319436_G_A:21319436:11,20,3,8
chr17	21319473	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=174,136;MMQ=59,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.249:42:17,3:14,7:10,22,4,6
chr17	21319488	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=167,184;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,10:0.281:37:9,6:17,4:0|1:21319436_G_A:21319436:11,16,4,6
chr17	21319519	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=153,211;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:12,7:16,3:0|1:21319519_G_C:21319519:19,10,4,6
chr17	21319523	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=29,26;MFRL=160,211;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,10:0.256:41:11,6:16,3:0|1:21319519_G_C:21319519:19,12,4,6
chr17	21319543	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=153,206;MMQ=52,45;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.232:37:13,6:14,0:0|1:21319519_G_C:21319519:18,11,4,4
chr17	21319560	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=168,225;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.236:32:11,7:10,0:0|1:21319519_G_C:21319519:15,10,3,4
chr17	21319650	.	CGAG	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:17,7:19,9:18,20,7,9
chr17	21319682	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,9:0.182:52:17,4:25,4:23,20,4,5
chr17	21319728	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=142,170;MMQ=60,42;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.146:46:18,2:20,4:19,21,1,5
chr17	21319743	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=133,173;MMQ=60,21;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,1:19,2:15,19,0,3
chr17	21319767	.	C	G,T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=24,30,26;MFRL=128,189,156;MMQ=60,50,60;MPOS=8,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.52,30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,13:0.220,0.442:29:4,2,5:5,3,8:3,7,5,14
chr17	21319785	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,2:8,4:2,11,1,5
chr17	21319786	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=184,189;MMQ=60,58;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:6,3:1,12,0,4
chr17	21319989	.	C	A,T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=24,26,24;MFRL=133,141,148;MMQ=60,60,60;MPOS=10,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=59.94,48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,17,15:0.381,0.342:44:9,6,7:2,9,6:8,4,26,6
chr17	21319993	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,33:0.694:47:12,13:2,18:11,3,27,6
chr17	21320008	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,22:0.371:60:17,11:15,11:0|1:21320008_C_T:21320008:29,9,16,6
chr17	21320012	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,22:0.359:62:21,11:18,9:0|1:21320008_C_T:21320008:28,12,16,6
chr17	21320025	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,32:0.418:76:26,16:16,13:30,14,19,13
chr17	21320263	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.259:29:10,5:10,2:14,8,5,2
chr17	21320279	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=156,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.272:32:13,3:9,3:12,11,6,3
chr17	21320365	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:15,7:8,3:7,16,2,8
chr17	21320392	.	C	CAAAA	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=31,17;MFRL=175,168;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=A;STR;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.434:7:3,0:1,0:1,3,1,2
chr17	21320424	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=29,26;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,3:1,2:0|1:21320424_AT_A:21320424:5,1,3,3
chr17	21320426	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=26,25;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,3:1,2:0|1:21320424_AT_A:21320424:5,1,3,3
chr17	21320429	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=27,23;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,4:1,1:0|1:21320424_AT_A:21320424:5,1,3,3
chr17	21320436	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=26,30;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:4,4:1,1:0|1:21320424_AT_A:21320424:5,0,4,3
chr17	21320440	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=31,25;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.534:17:4,6:2,1:0|1:21320424_AT_A:21320424:7,1,6,3
chr17	21320451	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.456:18:6,5:4,2:0|1:21320424_AT_A:21320424:9,1,6,2
chr17	21320480	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:11,6:7,8:15,4,12,2
chr17	21320499	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=27,31;MFRL=65,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,31:0.763:40:3,15:6,16:7,2,18,13
chr17	21320529	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=27,26;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,30:0.619:48:9,14:9,16:11,7,14,16
chr17	21320545	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=29,22;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.125:42:16,3:19,1:13,24,0,5
chr17	21320555	.	CA	TG	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.564:37:10,8:5,12:7,9,4,17
chr17	21320578	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=30,26;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:12,4:7,9:0|1:21320578_G_A:21320578:5,15,3,10
chr17	21320595	.	CA	TG	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,5:5,7:3,10,3,11
chr17	21320605	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,30;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.433:28:10,4:6,6:0|1:21320578_G_A:21320578:4,12,3,9
chr17	21320658	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=31,24;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:13,4:4,4:10,8,5,3
chr17	21320659	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=27,26;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,7:8,0:13,6,2,5
chr17	21320675	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=21,30;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.484:29:7,9:4,4:0|1:21320675_A_G:21320675:9,6,7,7
chr17	21320681	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=20,27;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:7,9:5,6:0|1:21320675_A_G:21320675:8,6,7,8
chr17	21320690	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,16:0.548:29:7,8:5,7:0|1:21320675_A_G:21320675:9,4,7,9
chr17	21320699	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=20,23;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.504:26:7,5:5,4:0|1:21320675_A_G:21320675:8,5,6,7
chr17	21320711	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=30,33;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:13,3:11,3:15,10,4,2
chr17	21320747	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:17,4:19,0:25,12,3,1
chr17	21320787	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,20:0.328:62:18,12:23,8:25,17,10,10
chr17	21320796	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,34:0.649:52:5,18:11,13:0|1:21320796_C_T:21320796:8,10,17,17
chr17	21320798	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,34:0.649:52:5,20:12,14:0|1:21320796_C_T:21320796:8,10,17,17
chr17	21320824	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=103,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,20:0.352:57:16,10:20,9:17,20,6,14
chr17	21320826	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=31,27;MFRL=99,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,12:0.219:57:17,9:27,3:16,29,7,5
chr17	21320851	.	C	CA	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=20,34;MFRL=85,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,13:0.274:48:15,5:18,8:14,21,2,11
chr17	21320853	.	CAA	C,CA	.	.	DP=51;ECNT=13;MBQ=20,32,31;MFRL=81,99,142;MMQ=60,60,60;MPOS=15,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.02,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,13,3:0.269,0.080:47:12,4,1:17,8,2:13,18,3,13
chr17	21320855	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=20,31;MFRL=65,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.277:43:14,3:16,9:13,18,1,11
chr17	21320867	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=30,25;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.394:41:9,6:16,9:10,15,3,13
chr17	21320882	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,33;MFRL=91,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:1,7:9,11:4,6,8,10
chr17	21320890	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=26,28;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:4,6:13,4:0|1:21320890_G_A:21320890:9,9,6,4
chr17	21320896	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,9:0.323:29:4,5:16,4:0|1:21320890_G_A:21320890:11,9,6,3
chr17	21320980	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:0,10:10,5:2,8,3,12
chr17	21320991	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=154,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,2:11,0:4,15,0,2
chr17	21320993	.	GG	TG,TA	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=34,27,24;MFRL=160,94,252;MMQ=60,60,60;MPOS=9,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.77,5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,8,2:0.407,0.135:20:1,5,2:9,1,0:1,9,2,8
chr17	21321016	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.397:18:1,5:10,2:0|1:21321016_T_C:21321016:1,10,2,5
chr17	21321028	.	CC	TG	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.397:18:1,4:9,3:0|1:21321016_T_C:21321016:1,10,2,5
chr17	21321050	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=124,197;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.529:19:3,3:5,6:0|1:21321050_C_T:21321050:3,6,3,7
chr17	21321052	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=117,168;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:2,6:5,7:0|1:21321050_C_T:21321050:1,6,7,7
chr17	21321064	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:4,3:12,3:6,11,3,3
chr17	21321250	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=145,104;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,13:0.637:20:4,8:3,5:0|1:21321250_G_A:21321250:4,3,8,5
chr17	21321252	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:8,2:5,3:0|1:21321250_G_A:21321250:7,6,3,2
chr17	21321955	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr17	21322607	.	CGTGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,31,30;MFRL=70,85,139;MMQ=60,60,60;MPOS=10,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,11,18;RU=GT;STR;TLOD=19.11,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,5:0.168,0.304:20:4,5,1:3,1,3:6,3,9,2
chr17	21322847	.	G	T	.	.	DP=97;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=87,85;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,20:0.215:95:47,9:26,11:38,37,10,10
chr17	21322859	.	CTG	C	.	.	DP=103;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=74,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,15:0.168:91:37,11:30,4:39,37,8,7
chr17	21322880	.	A	C	.	.	DP=148;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=92,79;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,36:0.251:146:31,23:40,12:0|1:21322880_A_C:21322880:25,85,17,19
chr17	21322883	.	G	A	.	.	DP=147;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=92,79;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,36:0.253:145:61,22:42,12:0|1:21322880_A_C:21322880:24,85,17,19
chr17	21322933	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.164:32:14,2:13,2:5,22,2,3
chr17	21322972	.	GT	CC	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:2,8:5,5:3,5,4,10
chr17	21322975	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.581:21:3,7:6,5:4,5,3,9
chr17	21323001	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:2,4:2,1,4,3
chr17	21323015	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:7,6,1,1
chr17	21323033	.	CG	TA	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=27,24;MFRL=124,189;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.539:21:3,4:6,5:5,5,4,7
chr17	21323056	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=124,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:9,1:13,3:0|1:21323056_G_T:21323056:11,11,0,6
chr17	21323074	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:8,3:14,3:0|1:21323056_G_T:21323056:12,13,0,6
chr17	21323096	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=31,23;MFRL=122,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:4,7:8,8:8,5,4,11
chr17	21323107	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=25,24;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:4,3:11,5:8,7,3,5
chr17	21323116	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=24,33;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:6,1:14,2:0|1:21323116_A_G:21323116:12,12,1,3
chr17	21323119	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=23,35;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:6,1:13,2:0|1:21323116_A_G:21323116:13,10,1,2
chr17	21323136	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=25,28;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:0|1:21323116_A_G:21323116:13,11,1,1
chr17	21323195	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=27,26;MFRL=117,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:2,4,1,4
chr17	21323214	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=98,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:0,1:2,3,1,3
chr17	21323236	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,22;MFRL=1091,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr17	21323244	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=183,1095;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr17	25909850	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr17	25912828	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	25917810	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr17	25919523	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:12,2:20,0:15,17,0,2
chr17	25936333	.	T	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.068:70:37,0:28,4:30,36,0,4
chr17	25944235	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	25949076	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=175,99;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,2,0
chr17	25958427	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.270:12:1,1:3,0:2,7,0,3
chr17	25967757	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.167:58:22,9:26,0:20,29,8,1
chr17	25969202	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,150;MMQ=57,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:11,3,3,0
chr17	25969440	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=115,149;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,5:3,2:1,6,1,6
chr17	26087722	.	GAGGATGCA	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:18,2:16,0:26,18,1,1
chr17	26088337	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	26092555	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:5,2,2,5
chr17	26093588	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=93,105;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:17,4:10,0:12,16,4,0
chr17	26096473	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:3,0,8,1
chr17	26096597	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:5,4:2,15:4,3,8,11
chr17	26101214	.	GCA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=102,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:9,0:15,5,2,0
chr17	26108040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.440:12:3,2:2,3:4,3,3,2
chr17	26109030	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,6:3,5:2,3,5,6
chr17	26109203	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	26110109	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=82,64;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:22,3:15,0:16,22,5,0
chr17	26125703	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:6,1:9,7,2,0
chr17	26206414	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr17	26495558	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:21,4:14,0:17,18,5,0
chr17	26603844	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,1:5,4:7,2,2,3
chr17	26646434	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr17	26667514	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=99,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.210:23:6,1:5,1:5,13,0,5
chr17	26669245	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr17	26679844	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,145;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:15,1,2,0
chr17	26680866	.	C	CATGTGCTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.168:15:4,0:9,0:0,13,0,2
chr17	26684529	.	G	GGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr17	26686369	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:15,5:23,0:17,21,5,0
chr17	26687484	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	26687898	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,6,10
chr17	26691647	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.396:36:12,0:9,14:9,13,0,14
chr17	26692224	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr17	26694979	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:4,4:6,0:11,2,0,5
chr17	26695704	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr17	26696107	.	G	GGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:26696107_G_GGTGC:26696107:0,0,0,1
chr17	26696109	.	G	GGTCTCAGGGGTTGTAAAACAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26696107_G_GGTGC:26696107:0,0,0,1
chr17	26696807	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,0:17,3:11,17,0,3
chr17	26698956	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	26708298	.	A	AGC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=163.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,18,20
chr17	26708302	.	GGT	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,18,20
chr17	26727721	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=59.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,8:0,0,12,9
chr17	26727747	.	AGG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=93,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,1:8,0:0|1:26727747_AGG_A:26727747:10,9,0,2
chr17	26727752	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=97,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,0:0|1:26727747_AGG_A:26727747:11,9,0,2
chr17	26729428	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	26731704	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,94;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:15,7:7,0:13,9,7,0
chr17	26816365	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.276:12:4,2:5,1:5,4,2,1
chr17	26817242	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr17	26817246	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr17	26818676	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr17	26820997	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=96,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:2,5:2,9:2,2,5,11
chr17	26850929	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr17	26851501	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=71,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.350:17:4,2:7,2:6,5,5,1
chr17	26856261	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:5,2:11,6:6,12,2,6
chr17	26861402	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:16,8,1,1
chr17	26861605	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=160,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.386:6:1,0:3,1:1,3,0,2
chr17	26861683	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:10,3:9,6,0,3
chr17	26864302	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,5:4,2:6,5,4,3
chr17	26874803	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.181:53:24,1:19,8:26,18,8,1
chr17	26875706	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:16,4:5,0:7,14,0,4
chr17	26883313	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.497:24:7,4:4,7:4,8,0,12
chr17	26898378	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,11;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:5,1:6,0:8,8,3,0
chr17	26901903	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:14,3:26,0:21,19,3,0
chr17	26901984	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.209:46:16,0:19,9:15,22,0,9
chr17	26906306	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,5:8,0:7,6,5,0
chr17	26911647	.	TAC	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=79,268100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:14,0:15,2:16,18,0,2
chr17	26938636	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,3:11,0:10,6,2,1
chr17	26939053	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=121,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:11,5:9,0:8,13,3,2
chr17	26942649	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:0|1:26942649_T_A:26942649:10,6,1,1
chr17	26942651	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:26942649_T_A:26942649:10,6,1,1
chr17	26947652	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=102,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:12,7:4,1:4,12,3,5
chr17	26951340	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=105,83;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:11,0:27,4:17,22,4,0
chr17	26955337	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:8,6:12,5:14,6,7,5
chr17	26958751	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=169,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:5,3,0,5
chr17	26960222	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:12,2:0|1:26960222_T_C:26960222:13,12,1,1
chr17	26960224	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:10,2:0|1:26960222_T_C:26960222:13,12,1,1
chr17	26960257	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=221,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,0:2,0:4,6,3,0
chr17	26961153	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr17	26961171	.	TT	CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:26961171_TT_CC:26961171:1,3,0,2
chr17	26961178	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:26961171_TT_CC:26961171:1,3,0,2
chr17	26961181	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,30;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:26961171_TT_CC:26961171:1,4,0,2
chr17	26961184	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:26961171_TT_CC:26961171:1,4,0,2
chr17	26963902	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr17	27000391	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:4,5:5,1:8,2,6,0
chr17	27002402	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:2,1:5,9:7,1,6,4
chr17	27004703	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:3,11:10,7:7,6,13,5
chr17	27010869	.	TTG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=134,81;MMQ=58,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.255:17:7,0:4,3:0|1:27010869_TTG_T:27010869:4,9,3,1
chr17	27010873	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=134,81;MMQ=58,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.258:17:8,0:3,3:0|1:27010869_TTG_T:27010869:4,9,3,1
chr17	27024715	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,314;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.090:54:31,4:16,0:22,28,4,0
chr17	27024870	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:6,4,1,2
chr17	27024912	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,0:5,1:2,7,3,0
chr17	27050924	.	AAT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=149,192;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.215:13:3,1:7,2:0,10,0,3
chr17	27051602	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.081:72:31,0:31,5:33,34,5,0
chr17	27051916	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:25,0:27,3:10,42,0,3
chr17	27061851	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.135:39:11,0:23,4:16,18,0,5
chr17	27068300	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr17	27069110	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=202,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr17	27074841	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=58,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:27074841_T_TGG:27074841:0,2,1,0
chr17	27074845	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=58,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:27074841_T_TGG:27074841:0,2,1,0
chr17	27075598	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=106,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,2:14,1:12,15,1,2
chr17	27183732	.	C	CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:3,1:2,1:2,8,2,1
chr17	27187636	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	27210134	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:0|1:27210134_G_T:27210134:9,16,1,1
chr17	27210138	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:27210134_G_T:27210134:8,16,1,1
chr17	27210253	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=580,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:1,10:0,10:0,1,8,13
chr17	27225937	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr17	27227975	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=139,67;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.119:39:13,4:19,0:29,6,4,0
chr17	27228470	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.632:9:1,0:2,1:0|1:27228470_A_C:27228470:0,3,6,0
chr17	27228474	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.493:12:1,0:4,0:0|1:27228470_A_C:27228470:2,4,6,0
chr17	27228477	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.460:13:1,2:4,3:0|1:27228470_A_C:27228470:2,5,6,0
chr17	27228482	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.404:15:2,2:6,1:0|1:27228470_A_C:27228470:3,6,6,0
chr17	27228487	.	CACGCAGGG	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:3,2:8,2:0|1:27228470_A_C:27228470:7,9,4,0
chr17	27228497	.	CTGCTG	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.210:22:5,2:11,1:0|1:27228470_A_C:27228470:9,9,4,0
chr17	27233437	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=142,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:14,3:21,0:0|1:27233437_T_C:27233437:18,17,2,2
chr17	27233438	.	G	GGTACAGTTCTAGACT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:14,4:20,0:0|1:27233437_T_C:27233437:18,17,2,2
chr17	27239797	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:4,5,2,0
chr17	27251317	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,4:4,0:0|1:27251317_G_T:27251317:1,11,2,2
chr17	27251318	.	T	TAACAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,4:5,0:0|1:27251317_G_T:27251317:1,11,2,2
chr17	27254016	.	CGAACAGTGCACCGGTGACACATCCACTCTCCAGGAGGCAACATTTCTTCACTCAGTGGAGGGTTACTGTGGG	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,2:0.044:67:22,2:9,0:31,34,1,1
chr17	27287948	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,0:10,3:10,7,2,1
chr17	27290969	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=88,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.644:17:4,7:1,3:4,2,8,3
chr17	27291202	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27291202_C_T:27291202:0,0,0,1
chr17	27291208	.	G	GCAGTCTTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27291202_C_T:27291202:0,1,0,1
chr17	27291212	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=12,31;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:27291202_C_T:27291202:0,1,0,1
chr17	27306661	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=100,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.724:20:1,4:4,7:3,2,8,7
chr17	27306898	.	CGTGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=GT;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	27382061	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,3:6,4:9,3,5,3
chr17	27401694	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=137,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:10,0:6,3:12,5,2,1
chr17	27409532	.	GGGGGTGTCT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=63,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:27409532_GGGGGTGTCT_G:27409532:0,2,0,1
chr17	27409540	.	C	CAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:27409540_C_CAAG:27409540:0,0,0,1
chr17	27409541	.	T	TTCAAGAGAAGAGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:27409540_C_CAAG:27409540:0,0,0,1
chr17	27409545	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27409532_GGGGGTGTCT_G:27409532:0,1,0,1
chr17	27413403	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.605:16:4,4:2,4:4,2,8,2
chr17	27413908	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:10,3,5,1
chr17	27420304	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr17	27421911	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=106,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,2,1
chr17	27422053	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,109;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:3,4:3,8:4,2,5,8
chr17	27424316	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=72,59;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,3:5,2:3,13,1,4
chr17	27434050	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,3:16,0:19,10,3,0
chr17	27438469	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.327:44:14,6:15,8:15,15,4,10
chr17	27438557	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=89,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:27,5:12,0:21,18,5,0
chr17	27442542	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=225,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.546:3:0,0:1,1:0|1:27442542_T_G:27442542:0,1,0,2
chr17	27442561	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.721:2:0,1:0,1:0|1:27442542_T_G:27442542:0,0,0,2
chr17	27449059	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr17	27574023	.	T	TCACACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	27576163	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,72;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,2:13,0:12,10,1,1
chr17	27591537	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:10,3:17,0:13,16,2,1
chr17	27620709	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,11;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,0:0,0:3,1,3,0
chr17	27620931	.	A	G	.	.	DP=181;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=104,140;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=134.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,55:0.318:175:71,0:47,55:55,65,1,54
chr17	27620951	.	GGCTGTGGTTGT	G	.	.	DP=103;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,3:0.040:92:46,3:31,0:0|1:27620951_GGCTGTGGTTGT_G:27620951:35,54,1,2
chr17	27620964	.	GAAATAATAATGGTGGTGGTGGTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGAGGGTGATGGTGCGGATGGTGGTGGC	G	.	.	DP=134;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:127,3:0.027:130:32,3:22,0:0|1:27620951_GGCTGTGGTTGT_G:27620951:48,79,1,2
chr17	27621038	.	GA	G	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:29,2:28,0:0|1:27620951_GGCTGTGGTTGT_G:27620951:21,40,1,1
chr17	27794298	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=193,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr17	27802597	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	27829588	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.393:13:4,2:4,3:8,0,4,1
chr17	27835052	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,3:5,0:8,9,2,1
chr17	27857551	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:29,2:15,2:20,25,3,1
chr17	27861066	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr17	27861113	.	TTC	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:12,2:10,1:14,9,2,1
chr17	27861329	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,10,23
chr17	27893015	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	27898828	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0|1:27898828_T_C:27898828:0,0,7,2
chr17	27898835	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:1,2:0|1:27898828_T_C:27898828:7,1,2,0
chr17	27901975	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	27903726	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr17	27904322	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr17	27904617	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0,0,8,8
chr17	27905629	.	GGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:27905629_GGGA_G:27905629:3,0,1,1
chr17	27905633	.	CAGGTCAAAGACTTGGAAAAGGTCATCGAGTCAGAGGCAGAGGAAGCAAGAGCAGAGGGTGGGGGATCAGAGAGGG	C	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.060:51:2,0:1,2:0|1:27905629_GGGA_G:27905629:28,19,3,1
chr17	27905673	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr17	27905818	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:36,4:15,0:17,34,2,2
chr17	27905819	.	A	AGCTGCT	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:38,2:15,0:0|1:27905819_A_AGCTGCT:27905819:18,36,1,1
chr17	27905823	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=118,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:30,2:14,0:0|1:27905819_A_AGCTGCT:27905819:18,27,1,1
chr17	27905825	.	GA	AT	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=116,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:29,2:13,0:0|1:27905819_A_AGCTGCT:27905819:18,26,1,1
chr17	27906124	.	C	CAAAATGTCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr17	27908914	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:9,0:0|1:27908914_A_C:27908914:2,12,2,0
chr17	27908918	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:9,1:0|1:27908914_A_C:27908914:2,12,2,0
chr17	27910706	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,5:0,1:0,0,1,8
chr17	27938811	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=187,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:5,3:3,4,2,1
chr17	27949934	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	27959239	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:7,5,1,1
chr17	27994241	.	T	TGTGGGG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:11,2:26,0:13,25,1,1
chr17	28029938	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,2:3,4:8,2,5,1
chr17	28120851	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,148;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,6:6,8:12,1,12,2
chr17	28296005	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,2:3,0:6,8,2,0
chr17	28323499	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr17	28361475	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr17	28378276	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:6,4:4,2:4,7,2,4
chr17	28380697	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:15,0:24,3:0|1:28380697_A_G:28380697:22,17,0,3
chr17	28380702	.	G	GCCCTGACTAAAAAAAA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=110,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:17,0:23,3:0|1:28380697_A_G:28380697:27,15,0,3
chr17	28386526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr17	28400734	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:7,8,3,7
chr17	28400792	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=152,163;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.350:17:1,0:10,4:2,9,0,6
chr17	28407287	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:2,3,2,1
chr17	28408070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	28409827	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	28410124	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr17	28417376	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:2,1,6,1
chr17	28434826	.	ACTTTT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTT;STR;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,0:6,4:10,2,4,0
chr17	28505024	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr17	28505248	.	GA	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,136;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:6,0:15,9:5,16,0,9
chr17	28506264	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,281;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.104:55:28,0:21,5:23,27,1,4
chr17	28525582	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr17	28538532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=38,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr17	28545191	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=95,89;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.116:49:27,5:16,0:29,15,5,0
chr17	28549898	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr17	28549977	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	28598409	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=123,888;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,2:2,0:2,5,0,2
chr17	28612448	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=97,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.518:48:14,10:9,14:9,14,11,14
chr17	28644126	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,6:6,0:7,1,6,0
chr17	28656471	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:16,0:5,3:9,12,0,4
chr17	28659010	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.581:34:4,8:10,11:12,2,15,5
chr17	28659019	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:9,7:14,10:15,8,15,2
chr17	28659079	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.078:62:28,0:30,4:29,29,2,2
chr17	28659093	.	A	ATGGTAGACTCCTTGAGCGGAAGTGTG	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:28,0:31,3:31,30,2,1
chr17	28750673	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:17,0:16,8:19,14,0,8
chr17	28765935	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=142,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.169:24:8,3:11,1:17,3,2,2
chr17	28778720	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.276:45:21,2:12,10:17,16,9,3
chr17	28811658	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.436:27:7,7:7,5:13,2,10,2
chr17	28890203	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=103,114;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.233:23:5,2:10,2:8,10,5,0
chr17	28900708	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr17	28900861	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=154,145;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,6:6,3:7,5,5,4
chr17	28900915	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=94,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.600:30:5,10:6,8:5,7,10,8
chr17	28903011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=103,203;MMQ=31,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr17	29120446	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,4:10,0:14,2,4,0
chr17	29182290	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=100,151;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:18,0:11,3:17,12,0,3
chr17	29206421	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=101,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.260:37:11,5:11,5:20,7,7,3
chr17	29221227	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=243,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr17	29258846	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,85;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.292:13:2,1:2,3:4,5,3,1
chr17	29276272	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:12,6,2,0
chr17	29315087	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:5,2:19,1:12,12,2,1
chr17	29325662	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.163:23:7,2:9,0:16,4,3,0
chr17	29486136	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:0|1:29486136_C_G:29486136:7,14,1,1
chr17	29486138	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:29486136_C_G:29486136:7,14,1,1
chr17	29486152	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr17	29496819	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	29508775	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,21,16
chr17	29528406	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,131;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.131:33:16,1:12,3:19,10,2,2
chr17	29541437	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr17	29545987	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr17	29546175	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr17	29563075	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,2:1,0:1,6,0,3
chr17	29586065	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,163;MMQ=55,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,11:14,0:17,7,11,0
chr17	29632225	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,7:0.105:74:45,0:20,7:44,23,0,7
chr17	29646024	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=186,278;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr17	29646032	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=255,177;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr17	29647358	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:0,1:6,1:4,4,2,1
chr17	29653115	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=104,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,0:8,3:9,5,2,1
chr17	29654599	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:17,5,2,0
chr17	29654660	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=118,136;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,0:13,3:13,12,0,3
chr17	29654876	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,4:2,7:0,3,2,9
chr17	29654912	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr17	29663624	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,1:2,1:0,2,2,0
chr17	29670190	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:0,7,0,6
chr17	29679246	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,7:2,1:3,2,7,1
chr17	29684153	.	TCCAGTCTACTTTTAGGAGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr17	29687527	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:14,0:15,5:20,9,1,4
chr17	29758897	.	CG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=103,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:6,0:8,7,1,1
chr17	29758908	.	C	CAGGAGTCTCCCAAGTGCGCAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:10,10,1,1
chr17	29761030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	29844658	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,5,1
chr17	29844909	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=38,30;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:5,5:9,4:0,14,0,9
chr17	29848450	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	29848991	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,0:15,4:14,15,0,4
chr17	29850698	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr17	29852092	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=78,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:5,1,5,6
chr17	30179249	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=112,134;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,17:0.269:65:24,0:23,16:22,26,0,17
chr17	30179368	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=143,160;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:13,0:13,4:0|1:30179368_G_A:30179368:5,23,0,4
chr17	30179374	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=121,160;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.184:25:13,0:8,4:0|1:30179368_G_A:30179368:4,17,0,4
chr17	30183857	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,2:2,7:2,2,5,5
chr17	30183967	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:30183967_A_AC:30183967:0,0,0,1
chr17	30183969	.	T	TCGGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:0,0:0|1:30183967_A_AC:30183967:0,1,0,1
chr17	30183972	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30183967_A_AC:30183967:0,1,0,1
chr17	30183976	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30183967_A_AC:30183967:0,1,0,1
chr17	30183978	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30183967_A_AC:30183967:0,1,0,1
chr17	30185892	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:0,3,0,7
chr17	30190540	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.227:18:9,1:5,3:4,10,1,3
chr17	30190554	.	A	AGGAGTAAAGATATCCCTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:5,11,0,2
chr17	30190628	.	TTAAC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr17	30200644	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,7:2,2:5,1,8,1
chr17	30200746	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:9,0:21,3:13,18,1,2
chr17	30219703	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=86,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:2,5:5,7:4,3,9,3
chr17	30228656	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,18:0,0,8,25
chr17	30293149	.	CT	C,CTT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=130,127,126;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.62,13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,10,15:0.186,0.313:46:12,7,9:9,3,5:12,9,16,9
chr17	30302411	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:7,0,3,0
chr17	30303480	.	TATATC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=145,157;MMQ=53,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,4:5,2:12,4,4,2
chr17	30315616	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=224,80;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:2,1:0,0:0,2,0,2
chr17	30320320	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.102:66:31,6:29,0:30,30,5,1
chr17	30320860	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.446:18:5,2:5,4:10,0,8,0
chr17	30321567	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,0:2,3:9,0,1,2
chr17	30321762	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=97,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:6,2:2,5,0,3
chr17	30322880	.	TT	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	30325752	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,74;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:25,3:14,0:23,16,2,1
chr17	30348468	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:5,2:14,0:0|1:30348468_G_A:30348468:8,11,1,1
chr17	30348478	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:0|1:30348468_G_A:30348468:6,11,1,1
chr17	30351901	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	30351916	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	30376932	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=115,152;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,2:3,4:6,3,6,0
chr17	30377162	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:8,6:10,1:2,16,0,7
chr17	30380381	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,13:0.280:48:20,6:15,7:20,15,4,9
chr17	30469423	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:0,9,0,7
chr17	30470028	.	G	GC	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,15:0.204:77:22,7:38,8:27,35,6,9
chr17	30502955	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,10:4,3:9,1,10,3
chr17	30509939	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=66,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,6:0,3:1,0,1,8
chr17	30520239	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=121,144;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,5:0.084:67:34,0:25,4:0|1:30520239_G_A:30520239:26,36,0,5
chr17	30520242	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=121,144;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,5:0.085:67:32,0:24,4:0|1:30520239_G_A:30520239:26,36,0,5
chr17	30526460	.	GATTT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,72;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTT;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.094:29:12,2:13,0:15,12,1,1
chr17	30526645	.	G	GAAGTGCTATATGTATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	30594967	.	A	AC	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=121,155;MMQ=60,37;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.246:55:22,11:20,1:20,22,0,13
chr17	30643361	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr17	30643428	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=44,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:30643428_T_TA:30643428:2,1,0,1
chr17	30643429	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=44,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:30643428_T_TA:30643428:2,1,0,1
chr17	30659006	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,2,15
chr17	30659071	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr17	30662432	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:6,12,1,1
chr17	30664856	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=104,98;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:16,0:12,13,1,1
chr17	30665005	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=87,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,3:7,6:3,9,3,6
chr17	30677298	.	C	A	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,23:0.188:124:55,22:43,0:63,38,23,0
chr17	30679002	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=145,210;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr17	30687522	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	30687599	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.394:13:7,2:1,3:8,0,3,2
chr17	30696292	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=138.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,12:0,22:0|1:30696292_C_T:30696292:0,0,18,19
chr17	30696296	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=87,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,21:0.556:38:5,7:10,14:0|1:30696292_C_T:30696292:7,10,12,9
chr17	30791503	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr17	30791509	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,3:7,6:11,4,3,6
chr17	30801825	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:15,2:17,1:19,15,2,1
chr17	30807461	.	TGTCTAACCTCATCTTTTACCTG	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=126,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:6,1:15,1:21,13,0,2
chr17	30815747	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:10,8,3,0
chr17	30822034	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr17	30980972	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr17	31039255	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	31082747	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr17	31107845	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr17	31258686	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,4,20
chr17	31266379	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=229,160;MMQ=49,35;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	31266419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=166,153;MMQ=30,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,5:0,7:1,0,11,2
chr17	31266438	.	A	AGG,AAGG,AAAGG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30,31,28;MFRL=166,166,182,99;MMQ=30,50,40,52;MPOS=21,18,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=8.27,4.75,11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,3,6:0.289,0.239,0.409:14:1,2,2,2:0,2,1,4:1,0,10,3
chr17	31319024	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:31319024_A_C:31319024:0,0,3,6
chr17	31319033	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:31319024_A_C:31319024:0,0,3,5
chr17	31319092	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	31324395	.	TCA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=141,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:4,0:6,4:8,2,3,1
chr17	31344549	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,5,4
chr17	31355227	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr17	32582424	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:9,13,1,1
chr17	32614777	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr17	32683712	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=161,175;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,1:8,1:0|1:32683712_T_TG:32683712:3,7,0,2
chr17	32683717	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=167,175;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,1:9,1:0|1:32683712_T_TG:32683712:3,9,0,2
chr17	32688712	.	TG	CA,CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,129,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.88,4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.568,0.336:6:0,2,1:0,2,1:0,0,6,0
chr17	32688992	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:1,0:2,0:0|1:32688992_C_A:32688992:0,3,0,2
chr17	32688998	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:1,0:0|1:32688992_C_A:32688992:0,3,0,2
chr17	32904480	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	32904586	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,25:0,10:0,0,24,11
chr17	32904733	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=209,99;MMQ=60,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0|1:32904733_G_GGC:32904733:0,2,0,1
chr17	32904734	.	T	TAACCAGTTTGTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=209,99;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0|1:32904733_G_GGC:32904733:0,2,0,1
chr17	32904737	.	C	CTCAACGTGTGTGACATGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=209,99;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32904733_G_GGC:32904733:0,2,0,1
chr17	32908036	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr17	32908064	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr17	32908210	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	32956286	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	32956933	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=104,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	32961751	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr17	32962179	.	GATTTTCCTAACCCCAACTGGCCCCCAGAACACTCTTCCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	32965275	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=220,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.454:11:1,0:3,1:0|1:32965275_AC_A:32965275:0,6,1,4
chr17	32965285	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,5:0.428:12:1,2:6,3:1|0:32965275_AC_A:32965275:1,6,0,5
chr17	33288433	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26,25;MFRL=186,150,80;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=10.54,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,2:0.497,0.248:10:0,2,0:2,2,1:1,1,1,7
chr17	33309982	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,24,20,25;MFRL=155,81,126,153;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,11,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=8.14,10.53,6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,8,9,7:0.254,0.297,0.224:30:4,3,5,2:0,2,0,1:4,2,11,13
chr17	33310077	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.091:63:30,5:27,0:19,39,0,5
chr17	33317908	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:9,0,3,0
chr17	33318215	.	TCTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0|1:33318215_TCTGG_T:33318215:0,3,0,1
chr17	33318223	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33318215_TCTGG_T:33318215:0,4,0,1
chr17	33318228	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33318215_TCTGG_T:33318215:0,3,0,1
chr17	33328205	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=106,175;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr17	33328438	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=90,112;MMQ=60,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:7,0:7,4:7,8,0,4
chr17	33329757	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,2:12,2:16,9,2,2
chr17	33330150	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:2,6,2,5
chr17	33331575	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,4:2,3:0,3,2,5
chr17	33341715	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:7,7:12,0:14,5,6,1
chr17	33341744	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:7,7:19,0:16,10,6,1
chr17	33341834	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:5,12:4,9:4,5,8,13
chr17	33353332	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:7,5:1,6:4,4,9,3
chr17	33353546	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:9,2:18,0:11,17,2,0
chr17	33427987	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:6,0:11,2:6,11,1,1
chr17	33434572	.	T	TCAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	33444090	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=107,100;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:3,11,0,2
chr17	33444107	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=121,100;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr17	33445576	.	AGCG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:15,2:7,0:9,14,1,1
chr17	33448818	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=64,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.495:42:8,6:13,13:6,15,13,8
chr17	33449006	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	33464595	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=96,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,2:4,1:7,6,2,1
chr17	33464864	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,2:4,6:3,6,2,6
chr17	33481698	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:6,0:5,2:7,4,0,2
chr17	33486507	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:33486507_C_T:33486507:9,9,1,1
chr17	33486514	.	A	ATT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:11,2:0|1:33486507_C_T:33486507:11,10,1,1
chr17	33486515	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=169,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:33486507_C_T:33486507:11,9,1,1
chr17	33486517	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=169,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:11,1:0|1:33486507_C_T:33486507:11,9,1,1
chr17	33497331	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=193,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr17	33502967	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:8,3:3,0:4,8,2,1
chr17	33510656	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=60,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr17	33513591	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=172,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:3,4,2,2
chr17	33520263	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=121,121;MMQ=50,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.753:18:3,5:1,9:2,2,11,3
chr17	33520307	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=119,189;MMQ=50,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.266:36:8,9:15,0:12,15,9,0
chr17	33586333	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=162,223;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:12,0:4,4:0|1:33586333_T_A:33586333:6,10,0,4
chr17	33586338	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=162,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:10,0:3,4:0|1:33586333_T_A:33586333:4,10,0,4
chr17	33586626	.	T	TGCTTTATGCTAGGTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	33592914	.	ACC	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,1:0,9,0,2
chr17	33592948	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:33592948_C_T:33592948:0,4,0,1
chr17	33592952	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:33592948_C_T:33592948:0,4,0,1
chr17	33687416	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.683:17:1,5:4,7:0|1:33687416_C_T:33687416:0,5,4,8
chr17	33687421	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=115,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:0|1:33687416_C_T:33687416:3,10,0,2
chr17	33687423	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=115,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:33687416_C_T:33687416:3,10,0,2
chr17	33689926	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,15,9
chr17	33690863	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	33748939	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr17	33749546	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,2:0,6:1,0,3,6
chr17	33879670	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:33879670_C_CAT:33879670:0,0,3,0
chr17	33879682	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:33879670_C_CAT:33879670:0,0,5,0
chr17	33881631	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,27:0,15:0,0,25,17
chr17	33881655	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=107,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:26,3:14,0:20,20,2,1
chr17	33881718	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=15,24;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.968:34:0,14:0,16:0|1:33881718_G_A:33881718:0,1,14,19
chr17	33881734	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.969:31:0,9:0,12:0|1:33881718_G_A:33881718:0,0,10,21
chr17	33881769	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,26,25;MFRL=109,117,168;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=10.25,11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,8:0.362,0.526:15:0,4,5:1,2,2:0,1,1,13
chr17	33884114	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:10,0:11,7,1,1
chr17	33921160	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr17	33968871	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr17	33998683	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	34001121	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=101,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr17	34001139	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	34067555	.	G	GGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=62,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:34067555_G_GGC:34067555:2,2,1,1
chr17	34067556	.	A	AATG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=62,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:34067555_G_GGC:34067555:2,2,1,1
chr17	34067558	.	AGG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=62,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:34067555_G_GGC:34067555:2,2,1,1
chr17	34071995	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:6,6,0,3
chr17	34100350	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,6,10
chr17	34147533	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.651:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr17	34151090	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=96,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:32,3:26,1:36,24,2,2
chr17	34151101	.	T	G	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:27,3:29,0:31,25,3,0
chr17	34161520	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:11,4:10,2:16,5,3,3
chr17	34165594	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,1:6,6:0,9,1,6
chr17	34171731	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=79,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,4:0.073:55:19,2:23,2:0|1:34171731_A_T:34171731:29,22,2,2
chr17	34171734	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=80,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,4:0.075:54:20,1:20,2:0|1:34171731_A_T:34171731:29,21,2,2
chr17	34172094	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,2:1,0:0,7,0,2
chr17	34182194	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:29,0:18,3:20,29,0,3
chr17	34192492	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34192492_C_A:34192492:0,0,0,1
chr17	34192493	.	A	ACGGAATGGAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34192492_C_A:34192492:0,0,0,1
chr17	34199519	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.202:32:15,1:10,5:3,23,2,4
chr17	34310774	.	G	GAGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:1,2:2,0:0|1:34310774_G_GAGCA:34310774:2,2,1,1
chr17	34310776	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:2,1:2,0:0|1:34310774_G_GAGCA:34310774:2,2,1,1
chr17	34312943	.	A	ATGAGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	34313646	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=117,135;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:18,0:15,4:0|1:34313646_T_G:34313646:27,8,0,4
chr17	34313648	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=117,135;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:17,0:15,4:0|1:34313646_T_G:34313646:27,8,0,4
chr17	34324902	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr17	34340161	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	34416453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr17	34416665	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr17	34417344	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:22,0:24,6:24,23,0,6
chr17	34431287	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,46;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,14:0,0,17,9
chr17	34431852	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=106,107380;MMQ=49,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,3:4,0:3,1,3,0
chr17	34431884	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr17	34848796	.	C	CGAAAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr17	34848806	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	34848823	.	T	TGCAAATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr17	34849697	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,5,2
chr17	34849724	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:34849724_G_T:34849724:13,6,1,1
chr17	34849727	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:34849724_G_T:34849724:14,6,1,1
chr17	34849730	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:34849724_G_T:34849724:14,6,1,1
chr17	34854232	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=124,66;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,0:11,2:7,9,1,2
chr17	34855069	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr17	34857165	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr17	34859931	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34859931_GC_G:34859931:0,0,0,1
chr17	34859933	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34859931_GC_G:34859931:0,0,0,1
chr17	34861303	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,3:0,6:0,3,1,8
chr17	34862256	.	GTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,3:2,3:1,2,6,0
chr17	34862984	.	GGATGGGA	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,32;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:34862984_GGATGGGA_G:34862984:10,13,1,1
chr17	34862993	.	CAGGGGGTCAG	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=114,32;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:0|1:34862984_GGATGGGA_G:34862984:8,13,1,1
chr17	34863005	.	CACCAA	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=112,32;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:34862984_GGATGGGA_G:34862984:6,12,1,1
chr17	34866546	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:6,3:2,0:7,1,2,2
chr17	34869625	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:1,6,0,3
chr17	34883618	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr17	34884082	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:1,9,2,1
chr17	34894609	.	AT	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.229:50:25,7:13,3:18,21,4,7
chr17	34894685	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=164,195;MMQ=48,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:1,19,0,2
chr17	34913039	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:19,5:15,0:17,17,5,0
chr17	34935878	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:11,6:6,7:2,15,1,12
chr17	34942595	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:1,9,0,8
chr17	34943719	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.597:10:2,3:1,3:1,3,0,6
chr17	34951327	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=114,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:3,3:2,1:6,1,4,0
chr17	34953387	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,161;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	34956585	.	CCA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,1:9,2:4,10,1,2
chr17	35295704	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=211,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:35295704_G_T:35295704:0,3,0,1
chr17	35295706	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=211,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:35295704_G_T:35295704:0,3,0,1
chr17	35299947	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr17	35300462	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:7,0:9,2:0|1:35300462_G_T:35300462:6,12,1,1
chr17	35300472	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:6,2:0|1:35300462_G_T:35300462:3,12,1,1
chr17	35300473	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:8,2:0|1:35300462_G_T:35300462:3,10,1,1
chr17	35310234	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.631:36:10,16:3,7:7,6,14,9
chr17	35310262	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.145:53:35,7:11,0:25,21,7,0
chr17	35310514	.	G	GA	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.060:81:28,1:47,3:21,56,0,4
chr17	35346641	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:6,2,2,2
chr17	35454830	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,2:11,1:11,7,1,2
chr17	35470230	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:1,5,3,6
chr17	35486486	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=245,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,1:0|1:35486486_C_T:35486486:0,1,0,3
chr17	35486495	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=245,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,2:0|1:35486486_C_T:35486486:0,1,0,3
chr17	35538343	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=112,116;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:6,0:8,2:3,12,0,3
chr17	35550408	.	T	TATCTACCTTGC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:0|1:35550408_T_TATCTACCTTGC:35550408:5,13,0,2
chr17	35550413	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:35550408_T_TATCTACCTTGC:35550408:5,13,0,2
chr17	35550415	.	CA	GC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:35550408_T_TATCTACCTTGC:35550408:5,12,0,2
chr17	35550418	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:35550408_T_TATCTACCTTGC:35550408:4,11,0,2
chr17	35550448	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	35578722	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,2:12,2:13,13,2,2
chr17	35581887	.	TTATATA	T,TTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26,24;MFRL=166,119,161;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,10;RU=TA;STR;TLOD=5.40,8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.332,0.336:9:2,3,2:1,0,1:3,0,5,1
chr17	35603893	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,0:7,7:7,6,0,7
chr17	35603951	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	35603976	.	A	ATGGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr17	35608889	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,0,4
chr17	35627762	.	G	GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:4,2:2,11,0,2
chr17	35632951	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,0:19,3:12,19,1,2
chr17	35632979	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=142,42;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,1:5,5:3,10,2,4
chr17	35640320	.	GGAGATGGGAATGGGAAGAAAAGGCAGAAAAAAGCAACAATGGAGGAAAA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.171:28:10,5:6,5:3,14,5,6
chr17	35696804	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=321,100;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0|1:35696804_G_A:35696804:0,1,1,2
chr17	35696820	.	AAAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=321,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:35696804_G_A:35696804:0,1,0,2
chr17	35735983	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:7,1,2,0
chr17	35745738	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,0:11,7:3,16,0,7
chr17	35766475	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:1,5,0,7
chr17	35771532	.	TG	CA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=107,109;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,1:2,1:3,10,0,2
chr17	35771536	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=107,109;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,1:3,3:3,8,0,4
chr17	35771541	.	C	A,G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,25,32;MFRL=107,108,113;MMQ=60,31,40;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.02,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,2:0.167,0.167:15:8,1,0:2,1,2:3,8,0,4
chr17	35771548	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=107,121;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:2,2:2,8,0,3
chr17	35783596	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,22:0.396:56:18,22:16,0:21,13,22,0
chr17	35783611	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.435:53:17,22:13,0:18,12,23,0
chr17	35783812	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=87,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr17	35797745	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=155,140;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:9,1,2,0
chr17	35818739	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=31,28,28;MFRL=192,170,98;MMQ=60,60,46;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=TG;STR;TLOD=3.17,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.405,0.264:8:1,2,2:2,1,0:0,3,0,5
chr17	35818783	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:4,3:8,0:0,12,0,3
chr17	35822296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:6,0:4,2:1,9,0,2
chr17	35825459	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=66,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr17	35873399	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=94,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:10,5:7,5:8,9,5,5
chr17	35873665	.	GTAAC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TAAC;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:5,2:3,9,0,4
chr17	35879265	.	G	GCCACGTGGAACTGTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	35898342	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr17	35921190	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,5:13,0:20,0,5,0
chr17	35936594	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr17	35944539	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	35956263	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,12,9
chr17	35979746	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:4,1:4,1:8,11,2,3
chr17	35979939	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:0,8,0,5
chr17	35993486	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=27,34;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,3,0,1
chr17	35993489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=24,34;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,3,0,1
chr17	35993493	.	AA	GT	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=24,33;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,3,0,1
chr17	35993497	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,3,0,1
chr17	35993499	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=31,31;MFRL=148,159;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993499_G_T:35993499:0,2,0,1
chr17	35993502	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=26,26;MFRL=170,115;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,2,0,1
chr17	35993505	.	AC	CT	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=23,34;MFRL=148,159;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993499_G_T:35993499:0,2,0,1
chr17	35993506	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=30,32;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,1,0,1
chr17	35993509	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=32,21;MFRL=170,115;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,2,0,1
chr17	35993511	.	CTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=170,115;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993486_T_C:35993486:0,2,0,1
chr17	35993515	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=29,25;MFRL=148,159;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993499_G_T:35993499:0,2,0,1
chr17	35993517	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=25,34;MFRL=148,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35993499_G_T:35993499:0,2,0,1
chr17	36003275	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr17	36047275	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr17	36058980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	36070680	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,52;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:3,12,1,1
chr17	36070692	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,52;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:7,2:0|1:36070692_A_AG:36070692:2,11,1,1
chr17	36070694	.	T	TGTACTCACCATTTTACCATCAGGTGAGAGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=131,52;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:36070692_A_AG:36070692:2,9,1,1
chr17	36093863	.	G	GCAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAGA;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	36099505	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.370:57:10,20:26,0:23,13,21,0
chr17	36104647	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,281;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:9,1,2,0
chr17	36462407	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,184;MMQ=57,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,1:4,2:7,1,3,0
chr17	36474721	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,149;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:6,2:3,1:1,11,0,5
chr17	36477914	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,159;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.282:16:4,1:8,3:12,0,4,0
chr17	36484023	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=199,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0|1:36484023_G_A:36484023:10,5,0,2
chr17	36484044	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:36484023_G_A:36484023:11,6,0,2
chr17	36484108	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,2,0
chr17	36484264	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=106,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:13,7,3,0
chr17	36484571	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,2:13,1:14,17,1,2
chr17	36486774	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:9,1:3,2:4,8,2,1
chr17	36495326	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,131;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:11,4:13,0:12,12,3,1
chr17	36495412	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=75,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:1,10:4,6:2,3,7,9
chr17	36521269	.	C	CTCCTCCGAGAAGAAGCCTCA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,38;MFRL=112,246;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.184:23:11,0:8,4:5,14,0,4
chr17	36551677	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=84,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.234:41:14,0:16,9:13,19,0,9
chr17	36638255	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=144,118;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,8:7,1:8,3,5,4
chr17	36638948	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,246;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr17	36642473	.	CTT	C,CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=22,22,22;MFRL=165,162,155;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=10.09,16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,10:0.258,0.462:23:1,3,4:4,1,3:0,6,3,14
chr17	36642492	.	A	ATG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,0:4,3:2,18,0,3
chr17	36646291	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:7,5,3,1
chr17	36653940	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr17	36654134	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=115,207;MMQ=48,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.365:18:4,0:2,1:5,6,0,7
chr17	36689701	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:1,4,2,5
chr17	36708648	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=94,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:5,7:5,3,7,2
chr17	36708985	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:9,3:16,0:13,12,2,1
chr17	36734700	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0|1:36734700_T_C:36734700:0,0,12,4
chr17	36734706	.	CAGCCGG	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,6:0,9:0|1:36734700_T_C:36734700:0,0,12,4
chr17	36861855	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,0,2
chr17	36868985	.	G	GTATA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:21,2:16,0:0|1:36868985_G_GTATA:36868985:23,15,1,1
chr17	36868986	.	C	CAAATAAAGAAA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:22,2:16,0:0|1:36868985_G_GTATA:36868985:23,15,1,1
chr17	36873257	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr17	36874112	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=77,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.166:58:28,9:21,0:28,21,9,0
chr17	36875833	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:4,0:10,4:5,10,0,4
chr17	36875844	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,0:8,4:3,9,0,4
chr17	36876558	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:0,0,1,0
chr17	36876563	.	C	CCCGG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:0,0,1,0
chr17	36876565	.	GTC	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,16;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:0,0,1,0
chr17	36876571	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:0,0,1,0
chr17	36876578	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:0,0,1,0
chr17	36876581	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:1,0,1,0
chr17	36876584	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36876558_G_C:36876558:1,0,1,0
chr17	36889466	.	G	GCCTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCTGC;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	36891626	.	GGT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:14,5,0,2
chr17	36894839	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:1,3,2,2
chr17	36895118	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:0|1:36895118_C_T:36895118:3,7,0,2
chr17	36895126	.	A	AGGAAC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:36895118_C_T:36895118:3,6,0,2
chr17	36895129	.	A	ATGTTTAG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:36895118_C_T:36895118:3,6,0,2
chr17	36895206	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=231,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,2:5,3:3,2,3,2
chr17	36896746	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr17	36909001	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,5:0.071:80:40,5:35,0:49,26,5,0
chr17	36918727	.	GTGTCAGGCATGGGAGTCAT	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:10,2:16,0:14,20,1,1
chr17	36918803	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,0:4,3:3,10,0,4
chr17	36934124	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr17	36958379	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=93,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.142:32:9,3:19,1:12,16,1,3
chr17	37006349	.	GTT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,8:0,11:0,0,16,3
chr17	37006701	.	C	CTAT	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=121,53;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.059:48:27,2:18,0:0|1:37006701_C_CTAT:37006701:19,27,1,1
chr17	37006702	.	G	GGGT	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=121,53;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:27,2:17,0:0|1:37006701_C_CTAT:37006701:19,27,1,1
chr17	37006705	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=132,53;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:24,2:18,0:0|1:37006701_C_CTAT:37006701:19,26,1,1
chr17	37009072	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=87,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr17	37070737	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,7:2,7:2,4,5,9
chr17	37071229	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr17	37074830	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,5:8,0:10,2,5,0
chr17	37094860	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:5,4,2,1
chr17	37224288	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,2:0,7:0,5,0,9
chr17	37226299	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=133,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.413:49:16,0:12,20:10,19,0,20
chr17	37234111	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr17	37234242	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,123;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:27,5:16,0:25,18,5,0
chr17	37239671	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,13:0,12:0,0,17,9
chr17	37244004	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=96,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:1,1,0,5
chr17	37253064	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	37253316	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr17	37262059	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr17	37295866	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:0,3:2,2:1,2,7,0
chr17	37295872	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=93,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:0,3:6,2:2,4,7,0
chr17	37316818	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.576:26:6,6:3,9:6,5,8,7
chr17	37317436	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=202,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chr17	37317636	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:6,4:4,5:7,4,1,8
chr17	37317672	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,5,5
chr17	37317697	.	CC	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=329,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	37322080	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,1:0,4,1,3
chr17	37339877	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr17	37340221	.	ACCTCCCACC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,23;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:0,1:1,0:2,1,0,1
chr17	37353745	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:17,0:12,2:19,11,2,0
chr17	37356712	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr17	37357653	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:0,0:1,1:0,5,0,3
chr17	37369936	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,152;MMQ=47,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr17	37370595	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:1,7,1,2
chr17	37370972	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr17	37371141	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,4:2,6:3,1,4,6
chr17	37371519	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:1,7,0,5
chr17	37421767	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,1,2
chr17	37425238	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=246,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr17	37427114	.	TA	T,TAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,26,27;MFRL=180,127,131;MMQ=60,60,60;MPOS=20,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=12.95,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,3:0.460,0.311:14:1,3,1:1,4,1:0,2,1,11
chr17	37427179	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=158,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr17	37439195	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37439195_G_A:37439195:0,0,0,1
chr17	37439198	.	AT	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37439195_G_A:37439195:0,0,0,1
chr17	37441679	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr17	37453294	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	37453485	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,1:3,6:1,5,2,5
chr17	37457342	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=69,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,4:2,1,1,6
chr17	37457371	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:37457371_T_G:37457371:1,2,1,1
chr17	37457374	.	GGG	TCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,2:2,0:0|1:37457371_T_G:37457371:1,3,1,1
chr17	37459730	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,3:5,1:14,1,4,0
chr17	37499604	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=193,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr17	37561613	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=61,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,3:3,8:1,2,2,9
chr17	37565435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=152,120;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:11,6,4,0
chr17	37571187	.	TG	CT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=165,158;MMQ=58,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,2:8,2:12,0,4,0
chr17	37571200	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=166,201;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:15,2,2,0
chr17	37571210	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.172:20:5,2:11,1:15,2,2,1
chr17	37571550	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:24,1:24,3:0|1:37571550_T_A:37571550:25,23,2,2
chr17	37571551	.	C	CCAAGGA	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:25,0:24,2:0|1:37571550_T_A:37571550:26,25,1,1
chr17	37571553	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=91,36;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:23,0:25,2:0|1:37571550_T_A:37571550:26,25,1,1
chr17	37571555	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=93,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:24,0:20,2:0|1:37571550_T_A:37571550:25,26,1,1
chr17	37571557	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=100,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.058:49:24,0:21,2:0|1:37571550_T_A:37571550:25,22,1,1
chr17	37576085	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=100,152;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:17,3:13,0:0|1:37576085_G_A:37576085:16,15,3,0
chr17	37576095	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=100,152;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:18,3:13,0:0|1:37576085_G_A:37576085:16,15,3,0
chr17	37580140	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr17	37580879	.	CC	TT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:20,0:13,2:17,17,1,1
chr17	37587534	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=181,211;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:0,2:0,4,1,3
chr17	37590445	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,3:8,0:16,3,3,0
chr17	37647066	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=210,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:37647066_A_T:37647066:0,2,0,1
chr17	37647074	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,1:0,0:1|0:37647066_A_T:37647066:0,1,0,1
chr17	37647075	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=210,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:37647066_A_T:37647066:0,2,0,1
chr17	37647076	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,1:0,0:1|0:37647066_A_T:37647066:0,1,0,1
chr17	37651026	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=146,186;MMQ=47,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,2:1,0:0,7,0,2
chr17	37657460	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:0,2:1,1,4,0
chr17	37657655	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.136:29:15,1:10,2:8,17,2,2
chr17	37671910	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr17	37673646	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=111,45;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:16,4:14,0:25,6,4,0
chr17	37681219	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=183,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr17	37762583	.	TTCCTCCTCCTCTTCC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:2,0:6,1:7,6,1,1
chr17	37762586	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:3,0:8,2:7,5,1,1
chr17	37785588	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr17	37790371	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:5,3:1,4:2,5,2,5
chr17	37842157	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=103,60;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.129:33:12,0:16,3:17,12,1,3
chr17	37842328	.	G	GGCTCTAAAATGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:37842328_G_GGCTCTAAAATGTC:37842328:0,3,0,1
chr17	37842330	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:37842328_G_GGCTCTAAAATGTC:37842328:0,3,0,1
chr17	37868234	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:15,0:5,4:12,8,0,4
chr17	37868555	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:1,0:1,0:0|1:37868555_A_C:37868555:0,2,3,0
chr17	37868559	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:1,0:0|1:37868555_A_C:37868555:1,2,2,0
chr17	37868785	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr17	37871613	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.148:52:32,7:10,0:20,25,7,0
chr17	37872128	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=21,18;MFRL=86,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:11,0:0|1:37872128_C_T:37872128:6,10,1,1
chr17	37872149	.	CCAAG	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:10,0:0|1:37872128_C_T:37872128:7,11,1,1
chr17	37872157	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=91,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:10,0:0|1:37872128_C_T:37872128:7,10,1,1
chr17	37879515	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=79,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:37879515_T_A:37879515:1,0,1,0
chr17	37879520	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=79,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:37879515_T_A:37879515:1,0,1,0
chr17	37879523	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,11;MFRL=74,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:1,0:0|1:37879515_T_A:37879515:1,1,2,0
chr17	37879527	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.585:5:1,0:0,0:1,1,3,0
chr17	37882198	.	AT	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=190,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr17	37898543	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=218,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,12:0,6:1,0,13,5
chr17	37901699	.	GTGGCCATGGACTTCTC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,2:7,1:16,3,2,1
chr17	37949275	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,179;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:4,3:1,9,0,3
chr17	37985653	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,0:12,2:0|1:37985653_A_C:37985653:12,12,1,1
chr17	37985656	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=108,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:12,2:0|1:37985653_A_C:37985653:14,12,1,1
chr17	37985801	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr17	37988433	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,0:7,3:4,13,0,3
chr17	38027030	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:9,4:11,4:8,12,4,4
chr17	38027050	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:12,2:21,0:0|1:38027050_G_A:38027050:15,18,1,1
chr17	38027057	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,2:21,0:0|1:38027050_G_A:38027050:15,17,1,1
chr17	38027914	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:1,5:6,4:0,7,1,8
chr17	38031714	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,6:1,2:0,6,1,7
chr17	38062085	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=87,38;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,0:10,2:8,6,0,2
chr17	38062265	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,4:14,0:7,16,4,0
chr17	38066240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	38066261	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38066263	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38066266	.	TG	GT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38066267	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=121,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr17	38066272	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38066274	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38066276	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:38066261_C_CCG:38066261:0,3,0,1
chr17	38068514	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.364:25:7,3:9,5:8,8,5,4
chr17	38121993	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.254:41:13,3:18,6:15,16,4,6
chr17	38122680	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.746:28:5,8:2,10:2,5,9,12
chr17	38122686	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.697:30:6,9:3,11:2,7,9,12
chr17	38122708	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.634:25:4,6:4,8:3,6,5,11
chr17	38126677	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=102,137;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,5:5,0:10,0,5,0
chr17	38126832	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=99,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:7,4:11,11,0,4
chr17	38126911	.	AACACACAC	A,AAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26,24;MFRL=0,175,120;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,10;RU=AC;STR;TLOD=5.89,13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.271,0.643:7:0,1,3:0,1,1:0,0,0,7
chr17	38127713	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr17	38128765	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:4,1,6,1
chr17	38129996	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=91,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:8,3:2,4:7,4,3,4
chr17	38130139	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=96,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:13,4:15,9:6,22,5,8
chr17	38130492	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr17	38140452	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=241,248;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=A;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.613:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	38140524	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=53,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,11:2,9:1,1,11,9
chr17	38145079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=115,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:38145079_G_A:38145079:0,2,0,1
chr17	38145088	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:38145079_G_A:38145079:0,1,0,2
chr17	38146542	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr17	38152373	.	CAA	C,CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,17,29;MFRL=99,69,137;MMQ=60,60,60;MPOS=11,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.70,18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,11:0.150,0.439:28:3,1,2:4,1,5:5,7,9,7
chr17	38153554	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=60,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:3,4,5,4
chr17	38153714	.	T	TGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	38171668	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:10,1,4,0
chr17	38172192	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,3,11
chr17	38172452	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,16,2
chr17	38172942	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr17	38172973	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr17	38176256	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=86,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	38176476	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	38176554	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:25,3:26,0:28,23,0,3
chr17	38178149	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,1,2
chr17	38178627	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=99,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.287:39:14,6:13,4:13,15,11,0
chr17	38179290	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr17	38179492	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:9,14:4,5:5,8,9,10
chr17	38179667	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr17	38183090	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:0,1,4,6
chr17	38183634	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:2,4:12,0:0|1:38183634_A_T:38183634:10,9,2,2
chr17	38183635	.	C	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:6,4:13,0:0|1:38183634_A_T:38183634:10,9,2,2
chr17	38187891	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:6,0:11,9:5,13,0,9
chr17	38188419	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr17	38188844	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,188;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.708:29:4,3:4,16:6,2,5,16
chr17	38189049	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:0|1:38189049_G_A:38189049:0,3,2,6
chr17	38189055	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,1:2,5:0|1:38189049_G_A:38189049:0,3,2,4
chr17	38189793	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	38191475	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,0:8,2:8,10,0,2
chr17	38192137	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=185,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr17	38209520	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.140:55:17,7:30,0:23,25,7,0
chr17	38233191	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:20,3:25,0:20,25,3,0
chr17	38233813	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.128:41:14,0:21,4:25,11,5,0
chr17	38245461	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=182,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,0:7,2,1,2
chr17	38251100	.	GAGATCGCA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,142;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:1,0:10,1:0|1:38251100_GAGATCGCA_G:38251100:17,0,2,0
chr17	38251112	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=170,142;MMQ=60,50;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:2,0:15,2:0|1:38251100_GAGATCGCA_G:38251100:17,0,2,0
chr17	38251385	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,7:1,10:0,1,2,15
chr17	38251657	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=12,23;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,41:0.971:44:0,10:0,20:3,0,27,14
chr17	38252667	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,14:0,0,27,7
chr17	38253228	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=129,314;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,3:2,0:2,0,2,1
chr17	38256185	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:1,0:2,5:4,0,5,0
chr17	38324766	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	38341024	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=163,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.610:24:6,0:3,13:1,8,0,15
chr17	38346802	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=92,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:7,9:13,4:9,11,4,9
chr17	38348363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,117;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr17	38348514	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.076:38:23,2:12,0:0|1:38348514_C_T:38348514:16,20,1,1
chr17	38348525	.	T	TTAGAGGTGTCCAAGAAAGTTATGTTTGACAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.080:36:19,2:11,0:0|1:38348514_C_T:38348514:15,19,1,1
chr17	38348616	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:1,6,1,3
chr17	38348862	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:15,0:19,3:23,11,2,1
chr17	38348990	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=166,124;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,0:6,3:5,11,0,3
chr17	38348996	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:1,4:2,5,2,5
chr17	38412726	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=23,8;MFRL=84,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.290:26:4,0:11,1:0|1:38412726_T_TG:38412726:4,15,7,0
chr17	38412732	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.294:28:5,2:14,1:0|1:38412726_T_TG:38412726:4,16,8,0
chr17	38412735	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.217:35:5,2:17,5:0|1:38412726_T_TG:38412726:10,18,7,0
chr17	38412741	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.176:38:8,2:20,3:0|1:38412726_T_TG:38412726:10,22,6,0
chr17	38416705	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=183,190;MMQ=55,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr17	38418990	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38418990_G_A:38418990:0,0,0,1
chr17	38418992	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38418990_G_A:38418990:0,0,0,1
chr17	38418993	.	G	GCAGTGAGCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38418990_G_A:38418990:0,0,0,1
chr17	38451739	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.332:20:5,4:6,3:2,11,1,6
chr17	38457343	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=166,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:8,4:5,9:0,13,3,10
chr17	38511647	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,0:20,3:19,18,0,3
chr17	38546388	.	G	GAAAAT	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.051:56:33,2:20,0:0|1:38546388_G_GAAAAT:38546388:28,26,1,1
chr17	38546389	.	GCACCGGT	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=113,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:32,2:21,0:0|1:38546388_G_GAAAAT:38546388:28,27,1,1
chr17	38548371	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:6,3:7,1:8,5,2,2
chr17	38556770	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,17:0,0,20,10
chr17	38563710	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr17	38567631	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,89;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:21,0:36,4:37,20,0,4
chr17	38572366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr17	38609187	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,11,3
chr17	38609207	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,11,3
chr17	38609431	.	G	GAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:0,1,1,3
chr17	38633986	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.259:20:6,1:2,2:4,11,0,5
chr17	38634012	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,13;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.261:12:2,1:1,0:1,8,0,3
chr17	38643669	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,4:0.061:80:35,0:37,4:40,36,1,3
chr17	38644752	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:7,2,5,2
chr17	38644901	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:8,3:13,0:0|1:38644901_G_A:38644901:5,18,0,3
chr17	38644903	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:0|1:38644901_G_A:38644901:5,18,0,3
chr17	38645125	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.511:39:8,12:10,8:6,13,6,14
chr17	38652220	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.362:34:8,7:13,5:8,14,7,5
chr17	38711222	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.605:43:10,15:6,11:6,11,9,17
chr17	38711817	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,148;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.282:30:11,0:10,8:10,12,0,8
chr17	38786451	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,30:0.891:33:0,17:3,13:1,2,23,7
chr17	38786985	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.259:48:21,0:15,12:22,14,1,11
chr17	38813824	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,4,1
chr17	38813828	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,4,1
chr17	38816448	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=164,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:38816448_A_G:38816448:10,11,1,1
chr17	38816454	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:38816448_A_G:38816448:10,9,1,1
chr17	38816455	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:38816448_A_G:38816448:10,9,1,1
chr17	38816536	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=247,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:0,2:1,1:0,2,0,4
chr17	38816555	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:38816555_TG_CA:38816555:0,5,0,2
chr17	38816558	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:38816555_TG_CA:38816555:0,5,0,2
chr17	38821199	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=69,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	38855615	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr17	38856297	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=83,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:9,6:10,10:11,8,7,9
chr17	38856662	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,1:4,2:0,6,0,4
chr17	38857401	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=74,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.625:38:7,13:7,9:8,6,16,8
chr17	38857446	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,8:7,9:4,7,8,9
chr17	38858134	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.512:35:6,8:11,10:8,9,10,8
chr17	38911212	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=99,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,4:14,2:9,14,6,0
chr17	38911327	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,2:9,5:6,9,2,5
chr17	38923932	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=98,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.351:17:5,2:5,4:3,8,1,5
chr17	38925031	.	CC	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=231,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	38926002	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:8,3:2,4:8,2,6,1
chr17	38927995	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=137,327;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:12,5:12,0:12,12,0,5
chr17	38928014	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:14,2:5,7:8,11,4,5
chr17	38928439	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=95,3114;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,0:2,9:0,4,9,0
chr17	38949318	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=198,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:11,0,3,1
chr17	38953540	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,4,12
chr17	38954687	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	38955961	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,28:0.745:37:7,10:2,17:7,2,18,10
chr17	38955991	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.176:60:18,5:32,5:18,32,8,2
chr17	38974612	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,1:7,8:11,0,9,0
chr17	38976716	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.571:30:6,9:7,8:5,8,10,7
chr17	38978439	.	ACCACCAAAGCCTCCTCCAAAGCCGCCTCCACCAAAGCCGCCTCCACCAAAGCTGCCC	A	.	.	DP=147;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,3:0.030:132:19,0:33,3:71,58,1,2
chr17	38978484	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=101,59;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,8:0.130:67:13,0:40,7:0|1:38978484_A_C:38978484:26,33,1,7
chr17	38978490	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=100,59;MMQ=60,45;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,8:0.128:68:16,0:38,7:0|1:38978484_A_C:38978484:28,32,1,7
chr17	38978536	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=271.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,30:0,50:0,0,24,58
chr17	38990834	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=501,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:0,16:1,15:0,1,23,8
chr17	38990957	.	GC	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=111,70;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:26,0:18,1:23,23,0,2
chr17	38991003	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.572:35:8,16:7,3:6,9,8,12
chr17	38991032	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,10,22
chr17	38992571	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=172,201;MMQ=56,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,3:1,1:0,4,0,4
chr17	38992616	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=209,176;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38992616_T_C:38992616:0,1,0,1
chr17	38992619	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=209,176;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:38992616_T_C:38992616:0,1,0,1
chr17	38992623	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38992616_T_C:38992616:0,0,0,1
chr17	39018961	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr17	39020213	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39020213_C_T:39020213:1,0,0,1
chr17	39020216	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39020213_C_T:39020213:1,0,0,1
chr17	39021015	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=60,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:1,3:0,3:0,1,6,0
chr17	39022480	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=178,51;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:5,13,1,1
chr17	39022501	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=177,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:39022501_GA_CC:39022501:2,11,1,1
chr17	39022504	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:39022501_GA_CC:39022501:2,10,1,1
chr17	39022508	.	A	ACTTCT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=186,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39022501_GA_CC:39022501:0,10,1,1
chr17	39022510	.	A	AAGT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=186,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39022501_GA_CC:39022501:0,10,1,1
chr17	39033672	.	G	GT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,0:4,2:6,12,1,2
chr17	39114842	.	ACC	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:13,2:0|1:39114842_ACC_A:39114842:19,11,1,1
chr17	39114845	.	TTGGGATGTTAGACTTTGG	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:13,2:0|1:39114842_ACC_A:39114842:21,16,1,1
chr17	39114865	.	AGGTCTGATGATGAAACAAGGCTGCACATGCTCGTAAGAAGAAAT	A	.	.	DP=62;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.051:58:16,0:15,2:0|1:39114842_ACC_A:39114842:29,27,1,1
chr17	39114920	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:20,4:15,0:17,18,4,0
chr17	39120012	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:17,3:13,0:16,14,0,3
chr17	39120052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,1:5,2:4,11,1,2
chr17	39120872	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=134,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:1,8,0,3
chr17	39123131	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:3,5:5,4:1,7,2,7
chr17	39134561	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:1,2:4,5:1,4,3,4
chr17	39134576	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:1,2:2,7:0|1:39134576_A_C:39134576:0,3,2,7
chr17	39134585	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,2:2,7:0|1:39134576_A_C:39134576:0,3,2,7
chr17	39134590	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:0,2:2,6:0|1:39134576_A_C:39134576:0,2,2,7
chr17	39135084	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=151,212;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0|1:39135084_A_G:39135084:4,2,5,1
chr17	39135089	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=122,193;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:0|1:39135084_A_G:39135084:5,2,7,1
chr17	39135143	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=166,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:11,8:6,4:13,4,9,4
chr17	39135205	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:2,5:4,4:0|1:39135205_A_G:39135205:4,4,4,5
chr17	39135214	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:4,6:6,5:0|1:39135205_A_G:39135205:5,5,6,5
chr17	39135322	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,5:3,0:0,6,0,5
chr17	39137297	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:3,13:7,6:6,4,9,10
chr17	39139256	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.446:7:2,0:2,3:0|1:39139256_A_T:39139256:4,0,3,0
chr17	39139274	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0|1:39139256_A_T:39139256:5,1,5,1
chr17	39139279	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,4:1,2:0|1:39139256_A_T:39139256:5,2,5,1
chr17	39139413	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,6:4,6:1,5,2,10
chr17	39139430	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:0,4:3,5:0|1:39139430_G_A:39139430:0,4,1,8
chr17	39139435	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:0,4:4,3:0|1:39139430_G_A:39139430:0,4,1,8
chr17	39140397	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=107,170;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.297:31:15,8:6,0:8,14,9,0
chr17	39140417	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.751:30:3,19:3,4:4,3,14,9
chr17	39150443	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr17	39155716	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr17	39156224	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr17	39156233	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:39156233_T_C:39156233:0,3,0,1
chr17	39156241	.	T	TTTTTAAGTCACAATTCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:39156233_T_C:39156233:0,3,0,1
chr17	39197459	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,34;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:39197459_C_T:39197459:12,7,1,1
chr17	39197466	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=132,34;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:6,1:0|1:39197459_C_T:39197459:12,7,1,1
chr17	39222068	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=121,259;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr17	39240781	.	CCTGCTGCCGCCCCAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=104,177;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:3,4:3,5,7,0
chr17	39254444	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr17	39257963	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=101,110;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=138.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,52:0.801:65:9,51:4,0:13,0,52,0
chr17	39261981	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=106,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr17	39262553	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=89,151;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:13,0:8,6:8,13,0,6
chr17	39274518	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,144;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:6,8:1,5:2,5,5,9
chr17	39305487	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=104,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,8:0.146:59:37,0:13,8:32,19,0,8
chr17	39305731	.	AGCAGCAGGTGGTCCT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=158,105;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGCAGGTGGTCCT;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:3,2:3,3,1,1
chr17	39324333	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=103,68;MMQ=47,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,2:8,2:0|1:39324333_T_A:39324333:12,9,2,2
chr17	39324347	.	GCG	TTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=135,68;MMQ=48,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:10,2:8,3:0|1:39324333_T_A:39324333:12,7,3,2
chr17	39333956	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,19,2
chr17	39334352	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=159,119;MMQ=52,50;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,0:9,2:9,6,0,2
chr17	39334456	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,11,27
chr17	39340597	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr17	39340707	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,21:0,26:0,0,24,25
chr17	39341646	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,1:0,1:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,4
chr17	39341648	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,4
chr17	39346595	.	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=72.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,4:0,3:0,0,5,12
chr17	39383322	.	ACTGCTGCCAGCC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=158,161;MMQ=27,34;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.502:12:3,2:2,4:0|1:39383322_ACTGCTGCCAGCC_A:39383322:1,5,1,5
chr17	39383335	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=161,154;MMQ=34,26;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.416:10:2,3:4,1:1|0:39383322_ACTGCTGCCAGCC_A:39383322:1,5,0,4
chr17	39389354	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=75,106;MMQ=51,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:1,9:5,8:3,3,11,6
chr17	39389466	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:16,1:16,2:0|1:39389466_T_C:39389466:18,16,1,2
chr17	39389475	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:17,1:18,2:0|1:39389466_T_C:39389466:20,17,1,2
chr17	39389626	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=126,144;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:12,1:9,15,2,0
chr17	39389637	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=130,203;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:0|1:39389637_G_A:39389637:10,13,1,1
chr17	39389646	.	TC	CT	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=125,203;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:39389637_G_A:39389637:10,12,1,1
chr17	39389653	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=123,203;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:0|1:39389637_G_A:39389637:9,11,1,1
chr17	39389690	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=115,129;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:10,2:14,1:0|1:39389690_G_T:39389690:9,15,1,2
chr17	39389698	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=115,129;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:9,2:15,1:0|1:39389690_G_T:39389690:9,16,1,2
chr17	39389767	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=155,208;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	39394674	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,25;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr17	39405960	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	39406409	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,14,18
chr17	39406447	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=101,124;MMQ=56,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,32:0.885:36:4,19:0,13:2,2,10,22
chr17	39406461	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,54;MMQ=60,54;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:24,3:17,0:18,23,2,1
chr17	39406567	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0|1:39406567_C_A:39406567:0,0,9,10
chr17	39406589	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0|1:39406567_C_A:39406567:0,0,13,9
chr17	39406812	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=136,224;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.139:41:17,3:18,2:0|1:39406812_C_T:39406812:16,20,1,4
chr17	39406820	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,2:15,0:0|1:39406812_C_T:39406812:15,18,0,2
chr17	39432690	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=108,198;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:14,10:14,0:0|1:39432690_T_G:39432690:14,15,10,0
chr17	39432692	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=108,198;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.268:39:12,10:15,0:0|1:39432690_T_G:39432690:14,15,10,0
chr17	39432956	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.713:15:1,7:2,4:0|1:39432956_GT_G:39432956:1,3,3,8
chr17	39432960	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.712:15:1,7:2,4:0|1:39432956_GT_G:39432956:1,3,3,8
chr17	39459167	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr17	39507029	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=166,23387;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:3,11,0,2
chr17	39522910	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.214:26:7,4:12,2:5,15,2,4
chr17	39524205	.	AC	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=140,143;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:20,0:14,2:0|1:39524205_AC_A:39524205:23,15,0,2
chr17	39524208	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=140,143;MMQ=60,50;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:20,0:17,2:0|1:39524205_AC_A:39524205:23,15,0,2
chr17	39538184	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=146,126;MMQ=60,59;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,26:0.693:37:7,13:4,13:0|1:39538184_G_C:39538184:6,5,15,11
chr17	39538187	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,64;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:20,0:16,2:0|1:39538184_G_C:39538184:23,16,1,1
chr17	39538198	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,64;MMQ=57,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:27,0:17,2:0|1:39538184_G_C:39538184:29,16,1,1
chr17	39538199	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,64;MMQ=57,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:26,0:18,2:0|1:39538184_G_C:39538184:29,16,1,1
chr17	39551364	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=136,102;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:7,0:4,10:2,10,0,10
chr17	39551698	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=107,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,11:5,5:5,4,6,10
chr17	39553811	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.811:14:1,5:1,6:1,1,4,8
chr17	39577799	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.226:42:20,4:13,5:15,18,5,4
chr17	39580802	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,131;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:3,0:7,10:2,8,0,11
chr17	39593620	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,5:3,2:12,0,7,0
chr17	39593872	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	39594356	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=93,88;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:1,9:7,10:4,4,9,10
chr17	39594679	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:7,3:3,2:8,3,3,2
chr17	39594934	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,2:5,1:2,9,0,3
chr17	39595354	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=193,203;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:39595354_G_T:39595354:2,0,3,0
chr17	39595356	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=193,203;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:39595354_G_T:39595354:2,0,3,0
chr17	39595390	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=218,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr17	39596611	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,2:6,2:8,6,1,3
chr17	39616274	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.473:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	39619193	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.572:47:13,13:7,14:10,10,15,12
chr17	39622349	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:12,0:17,5:10,19,0,6
chr17	39634576	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr17	39635303	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=161,89;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr17	39635338	.	C	CTCACTGCAATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39635338_C_CTCACTGCAATCT:39635338:0,1,0,1
chr17	39635341	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39635338_C_CTCACTGCAATCT:39635338:0,1,0,1
chr17	39635514	.	TCCCCAATGCTCACCTCCTCCCCATGTTCACCTCCTCCCCCATGCTCACCTGCTGTGCCGTGTTCACCTTTTC	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.068:44:2,1:2,2:14,27,1,2
chr17	39635518	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.892:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr17	39635874	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:10,0:14,5,2,0
chr17	39636044	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr17	39637389	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr17	39642754	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:5,2:18,0:9,14,2,0
chr17	39644057	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr17	39645003	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:3,2:3,3:3,3,1,6
chr17	39645063	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr17	39657888	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,14;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.342:4:0,0:2,0:2,1,1,0
chr17	39659091	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=219,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.755:22:3,14:1,3:2,3,8,9
chr17	39659183	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,5:7,1:9,7,3,3
chr17	39659194	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,14,12
chr17	39659529	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,19:0.340:57:20,6:16,13:21,17,12,7
chr17	39659913	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.353:51:14,7:17,9:23,10,10,8
chr17	39660005	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.675:35:2,8:9,15:6,5,8,16
chr17	39661366	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.601:48:12,9:6,20:11,8,16,13
chr17	39661561	.	AAGCCACCTCCAAGGCCACCTCCAT	A	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=95,177;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCCACCTCCAAGGCCACCTCCAT;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,3:0.055:72:21,0:17,3:47,22,1,2
chr17	39671045	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	39674540	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,3:6,5:7,1,6,2
chr17	39674641	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=97,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,11:0.240:48:18,8:18,3:18,19,5,6
chr17	39680580	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,10:0,0,10,7
chr17	39680796	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,10,17
chr17	39723425	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:2,5:0,1:2,0,6,0
chr17	39723451	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.703:16:2,5:0,6:5,0,11,0
chr17	39723837	.	GTAGCTGCCTCCACTTCCTCCCCTGGACCCACTTCCTCCACCATAGCCACCTCCACTTCCTCCTCCACCA	G	.	.	DP=171;ECNT=10;MBQ=24,20;MFRL=74,59;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,8:0.058:135:12,2:15,5:48,79,5,3
chr17	39723863	.	ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC	A	.	.	DP=113;ECNT=10;MBQ=23,20;MFRL=74,58;MMQ=60,51;MPOS=-35;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,11:0.097:110:13,4:25,7:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:39,60,6,5
chr17	39723894	.	TCCTCCTCCA	T	.	.	DP=110;ECNT=10;MBQ=22,20;MFRL=71,58;MMQ=60,51;MPOS=-38;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,11:0.093:110:16,4:60,7:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:37,62,6,5
chr17	39723909	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=10;MBQ=20,20;MFRL=69,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,3:0.038:101:21,2:77,1:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:36,62,1,2
chr17	39723912	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=10;MBQ=20,20;MFRL=65,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,5:0.058:99:21,2:70,3:36,58,2,3
chr17	39723926	.	CCCTGGA	C	.	.	DP=93;ECNT=10;MBQ=20,20;MFRL=74,58;MMQ=60,60;MPOS=-23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,2:0.032:92:16,2:70,0:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:31,59,1,1
chr17	39723936	.	TCTTCCATAA	T	.	.	DP=81;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=75,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,2:0.036:80:14,2:54,0:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:23,55,1,1
chr17	39723948	.	GCCTC	G	.	.	DP=59;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=76,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:8,2:46,0:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:11,46,1,1
chr17	39723954	.	ACTTCCTCCTC	A	.	.	DP=56;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=84,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:5,2:41,0:0|1:39723863_ACCCACTTCCTCCACCATAGCCACC_A:39723863:10,44,1,1
chr17	39723990	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=30,26;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:0,3:9,5:0,9,0,9
chr17	39724047	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=157,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,0:4,6:0,4,0,6
chr17	39725653	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.095:61:18,5:37,0:35,21,5,0
chr17	39726276	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,4,1
chr17	39727816	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=66,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.528:49:8,15:15,10:16,7,17,9
chr17	39728050	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=71,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,30:0.591:50:8,8:12,18:7,13,4,26
chr17	39739263	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,122;MMQ=52,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr17	39742479	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=78,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr17	39742492	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr17	39742718	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=156,148;MMQ=40,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:2,9:8,10:6,4,8,11
chr17	39742807	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=105,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,27:0.424:64:19,12:18,15:16,21,13,14
chr17	39742856	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=120,143;MMQ=60,56;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.301:38:11,4:16,7:7,20,1,10
chr17	39742894	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=151,148;MMQ=51,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,21:0.758:27:2,6:3,10:0|1:39742894_G_A:39742894:1,5,4,17
chr17	39742898	.	GC	AT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=151,160;MMQ=51,58;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,24:0.782:30:3,7:3,11:0|1:39742894_G_A:39742894:1,5,8,16
chr17	39742899	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,175;MMQ=60,56;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.957:18:0,7:0,7:0,0,10,8
chr17	39743081	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=9672919,162;MMQ=45,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:1,1,1,9
chr17	39766504	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,23,15
chr17	39766881	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=181,11516792;MMQ=60,29;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr17	39767593	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=96,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,0:8,4:9,16,1,3
chr17	39767836	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=116,172;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:6,10:4,9:5,5,12,7
chr17	39776817	.	GA	G,GAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,31,20;MFRL=140,141,132;MMQ=60,44,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.85,5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,6,5:0.153,0.140:38:8,0,1:9,4,2:12,15,4,7
chr17	39779160	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=108,151;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.364:34:8,4:12,8:16,6,8,4
chr17	39780767	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=146,178;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,3:4,6,2,4
chr17	39846959	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.144:46:15,6:25,0:30,10,4,2
chr17	39871700	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,7,19
chr17	39871892	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr17	39872125	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:12,0:10,5:8,14,5,0
chr17	39874137	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,21,11
chr17	39881487	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	39883595	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr17	39883789	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	39883972	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=55,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,1:1,2:1,0,4,1
chr17	39884171	.	C	CTTAACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=238,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	39884419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	39888102	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr17	39888455	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:2,5:6,6:5,3,5,7
chr17	39890876	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	39912145	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=224,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,7:1,8:0,1,3,13
chr17	39912581	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr17	39913645	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,13,5
chr17	39914070	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,5,15
chr17	39923614	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr17	39925481	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr17	39959511	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	39969579	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:4,10,0,2
chr17	39976721	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,18;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr17	39976727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:39976727_G_A:39976727:0,2,0,1
chr17	39976728	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:39976727_G_A:39976727:0,2,0,1
chr17	39976732	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39976727_G_A:39976727:0,3,0,1
chr17	39976734	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:39976727_G_A:39976727:0,3,0,1
chr17	39977433	.	GGTGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=163,151;MMQ=58,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:8,3:2,0:0|1:39977433_GGTGT_G:39977433:0,13,0,3
chr17	39977439	.	C	CACGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=162,151;MMQ=59,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,3:2,0:0|1:39977433_GGTGT_G:39977433:0,12,0,3
chr17	39977862	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr17	39983644	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,9,9
chr17	39983808	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,18:0,0,13,20
chr17	39988601	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.906:29:2,10:0,17:1,1,19,8
chr17	40002042	.	ACCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr17	40003421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr17	40010236	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:4,5,1,1
chr17	40024023	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,6,5
chr17	40024866	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=165,148;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	40024868	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=121,165;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr17	40024895	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr17	40025264	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,21,6
chr17	40025285	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=177.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,28:0,25:0,0,36,19
chr17	40025453	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr17	40025670	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr17	40027869	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,3:1,6:1,0,11,0
chr17	40028450	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,5:0,5:0,0,1,11
chr17	40048613	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr17	40049473	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr17	40052790	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,194;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.441:10:2,4:3,0:5,1,4,0
chr17	40053021	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr17	40062774	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:8,2:1,2:5,4,1,3
chr17	40068613	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr17	40095268	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:11,6,1,1
chr17	40118799	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:40118799_G_T:40118799:0,0,1,0
chr17	40118807	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40118799_G_T:40118799:0,0,1,0
chr17	40118816	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40118799_G_T:40118799:0,0,1,0
chr17	40123829	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr17	40134078	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr17	40134294	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=115,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.117:36:16,1:16,2:21,11,2,2
chr17	40139773	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=170,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:40139773_A_C:40139773:3,0,1,1
chr17	40139776	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=170,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:40139773_A_C:40139773:3,0,1,1
chr17	40139779	.	C	CTTCTGTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=170,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:40139773_A_C:40139773:3,0,1,1
chr17	40139780	.	A	ACAGTTCAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=170,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,0:1,2:0|1:40139773_A_C:40139773:3,0,1,1
chr17	40139984	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:2,11,0,2
chr17	40152431	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr17	40169519	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr17	40258090	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=135,133;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40258090_TC_CT:40258090:0,1,0,1
chr17	40258096	.	AA	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40258090_TC_CT:40258090:0,0,0,1
chr17	40258099	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40258090_TC_CT:40258090:0,0,0,1
chr17	40258101	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40258090_TC_CT:40258090:0,0,0,1
chr17	40265589	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=129,244;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:40265589_G_A:40265589:1,0,1,0
chr17	40265596	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=129,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40265589_G_A:40265589:1,0,1,0
chr17	40266214	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:13,8:19,0:17,15,8,0
chr17	40271757	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.353:29:10,5:9,5:8,11,3,7
chr17	40272894	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:5,6:6,2:6,5,6,3
chr17	40275302	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=182,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr17	40277874	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=92,48;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:17,5:12,0:18,11,5,0
chr17	40280484	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	40282409	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,284;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,3:15,0:19,13,2,1
chr17	40315434	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:40315434_G_T:40315434:1,3,0,1
chr17	40315438	.	T	TGTTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:40315434_G_T:40315434:1,1,0,1
chr17	40315441	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:40315434_G_T:40315434:0,1,0,1
chr17	40315443	.	G	GTGATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40315434_G_T:40315434:0,1,0,1
chr17	40342203	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:4,0:7,3:7,6,2,1
chr17	40344926	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:9,0:14,6,1,1
chr17	40345389	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.189:40:19,0:14,7:13,20,0,7
chr17	40354557	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr17	40369373	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:40369373_C_T:40369373:14,10,1,1
chr17	40369376	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:0|1:40369373_C_T:40369373:14,10,1,1
chr17	40376971	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr17	40447558	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr17	40452675	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,15,4
chr17	40459562	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:11,1:2,5:8,5,1,6
chr17	40460989	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=117,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:12,3:5,4:14,3,7,0
chr17	40461003	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,3:5,4:11,5,7,0
chr17	40467864	.	CAACTG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=108,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:11,2:0|1:40467864_CAACTG_C:40467864:8,18,1,1
chr17	40467870	.	G	GCC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:40467864_CAACTG_C:40467864:4,17,1,1
chr17	40467872	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:0|1:40467864_CAACTG_C:40467864:4,17,1,1
chr17	40475650	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.352:46:12,6:16,10:13,17,10,6
chr17	40481529	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=169.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,26:0,30:0,0,32,25
chr17	40490919	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	40491273	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:1,2:2,1:3,2,3,0
chr17	40619937	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr17	40639422	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:1,0:7,3:1,8,1,2
chr17	40642452	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	40642689	.	G	GT	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:27,2:14,1:25,16,0,3
chr17	40642738	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=161,185;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,1:3,1:0,14,0,2
chr17	40642742	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=166,185;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:13,0:3,1:0,16,0,2
chr17	40659716	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,142;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:4,0:6,2:0,10,0,3
chr17	40689613	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=218,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr17	40705100	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:10,10:7,14:10,7,18,6
chr17	40705715	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:0|1:40705715_G_A:40705715:2,1,7,2
chr17	40705724	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.694:11:1,5:1,3:0|1:40705715_G_A:40705715:2,1,7,1
chr17	40706906	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=167,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr17	40716235	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.593:18:3,6:4,3:3,4,5,6
chr17	40717632	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:18,3:8,0:7,21,0,3
chr17	40720605	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:3,2:1,9:1,3,3,9
chr17	40720632	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr17	40721042	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr17	40721360	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:3,5:7,3:2,8,3,6
chr17	40725656	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,4:6,8:5,7,1,11
chr17	40729455	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=106,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.128:41:17,4:19,0:21,15,5,0
chr17	40735469	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.588:22:4,9:4,4:5,4,10,3
chr17	40735641	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:7,4:4,5:1,11,1,8
chr17	40737117	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=46,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.384:16:5,2:4,3:6,4,3,3
chr17	40762339	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=245,203;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr17	40811781	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,8:3,5:2,3,11,2
chr17	40811919	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=93,186;MMQ=52,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:4,4:9,3:7,6,0,7
chr17	40811997	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=122,236;MMQ=39,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr17	40812797	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.282:26:10,4:9,3:1,18,0,7
chr17	40818584	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:5,11:11,9:7,9,9,11
chr17	40818699	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=107,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:8,6:12,8:10,10,7,7
chr17	40822308	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,3075;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	40824088	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.364:26:5,2:5,0:8,8,10,0
chr17	40824139	.	TC	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=134,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,0:16,1:16,15,1,1
chr17	40826525	.	AAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	40835819	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,5:0,0:1,0,3,3
chr17	40836975	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:2,4:5,10:4,3,6,8
chr17	40839152	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=221,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	40842284	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.364:17:3,1:3,1:4,7,0,6
chr17	40843392	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:1,9:4,7:2,3,6,10
chr17	40847908	.	C	CATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:2,1,0,1
chr17	40850689	.	C	CCATG	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:17,3:16,0:12,21,0,3
chr17	40856573	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:6,1:4,2:10,6,3,5
chr17	40865256	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,81;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.256:29:12,0:10,7:9,13,0,7
chr17	40870544	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:23,1:16,1:9,30,0,2
chr17	40881015	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=194,154;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0|1:40881015_T_A:40881015:1,5,0,2
chr17	40881031	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=16,19;MFRL=237,154;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:0,0:0|1:40881015_T_A:40881015:1,3,0,2
chr17	40914457	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=81,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:15,2:15,0:0|1:40914457_G_A:40914457:20,10,1,1
chr17	40914467	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=81,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,2:11,0:0|1:40914457_G_A:40914457:23,10,1,1
chr17	40928396	.	TCC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=129,87;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:4,0:0|1:40928396_TCC_T:40928396:2,10,1,1
chr17	40928401	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=130,87;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:40928396_TCC_T:40928396:2,11,1,1
chr17	40928403	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=141,87;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:4,0:0|1:40928396_TCC_T:40928396:2,12,1,1
chr17	40928405	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=149,87;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:40928396_TCC_T:40928396:1,13,1,1
chr17	40930992	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=102,121;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:12,5,4,0
chr17	40940403	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=98,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,0:19,3:15,19,1,2
chr17	40947891	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:11,1:10,2:0|1:40947891_G_A:40947891:9,12,1,2
chr17	40947892	.	G	GCTAATAAAAATAGTGTCCCAC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:0|1:40947891_G_A:40947891:9,13,1,1
chr17	40957983	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:3,1:0,9,0,2
chr17	40959964	.	G	GTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr17	40970267	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:15,0:9,4:14,10,3,1
chr17	40970960	.	A	AACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,2:4,0:0|1:40970960_A_AACAC:40970960:0,7,0,2
chr17	40970962	.	G	GACTCTGAGGAAAGAGTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,2:4,0:0|1:40970960_A_AACAC:40970960:0,7,0,2
chr17	40986454	.	GGAGAGAGAGA	G,GGA,GGAGAGAGA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,31,33,31;MFRL=118,80,131,127;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,10,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,11,12,15;RU=GA;STR;TLOD=7.35,3.84,14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,4,3,8:0.117,0.092,0.295:29:4,3,3,4:5,1,0,2:3,11,9,6
chr17	40990938	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:4,3:8,0:9,3,2,1
chr17	40997536	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:7,7,1,1
chr17	41002270	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:16,0:14,16,0,2
chr17	41002458	.	A	ATGTGACTGCCCTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	41061509	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,125;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:1,11,0,3
chr17	41063466	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr17	41103938	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr17	41107314	.	A	AATATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:41107314_A_AATATC:41107314:0,0,0,1
chr17	41107317	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41107314_A_AATATC:41107314:0,0,0,1
chr17	41108328	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=99,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:19,0:25,2:0|1:41108328_G_A:41108328:26,20,1,1
chr17	41108331	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=97,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:20,0:25,2:0|1:41108328_G_A:41108328:25,21,1,1
chr17	41108343	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=86,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:17,0:23,3:22,20,3,0
chr17	41108671	.	T	TTCGTCCTCGTCCATGATGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	41113131	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr17	41116291	.	CAGCCCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCCCT;STR;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,6,8
chr17	41116565	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr17	41121205	.	TGGG	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=60,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:1,5:1,10:2,0,7,11
chr17	41121217	.	G	GGA,A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31,15;MFRL=0,130,60;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.98,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,17,2:0.824,0.136:19:0,5,0:0,10,0:0,0,8,11
chr17	41121263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr17	41122443	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	41132578	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr17	41141656	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=103,149;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	41150949	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr17	41154600	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr17	41154817	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=168.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,32:0,22:0,0,29,26
chr17	41164126	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr17	41165734	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,7:0,0,6,3
chr17	41167992	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:13,3,1,2
chr17	41170898	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr17	41174366	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41174366_A_T:41174366:0,0,0,1
chr17	41174369	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41174366_A_T:41174366:0,0,0,1
chr17	41174371	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41174366_A_T:41174366:0,0,0,1
chr17	41174375	.	G	GCGAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=270,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41174366_A_T:41174366:0,1,0,1
chr17	41174379	.	G	GCAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=270,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41174366_A_T:41174366:0,1,0,1
chr17	41216050	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	41242938	.	GCA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=82,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,1:3,1:12,8,2,0
chr17	41245330	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=95,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:17,0:21,5:19,19,0,5
chr17	41245440	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:26,2:8,1:17,17,3,0
chr17	41248005	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=247,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,0:2,3:0,3,3,0
chr17	41361881	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.517:11:3,3:2,3:5,0,4,2
chr17	41365907	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:41365907_A_C:41365907:11,12,1,1
chr17	41365910	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,0:10,2:0|1:41365907_A_C:41365907:11,12,1,1
chr17	41367748	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:4,6:1,3:5,2,8,2
chr17	41561601	.	CGGAAGGA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAAGGA;STR;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.900:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr17	41566783	.	CTCT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=121.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,22:0,8:0,0,21,9
chr17	41566965	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:6,3:1,0:0,8,0,4
chr17	41567811	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=99,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:5,8,1,2
chr17	41569453	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:7,1,8,0
chr17	41570125	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:23,2:24,1:27,22,3,0
chr17	41573484	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=127,182;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:7,8:10,0:12,5,8,0
chr17	41573527	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=84,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:15,4:20,3:16,19,1,6
chr17	41582203	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:22,0:6,3:14,14,1,2
chr17	41607258	.	ATTTCTCAGGGACAACGCAGACATCATCTGGGAATGGTCGCAGAGG	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.068:47:16,2:12,0:21,24,1,1
chr17	41720827	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr17	41846964	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr17	41893477	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=101,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,2:7,0:0|1:41893477_G_GT:41893477:6,12,1,1
chr17	41893479	.	G	GGGC	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=101,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:10,2:7,0:0|1:41893477_G_GT:41893477:6,13,1,1
chr17	41893482	.	T	TGG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=129,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:6,0:0|1:41893477_G_GT:41893477:5,12,1,1
chr17	41893484	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:41893477_G_GT:41893477:3,11,1,1
chr17	41893488	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=133,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:5,0:0|1:41893477_G_GT:41893477:3,11,1,1
chr17	41898503	.	A	ACCTAAGTGCAGGGAAGGCTGGAAAATATCTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=149,174;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	41907551	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr17	41930294	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:11,0:8,2:9,12,1,1
chr17	41931426	.	GACCAACA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:9,0:0|1:41931426_GACCAACA_G:41931426:6,11,0,2
chr17	41931435	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:7,0:0|1:41931426_GACCAACA_G:41931426:5,11,0,2
chr17	41931437	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:41931426_GACCAACA_G:41931426:4,11,0,2
chr17	41955158	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr17	41960633	.	CG	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr17	42018471	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=142,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,5:1,2:6,0,4,3
chr17	42083840	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr17	42085150	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:8,4:8,12:5,11,6,10
chr17	42117419	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr17	42141342	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=120,191;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:0|1:42141342_C_T:42141342:2,12,0,2
chr17	42141346	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=120,191;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,1:0|1:42141342_C_T:42141342:1,11,0,2
chr17	42155838	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,18:0,6:0,0,5,19
chr17	42156225	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=80,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.270:39:14,0:13,10:11,18,0,10
chr17	42156471	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.326:17:3,3:5,2:8,4,3,2
chr17	42157739	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,3,2
chr17	42158310	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,2:0,5,1,4
chr17	42160132	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=84,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:27,0:14,3:20,21,2,1
chr17	42161136	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:42161136_C_G:42161136:0,3,3,0
chr17	42161138	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,1:0|1:42161136_C_G:42161136:0,3,3,0
chr17	42161142	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:2,2:0|1:42161136_C_G:42161136:0,5,3,0
chr17	42161146	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0|1:42161136_C_G:42161136:1,5,3,0
chr17	42161152	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:2,0:9,2:0|1:42161136_C_G:42161136:3,8,3,0
chr17	42164885	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,12:0.240:52:12,3:26,9:15,25,3,9
chr17	42170181	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	42170920	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,0:0|1:42170920_C_G:42170920:0,6,2,0
chr17	42170926	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:3,0:0|1:42170920_C_G:42170920:1,6,2,0
chr17	42170928	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,0:0|1:42170920_C_G:42170920:2,6,2,0
chr17	42170935	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,11;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,0:0|1:42170920_C_G:42170920:3,7,2,0
chr17	42171206	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:8,5:3,2:1,10,5,3
chr17	42225413	.	TC	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr17	42226342	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:10,1:13,0:3,22,3,0
chr17	42239326	.	CCATGAGCAGGCAGCTCTGGGCATGTGTCTGGTCACATCCAAGGGGGAGAAGAAGGCCAG	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.185:17:9,0:2,2:3,10,1,3
chr17	42239349	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,9:0,1:0,0,3,7
chr17	42249717	.	A	ATG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TG;STR;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:1,3:0,1:0,1,1,4
chr17	42254011	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,19,11
chr17	42254281	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr17	42255097	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,12,12
chr17	42264962	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr17	42272586	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr17	42274407	.	GGGAAGAGAAAGGGGCCAAGGGGAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.209:13:3,1:5,1:5,6,0,2
chr17	42288128	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,0:1,5:4,2,2,3
chr17	42289333	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=85,67;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:21,4:19,0:22,18,3,1
chr17	42293984	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:29,0:15,4:23,21,3,1
chr17	42332083	.	G	GGGCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:42332083_G_GGGCCC:42332083:0,2,0,1
chr17	42332085	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:42332083_G_GGGCCC:42332083:0,2,0,1
chr17	42332578	.	G	GAACT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=69,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:42332578_G_GAACT:42332578:8,4,1,1
chr17	42332580	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=69,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:42332578_G_GAACT:42332578:8,5,1,1
chr17	42332582	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=69,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:42332578_G_GAACT:42332578:8,5,1,1
chr17	42332584	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=69,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:42332578_G_GAACT:42332578:8,5,1,1
chr17	42332587	.	A	AAATT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=69,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:42332578_G_GAACT:42332578:8,5,1,1
chr17	42332980	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=93,138;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:7,2,2,0
chr17	42334640	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,139;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:5,3:15,0:18,2,3,0
chr17	42336488	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,112;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.322:50:14,15:20,0:24,10,16,0
chr17	42337091	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=242,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,4,2
chr17	42339051	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,3:2,0:0,7,1,2
chr17	42390632	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:1,8,0,2
chr17	42393012	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.368:14:1,0:5,0:0|1:42393012_G_C:42393012:1,8,5,0
chr17	42393015	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.368:14:2,0:6,1:0|1:42393012_G_C:42393012:1,8,5,0
chr17	42394918	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.215:35:17,7:11,0:12,16,0,7
chr17	42397864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr17	42398610	.	ATT	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=127,35;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:0|1:42398610_ATT_A:42398610:8,10,2,1
chr17	42398615	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=127,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,0:5,3:0|1:42398610_ATT_A:42398610:7,11,2,1
chr17	42398618	.	T	TCAAAGGCCCAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=135,35;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:9,0:3,3:0|1:42398610_ATT_A:42398610:6,8,2,1
chr17	42398757	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,5:3,4:4,2,10,0
chr17	42400264	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.199:27:7,2:7,0:7,14,6,0
chr17	42400313	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr17	42400329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr17	42400816	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr17	42427544	.	G	GAGTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTC;STR;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:3,1,5,0
chr17	42427732	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=63,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:1,2,5,5
chr17	42428222	.	G	GTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:42428222_G_GTGC:42428222:0,1,0,1
chr17	42428227	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42428222_G_GTGC:42428222:0,1,0,1
chr17	42430244	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=260,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,0:3,4:0,3,2,2
chr17	42431734	.	G	GGCATGCGCCTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:42431734_G_GGCATGCGCCTGT:42431734:3,1,1,1
chr17	42431736	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:42431734_G_GGCATGCGCCTGT:42431734:3,1,1,1
chr17	42436947	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=78,104;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:14,4:24,0:18,20,0,4
chr17	42437083	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	42452961	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=92,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,4:13,0:10,11,4,0
chr17	42454270	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=262,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr17	42454463	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.394:20:5,5:6,1:7,5,4,4
chr17	42455022	.	TGAGCCCCTG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,6:2,6:5,2,11,1
chr17	42462636	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:10,0:4,4:7,7,2,2
chr17	42463514	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,6:1,1:0,3,3,4
chr17	42476170	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=112,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:13,10,3,0
chr17	42477312	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.139:41:21,5:15,0:0|1:42477312_G_T:42477312:17,19,3,2
chr17	42477313	.	C	CTT	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=119,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:22,3:15,0:0|1:42477312_G_T:42477312:20,20,2,2
chr17	42477314	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=119,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.109:44:22,4:15,0:0|1:42477312_G_T:42477312:20,20,2,2
chr17	42477315	.	C	CTTTCTTTCT	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:20,3:18,0:0|1:42477312_G_T:42477312:20,20,2,2
chr17	42477738	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=125,80;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:8,5:12,0:9,13,5,0
chr17	42635716	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:7,10:4,8:5,6,10,8
chr17	42744210	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr17	42745013	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:6,6,1,1
chr17	42745253	.	TCG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr17	42745687	.	CTTGCCTTATTTCTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	42751607	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	42786630	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=150.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,32:0,19:0,0,30,22
chr17	42808387	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:0|1:42808387_A_T:42808387:13,8,1,1
chr17	42808389	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:42808387_A_T:42808387:13,8,1,1
chr17	42849096	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,3:9,0:7,5,1,2
chr17	42850212	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.290:14:3,0:4,1:4,6,4,0
chr17	42850238	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:1,2:3,0:3,3,3,0
chr17	42926856	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	42927628	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr17	42929075	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:12,1:6,6:9,9,3,4
chr17	42929970	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.956:18:0,8:0,10:0,0,4,14
chr17	42931049	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42931049_GT_G:42931049:0,3,0,1
chr17	42931051	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42931049_GT_G:42931049:0,3,0,1
chr17	42934372	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr17	42945296	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,5,16
chr17	42949808	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,10,12
chr17	42957855	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr17	42960351	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=171,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42960351_T_C:42960351:4,0,1,0
chr17	42960357	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=171,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42960351_T_C:42960351:4,0,1,0
chr17	42960588	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr17	42960624	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	42978398	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,114;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:19,0:27,5:24,22,0,5
chr17	42978554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=398,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,2:1,4:1,0,0,6
chr17	42980189	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr17	42981104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	42981239	.	G	GAGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=47,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,8:1,10:1,0,14,7
chr17	42981499	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,12:0,0,8,15
chr17	42982068	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:9,4,3,0
chr17	42984842	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr17	42987482	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,11:0,7:1,0,13,5
chr17	42988092	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,8:0,0,4,14
chr17	42988760	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.206:22:6,0:11,4:0|1:42988760_T_C:42988760:2,16,2,2
chr17	42988768	.	C	CCCTTCTTGGGCTGGGTACCTTCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.236:19:4,0:10,4:0|1:42988760_T_C:42988760:1,14,2,2
chr17	42988959	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	42991187	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:0|1:42991187_G_C:42991187:3,16,2,2
chr17	42991192	.	C	CTTCTCTTCTTCCCTCCTTCCTTCCT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:0|1:42991187_G_C:42991187:3,14,2,2
chr17	43003970	.	A	AACCAAAATGAACGAAAATCTGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	43006360	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:9,5,1,1
chr17	43138597	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr17	43138728	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.334:34:12,6:10,5:15,8,7,4
chr17	43138893	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,0:4,7:0,13,0,7
chr17	43163851	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=95.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,14:0,15:0,0,17,12
chr17	43181287	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	43181325	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=69,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:0,2,1,7
chr17	43190161	.	GCACAAAGGTGAACAGGGTCTGCAGGACCTGGACCCACATCCCTCTCCATCCCCACCAGCCTCCACCAACCTTGCTTTAGGCTGCTAAGAGGCAGTGTAAACTGGCC	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:2,1:1,2:17,7,2,1
chr17	43190658	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr17	43192549	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=80.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,12:0,0,11,17
chr17	43192821	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,11,15
chr17	43195811	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:43195811_A_T:43195811:7,15,1,1
chr17	43195817	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:43195811_A_T:43195811:7,14,1,1
chr17	43195819	.	C	CGCACCACCACACCCAGCTA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:12,2:0|1:43195811_A_T:43195811:6,14,1,1
chr17	43196157	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,0,2
chr17	43197849	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,0:3,2:0|1:43197849_C_T:43197849:3,11,1,1
chr17	43197857	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:43197849_C_T:43197849:2,11,1,1
chr17	43197858	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:0|1:43197849_C_T:43197849:2,11,1,1
chr17	43197861	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,1:0|1:43197849_C_T:43197849:2,11,1,1
chr17	43213772	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,2,3
chr17	43227669	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=145,899;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:18,3,0,3
chr17	43227766	.	T	TTTGG	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGG;STR;TLOD=330.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.989:79:0,40:0,35:0,0,40,39
chr17	43228673	.	CA	C,CAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,31,23;MFRL=131,134,168;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.38,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,9,5:0.208,0.120:44:10,2,0:16,7,4:13,17,4,10
chr17	43316520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	43317790	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=74,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,2:2,5:2,2,6,1
chr17	43318778	.	GC	CG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,11,8
chr17	43319431	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	43319434	.	TCCG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	43320687	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,4:9,0:10,12,2,2
chr17	43321530	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:0,1:1,0:5,1,4,0
chr17	43331713	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,105;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:9,2:8,0:0|1:43331713_G_A:43331713:14,4,2,0
chr17	43331716	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=129,105;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:0|1:43331713_G_A:43331713:14,5,2,0
chr17	43333700	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:5,4:6,7:8,3,6,6
chr17	43342611	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=165,59;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:15,4:8,0:13,10,4,0
chr17	43343956	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:12,4:14,0:16,10,4,0
chr17	43344073	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:5,3:7,3:3,9,1,6
chr17	43347760	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=93,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.287:18:3,4:9,0:6,7,3,2
chr17	43351902	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=31,22;MFRL=89,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:16,0:11,4:0|1:43351902_G_T:43351902:12,15,2,2
chr17	43351910	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=89,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:16,0:11,4:0|1:43351902_G_T:43351902:12,15,2,2
chr17	43351911	.	A	ATCGTATGTATACTCCCTGTG	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=22,20;MFRL=89,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:14,0:11,3:0|1:43351902_G_T:43351902:12,15,2,2
chr17	43351956	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=108,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:13,2:3,0:0|1:43351956_C_T:43351956:5,11,1,1
chr17	43351964	.	C	CTTG	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,2:3,0:0|1:43351956_C_T:43351956:5,10,1,1
chr17	43351965	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=24,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:3,0:0|1:43351956_C_T:43351956:5,10,1,1
chr17	43351968	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:43351956_C_T:43351956:4,8,1,1
chr17	43351970	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:3,0:0|1:43351956_C_T:43351956:4,8,1,1
chr17	43364293	.	C	CG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=116.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,22:0,14:0,0,18,22
chr17	43364642	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=99,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:26,2:19,1:18,27,1,2
chr17	43473307	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:3,2,5,1
chr17	43473508	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:5,10,0,2
chr17	43481915	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:10,2:9,2:8,11,2,2
chr17	43482476	.	C	CAGTGA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.262:9:3,2:2,0:0|1:43482476_C_CAGTGA:43482476:1,6,1,1
chr17	43482478	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:43482476_C_CAGTGA:43482476:1,6,1,1
chr17	43482481	.	A	AGATGGTGCCACTGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:43482476_C_CAGTGA:43482476:1,6,1,1
chr17	43507008	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.503:28:6,6:7,8:7,7,7,7
chr17	43507649	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	43522775	.	TTGTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=148,161;MMQ=40,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TG;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr17	43528211	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=273,275;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr17	43545893	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=108,137;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.250:46:18,4:17,7:17,18,4,7
chr17	43552537	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=155,161;MMQ=27,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,0:6,7:7,4,3,4
chr17	43552717	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,140;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:6,1,1,4
chr17	43552812	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=145,215;MMQ=39,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:5,5,1,1
chr17	43552921	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,150;MMQ=51,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.438:39:12,5:10,12:17,5,12,5
chr17	43553150	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:1,6:1,3,2,8
chr17	43555253	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=121,136;MMQ=58,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.497:14:4,3:3,4:5,2,7,0
chr17	43893751	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr17	43893769	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=158,282;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:43893769_GC_G:43893769:4,1,2,0
chr17	43893772	.	TGCCTG	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=164,282;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:43893769_GC_G:43893769:6,1,2,0
chr17	43906726	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr17	43907745	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr17	43907896	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=110,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:3,7,1,4
chr17	43907966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr17	43910455	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=64,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,2:2,9:2,0,6,5
chr17	43910507	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=71,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:5,8,5,0
chr17	43910653	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	43912159	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:2,4,1,3
chr17	43922405	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=80,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:6,5:14,0:11,9,5,0
chr17	43923266	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:2,3,1,2
chr17	43923654	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=81,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,2:5,2:4,6,2,2
chr17	43923683	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=108,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,2:6,1:5,7,1,2
chr17	43923703	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=78,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,2:6,2:6,8,0,4
chr17	43923898	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	43923934	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=203,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr17	43924073	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:10,5:4,0:8,6,4,1
chr17	43924130	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,2:2,1:4,6,0,3
chr17	43924200	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=102,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.632:10:2,2:2,3:0|1:43924200_C_G:43924200:2,2,3,3
chr17	43924219	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,3:1,3:0|1:43924200_C_G:43924200:0,3,3,4
chr17	43924231	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0|1:43924200_C_G:43924200:0,4,1,4
chr17	44039691	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.544:24:5,6:5,7:4,7,8,5
chr17	44049329	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:2,2,0,2
chr17	44051846	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:4,4,2,3
chr17	44055843	.	T	TAAAAGCAAGACAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	44060630	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.427:7:4,2:0,0:1,3,1,2
chr17	44061023	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr17	44061036	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,5:4,1:7,2,2,4
chr17	44061278	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,0:10,3:5,8,1,2
chr17	44064334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,6:2,1:6,1,5,2
chr17	44067400	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,7:2,7:2,4,5,9
chr17	44067508	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	44068924	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.295:52:20,4:17,11:10,27,5,10
chr17	44071294	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.366:33:15,8:6,3:16,5,8,4
chr17	44071391	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:6,12,0,2
chr17	44073889	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:0,2:4,2,5,0
chr17	44073973	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,3:3,2:4,8,1,4
chr17	44077044	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,13,11
chr17	44091724	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,6:4,2:4,3,3,5
chr17	44101563	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,2,4
chr17	44108906	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,5:7,1:5,9,3,3
chr17	44109537	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:7,13,2,0
chr17	44110532	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=73,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,13:0.359:37:10,4:13,9:0|1:44110532_G_A:44110532:4,20,5,8
chr17	44110541	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=73,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.378:35:10,4:12,7:0|1:44110532_G_A:44110532:4,18,5,8
chr17	44110650	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:3,3:13,0:10,7,3,0
chr17	44110670	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:12,1:14,3,1,1
chr17	44110888	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:2,7,2,5
chr17	44111613	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.314:26:13,2:5,5:6,12,4,4
chr17	44111679	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=131,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:5,10,0,3
chr17	44115886	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:5,7:7,10:6,6,12,5
chr17	44116312	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr17	44117119	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:16,6:11,6:16,11,5,7
chr17	44128125	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:5,0:6,5:0,11,0,5
chr17	44144152	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr17	44144169	.	C	CAAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:44144169_C_CAAAG:44144169:0,4,0,1
chr17	44144177	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:44144169_C_CAAAG:44144169:0,4,0,1
chr17	44144993	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=114.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,18,19
chr17	44159849	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:8,2:6,2:4,10,1,3
chr17	44159988	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	44248769	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=109,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,26:0.329:83:26,13:26,13:32,25,13,13
chr17	44248814	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,28:0.336:84:25,17:31,11:30,26,13,15
chr17	44248837	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,11:0.168:69:32,4:26,7:22,36,5,6
chr17	44249096	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,1:10,3:12,3,3,1
chr17	44249199	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,15:0.270:57:16,8:26,7:19,23,9,6
chr17	44408795	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	44409904	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,113;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.190:25:12,4:6,1:13,7,4,1
chr17	44413013	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	44413022	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	44413041	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44413041_A_G:44413041:0,0,0,1
chr17	44413043	.	AC	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44413041_A_G:44413041:0,0,0,1
chr17	44626036	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,184;MMQ=27,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr17	44626347	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=152,148;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:15,3:16,7:17,14,6,4
chr17	44630893	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=133,145;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:23,7:4,2:4,23,1,8
chr17	44632540	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	44632734	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,131;MMQ=27,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:10,3:16,1:12,14,0,4
chr17	44782224	.	A	AGT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=127,120;MMQ=27,45;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.431:35:7,7:13,8:11,9,7,8
chr17	44782279	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=143,148;MMQ=52,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,5:7,3:0,15,1,7
chr17	44788253	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	44788310	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.303:20:8,5:6,1:10,4,4,2
chr17	44833088	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=86,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.464:11:1,5:3,0:3,3,5,0
chr17	44851006	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=106,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr17	44950122	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=53,67;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:6,8:2,1:7,2,5,4
chr17	44950130	.	CTCAAGA	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=67,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:2,0:0|1:44950130_CTCAAGA_C:44950130:9,5,1,1
chr17	44950137	.	G	GGT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=67,53;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:44950130_CTCAAGA_C:44950130:7,3,1,1
chr17	44950167	.	G	GAGAGGAGAGAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=101,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr17	44952553	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:10,11,0,2
chr17	45012714	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=224,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr17	45017859	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,2,1
chr17	45214564	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,25;MFRL=133,88;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.248:26:13,4:7,2:12,8,4,2
chr17	45214582	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=26,31;MFRL=126,127;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.447:36:12,9:8,7:0|1:45214582_A_G:45214582:11,9,10,6
chr17	45214592	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=126,127;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,16:0.405:40:14,9:8,7:0|1:45214582_A_G:45214582:14,10,10,6
chr17	45214600	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=126,160;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,14:0.375:38:14,7:9,6:0|1:45214582_A_G:45214582:13,11,9,5
chr17	45214605	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=126,165;MMQ=60,36;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:16,6:9,4:0|1:45214582_A_G:45214582:15,11,8,2
chr17	45214606	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=29,27;MFRL=140,63;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:20,2:13,0:23,12,1,1
chr17	45214613	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=26,26;MFRL=126,169;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.278:34:14,6:10,3:0|1:45214582_A_G:45214582:15,10,7,2
chr17	45214616	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=27,31;MFRL=126,169;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:14,6:9,1:0|1:45214582_A_G:45214582:15,9,7,2
chr17	45214617	.	G	GC	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=126,169;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.294:32:14,5:9,1:0|1:45214582_A_G:45214582:15,8,7,2
chr17	45214631	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=134,158;MMQ=60,45;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,2:10,1:13,10,2,1
chr17	45214633	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=130,160;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,1:10,1:0|1:45214582_A_G:45214582:13,11,2,0
chr17	45214648	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=117,123;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,1:6,1:0|1:45214648_G_C:45214648:9,8,1,1
chr17	45214651	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=122,172;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,1:6,1:0|1:45214648_G_C:45214648:9,8,1,2
chr17	45214654	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=122,172;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:0|1:45214648_G_C:45214648:9,8,1,2
chr17	45214669	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=23,26;MFRL=120,73;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:8,2:8,3:0|1:45214669_T_G:45214669:9,7,4,2
chr17	45214673	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=120,73;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,3:8,3:0|1:45214669_T_G:45214669:9,7,4,2
chr17	45214682	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=23,20;MFRL=123,71;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,4:3,6,7,3
chr17	45214690	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=120,65;MMQ=60,47;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,2:6,2:8,8,3,1
chr17	45214699	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=23,20;MFRL=122,71;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,3:8,2:7,8,4,1
chr17	45216132	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=21,30;MFRL=88,89;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.281:30:11,5:9,2:0|1:45216132_T_G:45216132:12,10,3,5
chr17	45216141	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=89,92;MMQ=60,29;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.486:33:11,10:6,3:0|1:45216132_T_G:45216132:10,7,6,10
chr17	45216162	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=103,89;MMQ=60,31;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=67.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,18:0.432:42:10,15:13,3:0|1:45216132_T_G:45216132:13,11,7,11
chr17	45216168	.	TT	CG	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=103,89;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,18:0.452:40:9,13:12,3:0|1:45216132_T_G:45216132:12,10,7,11
chr17	45216172	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=108,89;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:9,14:12,3:0|1:45216132_T_G:45216132:11,10,7,10
chr17	45219299	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,90;MMQ=51,37;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.229:37:18,2:11,6:11,18,3,5
chr17	45219354	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:5,1:4,6,4,2
chr17	45221251	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=122,60;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:13,4:6,4:13,6,0,8
chr17	45221273	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=134,59;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:13,6:5,7:13,5,2,11
chr17	45221286	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=134,59;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.427:31:8,6:4,6:13,5,2,11
chr17	45221298	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=21,30;MFRL=141,59;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.454:29:6,5:5,6:0|1:45221298_A_G:45221298:9,7,2,11
chr17	45221303	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=22,23;MFRL=134,59;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.486:27:4,6:6,6:0|1:45221298_A_G:45221298:8,6,2,11
chr17	45221317	.	TA	CC	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=22,29;MFRL=138,65;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,0:7,3:9,6,1,2
chr17	45229087	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	45229221	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=128,95;MMQ=53,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,3:3,0:0|1:45229221_C_T:45229221:6,7,1,2
chr17	45229228	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=114,95;MMQ=57,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,3:6,0:0|1:45229221_C_T:45229221:9,7,1,2
chr17	45229234	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=114,95;MMQ=57,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:0|1:45229221_C_T:45229221:9,7,1,2
chr17	45229240	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=114,95;MMQ=55,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,3:6,0:0|1:45229221_C_T:45229221:9,6,1,2
chr17	45229253	.	TT	GG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=130,95;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:0|1:45229253_TT_GG:45229253:11,5,1,2
chr17	45229261	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=114,100;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:0|1:45229253_TT_GG:45229253:9,7,0,2
chr17	45232074	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=115,109;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,1:9,1:0|1:45232074_T_G:45232074:14,10,2,0
chr17	45232079	.	GA	AC	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=120,109;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:10,1:0|1:45232074_T_G:45232074:14,9,2,0
chr17	45232085	.	T	TCTC	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=129,109;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,1:12,1:0|1:45232074_T_G:45232074:14,8,2,0
chr17	45232087	.	T	TAC	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=121,109;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:12,1:0|1:45232074_T_G:45232074:13,8,2,0
chr17	45232088	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=121,109;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:12,1:0|1:45232074_T_G:45232074:13,8,2,0
chr17	45232093	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=121,109;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,1:11,1:0|1:45232074_T_G:45232074:13,8,2,0
chr17	45232102	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=120,109;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,1:12,1:0|1:45232074_T_G:45232074:14,7,2,0
chr17	45234298	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=96,73;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:4,8:2,11:3,3,12,7
chr17	45234331	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=11;MBQ=20,30;MFRL=77,84;MMQ=50,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,9:0.151:64:27,3:23,6:28,27,5,4
chr17	45234343	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=81,80;MMQ=52,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=207.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,54:0.809:66:6,27:5,26:0|1:45234343_T_G:45234343:6,6,28,26
chr17	45234360	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=11;MBQ=20,20;MFRL=85,84;MMQ=52,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=194.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,52:0.768:67:9,27:6,22:0|1:45234343_T_G:45234343:8,7,22,30
chr17	45234403	.	TT	GG	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=109,89;MMQ=52,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.447:36:15,7:5,9:0|1:45234403_TT_GG:45234403:10,10,5,11
chr17	45234406	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=30,24;MFRL=109,63;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:13,8:13,1:11,16,4,5
chr17	45234411	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=29,23;MFRL=109,85;MMQ=50,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:16,4:12,1:12,17,2,3
chr17	45234416	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=24,26;MFRL=112,95;MMQ=56,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.303:31:13,5:7,3:0|1:45234403_TT_GG:45234403:11,11,2,7
chr17	45234417	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=23,24;MFRL=114,63;MMQ=55,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:10,6:8,2:8,12,4,5
chr17	45234420	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=25,29;MFRL=114,86;MMQ=60,37;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,9:6,4:6,5,4,9
chr17	45234449	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=32,26;MFRL=154,128;MMQ=60,31;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:4,6,1,2
chr17	45234626	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=24,24;MFRL=125,100;MMQ=60,39;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,1:23,1:0|1:45234626_T_G:45234626:20,17,1,1
chr17	45234632	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=25,24;MFRL=90,100;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:14,1:25,1:0|1:45234626_T_G:45234626:25,20,1,1
chr17	45234645	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=90,100;MMQ=60,39;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:18,1:29,1:0|1:45234626_T_G:45234626:23,25,1,1
chr17	45234654	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=25,34;MFRL=89,100;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:17,1:28,1:0|1:45234626_T_G:45234626:20,25,1,1
chr17	45234657	.	TT	CG	.	.	DP=50;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=90,100;MMQ=60,39;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:17,1:27,1:0|1:45234626_T_G:45234626:21,27,1,1
chr17	45234663	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=11;MBQ=23,32;MFRL=90,100;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:16,1:28,1:0|1:45234626_T_G:45234626:20,26,1,1
chr17	45234664	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=11;MBQ=29,27;MFRL=102,44;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.120:48:17,0:25,5:21,22,0,5
chr17	45234665	.	TT	AA	.	.	DP=50;ECNT=11;MBQ=25,29;MFRL=90,100;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:15,1:29,1:0|1:45234626_T_G:45234626:20,26,1,1
chr17	45234707	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=21,24;MFRL=104,139;MMQ=52,36;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:11,2:22,0:0|1:45234707_T_A:45234707:17,17,0,2
chr17	45234710	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=21,25;MFRL=105,139;MMQ=52,36;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.072:40:13,2:25,0:0|1:45234707_T_A:45234707:17,21,0,2
chr17	45234760	.	CA	C,CAA	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=26,34,24;MFRL=128,123,127;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.51,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,6:0.279,0.311:20:4,0,1:2,5,2:2,6,2,10
chr17	45247333	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=76,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:14,1:30,2:18,26,1,2
chr17	45247362	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=111,50;MMQ=60,45;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.271:42:9,3:22,8:13,18,6,5
chr17	45266571	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=9;MBQ=27,22;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:11,4:6,4:4,18,5,9
chr17	45266575	.	G	GCACCC	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=146,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.400:45:14,4:10,8:0|1:45266575_G_GCACCC:45266575:4,23,6,12
chr17	45266582	.	CTG	C	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.160:47:19,4:20,3:9,31,0,7
chr17	45266583	.	TG	CA	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=59.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,40:0.641:62:11,15:9,22:0|1:45266575_G_GCACCC:45266575:3,19,6,34
chr17	45266610	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=248.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,61:0.747:81:11,30:9,29:0|1:45266610_T_G:45266610:0,20,4,57
chr17	45266622	.	CT	GG	.	.	DP=78;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=250.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,60:0.763:78:8,28:8,28:0|1:45266610_T_G:45266610:0,18,4,56
chr17	45266631	.	GA	CG	.	.	DP=75;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=257.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,61:0.805:75:7,31:6,25:0|1:45266610_T_G:45266610:0,14,4,57
chr17	45266655	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=196,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=139.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,33:0.810:40:3,16:3,13:0|1:45266610_T_G:45266610:0,7,2,31
chr17	45266659	.	A	AGACAGAATGACTTCTTTATCCTGCTGACTCTGGAAAGCCCGAC	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=25,24;MFRL=196,145;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=127.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,30:0.838:35:2,13:3,14:0|1:45266610_T_G:45266610:0,5,0,30
chr17	45291103	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,10,4
chr17	45299303	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,12;MFRL=203,84;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.523:2:0,0:0,0:0|1:45299303_T_G:45299303:0,1,0,1
chr17	45299311	.	G	GTCACCTGGCCAGAGCATTGAACCTCTTATT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45299303_T_G:45299303:0,0,0,1
chr17	45299314	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45299303_T_G:45299303:0,0,0,1
chr17	45299316	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,84;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45299303_T_G:45299303:0,0,0,1
chr17	45351897	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:45351897_T_A:45351897:4,6,1,1
chr17	45351899	.	TT	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=110,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:45351897_T_A:45351897:4,6,1,1
chr17	45366996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr17	45380002	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr17	45385012	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,11:4,2:3,5,5,8
chr17	45425115	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=317,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr17	45425144	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	45438886	.	CAGTG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr17	45438952	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	45447734	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr17	45455150	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=126,82;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:19,3:8,0:12,16,3,0
chr17	45456707	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	45479446	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,9:0,0,17,7
chr17	45490308	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=157,77;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:45490308_C_T:45490308:6,15,1,1
chr17	45490313	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=158,77;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:45490308_C_T:45490308:5,15,1,1
chr17	45490318	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=158,77;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:11,1:0|1:45490308_C_T:45490308:5,16,1,1
chr17	45492399	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,158;MMQ=40,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr17	45623436	.	G	T	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=119,148;MMQ=45,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.067:71:41,3:24,1:0|1:45623436_G_T:45623436:3,64,0,4
chr17	45623438	.	G	C	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=119,148;MMQ=45,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,4:0.070:69:36,3:21,1:0|1:45623436_G_T:45623436:3,62,0,4
chr17	45623439	.	T	TGTGA	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=134,136;MMQ=40,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.204:46:24,5:8,3:0,37,0,9
chr17	45646869	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,170;MMQ=39,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:12,0:5,3:12,5,3,0
chr17	45663680	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=143,114,133;MMQ=55,51,58;MPOS=2,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=TA;STR;TLOD=15.15,20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,8:0.287,0.326:25:7,5,5:3,2,3:7,3,11,4
chr17	45664573	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,112;MMQ=53,55;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.286:37:9,7:14,2:21,5,9,2
chr17	45669398	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,160;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:2,17,0,4
chr17	45690029	.	CTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,35,22;MFRL=153,181,160;MMQ=40,50,60;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,16;RU=T;STR;TLOD=6.86,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.273,0.310:7:0,0,1:0,2,0:0,3,0,4
chr17	45730168	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:12,10:9,13:8,13,8,15
chr17	45753736	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=92,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:0|1:45753736_C_T:45753736:13,14,1,1
chr17	45753745	.	G	GC	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:15,0:0|1:45753736_C_T:45753736:16,14,1,1
chr17	45753746	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=93,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:0|1:45753736_C_T:45753736:16,14,1,1
chr17	45753749	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,2:16,0:0|1:45753736_C_T:45753736:16,16,1,1
chr17	45754569	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	45755345	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:9,5:15,0:17,7,5,0
chr17	45755810	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr17	45774072	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=245,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,9:1,10:0,1,5,14
chr17	45777154	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=276,280;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.261:43:7,0:24,10:1,31,0,11
chr17	45777157	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=177,280;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.379:43:8,0:17,16:1,26,0,16
chr17	45785905	.	C	CTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:2,2:12,0:0|1:45785905_C_CTG:45785905:2,12,0,2
chr17	45785907	.	GCC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,1:12,0:0|1:45785905_C_CTG:45785905:3,13,0,2
chr17	45786065	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr17	45822645	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,1:7,2:5,6,1,2
chr17	45888251	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	45890707	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.376:26:9,3:7,4:7,9,6,4
chr17	45893862	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:17,4:11,5:16,12,2,7
chr17	45894735	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,13,5
chr17	45896478	.	TG	CA,CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35,25;MFRL=0,44,114;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.38,27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.199,0.736:12:0,0,5:0,2,5:0,0,3,9
chr17	45897233	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=104,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:3,4,2,0
chr17	45897531	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,10,11
chr17	45901480	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:7,0,6,1
chr17	45904163	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=66,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.682:31:6,11:3,10:4,6,8,13
chr17	45904205	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=137,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr17	45904236	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,2,0
chr17	45905779	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,6,0
chr17	45905850	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,20:0,0,22,19
chr17	45913926	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=302,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr17	45916061	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:7,0:6,3:5,8,0,4
chr17	45916725	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr17	45916804	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:11,3:15,9,1,2
chr17	45924768	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=183,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,0:3,2:3,3,2,1
chr17	45993440	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	45994154	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.691:31:5,12:4,5:4,5,9,13
chr17	46005289	.	C	CACCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	46048412	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,7:3,2:5,0,7,3
chr17	46048592	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=119.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,22:0,0,20,18
chr17	46048858	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr17	46051273	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,8:4,10:3,3,10,8
chr17	46051661	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,7:3,0:8,0,7,0
chr17	46051911	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,2:7,2:0,11,0,4
chr17	46052793	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr17	46052953	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=231,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:46052953_C_A:46052953:2,3,1,1
chr17	46052954	.	G	GAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=231,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:46052953_C_A:46052953:2,3,1,1
chr17	46054264	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr17	46055106	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	46055347	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr17	46056230	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,0;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:13,0:19,0:0|1:46056230_A_G:46056230:15,20,3,0
chr17	46056239	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:14,3:18,0:0|1:46056230_A_G:46056230:12,21,3,0
chr17	46103760	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,11:0,0,16,12
chr17	46106634	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr17	46109999	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,8:0.153:54:25,7:21,0:31,15,8,0
chr17	46110010	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=115,55;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:28,4:19,0:30,20,4,0
chr17	46111172	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:6,7:1,7:6,1,10,4
chr17	46136133	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,7:1,6:0,6,4,9
chr17	46137055	.	GCTGGAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTGGAC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr17	46152291	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=42,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:3,1,9,0
chr17	46152322	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=93,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:2,14:12,4:9,5,14,4
chr17	46152559	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=162,186;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	46154202	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:9,13:15,7:13,11,14,6
chr17	46190106	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,182;MMQ=40,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.364:11:5,3:2,1:1,6,0,4
chr17	46190819	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:1,5,2,5
chr17	46198876	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:6,4:6,2:3,10,2,4
chr17	46239765	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=136,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,0:3,2:6,0,3,0
chr17	46239985	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=70,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1,5,1,2
chr17	46507417	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.703:25:5,8:2,9:5,2,11,7
chr17	46507508	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:46507508_C_A:46507508:3,13,1,1
chr17	46507510	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:9,0:0|1:46507508_C_A:46507508:3,15,1,1
chr17	46607021	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr17	46622335	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	46628348	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:25,2:19,1:24,20,3,1
chr17	46628518	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr17	46629593	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,5:0,0:0,0,4,6
chr17	46629933	.	ACCCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=C;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.713:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	46655268	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.337:24:12,3:1,3:9,7,3,5
chr17	46670405	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:46670405_G_C:46670405:0,0,1,0
chr17	46670411	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46670405_G_C:46670405:0,0,1,0
chr17	46670415	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,11;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:46670405_G_C:46670405:0,0,1,0
chr17	46670422	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:46670405_G_C:46670405:1,0,1,0
chr17	46670424	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46670405_G_C:46670405:1,0,1,0
chr17	46673723	.	TC	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,17,3
chr17	46675240	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr17	46675535	.	CGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	46703444	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	46799812	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:15,3:3,22,0,3
chr17	46865442	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr17	46865458	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=211,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46865458_AG_A:46865458:0,2,0,1
chr17	46865460	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=211,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46865458_AG_A:46865458:0,2,0,1
chr17	46867199	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=193,188;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,1:3,6:6,0,6,1
chr17	46868838	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.112:69:35,7:24,0:33,29,3,4
chr17	46874362	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,1:0,1:8,2,2,0
chr17	46926772	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.925:24:1,16:0,7:0,1,10,13
chr17	46926778	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:10,2:6,0:0|1:46926778_A_T:46926778:5,13,1,1
chr17	46926781	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:46926778_A_T:46926778:5,13,1,1
chr17	46929867	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:24,2:9,0:0|1:46929867_G_A:46929867:17,16,1,1
chr17	46929892	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:21,2:14,0:0|1:46929867_G_A:46929867:20,15,1,1
chr17	46971852	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:25,1:24,2:26,24,1,2
chr17	46971867	.	CAC	TGT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=104,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:18,2:19,0:17,20,1,1
chr17	46972479	.	ATCTC	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=108,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:7,6:8,11:11,7,13,4
chr17	46972915	.	TCTCCCAGGAGTAACAGTCCCCATTCACCTCACCCTCCTGTGTCCTCCCCTCCCCTCACCCCTTCCTCTCCCTCAACTGGCAATGATCTCTGTCC	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.044:71:3,4:7,0:42,24,2,3
chr17	46973139	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.954:17:0,8:0,8:0,0,6,11
chr17	46973203	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:46973203_G_A:46973203:0,4,0,1
chr17	46973213	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46973203_G_A:46973203:0,2,0,1
chr17	46993370	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=177,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr17	47000110	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr17	47000128	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:2,2:6,1:8,4,2,1
chr17	47000221	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:9,2:25,0:15,19,0,2
chr17	47000251	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,3:9,8:7,6,3,8
chr17	47010795	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:2,0:0,5,0,2
chr17	47021418	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=151,160;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:1,5,1,5
chr17	47021428	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=158,164;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,6:0,2:1,3,0,8
chr17	47038391	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	47039132	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=69,140;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:9,2,2,3
chr17	47039254	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	47044463	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=117,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr17	47076449	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:13,2:4,1:10,9,3,0
chr17	47076551	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.973:29:0,20:0,9:0,0,23,6
chr17	47076557	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=119,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:13,3:3,5:13,3,6,2
chr17	47103892	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=116,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,5:0.075:76:48,2:23,3:0|1:47103892_C_T:47103892:51,20,5,0
chr17	47103910	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=95,26;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:65,4:0.070:69:37,4:25,0:1|0:47103892_C_T:47103892:44,21,3,1
chr17	47103931	.	T	TTCCCCAAATTTATATGTTGTCCTCCTAA	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=116,26;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:49,4:0.091:53:26,4:20,0:1|0:47103892_C_T:47103892:29,20,3,1
chr17	47117350	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=91,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:12,8:9,0:8,13,9,0
chr17	47117369	.	GT	AC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:19,2:12,0:18,13,1,1
chr17	47218661	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:10,8:10,0:10,10,8,0
chr17	47236651	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:0,4,1,8
chr17	47238028	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,5,14
chr17	47243712	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=93,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47243712_GG_CT:47243712:0,1,0,1
chr17	47243716	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=93,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47243712_GG_CT:47243712:0,1,0,1
chr17	47246979	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,6:6,5:6,1,5,6
chr17	47284621	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr17	47284831	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:47284831_T_C:47284831:0,4,0,1
chr17	47284834	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:47284831_T_C:47284831:0,4,0,1
chr17	47284861	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47284861_T_A:47284861:0,1,0,1
chr17	47284866	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47284861_T_A:47284861:0,1,0,1
chr17	47284868	.	C	CCGGTTAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:47284861_T_A:47284861:0,1,0,1
chr17	47295356	.	T	TCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr17	47302389	.	CAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=198,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	47484228	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:1,6,1,3
chr17	47486905	.	GTTTTTTTTTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=66,145;MMQ=59,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,2;RU=T;STR;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.515:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr17	47489228	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,0:9,4:1,14,0,4
chr17	47579417	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=90,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr17	47688881	.	T	TAGAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AG;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr17	47780731	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=233,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.289:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr17	47781677	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=88,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:1,2,0,5
chr17	47783145	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:10,2:10,0:17,3,2,0
chr17	47783728	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=41,122;MMQ=57,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,22:0.885:24:0,9:2,6:0|1:47783728_G_A:47783728:1,1,13,9
chr17	47783733	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=41,127;MMQ=57,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,23:0.888:25:0,10:2,4:0|1:47783728_G_A:47783728:1,1,11,12
chr17	47783738	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=0,130;MMQ=54,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.919:23:0,10:1,4:0|1:47783728_G_A:47783728:1,0,8,14
chr17	47785064	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=154.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,19:0,34:0,0,31,22
chr17	47793485	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:47793485_C_G:47793485:0,4,2,0
chr17	47793488	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:47793485_C_G:47793485:0,5,2,0
chr17	47793492	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=84,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:1,0:0|1:47793485_C_G:47793485:2,6,2,0
chr17	47793497	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=83,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,0:0|1:47793485_C_G:47793485:3,6,2,0
chr17	47874367	.	G	GTAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	47886600	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.697:18:3,7:2,5:1,4,6,7
chr17	47919068	.	G	GAGATGCTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=73,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	48051181	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:3,1:4,2:1,7,3,0
chr17	48151908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,12,17
chr17	48152757	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:7,5,2,0
chr17	48153876	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,1:0,1:2,0,2,1
chr17	48165064	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	48172779	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:11,6:11,2:21,1,8,0
chr17	48183471	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,1:1,4,0,6
chr17	48184288	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr17	48185440	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,2:3,0:0|1:48185440_G_A:48185440:12,3,2,0
chr17	48185442	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:0|1:48185440_G_A:48185440:12,3,2,0
chr17	48186131	.	T	TCTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTC;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr17	48186180	.	C	CAGCCTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=219,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48186180_C_CAGCCTCAT:48186180:0,1,0,1
chr17	48186184	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=229,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:48186180_C_CAGCCTCAT:48186180:0,2,0,1
chr17	48212647	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	48212910	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=78,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:3,2,3,1
chr17	48213303	.	G	GGCCCCCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:4,4:9,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCC:48213303:9,5,4,0
chr17	48213306	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:4,2:10,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCC:48213303:10,5,4,0
chr17	48213312	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,2:6,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCC:48213303:9,5,3,0
chr17	48213315	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,2:9,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCC:48213303:9,5,3,0
chr17	48226445	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	48243504	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,22:0,7:0,0,11,18
chr17	48245180	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr17	48245658	.	GG	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=226,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr17	48245940	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=106,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:4,16,0,3
chr17	48246639	.	G	GGGGGGTTCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,2:3,0:5,7,1,1
chr17	48252804	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,3:0,11:0,0,7,9
chr17	48262775	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr17	48262997	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.159:33:18,0:10,4:11,17,0,5
chr17	48263701	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:11,2:1,0:0|1:48263701_C_T:48263701:8,4,1,1
chr17	48263711	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:13,2:1,0:0|1:48263701_C_T:48263701:8,6,1,1
chr17	48263903	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:1,5,2,0
chr17	48264847	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=94,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,0:15,3:15,11,2,1
chr17	48264967	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:3,10,2,0
chr17	48265376	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,3:5,5:4,3,2,6
chr17	48266669	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,8,18
chr17	48269302	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,16:0,0,16,14
chr17	48269426	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.583:13:2,5:2,3:0,5,2,6
chr17	48271216	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr17	48271401	.	CCCTAAGGATGGGAGGCACGAAAGCAGCAGTGAGGACAGCAGGGAGGCAGACAGGACAATGGCAGGGGGTTCAGGGGGAGTGATACTTA	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=99,274;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,5:0.042:74:24,2:11,0:41,28,5,0
chr17	48272001	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=145,83;MMQ=60,34;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:6,6,0,3
chr17	48272055	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.472:21:5,5:5,3:9,2,7,3
chr17	48273439	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr17	48273464	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,14,6
chr17	48273806	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=91,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:10,4:19,0:18,13,4,0
chr17	48273834	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:11,4:19,0:16,14,4,0
chr17	48274291	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr17	48274309	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.543:15:4,3:1,5:4,3,4,4
chr17	48275631	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:48275631_A_T:48275631:4,15,0,2
chr17	48275634	.	CA	TT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:48275631_A_T:48275631:4,15,0,2
chr17	48275638	.	C	CTCGGCT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:48275631_A_T:48275631:4,15,0,2
chr17	48277059	.	AGCCCCAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCCCCAG;STR;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,1:0,6:0,0,4,4
chr17	48355230	.	C	CAAACAAAAAAAGCATTTGACTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=93,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	48433081	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=226,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,3:0,5:2,0,7,1
chr17	48445674	.	CCTGGTCAG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTGGTCAG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.432:5:2,1:0,1:0|1:48445674_CCTGGTCAG_C:48445674:0,3,0,2
chr17	48445699	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1|0:48445674_CCTGGTCAG_C:48445674:0,2,0,2
chr17	48452510	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:12,1,1,1
chr17	48452674	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,143;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:9,6:35,0:18,28,6,0
chr17	48452978	.	A	AAGC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGC;STR;TLOD=102.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,27:0.849:31:2,16:2,10:3,1,10,17
chr17	48453115	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:11,8,0,3
chr17	48453147	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:11,0:14,3:0|1:48453147_T_C:48453147:16,12,0,3
chr17	48453152	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,38;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:14,0:15,3:0|1:48453147_T_C:48453147:18,13,0,3
chr17	48455985	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:7,15:4,11:7,4,17,9
chr17	48456569	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.074:50:21,2:26,1:17,30,1,2
chr17	48457579	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=75,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr17	48469724	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr17	48474501	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr17	48539763	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:1,1:6,3:7,1,3,1
chr17	48539997	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0,8,0,4
chr17	48540960	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.265:10:1,2:6,0:1,7,0,2
chr17	48540967	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:2,0:3,1:0|1:48540967_A_C:48540967:0,5,0,1
chr17	48540970	.	CCTGGGCCCTGACA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:48540967_A_C:48540967:0,5,0,1
chr17	48540987	.	TTCCAAGCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:2,0:3,1:0|1:48540967_A_C:48540967:0,5,0,1
chr17	48541707	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:2,7,0,5
chr17	48542572	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=211,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr17	48542720	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=116,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:7,0:8,6:7,9,0,6
chr17	48546167	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	48548524	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:4,0:7,6:2,10,1,5
chr17	48561982	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr17	48595109	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr17	48595988	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=101,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.643:40:7,10:7,16:7,7,15,11
chr17	48596996	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=157,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,1:0|1:48596996_G_C:48596996:10,9,1,1
chr17	48597000	.	G	GAACT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:48596996_G_C:48596996:10,10,1,1
chr17	48597004	.	T	TTA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:8,2:0|1:48596996_G_C:48596996:10,10,1,1
chr17	48599450	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr17	48602412	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:4,5:5,5:1,8,4,7
chr17	48605419	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr17	48606313	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr17	48613837	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr17	48618106	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.386:21:4,4:8,4:6,7,7,1
chr17	48619272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:1,6,0,6
chr17	48619290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr17	48625223	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr17	48625828	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr17	48625928	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr17	48626389	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:5,5:11,4:0|1:48626389_C_T:48626389:9,7,1,8
chr17	48626398	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:5,1:8,4:0|1:48626389_C_T:48626389:7,6,1,5
chr17	48626575	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=93,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,0:2,4:2,2,3,2
chr17	48626626	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr17	48627860	.	CCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,2:7,7:5,6,5,5
chr17	48628581	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr17	48629312	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:8,2,5,1
chr17	48631607	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.296:18:5,0:7,5:7,6,2,3
chr17	48631857	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	48631872	.	G	GCAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=275,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48631872_G_GCAGC:48631872:0,2,0,1
chr17	48631877	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=275,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:48631872_G_GCAGC:48631872:0,2,0,1
chr17	48647011	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr17	48652833	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,4,0
chr17	48652875	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:9,4,1,1
chr17	48653011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=168,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:48653011_C_T:48653011:4,4,1,1
chr17	48653035	.	T	TTGCCGGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=183,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:48653011_C_T:48653011:4,6,1,1
chr17	48653037	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=175,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,1:0|1:48653011_C_T:48653011:5,6,1,1
chr17	48655493	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	48669490	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,0:3,2:0,11,0,2
chr17	48677203	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr17	48678093	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:11,5:15,0:18,8,4,1
chr17	48678325	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	48693760	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,3:3,7,1,4
chr17	48693779	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr17	48695269	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,1:4,1:5,6,1,1
chr17	48698977	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=83,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:7,3,1,1
chr17	48734016	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=101,72;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:8,6,2,1
chr17	48734469	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,7:0.142:54:25,0:22,7:18,29,0,7
chr17	48738552	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=233,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	48741116	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=91,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:10,9,3,0
chr17	48745035	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,8:3,6:5,1,7,7
chr17	48746135	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr17	48746923	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr17	48751114	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,1,3
chr17	48752866	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,3,3
chr17	48752890	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	48753996	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,1:1,0:0,1,1,1
chr17	48754023	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48754023_G_GGA:48754023:0,1,0,1
chr17	48754027	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:48754023_G_GGA:48754023:0,1,0,1
chr17	48777220	.	GTCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TCA;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr17	48797210	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=59.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,14:0,3:0,0,2,17
chr17	48817652	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,4:4,7:4,2,8,3
chr17	48818998	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=104,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:15,3:18,0:19,14,3,0
chr17	48821201	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:7,8:6,6:0|1:48821201_T_C:48821201:1,13,3,11
chr17	48821207	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,6:5,5:0|1:48821201_T_C:48821201:1,11,1,11
chr17	48823147	.	A	G	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,7:0.079:92:44,0:40,6:44,41,0,7
chr17	48823815	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr17	48917233	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:4,12,0,2
chr17	49054439	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr17	49067763	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr17	49074102	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:10,2:1,0:0,11,0,2
chr17	49124845	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	49231623	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0|1:49231623_C_G:49231623:0,0,13,1
chr17	49231627	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,7:0,7:0|1:49231623_C_G:49231623:0,0,14,1
chr17	49239036	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr17	49280478	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.225:15:3,0:9,3:8,4,2,1
chr17	49281229	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.118:56:28,0:22,6:26,24,2,4
chr17	49710866	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=101,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,3:22,0:17,19,3,0
chr17	49713205	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,3:6,5:5,2,6,2
chr17	49713450	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=294,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr17	49731127	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:2,9,1,1
chr17	49825078	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:8,9,1,2
chr17	51063941	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:13,3:5,3:8,10,2,4
chr17	51901084	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,11,8
chr17	51901192	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.169:22:10,3:9,0:10,9,2,1
chr17	51902492	.	A	AAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr17	51902527	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,4:4,0:5,1,3,1
chr17	52991026	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,75;MMQ=48,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,0:2,0,1,1
chr17	52992203	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=221,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr17	53007655	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0,3,0,7
chr17	53014442	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.394:16:2,3:7,3:9,1,6,0
chr17	53027340	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,4:0,1:5,0,5,0
chr17	53038082	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr17	53038783	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,1:2,6:0,2,0,7
chr17	53042017	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:0|1:53042017_C_G:53042017:3,2,7,0
chr17	53042023	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0|1:53042017_C_G:53042017:3,2,7,0
chr17	53063743	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=229,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr17	53120855	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr17	53124546	.	CGTGT	C,CGTGTGT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=20,24,26;MFRL=108,69,146;MMQ=60,58,60;MPOS=28,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=GT;STR;TLOD=3.53,7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.272,0.400:11:2,1,2:1,2,2:0,3,2,6
chr17	53158361	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,2,1
chr17	53343046	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53343046_C_A:53343046:0,0,0,1
chr17	53343054	.	CG	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53343046_C_A:53343046:0,0,0,1
chr17	53471801	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=74,49;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:22,0:11,2:19,14,2,0
chr17	53828706	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	53844833	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.917:20:0,9:1,9:1,0,8,11
chr17	53844847	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr17	53844872	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=146,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:4,0:0|1:53844872_G_C:53844872:2,11,0,2
chr17	53844875	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=129,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,0:0|1:53844872_G_C:53844872:2,8,0,2
chr17	53851071	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=97.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,14,8
chr17	53851078	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,15,8
chr17	53851228	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,5,13
chr17	53852111	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,21,3
chr17	54428067	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr17	54431452	.	C	CACTAATTTTTACTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	54517855	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	54554821	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=68,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.786:6:0,2:1,0:0,2,3,1
chr17	54558280	.	GTG	ACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	54921322	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,7:0,0,15,6
chr17	54921494	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,31:0,23:0,0,20,34
chr17	54925262	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr17	54925480	.	C	CATAT,CATATATAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,17;MFRL=0,66,132;MMQ=60,59,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,10,12;RU=AT;STR;TLOD=16.78,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.668,0.224:5:0,2,0:0,1,0:0,0,0,5
chr17	54933986	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,0:8,5:5,15,0,5
chr17	54939080	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	54972991	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:54972991_A_G:54972991:6,14,1,1
chr17	54973000	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:54972991_A_G:54972991:5,13,1,1
chr17	54981571	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	54985999	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=184,70;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:1,8,1,2
chr17	55016354	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.410:13:4,4:3,1:6,2,5,0
chr17	55026912	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr17	55027369	.	TGCCCCGTCCCTTA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:14,0:28,2:20,27,1,1
chr17	55027850	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,33;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,8,9
chr17	55027994	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:25,3:23,0:29,19,2,1
chr17	55028395	.	T	TAACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55028395_T_TAACAA:55028395:0,1,0,1
chr17	55028397	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55028395_T_TAACAA:55028395:0,1,0,1
chr17	55028399	.	T	TGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:55028395_T_TAACAA:55028395:0,1,0,1
chr17	55038062	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	55058689	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	55065530	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,14,9
chr17	55065558	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=85.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,19,11
chr17	55074335	.	GT	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:18,0:23,3:24,19,0,4
chr17	55182811	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=88,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:1,8:6,2:5,2,5,5
chr17	55191973	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=122,166;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:8,0:16,6:8,16,0,6
chr17	55191979	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.155:30:8,0:18,4:0|1:55191979_T_C:55191979:8,18,0,4
chr17	55191987	.	C	CCGGACCCAGGGCCTCTCTCATTTA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,38;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,0:6,4:0|1:55191979_T_C:55191979:6,9,0,4
chr17	55193514	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=185,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:55193514_G_GTT:55193514:2,3,1,1
chr17	55193516	.	CGAGCCCAAGTGG	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=162,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:0,2:5,0:0|1:55193514_G_GTT:55193514:5,3,1,1
chr17	55193531	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=162,37;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:55193514_G_GTT:55193514:5,4,1,1
chr17	55197691	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.536:35:9,7:7,10:5,11,12,7
chr17	55334511	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr17	55334577	.	GCCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=C;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	55334793	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr17	55822467	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,9:0,0,11,6
chr17	55918466	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:3,2:9,6:6,6,4,4
chr17	55950300	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,0,5
chr17	56056550	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=81,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,41:0.841:48:5,18:2,23:6,1,22,19
chr17	56056603	.	G	GC	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.316:13:8,0:1,4:0|1:56056603_G_GC:56056603:1,8,3,1
chr17	56056604	.	T	TGC	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.521:19:8,2:1,5:0|1:56056603_G_GC:56056603:1,8,3,7
chr17	56056706	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:11,3:11,4:5,18,0,7
chr17	56056726	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.693:21:3,7:3,7:0,6,1,14
chr17	56058230	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr17	56060215	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.232:44:16,6:18,3:20,14,6,4
chr17	56083771	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.228:33:7,0:17,4:0|1:56083771_A_C:56083771:1,25,7,0
chr17	56083774	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.216:35:6,0:18,0:0|1:56083771_A_C:56083771:3,25,7,0
chr17	56083777	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.154:37:8,0:17,2:0|1:56083771_A_C:56083771:5,27,5,0
chr17	56083783	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=130,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:11,1:24,1:0|1:56083771_A_C:56083771:8,27,2,0
chr17	56083786	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=133,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:10,0:24,0:0|1:56083771_A_C:56083771:8,28,2,0
chr17	56083789	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=140,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:10,0:25,0:0|1:56083771_A_C:56083771:9,29,2,0
chr17	56164651	.	AT	GC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:56164651_AT_GC:56164651:0,3,0,1
chr17	56164654	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:56164651_AT_GC:56164651:0,3,0,1
chr17	56280724	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=167,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:56280724_A_G:56280724:0,4,0,1
chr17	56280725	.	GAAAAACA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=167,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,1:2,0:0|1:56280724_A_G:56280724:0,4,0,1
chr17	56280734	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=201,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:0|1:56280724_A_G:56280724:0,2,0,1
chr17	56283449	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:4,1,6,2
chr17	56286043	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:56286043_T_TA:56286043:0,3,0,1
chr17	56286046	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:56286043_T_TA:56286043:0,4,0,1
chr17	56286048	.	T	TTTTAGTAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:56286043_T_TA:56286043:0,4,0,1
chr17	56290334	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:8,5:5,8:8,5,9,4
chr17	56294141	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,2:4,13:0,7,2,13
chr17	56321451	.	GAC	G,CAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34,27;MFRL=138,0,105;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.51,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,10:0.366,0.434:14:0,1,2:1,2,6:0,1,3,10
chr17	56326557	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=147,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.338:12:3,0:3,2:6,2,0,4
chr17	56344656	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=100,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr17	56350930	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.113:42:20,4:18,0:0|1:56350930_C_T:56350930:16,22,2,2
chr17	56350934	.	G	GGTGTGTATTTTTTTCTTTTTTGAGATGGA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=125,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:19,4:18,0:0|1:56350930_C_T:56350930:16,22,2,2
chr17	56355397	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=98,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,3:9,2:10,11,2,3
chr17	56357833	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:1,7:7,13:4,4,8,12
chr17	56383187	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.597:8:1,3:2,2:1,2,2,3
chr17	56383744	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.774:29:2,11:4,11:2,4,14,9
chr17	56383765	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,0:12,2:14,14,0,2
chr17	56384374	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	56384928	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=90,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,4,3
chr17	56386118	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:7,6:4,6:5,6,6,7
chr17	56386358	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,3,2
chr17	56386607	.	G	GTCCTCCTCT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=54,141;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,3:3,3:6,2,1,5
chr17	56388238	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:5,0,6,4
chr17	56388927	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:2,1,5,5
chr17	56393432	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:14,3:11,1:13,12,3,1
chr17	56397564	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0|1:56397564_G_A:56397564:5,11,0,2
chr17	56397569	.	A	ATTGCTTAAACCT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:56397564_G_A:56397564:5,11,0,2
chr17	56397572	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:8,2:0|1:56397564_G_A:56397564:5,11,0,2
chr17	56398006	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=81,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,7:1,5:2,3,6,6
chr17	56399835	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=270,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr17	56404853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=118,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr17	56404934	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=84,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.642:26:1,4:8,12:3,6,7,10
chr17	56423750	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:2,7,1,3
chr17	56424710	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr17	56429585	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr17	56435080	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=85,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=67.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.823:32:4,16:1,9:2,3,17,10
chr17	56436095	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,1:8,2:8,13,1,2
chr17	56436109	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.349:21:6,6:7,1:4,10,2,5
chr17	56499832	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=103,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,3:5,6:3,7,2,7
chr17	56544280	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr17	56557316	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:8,3:2,0:8,2,4,0
chr17	56569829	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:8,2:13,0:14,7,1,1
chr17	56569842	.	T	TGA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=104.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr17	56581651	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,14,9
chr17	56583006	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:3,6,1,2
chr17	56584508	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=99,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.667:31:2,13:8,8:5,5,10,11
chr17	56585782	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.247:22:5,3:11,2:10,7,3,2
chr17	56598213	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.368:30:13,4:6,7:7,12,5,6
chr17	56598519	.	CCA	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,19;MFRL=150,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:10,1:0|1:56598519_CCA_C:56598519:4,15,1,1
chr17	56598525	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:56598519_CCA_C:56598519:4,14,1,1
chr17	56598526	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=169,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:11,2:0|1:56598519_CCA_C:56598519:4,14,1,1
chr17	56598529	.	GCA	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=183,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:12,2:0|1:56598519_CCA_C:56598519:4,13,1,1
chr17	56598535	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=183,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:4,0:9,2:3,10,1,2
chr17	56598991	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=55,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,5:3,5:4,1,7,3
chr17	56599159	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:6,2:16,2:5,17,3,1
chr17	56599295	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:5,10:5,0:8,3,10,0
chr17	56603978	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.235:36:12,6:14,2:17,11,3,5
chr17	56606518	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=100,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.147:52:21,7:24,0:17,28,7,0
chr17	56620677	.	CC	TT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:7,5,1,1
chr17	56621286	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,19:0,9:0,0,10,19
chr17	56637002	.	A	AAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr17	56642143	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	56642300	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:56642300_CA_C:56642300:8,11,0,2
chr17	56642302	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:0|1:56642300_CA_C:56642300:8,11,0,2
chr17	56643126	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:56643126_C_T:56643126:11,5,1,1
chr17	56643142	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:4,2:0|1:56643126_C_T:56643126:10,3,1,1
chr17	56643145	.	A	AGAAAAGCAT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:0|1:56643126_C_T:56643126:9,2,1,1
chr17	56665187	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,67;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr17	56679084	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,8:1,0:3,1,8,0
chr17	56690827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=111,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,1:7,3:8,11,1,3
chr17	56695008	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=198,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:2,4:3,5:0,5,1,9
chr17	56780625	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,3:11,0:9,7,2,1
chr17	56783786	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:14,0,2,0
chr17	56797997	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=140,104;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	56798018	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,92;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr17	56798207	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=66,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,7:2,1:0,2,2,6
chr17	56833457	.	G	GGAACCC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GAACCC;STR;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.579:22:6,6:3,4:6,3,5,8
chr17	57094617	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,4:1,0:4,2,4,0
chr17	57109323	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,0:12,3:9,16,1,2
chr17	57141768	.	TA	T,TAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,24,24;MFRL=105,103,163;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.49,5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,4:0.173,0.152:30:8,2,0:8,2,3:5,16,5,4
chr17	57152920	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=208,203;MMQ=50,38;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr17	57152948	.	ACTACAGTATACAGAG	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=76,170;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:5,0:10,2:6,17,3,0
chr17	57152977	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=76,5112037;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:9,2:19,0:11,17,0,2
chr17	57168745	.	CTA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:3,1:8,1:1,10,0,2
chr17	57208752	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.780:25:2,7:3,13:1,4,3,17
chr17	57271005	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:14,0:17,4:15,17,0,4
chr17	57271009	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:12,0:17,5:14,16,1,4
chr17	57272173	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:16,0:23,3:20,19,3,0
chr17	57287667	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,3:3,5:6,4,2,6
chr17	57288350	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,260;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:2,0:7,3:6,4,3,0
chr17	57311748	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:5,2:2,2:7,0,3,1
chr17	57335055	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:3,4:5,0,8,3
chr17	57348350	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:11,0:23,5:13,21,0,5
chr17	57474396	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.542:7:0,1:3,3:2,1,3,1
chr17	57648076	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=134,65;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:6,2:0|1:57648076_T_C:57648076:4,17,0,2
chr17	57648085	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=134,65;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:57648076_T_C:57648076:1,18,0,2
chr17	57648091	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=136,65;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:3,2:0|1:57648076_T_C:57648076:0,16,0,2
chr17	57663596	.	TAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,20,24,26;MFRL=125,76,155,131;MMQ=60,39,49,60;MPOS=28,22,32;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.04,4.17,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,5,3:0.196,0.284,0.244:15:2,1,0,1:1,2,4,2:1,3,2,9
chr17	57663618	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,81;MMQ=50,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.163:20:7,1:9,1:1,16,2,1
chr17	57721907	.	T	TTTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,136;MMQ=24,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr17	57725043	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,7,19
chr17	57733479	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	57743691	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr17	57744412	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	57750982	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,20:0,15:0,0,29,6
chr17	57768132	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,0:11,3:0,16,0,3
chr17	57774770	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=103,114;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:18,3:13,0:0|1:57774770_T_G:57774770:21,12,3,0
chr17	57774780	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=102,114;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:20,3:14,0:0|1:57774770_T_G:57774770:21,14,3,0
chr17	57776140	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=240,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr17	57812869	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:5,0:6,7:1,10,0,7
chr17	57886125	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,1:8,4,5,1
chr17	57889192	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.591:13:3,3:2,3:1,4,2,6
chr17	57963537	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:16,2:13,5:18,11,6,1
chr17	57992145	.	TATC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:3,4:9,2:0|1:57992145_TATC_T:57992145:0,12,0,6
chr17	57992171	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.333:16:7,0:4,5:1|0:57992145_TATC_T:57992145:0,11,0,5
chr17	58011498	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,147;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:10,6:13,2:17,6,5,3
chr17	58013497	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr17	58014007	.	G	GTGTTCCTTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=216,132;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	58031309	.	ATT	A,AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26,29;MFRL=155,146,183;MMQ=60,60,60;MPOS=7,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.74,9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,5:0.235,0.358:14:1,1,4:4,2,1:5,1,8,0
chr17	58037374	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:12,4:6,2:10,8,4,2
chr17	58040546	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:58040546_T_C:58040546:6,4,1,1
chr17	58040554	.	C	CTTGGTCAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0|1:58040546_T_C:58040546:6,3,1,1
chr17	58042126	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,1:4,1:0,6,0,2
chr17	58125756	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,0:13,2:0|1:58125756_C_A:58125756:4,13,1,1
chr17	58125768	.	C	CAAAACAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:0|1:58125756_C_A:58125756:2,10,1,1
chr17	58147228	.	GAC	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.245:20:9,1:5,4:2,13,1,4
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chr17	58236587	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:15,2:16,2:14,17,2,2
chr17	58289316	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,171;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,2:4,1:7,1,2,1
chr17	58289507	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,99;MMQ=55,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:25,2:21,1:15,38,0,3
chr17	58332659	.	C	CTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.758:9:2,2:0,3:1,1,6,1
chr17	58342669	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,4:1,0:4,1,4,0
chr17	58500018	.	TGAGG	T	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=23,17;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAGG;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.064:42:18,1:12,0:22,18,0,2
chr17	58503315	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr17	58577843	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:30,3:26,0:21,35,2,1
chr17	58603190	.	AGGAGCGGATGTCTCGGCG	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:16,4:19,0:28,23,2,2
chr17	58725500	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=126,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr17	59118267	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,1:9,0:5,12,0,2
chr17	59479353	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:8,0:0,7:3,5,0,7
chr17	59482165	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:59482165_GC_G:59482165:0,1,0,3
chr17	59482169	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:59482165_GC_G:59482165:0,1,0,3
chr17	59482173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,1:0|1:59482165_GC_G:59482165:0,1,0,3
chr17	59485555	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,9:8,7:12,5,12,4
chr17	59544863	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=93,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.569:26:3,7:8,7:8,3,9,6
chr17	59545060	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=213,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,0:4,6:2,5,0,7
chr17	59545096	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr17	59763347	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,14:0,20:1,0,16,18
chr17	59763380	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.132:43:15,5:23,0:17,21,5,0
chr17	59857809	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr17	59857855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=254,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:59857855_G_A:59857855:0,3,0,1
chr17	59857857	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=254,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:59857855_G_A:59857855:0,3,0,1
chr17	59878522	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	59988926	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=104,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:18,3:28,1:27,19,4,0
chr17	59999198	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.179:24:3,0:11,4:2,18,0,4
chr17	60033242	.	ATC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.243:17:0,0:10,4:1,12,3,1
chr17	60033940	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,145;MMQ=60,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:0,8,0,2
chr17	60033942	.	CTGGA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,132;MMQ=49,45;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGA;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr17	60043884	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,14:0,0,10,9
chr17	60045674	.	TTTTA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=157,66;MMQ=54,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTA;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr17	60472623	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	60491298	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,185;MMQ=40,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr17	60501249	.	TCCGGCTCCGGTGTCATGG	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=128,87;MMQ=52,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:8,2:13,0:20,10,1,1
chr17	60524959	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,50;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0|1:60524959_TG_T:60524959:4,0,1,1
chr17	60524961	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,50;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0|1:60524959_TG_T:60524959:4,0,1,1
chr17	60526038	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=108,68;MMQ=52,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:18,1:21,3:21,18,1,3
chr17	60600569	.	AC	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=120,137;MMQ=57,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,1:17,2:9,29,0,3
chr17	60637398	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,155;MMQ=39,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:22,0:15,3:22,15,0,3
chr17	60642298	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:3,4:7,0:10,0,4,0
chr17	60642539	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr17	60742348	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr17	60743869	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,0:8,4:5,7,2,2
chr17	60748926	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	60758099	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=139,34679933;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60758099_T_C:60758099:3,0,1,0
chr17	60758102	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=139,34679933;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60758099_T_C:60758099:3,0,1,0
chr17	60758273	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr17	60759340	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:60759340_A_G:60759340:0,0,4,13
chr17	60759347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0|1:60759340_A_G:60759340:0,0,3,11
chr17	60766786	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,17,0
chr17	60766804	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,14:0,0,21,0
chr17	60767151	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr17	60767461	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,11,6
chr17	60767953	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr17	60768243	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr17	60768498	.	CG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:60768498_CG_C:60768498:15,8,1,1
chr17	60768508	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:60768498_CG_C:60768498:15,8,1,1
chr17	60769406	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=198,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr17	60779025	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:3,0,6,2
chr17	60814273	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,18:0.317:58:25,9:14,9:18,22,9,9
chr17	61087073	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:0,4,0,5
chr17	61271340	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=115,94;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,5:8,0:13,3,5,0
chr17	61428614	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,2:9,0:13,8,2,0
chr17	61457217	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr17	61466777	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:12,0:8,12,0,2
chr17	61473325	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr17	61489364	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:0|1:61489364_G_A:61489364:14,9,1,2
chr17	61489368	.	CTGG	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:0|1:61489364_G_A:61489364:13,10,1,1
chr17	61489374	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=141,35;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:0|1:61489364_G_A:61489364:12,8,1,1
chr17	61492869	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=86,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:10,3,2,1
chr17	61498733	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=114,112;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,0:20,3:17,25,0,3
chr17	61499139	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:61499139_A_C:61499139:9,3,0,2
chr17	61499143	.	CTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:6,0:0|1:61499139_A_C:61499139:9,3,0,2
chr17	61499147	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:61499139_A_C:61499139:9,3,0,2
chr17	61511766	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,135;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,3:10,0:10,6,3,0
chr17	61554706	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61554706_T_G:61554706:0,0,0,1
chr17	61554727	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61554706_T_G:61554706:0,0,0,1
chr17	61556527	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr17	61557813	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=116,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.158:29:8,2:16,2:0|1:61557813_C_T:61557813:14,11,2,2
chr17	61557821	.	G	GCTCCCGCTGCAGCTCCACC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:61557813_C_T:61557813:10,15,1,1
chr17	61558631	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,1,1
chr17	61558882	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:10,1,2,0
chr17	61559841	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,73;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:7,2:12,5,1,1
chr17	61561311	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,79;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,0:3,3:4,9,0,4
chr17	61562478	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr17	61562565	.	GTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,310;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:7,0:0|1:61562565_GTTT_G:61562565:9,7,0,2
chr17	61562570	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,310;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:0|1:61562565_GTTT_G:61562565:8,7,0,2
chr17	61600717	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	61607440	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,7:5,1:7,1,7,1
chr17	61607708	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:4,1:4,2:5,3,3,0
chr17	61607720	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:10,1:11,5,2,0
chr17	61607723	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,1:13,0:0|1:61607723_AC_A:61607723:13,6,1,1
chr17	61607726	.	AGGG	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,1:13,0:0|1:61607723_AC_A:61607723:13,8,1,1
chr17	61607734	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:11,0:0|1:61607723_AC_A:61607723:13,6,1,1
chr17	61611423	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.321:17:5,2:5,3:5,7,0,5
chr17	61615371	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=233,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr17	61619543	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr17	61621041	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.291:21:4,3:10,1:1,14,6,0
chr17	61623048	.	G	GGGAGGAA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=104,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:0|1:61623048_G_GGGAGGAA:61623048:6,6,2,1
chr17	61623049	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=104,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:0|1:61623048_G_GGGAGGAA:61623048:6,6,2,1
chr17	61623057	.	AAAAC	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=99,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:0|1:61623048_G_GGGAGGAA:61623048:9,6,1,1
chr17	61623062	.	TCTG	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=99,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:0|1:61623048_G_GGGAGGAA:61623048:9,6,1,1
chr17	61623071	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=97,40;MMQ=60,60;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:0|1:61623048_G_GGGAGGAA:61623048:8,7,1,1
chr17	61660889	.	CG	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=75.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,11:0,21:0,0,19,13
chr17	61662606	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,178;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:23,0:16,3:15,25,0,3
chr17	61683644	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,2:17,1:18,8,0,3
chr17	61710218	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,2:3,0:3,9,1,1
chr17	61730070	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,0:1,5:0,8,0,5
chr17	61776479	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=243,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,1,4
chr17	61781331	.	TAGAACC	T,TAGAACCAGAACC	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=23,27,24;MFRL=79,103,94;MMQ=60,60,60;MPOS=25,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=2,1,3;RU=AGAACC;STR;TLOD=6.33,88.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,3,25:0.057,0.413:60:15,1,7:17,2,16:28,4,16,12
chr17	61781951	.	GA	TT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0|1:61781951_GA_TT:61781951:0,3,1,1
chr17	61781957	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:61781951_GA_TT:61781951:0,3,1,1
chr17	61781958	.	C	CTGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:61781951_GA_TT:61781951:0,3,1,1
chr17	61783908	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:7,1,11,0
chr17	61790917	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,3:2,7:0,3,3,7
chr17	61805607	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr17	61829344	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:23,2:17,0:0|1:61829344_G_A:61829344:21,21,1,1
chr17	61829369	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:22,2:19,0:0|1:61829344_G_A:61829344:19,25,1,1
chr17	61829371	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:23,2:16,0:0|1:61829344_G_A:61829344:20,25,1,1
chr17	61829374	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:25,1:19,0:0|1:61829344_G_A:61829344:20,24,1,1
chr17	61829856	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr17	61829989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr17	61833717	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:6,0:7,7,1,3
chr17	61833795	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,10:5,5:4,4,10,5
chr17	61838196	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.304:14:1,1:5,3:6,4,4,0
chr17	61838247	.	C	G	.	.	DP=123;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:115,8:0.072:123:34,8:72,0:0|1:61838247_C_G:61838247:32,83,8,0
chr17	61838249	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:115,8:0.072:123:36,8:72,0:0|1:61838247_C_G:61838247:32,83,8,0
chr17	61838259	.	G	A	.	.	DP=141;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,80:0.582:138:19,22:35,57:17,41,20,60
chr17	61869784	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=122,96;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.259:37:8,9:16,0:14,14,9,0
chr17	61885175	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:15,0:14,17,1,1
chr17	61888618	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:0,7,0,2
chr17	61889213	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr17	61892862	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:5,5:3,7:5,3,12,2
chr17	61897683	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=90,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:25,1:19,3:22,24,1,3
chr17	61901439	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=105,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,26:0.750:34:4,4:4,21:5,3,12,14
chr17	61901641	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=200,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,31:0.762:40:7,13:2,16:0|1:61901641_T_C:61901641:3,6,20,11
chr17	61901657	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,27:0.757:35:6,12:1,13:0|1:61901641_T_C:61901641:2,6,19,8
chr17	61902822	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,5:3,8:4,1,10,3
chr17	61904337	.	TCCACTTCCAGTTTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACTTCCAGTTTC;STR;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr17	61904724	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,1:0|1:61904724_T_C:61904724:1,0,2,0
chr17	61904728	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:0|1:61904724_T_C:61904724:1,0,3,0
chr17	61907646	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,2:16,1:13,14,1,2
chr17	61911375	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=108,150;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.144:46:19,6:19,0:17,23,6,0
chr17	61911728	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,0,2
chr17	61912261	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	61958459	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=95,224;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.155:43:21,6:15,0:0|1:61958459_G_A:61958459:19,18,6,0
chr17	61958469	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=116,224;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.242:35:13,8:14,0:0|1:61958459_G_A:61958459:15,12,7,1
chr17	61958954	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.209:16:4,2:9,1:6,7,0,3
chr17	61958964	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:4,3:7,3:5,6,1,5
chr17	61988014	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,167;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr17	61995030	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,3:4,1:5,4,4,1
chr17	61995170	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=81.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.596:45:10,2:8,25:9,9,0,27
chr17	61996204	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=101,124;MMQ=43,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,4:8,2:6,12,2,4
chr17	61996255	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=103,94;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:0,6,1,3
chr17	61996273	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=150,107;MMQ=55,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr17	62006628	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=105,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:2,1:9,1:4,7,2,1
chr17	62008616	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:5,0:8,2,2,0
chr17	62020345	.	G	GGGTCCT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:62020345_G_GGGTCCT:62020345:14,9,1,1
chr17	62020348	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,9:0.370:25:10,5:5,4:1|0:62020345_G_GGGTCCT:62020345:9,7,6,3
chr17	62022659	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,13,2
chr17	62025238	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,6:5,5:3,5,5,6
chr17	62036722	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,129;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:10,10,0,2
chr17	62038515	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	62038633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:11,2:10,0:0|1:62038633_C_T:62038633:15,7,1,1
chr17	62038639	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:62038633_C_T:62038633:14,8,1,1
chr17	62038640	.	G	GTGAACAGCCTCCTACTAGT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,2:11,0:0|1:62038633_C_T:62038633:14,8,1,1
chr17	62041833	.	CC	TT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,0:13,1:14,15,2,0
chr17	62042078	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	62043604	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=75,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:6,4,2,2
chr17	62043631	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=75,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.353:9:4,1:2,0:5,1,0,3
chr17	62043635	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=119,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,1:4,0,0,3
chr17	62044016	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	62048467	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr17	62049235	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr17	62049738	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.342:21:10,3:3,3:11,3,5,2
chr17	62049955	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:12,3:8,0:4,16,0,3
chr17	62080969	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,12,7
chr17	62082818	.	C	CTATCTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr17	62083929	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=102.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,25,9
chr17	62122145	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr17	62122677	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr17	62122755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:62122755_C_T:62122755:8,8,1,1
chr17	62122765	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:62122755_C_T:62122755:12,11,1,1
chr17	62122768	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:62122755_C_T:62122755:12,11,1,1
chr17	62122771	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:62122755_C_T:62122755:12,11,1,1
chr17	62122776	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:10,2:0|1:62122755_C_T:62122755:13,13,1,1
chr17	62125272	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,8,9
chr17	62125411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=317,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0,2,1,6
chr17	62130389	.	G	GCCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCT;STR;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr17	62131713	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,1:14,1:10,11,2,1
chr17	62141455	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,13:0,12:0,0,14,11
chr17	62145672	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,8:0,0,10,15
chr17	62145728	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr17	62152611	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,27,28;MFRL=168,139,103;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,17,18;RU=A;STR;TLOD=15.80,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,11,5:0.566,0.248:19:1,2,0:2,8,4:0,3,0,16
chr17	62156933	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=74.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,20,2
chr17	62158012	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr17	62158278	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr17	62158300	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr17	62175472	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:19,4:31,0:24,26,4,0
chr17	62207416	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	62232405	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=277,113;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62232405_A_C:62232405:0,1,0,1
chr17	62232407	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=277,113;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62232405_A_C:62232405:0,1,0,1
chr17	62232412	.	C	CCTCGTGCACGCCCTTCACCACCACTGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=277,113;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:62232405_A_C:62232405:0,1,0,1
chr17	62265838	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr17	62270823	.	GCTTC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=137,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTTC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr17	62270913	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:14,4,3,0
chr17	62271011	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:18,1:12,17,2,0
chr17	62272531	.	G	GCCTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:0|1:62272531_G_GCCTT:62272531:0,3,0,1
chr17	62272532	.	G	GTGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:0|1:62272531_G_GCCTT:62272531:0,3,0,1
chr17	62272535	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:62272531_G_GCCTT:62272531:0,3,0,1
chr17	62289922	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:14,6:8,0:17,5,7,0
chr17	62291606	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:14,0:6,5:7,13,0,5
chr17	62401118	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:13,2:7,5:12,8,4,3
chr17	62406971	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:2,1:4,3:6,1,2,2
chr17	62406986	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=65,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,5:3,7:3,3,8,4
chr17	62463825	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	62502132	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,34;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.757:5:0,4:0,0:0|1:62502132_A_C:62502132:1,0,4,0
chr17	62502135	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.757:5:0,4:1,0:0|1:62502132_A_C:62502132:1,0,4,0
chr17	62502138	.	A	AGGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:62502132_A_C:62502132:0,0,3,0
chr17	62543675	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:62543675_G_C:62543675:0,3,1,0
chr17	62543681	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:62543675_G_C:62543675:0,3,1,0
chr17	62559054	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=99,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:17,0:15,4:12,20,1,3
chr17	62850663	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:17,0:10,2:16,13,1,1
chr17	62891661	.	G	GGCAGAAGAATTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	62893412	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=139,123;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.292:46:16,6:14,7:8,25,4,9
chr17	62893457	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=155,135;MMQ=45,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:7,5:8,3:1,14,1,8
chr17	63014251	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.367:4:1,0:2,0:0|1:63014251_A_C:63014251:3,0,1,0
chr17	63014258	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.308:5:0,1:0,0:0|1:63014251_A_C:63014251:4,0,1,0
chr17	63014260	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:63014251_A_C:63014251:1,0,1,0
chr17	63133804	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr17	63154484	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:8,0:3,18,0,3
chr17	63173756	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:5,1,4,1
chr17	63173959	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:10,4:15,0:8,17,2,2
chr17	63200479	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr17	63206629	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=121,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:8,9,1,2
chr17	63206687	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=92,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,3:9,0:5,9,1,2
chr17	63532365	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,2:8,2:11,1,4,0
chr17	63532396	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,99;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:10,13:15,0:13,12,13,0
chr17	63532767	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=274,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,4:2,1:0,2,0,6
chr17	63532914	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr17	63533523	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:6,2:7,4,1,1
chr17	63534221	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=225,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr17	63534250	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	63534538	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,1:3,6:0,6,0,7
chr17	63554148	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=94,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,2:10,1:10,10,0,3
chr17	63685174	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,151;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,1:4,7:6,0,8,0
chr17	63739352	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	64023781	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	64024340	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr17	64024375	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr17	64025926	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	64050062	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	64062830	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	64125984	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=104,116;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:29,0:19,4:18,30,0,4
chr17	64173170	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=248,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,3:0,8:0,1,0,11
chr17	64210528	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,6:4,6:2,8,5,7
chr17	64213104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:2,9,0,2
chr17	64216644	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=74,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:0,1:4,0,2,1
chr17	64225324	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=160,127;MMQ=53,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:64225324_A_G:64225324:10,0,2,0
chr17	64225341	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=138,127;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:64225324_A_G:64225324:12,3,2,0
chr17	64225343	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=138,127;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:64225324_A_G:64225324:12,3,2,0
chr17	64492479	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64492479_T_G:64492479:0,0,0,1
chr17	64492480	.	AGTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64492479_T_G:64492479:0,0,0,1
chr17	64728707	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr17	64735035	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr17	64737717	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr17	64783166	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,6:1,3:1,4,3,6
chr17	64785170	.	T	TGAAGCATGCCTTGCGAGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=42,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.376:3:2,1:0,0:0|1:64785170_T_TGAAGCATGCCTTGCGAGCA:64785170:0,2,0,1
chr17	64785173	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=42,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:64785170_T_TGAAGCATGCCTTGCGAGCA:64785170:0,2,0,1
chr17	64785191	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	64799961	.	CCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:64799961_CCTT_C:64799961:3,1,1,0
chr17	64799966	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64799961_CCTT_C:64799961:3,1,1,0
chr17	64875035	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=184,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr17	64876903	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr17	65026515	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:5,2:1,3:7,0,4,1
chr17	65026855	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:6,0:14,2:11,9,0,3
chr17	65051180	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,6:0,7:0,1,8,5
chr17	65052335	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.605:28:7,4:3,13:8,3,9,8
chr17	65074354	.	G	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.340:26:10,5:7,4:11,6,6,3
chr17	65083107	.	GAGGAGTGCTTACTTCTTC	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:13,2:16,0:16,23,1,1
chr17	65103270	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,6:3,2:5,1,8,0
chr17	65116491	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=80.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,6:0,20:0,0,20,6
chr17	65142087	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	65147229	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,9:0.196:49:12,0:26,8:0|1:65147229_A_T:65147229:23,17,0,9
chr17	65147237	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,9:0.189:51:17,0:24,9:0|1:65147229_A_T:65147229:25,17,0,9
chr17	65157129	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.096:71:29,0:35,6:32,33,0,6
chr17	65197158	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr17	65199653	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	65211949	.	C	CA,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,31,32;MFRL=90,167,182;MMQ=60,60,60;MPOS=12,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=17.35,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,11,3:0.382,0.123:29:4,6,2:10,4,1:7,8,9,5
chr17	65214873	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:7,6,1,5
chr17	65340620	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr17	65341770	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr17	65341976	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,7:5,3:3,5,3,7
chr17	65529127	.	A	ACAACTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	65548540	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	65549847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	65574283	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,9,5
chr17	65628371	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:65628371_A_C:65628371:5,15,1,1
chr17	65628376	.	A	AGTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:65628371_A_C:65628371:5,15,1,1
chr17	65665608	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr17	65665726	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=88,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:4,2:11,0:0|1:65665726_G_A:65665726:6,11,1,1
chr17	65665737	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=79,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,1:10,0:0|1:65665726_G_A:65665726:5,10,1,1
chr17	65715925	.	TAATATATAC	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.061:46:23,2:17,0:20,24,1,1
chr17	65718798	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.373:21:6,4:7,3:1,12,2,6
chr17	65718839	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr17	65720346	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,1,2
chr17	65722849	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	65730404	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:4,1,6,1
chr17	65732959	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr17	65733119	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,3:7,2:14,3,4,1
chr17	65735563	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr17	65739789	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:65739789_A_G:65739789:6,0,1,2
chr17	65739797	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:0|1:65739789_A_G:65739789:8,1,1,2
chr17	65822232	.	GCGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACATGGTCTC	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=100,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.298:39:6,11:3,0:22,6,10,1
chr17	65882312	.	GA	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,4:0.080:53:22,2:27,2:0|1:65882312_GA_G:65882312:23,26,2,2
chr17	65882317	.	CAGTAACA	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,36;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:22,2:29,0:0|1:65882312_GA_G:65882312:27,29,1,1
chr17	65882457	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=161.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,34:0,21:0,0,28,27
chr17	65899950	.	CA	C,CAA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=120,131,90;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=A;STR;TLOD=8.21,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,9,5:0.116,0.072:64:27,6,1:19,3,4:22,28,12,2
chr17	65907357	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:7,0:16,3:10,13,1,2
chr17	65918985	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,2:8,1:18,5,2,1
chr17	65919172	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr17	65920706	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=102,138;MMQ=60,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,13:0.249:54:16,13:25,0:18,23,13,0
chr17	65955651	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr17	65955773	.	AGC	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:20,0:12,2:9,31,0,2
chr17	66033401	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,0:11,3:16,8,2,1
chr17	66036957	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=189,268;MMQ=29,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:66036957_G_A:66036957:0,1,0,1
chr17	66036960	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=178,268;MMQ=45,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:66036957_G_A:66036957:0,2,0,1
chr17	66036962	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=178,268;MMQ=45,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:66036957_G_A:66036957:0,2,0,1
chr17	66038181	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:3,2,4,0
chr17	66038979	.	CAA	C,CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,17,31;MFRL=122,123,153;MMQ=60,60,60;MPOS=10,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=6.48,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,5:0.261,0.263:21:3,2,1:2,0,3:4,6,5,6
chr17	66039938	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27,26;MFRL=143,136,158;MMQ=60,60,60;MPOS=1,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.11,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,4:0.256,0.273:14:4,3,2:2,0,2:6,0,8,0
chr17	66250522	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,10:0,0,17,5
chr17	66252048	.	G	GATAGCATTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	66303875	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=94,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:10,1:5,13,0,2
chr17	66364804	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,3:3,7:4,1,5,5
chr17	66420766	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	66422158	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr17	66430713	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:16,2:18,0:20,14,1,1
chr17	66440625	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,11:0.230:50:21,11:18,0:22,17,11,0
chr17	66446803	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr17	66447073	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr17	66453410	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,4:9,9:13,3,13,0
chr17	66453572	.	GGCCCGGGAA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:3,3:9,6:0,15,0,9
chr17	66521947	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=105,64;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:24,4:25,0:26,23,3,1
chr17	66524987	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:11,14:5,6:10,6,17,3
chr17	66526027	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.622:23:3,10:6,4:7,2,11,3
chr17	66533791	.	G	GGGA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.075:48:21,3:20,0:23,22,2,1
chr17	66533979	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=221,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	66536062	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:9,16,3,0
chr17	66865868	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,9:6,6:4,6,10,5
chr17	66871570	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:3,1:2,2:4,12,0,3
chr17	66880081	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	66880371	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	66883719	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	66898823	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:16,3:6,0:15,7,3,0
chr17	66902365	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr17	66904031	.	GA	G,AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,17,26;MFRL=0,133,192;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.41,3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,7:0.441,0.499:15:0,2,1:0,1,6:0,0,2,13
chr17	66917447	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=179,133;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr17	66921089	.	A	AATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	66925116	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=210,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	66925910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:66925910_T_C:66925910:0,0,0,2
chr17	66925923	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:66925910_T_C:66925910:0,0,0,2
chr17	66928350	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24,34;MFRL=0,91,288;MMQ=60,60,40;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=A;STR;TLOD=5.23,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,0,2,1
chr17	66928473	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:1,5:5,4:2,4,5,4
chr17	66933003	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr17	66938232	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	66938260	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=109,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr17	66972250	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,8:4,7:5,6,11,4
chr17	66972364	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr17	66980346	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:2,3,3,4
chr17	66980374	.	T	TGGTAGTAAAGTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr17	66981150	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=113,114;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:13,0:15,10:8,20,1,9
chr17	66981172	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,114;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:12,0:10,9:5,17,0,9
chr17	66986162	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	66988411	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:0|1:66988411_G_A:66988411:4,16,1,1
chr17	66988413	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:66988411_G_A:66988411:4,16,1,1
chr17	67023755	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=80,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,1:1,6:2,0,5,2
chr17	67024585	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=171,155;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,3:3,5:3,0,7,1
chr17	67024799	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.435:12:4,4:3,1:2,5,0,5
chr17	67031369	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,18:0,13:0,0,21,10
chr17	67031457	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,20:0,34:0,0,26,29
chr17	67031823	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=96,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,8:0.108:81:31,8:41,0:38,35,8,0
chr17	67040619	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,47;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:14,3:5,0:14,6,3,0
chr17	67075072	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	67075294	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,8:0,0,10,6
chr17	67079454	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:11,0:19,4:15,15,2,2
chr17	67081130	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:5,0,7,0
chr17	67081732	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,29:0,19:0,0,26,23
chr17	67092948	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.243:15:2,1:9,2:6,6,0,3
chr17	67099129	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:1,6,1,3
chr17	67102319	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,117;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,0:18,4:20,10,0,4
chr17	67109662	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,1,1
chr17	67109673	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr17	67109894	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr17	67119593	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr17	67125840	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,20:0,10:0,0,17,13
chr17	67133352	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	67144884	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	67145290	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,1:2,6:1,2,0,7
chr17	67149484	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.180:48:27,8:13,0:16,24,0,8
chr17	67150039	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=105,69;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:6,9,1,1
chr17	67150176	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr17	67152893	.	CAAAT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAT;STR;TLOD=70.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr17	67160186	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,14,4
chr17	67170736	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,15,7
chr17	67171748	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	67178295	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:9,2:5,0:0|1:67178295_C_T:67178295:9,6,0,2
chr17	67178316	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,15:0,15:0|1:67178295_C_T:67178295:0,0,17,14
chr17	67178784	.	C	CA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.132:48:15,2:26,3:23,19,2,4
chr17	67178954	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,10:0,18:0,0,16,22
chr17	67178976	.	GAA	G,GA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=18,17,16;MFRL=95,140,136;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.44,8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,19:0.214,0.738:27:0,0,2:1,0,0:1,1,2,23
chr17	67181540	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:67181540_C_A:67181540:0,0,3,0
chr17	67181548	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:67181540_C_A:67181540:0,0,2,0
chr17	67181678	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:9,9,2,1
chr17	67186446	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=158,609;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr17	67187447	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:67187447_C_T:67187447:10,12,1,1
chr17	67187452	.	G	GCGAAC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:67187447_C_T:67187447:10,12,1,1
chr17	67187457	.	C	CCAACCCCAGA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:14,2:0|1:67187447_C_T:67187447:10,14,1,1
chr17	67187459	.	A	ATCC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,0:13,1:0|1:67187447_C_T:67187447:10,12,1,1
chr17	67188668	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr17	67189338	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=123,242;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:7,7,0,3
chr17	67193150	.	A	AGGGAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAGG;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	67193185	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=80,74;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:14,3:6,0:12,8,2,1
chr17	67193191	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=79,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.170:25:14,3:7,0:11,10,4,0
chr17	67211058	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	67212574	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	67212595	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr17	67221374	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:3,12:11,0:11,3,12,0
chr17	67256526	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:3,0:12,4:8,7,0,4
chr17	67260926	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=126,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.288:43:12,2:19,10:21,10,6,6
chr17	67261013	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.124:74:36,0:29,8:20,45,0,9
chr17	67264251	.	AGATATATCTTAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,1:1,4:0,2,0,5
chr17	67274054	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr17	67280310	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr17	67282369	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:5,1:10,1:11,7,1,1
chr17	67287404	.	TTTCCTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=125,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:7,0:13,2:13,8,1,1
chr17	67293535	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,3,15
chr17	67305364	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,6:3,1:6,3,6,1
chr17	67512924	.	G	GTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:2,10:4,7:3,3,12,5
chr17	67522919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	68128417	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:4,11:2,6:4,2,12,6
chr17	68130905	.	GAC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:8,2:9,8,3,0
chr17	68131148	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.647:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr17	68171456	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=94,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,6:0.085:78:36,2:35,4:40,32,3,3
chr17	68174060	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr17	68174168	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr17	68175917	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=107,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.214:20:7,3:4,1:16,0,3,1
chr17	70118935	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,32:0.639:50:11,16:6,16:9,9,15,17
chr17	70119699	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.250:38:10,0:19,9:4,25,0,9
chr17	70845688	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	70845779	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=112,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:8,0:11,8,3,0
chr17	70845949	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=61,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.309:8:2,1:3,0:0|1:70845949_CAAA_C:70845949:1,5,0,2
chr17	70845963	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.370:6:3,1:1,1:1|0:70845949_CAAA_C:70845949:1,3,0,2
chr17	71081078	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr17	71084753	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:8,3:11,4,2,1
chr17	71084898	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,1:5,4:6,9,2,3
chr17	71166943	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,3:8,0:12,5,3,0
chr17	71167316	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:4,9,0,2
chr17	71192610	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,1:9,1:15,11,2,0
chr17	71192663	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,16:0,0,11,19
chr17	71192955	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr17	71193594	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	71195949	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,7,7
chr17	71196995	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	71197200	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	71201675	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr17	71201904	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr17	71202777	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:5,1:3,2:8,0,3,0
chr17	71203231	.	CAAAAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=A;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.827:9:1,6:0,2:0,1,8,0
chr17	71223404	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=128,153;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.127:30:10,0:12,2:7,19,0,4
chr17	71223424	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=19,17;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:1,0:0,0:2,6,0,8
chr17	71223436	.	AACC	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:0|1:71223436_AACC_A:71223436:2,12,0,2
chr17	71223440	.	C	CAA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:6,2:0|1:71223436_AACC_A:71223436:2,12,0,2
chr17	71223501	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	71231604	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,16,5
chr17	71232804	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0|1:71232804_C_A:71232804:0,0,12,14
chr17	71232807	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0|1:71232804_C_A:71232804:0,0,11,14
chr17	71238525	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr17	71239000	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr17	71239016	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr17	71239190	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:71239190_A_T:71239190:0,0,1,5
chr17	71239214	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:71239190_A_T:71239190:0,0,1,6
chr17	71239227	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:71239190_A_T:71239190:0,0,0,5
chr17	71239234	.	T	TTTTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:71239190_A_T:71239190:0,0,0,4
chr17	71241321	.	CGTAA	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.551:38:4,5:11,16:9,8,8,13
chr17	71248685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=129,185;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,5:4,0:7,0,5,0
chr17	71248703	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=105,185;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,5:8,0:11,3,5,0
chr17	71257142	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,2:15,1:8,23,3,0
chr17	71257779	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=154,152;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:7,2,2,0
chr17	71257802	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=152,152;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:6,2:10,0:12,4,2,0
chr17	71344668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr17	71346352	.	CAA	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:0|1:71346352_CAA_C:71346352:14,4,2,0
chr17	71346353	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,14,4
chr17	71346358	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:11,0:0|1:71346352_CAA_C:71346352:14,6,2,0
chr17	71346359	.	CGCAGA	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:10,0:0|1:71346352_CAA_C:71346352:15,10,2,0
chr17	71346369	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=29,15;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:10,0:0|1:71346352_CAA_C:71346352:15,10,2,0
chr17	71346750	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr17	71346943	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr17	71348530	.	TCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr17	71357810	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:8,7:7,5:8,7,7,5
chr17	71358035	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=99,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:71358035_C_G:71358035:0,3,0,2
chr17	71358045	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,2:0,0:0|1:71358035_C_G:71358035:0,1,0,3
chr17	71361385	.	G	GAGTTGGAGATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr17	71377104	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.390:26:8,3:8,6:0|1:71377104_T_G:71377104:14,2,0,10
chr17	71377105	.	GCC	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.406:27:8,4:8,6:0|1:71377104_T_G:71377104:14,2,0,11
chr17	71377112	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.457:24:5,1:6,4:0|1:71377104_T_G:71377104:12,1,0,11
chr17	71382005	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.227:32:15,6:9,0:16,9,6,1
chr17	71382166	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	71382747	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	71384151	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=82,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:3,2:2,6,2,5
chr17	71386577	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=93,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:6,9:7,6:6,7,8,7
chr17	71397085	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=114,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.553:14:2,2:4,4:5,1,8,0
chr17	71397375	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=87,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,24:0.759:31:4,9:3,15:2,5,9,15
chr17	71415245	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	71418605	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,2:5,6:1,4,2,6
chr17	71419750	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr17	71420035	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr17	71427665	.	C	CCCCTCTTTGCCTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=79,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:10,0:0|1:71427665_C_CCCCTCTTTGCCTT:71427665:13,8,0,2
chr17	71427669	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=79,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:0|1:71427665_C_CCCCTCTTTGCCTT:71427665:13,8,0,2
chr17	71436925	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:2,13:10,0:7,5,13,0
chr17	71443924	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:1,7,0,5
chr17	71452208	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:1,4,1,2
chr17	71640100	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,0:0,0:0|1:71640100_G_C:71640100:0,0,3,0
chr17	71640103	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,1:0,0:0|1:71640100_G_C:71640100:0,0,3,0
chr17	72209858	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=157.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,51:0.964:52:1,28:0,23:0,1,21,30
chr17	72226945	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr17	72233419	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,5:4,8:4,3,6,7
chr17	72245629	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=260,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr17	72245986	.	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT;STR;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.893:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr17	72246382	.	TCTCG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=68,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.625:19:3,9:4,3:1,6,10,2
chr17	72246412	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=110,71;MMQ=60,54;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:9,7:14,0:11,12,5,2
chr17	72248363	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,7:5,1:6,2,6,3
chr17	72248483	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=71,35;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,3,3
chr17	72248524	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=16,26;MFRL=71,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.692:7:1,3:0,2:1,1,1,4
chr17	72248576	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:72248576_C_CG:72248576:0,0,0,1
chr17	72248579	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72248576_C_CG:72248576:0,0,0,1
chr17	72249229	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,3:1,6:2,1,2,7
chr17	72256196	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr17	72277879	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	72281367	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr17	72285659	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr17	72297104	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=51,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:9,2:0,1:3,7,3,0
chr17	72297180	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.306:18:5,3:5,2:7,6,3,2
chr17	72301432	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,16,9
chr17	72305534	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,6:1,0,2,10
chr17	72306116	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr17	72308276	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,0:15,3:10,15,2,1
chr17	72324644	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:72324644_G_A:72324644:1,1,0,1
chr17	72324649	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:72324644_G_A:72324644:1,1,0,2
chr17	72338164	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,0:0,0,1,3
chr17	72346736	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,6:0,0,5,7
chr17	72350277	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	72356031	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr17	72356426	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr17	72357805	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr17	72367843	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=78,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr17	72436091	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:0|1:72436091_CG_C:72436091:3,8,0,2
chr17	72436093	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:0|1:72436091_CG_C:72436091:3,8,0,2
chr17	72443192	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=11,23;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.918:25:0,9:0,11:0,2,10,13
chr17	72477385	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=99,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,4:7,1:11,4,3,2
chr17	72541838	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:2,4,5,0
chr17	72541980	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,1,2
chr17	72588326	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.778:25:5,9:0,11:2,3,8,12
chr17	72588806	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.678:20:2,4:4,8:3,3,9,5
chr17	72589114	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:2,4,11,0
chr17	72589435	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=78,86;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.785:26:3,9:2,10:2,3,12,9
chr17	72590267	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,31:0.603:51:8,13:12,16:14,6,14,17
chr17	72615157	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=120,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.449:9:1,0:4,4:0|1:72615157_T_TG:72615157:1,4,4,0
chr17	72615164	.	CT	AA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=120,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.326:10:1,0:6,0:0|1:72615157_T_TG:72615157:2,5,3,0
chr17	72615168	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,0:6,0:0|1:72615157_T_TG:72615157:4,5,2,0
chr17	72700899	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,134;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.279:41:18,0:12,11:16,14,0,11
chr17	72700943	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=97,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,3:4,6:4,10,2,7
chr17	72738324	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:5,5:7,4,7,3
chr17	72741275	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:3,6,1,2
chr17	72768970	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=304,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:1,0,13,1
chr17	72769694	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,9,5
chr17	72773387	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,15,1
chr17	72781812	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr17	72784932	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,12,7
chr17	72791088	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,15,2
chr17	72791266	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,3,12
chr17	72791618	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr17	72838481	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	72850995	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,68;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:13,4:11,0:9,15,3,1
chr17	72860883	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,1:1,0,3,0
chr17	72861007	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=94,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:20,0:11,4:15,16,2,2
chr17	72861163	.	T	TAGTGCTAATGACTTAGTAATTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	72862705	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr17	72888836	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	72889649	.	C	CGGTTCCATGGGCTCCGTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=68,97;MMQ=44,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGTTCCATGGGCTCCGTA;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:1,1:0,2,2,1
chr17	72889676	.	G	GGGCTCCGTAGGTTCCATC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=97,83;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.824:20:2,9:1,8:2,1,9,8
chr17	72889745	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,0:2,6:1,4,0,6
chr17	72916822	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=97,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	72921704	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.162:28:7,1:15,3:13,11,2,2
chr17	72927104	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=124,85;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,13:0.274:49:19,0:16,13:0|1:72927104_C_T:72927104:16,20,1,12
chr17	72927107	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=123,85;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,13:0.274:49:19,0:16,12:0|1:72927104_C_T:72927104:16,20,1,12
chr17	72927113	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=123,85;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,12:0.283:44:11,0:10,12:0|1:72927104_C_T:72927104:14,18,0,12
chr17	72927123	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.970:27:0,14:0,13:0,0,14,13
chr17	72929380	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr17	72938202	.	C	CAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=169,313;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.322:5:2,1:2,0:0|1:72938202_C_CAGT:72938202:0,4,0,1
chr17	72938203	.	C	CTATTTCTAAGCTCCAGCAGTGTTAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=170,313;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.312:6:1,1:2,0:0|1:72938202_C_CAGT:72938202:0,5,0,1
chr17	72939663	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr17	72939854	.	AAC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=AC;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	72939906	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	72945334	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:5,3:6,2:6,5,1,4
chr17	72948288	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:0,1:1,0:0|1:72948288_A_C:72948288:3,0,4,0
chr17	72948298	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,1:0,0:0|1:72948288_A_C:72948288:0,0,2,0
chr17	72948369	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,20,12
chr17	72951823	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,8,0
chr17	72951845	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,10,1
chr17	72957962	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:6,2,9,4
chr17	72959000	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr17	72997364	.	T	TAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,2:3,0:5,2,2,0
chr17	72999437	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:10,4,2,0
chr17	73000061	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:5,2,4,1
chr17	73013338	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=184,213;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:73013338_T_A:73013338:0,5,0,2
chr17	73013340	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=184,213;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:73013338_T_A:73013338:0,5,0,2
chr17	73015707	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr17	73043337	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	73058153	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,4:13,0:24,1,4,0
chr17	73089706	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	73090027	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73090027_GG_AC:73090027:0,1,0,1
chr17	73090031	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73090027_GG_AC:73090027:0,1,0,1
chr17	73096827	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,0:11,3:5,11,0,3
chr17	73124692	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr17	73125185	.	T	TGCTCTGTCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73125185_T_TGCTCTGTCG:73125185:0,2,0,1
chr17	73125190	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=198,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:73125185_T_TGCTCTGTCG:73125185:0,3,0,1
chr17	73126746	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,7,18
chr17	73127024	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr17	73132058	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr17	73143574	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr17	73204530	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	73205820	.	AGCCACCATGCCCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=204,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr17	73208176	.	T	TGC	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=102,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GC;STR;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,13:0.219:61:20,6:9,4:14,34,5,8
chr17	73208182	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=76,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.454:29:8,8:6,2:5,10,4,10
chr17	73208205	.	G	T,GTT,GTGTT,GTGTGTT	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,27,31,30,30;MFRL=116,112,77,61,102;MMQ=40,60,53,45,40;MPOS=3,14,14,23;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=11.51,4.79,4.22,10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,5,2,2,9:0.187,0.129,0.167,0.455:19:1,3,1,0,5:0,2,1,2,4:0,1,2,16
chr17	73221439	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,14:0,9:0,0,15,8
chr17	73228101	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	73230856	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=78,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.636:36:8,12:4,11:5,8,10,13
chr17	73231817	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.917:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr17	73235104	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:0|1:73235104_G_A:73235104:10,11,1,1
chr17	73235115	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=108,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:73235104_G_A:73235104:10,10,1,1
chr17	73235478	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:7,4:0,4:4,3,3,5
chr17	73240836	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr17	73242895	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr17	73242935	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	73258086	.	GC	CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.618:10:1,5:3,0:2,2,0,6
chr17	73258479	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr17	73258658	.	TG	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:24,2:15,0:25,15,3,0
chr17	73258966	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.064:75:29,0:41,4:38,33,1,3
chr17	73259453	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.115:42:13,0:24,4:20,17,2,3
chr17	73269818	.	AAGAAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	73274181	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.445:29:8,3:6,7:14,2,9,4
chr17	73274500	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr17	73279549	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,8:0.196:44:18,0:17,6:0|1:73279549_G_T:73279549:11,25,0,8
chr17	73279553	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.201:43:16,0:16,8:0|1:73279549_G_T:73279549:9,26,0,8
chr17	73279700	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr17	73282636	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,5:0,0:2,0,1,4
chr17	73316454	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=103,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.110:51:15,4:30,1:26,20,3,2
chr17	73316679	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:2,3,2,7
chr17	73328773	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=111.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,10:0,24:0,0,18,17
chr17	73482110	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr17	73484753	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	73485033	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr17	73485498	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:0,0:3,0:1,8,0,4
chr17	73485503	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.326:13:1,0:4,0:1,8,0,4
chr17	73485781	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,6,8
chr17	73489220	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr17	73489566	.	CC	TG	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=116,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:0|1:73489566_CC_TG:73489566:10,16,1,1
chr17	73489567	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,26:0.966:26:0,16:0,10:1|0:73489566_CC_TG:73489566:0,0,10,16
chr17	73489578	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,2:13,0:0|1:73489578_A_C:73489578:13,16,1,1
chr17	73489579	.	G	GGCTCACA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,2:13,0:0|1:73489578_A_C:73489578:13,16,1,1
chr17	73490611	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr17	73494963	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr17	73495491	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:73495491_G_A:73495491:0,3,0,1
chr17	73495509	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:73495491_G_A:73495491:0,4,0,1
chr17	73497794	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	73499196	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chr17	73499697	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,6,8
chr17	73499825	.	CCGATG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:73499825_CCGATG_C:73499825:0,4,0,1
chr17	73499834	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73499825_CCGATG_C:73499825:0,3,0,1
chr17	73499848	.	CACAAAGTCTGGCCAT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73499848_CACAAAGTCTGGCCAT_C:73499848:0,1,0,1
chr17	73499866	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73499848_CACAAAGTCTGGCCAT_C:73499848:0,1,0,1
chr17	73501752	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr17	73504416	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,4,13
chr17	73513185	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,7,10
chr17	73515055	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.230:21:10,3:3,2:15,1,4,1
chr17	73539631	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr17	73554523	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	73554756	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,0:2,6:0,7,1,6
chr17	73555304	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,3:5,0:8,3,2,1
chr17	73555399	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:19,5:9,0:20,10,5,0
chr17	73559342	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:4,1,3,1
chr17	73559563	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,3:2,6:3,5,2,7
chr17	73559629	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr17	73559642	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=226,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr17	73559787	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=92,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,4:13,0:16,8,4,0
chr17	73564962	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:3,0,3,5
chr17	73565014	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,2,1
chr17	73565262	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,14,15
chr17	73566536	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:73566536_G_T:73566536:13,9,0,2
chr17	73566539	.	TG	CT	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=20,34;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:6,2:0|1:73566536_G_T:73566536:13,9,0,2
chr17	73566542	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=20,29;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:73566536_G_T:73566536:12,9,0,2
chr17	73566547	.	C	CCTTCGTGTTGGT	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:73566536_G_T:73566536:11,11,0,2
chr17	73566561	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:6,3:3,3:5,5,1,5
chr17	73567208	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:2,0,2,3
chr17	73567940	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,14;MFRL=192,191;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:0,0:0|1:73567940_A_C:73567940:3,0,1,0
chr17	73567946	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,13;MFRL=152,191;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:73567940_A_C:73567940:3,0,1,0
chr17	73567948	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=152,191;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:73567940_A_C:73567940:4,0,1,0
chr17	73569010	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:3,0,1,1
chr17	73569039	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73569039_A_C:73569039:2,0,0,1
chr17	73569040	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73569039_A_C:73569039:2,0,0,1
chr17	73569043	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73569039_A_C:73569039:2,0,0,1
chr17	73569047	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73569039_A_C:73569039:2,0,0,1
chr17	73569776	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=255,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr17	73569810	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	73569927	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	73570756	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr17	73570774	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=124,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr17	73570842	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr17	73571030	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:1,3,3,5
chr17	73623861	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=173,168;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:73623861_A_G:73623861:0,3,0,1
chr17	73623865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=173,168;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:73623861_A_G:73623861:0,3,0,1
chr17	73625629	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,2:0,8:1,0,1,9
chr17	73626208	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	73626817	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,4:0,9:0|1:73626817_G_A:73626817:0,0,3,12
chr17	73626829	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,4:0,8:0|1:73626817_G_A:73626817:0,0,4,11
chr17	73626922	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=168,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:0|1:73626922_G_GT:73626922:4,0,3,1
chr17	73626924	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=168,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:3,1:1,2:0|1:73626922_G_GT:73626922:4,0,3,1
chr17	73626983	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr17	73627440	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,2:3,7:3,0,5,4
chr17	73627818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	73647429	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,2:1,1:0,7,0,3
chr17	73658489	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr17	73662457	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=137,77;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:24,5:11,0:21,14,5,0
chr17	73663392	.	CCGCCCGGAAGTCGGCGTCTTGAGTCATAGGAGTGAGCCA	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.052:76:17,1:15,1:45,28,2,1
chr17	73664528	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:14,3:3,0:17,0,3,0
chr17	73664546	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:21,2:8,1:29,0,3,0
chr17	73702135	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=79,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,1:7,3:6,10,1,3
chr17	73702402	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr17	73720691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr17	73720727	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,6:1,4:2,0,7,3
chr17	73720900	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,2,11
chr17	73723239	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:13,1:7,4:12,8,2,3
chr17	73723453	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=64.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,13,8
chr17	73723599	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:73723599_G_A:73723599:5,8,1,1
chr17	73723601	.	G	GACTGAAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:73723599_G_A:73723599:5,8,1,1
chr17	73723610	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:73723599_G_A:73723599:4,9,1,1
chr17	73725509	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:0|1:73725509_G_T:73725509:8,14,1,1
chr17	73725517	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:73725509_G_T:73725509:5,16,1,1
chr17	73725520	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:8,0:11,2:0|1:73725509_G_T:73725509:5,16,1,1
chr17	73726526	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,1:21,2:16,21,1,2
chr17	73726658	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73726658_C_T:73726658:0,3,0,1
chr17	73726662	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:73726658_C_T:73726658:0,3,0,1
chr17	73726664	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73726658_C_T:73726658:0,2,0,1
chr17	73726669	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73726658_C_T:73726658:0,2,0,1
chr17	73726973	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:9,1,1,1
chr17	73727470	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.597:3:0,2:1,0:0|1:73727470_C_CA:73727470:0,1,1,1
chr17	73727471	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.597:3:0,2:1,0:0|1:73727470_C_CA:73727470:0,1,1,1
chr17	73727473	.	G	GACCTCACAATGTGGATTGTGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.597:3:0,2:0,0:0|1:73727470_C_CA:73727470:0,1,1,1
chr17	73729483	.	TAATTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AATTA;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr17	73732045	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr17	73732522	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr17	73732810	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr17	73733315	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	73738662	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:3,0:2,4,0,2
chr17	73746146	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,5:9,3:8,7,7,1
chr17	73746370	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:6,1:6,4:2,11,2,3
chr17	73752999	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr17	73753651	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,0:9,1:0|1:73753651_A_C:73753651:0,17,2,0
chr17	73753657	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:10,0:0|1:73753651_A_C:73753651:0,17,2,0
chr17	73753660	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,0:0|1:73753651_A_C:73753651:0,16,2,0
chr17	73753661	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,9:0.556:16:4,4:3,5:1|0:73753651_A_C:73753651:1,6,0,9
chr17	73754248	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=152,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:7,1:0,3:1,6,1,3
chr17	73758816	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.148:31:12,2:14,2:0|1:73758816_G_A:73758816:14,13,2,2
chr17	73758822	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:11,2:11,2:0|1:73758816_G_A:73758816:13,13,2,2
chr17	73758823	.	T	TTTTTTTCACTTATTTCAAGTG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=141,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:12,2:11,2:0|1:73758816_G_A:73758816:12,12,2,2
chr17	73759038	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,7:0,0,8,7
chr17	73759304	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr17	73759552	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr17	73781075	.	GCC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=C;STR;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.738:9:0,0:1,4:0,2,0,7
chr17	73812909	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr17	73827407	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=99,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:7,9,0,2
chr17	73831470	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,15;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:73831470_T_A:73831470:2,0,1,0
chr17	73831480	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,13;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:73831470_T_A:73831470:4,0,1,0
chr17	73831482	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:73831470_T_A:73831470:4,0,1,0
chr17	73831488	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:73831470_T_A:73831470:4,0,1,0
chr17	73840351	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:10,0:9,8,2,1
chr17	73844748	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,4:4,1:2,6,3,2
chr17	73847613	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:3,7:12,4:8,7,8,3
chr17	73847799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:1,5,2,8
chr17	73871911	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,6:4,4:4,0,10,0
chr17	73872607	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:0,1,5,0
chr17	73872948	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,1:3,2:0,7,1,2
chr17	73872969	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr17	73874684	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	73886888	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,3:1,2:2,1,3,2
chr17	73887807	.	TGCACACACACACGTGCTCACA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=103,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:5,6:2,9:10,6,13,3
chr17	73888672	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	73897033	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:5,3:6,2:0|1:73897033_A_AC:73897033:6,9,2,5
chr17	73897046	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,12:0.419:29:7,5:9,6:0|1:73897033_A_AC:73897033:7,10,6,6
chr17	73897278	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:6,7:13,0:7,12,7,0
chr17	73898073	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:73898073_G_A:73898073:13,1,2,0
chr17	73898077	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:73898073_G_A:73898073:13,2,2,0
chr17	73906934	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,3:3,7:1,3,4,6
chr17	73913729	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	73913965	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr17	73924199	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:16,0:18,2:0|1:73924199_C_T:73924199:19,15,1,1
chr17	73924204	.	GCA	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,0:17,2:0|1:73924199_C_T:73924199:24,12,1,1
chr17	73924208	.	C	CCTG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:17,2:0|1:73924199_C_T:73924199:23,12,1,1
chr17	73926044	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=88,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:6,1:3,9,1,1
chr17	73929242	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73929242_G_C:73929242:0,2,0,1
chr17	73929246	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73929242_G_C:73929242:0,2,0,1
chr17	73929248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:73929242_G_C:73929242:0,2,0,1
chr17	73934130	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=122,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.627:9:2,3:1,1:2,1,4,2
chr17	73942957	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.170:19:7,2:6,0:0|1:73942957_G_GT:73942957:0,16,1,2
chr17	73942972	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:6,0:0|1:73942957_G_GT:73942957:0,18,0,2
chr17	73942976	.	G	A,GCA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,23,28;MFRL=160,178,103;MMQ=60,60,60;MPOS=17,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.82,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,2:0.339,0.150:15:3,5,2:5,0,0:0,8,0,7
chr17	73942979	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:73942957_G_GT:73942957:0,13,0,2
chr17	73944596	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr17	73947110	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:73947110_A_AT:73947110:3,11,0,2
chr17	73947112	.	A	AAGAGACAATGTAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:73947110_A_AT:73947110:3,11,0,2
chr17	73947125	.	C	CCCCCCGCCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr17	73951864	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:7,2,3,1
chr17	73974710	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:15,2:15,1:13,18,2,1
chr17	73997474	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,3:0,16:0,0,16,3
chr17	73997639	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:2,5:6,7:4,4,5,8
chr17	74005865	.	TCTTCACCTC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:12,10,1,1
chr17	74006073	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,0:11,4:3,13,0,4
chr17	74006456	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:13,8:20,0:14,19,8,0
chr17	74007574	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr17	74007846	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:12,5:5,5:8,10,4,6
chr17	74011452	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	74011721	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=89,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,6:1,2:3,6,4,4
chr17	74014468	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=307,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr17	74014668	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=94,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.927:39:2,19:0,18:2,0,23,14
chr17	74015158	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=119,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,6:4,1:2,4,1,6
chr17	74015590	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0|1:74015590_C_T:74015590:0,0,17,1
chr17	74015595	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.906:19:1,9:0,9:0|1:74015590_C_T:74015590:1,0,17,1
chr17	74015781	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=146,832;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr17	74017554	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:7,3:18,2:0|1:74017554_G_T:74017554:12,14,3,2
chr17	74017573	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=116,130;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.139:41:16,1:20,2:0|1:74017554_G_T:74017554:18,18,2,3
chr17	74017677	.	G	GCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=C;STR;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.934:11:0,2:0,9:0|1:74017677_G_GCC:74017677:0,0,0,11
chr17	74017700	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=200,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.834:10:1,1:0,6:0|1:74017677_G_GCC:74017677:0,1,0,9
chr17	74018655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr17	74019572	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr17	74023107	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr17	74036468	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.592:42:13,17:4,8:9,8,13,12
chr17	74037088	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr17	74075696	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:5,9,0,2
chr17	74075984	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:6,5,5,0
chr17	74076127	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr17	74076493	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:74076493_C_T:74076493:4,4,1,1
chr17	74076499	.	A	ACTTCGGGAGGCCGAGGCGGGCAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:74076493_C_T:74076493:5,3,1,1
chr17	74077497	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,7,10
chr17	74079838	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,8,10
chr17	74081345	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	74083905	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	74084737	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,4,1
chr17	74086633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	74087376	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,139;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:3,13,0,3
chr17	74090385	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr17	74090700	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=200,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,5:0,4:1,1,2,7
chr17	74094041	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=110,65;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:18,0:27,3:0|1:74094041_G_A:74094041:24,21,0,3
chr17	74094054	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=130,65;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.094:40:13,0:24,2:0|1:74094041_G_A:74094041:20,17,0,3
chr17	74094105	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,4:5,7:1,6,2,9
chr17	74151628	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=86,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:8,7,1,1
chr17	74162631	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=105,120;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:5,0:11,5:6,13,0,5
chr17	74208424	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,15:0,0,19,7
chr17	74261929	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,17:0,5:0,0,21,2
chr17	74283253	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,2:9,4:3,13,4,2
chr17	74286032	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,17;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:4,1:4,1:6,8,2,3
chr17	74286173	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,3:9,1:4,10,2,2
chr17	74287204	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=84,94;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,3:5,3:3,5,4,2
chr17	74287389	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=79,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:6,3,7,3
chr17	74289839	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.573:34:4,4:10,11:7,7,10,10
chr17	74300622	.	A	ACACACAC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:0|1:74300622_A_ACACACAC:74300622:5,9,1,1
chr17	74300624	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:0|1:74300622_A_ACACACAC:74300622:5,10,1,1
chr17	74300634	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:4,1:0|1:74300622_A_ACACACAC:74300622:3,9,1,1
chr17	74300916	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=148,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,1,1
chr17	74324729	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,6:0,19:0,0,23,3
chr17	74326553	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:74326553_G_A:74326553:0,0,9,0
chr17	74326556	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0|1:74326553_G_A:74326553:0,0,9,0
chr17	74392926	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=97,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr17	74401405	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr17	74401639	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:0|1:74401639_G_A:74401639:6,8,0,3
chr17	74401648	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,1:6,0:0|1:74401639_G_A:74401639:5,9,0,3
chr17	74465243	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=88,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:10,8,6,4
chr17	74471298	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=239,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:1,2,0,6
chr17	74476045	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=73,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.363:34:10,4:11,8:11,11,4,8
chr17	74476089	.	ATGTGTGTGTGTG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=213,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=TG;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.449:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	74477620	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,5:0,1:0,0,1,8
chr17	74524651	.	TT	GG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,3:0,0,15,1
chr17	74538554	.	GGGAGGA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GGA;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:5,0:12,2:13,7,1,1
chr17	74539092	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,19,7
chr17	74540054	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=115,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	74563653	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=103.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,9,22
chr17	74570408	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,18,4
chr17	74581914	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr17	74581945	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	74621635	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr17	74639530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr17	74639577	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,3:5,0:9,2,3,0
chr17	74684124	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	74719813	.	GC	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=180,155;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:0|1:74719813_GC_AT:74719813:11,0,2,0
chr17	74719818	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=181,155;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:2,0:0|1:74719813_GC_AT:74719813:12,0,2,0
chr17	74720239	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr17	74733099	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,21:0,23:0,0,27,20
chr17	74734598	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,1,17
chr17	74736999	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=82,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.540:11:2,4:2,2:0|1:74736999_CTT_C:74736999:3,2,5,1
chr17	74737017	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,9:0.317:30:9,9:7,0:1|0:74736999_CTT_C:74736999:15,6,9,0
chr17	74750215	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=61.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,9,10
chr17	74771092	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=75,92;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:16,2:23,3:19,21,5,0
chr17	74771122	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=104,92;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:11,2:10,3:8,13,5,0
chr17	74774505	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=115,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:1,11,0,2
chr17	74865130	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=111,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:12,15,1,1
chr17	74878420	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr17	74898704	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=104,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:7,8,0,2
chr17	74899320	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr17	74920957	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr17	74921257	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=222,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr17	74922636	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	74922652	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	74936576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,7:4,2:2,3,3,6
chr17	74944709	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,10,13
chr17	75187043	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.423:19:5,2:6,5:5,6,2,6
chr17	75187413	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=100,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:10,1:14,5:10,14,4,2
chr17	75192263	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=92,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:16,3:12,0:19,10,3,0
chr17	75202381	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.121:35:14,0:17,3:19,12,2,2
chr17	75202977	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:4,5:9,11:6,7,7,9
chr17	75207964	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=225,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	75207966	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	75209945	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,1:7,2:10,2,3,0
chr17	75210054	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:9,2:17,6:14,12,5,3
chr17	75316497	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.579:38:10,11:5,11:7,9,8,14
chr17	75442513	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=243,175;MMQ=46,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0|1:75442513_G_A:75442513:0,5,0,2
chr17	75442519	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=247,231;MMQ=43,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:75442513_G_A:75442513:0,4,0,1
chr17	75442553	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=378,252;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75442553_T_A:75442553:1,0,0,1
chr17	75442555	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=378,252;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75442553_T_A:75442553:1,0,0,1
chr17	75442558	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,21;MFRL=378,252;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75442553_T_A:75442553:1,0,0,1
chr17	75442667	.	AGG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,134;MMQ=40,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:4,1:12,0,2,0
chr17	75442685	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=157,134;MMQ=40,38;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:4,1:6,1:12,1,2,0
chr17	75478481	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=218,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr17	75484316	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=101,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:6,3:19,0:13,12,1,2
chr17	75484781	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:3,1,4,1
chr17	75484920	.	CT	TG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,2:15,0:10,19,1,1
chr17	75485014	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr17	75489015	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=292,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr17	75489244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,0,4
chr17	75494787	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.919:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr17	76047438	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.119:39:16,1:19,2:14,21,2,2
chr17	76073179	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,5:2,6:3,0,10,1
chr17	76075591	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=88,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:9,0:21,5:13,19,0,5
chr17	76087423	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr17	76089249	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr17	76089634	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=292,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	76093756	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.663:16:3,10:2,0:5,0,11,0
chr17	76093866	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,7:1,5:4,2,4,8
chr17	76098501	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,6:2,9:3,3,12,3
chr17	76100836	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	76100974	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	76109358	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,2:6,7:1,7,2,7
chr17	76113826	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:3,2:6,3,3,0
chr17	76113829	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,0:5,0:4,5,3,0
chr17	76113832	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:5,0:4,5,2,0
chr17	76114941	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:4,1,3,0
chr17	76114963	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:6,1,4,0
chr17	76114975	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,1:3,2:6,1,3,0
chr17	76115181	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:4,1:4,3:1,7,0,5
chr17	76115353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:6,3,1,2
chr17	76121318	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:4,7,5,5
chr17	76128394	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:0,0:2,2:4,2,2,0
chr17	76128662	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=311,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr17	76130947	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=101,38;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,4:4,4:5,3,6,2
chr17	76133746	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:1,8:3,4:2,2,12,1
chr17	76134828	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	76135402	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0|1:76135402_G_A:76135402:0,6,1,3
chr17	76135412	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.899:8:0,4:0,1:0|1:76135402_G_A:76135402:0,0,0,8
chr17	76137198	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	76142402	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr17	76156983	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,5:1,2:3,0,7,1
chr17	76160382	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:12,0:27,4:24,15,2,2
chr17	76162134	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:1,7:3,12:1,3,4,17
chr17	76178748	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:3,7,3,2
chr17	76181183	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:17,0:13,4:0|1:76181183_C_T:76181183:18,13,0,4
chr17	76181191	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:15,0:16,4:0|1:76181183_C_T:76181183:17,15,0,4
chr17	76182766	.	AAGGGG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=156,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGGGG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0|1:76182766_AAGGGG_A:76182766:6,0,2,0
chr17	76182788	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=166,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.182:18:8,0:6,1:0|1:76182766_AAGGGG_A:76182766:15,0,3,0
chr17	76187160	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:13,7:11,9:14,10,7,9
chr17	76198711	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=137,172;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.581:34:9,19:5,0:13,1,20,0
chr17	76198754	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:4,8,5,4
chr17	76203149	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,2:2,0:0|1:76203149_C_T:76203149:0,2,1,1
chr17	76203151	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,1:2,0:0|1:76203149_C_T:76203149:0,2,1,1
chr17	76203153	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:76203149_C_T:76203149:0,2,0,1
chr17	76203159	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:76203149_C_T:76203149:0,2,0,1
chr17	76210313	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=251,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	76210367	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr17	76212051	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:9,2:14,1:11,12,1,2
chr17	76212057	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=148,92;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:76212057_A_G:76212057:10,12,1,1
chr17	76212066	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=156,92;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:76212057_A_G:76212057:6,12,1,1
chr17	76392525	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr17	76394449	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:3,7,4,3
chr17	76394526	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr17	76395421	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.356:26:14,2:3,7:0|1:76395421_G_A:76395421:11,6,4,5
chr17	76395430	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:14,1:5,5:0|1:76395421_G_A:76395421:11,9,2,4
chr17	76395460	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=122,259;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:13,6,0,2
chr17	76396963	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=61,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:9,5:0,2:2,7,3,4
chr17	76400236	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=217,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:76400236_G_A:76400236:0,2,0,2
chr17	76400258	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=220,291;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:76400236_G_A:76400236:0,1,0,3
chr17	76400268	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=220,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:76400236_G_A:76400236:0,1,0,3
chr17	76410871	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr17	76411075	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:16,1:13,3:12,17,2,2
chr17	76411154	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,4:0,0,2,9
chr17	76422473	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr17	76430015	.	AGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr17	76433685	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr17	76446689	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	76446802	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:10,4,1,1
chr17	76451652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=136,216;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,6,0
chr17	76451698	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=117,115;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,4:2,5:2,3,8,1
chr17	76451921	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,5:0,13:0,0,9,9
chr17	76456108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:1,2,0,4
chr17	76456215	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:7,4:4,0:8,3,4,1
chr17	76456352	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr17	76457559	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	76457758	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:17,3:17,0:19,15,3,0
chr17	76457790	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.117:36:16,0:16,3:15,17,1,3
chr17	76459246	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=229,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:0,6,0,4
chr17	76476848	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=121,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:16,0:15,4:14,17,3,1
chr17	76481608	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr17	76481693	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=111,94;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.475:40:10,11:10,7:16,5,8,11
chr17	76482256	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,6:6,2:2,7,4,4
chr17	76490083	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,4:0,1:0,0,6,1
chr17	76490930	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=168,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:8,0:15,5:8,15,1,4
chr17	76490978	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,7:2,5:4,2,6,6
chr17	76495050	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr17	76496294	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,6:0,2:3,0,7,1
chr17	76496330	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,6:0,2:2,0,7,2
chr17	76496350	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:8,5,1,1
chr17	76496361	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,3:13,3:14,8,4,2
chr17	76496577	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=105.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:1,22:0,13:0,1,23,15
chr17	76496630	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=134,174;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,0:2,2:0,13,0,2
chr17	76497778	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr17	76498692	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr17	76525565	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,293;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,2:12,1:13,11,3,0
chr17	76525805	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,295;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr17	76528831	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,3:2,2:1,7,0,5
chr17	76535759	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,4:8,4:14,0,7,1
chr17	76548823	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:10,0:29,4:15,24,0,4
chr17	76554114	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:12,1,2,0
chr17	76554147	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:6,4:12,2:11,7,5,1
chr17	76556811	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,6:5,7:7,3,7,6
chr17	76558159	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	76563046	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:7,7,0,2
chr17	76566282	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=109,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:17,5:4,0:21,1,6,0
chr17	76566356	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,0:14,4:13,13,0,4
chr17	76568716	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	76569056	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=240,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr17	76672322	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr17	76723827	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=107,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:10,0:18,9:9,19,1,8
chr17	76794981	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=58,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.632:28:8,4:2,12:5,5,10,8
chr17	76795840	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=90,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,10:0.167:64:27,0:27,10:26,28,0,10
chr17	76798548	.	TTTTTTC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=74,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTC;STR;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.635:14:2,4:3,5:1,4,3,6
chr17	76799550	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.185:50:19,1:21,7:19,22,4,5
chr17	76799969	.	CTGGGGGCTTGGGGGTACTGGACAGCAATGTGGGG	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=84,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.208:23:12,0:6,4:12,7,2,2
chr17	76800017	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=50,45;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,0:2,5,1,1
chr17	76816015	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.169:21:8,3:10,0:14,4,1,2
chr17	76816199	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	76823425	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,10:3,8:2,6,5,13
chr17	76832133	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,9:5,4:8,1,12,1
chr17	76851951	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:0|1:76851951_G_A:76851951:6,7,0,2
chr17	76851955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:76851951_G_A:76851951:6,5,0,2
chr17	76867185	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,2:1,2:0,8,2,2
chr17	76888453	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:18,2:0|1:76888453_A_T:76888453:16,18,1,1
chr17	76888458	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:16,0:15,2:0|1:76888453_A_T:76888453:16,19,1,1
chr17	76897974	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,2:3,7:1,4,2,7
chr17	76972309	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=189,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:76972309_A_G:76972309:0,3,0,1
chr17	76972332	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=249,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76972309_A_G:76972309:0,1,0,1
chr17	76972333	.	G	GGAGATACCTCAGCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=249,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:76972309_A_G:76972309:0,1,0,1
chr17	76993517	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:9,2:5,2:0|1:76993517_C_G:76993517:12,3,0,6
chr17	76993520	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=106,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:8,2:4,2:0|1:76993517_C_G:76993517:13,3,0,6
chr17	76993546	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.331:37:15,4:9,8:15,10,6,6
chr17	77043574	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:7,1:9,4:8,8,1,4
chr17	77075629	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:13,4:27,1:12,28,5,0
chr17	77079755	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,3:1,5:1,3,3,5
chr17	77081222	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=208,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,3:5,8:8,0,8,3
chr17	77086851	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.312:24:14,6:3,1:14,3,7,0
chr17	77087005	.	C	CA	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,18:0.258:70:32,8:20,8:9,43,6,12
chr17	77090472	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=56,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	77090473	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	77092710	.	TC	AA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,28;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,1:0|1:77092710_TC_AA:77092710:2,1,1,0
chr17	77092714	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,0:0|1:77092710_TC_AA:77092710:2,1,1,0
chr17	77093768	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=75,53;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr17	77093900	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,0:3,3:3,4,1,2
chr17	77102782	.	G	GCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:77102782_G_GCC:77102782:4,8,1,1
chr17	77102783	.	A	AGTTTGGTCTCAAACTCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:77102782_G_GCC:77102782:4,8,1,1
chr17	77111676	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:10,3:6,0:8,8,2,1
chr17	77709282	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,2:6,1:11,7,3,0
chr17	77710873	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=132,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:11,1:10,3:9,12,2,2
chr17	77751983	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	77758484	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:3,2,2,1
chr17	77808690	.	T	G	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=101,77;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,6:0.087:78:48,0:24,6:40,32,0,6
chr17	77811733	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.536:18:4,4:2,4:0,8,2,8
chr17	77914561	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr17	77923478	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,4:2,9:4,0,12,1
chr17	77925234	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr17	78013724	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,33:0,12:0,0,22,24
chr17	78021037	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,4:2,2:2,0,4,2
chr17	78021214	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,5,3
chr17	78021260	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr17	78022439	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:12,4:23,0:27,9,4,0
chr17	78023614	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	78032659	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:13,0:10,6:8,15,0,6
chr17	78055757	.	CT	TG	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,21:0.564:37:5,11:11,10:0|1:78055757_CT_TG:78055757:8,8,8,13
chr17	78055758	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,36:0.974:37:0,15:0,21:1|0:78055757_CT_TG:78055757:1,0,15,21
chr17	78055845	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,0:5,10:5,7,0,10
chr17	78061317	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,1:2,2:4,0,3,0
chr17	78061353	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:6,1,5,1
chr17	78061979	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:1,4,1,6
chr17	78063467	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	78070996	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	78071247	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:4,3:0,3:1,3,0,6
chr17	78073355	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,4,1
chr17	78073562	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.569:19:3,4:5,6:3,5,5,6
chr17	78073589	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,4:4,6:2,6,3,7
chr17	78079481	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	78079509	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr17	78079544	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,14,5
chr17	78081526	.	A	AGCAGCGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,6:0,8:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:0,0,15,7
chr17	78081551	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=109,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.911:20:1,5:0,13:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:1,0,10,9
chr17	78081707	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,9,15
chr17	78082005	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr17	78083726	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,16:0,4:0,0,17,3
chr17	78084507	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr17	78084688	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,15:0,0,20,10
chr17	78086846	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	78090917	.	G	GCATGGTGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	78090928	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	78091405	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr17	78109759	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.129:36:11,4:21,0:14,18,2,2
chr17	78111222	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.151:35:16,0:13,4:13,17,0,5
chr17	78111877	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:6,1:8,2,4,0
chr17	78158063	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,1,8
chr17	78164547	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=116,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,1:6,1:11,5,1,1
chr17	78169137	.	AGCACTGGGGTCCTTCCTGGCACTGGGGTG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.234:16:6,2:4,1:5,8,1,2
chr17	78175551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:5,5,2,2
chr17	78179080	.	CCCCTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr17	78179478	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:1,1:0|1:78179478_G_A:78179478:2,3,0,3
chr17	78179481	.	GC	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,1:1,1:0|1:78179478_G_A:78179478:2,4,0,3
chr17	78181904	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,8;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.485:6:1,1:2,0:0|1:78181904_T_G:78181904:2,1,3,0
chr17	78181906	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,16;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.485:6:1,0:0,0:0|1:78181904_T_G:78181904:2,1,3,0
chr17	78181950	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=74,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,1:6,2:10,7,2,1
chr17	78187720	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:78187720_A_G:78187720:0,0,1,8
chr17	78187721	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0|1:78187720_A_G:78187720:0,0,1,8
chr17	78187954	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr17	78190802	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=14,13;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:0,0:0,0:0|1:78190802_A_C:78190802:3,0,2,0
chr17	78190808	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=19,14;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:0,0:0|1:78190808_T_A:78190808:1,0,3,0
chr17	78190811	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,14;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:78190808_T_A:78190808:2,0,2,0
chr17	78190815	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=18,21;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0|1:78190808_T_A:78190808:2,0,2,0
chr17	78190820	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,14;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:0,0:0|1:78190802_A_C:78190802:3,0,1,0
chr17	78190822	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,14;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:78190802_A_C:78190802:2,0,1,0
chr17	78190824	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=22,12;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:78190802_A_C:78190802:2,0,1,0
chr17	78190827	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,14;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:78190802_A_C:78190802:1,0,1,0
chr17	78190829	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=16,12;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:78190802_A_C:78190802:1,0,1,0
chr17	78196487	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=161,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:16,0:12,3:16,13,2,1
chr17	78196496	.	T	TCTAGAGATTA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,0:17,1:21,17,1,1
chr17	78196610	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:21,1:13,2:11,23,0,3
chr17	78201554	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	78210944	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	78211385	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:12,4:3,6:8,7,5,5
chr17	78219021	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=84,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.106:44:21,2:18,2:20,20,2,2
chr17	78219065	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,16,11
chr17	78219100	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=219,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,5:1,7:0,1,6,6
chr17	78219908	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr17	78222287	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:78222287_T_TAA:78222287:3,0,1,0
chr17	78222289	.	G	GTCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:78222287_T_TAA:78222287:3,0,1,0
chr17	78222291	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,23;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:78222287_T_TAA:78222287:3,0,1,0
chr17	78222293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:78222287_T_TAA:78222287:3,0,1,0
chr17	78222297	.	CTTCCCGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:78222287_T_TAA:78222287:3,0,1,0
chr17	78222565	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	78223103	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr17	78225055	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr17	78246996	.	C	CACTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=99,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:9,4:1,1:6,4,5,0
chr17	78262072	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:13,4:9,0:11,11,2,2
chr17	78263391	.	GA	G,GAA	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,29,26;MFRL=132,118,116;MMQ=60,60,60;MPOS=10,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.75,17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,13,18:0.217,0.389:47:10,7,5:3,3,4:12,4,15,16
chr17	78264289	.	TGTGTGTGCGC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:5,0:14,2:21,1,1,1
chr17	78265641	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,2:4,0:0|1:78265641_C_G:78265641:0,6,1,1
chr17	78265644	.	G	GGGGAGAGGGAAATGA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,1:4,0:0|1:78265641_C_G:78265641:0,6,1,1
chr17	78265645	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:1,1:4,0:0|1:78265641_C_G:78265641:0,6,1,1
chr17	78265667	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr17	78269255	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	78280030	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,8:5,1:5,5,4,5
chr17	78281057	.	T	TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=99,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:6,10,0,2
chr17	78281088	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr17	78286986	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:3,5,0,6
chr17	78290883	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:6,1:5,3:11,0,5,0
chr17	78290992	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=77,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,14:0.190:77:31,14:32,0:23,40,14,0
chr17	78314195	.	G	GATACCAGCCTCAGTCATCCCAGAAGACGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr17	78319380	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,89;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,5:8,8:8,7,10,3
chr17	78323757	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,4:3,11:0,6,5,10
chr17	78327229	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,7,0
chr17	78327358	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=82,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:6,10:7,14:3,10,13,12
chr17	78327388	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=89,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.156:49:18,7:24,0:18,24,7,0
chr17	78327420	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=136,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:17,0:22,4:17,22,3,1
chr17	78327745	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=70,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,1:2,2:2,1,3,0
chr17	78337004	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=99,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,0:8,2:7,9,2,0
chr17	78338159	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:12,2,3,0
chr17	78350322	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:9,1:0|1:78350322_C_T:78350322:9,5,1,1
chr17	78350327	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,0:10,2:0|1:78350322_C_T:78350322:9,5,1,1
chr17	78350375	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:5,0:3,2:0|1:78350375_A_T:78350375:5,4,1,1
chr17	78350377	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,0:4,1:0|1:78350375_A_T:78350375:5,4,1,1
chr17	78351506	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:7,11:3,11:5,5,16,6
chr17	78354661	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:4,5:0,4:3,1,4,5
chr17	78355494	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:2,1,1,6
chr17	78357633	.	TGCAG	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:15,2:0|1:78357633_TGCAG_T:78357633:7,15,0,2
chr17	78357641	.	AAG	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:16,2:0|1:78357633_TGCAG_T:78357633:9,16,0,2
chr17	78357648	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:15,2:0|1:78357633_TGCAG_T:78357633:9,15,0,2
chr17	78357650	.	AG	TA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:14,2:0|1:78357633_TGCAG_T:78357633:9,15,0,2
chr17	78359309	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:5,9:3,5:5,3,12,3
chr17	78360446	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:78360446_G_A:78360446:11,6,1,1
chr17	78360450	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:8,0:0|1:78360446_G_A:78360446:11,8,1,1
chr17	78362600	.	A	ACCGCCCCCCCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	78363193	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:4,8,0,3
chr17	78396152	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=156,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0,2,1,1
chr17	78399004	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	78446932	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	78599612	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:16,3:11,0:13,14,1,2
chr17	78599655	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:1,3,1,7
chr17	78617439	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=222,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr17	78681590	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr17	78704575	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78704575_T_A:78704575:0,0,0,1
chr17	78704577	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78704575_T_A:78704575:0,0,0,1
chr17	78704578	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78704575_T_A:78704575:0,0,0,1
chr17	78704584	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78704575_T_A:78704575:0,0,0,1
chr17	78727734	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=66,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:4,0,3,0
chr17	78765219	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,15,20
chr17	78811748	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,0:4,2:6,3,1,1
chr17	78820212	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr17	78829375	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,1:2,5:1,5,2,4
chr17	78854316	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.530:28:2,5:11,9:3,10,4,11
chr17	78854377	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr17	78865491	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:9,4:4,7:5,8,11,1
chr17	78867733	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr17	78882806	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	78882825	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	78896488	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,7,2
chr17	78897561	.	C	T,CTCTGCCTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27,20;MFRL=143,166,55;MMQ=60,60,60;MPOS=12,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.13,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.555,0.222:6:0,1,1:1,3,0:0,1,0,5
chr17	78897564	.	CA	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=166,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr17	78914245	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr17	78919387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=208,123;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,5:1,6:1,0,8,3
chr17	78923178	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr17	78969386	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr17	78969590	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr17	78970779	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,17,10
chr17	78970909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	78971148	.	GC	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:7,7:8,2:0|1:78971148_GC_G:78971148:3,12,5,7
chr17	78971156	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:7,9:8,2:0|1:78971148_GC_G:78971148:3,12,5,7
chr17	78971176	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,7:2,3:5,6,2,8
chr17	78971182	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,3:0,0,4,13
chr17	78971192	.	A	AGGACT	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:7,1:2,1:0|1:78971192_A_AGGACT:78971192:0,9,0,2
chr17	78971197	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:0|1:78971192_A_AGGACT:78971192:0,9,0,2
chr17	78971201	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:2,0:0|1:78971192_A_AGGACT:78971192:0,9,0,2
chr17	78972326	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	78972864	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr17	79009153	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr17	79077957	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr17	79077980	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.843:8:0,5:0,1:0,1,1,6
chr17	79078610	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr17	79078615	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=201,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	79082272	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:5,2:3,3,2,0
chr17	79082662	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr17	79089590	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:4,6:7,0:9,5,4,2
chr17	79093142	.	C	CCGCGTGCCCTACCTCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=98,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:4,1:1,6:0|1:79093142_C_CCGCGTGCCCTACCTCT:79093142:4,1,6,2
chr17	79093145	.	C	CGTGCCCTACCTCTCGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.196:13:3,2:8,0:1|0:79093142_C_CCGCGTGCCCTACCTCT:79093142:9,2,1,1
chr17	79093427	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:1,4,0,5
chr17	79098489	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:3,10:1,7:2,2,15,2
chr17	79102246	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:6,1:8,9,1,1
chr17	79105720	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=101,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:12,9:5,0:9,8,8,1
chr17	79108141	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,3:8,3:7,4,5,1
chr17	79166103	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=87,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,3:0,1:0,1,4,0
chr17	79168682	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,78;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,0:17,5:11,16,1,4
chr17	79170576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:1,7:3,2:4,1,6,3
chr17	79173398	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=251,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,2:1,2:1,1,1,4
chr17	79173462	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,0,4
chr17	79176146	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:10,3:11,13,0,3
chr17	79182667	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	79182885	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0|1:79182885_TC_T:79182885:0,2,1,1
chr17	79182887	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0|1:79182885_TC_T:79182885:0,2,1,1
chr17	79182892	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79182885_TC_T:79182885:0,2,0,1
chr17	79182894	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,21;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79182885_TC_T:79182885:0,2,0,1
chr17	79182896	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79182885_TC_T:79182885:0,2,0,1
chr17	79203003	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:2,3,2,0
chr17	79203332	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:1,7,0,4
chr17	79210707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=209,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:2,5,1,1
chr17	79214797	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.197:28:8,3:15,2:15,8,3,2
chr17	79219500	.	AATG	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.265:47:9,4:24,8:17,18,5,7
chr17	79219530	.	ACCCT	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.056:51:15,0:29,2:0|1:79219530_ACCCT_A:79219530:20,29,1,1
chr17	79219535	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:16,0:31,2:0|1:79219530_ACCCT_A:79219530:20,28,1,1
chr17	79225330	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:1,2,2,2
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chr17	79246270	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:4,4:3,4:6,1,6,2
chr17	79249997	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr17	79255912	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:5,0,7,0
chr17	79258784	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,2:3,7:0|1:79258784_T_C:79258784:2,2,2,7
chr17	79258787	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,2:3,7:0|1:79258784_T_C:79258784:2,2,2,7
chr17	79263415	.	GTAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TAAA;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr17	79268562	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,6:2,3:5,0,8,1
chr17	79287753	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:16,2:23,0:0|1:79287753_G_A:79287753:9,30,1,1
chr17	79287759	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,2:21,0:0|1:79287753_G_A:79287753:9,27,1,1
chr17	79409309	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	79409434	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,24;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr17	79411662	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=328,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr17	79411731	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=263,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:79411731_C_CG:79411731:2,0,1,0
chr17	79411736	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=263,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:79411731_C_CG:79411731:2,0,1,0
chr17	79414897	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=255,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:2,0,3,6
chr17	79414914	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr17	79418599	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	79418770	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,2:1,0:3,5,0,2
chr17	79422252	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr17	79422289	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,3:2,5:4,0,6,2
chr17	79424709	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=70,176;MMQ=43,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr17	79425141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr17	79426021	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:0,1:1,2,3,2
chr17	79426416	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,5:5,1:1,7,1,5
chr17	79426481	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	79477898	.	GC	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.391:39:9,9:13,6:16,8,9,6
chr17	79478870	.	CC	AT	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:11,2:20,3:21,12,4,1
chr17	79478916	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,17:0.280:62:19,7:26,9:21,24,13,4
chr17	79479469	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr17	79495519	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	79496289	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.428:21:6,4:6,4:4,8,5,4
chr17	79508263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	79513881	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.440:20:4,2:6,7:4,7,4,5
chr17	79514018	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,4:18,0:11,16,0,4
chr17	79514091	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,1:4,1:5,4,0,3
chr17	79514124	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:79514124_G_A:79514124:3,6,0,2
chr17	79514126	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:79514124_G_A:79514124:3,6,0,2
chr17	79532654	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,9:7,3:2,9,2,10
chr17	79539198	.	T	TTTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTAA;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	79573884	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=107,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,1:1,2:0,8,0,3
chr17	79589359	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr17	79589371	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	79596811	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,25:0,19:0,0,23,21
chr17	79603831	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	79609410	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,4:3,2:7,3,5,1
chr17	79609550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:2,4,0,2
chr17	79614932	.	TTAAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	79618059	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=93,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.290:24:8,4:8,1:10,7,4,3
chr17	79632537	.	GG	CA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:17,0:22,3:0|1:79632537_GG_CA:79632537:22,19,0,3
chr17	79632549	.	T	TGTGCTACCTCCTCAGGAG	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=25,38;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:17,0:19,3:0|1:79632537_GG_CA:79632537:21,18,0,3
chr17	79634774	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:12,7:3,7:8,9,7,7
chr17	79634813	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:13,2:3,4:5,11,2,4
chr17	79637565	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr17	79639198	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,7:5,1:1,8,4,5
chr17	79650181	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=115,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.596:30:7,11:5,7:5,7,2,16
chr17	79650675	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.586:32:5,8:8,9:9,4,6,13
chr17	79652531	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,5:1,0:4,0,5,0
chr17	79652647	.	GC	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:12,2:0|1:79652647_GC_G:79652647:17,15,1,1
chr17	79652649	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:13,2:0|1:79652647_GC_G:79652647:17,15,1,1
chr17	79657136	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:6,3:4,4:10,0,6,2
chr17	79663658	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,121;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:9,8,2,0
chr17	79667416	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=128,176;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:4,1:7,1:0|1:79667416_G_A:79667416:13,2,2,0
chr17	79667417	.	T	TTAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=128,176;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:4,0:7,0:0|1:79667416_G_A:79667416:13,2,2,0
chr17	79668226	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.710:17:2,3:1,7:4,3,0,10
chr17	79682650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,6:1,4:2,1,9,2
chr17	79683997	.	T	TGCCTCACCCCTG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=263,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.935:27:1,14:0,7:0,1,13,13
chr17	79791597	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.275:19:4,1:9,3:9,5,2,3
chr17	79801977	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:11,5:14,5:10,16,3,7
chr17	79805003	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:1,3,4,4
chr17	79817271	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:16,0:6,3:6,16,1,2
chr17	79818360	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,2:2,0:0,4,0,3
chr17	79827863	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr17	79852474	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=101,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.088:54:26,0:23,4:28,22,1,3
chr17	79862882	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr17	79872129	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,16,7
chr17	79872653	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr17	79890818	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.442:23:5,6:7,4:6,7,4,6
chr17	79893962	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:5,8:7,11:9,3,12,7
chr17	79894106	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=23,23,27;MFRL=106,133,64;MMQ=60,60,60;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.36,4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,4,4:0.171,0.190:23:9,2,2:3,1,1:6,9,3,5
chr17	79894170	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=178,149;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr17	79899670	.	G	GGCTGTGCTCCACTGCAGAAGTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:6,3,1,1
chr17	79912223	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0|1:79912223_AG_A:79912223:0,12,1,1
chr17	79912225	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:79912223_AG_A:79912223:0,13,1,1
chr17	79912227	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:79912223_AG_A:79912223:0,13,1,1
chr17	79969462	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=94,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.128:44:21,3:17,2:17,22,3,2
chr17	79974290	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	79977332	.	GG	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:2,1,0,1
chr17	79977355	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=196,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,0:2,1,2,0
chr17	79977707	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=23,18;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:9,2:7,1:0|1:79977707_A_C:79977707:0,16,6,0
chr17	79977710	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=27,12;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.279:23:10,0:6,0:0|1:79977707_A_C:79977707:0,17,6,0
chr17	79977714	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:11,1:6,2:0|1:79977707_A_C:79977707:1,17,5,0
chr17	79977718	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:12,3:6,2:0|1:79977707_A_C:79977707:1,18,5,0
chr17	79977720	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=23,22;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:10,1:7,1:0|1:79977707_A_C:79977707:2,18,5,0
chr17	79977726	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=23,31;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:11,2:10,1:0|1:79977707_A_C:79977707:3,18,3,0
chr17	79977730	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,2:12,0:0|1:79977707_A_C:79977707:5,20,3,0
chr17	79977732	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=23,13;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,1:11,0:0|1:79977707_A_C:79977707:5,20,3,0
chr17	79986148	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=111,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:12,3:23,0:19,17,3,0
chr17	79990972	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	79993919	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.439:34:9,4:9,9:11,8,6,9
chr17	80008676	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr17	80013738	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:6,8,2,0
chr17	80014663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=250,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,0,2
chr17	80014883	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.391:18:5,4:6,2:5,6,3,4
chr17	80037191	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,8,5
chr17	80038215	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=68,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:0,3:3,3:2,1,3,3
chr17	80038952	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	80039028	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr17	80039146	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:6,5,2,0
chr17	80040607	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	80042369	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,0:5,7:5,2,5,2
chr17	80043044	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=105,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:5,6:3,4:4,5,6,4
chr17	80043588	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,1,1
chr17	80045678	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,0;MFRL=124,71;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:4,0:6,0:12,1,0,2
chr17	80047513	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=106,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,1:10,3:12,6,3,1
chr17	80047696	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:80047696_A_T:80047696:0,4,0,1
chr17	80047700	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:80047696_A_T:80047696:0,3,0,1
chr17	80048445	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:80048445_G_A:80048445:10,8,1,1
chr17	80048452	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=122,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:80048445_G_A:80048445:10,9,1,1
chr17	80048456	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:80048445_G_A:80048445:9,8,1,1
chr17	80050554	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=G;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.761:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	80071635	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=266,182;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80071635_C_T:80071635:0,1,0,1
chr17	80071638	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=266,182;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:80071635_C_T:80071635:0,1,0,1
chr17	80071643	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80071635_C_T:80071635:0,0,0,1
chr17	80071649	.	A	AATAAAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80071635_C_T:80071635:0,0,0,1
chr17	80086522	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:2,5,1,3
chr17	80091941	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=161.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,56:0.967:57:0,27:1,28:1,0,37,19
chr17	80092131	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	80092171	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	80109471	.	C	CAGGCA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:4,9,1,1
chr17	80121275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr17	80129485	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	80129694	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.106:45:18,0:20,4:0|1:80129694_G_T:80129694:18,23,0,4
chr17	80129699	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.113:42:19,0:17,4:0|1:80129694_G_T:80129694:15,23,0,4
chr17	80136391	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=134,149;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:7,11,3,0
chr17	80136406	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=142,149;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:5,10,3,0
chr17	80136418	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr17	80146089	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr17	80146385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=187,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr17	80151805	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	80159505	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.105:35:18,3:14,0:22,10,2,1
chr17	80159566	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,19,11
chr17	80275253	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,6:0,0:0,0,5,2
chr17	80280056	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=101,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.339:30:8,3:11,6:13,7,7,3
chr17	80280124	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.119:41:18,0:16,2:17,18,0,6
chr17	80280707	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=18,12;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.253:14:5,0:0,0:0|1:80280707_A_C:80280707:7,4,3,0
chr17	80280714	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,11;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.253:14:7,0:1,0:0|1:80280707_A_C:80280707:7,4,3,0
chr17	80280721	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.223:16:7,0:2,0:0|1:80280707_A_C:80280707:8,5,3,0
chr17	80282358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=197,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr17	80282376	.	GCCCTCCCCCTGCCCAGGCCCCCTCCCCTCCCCGTGTCCCCTCTCACTC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=104,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr17	80320541	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,3:2,8,0,4
chr17	80320561	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=110,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:1,0,1,8
chr17	80356019	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr17	80356045	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,5:4,6:7,1,10,1
chr17	80361753	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr17	80363221	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=92,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.191:45:13,0:23,8:18,19,0,8
chr17	80363261	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:9,2:20,0:0|1:80363261_G_A:80363261:16,13,1,1
chr17	80363264	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,2:19,0:0|1:80363261_G_A:80363261:15,13,1,1
chr17	80367275	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:5,4:6,3:8,3,3,4
chr17	80367353	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=75,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,1,6
chr17	80377826	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:80377826_C_G:80377826:0,5,0,2
chr17	80377827	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:80377826_C_G:80377826:0,7,0,2
chr17	80377829	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:80377826_C_G:80377826:0,7,0,2
chr17	80377834	.	TG	GT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:80377826_C_G:80377826:0,6,0,2
chr17	80393594	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=107,78;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:8,5:23,1:0|1:80393594_G_A:80393594:15,18,5,1
chr17	80393596	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=107,78;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:9,5:23,1:0|1:80393594_G_A:80393594:15,18,5,1
chr17	80397484	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr17	80398854	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,1:8,2:7,13,3,0
chr17	80399193	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr17	80402045	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:2,4:10,2:4,8,2,4
chr17	80402296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,1:5,0,4,0
chr17	80403894	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=197,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,2:2,1:0,2,0,4
chr17	80404480	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:3,0:3,5:6,0,3,4
chr17	80405552	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=187,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,7:4,7:4,3,4,10
chr17	80426550	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	80426635	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:4,1,2,4
chr17	80438886	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr17	80443309	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.441:5:0,2:1,0:3,0,2,0
chr17	80443410	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:14,2:22,1:11,28,1,2
chr17	80521332	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=103,79;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.102:45:23,4:18,0:23,18,1,3
chr17	80544855	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=99,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr17	80545156	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr17	80574532	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr17	80575230	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=88,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,2:11,1:14,12,3,0
chr17	80583230	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.881:14:0,4:1,9:0,1,9,4
chr17	80585033	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,19,4
chr17	80601769	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,8:0,9:0,0,14,4
chr17	80615984	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,0:10,4:6,16,1,3
chr17	80674839	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr17	80676946	.	A	ACCACCCC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCACCCC;STR;TLOD=64.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.951:16:0,3:0,11:0,0,1,15
chr17	80677005	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr17	80678327	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=213,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,3,0
chr17	80684432	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.516:25:9,9:3,3:6,6,4,9
chr17	80684638	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr17	80685126	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	80693705	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	80693711	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=93,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:80693711_G_A:80693711:1,1,0,1
chr17	80693714	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=93,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:80693711_G_A:80693711:1,1,0,1
chr17	80696542	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,13:0,0,20,17
chr17	80699093	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr17	80699273	.	AGTGCCTGGGTG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:5,0:0|1:80699273_AGTGCCTGGGTG_A:80699273:5,14,1,1
chr17	80699285	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:0|1:80699273_AGTGCCTGGGTG_A:80699273:5,11,1,1
chr17	80706928	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr17	80708601	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:4,2:4,5,2,1
chr17	80710036	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:7,3,2,1
chr17	80755615	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.440:9:1,3:3,1:3,2,4,0
chr17	80758971	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,0;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	80763983	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr17	80789806	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:12,4:8,4:11,9,4,4
chr17	80828057	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,7:8,0:10,6,3,4
chr17	80858669	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:0,5,0,11
chr17	80861206	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:7,1,3,1
chr17	80865526	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr17	80867281	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,7:2,5:1,3,1,11
chr17	80878365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr17	80878389	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr17	80878412	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31,32;MFRL=129,109,108;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=7.34,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,2:0.315,0.199:14:1,0,1:4,5,1:6,1,6,1
chr17	80881502	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	80887244	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:2,3,3,6
chr17	80890638	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:1,6:3,4:1,4,3,7
chr17	80896115	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	80914988	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:4,0,6,2
chr17	80915192	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:5,8,1,1
chr17	80923432	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	80962888	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr17	80972389	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.156:42:14,3:21,3:22,14,4,2
chr17	81043175	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.346:47:17,12:14,4:14,17,9,7
chr17	81050833	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=102,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr17	81050982	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,1,4
chr17	81051007	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr18	166710	.	TTAAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr18	180211	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr18	203081	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,7:4,6:5,6,7,6
chr18	211138	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=140,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:8,7,3,0
chr18	214959	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=84,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,1,3
chr18	224184	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,6:4,0:1,3,3,3
chr18	226933	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=119,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:226933_A_AT:226933:1,3,0,1
chr18	226938	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=119,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:226933_A_AT:226933:1,3,0,1
chr18	259800	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	259836	.	A	AATAAGAAGGGAAAACAGTACTCTTAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr18	260108	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.657:9:3,5:0,1:2,1,6,0
chr18	264011	.	C	CAAAACAAAACAAAACT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=108,41;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,0:14,2:17,10,1,1
chr18	264012	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.313:27:5,3:12,5:11,8,6,2
chr18	264013	.	G	GAGTC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=108,41;MMQ=60,35;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:16,2:17,10,1,1
chr18	319944	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr18	335244	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	357443	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:10,2:8,12:8,10,6,8
chr18	580623	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr18	581201	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0|1:581201_T_A:581201:0,0,10,12
chr18	581202	.	GTT	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0|1:581201_T_A:581201:0,0,10,12
chr18	581435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,0:6,5:6,10,0,5
chr18	618026	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:13,9,2,0
chr18	618124	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,4,9
chr18	624783	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	624824	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr18	625070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr18	645176	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	649879	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34,34;MFRL=89,127,0;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.13,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.324,0.264:12:2,2,2:2,2,0:3,2,3,4
chr18	658064	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:1,2,3,3
chr18	658084	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:658084_C_G:658084:2,1,0,1
chr18	658087	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=233,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:658084_C_G:658084:1,1,0,1
chr18	658423	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr18	659827	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,179;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr18	662103	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr18	662370	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,2:0,3:1,4,1,4
chr18	670641	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,176;MMQ=60,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:8,3,3,0
chr18	672836	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=108,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:2,3:9,5:7,4,6,3
chr18	678847	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=105,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	688463	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	690611	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:5,2:19,1:12,12,1,2
chr18	691173	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=128,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,3:7,6:6,6,3,6
chr18	693767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,4,0
chr18	693828	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=97,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:9,9:12,10:10,12,10,10
chr18	693986	.	GCT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr18	694206	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=212,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,4:1,5:2,1,5,4
chr18	697377	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr18	706589	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,6:6,2:5,7,4,4
chr18	739715	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:14,7:7,0:11,11,7,0
chr18	742858	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr18	743226	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:3,4,6,2
chr18	743436	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr18	905345	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	905537	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	2539016	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	2547500	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:10,9:3,2:8,5,9,2
chr18	2606596	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr18	2666046	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=315,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr18	2688798	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr18	2705633	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr18	2705675	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=85,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,0:1,3:0,1,4,0
chr18	2705700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr18	2706511	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr18	2724930	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.809:8:0,1:1,6:1,0,6,1
chr18	2726335	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	2739326	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=207,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr18	2740625	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=286,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,1:2,2:2,0,4,0
chr18	2750501	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:3,2:3,7:1,5,3,7
chr18	2751475	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr18	2771516	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,14,16
chr18	2784404	.	TGAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,3:2,1:3,0,3,1
chr18	2847968	.	G	GAGTCACGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr18	2885047	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:13,8,1,1
chr18	2885062	.	G	GGTGCAGGAATT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:9,10,1,1
chr18	2885118	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:4,6:10,4:6,8,4,6
chr18	2891039	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr18	2909095	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2909095_TT_CC:2909095:0,2,0,1
chr18	2909105	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,290;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2909095_TT_CC:2909095:0,2,0,1
chr18	2909831	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,8,9
chr18	2920288	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=65,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:4,4:2,3:3,3,4,5
chr18	2921444	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,142;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr18	2922149	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.523:23:7,8:3,4:7,4,6,6
chr18	2923713	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr18	2934536	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr18	2951447	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.787:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr18	2954439	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr18	2960705	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,77;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:8,9,1,3
chr18	2982817	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,4,17
chr18	3075503	.	C	CAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=159.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,20:0,0,18,22
chr18	3075712	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,120;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,1:7,4:5,6,4,1
chr18	3084152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr18	3085191	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	3086118	.	AC	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:3086118_AC_CT:3086118:5,6,1,1
chr18	3086121	.	ATATGAGT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:7,0:0|1:3086118_AC_CT:3086118:5,8,1,1
chr18	3089186	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,98;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:19,8:19,0:15,23,7,1
chr18	3089522	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=102,208;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr18	3100051	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr18	3100429	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,4:3,3:4,5,2,5
chr18	3112231	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,4:5,1:4,1,5,0
chr18	3112252	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:8,1,3,1
chr18	3120060	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	3120092	.	C	CTTCCTATGTGCTTGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr18	3126632	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:4,2,9,1
chr18	3129158	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=233,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr18	3129548	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,0:3,3:5,7,3,0
chr18	3164218	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,4:5,0:11,1,4,0
chr18	3168816	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,7:4,1:3,3,4,4
chr18	3169070	.	C	CAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=274,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,15;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr18	3173816	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr18	3173873	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:6,3,5,1
chr18	3174018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,1,4
chr18	3174056	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:3174056_C_A:3174056:2,4,1,1
chr18	3174064	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0|1:3174056_C_A:3174056:2,5,2,0
chr18	3176017	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=102,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:3,0,3,1
chr18	3176040	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:0,2:11,1:6,5,2,1
chr18	3188664	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=95,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,1:2,2:6,0,2,1
chr18	3214918	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=96,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,2:0,4:2,0,5,2
chr18	3255704	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,2:5,0:13,3,2,0
chr18	3272798	.	AG	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,2:0,0,11,0
chr18	3272855	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr18	3272874	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.939:15:0,5:1,9:1,0,10,4
chr18	3273153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr18	3277162	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr18	3277237	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,21,11
chr18	3277466	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,12:0,2:0,0,4,10
chr18	3277691	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr18	3447871	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,0,13
chr18	3452222	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:1,5,2,1
chr18	3457606	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.389:39:14,9:10,6:16,8,8,7
chr18	3534175	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,6:2,8:5,2,8,6
chr18	3534224	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:12,9:3,2:5,10,4,7
chr18	3534688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=155,175;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:0,0:0|1:3534688_C_T:3534688:0,2,0,1
chr18	3534692	.	CTTTT	C,TTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31,14;MFRL=236,121,175;MMQ=60,40,40;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.62,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.358,0.286:3:0,1,0:0,0,0:0,1,0,2
chr18	3534708	.	T	TGA,TTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28,28;MFRL=236,121,175;MMQ=60,40,40;MPOS=10,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr18	3534712	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=236,175;MMQ=51,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3534688_C_T:3534688:0,3,0,1
chr18	5145752	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:5145752_C_T:5145752:6,12,1,1
chr18	5145754	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:5145752_C_T:5145752:6,12,1,1
chr18	5196981	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:2,2,3,4
chr18	5196992	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr18	5397364	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:3,2,5,3
chr18	5407839	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr18	5410500	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=205,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,1,1
chr18	5416402	.	A	AGAGGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	5423631	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr18	5428523	.	G	GCAACTGACACTCAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5428523_G_GCAACTGACACTCAAAT:5428523:0,1,0,1
chr18	5428526	.	T	TGGTGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5428523_G_GCAACTGACACTCAAAT:5428523:0,1,0,1
chr18	5428528	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5428523_G_GCAACTGACACTCAAAT:5428523:0,1,0,1
chr18	5428532	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5428523_G_GCAACTGACACTCAAAT:5428523:0,1,0,1
chr18	5433570	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=106,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr18	5434195	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	5437961	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr18	5478335	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,88;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:14,3:5,0:7,12,2,1
chr18	6215760	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:6,2:0,0:3,3,1,1
chr18	6311723	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,156;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,5:0,7,0,5
chr18	6837446	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr18	6870524	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.880:14:0,6:1,7:1,0,11,2
chr18	6873646	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33,29;MFRL=159,97,147;MMQ=60,60,60;MPOS=16,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=T;STR;TLOD=5.45,4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,3:0.166,0.176:18:5,2,1:4,1,1:8,4,5,1
chr18	6889973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:4,2,3,3
chr18	6896450	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:2,2,1,2
chr18	6898415	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=97,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:3,2:10,6:9,5,5,3
chr18	6942295	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr18	6947143	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr18	6947362	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr18	6948614	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr18	6948629	.	TTCA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	6948652	.	A	ACTCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=160,228;MMQ=60,35;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:6948652_A_ACTCC:6948652:0,4,0,1
chr18	6948655	.	C	CCTCAGATCAGCCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=160,228;MMQ=60,35;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:6948652_A_ACTCC:6948652:0,4,0,1
chr18	6949052	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=513,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:1,0,5,2
chr18	6950865	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,213;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:8,9,0,2
chr18	6950999	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr18	6951060	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	6958609	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:3,6:9,5:2,10,8,3
chr18	6958690	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=168,85;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,1:4,6:0,6,0,7
chr18	6962147	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=172,231;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:6962147_A_G:6962147:0,6,0,2
chr18	6962156	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=172,231;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:6962147_A_G:6962147:0,6,0,2
chr18	6965305	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:10,8,1,1
chr18	6966370	.	TCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr18	6980457	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	6980523	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr18	6982443	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr18	6982555	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=98,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:9,1:6,12,2,0
chr18	6985468	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr18	6985499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:6985499_C_T:6985499:0,0,5,0
chr18	6985506	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:6985499_C_T:6985499:0,0,5,0
chr18	6985655	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr18	6986259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr18	6997818	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.580:19:2,3:5,8:5,3,9,2
chr18	6997902	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:6997902_A_AT:6997902:0,4,0,1
chr18	6997903	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:6997902_A_AT:6997902:0,4,0,1
chr18	6997908	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:6997902_A_AT:6997902:0,4,0,1
chr18	6999694	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr18	7007354	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:7007354_G_A:7007354:0,0,0,1
chr18	7007362	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7007354_G_A:7007354:0,0,0,1
chr18	7011959	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=122,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.152:18:7,2:7,0:0|1:7011959_T_A:7011959:11,5,2,0
chr18	7011965	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=104,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:7011959_T_A:7011959:9,5,2,0
chr18	7015714	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=336,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,5:0,1,5,7
chr18	7024345	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:9,4,4,2
chr18	7026187	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	7033173	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,216;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:7033173_GA_G:7033173:0,1,0,2
chr18	7033184	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=175,216;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:7033173_GA_G:7033173:0,1,0,2
chr18	7034448	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:3,3,6,3
chr18	7034464	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=94,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:3,3:4,5:3,4,6,3
chr18	7038783	.	C	CCCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCG;STR;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr18	7043455	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr18	7567749	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr18	7774104	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=78,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,3:1,2:3,2,3,2
chr18	8085726	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=85,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:6,4:7,0:7,6,2,2
chr18	8113774	.	A	ACCAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:8113774_A_ACCAC:8113774:0,4,0,1
chr18	8113778	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:8113774_A_ACCAC:8113774:0,4,0,1
chr18	8114774	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,2:8,1:9,3,1,2
chr18	8244282	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.857:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr18	8247734	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	8252640	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8252640_G_GGC:8252640:0,1,0,1
chr18	8252641	.	T	TATGACTGGCACCGTGGCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8252640_G_GGC:8252640:0,1,0,1
chr18	8343333	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr18	8343530	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=67,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:2,10,3,2
chr18	8370925	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:7,7,0,3
chr18	8376443	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,6:8,2:7,6,3,5
chr18	8379089	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:8379089_T_A:8379089:0,0,3,0
chr18	8379095	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0|1:8379089_T_A:8379089:0,0,3,0
chr18	8380473	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	8387058	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:8387058_T_G:8387058:0,0,8,1
chr18	8387065	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0|1:8387058_T_G:8387058:0,0,8,1
chr18	8387195	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr18	8387219	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr18	8633199	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.400:38:15,14:8,0:15,8,15,0
chr18	8720368	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=81,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,4:2,4:4,5,5,3
chr18	8720591	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr18	8777732	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=63,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr18	8786108	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr18	8798374	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr18	8821556	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr18	8826032	.	GG	AA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.054:54:43,2:7,0:22,30,1,1
chr18	8826033	.	G	GAAGGAA	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:41,2:7,0:20,29,1,1
chr18	8828952	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=70,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,3:6,11:4,11,4,10
chr18	9104283	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:7,7:10,8:4,13,2,13
chr18	9105108	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr18	9124799	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr18	9221840	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=132,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,5:7,3:6,4,6,2
chr18	9255718	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=83,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:14,9:9,10:15,8,17,2
chr18	9256817	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=109,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:3,0:9,3:8,4,0,3
chr18	9512985	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:11,0,2,0
chr18	9522367	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=153,147;MMQ=40,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:4,6,2,0
chr18	9531034	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr18	9547895	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.339:21:11,0:3,6:3,11,0,7
chr18	9577219	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0,12,1,1
chr18	9588011	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,0;MFRL=113,122;MMQ=60,30;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,0:0|1:9588011_AAC_A:9588011:2,1,3,0
chr18	9588022	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=111,122;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,3:4,0:0|1:9588011_AAC_A:9588011:4,2,3,0
chr18	9588024	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=111,122;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,3:6,0:0|1:9588011_AAC_A:9588011:4,2,3,0
chr18	9775372	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.596:35:6,12:8,9:6,8,11,10
chr18	9775411	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=98,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,7:4,3:2,6,2,8
chr18	9859251	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.152:30:9,0:17,4:13,13,3,1
chr18	9859294	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:11,0:15,7:11,15,2,5
chr18	9887091	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,71;MMQ=57,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.131:44:18,2:17,3:23,16,3,2
chr18	9950502	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,1:11,0:0|1:9950502_G_A:9950502:10,18,1,1
chr18	9950508	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,1:10,0:0|1:9950502_G_A:9950502:9,17,1,1
chr18	9950516	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,2:14,0:0|1:9950502_G_A:9950502:12,19,1,1
chr18	9954058	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=116,106;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,5:6,5:8,2,7,3
chr18	9954233	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.455:7:1,1:2,2:1,3,0,3
chr18	10468453	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=78,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,1:7,4:6,6,2,3
chr18	10530664	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:2,1:3,1:5,0,3,0
chr18	10539739	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr18	10540432	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr18	10677880	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr18	10680104	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	10680132	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,0:0,4:1,0,4,0
chr18	10680142	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,5:0,0,6,0
chr18	10680163	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr18	10691192	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,3,1
chr18	10691216	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:2,4,4,2
chr18	10691357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=75,189;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,1,2
chr18	10696043	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,6:4,7:5,2,11,2
chr18	10696227	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:5,5,2,4
chr18	10696333	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0|1:10696333_C_G:10696333:4,3,0,3
chr18	10696337	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,0:3,3:0|1:10696333_C_G:10696333:4,3,0,3
chr18	11824829	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr18	11824880	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,6,0
chr18	11824886	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,6,0
chr18	11852612	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,29,30;MFRL=73,156,113;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=T;STR;TLOD=11.52,24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,15:0.242,0.600:27:2,5,7:1,1,5:2,2,7,16
chr18	11853731	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.982:55:0,22:0,32:0,0,37,18
chr18	11853987	.	AGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=240,247;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11853987_AGTT_A:11853987:0,3,0,1
chr18	11853991	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=240,247;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:11853987_AGTT_A:11853987:0,3,0,1
chr18	11864553	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr18	11864707	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	11872174	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr18	11884474	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:14,0:11,4:12,13,3,1
chr18	11884670	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=88,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.557:16:3,4:4,5:0|1:11884670_C_G:11884670:3,4,0,9
chr18	11884671	.	G	GCTACCACACCTGGCTAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.172:15:6,0:6,2:1|0:11884670_C_G:11884670:1,12,1,1
chr18	11885576	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr18	11886867	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=121,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr18	11893391	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	12009952	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,2:11,1:7,14,0,3
chr18	12014411	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr18	12028241	.	A	AGGATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12028241_A_AGGATG:12028241:0,1,0,1
chr18	12028243	.	C	CTTGAGCTCAAGAAGTTAAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12028241_A_AGGATG:12028241:0,1,0,1
chr18	12028247	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:12028247_A_G:12028247:0,0,0,1
chr18	12028249	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12028247_A_G:12028247:0,0,0,1
chr18	12030473	.	AGCTGCTCCCAAGGCCTCCCTGG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:7,2:9,0:6,16,1,1
chr18	12057195	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,2,2
chr18	12254539	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	12263067	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	12264512	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	12264549	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr18	12308377	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr18	12329536	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=79,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:6,2,3,2
chr18	12329726	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:0|1:12329726_A_G:12329726:9,17,1,1
chr18	12329733	.	A	AGG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:12,2:0|1:12329726_A_G:12329726:8,17,1,1
chr18	12348285	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=98,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:4,7,7,3
chr18	12352921	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,0:8,2:10,0,2,0
chr18	12358997	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,7:3,4:0,6,3,8
chr18	12359920	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=95,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:4,6:6,0:7,3,6,1
chr18	12363683	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=66,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr18	12363950	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr18	12367442	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr18	12421442	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr18	12429313	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr18	12453005	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr18	12486004	.	A	ATTATTTTCTTTTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,43;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:11,1:13,2:11,13,1,2
chr18	12512385	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:2,2:2,2:4,1,3,1
chr18	12512559	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr18	12512574	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr18	12535649	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=239,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12535649_T_TC:12535649:0,3,0,1
chr18	12535651	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=239,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12535649_T_TC:12535649:0,3,0,1
chr18	12535655	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=239,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12535649_T_TC:12535649:0,3,0,1
chr18	12634986	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:2,4:1,3:1,2,5,2
chr18	12657431	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	12674440	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr18	12680607	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,0:2,6,3,0
chr18	12703067	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:7,2,9,1
chr18	12703192	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=96,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:7,4:0,3:4,4,3,5
chr18	12712817	.	CATT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr18	12720740	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=101,191;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0|1:12720740_A_G:12720740:5,4,0,2
chr18	12720748	.	GA	AT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=101,191;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:12720740_A_G:12720740:5,4,0,2
chr18	12720755	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=94,191;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,2:0|1:12720740_A_G:12720740:2,4,0,2
chr18	12720768	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=101,191;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr18	12831054	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=76,102;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.301:28:12,0:8,8:11,9,0,8
chr18	12951738	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=225,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr18	12952001	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=178,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr18	12955439	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=61,154;MMQ=46,53;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:0,7:4,2:2,2,8,3
chr18	12978733	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:7,2,4,0
chr18	12982760	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr18	12986802	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,1:1,0,2,2
chr18	13008369	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=104,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr18	13008701	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.401:10:2,2:2,1:2,4,0,4
chr18	13015246	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr18	13029575	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr18	13029960	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:7,5,1,2
chr18	13049948	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=205,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:1,3:0,3,0,5
chr18	13056029	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:3,10,1,1
chr18	13059372	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=260,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,2,4
chr18	13068323	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:6,3,3,1
chr18	13068339	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:5,7:4,0:5,4,5,2
chr18	13069782	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=109,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:6,6:9,9:9,6,7,8
chr18	13069819	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=91,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:22,0:12,3:22,12,2,1
chr18	13072979	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:6,6,2,1
chr18	13095401	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	13099601	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.288:8:2,0:3,2:1,5,0,2
chr18	13621150	.	CGTGGTGGTCACGGTGATG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=112,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:6,6,1,1
chr18	13643516	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	13682077	.	TTTGAAGAGTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=103,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:6,6,1,1
chr18	13741788	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	13759816	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=219,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:0|1:13759816_T_C:13759816:1,0,4,0
chr18	13759820	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:13759816_T_C:13759816:0,0,5,0
chr18	13826350	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:6,2:13,6,2,1
chr18	13885692	.	A	ACCTCTTGAAAAAATTTCATAATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr18	13885709	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13885709_T_C:13885709:0,1,0,1
chr18	13885710	.	C	CCCACAGAGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13885709_T_C:13885709:0,1,0,1
chr18	13885725	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	14104992	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=90,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:7,2:5,0:0|1:14104992_A_T:14104992:8,4,1,1
chr18	14104997	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=84,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.218:16:7,2:6,1:0|1:14104992_A_T:14104992:8,5,2,1
chr18	14105016	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,3:3,3:6,2,2,4
chr18	14105229	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,0:9,1:5,9,1,1
chr18	14105853	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:5,4,3,3
chr18	14132402	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=233,167;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:0,2,1,7
chr18	14183630	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=107,93;MMQ=49,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.134:42:23,0:13,5:22,15,3,2
chr18	14183635	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=20,23;MFRL=95,112;MMQ=49,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:23,1:15,2:0|1:14183635_C_T:14183635:22,18,1,2
chr18	14183638	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=20,20;MFRL=73,107;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.697:44:8,17:5,13:6,7,17,14
chr18	14183642	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=20,29;MFRL=93,112;MMQ=49,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:24,1:16,2:0|1:14183635_C_T:14183635:22,19,1,2
chr18	14183646	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=20,27;MFRL=91,113;MMQ=49,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:23,2:18,2:0|1:14183635_C_T:14183635:22,20,2,2
chr18	14183651	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=20,33;MFRL=102,181;MMQ=42,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:20,3:21,2:21,22,3,2
chr18	14183678	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=113,117;MMQ=39,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:17,0:19,4:16,20,2,2
chr18	14183680	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=30,21;MFRL=114,108;MMQ=37,37;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.260:40:9,8:21,2:13,17,5,5
chr18	14183710	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=147,146;MMQ=37,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:4,5:11,3:7,8,2,6
chr18	14183789	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=147,108;MMQ=40,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:10,3:5,2:6,9,2,3
chr18	14183796	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=23,24;MFRL=143,101;MMQ=25,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,3:6,1:6,8,2,2
chr18	14183814	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=207,111;MMQ=42,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr18	14183840	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=23,22;MFRL=109,145;MMQ=37,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:3,7,1,3
chr18	14183885	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=149,132;MMQ=47,46;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0|1:14183885_A_AT:14183885:3,3,2,3
chr18	14183891	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,23;MFRL=177,94;MMQ=47,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:0|1:14183885_A_AT:14183885:4,3,2,2
chr18	14183894	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=177,94;MMQ=47,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,3:1,1:0|1:14183885_A_AT:14183885:4,3,2,2
chr18	14183901	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=183,94;MMQ=47,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:4,2:1,1:0|1:14183885_A_AT:14183885:4,1,2,2
chr18	14183978	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=142,198;MMQ=44,21;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:7,3,4,0
chr18	14184006	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=146,207;MMQ=44,20;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:5,2:6,4,3,0
chr18	14184023	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=145,207;MMQ=40,20;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:4,2:6,7,3,0
chr18	14513878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,191;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:0,5,0,4
chr18	14534886	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,145;MMQ=24,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr18	14538001	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=83,157;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:2,7,0,3
chr18	14542569	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=125,170;MMQ=28,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:4,1:0,2:2,2,3,0
chr18	14542648	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=71,120;MMQ=29,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,3:5,11:4,8,6,8
chr18	14542867	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=118,177;MMQ=43,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.119:32:20,0:7,2:0|1:14542867_C_T:14542867:17,11,4,0
chr18	14542909	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=158,131;MMQ=51,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.273:19:9,1:4,3:0|1:14542867_C_T:14542867:7,7,5,0
chr18	14542931	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=21,15;MFRL=105,124;MMQ=43,50;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.206:30:10,2:14,0:12,12,3,3
chr18	14542979	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=181,140;MMQ=47,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.751:20:2,8:2,7:2,3,2,13
chr18	14543057	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,5:8,5:5,6,4,6
chr18	14543098	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=146,105;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:3,5:5,1:3,5,1,5
chr18	14752768	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr18	14763938	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:0|1:14763938_T_C:14763938:12,9,1,1
chr18	14763957	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,1:10,0:0|1:14763938_T_C:14763938:10,10,1,1
chr18	14780082	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr18	14796443	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr18	14837168	.	GT	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.145:49:21,4:19,3:22,20,4,3
chr18	14837231	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=115,269;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,0:19,3:10,27,0,3
chr18	18531330	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=110,182;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.209:65:26,0:26,13:35,17,0,13
chr18	18531364	.	GA	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=101,94;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.241:44:17,6:16,5:20,13,8,3
chr18	18531452	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=153,122;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:1,7,0,3
chr18	18567024	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,0:13,3:9,20,1,2
chr18	18690877	.	T	TGGTGAGTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:7,3:11,0:0|1:18690877_T_TGGTGAGTA:18690877:3,16,1,2
chr18	18690879	.	C	CGCTGTTCTCTTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:7,3:12,0:0|1:18690877_T_TGGTGAGTA:18690877:3,16,1,2
chr18	19021496	.	TAGGTA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGTA;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:10,11,1,1
chr18	19065494	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr18	19079853	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr18	19100717	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:14,8:8,4:13,9,6,6
chr18	19100758	.	A	ATCT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=113.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,11:0,0,7,20
chr18	19100854	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr18	19110466	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.867:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr18	19119801	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=58.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,4:0,15:0,0,16,4
chr18	19119813	.	TAA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.156:29:6,2:17,2:11,14,3,1
chr18	19119974	.	GATAT	G,GAT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,131,162;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AT;STR;TLOD=5.88,38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.218,0.736:15:0,1,4:0,2,8:0,0,3,12
chr18	19154698	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,0:5,1:1,9,0,2
chr18	19203722	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=118,94;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.079:60:24,0:32,4:35,21,2,2
chr18	19208953	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=108,153;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,3:5,0:14,2,3,0
chr18	19239043	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,226;MMQ=40,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr18	19263539	.	T	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.050:78:36,3:38,0:33,42,3,0
chr18	19321496	.	AGCG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCG;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,0:2,2:12,1,2,0
chr18	19408950	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,14,9
chr18	19423963	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr18	19424063	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:19,2:3,1:13,9,0,3
chr18	19444473	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:11,7,1,1
chr18	19780527	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr18	19780858	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr18	19996102	.	GG	AA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,101;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:11,2:21,0:15,17,0,2
chr18	20526473	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:5,7:1,4:2,4,1,10
chr18	20555219	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,17:0,15:0,0,9,23
chr18	20562312	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:13,0:11,6:0|1:20562312_T_A:20562312:7,18,0,6
chr18	20562316	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:13,0:11,5:0|1:20562312_T_A:20562312:7,18,0,6
chr18	20564800	.	TTCA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCA;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,5:7,2:15,3,5,2
chr18	20573866	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:6,3:2,5:0,8,0,8
chr18	20581467	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr18	20774432	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,4:11,0:15,8,4,0
chr18	20817249	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:2,13,0,2
chr18	20817276	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:2,5:6,0:0,9,0,5
chr18	20950158	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31,31,34;MFRL=109,86,164,156;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,15,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.19,14.54,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,7,3:0.156,0.426,0.205:15:0,0,1,3:2,2,3,0:1,2,8,4
chr18	21017652	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=131,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr18	21017835	.	CT	TC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=114,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.306:34:5,4:18,6:0|1:21017835_CT_TC:21017835:9,15,4,6
chr18	21017836	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,33:0.972:33:0,10:0,23:1|0:21017835_CT_TC:21017835:0,0,12,21
chr18	21033582	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	21043106	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr18	21046229	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:24,0:25,3:17,33,0,3
chr18	21055092	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,4:0,17:0,0,4,17
chr18	21087929	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,6:7,0:13,4,6,0
chr18	21088081	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=55.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,2,17
chr18	21103971	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:7,2:0,1:7,0,3,0
chr18	21107693	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr18	21109250	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,7:0,0,6,16
chr18	21109269	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr18	21109493	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr18	21110108	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.589:37:8,11:7,11:6,9,8,14
chr18	21113285	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=93,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:3,7:2,5:2,3,10,2
chr18	21119291	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=102,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:7,6:2,6:7,2,9,3
chr18	21119522	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=295,297;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:21119522_T_C:21119522:0,1,0,1
chr18	21119525	.	AC	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=295,297;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21119522_T_C:21119522:0,1,0,1
chr18	21120035	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr18	21123536	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.709:11:2,3:1,3:1,2,3,5
chr18	21124834	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=75,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.570:9:0,3:2,2:3,1,4,1
chr18	21124945	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr18	21127910	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:2,2:0,8:2,0,7,3
chr18	21137096	.	T	TTGGCTTTATCTGGTATTTTCTCATGATG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.185:15:4,2:8,0:7,6,1,1
chr18	21140411	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.678:32:0,11:9,11:0|1:21140411_T_C:21140411:5,5,8,14
chr18	21140432	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,22:0.657:33:2,9:8,9:0|1:21140411_T_C:21140411:3,8,8,14
chr18	21209988	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr18	21242793	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21242793_G_T:21242793:0,0,0,1
chr18	21242797	.	C	CAGAGGGTGTGCGCCGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21242793_G_T:21242793:0,0,0,1
chr18	21242801	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21242793_G_T:21242793:0,0,0,1
chr18	21242802	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21242793_G_T:21242793:0,0,0,1
chr18	21269984	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=192,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21269984_T_C:21269984:0,2,0,1
chr18	21269988	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=192,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21269984_T_C:21269984:0,2,0,1
chr18	21269994	.	G	GGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=192,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:21269984_T_C:21269984:0,2,0,1
chr18	21294117	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	21330964	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.155:49:19,0:23,7:19,23,1,6
chr18	21331018	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=107,178;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:22,0:18,5:16,24,0,5
chr18	21338276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr18	21338481	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,0:2,0:3,11,0,4
chr18	21338515	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr18	21395358	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr18	21400005	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr18	21400028	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr18	21404334	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr18	21437721	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr18	21451319	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:8,0,4,0
chr18	21470161	.	C	CACAAAGGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=272,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr18	21474252	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=136,56;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:0|1:21474252_C_T:21474252:19,7,0,2
chr18	21474255	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=136,56;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:11,2:0|1:21474252_C_T:21474252:19,7,0,2
chr18	21487882	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=87,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:15,0:9,6:8,16,1,5
chr18	21487912	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=101,239;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,0:7,4:4,16,0,4
chr18	21489242	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:4,0:0|1:21489242_A_AC:21489242:1,6,0,2
chr18	21489243	.	G	GGCCTCGTTGCCTTCC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:4,0:0|1:21489242_A_AC:21489242:1,6,0,2
chr18	21489244	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=24,24;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:21489242_A_AC:21489242:1,6,0,2
chr18	21489247	.	T	TTC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=21,27;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:21489242_A_AC:21489242:1,5,0,2
chr18	21489251	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,23;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:21489242_A_AC:21489242:0,3,0,2
chr18	21489287	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21489287_CCA_C:21489287:0,0,0,1
chr18	21489290	.	A	ATGATCTT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21489287_CCA_C:21489287:0,0,0,1
chr18	21495483	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr18	21501329	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=216,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr18	21508078	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:22,3:22,0:24,20,2,1
chr18	21511172	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,6,14
chr18	21512073	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,8:2,7:4,1,14,1
chr18	21526087	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,17:0,13:0,0,20,10
chr18	21529722	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,18,10
chr18	21534701	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:21534701_C_A:21534701:0,0,0,2
chr18	21534703	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:21534701_C_A:21534701:0,0,0,2
chr18	21644075	.	TTG	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.090:71:26,6:33,0:47,18,5,1
chr18	21662816	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr18	21663141	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	21694618	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr18	21708999	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=85,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,3:4,8:2,4,1,10
chr18	21739725	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:4,4,5,8
chr18	21751271	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=156,139;MMQ=50,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,2:11,0:14,0,2,0
chr18	21751296	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:1,4:5,5:5,1,9,0
chr18	21751315	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,1:13,2:11,10,0,3
chr18	21758169	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.390:9:1,1:2,1:2,4,0,3
chr18	21761088	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,1:7,0:0|1:21761088_T_C:21761088:12,8,1,1
chr18	21761093	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:0|1:21761088_T_C:21761088:12,8,1,1
chr18	21805080	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=90,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.157:49:32,0:9,7:22,20,3,4
chr18	21901620	.	GGTAT	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=86,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAT;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,2:7,0:0|1:21901620_GGTAT_G:21901620:12,13,1,1
chr18	21901639	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=86,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:20,2:15,0:0|1:21901620_GGTAT_G:21901620:18,17,1,1
chr18	21912865	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=56,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr18	21913044	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=108,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.170:21:12,1:6,2:0|1:21913044_T_A:21913044:7,11,1,2
chr18	21913051	.	C	CTCTTGTTTGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:0|1:21913044_T_A:21913044:6,14,1,1
chr18	22008913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr18	22010421	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr18	22040724	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:22,0:16,3:23,15,2,1
chr18	22049016	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	23731853	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:12,0:6,4:7,11,1,3
chr18	23772317	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:8,0:16,3:10,16,1,2
chr18	23895125	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=218,168;MMQ=40,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.737:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr18	23937782	.	T	TAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:8,16,1,1
chr18	24039489	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr18	24039964	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	24628305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=222,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr18	24628568	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr18	24628582	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr18	25532080	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,2:5,0,7,0
chr18	25563011	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.151:30:10,4:16,0:17,9,2,2
chr18	25565020	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,0:8,3:8,13,2,1
chr18	25572837	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	25573507	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=129,252;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:15,6:9,0:13,11,6,0
chr18	25573622	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,5:0,14:0,0,0,20
chr18	25583199	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr18	25593694	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:4,4:4,2:3,5,4,3
chr18	25593713	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=221,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,8:3,5:2,3,7,6
chr18	25616554	.	A	AGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:25616554_A_AGC:25616554:1,3,1,1
chr18	25616557	.	A	ATGCTCTGCTATTCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:25616554_A_AGC:25616554:1,3,1,1
chr18	25616559	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:25616554_A_AGC:25616554:1,3,1,1
chr18	28584392	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28584392_G_A:28584392:0,1,0,1
chr18	28584393	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28584392_G_A:28584392:0,1,0,1
chr18	28587970	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.081:48:19,4:25,0:25,19,2,2
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chr18	28609637	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0,10,0,2
chr18	28611139	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=13,28;MFRL=103,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.945:20:0,11:0,7:1,0,8,11
chr18	28622526	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.236:38:14,1:13,1:7,22,9,0
chr18	28659724	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr18	28660289	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,4:10,0:6,13,0,4
chr18	28662793	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,140;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,1:6,3:10,0,4,0
chr18	28666526	.	T	TTAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=186.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,21:0,24:0,0,24,22
chr18	28672347	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr18	28711519	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,2:9,2,3,1
chr18	28712686	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,1,5
chr18	28719674	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:12,1,4,2
chr18	28720147	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=97,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.711:36:4,14:6,12:6,4,12,14
chr18	28728384	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	28735908	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr18	28737299	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr18	28739495	.	C	CA,CAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=18,23,25;MFRL=196,133,154;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.88,16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,9:0.197,0.499:18:0,1,4:1,1,2:0,6,1,11
chr18	28906897	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:13,2:31,1:27,17,2,1
chr18	28935375	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=240,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr18	28968825	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:1,4:1,5:1,1,7,2
chr18	28969008	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,4,15
chr18	28991061	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.392:46:17,10:11,7:22,6,14,4
chr18	28993080	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.268:28:8,7:12,0:13,8,7,0
chr18	29037131	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:1,7,2,1
chr18	29038524	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,122;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.167:40:15,0:18,7:14,19,1,6
chr18	29039761	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,6:3,2:13,1,7,1
chr18	29040756	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=188,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr18	29046398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr18	29046401	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=129,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr18	29046430	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=129,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,1:1,6:2,0,6,1
chr18	29049018	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:2,7:2,4:3,1,10,2
chr18	29098264	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,259;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,0:6,7:6,10,0,7
chr18	29101215	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,31,30;MFRL=129,132,155;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.38,7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.216,0.320:14:3,0,0:1,3,4:2,5,2,5
chr18	29122824	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=175,695097;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr18	29207155	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr18	29237837	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:29237837_C_T:29237837:5,1,2,0
chr18	29237860	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0|1:29237837_C_T:29237837:3,1,4,0
chr18	29238076	.	CAA	C,CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=19,26,25;MFRL=140,169,92;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.20,10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,7:0.205,0.357:20:1,0,2:2,3,4:1,8,1,10
chr18	29264182	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr18	29340853	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.628:27:2,8:7,9:1,9,1,16
chr18	29419469	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr18	29426669	.	A	G	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=92,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,24:0.230:107:36,6:44,18:23,60,4,20
chr18	29426868	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	29432367	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:6,4:10,3:10,7,5,2
chr18	29435778	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,25,25;MFRL=97,100,133;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=9.08,17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,12:0.245,0.565:21:1,2,6:3,3,6:0,4,3,14
chr18	29438023	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr18	29444811	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr18	29477697	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,4:0,2:4,0,6,0
chr18	29488448	.	T	TCAAAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=249,487;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29488448_T_TCAAAC:29488448:0,1,1,0
chr18	29488449	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=249,487;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29488448_T_TCAAAC:29488448:0,1,1,0
chr18	29488453	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=249,487;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29488448_T_TCAAAC:29488448:0,1,1,0
chr18	29488456	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=249,487;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29488448_T_TCAAAC:29488448:0,1,1,0
chr18	29488804	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,101;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:8,5:7,2:7,8,4,3
chr18	29493533	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=93,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr18	29496218	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,2:10,2:7,8,3,1
chr18	29497721	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr18	29511316	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:19,8,0,2
chr18	29511502	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:0,9,0,6
chr18	29522594	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=107,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:13,3:24,0:20,17,3,0
chr18	29617255	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,15,10
chr18	29693905	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=216,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:29693905_G_A:29693905:0,2,0,1
chr18	29693907	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=216,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:29693905_G_A:29693905:0,2,0,1
chr18	29693910	.	ATG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=232,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	29703646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=157,168;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:29703646_A_G:29703646:1,2,0,1
chr18	29703649	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=157,168;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:29703646_A_G:29703646:1,2,0,1
chr18	29703651	.	GTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=157,168;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:29703646_A_G:29703646:1,2,0,1
chr18	29703655	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=165,168;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:29703646_A_G:29703646:0,2,0,1
chr18	29704652	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,15,1
chr18	29708981	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	29793526	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,12,12
chr18	29867688	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=113,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:7,7:8,3:11,4,5,5
chr18	29890154	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,2:1,1:4,3,2,1
chr18	29972774	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=246,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,6:2,0,9,0
chr18	30257245	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=102,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:13,0:16,4:19,10,4,0
chr18	30275537	.	A	AGGGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:1,12,0,2
chr18	30672631	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr18	30672711	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,5:8,3:9,12,5,3
chr18	30873316	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,0:8,4:0,9,0,4
chr18	30873351	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=175,233;MMQ=40,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30873351_T_G:30873351:0,1,0,1
chr18	30873362	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=175,233;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30873351_T_G:30873351:0,1,0,1
chr18	30873367	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=13,25;MFRL=175,233;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:30873351_T_G:30873351:0,1,0,1
chr18	30873373	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=175,233;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30873351_T_G:30873351:0,1,0,1
chr18	30950168	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr18	30977255	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr18	30992012	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=97,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,22:0.299:75:36,22:17,0:28,25,21,1
chr18	31225030	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	31241497	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr18	31263320	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr18	31312106	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	31314196	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr18	31314327	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:12,6:18,0:0|1:31314327_A_G:31314327:15,15,6,0
chr18	31314330	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:12,6:17,0:0|1:31314327_A_G:31314327:15,15,6,0
chr18	31318376	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	31320229	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,8,7
chr18	31324017	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,2:6,3:6,8,3,2
chr18	31324212	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,2:11,2,1,1
chr18	31325042	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:31325042_G_T:31325042:6,6,1,1
chr18	31325047	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:31325042_G_T:31325042:7,7,1,1
chr18	31325051	.	A	AAAG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,2:0|1:31325042_G_T:31325042:7,7,1,1
chr18	31325675	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:3,4,2,0
chr18	32396063	.	TGTTTTAGGGAAGCCTATTTAGTGGCTCTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr18	32418186	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.570:9:1,3:1,2:2,2,1,4
chr18	32431905	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,124;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,0:8,5:9,10,0,5
chr18	32444040	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr18	32445995	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:11,1,2,0
chr18	32462184	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=20,12;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.119:36:12,0:16,1:0|1:32462184_A_C:32462184:11,21,4,0
chr18	32462187	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=115,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:12,1:17,0:0|1:32462187_C_T:32462187:11,18,1,1
chr18	32462189	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=22,12;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.138:31:10,0:10,1:0|1:32462184_A_C:32462184:8,19,4,0
chr18	32462194	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=23,12;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:8,0:9,1:0|1:32462184_A_C:32462184:6,15,3,0
chr18	32462197	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,2:10,0:0|1:32462187_C_T:32462187:7,15,1,1
chr18	32462199	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:6,2:11,0:0|1:32462187_C_T:32462187:6,14,1,1
chr18	32462203	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=137,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:32462187_C_T:32462187:3,14,1,1
chr18	32462206	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=137,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:10,0:0|1:32462187_C_T:32462187:3,14,1,1
chr18	32585367	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=110,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,2:4,0,3,0
chr18	32650341	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr18	32682086	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,4:12,0:14,13,4,0
chr18	32720189	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,4:3,0,7,0
chr18	32822382	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr18	32822911	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=257,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr18	32886528	.	T	TAGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr18	32886862	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,4:10,0:10,5,4,0
chr18	32887933	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,16:0,0,16,17
chr18	32888074	.	TA	T,TAA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=24,24,27;MFRL=110,68,103;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.19,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,5,5:0.173,0.212:24:2,3,1:12,2,4:10,4,4,6
chr18	32888380	.	CA	CAA,C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=128,131,126;MMQ=60,40,60;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,15;RU=A;STR;TLOD=12.76,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,11,8:0.449,0.255:25:2,3,2:2,6,5:4,2,14,5
chr18	32888401	.	A	AAG	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=127,117;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=124.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,43:0.882:49:0,16:4,25:6,0,14,29
chr18	32948446	.	T	TTTTATTTATTTA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=137,134;MMQ=42,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=TTTA;STR;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,4:0,1:0,1,0,7
chr18	32948502	.	G	GCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=140,195;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.317:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr18	32948510	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	32949130	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:9,3:7,0:13,3,4,0
chr18	32954279	.	A	ATGGAAATCAGAAAACAGTGCTATCATGGTTGCAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=39,23;MFRL=164,143;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.345:7:4,1:1,0:0,6,0,1
chr18	33048554	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.591:25:6,9:4,5:6,4,9,6
chr18	33058318	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,25,16,30;MFRL=103,89,101,108;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,16,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.11,3.43,10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,6,5,7:0.233,0.187,0.341:24:1,2,1,2:3,2,0,1:3,3,4,14
chr18	33077660	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.580:31:4,8:8,10:12,1,14,4
chr18	33234532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr18	33243536	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,8:1,7:6,1,14,1
chr18	33269274	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:2,13:11,5:4,9,5,13
chr18	33282985	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.819:31:4,14:1,11:0,5,4,22
chr18	33283016	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:1,7:2,4:0,3,0,11
chr18	33552598	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	33552986	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr18	33554775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr18	33611062	.	TAA	T,TA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=24,20,16;MFRL=146,133,91;MMQ=60,60,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.72,7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,8:0.185,0.265:31:3,2,1:7,3,2:8,9,4,10
chr18	33613595	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	33694201	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=90,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,11:0.158:74:40,1:22,10:41,22,11,0
chr18	33694228	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:49,3:28,0:38,40,1,2
chr18	33694230	.	TGGTGG	T	.	.	DP=93;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,2:0.032:93:53,2:30,0:0|1:33694230_TGGTGG_T:33694230:43,48,1,1
chr18	33694237	.	G	T	.	.	DP=91;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=97,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,2:0.034:87:55,2:29,0:0|1:33694230_TGGTGG_T:33694230:38,47,1,1
chr18	33703711	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=176,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr18	33706599	.	AGAGTGATGCTCGTGCTCTGAGTGATGCTCATGGTCTGAGTGACGCTCATGGTCT	A	.	.	DP=160;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,4:0.033:131:28,0:20,3:54,73,2,2
chr18	33706610	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=95,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.059:79:39,3:33,1:37,38,2,2
chr18	33706614	.	C	G	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=231.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.989:77:0,43:0,34:0,0,36,41
chr18	33724837	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr18	33725866	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,4:6,2:9,0,6,0
chr18	33744702	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr18	33750039	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:12,6:17,0:17,12,5,1
chr18	33767568	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr18	33778607	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,15,7
chr18	33778797	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:33778797_C_T:33778797:0,3,0,2
chr18	33778813	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33778797_C_T:33778797:0,4,0,1
chr18	33778815	.	T	TCTAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=168,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33778797_C_T:33778797:0,3,0,1
chr18	33779821	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,8:0,0,11,12
chr18	33779826	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,3:6,1:7,10,3,1
chr18	33779855	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr18	33779896	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr18	33780020	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr18	33785093	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,7:0,0,5,14
chr18	33785304	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	33793511	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,1,17
chr18	33795425	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=79,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr18	33828980	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,9,14
chr18	33831020	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=263,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr18	33831044	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	33848663	.	A	ATACAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,6,10
chr18	33877713	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr18	34081849	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=91,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.333:43:18,7:11,7:13,16,7,7
chr18	34182834	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr18	34205385	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr18	34261300	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=51,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:1,1:7,1:0|1:34261300_C_T:34261300:7,1,2,0
chr18	34261308	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.229:11:2,0:7,2:1|0:34261300_C_T:34261300:8,1,1,1
chr18	34261458	.	CAG	C	.	.	DP=127;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=81,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,6:0.069:99:54,5:36,1:53,40,4,2
chr18	34261475	.	C	T	.	.	DP=125;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=77,110;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,7:0.067:116:62,0:45,7:59,50,0,7
chr18	34261559	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.416:44:12,5:12,12:0|1:34261559_T_A:34261559:4,22,3,15
chr18	34261581	.	AG	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=64.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:9,6:7,12:0|1:34261559_T_A:34261559:2,17,0,18
chr18	34297753	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=91,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:1,14:8,3:5,4,11,6
chr18	34298323	.	CACCT	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.366:9:2,1:4,2:0|1:34298323_CACCT_C:34298323:1,5,3,0
chr18	34298333	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,11;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:2,0:0|1:34298323_CACCT_C:34298323:0,5,3,0
chr18	34298339	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:34298323_CACCT_C:34298323:0,5,3,0
chr18	34298342	.	CACCTTTCTGGGTTTGCCG	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:3,1:0|1:34298323_CACCT_C:34298323:0,8,3,0
chr18	34298366	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:0|1:34298323_CACCT_C:34298323:0,5,3,0
chr18	34298732	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr18	34324190	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,9:1,6:0,1,4,11
chr18	34398914	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=96,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:5,7,3,5
chr18	34424155	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=102,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.125:39:21,2:13,2:22,12,3,2
chr18	34465512	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:13,10:12,4:17,10,12,3
chr18	34465686	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:3,0:13,3:0,17,0,3
chr18	34647322	.	GT	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:3,1:2,9,2,3
chr18	34833903	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=142,139;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:7,0:3,4:1,10,0,4
chr18	34850980	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	34852895	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=359,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr18	34852931	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:7,7:0,0:7,0,7,0
chr18	35145660	.	T	TCTCG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CTCG;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr18	39617865	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr18	39629423	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,6:1,7:4,0,11,2
chr18	39629679	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=200,206;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:0,2:0,7,0,2
chr18	40323749	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr18	40503681	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.122:42:21,3:15,2:20,17,2,3
chr18	40503735	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=16,33,31;MFRL=124,188,196;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.90,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.298,0.362:9:0,1,2:0,2,1:0,3,1,5
chr18	40613840	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr18	40850383	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,172;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:14,0:15,6:16,13,1,5
chr18	42281739	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=109,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:7,3:2,7,1,2
chr18	42281768	.	GAGGAAGAAAGAAGCCACTCCAAAAAGAAGGT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.303:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr18	42456653	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:5,7:2,10:0|1:42456653_G_A:42456653:5,2,9,8
chr18	42456670	.	C	CTCTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=89.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,23:0.800:28:4,7:1,12:0|1:42456653_G_A:42456653:3,2,10,13
chr18	42532373	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,940;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:15,6:12,0:14,13,0,6
chr18	43221341	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr18	43243679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr18	43247784	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,11:0,0,18,10
chr18	43248212	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr18	43248504	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0|1:43248504_T_C:43248504:0,0,0,13
chr18	43248509	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.871:13:1,7:0,5:0|1:43248504_T_C:43248504:0,1,0,12
chr18	43252786	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	43253100	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr18	43262359	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,28:0.658:42:7,9:7,18:6,8,12,16
chr18	43262501	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:7,7:5,12:3,9,6,13
chr18	43262532	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,4:5,7:0,7,1,10
chr18	43307455	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr18	43310187	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	43311200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0|1:43311200_C_T:43311200:0,5,0,2
chr18	43311218	.	G	GAGAAGGTGCTTCCCCAAAGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43311200_C_T:43311200:0,4,0,1
chr18	43314401	.	G	GA,A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,20,24;MFRL=117,125,127;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.29,7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,16,6:0.689,0.170:25:1,1,5:2,8,0:0,3,4,18
chr18	43316607	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=88,164;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:6,13,3,0
chr18	43319274	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:9,2:4,6:7,7,3,5
chr18	43319359	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr18	43328325	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=123,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.109:35:16,2:16,1:15,17,1,2
chr18	43329899	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:43329899_G_T:43329899:8,9,1,1
chr18	43329904	.	AAGCC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=88,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:11,1:0|1:43329899_G_T:43329899:8,10,1,1
chr18	43405792	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,5,11
chr18	43435731	.	G	GCCAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=171,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43435731_G_GCCAAAAA:43435731:0,4,0,1
chr18	43435734	.	A	AAGTGAATTATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=171,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43435731_G_GCCAAAAA:43435731:0,4,0,1
chr18	43435738	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	43438836	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr18	43446734	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr18	43460002	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.254:41:13,10:18,0:15,16,10,0
chr18	43487885	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr18	43547050	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,5:7,4:14,1,9,0
chr18	43547127	.	TG	T	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=192.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,29:0,36:0,0,38,34
chr18	43565547	.	C	CCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43565547_C_CCTTT:43565547:0,1,0,1
chr18	43565549	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43565547_C_CCTTT:43565547:0,1,0,1
chr18	43666280	.	TAGTTAATATATTAATACCTTAAGA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.408:30:8,5:7,7:6,12,3,9
chr18	43666402	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=110,83;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:18,0:23,3:23,18,0,3
chr18	43666952	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.325:44:10,11:20,3:16,14,7,7
chr18	43667528	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,1:3,2:1,11,0,3
chr18	43669980	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:3,3:1,8,0,5
chr18	43703223	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.352:49:12,10:20,7:10,22,7,10
chr18	43705796	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=127,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.404:25:9,1:6,7:1,14,1,9
chr18	43820183	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:7,2:0,13,0,2
chr18	43833701	.	T	TCTG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTG;STR;TLOD=136.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,18:0,0,18,16
chr18	44063708	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:9,12,1,1
chr18	44063718	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=106,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:5,8,0,2
chr18	44098280	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=119,125;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr18	44098293	.	C	CTACACGACTGTAGTATTCTCCTCCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr18	44098301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=201,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44098301_G_T:44098301:0,1,0,1
chr18	44098306	.	A	ACACACGCACACG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=201,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44098301_G_T:44098301:0,1,0,1
chr18	44109115	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,3:7,5:10,5,5,3
chr18	44114473	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr18	44122806	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=88,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:16,4:6,0:7,15,4,0
chr18	44125484	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr18	44126909	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,9:1,7:1,0,9,7
chr18	44135027	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr18	44135050	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:2,6:0,4:1,1,6,4
chr18	44135143	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,12,10
chr18	44140009	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=125,188;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:44140009_A_C:44140009:0,2,1,0
chr18	44140011	.	T	TGCCCCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=125,188;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44140009_A_C:44140009:0,2,1,0
chr18	44140015	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=159,188;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:44140009_A_C:44140009:0,3,1,0
chr18	44140020	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=159,188;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:44140009_A_C:44140009:0,3,1,0
chr18	44143222	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=290,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:44143222_T_TGG:44143222:0,1,0,1
chr18	44143224	.	G	GCGCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=290,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:44143222_T_TGG:44143222:0,1,0,1
chr18	44171827	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr18	44172462	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:5,0:16,4:7,14,0,4
chr18	44262112	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	44266313	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=60.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.787:26:3,0:2,20:0,5,0,21
chr18	44272034	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr18	44392304	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=9,22,24;MFRL=132,186,194;MMQ=60,60,60;MPOS=5,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.16,5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.393,0.433:7:0,0,0:0,3,3:0,1,5,1
chr18	44407992	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,2:11,1:12,12,3,0
chr18	44424105	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.670:19:1,3:1,3:1,5,1,12
chr18	44424651	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=76,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.390:15:4,3:3,1:7,2,3,3
chr18	44426877	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr18	44435468	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:9,0:12,8,2,0
chr18	44555147	.	T	G	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,190;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,11:0.125:93:38,7:44,4:27,55,7,4
chr18	44559339	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:9,3,2,0
chr18	44560429	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,86;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:5,2:4,4:2,8,4,3
chr18	44580919	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr18	44595809	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=103,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,3,1
chr18	44601611	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,8:2,6:3,1,8,6
chr18	44635048	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr18	44635090	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:13,6,0,2
chr18	44639399	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:3,0:9,3:5,7,2,1
chr18	44702502	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=264,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:2,3:0,6:3,0,9,0
chr18	44702691	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=240,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.310:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr18	44702718	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=295,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:0,2,0,6
chr18	45371706	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,269;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:13,0:14,5:14,13,5,0
chr18	46197142	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,0:0|1:46197142_A_AG:46197142:0,11,2,0
chr18	46197147	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:46197142_A_AG:46197142:0,11,2,0
chr18	46197153	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:46197142_A_AG:46197142:0,9,2,0
chr18	46385948	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,7,19
chr18	46448115	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,6:6,5:4,4,5,6
chr18	46570614	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=200,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr18	46690141	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=123,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:8,0:23,4:11,20,0,4
chr18	47093790	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,14,10
chr18	47102002	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr18	47107863	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=111,235;MMQ=60,20;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:15,0:23,5:13,25,0,5
chr18	47108111	.	T	TCTGATACCCACTGAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	47313630	.	T	TAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=23,35;RU=A;STR;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,1:1,4:0,1,5,3
chr18	47313729	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.108:71:30,7:33,0:22,42,0,7
chr18	47317767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr18	47320850	.	AAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr18	47363009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=83,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr18	47369591	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=87,87;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:6,8:24,0:17,13,8,0
chr18	47373466	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.719:12:1,4:2,5:2,1,6,3
chr18	47375932	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,8:3,12:3,3,12,8
chr18	47376103	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr18	47376128	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	47398549	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=89,76;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,1:7,2:6,6,1,2
chr18	47401999	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,0:2,5:3,2,4,1
chr18	47402280	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr18	47405304	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.340:10:3,2:1,1:4,3,2,1
chr18	47405425	.	T	TGAG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.517:25:5,4:7,8:5,7,5,8
chr18	47405525	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:47405525_T_C:47405525:1,3,0,4
chr18	47405530	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,0:1,4:0|1:47405525_T_C:47405525:1,3,0,4
chr18	47406913	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr18	47455872	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:8,0:4,2:10,2,2,0
chr18	47456024	.	T	TTAGGCAGTAAGCACAATGCTAAATGCTGAGGCTACTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr18	47463587	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=80,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:2,6:4,7:3,3,9,4
chr18	47479745	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:9,2:4,0:3,10,0,3
chr18	47480660	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.659:36:5,12:6,12:10,2,16,8
chr18	47480898	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=471,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr18	47488625	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.777:16:0,6:3,6:2,1,9,4
chr18	47500728	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=106,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:10,18:16,0:16,10,18,0
chr18	47511247	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,0:4,4:1,5,0,4
chr18	47511277	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	47511288	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47511288_A_C:47511288:0,2,0,1
chr18	47511290	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47511288_A_C:47511288:0,2,0,1
chr18	47563299	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0|1:47563299_T_C:47563299:0,0,10,12
chr18	47563301	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:0|1:47563299_T_C:47563299:10,8,0,3
chr18	47765119	.	A	AGTAAACTAATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr18	47765121	.	G	C,GCATGGCTACGCTCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33,30;MFRL=0,155,171;MMQ=60,60,60;MPOS=15,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.53,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,2,1:0,2,0:0,0,0,5
chr18	47769551	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr18	47778172	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:1,3,2,5
chr18	47787402	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,10:0,15:0,0,20,6
chr18	47787620	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.518:8:2,0:1,0:0|1:47787620_G_C:47787620:3,1,0,4
chr18	47787622	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=106,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.518:8:2,1:1,2:0|1:47787620_G_C:47787620:3,1,0,4
chr18	47802200	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:22,4:18,0:22,18,4,0
chr18	47802346	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:6,0:12,2:0|1:47802346_C_T:47802346:5,14,1,1
chr18	47802354	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:47802346_C_T:47802346:5,14,1,1
chr18	47802355	.	C	CCCT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:13,2:0|1:47802346_C_T:47802346:5,14,1,1
chr18	47802971	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr18	47809581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=83,151;MMQ=60,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,6:4,0:6,2,6,0
chr18	47809871	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.656:39:8,7:5,17:6,7,7,19
chr18	47810251	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.391:39:5,5:18,9:15,9,8,7
chr18	47810731	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr18	47811038	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,149;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:9,7:9,0:15,3,7,0
chr18	47811305	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,2:4,8:0,5,4,6
chr18	47812700	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47812700_C_CT:47812700:0,0,0,1
chr18	47812702	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47812700_C_CT:47812700:0,0,0,1
chr18	47902337	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr18	47906416	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr18	47906719	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,1,1
chr18	47908556	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,15,23
chr18	47917735	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr18	47918639	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,4:7,3:5,9,1,6
chr18	48190271	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=230,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,6:0,2:3,0,7,1
chr18	48326352	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:5,1,3,0
chr18	48326378	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=84,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:3,3:9,2:6,7,3,2
chr18	48327815	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=80,100;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,1:9,5:13,6,5,1
chr18	48335773	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.235:28:10,3:9,3:7,15,3,3
chr18	48335806	.	C	CACACACACACACACACA	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:15,0:9,3:0|1:48335806_C_CACACACACACACACACA:48335806:4,20,0,3
chr18	48335811	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,0:9,3:0|1:48335806_C_CACACACACACACACACA:48335806:4,19,0,3
chr18	48335816	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:12,0:6,2:0|1:48335806_C_CACACACACACACACACA:48335806:1,18,0,3
chr18	48346363	.	AGA	TTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,2:4,0:4,16,0,2
chr18	48446953	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.290:36:14,3:11,7:6,20,7,3
chr18	48447002	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=142,136;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:21,7:7,0:17,11,8,0
chr18	48465831	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=203,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,5,0
chr18	48510837	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,59;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:15,4:14,20,0,4
chr18	48575184	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.101:57:37,2:14,3:26,26,4,1
chr18	48581245	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=106,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.215:40:19,8:12,0:16,16,7,1
chr18	50278654	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:11,2:19,1:19,12,3,0
chr18	50278686	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:4,6:12,6:11,5,7,5
chr18	50278817	.	A	ACATTCAGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=117,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50278817_A_ACATTCAGTC:50278817:0,2,0,1
chr18	50278819	.	A	ACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=117,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50278817_A_ACATTCAGTC:50278817:0,2,0,1
chr18	50450240	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=104,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:4,3:11,2:6,9,1,4
chr18	50451821	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr18	50589905	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr18	50731823	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	50731829	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr18	50831993	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=119,194;MMQ=60,21;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:11,8:16,0:19,9,8,0
chr18	50832102	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:4,6:7,10:2,9,5,11
chr18	50912352	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr18	50917982	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr18	50918311	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	50929276	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:9,5:0,4:2,7,2,7
chr18	50936780	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,9,3
chr18	50936994	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,5,15
chr18	50937026	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr18	50942653	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	50994208	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr18	51053176	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=69,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:2,6,0,3
chr18	51056861	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr18	51057092	.	C	CCAGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr18	51686057	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=213,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr18	51795957	.	GCGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CGA;STR;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,4:0,0,2,10
chr18	51797948	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	51804259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=178,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr18	51807260	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:8,5:4,5:2,10,1,9
chr18	51809122	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr18	51819989	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	51880586	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.616:15:1,4:5,5:0|1:51880586_AT_A:51880586:0,6,0,9
chr18	51880587	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,11:0.930:11:0,3:0,8:1|0:51880586_AT_A:51880586:0,0,0,11
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chr18	51904461	.	C	CTTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=226,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTA;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,2:1,0,6,0
chr18	51904641	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:51904641_A_G:51904641:0,0,4,12
chr18	51904644	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:51904641_A_G:51904641:0,0,4,12
chr18	52555398	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,1,15
chr18	52571741	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr18	52585071	.	GACACACACAC	G,GAC,GACACACACACAC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,23,32,33;MFRL=0,126,130,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,20,4;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,11,16;RU=AC;STR;TLOD=4.77,7.82,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,4,3:0.132,0.246,0.524:9:0,0,2,1:0,1,2,2:0,0,6,3
chr18	52586691	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr18	52608329	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,10,17
chr18	52895418	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:2,5:6,1,8,0
chr18	52896000	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=277,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:52896000_A_G:52896000:1,0,5,0
chr18	52896003	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=277,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:52896000_A_G:52896000:1,0,5,0
chr18	52922000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr18	52924695	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr18	52942827	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr18	53070835	.	C	CACTCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr18	53131202	.	TGTGTGTGA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=109,118;MMQ=58,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.210:19:7,0:4,2:13,2,4,0
chr18	53131488	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=224,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr18	53252455	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=95,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,12:0.236:53:12,12:29,0:21,20,12,0
chr18	54283362	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr18	54339977	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	54346482	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	54346510	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr18	54346745	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr18	54348514	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,11:0,0,20,7
chr18	54348650	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,7:0,0,7,11
chr18	54354024	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=186,152;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:54354024_T_A:54354024:9,1,2,0
chr18	54354026	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=186,152;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:54354024_T_A:54354024:9,1,2,0
chr18	54354074	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0|1:54354074_C_T:54354074:0,0,8,1
chr18	54354076	.	T	TTC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0|1:54354074_C_T:54354074:0,0,9,1
chr18	54354239	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr18	54359062	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr18	54362139	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr18	54362432	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=168,177;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,0:6,9:0,8,0,9
chr18	54363747	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr18	54398817	.	G	GCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:54398817_G_GCC:54398817:2,7,1,1
chr18	54398819	.	A	ACTGGGTCTGCTGTTGCTGTTTC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:54398817_G_GCC:54398817:2,7,1,1
chr18	54694151	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr18	54694452	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.882:23:1,11:1,10:0,2,4,17
chr18	55027212	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=92,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,5:5,4:5,3,6,3
chr18	55027526	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr18	55102991	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=88,68;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.206:45:15,0:21,8:17,19,1,8
chr18	55103068	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55103068_T_C:55103068:1,0,0,1
chr18	55103074	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55103068_T_C:55103068:1,0,0,1
chr18	55103476	.	GCAC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAC;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr18	55104025	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:0|1:55104025_G_A:55104025:8,14,1,1
chr18	55104028	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:0|1:55104025_G_A:55104025:8,14,1,1
chr18	55143589	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	55218122	.	T	TAGTGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,11;MFRL=170,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0,4,0,1
chr18	55218656	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr18	55221716	.	CCT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr18	55240455	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,12:0,2:1,0,10,4
chr18	55240505	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,5:7,0:5,5,2,3
chr18	55253756	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55253756_C_T:55253756:0,0,1,0
chr18	55253765	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55253756_C_T:55253756:0,0,1,0
chr18	55280764	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,6:2,4:6,1,9,1
chr18	55283236	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,7,24
chr18	55283306	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr18	55287739	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,14,6
chr18	55288879	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr18	55289076	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr18	55315959	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:15,4:9,3:11,13,0,7
chr18	55317591	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.338:30:11,2:9,7:13,7,5,5
chr18	55317824	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=168,157;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:9,0:3,2:0|1:55317824_T_C:55317824:1,12,0,2
chr18	55317826	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=168,157;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:9,0:3,2:0|1:55317824_T_C:55317824:1,12,0,2
chr18	55319329	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=110,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:17,0:39,2:0|1:55319329_T_A:55319329:28,28,1,1
chr18	55319331	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=110,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:17,0:39,2:0|1:55319329_T_A:55319329:28,28,1,1
chr18	55319341	.	G	GACATTTTCAGA	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=103,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:14,0:40,2:0|1:55319329_T_A:55319329:26,30,1,1
chr18	55319452	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=153,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55319452_C_CT:55319452:0,4,0,1
chr18	55319458	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=153,255;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55319452_C_CT:55319452:0,4,0,1
chr18	55319460	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=153,255;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55319452_C_CT:55319452:0,4,0,1
chr18	55319484	.	A	ATACATCTACCTTATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=281,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319484_A_ATACATCTACCTTATG:55319484:0,1,0,1
chr18	55319486	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,35;MFRL=281,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319484_A_ATACATCTACCTTATG:55319484:0,1,0,1
chr18	55322409	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=145,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:15,0,4,0
chr18	55328649	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.146:46:21,0:19,6:14,26,0,6
chr18	55338656	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:5,2,7,2
chr18	55352436	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	55352437	.	T	TGGGGCCAATTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=195,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr18	55352470	.	TTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	55359163	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.111:43:21,0:17,4:0|1:55359163_C_T:55359163:18,21,0,4
chr18	55359166	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:20,0:17,4:0|1:55359163_C_T:55359163:18,20,0,4
chr18	55362816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,0,17
chr18	55364830	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,13:0,15:0,0,21,10
chr18	55364852	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,20:0,17:0,0,18,20
chr18	55365047	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=76,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=107.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,41:0.645:64:6,22:17,19:10,13,23,18
chr18	55371806	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:10,5:19,0:15,14,5,0
chr18	55983330	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr18	55989734	.	ATGGG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=98,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGGG;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,2:6,0:0|1:55989734_ATGGG_A:55989734:13,2,1,1
chr18	55989740	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=98,71;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:4,0:0|1:55989734_ATGGG_A:55989734:13,2,1,1
chr18	56008394	.	TC	GA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:5,14,1,1
chr18	56008405	.	C	CTCTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:0|1:56008405_C_CTCTGT:56008405:3,12,1,1
chr18	56008407	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:8,1:0|1:56008405_C_CTCTGT:56008405:3,12,1,1
chr18	56024396	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,140,75;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=T;STR;TLOD=9.78,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.640,0.277:8:0,5,2:0,1,0:0,0,8,0
chr18	56033540	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	56052649	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr18	56057826	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr18	56148983	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:15,2,3,0
chr18	56149048	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=187,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.953:40:0,15:1,22:0,1,26,13
chr18	56149099	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,19:0,25:0,0,20,24
chr18	56165164	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr18	56165217	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:17,3:17,0:23,11,3,0
chr18	56182174	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,16,11
chr18	56184187	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=149,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:12,0:16,6:0|1:56184187_T_A:56184187:18,11,0,6
chr18	56184193	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,229;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:10,0:16,6:0|1:56184187_T_A:56184187:18,10,0,6
chr18	56202059	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr18	56203325	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:4,2:6,6,0,2
chr18	56204007	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:10,5:23,0:13,20,4,1
chr18	56246125	.	GT	TA	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:24,0:24,3:0|1:56246125_GT_TA:56246125:25,28,0,3
chr18	56246128	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.068:57:22,0:28,3:0|1:56246125_GT_TA:56246125:25,29,0,3
chr18	56246136	.	T	TTTCAGC	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:23,0:21,3:0|1:56246125_GT_TA:56246125:19,26,0,3
chr18	56383280	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr18	56585880	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=96,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:14,6:14,1:11,17,7,1
chr18	56586119	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,0:15,2:0|1:56586119_T_G:56586119:9,14,1,1
chr18	56586127	.	GA	AC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:56586119_T_G:56586119:7,13,1,1
chr18	56586766	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,0:21,2:0|1:56586766_T_A:56586766:15,20,1,1
chr18	56586771	.	T	TC	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=111,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.078:37:15,0:18,2:0|1:56586766_T_A:56586766:15,20,1,1
chr18	56586776	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:11,0:16,2:0|1:56586766_T_A:56586766:13,18,1,1
chr18	56615378	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,126;MMQ=52,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:19,3:16,0:14,21,2,1
chr18	56651713	.	T	TAGTA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,68;MMQ=50,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:4,0:16,4:4,16,2,2
chr18	56807308	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:18,2:14,3:9,23,1,4
chr18	56823071	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.419:10:3,1:2,3:1,5,1,3
chr18	56963916	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=67,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:2,1:4,0:0|1:56963916_A_C:56963916:1,6,3,0
chr18	56963921	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,8;MFRL=67,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.245:14:5,0:6,0:0|1:56963916_A_C:56963916:3,8,3,0
chr18	56963925	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=74,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,1:5,1:2,8,4,0
chr18	56964178	.	G	GGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.254:6:4,1:1,0:0|1:56964178_G_GGA:56964178:1,4,0,1
chr18	56964185	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:56964178_G_GGA:56964178:0,4,0,1
chr18	56964187	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:56964178_G_GGA:56964178:0,4,0,1
chr18	57000303	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=128,4626;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,0:0,2:1,1,2,0
chr18	57000518	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,0:6,3:0,10,0,4
chr18	57014812	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=138,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.386:23:8,6:6,3:3,11,3,6
chr18	57026573	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr18	57115133	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr18	57134152	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr18	57136869	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr18	57147351	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:7,4,3,1
chr18	57147390	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:7,4:9,5:11,6,5,4
chr18	57567451	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:8,1:3,8,0,2
chr18	59157685	.	ATAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=206,376;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:59157685_ATAAG_A:59157685:3,0,2,0
chr18	59157693	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=206,376;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:59157685_ATAAG_A:59157685:3,0,2,0
chr18	59157764	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr18	59158065	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr18	59166541	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,10,7
chr18	59166762	.	T	TACAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=68,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=AC;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.714:9:0,3:2,4:1,1,3,4
chr18	59170293	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=89,186;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:13,0:23,3:21,16,0,3
chr18	59170304	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,12:0,24:0,0,17,19
chr18	59174817	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:1,7,0,4
chr18	59203707	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr18	59206197	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=72,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.944:17:0,10:1,6:1,0,13,3
chr18	59217504	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:9,5:6,2:5,11,1,6
chr18	59221349	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:12,0,2,0
chr18	59483281	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:2,5,3,3
chr18	59739962	.	TA	T,TAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=25,28,24;MFRL=116,146,126;MMQ=60,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.92,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,5,6:0.115,0.160:35:10,2,2:11,3,4:5,19,3,8
chr18	59741925	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:10,3,3,0
chr18	59751715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:1,1:11,2:11,1,3,0
chr18	59756073	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,3:5,0:2,10,1,2
chr18	59763122	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.193:55:22,10:23,0:26,19,10,0
chr18	59763276	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,180;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:11,0:0,17,0,2
chr18	59777011	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:10,1,3,1
chr18	59806190	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:8,1:7,4:14,1,5,1
chr18	59807533	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=169,141;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:59807533_A_G:59807533:2,0,1,0
chr18	59807535	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=169,141;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:59807533_A_G:59807533:2,0,1,0
chr18	59807538	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=169,141;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr18	59807635	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.352:46:17,9:12,6:12,18,6,10
chr18	59828530	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:22,1:13,2:19,16,2,1
chr18	59888386	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:10,7:11,0:8,13,7,0
chr18	59888588	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:14,7:14,8:13,15,9,7
chr18	59895014	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr18	59922728	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:4,17,1,1
chr18	59925938	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr18	59941254	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=100,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:16,2:9,2:13,12,2,2
chr18	59947988	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:6,3:4,3:3,7,0,6
chr18	59948024	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr18	59954765	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:0,8,0,5
chr18	59958803	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:21,0:11,5:22,10,0,5
chr18	60027149	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=98,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,4,1
chr18	60027171	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:0,5:2,2:2,1,5,2
chr18	60027361	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr18	60191428	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr18	60209709	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:10,7:5,10:5,10,11,6
chr18	60227764	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:12,4,1,2
chr18	60230191	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=160,98;MMQ=43,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,3:2,8:8,0,8,3
chr18	60232383	.	ATACT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TACT;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:0,1:5,3:0,5,0,4
chr18	60232405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr18	60241197	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,5:2,4:5,0,9,0
chr18	60243764	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:25,3:11,0:14,22,2,1
chr18	60382816	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr18	60384109	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:60384109_GC_G:60384109:0,0,0,1
chr18	60384112	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:60384109_GC_G:60384109:0,0,0,1
chr18	60497522	.	CA	GG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,2:3,0:0|1:60497522_CA_GG:60497522:1,14,0,2
chr18	60497525	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,1:3,0:0|1:60497522_CA_GG:60497522:1,16,0,2
chr18	60572437	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,13:0,4:1,0,12,5
chr18	60582215	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=98,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:13,3:18,0:9,22,3,0
chr18	60612350	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:3,3:2,0:5,0,2,2
chr18	60639910	.	TACA	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=122,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.108:42:18,4:17,0:0|1:60639910_TACA_T:60639910:16,22,2,2
chr18	60639914	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=122,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.108:42:18,4:16,0:0|1:60639910_TACA_T:60639910:16,22,2,2
chr18	61034175	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr18	61034420	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr18	61060873	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,2:4,3:1,6,1,4
chr18	61066463	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,2:11,8:14,4,6,4
chr18	61067200	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=194,117;MMQ=49,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:9,0,2,0
chr18	61067959	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,6:4,2:0,8,2,6
chr18	61154388	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr18	61160372	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=87,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:0|1:61160372_A_C:61160372:5,6,0,2
chr18	61160374	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=87,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:61160372_A_C:61160372:5,6,0,2
chr18	61160385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr18	61160396	.	T	TTTGATGAAGGAGGAATACAGGAAGCAGAAAAGGAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr18	61166256	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=145,166;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr18	61166267	.	TGCGC	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=138,143;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=GC;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.564:13:3,6:3,1:6,0,7,0
chr18	61166269	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,17,0
chr18	61166273	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=139,136;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:6,2:1,2:7,1,4,0
chr18	61166280	.	G	GTATATA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,116;MMQ=43,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=TA;STR;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:10,2:4,1:13,2,5,1
chr18	61166282	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=124,135;MMQ=55,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.581:20:2,10:4,2:7,1,10,2
chr18	61170721	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,14:0,9:1,0,10,13
chr18	61223377	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,1:9,2:14,6,3,0
chr18	61223456	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=104,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.207:51:20,10:21,0:17,24,10,0
chr18	61223570	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,0:10,2:10,15,2,0
chr18	61225801	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	61226740	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr18	61228248	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr18	61231142	.	AAAAAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,125;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,7:1,2:1,0,9,0
chr18	61231417	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr18	61232914	.	TATCTACC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr18	61234039	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,6:1,12:2,1,12,7
chr18	61254525	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=229,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:0,3:1,0,5,0
chr18	61261515	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:61261515_T_C:61261515:0,0,4,0
chr18	61261540	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:61261515_T_C:61261515:0,0,11,0
chr18	61261565	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0|1:61261515_T_C:61261515:0,0,14,3
chr18	61261796	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=66,132;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:61261796_T_C:61261796:0,2,0,1
chr18	61261802	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=132,132;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:61261796_T_C:61261796:0,1,0,1
chr18	61261810	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=194,132;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61261796_T_C:61261796:0,1,0,1
chr18	61261813	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=194,132;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61261796_T_C:61261796:0,1,0,1
chr18	61264444	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:61264444_A_C:61264444:10,9,1,1
chr18	61264453	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:61264444_A_C:61264444:12,9,1,1
chr18	61271065	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr18	61271161	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=104,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,1:14,1:9,12,0,2
chr18	61308895	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr18	61324033	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr18	61324272	.	A	ACAGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:61324272_A_ACAGGG:61324272:0,2,0,1
chr18	61324274	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:61324272_A_ACAGGG:61324272:0,2,0,1
chr18	61324276	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:61324272_A_ACAGGG:61324272:0,3,0,1
chr18	61324278	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:61324272_A_ACAGGG:61324272:0,3,0,1
chr18	61326597	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,1:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,6,3
chr18	61326602	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,8,3
chr18	61326609	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,8,4
chr18	61326628	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=73.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,12,9
chr18	61377673	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61377673_A_C:61377673:0,0,0,1
chr18	61377676	.	T	TCAAGATGGCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61377673_A_C:61377673:0,0,0,1
chr18	61388269	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr18	61390509	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:14,9:19,0:21,12,9,0
chr18	61465746	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr18	61465810	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=95,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,7:2,2:6,1,8,1
chr18	61465822	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=73,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.480:17:7,7:2,1:6,3,6,2
chr18	61468306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr18	61569605	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=207,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr18	61570455	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=109,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:20,4:27,0:26,21,4,0
chr18	61575120	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:10,7:3,4:9,4,10,1
chr18	61575166	.	AT	A,ATT	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,28,29;MFRL=153,167,89;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.62,18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,16:0.177,0.553:28:3,4,12:3,1,3:5,2,15,6
chr18	61597330	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=22,0;MFRL=120,28;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,0:15,0:0|1:61597330_T_A:61597330:14,12,0,2
chr18	61597331	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,0;MFRL=120,28;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,0:15,0:0|1:61597330_T_A:61597330:14,12,0,2
chr18	61597332	.	A	AC	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=120,28;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,2:15,0:0|1:61597330_T_A:61597330:13,11,0,2
chr18	61597335	.	C	CTAA	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=124,28;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:15,0:0|1:61597330_T_A:61597330:12,10,0,2
chr18	61597340	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,19;MFRL=119,28;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,1:15,0:0|1:61597330_T_A:61597330:13,10,0,2
chr18	61600500	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:61600500_T_C:61600500:0,4,0,1
chr18	61600508	.	G	GTTACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:61600500_T_C:61600500:0,3,0,1
chr18	61600509	.	G	GAAGTTTTTAATTAATA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:61600500_T_C:61600500:0,3,0,1
chr18	63430018	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	63477317	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr18	63491778	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr18	63511213	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,76;MMQ=60,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:5,0:10,6:7,8,1,5
chr18	63530116	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:11,0:9,11,3,0
chr18	64235979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=307,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr18	65178503	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65178503_T_A:65178503:0,0,0,1
chr18	65178504	.	ATTTATTCTC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65178503_T_A:65178503:0,0,0,1
chr18	65178515	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65178503_T_A:65178503:0,0,0,1
chr18	66358514	.	TAA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:10,3:7,7:15,5,8,2
chr18	66364396	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr18	66365129	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:2,2:3,2,3,2
chr18	66367607	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,8:2,3:5,2,9,2
chr18	66367726	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.440:22:5,1:6,8:1,11,2,8
chr18	66381152	.	C	CGATG	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:25,3:22,0:0|1:66381152_C_CGATG:66381152:12,39,0,3
chr18	66381157	.	TG	CT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:15,3:21,0:0|1:66381152_C_CGATG:66381152:9,38,0,3
chr18	66504640	.	T	TGCAG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:66504640_T_TGCAG:66504640:0,2,0,1
chr18	66504645	.	GTCATATATA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:66504640_T_TGCAG:66504640:0,2,0,1
chr18	66504655	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66504640_T_TGCAG:66504640:0,1,0,1
chr18	66513471	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr18	66513662	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.528:38:11,15:6,5:7,11,6,14
chr18	66513749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr18	66678131	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr18	66721337	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:66721337_ACT_A:66721337:1,2,0,1
chr18	66721340	.	T	TATCGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:66721337_ACT_A:66721337:1,2,0,1
chr18	66721345	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:66721337_ACT_A:66721337:1,3,0,1
chr18	66721346	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:66721337_ACT_A:66721337:2,2,0,1
chr18	66721350	.	A	AAATGAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,23;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:66721337_ACT_A:66721337:2,2,0,1
chr18	67068605	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,0:0,0,1,8
chr18	67345034	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,8,17
chr18	67365698	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:2,0:0|1:67365698_AAT_A:67365698:2,1,0,1
chr18	67365701	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,1:3,0:0|1:67365698_AAT_A:67365698:2,1,0,1
chr18	67365904	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=124,124;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr18	67365926	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	67563348	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	67613926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr18	67613944	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr18	67613998	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:14,8,1,1
chr18	67614674	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=67,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.925:11:1,4:0,6:1,0,1,9
chr18	67685007	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	67727003	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr18	67733234	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	67733247	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr18	67741117	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr18	67741309	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr18	67742801	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,16:0,0,5,18
chr18	67759549	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr18	67809647	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=66,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.925:15:1,5:0,8:1,0,2,12
chr18	67812773	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr18	67816265	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:12,1:14,3:12,15,1,3
chr18	67817744	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr18	67818046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr18	67818066	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr18	67836350	.	A	AGAGTTTTGGCTCTGTTTTTTAGGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=154,293;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr18	67860719	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	67863850	.	T	TCTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=84.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,7:0,14:0,0,9,12
chr18	67866822	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:67866822_TAA_T:67866822:0,4,0,1
chr18	67866826	.	A	AAATGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1|0:67866822_TAA_T:67866822:0,4,0,1
chr18	67866828	.	A	AAAGAGTTTGAATGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:67866822_TAA_T:67866822:0,4,0,1
chr18	67871343	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,25,20
chr18	67993104	.	C	CAA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,39;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:28,2:32,0:0|1:67993104_C_CAA:67993104:48,13,1,1
chr18	67993105	.	G	GTGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCC	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=118,39;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:27,2:33,0:0|1:67993104_C_CAA:67993104:48,13,1,1
chr18	67993703	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=102,150;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.211:50:19,0:20,10:15,25,0,10
chr18	70205405	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:13,0:8,2:0|1:70205405_C_T:70205405:10,11,1,1
chr18	70205412	.	T	TATGACTGCATA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:0|1:70205405_C_T:70205405:10,10,1,1
chr18	70209321	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	70416367	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,2:0,4:0,5,0,6
chr18	70423192	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr18	70461460	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=98,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.103:45:15,0:25,4:21,20,2,2
chr18	70502639	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:70502639_G_C:70502639:0,3,0,1
chr18	70502644	.	G	GAGTAACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:70502639_G_C:70502639:0,3,0,1
chr18	70502645	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=236,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1|0:70502639_G_C:70502639:0,2,0,2
chr18	70532185	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:2,4,3,2
chr18	71749154	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.345:23:9,6:6,2:7,8,5,3
chr18	71796889	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:2,3:0,4,0,3
chr18	71807614	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=193,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:0,6,0,3
chr18	71815063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr18	71822321	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:0,4:5,3:4,2,7,0
chr18	71825718	.	T	TAATCA	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=21,24;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:12,2:17,5:0|1:71825718_T_TAATCA:71825718:16,15,3,5
chr18	71825719	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=93,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.749:38:3,12:5,16:3,6,14,15
chr18	71825720	.	G	GCAAGCA	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,9:0.238:40:13,3:18,5:0|1:71825718_T_TAATCA:71825718:16,15,3,6
chr18	71920966	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr18	71930734	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.243:30:8,1:14,5:4,19,1,6
chr18	71930758	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:2,0:7,5:1,8,1,4
chr18	72109428	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr18	72167124	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.704:15:1,2:3,8:2,2,8,3
chr18	72168486	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=246,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:2,0,5,0
chr18	72168608	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,63:0.721:87:14,37:10,25:14,10,32,31
chr18	72173270	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:0|1:72173270_GC_G:72173270:0,3,0,7
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chr18	72177949	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr18	72178300	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=253,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr18	72179579	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr18	72180739	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr18	72183695	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	72185972	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr18	72186117	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr18	72186175	.	T	TC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.973:36:0,22:0,12:0,0,16,20
chr18	72186404	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr18	72223634	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:14,0:0|1:72223634_C_T:72223634:10,15,2,0
chr18	72223654	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:0|1:72223634_C_T:72223634:7,19,2,0
chr18	72226539	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=91,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:6,8,3,1
chr18	72226578	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.706:21:3,5:2,10:5,1,7,8
chr18	72228065	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:10,8:8,0:8,10,7,1
chr18	72228124	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,11,10
chr18	72228319	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr18	72234434	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:13,11:11,0:17,7,11,0
chr18	72247278	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr18	72250762	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr18	72342875	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	72343181	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,5:5,10:9,3,8,7
chr18	72344223	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:14,10:5,6:9,10,7,9
chr18	72344669	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=88,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,1:11,2:8,19,2,1
chr18	72345260	.	CT	GG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=123,251;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,0:5,12,2,0
chr18	72493314	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,0:5,4:11,0,4,0
chr18	72515839	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr18	72593118	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr18	72913524	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:2,9:0,6:0,2,7,9
chr18	72997734	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.213:26:11,0:10,5:0|1:72997734_C_T:72997734:11,10,0,5
chr18	72997740	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=131,27239835;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.102:27:9,2:16,0:1|0:72997734_C_T:72997734:12,13,0,2
chr18	73001026	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,1:3,1:7,4,2,0
chr18	73130653	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.678:11:5,2:0,3:5,0,5,1
chr18	73130705	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:3,1:2,4:5,0,3,2
chr18	74082584	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:2,4,1,6
chr18	74082655	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	74090957	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,1,5
chr18	74153540	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,0,2
chr18	74154488	.	G	GTTAATCAATACCTTTCCTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=214,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr18	74591992	.	G	GT,GTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=179,186,172;MMQ=60,60,60;MPOS=12,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=11.55,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,3:0.473,0.256:14:1,3,1:3,3,2:5,0,9,0
chr18	74616278	.	TTTAA	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:74616278_TTTAA_T:74616278:9,3,1,1
chr18	74616286	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:74616278_TTTAA_T:74616278:10,3,1,1
chr18	74616287	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:74616278_TTTAA_T:74616278:10,3,1,1
chr18	74616290	.	A	AGTC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:74616278_TTTAA_T:74616278:10,3,1,1
chr18	74622529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	74622783	.	GG	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr18	74625800	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.131:35:12,4:19,0:17,14,1,3
chr18	74627577	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,18,13
chr18	74631861	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:12,4:24,0:16,21,2,2
chr18	74632037	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:6,13,0,2
chr18	74637067	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr18	74637226	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=100,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:12,1:21,2:18,15,2,1
chr18	74639116	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:74639116_G_C:74639116:6,10,1,1
chr18	74639118	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:74639116_G_C:74639116:6,10,1,1
chr18	74639122	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=166,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:74639116_G_C:74639116:6,10,1,1
chr18	74671768	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,11,12
chr18	74680114	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	74680369	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	74692334	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=99,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:11,3:13,0:14,10,1,2
chr18	74700177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr18	74702113	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=14,25;MFRL=213,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.735:5:0,1:0,2:0,1,1,3
chr18	74962645	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,8:2,2:5,1,6,4
chr18	74962657	.	C	CAACTAAGGTGAGATCAAGGTGAGTTTCAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,53;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:11,5,1,1
chr18	74980809	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr18	76753098	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:4,1,2,0
chr18	76753491	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,3,0
chr18	76753588	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr18	76754466	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr18	76754480	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:7,0:1,12,0,2
chr18	76914659	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr18	77063794	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=234,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr18	77107934	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr18	77108248	.	GAAAA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,3:0,3:0|1:77108248_GAAAA_G:77108248:0,0,3,8
chr18	77108253	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,2:0|1:77108248_GAAAA_G:77108248:0,0,3,8
chr18	77137202	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,0:0,10:0,0,6,4
chr18	77156174	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:2,0:11,4:0|1:77156174_G_A:77156174:13,0,4,1
chr18	77156197	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.354:29:4,4:14,6:0|1:77156174_G_A:77156174:16,3,8,2
chr18	77156449	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	77171061	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:3,8:8,6:6,5,9,5
chr18	77209015	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,1:2,1:0,9,1,1
chr18	77210902	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr18	77210953	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:20,2:7,1:19,8,1,2
chr18	77211175	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=229,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:0|1:77211175_T_C:77211175:1,4,0,6
chr18	77211195	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0|1:77211175_T_C:77211175:0,0,0,8
chr18	77211908	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:1,7,0,3
chr18	77221207	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.660:10:3,4:0,1:3,0,7,0
chr18	77221264	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:6,1:3,2:0|1:77221264_C_T:77221264:5,4,3,3
chr18	77221278	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.606:21:5,8:2,4:0|1:77221264_C_T:77221264:4,4,5,8
chr18	77221420	.	C	CTGGGGTCTGCTGGAGCCACTGCGGGTCCCTAGAGCCTGGGAGGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.640:11:2,1:4,2:1,5,1,4
chr18	77246406	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,6:3,8:1,3,2,12
chr18	77246978	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr18	77456172	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr18	77458037	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=250,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:2,7:8,3:1,10,3,7
chr18	77464669	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr18	77489169	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr18	77513841	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=219,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr18	77659444	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,2:4,0:5,1,1,1
chr18	77663896	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr18	77694128	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=249,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	77726544	.	GA	G,GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30,31;MFRL=136,199,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.76,7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,5:0.325,0.328:15:2,0,0:2,3,3:4,1,6,4
chr18	77728045	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr18	77730585	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
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chr19	327998	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,2,3
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chr19	362205	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:13,2:4,0:0|1:362203_G_A:362203:12,5,1,1
chr19	362455	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=118,302;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:4,9,4,0
chr19	367313	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	372551	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	373640	.	C	CTGTACGTGTGTGTTCGTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:373640_C_CTGTACGTGTGTGTTCGTCA:373640:0,1,0,1
chr19	373645	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:373640_C_CTGTACGTGTGTGTTCGTCA:373640:0,1,0,1
chr19	374453	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:3,5,2,2
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chr19	422496	.	A	AGGTGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,1:1,0:0|1:422495_C_CTGGG:422495:1,1,0,1
chr19	422534	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:422534_G_A:422534:0,0,1,4
chr19	422543	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:422534_G_A:422534:0,0,1,4
chr19	422555	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr19	439055	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr19	460475	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	463810	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	464230	.	TAGGGGCAGGGGCTGAGGTGTCC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,2:8,0:14,7,1,1
chr19	536437	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr19	547224	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr19	547427	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:547427_T_C:547427:0,2,1,1
chr19	547431	.	C	CTATTTACTTATTTTAAGAAAGGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:547427_T_C:547427:0,2,1,1
chr19	547491	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr19	549595	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	579450	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:0,2:4,3:5,0,5,0
chr19	579699	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr19	579713	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr19	580388	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:7,6,4,1
chr19	580575	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:2,2,7,1
chr19	581253	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=191,138;MMQ=33,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,2:0,3:1,0,5,0
chr19	582253	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr19	582468	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,2:2,1:6,3,3,0
chr19	604988	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=194,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr19	608196	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:0,6,1,2
chr19	618538	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=108,135;MMQ=58,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.128:38:12,4:20,0:18,16,4,0
chr19	618551	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:16,4:17,0:19,14,4,0
chr19	630164	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=236,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr19	652206	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	652238	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,3:1,1:4,1,1,3
chr19	652739	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:6,0,5,0
chr19	652948	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr19	685985	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	731055	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:11,9:14,3:12,13,6,6
chr19	731077	.	GG	CT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.310:43:15,8:15,4:9,21,7,6
chr19	734251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:734251_G_A:734251:1,3,0,1
chr19	734257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=66,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:734251_G_A:734251:1,2,0,1
chr19	740443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=84,68;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:4,5,0,3
chr19	740560	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	758422	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr19	758471	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr19	758636	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:9,0:0|1:758636_G_A:758636:10,11,1,1
chr19	758641	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:0|1:758636_G_A:758636:11,12,1,1
chr19	759864	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr19	805534	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:5,3:14,0:10,9,1,2
chr19	808489	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,0,1
chr19	813072	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	813395	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=223,47;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr19	815899	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:815899_G_T:815899:0,6,1,1
chr19	815903	.	C	CTCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:815899_G_T:815899:0,6,1,1
chr19	815905	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:815899_G_T:815899:0,6,1,1
chr19	828411	.	T	TCCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr19	830768	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=52,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:1,1,1,1
chr19	847944	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,3:3,6:1,2,2,7
chr19	853483	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,11;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr19	859831	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	860852	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	868544	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,0:4,2:0|1:868544_C_T:868544:0,4,1,1
chr19	868551	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0|1:868544_C_T:868544:0,2,1,2
chr19	868556	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,1:0|1:868544_C_T:868544:0,3,1,1
chr19	868560	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:868544_C_T:868544:0,3,0,1
chr19	868563	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:868544_C_T:868544:0,3,0,1
chr19	870946	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=76,183;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:2,1,3,0
chr19	871135	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,3:3,3:2,4,2,4
chr19	871987	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:13,3:5,8:10,8,7,4
chr19	885818	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:3,1,4,1
chr19	890195	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:11,0:0|1:890195_C_T:890195:16,8,1,1
chr19	890210	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:11,0:0|1:890195_C_T:890195:17,9,1,1
chr19	897571	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:9,5:8,10:5,12,8,7
chr19	899567	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:3,3,5,3
chr19	900789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=83,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	901955	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:0,6:4,2:3,2,8,0
chr19	913043	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:913043_A_C:913043:0,0,1,0
chr19	913048	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:913043_A_C:913043:0,0,1,0
chr19	913053	.	CGGCG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:913043_A_C:913043:0,0,1,0
chr19	917526	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr19	919586	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:2,3,0,5
chr19	960187	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr19	960266	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	964395	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=97,43;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,1:13,3:10,14,3,1
chr19	964414	.	C	CAGCGGACGTCCCAGGCCAAATG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:11,3:8,14,2,1
chr19	964434	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,3:4,1:1,6,2,2
chr19	968318	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=176,177;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr19	968345	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=162,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,3:1,11:1,0,15,2
chr19	968358	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.208:23:6,2:10,1:12,7,3,1
chr19	984554	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,233;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:984554_C_G:984554:0,7,0,3
chr19	984578	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=214,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:1,0:1,2:0|1:984554_C_G:984554:0,4,0,2
chr19	985815	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:0,3:4,2:2,2,5,1
chr19	985997	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,3:8,2:2,8,1,4
chr19	990394	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	990819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr19	991196	.	CGT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,11,8
chr19	991199	.	CCCAGG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,11,8
chr19	991892	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	1003205	.	CG	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=173,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:1003205_CG_TC:1003205:1,6,1,1
chr19	1003208	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=173,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:1003205_CG_TC:1003205:1,6,1,1
chr19	1008358	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	1008683	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr19	1008801	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1008801_C_G:1008801:0,0,1,0
chr19	1008805	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1008801_C_G:1008801:0,0,1,0
chr19	1008807	.	G	GGGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1008801_C_G:1008801:0,0,1,0
chr19	1008812	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:1008801_C_G:1008801:1,0,1,0
chr19	1008879	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=111,189;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,6:9,4:11,7,6,4
chr19	1008896	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=100,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:7,0:11,9,2,1
chr19	1010973	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr19	1011823	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,8,13
chr19	1011846	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=201,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:2,3,1,9
chr19	1011856	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:6,1:4,2:1,9,2,2
chr19	1011999	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,2:0|1:1011999_A_G:1011999:1,3,4,3
chr19	1012002	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:0|1:1011999_A_G:1011999:1,3,5,3
chr19	1012611	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,5:3,5:1,3,1,9
chr19	1020673	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr19	1031212	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,8:2,6:0,2,2,12
chr19	1032369	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=86.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,18,13
chr19	1032778	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	1036314	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=235,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,3:1,6:2,3,3,6
chr19	1036456	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=155,87;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,17:0.585:29:3,9:8,7:0|1:1036456_C_G:1036456:10,2,8,9
chr19	1036468	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,19:0.588:32:4,12:9,7:0|1:1036456_C_G:1036456:7,6,10,9
chr19	1036552	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0|1:1036552_T_C:1036552:0,0,7,18
chr19	1036575	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:3,2:8,3:0|1:1036552_T_C:1036552:2,9,0,5
chr19	1037551	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=80,148;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:2,0,10,0
chr19	1037563	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:4,0,10,0
chr19	1037584	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:4,7:2,8:6,0,13,2
chr19	1037715	.	TG	CA	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=23,32;MFRL=127,107;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.125:46:18,3:20,2:0|1:1037715_TG_CA:1037715:24,17,2,3
chr19	1037718	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=30,26;MFRL=126,107;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:19,3:22,2:0|1:1037715_TG_CA:1037715:24,18,2,3
chr19	1037731	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=137,107;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:16,3:22,2:0|1:1037715_TG_CA:1037715:17,23,2,3
chr19	1037749	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=154,127;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,10:0.229:46:16,5:18,5:0|1:1037715_TG_CA:1037715:15,21,4,6
chr19	1037756	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=159,147;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,8:0.196:44:17,4:19,4:0|1:1037715_TG_CA:1037715:15,21,3,5
chr19	1037766	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=28,27;MFRL=154,171;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.186:41:16,2:12,4:0|1:1037715_TG_CA:1037715:14,20,2,5
chr19	1037781	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=150,177;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:21,1:18,3:0|1:1037715_TG_CA:1037715:21,20,2,4
chr19	1037791	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=159,177;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,6:0.132:51:21,3:20,3:0|1:1037715_TG_CA:1037715:25,20,2,4
chr19	1037801	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=161,177;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:22,3:17,3:0|1:1037715_TG_CA:1037715:24,16,2,4
chr19	1037807	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=30,26;MFRL=160,173;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:20,3:19,2:0|1:1037715_TG_CA:1037715:24,19,2,3
chr19	1037810	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=153,173;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:21,2:22,2:0|1:1037715_TG_CA:1037715:26,18,2,3
chr19	1037812	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=26,28;MFRL=159,172;MMQ=60,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:20,2:21,1:0|1:1037715_TG_CA:1037715:25,18,1,3
chr19	1037932	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,13:0,0,3,22
chr19	1037968	.	CTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.811:8:0,4:1,1:0,1,0,7
chr19	1043505	.	T	TCCGAAGGAGCCTGTGCTAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,22;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:2,0:3,3,0,2
chr19	1043638	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=224,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr19	1043864	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,25:0.691:36:5,17:6,8:9,2,12,13
chr19	1044753	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,12:0,1:0,0,1,12
chr19	1044817	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=314,0;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1044817_G_A:1044817:2,2,1,0
chr19	1044820	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=314,0;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1044817_G_A:1044817:2,2,1,0
chr19	1044824	.	G	GGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=314,0;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1044817_G_A:1044817:2,2,1,0
chr19	1044833	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=314,0;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1044817_G_A:1044817:2,2,1,0
chr19	1047078	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,0:0,4:1,0,0,4
chr19	1047316	.	T	TCCCCCTCTCTTTCTGTTTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCCATCTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,63;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:3,7,1,1
chr19	1047687	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	1048807	.	C	CAAA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=116,182;MMQ=54,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,1:12,1:24,2,2,0
chr19	1048823	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=111,130;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.362:51:9,6:14,10:19,14,11,7
chr19	1048909	.	C	CATATAGCACCTTATGCCCTG	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:21,3:26,0:13,34,0,3
chr19	1049012	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,14:0,0,1,19
chr19	1049165	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,1:3,7:3,0,8,0
chr19	1049269	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,25:0.764:32:4,8:3,16:4,3,13,12
chr19	1061698	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,0;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:2,1,1,0
chr19	1063443	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr19	1064349	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1064349_T_C:1064349:0,1,0,1
chr19	1064351	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1064349_T_C:1064349:0,1,0,1
chr19	1065018	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,2:1,0:1,2,1,2
chr19	1065044	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=251,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:1,1,2,1
chr19	1065197	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:7,3,10,1
chr19	1068808	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.401:28:13,7:3,3:1,16,0,11
chr19	1073409	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	1074064	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,12,8
chr19	1074252	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.455:38:11,12:6,5:15,6,8,9
chr19	1078101	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:7,3:2,2:1,8,0,5
chr19	1080870	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=195,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:7,3,0,2
chr19	1081120	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr19	1081462	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr19	1086043	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:2,3,0,6
chr19	1090020	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr19	1090195	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=158,89;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:5,9,1,2
chr19	1090263	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	1090803	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1095151	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,2:3,3:6,0,5,0
chr19	1095168	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,2:3,3:6,0,6,0
chr19	1095352	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0|1:1095352_C_G:1095352:0,6,0,4
chr19	1095355	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:0|1:1095352_C_G:1095352:0,6,0,4
chr19	1095430	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,0:1,6:0,1,0,6
chr19	1105812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=147,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr19	1106477	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,6:2,7:4,1,7,6
chr19	1106615	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,1:3,4:3,5,1,5
chr19	1114348	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,0:14,4:7,15,2,2
chr19	1119475	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.683:11:3,5:0,0:1,2,8,0
chr19	1119699	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	1119876	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=80,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr19	1122518	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=149,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr19	1122582	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,1:4,1:0|1:1122582_G_GC:1122582:1,7,3,0
chr19	1122586	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,1:3,1:0|1:1122582_G_GC:1122582:1,7,3,0
chr19	1122590	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,0:0|1:1122582_G_GC:1122582:1,7,2,0
chr19	1124031	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.403:25:4,3:11,7:6,9,3,7
chr19	1124053	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,3:7,3:2,7,1,5
chr19	1221881	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=165,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr19	1235394	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr19	1235399	.	GAGAC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=171,276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGAC;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr19	1251781	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:2,7:3,9:3,2,9,10
chr19	1251999	.	GGGGGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGGA;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	1254122	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr19	1257298	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:19,0:27,3:29,18,0,3
chr19	1271274	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,7:6,5:10,5,7,5
chr19	1271529	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:6,7:3,7:6,3,8,7
chr19	1271953	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:11,2:8,2:13,6,2,2
chr19	1278665	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	1298535	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:5,1:5,1:10,4,0,2
chr19	1360288	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:11,13:9,0:10,10,13,0
chr19	1360575	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=91,130;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:9,6:4,7:8,5,7,6
chr19	1364693	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=182,255;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,0:1,3:0,7,0,3
chr19	1366422	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.373:25:5,8:10,1:7,9,4,5
chr19	1370675	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:7,3,2,5
chr19	1387759	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:6,0,2,0
chr19	1391235	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr19	1399412	.	C	CAGTTCAACTTCATCAAGGTGGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr19	1399969	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr19	1422320	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:4,4,2,0
chr19	1432720	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:9,11,0,3
chr19	1440271	.	G	GCTGGCC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:18,2:8,0:0|1:1440271_G_GCTGGCC:1440271:20,8,0,2
chr19	1440274	.	G	GGTTCAGCCGCCGCC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=139,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:18,2:8,0:0|1:1440271_G_GCTGGCC:1440271:20,8,0,2
chr19	1453236	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:8,2:5,1:6,9,0,3
chr19	1453705	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	1468394	.	G	GCCTCTGTCACCCTGGAGTAACCACAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=168,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,1,1
chr19	1487195	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=101,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr19	1488147	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr19	1497129	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:2,1,1,0
chr19	1497144	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	1497265	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,4:7,0:11,7,4,0
chr19	1507710	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr19	1510953	.	C	CGCCCAGCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr19	1619749	.	A	AGGGTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGTG;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:3,4:2,4:5,0,8,0
chr19	1619880	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:9,2:12,0:0|1:1619880_GT_G:1619880:7,15,1,1
chr19	1619883	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:12,0:0|1:1619880_GT_G:1619880:7,15,1,1
chr19	1619886	.	G	GATGAGGACTCAC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,2:13,0:0|1:1619880_GT_G:1619880:7,13,1,1
chr19	1754892	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1783236	.	TCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=73,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:3,5,2,3
chr19	1791936	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:4,1:0,0:0,4,3,0
chr19	1792021	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,2:2,2:6,4,2,2
chr19	1802482	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr19	1806210	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr19	1808226	.	GGAT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAT;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:4,2:10,5,2,1
chr19	1809836	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	1811547	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr19	1811751	.	AAGGGAGGTTCAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	1816372	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCAGATGGGG;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	1818403	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	1818459	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,13,3
chr19	1818556	.	GG	AA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=127,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:1,10,0,3
chr19	1818952	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr19	1819125	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:4,5:10,6:6,9,3,8
chr19	1823821	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	1823853	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=68,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:0|1:1823853_G_A:1823853:0,2,1,1
chr19	1823875	.	CTCGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=68,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:1823853_G_A:1823853:0,2,0,1
chr19	1823881	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=68,90;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:1823853_G_A:1823853:0,2,0,1
chr19	1825927	.	TCTC	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=71.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:8,5:9,14:7,10,7,12
chr19	1827003	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:5,8,0,2
chr19	1827020	.	TGGA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGA;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr19	1848165	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1848243	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	1848331	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:4,4,2,0
chr19	1863190	.	AG	CC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=139,127;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:10,0:2,9:1,11,0,9
chr19	1863580	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1863580_C_T:1863580:0,0,1,0
chr19	1863585	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1863580_C_T:1863580:0,0,1,0
chr19	1877480	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr19	1914940	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr19	1915118	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	1923194	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,0:6,3:7,7,0,3
chr19	1924076	.	TC	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,8:1,1:3,1,8,1
chr19	1952841	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr19	1954126	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,0,1,2
chr19	1954128	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,0:0,3:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,0,1,2
chr19	1979399	.	C	CTACTG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:1979399_C_CTACTG:1979399:7,13,1,1
chr19	1979401	.	A	AATT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=104,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,2:8,0:0|1:1979399_C_CTACTG:1979399:7,13,1,1
chr19	1979404	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:1979399_C_CTACTG:1979399:7,12,1,1
chr19	1979431	.	GCCCCCCACCCCCCA	G,GCCCCCCA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,34,30;MFRL=149,138,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,1,2;RU=CCCCCCA;STR;TLOD=3.32,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.288,0.362:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr19	1979673	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1979673_G_T:1979673:0,0,0,1
chr19	1979678	.	A	ATGGAGACG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1979673_G_T:1979673:0,0,0,1
chr19	1979680	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1979673_G_T:1979673:0,0,0,1
chr19	2037834	.	GAAAA	G,GAAAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=17,21,31;MFRL=137,135,56;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,16;RU=A;STR;TLOD=17.88,11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,14,6:0.491,0.354:23:1,2,0:0,5,4:1,2,9,11
chr19	2040061	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:8,1,6,1
chr19	2041032	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr19	2042886	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	2073466	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.569:26:5,6:6,8:5,6,8,7
chr19	2078227	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.138:42:20,3:15,1:20,16,3,3
chr19	2098529	.	G	GTGTCATCATCATGGTGGGGACAGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.355:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr19	2099111	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,3:2,2:3,1,1,4
chr19	2109019	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=89,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	2109834	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:7,0,4,1
chr19	2110019	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=215,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,8:2,3:2,1,2,9
chr19	2110989	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr19	2111649	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr19	2113284	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:3,3,7,4
chr19	2113377	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=105,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,1:4,1:8,0,0,3
chr19	2114225	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=94,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:14,0:23,4:12,28,2,2
chr19	2114717	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:10,7:2,0:6,6,7,0
chr19	2114756	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,2:8,0:15,8,0,2
chr19	2115127	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr19	2115493	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:2,3:2,4:5,0,5,2
chr19	2115668	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr19	2116130	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr19	2116281	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr19	2127272	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	2129473	.	TC	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr19	2137870	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,2,3
chr19	2164351	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	2190947	.	TTGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGG;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	2194657	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	2194660	.	A	ATGTTGGCACATGGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=131,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTTGGCACATGGC;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.703:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	2206863	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:1,10,0,2
chr19	2208859	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr19	2211050	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr19	2213580	.	AG	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:9,2:9,6,1,1
chr19	2214057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	2229807	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:10,10,2,0
chr19	2244903	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	2248461	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	2250528	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr19	2251512	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	2255112	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=212,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr19	2255336	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr19	2271282	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	2271323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr19	2271435	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.207:35:14,6:13,0:15,13,7,0
chr19	2271577	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr19	2271588	.	A	AGTGGCAGGAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=16,24;MFRL=263,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:0|1:2271588_A_AGTGGCAGGAT:2271588:2,1,0,1
chr19	2271590	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=263,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2271588_A_AGTGGCAGGAT:2271588:2,1,0,1
chr19	2271592	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=263,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:2271588_A_AGTGGCAGGAT:2271588:2,1,0,1
chr19	2271741	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr19	2280988	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:0,1:3,3:2,3,2,3
chr19	2290112	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=110,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:3,0:14,3:6,12,1,2
chr19	2328281	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr19	2337377	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	2337408	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,3:2,2:6,1,5,0
chr19	2339773	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr19	2339949	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=230,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.893:16:1,9:0,6:0|1:2339949_T_C:2339949:0,1,6,9
chr19	2339958	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:2339949_T_C:2339949:0,0,6,5
chr19	2339975	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr19	2340154	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	2341047	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr19	2344034	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=84,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:7,9:7,10:7,8,10,9
chr19	2344109	.	ACC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=C;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.704:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	2344484	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr19	2389954	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,5:4,2:0|1:2389954_G_A:2389954:0,8,1,6
chr19	2389958	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0|1:2389954_G_A:2389954:0,8,1,6
chr19	2396556	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=117,151;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:1,1,6,3
chr19	2396611	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,6:8,3:10,6,7,2
chr19	2401898	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,2:12,0:0|1:2401898_G_A:2401898:8,5,1,1
chr19	2401901	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:1,2:13,0:0|1:2401898_G_A:2401898:8,6,1,1
chr19	2408277	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:9,0,4,0
chr19	2431477	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=154,130;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chr19	2432322	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2432322_A_C:2432322:0,0,1,0
chr19	2432326	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2432322_A_C:2432322:0,0,1,0
chr19	2477113	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:12,16,3,0
chr19	2514984	.	AAG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,1:7,2:11,2,3,0
chr19	2520535	.	GCCTCCTGTTCATCATTTGCGGGGCCCCCAAGGGTCTCTCC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.196:14:3,0:1,2:0|1:2520535_GCCTCCTGTTCATCATTTGCGGGGCCCCCAAGGGTCTCTCC_G:2520535:10,2,1,1
chr19	2520556	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.906:8:0,5:0,3:1|0:2520535_GCCTCCTGTTCATCATTTGCGGGGCCCCCAAGGGTCTCTCC_G:2520535:0,0,7,1
chr19	2520716	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,2,2
chr19	2717879	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	2733316	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:1,0:16,2:0|1:2733316_G_A:2733316:9,12,1,1
chr19	2733320	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:3,0:18,2:0|1:2733316_G_A:2733316:9,12,1,1
chr19	2737433	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:3,0:1,1:0|1:2737433_T_G:2737433:1,3,0,1
chr19	2737438	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:2737433_T_G:2737433:0,3,0,1
chr19	2759232	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=93,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,1:11,2:13,9,3,0
chr19	2759397	.	C	CCATTTATTAAATA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:2759397_C_CCATTTATTAAATA:2759397:0,5,0,2
chr19	2759398	.	G	GGGAAT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.305:7:3,0:2,2:0|1:2759397_C_CCATTTATTAAATA:2759397:0,5,0,2
chr19	2759420	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,5:3,0:0,4,0,6
chr19	2767292	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2767292_GGA_G:2767292:0,1,0,1
chr19	2767295	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2767292_GGA_G:2767292:0,1,0,1
chr19	2767296	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2767292_GGA_G:2767292:0,1,0,1
chr19	2767300	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2767292_GGA_G:2767292:0,1,0,1
chr19	2794677	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	2794978	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,118;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0,10,0,2
chr19	2794979	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr19	2799649	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.574:10:0,1:2,0:2,2,6,0
chr19	2833617	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr19	2851678	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr19	2853401	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=91,98;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:2853401_T_C:2853401:10,9,1,1
chr19	2853403	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,98;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:2853401_T_C:2853401:10,9,1,1
chr19	2853405	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=98,98;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:10,2:0|1:2853401_T_C:2853401:11,9,1,1
chr19	2877663	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.348:29:8,2:11,7:11,8,4,6
chr19	2878397	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,111;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr19	2900915	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	2900930	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	2901114	.	CGCCGAAGTCT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,10:0,0,5,19
chr19	2915738	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	2916048	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,16,5
chr19	2917218	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:7,2:10,4,0,2
chr19	2917287	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr19	2917307	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,2:10,1:11,6,2,1
chr19	2917308	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:8,3:11,6,2,1
chr19	2933480	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,11,11
chr19	2936443	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr19	2978135	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr19	2980049	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.219:39:17,8:14,0:18,13,8,0
chr19	2981487	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:7,4:2,4:5,4,4,5
chr19	2982301	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,140;MMQ=51,42;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,1:1,1:0,8,0,2
chr19	2989810	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=89,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,1:3,5:2,2,4,3
chr19	2991814	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr19	2992076	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=153,189;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	2993427	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr19	2993918	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	2993946	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,185;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,2:0,2:0,0,6,2
chr19	2994107	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.944:27:1,8:1,16:0,3,10,14
chr19	2994814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	2994837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr19	2994885	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:4,6,3,2
chr19	3005993	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=240,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:1,0:1,1:1,2,0,3
chr19	3009004	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:5,0:0,1:1,4,0,1
chr19	3009788	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3013616	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	3013624	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=143,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr19	3017976	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr19	3028790	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.229:36:13,0:15,7:16,12,0,8
chr19	3028808	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=148,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:4,3:9,0:10,4,2,1
chr19	3053802	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	3054089	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr19	3056285	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=91,68;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.514:23:7,4:4,7:9,2,6,6
chr19	3110349	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,2:5,2:3,7,1,3
chr19	3113305	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:8,4:11,3,2,3
chr19	3119184	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=103,109;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:0,5:8,7:4,4,11,1
chr19	3119405	.	TG	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=65,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:1,2:0,2:1,1,1,4
chr19	3148819	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.338:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr19	3148869	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3150238	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,4,13
chr19	3155719	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=313,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3155719_G_A:3155719:1,0,0,1
chr19	3155723	.	C	CCCAGGCTGGAGTGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=313,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:3155719_G_A:3155719:1,0,0,1
chr19	3163057	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.321:7:1,1:2,0:0,5,0,2
chr19	3180160	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:7,5,2,1
chr19	3196122	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	3198755	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	3198777	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	3198931	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr19	3201695	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	3204172	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	3206235	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=181,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.367:10:3,2:4,1:6,1,1,2
chr19	3207338	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.601:13:4,7:1,1:0|1:3207338_T_C:3207338:2,3,2,6
chr19	3207348	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.626:14:3,7:2,2:0|1:3207338_T_C:3207338:3,2,3,6
chr19	3273818	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=221,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr19	3284819	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:2,5:5,5:5,3,5,5
chr19	3285012	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr19	3285042	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr19	3366532	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr19	3381645	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr19	3449182	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=210,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr19	3449201	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=210,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr19	3452683	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0|1:3452683_A_G:3452683:0,0,0,5
chr19	3452690	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3452683_A_G:3452683:0,3,0,1
chr19	3452700	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3452683_A_G:3452683:0,2,0,1
chr19	3452702	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:3452683_A_G:3452683:0,2,0,1
chr19	3452703	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:3452683_A_G:3452683:0,2,0,1
chr19	3453961	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3456482	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:3,0,7,0
chr19	3478456	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:6,6:1,7:2,5,7,7
chr19	3480358	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr19	3496869	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=233,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3496869_G_A:3496869:0,1,0,1
chr19	3496876	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:3496869_G_A:3496869:0,0,0,1
chr19	3496891	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=315,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	3526452	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	3527110	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=67,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,2:6,3:6,4,1,5
chr19	3534696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr19	3538646	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,4:0|1:3538646_A_G:3538646:0,0,13,1
chr19	3538647	.	C	CGTGGGTGCGTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,4:0|1:3538646_A_G:3538646:0,0,13,1
chr19	3538654	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,4:0|1:3538646_A_G:3538646:0,0,10,2
chr19	3542767	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:2,4:6,5:8,2,4,5
chr19	3546340	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr19	3546463	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,7,14
chr19	3547493	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=110,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.243:23:7,5:9,0:10,8,5,0
chr19	3547526	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=108,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,5:9,0:10,6,5,0
chr19	3548057	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	3548313	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	3551288	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=147,139;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3551288_A_C:3551288:0,2,0,1
chr19	3551291	.	G	GAATCTAGATAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,139;MMQ=60,49;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3551288_A_C:3551288:0,2,0,1
chr19	3577131	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3578653	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	3595794	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,4:3,8:4,3,2,10
chr19	3600457	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=181,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,0:12,3:7,12,2,1
chr19	3600673	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:3600673_C_A:3600673:1,3,0,1
chr19	3600681	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3600673_C_A:3600673:0,3,0,1
chr19	3600707	.	C	CTGGTTGGGAAGCAGCTGTCAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	3613346	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	3613400	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0|1:3613400_C_G:3613400:0,0,6,1
chr19	3613422	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,1:0|1:3613400_C_G:3613400:0,0,7,0
chr19	3613596	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.901:12:0,5:0,6:1,0,4,7
chr19	3619065	.	T	TTTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=78,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:2,0:8,5,1,1
chr19	3623730	.	GGTT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:9,0:13,12,1,1
chr19	3623906	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:3623906_T_A:3623906:2,1,1,1
chr19	3623909	.	AGG	TTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:3623906_T_A:3623906:2,1,1,1
chr19	3623914	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:3623906_T_A:3623906:2,1,1,1
chr19	3623916	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:3623906_T_A:3623906:2,1,1,1
chr19	3623919	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:3623906_T_A:3623906:2,1,1,1
chr19	3633273	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr19	3641672	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	3642830	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,5:6,0:10,0,6,0
chr19	3644253	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=160,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:0|1:3644253_C_CA:3644253:4,2,1,1
chr19	3644255	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:3644253_C_CA:3644253:4,2,1,1
chr19	3644258	.	A	ATATTTGGATAGCTTGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:3644253_C_CA:3644253:3,2,1,1
chr19	3645947	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,3:0,4:0,0,8,2
chr19	3646147	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=255,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	3647440	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,4,9
chr19	3660944	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr19	3667461	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	3738671	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.284:28:9,5:11,1:10,10,1,7
chr19	3743881	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr19	3743926	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=87,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:3743926_C_T:3743926:10,7,1,1
chr19	3743931	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=92,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,0:8,2:0|1:3743926_C_T:3743926:11,7,1,1
chr19	3781566	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr19	3784535	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	3784757	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr19	3785223	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3789310	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=79,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:14,5:8,0:9,13,5,0
chr19	3806031	.	C	CTTTGTCTAAATTCCACACTCAACCTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=160,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:7,1:1,0:3,5,1,1
chr19	3811457	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3820293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	3820305	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	3822008	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr19	3823192	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr19	3823237	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr19	3834863	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr19	3834960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr19	3852508	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=92,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,2:19,0:19,14,0,2
chr19	3869128	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	3902441	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,7:3,0:9,4,7,0
chr19	3908201	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,3,2
chr19	3908398	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr19	3910842	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.121:35:17,3:14,0:16,15,2,2
chr19	3910933	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr19	3913905	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=259,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,2,0,1
chr19	3913912	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=244,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,3,0,1
chr19	3913914	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=244,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,3,0,1
chr19	3913916	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=244,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,3,0,1
chr19	3913920	.	TG	AC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,4,0,1
chr19	3913924	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=25,24;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,4,0,1
chr19	3913928	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,4,0,1
chr19	3913929	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,4,0,1
chr19	3913934	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3913905_TG_T:3913905:0,4,0,1
chr19	3917608	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=167,148;MMQ=43,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.741:8:0,2:2,2:2,1,4,1
chr19	3918721	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	3938847	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	3938848	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	3939875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,3:4,0:7,2,2,1
chr19	3963724	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:3,5,1,4
chr19	3963744	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,0,6
chr19	3980824	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr19	3980870	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,13;MFRL=156,131;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,1,1,0
chr19	3980871	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,19;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,2,1,0
chr19	3980875	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,2,1,0
chr19	3980878	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=29,13;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,2,1,0
chr19	3980880	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=26,14;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,2,1,0
chr19	3980887	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:3980870_G_C:3980870:1,2,1,0
chr19	3980895	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,14;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3980870_G_C:3980870:2,1,1,0
chr19	3980901	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=137,131;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,0:0|1:3980870_G_C:3980870:2,1,1,0
chr19	4024020	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr19	4028067	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,7,6
chr19	4028185	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:1,3:6,0:5,2,1,2
chr19	4028783	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr19	4028864	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.340:9:2,0:3,3:0|1:4028864_T_TG:4028864:0,6,3,0
chr19	4028869	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.310:10:2,0:5,2:0|1:4028864_T_TG:4028864:0,7,3,0
chr19	4029040	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:1,5,1,3
chr19	4033244	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	4033614	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr19	4037525	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=175,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr19	4094474	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,2:16,1:16,12,2,1
chr19	4099187	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr19	4117705	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	4153659	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr19	4153815	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=88,331;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:0|1:4153815_G_T:4153815:8,7,3,0
chr19	4153819	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=88,331;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,0:9,3:0|1:4153815_G_T:4153815:8,8,3,0
chr19	4153889	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4153889_C_CAG:4153889:0,2,0,1
chr19	4153890	.	C	CCCCGGGGCAAAGGCACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4153889_C_CAG:4153889:0,2,0,1
chr19	4164512	.	CTGGGGG	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=105,43;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:11,2:5,0:0|1:4164512_CTGGGGG_C:4164512:10,8,1,1
chr19	4164519	.	CCT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=105,43;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:6,0:0|1:4164512_CTGGGGG_C:4164512:10,8,1,1
chr19	4164524	.	TACCTCCTGCGACCTGGGGCTGGG	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=99,43;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:6,0:0|1:4164512_CTGGGGG_C:4164512:10,13,1,1
chr19	4168379	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:7,1:7,2:8,6,2,1
chr19	4170248	.	C	CGGCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=175,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:4170248_C_CGGCA:4170248:3,4,1,1
chr19	4170250	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=175,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:4170248_C_CGGCA:4170248:3,4,1,1
chr19	4171701	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:12,0:9,3:14,8,0,3
chr19	4174950	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	4177004	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4177004_C_G:4177004:0,0,1,0
chr19	4177023	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4177004_C_G:4177004:0,0,1,0
chr19	4177029	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0|1:4177004_C_G:4177004:0,0,1,0
chr19	4177051	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr19	4179085	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:6,1:10,2,2,0
chr19	4186290	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=123,125;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr19	4186318	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=62,125;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr19	4186492	.	CTGCAA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=93,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:12,1:0|1:4186492_CTGCAA_C:4186492:13,6,0,2
chr19	4186500	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=93,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:0|1:4186492_CTGCAA_C:4186492:10,6,0,2
chr19	4186503	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=93,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:9,1:0|1:4186492_CTGCAA_C:4186492:10,6,0,2
chr19	4199707	.	TCCTGCCCGCCCTGCGGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.769:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr19	4199839	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	4207161	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=265,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr19	4208788	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:4,3:3,9:5,2,6,7
chr19	4210035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,3,1
chr19	4210401	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:7,3:4,5:3,8,3,5
chr19	4210465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=71,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr19	4212775	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=193,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.616:3:0,0:1,2:0|1:4212775_AC_A:4212775:0,1,1,1
chr19	4212778	.	AGTGCATGCACAGCCTCACACACGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=193,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.616:3:0,0:1,2:0|1:4212775_AC_A:4212775:0,1,1,1
chr19	4216508	.	AACTCCTGCCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=220,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:2,2,0,1
chr19	4217173	.	GGAGGCCACGGGCTCTAGGGCCACAGGGATGGAATCCACAGGAGTCAGTGCCACAGGTGTGGAGAACCCAGGGGTA	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.074:39:5,1:6,0:18,19,1,1
chr19	4217207	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:4,7:0,6:3,1,8,5
chr19	4217256	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:17,3:7,1:14,10,1,3
chr19	4219541	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,2:9,3:10,1,4,1
chr19	4229635	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr19	4231327	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr19	4236858	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr19	4249242	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,0:14,3:13,11,2,1
chr19	4250991	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=114,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,2:2,1:7,2,2,1
chr19	4254308	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,1:6,3:10,5,3,1
chr19	4254544	.	GCCAATGGT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,3:4,1:5,11,2,2
chr19	4262201	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,227;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:4262201_G_T:4262201:0,2,0,2
chr19	4262202	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=145,227;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:4262201_G_T:4262201:0,2,0,2
chr19	4268511	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=108,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr19	4268543	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr19	4288407	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=67,36;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:4288407_T_C:4288407:2,2,1,1
chr19	4288411	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=67,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:4288407_T_C:4288407:2,2,1,1
chr19	4288412	.	C	CATCCAGCCTACAGAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=67,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:4288407_T_C:4288407:2,2,1,1
chr19	4288417	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=67,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:3,2:0|1:4288407_T_C:4288407:2,2,1,1
chr19	4294542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=73,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:7,1:3,3:3,7,4,1
chr19	4294551	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=93,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,6:4,3:4,1,4,5
chr19	4297968	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:7,2,3,1
chr19	4304769	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	4306311	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=99,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.427:26:8,4:7,7:8,7,7,4
chr19	4310217	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.581:26:3,3:6,12:6,5,10,5
chr19	4317332	.	A	ATTCTCATTTCCATACAGTTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=183,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr19	4318284	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,47;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:4318284_C_G:4318284:2,1,1,1
chr19	4318292	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=152,47;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:4318284_C_G:4318284:5,1,1,1
chr19	4322990	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,5:7,4,2,7
chr19	4325150	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=103,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:4,0:0|1:4325150_G_A:4325150:7,4,0,2
chr19	4325167	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:6,0:0|1:4325150_G_A:4325150:6,5,0,2
chr19	4325255	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=115,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:12,2:6,0:4,14,2,0
chr19	4325327	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr19	4325433	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:1,4,4,2
chr19	4328860	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:2,2:1,7,1,4
chr19	4331940	.	AAAAG	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=103,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAG;STR;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:3,4:14,7:15,4,4,7
chr19	4332105	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,7:4,3:1,5,2,8
chr19	4352837	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=114,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:0,2:4,2:5,1,4,0
chr19	4352838	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr19	4352959	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:1,15:0,14:0,1,20,11
chr19	4354840	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.302:10:1,3:6,0:7,0,3,0
chr19	4355035	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,5:0,4:1,0,8,1
chr19	4355054	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=16,31;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.843:8:0,4:0,2:1,0,6,1
chr19	4355105	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=157,273;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,0:7,4:10,7,4,0
chr19	4355203	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,15,10
chr19	4362691	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,2:4,6:5,6,5,3
chr19	4363289	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	4363564	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	4363828	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=98,63;MMQ=60,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,0:12,3:10,9,0,3
chr19	4365397	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	4405976	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:12,2:6,0:8,10,1,1
chr19	4422738	.	CGG	TGG,C	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=26,22,20;MFRL=102,144,52;MMQ=60,60,60;MPOS=10,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.46,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:71,4,2:0.061,0.036:77:37,0,0:34,4,2:26,45,4,2
chr19	4422742	.	G	GACTTAAACCC	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,2:0.037:79:37,0:40,2:29,48,1,1
chr19	4423419	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:10,1:5,6:6,10,3,4
chr19	4423923	.	CT	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr19	4431896	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	4432281	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4432281_G_A:4432281:0,0,0,1
chr19	4432287	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4432281_G_A:4432281:0,0,0,1
chr19	4432973	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	4433095	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=126,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:9,2:20,1:15,15,2,1
chr19	4442336	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,13:0,20:0,0,15,19
chr19	4443046	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:1,5:8,4:4,5,1,9
chr19	4445481	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=89,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,4:12,0:15,14,4,0
chr19	4446765	.	AAGCCGGGCCCTCCTGCCCCGAGGCCCCTCGTCCCCATTCCCTACTC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.147:19:4,0:3,2:6,11,1,1
chr19	4446995	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr19	4452497	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,2:1,2:1,4,2,2
chr19	4453856	.	TCCAGGGCCAGGCA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=245,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr19	4453989	.	C	CTCAGCCTTCCCAAGTAGCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:4,2:3,3,1,1
chr19	4472322	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:5,1,4,0
chr19	4475362	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.572:45:10,11:9,13:11,8,8,18
chr19	4475636	.	C	CAAGATGTTAATATGAAATCTCAGAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	4488632	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	4488926	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:1,1:2,2:1,2,1,3
chr19	4493708	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:8,7:8,5:11,5,9,3
chr19	4498245	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr19	4498440	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=187,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr19	4499632	.	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCTGGCCGGGGAGG;STR;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.889:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr19	4508854	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:5,5,0,2
chr19	4508918	.	C	CAGCCCGGGCCAAAGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,0:6,1:4,4,0,2
chr19	4508945	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr19	4511278	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=109,76;MMQ=40,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:0,6:7,4:0|1:4511278_C_T:4511278:5,2,7,4
chr19	4511281	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=89,163;MMQ=48,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:9,6,3,0
chr19	4511283	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,76;MMQ=40,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:0,7:8,4:0|1:4511278_C_T:4511278:6,2,7,4
chr19	4511453	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,9:0,0,10,7
chr19	4511575	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=168,193;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:0|1:4511575_C_G:4511575:7,8,1,3
chr19	4511578	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=168,193;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,1:8,2:0|1:4511575_C_G:4511575:7,8,1,3
chr19	4511580	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=168,207;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,1:7,2:0|1:4511575_C_G:4511575:7,8,1,2
chr19	4511647	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,41;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr19	4511908	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=101,140;MMQ=60,46;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:4,8,2,4
chr19	4511920	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=21,21;MFRL=101,121;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.271:20:7,2:5,2:0|1:4511920_T_C:4511920:6,9,2,3
chr19	4511927	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=101,144;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.420:17:4,3:4,2:0|1:4511927_G_A:4511927:3,7,4,3
chr19	4511929	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=22,25;MFRL=101,177;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:0|1:4511927_G_A:4511927:3,7,4,1
chr19	4511935	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=139,158;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.171:16:7,2:7,0:0|1:4511920_T_C:4511920:6,8,1,1
chr19	4511955	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=88,126;MMQ=60,45;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:6,6,2,1
chr19	4512071	.	ATGGTGTCCTTGGTACCGGTTAGGACAGTTTTGG	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.120:40:11,2:8,2:17,19,3,1
chr19	4512469	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=125,162;MMQ=58,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:12,1:11,3:13,10,4,1
chr19	4512865	.	AGTGTTCTT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=100,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:9,3:5,11:0|1:4512865_AGTGTTCTT_A:4512865:8,11,6,9
chr19	4512878	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=51.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.442:32:13,4:5,10:0|1:4512865_AGTGTTCTT_A:4512865:8,10,5,9
chr19	4513549	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:0|1:4513549_G_A:4513549:2,3,2,3
chr19	4513559	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:4513549_G_A:4513549:0,0,6,4
chr19	4529319	.	TGC	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:4,2:0|1:4529319_TGC_T:4529319:1,6,1,1
chr19	4529324	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,2:0|1:4529319_TGC_T:4529319:1,6,1,1
chr19	4529327	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:4529319_TGC_T:4529319:1,5,1,1
chr19	4529329	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,1:0|1:4529319_TGC_T:4529319:1,5,1,1
chr19	4529337	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:4529319_TGC_T:4529319:0,4,0,1
chr19	4529975	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,209;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:5,2:1,0:1,7,0,2
chr19	4538656	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.345:35:10,6:12,0:17,5,13,0
chr19	4538911	.	ACAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr19	4546200	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr19	4546592	.	T	TTTAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTAA;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	4548245	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,0:3,4:3,1,4,1
chr19	4550995	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr19	4554546	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr19	4554576	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:4554576_G_A:4554576:0,1,1,0
chr19	4554583	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:4554576_G_A:4554576:0,1,1,0
chr19	4557056	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:7,4,3,2
chr19	4651964	.	C	CGCAGTACAGCTCATCCAGCACCTCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr19	4652822	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=98,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,0,2
chr19	4652849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:5,0:1,5,1,2
chr19	4653067	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=147,90;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:4,1:0|1:4653067_C_A:4653067:1,8,1,1
chr19	4653077	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=166,90;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0|1:4653067_C_A:4653067:1,9,1,1
chr19	4653351	.	C	G	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,31:0.402:78:21,19:24,11:23,24,16,15
chr19	4653370	.	C	G	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=119,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,28:0.419:67:18,18:21,10:20,19,11,17
chr19	4653420	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=139,125;MMQ=60,43;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,3:9,2:0,12,0,5
chr19	4653497	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=206,170;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4653497_G_GTA:4653497:0,2,0,1
chr19	4653499	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=206,170;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4653497_G_GTA:4653497:0,2,0,1
chr19	4653518	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=175,237;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4653518_C_T:4653518:0,1,0,1
chr19	4653529	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4653518_C_T:4653518:0,0,0,1
chr19	4653534	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4653518_C_T:4653518:0,0,0,1
chr19	4660799	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:2,6,0,3
chr19	4660809	.	CT	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:4660809_CT_TG:4660809:0,8,1,1
chr19	4660814	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:4660809_CT_TG:4660809:0,8,1,1
chr19	4660819	.	G	GACTCCCTTTAGACA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:4660809_CT_TG:4660809:0,8,1,1
chr19	4670093	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	4670165	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:3,4:8,10:8,3,8,6
chr19	4682878	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr19	4684642	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr19	4685630	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,3:2,0:6,2,2,1
chr19	4694647	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:11,2,3,0
chr19	4695384	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,7:8,3:7,6,5,5
chr19	4700187	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,4:8,2:6,5,4,2
chr19	4770870	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr19	4793468	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=130,48;MMQ=52,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:12,0:14,3:10,16,1,2
chr19	4794548	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,161;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.306:17:5,2:4,1:8,4,2,3
chr19	4794948	.	A	AAACCTCAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,6,3
chr19	4795390	.	ATT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=84,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:5,1:8,0:12,6,1,1
chr19	4795481	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=104,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:14,1:15,14,1,1
chr19	4795647	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr19	4816464	.	T	TGGGGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,15;RU=G;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,0:2,0:4,0,0,2
chr19	4817288	.	AAGGAGG	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AGG;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:13,1:4,1:17,4,2,0
chr19	4844665	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:6,3:8,2:6,8,3,2
chr19	4896948	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.658:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr19	4902754	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,6:9,3:5,9,5,4
chr19	4930693	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:8,0,5,2
chr19	4944555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	4945974	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,59;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,24:0,14:0,0,19,21
chr19	4947062	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25,27;MFRL=111,135,95;MMQ=60,60,60;MPOS=7,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.19,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.349,0.230:11:1,2,1:2,1,0:4,1,4,2
chr19	4950980	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,102;MMQ=52,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:4,8,0,2
chr19	4954310	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr19	4954644	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=142,158;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:3,3:3,4:5,1,5,3
chr19	4954679	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr19	4960583	.	CTG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,2:6,4:7,1,6,0
chr19	5047691	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr19	5071001	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr19	5082392	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:10,5,3,0
chr19	5082573	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr19	5132051	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,2,14
chr19	5135392	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,10,14
chr19	5143971	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=143,161;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:9,7,2,0
chr19	5151322	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,4:7,0:6,3,3,1
chr19	5206775	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=247,134;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,3:1,4:1,0,5,3
chr19	5208236	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,7:1,11:1,0,9,9
chr19	5210622	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,10,7
chr19	5211568	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr19	5212129	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,1:8,2:9,10,1,2
chr19	5212311	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:5,3,3,1
chr19	5214533	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr19	5215258	.	CA	TT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,14:5,0:6,6,16,0
chr19	5215472	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr19	5220436	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr19	5222071	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	5239111	.	GGA	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=81,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GA;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr19	5239169	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:5239169_G_A:5239169:0,0,0,1
chr19	5239171	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5239169_G_A:5239169:0,0,0,1
chr19	5239174	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5239169_G_A:5239169:0,0,0,1
chr19	5260749	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:0|1:5260749_G_T:5260749:12,1,1,1
chr19	5260758	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.214:15:4,1:8,1:0|1:5260749_G_T:5260749:10,2,1,2
chr19	5273571	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,6:6,4:3,10,3,7
chr19	5274378	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.488:4:1,2:1,0:0|1:5274378_G_GT:5274378:1,1,1,1
chr19	5274380	.	G	GAACAGAAAGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:5274378_G_GT:5274378:1,1,1,1
chr19	5455422	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr19	5456450	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:5456450_T_C:5456450:2,1,1,1
chr19	5456453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,1:0|1:5456450_T_C:5456450:2,1,1,1
chr19	5456921	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5456921_C_T:5456921:0,2,0,1
chr19	5456922	.	C	CTTGGAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5456921_C_T:5456921:0,2,0,1
chr19	5456923	.	C	CATATGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5456921_C_T:5456921:0,2,0,1
chr19	5456930	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=109,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	5587261	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=153,49;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:16,1:8,1:19,5,2,0
chr19	5587692	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=114,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,0:14,4:11,12,1,3
chr19	5587874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr19	5595354	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr19	5600370	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	5653987	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=219,244;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:5653987_T_G:5653987:3,0,1,0
chr19	5653994	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=219,244;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:5653987_T_G:5653987:3,0,1,0
chr19	5661896	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0|1:5661896_ATT_A:5661896:0,0,0,1
chr19	5661914	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5661896_ATT_A:5661896:0,0,0,1
chr19	5661919	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5661896_ATT_A:5661896:0,0,0,1
chr19	5667204	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=159,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:0,1:2,6,2,0
chr19	5687059	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	5691651	.	C	CTCTCTCTCT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:11,3:13,0:3,22,2,2
chr19	5692311	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	5694630	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	5696245	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr19	5707204	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr19	5707628	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr19	5708391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=100,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:4,6,2,1
chr19	5714248	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:16,7,2,1
chr19	5714346	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,146;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr19	5720074	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	5720106	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	5733771	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	5733931	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,1,3
chr19	5739320	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=98,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.402:6:3,2:0,0:3,1,2,0
chr19	5746121	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	5749029	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:5749029_CTG_C:5749029:4,0,1,0
chr19	5749033	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:5749029_CTG_C:5749029:4,0,1,0
chr19	5749070	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:3,4:3,1,9,0
chr19	5749171	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:6,9:7,9:7,6,12,6
chr19	5749276	.	AA	GC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=143,210;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:5749276_AA_GC:5749276:0,10,0,2
chr19	5749279	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=143,210;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,0:0|1:5749276_AA_GC:5749276:0,10,0,2
chr19	5749297	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,191;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	5759231	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	5775337	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,7:9,3:7,8,5,5
chr19	5775414	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=103,65;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:5775414_T_C:5775414:0,2,1,1
chr19	5775419	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=103,65;MMQ=60,37;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:5775414_T_C:5775414:0,2,1,1
chr19	5775424	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=201,65;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:5775414_T_C:5775414:0,1,1,1
chr19	5783905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr19	5785113	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr19	5786718	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:1,0,5,2
chr19	5786901	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr19	5786999	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=254,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,2,0
chr19	5787214	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=62,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:5787214_T_C:5787214:1,1,1,1
chr19	5787220	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=62,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:5787214_T_C:5787214:1,1,1,1
chr19	5787228	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=93,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:0|1:5787214_T_C:5787214:5,3,1,1
chr19	5789565	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr19	5791167	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,2:2,4:0,8,0,6
chr19	5828080	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=73,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr19	5832297	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:9,8:10,4:10,10,5,7
chr19	5844792	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:11,9:5,8:0|1:5844792_A_C:5844792:12,5,8,9
chr19	5844804	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=102,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,16:0.447:36:11,10:9,6:1|0:5844792_A_C:5844792:9,11,9,7
chr19	5866585	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	5903807	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,3:0,12:0,0,0,16
chr19	5918723	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:4,3:0,8,0,3
chr19	5928185	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	5951641	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr19	5951702	.	A	AACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=302,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	5995706	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=153,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:5995706_G_A:5995706:1,8,1,1
chr19	5995711	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:5995706_G_A:5995706:1,9,1,1
chr19	5995714	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:5995706_G_A:5995706:1,9,1,1
chr19	6010064	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	6013202	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,1:0,1:0,4,0,2
chr19	6026288	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:0,0:1,2:0,5,0,4
chr19	6040309	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=0,2559433;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr19	6141643	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:5,3:5,4:4,6,3,4
chr19	6147743	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,0:2,5:0,2,0,5
chr19	6151611	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=222,198;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6151611_T_C:6151611:2,0,1,0
chr19	6151613	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=222,198;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6151611_T_C:6151611:2,0,1,0
chr19	6151617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=222,198;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:6151611_T_C:6151611:2,0,1,0
chr19	6151648	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=213,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	6151703	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=58,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:9,1:8,6:5,12,4,3
chr19	6156598	.	C	CTCTTTTCACTTTTTATTTCTACACCACATTACTTGAACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=72,99;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr19	6177486	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr19	6183233	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,3:3,3:4,1,3,4
chr19	6187518	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=355,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,3,1
chr19	6187657	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=66,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,2:9,11:5,11,3,10
chr19	6187800	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:7,3:7,3:0|1:6187800_G_A:6187800:8,6,5,2
chr19	6187805	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=120,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.374:22:7,5:7,3:0|1:6187800_G_A:6187800:8,6,6,2
chr19	6190576	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.582:22:5,5:4,8:0|1:6190576_A_T:6190576:6,3,9,4
chr19	6190599	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.496:22:4,5:7,5:0|1:6190576_A_T:6190576:6,5,6,5
chr19	6216567	.	C	CAGCTAGTAAGCATTCAATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=209,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr19	6222124	.	T	TCA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,2:7,0:0|1:6222124_T_TCA:6222124:7,9,0,2
chr19	6222128	.	T	TGTACACCACACATACACACA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:8,0:0|1:6222124_T_TCA:6222124:8,9,0,2
chr19	6222133	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:7,0:0|1:6222124_T_TCA:6222124:8,9,0,2
chr19	6222640	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=155,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,2:0,0:0,3,1,1
chr19	6230638	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:16,11,3,0
chr19	6230771	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr19	6262355	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	6262380	.	C	CTCTGTGTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	6262417	.	C	CACTCCATTCTTTCCACTCCATCCCATTCCATTCCACTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=228,256;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	6270583	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=192,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:6270583_C_A:6270583:11,2,1,1
chr19	6270591	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=187,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:6270583_C_A:6270583:9,3,1,1
chr19	6306971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	6361845	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	6374155	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:3,3:7,10:7,3,12,1
chr19	6374813	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.522:27:5,5:7,9:9,4,8,6
chr19	6375368	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	6380733	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr19	6381313	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr19	6381689	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,3:7,0:0|1:6381689_C_T:6381689:9,7,1,2
chr19	6381700	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,18:0.655:27:3,12:6,6:0|1:6381689_C_T:6381689:7,2,8,10
chr19	6387618	.	C	CGTAAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=113,418;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:6387618_C_CGTAAT:6387618:1,6,1,1
chr19	6387621	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=113,418;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:6387618_C_CGTAAT:6387618:1,6,1,1
chr19	6387625	.	GTGTC	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=113,418;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:1,1:0|1:6387618_C_CGTAAT:6387618:1,6,1,1
chr19	6387631	.	C	CTCTG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=113,418;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:6387618_C_CGTAAT:6387618:1,5,1,1
chr19	6389699	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	6391847	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=78,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:3,3:4,1,6,1
chr19	6392078	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,3:1,6:0,2,0,10
chr19	6392843	.	GTGGGAGATGGGGCT	G	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=109,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:21,0:17,2:26,22,1,1
chr19	6392924	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=133,211;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:12,7:17,0:0|1:6392924_G_A:6392924:17,14,7,0
chr19	6392930	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=133,211;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:13,7:18,0:0|1:6392924_G_A:6392924:17,14,7,0
chr19	6414075	.	GA	G,GAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31,26;MFRL=119,0,64;MMQ=60,44,60;MPOS=1,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.01,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,4:0.139,0.175:26:10,3,2:8,0,1:13,6,6,1
chr19	6415545	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:5,2:1,1:3,4,2,1
chr19	6415795	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,5:4,6:5,2,7,4
chr19	6416467	.	T	TTCAGCCCCCCCATAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:3,0:3,7,1,1
chr19	6417855	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:6,2,2,1
chr19	6422303	.	AGGCCCCCAGCCCTTCCTCCTAAGCTAAAGGCAGCAGCAGGGAGTTACCTCCATCTTCCAACTGTCTCTTTT	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.107:36:2,0:4,3:22,11,1,2
chr19	6422416	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,1:13,2:8,16,0,3
chr19	6426347	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:5,1,2,1
chr19	6452305	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=95,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:3,3,3,1
chr19	6467452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr19	6467548	.	TCTGGGCCGGCTGCTGGG	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:6,0:13,2:0|1:6467548_TCTGGGCCGGCTGCTGGG_T:6467548:17,15,1,1
chr19	6467582	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=97,51;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,3:0.105:36:14,3:17,0:1|0:6467548_TCTGGGCCGGCTGCTGGG_T:6467548:13,20,3,0
chr19	6467910	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:11,6:9,3:11,10,3,6
chr19	6468378	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:5,11,0,3
chr19	6468840	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,2:1,2:3,0,2,3
chr19	6469052	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	6469735	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=213,131;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	6469767	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6469767_CG_C:6469767:0,3,0,1
chr19	6469769	.	TTCACCACCCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6469767_CG_C:6469767:0,3,0,1
chr19	6472930	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:5,3,2,2
chr19	6475613	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr19	6477324	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr19	6478919	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr19	6535080	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr19	6586473	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=267,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr19	6590789	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:6,2,1,1
chr19	6677978	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,2:9,0:7,9,1,1
chr19	6678474	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=223,108;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.334:34:19,9:4,2:2,21,4,7
chr19	6679360	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=115,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr19	6679388	.	CC	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,34;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:6,4,1,1
chr19	6684602	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=101,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:16,5:8,0:9,15,0,5
chr19	6694399	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:5,1,5,0
chr19	6696496	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,1:6,3:8,7,0,4
chr19	6702598	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=79,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:1,6:8,2:5,4,5,3
chr19	6710572	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr19	6710901	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:10,0,2,0
chr19	6710971	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:9,7,0,2
chr19	6718078	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:3,5,6,7
chr19	6718396	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:17,0:19,7:20,16,1,6
chr19	6730426	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:9,8,0,2
chr19	6731598	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=315,2314843;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:6731598_G_T:6731598:1,1,1,0
chr19	6731600	.	G	GTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=315,2314843;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:6731598_G_T:6731598:1,1,1,0
chr19	6731601	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=315,2314843;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:6731598_G_T:6731598:1,1,1,0
chr19	6731606	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=315,2314843;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,1:1,0:0|1:6731598_G_T:6731598:1,1,1,0
chr19	6732018	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,6:4,1:5,4,3,4
chr19	6734337	.	G	GATCTCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:6734337_G_GATCTCA:6734337:3,4,1,1
chr19	6734339	.	GG	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:1,0:0|1:6734337_G_GATCTCA:6734337:3,4,1,1
chr19	6739934	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr19	6743405	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=213,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:2,1:1,2,2,3
chr19	6743634	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr19	6744762	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr19	6745105	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	6750204	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=248,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,5:1,0:1,2,2,3
chr19	6750584	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=103,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:11,4:16,0:16,13,2,2
chr19	6751010	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:3,3:9,0:9,3,0,3
chr19	6752639	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:6,2:8,0:8,6,2,1
chr19	6754188	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr19	6754774	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,9,8
chr19	6755007	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=193,226;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,2,1
chr19	6759631	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=175,88;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,2,3
chr19	6760566	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.317:11:3,0:5,3:6,2,3,0
chr19	6760974	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:2,3:13,4:6,9,2,5
chr19	6761011	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:1,3:12,3:6,7,1,5
chr19	6825032	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:4,3,3,1
chr19	6828040	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	6833162	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.274:18:6,5:4,0:10,3,5,0
chr19	6833344	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,3:3,1:0|1:6833344_TC_T:6833344:2,6,0,4
chr19	6833346	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:0|1:6833344_TC_T:6833344:2,6,0,4
chr19	6833777	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,7:1,7:1,0,11,4
chr19	6843088	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=70,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:6843088_C_T:6843088:13,5,1,1
chr19	6843102	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=79,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:12,2:0|1:6843088_C_T:6843088:17,6,1,1
chr19	6847974	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:2,1:2,4:4,2,5,0
chr19	6897082	.	C	CTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=276,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:6897082_C_CTTTTT:6897082:1,0,3,0
chr19	6897103	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=17,12;MFRL=143,172;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.401:5:1,0:0,0:0|1:6897082_C_CTTTTT:6897082:2,1,2,0
chr19	6897110	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,18;MFRL=128,226;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:1,0:0,1,2,0
chr19	6897392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,107;MMQ=52,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,4:5,2:2,3,2,4
chr19	6906357	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr19	6913878	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,2,6
chr19	6913897	.	C	CACGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:6913897_C_CACGGG:6913897:1,3,0,1
chr19	6913898	.	T	TCCTAACTCTGCAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:6913897_C_CACGGG:6913897:1,3,0,1
chr19	6919529	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,15:0,18:0,1,12,22
chr19	6921713	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.687:11:3,5:0,3:2,1,5,3
chr19	6921879	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=44,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,1:1,6:3,5,3,4
chr19	6924672	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=113,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,4:2,1:4,4,2,3
chr19	6926355	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:6926355_T_C:6926355:2,0,1,1
chr19	6926358	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:6926355_T_C:6926355:2,0,1,1
chr19	6926378	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:6926355_T_C:6926355:1,0,2,1
chr19	6926396	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0|1:6926355_T_C:6926355:2,1,3,3
chr19	6926506	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=21,22;MFRL=104,23914360;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,1:15,3:18,10,3,1
chr19	6926550	.	G	GGAGTGTTT	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=122,47840558;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,1:10,1:12,10,2,0
chr19	6935113	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:14,2:2,4:0|1:6935113_C_T:6935113:1,15,2,4
chr19	6935121	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:7,2:1,3:0|1:6935113_C_T:6935113:1,9,1,4
chr19	6937683	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr19	6939910	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr19	7083818	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,170;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,9:1,1:1,2,0,10
chr19	7120676	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:13,2:10,12,0,3
chr19	7122996	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:3,2:8,0:5,6,1,2
chr19	7132192	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:0|1:7132192_G_C:7132192:18,5,1,1
chr19	7132196	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:7132192_G_C:7132192:19,5,1,1
chr19	7150418	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr19	7166109	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,10,7
chr19	7170505	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.786:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	7170517	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr19	7170757	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:15,0:14,5:15,15,0,5
chr19	7172206	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7172206_A_T:7172206:0,0,1,0
chr19	7172215	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7172206_A_T:7172206:2,0,1,0
chr19	7172222	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7172206_A_T:7172206:2,0,1,0
chr19	7184674	.	GAAAT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=39,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AAAT;STR;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.636:6:0,1:0,3:1,1,1,3
chr19	7267885	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=106,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:21,0:25,3:25,21,2,1
chr19	7505000	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.413:22:6,3:6,5:5,8,2,7
chr19	7506655	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:4,3,1,5
chr19	7506755	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:4,3,2,0
chr19	7509223	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=106,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:4,1,1,1
chr19	7518268	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr19	7524895	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,6:6,6:1,8,5,7
chr19	7528852	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:1,9,1,8
chr19	7531788	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:17,2:13,2:13,17,1,3
chr19	7543113	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	7546850	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr19	7565890	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,329;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7568966	.	A	ATCTCTCTC,ATCTCTCTCTC,ATCTCTCTCTCTC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26,25,27;MFRL=150,85,58,100;MMQ=60,60,50,40;MPOS=6,13,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,11,12,13;RU=TC;STR;TLOD=16.83,4.17,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,7,2,4:0.451,0.171,0.287:15:2,4,1,2:0,2,1,2:2,0,11,2
chr19	7569312	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:4,10,1,1
chr19	7570132	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr19	7571094	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr19	7573297	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:7,2:5,4:6,7,1,5
chr19	7584086	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr19	7585663	.	TTGATCCTGTGCCCAGCCCAGACCC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.154:18:6,0:3,2:11,5,1,1
chr19	7591320	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=114,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:16,3:15,11,1,2
chr19	7593589	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=98,104;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,6:5,7:6,4,6,7
chr19	7593634	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:10,0:4,6:6,8,0,6
chr19	7594159	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr19	7595121	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr19	7607564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr19	7615585	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7616347	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,5:2,8:1,3,4,9
chr19	7618935	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:4,0:0,0:0|1:7618935_C_G:7618935:2,3,0,2
chr19	7618938	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:0,0:0|1:7618935_C_G:7618935:2,3,0,2
chr19	7619191	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.281:25:11,0:5,4:12,6,0,7
chr19	7619195	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,14;RU=G;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,0:2,0:9,6,0,4
chr19	7619199	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr19	7619239	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr19	7619647	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	7619700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	7619760	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	7620116	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr19	7620275	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7620275_T_G:7620275:0,0,1,0
chr19	7620291	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7620275_T_G:7620275:0,0,1,0
chr19	7621475	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=203,134;MMQ=48,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:3,4:1,0:1,5,1,3
chr19	7621648	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.640:15:1,3:4,5:0,5,4,6
chr19	7621981	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	7621991	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,1:4,1:6,1,2,0
chr19	7622208	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr19	7622226	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.550:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr19	7623700	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	7624079	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:3,4,3,6
chr19	7625723	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:1,2,1,4
chr19	7626013	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr19	7626071	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,3:8,3:7,5,4,2
chr19	7626275	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,2:3,3:6,5,4,1
chr19	7626325	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:7,2:14,0:10,11,1,1
chr19	7670033	.	G	GGTGTGTGTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,20;RU=GT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.265:5:4,1:0,0:4,0,1,0
chr19	7671742	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=91,50;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:22,0:25,3:23,25,1,2
chr19	7675877	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,3:3,6:7,3,6,3
chr19	7676462	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:6,3,1,4
chr19	7676705	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7676705_G_A:7676705:0,4,0,1
chr19	7676710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:7676705_G_A:7676705:0,3,0,1
chr19	7676812	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr19	7681331	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr19	7681351	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:3,3:4,0,5,0
chr19	7682112	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,2,0
chr19	7682268	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,2:10,1:4,12,0,3
chr19	7687166	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=85,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:7687166_G_GAT:7687166:1,1,0,1
chr19	7687169	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=85,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:7687166_G_GAT:7687166:1,1,0,1
chr19	7688798	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr19	7688831	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7688831_C_CA:7688831:0,2,0,1
chr19	7688832	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7688831_C_CA:7688831:0,2,0,1
chr19	7690684	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=229,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr19	7692058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=253,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	7692211	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:11,5,2,1
chr19	7703498	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,6:2,0:3,0,6,0
chr19	7710269	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,2:2,1:0,2,0,4
chr19	7711171	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,4:5,9:5,6,7,7
chr19	7712193	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,1,1
chr19	7712474	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:3,1,2,4
chr19	7712585	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=145,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,7:5,6:4,5,5,8
chr19	7734178	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.267:43:22,11:9,0:26,6,11,0
chr19	7734369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=83,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,1,2
chr19	7735089	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,2:3,3:3,2,4,1
chr19	7735318	.	AGATGATGAT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=GAT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	7743033	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,0:9,2:10,7,0,2
chr19	7743783	.	T	TGCCC	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.220:34:16,2:10,3:0|1:7743783_T_TGCCC:7743783:3,24,7,0
chr19	7743787	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.215:35:14,2:9,2:0|1:7743783_T_TGCCC:7743783:4,24,7,0
chr19	7743790	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.166:34:11,3:10,1:0|1:7743783_T_TGCCC:7743783:5,24,5,0
chr19	7743796	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=25,18;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:17,1:14,1:0|1:7743783_T_TGCCC:7743783:8,24,4,0
chr19	7743801	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.134:35:11,2:11,2:0|1:7743783_T_TGCCC:7743783:9,22,4,0
chr19	7743821	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:9,8:4,9:6,7,7,10
chr19	7744075	.	ACC	A,AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,21,20;MFRL=0,190,161;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=6.60,8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.411,0.507:8:0,2,1:0,0,1:0,0,0,8
chr19	7755056	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:0,2,5,2
chr19	7755159	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0,1,3,5
chr19	7755285	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,1,2
chr19	7755469	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,4
chr19	7755472	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,4
chr19	7755478	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,4
chr19	7755482	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,4
chr19	7755485	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,3
chr19	7755518	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	7761667	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=74,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:1,2,2,3
chr19	7761812	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr19	7762380	.	TCCCCTGCAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:3,3:2,0:3,2,0,3
chr19	7763248	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,4:4,3:2,6,2,5
chr19	7764545	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:1,2:3,2:3,1,3,2
chr19	7764741	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr19	7764772	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	7794605	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	7796041	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7796041_TCC_T:7796041:2,1,1,0
chr19	7796049	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7796041_TCC_T:7796041:2,1,1,0
chr19	7796235	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	7796497	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr19	7808163	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=79,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:6,4:3,7,3,5
chr19	7809953	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,0:7,3:8,10,1,2
chr19	7812181	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,3:7,6:9,6,5,4
chr19	7831166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr19	7831177	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:7831177_A_G:7831177:0,3,0,1
chr19	7831182	.	C	CCCTAAATGCTGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:7831177_A_G:7831177:0,3,0,1
chr19	7831552	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=97,59;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,1:9,1:0|1:7831552_C_T:7831552:9,8,2,1
chr19	7831553	.	C	CATTCTTAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,59;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:7831552_C_T:7831552:11,9,1,1
chr19	7831628	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=99,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:4,6,6,1
chr19	7831700	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=65,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.946:18:1,7:0,10:1,0,8,9
chr19	7833690	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=93,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:6,2,2,2
chr19	7911342	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	7913752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	7913974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	7914147	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=131,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:5,2:8,5,1,1
chr19	7914912	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:5,2:9,0:8,6,1,1
chr19	7916475	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,8:0,3:0,1,8,3
chr19	7918103	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,13:0,8:0,1,13,8
chr19	7925383	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	7928407	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:14,3:4,0:12,6,2,1
chr19	7964165	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=96,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,1:9,3:7,12,1,3
chr19	7970635	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,33:0.667:49:11,24:5,9:13,3,22,11
chr19	7975464	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr19	7976116	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:1,3,0,3
chr19	7976529	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	7990106	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7990106_C_CG:7990106:0,0,1,0
chr19	7990108	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7990106_C_CG:7990106:0,0,1,0
chr19	7990111	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7990106_C_CG:7990106:0,0,1,0
chr19	7990119	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7990106_C_CG:7990106:0,0,1,0
chr19	7992013	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	7996006	.	AG	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:13,2:23,0:27,10,2,0
chr19	7996085	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,43;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:21,3:19,0:10,30,3,0
chr19	7997676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,3:1,4:2,1,4,3
chr19	8000052	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=97,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.274:13:2,0:3,1:5,5,0,3
chr19	8000086	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,1:7,1:1,15,0,2
chr19	8000104	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,4:3,2:0,9,0,6
chr19	8005904	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=13,21;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.472:7:0,1:1,1:4,0,3,0
chr19	8032432	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.487:29:9,6:5,8:11,4,7,7
chr19	8045915	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:8045915_C_T:8045915:5,4,1,1
chr19	8045920	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0|1:8045915_C_T:8045915:5,4,1,1
chr19	8045994	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=109,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,3:8,0:11,8,0,3
chr19	8121360	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=71,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,3:4,3:4,6,5,1
chr19	8122700	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:8122700_T_A:8122700:6,3,1,1
chr19	8122704	.	GA	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:5,0:0|1:8122700_T_A:8122700:7,5,1,1
chr19	8122708	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:0|1:8122700_T_A:8122700:7,5,1,1
chr19	8131213	.	TCG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8131213_TCG_T:8131213:0,0,0,1
chr19	8131218	.	T	TGTTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8131213_TCG_T:8131213:0,0,0,1
chr19	8131220	.	G	GACTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8131213_TCG_T:8131213:0,0,0,1
chr19	8145921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,3,4
chr19	8148042	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	8148314	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	8151239	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:3,4:4,8:0|1:8151239_G_C:8151239:5,2,5,7
chr19	8151261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.437:14:3,5:5,1:1|0:8151239_G_C:8151239:1,7,1,5
chr19	8154990	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:2,1,6,0
chr19	8156523	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	8159409	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,10:3,4:3,6,6,8
chr19	8160812	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,3:2,6:5,0,8,1
chr19	8161038	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=219,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:8161038_TG_CT:8161038:0,2,0,1
chr19	8161041	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=219,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:8161038_TG_CT:8161038:0,2,0,1
chr19	8161516	.	C	CTTGCGGCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:8161516_C_CTTGCGGCTT:8161516:0,0,0,1
chr19	8161519	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8161516_C_CTTGCGGCTT:8161516:0,0,0,1
chr19	8161521	.	G	GTGCCCTCCCCCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8161516_C_CTTGCGGCTT:8161516:0,0,0,1
chr19	8162319	.	CA	TT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:8162319_CA_TT:8162319:3,3,1,1
chr19	8162323	.	G	GCAGACACCGAGCTAGCT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:8162319_CA_TT:8162319:3,3,1,1
chr19	8162327	.	G	GACA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.416:5:3,2:0,0:0|1:8162327_G_GACA:8162327:1,2,1,1
chr19	8162329	.	C	CGAGCTAGCTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:3,1:0,0:0|1:8162327_G_GACA:8162327:1,2,1,1
chr19	8167590	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,4:1,3:4,1,5,2
chr19	8168399	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr19	8168545	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:7,8:7,10:8,7,10,8
chr19	8173207	.	A	ACCAGAAACCAGCAGGCTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr19	8174650	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	8176458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=218,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:8176458_A_G:8176458:3,0,3,0
chr19	8176463	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:8176458_A_G:8176458:0,0,6,0
chr19	8176569	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=99,101;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr19	8176640	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=70,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:5,6,3,3
chr19	8176919	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=62,86;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:1,1:1,8:1,1,4,6
chr19	8183871	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,7:5,9:2,5,6,12
chr19	8188812	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=75,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.484:37:7,7:12,10:7,12,10,8
chr19	8190674	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=194,192;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.360:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr19	8190680	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=194,192;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr19	8190750	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,1:3,5:6,2,3,4
chr19	8190970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr19	8191238	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0|1:8191238_C_T:8191238:0,0,5,13
chr19	8191248	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0|1:8191238_C_T:8191238:0,0,4,15
chr19	8191323	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr19	8191678	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:0|1:8191678_C_T:8191678:6,5,1,1
chr19	8191692	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=77,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:8191678_C_T:8191678:7,6,1,1
chr19	8191694	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=71,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:8191678_C_T:8191678:7,7,1,1
chr19	8191696	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:8191678_C_T:8191678:7,7,1,1
chr19	8196358	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=332,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:8196358_A_C:8196358:1,0,1,0
chr19	8196361	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,11;MFRL=266,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:8196358_A_C:8196358:2,0,1,0
chr19	8196368	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:8196358_A_C:8196358:3,0,1,0
chr19	8196374	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:8196358_A_C:8196358:4,0,1,0
chr19	8197786	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	8197865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr19	8201051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=96,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:1,2:4,1:1,4,2,2
chr19	8202944	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	8206559	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=105,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,3:0,6:0|1:8206559_G_C:8206559:2,3,6,3
chr19	8206568	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:4,3:0,2:0|1:8206559_G_C:8206559:1,3,5,3
chr19	8206607	.	A	ACCCACT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr19	8206748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,3:4,0,3,2
chr19	8209926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,2913;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	8212163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr19	8320656	.	TGGGGCGGGGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr19	8322917	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,0:1,5:1,6,0,5
chr19	8326904	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr19	8367568	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr19	8386367	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr19	8386998	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,4:3,6:3,9,0,10
chr19	8398069	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr19	8398949	.	CTCGCTGTCGCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	8402599	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=207,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	8464653	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr19	8467235	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr19	8467538	.	C	CTTGTTTTTTTCTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGTTTTTTTCTTT;STR;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,4:0,0:0,1,1,4
chr19	8486633	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr19	8503204	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr19	8528277	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr19	8528310	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=73.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,17:0,0,19,3
chr19	8530254	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=91,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:18,0:19,3:22,16,2,1
chr19	8536373	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	8548015	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:9,1:4,2:13,0,3,0
chr19	8548175	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:1,11,1,2
chr19	8551093	.	C	CCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=216,134;MMQ=60,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr19	8551094	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=134,216;MMQ=32,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,2,2
chr19	8551852	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr19	8553654	.	GGTGGCCGAGAGAGCCTGCCGGATGATGAATGGCATGAAGCTGA	G	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,3:0.039:105:29,0:22,3:58,44,2,1
chr19	8555137	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=104,90;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.179:43:16,0:17,7:18,18,0,7
chr19	8555886	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:7,4:3,2:5,5,2,5
chr19	8567340	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8567340_CA_C:8567340:0,1,1,0
chr19	8567345	.	CCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:1,0:0|1:8567340_CA_C:8567340:0,1,1,0
chr19	8575854	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	8576307	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr19	8577174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:6,1,2,0
chr19	8651245	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:3,1:13,2:10,7,1,2
chr19	8654512	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:0,14,1,1
chr19	8656590	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=200,139;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:5,0,2,1
chr19	8660890	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:0,1:3,2:3,1,4,0
chr19	8669873	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,12,9
chr19	8808900	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=78,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:6,5:6,4:6,6,7,2
chr19	8808942	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:5,1,3,5
chr19	8809159	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr19	8841558	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,10:0,14:0,0,10,14
chr19	8841655	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,4:3,0:6,7,0,4
chr19	8923238	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:12,3:21,0:22,11,0,3
chr19	8923260	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=115,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:12,0:16,6:18,10,2,4
chr19	8923279	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=84,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:15,0:13,2:0|1:8923279_C_T:8923279:15,14,1,1
chr19	8923289	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=107,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:11,2:0|1:8923279_C_T:8923279:15,12,1,1
chr19	8923291	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:14,0:11,2:0|1:8923279_C_T:8923279:14,12,1,1
chr19	8923292	.	C	CATG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:15,0:11,1:0|1:8923279_C_T:8923279:14,12,1,1
chr19	8923996	.	C	CATGGGCCAGTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=273,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	8932621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr19	8953664	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,253;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:7,7,0,2
chr19	8962315	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=93,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr19	8962461	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,121;MMQ=56,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:4,2:1,0:2,3,0,2
chr19	8971852	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:8971852_C_CAA:8971852:0,3,0,1
chr19	8971853	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:8971852_C_CAA:8971852:0,3,0,1
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chr19	8987348	.	A	AAG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AG;STR;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.781:16:2,4:1,0:2,1,2,11
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chr19	8994285	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:2,7,3,5
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chr19	8995853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=72,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0|1:8995853_T_C:8995853:3,1,3,2
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chr19	8999311	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,1:4,1:5,1,2,0
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chr19	8999438	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=125,71;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,14:0.312:46:14,8:18,6:0|1:8999438_A_T:8999438:15,17,6,8
chr19	8999441	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=117,70;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.220:48:16,6:22,2:0|1:8999441_G_A:8999441:19,19,4,6
chr19	8999443	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=23,26;MFRL=117,70;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.220:48:15,7:20,3:0|1:8999441_G_A:8999441:19,19,4,6
chr19	8999449	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=123,70;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,16:0.362:45:14,9:15,7:0|1:8999438_A_T:8999438:14,15,8,8
chr19	8999453	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=106,129;MMQ=52,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.184:41:19,3:14,4:16,18,4,3
chr19	9000064	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,4:2,0,1,4
chr19	9000169	.	CA	TG	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=92,84;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:22,5:13,0:0|1:9000169_CA_TG:9000169:25,12,5,0
chr19	9000185	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=92,84;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:16,5:15,0:22,11,5,0
chr19	9000187	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=92,84;MMQ=60,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.150:38:18,5:15,0:0|1:9000169_CA_TG:9000169:22,11,5,0
chr19	9000194	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=99,84;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:19,5:14,0:0|1:9000169_CA_TG:9000169:23,12,5,0
chr19	9000205	.	CA	AG	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=102,84;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:20,5:15,0:23,14,5,0
chr19	9000326	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,2,2
chr19	9000583	.	AAA	GCC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:9000583_AAA_GCC:9000583:3,12,1,1
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chr19	9002113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,3,1
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chr19	9002440	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,0:0,4:2,0,3,1
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chr19	9002519	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=113,85;MMQ=60,35;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:0|1:9002493_T_C:9002493:12,8,2,2
chr19	9003706	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:12,1:5,1:2,18,0,2
chr19	9003749	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=167,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr19	9005093	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:3,1,2,0
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chr19	9006405	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=69,154;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:27,1:22,1:0|1:9006392_C_T:9006392:35,17,1,1
chr19	9006415	.	TT	CA	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=68,69;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:23,3:18,2:0|1:9006415_TT_CA:9006415:30,15,2,3
chr19	9006418	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=68,69;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:23,3:18,2:0|1:9006415_TT_CA:9006415:28,15,2,3
chr19	9006437	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=30,22;MFRL=65,69;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:25,3:15,1:0|1:9006415_TT_CA:9006415:28,15,2,3
chr19	9006441	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=62,81;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:23,3:14,1:0|1:9006415_TT_CA:9006415:24,14,1,3
chr19	9006444	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=30,21;MFRL=65,81;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:21,3:14,1:0|1:9006415_TT_CA:9006415:22,14,1,3
chr19	9006463	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=20,31;MFRL=91,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:8,3:7,2:7,9,3,2
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chr19	9006778	.	G	GGGT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=76,220;MMQ=60,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:7,0:0|1:9006774_G_A:9006774:11,9,0,2
chr19	9006797	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=114,220;MMQ=60,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:8,2:2,0:0|1:9006797_T_C:9006797:6,4,0,2
chr19	9006805	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=121,220;MMQ=60,38;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:2,0:0|1:9006797_T_C:9006797:5,5,0,2
chr19	9007630	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=267,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr19	9007748	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.288:15:7,1:4,3:7,4,4,0
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chr19	9007820	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=24,34;MFRL=77,82;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:21,0:12,2:0|1:9007820_A_G:9007820:19,18,0,2
chr19	9007823	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=77,82;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:22,0:12,2:0|1:9007820_A_G:9007820:18,18,0,2
chr19	9007829	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=77,82;MMQ=60,33;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:23,0:14,2:0|1:9007820_A_G:9007820:18,19,0,2
chr19	9007832	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=71,82;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:21,0:13,3:16,18,1,2
chr19	9007850	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=23,35;MFRL=118,82;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:14,0:9,2:0|1:9007850_T_C:9007850:9,14,0,2
chr19	9007851	.	AGG	A	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=23,27;MFRL=118,82;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:12,0:7,2:0|1:9007850_T_C:9007850:9,14,0,2
chr19	9008248	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=30,21;MFRL=153,81;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:7,4:16,1:14,9,4,1
chr19	9008264	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=145,81;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.203:32:11,5:14,1:16,10,4,2
chr19	9008269	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=155,81;MMQ=60,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:13,4:14,1:18,10,3,2
chr19	9008290	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=141,81;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,4:6,1:9,7,3,2
chr19	9008292	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=130,81;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,5:6,1:8,7,4,2
chr19	9008303	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=141,81;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,3:6,1:9,7,2,2
chr19	9009254	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=139,136;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:7,1:15,2,2,1
chr19	9009276	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=164,136;MMQ=27,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:13,2:45,1:53,7,2,1
chr19	9009305	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=95,157;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.133:34:13,3:16,1:17,13,3,1
chr19	9009750	.	GA	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=98,60;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,2:7,3:0|1:9009750_GA_TG:9009750:0,8,1,4
chr19	9009761	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=85,60;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,2:3,3:0|1:9009750_GA_TG:9009750:0,5,1,4
chr19	9009772	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=85,60;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0|1:9009750_GA_TG:9009750:0,5,1,4
chr19	9009774	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=85,60;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,2:3,3:0|1:9009750_GA_TG:9009750:0,5,1,4
chr19	9009776	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=145,60;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0|1:9009750_GA_TG:9009750:0,3,1,4
chr19	9010720	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=84,27;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:9010720_A_G:9010720:8,13,0,2
chr19	9010725	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=86,27;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:9010720_A_G:9010720:7,12,0,2
chr19	9010743	.	G	GC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=86,27;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:9010743_G_GC:9010743:9,14,0,2
chr19	9010748	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=86,27;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:9,2:0|1:9010743_G_GC:9010743:9,14,0,2
chr19	9012644	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,0:7,4:4,13,0,4
chr19	9012840	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=15;MBQ=26,20;MFRL=108,65;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,12:0.243:52:24,6:15,6:20,20,7,5
chr19	9012858	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=15;MBQ=31,20;MFRL=91,60;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.175:60:31,3:19,7:25,25,5,5
chr19	9012867	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=15;MBQ=30,20;MFRL=91,69;MMQ=55,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,8:0.121:70:36,4:25,4:27,35,3,5
chr19	9012894	.	A	AG	.	.	DP=69;ECNT=15;MBQ=20,20;MFRL=84,67;MMQ=56,45;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,7:0.121:63:33,3:21,4:0|1:9012894_A_AG:9012894:19,37,3,4
chr19	9012896	.	CA	GG	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=28,20;MFRL=80,97;MMQ=57,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,8:0.138:63:36,1:18,6:0|1:9012896_CA_GG:9012896:19,36,3,5
chr19	9012897	.	AG	A	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=21,20;MFRL=88,77;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,8:0.145:57:31,3:14,5:0|1:9012894_A_AG:9012894:16,33,4,4
chr19	9012902	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=15;MBQ=23,34;MFRL=71,97;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,7:0.151:51:23,1:17,6:0|1:9012896_CA_GG:9012896:16,28,2,5
chr19	9012905	.	T	TG	.	.	DP=47;ECNT=15;MBQ=27,20;MFRL=88,62;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.149:37:13,3:19,2:0|1:9012905_T_TG:9012905:7,25,3,2
chr19	9012908	.	AG	GA	.	.	DP=43;ECNT=15;MBQ=24,20;MFRL=88,87;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.300:38:13,2:12,9:7,20,3,8
chr19	9012910	.	GT	G	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=30,20;MFRL=88,87;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.147:38:13,1:18,2:0|1:9012905_T_TG:9012905:7,26,2,3
chr19	9012913	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=31,22;MFRL=97,77;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:14,1:15,3:6,24,1,3
chr19	9012917	.	AC	GT	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=23,30;MFRL=88,101;MMQ=60,35;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:14,0:11,6:4,21,1,5
chr19	9012918	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=32,22;MFRL=88,83;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.182:25:12,2:8,2:0|1:9012905_T_TG:9012905:3,18,1,3
chr19	9012930	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=31,27;MFRL=122,119;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.238:23:11,3:7,2:0|1:9012930_C_T:9012930:1,17,0,5
chr19	9012937	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=24,31;MFRL=122,122;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:7,0:0|1:9012930_C_T:9012930:1,17,0,2
chr19	9014151	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=84,149947;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:22,0:12,4:20,15,4,0
chr19	9014324	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,1701;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	9016830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,60;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr19	9017340	.	G	GCCCCGACACACA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=95,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,2:9,0:0|1:9017340_G_GCCCCGACACACA:9017340:8,9,0,2
chr19	9017342	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=95,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.139:19:8,2:8,0:0|1:9017340_G_GCCCCGACACACA:9017340:8,9,0,2
chr19	9018166	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,135;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.453:40:17,10:5,8:15,7,11,7
chr19	9018458	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=111,76;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:6,0:13,2:11,8,2,1
chr19	9018463	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=121,76;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.209:25:6,2:14,2:12,8,2,3
chr19	9018476	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=116,108;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,2:15,4:0|1:9018476_G_A:9018476:13,9,3,3
chr19	9018479	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=101,108;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:7,2:14,4:0|1:9018476_G_A:9018476:12,9,3,3
chr19	9018508	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=130,76;MMQ=60,47;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:14,4:13,5:12,15,4,5
chr19	9018539	.	CA	TG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=136,139;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,1:13,1:12,18,0,3
chr19	9018573	.	ATT	GGG	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=140,140;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,1:7,1:0|1:9018573_ATT_GGG:9018573:4,15,0,2
chr19	9018577	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=140,140;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:0|1:9018573_ATT_GGG:9018573:4,15,0,2
chr19	9018600	.	CA	GG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=119,140;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:0|1:9018600_CA_GG:9018600:3,10,0,2
chr19	9018603	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=119,140;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:5,1:0|1:9018600_CA_GG:9018600:3,10,0,2
chr19	9019306	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=71,14027161;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:7,16,0,2
chr19	9019308	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=22,32;MFRL=71,14027161;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:9019308_A_T:9019308:7,16,0,2
chr19	9019312	.	T	TGC	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=74,14027161;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:9019308_A_T:9019308:9,15,0,2
chr19	9019315	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=23,27;MFRL=83,1737489;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:7,0:11,2:0|1:9019308_A_T:9019308:10,9,1,2
chr19	9019320	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=84,1737489;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:8,0:11,3:0|1:9019308_A_T:9019308:10,10,1,2
chr19	9019348	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=119,1737489;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:9019348_A_G:9019348:7,9,1,2
chr19	9019352	.	TG	CT	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=26,34;MFRL=119,1737489;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:9019348_A_G:9019348:7,9,1,2
chr19	9019371	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=27,30;MFRL=104,1737489;MMQ=60,42;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:0|1:9019371_A_C:9019371:9,9,1,2
chr19	9019374	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=26,31;MFRL=104,868745;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,1:0|1:9019371_A_C:9019371:9,9,1,1
chr19	9020666	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr19	9020811	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=94,78;MMQ=60,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.076:63:25,4:32,0:44,15,3,1
chr19	9020829	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=85,78;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.080:60:22,4:32,0:37,19,3,1
chr19	9021015	.	TC	GG	.	.	DP=23;ECNT=28;MBQ=22,31;MFRL=99,131;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:9,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:13,8,2,0
chr19	9021021	.	A	AC	.	.	DP=42;ECNT=28;MBQ=24,30;MFRL=129,131;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:9,2:19,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:25,15,2,0
chr19	9021022	.	TGG	T	.	.	DP=43;ECNT=28;MBQ=21,27;MFRL=120,131;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:8,2:24,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:26,15,2,0
chr19	9021028	.	AGGAGT	A	.	.	DP=41;ECNT=28;MBQ=27,31;MFRL=108,131;MMQ=54,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:12,2:26,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:24,15,2,0
chr19	9021036	.	AG	A	.	.	DP=40;ECNT=28;MBQ=27,31;MFRL=104,131;MMQ=45,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:10,2:26,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:24,14,2,0
chr19	9021038	.	TG	T	.	.	DP=40;ECNT=28;MBQ=23,26;MFRL=104,131;MMQ=45,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:10,2:23,0:0|1:9021015_TC_GG:9021015:23,15,2,0
chr19	9021043	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=28;MBQ=31,28;MFRL=104,130;MMQ=48,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:10,3:27,0:24,14,2,1
chr19	9021069	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=28;MBQ=20,27;MFRL=86,131;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.242:27:9,3:10,3:0|1:9021069_C_T:9021069:11,10,4,2
chr19	9021075	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=28;MBQ=22,29;MFRL=84,131;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:8,3:9,3:0|1:9021069_C_T:9021069:9,10,4,2
chr19	9021080	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=28;MBQ=23,20;MFRL=108,76;MMQ=60,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:0|1:9021080_T_C:9021080:13,10,1,1
chr19	9021084	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=28;MBQ=31,20;MFRL=97,76;MMQ=59,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:14,2:0|1:9021080_T_C:9021080:15,11,1,1
chr19	9021093	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=28;MBQ=31,20;MFRL=90,76;MMQ=59,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:16,2:0|1:9021080_T_C:9021080:15,11,1,1
chr19	9021096	.	G	T,A	.	.	DP=27;ECNT=28;MBQ=30,20,27;MFRL=85,76,132;MMQ=60,31,40;MPOS=25,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.42,7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,2,4:0.100,0.172:26:8,0,1:12,2,3:11,9,3,3
chr19	9021103	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=28;MBQ=23,20;MFRL=86,76;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:16,2:0|1:9021080_T_C:9021080:18,11,1,1
chr19	9021106	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=28;MBQ=30,20;MFRL=86,76;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:12,0:15,2:0|1:9021080_T_C:9021080:18,11,1,1
chr19	9021107	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=28;MBQ=29,27;MFRL=76,132;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:11,1:16,3:18,10,2,2
chr19	9021118	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=28;MBQ=20,22;MFRL=86,100;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:17,1:13,3:18,13,1,3
chr19	9021161	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=28;MBQ=30,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:14,2:27,1:0|1:9021161_C_T:9021161:25,16,2,1
chr19	9021164	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=28;MBQ=30,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:13,2:27,1:0|1:9021161_C_T:9021161:25,16,2,1
chr19	9021172	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=28;MBQ=30,20;MFRL=105,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,2:11,1:0|1:9021161_C_T:9021161:10,16,2,1
chr19	9021174	.	A	AGGGGCT,AGG	.	.	DP=27;ECNT=28;MBQ=24,27,20;MFRL=105,132,48;MMQ=60,37,60;MPOS=21,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.91,5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,4,2:0.188,0.101:24:10,1,2:8,3,0:7,11,1,5
chr19	9021176	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=28;MBQ=31,20;MFRL=125,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:10,0:0|1:9021176_C_G:9021176:7,16,1,1
chr19	9021178	.	GCCATAAC	G	.	.	DP=27;ECNT=28;MBQ=28,33;MFRL=94,132;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:13,1:8,3:8,15,0,4
chr19	9021179	.	CC	GA	.	.	DP=27;ECNT=28;MBQ=29,20;MFRL=115,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:8,0:0|1:9021176_C_G:9021176:7,14,1,1
chr19	9021182	.	TAACTG	T	.	.	DP=26;ECNT=28;MBQ=22,20;MFRL=117,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,2:8,0:0|1:9021176_C_G:9021176:7,13,1,1
chr19	9021186	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=28;MBQ=27,30;MFRL=118,132;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:7,1:9,3:0|1:9021186_T_TG:9021186:6,11,0,4
chr19	9021190	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=28;MBQ=24,32;MFRL=125,132;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,0:5,3:0|1:9021186_T_TG:9021186:4,9,0,3
chr19	9021197	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=28;MBQ=24,32;MFRL=125,132;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:0|1:9021186_T_TG:9021186:2,9,0,3
chr19	9024546	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:12,1:3,2:7,8,2,1
chr19	9024758	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr19	9024842	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=30,20;MFRL=108,54;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:10,1:6,2:7,10,2,1
chr19	9024845	.	C	CCT	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=108,54;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:11,1:5,2:0|1:9024845_C_CCT:9024845:7,10,2,1
chr19	9024855	.	GT	AG	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=30,20;MFRL=110,54;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:12,1:6,2:0|1:9024845_C_CCT:9024845:9,10,2,1
chr19	9024871	.	C	CGA	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=31,20;MFRL=142,54;MMQ=60,49;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:13,1:6,2:0|1:9024871_C_CGA:9024871:13,10,2,1
chr19	9024872	.	TTC	T	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=26,20;MFRL=126,54;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:13,1:8,2:0|1:9024871_C_CGA:9024871:14,10,2,1
chr19	9024875	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=25,20;MFRL=144,54;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:15,1:9,2:0|1:9024871_C_CGA:9024871:15,11,2,1
chr19	9024879	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=23,20;MFRL=142,54;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,1:11,2:0|1:9024871_C_CGA:9024871:15,10,2,1
chr19	9024882	.	TT	CG	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=24,20;MFRL=142,54;MMQ=60,49;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,1:11,2:0|1:9024871_C_CGA:9024871:14,11,2,1
chr19	9024930	.	GGGCTTT	G	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=31,0;MFRL=101,56;MMQ=60,50;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,0:14,0:17,14,1,1
chr19	9024988	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=123,57;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:7,2:11,2:0|1:9024988_C_G:9024988:5,14,1,3
chr19	9024994	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=57,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:1,7:0,11:0,3,3,15
chr19	9024995	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=33,19;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,0:0|1:9024988_C_G:9024988:3,15,0,2
chr19	9024998	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=30,22;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,1:11,0:0|1:9024988_C_G:9024988:3,16,0,2
chr19	9025009	.	T	TAA	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,2:12,0:0|1:9025009_T_TAA:9025009:1,15,0,2
chr19	9025010	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,2:11,0:0|1:9025009_T_TAA:9025009:1,15,0,2
chr19	9025014	.	G	GGGGAGGGATAGCATTA	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:11,0:0|1:9025009_T_TAA:9025009:1,15,0,2
chr19	9025604	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=94,83;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:19,1:15,3:22,12,4,0
chr19	9028432	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr19	9033314	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=87,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:5,12:7,6:5,7,11,7
chr19	9033548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,1:2,4:3,1,5,1
chr19	9038415	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=99,81;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,0:8,10:8,9,1,9
chr19	9046657	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=100,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:9046657_G_A:9046657:3,6,1,1
chr19	9046670	.	CCA	TAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=101,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:3,0:0|1:9046657_G_A:9046657:2,6,1,1
chr19	9046675	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=110,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:9046657_G_A:9046657:1,5,1,1
chr19	9048227	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=95,281;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,1:7,1:8,5,2,0
chr19	9048265	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=122,92;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,0:2,4,1,1
chr19	9049726	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=67,108;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.583:24:5,9:4,5:6,4,9,5
chr19	9049745	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,76;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:23,4:7,0:18,12,4,0
chr19	9049926	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=80,64;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,3:18,0:25,4,3,0
chr19	9050164	.	AGTGGTCTTCAGAGCTGTGGTG	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGGTCTTCAGAGCTGTGGTG;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.140:21:6,2:6,0:13,6,1,1
chr19	9054196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:12,3,2,1
chr19	9056480	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,2:10,2:8,9,2,2
chr19	9059062	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=191,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.255:45:13,5:20,6:31,3,6,5
chr19	9059808	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chr19	9060605	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr19	9060656	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=88,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,1,4
chr19	9061559	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:4,4:3,6:5,3,7,3
chr19	9061782	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=62,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,0:12,3:10,9,3,0
chr19	9062544	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr19	9062960	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=63,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:7,3:3,0:5,5,1,2
chr19	9063171	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:9,13,2,2
chr19	9063572	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=101,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.346:35:9,0:14,11:11,12,0,12
chr19	9063678	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,4:3,9:3,6,7,6
chr19	9063935	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,95;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,1:2,5:0,3,3,3
chr19	9064332	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.092:57:23,4:25,0:40,12,4,1
chr19	9064420	.	GC	TT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=84,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:9064420_GC_TT:9064420:5,14,0,2
chr19	9064423	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=84,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:9064420_GC_TT:9064420:4,14,0,2
chr19	9064426	.	AC	GA	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=84,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:9064420_GC_TT:9064420:4,15,0,2
chr19	9064433	.	TC	GT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=130,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,2:6,1:0|1:9064420_GC_TT:9064420:3,12,1,2
chr19	9064436	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,22;MFRL=141,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.230:16:6,2:6,1:0|1:9064420_GC_TT:9064420:4,9,1,2
chr19	9065851	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=139,101;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.183:25:10,0:9,4:0|1:9065851_C_T:9065851:12,9,0,4
chr19	9065858	.	A	ACC	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=26,38;MFRL=137,101;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:14,0:9,4:0|1:9065851_C_T:9065851:13,12,0,4
chr19	9065859	.	G	GTTGTTAGTGAAAATGTGTTT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=138,101;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:14,0:10,1:0|1:9065851_C_T:9065851:12,12,0,4
chr19	9065897	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=149,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:15,1:9,3:11,13,1,3
chr19	9066390	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr19	9068530	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:7,5:8,2,5,4
chr19	9069660	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=91,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:10,8,3,0
chr19	9070079	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:2,7:2,0:1,3,2,6
chr19	9070837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr19	9071584	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=111,135;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.289:19:6,0:6,5:7,7,0,5
chr19	9071763	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,2,8
chr19	9072313	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=60,92;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:2,4,4,3
chr19	9073666	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:16,0:3,10:3,16,0,10
chr19	9074950	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,76;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.570:21:2,7:6,5:8,1,7,5
chr19	9075565	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:8,5:8,12:5,11,6,11
chr19	9075584	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=87,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:5,4:6,6:4,8,3,7
chr19	9075635	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,2:1,5:0,4,5,2
chr19	9076278	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:3,8,3,5
chr19	9076728	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,16:0.200:78:10,9:47,6:49,13,11,5
chr19	9076825	.	T	TGGTGGTG	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.115:23:14,0:6,2:0|1:9076825_T_TGGTGGTG:9076825:9,12,1,1
chr19	9076831	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:0|1:9076825_T_TGGTGGTG:9076825:9,13,1,1
chr19	9076832	.	G	GGTTCCC	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=127,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:7,0:9,14,1,1
chr19	9076858	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:4,7:0,3:1,3,4,6
chr19	9076991	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=110,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,8:6,3:5,9,5,6
chr19	9077060	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:1,1,0,3
chr19	9077803	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.454:40:13,12:8,6:13,9,12,6
chr19	9077902	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:5,8:6,7:2,10,3,12
chr19	9082514	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,87;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.594:40:6,11:10,13:7,9,12,12
chr19	9083124	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:6,3,2,6
chr19	9084401	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:9,2,5,3
chr19	9087615	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,22:0,0,28,11
chr19	9088017	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,192;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:4,5:9,9:6,7,11,3
chr19	9090837	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=90,102;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.127:41:22,2:14,2:21,15,5,0
chr19	9213942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=219,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr19	9214019	.	C	CACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9214019_C_CACA:9214019:1,3,0,1
chr19	9214020	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:9214019_C_CACA:9214019:1,3,0,1
chr19	9226028	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:10,0:17,3:15,12,1,2
chr19	9226269	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,6:9,0:13,9,0,6
chr19	9237103	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:5,0:11,8:10,7,0,8
chr19	9237321	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=125,141;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:14,6:10,0:13,11,6,0
chr19	9237717	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr19	9237721	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:9237721_T_C:9237721:1,3,0,1
chr19	9237722	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:9237721_T_C:9237721:1,3,0,1
chr19	9267319	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=96,73;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:13,4:4,8:8,9,6,6
chr19	9297672	.	G	GCAGCGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=206,188;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9297672_G_GCAGCGT:9297672:0,1,0,1
chr19	9297677	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=206,188;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9297672_G_GCAGCGT:9297672:0,1,0,1
chr19	9298903	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,270;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9298903_G_A:9298903:0,0,0,1
chr19	9298905	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,270;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9298903_G_A:9298903:0,0,0,1
chr19	9298912	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,270;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9298903_G_A:9298903:0,0,0,1
chr19	9361740	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:5,0:7,3:8,4,1,3
chr19	9361940	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=127,177;MMQ=48,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9361940_A_C:9361940:2,2,0,1
chr19	9361943	.	CCCCCATGTACT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=127,177;MMQ=48,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:9361940_A_C:9361940:2,2,0,1
chr19	9362060	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=94,57;MMQ=60,21;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,3:9,0:9,9,0,3
chr19	9449149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:3,1,2,1
chr19	9449337	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:0,4,2,3
chr19	9490358	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	9490814	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,5:3,7:1,4,4,8
chr19	9524067	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:12,10,1,1
chr19	9524147	.	ATCCGCATGTGAAGGTTAACACACGTGGGAAACTTAAAAGCTTTGCCACATTCCATACACGTGAATGGTTTTTTGGCGCTGTGGG	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,14:0.197:45:10,12:4,1:0|1:9524147_ATCCGCATGTGAAGGTTAACACACGTGGGAAACTTAAAAGCTTTGCCACATTCCATACACGTGAATGGTTTTTTGGCGCTGTGGG_A:9524147:15,16,5,9
chr19	9524185	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,9:0.500:18:5,7:4,2:1|0:9524147_ATCCGCATGTGAAGGTTAACACACGTGGGAAACTTAAAAGCTTTGCCACATTCCATACACGTGAATGGTTTTTTGGCGCTGTGGG_A:9524147:6,3,6,3
chr19	9526274	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:7,2,1,1
chr19	9577920	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=174,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:9577920_CCA_C:9577920:5,3,1,1
chr19	9577923	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=164,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:9577920_CCA_C:9577920:5,4,1,1
chr19	9577925	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:9577920_CCA_C:9577920:5,4,1,1
chr19	9577929	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:9577920_CCA_C:9577920:4,4,1,1
chr19	9579104	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	9582092	.	TAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:2,3:1,0:2,2,1,3
chr19	9644585	.	GTAAAGTCCACTCCT	G	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=112,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,2:0.049:59:18,1:29,1:22,35,1,1
chr19	9644735	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9644735_GA_CC:9644735:0,1,0,1
chr19	9644740	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=286,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9644735_GA_CC:9644735:0,1,0,1
chr19	9644742	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=286,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9644735_GA_CC:9644735:0,1,0,1
chr19	9721986	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,51;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:9721986_G_A:9721986:7,8,1,1
chr19	9721993	.	C	CTGAACAGAACCCAGGGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,51;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:10,2:0|1:9721986_G_A:9721986:6,8,1,1
chr19	9722013	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=136,84;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:2,5,2,0
chr19	9771286	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:2,1:2,1:5,3,2,0
chr19	9872701	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:7,1,1,1
chr19	9875619	.	GAATCCATCAGT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATCCATCAGT;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:11,2:16,12,1,1
chr19	9921669	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,0:0|1:9921669_T_C:9921669:4,6,2,0
chr19	9921673	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:4,0:0|1:9921669_T_C:9921669:5,5,2,0
chr19	9921678	.	AG	CC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,1:3,0:0|1:9921669_T_C:9921669:5,6,2,0
chr19	9958660	.	C	CTGAATAAGTCGTCCTACAAATATGAAGGTCAGTGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,51;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	9958878	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr19	9964823	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr19	10071063	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr19	10071188	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:9,1:1,2:7,4,1,2
chr19	10077931	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	10078171	.	TCACA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=119,67;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CA;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,1:0,3,1,1
chr19	10079013	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,4:2,3:3,4,2,5
chr19	10080410	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=210,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr19	10080619	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,3:0,2:1,2,4,1
chr19	10081200	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr19	10081276	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:8,11:10,10:9,9,10,11
chr19	10084813	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=116,85;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.096:40:11,3:22,0:22,15,3,0
chr19	10087368	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:10087368_C_T:10087368:0,1,1,1
chr19	10087370	.	AC	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0|1:10087368_C_T:10087368:0,1,1,1
chr19	10090716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=113,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:1,4,0,3
chr19	10091294	.	TCA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.219:29:10,3:7,2:14,9,5,1
chr19	10091541	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,43;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:2,1:1,4,1,1
chr19	10096674	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,1,0,1
chr19	10096681	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,1,0,1
chr19	10096683	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,1,0,1
chr19	10096685	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,0,0,1
chr19	10096688	.	G	GACCTCTTTTCCTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,0,0,1
chr19	10096689	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10096674_A_T:10096674:0,0,0,1
chr19	10102839	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=148,222;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:10102839_TT_CA:10102839:0,3,0,1
chr19	10102847	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=148,222;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:10102839_TT_CA:10102839:0,3,0,1
chr19	10102850	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=148,222;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:10102839_TT_CA:10102839:0,3,0,1
chr19	10103858	.	A	ACCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10103858_A_ACCC:10103858:0,0,0,1
chr19	10103860	.	C	CAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10103858_A_ACCC:10103858:0,0,0,1
chr19	10106380	.	G	GAAATGCAGCAAAGCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=141,199;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.384:4:1,1:1,0:0|1:10106380_G_GAAATGCAGCAAAGCA:10106380:0,3,0,1
chr19	10106381	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=141,199;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.384:4:1,1:0,0:0|1:10106380_G_GAAATGCAGCAAAGCA:10106380:0,3,0,1
chr19	10106384	.	T	TAGAAACTGGTGTCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=144,199;MMQ=60,33;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10106380_G_GAAATGCAGCAAAGCA:10106380:0,2,0,1
chr19	10106386	.	C	CCGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=144,199;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10106380_G_GAAATGCAGCAAAGCA:10106380:0,2,0,1
chr19	10106779	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:14,0:14,10,4,0
chr19	10108756	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=102,181;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:11,0:15,7:13,13,0,7
chr19	10108908	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=188,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr19	10112148	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	10114893	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr19	10116375	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr19	10116386	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:10116386_G_C:10116386:5,13,1,1
chr19	10116392	.	T	TACTCTCCCACCAC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:10116386_G_C:10116386:3,13,1,1
chr19	10116393	.	G	GCCCAGATTT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,1:0|1:10116386_G_C:10116386:3,13,1,1
chr19	10116703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=85,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,6:2,7:1,1,6,7
chr19	10127668	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr19	10131849	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=322,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.783:7:0,1:1,4:0|1:10131849_C_CT:10131849:1,0,5,1
chr19	10131866	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=322,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.824:9:0,3:1,5:0|1:10131849_C_CT:10131849:1,0,7,1
chr19	10157743	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:2,1,5,1
chr19	10160578	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=121,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr19	10165844	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	10165854	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr19	10165932	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr19	10166233	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0|1:10166233_C_T:10166233:0,0,3,0
chr19	10166243	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:10166233_C_T:10166233:0,0,3,1
chr19	10166253	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:10166233_C_T:10166233:0,0,3,1
chr19	10169477	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr19	10200298	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:15,2:0|1:10200298_C_T:10200298:19,7,1,1
chr19	10200318	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:12,2:0|1:10200298_C_T:10200298:17,8,1,1
chr19	10218408	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:4,1,5,1
chr19	10218434	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,2:2,4:5,4,3,3
chr19	10221151	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:1,5,2,6
chr19	10221855	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr19	10225338	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=89,55;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:21,0:16,4:0|1:10225338_C_T:10225338:18,19,0,4
chr19	10225343	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=82,55;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:19,0:14,4:0|1:10225338_C_T:10225338:15,18,0,4
chr19	10225682	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	10226256	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:4,9:9,0:6,7,4,5
chr19	10226340	.	GTGCC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGCC;STR;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,5:5,8:5,8,8,5
chr19	10226760	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:10226760_A_T:10226760:5,10,1,1
chr19	10226764	.	G	GAATAGA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:10226760_A_T:10226760:5,10,1,1
chr19	10227677	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=149,35;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:0|1:10227677_G_T:10227677:11,11,1,1
chr19	10227683	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=149,35;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:10227677_G_T:10227677:10,10,1,1
chr19	10227684	.	G	GTCCCCCACA	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=140,35;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:9,2:0|1:10227677_G_T:10227677:9,11,1,1
chr19	10227688	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=133,35;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:10227677_G_T:10227677:7,10,1,1
chr19	10227690	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=133,35;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:10227677_G_T:10227677:7,10,1,1
chr19	10229240	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	10229267	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:2,16,0,2
chr19	10229297	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.346:50:16,6:17,11:6,27,7,10
chr19	10229521	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,5:6,1:2,6,0,6
chr19	10229726	.	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=122,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCAGTCCTCACTCACCTCCC;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.308:25:4,5:8,2:9,9,4,3
chr19	10251579	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:1,3,1,1
chr19	10251747	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=86,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,2:5,7:5,3,5,4
chr19	10257193	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=140,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10257193_C_A:10257193:0,4,0,1
chr19	10257194	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10257194_A_C:10257194:0,4,0,1
chr19	10257196	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10257194_A_C:10257194:0,4,0,1
chr19	10257197	.	G	GCTTCCGCAGCTGGC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=140,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10257193_C_A:10257193:0,4,0,1
chr19	10257198	.	AAT	A,GAT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,26,32;MFRL=141,223,103;MMQ=60,60,60;MPOS=3,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr19	10257199	.	A	ACTCGC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=23,24;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:10257194_A_C:10257194:0,3,0,1
chr19	10257208	.	A	AATATACTT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:10257208_A_AATATACTT:10257208:0,1,0,1
chr19	10257212	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,35;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10257208_A_AATATACTT:10257208:0,1,0,1
chr19	10265248	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:3,9:3,4:4,2,7,7
chr19	10291322	.	TTCA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TCA;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr19	10334443	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:1,6:6,2:8,0,8,0
chr19	10367521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:10367521_G_A:10367521:2,1,0,1
chr19	10367529	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10367521_G_A:10367521:2,0,0,1
chr19	10369086	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,4:4,9:6,3,7,6
chr19	10370542	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr19	10385743	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	10398004	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:9,9,0,2
chr19	10400810	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=77,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,1:5,4:4,2,4,1
chr19	10402017	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:3,8,1,1
chr19	10402131	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.520:25:6,7:4,4:5,7,7,6
chr19	10403947	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:8,10:8,8:7,9,7,11
chr19	10418784	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	10418838	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,1:0,4:1,1,6,0
chr19	10425986	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr19	10425992	.	TGG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,2:2,2:3,1,4,0
chr19	10425994	.	GGT	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr19	10425995	.	G	GTTTT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,23;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.835:8:0,3:1,4:0,1,7,0
chr19	10426024	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:0,3:3,3:2,1,1,5
chr19	10426557	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.262:39:13,1:15,0:0|1:10426557_A_C:10426557:2,27,10,0
chr19	10426559	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,19;RU=G;STR;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,10:0.262:39:14,1:15,4:0|1:10426557_A_C:10426557:2,27,10,0
chr19	10426628	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,2,19
chr19	10426652	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:4,7,0,3
chr19	10428506	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.387:20:4,2:8,0:0,12,8,0
chr19	10428510	.	C	CGGGGGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,10;RU=G;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.302:19:4,1:8,2:1,12,6,0
chr19	10429120	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr19	10429138	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr19	10431799	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	10431960	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10431960_G_C:10431960:0,1,0,1
chr19	10431966	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10431960_G_C:10431960:0,1,0,1
chr19	10432334	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.321:20:7,3:6,3:6,8,3,3
chr19	10441243	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=156,6961112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:5,2:0|1:10441243_T_A:10441243:2,6,1,1
chr19	10441248	.	G	GAGTAGGAGGAGAAAAGGAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=156,6961112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:0|1:10441243_T_A:10441243:2,6,1,1
chr19	10444826	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:0,5:4,3:1,3,5,4
chr19	10446584	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,0,2
chr19	10450326	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=82,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:5,7,2,1
chr19	10461912	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=132,198;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:2,1:0,8,0,2
chr19	10461923	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=138,128;MMQ=55,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr19	10461935	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=133,140;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	10461939	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=192,96;MMQ=32,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	10464645	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr19	10506671	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:23,1:14,1:24,13,1,1
chr19	10541784	.	GT	AG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=102,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:10541784_GT_AG:10541784:1,4,1,1
chr19	10541788	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:0|1:10541784_GT_AG:10541784:1,4,1,1
chr19	10541792	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=66,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:10541784_GT_AG:10541784:1,3,1,1
chr19	10564034	.	G	GAAAGAGCGAGACTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:4,0:3,2,1,1
chr19	10565634	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:4,2:0,0:0|1:10565634_A_AC:10565634:3,1,0,2
chr19	10565637	.	T	TCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:10565634_A_AC:10565634:3,1,0,2
chr19	10565638	.	T	TGGCTAACA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:10565634_A_AC:10565634:3,1,0,2
chr19	10572374	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.760:2:0,0:0,2:0|1:10572374_G_T:10572374:0,0,1,1
chr19	10572376	.	G	GCAAATCTAGTGAAAAGACAGCAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:10572374_G_T:10572374:0,0,1,1
chr19	10600318	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=81,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.270:15:3,1:3,0:3,8,4,0
chr19	10600322	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.320:16:5,1:4,0:3,8,5,0
chr19	10602180	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr19	10610475	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,3:10,0:6,9,1,2
chr19	10659737	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:1,9:0,16:0,1,10,15
chr19	10659804	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,29,34;MFRL=165,200,171;MMQ=60,50,60;MPOS=8,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.30,8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.232,0.378:10:3,2,2:1,0,2:0,4,1,5
chr19	10659807	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.408:10:5,2:1,2:0,6,1,3
chr19	10662622	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,1:14,2:13,12,0,3
chr19	10665691	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	10665912	.	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,148;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,3:1,7:1,0,8,12
chr19	10668383	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr19	10668953	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr19	10670978	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,0,1
chr19	10670992	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	10672493	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr19	10673340	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=489,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,9:1,11:1,0,14,6
chr19	10676343	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr19	10676487	.	G	GC,GCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31,30;MFRL=192,139,112;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=C;STR;TLOD=10.02,15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,10:0.344,0.525:18:2,1,5:0,4,5:1,1,5,11
chr19	10684997	.	T	TATTCCAGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=207,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	10689518	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:8,2:9,0:12,5,2,0
chr19	10689537	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,0:11,6:14,7,6,0
chr19	10690321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	10690557	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,4,17
chr19	10697773	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr19	10697801	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr19	10713291	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:8,0:3,4:5,7,0,4
chr19	10741681	.	C	CA,CAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=101,107,112;MMQ=60,60,50;MPOS=8,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=16.34,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,13,6:0.504,0.211:28:3,5,2:3,3,1:5,4,11,8
chr19	10741907	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr19	10742287	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr19	10742443	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr19	10742463	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	10745764	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,2:1,3:6,3,2,3
chr19	10747042	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=86,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,1:14,2:9,16,2,1
chr19	10748820	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=96,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.293:28:8,4:12,3:10,10,3,5
chr19	10748850	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:8,9:7,2:7,8,2,9
chr19	10752968	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,3,2
chr19	10790617	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:15,0:12,16,2,1
chr19	10792882	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:3,9,1,1
chr19	10793749	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:3,1,8,1
chr19	10799925	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,60;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:20,2:0|1:10799925_C_T:10799925:15,18,1,1
chr19	10799934	.	A	ACTGTGTCT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=102,60;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,0:18,1:0|1:10799925_C_T:10799925:17,18,1,1
chr19	10818092	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:8,5:8,4:5,11,3,6
chr19	10823375	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,1:6,0,1,1
chr19	10883126	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:11,1,3,0
chr19	10897425	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:2,2:6,0:1,8,1,1
chr19	10935852	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,147;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:15,0:24,5:26,13,0,5
chr19	10935973	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,127;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr19	10939792	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:3,12:2,7:3,2,9,11
chr19	10941093	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=173,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:10941093_A_T:10941093:0,3,0,1
chr19	10941094	.	C	CAGAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=173,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:10941093_A_T:10941093:0,3,0,1
chr19	10941096	.	CTGGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=173,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:10941093_A_T:10941093:0,3,0,1
chr19	10943572	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	10968940	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:15,0:30,3:5,40,0,3
chr19	10969134	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,3:0,0:0,2,1,2
chr19	10970558	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=86.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,18,8
chr19	11015562	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=182,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr19	11095896	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,3,1
chr19	11095919	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=151,61;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,4:4,0:0|1:11095919_G_A:11095919:8,4,4,0
chr19	11095925	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=149,61;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,4:3,0:0|1:11095919_G_A:11095919:7,4,4,0
chr19	11096004	.	TGAAAG	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=23,17;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,0:8,1:13,13,1,1
chr19	11096851	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:2,2:7,7:7,3,7,2
chr19	11105593	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:3,2,4,2
chr19	11105608	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:4,3,6,1
chr19	11106790	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr19	11107085	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,9:5,6:11,1,11,4
chr19	11107133	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:12,6:2,10:9,5,9,7
chr19	11107295	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=212,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,5:1,1:0,2,0,6
chr19	11113651	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	11118711	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:2,3:6,7:3,5,4,6
chr19	11129600	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=82,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,3:5,3:8,6,4,2
chr19	11132498	.	GCCGC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:10,0:0|1:11132498_GCCGC_G:11132498:11,4,1,1
chr19	11132505	.	GCTGCTGACGGGCACACCGCTGCAGAACAAGCTTCCCGAGCTCTGGGCGCTGCTCAACTT	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=127,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:5,2:8,0:0|1:11132498_GCCGC_G:11132498:14,14,1,1
chr19	11136215	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr19	11168896	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr19	11216242	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=104,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:3,8,2,0
chr19	11218247	.	G	GCTGTTATTTCACAATGAAAGTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr19	11221253	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr19	11221454	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr19	11221457	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,1,2
chr19	11224181	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr19	11224491	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr19	11227480	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:5,2:5,4:8,2,5,1
chr19	11227602	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=67,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,3:3,7:3,4,4,6
chr19	11238807	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,2:5,2:1,4,0,4
chr19	11241877	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:2,0:4,1,3,0
chr19	11241882	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr19	11241915	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:5,4,6,2
chr19	11242044	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:13,2:5,4:7,12,2,4
chr19	11258584	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=22,15;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.427:13:4,3:2,1:6,2,3,2
chr19	11258601	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,1:3,0:0|1:11258601_AAAAAAG_A:11258601:10,8,2,0
chr19	11258611	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=111,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:5,0:0|1:11258601_AAAAAAG_A:11258601:12,9,2,0
chr19	11266466	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11266466_T_C:11266466:0,0,0,1
chr19	11266470	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11266466_T_C:11266466:0,0,0,1
chr19	11266473	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11266466_T_C:11266466:0,0,0,1
chr19	11266476	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11266466_T_C:11266466:0,0,0,1
chr19	11266478	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11266466_T_C:11266466:0,0,0,1
chr19	11280699	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:3,3:3,6,2,1
chr19	11285390	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.367:25:6,3:10,6:4,12,5,4
chr19	11286535	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:8,1,4,0
chr19	11303459	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:11303459_GC_G:11303459:0,0,1,0
chr19	11303469	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:11303459_GC_G:11303459:0,0,3,0
chr19	11310920	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:3,2,2,2
chr19	11313256	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,2:3,4:5,2,3,3
chr19	11314807	.	CTGGGGATGAGGAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGATGAGGAG;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,0:1,2:3,2,1,1
chr19	11319491	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=86,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:4,5,4,2
chr19	11322771	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr19	11322807	.	C	CTCTTAAGGAGCTCATTCTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr19	11323809	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:10,0,5,0
chr19	11323935	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:11,12,0,3
chr19	11324890	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=83,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,4,3
chr19	11325417	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr19	11326119	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:7,5:0,2:0|1:11326119_A_G:11326119:3,4,2,5
chr19	11326125	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,4:0,2:0|1:11326119_A_G:11326119:3,4,2,4
chr19	11326629	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr19	11327608	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=76,82;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:9,7:9,8:11,10,5,10
chr19	11332505	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=87,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:6,4:6,2,3,2
chr19	11332570	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:0,7:13,2:5,8,5,4
chr19	11333358	.	GA	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=38,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,5:2,2:8,2,6,2
chr19	11333596	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,1,4
chr19	11333710	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:3,6,1,2
chr19	11338224	.	GGGGCT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11338224_GGGGCT_G:11338224:0,0,0,1
chr19	11338231	.	GAAGGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11338224_GGGGCT_G:11338224:0,0,0,1
chr19	11338242	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11338224_GGGGCT_G:11338224:0,0,0,1
chr19	11343795	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	11346192	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,2:7,0:7,1,2,0
chr19	11346252	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=95,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.326:29:9,1:8,8:10,10,4,5
chr19	11348098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=83,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:1,0,9,2
chr19	11348521	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr19	11352479	.	C	CTTAATTCTTTTTTAAATGTTTCTACAATGAAACTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	11352928	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,0:3,7:0|1:11352928_G_C:11352928:2,6,0,7
chr19	11352936	.	CA	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:5,0:2,1:0|1:11352928_G_C:11352928:1,6,0,7
chr19	11358700	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=85,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,3:2,2:4,1,4,1
chr19	11362777	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:7,4,0,2
chr19	11363049	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=10259941,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr19	11363146	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr19	11364330	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:0|1:11364330_G_A:11364330:12,10,1,1
chr19	11364346	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=128,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,2:5,0:0|1:11364330_G_A:11364330:11,7,1,1
chr19	11409111	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,15;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,1:2,0:0,7,0,3
chr19	11436302	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	11447769	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr19	11460927	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=278,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11460927_C_G:11460927:0,2,0,1
chr19	11460939	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:11460927_C_G:11460927:0,3,0,1
chr19	11460941	.	GC	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,14;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:11460927_C_G:11460927:0,3,0,1
chr19	11460944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11460927_C_G:11460927:0,3,0,1
chr19	11460971	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=105,216;MMQ=43,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:11460971_CTT_C:11460971:0,2,0,1
chr19	11460985	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=105,216;MMQ=43,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11460971_CTT_C:11460971:0,2,0,1
chr19	11462844	.	G	GCAGTGGCAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=225,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr19	11462864	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=235,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11462864_T_TG:11462864:0,1,0,1
chr19	11462867	.	T	TTTCTGTAAGATTATGATCGTGATTATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=235,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11462864_T_TG:11462864:0,1,0,1
chr19	11462870	.	CC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=235,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11462864_T_TG:11462864:0,1,0,1
chr19	11473358	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=111,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,3:5,6:4,6,1,8
chr19	11473415	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.385:16:3,3:7,3:0,10,1,5
chr19	11492849	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=12,20;MFRL=222,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:11492849_G_A:11492849:0,1,1,1
chr19	11492851	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=12,20;MFRL=222,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:11492849_G_A:11492849:0,1,1,1
chr19	11512769	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:3,2:9,4,2,0
chr19	11526759	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,13,8
chr19	11526765	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:3,6:5,5:6,2,7,5
chr19	11531504	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=110,82;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,3:15,0:15,22,3,0
chr19	11531526	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=110,82;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:25,4:14,0:14,25,3,1
chr19	11534503	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.789:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr19	11541685	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=59,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:13,3:2,3:0,15,4,2
chr19	11541712	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr19	11558240	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,13,3
chr19	11558404	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=68,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,8:0.149:58:36,8:12,0:27,23,0,8
chr19	11567959	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:11567959_C_T:11567959:6,5,1,1
chr19	11567978	.	G	GTTCCCAAACCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:11567959_C_T:11567959:6,6,1,1
chr19	11594490	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=100,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.400:43:21,9:5,8:15,11,11,6
chr19	11609120	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,3:13,0:14,17,2,1
chr19	11686029	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:11686029_A_T:11686029:12,10,1,1
chr19	11686035	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,0:13,2:0|1:11686029_A_T:11686029:12,10,1,1
chr19	11725413	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:9,7:3,9:5,7,9,7
chr19	11725761	.	ATTTT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,26,27,26;MFRL=34,79,136,140;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,24,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,16,18,19;RU=T;STR;TLOD=5.65,5.92,4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,5,5,5:0.179,0.206,0.206:27:5,4,4,2:4,1,1,2:10,2,8,7
chr19	11727503	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:2,2,7,4
chr19	11728224	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:8,2:8,1:9,7,2,1
chr19	11728386	.	CCACACTGGAGAGAAACCCTATGATTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTTGTTCCAGTTCGTTTCGAAAACATGAAAGAATT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.141:28:2,1:5,2:16,9,2,1
chr19	11878095	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=110,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:1,6,0,8
chr19	11892255	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=94,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:4,3:6,7:5,6,4,6
chr19	11917052	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:13,4:4,0:7,10,0,4
chr19	11917746	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.095:28:11,2:14,0:13,13,1,1
chr19	11918093	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:0,1:1,2,4,1
chr19	11941221	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=117,140;MMQ=52,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:3,5,3,3
chr19	11941256	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=194,148;MMQ=55,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,2:0,5:1,1,3,4
chr19	11941363	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=167,147;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,1:2,3:8,2,4,0
chr19	11941532	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,141;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:5,2:2,7:2,6,3,6
chr19	11943152	.	AAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:3,2:10,2:18,20,2,2
chr19	11943697	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr19	11943823	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=114,162;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr19	11979164	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=65,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:9,5:5,8:7,8,6,7
chr19	12014355	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=111,99;MMQ=34,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,1:2,2:5,1,2,1
chr19	12024135	.	CT	C,CTT	.	.	DP=105;ECNT=4;MBQ=31,34,31;MFRL=120,111,97;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.87,4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,7,6:0.077,0.065:87:43,4,1:28,3,4:50,24,7,6
chr19	12024208	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,34,20;MFRL=126,111,98;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=T;STR;TLOD=4.41,9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,10:0.095,0.389:25:3,1,7:8,1,2:2,11,6,6
chr19	12024263	.	G	GTGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:12024263_G_GTGC:12024263:0,4,0,1
chr19	12024266	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:12024263_G_GTGC:12024263:0,4,0,1
chr19	12035992	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:6,6:10,0:12,4,5,1
chr19	12088011	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,65;MMQ=54,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:11,1:7,2:0|1:12088011_A_G:12088011:8,12,1,2
chr19	12088017	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=150,65;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:10,1:9,0:0|1:12088011_A_G:12088011:6,13,1,2
chr19	12089633	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=114,607;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,0:8,4:0|1:12089633_CT_C:12089633:12,7,2,2
chr19	12089642	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=114,607;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:0|1:12089633_CT_C:12089633:12,7,2,2
chr19	12125747	.	GGGTTTCTCTCCAGTGTGAGTCCTTCCATGCCTTCGAAGGTTTGAGGGACATCCAAAAGCTTTCCCACATTGCTTACATTTATAC	G	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=114,172;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:5,1:7,2:17,10,1,2
chr19	12125777	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,15;MFRL=122,136;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.243:14:6,0:5,0:0|1:12125777_C_A:12125777:7,4,3,0
chr19	12125779	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,14;MFRL=122,136;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.244:14:6,0:4,0:0|1:12125777_C_A:12125777:7,4,3,0
chr19	12125785	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=159,136;MMQ=60,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.205:17:9,0:4,0:0|1:12125777_C_A:12125777:10,4,3,0
chr19	12125787	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=134,136;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.195:18:7,0:5,3:0|1:12125777_C_A:12125777:11,4,3,0
chr19	12125789	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=25,10;MFRL=128,136;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.205:17:8,0:5,0:0|1:12125777_C_A:12125777:10,4,3,0
chr19	12126090	.	TCTCCAGTGTGAGTCCTTCCATGATATCGAAAGGAGCTCGAACAGTTGAAGGATCTGCCACACTGCTTGCATTCATAGGTTTTTC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=113,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.157:37:4,6:1,4:16,11,4,6
chr19	12128613	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr19	12128923	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.386:14:4,3:4,2:8,1,5,0
chr19	12155986	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:12155986_CTTT_C:12155986:1,3,0,1
chr19	12155992	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:12155986_CTTT_C:12155986:1,3,0,1
chr19	12157334	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	12163962	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=58,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:0,0:0|1:12163962_T_C:12163962:2,1,1,0
chr19	12163966	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=58,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:12163962_T_C:12163962:2,1,1,0
chr19	12187094	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,406;MMQ=60,29;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,0:8,5:7,9,5,0
chr19	12187844	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,256;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:10,0:9,2:10,9,0,2
chr19	12244664	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:0|1:12244664_C_T:12244664:15,13,1,1
chr19	12244672	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,0:14,2:0|1:12244664_C_T:12244664:16,15,1,1
chr19	12244678	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:17,0:14,3:0|1:12244664_C_T:12244664:15,16,2,1
chr19	12385749	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,10:1,0,8,6
chr19	12429913	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,0:2,6:2,3,2,4
chr19	12460821	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=132,263;MMQ=60,43;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:5,0:7,3:7,5,0,4
chr19	12501717	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,108;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:16,5:11,0:15,12,6,0
chr19	12501948	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=160,80;MMQ=55,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:5,2:8,0:0|1:12501948_T_C:12501948:6,19,1,1
chr19	12501951	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=160,80;MMQ=55,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:17,0:0|1:12501948_T_C:12501948:6,19,1,1
chr19	12502558	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=128,20003;MMQ=33,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:10,4:20,0:18,12,4,0
chr19	12503074	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=221,179;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:12503074_G_C:12503074:0,1,0,2
chr19	12503077	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=221,179;MMQ=40,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:12503074_G_C:12503074:0,1,0,2
chr19	12541532	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,6:3,10:8,3,9,7
chr19	12543333	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=201,181;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr19	12551616	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=138,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:5,0,4,2
chr19	12576049	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.542:33:9,12:6,6:10,5,10,8
chr19	12576573	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=289,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr19	12577547	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,4:18,0:18,9,4,0
chr19	12577723	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=236,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr19	12637322	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:15,4:25,0:25,15,4,0
chr19	12638073	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:15,0:0|1:12638073_A_T:12638073:13,17,1,1
chr19	12638083	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:15,0:0|1:12638073_A_T:12638073:13,15,1,1
chr19	12734662	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=157,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.196:14:3,0:7,2:4,8,0,2
chr19	12740162	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=292,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12740162_T_C:12740162:0,3,0,1
chr19	12740166	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=292,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12740162_T_C:12740162:0,3,0,1
chr19	12757354	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr19	12760287	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:8,6:1,7:7,3,10,3
chr19	12760977	.	GCGAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr19	12763350	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.540:19:3,2:2,3:0,9,0,10
chr19	12767587	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=238,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:12767587_GT_G:12767587:0,2,0,1
chr19	12767590	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=238,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12767587_GT_G:12767587:0,2,0,1
chr19	12767594	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=238,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12767587_GT_G:12767587:0,2,0,1
chr19	12768391	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:14,6:5,9:5,14,7,8
chr19	12768843	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:7,7:3,7:5,5,7,8
chr19	12772263	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	12779442	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=113,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:4,13,1,2
chr19	12780549	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:7,1,3,3
chr19	12781728	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr19	12787002	.	G	GAGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGAC;STR;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	12802153	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:1,2,2,3
chr19	12816452	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=86,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:21,3:9,0:9,23,1,2
chr19	12841701	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=234,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr19	12845109	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=243,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr19	12848264	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,208;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,0:6,6:9,0,6,0
chr19	12858848	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.293:22:9,2:6,4:0|1:12858848_G_A:12858848:10,6,3,3
chr19	12858850	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,2:8,2:0|1:12858848_G_A:12858848:11,9,2,2
chr19	12858852	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,2:8,2:0|1:12858848_G_A:12858848:11,9,2,2
chr19	12858854	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,2:8,2:0|1:12858848_G_A:12858848:11,9,2,2
chr19	12864151	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=94,48;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:12864151_C_T:12864151:12,10,1,1
chr19	12864158	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:9,0:15,2:0|1:12864151_C_T:12864151:13,12,1,1
chr19	12874097	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,0:6,13:9,5,0,13
chr19	12874437	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:9,3:10,0:9,12,2,1
chr19	12874466	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,2:14,0:13,9,1,1
chr19	12880721	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr19	12880793	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=87,0;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,0,2
chr19	12881782	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:0|1:12881782_T_TG:12881782:7,10,0,2
chr19	12881783	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:0|1:12881782_T_TG:12881782:7,10,0,2
chr19	12881787	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:12881782_T_TG:12881782:8,10,0,2
chr19	12920947	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:8,9,1,1
chr19	12921295	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr19	12923804	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=143,148;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,0:9,1,2,0
chr19	12923806	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=144,118;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:4,1:8,1,3,0
chr19	12923816	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=143,59;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,0:10,2,1,1
chr19	12924144	.	AGGACTCAGCATCCGAGAATCAGGAG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=116,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,1:10,1:15,14,0,2
chr19	12951811	.	GTCCCCTGGACAGCCCCCGAAACTTCTCCCCCAAC	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=90,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.084:34:5,0:11,2:0|1:12951811_GTCCCCTGGACAGCCCCCGAAACTTCTCCCCCAAC_G:12951811:10,22,1,1
chr19	12951850	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=81,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:9,0:13,2:0|1:12951811_GTCCCCTGGACAGCCCCCGAAACTTCTCCCCCAAC_G:12951811:7,15,1,1
chr19	12951851	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=81,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:9,0:13,2:0|1:12951811_GTCCCCTGGACAGCCCCCGAAACTTCTCCCCCAAC_G:12951811:7,15,1,1
chr19	12958030	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	12963055	.	TTT	CGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=197,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:4,2,1,1
chr19	12969291	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.290:20:6,2:7,1:4,10,2,4
chr19	12977449	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=88,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:12,10:8,0:13,7,10,0
chr19	12977480	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.360:31:13,10:6,0:11,9,11,0
chr19	12985780	.	CACTCCTCTCCAGGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	13002033	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	13002400	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:1,5,3,6
chr19	13002563	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	13007817	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,3:5,0:4,11,2,1
chr19	13008741	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=180,190;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.399:6:0,1:0,1:0,4,0,2
chr19	13010520	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,5:6,6:7,3,8,3
chr19	13010739	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=244,168;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.656:18:3,11:2,0:3,3,12,0
chr19	13029188	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:1,5,0,5
chr19	13035000	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:13035000_G_A:13035000:7,5,1,1
chr19	13035006	.	G	A,GAAAACCCATTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20,20;MFRL=154,79,45;MMQ=60,60,60;MPOS=18,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.93,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,2:0.417,0.176:14:3,3,0:2,3,2:5,1,3,5
chr19	13035007	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:13035000_G_A:13035000:7,5,1,1
chr19	13035008	.	G	GTCCT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:13035000_G_A:13035000:7,5,1,1
chr19	13035146	.	C	CAGTTTCCATGTAGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	13035193	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr19	13036038	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,3:12,1:5,13,1,3
chr19	13039284	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:5,3,5,4
chr19	13054620	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=88,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,5:0.049:120:67,5:48,0:74,41,4,1
chr19	13054781	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:0,9,0,9
chr19	13063485	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=86,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:7,0:14,14,3,0
chr19	13080550	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,3:5,0:6,5,3,0
chr19	13084408	.	C	CGATGCTCAGTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=70,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.127:22:8,0:11,2:0|1:13084408_C_CGATGCTCAGTT:13084408:10,10,1,1
chr19	13084413	.	C	CTTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=74,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,1:0|1:13084408_C_CGATGCTCAGTT:13084408:9,9,1,1
chr19	13184162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:13,1,3,0
chr19	13184890	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,4:3,0:1,5,3,2
chr19	13220703	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,10:9,5:8,9,9,6
chr19	13223923	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=203,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	13249244	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr19	13249251	.	T	TCCTGGCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr19	13255536	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:4,2,1,2
chr19	13259823	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.312:46:14,14:18,0:15,17,14,0
chr19	13260240	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=129,138;MMQ=40,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.513:11:1,4:2,1:4,1,5,1
chr19	13260256	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.256:29:14,1:5,5:16,6,3,4
chr19	13265515	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=152,157;MMQ=57,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.104:41:12,1:14,1:23,13,0,5
chr19	13265750	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.302:21:7,0:6,6:2,13,0,6
chr19	13319693	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr19	13323124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr19	13323214	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:13,10:14,0:19,8,12,0
chr19	13323558	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:6,0:0|1:13323558_G_A:13323558:14,9,1,1
chr19	13323566	.	G	GGCA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCA;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:7,0:0|1:13323558_G_A:13323558:14,9,1,1
chr19	13323641	.	TACACACAC	T,TACACACACACAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,28,25;MFRL=512,152,166;MMQ=60,60,60;MPOS=29,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,7,13;RU=AC;STR;TLOD=3.33,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.285,0.350:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr19	13335432	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=209,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,4:3,7:3,1,5,6
chr19	13338180	.	AAAG	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAG;STR;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:5,7:6,4:7,6,5,6
chr19	13338311	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=96,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:34,0:19,3:35,18,0,3
chr19	13339421	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=187,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr19	13346508	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.250:33:12,3:13,4:17,8,8,0
chr19	13355900	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	13356150	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr19	13373477	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=90,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:5,2,2,1
chr19	13387837	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr19	13395990	.	GGC	G	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,20,0,3
chr19	13395993	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=26,31;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:15,0:14,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,20,0,3
chr19	13395997	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,0:13,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,19,0,3
chr19	13396000	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:15,0:12,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:8,22,0,3
chr19	13396003	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:14,0:15,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,22,0,3
chr19	13396005	.	T	TG	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=23,29;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,0:13,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,21,0,3
chr19	13396007	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=30,30;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,0:13,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,19,0,3
chr19	13396009	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=24,27;MFRL=103,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,0:13,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:9,19,0,3
chr19	13396012	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=24,33;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,0:10,3:0|1:13395990_GGC_G:13395990:10,16,0,3
chr19	13396014	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=24,30;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,0:13,2:0|1:13395990_GGC_G:13395990:10,16,0,3
chr19	13396117	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:13396117_C_A:13396117:0,2,0,2
chr19	13396120	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=93,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:13396117_C_A:13396117:0,2,0,2
chr19	13411482	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,11:0,0,6,11
chr19	13414404	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=66,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:10,6,1,1
chr19	13414796	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	13418707	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:2,4:4,2:2,4,1,6
chr19	13419163	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:2,1,0,1
chr19	13423522	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=123,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.180:25:9,1:11,3:10,11,2,2
chr19	13423688	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=164,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr19	13440982	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	13443770	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,4,8
chr19	13445144	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr19	13445407	.	TTGTG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=54,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	13616693	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=184,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr19	13867018	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:2,0:16,6:10,8,4,2
chr19	13876842	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:10,9:14,1:14,11,0,10
chr19	13879622	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:0,3,3,3
chr19	13885215	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:6,2:2,2:8,1,4,0
chr19	13910713	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=167,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:12,2:3,0:2,13,1,1
chr19	13993659	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:12,3:12,11,0,3
chr19	13993792	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.365:28:5,5:11,4:4,14,3,7
chr19	13996776	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:6,3,1,1
chr19	13996791	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,2,1
chr19	14006241	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=102,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:19,0:24,5:22,21,0,5
chr19	14024406	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:5,0:11,2:6,11,1,1
chr19	14029984	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:10,7,1,1
chr19	14038791	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:3,2:11,4:9,5,4,2
chr19	14043774	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=289,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:14043774_G_T:14043774:0,1,0,1
chr19	14043792	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=289,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14043774_G_T:14043774:0,1,0,1
chr19	14048587	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.610:13:2,3:2,5:2,3,5,3
chr19	14064003	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:9,9,0,2
chr19	14065074	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr19	14065488	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:3,3:4,3:2,5,1,5
chr19	14065534	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr19	14069896	.	CCTGCCCCCTGGCGCCTGCCAGCCCCCCTGAGCCCCAGAGCCCAGAG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:2,0:4,2:6,7,1,1
chr19	14071026	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=244,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr19	14073887	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:6,5:10,2:8,8,4,3
chr19	14091543	.	T	TGCATCCTCTCTGGGGTGGGCTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,1:0,0:0,0,0,11
chr19	14091563	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=177,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr19	14094363	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=86,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,1:0,1:1,3,1,1
chr19	14139004	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,16:0,6:0,0,16,7
chr19	14141480	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:4,6:5,3:6,3,10,1
chr19	14141666	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:8,8:5,1:8,5,3,6
chr19	14153190	.	GA	G,GAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32,30;MFRL=141,136,183;MMQ=60,60,60;MPOS=14,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.17,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,2:0.274,0.166:15:5,2,0:4,2,2:9,0,6,0
chr19	14157527	.	G	GACTCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,184;MMQ=48,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:14157527_G_GACTCCA:14157527:0,2,0,1
chr19	14157529	.	C	CTTTGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=199,184;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14157527_G_GACTCCA:14157527:0,2,0,1
chr19	14159986	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:8,0:8,13,2,1
chr19	14161745	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr19	14162347	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr19	14162676	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:2,2,3,2
chr19	14267529	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:13,0:5,2:10,8,0,3
chr19	14271601	.	G	GTGACAGGTGCCTATAGTCCCAGCTACTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=146,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	14271602	.	G	GATTGTGCTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14271602_G_GATTGTGCTTTGT:14271602:0,1,0,1
chr19	14271605	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:14271602_G_GATTGTGCTTTGT:14271602:0,1,0,1
chr19	14271607	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	14274020	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:9,0:12,4:8,13,2,2
chr19	14274277	.	GGAGA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=78,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=GA;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr19	14294288	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr19	14492219	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=130,138;MMQ=42,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr19	14492265	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=192,149;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,4:3,3:0|1:14492265_T_C:14492265:9,1,5,2
chr19	14492272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=191,163;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:0|1:14492265_T_C:14492265:9,2,5,1
chr19	14499357	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	14499410	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr19	14499731	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=188,68;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr19	14507307	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,3:8,2:4,12,2,3
chr19	14507342	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=178,113;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:9,1:1,13,0,2
chr19	14508385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	14508964	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0,0,17,13
chr19	14522434	.	GCCTTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTTA;STR;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.504:10:3,0:2,5:2,3,3,2
chr19	14551219	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.621:11:0,5:4,2:1,3,1,6
chr19	14552073	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:13,6,2,0
chr19	14561722	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,15,12
chr19	14575010	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr19	14578674	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:1,1,5,2
chr19	14578813	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=106,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,3:3,4:2,5,4,3
chr19	14580135	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=83,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,0:15,3:9,15,0,4
chr19	14580328	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.681:17:1,2:4,8:2,3,3,9
chr19	14580635	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:4,6:3,3:0|1:14580635_G_A:14580635:2,5,4,7
chr19	14580638	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.545:20:4,7:3,4:0|1:14580635_G_A:14580635:4,5,4,7
chr19	14580662	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.408:25:6,6:9,3:0|1:14580635_G_A:14580635:9,6,5,5
chr19	14580767	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,2:14,2:11,19,1,3
chr19	14580869	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	14589160	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr19	14590142	.	TGACAAGAGTGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	14590164	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=196,195;MMQ=60,36;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr19	14590279	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:5,3,8,4
chr19	14590433	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=250,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr19	14600197	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:3,5,3,2
chr19	14627050	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	14627715	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:8,0:14,3:8,14,1,2
chr19	14720906	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:16,1:3,2:7,12,1,2
chr19	14741115	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14741115_A_T:14741115:0,0,0,1
chr19	14741117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14741115_A_T:14741115:0,0,0,1
chr19	14741119	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14741115_A_T:14741115:0,0,0,1
chr19	14743902	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr19	14744181	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	14752325	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,1:0,0,3,5
chr19	14758212	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=0,164;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:7,1:0|1:14758212_T_C:14758212:11,3,0,2
chr19	14758213	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=0,164;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:7,2:0|1:14758212_T_C:14758212:11,3,0,2
chr19	14758222	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=164,172;MMQ=45,59;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:0,0:2,1:0,4,0,1
chr19	14758247	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=190,172;MMQ=50,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr19	14766033	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14766033_A_C:14766033:0,1,0,1
chr19	14766039	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14766033_A_C:14766033:0,2,0,1
chr19	14766040	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14766033_A_C:14766033:0,2,0,1
chr19	14769207	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr19	14769339	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,19,14
chr19	14774390	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:0|1:14774390_T_A:14774390:3,12,1,1
chr19	14774394	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:0|1:14774390_T_A:14774390:3,12,1,1
chr19	14779550	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr19	14804183	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,7,1
chr19	14805796	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:20,0:15,4:18,18,4,0
chr19	14806017	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	14815804	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,3,1
chr19	14826849	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	14827076	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,39;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.233:20:14,1:2,3:4,12,3,1
chr19	14827125	.	TGA	CAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=158,136;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr19	14827712	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr19	14856949	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr19	14857179	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,2:2,2:0|1:14857179_T_C:14857179:7,6,3,1
chr19	14857187	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=19,32;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:1,1:0|1:14857179_T_C:14857179:6,6,2,1
chr19	14857202	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=82,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.718:10:3,7:0,0:3,0,0,7
chr19	14857791	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.442:20:7,4:4,5:5,6,4,5
chr19	14857891	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=195,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	14862517	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,6:7,3:1,10,1,8
chr19	14862555	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	14862575	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14862575_A_T:14862575:0,2,0,1
chr19	14862584	.	ATGGCATT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14862575_A_T:14862575:0,2,0,1
chr19	14865684	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	14865704	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr19	14865973	.	TG	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,1:16,6,1,1
chr19	14866390	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=195,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:1,0:6,3:7,1,3,0
chr19	14866698	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:3,4,2,8
chr19	14866974	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	14867186	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr19	14875201	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr19	14875250	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=82,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,0:17,4:13,17,4,0
chr19	14876958	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=161,192;MMQ=51,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr19	14877043	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=126,147;MMQ=59,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:6,4:12,6:9,9,8,2
chr19	14877947	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=149,190;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:5,5,6,0
chr19	14878003	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=170,123;MMQ=49,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr19	14883272	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=152,76;MMQ=52,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:5,7,2,2
chr19	14884929	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=154,166;MMQ=44,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:2,0:0,1:1,1,0,3
chr19	14884934	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=187,99;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:14884934_G_C:14884934:1,3,0,1
chr19	14884935	.	A	ACG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,21;MFRL=187,99;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:14884934_G_C:14884934:1,3,0,1
chr19	14884937	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=187,99;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:14884934_G_C:14884934:1,3,0,1
chr19	14910438	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,11,10
chr19	14910709	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:6,0:15,6:17,4,0,6
chr19	14938760	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:10,0:15,10,0,2
chr19	14951889	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,7:9,8:12,5,8,7
chr19	14992178	.	C	CTATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TATT;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.351:6:2,1:2,0:1,3,0,2
chr19	15052983	.	T	TATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr19	15061216	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=39,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:3,3,0,3
chr19	15063757	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:7,6:8,10:7,8,10,6
chr19	15073217	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:15073217_A_C:15073217:0,4,0,1
chr19	15073220	.	AAT	GGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:15073217_A_C:15073217:0,4,0,1
chr19	15075020	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	15083485	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:8,2,3,4
chr19	15083795	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr19	15122024	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=231,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:15122024_C_T:15122024:1,2,1,0
chr19	15122045	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=230,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:15122024_C_T:15122024:2,0,1,0
chr19	15124474	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=47,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr19	15131180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,1:0,2:1,0,2,2
chr19	15131213	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	15131261	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:0,2:6,5:2,4,4,5
chr19	15132574	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr19	15133762	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,2:4,8:5,0,5,5
chr19	15198239	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr19	15198263	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr19	15198292	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,4,2
chr19	15221580	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15221580_C_T:15221580:0,1,0,1
chr19	15221587	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15221580_C_T:15221580:0,1,0,1
chr19	15221591	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15221580_C_T:15221580:0,1,0,1
chr19	15221594	.	A	AAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15221580_C_T:15221580:0,1,0,1
chr19	15223466	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	15224515	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:7,7,2,1
chr19	15226611	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,2:3,3:2,3,2,3
chr19	15229993	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=90,170;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:7,5:8,2,5,4
chr19	15230219	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:7,6:10,9:10,7,7,8
chr19	15233631	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:3,4:5,5:2,6,4,5
chr19	15235932	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr19	15273221	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:15273221_T_C:15273221:0,0,5,1
chr19	15273231	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0|1:15273221_T_C:15273221:0,0,5,3
chr19	15273248	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr19	15273381	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,7,8
chr19	15276340	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,2:2,1:0|1:15276340_T_A:15276340:2,7,0,3
chr19	15276341	.	G	GAGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,2:3,1:0|1:15276340_T_A:15276340:2,7,0,3
chr19	15276722	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:11,2:1,1:4,10,2,1
chr19	15276919	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,2,6
chr19	15276923	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,2,6
chr19	15278057	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr19	15285272	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	15289613	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:4,6,2,4
chr19	15290125	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:3,3:5,3:7,1,2,4
chr19	15292366	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr19	15292574	.	C	CCTCCTTCCTGATCTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr19	15300069	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr19	15303225	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.425:19:3,3:7,4:4,7,3,5
chr19	15308252	.	G	GGGGGGGGGGGGGGGGCCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr19	15308257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=112,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.430:7:1,1:1,0:0|1:15308257_T_C:15308257:2,2,3,0
chr19	15308265	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.316:10:2,1:5,1:0|1:15308257_T_C:15308257:5,2,3,0
chr19	15308398	.	G	GAAC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,2:10,0:0|1:15308398_G_GAAC:15308398:12,11,1,1
chr19	15308399	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:0|1:15308398_G_GAAC:15308398:12,11,1,1
chr19	15308403	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:15308398_G_GAAC:15308398:12,11,1,1
chr19	15308405	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:0|1:15308398_G_GAAC:15308398:12,10,1,1
chr19	15349677	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=80,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,0,1
chr19	15349705	.	CGCT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	15350504	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=263,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr19	15471856	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	15483092	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:10,7,2,0
chr19	15484603	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr19	15485350	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr19	15508130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	15508145	.	A	ACAAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	15512294	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,3:14,0:11,9,2,1
chr19	15512479	.	TCCTGCCCTCCCCAATCTCCCAGTCCAGCACCCAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	15533821	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=83,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr19	15537825	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:6,1:7,1:8,5,1,1
chr19	15567411	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=120,114;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:0|1:15567411_C_T:15567411:6,7,0,4
chr19	15567421	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,114;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,0:5,3:0|1:15567411_C_T:15567411:6,10,0,4
chr19	15570915	.	ACAGGGGGTGTTTGGTGTAGATTGGAATGATATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,33;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.486:5:0,2:1,0:3,0,1,1
chr19	15574858	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=254,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,12:0,10:0,1,10,12
chr19	15575173	.	TGG	T,TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,19,26;MFRL=0,106,105;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=G;STR;TLOD=4.43,6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.437,0.471:7:0,2,2:0,0,1:0,0,5,2
chr19	15579645	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr19	15587103	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=150,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:15587103_C_T:15587103:3,4,1,1
chr19	15587104	.	G	GATCCTCCAAGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=150,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:15587103_C_T:15587103:3,4,1,1
chr19	15651539	.	GCC	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,7
chr19	15651548	.	AAT	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,5
chr19	15651551	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,5
chr19	15651553	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,5
chr19	15651556	.	G	GAGC	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,5
chr19	15651560	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,5
chr19	15651562	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,4
chr19	15651564	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,4,4
chr19	15651568	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:15651539_GCC_G:15651539:0,0,3,4
chr19	15654669	.	GAAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,241;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr19	15655168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	15659076	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0|1:15659076_G_GCT:15659076:0,0,0,1
chr19	15659079	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:15659076_G_GCT:15659076:0,0,0,1
chr19	15659924	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=85,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:15659924_C_T:15659924:10,7,1,1
chr19	15659933	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:13,0:6,2:0|1:15659924_C_T:15659924:12,8,1,1
chr19	15726360	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	15726487	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,12,3
chr19	15726663	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:15726663_GA_G:15726663:3,6,1,1
chr19	15726665	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:0|1:15726663_GA_G:15726663:3,6,1,1
chr19	15726721	.	A	AACTCACTCATTCCTCTGATC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTCACTCATTCCTCTGATC;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.848:5:0,1:0,0:0,0,1,4
chr19	15730498	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,8:0,0,8,14
chr19	15730606	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:3,3,0,3
chr19	15734073	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=149,111;MMQ=55,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,1:8,9,1,1
chr19	15739084	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:2,4,5,2
chr19	15739274	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=222,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.603:16:2,4:4,4:3,3,5,5
chr19	15739315	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,2,3
chr19	15739597	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.326:25:6,4:11,3:11,6,2,6
chr19	15739926	.	TCCGGGCCTGGTTCCTGGCGCAGTGGGG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:1,1:13,5,1,1
chr19	15739935	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:4,1,2,0
chr19	15739992	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.484:33:10,6:7,10:9,8,11,5
chr19	15740220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr19	15757927	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:3,4:2,6:3,2,5,6
chr19	15760881	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,155;MMQ=45,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:6,5:5,5:7,4,7,3
chr19	15769253	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:4,4,1,1
chr19	15769270	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=176,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:5,3,5,2
chr19	15769414	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=150,135;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr19	15769449	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,2:8,4:8,5,2,4
chr19	15769529	.	GC	TT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=88,174;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,0:3,4:7,3,2,2
chr19	15769965	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=250,187;MMQ=21,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	15770018	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=121,169;MMQ=33,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:1,2:1,6:0|1:15770018_T_C:15770018:3,0,5,3
chr19	15770020	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=121,169;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,2:1,6:0|1:15770018_T_C:15770018:3,0,5,3
chr19	15770027	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=107,123;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:7,4,6,0
chr19	15784285	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	15784319	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	15784617	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=405,144;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,1,0
chr19	15789034	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,6,7
chr19	15789250	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr19	15789282	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr19	15789302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr19	15789316	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	15791180	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,10,16
chr19	15795566	.	TTGTGTGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=TG;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.575:5:0,3:0,0:0|1:15795566_TTGTGTGTG_T:15795566:2,0,3,0
chr19	15795576	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.348:8:4,1:1,1:1|0:15795566_TTGTGTGTG_T:15795566:5,0,3,0
chr19	15795842	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr19	15807212	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:8,6,0,2
chr19	15838753	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=123,114;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr19	15905289	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,55;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,6,11
chr19	15996907	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:2,4,1,2
chr19	16001343	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	16008257	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:6,4:2,5:4,5,4,5
chr19	16008434	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr19	16008512	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr19	16024739	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:2,3:11,0:5,8,1,3
chr19	16034944	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=89,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16034944_T_C:16034944:0,2,0,1
chr19	16034946	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=89,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16034944_T_C:16034944:0,2,0,1
chr19	16045141	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,2:4,4:0,7,3,3
chr19	16045294	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=285,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	16060021	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=89,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:8,7:15,9:9,14,8,8
chr19	16060636	.	C	CCCAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,1,1
chr19	16060827	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr19	16178587	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:1,2:0,2,1,2
chr19	16186813	.	AC	A,GC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=15,15,16;MFRL=168,197,204;MMQ=60,60,60;MPOS=22,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.96,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,3:0.520,0.336:10:0,1,0:0,0,0:0,1,7,2
chr19	16186823	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,0:0|1:16186823_C_CGGGGGGGGGGGGGGGGG:16186823:6,6,2,0
chr19	16186824	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,1:4,0:0|1:16186823_C_CGGGGGGGGGGGGGGGGG:16186823:6,6,2,0
chr19	16192625	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr19	16192667	.	C	CAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:16192667_C_CAAAAG:16192667:4,0,1,1
chr19	16192668	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:16192667_C_CAAAAG:16192667:4,0,1,1
chr19	16192898	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,3:9,6:6,6,1,8
chr19	16211966	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,199;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:16,0,2,0
chr19	16232508	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=82,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.589:20:4,6:4,4:6,2,9,3
chr19	16238219	.	ATC	GGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=93,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,0:6,0:1,10,2,0
chr19	16238279	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:3,3:9,6:6,6,6,3
chr19	16268207	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,7:0,19:0,0,13,14
chr19	16275515	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=61,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.507:16:0,5:7,3:4,4,6,2
chr19	16275772	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:1,7,0,6
chr19	16280634	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr19	16283863	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=139,54;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:16283863_A_T:16283863:11,2,1,1
chr19	16283871	.	AC	TA	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=105,54;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,0:11,2:0|1:16283863_A_T:16283863:16,11,1,1
chr19	16283879	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=100,54;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:12,0:22,2:0|1:16283863_A_T:16283863:17,21,1,1
chr19	16283881	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=100,54;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:14,0:23,2:0|1:16283863_A_T:16283863:17,24,1,1
chr19	16283884	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=100,54;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:15,0:25,2:0|1:16283863_A_T:16283863:17,24,1,1
chr19	16284186	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:9,6,1,1
chr19	16320075	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr19	16321047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr19	16337423	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=101,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	16338532	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr19	16339069	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=167,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	16345099	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=76,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:10,8:2,2:6,6,7,3
chr19	16435717	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,14,15
chr19	16436199	.	C	CTGTGACCCCGGACGCCGCCGCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	16547929	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=219,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:0,4,1,2
chr19	16548521	.	TAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=104,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:3,1:2,5,1,1
chr19	16548778	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	16551699	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=84,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,0:14,2:15,16,1,1
chr19	16590171	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	16593189	.	CAACAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AACAA;STR;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:16593189_CAACAA_C:16593189:0,0,7,3
chr19	16593203	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.906:19:1,8:0,10:0|1:16593189_CAACAA_C:16593189:1,0,12,6
chr19	16593415	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,7:1,17:1,0,17,7
chr19	16594967	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.941:14:0,4:0,8:0|1:16594967_A_G:16594967:0,0,11,3
chr19	16594979	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,2:0,4:0|1:16594967_A_G:16594967:0,0,8,4
chr19	16596142	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr19	16601154	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,9:1,0,9,11
chr19	16606742	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,14:0,6:0,0,14,6
chr19	16606766	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=89.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,19,8
chr19	16612210	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:4,2:16,0:9,11,2,0
chr19	16612368	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=128,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr19	16617403	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,226;MMQ=58,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr19	16617635	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.241:26:17,4:2,3:9,10,3,4
chr19	16617692	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=162,313;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:0,7,0,3
chr19	16620275	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:16620275_C_T:16620275:11,9,1,1
chr19	16620296	.	A	ATGCCCAGCAGATTT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:16620275_C_T:16620275:10,13,1,1
chr19	16620299	.	C	CTTT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:14,2:0|1:16620275_C_T:16620275:10,14,1,1
chr19	16625421	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,0:10,3:7,7,2,1
chr19	16625432	.	C	CTCAAGAGATCCACCTTCCTCAGCCTCCTGAAGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,56;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:6,7,1,1
chr19	16630040	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=123,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:9,2:0|1:16630040_T_G:16630040:13,13,1,1
chr19	16630043	.	G	GAAAT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:9,2:0|1:16630040_T_G:16630040:13,14,1,1
chr19	16633950	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:0,10:1,11:1,0,14,8
chr19	16633961	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:15,4,0,2
chr19	16633962	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,1:0|1:16633962_C_T:16633962:14,5,1,1
chr19	16633965	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:16633962_C_T:16633962:14,5,1,1
chr19	16634068	.	CG	TT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:16,2:21,0:21,19,1,1
chr19	16636179	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:31,3:10,0:0|1:16636179_G_A:16636179:26,17,2,1
chr19	16636182	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:31,3:14,0:0|1:16636179_G_A:16636179:28,18,2,1
chr19	16666101	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=197,89;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,10:0,9:1,0,9,10
chr19	16677433	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:19,0:9,2:12,16,2,0
chr19	16679043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=216,41;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr19	16770093	.	CAAAAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,163;MMQ=57,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=22,13;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr19	16771006	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr19	16791450	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=173,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:16791450_T_TG:16791450:0,2,1,1
chr19	16791451	.	A	ATGGGCGTGATGGATGCCCACCGCGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=173,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:16791450_T_TG:16791450:0,2,1,1
chr19	16797240	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	16798927	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr19	16798993	.	TGA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=98,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:11,0:13,11,0,2
chr19	16860084	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,0:4,3:3,2,3,1
chr19	16860105	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,7:0,0,9,4
chr19	16860558	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr19	16872940	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=72,90;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.472:30:5,7:10,7:9,7,6,8
chr19	16873033	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:2,7,0,2
chr19	16876099	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	16899731	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=112,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:9,1,2,3
chr19	16902376	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:4,0:19,2:5,18,1,1
chr19	16918817	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.257:25:9,0:10,6:12,7,2,4
chr19	16923494	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.942:17:0,3:0,13:0,1,11,5
chr19	16980341	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:9,0:5,9,1,1
chr19	16980357	.	G	GGCACTAGGGTCTCCTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:5,7,1,1
chr19	16980801	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:3,8,0,2
chr19	16988456	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,6:0,15:0,0,10,12
chr19	16988476	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,6,9
chr19	17011950	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr19	17025292	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=73,103;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,3:5,4:5,6,4,3
chr19	17036156	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,78;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:12,3:18,0:12,18,2,1
chr19	17039058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr19	17040076	.	G	GAGGAAGAGCTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17040076_G_GAGGAAGAGCTAC:17040076:0,1,0,1
chr19	17040079	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17040076_G_GAGGAAGAGCTAC:17040076:0,1,0,1
chr19	17056294	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	17062860	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:8,7,1,2
chr19	17068621	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr19	17085865	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr19	17091443	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,84;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:6,0:4,10,0,2
chr19	17100360	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr19	17104162	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	17104250	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:6,2,2,1
chr19	17115253	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr19	17133028	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,6:4,2:1,5,2,6
chr19	17166896	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	17169758	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=176,321;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr19	17170540	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr19	17173418	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:4,0,4,1
chr19	17173487	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:10,4:3,4:7,6,1,8
chr19	17179789	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,22,10
chr19	17186127	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:0|1:17186127_A_C:17186127:7,2,3,0
chr19	17186136	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0|1:17186127_A_C:17186127:0,0,13,3
chr19	17256277	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.257:40:14,2:15,6:17,13,0,10
chr19	17264961	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=220,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0|1:17264961_G_C:17264961:1,0,1,1
chr19	17264963	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:17264961_G_C:17264961:0,0,3,1
chr19	17273753	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,4:2,2:5,1,3,3
chr19	17273880	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=157,59;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr19	17273893	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,4,4
chr19	17283303	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,0,3
chr19	17283383	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr19	17283491	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:4,2:6,1:10,0,4,0
chr19	17286438	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.558:32:5,6:9,11:3,11,9,9
chr19	17286643	.	T	TCTGGGAGCTGCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr19	17296679	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,1:5,5:5,3,4,3
chr19	17298679	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	17298724	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,4:2,3:2,0,4,3
chr19	17298893	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:2,2,0,4
chr19	17301863	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:1,4:13,3:11,3,5,2
chr19	17301880	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=78.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,4:0,20:0,0,15,9
chr19	17302056	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr19	17302062	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=160,118;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,0:5,6:2,7,0,6
chr19	17302112	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	17303774	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr19	17306031	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0,1,2,11
chr19	17308734	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr19	17311442	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,1:1,6:2,2,6,1
chr19	17313178	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	17313619	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=397,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,2:0,8:1,0,9,1
chr19	17316253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	17316782	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=222,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:0,1,4,2
chr19	17317252	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	17320499	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.188:24:12,4:8,0:10,10,2,2
chr19	17321487	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr19	17321669	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr19	17326919	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:13,0:9,15,2,0
chr19	17336966	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:17336966_G_C:17336966:0,0,3,0
chr19	17336971	.	CAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=200,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:17336966_G_C:17336966:1,0,3,0
chr19	17337025	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,2:7,6:8,2,6,2
chr19	17337223	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr19	17337413	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	17338033	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr19	17339208	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=116,173;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:10,0:2,6:2,11,0,6
chr19	17339215	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=136,173;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:11,0:2,6:2,11,0,6
chr19	17339225	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=38,25;MFRL=173,114;MMQ=21,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,5:6,0:0,9,1,4
chr19	17361256	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=144,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.412:8:1,1:2,2:1,4,1,2
chr19	17362526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr19	17366110	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=77,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.754:12:3,4:0,5:2,1,8,1
chr19	17366278	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,5,5
chr19	17367585	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr19	17373858	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:3,0:1,1:2,2,0,1
chr19	17374726	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr19	17375213	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	17379517	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=223,236;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr19	17379519	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=236,223;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17379519_T_TA:17379519:2,1,1,0
chr19	17379520	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=236,223;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17379519_T_TA:17379519:2,1,1,0
chr19	17382505	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,6,8
chr19	17394931	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=111,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:23,0:15,2:0|1:17394931_C_T:17394931:19,21,2,0
chr19	17394942	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=111,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:26,0:14,2:0|1:17394931_C_T:17394931:20,20,2,0
chr19	17411566	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,200;MMQ=48,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr19	17417252	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,2:2,1:1,7,0,3
chr19	17424932	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:5,3:4,6:0,9,3,6
chr19	17424947	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:1,2:4,3:1,5,1,4
chr19	17435884	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:11,6:7,4:7,12,4,6
chr19	17438097	.	A	AAAGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=112,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:6,5,1,1
chr19	17439838	.	G	GAGAAAGGGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17439838_G_GAGAAAGGGAA:17439838:0,2,0,1
chr19	17439841	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17439838_G_GAGAAAGGGAA:17439838:0,2,0,1
chr19	17440542	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,1:0,3:6,0,3,1
chr19	17441686	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,1:10,3:11,5,1,3
chr19	17450146	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,174;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,12:2,0:4,1,12,0
chr19	17452224	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr19	17471723	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,160;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.754:5:1,0:0,2:0,1,0,4
chr19	17514646	.	T	TGGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=G;STR;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr19	17516280	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=98,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:17,0:15,4:15,18,0,4
chr19	17516400	.	A	AGCTGAAAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr19	17531018	.	CG	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,2:4,0:0|1:17531018_CG_TC:17531018:2,5,1,1
chr19	17531023	.	G	GACATCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,1:6,0:0|1:17531018_CG_TC:17531018:3,5,1,1
chr19	17531450	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,1:3,3:1,5,2,3
chr19	17533094	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.320:11:0,1:4,0:5,3,3,0
chr19	17533126	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,4:0,14:0,0,8,10
chr19	17534693	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	17535546	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr19	17535658	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr19	17566387	.	G	GGTGTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17566387_G_GGTGTGA:17566387:0,0,0,1
chr19	17566389	.	C	CCACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17566387_G_GGTGTGA:17566387:0,0,0,1
chr19	17571766	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17597830	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	17599603	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,254;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr19	17611261	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=276,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr19	17611490	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr19	17612251	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,1:1,8:0,1,2,7
chr19	17631966	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,0:9,3:0,13,0,3
chr19	17643065	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr19	17644301	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr19	17654522	.	CTGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=304,162;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:17654522_CTGGG_C:17654522:0,3,0,1
chr19	17654527	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=304,162;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17654522_CTGGG_C:17654522:0,3,0,1
chr19	17654530	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=304,162;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:17654522_CTGGG_C:17654522:0,3,0,1
chr19	17654539	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=221,162;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17654522_CTGGG_C:17654522:0,2,0,1
chr19	17664401	.	C	CCAACTTGCCTTGCCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	17670076	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:5,6:6,0:8,3,7,0
chr19	17679227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr19	17679597	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr19	17679610	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:17679610_T_A:17679610:0,3,0,1
chr19	17679614	.	A	ACATAGACAATAAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:17679610_T_A:17679610:0,3,0,1
chr19	17691751	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,2,1
chr19	17692043	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=110,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.491:20:2,3:8,5:5,5,4,6
chr19	17728733	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=162,287;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr19	17737449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr19	17743818	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr19	17743927	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=102,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:6,12,1,2
chr19	17760232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	17763392	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,12,6
chr19	17766900	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,6:6,1:5,5,3,4
chr19	17769166	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,0,8
chr19	17777431	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,7,9
chr19	17778832	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	17786748	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=92,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr19	17837512	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,3,2
chr19	17844058	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:9,4,2,0
chr19	17844325	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=242,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	17875111	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,115;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,0:10,2:16,1,2,0
chr19	17881171	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	17881552	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:2,5:2,1:3,1,5,2
chr19	17883211	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:7,1,2,1
chr19	17885308	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr19	17885336	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	17887563	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,4:3,1:2,3,1,5
chr19	17889044	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=95,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:4,4:6,4:5,5,3,6
chr19	17892193	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr19	17892478	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,13,4
chr19	17894068	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:1,0:1,1:0,3,0,5
chr19	17894075	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr19	17894878	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:3,6:1,2:1,3,6,3
chr19	17937819	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=436,224;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	17940816	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=267,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr19	17940842	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	17940992	.	GACATCCCGCTC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,0:17,2:11,22,1,1
chr19	17941294	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:3,5:5,2,7,1
chr19	17942005	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=246,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	17946659	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=248,885;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,0,3
chr19	17948732	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr19	17950564	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=184,158;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:17950564_T_C:17950564:0,2,0,1
chr19	17950565	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,158;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:17950564_T_C:17950564:0,2,0,1
chr19	17955001	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=156,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17955001_C_T:17955001:2,0,1,0
chr19	17955003	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=156,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17955001_C_T:17955001:2,0,1,0
chr19	17955021	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=156,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	17955254	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:2,15,0,3
chr19	17974164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=249,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr19	17986976	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=102,122;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr19	17987013	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=250,115;MMQ=50,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	17988447	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,103;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr19	18053489	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,1:11,3:13,12,1,3
chr19	18092442	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr19	18092985	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	18104242	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=15,25;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:1,0:0,2:0|1:18104242_A_C:18104242:7,0,3,0
chr19	18104244	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,0:2,0:0|1:18104242_A_C:18104242:7,0,3,0
chr19	18108956	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=70,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.441:16:7,1:2,6:6,3,5,2
chr19	18119703	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:1,2:0,3:0,1,5,0
chr19	18171886	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:5,5:8,5:7,6,6,4
chr19	18172043	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30,27;MFRL=128,113,62;MMQ=60,60,52;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=T;STR;TLOD=5.32,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,7:0.149,0.295:21:4,2,2:6,1,4:5,6,6,4
chr19	18173116	.	G	GATTGTGAACAAAGAAGTACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=214,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0,5,1,1
chr19	18177573	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,159;MMQ=54,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr19	18179113	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=162,73;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,1:3,1:5,0,2,0
chr19	18184265	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=146,97;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.277:36:11,8:14,0:0|1:18184265_T_A:18184265:18,8,10,0
chr19	18184269	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,97;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:13,8:16,0:0|1:18184265_T_A:18184265:20,10,8,0
chr19	18186737	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.269:12:3,0:5,2:1,8,0,3
chr19	18186752	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:0,4,1,6
chr19	18194164	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr19	18218273	.	T	TGATGAGGGATTTAAACATGGCGCTGACG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=176,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.262:11:4,2:3,0:9,0,1,1
chr19	18232754	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.597:18:4,5:3,5:0|1:18232754_G_T:18232754:3,4,2,9
chr19	18232778	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:18232754_G_T:18232754:0,0,2,8
chr19	18234005	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,3:4,6:4,2,5,4
chr19	18234567	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr19	18235352	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr19	18235424	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,8:10,5:6,8,7,6
chr19	18241378	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:18,10:13,0:18,13,10,0
chr19	18242669	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,264;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:18242669_G_C:18242669:0,0,2,0
chr19	18242675	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,264;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:18242669_G_C:18242669:0,0,2,0
chr19	18245813	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,1:3,4:0,6,3,2
chr19	18245891	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	18252829	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:7,5:2,7:3,6,3,9
chr19	18254897	.	A	AAAAAGAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18254897_A_AAAAAGAGCC:18254897:0,1,0,1
chr19	18254899	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18254897_A_AAAAAGAGCC:18254897:0,1,0,1
chr19	18257823	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:6,0:0|1:18257823_G_A:18257823:8,14,1,1
chr19	18257838	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:18257823_G_A:18257823:4,13,1,1
chr19	18258459	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	18258518	.	G	GCTCTTCCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0|1:18258518_G_GCTCTTCCCA:18258518:0,1,0,2
chr19	18258520	.	A	AGTCAACAGAGCAGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:18258518_G_GCTCTTCCCA:18258518:0,1,0,2
chr19	18260052	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,71;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:7,0:14,5:6,15,2,4
chr19	18273677	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=230,157;MMQ=54,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr19	18276789	.	GGGGGTGGGGTTTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:18276789_GGGGGTGGGGTTTT_G:18276789:0,0,1,1
chr19	18276804	.	AAGGCTGAATAGGAGTTCATTTGGTGCAGCAGGCGTTAGAAGAATGACACTCTGATAGAGGGACCAGCTTGAGCAGTCTCCGTATCAGAGTTGAGATGTGCCTTTACCCCTCACGAGGGCCTTTTGGGG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.164:24:0,2:0,0:0|1:18276789_GGGGGTGGGGTTTT_G:18276789:13,5,2,4
chr19	18276856	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1|0:18276789_GGGGGTGGGGTTTT_G:18276789:1,0,2,0
chr19	18277206	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=254,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr19	18277963	.	TCA	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,30;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:10,0:0|1:18277963_TCA_T:18277963:7,11,1,1
chr19	18277966	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,30;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:18277963_TCA_T:18277963:7,11,1,1
chr19	18277969	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=132,30;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,1:12,0:0|1:18277963_TCA_T:18277963:9,11,1,1
chr19	18277971	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=132,30;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,2:13,0:0|1:18277963_TCA_T:18277963:9,11,1,1
chr19	18279816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr19	18286134	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:18,4:13,0:15,16,4,0
chr19	18286546	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr19	18288069	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,28:0.601:46:6,13:12,15:7,11,15,13
chr19	18322095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr19	18324329	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.550:5:1,1:1,0:1,1,0,3
chr19	18327510	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:2,0,1,0
chr19	18331357	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=297,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr19	18331903	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=153,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr19	18375643	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.384:18:6,0:5,5:6,5,0,7
chr19	18375659	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,0,2
chr19	18375680	.	G	GGCTCAAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=205,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	18377274	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:5,5:5,4:3,8,5,4
chr19	18377647	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:1,3,5,4
chr19	18377883	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:10,12,1,1
chr19	18378082	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,0:9,5:5,14,0,5
chr19	18391272	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr19	18420704	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,3,12
chr19	18423402	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,12,4
chr19	18426950	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr19	18497024	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr19	18499422	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr19	18499780	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18499780_A_G:18499780:0,0,0,1
chr19	18499784	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,18117185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:18499780_A_G:18499780:0,0,1,1
chr19	18502728	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr19	18538646	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=22,14;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.128:30:13,0:7,1:0|1:18538646_T_G:18538646:15,11,0,4
chr19	18538647	.	G	GTGTGTGTGTGT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,4:0.142:33:11,4:15,0:1|0:18538646_T_G:18538646:15,14,2,2
chr19	18538648	.	GGC	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,4:0.142:33:13,2:15,0:1|0:18538646_T_G:18538646:15,14,2,2
chr19	18541579	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr19	18541675	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:6,4,1,1
chr19	18544677	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	18556048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:4,8,0,2
chr19	18649190	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,1:14,2:7,20,2,1
chr19	18650278	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=110,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.252:22:11,1:4,4:10,7,3,2
chr19	18652844	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:1,1,1,3
chr19	18704440	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=126,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.264:15:6,2:5,0:4,7,4,0
chr19	18704841	.	C	CGGGGG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:4,2:3,2:0|1:18704841_C_CGGGGG:18704841:0,7,4,0
chr19	18704842	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,17;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:4,0:3,0:0|1:18704841_C_CGGGGG:18704841:0,7,4,0
chr19	18704846	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:3,0:0|1:18704841_C_CGGGGG:18704841:2,6,2,0
chr19	18704850	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:4,0:3,1:0|1:18704841_C_CGGGGG:18704841:5,9,2,0
chr19	18704854	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:6,1:0|1:18704841_C_CGGGGG:18704841:5,10,2,0
chr19	18707342	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:4,1:5,1,2,0
chr19	18709301	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:0|1:18709301_G_T:18709301:14,10,1,1
chr19	18709303	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:11,0:0|1:18709301_G_T:18709301:14,11,1,1
chr19	18709312	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=110,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:0|1:18709301_G_T:18709301:15,9,1,1
chr19	18728998	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,3:4,0:7,5,3,0
chr19	18729336	.	GGA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:1,2:5,0:0|1:18729336_GGA_G:18729336:1,5,1,1
chr19	18729341	.	G	GAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:0|1:18729336_GGA_G:18729336:1,5,1,1
chr19	18729343	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:18729336_GGA_G:18729336:1,4,1,1
chr19	18748048	.	G	GAATCAATTCCCGGAACCCAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	18794473	.	TGGA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GGA;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,0:1,2:6,1,2,1
chr19	18860728	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:18860728_G_C:18860728:7,11,1,1
chr19	18860734	.	C	CTTCCCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,2:6,0:0|1:18860728_G_C:18860728:7,9,1,1
chr19	18879512	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,0;MFRL=175,64;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.314:10:3,0:4,0:0|1:18879512_C_T:18879512:4,3,0,3
chr19	18879517	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=177,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.288:11:4,0:4,2:0|1:18879512_C_T:18879512:4,4,0,3
chr19	18885805	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18885805_G_A:18885805:0,0,0,1
chr19	18885812	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18885805_G_A:18885805:0,0,0,1
chr19	18886431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:6,1:8,2,3,0
chr19	18886711	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	18887927	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr19	18893811	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:0,5:1,2:1,1,3,4
chr19	18894903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	18895218	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:0,8,1,3
chr19	18897526	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr19	18899181	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18899181_C_T:18899181:0,0,1,0
chr19	18899187	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18899181_C_T:18899181:0,0,1,0
chr19	18899192	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:18899181_C_T:18899181:0,0,1,0
chr19	18899197	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:18899181_C_T:18899181:0,0,1,0
chr19	18899659	.	TGCACACGGAGTTGGGGAC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=97,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:6,0:12,8,1,1
chr19	18900886	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,434;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:1,2,1,1
chr19	18966145	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18966145_A_AGG:18966145:0,0,0,1
chr19	18966147	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18966145_A_AGG:18966145:0,0,0,1
chr19	18966824	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:2,5,2,2
chr19	18990982	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=204,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	19015639	.	CC	TT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:7,0:18,2:11,15,1,1
chr19	19016321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=112,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr19	19016508	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	19040458	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=51,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,1:1,2,0,2
chr19	19040467	.	T	TGAGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr19	19049518	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.334:10:0,1:1,0:0|1:19049518_A_C:19049518:3,4,3,0
chr19	19049521	.	CAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,2:4,1:0|1:19049518_A_C:19049518:5,4,3,0
chr19	19049529	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,2:4,1:0|1:19049518_A_C:19049518:6,4,3,0
chr19	19049533	.	TGA	CCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,1:6,1:0|1:19049518_A_C:19049518:9,4,3,0
chr19	19105131	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:4,6:8,8:7,5,10,4
chr19	19105259	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.466:26:7,3:5,8:7,7,7,5
chr19	19119289	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr19	19121204	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=197,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr19	19121222	.	A	ACAGCACCAGCTTTGCCATCCTGCTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,22;MFRL=82,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:19121222_A_ACAGCACCAGCTTTGCCATCCTGCTG:19121222:1,1,0,1
chr19	19121227	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=82,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:19121222_A_ACAGCACCAGCTTTGCCATCCTGCTG:19121222:1,1,0,1
chr19	19121240	.	G	GCGTTCTCCGGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19121240_G_GCGTTCTCCGGC:19121240:0,0,0,1
chr19	19121244	.	A	AGGGCAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19121240_G_GCGTTCTCCGGC:19121240:0,0,0,1
chr19	19136242	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,2:6,0:0|1:19136242_CTT_C:19136242:3,6,0,2
chr19	19136246	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,2:6,0:0|1:19136242_CTT_C:19136242:3,6,0,2
chr19	19141981	.	TC	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=199,109;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:1,0:0,5,0,2
chr19	19165156	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.417:17:6,3:3,3:6,4,2,5
chr19	19168183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,3,2
chr19	19215612	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,2:1,1:7,1,3,0
chr19	19216613	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	19232666	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	19243843	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=218,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr19	19244033	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,4:4,7:8,4,5,6
chr19	19256870	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,3:3,2:2,4,3,2
chr19	19257409	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:7,2:0|1:19257409_C_T:19257409:11,10,1,1
chr19	19257429	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:19257409_C_T:19257409:10,11,1,1
chr19	19257432	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:19257409_C_T:19257409:10,11,1,1
chr19	19257434	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,1:0|1:19257409_C_T:19257409:10,11,1,1
chr19	19258023	.	C	CATAAAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=51,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.398:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr19	19267990	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,3:0,2:1,2,0,5
chr19	19304835	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:16,3:19,1:23,15,2,2
chr19	19308988	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=108,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:18,4:19,0:15,22,0,4
chr19	19330219	.	T	TCCCCCCATTTTTTTAGTGCTTGTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=333,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	19334845	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:19334845_A_G:19334845:15,7,1,1
chr19	19334848	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:0|1:19334845_A_G:19334845:15,7,1,1
chr19	19337739	.	C	CCATAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0|1:19337739_C_CCATAAAA:19337739:3,2,1,1
chr19	19337744	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:19337739_C_CCATAAAA:19337739:3,2,1,1
chr19	19338701	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:10,0:1,5:0|1:19338701_T_C:19338701:9,5,0,5
chr19	19338706	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:10,0:2,5:0|1:19338701_T_C:19338701:8,5,0,5
chr19	19349025	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=213,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,2,0
chr19	19379625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,0:0,1:0|1:19379625_T_C:19379625:0,2,0,1
chr19	19379648	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19379625_T_C:19379625:0,2,0,1
chr19	19381115	.	G	GGTCC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:11,0:0|1:19381115_G_GGTCC:19381115:9,11,0,2
chr19	19381119	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=144,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,2:10,0:0|1:19381115_G_GGTCC:19381115:9,11,0,2
chr19	19381321	.	G	GTTCAGAGATGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19381321_G_GTTCAGAGATGCT:19381321:0,1,0,1
chr19	19381325	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19381321_G_GTTCAGAGATGCT:19381321:0,1,0,1
chr19	19388446	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr19	19427323	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=52,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.365:39:13,7:12,7:9,16,5,9
chr19	19431423	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.647:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr19	19431963	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr19	19447933	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.678:15:3,4:1,7:2,2,6,5
chr19	19449603	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr19	19449686	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr19	19449786	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,0:10,4:4,13,1,3
chr19	19451591	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,7,4
chr19	19453521	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr19	19453560	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,6,6
chr19	19453742	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	19454828	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	19458203	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:4,4,1,1
chr19	19545895	.	GATCAGACAC	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:14,0:14,16,1,1
chr19	19545938	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:14,11,2,1
chr19	19547086	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr19	19605036	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr19	19606842	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.207:13:3,0:1,2:9,2,1,1
chr19	19612921	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,206;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0,7,0,3
chr19	19616350	.	CACTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=311,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19616350_CACTG_C:19616350:0,1,0,1
chr19	19616359	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=311,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19616350_CACTG_C:19616350:0,1,0,1
chr19	19627170	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.264:21:10,3:4,2:5,11,3,2
chr19	19639828	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:6,6:15,2:5,16,2,7
chr19	19643572	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=148,148;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	19672906	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:4,7,0,3
chr19	19681101	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=174,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:8,2,1,1
chr19	19681555	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=119,557;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,5:11,0:8,10,0,5
chr19	19681666	.	G	GCATCCACTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr19	19740692	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=212,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.560:12:5,5:0,0:5,0,7,0
chr19	19740729	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr19	19750822	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:19750822_C_T:19750822:0,0,2,0
chr19	19750824	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:19750822_C_T:19750822:0,0,2,0
chr19	19750886	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=106,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,3:6,0:6,5,2,1
chr19	19751456	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	19753292	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr19	19754426	.	AGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr19	19758190	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	19765269	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	19822950	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:7,4:11,0:8,10,2,2
chr19	19917975	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	19976701	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,3:6,2:10,1,3,2
chr19	20150075	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr19	20150247	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr19	20189027	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:20189027_TC_T:20189027:1,12,1,1
chr19	20189031	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:20189027_TC_T:20189027:1,12,1,1
chr19	20736476	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:7,5:0,6:4,3,7,4
chr19	20736677	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,2:4,4:1,5,0,6
chr19	20748522	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=159,101;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,2:6,6:4,7,4,4
chr19	20808515	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	20844340	.	G	GAAGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.855:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	21106262	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=84,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:7,5:0,8:2,5,3,11
chr19	21106322	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr19	21131481	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:7,1,9,3
chr19	21132751	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:5,3,5,4
chr19	21133129	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:2,7,0,4
chr19	21203552	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,13,13
chr19	21205531	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr19	21299774	.	T	TATA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=203.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,18:0,27:0,0,26,22
chr19	21301211	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,209;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	21349311	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,9,14
chr19	21476337	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.144:25:12,3:9,0:0|1:21476337_C_T:21476337:13,9,2,1
chr19	21476340	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=109,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.144:25:9,1:10,0:0|1:21476337_C_T:21476337:13,9,2,1
chr19	21477403	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.483:25:3,8:10,4:7,6,5,7
chr19	21477431	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,0:7,9:5,8,6,3
chr19	21493255	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.451:35:7,5:10,9:14,5,11,5
chr19	21493257	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=138,148;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.174:26:8,0:14,4:17,5,4,0
chr19	21493258	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.558:37:5,8:8,13:11,5,14,7
chr19	21493278	.	TA	T,TAA	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=25,25,28;MFRL=138,83,146;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.94,12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,8,9:0.128,0.163:59:19,1,1:18,7,7:17,25,3,14
chr19	21493339	.	C	CGAAACCCA	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:19,3:42,0:17,46,0,3
chr19	21544466	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr19	21544503	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,2:2,4:9,3,4,2
chr19	21544514	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:8,3:3,3:8,3,4,3
chr19	21558007	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:7,1,6,2
chr19	21558015	.	A	ATG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TG;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.421:20:8,7:3,1:9,3,6,2
chr19	21558169	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:2,3,2,5
chr19	21558818	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=83,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.275:22:6,3:4,3:1,15,1,5
chr19	21560314	.	G	GCA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=103,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=CA;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	21561408	.	CTTT	C,CT,CTTTT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,20,33,33;MFRL=170,138,126,92;MMQ=56,60,60,60;MPOS=20,30,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,16,17,20;RU=T;STR;TLOD=3.22,5.88,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,5,7:0.123,0.238,0.328:20:2,1,3,5:2,1,2,2:4,1,11,4
chr19	21587890	.	ATG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:6,1:2,1:9,0,2,0
chr19	21587918	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=124,96;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:13,7:9,11:15,7,13,5
chr19	21588692	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=74,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,8:4,3:8,4,6,6
chr19	21605645	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,153;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr19	21607534	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:2,3:12,0:9,5,3,0
chr19	21609382	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,46;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,3:16,0:17,12,1,2
chr19	21688495	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:4,3:11,6:9,6,6,3
chr19	21720086	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=92,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:5,5:14,0:8,11,5,0
chr19	21720452	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,74;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,2:1,4,2,2
chr19	21720842	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=146,139;MMQ=41,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:7,2:3,0:0|1:21720842_C_T:21720842:0,10,0,2
chr19	21720849	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=152,139;MMQ=40,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:7,2:2,0:0|1:21720842_C_T:21720842:0,9,0,2
chr19	21720911	.	CAAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,9;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	21910621	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.616:37:8,11:6,12:8,6,11,12
chr19	21927706	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,141;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.525:42:9,16:10,6:11,9,19,3
chr19	21948559	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,3:8,0:7,7,1,2
chr19	21950302	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=100,134;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:11,7:15,5:4,22,2,10
chr19	22154954	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,4:3,1:2,1,4,1
chr19	22156992	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,129;MMQ=58,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.386:16:6,1:4,5:3,7,1,5
chr19	22193451	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	22235307	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr19	22235491	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=108,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:2,5,3,6
chr19	22235526	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=63,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,0,4
chr19	22256396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr19	22363493	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=158,91;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:3,3:6,3:0|1:22363493_G_A:22363493:5,6,4,2
chr19	22363508	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,91;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:0|1:22363493_G_A:22363493:4,5,4,3
chr19	22363826	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=116,88;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:0,3:5,2:3,2,3,3
chr19	22585517	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	22585559	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=71,192;MMQ=25,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:10,1,2,0
chr19	22586192	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=121,170;MMQ=52,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:8,1:7,5,0,2
chr19	22586245	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=104,216;MMQ=51,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:8,4:15,0:14,9,0,4
chr19	22605032	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=94,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.433:46:12,0:14,18:13,13,0,20
chr19	22605103	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=219,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0,2,2,5
chr19	22605120	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=161,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,1,6
chr19	22938943	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=7215119,70;MMQ=45,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,1,2
chr19	22942325	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,84;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:6,3:13,7:9,10,3,7
chr19	23845038	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,4,9
chr19	23845042	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,46;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,9:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,4,8
chr19	23845795	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=60.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.935:27:0,4:0,22:0,1,11,15
chr19	23869684	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr19	23869941	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr19	23928102	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr19	23938402	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,1:5,1:1,4,0,2
chr19	23941459	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	30018076	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,11;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr19	30099457	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr19	30101566	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=174,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:30101566_GC_G:30101566:3,11,1,1
chr19	30101570	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=174,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:30101566_GC_G:30101566:3,11,1,1
chr19	30101591	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=258,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:30101566_GC_G:30101566:0,2,0,1
chr19	30106148	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=60,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,0:2,0:0,7,2,0
chr19	30106265	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.171:31:13,4:12,0:11,15,0,5
chr19	30166210	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:5,10:0,0:5,0,10,0
chr19	30199423	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr19	30303714	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:4,4,2,0
chr19	30313523	.	CCTT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=67,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:6,5:8,6:7,7,6,5
chr19	30313576	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	30313603	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=198,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr19	30433484	.	CGA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30433484_CGA_C:30433484:0,0,1,0
chr19	30433491	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30433484_CGA_C:30433484:0,0,1,0
chr19	30433493	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:30433484_CGA_C:30433484:0,0,1,0
chr19	30433498	.	CTTCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30433484_CGA_C:30433484:0,0,1,0
chr19	30433507	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=188,180;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30433484_CGA_C:30433484:1,0,1,0
chr19	30433513	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=188,180;MMQ=60,40;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:30433484_CGA_C:30433484:1,0,1,0
chr19	30433668	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	30462067	.	TTTTTCATGAGTAGTTATCTG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=117,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:6,2:15,7,1,1
chr19	30934766	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:30934766_G_A:30934766:8,5,1,1
chr19	30934775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:30934766_G_A:30934766:6,5,1,1
chr19	30936137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,6:6,0:3,5,6,0
chr19	31038995	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,0:2,8:1,3,4,4
chr19	31767695	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:13,2:9,2:7,15,1,3
chr19	31769763	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=52,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:3,8,3,2
chr19	32899074	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr19	32930069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:2,1:9,4:6,5,2,3
chr19	32946009	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:1,16,0,2
chr19	32949246	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=63,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,0:5,3,4,0
chr19	32949267	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=89,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:2,0:7,4,4,0
chr19	32954725	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=93,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:9,3,2,0
chr19	32968541	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:5,0:0|1:32968541_T_A:32968541:3,13,0,2
chr19	32968542	.	G	GGTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:32968541_T_A:32968541:3,13,0,2
chr19	33072069	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33072069_G_A:33072069:0,0,1,0
chr19	33072085	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33072069_G_A:33072069:0,0,1,0
chr19	33072089	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33072069_G_A:33072069:0,0,1,0
chr19	33072266	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr19	33073086	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=56,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:2,7:6,6:5,4,8,5
chr19	33098632	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,6,7
chr19	33106601	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=121,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:21,2:17,2:14,24,0,4
chr19	33106621	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,21:0,17:0,0,11,28
chr19	33108410	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=147,91;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,0:8,3:11,0,2,1
chr19	33108663	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr19	33110138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=191,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:2,2,1,0
chr19	33110143	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:1,1:4,0:2,3,1,0
chr19	33110149	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr19	33110204	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr19	33131112	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr19	33131336	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr19	33133936	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	33134270	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=139,83;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,0:6,8:8,8,0,8
chr19	33134425	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,5,13
chr19	33134635	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	33149768	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	33149802	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:7,2,1,1
chr19	33167879	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr19	33168036	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr19	33168059	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr19	33202744	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=115,76;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:9,0:17,8:16,10,1,7
chr19	33229680	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=157,167;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr19	33229939	.	CA	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=182,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,1:0,0:0|1:33229939_CA_AT:33229939:0,6,1,1
chr19	33229942	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=182,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:33229939_CA_AT:33229939:0,6,1,1
chr19	33268034	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:5,1,3,0
chr19	33268136	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:8,15,1,1
chr19	33324089	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,110;MMQ=57,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:4,11:5,3:3,6,9,6
chr19	33359412	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=98,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:10,11,3,0
chr19	33392170	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:26,1:17,2:20,23,0,3
chr19	33406206	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.582:7:2,2:0,2:2,1,4,0
chr19	33406442	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr19	33406484	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr19	33406493	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=84,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,1:1,7:0,2,0,8
chr19	33409048	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:33409048_GC_G:33409048:3,0,1,1
chr19	33409054	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:33409048_GC_G:33409048:3,0,1,1
chr19	33409061	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0|1:33409048_GC_G:33409048:3,0,2,1
chr19	33417285	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33417285_G_A:33417285:0,0,0,1
chr19	33417287	.	TGCAG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33417285_G_A:33417285:0,0,0,1
chr19	33428423	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	33439158	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr19	33444511	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr19	33444556	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=64,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:7,4:4,6:9,2,9,1
chr19	33444576	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,4:5,5:9,4,8,1
chr19	33444588	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:9,6,4,1
chr19	33444707	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,5,12
chr19	33464048	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr19	33464486	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=109,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,1:6,1:17,13,2,0
chr19	33467537	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,2:18,1:17,12,3,0
chr19	33467576	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,5:6,5:2,5,4,6
chr19	33467620	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr19	33470874	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,8:2,4:4,0,8,4
chr19	33481388	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=140,174;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:3,4:10,3:11,2,6,1
chr19	33487182	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=150,172;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:1,3:0,2,0,3
chr19	33490480	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=151,156;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.157:19:7,2:9,1:10,6,3,0
chr19	33490566	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=124,93;MMQ=37,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:14,4:13,5:11,16,5,4
chr19	33490585	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=122,114;MMQ=44,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,14:0.339:42:9,10:19,4:9,19,7,7
chr19	33490616	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=124,163;MMQ=40,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:13,5:12,2:9,16,2,5
chr19	33490667	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=139,134;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr19	33490685	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr19	33493334	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr19	33499168	.	T	TCTGAGATGGAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	33502637	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,0:13,2:13,11,1,1
chr19	33502646	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:14,2:0|1:33502646_G_GC:33502646:16,11,1,1
chr19	33502652	.	TG	CA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:15,2:0|1:33502646_G_GC:33502646:16,10,1,1
chr19	33512388	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=124,84;MMQ=40,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,1:6,0:0|1:33512388_A_G:33512388:6,0,1,1
chr19	33512393	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=107,84;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:0|1:33512388_A_G:33512388:6,2,1,1
chr19	33512396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=122,84;MMQ=40,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,2:8,0:0|1:33512396_G_A:33512396:7,2,1,1
chr19	33512400	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=107,84;MMQ=40,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:33512396_G_A:33512396:8,2,1,1
chr19	33585219	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=131,150;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:3,1:1,1:1,6,0,4
chr19	33587168	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:11,0:14,5:10,15,5,0
chr19	33635853	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:8,6:2,3:0|1:33635853_G_A:33635853:1,9,2,7
chr19	33635877	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:5,3:2,1:0|1:33635853_G_A:33635853:0,7,1,4
chr19	33635887	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:0|1:33635853_G_A:33635853:0,6,1,3
chr19	33638449	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=173,193;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:33638449_CA_TG:33638449:3,0,1,0
chr19	33638454	.	AGCCG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=161,193;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:33638449_CA_TG:33638449:4,0,1,0
chr19	33638460	.	T	TTGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=161,193;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33638449_CA_TG:33638449:4,0,1,0
chr19	33642246	.	A	ATCAGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,2:4,0:1,3,1,1
chr19	33642273	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:33642273_A_C:33642273:0,0,0,2
chr19	33642297	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33642273_A_C:33642273:0,1,0,1
chr19	33663189	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:10,6:2,5:11,1,9,2
chr19	33663354	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:13,5:9,13:9,13,3,15
chr19	33687542	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr19	33687750	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,5:0,9:0,1,3,12
chr19	33693929	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:15,1:4,1:2,19,0,2
chr19	33696708	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=230,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,3,0
chr19	33700174	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=82,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr19	33700281	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=110,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:4,1,2,3
chr19	33702245	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr19	33703266	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,0:8,11:6,8,0,11
chr19	33870903	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,2:2,4:0,5,1,6
chr19	33871174	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,5:7,4:6,7,2,7
chr19	33871255	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=139,1476;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:10,2:6,0:5,13,0,2
chr19	33871394	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:4,6:11,7:9,6,8,5
chr19	33872095	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=113,90;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:19,5:19,0:12,26,5,0
chr19	33872218	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.381:32:10,5:10,7:9,11,7,5
chr19	33872717	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:7,7:18,5:15,11,6,6
chr19	33872900	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:1,2:7,7:3,5,7,3
chr19	33878198	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,5,2
chr19	34180328	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=189,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:34180328_T_TTA:34180328:1,4,1,1
chr19	34180330	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=189,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:34180328_T_TTA:34180328:1,4,1,1
chr19	34303633	.	C	CCAGGAAGAAACAGAGGTCATCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr19	34303762	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:0|1:34303762_C_T:34303762:4,7,1,1
chr19	34303769	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:34303762_C_T:34303762:4,5,1,1
chr19	34685617	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr19	34706403	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=205,237;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:34706403_T_G:34706403:3,1,0,1
chr19	34706405	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=205,237;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:34706403_T_G:34706403:3,1,0,1
chr19	34706411	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=246,237;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:34706403_T_G:34706403:2,1,0,1
chr19	34706416	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=246,237;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:34706403_T_G:34706403:2,1,0,1
chr19	34710532	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=120,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,6:2,2:0,3,4,4
chr19	34710817	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:3,3:0,5:2,1,1,7
chr19	34718251	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.401:23:7,6:7,3:6,8,6,3
chr19	34791780	.	C	CTCCCAATCAACATTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	34819012	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,2:6,2:4,7,2,2
chr19	34819092	.	A	ATCACTATAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=194,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	34824770	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr19	34843649	.	TCA	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:8,2:13,0:0|1:34843649_TCA_T:34843649:10,14,0,2
chr19	34843654	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:15,0:0|1:34843649_TCA_T:34843649:11,15,0,2
chr19	34843657	.	C	CCGGCTTCCTCCAGGT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:7,1:17,0:0|1:34843649_TCA_T:34843649:11,15,0,2
chr19	34872355	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.236:14:4,2:6,0:7,4,1,2
chr19	34885006	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	34890322	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr19	34919520	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=100,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr19	34919572	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	34922710	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=166,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:34922710_A_T:34922710:8,2,1,1
chr19	34922717	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=160,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,1:0|1:34922710_A_T:34922710:8,3,1,1
chr19	34922719	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=131,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,0:6,2:0|1:34922710_A_T:34922710:8,4,1,1
chr19	34922865	.	T	TGTATAAA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,9:0,0,4,19
chr19	34942872	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr19	34954873	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr19	34981451	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=112,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34981451_C_A:34981451:0,1,0,1
chr19	34981452	.	T	TGAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=112,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34981451_C_A:34981451:0,1,0,1
chr19	34981455	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=112,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34981451_C_A:34981451:0,1,0,1
chr19	34986767	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=420,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:34986767_A_C:34986767:0,1,0,2
chr19	34986776	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=420,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34986767_A_C:34986767:0,1,0,1
chr19	35085527	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,98;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,12:0.172:73:34,0:25,12:35,26,4,8
chr19	35175208	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,28:0,0,26,21
chr19	35231472	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.925:16:0,4:1,10:1,0,13,2
chr19	35250350	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,5:9,7:7,8,4,8
chr19	35258416	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35258416_A_AT:35258416:0,0,0,1
chr19	35258419	.	C	CGACACAGGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35258416_A_AT:35258416:0,0,0,1
chr19	35420966	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,2:1,6:0,3,1,7
chr19	35422808	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:5,5:4,12:4,5,7,11
chr19	35424504	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=93,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:5,3,5,1
chr19	35435001	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=103,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,2:0,2:0|1:35435001_C_T:35435001:2,3,3,1
chr19	35435006	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=143,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.499:10:3,4:2,1:1|0:35435001_C_T:35435001:3,2,2,3
chr19	35448803	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=87,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:9,1,5,1
chr19	35450229	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.519:29:5,9:8,6:8,6,8,7
chr19	35450308	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:13,0:11,17,3,0
chr19	35451742	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=102,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.643:18:1,2:5,8:6,0,9,3
chr19	35454430	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:3,4:2,2,8,1
chr19	35454604	.	AA	CG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,4,17
chr19	35500919	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=90.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,10,20
chr19	35500955	.	C	CGTGACTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTGACTT;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:6,1:6,5:5,7,2,4
chr19	35502352	.	CCT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=104,107;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:8,5,2,0
chr19	35502495	.	T	TTGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,17;MFRL=26,61;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:0,0:1,3,1,1
chr19	35502498	.	C	CTAAGAATACTTCTTCAAAAGACTATAAATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=0,61;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:0,0:0,2,1,1
chr19	35504627	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=192.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,39:0,28:0,0,27,41
chr19	35506729	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr19	35506836	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=120,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:14,0:8,2:0|1:35506836_T_C:35506836:13,12,1,1
chr19	35506841	.	C	CCA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:35506836_T_C:35506836:13,10,1,1
chr19	35510102	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,10,11
chr19	35510504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr19	35517097	.	C	CAAAGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	35524824	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr19	35530542	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,2:10,2:6,17,1,3
chr19	35533550	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	35550855	.	GGAGGCTGCCCCACACCCA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:9,0:15,13,1,1
chr19	35551789	.	G	GCAATATCGTTGCTGTTCTCCTCGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=265,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr19	35556123	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr19	35556281	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr19	35556300	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr19	35556357	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr19	35556640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	35556655	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr19	35556659	.	A	G,AGAAGTTATCG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,34,25;MFRL=0,152,169;MMQ=60,60,60;MPOS=26,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.03,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.608,0.250:4:0,0,0:0,3,1:0,0,0,4
chr19	35556715	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	35556729	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	35556744	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr19	35557260	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr19	35608148	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:3,1,7,1
chr19	35609972	.	GGAC	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:3,3:1,4:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:4,0,8,1
chr19	35609981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:2,2:1,4:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:3,0,7,0
chr19	35610037	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=109,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,2:8,4:14,5,4,2
chr19	35611913	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=73,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,6:4,4:8,4,7,4
chr19	35612168	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=104,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.549:39:7,4:8,11:5,12,12,10
chr19	35612188	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=104,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.110:46:16,1:19,0:17,24,5,0
chr19	35613623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr19	35614253	.	GGT	G	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=96,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.104:61:26,4:27,2:28,27,4,2
chr19	35614272	.	ATG	A,GTG	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=25,25,32;MFRL=135,128,87;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.52,39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,18:0.081,0.424:45:13,1,7:11,2,10:11,13,14,7
chr19	35614274	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,24:0.401:60:18,11:16,13:16,20,14,10
chr19	35615995	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:11,1:3,2:14,0,3,0
chr19	35616016	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,3:2,1:3,0,5,0
chr19	35616086	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,3:9,4:10,7,4,3
chr19	35616315	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,8:7,3:8,2,10,1
chr19	35616464	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=70,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:0,2,0,11
chr19	35617122	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,8:3,4:7,2,8,4
chr19	35622492	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:1,2,0,5
chr19	35622662	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:35622662_C_T:35622662:2,1,0,1
chr19	35622670	.	TT	GC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=141,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,0:1,1:0|1:35622662_C_T:35622662:3,1,0,1
chr19	35622695	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,8,5
chr19	35624890	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,2:6,2,5,0
chr19	35625535	.	A	ACCCCCC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,8;RU=C;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:8,0:8,0:0|1:35625535_A_ACCCCCC:35625535:0,16,4,0
chr19	35625538	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,2:8,0:0|1:35625535_A_ACCCCCC:35625535:0,16,3,0
chr19	35625544	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:9,0:0|1:35625535_A_ACCCCCC:35625535:0,17,3,0
chr19	35632016	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=78,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,26:0.481:54:13,6:15,20:8,20,11,15
chr19	35633503	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=236,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,2,2
chr19	35633607	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=114,102;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:15,0:18,4:16,19,0,4
chr19	35633628	.	GT	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=131,102;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:18,0:17,4:14,21,0,4
chr19	35642665	.	G	GCCAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=84,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35642665_G_GCCAC:35642665:0,4,0,1
chr19	35642668	.	G	GGTTGCAGTCAGGGCACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=84,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35642665_G_GCCAC:35642665:0,4,0,1
chr19	35646501	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,19;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,1:0|1:35646501_T_G:35646501:6,7,1,1
chr19	35646510	.	CAGAGG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:35646501_T_G:35646501:6,7,1,1
chr19	35646516	.	TAAGAC	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:35646501_T_G:35646501:5,7,1,1
chr19	35646581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	35651531	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr19	35655128	.	CC	TT	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=73,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.056:51:23,0:23,2:0|1:35655128_CC_TT:35655128:27,22,1,1
chr19	35655138	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=73,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:25,0:21,2:0|1:35655128_CC_TT:35655128:25,22,1,1
chr19	35655151	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=81,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.386:39:18,6:6,8:13,11,8,7
chr19	35660546	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=116,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.513:23:3,5:8,5:5,6,7,5
chr19	35757250	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,15,3
chr19	35757335	.	T	TGCCC	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,19;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,1:8,0:0|1:35757335_T_TGCCC:35757335:7,8,4,1
chr19	35757339	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:6,1:9,0:0|1:35757335_T_TGCCC:35757335:8,8,4,0
chr19	35757341	.	CAAGA	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:6,0:9,0:0|1:35757335_T_TGCCC:35757335:9,11,4,0
chr19	35757350	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,2:8,2:0|1:35757335_T_TGCCC:35757335:9,10,4,0
chr19	35757356	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:4,1:9,1:0|1:35757335_T_TGCCC:35757335:5,11,3,0
chr19	35757752	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,0:13,2:10,12,1,1
chr19	35758275	.	G	GGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGA;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	35760622	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:7,1,5,1
chr19	35761963	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:12,2:11,1:15,10,3,0
chr19	35790503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr19	35791353	.	A	AGCCTGCTCCTGGAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35791353_A_AGCCTGCTCCTGGAGCTG:35791353:0,0,0,1
chr19	35791356	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35791353_A_AGCCTGCTCCTGGAGCTG:35791353:0,0,0,1
chr19	35791359	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35791353_A_AGCCTGCTCCTGGAGCTG:35791353:0,0,0,1
chr19	35800720	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	35802733	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35802733_C_T:35802733:0,0,1,0
chr19	35802735	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:35802733_C_T:35802733:0,0,1,0
chr19	35823094	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=250,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:35823094_G_A:35823094:0,2,0,1
chr19	35823096	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=250,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35823094_G_A:35823094:0,2,0,1
chr19	35823860	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35823860_G_GT:35823860:0,3,0,1
chr19	35823862	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:35823860_G_GT:35823860:0,4,0,1
chr19	35823867	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:35823860_G_GT:35823860:0,4,0,1
chr19	35823870	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35823860_G_GT:35823860:0,3,0,1
chr19	35832511	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:2,0:5,2:1,9,0,2
chr19	35836530	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,2:6,2,1,4
chr19	35837148	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.434:35:7,10:12,5:9,11,4,11
chr19	35837428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr19	35837695	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr19	35862393	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,6236;MMQ=45,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.331:18:8,4:4,0:7,5,6,0
chr19	35863383	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=119,126;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:2,8,1,2
chr19	35915658	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=76,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35915658_A_AG:35915658:0,2,0,1
chr19	35915660	.	A	ATCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=76,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35915658_A_AG:35915658:0,2,0,1
chr19	35940721	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,6:5,3:1,7,3,6
chr19	35981175	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35981175_A_G:35981175:0,0,1,0
chr19	35981177	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35981175_A_G:35981175:0,0,1,0
chr19	35991442	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,10,7
chr19	35992643	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=227,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr19	35992864	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=214,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr19	35992883	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr19	35994376	.	G	T,GT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=20,28,35;MFRL=111,131,127;MMQ=60,40,60;MPOS=19,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.29,8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,12,7:0.272,0.341:28:3,3,4:3,5,2:6,3,5,14
chr19	35994466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	35998346	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:15,0:15,3:18,13,0,4
chr19	35998349	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=108,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,0:16,2:16,16,1,1
chr19	35998456	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=88,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.160:16:5,2:9,0:6,8,1,1
chr19	36002487	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,2,0
chr19	36014328	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	36014330	.	T	TCCCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,12;RU=C;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	36014341	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=98,308;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr19	36015865	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=189,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:2,0:1,3,0,4
chr19	36015884	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=65,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36015884_TC_AA:36015884:0,2,0,1
chr19	36015891	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36015884_TC_AA:36015884:0,0,0,1
chr19	36015895	.	AGGGACCT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36015884_TC_AA:36015884:0,0,0,1
chr19	36017768	.	TTCCTTCCCGGCCTGTTCAAGGGTATGGTGAACTCCCTGGCCAAACTGCCCTGCC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.116:25:12,2:7,0:7,16,1,1
chr19	36019205	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:36019205_G_GAC:36019205:0,4,0,1
chr19	36019207	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:36019205_G_GAC:36019205:0,4,0,1
chr19	36019210	.	A	AGCT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,22;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:36019205_G_GAC:36019205:0,4,0,1
chr19	36019237	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=218,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36019237_T_A:36019237:0,1,0,1
chr19	36019239	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=218,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36019237_T_A:36019237:0,1,0,1
chr19	36019243	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=218,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:36019237_T_A:36019237:0,1,0,1
chr19	36037499	.	CAGGGA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGGA;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:9,0:4,2:0|1:36037499_CAGGGA_C:36037499:8,7,1,1
chr19	36037525	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=92,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,7:0.295:25:10,4:8,3:1|0:36037499_CAGGGA_C:36037499:11,7,5,2
chr19	36038390	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,4:4,2:0,4,0,6
chr19	36045772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:4,1,4,2
chr19	36045903	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=96,142;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:6,13,2,0
chr19	36046487	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:4,7,2,1
chr19	36047907	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,3:6,0:8,10,2,1
chr19	36049681	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,371;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36049681_TC_T:36049681:0,0,1,0
chr19	36049688	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,371;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36049681_TC_T:36049681:0,0,1,0
chr19	36051799	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=76,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:4,1:14,2:11,7,1,2
chr19	36105908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:2,1,3,1
chr19	36105917	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:3,1,2,1
chr19	36106337	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=286,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	36108942	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,31;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,0:4,2:0|1:36108942_C_T:36108942:6,3,1,1
chr19	36108949	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=175,31;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,0:6,1:0|1:36108942_C_T:36108942:7,4,1,1
chr19	36113459	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=117,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr19	36113529	.	GA	TC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:10,1:12,11,1,1
chr19	36113658	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr19	36122362	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,2:4,3:1,6,0,5
chr19	36124155	.	G	GATCAAAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:36124155_G_GATCAAAC:36124155:4,7,1,1
chr19	36124157	.	G	GGCAGTTCTC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:0|1:36124155_G_GATCAAAC:36124155:4,7,1,1
chr19	36124176	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,1:4,3:2,5,1,3
chr19	36135279	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,4,17
chr19	36135793	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:11,9:3,5:3,11,3,11
chr19	36142296	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=56,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr19	36145409	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.471:14:3,1:0,2:2,5,3,4
chr19	36145629	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:36145629_G_A:36145629:0,7,0,2
chr19	36145638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:36145629_G_A:36145629:0,5,0,2
chr19	36157893	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	36159451	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,128;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:9,3:16,6,0,3
chr19	36168663	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr19	36168914	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=259,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,9:1,7:0,1,10,6
chr19	36205556	.	AGCCCCT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:9,2:11,0:0|1:36205556_AGCCCCT_A:36205556:12,13,0,2
chr19	36205564	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:0|1:36205556_AGCCCCT_A:36205556:10,13,0,2
chr19	36206986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr19	36210767	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,2:16,1:11,15,3,0
chr19	36213187	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr19	36214632	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=61.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,6:0,0,9,10
chr19	36216056	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr19	36216506	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr19	36218367	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr19	36219604	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,133;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:7,0,0,2
chr19	36221051	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=48,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,3:1,4:2,3,1,6
chr19	36228245	.	G	GCTTCTGAGTCTGTCTGTGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36228245_G_GCTTCTGAGTCTGTCTGTGC:36228245:0,0,0,1
chr19	36228247	.	A	AGTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36228245_G_GCTTCTGAGTCTGTCTGTGC:36228245:0,0,0,1
chr19	36228249	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36228245_G_GCTTCTGAGTCTGTCTGTGC:36228245:0,0,0,1
chr19	36228253	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36228245_G_GCTTCTGAGTCTGTCTGTGC:36228245:0,0,0,1
chr19	36230174	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,11,8
chr19	36235928	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	36236178	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:0,3:9,2:0|1:36236178_G_GC:36236178:1,9,8,0
chr19	36236183	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:0,3:10,4:0|1:36236178_G_GC:36236178:1,11,8,0
chr19	36236186	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:0,4:11,4:0|1:36236178_G_GC:36236178:1,11,8,0
chr19	36236193	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.305:21:3,2:9,0:0|1:36236178_G_GC:36236178:1,14,6,0
chr19	36237245	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr19	36237503	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chr19	36243163	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.284:33:11,0:13,9:12,12,0,9
chr19	36243190	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr19	36243813	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chr19	36253221	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=114,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:0|1:36253221_A_C:36253221:8,14,2,0
chr19	36253225	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:10,0:12,2:1|0:36253221_A_C:36253221:11,14,1,1
chr19	36253235	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:12,0:15,2:1|0:36253221_A_C:36253221:14,14,1,1
chr19	36253317	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	36257932	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	36258895	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	36258937	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr19	36275074	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.940:15:0,3:0,8:0,0,11,4
chr19	36276086	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,7:0,0,11,12
chr19	36276164	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:3,8,1,1
chr19	36290900	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr19	36302989	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:7,1,5,3
chr19	36303161	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:3,4,2,0
chr19	36304232	.	G	GTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=108,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	36317626	.	C	CTGCCTCCTTTTCCTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	36321910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,3:0,5:1,0,6,2
chr19	36322509	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr19	36330464	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=58,145;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:4,13,2,0
chr19	36333535	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36333535_T_G:36333535:0,2,0,1
chr19	36333541	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=266,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36333535_T_G:36333535:0,1,0,1
chr19	36333543	.	GCCAC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=266,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36333535_T_G:36333535:0,1,0,1
chr19	36334395	.	GC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:0|1:36334395_GC_G:36334395:14,10,1,1
chr19	36334399	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:36334395_GC_G:36334395:13,10,1,1
chr19	36351591	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=61,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:36351591_G_T:36351591:1,2,1,1
chr19	36351597	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:36351591_G_T:36351591:2,2,1,1
chr19	36351598	.	T	TTTA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=117,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,2:0|1:36351591_G_T:36351591:2,2,1,1
chr19	36352733	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:7,3:6,0:6,7,4,0
chr19	36362474	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36362474_C_T:36362474:1,1,1,0
chr19	36362479	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:36362474_C_T:36362474:1,1,1,0
chr19	36364431	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	36365752	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:3,9,0,2
chr19	36367561	.	G	GCATCCACTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chr19	36369450	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.253:27:5,3:8,1:13,8,4,2
chr19	36393464	.	TCTGCCAGACCC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGCCAGACCC;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.136:34:12,1:16,2:12,18,2,2
chr19	36394353	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=88,60;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,0:12,2:10,15,0,2
chr19	36398287	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,0:0|1:36398287_A_T:36398287:0,3,1,0
chr19	36398290	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36398287_A_T:36398287:0,3,1,0
chr19	36398299	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:36398287_A_T:36398287:0,3,1,0
chr19	36398306	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,0;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36398287_A_T:36398287:0,3,1,0
chr19	36486445	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	36494387	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=101,231;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,6:10,0:12,11,7,0
chr19	36497358	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,13,12
chr19	36497634	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,158;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:4,5:6,0:10,1,5,0
chr19	36499331	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=241,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:36499331_C_T:36499331:0,3,1,1
chr19	36499334	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=241,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:36499331_C_T:36499331:0,3,1,1
chr19	36508846	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:14,0:5,4:10,9,4,0
chr19	36549969	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=94,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,1:13,1:16,13,0,2
chr19	36564457	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	36572505	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:36572505_G_C:36572505:4,15,0,2
chr19	36572509	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,2:0|1:36572505_G_C:36572505:4,15,0,2
chr19	36584904	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr19	36590309	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=182,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:2,2,3,2
chr19	36612475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:5,4,2,0
chr19	36631952	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,5:0.110:54:22,5:19,0:0|1:36631952_C_T:36631952:33,16,1,4
chr19	36631957	.	G	GTGGAA	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=92,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:17,3:16,0:0|1:36631952_C_T:36631952:23,14,0,3
chr19	36631958	.	CGGGGGAGGCGGGGGCCTGGGTGGGGGCCTGGGAAATGTGCTTGGAGGCCTGATCAGCGGGGCCGGG	C	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:48,7:0.140:55:12,6:12,1:1|0:36631952_C_T:36631952:36,12,4,3
chr19	36631960	.	G	GCCAT	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=93,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:13,2:13,0:0|1:36631952_C_T:36631952:18,11,0,2
chr19	36632151	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=14,18;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.184:32:6,1:5,1:9,17,0,6
chr19	36642310	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr19	36642349	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,6:6,6:5,2,7,5
chr19	36642561	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:6,4:1,2:0|1:36642561_G_GC:36642561:1,6,1,5
chr19	36642562	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:5,5:1,3:0|1:36642561_G_GC:36642561:1,5,1,7
chr19	36685310	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36685310_C_T:36685310:0,0,0,1
chr19	36685316	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:36685310_C_T:36685310:0,0,0,3
chr19	36727507	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:36727507_A_G:36727507:16,5,0,2
chr19	36727511	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:7,0:0|1:36727507_A_G:36727507:14,6,0,2
chr19	36727512	.	AGTATGTCATT	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:7,0:0|1:36727507_A_G:36727507:15,10,0,2
chr19	36728231	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr19	36885067	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	36896668	.	GTAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	36900778	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=85,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,2:1,4:1,1,2,4
chr19	36940069	.	CT	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=115,264;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:36940069_CT_TG:36940069:7,10,2,0
chr19	36940076	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=115,264;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:8,0:7,2:0|1:36940069_CT_TG:36940069:7,10,2,0
chr19	36940760	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,5:6,6:4,6,4,7
chr19	36963743	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	37005298	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:7,7:1,7:4,4,6,8
chr19	37063218	.	CA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,34,25,31;MFRL=107,129,78,93;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,18,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.78,5.90,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:29,5,8,3:0.113,0.153,0.082:45:7,1,4,2:19,4,1,0:10,19,4,12
chr19	37064240	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,2:2,1,2,1
chr19	37064267	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,2:0,2:2,1,4,1
chr19	37064512	.	G	GCGGAGCACCTGAGGTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	37129806	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,6:5,5:7,5,7,4
chr19	37134723	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:10,11,1,1
chr19	37134745	.	T	TATAGTTTGTAAATGTA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=77,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:0|1:37134745_T_TATAGTTTGTAAATGTA:37134745:9,10,1,1
chr19	37134746	.	C	CAGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=77,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,1:6,0:0|1:37134745_T_TATAGTTTGTAAATGTA:37134745:9,10,1,1
chr19	37134857	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37134857_A_G:37134857:0,2,0,1
chr19	37134864	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37134857_A_G:37134857:0,2,0,1
chr19	37134868	.	CT	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37134857_A_G:37134857:0,2,0,1
chr19	37134879	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:37134857_A_G:37134857:0,0,0,2
chr19	37149335	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=72,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,3:12,0:8,17,2,1
chr19	37149364	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:37149364_TA_T:37149364:1,10,0,2
chr19	37149366	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:37149364_TA_T:37149364:1,10,0,2
chr19	37155495	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	37203249	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr19	37369389	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:37369389_A_T:37369389:9,13,0,2
chr19	37369397	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:37369389_A_T:37369389:8,13,0,2
chr19	37369400	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:13,2:0|1:37369389_A_T:37369389:8,13,0,2
chr19	37369403	.	T	TCCTTCCTTCCTTCC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:4,0:13,2:0|1:37369389_A_T:37369389:8,10,0,2
chr19	37369525	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=91,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.338:20:7,1:6,5:5,8,4,3
chr19	37369728	.	TTTTTTTGTTTTTG	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=107,219;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.051:77:51,0:17,3:42,32,3,0
chr19	37369887	.	CG	AA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,21;MFRL=289,219;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,2,0,2
chr19	37369888	.	GCCA	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=296,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:37369888_GCCA_G:37369888:1,1,0,1
chr19	37369895	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=254,202;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:37369888_GCCA_G:37369888:1,3,0,1
chr19	37369896	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=289,219;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,2,0,2
chr19	37369900	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=21,34;MFRL=289,219;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,2,0,2
chr19	37369909	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=296,219;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,1,0,2
chr19	37369912	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=296,219;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,1,0,2
chr19	37369914	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=296,219;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:37369887_CG_AA:37369887:1,1,0,2
chr19	37398830	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:9,8,0,2
chr19	37416022	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	37441365	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,4,7
chr19	37581834	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr19	37619854	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:7,8,1,2
chr19	37642917	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,57;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0|1:37642917_G_A:37642917:0,0,5,15
chr19	37642922	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,57;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,7:0|1:37642917_G_A:37642917:0,0,5,13
chr19	37676154	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=149,118;MMQ=57,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,0:6,3:9,8,3,0
chr19	37676196	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=130,118;MMQ=43,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:10,7,3,0
chr19	37721404	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:4,3:3,1:2,6,0,4
chr19	37721498	.	T	TGAAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37721498_T_TGAAC:37721498:0,1,0,1
chr19	37721499	.	T	TCTTTCCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37721498_T_TGAAC:37721498:0,1,0,1
chr19	37721501	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37721498_T_TGAAC:37721498:0,1,0,1
chr19	37721504	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37721498_T_TGAAC:37721498:0,1,0,1
chr19	37734119	.	ACATCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGCAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTAGTGGCTCAGCACTTACTAAT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.113:46:3,9:11,2:18,17,7,4
chr19	37854418	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:1,7:5,4:1,5,6,5
chr19	37879538	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:8,12,0,3
chr19	37904560	.	C	CAATCAAAAGTCTTAACAAACTATTGTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:4,7,1,1
chr19	37967219	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=101,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.146:26:12,1:11,2:12,11,2,1
chr19	37975206	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.172:27:7,4:10,0:0|1:37975206_AG_A:37975206:12,8,3,4
chr19	37975208	.	CCAGAGTTCATCCCTTACTCTTCATCAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTATAGAGTGTGGAAAAGCCTTCAG	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,165;MMQ=60,57;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.109:36:7,3:12,0:0|1:37975206_AG_A:37975206:16,16,1,3
chr19	38028568	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=111,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:4,0:11,2:0|1:38028568_A_G:38028568:7,8,1,1
chr19	38028573	.	C	CCTTTGTCTGCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=107,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,0:12,1:0|1:38028568_A_G:38028568:8,8,1,1
chr19	38056763	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,10,12
chr19	38077474	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr19	38077661	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr19	38089277	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.300:44:18,0:11,12:22,9,0,13
chr19	38089304	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=127,194;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,21:0.278:77:23,21:32,0:27,29,20,1
chr19	38127269	.	T	TCACCTCCCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr19	38127302	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38127302_A_C:38127302:2,0,0,1
chr19	38127305	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,23;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:38127302_A_C:38127302:2,0,0,1
chr19	38135444	.	C	CAAAAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=482,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,4:1,0,10,0
chr19	38190845	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	38229378	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr19	38229824	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,7:0,8:0,1,8,7
chr19	38376577	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=110,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:8,12,1,1
chr19	38376594	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=99,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,3:9,4:7,7,3,4
chr19	38377409	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,28;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr19	38379203	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=79,50;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,3:24,0:12,29,3,0
chr19	38379823	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=99,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,0:14,2:8,21,2,0
chr19	38380643	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=98,201;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:10,0:15,11,3,0
chr19	38380767	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=112,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,3:17,0:11,16,3,0
chr19	38380779	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=92,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:7,3:14,0:0|1:38380779_G_A:38380779:8,13,3,0
chr19	38380780	.	G	GATAT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=92,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:7,3:14,0:0|1:38380779_G_A:38380779:8,13,3,0
chr19	38383786	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=109,33;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:6,5,1,1
chr19	38384825	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:38384825_T_C:38384825:2,7,1,1
chr19	38384830	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:38384825_T_C:38384825:2,7,1,1
chr19	38384831	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:38384825_T_C:38384825:2,7,1,1
chr19	38385237	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,3:5,0:8,9,2,1
chr19	38579390	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=92,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:38579390_A_T:38579390:9,11,1,1
chr19	38579397	.	G	GACTACA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:38579390_A_T:38579390:8,11,1,1
chr19	38579398	.	G	GGTGCCCGCTA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:38579390_A_T:38579390:8,11,1,1
chr19	38621473	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	38653039	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=143,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,2:11,0:4,9,0,2
chr19	38653097	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr19	38673298	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=101,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,3:6,9:2,9,6,6
chr19	38682966	.	TCC	GGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=76,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,1,0
chr19	38692656	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=139,39;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:38692656_C_T:38692656:6,8,2,0
chr19	38692666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=125,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:38692656_C_T:38692656:6,5,2,0
chr19	38704192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	38706881	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=171,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:12,2:1,1:9,4,3,1
chr19	38708329	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=216,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr19	38708398	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=63,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:2,2,3,3
chr19	38709313	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=82,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:3,1:10,6:5,8,0,7
chr19	38774268	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:10,2:0|1:38774268_C_T:38774268:14,7,1,1
chr19	38774271	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:38774268_C_T:38774268:13,7,1,1
chr19	38774328	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.090:54:16,0:33,4:38,12,4,0
chr19	38781218	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,9:5,5:1,7,8,6
chr19	38795270	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:0|1:38795270_C_T:38795270:9,8,2,2
chr19	38795272	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:0|1:38795270_C_T:38795270:9,8,2,2
chr19	38795287	.	C	CTTACAAGCTCCTTAAGTTGTATTTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.189:24:7,0:13,4:0|1:38795270_C_T:38795270:11,9,2,2
chr19	38797542	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=155,175;MMQ=48,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,1:5,3:8,0,4,0
chr19	38797565	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=153,107;MMQ=46,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.252:21:3,1:12,3:0|1:38797565_A_C:38797565:16,0,5,0
chr19	38797567	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=153,107;MMQ=46,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.251:21:3,1:13,4:0|1:38797565_A_C:38797565:16,0,5,0
chr19	38797598	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:12,2:31,2:0|1:38797598_A_G:38797598:23,23,3,2
chr19	38797601	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=122,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:12,3:34,2:0|1:38797598_A_G:38797598:24,23,3,2
chr19	38797611	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=118,101;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.046:64:17,2:42,0:0|1:38797611_G_A:38797611:25,37,1,1
chr19	38797616	.	C	G	.	.	DP=72;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=116,101;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:20,2:42,0:0|1:38797611_G_A:38797611:26,40,1,1
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chr19	38810597	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38810590_C_A:38810590:1,0,0,1
chr19	38828388	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,346;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	38835120	.	G	GTAAATACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	38861376	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:11,11,1,1
chr19	38871527	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=100,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,2:8,1:12,9,1,2
chr19	38871689	.	A	ATATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	38872898	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr19	38904136	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=104,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,2:10,0:8,13,1,1
chr19	38905683	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:5,3,4,4
chr19	38905792	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,4:9,2:9,3,0,6
chr19	38911931	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	38934361	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,0:8,5:6,11,1,4
chr19	38935350	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr19	38939117	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,0:6,3:0|1:38939117_C_T:38939117:8,7,2,1
chr19	38939137	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:38939117_C_T:38939117:8,7,1,1
chr19	38939140	.	C	CTGGGTTCAAGTGATTCTCCT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:38939117_C_T:38939117:8,7,1,1
chr19	38939408	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,9:0,0,8,6
chr19	38939478	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=95,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:38939478_G_A:38939478:2,4,1,1
chr19	38939486	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=98,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:38939478_G_A:38939478:1,4,1,1
chr19	38939505	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	38943728	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr19	38945851	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	38946182	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr19	38946215	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr19	38948356	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	38948809	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:6,2,1,1
chr19	38949729	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	38950947	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr19	38953996	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	38957117	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=223,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38957117_A_C:38957117:0,1,0,1
chr19	38957124	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=223,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38957117_A_C:38957117:0,1,0,1
chr19	38957128	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=223,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38957117_A_C:38957117:0,1,0,1
chr19	38957130	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38957117_A_C:38957117:0,0,0,1
chr19	38960116	.	A	ATCATTGCTCACCCATGGTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=83,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:1,2:7,0:3,5,1,1
chr19	38973959	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr19	38989658	.	CGCAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=271,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCAGG;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr19	38993592	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:38993592_C_CTT:38993592:1,6,1,1
chr19	38993593	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:38993592_C_CTT:38993592:1,6,1,1
chr19	38993594	.	C	CACCTTCTTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:38993592_C_CTT:38993592:1,6,1,1
chr19	38995415	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:7,4,1,1
chr19	39001231	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=105,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,2:11,0:0|1:39001231_G_A:39001231:11,11,1,1
chr19	39001238	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=105,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,1:13,0:0|1:39001231_G_A:39001231:10,11,1,1
chr19	39016029	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,2:3,0:6,4,1,1
chr19	39025495	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,0:5,4:0,12,0,4
chr19	39026737	.	C	CTCAGCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39051680	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=186,208;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	39056475	.	C	CAGGTTCTTTCCTATTTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	39056478	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39058653	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39058653_G_A:39058653:0,1,0,1
chr19	39058655	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39058653_G_A:39058653:0,1,0,1
chr19	39058657	.	A	ACCGCCCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,23;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39058653_G_A:39058653:0,1,0,1
chr19	39058658	.	A	ATCCACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,22;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39058653_G_A:39058653:0,1,0,1
chr19	39075748	.	T	TTTAAAATCAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:8,0:4,14,0,2
chr19	39077895	.	AAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:4,2:5,3,1,1
chr19	39086670	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,1:0|1:39086670_A_AC:39086670:1,7,2,0
chr19	39086675	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,21;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,1:0|1:39086670_A_AC:39086670:1,7,2,0
chr19	39086682	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,0:0|1:39086670_A_AC:39086670:2,7,2,0
chr19	39092021	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=88,38;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.195:19:10,1:5,2:10,6,3,0
chr19	39095982	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:1,0:0|1:39095982_T_C:39095982:0,1,3,0
chr19	39095987	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,1:1,1:0|1:39095982_T_C:39095982:1,1,3,0
chr19	39095992	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:2,1:0|1:39095982_T_C:39095982:1,3,2,0
chr19	39095994	.	CAGGCAT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=58,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:3,1:0|1:39095982_T_C:39095982:3,3,2,0
chr19	39104851	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,1:3,0:0|1:39104851_A_C:39104851:0,7,3,0
chr19	39104858	.	AA	CC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,1:0|1:39104851_A_C:39104851:0,7,3,0
chr19	39104862	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,0:0|1:39104851_A_C:39104851:1,7,2,0
chr19	39104864	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,0:0|1:39104851_A_C:39104851:1,7,2,0
chr19	39110074	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=174,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.192:14:7,2:1,0:0,12,0,2
chr19	39207674	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=189,268;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr19	39207955	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,2:4,0:4,12,0,2
chr19	39208812	.	C	CTCCTCTCCCCTCACTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr19	39214500	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39214500_G_C:39214500:1,1,0,1
chr19	39214501	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=227,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:39214500_G_C:39214500:1,2,0,1
chr19	39214506	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=227,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39214500_G_C:39214500:1,2,0,1
chr19	39214517	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=217,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:39214500_G_C:39214500:2,2,0,1
chr19	39216444	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=114,77;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,0:13,4:16,10,1,3
chr19	39216471	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=100,77;MMQ=55,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.150:30:15,0:11,4:15,11,1,3
chr19	39218706	.	GCT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.255:20:8,4:5,1:2,13,1,4
chr19	39219050	.	GCTCCTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=CTC;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.560:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	39221703	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.190:17:2,0:8,0:7,7,3,0
chr19	39224781	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=122,96;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:11,0:17,2:0|1:39224781_C_T:39224781:19,12,0,2
chr19	39224786	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=107,96;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,0:19,2:0|1:39224781_C_T:39224781:20,15,0,2
chr19	39226122	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:10,13,2,0
chr19	39227107	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:10,3:12,2:8,15,4,1
chr19	39232964	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39232964_A_G:39232964:3,0,1,0
chr19	39232973	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=119,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:39232964_A_G:39232964:3,1,1,0
chr19	39294259	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:5,5,3,3
chr19	39294466	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,2:5,6:5,4,5,3
chr19	39294621	.	CCCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCA;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr19	39297007	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=236,192;MMQ=42,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,2:1,5:2,0,7,1
chr19	39299362	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.883:23:0,9:0,12:0,2,7,14
chr19	39299465	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:39299465_G_T:39299465:5,14,1,1
chr19	39299472	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,0:8,2:0|1:39299465_G_T:39299465:5,17,1,1
chr19	39299516	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=121,295;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.180:26:11,0:9,4:12,10,0,4
chr19	39299680	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr19	39303158	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=89,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:6,6,2,2
chr19	39306425	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr19	39307740	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:2,0:12,3:9,6,1,2
chr19	39307893	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,5:1,4:3,2,3,6
chr19	39307925	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:3,4,4,2
chr19	39321691	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,4:8,7:8,8,8,3
chr19	39321899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:4,2,3,2
chr19	39322456	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.624:19:5,7:1,4:1,6,2,10
chr19	39327243	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,0;MMQ=48,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:39327243_A_C:39327243:3,0,1,0
chr19	39327247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=145,0;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:39327243_A_C:39327243:3,0,1,0
chr19	39329517	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=83,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.265:32:10,5:13,3:9,15,1,7
chr19	39330704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,4:2,5:2,0,8,1
chr19	39331296	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	39334811	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr19	39334830	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	39336503	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,68;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:12,0:13,4:16,11,1,3
chr19	39338142	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:0,7,0,8
chr19	39340390	.	C	CTTAAAATAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,32;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:39340390_C_CTTAAAATAAAA:39340390:0,0,1,1
chr19	39340391	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,32;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:39340390_C_CTTAAAATAAAA:39340390:0,0,1,1
chr19	39362277	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:8,7:2,9:4,6,10,6
chr19	39370217	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,251;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,1:0,1:1,4,1,1
chr19	39370396	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr19	39371340	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=99,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:19,0:7,3:17,11,0,3
chr19	39380030	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:2,3,4,0
chr19	39390931	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	39398416	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr19	39399277	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr19	39407014	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr19	39408360	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=70,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,6:2,12:1,1,10,10
chr19	39408540	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.311:10:3,1:4,0:2,5,3,0
chr19	39408688	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr19	39409046	.	CCA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:7,2:4,5,1,1
chr19	39409236	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	39411960	.	G	GCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.474:8:2,2:2,2:2,2,4,0
chr19	39421388	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr19	39437270	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:39437270_G_A:39437270:0,0,0,7
chr19	39437293	.	CTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:39437270_G_A:39437270:0,3,0,1
chr19	39437297	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:39437270_G_A:39437270:0,3,0,1
chr19	39589812	.	ACGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=186,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:39589812_ACGG_A:39589812:0,1,0,1
chr19	39589819	.	GGGGCGCGCGCAGGGATGGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=186,236;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39589812_ACGG_A:39589812:0,1,0,1
chr19	39591757	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:2,1:5,6:4,3,0,8
chr19	39664122	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr19	39666085	.	G	GGCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:6,0:8,2:8,6,1,1
chr19	39734962	.	A	AGAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAGG;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr19	39735637	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,150;MMQ=57,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:12,7,0,2
chr19	39759240	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=228,103;MMQ=30,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,2,1
chr19	39759723	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr19	39759960	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=193,98;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:39759960_T_C:39759960:0,2,1,3
chr19	39759968	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=193,91;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:39759960_T_C:39759960:0,2,1,2
chr19	39759974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=193,91;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:39759960_T_C:39759960:0,2,1,2
chr19	39760069	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr19	39804662	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:6,4,2,0
chr19	39819527	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr19	39819802	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr19	39823813	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.165:17:7,0:6,2:4,11,2,0
chr19	39826597	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,2:9,3:5,13,0,5
chr19	39860687	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,185;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.526:55:12,28:14,0:17,9,29,0
chr19	39876556	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=210,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr19	39878944	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,2:8,7:9,7,6,3
chr19	39881015	.	T	TAGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=198,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.495:10:1,1:4,4:0,5,3,2
chr19	39881053	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,0:4,9:1,8,0,9
chr19	39907679	.	G	GAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=195,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,1:5,0:0|1:39907679_G_GAT:39907679:1,7,1,1
chr19	39907681	.	T	TACTCACACAAAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=195,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:39907679_G_GAT:39907679:1,7,1,1
chr19	39909714	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	39911210	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:10,4,1,1
chr19	39911232	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:7,7,1,1
chr19	39911447	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=86,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:8,1:2,2:5,5,2,1
chr19	39914223	.	GCGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,1,0
chr19	39914308	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=94,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:1,1:14,3:13,3,3,1
chr19	39914748	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.491:35:6,7:10,10:8,10,5,12
chr19	39915627	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr19	39915637	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:2,1:0,1:2,1,1,2
chr19	39924129	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.580:31:6,8:6,10:5,8,10,8
chr19	39936502	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:10,2,4,1
chr19	39944082	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=97,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:7,8:11,4:10,9,8,4
chr19	39949570	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,3:7,6:4,9,4,5
chr19	39949764	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=83,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:6,3:9,2:11,4,4,2
chr19	39949897	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=73,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr19	39950124	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.139:24:9,2:8,0:17,4,2,1
chr19	39955477	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,91;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.275:26:9,6:10,0:9,10,7,0
chr19	39955733	.	TGTTCTCC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:5,0:0|1:39955733_TGTTCTCC_T:39955733:0,9,0,2
chr19	39955741	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:0|1:39955733_TGTTCTCC_T:39955733:0,8,0,2
chr19	39957232	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.339:12:4,1:3,0:3,5,0,4
chr19	39959519	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.561:30:5,11:8,5:8,5,7,10
chr19	39962036	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,51;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:12,0:16,6:12,17,0,6
chr19	39963828	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:4,1:0,1:2,3,0,2
chr19	39971622	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	39972766	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=319,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	39976278	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:3,4,3,4
chr19	39976464	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,4:4,2:3,8,3,3
chr19	39976734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=332,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr19	39980344	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,6,0
chr19	39980432	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=112,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:12,0:21,4:17,16,0,4
chr19	39997710	.	GCGCTGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGCTGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	40009396	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,4,1
chr19	40009683	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.409:25:10,4:4,6:13,2,5,5
chr19	40023088	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.658:33:6,8:5,14:5,6,13,9
chr19	40023308	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr19	40093111	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	40170103	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.292:11:4,1:4,1:1,7,1,2
chr19	40170150	.	CG	GC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr19	40174119	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=105,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:9,4:8,3:9,8,2,5
chr19	40174344	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	40198107	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40198107_A_C:40198107:0,0,0,1
chr19	40198109	.	C	CATGCCTAGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40198107_A_C:40198107:0,0,0,1
chr19	40199774	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=179,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr19	40222211	.	T	TTAGCCTCCCATGCCGCTGGGATTACAGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,227;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	40224986	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:3,3,1,1
chr19	40225168	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr19	40225646	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=63,91;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,4:4,6:2,3,6,4
chr19	40228436	.	CC	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr19	40318086	.	AG	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr19	40325345	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=119,44;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:17,0:15,3:18,14,0,3
chr19	40327312	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=65,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:4,5:0,9:2,2,6,8
chr19	40328327	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr19	40330879	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,2:10,1:12,6,3,0
chr19	40337080	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr19	40354389	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=87,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,1,1
chr19	40357711	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=99,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.525:32:5,15:10,0:11,4,17,0
chr19	40361112	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:0,9,1,5
chr19	40367945	.	G	GCATATGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=212,54;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:1,7,1,1
chr19	40368498	.	AA	CC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=110,144;MMQ=60,55;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.759:10:2,5:0,3:1,1,4,4
chr19	40389643	.	G	GATCCTCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,68;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr19	40389791	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	40389820	.	A	AAGTTACCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=180,171;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	40392359	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	40408128	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=105,135;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.387:16:6,1:4,5:0|1:40408128_C_T:40408128:5,5,2,4
chr19	40408146	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=163,105;MMQ=40,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,10:0.610:16:2,6:4,4:1|0:40408128_C_T:40408128:2,4,4,6
chr19	40408268	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,223;MMQ=27,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:3,1:10,2:7,6,0,3
chr19	40408821	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=181,190;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:2,1,1,6
chr19	40408857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,7,8
chr19	40408910	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:1,6,3,2
chr19	40411590	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,0:0,0:0|1:40411590_C_G:40411590:0,2,2,0
chr19	40411593	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:40411590_C_G:40411590:0,2,2,0
chr19	40411597	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=90,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:40411590_C_G:40411590:0,3,2,0
chr19	40411600	.	CACAGG	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=105,211;MMQ=58,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:1,0:0|1:40411590_C_G:40411590:1,5,2,0
chr19	40433042	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,5:6,1:3,8,2,4
chr19	40434035	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:8,11,1,1
chr19	40434050	.	TG	CT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:40434050_TG_CT:40434050:7,8,1,1
chr19	40434053	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:8,2:0|1:40434050_TG_CT:40434050:6,8,1,1
chr19	40434056	.	G	GCTT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:40434050_TG_CT:40434050:5,7,1,1
chr19	40480501	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,4:3,8:5,5,5,7
chr19	40480550	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.475:11:4,3:0,2:2,4,1,4
chr19	40480788	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=295,93;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	40486136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,2,2
chr19	40486158	.	G	GTCCCTTGGTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr19	40486465	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr19	40487301	.	T	TCTTCCGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40487301_T_TCTTCCGC:40487301:0,1,0,1
chr19	40487306	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:40487301_T_TCTTCCGC:40487301:0,1,0,1
chr19	40521032	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:6,0:9,5,1,2
chr19	40542168	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=109,86;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:40542168_TC_T:40542168:8,6,1,1
chr19	40542178	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=107,86;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:40542168_TC_T:40542168:9,6,1,1
chr19	40542186	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=109,86;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:40542168_TC_T:40542168:10,8,1,1
chr19	40542188	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=110,86;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:40542168_TC_T:40542168:9,8,1,1
chr19	40553423	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr19	40587845	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=181,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,6:0,3,3,7
chr19	40595028	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=226,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	40595220	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.442:32:11,6:7,8:10,8,6,8
chr19	40698316	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,5:5,0:0|1:40698316_C_T:40698316:6,4,2,3
chr19	40698334	.	G	GTCAGCTCATTCTTAGAGATTGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.302:11:4,2:4,0:0|1:40698316_C_T:40698316:5,3,2,1
chr19	40719410	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr19	40720079	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	40729096	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:2,1,5,3
chr19	40739721	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr19	40741161	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr19	40742320	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=96,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:2,1:1,1,1,2
chr19	40744697	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=276,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	40788535	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:0|1:40788535_C_CA:40788535:7,3,1,1
chr19	40788540	.	T	TTTCCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:9,0:1,2:0|1:40788535_C_CA:40788535:7,3,1,1
chr19	40788641	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr19	40839664	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	40875800	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.729:9:2,2:0,4:0|1:40875800_C_G:40875800:1,1,4,3
chr19	40875810	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0|1:40875800_C_G:40875800:1,1,4,3
chr19	40882459	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr19	40884160	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	40886223	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:2,4:7,4:4,5,4,5
chr19	40895761	.	AG	GC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=192,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:40895761_AG_GC:40895761:0,5,1,1
chr19	40895766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=181,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:40895761_AG_GC:40895761:0,4,1,1
chr19	40895767	.	CGATGATGTCGT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=181,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:40895761_AG_GC:40895761:0,4,1,1
chr19	40900683	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:2,1:11,0:4,9,0,2
chr19	40901574	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:3,3:13,0:9,7,2,1
chr19	40901604	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:0|1:40901604_A_G:40901604:4,9,0,5
chr19	40901614	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:3,3:7,4:0|1:40901604_A_G:40901604:4,9,1,6
chr19	40902395	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.121:22:7,2:11,0:0|1:40902395_G_T:40902395:9,11,1,1
chr19	40902397	.	ACT	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:8,1:11,0:0|1:40902395_G_T:40902395:11,12,1,1
chr19	40904602	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:3,3,3,5
chr19	40947373	.	GGATC	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GATC;STR;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:15,4:14,5:15,17,7,2
chr19	40957441	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=52,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.536:6:2,0:0,1:2,1,0,3
chr19	40964038	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,1:0|1:40964038_C_T:40964038:13,13,1,1
chr19	40964039	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.174:26:7,1:11,0:9,13,4,0
chr19	40964044	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:0|1:40964038_C_T:40964038:13,14,1,1
chr19	40971610	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:22,6:15,0:12,25,5,1
chr19	40996238	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=168,293;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:2,7,0,2
chr19	41007797	.	GTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:7,4:3,5:10,1,7,2
chr19	41010045	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=68,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:10,2:3,0:12,1,2,0
chr19	41010047	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,4:0,0,15,3
chr19	41025243	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	41040334	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	41056137	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:0|1:41056137_T_C:41056137:6,11,0,3
chr19	41056142	.	A	ACCATGGCCACTTGGCAGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:41056137_T_C:41056137:5,11,0,3
chr19	41062902	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:0,2:3,3:0,5,0,7
chr19	41071701	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr19	41075662	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	41077891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	41078049	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=122,92;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.114:29:15,1:11,2:9,17,0,3
chr19	41078061	.	AG	CA	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=122,93;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:12,0:11,2:0|1:41078061_AG_CA:41078061:11,13,0,2
chr19	41078065	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=127,93;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:11,2:0|1:41078061_AG_CA:41078061:11,16,0,2
chr19	41078068	.	A	ATAATC	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=128,93;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,0:11,2:0|1:41078061_AG_CA:41078061:12,16,0,2
chr19	41078070	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=24,35;MFRL=128,93;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:15,0:12,2:0|1:41078061_AG_CA:41078061:12,16,0,2
chr19	41083433	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:2,11,2,0
chr19	41086447	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:11,7,2,0
chr19	41089258	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=112,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:9,4,1,1
chr19	41094470	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:6,1,3,1
chr19	41096835	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:14,11,3,0
chr19	41099149	.	T	TTTTG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTTG;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.116:22:14,1:6,1:7,13,1,1
chr19	41106184	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	41116397	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr19	41118960	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.155:34:8,2:9,0:17,11,6,0
chr19	41119273	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:4,2,2,1
chr19	41123093	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=71.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,8,14
chr19	41125159	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr19	41125177	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr19	41132813	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr19	41173666	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:41173666_A_T:41173666:10,10,1,1
chr19	41173672	.	T	TGTGTTGGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:41173666_A_T:41173666:10,9,1,1
chr19	41173865	.	TTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGC	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.249:11:4,2:2,0:0|1:41173865_TTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGC_T:41173865:2,7,0,2
chr19	41173880	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,12:0.932:12:0,7:0,4:1|0:41173865_TTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGC_T:41173865:0,0,4,8
chr19	41173892	.	CTGCTGT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCTGT;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.494:6:3,1:0,1:0,3,1,2
chr19	41174137	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=85,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,3:2,1:0,4,0,5
chr19	41179421	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,0:11,3:9,9,2,1
chr19	41188734	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:8,2:4,1:6,6,2,2
chr19	41198804	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,1:2,0:0|1:41198804_A_C:41198804:2,3,2,0
chr19	41198806	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,10;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:0|1:41198804_A_C:41198804:2,3,2,0
chr19	41198807	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,0:0|1:41198804_A_C:41198804:2,3,2,0
chr19	41198809	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:41198804_A_C:41198804:2,3,2,0
chr19	41198814	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,2:2,0:1,3,3,0
chr19	41206208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr19	41220499	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,0:13,0:0|1:41220499_A_C:41220499:2,23,3,0
chr19	41220501	.	C	CGGGGGGGGGG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,12;RU=G;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,1:13,2:0|1:41220499_A_C:41220499:2,23,3,0
chr19	41220529	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:7,2:7,3:2,13,2,3
chr19	41243603	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,124;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,3:7,0:13,7,3,0
chr19	41245514	.	G	GTACAGTGGCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr19	41249960	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.250:28:8,5:12,0:7,14,7,0
chr19	41251180	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr19	41255648	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=84,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,9:0.082:119:48,9:55,0:0|1:41255648_G_A:41255648:70,40,8,1
chr19	41255657	.	T	C	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=83,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,8:0.077:114:47,8:52,0:0|1:41255648_G_A:41255648:65,41,7,1
chr19	41265368	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.172:33:12,0:15,5:15,13,0,5
chr19	41269533	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:18,0:15,7:18,16,0,7
chr19	41283365	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=89.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,4,23
chr19	41286243	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:4,10:4,7:7,1,13,4
chr19	41306587	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,0:8,2:0|1:41306587_A_T:41306587:10,15,1,1
chr19	41306592	.	T	TCAGG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=113,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:10,2:0|1:41306587_A_T:41306587:10,17,1,1
chr19	41306650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:2,2,3,4
chr19	41313202	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:1,6:13,5:3,11,3,8
chr19	41349640	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr19	41352757	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=126,16196;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,0:10,4:15,8,3,1
chr19	41352759	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=154,69;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:41352759_G_A:41352759:17,10,1,1
chr19	41352762	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,69;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:12,2:0|1:41352759_G_A:41352759:16,10,1,1
chr19	41354712	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr19	41356281	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,9:0,19:0,0,13,15
chr19	41381840	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr19	41381868	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,1,15
chr19	41382607	.	AG	CA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,1,9
chr19	41382612	.	CG	TA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,0,10
chr19	41382645	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,2,5
chr19	41382653	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,2,5
chr19	41382655	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,2,5
chr19	41382665	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,2,5
chr19	41383316	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=103,168;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:41383316_G_A:41383316:6,9,1,1
chr19	41383319	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=103,168;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:0|1:41383316_G_A:41383316:6,9,1,1
chr19	41383344	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr19	41383378	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr19	41383799	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=0,122;MMQ=33,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.864:12:0,4:1,7:0,1,4,7
chr19	41384637	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr19	41384675	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr19	41386282	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr19	41386584	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr19	41387647	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,39;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	41387656	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,39;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	41387669	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=63,148;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.706:4:0,1:0,2:0,1,1,2
chr19	41387907	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,5:8,2:7,6,5,2
chr19	41497281	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,0:0|1:41497281_C_T:41497281:10,7,1,1
chr19	41497291	.	T	TGTCTCCTGA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:41497281_C_T:41497281:7,6,1,1
chr19	41497294	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:41497281_C_T:41497281:6,7,1,1
chr19	41497296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=143,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:6,0:0|1:41497281_C_T:41497281:6,6,1,1
chr19	41518503	.	TGTA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:2,3:4,0:0|1:41518503_TGTA_T:41518503:4,4,0,3
chr19	41518508	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=197,247;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:0|1:41518503_TGTA_T:41518503:3,3,0,3
chr19	41518773	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr19	41596544	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=164,158;MMQ=53,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:41596544_CCA_C:41596544:0,2,0,1
chr19	41596549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=164,158;MMQ=53,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:41596544_CCA_C:41596544:0,2,0,1
chr19	41622107	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:5,2:5,6,1,3
chr19	41622189	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,1:2,5,3,0
chr19	41628677	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,4:0,1:5,0,5,0
chr19	41628705	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,1:1,0:3,0,3,0
chr19	41633747	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,113;MMQ=27,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:8,5:2,6:9,1,8,3
chr19	41703660	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr19	41703793	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:7,11:4,8:7,4,9,10
chr19	41704304	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr19	41704832	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr19	41707094	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr19	41711815	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr19	41712159	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	41725271	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr19	41725399	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:0,3,2,1
chr19	41727239	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41727239_GTC_G:41727239:0,3,0,1
chr19	41727243	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:41727239_GTC_G:41727239:0,3,0,1
chr19	41727249	.	GC	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:41727239_GTC_G:41727239:0,2,0,1
chr19	41743861	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,10,3
chr19	41743863	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:8,4,3,0
chr19	41743989	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:4,0:9,14:7,6,0,14
chr19	41748889	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:41748889_G_C:41748889:11,5,1,1
chr19	41748893	.	A	ACCGAGCGGCGTGTAAGAGTGCCCGTCGGGACAAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=110,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:6,2:0|1:41748889_G_C:41748889:11,5,1,1
chr19	41749454	.	AC	GG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,5:6,0:8,1,5,0
chr19	41759631	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr19	41762524	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:41762524_C_T:41762524:6,11,1,1
chr19	41762533	.	C	CCAGTGGAATGCTTACTGGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:41762524_C_T:41762524:6,11,1,1
chr19	41770704	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,3527;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41770704_G_A:41770704:0,0,1,0
chr19	41770706	.	G	GCCATGGACAATATTACCAGGCAGAACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,3527;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41770704_G_A:41770704:0,0,1,0
chr19	41785027	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:41785027_G_A:41785027:6,8,1,1
chr19	41785033	.	CA	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,1:0|1:41785027_G_A:41785027:6,8,1,1
chr19	41798468	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr19	41800432	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=177,185;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:12,5:3,0:8,7,5,0
chr19	41800462	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,185;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:14,5:5,0:13,6,5,0
chr19	41810149	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=95,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.190:50:11,9:30,0:14,27,9,0
chr19	41811730	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr19	41826318	.	TCACCAGCCGCATG	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:5,2:7,0:14,9,1,1
chr19	41826326	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:5,2:12,0:0|1:41826326_C_T:41826326:12,8,1,1
chr19	41826347	.	GAT	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=92,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,1:16,0:0|1:41826326_C_T:41826326:14,9,1,1
chr19	41863777	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.777:12:0,1:0,6:3,0,5,4
chr19	41869392	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=98,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.353:49:21,12:11,5:15,17,8,9
chr19	41869404	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:31,1:14,2:20,25,1,2
chr19	41869468	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:2,8:8,7:1,9,4,11
chr19	41869487	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,3:5,2:0,7,0,5
chr19	41889423	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=195.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,48:0.980:48:0,26:0,16:0|1:41889423_A_T:41889423:0,0,32,16
chr19	41889429	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=193.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,29:0,16:0|1:41889423_A_T:41889423:0,0,31,16
chr19	41895839	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=21,21,21,33;MFRL=133,172,71,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,24,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.76,10.23,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,3,9,6:0.105,0.249,0.166:33:11,2,5,3:2,1,2,1:7,8,7,11
chr19	41895853	.	TG	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.098:33:24,0:6,1:12,18,2,1
chr19	41897674	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	41897688	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	41903671	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=132.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,19:0,10:0|1:41903671_A_G:41903671:0,0,24,7
chr19	41903675	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=135.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,21:0,9:0|1:41903671_A_G:41903671:0,0,25,7
chr19	41919944	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=62.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,3:0,16:0,0,13,6
chr19	41928336	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr19	41928701	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr19	41928724	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr19	41928765	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	41928867	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr19	41930528	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=92,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.413:10:2,0:3,2:0|1:41930528_A_C:41930528:1,5,3,1
chr19	41930534	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=96,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:3,1:0|1:41930528_A_C:41930528:0,5,2,0
chr19	41931454	.	A	AGGCCAGGGCCGG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=132.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,9:0,0,21,9
chr19	41932084	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr19	41932275	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,9:0,0,10,7
chr19	41949870	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr19	42125660	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,166;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,2,1
chr19	42126013	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=101,39;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:9,1:10,1:15,6,0,2
chr19	42126562	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=142,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr19	42133443	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42133443_G_GC:42133443:0,1,0,1
chr19	42133446	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:42133443_G_GC:42133443:0,1,0,1
chr19	42191934	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=224,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr19	42212753	.	A	AGCACAGAGACTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=173,137;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.412:10:3,4:3,0:0,6,2,2
chr19	42218815	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=110,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:2,2,2,0
chr19	42221607	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,13,16
chr19	42223796	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr19	42231341	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=188,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	42265866	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:6,4:4,8:0|1:42265866_C_G:42265866:9,2,9,3
chr19	42265889	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:7,5:7,10:0|1:42265866_C_G:42265866:10,4,11,4
chr19	42300781	.	GC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42300781_GC_CA:42300781:0,3,0,1
chr19	42300790	.	G	GATGGCCTGCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=98,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42300781_GC_CA:42300781:0,2,0,1
chr19	42301771	.	A	AACCAGCAGACCAGGAGAT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=119,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:18,0:13,2:0|1:42301771_A_AACCAGCAGACCAGGAGAT:42301771:17,16,0,2
chr19	42301773	.	C	CTCATG	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=119,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,0:14,2:0|1:42301771_A_AACCAGCAGACCAGGAGAT:42301771:17,16,0,2
chr19	42313065	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=192,180;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr19	42341250	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,3:10,0:8,6,1,2
chr19	42355704	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=125,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:2,7,2,0
chr19	42373893	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	42398206	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A,AGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20,29;MFRL=0,70,92;MMQ=21,60,40;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,10,18;RU=GT;STR;TLOD=9.33,7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,5:0.171,0.642:10:1,4,3:0,0,0:1,0,6,3
chr19	42398325	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=83,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:16,4:10,0:7,19,0,4
chr19	42398547	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:8,2,2,0
chr19	42408220	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=93,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,3:3,0:7,5,1,2
chr19	42462517	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.101:46:23,2:19,2:17,25,2,2
chr19	42463447	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,8:7,5:7,8,8,5
chr19	42471050	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.638:12:1,3:3,4:4,0,6,2
chr19	42474440	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,1:9,2:9,11,1,2
chr19	42480539	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=139,315;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:11,1,2,0
chr19	42489516	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=127,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:10,4:2,2:9,3,2,4
chr19	42507447	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42507447_C_G:42507447:0,0,1,0
chr19	42507456	.	T	TGGGGGGGGGCGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42507447_C_G:42507447:0,0,1,0
chr19	42526099	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:12,0:15,4:16,11,0,4
chr19	42526124	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=96,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:14,0:18,4:20,12,0,4
chr19	42526197	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:7,0:0|1:42526197_A_G:42526197:5,12,1,1
chr19	42526213	.	G	GATCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:42526197_A_G:42526197:4,10,1,1
chr19	42526575	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42526575_G_C:42526575:0,4,0,1
chr19	42526580	.	G	GTCATTCGGAGCATCGATCTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=13,33;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:42526575_G_C:42526575:0,4,0,1
chr19	42526600	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=126,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr19	42546718	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:3,5,2,0
chr19	42584209	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=122,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:11,3:18,0:17,14,3,0
chr19	42585205	.	A	ACACACTT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,17;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:4,0:11,1:0|1:42585205_A_ACACACTT:42585205:8,9,1,1
chr19	42585213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=162,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.305:18:4,1:6,3:0|1:42585205_A_ACACACTT:42585205:6,7,2,3
chr19	42585216	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:4,0:12,2:0|1:42585205_A_ACACACTT:42585205:8,10,1,1
chr19	42585218	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:4,0:11,2:0|1:42585205_A_ACACACTT:42585205:8,11,1,1
chr19	42585219	.	C	CCGCTCA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:5,0:13,2:0|1:42585205_A_ACACACTT:42585205:8,11,1,1
chr19	42703822	.	TCACAAAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:3,0:12,2:10,8,1,1
chr19	42704009	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.112:36:16,1:14,2:0|1:42704009_G_C:42704009:9,24,2,1
chr19	42704012	.	G	GGGTGGGATGGTGGAAAGGCATGAGAGCTCTGCCC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,1:12,2:0|1:42704009_G_C:42704009:8,19,2,1
chr19	42729303	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=76,121;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.114:59:16,6:36,0:39,14,6,0
chr19	42736249	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=110,1657;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:22,0:14,4:19,17,4,0
chr19	42736267	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=249.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,18:0,52:0,0,15,57
chr19	42736377	.	T	TGACATCATACTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=119,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	42744332	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,0:8,5:3,14,0,5
chr19	42791994	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.321:17:7,3:3,2:5,7,3,2
chr19	42792997	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,2:5,5:7,0,6,1
chr19	42795970	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,192;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.533:35:10,0:6,16:0,16,0,19
chr19	42799120	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42799120_T_TC:42799120:0,1,0,1
chr19	42799125	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42799120_T_TC:42799120:0,1,0,1
chr19	42799130	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42799120_T_TC:42799120:0,1,0,1
chr19	42813788	.	GGTCGTGTCCGTC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:1,0:8,6,1,1
chr19	42813973	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,0,2
chr19	42837847	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,4:4,5:8,5,3,6
chr19	42840532	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42840532_GG_CC:42840532:0,3,0,1
chr19	42840537	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42840537_G_C:42840537:0,3,0,1
chr19	42840538	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:42840532_GG_CC:42840532:0,3,0,1
chr19	42840543	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840537_G_C:42840537:0,1,0,1
chr19	42840547	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,21;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840537_G_C:42840537:0,1,0,1
chr19	42840548	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840537_G_C:42840537:0,1,0,1
chr19	42840550	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,34;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840537_G_C:42840537:0,1,0,1
chr19	42848279	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr19	42848764	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr19	42855280	.	AGGGT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr19	42857845	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:1,6,4,0
chr19	42879960	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=102,34;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:0|1:42879960_T_C:42879960:8,9,1,1
chr19	42879964	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=102,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:42879960_T_C:42879960:8,9,1,1
chr19	42879966	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=92,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:42879960_T_C:42879960:8,8,1,1
chr19	42906024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr19	42914557	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:0|1:42914557_G_A:42914557:10,10,1,1
chr19	42914565	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,2:13,0:0|1:42914557_G_A:42914557:10,11,1,1
chr19	42931022	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,169;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.238:61:23,13:24,0:29,18,14,0
chr19	42933186	.	CT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:9,2:25,2:1,33,1,3
chr19	43092887	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:9,1,2,0
chr19	43098153	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=79,207;MMQ=60,26;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	43228207	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:43228207_T_A:43228207:1,4,1,1
chr19	43228211	.	G	GAAAGAAGAAAGAGGAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:43228207_T_A:43228207:1,4,1,1
chr19	43228213	.	T	TGAGGGAAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:43228207_T_A:43228207:1,4,1,1
chr19	43243141	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:10,11:3,7:8,5,6,12
chr19	43243217	.	AA	GG	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,12,14
chr19	43243238	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,6:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,8,13
chr19	43243248	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=166,137;MMQ=37,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,9:1,3:0,2,4,8
chr19	43257377	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	43371924	.	T	TAGCCGGGCGTAGTGGCAGACG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=133,57034;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,1:12,13,0,2
chr19	43371958	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,96;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:5,7,1,5
chr19	43372282	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,117;MMQ=50,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,1:6,2:9,9,2,1
chr19	43382368	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=87,156;MMQ=57,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.128:36:18,2:14,2:20,12,2,2
chr19	43382374	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=87,156;MMQ=56,30;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:16,2:13,2:20,11,2,2
chr19	43382402	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,86;MMQ=60,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:43382402_G_A:43382402:15,9,1,1
chr19	43382406	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=137,86;MMQ=60,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.101:28:18,0:7,2:0|1:43382402_G_A:43382402:16,10,1,1
chr19	43382522	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,197;MMQ=34,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr19	43406689	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr19	43407791	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=24,29;MFRL=149,141;MMQ=48,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:8,2:12,1,2,0
chr19	43407877	.	CAA	C,CA	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=18,26,23;MFRL=125,136,145;MMQ=24,60,57;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=12.89,12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,10,9:0.208,0.234:43:2,2,2:9,4,4:3,21,1,18
chr19	43407909	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=28,29;MFRL=150,125;MMQ=40,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.287:43:19,0:12,12:2,29,0,12
chr19	43407960	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=30,23;MFRL=95,190;MMQ=25,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr19	43407967	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,21;MFRL=155,288;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:43407967_C_A:43407967:0,3,0,1
chr19	43407969	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=155,288;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:43407967_C_A:43407967:0,3,0,1
chr19	43407971	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=155,288;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:43407967_C_A:43407967:0,3,0,1
chr19	43407976	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,31;MFRL=106,155;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43407976_TT_CA:43407976:0,3,0,1
chr19	43407982	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=106,155;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:43407976_TT_CA:43407976:0,3,0,1
chr19	43411402	.	A	AATGGGAAGTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,17;MFRL=209,66;MMQ=51,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0,4,1,1
chr19	43420264	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,2:2,7:3,1,4,5
chr19	43421778	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=217,190;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:5,0,1,0
chr19	43430945	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,173;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:3,6,0,5
chr19	43433570	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr19	43433734	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=104,73503;MMQ=60,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,4:10,0:13,9,0,4
chr19	43433805	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=95,110;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,4:10,1:5,12,3,2
chr19	43433822	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=91,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:9,7:3,8:6,6,8,8
chr19	43439490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,142;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.588:9:3,2:0,2:3,1,2,3
chr19	43439848	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=112,246;MMQ=40,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:4,1:9,5,1,1
chr19	43439970	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=87,61;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:3,3:11,1:8,7,2,2
chr19	43530640	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr19	43579815	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,189;MMQ=34,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr19	43585065	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=161,151;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:3,3,2,0
chr19	43585404	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=121,148;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.401:25:9,2:6,7:6,9,5,5
chr19	43586835	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=137,156;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr19	43674346	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,96;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr19	43690535	.	GGAGGGGCTGA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,67;MMQ=58,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,2:5,0:7,4,1,1
chr19	43698588	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,109;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:16,0:18,7:18,16,0,7
chr19	43702057	.	TAC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=161,59;MMQ=34,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0|1:43702057_TAC_T:43702057:1,3,1,1
chr19	43702060	.	T	TAAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=161,59;MMQ=34,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:43702057_TAC_T:43702057:1,3,1,1
chr19	43708853	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,1:3,0,4,0
chr19	43763259	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=98,57;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:14,0:4,2:11,7,1,1
chr19	43763280	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=99,57;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:15,0:3,2:0|1:43763280_C_A:43763280:9,9,1,1
chr19	43763282	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=99,57;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:15,0:3,2:0|1:43763280_C_A:43763280:9,9,1,1
chr19	43763284	.	TTC	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=99,57;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:15,0:3,2:0|1:43763280_C_A:43763280:9,9,1,1
chr19	43763288	.	CTGTGTGGA	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=99,57;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:14,0:2,2:0|1:43763280_C_A:43763280:8,9,1,1
chr19	43763299	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=21,30;MFRL=106,57;MMQ=56,50;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:2,1:0|1:43763280_C_A:43763280:3,7,1,1
chr19	43763344	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	43765938	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=113,179;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr19	43772389	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:2,0:6,4:3,6,2,2
chr19	43773416	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=140,71;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,1,1
chr19	43773599	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=91,91;MMQ=46,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,1:8,8:4,11,4,6
chr19	43773626	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=46,103;MMQ=46,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,0:4,7:0,6,2,5
chr19	43857873	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=247,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,6:1,12:1,0,7,11
chr19	43858120	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,1:5,5:3,7,3,3
chr19	43858317	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	43860053	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr19	43864507	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=9;MBQ=26,23;MFRL=146,119;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:14,3:17,1:18,13,2,2
chr19	43864521	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=143,35;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:15,0:16,2:0|1:43864521_C_T:43864521:16,17,1,1
chr19	43864530	.	C	CCT	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=148,35;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:14,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,16,1,1
chr19	43864531	.	AGG	A	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=26,20;MFRL=146,35;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:14,0:14,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,17,1,1
chr19	43864534	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=26,20;MFRL=146,35;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,0:15,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,17,1,1
chr19	43864538	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=146,35;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,0:16,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,17,1,1
chr19	43864542	.	C	CCAAA	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=144,35;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,16,1,1
chr19	43864544	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=144,35;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,16,1,1
chr19	43864546	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=27,20;MFRL=144,35;MMQ=60,56;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:14,2:0|1:43864521_C_T:43864521:14,16,1,1
chr19	43865316	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43865316_C_G:43865316:0,0,0,1
chr19	43865319	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=342,245;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:43865316_C_G:43865316:0,1,0,1
chr19	43865324	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=342,245;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43865316_C_G:43865316:0,1,0,1
chr19	43910764	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,6:0,2:0,2,0,8
chr19	43920443	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	43982338	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	43983697	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=141,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,0:10,2:14,7,1,2
chr19	43983740	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	43991217	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,2:7,1:7,8,1,2
chr19	43998991	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:1,3:9,0:3,8,2,1
chr19	43999634	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr19	43999816	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=108,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0|1:43999816_G_A:43999816:1,10,0,2
chr19	43999831	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,0:0|1:43999816_G_A:43999816:0,10,0,2
chr19	44001891	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:1,14:0,22:1,0,15,22
chr19	44012880	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr19	44047550	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,12:0,0,11,9
chr19	44055898	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:4,5:2,1:2,4,0,7
chr19	44065214	.	C	CTCTGGGCTCCCTGTGGCCTCAGCCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=218,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.387:8:1,0:4,3:1,4,0,3
chr19	44079625	.	CT	GG	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:24,2:18,0:0|1:44079625_CT_GG:44079625:19,32,3,0
chr19	44079628	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.072:53:23,0:18,0:0|1:44079625_CT_GG:44079625:19,31,3,0
chr19	44079687	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=80.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,21:0,9:0,0,10,21
chr19	44096109	.	TTCAAGCACCCAGGATTAAGCCCAGGCATCCCCTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,2:2,0:9,2,1,1
chr19	44098903	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	44101434	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,116;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,0:7,6:0,13,0,7
chr19	44118228	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr19	44128437	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:2,1:7,5:1,9,2,4
chr19	44129174	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,1:0|1:44129174_G_C:44129174:0,0,3,0
chr19	44129180	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:44129174_G_C:44129174:0,0,3,0
chr19	44129183	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:44129174_G_C:44129174:0,0,3,0
chr19	44129186	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,0:0|1:44129174_G_C:44129174:1,0,3,0
chr19	44129189	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,14;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:1,0:0|1:44129174_G_C:44129174:1,0,2,0
chr19	44131297	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,23,9
chr19	44153301	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,0:3,7,3,0
chr19	44159489	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr19	44159585	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=102,76;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:19,0:14,6:16,18,1,5
chr19	44160868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr19	44169475	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:19,2:0|1:44169475_G_T:44169475:21,13,1,1
chr19	44169487	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,0:24,2:0|1:44169475_G_T:44169475:22,16,1,1
chr19	44223125	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,7:5,6:4,4,10,3
chr19	44223145	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.749:26:1,7:5,11:4,2,12,8
chr19	44223457	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:5,3:5,4,2,1
chr19	44224161	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=96,141;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:1,1:4,9:0,5,3,7
chr19	44224184	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,0:1,7:0,1,0,7
chr19	44224225	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=145,225;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:1,0:3,10:0|1:44224225_G_T:44224225:0,4,0,12
chr19	44224229	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=160,225;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,0:2,10:0|1:44224225_G_T:44224225:0,4,0,12
chr19	44248878	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:0,2:8,6:5,3,5,3
chr19	44254972	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	44276370	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	44280803	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,2:15,1:12,20,2,1
chr19	44280837	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,11:0,0,4,16
chr19	44301838	.	G	GAAT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:19,0:18,2:20,17,1,1
chr19	44302624	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr19	44306407	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,21;MFRL=46,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,1:0|1:44306407_C_T:44306407:1,1,1,1
chr19	44306431	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,1:0|1:44306407_C_T:44306407:4,5,1,1
chr19	44351738	.	TT	AG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,62;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:0|1:44351738_TT_AG:44351738:10,6,1,1
chr19	44351746	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,62;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:4,2:0|1:44351738_TT_AG:44351738:8,8,1,1
chr19	44352208	.	ATC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=103,61;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,3:10,0:0|1:44352208_ATC_A:44352208:8,9,1,2
chr19	44352212	.	C	CTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,61;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:0|1:44352208_ATC_A:44352208:8,9,1,2
chr19	44376681	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr19	44376715	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=92,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:7,3:2,2:5,4,5,0
chr19	44418343	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.349:24:7,4:7,4:9,7,3,5
chr19	44418400	.	GCCTTTCCCACACTCCTCACATTTGTATGGCTTCTCTCCAGTGTGGCTTATCTGATGGGCCTGAAGGTGTGAACCCACACTGAAA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.101:41:11,4:6,4:14,16,3,8
chr19	44419030	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr19	44422982	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:5,5:4,3:6,4,5,3
chr19	44423828	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=100,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:18,0:9,2:0|1:44423828_C_T:44423828:14,15,1,1
chr19	44423848	.	C	CCT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=96,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,0:10,2:0|1:44423828_C_T:44423828:14,12,1,1
chr19	44426265	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:2,8:6,2:6,2,8,2
chr19	44426467	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr19	44469126	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=91,63;MMQ=60,47;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.185:41:14,7:20,0:19,15,7,0
chr19	44469577	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	44471209	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.954:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr19	44471323	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.961:20:0,11:0,9:0,0,12,8
chr19	44492568	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr19	44495598	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=303,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:8,1:3,3:12,1,4,0
chr19	44496070	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=75,158;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,5:9,3:6,11,2,6
chr19	44496145	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	44501116	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,18:0,19:0,0,18,19
chr19	44529556	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,3:10,0:16,8,2,1
chr19	44559190	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=241,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr19	44559332	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=76,50;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,2:10,0:9,6,2,0
chr19	44564981	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=102,153;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:8,7:2,2:5,5,0,9
chr19	44570866	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=179,29;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:0|1:44570866_G_A:44570866:9,7,2,1
chr19	44570868	.	G	GTGCTGATCTACATCTGAAGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=179,29;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:44570866_G_A:44570866:10,7,1,1
chr19	44580440	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	44585159	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=69,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,27:0.667:40:8,17:5,10:6,7,16,11
chr19	44586076	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	44589999	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=92,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,3:1,4:4,2,3,4
chr19	44591496	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	44604914	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=93,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.698:21:4,6:2,7:5,1,9,6
chr19	44605123	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:3,1:6,6:2,7,2,5
chr19	44611420	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,2,3
chr19	44620041	.	G	GCCTC	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=100,102;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:29,0:14,2:21,23,1,1
chr19	44620043	.	CTTGT	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=102,102;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:30,0:13,2:21,24,1,1
chr19	44620047	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=102,157;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:25,0:11,2:18,21,0,2
chr19	44620057	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=102,114;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.129:37:21,0:10,4:11,22,1,3
chr19	44634903	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=194,188;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	44652916	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,157102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:24,3:9,0:19,14,3,0
chr19	44661243	.	ATTTCAGGCCCATCGGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATACGTATGTAAAGTGTGTGGTAAGGGTTTCATTTACAGTTCAAGT	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,12:0.087:57:14,7:6,5:26,19,4,8
chr19	44662313	.	T	TCAGTGAACCACACAACTGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	44676148	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=225,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	44680827	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,43;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:0|1:44680827_G_T:44680827:13,10,1,1
chr19	44680833	.	A	ATTTTATTTGTAT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,43;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:12,2:0|1:44680827_G_T:44680827:14,12,1,1
chr19	44680836	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,43;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:0|1:44680827_G_T:44680827:13,12,1,1
chr19	44734046	.	C	CCCTCACTCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44734046_C_CCCTCACTCTT:44734046:0,1,0,1
chr19	44734050	.	G	GCCCCCATCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:44734046_C_CCCTCACTCTT:44734046:0,2,0,1
chr19	44734051	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44734046_C_CCCTCACTCTT:44734046:0,2,0,1
chr19	44738893	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.462:37:7,17:13,0:11,9,17,0
chr19	44739172	.	G	GATTCCATTTGATTCCACTTGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=143,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr19	44739193	.	C	CCGAAGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:44739193_C_CCGAAGAG:44739193:0,1,0,1
chr19	44739195	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44739193_C_CCGAAGAG:44739193:0,1,0,1
chr19	44739303	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:4,2,3,2
chr19	44739399	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:2,4,1,4
chr19	44740215	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:0|1:44740215_A_G:44740215:6,9,1,1
chr19	44740223	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=126,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:4,0:0|1:44740215_A_G:44740215:7,9,1,1
chr19	44740226	.	AT	TC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=126,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:44740215_A_G:44740215:6,10,1,1
chr19	44778405	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:6,3,4,5
chr19	44792701	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,9:5,1:8,7,5,5
chr19	44792738	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:20,2:9,2:13,16,3,1
chr19	44832992	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=147,53;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.537:9:1,1:2,3:2,3,1,3
chr19	44833023	.	C	CTCAGAGCTGGAGTCATTACTGAAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=170,573;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,1,0
chr19	44833224	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,0,3
chr19	44847480	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=120,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr19	44890801	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,4:2,6:4,1,6,4
chr19	44892333	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	44896487	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=65,167;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,1,3
chr19	44932687	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:6,5,0,2
chr19	44946792	.	TT	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=112,88;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:10,9,1,1
chr19	44983473	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:7,1,1,1
chr19	45010116	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	45016990	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,9,9
chr19	45026773	.	G	GC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=113,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:18,2:6,0:0|1:45026773_G_GC:45026773:16,11,0,2
chr19	45026776	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=113,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:20,2:7,0:0|1:45026773_G_GC:45026773:16,11,0,2
chr19	45033379	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=CA;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr19	45116933	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:11,2:5,6:11,5,6,2
chr19	45121424	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr19	45126994	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr19	45138669	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.635:9:2,3:0,2:0|1:45138669_TC_T:45138669:1,2,5,1
chr19	45138671	.	TCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:0|1:45138669_TC_T:45138669:1,2,5,1
chr19	45147576	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	45153023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,0:6,2:5,1,2,0
chr19	45157113	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr19	45184583	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=116,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,1:9,1:6,7,0,2
chr19	45202701	.	CT	C,CTT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,33,20;MFRL=102,146,44;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.93,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,3,6:0.097,0.150:37:13,2,2:14,1,2:15,13,4,5
chr19	45204692	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=46,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,9:3,4:1,2,7,6
chr19	45204698	.	C	CTAGCCTGACTCTTGTTAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:7,8,1,1
chr19	45206532	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr19	45206548	.	TCTCTTCTTCTGTCAAATGGGGCGATTGATCAAACCTGCCTCATCCAACCCCTCTGA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:0,0:3,2:14,1,1,1
chr19	45211407	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=180,73;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,6:3,4:6,6,7,3
chr19	45211468	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:10,0:11,11,3,0
chr19	45262188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=166,188;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45262188_G_A:45262188:0,4,0,1
chr19	45262189	.	A	ATTGCTCATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=166,188;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45262188_G_A:45262188:0,4,0,1
chr19	45262191	.	T	TTCCTCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=166,188;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45262188_G_A:45262188:0,4,0,1
chr19	45262848	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	45293156	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr19	45293235	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:45293235_A_C:45293235:2,4,2,0
chr19	45293237	.	TC	GG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=107,85;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,0:2,2:0|1:45293235_A_C:45293235:2,5,2,0
chr19	45296832	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=136,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:1,10:4,1:1,4,5,6
chr19	45296894	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:5,5,0,3
chr19	45296963	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=7244200,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45296963_GA_G:45296963:0,1,0,1
chr19	45296969	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=7244200,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45296963_GA_G:45296963:0,1,0,1
chr19	45296971	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=7244200,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45296963_GA_G:45296963:0,1,0,1
chr19	45297454	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:6,3:6,3:5,9,1,5
chr19	45297479	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:6,0:2,4:3,5,2,3
chr19	45321749	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=145,17504;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,0:9,1,0,2
chr19	45321781	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:9,9,3,0
chr19	45368484	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.312:11:1,2:3,0:0|1:45368484_C_G:45368484:7,1,3,0
chr19	45368493	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:6,0:0|1:45368484_C_G:45368484:11,8,2,0
chr19	45385483	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:15,2:0|1:45385483_C_T:45385483:16,11,1,1
chr19	45385488	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=114,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:15,2:0|1:45385483_C_T:45385483:14,12,1,1
chr19	45395752	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=110,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:22,0:20,4:9,33,1,3
chr19	45395778	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,0:13,3:3,17,0,3
chr19	45409139	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:45409139_C_A:45409139:5,7,1,1
chr19	45409141	.	TCTAGAAAGAGCTG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=107,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0|1:45409139_C_A:45409139:6,7,1,1
chr19	45451620	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	45477679	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:8,4,3,0
chr19	45477910	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr19	45477951	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr19	45488434	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:3,2:5,3:8,1,4,1
chr19	45490571	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,71;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:17,0:4,4:9,12,1,3
chr19	45493635	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,3:7,3:8,1,5,1
chr19	45494247	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	45532284	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:5,2:1,13,0,3
chr19	45532315	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:4,0:1,2:0|1:45532315_G_T:45532315:0,5,0,2
chr19	45532316	.	A	ATACACAGGTTAAGTT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:4,0:1,2:0|1:45532315_G_T:45532315:0,5,0,2
chr19	45532319	.	CCG	ATA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:45532315_G_T:45532315:0,5,0,2
chr19	45536036	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	45537417	.	AAAAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:0,1:2,6:2,0,6,1
chr19	45540878	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:14,0:6,3:12,8,2,1
chr19	45555513	.	G	GGGTATCTTAATTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	45570923	.	T	TCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	45571781	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=108,56;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.406:17:8,3:2,2:5,5,4,3
chr19	45579156	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr19	45593289	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.948:13:0,2:0,11:0,0,12,1
chr19	45594842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	45655647	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr19	45668292	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr19	45668403	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=85,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,2:9,0:7,6,3,0
chr19	45681560	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	45683448	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0,0,7,11
chr19	45683493	.	A	ATTTTTTTTTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=24,35;RU=T;STR;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr19	45684110	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45684110_G_C:45684110:0,0,0,1
chr19	45684111	.	AGT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,162;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45684110_G_C:45684110:0,0,0,1
chr19	45716678	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	45719469	.	G	GGCAGGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:45719469_G_GGCAGGAA:45719469:1,2,0,1
chr19	45719470	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,1:0|1:45719469_G_GGCAGGAA:45719469:1,2,0,1
chr19	45719473	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:45719469_G_GGCAGGAA:45719469:1,2,0,1
chr19	45754789	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,11;MFRL=210,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.526:2:0,0:0,0:0|1:45754789_A_C:45754789:1,0,1,0
chr19	45754793	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=210,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,20;RU=G;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.526:2:0,0:0,0:0|1:45754789_A_C:45754789:1,0,1,0
chr19	45769652	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:45769652_T_TCA:45769652:0,3,0,1
chr19	45769655	.	C	CTCTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:45769652_T_TCA:45769652:0,3,0,1
chr19	45769661	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=232,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr19	45801588	.	C	CATTAGGGCGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	45815010	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	45818897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=123,194;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.320:5:1,0:2,1:0|1:45818897_C_T:45818897:1,3,0,1
chr19	45818910	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=158,194;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45818897_C_T:45818897:0,4,0,1
chr19	45818915	.	G	GAAAGCTACTGTAGAAATCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=153,194;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:1,0:2,1:0|1:45818897_C_T:45818897:0,3,0,1
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chr19	45850598	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.239:15:1,0:8,3:11,1,3,0
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chr19	45860662	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,10070179;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:9,13,0,2
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chr19	45861043	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45861038_C_CCCT:45861038:0,1,0,1
chr19	45867802	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.302:41:13,12:16,0:18,11,11,1
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chr19	45889453	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45889453_G_T:45889453:0,0,0,1
chr19	45889455	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45889453_G_T:45889453:0,0,0,1
chr19	45889458	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45889453_G_T:45889453:0,0,0,1
chr19	45899634	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,1:8,2:8,12,1,2
chr19	45912489	.	CAAG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAG;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:12,4:12,1:13,11,3,2
chr19	45916797	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=103,114;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,1:15,1:0|1:45916797_A_G:45916797:14,9,1,1
chr19	45916800	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=103,114;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,1:17,1:0|1:45916797_A_G:45916797:14,10,1,1
chr19	45916919	.	T	TTAAAAATGTGAACGCCTGTAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,1:0|1:45916919_T_TTAAAAATGTGAACGCCTGTAA:45916919:7,12,1,1
chr19	45916923	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:45916919_T_TTAAAAATGTGAACGCCTGTAA:45916919:7,12,1,1
chr19	45916928	.	CTCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:8,2:0|1:45916919_T_TTAAAAATGTGAACGCCTGTAA:45916919:8,12,1,1
chr19	45920245	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=168,117;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:0,2,0,1
chr19	45920249	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=155,117;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:1,2,0,1
chr19	45920250	.	G	GGCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=155,117;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:1,2,0,1
chr19	45920253	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=155,117;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:1,2,0,1
chr19	45920256	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=155,117;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:1,2,0,1
chr19	45920259	.	G	GAGAATCATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=155,117;MMQ=60,30;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45920245_C_CT:45920245:1,2,0,1
chr19	45924428	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=116,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:6,5:20,0:16,10,5,0
chr19	45976348	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45976348_G_A:45976348:0,0,0,1
chr19	45976356	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45976348_G_A:45976348:0,0,0,1
chr19	46003399	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.334:18:10,2:2,2:1,11,1,5
chr19	46003836	.	AAGGGTGGGGTGGAATG	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.158:18:7,2:4,0:14,2,1,1
chr19	46004073	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:2,9,0,3
chr19	46025388	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr19	46027752	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr19	46029468	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=136,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:6,4:0|1:46029468_C_T:46029468:1,12,0,4
chr19	46029474	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=135,103;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,0:6,4:0|1:46029468_C_T:46029468:1,11,0,4
chr19	46113121	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,0:3,4:0,5,0,4
chr19	46116818	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:1,4:10,2:4,7,2,4
chr19	46119867	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:1,4,0,4
chr19	46120003	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:4,5,3,2
chr19	46121020	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr19	46122338	.	G	GTCAGATTTT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:13,1:14,0:0|1:46122338_G_GTCAGATTTT:46122338:16,13,0,2
chr19	46122340	.	G	GTAGA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:13,2:13,0:0|1:46122338_G_GTCAGATTTT:46122338:16,13,0,2
chr19	46122342	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,2:14,0:0|1:46122338_G_GTCAGATTTT:46122338:16,12,0,2
chr19	46124943	.	GCTGACCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	46127918	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,3,1
chr19	46130191	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr19	46136268	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=61.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.526:40:10,11:9,10:7,12,11,10
chr19	46136487	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	46137818	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=172,148;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.825:5:0,1:1,2:0,1,1,3
chr19	46141677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=264,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr19	46141994	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:6,6:4,6:7,4,11,1
chr19	46142134	.	GTCAGGAAAGGACAAAGAAAAAAAAAGGGTCTTAGTATTCAGT	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.085:69:14,0:23,5:31,33,4,1
chr19	46142150	.	GA	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:13,1:13,3:18,16,0,4
chr19	46177455	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:0|1:46177455_T_C:46177455:4,9,1,1
chr19	46177461	.	CGGCAG	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:3,0:0|1:46177455_T_C:46177455:2,8,1,1
chr19	46177467	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:46177455_T_C:46177455:0,7,1,1
chr19	46180150	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	46184757	.	A	AAAAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAC;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:1,3:6,2:6,1,6,3
chr19	46185217	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:0,13:1,14:0,1,8,19
chr19	46191021	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr19	46191717	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=117,76;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.146:45:23,0:16,6:19,20,0,6
chr19	46195051	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=95,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.317:13:1,4:8,0:6,3,0,4
chr19	46205050	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,8,7
chr19	46206098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:2,5,3,3
chr19	46269313	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,9:7,2:8,6,6,5
chr19	46272037	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,35;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr19	46274972	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:2,1,5,0
chr19	46281745	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.508:24:5,5:5,7:10,2,10,2
chr19	46282503	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.488:21:3,5:6,5:5,6,5,5
chr19	46285640	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=8,28;MFRL=144,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:46285640_C_T:46285640:0,1,0,1
chr19	46285642	.	G	GCTTCATAGGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46285640_C_T:46285640:0,1,0,1
chr19	46287955	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=88,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:46287955_C_T:46287955:8,6,1,1
chr19	46287964	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=70,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:46287955_C_T:46287955:7,6,1,1
chr19	46289392	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.596:18:4,7:3,3:7,0,7,4
chr19	46299164	.	CCCT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=85,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCT;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,0:7,2:6,6,1,1
chr19	46299188	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=81,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:9,0:12,3:8,15,3,0
chr19	46299431	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=173,213;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:6,0:6,7:2,10,0,7
chr19	46317709	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	46318717	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,1,0
chr19	46318758	.	GCCCCGCCCCGTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.709:5:0,2:0,2:0|1:46318758_GCCCCGCCCCGTCC_G:46318758:0,1,4,0
chr19	46318794	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.486:4:1,0:1,0:0|1:46318758_GCCCCGCCCCGTCC_G:46318758:0,2,1,1
chr19	46318963	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr19	46319829	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,4:7,0:4,11,2,2
chr19	46319847	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:7,0:4,11,1,2
chr19	46326200	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr19	46326968	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:1,4:5,0:3,3,3,2
chr19	46327033	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:14,2:9,0:10,14,1,1
chr19	46327185	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr19	46327209	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr19	46329438	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:3,3,4,0
chr19	46330879	.	ACTCTGCAGCAAAAGGAAAGGGACCCGAGCTCAGCCCACCTGAGTGTGC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:10,0:8,2:8,16,1,1
chr19	46332194	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,15:0.276:55:18,1:22,13:36,4,14,1
chr19	46334559	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=167,79;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,1:2,1:0|1:46334559_G_A:46334559:6,0,2,0
chr19	46334565	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=167,79;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:4,1:2,1:0|1:46334559_G_A:46334559:6,0,2,0
chr19	46345782	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,1,3
chr19	46352203	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr19	46355911	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	46357530	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=189,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:46357530_C_T:46357530:2,3,1,1
chr19	46357552	.	A	AGGTCACAGGGGATAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:46357530_C_T:46357530:6,4,1,1
chr19	46357811	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	46367703	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,1:3,5:3,0,5,1
chr19	46394171	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr19	46404493	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:10,4:5,0:14,1,4,0
chr19	46457107	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.242:45:21,1:11,10:6,28,0,11
chr19	46498827	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=274,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0|1:46498827_G_A:46498827:0,1,0,7
chr19	46498835	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=274,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0|1:46498827_G_A:46498827:0,1,0,6
chr19	46506203	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr19	46510033	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46510033_G_T:46510033:1,0,0,1
chr19	46510034	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46510033_G_T:46510033:1,0,0,1
chr19	46510038	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46510033_G_T:46510033:1,0,0,1
chr19	46511590	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46511590_G_GT:46511590:0,0,0,1
chr19	46511596	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=218,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:2,0:0,1:0|1:46511590_G_GT:46511590:0,3,0,1
chr19	46511617	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	46543566	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,3:9,0:12,9,2,1
chr19	46623524	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,1:10,2:11,5,2,1
chr19	46663968	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:0|1:46663968_C_T:46663968:11,7,1,1
chr19	46663989	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:46663968_C_T:46663968:6,6,1,1
chr19	46663991	.	AA	TT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:4,0:0|1:46663968_C_T:46663968:7,6,1,1
chr19	46664168	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	46664400	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,2:3,2:1,3,1,3
chr19	46733052	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:10,3:14,9,3,1
chr19	46800437	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46800437_G_T:46800437:1,0,0,1
chr19	46800439	.	G	GAGAGTTCTGTAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46800437_G_T:46800437:1,0,0,1
chr19	46811984	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:4,4,2,6
chr19	46812020	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:3,6,0,2
chr19	46812126	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=17563293,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	46812682	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr19	46815678	.	T	TGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=247,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr19	46815703	.	ATATT	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,23;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:1,3:0|1:46815703_ATATT_A:46815703:3,0,3,1
chr19	46815705	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	46815711	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.570:9:2,2:2,3:0|1:46815703_ATATT_A:46815703:3,1,4,1
chr19	46815993	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=227,182;MMQ=57,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.584:5:1,1:0,1:0,2,0,3
chr19	46823600	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	46832797	.	T	TAATCATAAGCTCTTGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=213,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0,6,1,1
chr19	46842728	.	GATTTATCTTTCGTCTTTTACCTTTCATTTATC	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.154:31:4,0:2,4:20,7,0,4
chr19	46857286	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr19	46887007	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr19	46887178	.	C	CTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=80,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr19	46893238	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,7:0,0,10,5
chr19	46893465	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,7,3
chr19	46915863	.	GCT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,1:6,1:0|1:46915863_GCT_G:46915863:9,4,0,2
chr19	46915870	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:5,1:4,0:0|1:46915863_GCT_G:46915863:7,3,0,3
chr19	46915874	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:5,1:3,1:0|1:46915863_GCT_G:46915863:7,2,0,3
chr19	46915876	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:5,1:3,0:0|1:46915863_GCT_G:46915863:7,1,0,3
chr19	46974233	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,21;MFRL=85,101;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,4:3,1:4,5,2,3
chr19	46974306	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:2,3,2,1
chr19	46974307	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,21;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,0:1,5:2,1,2,3
chr19	46974324	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:1,2,2,1
chr19	46974326	.	A	ATCG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr19	47104779	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr19	47109011	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:2,2:5,2:4,4,4,0
chr19	47111663	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:2,4,0,2
chr19	47124596	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,3:7,0:10,11,2,1
chr19	47126614	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	47127024	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:3,0,2,1
chr19	47137481	.	GAT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,4:0,1:1,4,0,5
chr19	47137972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,2:2,1,2,4
chr19	47193850	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=79,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.572:47:12,13:8,14:9,11,17,10
chr19	47207654	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr19	47214129	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr19	47217113	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr19	47228985	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	47231972	.	ATCCTCAGAGTCGTCT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:7,0:17,2:11,15,1,1
chr19	47232094	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47232094_T_A:47232094:0,1,0,1
chr19	47232097	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47232094_T_A:47232094:0,1,0,1
chr19	47258674	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=227,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr19	47261826	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=101,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.192:23:3,0:8,0:6,12,0,5
chr19	47261836	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=95,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.586:12:1,3:4,3:1,4,0,7
chr19	47282240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr19	47282254	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47282254_G_T:47282254:0,3,0,1
chr19	47282260	.	C	CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=227,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:47282254_G_T:47282254:0,2,0,1
chr19	47287939	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr19	47342929	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47342929_G_A:47342929:0,0,0,1
chr19	47342932	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47342929_G_A:47342929:0,0,0,1
chr19	47425661	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47425661_G_A:47425661:0,1,0,1
chr19	47425664	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47425661_G_A:47425661:0,1,0,1
chr19	47425673	.	T	TATTTCAGGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	47502522	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:11,1,2,0
chr19	47524457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:1,2:2,2:1,3,0,4
chr19	47535937	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:6,0:5,6,0,3
chr19	47535997	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:4,0:2,2:0|1:47535997_G_A:47535997:0,6,1,1
chr19	47536003	.	C	CAAGCAGTTCTCCAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:2,0:2,2:0|1:47535997_G_A:47535997:0,4,1,1
chr19	47543774	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,13,12
chr19	47544190	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,14;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:47544190_T_A:47544190:1,0,1,0
chr19	47544193	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:47544190_T_A:47544190:1,0,1,0
chr19	47544197	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,12;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:47544190_T_A:47544190:1,0,1,0
chr19	47544202	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,34;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:47544190_T_A:47544190:1,1,1,0
chr19	47549791	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,2:0,0,12,0
chr19	47575255	.	AGGGTGCATGTCCGGGTGCATGTCG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:12,2:9,1:14,14,2,1
chr19	47584699	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr19	47587772	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr19	47593212	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:11,0,6,0
chr19	47615852	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=46,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,3:1,1,1,8
chr19	47634313	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,11:0,0,2,20
chr19	47712371	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=107,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:5,3:18,0:19,4,3,0
chr19	47735818	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=113,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.352:49:23,4:8,12:14,18,8,9
chr19	47735887	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:16,0:19,3:16,19,0,3
chr19	47735913	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:10,0:11,6:6,15,0,6
chr19	47768195	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:47768195_G_A:47768195:0,2,0,1
chr19	47768210	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:47768195_G_A:47768195:0,0,0,1
chr19	47769988	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.317:36:7,7:17,4:11,14,0,11
chr19	47774989	.	TGCGCGCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=146,176;MMQ=43,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=GC;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr19	47823716	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:2,4,2,1
chr19	47823871	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,13:0,19:0,0,20,12
chr19	47865994	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr19	47878686	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	47879093	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=252,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,7,0
chr19	47879613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	47884234	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=96,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:12,2:0|1:47884234_C_A:47884234:7,19,1,1
chr19	47884249	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=96,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,1:0|1:47884234_C_A:47884234:7,17,1,1
chr19	47885180	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr19	47912323	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,12,2
chr19	47912894	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=137,108;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47912894_GC_G:47912894:0,2,0,1
chr19	47912897	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=137,108;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47912894_GC_G:47912894:0,2,0,1
chr19	47933328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,3:3,7:5,3,7,3
chr19	47933728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr19	47935352	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=214,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,8:1,0,12,2
chr19	47935572	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,8,11
chr19	47944710	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr19	47951154	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	47981085	.	G	GATGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=196,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:0|1:47981085_G_GATGT:47981085:0,12,1,1
chr19	47981087	.	CGGGT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=196,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:47981085_G_GATGT:47981085:0,12,1,1
chr19	47983240	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:4,0:4,2:0,10,2,0
chr19	47986729	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,1:9,1:12,12,0,2
chr19	47998707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr19	48006723	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.145:32:20,4:7,0:0|1:48006723_G_T:48006723:19,9,2,2
chr19	48006724	.	T	TATTATCACCATTTAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=91,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.144:32:20,4:8,0:0|1:48006723_G_T:48006723:19,9,2,2
chr19	48024765	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,73;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:7,2,1,2
chr19	48024776	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=118,73;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,0:4,3:8,1,1,2
chr19	48047521	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:6,6,2,0
chr19	48182508	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:5,6:6,4:9,2,6,4
chr19	48182522	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=92,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:7,8:6,5:5,8,9,4
chr19	48182568	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,14,15
chr19	48183114	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	48185147	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	48198318	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48198318_G_C:48198318:0,1,0,1
chr19	48198324	.	C	CTAGTCCTGTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48198318_G_C:48198318:0,1,0,1
chr19	48198557	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr19	48198817	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr19	48202125	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr19	48239557	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=137,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,1,1
chr19	48244045	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr19	48244440	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:1,0:7,2:5,3,1,2
chr19	48250320	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,21:0.414:51:16,12:14,9:10,20,10,11
chr19	48253579	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:3,1:3,7,2,0
chr19	48254392	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:1,1:10,2:6,5,1,2
chr19	48254403	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:4,6,2,1
chr19	48254707	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,3,1
chr19	48258149	.	G	GAGTGTGGAGGCTGGAGTTTGGTGGCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr19	48258717	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,5:3,5:5,2,9,1
chr19	48258826	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,24;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,4:0,1:0,1,1,4
chr19	48260079	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,308;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,0:1,3:1,4,1,2
chr19	48282077	.	C	CGCAGCGG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.452:22:4,2:7,6:5,7,6,4
chr19	48284025	.	C	CG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=96,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:12,6:4,5:7,9,6,5
chr19	48339595	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=140,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:8,2:19,0:0|1:48339595_G_A:48339595:13,15,1,1
chr19	48339601	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:9,2:18,0:0|1:48339595_G_A:48339595:14,15,1,1
chr19	48339607	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,2:20,0:0|1:48339595_G_A:48339595:15,16,1,1
chr19	48378145	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48378145_G_A:48378145:0,0,0,1
chr19	48378152	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48378145_G_A:48378145:0,0,0,1
chr19	48378157	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48378145_G_A:48378145:0,0,0,1
chr19	48378169	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=195,169;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48378169_AG_A:48378169:0,1,0,1
chr19	48378175	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=195,169;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48378169_AG_A:48378169:0,1,0,1
chr19	48378179	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=195,169;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48378169_AG_A:48378169:0,1,0,1
chr19	48382418	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=118,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:2,8,1,4
chr19	48382480	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr19	48387126	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	48389425	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr19	48479869	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr19	48511888	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:8,1,6,2
chr19	48517387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,8:2,2:2,0,4,6
chr19	48519241	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,1:2,6:4,1,2,6
chr19	48519364	.	G	GTTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:48519364_G_GTTA:48519364:0,1,0,1
chr19	48519368	.	G	GTTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48519364_G_GTTA:48519364:0,1,0,1
chr19	48519369	.	G	GATACCAGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48519364_G_GTTA:48519364:0,1,0,1
chr19	48519374	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:48519364_G_GTTA:48519364:0,1,0,1
chr19	48522894	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	48523169	.	G	GTTTTGAGACAGGGTCCTGCTCTGCCTCCCAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,97;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	48523197	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=170,102;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr19	48533847	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.391:15:2,3:4,3:1,8,1,5
chr19	48543774	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	48544753	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr19	48551546	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,8,3
chr19	48558342	.	TCTCCAGAAGACCC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCCAGAAGACCC;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	48558388	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	48565468	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	48571026	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=90,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,5,1
chr19	48581142	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=74,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,2:7,1:3,4,1,2
chr19	48581154	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:4,2:0|1:48581154_A_T:48581154:1,6,1,1
chr19	48581156	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:48581154_A_T:48581154:1,6,1,1
chr19	48581158	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,1:0|1:48581154_A_T:48581154:1,6,1,1
chr19	48581159	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:48581154_A_T:48581154:0,6,1,1
chr19	48581186	.	G	GAATCCCTAATGATAGTGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=204,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr19	48598916	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr19	48598948	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=219,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr19	48601350	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:4,5,3,0
chr19	48601512	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,3:3,2:2,6,1,4
chr19	48601528	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:2,4,1,3
chr19	48613788	.	T	TGCTCCGGAATCCGGTGCGGAGGCTTGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCTCCGGAATCCGGTGCGGAGGCTTGG;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:1,1,1,1
chr19	48618972	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:48618972_C_CT:48618972:10,10,1,1
chr19	48618977	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:48618972_C_CT:48618972:10,10,1,1
chr19	48622483	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:3,7,2,6
chr19	48630700	.	GCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr19	48634319	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=98,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:7,4,0,2
chr19	48638873	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,8;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,0:0,0:0|1:48638873_T_TG:48638873:0,1,3,0
chr19	48638876	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=86,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,0:0|1:48638873_T_TG:48638873:1,1,3,0
chr19	48638882	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=72,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:4,2:0,0:0|1:48638873_T_TG:48638873:1,3,2,0
chr19	48639235	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr19	48643149	.	TCTCCGATCCACCTGACCTCTGCATTTTCTCTGGCTGAGCTCCTGTCCTTCTGGTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=103,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.173:18:1,0:1,2:7,7,2,2
chr19	48646732	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:7,2,3,1
chr19	48646883	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,1:10,3:5,9,3,1
chr19	48660195	.	CAA	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:0,2:6,0:6,6,2,1
chr19	48660243	.	GAAGGGGCA	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=81.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,22:0.377:59:16,9:16,12:8,29,6,16
chr19	48660445	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,3:3,3:0,6,2,4
chr19	48664798	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,3:7,5:4,7,1,7
chr19	48668709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr19	48715269	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr19	48718613	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:6,7,2,0
chr19	48734018	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr19	48737706	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,6,12
chr19	48790078	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=93,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:10,5:13,0:9,14,5,0
chr19	48800218	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=87,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr19	48800791	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr19	48801218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr19	48801426	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=292,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,3,2
chr19	48821896	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=255,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,6,3
chr19	48830286	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr19	48832554	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,6:2,9:5,0,14,1
chr19	48833728	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=58,191;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.797:8:1,2:0,3:0,1,3,4
chr19	48833800	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr19	48886538	.	A	ATGGATGGATGGATGGATG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,0,2
chr19	48893820	.	C	CAGAG	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,17;MFRL=135,177;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=AG;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.224:14:4,1:4,0:0,11,0,3
chr19	48893838	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=165,177;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:1,3:5,0:0,7,0,3
chr19	48893863	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=161,177;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,3:7,0:0|1:48893863_G_T:48893863:0,10,0,3
chr19	48893866	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=161,177;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,3:8,0:0|1:48893863_G_T:48893863:0,10,0,3
chr19	48893875	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,0:5,2:0,6,0,2
chr19	48908631	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=90,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:4,3:1,0:1,4,2,2
chr19	48918359	.	G	GAAACTATGCTAGGGAGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=204,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	48918381	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48918381_A_C:48918381:0,2,0,1
chr19	48918384	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:48918381_A_C:48918381:0,2,0,1
chr19	48922772	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	48923101	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr19	48924963	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,4851914;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	48949766	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,8,18
chr19	48950185	.	CATG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr19	48954421	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.364:34:11,7:9,5:10,12,6,6
chr19	48975728	.	GCC	AGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,87;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,0:3,2:2,12,1,1
chr19	48975767	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=272,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	48981221	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,11;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:48981221_A_C:48981221:3,0,1,0
chr19	48981227	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48981221_A_C:48981221:3,0,1,0
chr19	48981933	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,201;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	48982521	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:7,2:0,0:1,7,0,2
chr19	49000603	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:10,3,3,0
chr19	49004912	.	CCCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=255,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr19	49004924	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=255,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr19	49016547	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,0:4,5:0,8,0,5
chr19	49102661	.	TA	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=92,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:4,2:0|1:49102661_TA_CC:49102661:5,6,0,2
chr19	49102664	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=92,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:49102661_TA_CC:49102661:5,6,0,2
chr19	49110184	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
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chr19	49116134	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr19	49123875	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=22,24;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.382:16:1,3:6,3:3,7,4,2
chr19	49123887	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=118,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:6,2:14,0:0|1:49123887_A_AG:49123887:9,11,0,2
chr19	49123889	.	A	ACTG	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:5,2:14,0:0|1:49123887_A_AG:49123887:9,12,0,2
chr19	49123891	.	A	AGAGGCC	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:14,0:0|1:49123887_A_AG:49123887:8,12,0,2
chr19	49123897	.	GA	TT	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,2:9,0:0|1:49123887_A_AG:49123887:5,12,0,2
chr19	49123902	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=34,21;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:7,0:0|1:49123887_A_AG:49123887:2,12,0,2
chr19	49129136	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,206;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr19	49141406	.	AAGAC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,13:0,11:0,0,10,14
chr19	49141532	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	49143025	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,6:0,1,6,5
chr19	49148781	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,8,20
chr19	49166875	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr19	49167531	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:4,7:7,1:6,6,5,3
chr19	49206145	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:5,1,3,2
chr19	49206172	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:2,3,2,3
chr19	49206199	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=80,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:8,8,4,0
chr19	49206985	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,6,10
chr19	49207255	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,26:0.932:27:1,11:0,15:0|1:49207255_A_G:49207255:0,1,9,17
chr19	49207257	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0|1:49207255_A_G:49207255:0,0,9,18
chr19	49207438	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,58;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,10:0,0:0,0,1,9
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chr19	49207496	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=210,185;MMQ=46,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:49207491_C_T:49207491:0,3,0,1
chr19	49207604	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=188,199;MMQ=53,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:4,0,2,0
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chr19	49207687	.	AAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=143,92;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.714:18:1,5:4,8:4,1,12,1
chr19	49207688	.	AAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,15:0,0,17,7
chr19	49207718	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,27:0,0,19,28
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chr19	49208543	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:49208543_T_C:49208543:0,0,4,0
chr19	49208564	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=218,208;MMQ=52,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0|1:49208543_T_C:49208543:1,0,4,0
chr19	49208629	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr19	49208978	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,12,10
chr19	49209010	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,17,6
chr19	49209226	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr19	49216926	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr19	49217261	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr19	49217305	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:4,3:5,6:3,6,4,5
chr19	49218060	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:11,10:12,9:15,8,11,8
chr19	49218111	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=93,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.590:40:11,14:5,7:11,5,14,10
chr19	49218430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:0|1:49218430_A_G:49218430:1,0,5,0
chr19	49218437	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0|1:49218430_A_G:49218430:1,0,7,0
chr19	49227510	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr19	49228140	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:2,7:11,6:7,6,7,6
chr19	49228272	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:0,5,0,10
chr19	49230816	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=154,274;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr19	49232895	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:4,0:15,3:1,18,1,2
chr19	49246866	.	AT	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	49247693	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=101,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,1:14,4:12,14,4,1
chr19	49248972	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=104,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,25:0.338:75:26,25:24,0:32,18,24,1
chr19	49259529	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,1:7,4:6,8,2,3
chr19	49261368	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.492:14:2,1:4,4:1,6,3,4
chr19	49299690	.	TCTCCTTCAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:5,8,1,1
chr19	49300605	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:2,3:1,5:1,3,3,5
chr19	49336100	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=222,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:49336100_T_TC:49336100:0,2,0,1
chr19	49336103	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=222,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49336100_T_TC:49336100:0,2,0,1
chr19	49348631	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=165,49;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:9,0:9,10,0,2
chr19	49348916	.	AATT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=116,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	49357305	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=146,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,0:17,3:13,13,1,2
chr19	49364625	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,2:3,3:5,2,5,1
chr19	49399628	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	49399821	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:12,5:5,1:6,11,2,4
chr19	49400991	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr19	49401205	.	CTTAT	C,CTTATTTAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=0,163,149;MMQ=60,60,60;MPOS=32,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TTAT;STR;TLOD=5.23,10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.386,0.505:5:0,2,1:0,0,2:0,0,1,4
chr19	49404393	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,1:2,3,2,5
chr19	49409026	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:9,10:6,5:5,10,7,8
chr19	49414508	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,3:3,0:5,8,2,1
chr19	49416456	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.393:14:3,2:6,3:3,6,1,4
chr19	49416554	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	49421829	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr19	49421903	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=113,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,7:6,4:7,7,5,6
chr19	49421966	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,3:3,4:7,6,2,5
chr19	49424354	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr19	49424381	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,3:2,3:2,4,3,4
chr19	49425772	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr19	49437076	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=205,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr19	49437123	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=194,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr19	49438292	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,1:5,1:9,7,1,1
chr19	49447577	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=174,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:4,0,6,2
chr19	49447713	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.427:24:6,6:7,4:7,7,7,3
chr19	49459104	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,4,13
chr19	49459428	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,1:11,2:21,5,3,0
chr19	49464200	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,1:4,1:0|1:49464200_A_C:49464200:0,12,3,0
chr19	49464203	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:4,0:0|1:49464200_A_C:49464200:0,12,3,0
chr19	49464205	.	CGCG	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:49464200_A_C:49464200:0,11,2,0
chr19	49464971	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	49473144	.	G	GAGGAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:0,1:2,0:0|1:49473144_G_GAGGAAAA:49473144:0,3,0,1
chr19	49473146	.	G	GTTGATTATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:49473144_G_GAGGAAAA:49473144:0,3,0,1
chr19	49477990	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=102,152;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.339:27:6,0:12,8:7,11,0,9
chr19	49489350	.	A	AATGGAGATTTGGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	49494518	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,4:2,0,7,2
chr19	49494812	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr19	49497155	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=98,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:5,9:5,5:6,4,11,3
chr19	49497277	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,9:3,5:2,2,1,13
chr19	49502478	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=187,188;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,6:1,0:0|1:49502478_G_A:49502478:4,0,6,0
chr19	49502482	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=123,188;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,6:2,0:0|1:49502478_G_A:49502478:4,1,6,0
chr19	49513022	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:6,5,2,1
chr19	49513349	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	49513716	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr19	49513785	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=156,336;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:7,12,0,2
chr19	49513843	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:11,0:8,7:6,14,1,6
chr19	49517745	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:8,0:5,3:9,4,2,1
chr19	49517752	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:49517752_C_CT:49517752:11,4,1,1
chr19	49517753	.	C	CCCCAAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:6,2:0|1:49517752_C_CT:49517752:11,4,1,1
chr19	49517755	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,1:0|1:49517752_C_CT:49517752:11,3,1,1
chr19	49517925	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:0,2,1,4
chr19	49519058	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr19	49519230	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=177,117;MMQ=53,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:0|1:49519230_T_G:49519230:7,0,3,1
chr19	49519240	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=117,175;MMQ=40,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.545:9:3,4:1,1:1|0:49519230_T_G:49519230:3,1,5,0
chr19	49519855	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=171,132;MMQ=35,45;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	49519997	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	49526119	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	49526286	.	CA	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,23;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	49527141	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	49527305	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr19	49527339	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr19	49540093	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=201,134;MMQ=45,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	49558498	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	49558509	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	49558573	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=63,142;MMQ=48,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr19	49558667	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=168,181;MMQ=40,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:2,2,3,2
chr19	49558678	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr19	49558690	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	49558729	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr19	49565059	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=65,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:0,0:3,2:0|1:49565059_C_T:49565059:1,2,1,1
chr19	49565061	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=65,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:0,0:1,0:0|1:49565059_C_T:49565059:1,2,1,1
chr19	49573914	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:7,5,2,0
chr19	49575396	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:2,6:8,9:5,5,9,6
chr19	49593540	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,14:0.241:59:21,13:24,0:25,20,12,2
chr19	49604749	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=95,181;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:15,0:20,3:0|1:49604749_C_A:49604749:18,20,0,3
chr19	49604751	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=95,181;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:17,0:19,3:0|1:49604749_C_A:49604749:18,20,0,3
chr19	49607964	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:5,9,1,1
chr19	49611319	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr19	49618045	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr19	49618457	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,9:5,1:6,2,7,3
chr19	49618681	.	CATG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0,7,0,7
chr19	49621355	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=221,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr19	49632079	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:4,3:1,4:2,4,6,2
chr19	49632309	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=202,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr19	49632772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:0,3:2,0:0,3,1,3
chr19	49638956	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr19	49639948	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,22;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.757:5:0,3:0,1:1,0,3,1
chr19	49643404	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=130,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,0:1,3:1,2,0,3
chr19	49644593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr19	49644840	.	C	CGTGT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GT;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:1,2:1,1:0,3,0,6
chr19	49644858	.	A	AGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=178,165;MMQ=48,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.492:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr19	49645959	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=257,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:0|1:49645959_C_G:49645959:1,2,3,0
chr19	49645963	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=1324,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0|1:49645959_C_G:49645959:0,2,3,0
chr19	49646006	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,3:6,4:3,6,3,4
chr19	49649498	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,3:1,7:0,5,2,8
chr19	49655174	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.673:13:2,4:1,3:4,0,7,2
chr19	49657710	.	A	ACAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=62,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=CAT;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.357:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr19	49661582	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,1,18
chr19	49671457	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.654:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr19	49675107	.	G	GGACAGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr19	49684586	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,8:6,3:7,3,7,4
chr19	49686115	.	GCGC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:49686115_GCGC_G:49686115:3,3,1,1
chr19	49686122	.	GA	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:49686115_GCGC_G:49686115:2,3,1,1
chr19	49692057	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:12,4:6,0:8,13,0,4
chr19	49700106	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=148,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49700106_T_A:49700106:1,0,0,1
chr19	49700113	.	T	TAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49700106_T_A:49700106:0,0,0,1
chr19	49714732	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,7:5,7:4,7,4,10
chr19	49796982	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49796982_C_T:49796982:0,0,1,0
chr19	49796988	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49796982_C_T:49796982:0,0,1,0
chr19	49797887	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr19	49838891	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.661:22:6,4:1,8:4,3,6,9
chr19	49843595	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:5,0:7,0:0|1:49843595_T_C:49843595:6,11,2,0
chr19	49843600	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.138:19:5,0:7,1:0|1:49843595_T_C:49843595:6,11,2,0
chr19	49845852	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=137,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.298:42:17,0:11,12:9,21,0,12
chr19	49846398	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	49846674	.	C	CAAAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:49846674_C_CAAAG:49846674:0,5,1,1
chr19	49846679	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:49846674_C_CAAAG:49846674:0,5,1,1
chr19	49846681	.	GT	AA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=138,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:1,2:0|1:49846674_C_CAAAG:49846674:0,5,1,1
chr19	49851941	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=84,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.360:48:17,4:14,13:19,12,11,6
chr19	49858670	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.270:34:11,0:14,8:13,12,0,9
chr19	49858750	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=97,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:0,1:2,3,0,2
chr19	49860403	.	AAGTCTCTGTCCCCCTCTCCCTGGGTCTCTGTCCCTCTCTTTCTGGGTCTCGGTCCCCCACCCCC	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=14,20;MFRL=90,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:0,2:0,0:1,3,1,1
chr19	49860515	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=100,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:0|1:49860515_C_T:49860515:11,7,1,1
chr19	49860534	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=100,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:12,1:0|1:49860515_C_T:49860515:15,9,1,1
chr19	49860535	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=100,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:11,1:0|1:49860515_C_T:49860515:15,9,1,1
chr19	49863041	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr19	49868704	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:7,1,1,1
chr19	49868959	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:1,5,1,3
chr19	49894217	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,4:2,4:5,5,4,4
chr19	49897753	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=100,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:13,0:0|1:49897753_G_A:49897753:12,8,1,1
chr19	49897777	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:14,0:0|1:49897753_G_A:49897753:16,8,1,1
chr19	49897798	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:6,4:12,0:11,7,4,1
chr19	49901484	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr19	49920805	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=1131,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:0|1:49920805_A_G:49920805:0,2,0,5
chr19	49920816	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:49920805_A_G:49920805:0,3,0,1
chr19	49925722	.	CG	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:27,0:17,6:22,25,0,6
chr19	49926683	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=318,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49926683_C_T:49926683:0,1,0,1
chr19	49926685	.	G	GGCTTGGTCCTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=318,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49926683_C_T:49926683:0,1,0,1
chr19	49934196	.	G	GTAACATGTTGTTTAATCCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,0,2
chr19	49934625	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,587;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:12,0:9,4:10,11,4,0
chr19	49935927	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,7,9
chr19	49936080	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:10,10,0,2
chr19	49939719	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=172,308;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	49949589	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,22,6
chr19	49949686	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:20,4:32,0:25,27,3,1
chr19	49954803	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0|1:49954803_C_T:49954803:0,0,9,10
chr19	49954807	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.953:18:0,10:0,7:0|1:49954803_C_T:49954803:0,0,9,9
chr19	49956690	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,4,12
chr19	49964188	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,4:6,0:6,7,2,2
chr19	49965131	.	GG	AC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr19	49965173	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chr19	49966081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	49969310	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	49973784	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	49977994	.	TGAGGGGAGATGGACGGGAGAACAGATGGACAGATGACGAGGAAATAG	T	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=96,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.078:42:14,0:9,1:15,25,0,2
chr19	49978034	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:10,12,0,2
chr19	49978035	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:8,0:8,13,2,1
chr19	49983467	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=164,129;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,3:5,0:13,1,3,0
chr19	49983588	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=103,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:6,0:17,2:0|1:49983588_G_C:49983588:3,22,3,0
chr19	49983594	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.127:29:6,0:17,0:0|1:49983588_G_C:49983588:4,22,3,0
chr19	49993977	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:15,3,2,0
chr19	50000753	.	CC	TA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,219;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:14,5:26,0:23,18,5,0
chr19	50002968	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:2,0:1,3:1,4,0,4
chr19	50004117	.	C	CTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.486:4:1,2:1,0:0|1:50004117_C_CTGT:50004117:0,2,1,1
chr19	50004118	.	A	AGTCCCAGCTACTTGGAAGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.493:4:1,2:1,0:0|1:50004117_C_CTGT:50004117:0,2,1,1
chr19	50037446	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=247,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr19	50059718	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:4,1:3,6:1,6,0,8
chr19	50060293	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,0:5,0:0|1:50060293_G_C:50060293:3,10,3,0
chr19	50060296	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:7,2:6,1:0|1:50060293_G_C:50060293:3,11,3,0
chr19	50060302	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:5,1:0|1:50060293_G_C:50060293:3,11,2,0
chr19	50060304	.	GG	CC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,1:0|1:50060293_G_C:50060293:3,11,2,0
chr19	50062293	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:3,2:1,2:0|1:50062293_C_G:50062293:0,4,0,4
chr19	50062309	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:50062293_C_G:50062293:0,3,0,1
chr19	50062311	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50062293_C_G:50062293:0,3,0,1
chr19	50086626	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=119,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:4,4:2,2:2,5,2,4
chr19	50087277	.	C	CTGTCTTACCTCCATATTCAGCAACTTTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	50093572	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:11,1:4,5:8,7,4,2
chr19	50095031	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.083:57:30,0:22,4:32,21,0,4
chr19	50095047	.	AGCCGG	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCCGG;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.489:23:4,8:4,1:1,11,2,9
chr19	50097932	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,4,1
chr19	50098816	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=111,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.191:15:3,2:9,1:0|1:50098816_A_C:50098816:0,12,3,0
chr19	50098820	.	CGTTCGA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:2,0:8,0:0|1:50098816_A_C:50098816:1,14,2,0
chr19	50099988	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=199,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr19	50100024	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,1,1
chr19	50101332	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,19;MFRL=155,154;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr19	50101362	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=157,149;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50101362_G_A:50101362:0,2,0,1
chr19	50101369	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=157,149;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50101362_G_A:50101362:0,2,0,1
chr19	50101371	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=157,149;MMQ=50,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50101362_G_A:50101362:0,2,0,1
chr19	50102629	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,2:12,2:10,15,2,2
chr19	50105137	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:6,1:12,3:6,12,1,3
chr19	50105239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr19	50118158	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:13,4:24,0:18,19,4,0
chr19	50123806	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	50128543	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr19	50139119	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50140068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,9,3
chr19	50140092	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,9,6
chr19	50140209	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,9:0,0,5,7
chr19	50140246	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr19	50148261	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr19	50154551	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:4,6,1,2
chr19	50154904	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	50157563	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,0:6,3:8,11,2,1
chr19	50161373	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:8,0,5,0
chr19	50162957	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=110,632;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,4:7,0:0|1:50162957_T_C:50162957:12,11,0,4
chr19	50162962	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=135,632;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:13,4:10,0:0|1:50162957_T_C:50162957:11,14,0,4
chr19	50169020	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	50170197	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr19	50180494	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr19	50183094	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.192:45:16,8:17,0:20,17,8,0
chr19	50187111	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:7,0,10,0
chr19	50191369	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:1,0:2,0:0|1:50191369_G_C:50191369:2,3,2,0
chr19	50191372	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,1:4,1:0|1:50191369_G_C:50191369:2,6,2,0
chr19	50209095	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	50213815	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr19	50216118	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=62.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,12:0,0,11,14
chr19	50216192	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.292:29:10,0:10,8:14,7,7,1
chr19	50245111	.	GTGGGACATGGTGGCCCATATTCCCTGGTACCAGAATCTTCTTGTGTAGCCTCTGACAGC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:2,0:6,2:9,8,1,1
chr19	50248698	.	A	AATCCCAGCACCATTTGACCATTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50265230	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr19	50265549	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=94,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr19	50266266	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:10,2,2,1
chr19	50285389	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:50285389_C_A:50285389:2,1,1,1
chr19	50285392	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:50285389_C_A:50285389:2,1,1,1
chr19	50298840	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.390:8:2,1:2,1:0,5,3,0
chr19	50302761	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:50302761_C_CA:50302761:1,4,1,1
chr19	50302763	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:50302761_C_CA:50302761:1,4,1,1
chr19	50302765	.	G	GCC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:50302761_C_CA:50302761:1,4,1,1
chr19	50302766	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=71,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:50302761_C_CA:50302761:1,4,1,1
chr19	50303085	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50303085_G_GGT:50303085:0,4,0,1
chr19	50303087	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:50303085_G_GGT:50303085:0,4,0,1
chr19	50304336	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,1:0,5:0,3,0,6
chr19	50305688	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,180;MMQ=48,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,2,1
chr19	50308893	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:6,9:2,9:2,7,6,12
chr19	50309860	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,2:3,8:9,4,7,3
chr19	50315423	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,11:2,0:5,0,10,1
chr19	50315698	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,0:1,5:0,3,2,3
chr19	50315773	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:4,0,6,0
chr19	50316083	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	50321512	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=246,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	50321587	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr19	50321853	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=102,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:21,11:25,0:26,20,11,0
chr19	50331678	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,6,0
chr19	50333564	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	50335495	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=14,19;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:0,0:2,1,2,0
chr19	50335510	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:5,0:5,4,1,1
chr19	50339548	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,0:2,8:1,3,3,5
chr19	50354574	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50358133	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=135,189;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,2:1,6:2,1,5,3
chr19	50358170	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr19	50361058	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.577:36:10,13:5,7:9,6,11,10
chr19	50361353	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=104,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:2,3:1,3:2,1,3,4
chr19	50363175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr19	50363652	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50365370	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,6:1,6:1,3,5,7
chr19	50370404	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,5:0,6,2,7
chr19	50375035	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:7,10:7,9:8,6,8,11
chr19	50381095	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,6:8,8:4,11,4,10
chr19	50386340	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,5:4,8:0,9,5,8
chr19	50391456	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:13,7,1,1
chr19	50391474	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=97,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.157:21:7,0:5,2:8,10,3,0
chr19	50391639	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	50393269	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.532:26:5,1:7,12:5,7,5,9
chr19	50397810	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=220,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50397810_AG_A:50397810:0,1,0,1
chr19	50397814	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=220,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50397810_AG_A:50397810:0,1,0,1
chr19	50399112	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:0|1:50399112_C_T:50399112:15,8,1,1
chr19	50399125	.	C	CGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:50399112_C_T:50399112:12,5,1,1
chr19	50399384	.	G	GC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=87.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,19:0,14:0,0,18,15
chr19	50412516	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,37:0.781:47:6,25:3,11:2,8,20,17
chr19	50435747	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:0,1:6,6:1,5,1,6
chr19	50435862	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,0:0,14:0,0,1,13
chr19	50435881	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=68,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,0:11,2:0,13,0,2
chr19	50436010	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=121,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:5,3,3,5
chr19	50453523	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50453523_T_C:50453523:0,0,0,1
chr19	50453524	.	A	ACAACATCAAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50453523_T_C:50453523:0,0,0,1
chr19	50453528	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50453523_T_C:50453523:0,0,0,1
chr19	50453534	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50453523_T_C:50453523:0,0,0,1
chr19	50453537	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50453523_T_C:50453523:0,0,0,1
chr19	50462244	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr19	50462398	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=138,97;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr19	50463670	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=120,249;MMQ=51,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:4,6,2,1
chr19	50463693	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,196;MMQ=39,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr19	50464211	.	T	TAGCTATTATTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=237,198;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50464211_T_TAGCTATTATTCTC:50464211:0,1,0,1
chr19	50464213	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=237,198;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50464211_T_TAGCTATTATTCTC:50464211:0,1,0,1
chr19	50484336	.	TGCCTAAGATATATACACA	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCTAAGATATATACACA;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.524:4:1,1:1,1:0|1:50484336_TGCCTAAGATATATACACA_T:50484336:0,2,0,2
chr19	50484352	.	ACAGCCT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,25;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:50484336_TGCCTAAGATATATACACA_T:50484336:0,1,0,1
chr19	50484361	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:50484336_TGCCTAAGATATATACACA_T:50484336:0,2,0,1
chr19	50484365	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1|0:50484336_TGCCTAAGATATATACACA_T:50484336:0,3,0,1
chr19	50484367	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1|0:50484336_TGCCTAAGATATATACACA_T:50484336:0,3,0,1
chr19	50492860	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr19	50493120	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	50496281	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	50500922	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	50511108	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=74,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,0,7
chr19	50511156	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	50519231	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:1,1:5,6:5,1,4,3
chr19	50519249	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,1:5,8:6,1,5,4
chr19	50519474	.	G	GTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	50542359	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,3:2,0,6,1
chr19	50548122	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.381:37:11,13:12,0:12,11,14,0
chr19	50657786	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr19	50662726	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:2,5:8,6:6,5,10,1
chr19	50713833	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:4,7,2,1
chr19	50720795	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,2:4,0:5,0,3,0
chr19	50726319	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,193;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:3,4,2,1
chr19	50726459	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,1:5,6:4,4,3,4
chr19	50727312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.490:6:2,0:1,3:3,0,1,2
chr19	50728955	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:1,3:5,6:1,5,2,7
chr19	50730047	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr19	50735340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=166,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,0:5,4:2,5,1,3
chr19	50735422	.	T	TCTTGTTGGTAGGTGGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50735422_T_TCTTGTTGGTAGGTGGTG:50735422:0,0,0,1
chr19	50735424	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50735422_T_TCTTGTTGGTAGGTGGTG:50735422:0,0,0,1
chr19	50747675	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=146,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr19	50750419	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr19	50760716	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=79,78;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.597:13:2,3:3,4:2,3,4,4
chr19	50764005	.	C	CGT	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=72,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.278:34:19,5:4,3:14,10,4,6
chr19	50764010	.	GTGTGTGTGCGTGCATGAGTGTGCGTGCA	G	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=126,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.143:43:21,6:8,0:16,21,2,4
chr19	50764017	.	T	C,TGC	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=26,32,26;MFRL=91,0,114;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,2,10:0.067,0.275:39:17,1,7:7,1,1:13,14,8,4
chr19	50766707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,4,9
chr19	50766740	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	50771609	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:1,1:2,3,1,4
chr19	50771635	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=61,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.862:9:1,6:0,2:1,0,1,7
chr19	50771691	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50771691_T_A:50771691:0,1,0,1
chr19	50771692	.	T	TCCCCAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50771691_T_A:50771691:0,1,0,1
chr19	50775742	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr19	50779987	.	CA	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:5,5,1,2
chr19	50780165	.	T	TTTACCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50780165_T_TTTACCAA:50780165:0,2,0,1
chr19	50780166	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50780165_T_TTTACCAA:50780165:0,2,0,1
chr19	50780169	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50780165_T_TTTACCAA:50780165:0,2,0,1
chr19	50796905	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:2,5:5,2:3,6,2,5
chr19	50796960	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr19	50805138	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:2,1:4,7,3,0
chr19	50812221	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=67,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:2,6:6,11:4,4,13,4
chr19	50812823	.	CTCTCTCCTCCCCCTTTCTCCTCCCCTCCCCTCCCCTCATTTCATCTCTGTATCCTGG	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.156:51:1,0:0,7:28,16,3,4
chr19	50864334	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=124,704;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,4:8,0:4,10,0,4
chr19	50868796	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,2:10,0:0|1:50868796_C_T:50868796:11,9,1,1
chr19	50868812	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,1:11,0:0|1:50868796_C_T:50868796:12,8,1,1
chr19	50880808	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:10,3:25,0:26,9,3,0
chr19	50881201	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0|1:50881201_A_C:50881201:0,0,0,1
chr19	50881203	.	TGGGAGG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50881201_A_C:50881201:0,0,0,1
chr19	50881211	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50881201_A_C:50881201:0,0,0,1
chr19	50881213	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50881201_A_C:50881201:0,0,0,1
chr19	50881820	.	A	AAAC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=110.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,10:0,17:0,0,14,14
chr19	50885690	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr19	50909389	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr19	50910716	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:0|1:50910716_G_A:50910716:7,15,1,1
chr19	50910720	.	CTGAGGTGGGAGGA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,0:5,2:0|1:50910716_G_A:50910716:7,15,1,1
chr19	50919797	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr19	50922370	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	50926126	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,5:3,6:0,9,6,6
chr19	50926264	.	TG	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr19	50939867	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,2:6,5:2,7,5,2
chr19	50941025	.	A	AATC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=111,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:0|1:50941025_A_AATC:50941025:3,10,1,1
chr19	50941026	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:3,9,1,2
chr19	50941029	.	GGTGGGTGA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:4,0:0|1:50941025_A_AATC:50941025:4,10,1,1
chr19	50941039	.	GCT	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=106,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:50941025_A_AATC:50941025:4,7,1,1
chr19	50944158	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:50944158_G_GT:50944158:14,5,1,1
chr19	50944168	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:50944158_G_GT:50944158:14,5,1,1
chr19	50947104	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:3,8,1,1
chr19	50954533	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:12,2:8,13,1,1
chr19	50954584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=156,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0,3,2,5
chr19	50955353	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=186,346;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:50955353_G_T:50955353:0,2,0,1
chr19	50955361	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=210,346;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50955353_G_T:50955353:0,1,0,1
chr19	50957519	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:7,3:9,5,3,0
chr19	50962062	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=135,270;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:1,0:2,3:3,1,1,2
chr19	50962135	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0|1:50962135_G_C:50962135:1,0,2,0
chr19	50962143	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50962135_G_C:50962135:1,0,1,0
chr19	50963307	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,3:9,5:10,4,5,3
chr19	51015112	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:6,4:3,0:2,7,0,4
chr19	51021259	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:12,3:7,0:11,9,1,2
chr19	51125839	.	GCAGCCCCTCCTCCCTCAGACCCAGGAGTCCAGGCCCC	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=131,153;MMQ=55,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.363:12:2,1:5,3:6,2,3,1
chr19	51125878	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=129,133;MMQ=50,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:2,1:4,2:0|1:51125878_AG_CC:51125878:6,4,3,0
chr19	51125884	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=129,122;MMQ=52,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:6,0:0|1:51125878_AG_CC:51125878:6,5,2,0
chr19	51128496	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=233,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr19	51128856	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr19	51172301	.	CCCGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,29;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:51172301_CCCGT_C:51172301:0,1,0,1
chr19	51172309	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51172301_CCCGT_C:51172301:0,1,0,1
chr19	51191003	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	51191172	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr19	51192736	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=238,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51192736_T_C:51192736:0,1,0,1
chr19	51192743	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=238,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51192736_T_C:51192736:0,1,0,1
chr19	51192744	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=238,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51192736_T_C:51192736:0,1,0,1
chr19	51217008	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr19	51217550	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=87,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:2,3,3,5
chr19	51218856	.	GGGTAGGGGGCTCCAGT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=71,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:2,1:10,1,2,0
chr19	51226955	.	ATGGGTGGTGAACTG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:12,0:8,16,1,1
chr19	51227260	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:18,2:9,0:0|1:51227260_G_A:51227260:10,17,1,1
chr19	51227278	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,2:3,0:0|1:51227260_G_A:51227260:5,8,1,1
chr19	51228802	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	51273969	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:11,0:0,2:0|1:51273969_G_A:51273969:9,3,1,1
chr19	51273972	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,3:0.248:14:9,3:2,0:1|0:51273969_G_A:51273969:7,4,3,0
chr19	51273976	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:11,0:1,2:0|1:51273969_G_A:51273969:9,3,1,1
chr19	51274144	.	CC	TT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:3,2:7,9,1,1
chr19	51274836	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=88,138;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,2,5
chr19	51294003	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,1:2,3:2,1,3,1
chr19	51297825	.	GC	AA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.635:39:5,15:9,9:8,6,14,11
chr19	51297944	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,2:1,1:0,3,1,2
chr19	51301456	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:2,5,2,2
chr19	51301476	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=105,53389;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:6,10,0,2
chr19	51323501	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=91,85;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,2:4,7:7,3,5,4
chr19	51323754	.	G	GAATGGAATGGAAAGGAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51323754_G_GAATGGAATGGAAAGGAAC:51323754:0,4,0,1
chr19	51323757	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51323754_G_GAATGGAATGGAAAGGAAC:51323754:0,4,0,1
chr19	51323759	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:51323754_G_GAATGGAATGGAAAGGAAC:51323754:0,4,0,1
chr19	51327003	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,0:5,2:0|1:51327003_A_C:51327003:4,14,1,1
chr19	51327004	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:11,0:6,2:0|1:51327003_A_C:51327003:4,14,1,1
chr19	51330203	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=161,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:2,0:0|1:51330203_AG_A:51330203:2,2,1,1
chr19	51330207	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:51330203_AG_A:51330203:2,2,1,1
chr19	51359497	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,0:8,2:0|1:51359497_T_C:51359497:4,8,1,2
chr19	51359503	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:2,1:8,3:0|1:51359497_T_C:51359497:4,7,2,2
chr19	51361644	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=104,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:2,1,2,1
chr19	51363398	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:4,9,5,2
chr19	51379893	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,88;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:3,3:2,2:3,2,3,3
chr19	51380110	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr19	51380364	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:6,2:2,6,1,2
chr19	51380395	.	GCC	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=100,177;MMQ=20,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.285:5:0,1:4,0:0|1:51380395_GCC_G:51380395:0,4,0,1
chr19	51380398	.	TCATCTGCCGCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=38,28;MFRL=100,177;MMQ=20,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:51380395_GCC_G:51380395:0,4,0,1
chr19	51410171	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=86,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.432:12:3,5:3,0:4,3,2,3
chr19	51413906	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=94,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:11,5,4,4
chr19	51447065	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr19	51452250	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr19	51462673	.	G	GAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=227,111;MMQ=48,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr19	51471433	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:12,2:1,20,1,2
chr19	51471460	.	TGGCCTGCTATGGTC	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:5,1:9,2:0|1:51471460_TGGCCTGCTATGGTC_T:51471460:0,19,0,3
chr19	51471479	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=165,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:13,1:0|1:51471460_TGGCCTGCTATGGTC_T:51471460:0,16,0,2
chr19	51482969	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	51484984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0|1:51484984_C_T:51484984:0,0,6,2
chr19	51484990	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:51484984_C_T:51484984:0,0,6,2
chr19	51485013	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr19	51485194	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr19	51500918	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	51503524	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	51504075	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=24579592,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr19	51518222	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr19	51518286	.	G	GCAAATTCCA	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:1,4,0,1
chr19	51518290	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=21,22;MFRL=160,258;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr19	51518297	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	51518299	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=20,30;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:51518299_TTG_T:51518299:1,1,0,1
chr19	51518302	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:51518299_TTG_T:51518299:1,1,0,1
chr19	51518306	.	G	GCGCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr19	51519236	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,1:0,0,5,2
chr19	51519259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr19	51519451	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	51519480	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	51522286	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51522286_C_T:51522286:0,0,1,0
chr19	51522291	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:51522286_C_T:51522286:0,0,1,0
chr19	51525703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	51528897	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:8,5:9,1:6,11,4,2
chr19	51530693	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr19	51563965	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=291,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	51582994	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=186,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0|1:51582994_G_T:51582994:0,1,2,2
chr19	51583003	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:51582994_G_T:51582994:0,1,1,3
chr19	51584743	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.587:22:2,7:6,5:7,2,9,4
chr19	51630224	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr19	51630482	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:1,6:3,5:2,2,6,6
chr19	51631363	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	51631751	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:10,0:10,17,1,1
chr19	51633052	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr19	51646140	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=139,159;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	51656218	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	51742969	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:51742969_G_A:51742969:2,3,1,1
chr19	51742973	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=192,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:51742969_G_A:51742969:1,3,1,1
chr19	51828627	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=93,61;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:8,4:17,0:14,12,0,4
chr19	51831930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:9,11,0,3
chr19	51832083	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=191,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:51832083_A_C:51832083:0,4,0,1
chr19	51832085	.	G	GCCTCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=191,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:51832083_A_C:51832083:0,4,0,1
chr19	51832088	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:51832083_A_C:51832083:0,4,0,1
chr19	51835816	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:7,3,2,0
chr19	51835892	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,8,8
chr19	51837213	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	51837344	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr19	51845262	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.105:45:24,0:16,3:21,19,0,5
chr19	51853749	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51853749_TTC_T:51853749:0,4,0,1
chr19	51853760	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:51853749_TTC_T:51853749:0,3,0,1
chr19	51853764	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:51853749_TTC_T:51853749:0,3,0,1
chr19	51857738	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,9,9
chr19	51857874	.	C	CCCACAG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=90,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCACAG;STR;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.614:24:3,8:6,5:2,7,2,13
chr19	51874950	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.653:6:1,2:0,2:1,1,4,0
chr19	51883727	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=97,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:2,6:9,5:7,4,7,5
chr19	51917735	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,2:3,6:7,6,4,4
chr19	51918360	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr19	51918394	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=180,194;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:4,2,6,0
chr19	51918901	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=206,140;MMQ=46,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:2,2,0,2
chr19	51919140	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=121,152;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,2:4,1:6,3,2,1
chr19	51919434	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:2,1:1,4,1,1
chr19	51920240	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=80,179;MMQ=36,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,3:7,1:4,10,3,1
chr19	51920803	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,154;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:4,0:12,8:4,12,0,8
chr19	51920820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,154;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,0:10,8:2,11,0,8
chr19	51955626	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:1,6:4,7:2,3,6,7
chr19	51958942	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:7,2:8,0:6,9,1,1
chr19	51961616	.	GGCA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:2,1:4,1:0,8,0,2
chr19	51983551	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,107;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr19	51983790	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,0;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,0:8,2:10,7,0,2
chr19	51984637	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=166,118;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:5,0:5,5,3,0
chr19	51984641	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=161,118;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:4,5,3,0
chr19	51984888	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:7,7,2,1
chr19	51986590	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,2:6,0:0|1:51986590_C_T:51986590:6,4,1,1
chr19	51986604	.	C	CCCAGCGTTATGGAGATAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=110,59;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:51986590_C_T:51986590:2,4,1,1
chr19	51994813	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=190,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	51994851	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=67,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:2,2:3,0:3,2,3,0
chr19	52000151	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,6:7,4,6,5
chr19	52001373	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,168;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.365:35:12,0:10,10:10,12,0,13
chr19	52002317	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	52003058	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	52003089	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr19	52004551	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,86;MMQ=52,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,3:7,1:8,3,3,1
chr19	52004791	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=68,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:0|1:52004791_G_GC:52004791:4,3,4,4
chr19	52004795	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=67,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:0|1:52004791_G_GC:52004791:4,4,4,4
chr19	52031162	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr19	52032936	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,2:1,0:2,1,3,0
chr19	52034940	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=80,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.661:22:3,8:4,4:5,2,8,7
chr19	52076481	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr19	52090842	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=194,321;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,5:8,0:8,7,0,5
chr19	52091192	.	CGGGAAAGCCTTCAACCAGAAGTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCCTTACAAATGCAGTGAATGT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:6,0:10,4:17,16,2,2
chr19	52115645	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,105;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:4,6:9,0:4,9,3,3
chr19	52130439	.	G	GCACTGCCCA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr19	52130830	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.340:10:3,0:4,3:2,5,2,1
chr19	52133060	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,6,7
chr19	52148973	.	ACACACACC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=144,171;MMQ=51,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,1:2,6:3,0,7,1
chr19	52149083	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=149,147;MMQ=36,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:19,4:21,0:17,25,0,4
chr19	52196453	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr19	52216963	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,0:8,4:7,6,1,3
chr19	52227137	.	TACAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=0,188;MMQ=54,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=AC;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.633:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr19	52249211	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,11,16
chr19	52249801	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,161;MMQ=60,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,4:6,0:10,4,4,0
chr19	52249947	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:10,3:3,5:3,10,5,3
chr19	52327203	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:13,0:9,18,0,3
chr19	52328523	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:9,4,0,3
chr19	52329273	.	CTTTTATTGTTTAAATCATGAATGAATGTTGAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=202,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.351:7:3,0:0,2:0,5,1,1
chr19	52443377	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	52443405	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=173,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr19	52449058	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=72,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:52449058_C_T:52449058:0,2,0,1
chr19	52449059	.	A	ATTTAAGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,23;MFRL=72,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52449058_C_T:52449058:0,2,0,1
chr19	52449061	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=72,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:52449058_C_T:52449058:0,2,0,1
chr19	52449063	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52449058_C_T:52449058:0,1,0,1
chr19	52449072	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	52468034	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,3,1
chr19	52469059	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=123,79;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:52469059_A_C:52469059:7,11,1,1
chr19	52469061	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=123,79;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:8,0:10,2:0|1:52469059_A_C:52469059:7,11,1,1
chr19	52469526	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:0|1:52469526_G_T:52469526:1,8,1,4
chr19	52469534	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,1:4,3:0|1:52469526_G_T:52469526:1,7,1,4
chr19	52471769	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	52471813	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr19	52472337	.	CTCCTCCCAAGTGAAGTCCACAGCCACA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:15,2:7,0:12,17,0,2
chr19	52496149	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,12,11
chr19	52521365	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:2,9,0,2
chr19	52529088	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:1,10,0,2
chr19	52619302	.	CGGTGACATACA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=135,617;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,1:10,1:0|1:52619302_CGGTGACATACA_C:52619302:12,14,0,2
chr19	52619316	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=135,617;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,1:14,0:0|1:52619302_CGGTGACATACA_C:52619302:11,11,0,2
chr19	52663694	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:18,0:12,2:19,11,2,0
chr19	52709171	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,2:2,6:3,1,9,0
chr19	52772756	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:52772756_C_T:52772756:4,0,1,0
chr19	52772761	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:52772756_C_T:52772756:4,0,1,0
chr19	52772768	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1|0:52772756_C_T:52772756:4,0,5,0
chr19	52786700	.	CTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=70,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,0:0,1:4,3,0,2
chr19	52793228	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=186,215;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:52793228_TG_T:52793228:4,0,1,0
chr19	52793234	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=183,215;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52793228_TG_T:52793228:3,0,1,0
chr19	52793237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=183,215;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52793228_TG_T:52793228:3,0,1,0
chr19	52794005	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=84,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,2:0|1:52794005_C_T:52794005:11,6,1,1
chr19	52794011	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=90,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:52794005_C_T:52794005:9,7,1,1
chr19	52794015	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=96,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:52794005_C_T:52794005:9,8,1,1
chr19	52803669	.	CTG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=68.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,12:0,6:0,0,7,11
chr19	52852523	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,7,10
chr19	52869534	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,7,9
chr19	52870052	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr19	52870096	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52870096_C_CA:52870096:0,1,0,1
chr19	52870101	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52870096_C_CA:52870096:0,1,0,1
chr19	52870103	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52870096_C_CA:52870096:0,1,0,1
chr19	52876385	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=49,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,11:1,12:0,1,10,13
chr19	52877716	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.227:22:12,4:5,1:9,8,2,3
chr19	52909303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=60,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr19	52909952	.	GG	AA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0|1:52909952_GG_AA:52909952:0,8,0,2
chr19	52909957	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,1:0|1:52909952_GG_AA:52909952:0,9,0,2
chr19	52909989	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr19	52920006	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,4:0,0,3,11
chr19	52938361	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=351,123;MMQ=52,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,8:0,8:1,0,7,9
chr19	52938408	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=133,51;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,1:0|1:52938408_G_GA:52938408:12,13,1,1
chr19	52938410	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=128,51;MMQ=57,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:10,2:0|1:52938408_G_GA:52938408:13,13,1,1
chr19	52938412	.	AAAT	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=123,51;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:10,2:0|1:52938408_G_GA:52938408:17,16,1,1
chr19	52940931	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	52941847	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr19	52942734	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr19	53015384	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,1:0,5:1,1,3,3
chr19	53057021	.	GAAACCTTACAAGTGTAAAGAGTGTGGAAAGTCCTTCAGTTACAAGTCATCCCTTACATGCCATCATAGACTTCATACTGGAGTA	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,12:0.077:65:6,5:10,3:19,34,6,6
chr19	53058398	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=97,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.231:19:4,2:11,2:7,8,1,3
chr19	53058766	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=107,66;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:53058766_G_T:53058766:6,10,1,1
chr19	53058769	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=107,66;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:53058766_G_T:53058766:6,10,1,1
chr19	53058776	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=106,66;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:53058766_G_T:53058766:6,11,1,1
chr19	53058783	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=107,66;MMQ=55,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:53058766_G_T:53058766:1,9,1,1
chr19	53058794	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,66;MMQ=59,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:0|1:53058766_G_T:53058766:4,6,1,1
chr19	53086598	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=145,172;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:6,1:7,3:6,8,3,1
chr19	53117531	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,8,11
chr19	53270384	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=127,112;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:5,5:6,4:5,6,4,5
chr19	53270920	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,164;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:23,0:12,4:23,12,0,4
chr19	53303948	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,63;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:53303948_C_T:53303948:6,5,1,1
chr19	53303952	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=113,63;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:53303948_C_T:53303948:6,6,1,1
chr19	53303966	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=89,63;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:0|1:53303948_C_T:53303948:10,5,1,1
chr19	53303972	.	GC	TT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=89,63;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:53303948_C_T:53303948:11,5,1,1
chr19	53344579	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:7,6,1,1
chr19	53345414	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr19	53384185	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr19	53453777	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:4,4,3,6
chr19	53454475	.	C	CACT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:3,9:4,5:1,6,7,8
chr19	53456100	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,150;MMQ=58,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,2:9,3:10,9,1,4
chr19	53572917	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,4:5,4:9,6,3,5
chr19	53573352	.	C	CTCTCTCTCT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.101:30:12,2:12,0:7,21,0,2
chr19	53625994	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:53625994_A_C:53625994:2,3,1,1
chr19	53625996	.	G	GTTTGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:53625994_A_C:53625994:2,3,1,1
chr19	53643832	.	GAA	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=117,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:9,0:0|1:53643832_GAA_G:53643832:10,11,0,2
chr19	53643835	.	T	TGTGTG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:10,0:0|1:53643832_GAA_G:53643832:10,12,0,2
chr19	53643837	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:53643832_GAA_G:53643832:10,11,0,2
chr19	53643840	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:11,0:0|1:53643832_GAA_G:53643832:10,12,0,2
chr19	53645291	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,9,12
chr19	53645867	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=253,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,2,0,1
chr19	53645869	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=253,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,2,0,1
chr19	53645874	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=253,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,2,0,1
chr19	53645879	.	A	C,AC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,34,23;MFRL=241,252,265;MMQ=60,60,60;MPOS=8,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr19	53645882	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=241,259;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,1,0,2
chr19	53645884	.	A	ACTCACTAAGC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=241,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,1,0,2
chr19	53645887	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=241,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:53645867_T_TG:53645867:0,1,0,2
chr19	53651845	.	T	TTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr19	53667637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	53667680	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,2:4,0:6,2,1,1
chr19	53669646	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53669646_T_A:53669646:0,0,0,1
chr19	53669650	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53669646_T_A:53669646:0,0,0,1
chr19	53678924	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	53740142	.	A	ACAGCTTGAATAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53740142_A_ACAGCTTGAATAC:53740142:1,0,1,0
chr19	53740144	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,0:0|1:53740142_A_ACAGCTTGAATAC:53740142:1,0,1,0
chr19	53741791	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53741791_TG_T:53741791:1,2,0,1
chr19	53741794	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53741791_TG_T:53741791:1,2,0,1
chr19	53741795	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53741791_TG_T:53741791:1,2,0,1
chr19	53741798	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:53741791_TG_T:53741791:1,2,0,1
chr19	53754736	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:5,3,8,1
chr19	53762563	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:3,13:6,3:7,2,8,9
chr19	53770612	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=126,52;MMQ=40,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:53770612_C_A:53770612:3,2,1,1
chr19	53770613	.	A	AATT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=126,52;MMQ=40,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,0:1,0:0|1:53770612_C_A:53770612:3,2,1,1
chr19	53770764	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=154,128;MMQ=39,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:3,3,4,1
chr19	53770937	.	CACTGATG	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,106;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:0|1:53770937_CACTGATG_C:53770937:1,11,0,2
chr19	53770946	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=156,106;MMQ=34,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:53770937_CACTGATG_C:53770937:0,8,0,2
chr19	53770948	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=156,106;MMQ=34,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:53770937_CACTGATG_C:53770937:0,8,0,2
chr19	53794579	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,2,7
chr19	53794858	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,10:1,7:1,0,2,15
chr19	53794956	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	53854712	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:18,2:15,1:17,17,1,2
chr19	53856349	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.400:38:11,9:12,6:8,15,8,7
chr19	53901350	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,5:1,7:2,2,5,7
chr19	53910912	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr19	53911708	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=173,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:8,0:5,4:0|1:53911708_A_G:53911708:7,7,1,3
chr19	53911712	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=180,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:7,0:5,3:0|1:53911708_A_G:53911708:7,7,1,3
chr19	53911714	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,0:5,3:0|1:53911708_A_G:53911708:7,7,1,2
chr19	53959804	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:10,5:7,7:9,8,6,7
chr19	53993551	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	53993657	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,61;MMQ=52,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:53993657_G_C:53993657:15,6,1,1
chr19	53993662	.	C	CGT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,61;MMQ=52,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:53993657_G_C:53993657:16,6,1,1
chr19	53993663	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=157,61;MMQ=52,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:53993657_G_C:53993657:16,6,1,1
chr19	53993667	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=156,61;MMQ=52,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:53993657_G_C:53993657:15,7,1,1
chr19	53994020	.	A	ATGGATAATGTTTGCCTACTTTATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=90,139702;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:12,3:19,0:18,13,0,3
chr19	53994514	.	CATGCCATCGTAGACTTCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTTAGTCGGAAGTCATCCCTTACATGCCATCATAGACTTCATACGGGAGAGAAACCTTATAAGTGTAATGAATGTGGCAAGACCTTCAGTCAGGAGTTAACCCTTAA	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,18:0.079:78:6,7:5,10:28,32,6,12
chr19	53994691	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=116,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.145:27:10,1:12,2:9,15,0,3
chr19	53995004	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,134;MMQ=60,55;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.532:36:8,8:7,11:7,10,10,9
chr19	53995400	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:4,5,0,3
chr19	54072757	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr19	54172312	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=134,1354;MMQ=30,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0|1:54172312_C_T:54172312:8,1,0,2
chr19	54172316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=138,1354;MMQ=38,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:54172312_C_T:54172312:8,2,0,2
chr19	54172336	.	A	AGCCGACTGACTAAACAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=142,1354;MMQ=40,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,0:6,2:7,4,0,2
chr19	54178892	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr19	54185311	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=67,190;MMQ=53,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:3,1,4,1
chr19	54188219	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:7,2,5,0
chr19	54191743	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:14,7:7,9:11,10,10,6
chr19	54191869	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,2:7,4:6,10,1,5
chr19	54197633	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:6,6:8,4,7,4
chr19	54198646	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:4,2:6,1:2,8,0,3
chr19	54205961	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=152,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:7,4:2,1:6,3,6,0
chr19	54210897	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,3:5,3:0,11,0,6
chr19	54211903	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=103,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:3,2:2,2,3,3
chr19	54216777	.	T	TTTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:4,6:2,1:1,5,3,4
chr19	54219769	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=168,34;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:3,2,3,1
chr19	54220019	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=62,91;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,1,1
chr19	54228742	.	G	GAAAGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=90,170;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAGA;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.286:15:5,1:6,2:7,4,2,2
chr19	54233007	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=115,134;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:8,3,5,3
chr19	54233170	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:19,2:19,1:24,14,3,0
chr19	54234353	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:6,1:4,5:4,7,1,6
chr19	54238265	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=83,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:2,1:1,4:1,2,3,2
chr19	54252047	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:8,7:4,8:5,7,3,12
chr19	54254658	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr19	54257185	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:54257185_C_G:54257185:0,0,6,1
chr19	54257190	.	AC	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:54257185_C_G:54257185:0,0,5,1
chr19	54261644	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=148,163;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,1:3,2:3,4,0,3
chr19	54261669	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=184,167;MMQ=47,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr19	54264352	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=105,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.177:24:1,3:15,0:12,8,3,1
chr19	54265779	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=70,102;MMQ=48,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.883:14:0,7:0,6:0,1,3,10
chr19	54299178	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,0:10,2:18,7,1,1
chr19	54299194	.	GT	CC	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:54299194_GT_CC:54299194:16,8,1,1
chr19	54299199	.	G	GC	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:0|1:54299194_GT_CC:54299194:15,9,1,1
chr19	54299202	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:16,0:8,2:0|1:54299194_GT_CC:54299194:15,9,1,1
chr19	54299205	.	GT	TG	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:9,2:0|1:54299194_GT_CC:54299194:17,9,1,1
chr19	54299208	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:6,2:0|1:54299194_GT_CC:54299194:16,9,1,1
chr19	54308554	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,9,6
chr19	54308775	.	C	CTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.710:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr19	54312771	.	C	CAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=24,29;RU=A;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,1:0,0:1,0,0,6
chr19	54314585	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr19	54314638	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr19	54327120	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:54327120_C_T:54327120:10,5,1,1
chr19	54327141	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:54327120_C_T:54327120:12,11,1,1
chr19	54327440	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr19	54377329	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:4,5,1,1
chr19	54377902	.	C	A	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,59;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,10:0.096:106:47,8:47,1:49,47,9,1
chr19	54378025	.	CT	C	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=14,19;MFRL=175,175;MMQ=50,46;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:0,2:2,1:0,8,2,6
chr19	54378029	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=162,161;MMQ=47,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.324:13:6,0:3,1:2,7,0,4
chr19	54378030	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=169,172;MMQ=45,54;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.254:17:4,2:5,2:1,12,2,2
chr19	54378082	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=187,154;MMQ=45,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,7:0,6:0,1,2,11
chr19	54378453	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20,20;MFRL=0,142,0;MMQ=60,60,60;MPOS=18,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,8,9;RU=GT;STR;TLOD=5.01,18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,7:0.228,0.633:10:0,1,2:1,0,2:1,0,5,4
chr19	54378789	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.953:23:0,11:0,11:0,1,19,3
chr19	54379103	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.228:16:2,1:8,1:7,6,2,1
chr19	54379515	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	54385437	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54387313	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	54395098	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,8,9
chr19	54395711	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54407929	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:8,0:12,8:6,14,2,6
chr19	54409783	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=98,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr19	54410099	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:54410099_C_T:54410099:6,13,1,1
chr19	54410115	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:54410099_C_T:54410099:6,12,1,1
chr19	54410120	.	A	AGTTCTGTGC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:0|1:54410099_C_T:54410099:6,11,1,1
chr19	54417754	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:12,2:5,0:11,6,1,1
chr19	54445594	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	54481482	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=99,110;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:13,0:18,4:17,14,4,0
chr19	54501460	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr19	54515432	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:2,2:12,2:6,8,2,2
chr19	54544189	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:2,3:2,5:3,1,6,2
chr19	54545274	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:7,0:5,3:4,8,2,2
chr19	54545390	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr19	54545499	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=99,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:15,2:0|1:54545499_C_T:54545499:16,17,1,1
chr19	54545513	.	TG	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=101,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:12,0:18,2:0|1:54545499_C_T:54545499:17,16,1,1
chr19	54545516	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,0:16,2:0|1:54545499_C_T:54545499:16,15,1,1
chr19	54545531	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,10:0.551:18:5,5:3,5:1|0:54545499_C_T:54545499:4,4,3,7
chr19	54545688	.	C	CATTCTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:1,1:2,0:0|1:54545688_C_CATTCTA:54545688:0,3,0,1
chr19	54545689	.	G	GTGCCTCAGCTTCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:1,1:2,0:0|1:54545688_C_CATTCTA:54545688:0,3,0,1
chr19	54545692	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:54545688_C_CATTCTA:54545688:0,3,0,1
chr19	54554694	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,2:4,1:5,9,1,2
chr19	54561493	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=74,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:2,0,5,3
chr19	54562089	.	ATATATATAATGTATATATGTAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=189,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	54566901	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,3:1,4:4,0,5,2
chr19	54573317	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=99,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:8,7,3,0
chr19	54578435	.	T	TTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTA;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	54603104	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:7,5:4,0:7,6,3,3
chr19	54603173	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=180,186;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,6:1,1:0,5,0,7
chr19	54604194	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:6,2:4,5,1,3
chr19	54606405	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=115,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:9,11:1,2:7,3,7,6
chr19	54609027	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=97,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.357:32:5,7:13,4:9,12,3,8
chr19	54609170	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.356:18:4,3:5,2:0|1:54609170_A_G:54609170:11,1,3,3
chr19	54609178	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.369:20:5,3:5,4:0|1:54609170_A_G:54609170:12,1,3,4
chr19	54611283	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.477:7:1,2:2,1:4,0,3,0
chr19	54611287	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr19	54611560	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:3,1,4,2
chr19	54611734	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=103,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:7,5:4,11:5,6,7,9
chr19	54627039	.	GCACA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CA;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr19	54627097	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr19	54628075	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr19	54630015	.	C	CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:0|1:54630015_C_CAA:54630015:5,15,1,1
chr19	54630016	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:5,0:0|1:54630015_C_CAA:54630015:5,15,1,1
chr19	54631376	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:4,0:3,4:0|1:54631376_G_T:54631376:6,1,3,1
chr19	54631378	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:54631376_G_T:54631376:0,0,9,4
chr19	54631381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0|1:54631376_G_T:54631376:0,0,9,4
chr19	54632352	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	54632423	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,4,6
chr19	54634830	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.612:24:2,8:7,6:4,5,9,6
chr19	54649671	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,6:0,8:1,0,7,7
chr19	54649850	.	A	ACCCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54649850_A_ACCCAC:54649850:0,1,0,1
chr19	54649852	.	T	TGCACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54649850_A_ACCCAC:54649850:0,1,0,1
chr19	54653572	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,1,2
chr19	54656220	.	G	GGCATGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=103,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:2,10,0,2
chr19	54657877	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=147,48480578;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	54664830	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:12,6,3,0
chr19	54665970	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:2,4:8,7:4,6,3,8
chr19	54666060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:54666060_T_C:54666060:0,0,0,3
chr19	54666078	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54666060_T_C:54666060:0,0,0,1
chr19	54666357	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:8,7:1,2:4,5,8,1
chr19	54667417	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.251:19:4,1:7,0:7,7,5,0
chr19	54667709	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=219,121;MMQ=30,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:0,2:0,0:0,1,0,3
chr19	54676814	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:8,3:5,3:6,7,2,4
chr19	54677738	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:6,0:13,7:10,10,0,7
chr19	54677759	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,9,9
chr19	54687334	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=68,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:0,4:3,6:2,1,7,3
chr19	54691225	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr19	54691979	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,2:6,3:12,1,4,1
chr19	54694334	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.585:34:6,11:8,9:2,12,2,18
chr19	54695163	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,19:0,3:0,0,18,4
chr19	54705317	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,15,11
chr19	54705340	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,18:0,0,19,19
chr19	54711258	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,18,11
chr19	54711525	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=210,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:54711525_G_GT:54711525:0,3,0,2
chr19	54711526	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=210,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:54711525_G_GT:54711525:0,3,0,2
chr19	54711528	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=210,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:54711525_G_GT:54711525:0,3,0,2
chr19	54721380	.	G	GGCTAGTTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,162;MMQ=40,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr19	54722905	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:11,0,2,0
chr19	54723738	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,14,14
chr19	54723813	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=113,157;MMQ=57,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,0:0,4:0|1:54723813_G_C:54723813:1,0,0,4
chr19	54723822	.	GT	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=113,157;MMQ=57,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,3:0|1:54723813_G_C:54723813:1,0,0,4
chr19	54723829	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=113,148;MMQ=57,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54723813_G_C:54723813:1,0,0,1
chr19	54723891	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=250,113;MMQ=40,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:54723891_C_CCG:54723891:0,1,0,1
chr19	54723893	.	CACT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=250,113;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54723891_C_CCG:54723891:0,1,0,1
chr19	54723898	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=250,113;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54723891_C_CCG:54723891:0,1,0,1
chr19	54725995	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,52;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	54726023	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	54726083	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=217,200;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	54726816	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=28,23;MFRL=128,123;MMQ=33,48;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,4:9,3,6,4
chr19	54726833	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=125,109;MMQ=27,39;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.222:34:13,6:12,1:0|1:54726833_T_C:54726833:20,7,4,3
chr19	54726839	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=117,109;MMQ=27,43;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:15,7:13,1:0|1:54726833_T_C:54726833:20,9,5,3
chr19	54726843	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=117,109;MMQ=27,43;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:16,7:14,1:0|1:54726833_T_C:54726833:20,10,5,3
chr19	54726861	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=115,109;MMQ=27,48;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,13:0.269:50:19,10:16,3:22,15,7,6
chr19	54726870	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=20,25;MFRL=106,125;MMQ=50,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:19,4:12,7:14,17,8,3
chr19	54726872	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=115,108;MMQ=27,48;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.333:40:13,10:13,3:14,13,6,7
chr19	54743057	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:5,1:6,3:0,11,1,4
chr19	54743747	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=120,182;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,2:10,1:15,9,0,3
chr19	54743758	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=186,108;MMQ=34,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:6,6:4,9:4,6,8,7
chr19	54743865	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	54744654	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,161;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:6,2:2,0:9,0,3,0
chr19	54745845	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=169,143;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:2,2:4,5:6,1,7,0
chr19	54746528	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,99;MMQ=39,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,32:0.485:66:20,13:14,19:20,14,16,16
chr19	54754699	.	C	CATTTATTTGTCCTCAATCCCACAGCTTGCCTATTCTG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=92,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.118:34:16,3:14,0:15,16,2,1
chr19	54754752	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,36;MFRL=119,152;MMQ=51,34;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:10,2:8,11,0,2
chr19	54754820	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=133,213;MMQ=39,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr19	54754865	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=183,211;MMQ=56,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:4,3,3,0
chr19	54755860	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=175,167;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:2,1,4,4
chr19	54755994	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:1,2:7,3:2,6,2,4
chr19	54756155	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr19	54756302	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=94.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,19:0,0,14,16
chr19	54756657	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=101,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:3,1,4,0
chr19	54756688	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=115,129;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.250:21:11,4:5,0:13,3,5,0
chr19	54759102	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,178;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,0:2,4:0|1:54759102_G_A:54759102:4,3,4,0
chr19	54759110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=159,178;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,0:2,4:0|1:54759102_G_A:54759102:5,2,4,0
chr19	54759361	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=95,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:6,8:8,6:6,8,10,4
chr19	54760691	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=183,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr19	54760926	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:3,0:12,3:10,5,2,1
chr19	54778694	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,120;MMQ=40,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:2,3,4,2
chr19	54781465	.	AC	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=129,121;MMQ=48,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.305:10:2,1:4,2:3,3,1,3
chr19	54781509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=136,135;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	54781843	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,109;MMQ=55,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:9,6,1,2
chr19	54782407	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:7,2:6,6:0|1:54782407_C_T:54782407:8,6,3,5
chr19	54782420	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:7,2:7,3:0|1:54782407_C_T:54782407:8,6,2,4
chr19	54782565	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:54782565_TG_T:54782565:0,0,2,1
chr19	54782589	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=84,152;MMQ=52,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:54782565_TG_T:54782565:1,1,2,0
chr19	54783923	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr19	54802937	.	C	CAGAGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,115;MMQ=49,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr19	54818721	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,7:3,2:5,3,6,3
chr19	54822930	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:12,0:6,4:7,11,2,2
chr19	54823533	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,6:5,2:4,3,3,5
chr19	54824177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr19	54824214	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,102;MMQ=56,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:6,3:1,0:4,3,1,2
chr19	54848090	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,4,2
chr19	54849116	.	T	TGGCTGCATCTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr19	54867684	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=237,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54867684_A_AC:54867684:0,3,0,1
chr19	54867690	.	A	ACATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=237,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54867684_A_AC:54867684:0,3,0,1
chr19	54927999	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:2,4,1,2
chr19	54937593	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54937781	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=82,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,1:7,2:11,7,3,0
chr19	54938020	.	C	CCTATTCAACATAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	54947062	.	TGCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCGGGGGGTCCTGAACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGAGCTGAGGGCCTGGCC	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=15,24;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.297:25:2,3:1,11:0|1:54947062_TGCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCGGGGGGTCCTGAACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGAGCTGAGGGCCTGGCC_T:54947062:3,8,4,10
chr19	54947134	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=94,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.624:3:1,1:0,1:1|0:54947062_TGCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCGGGGGGTCCTGAACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGAGCTGAGGGCCTGGCC_T:54947062:0,1,1,1
chr19	54947321	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,2:7,3:8,8,1,4
chr19	54962467	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,19,6
chr19	54962579	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:3,9:9,3:9,3,7,6
chr19	54963813	.	CCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=74,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.670:19:2,8:4,5:3,3,9,4
chr19	54964019	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr19	54965527	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	54965889	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	54966174	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:14,0:11,4:10,15,2,2
chr19	54966557	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.409:25:10,2:5,8:7,8,7,3
chr19	54966579	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,17,15
chr19	54966590	.	C	CCTCTT	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,2:13,0:0|1:54966590_C_CCTCTT:54966590:14,12,1,1
chr19	54966593	.	A	AAGT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=142,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,2:14,0:0|1:54966590_C_CCTCTT:54966590:14,13,1,1
chr19	54966834	.	G	GGCCGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	54967803	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:3,2,3,0
chr19	54969039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:2,8,4,0
chr19	54969643	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:6,15,1,1
chr19	54969794	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.085:38:10,0:14,2:0|1:54969794_A_C:54969794:16,19,3,0
chr19	54969801	.	AA	CC	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.084:44:14,0:21,0:0|1:54969794_A_C:54969794:16,25,3,0
chr19	54971897	.	C	CCGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:54971897_C_CCGG:54971897:0,3,2,0
chr19	54971898	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,0;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:54971897_C_CCGG:54971897:0,3,2,0
chr19	54972727	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:7,6:9,6:11,6,9,3
chr19	54972918	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=86,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,41:0.424:97:22,21:34,19:30,26,13,28
chr19	54973988	.	GCCT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,6:4,5:4,3,6,5
chr19	54974184	.	T	TGGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:1,4,1,1
chr19	54974234	.	A	ACTCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=132,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54974234_A_ACTCAG:54974234:1,0,0,1
chr19	54974237	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=132,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:54974234_A_ACTCAG:54974234:1,0,0,1
chr19	55044228	.	TTC	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.506:32:10,8:5,8:12,4,12,4
chr19	55044241	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,31,20;MFRL=145,115,120;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=T;STR;TLOD=9.02,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,4:0.240,0.258:15:6,2,1:0,3,1:5,1,6,3
chr19	55044912	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:0,0:4,2:5,0,2,0
chr19	55046957	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,136;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:5,10,3,0
chr19	55048213	.	T	TCACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=162,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr19	55048270	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=98,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,3:8,3:3,12,2,4
chr19	55049066	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=112,167;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:0,0:2,2:0|1:55049066_G_A:55049066:4,0,3,0
chr19	55049070	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=112,167;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:0,0:2,0:0|1:55049066_G_A:55049066:4,0,3,0
chr19	55049088	.	A	AAAAGAAAGAAAG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=128,128;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=AAAG;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:3,3:9,4:6,7,8,3
chr19	55054727	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,1:0|1:55054727_T_A:55054727:9,9,1,1
chr19	55054734	.	T	TCCACTATGTAGTCCCAGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:55054727_T_A:55054727:8,12,1,1
chr19	55054831	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=89,73;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,3:6,0:3,9,0,3
chr19	55054896	.	G	GGTCTCGAACTCCTGGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=162,136;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55054896_G_GGTCTCGAACTCCTGGCCTC:55054896:0,1,0,1
chr19	55054898	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=162,136;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55054896_G_GGTCTCGAACTCCTGGCCTC:55054896:0,1,0,1
chr19	55142439	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:0|1:55142439_C_T:55142439:6,9,1,1
chr19	55142447	.	C	CATTCACTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,2:3,0:0|1:55142439_C_T:55142439:6,9,1,1
chr19	55142623	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr19	55142861	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr19	55142930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr19	55143083	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,5:0,0,8,7
chr19	55143156	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=90,133;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:2,5:6,5:4,4,9,2
chr19	55146147	.	GCTC	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,128;MMQ=33,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTC;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:7,2:9,2:9,10,2,2
chr19	55147040	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=135,84;MMQ=60,31;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:55147040_G_A:55147040:13,6,0,2
chr19	55147043	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=135,84;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:0|1:55147040_G_A:55147040:13,6,0,2
chr19	55174928	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=90,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.066:71:21,2:44,1:0|1:55174928_G_A:55174928:6,61,0,4
chr19	55174957	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,40:0.570:70:12,12:17,27:0|1:55174928_G_A:55174928:5,25,4,36
chr19	55176535	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:3,3,3,0
chr19	55176584	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,1:6,6:3,9,4,3
chr19	55178035	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	55178137	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:7,9,1,1
chr19	55178303	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,161;MMQ=40,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,1,5
chr19	55237870	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55239223	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,2:5,2:6,6,2,2
chr19	55239342	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,6:2,3:0,3,8,1
chr19	55240902	.	GAGGAGAGCTGTGACAACGAAGAACCTCCCTGAGGAAACCACCTCTTCTCCTTCCAGGTCTATATGGGAAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCAGGC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=164,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:1,2:1,0:13,4,1,1
chr19	55240919	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	55240951	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=167,208;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr19	55246897	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	55246909	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:55246909_G_A:55246909:0,0,0,2
chr19	55246911	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:55246909_G_A:55246909:0,0,0,2
chr19	55247306	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,166;MMQ=44,51;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,2,3
chr19	55253593	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:0|1:55253593_G_A:55253593:11,9,1,1
chr19	55253601	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:55253593_G_A:55253593:9,10,1,1
chr19	55263802	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,195;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,4,3
chr19	55263947	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=119,7424;MMQ=59,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:23,4:19,0:19,23,0,4
chr19	55282183	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=191,94;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr19	55282351	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,158;MMQ=41,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,3:3,7:1,8,4,6
chr19	55284824	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=84,164;MMQ=60,40;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr19	55284858	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=102,172;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr19	55285144	.	A	AACACAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=215,155;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:55285144_A_AACACAG:55285144:1,2,0,1
chr19	55285145	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=215,155;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:55285144_A_AACACAG:55285144:1,2,0,1
chr19	55294484	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	55301595	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:4,6:10,4:7,7,5,5
chr19	55301617	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:2,8:10,5:6,6,6,7
chr19	55315307	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=126.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,26:0,15:0,0,22,20
chr19	55315440	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=98,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:1,2:0,3:1,0,1,4
chr19	55320200	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=63.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,15:0,2:0,0,17,0
chr19	55320239	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=329,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,6:1,6:1,0,6,6
chr19	55320279	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=329,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:0,11:1,10:1,0,13,9
chr19	55324566	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,12,9
chr19	55324635	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,5,15
chr19	55324674	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,4,6
chr19	55325240	.	GA	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr19	55327930	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0|1:55327930_A_G:55327930:0,0,11,0
chr19	55327960	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0|1:55327930_A_G:55327930:0,0,10,4
chr19	55328084	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr19	55329724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=158,115;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr19	55329783	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,10,7
chr19	55333096	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr19	55333347	.	GATCCTAAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0|1:55333347_GATCCTAAAT_G:55333347:0,0,0,1
chr19	55333358	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55333347_GATCCTAAAT_G:55333347:0,0,0,1
chr19	55333361	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55333347_GATCCTAAAT_G:55333347:0,0,0,1
chr19	55341590	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=104,123;MMQ=45,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:6,1:6,5:6,7,4,2
chr19	55341641	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=137,109;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:6,2:14,6:11,9,4,4
chr19	55346409	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:55346409_T_A:55346409:0,0,6,0
chr19	55346424	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:55346409_T_A:55346409:0,0,7,1
chr19	55348957	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,2:0,2:0,0,5,1
chr19	55348975	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=131,182;MMQ=50,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,1,0
chr19	55359272	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr19	55362719	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=270,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:1,0,5,8
chr19	55367368	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=100,87;MMQ=60,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:55367368_G_A:55367368:3,10,0,2
chr19	55367376	.	A	ACCAAAACTTAAAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=100,87;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:55367368_G_A:55367368:3,10,0,2
chr19	55385820	.	GAAATCCCA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,2:15,0:10,20,0,2
chr19	55386890	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	55396613	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	55396750	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:23,4:4,0:13,15,4,0
chr19	55399311	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	55438873	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	55438940	.	AAAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.657:13:1,4:3,5:2,2,5,4
chr19	55439166	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=94,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:1,1:2,2,3,4
chr19	55439197	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=73,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr19	55445775	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=122,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	55447572	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:3,2,3,3
chr19	55447724	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,71;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:7,10,2,1
chr19	55451797	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=69,69;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,4:1,3:4,3,2,5
chr19	55452194	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr19	55453134	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=98,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr19	55481669	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:2,2:10,0:5,7,1,2
chr19	55493651	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:7,2:2,4:5,5,3,3
chr19	55493952	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:5,13,0,2
chr19	55494157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=157,102;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,3:4,1,1,4
chr19	55494188	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=150,152;MMQ=34,27;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:2,2,2,1
chr19	55494632	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:4,10:1,0:0|1:55494632_A_G:55494632:3,2,8,2
chr19	55494651	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,7:0.380:19:10,6:2,1:1|0:55494632_A_G:55494632:9,3,4,3
chr19	55494927	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:8,4:13,0:13,9,4,0
chr19	55495131	.	T	TCAAAACAAAAACAAACAAAGAGCCCAACAAGAGGGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.465:4:0,0:1,1:0,3,0,1
chr19	55497506	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,5:5,4:4,3,5,4
chr19	55501316	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,2:2,5:3,0,8,0
chr19	55501348	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33,30;MFRL=154,110,92;MMQ=60,49,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.40,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,6:0.172,0.577:10:2,1,2:0,1,1:2,0,4,4
chr19	55501579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,2:4,3:1,9,1,4
chr19	55501834	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr19	55501865	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=56,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr19	55501866	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr19	55505718	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:17,4:12,0:18,13,4,0
chr19	55508950	.	TA	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=265,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr19	55512316	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=237,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	55525628	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=170,185;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr19	55525638	.	ATTTTTGTGTT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=170,184;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr19	55525894	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,3,12
chr19	55526345	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr19	55526932	.	TTACTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,0:1,4:3,1,5,0
chr19	55527189	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,762;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	55529933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:55529933_A_G:55529933:0,0,5,2
chr19	55529936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0|1:55529933_A_G:55529933:2,1,3,1
chr19	55530035	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr19	55558784	.	T	TTGTGCTGGGACATATAGAAGCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=101,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr19	55559733	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=187,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:0|1:55559733_C_T:55559733:10,7,2,1
chr19	55559740	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0|1:55559733_C_T:55559733:0,0,9,8
chr19	55574412	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	55587884	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:0,6,0,5
chr19	55589384	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,1,2
chr19	55589544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=110,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr19	55591277	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=174,307;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr19	55592070	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.516:17:3,7:5,0:5,3,6,3
chr19	55594023	.	C	CAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55595091	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,271;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr19	55597369	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:4,5,4,2
chr19	55603388	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	55605694	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=85,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:2,2:2,2:3,2,1,3
chr19	55614760	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,7:7,9:7,3,10,6
chr19	55624062	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=159,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:11,6,2,1
chr19	55645128	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:1,8:17,0:17,1,8,0
chr19	55645386	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:1,2,0,1
chr19	55648430	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55648430_A_C:55648430:0,0,1,0
chr19	55648439	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:55648430_A_C:55648430:0,1,1,0
chr19	55648442	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:55648430_A_C:55648430:0,1,1,0
chr19	55648443	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,11;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:55648430_A_C:55648430:0,1,1,0
chr19	55648446	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55648430_A_C:55648430:0,1,1,0
chr19	55648452	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=21,16;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:0,0:2,0:0|1:55648430_A_C:55648430:2,1,1,0
chr19	55649270	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:55649270_T_TGG:55649270:1,1,2,0
chr19	55649276	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:0|1:55649270_T_TGG:55649270:1,1,2,0
chr19	55652153	.	ATAATAATAG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=218,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:0,0:4,0,1,1
chr19	55652162	.	GTAA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=58,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TAA;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.472:3:2,1:0,0:1,1,1,0
chr19	55656855	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=93,45;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:8,4:8,0:10,7,4,0
chr19	55658088	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=73,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,7:2,2:3,2,4,5
chr19	55665584	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr19	55668722	.	C	CCTGT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGT;STR;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:1,0,2,6
chr19	55668805	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr19	55668819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr19	55668848	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr19	55670825	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,5:6,2:6,3,2,5
chr19	55671374	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:5,2,4,1
chr19	55672569	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:2,4,2,3
chr19	55672784	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:3,2:1,2:5,1,1,3
chr19	55676916	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=309,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	55677523	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr19	55693081	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr19	55697101	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:1,4:5,2:3,4,3,3
chr19	55703038	.	TCA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=110,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:6,9,1,1
chr19	55708521	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=113,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:5,1:8,1:4,9,0,2
chr19	55708557	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,9:0,24:0,0,21,12
chr19	55710074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,0,3
chr19	55711682	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,2:8,2:11,7,2,2
chr19	55713535	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=91,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.318:35:16,9:8,1:13,11,3,8
chr19	55738571	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,6:3,4:3,2,7,3
chr19	55738634	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,3:3,8:6,4,7,4
chr19	55739813	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr19	55741961	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,8,15
chr19	55748122	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=116,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,2:11,0:0|1:55748122_T_C:55748122:11,9,1,1
chr19	55748127	.	C	CCTTCCTTTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=116,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:12,0:0|1:55748122_T_C:55748122:12,9,1,1
chr19	55751123	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	55751542	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:1,1:1,0:3,0,3,0
chr19	55756593	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:2,0:0|1:55756593_C_G:55756593:1,3,1,0
chr19	55756598	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:2,1:0|1:55756593_C_G:55756593:1,3,1,0
chr19	55756606	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:55756593_C_G:55756593:1,3,1,0
chr19	55776823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	55785916	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:5,8,2,1
chr19	55795860	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=164,158;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:0,0:0|1:55795860_T_A:55795860:0,3,1,0
chr19	55795866	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=152,158;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:55795860_T_A:55795860:0,4,1,0
chr19	55800789	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:4,4:0,0:4,0,3,1
chr19	55801018	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:55801018_G_GA:55801018:0,5,1,1
chr19	55801019	.	C	CACATCAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:55801018_G_GA:55801018:0,5,1,1
chr19	55814318	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr19	55814764	.	CGGAATGATGTTGGTGAGAAGGCAGGGCTAGGGGACCAGACACCTGGGTCTCGAGATTGGAAGAGGCTGGCCACGGGGACCCCAGATTCCCAA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,0:8,2:11,16,1,1
chr19	55814962	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=227,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	55815386	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26,28;MFRL=83,147,176;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=4.18,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:0,0,1:2,2,1:2,0,4,0
chr19	55815894	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=99,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,6:0,1:3,1,4,3
chr19	55817614	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=157,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:4,5:2,5:6,1,7,3
chr19	55823442	.	C	CCTTCTTCACAGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr19	55828348	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=100,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.474:38:10,0:10,18:11,9,0,18
chr19	55854079	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:0,0:0,2:0|1:55854079_G_C:55854079:1,0,2,0
chr19	55854082	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=123,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,0:0|1:55854079_G_C:55854079:2,1,2,0
chr19	55854085	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=114,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:55854079_G_C:55854079:3,1,2,0
chr19	55856211	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,2:7,5:4,7,2,5
chr19	55865350	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55866661	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=106,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:3,0:7,2:0|1:55866661_A_C:55866661:7,4,1,1
chr19	55866666	.	G	GCTACAAGGGAGATTACCTGGGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:55866661_A_C:55866661:8,5,1,1
chr19	55869419	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.319:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr19	55869601	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=105,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:2,1,4,4
chr19	55871019	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,5,12
chr19	55872191	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.492:41:12,9:7,11:7,14,10,10
chr19	55879872	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,4:5,4,5,4
chr19	55881787	.	C	CCTGCTGCTCAGGGCACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr19	55888156	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.452:24:4,5:9,4:9,4,6,5
chr19	55888261	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=161.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,57:0.770:73:5,0:11,49:11,5,0,57
chr19	55888989	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:8,0:6,6:11,3,0,6
chr19	55897817	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:7,9:10,5:4,13,10,5
chr19	55903158	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr19	55915859	.	G	GTTGATGATAAAGGAAA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:20,2:21,0:21,21,0,2
chr19	55915882	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,5:4,13,1,8
chr19	55951923	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,2:3,0:7,5,1,1
chr19	55966933	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,0,1
chr19	55993260	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	55993907	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:55993907_TGC_T:55993907:2,0,1,0
chr19	55993919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:55993907_TGC_T:55993907:3,0,1,0
chr19	55993978	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,17;MFRL=218,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:0|1:55993978_T_A:55993978:3,0,1,1
chr19	55993984	.	AC	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=200,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55993978_T_A:55993978:2,0,0,1
chr19	56000429	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=33,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.677:7:0,5:1,0:0,2,0,5
chr19	56000878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56000878_G_A:56000878:0,0,0,1
chr19	56000896	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56000878_G_A:56000878:0,0,0,1
chr19	56024563	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,8,7
chr19	56024599	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr19	56029465	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,52;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,33:0,28:0,0,20,54
chr19	56029469	.	CATCCCACCACGACCCCTCACCCCACCACGACTCCTCACCCCACCACAACCCCTCACCCCACCACAACCCCTCACCCCACCATGACTCCTGACCCCACCACGACCCCTTACCCCACCACTACTCCTG	C	.	.	DP=103;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=114,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,29:0.085:103:27,10:10,15:11,63,15,14
chr19	56030411	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr19	56041128	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=110,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:4,6,1,1
chr19	56041255	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr19	56041557	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr19	56089353	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,8,9
chr19	56090259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:2,6,0,2
chr19	56104136	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr19	56133958	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:4,8,2,4
chr19	56134038	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr19	56154518	.	GTTT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.564:30:7,5:4,12:4,9,5,12
chr19	56156815	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.150:61:32,8:20,0:32,20,9,0
chr19	56160566	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:9,7:4,8:5,8,8,7
chr19	56162776	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=66,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,28:0.330:85:16,12:41,15:44,13,18,10
chr19	56163940	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.265:32:15,1:8,7:9,15,4,4
chr19	56164200	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:3,2:2,0:0|1:56164200_C_G:56164200:0,5,0,2
chr19	56164201	.	C	CTGGACTCTGCTACACTCAAAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:56164200_C_G:56164200:0,5,0,2
chr19	56164203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:56164200_C_G:56164200:0,4,0,2
chr19	56170800	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=232,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56170800_C_G:56170800:0,2,0,1
chr19	56170802	.	GGGTCCGGGCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=232,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56170800_C_G:56170800:0,2,0,1
chr19	56170803	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=345,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	56175149	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:2,5:11,5:2,11,4,7
chr19	56179974	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.177:29:6,1:14,0:6,18,5,0
chr19	56180402	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=101,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:56180402_A_G:56180402:0,1,2,0
chr19	56180407	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=101,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,1:1,0:0|1:56180402_A_G:56180402:0,1,2,0
chr19	56180968	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:5,12:9,9:8,6,10,11
chr19	56181111	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:1,9,0,2
chr19	56185250	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,7:5,2:7,2,6,3
chr19	56188644	.	G	GCCGGCAAGGGCCCAACA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.138:19:7,2:10,0:0|1:56188644_G_GCCGGCAAGGGCCCAACA:56188644:3,14,1,1
chr19	56188646	.	T	TTAGCAATTGTCAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,1:10,0:0|1:56188644_G_GCCGGCAAGGGCCCAACA:56188644:3,14,1,1
chr19	56188985	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:8,7:5,8:5,8,12,3
chr19	56197061	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=224,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	56201136	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr19	56206136	.	GGG	ACA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,1,1
chr19	56206137	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=215,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,1:2,3:5,1,2,2
chr19	56220485	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=80,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr19	56249445	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=50,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.863:12:0,5:1,6:1,0,8,3
chr19	56273868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,169;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:4,0,5,0
chr19	56273902	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=135,160;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.563:12:4,7:1,0:5,0,7,0
chr19	56273904	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,160;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,7:1,0:5,0,7,0
chr19	56274460	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,86;MMQ=27,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,2,1
chr19	56297249	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.583:20:6,2:2,9:2,6,3,9
chr19	56307553	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:1,1:7,4:4,4,2,3
chr19	56307583	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,7,5
chr19	56307679	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	56313133	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr19	56313160	.	A	ATGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:56313160_A_ATGAG:56313160:0,4,0,1
chr19	56313162	.	A	ATGGAATGTTTTTTCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:56313160_A_ATGAG:56313160:0,4,0,1
chr19	56320542	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:56320542_A_C:56320542:7,8,1,1
chr19	56320547	.	C	CTATACCTCTATGAGA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:56320542_A_C:56320542:7,8,1,1
chr19	56321295	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:2,2:6,3:5,3,4,1
chr19	56321414	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr19	56329629	.	T	TATGAAGTGGCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	56363725	.	AGGTGAGGGAGTCTGGGAAGGGGGAAGCCTTCTTATAATGAGGACTATGTCCTAATTTT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.108:32:4,2:10,2:11,15,4,2
chr19	56382391	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=172,88;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:22,0:2,4:5,20,1,3
chr19	56382456	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,5:0,0:0,4,0,5
chr19	56392832	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,4:9,0:11,2,4,0
chr19	56410340	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.872:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	56413583	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr19	56419263	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,3,2
chr19	56419333	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=122,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:9,6,1,2
chr19	56419358	.	GG	CA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=135,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:56419358_GG_CA:56419358:4,3,1,1
chr19	56419364	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:56419358_GG_CA:56419358:4,4,1,1
chr19	56419366	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:56419358_GG_CA:56419358:4,4,1,1
chr19	56419368	.	G	GCTACACCACAT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=146,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:56419358_GG_CA:56419358:3,4,1,1
chr19	56423897	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:14,0:19,6:17,17,0,6
chr19	56464058	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	56467229	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:12,8,1,1
chr19	56467245	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:7,0:0|1:56467245_G_C:56467245:12,8,1,1
chr19	56467247	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:56467245_G_C:56467245:11,8,1,1
chr19	56467248	.	G	GCTAACCTGGTGTC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:56467245_G_C:56467245:11,8,1,1
chr19	56477687	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr19	56477710	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=68,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.883:19:0,8:1,9:1,1,10,7
chr19	56487430	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0|1:56487430_G_A:56487430:0,0,11,0
chr19	56487450	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.959:21:0,16:0,5:0|1:56487430_G_A:56487430:0,0,16,5
chr19	56487696	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=187,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	56487721	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	56490778	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr19	56499337	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:56499337_C_T:56499337:0,0,0,3
chr19	56499345	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:56499337_C_T:56499337:0,0,0,3
chr19	56520299	.	C	CCCTTTAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	56520308	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	56538203	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr19	56538215	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,167;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:10,2,2,0
chr19	56552230	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	56552339	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:5,1:4,2,0,2
chr19	56561749	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	56564929	.	ATGC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=117,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:56564929_ATGC_A:56564929:2,1,1,0
chr19	56564949	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0|1:56564929_ATGC_A:56564929:2,2,1,1
chr19	56565233	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,2:4,5:0,10,1,6
chr19	56572832	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,3:8,9:6,8,8,4
chr19	56599405	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	56600270	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:7,7,2,0
chr19	56691835	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	56691912	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr19	56693620	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,1,3
chr19	56693643	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr19	56694611	.	CC	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=93,78;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:11,0:5,8:11,6,2,6
chr19	56702316	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=123,108;MMQ=56,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.391:39:11,0:11,14:11,13,0,15
chr19	56733220	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=159,60;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:56733220_G_T:56733220:5,4,1,1
chr19	56733222	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=159,60;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:56733220_G_T:56733220:5,4,1,1
chr19	56733225	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,60;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:56733220_G_T:56733220:5,4,1,1
chr19	56735015	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,91;MMQ=60,51;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,6:6,1:8,5,6,1
chr19	56901293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	56918560	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=68,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr19	56918574	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=68,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	56918598	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	56925629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,292;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:4,0,0,1
chr19	56934866	.	ATGCACACCTGGCCCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTATCAGTGTAAAGAATGTAAAAAAGCCTTCAGCCAGAT	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=111,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.051:78:17,3:12,0:40,35,2,1
chr19	56935050	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:7,0:7,9,1,1
chr19	56935649	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,350;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:11,12,0,2
chr19	56954066	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:56954066_AT_A:56954066:0,3,0,2
chr19	56954069	.	GATT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:56954066_AT_A:56954066:0,3,0,2
chr19	56954156	.	A	AAAGGAAGGCTCATGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56954156_A_AAAGGAAGGCTCATGAT:56954156:0,1,0,1
chr19	56954163	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56954156_A_AAAGGAAGGCTCATGAT:56954156:0,1,0,1
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chr19	57066843	.	ATTAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=261,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	57089050	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	57089087	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	57089375	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=108,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,5:4,1:8,2,3,3
chr19	57133381	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=182,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,2:6,0:7,3,1,1
chr19	57133885	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:9,4:4,0:4,9,2,2
chr19	57134745	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:8,11,3,0
chr19	57135011	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=130,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:10,13,1,1
chr19	57135165	.	CTTGA	C	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.170:39:21,4:12,2:0|1:57135165_CTTGA_C:57135165:16,17,3,3
chr19	57135177	.	CTT	GCG	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=107,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:16,2:12,0:0|1:57135165_CTTGA_C:57135165:13,17,3,3
chr19	57135182	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,1:12,0:0|1:57135165_CTTGA_C:57135165:13,15,1,1
chr19	57135195	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=34,21;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,16:1,15:0,1,14,18
chr19	57135589	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:57135589_C_T:57135589:2,3,1,1
chr19	57135591	.	A	AGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:57135589_C_T:57135589:2,3,1,1
chr19	57135593	.	TCG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:57135589_C_T:57135589:2,3,1,1
chr19	57184136	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	57184185	.	C	CACCTGGGTTGAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=183,50;MMQ=50,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr19	57184376	.	TTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=199,178;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57184376_TTTG_T:57184376:0,1,0,1
chr19	57184381	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=199,178;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57184376_TTTG_T:57184376:0,1,0,1
chr19	57184386	.	CTGA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=212,178;MMQ=30,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:57184376_TTTG_T:57184376:0,2,0,1
chr19	57286560	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:19,5,2,0
chr19	57290733	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=79,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,4:5,6:4,3,6,4
chr19	57325083	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.747:18:1,4:3,8:1,3,3,11
chr19	57326512	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,0:0,2:3,0,1,1
chr19	57326961	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,6:2,0:3,7,5,1
chr19	57640238	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=79,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:2,2:0,3,3,2
chr19	57642718	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=136,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:3,2,0,5
chr19	57643099	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=70,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:3,3,2,0
chr19	57646570	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:8,10:4,4:4,8,6,8
chr19	57647015	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,5:1,4:3,3,3,6
chr19	57647553	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=174,32;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:57647553_A_C:57647553:0,4,1,1
chr19	57647559	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=174,32;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:57647553_A_C:57647553:0,4,1,1
chr19	57647561	.	T	TCAGCCCTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=174,32;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:57647553_A_C:57647553:0,4,1,1
chr19	57648433	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:3,4,1,2
chr19	57654065	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=73,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,4:5,0:4,6,1,3
chr19	57654104	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr19	57665750	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=118,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,3:1,4:2,2,3,4
chr19	57665950	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=165,138;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57665950_T_TG:57665950:0,3,0,1
chr19	57665955	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=165,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57665950_T_TG:57665950:0,3,0,1
chr19	57665963	.	AC	GC,GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33,32;MFRL=204,167,138;MMQ=50,36,40;MPOS=34,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,0,0:0,1,1:0,2,0,2
chr19	57672254	.	CCC	TGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=127,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57672254_CCC_TGT:57672254:0,1,0,1
chr19	57672261	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57672254_CCC_TGT:57672254:0,0,0,1
chr19	57672263	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57672254_CCC_TGT:57672254:0,0,0,1
chr19	57703305	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=128,114;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:7,3,2,0
chr19	57703369	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:1,5:2,3:0,4,3,5
chr19	57723007	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:0|1:57723007_G_C:57723007:4,2,1,8
chr19	57723013	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:5,6:2,3:0|1:57723007_G_C:57723007:4,3,2,7
chr19	57742472	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr19	57742489	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,2:0,11:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,6,9
chr19	57742493	.	AGGACGAGCAGGATT	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,6,9
chr19	57742514	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,1:7,4:2,6,0,5
chr19	57743039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr19	57743067	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=96,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:6,4:9,6:11,4,5,5
chr19	57743334	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:3,0,3,2
chr19	57752326	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:15,14:5,8:12,9,6,16
chr19	57752388	.	AG	TT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=141,219;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:10,0:3,18:0,13,0,19
chr19	57755315	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=107,175;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:18,5:12,0:20,10,5,0
chr19	57755508	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr19	57759960	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,133;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:4,2,5,3
chr19	57760057	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,137;MMQ=54,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,3,2
chr19	57766152	.	A	ATCCCCTTCCCACTCTTCCCCCCAAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:6,1:12,1:0|1:57766152_A_ATCCCCTTCCCACTCTTCCCCCCAAG:57766152:9,10,0,2
chr19	57766157	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,1:13,1:0|1:57766152_A_ATCCCCTTCCCACTCTTCCCCCCAAG:57766152:10,11,0,2
chr19	57769066	.	CTT	C,CTTTT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,114,86;MMQ=60,60,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,23,27;RU=T;STR;TLOD=3.14,4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.287,0.568:6:0,2,3:0,1,0:0,0,6,0
chr19	57769155	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=160,168;MMQ=59,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr19	57769362	.	AA	CG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57769362_AA_CG:57769362:0,0,0,1
chr19	57769365	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57769362_AA_CG:57769362:0,0,0,1
chr19	57769805	.	G	GTTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,3:2,2:1,3,3,3
chr19	57769896	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,1,3
chr19	57769994	.	C	CTTCCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:4,3:2,5:2,4,4,5
chr19	57771134	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,111;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.230:12:2,2:6,0:10,0,2,0
chr19	57771545	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=97,71;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:4,4:13,0:11,6,3,1
chr19	57772703	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,7:0.138:50:12,0:16,0:25,18,0,7
chr19	57773718	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:0,1:1,1:1,1,2,2
chr19	57774102	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=51,85;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.793:17:1,6:2,8:2,1,5,9
chr19	57795968	.	GG	AA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:20,2:16,0:16,21,1,1
chr19	57802989	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:1,0:11,4:7,5,0,4
chr19	57832089	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	57832257	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:9,5:1,6:6,5,6,5
chr19	57834963	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	57835252	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	57837926	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	57838018	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr19	57865082	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=62,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.491:39:13,17:6,2:10,10,14,5
chr19	57867517	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:3,10:8,5:4,7,6,9
chr19	57868456	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=103,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:9,0:0|1:57868456_A_G:57868456:6,9,1,1
chr19	57868459	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=103,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,2:11,0:0|1:57868456_A_G:57868456:6,9,1,1
chr19	57869193	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:7,6,2,0
chr19	57879990	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:57879990_T_C:57879990:6,11,1,1
chr19	57879996	.	G	GCTTAAACATGCAATATTTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:57879990_T_C:57879990:6,11,1,1
chr19	57883371	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr19	57901422	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=225,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,3:3,1:2,3,3,1
chr19	57901548	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr19	57909872	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr19	57922664	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,10:0,2:0,0,10,2
chr19	57929213	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,45;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:7,1:5,2:9,6,3,1
chr19	57931553	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.603:30:5,12:5,6:9,3,10,8
chr19	57954628	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:3,0,2,2
chr19	57956828	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=68,135;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,4:5,1:4,5,1,4
chr19	57985160	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:7,3,1,1
chr19	57987967	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,1:8,0,0,3
chr19	57988064	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=80,293;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.259:24:12,5:6,0:10,8,0,6
chr19	57999298	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,43;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:16,2:0|1:57999298_C_T:57999298:14,14,1,1
chr19	57999306	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=100,43;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:0|1:57999298_C_T:57999298:15,15,1,1
chr19	58001512	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,1:4,4:5,3,4,3
chr19	58002819	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=0,106;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:4,3,1,3
chr19	58003580	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=99,130;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:3,8:4,5:5,2,8,6
chr19	58003613	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:1,4,0,5
chr19	58004158	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	58005094	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,63;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:58005094_A_G:58005094:8,9,1,1
chr19	58005106	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=106,63;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:0|1:58005094_A_G:58005094:11,10,1,1
chr19	58005536	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=248,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr19	58011421	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=182,186;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr19	58011440	.	C	CTGCCACATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58011440_C_CTGCCACATG:58011440:3,0,0,1
chr19	58011442	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58011440_C_CTGCCACATG:58011440:3,0,0,1
chr19	58011443	.	G	GTGCCTTTCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58011440_C_CTGCCACATG:58011440:3,0,0,1
chr19	58015981	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=136,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,2:4,6:5,1,4,4
chr19	58016237	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58016237_A_ACT:58016237:0,0,0,1
chr19	58016238	.	A	AAGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:58016237_A_ACT:58016237:0,0,0,1
chr19	58017660	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:4,0,1,0
chr19	58017753	.	CA	AG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,4:5,3,3,3
chr19	58017758	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,5:6,3,4,4
chr19	58018618	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,129;MMQ=60,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,5:9,5:6,8,6,4
chr19	58024328	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,86;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr19	58058246	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	58058329	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,6:6,6:7,4,6,6
chr19	58058536	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:8,0:0,10:6,3,4,6
chr19	58058870	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:6,10,1,2
chr19	58059059	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,0:9,3:10,9,0,3
chr19	58096316	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=96,45;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:58096316_A_T:58096316:10,13,1,1
chr19	58096321	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=92,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:58096316_A_T:58096316:8,14,1,1
chr19	58096322	.	T	TGCGGGTACTTC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:58096316_A_T:58096316:8,14,1,1
chr19	58115852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=239,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr19	58118341	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=123,136;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.108:39:15,0:18,3:16,19,1,3
chr19	58118377	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=142,72;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:10,0:17,4:17,12,1,3
chr19	58118726	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58118726_T_A:58118726:0,1,0,1
chr19	58118731	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58118726_T_A:58118726:0,1,0,1
chr19	58118740	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58118726_T_A:58118726:0,0,0,1
chr19	58118742	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58118726_T_A:58118726:0,0,0,1
chr19	58153422	.	GCCTCATTCAACACCGCAGAGTTCACACGGGAAAAAGGCCTTATCAGTGCAGTCAATGTGGGAAATCCTTTGGCTGCAAATCTGT	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,14:0.088:52:10,6:10,7:18,20,7,7
chr19	58153457	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=126,64;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.168:21:10,3:8,0:9,9,3,0
chr19	58187825	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:11,10,1,1
chr19	58187876	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=100,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:6,0:15,2:9,13,0,2
chr19	58213405	.	GCTGCACTCATAAGGCCTGGATCCACTGTGAACTTTCTGGTGTTTTATGAGACTGGAATGATATGTAAAAAACTTCCCACATTCA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=118,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,11:0.171:55:8,3:5,7:22,22,4,7
chr19	58214147	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,2:2,2:0,4,1,3
chr19	58232456	.	GT	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:8,7,1,1
chr19	58258512	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:58258512_A_C:58258512:0,7,1,1
chr19	58258514	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,0:0|1:58258512_A_C:58258512:0,7,1,1
chr19	58265085	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=136,130667;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:58265085_A_T:58265085:8,7,2,0
chr19	58265092	.	GAT	CCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=141,130667;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:58265085_A_T:58265085:10,7,2,0
chr19	58265099	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=106,130667;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:58265085_A_T:58265085:8,11,2,0
chr19	58265106	.	GT	AG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=106,130667;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:58265085_A_T:58265085:8,11,2,0
chr19	58290417	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,385;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:7,5,2,0
chr19	58324788	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,113;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr19	58370965	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=99,55;MMQ=55,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:21,3:22,0:0|1:58370965_C_T:58370965:24,19,1,2
chr19	58370983	.	T	TGGGATCTGTA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=99,55;MMQ=57,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,2:21,0:0|1:58370965_C_T:58370965:19,18,1,1
chr19	58370985	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=99,55;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,2:19,0:0|1:58370965_C_T:58370965:19,18,1,1
chr19	58386284	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=104,232;MMQ=52,33;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:5,6,0,2
chr19	58420699	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=148,89;MMQ=57,27;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:9,4:15,3:18,6,3,4
chr19	58439150	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=98,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.110:33:13,3:15,0:13,17,3,0
chr19	58441966	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:58441966_T_A:58441966:1,4,1,1
chr19	58441971	.	T	TTGCAGTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=51,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:58441966_T_A:58441966:0,4,1,1
chr19	58452549	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:4,11,1,1
chr19	58452550	.	GGTGTGACTTCTCCTATGTCTAATGAGGCTGGAGCTCTGGCTAAAAAACTTCCCACATTCATTGCACTCATAAGGCCTTTCTCCA	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:9,0:5,2:14,21,1,1
chr19	58453038	.	TATAAGGCCTTGTACCAGTGTGAACTCTCTGGTGTGTAATAAGGCTAGAACTATGGATAAAAGATTTCCCACATTCACTGCACTC	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=119,251;MMQ=60,45;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.063:47:12,0:10,3:23,21,2,1
chr19	58453762	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:13,7,0,3
chr19	58455381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr19	58485439	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=92,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.709:36:5,16:5,8:7,3,20,6
chr19	58549593	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr19	58573083	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:3,6:4,5,4,3
chr19	58574711	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	58574774	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=140,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr19	58578578	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,11:0,0,9,11
chr19	58579624	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=104,57;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:58579624_C_T:58579624:11,11,2,0
chr19	58579629	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=104,57;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:0|1:58579624_C_T:58579624:11,9,2,0
chr19	58579923	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	58598784	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr19	58640021	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:23,1:17,1:17,23,1,1
chr19	58640848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:58640848_C_T:58640848:2,9,1,1
chr19	58640856	.	C	CTGTGCTGATGGGCCTGATCCCCATGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.182:14:4,2:7,0:0|1:58640848_C_T:58640848:1,11,1,1
chr19	58697290	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	58698464	.	G	GAGTTCAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr19	58698483	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:58698483_G_T:58698483:0,2,0,1
chr19	58698484	.	CAGTAG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:58698483_G_T:58698483:0,2,0,1
chr19	58698491	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58698483_G_T:58698483:0,0,0,1
chr19	58698495	.	GGGAT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58698483_G_T:58698483:0,0,0,1
chr19	58698501	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58698483_G_T:58698483:0,0,0,1
chr19	58718269	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=123,249;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr19	58718360	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,7,9
chr19	58718632	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,87;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr19	58757870	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=239,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr19	58772864	.	TATGAGTGTG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,2:12,0:12,12,1,1
chr19	58773909	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=114,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:0|1:58773909_A_T:58773909:11,11,1,1
chr19	58773913	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=124,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:58773909_A_T:58773909:9,10,1,1
chr19	58773917	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:7,2:0|1:58773909_A_T:58773909:9,11,1,1
chr19	58774071	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.412:24:8,5:6,3:8,6,6,4
chr19	58790359	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,2:4,0:5,0,3,0
chr19	58797583	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr19	58864479	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr19	58864867	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	58864879	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr19	58868480	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr19	58879771	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr19	58879965	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	58879975	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=212,329;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58879975_GCC_G:58879975:0,1,1,0
chr19	58879976	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	58879978	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=212,329;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58879975_GCC_G:58879975:0,1,1,0
chr19	58899466	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:2,8:1,3:3,0,7,4
chr19	58906163	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,7:4,3:3,5,3,7
chr19	58928290	.	GCATGGGGCAGCTTTCCCACCTGGTTCCAGTTGTGGGCAACAGCAAGAAGTC	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.164:35:5,1:11,4:0|1:58928290_GCATGGGGCAGCTTTCCCACCTGGTTCCAGTTGTGGGCAACAGCAAGAAGTC_G:58928290:17,13,0,5
chr19	58928302	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=122,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,7:0.470:15:5,0:3,7:1|0:58928290_GCATGGGGCAGCTTTCCCACCTGGTTCCAGTTGTGGGCAACAGCAAGAAGTC_G:58928290:4,4,4,3
chr19	58946442	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,1:5,11,1,1
chr19	58980637	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:11,0:12,4:9,14,2,2
chr19	58983549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	58983586	.	G	GGTGGTGGAAGAGGGCCGGGCGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	58990976	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,0:9,1,5,0
chr19	59010593	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr19	59010819	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr19	59025685	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,7,16
chr19	59025751	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr19	59061233	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,47;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:7,5:15,0:12,10,5,0
chr19	59067682	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=107,122;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:27,0:28,3:26,29,0,3
chr19	59068569	.	AAG	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=114,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.255:21:8,2:6,3:2,14,1,4
chr19	59069573	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:9,4,1,1
chr19	59074366	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:59074366_G_T:59074366:2,3,1,1
chr19	59074367	.	CGCGCG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:59074366_G_T:59074366:2,3,1,1
chr19	59074373	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:59074366_G_T:59074366:2,3,1,1
chr19	59074376	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:59074366_G_T:59074366:2,3,1,1
chr20	126310	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr20	138148	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,1,3
chr20	139362	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr20	139409	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=94,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:7,4:8,5:10,5,6,3
chr20	139576	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:3,7:2,11:3,2,10,8
chr20	139745	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	168466	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=105,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr20	168728	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=79,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:7,5:8,9:7,8,4,10
chr20	207889	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=61,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:2,2:3,5:2,3,4,3
chr20	238435	.	CTGGTCT	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:6,5:9,6:6,9,4,7
chr20	238453	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:8,13,1,1
chr20	238507	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=100,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:4,3:1,5,1,5
chr20	238530	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=80,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:0|1:238530_T_G:238530:0,2,1,3
chr20	238540	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:238530_T_G:238530:0,1,1,2
chr20	239664	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr20	239688	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.454:16:7,3:2,2:0|1:239688_G_A:239688:5,4,7,0
chr20	239697	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.463:20:8,6:3,3:0|1:239688_G_A:239688:5,6,8,1
chr20	256573	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,35;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,5,1
chr20	256727	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=84,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:5,6:6,1:6,5,5,2
chr20	256755	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=149,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:5,2:4,7,1,1
chr20	256760	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,2:8,1:4,8,1,3
chr20	256763	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:3,7,1,3
chr20	257812	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr20	259779	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr20	259899	.	GGTTGAGCTTGCTGAGGAAGT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:4,7,1,1
chr20	264764	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:1,5,1,4
chr20	271135	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=96.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,8:0,15:0,0,18,10
chr20	271204	.	ATT	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=104,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.364:28:9,7:4,1:11,7,6,4
chr20	271225	.	T	TTTA	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=104,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.153:47:16,3:18,4:12,27,3,5
chr20	278174	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:5,1:3,0:0|1:278174_G_A:278174:10,0,1,1
chr20	278187	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,1:3,1:0|1:278174_G_A:278174:7,2,1,1
chr20	278687	.	CCGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr20	309180	.	T	TGAGATGAAGTTTTGCTCTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=31,163;MMQ=60,28;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.465:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr20	310222	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,2:3,6:3,5,1,7
chr20	334288	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:2,6,1,1
chr20	334317	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=162,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr20	372235	.	C	CACTCATGCTTCTAATCCTAGCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr20	391025	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,2:4,2:8,1,3,1
chr20	391051	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:391051_C_T:391051:15,8,1,1
chr20	391060	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:391051_C_T:391051:16,10,1,1
chr20	391100	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:15,0:23,2:19,19,1,1
chr20	397928	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=106,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,31:0.603:51:10,14:10,16:12,8,24,7
chr20	398182	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.211:21:10,4:7,0:8,9,2,2
chr20	409239	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.107:49:28,0:15,3:18,26,1,4
chr20	419681	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,179;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,3:3,0:7,3,3,0
chr20	425606	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.494:10:0,3:5,2:5,0,3,2
chr20	428767	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:1,7,0,5
chr20	590900	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	629649	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr20	633599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:2,2:4,1:2,4,3,2
chr20	633726	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	742237	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:0|1:742237_G_A:742237:5,1,5,1
chr20	742239	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:742237_G_A:742237:0,0,10,2
chr20	744308	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:4,9:3,6:5,3,7,8
chr20	744382	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,3:4,1:3,7,1,3
chr20	744415	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:5,6,2,3
chr20	744662	.	A	ACAGGTCAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr20	853822	.	G	GTGTGTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=105,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	853853	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:853853_A_AC:853853:0,0,0,1
chr20	853855	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:853853_A_AC:853853:0,0,0,1
chr20	865664	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.461:13:1,3:4,3:5,2,4,2
chr20	1099329	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr20	1115681	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,0:0,6:1,0,4,2
chr20	1161471	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:12,4:2,0:7,7,5,0
chr20	1184166	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:8,10,3,1
chr20	1187509	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,0:17,2:15,11,0,2
chr20	1210647	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,8:1,4,5,8
chr20	1210665	.	A	AAAAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:7,2:4,9,1,1
chr20	1212186	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,6:6,7:5,11,8,5
chr20	1220136	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1220136_T_C:1220136:0,0,0,1
chr20	1220140	.	G	GGGTTGTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1220136_T_C:1220136:0,0,0,1
chr20	1223385	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:8,16,0,2
chr20	1229302	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=142,81;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:15,0:15,13,4,0
chr20	1247418	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr20	1281250	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=83,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.193:17:8,0:5,1:0|1:1281250_A_C:1281250:4,10,3,0
chr20	1281258	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=22,11;MFRL=96,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.182:18:8,0:5,0:0|1:1281250_A_C:1281250:3,12,3,0
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chr20	2290547	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
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chr20	2376022	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=106,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:8,5,3,0
chr20	2378555	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:2378555_G_A:2378555:13,7,1,1
chr20	2378569	.	G	GATGGGAAGAAAGGAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:6,2:0|1:2378555_G_A:2378555:11,9,1,1
chr20	2380396	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr20	2411491	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=96,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:10,4,0,3
chr20	2411731	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,0:3,4:0,3,1,3
chr20	2413125	.	CC	TT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:0|1:2413125_CC_TT:2413125:7,1,8,3
chr20	2413126	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,19:0.952:19:0,12:0,7:1|0:2413125_CC_TT:2413125:0,0,15,4
chr20	2413320	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=110,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:1,3,1,3
chr20	2413373	.	AGGCCTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2413373_AGGCCTC_A:2413373:0,1,0,1
chr20	2413380	.	AGTTAATCCT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:2413373_AGGCCTC_A:2413373:0,1,0,1
chr20	2463888	.	CCCTGAGTGTGTCCTCTGGTGGACAAGGAGGAGTGATTTCCGGCTAAAGCCTCGGCCACACTCACTGCACACGTAAGGCTTCTCT	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,24:0.104:70:19,18:5,2:20,26,8,16
chr20	2464669	.	CTGAGGTTGGACTTCTGGCTAAAACCTCGCCCGCACTCACTGCACACATAAGGCTTCTCCATCGAGTGTATACGATGGTGTCTGA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.128:36:5,6:2,3:13,13,8,2
chr20	2474081	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr20	2474136	.	GAAA	G,GAAAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=113,111,78;MMQ=60,60,60;MPOS=25,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,13;RU=A;STR;TLOD=3.88,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.140,0.181:24:8,0,0:7,4,3:9,7,7,1
chr20	2517331	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:7,10,1,2
chr20	2517377	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr20	2517402	.	GCT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2517402_GCT_G:2517402:0,2,0,1
chr20	2517405	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2517402_GCT_G:2517402:0,2,0,1
chr20	2517409	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=13,28;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:2517402_GCT_G:2517402:0,2,0,1
chr20	2517410	.	T	TCAG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2517402_GCT_G:2517402:0,2,0,1
chr20	2517432	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	2517825	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=311,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr20	2539430	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=95,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr20	2542580	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=72,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:1,0:19,2:0|1:2542580_G_T:2542580:12,8,1,1
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chr20	2779257	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,1,2
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chr20	2797461	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:2797454_G_C:2797454:12,5,1,1
chr20	2797463	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:2797454_G_C:2797454:12,5,1,1
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chr20	2821490	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.192:17:7,0:6,0:0|1:2821486_G_C:2821486:0,14,3,0
chr20	2821494	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:6,1:0|1:2821486_G_C:2821486:0,15,2,0
chr20	2841955	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.189:17:3,0:7,0:9,5,0,3
chr20	2843407	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,2:5,0:8,0,1,1
chr20	2955734	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:3,4:3,0:6,0,5,0
chr20	2988014	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=75,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,0:13,4:18,16,1,3
chr20	3002853	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:8,0:11,4:11,8,2,2
chr20	3003433	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:17,0:7,3:17,8,0,3
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chr20	3007751	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=103,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:5,2:0|1:3007744_A_G:3007744:5,14,1,1
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chr20	3199373	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
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chr20	3211556	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=23,22;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,1:3,1:0|1:3211552_A_C:3211552:2,7,5,0
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chr20	3211566	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=130,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:5,1:0|1:3211552_A_C:3211552:4,6,4,0
chr20	3211569	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,2:5,1:0|1:3211552_A_C:3211552:5,6,4,0
chr20	3211575	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=24,19;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,0:6,1:0|1:3211552_A_C:3211552:7,6,3,0
chr20	3211577	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=25,12;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:4,0:0|1:3211552_A_C:3211552:7,6,2,0
chr20	3211719	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,11:0,5:0,0,5,11
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chr20	3211895	.	GA	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:3211893_A_G:3211893:6,5,0,2
chr20	3214126	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
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chr20	3215573	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=92,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:3215569_GGC_TTT:3215569:6,7,0,2
chr20	3234453	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,3:12,0:11,15,3,0
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chr20	3321083	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,11;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr20	3329290	.	GA	CC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:5,0:2,2:0|1:3329290_GA_CC:3329290:2,5,1,1
chr20	3329299	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:3329290_GA_CC:3329290:2,4,1,1
chr20	3329300	.	T	TCTCTAGAC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=120,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:3329290_GA_CC:3329290:2,4,1,1
chr20	3329351	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr20	3356957	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=115,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:0,11,1,3
chr20	3526341	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr20	3527884	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:10,8:6,4:11,5,9,3
chr20	3541603	.	TCTAAGCTTATTATTTTGACTGTTTAGAAAAGTTCAAC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.401:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr20	3541633	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	3546162	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3546162_T_C:3546162:0,3,0,1
chr20	3546164	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=140,132;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3546162_T_C:3546162:0,3,0,1
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chr20	3557610	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:0|1:3557609_G_GAACC:3557609:2,7,1,1
chr20	3559191	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=125,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr20	3564772	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,1:1,6:0,1,2,5
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chr20	3575248	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr20	3605059	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr20	3605336	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:0,1,1,6
chr20	3614944	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=105,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:22,0:19,3:19,22,0,3
chr20	3624704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr20	3640467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr20	3640499	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:6,0,2,1
chr20	3649713	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:3649713_A_G:3649713:0,0,1,4
chr20	3649721	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:3649713_A_G:3649713:0,0,1,5
chr20	3650066	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,6:0,0,8,14
chr20	3652207	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:4,4:4,1:2,6,3,2
chr20	3655085	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr20	3657803	.	AT	GA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr20	3657839	.	G	GTTTGAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3657839_G_GTTTGAA:3657839:0,3,0,1
chr20	3657840	.	C	CAGCCATAACACTCCTAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3657839_G_GTTTGAA:3657839:0,3,0,1
chr20	3657890	.	G	GAAGGCTAACATGAAAAGGGAGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	3660083	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,0:4,2:7,3,2,0
chr20	3669873	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,0:8,3:9,11,0,3
chr20	3671939	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr20	3673099	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3673099_C_T:3673099:0,1,1,0
chr20	3673107	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3673099_C_T:3673099:0,1,1,0
chr20	3675191	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=195,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:3675191_G_GTT:3675191:5,3,1,1
chr20	3675193	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=195,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:3675191_G_GTT:3675191:5,3,1,1
chr20	3677688	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=193,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3677688_C_CTT:3677688:1,0,0,1
chr20	3677694	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=172,256;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3677688_C_CTT:3677688:2,0,0,1
chr20	3677697	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=172,256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3677688_C_CTT:3677688:2,0,0,1
chr20	3682370	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3682370_A_T:3682370:1,3,0,1
chr20	3682371	.	CCG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3682370_A_T:3682370:1,3,0,1
chr20	3682375	.	T	TATTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:3682370_A_T:3682370:1,3,0,1
chr20	3682378	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3682370_A_T:3682370:1,2,0,1
chr20	3687798	.	GT	AC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:3687798_GT_AC:3687798:0,3,0,1
chr20	3687802	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:3687798_GT_AC:3687798:0,3,0,1
chr20	3687804	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:3687798_GT_AC:3687798:0,3,0,1
chr20	3687806	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:3687798_GT_AC:3687798:0,3,0,1
chr20	3719277	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.370:33:12,7:9,5:13,8,7,5
chr20	3723091	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,3:0,0,3,6
chr20	3725764	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:8,0:1,2:2,7,0,3
chr20	3730524	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,3,7
chr20	3740606	.	ACG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=142,96;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:4,0:8,2,2,1
chr20	3740620	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,25,32;MFRL=99,146,116;MMQ=60,60,60;MPOS=10,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CA;STR;TLOD=3.88,17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.212,0.581:11:1,0,5:0,1,2:1,1,7,2
chr20	3740686	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,0:11,4:10,15,2,2
chr20	3759200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr20	3759528	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:4,1,6,2
chr20	3759944	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=91,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,1:14,4:22,9,4,1
chr20	3759952	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:17,1:15,2:23,11,3,0
chr20	3759971	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=92,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:22,4:22,0:25,19,3,1
chr20	3761725	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,1:0|1:3761725_C_T:3761725:19,0,1,1
chr20	3761736	.	CCACAAGCACACAAACACAAAGAGTTTGCACAGAGACCCGTTACACACGAACATACAGGACAGAACATGCAGACA	C	.	.	DP=103;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,5:0.030:103:8,0:11,1:0|1:3761725_C_T:3761725:55,43,1,4
chr20	3766806	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,1:0|1:3766806_C_T:3766806:6,0,2,0
chr20	3766814	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=183,91;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:3766806_C_T:3766806:7,0,2,0
chr20	3766825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=180,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr20	3778433	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:0,7,1,3
chr20	3778962	.	GTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,81;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.522:4:0,1:2,1:0|1:3778962_GTTT_G:3778962:2,0,2,0
chr20	3778985	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=95,81;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.234:11:3,0:4,0:0|1:3778962_GTTT_G:3778962:2,7,2,0
chr20	3779002	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=83,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.327:22:9,1:5,5:5,10,4,3
chr20	3780857	.	T	TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=134,59;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.106:25:12,0:9,2:12,11,1,1
chr20	3780925	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=105,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,28:0.542:51:10,17:12,10:0|1:3780925_T_A:3780925:11,12,2,26
chr20	3780930	.	C	CATTTGTTGCCCT	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=31,39;MFRL=108,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,26:0.487:53:10,16:14,9:0|1:3780925_T_A:3780925:13,14,0,26
chr20	3780932	.	TAG	T	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=107,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,26:0.496:52:11,1:14,0:0|1:3780925_T_A:3780925:12,14,0,26
chr20	3781361	.	TCTGCCTGCCGCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=230,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:1,3:2,0:4,0,3,0
chr20	3781953	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:18,2:12,0:0|1:3781953_T_C:3781953:14,18,1,1
chr20	3781969	.	G	GCAAGGAGT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:22,1:12,0:0|1:3781953_T_C:3781953:16,19,1,1
chr20	3781971	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:19,2:13,0:0|1:3781953_T_C:3781953:16,19,1,1
chr20	3782878	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,2:5,0:6,3,1,1
chr20	3783649	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,6,16
chr20	3783764	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:9,11:8,7:9,8,8,10
chr20	3785397	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:7,1:7,5,2,0
chr20	3785403	.	GGGAGGGTT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=112,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.287:15:3,1:6,3:11,0,0,4
chr20	3843027	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.743:28:1,6:5,15:4,3,6,15
chr20	3843123	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=146,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr20	3897559	.	T	TTTCCCC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCCCC;STR;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.639:23:6,6:1,9:3,5,7,8
chr20	3954899	.	CC	TT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,0:16,2:15,7,1,1
chr20	4155935	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,2:5,7:1,5,6,3
chr20	4158315	.	C	CAGGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	4162349	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr20	4163242	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:3,8:8,8:7,4,9,7
chr20	4164198	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:4,12:13,3:10,7,6,9
chr20	4202802	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr20	4228883	.	G	GAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.204:22:11,2:7,2:9,9,2,2
chr20	4229438	.	ACGC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=180,229;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	4682332	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	4705159	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=160,73;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:9,4,2,1
chr20	4705838	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:4,11,1,1
chr20	4705865	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=470,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,3:1,12:1,0,5,10
chr20	4706508	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=34,29,20,25;MFRL=102,117,121,105;MMQ=60,60,60,56;MPOS=17,23,15;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.25,13.55,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,8,4:0.149,0.374,0.186:22:6,0,2,1:0,2,2,1:5,2,7,8
chr20	4706587	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:5,4:2,0:0|1:4706587_G_A:4706587:1,6,0,4
chr20	4706592	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=186,157;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,1:2,0:0|1:4706587_G_A:4706587:1,6,0,2
chr20	4707388	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,13:0,0,9,11
chr20	4707567	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,0:17,3:22,16,0,3
chr20	4708439	.	C	CTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,23;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.976:32:0,15:0,5:0,0,20,12
chr20	4768475	.	A	AAGGGACT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,1:0,0,1,11
chr20	4770440	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr20	4773338	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:5,2:5,2:0,10,0,5
chr20	4776418	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=194,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr20	4776445	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:6,2:9,6:11,4,7,2
chr20	4776659	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr20	4776683	.	A	AGATGCAGGACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4776683_A_AGATGCAGGACG:4776683:0,3,0,1
chr20	4776686	.	T	TGGAGAACCTGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:4776683_A_AGATGCAGGACG:4776683:0,3,0,1
chr20	4839897	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=196,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,1,2
chr20	4843370	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	4850548	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=93,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,4:8,1:13,4,5,0
chr20	4864570	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	4866651	.	A	ACACACACACACACACACACAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:4866651_A_ACACACACACACACACACACAC:4866651:0,4,0,2
chr20	4866652	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:4866651_A_ACACACACACACACACACACAC:4866651:0,4,0,2
chr20	4880132	.	AGCTCAATGCCTTCTGC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr20	4893522	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:19,8:9,0:8,21,8,0
chr20	4913095	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=94,85;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,5:13,0:13,11,4,1
chr20	4913283	.	A	ACATCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	5165508	.	A	AATCAGTCATTCGAATAGTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:12,2:5,0:6,11,0,2
chr20	5169877	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,4:2,1:0,5,1,4
chr20	5169888	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0|1:5169888_T_C:5169888:0,4,0,2
chr20	5169890	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,1:1,0:0|1:5169888_T_C:5169888:0,4,0,2
chr20	5170800	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:7,0:41,2:0|1:5170800_C_T:5170800:35,13,1,1
chr20	5170814	.	C	CCTCTCCAGCACCTG	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:9,0:47,2:0|1:5170800_C_T:5170800:43,13,1,1
chr20	5539564	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr20	5548208	.	TAA	T,TA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=15,17,15;MFRL=95,132,128;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.68,23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,16:0.204,0.553:30:1,2,2:3,1,3:2,6,2,20
chr20	5556686	.	TAC	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:3,2:3,2:0,7,0,4
chr20	5556714	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:5556714_C_A:5556714:0,8,0,2
chr20	5556716	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:5556714_C_A:5556714:0,8,0,2
chr20	5559292	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr20	5574134	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr20	5753865	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:5,6,0,6
chr20	5843812	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=88,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,7:5,2:5,6,4,5
chr20	5844104	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,119;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.189:28:11,0:12,4:10,13,0,5
chr20	5844121	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,1:3,10,2,6
chr20	5897384	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr20	5897639	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,38;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr20	5903517	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,14:0,19:0,0,15,18
chr20	5905779	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	5921596	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=182,277;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:5921596_T_G:5921596:3,0,1,0
chr20	5921598	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=182,277;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:5921596_T_G:5921596:3,0,1,0
chr20	5921602	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=191,277;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5921596_T_G:5921596:2,0,1,0
chr20	5921690	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.346:27:13,9:4,0:10,8,9,0
chr20	5923086	.	GC	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=94,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,0:15,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:15,13,1,1
chr20	5923089	.	TCCTCTC	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:12,0:16,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:16,15,1,1
chr20	5923099	.	TTAGGCCCCTTA	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=97,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,0:16,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:17,15,1,1
chr20	5923117	.	GG	CT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:12,15,1,1
chr20	5923121	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:13,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:11,18,1,1
chr20	5923124	.	GAGAAATTGTTTCCA	G	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:13,2:0|1:5923086_GC_G:5923086:13,24,1,1
chr20	5927014	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=82,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:11,4:13,0:16,9,4,0
chr20	5932747	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=115,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:17,0:14,6:14,17,0,6
chr20	5935385	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr20	5948706	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:5948706_A_G:5948706:0,0,1,6
chr20	5948712	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:5948706_A_G:5948706:0,0,1,7
chr20	5953669	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=104,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:16,3:8,0:16,8,3,0
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chr20	9371129	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:4,7:2,4:4,2,9,3
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chr20	9389865	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=98,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:11,0:14,10:6,19,0,10
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chr20	9404627	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9404624_A_AACCACGGAAAAC:9404624:0,1,0,1
chr20	9404629	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:9404624_A_AACCACGGAAAAC:9404624:0,1,0,1
chr20	9404633	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9404624_A_AACCACGGAAAAC:9404624:0,0,0,1
chr20	9417842	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,63;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,2:4,0:0|1:9417842_T_C:9417842:0,8,1,1
chr20	9417843	.	A	AGCCTCCCAAAGTGTTGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=160,63;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:9417842_T_C:9417842:0,8,1,1
chr20	9453567	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	9453901	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.539:10:4,4:0,1:4,1,4,1
chr20	9496307	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=163,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr20	9498647	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=72,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:10,9,0,3
chr20	9520142	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,6:5,5:4,4,5,6
chr20	9625003	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	10023689	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr20	10030931	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr20	10389385	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.261:25:10,0:7,6:7,12,2,4
chr20	10389533	.	C	CTGGGCACAGTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	10438780	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr20	10439002	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr20	10541416	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=120,44;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:25,0:31,2:0|1:10541416_G_T:10541416:29,28,1,1
chr20	10541418	.	ACAGGC	A	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=23,20;MFRL=123,44;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:25,0:32,2:0|1:10541416_G_T:10541416:32,30,1,1
chr20	10541427	.	CAAATG	C	.	.	DP=64;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:21,0:34,2:0|1:10541416_G_T:10541416:30,32,1,1
chr20	10541433	.	CAG	C	.	.	DP=63;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:22,0:37,2:0|1:10541416_G_T:10541416:29,32,1,1
chr20	10541441	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=126,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:19,0:31,2:0|1:10541416_G_T:10541416:26,30,1,1
chr20	10541444	.	AG	A	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:20,0:31,2:0|1:10541416_G_T:10541416:22,30,1,1
chr20	10541446	.	ATC	A	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=127,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:18,0:30,2:0|1:10541416_G_T:10541416:22,30,1,1
chr20	10541450	.	AATCCC	A	.	.	DP=51;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=124,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:18,0:29,2:0|1:10541416_G_T:10541416:21,28,1,1
chr20	10541458	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=123,44;MMQ=60,60;MPOS=-19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:17,0:27,2:21,25,1,1
chr20	10603326	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=95,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr20	10620499	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,2:15,1:10,16,0,3
chr20	10622080	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.714:9:0,4:2,2:2,0,5,2
chr20	10622405	.	GAACT	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=116,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:5,0:0|1:10622405_GAACT_G:10622405:7,4,1,1
chr20	10622410	.	GCGGCAGCC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=116,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:6,0:0|1:10622405_GAACT_G:10622405:8,7,1,1
chr20	10622424	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=137,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:5,0:0|1:10622405_GAACT_G:10622405:7,7,1,1
chr20	10623035	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr20	10629292	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:18,0:11,3:13,16,1,2
chr20	10633313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr20	10653618	.	G	GCACAACACAAATCCAGGAAGCTCAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:1,5,1,1
chr20	11790885	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=94,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:1,2,5,4
chr20	11791094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,4:0,3:1,3,4,3
chr20	11830180	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr20	12990044	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,8,12
chr20	13029832	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13029832_GTT_G:13029832:0,1,0,1
chr20	13029837	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13029832_GTT_G:13029832:0,1,0,1
chr20	13060331	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr20	13074235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:13074235_G_A:13074235:0,0,5,6
chr20	13074243	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:13074235_G_A:13074235:0,0,4,7
chr20	13140617	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,135;MMQ=60,41;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.301:22:4,1:11,5:12,4,6,0
chr20	13464030	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,0:8,5:2,10,1,4
chr20	13509263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr20	13550077	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	13695464	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr20	13695498	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr20	13695607	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:8,17:12,4:10,10,11,10
chr20	13695824	.	C	CA,CAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,34,34;MFRL=107,117,115;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=A;STR;TLOD=11.01,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,3:0.427,0.178:19:4,3,1:3,5,2:2,6,4,7
chr20	13698006	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,9:0,20:0,0,13,16
chr20	13755728	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.405:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr20	13755996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:13755996_T_C:13755996:0,2,0,2
chr20	13756006	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:13755996_T_C:13755996:0,2,0,2
chr20	13756008	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13755996_T_C:13755996:0,2,0,1
chr20	13769127	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr20	13782409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr20	13797244	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,119;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:12,0:4,4:2,14,0,4
chr20	13845753	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr20	13845987	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,11,7
chr20	13868674	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr20	13868745	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	14066332	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=111,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.174:38:17,6:14,0:0|1:14066332_G_A:14066332:15,17,4,2
chr20	14066356	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=124,39;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:17,2:11,0:0|1:14066332_G_A:14066332:14,15,0,2
chr20	15480308	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	15480548	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr20	15913913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=169,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:6,3,2,2
chr20	15913920	.	GA	TC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:15913920_GA_TC:15913920:6,4,1,1
chr20	15913925	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:15913920_GA_TC:15913920:6,4,1,1
chr20	15913926	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=94,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:0|1:15913920_GA_TC:15913920:6,4,1,1
chr20	15967294	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:7,0,3,1
chr20	16030469	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=101,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:16,10,0,2
chr20	16030505	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=105,85;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:14,3:23,0:20,17,3,0
chr20	16351329	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=87,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	16359450	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.125:26:8,2:15,0:0|1:16359450_C_A:16359450:14,9,2,1
chr20	16359464	.	C	CTCAGCGTA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=92,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:0|1:16359450_C_A:16359450:10,10,1,1
chr20	16362235	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr20	16362674	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:13,1,3,0
chr20	16410559	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:5,3,3,1
chr20	16484950	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr20	16488640	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:15,2:0|1:16488640_C_T:16488640:15,11,1,1
chr20	16488643	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:16,2:0|1:16488640_C_T:16488640:15,12,1,1
chr20	16488657	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:10,0:14,2:1|0:16488640_C_T:16488640:14,11,1,1
chr20	16493580	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:3,6,0,6
chr20	16496362	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=144,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	16506939	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	16712280	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:4,6:4,4:7,1,8,2
chr20	16729138	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=123,86;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,7:5,7:2,5,6,8
chr20	16729654	.	A	AAGATG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=77,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.752:22:5,7:0,10:3,2,5,12
chr20	16729702	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr20	16730522	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,2,3
chr20	17434286	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	17436891	.	AAATG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr20	17436895	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr20	17474690	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,13:0,0,14,5
chr20	17475217	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,20,13
chr20	17475646	.	T	TATTGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=77,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:23,2:7,0:0|1:17475646_T_TATTGA:17475646:6,24,1,1
chr20	17475649	.	T	TGTATGTGA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=77,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:23,2:6,0:0|1:17475646_T_TATTGA:17475646:6,24,1,1
chr20	17477689	.	GAACAAGCCAAACAGAGGTCAGGGGCAAGAGCGACTCTCGTTAATGTTGAGCAAAAATGAAAA	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:7,0:0|1:17477689_GAACAAGCCAAACAGAGGTCAGGGGCAAGAGCGACTCTCGTTAATGTTGAGCAAAAATGAAAA_G:17477689:9,15,1,1
chr20	17477751	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.722:5:1,4:0,0:1|0:17477689_GAACAAGCCAAACAGAGGTCAGGGGCAAGAGCGACTCTCGTTAATGTTGAGCAAAAATGAAAA_G:17477689:0,1,0,4
chr20	17495489	.	C	CTGTGGTTCTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	17594714	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr20	17594729	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:3,2,2,0
chr20	17595329	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr20	17596155	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:2,1,3,4
chr20	17596198	.	C	CCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17596198_C_CCAGA:17596198:1,0,0,1
chr20	17596199	.	T	TCAAGTCAGGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17596198_C_CCAGA:17596198:1,0,0,1
chr20	17596731	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17596731_C_T:17596731:0,0,0,1
chr20	17596737	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17596731_C_T:17596731:0,0,0,1
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chr20	18394927	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:5,3:5,0:12,1,4,0
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chr20	18407895	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18407880_TG_T:18407880:0,0,0,1
chr20	18446024	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.504:12:2,3:4,3:0,6,0,6
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chr20	18448079	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr20	18460614	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
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chr20	18462492	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr20	18462518	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr20	18464110	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,4:1,2:1,0,4,2
chr20	18470664	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr20	18470980	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,2:0,13:0,0,10,5
chr20	18477614	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr20	18477870	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr20	18505563	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.230:19:7,2:7,2:11,4,4,0
chr20	18506616	.	TG	CA,CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32,27;MFRL=0,127,115;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.84,20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,8:0.446,0.502:15:0,4,5:0,2,3:0,0,3,12
chr20	18508255	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=102,85;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.193:39:19,0:12,7:0|1:18508255_G_T:18508255:15,17,0,7
chr20	18508261	.	T	TCTCTGTGTGTCCCCGTCTATGTGTCTC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=25,38;MFRL=116,85;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.204:37:19,0:11,7:0|1:18508255_G_T:18508255:14,16,0,7
chr20	18511456	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,15:0,5:0,0,16,11
chr20	18511504	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=103,136;MMQ=24,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,9:0,2:0,1,0,11
chr20	18513345	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:19,0:8,3:18,10,0,3
chr20	18523864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr20	18529233	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.607:21:6,5:2,7:3,5,9,4
chr20	18576912	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr20	18608937	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=104,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr20	18790798	.	CAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr20	18810705	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=78,51;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:7,4:5,5,3,3
chr20	19560555	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr20	19560664	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,5:0,0,13,6
chr20	19646477	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,45;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:1,0:7,2,0,2
chr20	19662717	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.662:4:1,2:0,1:0|1:19662717_CA_TG:19662717:0,1,0,3
chr20	19662721	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=159,130;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:19662717_CA_TG:19662717:0,2,0,2
chr20	19662724	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=172,130;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:19662717_CA_TG:19662717:0,1,0,2
chr20	19662726	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,32;MFRL=172,142;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19662717_CA_TG:19662717:0,1,0,1
chr20	19673859	.	G	GTTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.376:19:6,2:6,3:10,2,5,2
chr20	19674142	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr20	19677615	.	AAGGGAGGGAGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=AGGG;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	19701716	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=102,60;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:15,6:12,0:15,12,0,6
chr20	19867267	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,4:3,0:6,5,4,0
chr20	19937158	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr20	19945757	.	C	CAGAGACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=199,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19945757_C_CAGAGACCA:19945757:0,1,0,1
chr20	19945759	.	G	GGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=199,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19945757_C_CAGAGACCA:19945757:0,1,0,1
chr20	19955651	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:12,2:0|1:19955651_A_C:19955651:10,15,1,1
chr20	19955659	.	C	CTGG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=93,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:19955651_A_C:19955651:11,12,1,1
chr20	20003196	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,2:0,1,0,6
chr20	20006471	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:0,6,3,0
chr20	20007479	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,3:14,0:16,18,3,0
chr20	20018012	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:9,0:15,4:12,13,0,4
chr20	20020516	.	A	AGTAGACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr20	20020519	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr20	20033423	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,3:9,5:3,11,1,7
chr20	20037222	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr20	20056038	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr20	20056082	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:2,0,6,2
chr20	20071634	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,12:0,7:0,0,8,11
chr20	20139951	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr20	20140111	.	GCGTGCCTTCTAGCCACCCCATGGGTTTCACACCTTTCTACCTCAGAGGATTTGTGCCCTTTCCTCCTCCCAATCTC	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,171;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:5,0:4,4:0|1:20140111_GCGTGCCTTCTAGCCACCCCATGGGTTTCACACCTTTCTACCTCAGAGGATTTGTGCCCTTTCCTCCTCCCAATCTC_G:20140111:5,13,0,4
chr20	20140192	.	CCTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=164,171;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:0|1:20140111_GCGTGCCTTCTAGCCACCCCATGGGTTTCACACCTTTCTACCTCAGAGGATTTGTGCCCTTTCCTCCTCCCAATCTC_G:20140111:1,6,0,4
chr20	20140196	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,5:0.879:5:0,3:0,2:1|0:20140111_GCGTGCCTTCTAGCCACCCCATGGGTTTCACACCTTTCTACCTCAGAGGATTTGTGCCCTTTCCTCCTCCCAATCTC_G:20140111:0,0,1,4
chr20	20150182	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr20	20152581	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr20	20168497	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr20	20177319	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=140,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:12,0:12,8,0,2
chr20	20180447	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:17,3:8,0:0|1:20180447_C_CT:20180447:15,15,1,2
chr20	20180449	.	T	TG	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:18,2:12,0:0|1:20180447_C_CT:20180447:15,15,1,2
chr20	20180452	.	A	ACTCCCATCTCTGCCTCCG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,2:12,0:0|1:20180447_C_CT:20180447:15,15,1,1
chr20	20180454	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:16,1:12,0:0|1:20180447_C_CT:20180447:14,15,1,1
chr20	20243527	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr20	20243532	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=144,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:10,0,3,0
chr20	20243558	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:3,2:7,1,6,0
chr20	20243562	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=19,34;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:0,2:6,0,5,1
chr20	20257759	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,2:0,5:2,0,7,0
chr20	20269534	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=92,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:4,8,1,1
chr20	20349537	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:1,0:0|1:20349537_A_G:20349537:4,1,1,1
chr20	20349542	.	C	CGCAGGGGGCGCGGCG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:20349537_A_G:20349537:4,1,1,1
chr20	20349544	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=175,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:20349537_A_G:20349537:4,1,1,1
chr20	20373683	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,141;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr20	20373831	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:19,3:10,0:14,15,3,0
chr20	20377421	.	A	AC	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=129.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,16:0,28:0,0,23,24
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chr20	20552406	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr20	20565506	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,0:4,2:9,8,1,1
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chr20	21117288	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:21117288_A_G:21117288:1,8,0,2
chr20	21117290	.	A	AGTG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:21117288_A_G:21117288:1,8,0,2
chr20	21117291	.	C	CAGTGGCGCAATG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,1:2,0:0|1:21117288_A_G:21117288:1,8,0,2
chr20	21126194	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=70,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.682:23:4,7:3,9:5,2,11,5
chr20	21142454	.	A	AC,AAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28,30;MFRL=116,100,188;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.365,0.293:8:0,1,1:2,2,1:2,1,4,1
chr20	21186161	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,7,8
chr20	21186296	.	T	TAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	21209633	.	TTTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,1,1
chr20	21227314	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	21307107	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=110,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.570:33:7,10:7,8:11,3,13,6
chr20	21312325	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,2:4,2:4,5,1,3
chr20	21313109	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0|1:21313109_T_TA:21313109:0,5,0,4
chr20	21313120	.	A	AAAGTTTGAAGCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:2,0:5,2:1|0:21313109_T_TA:21313109:0,8,0,2
chr20	21319828	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr20	21321294	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr20	21324765	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:13,2:0|1:21324765_A_T:21324765:9,12,1,1
chr20	21324769	.	C	CTTGTGCTTGAGAAGGTTA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:21324765_A_T:21324765:10,11,1,1
chr20	21328715	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr20	21330114	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=104,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.235:28:12,5:9,1:9,13,2,4
chr20	21336825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:5,6:2,7:4,3,2,11
chr20	21346441	.	TATATA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATATA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	21349195	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=99,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,1:14,0:0|1:21349195_A_T:21349195:11,15,1,1
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chr20	21362518	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,0:0,6:1,0,6,0
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chr20	21362758	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr20	21367741	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr20	21377646	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
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chr20	22562438	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.622:22:7,11:1,2:7,1,7,7
chr20	22562674	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.900:17:0,13:1,3:0,1,6,10
chr20	22563025	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr20	22563571	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=239,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr20	23028724	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=103,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.344:9:4,0:2,2:4,2,2,1
chr20	23065342	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=80,103;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.642:23:3,8:5,7:4,4,7,8
chr20	23065370	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=103,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:9,0:20,2:0|1:23065370_C_T:23065370:13,18,1,1
chr20	23065376	.	T	TCC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,0:19,2:0|1:23065370_C_T:23065370:13,18,1,1
chr20	23065380	.	C	CCCCAAG	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,0:18,2:0|1:23065370_C_T:23065370:14,17,1,1
chr20	23065984	.	GG	AA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,2:7,0:4,6,1,1
chr20	23066728	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:1,3,0,5
chr20	23335059	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=97,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,3:11,0:9,9,0,3
chr20	23345844	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,27:0.484:56:14,13:14,14:20,9,17,10
chr20	23347553	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr20	23349607	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.466:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr20	23360171	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,1,2
chr20	23375907	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	23401904	.	ACCCC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=C;STR;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.875:12:1,2:0,8:0,1,7,4
chr20	23424613	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=116,85;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,6:6,11:7,4,8,9
chr20	23424710	.	C	CAGGGTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr20	23424737	.	A	ATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23424737_A_ATAT:23424737:0,2,0,1
chr20	23424738	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:23424737_A_ATAT:23424737:0,2,0,1
chr20	23425389	.	TTTCTTTCTTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:4,0:11,7,1,1
chr20	23425430	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:15,4:7,0:14,8,4,0
chr20	23432571	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:11,0:6,4:6,11,0,4
chr20	23433125	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	23476412	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.657:10:1,4:1,2:2,1,5,2
chr20	23476654	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	23528536	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=189,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,7:2,2:0,4,3,6
chr20	23529377	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,4:0,13:0,0,13,4
chr20	23529388	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:5,1:8,7:10,4,4,4
chr20	23529418	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:4,6:9,9:5,8,9,6
chr20	23546639	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=73,131;MMQ=60,54;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,6:1,5:0,2,7,4
chr20	23548774	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr20	23584116	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,4:1,5:3,1,5,4
chr20	23586184	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=203,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.778:13:2,5:0,5:3,0,8,2
chr20	23586547	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=99,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:2,1:8,3:3,8,1,3
chr20	23615819	.	TCA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=85,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:1,0:4,2:7,2,2,0
chr20	23669457	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:4,11,1,2
chr20	23728377	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=171,76;MMQ=52,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:4,0,1,1
chr20	23731484	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr20	23805748	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=202,96;MMQ=56,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:23805748_T_TAC:23805748:2,0,1,1
chr20	23805749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=202,96;MMQ=56,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:23805748_T_TAC:23805748:2,0,1,1
chr20	23805782	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=94,115;MMQ=56,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:5,1,3,0
chr20	23805832	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=79,125;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,1:9,6:7,7,4,3
chr20	23807028	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:6,0,6,1
chr20	23860028	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	23860174	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:8,0:6,4:6,8,1,3
chr20	24645939	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,5:0,0,11,5
chr20	24938195	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	24944933	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr20	24945079	.	AGGC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr20	24950373	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	24959382	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr20	24959385	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr20	24990002	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=89,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.105:35:7,0:24,3:14,18,1,2
chr20	24993149	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:24993149_A_T:24993149:2,0,0,1
chr20	24993151	.	T	TCAGGTAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24993149_A_T:24993149:2,0,0,1
chr20	25002262	.	GC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=311,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25002262_GC_CA:25002262:0,3,0,1
chr20	25002265	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=311,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25002262_GC_CA:25002262:0,3,0,1
chr20	25003638	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,2:12,0:9,8,0,2
chr20	25004071	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr20	25027630	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr20	25053234	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:8,5,1,1
chr20	25056885	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,249;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:15,8,2,0
chr20	25176296	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr20	25199109	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=133,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr20	25199199	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:9,3,1,2
chr20	25201793	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:8,1,1,1
chr20	25258044	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=14887465,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,2:2,2:0,2,1,3
chr20	25259724	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,3:14,0:14,10,2,1
chr20	25262864	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,1,1
chr20	25274808	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:12,1:11,6,2,0
chr20	25274951	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.311:17:7,2:5,3:0|1:25274951_G_A:25274951:9,3,2,3
chr20	25274953	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.312:17:6,2:5,1:0|1:25274951_G_A:25274951:9,3,2,3
chr20	25274987	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr20	25277244	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=252,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr20	25282944	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,1:6,1:12,11,1,1
chr20	25282967	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:4,10:2,3:3,3,4,10
chr20	25284375	.	ATTTCTGCTGGATTT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	25288505	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr20	25320228	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,13:0,12:0,0,19,6
chr20	25398876	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr20	25426583	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:14,2:12,0:0|1:25426583_G_C:25426583:14,13,2,0
chr20	25426587	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,2:13,0:0|1:25426583_G_C:25426583:14,14,2,0
chr20	25436451	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=142,0;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,0:15,3:13,16,2,1
chr20	25436455	.	AT	GC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=142,0;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:14,1:12,17,2,0
chr20	25459919	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr20	25470447	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:25470447_G_C:25470447:0,0,2,0
chr20	25470450	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:25470447_G_C:25470447:0,0,2,0
chr20	25470456	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0|1:25470447_G_C:25470447:0,0,2,0
chr20	25507170	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=122,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:22,1:6,0:0|1:25507170_G_A:25507170:15,15,1,1
chr20	25507190	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=167,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:26,2:7,0:0|1:25507170_G_A:25507170:12,22,1,1
chr20	25755593	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=171,170;MMQ=51,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:8,2,2,0
chr20	25755672	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=170,142;MMQ=60,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,3:6,6:6,6,4,5
chr20	25756020	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=73,166;MMQ=44,33;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr20	25829260	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=25,20;MFRL=120,99;MMQ=50,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,26:0.328:80:23,10:31,16:26,28,16,10
chr20	25829290	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=20,27;MFRL=110,105;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,23:0.403:61:17,12:16,11:19,19,9,14
chr20	25829292	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=117,145;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.206:57:22,7:21,4:22,24,3,8
chr20	25829303	.	ATGCAGTGGGGGTATCAATGGGATCCATCTGTCAATACCTTGCATCCAGTGACCACCTGGAGCACACCTGCAGTTCGCAAGTTAGGCTTCCTGC	A	.	.	DP=97;ECNT=12;MBQ=24,22;MFRL=135,132;MMQ=47,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,8:0.033:96:32,3:18,3:41,47,4,4
chr20	25829312	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=128,155;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.135:58:33,3:16,3:27,24,2,5
chr20	25829319	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=24,31;MFRL=123,162;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.226:43:27,2:6,7:18,16,3,6
chr20	25829329	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=23,28;MFRL=128,162;MMQ=60,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:34,1:9,4:0|1:25829329_A_T:25829329:22,23,2,3
chr20	25829335	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=128,162;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:32,1:10,4:0|1:25829329_A_T:25829329:20,22,2,3
chr20	25829342	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=123,159;MMQ=60,38;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,14:0.294:49:28,5:7,9:0|1:25829342_T_C:25829342:16,19,6,8
chr20	25829352	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=12;MBQ=26,28;MFRL=123,162;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,15:0.302:49:28,5:6,10:0|1:25829342_T_C:25829342:15,19,6,9
chr20	25829384	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=128,168;MMQ=40,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:9,6:8,4:0|1:25829384_T_C:25829384:6,11,5,5
chr20	25829386	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=24,33;MFRL=128,168;MMQ=40,24;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:7,6:7,4:0|1:25829384_T_C:25829384:6,11,5,5
chr20	25829435	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=117,205;MMQ=40,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:12,4:10,6:8,14,5,5
chr20	25829436	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=131,117;MMQ=49,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,4:12,4:9,15,3,5
chr20	25829470	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=107,95;MMQ=49,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.332:40:15,8:12,5:12,15,5,8
chr20	26061784	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=64,123;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:5,0:1,2:4,3,2,0
chr20	26062002	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=149,153;MMQ=40,29;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:0|1:26062002_G_C:26062002:3,8,3,0
chr20	26062021	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=29,24;MFRL=175,153;MMQ=40,29;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,0:4,2:0|1:26062002_G_C:26062002:5,5,3,0
chr20	26062036	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=175,153;MMQ=40,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:3,3:0|1:26062002_G_C:26062002:4,4,3,6
chr20	26062047	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=175,153;MMQ=40,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:5,4:3,6:0|1:26062002_G_C:26062002:4,4,3,9
chr20	26062057	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=151,153;MMQ=52,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,13:0.560:23:5,4:4,9:0|1:26062002_G_C:26062002:6,4,4,9
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chr20	29623147	.	C	T	.	.	DP=173;ECNT=28;MBQ=30,23;MFRL=128,176;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,13:0.079:173:88,6:62,6:120,40,10,3
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chr20	29623159	.	A	G	.	.	DP=216;ECNT=28;MBQ=24,31;MFRL=121,149;MMQ=35,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:186,25:0.122:211:109,14:69,11:125,61,21,4
chr20	29623164	.	T	C	.	.	DP=214;ECNT=28;MBQ=23,31;MFRL=117,127;MMQ=40,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:203,11:0.056:214:121,7:73,4:0|1:29623143_G_T:29623143:131,72,7,4
chr20	29623175	.	A	T	.	.	DP=226;ECNT=28;MBQ=24,20;MFRL=120,86;MMQ=40,35;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:188,29:0.135:217:114,15:70,14:113,75,16,13
chr20	29623179	.	A	T	.	.	DP=218;ECNT=28;MBQ=23,23;MFRL=115,122;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:204,11:0.054:215:113,8:79,2:0|1:29623143_G_T:29623143:120,84,6,5
chr20	29623182	.	G	A	.	.	DP=214;ECNT=28;MBQ=31,20;MFRL=116,81;MMQ=40,35;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:198,11:0.056:209:112,9:81,1:110,88,8,3
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chr20	29623214	.	C	T	.	.	DP=215;ECNT=28;MBQ=28,27;MFRL=120,114;MMQ=35,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:199,9:0.047:208:89,6:97,3:0|1:29623214_C_T:29623214:102,97,5,4
chr20	29623215	.	G	A	.	.	DP=215;ECNT=28;MBQ=27,28;MFRL=119,130;MMQ=35,24;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:191,16:0.077:207:89,10:94,6:95,96,10,6
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chr20	29623223	.	T	C	.	.	DP=215;ECNT=28;MBQ=23,29;MFRL=116,122;MMQ=26,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:174,32:0.157:206:78,15:88,16:80,94,11,21
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chr20	29623263	.	C	T	.	.	DP=220;ECNT=28;MBQ=29,26;MFRL=110,112;MMQ=42,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:194,23:0.109:217:94,8:92,13:0|1:29623254_G_A:29623254:61,133,6,17
chr20	29623317	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=28;MBQ=30,23;MFRL=125,118;MMQ=48,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.095:60:24,3:28,2:7,48,0,5
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chr20	29623957	.	C	G	.	.	DP=127;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=125,133;MMQ=23,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,46:0.393:119:41,16:29,30:40,33,33,13
chr20	29623960	.	AT	A	.	.	DP=134;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=114,115;MMQ=36,23;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,18:0.133:121:48,9:47,9:67,36,7,11
chr20	29623980	.	G	A	.	.	DP=151;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=116,92;MMQ=39,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,16:0.113:146:65,10:64,6:76,54,6,10
chr20	29623988	.	A	G	.	.	DP=161;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=111,135;MMQ=40,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:146,8:0.056:154:75,4:71,4:83,63,2,6
chr20	29624020	.	G	GT	.	.	DP=192;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=125,111;MMQ=55,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=210.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,107:0.714:150:26,62:17,40:18,25,53,54
chr20	29624067	.	AT	TC	.	.	DP=180;ECNT=8;MBQ=23,25;MFRL=107,172;MMQ=51,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:170,3:0.023:173:98,2:64,1:74,96,3,0
chr20	29624070	.	G	A	.	.	DP=182;ECNT=8;MBQ=29,22;MFRL=118,103;MMQ=51,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=237.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,105:0.617:170:48,60:15,45:34,31,42,63
chr20	29624093	.	G	T	.	.	DP=156;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=117,88;MMQ=40,48;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,8:0.057:148:81,5:57,3:54,86,3,5
chr20	29624158	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=151,152;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,18:0.430:42:19,15:5,3:0|1:29624158_A_T:29624158:7,17,2,16
chr20	29624166	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:11,14:4,2:4,12,2,16
chr20	29624177	.	GG	AC	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=161,151;MMQ=47,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.256:33:18,6:7,2:0|1:29624158_A_T:29624158:7,18,0,8
chr20	29624178	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=169,151;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.599:31:9,11:3,8:4,8,3,16
chr20	29625788	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=26;MBQ=31,26;MFRL=166,171;MMQ=42,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:16,8:20,7:31,6,11,4
chr20	29625817	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=26;MBQ=23,31;MFRL=138,220;MMQ=40,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,6:0.128:53:17,2:30,4:0|1:29625817_T_C:29625817:37,10,6,0
chr20	29625818	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=26;MBQ=31,22;MFRL=151,110;MMQ=40,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.085:55:18,1:31,3:41,10,3,1
chr20	29625832	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=26;MBQ=24,31;MFRL=141,227;MMQ=40,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.089:66:22,2:36,3:0|1:29625817_T_C:29625817:46,15,5,0
chr20	29625838	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=26;MBQ=29,27;MFRL=149,146;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=210.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,59:0.851:69:4,24:5,32:5,5,46,13
chr20	29625852	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=26;MBQ=25,31;MFRL=140,129;MMQ=40,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,24:0.236:104:29,12:44,10:0|1:29625852_A_G:29625852:50,30,17,7
chr20	29625854	.	C	G	.	.	DP=111;ECNT=26;MBQ=31,32;MFRL=134,138;MMQ=43,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,5:0.051:111:42,0:54,4:0|1:29625854_C_G:29625854:66,40,3,2
chr20	29625855	.	T	C	.	.	DP=114;ECNT=26;MBQ=24,31;MFRL=138,129;MMQ=40,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,24:0.227:108:26,11:44,12:0|1:29625852_A_G:29625852:52,32,17,7
chr20	29625856	.	A	G	.	.	DP=119;ECNT=26;MBQ=25,32;MFRL=133,138;MMQ=44,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,6:0.056:119:45,0:57,4:0|1:29625854_C_G:29625854:72,41,3,3
chr20	29625867	.	G	A	.	.	DP=148;ECNT=26;MBQ=32,24;MFRL=126,188;MMQ=51,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:141,7:0.053:148:63,0:66,7:0|1:29625854_C_G:29625854:81,60,4,3
chr20	29625873	.	A	C	.	.	DP=164;ECNT=26;MBQ=26,30;MFRL=128,123;MMQ=50,52;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,23:0.144:163:57,10:75,13:83,57,10,13
chr20	29625876	.	C	T	.	.	DP=162;ECNT=26;MBQ=31,24;MFRL=130,123;MMQ=50,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,51:0.324:158:50,20:56,30:60,47,28,23
chr20	29625877	.	G	A	.	.	DP=162;ECNT=26;MBQ=30,26;MFRL=125,129;MMQ=54,46;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,68:0.431:158:38,33:49,35:50,40,38,30
chr20	29625885	.	A	T	.	.	DP=166;ECNT=26;MBQ=26,23;MFRL=126,188;MMQ=52,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:159,7:0.048:166:77,0:78,6:0|1:29625854_C_G:29625854:89,70,4,3
chr20	29625895	.	G	A	.	.	DP=171;ECNT=26;MBQ=31,23;MFRL=130,98;MMQ=52,36;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,10:0.063:169:72,8:81,2:89,70,4,6
chr20	29625925	.	C	CTTG	.	.	DP=142;ECNT=26;MBQ=31,30;MFRL=115,145;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTG;STR;TLOD=246.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,70:0.622:112:21,21:20,35:23,19,34,36
chr20	29625979	.	C	A	.	.	DP=136;ECNT=26;MBQ=32,24;MFRL=140,150;MMQ=39,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,22:0.174:129:44,8:57,14:53,54,9,13
chr20	29625984	.	TG	CC	.	.	DP=146;ECNT=26;MBQ=25,31;MFRL=146,122;MMQ=39,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,28:0.203:141:51,7:57,21:52,61,11,17
chr20	29625997	.	A	T	.	.	DP=134;ECNT=26;MBQ=25,25;MFRL=129,131;MMQ=39,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=156.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,70:0.523:132:24,34:35,35:22,40,33,37
chr20	29626013	.	T	C	.	.	DP=140;ECNT=26;MBQ=24,34;MFRL=126,149;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,19:0.144:137:55,9:55,9:0|1:29626013_T_C:29626013:48,70,5,14
chr20	29626021	.	G	A	.	.	DP=132;ECNT=26;MBQ=30,24;MFRL=121,149;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,19:0.149:132:53,9:53,10:0|1:29626013_T_C:29626013:44,69,4,15
chr20	29626025	.	A	C	.	.	DP=133;ECNT=26;MBQ=24,34;MFRL=122,131;MMQ=39,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,16:0.131:127:56,6:54,10:38,73,5,11
chr20	29626027	.	C	T	.	.	DP=131;ECNT=26;MBQ=32,22;MFRL=124,111;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,45:0.368:123:38,23:40,22:24,54,18,27
chr20	29626029	.	G	C	.	.	DP=129;ECNT=26;MBQ=31,32;MFRL=125,111;MMQ=40,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,24:0.191:127:48,9:53,12:34,69,9,15
chr20	29626045	.	C	A	.	.	DP=112;ECNT=26;MBQ=32,24;MFRL=123,107;MMQ=41,26;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,4:0.044:111:48,3:56,1:27,80,0,4
chr20	29626055	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=26;MBQ=23,30;MFRL=123,115;MMQ=53,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,19:0.202:86:36,8:31,11:17,50,5,14
chr20	29626083	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,154;MMQ=52,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,12:0.228:55:21,6:21,6:7,36,2,10
chr20	29628158	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=22;MBQ=31,27;MFRL=132,121;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:10,9:7,6:18,1,13,2
chr20	29628164	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=22;MBQ=31,28;MFRL=131,133;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.679:41:6,15:6,13:12,1,25,3
chr20	29628167	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=22;MBQ=30,22;MFRL=121,99;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.089:53:25,3:21,1:42,7,3,1
chr20	29628177	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=22;MBQ=30,24;MFRL=106,146;MMQ=44,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,9:0.121:80:42,6:28,3:0|1:29628177_C_T:29628177:56,15,9,0
chr20	29628185	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=22;MBQ=27,33;MFRL=106,146;MMQ=40,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,9:0.106:92:44,6:33,3:0|1:29628177_C_T:29628177:67,16,9,0
chr20	29628216	.	G	C	.	.	DP=181;ECNT=22;MBQ=20,31;MFRL=104,112;MMQ=42,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,20:0.105:180:83,11:72,9:103,57,12,8
chr20	29628226	.	G	A	.	.	DP=183;ECNT=22;MBQ=30,20;MFRL=106,87;MMQ=40,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:164,15:0.083:179:82,9:76,6:98,66,5,10
chr20	29628229	.	G	GA	.	.	DP=185;ECNT=22;MBQ=20,31;MFRL=105,121;MMQ=40,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:171,7:0.038:178:88,4:78,3:93,78,3,4
chr20	29628233	.	A	G	.	.	DP=184;ECNT=22;MBQ=21,20;MFRL=107,87;MMQ=40,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:174,9:0.050:183:86,6:83,3:94,80,2,7
chr20	29628237	.	C	A	.	.	DP=177;ECNT=22;MBQ=28,20;MFRL=108,100;MMQ=40,37;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:149,24:0.141:173:76,12:72,12:75,74,13,11
chr20	29628241	.	G	C	.	.	DP=168;ECNT=22;MBQ=29,31;MFRL=108,143;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:153,9:0.061:162:71,8:79,1:0|1:29628241_G_C:29628241:69,84,7,2
chr20	29628243	.	T	C	.	.	DP=165;ECNT=22;MBQ=24,31;MFRL=109,144;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:154,11:0.072:165:71,8:77,1:0|1:29628241_G_C:29628241:68,86,7,4
chr20	29628254	.	A	G	.	.	DP=169;ECNT=22;MBQ=23,29;MFRL=116,120;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,25:0.159:160:65,14:68,11:55,80,11,14
chr20	29628257	.	T	C	.	.	DP=166;ECNT=22;MBQ=26,28;MFRL=116,144;MMQ=40,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:152,13:0.078:165:63,8:74,4:0|1:29628241_G_C:29628241:59,93,6,7
chr20	29628271	.	C	T	.	.	DP=117;ECNT=22;MBQ=32,25;MFRL=130,136;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,48:0.427:113:29,20:34,26:22,43,12,36
chr20	29628273	.	A	G	.	.	DP=120;ECNT=22;MBQ=25,30;MFRL=135,144;MMQ=40,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,9:0.083:119:43,5:55,4:0|1:29628273_A_G:29628273:32,78,1,8
chr20	29628274	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=127;ECNT=22;MBQ=27,28;MFRL=135,144;MMQ=40,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,9:0.078:126:46,5:56,4:0|1:29628273_A_G:29628273:36,81,1,8
chr20	29628328	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=22;MBQ=32,30;MFRL=149,156;MMQ=40,33;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:17,4:23,3:11,29,3,4
chr20	29628335	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=22;MBQ=23,26;MFRL=142,149;MMQ=40,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.256:39:11,6:16,4:11,18,1,9
chr20	29628336	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=22;MBQ=26,26;MFRL=142,171;MMQ=40,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:13,3:19,1:11,24,1,3
chr20	29628341	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=22;MBQ=29,23;MFRL=122,152;MMQ=52,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.363:33:4,6:16,4:7,14,1,11
chr20	29628361	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=22;MBQ=27,35;MFRL=128,156;MMQ=57,31;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:3,2:10,5:2,12,1,6
chr20	29628415	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=166,173;MMQ=40,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.120:48:19,3:24,2:9,34,2,3
chr20	29628424	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=166,177;MMQ=40,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:19,1:18,2:10,28,0,3
chr20	29628431	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=99,173;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=99.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,31:0.782:39:2,18:6,13:3,5,10,21
chr20	29631591	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=157,184;MMQ=27,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,6:0.116:58:25,4:24,2:27,25,6,0
chr20	29631604	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=33,25;MFRL=168,173;MMQ=27,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,3:0.063:60:28,2:27,1:0|1:29631604_G_A:29631604:38,19,2,1
chr20	29631606	.	A	C	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=27,29;MFRL=172,166;MMQ=27,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.095:61:27,4:27,1:37,19,5,0
chr20	29631613	.	TG	CA	.	.	DP=67;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=167,174;MMQ=27,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,12:0.209:60:24,8:22,4:35,13,12,0
chr20	29631627	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=12;MBQ=26,29;MFRL=161,139;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:32,3:25,2:0|1:29631604_G_A:29631604:48,10,5,0
chr20	29631632	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=158,139;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.094:62:33,3:23,1:0|1:29631604_G_A:29631604:49,8,5,0
chr20	29631642	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=26,33;MFRL=156,164;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:30,6:22,2:47,6,8,0
chr20	29631704	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=126,117;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,24:0.258:95:45,16:25,8:27,44,9,15
chr20	29631715	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=127,115;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,20:0.180:113:57,16:34,4:30,63,6,14
chr20	29631725	.	T	G	.	.	DP=114;ECNT=12;MBQ=26,30;MFRL=156,126;MMQ=58,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=379.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,102:0.897:113:6,67:5,32:5,6,29,73
chr20	29631733	.	CT	AT,AC	.	.	DP=110;ECNT=12;MBQ=31,23,26;MFRL=129,123,135;MMQ=27,27,27;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=130.22,19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:56,46,7:0.419,0.071:109:36,29,3:19,14,4:16,40,10,43
chr20	29631734	.	T	C	.	.	DP=108;ECNT=12;MBQ=28,27;MFRL=126,156;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,4:0.041:100:62,1:31,2:21,75,2,2
chr20	29632562	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=135,107;MMQ=40,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,4:0.053:90:41,3:42,1:65,21,4,0
chr20	29632564	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=139,130;MMQ=60,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=144.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,52:0.542:96:19,26:23,21:26,18,48,4
chr20	29632569	.	CAG	C	.	.	DP=148;ECNT=13;MBQ=31,32;MFRL=122,136;MMQ=49,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:136,11:0.081:147:50,7:51,4:104,32,10,1
chr20	29632583	.	T	C	.	.	DP=197;ECNT=13;MBQ=23,30;MFRL=116,97;MMQ=49,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:179,12:0.038:191:80,7:89,5:128,51,12,0
chr20	29632593	.	A	G	.	.	DP=251;ECNT=13;MBQ=24,31;MFRL=98,114;MMQ=49,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:209,33:0.132:242:96,19:103,14:139,70,25,8
chr20	29632632	.	A	G	.	.	DP=299;ECNT=13;MBQ=21,31;MFRL=113,113;MMQ=49,37;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:279,15:0.049:294:132,8:131,7:151,128,10,5
chr20	29632635	.	C	G	.	.	DP=290;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=112,96;MMQ=49,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:260,15:0.044:275:122,10:131,5:137,123,9,6
chr20	29632638	.	C	A	.	.	DP=290;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=114,110;MMQ=47,50;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:235,46:0.159:281:109,25:118,20:125,110,23,23
chr20	29632643	.	T	C	.	.	DP=285;ECNT=13;MBQ=25,27;MFRL=116,104;MMQ=49,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:267,14:0.053:281:123,8:121,5:137,130,8,6
chr20	29632660	.	G	T	.	.	DP=320;ECNT=13;MBQ=30,23;MFRL=114,124;MMQ=52,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:298,17:0.056:315:145,6:140,11:171,127,9,8
chr20	29632662	.	G	T,C	.	.	DP=327;ECNT=13;MBQ=30,22,31;MFRL=114,104,123;MMQ=57,39,27;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=31.21,143.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:234,14,61:0.046,0.192:309:113,8,24:110,6,33:130,104,44,31
chr20	29632673	.	T	C	.	.	DP=343;ECNT=13;MBQ=26,31;MFRL=113,117;MMQ=52,36;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:329,8:0.025:337:162,2:158,6:181,148,5,3
chr20	29632674	.	T	TA	.	.	DP=346;ECNT=13;MBQ=24,25;MFRL=112,117;MMQ=52,57;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=74.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:271,50:0.150:321:133,25:133,23:157,114,26,24
chr20	29632707	.	G	A	.	.	DP=365;ECNT=9;MBQ=28,21;MFRL=109,99;MMQ=51,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:319,39:0.108:358:179,23:133,16:178,141,19,20
chr20	29632709	.	C	T	.	.	DP=366;ECNT=9;MBQ=24,20;MFRL=111,107;MMQ=52,47;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=283.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:276,88:0.242:364:145,48:121,33:0|1:29632709_C_T:29632709:152,124,47,41
chr20	29632714	.	CT	AG	.	.	DP=350;ECNT=9;MBQ=30,24;MFRL=110,113;MMQ=51,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=278.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:265,82:0.238:347:130,44:110,35:0|1:29632709_C_T:29632709:145,120,42,40
chr20	29632719	.	C	T	.	.	DP=320;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=112,96;MMQ=51,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:296,15:0.046:311:152,8:125,7:154,142,7,8
chr20	29632726	.	CTATT	C	.	.	DP=294;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=113,114;MMQ=51,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=307.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:150,91:0.380:241:87,49:57,42:72,78,35,56
chr20	29632749	.	A	G	.	.	DP=216;ECNT=9;MBQ=23,29;MFRL=123,112;MMQ=46,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,39:0.199:198:80,23:75,16:64,95,17,22
chr20	29632751	.	T	C	.	.	DP=204;ECNT=9;MBQ=26,34;MFRL=120,145;MMQ=47,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:174,10:0.040:184:91,3:75,7:70,104,4,6
chr20	29632759	.	G	A	.	.	DP=186;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=125,132;MMQ=45,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:156,18:0.084:174:79,11:71,7:56,100,10,8
chr20	29632761	.	T	C	.	.	DP=181;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=147,128;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=592.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,158:0.915:172:8,81:6,69:1,13,61,97
chr20	29633823	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=14;MBQ=25,29;MFRL=152,111;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,15:0.176:88:42,6:30,9:58,15,10,5
chr20	29633887	.	G	A	.	.	DP=170;ECNT=14;MBQ=30,25;MFRL=121,119;MMQ=51,44;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:143,8:0.053:151:81,4:53,4:75,68,4,4
chr20	29633894	.	C	A	.	.	DP=162;ECNT=14;MBQ=31,26;MFRL=122,139;MMQ=49,55;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:148,6:0.043:154:82,4:54,2:68,80,4,2
chr20	29633900	.	AA	GA,GG	.	.	DP=179;ECNT=14;MBQ=24,31,21;MFRL=121,137,101;MMQ=51,33,48;MPOS=14,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=66.05,26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:128,35,11:0.202,0.067:174:80,20,5:40,15,6:58,70,22,24
chr20	29633915	.	C	T	.	.	DP=173;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=126,135;MMQ=49,33;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:157,13:0.081:170:89,10:57,3:72,85,5,8
chr20	29633916	.	G	T,A	.	.	DP=172;ECNT=14;MBQ=30,25,26;MFRL=117,123,138;MMQ=52,49,33;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=199.38,206.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,56,65:0.331,0.400:164:24,35,40:18,19,23:18,25,57,64
chr20	29633925	.	T	A	.	.	DP=169;ECNT=14;MBQ=27,25;MFRL=126,101;MMQ=49,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:164,5:0.035:169:99,2:59,3:73,91,1,4
chr20	29633927	.	C	A	.	.	DP=166;ECNT=14;MBQ=32,24;MFRL=123,126;MMQ=46,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,56:0.339:166:63,36:42,19:0|1:29633927_C_A:29633927:49,61,22,34
chr20	29633929	.	A	G	.	.	DP=168;ECNT=14;MBQ=24,31;MFRL=125,126;MMQ=48,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,56:0.335:168:65,36:41,20:0|1:29633927_C_A:29633927:49,63,22,34
chr20	29633938	.	A	G	.	.	DP=167;ECNT=14;MBQ=24,31;MFRL=122,138;MMQ=50,31;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:122,42:0.257:164:76,24:41,15:52,70,15,27
chr20	29633952	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=135,141;MMQ=49,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,35:0.293:121:51,18:30,13:0|1:29633927_C_A:29633927:36,50,11,24
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chr20	29994026	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29994026_G_C:29994026:0,3,0,1
chr20	29994029	.	GT	CC,CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29,34;MFRL=127,140,131;MMQ=60,60,36;MPOS=6,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,0:1,0,1:0,2,0,2
chr20	29994032	.	CAGA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:29994026_G_C:29994026:0,4,0,1
chr20	29994035	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=128,131;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:29994035_A_C:29994035:0,3,0,1
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chr20	30037783	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=69,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,5:2,5:4,4,7,3
chr20	30053255	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
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chr20	30138038	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:30138033_T_TC:30138033:1,6,0,2
chr20	30142532	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.303:32:5,2:13,4:9,13,7,3
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chr20	30363645	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=88,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:3,6:6,8:5,4,11,5
chr20	30380635	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,2:17,0:0|1:30380635_T_C:30380635:14,22,1,1
chr20	30380645	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,2:15,0:0|1:30380635_T_C:30380635:12,18,1,1
chr20	30380647	.	A	AAGCAGAAGGTAATGTTTTTT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=99,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:0|1:30380635_T_C:30380635:12,18,1,1
chr20	30381758	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=107,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.667:34:5,14:6,9:5,6,11,12
chr20	30385192	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=104,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,4:3,4:7,1,7,1
chr20	30419572	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=112,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:14,2:0|1:30419572_C_CT:30419572:8,13,1,1
chr20	30419576	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=104,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:30419572_C_CT:30419572:8,14,1,1
chr20	30421459	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=87,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:4,6:7,2:8,4,4,4
chr20	30449325	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr20	30452709	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:1,3,4,6
chr20	30467811	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:30467811_G_A:30467811:0,0,0,5
chr20	30467818	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:30467811_G_A:30467811:0,0,0,3
chr20	30467820	.	G	GCAGTTGAAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:30467811_G_A:30467811:0,0,0,2
chr20	30467823	.	G	GCAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30467811_G_A:30467811:0,0,0,1
chr20	30467825	.	G	GAATTATGGGAAGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:30467811_G_A:30467811:0,0,0,1
chr20	30512834	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=90,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,0:10,2:10,9,1,1
chr20	30512913	.	GATGGGGGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr20	30671875	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	30720778	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:8,0:2,3:8,2,2,1
chr20	30729488	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:1,5,0,6
chr20	30732847	.	G	GGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:1,3:8,0:8,2,3,0
chr20	30737663	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr20	30742834	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=199,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,13:4,0:6,0,13,0
chr20	30753270	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:4,4,2,6
chr20	30784654	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=155,118;MMQ=40,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:5,5:15,3:6,14,3,5
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chr20	30784829	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,14:0.326:44:21,0:9,14:0|1:30784822_C_T:30784822:14,16,0,14
chr20	30804785	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:12,1,1,1
chr20	30818850	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=86,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,5:0,3:1,2,3,5
chr20	30818909	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr20	30898386	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:5,3,4,0
chr20	30898412	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=75,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:7,8,4,0
chr20	30914706	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:2,7,0,2
chr20	30954295	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,18:0.387:47:14,11:15,7:15,14,7,11
chr20	31016314	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr20	31019024	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr20	31024694	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:6,3:8,4,2,4
chr20	31024798	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,0:10,3:7,9,1,2
chr20	31025163	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,2:6,4:2,9,1,5
chr20	31025231	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr20	31041555	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr20	31099311	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr20	31189411	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr20	31291161	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr20	31291919	.	GGGCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr20	31292184	.	T	TATG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,10:0,0,18,5
chr20	31292298	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30,26,30;MFRL=129,121,141,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,22,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.20,4.44,18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,3,4,10:0.143,0.204,0.502:20:1,1,3,0:1,1,0,8:2,1,7,10
chr20	31292700	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:15,0:4,3:3,17,0,3
chr20	31294314	.	CA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=79,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:2,2:5,3:8,14,4,2
chr20	31294655	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr20	31367986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:3,4:5,0:4,4,2,2
chr20	31383480	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.210:27:8,5:11,0:12,10,5,0
chr20	31385136	.	G	GTCTGTGCCCCCCGGCTCGCTGTCCTCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=133,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.254:9:2,2:4,0:0,7,1,1
chr20	31385157	.	C	CAGTCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr20	31388573	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr20	31390138	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:2,1,6,1
chr20	31424505	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=98,39;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:21,0:10,2:19,12,2,0
chr20	31427592	.	GCCCTGGTGTGGTGCGAAAGAA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=108,42;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.090:32:16,0:9,2:14,16,1,1
chr20	31446766	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:7,6:0,5:2,5,6,5
chr20	31466534	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr20	31473483	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr20	31477274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr20	31480938	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr20	31480961	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr20	31484417	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	31531544	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,2:9,5:7,7,4,4
chr20	31546212	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=116,102;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:16,4:11,0:11,16,4,0
chr20	31547816	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:11,13,2,1
chr20	31549424	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr20	31573044	.	G	GGCTGTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=130,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:0|1:31573044_G_GGCTGTCTCC:31573044:0,2,0,1
chr20	31573049	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=199,267;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31573044_G_GGCTGTCTCC:31573044:0,2,0,1
chr20	31573057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=199,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31573044_G_GGCTGTCTCC:31573044:0,2,0,1
chr20	31573059	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=199,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31573044_G_GGCTGTCTCC:31573044:0,2,0,1
chr20	31573528	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,6:1,9:0,1,11,5
chr20	31573614	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,2:12,1:8,13,2,1
chr20	31573769	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr20	31588002	.	T	TTTCTCCTATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:31588002_T_TTTCTCCTATC:31588002:0,2,0,1
chr20	31588009	.	CG	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:31588002_T_TTTCTCCTATC:31588002:0,3,0,1
chr20	31590530	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr20	31592242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr20	31604937	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:1,3,0,1
chr20	31606474	.	TCCTGCCCACGGATGCCACCCCTTTTGTGTTGCCAAGGCATGTGGGTACCGAGGGCTCCATGGCCACCGTGGGCCTCTCCCAGCAGCTGTTTGACTCTGCGCTCCTGCTGCTGCAGAAGGCCGGTGCCCTCAA	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.117:31:5,1:7,3:7,18,4,2
chr20	31606548	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=130,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:1,0:7,2:0|1:31606548_C_T:31606548:3,5,1,1
chr20	31606552	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:0,0:4,2:0|1:31606548_C_T:31606548:3,4,1,1
chr20	31606564	.	T	TCTTCCA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:1,0:5,2:3,3,1,1
chr20	31623061	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	31630728	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=63,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:0|1:31630728_T_G:31630728:2,5,1,1
chr20	31630730	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=63,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:31630728_T_G:31630728:2,5,1,1
chr20	31630731	.	A	ATCTCTGTGACCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=63,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:0|1:31630728_T_G:31630728:2,5,1,1
chr20	31647204	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:7,1:7,5,3,0
chr20	31649724	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:31649724_GC_G:31649724:0,3,0,1
chr20	31649726	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=85,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:31649724_GC_G:31649724:0,3,0,1
chr20	31651583	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr20	31660489	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=73,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:10,4:12,2:14,8,2,4
chr20	31671599	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=112,79;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,4:8,10:8,7,10,4
chr20	31671663	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr20	31671693	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	31672726	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:8,4,1,1
chr20	31672736	.	TGCG	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:6,2:0|1:31672736_TGCG_T:31672736:8,5,1,1
chr20	31672743	.	C	CCAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:31672736_TGCG_T:31672736:8,6,1,1
chr20	31677476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	31678638	.	G	GCACACATATA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:31678638_G_GCACACATATA:31678638:0,7,1,1
chr20	31678640	.	C	CTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:31678638_G_GCACACATATA:31678638:0,7,1,1
chr20	31678641	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:31678638_G_GCACACATATA:31678638:0,7,1,1
chr20	31680495	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31680495_C_A:31680495:0,1,0,1
chr20	31680497	.	G	GGGTGGGTGAGTGGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:31680495_C_A:31680495:0,1,0,1
chr20	31685405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:2,2,4,0
chr20	31688260	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr20	31688330	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr20	31767402	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,0:10,3:8,10,1,2
chr20	31768282	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:10,0:17,4:16,12,1,3
chr20	31811551	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,18,4
chr20	31813134	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr20	31814348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr20	31825704	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=26,18;RU=TG;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.863:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr20	31825999	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:31825999_C_T:31825999:8,7,1,1
chr20	31826006	.	G	GGGC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=146,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:31825999_C_T:31825999:8,8,1,1
chr20	31826010	.	A	AGATTAAG	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:31825999_C_T:31825999:5,8,1,1
chr20	31826012	.	C	CTCCGTCTCAAA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:5,1:0|1:31825999_C_T:31825999:5,8,1,1
chr20	31826027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,29;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,3:2,3:3,3,2,4
chr20	31826088	.	GGCAGTGACCCTGAA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	31828265	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	31873821	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:2,1,5,0
chr20	31876485	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr20	31876777	.	A	ACCTCCATCTCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=215,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,0:0|1:31876777_A_ACCTCCATCTCCC:31876777:0,1,0,1
chr20	31876778	.	G	GAGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=215,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:31876777_A_ACCTCCATCTCCC:31876777:0,1,0,1
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chr20	31878901	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31878900_A_ACGTC:31878900:0,1,0,1
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chr20	31975062	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.536:10:3,2:2,2:3,2,4,1
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chr20	31996742	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=90,86;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:31996741_C_CACACACACACACACACACACACACACA:31996741:4,9,0,2
chr20	32000355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,169;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:7,0,3,0
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chr20	32026930	.	C	CCATCTCCATCACAGGCTAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	32207419	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=117,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:32207419_TG_T:32207419:7,13,1,1
chr20	32207422	.	TAATTA	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:8,0:0|1:32207419_TG_T:32207419:7,15,1,1
chr20	32207428	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:10,0:0|1:32207419_TG_T:32207419:6,15,1,1
chr20	32211760	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=48,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.509:16:0,1:1,1:1,7,0,8
chr20	32216323	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0,12,0,2
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chr20	32245546	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr20	32245869	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr20	32248163	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,7,8
chr20	32257511	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:6,0:17,2:14,10,2,0
chr20	32264559	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=84,81;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:21,6:12,0:0|1:32264559_G_T:32264559:15,19,6,0
chr20	32264561	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=84,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:22,6:10,0:0|1:32264559_G_T:32264559:15,19,6,0
chr20	32264859	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,33;MFRL=208,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,2,0
chr20	32264871	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=24,16;MFRL=97,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,1,1,0
chr20	32264879	.	TG	GC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=97,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,1,1,0
chr20	32264885	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=22,26;MFRL=49,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,2,1,0
chr20	32264890	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=22,31;MFRL=49,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,2,1,0
chr20	32264894	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=21,31;MFRL=49,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,4,1,0
chr20	32264897	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,12;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,3,1,0
chr20	32264903	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,13;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,4,1,0
chr20	32264905	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=23,12;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:32264871_A_AG:32264871:0,4,1,0
chr20	32295541	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,11,12
chr20	32295773	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,3:14,0:15,16,0,3
chr20	32298323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,3,2
chr20	32333181	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr20	32336754	.	C	CACT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:20,2:23,1:0|1:32336754_C_CACT:32336754:18,26,0,3
chr20	32336755	.	G	GAC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:21,2:23,1:0|1:32336754_C_CACT:32336754:18,26,0,3
chr20	32376844	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:32376844_G_T:32376844:1,1,0,1
chr20	32376847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=231,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32376844_G_T:32376844:0,1,0,1
chr20	32376850	.	T	TACTACTGTTCATCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=231,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:32376844_G_T:32376844:0,1,0,1
chr20	32664864	.	C	CCAG	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:12,9:10,8:13,9,10,7
chr20	32665084	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:3,6,1,6
chr20	32891200	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr20	32996689	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,7:0,2:1,3,1,8
chr20	33037336	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:2,3,2,4
chr20	33045170	.	TCCCCTG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCTG;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:7,2:12,9,1,1
chr20	33057954	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.201:31:12,1:13,4:9,16,4,2
chr20	33057974	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr20	33068563	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:1,4,1,5
chr20	33077105	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,158;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,3:16,0:15,14,3,0
chr20	33104527	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,4:9,3:14,3,7,0
chr20	33114201	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:3,9,2,5
chr20	33147079	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:8,0:5,1:0|1:33147079_A_C:33147079:0,13,3,0
chr20	33147084	.	CAGCCCTG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:0|1:33147079_A_C:33147079:0,13,3,0
chr20	33147096	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:33147079_A_C:33147079:0,13,2,0
chr20	33147737	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:3,5,1,6
chr20	33148861	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr20	33296964	.	GGTGTGTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=51,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=GT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:33296964_GGTGTGTGT_G:33296964:2,0,1,0
chr20	33296988	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=123,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33296964_GGTGTGTGT_G:33296964:2,0,1,0
chr20	33315120	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,3:8,0:12,5,3,0
chr20	33320344	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,189;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:7,3:14,0:15,6,3,0
chr20	33329590	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=168,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:5,5,2,1
chr20	33329641	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:6,3:8,6,2,1
chr20	33334540	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=207,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr20	33334719	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,1:8,2:15,6,0,3
chr20	33337751	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.660:21:5,8:1,5:3,4,6,8
chr20	33342439	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr20	33342477	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:7,6:5,0:9,3,5,1
chr20	33346556	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr20	33447162	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr20	33448189	.	A	AGAACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	33451148	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:3,7:8,6:4,7,5,9
chr20	33460366	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr20	33462979	.	GGGTGGAGGGGCTAGAGAGAAGCTAGAGGTAATTAAGCCCAGGTTGT	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,5:0.073:83:38,5:16,0:34,44,3,2
chr20	33501071	.	GGGAT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:0|1:33501071_GGGAT_G:33501071:1,10,0,2
chr20	33501080	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:0|1:33501071_GGGAT_G:33501071:1,10,0,2
chr20	33508588	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr20	33508996	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr20	33509275	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr20	33509523	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr20	33513860	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:12,0,1,1
chr20	33514583	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=143,205;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,12:3,0:8,0,12,0
chr20	33517168	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,31;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:33517168_G_A:33517168:10,2,1,1
chr20	33517176	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=123,31;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:33517168_G_A:33517168:11,3,1,1
chr20	33530507	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=244,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:33530507_C_CA:33530507:0,1,0,1
chr20	33530508	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=244,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:33530507_C_CA:33530507:0,1,0,1
chr20	33533736	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,15,11
chr20	33565366	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.184:47:30,8:7,0:31,8,8,0
chr20	33565399	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:13,0:11,5:11,13,0,5
chr20	33565511	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=82,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:7,4,1,1
chr20	33565665	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=246,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr20	33575718	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:16,0:19,6:5,33,0,6
chr20	33584822	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr20	33584864	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	33585032	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=162,67;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:0|1:33585032_C_T:33585032:1,5,1,2
chr20	33585048	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,67;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,1:0|1:33585032_C_T:33585032:0,4,1,2
chr20	33586808	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.767:24:2,17:3,0:4,1,19,0
chr20	33588893	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.304:44:19,9:12,4:14,17,2,11
chr20	33589406	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,0:3,5:1,5,0,5
chr20	33593491	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:6,5,2,2
chr20	33596441	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,2:6,1:9,6,0,3
chr20	33596469	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=142,129;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:3,0:9,6,0,2
chr20	33632219	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=170,171;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:3,1,1,0
chr20	33632256	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=119,130;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,2:5,0:9,6,2,0
chr20	33642849	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:6,12,1,2
chr20	33645273	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.432:28:10,4:6,8:9,7,8,4
chr20	33730364	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	33734905	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,9,5
chr20	33762489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,2:0,5:1,0,5,2
chr20	33762854	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	33763951	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr20	33764632	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=254,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,9:0,7:1,0,3,13
chr20	33859675	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	33867697	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,6:2,6:4,2,8,4
chr20	33874658	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:9,0:4,11,1,2
chr20	33891946	.	CCTCCCAGAGGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33891946_CCTCCCAGAGGAG_C:33891946:0,3,0,1
chr20	33891960	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33891946_CCTCCCAGAGGAG_C:33891946:0,3,0,1
chr20	34021829	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=64,54;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,4:16,0:26,14,4,0
chr20	34023103	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34023103_A_G:34023103:0,1,0,1
chr20	34023106	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34023103_A_G:34023103:0,1,0,1
chr20	34025756	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=130,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:2,8,0,3
chr20	34054065	.	C	CCCATTTAAAATTCCCTTTGAAAAGATCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,101;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.386:4:3,1:0,0:0|1:34054065_C_CCCATTTAAAATTCCCTTTGAAAAGATCT:34054065:0,3,0,1
chr20	34054069	.	T	TTTGGGTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=171,101;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:34054065_C_CCCATTTAAAATTCCCTTTGAAAAGATCT:34054065:0,2,0,1
chr20	34054994	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,1,2
chr20	34057632	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=293,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.551:2:1,0:0,0:0|1:34057632_G_T:34057632:1,0,1,0
chr20	34057640	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=293,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.551:2:1,0:0,0:0|1:34057632_G_T:34057632:1,0,1,0
chr20	34057653	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=242,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:34057632_G_T:34057632:4,0,1,0
chr20	34057984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr20	34079200	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,8,17
chr20	34082413	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:15,0:11,2:0|1:34082413_G_T:34082413:15,13,0,2
chr20	34082415	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:11,2:0|1:34082413_G_T:34082413:15,13,0,2
chr20	34082416	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:10,2:0|1:34082413_G_T:34082413:14,11,0,2
chr20	34099165	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.321:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr20	34099366	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.146:25:11,1:11,2:0|1:34099366_C_T:34099366:9,13,3,0
chr20	34099374	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=126,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,3:0.165:22:9,3:10,0:1|0:34099366_C_T:34099366:11,8,0,3
chr20	34130710	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=73,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:1,2,1,6
chr20	34144107	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,2,15
chr20	34205557	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.274:11:3,0:3,0:3,5,0,3
chr20	34214012	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=187,564;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,5:1,0:3,0,0,5
chr20	34215109	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=22,25;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	34241045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=118,219;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:5,0:7,3:3,9,0,4
chr20	34241075	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=97,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:4,4,0,2
chr20	34263172	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:8,3:11,0:3,16,1,2
chr20	34278541	.	GA	TT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0|1:34278541_GA_TT:34278541:0,9,0,2
chr20	34278545	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:34278541_GA_TT:34278541:0,8,0,2
chr20	34285515	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:2,9:7,0:8,1,9,0
chr20	34301019	.	C	CAAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:11,2:7,0:0|1:34301019_C_CAAA:34301019:7,11,1,1
chr20	34301020	.	T	TGTTCTCTCCAACTGACCC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:11,2:7,0:0|1:34301019_C_CAAA:34301019:7,11,1,1
chr20	34302151	.	AA	TG	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=133,211;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=109.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:9,25:16,3:11,14,28,0
chr20	34304616	.	TA	T,TAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,26,27;MFRL=135,118,0;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=14.98,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,11,3:0.371,0.139:27:7,4,1:6,7,2:11,2,11,3
chr20	34304736	.	GAAAAGCATAATTACTATAACTT	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:15,2:22,0:16,35,1,1
chr20	34328722	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,148;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.077:63:27,4:30,0:36,23,4,0
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chr20	34435246	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.293:12:6,3:3,0:9,0,3,0
chr20	34437378	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=124,120;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:32,8:21,0:34,19,8,0
chr20	34437433	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=108,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,9:0.151:64:22,0:32,9:0|1:34437433_T_C:34437433:23,32,0,9
chr20	34437436	.	T	G	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=100,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,9:0.151:64:21,0:32,9:0|1:34437433_T_C:34437433:23,32,0,9
chr20	34451230	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=127,197;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:7,5:16,0:13,10,5,0
chr20	34596200	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:2,0:5,3:5,2,2,1
chr20	34618490	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.312:26:6,7:12,0:8,10,8,0
chr20	34763425	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,4:3,0:9,2,4,0
chr20	34775551	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr20	34782186	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:16,0:6,2:13,10,0,2
chr20	34782211	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:15,0:10,4:11,14,1,3
chr20	34785723	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr20	34797851	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:10,9,2,1
chr20	34809849	.	GA	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=198,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:34809849_GA_TC:34809849:1,6,1,1
chr20	34809853	.	T	TCTCTCTCACAGTTCTGGACCTCTCTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=198,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:34809849_GA_TC:34809849:1,6,1,1
chr20	34832601	.	CCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=70.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr20	34832709	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=77,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:12,4:16,0:16,13,4,0
chr20	34843605	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:7,8:3,6:5,5,7,8
chr20	35060913	.	ACTGCCCCACCACCCCCGCCCGCACCCCCAGCCAC	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:5,0:7,2:7,27,1,1
chr20	35125526	.	G	GTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:35125526_G_GTGT:35125526:0,1,0,1
chr20	35125528	.	A	AAAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:35125526_G_GTGT:35125526:0,1,0,1
chr20	35127613	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.283:18:4,5:4,0:9,4,4,1
chr20	35128117	.	CCTCTCCCTCCCTCCGCTCTCACCTCTCCTG	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.102:28:10,0:12,2:7,19,1,1
chr20	35128147	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:9,1:6,1:0|1:35128147_G_C:35128147:1,14,0,2
chr20	35128153	.	C	CTCCT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.140:20:8,1:9,0:0|1:35128147_G_C:35128147:2,16,0,2
chr20	35173248	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,0:0,2,2,0
chr20	35288649	.	AG	GA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:35288649_AG_GA:35288649:4,3,1,1
chr20	35288653	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=127,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:35288649_AG_GA:35288649:5,3,1,1
chr20	35288655	.	G	GTCTAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0|1:35288649_AG_GA:35288649:5,3,1,1
chr20	35406352	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=177,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr20	35443554	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=118,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:15,6:13,7:13,15,4,9
chr20	35445693	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=179,168;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:0,1:4,0,2,0
chr20	35445882	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.294:14:3,0:3,0:1,9,0,4
chr20	35491094	.	C	CCCTTTCTGGTTGCAGTGACTGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,63;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:4,2,1,1
chr20	35508959	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	35532501	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:6,1,3,0
chr20	35534006	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	35632028	.	GA	G,AA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30,25;MFRL=184,179,254;MMQ=60,60,60;MPOS=12,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.65,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,3:0.523,0.306:9:0,2,2:1,3,1:1,0,7,1
chr20	35636055	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=156,181;MMQ=48,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:35636055_GT_TC:35636055:0,4,0,1
chr20	35636059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=130,181;MMQ=36,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:35636055_GT_TC:35636055:0,3,0,1
chr20	35661046	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr20	35684754	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=128,210;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr20	35695535	.	GAAAA	G,GA,GAAA,GAAAAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28,33,16,16;MFRL=148,113,144,172,126;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=22,23,15,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.80,8.77,4.41,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,4,4,3,3:0.159,0.179,0.168,0.194:19:2,0,2,0,0:2,3,1,1,1:3,2,6,8
chr20	35738562	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=166,141;MMQ=50,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr20	35738567	.	C	CCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr20	35738574	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr20	35738786	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:9,0:3,6:0,12,0,6
chr20	35738841	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr20	35748024	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,24,0
chr20	35748039	.	G	GAAAGAAAAGA,GAAAGAAAAGAAAAGA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,24,32;MFRL=0,74,99;MMQ=60,22,40;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=AAAGA;STR;TLOD=3.52,9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.344,0.633:7:0,0,1:0,1,1:0,0,5,2
chr20	35748894	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr20	35766172	.	ATAATCCAATT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,0:4,2:17,5,1,1
chr20	35776098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr20	35776103	.	GC	TC,TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27,27;MFRL=174,145,160;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:1,0,2,0
chr20	35786188	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr20	35787473	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr20	35807790	.	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,4:0,0,6,5
chr20	35827463	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:3,0:8,3:8,3,2,1
chr20	35827682	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr20	35828757	.	ATT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.930:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr20	35828958	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.163:59:27,0:23,9:13,37,1,8
chr20	35835657	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr20	35835889	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr20	35838372	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.884:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	35838591	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr20	35842302	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.307:34:13,0:10,9:7,17,0,10
chr20	35852395	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr20	35852450	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	35860657	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr20	35864924	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr20	35869619	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr20	35879770	.	G	GCAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35879770_G_GCAGC:35879770:0,0,0,1
chr20	35879772	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,124;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35879770_G_GCAGC:35879770:0,0,0,1
chr20	36028710	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:36028710_C_A:36028710:3,9,1,1
chr20	36028716	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:36028710_C_A:36028710:3,8,1,1
chr20	36031097	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr20	36031800	.	CCGGCTTCT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=202,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr20	36365785	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=125,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:10,0:0|1:36365785_G_T:36365785:8,15,0,2
chr20	36365786	.	C	CATTTTCTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=125,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,1:10,0:0|1:36365785_G_T:36365785:8,15,0,2
chr20	36470866	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:10,3:9,5:7,12,4,4
chr20	36488508	.	TCTCA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCA;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr20	36500313	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr20	36561873	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=82,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36561873_G_T:36561873:0,1,1,0
chr20	36561876	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=82,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:36561873_G_T:36561873:0,1,1,0
chr20	36561881	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:36561873_G_T:36561873:0,4,1,0
chr20	36572751	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr20	36669015	.	AC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:22,0:4,2:4,23,0,2
chr20	36685888	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36685888_A_T:36685888:4,0,1,0
chr20	36685915	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.663:10:1,3:2,3:0|1:36685888_A_T:36685888:3,0,5,2
chr20	36686108	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr20	36759573	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=111,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:6,8,1,2
chr20	36793501	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:7,2,6,1
chr20	36793529	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=90,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:5,4:5,2:7,4,5,3
chr20	36842074	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=176,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:3,2:1,0:0|1:36842074_A_AG:36842074:2,2,1,1
chr20	36842075	.	C	CCAAGTCTGCAGTGAGTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0|1:36842074_A_AG:36842074:2,2,1,1
chr20	36845738	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=91,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,4:8,6:3,6,6,4
chr20	36855661	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,3:8,0:6,9,1,2
chr20	36869239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,120;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:4,4:0|1:36869239_C_T:36869239:5,7,0,4
chr20	36869244	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=171,120;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,0:5,4:0|1:36869239_C_T:36869239:6,7,0,4
chr20	36889021	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=124,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	36917508	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:8,3:16,2:13,11,1,4
chr20	36919758	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=88,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:5,3:5,7:5,5,6,4
chr20	36932551	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr20	36932631	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:14,10,1,1
chr20	36932645	.	AC	GT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=122,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:9,2:0|1:36932645_AC_GT:36932645:11,14,1,1
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chr20	36932660	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=66,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,9:1,6:0,1,8,10
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chr20	36938878	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=70,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:2,5:3,10:2,3,11,4
chr20	36939112	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr20	36946848	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,2:4,5:7,6,5,2
chr20	36948481	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr20	36948547	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=110,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:9,2:5,3:12,2,3,2
chr20	36953097	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:4,4:0,6:3,1,8,2
chr20	36959353	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr20	36959566	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr20	36982754	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,3:2,6:3,5,4,5
chr20	36999366	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.142:39:20,2:14,3:18,16,3,2
chr20	37001758	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,0:4,3:8,3,0,4
chr20	37002661	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=75,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:21,1:9,2:19,12,2,1
chr20	37146131	.	CT	C,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31,21;MFRL=144,150,160;MMQ=60,60,60;MPOS=5,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.39,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,7:0.174,0.254:25:7,2,1:3,2,4:10,4,6,5
chr20	37150253	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,137;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:23,3:21,0:33,11,3,0
chr20	37175018	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:0|1:37175018_C_T:37175018:9,7,1,1
chr20	37175027	.	C	CAGGTGTACACTTATGGGGCGGA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:8,2:0|1:37175018_C_T:37175018:8,15,1,1
chr20	37177236	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=137,114;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:4,4:0,0:4,0,4,0
chr20	37198492	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=106,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:14,3:5,0:10,9,3,0
chr20	37203694	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:37203694_T_A:37203694:0,3,0,1
chr20	37203701	.	A	AGACTAGTAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:37203694_T_A:37203694:0,3,0,1
chr20	37203703	.	A	ACAACTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:37203694_T_A:37203694:0,2,0,1
chr20	37209985	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=123,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:1,0:14,4:6,9,0,4
chr20	37214025	.	TCAAAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAAA;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:3,0:4,4,1,1
chr20	37216891	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,0:11,2:10,8,1,1
chr20	37267908	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:9,8,2,0
chr20	37277271	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=286,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,5,1
chr20	37278946	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,6:0,4:3,1,6,4
chr20	37279255	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=56,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:6,2,5,1
chr20	37279376	.	TGACGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=97,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:4,0:3,7,0,2
chr20	37353706	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:7,10,1,1
chr20	37357031	.	ACGCTGCTCATGGCCATTTATGTGCCGCACTTCG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=176,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.291:9:3,0:3,1:2,5,1,1
chr20	37524435	.	T	TTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr20	37529250	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,4:6,0:9,4,2,2
chr20	37534582	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	37534665	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=79,87;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,5:6,1:6,3,3,3
chr20	37534691	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=87,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:3,2:0|1:37534691_A_G:37534691:6,9,1,1
chr20	37534696	.	G	GGCAGCTCTAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=100,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:37534691_A_G:37534691:6,9,1,1
chr20	37534698	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=100,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:37534691_A_G:37534691:6,8,1,1
chr20	37580130	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=91,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr20	37620888	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr20	37621180	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=147,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr20	37623541	.	CCT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=98,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:10,2:3,17,0,2
chr20	37634704	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr20	37635027	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,6:1,1:0,3,0,7
chr20	37643406	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,0:2,3:6,1,1,2
chr20	37643659	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:1,3,0,3
chr20	37654024	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=83,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:7,7:4,5:3,9,6,6
chr20	39704995	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:0,6,1,7
chr20	39726776	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,1:4,4:4,0,5,0
chr20	39741331	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:13,0,2,0
chr20	39744127	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:5,2:1,0:0|1:39744127_T_TC:39744127:1,5,1,1
chr20	39744129	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:3,2:1,0:0|1:39744127_T_TC:39744127:1,5,1,1
chr20	39744131	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:4,1:1,0:0|1:39744127_T_TC:39744127:1,5,1,1
chr20	39788855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=177,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr20	39791091	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:5,6,1,1
chr20	39791493	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,2:11,2:20,0,4,0
chr20	39791741	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:4,6,7,4
chr20	39792527	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:5,8,0,3
chr20	39794489	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr20	39795536	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr20	39796668	.	AGTG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	39797465	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,7,10
chr20	39797646	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr20	39803004	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=206,67;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:3,4,3,0
chr20	39813729	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:5,4,4,0
chr20	39813924	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:0,8,1,3
chr20	39829993	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,3:6,0:5,9,3,0
chr20	39830122	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	39831965	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:3,6,0,2
chr20	39832322	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=126,341;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:11,0:12,6:13,11,6,0
chr20	39832628	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,2:2,3:4,0,3,2
chr20	39974539	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,2:12,1:10,13,3,0
chr20	39978564	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=163,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.785:15:0,7:2,4:0,3,4,8
chr20	39979121	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:39979121_A_AG:39979121:0,5,1,1
chr20	39979124	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:39979121_A_AG:39979121:0,5,1,1
chr20	39986851	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=369,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr20	39991783	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,19;MFRL=212,190;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr20	40033134	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr20	40043890	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:17,0:12,5:0|1:40043890_T_G:40043890:8,21,1,4
chr20	40043895	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:14,0:11,4:0|1:40043890_T_G:40043890:7,21,1,4
chr20	40049450	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.373:33:14,7:6,5:11,10,7,5
chr20	40113237	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:40113237_A_T:40113237:7,13,1,1
chr20	40113243	.	T	TTCCTTTTTCAGGAGTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:40113237_A_T:40113237:7,10,1,1
chr20	40116207	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:5,0,2,1
chr20	40116346	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:11,6:19,0:21,10,1,5
chr20	40116467	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:3,5,4,3
chr20	40126679	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr20	40714524	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=232,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.818:10:0,1:2,7:0|1:40714524_C_G:40714524:0,2,4,4
chr20	40714540	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=232,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.777:8:0,1:2,5:0|1:40714524_C_G:40714524:0,2,2,4
chr20	40727179	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=169,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:0|1:40727179_G_A:40727179:3,9,1,1
chr20	40727187	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:40727179_G_A:40727179:2,9,1,1
chr20	40733420	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:40733420_G_GAC:40733420:0,1,0,1
chr20	40733421	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:40733420_G_GAC:40733420:0,1,0,1
chr20	40733431	.	G	GCTCTAAGGTTGCAGATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	40735534	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:6,11,1,1
chr20	40743829	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=70,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:7,0:2,5,1,1
chr20	40744695	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=64,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:3,0:13,3:10,6,1,2
chr20	40757556	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=260,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40757556_G_C:40757556:0,1,0,1
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chr20	40757563	.	T	TTTGACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=260,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40757556_G_C:40757556:0,1,0,1
chr20	40827927	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,1:9,2:15,6,3,0
chr20	40981002	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=225,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr20	41101274	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr20	41306488	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr20	41400229	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr20	41408964	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=355,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,0:2,7:2,2,2,5
chr20	41420135	.	A	AAATGTTAGTTACTGTTATCATTGGATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:3,4:2,0:0,5,2,2
chr20	42089140	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=103,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.239:44:23,7:11,3:18,16,7,3
chr20	42176679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=187,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr20	42195863	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,292;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr20	42205061	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	42208522	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr20	42242700	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	42249398	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr20	42249479	.	C	CT,CTT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31,31;MFRL=113,132,121;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=24.16,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,14,4:0.570,0.194:23:4,9,2:1,4,1:4,1,12,6
chr20	42264502	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr20	42264726	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr20	42265726	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42265726_C_T:42265726:3,0,1,0
chr20	42265740	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=202,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42265726_C_T:42265726:2,0,1,0
chr20	42265777	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:10,1,3,0
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chr20	42265928	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,2:1,0:5,13,1,1
chr20	42265966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,0,8
chr20	42275499	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	42275587	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,1:8,2:11,4,2,1
chr20	42302371	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	42311375	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr20	42311437	.	CG	AT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=138,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:42311437_CG_AT:42311437:9,6,1,1
chr20	42311443	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:42311437_CG_AT:42311437:9,7,1,1
chr20	42311444	.	A	ATCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:42311437_CG_AT:42311437:9,7,1,1
chr20	42328749	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	42333992	.	ATGCTGCGTGAG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=77,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:10,0:10,10,1,1
chr20	42340298	.	G	GCAGAGAAAAAAGACAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:2,1:0,0:0|1:42340298_G_GCAGAGAAAAAAGACAGT:42340298:1,1,0,1
chr20	42340300	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:1,1:0,0:0|1:42340298_G_GCAGAGAAAAAAGACAGT:42340298:1,1,0,1
chr20	42343821	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=112,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,8:3,8:2,4,9,7
chr20	42354900	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=137,124;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.363:23:6,8:8,0:11,4,8,0
chr20	42355448	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:12,4:21,0:16,17,4,0
chr20	42694670	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=80,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:42694670_C_T:42694670:0,6,1,1
chr20	42694672	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=80,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:42694670_C_T:42694670:0,6,1,1
chr20	42744221	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:42744221_A_C:42744221:3,1,1,0
chr20	42744224	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:1,0:0|1:42744221_A_C:42744221:4,1,1,0
chr20	42744265	.	G	C,T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,27,26;MFRL=153,91,141;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.91,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,2:0.530,0.175:14:0,4,1:4,4,1:4,0,5,5
chr20	42744302	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=145,34;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,2:16,0:12,14,1,1
chr20	42788239	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=245,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,0:1,1:2,0,3,0
chr20	42814919	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=14,13;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,0:0,0:0|1:42814919_A_C:42814919:2,0,2,0
chr20	42814927	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:42814919_A_C:42814919:2,0,1,0
chr20	42814931	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=15,31;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:42814919_A_C:42814919:2,0,1,0
chr20	42814934	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,12;MFRL=88,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:0,0:0|1:42814919_A_C:42814919:2,1,1,0
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chr20	42815325	.	G	GCCAGCAACATTGCATCTCTTTGATGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=79,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr20	42887194	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.305:28:16,5:3,0:11,8,9,0
chr20	42892017	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42892017_G_T:42892017:1,0,1,0
chr20	42892021	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:42892017_G_T:42892017:1,0,1,0
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chr20	42966143	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=244,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42966143_C_T:42966143:0,1,0,1
chr20	42966157	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=122,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42966143_C_T:42966143:0,2,0,1
chr20	43030160	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:7,4:1,2:3,5,4,2
chr20	43031106	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr20	43034660	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr20	43034693	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=179,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:7,0,8,1
chr20	43034783	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,6:4,7:2,4,6,8
chr20	43052570	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	43052934	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,0:9,4:9,10,0,4
chr20	43090780	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:9,3:3,0:4,8,1,2
chr20	43090929	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=69,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.640:15:3,6:3,3:2,4,2,7
chr20	43109168	.	C	CTCTGTGCCCAGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=251,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	43118017	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.310:46:18,3:13,10:16,16,5,9
chr20	43129746	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,0:10,5:8,15,0,5
chr20	43142682	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=95,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:9,12,2,1
chr20	43142694	.	C	CTGTCGTATCCTAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=86,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:11,2:0|1:43142694_C_CTGTCGTATCCTAT:43142694:7,9,1,1
chr20	43142696	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=86,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,1:0|1:43142694_C_CTGTCGTATCCTAT:43142694:6,9,1,1
chr20	43243407	.	G	GGGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43243407_G_GGGTTTT:43243407:0,1,0,1
chr20	43243410	.	T	TGTGATAACCAAGAAAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43243407_G_GGGTTTT:43243407:0,1,0,1
chr20	43251214	.	GG	AA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=106,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:7,8,1,1
chr20	43251281	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=121,4;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.203:16:7,0:5,2:0|1:43251281_A_C:43251281:7,6,3,0
chr20	43251288	.	G	GAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=121,4;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.204:16:6,0:7,3:0|1:43251281_A_C:43251281:7,6,3,0
chr20	43264927	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,7,15
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chr20	43534934	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,9,1
chr20	43535145	.	T	TAAAAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,0;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=23,30;RU=A;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr20	43538733	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr20	43547677	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.707:22:5,8:1,7:4,2,6,10
chr20	43559043	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr20	43559263	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=150,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,0:14,2:0|1:43559263_A_C:43559263:9,18,1,1
chr20	43559272	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=146,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:43559263_A_C:43559263:9,14,1,1
chr20	43559273	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=146,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,1:0|1:43559263_A_C:43559263:9,14,1,1
chr20	43561853	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=50,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:43561853_T_G:43561853:1,1,0,1
chr20	43561859	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=50,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:43561853_T_G:43561853:1,1,0,1
chr20	43565622	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=40,69;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:5,6:2,4:5,2,6,4
chr20	43567442	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=68,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:1,4,1,9
chr20	43589041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,6:1,3:0,3,3,6
chr20	43600673	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.575:40:5,11:11,11:12,5,15,8
chr20	43610379	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr20	43610454	.	GTC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:4,0:6,2:8,4,1,1
chr20	43623658	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:5,0,5,2
chr20	43625783	.	TTTTG	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTG;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,1:17,2:21,19,1,2
chr20	43653810	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,1:4,2:1,6,0,4
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chr20	44259673	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,8:3,6:2,6,7,7
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chr20	44334588	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr20	44334633	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:1,9,0,3
chr20	44334669	.	G	GTTCTCTTGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:44334669_G_GTTCTCTTGC:44334669:1,2,0,1
chr20	44334670	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:44334669_G_GTTCTCTTGC:44334669:1,2,0,1
chr20	44350931	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr20	44352740	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr20	44354312	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:1,3:9,2:3,7,4,2
chr20	44354372	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	44354387	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	44417675	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=83,100;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:6,3:10,7:8,8,3,7
chr20	44418471	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:8,3:2,3:7,3,5,1
chr20	44420682	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	44422530	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=102,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.092:51:19,0:27,4:24,23,2,2
chr20	44422543	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:22,0:27,4:25,25,1,3
chr20	44422705	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=87,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,4:10,3:5,15,0,7
chr20	44430214	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,232;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr20	44451901	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:6,0,6,1
chr20	44453126	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr20	44453153	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,1:4,8:4,4,2,7
chr20	44453169	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,0:8,4:6,7,0,4
chr20	44453345	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44453345_A_C:44453345:0,1,1,0
chr20	44453352	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=82,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:44453345_A_C:44453345:0,2,1,0
chr20	44468982	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,1:1,2:0,1,2,2
chr20	44470053	.	C	CATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr20	44470775	.	C	CGGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=215,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	44470779	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0|1:44470779_CT_AC:44470779:0,0,0,1
chr20	44470784	.	AGTGGACTTCTT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44470779_CT_AC:44470779:0,0,0,1
chr20	44473100	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr20	44477347	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr20	44482659	.	GT	G,GTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29,30;MFRL=146,121,116;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=T;STR;TLOD=19.05,24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,10,13:0.398,0.491:25:2,8,9:0,2,4:1,1,8,15
chr20	44505830	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:6,2:2,3:4,4,4,1
chr20	44512744	.	TACACACACACAC	T,TACACACACAC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=15,27,20;MFRL=140,151,122;MMQ=60,60,60;MPOS=28,14;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,13,18;RU=AC;STR;TLOD=6.54,12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.145,0.621:11:0,2,1:1,1,2:1,1,3,6
chr20	44513252	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,164;MMQ=40,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:6,2,6,0
chr20	44513357	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.543:50:14,11:7,16:11,12,8,19
chr20	44513462	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,25;MFRL=186,182;MMQ=48,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44513462_C_T:44513462:0,2,0,1
chr20	44513466	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,24;MFRL=174,207;MMQ=51,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44513466_AT_A:44513466:0,2,0,1
chr20	44513467	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=165,182;MMQ=55,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44513462_C_T:44513462:0,1,0,1
chr20	44513468	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=174,207;MMQ=51,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44513466_AT_A:44513466:0,2,0,1
chr20	44513475	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=186,182;MMQ=48,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44513462_C_T:44513462:0,2,0,1
chr20	44513478	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,22;MFRL=186,182;MMQ=48,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44513462_C_T:44513462:0,2,0,1
chr20	44515511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:4,4,2,0
chr20	44517360	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:3,3:2,5:4,1,4,5
chr20	44517584	.	G	GACATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44517584_G_GACATT:44517584:0,1,0,1
chr20	44517585	.	G	GTGTTTTGTAAAAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44517584_G_GACATT:44517584:0,1,0,1
chr20	44518843	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:3,1,5,0
chr20	44520237	.	CCTGCTG	C,CCTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=177,193,253;MMQ=60,60,60;MPOS=26,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CTG;STR;TLOD=6.75,6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.271:8:3,1,1:1,1,1:2,2,4,0
chr20	44520716	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:6,1:2,1:0,8,1,1
chr20	44522005	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:1,7,1,3
chr20	44522594	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=179,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,7:8,1:10,2,6,2
chr20	44523248	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:3,2:4,2,2,0
chr20	44523298	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.255:45:17,11:17,0:18,16,10,1
chr20	44523547	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=113,188;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:5,5,4,3
chr20	44523782	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=60,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:0,8:7,5:3,4,5,8
chr20	44527142	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr20	44530838	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:4,2,2,1
chr20	44535095	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr20	44573632	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr20	44573695	.	A	AAGCGCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=230,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr20	44573712	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=196,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr20	44574835	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr20	44578776	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chr20	44578999	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,2:19,0:0|1:44578999_C_T:44578999:16,17,1,1
chr20	44579021	.	G	GGTGTCT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:10,0:0|1:44578999_C_T:44578999:13,12,1,1
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chr20	44751250	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,22;MFRL=86,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:44751246_C_T:44751246:11,6,2,0
chr20	44751260	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=96,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:44751246_C_T:44751246:14,7,2,0
chr20	44751280	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:16,3:18,8,2,1
chr20	44841735	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=88,58;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:16,0:9,4:11,14,0,4
chr20	44869963	.	A	ACTTGTCAGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	44985307	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr20	45003321	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:2,2:0|1:45003321_C_T:45003321:2,7,1,1
chr20	45003326	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0|1:45003321_C_T:45003321:0,0,1,7
chr20	45003788	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	45003977	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=94,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:8,1:13,4:11,10,1,4
chr20	45021689	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:45021689_GT_G:45021689:9,3,1,1
chr20	45021693	.	GTGA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:45021689_GT_G:45021689:9,4,1,1
chr20	45113296	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr20	45131759	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr20	45132887	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=92,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:8,0:12,3:9,11,1,2
chr20	45133219	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.492:26:6,11:7,0:12,1,13,0
chr20	45173910	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	45174026	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=66,119;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:0,3:2,1,3,3
chr20	45192253	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=243,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.938:26:0,8:1,14:0,1,4,21
chr20	45192254	.	G	GAGA,GAGAGA,GAGAGAGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,34,33,31;MFRL=243,209,205,132;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,21,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.23,4.21,19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,8:0.186,0.183,0.572:13:0,0,1,3:1,2,1,5:0,1,0,12
chr20	45204266	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,16,8
chr20	45242444	.	G	GATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=234,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	45607148	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,0;MFRL=110,133;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,0:5,0:0|1:45607148_C_G:45607148:8,2,4,0
chr20	45607155	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:6,0:4,4:0|1:45607148_C_G:45607148:8,3,4,0
chr20	45607355	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=95,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,2:8,1:4,13,0,3
chr20	45629941	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	45630157	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:6,6:2,10,3,7
chr20	45717954	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.642:37:7,11:6,13:5,8,9,15
chr20	45797883	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,0,3
chr20	45797954	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr20	45801319	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:2,3:2,6:4,1,4,6
chr20	45809652	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr20	45811860	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,0:2,4:4,0,4,0
chr20	45811877	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,198;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:8,2,2,0
chr20	45816639	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=108,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:45816639_A_G:45816639:1,0,4,0
chr20	45816649	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=108,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:0,3:0|1:45816639_A_G:45816639:2,1,5,0
chr20	45816675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=117,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr20	45910955	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,2:10,0:4,8,2,0
chr20	45923383	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,5:0,15:0,0,13,7
chr20	45923516	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:0|1:45923516_G_GA:45923516:5,11,1,1
chr20	45923517	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:0|1:45923516_G_GA:45923516:5,11,1,1
chr20	45923539	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=90,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,1:6,3:1,6,1,3
chr20	45927662	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=120,219;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:13,0:10,9:15,8,0,9
chr20	46256783	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=27,20;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:15,0:5,2:0|1:46256783_T_C:46256783:5,18,1,1
chr20	46256784	.	T	TGC	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=27,20;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:15,0:5,2:0|1:46256783_T_C:46256783:5,18,1,1
chr20	46256797	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:13,2:2,3:1,14,2,3
chr20	46256801	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=30,28;MFRL=147,320;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:3,0:0|1:46256801_G_T:46256801:2,10,0,2
chr20	46256803	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:3,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,11,0,2
chr20	46256804	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=25,29;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,11,0,2
chr20	46256807	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=23,27;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:4,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,13,0,2
chr20	46256809	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,13,0,2
chr20	46256811	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=23,22;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,13,0,2
chr20	46256813	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=23,24;MFRL=132,320;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:5,0:0|1:46256801_G_T:46256801:1,13,0,2
chr20	46264998	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:10,6,3,0
chr20	46267950	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,6,11
chr20	46279652	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.640:15:2,8:3,0:5,0,10,0
chr20	46279814	.	TGCAGCAGCA	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=136,152;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=GCA;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.282:18:7,2:4,3:9,4,4,1
chr20	46279836	.	ACAG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CAG;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,4:6,5:7,8,4,5
chr20	46287012	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr20	46311719	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.591:10:0,3:4,3:2,2,5,1
chr20	46386140	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:3,18,0,2
chr20	47244347	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:4,1,3,0
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chr20	47276529	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=100,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:9,15,2,0
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chr20	47351275	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=238,202;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47351267_GGT_G:47351267:0,1,0,1
chr20	47361519	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr20	47538333	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr20	47580347	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:17,6:14,3:14,17,5,4
chr20	47585635	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=121,50;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:8,0:9,2,1,1
chr20	47585638	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,25;MFRL=121,50;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:47585638_C_T:47585638:9,2,1,1
chr20	47585641	.	G	GCA	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=121,50;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:7,0:0|1:47585638_C_T:47585638:9,4,1,1
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chr20	47585646	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=120,50;MMQ=60,41;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.165:15:5,2:8,0:0|1:47585638_C_T:47585638:7,6,1,1
chr20	47585659	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.488:47:11,22:13,0:12,12,23,0
chr20	47601323	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.227:29:9,6:13,0:9,14,6,0
chr20	47610896	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr20	47614866	.	C	CTGG	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.063:45:19,0:24,2:0|1:47614866_C_CTGG:47614866:20,23,1,1
chr20	47614867	.	C	CTGGCTTGGCTGGCA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:19,0:24,2:0|1:47614866_C_CTGG:47614866:20,23,1,1
chr20	47626736	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:3,0,3,1
chr20	47626847	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=92,77;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:7,4:3,3:5,6,3,4
chr20	47628434	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,3:5,5,3,2
chr20	47630162	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:16,0:7,3:12,11,0,3
chr20	47639737	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=152,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,3:2,0:2,3,1,3
chr20	47645002	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:5,1,6,1
chr20	47649510	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr20	47649603	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,2:16,0:12,15,1,1
chr20	47675176	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr20	47679655	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:47679655_AT_A:47679655:1,0,1,1
chr20	47679663	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:47679655_AT_A:47679655:1,0,1,1
chr20	47679963	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=165,176;MMQ=50,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:1,2:0,2,0,6
chr20	47689036	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=91,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:0,2,4,4
chr20	47691430	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=70,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,9:8,3:6,9,4,8
chr20	47701765	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr20	47705763	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:4,5:3,1:6,1,5,1
chr20	47713063	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	47731311	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=138,95;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,4:5,0:12,1,4,0
chr20	47731334	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=109,113;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,4:7,0:15,4,4,0
chr20	47734968	.	A	AGAGAGAGGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:0|1:47734968_A_AGAGAGAGGGG:47734968:0,8,0,2
chr20	47734970	.	A	AGAGAGAGAGAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:47734968_A_AGAGAGAGGGG:47734968:0,8,0,2
chr20	47739555	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr20	47739814	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,0:3,3:2,2,1,2
chr20	47770443	.	CAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:1,3:1,2:2,0,5,1
chr20	47770461	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:3,0:9,2,2,0
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chr20	48439582	.	A	AT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=70.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,37:0.677:55:12,25:5,9:11,7,25,12
chr20	48456238	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr20	48467300	.	GT	G,GTT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,26,32;MFRL=123,99,120;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.03,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,7,6:0.145,0.136:43:13,6,4:17,1,1:24,6,9,4
chr20	48467404	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:18,0:35,3:22,31,0,3
chr20	48471889	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=152,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,11:4,0:8,0,0,11
chr20	48479547	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=94,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:23,0:22,4:23,23,0,4
chr20	48491258	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=97,103;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:5,3:12,7:11,6,6,4
chr20	48494650	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,5:2,0:0,7,1,4
chr20	48503428	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:5,14,1,1
chr20	48558316	.	C	CTCTAAATATACTCGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	48561893	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:8,5:6,4:10,5,4,5
chr20	48562083	.	G	GTTGGACACC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr20	48562797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26,31;MFRL=119,91,121;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.02,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,3:0.456,0.264:12:0,2,2:2,4,1:1,2,1,8
chr20	48729677	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr20	48741678	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:5,13,1,3
chr20	48760220	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:6,0:7,2:2,11,0,3
chr20	48807963	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=99,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.347:47:17,7:14,9:17,14,7,9
chr20	48808062	.	CCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr20	48808658	.	AGCGCCC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCGCCC;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,1:11,1:22,1,2,0
chr20	49184862	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:11,1:7,2:17,1,3,0
chr20	49191228	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,6,17
chr20	49194866	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr20	49195248	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr20	49196167	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr20	49219097	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:3,5:4,7:3,5,8,4
chr20	49219208	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:2,2,0,1
chr20	49219212	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:2,2,0,1
chr20	49219213	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:2,2,0,1
chr20	49219221	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:0,2,0,1
chr20	49219223	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:0,1,0,1
chr20	49219225	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:0,1,0,1
chr20	49219230	.	AGCAAGTCCCCCAGAGGGGCTT	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:49219208_CA_C:49219208:0,4,0,1
chr20	49224995	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:2,9:5,10:5,2,12,8
chr20	49225953	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr20	49227294	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr20	49227544	.	G	GGGCTTAGTGCCGGGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0,0,3,2
chr20	49231330	.	T	TTA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=89,93;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:13,0:11,2:0|1:49231330_T_TTA:49231330:13,13,1,1
chr20	49231332	.	ATG	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=91,93;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:10,0:12,2:0|1:49231330_T_TTA:49231330:13,14,1,1
chr20	49236478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr20	49354351	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32,30,30;MFRL=146,148,123,82;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,26,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.06,5.90,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,5,6:0.104,0.260,0.291:19:3,1,2,2:2,1,2,3:5,1,9,4
chr20	49367076	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	49507892	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr20	49551751	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.072:70:26,4:37,1:29,36,2,3
chr20	49551780	.	TA	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.365:36:8,4:14,9:7,16,2,11
chr20	49557493	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,0:13,5:10,17,0,5
chr20	49576406	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=84,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:19,0:16,2:0|1:49576406_C_A:49576406:20,19,1,1
chr20	49576411	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=87,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:18,0:17,2:0|1:49576406_C_A:49576406:19,17,1,1
chr20	49576429	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=22,22;MFRL=84,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:22,0:15,4:15,22,2,2
chr20	49576438	.	G	GCCTCAACTCCAACAGGCCCCGAAATT	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=87,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:25,0:15,3:17,25,2,1
chr20	49577319	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=183,203;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr20	49577335	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=183,179;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49577335_T_C:49577335:0,1,0,1
chr20	49577341	.	TG	GA	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=183,179;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49577335_T_C:49577335:0,1,0,1
chr20	49577345	.	ATC	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=22,23;MFRL=179,183;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49577345_ATC_A:49577345:0,1,0,1
chr20	49577350	.	A	G,ATG	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,29,23;MFRL=0,179,183;MMQ=60,40,60;MPOS=5,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr20	49577354	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=27,25;MFRL=179,183;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49577345_ATC_A:49577345:0,1,0,1
chr20	49577356	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,23;MFRL=179,183;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:49577345_ATC_A:49577345:0,1,0,1
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chr20	50803686	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=241,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50803681_T_C:50803681:0,1,0,1
chr20	50803688	.	A	AAATATTGACTACTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=241,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50803681_T_C:50803681:0,1,0,1
chr20	51589955	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr20	51870849	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr20	52185814	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,1:1,5:0,4,1,5
chr20	52197956	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=209,267;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr20	52557949	.	G	T,GTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,27,32;MFRL=139,148,118;MMQ=52,60,54;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.67,17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,6:0.356,0.501:12:2,4,2:0,0,3:2,0,10,0
chr20	52557958	.	C	CGCGCGTGTGTGT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=139,116;MMQ=52,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=87.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,28:0.906:30:2,13:0,14:2,0,18,10
chr20	52558099	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:2,6:4,6:1,5,2,11
chr20	52569942	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:16,0:21,3,2,0
chr20	52573971	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.722:27:3,10:4,8:5,2,12,8
chr20	52592026	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr20	52611427	.	TACAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr20	52611540	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,3:7,3:8,11,2,4
chr20	52612549	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,3:6,6:7,5,5,4
chr20	52645122	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,0:8,3:11,13,1,2
chr20	52674771	.	A	AAAGAAGACGGGGAATAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	52675188	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=96,70;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,4:8,5:4,15,4,5
chr20	52773634	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr20	52773736	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.385:42:14,4:12,12:15,11,10,6
chr20	52774579	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,0:1,4:4,2,4,0
chr20	52774601	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,2:5,4:5,2,4,2
chr20	52775728	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=154,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr20	52782191	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	53205396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr20	53208368	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=160,186;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr20	53208395	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:3,2:0,0:0|1:53208395_T_TG:53208395:0,4,0,2
chr20	53208396	.	T	TGTGCGCGTGTTAAGC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:4,1:0,0:0|1:53208395_T_TG:53208395:0,4,0,2
chr20	53226840	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	53259964	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr20	54823779	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr20	54823805	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=90,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:5,5:12,6:7,10,6,5
chr20	54824026	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:11,1:3,0:0|1:54824026_G_A:54824026:11,3,1,1
chr20	54824029	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:9,2:3,1:0|1:54824026_G_A:54824026:10,2,2,1
chr20	54824680	.	CACCTGGTCCTCATCATCACCTGCCCCACCAACCCCTACTGCATCTGCTACACTGCCCACTTCAACACCT	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,19:0.053:79:5,7:13,11:24,36,6,13
chr20	54940417	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=147,149;MMQ=57,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr20	54956671	.	C	CTGTTTCTTA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,1:4,0:1,8,1,1
chr20	54956702	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:54956702_T_A:54956702:0,4,0,1
chr20	54956704	.	TT	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:54956702_T_A:54956702:0,4,0,1
chr20	54956707	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr20	54959296	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr20	54963092	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,0:2,2:6,0,2,0
chr20	55012495	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.169:21:5,1:13,1:7,11,2,1
chr20	55020967	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.148:38:17,0:16,5:19,14,3,2
chr20	55027049	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=69,44;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,0:15,3:16,15,2,1
chr20	55027053	.	G	GCA	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=69,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:15,0:15,2:0|1:55027053_G_GCA:55027053:16,16,1,1
chr20	55027054	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=78,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:14,2:0|1:55027053_G_GCA:55027053:16,16,1,1
chr20	55027058	.	AG	TA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=89,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,0:13,2:0|1:55027053_G_GCA:55027053:12,15,1,1
chr20	55027076	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=99,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:8,2:0|1:55027076_C_T:55027076:10,9,1,1
chr20	55027079	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=100,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:8,2:0|1:55027076_C_T:55027076:8,8,1,1
chr20	55048496	.	T	TGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr20	55071639	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=218,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,4,2
chr20	55111588	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=236,188;MMQ=50,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	55206241	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.337:9:2,1:3,1:4,2,3,0
chr20	55211581	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,187;MMQ=44,51;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.509:9:2,1:1,4:4,0,4,1
chr20	55777585	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:3,5,0,2
chr20	55929705	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,169;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:4,4:16,0:17,3,4,0
chr20	55929881	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:6,11:5,7:2,9,7,11
chr20	55966623	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=209,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr20	55966904	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr20	55982579	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.285:40:15,6:13,5:19,10,7,4
chr20	56064157	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,334;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	56078581	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=115,328;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:14,0:17,7:10,21,0,7
chr20	56078690	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr20	56089629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.520:25:8,3:4,10:6,6,10,3
chr20	56089869	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr20	56098070	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:7,1,1,1
chr20	56099114	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:6,4:1,8:5,2,8,4
chr20	56099305	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr20	56139403	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr20	56140076	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=T;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,6:0,3:0,0,6,5
chr20	56179875	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:3,8:1,5:1,3,2,11
chr20	56186978	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,0,2
chr20	56188266	.	ATCTGGATGGCTTCGGAGTTTGCAATGGAAATCCAGCTGTTGGGTCCAT	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=89,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.068:49:13,4:13,1:21,21,4,3
chr20	56191438	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:17,0:7,10:10,14,0,10
chr20	56227532	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.552:29:7,9:5,7:8,5,7,9
chr20	56228019	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:0,5:3,1:2,1,6,0
chr20	56265366	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.453:7:0,0:3,0:0|1:56265366_A_C:56265366:1,3,3,0
chr20	56265370	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.407:8:0,0:3,0:0|1:56265366_A_C:56265366:2,3,3,0
chr20	56265376	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=108,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:1,0:4,1:0|1:56265366_A_C:56265366:3,5,3,0
chr20	56265379	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=99,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:6,1:0|1:56265366_A_C:56265366:4,5,3,0
chr20	56265381	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,11;MFRL=99,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:6,0:0|1:56265366_A_C:56265366:4,5,3,0
chr20	56265385	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:6,1:0|1:56265366_A_C:56265366:4,6,2,0
chr20	56265389	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,0:0|1:56265366_A_C:56265366:4,6,2,0
chr20	56726107	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,14:0,0,17,17
chr20	56735759	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,1:7,4:11,7,4,1
chr20	56793546	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,12,10
chr20	56793899	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr20	56798017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=170,8420;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr20	56811331	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,72;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:5,10,1,2
chr20	56811400	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	56822236	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr20	56822536	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,9:0,15:0,0,12,13
chr20	56825826	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	56826934	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,4,13
chr20	56846580	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,11,14
chr20	56929143	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=119,4645915;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr20	57089814	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr20	57269611	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,5:17,0:15,13,5,0
chr20	57273735	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=100,43;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:9,4,1,1
chr20	57273753	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=100,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:57273753_C_A:57273753:7,6,1,1
chr20	57273755	.	A	AGACTC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=100,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:57273753_C_A:57273753:7,6,1,1
chr20	57273757	.	A	ATAGAGAAG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=100,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:57273753_C_A:57273753:7,5,1,1
chr20	57288422	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:6,1,4,1
chr20	57290347	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:0,4,6,5
chr20	57392759	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:57392759_C_T:57392759:7,14,1,1
chr20	57392767	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:57392759_C_T:57392759:5,15,1,1
chr20	57392771	.	G	GCCCTTGT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:57392759_C_T:57392759:5,14,1,1
chr20	57392773	.	C	CGGAG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,1:0|1:57392759_C_T:57392759:4,14,1,1
chr20	57415588	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:10,6:14,0:10,17,0,6
chr20	57429164	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,3:5,5,1,2
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chr20	57466761	.	CCCGCCG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CCG;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:5,2:9,1,2,0
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chr20	57475128	.	G	GGTCGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:57475127_G_GA:57475127:2,1,0,1
chr20	57475133	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57475127_G_GA:57475127:2,0,0,1
chr20	57478807	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,15:0,28:0,0,22,21
chr20	57480420	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=97,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:3,4,5,2
chr20	57564927	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:27,2:7,1:20,14,2,1
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chr20	57569118	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,0:2,2:5,0,2,0
chr20	57569617	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,34,17;MFRL=135,149,98;MMQ=60,60,60;MPOS=10,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,17;RU=A;STR;TLOD=5.69,6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,6:0.198,0.256:25:2,4,2:4,1,0:5,8,6,6
chr20	57569816	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr20	57570710	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,0:12,3:13,11,2,1
chr20	57572614	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr20	57572675	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,10:0,0,14,10
chr20	57598562	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,7:7,3:11,3,8,2
chr20	57599016	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,14:0,0,11,16
chr20	57612390	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:1,0,0,13
chr20	57613704	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20,32;MFRL=163,91,0;MMQ=60,60,60;MPOS=28,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,18;RU=A;STR;TLOD=4.26,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,3:0.504,0.367:9:0,1,2:1,4,1:0,1,2,6
chr20	57767605	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:3,3:5,6,1,2
chr20	57829162	.	CTC	TGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:0|1:57829162_CTC_TGG:57829162:6,8,0,2
chr20	57829169	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:6,0:0|1:57829162_CTC_TGG:57829162:8,9,0,2
chr20	57829171	.	T	TGATTTATGCAGACAC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:57829162_CTC_TGG:57829162:8,9,0,2
chr20	57829472	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=92,143;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:8,6,5,0
chr20	57829502	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=99,143;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:13,5:4,0:9,8,5,0
chr20	57899361	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:9,10:13,0:19,4,10,0
chr20	58411441	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr20	58420336	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=92,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:9,6:11,5:10,10,5,6
chr20	58455569	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,0:8,4:2,10,0,4
chr20	58460945	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=103,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:19,2:20,0:0|1:58460945_G_A:58460945:24,16,1,1
chr20	58460968	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=96,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:17,2:23,0:0|1:58460945_G_A:58460945:22,18,1,1
chr20	58467393	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:3,4:4,2:1,7,0,6
chr20	58497481	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=108,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.310:17:2,1:9,4:5,7,1,4
chr20	58519777	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:18,0:16,4:22,12,0,4
chr20	58522559	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr20	58523103	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:3,5,0,3
chr20	58523104	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.856:11:1,6:0,4:0,1,2,8
chr20	58533744	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=105,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,6:6,2:0|1:58533744_T_G:58533744:2,6,4,4
chr20	58533759	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=138,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.499:24:4,7:8,4:0|1:58533744_T_G:58533744:5,7,6,6
chr20	58558073	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,2:8,6:8,7,2,6
chr20	58562690	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=74,108;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,0:7,4:7,8,0,4
chr20	58562707	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:1,4,2,4
chr20	58574584	.	TATTTCTGCTATCTGTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:2,2:9,1,1,1
chr20	58576449	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=113,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:2,2:6,15:4,4,9,8
chr20	58581863	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0|1:58581863_G_C:58581863:0,0,6,7
chr20	58581873	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.847:11:1,7:0,3:0|1:58581863_G_C:58581863:0,1,4,6
chr20	58606276	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:10,0:5,3:9,7,1,2
chr20	58644995	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr20	58645106	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=88,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,1:2,4:7,4,1,4
chr20	59829847	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,8:5,3:7,0,8,3
chr20	60294161	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,1:9,2:8,8,2,1
chr20	60294279	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:1,7:4,4:4,1,10,2
chr20	60348071	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:11,0:25,4:24,12,4,0
chr20	60448738	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr20	60509054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,1,2
chr20	60512028	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,2,3
chr20	60528625	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=82,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:19,0:10,3:18,11,1,2
chr20	60528759	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr20	60584215	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:6,1:7,2:5,8,2,1
chr20	60639409	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	60639604	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr20	60704117	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr20	60704185	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr20	60704825	.	CC	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,1:15,0:15,9,1,1
chr20	60712347	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr20	60712479	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=105,19;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:18,4:29,0:23,25,3,1
chr20	60712511	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,17:0,0,11,17
chr20	60718420	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr20	60718433	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr20	60747664	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,1:3,1:7,1,2,0
chr20	60749479	.	GAAGAGGAAGTTTTAAAAAAAATTTTTAAGTT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.118:41:5,4:6,0:26,11,2,2
chr20	60791821	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:60791821_G_GC:60791821:9,9,1,1
chr20	60791829	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:60791821_G_GC:60791821:10,9,1,1
chr20	60793714	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:3,7,1,1
chr20	60838764	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=123,43;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,0:11,4:10,7,0,4
chr20	60861782	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	60881330	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,12,11
chr20	60881643	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,14:0,13:1,0,21,7
chr20	60881780	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,8,14
chr20	60882888	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr20	60883273	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	60885399	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:7,8,1,1
chr20	60885428	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:60885428_C_A:60885428:0,1,0,5
chr20	60885448	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:60885428_C_A:60885428:0,0,1,4
chr20	60885697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,0,2
chr20	60886153	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr20	60889313	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr20	60891711	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=111,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:60891711_G_GA:60891711:5,6,1,1
chr20	60891712	.	G	GGCCTCCAACGCCTAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=111,38;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:60891711_G_GA:60891711:5,6,1,1
chr20	60891716	.	CCA	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=111,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:8,0:5,2:0|1:60891711_G_GA:60891711:7,8,1,1
chr20	60892172	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr20	60892692	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,9:0,0,21,4
chr20	60892925	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:60892925_A_AG:60892925:0,2,0,1
chr20	60892928	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:60892925_A_AG:60892925:0,2,0,1
chr20	60892932	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	60893506	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr20	60894870	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr20	60894907	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:60894907_A_C:60894907:1,3,0,1
chr20	60894909	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:60894907_A_C:60894907:1,3,0,1
chr20	60895738	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,7:0,0,8,5
chr20	60897561	.	CC	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:60897561_CC_GA:60897561:0,0,4,7
chr20	60897570	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:60897561_CC_GA:60897561:0,0,0,7
chr20	60897661	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr20	60906055	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:1,12:2,5:2,1,11,7
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chr20	60921701	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:1,6:1,0,5,4
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chr20	60927431	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr20	60927475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr20	60927482	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr20	60963346	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=168,139,114;MMQ=60,60,60;MPOS=3,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.32,34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,15:0.166,0.747:19:1,2,8:0,0,5:1,0,14,4
chr20	60969162	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr20	60969886	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr20	60971306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr20	60971323	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=156,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:9,1,1,1
chr20	60971327	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr20	60986019	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:2,4:10,8:5,7,7,5
chr20	60990162	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,12,4
chr20	60990618	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,1:3,1:9,1,2,0
chr20	61048549	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,5:8,6:10,3,4,7
chr20	61143487	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,241;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr20	61143664	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:2,2,0,3
chr20	61144010	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr20	61150928	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,1:3,2:3,3,0,3
chr20	61150959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=264,356;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr20	61287727	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	61289958	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr20	61326380	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,5:0,0,9,7
chr20	61341141	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:6,7,2,0
chr20	61341286	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:6,2:3,6:3,7,4,4
chr20	61386316	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61386316_G_A:61386316:0,0,0,1
chr20	61386318	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61386316_G_A:61386316:0,0,0,1
chr20	61386321	.	G	GTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61386316_G_A:61386316:0,0,0,1
chr20	61428423	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=89,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.341:28:3,4:11,5:9,10,5,4
chr20	61439708	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,1:7,4:3,6,0,5
chr20	61441035	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:6,0,4,3
chr20	61441797	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr20	61442020	.	C	CAGAAACG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	61443547	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:6,2:3,4:6,4,5,1
chr20	61443636	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:0|1:61443636_G_A:61443636:6,7,5,2
chr20	61443660	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:3,3:7,2:0|1:61443636_G_A:61443636:4,7,4,4
chr20	61453569	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:5,11,1,1
chr20	61459450	.	G	GATGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	61462005	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:61462005_C_CAA:61462005:0,2,0,1
chr20	61462006	.	C	CCACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:61462005_C_CAA:61462005:0,2,0,1
chr20	61462010	.	A	AGCTAATTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:61462005_C_CAA:61462005:0,2,0,1
chr20	61462011	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1|0:61462005_C_CAA:61462005:0,1,0,2
chr20	61467898	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,4:5,2:4,8,2,4
chr20	61467997	.	C	CACATCCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.302:5:3,0:1,1:0|1:61467997_C_CACATCCG:61467997:0,4,0,1
chr20	61467999	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61467997_C_CACATCCG:61467997:0,4,0,1
chr20	61473283	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,3:10,0:0|1:61473283_G_C:61473283:8,10,2,1
chr20	61473289	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,0;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,0:10,0:0|1:61473283_G_C:61473283:8,10,2,1
chr20	61473290	.	T	TCC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=23,0;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,0:10,0:0|1:61473283_G_C:61473283:8,11,2,1
chr20	61510508	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	61511079	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:9,6,2,1
chr20	61526074	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr20	61526296	.	GGCCTTGTTTTCTAGGAGGAAAGCATCGCTTAT	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:15,2:11,0:17,16,2,0
chr20	61526322	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:11,0:9,2:9,13,2,0
chr20	61527563	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,10:0,0,12,8
chr20	61528074	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,10:0,0,11,10
chr20	61528306	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,8:0,23:0,0,10,21
chr20	61538591	.	A	ATTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,2:12,0:0|1:61538591_A_ATTT:61538591:14,10,1,1
chr20	61538595	.	C	CTGCCAG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,2:14,0:0|1:61538591_A_ATTT:61538591:16,10,1,1
chr20	61541028	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr20	61589013	.	AG	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:2,0:1,1:0|1:61589013_AG_GT:61589013:0,3,0,1
chr20	61589018	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:2,0:1,1:0|1:61589013_AG_GT:61589013:0,3,0,1
chr20	61589022	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:1,0:1,1:0|1:61589013_AG_GT:61589013:0,3,0,1
chr20	61589025	.	G	GTGTGTGTAGAGGGAGAGACAGAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:2,0:1,1:0|1:61589013_AG_GT:61589013:0,3,0,1
chr20	61594983	.	TCCTCTCCTGGCTGCCCACCTTCTTCGAGGAGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=158,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.204:13:3,0:3,2:4,7,1,1
chr20	61595537	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr20	61597946	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:7,5:8,1:7,8,2,4
chr20	61598665	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:13,7,2,0
chr20	61598899	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr20	61834054	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=152,53;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr20	61834282	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:4,12,2,0
chr20	61847068	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=214,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:4,5:1,1:1,5,1,5
chr20	61869223	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=115,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:6,2,4,1
chr20	61870605	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr20	61872905	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr20	61873039	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,7:0,14:0,0,11,10
chr20	61875256	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr20	61875497	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,0,13
chr20	61878950	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,6:1,4:2,1,4,6
chr20	61880169	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=64,70;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,7:3,1:1,2,2,6
chr20	61880177	.	C	CAGTCCCATCCTTGTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=70,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:2,7,1,1
chr20	61880274	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr20	61907075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr20	61916286	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,3:8,2:5,10,3,3
chr20	61916311	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:61916311_T_C:61916311:5,14,1,1
chr20	61916333	.	T	TTCTCCCATTGAG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=162,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:5,2:0|1:61916311_T_C:61916311:1,14,1,1
chr20	61916335	.	T	TTGTTTGGGGA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=162,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:7,1:0|1:61916311_T_C:61916311:1,14,1,1
chr20	61917241	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	61929296	.	G	GATCAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:9,8,0,2
chr20	61942760	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=177,0;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:61942760_C_A:61942760:5,0,0,2
chr20	61942764	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=177,0;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:61942760_C_A:61942760:5,0,0,2
chr20	61943089	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,3:0,4,1,4
chr20	61943916	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,4:2,0:0,4,1,3
chr20	61946692	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr20	61946848	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	61946859	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61946859_C_T:61946859:0,0,0,1
chr20	61946860	.	CAAGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61946859_C_T:61946859:0,0,0,1
chr20	61950397	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr20	61950792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:3,5,1,2
chr20	61950972	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:0|1:61950972_C_T:61950972:1,3,1,1
chr20	61950978	.	C	CAACCCCTCGACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:61950972_C_T:61950972:1,4,1,1
chr20	61951326	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr20	61951729	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=98,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:61951729_C_G:61951729:3,5,1,1
chr20	61951730	.	G	GCCTTTTTCTTTT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=98,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:61951729_C_G:61951729:3,5,1,1
chr20	61951742	.	T	TGAG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=148,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:61951742_T_TGAG:61951742:1,4,1,1
chr20	61951745	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,18;MFRL=148,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:61951742_T_TGAG:61951742:1,4,1,1
chr20	61951789	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	61952490	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr20	61953365	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr20	61953504	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr20	61956782	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:9,7:3,3:5,7,3,7
chr20	61959642	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=203,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:2,0:2,1,2,1
chr20	61981611	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:6,6,1,1
chr20	61987695	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.266:15:4,1:6,1:11,0,0,4
chr20	61990874	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr20	62044712	.	C	CGTA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:5,2:12,0:0|1:62044712_C_CGTA:62044712:4,13,0,2
chr20	62044713	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:0|1:62044712_C_CGTA:62044712:4,13,0,2
chr20	62044947	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,0:2,0,1,1
chr20	62046496	.	C	CGACAGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=GACA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr20	62055417	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,15:0,0,13,14
chr20	62059605	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=254,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr20	62059804	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.123:23:11,1:9,1:10,11,0,2
chr20	62076743	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,12:0,0,6,12
chr20	62122094	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:62122094_GA_TT:62122094:0,2,0,1
chr20	62122100	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,14;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:62122094_GA_TT:62122094:0,2,0,1
chr20	62122106	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:62122094_GA_TT:62122094:0,2,0,1
chr20	62122110	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=223,259;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:62122094_GA_TT:62122094:0,1,0,1
chr20	62126362	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,93;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.357:29:9,0:9,10:7,12,0,10
chr20	62162340	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,3:0,1,0,4
chr20	62163783	.	CGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr20	62172989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	62173029	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	62173947	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,2:3,0:4,4,0,2
chr20	62175792	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr20	62187776	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:7,6,2,0
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chr20	62202240	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,6,12
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chr20	62224083	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr20	62227180	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:0,8,0,4
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chr20	62234240	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr20	62234241	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr20	62234273	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,7,6
chr20	62272583	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=225,176;MMQ=40,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr20	62272658	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=102.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,16:0,0,24,10
chr20	62272788	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:1,1:0,0:0,7,0,4
chr20	62290663	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,4:5,0:6,0,3,1
chr20	62290697	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:6,3:3,5:6,4,7,1
chr20	62294015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:3,3:2,2,2,3
chr20	62294045	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,1,1
chr20	62309554	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,2:4,3:6,6,1,4
chr20	62312118	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=121,61;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.291:21:10,5:5,0:5,10,3,3
chr20	62319568	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr20	62319604	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,31;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr20	62321655	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.703:15:2,8:2,2:1,3,8,3
chr20	62322250	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:1,0:0|1:62322250_GC_G:62322250:3,1,1,1
chr20	62322253	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,2:1,0:0|1:62322250_GC_G:62322250:3,1,1,1
chr20	62322257	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=143,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:2,0:0|1:62322250_GC_G:62322250:3,2,1,1
chr20	62323006	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=199,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:5,1:1,3:6,0,4,0
chr20	62325731	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:9,2:25,1:20,15,2,1
chr20	62328829	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:6,4:5,4:5,7,5,3
chr20	62332638	.	A	AC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=68.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,26:0.771:33:3,13:4,11:0|1:62332638_A_AC:62332638:3,4,12,14
chr20	62332641	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,8:0.230:37:17,4:11,4:1|0:62332638_A_AC:62332638:14,15,4,4
chr20	62333350	.	GCCCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	62337622	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr20	62338528	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr20	62364885	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,10,1
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chr20	62369300	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:2,5,1,1
chr20	62369895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:2,2,3,4
chr20	62370349	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
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chr20	62372706	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=219,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.654:4:0,0:1,0:1,0,3,0
chr20	62373983	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,2:5,4:8,4,3,3
chr20	62374219	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr20	62374441	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	62384309	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,1:0,3:0,1,0,5
chr20	62421622	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,4,4
chr20	62518852	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=122,96;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:12,4:9,0:17,4,1,3
chr20	62518906	.	C	CCT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.123:30:11,3:15,0:0|1:62518906_C_CCT:62518906:9,18,1,2
chr20	62518909	.	C	CATGA	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:11,3:15,0:0|1:62518906_C_CCT:62518906:10,18,1,2
chr20	62518910	.	C	CAGATTGAAATTAA	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:11,3:14,0:0|1:62518906_C_CCT:62518906:10,18,1,2
chr20	62518913	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:13,1:10,18,0,2
chr20	62518914	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,2:14,0:0|1:62518906_C_CCT:62518906:10,18,0,2
chr20	62562388	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:0|1:62562388_C_T:62562388:3,19,1,1
chr20	62562397	.	CGT	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:9,1:5,1:3,11,0,2
chr20	62562404	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:3,2:0|1:62562388_C_T:62562388:3,14,1,1
chr20	62562411	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=157,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:62562388_C_T:62562388:2,12,1,1
chr20	62562416	.	G	GAGATAA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:62562388_C_T:62562388:2,9,1,1
chr20	62562419	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:62562388_C_T:62562388:2,9,1,1
chr20	62574152	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	62578000	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=223,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,2:1,0:0,3,1,1
chr20	62578077	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	62594147	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,1,0
chr20	62594899	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:4,2,3,0
chr20	62595547	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:3,7,1,2
chr20	62595990	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:4,4,5,2
chr20	62597694	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,20:0.401:50:17,11:13,8:14,16,12,8
chr20	62614338	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,9:9,2:9,2,9,2
chr20	62616201	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,0:4,4:11,1,4,0
chr20	62630361	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr20	62648292	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr20	62663408	.	TC	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=194,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,2:1,0:0|1:62663408_TC_AG:62663408:4,3,1,1
chr20	62663411	.	A	AACCCAGCACTGTGCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=194,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:62663408_TC_AG:62663408:4,3,1,1
chr20	62664365	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=100,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:3,7,0,4
chr20	62697751	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr20	62698188	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:3,0,3,1
chr20	62701092	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=81,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,1:2,2:7,2,3,0
chr20	62702022	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:3,6,0,2
chr20	62703490	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:7,1:2,6:6,4,5,2
chr20	62705140	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr20	62723982	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=177,147;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:1,5:2,0:4,0,6,0
chr20	62737083	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	62737160	.	G	GGGCGTGATGATA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:16,5,1,1
chr20	62737318	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=221,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,6:0,3:1,1,1,8
chr20	62836520	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,4:0,5:0,3,1,8
chr20	62838933	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=80,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.397:36:10,6:11,8:10,12,6,8
chr20	62839888	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr20	62845086	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TG;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	62848696	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:62848696_A_T:62848696:0,4,0,1
chr20	62848700	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:62848696_A_T:62848696:0,3,0,1
chr20	62848705	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62848696_A_T:62848696:0,0,0,1
chr20	62848709	.	GGAGGGAC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62848696_A_T:62848696:0,0,0,1
chr20	62851020	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,1:0,3:3,3,4,0
chr20	62851123	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:16,3:17,0:16,18,1,2
chr20	62854417	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:4,1,3,1
chr20	62854778	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr20	62868043	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=65,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:7,5:2,7:3,6,7,6
chr20	62868079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62868079_G_A:62868079:0,2,0,1
chr20	62868081	.	A	ATTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62868079_G_A:62868079:0,2,0,1
chr20	62891426	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:11,4:3,0:6,8,2,2
chr20	62895950	.	A	AAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr20	62895968	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62895968_G_GA:62895968:0,1,0,1
chr20	62895969	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62895968_G_GA:62895968:0,1,0,1
chr20	62904542	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.517:23:4,8:6,3:6,5,11,1
chr21	10863087	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,6,17
chr21	10906928	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:19,2:13,4:21,11,3,3
chr21	10908725	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=165,155;MMQ=52,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:11,0,2,0
chr21	10908767	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=145,140;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:14,3:19,3:24,10,6,0
chr21	10910291	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=110,136;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,3:6,6:5,3,6,3
chr21	10910311	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=124,138;MMQ=60,48;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.577:31:4,10:9,8:7,6,12,6
chr21	10916290	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=135,168;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:12,2,4,0
chr21	10916293	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=143,135;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.803:18:2,10:1,5:2,1,14,1
chr21	10916322	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=134,160;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.290:36:14,7:11,3:17,9,8,2
chr21	10916519	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=134,140;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:6,2:5,11,0,2
chr21	10916534	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=145,139;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:3,2:5,6,1,2
chr21	10916548	.	G	GAGA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=114,140;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:4,2:0|1:10916548_G_GAGA:10916548:6,9,0,2
chr21	10916551	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=114,140;MMQ=60,51;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:4,2:0|1:10916548_G_GAGA:10916548:6,9,0,2
chr21	10920041	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=153,0;MMQ=41,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,2:4,2:9,0,3,1
chr21	10920067	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=143,0;MMQ=48,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:13,1,2,1
chr21	10920098	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,46;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,22,6
chr21	10920176	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,125;MMQ=49,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:22,1:5,3:12,15,1,3
chr21	10922035	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.157:49:20,0:21,7:17,25,0,7
chr21	10942681	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.244:51:26,5:13,7:27,12,9,3
chr21	10942924	.	CCTT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:19,7:25,2:23,22,8,1
chr21	10943003	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.178:43:13,4:22,3:12,24,1,6
chr21	10943038	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=180,179;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:15,3:11,2:6,20,0,5
chr21	10944640	.	TAA	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=138,173;MMQ=40,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:22,2:27,3:32,19,4,1
chr21	10952798	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,174;MMQ=52,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr21	10953012	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=146,150;MMQ=30,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,6:9,2:4,9,1,7
chr21	10959806	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.136:49:17,2:26,4:17,26,2,4
chr21	10959858	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,163;MMQ=50,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,3:3,4:0,4,3,5
chr21	10969188	.	A	ACT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=148,127;MMQ=46,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:0,12,0,3
chr21	10969251	.	CAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=206,158;MMQ=42,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.315:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr21	10969894	.	AATGG	A,AATGGATGG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,28,27;MFRL=142,160,158;MMQ=60,54,60;MPOS=25,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=ATGG;STR;TLOD=6.47,6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.229,0.323:7:2,1,2:1,1,0:2,1,4,0
chr21	10969906	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,70;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,3:3,0:12,1,1,2
chr21	10970003	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,12:0.231:54:21,6:20,6:10,32,2,10
chr21	10970008	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,17:0.329:52:17,10:18,6:5,30,7,10
chr21	10971210	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=161,230;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,1:6,0,4,0
chr21	10971453	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr21	10973787	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=130,163;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:0|1:10973787_T_A:10973787:1,7,3,6
chr21	10973798	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=130,161;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0|1:10973787_T_A:10973787:1,7,1,3
chr21	11049503	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=208,216;MMQ=33,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:5,7,0,5
chr21	11049516	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr21	11049533	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=197,181;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:11,7,2,0
chr21	11049617	.	C	G	.	.	DP=102;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,112;MMQ=39,30;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,8:0.085:101:45,7:47,1:0|1:11049617_C_G:11049617:55,38,4,4
chr21	11049621	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=106,138;MMQ=39,33;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:98,5:0.048:103:49,3:47,2:1|0:11049617_C_G:11049617:55,43,3,2
chr21	11049623	.	T	C	.	.	DP=108;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=106,138;MMQ=39,33;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:98,5:0.048:103:47,3:48,2:1|0:11049617_C_G:11049617:55,43,3,2
chr21	11058085	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=153,161;MMQ=40,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,1:9,3:8,6,4,0
chr21	11058119	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=137,176;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:4,7:10,4:8,6,5,6
chr21	11058322	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=103,108;MMQ=51,33;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,5:0.064:90:43,4:42,1:33,52,1,4
chr21	11058349	.	T	G	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=107,176;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.096:60:32,2:23,3:16,39,0,5
chr21	11058404	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=199,155;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr21	11098597	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=28,24;MFRL=136,88;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:3,1:0|1:11098597_A_G:11098597:12,2,2,0
chr21	11098615	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=34,24;MFRL=149,88;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:0|1:11098597_A_G:11098597:11,3,2,0
chr21	11098626	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=149,158;MMQ=55,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:9,1,5,3
chr21	11098664	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=26,25;MFRL=110,129;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.261:44:13,4:18,6:0|1:11098664_A_G:11098664:18,15,7,4
chr21	11098673	.	GTACTCCTAC	G	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=97,119;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,12:0.228:55:14,4:18,7:0|1:11098664_A_G:11098664:22,21,8,4
chr21	11098674	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.975:33:0,14:0,19:0,0,17,16
chr21	11098685	.	CTCCAGCCGCCA	C	.	.	DP=65;ECNT=10;MBQ=30,30;MFRL=94,109;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,11:0.179:65:18,4:25,7:0|1:11098664_A_G:11098664:26,28,7,4
chr21	11098704	.	A	G	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=23,27;MFRL=89,119;MMQ=60,48;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,12:0.181:70:21,4:25,8:0|1:11098664_A_G:11098664:26,32,7,5
chr21	11098723	.	TG	CG,CA	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=27,29,31;MFRL=91,95,96;MMQ=60,49,60;MPOS=-2,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.39,22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,10,8:0.169,0.154:56:14,4,4:20,6,3:18,20,9,9
chr21	11098728	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=97,95;MMQ=60,49;MPOS=-7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.195:55:16,4:23,5:20,25,5,5
chr21	14982886	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=90,169;MMQ=24,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.899:17:1,12:0,4:0,1,8,8
chr21	14982952	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr21	14983098	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=121,186;MMQ=25,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr21	14990578	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr21	14992475	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,206;MMQ=24,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,1,3
chr21	15013735	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=109.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0,0,24,12
chr21	15481234	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr21	15481500	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	15558346	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=77,125;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,0:6,5:3,5,2,3
chr21	15561781	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=105,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr21	15592125	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=135,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:15592125_A_T:15592125:0,1,0,1
chr21	15592127	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=135,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15592125_A_T:15592125:0,1,0,1
chr21	15592128	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=135,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15592125_A_T:15592125:0,1,0,1
chr21	15596882	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr21	15599118	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr21	15599144	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr21	15748186	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr21	15755349	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=75,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:6,5:6,3:7,5,6,2
chr21	15884949	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=228,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr21	15893594	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,4:4,9:0,6,0,13
chr21	15954660	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr21	15966421	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr21	15988184	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=25,24;RU=A;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.815:2:0,1:0,1:0|1:15988184_CA_C:15988184:0,0,2,0
chr21	15988210	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=93,196;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:9,0:15,0:0|1:15988184_CA_C:15988184:3,24,2,0
chr21	15988213	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=92,196;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:17,0:0|1:15988184_CA_C:15988184:5,25,2,0
chr21	16015250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr21	17197367	.	CAAAGGCTAG	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:11,2:16,0:9,19,1,1
chr21	17202780	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,2:10,6:11,3,8,0
chr21	17202812	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=110,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:9,6:13,5:14,8,9,2
chr21	17250645	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:12,5:19,0:25,6,5,0
chr21	18814226	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:3,2:4,0:2,11,0,2
chr21	18814243	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,4:0,0,0,11
chr21	18814246	.	G	A,GT,GTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,22,32,33;MFRL=201,156,197,202;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,19,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.51,8.05,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,4,2:0.200,0.389,0.226:10:1,2,1,0:1,0,2,2:0,2,0,8
chr21	18932934	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr21	18933561	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr21	19167515	.	TG	CC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:8,2:12,7,1,1
chr21	19190427	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:6,0,8,1
chr21	19628809	.	CTT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.224:23:7,2:5,1:13,5,4,1
chr21	19628823	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,9;MFRL=98,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.239:32:13,1:6,0:9,14,9,0
chr21	19629205	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=221,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:19629205_C_T:19629205:2,0,0,1
chr21	19629208	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:19629205_C_T:19629205:3,0,0,1
chr21	19629209	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:0|1:19629205_C_T:19629205:3,0,0,1
chr21	19632477	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=124,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr21	19635154	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:11,9,1,1
chr21	19635158	.	TTACTGA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=104,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:7,0:9,12,1,1
chr21	19666526	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:19666526_C_T:19666526:0,0,7,0
chr21	19666530	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.779:7:0,2:1,4:0|1:19666526_C_T:19666526:1,0,6,0
chr21	19685405	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,3,6
chr21	19704296	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr21	19716399	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=106,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:4,4,2,9
chr21	22658544	.	TTTTGTGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTGTGA;STR;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr21	22664619	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr21	22696837	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=109,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.462:7:2,1:2,2:2,2,0,3
chr21	22696881	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr21	22804674	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr21	22849776	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=110,223;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.314:38:14,0:12,10:8,18,0,12
chr21	22910116	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,6:4,1:0|1:22910116_C_T:22910116:9,3,5,2
chr21	22910123	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:8,6:5,1:0|1:22910116_C_T:22910116:11,3,5,2
chr21	26957980	.	CATTTATTTTATTATACAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:6,2,1,1
chr21	26960189	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr21	26961086	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr21	26965100	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,12,2
chr21	26966317	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr21	26973663	.	A	ATATACT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=181.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.959:46:1,19:0,20:1,0,34,11
chr21	26973743	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:15,0:16,7:15,16,0,7
chr21	26976250	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=111.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,10:0,23:0,0,14,21
chr21	26979628	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr21	27074647	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:27074647_G_GCA:27074647:0,5,1,1
chr21	27074648	.	T	TGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:27074647_G_GCA:27074647:0,5,1,1
chr21	27074650	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:27074647_G_GCA:27074647:0,5,1,1
chr21	27086600	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=165,147;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:3,2:3,0:0|1:27086600_C_CCT:27086600:1,7,0,2
chr21	27086603	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=165,147;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:27086600_C_CCT:27086600:1,7,0,2
chr21	27086627	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=232,151;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:27086627_G_GC:27086627:1,3,0,1
chr21	27086632	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=232,151;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:27086627_G_GC:27086627:1,3,0,1
chr21	27130595	.	GTTTATTGA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=179,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:27130595_GTTTATTGA_G:27130595:0,2,0,1
chr21	27130605	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=179,243;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:27130595_GTTTATTGA_G:27130595:0,2,0,1
chr21	27136641	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:11,2:23,0:0|1:27136641_G_C:27136641:18,20,1,1
chr21	27136643	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:12,2:23,0:0|1:27136641_G_C:27136641:18,19,1,1
chr21	27141273	.	C	CATTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTT;STR;TLOD=51.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,5:0,0,13,0
chr21	27277278	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=109,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:6,4:4,5:8,3,7,3
chr21	27326859	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,12:0,0,10,7
chr21	27327100	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr21	27327862	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr21	27369743	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:4,22,0,3
chr21	27852724	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:5,2:1,6,3,0
chr21	28210657	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr21	28212649	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,0:11,4:15,7,0,5
chr21	28214968	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:9,0:10,8:6,13,0,8
chr21	28215826	.	C	CACA	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=92,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,23:0.436:53:18,10:11,11:0|1:28215826_C_CACA:28215826:19,11,14,9
chr21	28215836	.	GC	G	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=81.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,26:0.434:60:20,10:13,14:0|1:28215826_C_CACA:28215826:22,12,13,13
chr21	28216445	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,2,1
chr21	28216692	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr21	28217320	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr21	28296324	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr21	28315963	.	T	TAATTAAAAACTGAATATACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=212,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	30252088	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr21	30255355	.	AC	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:20,2:20,0:0|1:30255355_AC_A:30255355:22,19,1,1
chr21	30255362	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,2:18,0:0|1:30255355_AC_A:30255355:21,19,1,1
chr21	30257560	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,11:0,18:0|1:30257560_C_G:30257560:0,0,13,17
chr21	30257568	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0|1:30257560_C_G:30257560:0,0,12,19
chr21	30257729	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr21	30303388	.	GGTGT	G,GGT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=169,144,184;MMQ=60,49,60;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=GT;STR;TLOD=10.43,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,2:0.283,0.191:13:4,2,1:3,2,1:7,0,6,0
chr21	30313518	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:8,3:8,6,1,2
chr21	30318076	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,172;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:4,7:11,1:15,0,8,0
chr21	30319929	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:3,2:3,11,1,1
chr21	30319946	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,2:0|1:30319946_A_C:30319946:2,10,1,1
chr21	30319948	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:30319946_A_C:30319946:1,10,1,1
chr21	30319951	.	C	CCAACTCTAAGAAGGTTAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,1:0|1:30319946_A_C:30319946:0,9,1,1
chr21	30330693	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:20,7,0,3
chr21	30338153	.	C	CA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.223:27:8,2:9,1:14,7,3,3
chr21	30338293	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,0,12
chr21	30354549	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:3,2:0,0:4,0,0,2
chr21	30357307	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	30365322	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr21	30391671	.	GAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,2:0,0:0,0,0,5
chr21	30400154	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:8,0,1,1
chr21	30403029	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:20,4:6,0:9,17,3,1
chr21	30407109	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=138,91;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:8,5:6,0:12,2,4,2
chr21	30414724	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr21	30414919	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:0,5,1,5
chr21	30426569	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr21	30435729	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=86,44;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:30435729_G_C:30435729:9,13,1,1
chr21	30435737	.	T	TGAGGACC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=86,44;MMQ=59,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:9,2:0|1:30435729_G_C:30435729:12,14,1,1
chr21	30435738	.	T	TTA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=86,44;MMQ=59,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,0:9,2:0|1:30435729_G_C:30435729:12,14,1,1
chr21	30438952	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:8,0,3,0
chr21	30442475	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:30442475_T_C:30442475:0,0,7,0
chr21	30442481	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:30442475_T_C:30442475:0,0,7,0
chr21	30442687	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,1,1
chr21	30445961	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr21	30458164	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,11:2,0:4,2,5,6
chr21	30505836	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr21	30714826	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,0:21,3:16,26,2,1
chr21	30714842	.	A	ACCCGCCCTCCTGTC	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,0:17,2:10,23,1,1
chr21	30959813	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:8,2:0|1:30959813_G_A:30959813:10,11,1,1
chr21	30959820	.	G	GAGCGGGTGGTGGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=99,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:30959813_G_A:30959813:10,11,1,1
chr21	30961131	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,6:2,4:3,1,10,0
chr21	31002803	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=78,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:4,3:4,2:3,5,4,2
chr21	31654809	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,2:1,4:4,3,4,2
chr21	31661909	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=146,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr21	31692541	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr21	31710061	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr21	31813023	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:31813023_C_T:31813023:4,9,1,1
chr21	31813026	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:31813023_C_T:31813023:4,9,1,1
chr21	31813034	.	G	GGCTA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=103,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:31813023_C_T:31813023:5,9,1,1
chr21	31813037	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=103,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:0|1:31813023_C_T:31813023:5,9,1,1
chr21	31933726	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr21	31964982	.	A	ATAGGTGCGGCT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=92,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:12,3:16,0:5,25,1,2
chr21	31965144	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=91,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:31965144_C_T:31965144:7,7,1,1
chr21	31965149	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=84,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:3,2:10,0:0|1:31965144_C_T:31965144:8,6,1,1
chr21	31971298	.	C	CTGCCCTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr21	31973405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr21	31973645	.	G	GTGTTATTTATAATAATGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,4,9
chr21	31989115	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	32015170	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr21	32119349	.	CACAGCCAGAGCCGTATCCACAGCCATAGCCACAGCCAGTTCCATAGCCAGAGCCATATCT	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=81,133;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.107:53:6,3:7,0:32,16,3,2
chr21	32201969	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,10,10
chr21	32253932	.	T	TGACTTCAGGTGATCCATCCGCCTCGACCTCCCAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=239,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr21	32410477	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=244,194;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,6:6,0:0|1:32410477_C_CT:32410477:9,0,6,0
chr21	32410480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=244,194;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,6:5,0:0|1:32410477_C_CT:32410477:9,0,6,0
chr21	32491083	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,4:0,0:0,2,0,5
chr21	32493204	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr21	32496772	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:7,1,2,0
chr21	32519135	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,2,2
chr21	32524852	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr21	32525302	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr21	32525345	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,2:3,7:4,2,5,4
chr21	32526841	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=293,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr21	32590006	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr21	32597972	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,169;MMQ=60,23;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr21	32598291	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:4,0:8,2:2,11,0,3
chr21	32617713	.	A	ACCTTGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr21	32617803	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=63,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:11,0:6,16,3,0
chr21	33044256	.	GGCT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.274:16:9,4:2,0:5,7,2,2
chr21	33067170	.	A	ATCCC	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:13,0:29,1:0|1:33067170_A_ATCCC:33067170:35,8,2,0
chr21	33067172	.	G	GCT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:13,1:30,0:0|1:33067170_A_ATCCC:33067170:36,10,2,0
chr21	33074260	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=131,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr21	33104112	.	G	GTACTTCACCCTTATTTTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	33371038	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=122,47;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:13,4:15,1:14,14,4,1
chr21	33371540	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr21	33416324	.	AGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GT;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr21	33641240	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:1,0,10,1
chr21	33686771	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=151,127;MMQ=50,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:13,0,2,0
chr21	33686776	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=147,137;MMQ=50,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,2:7,1:11,0,3,0
chr21	33690293	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr21	33691502	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=92,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,6:0,12:1,0,14,4
chr21	33691754	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr21	33693043	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=208,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	33719695	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,6:0,0,10,8
chr21	33721667	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:14,0:10,3:13,12,1,2
chr21	33721843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	33726201	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr21	33730013	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr21	33733289	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.458:24:7,10:6,0:10,3,11,0
chr21	33735476	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=110,7683;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.326:28:6,0:13,8:11,8,9,0
chr21	33740637	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=9,28;MFRL=0,166;MMQ=23,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,1:0,4:1,0,5,0
chr21	33755633	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr21	33867280	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr21	33876246	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=113,135;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:3,5,4,4
chr21	33949056	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.751:18:3,3:1,10:0|1:33949056_A_G:33949056:2,2,10,4
chr21	33949059	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:3,3:1,12:0|1:33949056_A_G:33949056:2,2,10,5
chr21	33951180	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:1,4,1,5
chr21	33954716	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=137,99;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.120:48:19,0:24,5:28,15,0,5
chr21	33954763	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:4,8,4,4
chr21	33979904	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,30,17;MFRL=109,157,65;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=A;STR;TLOD=4.13,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,5:0.220,0.242:18:1,1,0:4,3,1:1,8,4,5
chr21	33982072	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.368:14:2,2:7,3:8,1,4,1
chr21	33997451	.	T	TGCTATTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr21	33997466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr21	34003579	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:8,7,0,3
chr21	34003928	.	A	AAGTATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=83,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.387:21:6,3:7,4:7,6,4,4
chr21	34017857	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	34029509	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34029509_T_C:34029509:0,2,0,1
chr21	34029517	.	T	TTCTATTTGCTAGAAAAGTCGCCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34029509_T_C:34029509:0,2,0,1
chr21	34050939	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,1:7,5:0|1:34050939_TA_T:34050939:10,4,5,1
chr21	34050941	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,1:7,5:0|1:34050939_TA_T:34050939:10,4,5,1
chr21	34056293	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:4,1,7,1
chr21	34059207	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr21	34067546	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,0:13,4:11,11,2,2
chr21	34115993	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.203:42:17,8:17,0:18,16,8,0
chr21	34127438	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26,24;MFRL=158,113,101;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.27,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.398,0.404:7:0,3,1:1,0,2:1,0,6,0
chr21	34128717	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=99,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:3,9,2,8
chr21	34157235	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,2:0,2:0,3,0,5
chr21	34166190	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,13,11
chr21	34169181	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr21	34169317	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=61,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.590:32:6,7:7,12:6,7,12,7
chr21	34443520	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,1:4,0:0|1:34443520_T_C:34443520:0,4,3,0
chr21	34443521	.	T	TGG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,0:4,0:0|1:34443520_T_C:34443520:0,4,3,0
chr21	34443526	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,1:3,1:0|1:34443520_T_C:34443520:2,3,3,0
chr21	34443532	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:34443520_T_C:34443520:3,3,3,0
chr21	34538065	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr21	34602794	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,2:3,2,4,1
chr21	34602934	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,8:1,2:0,4,3,7
chr21	34614250	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=107,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:0|1:34614250_T_C:34614250:2,5,3,4
chr21	34614255	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=107,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:0|1:34614250_T_C:34614250:2,5,3,4
chr21	34617213	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:5,0,4,2
chr21	34617729	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=93,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:2,4,3,2
chr21	34624386	.	C	CATCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=ATCT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr21	34624917	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr21	34635053	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.666:16:3,5:2,5:0|1:34635053_G_GT:34635053:4,1,6,5
chr21	34635065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.599:13:2,1:2,3:0|1:34635053_G_GT:34635053:4,1,4,4
chr21	34635079	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=197,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,3:1,3:1,0,4,3
chr21	34638859	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr21	34668747	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr21	34697264	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr21	34707808	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=113,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.551:38:10,13:7,8:11,6,16,5
chr21	34715902	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:9,0:12,2:0|1:34715902_A_T:34715902:17,6,1,1
chr21	34715908	.	T	TGGGGATATTCTATTTTTC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:34715902_A_T:34715902:17,7,1,1
chr21	34721466	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=101,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,10:0.156:68:28,10:29,0:27,31,10,0
chr21	34726127	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,1,13
chr21	34799350	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,3,16
chr21	34804966	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=14,27;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.948:22:0,14:0,7:1,0,15,6
chr21	34805193	.	ATC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=88,0;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:4,1:7,1:6,8,1,1
chr21	34805197	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=0,88;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.398:15:3,2:5,4:6,3,1,5
chr21	34809049	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.921:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr21	34823214	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=114,43;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:16,3:12,13,0,3
chr21	34823252	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr21	34837623	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,11,10
chr21	34837786	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:2,3,1,2
chr21	34860488	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,4:4,0:10,2,4,0
chr21	34876708	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:11,4:2,7:7,6,6,5
chr21	34882121	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=85,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:1,1:5,2:0,7,2,1
chr21	34883776	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:3,9,0,2
chr21	34893344	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr21	34894623	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr21	34897397	.	TT	GG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34897397_TT_GG:34897397:0,2,0,1
chr21	34897408	.	A	ATCCATTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34897397_TT_GG:34897397:0,1,0,1
chr21	34900924	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=127,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.565:8:2,1:1,1:1,3,1,3
chr21	34902984	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,329;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:6,2:1,0:7,0,2,0
chr21	34903875	.	ATTTTTTTT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=20,12;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:3,0:4,6,1,1
chr21	34915324	.	CG	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr21	34918610	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:19,4:23,0:21,21,4,0
chr21	34918786	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr21	34921913	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.130:43:23,5:13,0:14,24,4,1
chr21	34924603	.	GTCTATGATGTCCCCTATGGCTGAACGCTCTATGATGTCAGCCTACGAGCGCTCTATGATGTCAGCCTACGAGCGC	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,21:0.140:77:13,11:13,8:24,32,13,8
chr21	34924842	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:17,11,0,3
chr21	34931989	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.120:56:28,6:21,0:20,30,6,0
chr21	34931994	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:28,3:17,0:22,24,3,0
chr21	34932500	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr21	34941905	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=107,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:12,0:19,2:0|1:34941905_T_C:34941905:15,17,1,1
chr21	34941916	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=107,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:16,2:0|1:34941905_T_C:34941905:13,17,1,1
chr21	34947856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr21	34948684	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,10,12
chr21	34948696	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,11:0,8:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,8,13
chr21	34948788	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:9,11,1,1
chr21	34954156	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr21	34954602	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=122,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr21	34959776	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,2:5,7:6,4,7,2
chr21	34961965	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr21	34968443	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=99,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:8,0:10,11,1,1
chr21	34971465	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=95,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.109:53:26,0:22,5:24,24,1,4
chr21	34988745	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	35094849	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.223:13:4,2:6,1:10,0,2,1
chr21	35107734	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr21	35122710	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:35122710_T_C:35122710:0,3,0,1
chr21	35122714	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:35122710_T_C:35122710:0,3,0,1
chr21	35122725	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr21	35124253	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=71.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,13,10
chr21	35127735	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	35153957	.	CA	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=174,195;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:1,0:0,7,0,2
chr21	35166803	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,2:2,4:0,5,0,6
chr21	35186127	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.687:10:1,0:2,2:3,0,6,1
chr21	35189985	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	35190802	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,2:2,6:2,5,1,7
chr21	35199150	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:12,4:8,0:11,9,1,3
chr21	35201281	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,5:2,8:5,3,3,10
chr21	35229197	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	35237608	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:2,2:10,5:5,8,3,4
chr21	35247873	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr21	35257713	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,90;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,4:5,0:5,1,4,0
chr21	35258514	.	TAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=107,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.315:13:1,0:2,3:2,7,3,1
chr21	35281306	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr21	35446136	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,2:1,4:0,6,0,6
chr21	35467472	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr21	35468605	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,1:4,4:7,0,3,3
chr21	35469121	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=118,863;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:9,3:9,6,3,0
chr21	35469193	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,4:0,0,4,11
chr21	35469708	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,18:0,4:0|1:35469708_G_GA:35469708:0,0,13,10
chr21	35469726	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=81.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,13:0,7:0|1:35469708_G_GA:35469708:0,0,13,8
chr21	35470210	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,16:0,7:0|1:35470210_T_G:35470210:0,0,10,14
chr21	35470213	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,17:0,6:0|1:35470210_T_G:35470210:0,0,10,14
chr21	35470979	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:8,1:0|1:35470979_TC_T:35470979:8,11,0,2
chr21	35470981	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:8,1:0|1:35470979_TC_T:35470979:8,11,0,2
chr21	35471579	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,2:6,0:6,5,1,1
chr21	35471878	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,8:9,2:9,7,4,6
chr21	35472761	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:7,0:9,3,1,1
chr21	35474410	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:3,8,3,8
chr21	35475402	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:11,7,2,0
chr21	35475879	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:11,5,2,1
chr21	35476340	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:4,7,1,1
chr21	35772136	.	GCTTGGCGACCATCTGGACAATATCTCGCCCATGGCAAGCTGGATCCCTGTGGATTACTTTGGTGGGTGGAAA	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,311;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.068:45:5,0:14,2:21,22,0,2
chr21	35773445	.	T	TGTTTGAACTCTCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr21	35774244	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr21	35774491	.	ATTT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:1,1:0,3,1,1
chr21	35791796	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:35791796_G_C:35791796:5,4,1,1
chr21	35791801	.	G	GCCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:35791796_G_C:35791796:5,3,1,1
chr21	35791802	.	T	TTTGCCCCCAGGTGGGC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,0:3,2:0|1:35791796_G_C:35791796:5,3,1,1
chr21	35822019	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr21	35893737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	36042462	.	GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	36042579	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:36042579_C_G:36042579:0,0,2,1
chr21	36042584	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:36042579_C_G:36042579:0,0,2,1
chr21	36079492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=113,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr21	36079735	.	GCA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=11,17;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=CA;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,1:0,0:0,2,0,2
chr21	36080204	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr21	36080290	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=99,114;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:4,4,7,4
chr21	36080908	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	36193871	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,12,2
chr21	36206932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,4:0,0:0,0,3,4
chr21	36265323	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31,25;MFRL=165,127,111;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.31,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,4:0.228,0.225:17:5,3,0:3,1,4:3,6,3,5
chr21	37408608	.	AACGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACGT;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr21	37420650	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=93,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:5,6:9,10:5,9,8,8
chr21	37425955	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr21	37425971	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr21	37429778	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:2,3:1,0:0,4,0,3
chr21	37431265	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr21	37444696	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:10,8:5,9:8,7,6,11
chr21	37444973	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=92,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:9,8:7,12:6,11,9,11
chr21	37507745	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:1,5:8,5:4,5,9,1
chr21	37510214	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=97,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:8,0:5,3:6,7,2,1
chr21	37518362	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,4:2,7:7,5,7,4
chr21	37518554	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:25,0:8,2:0|1:37518554_C_T:37518554:24,9,1,1
chr21	37518575	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:22,0:9,2:0|1:37518554_C_T:37518554:22,11,1,1
chr21	37518893	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr21	37571593	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.675:16:0,5:4,5:1,4,4,7
chr21	37580927	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	37581205	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr21	37586831	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:3,9,1,1
chr21	37586877	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr21	37591824	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=107,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:6,11,3,0
chr21	37605258	.	AACG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=83,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:6,2:9,10,1,1
chr21	37605463	.	CCACTTCTCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr21	37612310	.	C	CTAACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:37612310_C_CTAACT:37612310:0,2,1,1
chr21	37612314	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37612310_C_CTAACT:37612310:0,2,0,1
chr21	37612317	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37612310_C_CTAACT:37612310:0,2,0,1
chr21	37619724	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr21	37619931	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,23,23,23;MFRL=167,99,158,160;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,21,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.82,3.59,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,3,2:0.176,0.227,0.175:13:4,2,1,2:2,0,2,0:1,5,0,7
chr21	37623447	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=75,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:2,5:3,1:5,0,4,2
chr21	37626011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr21	37626282	.	A	ACGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	37636043	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:8,0:12,4:0|1:37636043_C_A:37636043:12,8,0,4
chr21	37636048	.	T	TGCAAGTGTCCATACATACACATGGC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.188:24:7,0:12,4:0|1:37636043_C_A:37636043:12,8,0,4
chr21	37642495	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=118,94;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:7,12,0,2
chr21	37642513	.	C	CTAGTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=110,94;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.139:21:9,0:8,2:0|1:37642513_C_CTAGTT:37642513:3,16,0,2
chr21	37642514	.	C	CTTTTAATTGTGATGGTAGGGTGTCAATT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=106,94;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.141:20:9,0:8,2:0|1:37642513_C_CTAGTT:37642513:2,16,0,2
chr21	37650235	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,1:4,4:4,1,5,0
chr21	37661180	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr21	37664372	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:9,9:4,1:7,6,6,4
chr21	37664554	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,3:0,0:1,2,0,5
chr21	37664571	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:1,3,0,5
chr21	37706065	.	GT	G,GTT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,30,31;MFRL=129,111,120;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.18,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,4,4:0.134,0.146:29:8,2,2:7,2,1:8,13,1,7
chr21	37706087	.	GT	G,GTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,29,32;MFRL=176,129,170;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.73,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.283,0.281:11:2,3,1:1,0,1:0,5,1,5
chr21	37709191	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=23,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:9,0:23,2:0|1:37709191_T_A:37709191:16,18,1,1
chr21	37709197	.	C	CTT	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:10,0:25,2:0|1:37709191_T_A:37709191:18,18,1,1
chr21	37709199	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:11,0:25,2:0|1:37709191_T_A:37709191:18,20,1,1
chr21	37709201	.	A	AGC	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:13,0:23,2:0|1:37709191_T_A:37709191:18,21,1,1
chr21	37709202	.	AAC	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=112,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:14,0:23,2:0|1:37709191_T_A:37709191:18,21,1,1
chr21	37709209	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=22,20;MFRL=114,43;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:20,2:0|1:37709191_T_A:37709191:15,18,1,1
chr21	37710096	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=106,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:17,0:12,3:17,13,2,1
chr21	37734398	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:4,5:8,2,5,0
chr21	37734540	.	C	CT	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=84,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.375:26:8,7:5,3:13,3,8,2
chr21	37734595	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=160,166;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:0,13,0,3
chr21	37734611	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,151;MMQ=47,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0,17,0,2
chr21	37749689	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr21	37760118	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=251,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,2:1,0:0,2,0,4
chr21	37763761	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.394:11:3,2:3,2:7,0,3,1
chr21	37763779	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.308:18:7,0:3,5:12,1,3,2
chr21	37769689	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,0:0|1:37769689_C_T:37769689:3,2,2,0
chr21	37769701	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.431:7:1,2:3,1:0|1:37769689_C_T:37769689:3,1,2,1
chr21	37788653	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,101;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:7,0:10,4:6,11,0,5
chr21	38092072	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr21	38092103	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:11,2,3,0
chr21	38092247	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.624:11:2,5:1,2:0,4,0,7
chr21	38095452	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,2:9,1:3,11,0,3
chr21	38098545	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:13,4:5,0:9,9,2,2
chr21	38113998	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:1,2:1,1,4,0
chr21	38128780	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=113,169;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.310:14:4,0:5,1:0|1:38128780_G_A:38128780:4,6,4,0
chr21	38128782	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,13;MFRL=113,169;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.310:14:4,0:6,0:0|1:38128780_G_A:38128780:4,6,4,0
chr21	38128784	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=113,175;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:0|1:38128780_G_A:38128780:4,6,3,0
chr21	38128786	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=112,175;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,0:6,0:0|1:38128780_G_A:38128780:4,7,3,0
chr21	38128789	.	CT	AA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=112,169;MMQ=60,35;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,0:6,0:0|1:38128780_G_A:38128780:4,7,2,0
chr21	38132172	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr21	38302620	.	GG	AA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,2:16,0:15,12,1,1
chr21	38302769	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,10,10
chr21	38380570	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:3,7,3,2
chr21	38390387	.	G	GAAAAGTAAAAGCTGACTTTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,1:4,6,0,2
chr21	38441935	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.175:55:17,0:28,9:17,29,0,9
chr21	38444863	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,4,16
chr21	38444881	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,4:2,5:0,4,0,9
chr21	38444890	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr21	38460488	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr21	38462614	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr21	38466203	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	38466261	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr21	38467616	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,19:0,13:0,0,19,14
chr21	38469017	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr21	38495185	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr21	38495270	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0,0,11,11
chr21	38501185	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,3:8,3:10,1,6,0
chr21	38522522	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:1,17,0,2
chr21	38524124	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,7:4,8:10,1,11,4
chr21	38525198	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,26,6
chr21	38528866	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0|1:38528866_A_G:38528866:5,0,3,0
chr21	38528872	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.907:8:0,5:0,3:0|1:38528866_A_G:38528866:0,0,7,1
chr21	38529630	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38529630_A_C:38529630:0,2,0,1
chr21	38529638	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38529630_A_C:38529630:0,2,0,1
chr21	38529640	.	A	AGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38529630_A_C:38529630:0,2,0,1
chr21	38531921	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr21	38532058	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=113.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.968:28:0,7:0,20:0|1:38532058_TG_T:38532058:0,0,11,17
chr21	38532068	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=108.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,6:0,17:0|1:38532058_TG_T:38532058:0,0,10,15
chr21	38532086	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=81.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,5:0,12:0|1:38532058_TG_T:38532058:0,0,7,12
chr21	38534228	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=98.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,17:0,6:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,18,5
chr21	38534234	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,17:0,6:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,18,5
chr21	38539745	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr21	38539836	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,9:0,0,17,11
chr21	38563639	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:14,7:11,5:17,9,7,5
chr21	38564530	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,20,33;MFRL=141,92,129;MMQ=60,60,60;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.97,12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,7:0.157,0.381:20:4,1,1:3,2,6:2,8,2,8
chr21	38568290	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,196;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:15,0:15,4:13,17,0,4
chr21	38573912	.	A	AGAGTAGAATTCATGTTGCATTCTTACTAAAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr21	38599934	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr21	38600154	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr21	38600715	.	G	GAGACTGAGACAATGTTTCATATTTAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=137,32;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,1:0|1:38600715_G_GAGACTGAGACAATGTTTCATATTTAA:38600715:2,5,1,1
chr21	38600717	.	G	GGGATGAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,32;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,1:0|1:38600715_G_GAGACTGAGACAATGTTTCATATTTAA:38600715:2,5,1,1
chr21	38604570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr21	38604600	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,6:6,0,6,1
chr21	38639698	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=117,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38639698_G_GC:38639698:1,0,0,1
chr21	38639702	.	G	GCCAGGCCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0|1:38639698_G_GC:38639698:1,1,0,1
chr21	38850640	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr21	38862376	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr21	38862862	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr21	39086706	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=93,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:13,3:17,0:0|1:39086706_A_C:39086706:14,16,1,2
chr21	39086709	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:14,3:17,0:0|1:39086706_A_C:39086706:14,17,1,2
chr21	39086897	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:8,0:2,9:6,5,0,9
chr21	39212857	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr21	39493236	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:10,2,3,0
chr21	39755427	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:17,6:6,0:14,10,5,1
chr21	39763696	.	GA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0,14,0,2
chr21	39764355	.	C	CTTTTCTGTCTTCATACACTGAATTAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:4,2:4,0:0,9,1,1
chr21	39764437	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=242,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr21	39774592	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,62;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:5,1:2,4,0,2
chr21	39775373	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr21	39795290	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=103,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,4,0
chr21	39947610	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr21	40181922	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:10,3:23,1,3,0
chr21	40181937	.	CT	C	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.154:39:13,4:17,2:24,9,6,0
chr21	40182049	.	AT	A	.	.	DP=89;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,9:0.145:62:34,5:19,4:16,37,3,6
chr21	40186878	.	TGGGAACATCTGGAGCAAATGATCAAAGGTACCAGCTGAACGTCTTACTTCTCCTTGTCCAGGATGAGCTGTGGCC	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.048:64:24,4:20,0:20,40,1,3
chr21	40190406	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,0:22,1:0|1:40190406_G_A:40190406:19,18,1,1
chr21	40190413	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,0:20,2:0|1:40190406_G_A:40190406:19,17,1,1
chr21	40190443	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.324:38:9,6:17,6:9,17,6,6
chr21	40190620	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	40553845	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=82.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,0,22
chr21	40568384	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=107,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:23,4:15,0:13,25,2,2
chr21	40584523	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:8,5:5,0:0|1:40584523_T_A:40584523:12,2,5,0
chr21	40584526	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,5:5,0:0|1:40584523_T_A:40584523:12,2,5,0
chr21	40587069	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=54,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr21	40587071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr21	40587088	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:12,2,1,1
chr21	40597215	.	A	AAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	40636351	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,0:0,0,3,2
chr21	40641858	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:4,12:9,2:8,5,8,6
chr21	40642189	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr21	40646226	.	A	AGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.788:2:0,1:0,1:0|1:40646226_A_AGC:40646226:0,0,2,0
chr21	40646230	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.902:7:0,4:0,3:0|1:40646226_A_AGC:40646226:0,0,7,0
chr21	40648265	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	40649088	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	40650567	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	40650621	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr21	40652040	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,16,5
chr21	40684861	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,2:0,0,1,8
chr21	40684887	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	40684897	.	GGGCGGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGCGGGC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	40685246	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,8,14
chr21	40715132	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,9,14
chr21	40715167	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr21	40717035	.	T	TCACACACACACACACA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,22;RU=CA;STR;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.948:22:0,4:1,4:1,0,15,6
chr21	40719477	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr21	40720217	.	CCTTCGCTGCTGCCTTTTTCGG	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:15,0:18,2:24,20,1,1
chr21	40782124	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:0|1:40782124_T_A:40782124:6,2,2,1
chr21	40782132	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:40782124_T_A:40782124:9,2,1,1
chr21	40782136	.	ATTT	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:40782124_T_A:40782124:9,2,1,1
chr21	40782140	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:40782124_T_A:40782124:8,2,1,1
chr21	40782141	.	T	TAAAA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:3,0:0|1:40782124_T_A:40782124:8,2,1,1
chr21	40782836	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=73,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:4,4:3,6:4,3,5,5
chr21	40794945	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:15,3:7,3:16,7,2,4
chr21	40795445	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	40823981	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.976:36:0,21:0,15:0,0,20,16
chr21	40847073	.	T	TCTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:4,2,1,1
chr21	40847249	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	40880878	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,12:3,3:4,4,11,4
chr21	40880881	.	CTTGAA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:12,4:4,3:12,5,4,3
chr21	40883514	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr21	40883537	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,2,2
chr21	40883671	.	G	GAGA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGA;STR;TLOD=113.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.972:29:0,11:0,17:0,0,12,17
chr21	40883712	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,4:4,8:3,7,0,12
chr21	40887185	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr21	40969826	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,9,7
chr21	40984184	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=66,162;MMQ=35,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:1,0:1,1:0|1:40984184_A_C:40984184:5,2,2,0
chr21	40984190	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=66,162;MMQ=35,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:4,0:3,0:0|1:40984184_A_C:40984184:6,3,2,0
chr21	41032740	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,8:0,0,7,8
chr21	41032804	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr21	41033471	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=87,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:7,4:2,5:6,3,3,6
chr21	41034127	.	AGAGTT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:0|1:41034127_AGAGTT_A:41034127:6,4,1,1
chr21	41034136	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0|1:41034127_AGAGTT_A:41034127:6,3,1,1
chr21	41034215	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr21	41117368	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,152;MMQ=46,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr21	41117533	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr21	41137362	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	41142775	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	41142803	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=210,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr21	41159977	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,5:2,4:2,0,8,1
chr21	41160100	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:13,0:5,4:8,10,1,3
chr21	41165418	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=98,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:5,3,6,1
chr21	41165566	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,2:10,10:3,15,3,9
chr21	41414243	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	41434671	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	41452034	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	41514421	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr21	41514688	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr21	41516322	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr21	41516366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr21	41667909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr21	41684090	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,3,3
chr21	41684364	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41684364_GA_G:41684364:0,1,0,1
chr21	41684372	.	AG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41684364_GA_G:41684364:0,1,0,1
chr21	41711126	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:41711126_A_G:41711126:6,10,1,1
chr21	41711132	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:41711126_A_G:41711126:6,7,1,1
chr21	41719583	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,94;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,0:7,3:10,8,1,2
chr21	41740943	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr21	42080383	.	CCTTGATGTGGACATCCTGACTTCTAATTTTCCCTGAAGGATTTTCAGCTGTGCAATAATAAGTATTATCATGGATTAAGGTACTGAAG	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.085:48:6,10:8,1:0|1:42080383_CCTTGATGTGGACATCCTGACTTCTAATTTTCCCTGAAGGATTTTCAGCTGTGCAATAATAAGTATTATCATGGATTAAGGTACTGAAG_C:42080383:25,12,9,2
chr21	42080479	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.090:33:14,2:16,0:0|1:42080383_CCTTGATGTGGACATCCTGACTTCTAATTTTCCCTGAAGGATTTTCAGCTGTGCAATAATAAGTATTATCATGGATTAAGGTACTGAAG_C:42080383:25,5,2,1
chr21	42551058	.	T	A	.	.	DP=89;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=91,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.038:81:52,2:16,0:50,28,2,1
chr21	42551159	.	A	AT	.	.	DP=104;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=63,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,3:0.039:100:62,0:24,3:0|1:42551159_A_AT:42551159:67,30,0,3
chr21	42551162	.	G	T	.	.	DP=104;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=63,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,3:0.038:104:67,0:24,3:0|1:42551159_A_AT:42551159:69,32,0,3
chr21	42551166	.	CC	GA	.	.	DP=102;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=66,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:96,3:0.039:99:59,0:24,3:0|1:42551159_A_AT:42551159:62,34,0,3
chr21	42553555	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=164,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:42553555_T_A:42553555:8,4,1,1
chr21	42553562	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=164,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:42553555_T_A:42553555:6,4,1,1
chr21	42553563	.	TAGATGCCCAAC	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=164,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:42553555_T_A:42553555:6,4,1,1
chr21	42556618	.	CATT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,11,11
chr21	42556885	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,8,10
chr21	42615293	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:8,4:4,2:5,7,4,2
chr21	42617912	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:0|1:42617912_G_C:42617912:10,11,1,1
chr21	42617921	.	C	CTACTATCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:42617912_G_C:42617912:10,10,1,1
chr21	42622657	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:5,3:11,11:10,6,8,6
chr21	42629044	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,8:3,0:6,0,8,0
chr21	42694816	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:8,9,2,1
chr21	42729109	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:19,0:11,5:15,16,0,5
chr21	42762439	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.554:9:4,1:0,4:2,2,5,0
chr21	42762714	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=188,189;MMQ=59,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:42762714_C_CCT:42762714:0,4,0,2
chr21	42762719	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=188,213;MMQ=59,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:42762714_C_CCT:42762714:0,4,0,1
chr21	42762726	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=180,213;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42762714_C_CCT:42762714:0,3,0,1
chr21	42762728	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=180,213;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42762714_C_CCT:42762714:0,3,0,1
chr21	42762731	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=180,213;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42762714_C_CCT:42762714:0,3,0,1
chr21	42767561	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,3:10,1:14,11,3,1
chr21	42767733	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr21	42769679	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:42769679_T_C:42769679:0,6,1,1
chr21	42769684	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,2:0|1:42769679_T_C:42769679:0,6,1,1
chr21	42769687	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:42769679_T_C:42769679:0,4,1,1
chr21	42769690	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,23;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:42769679_T_C:42769679:0,3,1,1
chr21	42769691	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:42769679_T_C:42769679:0,3,1,1
chr21	42769700	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42769700_CCA_C:42769700:0,3,0,1
chr21	42769706	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42769700_CCA_C:42769700:0,3,0,1
chr21	42771362	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.917:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr21	42775179	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=80,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.932:25:0,12:2,10:1,1,12,11
chr21	42775180	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,14,13
chr21	42778713	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:13,0:15,19,0,4
chr21	42808015	.	A	G,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30,28;MFRL=0,142,101;MMQ=60,60,55;MPOS=5,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.81,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.667,0.222:6:0,4,0:0,1,1:0,0,0,6
chr21	42808054	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	42811637	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:21,5:14,0:23,12,4,1
chr21	42812891	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,12,7
chr21	42813933	.	A	AGTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=GT;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr21	42817582	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	42818106	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	42818131	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42818131_T_TG:42818131:0,3,0,1
chr21	42818132	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr21	42818134	.	A	ACACTAACCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42818131_T_TG:42818131:0,3,0,1
chr21	42821265	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:0,2,2,2
chr21	42824733	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.637:23:7,8:1,6:4,4,8,7
chr21	42824874	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr21	42838138	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:2,5:17,1:0,19,1,5
chr21	42838198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=203,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr21	42842683	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42842683_G_GAC:42842683:1,2,0,1
chr21	42842685	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42842683_G_GAC:42842683:1,2,0,1
chr21	42842693	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42842683_G_GAC:42842683:1,2,0,1
chr21	42842713	.	C	CCTAAGGCCTCGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,337626;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.760:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr21	42843960	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr21	42843962	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=195,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr21	42848560	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr21	42852320	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr21	42860307	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:6,3:3,4:6,3,2,5
chr21	42860485	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=92,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,0:3,3:2,1,1,2
chr21	42860494	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=85,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr21	42861389	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,126;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:9,1,2,0
chr21	43160908	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr21	43161726	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr21	43162200	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr21	43164345	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr21	43164387	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	43165824	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:1,3:0,3:2,0,6,0
chr21	43166796	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,0:6,3:6,3,2,1
chr21	43221826	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=87,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:6,9:11,9:8,9,8,10
chr21	43222779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr21	43224683	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,6:2,6:4,1,8,4
chr21	43231296	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr21	43236252	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr21	43239972	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,3:7,6:3,5,3,6
chr21	43242207	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:4,0,5,2
chr21	43243902	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=224,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr21	43246223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=262,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr21	43248432	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=257,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr21	43254638	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,39;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,1,3
chr21	43255509	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr21	43258000	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:6,2,3,3
chr21	43274653	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr21	43279131	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,0:4,4:3,4,0,4
chr21	43281651	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr21	43281668	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:3,1,2,1
chr21	43299327	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=116,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr21	43299354	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=12,33;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,2:0,3:0,1,3,2
chr21	43309191	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,3:4,4:4,3,4,3
chr21	43321735	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:7,8:15,0:11,11,8,0
chr21	43325742	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.541:9:3,3:1,2:4,0,4,1
chr21	43325973	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr21	43327856	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,13,9
chr21	43332630	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=155,129;MMQ=55,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr21	43334874	.	ATTGAGGG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:43334874_ATTGAGGG_A:43334874:0,4,1,1
chr21	43334885	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,2:0|1:43334874_ATTGAGGG_A:43334874:0,4,1,1
chr21	43334896	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	43373409	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr21	43412705	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:5,8:5,8:6,4,6,10
chr21	43413158	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=96,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,4:3,8:4,8,8,4
chr21	43413731	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.950:38:0,16:1,20:1,0,17,20
chr21	43496017	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	43496381	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,2,13
chr21	43504429	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:43504429_T_A:43504429:0,2,0,1
chr21	43504449	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43504429_T_A:43504429:0,2,0,1
chr21	43504450	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:43504450_AG_GA:43504450:0,2,0,1
chr21	43504455	.	C	CTATTTTTGGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43504450_AG_GA:43504450:0,1,0,1
chr21	43508689	.	T	TCCTCATTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	43549794	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	43557456	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	43557494	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	43557559	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.564:19:5,6:3,3:7,1,7,4
chr21	43557736	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,4:4,5:6,4,5,4
chr21	43639332	.	CCCG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CCG;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr21	43640197	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:25,0:8,2:0|1:43640197_T_C:43640197:14,19,1,1
chr21	43640199	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:24,0:8,2:0|1:43640197_T_C:43640197:14,19,1,1
chr21	43640206	.	GG	AC	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:23,0:7,2:0|1:43640197_T_C:43640197:12,19,1,1
chr21	43679656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr21	43693570	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:6,0:0|1:43693570_A_C:43693570:1,13,2,0
chr21	43693575	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:7,0:0|1:43693570_A_C:43693570:1,14,2,0
chr21	43706178	.	C	CCTTACATCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	43708431	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.612:8:2,2:1,3:2,1,4,1
chr21	43710096	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:4,5:2,4:6,1,9,0
chr21	43732425	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr21	43766560	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr21	43767500	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:43767500_T_A:43767500:0,0,2,0
chr21	43767505	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43767500_T_A:43767500:0,0,1,0
chr21	43770145	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:43770145_G_GC:43770145:0,5,1,1
chr21	43770147	.	A	ATCAGCTGAGATCTTTTGGCTCCGGGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:43770145_G_GC:43770145:0,5,1,1
chr21	43770902	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=227,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr21	43770926	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr21	43770933	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.614:11:4,2:0,5:4,0,6,1
chr21	43782628	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:7,5,0,2
chr21	43783346	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=105,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,2:2,3:8,2,5,0
chr21	43783518	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=54,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:6,4,1,2
chr21	43786512	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr21	43796854	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:1,2,0,7
chr21	43803392	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43803392_CT_C:43803392:0,1,0,1
chr21	43803397	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43803392_CT_C:43803392:0,1,0,1
chr21	43804078	.	CC	TT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:11,10,1,1
chr21	43805502	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,1:11,3,1,1
chr21	43805515	.	T	TGGTCTACTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,0:7,2:11,4,1,1
chr21	43808964	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr21	43810084	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=88,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.322:32:16,4:6,6:12,10,6,4
chr21	43826344	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr21	43826391	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr21	43826567	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr21	43829758	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr21	43833112	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:18,2:3,0:13,8,2,0
chr21	43836770	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=129,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:43836770_T_G:43836770:2,17,1,1
chr21	43836772	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:8,2:7,2:0|1:43836770_T_G:43836770:2,13,1,3
chr21	43836776	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=130,496;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:8,2:8,0:1|0:43836770_T_G:43836770:3,13,0,2
chr21	43846729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr21	43846801	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:1,2:3,3,4,3
chr21	43852146	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:6,1,5,0
chr21	43852160	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=75,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:5,1,6,1
chr21	43852232	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:7,1:1,3:2,6,1,3
chr21	43857602	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=70,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:5,4,1,2
chr21	43916339	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,4:5,1:0,6,1,5
chr21	43938445	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=327,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr21	43938465	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr21	43938673	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=73,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:2,6,0,5
chr21	43959770	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=105.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,23:0,11:0,0,15,20
chr21	43963759	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr21	43967126	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:2,0,6,1
chr21	43974317	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:43974317_G_A:43974317:0,3,0,3
chr21	43974335	.	TGC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43974317_G_A:43974317:0,3,0,1
chr21	43974340	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:43974317_G_A:43974317:0,3,0,1
chr21	43974345	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43974317_G_A:43974317:0,1,0,1
chr21	43979127	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=90,164;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:3,4:2,3:4,2,6,1
chr21	43979265	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr21	43994858	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:4,1,2,2
chr21	44000366	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:1,1,2,1
chr21	44073833	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr21	44107931	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr21	44107989	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:7,2,5,4
chr21	44118958	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr21	44163839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr21	44171322	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,5:6,5:7,7,6,4
chr21	44180866	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr21	44180916	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr21	44182431	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44182431_TCC_T:44182431:0,1,0,1
chr21	44182435	.	A	AGATCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44182431_TCC_T:44182431:0,1,0,1
chr21	44188249	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr21	44188485	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr21	44424347	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.212:21:4,3:10,1:8,9,3,1
chr21	44436974	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=181,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,0:7,3:10,0,2,1
chr21	44437142	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,3,13
chr21	44438157	.	C	CAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,30;RU=A;STR;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	44444953	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,0:7,5:11,2,2,3
chr21	44444982	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=172,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:7,3,0,3
chr21	44444987	.	T	TCCCTCACTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,38;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:8,3,0,3
chr21	44475786	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:3,1:3,4:0|1:44475786_C_T:44475786:7,0,4,1
chr21	44475796	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:0|1:44475786_C_T:44475786:8,0,5,1
chr21	44476000	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:10,2:8,11,0,2
chr21	44476889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:2,1,1,1
chr21	44482433	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:10,4:28,0:21,18,4,0
chr21	44485425	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:14,5:12,0:11,15,5,0
chr21	44486271	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr21	44486324	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr21	44488755	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,31,16;MFRL=54,144,176;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.85,12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,7:0.249,0.498:13:0,0,1:2,2,0:2,1,2,8
chr21	44488760	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr21	44579825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.184:19:8,3:8,0:7,9,2,1
chr21	44589920	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=97,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.297:12:1,1:5,2:1,8,0,3
chr21	44590059	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr21	44837551	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.473:17:7,3:2,3:0|1:44837551_G_A:44837551:8,1,6,2
chr21	44837555	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.499:18:7,3:2,4:0|1:44837551_G_A:44837551:8,1,7,2
chr21	44841268	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:9,0:19,3:14,16,0,3
chr21	44846016	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,1:6,3:4,10,0,4
chr21	44846158	.	C	CTGTTAAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	44949915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=228,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr21	44949926	.	C	CTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=217,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr21	45094574	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:26,5:19,0:15,30,0,5
chr21	45096560	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,4:3,0:6,0,4,0
chr21	45103227	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:25,0:15,4:23,17,4,0
chr21	45104592	.	GGG	AAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr21	45169005	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:0|1:45169005_A_G:45169005:2,5,0,5
chr21	45169018	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=171,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:2,0:5,2:1|0:45169005_A_G:45169005:0,8,1,1
chr21	45169024	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=171,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1|0:45169005_A_G:45169005:0,8,1,1
chr21	45169047	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=173,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1|0:45169005_A_G:45169005:0,7,1,1
chr21	45170285	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr21	45175958	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr21	45222324	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=186,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,1,0,1
chr21	45222328	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=186,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,1,0,1
chr21	45222337	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,0,0,1
chr21	45222338	.	T	TCGG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,0,0,1
chr21	45222341	.	C	CTCATG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,0,0,1
chr21	45222344	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,0,0,1
chr21	45222348	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45222324_C_T:45222324:0,0,0,1
chr21	45401019	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=90,169;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:11,0:17,4:0|1:45401019_C_T:45401019:9,19,0,4
chr21	45401028	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=80,169;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,0:12,4:0|1:45401019_C_T:45401019:9,16,0,4
chr21	45401037	.	G	GCCCAGGAGATTAAAAACTGTATCAC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,38;MFRL=97,169;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:11,0:10,4:0|1:45401019_C_T:45401019:7,15,0,4
chr21	45401165	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	45432354	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr21	45472251	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:8,10,2,1
chr21	45502599	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr21	45512026	.	A	AGTTTCGCTCTTGTCGCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	45514133	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=133,67;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:2,11,1,1
chr21	45514141	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=67,166;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.711:8:0,5:2,1:1,1,0,6
chr21	45514149	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr21	45514168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr21	45514188	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr21	45528919	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,10,9
chr21	45534032	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=259,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr21	45535691	.	AGAG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,1:4,1:6,7,2,0
chr21	45538725	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr21	45538782	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr21	45539240	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr21	45539426	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,5:0,0,2,14
chr21	45540143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	45540207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,8,2
chr21	45547736	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.700:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr21	45550460	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr21	45561039	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,10,11
chr21	45564931	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,233;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.241:6:1,1:2,0:0,5,0,1
chr21	45642817	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:12,1,2,1
chr21	45648992	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:45648992_T_C:45648992:0,0,3,13
chr21	45649015	.	G	GCTTCCTTGAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=179,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0|1:45648992_T_C:45648992:0,8,1,1
chr21	45649494	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr21	45649543	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:4,1,0,7
chr21	45649778	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:45649778_A_G:45649778:0,0,7,7
chr21	45649780	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=101,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:0|1:45649778_A_G:45649778:5,7,2,0
chr21	45650009	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr21	45651413	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	45706033	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,1,1,0
chr21	45706037	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,1,1,0
chr21	45706044	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,1,1,0
chr21	45706046	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,1,1,0
chr21	45706052	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,1,1,0
chr21	45708277	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,128;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,4:4,3:5,4,3,4
chr21	45712357	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr21	45716199	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,6:3,0:3,0,4,2
chr21	45726460	.	CAGGGTGTCCAGGCCTCCCCTACCCCCTGTCCTCTGAGATGGGG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,50;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:2,0:8,1,1,1
chr21	45730983	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=59,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.146:45:12,2:27,4:29,10,3,3
chr21	45733911	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=99,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,4:2,0:2,3,2,2
chr21	45736383	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,3,5
chr21	45740045	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:6,0:3,2:5,6,1,2
chr21	45741854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr21	45742115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr21	45742822	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:2,7:1,1:1,2,5,4
chr21	45744663	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,1:7,8:8,4,6,3
chr21	45744821	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:5,6,2,7
chr21	45744836	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:6,3:4,5:2,8,2,6
chr21	45746102	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.578:22:3,5:6,6:5,4,5,8
chr21	45746214	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	45746225	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr21	45746511	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr21	45746570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr21	45750145	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=254,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:2,1,3,2
chr21	45750248	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:4,1,5,2
chr21	45750856	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr21	45750880	.	T	TCTGTGAATG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=220,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:45750880_T_TCTGTGAATG:45750880:0,4,0,2
chr21	45750885	.	TC	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=220,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:45750880_T_TCTGTGAATG:45750880:0,5,0,2
chr21	45751766	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:6,3,3,3
chr21	45774663	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=102,135;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.200:48:23,0:16,9:15,24,0,9
chr21	45789011	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr21	45789323	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,1:0|1:45789323_G_A:45789323:1,2,0,1
chr21	45789327	.	G	GGGCGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:3,0:0,1:0|1:45789323_G_A:45789323:1,2,0,1
chr21	45797524	.	CAGGTGTGGCCCTCACTCGGCTCCGTGCTTTGTTT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.097:47:8,4:16,1:27,15,4,1
chr21	45799062	.	T	TTCTTCATATTCTGCTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,17;MFRL=81,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,0:7,4,1,1
chr21	45811343	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr21	45817808	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr21	45821741	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=90,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:6,0:14,3:4,18,0,3
chr21	45821747	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=108,80;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.323:26:7,0:10,8:5,13,0,8
chr21	45826683	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr21	45846812	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=203,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,2:2,1:0|1:45846812_TG_T:45846812:3,1,3,0
chr21	45846823	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,2:3,1:0|1:45846812_TG_T:45846812:4,1,3,0
chr21	45846859	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=139,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,1:13,2:14,4,2,1
chr21	45854925	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:2,2:5,1:7,0,4,0
chr21	45856958	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,2:4,5:6,1,4,3
chr21	45860805	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=98,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:5,0:6,1:0|1:45860805_C_T:45860805:4,7,1,1
chr21	45860825	.	G	GAGGAGGCCATGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:45860805_C_T:45860805:0,1,1,1
chr21	45876539	.	GCGCCCACCT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:9,13,1,1
chr21	45876557	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,0:8,1:10,14,1,1
chr21	45876920	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr21	45878384	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,7:8,2:5,10,5,4
chr21	45878637	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,11:6,3:10,2,12,2
chr21	45878645	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:12,4:3,5:12,3,9,0
chr21	45919659	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:8,2,2,0
chr21	45938219	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=127,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.336:43:16,1:11,13:10,19,2,12
chr21	45938245	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:10,0:12,10:5,17,0,12
chr21	45959312	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,2:0,0,8,2
chr21	45959918	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr21	45960106	.	A	AGTT	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:36,2:17,0:0|1:45960106_A_AGTT:45960106:18,39,1,1
chr21	45960107	.	C	CTCA	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:35,2:20,0:0|1:45960106_A_AGTT:45960106:18,39,1,1
chr21	45960111	.	GT	G	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=99,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:21,2:20,0:0|1:45960106_A_AGTT:45960106:18,38,1,1
chr21	45971380	.	A	AGTGAGTGAGTGT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=79,104;MMQ=26,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTGAGTGAGTGT;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.235:36:11,3:17,2:6,22,3,5
chr21	45978587	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=111,111;MMQ=60,56;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:10,6:4,2:0|1:45978587_A_G:45978587:8,10,5,4
chr21	45978592	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=21,28;MFRL=111,118;MMQ=60,52;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:8,6:3,2:0|1:45978587_A_G:45978587:7,8,5,3
chr21	45978729	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=134,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:45978729_G_GAA:45978729:0,1,0,1
chr21	45978730	.	C	CCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=134,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45978729_G_GAA:45978729:0,1,0,1
chr21	45993598	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=129,375;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr21	45994843	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr21	46000284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,145;MMQ=49,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,4,3
chr21	46011456	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=183,74;MMQ=48,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr21	46011468	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,48;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr21	46012240	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,33;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	46020473	.	C	CTCAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,2:0,0,9,0
chr21	46020867	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=238,117;MMQ=25,45;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:1,0,6,4
chr21	46020958	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=118,17965;MMQ=56,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:46020958_G_A:46020958:5,4,0,2
chr21	46020965	.	AG	CC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=118,17965;MMQ=56,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:46020958_G_A:46020958:5,5,0,2
chr21	46020968	.	T	TGTTCTCA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=118,17965;MMQ=56,31;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:46020958_G_A:46020958:5,5,0,2
chr21	46021370	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=100999,122;MMQ=51,47;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:3,7:0,7:0,3,8,6
chr21	46021607	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,9,13
chr21	46021934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr21	46021946	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr21	46021954	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr21	46032094	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr21	46032668	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,3:2,5:3,3,5,4
chr21	46047633	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=76638,118;MMQ=25,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.853:25:1,13:0,8:3,0,9,13
chr21	46048131	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=217,153;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr21	46048143	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=14,28;MFRL=217,153;MMQ=60,40;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,2,1
chr21	46048158	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=217,153;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:46048158_T_G:46048158:1,0,2,1
chr21	46048167	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:46048158_T_G:46048158:0,0,2,1
chr21	46057319	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=73,69;MMQ=52,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.219:25:8,0:12,5:7,13,1,4
chr21	46057391	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=219,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.779:16:2,6:1,7:0|1:46057391_A_G:46057391:1,2,5,8
chr21	46057393	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:46057391_A_G:46057391:0,0,6,10
chr21	46057417	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=229,167;MMQ=60,59;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.824:15:1,7:1,6:0|1:46057391_A_G:46057391:1,1,7,6
chr21	46057422	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.824:15:1,6:1,4:0|1:46057391_A_G:46057391:1,1,8,5
chr21	46057590	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=142,85;MMQ=56,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.481:15:3,4:3,2:4,4,4,3
chr21	46057612	.	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=90,190;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.194:17:6,1:4,2:7,7,1,2
chr21	46057711	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=108,83;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,0:3,3:3,2,2,1
chr21	46057720	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:3,3,2,2
chr21	46057806	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr21	46058223	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,8;MFRL=107,197;MMQ=45,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:46058223_T_TG:46058223:1,1,1,0
chr21	46058227	.	C	CTGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=107,197;MMQ=45,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:46058223_T_TG:46058223:1,1,1,0
chr21	46058229	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=30,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:46058223_T_TG:46058223:1,0,1,0
chr21	46058231	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,0;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:46058223_T_TG:46058223:0,0,1,0
chr21	46058396	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=115,101;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.441:16:3,3:5,4:5,4,1,6
chr21	46058457	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr21	46066319	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=66,88;MMQ=33,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.902:17:0,5:1,11:0,1,12,4
chr21	46066764	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chr21	46067180	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr21	46074104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr21	46077812	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr21	46078220	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr21	46078302	.	T	TGGCGG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46078302_T_TGGCGG:46078302:0,2,0,1
chr21	46078304	.	A	AGGTGACCCGAT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,24;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46078302_T_TGGCGG:46078302:0,2,0,1
chr21	46078306	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46078302_T_TGGCGG:46078302:0,2,0,1
chr21	46078309	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46078302_T_TGGCGG:46078302:0,2,0,1
chr21	46078342	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,1
chr21	46078345	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,1
chr21	46078351	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,2
chr21	46086377	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:6,6:2,8:4,4,7,7
chr21	46086718	.	GA	CG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:6,7:0,8:3,3,6,9
chr21	46086757	.	GC	AT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,16,8
chr21	46086868	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,6:0,5:0|1:46086868_C_T:46086868:0,0,1,12
chr21	46086884	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:46086868_C_T:46086868:0,0,0,13
chr21	46086901	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=175,169;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:7,2:0,9,0,6
chr21	46101688	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=306,161;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr21	46102090	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,7,12
chr21	46117962	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,8:0,0,8,12
chr21	46131456	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.106:24:11,0:9,2:0|1:46131456_C_T:46131456:6,16,1,1
chr21	46131462	.	T	TCAACAGGTGG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=122,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:46131456_C_T:46131456:6,15,1,1
chr21	46131465	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:46131456_C_T:46131456:5,15,1,1
chr21	46131469	.	AG	TT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,2:0|1:46131456_C_T:46131456:6,14,1,1
chr21	46191270	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,7:4,1:7,1,5,3
chr21	46226786	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:6,4,7,1
chr21	46227056	.	CT	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	46228413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:4,3,1,1
chr21	46233868	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr21	46319041	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:5,2:15,1:11,9,2,1
chr21	46321677	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr21	46326815	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,9,9
chr21	46327835	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr21	46328099	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr21	46330377	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr21	46389017	.	C	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,43:0.602:71:11,19:17,23:10,18,22,21
chr21	46389189	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,10:0,0,1,14
chr21	46389212	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:2,6,0,6
chr21	46393090	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,14,11
chr21	46554604	.	AT	A,ATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28,28;MFRL=0,156,121;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=T;STR;TLOD=3.75,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.375,0.482:4:0,2,1:0,0,1:0,0,4,0
chr21	46554615	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=116,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:7,1,2,0
chr21	46554638	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=48,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:6,0:1,0:4,4,4,0
chr21	46591679	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr21	46602483	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,2:2,0:4,3,2,0
chr21	46641017	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=186,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr21	46645561	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:4,8,1,1
chr21	46645567	.	ACAAACACATGTACAGTGGCTCTTTTTCCTTCT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.190:14:5,0:5,2:2,10,1,1
chr21	46685464	.	T	TCCTGGGCG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,1:19,1:13,18,0,2
chr21	46685560	.	ATCACAGAGGTTCCAGAGTCAGGGAGAACTGGCG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=108,176;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.679:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr21	46705847	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,0:6,3:0,8,3,0
chr21	46705886	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:46705886_T_C:46705886:0,3,0,1
chr21	46705893	.	A	ATTCTTCACGTAGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:46705886_T_C:46705886:0,3,0,1
chr21	46876173	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,1:0,4:0,2,1,4
chr21	46888094	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=85,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr21	46895521	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr21	46896458	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.511:24:5,9:4,3:1,11,1,11
chr21	46896489	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.381:12:7,4:1,0:0,8,0,4
chr21	46897214	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=1036,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr21	46898174	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,7:2,3:4,2,6,4
chr21	46898243	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:8,6:9,7:8,9,8,5
chr21	46899947	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:2,2,3,2
chr21	46900546	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr21	46901973	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:3,6,4,6
chr21	46906711	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	46906933	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr21	46907287	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr21	46909516	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:0,5,0,6
chr21	46910091	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr21	46910654	.	TAAAG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=66,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,3:4,1,3,4
chr21	46911276	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:2,3,1,7
chr21	46912658	.	G	GCCCGCCACTGCCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=219,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,1:3,1:0,5,0,3
chr21	46913517	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=241,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,8:1,1:0,2,0,9
chr21	46918574	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,3:2,1:0,4,0,5
chr21	46923874	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=88,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:4,6:7,5:5,6,7,5
chr21	46924052	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,0:4,3:0,6,1,2
chr21	46924383	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.534:20:4,4:5,4:0|1:46924383_C_T:46924383:3,6,8,3
chr21	46924389	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.534:20:4,4:5,4:0|1:46924383_C_T:46924383:3,6,8,3
chr21	46924425	.	CGGCCCCCCA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCCCCCCA;STR;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr21	46927356	.	AC	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,2:2,1,2,0
chr21	46927372	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,29;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.692:7:0,5:1,0:1,1,5,0
chr21	46935092	.	C	CTAAATTAGAATGTCATAGAAAGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,0,1
chr21	46950901	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=91,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,2:0|1:46950901_T_A:46950901:2,0,1,1
chr21	46950903	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=91,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:46950901_T_A:46950901:2,0,1,1
chr21	46950904	.	G	GCACGCGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=91,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:46950901_T_A:46950901:2,0,1,1
chr21	46952094	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr21	46957633	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	46957916	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	47316158	.	GCACCCTCAGCACCTTAAGCCAC	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,0:11,2:13,17,1,1
chr21	47320377	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,3,1
chr21	47320425	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:7,2,2,0
chr21	47320633	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:2,7,0,2
chr21	47329352	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr21	47350796	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,5:0,0:2,3,1,4
chr21	47350799	.	A	ACACCCACACACAGCAGCATGTTTAAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:2,6,1,1
chr21	47355341	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,277;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	47401760	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr21	47401798	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:9,4,2,0
chr21	47404302	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:4,1:3,2:4,3,3,2
chr21	47404397	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	47406612	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,23;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.888:11:0,1:0,7:1,0,2,8
chr21	47409113	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=99,338;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr21	47410115	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47410115_C_T:47410115:3,1,1,0
chr21	47410120	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47410115_C_T:47410115:3,1,1,0
chr21	47410122	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,14;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:47410122_T_A:47410122:3,1,1,0
chr21	47410127	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,14;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:47410122_T_A:47410122:3,1,1,0
chr21	47410132	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=16,12;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:1,0:0,0:2,1,2,0
chr21	47410136	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:0|1:47410122_T_A:47410122:3,2,1,0
chr21	47410372	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=54,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:47410372_G_C:47410372:1,1,0,1
chr21	47410373	.	A	ATTGGCCACTAGTGCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=54,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:47410372_G_C:47410372:1,1,0,1
chr21	47410576	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr21	47410626	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr21	47412751	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=75,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:6,2:7,4:6,7,2,4
chr21	47417303	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr21	47417432	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.579:5:0,2:2,1:1,1,1,2
chr21	47418393	.	C	CTGAGGAACGGAATTCCTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=130,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr21	47420250	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:2,2,3,2
chr21	47420565	.	AGGAGGGCGGCCGGGGAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:1,2:6,0,2,0
chr21	47420726	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:3,3,1,2
chr21	47420761	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:47420761_G_A:47420761:1,1,1,1
chr21	47420769	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:47420761_G_A:47420761:1,1,1,1
chr21	47421315	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr21	47421864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr21	47421962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=100,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,1:4,1:2,5,2,0
chr21	47422011	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:47422011_T_C:47422011:0,6,2,0
chr21	47422015	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:47422011_T_C:47422011:0,6,2,0
chr21	47422020	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:47422011_T_C:47422011:0,6,2,0
chr21	47422412	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=159,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,1,1
chr21	47422639	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=72,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47422639_A_G:47422639:3,4,2,0
chr21	47422644	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=72,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47422639_A_G:47422639:3,4,2,0
chr21	47423133	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:0,6,1,4
chr21	47423280	.	AACGGCTGCCCACCCCGCCCCGCAGTCACGTTCTCCTCCCCGGCTGACATCACCATCCTGCTGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr21	47532162	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,3:6,0:0|1:47532162_C_T:47532162:7,6,2,1
chr21	47532165	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:0|1:47532162_C_T:47532162:6,6,2,1
chr21	47532544	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,3,8
chr21	47537882	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,5:0,0,6,10
chr21	47539065	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:5,1:0,7,1,6
chr21	47539790	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,7:0,0,8,12
chr21	47540573	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.870:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr21	47542861	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr21	47544451	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:47544451_GC_G:47544451:0,0,6,0
chr21	47544454	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.879:6:0,5:0,1:0|1:47544451_GC_G:47544451:0,0,6,0
chr21	47544541	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0,0,12,7
chr21	47544902	.	GTGGGGGAAGGTCAGCTGGC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:3,2:0|1:47544902_GTGGGGGAAGGTCAGCTGGC_G:47544902:1,7,1,1
chr21	47544923	.	CGGTCAGAG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=172,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:47544902_GTGGGGGAAGGTCAGCTGGC_G:47544902:1,6,1,1
chr21	47546244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr21	47546528	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=196,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr21	47549297	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,0,10
chr21	47551833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr21	47557074	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr21	47570185	.	T	TCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:47570185_T_TCTG:47570185:1,3,0,1
chr21	47570194	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:47570185_T_TCTG:47570185:2,2,0,1
chr21	47570220	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr21	47571383	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	47571508	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:5,1:2,5,4,3
chr21	47602764	.	C	CGTTTCGCCCATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=80,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:47602764_C_CGTTTCGCCCATA:47602764:1,3,1,1
chr21	47602769	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=80,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:47602764_C_CGTTTCGCCCATA:47602764:1,3,1,1
chr21	47608580	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,2:4,8:2,5,4,6
chr21	47611788	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:5,6,2,0
chr21	47614469	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:2,0:0,6:1,1,3,3
chr21	47614478	.	G	GAACGGCCATCAGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,0:7,2:4,6,1,1
chr21	47614599	.	C	CTGAGTAGCGAACAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr21	47616071	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:0|1:47616071_G_C:47616071:6,1,4,3
chr21	47616080	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0|1:47616071_G_C:47616071:3,1,4,3
chr21	47627245	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=262,257;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr21	47627499	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:1,2,1,1
chr21	47627504	.	A	ACCTGGGACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:47627504_A_ACCTGGGACTT:47627504:1,2,1,1
chr21	47627507	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:47627504_A_ACCTGGGACTT:47627504:1,2,0,1
chr21	47630550	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr21	47635302	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	47635713	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr21	47641700	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=118,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr21	47647382	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr21	47647618	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=16,31,19;MFRL=70,151,134;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,11;RU=A;STR;TLOD=8.66,16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,9:0.264,0.453:21:1,3,2:1,2,1:2,4,2,13
chr21	47648729	.	CCCCGCCCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCGCCCCT;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.517:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	47656712	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr21	47662798	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:21,2:11,1:21,11,2,1
chr21	47662920	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr21	47665116	.	GAAGA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr21	47671690	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr21	47674275	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,1:5,5:5,4,0,6
chr21	47674659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:47674659_G_A:47674659:7,2,1,1
chr21	47674666	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:47674659_G_A:47674659:8,2,1,1
chr21	47676711	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=94,77;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,2,2
chr21	47676934	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr21	47678774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.792:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	47679038	.	G	GGATCCGGAATATATAAAGAACTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr21	47681127	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr21	47686152	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:47686152_C_T:47686152:0,0,0,6
chr21	47686174	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:47686152_C_T:47686152:0,0,0,6
chr21	47687144	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:1,5,0,4
chr21	47692778	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47692778_TTC_T:47692778:0,4,0,1
chr21	47692781	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47692778_TTC_T:47692778:0,4,0,1
chr21	47692798	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr21	47703455	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr21	47703948	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,188;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:9,0,3,0
chr21	47705237	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,1:0,0,0,12
chr21	47707039	.	T	TAAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TTAAAAA,TAAAAAAA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,19,25,23,27,11;MFRL=0,117,130,0,104,109;MMQ=60,60,60,60,50,60;MPOS=19,15,15,20,9;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=10.13,5.87,5.44,3.05,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4/5:0,13,5,5,2,3:0.443,0.210,0.190,0.062,0.071:28:0,5,2,1,2,1:0,1,2,2,0,0:0,0,8,20
chr21	47707050	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=124.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,17:0,13:0|1:47707050_T_A:47707050:0,0,8,23
chr21	47707054	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=135.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,11:0|1:47707050_T_A:47707050:0,0,8,23
chr21	47711229	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr21	47716230	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	47717350	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr21	47717616	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr21	47721985	.	A	ATGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=69,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TGG;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,2:2,0:0,2,2,0
chr21	47722391	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,11:1,11:1,0,10,12
chr21	47722578	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr21	47734659	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,7,12
chr21	47742634	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:12,0:12,4:10,15,2,2
chr21	47744037	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr21	47766139	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,381;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr21	47777169	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=224,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47777169_G_T:47777169:0,2,0,1
chr21	47777175	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:47777169_G_T:47777169:0,1,0,1
chr21	47786449	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr21	47786494	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,12:0,14:0,1,18,8
chr21	47821688	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0|1:47821688_G_A:47821688:2,3,1,1
chr21	47821697	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,1:0,0:0|1:47821688_G_A:47821688:1,2,1,1
chr21	47848466	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr21	47852049	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:12,5:7,3:16,3,5,3
chr21	47852151	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr21	47858272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=524,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,9:0,9:1,0,7,11
chr21	47858311	.	T	TAATTTTTTCTACAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=233,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr21	47859903	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=181,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr21	47862566	.	T	TGGAAAACACTAGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47862566_T_TGGAAAACACTAGAC:47862566:0,4,0,1
chr21	47862568	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47862566_T_TGGAAAACACTAGAC:47862566:0,4,0,1
chr21	47862580	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=197,263;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr21	47864813	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:47864813_C_T:47864813:0,0,0,6
chr21	47864823	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:47864813_C_T:47864813:0,0,0,5
chr21	47904569	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr21	47917047	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr21	47931245	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr21	47961634	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr21	47961871	.	G	GCAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0,9,1,1
chr21	47966977	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=65,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,3:3,9:2,6,2,10
chr21	47971539	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,21,4
chr21	47976987	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:5,8,0,2
chr21	47978321	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.910:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr21	47980570	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr21	47983657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr21	47986465	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,7:7,0:9,9,7,0
chr21	47986633	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr21	48022375	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr21	48063387	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.503:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr21	48063476	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,15,14
chr21	48071806	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,9:0.147:68:28,0:22,7:29,30,7,2
chr21	48078611	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr22	16277923	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=203,175;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr22	16287423	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,69;MMQ=24,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr22	16449207	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=158,141;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16449207_AT_A:16449207:2,0,0,1
chr22	16449210	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=158,141;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16449207_AT_A:16449207:2,0,0,1
chr22	16449216	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=158,141;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:16449207_AT_A:16449207:4,0,0,1
chr22	17071834	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=113,143;MMQ=53,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,6:9,0:8,10,6,0
chr22	17072483	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,34;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr22	17264565	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr22	17264904	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr22	17265194	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr22	17446157	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=84,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,2:5,1:8,9,0,3
chr22	17446991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=91,87;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,10:1,5:3,1,8,8
chr22	17449115	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=65,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:2,0,3,2
chr22	17469026	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=6,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,5:3,7:0,4,3,9
chr22	17469049	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=12,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,2,6
chr22	17488823	.	C	CG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:0,12:3,8:3,0,8,12
chr22	17489030	.	G	GTGGGCCATCACAGTAGAGAAAAAGCTTGGAGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=81,95;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,0,1
chr22	17582776	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,9,2
chr22	17586583	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr22	17586595	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr22	17586609	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,2,8
chr22	17586614	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,2,8
chr22	17586631	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr22	17586715	.	ATCAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAC;STR;TLOD=70.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr22	17589209	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=247,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.885:24:0,9:2,12:0,2,7,15
chr22	17590744	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr22	17600148	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr22	17619292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.750:13:1,4:1,5:0,3,3,7
chr22	17619716	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	17623880	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr22	17630389	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	17630537	.	C	CACA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:13,0:6,13,1,1
chr22	17662812	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:1,12,0,2
chr22	17663708	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:2,1,0,3
chr22	17669151	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	17669199	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=148,107;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,1:0,7:2,0,7,2
chr22	17669306	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,22;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:2,4:4,7:2,4,7,5
chr22	17669328	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:0|1:17669328_C_T:17669328:7,9,1,1
chr22	17669343	.	G	GTGAGCTGGGC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=102,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:1,0:8,2:0|1:17669328_C_T:17669328:4,10,1,1
chr22	17669351	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=103,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:0,0:7,2:0|1:17669328_C_T:17669328:3,8,1,1
chr22	17669353	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=118,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,0:8,2:0|1:17669328_C_T:17669328:3,6,1,1
chr22	17669406	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr22	17680311	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	17680519	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:0,3,2,8
chr22	17684355	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	17690534	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17690534_G_A:17690534:1,0,0,1
chr22	17690550	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17690534_G_A:17690534:1,0,0,1
chr22	17956759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr22	17978600	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,8,17
chr22	17991017	.	TCCTTCA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=223,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17991017_TCCTTCA_T:17991017:0,1,0,1
chr22	17991027	.	TTTTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=223,88;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17991017_TCCTTCA_T:17991017:0,1,0,1
chr22	17991033	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,21;MFRL=223,88;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17991017_TCCTTCA_T:17991017:0,1,0,1
chr22	18021505	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,4,2
chr22	18027817	.	CTT	C,CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34,34;MFRL=167,148,174;MMQ=60,60,60;MPOS=31,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.58,6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.365,0.379:8:0,3,3:2,0,0:2,0,6,0
chr22	18028528	.	ATTCCTACCACCCACCGCCACAGCC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=80,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,0:1,2:2,6,1,1
chr22	18028827	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=81,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,0:10,6:8,7,0,6
chr22	18031748	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=69,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:4,3:20,0:15,9,2,1
chr22	18031762	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:7,0:11,3:8,10,2,1
chr22	18031773	.	AA	CC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:4,11,1,1
chr22	18082689	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,0:6,5:10,1,5,0
chr22	18082768	.	G	A	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=105,105;MMQ=47,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,22:0.295:76:13,21:40,0:51,3,22,0
chr22	18084001	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	18095715	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,123;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,0:4,7:0,7,0,7
chr22	18165898	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.509:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr22	18185139	.	AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG	A	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=24,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.102:29:9,2:11,1:0|1:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:7,19,2,1
chr22	18185221	.	TG	CA	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=203,141;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.325:4:1,0:2,1:1|0:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:1,2,0,1
chr22	18185224	.	GT	AG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=203,141;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.325:4:1,0:2,1:1|0:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:1,2,0,1
chr22	18185233	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=203,141;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.325:4:1,0:2,1:1|0:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:1,2,0,1
chr22	18185238	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,33;MFRL=203,141;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.325:4:1,0:2,1:1|0:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:1,2,0,1
chr22	18185242	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=102,141;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.394:3:1,0:1,1:1|0:18185139_AGCAAGGTGGCTGGGTATGAGCTGTTATATATTAAAAATATTTTCTTGAAAAAAAATTAGGTTTGTTGTTTTTCTTAAGAGATGGGTTCTTGCTGTGTTACCCG_A:18185139:0,2,0,1
chr22	18185251	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=71,59;MMQ=45,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0|1:18185251_T_A:18185251:0,2,1,1
chr22	18185254	.	AGTGTCTAATTG	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=71,59;MMQ=45,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0|1:18185251_T_A:18185251:0,2,1,1
chr22	18233000	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=133,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr22	18273463	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.659:15:0,4:4,6:3,2,7,3
chr22	18293650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,1,1
chr22	18299416	.	GG	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:7,6,1,1
chr22	18300879	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.747:22:2,11:3,3:4,1,8,9
chr22	18301083	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=206,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr22	18301693	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,7,3
chr22	18304695	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	18310363	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:18310363_C_T:18310363:0,0,4,0
chr22	18310367	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:18310363_C_T:18310363:0,0,4,0
chr22	18314693	.	C	CTCCTCT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=88,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCT;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.130:20:7,0:9,2:6,12,0,2
chr22	18314824	.	GCTC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTC;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:7,2:1,0:2,6,1,1
chr22	18362064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=86,54;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,2:10,1:8,4,1,2
chr22	18363991	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=83,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:24,1:15,2:18,21,2,1
chr22	18368632	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:10,11:11,0:13,8,11,0
chr22	18370066	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,9,13
chr22	18389254	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,2:7,1:10,8,2,1
chr22	18463608	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.866:12:0,5:1,6:1,0,7,4
chr22	18463747	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:0,1,1,7
chr22	18568093	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:18568093_T_G:18568093:0,3,0,1
chr22	18568098	.	G	GGGGCTGGCTCATGCCCAGTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:18568093_T_G:18568093:0,3,0,1
chr22	18568122	.	G	GATATGAGGTGTGAGCGATATACTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	18570665	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr22	18613603	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,3:14,3:12,11,3,3
chr22	18613952	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=67,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr22	18644702	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=147,144;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:9,2:7,8,1,2
chr22	18650094	.	TGCACTTGGTAAGAACCTAGAACCAGA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=144,116;MMQ=52,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:5,0:17,2:16,13,1,1
chr22	18655860	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr22	18894061	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,1:5,3:5,5,3,1
chr22	18896301	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr22	18898339	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr22	18898582	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=96,168;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr22	18899016	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,166;MMQ=46,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,6:2,5:2,0,10,1
chr22	18900669	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.642:23:4,9:3,6:5,3,11,4
chr22	18901090	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr22	18910257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr22	18910284	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr22	18910301	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,143;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0|1:18910301_A_G:18910301:0,0,8,2
chr22	18910307	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:18910301_A_G:18910301:0,0,8,2
chr22	18910450	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.275:23:8,2:7,4:9,8,3,3
chr22	18910477	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:7,2:17,0:0|1:18910477_CA_C:18910477:2,24,1,1
chr22	18910479	.	CGCCCCTGCCCA	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:8,1:18,0:0|1:18910477_CA_C:18910477:2,25,1,1
chr22	18910482	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=103,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,0:7,10:2,13,0,11
chr22	18910490	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:5,0:18,0:0,23,2,0
chr22	18910502	.	CACACAG	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:6,0:2,15,2,0
chr22	18910756	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr22	19028476	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:19028476_T_C:19028476:0,0,2,0
chr22	19028480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:19028476_T_C:19028476:0,0,2,0
chr22	19036220	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=75,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19036220_G_GA:19036220:0,1,0,1
chr22	19036225	.	CAC	AGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:19036220_G_GA:19036220:0,2,0,1
chr22	19036230	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19036220_G_GA:19036220:0,2,0,1
chr22	19036232	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19036220_G_GA:19036220:0,2,0,1
chr22	19036236	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19036220_G_GA:19036220:0,1,0,1
chr22	19050635	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr22	19050851	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr22	19050878	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:19050878_A_G:19050878:0,1,1,2
chr22	19050894	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19050878_A_G:19050878:0,0,0,1
chr22	19050897	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19050878_A_G:19050878:0,0,0,1
chr22	19055542	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr22	19077049	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr22	19109609	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	19109753	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=67.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0|1:19109753_A_G:19109753:0,0,6,11
chr22	19109764	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:19109753_A_G:19109753:0,0,3,8
chr22	19109788	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	19109812	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr22	19119141	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:8,11,1,2
chr22	19119900	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,1,1
chr22	19121872	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=112,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:2,6,3,0
chr22	19122706	.	TGTGGGTAGCTGCGCCAGGCCTGCCACACGCCAGGCAGCCCCTCACACAGAAAGCCACTGTG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=95,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:6,1:7,0:7,11,1,1
chr22	19163577	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:6,1:1,1:7,0,2,0
chr22	19163766	.	G	GGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=258,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19163766_G_GGCC:19163766:0,1,0,1
chr22	19163767	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=258,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19163766_G_GGCC:19163766:0,1,0,1
chr22	19163771	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=258,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19163766_G_GGCC:19163766:0,1,0,1
chr22	19164535	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,142;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:6,3,3,0
chr22	19168400	.	G	GATCTCGAACTCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,1:0,2,1,1
chr22	19187375	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr22	19187427	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=213,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	19189003	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,9,9
chr22	19197752	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	19197896	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:10,2,1,2
chr22	19207410	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:9,12,2,1
chr22	19220838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,0:2,8:2,7,0,8
chr22	19226859	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:19226859_T_A:19226859:13,8,1,1
chr22	19226864	.	A	ATGTTAC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:0|1:19226859_T_A:19226859:13,9,1,1
chr22	19226866	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:19226859_T_A:19226859:14,9,1,1
chr22	19226868	.	G	GATACTGCCCTCAGAT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:14,0:8,1:0|1:19226859_T_A:19226859:14,9,1,1
chr22	19344490	.	CAGG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=64,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:14,2:3,0:8,9,1,1
chr22	19371052	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=243,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr22	19376124	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.504:12:1,2:5,4:2,4,0,6
chr22	19418894	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=86,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr22	19419005	.	GGCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr22	19419093	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	19429342	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=133,168;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.401:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr22	19438362	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr22	19442220	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,4:16,0:17,12,3,1
chr22	19444091	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=78,157;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:9,7:8,0:0|1:19444091_C_A:19444091:13,8,7,0
chr22	19444094	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=78,157;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.266:28:12,7:9,0:0|1:19444091_C_A:19444091:13,8,7,0
chr22	19455376	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,17,10
chr22	19459157	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr22	19462466	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr22	19467652	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.928:26:1,11:0,12:0,1,16,9
chr22	19468514	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:12,5:19,4:8,23,5,4
chr22	19468655	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr22	19468672	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr22	19471446	.	GGGATGAAGAGGA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:8,2:16,0:13,20,1,1
chr22	19471609	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	19486777	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	19495064	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=159,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:19495064_C_T:19495064:0,4,0,1
chr22	19495065	.	A	ACTAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=159,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:19495064_C_T:19495064:0,4,0,1
chr22	19495967	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=298,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr22	19504318	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:2,2:2,0:3,3,2,0
chr22	19504470	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr22	19512359	.	CCCCCACCCCGTCACCGCCGTAGAGGCCCTCGTAGGGGGGCTCTCCAGAAAGCCCGCCCCGGGGTCCAAG	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=121,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.077:40:8,0:5,2:23,14,2,1
chr22	19709318	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.202:16:7,0:4,0:0|1:19709318_A_C:19709318:1,12,3,0
chr22	19709323	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:19709318_A_C:19709318:1,11,2,0
chr22	19747082	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr22	19753449	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr22	19794366	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	19885548	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,7:1,12:3,0,18,1
chr22	19886515	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=189,257;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr22	19886592	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:19886592_C_T:19886592:3,4,1,1
chr22	19886595	.	TT	AA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,1:0|1:19886592_C_T:19886592:3,4,1,1
chr22	19898837	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=112,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,3,2
chr22	19898906	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:7,1:3,2:7,4,2,1
chr22	19903327	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:9,10:7,1:6,10,11,0
chr22	19907192	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=200,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,2,4
chr22	19950027	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,316;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19950027_G_GC:19950027:0,0,1,0
chr22	19950032	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=236,316;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:19950027_G_GC:19950027:1,0,1,0
chr22	19950037	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=203,316;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:19950027_G_GC:19950027:1,1,1,0
chr22	19950041	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=203,316;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:19950027_G_GC:19950027:1,1,1,0
chr22	19951351	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr22	19954916	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=82,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:3,3:0,7,0,3
chr22	19959366	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr22	19960188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr22	19960583	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=192,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:19960583_G_C:19960583:0,3,1,0
chr22	19960590	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:19960583_G_C:19960583:0,4,1,0
chr22	19960606	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=156,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr22	19964348	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,34;MFRL=94,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:19964348_A_C:19964348:1,1,0,1
chr22	19964350	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=94,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:19964348_A_C:19964348:1,1,0,1
chr22	19964352	.	T	TGGCTGTGGACAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19964348_A_C:19964348:1,0,0,1
chr22	19965501	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:4,2,1,1
chr22	20024349	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=177,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,0:8,2:0|1:20024349_C_T:20024349:7,9,1,1
chr22	20024352	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=176,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,1:0|1:20024349_C_T:20024349:6,9,1,1
chr22	20049285	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr22	20074193	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:20074193_A_T:20074193:0,3,0,1
chr22	20074216	.	C	CGCCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20074193_A_T:20074193:0,0,0,1
chr22	20074218	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20074193_A_T:20074193:0,0,0,1
chr22	20094229	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,125;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:8,0:6,18:6,8,0,18
chr22	20096314	.	G	GCGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr22	20097730	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	20100409	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=230,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,2:1,0,6,0
chr22	20100596	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:11,3,2,0
chr22	20102090	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.752:13:1,2:1,8:2,1,2,8
chr22	20104235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr22	20104301	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,6,10
chr22	20105561	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=223,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr22	20106508	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=143,186;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.627:33:9,20:3,0:11,1,21,0
chr22	20106535	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=126,186;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:15,21:5,0:16,4,21,0
chr22	20110246	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=21,19;MFRL=235,154;MMQ=35,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=TG;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.376:3:0,0:1,0:0,2,0,1
chr22	20110285	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=22,30;MFRL=77,154;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:20110285_TG_T:20110285:0,4,0,1
chr22	20110286	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=0,316;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:20110286_G_GT:20110286:0,3,0,1
chr22	20110289	.	G	GTGGTGTCC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=77,316;MMQ=50,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:20110286_G_GT:20110286:0,4,0,1
chr22	20110290	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=21,28;MFRL=77,154;MMQ=50,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:20110290_T_G:20110290:0,4,0,1
chr22	20110291	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=77,154;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20110285_TG_T:20110285:0,4,0,1
chr22	20110292	.	TG	GA	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=77,154;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20110290_T_G:20110290:0,4,0,1
chr22	20110293	.	G	GGTGGCGA	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,30;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:20110285_TG_T:20110285:0,3,0,1
chr22	20110294	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,27;MFRL=77,316;MMQ=50,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr22	20113777	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	20116994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr22	20127554	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr22	20128651	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr22	20132972	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr22	20134442	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	20134525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr22	20134791	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:5,2:0,0:0|1:20134791_G_GC:20134791:1,4,1,1
chr22	20134796	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,2:0,0:0|1:20134791_G_GC:20134791:1,4,1,1
chr22	20136193	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=95,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,2,0
chr22	20136379	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:20136379_C_A:20136379:0,0,5,0
chr22	20136384	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:20136379_C_A:20136379:2,0,2,0
chr22	20136651	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20136651_A_T:20136651:0,0,1,0
chr22	20136673	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=76,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20136651_A_T:20136651:1,0,1,0
chr22	20136731	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=76,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,0,2
chr22	20137046	.	CC	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr22	20138379	.	C	CTCTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,61;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:3,7,1,1
chr22	20229765	.	GTC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=206,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:20229765_GTC_G:20229765:1,1,0,1
chr22	20229768	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=206,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:20229765_GTC_G:20229765:1,1,0,1
chr22	20457922	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=160,64;MMQ=25,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:20457922_G_T:20457922:1,7,1,1
chr22	20457923	.	CATAA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,64;MMQ=25,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:20457922_G_T:20457922:1,8,1,1
chr22	20457928	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,64;MMQ=25,37;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:20457922_G_T:20457922:1,5,1,1
chr22	20729953	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,314;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20729953_C_CCA:20729953:0,0,0,1
chr22	20729957	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,314;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20729953_C_CCA:20729953:0,0,0,1
chr22	20731566	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,120;MMQ=40,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,5:5,0:6,9,1,4
chr22	20749051	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,177;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,1:0,0,0,6
chr22	20755098	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=417,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,4:1,2:0,2,1,5
chr22	20761325	.	C	CTCTTTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr22	20761344	.	C	CGCCCCATAAAAAGCAGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	20783721	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr22	20785852	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=227,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr22	20847493	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:6,0:18,3:14,11,1,2
chr22	20891545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	20891568	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr22	20918915	.	C	CCAG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=77,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CAG;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.272:19:8,2:6,2:4,10,2,3
chr22	20938775	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr22	20939153	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,1:4,2:0|1:20939153_A_C:20939153:1,5,3,0
chr22	20939155	.	C	CCCCCCCCCGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.357:9:1,1:5,2:0|1:20939153_A_C:20939153:1,5,3,0
chr22	20940888	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,2:9,0:5,8,1,1
chr22	21064356	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=133,144;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr22	21064387	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,172;MMQ=40,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr22	21068659	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr22	21068878	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,172;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:9,3:15,6:10,14,3,6
chr22	21073122	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=90,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,3:10,5:6,11,2,6
chr22	21075537	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:5,3,3,0
chr22	21080721	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=88,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.442:21:3,6:9,3:7,5,8,1
chr22	21081964	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	21084030	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.526:30:7,0:7,14:4,10,0,16
chr22	21084231	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:16,2:11,0:0|1:21084231_TC_T:21084231:18,9,1,1
chr22	21084234	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:16,2:11,0:0|1:21084231_TC_T:21084231:19,9,1,1
chr22	21084237	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:16,2:10,1:0|1:21084231_TC_T:21084231:18,8,2,1
chr22	21088146	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=178,83;MMQ=55,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:10,9:5,0:4,11,4,5
chr22	21088171	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=113,689525;MMQ=55,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,3:3,0:2,10,0,3
chr22	21088766	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=99,101;MMQ=41,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,0:5,3:7,2,2,1
chr22	21096666	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,0:4,3:3,10,0,3
chr22	21101815	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr22	21106085	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=102,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,2,8
chr22	21107153	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,2,1
chr22	21107443	.	GACTGCAATCACAC	G,AACTGCAATCACAC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20,28;MFRL=140,90,309851;MMQ=59,60,39;MPOS=26,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.43,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.112,0.115:20:11,2,0:5,0,2:7,9,3,1
chr22	21134386	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:9,4,3,0
chr22	21140231	.	CATG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr22	21140425	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=95,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,0:4,2:5,6,2,0
chr22	21153590	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:4,7,0,3
chr22	21156377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:6,9,0,2
chr22	21167787	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=81,91;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,7:8,2:6,11,4,5
chr22	21213380	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=86,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,24:0.722:33:8,10:0,13:6,3,18,6
chr22	21213416	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=107,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,33:0.755:43:9,14:1,16:5,5,18,15
chr22	21322097	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=265,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr22	21322249	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,180;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,0:17,2:12,9,0,2
chr22	21327603	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=77,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:8,8,1,1
chr22	21327834	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	21329123	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,7,8
chr22	21330787	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:3,4,2,5
chr22	21331918	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,2:3,8:7,1,8,2
chr22	21331950	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,10,5
chr22	21332122	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=65,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.869:21:2,10:0,9:0,2,6,13
chr22	21332394	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	21334440	.	G	GGACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:21334440_G_GGACA:21334440:0,4,0,1
chr22	21334444	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:21334440_G_GGACA:21334440:0,4,0,1
chr22	21334924	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr22	21335259	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=77,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.823:26:2,7:2,15:2,2,8,14
chr22	21337266	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,5:1,6:0,1,9,3
chr22	21337415	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr22	21341772	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:12,2:7,0:10,9,0,2
chr22	21341956	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=205,333;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:0,6,0,5
chr22	21341976	.	GG	AA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=220,333;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0,5,0,5
chr22	21343982	.	TGGGGAGCCAGGGCGCAGGTAGAGGAGGTGAGGGGCAC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=292,84;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.731:10:0,4:0,2:0,3,4,3
chr22	21346485	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:3,5,3,0
chr22	21348084	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=219,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr22	21350235	.	CC	TT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:8,8,1,1
chr22	21369675	.	TG	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=197,165;MMQ=46,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.619:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr22	21372405	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr22	21377071	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=282,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,2:1,2:1,1,0,5
chr22	21380622	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=103,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.164:26:9,0:13,3:11,11,4,0
chr22	21384173	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:2,7,2,0
chr22	21567384	.	A	AATTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=172,235;MMQ=24,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21567384_A_AATTCC:21567384:0,1,0,1
chr22	21567386	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=172,235;MMQ=24,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21567384_A_AATTCC:21567384:0,1,0,1
chr22	21568221	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21568221_G_A:21568221:0,0,0,1
chr22	21568228	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21568221_G_A:21568221:0,0,0,1
chr22	21568234	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21568221_G_A:21568221:0,0,0,1
chr22	21570175	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr22	21570296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=113,146;MMQ=52,31;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr22	21570431	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,108;MMQ=34,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.369:16:5,3:5,1:1,9,3,3
chr22	21570436	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,108;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:2,9,2,3
chr22	21576082	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=129,91;MMQ=53,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.193:23:7,1:12,3:16,3,3,1
chr22	21576172	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,103;MMQ=54,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:11,4:13,2:13,11,2,4
chr22	21576361	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=92,316;MMQ=57,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:0,2,2,0
chr22	21797092	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,121;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:21797092_A_C:21797092:0,0,1,1
chr22	21797094	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,25;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:21797092_A_C:21797092:0,0,1,1
chr22	21829480	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr22	21829507	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,25;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0|1:21829507_G_A:21829507:0,0,0,6
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chr22	21832031	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21832031_A_G:21832031:0,0,1,0
chr22	21832041	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:21832031_A_G:21832031:0,0,3,0
chr22	21832241	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=164,161;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:21832241_C_T:21832241:1,4,0,2
chr22	21832247	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=161,161;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:21832241_C_T:21832241:0,4,0,2
chr22	21832470	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr22	21838277	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	21838301	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	21842352	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21842352_G_A:21842352:0,0,0,1
chr22	21842356	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21842352_G_A:21842352:0,0,0,1
chr22	21842655	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=215,198;MMQ=40,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,2,1
chr22	21900334	.	A	ATAAAGGGCACAACCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=183,167;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	21965377	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:3,1:3,5,0,3
chr22	21965390	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.767:5:0,0:0,1:0,1,0,4
chr22	21982781	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:21982781_C_T:21982781:13,7,1,1
chr22	21982790	.	C	CTTCAGGCTTTTTCTCTTTTATAGCT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:9,2:0|1:21982781_C_T:21982781:8,7,1,1
chr22	21987240	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=123,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr22	21987318	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:12,3:11,12,1,2
chr22	22007370	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr22	22024507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr22	22024733	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=210,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr22	22036832	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr22	22041860	.	AGCCT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,166;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22041860_AGCCT_A:22041860:0,0,1,0
chr22	22041866	.	C	CAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,166;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22041860_AGCCT_A:22041860:0,0,1,0
chr22	22042079	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr22	22048770	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr22	22058000	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	22153239	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr22	22153338	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:22,4:14,0:25,12,2,2
chr22	22160384	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr22	22162186	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=203,311;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr22	22277430	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=161,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.865:9:0,5:0,3:0,1,7,1
chr22	22277571	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:3,8:4,10:5,2,7,11
chr22	22280073	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22280073_G_T:22280073:0,0,0,1
chr22	22280077	.	T	TCACCGAGCCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:22280073_G_T:22280073:0,1,0,1
chr22	22280080	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22280073_G_T:22280073:0,2,0,1
chr22	22280082	.	CG	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22280073_G_T:22280073:0,2,0,1
chr22	22288309	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr22	22292651	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:4,2:1,5,3,0
chr22	22317214	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=69,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr22	22325289	.	CCTAGCTTGTGGTGGGGGCAGCTCGGGCTAAAGCACAGCAGGGGTCCTGGAGCCGAGACTCACTAGGAAGGCCGTGCAGTGGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,1,0
chr22	22326376	.	C	CACTACTCGCCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	22327099	.	CAGTCACAGTGACATTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr22	22330047	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:22330047_G_C:22330047:2,2,1,1
chr22	22330049	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:22330047_G_C:22330047:2,2,1,1
chr22	22330050	.	G	GGCTTT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCTTT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:22330047_G_C:22330047:2,2,1,1
chr22	22330057	.	C	CCTTTTAATA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:22330047_G_C:22330047:1,2,1,1
chr22	22330082	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr22	22550339	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr22	22550760	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	22556368	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22556368_C_T:22556368:0,0,1,0
chr22	22556376	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22556368_C_T:22556368:0,0,1,0
chr22	22569137	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	22569176	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr22	22569448	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr22	22569640	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	22599719	.	ACCCAC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22599719_ACCCAC_A:22599719:0,1,0,1
chr22	22599727	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22599719_ACCCAC_A:22599719:0,1,0,1
chr22	22673474	.	A	AAATCTCTTCTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=128,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:5,4,1,1
chr22	22673639	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	22707222	.	A	AG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=99,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.453:33:9,10:9,5:15,3,11,4
chr22	22707316	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=20,32;MFRL=73,160;MMQ=60,47;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.395:21:7,5:5,3:7,6,3,5
chr22	22707349	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,24;MFRL=83,145;MMQ=60,53;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,6:6,1:0|1:22707349_C_A:22707349:7,5,3,4
chr22	22707351	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=83,145;MMQ=60,53;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:5,6:7,1:0|1:22707349_C_A:22707349:7,6,3,4
chr22	22707361	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=23,31;MFRL=83,171;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:4,5:8,1:0|1:22707349_C_A:22707349:7,6,2,4
chr22	22707366	.	CA	AC	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=31,23;MFRL=83,171;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:6,5:7,0:0|1:22707349_C_A:22707349:8,7,2,4
chr22	22707369	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=25,27;MFRL=91,171;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:5,5:8,1:0|1:22707349_C_A:22707349:7,7,2,4
chr22	22707452	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,1:4,1:0|1:22707452_G_GT:22707452:6,3,1,2
chr22	22707456	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:0|1:22707452_G_GT:22707452:6,3,1,2
chr22	22707493	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=106,214;MMQ=60,54;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.383:14:3,3:4,2:4,5,3,2
chr22	22712261	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	22712276	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,176;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr22	22712304	.	G	GACT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=145,210;MMQ=37,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.459:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr22	22712402	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=96,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:8,2:16,1:11,13,2,1
chr22	22712557	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=80,112;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:6,6:5,11:6,5,8,10
chr22	22724135	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,16:0,8:0,0,9,15
chr22	22724394	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr22	22730504	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:3,8,3,0
chr22	22730787	.	GG	AA	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=121,138;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:14,1:5,2:9,10,0,3
chr22	22730799	.	GA	CC	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=120,118;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:10,10,0,2
chr22	22730829	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=100,95;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,0:7,4:10,11,1,3
chr22	22730849	.	GTA	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=20,33;MFRL=97,110;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:12,0:6,4:0|1:22730849_GTA_G:22730849:10,8,1,3
chr22	22730853	.	G	GCC	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=20,33;MFRL=97,110;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,0:6,4:0|1:22730849_GTA_G:22730849:10,8,1,3
chr22	22730860	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=20,28;MFRL=91,110;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:11,0:6,4:0|1:22730849_GTA_G:22730849:9,11,1,3
chr22	22730869	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=20,26;MFRL=86,110;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,0:8,4:0|1:22730849_GTA_G:22730849:8,10,1,3
chr22	22730891	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=29,35;MFRL=97,55;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:6,12,0,2
chr22	22735382	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=159,162;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,1:4,2:6,9,3,0
chr22	22735736	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr22	22786587	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=110,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.294:44:18,11:13,0:15,16,13,0
chr22	22786594	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=129,379;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:24,3:12,0:24,15,3,0
chr22	22786713	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,144;MMQ=40,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:4,0:10,2:4,10,2,0
chr22	22843474	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:14,1:7,3:13,8,1,3
chr22	22869752	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,154;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,12:9,0:9,7,12,0
chr22	22898427	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,0:2,3:0|1:22898427_T_G:22898427:0,7,0,3
chr22	22898429	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.334:10:4,0:3,3:0|1:22898427_T_G:22898427:0,7,0,3
chr22	22898430	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0|1:22898427_T_G:22898427:0,7,0,3
chr22	22898433	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,0:3,1:0|1:22898427_T_G:22898427:0,7,0,3
chr22	22899234	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,9:2,9:2,2,7,11
chr22	22899363	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr22	22901703	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:9,3,5,0
chr22	22930612	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:8,4,1,1
chr22	22930770	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,5:0,8:1,0,7,6
chr22	22977902	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	22979755	.	TCCG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22979755_TCCG_T:22979755:0,0,0,1
chr22	22979759	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22979755_TCCG_T:22979755:0,0,0,1
chr22	22979762	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,167;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22979755_TCCG_T:22979755:0,0,0,1
chr22	22979764	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22979755_TCCG_T:22979755:0,0,0,1
chr22	22986688	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=101,46;MMQ=52,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:7,11,0,4
chr22	22986785	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=167,170;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22986785_A_T:22986785:0,1,0,1
chr22	22986787	.	AT	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=167,170;MMQ=48,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22986785_A_T:22986785:0,1,0,1
chr22	22988720	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=170,207;MMQ=46,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,1,0
chr22	22988846	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=128,192;MMQ=27,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:22988846_C_T:22988846:1,3,1,1
chr22	22988864	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=128,192;MMQ=27,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:22988846_C_T:22988846:1,3,1,1
chr22	22988876	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=174,192;MMQ=27,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:22988846_C_T:22988846:0,3,1,1
chr22	22989622	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,185;MMQ=36,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr22	23011376	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	23029374	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr22	23029482	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,93;MMQ=52,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,2:12,1:12,6,1,2
chr22	23029526	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,3:3,10:4,2,6,7
chr22	23040334	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:5,0:1,3:4,3,3,0
chr22	23040362	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=141,127;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr22	23040389	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=120,127;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:6,1:5,7,0,2
chr22	23046741	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,4:2,7:2,0,9,2
chr22	23055331	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	23063645	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=104,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.245:18:10,0:4,4:7,7,3,1
chr22	23089857	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:3,0:0|1:23089857_G_A:23089857:6,0,3,0
chr22	23089865	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0|1:23089857_G_A:23089857:6,0,3,1
chr22	23089941	.	ACT	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:7,1:10,10,0,2
chr22	23101103	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=142,204;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr22	23101132	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=142,190;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:6,3,3,0
chr22	23101159	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=147,188;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:5,5,2,0
chr22	23101170	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=158,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:23101170_G_A:23101170:7,6,1,1
chr22	23101193	.	G	GAGTGCAAT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:0|1:23101170_G_A:23101170:6,6,1,1
chr22	23101247	.	GC	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=90,158;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:4,2:10,1:10,6,1,2
chr22	23101280	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=98,145;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,3:12,1:12,8,2,2
chr22	23101347	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,132;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,3:7,0:4,11,1,2
chr22	23101523	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=146,143;MMQ=40,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,5:7,2:8,6,5,2
chr22	23101559	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=123,145;MMQ=52,47;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,4:10,2:7,6,5,1
chr22	23114285	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,0;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:8,7,4,0
chr22	23114748	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr22	23114993	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:4,6,1,4
chr22	23165242	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=0,149;MMQ=33,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,6:0,9:0,1,8,7
chr22	23165839	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr22	23223070	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr22	23241620	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=210,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr22	23241753	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=173,139;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:1,2,7,2
chr22	23241864	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=202,122;MMQ=44,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,0,7
chr22	23243484	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=264,147;MMQ=40,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:23243484_C_A:23243484:2,1,0,1
chr22	23243487	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=264,147;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:23243484_C_A:23243484:2,1,0,1
chr22	23243489	.	AC	A,CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31,34;MFRL=0,271,147;MMQ=60,40,27;MPOS=16,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.95,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.546,0.286:3:0,2,0:0,0,1:0,0,2,1
chr22	23243495	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=271,147;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:23243484_C_A:23243484:2,0,0,1
chr22	23243498	.	C	CCCCCCGCAAAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=271,147;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:23243484_C_A:23243484:2,0,0,1
chr22	23247028	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr22	23256464	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,14:0,26:0,0,24,17
chr22	23260278	.	CGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=65,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.909:21:0,9:3,8:0,3,15,3
chr22	23264933	.	A	AGG	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=113,141;MMQ=56,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.120:22:8,2:11,0:0|1:23264933_A_AGG:23264933:8,12,0,2
chr22	23264934	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=113,141;MMQ=56,55;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.120:22:9,2:11,0:0|1:23264933_A_AGG:23264933:8,12,0,2
chr22	23264937	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=127,141;MMQ=53,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:23264933_A_AGG:23264933:8,11,0,2
chr22	23492330	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=110,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,0:9,3:13,11,1,2
chr22	23501286	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr22	23502965	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=165,10994308;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr22	23502987	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	23503008	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr22	23503170	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,8,14
chr22	23503205	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr22	23503266	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr22	23503569	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	23503580	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr22	23503651	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr22	23615333	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=94,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:1,5,1,1
chr22	23627369	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,7,8
chr22	23627441	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr22	23653975	.	T	TCCGG	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=113,106;MMQ=40,25;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGG;STR;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.185:30:15,5:9,0:15,10,0,5
chr22	23654047	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=123,679003;MMQ=52,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:8,16,0,3
chr22	23915383	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=126,110;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr22	23915700	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,3:10,0:16,9,2,1
chr22	23962744	.	T	TTTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,4:6,1:3,6,0,5
chr22	23967115	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=134,116;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.212:27:9,0:11,5:0|1:23967115_C_T:23967115:9,13,0,5
chr22	23967123	.	A	ATACATAAGGGGGATACAATAGTCTTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=113,116;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:8,0:10,5:0|1:23967115_C_T:23967115:7,13,0,5
chr22	24034288	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr22	24039341	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=91,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.161:21:5,1:5,1:10,8,3,0
chr22	24041096	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=94,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:13,5:11,0:15,9,5,0
chr22	24086825	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=123,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:9,9,0,2
chr22	24106607	.	CCCCTG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=105,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,2:11,0:0|1:24106607_CCCCTG_C:24106607:14,12,1,1
chr22	24106614	.	AGCTATGGTAGAATGTAAGAGGGGGGCATAGCAGACCATAGACCACCCAAGGCCCTGTCCG	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.084:34:14,2:8,0:0|1:24106607_CCCCTG_C:24106607:18,14,1,1
chr22	24106674	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=16,24;MFRL=207,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.729:8:0,5:1,1:2,0,2,4
chr22	24107666	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,7:4,5:5,4,8,6
chr22	24108103	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,5:1,9:2,1,7,7
chr22	24108288	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,10:1,8:1,0,11,7
chr22	24108412	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=111,129;MMQ=55,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,6:0,7:1,1,10,4
chr22	24108446	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=92,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	24109462	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=67,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,1:1,6:2,0,7,0
chr22	24109550	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=97.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,15,16
chr22	24109774	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	24109905	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:24109905_A_C:24109905:0,0,1,0
chr22	24109918	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:24109905_A_C:24109905:3,0,1,0
chr22	24109921	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:24109905_A_C:24109905:3,0,1,0
chr22	24109923	.	AT	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,0:0|1:24109905_A_C:24109905:3,0,1,0
chr22	24122479	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=157,182;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:0|1:24122479_C_T:24122479:12,0,3,0
chr22	24122499	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0|1:24122479_C_T:24122479:0,0,14,2
chr22	24124393	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:10,2,2,0
chr22	24125565	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,12,3
chr22	24129553	.	GGC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr22	24145395	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	24145675	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	24175989	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr22	24176959	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	24179051	.	GGGGGTCACTGCTGCGGGGGTGGCAGATGGGGTCCTGGCTGTTCCTCAGGGAGGGGCAGGTAATT	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=71,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:10,0:5,2:36,9,1,1
chr22	24179156	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=90,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.134:34:14,4:16,0:14,16,2,2
chr22	24180123	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	24199262	.	G	GCTCTGTA	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=98,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.402:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr22	24199265	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0|1:24199265_G_A:24199265:0,2,0,1
chr22	24199266	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=78,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1|0:24199265_G_A:24199265:0,1,0,2
chr22	24199269	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=73,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr22	24199270	.	GG	CA,AG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,30,23;MFRL=103,68,78;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr22	24199272	.	G	GAAAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=86,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:24199265_G_A:24199265:0,2,0,1
chr22	24199769	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:24199769_C_CG:24199769:0,1,0,4
chr22	24199792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=205,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:24199769_C_CG:24199769:0,4,0,2
chr22	24200397	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=110,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:14,3:13,2:9,18,2,3
chr22	24208752	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=118,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24208752_T_TCA:24208752:0,1,0,1
chr22	24208754	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=118,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24208752_T_TCA:24208752:0,1,0,1
chr22	24208759	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=118,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24208752_T_TCA:24208752:0,1,0,1
chr22	24208762	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:24208752_T_TCA:24208752:0,2,0,1
chr22	24208765	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:24208752_T_TCA:24208752:0,2,0,1
chr22	24210050	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr22	24226242	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=406,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr22	24227095	.	G	GCCTCCACCCTCTGAAAGTACCCAGTGTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr22	24237463	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,14:0,0,16,22
chr22	24323303	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,155;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr22	24325024	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:24325024_C_T:24325024:0,0,1,3
chr22	24325047	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:24325024_C_T:24325024:0,0,1,3
chr22	24376322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=212,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr22	24452885	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,305;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr22	24459438	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=51,90;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.878:22:0,8:2,12:1,1,11,9
chr22	24460711	.	T	TTTCTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr22	24468234	.	CTCCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,33;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:24468234_CTCCCT_C:24468234:3,1,0,1
chr22	24468243	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,33;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:24468234_CTCCCT_C:24468234:3,1,0,1
chr22	24480503	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr22	24492061	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:7,2:10,2:7,10,1,3
chr22	24551909	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	24563002	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:1,13,1,1
chr22	24573572	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.226:16:8,3:5,0:7,6,3,0
chr22	24573687	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=84,150;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.405:43:7,1:17,11:15,10,17,1
chr22	24583879	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,7,3
chr22	24621491	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr22	24640438	.	TCA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=139,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,3:5,4:15,2,7,0
chr22	24717850	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,11,9
chr22	24730587	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr22	24891292	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	24891440	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:15,5:10,0:14,11,5,0
chr22	24938908	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr22	24944053	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.910:9:0,3:0,3:0,0,1,8
chr22	24951086	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,468;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	24953571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr22	24963921	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,1:10,2:11,3,0,3
chr22	24988508	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	25003852	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=119,141;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,4:4,2:0|1:25003852_GGC_G:25003852:7,1,7,1
chr22	25003859	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=119,134;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:0|1:25003852_GGC_G:25003852:6,1,9,2
chr22	25003922	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=113,148;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:14,4:6,2:14,6,4,3
chr22	25004008	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,196;MMQ=55,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,2:9,3:4,11,0,5
chr22	25005953	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=149,151;MMQ=25,24;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:25005953_G_A:25005953:5,0,2,0
chr22	25005956	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=149,151;MMQ=25,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:25005953_G_A:25005953:5,0,2,0
chr22	25006031	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=173,167;MMQ=25,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:1,1:6,4:1,7,2,3
chr22	25006069	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=257,146;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,0:2,4:0,5,2,2
chr22	25007008	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=110,149;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:11,2:5,2:11,5,3,1
chr22	25007109	.	GGC	AAT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,147;MMQ=49,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:16,0:4,3:11,10,1,3
chr22	25007290	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=147,137;MMQ=60,28;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,0:6,15:1,10,0,15
chr22	25010670	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=160,216;MMQ=40,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:0|1:25010670_G_A:25010670:7,3,2,1
chr22	25010681	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=172,147;MMQ=39,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr22	25010682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=160,216;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:0|1:25010670_G_A:25010670:10,2,2,1
chr22	25010692	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=160,216;MMQ=40,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:6,1:4,1:0|1:25010670_G_A:25010670:10,2,2,1
chr22	25010828	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,82;MMQ=50,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.186:35:19,3:10,3:12,17,2,4
chr22	25010940	.	CGGT	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.177:39:7,0:5,1:25,7,0,7
chr22	25010979	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.431:19:4,5:6,3:10,1,8,0
chr22	25011027	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,85;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.285:33:10,7:14,2:0|1:25011027_C_T:25011027:14,10,5,4
chr22	25011031	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,85;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:10,6:15,1:0|1:25011027_C_T:25011027:15,10,3,4
chr22	25019313	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,194;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr22	25024040	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=149,175;MMQ=47,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:4,6:8,1:6,7,1,6
chr22	25024072	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=122,179;MMQ=40,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:7,6:7,0:0|1:25024072_G_T:25024072:12,2,1,5
chr22	25024076	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=126,179;MMQ=40,26;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:7,6:5,0:0|1:25024072_G_T:25024072:11,3,1,5
chr22	25115828	.	CTTGCACAGACTGACTCACAATAAAAAAGTCATACCTGGAAATATAGGACATGTGGGTATCAGCTCATT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.070:44:17,2:15,1:15,25,2,2
chr22	25123873	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=196,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr22	25124095	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr22	25129964	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,1:2,6:2,0,7,0
chr22	25147324	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:12,2,2,0
chr22	25150694	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr22	25154074	.	C	CAACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=135,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr22	25154097	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25154097_A_AC:25154097:0,0,0,1
chr22	25154098	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25154097_A_AC:25154097:0,0,0,1
chr22	25154101	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=257,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25154097_A_AC:25154097:0,1,0,1
chr22	25158547	.	T	TCCGTATAGTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25158547_T_TCCGTATAGTCTC:25158547:0,1,0,1
chr22	25158551	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25158547_T_TCCGTATAGTCTC:25158547:0,1,0,1
chr22	25251664	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:14,0:9,2:8,17,1,1
chr22	25255780	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=84,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,0:12,3:6,9,2,1
chr22	25255862	.	A	AGTCCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr22	25263240	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	25272453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr22	25275393	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=58,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,8:1,8:1,1,13,4
chr22	25291076	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=487,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:25291076_C_T:25291076:1,0,2,0
chr22	25291095	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:25291076_C_T:25291076:0,0,4,0
chr22	25291182	.	TTTC	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,16,10
chr22	25293971	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=66,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:0|1:25293971_G_A:25293971:11,8,0,2
chr22	25293978	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=80,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:25293971_G_A:25293971:10,12,0,2
chr22	25297742	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:25297742_G_C:25297742:3,0,3,0
chr22	25297755	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:5,1:3,2:1|0:25297742_G_C:25297742:7,1,3,0
chr22	25428768	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	25435579	.	G	GTGAGCGCTTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:0|1:25435579_G_GTGAGCGCTTT:25435579:8,6,0,2
chr22	25435586	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:25435579_G_GTGAGCGCTTT:25435579:8,6,0,2
chr22	25435587	.	G	GTCCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:0|1:25435579_G_GTGAGCGCTTT:25435579:8,6,0,2
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chr22	25437122	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:9,12,1,1
chr22	25437357	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:1,4,2,3
chr22	25445386	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=210,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25445386_A_AC:25445386:0,3,0,1
chr22	25445389	.	G	GGTCTCAAGTAATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=210,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25445386_A_AC:25445386:0,3,0,1
chr22	25577846	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	25586564	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr22	25597331	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr22	25601355	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=105,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:7,8,3,0
chr22	25625427	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,152;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25625427_C_CT:25625427:0,1,0,1
chr22	25625430	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=174,152;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25625427_C_CT:25625427:0,1,0,1
chr22	25625530	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=83,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,1:8,2:12,9,2,1
chr22	25625554	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,12:0,4:0,0,8,8
chr22	25713904	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=174,229;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:25713904_GG_CA:25713904:1,0,1,0
chr22	25713908	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=174,229;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25713904_GG_CA:25713904:1,0,1,0
chr22	25716068	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr22	25750814	.	C	CAGGGCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr22	25750873	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr22	25753321	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:11,2:12,3:10,13,3,2
chr22	26159129	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,4,4
chr22	26159289	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr22	26163996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=205,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr22	26164079	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr22	26165143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr22	26165177	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:4,0:6,3:6,4,0,4
chr22	26168519	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:26168519_C_G:26168519:1,3,0,1
chr22	26168521	.	G	GAGAGAACTAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:26168519_C_G:26168519:1,3,0,1
chr22	26168558	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	26173484	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	26219412	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr22	26219533	.	C	CTCGGCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:2,9,0,2
chr22	26222505	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=191,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,1,7
chr22	26228797	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr22	26239850	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=91,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:0,1,2,3
chr22	26239906	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	26239950	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	26270190	.	A	ACC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=C;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,1:0,0,5,1
chr22	26270206	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr22	26273850	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	26273889	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr22	26274053	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:9,2:3,12,0,2
chr22	26298754	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,3,5
chr22	26304491	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=58,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26304491_T_A:26304491:0,2,0,1
chr22	26304493	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=58,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26304491_T_A:26304491:0,2,0,1
chr22	26304495	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,34;MFRL=58,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26304491_T_A:26304491:0,2,0,1
chr22	26304497	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=58,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:26304491_T_A:26304491:0,2,0,1
chr22	26317155	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr22	26342056	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,4,4
chr22	26343805	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr22	26346311	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.414:13:5,3:2,2:6,2,4,1
chr22	26346484	.	A	ATGTGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=215,139;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=TG;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.353:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr22	26346517	.	TA	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr22	26348373	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:9,0:6,8:8,7,0,8
chr22	26690407	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=260,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:1,3:1,0,2,5
chr22	26701854	.	TTC	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=74,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:0,3:0,1,8,0
chr22	26702004	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:9,0:11,2:0|1:26702004_C_T:26702004:8,14,1,1
chr22	26702010	.	A	ATAAGGGACTAGT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=93,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:26702004_C_T:26702004:8,14,1,1
chr22	26702015	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=53,96;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.924:22:0,9:1,11:0,1,8,13
chr22	26706834	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=205,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr22	26747106	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=67,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,0:3,2:0|1:26747106_C_T:26747106:10,7,1,1
chr22	26747109	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:15,0:4,2:0|1:26747106_C_T:26747106:14,7,1,1
chr22	26830337	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=99,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:7,2:11,5:11,7,4,3
chr22	26853980	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=182,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr22	26854332	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=183,183;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr22	26854441	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:10,4:12,1:9,13,3,2
chr22	26861545	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:3,7,0,2
chr22	26862153	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:10,2:6,4:7,9,4,2
chr22	26868468	.	G	GATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=253,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:4,0:1,1:0,5,0,1
chr22	26868937	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.211:36:14,0:15,7:10,19,0,7
chr22	26882142	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr22	26884111	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,3:12,0:21,7,3,0
chr22	26884156	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=97,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:28,0:21,3:35,15,1,2
chr22	26886953	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.260:24:12,4:3,2:14,4,4,2
chr22	26886973	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.145:37:23,5:9,0:23,9,3,2
chr22	26887099	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,6,19
chr22	26895061	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=84,306;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:8,8,2,1
chr22	26895337	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,3:7,2:2,10,2,3
chr22	26906087	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=109,67;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.149:52:25,7:18,0:20,25,7,0
chr22	26906216	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=204,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,4:2,6:2,1,7,4
chr22	26936867	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,177;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,3:5,0:6,8,3,0
chr22	26937139	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.893:26:1,14:1,9:2,0,14,10
chr22	27004019	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=121,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:2,7,2,0
chr22	27004062	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,30;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:27004062_C_CCA:27004062:0,1,0,1
chr22	27004063	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27004062_C_CCA:27004062:0,1,0,1
chr22	27004065	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27004062_C_CCA:27004062:0,1,0,1
chr22	27008020	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,6,4
chr22	27008078	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:9,6:12,0:12,10,5,1
chr22	27018633	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.772:2:0,0:0,2:0|1:27018633_G_T:27018633:0,0,1,1
chr22	27018636	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:27018633_G_T:27018633:0,0,1,1
chr22	27018640	.	G	GTGATCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:27018633_G_T:27018633:0,0,1,1
chr22	27019154	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=270,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,2:1,6:2,0,7,1
chr22	27019374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,1,7
chr22	27021358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr22	27021409	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=220,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr22	27021425	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,2:0,0,8,4
chr22	27021457	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0,0,11,6
chr22	27021589	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.740:17:4,4:0,9:1,3,6,7
chr22	27024312	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:7,7,2,0
chr22	27026286	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=2684647,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:1,8:1,5:0,2,11,3
chr22	28195602	.	ATGC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGC;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:3,3:6,0:5,6,2,1
chr22	28292672	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,0:2,2:0,7,1,1
chr22	28379785	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:13,5:5,0:6,12,5,0
chr22	28394471	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,130;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:13,2:2,0:15,0,2,0
chr22	28395314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.368:11:6,2:1,1:1,6,1,3
chr22	28410273	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:20,3:6,0:16,10,3,0
chr22	29091037	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr22	29117550	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=118,86;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,4:0.069:70:21,2:44,1:0|1:29117550_A_C:29117550:33,33,2,2
chr22	29117553	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=8;MBQ=23,24;MFRL=110,86;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,4:0.066:73:22,3:42,1:0|1:29117550_A_C:29117550:35,34,2,2
chr22	29117563	.	CC	TT	.	.	DP=76;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=108,86;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,2:0.040:72:24,2:46,0:30,40,1,1
chr22	29117624	.	TA	T,TAA	.	.	DP=66;ECNT=8;MBQ=25,26,27;MFRL=107,105,127;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=8.95,11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,10,5:0.187,0.121:47:18,1,1:12,9,2:2,30,2,13
chr22	29117637	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:22,2:25,1:0|1:29117637_A_T:29117637:4,44,0,3
chr22	29117639	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=24,31;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:20,2:22,1:0|1:29117637_A_T:29117637:3,44,0,3
chr22	29117642	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:18,2:19,1:0|1:29117637_A_T:29117637:3,41,0,3
chr22	29117643	.	A	AG	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=23,22;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:19,2:19,1:0|1:29117637_A_T:29117637:3,38,0,3
chr22	29121295	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=78,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:25,0:11,4:18,18,0,4
chr22	29130347	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr22	29130790	.	C	CGGGCTGCAGATTAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr22	29153175	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:27,0:16,4:21,22,0,4
chr22	29442731	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,5:10,0:13,4,5,0
chr22	29444575	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:0,0:7,5:0,7,0,5
chr22	29446762	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:4,11,0,2
chr22	29456733	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=169,92;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.370:22:11,5:2,2:7,7,5,3
chr22	29490497	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr22	29521313	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:13,2:10,0:0|1:29521313_C_T:29521313:11,12,1,1
chr22	29521322	.	A	ATTTAGAACCCACTTTTTG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:0|1:29521313_C_T:29521313:10,13,1,1
chr22	29538193	.	CCCTCCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	29626933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,1,1
chr22	29651161	.	CG	TC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=236,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr22	29651174	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,26;MFRL=312,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:29651174_T_TG:29651174:1,0,1,0
chr22	29651176	.	C	CCCCA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=11,12;MFRL=165,312;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:29651176_C_CCCCA:29651176:1,0,1,0
chr22	29651179	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr22	29651183	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=14,34;MFRL=312,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:29651174_T_TG:29651174:1,0,1,0
chr22	29651186	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=165,312;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29651176_C_CCCCA:29651176:1,0,1,0
chr22	29651187	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:29651174_T_TG:29651174:0,0,1,0
chr22	29651197	.	G	GGGACCCC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,16;MFRL=131,312;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:29651176_C_CCCCA:29651176:2,2,1,0
chr22	29669648	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,7:1,5:3,0,10,2
chr22	29669693	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,30:0.931:32:1,15:0,13:0,2,20,10
chr22	29683213	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,165;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,0:6,9:2,9,0,9
chr22	29687461	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=125,126;MMQ=60,28;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.438:32:3,13:15,0:14,4,14,0
chr22	29706397	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,0:11,4:12,6,2,2
chr22	29707639	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	29727886	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr22	29735661	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=64,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:29735661_G_C:29735661:2,0,2,0
chr22	29735667	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=64,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:29735661_G_C:29735661:2,0,2,0
chr22	29735672	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,0:2,0:0|1:29735661_G_C:29735661:3,1,2,0
chr22	29746164	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,78;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr22	29750954	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr22	29754988	.	C	CGTCCTCGCTCAAGTTCACCAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.596:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr22	29763090	.	T	TGGTATGTGTTTTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,47;MMQ=52,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:4,0:6,0,1,1
chr22	29837537	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,53;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,11:0,0,13,11
chr22	29837566	.	TTCC	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=77.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.958:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr22	29837595	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=101,57;MMQ=47,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:13,11,0,3
chr22	29879265	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=109,149;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:2,0:0,4:2,0,4,1
chr22	29881884	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr22	29886413	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=110,111;MMQ=60,52;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,46:0.943:48:0,25:1,20:1,1,32,14
chr22	29886484	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,93;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:37,2:42,1:52,29,0,3
chr22	29904354	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,0:0,4:0,0,5,1
chr22	29907032	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr22	29908154	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=70,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:3,7:2,4:2,3,4,7
chr22	29915144	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0,4,1,4
chr22	29924160	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:7,0:11,2:0|1:29924160_G_T:29924160:3,16,1,1
chr22	29924168	.	TGGACAAAGGAAA	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:29924160_G_T:29924160:3,16,1,1
chr22	29924186	.	AA	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=136,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:29924160_G_T:29924160:2,10,1,1
chr22	29925284	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,4:1,5:0,1,1,8
chr22	29938752	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:12,0,3,0
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chr22	29939045	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:29939044_G_GCAAAATATTTAACAAAA:29939044:0,3,0,1
chr22	29939336	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=180,200;MMQ=40,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=25,24;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.341:7:0,1:4,1:5,0,2,0
chr22	29939362	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.264:12:4,0:3,0:6,3,2,1
chr22	29957135	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,4:2,2:3,1,5,1
chr22	29957321	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=274,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr22	29957911	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:2,3:5,2:0,8,1,4
chr22	29966083	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=73,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:4,4,3,0
chr22	30032900	.	A	AAGCAATAAAATGG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,2:12,0:0|1:30032900_A_AAGCAATAAAATGG:30032900:7,14,1,1
chr22	30032902	.	G	GTGAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,1:12,0:0|1:30032900_A_AAGCAATAAAATGG:30032900:7,14,1,1
chr22	30038152	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.741:24:4,8:1,9:4,2,13,5
chr22	30051705	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=21,33,32;MFRL=95,193,158;MMQ=60,60,60;MPOS=31,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.69,6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.173,0.406:12:2,2,2:2,1,1:1,4,4,3
chr22	30077361	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	30124968	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr22	30185187	.	AACCC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACCC;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:5,12,0,2
chr22	30185192	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:8,1:7,0:4,11,0,3
chr22	30228410	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,2,1
chr22	30367073	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.267:15:3,3:7,1:0,11,1,3
chr22	30384577	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:14,1:5,1:0|1:30384577_G_GT:30384577:7,12,0,2
chr22	30384578	.	C	CTGTGATTTCTTTCAGCAG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:14,1:4,1:0|1:30384577_G_GT:30384577:7,13,0,2
chr22	30394731	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=80,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.777:15:3,2:0,10:2,1,8,4
chr22	30398960	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:14,2:0|1:30398960_C_T:30398960:13,15,1,1
chr22	30398966	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:13,2:0|1:30398960_C_T:30398960:13,15,1,1
chr22	30405151	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,2,12
chr22	30412465	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=95,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:10,4,3,2
chr22	30418161	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr22	30499553	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr22	30500536	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr22	30507685	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:15,1,3,1
chr22	30508607	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr22	30639769	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:15,0:8,4:13,10,2,2
chr22	30640849	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,27:0.848:31:2,15:2,10:2,2,12,15
chr22	30660517	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr22	30661159	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,0:10,5:1,17,0,5
chr22	30661184	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=38,25;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:0,7:5,5:0,5,0,12
chr22	30681797	.	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=76,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.657:20:4,3:2,3:6,1,10,3
chr22	30682404	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.722:15:1,7:2,4:0,4,0,11
chr22	30683285	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=229,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:0,6:2,6:1,1,6,7
chr22	30685254	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,17;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:1,3,1,0
chr22	30685318	.	CGG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=207,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:30685318_CGG_C:30685318:3,4,1,1
chr22	30685322	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=207,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:30685318_CGG_C:30685318:3,4,1,1
chr22	30690895	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:6,0:0|1:30690895_A_C:30690895:1,11,3,0
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chr22	30730711	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr22	30731387	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:5,0,8,2
chr22	30733111	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,6:0,7:0,1,9,5
chr22	30733149	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:30733149_C_T:30733149:10,10,1,1
chr22	30733162	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:30733149_C_T:30733149:9,11,1,1
chr22	30734716	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,8,1
chr22	30735336	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,28;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:30735336_TGG_T:30735336:0,1,0,1
chr22	30735340	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30735336_TGG_T:30735336:0,1,0,1
chr22	30736147	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:6,3,2,0
chr22	30738161	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,0:11,4:12,5,3,1
chr22	30738737	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr22	30741086	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:10,0:11,8,0,2
chr22	30748867	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr22	30748901	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:7,1,3,0
chr22	30752696	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:12,3:6,1:12,6,3,1
chr22	30761939	.	CG	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	30762857	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=222,210;MMQ=43,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:30762857_G_A:30762857:0,2,0,1
chr22	30762865	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=222,153;MMQ=43,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:30762857_G_A:30762857:0,2,1,1
chr22	30762875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=222,153;MMQ=43,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:30762857_G_A:30762857:0,2,1,1
chr22	30765502	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr22	30767536	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr22	30767729	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=62,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,4:6,7:3,5,4,7
chr22	30767781	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr22	30768197	.	TGGCCAGCAGGTCTGCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:2,1:0,0:0,4,0,1
chr22	30769901	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:2,5:0,3:0|1:30769901_G_C:30769901:1,1,8,1
chr22	30769906	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=87,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.716:12:3,5:0,4:0|1:30769901_G_C:30769901:2,1,8,1
chr22	30771458	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=247,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr22	30776095	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=86,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,13:1,2:3,4,10,5
chr22	30776097	.	C	CTTGGAAGG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:16,2:4,0:0|1:30776097_C_CTTGGAAGG:30776097:11,9,1,1
chr22	30776099	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:16,1:4,0:0|1:30776097_C_CTTGGAAGG:30776097:12,10,1,1
chr22	30776419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:3,5,1,4
chr22	30793270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr22	30794788	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,127;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,0:14,2:11,16,0,2
chr22	30802444	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,0:3,6,1,2
chr22	30812461	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=105,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr22	30812549	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr22	30822920	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	30822999	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,12;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:30822999_A_C:30822999:1,0,1,0
chr22	30823001	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:30822999_A_C:30822999:1,0,1,0
chr22	30823003	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,14;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:30822999_A_C:30822999:2,0,1,0
chr22	30823009	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30822999_A_C:30822999:2,0,1,0
chr22	30824481	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=98,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,0:11,3:12,12,0,3
chr22	30845260	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:6,2:2,10,0,2
chr22	30864437	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr22	30864692	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,5,4
chr22	30864867	.	A	AACTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr22	30864897	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	30866326	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	30921939	.	G	GAGCCTCTAGCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,215;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	30927975	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr22	30929905	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr22	30930080	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=92,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:4,4,0,4
chr22	30953202	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:30953202_A_C:30953202:3,0,1,0
chr22	30953204	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=17,18;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:30953202_A_C:30953202:3,0,1,0
chr22	30953213	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:0,1:2,0,3,0
chr22	30953223	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=105,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:3,0:6,1,2,0
chr22	30973146	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=96,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.641:17:1,5:3,6:0|1:30973146_AG_A:30973146:3,3,6,5
chr22	30973167	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,5:0.362:13:1,0:5,1:1|0:30973146_AG_A:30973146:4,4,0,5
chr22	30975134	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=124,69;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:6,3:3,0:9,3,2,1
chr22	30976702	.	G	GATCCAATTTCAGCTAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,138;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,1:8,1:3,9,0,2
chr22	30987829	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=122,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,2:5,0:0|1:30987829_G_A:30987829:8,10,1,1
chr22	30987834	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:30987829_G_A:30987829:7,8,1,1
chr22	30987861	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr22	30987933	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr22	31011557	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=497,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,5:1,0,6,3
chr22	31011610	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr22	31013296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=46,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.407:12:1,0:6,3:2,5,3,2
chr22	31018938	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:7,0:16,4:13,10,0,4
chr22	31022590	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr22	31032836	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.212:25:9,2:8,2:11,9,2,3
chr22	31042535	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr22	31089958	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.727:25:3,4:2,6:3,4,9,9
chr22	31090067	.	T	TCCACAACTA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:12,0:10,4:7,17,2,2
chr22	31285273	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,10;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:31285273_G_C:31285273:0,1,0,1
chr22	31285277	.	G	GAGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,29;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:31285273_G_C:31285273:0,1,0,1
chr22	31285462	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=109,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:31285462_C_T:31285462:8,8,2,0
chr22	31285465	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=109,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:31285462_C_T:31285462:8,8,2,0
chr22	31285605	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,0:9,3:6,12,1,2
chr22	31301734	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	31329056	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,282;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr22	31329414	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,1:1,0:2,6,2,0
chr22	31333788	.	CC	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:9,9:10,0:12,7,9,0
chr22	31338020	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=153,126;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:6,4:0|1:31338020_A_C:31338020:7,12,0,4
chr22	31338027	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=153,126;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,0:9,4:0|1:31338020_A_C:31338020:6,12,0,4
chr22	31486166	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:31486166_G_T:31486166:5,12,0,2
chr22	31486173	.	G	GGTATAGGAAGC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:31486166_G_T:31486166:5,11,0,2
chr22	31486176	.	CC	AG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:0|1:31486166_G_T:31486166:5,11,0,2
chr22	31486911	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:4,7:1,11:4,1,7,12
chr22	31493210	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=93,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,3:11,0:14,9,2,1
chr22	31496770	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=212,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:31496770_C_T:31496770:2,0,1,0
chr22	31496780	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=213,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31496770_C_T:31496770:1,0,1,0
chr22	31496809	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	31497054	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	31501274	.	TGGAGGTGGTGTTAAGGAGCGGGGTGGTGGGCAGAG	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.093:32:14,0:9,2:10,20,1,1
chr22	31503592	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	31521155	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:2,5:4,4:3,3,7,2
chr22	31529043	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:2,6:0,10:2,0,11,5
chr22	31529679	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=90,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:12,0:12,7,2,1
chr22	31529772	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,2,5
chr22	31532568	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=293,240;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr22	31532608	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr22	31532766	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:31532766_G_A:31532766:5,12,1,1
chr22	31532776	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=107,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:4,0:0|1:31532766_G_A:31532766:4,10,1,1
chr22	31533045	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:18,0:18,4:16,20,0,4
chr22	31583007	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,0:9,4:7,4,4,0
chr22	31591433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr22	31600460	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=87,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,13:0.298:45:11,9:20,3:21,11,8,5
chr22	31608344	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=92,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.240:51:8,11:31,0:27,12,12,0
chr22	31608388	.	C	CCA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.097:49:19,0:26,4:0|1:31608388_C_CCA:31608388:19,26,2,2
chr22	31608391	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.079:48:19,0:24,2:0|1:31608388_C_CCA:31608388:19,26,1,2
chr22	31658259	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=104,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:12,2:12,0:11,13,0,2
chr22	31658281	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:3,8,1,3
chr22	31663841	.	T	TGCGGCA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=131,63;MMQ=60,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:10,2:9,0:0|1:31663841_T_TGCGGCA:31663841:7,12,1,1
chr22	31663842	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,1:7,2:7,11,1,2
chr22	31663843	.	C	CCCTCTGA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=131,63;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,1:9,0:0|1:31663841_T_TGCGGCA:31663841:7,12,1,1
chr22	31663911	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=100,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	31672676	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=160,214;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	31679286	.	AAAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:3,3:1,7,1,3
chr22	31685129	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:1,2:8,4:6,3,4,2
chr22	31685458	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:2,1:7,1:7,2,2,1
chr22	31687142	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,9,17
chr22	31687313	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,7,18
chr22	31737304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,265;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	31795769	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=112,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:23,2:19,2:15,27,1,3
chr22	31796563	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,3:6,1:12,1,4,0
chr22	31798914	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,8:5,0:11,0,8,0
chr22	31819212	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr22	31822680	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:10,7,1,1
chr22	31835772	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	31843567	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.624:14:1,4:4,4:3,2,2,7
chr22	31844293	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,4:1,6:0,3,1,9
chr22	31851391	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=191,134;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31851391_T_TG:31851391:0,4,0,1
chr22	31851393	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=191,134;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31851391_T_TG:31851391:0,4,0,1
chr22	31854434	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=124,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.849:18:1,4:1,12:0,2,11,5
chr22	31854677	.	T	TGGTGCTGCGATAACTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=97,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr22	31859637	.	TAA	T,TA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=22,24,25;MFRL=133,139,117;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,20,21;RU=A;STR;TLOD=3.90,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,6:0.221,0.370:18:1,0,1:3,4,4:3,5,4,6
chr22	31859720	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,6:0.083:81:21,4:52,2:21,54,0,6
chr22	31904170	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:7,5,6,7
chr22	31926475	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr22	31926612	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:10,7,0,2
chr22	31926725	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr22	31946165	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,114;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,1:0|1:31946165_A_G:31946165:6,0,4,0
chr22	31946168	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=166,114;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:2,2:0|1:31946165_A_G:31946165:6,0,4,0
chr22	31971172	.	A	ATCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr22	31976235	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:8,3,5,0
chr22	32002294	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	32011199	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=299,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32011199_A_C:32011199:0,1,0,1
chr22	32011219	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:32011199_A_C:32011199:0,0,0,1
chr22	32011305	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=1431,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32011305_A_T:32011305:0,1,0,1
chr22	32011306	.	C	CCATCTCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=1431,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32011305_A_T:32011305:0,1,0,1
chr22	32014250	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:14,1:4,2:9,9,2,1
chr22	32016773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:32016773_A_G:32016773:0,3,0,1
chr22	32016779	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32016773_A_G:32016773:0,3,0,1
chr22	32044166	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=104.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.868:43:1,16:4,22:3,2,22,16
chr22	32081436	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,127;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr22	32084273	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=171,241;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:32084273_A_T:32084273:0,4,0,1
chr22	32084275	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=171,241;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:32084273_A_T:32084273:0,4,0,1
chr22	32084287	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=171,241;MMQ=58,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:32084287_T_C:32084287:0,4,0,1
chr22	32084288	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=171,241;MMQ=58,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:32084287_T_C:32084287:0,4,0,1
chr22	32084301	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32084301_G_T:32084301:0,4,0,1
chr22	32084306	.	T	TGGTGC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32084301_G_T:32084301:0,4,0,1
chr22	32084308	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32084301_G_T:32084301:0,4,0,1
chr22	32097844	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=235,179;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:0,1:0|1:32097844_T_A:32097844:0,2,0,1
chr22	32097846	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=235,179;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32097844_T_A:32097844:0,2,0,1
chr22	32097848	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=235,179;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32097844_T_A:32097844:0,2,0,1
chr22	32099734	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:32099734_T_A:32099734:1,4,1,1
chr22	32099739	.	GGG	CAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:32099734_T_A:32099734:1,4,1,1
chr22	32100550	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:3,4:2,3:7,0,7,0
chr22	32108824	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=98,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:12,1:15,5:17,10,3,3
chr22	32108968	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:12,2:15,7,2,0
chr22	32110943	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:10,3:12,5:10,12,5,3
chr22	32111338	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:15,0:12,16,3,0
chr22	32112461	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,5:12,1:10,12,3,3
chr22	32113164	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,8:0.163:53:29,6:15,2:20,25,3,5
chr22	32121625	.	G	GCAATATCATAA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.207:12:2,0:8,2:0|1:32121625_G_GCAATATCATAA:32121625:5,5,1,1
chr22	32121626	.	G	C,GACTTCATCTCCACAAA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,29,34;MFRL=220,139,67;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.58,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,2:0.606,0.194:12:1,1,0:1,7,1:1,1,5,5
chr22	32121627	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.207:12:2,0:8,1:0|1:32121625_G_GCAATATCATAA:32121625:5,5,1,1
chr22	32121677	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr22	32121700	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=239,172;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr22	32154502	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:1,8:3,3:0,4,9,2
chr22	32173977	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:16,0,2,0
chr22	32179850	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,15:0,5:0,0,13,7
chr22	32198831	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:19,0:10,2:0|1:32198831_C_T:32198831:8,21,1,1
chr22	32198837	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:8,2:0|1:32198831_C_T:32198831:6,19,1,1
chr22	32198862	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,0:4,3:5,10,0,3
chr22	32200715	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32200715_A_G:32200715:2,0,1,0
chr22	32200718	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=187,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:32200715_A_G:32200715:4,0,1,0
chr22	32200724	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=129,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr22	32211371	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:4,1:2,0:5,4,1,2
chr22	32211412	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr22	32229977	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=80,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.292:39:20,6:8,5:17,11,5,6
chr22	32346468	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,8:0,4:0,1,4,8
chr22	32352726	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:3,0:12,2:9,6,1,1
chr22	32352791	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=13439,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,2:3,7:0,4,4,5
chr22	32445917	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,100;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:12,0:14,4:16,10,0,4
chr22	32463875	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,17:1,8:1,0,21,4
chr22	32463966	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:20,3:12,0:19,14,2,1
chr22	32477890	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=94,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:8,0:8,12,1,1
chr22	32477897	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:9,2:6,1:5,10,2,2
chr22	32478972	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr22	32482321	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=112,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:20,1:10,5:13,17,2,4
chr22	32505996	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=105,274;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,10:4,0:7,2,10,0
chr22	32545501	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:2,3:3,0,5,2
chr22	32545849	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr22	32546946	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,105;MMQ=60,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.226:42:16,2:17,7:14,19,4,5
chr22	32547983	.	AC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:14,3:11,1:15,11,1,3
chr22	32548036	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:13,7,0,2
chr22	32554985	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,30:0.862:34:0,9:4,21:2,2,11,19
chr22	32587020	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,233;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,0:17,3:15,17,0,3
chr22	32588981	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:13,4:5,5:13,5,0,9
chr22	32589034	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=102,157;MMQ=60,55;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:3,5,2,1
chr22	32590449	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,2:13,1:9,18,1,2
chr22	32598367	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=101,28;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:0|1:32598367_CA_C:32598367:5,16,1,1
chr22	32598371	.	A	ACACTCCTC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=101,28;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:32598367_CA_C:32598367:5,16,1,1
chr22	32614430	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=158,245;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,0:0|1:32614430_T_A:32614430:0,1,1,0
chr22	32614435	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=204,245;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32614430_T_A:32614430:1,1,1,0
chr22	32614439	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=204,245;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,0:0|1:32614430_T_A:32614430:1,1,1,0
chr22	32616877	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:8,6,3,0
chr22	32617062	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,381;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:0,10,1,1
chr22	32644894	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=88,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr22	32650053	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=112,78;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:2,0:6,4,1,1
chr22	32756830	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:2,2:8,1:2,8,1,2
chr22	32763635	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:5,0:4,3:8,1,3,0
chr22	32764388	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	32764506	.	TCACTTGCC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:13,0:15,8,1,1
chr22	32788402	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	32791003	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=89,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:6,9:0,8:4,2,9,8
chr22	32795641	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,31:0.889:34:1,16:2,15:1,2,16,15
chr22	32802574	.	CTG	AGA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=156,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:13,1,1,1
chr22	32802597	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,2:9,1:11,7,2,1
chr22	32802598	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:0|1:32802598_G_A:32802598:13,9,1,1
chr22	32802604	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,1:13,0:0|1:32802598_G_A:32802598:13,11,1,1
chr22	32804313	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr22	32804656	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:0|1:32804656_G_A:32804656:3,0,8,1
chr22	32804665	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,9:2,1:0|1:32804656_G_A:32804656:4,0,9,1
chr22	32808078	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.813:25:1,7:3,12:3,1,13,8
chr22	32810268	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,5:11,0:11,9,5,0
chr22	32811952	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.744:29:4,11:3,11:2,5,10,12
chr22	32812066	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=153,127;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr22	32813007	.	CAGCCGATGCAGATGTTAAATGTT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=90,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:15,0:7,2:28,10,1,1
chr22	32813176	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.355:8:3,1:2,2:3,2,2,1
chr22	32815398	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=84,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.808:29:4,10:1,14:2,3,8,16
chr22	32833663	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32833663_G_C:32833663:1,0,1,0
chr22	32833668	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32833663_G_C:32833663:1,0,1,0
chr22	32841503	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=152,177;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chr22	32842072	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=350,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr22	32853472	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=264,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	32881046	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=96,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:10,3:11,13,2,1
chr22	32891355	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:2,1:3,1:0|1:32891355_G_GT:32891355:8,0,2,0
chr22	32891371	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=13,14;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:2,0:0|1:32891355_G_GT:32891355:8,0,2,0
chr22	32894435	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:13,0:10,3:8,15,0,3
chr22	32937740	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,5:0,7:0,1,3,9
chr22	33253283	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:13,0:15,4:12,16,4,0
chr22	33562887	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr22	33679332	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=99,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:33679332_T_G:33679332:4,7,0,2
chr22	33679334	.	CC	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=99,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:33679332_T_G:33679332:4,7,0,2
chr22	35463162	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,11,6
chr22	35463179	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.881:14:1,7:0,6:1,0,9,4
chr22	35478486	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr22	35478685	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr22	35478688	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=90,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,0,6
chr22	35481776	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	35684429	.	CAGTTTCCCATAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=102,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGTTTCCCATAT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:3,0:3,8,1,1
chr22	35713997	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,120;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:2,8,0,3
chr22	35783074	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=93,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:7,3:16,0:9,14,1,2
chr22	35804414	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=101,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:14,5,1,3
chr22	35810009	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=183,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:35810009_T_G:35810009:1,4,1,1
chr22	35810011	.	G	GTTCAAGCGATTCTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=183,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:35810009_T_G:35810009:1,4,1,1
chr22	35810052	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr22	36006923	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,18:0,0,16,12
chr22	36055523	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,7:0.110:58:22,1:17,1:0|1:36055523_G_C:36055523:38,13,0,7
chr22	36055527	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=95,102;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:52,5:0.101:57:24,5:25,0:1|0:36055523_G_C:36055523:32,20,5,0
chr22	36113801	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36113801_G_A:36113801:0,0,1,0
chr22	36113805	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36113801_G_A:36113801:0,0,1,0
chr22	36114047	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:36114047_C_T:36114047:0,0,0,1
chr22	36114054	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36114047_C_T:36114047:0,0,0,1
chr22	36114065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	36116535	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=163,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr22	36122930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=51,97;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,8:1,4:1,1,10,2
chr22	36152245	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:0|1:36152245_C_A:36152245:1,15,1,1
chr22	36152248	.	T	TTGTGATGTGTGTACTTAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:5,0:0|1:36152245_C_A:36152245:1,15,1,1
chr22	36424450	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	36537500	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=55,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,6:0,8:1,1,7,7
chr22	36537763	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,1,1
chr22	36537893	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:11,5,1,2
chr22	36541725	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr22	36545016	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr22	36550537	.	CAAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:2,4:3,1,8,0
chr22	36556964	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr22	36587845	.	A	ACT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=96,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:2,0:9,2:4,7,2,1
chr22	36593628	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.258:13:3,1:7,2:0|1:36593628_A_AC:36593628:8,2,3,0
chr22	36593640	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,1:8,3:0|1:36593628_A_AC:36593628:9,6,3,1
chr22	36629077	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	36649966	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=98,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:12,6:14,5:13,13,5,6
chr22	36650956	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,83;MMQ=60,51;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.099:47:17,4:25,0:19,24,1,3
chr22	36653275	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:10,4:2,4:5,7,2,6
chr22	36653543	.	CGG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=118,60;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:9,2:0|1:36653543_CGG_C:36653543:3,9,1,1
chr22	36653546	.	A	ATC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=118,60;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:11,2:0|1:36653543_CGG_C:36653543:3,9,1,1
chr22	36653548	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=118,60;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:11,2:0|1:36653543_CGG_C:36653543:3,9,1,1
chr22	36653552	.	TAG	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=118,60;MMQ=60,45;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:10,1:0|1:36653543_CGG_C:36653543:3,9,1,1
chr22	36657596	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr22	36657628	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr22	36657789	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr22	36661149	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,9:0,15:0|1:36661149_A_G:36661149:0,0,18,9
chr22	36661152	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,11:0,14:0|1:36661149_A_G:36661149:0,0,18,9
chr22	36661536	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,15,15
chr22	36661566	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,14,14
chr22	36662141	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	36680429	.	TGCCCCACCAGC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:5,2:13,3,1,1
chr22	36681971	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=71,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:5,10,0,2
chr22	36684331	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:9,2:9,5:15,4,5,2
chr22	36690113	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,5604192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	36690445	.	A	ATTATCTCAGAGCCACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=128,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr22	36691607	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,12,13
chr22	36691832	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr22	36691841	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36691841_G_GA:36691841:0,1,0,1
chr22	36691844	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36691841_G_GA:36691841:0,1,0,1
chr22	36695173	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	36696154	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:4,0:7,1,1,1
chr22	36698692	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:11,9,1,2
chr22	36700027	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.817:20:1,8:2,8:2,1,12,5
chr22	36705529	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr22	36708084	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr22	36708338	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr22	36710183	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,20,11
chr22	36712472	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr22	36717001	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=53,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.562:9:2,3:1,1:0,4,0,5
chr22	36722534	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr22	36863785	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,4:2,5:2,0,7,2
chr22	36872750	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr22	36877695	.	G	GGA	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,31:0.234:132:46,18:53,13:77,24,22,9
chr22	36886387	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:36886387_CAA_C:36886387:1,2,1,1
chr22	36886390	.	T	TTCCCCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:36886387_CAA_C:36886387:1,2,1,1
chr22	36886391	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:36886387_CAA_C:36886387:1,2,1,1
chr22	36886395	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:36886387_CAA_C:36886387:0,2,1,1
chr22	36886398	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=227,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:36886387_CAA_C:36886387:0,1,1,1
chr22	36889930	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=94,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr22	36894283	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	36907098	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:6,5:12,3:5,13,2,6
chr22	36912630	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:9,1:17,4:9,17,2,3
chr22	36915366	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,3:1,3:3,0,6,1
chr22	36919343	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=141,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,2:13,1:7,14,1,2
chr22	36919393	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=143,72;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,1:0,12,0,2
chr22	36919854	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:9,1,4,1
chr22	36920099	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr22	36920834	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=177,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr22	36921614	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr22	36922052	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:9,5:14,3:15,8,8,0
chr22	36922205	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=116,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:5,13,1,3
chr22	36922262	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=290,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr22	36962353	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr22	36962629	.	CG	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	36983404	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr22	36983428	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,6,0
chr22	37098348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=151,287;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37098348_G_A:37098348:1,0,1,0
chr22	37098371	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:37098348_G_A:37098348:3,0,1,0
chr22	37162141	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=86,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,2:10,0:12,6,1,1
chr22	37163329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,5,8
chr22	37171611	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr22	37196871	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,10:0,0,21,8
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chr22	37196957	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=114,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:13,2:24,0:0|1:37196953_G_GC:37196953:17,21,1,1
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chr22	37263618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=222,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr22	37268079	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
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chr22	37271882	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,22:0,0,19,20
chr22	37272008	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.246:27:7,1:13,2:4,17,6,0
chr22	37318426	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,3:0,0,1,6
chr22	37319400	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=131,65;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,5:0.107:53:26,3:21,2:0|1:37319400_G_A:37319400:23,25,2,3
chr22	37319425	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=115.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,23:0,12:0|1:37319400_G_A:37319400:0,0,17,24
chr22	37321973	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,4:1,7:3,1,7,4
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chr22	37331305	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:7,0,3,0
chr22	37387461	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr22	37387505	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=134,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,4:3,7:5,3,9,3
chr22	37396040	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=130,99;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:6,0:7,3:0|1:37396040_A_T:37396040:4,10,0,4
chr22	37396044	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=130,99;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,0:8,4:0|1:37396040_A_T:37396040:4,10,0,4
chr22	37407403	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:3,7,1,1
chr22	37407413	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:0,1:2,1:2,4,0,3
chr22	37425201	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr22	37449061	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37449061_C_A:37449061:1,0,1,0
chr22	37449069	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37449061_C_A:37449061:2,0,1,0
chr22	37458461	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr22	37464624	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=91,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:5,9,2,1
chr22	37470604	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr22	37491573	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=95,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.094:42:19,2:18,2:25,13,1,3
chr22	37494420	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,3:1,1:0,1,2,2
chr22	37524281	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:7,0:12,5:8,12,3,3
chr22	37528576	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr22	37528606	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr22	37531376	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:15,2:18,4:8,26,1,5
chr22	37532346	.	GC	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr22	37533530	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr22	37581383	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:2,11:4,7:0,6,4,14
chr22	37602583	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr22	37627941	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.192:22:10,1:7,2:12,6,2,2
chr22	37628053	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.771:20:3,8:1,6:2,2,5,11
chr22	37628145	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr22	37678551	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.852:22:0,9:2,10:0,3,16,3
chr22	37678565	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.716:26:4,7:2,12:3,4,15,4
chr22	37693788	.	GA	TC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,0:0|1:37693788_GA_TC:37693788:0,2,0,1
chr22	37693789	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,30;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.495:2:0,0:1,1:1|0:37693788_GA_TC:37693788:0,1,0,1
chr22	37693790	.	T	TTTGA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:37693788_GA_TC:37693788:0,2,0,1
chr22	37693791	.	G	GCGTGTAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37693788_GA_TC:37693788:0,2,0,1
chr22	37693793	.	G	GAGTTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:37693788_GA_TC:37693788:0,2,0,1
chr22	37693795	.	AG	TA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:37693788_GA_TC:37693788:0,2,0,1
chr22	37695256	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr22	37699197	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr22	37707126	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=97,58;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:0|1:37707126_C_T:37707126:9,14,1,1
chr22	37707150	.	C	CAGAGCCATCGGCCAGGTACCAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=104,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:37707126_C_T:37707126:6,12,1,1
chr22	37707962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr22	37708004	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,5:0,11:0,1,10,6
chr22	37873104	.	A	ACTCCCCAGCTAAATCCCTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=185,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:37873104_A_ACTCCCCAGCTAAATCCCTCT:37873104:0,4,0,1
chr22	37873110	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=185,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:37873104_A_ACTCCCCAGCTAAATCCCTCT:37873104:0,4,0,1
chr22	37873112	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=185,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:37873104_A_ACTCCCCAGCTAAATCCCTCT:37873104:0,4,0,1
chr22	37882136	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:5,1:1,1:3,4,2,0
chr22	37888369	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	37888868	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr22	37900141	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:7,2:6,13,0,2
chr22	37902177	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr22	37903853	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:11,2:15,1:16,10,1,3
chr22	37904957	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,12,5
chr22	37966554	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:15,0:18,2:0|1:37966554_C_T:37966554:20,14,1,1
chr22	37966571	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:18,0:19,2:0|1:37966554_C_T:37966554:23,19,1,1
chr22	38021125	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.324:26:11,0:5,8:5,13,0,8
chr22	38037407	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=106,174;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,11:0.165:64:25,8:27,0:33,20,11,0
chr22	38037433	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:22,2:23,1:23,23,2,1
chr22	38039835	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.345:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr22	38041015	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:3,4:0,4,2,2
chr22	38043199	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:8,0,1,1
chr22	38043520	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:38043520_C_T:38043520:6,9,1,1
chr22	38043532	.	A	ATCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:38043520_C_T:38043520:6,8,1,1
chr22	38043536	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:38043520_C_T:38043520:5,8,1,1
chr22	38046814	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,261;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:0,10,0,3
chr22	38055377	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr22	38061803	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,0:13,2:5,13,1,1
chr22	38062112	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:5,8,1,1
chr22	38062259	.	TGGCCCTTG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:8,0:17,2:12,15,1,1
chr22	38071731	.	AC	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.166:44:18,4:13,3:17,20,3,4
chr22	38072914	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.205:28:6,1:12,0:3,19,6,0
chr22	38072920	.	AG	CC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:8,2:12,1:0|1:38072920_AG_CC:38072920:6,18,3,0
chr22	38072924	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:8,1:12,0:0|1:38072920_AG_CC:38072920:5,18,3,0
chr22	38074343	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.204:27:9,3:13,2:14,8,2,3
chr22	38074434	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=103,93;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,10:0.186:57:23,7:22,3:26,21,3,7
chr22	38084215	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr22	38084433	.	G	GTGTGTGTGTGT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,3:12,0:5,18,0,3
chr22	38119180	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:0|1:38119180_T_TC:38119180:7,4,1,1
chr22	38119181	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:0|1:38119180_T_TC:38119180:7,4,1,1
chr22	38119188	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:0|1:38119180_T_TC:38119180:7,4,1,1
chr22	38119429	.	CCTCCAGGGCCTCATCCACCCAACAGGAAAT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=87,164;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.111:29:3,1:11,1:13,14,2,0
chr22	38120532	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=90,92;MMQ=57,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:18,0:24,3:23,22,1,2
chr22	38121152	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=248,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:1,16:0,12:0,1,13,16
chr22	38122448	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr22	38122462	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	38129332	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,21:0,0,25,22
chr22	38130385	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr22	38130472	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,16:0,0,16,12
chr22	38130541	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=97,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:9,0:10,9,1,1
chr22	38137083	.	A	ACTGGAGATTTAAAAGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr22	38146585	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr22	38146847	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr22	38151100	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:5,7,2,0
chr22	38155317	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr22	38161835	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,2:0,0,1,3
chr22	38168508	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	38202403	.	CG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=90.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,22:0,7:0,0,29,2
chr22	38212762	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,3,13
chr22	38219811	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38219811_G_T:38219811:0,1,0,1
chr22	38219813	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38219811_G_T:38219811:0,1,0,1
chr22	38219814	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=108,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:38219811_G_T:38219811:0,1,0,1
chr22	38219815	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38219811_G_T:38219811:0,1,0,1
chr22	38219817	.	G	GAGTGGAGT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38219811_G_T:38219811:0,1,0,1
chr22	38219820	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=12,25;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,0:0,1:0|1:38219811_G_T:38219811:0,2,0,1
chr22	38219821	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.609:3:0,0:1,2:1|0:38219811_G_T:38219811:0,1,0,2
chr22	38236308	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=143,168;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:3,5,0,2
chr22	38243675	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,22:0,7:0,0,15,16
chr22	38243710	.	CCCTGAACCAAGGAAGAGACTGTGACTCTTCCTTGGTTCAGGGAAGGT	C	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=92,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.072:70:19,2:16,2:36,30,3,1
chr22	38247595	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38247595_G_A:38247595:0,3,0,1
chr22	38247597	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38247595_G_A:38247595:0,3,0,1
chr22	38247602	.	T	TATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38247595_G_A:38247595:0,1,0,1
chr22	38251686	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr22	38282897	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:0,4,6,8
chr22	38284535	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,199;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:18,0:9,4:10,17,0,4
chr22	38307899	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=75,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:17,3:5,0:13,10,3,0
chr22	38308048	.	ATG	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.295:14:3,2:3,2:1,9,2,2
chr22	38308455	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:11,0:16,5:18,10,4,1
chr22	38321653	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,0:2,0:0,2,4,0
chr22	38321761	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,0:14,2:0|1:38321761_G_A:38321761:17,14,1,1
chr22	38321763	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=90,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:15,0:13,2:0|1:38321761_G_A:38321761:17,14,1,1
chr22	38322108	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=22,17;MFRL=153,164;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:1,0:1,1:0|1:38322108_C_CG:38322108:1,3,0,2
chr22	38322109	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=18,29;MFRL=153,164;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:1,0:0,2:0|1:38322108_C_CG:38322108:1,3,0,2
chr22	38322114	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=157,164;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,0:0|1:38322108_C_CG:38322108:1,2,0,2
chr22	38322120	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=165,164;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0|1:38322108_C_CG:38322108:1,1,0,2
chr22	38322122	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=172,164;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:38322108_C_CG:38322108:0,1,0,2
chr22	38322125	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=172,164;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:38322108_C_CG:38322108:0,1,0,2
chr22	38340413	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=98,111;MMQ=60,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,4:13,0:12,17,4,0
chr22	38349919	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:38349919_G_GAC:38349919:1,3,0,1
chr22	38349921	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:38349919_G_GAC:38349919:1,3,0,1
chr22	38363234	.	C	CAGTGTGCAGCACTTAAAGGTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.286:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr22	38370187	.	GGTGGGCCATGGCTCTGGCCTGGGTA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.295:5:1,0:1,1:0|1:38370187_GGTGGGCCATGGCTCTGGCCTGGGTA_G:38370187:2,2,0,1
chr22	38370216	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:38370187_GGTGGGCCATGGCTCTGGCCTGGGTA_G:38370187:0,3,0,1
chr22	38370222	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38370187_GGTGGGCCATGGCTCTGGCCTGGGTA_G:38370187:0,3,0,1
chr22	38429179	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38429179_AG_A:38429179:0,0,0,1
chr22	38429183	.	AAAAG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38429179_AG_A:38429179:0,0,0,1
chr22	38463652	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr22	38463968	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,7,0
chr22	38464024	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=98,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,1:10,3:6,9,1,3
chr22	38466737	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:38466737_C_T:38466737:3,0,1,0
chr22	38466739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38466737_C_T:38466737:3,0,1,0
chr22	38467784	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:1,3:1,3:1,1,2,4
chr22	38470908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:7,5,1,1
chr22	38471093	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,3:5,0:6,9,2,1
chr22	38482352	.	GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=93,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.092:43:11,1:5,2:27,13,2,1
chr22	38485010	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38485010_T_C:38485010:0,0,1,0
chr22	38485016	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38485010_T_C:38485010:0,0,1,0
chr22	38485167	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr22	38503969	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.234:10:8,1:0,0:0|1:38503969_G_C:38503969:2,6,1,1
chr22	38503972	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=52,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,7:0.728:9:2,7:0,0:1|0:38503969_G_C:38503969:1,1,2,5
chr22	38504372	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:3,5,0,3
chr22	38508469	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:6,2,2,0
chr22	38512260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,2:0|1:38512260_C_T:38512260:7,10,1,1
chr22	38512266	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:38512260_C_T:38512260:9,10,1,1
chr22	38530967	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	38535946	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:11,3:3,2:12,2,3,2
chr22	38543453	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=147,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:14,10:13,8:19,8,9,9
chr22	38543545	.	CT	C,CTT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=23,19,31;MFRL=102,158,118;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=T;STR;TLOD=4.35,10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,10:0.268,0.624:17:0,1,3:1,1,4:0,1,7,9
chr22	38564041	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=88,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,1:7,5:6,12,2,4
chr22	38565160	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,148;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,4:2,0:8,0,4,0
chr22	38609950	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=71,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:0,5:10,6:2,9,3,8
chr22	38612322	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr22	38612330	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr22	38612372	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,0:8,5:13,1,4,1
chr22	38612518	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=101,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:9,3:12,4:9,12,3,4
chr22	38612604	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr22	38620717	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,757;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:6,0,0,2
chr22	38620903	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:4,10,1,2
chr22	38641892	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641892_CAG_C:38641892:0,0,2,0
chr22	38641900	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641892_CAG_C:38641892:0,0,2,0
chr22	38641908	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641892_CAG_C:38641892:0,0,2,0
chr22	38641912	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641892_CAG_C:38641892:0,0,2,0
chr22	38641917	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641892_CAG_C:38641892:0,0,2,0
chr22	38699050	.	GAGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGC;STR;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr22	38875549	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,21,10
chr22	38881952	.	AGGAGGAGGAGGG	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,2:1,0:15,6,1,1
chr22	38881964	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=108,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:11,2:5,2:13,4,2,2
chr22	38882026	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=92,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:19,0:15,6:17,18,1,5
chr22	38889657	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=101,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:8,5:10,3:12,6,3,5
chr22	38891973	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=107,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:6,3:10,0:13,7,1,2
chr22	38894405	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,4:9,0:12,4,4,0
chr22	38895521	.	AAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr22	38901916	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,12;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:0,1:0|1:38901916_A_C:38901916:0,1,3,0
chr22	38901922	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=78,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.384:8:1,1:1,1:0|1:38901916_A_C:38901916:3,2,3,0
chr22	38901924	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=78,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,0:0|1:38901916_A_C:38901916:3,2,2,0
chr22	38934670	.	T	TTATACATGTAGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr22	38948584	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:7,4,3,0
chr22	39003495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=44,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:3,3,1,2
chr22	39016182	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:10,1:11,3:11,10,2,2
chr22	39019241	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,3:17,0:13,15,2,1
chr22	39019328	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:8,0:5,4:6,7,1,3
chr22	39024961	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,3,12
chr22	39041594	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:6,2:0|1:39041594_G_C:39041594:10,11,1,1
chr22	39041598	.	ATT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:6,2:0|1:39041594_G_C:39041594:12,11,1,1
chr22	39064199	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:0|1:39064199_T_C:39064199:3,12,1,1
chr22	39064205	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:39064199_T_C:39064199:0,12,1,1
chr22	39064207	.	A	ACGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:4,2:0|1:39064199_T_C:39064199:0,12,1,1
chr22	39079006	.	G	GAGAAGCTTCATCTGTGTTTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,3:7,0:5,16,1,2
chr22	39079920	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:1,1:2,1:0,8,0,5
chr22	39084073	.	A	AAATATCTTATGCCAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=140,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:2,1:0,0:0|1:39084073_A_AAATATCTTATGCCAGAG:39084073:0,2,0,1
chr22	39084075	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=140,249;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:39084073_A_AAATATCTTATGCCAGAG:39084073:0,2,0,1
chr22	39084090	.	C	CCCCCACCCCCATCTTGCTCAAGAACCTTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	39105011	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=145,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:8,0:7,3:2,18,0,3
chr22	39117737	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.397:23:11,8:1,0:8,6,9,0
chr22	39123349	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=172,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:39123349_C_T:39123349:7,17,1,1
chr22	39123355	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=176,35;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:39123349_C_T:39123349:5,15,1,1
chr22	39123359	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=177,35;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:8,2:0|1:39123349_C_T:39123349:3,16,1,1
chr22	39123363	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=177,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:39123349_C_T:39123349:3,16,1,1
chr22	39123368	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=180,35;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:39123349_C_T:39123349:3,15,1,1
chr22	39134715	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.336:22:10,4:4,3:4,11,2,5
chr22	39138305	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,0:15,2:15,13,2,0
chr22	39138423	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,0:14,3:15,15,0,3
chr22	39148483	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.245:30:12,4:11,3:15,8,5,2
chr22	39178701	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:12,2:10,6:11,11,1,7
chr22	39224248	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	39262586	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=229,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39262586_G_A:39262586:1,0,0,1
chr22	39262589	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=229,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39262586_G_A:39262586:1,0,0,1
chr22	39355717	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:5,2:6,2:5,6,0,4
chr22	39357581	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,112;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,1:6,8:7,4,4,5
chr22	39379992	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=165,209;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:39379992_A_G:39379992:12,2,2,0
chr22	39379996	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=159,209;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:39379992_A_G:39379992:12,2,2,0
chr22	39381756	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr22	39385404	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=82,117;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:7,0:6,6:11,2,7,0
chr22	39414224	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr22	39414240	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,178;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:7,3,1,1
chr22	39428396	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,172;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr22	39441526	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,85;MMQ=50,22;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:13,0:16,6:20,10,4,2
chr22	39477201	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,2:10,1:4,13,0,3
chr22	39496196	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=162,194;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:11,1,2,0
chr22	39496199	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,8:1,4:1,0,12,1
chr22	39496238	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,1:14,2:20,11,2,1
chr22	39496322	.	TAAC	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=118.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,31:0.843:36:0,18:5,13:3,2,13,18
chr22	39496336	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,31:0.821:37:0,19:6,12:3,3,13,18
chr22	39496412	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,4:3,10:0,3,7,7
chr22	39498421	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=149,135;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:9,2:13,0,2,0
chr22	39498677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	39499575	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	39499604	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=83,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr22	39499653	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=87,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,30:0.839:35:2,17:3,12:2,3,20,10
chr22	39499763	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.828:21:3,11:0,7:1,2,5,13
chr22	39537283	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39537283_T_A:39537283:1,0,1,0
chr22	39537289	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39537283_T_A:39537283:1,0,1,0
chr22	39537292	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39537283_T_A:39537283:1,0,1,0
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chr22	39537302	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39537283_T_A:39537283:2,0,1,0
chr22	39537463	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:20,0:11,2:13,19,1,1
chr22	39626024	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr22	39626177	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,0:5,3:4,10,1,2
chr22	39636899	.	GTC	G	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=103,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.154:52:18,4:24,4:23,21,6,2
chr22	39636926	.	GCA	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.267:16:6,2:3,2:1,11,0,4
chr22	39636930	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=108,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.126:53:22,2:20,3:20,27,3,3
chr22	39709713	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,2:9,1:7,6,2,1
chr22	39709776	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,3,9
chr22	39710244	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,4,12
chr22	39713105	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	39715140	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr22	39746186	.	ACCGACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGACC;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	39777822	.	C	CCAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,5:0,8:0,0,1,13
chr22	39795683	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	39795962	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=176,28;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:1,8,1,1
chr22	39812986	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	39813625	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:3,4:3,1:6,1,5,0
chr22	39823015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	39884981	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=129,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:6,0:0|1:39884981_A_G:39884981:10,14,1,1
chr22	39884985	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:0|1:39884981_A_G:39884981:11,13,1,1
chr22	39888226	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39888226_G_A:39888226:0,3,0,1
chr22	39888229	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39888226_G_A:39888226:0,3,0,1
chr22	39888230	.	C	CTCCCTGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39888226_G_A:39888226:0,3,0,1
chr22	39911371	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.172:36:15,0:15,5:12,18,0,6
chr22	39913557	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=192,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.726:42:6,16:5,13:7,4,15,16
chr22	39967010	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,5:6,0:2,10,4,1
chr22	39994105	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,7:0,0,9,5
chr22	39994293	.	C	CGCCCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=243,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCCT;STR;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr22	40030477	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:2,0:1,1:16,0,2,0
chr22	40043812	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.828:19:1,11:1,5:2,1,12,4
chr22	40055896	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr22	40057273	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,9,12
chr22	40058186	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,3,3
chr22	40059708	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:40059708_G_C:40059708:0,2,2,0
chr22	40059712	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:40059708_G_C:40059708:1,2,2,0
chr22	40059715	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:40059708_G_C:40059708:1,3,2,0
chr22	40061683	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr22	40066135	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=84,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:0|1:40066135_C_G:40066135:6,11,1,1
chr22	40066142	.	G	GGCGCCTGT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=96,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:0|1:40066135_C_G:40066135:6,10,1,1
chr22	40068853	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	40070034	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0|1:40070034_C_CT:40070034:1,5,1,1
chr22	40070037	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=94,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0|1:40070034_C_CT:40070034:1,5,1,1
chr22	40070139	.	GAG	CCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	40074126	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=126,99;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:11,0:2,3:6,8,0,3
chr22	40077054	.	C	CAAAACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.294:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	40161181	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=TG;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:0,1:3,0,1,0
chr22	40258086	.	A	ACTCCTTTGTAATGTGTGCGTTCAACTCACAAAGTTTAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=200,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40258086_A_ACTCCTTTGTAATGTGTGCGTTCAACTCACAAAGTTTAACC:40258086:0,1,0,1
chr22	40258090	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=275,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:1,1:0,0:0|1:40258086_A_ACTCCTTTGTAATGTGTGCGTTCAACTCACAAAGTTTAACC:40258086:0,2,0,1
chr22	40365390	.	CC	TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:12,10,1,1
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chr22	40641980	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,23,7
chr22	40658091	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:14,9,0,2
chr22	40666350	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=147,209;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:40666350_T_C:40666350:0,7,0,2
chr22	40666353	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=147,209;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:40666350_T_C:40666350:0,7,0,2
chr22	40696633	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr22	40704595	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=91,100;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:14,3:0|1:40704595_C_T:40704595:9,16,0,3
chr22	40704604	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=102,100;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:7,0:10,3:0|1:40704595_C_T:40704595:7,11,0,3
chr22	40704748	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=78,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr22	40707015	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.191:29:8,0:16,5:5,19,2,3
chr22	40711851	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=71,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,1:0,4:2,0,5,1
chr22	40719240	.	A	AAAAGAGGGAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=268,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	40756337	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:10,1,2,0
chr22	40757228	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=80,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,1:1,2:6,3,3,0
chr22	40801282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr22	40803186	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:5,8:13,3:13,5,7,4
chr22	40803731	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr22	40803748	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,1:3,3:6,3,3,1
chr22	40807361	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:0,1:2,0,3,0
chr22	40816907	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,6:7,0:6,4,6,0
chr22	40825574	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=90,62;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,3:8,0:15,10,0,3
chr22	41166854	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=103,283;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,1:13,1:12,7,0,2
chr22	41172351	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,7,14
chr22	41173355	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=84,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,1:13,2:7,14,0,3
chr22	41194909	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,2:0,15:0,0,17,0
chr22	41194947	.	CAAA	C,CAAAA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,31,27;MFRL=161,166,133;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,16;RU=A;STR;TLOD=4.98,15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,13:0.077,0.435:30:6,1,2:6,2,6:11,3,8,8
chr22	41195191	.	A	AGTGGCATGGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr22	41223233	.	CCT	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=107,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:41223233_CCT_C:41223233:4,12,0,2
chr22	41223238	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=107,153;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:0|1:41223233_CCT_C:41223233:4,12,0,2
chr22	41223240	.	T	TAG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=107,153;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:0|1:41223233_CCT_C:41223233:4,12,0,2
chr22	41244398	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr22	41257498	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=98,50;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:11,3:34,0:16,30,2,1
chr22	41257500	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=106,91;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.139:48:13,0:27,6:17,25,1,5
chr22	41257530	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=132,91;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:13,0:14,5:9,19,0,5
chr22	41258056	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=96,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,4:0.061:80:44,0:31,4:0|1:41258056_G_C:41258056:30,46,0,4
chr22	41258058	.	TCA	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=96,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,4:0.061:80:45,0:30,4:0|1:41258056_G_C:41258056:30,46,0,4
chr22	41282579	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=156,171;MMQ=52,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr22	41282610	.	A	ACT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=170,286;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:4,1:0,0:0|1:41282610_A_ACT:41282610:0,4,0,1
chr22	41282612	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=170,286;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:4,1:0,0:0|1:41282610_A_ACT:41282610:0,4,0,1
chr22	41282616	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=170,286;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:41282610_A_ACT:41282610:0,4,0,1
chr22	41310148	.	GAA	G,GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=142,142,158;MMQ=40,60,56;MPOS=6,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.30,10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.286,0.441:11:1,1,3:2,2,2:3,0,8,0
chr22	41513094	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	41531813	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=93,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:19,4:25,0:20,24,2,2
chr22	41537234	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,8:1,6:1,0,4,10
chr22	41545024	.	GT	G,GTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,35,35;MFRL=112,138,129;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.09,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,3:0.278,0.158:19:6,4,2:1,0,0:8,3,8,0
chr22	41545039	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.199:25:6,1:3,0:11,9,5,0
chr22	41545233	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:0,9,0,4
chr22	41545818	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:15,2:21,0:19,18,0,2
chr22	41545941	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=107,43;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,0:13,2:10,15,0,2
chr22	41550954	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr22	41562559	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,0:4,2:14,3,1,1
chr22	41568480	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,5:1,8:3,0,10,4
chr22	41569609	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=102,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:5,11:3,11:6,2,12,10
chr22	41569887	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=212,188;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:1,5:0,0:0,2,0,5
chr22	41573177	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:3,0:10,3:5,8,2,1
chr22	41573892	.	GTCTCCCAGC	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=98,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,2:11,0:10,12,1,1
chr22	41574070	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:10,6,3,0
chr22	41574083	.	GG	TA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=98,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:9,2:19,0:16,12,1,1
chr22	41574342	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=116,154;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:12,0:14,3:0|1:41574342_C_T:41574342:18,9,0,4
chr22	41574347	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=82,154;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:12,0:19,4:0|1:41574342_C_T:41574342:17,15,0,4
chr22	41575011	.	A	AACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:41575011_A_AACG:41575011:0,1,0,1
chr22	41575015	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:41575011_A_AACG:41575011:0,1,0,1
chr22	41575018	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:41575011_A_AACG:41575011:0,1,0,1
chr22	41605635	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:0,1:0|1:41605635_T_C:41605635:2,0,1,0
chr22	41605639	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=66,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:1,0:2,1:0|1:41605635_T_C:41605635:2,1,1,0
chr22	41609859	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,4:10,1:15,4,5,0
chr22	41610024	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,2:8,1:6,9,1,2
chr22	41610121	.	A	AGACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	41616663	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,30;MFRL=88,203;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:0,1:0,2:0,1,3,0
chr22	41617160	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:0,0:6,3:6,0,2,1
chr22	41626120	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=75,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:2,1,1,0
chr22	41650543	.	C	CCCCATCACCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41650543_C_CCCCATCACCTT:41650543:0,0,0,1
chr22	41650546	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41650543_C_CCCCATCACCTT:41650543:0,0,0,1
chr22	41652345	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:1,6,1,1
chr22	41652667	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:41652667_A_C:41652667:0,0,2,0
chr22	41652670	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0|1:41652667_A_C:41652667:0,0,2,0
chr22	41652674	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:2,0,1,0
chr22	41676997	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,202;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,0:8,4:8,17,0,4
chr22	41721842	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,1:8,2:11,9,1,2
chr22	41725927	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:2,11:1,0:0|1:41725927_T_A:41725927:3,0,11,0
chr22	41725930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:2,11:1,0:0|1:41725927_T_A:41725927:3,0,11,0
chr22	41728335	.	TCCGCCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr22	41735081	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,191;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr22	41742012	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,7:7,0:4,7,7,0
chr22	41744135	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:41744135_C_T:41744135:10,4,1,1
chr22	41744145	.	T	TTTGAACTCCAACCCCATCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=111,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:41744135_C_T:41744135:8,6,1,1
chr22	41752321	.	GTGCCCTGTCCCTGTCCCC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=85,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:8,2:14,8,1,1
chr22	41863423	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=121.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,23:0,0,27,12
chr22	41864190	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,1:5,6:3,10,2,5
chr22	41864216	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr22	41904059	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=90,87;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:20,0:17,15:17,20,0,15
chr22	41911525	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,8:0,0,16,12
chr22	41913657	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=114,66;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:5,10,0,3
chr22	41919775	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr22	41921182	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=102,134;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:9,0:28,7:23,14,0,7
chr22	41926811	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,0:9,4:12,5,2,2
chr22	41926859	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:5,3:10,1:7,8,2,2
chr22	41936827	.	AGT	CAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:0|1:41936827_AGT_CAC:41936827:5,6,0,3
chr22	41936835	.	TGG	CAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:0|1:41936827_AGT_CAC:41936827:5,6,0,3
chr22	41936839	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,1:7,1:0|1:41936827_AGT_CAC:41936827:5,6,0,3
chr22	41939668	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr22	42016699	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr22	42076381	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr22	42084889	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:1,7,0,2
chr22	42090069	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr22	42091027	.	A	AAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=116.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0,0,12,19
chr22	42109917	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	42128612	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42128612_G_A:42128612:0,2,0,1
chr22	42128615	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42128612_G_A:42128612:0,2,0,1
chr22	42139054	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr22	42139078	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,13:0,4:0,0,10,7
chr22	42141871	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:1,0:0,5:1,0,4,1
chr22	42144038	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:6,0,0,2
chr22	42144248	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,2:8,0:0|1:42144248_T_A:42144248:9,13,1,1
chr22	42144252	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:7,0:0|1:42144248_T_A:42144248:9,13,1,1
chr22	42144255	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:42144248_T_A:42144248:9,10,1,1
chr22	42150146	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	42154564	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=153,114;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42154564_T_A:42154564:0,3,0,1
chr22	42154568	.	G	GGGCATTTCTCTCCCCGTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=133,114;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:42154564_T_A:42154564:0,2,0,1
chr22	42154618	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42154618_T_A:42154618:0,1,0,1
chr22	42154622	.	A	ATCCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=218,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:42154618_T_A:42154618:0,2,0,1
chr22	42154624	.	C	CAAGGCCATTTCTGTCAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=218,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42154618_T_A:42154618:0,2,0,1
chr22	42166954	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:8,10,2,1
chr22	42172080	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:3,10:6,9:3,6,12,7
chr22	42180869	.	C	CACCTCAATCACACTACTCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	42189761	.	GTTTTTTCTTGGTTGGCACCAAAAGCCATTGGTAGCAAAACCTGACCTGATTTTTTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=115,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:1,1:4,2,2,0
chr22	42266928	.	CC	TT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,2:12,0:0|1:42266928_CC_TT:42266928:14,10,0,2
chr22	42266932	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:14,0:0|1:42266928_CC_TT:42266928:14,10,0,2
chr22	42270011	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,55;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:7,2:18,0:0|1:42270011_G_A:42270011:14,13,1,1
chr22	42270023	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:17,0:0|1:42270011_G_A:42270011:13,12,1,1
chr22	42274733	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=88,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,0:13,3:14,9,1,2
chr22	42276742	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,34:0.813:41:4,21:3,12:4,3,15,19
chr22	42293140	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,8:1,8:1,2,8,8
chr22	42294739	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:10,3:8,14,0,3
chr22	42294775	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=111,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:16,0:10,12,2,0
chr22	42297076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr22	42300948	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:2,1,1,8
chr22	42301014	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=424384,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:1,0,0,3
chr22	42301748	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=119,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	42321451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=86,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,5,4
chr22	42321591	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=263,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr22	42322016	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=97,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:2,3:0,2:1,1,6,0
chr22	42339516	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr22	42339545	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=105,150;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,0:2,1,6,0
chr22	42341308	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,9:1,7:0,1,8,8
chr22	42341363	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=55,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:3,7:1,11:4,0,6,12
chr22	42341934	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,29:0.884:32:1,16:2,13:2,1,15,14
chr22	42383536	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	42388826	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=94,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr22	42388841	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=188,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr22	42390272	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:8,2:4,0:7,5,0,2
chr22	42418185	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:4,0,1,1
chr22	42422984	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=143,60;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.090:39:14,2:18,0:0|1:42422984_T_C:42422984:11,25,2,1
chr22	42422994	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=146,75;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.094:39:9,2:10,0:0|1:42422984_T_C:42422984:13,22,2,2
chr22	42457131	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42457131_C_T:42457131:0,2,0,1
chr22	42457137	.	G	GTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42457131_C_T:42457131:0,2,0,1
chr22	42457138	.	G	GCGTTTAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42457131_C_T:42457131:0,2,0,1
chr22	42458827	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=76,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:3,5,1,3
chr22	42461918	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:7,5:7,5,4,2
chr22	42474676	.	A	ATTCTGC	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=71,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCTGC;STR;TLOD=135.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,42:0.844:49:3,23:4,15:5,2,23,19
chr22	42474876	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=100,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,15:0.202:77:39,0:23,15:29,33,0,15
chr22	42475703	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	42525798	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,2:8,2:7,11,1,3
chr22	42525811	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=134,166;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:7,1:0|1:42525811_T_C:42525811:6,9,0,2
chr22	42525821	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=134,166;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:0|1:42525811_T_C:42525811:5,8,0,2
chr22	42526610	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,131;MMQ=58,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:0,9:3,6:1,2,11,5
chr22	42526694	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:8,6:16,5:12,12,7,4
chr22	42557211	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr22	42781071	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,2:0,5:0,2,7,0
chr22	42899169	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=94,81;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:11,2:19,9,2,0
chr22	42905177	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,139;MMQ=52,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr22	42910668	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,88;MMQ=37,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,0:4,3:7,1,2,1
chr22	42910685	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,88;MMQ=27,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:5,0:3,3:4,4,1,2
chr22	42911103	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,207;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	42952031	.	G	GCGTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,88;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42952031_G_GCGTTTCC:42952031:0,0,0,1
chr22	42952032	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42952031_G_GCGTTTCC:42952031:0,0,0,1
chr22	42967198	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=94,72;MMQ=52,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:8,9,2,2
chr22	42969877	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=142,153;MMQ=40,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr22	42969920	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=115,132;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.344:18:3,0:8,0:0|1:42969920_A_C:42969920:2,10,6,0
chr22	42969924	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=100,132;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.312:20:4,1:8,2:0|1:42969920_A_C:42969920:3,11,6,0
chr22	42969930	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=143,135;MMQ=52,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.168:32:17,0:9,0:0|1:42969920_A_C:42969920:14,13,5,0
chr22	42969932	.	C	CCCCAA	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=142,165;MMQ=49,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.138:32:18,1:9,2:0|1:42969920_A_C:42969920:15,13,4,0
chr22	42981890	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=90,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:8,2:17,2:11,14,3,1
chr22	42993786	.	CT	C,CTT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=28,20,20;MFRL=150,125,122;MMQ=60,60,50;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=T;STR;TLOD=3.69,8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,10:0.181,0.475:21:2,2,4:2,1,3:2,4,6,9
chr22	42993868	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=173,118;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:0|1:42993868_C_G:42993868:0,9,0,2
chr22	42993872	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=173,118;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,1:3,0:0|1:42993868_C_G:42993868:0,9,0,2
chr22	42995662	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:15,4,2,1
chr22	42997944	.	TTC	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.177:36:3,4:26,2:24,6,2,4
chr22	43010817	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.206:51:19,3:22,7:15,26,4,6
chr22	43026946	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:11,10,2,1
chr22	43089055	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:1,9:4,10:2,3,9,10
chr22	43193603	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:14,3:8,0:15,7,3,0
chr22	43195147	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,13:1,15:0,1,9,20
chr22	43218178	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43218178_C_G:43218178:0,0,1,0
chr22	43218188	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43218178_C_G:43218178:0,0,1,0
chr22	43218397	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:12,4:13,3:7,18,4,3
chr22	43218446	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:3,2:5,2:0,8,1,4
chr22	43218463	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr22	43223067	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:7,4:1,8,0,5
chr22	43223095	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr22	43230140	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr22	43231584	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=221,167;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43231584_C_T:43231584:0,1,0,1
chr22	43231593	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43231584_C_T:43231584:0,0,0,1
chr22	43237135	.	T	TAACTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	43243578	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:22,4:18,0:15,25,1,3
chr22	43267336	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,3:0,0,8,3
chr22	43272085	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr22	43272792	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr22	43272830	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=157,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AG;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr22	43275250	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	43278162	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,15,4
chr22	43280650	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr22	43286876	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr22	43447891	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.894:16:0,10:1,5:0,1,7,8
chr22	43455360	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:4,0:0|1:43455360_A_G:43455360:5,2,2,0
chr22	43455366	.	CT	GG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:0,0:5,0:0|1:43455360_A_G:43455360:6,2,2,0
chr22	43455592	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr22	43471386	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr22	43520258	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:43520258_A_C:43520258:0,0,0,5
chr22	43520263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0|1:43520258_A_C:43520258:0,2,0,3
chr22	43524487	.	CCT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=94,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.794:22:3,8:0,10:3,1,13,5
chr22	43525176	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr22	43529029	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:4,5:1,7:2,3,7,6
chr22	43529097	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:13,9,1,1
chr22	43529517	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr22	43537190	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:12,2:25,1:20,17,2,1
chr22	43555194	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr22	43563982	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:12,3,1,1
chr22	43572308	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,3:7,2:11,1,5,0
chr22	43600225	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:0,1:1,0:1,0,0,4
chr22	43604008	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:3,3:9,0,3,0
chr22	43606143	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr22	43606181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	43606212	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43606212_G_A:43606212:0,1,0,1
chr22	43606217	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43606212_G_A:43606212:0,1,0,1
chr22	43606224	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43606212_G_A:43606212:0,2,0,1
chr22	43610282	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:0,7,0,3
chr22	43610309	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr22	43617350	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.794:8:1,2:0,0:0,1,0,7
chr22	43651421	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=98,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,0:9,5:8,5,3,2
chr22	43651440	.	GCA	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.125:37:8,1:23,3:20,13,2,2
chr22	43654295	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,10:8,0:5,9,10,0
chr22	43924668	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr22	43950853	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.553:27:11,10:1,5:6,6,11,4
chr22	44027929	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:9,3,3,0
chr22	44028174	.	CTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=165,175;MMQ=41,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:0,0:0,2,0,1
chr22	44073837	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44073837_T_G:44073837:3,1,0,1
chr22	44073839	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:44073837_T_G:44073837:3,1,0,1
chr22	44074098	.	A	ACAATTCAATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr22	44127774	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44127774_G_T:44127774:0,1,0,1
chr22	44127780	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44127774_G_T:44127774:0,1,0,1
chr22	44127782	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44127774_G_T:44127774:0,1,0,1
chr22	44151646	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:21,1:24,3:24,22,3,1
chr22	44151721	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.201:20:5,0:8,4:0,16,1,3
chr22	44223635	.	CCACACACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=75,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=CA;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr22	44229492	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:44229492_G_C:44229492:0,0,5,1
chr22	44229508	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.748:10:1,4:1,3:0|1:44229492_G_C:44229492:2,0,6,2
chr22	44234673	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,254;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.515:26:3,2:6,11:13,0,13,0
chr22	44234933	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr22	44258003	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:44258003_A_G:44258003:0,0,5,0
chr22	44258014	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:44258003_A_G:44258003:0,0,5,0
chr22	44258311	.	ACGCGCC	A,ACGCGCCCGCGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25,26;MFRL=0,165,135;MMQ=60,60,60;MPOS=23,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,6;RU=CGCGCC;STR;TLOD=3.37,8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.286,0.545:3:0,0,0:0,1,2:0,0,0,3
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chr22	44277345	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44277345_C_T:44277345:2,0,1,0
chr22	44277350	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44277345_C_T:44277345:2,0,1,0
chr22	44282307	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:4,4,3,3
chr22	44283556	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:4,0:7,3:6,5,2,2
chr22	44285765	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:0,0:12,3:4,8,1,2
chr22	44322970	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=124,89;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,5:5,5:4,1,7,3
chr22	44323121	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323121_G_A:44323121:0,1,0,1
chr22	44323123	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323121_G_A:44323121:0,1,0,1
chr22	44323126	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323121_G_A:44323121:0,1,0,1
chr22	44323129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323121_G_A:44323121:0,1,0,1
chr22	44323143	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323143_C_G:44323143:0,1,0,1
chr22	44323146	.	AAGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,21;MFRL=174,188;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44323143_C_G:44323143:0,1,0,1
chr22	44335885	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=104,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:3,5,4,4
chr22	44341986	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,4,0
chr22	44342325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chr22	44364594	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,5,5
chr22	44364794	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	44368741	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=181,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.731:16:1,2:2,9:4,0,4,8
chr22	44372629	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=100,91;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,0:8,4:7,8,0,4
chr22	44377243	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:2,0:0|1:44377243_A_G:44377243:7,3,2,0
chr22	44377246	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:0|1:44377243_A_G:44377243:7,3,2,0
chr22	44379822	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,6:3,11:2,3,8,10
chr22	44379838	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,3:2,9:2,1,8,4
chr22	44395577	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=111,42;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,8,1,1
chr22	44395587	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=21,20;MFRL=94,42;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,6,1,1
chr22	44395592	.	GG	TT	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=94,42;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,5,1,1
chr22	44395596	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=94,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,5,1,1
chr22	44395597	.	G	GTTGAAT	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=88,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,3,1,1
chr22	44395602	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=88,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:44395577_C_T:44395577:4,3,1,1
chr22	44395607	.	CT	TC	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=88,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:44395577_C_T:44395577:4,3,1,1
chr22	44515841	.	A	AAACCCACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr22	44554049	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=283,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr22	44564402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr22	44579381	.	C	CATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	44582372	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=108,334;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr22	44588042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44588042_C_T:44588042:2,2,0,1
chr22	44588044	.	G	GTTGA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:44588044_G_GTTGA:44588044:2,2,0,1
chr22	44588046	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:44588044_G_GTTGA:44588044:2,2,0,1
chr22	44588049	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:44588042_C_T:44588042:1,2,0,1
chr22	44588051	.	G	GTAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=12,32;MFRL=64,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:44588042_C_T:44588042:1,1,0,1
chr22	44588052	.	G	GTGAAGCATTCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=11,32;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:44588042_C_T:44588042:0,1,0,1
chr22	44594476	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,5,5
chr22	44602172	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=79,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,8:2,2:3,1,7,3
chr22	44602229	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,14:0,4:0,0,11,7
chr22	44761631	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr22	44893563	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:1,4,2,7
chr22	45130965	.	A	ACTACTCTCTCACCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=177,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr22	45210666	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=201,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:0,1,1,3
chr22	45218223	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr22	45241303	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=204,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr22	45243771	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr22	45244906	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=115,18;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr22	45244930	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr22	45245005	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	45255527	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=191,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0|1:45255527_A_C:45255527:1,0,5,1
chr22	45255532	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:1,4:0|1:45255527_A_C:45255527:1,0,6,1
chr22	45255580	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr22	45258268	.	C	CTTGTCATTCCTCCCT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0|1:45258268_C_CTTGTCATTCCTCCCT:45258268:2,5,1,1
chr22	45258271	.	G	GGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:45258268_C_CTTGTCATTCCTCCCT:45258268:3,5,1,1
chr22	45258272	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,0:0|1:45258268_C_CTTGTCATTCCTCCCT:45258268:3,5,1,1
chr22	45291833	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=233,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr22	45309856	.	TGGAGGGGTGAAGGGGACAGTGATGGGGAGGGAGGGGTGAGGGGAAGAGA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,86;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.157:30:7,1:3,2:23,3,2,2
chr22	45312113	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr22	45404335	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	45579422	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr22	45580571	.	TGC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:5,5,4,6
chr22	45593661	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=68,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,3,0
chr22	45595721	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr22	45598833	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	45599756	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:13,0:9,4:8,14,2,2
chr22	45599850	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,35;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,0:7,2:14,11,1,1
chr22	45603485	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,4:2,9:5,2,10,3
chr22	45603501	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=58,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:3,8:1,11:1,3,11,9
chr22	45603545	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,34:0.730:46:8,17:4,17:6,6,12,22
chr22	45609151	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr22	45622014	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr22	45683246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,4:4,0:7,6,1,3
chr22	45718414	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=209,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr22	45728632	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=136,89;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.348:23:6,6:5,2:2,13,3,5
chr22	45731182	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,8,9
chr22	45732328	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr22	45736153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr22	45741543	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	45748284	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	45748339	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr22	45749773	.	C	CAAAAAAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=27,37;RU=A;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.815:3:0,1:0,2:0|1:45749773_C_CAAAAAAAAAA:45749773:0,0,3,0
chr22	45749801	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:45749773_C_CAAAAAAAAAA:45749773:0,0,8,2
chr22	45749983	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,12,25
chr22	45754517	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr22	45754558	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr22	45755666	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr22	45758758	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr22	45782869	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,101;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,0:14,3:6,14,0,3
chr22	45810278	.	A	AC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=130.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,17:0,22:0,0,27,15
chr22	45828091	.	CAAAAAA	C,CAAAAA,CAAAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34,25,33;MFRL=0,139,65,207;MMQ=60,60,55,60;MPOS=19,28,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,8,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.26,4.71,4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,2,2:0.222,0.337,0.336:5:0,1,1,1:0,0,0,1:0,0,3,2
chr22	45828137	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:5,2:5,2:11,0,3,1
chr22	45898117	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr22	45898130	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr22	45913394	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=204,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr22	45914461	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	45921408	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=146,281;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:0|1:45921408_A_C:45921408:2,0,2,0
chr22	45921415	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=144,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:1,0:0|1:45921408_A_C:45921408:4,1,2,0
chr22	45921419	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=150,281;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:0,0:0|1:45921408_A_C:45921408:4,2,2,0
chr22	45921421	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=150,281;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,0:0|1:45921408_A_C:45921408:4,2,2,0
chr22	45927112	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:11,5:10,0:9,12,3,2
chr22	45927130	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=110,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:8,12,1,1
chr22	45954029	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr22	45970446	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=111,160;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:11,0:18,3:0|1:45970446_G_T:45970446:14,15,0,3
chr22	45970448	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=111,160;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:11,0:15,3:0|1:45970446_G_T:45970446:14,15,0,3
chr22	46323342	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,0:0,3:2,1,2,1
chr22	46327093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=191,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr22	46367995	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:0,0,1,0
chr22	46368000	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:0,0,1,0
chr22	46368004	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:0,0,1,0
chr22	46368008	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,34;MFRL=69,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:1,1,1,0
chr22	46368013	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=78,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:2,2,1,0
chr22	46368015	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=20,34;MFRL=78,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:2,2,1,0
chr22	46368017	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=22,34;MFRL=78,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:2,2,1,0
chr22	46368020	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=22,34;MFRL=78,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:46367995_A_AGGG:46367995:2,2,1,0
chr22	46449587	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=236,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr22	46505986	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	46508765	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=295,114;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,3:1,11:0,1,1,13
chr22	46594555	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=205,159;MMQ=40,36;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:0,0:0,1:0,4,0,1
chr22	46643029	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,0:16,2:13,10,0,2
chr22	46656553	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:6,0:12,8,1,1
chr22	46658062	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,1:10,1:6,12,2,0
chr22	46663911	.	C	CAGACCCAGCTTGGTCTTCTCAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr22	46664985	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=108,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:3,5,2,0
chr22	46665003	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:5,6,1,1
chr22	46671084	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=93,380;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,1,0
chr22	46677517	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:9,2:17,0:0|1:46677517_G_T:46677517:13,13,1,1
chr22	46677519	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:9,0:17,0:0|1:46677517_G_T:46677517:13,13,1,1
chr22	46709702	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:5,2:6,0:11,0,3,0
chr22	46711920	.	A	AC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.321:25:11,7:6,1:7,10,5,3
chr22	46722531	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:1,7,2,4
chr22	46722560	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:0,8,2,2
chr22	46724558	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr22	46731771	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:1,2:2,0:2,3,0,2
chr22	46731791	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr22	46739096	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=91,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.352:7:3,1:2,0:4,1,1,1
chr22	46739288	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.390:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr22	46760193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr22	46760199	.	C	CCG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:46760199_C_CCG:46760199:0,6,0,2
chr22	46760201	.	GCT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:46760199_C_CCG:46760199:0,6,0,2
chr22	46762402	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:0|1:46762402_AC_A:46762402:5,9,1,1
chr22	46762404	.	TGCCAA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:3,2:0|1:46762402_AC_A:46762402:5,10,1,1
chr22	46762969	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr22	46765181	.	G	GTCAGGTCGCCGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,3,6
chr22	46774416	.	T	TGCAGGTTTGGGGGGGAGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCAGGTTTGGGGGGGAGGG;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	46787620	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:13,1,2,1
chr22	46793734	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:1,0:10,2:3,9,0,2
chr22	46832047	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,27;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr22	46858687	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	46929692	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,6:0,15:0,0,12,9
chr22	47057355	.	C	CTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,289;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr22	47059597	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	47064049	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,3:12,0:6,12,1,2
chr22	47064665	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,2,4
chr22	47066920	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr22	47067164	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	47072477	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,8,7
chr22	47095409	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr22	47116002	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:15,6,0,3
chr22	47185415	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0|1:47185415_C_T:47185415:0,1,0,4
chr22	47185422	.	C	CACAGCCTACAAACTCTGACGTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:47185415_C_T:47185415:0,3,0,1
chr22	47274638	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,8:4,0:4,4,3,5
chr22	47290858	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	47309247	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=119,77;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,3:3,9:1,4,5,7
chr22	47370354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=171,42;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:4,2:1,5,1,2
chr22	47507367	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:9,8,2,1
chr22	48940553	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,5,12
chr22	48940644	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr22	48940660	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=188,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:3,7,3,0
chr22	48942482	.	G	GAAGAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr22	49103660	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr22	49834855	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,8:1,7:0,1,4,11
chr22	50014058	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,14;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.606:3:0,0:1,0:0|1:50014058_C_A:50014058:0,1,2,0
chr22	50014065	.	G	GCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,9;RU=C;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:50014058_C_A:50014058:0,2,2,0
chr22	50014069	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:50014058_C_A:50014058:0,2,2,0
chr22	50014073	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=66,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:50014058_C_A:50014058:0,4,2,0
chr22	50016735	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr22	50017234	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.708:28:3,5:4,15:6,2,7,13
chr22	50018069	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=80,129;MMQ=60,59;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,5:8,4:8,1,4,5
chr22	50018639	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:50018639_G_A:50018639:0,0,0,3
chr22	50018651	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:50018639_G_A:50018639:0,0,0,3
chr22	50018654	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50018639_G_A:50018639:0,0,0,1
chr22	50188016	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,24;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:50188016_TTC_T:50188016:0,1,0,1
chr22	50188019	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50188016_TTC_T:50188016:0,1,0,1
chr22	50188025	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50188016_TTC_T:50188016:0,1,0,1
chr22	50217886	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:9,4,2,2
chr22	50277835	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,6:0,21:0,0,14,13
chr22	50278568	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,4,4
chr22	50278913	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=188,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:0|1:50278913_T_A:50278913:7,5,1,1
chr22	50278917	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:50278913_T_A:50278913:8,5,1,1
chr22	50278923	.	TGACTGACTTG	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=171,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:50278913_T_A:50278913:7,7,1,1
chr22	50278935	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:50278913_T_A:50278913:5,7,1,1
chr22	50283115	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TTTG;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.359:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr22	50307388	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,0:8,10:5,6,0,10
chr22	50316398	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=106,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:50316398_C_T:50316398:0,3,0,1
chr22	50316406	.	GTG	CAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=106,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:50316398_C_T:50316398:0,1,0,1
chr22	50356274	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,10:1,4:4,0,14,0
chr22	50356302	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.799:28:3,18:2,4:4,1,19,4
chr22	50356555	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,3,1
chr22	50356850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,2:2,6:0,3,0,8
chr22	50435480	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:11,3:12,3:15,9,5,1
chr22	50439430	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:11,3,2,0
chr22	50472919	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=206,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr22	50479770	.	GGGCACCCCGACACCCATAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:1,0:0,2:1,3,1,1
chr22	50488766	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0|1:50488766_G_A:50488766:0,0,0,1
chr22	50488771	.	T	TTAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50488766_G_A:50488766:0,0,0,1
chr22	50507035	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr22	50512617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,1:9,2:10,3,3,0
chr22	50515323	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:20,5,2,0
chr22	50518723	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,3,0
chr22	50529105	.	T	TTG	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=84,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:14,3:5,2:5,15,3,2
chr22	50547293	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:16,0:9,2:0|1:50547293_G_A:50547293:10,15,1,1
chr22	50547309	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:50547293_G_A:50547293:3,14,1,1
chr22	50547312	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,1:0|1:50547293_G_A:50547293:3,14,1,1
chr22	50555619	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=104,98;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:11,3:4,2:0|1:50555619_C_T:50555619:9,6,3,2
chr22	50555628	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.220:16:8,3:5,0:1|0:50555619_C_T:50555619:8,5,2,1
chr22	50584101	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=91,45;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,2:7,0:3,4,1,1
chr22	50584113	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=91,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:0,2:7,0:0|1:50584113_C_CA:50584113:5,5,1,1
chr22	50584115	.	C	CACCTCAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=91,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,2:9,0:0|1:50584113_C_CA:50584113:4,5,1,1
chr22	50598030	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=222,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:1,1:5,4:5,2,4,1
chr22	50599569	.	TC	T,TCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25,30;MFRL=193,178,234;MMQ=60,60,60;MPOS=4,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=2,1,4;RU=C;STR;TLOD=3.37,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.290:4:2,1,0:0,0,1:0,2,0,2
chr22	50599572	.	A	T,AAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,18,27;MFRL=193,178,234;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.298,0.253:4:2,0,0:0,0,1:0,2,0,2
chr22	50599574	.	T	TGTGACAGCTAAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=193,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:4,0:0,1:0|1:50599574_T_TGTGACAGCTAAAA:50599574:0,4,0,1
chr22	50599577	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=210,234;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50599574_T_TGTGACAGCTAAAA:50599574:0,2,0,1
chr22	50632087	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.751:30:1,13:6,10:3,4,11,12
chr22	50635627	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr22	50654064	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=G;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr22	50657885	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:50657885_G_T:50657885:3,10,1,1
chr22	50657892	.	G	GAGCCCGGCCACCACCTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:50657885_G_T:50657885:3,10,1,1
chr22	50658017	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,5:3,3:2,1,7,1
chr22	50658053	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=123.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,6:0,32:0,0,28,10
chr22	50659742	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:4,0:0|1:50659742_C_G:50659742:1,7,1,1
chr22	50659744	.	T	TGGTAGGCAACTCAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:50659742_C_G:50659742:1,7,1,1
chr22	50664592	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,3:10,0:6,12,1,2
chr22	50664612	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=94,112;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr22	50664879	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	50665274	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:5,3,0,2
chr22	50667842	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=84,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:15,0:11,4:16,10,2,2
chr22	50668036	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=172,104;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr22	50668074	.	CCTCCACCCTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr22	50678571	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,1:3,1:8,0,0,2
chr22	50684296	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.370:14:3,0:6,5:5,4,2,3
chr22	50684312	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:3,0:6,3:5,4,1,3
chr22	50687549	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:13,2:0|1:50687549_G_C:50687549:15,12,1,1
chr22	50687554	.	A	ATGG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:15,2:0|1:50687549_G_C:50687549:15,13,1,1
chr22	50688235	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chr22	50694534	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=73,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:2,0:22,3:15,9,3,0
chr22	50695270	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr22	50705059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:0,3,2,1
chr22	50705725	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50705725_G_GT:50705725:1,2,0,1
chr22	50705726	.	G	GGGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50705725_G_GT:50705725:1,2,0,1
chr22	50705730	.	T	TCACC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:50705725_G_GT:50705725:1,2,0,1
chr22	50705733	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,22;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:50705725_G_GT:50705725:1,2,0,1
chr22	50705737	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=353,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50705725_G_GT:50705725:0,1,0,1
chr22	50708594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	50708731	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr22	50714289	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.812:25:2,8:2,10:2,2,10,11
chr22	50715029	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,16,3
chr22	50715187	.	GGT	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:50715187_GGT_G:50715187:4,3,1,1
chr22	50715192	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:50715187_GGT_G:50715187:5,2,1,1
chr22	50715195	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:50715187_GGT_G:50715187:5,1,1,1
chr22	50715197	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:50715187_GGT_G:50715187:5,1,1,1
chr22	50715198	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:50715187_GGT_G:50715187:5,1,1,1
chr22	50715973	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr22	50717129	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr22	50717144	.	C	CCACTGCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:50717144_C_CCACTGCG:50717144:0,3,0,1
chr22	50717147	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50717144_C_CCACTGCG:50717144:0,3,0,1
chr22	50718347	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=199,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:3,3,0,2
chr22	50718397	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr22	50719165	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr22	50719976	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,4,4
chr22	50720181	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	50721847	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.251:34:7,0:18,8:12,14,0,8
chr22	50724190	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	50729098	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=231,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50729098_G_A:50729098:0,1,0,1
chr22	50729105	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=231,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50729098_G_A:50729098:0,1,0,1
chr22	50729107	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=231,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50729098_G_A:50729098:0,1,0,1
chr22	50751988	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr22	50752150	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:6,2:0|1:50752150_C_T:50752150:5,4,2,1
chr22	50752169	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,1:3,2:0|1:50752150_C_T:50752150:5,3,3,1
chr22	50754052	.	TACTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr22	50754363	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,4:1,0,7,1
chr22	50755682	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr22	50757470	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr22	50757497	.	A	ATCTCTTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=213,69;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.366:3:1,0:1,1:0|1:50757497_A_ATCTCTTC:50757497:1,1,0,1
chr22	50757502	.	C	CTTTGTTAGCTCCATGTAACTTTTGTTGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=213,69;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,0:1,1:0|1:50757497_A_ATCTCTTC:50757497:1,1,0,1
chr22	50757541	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	50853132	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=15,28;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:0,4:0,1:0|1:50853132_TC_T:50853132:0,1,0,5
chr22	50853134	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:50853132_TC_T:50853132:0,1,0,5
chr22	50854475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:5,6,2,1
chr22	50860583	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50870620	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:3,1,8,0
chr22	50876077	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	50876235	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=168,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,6:1,1:2,1,5,2
chr22	50876357	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=79,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:1,2:3,5:1,4,2,5
chr22	50876755	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr22	50877208	.	G	GACATCTGACTCTGAATCTCCCCCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=150,37;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:50877208_G_GACATCTGACTCTGAATCTCCCCCA:50877208:0,4,1,1
chr22	50877211	.	GC	TT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=150,37;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:50877208_G_GACATCTGACTCTGAATCTCCCCCA:50877208:0,4,1,1
chr22	50882536	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:6,2,0,2
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chr22	50927394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50927376_G_T:50927376:0,0,1,0
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chr22	50927750	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=68,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:50927747_G_T:50927747:1,2,1,1
chr22	50927752	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=68,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:50927747_G_T:50927747:1,2,1,1
chr22	50942135	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50942135_G_A:50942135:2,1,1,0
chr22	50942159	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50942135_G_A:50942135:1,0,1,0
chr22	50942761	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.261:25:11,3:6,3:9,10,3,3
chr22	50943423	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:20,4:13,2:15,18,4,2
chr22	50946965	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	50954124	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=159,67;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.775:8:1,0:1,2:2,0,2,4
chr22	50956676	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,26:0.731:35:4,15:5,11:2,7,10,16
chr22	50960101	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:12,5:0,4:12,0,8,3
chr22	50961169	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr22	50961390	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,265;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:1,9,2,0
chr22	50961854	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	50962764	.	A	AAAGTGCTGGGATTACAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	50963003	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=82,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:19,1:21,0:0|1:50963003_A_G:50963003:21,24,1,1
chr22	50963005	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:21,2:18,0:0|1:50963003_A_G:50963003:22,24,1,1
chr22	50963006	.	TCCACC	T	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:21,2:19,0:0|1:50963003_A_G:50963003:22,25,1,1
chr22	50963014	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:22,2:20,0:0|1:50963003_A_G:50963003:23,21,1,1
chr22	50963015	.	ACCAAACATC	A	.	.	DP=55;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:21,2:19,0:0|1:50963003_A_G:50963003:28,25,1,1
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chr22	50969695	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=131,59;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:20,0:11,3:0|1:50969695_C_T:50969695:15,16,2,2
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chr22	50969703	.	GCT	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=136,59;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:19,0:10,4:0|1:50969695_C_T:50969695:17,17,2,2
chr22	50969707	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=140,59;MMQ=60,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:18,0:9,4:0|1:50969695_C_T:50969695:13,15,2,2
chr22	50969710	.	CC	TT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=136,59;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:17,0:10,4:0|1:50969695_C_T:50969695:13,16,2,2
chr22	50969717	.	GTACCTGC	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=136,59;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:17,0:9,2:0|1:50969695_C_T:50969695:14,16,0,2
chr22	50988193	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr22	50989368	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=112,125;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.125:62:30,7:23,0:24,31,7,0
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chr22	50994881	.	C	CAAAACAAAAACAAAAACAAAAGTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:50994879_T_C:50994879:0,4,1,1
chr22	51009953	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr22	51010052	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	51010788	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,2,10
chr22	51011936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,6,4
chr22	51015196	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51015196_T_G:51015196:2,0,0,1
chr22	51015198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51015196_T_G:51015196:2,0,0,1
chr22	51015210	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	51015481	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr22	51015501	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=180,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:3,1:4,0:0,7,0,2
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chr22	51015830	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=103,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:0|1:51015828_G_GCCCAGATCA:51015828:6,5,1,1
chr22	51015831	.	G	GGCTCCATCCTGTTAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=103,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.194:13:5,2:6,0:0|1:51015828_G_GCCCAGATCA:51015828:6,5,1,1
chr22	51018080	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.306:24:4,3:12,0:15,1,8,0
chr22	51018579	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr22	51020668	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,13:0,0,15,10
chr22	51020966	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,4:5,0:8,2,3,1
chr22	51039216	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr22	51045190	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,4,4
chr22	51045433	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,10,10
chr22	51045480	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr22	51048781	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,5,6
chr22	51048812	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=247,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:0,3:0,1,2,3
chr22	51063987	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr22	51064039	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,21,23
chr22	51064141	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr22	51115114	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=92,44;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:51115114_A_G:51115114:7,10,1,1
chr22	51115118	.	AAAGGTAAAGG	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=93,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,2:0|1:51115114_A_G:51115114:7,13,1,1
chr22	51115130	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=120,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:8,2:0|1:51115114_A_G:51115114:7,12,1,1
chr22	51115139	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=120,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:51115114_A_G:51115114:6,9,1,1
chr22	51137249	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr22	51149925	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,2:5,0:15,0,2,0
chr22	51150167	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr22	51169808	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	51176791	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:7,0:6,4:5,8,0,7
chr22	51182485	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr22	51182619	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=104,78;MMQ=43,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:0|1:51182619_G_A:51182619:4,8,1,1
chr22	51182623	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,78;MMQ=40,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:51182619_G_A:51182619:4,6,1,1
chr22	51183255	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=201,166;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,3,2
chr22	51183421	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	51208537	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,185;MMQ=33,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chrX	2700027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:1,0,6,0
chrX	2712738	.	G	GAGCAGCTTGCCTGAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2712738_G_GAGCAGCTTGCCTGAGC:2712738:0,0,0,1
chrX	2712741	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2712738_G_GAGCAGCTTGCCTGAGC:2712738:0,0,0,1
chrX	2729346	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,4,2
chrX	2732356	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=223,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.688:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chrX	2748292	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chrX	2773256	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=186,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chrX	2774478	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	2779481	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	2779570	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chrX	2825403	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chrX	2825754	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chrX	2827794	.	T	TA,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,14,22;MFRL=172,134,50;MMQ=60,60,45;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=36.50,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,17,4:0.638,0.172:26:2,1,2:3,6,1:3,2,6,15
chrX	2832661	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:12,4,0,2
chrX	2832668	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=97,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:12,4,1,1
chrX	2832696	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:8,5,1,2
chrX	2832708	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,1:6,2:0|1:2832708_G_T:2832708:7,6,1,3
chrX	2832715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:0|1:2832708_G_T:2832708:6,6,1,3
chrX	2832742	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chrX	2832860	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.281:12:4,3:3,0:0|1:2832860_G_A:2832860:2,7,1,2
chrX	2832871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=188,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,1:2,0:0|1:2832860_G_A:2832860:1,6,1,2
chrX	2833506	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	2833533	.	GTTACGCCC	G	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,23;MFRL=106,113;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,1:0|1:2833533_GTTACGCCC_G:2833533:3,4,0,2
chrX	2833551	.	AC	TG	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=23,30;MFRL=106,113;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:8,1:0,1:0|1:2833533_GTTACGCCC_G:2833533:4,5,0,2
chrX	2833580	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=106,225;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:10,2:3,1:7,6,0,3
chrX	2833605	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=31,24;MFRL=106,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:9,2:1,1:6,4,1,2
chrX	2833628	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:0|1:2833628_A_C:2833628:3,3,2,2
chrX	2833631	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,3:2,2:0|1:2833628_A_C:2833628:3,3,2,3
chrX	2833638	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=29,23;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,3:2,2:0|1:2833628_A_C:2833628:3,4,3,3
chrX	2833643	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,3:1,2:0|1:2833628_A_C:2833628:4,4,3,2
chrX	2833749	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=96,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.353:12:4,4:4,0:0|1:2833749_T_C:2833749:2,6,2,2
chrX	2833752	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=90,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:4,3:3,0:0|1:2833749_T_C:2833749:2,5,2,1
chrX	2833769	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=122,88;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:4,2:4,0:0|1:2833769_T_C:2833769:2,6,1,1
chrX	2833771	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=23,20;MFRL=122,88;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:4,2:4,0:0|1:2833769_T_C:2833769:2,6,1,1
chrX	2833786	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=154,88;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0|1:2833769_T_C:2833769:0,3,0,1
chrX	2833796	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=172,88;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:0,1:1,0:0|1:2833769_T_C:2833769:0,2,0,1
chrX	2833797	.	C	CTGCTGG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=190,88;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:2833769_T_C:2833769:0,1,0,1
chrX	2835831	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,5:8,2:11,0,7,0
chrX	2835863	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:5,3:13,3:11,7,6,0
chrX	2835964	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=26,24;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,17:0.409:42:11,6:14,11:0|1:2835964_G_A:2835964:16,9,7,10
chrX	2835985	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:14,3:14,6:0|1:2835964_G_A:2835964:16,12,2,7
chrX	2835989	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,10:0.275:38:12,4:13,6:0|1:2835964_G_A:2835964:16,12,2,8
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chrX	2836285	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:3,1:4,8:0|1:2836283_A_G:2836283:2,6,1,9
chrX	2836293	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:2,1:4,8:0|1:2836283_A_G:2836283:0,6,1,8
chrX	2856155	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,16,6
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chrX	2871369	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:2871354_CCTGTTTGTTATTT_C:2871354:0,1,1,1
chrX	2878334	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=205,179;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:2878334_AAG_A:2878334:3,0,1,0
chrX	2878339	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=205,179;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:2878334_AAG_A:2878334:3,0,1,0
chrX	2878341	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=185,179;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:2878334_AAG_A:2878334:4,0,1,0
chrX	2933287	.	TG	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=89,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:5,9,1,1
chrX	2951434	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chrX	2986260	.	TT	CC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=209,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0,13,1,1
chrX	2986272	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:0|1:2986272_C_T:2986272:0,10,0,3
chrX	2986274	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,3:4,0:0|1:2986272_C_T:2986272:0,10,0,3
chrX	2986278	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=204,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0|1:2986272_C_T:2986272:0,5,0,3
chrX	2999141	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	3002219	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	3002380	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,0:3,7:4,4,0,7
chrX	3190004	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0|1:3190004_G_A:3190004:0,0,2,6
chrX	3190027	.	T	TCTCACATGGCGGGAGCAGGAGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=204,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.377:3:1,1:1,0:0|1:3190004_G_A:3190004:0,2,0,1
chrX	3190297	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,8,8
chrX	3190504	.	C	CCCTTGAAGCCCTCAAAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=175,181;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	3190512	.	A	AACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=150,175;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3190512_A_AACC:3190512:0,1,0,1
chrX	3190515	.	GAT	CGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=150,175;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3190512_A_AACC:3190512:0,1,0,1
chrX	3236085	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236089	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236090	.	T	TAG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236091	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236095	.	A	ACC	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=22,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236096	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=21,20;MFRL=122,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,4,1,1
chrX	3236098	.	G	GCAGTATCTTC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:3236085_C_G:3236085:0,3,1,1
chrX	3238341	.	G	GACGAGGTGACTGGGAAGTTACAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=145,597;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3238341_G_GACGAGGTGACTGGGAAGTTACAAA:3238341:0,3,1,0
chrX	3238344	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=145,597;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3238341_G_GACGAGGTGACTGGGAAGTTACAAA:3238341:0,3,1,0
chrX	3238372	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=148,118;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,0:3,4:4,2,5,0
chrX	3238982	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,2:2,0:5,1,2,0
chrX	3239350	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:0|1:3239350_G_C:3239350:3,7,0,3
chrX	3239352	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0|1:3239350_G_C:3239350:3,7,0,3
chrX	3240343	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chrX	3241256	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chrX	3241284	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,7,7
chrX	3241317	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chrX	3530194	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	3533962	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=90,124;MMQ=52,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,3:0,10:1,0,7,6
chrX	3539358	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:2,2:1,4,0,2
chrX	3539376	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chrX	3539396	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chrX	3592847	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chrX	5827267	.	G	GTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=234,137;MMQ=43,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	5827379	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	6995397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chrX	7175291	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=97,451;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,4:9,0:11,9,0,4
chrX	7193970	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.433:7:1,1:2,2:3,1,3,0
chrX	7243304	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	7268045	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=214,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chrX	7889697	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=71,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chrX	7890035	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,0:4,4:4,3,4,0
chrX	8095173	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chrX	8138284	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	8434513	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,172;MMQ=27,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=128.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,62:0.832:74:6,0:5,52:3,9,0,62
chrX	8501195	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	8503641	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0|1:8503641_G_A:8503641:0,0,8,13
chrX	8503648	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=110,172;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:0|1:8503641_G_A:8503641:10,11,0,3
chrX	8504773	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chrX	9622450	.	T	TAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGA;STR;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chrX	9656179	.	TGCG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:9,1:9,1:15,8,0,2
chrX	9659549	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:4,1,3,0
chrX	9659790	.	A	AAAGAGAATCGCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=87,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.235:6:4,1:1,0:1,4,0,1
chrX	9660220	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=201,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:7,2,1,1
chrX	9661162	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:4,0:13,5:7,10,1,4
chrX	9661557	.	G	GCTGGATGGAATCTCAACCTCTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.664:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chrX	9684179	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.563:12:4,5:1,0:4,1,7,0
chrX	9709315	.	CT	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chrX	9859197	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chrX	9862311	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:2,20:4,0:6,0,20,0
chrX	9862887	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:9862887_C_T:9862887:1,6,1,1
chrX	9862890	.	ACCT	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=129,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:9862887_C_T:9862887:0,6,1,1
chrX	9862899	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:9862887_C_T:9862887:1,6,1,1
chrX	9862905	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:1,4,1,2
chrX	9864078	.	CCCGGAGTCACTGGAACA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,2:4,0:5,3,1,1
chrX	9866420	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	10062315	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:3,2:9,0:5,7,0,2
chrX	10085275	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:9,2:10,7,2,1
chrX	10090738	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,1:5,2:7,7,1,2
chrX	10104585	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:10104585_G_T:10104585:0,0,5,0
chrX	10104606	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0|1:10104585_G_T:10104585:0,0,9,0
chrX	10106752	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:14,9,2,0
chrX	10107056	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,398;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	10107389	.	T	TAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=23,37;RU=A;STR;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chrX	10153058	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:10153058_C_A:10153058:7,6,1,1
chrX	10153062	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:10153058_C_A:10153058:7,7,1,1
chrX	10155658	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,3,12
chrX	10176156	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=133,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:6,8,1,2
chrX	10176184	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:9,1:2,3:6,5,1,3
chrX	10188938	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=110,57;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,7:3,0:1,6,0,7
chrX	10491233	.	CAA	C,CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,18,29;MFRL=159,124,144163;MMQ=60,60,60;MPOS=20,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.71,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.335,0.339:6:2,0,1:0,0,1:0,2,1,3
chrX	11130333	.	T	TGGCTGGCTTGGCTGACTTGGCTGGCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=143,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:0,1:0,5,0,1
chrX	11132992	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:8,5,3,0
chrX	11135402	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:15,0:14,12,2,0
chrX	11187811	.	GAGAAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=107,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAC;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chrX	11272836	.	CAAA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.236:11:2,1:5,1:4,5,0,2
chrX	11313027	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chrX	11316846	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=93,45;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:16,9,3,0
chrX	11778471	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chrX	11779538	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chrX	11783502	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	11783953	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chrX	11786839	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chrX	11790366	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=56,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chrX	12516777	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:5,1,2,0
chrX	12628049	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	12633001	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:13,6,1,1
chrX	12633034	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chrX	12722616	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chrX	12724930	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=135,86;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.285:40:14,11:15,0:20,9,11,0
chrX	12725042	.	CTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:2,2:2,2:3,2,1,6
chrX	12725690	.	T	TGGGCTTTCCAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=73,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,2:0,0:0|1:12725690_T_TGGGCTTTCCAC:12725690:2,5,1,1
chrX	12725693	.	AG	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=73,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:7,2:0,0:0|1:12725690_T_TGGGCTTTCCAC:12725690:2,5,1,1
chrX	12725701	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,2,5
chrX	12734649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chrX	12738684	.	A	AAATATTATTGTTACTAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=98,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chrX	12905306	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:12905306_C_A:12905306:2,3,1,1
chrX	12905309	.	C	CTGCTTGCAACCTAATCCCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0|1:12905306_C_A:12905306:2,3,1,1
chrX	12906671	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:4,3,2,0
chrX	12924697	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	12937217	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:6,4,3,0
chrX	12937980	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=83,98;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:5,4,3,0
chrX	12939412	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chrX	12994867	.	CTTTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,20,20,19;MFRL=154,86,68,157;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,16,8;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.25,5.38,4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,5,4,4:0.168,0.211,0.220:22:6,2,2,0:3,1,0,0:9,0,4,9
chrX	13061302	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=90,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:11,14,2,0
chrX	13624691	.	C	CACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	13645364	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chrX	13645375	.	G	GAGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=102,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:13645375_G_GAGA:13645375:1,5,1,1
chrX	13645381	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13645375_G_GAGA:13645375:1,3,0,1
chrX	13681883	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=65.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.532:43:10,0:10,22:8,12,0,23
chrX	13682650	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.125:41:17,0:18,4:16,20,3,2
chrX	13683603	.	TTT	AGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=233,188;MMQ=42,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13683603_TTT_AGA:13683603:0,1,0,1
chrX	13683608	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=233,188;MMQ=42,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13683603_TTT_AGA:13683603:0,1,0,1
chrX	13683614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,15;MFRL=233,188;MMQ=42,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:13683603_TTT_AGA:13683603:0,1,0,1
chrX	13683619	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=233,188;MMQ=42,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13683603_TTT_AGA:13683603:0,1,0,1
chrX	13683627	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=233,188;MMQ=42,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13683603_TTT_AGA:13683603:0,1,0,1
chrX	13734539	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chrX	13737928	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chrX	13764955	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=74,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:11,13,3,0
chrX	13767718	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chrX	13771576	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,10:0,0,15,11
chrX	13779124	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chrX	13779409	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,0:0,0,0,2
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chrX	13803960	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chrX	13825946	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chrX	14038169	.	G	GTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,465;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chrX	14039621	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=97,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,2:23,0:0|1:14039621_G_A:14039621:10,27,0,2
chrX	14039634	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=72,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:21,2:21,0:0|1:14039621_G_A:14039621:6,39,0,2
chrX	14548212	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:5,0:0|1:14548212_C_CT:14548212:7,6,1,1
chrX	14548216	.	T	TAACA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=121,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:14548212_C_CT:14548212:7,6,1,1
chrX	14548217	.	T	TCACAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:14548212_C_CT:14548212:7,6,1,1
chrX	14550352	.	T	TAAAAGTTTAAAAATGGGCCAGCCACG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=70,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:6,2:12,0:10,9,1,1
chrX	15277172	.	A	ATCATTTTGATGTTTGTGAGAGTTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=211,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	15301785	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=20,14;MFRL=74,235;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:5,0:0|1:15301785_A_T:15301785:2,3,0,2
chrX	15301787	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=20,20;MFRL=74,235;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:3,1:0|1:15301785_A_T:15301785:2,3,0,2
chrX	15301790	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=31,12;MFRL=73,195;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:2,0:0|1:15301785_A_T:15301785:1,2,0,3
chrX	15301794	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,14;MFRL=74,195;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,0:0|1:15301785_A_T:15301785:0,2,0,3
chrX	15301795	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=195,73;MMQ=42,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15301795_G_A:15301795:0,3,0,1
chrX	15301797	.	T	G,A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,13,27;MFRL=0,195,73;MMQ=60,42,60;MPOS=11,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.19,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.571,0.286:4:0,0,0:0,1,1:0,0,0,4
chrX	15301801	.	G	GCTGAAAATTGAATTGCTA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=26,33;MFRL=195,73;MMQ=42,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15301795_G_A:15301795:0,3,0,1
chrX	15301802	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,12;MFRL=73,195;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,1:0|1:15301785_A_T:15301785:0,1,0,3
chrX	15301828	.	A	ATGTGGCTCAGAGAACCACGCAAT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=24,23;MFRL=0,274;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	15365219	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:7,1,4,0
chrX	15373259	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chrX	15473925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=163,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chrX	15561367	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:15561367_G_T:15561367:0,1,0,1
chrX	15561369	.	C	CATATATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15561367_G_T:15561367:0,1,0,1
chrX	15568117	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=79,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,1:12,1:0|1:15568117_C_T:15568117:3,10,0,2
chrX	15568118	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=96,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,3:0.233:15:2,0:10,3:1|0:15568117_C_T:15568117:2,10,1,2
chrX	15591684	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	15607648	.	CATAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:15607648_CATAG_C:15607648:0,3,0,1
chrX	15607656	.	AGCC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=209,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15607648_CATAG_C:15607648:0,2,0,1
chrX	15607660	.	TTGCTGGGAGGTTAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=209,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15607648_CATAG_C:15607648:0,2,0,1
chrX	15613227	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	15706830	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=187,174;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,3:0,1,0,8
chrX	15709201	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chrX	15709454	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chrX	15711209	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,105;MMQ=27,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,3:5,8:2,7,2,9
chrX	15768218	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:16,0:5,4:10,11,0,4
chrX	15780978	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=250,119;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,7:0,10:1,0,6,11
chrX	15782887	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=262,246;MMQ=40,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:15782887_C_A:15782887:0,1,0,1
chrX	15782895	.	T	TATAAGAACACAATGTTGGCCGGGCGAGATAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=262,246;MMQ=40,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15782887_C_A:15782887:0,1,0,1
chrX	15792527	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chrX	15794815	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chrX	15800600	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chrX	15817963	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,5:0,22:0,0,15,13
chrX	15818060	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=99,62;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:15818060_C_T:15818060:7,11,1,1
chrX	15818064	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=99,62;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:15818060_C_T:15818060:7,11,1,1
chrX	15818065	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,62;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:15818060_C_T:15818060:6,11,1,1
chrX	15818114	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chrX	15822006	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,156;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chrX	15822013	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,187;MMQ=40,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chrX	15827524	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	15836648	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chrX	15863540	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=128,149;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,0:13,3:16,6,3,0
chrX	15863953	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chrX	16142498	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=69,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chrX	16170423	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=129,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:11,0:9,7:6,14,0,7
chrX	16638321	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chrX	16638333	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=156,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chrX	16657017	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:16657017_G_T:16657017:6,3,1,1
chrX	16657026	.	A	AAGTTACAAACCCAGAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=39,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:16657017_G_T:16657017:6,4,1,1
chrX	16657028	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=39,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,0:0|1:16657017_G_T:16657017:6,4,1,1
chrX	16701386	.	TAACAGAACATCACA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	16709626	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chrX	16711202	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,3,5
chrX	16804743	.	GG	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,294;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chrX	16877008	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=129,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:5,1:7,1:0|1:16877008_T_A:16877008:4,9,1,1
chrX	16877010	.	A	ACACACATAGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=129,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,0:0|1:16877008_T_A:16877008:4,9,1,1
chrX	17086436	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,72;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chrX	17153521	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,3:4,0:0|1:17153521_AG_A:17153521:1,6,0,3
chrX	17153525	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:0|1:17153521_AG_A:17153521:1,6,0,3
chrX	17653839	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17653839_C_CTA:17653839:0,1,0,1
chrX	17653841	.	A	AACTAGCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17653839_C_CTA:17653839:0,1,0,1
chrX	17705850	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	17750056	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:10,8,1,2
chrX	17750263	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=130,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:8,8,1,3
chrX	17750375	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:4,3:13,0:5,12,1,2
chrX	17768493	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	17770172	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:17770172_G_A:17770172:0,3,0,1
chrX	17770176	.	G	GAAACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:17770172_G_A:17770172:0,3,0,1
chrX	17819377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,12,6
chrX	18234703	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,0:10,5:6,8,0,5
chrX	18260697	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=92,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,2:1,0:3,5,1,1
chrX	18260716	.	A	ATAGCATAAATTTGGAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=109,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.240:6:4,1:1,0:1,4,0,1
chrX	18582646	.	GAT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.753:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chrX	18600019	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=93,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:9,9,2,1
chrX	18622236	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=107,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:4,0:25,15:18,12,0,15
chrX	18627624	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,11;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,0:9,0:3,9,0,2
chrX	18631193	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=135,117;MMQ=40,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:11,0,2,0
chrX	18664093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,0:6,3:8,1,0,3
chrX	18668641	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:6,7,1,1
chrX	18800531	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=91,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:0,1:1,2:1,1,0,3
chrX	18913399	.	C	CATATAAAAAATACATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	18917200	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chrX	18924056	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18924056_G_A:18924056:0,1,0,1
chrX	18924060	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18924056_G_A:18924056:0,0,0,1
chrX	18924061	.	G	GAATATTTAAAGCCAGCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18924056_G_A:18924056:0,0,0,1
chrX	18924064	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18924056_G_A:18924056:0,0,0,1
chrX	18924066	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18924056_G_A:18924056:0,0,0,1
chrX	18929163	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18929163_A_G:18929163:0,0,0,1
chrX	18929180	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18929163_A_G:18929163:0,0,0,1
chrX	18929183	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:18929163_A_G:18929163:0,0,0,1
chrX	19014299	.	A	ACACCAGCTCCATTTTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chrX	19017478	.	TAACATTTTACTGA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	19018172	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=151,201;MMQ=44,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chrX	19018174	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=168,144;MMQ=44,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chrX	19018175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=168,121;MMQ=44,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:19018175_G_A:19018175:0,4,0,1
chrX	19018177	.	TCTCG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=168,121;MMQ=44,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:19018175_G_A:19018175:0,4,0,1
chrX	19037607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=208,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chrX	19045473	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chrX	19054185	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19054185_C_T:19054185:0,1,0,1
chrX	19054188	.	A	AATTAAAAAAAAATTCCCTAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19054185_C_T:19054185:0,1,0,1
chrX	19058405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chrX	19086800	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.228:15:4,0:2,2:6,6,2,1
chrX	19367346	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chrX	19368226	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=71,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:7,0:9,3:7,10,0,4
chrX	19371335	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,248;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.369:36:14,0:9,13:7,16,0,13
chrX	19373735	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:2,1:1,3,0,2
chrX	19377801	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:3,0:0,2:0|1:19377801_G_T:19377801:1,2,1,1
chrX	19377804	.	G	GTTGTTCAGTCACTTCTAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:2,0:0,2:0|1:19377801_G_T:19377801:1,2,1,1
chrX	19380975	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	19389184	.	TAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=155,123;MMQ=48,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.163:23:4,1:5,0:2,18,0,3
chrX	19390727	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:4,2,3,0
chrX	19410454	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,5:9,0:7,5,5,0
chrX	19425424	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19425424_G_GT:19425424:0,1,0,1
chrX	19425429	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19425424_G_GT:19425424:0,1,0,1
chrX	19606998	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.693:1:0,0:0,0:0|1:19606998_C_CAA:19606998:0,0,0,1
chrX	19606999	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19606998_C_CAA:19606998:0,0,0,1
chrX	19688957	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30,32;MFRL=117,121,98;MMQ=60,60,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=8.22,10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,7,9:0.158,0.269:37:12,3,5:6,4,4:6,15,10,6
chrX	19713206	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:4,6,0,2
chrX	19854283	.	ATCTGTCCCTCCCACCAGCCTCCATCCTCCTTCCTGATGTTGG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.128:22:8,2:7,0:8,12,1,1
chrX	19955746	.	AATT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=171,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	19983487	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=102,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chrX	20034235	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.099:37:19,0:15,3:25,9,3,0
chrX	20148664	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=139,274;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,3:11,0:5,9,0,3
chrX	20190806	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chrX	20194363	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=127,289;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,1:13,0:8,17,2,0
chrX	20204548	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chrX	20236935	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=100,55;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:6,0:16,3:11,12,0,3
chrX	21516016	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chrX	21579722	.	A	AAGCCTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=86,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chrX	21666912	.	C	CTTTTTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=140,67;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=25,34;RU=T;STR;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:0,3:1,2:4,0,6,2
chrX	21674923	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=173,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:0|1:21674923_C_A:21674923:2,5,1,1
chrX	21674924	.	T	TGGTAGAAGGAGAAGGAGGAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=173,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:21674923_C_A:21674923:2,5,1,1
chrX	21772465	.	TCCTCA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0|1:21772465_TCCTCA_T:21772465:0,4,1,1
chrX	21772475	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:21772465_TCCTCA_T:21772465:0,6,1,1
chrX	21861434	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chrX	21874560	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,4,4
chrX	21874783	.	G	GTGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,33;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0|1:21874783_G_GTGA:21874783:4,3,1,1
chrX	21874789	.	CA	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=102,33;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:21874783_G_GTGA:21874783:5,3,1,1
chrX	21875821	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chrX	21899134	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:2,16,0,3
chrX	21985464	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chrX	22003324	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=94,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.278:44:15,11:16,0:14,18,12,0
chrX	22010630	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chrX	22051034	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chrX	22115203	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=141,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chrX	22132770	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chrX	22186532	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:22186532_T_TA:22186532:5,7,1,1
chrX	22186536	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:5,2:0|1:22186532_T_TA:22186532:5,7,1,1
chrX	22237172	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=89,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:0,4:5,0:2,3,5,0
chrX	22239711	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:7,2,0,2
chrX	23398059	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=85,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,1:10,2:10,11,0,3
chrX	23398465	.	T	TGTAGATTCTGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23398465_T_TGTAGATTCTGGA:23398465:0,0,0,1
chrX	23398468	.	AC	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23398465_T_TGTAGATTCTGGA:23398465:0,0,0,1
chrX	23682589	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	23682877	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chrX	23685964	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chrX	23689636	.	AT	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,7,4
chrX	23693084	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.322:13:3,3:5,1:7,2,4,0
chrX	23700473	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,3:0,17:0,0,18,3
chrX	23700693	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	23701662	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chrX	23701927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=213,268;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chrX	23724062	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=60,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chrX	23724663	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,16,1
chrX	23724675	.	CA	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=105,158;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.284:22:1,1:4,2:5,11,3,3
chrX	23740139	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:7,4:1,10,0,4
chrX	23740681	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=189,177,177;MMQ=60,40,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.71,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.401,0.299:7:1,1,0:1,2,1:2,0,5,0
chrX	23740837	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:9,0:6,12,0,3
chrX	23761122	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	23801593	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,5,7
chrX	23801702	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chrX	23886691	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,18:0,9:0,0,17,10
chrX	23886856	.	A	AATTACATTAAGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chrX	23899112	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	23925834	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,7:0,3:0,1,6,7
chrX	23930070	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=150,174;MMQ=57,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chrX	23953422	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:7,2,3,0
chrX	23956810	.	A	ATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,0:8,9:5,9,0,9
chrX	24007151	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	24084241	.	G	GT,GTT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,33,30;MFRL=98,129,90;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=18.09,14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,10,7:0.471,0.329:21:4,3,4:0,6,3:1,3,6,11
chrX	24084257	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=124,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.155:25:10,0:6,2:6,15,2,2
chrX	24190977	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chrX	24225362	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,76;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chrX	24330380	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,63;MMQ=53,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:6,2:0|1:24330380_C_T:24330380:12,5,1,1
chrX	24330389	.	C	CAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,63;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:24330380_C_T:24330380:8,5,1,1
chrX	24382173	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=262,105;MMQ=40,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chrX	24382184	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=105,263;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chrX	24382200	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=164,94;MMQ=40,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:7,1,3,1
chrX	24382950	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chrX	24383026	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,63;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:7,4,1,1
chrX	24383061	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chrX	24383620	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=71,126;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chrX	24516925	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.427:16:3,4:4,3:8,1,6,1
chrX	24536954	.	GCACACACACACACACACA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=158,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=21,12;RU=CA;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.388:9:0,0:0,3:4,2,2,1
chrX	24552093	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.589:32:6,8:7,11:5,8,0,19
chrX	24557178	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chrX	24593275	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=177,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24593275_A_T:24593275:4,1,1,1
chrX	24593276	.	GGAAGT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:3,0:0|1:24593275_A_T:24593275:6,2,1,1
chrX	24608274	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,0:1,2,1,1
chrX	24637013	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,191;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chrX	24735750	.	GCAGTTTCTCAGTGCAAGAAGTTCAAGTGGATTC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=109,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:6,1:8,0:9,13,1,1
chrX	24735940	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chrX	24750578	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:5,2:1,1:2,4,2,1
chrX	24751958	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,14:0,0,13,17
chrX	24751987	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,1:5,1:6,16,0,2
chrX	24760276	.	ACC	A,AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21,22;MFRL=0,56,154;MMQ=60,60,60;MPOS=28,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=3.78,6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.378,0.511:5:0,0,2:0,1,0:0,0,0,5
chrX	24761398	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:6,3,2,0
chrX	24766651	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chrX	24833074	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=164,0;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	24833091	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=0,164;MMQ=30,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:24833091_TG_T:24833091:1,0,1,0
chrX	24833100	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,82;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chrX	24833102	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,14;MFRL=0,164;MMQ=30,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:24833091_TG_T:24833091:1,0,1,0
chrX	25025355	.	AGGCGGCGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chrX	25031362	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=99,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chrX	26157045	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chrX	26157058	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chrX	26158233	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	26213364	.	T	TTTGTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chrX	26235887	.	GATATGATGCAAAT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:5,2,1,1
chrX	27765417	.	G	GAGAGTTCAAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=213,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	27766466	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=114,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:4,4:7,0:5,6,4,0
chrX	27766702	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,148;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,9:4,0:6,3,0,9
chrX	27840002	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:5,2:0,0:1,5,2,0
chrX	27840938	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=187,148;MMQ=45,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chrX	27840950	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=168,164;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27840950_G_A:27840950:0,4,0,1
chrX	27840960	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=187,164;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27840950_G_A:27840950:0,2,0,1
chrX	27840976	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	28807442	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chrX	28807577	.	A	AATTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=85,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:28807577_A_AATTTCCT:28807577:1,1,0,1
chrX	28807580	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=85,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28807577_A_AATTTCCT:28807577:1,1,0,1
chrX	29417510	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	30237824	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:4,1:9,0,2,1
chrX	30268900	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:1,2:11,1:0|1:30268900_C_G:30268900:6,6,0,3
chrX	30268903	.	CA	TT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:1,2:11,1:0|1:30268900_C_G:30268900:6,6,0,3
chrX	30269516	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,1,1
chrX	30322895	.	C	CTCCTTTGCCCTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0|1:30322895_C_CTCCTTTGCCCTG:30322895:3,2,1,1
chrX	30322896	.	A	ATCTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0|1:30322895_C_CTCCTTTGCCCTG:30322895:3,2,1,1
chrX	30322993	.	G	GTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30322993_G_GTAAA:30322993:0,1,0,1
chrX	30322994	.	C	CTTGAAGGTGTTCTGTGAATGCTGTACAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30322993_G_GTAAA:30322993:0,1,0,1
chrX	30326562	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=163,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chrX	30578325	.	G	GATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chrX	30635748	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,99;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,0:10,3:3,9,2,1
chrX	30709353	.	TC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,104;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.588:27:9,0:2,16:3,8,0,16
chrX	30872793	.	GGTGGA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=87,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,2:7,0:9,5,1,1
chrX	30877634	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,45;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,3:20,0:9,25,3,0
chrX	31090061	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:12,17:9,0:14,7,17,0
chrX	31165667	.	AAAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chrX	31191589	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chrX	31198487	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=99,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:13,10,0,2
chrX	31200832	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,1:0,3:0,0,4,2
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chrX	31224881	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	31227614	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:10,6:22,0:16,17,6,0
chrX	31227761	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,0:8,2:6,11,1,1
chrX	31279092	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:31279092_G_T:31279092:9,10,1,1
chrX	31279097	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:31279092_G_T:31279092:9,11,1,1
chrX	31279102	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:31279092_G_T:31279092:9,11,1,1
chrX	31279103	.	A	ATGTCG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=102,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,0:10,2:0|1:31279092_G_T:31279092:9,11,1,1
chrX	31646044	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=274,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31646044_A_AC:31646044:0,1,0,1
chrX	31646045	.	T	TGGAGAGAGACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=274,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31646044_A_AC:31646044:0,1,0,1
chrX	31854782	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chrX	32360138	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	32363964	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chrX	32404499	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=119,35;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:32404499_C_T:32404499:3,5,1,1
chrX	32404502	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=119,35;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:5,0:0|1:32404499_C_T:32404499:3,5,1,1
chrX	32404503	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=119,35;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:5,0:0|1:32404499_C_T:32404499:3,5,1,1
chrX	32404505	.	T	TGA	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=71,35;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:32404499_C_T:32404499:3,3,1,1
chrX	32404508	.	C	CCA	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=0,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:32404499_C_T:32404499:2,3,1,1
chrX	32404509	.	T	TTCGA	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=0,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:32404499_C_T:32404499:2,3,1,1
chrX	32404512	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=71,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,2:4,0:0|1:32404499_C_T:32404499:2,2,1,1
chrX	32481676	.	A	AGATTATTC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:0|1:32481676_A_AGATTATTC:32481676:5,2,1,1
chrX	32481679	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:32481676_A_AGATTATTC:32481676:5,2,1,1
chrX	32481681	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:32481676_A_AGATTATTC:32481676:5,2,1,1
chrX	32481700	.	A	AATATCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=71,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32481700_A_AATATCT:32481700:1,1,0,1
chrX	32481703	.	G	GTATCTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=71,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32481700_A_AATATCT:32481700:1,1,0,1
chrX	32509367	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=80,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:10,9:10,0:12,8,9,0
chrX	32563263	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chrX	32563488	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chrX	32583717	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	32659551	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chrX	32716110	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chrX	32717258	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chrX	34657442	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,3:6,0:10,2,1,2
chrX	34962459	.	G	GTCCCATCTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:34962459_G_GTCCCATCTC:34962459:4,8,1,1
chrX	34962461	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:34962459_G_GTCCCATCTC:34962459:4,8,1,1
chrX	34962463	.	T	TGGAACCTCCCAACAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=78,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:34962459_G_GTCCCATCTC:34962459:4,8,1,1
chrX	35644805	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=259,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chrX	35820265	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chrX	35821218	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,1,1
chrX	35821231	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=53,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:35821231_A_T:35821231:2,2,0,1
chrX	35821234	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:35821231_A_T:35821231:1,2,0,1
chrX	35821236	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=53,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:35821231_A_T:35821231:2,2,0,1
chrX	35821558	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chrX	35821594	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chrX	35938045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=40242680,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,10:1,6:1,0,9,7
chrX	35969417	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=166,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:35969417_A_G:35969417:5,9,1,1
chrX	35969422	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=157,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:35969417_A_G:35969417:3,9,1,1
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chrX	36090053	.	A	AAAAGAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=118,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:36090043_A_T:36090043:4,2,1,1
chrX	36091509	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chrX	36122833	.	ACAAATTATTG	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:9,0:3,12,1,1
chrX	36122881	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=119,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,0:3,1:0|1:36122881_A_T:36122881:0,4,0,1
chrX	36122883	.	AC	TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:0|1:36122881_A_T:36122881:0,5,0,1
chrX	36122886	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0|1:36122881_A_T:36122881:0,5,0,1
chrX	36156447	.	AT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26,26;MFRL=123,121,223;MMQ=60,60,60;MPOS=0,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.88,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.202,0.203:17:5,2,1:5,1,2:10,1,5,1
chrX	36162684	.	C	CTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chrX	36317167	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,4:8,0:11,10,0,4
chrX	36325090	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=209,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	36337366	.	A	AAATTTTTTATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=160,27;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chrX	36368166	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chrX	36385054	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36385054_C_T:36385054:2,0,1,0
chrX	36385060	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36385054_C_T:36385054:2,0,1,0
chrX	36385087	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:36385087_CAT_C:36385087:2,0,1,0
chrX	36385092	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,0:0|1:36385087_CAT_C:36385087:2,0,1,0
chrX	37026691	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=101,45;MMQ=52,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:3,0:7,2:0|1:37026691_G_C:37026691:6,5,1,1
chrX	37026697	.	C	CTGCCTCTTTTCTGTCTTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=112,45;MMQ=51,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:6,2:0|1:37026691_G_C:37026691:5,6,1,1
chrX	37027695	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chrX	37265461	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:3,3:8,0:6,6,3,0
chrX	37515149	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=224,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37515149_G_A:37515149:0,1,0,1
chrX	37515152	.	A	ACTGATTCTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=224,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37515149_G_A:37515149:0,1,0,1
chrX	37527573	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	37639261	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chrX	37642809	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:13,9:11,0:11,14,9,0
chrX	37699990	.	CACACACACACAT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,153;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:3,3:0,8,0,5
chrX	37700014	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=157,191;MMQ=44,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:2,1:3,4:0,6,0,8
chrX	37705714	.	A	AAGAAGAATATTTTGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	37850182	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,0:9,3:10,7,2,1
chrX	37850327	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=147,259;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:4,8,7,1
chrX	37962345	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,2:5,1:4,7,0,3
chrX	37985963	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=55,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:1,0:5,2:0|1:37985963_A_C:37985963:3,4,1,1
chrX	37985967	.	G	GTGAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=55,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:37985963_A_C:37985963:3,3,1,1
chrX	38037620	.	C	CAGCTTGTGTCACCATTGAGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chrX	38147163	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,52;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:14,2:0|1:38147163_G_A:38147163:8,18,1,1
chrX	38147170	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,52;MMQ=60,48;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:15,2:0|1:38147163_G_A:38147163:8,19,1,1
chrX	38147172	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=107,52;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:38147163_G_A:38147163:8,19,1,1
chrX	38150801	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38150803	.	A	ATCAAT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38150807	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38150808	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38150814	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38150815	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38150801_AG_A:38150801:0,0,0,1
chrX	38160665	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:38160665_C_A:38160665:1,1,1,1
chrX	38160666	.	T	TAGAGGAAATCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:38160665_C_A:38160665:1,1,1,1
chrX	38178019	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38178019_G_A:38178019:0,0,1,0
chrX	38178039	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:38178019_G_A:38178019:4,0,1,0
chrX	38226757	.	G	GCGTTTCAAAACTTCTCTATGAAAAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	38262808	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chrX	38263062	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38263062_C_G:38263062:0,0,0,1
chrX	38263066	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38263062_C_G:38263062:0,0,0,1
chrX	38263067	.	AAAGCTCTCTTCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=217,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38263062_C_G:38263062:0,1,0,1
chrX	38664393	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=130,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:5,2:0|1:38664393_A_G:38664393:9,11,1,1
chrX	38664398	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:5,2:0|1:38664393_A_G:38664393:10,10,1,1
chrX	38664817	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.656:13:2,3:2,5:2,2,6,3
chrX	38665062	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=99,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:0|1:38665062_TG_T:38665062:4,16,0,2
chrX	38665065	.	T	TCA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=99,246;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:9,1:0|1:38665062_TG_T:38665062:4,16,0,2
chrX	38665069	.	T	TCC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=107,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,1:8,1:0|1:38665062_TG_T:38665062:3,15,0,2
chrX	38665070	.	T	TTA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=107,246;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,1:6,1:0|1:38665062_TG_T:38665062:3,15,0,2
chrX	40456536	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:14,10,1,1
chrX	40456731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,162;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,0,2
chrX	40456961	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	40514322	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chrX	40518809	.	A	ACTGTGCTGCATTCCAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chrX	40526191	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	40551523	.	GC	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:10,8,2,0
chrX	40556492	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	40568621	.	C	CCATGGTGGAAAAGGGACTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:2,6,1,1
chrX	40588605	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:0,1:0,0:0,3,1,2
chrX	40988338	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:0|1:40988338_A_G:40988338:11,12,1,1
chrX	40988348	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:0|1:40988338_A_G:40988338:10,11,1,1
chrX	41000361	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,156;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,4:9,0:6,12,4,0
chrX	41029302	.	AC	GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:9,3:19,0:13,15,3,0
chrX	41029838	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:13,0:7,4:9,11,4,0
chrX	41047459	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:41047459_A_ATT:41047459:0,4,0,1
chrX	41047460	.	A	ATTGTTATTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:41047459_A_ATT:41047459:0,4,0,1
chrX	41047462	.	A	ATTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:41047459_A_ATT:41047459:0,4,0,1
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chrX	41203744	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=155,131;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:41203741_A_G:41203741:0,2,0,1
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chrX	41554814	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,9,2
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chrX	41588169	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,11,12
chrX	41589234	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:9,1:12,2:12,11,1,2
chrX	43542821	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,0:9,4:8,15,2,2
chrX	43595428	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chrX	43601142	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chrX	43601363	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	43603643	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=104,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.168:22:10,0:8,3:10,9,0,3
chrX	43656552	.	GGAGAGCAGCTTCTT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=121,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43656552_GGAGAGCAGCTTCTT_G:43656552:0,3,0,1
chrX	43656568	.	ATTCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=61,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43656552_GGAGAGCAGCTTCTT_G:43656552:0,2,0,1
chrX	43741616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chrX	44094685	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chrX	44120630	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	44202890	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,5,5
chrX	44401934	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=108,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:4,3:2,1:5,2,4,0
chrX	44833826	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chrX	44833841	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chrX	44834045	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chrX	44897039	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	44913052	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chrX	44918241	.	C	CTTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:8,0:0|1:44918241_C_CTTG:44918241:8,8,1,1
chrX	44918242	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:0|1:44918241_C_CTTG:44918241:8,8,1,1
chrX	44918246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=157,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,2:4,0:8,8,1,1
chrX	44920068	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	44928978	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:6,12,1,1
chrX	44935924	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,27;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chrX	44949951	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.339:10:3,2:3,1:6,1,3,0
chrX	44950178	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	44966795	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chrX	44966805	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=50.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chrX	45013061	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chrX	45016990	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=103,50;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,0:5,2:8,6,1,1
chrX	45017006	.	C	CTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=122,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:45017006_C_CTG:45017006:8,8,1,1
chrX	45017008	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:0|1:45017006_C_CTG:45017006:6,8,1,1
chrX	45050973	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chrX	45051258	.	G	GTCAGCAA	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:45051258_G_GTCAGCAA:45051258:1,4,1,1
chrX	45051260	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:45051258_G_GTCAGCAA:45051258:1,4,1,1
chrX	45051273	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=145,147;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:1,2,0,1
chrX	45051274	.	A	AGAAGGG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,19;MFRL=145,147;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:1,2,0,1
chrX	45051276	.	C	CATATTATAAAA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,18;MFRL=145,147;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:1,2,0,1
chrX	45051278	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=145,147;MMQ=60,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:1,2,0,1
chrX	45051280	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=145,147;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:1,2,0,1
chrX	45051284	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=23,25;MFRL=166,147;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:45051273_T_TC:45051273:0,3,0,1
chrX	45605664	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,4:12,0:11,14,1,3
chrX	45606561	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:45606561_TC_T:45606561:3,1,0,1
chrX	45606563	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:45606561_TC_T:45606561:3,1,0,1
chrX	46322709	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=103,0;MMQ=58,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0|1:46322709_C_T:46322709:2,6,0,2
chrX	46322716	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=81,0;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:46322709_C_T:46322709:3,6,0,2
chrX	46332444	.	ATGATGGATG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:14,5,1,1
chrX	46387773	.	GCCTGT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,1:0|1:46387773_GCCTGT_G:46387773:4,4,1,1
chrX	46387785	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:46387773_GCCTGT_G:46387773:4,5,1,1
chrX	46433822	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:46433822_G_GC:46433822:1,2,0,1
chrX	46433824	.	T	TTACCGCCCCCGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:46433822_G_GC:46433822:1,2,0,1
chrX	46433855	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chrX	46466662	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46466662_C_CA:46466662:0,1,0,1
chrX	46466671	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46466662_C_CA:46466662:0,1,0,1
chrX	46466674	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46466662_C_CA:46466662:0,1,0,1
chrX	46472666	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chrX	46472826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chrX	46472849	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=120,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:46472849_G_GGT:46472849:2,1,0,1
chrX	46472852	.	A	AGCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=120,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:46472849_G_GGT:46472849:2,1,0,1
chrX	46472853	.	A	ATCAACTAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=120,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:46472849_G_GGT:46472849:2,1,0,1
chrX	46713115	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:46713115_C_T:46713115:2,6,1,1
chrX	46713117	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:46713115_C_T:46713115:2,6,1,1
chrX	46713119	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=145,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:46713115_C_T:46713115:2,6,1,1
chrX	46845047	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,6:3,0:7,0,6,0
chrX	46887313	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=181,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,2:15,0:13,7,1,1
chrX	46893249	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chrX	46917677	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=98,82;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.169:39:16,0:17,6:17,16,0,6
chrX	46918371	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:46918371_G_A:46918371:0,2,1,0
chrX	46918374	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46918371_G_A:46918371:0,2,1,0
chrX	46940515	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:12,3,1,2
chrX	46949403	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chrX	46951004	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	46952219	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	47003801	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47003801_A_C:47003801:0,0,1,0
chrX	47003809	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47003801_A_C:47003801:0,0,1,0
chrX	47003816	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,11;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47003801_A_C:47003801:0,0,1,0
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chrX	47060859	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chrX	47061018	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,10:0,0,14,11
chrX	47063003	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=134,42;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:11,3:14,10,2,1
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chrX	47065031	.	G	GCAGACAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=128,99;MMQ=60,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:47065028_G_A:47065028:0,2,0,1
chrX	47072567	.	C	CAACCACCATTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chrX	47086347	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chrX	47086681	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,1:5,1:2,5,1,1
chrX	47087933	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=90,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:47087933_C_T:47087933:3,1,1,0
chrX	47087935	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=90,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:47087933_C_T:47087933:3,1,1,0
chrX	47099816	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,0:10,2:10,8,1,1
chrX	47099920	.	A	ATATCTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chrX	47100240	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,61;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:10,3:4,12,1,2
chrX	47106419	.	CA	C,CAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29,24;MFRL=153,147,96;MMQ=60,60,60;MPOS=6,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.26,10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,8:0.216,0.438:18:0,1,3:4,2,1:4,2,5,7
chrX	47230204	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chrX	47308894	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=168,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:2,8,0,2
chrX	47315351	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=126,44;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,0:8,5:3,11,0,5
chrX	47315456	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chrX	47342920	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	47343980	.	GTACATTAGGGATAT	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:11,2:14,0:17,20,1,1
chrX	47344204	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47344204_A_T:47344204:0,3,0,1
chrX	47344207	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=202,238;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.512:4:1,0:1,0:1|0:47344204_A_T:47344204:0,2,0,2
chrX	47426043	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,19;MFRL=92,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,1:0|1:47426043_G_C:47426043:2,2,2,0
chrX	47426045	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:47426043_G_C:47426043:3,2,2,0
chrX	47426048	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:47426043_G_C:47426043:3,2,2,0
chrX	47426052	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,2:0|1:47426043_G_C:47426043:3,3,2,0
chrX	47426646	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:7,9,2,1
chrX	47435937	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:8,0:10,7:11,8,0,7
chrX	47444278	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chrX	47444875	.	TTTGGCAGC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGGCAGC;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:6,6,1,1
chrX	47464377	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=86,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:6,2:6,2,2,0
chrX	47464409	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=98,110;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:10,3,0,2
chrX	47478686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chrX	47479167	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47479167_C_CA:47479167:0,0,0,1
chrX	47479168	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47479167_C_CA:47479167:0,0,0,1
chrX	47479171	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47479167_C_CA:47479167:0,0,0,1
chrX	47483929	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:47483929_CGA_C:47483929:0,0,0,1
chrX	47483932	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47483929_CGA_C:47483929:0,0,0,1
chrX	47485783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:7,5,2,0
chrX	47486980	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=121,59;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:47486980_C_T:47486980:7,7,1,1
chrX	47486991	.	GGTGA	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=128,59;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:2,2:0|1:47486980_C_T:47486980:7,8,1,1
chrX	47486997	.	A	AGGCT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=113,59;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,1:0|1:47486980_C_T:47486980:6,6,1,1
chrX	47487003	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=87,59;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,1:0|1:47486980_C_T:47486980:7,4,1,1
chrX	47487559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:47487559_C_T:47487559:10,5,1,1
chrX	47487566	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,0:9,2:0|1:47487559_C_T:47487559:9,7,1,1
chrX	47498652	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:0|1:47498652_C_T:47498652:10,11,1,1
chrX	47498656	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:47498652_C_T:47498652:10,11,1,1
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chrX	48116688	.	C	CTGTGGTGCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=76,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chrX	48123430	.	G	GTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,70;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chrX	48164138	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.895:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chrX	48269383	.	T	TAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	48318147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chrX	48319357	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	48324547	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=252,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chrX	48325214	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.384:45:5,0:22,17:16,12,0,17
chrX	48325280	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:5,11,0,2
chrX	48326251	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=83,327;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:9,6,0,3
chrX	48382202	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=88,84;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:15,4:25,0:16,24,4,0
chrX	48385473	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,2:7,0:0|1:48385473_G_A:48385473:5,7,1,1
chrX	48385476	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,2:10,0:0|1:48385473_G_A:48385473:5,8,1,1
chrX	48418812	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=142,63;MMQ=55,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.494:4:2,0:0,0:0|1:48418812_A_T:48418812:2,0,1,1
chrX	48418823	.	C	CTGGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=67,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:48418812_A_T:48418812:3,2,1,1
chrX	48418824	.	C	CCAGGTATTACCCACCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=67,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:48418812_A_T:48418812:3,2,1,1
chrX	48433499	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chrX	48433529	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chrX	48433905	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:15,3:7,0:16,6,3,0
chrX	48460625	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	48462624	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	48546437	.	TCCCAGGCATGTCAGCCACGTGGGGTGGGACC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:6,0:12,11,1,1
chrX	48558910	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chrX	48559150	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=209,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chrX	48564727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=86,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:48564727_C_T:48564727:5,4,2,0
chrX	48564736	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=86,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:48564727_C_T:48564727:6,5,2,0
chrX	48565735	.	CCCCTGCCTCCTTCCCTACCTTCCTCCCTCCCTCCTTCTCCCCCTCCCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.464:5:1,0:0,2:1,2,1,1
chrX	48649426	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,5,0
chrX	48649449	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,6,0
chrX	48649456	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,4,3
chrX	48650532	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=86,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:6,2:0|1:48650532_T_G:48650532:7,4,1,1
chrX	48650537	.	C	CCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=86,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:48650532_T_G:48650532:7,4,1,1
chrX	48652289	.	TCTGGGAGGCACAGGAGCAGCCGAAGGACCAGCTGGTGGCTTTATGGTGGTGG	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=109,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.148:32:5,2:8,2:17,11,2,2
chrX	48652724	.	G	GAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:0,0:2,1:0|1:48652724_G_GAGT:48652724:0,2,0,1
chrX	48652733	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48652724_G_GAGT:48652724:0,3,0,1
chrX	48652740	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chrX	48664059	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=109,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:16,3:5,0:14,8,3,0
chrX	48673167	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:3,5,5,0
chrX	48675116	.	C	CGGAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	48681543	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:1,2:6,0:0|1:48681543_G_A:48681543:1,8,1,1
chrX	48681546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:48681543_G_A:48681543:1,8,1,1
chrX	48681592	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:0,4,2,0
chrX	48763895	.	C	CTAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.469:2:1,0:0,1:0|1:48763895_C_CTAG:48763895:0,1,0,1
chrX	48763898	.	GCT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48763895_C_CTAG:48763895:0,1,0,1
chrX	48763903	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48763895_C_CTAG:48763895:0,1,0,1
chrX	48763904	.	G	GATTGCAAAGAGAAATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48763895_C_CTAG:48763895:0,1,0,1
chrX	48780448	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=87,54;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:5,10,1,1
chrX	48780467	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:48780467_G_A:48780467:4,6,1,1
chrX	48780469	.	CGG	ACA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:48780467_G_A:48780467:4,6,1,1
chrX	48780475	.	T	TCTATATGCTAATAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=77,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:4,2:0|1:48780467_G_A:48780467:4,4,1,1
chrX	48823111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=115,42;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.284:10:3,0:3,2:0|1:48823111_G_A:48823111:3,4,2,1
chrX	48823113	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=115,42;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:48823111_G_A:48823111:3,4,1,1
chrX	48823117	.	ACCT	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=22,20;MFRL=161,42;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:48823111_G_A:48823111:2,4,1,1
chrX	48823122	.	CCTCCCCGTTATGGCTCACCCCAACCCTATCCAGGCCCCGACCCACCTCAAGGCCCCCATTCTGCTTGTACTGCAGGA	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=148,42;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:3,2:0|1:48823111_G_A:48823111:3,7,1,1
chrX	48823160	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48823160_CG_C:48823160:0,1,0,1
chrX	48823164	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,21;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48823160_CG_C:48823160:0,1,0,1
chrX	48823168	.	CT	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:48823160_CG_C:48823160:0,2,0,1
chrX	48825815	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:11,2:9,1:0|1:48825815_A_T:48825815:11,9,2,1
chrX	48825817	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=144,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.152:24:11,1:8,0:0|1:48825815_A_T:48825815:11,10,2,1
chrX	48838322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chrX	48839341	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	48855832	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=87,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:11,2:7,15,0,2
chrX	48858647	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=108,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.209:22:8,0:9,1:0|1:48858647_C_G:48858647:1,17,4,0
chrX	48858653	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=110,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:6,0:11,3:0|1:48858647_C_G:48858647:1,18,3,0
chrX	48888074	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.899:17:0,9:1,7:0,1,10,6
chrX	48897932	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,0;MFRL=99,177;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,0:0|1:48897932_A_G:48897932:9,4,2,0
chrX	48897942	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=99,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:4,0:0|1:48897932_A_G:48897932:9,6,2,0
chrX	48898183	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chrX	48919859	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=76,164;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:6,8,0,2
chrX	48919958	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chrX	48920166	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48920166_AG_A:48920166:0,1,0,1
chrX	48920174	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48920166_AG_A:48920166:0,1,0,1
chrX	48922205	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=75,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,1,1
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chrX	48922221	.	AGAG	A,AGTAGAATTGAG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=22,20,20;MFRL=83,67,54;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.81,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.197,0.201:12:2,2,2:6,0,0:3,5,2,2
chrX	48922225	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=79,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chrX	48922232	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=83,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:5,0:3,2:0|1:48922232_T_A:48922232:1,7,1,1
chrX	48922234	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=83,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:5,0:3,1:0|1:48922232_T_A:48922232:1,7,1,1
chrX	48932990	.	A	ATG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=133,213;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:5,1:8,7,0,2
chrX	48935676	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.153:19:8,2:8,0:7,9,3,0
chrX	48972672	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:5,9,0,2
chrX	48979129	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=104,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:23,2:12,0:16,20,2,0
chrX	49029866	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=94,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:8,0:9,4:7,10,2,2
chrX	49029896	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=83,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:8,0:3,8,0,2
chrX	49030776	.	AGT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:7,1:9,1:6,10,1,1
chrX	49040115	.	AGT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=176,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:3,3:5,2,1,2
chrX	49054346	.	G	GGAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.326:7:2,0:2,2:0|1:49054346_G_GGAA:49054346:4,1,1,1
chrX	49054350	.	G	GTTCCTGCACC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:3,2:0|1:49054346_G_GGAA:49054346:4,1,1,1
chrX	49062125	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:4,8,2,0
chrX	49063092	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=93,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,1:5,0,0,2
chrX	49069247	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=201,40;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:49069247_C_T:49069247:3,4,1,1
chrX	49069253	.	GC	AA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=146,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:49069247_C_T:49069247:4,5,1,1
chrX	49069259	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=174,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:49069247_C_T:49069247:3,5,1,1
chrX	49069260	.	GGT	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:4,2:0|1:49069247_C_T:49069247:3,9,1,1
chrX	49069268	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=153,40;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:49069247_C_T:49069247:3,9,1,1
chrX	49071840	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,2:3,0:8,6,1,1
chrX	49072013	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=44,86;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,2,0,1
chrX	49072015	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=44,86;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,2,0,1
chrX	49072017	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=0,86;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,1,0,1
chrX	49072021	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,86;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,0,0,1
chrX	49072025	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,86;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,0,0,1
chrX	49072028	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49072013_C_G:49072013:0,0,0,1
chrX	49082366	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,18;MFRL=157,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:49082366_T_G:49082366:5,1,1,1
chrX	49082379	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:6,2:0|1:49082366_T_G:49082366:6,3,1,1
chrX	49082381	.	G	GAGCA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=93,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:49082366_T_G:49082366:5,3,1,1
chrX	49082415	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=165,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:49082415_G_T:49082415:3,7,1,1
chrX	49082420	.	G	GCTGTACTGGTTGTTGTGTGGAAT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:49082415_G_T:49082415:3,8,1,1
chrX	49082745	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:17,3:4,0:7,14,1,2
chrX	49084727	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=89,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:10,9,1,1
chrX	49084740	.	C	CACCTTCCCATCAAAGTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=95,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:11,0:0|1:49084740_C_CACCTTCCCATCAAAGTT:49084740:10,9,1,1
chrX	49084742	.	TGG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=95,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:49084740_C_CACCTTCCCATCAAAGTT:49084740:10,9,1,1
chrX	49089677	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.286:10:3,2:4,0:7,0,0,3
chrX	49089688	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=96,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.276:14:4,0:5,0:9,1,0,4
chrX	49104815	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chrX	49105610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chrX	49105751	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,13;MFRL=237,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:0,0:0|1:49105751_T_G:49105751:2,0,0,1
chrX	49105757	.	G	GATAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49105751_T_G:49105751:0,0,0,1
chrX	49105759	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49105751_T_G:49105751:0,0,0,1
chrX	49105762	.	TGGG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49105751_T_G:49105751:0,0,0,1
chrX	49105768	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49105751_T_G:49105751:0,0,0,1
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chrX	49594999	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:49594999_C_T:49594999:7,1,2,0
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chrX	49595585	.	C	CTTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=63,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:0|1:49595585_C_CTTG:49595585:4,3,1,1
chrX	49595586	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=63,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:0|1:49595585_C_CTTG:49595585:4,3,1,1
chrX	49646522	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=91,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,0:3,3,1,4
chrX	49646525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=92,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:4,3,0,4
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chrX	49767886	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49767886_G_A:49767886:0,0,0,1
chrX	49767896	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49767886_G_A:49767886:0,0,0,1
chrX	49767904	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49767886_G_A:49767886:0,0,0,1
chrX	49777985	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=67,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chrX	49851601	.	A	AATCACAGAGCTTGGAGGAGTCCAGAAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	49853558	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:3,9,0,3
chrX	49855147	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:5,0:4,3:0|1:49855147_C_T:49855147:2,8,2,1
chrX	49855149	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:0|1:49855147_C_T:49855147:2,8,2,1
chrX	49855152	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=140,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:0|1:49855147_C_T:49855147:2,9,2,1
chrX	49855153	.	G	GGATGGTGGTGTTTGTTGCATA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=140,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:4,3:0|1:49855147_C_T:49855147:2,9,2,1
chrX	49955671	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=64,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.163:20:8,2:9,0:7,10,3,0
chrX	49955823	.	AA	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chrX	49965661	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49965661_C_CT:49965661:0,2,0,1
chrX	49965663	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49965661_C_CT:49965661:0,2,0,1
chrX	49965666	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49965661_C_CT:49965661:0,2,0,1
chrX	50051544	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=77,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.204:17:4,1:10,2:7,7,2,1
chrX	50052534	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.306:19:7,3:5,0:8,5,6,0
chrX	50053963	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,1:4,2:2,5,1,2
chrX	50056814	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chrX	50056940	.	GAGGTGC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:7,3,1,1
chrX	50085364	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:50085364_A_AG:50085364:0,1,1,1
chrX	50085367	.	A	ACACACACACGACACAGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:50085364_A_AG:50085364:0,1,1,1
chrX	50118957	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chrX	50119003	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=130,94;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:6,5,2,0
chrX	50119085	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,7,7
chrX	50119234	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0|1:50119234_G_A:50119234:0,3,0,2
chrX	50119249	.	T	TTGGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:50119234_G_A:50119234:0,3,0,1
chrX	50119250	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:50119234_G_A:50119234:0,3,0,1
chrX	50119252	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:50119234_G_A:50119234:0,3,0,1
chrX	50121146	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,5,3
chrX	50121708	.	G	GAGAAATGAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chrX	50122932	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chrX	50129369	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chrX	50130544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chrX	50130683	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=158,193;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50130683_C_G:50130683:0,4,0,1
chrX	50130684	.	A	AGAGGTAAATGTGAATGTATTGGTAATGTGTATTCGTATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=158,193;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50130683_C_G:50130683:0,4,0,1
chrX	50130717	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	50134383	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	50135327	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chrX	50136344	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=71,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,0,2
chrX	50136371	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:1,0:4,1:0|1:50136371_G_A:50136371:0,6,1,1
chrX	50136377	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:2,0:4,1:0|1:50136371_G_A:50136371:0,6,1,1
chrX	50143965	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chrX	50147246	.	TGAAAATC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50147246_TGAAAATC_T:50147246:0,0,0,1
chrX	50147256	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50147246_TGAAAATC_T:50147246:0,0,0,1
chrX	50147258	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50147246_TGAAAATC_T:50147246:0,0,0,1
chrX	50165600	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50165600_A_T:50165600:0,2,0,1
chrX	50165606	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50165600_A_T:50165600:0,1,0,1
chrX	50350758	.	C	CTGCTGCTGCTGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=44,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGCTGCTGCTGT;STR;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:2,1:0,2:0,2,3,3
chrX	50350777	.	T	TGCTGTTGCTGCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=81,44;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:3,2:7,0:4,6,0,2
chrX	50653775	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chrX	50653812	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:0|1:50653812_T_C:50653812:8,7,1,1
chrX	50653821	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=98,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:50653812_T_C:50653812:8,8,1,1
chrX	50659284	.	C	CAATGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=96,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:4,2:1,5,1,1
chrX	51075762	.	GCAGCTGCGT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,86;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,2:6,0:10,3,2,0
chrX	51078975	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=182,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chrX	51149806	.	TCG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chrX	51149899	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:3,2,1,1
chrX	51239295	.	ATCCTCGAGGCAGCC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCGAGGCAGCC;STR;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.913:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chrX	51486659	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	51486964	.	C	CTGTTAGCTGGGACCCCAACAAAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,2:9,0:4,5,1,1
chrX	51487370	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=89,53;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:13,10,0,2
chrX	51488437	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,82;MMQ=60,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.511:25:6,0:6,11:7,5,11,2
chrX	51488806	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:51488806_C_T:51488806:2,1,1,1
chrX	51488815	.	GT	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:51488806_C_T:51488806:0,1,1,1
chrX	51488818	.	C	CCCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51488806_C_T:51488806:0,1,0,1
chrX	51637757	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=102,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:2,0:4,1:0|1:51637757_T_A:51637757:1,5,6,0
chrX	51637763	.	AG	CC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=80,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:2,3:7,0:0|1:51637757_T_A:51637757:6,9,6,0
chrX	51637767	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=84,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.190:24:3,0:13,0:0|1:51637757_T_A:51637757:8,12,4,0
chrX	51638900	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,3,17
chrX	51641335	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,108;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,30:0.620:48:8,0:10,30:5,13,0,30
chrX	52674516	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=137,157;MMQ=40,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52674516_C_A:52674516:0,1,0,1
chrX	52674517	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=137,157;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52674516_C_A:52674516:0,1,0,1
chrX	52674520	.	GATCTCTT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=166,157;MMQ=35,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:52674516_C_A:52674516:0,2,0,1
chrX	52674530	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=166,157;MMQ=35,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:52674516_C_A:52674516:0,2,0,1
chrX	52674584	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=249,195;MMQ=34,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52674584_C_CAG:52674584:0,2,0,1
chrX	52674586	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=249,195;MMQ=34,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52674584_C_CAG:52674584:0,2,0,1
chrX	52674587	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,23;MFRL=249,195;MMQ=34,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52674584_C_CAG:52674584:0,2,0,1
chrX	52825471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chrX	52847232	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=83,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:9,5:8,0:7,10,5,0
chrX	52891512	.	AC	TT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:0|1:52891512_AC_TT:52891512:1,0,3,0
chrX	52891523	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=35,23;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0|1:52891512_AC_TT:52891512:6,0,3,0
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chrX	53112541	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:3,0:2,0:0|1:53112541_A_T:53112541:1,4,0,3
chrX	53112544	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,0:1,1:0|1:53112541_A_T:53112541:1,4,0,3
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chrX	53221994	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:53221987_G_A:53221987:6,1,1,1
chrX	53222025	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=20,16;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:1,0:0|1:53222025_C_G:53222025:2,1,1,0
chrX	53222028	.	GTA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=16,34;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:0,0:0|1:53222025_C_G:53222025:2,1,1,0
chrX	53222033	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=17,19;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:0,0:0|1:53222025_C_G:53222025:1,1,1,0
chrX	53222037	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,15;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:53222025_C_G:53222025:1,1,1,0
chrX	53223286	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,127;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:7,1,3,0
chrX	53226311	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,499;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	53228148	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chrX	53245092	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=78,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:5,0:8,12:6,8,0,12
chrX	53246256	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chrX	53247481	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,5:8,0:8,5,5,0
chrX	53271147	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chrX	53408093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=191,199;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chrX	53408118	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=191,199;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chrX	53409356	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chrX	53421882	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53421882_G_A:53421882:0,0,0,1
chrX	53421896	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53421882_G_A:53421882:0,0,0,1
chrX	53436232	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	53436269	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=96,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chrX	53442044	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=117,2103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:8,0:12,2,0,3
chrX	53442170	.	G	GAGAGAGAGAGAGAGAGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chrX	53448859	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.222:20:8,1:7,0:0|1:53448859_T_G:53448859:14,2,0,4
chrX	53448866	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.223:20:8,0:7,1:0|1:53448859_T_G:53448859:15,1,0,4
chrX	53449369	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chrX	53569528	.	TA	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=189,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:53569528_TA_CC:53569528:0,6,1,1
chrX	53569531	.	GGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:0|1:53569528_TA_CC:53569528:0,6,1,1
chrX	53578050	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:53578050_G_A:53578050:1,6,1,1
chrX	53578057	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:53578050_G_A:53578050:1,4,1,1
chrX	53578058	.	C	CCATAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:53578050_G_A:53578050:1,5,1,1
chrX	53578080	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	53578505	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=198,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53578505_G_C:53578505:0,2,0,1
chrX	53578507	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=198,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53578505_G_C:53578505:0,2,0,1
chrX	53600887	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,0:2,7:4,3,0,7
chrX	53607754	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chrX	53607842	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=81,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:5,14,1,1
chrX	53608069	.	AGCTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=224,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53608069_AGCTTT_A:53608069:0,1,0,1
chrX	53608076	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=224,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:53608069_AGCTTT_A:53608069:0,1,0,1
chrX	53622078	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chrX	53629649	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.714:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	53644176	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,222;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:4,5:2,0:3,3,0,5
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGGG;STR;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,8:0,0,8,4
chrX	53674458	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.490:18:4,0:5,7:3,6,9,0
chrX	53680928	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	53964367	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,199;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,0:0,8:2,0,8,0
chrX	53965764	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53965764_C_CAGG:53965764:0,1,0,1
chrX	53965765	.	C	CTCAAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53965764_C_CAGG:53965764:0,1,0,1
chrX	54014364	.	T	TCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:54014364_T_TCCTCC:54014364:0,3,0,1
chrX	54014366	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:54014364_T_TCCTCC:54014364:0,3,0,1
chrX	54026202	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.811:12:0,0:1,10:2,0,10,0
chrX	54028681	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:6,8,2,1
chrX	54048796	.	T	TGGAAACACTC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=27,28;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54048796_T_TGGAAACACTC:54048796:0,1,0,1
chrX	54048798	.	T	TTTTGTAGAATGTG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,28;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54048796_T_TGGAAACACTC:54048796:0,1,0,1
chrX	54048873	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048876	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048878	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048882	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048884	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048886	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54048888	.	C	CCAGGGTT	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54048873_G_C:54048873:0,0,0,1
chrX	54099381	.	T	TATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	54107692	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	54107956	.	AA	GC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=177,116;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chrX	54107980	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=180,137;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:54107980_G_T:54107980:0,4,0,1
chrX	54107984	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=187,137;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:54107980_G_T:54107980:0,3,0,1
chrX	54112418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=164,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:54112418_A_C:54112418:0,3,0,1
chrX	54112422	.	A	AGTGCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=164,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54112418_A_C:54112418:0,1,0,1
chrX	54117651	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=110,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	54117740	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chrX	54159199	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=123,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,1:0|1:54159199_C_T:54159199:6,9,1,1
chrX	54159204	.	T	TCCATGTA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:0|1:54159199_C_T:54159199:6,8,1,1
chrX	54159208	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:54159199_C_T:54159199:7,7,1,1
chrX	54159210	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:54159199_C_T:54159199:7,7,1,1
chrX	54185803	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:2,0:5,19:5,2,19,0
chrX	54185858	.	T	TGAGTGC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=106,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:54185858_T_TGAGTGC:54185858:7,8,1,1
chrX	54185860	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:54185858_T_TGAGTGC:54185858:7,8,1,1
chrX	54209518	.	GTGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=226,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chrX	54228517	.	T	TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:5,6,1,2
chrX	54263335	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=62,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chrX	54265541	.	GACAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=ACAAA;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.522:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chrX	54275807	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=88,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,8:6,0:4,4,8,0
chrX	54276055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:54276055_G_A:54276055:0,2,0,1
chrX	54276057	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:54276055_G_A:54276055:0,2,0,1
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chrX	54482256	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=89,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chrX	54497038	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54497038_A_G:54497038:2,0,1,0
chrX	54497044	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54497038_A_G:54497038:2,0,1,0
chrX	54497050	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54497038_A_G:54497038:2,0,1,0
chrX	54559092	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=110,82;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:22,0:9,8:12,20,0,8
chrX	54559125	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=130,136;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:4,1:0,17,0,2
chrX	54559153	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=158,74;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:0,19,0,2
chrX	54578109	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:1,5,1,1
chrX	54578260	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=74,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:6,0:11,1:0|1:54578260_A_C:54578260:7,12,1,1
chrX	54578264	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=74,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:54578260_A_C:54578260:7,12,1,1
chrX	54780323	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=39479085,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:54780323_C_T:54780323:1,1,1,0
chrX	54780330	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=39479085,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:54780323_C_T:54780323:1,1,1,0
chrX	54784006	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:10,5,2,1
chrX	54800494	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=82,51;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:3,3:12,1:13,2,4,0
chrX	54800637	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=17,23;MFRL=67,34;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.466:9:0,1:0,1:0,5,0,4
chrX	54823498	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=94,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chrX	54841048	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	54948666	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=92,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:6,8,0,2
chrX	54949756	.	TT	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:6,0:14,2:9,12,1,1
chrX	54952989	.	CCT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=239,130;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.834:9:0,2:1,6:1,0,4,4
chrX	54953647	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	54955936	.	ACTGGCTTTGGAGGCACACTTAGCACCAGTGTCTCCTTTGGTGGCTCTTCCAGCACCAGTGCCAATTTTGGTGGTACACTAAGTACCAGCATCTGCTTTGATGGCTCTCCCAGCACTGGTG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.104:30:7,1:3,3:15,11,1,3
chrX	54956987	.	CTGGCTTTGGTGGTGGACTGGTCACTAGTGA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=83,43;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.166:17:3,2:6,0:5,10,1,1
chrX	54957180	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:3,5,3,1
chrX	54986301	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:4,2:6,5,1,1
chrX	54986390	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:54986390_T_A:54986390:0,6,1,1
chrX	54986396	.	CAGTA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:54986390_T_A:54986390:0,6,1,1
chrX	54986402	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=192,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:4,2:0|1:54986390_T_A:54986390:0,5,1,1
chrX	55027010	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=92,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:3,0:14,2:7,10,1,1
chrX	55027031	.	A	ACGACTTGTGAGGGGATGGGGAGAGGAGAGGGCCCTTGTTGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=153,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:3,4,2,1
chrX	55046791	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=226,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0|1:55046791_T_C:55046791:2,3,1,1
chrX	55046795	.	CA	GG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=226,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:55046791_T_C:55046791:2,3,1,1
chrX	55046967	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=235,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:55046967_A_G:55046967:0,3,1,1
chrX	55046969	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=235,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:55046967_A_G:55046967:0,3,1,1
chrX	55046971	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=235,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:55046967_A_G:55046967:0,3,1,1
chrX	55046974	.	A	ACTGTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=235,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:55046967_A_G:55046967:0,3,1,1
chrX	55046979	.	T	TCAGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=235,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:55046967_A_G:55046967:0,3,0,1
chrX	55047547	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=108,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:15,3:11,14,3,0
chrX	55047741	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chrX	55057325	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=103,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:55057325_G_T:55057325:7,9,1,1
chrX	55057330	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:3,2:0|1:55057325_G_T:55057325:7,9,1,1
chrX	55102573	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=112,103;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:9,0:3,4:0|1:55102573_A_C:55102573:7,5,0,4
chrX	55102579	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=141,103;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:9,0:2,4:0|1:55102573_A_C:55102573:7,4,0,4
chrX	55117076	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=115,14073;MMQ=60,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:0|1:55117076_T_A:55117076:2,8,0,3
chrX	55117085	.	T	TTGCAGTGAAGCGAGATCACGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=116,14073;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:1,3:0|1:55117076_T_A:55117076:1,7,0,3
chrX	55172521	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,3:7,3:17,2,6,0
chrX	55172537	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=98.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.914:33:2,15:0,13:1,1,26,5
chrX	55172572	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.307:46:15,10:17,3:18,14,10,4
chrX	55172606	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=12;MBQ=30,26;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,30:0.348:87:25,13:32,17:27,30,17,13
chrX	55172630	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=12;MBQ=31,24;MFRL=101,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,43:0.386:112:34,18:34,25:37,32,24,19
chrX	55172645	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=12;MBQ=28,24;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=327.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,100:0.911:109:3,50:6,47:5,4,54,46
chrX	55172675	.	C	T	.	.	DP=114;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,15:0.140:111:45,11:45,4:55,41,8,7
chrX	55172680	.	G	C	.	.	DP=113;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=100,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=167.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,47:0.425:111:32,23:27,22:0|1:55172680_G_C:55172680:38,26,25,22
chrX	55172685	.	A	AT	.	.	DP=106;ECNT=12;MBQ=20,25;MFRL=99,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=163.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,44:0.417:106:26,21:27,23:0|1:55172680_G_C:55172680:34,28,23,21
chrX	55172687	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=12;MBQ=24,29;MFRL=107,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,47:0.461:102:21,26:31,20:30,25,24,23
chrX	55172688	.	TG	T	.	.	DP=102;ECNT=12;MBQ=24,26;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,43:0.427:101:26,19:29,21:0|1:55172680_G_C:55172680:31,27,23,20
chrX	55172708	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=12;MBQ=20,31;MFRL=92,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=240.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,58:0.844:68:1,27:8,27:6,4,30,28
chrX	55185568	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:6,2:10,8:10,6,5,5
chrX	55185656	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=94,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.201:47:15,4:23,5:17,21,2,7
chrX	55187604	.	A	ACGAGTATCCTTTTAAATACCTAGTCATTTCTATGTCTTCTTTGGAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=91,1990;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.335:32:8,4:10,5:10,13,0,9
chrX	55246965	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chrX	55247030	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chrX	55247107	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,2:6,0:5,11,1,1
chrX	55247954	.	T	TCTATTTAAAAAGTTGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chrX	55248376	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chrX	55249049	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chrX	55249159	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,48;MMQ=57,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chrX	55289593	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chrX	55290426	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55290426_G_A:55290426:0,0,0,1
chrX	55290436	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:55290426_G_A:55290426:0,0,0,1
chrX	55650363	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=89,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:5,8,0,4
chrX	55757744	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	55783664	.	T	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=105,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:6,3,0,3
chrX	55783768	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:55783768_AG_A:55783768:2,6,1,1
chrX	55783770	.	TTTAAAC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:55783768_AG_A:55783768:2,6,1,1
chrX	56276845	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56276845_GA_G:56276845:0,1,0,1
chrX	56276847	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,24;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56276845_GA_G:56276845:0,1,0,1
chrX	56276850	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56276845_GA_G:56276845:0,1,0,1
chrX	56291516	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	56295958	.	ATG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.806:7:0,5:1,1:1,0,2,4
chrX	56296814	.	C	CTACCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chrX	56591444	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chrX	56592361	.	TTTCTCCTTTGCTTATTTTTCCTA	T	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,2:0.037:80:28,2:30,0:0|1:56592361_TTTCTCCTTTGCTTATTTTTCCTA_T:56592361:36,42,1,1
chrX	56592390	.	CCTTCCTCTTGT	C	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=95,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:15,2:21,0:0|1:56592361_TTTCTCCTTTGCTTATTTTTCCTA_T:56592361:18,30,1,1
chrX	56592406	.	CCACTCCCTCCCTCTTTGTTTCCTTCCT	C	.	.	DP=90;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=103,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,2:0.037:81:15,2:33,0:0|1:56592361_TTTCTCCTTTGCTTATTTTTCCTA_T:56592361:26,53,1,1
chrX	56594168	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,120;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,0:9,6:9,10,0,6
chrX	57021153	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:57021153_T_C:57021153:14,8,1,1
chrX	57021158	.	G	GTC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:0|1:57021153_T_C:57021153:14,9,1,1
chrX	57407556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57407556_T_C:57407556:0,1,0,1
chrX	57407558	.	A	AGACACTAAGCAGAGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57407556_T_C:57407556:0,1,0,1
chrX	57474943	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chrX	57515433	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:57515433_G_A:57515433:0,4,1,1
chrX	57515439	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:57515433_G_A:57515433:0,0,1,5
chrX	57618725	.	AGCGGCGGCG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=GCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	57623418	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=84,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:1,0:11,2:0|1:57623418_A_C:57623418:8,5,0,2
chrX	57623421	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=84,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:1,0:12,2:0|1:57623418_A_C:57623418:8,5,0,2
chrX	62570687	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=103,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:10,10:7,0:7,10,10,0
chrX	63004950	.	G	GGT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,17;MFRL=77,36;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:4,0:0|1:63004950_G_GGT:63004950:3,8,1,1
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chrX	64137685	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:6,5,0,2
chrX	64732646	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=108,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:3,5,2,0
chrX	64732806	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:64732806_C_T:64732806:3,7,1,1
chrX	64732814	.	G	GCTTGTTGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:64732806_C_T:64732806:3,8,1,1
chrX	64734730	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=164,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chrX	64743867	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chrX	64744223	.	C	CAGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:64744223_C_CAGA:64744223:2,3,0,2
chrX	64744229	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:64744223_C_CAGA:64744223:2,3,0,2
chrX	64744618	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
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chrX	64744944	.	A	ACTGTCTATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:64744943_G_T:64744943:1,2,1,1
chrX	64749130	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.347:27:8,9:9,0:5,13,9,0
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chrX	64956699	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=91,0;MMQ=60,32;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.115:46:19,4:21,0:23,18,3,2
chrX	65393658	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
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chrX	65420609	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chrX	65423455	.	AAAAAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=102,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	65480025	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=70,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:65480025_G_A:65480025:3,1,1,1
chrX	65480027	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=70,55;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:65480025_G_A:65480025:3,1,1,1
chrX	65480028	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=70,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:65480025_G_A:65480025:3,1,1,1
chrX	65480037	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,2:0|1:65480025_G_A:65480025:5,1,1,1
chrX	65486398	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=74,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,1:2,2:5,4,2,1
chrX	65819286	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chrX	66937342	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chrX	66937357	.	C	CTTCTTCCATTTGGGCTGCCGCAACAAAATACCTT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:7,6,1,1
chrX	66937438	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=21,32;MFRL=67,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chrX	66937480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=228,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chrX	66941597	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chrX	66941873	.	A	AGCACTATAAGAAATGCTAAAAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=196,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	67316935	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:67316935_G_A:67316935:0,0,0,1
chrX	67316942	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67316935_G_A:67316935:0,0,0,1
chrX	67316955	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67316935_G_A:67316935:0,0,0,1
chrX	67412906	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	67652901	.	A	AGGCCCTTCACAGGGGACCTCCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chrX	67652926	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:67652926_C_A:67652926:0,4,0,1
chrX	67652929	.	TA	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:67652926_C_A:67652926:0,4,0,1
chrX	67937396	.	G	GAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:67937396_G_GAGAAA:67937396:0,0,0,1
chrX	67937399	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:67937396_G_GAGAAA:67937396:0,0,0,1
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chrX	69284035	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69284035_A_G:69284035:0,0,1,0
chrX	69284044	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69284035_A_G:69284035:0,0,1,0
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chrX	69489990	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:5,7,1,1
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chrX	69504613	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=103,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
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chrX	69607212	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:1,2:2,2:0,3,0,4
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chrX	69615946	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69615945_A_G:69615945:0,1,0,1
chrX	69626017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=354,407;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chrX	69626739	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,15:0,6:0,0,14,7
chrX	69637865	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chrX	69639662	.	A	ATCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=95,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:69639662_A_ATCCC:69639662:0,4,0,1
chrX	69639664	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=95,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:2,1:2,0:0|1:69639662_A_ATCCC:69639662:0,4,0,1
chrX	69639698	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chrX	69639832	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chrX	69645230	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chrX	69645372	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chrX	69645983	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chrX	69647169	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=181,39;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,6:0,9:0,1,7,8
chrX	69647350	.	G	GATTCTACAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69647350_G_GATTCTACAAAA:69647350:0,1,0,1
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chrX	69649605	.	T	TTA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,1:0|1:69649605_T_TTA:69649605:2,4,1,1
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chrX	70053469	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
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chrX	70148621	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=511,300;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chrX	70149626	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=81,163;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.528:38:11,0:6,20:11,7,0,20
chrX	70282696	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chrX	70321631	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chrX	70321664	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:70321664_C_G:70321664:0,3,0,1
chrX	70321666	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:70321664_C_G:70321664:0,3,0,1
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chrX	70324331	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=216,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:70324327_GT_CA:70324327:0,2,0,1
chrX	70328049	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.705:5:0,0:1,0:1,0,4,0
chrX	70328289	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chrX	70329043	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,6:8,0:11,6,6,0
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chrX	70330942	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:2,0:1,1:0|1:70330942_T_A:70330942:1,2,0,1
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chrX	70330946	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.395:3:1,1:1,0:1|0:70330942_T_A:70330942:0,2,0,1
chrX	70330947	.	GTCAGAAGGAGGAGGCCAA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:70330942_T_A:70330942:1,2,0,1
chrX	70330964	.	A	ATTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70330942_T_A:70330942:0,1,0,1
chrX	70339498	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=341,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chrX	70339921	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=141,86;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:9,10,2,0
chrX	70340049	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:70340049_G_T:70340049:0,2,0,1
chrX	70340056	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:70340049_G_T:70340049:0,2,0,1
chrX	70340058	.	T	TTCCAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:70340049_G_T:70340049:0,1,0,1
chrX	70340738	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=319,127;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:1,0,4,2
chrX	70341122	.	T	TACTTTATCTGCTTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTTTATCTGCTTC;STR;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	70341169	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chrX	70341565	.	CCT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:5,0:0|1:70341565_CCT_C:70341565:5,8,1,1
chrX	70341571	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=87,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:4,0:0|1:70341565_CCT_C:70341565:4,8,1,1
chrX	70341572	.	C	CCATCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=87,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:5,0:0|1:70341565_CCT_C:70341565:4,8,1,1
chrX	70342820	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
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chrX	70345630	.	C	CCCATCCACAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chrX	70345683	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	70348322	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=236,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0|1:70348322_G_GA:70348322:1,0,1,1
chrX	70348323	.	C	CTGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=236,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0|1:70348322_G_GA:70348322:1,0,1,1
chrX	70348325	.	G	GGAGGGTTAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=236,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:70348322_G_GA:70348322:1,0,1,1
chrX	70348344	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	70352417	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chrX	70356642	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chrX	70361077	.	TAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=94,103;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGC;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:4,0:5,2:0|1:70361077_TAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGC_T:70361077:14,2,1,1
chrX	70361100	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=101,80;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.173:15:7,2:6,0:1|0:70361077_TAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGC_T:70361077:11,2,2,0
chrX	70361651	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.695:16:0,2:4,5:3,2,6,5
chrX	70361967	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chrX	70368779	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=108,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GA;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.463:8:0,1:4,3:0,4,0,4
chrX	70373216	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chrX	70443981	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chrX	70444443	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:70444443_C_CAA:70444443:0,1,0,1
chrX	70444444	.	G	GAACTAGGCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:70444443_C_CAA:70444443:0,1,0,1
chrX	70445407	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chrX	70460976	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:70460976_G_T:70460976:2,1,0,1
chrX	70460981	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=195,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70460976_G_T:70460976:2,0,0,1
chrX	70460983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=195,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70460976_G_T:70460976:2,0,0,1
chrX	70464372	.	G	GGATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	70465273	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:70465273_G_A:70465273:2,5,1,1
chrX	70465275	.	G	GCTCTGCCTCC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=134,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:70465273_G_A:70465273:2,5,1,1
chrX	70465280	.	CC	TT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:70465273_G_A:70465273:2,4,1,1
chrX	70465305	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,22;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70465305_A_AT:70465305:2,2,0,1
chrX	70465308	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70465305_A_AT:70465305:2,2,0,1
chrX	70467457	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chrX	70470412	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:8,6,1,1
chrX	70473171	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:70473171_T_G:70473171:1,0,0,1
chrX	70473173	.	A	AGCTAGTGGTGCATATGCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:70473171_T_G:70473171:1,0,0,1
chrX	70521785	.	G	GTCTCTGGTGGTTGTGAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.477:6:0,0:2,3:0|1:70521785_G_GTCTCTGGTGGTTGTGAT:70521785:1,2,2,1
chrX	70521787	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.477:6:0,0:3,2:0|1:70521785_G_GTCTCTGGTGGTTGTGAT:70521785:1,2,2,1
chrX	70523703	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:70523703_T_G:70523703:11,12,1,1
chrX	70523708	.	GC	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=96,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:5,2:0|1:70523703_T_G:70523703:10,13,1,1
chrX	70523710	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=97,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:5,2:0|1:70523703_T_G:70523703:8,12,1,1
chrX	70524094	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:6,4:8,0:10,5,2,2
chrX	70597076	.	A	ACAAAGACTTCTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:70597076_A_ACAAAGACTTCTGG:70597076:0,1,0,1
chrX	70597082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=276,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:70597076_A_ACAAAGACTTCTGG:70597076:0,1,0,1
chrX	70597603	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=88,79;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:4,11,0,2
chrX	70598090	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,2:6,2:10,5,2,2
chrX	70598956	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70598956_T_G:70598956:0,0,1,0
chrX	70598979	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:70598956_T_G:70598956:0,4,1,0
chrX	70601781	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=105,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:5,0:6,4:3,9,0,4
chrX	70602773	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:6,2,0,3
chrX	70612497	.	G	GGAAATCTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,50;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:6,3,1,1
chrX	70617187	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,175;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:12,4,2,0
chrX	70621394	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,53;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,5:6,0:8,4,4,1
chrX	70627351	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=183,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:70627351_A_T:70627351:7,1,1,1
chrX	70627354	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:70627351_A_T:70627351:8,1,1,1
chrX	70627357	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:70627351_A_T:70627351:8,1,1,1
chrX	70642882	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,141;MMQ=54,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chrX	70643975	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,3:6,0:0|1:70643975_A_G:70643975:7,8,0,3
chrX	70643977	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:9,2:6,0:0|1:70643975_A_G:70643975:7,8,0,3
chrX	70775098	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:17,4:16,0:8,25,0,4
chrX	70776795	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chrX	70823583	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=70,81;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.108:30:13,0:11,2:14,13,0,3
chrX	70832703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chrX	70837317	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=73,73;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,4:10,0:11,8,3,1
chrX	71350250	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTC;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,0:8,2:9,3,0,2
chrX	71351519	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chrX	71353869	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=182,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chrX	71353928	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=93,145;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:8,3:5,0:6,7,4,0
chrX	71357066	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:2,6,2,1
chrX	71357093	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chrX	71357160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	71358792	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chrX	71361295	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:71361295_T_G:71361295:0,5,0,2
chrX	71361297	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:71361295_T_G:71361295:0,6,0,2
chrX	71361300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:71361295_T_G:71361295:0,4,0,2
chrX	71362078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:8,4,2,1
chrX	71363480	.	GAGAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:71363480_GAGAAA_G:71363480:0,0,0,8
chrX	71363487	.	G	GTTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:71363480_GAGAAA_G:71363480:0,0,0,8
chrX	71364479	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,0:0,8:0,0,1,7
chrX	71379881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=99,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,4,3
chrX	71401726	.	A	AAGGG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGGG;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:9,0:9,2:6,12,2,0
chrX	71416534	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chrX	71493691	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=194,101;MMQ=40,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,14:0,8:1,0,9,13
chrX	71495344	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,10,6
chrX	71495388	.	T	TCTA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,9:0,10:0,0,13,8
chrX	71521867	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chrX	71522809	.	T	TGATTGTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=48,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:71522809_T_TGATTGTC:71522809:0,2,0,1
chrX	71522811	.	A	ATCCCAGAGTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=48,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:71522809_T_TGATTGTC:71522809:0,2,0,1
chrX	71525265	.	C	CTACTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=218,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chrX	71687825	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:11,12,0,2
chrX	71792697	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71792697_C_G:71792697:0,1,0,1
chrX	71792699	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71792697_C_G:71792697:0,1,0,1
chrX	71792702	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71792697_C_G:71792697:0,1,0,1
chrX	71792703	.	C	CACCCTTCACGTATTTTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71792697_C_G:71792697:0,1,0,1
chrX	71792710	.	G	GGCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=305,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	71802489	.	C	CGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=84,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:3,0:2,1:0|1:71802489_C_CGT:71802489:2,3,0,1
chrX	71802490	.	A	AAGCTTATTAATTGGCCTAATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=84,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:71802489_C_CGT:71802489:2,3,0,1
chrX	71813191	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,232;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chrX	71933550	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.539:5:0,2:2,0:2,0,3,0
chrX	72224291	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=130,161;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72224291_C_T:72224291:1,0,1,0
chrX	72224299	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,26;MFRL=130,161;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:72224291_C_T:72224291:1,0,1,0
chrX	72224315	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,16;MFRL=121,161;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:72224291_C_T:72224291:2,0,1,0
chrX	72225593	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chrX	72433675	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.228:7:3,0:1,1:2,4,1,0
chrX	72673527	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chrX	73095072	.	TG	CA,CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35,34;MFRL=110,163,147;MMQ=60,40,60;MPOS=31,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chrX	73095080	.	TG	CA,CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35,34;MFRL=110,163,147;MMQ=60,40,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chrX	73095338	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=88,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,0:13,3:12,13,1,2
chrX	73740932	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,7:0,4:0,0,6,7
chrX	73744696	.	C	CCCCTACTCCCCGCTTCTGTTCCCCTGCCCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=250,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.666:2:0,1:0,0:0|1:73744696_C_CCCCTACTCCCCGCTTCTGTTCCCCTGCCCTG:73744696:0,1,0,1
chrX	73744698	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73744696_C_CCCCTACTCCCCGCTTCTGTTCCCCTGCCCTG:73744696:0,0,0,1
chrX	73744699	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73744696_C_CCCCTACTCCCCGCTTCTGTTCCCCTGCCCTG:73744696:0,0,0,1
chrX	73749152	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=78,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,0:1,2:0|1:73749152_C_T:73749152:5,5,1,1
chrX	73749159	.	A	ATTTTACATCCAGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=79,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:8,0:1,2:0|1:73749152_C_T:73749152:5,5,1,1
chrX	73749319	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	73815856	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0|1:73815856_A_G:73815856:1,4,1,1
chrX	73815859	.	C	CACCACTTCCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:73815856_A_G:73815856:0,4,1,1
chrX	73815863	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:73815856_A_G:73815856:0,4,0,1
chrX	73960933	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,2985580;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:3,6,0,2
chrX	74273505	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74273505_G_A:74273505:0,0,0,1
chrX	74273507	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74273505_G_A:74273505:0,0,0,1
chrX	74289263	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=113,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:0|1:74289263_C_T:74289263:10,3,1,1
chrX	74289270	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:74289263_C_T:74289263:7,2,1,1
chrX	74289271	.	GAGA	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:74289263_C_T:74289263:7,3,1,1
chrX	74289280	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=113,46;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:74289263_C_T:74289263:7,2,1,1
chrX	74334522	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chrX	74375871	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chrX	74494470	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chrX	74494483	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chrX	74519557	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=63,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,0,1
chrX	74519563	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,2,0
chrX	74523367	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chrX	74598903	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chrX	74637024	.	G	GCATCAACAGGCTCTCAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.483:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	74641877	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:74641877_C_A:74641877:0,2,0,1
chrX	74641879	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74641877_C_A:74641877:0,2,0,1
chrX	74649671	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chrX	74670474	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	74670767	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:74670767_G_A:74670767:1,3,1,1
chrX	74670770	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:74670767_G_A:74670767:1,3,1,1
chrX	74670774	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:74670767_G_A:74670767:1,3,1,1
chrX	74725743	.	A	ACC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=96,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0|1:74725743_A_ACC:74725743:0,3,1,1
chrX	74725746	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=96,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:74725743_A_ACC:74725743:0,3,1,1
chrX	75004485	.	A	ATCCTCCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=95,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,2:7,0:0|1:75004485_A_ATCCTCCT:75004485:4,5,1,1
chrX	75004486	.	G	GCCTCGGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=95,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.225:11:2,1:7,0:0|1:75004485_A_ATCCTCCT:75004485:4,5,1,1
chrX	75393056	.	CT	C	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=98,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.152:38:15,3:17,3:14,18,2,4
chrX	75393079	.	AAG	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=117,35;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:8,0:6,2:0|1:75393079_AAG_A:75393079:3,12,1,1
chrX	75393083	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=124,35;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:5,1:0|1:75393079_AAG_A:75393079:3,12,1,1
chrX	75393091	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=135,97;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:1,10,0,2
chrX	75393439	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:14,0:3,3:9,8,0,3
chrX	75397486	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=87,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,2:15,2:18,10,2,2
chrX	75649054	.	T	TGAGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,1:1,1:0|1:75649054_T_TGAGTC:75649054:3,0,0,2
chrX	75649056	.	A	ACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=116,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,1:2,0:0|1:75649054_T_TGAGTC:75649054:3,1,0,1
chrX	76226014	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chrX	76813157	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chrX	76937235	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:3,0:3,2:1,7,0,2
chrX	77084683	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,2:6,0:0|1:77084683_A_T:77084683:10,12,1,1
chrX	77084688	.	T	TATCCATG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=91,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:7,0:0|1:77084683_A_T:77084683:10,13,1,1
chrX	77110947	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:2,2,2,0
chrX	77224979	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=90,67;MMQ=60,28;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:0|1:77224979_C_T:77224979:7,4,2,1
chrX	77224994	.	C	CAAGCTCAAAAAGTCTAAAATAGGCCTTTGTCTACATG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=90,67;MMQ=54,28;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.244:14:4,0:5,3:0|1:77224979_C_T:77224979:7,4,2,1
chrX	77225215	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=273,109;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chrX	77243910	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=103,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,4:2,0:0|1:77243910_T_A:77243910:4,5,4,0
chrX	77243914	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=103,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,4:2,0:0|1:77243910_T_A:77243910:4,5,4,0
chrX	77245174	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.314:25:11,0:6,5:0|1:77245174_G_A:77245174:8,9,0,8
chrX	77245179	.	C	CTTTAT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,38;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.315:25:13,0:4,8:0|1:77245174_G_A:77245174:8,9,0,8
chrX	77245181	.	T	TTCACTCCAATATGTAAGCAG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=98,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.315:25:13,0:4,1:0|1:77245174_G_A:77245174:8,9,0,8
chrX	77266801	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=171,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chrX	77268531	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:6,7,0,2
chrX	77286830	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chrX	77296047	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chrX	77369731	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	77387277	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:2,2:0|1:77387277_A_AC:77387277:1,7,1,1
chrX	77387283	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0|1:77387277_A_AC:77387277:1,7,1,1
chrX	77913065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:5,5,1,1
chrX	77913079	.	C	CCTCCTCCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,1,1
chrX	77913427	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:4,2,1,1
chrX	78426471	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chrX	78426488	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chrX	78616983	.	ATC	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:78616983_ATC_A:78616983:2,9,0,2
chrX	78616989	.	AGC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:78616983_ATC_A:78616983:1,8,0,2
chrX	78617053	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	78617999	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chrX	78618050	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,13,3
chrX	78618841	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chrX	78619095	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=146,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:78619095_T_A:78619095:1,7,0,2
chrX	78619097	.	TTA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=146,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:78619095_T_A:78619095:1,7,0,2
chrX	79278013	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chrX	79279763	.	A	ACAAACAGTGGTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=225,257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	79282873	.	GTTTT	G,GTTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31,34;MFRL=0,126,128;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,18;RU=T;STR;TLOD=6.37,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,8:0.167,0.492:19:2,3,5:3,1,0:5,1,8,5
chrX	79283388	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	79700418	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:4,3:7,6,2,1
chrX	79937084	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	79947281	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=182,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chrX	79985569	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chrX	79999780	.	A	AATGTTCTTTCTCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chrX	79999796	.	T	TCAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chrX	80064910	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,10:1,8:0,1,4,16
chrX	80370594	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=107,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.088:55:19,0:29,4:19,32,0,4
chrX	80374244	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:3,0:15,2:0|1:80374244_A_T:80374244:8,11,1,1
chrX	80374250	.	T	TCATCTGCAAAATTTTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:17,2:0|1:80374244_A_T:80374244:9,13,1,1
chrX	82763523	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,2:0,0:3,1,0,2
chrX	82764016	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:3,6,0,2
chrX	82764040	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:82764040_A_G:82764040:0,0,5,7
chrX	82764042	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:82764040_A_G:82764040:0,0,5,7
chrX	83124802	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
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chrX	83402167	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=139,266;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	83403148	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=128,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.310:8:3,1:0,1:2,4,1,1
chrX	83403178	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chrX	83442983	.	CCCG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CCG;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	83581373	.	G	GGTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=106,281;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83581373_G_GGTTTTT:83581373:0,1,0,1
chrX	83581374	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=106,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83581373_G_GGTTTTT:83581373:0,1,0,1
chrX	83581376	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=106,281;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83581373_G_GGTTTTT:83581373:0,1,0,1
chrX	83724381	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=96,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:7,7,1,4
chrX	84258843	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chrX	84350010	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	84350074	.	A	AAGAAAGAGGAGGGAGGTCCCAGACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=262,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	84362868	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=93,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:0|1:84362868_T_A:84362868:10,8,1,1
chrX	84362878	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=93,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:0|1:84362868_T_A:84362868:9,4,1,1
chrX	84362885	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=87,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:9,2:5,0:0|1:84362868_T_A:84362868:10,4,1,1
chrX	84362886	.	T	TTGTTTCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=87,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:9,2:3,0:0|1:84362868_T_A:84362868:10,4,1,1
chrX	84363523	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,54;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chrX	84526647	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:8,8,2,0
chrX	84526861	.	T	TCTAAACACAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,266;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	84534383	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.956:18:0,6:0,12:0,0,12,6
chrX	84558534	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=119,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:1,2,0,2
chrX	84563135	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,17:0,2:0,0,11,8
chrX	85128113	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=127,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,0:5,3:6,8,2,1
chrX	85128120	.	T	TTCCTA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=138,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:8,7,1,1
chrX	85149266	.	TGCTG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,0:9,1:4,6,1,1
chrX	85282415	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,7,0
chrX	85403619	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:85403619_G_A:85403619:8,2,1,1
chrX	85403621	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:85403619_G_A:85403619:8,2,1,1
chrX	85994683	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chrX	86071150	.	CCTGGGGATGAGGTGGGGATGAG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,2:5,0:6,10,1,1
chrX	86071151	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chrX	86087283	.	T	TTGTGGATCAGCATTTGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	86869103	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chrX	86872866	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chrX	86887124	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	89177024	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chrX	90690574	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:90690574_G_A:90690574:2,1,0,1
chrX	90690580	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:90690574_G_A:90690574:3,1,0,1
chrX	90691590	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:6,6:4,0:8,2,7,0
chrX	90692651	.	TG	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=133,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:12,0:3,3:6,9,1,2
chrX	90692662	.	T	TACATTA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.257:13:7,2:2,1:0|1:90692662_T_TACATTA:90692662:4,6,2,1
chrX	90692664	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.258:13:8,1:2,0:0|1:90692662_T_TACATTA:90692662:4,6,2,1
chrX	90693663	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	91137997	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=241,145;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chrX	92928625	.	TG	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:1,8,1,1
chrX	92965651	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=101,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:0|1:92965651_T_A:92965651:4,8,1,1
chrX	92965654	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:92965651_T_A:92965651:4,7,1,1
chrX	96139556	.	G	GAGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chrX	96167645	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	96197175	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	96396739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=99,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,3:6,0:7,6,2,1
chrX	96684809	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=98,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chrX	99848971	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,3:6,0:9,6,3,0
chrX	99849017	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,9,10
chrX	99849051	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chrX	99849419	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chrX	99854583	.	T	TCTATTGAGATATCATTCAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=108,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chrX	99854742	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,1,0,1
chrX	99854745	.	C	CTTTCACTTTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,1,0,1
chrX	99854747	.	G	GCACTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,1,0,1
chrX	99854750	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,1,0,1
chrX	99854754	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,0,0,1
chrX	99854757	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99854742_C_CT:99854742:0,0,0,1
chrX	99887443	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:9,0:8,13,3,0
chrX	99890199	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=88,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:10,0:19,3:17,12,2,1
chrX	99890786	.	A	ATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	99919733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chrX	99922270	.	GCTATGAAGATTAACGTCAACGTCAACTCAGCTGCTGGTCTCTTGGATCAATT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=77,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.143:23:5,1:6,2:10,8,4,1
chrX	99933433	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:99933433_C_T:99933433:1,3,1,0
chrX	99933440	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:99933433_C_T:99933433:1,3,1,0
chrX	99934394	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chrX	99936147	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chrX	99940937	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=100,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	99941863	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=254,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:99941863_A_C:99941863:1,1,1,0
chrX	99941872	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=254,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:99941863_A_C:99941863:1,1,1,0
chrX	99941980	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	99942317	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99942317_A_ACC:99942317:0,1,0,1
chrX	99942318	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99942317_A_ACC:99942317:0,1,0,1
chrX	99942323	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99942317_A_ACC:99942317:0,1,0,1
chrX	100075741	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chrX	100075747	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chrX	100077193	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chrX	100088554	.	G	GTTGTGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	100093206	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=88,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.348:16:5,3:6,2:3,8,2,3
chrX	100098355	.	TAAG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chrX	100098454	.	TTGTTTATTATTTA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=97,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:15,1:3,3:9,10,2,2
chrX	100103816	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=143,183;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chrX	100103830	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=172,183;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100103830_C_T:100103830:0,1,0,1
chrX	100103839	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=172,183;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100103830_C_T:100103830:0,1,0,1
chrX	100125835	.	A	ACTAAACCAACTAAACATAATAGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chrX	100170049	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0|1:100170049_C_T:100170049:0,4,1,1
chrX	100170070	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:100170049_C_T:100170049:0,3,0,1
chrX	100170085	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100170049_C_T:100170049:0,0,0,1
chrX	100170086	.	A	ACACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100170049_C_T:100170049:0,0,0,1
chrX	100229050	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chrX	100242323	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	100274428	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100274428_C_A:100274428:0,2,0,1
chrX	100274429	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chrX	100274431	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1|0:100274428_C_A:100274428:0,3,0,1
chrX	100274434	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:100274428_C_A:100274428:0,3,0,1
chrX	100274436	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:100274428_C_A:100274428:0,2,0,1
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chrX	100531435	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=149,126;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:6,0:9,2:0|1:100531425_C_A:100531425:6,12,0,3
chrX	100531437	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=149,126;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:9,3:0|1:100531425_C_A:100531425:6,11,0,3
chrX	100531443	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=149,126;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:0|1:100531425_C_A:100531425:6,9,0,3
chrX	100531452	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=154,126;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:7,3:0|1:100531425_C_A:100531425:6,8,0,3
chrX	100531458	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=149,128;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,1:0|1:100531425_C_A:100531425:5,8,0,2
chrX	100536873	.	CTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	100538378	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:100538378_A_T:100538378:6,0,1,1
chrX	100538381	.	G	GTATATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:100538378_A_T:100538378:6,1,1,1
chrX	100601740	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,261;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100601740_A_C:100601740:0,1,0,1
chrX	100601744	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=152,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100601740_A_C:100601740:0,1,0,1
chrX	100604757	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	100609547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chrX	100609659	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:2,10,1,2
chrX	100615478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chrX	100625056	.	A	AGCTCCTAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=88,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chrX	100656784	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.292:41:11,0:18,10:12,17,0,12
chrX	100658946	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,35;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:4,6,1,1
chrX	100808560	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,2:1,1:3,6,2,1
chrX	100809673	.	G	GAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.960:17:0,7:0,2:0,0,9,8
chrX	100871711	.	C	CCAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:0|1:100871711_C_CCAA:100871711:1,7,1,1
chrX	100871713	.	G	GGCCAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:2,0:0|1:100871711_C_CCAA:100871711:1,10,1,1
chrX	101087374	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,0:5,15:4,6,0,15
chrX	101093412	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=113,56;MMQ=25,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chrX	101096043	.	TTCAG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,60;MMQ=47,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.290:9:6,2:1,0:0|1:101096043_TTCAG_T:101096043:4,3,1,1
chrX	101096045	.	C	CTTAAACAAAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=155,47;MMQ=25,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.417:8:4,3:1,0:1|0:101096043_TTCAG_T:101096043:3,2,1,2
chrX	101096052	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=159,60;MMQ=25,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:101096043_TTCAG_T:101096043:2,2,1,1
chrX	101395780	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	101396133	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=85,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.094:40:13,0:23,3:0|1:101396133_C_T:101396133:11,26,2,1
chrX	101396153	.	CAG	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=78,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:13,0:17,1:0|1:101396133_C_T:101396133:8,23,2,1
chrX	101409106	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=74,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,1:7,1:3,5,2,0
chrX	101409254	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=0,103;MMQ=51,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,1:1,0:0,1,0,3
chrX	101572314	.	C	CCACCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=161,98;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101572314_C_CCACCG:101572314:0,1,0,1
chrX	101572316	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,98;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101572314_C_CCACCG:101572314:0,1,0,1
chrX	101623586	.	ATGG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=66,382;MMQ=60,26;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TGG;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:2,3:0,0:1,1,3,0
chrX	101623756	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=144,151;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
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chrX	101856987	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101856977_G_GGCCA:101856977:0,0,0,1
chrX	101856990	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101856977_G_GGCCA:101856977:0,0,0,1
chrX	101856993	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:101856977_G_GGCCA:101856977:1,0,0,1
chrX	101856995	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,31;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101856977_G_GGCCA:101856977:1,0,0,1
chrX	101856997	.	A	AAAATATTAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101856977_G_GGCCA:101856977:1,0,0,1
chrX	101908947	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=61,177;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:5,3,2,0
chrX	101910039	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,525;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chrX	101910763	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,66;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:0|1:101910763_C_T:101910763:5,6,1,1
chrX	101910783	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=166,66;MMQ=60,54;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:101910763_C_T:101910763:8,5,1,1
chrX	101910787	.	A	AGTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=146,66;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,1:0|1:101910763_C_T:101910763:10,6,1,1
chrX	101913320	.	GTA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=106,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:6,1,2,1
chrX	101913597	.	TAA	T,TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,26,27;MFRL=115,184,180;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.14,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.166,0.235:14:1,0,2:5,2,1:2,7,2,3
chrX	101970823	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:9,0:10,5:6,13,0,5
chrX	101971137	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,2:6,0:4,7,0,2
chrX	102005084	.	T	TCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:102005084_T_TCA:102005084:3,2,1,1
chrX	102005086	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:102005084_T_TCA:102005084:3,2,1,1
chrX	102005088	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:102005084_T_TCA:102005084:3,2,1,1
chrX	102006595	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=74,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,1:14,3:16,9,1,3
chrX	102006877	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25,26;MFRL=147,191,190;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=T;STR;TLOD=4.57,6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.234,0.478:9:2,1,0:0,1,3:1,2,2,4
chrX	102007584	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:9,7:4,0:0|1:102007584_T_G:102007584:8,6,7,0
chrX	102007589	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:10,7:4,0:0|1:102007584_T_G:102007584:8,6,7,0
chrX	102007770	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,172;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0,12,0,2
chrX	102193031	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,24;MFRL=237,0;MMQ=59,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,1,0
chrX	102193038	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=145,231;MMQ=54,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,3,0,1
chrX	102193039	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=145,231;MMQ=54,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,3,0,1
chrX	102193040	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=145,231;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,3,0,1
chrX	102193044	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=145,231;MMQ=54,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,3,0,1
chrX	102193048	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=242,231;MMQ=51,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,2,0,1
chrX	102193052	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=242,231;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:102193038_G_A:102193038:1,2,0,1
chrX	102335224	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102335224_A_AT:102335224:0,1,0,1
chrX	102335225	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102335224_A_AT:102335224:0,1,0,1
chrX	102335228	.	T	TTGCAGTTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102335224_A_AT:102335224:0,1,0,1
chrX	102472037	.	GTGTGTGTACGTAACTATATACATA	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,41;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.109:36:17,2:13,1:11,22,2,1
chrX	102564572	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,70;MMQ=60,52;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:13,2:6,0:9,10,1,1
chrX	102564829	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:7,6,2,1
chrX	102586616	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=102,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,1:4,1:5,10,1,1
chrX	102587292	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,61;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:102587292_T_TA:102587292:1,3,1,1
chrX	102587293	.	T	TGGCCTCCCTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,61;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:102587292_T_TA:102587292:1,3,1,1
chrX	102612711	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:11,11,0,2
chrX	102754890	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=126,71;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,0:1,3:3,0,0,5
chrX	102754893	.	GCTCT	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=124,61;MMQ=48,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,1:1,3:3,1,0,4
chrX	102754902	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=54,71;MMQ=58,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:3,0:0,4:2,2,0,5
chrX	102754905	.	G	GGGGGC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=54,71;MMQ=58,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,1:0,3:2,2,0,5
chrX	102756374	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:4,7,0,4
chrX	102831549	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=171,231;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831549_T_G:102831549:0,1,0,1
chrX	102831552	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=171,231;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831549_T_G:102831549:0,1,0,1
chrX	102831558	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=171,231;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831549_T_G:102831549:0,1,0,1
chrX	102864446	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,118;MMQ=50,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.347:55:12,18:24,0:19,17,19,0
chrX	102962181	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chrX	102962468	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102962468_G_GA:102962468:0,0,0,1
chrX	102962471	.	T	TGCACCTCCACAAAAGTCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:102962468_G_GA:102962468:0,1,0,1
chrX	102962474	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102962468_G_GA:102962468:0,1,0,1
chrX	102978965	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=284,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:1,2,3,2
chrX	103219004	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chrX	103267187	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chrX	103267974	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chrX	103268241	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,3:1,1:0,1,3,2
chrX	104464276	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:104464276_CA_C:104464276:0,0,2,2
chrX	104464281	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0|1:104464276_CA_C:104464276:0,0,2,2
chrX	104464353	.	C	CCATGCTGGATGCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=50,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chrX	104464365	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=206,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104464365_T_TC:104464365:0,1,0,1
chrX	104464366	.	T	TGCCACTTTAGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=206,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104464365_T_TC:104464365:0,1,0,1
chrX	104465128	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,165;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:104465128_CAG_C:104465128:0,1,0,1
chrX	104465132	.	C	CCCCAATCACAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,165;MMQ=60,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:104465128_CAG_C:104465128:0,1,0,1
chrX	104650306	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,54;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chrX	105159893	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,4:1,0:0,6,0,5
chrX	105167049	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	105169121	.	A	AAAGGAGTCCTAAACATGGAAATGAAAGTATAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	105197209	.	TTG	AGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chrX	105281139	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105281139_T_G:105281139:0,0,0,1
chrX	105281140	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105281139_T_G:105281139:0,0,0,1
chrX	105451070	.	CG	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=96,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	105451577	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chrX	105451635	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:12,0:8,3:14,6,1,2
chrX	105921555	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=139,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105921555_C_T:105921555:0,1,0,1
chrX	105921558	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=139,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105921555_C_T:105921555:0,1,0,1
chrX	105921569	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=139,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105921569_A_AT:105921569:0,1,0,1
chrX	105921571	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=139,256;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105921569_A_AT:105921569:0,1,0,1
chrX	105921575	.	T	TCTGAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=139,256;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105921569_A_AT:105921569:0,1,0,1
chrX	105970559	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:7,6,1,1
chrX	106028279	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=99,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:4,2:6,1:8,4,3,0
chrX	106033473	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=112,47;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:15,0:14,5:14,15,0,5
chrX	106033494	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=106,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.304:41:12,0:16,12:8,21,1,11
chrX	106034383	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:6,3,1,1
chrX	106092474	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=81,81;MMQ=58,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:4,0:22,4:11,16,4,0
chrX	106146657	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:106146657_AGG_A:106146657:0,1,0,1
chrX	106146664	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,24;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:106146657_AGG_A:106146657:0,1,0,1
chrX	106146666	.	A	AAAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,23;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:106146657_AGG_A:106146657:0,1,0,1
chrX	106173204	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:106173204_G_A:106173204:9,7,1,1
chrX	106173213	.	G	GTTTGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,0:2,2:0|1:106173204_G_A:106173204:8,6,1,1
chrX	106221457	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chrX	106236663	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	106331729	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,138;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chrX	106359085	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=85,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:106359085_C_T:106359085:11,12,1,1
chrX	106359087	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=85,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:14,2:0|1:106359085_C_T:106359085:11,12,1,1
chrX	106359096	.	T	TCC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=90,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,0:17,2:0|1:106359096_T_TCC:106359096:14,15,1,1
chrX	106359098	.	A	AGCT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:16,2:0|1:106359096_T_TCC:106359096:13,15,1,1
chrX	106396617	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.277:22:10,2:5,2:6,10,2,4
chrX	106396721	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=116,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:5,8,1,2
chrX	106397477	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chrX	106410990	.	G	GTGGCTCACGTCTGTAATC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,31;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:7,10,1,1
chrX	106418445	.	A	ACACAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.262:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chrX	106466043	.	C	CAGATGAAAGAGCAATTTCCTGTCA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=99,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,1:16,1:12,9,0,2
chrX	106516371	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=66,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:5,4,2,1
chrX	106789123	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:106789123_G_A:106789123:0,1,0,1
chrX	106789126	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106789123_G_A:106789123:0,0,0,1
chrX	106840806	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:10,0:5,3:7,9,0,3
chrX	106882790	.	T	TGCAATCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=361,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	106888318	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=184,154;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chrX	106893363	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=237,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106893363_T_TTC:106893363:0,1,0,1
chrX	106893364	.	G	GGATAAGCTCTAATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=237,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:106893363_T_TTC:106893363:0,1,0,1
chrX	107037860	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=126,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:10,6:4,1:5,9,0,7
chrX	107148929	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107148929_G_T:107148929:0,0,0,1
chrX	107148930	.	G	GCCATTCTCCTGCCTCAGCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107148929_G_T:107148929:0,0,0,1
chrX	107159429	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:107159429_T_TG:107159429:0,1,0,1
chrX	107159430	.	T	TTTCCGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:107159429_T_TG:107159429:0,1,0,1
chrX	107169296	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.296:11:3,1:2,2:5,3,3,0
chrX	107224862	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=197,158;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:0|1:107224862_C_A:107224862:1,3,5,0
chrX	107224865	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=197,158;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:0|1:107224862_C_A:107224862:1,3,5,0
chrX	107328331	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:107328331_A_T:107328331:6,7,1,1
chrX	107328338	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:107328331_A_T:107328331:8,7,1,1
chrX	107328436	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chrX	107331894	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chrX	107332133	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	107393330	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	107396165	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:107396165_G_A:107396165:5,2,1,1
chrX	107396170	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:107396165_G_A:107396165:6,2,1,1
chrX	107396365	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chrX	107400449	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=62,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:107400449_G_T:107400449:2,5,1,1
chrX	107400452	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=62,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:107400449_G_T:107400449:2,5,1,1
chrX	107408503	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:5,0,4,0
chrX	107414205	.	C	CACCCACTTCCCACTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	107418281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chrX	107418420	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=48,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,0:1,3:4,5,1,2
chrX	107418906	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,9,6
chrX	107420199	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:9,0:9,7:0|1:107420199_G_T:107420199:11,8,0,7
chrX	107420206	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:9,0:10,7:0|1:107420199_G_T:107420199:11,8,0,7
chrX	107423674	.	TACAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AC;STR;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,3:1,3:2,0,3,5
chrX	107431293	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107431293_AG_TT:107431293:0,0,0,1
chrX	107431298	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107431293_AG_TT:107431293:0,0,0,1
chrX	107431301	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107431293_AG_TT:107431293:0,0,0,1
chrX	107437848	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chrX	107449874	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:107449874_T_A:107449874:0,3,1,1
chrX	107449880	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,1:0|1:107449874_T_A:107449874:0,3,1,1
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chrX	107455014	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
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chrX	107554009	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=90,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:16,0:10,1:0|1:107554009_C_T:107554009:11,16,1,1
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chrX	107554033	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:10,1:0|1:107554009_C_T:107554009:8,10,1,1
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chrX	107783009	.	G	GTTTTTTTTCCCTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:107783007_G_GTTTT:107783007:2,4,1,1
chrX	107806992	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chrX	107814707	.	A	AGACC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:107814707_A_AGACC:107814707:4,3,1,1
chrX	107814711	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:107814707_A_AGACC:107814707:4,3,1,1
chrX	107814715	.	GA	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=86,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:107814707_A_AGACC:107814707:3,3,1,1
chrX	107819028	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=226,186;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:107819028_T_C:107819028:1,0,1,0
chrX	107819031	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=195,186;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:107819028_T_C:107819028:2,0,1,0
chrX	107819045	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=226,175;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chrX	107819047	.	ACAC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=195,186;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:107819047_ACAC_A:107819047:2,0,1,0
chrX	107819051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=195,186;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:107819047_ACAC_A:107819047:2,0,1,0
chrX	107821665	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=253,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:107821665_TAG_T:107821665:0,1,0,1
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chrX	107824012	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.170:15:5,1:8,1:3,10,0,2
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chrX	107829782	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	107840145	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	107840188	.	ATTGTGTGTGTGTGTGTTTGT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,19;MFRL=44,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:1,0:13,3,2,0
chrX	107840191	.	GTGTGTGTGTGTGTTTGTT	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=44,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.206:18:8,4:1,0:12,2,3,1
chrX	107844758	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=13,20;MFRL=161,117;MMQ=53,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.600:5:0,1:0,1:0,2,0,3
chrX	107844810	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=150,198;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chrX	107845035	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=89,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:7,3,2,0
chrX	107845037	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:5,2,4,1
chrX	107845039	.	AG	CA,TG	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,32,20;MFRL=114,84,89;MMQ=60,50,50;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.02,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,2:0.167,0.167:15:7,1,2:3,0,0:9,2,2,2
chrX	107845048	.	CT	GC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=84,89;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,2:5,0:11,6,1,1
chrX	107845049	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=88,84;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:5,0:0|1:107845049_T_C:107845049:11,5,1,1
chrX	107845052	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=89,84;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:0|1:107845049_T_C:107845049:12,6,1,1
chrX	107867449	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=91,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,1,0
chrX	107918007	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.675:12:1,1:0,1:0,4,1,7
chrX	107978253	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,6:0,1,6,5
chrX	107978665	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:3,3,3,0
chrX	108619168	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.319:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chrX	108628512	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=109,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,2:13,0:0|1:108628512_C_CA:108628512:5,12,1,1
chrX	108628513	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=109,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,2:13,0:0|1:108628512_C_CA:108628512:5,12,1,1
chrX	108628515	.	T	TTTCAGCTGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=109,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:13,0:0|1:108628512_C_CA:108628512:5,12,1,1
chrX	108635140	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:17,1:5,1:11,11,1,1
chrX	108887414	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,1:0|1:108887414_C_T:108887414:1,6,1,1
chrX	108887416	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0|1:108887414_C_T:108887414:1,6,1,1
chrX	108904729	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chrX	108917757	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=103,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:0,1,0,6
chrX	108917773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	108925988	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=91,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,0:14,3:15,7,1,2
chrX	109387928	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
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chrX	109694887	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=91,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:0|1:109694887_C_A:109694887:3,7,1,2
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chrX	109694892	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,30;MFRL=91,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:0|1:109694887_C_A:109694887:3,7,1,2
chrX	109694896	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=100,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:2,2:0|1:109694887_C_A:109694887:4,7,1,2
chrX	109694897	.	T	TGTCAGTCCCA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=93,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:109694887_C_A:109694887:3,6,0,2
chrX	109695373	.	ATGTCC	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,36;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:109695373_ATGTCC_A:109695373:6,2,1,1
chrX	109695380	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=131,36;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:109695373_ATGTCC_A:109695373:6,2,1,1
chrX	109695384	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=131,36;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:109695373_ATGTCC_A:109695373:6,2,1,1
chrX	109695387	.	AG	TT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=131,36;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:0|1:109695373_ATGTCC_A:109695373:6,2,1,1
chrX	109696384	.	A	AGTAATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=92,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,0:3,2:5,3,1,1
chrX	109924712	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=89,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:6,3,1,1
chrX	109924722	.	T	TCCTCCTGCCCCAGCCTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=107,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:7,4,1,1
chrX	109937570	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:109937570_A_T:109937570:0,2,0,1
chrX	109937572	.	A	AGCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:109937570_A_T:109937570:0,2,0,1
chrX	109937573	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:109937570_A_T:109937570:0,2,0,1
chrX	109963131	.	T	TAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:7,1,1,1
chrX	110435484	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,25;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:1,1:1,3,0,3
chrX	110494999	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110494999_A_C:110494999:0,0,0,1
chrX	110495005	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110494999_A_C:110494999:0,0,0,1
chrX	110644234	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,1:6,0:0|1:110644234_G_A:110644234:7,4,1,1
chrX	110644237	.	T	TTTTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:110644234_G_A:110644234:7,5,1,1
chrX	110644238	.	A	ATCTTCCGCAGC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,1:6,0:0|1:110644234_G_A:110644234:7,5,1,1
chrX	110988073	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=58,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:9,12,0,2
chrX	111000721	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	111078114	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chrX	112021803	.	G	GGTACTGTGTACTAGTTTACTGAAGAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:7,0:1,2:6,2,1,1
chrX	112022712	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,0:1,2:3,3,2,0
chrX	112054413	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112054413_C_T:112054413:0,0,1,0
chrX	112054416	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112054413_C_T:112054413:0,0,1,0
chrX	112054677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=188,405;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chrX	112058974	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:1,0:6,5,2,2
chrX	114082535	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chrX	114082685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=189,40668454;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,2,0
chrX	114400318	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chrX	114414106	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chrX	114414406	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114414406_G_A:114414406:0,0,0,1
chrX	114414408	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114414406_G_A:114414406:0,0,0,1
chrX	114414413	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114414406_G_A:114414406:0,0,0,1
chrX	114414415	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114414406_G_A:114414406:0,0,0,1
chrX	114425181	.	A	AGAGGCCGCTCGCCCAACGCCCACAGCG	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=123.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,7:0,11:0,0,16,15
chrX	114426917	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chrX	115305322	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115305322_A_AAC:115305322:0,1,0,1
chrX	115305324	.	T	TGTTTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115305322_A_AAC:115305322:0,1,0,1
chrX	115305330	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115305322_A_AAC:115305322:0,1,0,1
chrX	115584402	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	115585695	.	G	GTAGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=219,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:115585695_G_GTAGAT:115585695:0,1,0,1
chrX	115585697	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=219,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:115585695_G_GTAGAT:115585695:0,1,0,1
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chrX	117043395	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,8:9,0:9,7,8,0
chrX	117053499	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,9,8
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chrX	117106630	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.832:4:0,2:0,2:1|0:117106629_CA_TG:117106629:0,0,4,0
chrX	117512512	.	T	TGAGACAGAGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	117512528	.	AGT	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117512528_AGT_A:117512528:0,0,0,1
chrX	117512532	.	A	ACATATATTACCTTCTCACATTCTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117512528_AGT_A:117512528:0,0,0,1
chrX	117512534	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117512528_AGT_A:117512528:0,0,0,1
chrX	117512537	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117512528_AGT_A:117512528:0,0,0,1
chrX	117512539	.	C	CTATTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117512528_AGT_A:117512528:0,0,0,1
chrX	117520365	.	AAT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=117,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:10,2:5,1:5,10,1,2
chrX	117527156	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:4,8,0,2
chrX	117530912	.	GT	G,GTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=142,121,185;MMQ=60,60,60;MPOS=15,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.56,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.301,0.206:17:3,3,1:4,2,1:7,1,8,1
chrX	117540905	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:0|1:117540905_T_A:117540905:7,7,1,1
chrX	117540910	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=80,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:7,1:0|1:117540905_T_A:117540905:10,7,1,1
chrX	117727327	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=71,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.879:13:1,3:0,8:1,0,4,8
chrX	117742356	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chrX	117758495	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:17,0:12,2:15,14,0,2
chrX	117762109	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.233:18:5,1:8,2:8,6,3,1
chrX	117764505	.	G	GAGTGTACTACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	117764541	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	117817266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	117874898	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	117883813	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chrX	117895296	.	T	TTATAAAAATTAAATTCAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chrX	117895317	.	A	ATACTTGGCCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=222,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	117960068	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=70,15508480;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chrX	118109266	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.110:26:14,0:9,2:0|1:118109266_C_T:118109266:11,13,1,1
chrX	118109277	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=128,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:5,2:0|1:118109266_C_T:118109266:7,11,1,1
chrX	118109283	.	G	GGCACAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:118109266_C_T:118109266:5,12,1,1
chrX	118109285	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,1:0|1:118109266_C_T:118109266:5,11,1,1
chrX	118148403	.	C	CTTTGCGGATTTATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	118151628	.	C	CCCCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=10,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0|1:118151628_C_CCCCA:118151628:3,4,1,1
chrX	118151630	.	T	TCATGAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=10,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:118151628_C_CCCCA:118151628:3,4,1,1
chrX	118227597	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:1,5,2,1
chrX	118250601	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chrX	118257432	.	G	GGATTCTTCAGAACAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:118257432_G_GGATTCTTCAGAACAGA:118257432:2,0,0,1
chrX	118257435	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118257432_G_GGATTCTTCAGAACAGA:118257432:2,0,0,1
chrX	118284446	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,77;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:3,0:6,4,2,1
chrX	118284579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chrX	118284610	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	118586145	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=75,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:118586145_T_C:118586145:2,1,1,1
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chrX	118603706	.	A	AG	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=108,116;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:14,2:9,6:0|1:118603706_A_AG:118603706:14,10,4,4
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chrX	118603729	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=123,124;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.289:36:14,2:11,6:0|1:118603706_A_AG:118603706:16,10,4,6
chrX	118603742	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=132,125;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:10,3:8,3:0|1:118603706_A_AG:118603706:10,8,1,5
chrX	118603747	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=128,125;MMQ=60,35;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:7,4:9,3:9,8,1,6
chrX	118603756	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=128,124;MMQ=52,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:12,1:11,2:13,12,1,2
chrX	118603773	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=126,138;MMQ=52,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.283:29:11,3:10,4:10,11,5,3
chrX	118603881	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=24,28;MFRL=129,142;MMQ=60,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:12,11,0,2
chrX	118603922	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=29,30;MFRL=134,72;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:15,0:8,6:11,12,2,4
chrX	118603925	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=25,27;MFRL=115,149;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,4:15,0:0|1:118603925_G_A:118603925:12,15,2,2
chrX	118603929	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=98,149;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:12,4:14,0:0|1:118603925_G_A:118603925:14,18,2,2
chrX	118603941	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=24,34;MFRL=98,149;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:11,2:18,0:0|1:118603925_G_A:118603925:13,17,2,2
chrX	118603958	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=115,141;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,2:12,0:0|1:118603925_G_A:118603925:8,19,2,0
chrX	118603961	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=30,29;MFRL=121,134;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:10,2:12,0:0|1:118603925_G_A:118603925:8,15,2,1
chrX	118603984	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=28,20;MFRL=125,120;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,1:12,2:5,14,1,2
chrX	118604004	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=31,23;MFRL=129,141;MMQ=52,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:118604004_C_A:118604004:2,12,0,2
chrX	118604006	.	AC	GT	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=25,30;MFRL=129,141;MMQ=52,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:118604004_C_A:118604004:2,12,0,2
chrX	118604014	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=125,141;MMQ=52,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:118604004_C_A:118604004:3,12,0,2
chrX	118604030	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=27,24;MFRL=123,141;MMQ=52,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:8,0:0|1:118604004_C_A:118604004:3,7,0,2
chrX	118604367	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=25,23;MFRL=139,116;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:18,5:16,1:20,14,4,2
chrX	118604399	.	CT	GG	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=144,108;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.240:48:17,8:17,3:0|1:118604399_CT_GG:118604399:20,17,5,6
chrX	118604409	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=28,27;MFRL=130,108;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,13:0.274:49:17,8:18,5:0|1:118604399_CT_GG:118604399:19,17,6,7
chrX	118604412	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=30,23;MFRL=117,112;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,12:0.250:50:19,8:18,4:0|1:118604412_G_A:118604412:20,18,5,7
chrX	118604416	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=119,112;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,12:0.255:49:19,8:17,4:0|1:118604412_G_A:118604412:20,17,5,7
chrX	118604428	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=141,112;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.199:43:16,4:16,4:0|1:118604428_T_C:118604428:17,18,2,6
chrX	118604436	.	T	A,C	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=0,22,26;MFRL=0,105,143;MMQ=60,55,60;MPOS=4,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.99,89.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,30:0.163,0.813:36:0,3,16:0,3,13:0,0,14,22
chrX	118604444	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=129,108;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:19,1:13,1:0|1:118604428_T_C:118604428:13,21,0,3
chrX	118604553	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chrX	118679315	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.790:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chrX	118679429	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=119,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:0|1:118679429_G_A:118679429:6,12,0,2
chrX	118679448	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=119,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,1:6,0:0|1:118679429_G_A:118679429:9,11,0,2
chrX	118679451	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=112,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:12,2:5,0:0|1:118679429_G_A:118679429:9,10,0,2
chrX	118699320	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chrX	118725274	.	T	TTATCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	118750678	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=79,44;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:9,0:7,2:8,9,0,2
chrX	118754064	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.809:16:1,4:2,7:2,1,2,11
chrX	118783805	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=144,251;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:118783805_G_C:118783805:3,0,1,0
chrX	118783812	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=144,251;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:118783805_G_C:118783805:3,0,1,0
chrX	118783825	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=144,251;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:118783825_C_CT:118783825:3,0,1,0
chrX	118783828	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,34;MFRL=144,251;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:118783825_C_CT:118783825:3,0,1,0
chrX	118783834	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=72,251;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118783825_C_CT:118783825:2,0,1,0
chrX	118783881	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=284,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chrX	118784067	.	G	C,GAATCTCGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35,31;MFRL=118,122,107;MMQ=60,60,60;MPOS=6,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,1:1,1,0:0,3,0,2
chrX	118784070	.	A	AAACATGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:118784070_A_AAACATGG:118784070:0,4,0,1
chrX	118784071	.	G	GGTTGCGGTGAGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1|0:118784070_A_AAACATGG:118784070:0,4,0,1
chrX	118787022	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=302,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.815:9:1,3:0,3:0,1,1,7
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chrX	118920809	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
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chrX	119059147	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
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chrX	119059414	.	A	AGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119059412_T_TAA:119059412:0,1,0,1
chrX	119070411	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chrX	119072764	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:0|1:119072764_A_T:119072764:2,12,0,4
chrX	119072765	.	CTTAA	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,3:5,1:0|1:119072764_A_T:119072764:2,18,0,4
chrX	119072867	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	119249314	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119249314_G_GAA:119249314:0,0,0,1
chrX	119249316	.	G	GAAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:119249314_G_GAA:119249314:0,0,0,1
chrX	119388721	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=145,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:119388721_A_G:119388721:11,9,1,1
chrX	119388727	.	T	TAGTGAAAATGAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:119388721_A_G:119388721:9,9,1,1
chrX	119389093	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=69,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:13,10,1,1
chrX	119389110	.	GGTATT	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,2:0|1:119389110_GGTATT_G:119389110:12,8,1,1
chrX	119389119	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=129,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:119389110_GGTATT_G:119389110:8,5,1,1
chrX	119390643	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29,23;MFRL=135,184,106;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.95,4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.229,0.380:10:2,1,0:2,1,3:0,4,2,4
chrX	119402264	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chrX	119419863	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119419863_T_C:119419863:0,2,0,1
chrX	119419865	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119419863_T_C:119419863:0,2,0,1
chrX	119445015	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chrX	119500632	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=70,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:6,12,1,1
chrX	119510144	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	119565280	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.277:23:5,0:11,6:7,10,1,5
chrX	119573043	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,60;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,0:11,3:8,10,1,2
chrX	119575831	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:119575831_C_T:119575831:0,1,0,1
chrX	119575841	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:119575831_C_T:119575831:0,1,0,1
chrX	119580335	.	G	GTGACTGAAGTTCCTTCCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.481:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	119674476	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chrX	119676896	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.550:11:2,1:1,5:2,3,0,6
chrX	119677553	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,94;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:7,2,3,1
chrX	119738115	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=137,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:15,0:4,2:0|1:119738115_T_A:119738115:6,13,1,1
chrX	119738119	.	G	GCACAATCTCGGCTCACTACAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:16,0:3,2:0|1:119738115_T_A:119738115:7,12,1,1
chrX	119745016	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=253,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:119745016_T_A:119745016:0,1,0,1
chrX	119745020	.	A	ACGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=253,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119745016_T_A:119745016:0,1,0,1
chrX	122251656	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122251656_C_CAA:122251656:0,0,0,1
chrX	122251657	.	T	TCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122251656_C_CAA:122251656:0,0,0,1
chrX	122318386	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chrX	122336600	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,0:0,1,0,4
chrX	122338205	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,5,5
chrX	122338412	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122338412_T_A:122338412:0,1,0,1
chrX	122338414	.	T	TGCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:122338412_T_A:122338412:0,1,0,1
chrX	122338415	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:122338412_T_A:122338412:0,1,0,1
chrX	122528803	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
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chrX	122771927	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=92,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,0:5,9:5,9,0,9
chrX	122805622	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.343:10:1,2:6,1:5,2,0,3
chrX	123019835	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:123019835_C_T:123019835:1,2,1,0
chrX	123019843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=117,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:123019835_C_T:123019835:1,2,1,0
chrX	123034636	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=240,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:123034636_T_TC:123034636:0,4,0,2
chrX	123034637	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=240,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:123034636_T_TC:123034636:0,4,0,2
chrX	123041043	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chrX	123041071	.	CCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=197,117;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:123041071_CCTG_C:123041071:0,4,0,1
chrX	123041075	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=197,117;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:123041071_CCTG_C:123041071:0,4,0,1
chrX	123189956	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chrX	123200060	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=78,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:20,4:8,0:0|1:123200060_G_A:123200060:6,22,0,4
chrX	123200076	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=73,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:15,4:8,0:0|1:123200060_G_A:123200060:6,17,0,4
chrX	123229257	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:6,8,2,1
chrX	123695525	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=103,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,4:11,0:9,8,4,0
chrX	125685837	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=142,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,3:5,0:4,2,1,2
chrX	125953932	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chrX	125954910	.	C	CTCTTTCCTAAATGCAAGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:2,3,1,1
chrX	125955490	.	C	CATTTCCTGCCAACAACCCTAAGAATAGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chrX	128701279	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,11:7,0:3,5,9,2
chrX	128876120	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=82,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:10,4:5,0:8,7,0,4
chrX	128885745	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,62;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,0:12,4:4,15,0,4
chrX	128887113	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=99,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:128887113_T_C:128887113:10,10,1,1
chrX	128887115	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=99,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:128887113_T_C:128887113:10,10,1,1
chrX	128893194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=82,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chrX	128922625	.	ACCACCTC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=234,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128922625_ACCACCTC_A:128922625:0,1,0,1
chrX	128922635	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=234,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128922625_ACCACCTC_A:128922625:0,1,0,1
chrX	128946671	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=187,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:11,1,1,1
chrX	128957640	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chrX	128976019	.	C	CCCTGGGGGTCAGGTGAGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chrX	129053454	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=104,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:1,0:11,4:6,7,0,4
chrX	129060300	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,53;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:6,10,1,2
chrX	129147374	.	GT	CC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=86,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0|1:129147374_GT_CC:129147374:5,8,1,1
chrX	129147384	.	T	TCAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=86,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:2,0:7,2:0|1:129147374_GT_CC:129147374:3,8,1,1
chrX	129150220	.	C	CAGGGTTCTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	129156801	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	129168685	.	TTG	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:129168685_TTG_T:129168685:0,6,0,2
chrX	129168690	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:129168685_TTG_T:129168685:0,6,0,2
chrX	129168695	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:129168685_TTG_T:129168685:0,6,0,2
chrX	129203720	.	TCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129203720_TCCC_T:129203720:0,1,0,1
chrX	129203728	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129203720_TCCC_T:129203720:0,1,0,1
chrX	129206140	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,8;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:129206140_G_GC:129206140:0,2,1,0
chrX	129206148	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:129206140_G_GC:129206140:0,3,1,0
chrX	129206150	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:129206140_G_GC:129206140:0,3,1,0
chrX	129206155	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=45,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:129206140_G_GC:129206140:1,3,1,0
chrX	129265676	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:3,2:0|1:129265676_T_C:129265676:9,3,1,1
chrX	129265681	.	T	TCTTGGGTAAGTTAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:129265676_T_C:129265676:9,4,1,1
chrX	129267464	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,1:0,1:1,3,0,2
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chrX	129339387	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=120,166;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.292:11:5,0:2,2:5,3,0,3
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chrX	129493166	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129493166_G_A:129493166:0,0,0,1
chrX	129493171	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129493166_G_A:129493166:0,0,0,1
chrX	129493183	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	129507020	.	A	ACTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:129507020_A_ACTT:129507020:0,1,0,1
chrX	129507022	.	CAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129507020_A_ACTT:129507020:0,1,0,1
chrX	129507028	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129507020_A_ACTT:129507020:0,1,0,1
chrX	129507031	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129507020_A_ACTT:129507020:0,1,0,1
chrX	129546260	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.704:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chrX	129546654	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=94,137;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.171:37:7,5:23,0:17,14,6,0
chrX	129629632	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:5,4,2,0
chrX	129630099	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,136;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chrX	129759509	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=142,34;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:129759509_G_A:129759509:0,1,1,1
chrX	129759512	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=142,34;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:129759509_G_A:129759509:0,1,1,1
chrX	129771279	.	T	TTTTTAGGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,0:6,16,1,1
chrX	130217217	.	TTG	AGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=115,37;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:130217217_TTG_AGA:130217217:1,8,1,1
chrX	130217224	.	T	TCCAGCA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=90,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:130217217_TTG_AGA:130217217:1,7,1,1
chrX	130217227	.	T	TGA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=90,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:130217217_TTG_AGA:130217217:1,7,1,1
chrX	130217229	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=90,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,0:0|1:130217217_TTG_AGA:130217217:1,7,1,1
chrX	130218390	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:130218390_G_T:130218390:3,1,0,1
chrX	130218399	.	G	GTCCAACGATAGACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:1,0:0|1:130218390_G_T:130218390:2,1,0,1
chrX	130222766	.	T	TCATCGACGCCCAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	130411225	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=108,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,2:6,0:2,6,1,1
chrX	130411256	.	ATTAAGAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=113,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:130411256_ATTAAGAAC_A:130411256:1,5,0,2
chrX	130411273	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:130411256_ATTAAGAAC_A:130411256:0,4,0,2
chrX	130411999	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chrX	130412177	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=183,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130412177_A_C:130412177:0,1,0,1
chrX	130412179	.	TTTGTCAGCAAATAAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=183,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130412177_A_C:130412177:0,1,0,1
chrX	130412198	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130412177_A_C:130412177:0,0,0,1
chrX	130416759	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=242,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:130416759_T_C:130416759:0,3,0,1
chrX	130416762	.	C	CTTCTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=242,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:130416759_T_C:130416759:0,3,0,1
chrX	130416763	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=242,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:130416759_T_C:130416759:0,3,0,1
chrX	130416785	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=224,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chrX	130416793	.	C	T,A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,24,21;MFRL=0,242,249;MMQ=60,60,60;MPOS=4,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chrX	130416795	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	130417214	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:130417214_G_C:130417214:0,3,1,0
chrX	130417221	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:130417214_G_C:130417214:0,3,1,0
chrX	130419144	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=56,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:130419144_C_A:130419144:2,2,1,0
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chrX	130419215	.	T	TTGTTGTCCCA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=121,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:130419212_AT_CA:130419212:4,1,1,1
chrX	130678844	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chrX	131197395	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chrX	131203438	.	CATATATATATATATATATATATATATAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=21,7;RU=AT;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.774:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	131212064	.	C	CCTGGCTATAGCTTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:4,2,1,1
chrX	131212757	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=69,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:7,0:6,2:0|1:131212757_TA_T:131212757:10,4,1,1
chrX	131212764	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=69,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:131212757_TA_T:131212757:9,4,1,1
chrX	131231430	.	TAC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.865:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	131520613	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chrX	131803311	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=219,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:131803311_C_CA:131803311:0,8,0,2
chrX	131803312	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=219,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:131803311_C_CA:131803311:0,8,0,2
chrX	131803314	.	A	AGGC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=219,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:131803311_C_CA:131803311:0,8,0,2
chrX	131803318	.	C	CTGGCTTTA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=219,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:131803311_C_CA:131803311:0,8,0,2
chrX	132092639	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,19;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,0:6,2:0|1:132092639_T_A:132092639:2,7,2,2
chrX	132092641	.	AGG	CCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,2:6,2:0|1:132092639_T_A:132092639:2,7,2,2
chrX	132092648	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:0|1:132092639_T_A:132092639:2,7,2,2
chrX	132161340	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:9,2:5,0:0|1:132161340_G_A:132161340:5,9,1,1
chrX	132161343	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,2:5,0:0|1:132161340_G_A:132161340:4,8,1,1
chrX	132161412	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chrX	132351002	.	TA	T,TAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24,23;MFRL=0,0,204;MMQ=60,60,60;MPOS=27,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.14,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.404,0.403:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chrX	132351018	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:2,0,2,0
chrX	132351022	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=144,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:3,1,1,0
chrX	132351029	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=144,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:3,1,1,0
chrX	132351514	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chrX	132438947	.	T	TAGATTTTAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132438947_T_TAGATTTTAAG:132438947:0,0,0,1
chrX	132438949	.	C	CTTCCTCATCAGCTAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132438947_T_TAGATTTTAAG:132438947:0,0,0,1
chrX	132730502	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.131:27:16,0:8,3:15,9,1,2
chrX	132887454	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:132887454_G_T:132887454:3,2,1,1
chrX	132887457	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=119,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:132887454_G_T:132887454:2,2,1,1
chrX	132887458	.	C	CTCTCCTTTCTCCTCCTCCTTTCCCTCTTCCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=119,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:132887454_G_T:132887454:2,2,1,1
chrX	133119555	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133119555_CAG_C:133119555:0,1,0,1
chrX	133119558	.	T	TGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:133119555_CAG_C:133119555:0,1,0,1
chrX	133379551	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chrX	133511988	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,6,2
chrX	133527685	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:133527685_TAA_T:133527685:3,1,0,1
chrX	133527688	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:133527685_TAA_T:133527685:3,1,0,1
chrX	133527692	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:133527685_TAA_T:133527685:3,1,0,1
chrX	133680547	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chrX	134033226	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.318:18:3,2:8,1:0|1:134033226_GT_G:134033226:6,7,0,5
chrX	134033242	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.227:16:4,3:6,0:0|1:134033226_GT_G:134033226:4,9,0,3
chrX	134033244	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=107,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.252:14:4,3:4,0:0|1:134033226_GT_G:134033226:3,8,0,3
chrX	134033248	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:4,0:0|1:134033226_GT_G:134033226:2,8,0,3
chrX	134126535	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	134156121	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chrX	134166790	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=116,188;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:2,2,0,1
chrX	134186213	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:134186213_T_G:134186213:0,1,0,1
chrX	134186220	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:134186213_T_G:134186213:0,1,0,1
chrX	134305000	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=145,50;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:134305000_A_T:134305000:7,3,1,1
chrX	134305003	.	T	TCGGAGGATGCAGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=145,50;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:134305000_A_T:134305000:7,3,1,1
chrX	134421168	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,7:0,0,11,7
chrX	134421855	.	G	GCAAGAGGGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	134481795	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,6:9,0:11,6,6,0
chrX	134493747	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chrX	134494338	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:5,5,0,2
chrX	134494968	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:10,0:12,5:10,13,0,5
chrX	134654818	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	134680405	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=119,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:5,1:1,4:2,4,2,3
chrX	134708014	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,0:4,7:2,3,0,7
chrX	134948167	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chrX	134978425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=211,95;MMQ=50,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,3:0,9:1,0,5,7
chrX	134986768	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,3,6
chrX	134986769	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,3,6
chrX	134986772	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,3,3
chrX	134986775	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,3,3
chrX	134986780	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,2,3
chrX	134986781	.	G	GTATGTC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,2,3
chrX	134988393	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chrX	134988987	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	134989037	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=117,61;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chrX	134990000	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chrX	134990944	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	134993584	.	T	TGCATGTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134993584_T_TGCATGTGA:134993584:0,0,0,1
chrX	134993586	.	C	CATTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134993584_T_TGCATGTGA:134993584:0,0,0,1
chrX	135055694	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chrX	135080623	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.441:12:6,3:1,1:7,0,4,1
chrX	135095664	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=180,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:1,1:0,5,0,2
chrX	135126568	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:10,0,2,0
chrX	135278976	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=126,76;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,8:5,0:5,7,8,0
chrX	135279003	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=76,41;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:17,0:4,2:0|1:135279003_G_A:135279003:13,9,1,1
chrX	135279007	.	C	CTGTAAAATACAAAT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=124,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:135279003_G_A:135279003:5,9,1,1
chrX	135279011	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=122,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:0|1:135279003_G_A:135279003:6,9,1,1
chrX	135292022	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.939:15:0,7:0,7:0,0,8,7
chrX	135310765	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chrX	135310785	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chrX	135312618	.	T	TATTATTTTTACTTATTTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:5,7,0,2
chrX	135313034	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=288,121;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:1,6:1,0,7,2
chrX	135314431	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	135322440	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	135323452	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chrX	135391061	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135391061_A_AT:135391061:0,1,0,1
chrX	135391063	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135391061_A_AT:135391061:0,1,0,1
chrX	135391065	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135391061_A_AT:135391061:0,1,0,1
chrX	135391068	.	AA	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135391061_A_AT:135391061:0,1,0,1
chrX	135427079	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:2,0:14,3:8,8,0,3
chrX	135427133	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=123,74;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:12,0:13,4:14,11,2,2
chrX	135429389	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,12;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,0:8,3:3,15,2,1
chrX	135429952	.	ACAGCTCTCCCC	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:4,7,0,2
chrX	135429962	.	C	CTCCATCCT	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.294:8:4,1:2,1:1|0:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:3,3,0,2
chrX	135429965	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=121,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:3,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:5,5,0,2
chrX	135429968	.	A	AGT	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=29,24;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:5,4,0,2
chrX	135429969	.	AGCTCTGAC	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,23;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:6,4,0,2
chrX	135429979	.	ATC	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,23;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:7,3,0,2
chrX	135429983	.	CCA	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:6,2:4,0:0|1:135429952_ACAGCTCTCCCC_A:135429952:7,3,0,2
chrX	135430956	.	A	AAGTATCTTTATGTCAAAGCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chrX	135435656	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:135435656_AT_A:135435656:0,2,0,1
chrX	135435659	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:135435656_AT_A:135435656:0,2,0,1
chrX	135474420	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chrX	135474444	.	AGAT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAT;STR;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chrX	135477733	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135477733_A_T:135477733:0,1,0,1
chrX	135477734	.	A	ATTCACTATCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135477733_A_T:135477733:0,1,0,1
chrX	135477738	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135477733_A_T:135477733:0,1,0,1
chrX	135480126	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chrX	135496398	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chrX	135574099	.	GCTAT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=33,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:4,0:2,10,2,0
chrX	135581888	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,0:11,3:16,10,2,1
chrX	135582270	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=163,163;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,7:10,0:17,0,7,0
chrX	135633094	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chrX	135730449	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=75,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:4,2,1,1
chrX	135772847	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:9,2:0|1:135772847_T_C:135772847:9,6,1,1
chrX	135772852	.	T	TGATTGATA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:135772847_T_C:135772847:10,7,1,1
chrX	135772885	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chrX	135789224	.	A	AGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	135814349	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=101,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:7,16,1,1
chrX	135960333	.	AAATGCAGTTAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=269,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chrX	135961585	.	ATG	A,ATTG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,26,19;MFRL=144,133,108;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.26,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,6:0.225,0.281:21:4,3,1:5,2,2:3,7,3,8
chrX	135961586	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.445:22:5,6:7,4:3,9,3,7
chrX	135961587	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.962:25:0,13:0,11:0,0,7,18
chrX	136112399	.	GGG	TTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=102,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.185:13:4,1:7,0:0|1:136112399_GGG_TTT:136112399:3,8,1,1
chrX	136112404	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.185:13:4,2:7,0:0|1:136112399_GGG_TTT:136112399:3,8,1,1
chrX	136649117	.	C	CACACACACACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chrX	136659401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chrX	137749997	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	137821544	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	138286157	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chrX	138619206	.	T	TATCTATTAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=148,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:6,2:3,0:6,3,1,1
chrX	138670026	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chrX	138697246	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chrX	138698652	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,18;MFRL=106,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.862:15:2,3:0,2:0|1:138698652_GA_G:138698652:2,0,4,9
chrX	138698665	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=70.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,9:0,8:0|1:138698652_GA_G:138698652:0,0,6,13
chrX	138708684	.	CA	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=231,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chrX	138714580	.	C	CAACT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=120,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:16,2:27,0:20,24,1,1
chrX	138714613	.	C	CTAAGATTGCACCACTGCACTCCAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=122,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.232:19:6,4:7,0:6,9,2,2
chrX	138714666	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,3:5,0:0,7,0,4
chrX	138724725	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	138729127	.	T	TAACGTTATAATCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:138729127_T_TAACGTTATAATCAC:138729127:0,1,0,1
chrX	138729130	.	T	TTTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138729127_T_TAACGTTATAATCAC:138729127:0,1,0,1
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chrX	138823331	.	GT	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:138823325_T_A:138823325:0,4,0,1
chrX	138825675	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chrX	138827962	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:17,0:10,5:13,14,0,5
chrX	138839966	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,0:9,3:6,11,3,0
chrX	138840029	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:2,1:1,4,0,2
chrX	138869513	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,199;MMQ=40,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chrX	138897130	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chrX	139006464	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=259,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.469:2:1,1:0,0:0|1:139006464_G_GA:139006464:0,1,0,1
chrX	139006467	.	T	TATCTTCATATATAAACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=259,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139006464_G_GA:139006464:0,1,0,1
chrX	139038968	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chrX	139040477	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	139586875	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=80,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chrX	140008347	.	C	CTCTCCTCTAGGGG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=93,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:7,11,0,2
chrX	140785593	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=92,66;MMQ=49,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:140785593_T_A:140785593:7,7,1,1
chrX	140785598	.	A	ATT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,66;MMQ=48,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:140785593_T_A:140785593:7,8,1,1
chrX	140785600	.	G	GTTGAC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=94,66;MMQ=44,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,1:0|1:140785593_T_A:140785593:8,8,1,1
chrX	140785855	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=102,116;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:9,8:1,10:4,6,6,12
chrX	140785875	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,82;MMQ=40,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:4,12,1,1
chrX	140967287	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=396,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,2,3
chrX	140969238	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,0:3,3,1,2
chrX	140969262	.	C	CCGCCCTTGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,0,1
chrX	140983031	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chrX	140983064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chrX	140993852	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=101,112;MMQ=57,42;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:6,5:5,4:0|1:140993852_C_G:140993852:4,8,2,7
chrX	140993859	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=105,112;MMQ=54,42;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:5,5:4,4:0|1:140993852_C_G:140993852:4,7,2,7
chrX	140993864	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=121,112;MMQ=36,42;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,5:3,4:0|1:140993852_C_G:140993852:2,5,2,7
chrX	140993875	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=112,109;MMQ=29,53;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:7,0:2,2:1|0:140993852_C_G:140993852:3,6,0,2
chrX	140993877	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=121,91;MMQ=51,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:0|1:140993852_C_G:140993852:1,4,2,4
chrX	140993906	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=132,69;MMQ=25,29;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:140993852_C_G:140993852:0,1,1,1
chrX	140994085	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=87,91;MMQ=42,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,0:7,3:3,4,1,2
chrX	140994591	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chrX	140995973	.	C	CAACCATGGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=82,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:140995973_C_CAACCATGGT:140995973:2,4,1,1
chrX	140995975	.	A	AGTAAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=82,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,0:0|1:140995973_C_CAACCATGGT:140995973:2,4,1,1
chrX	140996339	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=289,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:0,1,4,5
chrX	142597092	.	G	GATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,88;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	142803743	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:6,3:4,9,3,0
chrX	142968007	.	CTTTAT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAT;STR;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.933:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chrX	142968082	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chrX	144904171	.	A	AGCTACTAATGATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=57,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:2,2,0,1
chrX	144904179	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:144904179_CAA_C:144904179:2,1,1,1
chrX	144904183	.	CGAATT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:144904179_CAA_C:144904179:2,1,1,1
chrX	144904269	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=90,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:5,0:0,2:0|1:144904269_T_TC:144904269:4,4,1,1
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chrX	144905015	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,22;MFRL=66,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:144905012_G_GT:144905012:2,2,0,1
chrX	144906346	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,4:8,0:5,8,4,0
chrX	144906687	.	CTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=71,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,1:2,2:5,1,0,5
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chrX	146366330	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,38;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	147003339	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chrX	147003564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chrX	147009936	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:147009936_T_C:147009936:4,12,1,1
chrX	147009942	.	TATATTG	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:8,2:0|1:147009936_T_C:147009936:4,13,1,1
chrX	147009949	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=130,53;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:147009936_T_C:147009936:4,11,1,1
chrX	147011778	.	C	CGTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:147011778_C_CGTTT:147011778:1,1,1,1
chrX	147011781	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:147011778_C_CGTTT:147011778:1,1,0,1
chrX	147011784	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:147011778_C_CGTTT:147011778:1,1,0,1
chrX	147011786	.	GC	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=65,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:147011786_GC_AG:147011786:1,2,0,1
chrX	147011788	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=65,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:147011786_GC_AG:147011786:1,2,0,1
chrX	147015021	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	147024558	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	147026330	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chrX	147106364	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=165,64;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:5,4:16,0:16,6,3,1
chrX	147744257	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=72,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:4,0:13,8:9,8,0,8
chrX	147891498	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:2,8,1,1
chrX	147891558	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	147925053	.	C	CAGGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	147925074	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:147925074_T_C:147925074:0,1,0,1
chrX	147925076	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147925074_T_C:147925074:0,1,0,1
chrX	148035332	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:3,0:0,11,0,2
chrX	148035344	.	GAC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chrX	148037055	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chrX	148037816	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:7,14,0,2
chrX	148048639	.	T	TCACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	148055144	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chrX	148059593	.	T	TTATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chrX	148062377	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chrX	148577937	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:5,2,2,0
chrX	148690238	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=178,124;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:148690238_A_G:148690238:2,0,1,0
chrX	148690240	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=178,124;MMQ=50,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:148690238_A_G:148690238:2,0,1,0
chrX	148693171	.	GAAGGATTCACTTTTACAAATATGTGATACTGAAATGGGGAGTAATAAGAGCCACATTTGTCAGCATGTAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.590:12:2,0:2,7:0,5,1,6
chrX	148794953	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,28;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chrX	148797200	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	148797300	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,112;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,5:7,0:4,7,5,0
chrX	149013079	.	G	GCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:149013079_G_GCA:149013079:0,6,1,1
chrX	149013080	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:149013079_G_GCA:149013079:0,6,1,1
chrX	149013082	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:149013079_G_GCA:149013079:0,6,1,1
chrX	149613812	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=107,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.249:24:7,4:11,0:9,9,6,0
chrX	149638879	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149638879_C_T:149638879:2,1,0,1
chrX	149638894	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=107,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:149638879_C_T:149638879:1,0,0,1
chrX	149639651	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chrX	149671868	.	A	AAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chrX	149895603	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chrX	149895683	.	TC	CT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=92,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:149895683_TC_CT:149895683:4,3,1,1
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chrX	149895688	.	G	GGTTTTAGGTCC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=92,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,2:2,0:0|1:149895683_TC_CT:149895683:4,3,1,1
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chrX	149901139	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,0,2
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chrX	149901273	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149901268_A_T:149901268:0,2,0,1
chrX	149901281	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:149901268_A_T:149901268:0,3,0,1
chrX	149901297	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chrX	149945837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,58;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chrX	149962321	.	TT	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=240,204;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.348:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chrX	149984523	.	TGTGGTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GTG;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chrX	150156281	.	T	TCAACAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:150156281_T_TCAACAC:150156281:3,4,1,1
chrX	150156283	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:150156281_T_TCAACAC:150156281:3,4,1,1
chrX	150349361	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:150349361_A_T:150349361:1,6,1,1
chrX	150349364	.	G	C,A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20,25;MFRL=64,64,169;MMQ=60,60,60;MPOS=10,-1073741821;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.52,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.279:8:1,0,2:3,2,0:0,4,2,2
chrX	150349367	.	TA	CT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,21;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:150349361_A_T:150349361:1,5,1,1
chrX	150349370	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:150349361_A_T:150349361:0,5,0,1
chrX	150349372	.	TAAGC	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:150349361_A_T:150349361:0,5,0,1
chrX	150349379	.	GC	CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:150349361_A_T:150349361:0,4,0,1
chrX	150349557	.	CCACCACTGGCCA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chrX	150789334	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chrX	150789950	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chrX	150840185	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=89148586,115;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,5:1,3:1,0,4,5
chrX	150840193	.	T	TAC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,0:0,2:0|1:150840193_T_TAC:150840193:1,3,1,1
chrX	150840198	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:150840193_T_TAC:150840193:0,3,1,1
chrX	150840201	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:150840193_T_TAC:150840193:0,3,1,1
chrX	150840231	.	C	CTGAGAGAGAGAGCTCCTGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	150840876	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:150840876_G_A:150840876:5,14,1,1
chrX	150840888	.	G	GTGTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:150840876_G_A:150840876:3,14,1,1
chrX	150840890	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:3,2:0|1:150840876_G_A:150840876:2,14,1,1
chrX	150868794	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:150868794_T_C:150868794:0,4,1,0
chrX	150868799	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:150868794_T_C:150868794:0,2,1,0
chrX	150873651	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chrX	150873964	.	C	CACCCCATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150873964_C_CACCCCATA:150873964:0,2,0,1
chrX	150873965	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150873964_C_CACCCCATA:150873964:0,2,0,1
chrX	150873967	.	G	GCCCAGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150873964_C_CACCCCATA:150873964:0,2,0,1
chrX	150891261	.	C	CTCTTAAGGCAGGATTGGGAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=193,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chrX	150911512	.	GT	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chrX	151092437	.	G	GCTCAGGCTCCCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chrX	151129944	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,0:1,2:0,9,0,2
chrX	151138890	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=89,23;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0,9,1,1
chrX	151283567	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chrX	151283599	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chrX	151304182	.	T	TTGGCCTTTGTTA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:2,1:10,2:6,7,1,2
chrX	151419704	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chrX	151562058	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chrX	151562089	.	A	AGCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chrX	151808980	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151808980_A_C:151808980:0,3,0,1
chrX	151808983	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151808980_A_C:151808980:0,3,0,1
chrX	151817820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chrX	151899760	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chrX	151909281	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,4:0|1:151909281_C_G:151909281:0,0,0,7
chrX	151909305	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:151909281_C_G:151909281:0,0,0,10
chrX	152018832	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chrX	152086652	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=71,42;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:152086652_C_T:152086652:8,6,1,1
chrX	152086663	.	T	TCTAGTGCTGCCA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=76,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:7,2:0|1:152086652_C_T:152086652:6,5,1,1
chrX	152086665	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=145,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,1:0|1:152086652_C_T:152086652:6,3,1,1
chrX	152087569	.	CGAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=73,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GAG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chrX	152088850	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:7,4,1,1
chrX	152091338	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,2:0,0:3,4,0,2
chrX	152100140	.	TTGAGGATGAGGTAACAGCCCACACC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:4,0,1,0
chrX	152101409	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=83,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:5,8,4,1
chrX	152106759	.	G	GTACTATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:152106759_G_GTACTATA:152106759:0,1,1,1
chrX	152106760	.	G	GTATAATCTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:152106759_G_GTACTATA:152106759:0,1,1,1
chrX	152106763	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=86,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:152106759_G_GTACTATA:152106759:0,1,0,1
chrX	152134160	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=289,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chrX	152138068	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,30;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:152138068_C_T:152138068:0,0,3,8
chrX	152138078	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:152138068_C_T:152138068:0,0,2,5
chrX	152158880	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chrX	152159267	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:152159267_G_T:152159267:0,3,1,0
chrX	152159272	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:152159267_G_T:152159267:0,4,1,0
chrX	152160236	.	A	AAAGCGCAGTATTCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,18;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:2,5,1,1
chrX	152226440	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=238,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:12,0:1,3:3,10,0,3
chrX	152228332	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chrX	152228776	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:152228776_C_T:152228776:0,0,5,2
chrX	152228778	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:152228776_C_T:152228776:0,0,5,2
chrX	152610947	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	152611054	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chrX	152613702	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,6:0,7:1,0,10,3
chrX	152616952	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	152710776	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=109,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:5,2,0,3
chrX	152719845	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chrX	152719900	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=46,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chrX	152719908	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chrX	152720579	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chrX	152721031	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=109,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,2:13,0:11,6,1,1
chrX	152728003	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chrX	152770618	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,79;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chrX	152771575	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chrX	152772473	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chrX	152773944	.	G	GCCTCCCCATCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chrX	152801756	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:152801756_G_T:152801756:6,9,1,1
chrX	152801764	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:152801756_G_T:152801756:6,9,1,1
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chrX	152815089	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,6:0,9:0,0,8,9
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chrX	152821887	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,5,9
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chrX	152825414	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chrX	152825433	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=160,152;MMQ=48,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:0,1,3,6
chrX	152827588	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,4:0,1:0,0,4,2
chrX	152830322	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chrX	152845465	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=109,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:10,1:18,4:12,16,1,4
chrX	152864477	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	152908887	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,10:0,0,11,6
chrX	152938409	.	TAC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=87,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:2,2:2,2:4,3,2,2
chrX	152954025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chrX	152957437	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=154,147;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:2,2,0,2
chrX	152991616	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.129:25:12,0:9,2:0|1:152991616_C_T:152991616:13,9,0,3
chrX	152991630	.	G	GGTCAGATTGCTGATCCAGATGAGCA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.129:25:11,0:8,3:0|1:152991616_C_T:152991616:12,10,0,3
chrX	153001534	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:153001534_G_C:153001534:0,3,1,0
chrX	153001539	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:153001534_G_C:153001534:0,3,1,0
chrX	153001542	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:153001534_G_C:153001534:0,3,1,0
chrX	153001546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=97,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:153001534_G_C:153001534:0,3,1,0
chrX	153001939	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,2:5,1:6,11,2,1
chrX	153002581	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chrX	153002667	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,0:11,5:9,6,2,3
chrX	153002688	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.314:17:2,0:10,5:0|1:153002688_G_T:153002688:6,6,2,3
chrX	153002693	.	C	CTGTCTGGCAAGGAGCCTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:2,0:11,4:0|1:153002688_G_T:153002688:6,7,2,3
chrX	153008911	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,6:0,18:0,0,15,10
chrX	153009197	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chrX	153031839	.	TG	CC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chrX	153036884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	153037275	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	153037578	.	G	GGGTGGAGAAGGTGCGCTCGGTAGCAGCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,1:0,3:0|1:153037578_G_GGGTGGAGAAGGTGCGCTCGGTAGCAGCT:153037578:0,0,7,0
chrX	153037594	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:153037578_G_GGGTGGAGAAGGTGCGCTCGGTAGCAGCT:153037578:0,0,8,1
chrX	153037779	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chrX	153038468	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chrX	153038516	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chrX	153038661	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,9:0,5:1,0,7,7
chrX	153039615	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chrX	153048403	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chrX	153049256	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=78,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.171:32:15,2:12,3:11,16,2,3
chrX	153049389	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:153049389_A_G:153049389:0,0,4,5
chrX	153049391	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:153049389_A_G:153049389:0,0,4,5
chrX	153049535	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chrX	153050619	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:153050619_A_C:153050619:2,2,0,1
chrX	153050621	.	C	CACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:153050619_A_C:153050619:2,2,0,1
chrX	153050984	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chrX	153051050	.	C	CCCCACCCTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=359,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	153051515	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chrX	153051907	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,9:0,6:0,0,3,13
chrX	153052649	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=216,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:0,1,1,5
chrX	153052661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chrX	153061984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:2,4,1,2
chrX	153063499	.	AGCACCTCCCTT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=82,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCACCTCCCTT;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:3,1:3,4,1,2
chrX	153072107	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	153073752	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	153129099	.	A	AGTTTCTGTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:153129099_A_AGTTTCTGTTTTT:153129099:0,5,0,2
chrX	153129100	.	A	AAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:153129099_A_AGTTTCTGTTTTT:153129099:0,5,0,2
chrX	153129103	.	G	GAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:153129099_A_AGTTTCTGTTTTT:153129099:0,4,0,2
chrX	153129556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	153136300	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:4,2:14,0:0|1:153136300_G_A:153136300:13,6,0,2
chrX	153136303	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:14,0:0|1:153136300_G_A:153136300:12,6,0,2
chrX	153136574	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:3,0:8,2:0|1:153136574_A_T:153136574:6,5,1,1
chrX	153136578	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,0:8,2:0|1:153136574_A_T:153136574:7,5,1,1
chrX	153149118	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chrX	153149708	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,2
chrX	153149715	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,2
chrX	153150791	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chrX	153170980	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chrX	153171993	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chrX	153174819	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chrX	153174867	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chrX	153175053	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chrX	153175413	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:153175413_G_T:153175413:3,1,0,1
chrX	153175414	.	G	GAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:153175413_G_T:153175413:3,1,0,1
chrX	153176750	.	CA	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=136,152;MMQ=56,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:153176750_CA_GG:153176750:0,4,0,1
chrX	153176761	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=145,130;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chrX	153176763	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=136,152;MMQ=56,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:153176750_CA_GG:153176750:0,4,0,1
chrX	153178459	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chrX	153178767	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:8,0:3,3:5,6,2,1
chrX	153186484	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chrX	153195393	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chrX	153196345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,3,10
chrX	153199403	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,1:17,2:16,19,2,1
chrX	153200020	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	153207545	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chrX	153208278	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=144,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153208278_A_C:153208278:0,1,1,0
chrX	153208281	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=149,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:153208278_A_C:153208278:2,1,1,0
chrX	153210179	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	153210195	.	GCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	153216036	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.957:18:0,6:0,10:0,0,4,14
chrX	153217335	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chrX	153218365	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chrX	153219189	.	C	CTGCACCCGGTTACACAGCATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chrX	153219884	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,0:2,3:7,6,1,2
chrX	153220360	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chrX	153222835	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=237,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,12:0,3:0,1,6,10
chrX	153225518	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:6,5:2,0:0|1:153225518_G_A:153225518:5,3,3,2
chrX	153225540	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=139,33;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:0|1:153225518_G_A:153225518:6,4,0,2
chrX	153225634	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chrX	153225863	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=102,102;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:5,0:13,2:6,12,0,2
chrX	153227770	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,6:0,6:0,1,7,6
chrX	153227800	.	C	CGATGCATGGCCCATATAGTCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:3,2:3,0:2,5,1,1
chrX	153228872	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=116,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:7,0:5,8,2,1
chrX	153248123	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=103,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:9,0:0|1:153248123_T_A:153248123:8,7,1,1
chrX	153248129	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:153248123_T_A:153248123:8,6,1,1
chrX	153248248	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chrX	153248459	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=180,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,5:5,0:7,2,0,5
chrX	153276324	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chrX	153276594	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153276597	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153276599	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153276603	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153276606	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153276608	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153276594_CA_GG:153276594:0,0,0,1
chrX	153277416	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153277416_C_T:153277416:0,0,1,0
chrX	153277437	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153277416_C_T:153277416:0,0,1,0
chrX	153281957	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.144:18:4,2:12,0:0|1:153281957_G_A:153281957:6,10,1,1
chrX	153281966	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,2:10,0:0|1:153281957_G_A:153281957:7,9,1,1
chrX	153296570	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=177,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:153296570_C_A:153296570:1,3,0,1
chrX	153296572	.	C	CTGTGCCGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.297:6:1,1:3,0:0|1:153296570_C_A:153296570:1,3,0,2
chrX	153296893	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=86,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:0,0:9,6:2,8,0,6
chrX	153357614	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,27;MFRL=37,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:0,1:0,0:0,2,2,0
chrX	153422080	.	T	TCAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=209,142;MMQ=40,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	153482563	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,199;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chrX	153555952	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:8,10,1,1
chrX	153557970	.	TTGCTGGATATGTATGGAATTAGTGCCAGACATATCATAGTGGCCGTGAAA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:9,2:8,0:14,20,1,1
chrX	153580488	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chrX	153580494	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,22;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:0|1:153580494_AA_CC:153580494:2,0,2,0
chrX	153580500	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=14,34;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:153580494_AA_CC:153580494:4,0,1,0
chrX	153580609	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=170,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:153580609_C_T:153580609:7,9,1,1
chrX	153580614	.	T	TTCTTTCTTTCA	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=163,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:153580609_C_T:153580609:8,10,1,1
chrX	153581404	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=191,1334;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,0:5,2:5,2,2,0
chrX	153607919	.	TGTA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTA;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:7,0:9,8,1,1
chrX	153633953	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,4,11
chrX	153637602	.	C	CAGGTATGGGAGCCCCCTGGGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153637602_C_CAGGTATGGGAGCCCCCTGGGGAGA:153637602:0,1,0,1
chrX	153637605	.	G	GAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=154,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153637602_C_CAGGTATGGGAGCCCCCTGGGGAGA:153637602:0,1,0,1
chrX	153641558	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=85,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:12,0:9,2:0|1:153641558_C_T:153641558:10,11,1,1
chrX	153641582	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:153641558_C_T:153641558:8,9,1,1
chrX	153641585	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:0|1:153641558_C_T:153641558:8,9,1,1
chrX	153641586	.	G	GTTAAGCCCC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=95,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:153641558_C_T:153641558:8,8,1,1
chrX	153660070	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chrX	153668022	.	CAA	C,CA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31,26;MFRL=120,135,86;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.68,38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,20:0.110,0.723:27:3,1,8:1,2,9:3,1,9,14
chrX	153668172	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chrX	153670995	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:16,3:10,0:12,14,0,3
chrX	153678917	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	153689163	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	153692923	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153692923_TG_CA:153692923:0,0,0,1
chrX	153692926	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153692923_TG_CA:153692923:0,0,0,1
chrX	153692928	.	C	CAGGGGACAGAGAGATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153692923_TG_CA:153692923:0,0,0,1
chrX	153693242	.	G	GATGAAGCACAGAGTCAAAGCCAGACTTTCCCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
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chrX	153736852	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,2,0
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chrX	153770501	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,13:5,0:6,6,13,0
chrX	153906394	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=92,147;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:1,1:4,1:0|1:153906394_G_A:153906394:6,2,2,0
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chrX	153906407	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=94,147;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:2,0:14,0:7,10,2,0
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chrX	153907316	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
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chrX	153944655	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0|1:153944655_C_CCT:153944655:0,0,0,1
chrX	153944658	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:153944655_C_CCT:153944655:0,1,0,1
chrX	153944663	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153944655_C_CCT:153944655:0,1,0,1
chrX	153944664	.	TGCCAAGAAC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153944655_C_CCT:153944655:0,1,0,1
chrX	153994596	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,15:0,0,11,16
chrX	153996562	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,2:17,0:0|1:153996562_G_A:153996562:19,9,1,1
chrX	153996564	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:10,2:18,0:0|1:153996562_G_A:153996562:19,9,1,1
chrX	154004585	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,0:17,3:15,11,2,1
chrX	154005148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chrX	154007475	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,3:4,0:0|1:154007475_C_G:154007475:7,6,3,0
chrX	154007478	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,3:4,0:0|1:154007475_C_G:154007475:8,7,3,0
chrX	154132090	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	154189435	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=91,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chrX	154305506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:2,5,0,3
chrX	154317630	.	TTGTGTGTGCA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,85;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.258:36:20,0:6,9:12,15,9,0
chrX	154344344	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,68;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:5,0:0|1:154344344_C_G:154344344:7,7,1,1
chrX	154344351	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,68;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:154344344_C_G:154344344:7,7,1,1
chrX	154456747	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,3,10
chrX	154464633	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=119,451278;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:6,0:9,6:7,8,7,0
chrX	154774663	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	154774707	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chrY	2655796	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:0,8,0,2
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chrY	2713606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chrY	2722817	.	GT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,2:12,1:9,16,2,1
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chrY	3447295	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=85,57;MMQ=32,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:10,8,0,2
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chrY	3447363	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=150,69;MMQ=34,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0|1:3447357_A_AG:3447357:0,4,1,1
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chrY	4967853	.	A	AATGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=144,152;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4967852_T_G:4967852:0,1,0,1
chrY	4968169	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=230,112;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4968169_T_C:4968169:0,1,0,1
chrY	4968170	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=230,112;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4968169_T_C:4968169:0,1,0,1
chrY	4968172	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=230,112;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4968169_T_C:4968169:0,1,0,1
chrY	4968180	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=230,112;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4968169_T_C:4968169:0,1,0,1
chrY	5605490	.	ACCACAGCCCACCAGTGACACAGACCATTGTTCTCTGCCACAGCCCTCCAGTGACACAGACCATCGCATTGTG	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=141,48;MMQ=45,21;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.145:27:5,0:3,3:11,13,1,2
chrY	6740590	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:6740590_A_T:6740590:12,6,1,1
chrY	6740598	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:6740590_A_T:6740590:13,6,1,1
chrY	6740600	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:6740590_A_T:6740590:13,5,1,1
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chrY	14475462	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=24,34;MFRL=105,130;MMQ=60,26;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,0:0|1:14475454_G_A:14475454:9,6,2,0
chrY	14821420	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=103,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:14821420_G_A:14821420:6,15,0,2
chrY	14821423	.	A	ATAC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=99,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:0|1:14821420_G_A:14821420:7,17,0,2
chrY	14821424	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=99,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:0|1:14821420_G_A:14821420:7,17,0,2
chrY	14821428	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=98,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:14821420_G_A:14821420:6,16,0,2
chrY	14832620	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
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chrY	14898435	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.411:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chrY	14924685	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chrY	14925051	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14925051_TGG_T:14925051:0,3,0,1
chrY	14925055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14925051_TGG_T:14925051:0,3,0,1
chrY	14925059	.	T	TG,TTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26,26;MFRL=173,248,237;MMQ=60,60,60;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.02,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:0,2,0,2
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chrY	14953040	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=104,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:17,4:19,0:21,15,2,2
chrY	14954404	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.536:11:0,2:5,1:1,4,1,5
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chrY	14958218	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
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chrY	15023787	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:25,3:19,0:29,17,1,2
chrY	15026633	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chrY	15026658	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=210,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chrY	15027529	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,11:0,0,10,7
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chrY	15372260	.	CTTCAGAATT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=127,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,0:15,2:0|1:15372257_T_A:15372257:10,15,1,1
chrY	15372279	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=116,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:16,2:0|1:15372257_T_A:15372257:9,13,1,1
chrY	15372282	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=116,50;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:15,2:0|1:15372257_T_A:15372257:9,13,1,1
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chrY	15471941	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:15471941_T_A:15471941:0,3,0,1
chrY	15471949	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:15471941_T_A:15471941:0,2,0,1
chrY	15471955	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15471941_T_A:15471941:0,1,0,1
chrY	15526751	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chrY	15591537	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,12:0,7:0,0,8,16
chrY	16936309	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=168,168;MMQ=54,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:0,8,0,4
chrY	16942325	.	TT	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=109,76;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:10,2:0|1:16942325_TT_CA:16942325:9,11,0,2
chrY	16942334	.	C	CTGGACTTGTCTACACCATGGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=93,76;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:15,2:0|1:16942325_TT_CA:16942325:11,11,0,2
chrY	16952697	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,210;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:5,5,0,2
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chrY	21154569	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=143,69;MMQ=53,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:2,6:0,5:0,2,3,8
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